JP6559353B2 - 自動核セグメンテーション - Google Patents
自動核セグメンテーション Download PDFInfo
- Publication number
- JP6559353B2 JP6559353B2 JP2018531090A JP2018531090A JP6559353B2 JP 6559353 B2 JP6559353 B2 JP 6559353B2 JP 2018531090 A JP2018531090 A JP 2018531090A JP 2018531090 A JP2018531090 A JP 2018531090A JP 6559353 B2 JP6559353 B2 JP 6559353B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- local
- superpixel
- superpixels
- global
- score
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 230000011218 segmentation Effects 0.000 title description 28
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 71
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 claims description 6
- 230000015654 memory Effects 0.000 description 37
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 33
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 33
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 25
- 230000006870 function Effects 0.000 description 15
- 238000010801 machine learning Methods 0.000 description 12
- PCTMTFRHKVHKIS-BMFZQQSSSA-N (1s,3r,4e,6e,8e,10e,12e,14e,16e,18s,19r,20r,21s,25r,27r,30r,31r,33s,35r,37s,38r)-3-[(2r,3s,4s,5s,6r)-4-amino-3,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-19,25,27,30,31,33,35,37-octahydroxy-18,20,21-trimethyl-23-oxo-22,39-dioxabicyclo[33.3.1]nonatriaconta-4,6,8,10 Chemical compound C1C=C2C[C@@H](OS(O)(=O)=O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2.O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 PCTMTFRHKVHKIS-BMFZQQSSSA-N 0.000 description 11
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 10
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 8
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 8
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 5
- 230000005236 sound signal Effects 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 4
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 4
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 208000024191 minimally invasive lung adenocarcinoma Diseases 0.000 description 3
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 3
- 239000004065 semiconductor Substances 0.000 description 3
- 238000012549 training Methods 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 238000000224 chemical solution deposition Methods 0.000 description 2
- 238000013500 data storage Methods 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 2
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 2
- 238000002922 simulated annealing Methods 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 238000003491 array Methods 0.000 description 1
- 238000013473 artificial intelligence Methods 0.000 description 1
- 238000013528 artificial neural network Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005286 illumination Methods 0.000 description 1
- 230000010365 information processing Effects 0.000 description 1
- 239000004973 liquid crystal related substance Substances 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 238000003909 pattern recognition Methods 0.000 description 1
- 238000007637 random forest analysis Methods 0.000 description 1
- 238000011524 similarity measure Methods 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 238000012706 support-vector machine Methods 0.000 description 1
- 230000001360 synchronised effect Effects 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/10—Segmentation; Edge detection
- G06T7/11—Region-based segmentation
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F18/00—Pattern recognition
- G06F18/20—Analysing
- G06F18/23—Clustering techniques
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/60—Analysis of geometric attributes
- G06T7/62—Analysis of geometric attributes of area, perimeter, diameter or volume
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V10/00—Arrangements for image or video recognition or understanding
- G06V10/70—Arrangements for image or video recognition or understanding using pattern recognition or machine learning
- G06V10/762—Arrangements for image or video recognition or understanding using pattern recognition or machine learning using clustering, e.g. of similar faces in social networks
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
- G06V20/695—Preprocessing, e.g. image segmentation
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
- G16B40/20—Supervised data analysis
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
- G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
- G06T2207/30004—Biomedical image processing
- G06T2207/30024—Cell structures in vitro; Tissue sections in vitro
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V10/00—Arrangements for image or video recognition or understanding
- G06V10/70—Arrangements for image or video recognition or understanding using pattern recognition or machine learning
- G06V10/74—Image or video pattern matching; Proximity measures in feature spaces
- G06V10/75—Organisation of the matching processes, e.g. simultaneous or sequential comparisons of image or video features; Coarse-fine approaches, e.g. multi-scale approaches; using context analysis; Selection of dictionaries
- G06V10/759—Region-based matching
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Evolutionary Computation (AREA)
- Artificial Intelligence (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Software Systems (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Computing Systems (AREA)
- Geometry (AREA)
- Image Analysis (AREA)
Description
本出願は、2015年12月15日出願の米国仮特許出願番号第62/267,775号「Automatic Nuclear Segmentation」の優先権を主張し、その全体を参照により本明細書に組み込む。
・「Quick shift and kernel methods for mode seeking」Vedaldi et al.著、Lecture Notes in Computer Science(サブシリーズのLecture Notes Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformaticsを含む)、vol.5305 LNCS,no.PART4,pp.705−718(2008)に記載されたQuick Shift、その内容を参照により本明細書に組み込む。
・「SEEDS:Superpixels Extracted via Energy−Driven Sampling」Van Den Bergh et al.著(2013)に記載されたSuperpixels Extracted via Energy−Driven Sampling(SEEDS)、その内容を参照により本明細書に組み込む。
・「SLIC Superpixels compared to state−of−the−art Superpixel methods」Achanta et al.著、IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence,vol.34,no.11,pp.2274−81(2012)に記載されたSimple Linear Iterative Clustering(SLIC)Superpixels、その内容を参照により本明細書に組み込む。
自動核セグメンテーションのプロセスの実施形態を詳細に記載する。記載のプロセスは、1つまたは複数のハードウェアプロセッサによって実行される1つまたは複数のソフトウェアモジュールで実現されてよいことは理解されたい。記載のプロセスは、ソースコード、オブジェクトコード、および/または、機械コードで表された命令として実施されてよい。これらの命令は、ハードウェアプロセッサ(複数可)によって直接、実行されてもよく、あるいは、オブジェクトコードとハードウェアプロセッサ(複数可)との間で動作する仮想マシンによって実行されてもよい。
ステップ120において、デジタル画像のスーパーピクセルが生成される。ある実施形態においては、デジタル画像の各ピクセルは、スーパーピクセルに割り当てられる。スーパーピクセルは、上記のように、オーバーセグメンテーションのために構成されたQuick Shiftアルゴリズム、SEEDSアルゴリズム、SLICスーパーピクセルアルゴリズム、または、流域アルゴリズムを用いて生成されてよい。しかしながら、核セグメンテーションの好ましい実施形態において、スーパーピクセルは、曲率セグメンテーション技術を用いて生成される。曲率セグメンテーション技術は、核セグメンテーションに適切な種類のスーパーピクセルを生成する傾向がある。
