JP5990888B2 - Recombinant producing human methyl sterol oxidase and use thereof - Google Patents

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Description

本発明は、ヒト由来メチルステロール酸化酵素を生産する組換体及びその利用に関する。特に本発明は、ヒト由来メチルステロール酸化酵素を生産する組換体並びにこの組換体を利用した分析方法及び製造方法に関する。   The present invention relates to a recombinant that produces human-derived methylsterol oxidase and use thereof. In particular, the present invention relates to a recombinant producing a human-derived methyl sterol oxidase, and an analysis method and a production method using the recombinant.

医薬品開発において、ヒト体内における医薬品代謝物の解析は重要である。同様に食品成分の代謝についても検討が成されつつある。これまでに種々の医薬品あるいは食品成分の代謝物の解析が行われてきた。   In drug development, analysis of drug metabolites in the human body is important. Similarly, the metabolism of food components is being studied. So far, analysis of metabolites of various pharmaceuticals or food ingredients has been performed.

ところで、ヒト由来メチルステロール酸化酵素(SC4MOL)はコレステロール生合成経路において4,4'-ジメチル-5α-コレスト-8-エン-3β-オール(4,4'-dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol)の4位および4'位メチル基脱離反応を触媒する、生理的にきわめて重要な酵素である。SC4MOL遺伝子を欠損するヒトはコレステロール中間体の蓄積によるさまざまな障害が生じることが知られている(非特許文献1)。しかしながら、SC4MOLが医薬品や食品成分の代謝に関与することは全く知られていない。しかしながら、SC4MOLが医薬品や食品成分の代謝に関与する場合には、SC4MOLを阻害する医薬品・食品成分は副作用を及ぼす可能性があり、医薬品開発の初期段階において、阻害、代謝の両者を調べる必要があるのではないか、と本発明者らは考えている。   By the way, human methyl sterol oxidase (SC4MOL) is 4,4'-dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol (4,4'-dimethyl-5α-cholest-8-en) in the cholesterol biosynthesis pathway. -3β-ol) is a physiologically important enzyme that catalyzes the elimination of the 4- and 4'-position methyl groups. It is known that humans deficient in the SC4MOL gene cause various disorders due to accumulation of cholesterol intermediates (Non-patent Document 1). However, it is not known that SC4MOL is involved in the metabolism of pharmaceuticals and food ingredients. However, when SC4MOL is involved in the metabolism of drugs and food ingredients, the drugs and food ingredients that inhibit SC4MOL may have side effects, and it is necessary to investigate both inhibition and metabolism in the early stages of drug development. The present inventors think that there may be.

薬物代謝において中心的役割を果たしているのはシトクロムP450を中心とするフェイズI酵素群と、高い水溶性を与えるための抱合反応を触媒するフェイズII酵素群であり、これら多くの酵素によって多種多様な生体異物を代謝、排泄することを可能にしている。本発明者らは骨粗鬆症治療薬として販売されているビタミンD誘導体、エルデカルシトールの代謝研究において、これまでに知られている薬物代謝酵素の代謝だけでは説明できない代謝が存在することを見出した。薬物代謝研究においてこのような状況に陥ることは往々にしてあるが、詳細な研究がなされないまま製品化される場合が多い。副作用問題の原因となる薬物間相互作用や薬物-食品相互作用を予測・解決するためには、代謝酵素の同定は必須である。   The central role in drug metabolism is the Phase I enzyme group centered on cytochrome P450 and the Phase II enzyme group catalyzing the conjugation reaction to give high water solubility. It makes it possible to metabolize and excrete xenobiotics. The present inventors have found that there is a metabolism that cannot be explained only by the metabolism of a drug-metabolizing enzyme that has been known so far in the study of metabolism of a vitamin D derivative, eldecalcitol, which is sold as an osteoporosis therapeutic agent. This situation often occurs in drug metabolism research, but in many cases, it is commercialized without detailed research. Identification of metabolic enzymes is essential for predicting and solving drug-drug interactions and drug-food interactions that cause side-effect problems.

上記のエルデカルシトールを代謝する酵素はNADHあるいはNADPHを必要とすることがわかった。そこで、ビタミンD誘導体であるエルデカルシトールの代謝にSC4MOLが関与しているかを検討することにした。SC4MOLの関与を検討する手段として、例えば、SC4MOL特異的阻害剤と言われている化合物が存在する。しかし、この化合物はSC4MOLに対する特異性がそれほど高くなかった。また、SC4MOL抗体が市販されているが、活性阻害の報告はなく、決め手になる実験を容易に行うことはできなかった。   It was found that the above-mentioned enzyme that metabolizes eldecalcitol requires NADH or NADPH. Therefore, we decided to investigate whether SC4MOL is involved in the metabolism of the vitamin D derivative eldecalcitol. As a means for examining the involvement of SC4MOL, for example, there are compounds called SC4MOL-specific inhibitors. However, this compound was not very specific for SC4MOL. Moreover, although SC4MOL antibody is commercially available, there has been no report of activity inhibition, and decisive experiments could not be easily performed.

そこで、まずは、ヒト由来SC4MOLの発現系を探索することとした。これまでにSC4MOLを発現させた例としては哺乳動物由来培養細胞(特許文献1)がある。   Therefore, first, we decided to search for an expression system for human-derived SC4MOL. An example of SC4MOL that has been expressed so far is a mammal-derived cultured cell (Patent Document 1).

US 2010/0021892 A1US 2010/0021892 A1

He M, Kratz LE, Michel JJ, Vallejo AN, Ferris L, Kelley RI, Hoover JJ, Jukic D, Gibson KM, Wolfe LA, Ramachandran D, Zwick ME, Vockley J. (2011) J Clin Invest. 121,976-984.He M, Kratz LE, Michel JJ, Vallejo AN, Ferris L, Kelley RI, Hoover JJ, Jukic D, Gibson KM, Wolfe LA, Ramachandran D, Zwick ME, Vockley J. (2011) J Clin Invest. 121,976-984. Yasuda K, Ikushiro S, Kamakura M, Ohta M and Sakaki T (2010). Drug Metab Dispos.38(12):2117-2123Yasuda K, Ikushiro S, Kamakura M, Ohta M and Sakaki T (2010). Drug Metab Dispos. 38 (12): 2117-2123 Nishihara K, Kanemori M, Kitagawa M, Yanagi H, Yura T. (1998). Appl Environ Microbiol. 64,1694-1699Nishihara K, Kanemori M, Kitagawa M, Yanagi H, Yura T. (1998). Appl Environ Microbiol. 64,1694-1699

SC4MOLは、もともとヒト由来の酵素であることから、特許文献1に記載のように、哺乳動物由来培養細胞での発現は容易である。しかも、哺乳動物由来培養細胞においては、NADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5が存在するため、SC4MOL活性が発現するであろうことは容易に推察できる。NADHからNADH-cyt.b5 還元酵素、cyt.b5を介して最後にSC4MOLへと電子が渡る電子伝達系、あるいはNADPHからNADPH-P450 還元酵素、cyt.b5を介して最後にSC4MOLへと電子が渡る電子伝達系によってSC4MOLの鉄原子が還元されることにより活性が発揮されるからである。しかし、哺乳動物由来培養細胞は増殖が遅く、大量の代謝物を短時間で生産するには適していない。一方、酵母や大腸菌などの微生物は、哺乳動物由来培養細胞に比べて、増殖が速く、大量の代謝物を短時間で生産するには適している。   Since SC4MOL is originally a human-derived enzyme, as described in Patent Document 1, it can be easily expressed in mammalian-derived cultured cells. In addition, since cultured cells derived from mammals have NADH-cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase and cyt.b5, it can be easily assumed that SC4MOL activity will be expressed. Electrons are transferred from NADH to NADH-cyt.b5 reductase and finally to SC4MOL via cyt.b5, or from NADPH to NADPH-P450 reductase and finally to SC4MOL via cyt.b5. This is because the activity is exhibited when the iron atom of SC4MOL is reduced by the crossing electron transfer system. However, cultured cells derived from mammals are slow to grow and are not suitable for producing a large amount of metabolites in a short time. On the other hand, microorganisms such as yeast and Escherichia coli grow faster than mammalian-derived cultured cells and are suitable for producing a large amount of metabolites in a short time.

