JP6245688B2 - IgY-specific binding peptide and method for purifying IgY thereby - Google Patents
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Description
本発明は、IgY特異的結合ペプチドに関する。
本発明はまた、該ペプチドによるIgYの精製法を提供する。
The present invention relates to IgY-specific binding peptides.
The present invention also provides a method for purifying IgY with the peptide.
現在、臨床診断や研究用の試薬としての抗体は、マウスのモノクローナル抗体やウサギのポリクローナル抗体が多く使われており、大きな市場を持っている。一方、ニワトリのIgY抗体は、免疫による特異抗体作製方法の確立とともに、試験動物としてのコストの安さ、動物抗体との交差反応の低さに加え、卵黄から非侵襲的にIgYの抗体が精製できることがメリットとして注目され、試薬としての新しい抗体として期待されている。 Currently, mouse monoclonal antibodies and rabbit polyclonal antibodies are widely used as antibodies for clinical diagnosis and research and have a large market. On the other hand, chicken IgY antibody can be purified non-invasively from egg yolk in addition to the establishment of a specific antibody production method by immunization, low cost as a test animal, low cross-reactivity with animal antibodies. Is attracting attention as a merit and is expected as a new antibody as a reagent.
卵黄からのIgYの精製法として、いくつかの方法が報告されてきた(非特許文献1)。卵黄には、不溶性のリン脂質やリポプロテインが多く含まれており、これらがアフィニティ精製の際の障害となるため、これをPEG、Pectinなどを使った沈殿法によって除くプロトコールが報告されている(非特許文献2)。市販のIgY精製キットも同様な原理を用いたものであり、現在、主なもので、Eggcellent (Thermo Pierce) と EGGstract (Promega)がよく使われている。最近、Sock Hwee Tanらは、plant gums pectinとκ-carrageenanを用いた沈殿法で、市販のものとも、純度や収量で劣らない精製プロトコールを報告した(非特許文献3)。しかし、このような方法においても、精製されるIgYの純度は50〜80%程度であり、より高精製度のIgYの調製には、アフィニティカラムの使用が不可欠である。 Several methods have been reported as methods for purifying IgY from egg yolk (Non-patent Document 1). Egg yolk contains a lot of insoluble phospholipids and lipoproteins, and these become obstacles to affinity purification, so a protocol to remove this by precipitation using PEG, Pectin, etc. has been reported ( Non-patent document 2). Commercial IgY purification kits use the same principle, and are currently the main ones, and Eggcellent (Thermo Pierce) and EGGstract (Promega) are often used. Recently, Sock Hwee Tan et al. Reported a purification protocol that uses plant gums pectin and κ-carrageenan and is not inferior in purity or yield to commercially available ones (Non-patent Document 3). However, even in such a method, the purity of purified IgY is about 50 to 80%, and the use of an affinity column is indispensable for the preparation of IgY having a higher degree of purification.
しかしながら、例えば、ヒトIgGにおけるプロテインAのような、IgYを精製するための特異的なリガンドは、報告されておらず、精製用の合成リガンドが報告されているものの(非特許文献4、あるいはGE Healthcare社の2-mercaptopyridine固定化カラム:HiTrap IgY Purification HP)、精製されたIgY抗体の純度の観点からは、不十分(70%程度)と言わざるを得ない。
However, for example, specific ligands for purifying IgY, such as protein A in human IgG, have not been reported, and synthetic ligands for purification have been reported (Non-patent
本発明者らは、これまで、T7ファージディスプレイシステムによって構築したランダムペプチドライブラリを用いて、ヒトIgGやヒトIgAに特異的に結合するペプチドを単離し、そのペプチドを固定化したアフィニティカラムを使った抗体の精製法を報告してきた(特許文献1、2)。
しかし、IgY結合ペプチドについては、これまで十分な報告がなかった。
The present inventors have so far used a random peptide library constructed by the T7 phage display system to isolate a peptide that specifically binds to human IgG or human IgA and use an affinity column on which the peptide is immobilized. Antibody purification methods have been reported (
However, there have been no sufficient reports on IgY-binding peptides.
本発明は、ランダムペプチドライブラリを用いて、IgYに対するバイオパンニングによって得られたクローンから、IgYに特異的に結合するペプチドを見出すことを目的とする。
本発明はまた、このペプチドを用いたIgYの精製法を構築することを目的とする。
The object of the present invention is to find a peptide that specifically binds to IgY from a clone obtained by biopanning against IgY using a random peptide library.
Another object of the present invention is to construct a method for purifying IgY using this peptide.
本発明は、以下の特徴を包含する。
(1) 下記の式(I):
(X1-3)-C-(X5)-W-(X7-11)-W-(X13)-C-(X15-17) (I)
(式中、X1-3のうちX1とX3は、独立に、システイン残基以外の任意のアミノ酸残基であり、X2は、システイン残基であってもよい任意のアミノ酸残基であり、
Cはシステイン残基であり、
X5は、T、D、V、S又はEのアミノ酸残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
X7-11は、アミノ酸配列(S、T、R又はN)-(S、A、K又はR)-(I、A、V、T又はG)-(V、Y、T、R又はS)-(G又はD)であり、
X13は、V、L、D、S、M、T又はRのアミノ酸残基であり、並びに、
X15-17の3個のアミノ酸残基は、独立に、システイン残基以外の任意のアミノ酸残基である)
によって表される、17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、4位のシステイン残基と14位のシステイン残基との間でジスルフィド結合を形成しており、並びに、トリIgYと結合可能であることを特徴とするペプチド。
(2) 上記のX1-3は、アミノ酸配列(G、R、W、E、A又はV)-(V、T、C、I、W又はN)-(K、R、V、S、T又はW)であることを特徴とする、(1)に記載のペプチド。
(3) 上記のX1-3が、アミノ酸配列GVK、GTR、RCV、WIR、EWS、GTS、ATT、VNV又はGTWからなる群から選択されることを特徴とする、(2)に記載のペプチド。
(4) 上記のX15-17は、アミノ酸配列(V、Y、R、F、D、N、S又はG)-(D、N、A、R、T、S、K又はI)-(M、Y、D、S、P、V又はG)であることを特徴とする、(1)〜(3)のいずれかに記載のペプチド。
(5) 上記のX15-17は、アミノ酸配列VDM、YDY、RND、FAS、DRD、NTP、YSV、SKS又はGIGからなる群から選択されることを特徴とする、(4)に記載のペプチド。
(6) 上記のX5は、T、D又はVであることを特徴とする、(1)〜(5)のいずれかに記載のペプチド。
(7) 上記のX7-11は、アミノ酸配列SSIVD、SAAYG、TAVTG、TKVTG、RKTTG、NRGRG、TRGSG、RSGRG又はRRTSGからなる群から選択されることを特徴とする、(1)〜(6)のいずれかに記載のペプチド。
(8) 上記のX13は、V、S又はRであることを特徴とする、(1)〜(7)のいずれかに記載のペプチド。
(9) 以下のいずれかのアミノ酸配列からなることを特徴とする、(1)〜(8)のいずれかに記載のペプチド。
GVKCTWSSIVDWVCVDM(配列番号1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY(配列番号2)
RCVCVWTAVTGWDCRND(配列番号3)
WIRCDWTKVTGWVCFAS (配列番号4)
EWSCVWRKTTGWSCDRD (配列番号5)
GTSCSWNRGRGWMCNTP (配列番号6)
ATTCTWTRGSGWSCYSV (配列番号7)
VNVCEWRSGRGWTCSKS (配列番号8)
GTWCTWRRTSGWRCGIG (配列番号9)
(10) 標識が結合されている、(1)〜(9)のいずれかに記載のペプチド。
(11) (1)〜(9)のいずれかに記載のペプチドと連結されたタンパク質からなる融合タンパク質。
(12) (1)〜(9)のいずれかに記載のペプチドを固相に結合してなる固定化ペプチド。
(13) (1)〜(9)のいずれかに記載のペプチドをコードする核酸。
(14) (1)〜(9)のいずれかに記載のペプチド又は(12)に記載の固定化ペプチドをIgYと結合させること、並びに、結合したIgYを遊離させてIgYを回収することを含む、IgYの精製方法。
(15) (1)〜(9)のいずれかに記載のペプチド又は(12)に記載の固定化ペプチドにサンプル中のIgYを結合させ、結合したIgYを検出することを含む、IgYの検出方法。
(16) (1)〜(9)のいずれかに記載のペプチド又は(12)に記載の固定化ペプチドの少なくとも1種を含む、IgYの分析又は精製のためのキット。
(17) (12)に記載の固定化ペプチドを含有する、IgY分離用カラム。
The present invention includes the following features.