I(x,y)は、平滑化された画像の座標x,yの強度値である。画像の高い正曲率のエリアを使用して、スーパーピクセルの境界を示す。これらの境界は、オブジェクト(例えば、核)と背景のオーバーセグメンテーションとを規定する。
ある実施形態においては、機械学習アルゴリズムは、スーパーピクセルの特定の組み合わせが、関心オブジェクト(例えば、細胞核)を表していそうか否かを予測するように訓練されてよい。機械学習アルゴリズムは、注釈付きテスト画像セットを用いて訓練されてよい。例えば、専門家は、テスト画像セットにおいて、画像セットに注釈を加えることによって、例えば、セットの各テスト画像の各オブジェクトの輪郭を描くことによって、または、他の方法で各オブジェクトを画定することによって、オブジェクト(例えば、核)を識別してよい。核セグメンテーションのために設計された実施形態において、テスト画像セットは、ある濃度範囲(すなわち、複数の濃度)と、ある光学倍率範囲(すなわち、複数の光学倍率)と、で撮像された異なる種類の核(例えば、蛍光標識された核)を含んでよい。
C=e−d
と定義されてよく、ここで、dは、凸欠陥の数である。
凸欠陥は、局所的組み合わせとその凸包との間の偏差として計算されてよい。偏心度は、
Q=4πA/p2
として定義されてよく、ここで、Aは、局所的組み合わせの面積であり、Pは、その外周である。鈍角割合は、局所的組み合わせの全ての角に対する鈍角の割合として計算されてよい。凸度は、その局所的組み合わせの面積の、凸包の面積に対する割合として定義されてよい。直角度は、
S=A/D2
として計算されてよく、ここで、Aは、局所的組み合わせの面積であり、Dは、局所的組み合わせを囲む境界ボックスの最長寸法である。7つの不変Huモーメントは、ある実施形態において、「Visual pattern recognition by moment invariants」Hu著、IRE Transactions on Information Theory(1962),pp.179−87に記載のように計算されてよく、その内容を参照により本明細書に組み込む。ある実施形態においては、訓練および予測の前に、特徴の全ては、平均を引き、標準偏差で割ることにより、スケーリング、センタリングされる。
上記のように、ある実施形態においては、各可能な局所的組み合わせに関してステップ160で決定された局所的スコアは、局所的組み合わせが関心オブジェクト(例えば、核)である尤度(例えば、ダイスインデックス等の尤度メトリックに組み合わせ内のスーパーピクセルの数を掛ける)を表す。プロセス100が、ステップ140からステップ170に移る時には、スーパーピクセルのこれらの局所的組み合わせのそれぞれに局所的スコアが割り当てられている。
bij=bmj∀i,m∈combinationj
遺伝的プログラミングまたはシミュレーテッドアニーリング等の他の最適化方法を使用して、大域的セグメンテーションスコアの最大化という同じ目的を達成してよい。
最適大域的スコアを有する大域的集合が一旦、識別されると、大域的集合の各局所的組み合わせは、別個のオブジェクト(例えば、核)と決定されてよい。言い換えると、各局所的組み合わせの外周は、デジタル画像内の個々のオブジェクトの外周を表す。従って、ステップ110で受信されたデジタル画像のオブジェクトは、例えば、一意的ラベルLiを各オブジェクトに割り当てることによって画定されてよい。所与のオブジェクト内の各スーパーピクセルは、同じラベルLiを割り当てられてよく、その結果、スーパーピクセルは、そのスーパーピクセルが表す各オブジェクトに従ってグループ化される。ある実施形態においては、オブジェクト(例えば、核)は、例えば、境界線、ラベル、または、他の注釈を用いて、デジタル画像内で視覚的に区別されてよい。
図5は、本明細書に記載の様々な実施形態と関連して使用し得る有線もしくは無線のシステム500の例を示すブロック図である。例えば、システム500は、図1のプロセス100等、上記プロセスの1つまたは複数として、または、それと共に使用されてよく、図1のプロセス100等、上記プロセスの1つまたは複数を実行するシステムのコンポーネントを表してよい。システム500は、サーバもしくは任意の従来型のパーソナルコンピュータ、または、有線または無線のデータ通信が可能な任意の他のプロセッサ対応装置であってよい。当業者には明らかなように、有線または無線のデータ通信ができない装置を含む他のコンピュータシステムおよび/またはアーキテクチャも使用されてよい。
Claims (16)
- 少なくとも1つのハードウェアプロセッサを用いて、
デジタル画像の複数のスーパーピクセルを決定するステップと、
前記複数のスーパーピクセルのそれぞれに関して、
前記スーパーピクセルから検索半径内に位置する任意のスーパーピクセルを識別するステップと、
前記スーパーピクセルと、前記スーパーピクセルから前記検索半径内に位置する任意の識別されたスーパーピクセルと、の各一意的な局所的組み合わせに関して、前記局所的組み合わせの局所的スコアを決定するステップと、
局所的組み合わせの複数の大域的集合のうち、最適な大域的スコアを有する1つの大域的集合を、前記決定された局所的スコアに基づいて識別するステップと、
を含む方法。 - 前記デジタル画像の前記複数のスーパーピクセルを決定するステップは、
前記デジタル画像を受信するステップと、
前記デジタル画像の複数のピクセルを最初のスーパーピクセル集合に組み合わせるステップと、
前記複数のスーパーピクセルを前記最初のスーパーピクセル集合から決定するステップと、
を含む、
請求項1に記載の方法。 - 前記複数のスーパーピクセルを前記最初のスーパーピクセル集合から決定するステップは、前記複数のスーパーピクセルを前記最初のスーパーピクセル集合から閾値に基づいて選択するステップを含む、
請求項2に記載の方法。 - 局所的組み合わせの前記複数の大域的集合のそれぞれは、前記スーパーピクセルのそれぞれを少なくとも一度含む、
請求項1から3のいずれかに記載の方法。 - 局所的組み合わせの前記複数の大域的集合のそれぞれは、前記スーパーピクセルのそれぞれから一度だけなる、
請求項4に記載の方法。 - 局所的組み合わせの前記複数の大域的集合のうち、最適な大域的スコアを有する1つの大域的集合を識別するステップは、前記複数の大域的集合の各大域的集合内の全ての局所的組み合わせの前記局所的スコアの和を最大にするステップを含む、
請求項1から5のいずれかに記載の方法。 - 前記複数の大域的集合の各大域的集合内の全ての局所的組み合わせの前記局所的スコアの前記和を最大にするステップは、整数計画法によって行われる、
請求項6に記載の方法。 - スーパーピクセルは、少なくとも部分的に前記検索半径内にある時、前記検索半径内に位置する、
請求項1から7のいずれかに記載の方法。 - スーパーピクセルは、全体が前記検索半径内にある時のみ、前記検索半径内に位置する、
請求項1から7のいずれかに記載の方法。 - 各局所的組み合わせに関する前記局所的スコアは、前記局所的組み合わせのダイスインデックスに基づく、
請求項1から9のいずれかに記載の方法。 - 各局所的組み合わせに関する前記局所的スコアは、前記局所的組み合わせの前記ダイスインデックスに前記局所的組み合わせ内のスーパーピクセルの数を掛けたものを含む、
請求項10に記載の方法。 - 各局所的組み合わせの前記局所的スコアは、前記局所的組み合わせが関心オブジェクトを表す尤度を表す、
請求項1から11のいずれかに記載の方法。 - 前記少なくとも1つのハードウェアプロセッサを用いて、ユーザインタフェース内で、前記デジタル画像内の各関心オブジェクトを視覚的に区別することをさらに含む、
請求項12に記載の方法。 - 前記関心オブジェクトは、細胞核である、
請求項12に記載の方法。 - 少なくとも1つのハードウェアプロセッサと、
1つまたは複数のソフトウェアモジュールと、
を含むシステムであって、
前記1つまたは複数のソフトウェアモジュールは、前記少なくとも1つのハードウェアプロセッサによって実行されると、
デジタル画像の複数のスーパーピクセルを決定し、
前記複数のスーパーピクセルのそれぞれに関して、前記スーパーピクセルから検索半径内に位置する任意のスーパーピクセルを識別し、前記スーパーピクセルと、前記スーパーピクセルから前記検索半径内に位置する任意の識別されたスーパーピクセルと、の各一意的な局所的組み合わせに関して、前記局所的組み合わせの局所的スコアを決定し、
局所的組み合わせの複数の大域的集合のうち、最適な大域的スコアを有する1つの大域的集合を、前記決定された局所的スコアに基づいて識別する、
システム。 - 命令を記憶する非一時的コンピュータ可読媒体であって、前記命令は、プロセッサによって実行されると、前記プロセッサに、
デジタル画像の複数のスーパーピクセルを決定させ、
前記複数のスーパーピクセルのそれぞれに関して、
前記スーパーピクセルから検索半径内に位置する任意のスーパーピクセルを識別させ、
前記スーパーピクセルと、前記スーパーピクセルから前記検索半径内に位置する任意の識別されたスーパーピクセルと、の各一意的な局所的組み合わせに関して、
前記局所的組み合わせに関する局所的スコアを決定させ、
局所的組み合わせの複数の大域的集合のうち、最適な大域的スコアを有する1つの大域的集合を、前記決定された局所的スコアに基づいて識別させる、
非一時的コンピュータ可読媒体。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201562267775P | 2015-12-15 | 2015-12-15 | |
US62/267,775 | 2015-12-15 | ||
PCT/US2016/066200 WO2017106106A1 (en) | 2015-12-15 | 2016-12-12 | Automatic nuclear segmentation |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2019502994A JP2019502994A (ja) | 2019-01-31 |
JP6559353B2 true JP6559353B2 (ja) | 2019-08-14 |
Family
ID=59057884
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018531090A Active JP6559353B2 (ja) | 2015-12-15 | 2016-12-12 | 自動核セグメンテーション |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10108779B2 (ja) |
EP (1) | EP3391335A4 (ja) |
JP (1) | JP6559353B2 (ja) |
CN (1) | CN108352069B (ja) |
WO (1) | WO2017106106A1 (ja) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2746152C2 (ru) * | 2016-06-03 | 2021-04-07 | Конинклейке Филипс Н.В. | Обнаружение биологического объекта |
CN111133359B (zh) * | 2017-09-29 | 2022-12-13 | 徕卡生物系统成像股份有限公司 | 二维和三维固定z扫描 |
CN110006420B (zh) * | 2018-05-31 | 2024-04-23 | 上海快仓智能科技有限公司 | 建图方法、图像采集和处理系统和定位方法 |
US10853704B2 (en) * | 2018-12-18 | 2020-12-01 | Clarifai, Inc. | Model-based image labeling and/or segmentation |
Family Cites Families (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA3010836C (en) * | 2010-07-30 | 2020-09-08 | Fundacao D. Anna Sommer Champalimaud E Dr. Carlos Montez Champalimaud | Systems and methods for segmentation and processing of tissue images and feature extraction from same for treating, diagnosing, or predicting medical conditions |
EP2463821A1 (en) * | 2010-12-08 | 2012-06-13 | Alcatel Lucent | Method and system for segmenting an image |
AU2011265383A1 (en) * | 2011-12-20 | 2013-07-04 | Canon Kabushiki Kaisha | Geodesic superpixel segmentation |
US8849050B2 (en) * | 2012-11-08 | 2014-09-30 | Seiko Epson Corporation | Computer vision methods and systems to recognize and locate an object or objects in one or more images |
CN103353938B (zh) * | 2013-06-14 | 2016-04-13 | 山东大学 | 一种基于层次级特征的细胞膜分割方法 |
TWI496112B (zh) * | 2013-09-13 | 2015-08-11 | Univ Nat Cheng Kung | 細胞影像分割方法以及核質比評估方法 |
CN103489187A (zh) * | 2013-09-23 | 2014-01-01 | 华南理工大学 | 基于质量检测的宫颈lct图像中细胞核的分割方法 |
EP2874119A1 (en) * | 2013-11-19 | 2015-05-20 | Thomson Licensing | Method and apparatus for generating superpixels |
US9430830B2 (en) * | 2014-01-30 | 2016-08-30 | Case Western Reserve University | Spatially aware cell cluster (SPACCL) graphs |
CN103927758B (zh) * | 2014-04-30 | 2017-02-15 | 重庆大学 | 一种基于对比度与角点最小凸包的显著性检测方法 |
CN103984958B (zh) * | 2014-05-07 | 2017-11-07 | 深圳大学 | 宫颈癌细胞分割方法及系统 |
CN104063707B (zh) * | 2014-07-14 | 2017-05-24 | 南京原觉信息科技有限公司 | 基于人类视觉多尺度感知特性的彩色图像聚类分割方法 |
EP3178035B1 (en) * | 2014-08-04 | 2020-09-23 | Ventana Medical Systems, Inc. | Image analysis system using context features |
CA2965564C (en) * | 2014-11-10 | 2024-01-02 | Ventana Medical Systems, Inc. | Classifying nuclei in histology images |
CN104766324B (zh) * | 2015-04-08 | 2016-04-13 | 山东大学 | 基于超像素和异常检测的彩色血细胞图像白细胞分割方法 |
-
2016
- 2016-12-12 EP EP16876451.2A patent/EP3391335A4/en not_active Withdrawn
- 2016-12-12 CN CN201680065655.4A patent/CN108352069B/zh active Active
- 2016-12-12 US US15/517,489 patent/US10108779B2/en active Active
- 2016-12-12 JP JP2018531090A patent/JP6559353B2/ja active Active
- 2016-12-12 WO PCT/US2016/066200 patent/WO2017106106A1/en active Application Filing
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN108352069B (zh) | 2022-11-25 |
EP3391335A1 (en) | 2018-10-24 |
JP2019502994A (ja) | 2019-01-31 |
EP3391335A4 (en) | 2019-07-17 |
CN108352069A (zh) | 2018-07-31 |
US10108779B2 (en) | 2018-10-23 |
US20170300617A1 (en) | 2017-10-19 |
WO2017106106A1 (en) | 2017-06-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7384960B2 (ja) | 腫瘍を識別するための畳み込みニューラルネットワークを用いた組織像の処理 | |
US10957079B2 (en) | Systems and methods for automated detection of an indication of malignancy in a mammographic image | |
Nir et al. | Automatic grading of prostate cancer in digitized histopathology images: Learning from multiple experts | |
US11893732B2 (en) | Computer supported review of tumors in histology images and post operative tumor margin assessment | |
Bejnordi et al. | Context-aware stacked convolutional neural networks for classification of breast carcinomas in whole-slide histopathology images | |
Janowczyk et al. | A resolution adaptive deep hierarchical (RADHicaL) learning scheme applied to nuclear segmentation of digital pathology images | |
Wang et al. | Mitosis detection in breast cancer pathology images by combining handcrafted and convolutional neural network features | |
Kothari et al. | Pathology imaging informatics for quantitative analysis of whole-slide images | |
JP6559353B2 (ja) | 自動核セグメンテーション | |
US11682186B2 (en) | Detection of annotated regions of interest in images | |
Salvi et al. | cyto‐Knet: An instance segmentation approach for multiple myeloma plasma cells using conditional kernels | |
RS | CoC-ResNet-classification of colorectal cancer on histopathologic images using residual networks | |
Qin et al. | Computerized delineation of nuclei in liquid‐based pap smears stained with immunohistochemical biomarkers | |
Zhao et al. | Improved nuclear segmentation on histopathology images using a combination of deep learning and active contour model | |
Shete et al. | Breast cancer cell detection using digital image processing | |
Miranda Ruiz | Automatic segmentation of epithelium in cervical whole slide images to assist diagnosis of cervical intraepithelial neoplasia |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20190621 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20190708 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20190716 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6559353 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |