JP5967674B2 - RabG3bCAを利用した形質転換された樹木及びその用途 - Google Patents
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Description
列の解読、EST、マイクロアレイデータ(microarray data)の蓄積、分子マーカー(molecular marker)の開発、形質転換技術確立など多様な分子生物学的データベース構築とシステムの確立は、ポプラ研究の活性化のための重要な基盤になっている。
また、本発明の他の目的は、RabG3bCAが形質転換された樹木を原料とする紙及び上記形質転換された樹木から生産されたパルプを提供することにある。
ポプラ樹木は、環境学的、経済学的価値を有しており、また、木材産業において重要な樹木のうち1つである[Kaneda et al.(2010)Journal of Integrative Plant Biology 52、234−243]。樹木での最も重要な生物学的資源は、樹木あるいは2次木部の部分であり、これは、リサイクル可能な紙、パルプ、バイオ燃料の生産に利用される[Demura et al.(2010)Current Opinionin Plant Biology 13、299−304]。最近の遺伝学的、遺伝工学的研究は、樹木の生産過程のいくつかの重要な核心遺伝子を明らかにし、樹木の生産過程に対する理解を広げた。しかし、本発明者らは、以前発明の結果でRabG3bCAがシロイヌナズナで木部の発達過程の促進作用と関系があることを示し、本発明においてポプラ樹木でRabG3bCAを増大させることによって、樹木の生産能力を変えることができることを示した。すなわち、RabG3bCAが過発現されたポプラ樹木で幹の成長速度と木部の発達が増大し、この効果は、シロイヌナズナとポプラ樹木との間で保存されることによって、機能的にシロイヌナズナのRabG3bCAがポプラ樹木でも相同であることを示す。ポプラ樹木の誘電体分析(http://genome.jgi−psf.org/Poptr1_1/Poptr1_1.home.html;Tuskan et al.2006)結果を参照すれば、8個のポプラ樹木同属体がシロイヌナズナのRabG3bと70%に近いアミノ酸配列類似性を示しており、そのうち1つ(estExt_Genewise1_v1.C_LG_II2093)は、90%に達する高い類似性と83%に達する同一性をシロイヌナズナのRabG3bタンパク質と比較して有している。これらRabG同属体がシロイヌナズナのRabG3bとその木部の発達に対する影響と機能的に類似しているかを調べるに値する価値を有している。
(2010)Autophagy 6、1187−1189.]。本発明者らは、自食が木部の分化で重要な過程であることを証明し、シロイヌナズナで管状要素のプログラムされた細胞死滅と関連された要素であることを証明した。ポプラ樹木で木部細胞が分化する間に、自食構造が発見され、RabG3bCAが形質転換された樹木では、さらに多い蓄積を切られたサンプル分析を通じて発見した[図8]。注目すべきことは、カルス培養での野生型細胞株で木部分化やリグニンの蓄積が増加されなかったが、RabG3bCAが形質転換された細胞株では、木部の分化が増大し、酸性染色によって現われた自食構造の形成の増加が伴われたということである[図7]。以前の研究結果で、ATG遺伝子とタンパク質発現をシロイヌナズナで調査したとき、管状要素の分化中に自食の活性と関系があったことが分かった[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.;Kwon et al.(2010)Autophagy 6、1187−1189]。本発明においていくつかのATG遺伝子がRabG3bCAが増大した細胞株において野生型細胞株より2倍以上さらに多く増加したことを成長しているポプラ樹木の幹で示した[図9の(c)]。これら結果は、自食が木部の分化に必ず経なければならない過程であり、シロイヌナズナの場合と同様に、ポプラ樹木でもRabG3bのGTPase活性がこれを調節することを示す。特に、シロイヌナズナのような草本遺伝形質がポプラ樹木のような木本にそのまま現われることは非常にまれな場合であり、本発明は、産業的利用価値を有する。
I.材料及び実験方法
1.植物と成長条件
