JP5967674B2 - RabG3bCAを利用した形質転換された樹木及びその用途 - Google Patents

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Description

本発明は、RabG3bCAを利用した形質転換された樹木及びその用途に関する。
地球上に存在する炭素基盤植物は、世界石油消費量の10倍、すべての種類のエネルギー使用量の5倍に達するものと報告されている。世界バイオマス作物の可用現況は、稲わら(rice straw)、麦わら(wheat straw)、トウモロコシ茎葉(corn stover)、バガス(bagasse)などの順であり、総量は、1549兆kgである。最近、化石燃料を代替することができる次世代親環境エネルギー源として注目される植物バイオエネルギーの安定的な生産のために、生産性が高いバイオマス植物の開発に対する関心が増大されている。現在、最大のイシューになっている代替エネルギーバイオエタノールの原料は、大きく、糖質系(サトウキビ、サトウダイコンなど)、澱粉質系(とうもろこし、じゃがいも、さつまいもなど)、木質系(間伐材、廃木材、稲わらなど)などに分けることができ、商用化されたバイオエタノール生産技術は、すべて食糧資源である糖質系及び澱粉質系バイオマスを原料として使用するので、人類の食糧需給状況と非常に密接な連関関系が存在する。長期的に見るとき、このような問題を解決するために、さらに低価格で、原料需給に問題が少ない第2世代バイオマスと呼ばれる木質系バイオマスを原料として使用する技術が活発に開発されている。代表的な木質系バイオマス作物としては、ポプラとユーカリプタスなどがあり、これら樹木の木材は、紙、パルプ、繊維など多様な製品とバイオエタノール生産の重要な原料として注目されている。このような経済的な重要性を有するため、木材の量と質を高めるための研究が進められてきており、したがって、木材の合成経路と合成調節の機作に対する研究は非常に重要であると言える。樹木の木材層は、2次木部(secondary xylem)よりなり、主に導管細胞(vessel element)と繊維(fiber)で構成されている。木材、すなわち2次木部は、ポプラやユーカリプタスのような被子植物の場合、維管束形成層(vascular cambium)で作われ、2次細胞壁(secondary cell wall)の形成と細胞死滅(programmed cell death)の発達過程を経て完成される。最近、ポプラは、研究目的のモデル樹木であって、そしてバイオマス用樹木として重要な研究の対象作物になってきた。特に、ポプラのゲノム配
列の解読、EST、マイクロアレイデータ(microarray data)の蓄積、分子マーカー(molecular marker)の開発、形質転換技術確立など多様な分子生物学的データベース構築とシステムの確立は、ポプラ研究の活性化のための重要な基盤になっている。
バイオマス用樹木を開発するためには、木材、すなわち木部の量的、質的な増加が行われなければならない。このためには、木部発達の分子的機作の理解が基本にならなければならないし、したがって、2次細胞壁形成と細胞死滅過程に対する研究が必須である。2次細胞壁の形成に対する研究は、非常に活発に進行されてきたが、相対的に細胞死滅に対する研究は、不足な状況である。現象的に見るとき、細胞死滅の過程は、液胞崩壊(vacuole collapse)、多様な分解酵素の分泌と活性、細胞質の分解が順次に行われ、木部が最終形成されることを観察することができるが、具体的な分子的機序や核心の調節因子については、大部分知られていない。本研究室では、自食(autophagy)が細胞死滅を調節する重要な過程であることを認識し、去る数年間自食と細胞死滅の機序に関する研究を行ってきた。一方、2000年Fukuda実験室で、導管細胞の分化の細胞死滅過程に自食の関連可能性について言及したりしたが、後続の研究は全く行われなかった。維管束形成層から由来する木部発達の機序を糾明するためには、特に導管細胞の分化の分子レベルでの研究と一緒に、導管細胞の分化過程における自食の機能と細胞死滅と自食の相互連繋性に対する研究が必須に行われなければならない。これにより、木部の発達を促進させて、木材層の質的、量的増加を誘導することによって、窮極的に産業的に有用な木質系バイオマス作物の開発を成功に導くことができる。
エタノール及びブタノールのような多様な液体燃料またはグルコースのような発酵性糖から生産されたポリ乳酸のような生重合体の単量体を含む多様な範囲の付加価置製品を含む“シューガプラットホーム(sugar platform)”を達成するために、最近、原油精製業のような、リグノセルロース−由来バイオリファイナリーが有望な産業として注目されている[Kamm, B., Kamm, M. 2004. Principles of biorefineries. Appl Microbiol Biotechnol, 64(2), 191 137−45. ; Lynd, L. R., Wyman, C. E., Gerngross, T. U. 1999. Biocommodity Engineering. Biotechnol 198 Prog, 15(5), 777−93.]。高費用効率の供給原料の開発は、産業化のための主な挑戦中の1つであり、専用のリグノセルロースバイオマスの開発と関連した多様な研究が米国及びヨーロッパを含めた世界で依然として進行している。速い成長率及び短期循環によって、ポプラは、この分野で代表的なバイオマス作物であると言える[Sannigrahi, P., Tuskan, G. A., Ragauskas, A. J. 2010. Poplar as a feedstock for biofuels:a 200 review of compositional characteristics. Biofuels Bioprod Bioref, 4, 209−226.]。また、この多年生樹木は、糖転換の主な成分であるセルロース及びヘミセルロースが豊かであり、多量の化学製品投入を必要としないので、耕作においてさらに少ない投資を必要とする[Baucher, M., Halpin, C., Petit−Conil, M., Boerjan, W. 2003. Lignin:genetic engineering and 166 impact on pulping. Crit Rev Biochem Mol Biol, 38(4), 305−50.]。今まで、リグノセルロースの転換は、木材比重及びリグニン及びセルロースの含量によって左右されることができるので、遺伝学的変形と関連したいくつかの研究が行われてきた。ポプラの遺伝学的改良と関連した詳細事項は、これら論文で確認することができる[Chen, F., Dixon, R. A. 2007. Lignin modification improves fermentable sugar yields for 168 biofuel production. Nat Biotechnol, 25(7), 759−61.; Dinus, R. J. 2001a. Genetic improvement of poplar feedstock quality for ethanol production. 170 Appl Biochem Biotechnol, 91−93, 23−34.; Sannigrahi, P., Tuskan, G. A., Ragauskas, A. J. 2010. Poplar as a feedstock for biofuels:a 200 review of compositional characteristics. Biofuels Bioprod Bioref, 4, 209−226.]。実際に、ポプラで50%のリグニンが減少した遺伝学的変形を用いた改良が1999年に報告されている[Service, R. F. 2007. Cellulosic ethanol. Biofuel researchers prepare to reap a new harvest. 204 Science, 315(5818), 1488−91. ]。しかし、今まで、糖生産のためにポプラを含めて遺伝学的に変形された植物を使用するための体系的接近を実用的に示す研究はなかった。