しかし、ヒト由来SC4MOLが、微生物において活性を発現し得るかは極めて疑問であった。何故なら、SC4MOLは本来、小胞体膜に結合している膜結合型の酵素であるため、タンパク質としての発現が困難であることが予想された。さらに、微生物は、SC4MOLの活性発現に必要な電子伝達系NADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5を有さないか、あるいは、有する場合であっても、ヒトのNADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5とは構造が異なるためである。微生物において、SC4MOLのタンパク質が発現しても、電子伝達系NADH-cyt.b5 還元酵素とcyt.b5あるいはNADPH-P450 還元酵素とcyt.b5との連携が上手く機能しなければ、SC4MOLの活性発現は得られないからである。   However, it was extremely questionable whether human-derived SC4MOL can express activity in microorganisms. Because SC4MOL is originally a membrane-bound enzyme that binds to the endoplasmic reticulum membrane, it was expected that expression as a protein would be difficult. In addition, the microorganisms may or may not have the electron transfer systems NADH-cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase and cyt.b5 necessary for the expression of SC4MOL activity. This is because the structures are different from those of -cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase and cyt.b5. Even if the SC4MOL protein is expressed in microorganisms, the interaction between the electron transport system NADH-cyt.b5 reductase and cyt.b5 or NADPH-P450 reductase and cyt.b5 does not function properly. It is because it is not possible to obtain.

そこで本発明の目的は、ヒト由来メチルステロール酸化酵素(SC4MOL)を発現し、かつSC4MOL活性を発現し得る組換え微生物を提供することにある。さらに本発明は、SC4MOL活性を発現し得る組換え微生物を用いた、SC4MOLによる代謝物の分析方法及び製造方法を提供することにある。   Accordingly, an object of the present invention is to provide a recombinant microorganism that expresses human-derived methylsterol oxidase (SC4MOL) and can express SC4MOL activity. Furthermore, the present invention is to provide a method for analyzing and producing a metabolite by SC4MOL using a recombinant microorganism capable of expressing SC4MOL activity.

本発明者らは、ヒト由来SC4MOLをコードするcDNAを微生物内で発現させることを試みた。まず、内在性のNADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5を有する出芽酵母を用いてSC4MOLタンパク質を発現させること、さらには、SC4MOL活性の発現を試みた。出芽酵母が有するNADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5は、哺乳動物由来のNADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5とは相同性がそれぞれ34、32及び28%しかなく、非常に低い。そのため、出芽酵母の菌体内において、発現したSC4MOLに対してうまく電子を供与できるかどうか非常に疑わしかった。また、大腸菌においてもSC4MOLの発現とSC4MOL活性の発現を試みた。大腸菌にはNADH-cyt.b5 還元酵素、NADPH-P450 還元酵素及びcyt.b5に相当する酵素は存在しない。従って、SC4MOLはタンパク質としては発現しても、SC4MOL活性は発現し得ないと予想された。   The present inventors tried to express a cDNA encoding human-derived SC4MOL in a microorganism. First, SC4MOL protein was expressed using budding yeast having endogenous NADH-cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase and cyt.b5, and further, expression of SC4MOL activity was attempted. NADH-cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase and cyt.b5 in budding yeast are homologous to mammalian NADH-cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase and cyt.b5, respectively. Only 34, 32 and 28%, very low. Therefore, it was very doubtful whether electrons could be successfully donated to the expressed SC4MOL in the budding yeast cells. We also attempted to express SC4MOL and SC4MOL activity in E. coli. There is no NADH-cyt.b5 reductase, NADPH-P450 reductase, or an enzyme corresponding to cyt.b5 in E. coli. Therefore, even if SC4MOL was expressed as a protein, it was expected that SC4MOL activity could not be expressed.

本発明者らは、ヒト由来SC4MOLをコードするcDNAをクローニングし、出芽酵母及び大腸菌内で発現させることを試みた。その結果、予想外にも、ヒト由来SC4MOLをコードするcDNAを導入した組換え出芽酵母及び大腸菌のいずれにおいても、SC4MOLが発現し、かつSC4MOL活性が得られることを見出して本発明を完成させた。   The present inventors have attempted to clone a cDNA encoding human-derived SC4MOL and to express it in budding yeast and Escherichia coli. As a result, it was unexpectedly found that SC4MOL was expressed and SC4MOL activity was obtained in both recombinant budding yeast and E. coli introduced with cDNA encoding human-derived SC4MOL, and the present invention was completed. .

さらに本発明者らは、SC4MOL活性を発現する微生物を用いてエルデカルシトールに対する反応性について検討した。その結果、SC4MOLはエルデカルシトールに対して酵素活性を示し、従って、SC4MOLはエルデカルシトールの代謝に関与し得ることが判明した。この結果に基づいて、ヒト由来SC4MOL活性を発現し得る本発明の組換え出芽酵母または大腸菌を用いることで、SC4MOLによる種々の代謝物の製造と分析が可能になることも見出して本発明を完成させた。   Furthermore, the present inventors examined the reactivity to eldecalcitol using a microorganism that expresses SC4MOL activity. As a result, it was found that SC4MOL showed enzyme activity against eldecalcitol, and therefore SC4MOL could be involved in the metabolism of eldecalcitol. Based on this result, it was found that the use of the recombinant budding yeast or Escherichia coli of the present invention capable of expressing human-derived SC4MOL activity makes it possible to produce and analyze various metabolites using SC4MOL, thereby completing the present invention. I let you.

本発明は、以下のとおりである。
[1]
ヒト由来メチルステロール酸化酵素(SC4MOL)遺伝子を宿主微生物細胞に発現可能な状態で、かつSC4MOL活性を発現し得る状態で導入した組換体。
[2]
宿主微生物が出芽酵母である[1]に記載の組換体。
[3]
SC4MOL遺伝子を載せたプラスミドベクターpGYRを導入して形質転換した出芽酵母である[2]に記載の組換体。
[4]
宿主微生物が大腸菌である[1]に記載の組換体。
[5]
SC4MOL遺伝子を載せたプラスミドベクターpET17bを導入して形質転換した大腸菌である[4]に記載の組換体。
[6]
分析用検体を[1]〜[5]のいずれかに記載の組換体と共にインキュベーションして、分析用検体のSC4MOLによる反応生成物を得、得られた反応生成物を分析することを含む分析用検体のSC4MOLによる反応生成物の分析方法。
[7]
分析用検体が、医薬品若しくは医薬品の候補品、または食品成分若しくは食品成分の候補品である[6]に記載の方法。
[8]
SC4MOLの基質となり得る化合物を、[1〜5いずれかに記載の組換体と共にインキュベーションして、前記化合物のSC4MOLによる反応生成物を得、得られた反応生成物を収集することを含む、SC4MOLの基質となり得る化合物のSC4MOLによる反応生成物の製造方法。
[9]
SC4MOLの基質となり得る化合物、医薬品若しくは医薬品の候補品、または食品成分若しくは食品成分の候補品である[7]に記載の方法。
[10]
分析用検体またはSC4MOLの基質となり得る化合物が、ジメチル-5α-コレスト-8-エン-3β-オール、テストステロン、エルデカルシトール、セサミン、またはエピセサミンである[6]〜[9]のいずれかに記載の方法。
The present invention is as follows.
[1]
A recombinant in which a human-derived methylsterol oxidase (SC4MOL) gene is introduced in a state capable of expressing in a host microbial cell and capable of expressing SC4MOL activity.
[2]
The recombinant according to [1], wherein the host microorganism is budding yeast.
[3]
The recombinant according to [2], which is a budding yeast transformed by introducing a plasmid vector pGYR carrying the SC4MOL gene.
[Four]
The recombinant according to [1], wherein the host microorganism is Escherichia coli.
[Five]
The recombinant according to [4], which is Escherichia coli transformed by introducing a plasmid vector pET17b carrying the SC4MOL gene.
[6]
Incubating the analytical sample with the recombinant according to any one of [1] to [5] to obtain a reaction product of the analytical sample by SC4MOL, and analyzing the obtained reaction product Analysis method of reaction products by SC4MOL of specimens.
[7]
[6] The method according to [6], wherein the sample for analysis is a drug or a drug candidate, or a food ingredient or a food ingredient candidate.
[8]
Incubating a compound that can be a substrate of SC4MOL with the recombinant according to any one of 1 to 5 to obtain a reaction product of SC4MOL of the compound and collecting the obtained reaction product, A method for producing a reaction product by SC4MOL of a compound that can be a substrate.
[9]
[7] The method according to [7], which is a compound that can be a substrate of SC4MOL, a pharmaceutical product or a candidate product for a pharmaceutical product, or a food component or a candidate product for a food component.
[Ten]
[6] to [9], wherein the analyte or the compound that can be a substrate of SC4MOL is dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol, testosterone, eldecalcitol, sesamin, or episesamin the method of.