(1) The following formula (I):
(X 1-3 ) -C- (X 5 ) -W- (X 7-11 ) -W- (X 13 ) -C- (X 15-17 ) (I)
(In the formula, X 1 and X 3 out of X 1-3 are independently any amino acid residues other than cysteine residues, and X 2 is any amino acid residue which may be a cysteine residue. And
C is a cysteine residue;
X 5 is an amino acid residue of T, D, V, S or E;
W is a tryptophan residue;
X 7-11 is an amino acid sequence (S, T, R or N)-(S, A, K or R)-(I, A, V, T or G)-(V, Y, T, R or S )-(G or D),
X 13 is a V, L, D, S, M, T or R amino acid residue, and
3 amino acid residues of X 15-17 are independently any amino acid residues other than cysteine residues)
It includes an amino acid sequence consisting of 17 amino acid residues, and forms a disulfide bond between the cysteine residue at
(2) X 1-3 above is an amino acid sequence (G, R, W, E, A or V)-(V, T, C, I, W or N)-(K, R, V, S, The peptide according to (1), which is T or W).
(3) The peptide according to (2), wherein X 1-3 is selected from the group consisting of amino acid sequences GVK, GTR, RCV, WIR, EWS, GTS, ATT, VNV or GTW .
(4) X 15-17 is an amino acid sequence (V, Y, R, F, D, N, S, or G)-(D, N, A, R, T, S, K, or I)-( The peptide according to any one of (1) to (3), which is M, Y, D, S, P, V or G).
(5) The peptide according to (4), wherein X 15-17 is selected from the group consisting of amino acid sequences VDM, YDY, RND, FAS, DRD, NTP, YSV, SKS, or GIG .
(6) The peptide according to any one of (1) to (5), wherein X 5 is T, D, or V.
(7) The above X 7-11 is selected from the group consisting of amino acid sequences SSIVD, SAAYG, TAVTG, TKVTG, RKTTG, NRGRG, TRGSG, RSGRG or RRTSG, (1) to (6) The peptide according to any one of the above.
(8) The peptide according to any one of (1) to (7), wherein X 13 is V, S or R.
(9) The peptide according to any one of (1) to (8), comprising any one of the following amino acid sequences.
GVKCTWSSIVDWVCVDM (SEQ ID NO: 1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY (SEQ ID NO: 2)
RCVCVWTAVTGWDCRND (SEQ ID NO: 3)
WIRCDWTKVTGWVCFAS (SEQ ID NO: 4)
EWSCVWRKTTGWSCDRD (SEQ ID NO: 5)
GTSCSWNRGRGWMCNTP (SEQ ID NO: 6)
ATTCTWTRGSGWSCYSV (SEQ ID NO: 7)
VNVCEWRSGRGWTCSKS (SEQ ID NO: 8)
GTWCTWRRTSGWRCGIG (SEQ ID NO: 9)
(10) The peptide according to any one of (1) to (9), to which a label is bound.
(11) A fusion protein comprising a protein linked to the peptide according to any one of (1) to (9).
(12) An immobilized peptide obtained by binding the peptide according to any one of (1) to (9) to a solid phase.
(13) A nucleic acid encoding the peptide according to any one of (1) to (9).
(14) The method includes binding the peptide according to any one of (1) to (9) or the immobilized peptide according to (12) to IgY, and recovering IgY by releasing the bound IgY. And purification method of IgY.
(15) A method for detecting IgY, comprising binding IgY in a sample to the peptide according to any one of (1) to (9) or the immobilized peptide according to (12), and detecting the bound IgY. .
(16) A kit for analyzing or purifying IgY, comprising at least one of the peptide according to any one of (1) to (9) or the immobilized peptide according to (12).
(17) An IgY separation column containing the immobilized peptide according to (12).
本発明により、トリIgYなどのIgYの精製が容易かつ純度よく行えるようになった。 According to the present invention, IgY such as tri-IgY can be purified easily and with high purity.
今回、本発明者らが見出したトリIgYに対し特異的又は選択的な結合性を有するペプチドは、T7ファージ提示システムによって構築された分子内に1つのジスルフィド結合を含むランダムペプチドライブラリ( Sakamoto, K., Ito, Y., Hatanaka, T., Soni, P. B., Mori, T., and Sugimura, K. (2009) The Journal of biological chemistry 284(15), 9986-9993)を参考に、新たにデザイン、構築したライブラリからバイオパンニング法を利用して単離されたものであり、このとき得られた3種の特異的クローンには、互いに共通の特徴的な一次構造(配列)の相同性が見られ、その配列を基に合成ペプチドは、IgYに対する優れた特異性と親和性を示した。これらのペプチドのIgY結合に必須の残基の同定を行い、親和性増強へのアプローチ並びに該ペプチドを使った卵黄からのIgYの精製への応用を可能にした。本発明のIgY結合性ペプチドは、17残基からなり、IgYの精製システムの構築が期待できる。 The peptide having specific or selective binding property to avian IgY found by the present inventors is a random peptide library containing one disulfide bond in the molecule constructed by the T7 phage display system (Sakamoto, K ., Ito, Y., Hatanaka, T., Soni, PB, Mori, T., and Sugimura, K. (2009) The Journal of biological chemistry 284 (15), 9986-9993) The three specific clones were isolated from the constructed library using the biopanning method, and the homology of the characteristic primary structure (sequence) common to each other was observed. Based on that sequence, the synthetic peptide showed excellent specificity and affinity for IgY. Residues essential for IgY binding of these peptides were identified, enabling an approach to affinity enhancement and application to the purification of IgY from egg yolk using the peptides. The IgY-binding peptide of the present invention consists of 17 residues, and it can be expected to construct an IgY purification system.
以下に、本発明についてさらに詳細に説明する。
具体的には、本発明のIgY結合性ペプチド、該ペプチドによるIgYの精製法及び分析法、そのようなIgY精製又は検出のためのキットについて説明する。
Hereinafter, the present invention will be described in more detail.
Specifically, the IgY-binding peptide of the present invention, a method for purifying and analyzing IgY using the peptide, and a kit for purifying or detecting such IgY are described.
<IgY結合性ペプチド>
本発明のペプチドは、多数のランダムペプチドを含むファージライブラリのなかからトリIgYと特異的に又は選択的に結合性を有するものとしてスクリーニングされたものである。
<IgY binding peptide>
The peptide of the present invention has been screened as having specific or selective binding to avian IgY from a phage library containing a large number of random peptides.
