JP6338872B2 - 視神経障害発症リスクの判定方法 - Google Patents
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Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Description
本発明者らは、視神経挫滅(optic nerve crush;ONC)による軸索損傷処理を行った視神経障害モデルマウスから、ONC処理後2日目にRGCを含む網膜を単離し、かかる網膜試料中のmRNAの発現レベルを、次世代シーケンサー(Hiseq2000[Illumina社製])を用いて解析(RNA−Seq)した。その結果、視神経障害との関連が知られている遺伝子よりも、検出感度や特異度が高く、視神経障害発症リスクを判定できる遺伝子を見いだした。さらに、軸索障害によりmRNAの発現レベルの変動が認められた遺伝子群を基に、上流解析を行ったところ、それら遺伝子群の上流で転写制御し、且つ視神経障害発症リスクを判定できる遺伝子(転写因子)を見いだした。本発明はこれらの知見に基づいて完成するに至ったものである。
以下の[a−2グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の減少、
以下の[d−1グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの増加、或いは
以下の[d−2グループ]の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの減少
を検出することを特徴とする視神経障害発症リスクの判定方法に関する。
[a−1グループ]
TMC1、ADM2、MAT1A、DNMT3L、GMFG、TNNC2
[a−2グループ]
TLDC2、TLCD2、SCN4B、ACPT、TNFAIP8L3、SERPINC1
[bグループ]
ATF5、CHAC1、EGR1、TRIB3
[cグループ]
SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、JUN
[d−1グループ]
CREB1、ATF2、HIF1A、EGR1、STAT3、RELA、EP300、RARA、MYOD1
[d−2グループ]
TBX2
[a−1グループ]
TMC1、ADM2、MAT1A、DNMT3L、GMFG、TNNC2
[a−2グループ]
TLDC2、TLCD2、SCN4B、ACPT、TNFAIP8L3、SERPINC1
[bグループ]
ATF5、CHAC1、EGR1、TRIB3
[cグループ]
SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、JUN
このキット発明は、視神経障害発症リスクを判定(診断)するためのキットに関する用途発明であり、このキットには、通常、視神経障害発症リスクを判定するための説明書が含まれる。
[a−1グループ]
TMC1、ADM2、MAT1A、DNMT3L、GMFG、TNNC2
[a−2グループ]
TLDC2、TLCD2、SCN4B、ACPT、TNFAIP8L3、SERPINC1
[bグループ]
ATF5、CHAC1、EGR1、TRIB3
[cグループ]
SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、JUN
このキット発明は、視神経障害発症リスクを判定(診断)するためのキットに関する用途発明であり、このキットには、通常、視神経障害発症リスクを判定するための説明書が含まれる。
(a)視神経障害非ヒト動物に被検薬剤又は被検物質を投与する工程;
(b)前記非ヒト動物から採取された判定用試料中の、以下の[A−1グループ]、[Bグループ]、及び[Cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAの発現、或いは該遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の発現の減少、
前記非ヒト動物から採取された判定用試料中の、以下の[A−2グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAの発現、或いは該遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の発現の増加、
前記非ヒト動物から採取された判定用試料中の、以下の[D−1グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの減少、或いは
前記非ヒト動物から採取された判定用試料中の、以下の[D−2グループ]の遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの増加