本発明によれば、ヒト由来メチルステロール酸化酵素(SC4MOL)の活性を発現した、大腸菌及び酵母等の組換え微生物を提供することができる。さらに、これら組換え微生物の菌体を含む培養液あるいはグルコースを含む緩衝液等に種々の医薬品あるいは食品成分を添加し、インキュベートすることにより、種々の代謝物を製造することが可能になった。そのため、以下のような利点がある。
(1)本発明のヒト由来SC4MOL発現微生物は、医薬品・食品成分・環境物質などがヒト体内で、どのような代謝を受けるのか予測するために利用することができる。
(2)代謝物を大量に製造し、その安全性や生理機能を調べることが可能である。
(3)これらの代謝物の中には元の化合物にはない有用な性質を示すことがあるため、新たな医薬品開発のためのツールになると考えられる。
ADVANTAGE OF THE INVENTION According to this invention, recombinant microorganisms, such as colon_bacillus | E._coli and yeast, which expressed the activity of human methyl sterol oxidase (SC4MOL) can be provided. Furthermore, various metabolites can be produced by adding various pharmaceuticals or food ingredients to a culture solution containing the cells of these recombinant microorganisms or a buffer solution containing glucose and incubating them. Therefore, there are the following advantages.
(1) The human-derived SC4MOL-expressing microorganism of the present invention can be used for predicting how a drug, food ingredient, environmental substance and the like undergo metabolism in the human body.
(2) It is possible to manufacture a large amount of metabolites and investigate their safety and physiological functions.
(3) Some of these metabolites may show useful properties that are not found in the original compound, and are considered to be a tool for new drug development.

生理的に重要な機能を持つ酵素SC4MOLが、種々の医薬品・食品成分等を代謝することを見出した我々の結果は予想されなかった事実であり、今後、本酵素が重要な薬物代謝酵素の一つとして位置づけられる可能性が高い。現在、医薬品の開発において代謝酵素の同定は必須であり、代謝酵素が判明しなければ開発が中止される可能性がある。したがって、我々が確立した技術は今後の医薬品開発に必須のものになると思われる。   Our finding that the enzyme SC4MOL, which has a physiologically important function, metabolizes various pharmaceuticals, food ingredients, etc. is an unexpected result. In the future, this enzyme is one of the important drug-metabolizing enzymes. Is likely to be positioned as one. Currently, identification of metabolic enzymes is essential in the development of pharmaceuticals, and development may be stopped if metabolic enzymes are not known. Therefore, the technology we have established will be indispensable for future drug development.

酵母発現用ベクターpGYR-HindIIIへのSC4MOL遺伝子挿入を示す模式図である。FIG. 3 is a schematic diagram showing SC4MOL gene insertion into a yeast expression vector pGYR-HindIII. SC4MOL発現酵母培養24時間後のエルデカルシトール(a)、エピセサミン(b)、パクリタキセル(c)、テストステロン(d)の代謝物のHPLC結果を示した図である。FIG. 4 shows the HPLC results of metabolites of eldecalcitol (a), episesamin (b), paclitaxel (c), and testosterone (d) after 24 hours of culture of SC4MOL-expressing yeast. SC4MOL発現酵母培養によるエルデカルシトール代謝物の質量分析結果および推測される代謝を示した図である。It is the figure which showed the mass spectrometry result of the eldecalcitol metabolite by SC4MOL expression yeast culture, and the estimated metabolism.

<組換体>
本発明の組換体は、ヒト由来メチルステロール酸化酵素(SC4MOL)遺伝子を宿主微生物細胞に発現可能な状態で、かつSC4MOL活性を発現し得る状態で導入した組換体である。ヒト由来SC4MOL遺伝子の塩基配列およびアミノ酸配列は以下のサイトから入手可能であり、また、配列表に配列番号1及び2として記載した。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/5803157
NCBI Reference Sequence: NP_006736.1
<Recombinant>
The recombinant of the present invention is a recombinant in which a human-derived methylsterol oxidase (SC4MOL) gene is introduced in a state capable of expressing in a host microbial cell and capable of expressing SC4MOL activity. The base sequence and amino acid sequence of the human-derived SC4MOL gene can be obtained from the following site, and are described as SEQ ID NOS: 1 and 2 in the sequence listing.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/5803157
NCBI Reference Sequence: NP_006736.1

SC4MOLは、EC番号が1.14.13.72であり、前述のように、コレステロール生合成経路において4,4'-ジメチル-5α-コレスト-8-エン-3β-オールの4位および4'位メチル基脱離反応を触媒して、4β-ヒドロキシメチル-4α-メチル-5α-コレスト-7-エン-3β-オールを生成する酵素である。   SC4MOL has an EC number of 1.14.13.72, and as described above, the 4 and 4 ′ positions of the 4,4′-dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol in the cholesterol biosynthesis pathway are removed. It is an enzyme that catalyzes a release reaction to produce 4β-hydroxymethyl-4α-methyl-5α-cholest-7-en-3β-ol.

本発明の組換体において、宿主微生物細胞として用いられる微生物は、SC4MOL遺伝子を発現可能な状態で導入したときに、SC4MOL活性を発現し得る微生物に限られる。そのような微生物としては、出芽酵母及び大腸菌を挙げることができる。SC4MOL活性の発現には、SC4MOLのタンパク質としての発現に加えて、電子伝達系NADH-cyt.b5 還元酵素及びcyt.b5が細胞内またはその近傍に存在し、かつSC4MOLに電子を供与できる必要がある。そのような機能を有する微生物は、本発明者らが確認したところ、出芽酵母及び大腸菌であった。出芽酵母の菌株には特に制限はないが、例えば、AH22株、SHY3株、NA87-11A株等を挙げることができる。また、大腸菌の菌株には特に制限はないが、例えば、大腸菌K12株由来のJM109, DH5α, TOP10、あるいは大腸菌B株由来のBL21株等を挙げることができる。   In the recombinant of the present invention, microorganisms used as host microorganism cells are limited to microorganisms that can express SC4MOL activity when introduced in a state where the SC4MOL gene can be expressed. Examples of such microorganisms include budding yeast and E. coli. In addition to the expression of SC4MOL as a protein, the expression of SC4MOL activity requires that the electron transport system NADH-cyt.b5 reductase and cyt.b5 be present in or near the cell and be able to donate electrons to SC4MOL. is there. Microorganisms having such a function were budding yeast and Escherichia coli as confirmed by the present inventors. The strain of budding yeast is not particularly limited, and examples thereof include AH22 strain, SHY3 strain, NA87-11A strain and the like. The E. coli strain is not particularly limited, and examples thereof include JM109, DH5α, TOP10 derived from E. coli K12 strain, BL21 strain derived from E. coli B strain, and the like.