すなわち、本発明のペプチドは、下記の式(I):
(X1-3)-C-(X5)-W-(X7-11)-W-(X13)-C-(X15-17) (I)
(式中、X1-3のうちX1とX3は、独立に、システイン残基以外の任意のアミノ酸残基であり、X2は、システイン残基であってもよい任意のアミノ酸残基であり、
Cはシステイン残基であり、
X5は、T、D、V、S又はEのアミノ酸残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
X7-11は、アミノ酸配列(S、T、R又はN)-(S、A、K又はR)-(I、A、V、T又はG)-(V、Y、T、R又はS)-(G又はD)であり、
X13は、V、L、D、S、M、T又はRのアミノ酸残基であり、並びに、
X15-17の3個のアミノ酸残基は、独立に、システイン残基以外の任意のアミノ酸残基である)
によって表される、17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、4位のシステイン残基と14位のシステイン残基との間でジスルフィド結合を形成しており、並びに、トリIgYと結合可能であることを特徴とするペプチドである。
That is, the peptide of the present invention has the following formula (I):
(X 1-3 ) -C- (X 5 ) -W- (X 7-11 ) -W- (X 13 ) -C- (X 15-17 ) (I)
(In the formula, X 1 and X 3 out of X 1-3 are independently any amino acid residues other than cysteine residues, and X 2 is any amino acid residue which may be a cysteine residue. And
C is a cysteine residue;
X 5 is an amino acid residue of T, D, V, S or E;
W is a tryptophan residue;
X 7-11 is an amino acid sequence (S, T, R or N)-(S, A, K or R)-(I, A, V, T or G)-(V, Y, T, R or S )-(G or D),
X 13 is a V, L, D, S, M, T or R amino acid residue, and
3 amino acid residues of X 15-17 are independently any amino acid residues other than cysteine residues)
It includes an amino acid sequence consisting of 17 amino acid residues, and forms a disulfide bond between the cysteine residue at
式(I)において、例えばX1-3の「1-3」は、ペプチドのアミノ酸配列の1位から3位を表す意味で使用されている。 In formula (I), for example, “1-3” in X 1-3 is used to mean the 1st to 3rd positions in the amino acid sequence of the peptide.
本発明のペプチドは、式(I)の2つのシステイン残基(4位のCと14位のC)間でジスルフィド結合して環状ペプチドを形成している。
The peptide of the present invention forms a cyclic peptide by disulfide bond between two cysteine residues of formula (I) (C at
本発明の実施形態により、式(I)のX1-3は、アミノ酸配列(G、R、W、E、A又はV)-(V、T、C、I、W又はN)-(K、R、V、S、T又はW)であることを特徴とする。具体的には、X1-3が、アミノ酸配列GVK、GTR、RCV、WIR、EWS、GTS、ATT、VNV又はGTWからなる群から選択される。 According to an embodiment of the present invention, X 1-3 of formula (I) is an amino acid sequence (G, R, W, E, A or V)-(V, T, C, I, W or N)-(K , R, V, S, T or W). Specifically, X 1-3 is selected from the group consisting of the amino acid sequences GVK, GTR, RCV, WIR, EWS, GTS, ATT, VNV or GTW.
本発明の実施形態により、式(I)のX15-17は、アミノ酸配列(V、Y、R、F、D、N、S又はG)-(D、N、A、R、T、S、K又はI)-(M、Y、D、S、P、V又はG)であることを特徴とする。具体的には、X15-17は、アミノ酸配列VDM、YDY、RND、FAS、DRD、NTP、YSV、SKS又はGIGからなる群から選択される。 According to an embodiment of the present invention, X 15-17 of formula (I) is an amino acid sequence (V, Y, R, F, D, N, S or G)-(D, N, A, R, T, S , K or I)-(M, Y, D, S, P, V or G). Specifically, X 15-17 is selected from the group consisting of the amino acid sequences VDM, YDY, RND, FAS, DRD, NTP, YSV, SKS or GIG.
本発明の実施形態により、式(I)のX5は、T、D又はVであることを特徴とする。
本発明の実施形態により、式(I)のX11は、好ましくはGである。
本発明の実施形態により、式(I)のX7-11は、アミノ酸配列SSIVD、SAAYG、TAVTG、TKVTG、RKTTG、NRGRG、TRGSG、RSGRG又はRRTSGからなる群から選択されることを特徴とする。
本発明の実施形態により、式(I)のX13は、V、S又はRであることを特徴とする。
According to an embodiment of the present invention, X 5 in formula (I) is T, D or V.
According to an embodiment of the present invention, X 11 in formula (I) is preferably G.
According to an embodiment of the invention, X 7-11 of formula (I) is characterized in that it is selected from the group consisting of the amino acid sequences SSIVD, SAAYG, TAVTG, TKVTG, RKTTG, NRGRG, TRGSG, RSGRG or RRTSG.
According to an embodiment of the present invention, X 13 in formula (I) is V, S or R.
好ましいペプチドの具体例は、以下のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである。
GVKCTWSSIVDWVCVDM(配列番号1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY(配列番号2)
RCVCVWTAVTGWDCRND(配列番号3)
WIRCDWTKVTGWVCFAS (配列番号4)
EWSCVWRKTTGWSCDRD (配列番号5)
GTSCSWNRGRGWMCNTP (配列番号6)
ATTCTWTRGSGWSCYSV (配列番号7)
VNVCEWRSGRGWTCSKS (配列番号8)
GTWCTWRRTSGWRCGIG (配列番号9)
Specific examples of preferred peptides are peptides consisting of any of the following amino acid sequences.
GVKCTWSSIVDWVCVDM (SEQ ID NO: 1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY (SEQ ID NO: 2)
RCVCVWTAVTGWDCRND (SEQ ID NO: 3)
WIRCDWTKVTGWVCFAS (SEQ ID NO: 4)
EWSCVWRKTTGWSCDRD (SEQ ID NO: 5)
GTSCSWNRGRGWMCNTP (SEQ ID NO: 6)
ATTCTWTRGSGWSCYSV (SEQ ID NO: 7)
VNVCEWRSGRGWTCSKS (SEQ ID NO: 8)
GTWCTWRRTSGWRCGIG (SEQ ID NO: 9)
本発明のペプチドは、ニワトリIgYとの結合親和性が高い。例えば、本発明のペプチドの解離定数(Kd)は、表面プラズモン共鳴スペクトル解析(例えばBIACORE T-200システム(タンパク質相互作用解析)使用)により決定可能であり、例えば1×10-6M〜1×10-5M、又はその範囲以下である。 The peptide of the present invention has a high binding affinity for chicken IgY. For example, the dissociation constant (Kd) of the peptide of the present invention can be determined by surface plasmon resonance spectrum analysis (for example, using BIACORE T-200 system (protein interaction analysis)), for example, 1 × 10 −6 M to 1 × 10 -5 M or less.
固相に固定化した本発明のペプチドを用いて、実際にトリ血清中のIgYとの結合を試みたときには、IgYの血清型に結合することが判明し、IgYの分離も可能であることが示された。 When the peptide of the present invention immobilized on a solid phase was used to actually bind IgY in avian serum, it was found to bind to IgY serotype, and IgY could be separated. Indicated.
