JP5737403B2 - Chromatographic data processor - Google Patents
Chromatographic data processor Download PDFInfo
- Publication number
- JP5737403B2 JP5737403B2 JP2013523875A JP2013523875A JP5737403B2 JP 5737403 B2 JP5737403 B2 JP 5737403B2 JP 2013523875 A JP2013523875 A JP 2013523875A JP 2013523875 A JP2013523875 A JP 2013523875A JP 5737403 B2 JP5737403 B2 JP 5737403B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- peak
- baseline
- intersection
- detected
- width
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/86—Signal analysis
- G01N30/8624—Detection of slopes or peaks; baseline correction
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/86—Signal analysis
- G01N30/8624—Detection of slopes or peaks; baseline correction
- G01N30/8631—Peaks
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/86—Signal analysis
- G01N30/8624—Detection of slopes or peaks; baseline correction
- G01N30/8641—Baseline
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Treatment Of Liquids With Adsorbents In General (AREA)
Description
本発明は、ガスクロマトグラフ、液体クロマトグラフ等のクロマトグラフ用のデータ処理装置に関する。 The present invention relates to a data processing apparatus for a chromatograph such as a gas chromatograph or a liquid chromatograph.
クロマトグラフ装置の性能や効率を判断する指標として理論段数や分離度などがある。このうち理論段数はカラムの分離性能を表す指標であり、クロマトグラム上の成分の保持時間とそのピーク幅とから求められる。 There are the number of theoretical plates and the degree of separation as indices for judging the performance and efficiency of the chromatographic apparatus. Of these, the theoretical plate number is an index representing the separation performance of the column, and is determined from the retention time of the components on the chromatogram and the peak width.
米国食品医薬品局(Food and Drug Administration: FDA)が管轄する米国薬局方(United States Pharmacopeia: USP)では、ピーク幅を次のように規定している(非特許文献1)。すなわち、図1に示すように、ピークトップPを挟んでピークの前半部及び後半部でそれぞれの変曲点C1、C2を求め、この変曲点C1、C2においてピーク波形に接線を引く。この両接線とベースラインBLとの交点B1、B2を求め、両交点B1、B2間の距離をピーク幅Wとする。理論段数Nは、このピーク幅Wと保持時間Trとから、次の式(1)により求められる。
N=16×(Tr/W)2 …(1)In the United States Pharmacopeia (USP), which is under the jurisdiction of the US Food and Drug Administration (FDA), the peak width is defined as follows (Non-patent Document 1). That is, as shown in FIG. 1, the inflection points C1 and C2 are obtained at the first half and the second half of the peak across the peak top P, and the peak waveform is drawn at the inflection points C1 and C2. The intersections B1 and B2 between the both tangents and the base line BL are obtained, and the distance between the intersections B1 and B2 is defined as the peak width W. The theoretical plate number N is obtained from the peak width W and the holding time Tr by the following equation (1).
N = 16 × (Tr / W) 2 (1)
また、厚生労働省が管轄する日本薬局方(Japanese Pharmacopeia: JP)では、図2に示すように、ピークトップPから垂線を下ろし、ベースラインBLとの交点Qを求め、その高さPQの1/2となる点を通り、ベースラインBLに平行な直線とピークの前半部と後半部のそれぞれの交点D1、D2間の距離をピーク幅W0.5と規定している。この場合、理論段数Nは、次の式(2)により求められる(非特許文献2)。
N=5.54×(Tr/W0.5)2 …(2)In addition, in the Japanese Pharmacopeia (JP) under the jurisdiction of the Ministry of Health, Labor and Welfare, as shown in FIG. The distance between the straight line parallel to the base line BL and the intersections D1 and D2 of the first half and the second half of the peak is defined as a peak width W 0.5 . In this case, the theoretical plate number N is obtained by the following equation (2) (Non-Patent Document 2).
N = 5.54 × (Tr / W 0.5 ) 2 (2)
式(1)及び(2)により求められる理論段数Nは、クロマトグラムのピーク形状が理想的なガウス分布(正規分布)である場合には一致する。ピーク幅W、W0.5は、理論段数以外にも例えば分離度を求める際にも用いられる。また、ベースラインBLから5%、10%の高さのピーク幅W0.05、W0.1を算出し、シンメトリー係数等の他の指標を求めることもある。
なお、日本薬局方によるピーク幅の算出方法は、上記のようにベースラインBLから50%の高さにおいて行うものであるが、5%や10%など異なる高さのピーク幅を算出する場合も同様の手順で行うことができる。そのため、以下では、これらをまとめて「日本薬局方のピーク幅算出方法」と呼ぶことにする。The theoretical plate number N obtained from the equations (1) and (2) is the same when the peak shape of the chromatogram is an ideal Gaussian distribution (normal distribution). The peak widths W and W 0.5 are used not only for the number of theoretical plates but also for obtaining the degree of separation, for example. In addition, peak widths W 0.05 and W 0.1 having a height of 5% and 10% from the baseline BL may be calculated to obtain other indices such as symmetry coefficients.