本発明者らは、木部の代表的細胞層である導管細胞の分化過程に関する研究を進行している。特に、シロイヌナズナの分泌タンパク質体の分析を通じて発見した小さいGTP結合タンパク質であるRabG3bに関心を持つようになり、シロイヌナズナRabG3bが自食と導管細胞の分化に関与し、ひいては、自食が導管細胞の分化に関与することができるという可能性を考えるようになった。多様な分子生物学的、細胞学的研究によりRabG3bが植物の導管細胞の分化、すなわち木部の発達に関与し、これは、RabG3bの自食調節機能を用いた機序であることを知見した。さらに、自食が導管細胞の分化に重要な過程であることを明らかにした。シロイヌナズナにRabG3bCAを過発現させたとき、長さ生長と厚さ生長がいずれも野生型植物体に比べて増加することを示し、このような生長の増加が木部の発達の促進によるものであることを確認することができた[大韓民国特許出願第2010−0085609号公報]。
大韓民国特許出願第2010-0085609号公報
Kamm, B., Kamm, M. 2004. Principles of biorefineries. Appl Microbiol Biotechnol, 64(2), 191 137-45. ; Lynd, L. R., Wyman, C. E., Gerngross, T. U. 1999. Biocommodity Engineering. Biotechnol 198 Prog, 15(5), 777-93. Sannigrahi, P., Tuskan, G. A., Ragauskas, A. J. 2010. Poplar as a feedstock for biofuels:a 200 review of compositional characteristics. Biofuels Bioprod Bioref, 4, 209-226. Baucher, M., Halpin, C., Petit-Conil, M., Boerjan, W. 2003. Lignin:genetic engineering and 166 impact on pulping. Crit Rev Biochem Mol Biol, 38(4), 305-50. Chen, F., Dixon, R. A. 2007. Lignin modification improves fermentable sugar yields for 168 biofuel production. Nat Biotechnol, 25(7), 759-61. Dinus, R. J. 2001a. Genetic improvement of poplar feedstock quality for ethanol production. 170 Appl Biochem Biotechnol, 91-93, 23-34. Sannigrahi, P., Tuskan, G. A., Ragauskas, A. J. 2010. Poplar as a feedstock for biofuels:a 200 review of compositional characteristics. Biofuels Bioprod Bioref, 4, 209-226 Service, R. F. 2007. Cellulosic ethanol. Biofuel researchers prepare to reap a new harvest. 204 Science, 315(5818), 1488-91.
大部分の植物の特異遺伝形質は、発見され、これが異種植物に適用されても、同一の効果を示さないことが一般的であり、 特に草本植物の遺伝形質が木本植物でそのまま現れないことが一般的である。しかし、本発明者らは、シロイヌナズナ由来RabG3bの活性型突然変異体であるRabG3bCAを過発現させて、シロイヌナズナのような形質(木部の増大)を有する樹木を開発した。また、本発明で開発したRabG3bCA遺伝子形質転換された樹木の組成変化を分析した。特定触媒で前処理し、セルラーゼのような適量の酵素添加を利用して加水分解した。次いで、全体工程にわたって物質収支(material balances)を樹立し、経済的観点で形質転換された樹木の可能性を確認した。本発明のRabG3bCAが形質転換された樹木は、野生型樹木に比較して繊維細胞長さの増大による紙、パルプ生産及びセルロース及び/またはグルコース含量の増加によるバイオエタノール生産が可能であり、産業的に非常に有用なものと期待される。
したがって、本発明の目的は、シロイヌナズナ由来RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子が形質転換された樹木を提供することにある。
また、本発明の他の目的は、RabG3bCAが形質転換された樹木を原料とする紙及び上記形質転換された樹木から生産されたパルプを提供することにある。
また、本発明のさらに他の目的は、RabG3bCAが形質転換された樹木から生産されたバイオマスを提供することにある。
また、本発明のさらに他の目的は、樹木を利用したバイオマスの生産方法において、上記樹木は、RabG3bCAが形質転換された樹木であるバイオマスの生産方法を提供することにある。
上記目的を達成するために、本発明は、RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)が形質転換された樹木を提供する。
本発明は、また、RabG3bCAが形質転換された樹木を原料とする紙及び上記形質転換された樹木から生産されたパルプを提供する。
本発明は、また、RabG3bCAが形質転換された樹木から生産されたバイオマスを提供する。
本発明は、また、樹木を利用したバイオマスの生産方法において、上記樹木は、RabG3bCAが形質転換された樹木であるバイオマスの生産方法を提供する。
RabG3bCAが形質転換された樹木を製作し、1次的な形質分析を行った結果、バイオマスと関連した特性が観察された。すなわち、形質転換された樹木において野生型樹木に比べて長さ生長と厚さ生長がすべて増加し、特に木部、すなわち木材層が40%以上増加し、製紙、パルプの質を決定する最も重要な要素である繊維細胞の長さが50%以上増加する結果を得ることができた。
また、化学成分の分析結果、バイオエタノールの原料となるセルロース及び/またはグルコース含量が10%増加したが、セルロース分解に妨害になるヘミセルロース含量は25%減少することによって、本発明によるRabG3bCAが形質転換された樹木が、産業的な価値を有するバイオマス/バイオエネルギー用樹木として活用することができることを示唆する。