SC4MOL遺伝子を宿主微生物細胞に発現可能な状態で導入される。具体的には、遺伝子発現用プラスミドのプロモーター配列の下流に、SC4MOL遺伝子を導入したプラスミドを宿主微生物細胞に導入することができる。遺伝子発現用プラスミドベクターとしては、例えば、出芽酵母においてはpGYR、YEp352、Yep51、pSH19、大腸菌においてはpkk223-3、pKSNdl、pCW、pET17b等を挙げることができる。プラスミドの宿主微生物細胞への導入方法には特に制限はなく、宿主微生物の種類に応じて、常法を用いることができる。尚、実施例において出芽酵母を形質転換する際に用いたpGYRにはNADPH-P450還元酵素遺伝子が含まれている。しかし、宿主である出芽酵母のゲノム上にも同じ遺伝子がある。酵母菌体の中でベクターは菌体あたり20コピー程度あると考えられており、酵母AH22株は一倍体の酵母であることから、pGYRを導入した菌体ではNADPH-P450還元酵素の発現量が野生型の20倍程度になっていると推察される。一方、実施例において大腸菌を形質転換する際に発現ベクターとして用いたpET17bには還元酵素や補酵素の遺伝子は含まれていない。   The SC4MOL gene is introduced into a host microbial cell in a state where it can be expressed. Specifically, a plasmid into which the SC4MOL gene has been introduced can be introduced into the host microorganism cell downstream of the promoter sequence of the gene expression plasmid. Examples of gene expression plasmid vectors include pGYR, YEp352, Yep51, and pSH19 in budding yeast, and pkk223-3, pKSNdl, pCW, and pET17b in Escherichia coli. The method for introducing the plasmid into the host microorganism cell is not particularly limited, and a conventional method can be used depending on the type of the host microorganism. In addition, NADPH-P450 reductase gene is contained in pGYR used when transforming budding yeast in Examples. However, there is the same gene on the genome of the budding yeast as a host. It is considered that there are about 20 copies of the vector per yeast in the yeast cells, and the yeast AH22 strain is a haploid yeast, so the expression level of NADPH-P450 reductase in the cells into which pGYR was introduced Is estimated to be about 20 times that of the wild type. On the other hand, pET17b used as an expression vector when transforming Escherichia coli in Examples does not contain a reductase gene or a coenzyme gene.

SC4MOL遺伝子を発現可能な状態で導入した宿主微生物細胞は、適宜、培養して増殖させ、その後収集することで、本発明の組換体を得ることができる。収集した本発明の組換体は、湿潤菌体、乾燥菌体のいずれの状態でも利用できる。   The host microbial cells into which the SC4MOL gene has been introduced can be appropriately cultured and grown, and then collected to obtain the recombinant of the present invention. The collected recombinant of the present invention can be used in any state of wet cells and dry cells.

<分析方法>
本発明は、分析用検体のSC4MOLによる反応生成物の分析方法を包含する。この分析方法は、分析用検体を本発明の組換体と共にインキュベーションして、分析用検体のSC4MOLによる反応生成物を得、得られた反応生成物を分析することを含む方法である。
<Analysis method>
The present invention includes a method for analyzing a reaction product by SC4MOL of a sample for analysis. This analysis method is a method comprising incubating an analysis sample with the recombinant of the present invention to obtain a reaction product of the analysis sample by SC4MOL, and analyzing the obtained reaction product.

分析用検体は、例えば、医薬品若しくは医薬品の候補品、または食品成分若しくは食品成分の候補品であることができる。但し、これらの限定される意図ではない。分析用検体は、特に、SC4MOLによる代謝を受けることが予想されるメチルステロール化合物であることができる。   The sample for analysis can be, for example, a drug or a drug candidate, or a food ingredient or a food ingredient candidate. However, these are not intended to be limited. The analyte for analysis can in particular be a methyl sterol compound that is expected to undergo metabolism by SC4MOL.

分析用検体と本発明の組換体とのインキュベーションは、組換体に用いた宿主微生物の種類に応じて、さらには、分析用検体の種類に応じて適宜実施できる。インキュベーションの条件は、特に制限はされないが、例えば、以下のとおりである。
増殖中の菌体培養液に分析用検体を添加する場合、組換え酵母(AH22株)においては、SD液体培地(2% グルコース、0.67% N-base w/o アミノ酸、20μg/ml L-ヒスチジン)で30℃、24時間インキュベートする。組換え大腸菌においては、アンピシリン50μg/mlおよびカナマイシン25μg/mlを含むTB 培地(トリプトン12 g、イーストエキストラクト 24 g、グリセロール 5 gを蒸留水900mLに溶解後、1Mリン酸バッファー(pH 7.0)を100mL添加し、1Lの培地とする)37℃、24時間インキュベートする。また、遠心分離等の方法により集めた組換え酵母あるいは組換え大腸菌の菌体を8% グルコースを含む0.1M リン酸カリウム緩衝液(pH 7.4)に懸濁し、分析用検体を添加し、数時間〜24時間インキュベートすることにより反応生成物を得ることができる。
Incubation of the sample for analysis and the recombinant of the present invention can be appropriately carried out according to the type of host microorganism used for the recombinant, and further according to the type of sample for analysis. The incubation conditions are not particularly limited, but are as follows, for example.
When adding a specimen for analysis to the growing cell culture, in recombinant yeast (AH22 strain), SD liquid medium (2% glucose, 0.67% N-base w / o amino acid, 20 μg / ml L-histidine) ) Incubate at 30 ° C for 24 hours. In recombinant E. coli, TB medium containing ampicillin 50 μg / ml and kanamycin 25 μg / ml (tryptone 12 g, yeast extract 24 g, glycerol 5 g was dissolved in distilled water 900 mL, and then 1M phosphate buffer (pH 7.0) was added. Add 100mL to make 1L medium) Incubate at 37 ° C for 24 hours. Recombinant yeast or recombinant E. coli cells collected by methods such as centrifugation are suspended in 0.1 M potassium phosphate buffer (pH 7.4) containing 8% glucose, and an analytical sample is added for several hours. The reaction product can be obtained by incubating for ~ 24 hours.

発明の組換体とのインキュベーションにより生成したSC4MOLによる反応生成物は、粗のまま、または適宜精製した後に、所定の分析に供される。所定の分析は、特に制限はないが、例えば、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、薄層クロマトグラフィー(TLC)、質量分析計、NMRなどを用いることができる。   The reaction product by SC4MOL produced by incubation with the recombinant of the invention is subjected to a predetermined analysis as it is or after being appropriately purified. The predetermined analysis is not particularly limited, and for example, high performance liquid chromatography (HPLC), thin layer chromatography (TLC), mass spectrometer, NMR, etc. can be used.

本発明の分析方法によれば、分析用検体のSC4MOLによる反応生成物の同定や定量などを行うことができる。   According to the analysis method of the present invention, it is possible to identify and quantify a reaction product by SC4MOL of a sample for analysis.

<製造方法>
本発明は、SC4MOLの基質となり得る化合物がSC4MOLによって変換されることにより得られる反応生成物の製造方法を包含する。この製造方法は、SC4MOLの基質となり得る化合物を、本発明の組換体と共にインキュベーションして、SC4MOLの基質となり得る化合物のSC4MOLによる反応生成物を得、得られた反応生成物を収集することを含む。
<Manufacturing method>
The present invention includes a method for producing a reaction product obtained by converting a compound that can be a substrate of SC4MOL by SC4MOL. This production method includes incubating a compound that can be a substrate of SC4MOL with the recombinant of the present invention to obtain a reaction product of the compound that can be a substrate of SC4MOL by SC4MOL, and collecting the obtained reaction product. .

SC4MOLの基質となり得る化合物は、特に制限はなく、例えば、本来の基質である4,4'-ジメチル-5α-コレスト-8-エン-3β-オールおよびその類縁体(例えば、4β-ヒドロキシメチル-4α-メチル-5α-コレスト-7-エン-3β-オール、3β-ヒドロキシ-4β-メチル-5α-コレスト-7-エン-4α-カルバルデヒド)、テストステロンおよびその類縁体、エルデカルシトール(ED71)等のビタミンD誘導体、セサミン、エピセサミン等のリグナン類を挙げることができる。   The compound that can be a substrate of SC4MOL is not particularly limited. For example, 4,4′-dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol, which is the original substrate, and its analogs (for example, 4β-hydroxymethyl- 4α-methyl-5α-cholest-7-en-3β-ol, 3β-hydroxy-4β-methyl-5α-cholest-7-en-4α-carbaldehyde), testosterone and its analogs, eldecalcitol (ED71) And lignans such as sesamin and episesamin.

SC4MOLの基質となり得る化合物と本発明の組換体とのインキュベーションは、組換体に用いた宿主微生物の種類に応じて、さらには、SC4MOLの基質となり得る化合物の種類に応じて適宜実施できる。インキュベーションの条件等は、上記分析方法における記載を参照できる。   Incubation of the compound that can be a substrate of SC4MOL and the recombinant of the present invention can be appropriately carried out according to the type of host microorganism used for the recombinant, and further according to the type of compound that can be a substrate of SC4MOL. For the incubation conditions, the description in the above analysis method can be referred to.