The method for calculating the peak width by the Japanese Pharmacopoeia is performed at a height of 50% from the baseline BL as described above. However, there are cases where peak widths of different heights such as 5% and 10% are calculated. The same procedure can be used. Therefore, in the following, these will be collectively referred to as the “Japanese Pharmacopoeia peak width calculation method”.
クロマトグラフ用のデータ処理装置では、上記のように、得られたクロマトグラムの理論段数や分離度等の指標を計算するために、ピーク幅の算出が必要となることが多い。しかしながら、図3及び図4に示すように隣り合うピークが重なる場合、実際と異なるピーク幅を算出してしまったり、ピーク幅を算出できなくなったりすることがある。 In a chromatograph data processing apparatus, as described above, it is often necessary to calculate a peak width in order to calculate an index such as the number of theoretical plates and the resolution of the obtained chromatogram. However, when adjacent peaks overlap as shown in FIGS. 3 and 4, a peak width different from the actual peak width may be calculated, or the peak width may not be calculated.
図3は、図1に示した米国薬局方のピーク幅算出方法によりピーク幅Wを算出する例を示したものである。この図の隣り合う2つのピークのうち、左側のピーク1については前半部と後半部の両方で適切に変曲点が得られるため、ピーク幅Wを正しく算出することができる。一方、右側のピーク2については、その前半部がピーク1と重なっていることにより、前半部における本来の変曲点の位置とは異なる位置に変曲点が検出されている。このような場合、ピーク2のピーク幅Wを正しく算出することができない。
FIG. 3 shows an example in which the peak width W is calculated by the US Pharmacopoeia peak width calculation method shown in FIG. Of the two adjacent peaks in this figure, for the left peak 1, inflection points are appropriately obtained in both the first half and the second half, so that the peak width W can be calculated correctly. On the other hand, for the
図4は、日本薬局方のピーク幅算出方法によりピーク幅W0.5を算出する例を示したものである。この図の2つのピークのうち、ピーク1については、ベースラインに平行な直線とピーク1との交点が前半部と後半部の両方で得られるため、ピーク幅W0.5を算出することができる。一方、ピーク2については、その前半部がピーク1と重なっていることにより、前半部では交点を得ることができず、ピーク幅W0.5を算出することができない。FIG. 4 shows an example in which the peak width W 0.5 is calculated by the Japanese Pharmacopoeia peak width calculation method. Of the two peaks in this figure, for peak 1, the intersection point between the straight line parallel to the base line and peak 1 is obtained in both the first half and the second half, so the peak width W 0.5 can be calculated. On the other hand, since the first half of
以上の場合、デコンボリューション演算によりピークを分離してからピーク幅を算出することも可能ではあるが、分離のための処理に時間を要すると共に、求める値は推定値の域を越えない。 In the above case, although it is possible to calculate the peak width after separating the peaks by the deconvolution calculation, it takes time for the separation processing, and the obtained value does not exceed the range of the estimated value.
本発明が解決しようとする課題は、ピークが重なることにより、ピークの前半部と後半部のいずれか一方の変曲点又は交点が適切に得られない場合でも、複雑な処理を行うことなく、より確かなピーク幅を算出することができるクロマトグラフ用データ処理装置を提供することである。 The problem to be solved by the present invention is that even if inflection points or intersections of any one of the first half and the second half of the peak cannot be obtained appropriately due to overlapping peaks, complicated processing is not performed. It is an object of the present invention to provide a chromatographic data processing apparatus capable of calculating a more reliable peak width.
上記課題を解決するために成された本発明に係るクロマトグラフ用データ処理装置の第一の態様は、
a) クロマトグラムのベースラインを決定するベースライン決定手段と、
b) 前記クロマトグラムのピークトップを検出するピークトップ検出手段と、
c) 前記ピークトップを挟んでピークの前半部又は後半部において変曲点を検出し、該変曲点における接線と前記ベースラインとの交点と、該ピークトップから該ベースラインに下ろした垂線と該ベースラインとの交点と、をそれぞれ検出し、これら両交点間の距離を求め、その距離の2倍の値を該ピークのピーク幅として算出するピーク幅算出手段と、
を備えることを特徴とする。The first aspect of the chromatograph data processing apparatus according to the present invention made to solve the above problems,
a) a baseline determination means for determining a baseline of the chromatogram;
b) Peak top detecting means for detecting the peak top of the chromatogram;
c) detecting an inflection point in the first half or the latter half of the peak across the peak top, an intersection of the tangent line at the inflection point and the base line, and a perpendicular line extending from the peak top to the baseline. A peak width calculating means for detecting an intersection with the baseline, obtaining a distance between the two intersections, and calculating a value twice as large as the peak width of the peak;
It is characterized by providing.