本発明のペプチドは、慣用の液相合成法、固相合成法などのペプチド合成法、自動ペプチド合成機によるペプチド合成などによって製造することができる(Kelley et al., Genetics Engineering Principles and Methods, Setlow, J.K. eds., Plenum Press NY. (1990) Vol.12, p.1-19;S tewart et al., Solid-Phase Peptide Synthesis (1989) W.H. Freeman Co.; Houghten, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1985) 82: p.5132、「新生化学実験講座1 タンパク質IV」(1992)日本生化学会編,東京化学同人、東京、日本国)。あるい は、本発明のペプチドをコードする核酸を用いた遺伝子組換え法やファージディスプレイ法などによって、ペプチドを製造してもよい。例えば本発明のペプチドのアミノ酸配列をコードするDNAを発現ベクター中に組み込み、宿主細胞中に導入し培養することにより、目的のペプチドを製造することができる。製造されたペプチドは、常法により、例えば、ゲルろ過クロマトグラフィー、イオン交換カラムクロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィー、HPLCなどのクロマトグラフィー、硫安分画、限外ろ過、免疫吸着法などにより、回収又は精製することができる。
The peptide of the present invention can be produced by a conventional liquid phase synthesis method, a peptide synthesis method such as a solid phase synthesis method, peptide synthesis by an automatic peptide synthesizer, etc. (Kelley et al., Genetics Engineering Principles and Methods, Setlow , JK eds., Plenum Press NY. (1990) Vol. 12, p.1-19; Stewart et al., Solid-Phase Peptide Synthesis (1989) WH Freeman Co .; Houghten, Proc. Natl. Acad. Sci USA (1985) 82: p.5132, “Seminar in
ペプチド合成は、各アミノ酸の、結合しようとするα−アミノ基とα−カルボキシル基以外の官能基を保護したアミノ酸類を用意し、それぞれのアミノ酸のα−アミノ基とα−カルボキシル基との間でペプチド結合形成反応を行う。通常、ペプチドのC末端に位置するアミノ酸残基のカルボキシル基を適当なスペーサー又はリンカーを介して固相に結合しておく。上で得られたジペプチドのアミノ末端の保護基を選択的に除去し、次のアミノ酸のα−カルボキシル基との間でペプチド結合を形成する。このような操作を連続して行い側基が保護されたペプチドを製造し、最後に、すべての保護基を除去し、固相から分離する。保護基の種類や保護方法、ペプチド結合法の詳細は、上記の文献に詳しく記載されている。 Peptide synthesis is performed by preparing amino acids in which functional groups other than the α-amino group and α-carboxyl group to be bonded are protected, and between each α-amino group and α-carboxyl group of each amino acid. The peptide bond formation reaction is performed in Usually, the carboxyl group of the amino acid residue located at the C-terminus of the peptide is bound to the solid phase via an appropriate spacer or linker. The amino terminal protecting group of the dipeptide obtained above is selectively removed to form a peptide bond with the α-carboxyl group of the next amino acid. Such operations are continuously performed to produce a peptide having a side group protected, and finally, all the protecting groups are removed and separated from the solid phase. The details of the types of protecting groups, the protecting method, and the peptide bonding method are described in detail in the above-mentioned documents.
遺伝子組換え法は、本発明のペプチドをコードするDNAを適当な発現ベクター中に挿入し、適当な宿主細胞にベクターを導入し、細胞を培養し、細胞内から又は細胞外液から目的のペプチドを回収することを含む。ベクターは、限定されないが、例えば、プラスミド、ファージ、コスミド、ファージミド、ウイルスなどのベクターである。プラスミドベクターとしては、限定するものではないが、大腸菌由来のプラスミド(例えばpET22b(+)、pBR322、pBR325、pUC118、pUC119、pUC18、pUC19、pBluescript等)、枯草菌由来のプラスミド(例えばpUB110、pTP5等)、酵母由来のプラスミド(例えばYEp13、YCp50等)などが挙げられる。ファージベクターとしては、限定するものではないが、T7ファージディスプレイベクター(T7Select10-3b、T7Select1-1b、 T7Select1-2a、T7Select1-2b、T7Select1-2c等(Novagen))、λファージベクター(Charon4A、 Charon21A、EMBL3、EMBL4、λgt10、λgt11、λZAP、λZAPII等)が挙げられる。ウイルスベクターとしては、限定するものではないが、例えばレトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ワクシニアウイルス、センダイウイルスなどの動物ウイルス、バキュロウイルスなどの昆虫ウイルスなどが挙げられる。コスミドベクターとしては、限定するものではないが、Lorist 6、Charomid9-20、Charomid9-42などが挙げられる。ファージミドベクターとしては、限定するものではないが、例えばpSKAN、pBluescript、pBK、pComb3Hなどが知られている。ベクターには、目的のDNAが発現可能なように調節配列や、目的DNAを含むベクターを選別するための選択マーカー、目的DNAを挿入するためのマルチクローニングサイトなどが含まれうる。そのような調節配列には、プロモーター、エンハンサー、ターミネーター、S-D配列又はリボソーム結合部位、複製開始点、ポリAサイトなどが含まれる。また、選択マーカーには、例えばアンピシリン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子、等が用いられうる。ベクターを導入するための宿主細胞は、大腸菌や枯草菌等の細菌、酵母細胞、昆虫細胞、動物細胞(例えば、哺乳動物細胞)、植物細胞等であり、これらの細胞への形質転換又はトランスフェクションは、例えば、リン酸カルシウム法、エレクトロポレーション法、リポフェクション法、パーテイクルガン法、PEG法等を含む。形質転換細胞を培養する方法は、宿主生物の培養に用いられる通常の方法に従って行われる。例えば、大腸菌や酵母細胞等の微生物の培養では、宿主微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有する。本発明のペプチドの回収を容易にするために、発現によって生成したペプチドを細胞外に分泌させることが好ましい。そのために、その細胞からのペプチドの分泌を可能にするペプチド配列をコードするDNAを、目的ペプチドをコードするDNAの5'末端側に結合する。細胞膜に移行した融合ペプチドがシグナルペプチダーゼによって切断されて、目的のペプチドが培地に分泌放出される。あるいは、細胞内に蓄積された目的ペプチドを回収することもできる。この場合、細胞を物理的又は化学的に破壊し、タンパク質精製技術を使用して目的ペプチドを回収する。
In the gene recombination method, DNA encoding the peptide of the present invention is inserted into an appropriate expression vector, the vector is introduced into an appropriate host cell, the cell is cultured, and the target peptide is obtained from inside the cell or from the extracellular fluid. Recovering. The vector is not limited, but is a vector such as a plasmid, a phage, a cosmid, a phagemid, or a virus. Plasmid vectors include, but are not limited to, E. coli-derived plasmids (eg, pET22b (+), pBR322, pBR325, pUC118, pUC119, pUC18, pUC19, pBluescript, etc.), Bacillus subtilis-derived plasmids (eg, pUB110, pTP5, etc.) ), Yeast-derived plasmids (eg, YEp13, YCp50, etc.). Examples of phage vectors include, but are not limited to, T7 phage display vectors (T7Select10-3b, T7Select1-1b, T7Select1-2a, T7Select1-2b, T7Select1-2c, etc. (Novagen)), λ phage vectors (Charon4A, Charon21A, EMBL3, EMBL4, λgt10, λgt11, λZAP, λZAPII, etc.). Examples of viral vectors include, but are not limited to, retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses, animal viruses such as vaccinia viruses and Sendai viruses, and insect viruses such as baculoviruses. Examples of cosmid vectors include, but are not limited to,
それゆえに、本発明はさらに、本発明のペプチドをコードする核酸にも関する。ここで、核酸は、DNA又はRNA(例えばcDNA及びmRNA)を含む。 Therefore, the present invention further relates to nucleic acids encoding the peptides of the present invention. Here, the nucleic acid includes DNA or RNA (for example, cDNA and mRNA).
本発明のペプチドは、IgYの検出を可能にするために、標識されていてもよい。標識は、限定されないが、例えば蛍光色素、化学発光色素、酵素、放射性同位元素、蛍光タンパク質、ビオチンなどを含む。好ましい標識の例は、フルオレセイン、FITCなどのフルオレセイン誘導体、ローダミン、テトラメチルローダミンなどのローダミン誘導体、テキサスレッドなどの蛍光色素である。 The peptides of the invention may be labeled in order to allow detection of IgY. Labels include but are not limited to, for example, fluorescent dyes, chemiluminescent dyes, enzymes, radioisotopes, fluorescent proteins, biotin and the like. Examples of preferred labels are fluorescein derivatives such as fluorescein and FITC, rhodamine derivatives such as rhodamine and tetramethylrhodamine, and fluorescent dyes such as Texas Red.
本発明のペプチドは、任意のタンパク質と融合させてもよい。タンパク質がGFP(緑色蛍光タンパク質)のような蛍光タンパク質、ペルオキシダーゼなどの酵素などであれば、該タンパク質を標識として使用できる。この場合、本発明のペプチドと該タンパク質とを、必要に応じて適当なリンカーを介して融合タンパク質として遺伝子組換え法によって作製できる。このとき、本発明のペプチドがトリIgYとの結合性を損なわないように融合タンパク質を作製するべきである。 The peptide of the present invention may be fused with any protein. If the protein is a fluorescent protein such as GFP (green fluorescent protein) or an enzyme such as peroxidase, the protein can be used as a label. In this case, the peptide of the present invention and the protein can be produced by gene recombination as a fusion protein via an appropriate linker as necessary. At this time, a fusion protein should be prepared so that the peptide of the present invention does not impair the binding property with avian IgY.
本発明のペプチドはさらに、IgYの分離精製、分析などに使用できるように、アフィニティカラムに充填可能な固相上に固定化されてもよい。 The peptide of the present invention may be further immobilized on a solid phase that can be packed in an affinity column so that it can be used for separation and purification of IgY, analysis, and the like.
ペプチドを固定化するのに用いる好適な固相としては、限定するものではないが、例えば、ポリスチレン、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリエステル、ポリアクリロニトリル、スチレン−ブタジエン共重合体、(メタ)アクリル酸エステルポリマー、フッ素樹脂、シリカゲル、架橋デキストラン、ポリサッカライド、アガロース等の多糖類、ガラス、金属、磁性物質、及びこれらの組み合わせなどが挙げられる。そのような固相の形状は、例えば、トレー、球、繊維、粒子、棒、平板、容器、セル、マイクロプレート、試験管、膜(フィルム又はメンブラン)、ゲル、チップなどの任意の形状でよい。具体的には例えば、磁性ビーズ、ガラスビーズ、ポリスチレンビーズ、セファロースビーズ、シリカゲルビーズ、多糖類ビーズ、ポリスチレンプレート、ガラスプレート、ポリスチレンチューブなどが挙げられる。これら固相への本発明のペプチドの固定化は、当業者に周知の方法を用いて行うことができ、例えば物理的吸着法、共有結合法、イオン結合法等によって行うことができる。固定化は共有結合にて行うことが好ましく、固相表面に化学官能基(例えばヒドロキシ基、アミノ基、N-ヒドロキシスクシンイミジル基など)、好ましくは炭素数約4〜20のアルキレン鎖をスペーサーとして有する化学官能基を有しており、これとペプチドのカルボキシ末端を化学的に反応させてエステル結合又はアミド結合等を形成する。本発明のペプチドを固定化した固相は、アフィニティークロマトグラフィーカラム、HPLCカラム等のカラムに充填して、IgYを検出、精製又は分離するために用いることができる。 Suitable solid phases used to immobilize peptides include, but are not limited to, for example, polystyrene, polyethylene, polypropylene, polyester, polyacrylonitrile, styrene-butadiene copolymers, (meth) acrylate polymers, Examples include fluororesins, silica gels, cross-linked dextrans, polysaccharides, polysaccharides such as agarose, glasses, metals, magnetic substances, and combinations thereof. The shape of such a solid phase may be any shape such as a tray, sphere, fiber, particle, rod, flat plate, container, cell, microplate, test tube, membrane (film or membrane), gel, chip, and the like. . Specific examples include magnetic beads, glass beads, polystyrene beads, sepharose beads, silica gel beads, polysaccharide beads, polystyrene plates, glass plates, polystyrene tubes, and the like. Immobilization of the peptide of the present invention on these solid phases can be performed using methods well known to those skilled in the art, for example, physical adsorption method, covalent bond method, ion bond method and the like. Immobilization is preferably carried out by a covalent bond, and a chemical functional group (for example, hydroxy group, amino group, N-hydroxysuccinimidyl group, etc.), preferably an alkylene chain having about 4 to 20 carbon atoms, is provided on the solid surface. It has a chemical functional group as a spacer and chemically reacts with the carboxy terminus of the peptide to form an ester bond or an amide bond. The solid phase on which the peptide of the present invention is immobilized can be packed in a column such as an affinity chromatography column or HPLC column and used to detect, purify or separate IgY.
<IgYの精製法>
本発明はさらに、上記のペプチド又は固定化ペプチドをIgYと結合させること、並びに、結合したIgYを遊離させてIgYを回収することを含む、IgYの精製方法を提供する。
<IgY purification method>
The present invention further provides a method for purifying IgY, comprising binding the above-mentioned peptide or immobilized peptide to IgY, and releasing the bound IgY to recover IgY.
本発明のペプチドを固定化した固相を、アフィニティークロマトグラフィーカラム、HPLCカラム等のカラムに充填し、適当なバッファーで平衡化し、室温〜0℃、好ましくは約10℃〜0℃の低温(更に好ましくは約4℃)でIgYを含有する液をアプライし、固相上のペプチドにトリIgYを結合させる。例えば血清中のIgYを分離する場合には、中性域のpH、例えばpH6.0〜7.5のバッファーを使用してカラムにアプライし、結合操作を行うことができる。溶出は、酸性域のpH、例えばpH2〜4のバッファー(例えば0.3MのNaClを含有するpH3.5からpH2.5の0.2Mグリシン-HClバッファー)をカラムに流して行うことができる。 The solid phase on which the peptide of the present invention has been immobilized is packed into a column such as an affinity chromatography column or HPLC column, equilibrated with an appropriate buffer, and cooled to room temperature to 0 ° C, preferably about 10 ° C to 0 ° C (further, A solution containing IgY is preferably applied at about 4 ° C. to bind triIgY to the peptide on the solid phase. For example, when separating IgY in serum, a binding operation can be performed by applying to a column using a buffer having a neutral pH, for example, pH 6.0 to 7.5. Elution can be carried out by passing a pH range of acid, for example, pH 2-4 buffer (for example, pH 3.5 to pH 2.5 0.2 M glycine-HCl buffer containing 0.3 M NaCl) through the column.
IgYが回収されたかどうかは、例えば、電気泳動、その後の抗トリIgY抗体を使用するウエスタンブロット法によって測定できる。泳動は、5〜20%アクリルアミドグラジエントゲルを用いたSDS-PAGEを行い、また、ウエスタンブッロトは、泳動後のタンパク質をPVDF膜に転写し、スキムミルクでブロッキングした後、適当な標識抗体等を用いて検出を行うことができる。 Whether or not IgY has been recovered can be measured, for example, by electrophoresis followed by Western blotting using an anti-tri-IgY antibody. Electrophoresis was performed by SDS-PAGE using a 5-20% acrylamide gradient gel. Western blot transferred the protein after migration to a PVDF membrane, blocked with skim milk, and then used an appropriate labeled antibody. Can be detected.
本発明の方法は、種々の方法で生産されたIgY含有生産物からIgYを精製する工程のなかでIgYに富む画分を得る場合に有用である。それゆえに、アフィニティークロマトグラフィー、HPLC等のカラムクロマトグラフィーにおいて本発明の方法を使用することが好ましい。IgYの精製に際しては、このようなクロマトグラフィー法に加えて、タンパク質の慣用的な精製技術、例えばゲルろ過クロマトグラフィー、イオン交換カラムクロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィーなどのクロマトグラフィー、硫安分画、限外ろ過などを適宜組み合わせることができる。 The method of the present invention is useful for obtaining an IgY-rich fraction in a process of purifying IgY from an IgY-containing product produced by various methods. Therefore, it is preferable to use the method of the present invention in column chromatography such as affinity chromatography and HPLC. In the purification of IgY, in addition to such chromatographic methods, conventional protein purification techniques such as gel filtration chromatography, ion exchange column chromatography, reverse phase column chromatography, etc., ammonium sulfate fractionation, Ultrafiltration and the like can be combined as appropriate.
<IgYの分析法>
本発明はさらに、上記の本発明のペプチド又は固定化ペプチドにサンプル中のIgYを結合させ、結合したIgYを検出することを含む、IgYの検出方法を提供する。ここで、検出には、定性又は定量のいずれかの分析を含むものとする。
<Analysis method of IgY>
The present invention further provides a method for detecting IgY, which comprises binding IgY in a sample to the above-described peptide of the present invention or immobilized peptide, and detecting the bound IgY. Here, detection shall include either qualitative or quantitative analysis.
IgYの検出は、操作中に適するバッファーを使用しながら、メンブランやポリスチレンウエルプレートなどにサンプルを結合し、これに本発明の標識ペプチドを接触させ、必要に応じて洗浄後、標識のレベルを定性又は定量することによって行うことができる。 For detection of IgY, the sample is bound to a membrane or polystyrene well plate using a suitable buffer during the operation, and the labeled peptide of the present invention is contacted with this. After washing as necessary, the level of the label is qualitatively determined. Or it can carry out by quantifying.
あるいは、上記のような本発明のペプチドを固定化したHPLCカラムを使用する場合には、該カラムに、トリIgYを含有するサンプルを注入し、結合バッファーを流してペプチドにトリIgYを結合し、例えば吸光度280nm又は450nmで、もしくは280nmの励起光による350nmの蛍光で、タンパク質を検出し記録し、溶出緩衝液(例えば、0.15MのNaClを含む0.1Mグリシン塩酸緩衝液pH2.5へのグラジエント溶出)にてカラムから溶出させ、現れたピーク及びピーク面積により、IgYの定性及び定量を行うことができる。 Alternatively, when using an HPLC column on which the peptide of the present invention is immobilized as described above, a sample containing tri-IgY is injected into the column, and a binding buffer is passed to bind tri-IgY to the peptide. For example, detect and record protein with absorbance at 280 nm or 450 nm, or 350 nm fluorescence with 280 nm excitation light, and elution in elution buffer (eg, 0.1 M glycine hydrochloride buffer pH 2.5 containing 0.15 M NaCl) ), And qualitative and quantitative determination of IgY can be performed by the peak and peak area that are eluted from the column.
<キット及びカラム>
本発明はさらに、上記の本発明のペプチド又は固定化ペプチドの少なくとも1種を含む、IgYの分析(定性、定量等)又は精製のためのキットを提供する。
<Kit and column>
The present invention further provides a kit for analysis (qualitative, quantitative, etc.) or purification of IgY, comprising at least one of the above-mentioned peptides or immobilized peptides of the present invention.
本発明のキットに含まれる個々のペプチド又は固定化ペプチドは、個別の容器に収容される。また、必要であれば、IgYの分析手順や精製手順を記載した使用説明書をキットに備えてもよい。さらにキットには、分析に必要な試薬やバッファー、固定化ペプチド充填カラムなどを含めてもよい。 Individual peptides or immobilized peptides contained in the kit of the present invention are accommodated in individual containers. Further, if necessary, the kit may be provided with instructions for use that describe the analysis procedure and purification procedure of IgY. Furthermore, the kit may contain reagents and buffers necessary for analysis, an immobilized peptide packed column, and the like.
本発明はさらに、上記の本発明の固定化ペプチドを含有する、IgY分離用カラムを提供する。
固定化ペプチドは、ペプチドを、一般にクロマトグラフィー用の担体(充填材)に共有的に又は非共有的に結合することによって作製されうる。そのような担体の例は、アガロースやセファロースなどの多糖類ベースの担体、シリカゲルベースの担体、樹脂ベース若しくはポリマーベースの担体などである。ペプチドを担体に結合するときには、炭化水素鎖(例えばC4〜C16)のようなスペーサーを介して結合してもよい。
The present invention further provides an IgY separation column containing the above-described immobilized peptide of the present invention.
Immobilized peptides can be produced by covalently or non-covalently binding peptides to a chromatographic support (packing material). Examples of such carriers are polysaccharide-based carriers such as agarose and sepharose, silica gel-based carriers, resin-based or polymer-based carriers. When the peptide is bound to the carrier, it may be bound via a spacer such as a hydrocarbon chain (for example, C4 to C16).
上記IgY分離用カラムは、IgYを分離するためのカラムであり、具体的には、IgYの分析又は精製・分取のための、クロマトグラフィーカラム、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)カラム等のカラムを包含する。カラムのサイズは、特に制限されないものとし、分析用、精製・分取用などの用途、アプライ(搭載)又は注入する量、などに応じて変化させうる。また、カラムの材質は、金属、プラスチック、ガラス等の、カラムとして通常使用されるようなものでよい。 The above-mentioned column for separating IgY is a column for separating IgY, and specifically, a column such as a chromatography column or a high performance liquid chromatography (HPLC) column for analyzing or purifying / sorting IgY. Include. The size of the column is not particularly limited, and can be changed according to the use for analysis, purification and fractionation, the amount to be applied (loaded) or injected. The material of the column may be a metal, plastic, glass, or the like that is usually used as a column.
上記のカラムは、上記の手法に準じて作製した本発明の固定化ペプチド(乾燥又は湿潤状態)をカラムに密に充填することによって製造できる。 The above-mentioned column can be produced by closely packing the immobilized peptide (dried or wet state) of the present invention prepared according to the above-described method into the column.
以下に、実施例を挙げて本発明をさらに具体的に説明するが、本発明の範囲は、それらの実施例によって制限されないものとする。 EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples. However, the scope of the present invention is not limited by these examples.
[実施例1]
<IgY結合ペプチドの探索>
T7ファージ提示法によって構築した2つのCysによって環状構造を持つランダムペプチドライブラリを用いたニワトリIgYに対するバイオパンニングによって、ニワトリIgYに結合するファージクローン3種を得た。
[Example 1]
<Search for IgY-binding peptides>
Three phage clones that bind to chicken IgY were obtained by biopanning on chicken IgY using a random peptide library having a cyclic structure with two Cys constructed by the T7 phage display method.