RabG3bの発現程度を野生型樹木(WT)と形質転換されたポプラ樹木(OX)で比較した結果である[(a)RabG3bCA発現の半定量的なリアルタイムPCR分析、アクチンは対照群として使用;(b)ウェスタンブロッティングでRabG3bの発現程度分析、幹の4番目節間(節の間)で葉から抽出、Ponceau S染色は、ローディング対照群である。] RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木(OX)と野生型樹木(WT)の間の形態学的比較を示すものである[(a)10週間土壌で育てた形質転換されたポプラ樹木(OX)と野生型樹木(WT)の間の比較写真;(b)幹長さ;(c)幹直径;形質転換されたポプラ樹木(OX)と野生型樹木(WT)の幹成長は、1週間間隔で10週間測定したものである(b、c);(d)10週間育てた形質転換されたポプラ樹木(OX)と野生型樹木(WT)の節間数の比較;(e)乾燥前に10週になった形質転換されたポプラ樹木(OX)と野生型樹木(WT)の重量比較;(f)乾燥後に10週になった形質転換されたポプラ樹木(OX)と野生型樹木(WT)の重量比較;5回繰り返して平均±標準偏差を求める、t−test;*P<0.05**P<0.01] RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木での維管束の発達変化を示すものである[(a)−(c):幹の基底断面をトルイジンブルーで染色し、維管束のパターンを観察;(d)−(f):幹の基底断面をリグニン蛍光染色法を使用して木部細胞でのリグニンの蓄積程度を調べる;野生型樹木(a、d)と形質転換樹木(b、c、e、f)の底部からレジンが充填された断面を準備、樹木は、培養培地で5週間育てたもの。Bars=50μm] RabG3bCAが形質転換された樹木で増加した木部の発達を示すものである[(a)WTとOXの10番目の年輪の幹断面を切ってトルイジンブルーで染色し、PPF(1次師部繊維)、P(師部)、VC(維管束形成層)、SX(2次木部)、PX(1次木部)分布を観察;(b)WTとOXの30番目節間の幹断面をトルイジンブルーで染色し、OB(外皮)、P(師部)、C(維管束形成層)、X(木部)分布を観察;Bars=200μm(a、b);(c)(b)で使用したサンプルで組職の幅を比較する(平均±標準偏差);10回以上実験して比較、t−test;**P<0.01] 野生型樹木(WT)とRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木(OX)の幹での導管要素と繊維細胞の変化を示すものである。 RabG3bCAが形質転換された樹木(OX)で木部の細胞サイズの変化を比較したものである[(a)繊維細胞長さ;(b)繊維細胞直径;(c)導管要素長さ;(d)導管要素直径;土壌で10週になったWTとOX−8幹の下部分、中間部分を取って細胞を分離して得る、数値は、測定時に25個細胞の平均±標準偏差;t−test;*P<0.05**P<0.01]。 RabG3bCA培養細胞株での2次細胞壁のリグニン生成と自食増大を観察した写真である[(a)WT、OX−8培養細胞をフロログルシノール−HClで染色し、リグニン化された木部細胞を光顕微鏡で観察;矢印は、導管要素の2次細胞壁パターン表示;(b)WT、OX−8培養細胞をLTGで染色し、自食構造を蛍光顕微鏡(左、中間)と光顕微鏡(右)で観察;Bars=100μm]。 分化中のポプラ樹木の幹で自食構造の形成を示すものである[(a、g)WT(a)とOX−8(g)2番目節間の幹の断面をトルイジンブルーで染色;(b、h)分化中の木部細胞を低倍率TEMイメージ;(c、d、i、j)WT(c、d)とOX−8(i、j)幹分化中の木部細胞の自食構造TEMイメージ;(c、d、i、j)のボックス部分は、(e、f、k、l)で拡大;矢印:オートファゴソーム/オートリソソーム構造;Bars=50μm(a、g)、5μm(b、h)、1μm(c、d、i、j)、及び0.5μm(e、f、k、l)]。 幼いポプラ樹木の幹での木部発達過程と連携された遺伝子の発現分析を示すものである[(a)2次細胞壁の形成と関連した遺伝子の比較分析;(b)細胞死滅と関連した遺伝子の比較分析;(c)自食と関連した遺伝子の比較分析、結果値は、3回繰り返し実験したものであって、平均±標準偏差で示す]。 硫酸、水酸化ナトリウム及び水性アンモニアの触媒それぞれで前処理する前と後、3つのポプラ樹木(WT、OX−3、OX−8)のグルコース収率を示すものである。
本発明は、RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子が形質転換された樹木に関する。
上記樹木は、ポプラ、ユーカリプタス、シラカバ、ブナ、ハコヤナギ、オークなどの広葉樹と、マツ、モミ、カラマツなどの針葉樹を含む製紙パルプ原料とする樹木をすべて含むことができる。
本発明において、RabG3bは、シロイヌナズナ(Arabidopsis)由来であるが、関心対象の他の種からのRabG3b遺伝子または類似遺伝子も、また使用することができる。
上記RabG3bCA遺伝子は、配列番号1の塩基配列で表示される。
本発明による形質転換された樹木は、対応野生型植物と比較してセルロース及び/またはグルコース含量が増加した。また、繊維細胞の長さが増加した。これは、木部が増加した形質から現われる結果である。
また、本発明は、上記形質転換された樹木から生産されたパルプまたは上記形質転換された樹木を原料とする紙を含むことができる。
また、本発明は、上記形質転換された樹木から生産されたバイオマスを含むことができる。
また、本発明は、上記形質転換された樹木を利用したバイオマスの生産方法を含むことができる。一般的な木材を利用したバイオマス生産方法と同一に実施する。上記バイオマスは、木質系から生産されるバイオマスをすべて含み、具体的に、セルロース、グルコースなどの糖類を含むことができる。特に、上記形質転換された樹木を水酸化ナトリウムで前処理した後、酵素で加水分解し、バイオマスを生産することを含むことができる。
また、本発明は、上記形質転換された樹木を利用したパルプの生産方法を含むことができる。一般的な木材を利用したパルプ生産方法と同一に実施する。
また、本発明は、RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子を過発現させて、セルロース及び/またはグルコースが増加した形質転換された樹木を製造する方法を含む。
以下、本発明の一実施例による形質転換ポプラ樹木に関する具体的な説明は、次の通りである。
ポプラ樹木は、環境学的、経済学的価値を有しており、また、木材産業において重要な樹木のうち1つである[Kaneda et al.(2010)Journal of Integrative Plant Biology 52、234−243]。樹木での最も重要な生物学的資源は、樹木あるいは2次木部の部分であり、これは、リサイクル可能な紙、パルプ、バイオ燃料の生産に利用される[Demura et al.(2010)Current Opinionin Plant Biology 13、299−304]。最近の遺伝学的、遺伝工学的研究は、樹木の生産過程のいくつかの重要な核心遺伝子を明らかにし、樹木の生産過程に対する理解を広げた。しかし、本発明者らは、以前発明の結果でRabG3bCAがシロイヌナズナで木部の発達過程の促進作用と関系があることを示し、本発明においてポプラ樹木でRabG3bCAを増大させることによって、樹木の生産能力を変えることができることを示した。すなわち、RabG3bCAが過発現されたポプラ樹木で幹の成長速度と木部の発達が増大し、この効果は、シロイヌナズナとポプラ樹木との間で保存されることによって、機能的にシロイヌナズナのRabG3bCAがポプラ樹木でも相同であることを示す。ポプラ樹木の誘電体分析(http://genome.jgi−psf.org/Poptr1_1/Poptr1_1.home.html;Tuskan et al.2006)結果を参照すれば、8個のポプラ樹木同属体がシロイヌナズナのRabG3bと70%に近いアミノ酸配列類似性を示しており、そのうち1つ(estExt_Genewise1_v1.C_LG_II2093)は、90%に達する高い類似性と83%に達する同一性をシロイヌナズナのRabG3bタンパク質と比較して有している。これらRabG同属体がシロイヌナズナのRabG3bとその木部の発達に対する影響と機能的に類似しているかを調べるに値する価値を有している。
以前に、細胞培養システムと蛍光幹でシロイヌナズナのRabG3bの管状要素増大の活性は、われらが管状要素の分化で自食の役目を知ることができるようにした[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.;Kwon et al.