を検出する工程;
[A−1グループ]
Tmc1、Adm2、Mat1a、Dnmt3I、Gmfg、Tnnc2、LOC101056098、
[A−2グループ]
Gm1332、Tlcd2、Scn4b、Gm3383、Acpt、Gm13547、Vmn2r83、Tnfaip8l3、Serpinc1
[Bグループ]
Atf5、Chac1、Egr1、Trib3
[Cグループ]
Sox11、Tnfrsf12a、Hmox1、Plat、Jun
[D−1グループ]
Creb1、Atf2、Hif1a、Egr1、Stat3、Rela、Ep300、Rara、Myod1
[D−2グループ]
Tbx2
(a’)被験者(提供者)から採取された判定(診断)用試料中の、上記[a−1グループ]、[bグループ]、及び[cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現の増加、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の増加、上記[a−2グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現の減少、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の減少、上記[d−1グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの増加、或いは上記[d−2グループ]の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの減少を検出する工程;
(b’)被験者(提供者)から採取された判定(診断)用試料中の、上記[a−1グループ]、[bグループ]、及び[cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現の増加、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の増加、上記[a−2グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現の減少、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の減少、上記[d−1グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの増加、或いは上記[d−2グループ]の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の活性化レベルの減少が検出された場合、被験者(提供者)は視神経障害を発症するリスクが高いと診断する工程;
(c’)前記診断された被験者(提供者)に視神経症障害発症を予防又は視神経障害を治療するための処置を施す工程;
本件判定方法や本件判定キット1や2における遺伝子としては、上記[a−1グループ]及び[a−2グループ]から選択される遺伝子を好適に例示することができる。
なお、上記[a−1グループ]、[a−2グループ]、[bグループ]、及び[cグループ]に含まれる遺伝子を総称して、以下「本件バイオマーカー遺伝子a〜c」ということや、上記[d−1グループ]及び[d−2グループ]に含まれる遺伝子を総称して、以下「本件バイオマーカー遺伝子d」ということがある。
なお、上記[A−1グループ]、[A−2グループ]、[Bグループ]、及び[Cグループ]に含まれる遺伝子を総称して、以下「本件バイオマーカー遺伝子A〜C」ということや、上記[D−1グループ]及び[D−2グループ]に含まれる遺伝子を総称して、以下「本件バイオマーカー遺伝子D」ということがある。
[a−1グループ]
TMC1(NCBIリファレンス配列NM_138691)
ADM2(NCBIリファレンス配列NM_001253845、又はNM_024866)
MAT1A(NCBIリファレンス配列NM_000429)
DNMT3L(NCBIリファレンス配列NM_013369、又はNM_175867)
GMFG(NCBIリファレンス配列NM_004877)
TNNC2(NCBIリファレンス配列NM_003279)
[a−2グループ]
TLDC2(NCBIリファレンス配列NM_080628)
TLCD2(NCBIリファレンス配列NM_001164407)
SCN4B(NCBIリファレンス配列NM_001142348、NM_001142349、又はNM_174934)
ACPT(NCBIリファレンス配列NM_033068)
TNFAIP8L3(NCBIリファレンス配列NM_207381)
SERPINC1(NCBIリファレンス配列NM_000488)
[bグループ]
ATF5(NCBIリファレンス配列NM_001193646、又はNM_012068)
CHAC1(NCBIリファレンス配列NM_001142776、又はNM_024111)
EGR1(NCBIリファレンス配列NM_001964)
TRIB3(NCBIリファレンス配列NM_021158)
[cグループ]
SOX11(NCBIリファレンス配列NM_003108)
TNFRSF12A(NCBIリファレンス配列NM_016639)
HMOX1(NCBIリファレンス配列NM_002133)
PLAT(NCBIリファレンス配列NM_000930)
JUN(NCBIリファレンス配列NM_002228)
[A−1グループ]
Tmc1(NCBIリファレンス配列NM_028953)
Adm2(NCBIリファレンス配列NM_182928)
Mat1a(NCBIリファレンス配列NM_133653)
Dnmt3I(NCBIリファレンス配列NM_019448)
Gmfg(NCBIリファレンス配列NM_022024)
Tnnc2(NCBIリファレンス配列NM_009394)
LOC101056098(NCBIリファレンス配列XM_003945483)
[A−2グループ]
Gm1332(NCBIリファレンス配列NM_001177439)
Tlcd2(NCBIリファレンス配列NM_027249)
Scn4b(NCBIリファレンス配列NM_001013390)
Gm3383(NCBIリファレンス配列NM_001205306)
Acpt(NCBIリファレンス配列NM_001195034)
Gm13547(NCBIリファレンス配列NM_001177392)
Vmn2r83(NCBIリファレンス配列NM_001104537)
Tnfaip8l3(NCBIリファレンス配列NM_00103353)
Serpinc1(NCBIリファレンス配列NM_080844)
[Bグループ]
Atf5(NCBIリファレンス配列NM_030693)
Chac1(NCBIリファレンス配列NM_026929)
Egr1(NCBIリファレンス配列NM_007913)
Trib3(NCBIリファレンス配列NM_175093)
[Cグループ]
Sox11(NCBIリファレンス配列NM_009234)
Tnfrsf12a(NCBIリファレンス配列NM_001161746)
Hmox1(NCBIリファレンス配列NM_010442)
Plat(NCBIリファレンス配列NM_008872)
Jun(NCBIリファレンス配列NM_010591)
本実施例のモデル動物として、C57BL/6マウス(雄、12週齢;日本SLC社製)を用いた。マウスの外科的処置は、ケタミン(100mg/kg)とキシラジン(9mg/kg)の混合液を筋肉内投与し、深麻酔下で行った。C57BL/6マウスは、眼科と視覚研究における動物の使用のためのARVO宣言の指針や、ヘルシンキ宣言の指針や、動物の使用と管理についての指導原則に従って維持し、取り扱った。すべての実験手順は、東北大学医学部における動物実験のための倫理委員会により承諾を受けたものであり、また、実験動物の管理と使用に関するアメリカ国立衛生研究所の指針に従って行った。
C57BL/6マウスにおいて、視神経挫滅(optic nerve crush;ONC)による軸索損傷を、文献(Ryu, M. et al. J Neurosci Res 2012, 90(4):802-815.)に記載の方法に従って行い、視神経障害モデルマウスを調製した。すなわち、C57BL/6マウスの視神経を露出させ、球後2mmの部位の視神経を鑷子で10秒間挫滅した(ONC群:n=18)。眼底検査により血流が正常であることを確認し、抗生物質軟膏を塗った。また、コントロールとして視神経を挫滅しないで処理を行ったC57BL/6マウスを用いた(Sham群:n=18)。
ONC処理後2日目にマウスの網膜を単離し、すばやくRNA stabilization reagent(Qiagen社製)中に浸し、Qiazol(Qiagen社製)を加え、ホモジナイザーを用いて破砕処理し、miRNeasy mini kit (Qiagen社製)を用いて全RNAを精製し、その後RNAの濃度をNanoDrop 2000c(Thermo Scientific社製)を用いて測定した。RNAの定量を行った際の個体差による影響を最小限に抑えるために、ONC群及びSham群のそれぞれにおいて、任意の6種類のRNAサンプルを1つにまとめ、計3種類のRNAサンプルを調製した。全RNAの定量は、Agilent 2100 Bioanalyzer(Agilent Technologies社製)を用いて行った。また、RNA integrity number (RIN)が7.8を超えるRNAサンプルを用いた。Illumina Tru-Seq RNA Sample Prep Kits(Illumina社製)を用い、使用説明書に従って100bp末端読み込み用のcDNAライブラリーを調製した。cDNAのシーケンシングは、Hiseq2000(Illumina社製)を用いて行った。データは、FASTQフォーマットで記録し、解析ソフトウェア(CLC Genomics Workbench[CLC Bio社製])へインポートした。シーケンシングしたすべての配列は、リファレンスゲノム(NCBI37/mm9)上にマッピングした。
RPKM(reads per kilobase of exon per million mapped sequence reads)を指標として用い(文献[Mortazavi, A. et al. Nat Methods 2008, 5(7):621-628.]参照)、mRNAの発現レベルを解析し、ONC群とSham群間でmRNAの発現が変動する遺伝子(DEG)を同定した。なお、DEGは、FC>1.5でかつ、p<0.05を示す遺伝子と、FC<−1.5でかつ、p<0.05を示す遺伝子を選択した。また、DEGの階層的クラスタリング解析は、完全連結法を用いて行い、オープンソースソフトウェアクラスタ3.0を用いて相関関係に重点を置いた。結果を、Java(登録商標)Treeviewを用いて可視化した(文献[Saldanha, A.J. Bioinformatics 2004, 20(17):3246-3248.]参照)。
ONC群(n=6)及びSham群(n=6)のマウス網膜から、miRNeasy mini kit (Qiagen社製)を用いて全RNA(200ng/サンプル)を単離し、SuperScript III(Invitrogen Life Technologies社製)を用いて逆転写によりcDNAを調製した。細胞死や細胞生存に関連する7種類の遺伝子(Sox11、Tnfrsf12a、Hmox1、Plat、Egr1、Atf5、及びJun)のmRNAの発現を定量するために、以下の1)〜4)からなる溶液を調製し、7500 Fast Real-Time PCR System(Applied Biosystems社製)を用い、文献(Shanab, A.Y. et al, Neurobiology of disease 2012, 48(3):556-567.)に記載の方法に従って定量PCRを行った。なお、内部標準としてGAPDH遺伝子のmRNAの発現を定量した。
1)TaqMan Fast Universal PCR Master Mix(Applied Biosystems社製);10μL
2)TaqMan Probe(Applied Biosystems社製);1μL
3)cDNA溶液(テンプレートDNA);1μL
4)DEPC water(Rnase-free water);8μL
Sox11(Assay ID:Mm01281943_s1)
Tnfrsf12a(Assay ID:Mm01302476_g1)
Hmox1(Assay ID:Mm00516007_m1)
Plat(Assay ID:Mm00476931_m1)
Egr1(Assay ID:Mm00656724_m1)
Atf5(Assay ID:Mm04179654_m1)
Jun(Assay ID:Mm00495062_s1)
Gapdh(Assay ID:Mm99999915_g1)
DEGのパスウェイ解析と上流解析は、IPA(Ingenuity Pathways Analysis)ソフトウェアを用い、文献(Ramayo-Caldas, Y. et al., BMC Genomics 2012, 13(1):1-1.)に記載の方法に従って行った。DEGデータセットを、IPAのアプリケーションにアップロードし、IPKB(Ingenuity Pathways Knowledge Base)にマッピングした。各遺伝子の識別子は、その対応IPKBにマップした。これらの遺伝子のネットワークは、それらの連結性(connectivity)に基づいて作成した。DEGデータセットと生体機能との関連の有意性は、その経路における遺伝子の総数で割った経路にマッピングするデータセットからの遺伝子の数の比を用いて測定した。
また、上流解析は、データセットのDEGと、上流で転写調節因子により制御されることが知られているDEGとを比較して行った。それらの間の一致分析に基づいて、活性化スコア(activation score)は、可能性のある転写調節因子が「活性化した(Activated)」(Zスコア>2)状態か、「抑制された(inhibited)」(Zスコア<−2)状態か、あるいは「不確実な」状態であるかを示すために、割り当てた。
RNA−seqデータを、CLC Genomics Workbenchを用い対応のないt検定で解析した。RT−PCRデータを、R(バージョン3.0.1)を用い対応のないt検定で解析した。パスウェイ解析の有意性は、IPAアプリケーション中でFisherの正確確率検定(Fisher’s exact test)を行い、p値が0.05未満の場合、統計的に有意差があると評価した。
視神経障害を初期の段階で判定できるバイオマーカー遺伝子を探索するために、上記[網膜神経節細胞(RGC)における全RNAの単離・シーケンシング]の項目に記載の方法に従って、視神経障害モデルを用いたトランスクリプトーム(transcriptome)プロファイル解析を行った。
次に、各遺伝子について、ONC群とSham群間における倍率変化(FC)を算出し、DEG、すなわち、ONC群とSham群間でmRNAの発現が変動する遺伝子を314種類同定した(図1A及び図1に関する図面の簡単な説明参照)。かかる314種類の遺伝子のうち、239種類の遺伝子は、Sham群に対してONC群でmRNAの発現が増加し、また、75種類の遺伝子は、Sham群に対してONC群でmRNAの発現が減少することが示された。さらに、上記314種類の遺伝子(DEG)の階層的クラスタリング解析したところ、各グループにおいて似たような発現パターンを示すことが確認された(図1B参照)。
視神経軸索損傷に関与するシグナル経路を調べるために、上記[パスウェイ解析]の項目に記載の方法に従って、DEGのパスウェイ解析を行った。その結果、視神経軸索損傷に関与する2種類のネットワーク(ネットワーク1及び2)を同定した(図2参照)。このうち、ネットワーク1は、発達障害、遺伝性疾患、及び免疫疾患に関連するものであり(図2A参照)、ネットワーク2は、腎及び泌尿器疾患、細胞死及び生存、並びに神経系の発達及び機能に関連するものである(図2B参照)。また、DEGを5種類の分子機能や細胞機能(細胞死及び生存[Cell Death and Survival]、細胞運動[Cellular Movement]、細胞間シグナリング及び相互作用[Cell-To-Cell Signaling and Interaction]、分子輸送[Molecular Transport]、並びに低分子生化学[Small Molecule Biochemistry])のパスウェイに分類することができた(表3参照)。このうち、IPAによると、103のDEGが関与する「細胞死及び生存」パスウェイが視神経軸索損傷に関与する最も重要な経路であることが明らかとなった。
RNA−seq解析のバリデーションを行うために、RT−PCR解析を行った。具体的には、RNA−seq解析により同定した314種類のDEGの中から、視神経障害との関連性が報告されていないDEGを選択し、細胞死や細胞生存に関連する7種類の遺伝子(Atf5、Egr1、Sox11、Tnfrsf12a、Hmox1、Plat、及びJun)を選択し、上記[定量RT−PCR法]の項目に記載の方法に従って、mRNAの発現レベルを定量した。その結果、RNA−seq解析で同定したDEGのmRNAの発現レベルを、RT−PCR解析で検出した場合においても同様に、検出感度や特異度が高く視神経障害発症リスクを判定できることが明らかとなった(表4参照)。
RT−PCR解析を行った上記7種類の遺伝子のうち、新たに同定された5種類の遺伝子(Sox11、Tnfrsf12a、Hmox1、Plat、及びJun;本件バイオマーカー[Cグループ])を、視神経障害発症リスク判定用バイオマーカー遺伝子として選択した。なお、本件バイオマーカー[Cグループ](Sox11、Tnfrsf12a、Hmox1、Plat、及びJun)のヒトオーソログは、それぞれ5種類の遺伝子(SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、及びJUN;本件バイオマーカー[cグループ])である。
DEGのmRNAの発現を変化させる原因因子を特定するために、RNA−seq解析により同定したDEGを用いて、上記[パスウェイ解析及び上流解析]の項目に記載の方法に従って、上流解析を行った。その結果、10種類の転写因子(活性化レベルが増加する9種類の転写因子[Creb1、Atf2、Hif1a、Egr1、Stat3、Rela、Ep300、Rara、及びMyod1;本件バイオマーカー[D−1グループ]]、及び活性化レベルが減少する1種類の転写因子[Tbx2;本件バイオマーカー[D−2グループ]])が同定され(表5及び図3参照)、これら10種類の転写因子を視神経障害発症リスク判定用バイオマーカー遺伝子として選択した。なお、上記9種類の転写因子(Creb1、Atf2、Hif1a、Egr1、Stat3、Rela、Ep300、Rara、及びMyod1)のヒトオーソログは、それぞれ9種類の転写因子(CREB1、ATF2、HIF1A、EGR1、STAT3、RELA、EP300、RARA、及びMYOD1;本件バイオマーカー[d−1グループ])であり、また、上記1種類の転写因子(Tbx2)のヒトオーソログは、1種類の転写因子(TBX2;本件バイオマーカー[d−2グループ])である(表5及び図3参照)。
