JP7240403B2 - 3d医用画像の解剖学的ジオメトリに従った、構造化された畳み込みを通した1つまたはいくつかのニューラルネットワークによる3d医用画像の自動セグメンテーションプロセス - Google Patents
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Description
方法は、以下の3つのプロセスステップ、すなわち:
a/2 × b/2 × nのディメンションの9つのサブ画像を前記医用画像から抽出する、すなわち、9つの部分的にオーバーラップするa/2 × b/2のサブ画像を各2D画像から抽出することにある第1のステップ;
9つの畳み込みニューラルネットワークが、各2D画像のこれら9つのサブ画像の各々を解析し、セグメント化することにある第2のステップ;
n個の異なる2D画像の9つの解析およびセグメンテーションの結果を、したがってa/2 × b/2 × nのディメンションを有する9つのセグメント化されたサブ画像の結果を、最初の医用画像の単一のセグメンテーションに対応する、a×b×nのディメンションを有する単一の画像に結合することにある第3のステップ
を主に含むことを特徴とする。
方法は、3つのプロセスステップ、すなわち:
a/2 × b/2 × nのディメンションの9つのサブ画像(1から9)を前記医用画像から抽出する、すなわち、9つの部分的にオーバーラップするa/2 × b/2のサブ画像を各2D画像から抽出することにある第1のステップ;
9つの畳み込みニューラルネットワーク(CNN)が、各2D画像のこれら9つのサブ画像(1から9)の各々を解析し、セグメント化することにある第2のステップ;
n個の異なる2D画像の9つの解析およびセグメンテーションの結果を、したがってa/2 × b/2 × nのディメンションを有する9つのセグメント化されたサブ画像の結果を、最初の医用画像の単一のセグメンテーションに対応する、a×b×nのディメンションを有する単一の画像に結合することにある第3のステップ
を主に含むことを特徴とする。
- 2D画像を、2対の対向する辺の仲介により、4つのサブ画像1から4に対称的に区分する;
- 2D画像の2つの方向の各々に従って、1つの辺を間に共有し、前記画像の垂直な辺に向かって中心に配置された2つのサブ画像5、6および7、8を形成する;
- 2D画像に向かって中心に配置され、前記画像の辺に平行な辺を有するサブ画像9を形成する。
- a×b×N(i)のディメンションのK個のセグメント化された医用画像から知識データベースを構築すること、
- a/2 × b/2 × N(i)のディメンションの画像の9つのサブセットを知識データベースの各画像から作成すること、
- a/2 × b/2 × N(i)のディメンションの9つのサブ画像のセグメンテーション、および9つのサブ画像からの各サブセットの画像作成を可能とし、次いでこの選択をXおよびY方向に1からTボクセル分シフトさせ、したがって、各々が同じディメンションを有する、4から(T+1)2個の画像の9つのサブセットを提供すること
であってもよく、N(i)は画像iのZに沿ったスライスの数であり、iは1からKまで変化する。
- 1つの専用の2D CNNを用いて、およびa/2 × b/2のディメンションを有するn個のスライスを順次セグメント化することにより、9つのサブ画像1から9の各々を解析することと、次いで、
- 全ての9つのCNNにより提供された結果を結合して、前記結果のマージにより単一の最初の画像のセグメンテーションを提供することと
にある。
- 1つの専用の3D CNNを用いて、およびa/2 × b/2のディメンションを有するL個の連続するスライスの全てのサブセットを順次セグメント化することにより、9つのサブ画像の各々を解析することと、次いで、
- 全ての9つのCNNにより提供された解析結果を結合して、前記結果のマージにより単一の最初の画像のセグメンテーションを提供することと
にあり、Lは2からnまでの範囲を取り、a/2 × b/2のディメンションを有する3Dサブ画像のサブセットの数は1とn-L+1の間で変化する。
Claims (6)
- a×b×nのディメンションの、すなわち各々がa×bのディメンションのn個の異なる2D画像から構成される3D医用画像において見られ得る解剖学的および病理学的構造物または器具についての情報を収容する知識データベースを利用する、医用画像の自動セグメンテーション方法であって、方法が、3つのプロセスステップ、すなわち、
