JP7178607B2 - Reagent for extracting amyloid protein - Google Patents

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特許法第30条第2項適用 1.集会において発表 発表日 2018(平成30)年3月29日 集会名、開催場所 The XVI International Symposium on Amyloidosis KKRホテル熊本(熊本県熊本市中央区千葉城町3-31)Application of Article 30, Paragraph 2 of the Patent Law 1. Presentation at the meeting Announcement date March 29, 2018 Name of the meeting, location The XVI International Symposium on Amyloidosis KKR Hotel Kumamoto (3-31 Chibashiro-cho, Chuo-ku, Kumamoto-shi, Kumamoto)

本発明は、アミロイドタンパク質を抽出する試薬および抽出する方法に関する。より具体的には、本発明は、生体試料から、アミロイドタンパク質を特異的に抽出する試薬および抽出する方法に関する。 The present invention relates to reagents and methods for extracting amyloid protein. More specifically, the present invention relates to reagents and methods for specifically extracting amyloid protein from biological samples.

アミロイドタンパク質は、水に不溶性の線維状のタンパク質で、βシート構造が積層した構造(クロスβ構造)をとり、主に器官や組織の細胞外領域に沈着する。アミロイドタンパク質をコンゴーレッド(Congo red)で染色し、偏光顕微鏡で観察すると、緑色、黄色または橙色の複屈折を呈する(非特許文献1)。
アミロイドーシスは、アミロイドタンパク質が臓器の細胞外に沈着し、機能障害を引き起こす疾患の総称で、全身の様々な臓器にアミロイドタンパク質が沈着する全身性アミロイドーシスと、ある種特定の臓器に限局してアミロイドタンパク質が沈着する限局性アミロイドーシスに大別される。全身性アミロイドーシスの代表的なものとしては、ALアミロイドーシス(免疫グロブリン性アミロイドーシス)、AAアミロイドーシス、Aβ2Mアミロイドーシス(透析アミロイドーシス)、家族性アミロイドポリニューロパチー (FAP) 、老人性全身性アミロイドーシス (SSA) などがある。これらの疾患のうち、ALアミロイドーシス、FAP、SSAの3者は、日本において指定難病となっている。一方、限局性アミロイドーシスとしては、アルツハイマー病、脳アミロイドアンギオパチー、プリオン病などの脳アミロイドーシスがある(非特許文献2)。現在までに、アミロイドーシスの原因となるアミロイドタンパク質として約30種が同定されている(非特許文献1)。
Amyloid protein is a water-insoluble fibrous protein, has a structure in which β-sheet structures are laminated (cross-β structure), and is mainly deposited in the extracellular regions of organs and tissues. When amyloid protein is stained with Congo red and observed with a polarizing microscope, it exhibits green, yellow or orange birefringence (Non-Patent Document 1).
Amyloidosis is a general term for diseases in which amyloid protein deposits outside the cells of organs and causes dysfunction. It is broadly classified into focal amyloidosis in which is deposited. Representative examples of systemic amyloidosis include AL amyloidosis (immunoglobulin amyloidosis), AA amyloidosis, Aβ2M amyloidosis (dialysis amyloidosis), familial amyloid polyneuropathy (FAP), and senile systemic amyloidosis (SSA). . Among these diseases, AL amyloidosis, FAP, and SSA are designated as intractable diseases in Japan. On the other hand, localized amyloidosis includes cerebral amyloidosis such as Alzheimer's disease, cerebral amyloid angiopathy, and prion disease (Non-Patent Document 2). Up to now, about 30 kinds of amyloid proteins have been identified as causative of amyloidosis (Non-Patent Document 1).

アミロイドーシスの病理診断は、ホルマリン固定パラフィン(formalin-fixed paraffin-embedded: FFPE)切片で実施され、免疫染色でアミロイド種が同定される。しかし、免疫染色では同定が難しい症例が約1割存在する。代替法として、質量分析法が用いられるが、そのためにはFFPE切片からアミロイドを抽出する必要がある。従来は、FFPE切片からレーザーマイクロダイセクションでアミロイド沈着部位を採取し(マイクロダイセクション法)、ホルマリンで架橋されたアミロイドを界面活性剤で処理し、抽出していた。この方法は、病理専門家がアミロイド沈着部位を特定したのち、沈着部位をマイクロダイセクションで採取するため、工程が煩雑な上、高額なマイクロダイセクション装置が必要であり、小規模な医療機関などにおいては、人材および費用の点から、容易に実施できる方法ではない。
また、アミロイドーシスの病態を解明する上では、アミロイドタンパク質の解析が必須であるが、従来は、アミロイドタンパク質を新鮮または凍結した材料から、多段階の工程を経て水抽出(水抽出法)により調製していた(非特許文献3)。しかしながら、この方法ではFFPE切片からアミロイドタンパク質を調製することができず、また、大量(グラム単位)の新鮮または凍結した材料を準備しなくてはならず、多くの労力と費用がかかっていた。
Pathological diagnosis of amyloidosis is performed on formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) sections, and immunostaining identifies amyloid species. However, about 10% of cases are difficult to identify by immunostaining. As an alternative, mass spectrometry is used, which requires extraction of amyloid from FFPE sections. Conventionally, amyloid deposition sites were collected from FFPE sections by laser microdissection (microdissection method), and formalin-crosslinked amyloid was treated with a surfactant and extracted. In this method, a pathologist identifies the site of amyloid deposition and then collects the deposition site by microdissection. However, it is not an easy method to implement in terms of human resources and costs.
In order to elucidate the pathophysiology of amyloidosis, analysis of amyloid proteins is essential. Conventionally, amyloid proteins are prepared from fresh or frozen materials by water extraction (water extraction method) through a multistep process. (Non-Patent Document 3). However, this method cannot prepare amyloid protein from FFPE sections, and requires the preparation of large amounts (in grams) of fresh or frozen material, which is labor intensive and costly.

このような状況において、FFPE切片からアミロイドタンパク質を簡便かつ低コストで抽出する技術があれば、迅速なアミロイドーシス診断と病態解明の研究が可能となるが、現在のところ、そのような技術は存在しない。 Under such circumstances, if there is a technology to extract amyloid protein from FFPE sections easily and at low cost, it will be possible to conduct rapid diagnosis of amyloidosis and research to elucidate the pathology, but currently there is no such technology. .

Sipeら, Amyloid 23:209-213 2016Sipe et al., Amyloid 23:209-213 2016 難病情報センターHP(http://www.nanbyou.or.jp/entry/45)Intractable Disease Information Center HP (http://www.nanbyou.or.jp/entry/45) Schubertら, J Clin Invest., 47:924-933 1968Schubert et al., J Clin Invest., 47:924-933 1968

上記事情に鑑み、本発明は、生体試料(例えば、FFPE切片など)からアミロイドタンパク質を特異的に抽出する試薬および該試薬を含むアミロイドタンパク質調製キットの提供を目的とする。
また、本発明は、生体試料からアミロイドタンパク質を特異的に抽出する方法の提供を目的とする。
In view of the above circumstances, an object of the present invention is to provide a reagent for specifically extracting amyloid protein from a biological sample (eg, FFPE section, etc.) and an amyloid protein preparation kit containing the reagent.
Another object of the present invention is to provide a method for specifically extracting an amyloid protein from a biological sample.

