JP5747839B2 - Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry - Google Patents
Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry Download PDFInfo
- Publication number
- JP5747839B2 JP5747839B2 JP2012036535A JP2012036535A JP5747839B2 JP 5747839 B2 JP5747839 B2 JP 5747839B2 JP 2012036535 A JP2012036535 A JP 2012036535A JP 2012036535 A JP2012036535 A JP 2012036535A JP 5747839 B2 JP5747839 B2 JP 5747839B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- data
- mass spectrum
- measurement
- mass
- saturation
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Description
本発明は、ガスクロマトグラフ(GC)や液体クロマトグラフ(LC)等のクロマトグラフと、MSn型質量分析装置を含む質量分析装置とを組み合わせた、ガスクロマトグラフ質量分析装置(GC/MS)、液体クロマトグラフ質量分析装置(LC/MS)などのクロマトグラフ質量分析装置で収集されるデータを処理するデータ処理装置に関する。 The present invention relates to a gas chromatograph mass spectrometer (GC / MS), a liquid comprising a combination of a chromatograph such as a gas chromatograph (GC) or a liquid chromatograph (LC) and a mass spectrometer including an MS n- type mass spectrometer. The present invention relates to a data processing apparatus that processes data collected by a chromatograph mass spectrometer such as a chromatograph mass spectrometer (LC / MS).
複数の成分(化合物)を含む試料中の各成分の定性分析や定量分析を行う際には、GC/MSやLC/MSがよく利用される。GC/MSやLC/MSを用いた定性分析では、一般に質量分析装置においてスキャン測定が行われ、所定の質量電荷比範囲に亘るマススペクトルが繰り返し取得される。このマススペクトルのパターンを予めスペクトルデータベース(ライブラリ)に格納されているマススペクトルパターンと照合することによって、パターンの類似度が高い化合物を抽出し、クロマトグラム上のピークに対応する化合物を特定する。クロマトグラム上に時間幅の狭い鋭いピークが現れる場合には、そのピークトップを与える測定点(測定時刻)のマススペクトルを利用して定性を行えばよい。 When performing qualitative analysis or quantitative analysis of each component in a sample containing a plurality of components (compounds), GC / MS or LC / MS is often used. In qualitative analysis using GC / MS or LC / MS, generally, scan measurement is performed in a mass spectrometer, and mass spectra over a predetermined mass-to-charge ratio range are repeatedly acquired. By comparing this mass spectrum pattern with a mass spectrum pattern stored in advance in a spectrum database (library), a compound having a high pattern similarity is extracted, and a compound corresponding to a peak on a chromatogram is specified. When a sharp peak with a narrow time width appears on the chromatogram, qualitative analysis may be performed using the mass spectrum of the measurement point (measurement time) giving the peak top.
しかしながら、クロマトグラムのピークは様々な要因によって鈍ったり変形したりするため、厳密にピークトップを与える測定点を決めるのが困難である場合も多い。このような場合に備えて、従来のGC/MS、LC/MS用のデータ処理装置は、クロマトグラムのピークトップ付近の複数の測定点(一般的には3点から5点程度)のマススペクトルを平均した平均マススペクトルを算出する機能を有している(非特許文献1参照)。 However, since the peak of the chromatogram is dull or deformed due to various factors, it is often difficult to determine the measurement point that gives the peak top strictly. In preparation for such cases, conventional GC / MS and LC / MS data processing apparatuses use mass spectra at a plurality of measurement points (generally about 3 to 5 points) near the peak top of the chromatogram. Has a function of calculating an average mass spectrum obtained by averaging (see Non-Patent Document 1).
ところで、質量分析装置としてタンデム四重極型質量分析装置などを用いたGC/MS/MSやLC/MS/MSでは、目的化合物の定量分析を行うために多重反応モニタリング(MRM=Multiple Reaction Monitoring)測定モードによる分析がよく用いられる。MRM測定モードは、前段四重極マスフィルタと後段四重極マスフィルタとでそれぞれ特定の質量電荷比を有するイオンのみを通過させて最終的に検出器に到達するイオンを検出するモードであり、クロマトグラフでは分離できなかった夾雑物由来のイオンと目的成分由来のイオンとを分離して後者のみを検出できるという利点を有する。その反面、MRM測定モードでは保持時間以外に定性情報が得られないため、未知の成分が試料に含まれていてもこれを同定することは難しい。そこで、従来のGC/MS/MSやLC/MS/MSでは、MRM測定とスキャン測定とを実質的に同時であるとみなせるような短い時間間隔で交互に繰り返すことにより、MRM測定による定量情報とスキャン測定による定性情報とを並行して取得できるようになっている。 By the way, in GC / MS / MS and LC / MS / MS using a tandem quadrupole mass spectrometer as a mass spectrometer, multiple reaction monitoring (MRM = Multiple Reaction Monitoring) is performed in order to perform quantitative analysis of the target compound. Analysis by measurement mode is often used. The MRM measurement mode is a mode in which only ions having a specific mass-to-charge ratio are passed through the front-stage quadrupole mass filter and the rear-stage quadrupole mass filter to detect ions that finally reach the detector, There is an advantage that ions derived from impurities that could not be separated by the chromatograph and ions derived from the target component can be separated to detect only the latter. On the other hand, in the MRM measurement mode, since qualitative information cannot be obtained except for the holding time, it is difficult to identify even if an unknown component is included in the sample. Therefore, in the conventional GC / MS / MS and LC / MS / MS, the MRM measurement and the scan measurement are alternately repeated at short time intervals that can be considered to be substantially the same, so that the quantitative information by the MRM measurement can be obtained. Qualitative information from scan measurement can be acquired in parallel.
しかしながら、MRM測定とスキャン測定とを短い時間間隔で交互に繰り返す場合には、次のような問題がある。 However, when MRM measurement and scan measurement are repeated alternately at short time intervals, there are the following problems.
即ち、MRM測定では2段の四重極マスフィルタでイオン選択が行われるため、一方の四重極マスフィルタをイオンが素通りする単純スキャン測定に比べて検出器に到達するイオン量が相対的にかなり少なくなる。一方で、定量分析を行うMRM測定では高い感度が要求される。そこで、一般に、MRM測定とスキャン測定とが同時に(厳密には上述したように時分割であるが長い時間でみれば実質的に同時である)実施される場合には、MRM測定で得られる相対的に少量のイオンでも充分な検出信号が得られるように、検出器のゲインは高く設定される。ところが、このように検出器のゲインが高いと、スキャン測定で得られる検出信号はA/D変換器の入力レンジを超えてしまい、しばしばデータの飽和が生じることになる。 That is, in the MRM measurement, since ion selection is performed by a two-stage quadrupole mass filter, the amount of ions reaching the detector is relatively smaller than the simple scan measurement in which ions pass through one quadrupole mass filter. Considerably less. On the other hand, high sensitivity is required for MRM measurement for quantitative analysis. Therefore, in general, when the MRM measurement and the scan measurement are performed at the same time (strictly speaking, it is time-division as described above, but is substantially the same in a long time), the relative values obtained by the MRM measurement Thus, the gain of the detector is set high so that a sufficient detection signal can be obtained even with a small amount of ions. However, when the gain of the detector is high in this way, the detection signal obtained by the scan measurement exceeds the input range of the A / D converter, and data saturation often occurs.
スキャン測定において或る質量電荷比の信号強度データが飽和すると、そのときのマススペクトルのパターンは崩れてしまう。クロマトグラムピークのトップ付近の所定の時間範囲で上記のように平均マススペクトルを算出する際にパターンが崩れたマススペクトルが含まれると、得られる平均マススペクトルも目的化合物の特徴を的確に表さないものとなるおそれがある。そうなると、データベース検索の際に誤った化合物がヒットして誤同定を引き起こしたり、正解の化合物がヒットせずに同定漏れを引き起こしたりすることになる。 When signal intensity data of a certain mass-to-charge ratio is saturated in scan measurement, the pattern of the mass spectrum at that time is destroyed. When the average mass spectrum is calculated in the predetermined time range near the top of the chromatogram peak and a mass spectrum with a corrupted pattern is included, the resulting average mass spectrum also accurately represents the characteristics of the target compound. There is a risk of not being. In this case, an incorrect compound hits during database search and causes misidentification, or a correct compound does not hit and causes identification failure.
本発明は上記課題を解決するために成されたものであり、その目的とするところは、目的化合物の特徴を的確に表した平均マススペクトルを求めることにより、定性分析の正確性を向上させることができるクロマトグラフ質量分析用データ処理装置を提供することにある。 The present invention has been made to solve the above-mentioned problems, and its object is to improve the accuracy of qualitative analysis by obtaining an average mass spectrum that accurately represents the characteristics of the target compound. It is an object of the present invention to provide a data processing apparatus for chromatographic mass spectrometry capable of performing
上記課題を解決するためになされた本発明は、クロマトグラフで時間的に分離された試料中の成分を質量分析装置により分析するクロマトグラフ質量分析装置で得られたデータを処理するデータ処理装置であって、前記質量分析装置においてスキャン測定を実施することで繰り返し得られたマススペクトルデータを処理するクロマトグラフ質量分析データ処理装置において、
a)目的成分が質量分析装置に導入されている期間に得られたマススペクトルデータであって所定の時間範囲又は測定点範囲に含まれる複数の測定点のマススペクトルデータの中で、測定時に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むマススペクトルデータを識別する飽和データ識別手段と、
b)前記複数の測定点のマススペクトルデータの中で、前記飽和データ識別手段により信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むと判定されなかったマススペクトルデータのみを利用して、平均マススペクトルを作成する平均マススペクトル作成手段と、
を備えることを特徴としている。
The present invention made to solve the above problems is a data processing device for processing data obtained by a chromatograph mass spectrometer that analyzes a component in a sample temporally separated by a chromatograph by a mass spectrometer. In the chromatograph mass spectrometry data processing apparatus for processing mass spectrum data repeatedly obtained by carrying out scan measurement in the mass spectrometer,
a) Mass spectrum data obtained during the period when the target component is introduced into the mass spectrometer and a signal at the time of measurement among mass spectrum data of a plurality of measurement points included in a predetermined time range or measurement point range. Saturation data identification means for identifying mass spectral data including data where saturation has occurred or is likely to occur;
b) Among the mass spectrum data of the plurality of measurement points, only the mass spectrum data that has not been determined to include data that has been or may have been signal saturated by the saturation data identifying means, An average mass spectrum creating means for creating a mass spectrum;
It is characterized by having.
本発明に係るクロマトグラフ質量分析用データ処理装置の一態様として、
測定時にマススペクトルデータ毎に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータが含まれるか否かを判定してその判定結果を示す飽和識別フラグをデータに対応付けて記憶するフラグ記憶手段をさらに備え、
前記飽和データ識別手段は、マススペクトルデータに対応付けて記憶されている飽和識別フラグに基づいて、測定時に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むマススペクトルデータを識別する構成とすることができる。
As one aspect of the data processing apparatus for chromatographic mass spectrometry according to the present invention,
Flag storage means for determining whether or not signal saturation has occurred or is likely to be included for each mass spectrum data during measurement and storing a saturation identification flag indicating the determination result in association with the data Prepared,
The saturation data identification unit is configured to identify mass spectrum data including data in which signal saturation has occurred or is likely to occur at the time of measurement based on a saturation identification flag stored in association with mass spectrum data. be able to.
ここでいうクロマトグラフはガスクロマトグラフ、液体クロマトグラフのいずれも含む。また、質量分析装置は一般的な質量分析装置のほか、タンデム四重極型質量分析装置のようなMSn型の質量分析装置も含む。したがって、ここでいうスキャン測定とは単純なスキャン測定のほか、MS/MS分析におけるプリカーサイオンスキャン測定、プロダクトイオンスキャン測定、ニュートラルロススキャン測定を含み、マススペクトルデータとはこれら各種スキャン測定で得られるMS2スペクトルデータを含む。 The chromatograph here includes both a gas chromatograph and a liquid chromatograph. The mass spectrometer includes not only a general mass spectrometer but also an MS n type mass spectrometer such as a tandem quadrupole mass spectrometer. Therefore, the scan measurement here includes not only simple scan measurement but also precursor ion scan measurement, product ion scan measurement, and neutral loss scan measurement in MS / MS analysis. Mass spectral data can be obtained by these various scan measurements. Includes MS 2 spectral data.
本発明に係るクロマトグラフ質量分析用データ処理装置では、例えば、解析対象の目的成分がユーザにより指定され、該目的成分に対応するクロマトグラム上でその平均化処理を行う時間範囲又は測定点範囲がユーザにより指定されると、飽和データ識別手段は、指定された時間範囲又は測定点範囲に含まれる複数の測定点のマススペクトルデータの中で、測定時に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むマススペクトルデータを識別する。平均マススペクトル作成手段は、信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むと判定されたマススペクトルデータを除外し、残りのマススペクトルデータを利用して、質量電荷比毎に時間方向に信号強度データを平均化することで平均マススペクトルを作成する。したがって、目的成分の特徴を的確に示さないマススペクトルは平均マススペクトルに反映されないので、検出器のゲインが高い場合でも正確な平均マススペクトルを算出することが可能である。
In the data processing apparatus for chromatographic mass spectrometry according to the present invention, for example, there is a time range or measurement point range in which a target component to be analyzed is designated by a user and the averaging process is performed on a chromatogram corresponding to the target component. When specified by the user, the saturation data identifying means may or may have caused signal saturation during measurement in the mass spectrum data of a plurality of measurement points included in the specified time range or measurement point range. Identify mass spectral data, including data. The average mass spectrum creation means excludes mass spectrum data determined to include data in which signal saturation has occurred or is likely to occur, and uses the remaining mass spectrum data in the time direction for each mass to charge ratio. An average mass spectrum is created by averaging the signal strength data. Therefore, since a mass spectrum that does not accurately show the characteristics of the target component is not reflected in the average mass spectrum, an accurate average mass spectrum can be calculated even when the gain of the detector is high.