(2010)Autophagy 6、1187−1189.]。本発明者らは、自食が木部の分化で重要な過程であることを証明し、シロイヌナズナで管状要素のプログラムされた細胞死滅と関連された要素であることを証明した。ポプラ樹木で木部細胞が分化する間に、自食構造が発見され、RabG3bCAが形質転換された樹木では、さらに多い蓄積を切られたサンプル分析を通じて発見した[図8]。注目すべきことは、カルス培養での野生型細胞株で木部分化やリグニンの蓄積が増加されなかったが、RabG3bCAが形質転換された細胞株では、木部の分化が増大し、酸性染色によって現われた自食構造の形成の増加が伴われたということである[図7]。以前の研究結果で、ATG遺伝子とタンパク質発現をシロイヌナズナで調査したとき、管状要素の分化中に自食の活性と関系があったことが分かった[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.;Kwon et al.(2010)Autophagy 6、1187−1189]。本発明においていくつかのATG遺伝子がRabG3bCAが増大した細胞株において野生型細胞株より2倍以上さらに多く増加したことを成長しているポプラ樹木の幹で示した[図9の(c)]。これら結果は、自食が木部の分化に必ず経なければならない過程であり、シロイヌナズナの場合と同様に、ポプラ樹木でもRabG3bのGTPase活性がこれを調節することを示す。特に、シロイヌナズナのような草本遺伝形質がポプラ樹木のような木本にそのまま現われることは非常にまれな場合であり、本発明は、産業的利用価値を有する。
プログラムされた細胞死滅は、管状要素の発達過程において重要な過程であり、終わりに起きる。以前の研究は、木部の分化過程において管状要素のプログラムされた細胞死滅が自食と関連があることを提示する[Fukuda H.(2000)Plant Molecular Biology 44、245−253.;Weir et al.(2005)Cytometry Part A68A、81−91.]。そして、われらは、管状要素の分化で自食が液胞が裂けることで起きるプログラムされた細胞死滅と関連があることを証明した[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.;Kwon et al.(2010)Autophagy 6、1187−1189]。ポプラ樹木での遺伝子発現、組職学的、構造的分析は、RabG3bと自食が結合的に木部の発達での細胞死滅に関与することを示した。また、RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木で自食構造の蓄積と液胞の崩壊と細胞内容物の分解が大きく増加したことを確認した[図8]。木部の形成過程中にRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木でプログラムされた細胞死滅と関連した遺伝子(i.e.、MC9、peroxidase、andβ−VPE)とATG遺伝子が大幅に増加した[図8の(b)]。これら結果は、シロイヌナズナと同様に、RabG3bと連携された自食が細胞死滅を導いて、この自食による細胞死滅は、ポプラ樹木の木部の分化期間中のプログラムされた細胞死滅に必要であることが分かる。
シロイヌナズナでは、管状要素の形成過程中にプログラムされた細胞死滅と自食が2次細胞壁の形成と密接に関連しているものと認められる[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164]。自食の活性は、RabG3bCAが増大した細胞でプログラムされた細胞死滅、2次細胞壁蓄積に伴われる。対照的に、管状要素と関連した形態学的変化は、自食が欠乏されたRabG3bDN、RabG3bRNAi、atg5−1細胞では1つも観察されなかった。RabG3bCAが増大した細胞の管状要素の分化過程でプログラムされた細胞死滅と2次細胞壁と関連した遺伝子がすべて大きく増加した。ポプラ樹木でのRabG3bCAの過発現は、プログラムされた細胞死滅と自食と関連した遺伝子、2次細胞壁構成要素のバイオ生合成と関連した遺伝子の発現増大を導く[図9]。そして、これは、木部の発達で2次細胞壁形成とプログラムされた細胞死滅の連関可能性を提示する。
セルロースは、重要な2次細胞壁構成要素であって、バイオ燃料の生産に使用され、セルロース分解酵素によって分解されて糖化され、グルコースに変換される[Abramson et al.(2010)Plant Science 178、61−72]。リグニンとヘミセルロースは、セルロースの酵素的分解に物理的障壁の役目をし、遺伝工学者と化学者は、リグニンとキシランの生合成を低減し、さらに壊す方法を開発している[Pilate et al.(2002)Nature Biotechnology 20、607−612.;Yang et al.(2004)Biotechnology & Bioengineering 86、88−95.;Weng et al.(2008)Current Opinion in Biotechnology 19、166−172]。本発明は、RabG3bCAが形質転換された幹の細胞壁の要素がバイオ燃料としての木の品質を良好にする方向に変更されたことを示している(セルロースとグルコースは10%増加し、キシランは25%減少したが、リグニンの含量には大きい変化がなかった(表3))。セルロース対キシランの比率の増加は、2次細胞壁の分解をさらに容易にし、よって、バイオエタノール生産をさらに増大させることができる[Sticklen M.(2006)Current Opinion in Biotechnology 17、315−319.;Pauly et al.(2010)Current Opinion in Plant Biology 13、305−312]。
おもしろい結果は、RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木の幹は、野生型ポプラ樹木の 幹に比べて繊維細胞が37〜60%延長していることを発見した[図5、図6]。初期発達過程で繊維細胞は、軸に過度に延長し、次いで、2次細胞壁が固くなることとプログラムされた細胞死滅がつながる[Dejardin et al.(2010)Comptes Rendus Biologies 333、325−334。]。繊維細胞延長の過程は、花粉管と根毛の成長と類似していて、細胞のチップに向かって小胞の分泌が活性され、これは、アクチンフィラメントを通じて行われる[Chaffey et al.(2002)Tree Physiology 22、239−249.]。直接的な小胞の細胞のチップへの移動は、延長された区域への栄養供給に非常に重要であり、この栄養の再分配過程は、自食によって調節されることができる。紙を作る過程で繊維細胞の長さは、非常に重要な要素なので、RabG3bCAが形質転換された樹木を原料として製紙、パルプの製造が可能である。
RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木は、野生型樹木と類似するリグニンの量にもかかわらず、100gバイオマスから20%以上のグルコース収率を示した。これは、特にOX8でさらに速い成長をもたらし、ヘミセルロース及びリグニンのような他の木材成分とセルロースの結合が緩くなり、次いで少ない立体障害によってセルロースへのセルラーゼ接近を容易に増強させるRabG3bCA遺伝子の効果によるものであることができる。また、全体バイオマス重量を考慮すれば、OX8が同一の期間内に2倍以上の重量の増加[図2の(e)、(f)参照]を示すので、可能なグルコース生産が非常に拡大される。
また、触媒前処理後、グルコース収率は、触媒によって異なる。ヘミセルロース除去収率が他の触媒を使用した場合に比べて、硫酸の浸漬でさらに高く調査されたとしても、最も低い消化率を示した。これは、低いセルロース回収率とリグニン除去率に起因して酵素のセルロース分子に対する接近性が減少したからであると言える。水酸化ナトリウムが消化率及びグルコース収率と関連してポプラに最も効果的な触媒として立証された。
本発明者らは、RabG3bCAの過発現に対する研究は、一年生草であるシロイヌナズナと多年生樹木であるポプラ樹木においてすべて木部の発達に対する形態学的変化を導いた。また、RabG3bの自食による細胞死滅を導く、そして樹木の形成中に2次細胞壁の生成を促進する生理学的な作用があることを明らかにした。本発明に基づいて、持続的なRabG3bと自食要素の増加は、木の品質を増大させることができ、林業に適用させることができる。しかも、RabG3bと連関性がある知られた因子は、木部の発達過程の要素の複合ネットワークに新しい情報を提供し、樹木の生理学的理解をさらに高めるのに寄与することができる。
以下、下記実施例を通じて本発明をさらに詳しく説明するが、本発明の範囲が下記提示された実施例によって制限されるものではない。
[実施例]
I.材料及び実験方法
1.植物と成長条件
ポプラ樹木の形質転換のために、成長点培養を維持するハイブリッドポプラ樹木クローンであるBH1(P.alba x P.tremula var.glandulosa BH1)を使用した。RabG3bCA構造は、pBI121植物発現ベクターに以前にクローンされ[Kwon et al(2009)Journal of Plant Biology 52、79−87.]、ポプラ樹木細胞にアグロバクテリウム媒介(Agrobacterium−mediated)形質転換法によって伝達された[Choi et al(2005)Journal of Plant Biology 48、351−355.;Kim Y.H.、Kim et al(2011)Plant Biotechnology Journal 9、334−347.]。形質転換された細胞は、500mg/Lセフォタキシムと50mg/Lカナマイシンが含まれているカルス誘導培地(Murashige and Skoog[MS]medium、pH 5.8、3% sucrose、0.8% agar、1mg/L 2、4−dichlorophenoxyacetic acid、0.01mg/L benzylaminopurine、and 0.1mg/L 1−naphthylacetic acid[NAA])によって選別された。根は、樹木の培地に移されて再生された。形質転換過程中に、培地は、培養室で25℃を維持し、16時間白色光(30μmol/m・s)に晒し、8時間暗条件下で放置した。再生された根は、根付くために0.2mg/Lインドール酪酸を含むMS培地に移された。根付いた植物は、植木鉢で適応期間を有し、追加研究のために温室の土壌に移された。植物は、温室、28〜30℃の温度、12時間明条件/12時間暗条件下で培養と実験をすべて実施した。
2.植物成長測定
植物の生長は、根の生長点から幹の基底までである幹の長さ、幹基底の直径、節間の数と長さを測定して決定した。初期の植物長さを同一にするために、植物が土壌で20cm以内の長さに成長したとき、基底を切って同じ時間に同じ長さで測定し、測定は、3〜5回程度繰り返した。
3.組織化学的分析
組織化学的分析は、以前論文[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.]のように行った。
ポプラ樹木の幹を0.1Mリン酸緩衝溶液(pH 7.4)に2.5%グルタルアルデヒド及び4%p−ホルムアルデヒドを含む溶液で4℃で4時間固定し、0.1Mリン酸緩衝溶液(pH 7.4)で洗浄し、1% OsOで2時間室温に固定した。0.1Mリン酸溶液で洗浄した後、サンプルを脱水し、LRホワイトレジン(London Resin)に充填した。ウルトラマイクロトーム(RMC MT X)を利用して断面(Cross−section)(1μm)を準備した後、染色し、光顕微鏡で観察した。60〜70nmに切り出した後、濾過した1%トルイジンブルー(toluidine blue)で短く染色した。上記断面を光顕微鏡(Olympus、BX51TRF)で撮影した。走査式電子顕微鏡(TEM)分析で薄い断面(60−70nm)は、銅格子板(1−GN、150メッシュ)上に収集し、ウラニルアセテート及びクエン酸鉛で染色し、TEM(Philips、Tecnai 12)で照射した。リグニン自発蛍光(autofluorescence)分析のための、ポプラ幹は、固定され、paraplast(McCormick Scientific)に内蔵した。断面(10μm)をマイクロトーム(Leica RM2235)を使用して準備した後、405/460nm励起/発光で共焦点顕微鏡(Zeiss LSM 510 META)を使用して撮影した。リグニン染色のための培養細胞は、フロログルシノール溶液(2%ethanol/water、95/5[v/v])で1時間染色し、6N HClに浸した。染色された細胞培養サンプルの明視野写真(Bright−field photographs)は、光顕微鏡(Olympus、BX51TRF)で撮影された。
LTG(Lyso Tracker Green)染色のための培養細胞は、1μM LTG DND−26(Molecular Probes)で1時間暗条件の下で培養された。488/505nm励起/発光で共焦点顕微鏡(Zeiss LSM 510 META)を使用してイメージを得た。染色用培養細胞をカルス誘導培地上で5週間葉ディスクを培養し、準備した。
4.浸軟した木部細胞を準備
導管要素と繊維のサイズを測るために、10週間土壌で栽培された野生型樹木と形質転換されたポプラ樹木の底及び中間部位から取った幹部分(1cm)を2mmX1mmX2mmサイズの切れに切った。木切れは、直ちに50%硝酸内6% KClOを含むSchulze’s 試薬に浸した後、1週間室温で保管された。このサンプルは、その後、60℃で30分間激しくシェーキングし、それぞれの個別的な細胞に分離した。浸軟した個別細胞を蒸留水で3回洗浄し、顕微鏡スライドに載置し、カバーグラスで覆った。そして光顕微鏡(Olympus、BX51TRF)で観察し、細胞の長さと幅を測定した。
5.2次細胞壁要素に対する分析
10週間土壌で栽培された植物から得られた幹サンプルが細胞壁要素を分析するのに使用された。不要であり、主要ではない要素をアセトンと温水で抽出し、除去した。
幹(2g)を液体窒素で40−60meshに研磨し、20mlアセトン(99.9%、reagent grade)で室温で8時間抽出し、ワットマンNo.2濾過紙で濾過した。その後、アセトン−抽出されたサンプルを熱湯に2時間抽出し、ワットマンNo.2濾過紙で濾過し、風乾した。
そして、上記不要な要素が除去されたサンプル(200mg)を72%硫酸(1.5ml)に2時間20℃で溶解させた。その後、3%硫酸が入っている熱湯に希釈させ、上記サンプル溶液を3時間沸かした。そして、沸いたサンプル溶液をKlasonリグニンを沈澱させるために、一晩中室温に冷却させ、1G4磁器るつぼフィルタで濾過した。
そして、濾過残余物でKlasonリグニン含量(TAPPI Standard 222om−88)を分析した。単糖類を分析するために、1/10スケールダウンをして、実験を行った後、2段階加水分解は、H−NMR分光分析のために熱湯の代わりに、NMR溶液であるDOで希釈を行った[Shin et al(2008)Cellulose 15、255−260.]。
特異的NMR条件は、下記の通りである:
Broad band Observe Probe type、30℃、90°、11μsec pulse、10 sec delay between pulses、2.73sec for acquisition time、10ppm for sweep width。
細胞壁で単糖類構成は、説明した通り、アノマリック水素(anomeric hydrogen)ピーク積分でH−NMRスペクトルの解釈を基礎として推定した[Shin et al(2008)Cellulose 15、255−260.]。