インキュベーションによって得られたSC4MOLの基質となり得る化合物のSC4MOLによる反応生成物は、常法により収集される。常法としては、例えば、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、薄層クロマトグラフィー(TLC)を挙げることができる。   The reaction product of SC4MOL, which can be a substrate of SC4MOL obtained by incubation, is collected by a conventional method. Examples of conventional methods include high performance liquid chromatography (HPLC) and thin layer chromatography (TLC).

さらに、収集された化合物は常法により精製することもできる。   Furthermore, the collected compounds can be purified by conventional methods.

本発明の分析方法及び製造方法に使用される分析用検体及びSC4MOLの基質となり得る化合物は、例えば、医薬品若しくは医薬品の候補品、または食品成分若しくは食品成分の候補品であることができる。分析用検体または化合物としては、例えば、医薬品のエルデカルシトール、食品成分のセサミン等であることができる。但し、これらは単なる例示である。   The analytical sample used in the analysis method and the production method of the present invention and the compound that can be a substrate of SC4MOL can be, for example, a pharmaceutical product or a drug candidate product, or a food component or a food component candidate product. Examples of the analyte or compound for analysis may include eldecalcitol, a pharmaceutical product, and sesamin, a food ingredient. However, these are merely examples.

以下、本発明を実施例によりさらに詳細に説明する。   Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples.

1.ヒトSC4MOL遺伝子のクローニング
SC4MOLをコードする遺伝子を、ヒト肝cDNAライブラリーを鋳型とし、プライマー1および2 (配列番号3および4)を用いPCRにより増幅した。PCRは、反応1(94℃ 2分後、94℃ 15秒、52℃ 30秒、68℃ 1分、30サイクル;鋳型DNA 10 ng、反応液、dNTP 0.2 mM、KOD-plus-DNA polymerase (TOYOBO) 1 U、10x PCR Buffer for KOD -Plus- 5μl、プライマー各0.2μM、最終液量50μl)の条件で行った。PCR産物を1%アガロースゲルにより電気泳動した結果、目的サイズ(約0.9kb)に特異的な増幅がみられた(以下、1%アガロースゲルでの電気泳動は、単に電気泳動と略称する)。TArget CloneTM -Plus-(TOYOBO)の取扱説明書に従い、PCR産物をpTA2ベクターに連結した。塩化カルシウム法 〔Journal of Molecular Biology, 53, 159 (1970)〕によりエシェリヒア コリJM109を形質転換し、アンピシリン50μg/mlを含むLB寒天培地(ポリペプトン10 g、イーストエキストラクト 5 g、NaCl 5 gおよび寒天15 gを蒸留水1Lに溶解)に塗布した。得られた大腸菌コロニーのうち数個を選択し、それらを鋳型としてコロニーPCRを行った。PCRは、EmeraldAmp(登録商標) PCR Master Mix (Takara) の取扱説明書に従い、反応2(98℃ 10秒、55℃ 30秒、72℃ 1分、30サイクル;反応液、EmeraldAmp PCR Master Mix(2×Premix) (Takara) 5μl、M13-M3プライマーおよびM13-Rvプライマー各0.2μM、最終液量10μl)の条件で行った。得られたPCR産物の電気泳動を行い、予想サイズ(約1.0 kb)に特異的な増幅が見られるクローンを数個得た。得られたクローンのインサート配列にPCRによる変異が入っていないことを確認するためにシーケンスを行った。まず、得られた大腸菌コロニーを5mlのLB 培地(アンピシリン50μg/ml含有)に植菌し、37℃、200rpmで16時間振盪培養を行った。その後、Wizard(登録商標) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega)を用いてプラスミドを抽出し、プラスミド濃度を260nmの吸光度を用いて測定し、テンプレートDNAとした。サイクルシークエンス反応は、BigDye(登録商標) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems)を用いて行った。配列決定を行った結果、SC4MOLをコードする遺伝子特有の正確な配列であることが確認できた。このプラスミドをpTA2-SC4MOLと命名した。
1. Cloning of human SC4MOL gene
The gene encoding SC4MOL was amplified by PCR using a human liver cDNA library as a template and primers 1 and 2 (SEQ ID NOs: 3 and 4). PCR was performed in reaction 1 (94 ° C 2 minutes, 94 ° C 15 seconds, 52 ° C 30 seconds, 68 ° C 1 minute, 30 cycles; template DNA 10 ng, reaction solution, dNTP 0.2 mM, KOD-plus-DNA polymerase (TOYOBO ) 1 U, 10 × PCR Buffer for KOD-Plus-5 μl, each primer 0.2 μM, final volume 50 μl). As a result of electrophoresis of the PCR product on a 1% agarose gel, amplification specific to the target size (about 0.9 kb) was observed (hereinafter, electrophoresis on a 1% agarose gel is simply referred to as electrophoresis). The PCR product was ligated to the pTA2 vector according to the instruction manual of TArget CloneTM-Plus- (TOYOBO). Escherichia coli JM109 was transformed by the calcium chloride method [Journal of Molecular Biology, 53, 159 (1970)], and LB agar medium containing 50 μg / ml ampicillin (polypeptone 10 g, yeast extract 5 g, NaCl 5 g and agar) 15 g was dissolved in 1 L of distilled water). Several colonies of the obtained E. coli colonies were selected, and colony PCR was performed using them as templates. PCR was performed according to the instruction manual of EmeraldAmp (registered trademark) PCR Master Mix (Takara). Reaction 2 (98 ° C 10 seconds, 55 ° C 30 seconds, 72 ° C 1 minute, 30 cycles; reaction solution, EmeraldAmp PCR Master Mix (2 × Premix) (Takara) 5 μl, M13-M3 primer and M13-Rv primer each 0.2 μM, final solution volume 10 μl). The obtained PCR product was electrophoresed to obtain several clones in which specific amplification was observed at the expected size (about 1.0 kb). Sequencing was performed in order to confirm that the insert sequence of the obtained clone did not contain any mutation due to PCR. First, the obtained Escherichia coli colony was inoculated into 5 ml of LB medium (containing 50 μg / ml of ampicillin), followed by shaking culture at 37 ° C. and 200 rpm for 16 hours. Thereafter, the plasmid was extracted using Wizard (registered trademark) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega), and the plasmid concentration was measured using absorbance at 260 nm to obtain template DNA. The cycle sequencing reaction was performed using BigDye (registered trademark) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems). As a result of sequencing, it was confirmed that the sequence was unique to the gene encoding SC4MOL. This plasmid was named pTA2-SC4MOL.

配列番号3:5'-ATATAAGCTTAAAAAAATGGCAACAAATGAAAGTGT-3'
配列番号4:5'-ATATAAGCTTTTATTCAGTCTTTTTCTC-3'
Sequence number 3: 5'-ATATAAGCTTAAAAAAATGGCAACAAATGAAAGTGT-3 '
Sequence number 4: 5'-ATATAAGCTTTTATTCAGTCTTTTTCTC-3 '