本発明に係るクロマトグラフ質量分析データ処理装置によれば、例えば質量分析装置の検出器のゲインが過大であってデータ飽和が生じるような場合であっても、クロマトグラムピークトップ付近の複数の測定点から、正確な、即ち、目的成分の特徴を的確に表すパターンを呈する平均マススペクトルを作成し表示することができる。それによって、平均マススペクトルを利用した定性分析の正確性を確保することができる。 According to the chromatograph mass spectrometry data processing apparatus of the present invention, for example, even when the gain of the detector of the mass spectrometer is excessive and data saturation occurs, a plurality of measurements near the chromatogram peak top are performed. From the point, it is possible to create and display an average mass spectrum that is accurate, that is, exhibits a pattern that accurately represents the characteristics of the target component. Thereby, the accuracy of the qualitative analysis using the average mass spectrum can be ensured.
以下、本発明に係るクロマトグラフ質量分析データ処理装置について一例を挙げて詳細に説明する。図1は本発明に係るクロマトグラフ質量分析データ処理装置を適用したGC/MS/MSの一実施例の全体構成図である。 Hereinafter, the chromatograph mass spectrometry data processing apparatus according to the present invention will be described in detail with an example. FIG. 1 is an overall configuration diagram of an embodiment of GC / MS / MS to which a chromatographic mass spectrometry data processing apparatus according to the present invention is applied.
このGC/MS/MSは、試料に対して分析を実行してデータを収集するために、ガスクロマトグラフ(GC)1とタンデム四重極型質量分析装置2とを備える。GC1においては、ヘリウム等のキャリアガスが一定流量で試料気化室10を経てカラム12に供給される。カラム12はカラムオーブン11に内装され、一定温度に維持されるように又は所定の温度プロファイルに従うように温調される。所定のタイミングで試料気化室10に微量の試料液が注入されると、該試料液は短時間で気化し、キャリアガス流に乗ってカラム12に導入される。そして、カラム12を通過する間に、試料に含まれる各種成分は分離され、時間的にずれてカラム12出口から流出する。
The GC / MS / MS includes a gas chromatograph (GC) 1 and a tandem quadrupole mass spectrometer 2 in order to perform analysis on a sample and collect data. In GC1, a carrier gas such as helium is supplied to the
タンデム四重極型質量分析装置2は、電子イオン化(EI)法や化学イオン化(CI)法などによるイオン源21、前段四重極マスフィルタ22、多重極型イオンガイド24が内装されたコリジョンセル23、後段四重極マスフィルタ25、及び検出器26を、真空チャンバ20内に備える。検出器26としては、例えばコンバージョンダイノードと電子増倍管との組み合わせが利用される。
The tandem quadrupole mass spectrometer 2 includes a collision cell in which an
MS/MS分析を行う際には、コリジョンセル23内に衝突誘起解離(CID)ガスが供給される。GC1のカラム12出口から流出する試料ガスはイオン源21に導入され、試料ガス中の成分分子はイオン化される。発生した各種イオンのうち特定の質量電荷比を有するイオンのみが前段四重極マスフィルタ22を通り抜けコリジョンセル23内に導入される。イオンはコリジョンセル23内でCIDガスに接触して解離が促進され、各種のプロダクトイオンが生成される。特定の質量電荷比を有するプロダクトイオンのみが後段四重極マスフィルタ25を通り抜け検出器26に到達して検出される。
When performing MS / MS analysis, collision-induced dissociation (CID) gas is supplied into the
タンデム四重極型質量分析装置2では、コリジョンセル23内にCIDガスを導入せずに、前段四重極マスフィルタ22と後段四重極マスフィルタ25のいずれかでイオンを素通りさせる(イオン選択を実行しない)ことにより、イオンの解離を伴わない通常の質量分析、即ち、選択イオンモニタリング(SIM)測定モードやスキャン測定モードによる測定を実行することも可能である。
In the tandem quadrupole mass spectrometer 2, ions are passed through either the front quadrupole
検出器26は到達したイオンの量に応じた検出信号を出力し、検出信号はA/D変換器27でデジタルデータに変換されてデータ処理部30に入力される。データ処理部30は機能ブロックとしてデータ収集処理部31を含み、データ収集処理部31を通してデータ格納部33にデータを格納する。また、データ処理部30は本実施例に特徴的な動作を実施する平均マススペクトル作成処理部32を含む。GC1やタンデム四重極型質量分析装置2の各部は分析制御部40により制御され、さらに分析制御部40やデータ処理部30の動作は中央制御部41により統括的に制御される。中央制御部41には、ユーザインターフェイスとして入力部42や表示部43が接続されている。
The
なお、データ処理部30、分析制御部40、及び中央制御部41の全て又は一部は、パーソナルコンピュータをハードウエア資源とし、そのコンピュータに予めインストールされた専用の制御・処理ソフトウエアを実行することにより、それぞれの機能が実現されるものとすることができる。
All or a part of the
タンデム四重極型質量分析装置2では様々なモードの測定が実行可能である。既知の目的成分の定量分析を行う際には前述のMRM測定モードが一般に使用される。MRM測定モードは、前段四重極マスフィルタ22及び後段四重極マスフィルタ25でそれぞれ所定の質量電荷比をもつイオンを選択するようにそれぞれへの印加電圧を設定することで、目的成分由来の特定のフラグメントイオンを検出する。この測定モードでは、目的成分と同時にイオン源21に導入される夾雑物由来のイオンを排除することができるため、こうした不所望のイオンに起因するノイズを除去することができる。ただし、単純なMRM測定モードでは試料に含まれる未知成分が検出されないので、試料中にどのような成分が含まれるのかを並行して知りたい場合には、MRM測定モードとスキャン測定モードとを短い時間間隔で交互に実行するような測定手法が採られることがよくある。