本発明者らは、FFPE切片を脱パラフィン処理したのち、アミロイド中のβシートを変性(破壊)する試薬である、スルホキシド類のジメチルスルホキシド(dimethyl sulfoxide: DMSO、以下「DMSO」と略記する)、酸アミド類のN,N-ジメチルホルムアミド(N,N-dimethylformamide: DMF、以下「DMF」と略記する)、低級アルコール類のメタノール(methanol)、フッ化アルコール類の2,2,2-トリフルオロエタノール(2,2,2-Trifluoroethanol: TFE、以下「TFE」と略記する)およびヘキサフルオロイソプロパノール(1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol: HFIP、以下「HFIP」と略記する)などで処理すると、FFPE切片からアミロイドタンパク質が特異的に抽出されることを見いだした。
また、上記5溶媒を混合してもアミロイドタンパク質を抽出することが可能であること、特に、DMSOとTFEまたはDMFとTFEを各々混合した溶液で処理すると、抽出されるアミロイドタンパク質の特異性が上がることも併せて見い出した。
本発明は上記知見に基づいて完成されたものである。
After deparaffinizing FFPE sections, the present inventors used dimethyl sulfoxide (DMSO, hereinafter abbreviated as "DMSO"), which is a sulfoxide, which is a reagent that denatures (destroys) β-sheets in amyloid. Acid amides N,N-dimethylformamide (DMF, hereinafter abbreviated as "DMF"), lower alcohols methanol (methanol), fluorinated alcohols 2,2,2-trifluoro Ethanol (2,2,2-Trifluoroethanol: TFE, hereinafter abbreviated as “TFE”) and hexafluoroisopropanol (1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol: HFIP, hereinafter “HFIP”) It was found that amyloid protein was specifically extracted from the FFPE section when treated with (abbreviated below).
In addition, it is possible to extract amyloid protein even if the above five solvents are mixed, and in particular, treatment with a mixed solution of DMSO and TFE or DMF and TFE increases the specificity of the extracted amyloid protein. I also found out.
The present invention has been completed based on the above findings.

すなわち、本発明は以下の(1)~(19)である。
(1)生体試料からアミロイドタンパク質を抽出する試薬であって、βシート構造を変性させる化合物を含む、前記試薬。
(2)前記βシート構造を変性させる化合物が、スルホキシド類、酸アミド類、炭素数1~4のアルコール類およびフッ化アルコール類に含まれる化合物の1または複数であることを特徴とする上記(1)に記載の試薬。
(3)前記スルホキシド類が、ジメチルスルホキシド(DMSO)またはジエチルスルホキシドのいずれかであることを特徴とする上記(2)に記載の試薬。
(4)前記酸アミド類が、N,N-ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N-ジエチルホルムアミド、N,N-ジメチルアセトアミド、N,N-ジエチルアセトアミドまたはN,N-ジメチルプロピオンアミドのいずれかであることを特徴とする上記(2)に記載の試薬。
(5)前記炭素数1~4のアルコール類が、メタノール、エタノール、n-プロパノール、イソプロパノール、n-ブタノール、2-ブタノール、2-メチル-1-プロパノール、t-ブタノール、アリルアルコール、3-ブテン-2-オール、シクロブタノール、1,2-エタンジオール、1,2-プロパンジオールまたは1,3-プロパンジオールのいずれかであることを特徴とする上記(2)に記載の試薬。
(6)前記フッ化アルコール類が、2、2、2-トリフルオロエタノール(TFE)、1、1、1-トリフルオロ-2-プロパノール、1、1、1、3、3、3-ヘキサフルオル-2-プロパノール(HFIP)、1、1、1、3、3、3-ヘキサフルオル-2-メチル-2-プロパノール、2、2、3、4、4、4-ヘキサフルオロ-1-ブタノールまたは2、2、3、3、4、4-ヘキサフルオロ-1、5-ペンタンジオールンジオールのいずれかであることを特徴とする上記(2)に記載の試薬。
(7)生体試料からアミロイドタンパク質を抽出する試薬であって、DMSO、DMF、メタノール、HFIPおよびTFEからなるグループから選択される1または複数を含むことを特徴とする上記(4)ないし(6)のいずれかに記載の試薬。
(8)DMSOおよびTFEを選択することを特徴とする上記(7)に記載の試薬。
(9)DMFおよびTFEを選択することを特徴とする上記(7)に記載の試薬。
(10)前記生体試料が固定されたものであることを特徴とする上記(1)ないし(9)のいずれかに記載の試薬。
(11)前記生体試料がアルデヒド基を有する固定化試薬により固定されたものであることを特徴とする上記(10)に記載の試薬。
(12)前記生体試料がホルマリン固定パラフィン包埋切片であることを特徴とする上記(11)に記載の試薬。
(13)生体試料からアミロイドタンパク質を抽出するためのキットであって、少なくとも上記(1)ないし(12)のいずれかに記載の試薬を含むキット。
(14)ワックス可溶化剤をさらに含むことを特徴とする上記(13)に記載のキット。
(15)生体試料からアミロイドタンパク質を抽出する方法であって、以下の工程を含む方法。
(a)生体試料を上記(1)ないし(12)のいずれかに記載の試薬と接触させ、インキュベートする工程、
(b)工程(a)のインキュベート後の混合物から、不溶物を除去する工程、および
(c)工程(b)で得られた画分から前記試薬を除去する工程、
(16)前記生体試料が固定されたものであることを特徴とする上記(15)に記載の方法。
(17)前記生体試料がアルデヒド基を有する固定化試薬により固定されたものであることを特徴とする上記(16)に記載の方法。
(18)前記生体試料をワックス可溶化剤で脱パラフィン処理をする工程をさらに含む、上記(15)ないし(17)のいずれかに記載の方法。
(19)上記(15)ないし(18)のいずれかに記載の方法で抽出したアミロイドタンパク質のアミノ酸配列を決定することを含む、生体試料中のアミロイドタンパク質の同定方法。
That is, the present invention is the following (1) to (19).
(1) A reagent for extracting an amyloid protein from a biological sample, the reagent containing a compound that denatures a β-sheet structure.
(2) The above ( 1) The reagent described in 1).
(3) The reagent according to (2) above, wherein the sulfoxide is either dimethylsulfoxide (DMSO) or diethylsulfoxide.
(4) the acid amides are N,N-dimethylformamide (DMF), N,N-diethylformamide, N,N-dimethylacetamide, N,N-diethylacetamide or N,N-dimethylpropionamide; The reagent according to (2) above, characterized in that
(5) the alcohol having 1 to 4 carbon atoms is methanol, ethanol, n-propanol, isopropanol, n-butanol, 2-butanol, 2-methyl-1-propanol, t-butanol, allyl alcohol, 3-butene; -2-ol, cyclobutanol, 1,2-ethanediol, 1,2-propanediol or 1,3-propanediol.
(6) the fluorinated alcohols are 2,2,2-trifluoroethanol (TFE), 1,1,1-trifluoro-2-propanol, 1,1,1,3,3,3-hexafluoro- 2-propanol (HFIP), 1, 1, 1, 3, 3, 3-hexafluoro-2-methyl-2-propanol, 2, 2, 3, 4, 4, 4-hexafluoro-1-butanol or 2, The reagent according to (2) above, which is 2, 3, 3, 4, 4-hexafluoro-1, 5-pentanediol diol.
(7) A reagent for extracting amyloid protein from a biological sample, characterized by containing one or more selected from the group consisting of DMSO, DMF, methanol, HFIP and TFE (4) to (6) The reagent according to any one of.
(8) The reagent according to (7) above, characterized in that DMSO and TFE are selected.
(9) The reagent according to (7) above, characterized in that DMF and TFE are selected.
(10) The reagent according to any one of (1) to (9) above, wherein the biological sample is immobilized.
(11) The reagent according to (10) above, wherein the biological sample is immobilized with a immobilizing reagent having an aldehyde group.
(12) The reagent according to (11) above, wherein the biological sample is a formalin-fixed, paraffin-embedded section.
(13) A kit for extracting an amyloid protein from a biological sample, the kit comprising at least the reagent according to any one of (1) to (12) above.
(14) The kit according to (13) above, further comprising a wax solubilizer.
(15) A method for extracting an amyloid protein from a biological sample, the method comprising the following steps.
(a) contacting and incubating a biological sample with the reagent according to any one of (1) to (12) above;
(b) removing insolubles from the mixture after incubation in step (a); and (c) removing the reagent from the fraction obtained in step (b);
(16) The method according to (15) above, wherein the biological sample is fixed.
(17) The method according to (16) above, wherein the biological sample is immobilized with a immobilizing reagent having an aldehyde group.
(18) The method according to any one of (15) to (17) above, further comprising the step of deparaffinizing the biological sample with a wax solubilizer.
(19) A method for identifying amyloid protein in a biological sample, comprising determining the amino acid sequence of the amyloid protein extracted by the method according to any one of (15) to (18) above.

