JP6427750B2 - Cxcl1、ならびにsmoxおよび/またはid1の発現量に基づく肺癌患者の予後を判定するためのデータ収集方法およびキット - Google Patents
Cxcl1、ならびにsmoxおよび/またはid1の発現量に基づく肺癌患者の予後を判定するためのデータ収集方法およびキット Download PDFInfo
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(1)肺腺癌患者サンプルにおいて、ケモカイン(C−X−Cモチーフ)リガンド1(CXCL1)、GAPDH、SEPW1、PAK2およびGNG11を含んでなる複数の遺伝子の発現量を測定し、
式1:
を含んでなる、肺腺癌の予後を判定するためのデータを収集する方法。
(2)式2:
(3)発現量が、定量的PCR法により測定される、(1)に記載の方法。
によりハザードが計算され、この数式の各係数はカプランマイヤー法で求めた推定値から求めることができることが周知である。
で表されるリスクスコアが正である場合には、予後が不良であると判定し、負である場合には予後が良好であると判定することができる。一遺伝子で予後を判定する場合には、患者集団の平均値よりもリスクスコアが高い場合には、予後が不良であると判定し、低い場合には、予後が良好であると判定することができる。
本実施例では、予後との関連が疑われた表1に示す38遺伝子を診断マーカーとして用いてその発現量と予後との関係を明らかにした。
本実施例では、実施例1で調べた38遺伝子についてリスクスコアリングモデルを構築した。
によりハザードが計算され、この数式の各係数は実施例1に記載した103症例に関するカプランマイヤー曲線から求めた。
で表されるリスクスコアが大きいときには、予後が不良であることを意味し、リスクスコアが小さいときには、予後が良好であることを意味する。以下の実施例では、リスクスコアが正である場合には予後が不良である可能性が高いと判定し、リスクスコアが負である場合には予後が不良である可能性が低いと判定した。
本実施例では、実施例2で求めたリスクスコアリングモデルを用いて、ステージI、IIおよびIIIの別の肺腺癌患者101例の凍結標本での遺伝子発現プロファイルを求め、予後を判定した。
Claims (3)
- 肺腺癌患者サンプルにおいて、ケモカイン(C−X−Cモチーフ)リガンド1(CXCL1)、GAPDH、SEPW1、PAK2およびGNG11を含んでなる複数の遺伝子の発現量を測定し、
式1:
を含んでなる、肺腺癌の予後を判定するためのデータを収集する方法。 - 式2:
- 発現量が、定量的PCR法により測定される、請求項1に記載の方法。
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