2.SC4MOL遺伝子発現酵母の作製
1で作成したpTA2-SC4MOLプラスミド約1μgを37℃で1時間、HindIII処理し、電気泳動を行った。約0.9kbのDNA断片を電気泳動により分離し、QIAquick Gel Extraction Kit(QIAGEN)を用いてゲルから回収し、インサート断片とした。酵母発現ベクターとしては小胞体膜酵素であるシトクロムP450の発現で実績のあるpGYRを用いた(非特許文献2*)。pGYRベクターを37℃で1時間HindIII処理し、約11kbのDNA断片を電気泳動により分離し、ゲルから回収した。HindIII処理されたpGYRベクターをCalf Intestinal Alkaline Phosphatase(Takara) により脱リン酸化処理し、QIAquick PCR Purification Kit(Takara)を用いてベクター断片を調製した。インサート断片とpGYRベクター断片の濃度を電気泳動で確認後、それらのモル比が3:1〜10:1程度になるように混合し、等量のDNA Ligation Kit Ver. 2 (TaKaRa)のsolution Iを加え、16℃、30分反応を行った。その後、塩化カルシウム法により大腸菌JM109株を形質転換し、アンピシリン50μg/mlを含むLB寒天培地に塗布した。得られた大腸菌コロニーのうち数個を選択し、それらを鋳型としてコロニーPCRを行った。PCRは、EmeraldAmp(登録商標) PCR Master Mix (Takara) の取扱説明書に従い、反応2の条件で行った。プライマー1及び3(配列番号3と配列番号5)を用いた。得られたPCR産物の電気泳動を行い、予想サイズ(約1.8 kb)に特異的な増幅が見られるクローンを数個得た。得られた大腸菌コロニーを5mlのLB 培地(アンピシリン50μg/ml含有)に植菌し、37℃、200rpmで16時間振盪培養を行った。その後、Wizard(登録商標)Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega)を用いてプラスミドを抽出しその一部を37℃で1時間、HindIII処理し、電気泳動をしてインサートの導入を確認した。このプラスミドをpGYR-SC4MOLと命名した。塩化リチウム法によりサッカロマイセス・セレビシエAH22株を形質転換し、SD寒天培地(2%グルコース、0.67% N-base w/o アミノ酸、1.5%寒天、20μg/ml L-ヒスチジン)に塗布した。得られたコロニーをSC4MOL遺伝子発現酵母として、以下の生産試験に用いた。
配列番号5:5'- GACGTTGTAAAACGACGGCAGTG -3'
2. Production of yeast expressing SC4MOL gene
About 1 μg of the pTA2-SC4MOL plasmid prepared in 1 was treated with HindIII at 37 ° C. for 1 hour and electrophoresed. An about 0.9 kb DNA fragment was separated by electrophoresis and recovered from the gel using the QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN) to obtain an insert fragment. As a yeast expression vector, pGYR, which has a proven record in the expression of cytochrome P450, an endoplasmic reticulum membrane enzyme, was used (Non-patent Document 2 *). The pGYR vector was treated with HindIII at 37 ° C. for 1 hour, and an approximately 11 kb DNA fragment was separated by electrophoresis and recovered from the gel. The HindIII-treated pGYR vector was dephosphorylated with Calf Intestinal Alkaline Phosphatase (Takara), and a vector fragment was prepared using QIAquick PCR Purification Kit (Takara). After confirming the concentration of the insert fragment and pGYR vector fragment by electrophoresis, mix them so that their molar ratio is about 3: 1 to 10: 1, and then add an equal volume of DNA Ligation Kit Ver. 2 (TaKaRa) solution I And reacted at 16 ° C. for 30 minutes. Thereafter, Escherichia coli JM109 strain was transformed by the calcium chloride method, and applied to an LB agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin. Several colonies of the obtained E. coli colonies were selected, and colony PCR was performed using them as templates. PCR was performed under the conditions of Reaction 2 according to the instruction manual of EmeraldAmp (registered trademark) PCR Master Mix (Takara). Primers 1 and 3 (SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 5) were used. The obtained PCR product was electrophoresed to obtain several clones showing specific amplification at the expected size (about 1.8 kb). The obtained Escherichia coli colony was inoculated into 5 ml of LB medium (containing 50 μg / ml of ampicillin), and cultured with shaking at 37 ° C. and 200 rpm for 16 hours. Thereafter, a plasmid was extracted using Wizard (registered trademark) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega), a portion thereof was treated with HindIII at 37 ° C. for 1 hour, and electrophoresis was confirmed to introduce the insert. This plasmid was named pGYR-SC4MOL. Saccharomyces cerevisiae AH22 strain was transformed by the lithium chloride method and applied to SD agar medium (2% glucose, 0.67% N-base w / o amino acid, 1.5% agar, 20 μg / ml L-histidine). The obtained colony was used as the SC4MOL gene-expressing yeast in the following production test.
SEQ ID NO: 5: 5'-GACGTTGTAAAACGACGGCAGTG-3 '

3.SC4MOL遺伝子発現大腸菌の作製
1で作成したpTA2-SC4MOLプラスミドを鋳型とし、プライマー2および4(配列番号4および6)を用いPCRにより反応1の条件で増幅した。得られたPCR産物を電気泳動した結果、目的サイズ(約0.9kb)に特異的な増幅がみられた。TArget CloneTM -Plus-(TOYOBO)の取扱説明書に従い、PCR産物をpTA2ベクターに連結した。塩化カルシウム法によりエシェリヒア コリJM109を形質転換し、アンピシリン50μg/mlを含むLB寒天培地に塗布した。得られた大腸菌コロニーのうち数個を選択し、それらを鋳型としてコロニーPCRを行った。PCRは、EmeraldAmp(登録商標)PCR Master Mix (Takara)の取扱説明書に従い、反応2の条件で行った。得られたPCR産物の電気泳動を行い、予想サイズ(約1.0 kb)に特異的な増幅が見られるクローンを数個得た。得られたクローンのインサート配列にPCRによる変異が入っていないことを確認するためにシーケンスを行った。まず、得られた大腸菌コロニーを5mlのLB 培地(アンピシリン50μg/ml含有)に植菌し、37℃、200rpmで16時間振盪培養を行った。その後、Wizard(登録商標) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega)を用いてプラスミドを抽出し、プラスミド濃度を260nmの吸光度を用いて測定し、テンプレートDNAとした。サイクルシークエンス反応は、BigDye(登録商標) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems)を用いて行った。配列決定を行った結果、SC4MOLをコードする遺伝子特有の正確な配列であることが確認できた。得られたプラスミド約1μgを37℃で1時間、NdeIおよびHindIIIで処理し、電気泳動を行った。約0.9kbのDNA断片を電気泳動により分離し、QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN)を用いてゲルから回収し、インサート断片とした。pET17bベクターを37℃で1時間NdeIおよびHindIII処理し、約3kbのDNA断片を電気泳動により分離した後に、ゲルから回収しQIAquick PCR Purification Kit(Takara)を用いてベクター断片を調製した。インサート断片とpET17bベクター断片の濃度を電気泳動で確認後、それらのモル比が3:1〜10:1程度になるように混合し、等量のDNA Ligation Kit Ver. 2 (TaKaRa)のsolution Iを加え、16℃、30分反応を行った。その後、塩化カルシウム法によりエシェリヒア コリJM109を形質転換し、アンピシリン50μg/mlを含むLB寒天培地に塗布した。得られた大腸菌コロニーのうち数個を選択し、それらを鋳型としてコロニーPCRを行った。PCRは、EmeraldAmp(登録商標)PCR Master Mix (Takara)の取扱説明書に従い、プライマーの配列のみを変えた反応2の条件で行った。プライマーはT7-プロモータープライマーとT7-ターミネータープライマーを用いた。得られたPCR産物の電気泳動を行い、予想サイズ(約1.1 kb)に特異的な増幅が見られるクローンを数個得た。得られた大腸菌コロニーを5mlのLB 培地(アンピシリン50μg/ml含有)に植菌し、37℃、200rpmで16時間振盪培養を行った。その後、Wizard(登録商標) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega)を用いてプラスミドを抽出しその一部を37℃で1時間、NdeIおよびHindIII処理し、電気泳動をしてインサートの導入を確認した。このプラスミドをpET17b-SC4MOLと命名した。GroEL/ES発現ベクターであるpGro12(非特許文献3)が導入された大腸菌BL21株を塩化カルシウム法により形質転換し、pET17b-SC4MOLプラスミドを導入した。アンピシリン50μg/mlおよびカナマイシン25μg/mlを含むLB寒天培地に塗布して、得られたコロニーをSC4MOL遺伝子発現大腸菌として、以下の生産試験に用いた。
配列番号6:5'-ATATCATATGGCAACAAATGAAAGTGTCAGCATCTTTA-3'
3. SC4MOL gene-expressing E. coli
Using the pTA2-SC4MOL plasmid prepared in 1 as a template, PCR was performed using primers 2 and 4 (SEQ ID NOs: 4 and 6) under the conditions of reaction 1 by PCR. As a result of electrophoresis of the obtained PCR product, amplification specific to the target size (about 0.9 kb) was observed. The PCR product was ligated to the pTA2 vector according to the instruction manual of TArget CloneTM-Plus- (TOYOBO). Escherichia coli JM109 was transformed by the calcium chloride method and applied to an LB agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin. Several colonies of the obtained E. coli colonies were selected, and colony PCR was performed using them as templates. PCR was performed under the conditions of Reaction 2 according to the instruction manual of EmeraldAmp (registered trademark) PCR Master Mix (Takara). The obtained PCR product was electrophoresed to obtain several clones in which specific amplification was observed at the expected size (about 1.0 kb). Sequencing was performed in order to confirm that the insert sequence of the obtained clone did not contain any mutation due to PCR. First, the obtained Escherichia coli colony was inoculated into 5 ml of LB medium (containing 50 μg / ml of ampicillin), followed by shaking culture at 37 ° C. and 200 rpm for 16 hours. Thereafter, the plasmid was extracted using Wizard (registered trademark) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega), and the plasmid concentration was measured using absorbance at 260 nm to obtain template DNA. The cycle sequencing reaction was performed using BigDye (registered trademark) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems). As a result of sequencing, it was confirmed that the sequence was unique to the gene encoding SC4MOL. About 1 μg of the obtained plasmid was treated with NdeI and HindIII at 37 ° C. for 1 hour and electrophoresed. An about 0.9 kb DNA fragment was separated by electrophoresis and recovered from the gel using the QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN) to obtain an insert fragment. The pET17b vector was treated with NdeI and HindIII at 37 ° C. for 1 hour, and a DNA fragment of about 3 kb was separated by electrophoresis, then recovered from the gel, and a vector fragment was prepared using QIAquick PCR Purification Kit (Takara). After confirming the concentration of the insert fragment and pET17b vector fragment by electrophoresis, mix them so that their molar ratio is about 3: 1 to 10: 1, and then add an equal volume of DNA Ligation Kit Ver. 2 (TaKaRa) solution I And reacted at 16 ° C. for 30 minutes. Thereafter, Escherichia coli JM109 was transformed by the calcium chloride method and applied to an LB agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin. Several colonies of the obtained E. coli colonies were selected, and colony PCR was performed using them as templates. PCR was performed under the conditions of Reaction 2 in which only the primer sequence was changed according to the instruction manual of EmeraldAmp (registered trademark) PCR Master Mix (Takara). The primer used was a T7-promoter primer and a T7-terminator primer. The obtained PCR product was electrophoresed to obtain several clones in which specific amplification was observed at the expected size (about 1.1 kb). The obtained Escherichia coli colony was inoculated into 5 ml of LB medium (containing 50 μg / ml of ampicillin), and cultured with shaking at 37 ° C. and 200 rpm for 16 hours. Thereafter, the plasmid was extracted using Wizard (registered trademark) Plus SV Minipreps DNA Purification System (Promega), a portion thereof was treated with NdeI and HindIII at 37 ° C. for 1 hour, and electrophoresis was confirmed to introduce the insert. . This plasmid was named pET17b-SC4MOL. Escherichia coli BL21 strain into which pGro12 (Non-patent Document 3), a GroEL / ES expression vector, was introduced was transformed by the calcium chloride method, and the pET17b-SC4MOL plasmid was introduced. The resulting colonies were applied to an LB agar medium containing 50 μg / ml of ampicillin and 25 μg / ml of kanamycin, and the obtained colonies were used as SC4MOL gene-expressing E. coli in the following production test.
Sequence number 6: 5'-ATATCATATGGCAACAAATGAAAGTGTCAGCATCTTTA-3 '