本発明により、生体試料から、簡便かつ低コストでアミロイドタンパク質を特異的に抽出することが可能になる。その結果、アミロイドーシス診断が容易になり、また、免疫染色による同定ができない症例であっても、簡便に診断することが可能となる。 INDUSTRIAL APPLICABILITY According to the present invention, amyloid protein can be specifically extracted from a biological sample simply and at low cost. As a result, the diagnosis of amyloidosis becomes easy, and even cases that cannot be identified by immunostaining can be easily diagnosed.

さらに、本発明によりFFPEからのアミロイドタンパク質の抽出が可能になることから、蓄積されたFFPEを用いた病態解析ができることになり、研究対象が飛躍的に広がる。 Furthermore, since the present invention enables extraction of amyloid protein from FFPE, pathological analysis can be performed using accumulated FFPE, and the scope of research subjects is dramatically expanded.

DMSO、DMFおよびTFEを用いたアルツハイマー病モデルマウスのFFPE切片からの抽出物をSDSPAGEで分離した結果を示す。矢印は抽出されたアミロイドタンパク質を示す。The results of SDSPAGE separation of extracts from FFPE sections of Alzheimer's disease model mice using DMSO, DMF and TFE are shown. Arrows indicate extracted amyloid proteins. DMSOを用いたアルツハイマー病モデルマウスのFFPE切片からの抽出物の質量分析の結果を示す。Fig. 2 shows the results of mass spectrometric analysis of extracts from FFPE sections of Alzheimer's disease model mice using DMSO. FFPE切片からのAmyloid β抽出に対する温度の影響とDMSO、DMFおよびTFEの混合液の効果に関する検討結果を示す。矢印は抽出されたアミロイドタンパク質(Amyloid β)を示す。Figure 2 shows the results of a study on the effect of temperature and the effect of a mixed solution of DMSO, DMF and TFE on Amyloid β extraction from FFPE sections. Arrows indicate the extracted amyloid protein (Amyloid β). DMSO、 DMF、メタノール、TFEおよび HFIPを用いたアルツハイマー病モデルマウスのFFPE切片からの抽出物をSDSPAGEで分離した結果を示す。矢印は抽出されたアミロイドタンパク質(Amyloid β)を示す。The results of SDSPAGE separation of extracts from FFPE sections of Alzheimer's disease model mice using DMSO, DMF, methanol, TFE and HFIP are shown. Arrows indicate the extracted amyloid protein (Amyloid β). ヒトのアミロイド症の検体由来のアミロイドタンパク質の抽出結果を示す。1 shows the results of extraction of amyloid protein from human amyloidosis specimens. ヒトのアミロイド症の検体由来のアミロイドタンパク質の質量分析の結果を示す。Fig. 2 shows the results of mass spectrometric analysis of amyloid proteins from human amyloidosis specimens. 非ヒト動物のアミロイド症の検体からのアミロイドタンパク質の抽出結果を示す。Fig. 3 shows the results of extracting amyloid protein from non-human animal amyloidosis specimens. TFEのアミロイドタンパク質中のβシート構造に対する影響を検討した結果を示す。1 shows the results of examining the effect of TFE on the β-sheet structure in amyloid protein.

本発明の第1の実施形態は、生体試料からアミロイドタンパク質を抽出する試薬であって、βシート構造を変性させる化合物を含む、前記試薬(「本発明の試薬」とも記載する)である。
ここで、βシート構造を変性させる化合物とは、該βシート構造を変性、破壊等することができる化合物であれば特に限定されず、例えば、ジメチルスルホキシド(DMSO)およびジエチルスルホキシドなどのスルホキシド類、N,N-ジメチルホミアミド(DMF)、N,N-ジエチルホルミアミド、N,N-ジメチルアセトアミド、N,N-ジエチルアセトアミドおよびN,N-ジメチルプロピオンアミドなどの酸アミド類、メタノール、エタノール、n-プロパノール、イソプロパノール、n-ブタノール、2-ブタノール、2-メチル-1-プロパノール、t-ブタノール、アリルアルコール、3-ブテン-2-オール、シクロブタノール、1,2-エタンジオール、1,2-プロパンジオールおよび1,3-プロパンジオールなどの炭素数1~4の低級アルコール類、2,2,2-トリフルオロエタノール(TFE)、1,1,1-トリフルオロ-2-プロパノール、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオル-2-プロパノール(HFIP)、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオル-2-メチル-2-プロパノール、2,2,3,4,4-ヘキサフルオロ-1-ブタノールおよび2,2,3,3,4,4-ヘキサフルオロ-1,5-ペンタンジオールなどのフッ化アルコール類などの化合物を挙げることができる。本発明の試薬には、上記化合物(βシート構造を変性させる化合物)から選択される1または複数が含まれていてもよい。本発明の試薬として、より好ましいものは、DMSO、DMF、メタノール、HFIPおよびTFEからなるグループより選択される1または複数を含む試薬である。
A first embodiment of the present invention is a reagent for extracting an amyloid protein from a biological sample, the reagent containing a compound that denatures the β-sheet structure (also referred to as the "reagent of the present invention").
Here, the compound that modifies the β-sheet structure is not particularly limited as long as it can modify or destroy the β-sheet structure. Examples include sulfoxides such as dimethylsulfoxide (DMSO) and diethylsulfoxide, Acid amides such as N,N-dimethylformamide (DMF), N,N-diethylformamide, N,N-dimethylacetamide, N,N-diethylacetamide and N,N-dimethylpropionamide, methanol, ethanol , n-propanol, isopropanol, n-butanol, 2-butanol, 2-methyl-1-propanol, t-butanol, allyl alcohol, 3-buten-2-ol, cyclobutanol, 1,2-ethanediol, 1, C1-4 lower alcohols such as 2-propanediol and 1,3-propanediol, 2,2,2-trifluoroethanol (TFE), 1,1,1-trifluoro-2-propanol, 1 ,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol (HFIP), 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-methyl-2-propanol, 2,2,3,4, Mention may be made of compounds such as fluorinated alcohols such as 4-hexafluoro-1-butanol and 2,2,3,3,4,4-hexafluoro-1,5-pentanediol. The reagent of the present invention may contain one or more selected from the above compounds (compounds that modify the β-sheet structure). More preferred reagents of the present invention are reagents containing one or more selected from the group consisting of DMSO, DMF, methanol, HFIP and TFE.