6.セルロースの結晶度分析
セルロースの結晶度分析は、以前に作った不要な要素が除去されたサンプルをX−RAY回折分析機(Bruker D5005)により(40Kv、40mA)行われた。
回折スペクトルは、θ−2θ方法及び重複サンプルは、0.01゜の段階で2θ=10゜−30゜から1゜/minスキャンした。相対結晶指数が以前文献のように測定された[Segal et al(1959)Textile Research Journal 29、786−794.]。
7.遺伝子発現分析
RabG3bCA過発現株でRabG3bCAの発現程度を確認するためのポプラ樹木の葉からまたは植物RNA精製試薬(Invitrogen)を使用して定量的なRT−PCRで多様な遺伝子発現を確認するための幼い幹から全体RNAを分離した。分離してそれぞれのサンプルで定量的なリアルタイムPCRを用いて分析した。
その後、ゲノミックDNAを除去するために、RNase−free DNase Iを処理した。定量的な発現分析のために、全体RNA(1.5μg)を製造社のプロトコルによってPower cDNA Synthesis Kit(iNtRON)を使用して一番目ストランドcDNAs合成に使用した。
定量的なリアルタイムPCRは、Light Cycler 480 system(Roche)にKAPA SYBR FAST qPCR master mixを使用して実施した。
遺伝子と特異的なプライマーを使用し、それらの対応遺伝子モデルは、目録化した。
テストされた遺伝子発現レベルは、18SrRNAの構成発現レベルに標準化し、2−ΔΔ方法を使用して計算された[Schmittgen et al.(2008)Nature Protocols 3、1101−1108]。
実験は、生物学的に独立的なサンプルで3回繰り返して行った。
8.ウェスタンブロッティング
ウェスタンブロッティングは、以前論文で明らかにしたものと同様に行われた[Kwon et al.(2009)Journal of Plant Biology 52、79−87.]。
タンパク質を15%SDS−ポリアクリルアミドゲル上に分離し、ニトロセルローズ膜に移し、その後、4℃で一晩中抗−RabG3b抗体と培養した。
抗体結合タンパク質は、コンジュゲートされた2次抗体と培養し、ECLシステム(Amersham Biosciences)を使用することによって検出した。
9.サザンブロット分析
ゲノミックDNAは、DNAzol溶液(MRC)を使用することによって、ポプラ葉から抽出し[Chomczynski et al.(1997)BioTechniques 22、550−553.]、制限酵素EcoRIを一晩中処理した。
その後、切られたDNAを0.7%アガロースゲル上に分離し、Hybond−XL膜(Amersham Bioscience)に移した。
ブロットは、混成反応緩衝溶液に60℃で24時間[α−32P]dCTP−labeled RabG3b cDNAプローブで混成反応した。
混成反応されたブロットは、50℃で30分間2xSSC及び1xSSCで持続的に洗浄し、X線フィルムに露出した。
10.前処理
本実験でポプラの前処理のために硫酸(Daejung Chemicals & Metals、Gyeonggi、Korea)、水酸化ナトリウム(Sigma−Aldrich、St.Louis、MO)及び水性アンモニア(Junsei、Tokyo、Japan)を含有する3種類の触媒を使用した。アンモニア処理のために、粉砕ポプラを80℃の水槽(Biofree、Seoul、Korea)内で10時間14%(w/w)の水性アンモニア溶液内にインキュベーションした。硫酸及び水酸化ナトリウム処理の場合、温度を3分以内に190℃に昇温しながらポプラを極超短波オーブンで1%(w/v)の各触媒に浸した。次いで、反応を抑制するために極超短波容器を氷水に移した。各処理が終決された後、前処理されたバイオマスを濾過布(filtration cloth)(22〜25μm、Calbiochem、La Jolla、CA)を利用して濾過し、液体のpHが6〜7になるまで十分な量の水で洗浄した後、3日間オーブン内で乾燥させた。
11.酵素的加水分解
前処理効能を調査するために非処理及び前処理ポプラの両方をNREL手続によって消化した[Selig、M.、Weiss、N.、Ji、Y.2008.Laboratory analytical procedure:enzymatic saccharification 202 of lignocellulosic biomass.National Renewable Energy Laboratory、Golden、CO.]。酵素活性は、1ml溶液当たり56.8 FPUで測定された。1%(w/v)のバイオマスを0.05Mのクエン酸緩衝液及びテトラサイクリンとシクロヘキシミドのような抗生剤が既に満たされた20mlバイアルに添加した後、1gのグルカン当たり15FPUのアクセレラーゼ(Accellerase)1000(Genencor、Rochester、NY)を使用して72時間インキュベーションした。酵素と基質の反応プロファイリングを確認するために、2、6、10、24、48、及び72時間目に試料をそれぞれ採集した。
12.成分分析
NREL手続によって成分分析を行った[Sluiter、A.、Hames、B.、Ruiz、R.、Scarlata、C.、Sluiter、J.、Templeton、D.、Crocker、D.2008.210 Laboratory analytical procedure:determination of structural carbohydrates and lignin 211 in biomass.National Renewable Energy Laboratory、Golden、CO.]。要約すれば、0.3gの乾燥バイオマスを72%(w/w)硫酸を使用して前消化し、4%に希釈した後、121℃で1時間消化した。バイオマススラリーをるつぼを用いて濾過した。るつぼ上の残渣を575℃で3時間溶鉱炉内に移動させた(Daihan Lab Tech、Kyonggi−Do、Korea)。溶鉱炉内での燃焼の前及び後に重量差を測定し、酸−不溶性リグニンを決定した。中和貫流(flow−through)を5分間16,000rpmで遠心分離し、0.2μm注射濾過器(Chrom Tech、Apple Valley、MN)を使用して濾過し、SP0810カラム(Shodex、Showa Denko、Kawasaki、Japan;Pb2+form、300mmx8.0mmx7μm)及び屈折率検出器(G1362A、Agilent Technologies、Waldbronn、Germany)が装着された高性能液体クロマトグラフィー(HPLC;Agilent 1100、Agilent Technologies、Waldbronn、Germany)でグルコース、キシロースなどを含む炭水化物を分析した。すべての分析は、3回繰り返して行った。
II.実験結果
1.RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木構成
インシリコデータによれば、シロイヌナズナRabG3bは、ブラシノリド/ホウ酸投与とプログラムされた細胞死滅のような木部の分化条件下で高く発現される[Kwon et al.(2009)Journal of Plant Biology 52、79−87.;Kwon et al.(2010) Plant Journal 64、151−164.]。以前の研究で、RabG3bは、シロイヌナズナでのその自体の自食を通じて管状要素の分化を調節することを示した[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164。]。本発明者らは、シロイヌナズナのようにポプラ樹木でRabG3bが同じ役目を行うか、そしてポプラ樹木の木部の成長を促進させるかを調べるために、カリフラワーモザイクウイルス35Sプローモーターを通じてRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木を製作した。RT−PCRとウェスタンブロッティングを使用して形質転換された遺伝子発現で14個ラインが発見され、これは、転写レベルとタンパク質レベルで良い一致を示した[図1]。