4.SC4MOL遺伝子発現酵母を用いたさまざまな基質の代謝
SC4MOL遺伝子発現酵母を5mLのSD液体培地(2% グルコース、0.67% N-base w/o アミノ酸、20μg/ml L-ヒスチジン)に植菌し、30℃、200rpmで振盪培養を行った。OD610値が0.25〜0.3に到達した時点で、基質を終濃度10μMで添加した。今回用いた基質はエルデカルシトール(中外製薬(株))、テストステロン、パクリタキセル、セサミン、エピセサミンの5種類であるが、これらに限定されるものではない。基質添加後、さらに培養を続け、24時間後の培養液500μLに2mLのクロロホルム:メタノール=3:1を添加し、激しく攪拌した後、クロロホルム層を回収、減圧乾固した。これをアセトニトリルに溶解した後に14500rpm、15分遠心し、その上清をHPLCにより分析した。(条件:カラム:YMC社製 YMC−Pack ODS−AM (内径4.6mm×長さ300mm);流速:1.0ml/min;カラム温度:40℃、検出波長および溶離条件は以下のとおり基質により異なる。)
Four. Metabolism of various substrates using SC4MOL gene-expressing yeast
The SC4MOL gene-expressing yeast was inoculated into 5 mL of SD liquid medium (2% glucose, 0.67% N-base w / o amino acid, 20 μg / ml L-histidine), and cultured with shaking at 30 ° C. and 200 rpm. When the OD 610 value reached 0.25-0.3, the substrate was added at a final concentration of 10 μM. The substrates used this time are eldecalcitol (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.), testosterone, paclitaxel, sesamin, and episesamin, but are not limited thereto. After addition of the substrate, the culture was further continued, and 2 mL of chloroform: methanol = 3: 1 was added to 500 μL of the culture solution 24 hours later, and after vigorous stirring, the chloroform layer was collected and dried under reduced pressure. This was dissolved in acetonitrile, centrifuged at 14500 rpm for 15 minutes, and the supernatant was analyzed by HPLC. (Condition: Column: YMC-Pack ODS-AM manufactured by YMC Co., Ltd. (inner diameter: 4.6 mm × length: 300 mm); flow rate: 1.0 ml / min; column temperature: 40 ° C., detection wavelength and elution conditions differ depending on the substrate as follows. )

HPLC条件1:エルデカルシトール
水/アセトニトリル系;25−95% アセトニトリル直線濃度勾配(25分間)検出波長:265nm
HPLC条件2:テストステロン
水/アセトニトリル系;20−100 %アセトニトリル直線濃度勾配(25分間)検出波長:290nm
HPLC条件3:パクリタキセル
水/メタノール系;10−95% 0.01%トリフルオロ酢酸を含むメタノール直線濃度勾配(16分間)後、0.01%トリフルオロ酢酸を含むメタノール95%(8分間)検出波長:227nm
HPLC条件4:セサミン、エピセサミン
水/メタノール系;10−90% メタノール直線濃度勾配(30分間)検出波長:280nm
HPLC condition 1: Eldecalcitol water / acetonitrile system; 25-95% acetonitrile linear concentration gradient (25 minutes) Detection wavelength: 265 nm
HPLC condition 2: Testosterone water / acetonitrile system; 20-100% acetonitrile linear concentration gradient (25 minutes) Detection wavelength: 290 nm
HPLC condition 3: Paclitaxel water / methanol system; 10-95% methanol linear concentration gradient containing 0.01% trifluoroacetic acid (16 minutes) followed by 95% methanol containing 0.01% trifluoroacetic acid (8 minutes) Detection wavelength: 227 nm
HPLC condition 4: Sesamin, episesamin water / methanol system; 10-90% methanol linear concentration gradient (30 minutes) Detection wavelength: 280 nm

図2に代謝物のHPLCチャートの例を示す。セサミンとエピセサミンの代謝物は、それぞれのP450による代謝物(非特許文献2)とHPLCの検出時間が一致することを確認しており、メチレンジオキシフェニル基が開裂したモノカテコール体であると推測できる。また、テストステロンの代謝物はCYP3A4による代謝物とHPLCの検出時間が一致し、代謝物は6β-水酸化体であると考えられる。   Fig. 2 shows an example of an HPLC chart of metabolites. The metabolites of sesamin and episesamin have been confirmed to match the metabolites of their respective P450s (Non-patent Document 2) and HPLC detection times, and are presumed to be monocatechol bodies in which the methylenedioxyphenyl group is cleaved. it can. In addition, the metabolite of testosterone matches that of CYP3A4 and the detection time of HPLC, and the metabolite is considered to be 6β-hydroxide.