The tandem quadrupole mass spectrometer 2 can perform various modes of measurement. The above-described MRM measurement mode is generally used when performing quantitative analysis of a known target component. In the MRM measurement mode, the applied voltage to each is selected so that ions having a predetermined mass-to-charge ratio are selected by the front-stage quadrupole
MRM測定モードでは、前段四重極マスフィルタ22及び後段四重極マスフィルタ25の両方でイオン選択を実施するため、最終的に検出器26に到達する目的成分由来のイオンの量はイオン源21で生成される同イオンの量に比べてかなり少ない。一方、イオン解離を伴わないスキャン測定では一方の四重極マスフィルタ22又は25のみでイオン選択が実施されるため、検出器26に到達する目的成分由来のイオンの量はMRM測定に比べて多くなる。そのため、MRM測定時にイオンを高い感度で検出できるように検出器26のゲインを上げておくと、スキャン測定時には検出信号が大き過ぎてA/D変換器27の入力レンジをオーバーし、出力されるデータがデジタル的に飽和してしまうおそれがある。そこで、本実施例のGC/MS/MSでは測定によって収集されるデータが飽和した場合であっても、そうしたデータを処理した結果に悪影響が及ぶのを回避するため、特徴的なデータ処理を実施するようにしている。
In the MRM measurement mode, since ion selection is performed by both the front-stage quadrupole
次に、本実施例のGC/MS/MSにおいて実行される特徴的なデータ処理動作について説明する。まず、スキャン測定モードによりマススペクトルデータを収集する際に、データ収集処理部31を中心に実行される処理動作について図2により説明する。図2はスキャン測定モードでのデータ収集時の制御及び処理動作を示すフローチャートである。なお、上述したようにMRM測定とスキャン測定とを交互に繰り返す場合には、スキャン測定期間中のみ図2に示した処理を実行し、MRM測定期間中には従来と同様にデータ収集を行えばよい。 Next, characteristic data processing operations executed in the GC / MS / MS of this embodiment will be described. First, processing operations executed mainly by the data collection processing unit 31 when collecting mass spectrum data in the scan measurement mode will be described with reference to FIG. FIG. 2 is a flowchart showing control and processing operations during data collection in the scan measurement mode. When the MRM measurement and the scan measurement are alternately repeated as described above, the processing shown in FIG. 2 is executed only during the scan measurement period, and data is collected during the MRM measurement period as in the conventional case. Good.
測定が開始されると、分析制御部40は所定の質量電荷比範囲に亘る質量走査を繰り返すように前段又は後段四重極マスフィルタ22又は25に電圧を印加する。1回の質量走査の期間中に、検出器26で得られる検出信号はA/D変換器27によりデジタル値に変換されてデータ収集処理部31に送られる。1回の質量走査により得られるデータは或る1つの測定点(測定時刻)におけるマススペクトルデータである。データ収集処理部31は或る1測定点のマススペクトルデータが得られると(ステップS1)、そのデータ中に信号強度が閾値を超えるようなデータが存在するか否かを判定する(ステップS2)。
When the measurement is started, the
上述したように検出器26から出力される検出信号が過大であるとA/D変換器27の入力レンジを超えてしまう場合がある。入力レンジを超えて出力データが飽和した場合、データ値は所定値以上になるから、これに応じて、つまり飽和が生じたか或いはその可能性が高い状態を検出できるように上記閾値を決めておけばよい。マススペクトルデータ中に信号強度が閾値を超えたデータが存在する場合には、そのマススペクトルデータに対する飽和識別フラグFを「1」にセットし(ステップS3)、信号強度が閾値を超えたデータがなければ飽和識別フラグFを「0」にセットする(ステップS4)。そして、取得したマススペクトルデータと飽和識別フラグFとを対応付けてデータ格納部33に格納する(ステップS5)。なお、データ格納部33に格納されるマススペクトルデータは、所定質量電荷比に対応したプロファイルデータであってもよいし、これをセントロイド処理したマススペクトルデータであってもよい。
As described above, if the detection signal output from the
そして、例えば測定開始時から所定の測定時間が経過したことを判定するなどして測定終了か否かを判定し(ステップS6)、未だ測定終了でなければステップS1に戻りスキャン測定により得られたデータの収集を継続する。上記のステップS1〜S5の繰り返しにより、測定開始時点から測定終了時点までの質量走査毎に、マススペクトルデータが飽和識別フラグFとともにデータ格納部33に格納される。
Then, for example, it is determined whether or not the measurement is completed by determining that a predetermined measurement time has elapsed since the start of measurement (step S6). If the measurement is not yet completed, the process returns to step S1 and obtained by scan measurement. Continue collecting data. By repeating the above steps S1 to S5, the mass spectrum data is stored in the
