JP6609444B2 - Vascular lesion evaluation method and vascular lesion evaluation kit - Google Patents

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Description

本発明は、miR−214およびmiR−126からなる群から選択されるバイオマーカーを用いた血管病変の評価方法および、当該バイオマーカーの検出物質を含む血管病変評価用キットに関する。   The present invention relates to a method for evaluating a vascular lesion using a biomarker selected from the group consisting of miR-214 and miR-126, and a vascular lesion evaluation kit comprising a detection substance for the biomarker.

近年、種々の疾病や障害を迅速かつ簡便に検出する手段として、バイオマーカーの利用開発が行われている。例えば、特許文献1には、卵巣癌を診断する方法として、miR−21、miR−141、miR−200a、miR−200b、miR−200c、miR−203、miR−205及びmiR−214からなる群より選択されるマイクロRNA(miRNA)の量を指標とする発明が開示されている。   In recent years, biomarkers have been developed for use as a means for quickly and easily detecting various diseases and disorders. For example, Patent Document 1 discloses a group consisting of miR-21, miR-141, miR-200a, miR-200b, miR-200c, miR-203, miR-205 and miR-214 as a method for diagnosing ovarian cancer. An invention using the amount of microRNA (miRNA) selected more as an index is disclosed.

一方、血管病変は血管またはリンパ管の限局性のなんらかの病理学的変化、障害または疾患をいい、血管腫(Hemangioma;血管増殖の結果、新生物に類似した腫瘤となったもの)や血管肉腫(Hemangiosarcoma;血管由来の未分化細胞からなる悪性新生物)などの良性または悪性の腫瘍や、アテローム性動脈硬化等の動脈硬化が挙げられる。このうち、血管肉腫は、ヒトでは稀ながら、イヌでは癌の5〜7%程度を占める主要な癌として知られている。血管肉腫は予後不良であり、早期発見手段の開発に対して強い要請がある。特許文献2には、miR−503、miR−193b、let−7e、miR−451、miR−423a、およびmiR−551bからなる群から選択される1又は2つ以上のmiRNAの発現量の増加を指標として哺乳動物の血管肉腫を検出する方法が記載されている。   Vascular lesions, on the other hand, refer to any localized pathological change, disorder or disease of blood vessels or lymphatic vessels, such as hemangiomas (hemangiomas; those resulting from vascular proliferation resulting in tumors similar to neoplasms) and angiosarcomas ( Benign or malignant tumors such as Hemangiosarcoma; a malignant neoplasm composed of undifferentiated cells derived from blood vessels) and arteriosclerosis such as atherosclerosis. Among these, angiosarcoma is known as a major cancer that accounts for about 5 to 7% of cancer in dogs, although rare in humans. Angiosarcoma has a poor prognosis, and there is a strong demand for the development of early detection means. Patent Document 2 discloses an increase in the expression level of one or more miRNAs selected from the group consisting of miR-503, miR-193b, let-7e, miR-451, miR-423a, and miR-551b. A method for detecting angiosarcoma in mammals is described as an index.

特開2010−534480号公報(国際公開第2009/015357号に相当)JP 2010-534480 A (corresponding to International Publication No. 2009/015357) 特開2014−082953号公報Japanese Patent Application Laid-Open No. 2014-082953

バイオマーカーを用いることで病理学的変化等を迅速かつ簡便に検出することが期待されるものの、従来のバイオマーカーでは、血管病変の評価において特異性および感度の点において十分でない場合があった。したがって、本発明は、血管肉腫をはじめとする血管病変を、特異的且つ高感度に検出する手段を提供することを課題とする。   Although the use of biomarkers is expected to detect pathological changes and the like quickly and easily, conventional biomarkers may not be sufficient in terms of specificity and sensitivity in evaluating vascular lesions. Therefore, an object of the present invention is to provide means for detecting vascular lesions such as angiosarcoma specifically and with high sensitivity.

本発明者らは、上記の問題を解決すべく、鋭意研究を行った。その結果、血管病変を罹患した患者では、miR−214およびmiR−126の少なくとも一方の発現レベルが上昇することを見出した。これにより、miR−214およびmiR−126からなる群から選択されるバイオマーカーを用いること、特に、miR−214とmiR−126とを組み合わせて用いることにより、特異的且つ高感度に血管病変を検出できることを見出し、本発明の完成に至った。   The present inventors have intensively studied to solve the above problems. As a result, it was found that the expression level of at least one of miR-214 and miR-126 is increased in patients suffering from vascular lesions. Thereby, using a biomarker selected from the group consisting of miR-214 and miR-126, in particular, by using a combination of miR-214 and miR-126, it is possible to detect vascular lesions specifically and with high sensitivity. As a result, the present invention has been completed.

本発明によれば、特異的且つ高感度に血管病変を検出できる。   According to the present invention, a vascular lesion can be detected specifically and with high sensitivity.

図1は、イヌ正常血管内皮細胞(CnAOEC細胞)ならびにイヌ血管肉腫由来培養細胞(Re12細胞、およびUd6細胞)を用いて、培地に分泌されたバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルを測定した結果である。FIG. 1 shows the expression of biomarkers (miR-214, miR-126) secreted into the medium using canine normal vascular endothelial cells (CnAOEC cells) and canine hemangiosarcoma-derived cultured cells (Re12 cells and Ud6 cells). It is the result of measuring the level. 図2は、健康群、非腫瘍性脾疾患群および血管肉腫罹患群のイヌから回収した血漿中のバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルを測定した結果である。FIG. 2 shows the results of measuring the expression levels of biomarkers (miR-214, miR-126) in plasma collected from dogs in a healthy group, a non-neoplastic splenic disease group, and an angiosarcoma-affected group. 図3は、実施例2における試験データを、miR−214およびmiR−126をそれぞれ独立したバイオマーカーとした場合の統計解析結果である。FIG. 3 is a statistical analysis result when miR-214 and miR-126 are independent biomarkers as test data in Example 2. 図4は、健康群、非腫瘍性脾疾患群および血管肉腫罹患群の各個体におけるmiR−214、miR−126の発現レベルを示す。FIG. 4 shows the expression levels of miR-214 and miR-126 in each individual of a healthy group, a non-neoplastic splenic disease group, and an angiosarcoma affected group. 図5は、実施例2における試験データを、miR−214およびmiR−126を組み合わせてバイオマーカーとした場合の統計解析結果である。FIG. 5 is a statistical analysis result when the test data in Example 2 is combined with miR-214 and miR-126 to be a biomarker. 図6は、血管肉腫摘出前後における、血漿中のバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルを測定した結果である。FIG. 6 shows the results of measuring the expression levels of biomarkers (miR-214, miR-126) in plasma before and after angiosarcoma removal. 図7は、ヒト血管内皮細胞(HMEC1細胞)ならびにヒト血管肉腫由来培養細胞(ISO−HAS細胞、およびHAMON細胞)を用いて、培地に分泌されたバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルを測定した結果である。FIG. 7 shows biomarkers (miR-214, miR-126) secreted into a medium using human vascular endothelial cells (HMEC1 cells) and human hemangiosarcoma-derived cultured cells (ISO-HAS cells and HAMON cells). It is the result of measuring the expression level.

以下、本発明の実施の形態を説明する。なお、本発明は、以下の実施の形態のみには限定されない。   Embodiments of the present invention will be described below. In addition, this invention is not limited only to the following embodiment.

本明細書において、範囲を示す「X〜Y」は「X以上Y以下」を意味する。また、特記しない限り、操作および物性等の測定は室温(20〜25℃)/相対湿度40〜50%の条件で測定する。   In this specification, “X to Y” indicating a range means “X or more and Y or less”. Unless otherwise specified, measurement of operation and physical properties is performed under conditions of room temperature (20 to 25 ° C.) / Relative humidity 40 to 50%.

本発明の第1の形態は、被験者における血管病変の評価方法であって、前記被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、および前記バイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、前記バイオマーカーが、miR−214およびmiR−126からなる群から選択される、血管病変の評価方法に関する。本発明によれば、特異的且つ高感度に血管病変を検出できる。なお、本明細書における「測定」には、定量、半定量および検出のいずれの概念も包含される。さらに、「発現レベルを測定する」ことには、miRNAを直接的に測定する場合のほか、RT−PCR等によりmiRNAを一旦cDNAへと変換した後に当該cDNAを測定する場合のように、mRNAを間接的に測定する場合も包含される。また、「検出物質」には、miRNAに直接的にハイブリダイズして検出する物質のほか、RT−PCR等によりmiRNAを一旦cDNAへと変換した後に当該cDNAにハイブリダイズして検出する物質の両方を含む。   A first aspect of the present invention is a method for evaluating a vascular lesion in a subject, measuring a biomarker expression level in a biological sample separated from the subject, and comparing the biomarker expression level with a reference value The biomarker is selected from the group consisting of miR-214 and miR-126. According to the present invention, a vascular lesion can be detected specifically and with high sensitivity. It should be noted that “measurement” in this specification includes any concept of quantitative, semi-quantitative, and detection. Furthermore, “measuring the expression level” includes not only directly measuring miRNA, but also miRNA is converted to cDNA by RT-PCR or the like and then measuring the cDNA. Indirect measurement is also included. The “detection substance” includes both substances that hybridize and detect directly to miRNA, and substances that hybridize and detect miRNA once converted to cDNA by RT-PCR or the like. including.