エルデカルシトールについては、代謝物の構造を推測するためにLC-MSによる解析を行った。LC-MSはFinnigan LCQ ADVANTAGE MIX(ThermoFisher SCIENTIFIC,Waltham,MA,USA)を用い、APCI法、positive modeで行った。LC条件は以下のとおりである。カラム;ODS(2mm×150mm Develosil ODS-HG-3,Nomura Chemical Co.Ltd.,Aichi,Japan);移動相,アセトニトリル:メタノール:水=3:4:3;流速,0.2mL・min;UV検出波長,265nm.LC/MSの結果を図2に示す。分子イオンピーク(M+H)はm/z=433であり、代謝物分子量は432であることがわかった。エルデカルシトールの分子量490と比較すると、58マス小さいことがわかり、代謝物は2位のヒドロキシプロポキシ基が脱ヒドロキシプロピル化した構造であることが示唆された(図3)。   Eldecalcitol was analyzed by LC-MS to estimate the metabolite structure. LC-MS was performed using Finnigan LCQ ADVANTAGE MIX (ThermoFisher SCIENTIFIC, Waltham, MA, USA) in APCI method and positive mode. The LC conditions are as follows. Column; ODS (2 mm × 150 mm Develosil ODS-HG-3, Nomura Chemical Co. Ltd., Aichi, Japan); mobile phase, acetonitrile: methanol: water = 3: 4: 3; flow rate, 0.2 mL · min; UV detection Wavelength, 265nm. The LC / MS results are shown in FIG. The molecular ion peak (M + H) was found to be m / z = 433, and the metabolite molecular weight was 432. Compared with the molecular weight 490 of eldecalcitol, it was found to be 58 mass smaller, suggesting that the metabolite has a structure in which the hydroxypropoxy group at the 2-position is dehydroxypropylated (FIG. 3).

5.SC4MOL遺伝子発現大腸菌を用いたエルデカルシトールの代謝
SC4MOL遺伝子発現大腸菌をアンピシリン50μg/mlおよびカナマイシン25μg/mlを含む5mLのTB 培地(トリプトン12 g、イーストエキストラクト 24 g、グリセロール 5 gを蒸留水900mLに溶解後、1Mリン酸バッファー(pH 7.0)を100mL添加し、1Lの培地とした)に植菌し、37℃、200rpmで振盪培養を行った。OD610が0.5〜1.0に到達した時点で、IPTG(終濃度1mM)、アラビノースを終濃度(4mg/mL)、基質としてエルデカルシトール(終濃度10μM)を添加した。さらに培養を続け、24時間後の培養液500μLに2mLのクロロホルム:メタノール=3:1を添加し、激しく攪拌した後、クロロホルム層を回収、減圧乾固した。これをアセトニトリルに溶解した後に14500rpm、15分遠心し、その上清をHPLCにより分析した。
Five. Metabolism of eldecalcitol using Escherichia coli expressing SC4MOL gene.
SC4MOL gene-expressing E. coli is dissolved in 900 mL of distilled water after 5 mL of TB medium (trypton 12 g, yeast extract 24 g, glycerol 5 g containing ampicillin 50 μg / ml and kanamycin 25 μg / ml, then 1M phosphate buffer (pH 7.0) Was inoculated into a 1 L medium) and cultured with shaking at 37 ° C. and 200 rpm. When OD 610 reached 0.5 to 1.0, IPTG (final concentration 1 mM), arabinose was final concentration (4 mg / mL), and eldecalcitol (final concentration 10 μM) was added as a substrate. The culture was further continued, and 2 mL of chloroform: methanol = 3: 1 was added to 500 μL of the culture solution after 24 hours, and after vigorous stirring, the chloroform layer was collected and dried under reduced pressure. This was dissolved in acetonitrile, centrifuged at 14500 rpm for 15 minutes, and the supernatant was analyzed by HPLC.

その結果、SC4MOL遺伝子発現酵母の場合と同じ位置に代謝物のピークが検出され、SC4MOL遺伝子発現大腸菌を用いた場合においても、SC4MOL遺伝子発現酵母と同じ代謝がみられることを確認した。   As a result, a metabolite peak was detected at the same position as in the case of the SC4MOL gene-expressing yeast, and it was confirmed that the same metabolism as in the SC4MOL gene-expressing yeast was observed even when the SC4MOL gene-expressing Escherichia coli was used.

参考例1
SC4MOL cDNAを含まないベクターpGYRを導入したコントロール株では、いずれの活性も認められなかった。この結果から、上記実施例におけるエルデカルシトールの代謝物は、酵母内で発現したSC4MOLに由来する活性と考えられる。
Reference example 1
None of the activities was observed in the control strain into which the vector pGYR containing no SC4MOL cDNA was introduced. From these results, the metabolite of eldecalcitol in the above examples is considered to be an activity derived from SC4MOL expressed in yeast.

参考例2
SC4MOL cDNAを含まないベクター pET17bを導入したコントロール株では、活性が認められなかった。この結果から、上記実施例におけるエルデカルシトールの代謝物は、大腸菌内で発現したSC4MOLに由来する活性と考えられる。
Reference example 2
No activity was observed in the control strain into which the vector pET17b containing no SC4MOL cDNA was introduced. From these results, the metabolite of eldecalcitol in the above examples is considered to be an activity derived from SC4MOL expressed in E. coli.

本発明は、生理的に重要な機能を持つ酵素SC4MOLの発現系を提供するものであることから、医薬品や食品の分野において有用である。   Since the present invention provides an expression system for the enzyme SC4MOL having physiologically important functions, it is useful in the field of pharmaceuticals and foods.

Claims (5)

ジメチル-5α-コレスト-8-エン-3β-オール、テストステロン、エルデカルシトール、セサミン、及びエピセサミンから成る群から選ばれるヒト由来メチルステロール酸化酵素(SC4MOL)の基質となる少なくとも1種の化合物を、ヒト由来SC4MOL遺伝子を発現可能な状態で載せたプラスミドベクターで形質転換した酵母である組換酵母と共にインキュベーションして、前記化合物のSC4MOLによる反応生成物を得、得られた反応生成物を収集することを含む、SC4MOLによる反応生成物の製造方法。 At least one compound serving as a substrate for human methyl sterol oxidase (SC4MOL) selected from the group consisting of dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol, testosterone, eldecalcitol, sesamin, and episesamin ; Incubating with a recombinant yeast, which is a yeast transformed with a plasmid vector carrying the human-derived SC4MOL gene in an expressible state, to obtain a reaction product of SC4MOL of the compound and collect the obtained reaction product A process for producing a reaction product using SC4MOL. 前記SC4MOL遺伝子を発現可能な状態で載せたプラスミドベクターが、酵母由来NADPH-P450還元酵素遺伝子をさらに発現可能な状態で載せたプラスミドベクターである請求項1に記載の製造方法。 The production method according to claim 1, wherein the plasmid vector carrying the SC4MOL gene in an expressible state is a plasmid vector carrying the yeast-derived NADPH-P450 reductase gene in an expressible state. 前記SC4MOL遺伝子及び酵母由来NADPH-P450還元酵素遺伝子を発現可能な状態で載せたプラスミドベクターが、SC4MOL遺伝子を載せたプラスミドベクターpGYRである請求項2に記載の製造方法。 The production method according to claim 2, wherein the plasmid vector carrying the SC4MOL gene and the yeast-derived NADPH-P450 reductase gene in an expressible state is a plasmid vector pGYR carrying the SC4MOL gene. ジメチル-5α-コレスト-8-エン-3β-オール、テストステロン、エルデカルシトール、セサミン、及びエピセサミンから成る群から選ばれるヒト由来SC4MOLの基質となる少なくとも1種の化合物を、ヒト由来SC4MOL遺伝子を発現可能な状態で載せたプラスミドベクターで形質転換した大腸菌である組換大腸菌と共にインキュベーションして、前記化合物のSC4MOLによる反応生成物を得、得られた反応生成物を収集することを含む、SC4MOLによる反応生成物の製造方法。 Express human-derived SC4MOL gene with at least one compound that is a substrate of human-derived SC4MOL selected from the group consisting of dimethyl-5α-cholest-8-en-3β-ol, testosterone, eldecalcitol, sesamin, and episesamin SC4MOL reaction comprising incubating with recombinant E. coli, which is E. coli transformed with a plasmid vector loaded as possible, to obtain a reaction product of SC4MOL of said compound and collecting the resulting reaction product Product manufacturing method. 前記SC4MOL遺伝子を載せた発現可能な状態でプラスミドベクターが、SC4MOL遺伝子を載せたプラスミドベクターpET17bである請求項4に記載の製造方法。 The production method according to claim 4, wherein the plasmid vector carrying the SC4MOL gene in an expressible state is the plasmid vector pET17b carrying the SC4MOL gene.
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