また、上記課題を解決するために成された本発明に係るクロマトグラフ用データ処理装置の第二の態様は、
a) クロマトグラムのベースラインを決定するベースライン決定手段と、
b) 前記クロマトグラムのピークトップを検出するピークトップ検出手段と、
c) 前記ベースラインからピークトップまでの高さのM%の高さに該ベースラインに平行な直線を引き、該ピークトップを挟んでピークの前半部又は後半部における該直線との交点と、該ピークトップから該直線に下ろした垂線と該直線との交点と、をそれぞれ検出し、これら両交点間の距離を求め、その距離の2倍の値を該ピークのピーク幅として算出するピーク幅算出手段と、
を備えることを特徴とする。In addition, the second aspect of the chromatographic data processing apparatus according to the present invention made to solve the above problems,
a) a baseline determination means for determining a baseline of the chromatogram;
b) Peak top detecting means for detecting the peak top of the chromatogram;
c) A straight line parallel to the baseline is drawn at a height of M% of the height from the baseline to the peak top, and the intersection with the straight line in the first half or the second half of the peak across the peak top; A peak width that detects a perpendicular line drawn from the peak top to the straight line and an intersection of the straight line, obtains a distance between the two intersection points, and calculates a value twice the distance as the peak width of the peak A calculation means;
It is characterized by providing.
クロマトグラムにおける理論段数等の指標は、元々クロマトグラムのピーク形状がガウス分布に従うものとして、計算式が作られている。クロマトグラムのピーク形状が理想的なガウス分布である場合、このピークはピークトップを挟んで前半部と後半部で対称になる。本発明は、この対称性を仮定することにより、デコンボリューション演算などによるピークの分離を行わずに、ピークの前半部と後半部のいずれか一方の算出可能な幅の2倍で以てピーク幅を算出するものである。 Indices such as the number of theoretical plates in the chromatogram are calculated by assuming that the peak shape of the chromatogram originally follows a Gaussian distribution. When the peak shape of the chromatogram is an ideal Gaussian distribution, this peak is symmetric between the first half and the second half with the peak top in between. By assuming this symmetry, the present invention does not perform peak separation by a deconvolution operation or the like, and the peak width is doubled by a width that can be calculated from either the first half or the second half of the peak. Is calculated.
なお、ピーク同士が重なっていない場合や、重なっていたとしてもそれが図3や図4のピーク1のようにピーク幅の算出に影響しない場合には、従来通り、ピークの前半部及び後半部の各々の変曲点における接線とベースラインとの交点間の距離、又はベースラインに平行な直線とピークとの2つの交点間の距離をピーク幅として算出することが望ましい。 If the peaks do not overlap or if they do not affect the calculation of the peak width as in peak 1 of FIG. 3 or FIG. 4, the first half and the second half of the peak as before. It is desirable to calculate the distance between the intersections of the tangent and the base line at each inflection point or the distance between the two intersections of the straight line and the peak parallel to the baseline as the peak width.
本発明に係るクロマトグラフ用データ処理装置によれば、目的とするピークの前半部と後半部の幅のうち一方を求めることさえできれば、そのピーク幅を容易に算出することができる。また、ピーク形状の対称性が保たれている場合には、デコンボリューション演算によりピークを分離するよりも確かなピーク幅を算出することができる。 According to the chromatographic data processing apparatus of the present invention, the peak width can be easily calculated as long as one of the widths of the first half and the second half of the target peak can be obtained. In addition, when the symmetry of the peak shape is maintained, a more reliable peak width can be calculated than when the peaks are separated by deconvolution calculation.
以下、本発明に係るクロマトグラフ用データ処理装置の一実施例について、図5〜図10を参照して説明する。 Hereinafter, an embodiment of a chromatographic data processing apparatus according to the present invention will be described with reference to FIGS.