得られた3種のファージの提示するペプチドの配列とELISAによる結合活性を図1に示す。得られたファージは、いずれもニワトリIgYもしくは、そのFc断片(IgY-Fc)にのみ結合活性を示し、その他のタンパク質には結合活性を示さなかった。得られたクローンが提示するペプチドのアミノ酸配列の比較では、ライブラリ由来の2つのCysの内側に、2つのTrpを含む保存性の高いアミノ酸が見られた(図1A)。 FIG. 1 shows the sequences of peptides displayed by the three phages obtained and the binding activity by ELISA. All of the obtained phages showed binding activity only to chicken IgY or its Fc fragment (IgY-Fc), and did not show binding activity to other proteins. In the comparison of the amino acid sequences of the peptides presented by the obtained clones, amino acids with high conservability including two Trps were found inside the two Cys derived from the library (FIG. 1A).
3つのクローンのうち、Y4-4とY5-55について、ペプチド合成を行い、その結合活性を評価した。ペプチド合成は、N末にビオチン化(PEG)4を付加し、かつ、C末をアミド化したペプチドを合成し、分子内のSS結合は空気酸化により形成させた後、逆相カラムで精製したものを用いた。 Among the three clones, Y4-4 and Y5-55 were synthesized with peptides and their binding activities were evaluated. Peptide synthesis was performed by adding biotinylated (PEG) 4 to the N terminus and amidating the C terminus, and forming an SS bond in the molecule by air oxidation, followed by purification on a reverse phase column. A thing was used.
図2にELISAでのこれらのペプチドの結合活性を示す。2種のペプチドとも、IgY並びにIgY-Fcへ特異的な結合活性を示した。 FIG. 2 shows the binding activity of these peptides by ELISA. Both types of peptides showed specific binding activity to IgY and IgY-Fc.
さらに、このペプチドを用いて、BIAcore T-200でのSPRによる親和性解析を行った結果を図3に示す。 Furthermore, FIG. 3 shows the results of affinity analysis by SPR with BIAcore T-200 using this peptide.
Y4-4ペプチドは、IgY及びIgY-Fcに対して、ほぼ同じ親和性(7.0、7.8μMのKd値)で結合し、一方Y5-55ペプチドは、若干強い結合力(4.2、4.1μMのKd値)で結合したことから、これらのペプチドは、精製用リガンドとして、十分機能することが期待された(表1)。 The Y4-4 peptide binds to IgY and IgY-Fc with approximately the same affinity (7.0, Kd values of 7.8 μM), whereas the Y5-55 peptide binds slightly stronger (4.2, 4.1 μM Kd) These peptides were expected to function satisfactorily as purification ligands (Table 1).
さらにまた、上記と同様に、T7ファージ提示法によって構築した2つのCysによって環状構造を持つランダムペプチドライブラリを用いたニワトリIgYに対するバイオパンニングによって、ニワトリIgYに結合するファージクローン6種を得た(表2)。 Furthermore, in the same manner as described above, six phage clones that bind to chicken IgY were obtained by biopanning on chicken IgY using a random peptide library having a cyclic structure with two Cys constructed by the T7 phage display method (Table 1). 2).
配列決定された表中のペプチドはいずれも、C4-X5-W6-X7X8X9X10G11-W12-X13-C14の構造を有しており、11位のアミノ酸残基(X11)がすべてGlyであったことを除いて、図1に示した基本骨格と同じであった。 All of the peptides in the sequenced table have the structure C 4 -X 5 -W 6 -X 7 X 8 X 9 X 10 G 11 -W 12 -X 13 -C 14 and position 11 The basic skeleton shown in FIG. 1 was the same except that all amino acid residues (X 11 ) were Gly.
<IgYの精製>
得られたIgY結合ペプチドの有用性を検討するために、IgY結合ペプチドを結合させたビーズを使ってIgYの回収が可能かどうかを検討した。
<Purification of IgY>
In order to examine the usefulness of the obtained IgY-binding peptide, it was examined whether or not IgY could be recovered using beads to which the IgY-binding peptide was bound.
すなわち、SA(ストレプトアビジン)固定化ビーズ(SA-Agarose:1 nmol SA/10μl)に、ビオチン化Y4-4, Y5-55ペプチド(10nmol/100μl)を加え結合させ、洗浄により余分なペプチドを除いた。このビーズに、IgY溶液(30μg/100ul 0.25NaClを含む25mMPB)を加え、室温で1時間反応後、遠心分離によりビーズを回収し、0.25NaClを含む25mMPBで2回洗浄した。その後、ビーズを90μlのSDSサンプル溶液に分散し、3分の1(30μl)を用いてSDS-PAGEを行い、泳動後ゲルのCBB染色を行った結果を図4に示す。 Specifically, biotinylated Y4-4 and Y5-55 peptides (10 nmol / 100 μl) were added to SA (streptavidin) -immobilized beads (SA-Agarose: 1 nmol SA / 10 μl) and bound, and the excess peptide was removed by washing. It was. An IgY solution (25 mMPB containing 30 μg / 100 ul of 0.25 NaCl) was added to the beads, and after reacting at room temperature for 1 hour, the beads were collected by centrifugation and washed twice with 25 mMPB containing 0.25 NaCl. Thereafter, the beads were dispersed in 90 μl of SDS sample solution, subjected to SDS-PAGE using 1/3 (30 μl), and the results of CBB staining of the gel after electrophoresis are shown in FIG.
Y4-4並びにY5-55ペプチドを固定化したビーズでは、溶液からIgYの回収に成功した(図4、レーン1、3)。一方で、コントロールとして用いたヒトIgGは、このビーズではほとんど回収されなかった(図4、レーン2、4)。またペプチドを固定化していないビーズを用いた場合でも、IgYの回収はできなかった(図4、レーン5)。このように、今回、同定されたIgY結合ペプチドは、IgYを溶液からビーズ沈降によって回収するためのアフィニティリガンドとして機能することが分かった。
With beads immobilized with Y4-4 and Y5-55 peptides, IgY was successfully recovered from the solution (FIG. 4,
さらに、IgY結合ペプチドが、IgY精製用のカラムのアフィニティリガンドとして機能するかどうかを検討するために、SA固定化カラム(GE Healthcare, HiTrap-SA, 1ml)に、ビオチン化ペプチドを固定化したカラムを作製し、このカラムへのIgYの結合挙動を調べた(図5)。 Furthermore, in order to examine whether IgY-binding peptides function as affinity ligands for IgY purification columns, columns with biotinylated peptides immobilized on SA immobilized columns (GE Healthcare, HiTrap-SA, 1 ml) And the binding behavior of IgY to this column was examined (Fig. 5).
対照実験として、HiTrap-SAカラム(1ml)にビオチンを加え、SAを飽和させたカラムに、IgY、IgY-FcもしくはヒトIgGをインジェクトしたところ、図5Aのように、いずれのタンパク質も、素通りの分画に溶出された。次に、Y4-4(図5B)もしくは、Y5-55ペプチド(図5C)を固定化したカラムを用いて実験を行ったところ、ヒトIgGは、素通り画分に溶出されたが、IgY並びにIgY-Fcは、ほぼ全量がカラムに吸着された。また、5分後に0.1M Glycine-HCl(pH2.5)の溶出液へ切り替えることで、約11分に結合したIgY並びにIgY-Fcがピークとして溶出された(ただし、約17分にあるピークは、0.1M Glycine-HClからPBSに切り替えた際に溶出されたタンパク質である)。以上のことは、Y4-4もしくは、Y5-55を固定化したカラムは、ニワトリIgYを精製するためのアフィニティカラムとして十分機能することを示している。 As a control experiment, biotin was added to a HiTrap-SA column (1 ml), and IgY, IgY-Fc or human IgG was injected into a column saturated with SA. As shown in FIG. Were eluted in the fractions. Next, when an experiment was performed using a column on which Y4-4 (FIG. 5B) or Y5-55 peptide (FIG. 5C) was immobilized, human IgG was eluted in the flow-through fraction, but IgY and IgY -Fc was almost completely adsorbed on the column. In addition, by switching to an eluent of 0.1 M Glycine-HCl (pH 2.5) after 5 minutes, IgY and IgY-Fc bound to about 11 minutes were eluted as peaks (however, the peak at about 17 minutes is , The protein eluted when switching from 0.1 M Glycine-HCl to PBS). The above shows that the column on which Y4-4 or Y5-55 is immobilized functions sufficiently as an affinity column for purifying chicken IgY.