本発明においては、バイオマーカーとしてmiR−214およびmiR−126からなる群から選択されるmiRNA(マイクロRNA)を用いる。miRNAは、細胞内在性の、20〜25塩基程度の非コードRNAである。miRNAは、ゲノムDNA上のmiRNA遺伝子から、まず数百〜数千塩基程度の長さの一次転写物(pri−miRNA)として転写される。次いで、プロセシングを受けて約60〜70塩基程度のヘアピン構造を有するpre−miRNAとなる。その後、核から細胞質内に移り、さらにプロセシングを受けて20〜25塩基程度の二量体(ガイド鎖およびパッセンジャー鎖)からなる成熟miRNAとなる。成熟miRNAは、そのうちのガイド鎖(アンチセンス鎖)がRISC(RNA−Induced Silencing Complex)と呼ばれるタンパク質と複合体を形成し、標的遺伝子のmRNAに作用することで、標的遺伝子の翻訳を阻害する働きをすることが知られている。   In the present invention, miRNA (microRNA) selected from the group consisting of miR-214 and miR-126 is used as a biomarker. miRNA is a non-coding RNA of about 20 to 25 bases that is endogenous to cells. miRNA is first transcribed from a miRNA gene on genomic DNA as a primary transcript (pri-miRNA) having a length of about several hundred to several thousand bases. Then, it is processed to become a pre-miRNA having a hairpin structure of about 60 to 70 bases. Thereafter, the miRNA moves from the nucleus into the cytoplasm and is further processed to become a mature miRNA composed of a dimer (guide strand and passenger strand) of about 20 to 25 bases. In mature miRNA, the guide strand (antisense strand) of the mature miRNA forms a complex with a protein called RISC (RNA-Induced Silencing Complex) and acts on the mRNA of the target gene, thereby inhibiting the translation of the target gene. It is known to do.

ある種の細胞は、タンパク質や核酸等の分子を脂質二重膜構造に内包した小胞を細胞外に分泌することが知られており、これらの小胞はマイクロベシクルやナノベシクル等として知られている。分泌された小胞は他の細胞と融合し、内包するタンパク質や核酸等の分子を当該他の細胞へ伝達する機能を果たしていると考えられている。小胞に内包される分子は細胞の種類によって相違すると考えられている。したがって、腫瘍細胞が分泌する小胞に特異的に内包される分子を指標として、腫瘍検出のためのバイオマーカーとして利用することも検討されている。小胞に内包される分子として、ある種のmiRNAが細胞の種類特異的に含まれることも知られている。   Certain cells are known to secrete vesicles encapsulating molecules such as proteins and nucleic acids in lipid bilayer structures, and these vesicles are known as microvesicles, nanovesicles, etc. Yes. Secreted vesicles are considered to have a function of fusing with other cells and transferring molecules such as encapsulated proteins and nucleic acids to other cells. Molecules contained in vesicles are thought to differ depending on the cell type. Therefore, the use of a molecule that is specifically encapsulated in a vesicle secreted by a tumor cell as an index is also considered as a biomarker for tumor detection. It is also known that certain miRNAs are contained in a cell type-specific manner as molecules contained in vesicles.

一方、本発明者らは、障害を受けた血管内皮細胞(特に、血管内皮腫瘍細胞)が、細胞外へmiR−214およびmiR−126を多く分泌することを見出した。本発明の技術的範囲を制限するものではないが、これは、障害を受けた血管内皮細胞(特に、血管内皮腫瘍細胞)が、他の細胞へのシグナルとしてmiR−214およびmiR−126を利用しており、その伝達手段として分泌する小胞内にこれらの分子が含まれているためではないかと考えられる。なお、本発明で発現レベルの測定対象や検出物質の検出対象とされるmiRNAは、pri−miRNA、pre−miRNA(pri−miRNA、およびpre−miRNAを、「前駆体miRNA」とも称する。)および成熟miRNAのいずれであってもよいが、好ましくは成熟miRNAである。   On the other hand, the present inventors have found that damaged vascular endothelial cells (particularly vascular endothelial tumor cells) secrete a large amount of miR-214 and miR-126 to the outside of the cells. Without limiting the technical scope of the present invention, this is because damaged vascular endothelial cells (especially vascular endothelial tumor cells) utilize miR-214 and miR-126 as signals to other cells. It is thought that these molecules are contained in vesicles that are secreted as a means of transmission. In the present invention, the miRNA that is an expression level measurement target or a detection substance detection target is pri-miRNA, pre-miRNA (pri-miRNA and pre-miRNA are also referred to as “precursor miRNA”) and. Although it may be any mature miRNA, it is preferably a mature miRNA.

本明細書における「被験者」は、miR−214および/またはmiR−126を発現するヒトおよび非ヒト動物を含む動物であれば特に制限されないが、例えば、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウマ、ウシ、ブタ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ等の哺乳動物であることが好ましい。測定対象であるmiR−214およびmiR−126は、上記のような多くの哺乳動物において存在が確認されている。このうち、本発明にかかる血管病変の評価方法は、ヒトまたはイヌに対して好適に用いられる。例として、ヒトおよびイヌの成熟miR−214(配列番号1)および成熟miR−126(配列番号2)配列を示す。成熟miR−214および成熟miR−126のヌクレオチド配列は、ヒトおよびイヌを含む哺乳類で共通である。   The “subject” in the present specification is not particularly limited as long as it is an animal including human and non-human animals that express miR-214 and / or miR-126. For example, human, dog, cat, mouse, rat, hamster It is preferably a mammal such as guinea pig, monkey, horse, cow, pig, rabbit, sheep, goat. The presence of miR-214 and miR-126, which are measurement targets, has been confirmed in many mammals as described above. Among these, the method for evaluating a vascular lesion according to the present invention is suitably used for humans or dogs. By way of example, human and canine mature miR-214 (SEQ ID NO: 1) and mature miR-126 (SEQ ID NO: 2) sequences are shown. The nucleotide sequences of mature miR-214 and mature miR-126 are common in mammals including humans and dogs.

本発明において用いられる「生体試料」は、被験者から生体外に取出された細胞、組織または体液、例えば生検、穿刺吸引物、剥離物、細胞浸出液など、を意味する。特に限定されないが、より具体的には、例えば、尿、粘液、唾液、涙、血液、血漿、血清、痰、脊髄液、胸水、乳頭吸引物、リンパ液、気道液、腸液、泌尿生殖管液、母乳、精液、脳脊髄液、気管系内体液、腹水、嚢胞性腫瘍体液、および羊水液が例示できるが、入手の容易さの観点から血液、血漿、および血清からなる群から選択されることが好ましい。生体試料の分離方法は、本技術分野において従来公知の手段により行えばよい。   The “biological sample” used in the present invention means a cell, tissue or body fluid taken out from a subject ex vivo, such as a biopsy, a puncture aspirate, a exfoliated material, a cell exudate, and the like. Although not particularly limited, more specifically, for example, urine, mucus, saliva, tears, blood, plasma, serum, sputum, spinal fluid, pleural effusion, nipple aspirate, lymph fluid, airway fluid, intestinal fluid, genitourinary tract fluid, Examples include breast milk, semen, cerebrospinal fluid, endotracheal fluid, ascites, cystic tumor fluid, and amniotic fluid, but may be selected from the group consisting of blood, plasma, and serum from the viewpoint of availability. preferable. A biological sample separation method may be performed by a conventionally known means in this technical field.

本明細書において「血管病変」とは、血管またはリンパ管の限局性の病理学的変化、障害または疾患をいい、特に限定されるものではないが、例えば、血管腫(例えば、血管芽腫、血管内皮腫、血管外皮腫、毛細血管性血管腫、乳児毛細血管性血管腫、海綿状血管腫、蔓状血管腫、硬化性血管腫、老年性血管腫、クモ状血管腫、イチゴ状血管腫、疣贅状血管腫、リンパ管腫、蛇行性血管腫)、血管肉腫(例えば、悪性血管内皮腫、悪性血管外皮腫、カポジ肉腫)、アテローム性動脈硬化、肥厚性動脈硬化、高血圧性動脈硬化、血管内膜炎、冠状動脈疾患、脳卒中、心筋梗塞、再狭窄、および糖尿病性血管障害等が例示できる。本発明は特に、血管腫または血管肉腫の検出に好適に用いられ、より好ましくは、血管肉腫の検出に用いられる。   As used herein, “vascular lesion” refers to a localized pathological change, disorder or disease of a blood vessel or lymphatic vessel, and is not particularly limited. For example, hemangioma (for example, hemangioblastoma, Hemangioendothelioma, angioderma, capillary hemangioma, infantile hemangioma, spongiform hemangioma, venous hemangioma, sclerosing hemangioma, senile hemangioma, spider hemangioma, strawberry hemangioma , Wart angioma, lymphangioma, tortuous hemangioma), angiosarcoma (eg malignant hemangioendothelioma, malignant hemangioderma, Kaposi sarcoma), atherosclerosis, hypertrophic arteriosclerosis, hypertensive arteriosclerosis Examples thereof include endometriosis, coronary artery disease, stroke, myocardial infarction, restenosis, and diabetic vascular disorder. The present invention is particularly preferably used for detection of hemangiomas or angiosarcomas, and more preferably for detection of hemangiosarcomas.

本発明においては、バイオマーカーとしてmiR−214およびmiR−126の少なくとも一方を用いるが、好ましくは、特異性および感度を顕著に向上できるという観点から、バイオマーカーとして、miR−214およびmiR−126の発現レベルを測定する。バイオマーカーの発現レベルの測定には、従来公知の定量的・半定量的手法が採用でき、例えば、発現レベルの測定は、核酸増幅法、マイクロアレイ法、またはノーザンブロット法により行われてもよい。より好ましくは、配列特異性の高さの観点から、核酸増幅法によって発現レベルの測定が行われる。以下、代表的な発現レベルの測定方法として核酸増幅法、ノーザンブロット法、およびマイクロアレイ法についてさらに説明するが、発現レベルの測定方法が下記に限定されるものではない。   In the present invention, at least one of miR-214 and miR-126 is used as a biomarker. Preferably, miR-214 and miR-126 are used as biomarkers from the viewpoint that the specificity and sensitivity can be significantly improved. The expression level is measured. For the measurement of the expression level of a biomarker, a conventionally known quantitative / semi-quantitative technique can be employed. For example, the expression level may be measured by a nucleic acid amplification method, a microarray method, or a Northern blot method. More preferably, from the viewpoint of high sequence specificity, the expression level is measured by a nucleic acid amplification method. Hereinafter, the nucleic acid amplification method, the Northern blot method, and the microarray method will be further described as typical expression level measurement methods, but the expression level measurement method is not limited to the following.

核酸増幅法を用いる場合は、バイオマーカー(miR−214、miR−126)の成熟miRNAに相当する領域(例えば、連続する7〜25残基)を含むように設定したプライマーを用いる核酸増幅法により、バイオマーカー(miR−214、miR−126)の成熟miRNAの塩基配列を含むRNAまたはそのcDNAの部分領域を特異的に増幅し、増幅産物を測定することを含む。ここで、「領域に設定した」とは、ストリンジェントな条件下でその領域とハイブリダイズするという意味であり、バイオマーカー(miR−214、miR−126)のガイド鎖に対するリバース側プライマーを用いる場合と、フォワード側プライマーを用いる場合の両者が包含される。ストリンジェントな条件とは、特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいい、例えば成書に記載の条件(サムブルック(Sambrook)ら編、「モレキュラークローニング,ア ラボラトリーマニュアル 第2版」、1989年、コールドスプリングハーバーラボラトリー、特に11.45節“Conditions for Hybridization of Oligonucleotide probes”等)にしたがって決定でき、特に制限されない。ストリンジェントな条件は、塩濃度、温度、およびその他の条件によって決まり、例えば、塩濃度が低いほど、温度が高いほど、ストリンジェンシーは高くなり、プライマーとRNA(または、そのcDNA)とがハイブリダイゼーションしにくくなる。塩濃度は、一般に、SSC溶液(NaCl+クエン酸三ナトリウム)の濃度を調節することによって調節され、ストリンジェントな塩濃度は、例えば、NaCl約250mM以下およびクエン酸三ナトリウム約25mM以下である。ストリンジェントな温度は、一般に、完全ハイブリッドの融解温度(Tm)より15〜25℃低い温度であり、例えば、約30℃以上である。溶液に有機溶媒(例えばホルムアミド)を加えることにより、温度を下げることができる。その他の条件としては、ハイブリダイゼーション時間、洗浄剤(例えば、SDS)の濃度、およびキャリアーDNAの存否等であり、これらの条件を組み合わせることによって、様々なストリンジェンシーを設定することができる。好ましい例として、250mM NaCl、25mM クエン酸三ナトリウム、1% SDS、50% ホルムアミド、200μg/mLの変性サケ精子DNAの条件で、42℃の温度によりハイブリダイゼーションを行う。また、ハイブリダイゼーション後の洗浄の条件もストリンジェンシーに影響する。この洗浄条件もまた、塩濃度および温度によって定義され、塩濃度の減少と温度の上昇によって洗浄のストリンジェンシーは増加する。好ましい例として、15mM NaCl、1.5mMクエン酸三ナトリウムおよび0.1% SDSの条件で、68℃の温度にて洗浄を行う。また、「特異的に増幅する」とは、miR−214またはmiR−126のいずれか一方の成熟miRNAの塩基配列を含むRNAまたはそのcDNAの部分領域は増幅されるが、当該測定対象であるmiR−214またはmiR−126以外の成熟miRNAの塩基配列を含むRNAまたはそのcDNAの部分領域は増幅されないことを意味する。なお、プライマーのサイズは特に限定されないが、通常13〜30塩基程度であり、好ましくは15〜25塩基程度である。   When using a nucleic acid amplification method, a nucleic acid amplification method using a primer set to include a region (for example, 7 to 25 consecutive residues) corresponding to a mature miRNA of a biomarker (miR-214, miR-126). , Specifically amplifying a partial region of RNA or cDNA thereof containing a mature miRNA base sequence of a biomarker (miR-214, miR-126), and measuring the amplified product. Here, “set to a region” means that it hybridizes with the region under stringent conditions, and a reverse primer for the guide strand of a biomarker (miR-214, miR-126) is used. And the case where the forward primer is used are included. Stringent conditions refer to conditions in which specific hybrids are formed and non-specific hybrids are not formed. For example, the conditions described in the textbook (edited by Sambrook et al., “Molecular Cloning, Laboratory Manual”). 2nd edition ", 1989, Cold Spring Harbor Laboratory, in particular Section 11.45" Conditions for Hybridization of Oligonucleotide Probes "etc.), and is not particularly limited. Stringent conditions depend on salt concentration, temperature, and other conditions. For example, the lower the salt concentration, the higher the temperature, the higher the stringency, and the primer and RNA (or its cDNA) hybridize. It becomes difficult to do. The salt concentration is generally adjusted by adjusting the concentration of the SSC solution (NaCl + trisodium citrate), and the stringent salt concentration is, for example, about 250 mM or less NaCl and about 25 mM or less trisodium citrate. The stringent temperature is generally 15 to 25 ° C. lower than the melting temperature (Tm) of the complete hybrid, for example, about 30 ° C. or more. The temperature can be lowered by adding an organic solvent (eg, formamide) to the solution. Other conditions include hybridization time, detergent (eg, SDS) concentration, presence or absence of carrier DNA, and various stringencies can be set by combining these conditions. As a preferred example, hybridization is performed at a temperature of 42 ° C. under conditions of 250 mM NaCl, 25 mM trisodium citrate, 1% SDS, 50% formamide, and 200 μg / mL denatured salmon sperm DNA. In addition, washing conditions after hybridization also affect stringency. This wash condition is also defined by salt concentration and temperature, and wash stringency increases with decreasing salt concentration and increasing temperature. As a preferred example, washing is performed at a temperature of 68 ° C. under conditions of 15 mM NaCl, 1.5 mM trisodium citrate and 0.1% SDS. In addition, “specifically amplify” means that an RNA containing the base sequence of either miR-214 or miR-126 or a partial region of its cDNA is amplified, but the miR that is the subject of measurement. This means that an RNA containing a base sequence of mature miRNA other than -214 or miR-126 or a partial region of cDNA thereof is not amplified. In addition, although the size of a primer is not specifically limited, Usually, it is about 13-30 bases, Preferably it is about 15-25 bases.

テンプレートとなるRNAの部分領域と同じ塩基配列(ただしuはtになる)を有するDNA(cDNA)を得る好ましい例として、逆転写PCR(RT−PCR)が挙げられる。RT−PCRでは、生体試料からRNAを常法により抽出し、逆転写酵素の作用によりRNAをテンプレートとして第一鎖cDNAを生成させ、さらにこの第一鎖cDNAをテンプレートとして相補鎖を生成させて、二本鎖cDNAを得る。次いで、得られた二本鎖cDNAをテンプレートとしてPCRを行い、該cDNAまたはその部分領域を増幅する。RT−PCR自体は周知の技術であり、そのためのキットや装置も市販されているため、容易に実施することができる。   A preferred example of obtaining DNA (cDNA) having the same base sequence as the template partial RNA region (where u is t) is reverse transcription PCR (RT-PCR). In RT-PCR, RNA is extracted from a biological sample by a conventional method, a first strand cDNA is generated using RNA as a template by the action of reverse transcriptase, and a complementary strand is generated using this first strand cDNA as a template. Double stranded cDNA is obtained. Next, PCR is performed using the obtained double-stranded cDNA as a template to amplify the cDNA or a partial region thereof. RT-PCR itself is a well-known technique, and kits and devices therefor are also commercially available, and can be easily implemented.

なお、RT−PCRを行う場合、最初のRNAの抽出時に混入するゲノムDNAに含まれる偽遺伝子を鋳型とする増幅が起きる場合がある。従って、用いるプライマーセットは、このような偽遺伝子に起因する増幅が起きないプライマーを選択したセットであることが好ましい。偽遺伝子に起因する増幅が起きるか否かは、例えば、そのプライマーセットを用い、ゲノムDNAをテンプレートとしてPCRを行った場合に、cDNAを鋳型としてPCRを行った場合と同じサイズの増幅産物のみが生成するか否かにより判定することができる。   When RT-PCR is performed, amplification using a pseudogene contained in genomic DNA mixed at the time of initial RNA extraction as a template may occur. Accordingly, the primer set to be used is preferably a set in which primers that do not cause amplification due to such pseudogenes are selected. Whether or not amplification due to the pseudogene occurs, for example, when PCR is performed using the primer set and genomic DNA as a template, only amplification products of the same size as when PCR is performed using cDNA as a template. It can be determined by whether or not it is generated.

核酸増幅の一般的な手法が、PCRである。PCR自体は常法に従って行うことができる。そして、PCRによる増幅後に、増幅産物の発現レベルを測定する。かような発現レベルの測定も、常法により行うことができる。さらに、増幅産物の電気泳動バンドの蛍光強度測定や、太さの目視判定のような、簡易定量または半定量も「測定」の概念に包含される。発現レベルの測定は、例えば逆転写産物を電気泳動にかけ、増幅バンドを検出することにより行うこともできる。また、蛍光標識したヌクレオチド三リン酸の存在下にPCRを行うことによって逆転写産物を蛍光標識し、増幅バンドの蛍光強度を測定することによっても、発現レベルを測定できる。さらに、電気泳動パターンをナイロンやニトロセルロースからなるメンブレンに転写し、逆転写産物にハイブリダイズする標識プローブをハイブリダイズさせて、標識を検出または定量する(PCR−サザン(Southern)法)によっても行うことができる。さらには、逆転写産物にハイブリダイズするプローブを固相化し、上記増幅工程を標識ヌクレオチド三リン酸の存在下に行い、固相化プローブに逆転写産物を結合させ、固相に結合された逆転写産物を測定することによっても行うことができる。これらはいずれも常法であり、周知の知見が適宜参照されうる。   A common technique for nucleic acid amplification is PCR. PCR itself can be performed according to a conventional method. Then, after amplification by PCR, the expression level of the amplification product is measured. Such expression level can also be measured by a conventional method. Furthermore, simple determination or semi-quantification such as measurement of the fluorescence intensity of the electrophoresis band of the amplification product and visual determination of the thickness is also included in the concept of “measurement”. The expression level can be measured, for example, by subjecting a reverse transcription product to electrophoresis and detecting an amplification band. The expression level can also be measured by fluorescently labeling the reverse transcription product by performing PCR in the presence of fluorescently labeled nucleotide triphosphate and measuring the fluorescence intensity of the amplified band. Furthermore, the electrophoresis pattern is transferred to a membrane made of nylon or nitrocellulose, and a labeled probe that hybridizes to the reverse transcription product is hybridized to detect or quantify the label (PCR-Southern method). be able to. Furthermore, a probe that hybridizes to the reverse transcription product is immobilized, the amplification step is performed in the presence of labeled nucleotide triphosphate, the reverse transcription product is bound to the immobilized probe, and the reverse phase bound to the solid phase. It can also be done by measuring the transcript. These are all conventional methods, and known knowledge can be referred to appropriately.

上述したRT−PCRの逆転写産物を用いて、リアルタイムPCR(定量PCR)によりバイオマーカーの発現レベルを測定してもよい。あるいは、上記の逆転写反応とリアルタイムPCR(定量PCR)による定量を同一チューブ内で行う、いわゆるワンステップRT−PCRによってバイオマーカーの発現レベルを測定してもよい。リアルタイムPCR(定量PCR)は蛍光色素を用いた従来公知の手法で行えばよく、TaqMan(登録商標)プローブ法およびインターカレータ法(SYBR(登録商標) Green I)のいずれであってもよい。配列特異性の高さから、本発明においては、好ましくは、TaqMan(登録商標)プローブ法によってバイオマーカーの発現レベルを測定する。   The expression level of the biomarker may be measured by real-time PCR (quantitative PCR) using the RT-PCR reverse transcription product described above. Alternatively, the expression level of the biomarker may be measured by so-called one-step RT-PCR in which the reverse transcription reaction and quantification by real-time PCR (quantitative PCR) are performed in the same tube. Real-time PCR (quantitative PCR) may be performed by a conventionally known method using a fluorescent dye, and may be either TaqMan (registered trademark) probe method or intercalator method (SYBR (registered trademark) Green I). In the present invention, the expression level of the biomarker is preferably measured by the TaqMan (registered trademark) probe method because of its high sequence specificity.

以上、本発明の測定方法をPCR法によりおこなう場合を例に挙げて詳細に説明したが、本発明の測定方法は、上述したプライマーを用いてバイオマーカー(miR−214、miR−126)の成熟miRNAの塩基配列を含むRNAまたはそのcDNAの部分領域の増幅を行う方法であれば、他の核酸増幅法を利用するものであってもよい。   As described above, the case where the measurement method of the present invention is performed by the PCR method has been described in detail. However, the measurement method of the present invention uses the above-described primers to mature the biomarkers (miR-214, miR-126). Any other nucleic acid amplification method may be used as long as it is a method for amplifying an RNA containing a miRNA base sequence or a partial region of its cDNA.

バイオマーカーの発現レベルの測定は、ノーザンブロット法により行ってもよい。ノーザンブロット法に用いるプローブは、バイオマーカー(miR−214、miR−126)の成熟miRNAに相当する領域(例えば、連続する7〜25残基)を含むように設定したプローブである。プローブは、上記のプライマーと同様、検出対象であるバイオマーカー(miR−214、miR−126)とストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なものであり、例えば、検出対象と、70%以上(例えば、80%以上、90%以上、92%以上、95%以上、99%以上、100%)相補的であり得る。プローブは検出対象であるバイオマーカー(miR−214、miR−126)とストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なものであれば特に制限されず、DNAプローブやRNAプローブのいずれであってもよく、あるいは、LNA(登録商標)などの架橋化した核酸など化学修飾されたもの、非天然塩基(人工塩基)を含むものでもよい。プローブ長さは、例えば、5〜30残基であり、好ましくは10〜25残基である。プローブは、放射線標識、蛍光色素、ジゴキシゲニン(DIG)、ビオチン、酵素等の標識化物質によって検出可能に標識化されたものである。   The measurement of the expression level of the biomarker may be performed by the Northern blot method. The probe used for Northern blotting is a probe set to include a region (for example, continuous 7 to 25 residues) corresponding to a mature miRNA of a biomarker (miR-214, miR-126). The probe is capable of hybridizing under stringent conditions with the biomarker (miR-214, miR-126) to be detected, as with the above-described primer. For example, the probe is 70% or more (for example, 80% or more, 90% or more, 92% or more, 95% or more, 99% or more, 100%). The probe is not particularly limited as long as it can hybridize with a biomarker to be detected (miR-214, miR-126) under stringent conditions, and may be either a DNA probe or an RNA probe, Alternatively, it may be chemically modified such as a cross-linked nucleic acid such as LNA (registered trademark), or may contain a non-natural base (artificial base). The probe length is, for example, 5 to 30 residues, preferably 10 to 25 residues. The probe is detectably labeled with a labeling substance such as a radiolabel, a fluorescent dye, digoxigenin (DIG), biotin, or an enzyme.

ノーザンブロットは本技術分野において周知の手法により実施することができる。詳細には、生体試料から抽出したRNAをゲル電気泳動によって分画し、ニトロセルロースメンブレンやナイロンメンブレン等のメンブレンに転写する。次いで、メンブレンを前述のプローブ存在下、緩衝液中でインキュベートする。その後、プローブの標識を検出することによって、プローブとハイブリダイズしたmiRNAを検出できる。発現レベルの測定はバンド強度を数値化すればよく、例えば、放射性物質で標識したプローブを使用する場合はオートラジオグラフィー等の手法により行えばよい。   Northern blots can be performed by techniques well known in the art. Specifically, RNA extracted from a biological sample is fractionated by gel electrophoresis and transferred to a membrane such as a nitrocellulose membrane or a nylon membrane. The membrane is then incubated in buffer in the presence of the probe. Thereafter, miRNA hybridized with the probe can be detected by detecting the label of the probe. The expression level may be measured by digitizing the band intensity. For example, when a probe labeled with a radioactive substance is used, it may be performed by a technique such as autoradiography.

バイオマーカーの発現レベルの測定は、マイクロアレイ法により行ってもよい。マイクロアレイに用いるプローブは、検出対象であるバイオマーカー(miR−214、miR−126)とストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能な、上記したようなものである。同一の検出対象に対してハイブリダイズする複数のプローブを、同一のアレイに別々のスポットとして配置してもよい。   The expression level of the biomarker may be measured by a microarray method. The probe used for the microarray is as described above, which can hybridize with the biomarker (miR-214, miR-126) to be detected under stringent conditions. A plurality of probes that hybridize to the same detection target may be arranged as separate spots in the same array.

アレイ技法は公知で、遺伝子発現を解析するために用いられている(Chee,M.et al.(1996)Science,.274,610−613)。例えば、ポリL−リジン等による表面処理がなされたガラス、プラスチック、ポリマー、ラテックス、金属などの基材に、上記のプローブが位置指定可能に配置される。プローブの配置は、スポッターやアレイヤーによってプローブを付着させてもよく、または、光リソグラフィーやインクジェットプリント等の手段により基材上でプローブを合成してもよい。   Array techniques are known and have been used to analyze gene expression (Chee, M. et al. (1996) Science, .274, 610-613). For example, the probe described above is disposed on a base material such as glass, plastic, polymer, latex, or metal that has been surface-treated with poly-L-lysine or the like so that the position can be specified. As for the arrangement of the probes, the probes may be attached by a spotter or an arrayer, or the probes may be synthesized on the substrate by means such as photolithography or inkjet printing.

本発明にかかる評価方法では、以上により測定した生体試料におけるバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルを、基準値と比較する。   In the evaluation method according to the present invention, the expression level of the biomarker (miR-214, miR-126) in the biological sample measured as described above is compared with a reference value.

ある実施形態では、基準値は、健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルである。当該基準値は、複数(例えば、5〜1000個体)の健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルの平均値または中央値であり得る。この場合、バイオマーカー発現レベルが、基準値以下のときは血管病変を有しない指標であるとし、基準値を超えるときは血管病変を有する指標であるとすることができ、基準値は健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルである。さらなる実施形態では、基準値は、健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベル(または、複数(例えば、5〜1000個体)の健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルの平均値または中央値)を1.2倍(あるいは、1.5倍)した値である。   In certain embodiments, the reference value is a biomarker expression level in a biological sample isolated from a healthy individual. The reference value may be an average value or a median value of biomarker expression levels in a biological sample separated from a plurality (for example, 5 to 1000) of healthy individuals. In this case, when the biomarker expression level is lower than the reference value, it can be considered as an index having no vascular lesion, and when it exceeds the reference value, it can be considered as an index having vascular lesion. The reference value is a healthy individual. It is a biomarker expression level in the biological sample isolate | separated from. In a further embodiment, the reference value is a biomarker expression level in a biological sample separated from healthy individuals (or a biomarker expression level in a biological sample separated from multiple (eg, 5-1000 individuals) healthy individuals. (Average value or median value) is 1.2 times (or 1.5 times).

ある実施形態では、基準値は、同一の被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルであり得る。例えば、血管病変を罹患した被験者において、治療的処置(例えば、投薬、外科的処置)前における生体試料中のバイオマーカー発現レベルを基準値として、治療的処置(例えば、投薬、外科的処置)を施した後の同一被験者について、本発明により血管病変の検出を行ってもよい。この場合、治療的処置後の被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルが、基準値未満のときは血管病変を有しない指標であるとし、基準値以上のときは血管病変を有する指標であるとし、基準値は治療的処置前における同一被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルである。別の実施形態では、基準値は、同一の被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを0.8倍(あるいは、0.6倍)した値である。医学的に適切な治療的処置は、当業者において適宜選択され、公知である。バイオマーカー発現レベルは被験者における血管病変を評価する指標となるため、本発明の一実施形態では、被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、およびバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、バイオマーカーがmiR−214およびmiR−126からなる群から選択される、被験者における血管病変のデータ取得方法が提供される。別の実施形態では、血管病変患者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、およびバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、バイオマーカーがmiR−214およびmiR−126からなる群から選択される、血管病変患者の治療を管理する方法が提供される。   In certain embodiments, the reference value may be a biomarker expression level in a biological sample separated from the same subject. For example, in a subject suffering from a vascular lesion, the therapeutic treatment (eg, medication, surgical treatment) is performed using the biomarker expression level in the biological sample before the therapeutic treatment (eg, medication, surgical treatment) as a reference value. With respect to the same subject after application, detection of a vascular lesion may be performed according to the present invention. In this case, when the biomarker expression level in the biological sample separated from the subject after the therapeutic treatment is less than the reference value, it is an index that does not have vascular lesions, and when the biomarker expression level is greater than or equal to the reference value, it is an index that has vascular lesions. As such, the reference value is the biomarker expression level in a biological sample separated from the same subject prior to therapeutic treatment. In another embodiment, the reference value is a value obtained by multiplying the biomarker expression level in a biological sample separated from the same subject by 0.8 (or 0.6). Medically appropriate therapeutic treatment is appropriately selected and known by those skilled in the art. Since the biomarker expression level serves as an index for evaluating vascular lesions in a subject, in one embodiment of the present invention, the biomarker expression level in a biological sample separated from the subject is measured, and the biomarker expression level is a reference value. And a method for acquiring data of vascular lesions in a subject, wherein the biomarker is selected from the group consisting of miR-214 and miR-126. In another embodiment, the method comprises measuring a biomarker expression level in a biological sample isolated from a vascular lesion patient, and comparing the biomarker expression level to a reference value, wherein the biomarkers are miR-214 and miR-126. A method of managing treatment of a vascular lesion patient selected from the group consisting of:

本発明においては、miR−214およびmiR−126からなる群から選択されるバイオマーカーの少なくとも一方について測定した発現レベルを基準値と比較することにより血管病変の評価を行ってもよいが、miR−214およびmiR−126の両者について測定した発現レベルをそれぞれ基準値と比較することにより血管病変の評価を行うことが、特異性および感度が顕著であるという観点から好ましい。このとき、miR−214およびmiR−126の少なくとも一方の発現レベルが基準値以下(または、基準値未満)の場合は血管病変を有しない指標であるとし、miR−214およびmiR−126の発現レベルがともに基準値を超える(または、基準値以上の)場合は血管病変を有する指標であることができる。これにより、バイオマーカーとしての特異性が高くなる。あるいは、miR−214およびmiR−126の発現レベルがともに基準値以下(または、基準値未満)の場合は血管病変を有しない指標であるとし、miR−214およびmiR−126の少なくとも一方の発現レベルが基準値を超える(または、基準値以上の)場合は血管病変を有する指標であることができる。これにより、バイオマーカーとしての検出感度が高くなる。あるいは、miR−214およびmiR−126の発現レベルがともに基準値以下(または、基準値以上の)の場合を病態レベル1(健常)、miR−214およびmiR−126の少なくとも一方の発現レベルが基準値を超える(または、基準値以上の)場合をレベル2、ならびにmiR−214およびmiR−126の発現レベルがともに基準値を超える(または、基準値以上の)場合をレベル3として、血管病変の病態を段階的に評価するために使用することもできる。以上の判断手法は、評価の目的に応じて選択して使用することができる。   In the present invention, vascular lesions may be evaluated by comparing the expression level measured for at least one of the biomarkers selected from the group consisting of miR-214 and miR-126 with a reference value. It is preferable to evaluate the vascular lesion by comparing the expression levels measured for both 214 and miR-126 with reference values, respectively, from the viewpoint of remarkable specificity and sensitivity. At this time, if the expression level of at least one of miR-214 and miR-126 is lower than or equal to the reference value (or less than the reference value), it is assumed that the index has no vascular lesion, and the expression level of miR-214 and miR-126 Can exceed the reference value (or more than the reference value), it can be an indicator having a vascular lesion. Thereby, the specificity as a biomarker becomes high. Alternatively, when the expression levels of miR-214 and miR-126 are both lower than or equal to the reference value (or less than the reference value), the expression level is not an vascular lesion, and the expression level of at least one of miR-214 and miR-126 Can be an indicator having a vascular lesion. Thereby, the detection sensitivity as a biomarker becomes high. Alternatively, when the expression levels of miR-214 and miR-126 are both lower than the reference value (or higher than the reference value), pathological condition level 1 (healthy), and the expression level of at least one of miR-214 and miR-126 is the reference If the value exceeds (or exceeds the reference value) level 2, and if the expression levels of miR-214 and miR-126 both exceed the reference value (or above the reference value), level 3 It can also be used to assess the disease state in stages. The above judgment methods can be selected and used according to the purpose of evaluation.

本発明の一実施形態では、上記のバイオマーカーの測定値を補正するため、バイオマーカー発現レベルの測定に用いる同一生体試料中の内在性コントロール発現レベルをさらに測定してもよい。すなわち、本発明の一実施形態では、生体試料中の内在性コントロール発現レベルを測定すること、および内在性コントロール発現レベルにより補正したバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含む。内在性コントロール発現レベルにより補正したバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することで、より信頼性の高い評価を行うことができる。内在性コントロールの発現レベルは、上記のバイオマーカー発現レベルと同一の方法により測定することができる。なお、本実施形態では、基準値として用いられる発現レベルも、同様にして内在性コントロール発現レベルにより補正した値である。   In one embodiment of the present invention, in order to correct the measurement value of the biomarker, the endogenous control expression level in the same biological sample used for measurement of the biomarker expression level may be further measured. That is, one embodiment of the present invention includes measuring the endogenous control expression level in the biological sample, and comparing the biomarker expression level corrected by the endogenous control expression level with a reference value. By comparing the biomarker expression level corrected by the endogenous control expression level with a reference value, more reliable evaluation can be performed. The expression level of the endogenous control can be measured by the same method as the above-described biomarker expression level. In the present embodiment, the expression level used as the reference value is also a value corrected in the same manner by the endogenous control expression level.