図5は、本実施例によるデータ処理装置を備えるガスクロマトグラフ分析システムの概略構成図である。液体試料はシリンジ11等により試料気化室12に注入され、そこで気化されて、キャリアガス流路13から一定流量で供給されるキャリアガス流に乗ってカラム14内に送り込まれる。試料に含まれる各種成分は、カラム14を通過する間に時間的に分離されてカラム14から出て、順次、検出器15により検出される。検出器15による検出信号はデジタルデータに変換された後、逐次、データ処理装置16に送られ、そこで一旦、ハードディスク等の記憶部に格納される。1つの試料の分析が終了した後(或いは、連続に実行される複数の試料の分析が終了した後)、記憶部に格納されたデータが読み出され、クロマトグラムの作成、ピーク検出等の各種のデータ処理が行われる。
FIG. 5 is a schematic configuration diagram of a gas chromatograph analysis system including a data processing apparatus according to the present embodiment. The liquid sample is injected into the
なお、データ処理装置16の実体は専用又は汎用のコンピュータであり、所定の処理プログラムを動作させることにより、当該コンピュータをクロマトグラム作成部161、ベースライン決定部162、ピークトップ検出部163、ピーク幅算出部164として機能させる他、各種分析のためのデータ処理を実行させる。
The entity of the
上記データ処理装置16において理論段数Nを算出する際の処理手順を、図6のフローチャートに示す。まずデータ処理装置16内の記憶部から読み出したクロマトグラムデータに対し、クロマトグラム作成部161がクロマトグラムを作成し、ベースライン決定部162及びピークトップ検出部163が所定のアルゴリズムに基づいて、作成したクロマトグラムのベースライン及びピーク(単数又は複数)を決定・検出する(ステップS1、S2)。そして、各ピーク又は必要なピークのみに関し、ピーク開始時間Ts、ピークトップ時間Tp、ピーク終了時間Te、ピーク高さHp、ピーク面積S等、ピークを特徴付けるパラメータを算出する(ステップS3)。さらに、上記パラメータとクロマトグラムデータとを利用して、ピーク幅算出部164がピーク幅を算出し(ステップS4)、ピーク幅の算出方法に対応した式(1)や式(2)等の式により理論段数Nを求める(ステップS5)。
The processing procedure for calculating the theoretical plate number N in the
本発明に係るデータ処理の特徴はステップS4のピーク幅算出処理にあるので、この処理に関し詳細に説明する。なお、ピーク幅の算出方法は、上記のように、大別して米国薬局方の方法と日本薬局方の方法との2種類があるが、まず米国薬局方の方法に準じてピーク幅Wを算出する手順を示す。 Since the feature of the data processing according to the present invention is the peak width calculation processing in step S4, this processing will be described in detail. As described above, there are two types of peak width calculation methods, the US Pharmacopeia method and the Japanese Pharmacopeia method. First, the peak width W is calculated according to the US Pharmacopeia method. Show the procedure.
[第1のピーク幅算出処理]
図7は、本実施例における第1のピーク幅算出処理のフローチャートである。以下、図1及び図8の説明図を参照しつつ、この第1のピーク幅算出処理の手順を説明する。[First peak width calculation process]
FIG. 7 is a flowchart of the first peak width calculation process in the present embodiment. Hereinafter, the procedure of the first peak width calculation process will be described with reference to the explanatory diagrams of FIGS. 1 and 8.
本実施例における第1のピーク幅算出処理では、まず目的とするピークに対し、そのピーク開始時間からピーク終了時間までの間で、ピークトップPを挟んで前半部と後半部における変曲点を探索する(ステップS11)。なお、変曲点を探索する一般的なアルゴリズムは、次の通りである。 In the first peak width calculation process in the present embodiment, first, inflection points in the first half and the second half of the target peak are sandwiched between the peak start time and the peak end time with the peak top P interposed therebetween. Search is performed (step S11). A general algorithm for searching for an inflection point is as follows.
ピークトップPから時間的にマイナス側に移動しつつ、ピーク波形上の各点において2次微分値及び1次微分値を算出し、2次微分値が0であって且つ1次微分値が0より大(つまり正値である)であるか否かを判定する。そして、この条件が満たされる際のクロマトグラム上の点を前半部の変曲点C1として採用する。後半部の変曲点C2については、ピークトップPから時間的にプラス側に移動する点と、1次微分値に関する判定条件が0より小(つまり負値である)となる点以外は同様である。なお、ピークトップPからではなく、ピークの裾野(ピーク開始点及びピーク終了点)から変曲点を探索する方法もある。また、2次微分値及び1次微分値の算出には、例えばサビツキ・ゴーレイ(Savitzky-Golay)の方法など既知のアルゴリズムを用いることができる。 The secondary differential value and the primary differential value are calculated at each point on the peak waveform while moving from the peak top P to the negative side in time. The secondary differential value is 0 and the primary differential value is 0. It is determined whether it is larger (that is, a positive value). And the point on the chromatogram when this condition is satisfied is adopted as the inflection point C1 in the first half. The inflection point C2 in the latter half is the same except that it moves from the peak top P to the plus side in time and the determination condition for the first derivative is smaller than 0 (that is, a negative value). is there. There is also a method of searching for an inflection point not from the peak top P but from the peak base (peak start point and peak end point). For calculating the secondary differential value and the primary differential value, for example, a known algorithm such as a Savitzky-Golay method can be used.