最後に、図5で用いたY4-4ペプチドを固定化したカラムを用いて、ニワトリ卵黄の抽出物からのIgYの精製を検討した。卵黄1mlを0.25M NaClを含む50mM PB(pH7.0)で、5倍に希釈後、4℃で一晩、ゆっくりと撹拌した。遠心分離(10000g×15分)にて、不溶性画分を沈殿させ、上澄み(5ml)をカラムにアプライした。0.25M NaClを含む50mM PB(pH7.0)でカラムを洗浄後、pH2.5の0.1M グリシン塩酸緩衝液(図6A)もしくは、pH3.0の同緩衝液(図6B)で溶出した。卵黄抽出画分、pH2.5ならびに3.0での溶出による精製での素通り(約18分)ならびに溶出画分(約43分)について、SDS-PAGEを行った(図6C)。ペプチド固定化カラムによる精製では、卵黄中に含まれるIgY以外のタンパク質は素通り画分に回収され、カラムに吸着され酸性pHで溶出された画分は、ほぼIgYのみのバンドが見られた。これ科の結果は、本ペプチド固定化カラムが、実際に卵黄からのIgYの特異的かつ効率的な精製カラムとして機能することを示している。 Finally, purification of IgY from chicken egg yolk extract was examined using the column immobilized with Y4-4 peptide used in FIG. 1 ml of egg yolk was diluted 5-fold with 50 mM PB (pH 7.0) containing 0.25 M NaCl, and then slowly stirred at 4 ° C. overnight. The insoluble fraction was precipitated by centrifugation (10000 g × 15 minutes), and the supernatant (5 ml) was applied to the column. After washing the column with 50 mM PB (pH 7.0) containing 0.25 M NaCl, the column was eluted with 0.1 M glycine hydrochloride buffer (pH 6A) or pH 3.0 (FIG. 6B). SDS-PAGE was performed on the yolk extract fraction, the flow through purification by elution at pH 2.5 and 3.0 (about 18 minutes) and the eluted fraction (about 43 minutes) (FIG. 6C). In the purification using the peptide-immobilized column, proteins other than IgY contained in the egg yolk were collected in the flow-through fraction, and the fraction adsorbed on the column and eluted at acidic pH showed a band almost exclusively of IgY. The results of this family show that this peptide-immobilized column actually functions as a specific and efficient purification column for IgY from egg yolk.
本発明により、IgY抗体に特異的に結合可能なペプチドが提供される。このペプチドを固定化したアフィニティカラムを用いることにより、IgYを高度に精製することが可能になった。 According to the present invention, a peptide capable of specifically binding to an IgY antibody is provided. By using an affinity column on which this peptide is immobilized, IgY can be highly purified.
配列番号1〜9:人工配列 Sequence number 1-9: Artificial sequence
Claims (16)
(X1-3)-C-(X5)-W-(X7-11)-W-(X13)-C-(X15-17) (I)
(式中、X 1-3 が、N末端側からC末端側へのアミノ酸配列GVK、GTR、RCV、WIR、EWS、GTS、ATT、VNV及びGTWからなる群から選択され、
Cはシステイン残基であり、
X5は、T、D、V、S又はEのアミノ酸残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
X7-11は、N末端側からC末端側へのアミノ酸配列SSIVD、SAAYG、TAVTG、TKVTG、RKTTG、NRGRG、TRGSG、RSGRG及びRRTSGからなる群から選択され、
X13は、V、L、D、S、M、T又はRのアミノ酸残基であり、並びに、
X 15-17 は、N末端側からC末端側へのアミノ酸配列VDM、YDY、RND、FAS、DRD、NTP、YSV、SKS及びGIGからなる群から選択される)によって表される、17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、4位のシステイン残基と14位のシステイン残基との間でジスルフィド結合を形成しており、並びに、トリIgYと結合可能であることを特徴とするペプチド。 Formula (I) below:
(X 1-3 ) -C- (X 5 ) -W- (X 7-11 ) -W- (X 13 ) -C- (X 15-17 ) (I)
( Wherein X 1-3 is selected from the group consisting of amino acid sequences GVK, GTR, RCV, WIR, EWS, GTS, ATT, VNV and GTW from the N-terminal side to the C-terminal side ,
C is a cysteine residue;
X 5 is an amino acid residue of T, D, V, S or E;
W is a tryptophan residue;
X 7-11 is selected from the group consisting of the amino acid sequence SSIVD, SAAYG, TAVTG, TKVTG, RKTTG, NRGRG, TRGSG, RSGRG and RRTSG from the N-terminal side to the C-terminal side ,
X 13 is a V, L, D, S, M, T or R amino acid residue, and
X 15-17 is selected from the group consisting of the amino acid sequence VDM, YDY, RND, FAS, DRD, NTP, YSV, SKS, and GIG from the N-terminal side to the C-terminal side. A peptide comprising an amino acid sequence comprising a group, having a disulfide bond formed between a cysteine residue at position 4 and a cysteine residue at position 14, and capable of binding to triIgY.
GVKCTWSSIVDWVCVDM(配列番号1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY(配列番号2)
RCVCVWTAVTGWDCRND(配列番号3)
WIRCDWTKVTGWVCFAS (配列番号4)
EWSCVWRKTTGWSCDRD (配列番号5)
GTSCSWNRGRGWMCNTP (配列番号6)
ATTCTWTRGSGWSCYSV (配列番号7)
VNVCEWRSGRGWTCSKS (配列番号8)
GTWCTWRRTSGWRCGIG (配列番号9) The peptide according to any one of claims 1 to 6 , which comprises any one of the following amino acid sequences.
GVKCTWSSIVDWVCVDM (SEQ ID NO: 1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY (SEQ ID NO: 2)
RCVCVWTAVTGWDCRND (SEQ ID NO: 3)
WIRCDWTKVTGWVCFAS (SEQ ID NO: 4)
EWSCVWRKTTGWSCDRD (SEQ ID NO: 5)
GTSCSWNRGRGWMCNTP (SEQ ID NO: 6)
ATTCTWTRGSGWSCYSV (SEQ ID NO: 7)
VNVCEWRSGRGWTCSKS (SEQ ID NO: 8)
GTWCTWRRTSGWRCGIG (SEQ ID NO: 9)
GVKCTWSSIVDWVCVDM(配列番号1)GVKCTWSSIVDWVCVDM (SEQ ID NO: 1)
GTRCDWSAAYGWLCYDY(配列番号2)GTRCDWSAAYGWLCYDY (SEQ ID NO: 2)
RCVCVWTAVTGWDCRND(配列番号3)RCVCVWTAVTGWDCRND (SEQ ID NO: 3)
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