これらの結果は、本件バイオマーカー[D−1グループ]や[d−1グループ]の活性化レベルの増加や、本件バイオマーカー[D−2グループ]や[d−2グループ]の活性化レベルの減少を指標として、視神経障害発症リスクを判定できることを示唆している。
Claims (8)
- 以下の[a−1グループ]、[bグループ]、及び[cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の増加、或いは
以下の[a−2グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA若しくはcDNAの発現、又は該遺伝子のmRNA若しくはcDNAがコードするタンパク質の発現の減少
を検出することを特徴とする視神経障害発症リスクの判定方法。
[a−1グループ]
TMC1、ADM2、MAT1A、DNMT3L、GMFG、TNNC2
[a−2グループ]
TLDC2、TLCD2、SCN4B、ACPT、TNFAIP8L3、SERPINC1
[bグループ]
ATF5、CHAC1、EGR1、TRIB3
[cグループ]
SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、JUN - 遺伝子が、[a−1グループ]及び[a−2グループ]から選択されることを特徴とする請求項1に記載の判定方法。
- 以下の[a−1グループ]、[a−2グループ]、[bグループ]、及び[cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA又はcDNAの発現を検出するためのプライマー対若しくはプローブ、又はそれらの標識物を備えることを特徴とする視神経障害発症リスクの判定用キット。
[a−1グループ]
TMC1、ADM2、MAT1A、DNMT3L、GMFG、TNNC2
[a−2グループ]
TLDC2、TLCD2、SCN4B、ACPT、TNFAIP8L3、SERPINC1
[bグループ]
ATF5、CHAC1、EGR1、TRIB3
[cグループ]
SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、JUN - 遺伝子が、[a−1グループ]及び[a−2グループ]から選択されることを特徴とする請求項3に記載のキット。
- 以下の[a−1グループ]、[a−2グループ]、[bグループ]、及び[cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子のmRNA又はcDNAがコードするタンパク質に特異的に結合する抗体、又はそれらの標識物を備えることを特徴とする視神経障害発症リスクの判定用キット。
[a−1グループ]
TMC1、ADM2、MAT1A、DNMT3L、GMFG、TNNC2
[a−2グループ]
TLDC2、TLCD2、SCN4B、ACPT、TNFAIP8L3、SERPINC1
[bグループ]
ATF5、CHAC1、EGR1、TRIB3
[cグループ]
SOX11、TNFRSF12A、HMOX1、PLAT、JUN - 遺伝子が、[a−1グループ]及び[a−2グループ]から選択されることを特徴とする請求項5に記載のキット。
- 以下の工程(a)及び(b)を備えたことを特徴とする視神経障害の予防又は治療剤のスクリーニング方法。
(a)視神経障害非ヒト動物に被検薬剤又は被検物質を投与する工程;
(b)前記非ヒト動物から採取された判定用試料中の、以下の[A−1グループ]、[Bグループ]、及び[Cグループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAの発現、或いは該遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の発現の減少、或いは
前記非ヒト動物から採取された判定用試料中の、以下の[A−2グループ]から選択される少なくとも1つ以上の遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAの発現、或いは該遺伝子若しくは該遺伝子のオーソログのmRNA又はcDNAがコードするタンパク質の発現の増加
を検出する工程;
[A−1グループ]
Tmc1、Adm2、Mat1a、Dnmt3I、Gmfg、Tnnc2、LOC101056098、
[A−2グループ]
Gm1332、Tlcd2、Scn4b、Gm3383、Acpt、Gm13547、Vmn2r83、Tnfaip8l3、Serpinc1
[Bグループ]
Atf5、Chac1、Egr1、Trib3
[Cグループ]
Sox11、Tnfrsf12a、Hmox1、Plat、Jun - 遺伝子が、[A−1グループ]及び[A−2グループ]から選択されることを特徴とする請求項7に記載のスクリーニング方法。
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