次に、変曲点がピークの前半部と後半部の両方で適切に検出されたか否かを判定する(ステップS12)。なお、ピーク形状が理想的なガウス分布に従う場合、変曲点はピーク高さHpの1/e0.5(eは自然対数の底)倍の高さになることが分かっている(特開2004-184148号公報を参照)。従って、例えば検出された変曲点のベースラインからの高さが1/e0.5Hpから所定範囲内に収まっているか否かにより、該変曲点が適切であるか否かを判定することができる。Next, it is determined whether or not the inflection point is properly detected in both the first half and the second half of the peak (step S12). When the peak shape follows an ideal Gaussian distribution, the inflection point is known to be 1 / e 0.5 (e is the base of natural logarithm) times the peak height Hp (Japanese Patent Laid-Open No. 2004-2004). 184148). Therefore, for example, whether or not the inflection point is appropriate can be determined based on whether or not the height from the baseline of the detected inflection point is within a predetermined range from 1 / e 0.5 Hp. it can.
ステップS12において、図1のように変曲点C1、C2がピークの前半部と後半部でそれぞれ適切に検出された場合は、各々の変曲点C1、C2において1次微分値を用いて接線を引き、該接線とベースラインとの交点B1、B2を検出する(ステップS16)。そして、両交点B1、B2間の距離をピーク幅Wとして採用する(ステップS17)。これらは従来通りの算出処理である。
In step S12, when the inflection points C1 and C2 are appropriately detected in the first half and the latter half of the peak as shown in FIG. 1, the tangent lines are obtained using the primary differential values at the inflection points C1 and C2. And the intersection points B1 and B2 between the tangent line and the base line are detected (step S1 6 ). Then, the distance between the two intersections B1 and B2 is adopted as the peak width W (step S1 7 ). These are conventional calculation processes.
一方、図8のように、ピークの前半部と後半部のいずれかの変曲点が適切に検出されない場合、このままではピーク幅を正しく算出することができない。このような場合、本実施例における第1のピーク幅算出処理では、検出された方の変曲点(図8の例では点C2)に接線を引き、ベースラインBLとの交点B(又は交点B2)を検出すると共に、ピークトップPからベースラインBLに下ろした垂線とベースラインBLとの交点Qを検出する(ステップS13、S14)。そして、ステップS13及びS14で検出した2つの交点B、Q間の距離を求め、この距離の2倍の値をピーク幅Wとして採用する(ステップS15)。
これらステップS13〜S15の処理により、変曲点の一方が適切に検出されない場合であっても、ピーク幅Wを算出することが可能となる。On the other hand, as shown in FIG. 8, when any inflection point in the first half or the second half of the peak is not properly detected, the peak width cannot be calculated correctly as it is. In such a case, in the first peak width calculation process in the present embodiment, a tangent line is drawn to the detected inflection point (point C2 in the example of FIG. 8), and the intersection B (or intersection) with the base line BL. B2) is detected, and an intersection point Q between the perpendicular line dropped from the peak top P to the base line BL and the base line BL is detected (steps S13 and S14). Then, the distance between the two intersections B and Q detected in steps S13 and S14 is obtained, and a value twice the distance is adopted as the peak width W (step S15).
Through the processes in steps S13 to S15, the peak width W can be calculated even when one of the inflection points is not properly detected.
[第2のピーク幅算出処理]
次に、日本薬局方の方法に準じてピーク高さの50%の位置におけるピーク幅W0.5を算出する処理の手順を、図2及び図10の説明図を参照しつつ、図9のフローチャートを用いて説明する。[Second peak width calculation process]
Next, the processing procedure for calculating the peak width W 0.5 at the position of 50% of the peak height according to the method of the Japanese Pharmacopoeia is shown in the flowchart of FIG. 9 with reference to the explanatory diagrams of FIGS. It explains using.