内在性コントロールとしては、β−アクチン、GAPDH(グリセルアルデヒド3リン酸デヒドロゲナーゼ)、HPRT1(ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ1)、5S rRNA等のハウスキーピング遺伝子を用いてもよいが、測定試料の調製が容易であるという観点から、好ましくは、let−7a、miR−16、RNU48、U6、U47、RNU6B、snoRNA202、snoRNA234、RNU24、RNU38B、またはZ30等の低分子RNAまたはそのcDNAである。これらの内在性コントロールは、測定される生体試料によって適宜選択され得る。   As an endogenous control, housekeeping genes such as β-actin, GAPDH (glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase), HPRT1 (hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1), and 5S rRNA may be used. From the viewpoint of ease, it is preferably a small RNA such as let-7a, miR-16, RNU48, U6, U47, RNU6B, snoRNA202, snoRNA234, RNU24, RNU38B, or Z30, or a cDNA thereof. These endogenous controls can be appropriately selected depending on the biological sample to be measured.

内在性コントロール発現レベルによりバイオマーカー発現レベルを補正するためには、検出されたバイオマーカーの測定値を、検出された内在性コントロールの測定値で除し、算出された値をバイオマーカー発現レベルとして用いればよい。   In order to correct the biomarker expression level by the endogenous control expression level, the measured value of the detected biomarker is divided by the measured value of the detected endogenous control, and the calculated value is used as the biomarker expression level. Use it.

本発明の第2の形態は、miR−214およびmiR−126からなる群から選択されるバイオマーカーの検出物質を含む、血管病変評価用キットに関する。本発明によれば、特異的且つ高感度に血管病変を検出できる。   The second aspect of the present invention relates to a vascular lesion evaluation kit comprising a biomarker detection substance selected from the group consisting of miR-214 and miR-126. According to the present invention, a vascular lesion can be detected specifically and with high sensitivity.

本発明に用いられる「バイオマーカーの検出物質」は、核酸増幅法、ノーザンブロット法、およびマイクロアレイ法等のmiRNAの発現レベルの測定に用いられる検出物質であり、例えば、上記のような核酸増幅用プライマー、およびプローブが例示できる。当該キットは、miR−214およびmiR−126からなる群から選択される少なくとも一方のバイオマーカーについての検出物質を含む。好ましくは、上記のようにmiR−214およびmiR−126の両者の発現レベルを測定することによりバイオマーカーとしての特異性および感度を顕著に向上できることから、キットは、バイオマーカーの検出物質として、miR−214検出物質およびmiR−126検出物質を含む。より好ましくは、本発明にかかるキットは、上記の内在性コントロール検出物質をさらに含む。   The “biomarker detection substance” used in the present invention is a detection substance used for measuring the expression level of miRNA, such as nucleic acid amplification method, Northern blotting method, and microarray method. Primers and probes can be exemplified. The kit includes a detection substance for at least one biomarker selected from the group consisting of miR-214 and miR-126. Preferably, since the specificity and sensitivity as a biomarker can be significantly improved by measuring the expression levels of both miR-214 and miR-126 as described above, the kit can be used as a biomarker detection substance. -214 detection material and miR-126 detection material. More preferably, the kit according to the present invention further includes the above-described endogenous control detection substance.

キットの形態は乾燥状態でもよく、検出物質が溶液に溶解された状態でもよい。あるいは、マイクロアレイの基材、マイクロタイタープレート、または樹脂もしくは金属製のビーズ等を担体として、当該担体に検出物質が固定化された状態でもよい。また、キットは、上記の検出物質に加えて、逆転写酵素、DNAポリメラーゼ(例えば、Taqポリメラーゼ)、dNTP、オリゴdTプライマー、ランダムプライマー、RNase阻害剤、RNaseH、標識化物質、緩衝液等を含めて測定用キットにすることもできる。さらに、本発明の評価方法を実行するために使用できる各種機器や、使用説明書を含んでもよい。   The kit may be in a dry state or a detection substance dissolved in a solution. Alternatively, the detection substance may be immobilized on the carrier using a microarray substrate, a microtiter plate, or resin or metal beads as a carrier. In addition to the above detection substances, the kit includes reverse transcriptase, DNA polymerase (eg, Taq polymerase), dNTP, oligo dT primer, random primer, RNase inhibitor, RNase H, labeling substance, buffer, and the like. To make a measurement kit. Furthermore, various devices that can be used for executing the evaluation method of the present invention and instructions for use may be included.

本発明の効果を、以下の実施例および比較例を用いて説明する。ただし、本発明の技術的範囲が以下の実施例のみに制限されるわけではない。   The effects of the present invention will be described using the following examples and comparative examples. However, the technical scope of the present invention is not limited only to the following examples.

《実施例1》
イヌ正常血管内皮細胞(CnAOEC細胞)およびイヌ血管肉腫由来培養細胞(Re12細胞、およびUd6細胞)を用いて、培養中に培地に分泌されたバイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(RNU6B)の発現レベルを測定した。
Example 1
Biomarkers (miR-214, miR-126) and endogenous secreted into the culture medium during culture using canine normal vascular endothelial cells (CnAOEC cells) and canine hemangiosarcoma-derived cultured cells (Re12 cells and Ud6 cells) The expression level of the control (RNU6B) was measured.

(細胞培養)
イヌ正常血管内皮細胞(CnAOEC細胞)は、CELL APPLICATIONS社より購入した。
(Cell culture)
Canine normal vascular endothelial cells (CnAOEC cells) were purchased from CELL APPLICATIONS.

イヌ血管肉腫由来培養細胞(Re12細胞、およびUd6細胞)は以下のように調製した。すなわち、血管肉腫に罹患した2個体のイヌから採取した腫瘍細胞を、ヌードマウスの皮下に1×10cell/匹となるように移植した。移植処置から2〜4週間後、形成された腫瘍を摘出し、細胞培養用のフラスコにて10%(v/v)の熱不活化FBS(シグマ−アルドリッチ株式会社)を添加したDME培地中で腫瘍細胞を培養した。その後、腫瘍細胞集団から細胞株のクローニングを行い、2個体からそれぞれ増殖活性の高かった株として、Re12細胞およびUd6細胞を単離した。 Canine hemangiosarcoma-derived cultured cells (Re12 cells and Ud6 cells) were prepared as follows. That is, tumor cells collected from two dogs affected with angiosarcoma were transplanted subcutaneously into nude mice at 1 × 10 6 cells / mouse. Two to four weeks after the transplantation treatment, the formed tumor was removed, and in a DME medium supplemented with 10% (v / v) heat-inactivated FBS (Sigma-Aldrich) in a flask for cell culture. Tumor cells were cultured. Thereafter, cell lines were cloned from the tumor cell population, and Re12 cells and Ud6 cells were isolated from the two individuals as strains having high proliferation activity.

なお、細胞の培養は、37℃のインキュベーター(95%空気/5%CO)内で行った。 The cells were cultured in an incubator at 37 ° C. (95% air / 5% CO 2 ).

(マーカーの測定)
1×10cell/mlの濃度で6ウェルプレートに播種した細胞を、上記条件で48時間培養した。次いで、培養後の培地をすべて回収し、NucleoSpin miRNA(タカラバイオ株式会社)を用いて低分子RNAを回収した。PrimeScript(登録商標)RT reagent kit(タカラバイオ株式会社)を用いて、回収したRNAの逆転写反応を行い、得られたcDNAをバイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(RNU6B;RNA, U6B small nuclear)の発現レベル測定用試料とした。
(Measurement of marker)
Cells seeded in a 6-well plate at a concentration of 1 × 10 6 cells / ml were cultured for 48 hours under the above conditions. Subsequently, all the culture media after culture | cultivation were collect | recovered, and low molecular RNA was collect | recovered using NucleoSpin miRNA (Takara Bio Inc.). Using PrimeScript (registered trademark) RT reagent kit (Takara Bio Inc.), reverse transcription reaction of the recovered RNA was performed, and the obtained cDNA was used as a biomarker (miR-214, miR-126) and endogenous control (RNU6B). RNA, U6B small nucleotide) expression level measurement sample.

バイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(RNU6B)の発現レベル測定は、TaqMan(登録商標)プローブを用いた定量PCR法により行った。具体的には、反応試薬としてPremix EX Taq(Probe qPCR)(タカラバイオ株式会社)を用い、7500リアルタイムPCRシステム(アプライドバイオシステムズ)により測定を行った。また、プライマーセットおよびプローブとして、TaqMan(登録商標)MicroRNA Assays(アプライドバイオシステムズ)を用いた。   The expression levels of biomarkers (miR-214, miR-126) and endogenous control (RNU6B) were measured by quantitative PCR using a TaqMan (registered trademark) probe. Specifically, Premix EX Taq (Probe qPCR) (Takara Bio Inc.) was used as a reaction reagent, and measurement was performed with a 7500 real-time PCR system (Applied Biosystems). Moreover, TaqMan (registered trademark) MicroRNA Assays (Applied Biosystems) was used as a primer set and a probe.

内在性コントロール(RNU6B)発現レベルで補正したバイオマーカー(miR−214、miR−126)発現レベルを、結果を図1に示す。図1に示す通り、正常血管内皮細胞(CnAOEC細胞)と比べて、血管肉腫由来培養細胞ではmiR−214の培地への分泌量が多かった。また、血管肉腫由来培養細胞のうち、Re12細胞は、miR−126の分泌量も多かった。   FIG. 1 shows the biomarker (miR-214, miR-126) expression level corrected with the endogenous control (RNU6B) expression level. As shown in FIG. 1, compared with normal vascular endothelial cells (CnAOEC cells), the amount of miR-214 secreted into the medium was higher in cultured cells derived from angiosarcoma. Of the angiosarcoma-derived cultured cells, Re12 cells also had a large amount of miR-126 secretion.

《実施例2》
イヌの健康群(n=10)、非腫瘍性脾疾患群(n=9)、および血管肉腫罹患群(n=10)から、それぞれ3〜4mlの血液を採血管(エチレンジアミン四酢酸−2ナトリウム処理)に回収した。血液から速やかに血漿を回収し、使用時まで−80℃にて保管した。血漿サンプルからNucleoSpin miRNA(タカラバイオ株式会社)を用いて低分子RNAを回収した。内在性コントロールとしてmiR−16を用いた以外は実施例1と同様の手法により、バイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(miR−16)の発現レベルを測定した。
Example 2
3 to 4 ml of blood was collected from the dog healthy group (n = 10), the non-neoplastic splenic disease group (n = 9), and the angiosarcoma affected group (n = 10), respectively. Recovered). Plasma was quickly collected from the blood and stored at −80 ° C. until use. Low molecular RNA was recovered from the plasma sample using NucleoSpin miRNA (Takara Bio Inc.). The expression levels of the biomarkers (miR-214, miR-126) and the endogenous control (miR-16) were measured by the same method as in Example 1 except that miR-16 was used as the endogenous control.

内在性コントロール(miR−16)発現レベルで補正したバイオマーカー(miR−214、miR−126)発現レベルについての結果を、図2に示す(Control:イヌ健康個体群、NNS:イヌ非腫瘍性脾疾患群、HSA:イヌ血管肉腫罹患群)。図2Aに示す通り、血管肉腫罹患群では、miR−214および/またはmiR−126の血漿中で高い発現レベルを示す個体が多かった。血管肉腫罹患群においては、HSA3のようにmiR−214およびmiR−126の発現レベルがともに高い個体;HSA10のようにmiR−214の発現レベルが高く、miR−126の発現レベルがやや高い個体;HSA9のようにmiR−214の発現レベルが低く、miR−126の発現レベルが高い個体、等が確認された。   The results for the biomarker (miR-214, miR-126) expression level corrected by the endogenous control (miR-16) expression level are shown in FIG. 2 (Control: canine healthy population, NNS: canine non-neoplastic spleen) Disease group, HSA: dog angiosarcoma affected group). As shown in FIG. 2A, in the angiosarcoma affected group, there were many individuals showing high expression levels in plasma of miR-214 and / or miR-126. In an angiosarcoma-affected group, individuals with high miR-214 and miR-126 expression levels such as HSA3; individuals with high miR-214 expression levels and slightly higher miR-126 expression levels, such as HSA10; Individuals with low miR-214 expression level and high miR-126 expression level, such as HSA9, were confirmed.

図2Aの結果について、スティール法により統計解析を行った結果を図2Bに示す(図2B中、「**」は統計的有意差があることを示す。)。図2Bに示す通り、血管肉腫罹患群では、健康群や非腫瘍性脾疾患群と比較して、血漿中でのバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルが上昇していた。   FIG. 2B shows the result of statistical analysis by the Steel method for the result of FIG. 2A (in FIG. 2B, “**” indicates that there is a statistically significant difference). As shown in FIG. 2B, in the angiosarcoma-affected group, the expression level of biomarkers (miR-214, miR-126) in plasma was increased compared to the healthy group and the non-neoplastic splenic disease group.

上記結果を医療統計解析ソフトGraphPad Prism6(グラフパッドソフトウェア社)にて解析した結果を図3A(miR−214)およびB(miR−126)に示す。図3において、縦軸(Sensitivity%)はバイオマーカーとしての感度(値が高いほど、偽陰性を示す確率が低いことを示す)を、横軸(Specificity%)はバイオマーカーとしての特異性(値が高いほど、偽陽性を示す確率が低いことを示す)を示す。図3において、AUC(曲線下面積)が大きいほど、信頼度が高いことを示す。AUC(曲線下面積)は0.9以上であればよいが、特異性および感度の観点から、0.95以上が好ましい(最大値:1.0)。図3に示す通り、miR−214(AUC=0.9)およびmiR−126(AUC=0.94)は、血管病変の検出に利用し得ることが分かる。   3A (miR-214) and B (miR-126) show the results of analyzing the above results using medical statistical analysis software GraphPad Prism 6 (GraphPad Software). In FIG. 3, the vertical axis (Sensitivity%) indicates the sensitivity as a biomarker (the higher the value, the lower the probability of showing false negatives), and the horizontal axis (Specificity%) indicates the specificity (value) as a biomarker. The higher the value, the lower the probability of showing false positives). In FIG. 3, the larger the AUC (area under the curve), the higher the reliability. AUC (area under the curve) may be 0.9 or more, but 0.95 or more is preferable from the viewpoint of specificity and sensitivity (maximum value: 1.0). As shown in FIG. 3, it can be seen that miR-214 (AUC = 0.9) and miR-126 (AUC = 0.94) can be used for detection of vascular lesions.

内在性コントロール(miR−16)発現レベルで補正したmiR−214発現レベルを横軸に、内在性コントロール(miR−16)発現レベルで補正したmiR−126発現レベルを縦軸にプロットした結果を図4に示す。図4に示す通り、血管肉腫罹患群の個体では、miR−214およびmiR−126の少なくとも一方について、発現量が多くなる傾向にあった。さらに、miR−214およびmiR−126の両者を組み合わせてバイオマーカーとした場合について、医療統計解析ソフトGraphPad Prism6(グラフパッドソフトウェア社)にて解析した結果を図5に示す。図5に示す通り、miR−214およびmiR−126の両者を組み合わせることにより、miR−214およびmiR−126をそれぞれ単独でバイオマーカーとして用いた場合と比べて、特異性および感度において一層優れた血管病変バイオマーカーとなる(AUC=0.97)ことが分かる。   The result of plotting the miR-214 expression level corrected by the endogenous control (miR-16) expression level on the horizontal axis and the miR-126 expression level corrected by the endogenous control (miR-16) expression level on the vertical axis is shown in FIG. 4 shows. As shown in FIG. 4, in the angiosarcoma affected group individuals, the expression level of at least one of miR-214 and miR-126 tended to increase. Furthermore, FIG. 5 shows the results of analysis using medical statistical analysis software GraphPad Prism 6 (GraphPad Software Co., Ltd.) for the case where both miR-214 and miR-126 are combined into a biomarker. As shown in FIG. 5, by combining both miR-214 and miR-126, blood vessels with superior specificity and sensitivity compared to the case where miR-214 and miR-126 are each used alone as a biomarker. It turns out that it becomes a lesion biomarker (AUC = 0.97).

《実施例3》
実施例2で用いた血管肉腫罹患群のうち3個体について、腫瘍摘出手術を行った。腫瘍摘出手術前後における血漿中のバイオマーカーの発現レベルを測定した。具体的には、血管肉腫罹患個体であるHSA3、HSA6およびHSA8から、手術当日を0日目として、初診時から術前日までに採血した。それぞれの個体から腫瘍摘出手術を行い、20日目(HSA3)、21日目(HSA6)または15日目(HSA8)に再度採血した。回収した血液から血漿を調製し、上記と同様の手法によりバイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(miR−16)の発現レベルを測定した。
Example 3
Tumor excision surgery was performed on 3 individuals of the angiosarcoma affected group used in Example 2. The expression level of the biomarker in plasma before and after the tumor removal operation was measured. Specifically, blood was collected from HSA3, HSA6, and HSA8, which are affected by hemangiosarcoma, from the first visit to the day before surgery on the day of surgery as day 0. Tumor removal surgery was performed from each individual, and blood was collected again on day 20 (HSA3), day 21 (HSA6), or day 15 (HSA8). Plasma was prepared from the collected blood, and the expression levels of biomarkers (miR-214, miR-126) and endogenous control (miR-16) were measured in the same manner as described above.

腫瘍摘出手術前後での、血漿中の内在性コントロール(miR−16)発現レベルで補正したバイオマーカー(miR−214、miR−126)発現レベルを、図6に示す(図6A:miR−214、 図6B:miR−126、縦軸は対数表示)。なお、図6において、「FC」の下の数値はFold−Change(倍率変化;手術前における発現レベルを1としたときの、手術後における発現レベル)を意味する。また、図6中、「**」は統計的有意差があることを示す。   The biomarker (miR-214, miR-126) expression level corrected with the endogenous control (miR-16) expression level in plasma before and after tumor excision surgery is shown in FIG. 6 (FIG. 6A: miR-214, FIG. 6B: miR-126, vertical axis is logarithmic display). In FIG. 6, the numerical value under “FC” means Fold-Change (magnification change; expression level after surgery when the expression level before surgery is 1). In FIG. 6, “**” indicates that there is a statistically significant difference.

図6に示す通り、HSA3およびHSA6については、血漿中のバイオマーカー(miR−214、miR−126)の発現レベルが低下していた。一方、HSA8についてはmiR−126の発現レベルに低下傾向が認められるものの、miR−214はほとんど変動が認められなかった。したがって、血管病変のバイオマーカーとしてmiR−214およびmiR−126の両者について発現レベルを測定することで、より高感度な血管病変の評価が可能であることが分かる。   As shown in FIG. 6, for HSA3 and HSA6, the expression level of plasma biomarkers (miR-214, miR-126) was decreased. On the other hand, with respect to HSA8, although a decreasing tendency was observed in the expression level of miR-126, miR-214 hardly changed. Therefore, it can be seen that by measuring the expression levels of both miR-214 and miR-126 as biomarkers of vascular lesions, it is possible to evaluate vascular lesions with higher sensitivity.

《実施例4》
ヒト血管内皮細胞(HMEC1細胞)およびヒト血管肉腫由来培養細胞(ISO−HAS細胞、およびHAMON細胞)を用いて、培養中に培地に分泌されたバイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(miR−16)の発現レベルを測定した。
Example 4
Biomarkers (miR-214, miR-126) and endogenous secreted into the culture medium using human vascular endothelial cells (HMEC1 cells) and human hemangiosarcoma-derived cultured cells (ISO-HAS cells and HAMON cells) The expression level of the sex control (miR-16) was measured.

(細胞培養)
HMEC1細胞(ヒト血管内皮細胞)は、MCDB131培地(10ng/ml EGF、1μg/mlハイドロコルチゾン、10mMグルタミン、10%(v/v)ウシ胎児血清を含む)にて培養した。ISO−HAS細胞(ヒト血管肉腫由来培養細胞、International Journal of Cancer (1999),81(2)305〜308参照)は、DME培地(15%(v/v)ウシ胎児血清、50%(v/v)ISOS−1細胞培養上清(15%(v/v)ウシ胎児血清を含むDME培地でISOS−1細胞を3〜4日培養し、0.22μmフィルタでろ過して回収)を含む)にて培養した。HAMON細胞(ヒト血管肉腫由来培養細胞、Journal of Dermatological Science (2013),70(2),116〜122参照)は、DME培地(牛胎児血清10%を含む)にて培養した。
(Cell culture)
HMEC1 cells (human vascular endothelial cells) were cultured in MCDB131 medium (containing 10 ng / ml EGF, 1 μg / ml hydrocortisone, 10 mM glutamine, 10% (v / v) fetal bovine serum). ISO-HAS cells (cultured cells derived from human hemangiosarcoma, see International Journal of Cancer (1999), 81 (2) 305-308) are composed of DME medium (15% (v / v) fetal bovine serum, 50% (v / v v) ISOS-1 cell culture supernatant (including ISOS-1 cells cultured in DME medium containing 15% (v / v) fetal bovine serum for 3-4 days and collected by filtration through a 0.22 μm filter) Incubated in HAMON cells (human hemangiosarcoma-derived cultured cells, see Journal of Dermatological Science (2013), 70 (2), 116-122) were cultured in DME medium (containing 10% fetal bovine serum).

(マーカーの測定)
1〜2×10cell/mlの濃度で6ウェルプレートに播種した細胞を、37℃のインキュベーター(95%空気/5%CO)内で48時間培養した。培養後の培地を回収し、以下のプライマーおよびプローブを用いて実施例1、2に準じてバイオマーカー(miR−214、miR−126)および内在性コントロール(miR−16)の発現レベルを測定した。
(Measurement of marker)
Cells seeded in a 6-well plate at a concentration of 1-2 × 10 5 cells / ml were cultured for 48 hours in a 37 ° C. incubator (95% air / 5% CO 2 ). The cultured medium was collected, and the expression levels of biomarkers (miR-214, miR-126) and endogenous control (miR-16) were measured according to Examples 1 and 2 using the following primers and probes. .

内在性コントロール(miR−16)発現レベルで補正したバイオマーカー(miR−214、miR−126)発現レベルを、結果を図7に示す。図7に示す通り、ヒト血管内皮細胞(HMEC1細胞)と比べて、ヒト血管肉腫由来培養細胞はmiR−214の培地への分泌が多かった。また、血管肉腫由来培養細胞のうち、HAMON細胞は、miR−126の分泌量も多かった。   The biomarker (miR-214, miR-126) expression level corrected by the endogenous control (miR-16) expression level is shown in FIG. As shown in FIG. 7, compared to human vascular endothelial cells (HMEC1 cells), human hemangiosarcoma-derived cultured cells secreted more miR-214 into the medium. Among the angiosarcoma-derived cultured cells, HAMON cells also had a large amount of miR-126 secretion.

Claims (8)

被験者における血管病変の評価方法であって、
前記被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、および
前記バイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、
前記バイオマーカー発現レベルが、前記基準値以下の場合は血管病変を有しない指標であるとし、前記基準値を超える場合は血管病変を有する指標であるとし、前記基準値は健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルであり、
前記血管病変が、血管肉腫であり、
前記バイオマーカーが、miR−214およびmiR−126からなる群から選択される、血管病変の評価方法。
A method for evaluating a vascular lesion in a subject,
Measuring a biomarker expression level in a biological sample separated from the subject, and comparing the biomarker expression level to a reference value,
When the biomarker expression level is equal to or lower than the reference value, it is an index that does not have a vascular lesion, and when it exceeds the reference value, it is an index that has a vascular lesion, and the reference value is separated from a healthy individual The level of biomarker expression in the biological sample,
The vascular lesion is an angiosarcoma;
The method for evaluating a vascular lesion, wherein the biomarker is selected from the group consisting of miR-214 and miR-126.
被験者における血管病変の評価方法であって、A method for evaluating a vascular lesion in a subject,
前記被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、およびMeasuring a biomarker expression level in a biological sample separated from the subject; and
前記バイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、Comparing the biomarker expression level to a reference value,
治療的処置後の前記被験者から分離した生体試料中の前記バイオマーカー発現レベルが、前記基準値未満のときは血管病変を有しない指標であるとし、前記基準値以上のときは血管病変を有する指標であるとし、前記基準値は当該治療的処置前における同一被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルであり、When the expression level of the biomarker in the biological sample separated from the subject after the therapeutic treatment is less than the reference value, it is an index that does not have a vascular lesion, and when it is equal to or higher than the reference value, the index that has a vascular lesion And the reference value is a biomarker expression level in a biological sample separated from the same subject prior to the therapeutic treatment,
前記血管病変が、血管肉腫であり、The vascular lesion is an angiosarcoma;
前記バイオマーカーが、miR−214およびmiR−126からなる群から選択される、血管病変の評価方法。The method for evaluating a vascular lesion, wherein the biomarker is selected from the group consisting of miR-214 and miR-126.
前記バイオマーカーとして、miR−214およびmiR−126の発現レベルを測定する、請求項1または2に記載の血管病変の評価方法。 The evaluation method of the vascular lesion of Claim 1 or 2 which measures the expression level of miR-214 and miR-126 as said biomarker. 前記発現レベルの測定が、核酸増幅法、マイクロアレイ法、またはノーザンブロット法により行われる、請求項1〜のいずれか1項に記載の血管病変の評価方法。 The method for evaluating a vascular lesion according to any one of claims 1 to 3 , wherein the expression level is measured by a nucleic acid amplification method, a microarray method, or a Northern blot method. 前記生体試料中の内在性コントロール発現レベルを測定すること、および
当該内在性コントロール発現レベルにより補正した前記バイオマーカー発現レベルを前記基準値と比較する、請求項1〜のいずれか1項に記載の血管病変の評価方法。
Measuring the endogenous control expression level in the biological sample, and the biomarker expression level has been corrected by the endogenous control expression level is compared with the reference value, according to any one of claims 1-4 Method for evaluating vascular lesions.
前記生体試料が、血液、血漿、および血清からなる群から選択される、請求項1〜のいずれか1項に記載の血管病変の評価方法。 The method for evaluating a vascular lesion according to any one of claims 1 to 5 , wherein the biological sample is selected from the group consisting of blood, plasma, and serum. miR−214およびmiR−126であるバイオマーカーの検出物質を含む、血管肉腫評価用キット。 An angiosarcoma evaluation kit comprising a biomarker detection substance that is miR-214 and miR-126. 前記検出物質が、核酸増幅用プライマー、またはプローブである、請求項に記載の血管肉腫評価用キット。 The kit for angiosarcoma evaluation according to claim 7 , wherein the detection substance is a primer for nucleic acid amplification or a probe.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2010529966A (en) * 2007-06-08 2010-09-02 アシュラジェン インコーポレイテッド Genes and pathways regulated by miR-34 as targets for therapeutic intervention
US8071562B2 (en) * 2007-12-01 2011-12-06 Mirna Therapeutics, Inc. MiR-124 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
US20110086348A1 (en) * 2009-02-19 2011-04-14 The Cleveland Clinic Foundation Method for assessing heart disease
GB201101400D0 (en) * 2011-01-26 2011-03-09 King S College London Detection method
JP2014082953A (en) * 2012-10-19 2014-05-12 Rakuno Gakuen Cancer detection method, cancer detection kit, method for screening for therapeutic agent for cancer, and therapeutic agent for cancer

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