ここで、生体試料とは、動物の生体に由来する試料のことで、生体組織などのことである。当該生体試料は、可溶性タンパク質が流出しないように固定されたものであってもよく、固定化剤としては、ホルムアルデヒドやグルタルアルデヒドなどのアルデヒド基を有する剤が好ましい。また、生体試料は、ホルマリン固定パラフィン(FFPE)切片などであってもよい。生体試料がFFPE切片である場合には、ワックス可溶化処理(脱パラフィン処理)を行うことが望ましい。ワックス 可溶化剤は、ワックスを可溶化する(脱パラフィン化する)化合物を含むものであれば特に限定はされず、例えば、ベンゼン、トルエン、キシレンなどの炭素数6~8の芳香族炭化水素類、n-ヘキサン、2,2-ジメチルブタン、2,3-ジメチルブタン、2-メチルペンタン、3-メチルペンタン、n-ヘプタン、n-オクタン、n-ノナン、n-デカン、シクロヘキサン、シクロヘプタンおよびシクロオクタンなどの炭素数6~10の脂肪族炭化水素類、ミネラルオイル(流動パラフィン)および石油ベンジンなどの石油系混合炭化水素類、D-リモネンなどの天然製油類、ジクロルメタン、クロロホルム、1,2-ジクロルエタン、1,1,1-トリクロルエタン、1,1,2-トリクロルエタンおよびテトラクロロエチレンなどの塩素化炭化水素類、ジエチルエーテル、テトラヒドロフラン、2-メチルテトラヒドロフランおよびテトラヒドロピランなどの脂肪族エーテル類、その他二硫化炭素などを挙げることができ、これらの化合物は1または複数混合して使用することもできる。ワックス可溶化剤として、より好ましくは、キシレン、n-ヘキサン、ミネラルオイル、D-リモネン、クロロホルム、ベンゼン、ジエチルエーテル、二硫化炭素および石油ベンジンからなるグループより選択される1または複数の化合物を含むものを挙げることができる。特に、上記βシート構造を変性させる試薬(例えば、DMSO、DMF、メタノール、HFIPおよび/またはTFEを含む試薬)と混合した場合に相分離するワックス可溶化剤が好ましい。このようなワックス可溶化剤を用いると、FFPE切片からのアミロイドタンパク質の抽出をより簡便に行うことが可能になる。 Here, the biological sample is a sample derived from the living body of an animal, such as a biological tissue. The biological sample may be immobilized so that soluble proteins do not flow out, and the immobilizing agent is preferably an agent having an aldehyde group such as formaldehyde or glutaraldehyde. Also, the biological sample may be a formalin-fixed paraffin (FFPE) section or the like. When the biological sample is an FFPE section, it is desirable to perform a wax solubilization treatment (deparaffinization treatment). The wax solubilizer is not particularly limited as long as it contains a compound that solubilizes wax (deparaffinizes). Examples include aromatic hydrocarbons having 6 to 8 carbon atoms such as benzene, toluene, and xylene. , n-hexane, 2,2-dimethylbutane, 2,3-dimethylbutane, 2-methylpentane, 3-methylpentane, n-heptane, n-octane, n-nonane, n-decane, cyclohexane, cycloheptane and Aliphatic hydrocarbons with 6 to 10 carbon atoms such as cyclooctane, petroleum mixed hydrocarbons such as mineral oil (liquid paraffin) and petroleum benzine, natural oils such as D-limonene, dichloromethane, chloroform, 1,2 -chlorinated hydrocarbons such as dichloroethane, 1,1,1-trichloroethane, 1,1,2-trichloroethane and tetrachloroethylene, aliphatic ethers such as diethyl ether, tetrahydrofuran, 2-methyltetrahydrofuran and tetrahydropyran, etc. Carbon disulfide and the like can be mentioned, and one or more of these compounds can be used in combination. As a wax solubilizer, more preferably one or more compounds selected from the group consisting of xylene, n-hexane, mineral oil, D-limonene, chloroform, benzene, diethyl ether, carbon disulfide and petroleum benzine. things can be mentioned. In particular, wax solubilizers that phase separate when mixed with reagents that modify the beta-sheet structure (eg, reagents including DMSO, DMF, methanol, HFIP and/or TFE) are preferred. Using such a wax solubilizer makes it possible to more easily extract amyloid protein from FFPE sections.

本発明の第1の実施形態にかかる試薬は、βシート構造を変性、破壊等することができる化合物を含む試薬(例えば、DMSO、DMF、メタノール、HFIPおよびTFEからなるグループから選択される1または複数を含む試薬)であり、これらの化合物以外の物質(例えば、水など)を含んでいてもよく、βシート構造を変性、破壊等することができる化合物以外の物質(例えば、水など)の含量は、10 %以下、好ましくは5 %以下、より好ましくは2 %以下である。
本発明の試薬にβシート構造を変性させる化合物の1つのみが含まれているものであっても、生体試料からアミロイドタンパク質の抽出を特異的(すなわち、アミロイドタンパク質以外のタンパク質等は抽出しない)に行うことができるが、複数の化合物が含まれる試薬であっても、好適に目的を達成することができる。より具体的に説明すると、例えば、スルホキシド類のDMSO、酸アミド類のDMF、低級アルコール類のメタノール、フッ化アルコール類TFEおよびHFIPから複数を選択して混合したものであってもよい。この場合、DMSOとTFEまたはDMFとTFEを混合すると、アミロイドタンパク質の抽出の特異性がより向上する。本発明の試薬として、DMSO、DMF、メタノール、HFIPおよびTFEからなるグループから選択された1または複数を混合して調製する場合、当該試薬における各物質の存在比率は、特に限定されないが、例えば、10 %(重量%、以下同じ)未満、10 %以上20 %未満、20 %以上30 %未満、30 %以上40 %未満、40 %以上50 %未満、50 %以上60 %未満、60 %以上70 %未満、70 %以上80 %未満、80 %以上90 %未満、90 %以上100 %未満であってもよい。
The reagent according to the first embodiment of the present invention is a reagent containing a compound capable of denaturing, destroying, etc. the β-sheet structure (e.g., one selected from the group consisting of DMSO, DMF, methanol, HFIP and TFE, or and may contain substances other than these compounds (e.g., water, etc.), and substances other than compounds (e.g., water, etc.) capable of denaturing, destroying, etc. the β-sheet structure. The content is 10% or less, preferably 5% or less, more preferably 2% or less.
Even if the reagent of the present invention contains only one compound that denatures the β-sheet structure, the amyloid protein can be specifically extracted from the biological sample (that is, proteins other than the amyloid protein are not extracted). However, even a reagent containing a plurality of compounds can suitably achieve the purpose. More specifically, for example, a mixture of a plurality of selected from sulfoxides DMSO, acid amides DMF, lower alcohols methanol, fluorinated alcohols TFE and HFIP may be used. In this case, mixing DMSO and TFE or DMF and TFE further improves the specificity of amyloid protein extraction. When the reagent of the present invention is prepared by mixing one or more selected from the group consisting of DMSO, DMF, methanol, HFIP and TFE, the abundance ratio of each substance in the reagent is not particularly limited. Less than 10% (by weight, the same below), 10% to less than 20%, 20% to less than 30%, 30% to less than 40%, 40% to less than 50%, 50% to less than 60%, 60% to less than 70% %, 70% or more and less than 80%, 80% or more and less than 90%, or 90% or more and less than 100%.

本発明の第2の実施形態は、生体試料からアミロイドタンパク質を抽出するためのキットであって、少なくとも本発明の試薬を含むキットである。
本発明の第2の実施形態にかかるキット(「本発明のキット」とも記載する)は、本発明の試薬が少なくとも1つ含まれており、複数の本発明の試薬が含まれていてもよい。本発明のキットには、本発明の試薬の他、ワックス可溶化剤(例えば、ベンゼン、トルエン、キシレンなどの炭素数6~8の芳香族炭化水素類、n-ヘキサン、2,2-ジメチルブタン、2,3-ジメチルブタン、2-メチルペンタン、3-メチルペンタン、n-ヘプタン、n-オクタン、n-ノナン、n-デカン、シクロヘキサン、シクロヘプタンおよびシクロオクタンなどの炭素数6~10の脂肪族炭化水素類、ミネラルオイル(流動パラフィン)および石油ベンジンなどの石油系混合炭化水素類、D-リモネンなどの天然製油類、ジクロルメタン、クロロホルム、1,2-ジクロルエタン、1,1,1-トリクロルエタン、1,1,2-トリクロルエタンおよびテトラクロロエチレンなどの塩素化炭化水素類、ジエチルエーテル、テトラヒドロフラン、2-メチルテトラヒドロフランおよびテトラヒドロピランなどの脂肪族エーテル類、その他二硫化炭素など)が含まれていてもよく、さらに、抽出したアミロイドを希釈等するための緩衝剤が含まれていてもよい。試薬等以外にも、本発明のキットの使用説明書が含まれていてもよい。
A second embodiment of the present invention is a kit for extracting an amyloid protein from a biological sample, the kit comprising at least the reagent of the present invention.
The kit according to the second embodiment of the present invention (also referred to as "the kit of the present invention") contains at least one reagent of the present invention, and may contain a plurality of reagents of the present invention. . In addition to the reagents of the present invention, the kit of the present invention contains wax solubilizers (e.g., aromatic hydrocarbons having 6 to 8 carbon atoms such as benzene, toluene, and xylene, n-hexane, and 2,2-dimethylbutane). C6-10 fats such as , 2,3-dimethylbutane, 2-methylpentane, 3-methylpentane, n-heptane, n-octane, n-nonane, n-decane, cyclohexane, cycloheptane and cyclooctane petroleum-based mixed hydrocarbons such as mineral oil (liquid paraffin) and petroleum benzine, natural oils such as D-limonene, dichloromethane, chloroform, 1,2-dichloroethane, 1,1,1-trichloroethane , chlorinated hydrocarbons such as 1,1,2-trichloroethane and tetrachloroethylene, aliphatic ethers such as diethyl ether, tetrahydrofuran, 2-methyltetrahydrofuran and tetrahydropyran, and carbon disulfide, etc.) It may also contain a buffer for diluting the extracted amyloid. Instructions for use of the kit of the present invention may be included in addition to reagents and the like.

本発明の第3の実施形態は、生体試料からアミロイドタンパク質を抽出する方法であって、以下の工程を含む方法。
(a)生体試料を本発明の試薬と接触させ、インキュベートする工程、
(b)工程(a)のインキュベート後の混合物から、不溶物を除去する工程、および
(c)工程(b)で得られた画分から前記試薬を除去する工程、
工程(a)は、アミロイドタンパク質を含む生体試料(ホルムアルデヒド等で固定した試料が好ましい)を本発明の試薬と接触させ、試料中の成分(例えば、DMSO、DMF、メタノール、 HFIPおよび/またはTFE)が生体試料の表面および内部に浸透するように、インキュベートする工程である。工程(a)におけるインキュベーションの温度は、特に限定はしないが、例えば、約10℃~約70℃、好ましくは、約20℃~60℃、より好ましくは、約30℃~約50℃程度である。また、インキュベーションの時間は、例えば、約0.5時間~約24時間、好ましくは、約1時間~約15時間程度である。なお、生体試料としてFFPE切片を用いる場合には、あらかじめ、脱パラフィン処理をしておくことが好ましい。
行程(b)は、生体試料と本発明の試薬の混合物から不溶物を除去する工程である。本発明の試薬に溶解しなかった不溶物は、遠心分離などにより沈殿画分として除去し、アミロイドタンパク質を上清画分に回収することができる。
工程(c)は、工程(b)で不溶物を除去して得られた画分から本発明の試薬(例えば、DMSO、DMF、メタノール、HFIPおよび/またはTFE)を除去する工程である。本発明の試薬の除去は、当業者であれば容易に実施することができる有機溶媒の一般的な除去方法で実施可能である。例えば、遠心分離などで不溶物を除去した上清画分をエバポレーター等などの真空乾燥機で有機溶媒を除去する方法を挙げることができる。本発明の試薬が除去されると、生体試料から抽出されたアミロイドタンパク質を乾燥標品として得ることができる。
A third embodiment of the present invention is a method for extracting an amyloid protein from a biological sample, comprising the following steps.
(a) contacting and incubating a biological sample with a reagent of the invention;
(b) removing insolubles from the mixture after incubation in step (a); and (c) removing the reagent from the fraction obtained in step (b);
In step (a), a biological sample containing amyloid protein (preferably a sample fixed with formaldehyde or the like) is brought into contact with the reagent of the present invention, and components in the sample (e.g., DMSO, DMF, methanol, HFIP and/or TFE) is the step of incubating the biological sample so that it permeates the surface and interior of the biological sample. The incubation temperature in step (a) is not particularly limited, but is, for example, about 10°C to about 70°C, preferably about 20°C to 60°C, more preferably about 30°C to about 50°C. . Incubation time is, for example, about 0.5 hours to about 24 hours, preferably about 1 hour to about 15 hours. When FFPE sections are used as biological samples, they are preferably deparaffinized in advance.
Step (b) is a step of removing insoluble matter from the mixture of the biological sample and the reagent of the present invention. Insoluble matter not dissolved in the reagent of the present invention can be removed as a precipitate fraction by centrifugation or the like, and the amyloid protein can be recovered in the supernatant fraction.
Step (c) is a step of removing the reagent of the present invention (eg, DMSO, DMF, methanol, HFIP and/or TFE) from the fraction obtained by removing insolubles in step (b). Removal of the reagent of the present invention can be carried out by a general method for removing organic solvents that can be easily carried out by those skilled in the art. For example, a method of removing an organic solvent from a supernatant fraction obtained by removing insoluble matter by centrifugation or the like using a vacuum dryer such as an evaporator can be used. Once the reagent of the present invention is removed, the amyloid protein extracted from the biological sample can be obtained as a dry preparation.

本発明の第4の実施形態は、本発明の第3の実施形態(以下「本発明のアミロイドタンパク質抽出方法」とも記載する)により、生体試料からアミロイドタンパク質を抽出し、抽出されたアミロイドタンパク質のアミノ酸配列を決定することを含む、生体試料中のアミロイドタンパク質の同定方法である。
本発明のアミロイドタンパク質抽出方法により得られたアミロイドタンパク質は、常法により、そのアミノ酸配列を決定することができる。決定したアミノ酸配列情報に基づいて、抽出されたアミロイドタンパク質が同定され、当該アミロイドタンパク質と関連性を有するアミロイドーシスの特定が可能となる。
また、抽出されたアミロイドタンパク質以外に他のタンパク質が微量混在している場合には、抽出したアミロイドタンパク質画分から、アミロイドタンパク質をSDSPAGEやカラムクロマトグラフィーなどの方法で分離してから、当該アミロイドタンパク質のアミノ酸配列解析を行ってもよい。
In a fourth embodiment of the present invention, amyloid protein is extracted from a biological sample according to the third embodiment of the present invention (hereinafter also referred to as "the amyloid protein extraction method of the present invention"), and the extracted amyloid protein is A method for identifying amyloid protein in a biological sample comprising determining the amino acid sequence.
The amino acid sequence of the amyloid protein obtained by the amyloid protein extraction method of the present invention can be determined by a conventional method. Based on the determined amino acid sequence information, the extracted amyloid protein is identified, making it possible to identify amyloidosis associated with the amyloid protein.
In addition, if a trace amount of other protein is present in addition to the extracted amyloid protein, the amyloid protein is separated from the extracted amyloid protein fraction by a method such as SDSPAGE or column chromatography, and then the amyloid protein is isolated. Amino acid sequence analysis may be performed.

本明細書において引用されたすべての文献の開示内容は、全体として明細書に参照により組み込まれる。また、本明細書が英訳されて、単数形の「a」、「an」、および「the」の単語が含まれる場合、文脈から明らかにそうでないことが示されていない限り、単数のみならず複数のものを含むものとする。
以下に実施例を示してさらに本発明の説明を行うが、実施例は、あくまでも本発明の実施形態の例示にすぎず、本発明の範囲を限定するものではない。
The disclosures of all documents cited herein are hereby incorporated by reference in their entirety. Also, where this specification has been translated into English and includes the words "a", "an" and "the" in the singular, unless the context clearly indicates otherwise, the singular rather than the singular It shall include plural things.
EXAMPLES The present invention will be further described below with reference to Examples, but the Examples are merely illustrations of embodiments of the present invention and do not limit the scope of the present invention.

1.アルツハイマー病モデルマウスのFFPE切片からのAmyloid βの抽出
1-1.材料および方法
アルツハイマー病モデルマウスである5XFADマウスの脳のホルマリン固定パラフィン包埋(Formalin Fixed Paraffin Embedded: FFPE)ブロックを10 μmに薄切した切片を用いた。
脱パラフィンした切片を1枚ずつチューブに入れ、DMSO、DMFとTFEおよび各液の1%NH3溶液と1%ギ酸溶液を各100μlずつ加えて、37℃で16時間静置した。各サンプルを遠心した後の上清を別チューブに移し、熱をかけながら真空乾燥機で乾固させて抽出物を得た。得られた抽出物をSDSPAGEにかけて分離し、銀染色を行った。
この結果を踏まえて、抽出タンパク質のアミノ酸配列の決定を行った。脱パラフィンした切片にDMSOを100 μl加えて、37℃で16時間静置した。上清10 μlに20mM Tris-HCl, pH8.0を90 μl加え、トリプシンを0.5 μg加えて37℃で16時間酵素消化し、ペプチド試料を作製した。ペプチド試料をLC/MS/MS(Q-Exactive plus, Thermo Fischer Scientific)で測定し、mascot search engineを用いて取得データからタンパク質を同定した。
1. Extraction of Amyloid β from FFPE section of Alzheimer's disease model mouse 1-1. Materials and Methods A 10 μm-thick section of a formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) block of the brain of a 5XFAD mouse, an Alzheimer's disease model mouse, was used.
The deparaffinized sections were placed in a tube one by one, DMSO, DMF and TFE, 100 μl each of 1% NH 3 solution and 1% formic acid solution of each solution were added and allowed to stand at 37° C. for 16 hours. After centrifuging each sample, the supernatant was transferred to another tube and heated to dryness in a vacuum dryer to obtain an extract. The resulting extracts were separated by SDSPAGE and silver stained.
Based on this result, the amino acid sequence of the extracted protein was determined. 100 μl of DMSO was added to the deparaffinized section and allowed to stand at 37° C. for 16 hours. 90 μl of 20 mM Tris-HCl, pH 8.0 was added to 10 μl of the supernatant, and 0.5 μg of trypsin was added for enzymatic digestion at 37° C. for 16 hours to prepare a peptide sample. Peptide samples were measured by LC/MS/MS (Q-Exactive plus, Thermo Fischer Scientific) and proteins were identified from the acquired data using a mascot search engine.

1-2.結果
DMSO、DMFおよびTFEを用いることで分子量10kDa以下にタンパク質バンド(図1矢印)が確認された。TFEはアルカリ、酸性条件では高分子量領域に抽出物が若干観察された。
また、DMSOを用いた抽出物のアミノ酸配列を決定した結果、Amyloid βタンパク質に由来するペプチド(LVFFAEDVGSNK:配列番号1)が同定された。図2に、抽出されたペプチドのMSMSスペクトラムを示す。
1-2. result
Using DMSO, DMF and TFE, a protein band (arrow in FIG. 1) was confirmed at a molecular weight of 10 kDa or less. Under alkaline and acidic conditions, some extracts were observed in the high molecular weight region of TFE.
Moreover, as a result of determining the amino acid sequence of the extract using DMSO, a peptide (LVFFAEDVGSNK: SEQ ID NO: 1) derived from the Amyloid β protein was identified. FIG. 2 shows the MSMS spectrum of the extracted peptides.

2.FFPE切片からのAmyloid βの抽出における温度の影響とDMSO、DMFおよびTFEの混合液の効果に関する検討
2-1.材料および方法
アルツハイマー病モデルマウスである5XFADマウスの脳のホルマリン固定パラフィン包埋ブロックを10 μmに薄切した切片を用いた。
脱パラフィンした切片にDMSO、DMFおよびTFEを各100 μl加え、37℃、60℃で16時間静置した。また、脱パラフィンした切片に各液の50%水溶液、50%DMSO/TFE混合液、50%DMF/TFE混合液または50%DMSO/DMF混合液を加えて37℃で16時間静置した。各上清を、SDSPAGEにかけ銀染色を行った。
2. Investigation on the effects of temperature and mixtures of DMSO, DMF and TFE on extraction of Amyloid β from FFPE sections 2-1. Materials and Methods A 10 μm slice of a formalin-fixed, paraffin-embedded brain block of a 5XFAD mouse, an Alzheimer's disease model mouse, was used.
100 μl each of DMSO, DMF and TFE were added to the deparaffinized sections and allowed to stand at 37° C. and 60° C. for 16 hours. A 50% aqueous solution of each solution, a 50% DMSO/TFE mixture, a 50% DMF/TFE mixture, or a 50% DMSO/DMF mixture was added to the deparaffinized sections, and the sections were allowed to stand at 37°C for 16 hours. Each supernatant was subjected to SDSPAGE and silver-stained.

2-2.結果
37℃と60℃では、各液を用いた抽出に差を認めなかった。各50%水溶液ではAmyloidβは抽出されなかった。50%DMSO/TFE, 50%DMF/TFE混合液では、DMSO、DMFのみによる抽出物に比べ、高分子領域のスメア上のシグナルが消失しており、Amyloid β以外のタンパク質の抽出が抑制されていることが示された(図3)。
2-2. result
At 37°C and 60°C, there was no difference in the extraction using each solution. Amyloid β was not extracted with each 50% aqueous solution. In the 50% DMSO/TFE and 50% DMF/TFE mixtures, compared to the DMSO and DMF-only extracts, smear signals in the high-molecular region disappeared, and the extraction of proteins other than Amyloid β was suppressed. (Fig. 3).

3.FFPE切片からのAmyloid βの抽出におけるDMSO、DMF、メタノール、TFEおよびHFIPの効果に関する検討
3-1.材料および方法
アルツハイマー病モデルマウスである5XFADマウスの脳のホルマリン固定パラフィン包埋ブロックを10 μmに薄切した切片を用いた。
脱パラフィンした切片にDMSO、DMF、メタノール、TFEおよびHFIPを各100 μl加え、37℃で16時間静置した。各上清を、SDSPAGEにかけ銀染色を行った。
3. Investigation on the effects of DMSO, DMF, methanol, TFE and HFIP on the extraction of Amyloid β from FFPE sections 3-1. Materials and Methods A 10 μm slice of a formalin-fixed, paraffin-embedded brain block of a 5XFAD mouse, an Alzheimer's disease model mouse, was used.
100 μl each of DMSO, DMF, methanol, TFE and HFIP were added to the deparaffinized sections and allowed to stand at 37° C. for 16 hours. Each supernatant was subjected to SDSPAGE and silver-stained.

3-2.結果
DMSO、DMF、メタノール、TFEおよびHFIPを用いることで、図1と同様の分子量約10kDa以下にタンパク質バンドを検出した。
3-2. result
Using DMSO, DMF, methanol, TFE and HFIP, a protein band was detected with a molecular weight of about 10 kDa or less similar to that in FIG.

4.ヒトのアミロイド症の検体からのアミロイドタンパク質の抽出
4-1.材料および方法
新潟大学大学病院においてコンゴーレッド染色でアミロイド症と診断された、以下のヒトの3症例のFFPE切片を用いた。
症例1:AAアミロイド症の腎臓、
症例2:アミロイドタンパク質が同定されていない症例の心臓
症例3:アミロイドタンパク質が同定されていない症例の腸管
脱パラフィンした切片各1枚にDMFを100 μl加えたのち、37℃で16時間静置した。サンプルを遠心した後の上清を別チューブに移し、熱をかけながら真空乾燥機で乾固させて抽出物を得た。得られた抽出物をSDSPAGEにかけて分離し、銀染色を行った。
4. Extraction of amyloid protein from human amyloidosis specimen 4-1. Materials and Methods FFPE sections of the following three human cases diagnosed as having amyloidosis by Congo red staining at Niigata University University Hospital were used.
Case 1: Kidney with AA Amyloidosis,
Case 2: Heart in a case where amyloid protein was not identified Case 3: Intestinal tract in a case where amyloid protein was not identified After adding 100 μl of DMF to each deparaffinized section, it was allowed to stand at 37°C for 16 hours. . After centrifuging the sample, the supernatant was transferred to another tube and heated to dryness in a vacuum dryer to obtain an extract. The resulting extracts were separated by SDSPAGE and silver stained.

4-2.結果
各症例で、分子量が異なる特異的なタンパク質が抽出された(図4)。
4-2. Results In each case, specific proteins with different molecular weights were extracted (Fig. 4).

5.ヒトのアミロイド症の検体由来のアミロイドタンパク質の質量分析による同定
5-1.材料および方法
上記3で得られた抽出物各10 μlを質量分析に供した。
上記1と図2と同様に各抽出物をトリプシンで消化し、ペプチド試料を作製した。得られたペプチド試料をLCMSMS(TSQ quantive, Thermo Fischer Scientific)で測定した。質量分析は、Serum Amyloid A、Apolipoprotein A IV、Transthyretinをトリプシン消化して得られる断片ペプチドの質量に対するtransitionを設定したselected reaction monitoring (SRM) を行った。
5. Identification of amyloid proteins from human amyloidosis specimens by mass spectrometry 5-1. Materials and Methods 10 μl each of the extract obtained in 3 above was subjected to mass spectrometry.
Each extract was digested with trypsin in the same manner as in 1 above and FIG. 2 to prepare a peptide sample. The obtained peptide samples were measured by LCMSMS (TSQ quantive, Thermo Fischer Scientific). For mass spectrometry, selected reaction monitoring (SRM) was performed by setting a transition for the mass of fragment peptides obtained by tryptic digestion of Serum Amyloid A, Apolipoprotein A IV, and Transthyretin.

5-2.結果
症例1、2および3の抽出物から、各々、Serum Amyloid A(AYSDMR:配列番号2)、Apolipoprotein IV(SLAPYAQDTQEK:配列番号3、LGEVNTYAGDLQK:配列番号4、SELTQQLNALFQDK:配列番号5)、Transthyretin(GSPAINVAVHVFR:配列番号6、ALGISPFHEHAEVVFTANDSGPR:配列番号7、AADDTWEPFASGK:配列番号8) に特異的なペプチドが検出された(図5)。
5-2. Results Serum Amyloid A (AYSDMR: SEQ ID NO: 2), Apolipoprotein IV (SLAPYAQDTQEK: SEQ ID NO: 3, LGEVNTYAGDLQK: SEQ ID NO: 4, SELTQQLNALFQDK: SEQ ID NO: 5), Transthyretin (GSPAINVAVHVFR : SEQ ID NO: 6, ALGISFHEHAEVVFTANDSGPR: SEQ ID NO: 7, AADDTWEPFASGK: SEQ ID NO: 8) were detected (Fig. 5).

6.非ヒト動物のアミロイド症の検体からのアミロイドタンパク質の抽出
6-1.材料および方法
コンゴーレッド染色でアミロイド沈着が確認された以下の動物組織のFFPE切片を用いた。
症例1 犬の髄様癌
症例2 犬の腸管型形質細胞腫
上記3と同様に処理し、SDSPAGEと銀染色を行った。
6. Extraction of amyloid protein from amyloidosis specimen of non-human animal 6-1. Materials and Methods FFPE sections of the following animal tissues in which amyloid deposition was confirmed by Congo red staining were used.
Case 1 Canine medullary carcinoma Case 2 Canine intestinal plasmacytoma Treated in the same manner as in 3 above, and subjected to SDSPAGE and silver staining.

6-2.結果
各症例で、分子量が異なる特異的なタンパク質が抽出された(図6)。
6-2. Results In each case, specific proteins with different molecular weights were extracted (Fig. 6).

7.本発明の試薬のβシート構造に対する影響の確認
TFEのアミロイドタンパク質中のβシート構造への影響を確認した。
アミロイドタンパク質であるAmyloidβ1-42(株式会社ペプチド研究所)およびTransthyretin(和光純薬工業株式会社)のTris-HClバッファー中におけるCDスペクトルと、TFE中におけるCDスペクトルを各々測定し、両者を比較した。
その結果、Tris-HClバッファーおよびTFE中のアミロイドタンパク質のCDスペクトルは、Amyloidβ1-42, Transthyretinともに、Tris-HCl緩衝液中ではβ構造を示す215nm付近に負の極大、195nm付近に正の極大が観察された。これに対し、TFE中では両タンパク質ともαへリックス構造を示す208および222付近に負のピークが観察された。
以上のことから、本発明の試薬の1つであるTFEは、アミロイドタンパク質中のβシート構造を変性させることが確認できた。
7. Confirmation of the effect of the reagent of the present invention on the β-sheet structure
We confirmed the effect of TFE on the β-sheet structure in amyloid protein.
CD spectra of amyloid proteins Amyloid β1-42 (Peptide Research Institute, Inc.) and Transthyretin (Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) in Tris-HCl buffer and in TFE were measured and compared.
As a result, the CD spectra of amyloid protein in Tris-HCl buffer and TFE showed a negative maximum near 215 nm and a positive maximum near 195 nm, indicating a β structure, for both Amyloidβ1-42 and Transthyretin in Tris-HCl buffer. observed. In contrast, in TFE, negative peaks were observed around 208 and 222, which indicate α-helical structures for both proteins.
From the above, it was confirmed that TFE, one of the reagents of the present invention, denatures the β-sheet structure in amyloid protein.

本発明は、アミロイドタンパク質を生体試料から簡便かつ特異的に抽出するための試薬および方法を提供するものである。従って、本発明は、アミロイドーシスの研究および診断などの医学分野の発展に大きく貢献するものである。 The present invention provides reagents and methods for convenient and specific extraction of amyloid protein from biological samples. Therefore, the present invention greatly contributes to the development of medical fields such as research and diagnosis of amyloidosis.

Claims (10)

ホルマリン固定パラフィン包埋切片からアミロイドタンパク質を抽出する試薬であって、
N,N-ジメチルホルムアミド(DMF)、メタノール、2、2、2-トリフルオロエタノール(TFE)、DMSOおよびTFEの混合液、またはDMFおよびTFEの混合液のいずれかを含む、前記試薬。
A reagent for extracting amyloid protein from formalin-fixed paraffin-embedded sections ,
Said reagent comprising either N,N-dimethylformamide (DMF), methanol, 2,2,2-trifluoroethanol (TFE), a mixture of DMSO and TFE, or a mixture of DMF and TFE .
前記試薬がDMFおよびTFEの混合液、またはDMSOおよびTFEの混合液である、請求項1に記載の試薬The reagent of claim 1, wherein the reagent is a mixture of DMF and TFE, or a mixture of DMSO and TFE. 前記DMFおよびTFEの混合液中のDMFの存在比率が40重量%以上60重量%未満である、請求項1または請求項2に記載の試薬。3. The reagent according to claim 1, wherein the DMF content in the mixture of DMF and TFE is 40% by weight or more and less than 60% by weight. 前記DMSOおよびTFEの混合液中のDMSOの存在比率が40重量%以上60重量%未満である、請求項1または請求項2に記載の試薬。3. The reagent according to claim 1, wherein the content ratio of DMSO in the mixed solution of DMSO and TFE is 40% by weight or more and less than 60% by weight. ホルマリン固定パラフィン包埋切片からアミロイドタンパク質を抽出するためのキットであって、少なくとも請求項1ないしのいずれかに記載の試薬を含むキット。 A kit for extracting amyloid protein from formalin-fixed, paraffin-embedded sections , the kit comprising at least the reagent according to any one of claims 1 to 4 . ワックス可溶化剤をさらに含むことを特徴とする請求項に記載のキット。 6. The kit of Claim 5 , further comprising a wax solubilizer. ホルマリン固定パラフィン包埋切片からアミロイドタンパク質を抽出する方法であって、以下の工程を含む方法。
(a)生体試料を請求項1ないしのいずれかに記載の試薬と接触させ、インキュベートする工程、
(b)工程(a)のインキュベート後の混合物から、不溶物を除去する工程、および
(c)工程(b)で得られた画分から前記試薬を除去する工程、
A method for extracting amyloid protein from formalin-fixed, paraffin-embedded sections , the method comprising the steps of:
(a) contacting and incubating a biological sample with the reagent according to any one of claims 1 to 4 ;
(b) removing insolubles from the mixture after incubation in step (a); and (c) removing the reagent from the fraction obtained in step (b);
前記工程(a)におけるインキュベーションの温度が、20℃~60℃である、請求項7に記載の方法。 The method according to claim 7, wherein the temperature of incubation in step (a) is between 20°C and 60°C. ホルマリン固定パラフィン包埋切片をワックス可溶化剤で脱パラフィン処理をする工程をさらに含む、請求項7または8に記載の方法。 9. The method of claim 7 or 8 , further comprising the step of deparaffinizing the formalin-fixed, paraffin-embedded sections with a wax solubilizer. 請求項7ないし9のいずれかに記載の方法で抽出したアミロイドタンパク質のアミノ酸配列を決定することを含む、生体試料中のアミロイドタンパク質の同定方法。 A method for identifying amyloid protein in a biological sample, comprising determining the amino acid sequence of the amyloid protein extracted by the method according to any one of claims 7 to 9 .
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