9個のライン(OX−1、−3、−7、−8、−11、−12、−13、−15、−16)は、単一コピー挿入を示した。この結果を通じて見れば、3個の独立的なライン(OX−3、−8、−15)は、高い発現レベルと単一遺伝子コピーを示し、次の研究のために選択された。
2.RabG3bCA形質転換されたポプラ樹木の発現された表現型
RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木の幹成長が先に測定された[図2の(a)]。形質転換されたポプラ樹木(P.alba x P.tremula var.glandulosa)(OX)が培地と土壌の両方で対照群(WT)に比べてさらに速く成長した。培養培地では、5週間対照群は5cm成長し、形質転換された樹木は、7〜8cm程度成長した。土壌に移され、10週間栽培した後、測定した結果、RabG3bCAが形質転換された樹木は、幹の長さでは対照群に比べて13〜20%さらに成長し、厚さは、10〜12%さらに成長した[図2の(b)、(c)]。節間数字は、約10%程度形質転換されたポプラ樹木で増加することを示した[図2の(d)]。また、木を乾かした後、重さを測ったところ、RabG3bCAが形質転換された樹木が対照群に比べて重さが2倍程度多い[図2の(e)、(f)]。
3.RabG3bCA形質転換されたポプラ樹木での木部発達及び繊維細胞増大
RabG3bCAが形質転換されたシロイヌナズナのようにRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木で木部の発達が増大されることによる幹成長の増加が解剖学的分析を通じて明らかにされた[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164]。
培地で5週間成長した樹木を幹の下部分を切って、維管束のパターンを観察した[図3]。たとえ、総合的な維管束の形態は、形質転換された樹木や対照群で類似しているが、形質転換された樹木で木部の変形が目立つように増加した[図3の(a)−(c)]。リグニンの蛍光分析は、RabG3bCAが形質転換された樹木で対照群に比べてリグニンの形成と2次細胞壁形成がさらに増大したことを示した[図3の(d)−(f)]。維管束の発達は、土壌で栽培された樹木で追加観察された。幹の上部分で10番目節間を切り出した断面で、2次木部は、形質転換された樹木で目立つように発達された状態であったが、対照群では、発達し始まる段階であった[図4の(a)]。下側で二次成長をしている30番目節間を切り出した追加断面を得た[図4の(b)、(c)]。組職部分を観察したとき、形質転換された樹木で対照群より40%直径がさらに広い2次木部(SX)の成長を示したとを発見した。しかし、師部(P)、維管束形成層(C)、外皮(OB)では、形質転換された樹木と対照群の差がほとんどなかった。この結果は、ポプラ樹木でのRabG3bCAの過発現が木部成長の増大による2次木の成長の増加を導いたことを示す。
木部の細胞のサイズが形質転換された樹木に及んだ影響を調べるために、導管要素と繊維細胞の細胞を分離し、長さと幅を測定した[図5及び図6]。
RabG3bCAが形質転換された樹木では、繊維細胞の長さが大きく増大し(middle:45−60%、bottom:37−47%増加)、直径もやはり大きく増大(middle:40−47%、bottom:25−41%増加)することは勿論、導管要素の直径も有意的に増加したが(middle:40−57%、bottom:66−80%増加)、導管要素の長さは、有意的に増加しなかった(middle:18−20%、bottom:24−33%減少)。
4.RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木の幹での化学的構成
RabG3bCA形質転換されたポプラ樹木幹での細胞壁構成要素の変化を見るために構成要素を分析した[表3]。
2つの主要構造的構成要素であるセルロースとリグニンを観察したが、リグニンは、形質転換されたポプラ樹木で対照群と比較したとき、変化がなかったが、セルロースは、略10%(OX−8)増加した。全体多糖類の含量は、対照群と形質転換されたポプラ樹木の両方の間で類似した。セルロースの1次的要素であるグルコースの量は、形質転換された樹木で6〜11%程度さらに高かった。対照的にヘミセルロースであるキシラン、キシロース(キシランの主要要素)は、形質転換された樹木で23〜26%減少した。セルロースの結晶度は、対照群と形質転換された樹木との間で差がなかった。
5.ポプラ樹木での木部発達中の自食活性
本発明者らの以前研究で、自食は、シロイヌナズナの管状要素の分化を活性化させ、自食と管状要素の分化は、また、RabG3bCAの過発現によって有意的に刺激された[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.]。カルスは、ポプラ樹木葉で増加し、MS固体培地で成長した。たとえカルス培養培地が木部の分化に適していないが、本発明者らは、フロログルシノール−HClでリグニン染色を用いた分析を通じてRabG3bCAが形質転換された樹木の細胞が自然な木部の増加を起こしていると認められる[図7の(a)]。RabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株で略20〜30%増加した強いリグニン染色程度が発見され、対照群では捜すことができなかった。特に、いくつかの染色されたRabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株で注目すべき導管要素の2次細胞壁パターンを示した[図7の(a)、矢印]。これは、リグニンの蓄積を示すと同時に、野生型樹木の細胞株では木部の分化が促進されない条件で木部の分化がRabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株で増加したことを示す。
RabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株での自食が増加される可能性については、自食構造を酸性染色LTG(Lyso Tracker Green)して研究した[Via et al.(1998)Journal of Cell Science 111、897−905.;Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164][図7の(b)]。RabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株では、野生型樹木の細胞株に比べて酸性染色試薬で染色された斑点がさらに多く観察された。
この染色によって得られた結果がポプラ樹木に直接適用されるかを観察するために、2番目節間で得られたサンプルを走査式電子顕微鏡で分析した[図8]。1次木部細胞株の分化は、野生型樹木、形質転換された樹木の両方で同一に観察された[図8の(a)、(g)]。野生型樹木の木部細胞では、多くの部分が損傷されない細胞内容物で満たされていて、いくつかの細胞は、2次細胞壁が沈着されている[図8の(b)]。これは、この細胞が分化の初期段階にあることを示す。注目すべきことは、野生型樹木の細胞株では、自食構造が細胞器官と構造を取り囲んで分解しているものであった[図8の(c)−(f)]。対照的に、RabG3bCAが形質転換された樹木の木部細胞では、大きく液胞の崩壊が進行されながら細胞内容物が分解されており[図8の(h)]、多くの自食構造が蓄積されていた[図8の(i)−(l)]。この結果が示すことは、木部細胞株の分化過程中に自食が起きることができ、この木部細胞株の分化作用と自食がRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木でさらに活発であることである。
6.木部の発達と関連した遺伝子の分析
以前のシロイヌナズナとポプラ樹木での木部発達に対する研究結果に基づいて、木部の発達に関与する遺伝子の複数のグループを選別し、それらの発現程度を野生型樹木とRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木で幼い幹であるとき、木部の分化が進行される間に比較分析した[Courtois−Moreau et al.(2009)Plant Journal 58、260−274.;Du et al.(2009)Plant Journal 60、1000−1014.;Shi et al.(2010)Plant & Cell Physiology 51、144−163.;Song et al.(2010)New Phytologist 187、777−790]。
本発明者らは、2次細胞壁形成と関連した2グループ(monolignol合成遺伝子(4CL3、C3H3、CCoAOMT1、COMT2、CAD1、CAD4、CAD10)と細胞壁炭水化物合成遺伝子(CesA4、CesA7、CesA8、CesA18、IRX8、IRX9、FRA8)の発現程度を比較した[図9の(a)]。少数(e.g.CesA4)を除いた大部分の細胞壁合成遺伝子がRabG3bCA形質転換された樹木で増加した。また、本発明者らは、細胞内容物を分解する2つのグループの遺伝子[プログラムされた細胞死滅と関連した遺伝子(peroxidase、VPE、and MC9)と自食と関連した遺伝子(ATG8d1、ATG8f2、ATG8i)]の発現程度を分析した[Courtois−Moreau et al.(2009)Plant Journal 58、260−274][図9の(b)、(c)]。形質転換された樹木で現われる細胞壁が分解が増加し、自食構造の形成が増加する表現型的特徴と同様に、これら分解する遺伝子は、形質転換された樹木でさらに増加した。この結果は、RabG3bCAが形質転換された樹木での形質転換された表現型と木部の分化程度がこれら遺伝子の発現と連関があることを証明する。
7.酵素接近性の調査
セルロースに対する酵素接近性を非間接的に調査するために、WT、OX3、及びOX8を含む3種のポプラを72時間1gグルカン当たり15 PFUのアクセレラーゼ1000を使用して加水分解した。WTを加水分解すれば、理論的最大グルコースを基準として32.8%の消化率(digestibility)が収得された。このように相対的に低い消化率は、リグノセルロースの天然難消化性及び強直性に起因したものであることができる。しかし、大部分の非処理バイオマスで通常20%未満として確認されたセルロース加水分解収率は、若干さらに高かった。OX3及びOX8で、それぞれ33.9%及び42.9%の加水分解収率が得られた。OX3が任意の差を示さないとしても、OX8は、WTと類似なリグニン含量にもかかわらず、消化率で約10%の改善を示した。このような結果は、RabG3bCA遺伝子が長さ及び厚さのような表現形質だけでなく、組成において任意の有意味な変化なしに形状または形態にも影響を及ぼしたことを立証した。したがって、バイオマス加水分解収率を増加させるための多様な前処理を在来式及び形質転換ポプラの両方に適用した。
硫酸、水酸化ナトリウム、及びアンモニアをリグノセルロースの前処理用触媒として使用した。各触媒で前処理条件は、われらの事前研究に基づいて決定した。WTの場合に、硫酸、水酸化ナトリウム、及びアンモニア前処理で60 FPUセルラーゼを使用した不溶性固形物の回収率は、それぞれ49.0%、58.7%、67.2%であり、酵素的消化率は、それぞれ54.4%、58.7%、44.9%であった。各処理で、23.8%、37.3%、36.4%水準の軽微な脱リグニン化によって、34.8%の消化率を示す非処理WTに比べて消化率は、それぞれ1.6−、1.7−及び1.3−倍増加を示した。OX3及びOX8を含む形質転換ポプラの場合、全般的な結果様相は、WTと多少類似していた。OX3で、硫酸、水酸化ナトリウム及びアンモニア前処理で不溶性固形物の回収率は、それぞれ43.5%、58.2%、66.3%であり、酵素的消化率は、それぞれ69.4%、74.3%、53.3%であった。各前処理条件でリグニン含量において30.5%、37.3%、及び34.1%減少とともに非処理OX3で35.1%の消化率に比べて2.0−、2.1−及び1.5−倍増加が測定された。最後に、硫酸、水酸化ナトリウム、及びアンモニア前処理で処理されたOX8から不溶性固形物回収率は、それぞれ44.1%、60.0%、63.7%であり、酵素的消化率は、それぞれ61.9%、69.4%、61.3%であった。また、各前処理条件で27.6%、37.6%、及び38.4%の脱リグニン化を示すとき、処理された43.0%消化率と比較して1.4−、1.6−及び1.4−倍改善が開発された。アンモニア再循環浸出ハイブリッドポプラに関する実験によれば、60%以上のリグニン除去にもかかわらず、15FPUのセルラーゼを使用した消化率は、残余リグニン及びリグニンに対する酵素の非生産的結合によって50%以下であった。したがって、本研究で、形質転換ポプラであるOX3及びOX8は、エタノールのような高付加価値製品の生産に適したリグノセルロースであることができる。
これら結果から、図10に示されたように、在来式及び遺伝学的に操作されたポプラを前処理するための各触媒の効率を評価するために、酵素的糖化により獲得された全体グルコース収率(不溶性固形物xグルカン含量x酵素的消化率)を比較した。100gの乾燥重量基準の非処理WT、OX3及びOX8の場合、生産されたグルコース収率は、それぞれ15.9、15.8、及び21.5gであった。100gの前処理ポプラの場合、WTで15.3−18.5g、OX3で17.7−24.0g、及びOX8で15.8−23.7g範囲の計算されたグルコース収率が収得された。
配列番号1:シロイヌナズナ RabG3b 活性構造遺伝子

Claims (10)

  1. シロイヌナズナ由来RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子が形質転換されたポプラであって、対応野生型植物と比較して繊維細胞長さが 37〜60% 増加し、木部が40% 以上増加しており、上記RabG3bCA遺伝子は、配列番号1の塩基配列である、形質転換されたポプラ。
  2. 対応野生型植物と比較してセルロース及び/またはグルコース含量が増加した、請求項1に記載の形質転換されたポプラ。
  3. 請求項1に記載の形質転換されたポプラを原料とする紙。
  4. 請求項1に記載の形質転換されたポプラから生産されたパルプ。
  5. 請求項1に記載の形質転換されたポプラから生産されたバイオマス。
  6. 樹木を利用したバイオマスの生産方法において、
    上記樹木は、請求項1に記載の形質転換されたポプラである、バイオマスの生産方法。
  7. 上記ポプラを水酸化ナトリウムで前処理した後、酵素で加水分解し、バイオマスを生産する、請求項に記載のバイオマスの生産方法。
  8. 樹木を利用したパルプの生産方法において、
    上記樹木は、請求項1に記載の形質転換されたポプラである、パルプの生産方法。
  9. シロイヌナズナ由来RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子を過発現させてバイオマスが増加した形質転換されたポプラを製造する方法であって、上記RabG3bCA遺伝子は、配列番号1の塩基配列である、方法
  10. 上記バイオマスがセルロース及び/またはグルコースである、請求項に記載の方法。
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