本実施例における第2のピーク幅算出処理では、まず目的とするピークのベースラインBLからピークトップPまでの高さの50%の高さにベースラインBLに平行な直線PLを引き、該ピークとの交点を検出する(ステップS21)。そして、ステップS21で検出した交点が該ピークの前半部と後半部の両方において得られたか否かを判定する(ステップS22)。 In the second peak width calculation process in this embodiment, first, a straight line PL parallel to the base line BL is drawn to a height of 50% of the height from the base line BL of the target peak to the peak top P, and the peak Is detected (step S21). Then, it is determined whether or not the intersection detected in step S21 is obtained in both the first half and the second half of the peak (step S22).
ステップS22において、ピークの前半部と後半部の両方において直線PLとの交点が存在する場合は、図2に示すように各々の交点D1、D2の間の距離を求めることで、ピーク幅W0.5を算出する(ステップS25)。In step S22, if there is a point of intersection between the straight line PL in both the first half and the second half of the peak, by obtaining the distance between each of the intersection points D1, D2 as shown in FIG. 2, peak width W 0.5 Is calculated (step S25).
一方、図10のように、ピークの前半部と後半部のいずれかの交点が得られない場合、本実施例における第2のピーク幅算出処理では、ピークトップPから直線PLに下ろした垂線と該直線Sとの交点Rを求める(ステップS23)。そして、ステップS21で検出された方の交点(図10の例では点D)と交点Rの間の距離を算出し、この距離の2倍の値をピーク幅W0.5として採用する(ステップS24)。
これらステップS23及びS24における処理により、目的とするピークと直線PLとの交点のうちの一方が検出されない場合であっても、ピーク幅W0.5を算出することが可能となる。On the other hand, as shown in FIG. 10, when the intersection of either the first half or the second half of the peak is not obtained, the second peak width calculation process in the present embodiment uses a perpendicular line dropped from the peak top P to the straight line PL. An intersection R with the straight line S is obtained (step S23). Then, the distance between the intersection (point D in the example of FIG. 10) detected at step S21 and the intersection R is calculated, and a value twice this distance is adopted as the peak width W 0.5 (step S24). .
By the processing in steps S23 and S24, the peak width W0.5 can be calculated even when one of the intersections between the target peak and the straight line PL is not detected.
なお、上記実施例は本発明の一例にすぎないから、上記記載の点以外についても、本発明の趣旨の範囲で適宜に変更や修正を加えることができることは明らかである。例えば、本実施例では第2のピーク幅算出処理を、ベースラインからピークトップまでの高さの50%の高さにおけるピーク幅を求める場合について説明したが、より一般的にM%(0<M<100)としても同様の手順により算出することができる。 Since the above embodiment is merely an example of the present invention, it is obvious that changes and modifications can be made as appropriate within the scope of the present invention except for the points described above. For example, in the present embodiment, the second peak width calculation process has been described for the case where the peak width at the height of 50% of the height from the baseline to the peak top is obtained, but more generally M% (0 < M <100) can be calculated by the same procedure.
また、特開2004-184148号公報では、ベースラインからピーク高さの1/e0.5倍の高さにおけるピーク上の点を仮想変曲点として定め、ピークの前半部及び後半部の仮想変曲点における接線とベースラインとの2つの交点間の距離をピーク幅Wとして算出する方法を示しているが、このような算出方法に対しては、仮想変曲点の検出及び検出した仮想変曲点の判定については図9のステップS21、S22と同様の処理で、判定後のピーク幅の算出については図7のステップS13〜S17と同様の処理で、それぞれ行えば良い。Further, in Japanese Patent Laid-Open No. 2004-184148, a point on the peak at a height 1 / e 0.5 times the peak height from the baseline is defined as a virtual inflection point, and virtual inflections in the first half and the latter half of the peak A method of calculating the distance between two intersections of a tangent and a baseline at a point as a peak width W is shown. For such a calculation method, detection of a virtual inflection point and detection of a virtual inflection detected The determination of the point may be performed by the same processing as steps S21 and S22 in FIG. 9, and the calculation of the peak width after the determination may be performed by the processing similar to steps S13 to S17 of FIG.