なお、A/D変換器によっては入力レンジオーバーフロー検出機能を有しているものもあり、こうしたA/D変換器を利用可能である場合には、マススペクトルデータ中に信号強度の飽和が生じたデータが存在したか否かをオーバーフロー検出出力に基づいて判断することができる。また、A/D変換器27に入力されるアナログ検出信号のレベルを検出することで、A/D変換後のデータが飽和を生じるか否かを判定するようにしてもよい。
Some A / D converters have an input range overflow detection function. When such an A / D converter is available, signal intensity saturation occurs in the mass spectrum data. Whether there is data can be determined based on the overflow detection output. Further, by detecting the level of the analog detection signal input to the A /
次に、上述したようにマススペクトルデータがデータ格納部33に格納されている状態で、平均マススペクトルを作成・表示する際の処理動作を図3、図4により説明する。図3は平均マススペクトル作成処理動作を示すフローチャート、図4は平均マススペクトル作成動作を説明するための模式図である。
Next, processing operations when creating and displaying an average mass spectrum in a state where the mass spectrum data is stored in the
ユーザは入力部42にて所定の操作を行うことにより、目的試料に対して実施されたスキャン測定モードにより収集されたデータに基づいて作成されたトータルイオンクロマトグラム(TIC)を表示部43の画面上に表示する。ユーザはこのトータルイオンクロマトグラム上で平均化処理を行いたいクロマトグラムピークを指定し、平均化処理のために必要なパラメータ(処理条件)を設定する(ステップS11)。このパラメータは、例えば平均化に使用される測定点の点数又は時間範囲などを含む。クロマトグラム上でドラッグ等のグラフィカルな操作を行うことで、平均化処理を行う時間範囲などを指定できるようにしてもよい。
The user performs a predetermined operation on the
ユーザにより処理実行指示が行われると(ステップS12)、これを受けて平均マススペクトル作成処理部32は、上記パラメータ等で指示された測定点範囲のマススペクトルデータを飽和識別フラグとともにデータ格納部33から読み出す(ステップS13)。一例として、図4に示すようなクロマトグラムピークに対し平均化処理対象の測定点点数を「5」とする場合を考える。このとき、平均化処理対象である測定点はピークトップ付近のA1〜A5であるから、それら測定点A1〜A5において得られたマススペクトルデータが飽和識別フラグとともにデータ格納部33から読み出される。
When a process execution instruction is issued by the user (step S12), the average mass spectrum
次に平均マススペクトル作成処理部32は、変数nを1にセットしたあと(ステップS14)、n番目の測定点のマススペクトルデータを取得する(ステップS15)。図4の例ではまず1番目の測定点A1のマススペクトルデータが取得される。次に、このマススペクトルデータに対応付けられている飽和識別フラグFが0であるか否かを判定する(ステップS16)。飽和識別フラグFが0であれば、そのときのマススペクトルデータは信号飽和が生じたデータを含まないと判断できるので、取得したマススペクトルデータを平均化処理対象に設定し(ステップS17)てからステップS18へ進む。一方、飽和識別フラグFが1であれば、そのときのマススペクトルデータは信号飽和を生じたデータを含む可能性が高いので、ステップS17の処理を回避してステップS18へ進む。つまり、このときにはマススペクトルデータは平均化処理対象に設定されない。
Next, after setting the variable n to 1 (step S14), the average mass spectrum
ステップS18では変数nが測定点範囲内の最終点であるか否かが判定され、最終点でなければ変数nをインクリメントして(ステップS19)ステップS15へと戻る。図4の例では測定点A5が測定点範囲内の最終点であるから、ステップS15〜S19を4回繰り返し次にステップS18に達した時点で最終点であると判断されてステップS20へと進む。このステップS15〜S19の繰り返しにより、測定点A1〜A5のそれぞれのマススペクトルデータが取得されるが、いま測定実行時に付与された飽和識別フラグFが測定点A3、A4に対し1であったとすると、測定点A3、A4の2つのマススペクトルデータは平均化処理対象には設定されない。つまりは、測定点A1、A2、A5の3測定点のマススペクトルデータのみが平均化処理に供される。 In step S18, it is determined whether or not the variable n is the final point within the measurement point range. If it is not the final point, the variable n is incremented (step S19), and the process returns to step S15. In the example of FIG. 4, since the measurement point A5 is the final point within the measurement point range, Steps S15 to S19 are repeated four times, and when Step S18 is reached, the final point is determined and the process proceeds to Step S20. . By repeating these steps S15 to S19, the respective mass spectrum data of the measurement points A1 to A5 are acquired, but it is assumed that the saturation identification flag F given at the time of measurement is 1 for the measurement points A3 and A4. The two mass spectrum data of the measurement points A3 and A4 are not set as the averaging process target. In other words, only the mass spectrum data of the three measurement points A1, A2, and A5 are subjected to the averaging process.
平均マススペクトル作成処理部32は飽和識別フラグに応じて選択された測定点のマススペクトルデータのみを用いて、質量電荷比毎の強度データの平均値を計算し、平均マススペクトルを作成する(ステップS20)。そして、表示部43の画面上に、作成された平均マススペクトルを描画するとともに、平均化処理に利用された測定点(上記例ではA1、A2、A5)と平均化処理から除外された測定点(上記例ではA3、A4)とを識別可能に表示する(ステップS21)。後者の表示は図4中に示したようにテキスト情報で行ってもよいし、例えばクロマトグラムカーブ上の測定点を示すマークを異なる表示色で示す等、グラフィカルに表示してもよい。
The average mass spectrum
以上のように本実施例のGC/MS/MSでは、或る成分に対する平均マススペクトルを作成・表示する際に、信号強度が飽和した可能性があるデータを含むマススペクトルデータが除外されるので、平均マススペクトルの正確性が向上する。 As described above, in the GC / MS / MS according to the present embodiment, when an average mass spectrum for a certain component is created and displayed, mass spectrum data including data whose signal intensity may be saturated is excluded. The accuracy of the average mass spectrum is improved.
また、上記実施例では単純なスキャン測定の際に得られたマススペクトルデータについて特徴的な処理を実施したが、マススペクトルデータを収集する測定モード、つまりは、MS/MS分析におけるプリカーサイオンスキャン測定モード、プロダクトイオンスキャン測定モード、ニュートラルロススキャン測定モードなどにおいても上述したような処理を適用することができる。 In the above embodiment, the characteristic processing is performed on the mass spectrum data obtained in the simple scan measurement. However, the measurement mode for collecting the mass spectrum data, that is, the precursor ion scan measurement in the MS / MS analysis. The above-described processing can be applied to the mode, the product ion scan measurement mode, the neutral loss scan measurement mode, and the like.
また、上記実施例はGC/MS/MSであるが、LC/MS/MSでもよく、GC/MSやLC/MSでもよいことは明らかである。さらに、上記実施例は本発明の一例であり、上記記載の変形例以外でも、本願発明の趣旨の範囲で適宜変形、修正、追加を行っても本願特許請求の範囲に包含されることは明らかである。 Moreover, although the said Example is GC / MS / MS, LC / MS / MS may be sufficient, and it is clear that GC / MS and LC / MS may be sufficient. Further, the above-described embodiment is an example of the present invention, and it is obvious that other than the above-described modified examples, any appropriate modification, correction, or addition within the spirit of the present invention is included in the scope of the claims of the present application. It is.
1…ガスクロマトグラフ(GC)
10…試料気化室
11…カラムオーブン
12…カラム
2…タンデム四重極型質量分析装置
20…真空チャンバ
21…イオン源
22…前段四重極マスフィルタ
23…コリジョンセル
24…多重極型イオンガイド
25…後段四重極マスフィルタ
26…検出器
27…A/D変換器
30…データ処理部
31…データ収集処理部
32…平均マススペクトル作成処理部
33…データ格納部
40…分析制御部
41…中央制御部
42…入力部
43…表示部
1. Gas chromatograph (GC)
DESCRIPTION OF
Claims (2)
a)目的成分が質量分析装置に導入されている期間に得られたマススペクトルデータであって所定の時間範囲又は測定点範囲に含まれる複数の測定点のマススペクトルデータの中で、測定時に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むマススペクトルデータを識別する飽和データ識別手段と、
b)前記複数の測定点のマススペクトルデータの中で、前記飽和データ識別手段により信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むと判定されなかったマススペクトルデータのみを利用して、平均マススペクトルを作成する平均マススペクトル作成手段と、
を備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析データ処理装置。 A data processing device for processing data obtained by a chromatograph mass spectrometer for analyzing components in a sample separated in time by a chromatograph by a mass spectrometer, and performing a scan measurement in the mass spectrometer In the chromatograph mass spectrometry data processing apparatus that processes the mass spectrum data obtained repeatedly,
a) Mass spectrum data obtained during the period when the target component is introduced into the mass spectrometer and a signal at the time of measurement among mass spectrum data of a plurality of measurement points included in a predetermined time range or measurement point range. Saturation data identification means for identifying mass spectral data including data where saturation has occurred or is likely to occur;
b) Among the mass spectrum data of the plurality of measurement points, only the mass spectrum data that has not been determined to include data that has been or may have been signal saturated by the saturation data identifying means, An average mass spectrum creating means for creating a mass spectrum;
A chromatographic mass spectrometry data processing apparatus comprising:
測定時にマススペクトルデータ毎に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータが含まれるか否かを判定してその判定結果を示す飽和識別フラグをデータに対応付けて記憶するフラグ記憶手段をさらに備え、
前記飽和データ識別手段は、マススペクトルデータに対応付けて記憶されている飽和識別フラグに基づいて、測定時に信号飽和が生じた又はその可能性があるデータを含むマススペクトルデータを識別することを特徴とするクロマトグラフ質量分析データ処理装置。 A chromatograph mass spectrometry data processing apparatus according to claim 1,
Flag storage means for determining whether or not signal saturation has occurred or is likely to be included for each mass spectrum data during measurement and storing a saturation identification flag indicating the determination result in association with the data Prepared,
The saturation data identification means identifies mass spectrum data including data in which signal saturation has occurred or is likely to occur during measurement based on a saturation identification flag stored in association with mass spectrum data. A chromatograph mass spectrometry data processing apparatus.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2012036535A JP5747839B2 (en) | 2012-02-22 | 2012-02-22 | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2012036535A JP5747839B2 (en) | 2012-02-22 | 2012-02-22 | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2013170995A JP2013170995A (en) | 2013-09-02 |
JP5747839B2 true JP5747839B2 (en) | 2015-07-15 |
Family
ID=49265015
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012036535A Active JP5747839B2 (en) | 2012-02-22 | 2012-02-22 | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP5747839B2 (en) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP6931586B2 (en) * | 2017-10-06 | 2021-09-08 | 日本電子株式会社 | Mass spectrometry data processing device and mass spectrometry data processing method |
JPWO2023112156A1 (en) * | 2021-12-14 | 2023-06-22 |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2995841B2 (en) * | 1990-10-03 | 1999-12-27 | 株式会社島津製作所 | Gas chromatograph mass spectrometer data processor |
JP3040242B2 (en) * | 1992-03-16 | 2000-05-15 | 日本電子株式会社 | How to create a sensitivity calibration curve for an electron multiplier |
JP2904061B2 (en) * | 1995-06-07 | 1999-06-14 | 株式会社島津製作所 | Liquid chromatograph mass spectrometer |
JP3675047B2 (en) * | 1996-07-05 | 2005-07-27 | 株式会社島津製作所 | Data processing device |
US7038197B2 (en) * | 2001-04-03 | 2006-05-02 | Micromass Limited | Mass spectrometer and method of mass spectrometry |
JP2006184275A (en) * | 2004-11-30 | 2006-07-13 | Jeol Ltd | Mass spectrometric method and mass spectrograph |
JP4967857B2 (en) * | 2007-06-29 | 2012-07-04 | 株式会社島津製作所 | Chromatographic mass spectrometry data processor |
-
2012
- 2012-02-22 JP JP2012036535A patent/JP5747839B2/en active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2013170995A (en) | 2013-09-02 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US9514922B2 (en) | Mass analysis data processing apparatus | |
US10121643B2 (en) | Chromatography/mass spectrometry data processing device | |
JP4973628B2 (en) | Chromatograph mass spectrometry data analysis method and apparatus | |
JP5821767B2 (en) | Chromatographic tandem quadrupole mass spectrometer | |
JP6176049B2 (en) | Tandem quadrupole mass spectrometer | |
JP5757270B2 (en) | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry | |
JP6065983B2 (en) | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry | |
JP6176334B2 (en) | Mass spectrometry method, mass spectrometer, and mass spectrometry data processing program | |
JP5737419B2 (en) | Quantitative analysis method using mass spectrometer and mass spectrometer | |
WO2017077618A1 (en) | Chromatograph mass-spectrometry-data processing method and processing device | |
JP2009008582A (en) | Chromatogram data processor | |
JP6737396B2 (en) | Mass spectrometer and chromatograph mass spectrometer | |
WO2013153647A1 (en) | Mass analysis device | |
JP5757264B2 (en) | Chromatographic mass spectrometry data processor | |
JP7173293B2 (en) | Chromatograph mass spectrometer | |
US7529630B2 (en) | Method of analyzing mass analysis data and apparatus for the method | |
JP4470505B2 (en) | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry | |
JP5747839B2 (en) | Data processing equipment for chromatographic mass spectrometry | |
WO2018163926A1 (en) | Tandem mass spectrometry device and program for same device | |
JP2016053500A (en) | Chromatograph mass spectrometer | |
JPWO2018109895A1 (en) | Mass spectrometer | |
JP6528896B2 (en) | Mass spectrometer | |
JP2008298517A (en) | Apparatus and method for analyzing mass spectrometry data | |
JP6954143B2 (en) | Chromatograph mass spectrometer | |
JP2013142581A (en) | Chromatograph tandem quadrupole type mass spectrograph |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20140501 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20141222 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20150120 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20150323 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20150414 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20150427 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 5747839 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |