JP7108697B2 - 候補分析種を順位づけるための方法 - Google Patents
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Description
88 ライブラリ類似度スコアを比較するための方法
90 分子イオンの最も存在度の高い同位体を比較するための方法
92 フラグメントイオンを比較するための方法
94 保持指標値を比較するための方法
Claims (15)
- 候補分析種を順位づけるための方法であって、
分析種分子から検出されたイオン及びフラグメントイオンをマススペクトルとして提示することによって質量分析計での実験分析種を分析する工程であって、前記マススペクトルが各検出瞬時に対応するイオン質量と信号強度の組合せのリストを含む、分析する工程と、
所定の値の不合格範囲又は不合格判定基準、所定の値の合格範囲又は合格判定基準、及び所定の値の中立範囲又は中立判定基準をあらかじめ定める工程と、
前記所定の値の不合格範囲、前記所定の値の合格範囲及び前記所定の値の中立範囲の各々の累積信頼度スコアの部分をあらかじめ定める工程と、
前記実験分析種をライブラリヒットリスト内の複数の候補分析種に比較し、各候補分析種へ前記累積信頼度スコアの部分のひとつを割り当てる工程であって、
各候補分析種のライブラリマススペクトルに対するライブラリ類似度スコアに基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較する工程、
前記ライブラリヒットリスト内の各候補分析種の前記ライブラリマススペクトル内の分子イオンの最も存在度の高い同位体の存在及びそれの質量に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較する工程、及び、
フラグメントイオンの存在度、イオンピーク中の最小イオン数、及びフラグメントイオンの質量に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較する工程、
に基づいて、前記累積信頼度スコアの部分のひとつを割り当てる工程と、
前記ライブラリヒットリスト内の誤った結果の確率を下げるために各候補分析種に割り当てられた前記累積信頼度スコアの部分に基づいて、前記候補分析種を順位づける工程と、
を備えている方法。 - 前記ライブラリ類似度スコアのためのあらかじめ定められた前記所定の値の不合格範囲はX以下であり、前記ライブラリ類似度スコアのためのあらかじめ定められた前記所定の値の合格範囲はY以上であり、前記ライブラリ類似度スコアのためのあらかじめ定められた前記所定の値の中立範囲はXとYの間である、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記不合格範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は-1.5の値を割り当てられ、前記中立範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は0の値を割り当てられ、前記合格範囲に入る候補の前記累積信頼度スコアの部分は1の値を割り当てられる、請求項2に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の所定の判定基準は、最低限の許容可能な存在度及び質量確度ウインドーに基づく不合格判定基準、合格判定基準、及び中立判定基準を含んでおり、前記不合格判定基準は、前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の質量が前記質量確度ウインドーの外であることを要件とし、前記合格判定基準は、前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記分子イオンの前記最も存在度の高い同位体の前記質量が前記質量確度ウインドーの内であることを要件とし、前記中立判定基準は、前記不合格判定基準及び前記合格判定基準が満たされない場合に満たされる、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記不合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は-1.5の値を割り当てられ、前記合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は1の値を割り当てられ、前記中立判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は0の値を割り当てられる、請求項4に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記フラグメントイオンの所定の判定基準は、最低限の許容可能な存在度及び質量確度ウインドーに基づく合格判定基準、中立判定基準、及び不合格判定基準を含んでおり、前記合格判定基準は、前記フラグメントイオンの前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記フラグメントイオンの前記質量が前記質量確度ウインドーの内であることを要件とし、前記不合格判定基準は、前記フラグメントイオンの前記存在度が前記最低限の許容可能な存在度を超過し且つ前記フラグメントイオンの前記質量が前記質量確度ウインドーの外である場合に満たされ、前記中立判定基準は、前記フラグメントイオンが前記最低限の許容可能な存在度判定基準を超過しない場合又は前記フラグメントイオンのピークのどれもが少なくとも最小イオン数を包含していない場合に満たされる、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は1の値を割り当てられ、前記不合格判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は-1.5の値を割り当てられ、前記中立判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は0の値を割り当てられる、請求項6に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記実験分析種をライブラリヒットリスト内の複数の候補分析種に比較し、各候補分析種へ累積信頼度スコアを割り当てる前記工程は、
保持指標値に基づいて前記実験分析種を前記候補分析種に比較し、前記保持指標値のあらかじめ定められた判定基準に基づいて各候補分析種へ前記累積信頼度スコアの第4の部分を割り当てる工程、を更に備えている、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。 - 前記保持指標値は、1つ又はそれ以上の次元による保持指標値から選択されている、請求項8に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記保持指標値は、許容保持指標ウインドーに基づく合格範囲、中立判定基準、及び不合格範囲を有しており、前記合格範囲は前記許容保持指標ウインドーの内であり、前記中立判定基準は前記候補分析種の前記保持指標値が使えないことを要件とし、前記不合格範囲は前記許容保持指標ウインドーの外である、請求項8に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記合格範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は1の値を割り当てられ、前記中立判定基準を満たしている候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は0の値を割り当てられ、前記不合格範囲に入る候補分析種の前記累積信頼度スコアの部分は0の値を割り当てられる、請求項10に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記累積信頼度スコアは-6から4までの範囲である、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記候補分析種は各候補分析種の前記累積信頼度スコアの降順に順位づけられる、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 実験分析種を分析することに関する前記工程は、ガスクロマトグラフィ-質量分析計を使用して起こる、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
- 前記候補分析種を順位づける前記工程は、前記候補分析種を、各候補分析種に割当てられた前記累積信頼度スコアの部分に基づいて降順に順位づける工程を備えている、請求項1に記載の候補分析種を順位づけるための方法。
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