ポプラ樹木の形質転換のために、成長点培養を維持するハイブリッドポプラ樹木クローンであるBH1(P.alba x P.tremula var.glandulosa BH1)を使用した。RabG3bCA構造は、pBI121植物発現ベクターに以前にクローンされ[Kwon et al(2009)Journal of Plant Biology 52、79−87.]、ポプラ樹木細胞にアグロバクテリウム媒介(Agrobacterium−mediated)形質転換法によって伝達された[Choi et al(2005)Journal of Plant Biology 48、351−355.;Kim Y.H.、Kim et al(2011)Plant Biotechnology Journal 9、334−347.]。形質転換された細胞は、500mg/Lセフォタキシムと50mg/Lカナマイシンが含まれているカルス誘導培地(Murashige and Skoog[MS]medium、pH 5.8、3% sucrose、0.8% agar、1mg/L 2、4−dichlorophenoxyacetic acid、0.01mg/L benzylaminopurine、and 0.1mg/L 1−naphthylacetic acid[NAA])によって選別された。根は、樹木の培地に移されて再生された。形質転換過程中に、培地は、培養室で25℃を維持し、16時間白色光(30μmol/m2・s)に晒し、8時間暗条件下で放置した。再生された根は、根付くために0.2mg/Lインドール酪酸を含むMS培地に移された。根付いた植物は、植木鉢で適応期間を有し、追加研究のために温室の土壌に移された。植物は、温室、28〜30℃の温度、12時間明条件/12時間暗条件下で培養と実験をすべて実施した。
植物の生長は、根の生長点から幹の基底までである幹の長さ、幹基底の直径、節間の数と長さを測定して決定した。初期の植物長さを同一にするために、植物が土壌で20cm以内の長さに成長したとき、基底を切って同じ時間に同じ長さで測定し、測定は、3〜5回程度繰り返した。
組織化学的分析は、以前論文[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.]のように行った。
ポプラ樹木の幹を0.1Mリン酸緩衝溶液(pH 7.4)に2.5%グルタルアルデヒド及び4%p−ホルムアルデヒドを含む溶液で4℃で4時間固定し、0.1Mリン酸緩衝溶液(pH 7.4)で洗浄し、1% OsO4で2時間室温に固定した。0.1Mリン酸溶液で洗浄した後、サンプルを脱水し、LRホワイトレジン(London Resin)に充填した。ウルトラマイクロトーム(RMC MT X)を利用して断面(Cross−section)(1μm)を準備した後、染色し、光顕微鏡で観察した。60〜70nmに切り出した後、濾過した1%トルイジンブルー(toluidine blue)で短く染色した。上記断面を光顕微鏡(Olympus、BX51TRF)で撮影した。走査式電子顕微鏡(TEM)分析で薄い断面(60−70nm)は、銅格子板(1−GN、150メッシュ)上に収集し、ウラニルアセテート及びクエン酸鉛で染色し、TEM(Philips、Tecnai 12)で照射した。リグニン自発蛍光(autofluorescence)分析のための、ポプラ幹は、固定され、paraplast(McCormick Scientific)に内蔵した。断面(10μm)をマイクロトーム(Leica RM2235)を使用して準備した後、405/460nm励起/発光で共焦点顕微鏡(Zeiss LSM 510 META)を使用して撮影した。リグニン染色のための培養細胞は、フロログルシノール溶液(2%ethanol/water、95/5[v/v])で1時間染色し、6N HClに浸した。染色された細胞培養サンプルの明視野写真(Bright−field photographs)は、光顕微鏡(Olympus、BX51TRF)で撮影された。
導管要素と繊維のサイズを測るために、10週間土壌で栽培された野生型樹木と形質転換されたポプラ樹木の底及び中間部位から取った幹部分(1cm)を2mmX1mmX2mmサイズの切れに切った。木切れは、直ちに50%硝酸内6% KClO3を含むSchulze’s 試薬に浸した後、1週間室温で保管された。このサンプルは、その後、60℃で30分間激しくシェーキングし、それぞれの個別的な細胞に分離した。浸軟した個別細胞を蒸留水で3回洗浄し、顕微鏡スライドに載置し、カバーグラスで覆った。そして光顕微鏡(Olympus、BX51TRF)で観察し、細胞の長さと幅を測定した。
10週間土壌で栽培された植物から得られた幹サンプルが細胞壁要素を分析するのに使用された。不要であり、主要ではない要素をアセトンと温水で抽出し、除去した。
Broad band Observe Probe type、30℃、90°、11μsec pulse、10 sec delay between pulses、2.73sec for acquisition time、10ppm for sweep width。
セルロースの結晶度分析は、以前に作った不要な要素が除去されたサンプルをX−RAY回折分析機(Bruker D5005)により(40Kv、40mA)行われた。
回折スペクトルは、θ−2θ方法及び重複サンプルは、0.01゜の段階で2θ=10゜−30゜から1゜/minスキャンした。相対結晶指数が以前文献のように測定された[Segal et al(1959)Textile Research Journal 29、786−794.]。
RabG3bCA過発現株でRabG3bCAの発現程度を確認するためのポプラ樹木の葉からまたは植物RNA精製試薬(Invitrogen)を使用して定量的なRT−PCRで多様な遺伝子発現を確認するための幼い幹から全体RNAを分離した。分離してそれぞれのサンプルで定量的なリアルタイムPCRを用いて分析した。
実験は、生物学的に独立的なサンプルで3回繰り返して行った。
ウェスタンブロッティングは、以前論文で明らかにしたものと同様に行われた[Kwon et al.(2009)Journal of Plant Biology 52、79−87.]。
抗体結合タンパク質は、コンジュゲートされた2次抗体と培養し、ECLシステム(Amersham Biosciences)を使用することによって検出した。
ゲノミックDNAは、DNAzol溶液(MRC)を使用することによって、ポプラ葉から抽出し[Chomczynski et al.(1997)BioTechniques 22、550−553.]、制限酵素EcoRIを一晩中処理した。
本実験でポプラの前処理のために硫酸(Daejung Chemicals & Metals、Gyeonggi、Korea)、水酸化ナトリウム(Sigma−Aldrich、St.Louis、MO)及び水性アンモニア(Junsei、Tokyo、Japan)を含有する3種類の触媒を使用した。アンモニア処理のために、粉砕ポプラを80℃の水槽(Biofree、Seoul、Korea)内で10時間14%(w/w)の水性アンモニア溶液内にインキュベーションした。硫酸及び水酸化ナトリウム処理の場合、温度を3分以内に190℃に昇温しながらポプラを極超短波オーブンで1%(w/v)の各触媒に浸した。次いで、反応を抑制するために極超短波容器を氷水に移した。各処理が終決された後、前処理されたバイオマスを濾過布(filtration cloth)(22〜25μm、Calbiochem、La Jolla、CA)を利用して濾過し、液体のpHが6〜7になるまで十分な量の水で洗浄した後、3日間オーブン内で乾燥させた。
前処理効能を調査するために非処理及び前処理ポプラの両方をNREL手続によって消化した[Selig、M.、Weiss、N.、Ji、Y.2008.Laboratory analytical procedure:enzymatic saccharification 202 of lignocellulosic biomass.National Renewable Energy Laboratory、Golden、CO.]。酵素活性は、1ml溶液当たり56.8 FPUで測定された。1%(w/v)のバイオマスを0.05Mのクエン酸緩衝液及びテトラサイクリンとシクロヘキシミドのような抗生剤が既に満たされた20mlバイアルに添加した後、1gのグルカン当たり15FPUのアクセレラーゼ(Accellerase)1000(Genencor、Rochester、NY)を使用して72時間インキュベーションした。酵素と基質の反応プロファイリングを確認するために、2、6、10、24、48、及び72時間目に試料をそれぞれ採集した。
NREL手続によって成分分析を行った[Sluiter、A.、Hames、B.、Ruiz、R.、Scarlata、C.、Sluiter、J.、Templeton、D.、Crocker、D.2008.210 Laboratory analytical procedure:determination of structural carbohydrates and lignin 211 in biomass.National Renewable Energy Laboratory、Golden、CO.]。要約すれば、0.3gの乾燥バイオマスを72%(w/w)硫酸を使用して前消化し、4%に希釈した後、121℃で1時間消化した。バイオマススラリーをるつぼを用いて濾過した。るつぼ上の残渣を575℃で3時間溶鉱炉内に移動させた(Daihan Lab Tech、Kyonggi−Do、Korea)。溶鉱炉内での燃焼の前及び後に重量差を測定し、酸−不溶性リグニンを決定した。中和貫流(flow−through)を5分間16,000rpmで遠心分離し、0.2μm注射濾過器(Chrom Tech、Apple Valley、MN)を使用して濾過し、SP0810カラム(Shodex、Showa Denko、Kawasaki、Japan;Pb2+form、300mmx8.0mmx7μm)及び屈折率検出器(G1362A、Agilent Technologies、Waldbronn、Germany)が装着された高性能液体クロマトグラフィー(HPLC;Agilent 1100、Agilent Technologies、Waldbronn、Germany)でグルコース、キシロースなどを含む炭水化物を分析した。すべての分析は、3回繰り返して行った。
1.RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木構成
インシリコデータによれば、シロイヌナズナRabG3bは、ブラシノリド/ホウ酸投与とプログラムされた細胞死滅のような木部の分化条件下で高く発現される[Kwon et al.(2009)Journal of Plant Biology 52、79−87.;Kwon et al.(2010) Plant Journal 64、151−164.]。以前の研究で、RabG3bは、シロイヌナズナでのその自体の自食を通じて管状要素の分化を調節することを示した[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164。]。本発明者らは、シロイヌナズナのようにポプラ樹木でRabG3bが同じ役目を行うか、そしてポプラ樹木の木部の成長を促進させるかを調べるために、カリフラワーモザイクウイルス35Sプローモーターを通じてRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木を製作した。RT−PCRとウェスタンブロッティングを使用して形質転換された遺伝子発現で14個ラインが発見され、これは、転写レベルとタンパク質レベルで良い一致を示した[図1]。
9個のライン(OX−1、−3、−7、−8、−11、−12、−13、−15、−16)は、単一コピー挿入を示した。この結果を通じて見れば、3個の独立的なライン(OX−3、−8、−15)は、高い発現レベルと単一遺伝子コピーを示し、次の研究のために選択された。
RabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木の幹成長が先に測定された[図2の(a)]。形質転換されたポプラ樹木(P.alba x P.tremula var.glandulosa)(OX)が培地と土壌の両方で対照群(WT)に比べてさらに速く成長した。培養培地では、5週間対照群は5cm成長し、形質転換された樹木は、7〜8cm程度成長した。土壌に移され、10週間栽培した後、測定した結果、RabG3bCAが形質転換された樹木は、幹の長さでは対照群に比べて13〜20%さらに成長し、厚さは、10〜12%さらに成長した[図2の(b)、(c)]。節間数字は、約10%程度形質転換されたポプラ樹木で増加することを示した[図2の(d)]。また、木を乾かした後、重さを測ったところ、RabG3bCAが形質転換された樹木が対照群に比べて重さが2倍程度多い[図2の(e)、(f)]。
RabG3bCAが形質転換されたシロイヌナズナのようにRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木で木部の発達が増大されることによる幹成長の増加が解剖学的分析を通じて明らかにされた[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164]。
RabG3bCA形質転換されたポプラ樹木幹での細胞壁構成要素の変化を見るために構成要素を分析した[表3]。
本発明者らの以前研究で、自食は、シロイヌナズナの管状要素の分化を活性化させ、自食と管状要素の分化は、また、RabG3bCAの過発現によって有意的に刺激された[Kwon et al.(2010)Plant Journal 64、151−164.]。カルスは、ポプラ樹木葉で増加し、MS固体培地で成長した。たとえカルス培養培地が木部の分化に適していないが、本発明者らは、フロログルシノール−HClでリグニン染色を用いた分析を通じてRabG3bCAが形質転換された樹木の細胞が自然な木部の増加を起こしていると認められる[図7の(a)]。RabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株で略20〜30%増加した強いリグニン染色程度が発見され、対照群では捜すことができなかった。特に、いくつかの染色されたRabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株で注目すべき導管要素の2次細胞壁パターンを示した[図7の(a)、矢印]。これは、リグニンの蓄積を示すと同時に、野生型樹木の細胞株では木部の分化が促進されない条件で木部の分化がRabG3bCAが形質転換された樹木の細胞株で増加したことを示す。
以前のシロイヌナズナとポプラ樹木での木部発達に対する研究結果に基づいて、木部の発達に関与する遺伝子の複数のグループを選別し、それらの発現程度を野生型樹木とRabG3bCAが形質転換されたポプラ樹木で幼い幹であるとき、木部の分化が進行される間に比較分析した[Courtois−Moreau et al.(2009)Plant Journal 58、260−274.;Du et al.(2009)Plant Journal 60、1000−1014.;Shi et al.(2010)Plant & Cell Physiology 51、144−163.;Song et al.(2010)New Phytologist 187、777−790]。
セルロースに対する酵素接近性を非間接的に調査するために、WT、OX3、及びOX8を含む3種のポプラを72時間1gグルカン当たり15 PFUのアクセレラーゼ1000を使用して加水分解した。WTを加水分解すれば、理論的最大グルコースを基準として32.8%の消化率(digestibility)が収得された。このように相対的に低い消化率は、リグノセルロースの天然難消化性及び強直性に起因したものであることができる。しかし、大部分の非処理バイオマスで通常20%未満として確認されたセルロース加水分解収率は、若干さらに高かった。OX3及びOX8で、それぞれ33.9%及び42.9%の加水分解収率が得られた。OX3が任意の差を示さないとしても、OX8は、WTと類似なリグニン含量にもかかわらず、消化率で約10%の改善を示した。このような結果は、RabG3bCA遺伝子が長さ及び厚さのような表現形質だけでなく、組成において任意の有意味な変化なしに形状または形態にも影響を及ぼしたことを立証した。したがって、バイオマス加水分解収率を増加させるための多様な前処理を在来式及び形質転換ポプラの両方に適用した。
Claims (10)
- シロイヌナズナ由来RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子が形質転換されたポプラであって、対応野生型植物と比較して繊維細胞長さが 37〜60% 増加し、木部が40% 以上増加しており、上記RabG3bCA遺伝子は、配列番号1の塩基配列である、形質転換されたポプラ。
- 対応野生型植物と比較してセルロース及び/またはグルコース含量が増加した、請求項1に記載の形質転換されたポプラ。
- 請求項1に記載の形質転換されたポプラを原料とする紙。
- 請求項1に記載の形質転換されたポプラから生産されたパルプ。
- 請求項1に記載の形質転換されたポプラから生産されたバイオマス。
- 樹木を利用したバイオマスの生産方法において、
上記樹木は、請求項1に記載の形質転換されたポプラである、バイオマスの生産方法。 - 上記ポプラを水酸化ナトリウムで前処理した後、酵素で加水分解し、バイオマスを生産する、請求項6に記載のバイオマスの生産方法。
- 樹木を利用したパルプの生産方法において、
上記樹木は、請求項1に記載の形質転換されたポプラである、パルプの生産方法。 - シロイヌナズナ由来RabG3bの活性型突然変異体(RabG3bCA)遺伝子を過発現させてバイオマスが増加した形質転換されたポプラを製造する方法であって、上記RabG3bCA遺伝子は、配列番号1の塩基配列である、方法。
- 上記バイオマスがセルロース及び/またはグルコースである、請求項9に記載の方法。
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