JP6846420B2 - 延長された保存寿命かつ高性能を備える電気泳動ゲル - Google Patents
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Description
本出願は、米国特許法119(e)条に基づき、2015年10月14日に出願された米国仮特許出願第62/241,642号に対する優先権を主張し、これは本出願と同一所有者であり、本明細書に完全に記載されているかのようにその全体が参照により明示的に本明細書に組み込まれる。
この実施例は、それぞれ本開示の範囲内の異なるトリス系ゲル緩衝剤で調製されたポリアクリルアミドゲルの性能を示す。図1Aのゲルは、400mM及び0mMのグリシンのゲル緩衝剤配合物を含み、かつ8.7のpHを有する、対照ゲル100、すなわち市販のNovex(商標)トリス−グリシンポリアクリルアミドゲル(%T=10%)(Thermo Fisher Scientific,Incによる)である。それぞれ図1B〜1Hに示す一連のポリアクリルアミドゲル配合物101〜107を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(%C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の10%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=10%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。生成されたゲルは、厚さ1mm、長さ約8cm、幅約8cmであった。各ゲルカセットは、10個の平行なレーン1〜10を有するように形成された。対照ゲル100及び調製された各ゲル配合物101〜107はまた、3.3%T、2.6%Cスタッキングゲル部分を有する。ゲル100〜107は、様々なゲル緩衝剤配合物を有していたが、個々のゲルの分解ゲル部分及びスタッキングゲル部分内で使用されたゲル緩衝剤は同じであった。
この実施例は、本開示の範囲内の非勾配ポリアクリルアミドゲルの性能と2つの市販の非勾配ポリアクリルアミドゲルの性能との比較を示す。それぞれ図2Aに示すポリアクリルアミドゲル配合物200を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(%C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の10%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=10%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。生成されたゲルは、厚さ1mm、長さ約8cm、幅約8cmであった。調製されたゲル配合物200は、3.3%T、2.6%Cスタッキングゲル部分をさらに有していた。ゲル配合物200は、7.1のpHを有し、ゲルアミン緩衝剤として75mMのトリス、一次両性電解質として125mMグリシン、及び共役両性電解質として10mMのトレオニンのゲル緩衝剤を含んだ。ゲル緩衝剤を6NのHClでpH7.1に調整した。6.8のpHを有する63mMのトリス−HCl、10%のグリセロール、2%のSDS、及び0.0025%のブロモフェノールブルーのサンプル緩衝剤を各ゲル配合物200と共に使用した。8.3のpHを有する25mMのトリス、192mMのグリシン、及び0.1%のSDSの泳動緩衝剤を各ゲル配合物200と共に使用した。
この実施例は、本開示の範囲内の勾配ポリアクリルアミドゲルの性能と2つの市販の勾配ポリアクリルアミドゲルの性能との比較を示す。それぞれ図3Aに示すポリアクリルアミドゲル300を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の4〜20%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=4〜20%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。調製されたゲル配合物300は、3%T、2.6%Cスタッキングゲル部分をさらに有していた。生成されたゲル300は、厚さ1mm、長さ約8cm、幅約8cmであった。ゲル300は、7.1のpHを有し、ゲルアミン緩衝剤として75mMのトリス、一次両性電解質として125mMグリシン、及び共役両性電解質として10mMのトレオニンのゲル緩衝剤を含んだ。勾配ゲルにおいて、ゲル内のゲル緩衝剤濃度は、アクリルアミドの異なる濃度によって変化し得、したがって、本明細書で提供されるゲル緩衝剤の値は平均値であることに留意されたい。ゲル緩衝剤を6NのHClでpH7.1に調整した。6.8のpHを有する63mMのトリス−HCl、10%のグリセロール、2%のSDS、及び0.0025%のブロモフェノールブルーのサンプル緩衝剤を各ゲル配合物300と共に使用した。8.3のpHを有する25mMのトリス、192mMのグリシン、及び0.1%のSDSの泳動緩衝剤を各ゲル配合物300と共に使用した。
この実施例は、本開示の範囲内の勾配ポリアクリルアミドゲルの性能と1つの市販の勾配ポリアクリルアミドゲルの性能との比較を示す。それぞれ図4Aに示すポリアクリルアミドゲル400を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の8〜16%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=8〜16%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。調製されたゲル配合物400は、3.5%T、2.6%Cスタッキングゲル部分をさらに有していた。ゲル400は、7.1のpHを有し、117mMのトリス、195mMのグリシン、及び15.6mMのトレオニンのゲル緩衝剤を含んだ。勾配ゲルにおいて、ゲル内のゲル緩衝剤濃度は、アクリルアミドの濃度によって変化し、したがって、提供されるゲル緩衝剤の値は平均値であることに留意されたい。ゲル緩衝剤を6NのHClでpH7.1に調整した。6.8のpHを有する63mMのトリス−HCl、10%のグリセロール、2%のSDS、及び0.0025%のブロモフェノールブルーのサンプル緩衝剤を各ゲル配合物400と共に使用した。8.3のpHを有する25mMのトリス、192mMのグリシン、及び0.1%のSDSの泳動緩衝剤を各ゲル配合物400と共に使用した。
図5に示すように、この実施例は、本開示の範囲内で5つのポリアクリルアミドゲルの性能を示し、ここでは、様々な濃度のトリスを有するゲル緩衝剤を含み、本開示のゲル緩衝剤について所望のトリス濃度範囲を同定した。各ゲルの性能はまた、400mM及び0mMのグリシンのゲル緩衝剤配合物を含み、かつ8.7のpHを有する、対照ゲル、すなわち市販のNovex(商標)トリス−グリシンポリアクリルアミドゲル(%T=10%)(Thermo Fisher Scientific,Incによる)と比較された。
この実施例は、図6A〜6Cに示すように、本開示の範囲内で3つのポリアクリルアミドゲルの性能を示す。それぞれ図6A及び6Bに示す非勾配ポリアクリルアミドゲル配合物600〜601を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(%C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の6%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=10%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。調製されたゲル配合物600及び601は、4%のT、2.6%のCスタッキングゲル部分をさらに有していた。それぞれ図6Cに示す勾配ポリアクリルアミドゲル602を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(%C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の4〜20%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=4〜20%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。調製されたゲル配合物602は、3%T、2.6%Cスタッキングゲル部分をさらに有していた。生成されたゲルは、厚さ1mm、長さ約8cm、幅約8cmであった。ゲル配合物600〜602を含有する各ゲルカセットは、10本の平行なレーン1〜10を有するように形成された。
図7に示すように、この実施例は、本開示の範囲内で5つのポリアクリルアミドゲルの性能を示し、ここでは、様々な濃度のグリシンを有するゲル緩衝剤を含み、本開示のゲル緩衝剤について適切なグリシン濃度範囲を同定した。各ゲルの性能はまた、400mM及び0mMのグリシンのゲル緩衝剤配合物を含み、かつ8.7のpHを有する、対照ゲル、すなわち市販のNovex(商標)トリス−グリシンポリアクリルアミドゲル(%T=10%)(Thermo Fisher Scientific,Incによる)と比較された。
図8に示すように、この実施例は、本開示の範囲内で5つのポリアクリルアミドゲルの性能を示し、ここでは、様々な濃度のトレオニンを有するゲル緩衝剤を含み、本開示のゲル緩衝剤について適切なトレオニン濃度範囲を同定した。各ゲルの性能はまた、400mM及び0mMのグリシンのゲル緩衝剤配合物を含み、かつ8.7のpHを有する、対照ゲル、すなわち市販のNovex(商標)トリス−グリシンポリアクリルアミドゲル(T=10%)(Thermo Fisher Scientific,Incによる)と比較された。5つの調製されたポリアクリルアミドゲルを、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(%C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の10%アクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液(%T=10%)を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。5つの調製されたゲルは、厚さ1mm、長さ約8cm、幅約8cmであった。調整された5つのゲルはそれぞれ、75mMのトリス及び125mMのグリシンを含む7.1pHのゲル緩衝剤配合物を有した。また、調製された5つのゲルのそれぞれは、0mM〜200mMの範囲の異なるトレオニン濃度を有するゲル緩衝剤を有した。対照ゲル及び調整されたゲルのそれぞれは、様々なゲル緩衝剤配合物を有していたが、個々のゲルの分解ゲル部分及びスタッキングゲル部分内で使用されたゲル緩衝剤は同じであった。
この実施例は、本開示の範囲内で4つのポリアクリルアミドゲルの延長された保存寿命性能を説明する。一連の4つの調製されたポリアクリルアミドゲル配合物を、その内ビスアクリルアミドがモノマー混合物の2.6%(%C=2.6%)を構成する、分解ゲル部分用の可変ポリアクリルアミド濃度を有するアクリルアミド/ビスアクリルアミド水溶液を用いてスラブゲル電気泳動カセットに入れた。ゲルは、8%ポリアクリルアミド濃度(%T=8%)を有する非勾配ポリアクリルアミドゲル、10%ポリアクリルアミド濃度(%T=10%)を有する非勾配ポリアクリルアミドゲル、4〜12%ポリアクリルアミド濃度(%T=4〜12%)を有する勾配ポリアクリルアミドゲル、及び4〜20%ポリアクリルアミド濃度(%T=4〜20%)を有する勾配ポリアクリルアミドゲルを含んだ。4つのゲルのそれぞれは、ゲルアミン緩衝剤として75mMのトリス、一次両性電解質として125mMグリシン、及び共役両性電解質として10mMのトレオニンのゲル配合物を有した。生成されたゲルは、厚さ1mm、長さ約8cm、幅約8cmであった。各ゲルカセットは、10個の平行なレーンを有するように形成された。
(付記1)
ゲル緩衝剤を含むゲル電気泳動用ポリアクリルアミドゲルであって、前記ゲル緩衝剤が、
ゲルアミン緩衝剤と、
一次ゲル両性電解質と、
トレオニン及びセリンから選択される共役ゲル両性電解質と、を含む、ポリアクリルアミドゲル。
(付記2)
前記ゲルアミン緩衝剤が、ビス(2−ヒドロキシエチル)−アミノ−トリス(ヒドロキシメチル)−メタン、1,3−ビス(トリス(ヒドロキシメチル)メチルアミノ)プロパン、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、及びトリエタニオールアミンから選択される、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記3)
前記ゲルアミン緩衝剤が、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンである、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記4)
前記一次ゲル両性電解質が、グリシン及びトリシンから選択される、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記5)
前記一次ゲル両性電解質が、グリシンである、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記6)
前記共役ゲル両性電解質が、トレオニンである、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記7)
前記共役ゲル両性電解質が、セリンである、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記8)
前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、約150mM未満である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記9)
前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、約40mM〜約150mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記10)
前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、約70mM〜約140mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記11)
前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、約70mM〜約80mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記12)
前記一次ゲル両性電解質の濃度が、約25mM〜約250mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記13)
前記一次ゲル両性電解質の濃度が、約100mM〜約250mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記14)
前記共役ゲル両性電解質の濃度が、約10mM〜約20mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記15)
前記共役ゲル両性電解質の濃度が、約0.1mM〜約50mMの範囲または約10mM〜約50mMの範囲である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記16)
前記ゲル緩衝剤のpHが、約6.5〜約7.5、もしくは約6.75〜約7.25の範囲である、または約7.0である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記17)
前記ゲル緩衝剤のpHが、約6.5〜約7.5、もしくは約6.9〜約7.5、もしくは約7.0〜約7.2の範囲である、または約7.1である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記18)
少なくとも約6ヶ月、少なくとも約8ヶ月、少なくとも約10ヶ月、または約4℃で保存される場合、少なくとも約12ヶ月、もしくは最大約24ヶ月、少なくとも18ヶ月、少なくとも約16ヶ月、少なくとも約14ヶ月、少なくとも約12ヶ月、少なくとも約10ヶ月、少なくとも約8ヶ月、もしくは最大約6ヶ月、の保存寿命を有するように配合される、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記19)
前記ゲルアミン緩衝剤のpKaが、約5〜約10、もしくは約5.5〜約10、もしくは約6〜約9、もしくは約7〜約8.5、もしくは約7.9〜約8.2、もしくは約8〜約8.1、もしくは約7.9〜約9.8の範囲であるか、または前記ゲルアミン緩衝剤のpKaが、約8.1である、付記1に記載のポリアクリルアミドゲル。
(付記20)
電気泳動によりサンプル中の分子を分離する方法であって、前記方法が、
ポリアクリルアミドゲルを形成することと、
前記ポリアクリルアミドゲルに前記サンプルを装填することと、
質量及び/または電荷に応じて変化する移動速度で前記ゲルを通って前記分子を移動させるために、前記ゲルにわたって電圧差を課すことと、を含み、
前記ポリアクリルアミドゲルが、
ゲルアミン緩衝剤と、
一次ゲル両性電解質と、
トレオニン及びセリンから選択される共役ゲル両性電解質と、を含む、方法。
(付記21)
前記ゲルアミン緩衝剤が、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンであり、前記一次ゲル両性電解質が、グリシンであり、前記共役ゲル両性電解質が、トレオニン及びセリンから選択される、付記19に記載の方法。
(付記22)
前記ポリアクリルアミドゲル中の前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、約150mM未満である、付記19に記載の方法。
(付記23)
前記分子が、タンパク質である、付記19に記載の方法。
(付記24)
前記形成工程後かつ前記装填工程前に最大約24ヶ月、最大約18ヶ月、最大約16ヶ月、最大約14ヶ月、最大約12ヶ月、最大約10ヶ月、最大約8ヶ月、または最大約6ヶ月の期間の間、冷蔵下で前記ポリアクリルアミドゲルを保存することをさらに含む、付記19に記載の方法。
(付記25)
ゲルアミン緩衝剤と、
一次ゲル両性電解質と、
トレオニン及びセリンから選択される共役ゲル両性電解質と、を含む、ポリアクリルアミドゲル緩衝剤であって、前記ゲルアミン緩衝剤のpHが、約6.5〜約7.5の範囲である、ポリアクリルアミドゲル緩衝剤。
Claims (24)
- ポリアクリルアミドゲル及びゲル緩衝剤を含むゲル電気泳動用ゲルであって、前記ゲル緩衝剤が、
ゲルアミン緩衝剤と、
ゲル両性電解質と、
トレオニンである共役ゲル両性電解質と、を含む、ゲル
(ただし、その構造中の少なくとも一部に下記式(A)で表される構造を有し、下記組成(1)および(2)の緩衝液を含有するアクリルアミド系共重合体水性ゲルであることを特徴とする電気泳動用プレキャストゲルを除く:
(1)トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンおよび/またはビス(2−ヒドロキシエチル)イミノトリス(ヒドロキシメチル)メタンと1種以上の両性電解質
(2)pHが6.0〜6.8
式中、M2+は遷移金属イオン)。 - 前記ポリアクリルアミドゲルが、アクリルアミド及びビスアクリルアミドからなる、請求項1に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤が、ビス(2−ヒドロキシエチル)−アミノ−トリス(ヒドロキシメチル)−メタン、1,3−ビス(トリス(ヒドロキシメチル)メチルアミノ)プロパン、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、及びトリエタノールアミンから選択される、請求項1又は2に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤が、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンである、請求項1〜3のいずれか1項に記載のゲル。
- トリエタノールアミンを含む緩衝液中の架橋ポリアクリルアミドを含む、ポリアクリルアミドゲルであって、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンを有さないかまたは0.3mM以下で有し、かつ、ビス(2-ヒドロキシエチル)アミノ-トリス(ヒドロキシメチル)メタンを有さないかまたは0.3mM以下で有する、ゲルを除く、請求項1〜4のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤が、ビス(2−ヒドロキシエチル)−アミノ−トリス(ヒドロキシメチル)−メタン、1,3−ビス(トリス(ヒドロキシメチル)メチルアミノ)プロパン、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンから選択され、前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、40mM〜150mMの範囲である、請求項1〜5のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲル両性電解質が、グリシン及びトリシンから選択される、請求項1〜6のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲル両性電解質が、グリシンである、請求項1〜7のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記共役ゲル両性電解質が、セリンをさらに含む、請求項1〜8のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、150mM未満である、請求項1〜9のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、40mM〜150mMの範囲である、請求項1〜10のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、70mM〜140mMの範囲である、請求項1〜11のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤の濃度が、70mM〜80mMの範囲である、請求項1〜12のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲル両性電解質の濃度が、25mM〜250mMの範囲である、請求項1〜13のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲル両性電解質の濃度が、100mM〜250mMの範囲である、請求項1〜14のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記共役ゲル両性電解質の濃度が、10mM〜20mMの範囲である、請求項1〜15のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記共役ゲル両性電解質の濃度が、0.1mM〜50mMの範囲または10mM〜50mMの範囲である、請求項1〜15のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲル緩衝剤のpHが、6.5〜7.5、もしくは6.75〜7.25の範囲である、または7.0である、請求項1〜17のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲル緩衝剤のpHが、6.5〜7.5、もしくは6.9〜7.5、もしくは7.0〜7.2の範囲である、または7.1である、請求項1〜18のいずれか1項に記載のゲル。
- 室温で保存される場合、少なくとも6ヶ月、少なくとも8ヶ月、少なくとも10ヶ月、または4℃で保存される場合、少なくとも12ヶ月、もしくは最大24ヶ月、少なくとも18ヶ月、少なくとも16ヶ月、少なくとも14ヶ月、少なくとも12ヶ月、少なくとも10ヶ月、もしくは少なくとも8ヶ月、の保存寿命を有するように配合される、請求項1〜19のいずれか1項に記載のゲル。
- 前記ゲルアミン緩衝剤のpKaが、5〜10、もしくは5.5〜10、もしくは6〜9、もしくは7〜8.5、もしくは7.9〜8.2、もしくは8〜8.1、もしくは7.9〜9.8の範囲であるか、または前記ゲルアミン緩衝剤のpKaが、8.1である、請求項1〜20のいずれか1項に記載のゲル。
- 電気泳動によりサンプル中の分子を分離する方法であって、前記方法が、
請求項1〜21のいずれか1項に記載のゲルを形成することと、
前記ゲルに前記サンプルを装填することと、
質量及び/または電荷に応じて変化する移動速度で前記ゲルを通って前記分子を移動させるために、前記ゲルにわたって電圧差を課すことと、を含む、方法。 - 前記分子が、タンパク質である、請求項22に記載の方法。
- 前記形成工程後かつ前記装填工程前に最大24ヶ月、最大18ヶ月、最大16ヶ月、最大14ヶ月、最大12ヶ月、最大10ヶ月、最大8ヶ月、または最大6ヶ月の期間の間、冷蔵下で前記ゲルを保存することをさらに含む、請求項22又は23に記載の方法。
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