a/2 × b/2 × nのディメンションの9つのサブ画像(1から9)を前記医用画像から抽出する、すなわち、9つの部分的にオーバーラップするa/2 × b/2のサブ画像を各2D画像から抽出することにある第1のステップ、
9つの畳み込みニューラルネットワーク(CNN)が、各2D画像のこれら9つのサブ画像(1から9)の各々を解析し、セグメント化することにある第2のステップ、
n個の異なる2D画像の9つの解析およびセグメンテーションの結果を、したがってa/2 × b/2 × nのディメンションを有する9つのセグメント化されたサブ画像の結果を、最初の医用画像の単一のセグメンテーションに対応する、a×b×nのディメンションを有する単一の画像に結合することにある第3のステップ
を主に含み、
各々a/2 × b/2のディメンションの9つのサブ画像(1から9)が、a×bのディメンションの2D画像から以下のように、すなわち、
- 2D画像を、2対の対向する辺の仲介により、4つのサブ画像(1から4)に対称的に区分すること、
- 2D画像の2つの方向の各々に従って、1つの辺を間に共有し、前記画像の垂直な辺に向かって中心に配置された2つのサブ画像(5、6および7、8)を形成すること、
- 2D画像に向かって中心に配置され、前記画像の辺に平行な辺を有するサブ画像(9)を形成すること
により抽出されることを特徴とする、自動セグメンテーション方法。 - 9つのサブ画像(1から9)のオーバーラップが、考慮される最初の2D画像の全面を共にカバーする、各々a/4 × b/4のディメンションの16個の断片的な相補的領域(AからP)を生成するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の自動セグメンテーション方法。
- 自動セグメンテーション方法が、
- a×b×N(i)のディメンションのK個のセグメント化された医用画像から知識データベースを構築すること、
- a/2 × b/2 × N(i)のディメンションの画像の9つのサブセットを、知識データベースの各画像から作成すること、
- a/2 × b/2 × N(i)のディメンションの9つのサブ画像のセグメンテーション、および9つのサブ画像からの各サブセットの画像作成を可能とし、次いでこの選択をXおよびY方向に1からTボクセル分シフトさせ、したがって、各々が同じディメンションを有する4から(T+1)2個の画像の9つのサブセットを提供すること
にあり、N(i)は画像iのZに沿ったスライスの数であり、iは1からKまで変化することを特徴とする、請求項1または2に記載の自動セグメンテーション方法。 - 自動セグメンテーション方法が、9つの2D CNNを用いて、
- 1つの専用の2D CNNを用いて、およびa/2 × b/2のディメンションを有するn個のスライスを順次セグメント化することにより、9つのサブ画像(1から9)の各々を解析することと、次いで、
- 全ての9つのCNNにより提供された結果を結合して、前記結果のマージにより単一の最初の画像のセグメンテーションを提供することと
にあることを特徴とする、請求項1から3のいずれか一項に記載の自動セグメンテーション方法。 - 自動セグメンテーション方法が、9つの3D CNNを用いて、
- 1つの専用の3D CNNを用いて、およびa/2 × b/2のディメンションを有するL個の連続するスライスの全てのサブセットを順次セグメント化することにより、9つのサブ画像の各々を解析することと、次いで、
- 全ての9つのCNNにより提供された解析結果を結合して、前記結果のマージにより単一の最初の画像のセグメンテーションを提供することと
にあり、Lは2からnまでの範囲を取り、a/2 × b/2のディメンションを有する3Dサブ画像のサブセットの数は、1とn-L+1の間で変化することを特徴とする、請求項1から3のいずれか一項に記載の自動セグメンテーション方法。 - 請求項1から5のいずれか一項に記載の方法を実行することにより医用画像の自動セグメンテーションを行うためのシステムであって、知識データベースからの情報を用いることにより、医用画像の少なくとも一部のセグメンテーションを行うように適合された9つの畳み込みニューラルネットワーク(CNN)の協調動作をホストし、可能とする、少なくとも1つのコンピュータデバイスを含み、前記少なくとも1つのコンピュータデバイスはまた、医用画像の区分と、異なるCNNにより提供された部分的セグメンテーション結果のマージとを実施するプログラムをホストし、走らせることを特徴とする、システム。
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