11…シリンジ
12…試料気化室
13…キャリアガス流路
14…カラム
15…検出器
16…データ処理装置
161…クロマトグラム作成部
162…ベースライン決定部
163…ピークトップ検出部
164…ピーク幅算出部DESCRIPTION OF
Claims (3)
b) 前記クロマトグラムのピークトップを検出するピークトップ検出手段と、
c) 前記ピークトップを挟んでピークの前半部及び後半部において変曲点を検出するとともに該検出した変曲点がピーク本来のものであるかを判定し、ピークの前半部と後半部の両方において前記変曲点がピーク本来のものであると判定したときは該2つの変曲点のそれぞれにおける接線と前記ベースラインとの交点を検出して、これら両交点間の距離をピーク幅として算出し、前記ピークの前半部及び後半部のいずれかにおける変曲点がピーク本来のものであると判定したときは、該ピーク本来のものであると判定した変曲点における接線と前記ベースラインとの交点と、該ピークトップから該ベースラインに下ろした垂線と該ベースラインとの交点と、をそれぞれ検出して、これら両交点間の距離を求め、その距離の2倍の値を該ピークのピーク幅として算出するピーク幅算出手段と、
を備えることを特徴とするクロマトグラフ用データ処理装置。 a) a baseline determination means for determining a baseline of the chromatogram;
b) Peak top detecting means for detecting the peak top of the chromatogram;
c) Inflection points are detected in the first half and the second half of the peak across the peak top, and it is determined whether the detected inflection point is the original peak, and both the first half and the second half of the peak are detected. When it is determined that the inflection point is the original peak, the intersection between the tangent and the base line at each of the two inflection points is detected, and the distance between the two intersections is calculated as the peak width. When the inflection point in either the first half or the second half of the peak is determined to be the original peak , the tangent at the inflection point determined to be the original peak and the baseline And the intersection of the base line and the perpendicular line drawn down from the peak top to the baseline, respectively, to determine the distance between the two intersection points, and to obtain a value twice the distance of the peak And peak width calculating means for calculating as over click width,
A chromatograph data processing apparatus comprising:
b) 前記クロマトグラムのピークトップを検出するピークトップ検出手段と、
c) 前記ベースラインからピークトップまでの高さのM%の高さに該ベースラインに平行な直線を引き、該ピークトップを挟んでピークの前半部と後半部の両方において該ピークと前記直線との交点を検出可能な場合に、前記ピーク幅算出手段がこれら2つの交点間の距離をピーク幅として算出し、前記ピークの前半部又は後半部のいずれかにおける該直線と該ピークとの交点を検出可能な場合に該交点と、該ピークトップから該直線に下ろした垂線と該直線との交点と、をそれぞれ検出し、これら両交点間の距離を求め、その距離の2倍の値を該ピークのピーク幅として算出するピーク幅算出手段と、
を備えることを特徴とするクロマトグラフ用データ処理装置。 a) a baseline determination means for determining a baseline of the chromatogram;
b) Peak top detecting means for detecting the peak top of the chromatogram;
c) A straight line parallel to the baseline is drawn at a height of M% of the height from the baseline to the peak top , and the peak and the straight line are both in the first half and the second half of the peak across the peak top. When the intersection with the peak can be detected, the peak width calculation means calculates the distance between the two intersections as the peak width, and the intersection of the straight line and the peak in either the first half or the second half of the peak Is detected , the intersection between the intersection and the perpendicular line drawn down from the peak top to the straight line and the straight line is obtained, the distance between the two intersections is obtained, and a value twice the distance is obtained. A peak width calculating means for calculating the peak width of the peak;
A chromatograph data processing apparatus comprising:
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013523875A JP5737403B2 (en) | 2011-07-08 | 2012-06-22 | Chromatographic data processor |
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2011151433 | 2011-07-08 | ||
JP2011151433 | 2011-07-08 | ||
JP2013523875A JP5737403B2 (en) | 2011-07-08 | 2012-06-22 | Chromatographic data processor |
PCT/JP2012/066068 WO2013008611A1 (en) | 2011-07-08 | 2012-06-22 | Data processing device for chromatograph |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2013008611A1 JPWO2013008611A1 (en) | 2015-02-23 |
JP5737403B2 true JP5737403B2 (en) | 2015-06-17 |
Family
ID=47505908
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013523875A Active JP5737403B2 (en) | 2011-07-08 | 2012-06-22 | Chromatographic data processor |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20140149050A1 (en) |
JP (1) | JP5737403B2 (en) |
WO (1) | WO2013008611A1 (en) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103969379B (en) * | 2013-01-29 | 2017-07-18 | 深圳普门科技有限公司 | The measured value adquisitiones that a kind of liquid chromatogram is examined |
JP6379463B2 (en) * | 2013-09-18 | 2018-08-29 | 株式会社島津製作所 | Waveform processing support method and waveform processing support device |
GB2520684B (en) * | 2013-11-27 | 2020-05-20 | Micromass Ltd | Method for measurement of ion events |
JP2015224895A (en) * | 2014-05-26 | 2015-12-14 | 有限会社シマムラテック | Recycle isolation method in liquid chromatography |
JP6540424B2 (en) * | 2015-09-24 | 2019-07-10 | 富士通株式会社 | Estimation device, estimation method, estimation program, engine and mobile device |
WO2018025366A1 (en) * | 2016-08-04 | 2018-02-08 | 株式会社島津製作所 | Chromatograph input device and chromatograph |
WO2018098502A1 (en) * | 2016-11-28 | 2018-05-31 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Systems, methods and devices for width-based analysis of peak traces |
GB201803129D0 (en) | 2018-02-27 | 2018-04-11 | Ge Healthcare Bio Sciences Ab | Method in liquid chiromatorgraphy |
CN113607867B (en) * | 2021-07-23 | 2024-06-11 | 清华大学合肥公共安全研究院 | Double-overlap spectrum peak analysis method based on peak body mapping |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0395481A3 (en) * | 1989-04-25 | 1991-03-20 | Spectra-Physics, Inc. | Method and apparatus for estimation of parameters describing chromatographic peaks |
JPH0798270A (en) * | 1993-09-29 | 1995-04-11 | Shimadzu Corp | Flow-through-type ultraviolet visible spectrophotometer |
US6019896A (en) * | 1998-03-06 | 2000-02-01 | Molecular Dynamics, Inc. | Method for using a quality metric to assess the quality of biochemical separations |
JP3554181B2 (en) * | 1998-03-31 | 2004-08-18 | 京セラ株式会社 | Fluid separation device and method of forming the same |
JP3702831B2 (en) * | 2001-10-18 | 2005-10-05 | 株式会社島津製作所 | Chromatographic data processor |
JP3985671B2 (en) * | 2002-12-02 | 2007-10-03 | 株式会社島津製作所 | Chromatographic data processor |
EP1915717A1 (en) * | 2005-08-19 | 2008-04-30 | University Of Tennessee Research Foundation | Method and apparatus for allele peak fitting and attribute extraction from dna sample data |
-
2012
- 2012-06-22 US US14/131,251 patent/US20140149050A1/en not_active Abandoned
- 2012-06-22 JP JP2013523875A patent/JP5737403B2/en active Active
- 2012-06-22 WO PCT/JP2012/066068 patent/WO2013008611A1/en active Application Filing
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPWO2013008611A1 (en) | 2015-02-23 |
US20140149050A1 (en) | 2014-05-29 |
WO2013008611A1 (en) | 2013-01-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5737403B2 (en) | Chromatographic data processor | |
Melamud et al. | Metabolomic analysis and visualization engine for LC− MS data | |
Wei et al. | Data preprocessing method for liquid chromatography–mass spectrometry based metabolomics | |
JP6610678B2 (en) | Peak detection method and data processing apparatus | |
Jiang et al. | An automated data analysis pipeline for GC− TOF− MS metabonomics studies | |
JP6213572B2 (en) | Waveform data processing apparatus and waveform data processing program | |
Vivó-Truyols | Bayesian approach for peak detection in two-dimensional chromatography | |
Tengstrand et al. | TracMass 2 A Modular Suite of Tools for Processing Chromatography-Full Scan Mass Spectrometry Data | |
Zhang | Retention time alignment of LC/MS data by a divide-and-conquer algorithm | |
Jiang et al. | Practical and efficient strategy for evaluating oral absolute bioavailability with an intravenous microdose of a stable isotopically-labeled drug using a selected reaction monitoring mass spectrometry assay | |
WO2015029254A1 (en) | Data processing device for chromatograph, and method | |
Takemura et al. | Evaluation of protein-protein docking model structures using all-atom molecular dynamics simulations combined with the solution theory in the energy representation | |
JP2011122822A (en) | Chromatograph mass analyzer | |
JPWO2017077618A1 (en) | Chromatograph mass spectrometry data processing method and processing apparatus | |
JP6573028B2 (en) | Data processing device | |
JP6036838B2 (en) | Comprehensive 2D chromatograph data processor | |
JP5930066B2 (en) | Chromatograph data processing apparatus and data processing method | |
Mahieu et al. | Warpgroup: increased precision of metabolomic data processing by consensus integration bound analysis | |
JP5211753B2 (en) | Chromatographic data processor | |
Pezzatti et al. | Evaluation of different tandem MS acquisition modes to support metabolite annotation in human plasma using ultra high-performance liquid chromatography high-resolution mass spectrometry for untargeted metabolomics | |
JP3985671B2 (en) | Chromatographic data processor | |
Paritala et al. | Quantitative structure retention relationship (QSRR) approach for assessment of chromatographic behavior of antiviral drugs in the development of liquid chromatographic method | |
JP6493076B2 (en) | Peak waveform processing device | |
Zhou et al. | AB-Amy: machine learning aided amyloidogenic risk prediction of therapeutic antibody light chains | |
Kundrotas et al. | Protein–protein alternative binding modes do not overlap |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20150324 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20150406 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 5737403 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |