JP5638747B2 - Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma - Google Patents

Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma Download PDF

Info

Publication number
JP5638747B2
JP5638747B2 JP2008211934A JP2008211934A JP5638747B2 JP 5638747 B2 JP5638747 B2 JP 5638747B2 JP 2008211934 A JP2008211934 A JP 2008211934A JP 2008211934 A JP2008211934 A JP 2008211934A JP 5638747 B2 JP5638747 B2 JP 5638747B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
cells
antibody
carrier
substance
peptide
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
JP2008211934A
Other languages
Japanese (ja)
Other versions
JP2010045996A (en
Inventor
博子 多田
博子 多田
理 小澤
理 小澤
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hitachi Ltd
Original Assignee
Hitachi Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hitachi Ltd filed Critical Hitachi Ltd
Priority to JP2008211934A priority Critical patent/JP5638747B2/en
Publication of JP2010045996A publication Critical patent/JP2010045996A/en
Application granted granted Critical
Publication of JP5638747B2 publication Critical patent/JP5638747B2/en
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Landscapes

  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Description

本発明は、目的物質を収集するための方法及びキット、より具体的には、がん腫の遺伝子診断の前処理に適用可能な、細胞を回収・単離するための方法及びキットに関するものである。   The present invention relates to a method and kit for collecting a target substance, and more specifically, to a method and kit for recovering and isolating cells that can be applied to pretreatment for genetic diagnosis of carcinoma. is there.

近年、遺伝子診断分野、特にがんの確定診断のための遺伝子診断分野において、夾雑物を多く含む被検試料や細胞集団(例えば血液、尿、便)から特定の細胞を回収する方法に注目が集まっている。   In recent years, in the field of genetic diagnosis, particularly in the field of genetic diagnosis for definite diagnosis of cancer, attention has been focused on methods for recovering specific cells from test samples and cell populations (eg, blood, urine, stool) that contain a large amount of contaminants. Gathered.

がんによる死亡率は、日本では1981年以来首位となっており、2004年には総死亡数の31.1%であった。上皮細胞の悪性腫瘍であるがん腫は、がんの大半を占め胃、肺、大腸、肝臓、乳房など多くの組織で生じる。その中でも大腸がんの患者数は、近年急激に増加し、今後もさらに増加していくことが予想される。一方、大腸がんは他のがんとは異なり、早期発見であれば手術により完治することが知られている。   Cancer mortality has been the highest in Japan since 1981, accounting for 31.1% of all deaths in 2004. Carcinoma, which is a malignant tumor of epithelial cells, occupies most of the cancer and occurs in many tissues such as the stomach, lungs, large intestine, liver, and breast. Among them, the number of patients with colorectal cancer has increased rapidly in recent years and is expected to increase further in the future. On the other hand, unlike other cancers, colorectal cancer is known to be completely cured by surgery if detected early.

大腸がんの早期発見のために様々な検査法が考案されてきた。現在、大腸がん検診の代表的な方法に便潜血法と内視鏡検査がある。一般向けスクリーニングとして便潜血法が行われ、陽性であった場合確定診断のために内視鏡検査が行われる。便潜血法では、糞便に含まれるヘモグロビンの存在を調べることで、腸内の出血の有無を確認し、間接的に大腸がんの発生の予測を行うが、この検査方法は、偽陽性のみならず偽陰性を多く含んでいる。内視鏡検査は、大腸の中を直接内視鏡で調べるため、大腸がんの発生に対して高い感度と特異性を有する。しかし、侵襲性が高く出血や穿孔の恐れがあること、検査に苦痛を伴う場合があることから無症状の一般人に対する大腸がん検査には向いていない。   Various tests have been devised for early detection of colorectal cancer. Currently, fecal occult blood and endoscopy are representative methods of colorectal cancer screening. The fecal occult blood test is performed as a general screening, and if it is positive, an endoscopy is performed for a definitive diagnosis. In the fecal occult blood test, the presence of hemoglobin in the stool is checked to confirm the presence of bleeding in the intestine and indirectly predict the occurrence of colorectal cancer. It contains a lot of false negatives. Endoscopy is highly sensitive and specific to the development of colorectal cancer because the inside of the large intestine is examined directly with an endoscope. However, it is not suitable for colorectal cancer testing for asymptomatic general people because it is highly invasive and may cause bleeding and perforation, and it may be painful.

そこで上記の課題を解決するために、近年、一般向け大腸がんスクリーニング法として糞便からがん細胞を回収し、その細胞からDNAを抽出し遺伝子検査を行う方法に注目が集まっている。特開2005-46062(以下第1の従来例)では、糞便からの細胞回収方法として、「上皮系細胞及び/又は上皮系癌細胞の表面抗原に対する抗体が固定化」された「固体担体」を用いて、糞便から「上皮系細胞及び/又は上皮系癌細胞」の回収が試みられている。   Therefore, in order to solve the above-mentioned problems, attention has recently been focused on a method for collecting cancer cells from feces, extracting DNA from the cells, and performing genetic testing as a general-purpose colorectal cancer screening method. In JP-A-2005-46062 (hereinafter referred to as the first conventional example), as a method for recovering cells from feces, a “solid carrier” in which “antibodies against surface antigens of epithelial cells and / or epithelial cancer cells” are immobilized. It has been attempted to collect “epithelial cells and / or epithelial cancer cells” from feces.

抗体結合ビーズで回収された細胞を、細胞回収後に、抗体結合ビーズと細胞に解離させる方法として、特表平9-508534では、「不均質な細胞懸濁物から抗体を介したビーズまたは他の固体支持体への結合によりポジティブに選択された細胞を放出するための、非酵素的な方法」が提供されている(以下第2の従来例)。これによると、「標的細胞上に存在する表面抗原に結合する抗体」により、標的細胞を細胞懸濁液から分離する工程の後、「前記抗体と結合して細胞表面抗原から抗体を放出しうるペプチド」、即ち前記抗体のエピトープ配列を含むペプチドを添加することで、回収後の細胞から抗体を解離している。この第2の従来例では、がん患者由来の骨髄または血液の懸濁物内から、CD34陽性幹細胞を選択的に回収し、回収した「CD34陽性細胞組成物は、患者の免疫系再構成のために使用」する旨の記載がある。   As a method of dissociating cells collected with antibody-bound beads into antibody-bound beads and cells after cell recovery, Japanese Patent Application Laid-Open No. 9-508534 describes, “Antibody-mediated beads or other beads from a heterogeneous cell suspension. A “non-enzymatic method” is provided for releasing positively selected cells by binding to a solid support (hereinafter referred to as second conventional example). According to this, “the antibody that binds to the surface antigen present on the target cell” can be released from the cell surface antigen by binding to the antibody after the step of separating the target cell from the cell suspension. The antibody is dissociated from the recovered cells by adding a peptide, that is, a peptide containing the epitope sequence of the antibody. In this second conventional example, CD34 positive stem cells are selectively recovered from a bone marrow or blood suspension derived from a cancer patient, and the recovered “CD34 positive cell composition is used to reconstitute a patient's immune system. For use ".

上記第1の従来例には以下の問題が考えられる。回収後の細胞には、「上皮系細胞及び/又は上皮系癌細胞の表面抗原に対する抗体」、即ち抗EpCAM抗体(クローン名:BerEP4)が、結合したままである。EpCAM分子は、細胞の接着やシグナル伝達に関与する細胞表面抗原であり、この抗体が細胞表面上に結合したままだと、生細胞の割合が減少することが知られている(図5)。少量の試料から、細胞を回収し、その細胞から遺伝子診断に用いる核酸を効率よく回収するためには、回収後の細胞の活性は維持されているのが望ましい。しかし、第1の従来例では抗体が細胞表面に残存しているので、生細胞の割合が減少し、核酸が分解されるため、核酸抽出の収量が低下し、PCRのテンプレートとして利用可能な核酸を十分量確保するのが困難となり、高精度な遺伝子検査が行えないという問題がある。   The first conventional example has the following problems. In the cells after collection, “an antibody against the surface antigen of epithelial cells and / or epithelial cancer cells”, that is, an anti-EpCAM antibody (clone name: BerEP4) remains bound. EpCAM molecules are cell surface antigens involved in cell adhesion and signal transduction, and it is known that the proportion of living cells decreases if this antibody remains bound on the cell surface (FIG. 5). In order to recover cells from a small amount of sample and efficiently recover nucleic acids used for genetic diagnosis from the cells, it is desirable to maintain the activity of the cells after recovery. However, in the first conventional example, since the antibody remains on the cell surface, the percentage of living cells is reduced and the nucleic acid is degraded, so that the yield of nucleic acid extraction is reduced and the nucleic acid that can be used as a template for PCR. There is a problem that it is difficult to secure a sufficient amount of the protein and high-precision genetic testing cannot be performed.

上記第2の従来例では、抗体結合磁気ビーズで細胞を回収した後、前記抗体のエピトープ配列を含むペプチドを添加することで、抗体結合磁気ビーズと細胞の解離を行っているが、この技術を第1の従来例と組み合わせて、がん腫の遺伝子診断に適用しようとした場合、次のような問題があげられる。第2の従来例では、CD34陽性細胞の回収例のみを示しており、その他の抗原に対する効果は不明である。例えば第1の従来例で示したEpCAM抗原に対する抗体を用いてがん細胞を回収し、その抗体のエピトープ配列を含むペプチドを添加して抗体結合磁気ビーズと細胞の解離を行う場合、購入可能な抗EpCAM抗体の中でエピトープ配列が開示されている抗体が存在しないので、添加すべきペプチドが不明であり、そのままでは適用できない。また、EpCAM抗原はがん化に伴い発現量が増加することが知られているが、高発現している抗原を細胞回収のターゲットにした場合、その抗原と磁気ビーズ表面上に存在する抗体の相互作用は高頻度に存在すると考えられるので、それらの相互作用がペプチドの添加によって全て解消されないと、抗体と細胞は解離できない。   In the second conventional example, after collecting cells with antibody-bound magnetic beads, the antibody-bound magnetic beads and cells are dissociated by adding a peptide containing the antibody epitope sequence. When combined with the first conventional example and applied to genetic diagnosis of carcinoma, the following problems are raised. In the second conventional example, only a recovery example of CD34 positive cells is shown, and the effect on other antigens is unknown. For example, if cancer cells are collected using the antibody against EpCAM antigen shown in the first conventional example, and the peptide containing the antibody epitope sequence is added to dissociate the cell from the antibody-bound magnetic beads, it can be purchased. Since there is no antibody whose epitope sequence is disclosed among anti-EpCAM antibodies, the peptide to be added is unknown and cannot be applied as it is. In addition, EpCAM antigen is known to increase in expression with canceration, but when high-expressing antigen is targeted for cell recovery, the antigen and antibody present on the magnetic bead surface Since interactions are thought to exist at a high frequency, antibodies and cells cannot be dissociated unless all of these interactions are eliminated by the addition of peptides.

特開2005-46062JP2005-46062 特表平9-508534Special table flat 9-508534

本発明は、収集対象物質に結合する物質を用いて当該対象物質との結合体を形成させてこれを回収し、その後、結合体から収集対象物質の解離を行う方法において、結合体における強固な結合を効率よく解離する方法を提供することを目的とする。   The present invention provides a method for forming a conjugate with a target substance using a substance that binds to the collection target substance and recovering this, and then dissociating the collection target substance from the conjugate. It is an object to provide a method for efficiently dissociating bonds.

本発明者らは、結合体から収集対象物質の解離を行う工程において、収集対象物質に結合する物質と特異的に結合する領域を少なくとも一部に含むプローブを表面に保持する担体を用いることにより、上記課題が解決できることを見出し、本発明を完成するに至った。   In the step of dissociating the substance to be collected from the conjugate, the present inventors use a carrier that holds on its surface a probe that includes at least a part of a region that specifically binds to the substance that binds to the substance to be collected. The present inventors have found that the above problems can be solved and have completed the present invention.

即ち、本発明は以下の発明を包含する。
(1)物質の収集方法であって、
第1の支持体の表面に第1の物質が固定された第1の担体と、収集対象物質である第2の物質とを結合させて結合体を生成する第1のステップと、
前記第1の支持体に基づいて前記結合体を収集する第2のステップと、
前記第1のステップより後に、前記第1の物質と特異的に結合する領域を少なくとも一部に含むプローブを表面に保持する第2の担体を供給し、前記第1の担体と第2の担体の複合体を形成させ、前記結合体から前記第2の物質を解離させる第3のステップと
前記複合体を除去し、前記第2の物質を得る第4のステップ
を有する前記方法。
(2)前記第1の物質が抗体であることを特徴とする(1)に記載の収集方法。
(3)前記第2の物質は前記抗体が認識する抗原を含む収集対象物質であることを特徴とする請求項(2)に記載の収集方法。
(4)前記第2の物質が細胞であることを特徴とする(3)に記載の収集方法。
(5)前記プローブが前記抗体と特異的に結合する領域を少なくとも一部に含むペプチドであることを特徴とする(2)に記載の収集方法。
(6)前記ペプチドが配列番号1のアミノ酸配列を含むことを特徴とする(5)に記載の収集方法。
(7)物質を収集するためのキットであって、
収集対象物質に特異的に結合する第1の物質と、
前記第1の物質を表面に固定する第1の支持体と、
前記第1の物質と特異的に結合する領域を少なくとも一部に含むペプチドと、
前記ペプチドを表面に保持する第2の支持体
を有する前記キット。
(8)前記第1の物質が抗体であることを特徴とする(7)に記載のキット。
(9)前記第2の支持体がビーズであることを特徴とする(7)に記載のキット。
(10)前記ペプチドが前記抗体のエピトープ配列を含むことを特徴とする(8)に記載のキット。
(11)前記抗体が抗EpCAM抗体であり、前記ペプチドが前記抗EpCAM抗体のエピトープ配列を含むことを特徴とする(10)に記載のキット。
(12)前記エピトープ配列が配列番号1のアミノ酸配列であることを特徴とする(11)に記載のキット。
(13)前記収集対象物質が細胞であることを特徴とする(7)に記載のキット。
(14)前記細胞がヒト上皮細胞であることを特徴とする(13)に記載のキット。
That is, the present invention includes the following inventions.
(1) A method for collecting substances,
A first step of generating a conjugate by binding the first carrier having the first substance immobilized on the surface of the first support and the second substance, which is the substance to be collected;
A second step of collecting the conjugate based on the first support;
After the first step, a second carrier that holds on its surface a probe that includes at least part of a region that specifically binds to the first substance is supplied, and the first carrier and the second carrier The method further comprising: a third step of forming a complex of: and dissociating the second substance from the conjugate; and a fourth step of removing the complex to obtain the second substance.
(2) The collection method according to (1), wherein the first substance is an antibody.
(3) The collection method according to (2), wherein the second substance is a collection target substance containing an antigen recognized by the antibody.
(4) The collection method according to (3), wherein the second substance is a cell.
(5) The collection method according to (2), wherein the probe is a peptide including at least part of a region that specifically binds to the antibody.
(6) The collection method according to (5), wherein the peptide comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
(7) A kit for collecting substances,
A first substance that specifically binds to the substance to be collected;
A first support for fixing the first substance to the surface;
A peptide comprising at least a part of a region that specifically binds to the first substance;
The kit having a second support for holding the peptide on the surface.
(8) The kit according to (7), wherein the first substance is an antibody.
(9) The kit according to (7), wherein the second support is a bead.
(10) The kit according to (8), wherein the peptide contains the epitope sequence of the antibody.
(11) The kit according to (10), wherein the antibody is an anti-EpCAM antibody, and the peptide includes an epitope sequence of the anti-EpCAM antibody.
(12) The kit according to (11), wherein the epitope sequence is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
(13) The kit according to (7), wherein the collection target substance is a cell.
(14) The kit according to (13), wherein the cell is a human epithelial cell.

本発明により、収集対象物質に特異的に結合する物質を用いて当該対象物質との結合体を形成させてこれを回収し、その後、結合体から収集対象物質の解離を行う方法において、結合体における強固な結合を効率よく解離させることが可能となる。   According to the present invention, in a method for forming a conjugate with a target substance by using a substance that specifically binds to the target substance to be collected and recovering the same, and then dissociating the target substance from the conjugate, It is possible to efficiently dissociate the strong bond in.

本発明の構成要素について図1〜3を用いて説明する。
図1は本発明が処理対象とする第2の物質1、つまり収集対象物質である。収集対象物質としては、例えば、細胞、抗体、抗原、蛋白質、ペプチド、糖、核酸(DNAおよびRNAを含む)などの生体分子があげられる。本発明においては、好ましくは細胞を収集対象物質、すなわち標的とする。細胞としては、哺乳動物(例えば、ヒト、モルモット、ラット、マウス、ウサギ、ブタ、ヒツジ、ウシ、サルなど)のあらゆる細胞(例えば、脾細胞、神経細胞、グリア細胞、膵臓β細胞、骨髄細胞、メサンギウム細胞、ランゲルハンス細胞、表皮細胞、上皮細胞、内皮細胞、繊維芽細胞、繊維細胞、筋細胞、脂肪細胞、免疫細胞(例、マクロファージ、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー細胞、肥満細胞、好中球、好塩基球、好酸球、単球)、巨核球、滑膜細胞、軟骨細胞、骨細胞、骨芽細胞、破骨細胞、乳腺細胞、肝細胞もしくは間質細胞、またはこれら細胞の前駆細胞など)や血球系の細胞(例、白血球、赤血球)があげられる。本発明は、がん細胞の収集において有利であり、例えば、上記細胞のがん細胞、ならびに脳、胃、膵臓、腎臓、肝臓、骨髄、副腎、皮膚、筋肉、肺、消化管(例、大腸、小腸)、前立腺、精巣、卵巣などの組織におけるがんに由来するがん細胞の収集に好適である。これら組織由来の細胞を、一度培養することによって得られる細胞集団でもよい。より具体的には、細胞表面にEpCAM分子を発現している細胞、例えば、HT29細胞があげられる。EpCAM分子のアミノ酸配列は公知であり、公開されたデータベース(GenBank)において、NP_002345(配列番号2)として登録されている。
The components of the present invention will be described with reference to FIGS.
FIG. 1 shows a second substance 1 to be treated by the present invention, that is, a substance to be collected. Examples of substances to be collected include biomolecules such as cells, antibodies, antigens, proteins, peptides, sugars, and nucleic acids (including DNA and RNA). In the present invention, cells are preferably collected substances, that is, targets. Examples of cells include any cells (eg, spleen cells, nerve cells, glial cells, pancreatic β cells, bone marrow cells) of mammals (eg, humans, guinea pigs, rats, mice, rabbits, pigs, sheep, cows, monkeys, etc.). Mesangial cells, Langerhans cells, epidermal cells, epithelial cells, endothelial cells, fibroblasts, fiber cells, muscle cells, adipocytes, immune cells (eg, macrophages, T cells, B cells, natural killer cells, mast cells, neutrophils) Spheres, basophils, eosinophils, monocytes), megakaryocytes, synoviocytes, chondrocytes, bone cells, osteoblasts, osteoclasts, mammary cells, hepatocytes or stromal cells, or precursors of these cells Cells) and blood cells (eg, white blood cells, red blood cells). The present invention is advantageous in the collection of cancer cells. For example, cancer cells of the above cells, as well as brain, stomach, pancreas, kidney, liver, bone marrow, adrenal gland, skin, muscle, lung, gastrointestinal tract (eg, large intestine) , Small intestine), prostate, testis, ovary and other tissues suitable for collecting cancer cells derived from cancer. A cell population obtained by once culturing cells derived from these tissues may be used. More specifically, cells expressing EpCAM molecules on the cell surface, such as HT29 cells, can be mentioned. The amino acid sequence of the EpCAM molecule is known and is registered as NP_002345 (SEQ ID NO: 2) in a public database (GenBank).

図2に、本発明の構成要素である第1の担体4を示す。第1の担体4は、第1の物質2と第1の支持体3とから構成される。第1の物質は、収集対象物質である第2の物質と特異的に結合する物質であれば特に制限されず、当業者であれば適宜選択できる。第2の物質としては、例えば、抗体、抗原、エピトープ、細胞、蛋白質、ペプチド、糖、核酸(DNAおよびRNAを含む)などの生体分子があげられる。本発明においては、好ましくは第1の物質として抗体を用いる。収集対象物質として細胞を標的とする場合は、標的細胞の表面に発現する抗原と特異的に結合する抗体を第1の物質として用いることが好ましい。がん細胞を標的とする場合は、がん細胞の表面に特異的に発現する抗原と結合する抗体を第1の物質として用いることが好ましい。細胞表面にEpCAM分子を発現している細胞を収集対象とする場合は、ハイブリドーマhrk29が産生するモノクローナル抗体hrk29を用いることが好ましい。ハイブリドーマhrk29 (Hybridoma hrk29)は、受託番号FERM P-21604として、独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1丁目1番地1中央第6)に寄託されている。   FIG. 2 shows a first carrier 4 which is a component of the present invention. The first carrier 4 is composed of a first substance 2 and a first support 3. The first substance is not particularly limited as long as it is a substance that specifically binds to the second substance to be collected, and can be appropriately selected by those skilled in the art. Examples of the second substance include biomolecules such as antibodies, antigens, epitopes, cells, proteins, peptides, sugars, and nucleic acids (including DNA and RNA). In the present invention, an antibody is preferably used as the first substance. When a cell is targeted as a collection target substance, an antibody that specifically binds to an antigen expressed on the surface of the target cell is preferably used as the first substance. When targeting cancer cells, it is preferable to use an antibody that binds to an antigen specifically expressed on the surface of the cancer cells as the first substance. When collecting cells expressing EpCAM molecules on the cell surface, it is preferable to use the monoclonal antibody hrk29 produced by the hybridoma hrk29. Hybridoma hrk29 (Hybridoma hrk29) has been deposited under the accession number FERM P-21604 at the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology Patent Biological Depositary Center (1st, 1st, 1st East, 1st Street, Tsukuba, Ibaraki Prefecture).

第1の支持体3としては、第1の物質2を固定できるものであれば特に制限されないが、例えば、樹脂、ガラス素材、鉄、酸化鉄等を使用できる。これらはいかなる形状でもよく、材質の種類やその後の工程等によって適宜選択可能である。例えば、板状、ビーズ状、薄膜状、糸状、コイル状等があげられる。鉄または酸化鉄を素材としたビーズであれば、磁気分離が可能となり、その後の回収工程を簡便に実施できる。第1の支持体3のサイズは、いかなるサイズでもよく、形状と同様に材質の種類やその後の工程等によって決定される。例えば、磁気ビーズであれば、1.0〜4.5μm程度であれば、その後の磁気分離の操作に適する。   The first support 3 is not particularly limited as long as it can fix the first substance 2, and for example, a resin, a glass material, iron, iron oxide, or the like can be used. These may have any shape, and can be appropriately selected depending on the type of material and the subsequent steps. Examples thereof include a plate shape, a bead shape, a thin film shape, a thread shape, and a coil shape. If the beads are made of iron or iron oxide, magnetic separation is possible, and the subsequent recovery process can be carried out easily. The size of the first support 3 may be any size, and is determined by the type of material, the subsequent steps, etc., as with the shape. For example, if it is a magnetic bead, if it is about 1.0-4.5 micrometers, it will be suitable for operation of subsequent magnetic separation.

第1の物質2を第1の支持体3に結合する方法としては、抗体を第1の支持体3に結合する場合、例えば、二次抗体法を用いることができる。その他の結合法も採用可能である。例えば、第1の支持体3に直接結合する方法としては、第1の支持体3を臭化シアン処理等によって活性化し、そこにアミノ基またはヒドロキシル基を有する第1の物質2(例えば、抗体)を結合することで行う。間接的に結合する方法として、例えばプロテインA、プロテインG等が表面に付加された第1の支持体3を用いて、これらを介して第1の物質2(例えば、抗体)を結合する方法も使用できる。ストレプトアビジンが表面に付加された第1の支持体3を用いることにより、第1の物質2をビオチン化しておくことで、同様に間接的に結合する方法も採用可能である。   As a method for binding the first substance 2 to the first support 3, when the antibody is bound to the first support 3, for example, a secondary antibody method can be used. Other coupling methods can also be employed. For example, as a method of directly binding to the first support 3, the first support 3 is activated by cyanogen bromide treatment or the like, and the first substance 2 having an amino group or a hydroxyl group (for example, an antibody) ). As a method of indirectly binding, for example, a method of binding the first substance 2 (for example, an antibody) through the first support 3 with the protein A, protein G or the like added on the surface thereof is also available. Can be used. By using the first support 3 having streptavidin added to the surface, the first substance 2 can be biotinylated to similarly bind indirectly.

第1の担体の作製において使用される第1の支持体3の量は、1〜6×106個の範囲が好適である。第1の物質2として抗体を用いる場合、抗体の量は0.03〜0.8μgの範囲で使用可能だが、0.3μg以上が望ましい。一定量の第1の支持体3をPBS等の緩衝液で一度、または複数回洗浄した後、一定量のPBS等で懸濁し、抗体を添加する。抗体と磁気ビーズの反応時間は、30分〜1時間程度が望ましい。一定時間反応した後、再びPBS等の緩衝液で一度、または複数回洗浄することで、第1の支持体3に抗体が固定化された第1の担体4を得ることができる。 The amount of the first support 3 used in the production of the first carrier is preferably in the range of 1 to 6 × 10 6 . When an antibody is used as the first substance 2, the amount of the antibody can be used in the range of 0.03 to 0.8 μg, but 0.3 μg or more is desirable. A fixed amount of the first support 3 is washed once or a plurality of times with a buffer solution such as PBS, and then suspended in a certain amount of PBS and the antibody is added. The reaction time between the antibody and the magnetic beads is preferably about 30 minutes to 1 hour. After reacting for a certain period of time, the first carrier 4 in which the antibody is immobilized on the first support 3 can be obtained by washing once or a plurality of times with a buffer solution such as PBS.

図3は、第2の担体7の模式図である。第2の担体7は、第1の物質と特異的に結合する領域を少なくとも一部に含むプローブ5と、第2の支持体6とから構成される。   FIG. 3 is a schematic diagram of the second carrier 7. The second carrier 7 includes a probe 5 including at least part of a region that specifically binds to the first substance, and a second support 6.

第2の支持体6としては、プローブ5を固定できるものであれば特に制限されないが、例えば、樹脂、ガラス素材、鉄、酸化鉄等を使用できる。これらはいかなる形状でもよく、材質の種類やその後の工程等によって適宜選択可能である。例えば、板状、ビーズ状、薄膜状、糸状、コイル状等があげられる。鉄または酸化鉄を素材としたビーズであれば、磁気分離が可能となり、その後の回収工程を簡便に実施できる。第2の支持体6のサイズは、いかなるサイズでもよく、形状と同様に材質の種類やその後の工程等によって決定される。例えば、磁気ビーズであれば、好ましくは1.0〜4.5μm程度、より好ましくは1.0μm程度である。   The second support 6 is not particularly limited as long as the probe 5 can be fixed. For example, a resin, a glass material, iron, iron oxide, or the like can be used. These may have any shape, and can be appropriately selected depending on the type of material and the subsequent steps. Examples thereof include a plate shape, a bead shape, a thin film shape, a thread shape, and a coil shape. If the beads are made of iron or iron oxide, magnetic separation is possible, and the subsequent recovery process can be carried out easily. The size of the second support 6 may be any size, and is determined by the type of material, the subsequent steps, etc., as with the shape. For example, in the case of magnetic beads, the thickness is preferably about 1.0 to 4.5 μm, more preferably about 1.0 μm.

第1の物質として抗体を用いる場合、該抗体が認識するエピトープ配列を含むペプチドをプローブ5として用いることが好ましい。抗体として、ハイブリドーマhrk29が産生するモノクローナル抗体hrk29を用いる場合、好ましくはエピトープ配列として配列番号1のアミノ酸配列(ICSKLA)を含むペプチドを用いる。配列番号1のアミノ酸配列は、EpCAM分子のアミノ酸配列(配列番号2)の58〜63番目のアミノ酸に相当する。ペプチドの残基数は特に制限されないが、好ましくは11残基以上15残基以下である。より好ましくは配列番号2のアミノ酸配列の部分配列であって、配列番号2の58〜63番目のアミノ酸を含む連続した11〜15残基の配列からなるペプチドをプローブ5として用いる。   When an antibody is used as the first substance, a peptide containing an epitope sequence recognized by the antibody is preferably used as the probe 5. When the monoclonal antibody hrk29 produced by the hybridoma hrk29 is used as the antibody, a peptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 (ICSKLA) is preferably used as the epitope sequence. The amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 corresponds to the 58th to 63rd amino acids of the amino acid sequence of the EpCAM molecule (SEQ ID NO: 2). The number of residues of the peptide is not particularly limited, but is preferably 11 residues or more and 15 residues or less. More preferably, it is a partial sequence of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and a peptide consisting of a sequence of 11 to 15 residues including the 58th to 63rd amino acids of SEQ ID NO: 2 is used as the probe 5.

ペプチドとしては、化学的に合成したペプチドも、遺伝子工学的に作製したペプチドも使用可能である。N末端またはC末端のどちらかにビオチン標識を有していれば、その後の第2の支持体6への結合が簡便となる。ペプチドの第2の支持体6への結合方法として、例えば、ストレプトアビジンが表面に付加された第2の支持体6では、ペプチドをビオチン化しておくことで、間接的に結合することが可能である。使用するペプチドの量は40〜400pmolの範囲が好適である。一定量の第2の支持体6をPBS等の緩衝液で一度、または複数回洗浄した後、一定量のPBS等で懸濁し、ペプチドを添加する。ペプチドと第2の支持体6の反応時間は、30分〜1時間程度が望ましい。一定時間反応させた後、再びPBS等の緩衝液で一度、または複数回洗浄することで、第2の担体7を得ることができる。   As the peptide, a chemically synthesized peptide or a gene engineered peptide can be used. If it has a biotin label at either the N-terminus or the C-terminus, the subsequent binding to the second support 6 becomes easy. As a method of binding the peptide to the second support 6, for example, in the second support 6 with streptavidin added to the surface, it is possible to bind the peptide indirectly by biotinylating the peptide. is there. The amount of peptide used is preferably in the range of 40 to 400 pmol. A certain amount of the second support 6 is washed once or a plurality of times with a buffer solution such as PBS, and then suspended in a certain amount of PBS and the peptide is added. The reaction time between the peptide and the second support 6 is preferably about 30 minutes to 1 hour. After reacting for a certain period of time, the second carrier 7 can be obtained by washing once or a plurality of times with a buffer solution such as PBS.

本発明の方法の概略について図4を用いて説明する。図4は本発明の方法における操作を示すフロー図である。まず、本発明の構成要素について図4を用いて説明する。結合体8は、第2の物質1(例えば、標的細胞)と第1の担体4が結合したものであり、磁石9は磁気分離のために用いられる。精製結合体10は不純物を除いた後に得られる結合体8であり、複合体11は第1の担体4と第2の担体7が複合したものである。   The outline of the method of the present invention will be described with reference to FIG. FIG. 4 is a flowchart showing operations in the method of the present invention. First, the components of the present invention will be described with reference to FIG. The conjugate 8 is a combination of the second substance 1 (for example, a target cell) and the first carrier 4, and the magnet 9 is used for magnetic separation. The purified conjugate 10 is a conjugate 8 obtained after removing impurities, and the complex 11 is a composite of the first carrier 4 and the second carrier 7.

本発明の方法は、ステップ1、ステップ2、ステップ3、ステップ4の4個のステップを含む。ステップ1は結合体形成のステップであり、具体的には、第2の物質1(例えば、標的細胞)と、第1の担体4とを混合し、結合体8を形成するステップである。ステップ2は結合体収集のステップであり、具体的には結合体8を、磁石9を用いて磁気分離を行い、結合体8以外の不純物を除去し、精製結合体10を得るステップである。ステップ3は複合体形成と結合体解離のステップであり、具体的には精製結合体10と、第2の担体7とを混合し、複合体11を形成させることにより、精製結合体10から収集対象物質である第2の物質1(例えば、標的細胞)を解離するステップである。ステップ4は複合体除去のステップであり、具体的には複合体11を磁気分離により除去して、第2の物質1(例えば、標的細胞)を回収するステップである。   The method of the present invention includes four steps of Step 1, Step 2, Step 3, and Step 4. Step 1 is a step of forming a conjugate, specifically, a step of mixing the second substance 1 (for example, a target cell) and the first carrier 4 to form a conjugate 8. Step 2 is a step of collecting the conjugate. Specifically, the conjugate 8 is magnetically separated using the magnet 9 to remove impurities other than the conjugate 8 to obtain a purified conjugate 10. Step 3 is a step of complex formation and conjugate dissociation. Specifically, the purified conjugate 10 and the second carrier 7 are mixed to form a complex 11, thereby collecting from the purified conjugate 10. This is a step of dissociating the second substance 1 (for example, the target cell) that is the target substance. Step 4 is a step of removing the complex. Specifically, the complex 11 is removed by magnetic separation, and the second substance 1 (for example, target cell) is recovered.

第2の物質1として細胞を収集対象とし、第1の物質2として抗体を用い、プローブ5として抗体が認識するエピトープ配列を含むペプチドを用いる場合の実施形態について、以下に説明する。   An embodiment in which cells are collected as the second substance 1, an antibody is used as the first substance 2, and a peptide containing an epitope sequence recognized by the antibody is used as the probe 5 will be described below.

ステップ1において使用する細胞数は特に限定されないが、1×104〜1×106個の範囲で好適に使用可能である。ステップ1の標的細胞1と第1の担体4の反応時間は特に限定されないが、30分〜1時間程度が望ましい。ステップ2として標的細胞1と接触させた第1の担体4を、磁石9を用いて回収し、PBS等の細胞に悪影響を与えない緩衝液を用いて、一回または複数回洗浄する。その後、ステップ3として第2の担体7を加え、一定時間撹拌することで、標的細胞1から第1の担体4を解離する。特に反応時間は制限されないが、30分〜1時間程度が望ましい。第1の担体4と、第2の担体7の割合は、特に限定されないが、第1の支持体3の表面に存在する抗体2のモル数以上のペプチド5を添加できる量の第2の担体7が添加されることが望ましい。第1の担体4と標的細胞1を解離後に、ステップ4として磁石9を用いて、複合体11を除去することで、第1の担体4から解離した標的細胞1を得ることが可能となる。 The number of cells used in Step 1 is not particularly limited, but can be suitably used in the range of 1 × 10 4 to 1 × 10 6 cells. The reaction time between the target cell 1 and the first carrier 4 in step 1 is not particularly limited, but is preferably about 30 minutes to 1 hour. In step 2, the first carrier 4 brought into contact with the target cell 1 is collected using a magnet 9 and washed once or a plurality of times using a buffer solution that does not adversely affect the cells such as PBS. Thereafter, in step 3, the second carrier 7 is added, and the first carrier 4 is dissociated from the target cells 1 by stirring for a certain time. The reaction time is not particularly limited, but is preferably about 30 minutes to 1 hour. The ratio of the first carrier 4 and the second carrier 7 is not particularly limited, but the amount of the second carrier can be added so that the peptide 5 having the number of moles or more of the antibody 2 present on the surface of the first support 3 can be added. Preferably 7 is added. After the first carrier 4 and the target cell 1 are dissociated, the target cell 1 dissociated from the first carrier 4 can be obtained by removing the complex 11 using the magnet 9 as step 4.

なお、本発明の主たる観点は、夾雑物を多く含む試料中から、収集対象物質1を回収し、回収後の収集対象物質1から回収に用いた第1の担体4を解離することにあるためその後の操作については詳述しないが、例えば従来例1に記載の方法を適用することにより、核酸抽出、PCR、遺伝子変異解析などを経て、がんの遺伝子診断が実施可能である。   Note that the main aspect of the present invention is to recover the collection target substance 1 from a sample containing a large amount of contaminants and dissociate the first carrier 4 used for the collection from the collection target substance 1 after the recovery. Although subsequent operations are not described in detail, for example, by applying the method described in Conventional Example 1, cancer genetic diagnosis can be performed through nucleic acid extraction, PCR, gene mutation analysis, and the like.

本発明により、細胞表面に高発現する抗原を細胞回収のターゲットとした場合に、抗体と細胞の間の強固な結合を効率よく解離することができる。本発明では、第1の従来例と相違し、細胞回収および単離後において、細胞表面に抗体が存在しないため、細胞活性を維持することが可能となる。また、第2の従来例と異なり、エピトープ配列を含むペプチドを表面に保持する担体を用いることにより、細胞から抗体を効率的に解離することが可能となる。これらにより、活性の高い細胞を高純度に回収することが可能となり、また回収細胞から十分量、かつ高品質な核酸を抽出することができ、がん腫を対象とした遺伝子検査において、高い精度を提供することが可能となる。   According to the present invention, when an antigen highly expressed on the cell surface is used as a target for cell recovery, a strong bond between the antibody and the cell can be efficiently dissociated. In the present invention, unlike the first conventional example, since no antibody is present on the cell surface after cell recovery and isolation, cell activity can be maintained. Further, unlike the second conventional example, the use of a carrier that retains a peptide containing an epitope sequence on the surface makes it possible to efficiently dissociate antibodies from cells. These make it possible to collect highly active cells with high purity, and to extract a sufficient amount of high-quality nucleic acid from the collected cells, which is highly accurate in genetic testing for carcinomas. Can be provided.

また、新たに開発した、エピトープ配列を明らかにした抗体を利用することにより、前記抗体のエピトープ配列を含むペプチドを用いて、抗EpCAM抗体を抗原であるEpCAM分子から解離することが可能になる。さらに、該エピトープ配列を含むペプチドを表面に保持する担体を用いることにより、EpCAMを高発現する上皮細胞から抗体やそれと結合した磁気ビーズを効率的に解離することが可能になる。   In addition, by using a newly developed antibody with the epitope sequence clarified, it becomes possible to dissociate the anti-EpCAM antibody from the EpCAM molecule as an antigen using a peptide containing the epitope sequence of the antibody. Furthermore, by using a carrier that holds the peptide containing the epitope sequence on the surface, it becomes possible to efficiently dissociate the antibody and the magnetic beads bound thereto from epithelial cells that highly express EpCAM.

以下に、本発明の具体的な実施例を挙げて説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
〔実施例1〕
抗体2の作製
ハイブリドーマの作製は常法に従って行った。遺伝子組み換えによって作製したEpCAM分子をアジュバンド(TiterMax)と混合後、フットパッド法によりBalb/Cマウスに免疫した。免疫を3回繰り返した後、リンパ節を取り出し、リンパ球とミエローマ細胞(P3U1)を融合させ、ハイブリドーマを作製した。ハイブリドーマのスクリーニングは、HT29細胞表面への結合量を指標に行った。1×106個のHT29細胞に対し100μLのハイブリドーマ培養上清を添加し、4 ℃、30分間静置した。PBSで洗浄後、ヤギ由来の抗マウスIg抗体-PE標識を2 μg添加し再び4 ℃、30分間静置した。再びPBSで洗浄後、500 μLのPBSで懸濁し、フローサイトメーターを用いて蛍光強度の測定を行った。スクリーニングで陽性を示したハイブリドーマは限界希釈法によりクローニングを2回行った。クローニング後、再びフローサイトメーターでスクリーニングを行い、陽性のクローンを選抜した。このようにして得られたハイブリドーマ並びにそれが産生する抗体のクローン名をhrk29とした。ハイブリドーマhrk29 (Hybridoma hrk29)は、受託番号FERM P-21604として、独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1丁目1番地1中央第6)に寄託されている。モノクローナル抗体hrk29のイムノグロブリンのサブクラスを知るため、Mouse Monoclonal Antibody Isotyping Test Kit (Serotec社)を使用しサブクラスを決定した。その結果、モノクローナル抗体hrk29のアイソタイプはIgG1と判明した。
Hereinafter, specific examples of the present invention will be described. However, the present invention is not limited to these examples.
Example 1
Preparation of Antibody 2 Hybridoma was prepared according to a conventional method. EpCAM molecules prepared by gene recombination were mixed with adjuvant (TiterMax), and then Balb / C mice were immunized by the footpad method. After three immunizations, the lymph nodes were removed and lymphocytes and myeloma cells (P3U1) were fused to prepare a hybridoma. Hybridoma screening was performed using the amount of binding to the HT29 cell surface as an index. 100 μL of hybridoma culture supernatant was added to 1 × 10 6 HT29 cells and allowed to stand at 4 ° C. for 30 minutes. After washing with PBS, 2 μg of goat-derived anti-mouse Ig antibody-PE label was added and again allowed to stand at 4 ° C. for 30 minutes. After washing with PBS again, it was suspended in 500 μL of PBS, and the fluorescence intensity was measured using a flow cytometer. Hybridomas that were positive in the screening were cloned twice by limiting dilution. After cloning, screening was performed again with a flow cytometer, and positive clones were selected. The clone name of the hybridoma thus obtained and the antibody produced by it was designated as hrk29. Hybridoma hrk29 (Hybridoma hrk29) has been deposited at the Patent Biological Depositary Center of the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (Higashi 1-chome, 1-chome, 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki) as deposit number FERM P-21604. In order to know the immunoglobulin subclass of the monoclonal antibody hrk29, the subclass was determined using Mouse Monoclonal Antibody Isotyping Test Kit (Serotec). As a result, the isotype of monoclonal antibody hrk29 was found to be IgG1.

抗体2のエピトープ配列決定
モノクローナル抗体hrk29の認識するエピトープ配列を解析するために、断片化したEpCAM分子(EpCAMのアミノ酸残基24〜62、63〜139、24〜139/EC1、EC2、EC3、図6)を大腸菌で発現させ、モノクローナル抗体hrk29が認識するドメインをウェスタンブロットにより検討した。図9に示すようにEC1(分子量およそ35kDa)とEC3(同43kDa)に対し反応性が認められた。即ち、この抗体は、EpCAMの24〜62番のアミノ酸を含む領域を認識することが確認された。
Epitope sequencing of antibody 2 To analyze the epitope sequence recognized by the monoclonal antibody hrk29, fragmented EpCAM molecules (EpCAM amino acid residues 24-62, 63-139, 24-139 / EC1, EC2, EC3, Figure 6) was expressed in E. coli, and the domain recognized by the monoclonal antibody hrk29 was examined by Western blot. As shown in FIG. 9, reactivity was observed for EC1 (molecular weight approximately 35 kDa) and EC3 (43 kDa). That is, it was confirmed that this antibody recognizes a region containing amino acids 24 to 62 of EpCAM.

EC1のアミノ酸配列に従い、図10、11に示すペプチド(ペプチドA〜E;それぞれ配列番号3〜7)を合成しELISA法によりモノクローナル抗体hrk29が認識するエピトープ配列をICSKLA(配列番号1)と決定した(図12)。   According to the amino acid sequence of EC1, peptides shown in FIGS. 10 and 11 (peptides A to E; SEQ ID NOs: 3 to 7, respectively) were synthesized, and the epitope sequence recognized by the monoclonal antibody hrk29 was determined to be ICSKLA (SEQ ID NO: 1) by ELISA. (Figure 12).

第1の担体4の作製
第1の担体4を以下に示すように作製した。第1の支持体3として、Dynabeads(登録商標)M-450 Sheep anti-mouse IgG、抗体2として前記で作製した抗EpCAM抗体:hrk29を用いた。第1の支持体3を一度PBSで洗浄した後、100μLのPBSで懸濁し、1×106個の第1の支持体3に対して0.03μgの抗体2を添加して室温で30分間撹拌した。その後PBSを用いて2回洗浄を行った後、PBS100μLで懸濁し、第1の担体4を得た。
Production of the first carrier 4 The first carrier 4 was produced as follows. As the first support 3, Dynabeads (registered trademark) M-450 Sheep anti-mouse IgG was used, and as the antibody 2, the anti-EpCAM antibody prepared above: hrk29 was used. The first support 3 is washed once with PBS, suspended in 100 μL of PBS, 0.03 μg of antibody 2 is added to 1 × 10 6 first supports 3, and stirred at room temperature for 30 minutes. did. Thereafter, the plate was washed twice with PBS and then suspended in 100 μL of PBS to obtain a first carrier 4.

第2の担体7の作製
ペプチド5を表面に有する第2の担体7の作製法を以下に示す。第2の支持体6としてDynabeads(登録商標)MyOne Streptavidin T1を、ペプチド5として本実施例で作製した抗体2(hrk29)が認識するエピトープ配列ICSKLAを含むビオチン化ペプチド(アミノ酸配列ICSKLAANKMKAE;配列番号8)を用いた。第2の支持体6を一度PBSで洗浄した後、100μLのPBSで懸濁し、7×108個のビーズに対して400pmolのペプチド5を添加して室温で30分間撹拌し、エピトープ配列を含むペプチド5を表面に保持する第2の担体7を得た。
Production of second carrier 7 A production method of the second carrier 7 having the peptide 5 on the surface is described below. Biotinylated peptide (amino acid sequence ICSKLAANKMKAE; SEQ ID NO: 8) containing Dynabeads (registered trademark) MyOne Streptavidin T1 as the second support 6 and the epitope sequence ICSKLA recognized by the antibody 2 (hrk29) prepared in this example as the peptide 5 ) Was used. The second support 6 is washed once with PBS, then suspended in 100 μL of PBS, 400 pmol of peptide 5 is added to 7 × 10 8 beads, and stirred at room temperature for 30 minutes to contain the epitope sequence. A second carrier 7 holding the peptide 5 on the surface was obtained.

細胞回収及び解離
抗EpCAM抗体を表面に結合させた磁気ビーズによる細胞回収及び解離方法を以下に示す。標的細胞1であるHT29細胞1×106個を500μLのPBSに分散した。ステップ1としてこの出発材料に第1の担体4を添加し、室温で30分撹拌した。ステップ2として、磁気分離後、0.5% BSA、2mM EDTAを含むPBSで二回洗浄後、精製複合体10を得た。ステップ3として第2の担体7を添加し、室温で30分撹拌した。その後、ステップ4として磁気分離を行い、標的細胞1を回収するとともに、複合体11並びに未反応の精製結合体10を除去した。回収した標的細胞1の数と、精製結合体10に含まれる標的細胞1の数から、抗体2から解離した標的細胞1の割合を算出した。
Cell recovery and dissociation Cell recovery and dissociation methods using magnetic beads with anti-EpCAM antibody bound to the surface are described below. 1 × 10 6 HT29 cells, which are target cells 1, were dispersed in 500 μL of PBS. As Step 1, the first support 4 was added to this starting material and stirred at room temperature for 30 minutes. As Step 2, after the magnetic separation, the purified complex 10 was obtained after washing twice with PBS containing 0.5% BSA and 2 mM EDTA. In Step 3, the second carrier 7 was added and stirred at room temperature for 30 minutes. Thereafter, magnetic separation was performed as step 4 to collect the target cells 1 and to remove the complex 11 and the unreacted purified conjugate 10. From the number of collected target cells 1 and the number of target cells 1 contained in the purified conjugate 10, the ratio of target cells 1 dissociated from antibody 2 was calculated.

〔実施例2〕
実施例1と同様の方法であるが、第2の担体7に使用する第2の支持体6として、Qdot(登録商標)565ITKTM Streptavidin Conjugateを使用した。
(Example 2)
Although it was the same method as Example 1, Qdot (registered trademark) 565ITKTM Streptavidin Conjugate was used as the second support 6 used for the second carrier 7.

実施例1と実施例2の結果を、図13を用いて説明する。図13は、解離した標的細胞1の割合、つまり細胞解離率を示すグラフである。なお、第2の従来例を変形した方法、即ちステップ3において、第2の担体7ではなくペプチド5のみを添加した結果も比較検討した。第2の担体7を使用した結果、第2の従来例の変形例、即ちペプチド5のみを添加する方法と比べて、解離した標的細胞1の割合が増加し、本発明の有効性が示された。つまり、ペプチドのみを添加する方法と異なり、第2の担体7を添加することにより、標的細胞1と抗体2の解離をより効率的に行うことができ、活性の高い細胞を高純度に回収することが可能となった。これにより、回収した細胞から十分量、かつ高品質な核酸を抽出することが可能となり、がん腫を対象とした遺伝子検査において、高い精度を提供することが可能となった。   The results of Example 1 and Example 2 will be described with reference to FIG. FIG. 13 is a graph showing the ratio of the dissociated target cells 1, that is, the cell dissociation rate. In addition, the method in which the second conventional example was modified, that is, the result of adding only the peptide 5 instead of the second carrier 7 in Step 3, was also compared. As a result of using the second carrier 7, the ratio of the dissociated target cells 1 is increased as compared with the modified example of the second conventional example, that is, the method of adding only the peptide 5, and the effectiveness of the present invention is shown. It was. In other words, unlike the method in which only the peptide is added, by adding the second carrier 7, the target cell 1 and the antibody 2 can be dissociated more efficiently, and highly active cells are recovered with high purity. It became possible. This makes it possible to extract a sufficient amount of high-quality nucleic acid from the collected cells, and to provide high accuracy in genetic testing for carcinomas.

本発明の構成要素のうち第2の物質(標的細胞)1を示す図である。It is a figure which shows the 2nd substance (target cell) 1 among the components of this invention. 本発明の構成要素のうち第1の担体4を示す図である。FIG. 3 is a diagram showing a first carrier 4 among the components of the present invention. 本発明の構成要素のうち第2の担体7を示す図である。FIG. 3 is a diagram showing a second carrier 7 among the components of the present invention. 本発明の方法の一実施形態を示す模式図である。It is a schematic diagram which shows one Embodiment of the method of this invention. 抗体が生細胞率に及ぼす影響を示すグラフである。It is a graph which shows the influence which an antibody has on a viable cell rate. モノクローナル抗体hrk29の抗原のドメインを決定するために作製したEC1、EC2、EC3を示す模式図である。FIG. 4 is a schematic diagram showing EC1, EC2, and EC3 prepared to determine the antigen domain of monoclonal antibody hrk29. EC1、EC2、EC3の発現のために使用したベクターを示す図である。It is a figure which shows the vector used for the expression of EC1, EC2, and EC3. 図7のベクターによって発現した組換えタンパク質を示す模式図である。It is a schematic diagram which shows the recombinant protein expressed with the vector of FIG. モノクローナルhrk29が認識する抗原のドメインを示す図である。It is a figure which shows the domain of the antigen which monoclonal hrk29 recognizes. エピトープ配列を決定するために使用したペプチドを示す図である。FIG. 2 shows peptides used to determine the epitope sequence. 実施例で使用したペプチドA〜Eの配列を示す図である。It is a figure which shows the arrangement | sequence of the peptide AE used in the Example. モノクローナル抗体hrk29と、ペプチドA〜Eの反応性を示す図である。It is a figure which shows the reactivity of the monoclonal antibody hrk29 and peptides A-E. 従来の実施例の変形例と、本発明の方法を用いた場合の細胞解離率を比較した図である。It is the figure which compared the cell dissociation rate at the time of using the modification of the conventional Example, and the method of this invention.

符号の説明Explanation of symbols

1…第2の物質(標的細胞)
2…第1の物質(抗体)
3…第1の支持体
4…第1の担体
5…プローブ(ペプチド)
6…第2の支持体
7…第2の担体
8…結合体
9…磁石
10…精製結合体
11…複合体
12…グルタチオンS-トランスフェラーゼ
13…6×Hisタグ
14…EC1〜3
1… Second substance (target cell)
2… First substance (antibody)
3 ... first support
4 ... first carrier
5 ... Probe (peptide)
6 ... second support
7 ... second carrier
8 ... Conjugate
9 ... Magnet
10 ... Purified conjugate
11 ... complex
12… Glutathione S-transferase
13… 6 × His tag
14 ... EC1 ~ 3

Claims (6)

細胞表面にEpCAM分子を発現している細胞の収集方法であって、
第1の支持体の表面に抗EpCAM抗体が固定された第1の担体と、収集対象物質である細胞表面にEpCAM分子を発現している細胞とを結合させて結合体を生成する第1のステップと、
前記第1の支持体に基づいて前記結合体を収集する第2のステップと、
前記第1のステップより後に、前記抗EpCAM抗体のエピトープ配列を含むペプチドを表面に保持する第2の担体を供給し、前記第1の担体と第2の担体の複合体を形成させ、前記結合体から前記細胞を解離させる第3のステップと
前記複合体を除去し、前記細胞を得る第4のステップ
を有する前記方法。
A method of collecting cells expressing EpCAM molecules on the cell surface ,
The first carrier that binds the first carrier having the anti-EpCAM antibody immobilized on the surface of the first support and the cells expressing the EpCAM molecule on the cell surface, which is the collection target substance. Steps,
A second step of collecting the conjugate based on the first support;
After the first step, a second carrier holding a peptide containing the epitope sequence of the anti-EpCAM antibody on the surface is supplied to form a complex of the first carrier and the second carrier, and the binding The method comprising: a third step of dissociating the cell from the body; and a fourth step of removing the complex and obtaining the cell.
前記ペプチドが配列番号1のアミノ酸配列を含むことを特徴とする請求項に記載の収集方法。 The collection method according to claim 1 , wherein the peptide comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. 細胞表面にEpCAM分子を発現している細胞を収集するためのキットであって、
抗EpCAM抗体と、
前記抗EpCAM抗体を表面に固定する第1の支持体と、
前記抗EpCAM抗体のエピトープ配列を含むペプチドと、
前記ペプチドを表面に保持する第2の支持体
を有する前記キット。
A kit for collecting cells expressing EpCAM molecules on the cell surface ,
An anti-EpCAM antibody,
A first support for immobilizing the anti-EpCAM antibody on a surface;
A peptide comprising the epitope sequence of the anti-EpCAM antibody;
The kit having a second support for holding the peptide on the surface.
前記第2の支持体がビーズであることを特徴とする請求項に記載のキット。 The kit according to claim 3 , wherein the second support is a bead. 前記エピトープ配列が配列番号1のアミノ酸配列であることを特徴とする請求項3または4に記載のキット。 The kit according to claim 3 or 4 , wherein the epitope sequence is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. 前記細胞がヒト上皮細胞であることを特徴とする請求項3〜5のいずれか1項に記載のキット。 The kit according to any one of claims 3 to 5 , wherein the cells are human epithelial cells.
JP2008211934A 2008-08-20 2008-08-20 Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma Expired - Fee Related JP5638747B2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2008211934A JP5638747B2 (en) 2008-08-20 2008-08-20 Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2008211934A JP5638747B2 (en) 2008-08-20 2008-08-20 Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2010045996A JP2010045996A (en) 2010-03-04
JP5638747B2 true JP5638747B2 (en) 2014-12-10

Family

ID=42063662

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2008211934A Expired - Fee Related JP5638747B2 (en) 2008-08-20 2008-08-20 Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JP5638747B2 (en)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20140073215A (en) 2012-12-06 2014-06-16 삼성전자주식회사 A composition and a kit for seperating a cell, and a method for seperating a cell using the same

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5968753A (en) * 1994-06-14 1999-10-19 Nexell Therapeutics, Inc. Positive and positive/negative cell selection mediated by peptide release

Also Published As

Publication number Publication date
JP2010045996A (en) 2010-03-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US9429577B2 (en) Anti-uroplakin II antibodies systems and methods
KR102074141B1 (en) COMPOSITIONS AND METHODS OF USE FOR DETERMINATION OF HE4a
JP2014105159A (en) Monoclonal antibody to human-derived epithelial cell adhesion molecule and method for detecting circulating tumor cells using the same
CN106866820B (en) Monoclonal antibody for capturing tumor cells and resisting human keratin 18 and application thereof
CN115667304A (en) Anti-human LAG-3 antibodies and their use in Immunohistochemistry (IHC)
JP5638747B2 (en) Cell collection and isolation method and kit for genetic diagnosis of carcinoma
CN117304314A (en) AQP4 antibody and application thereof
WO2023035825A1 (en) Anti-ca724 antibody or antigen binding fragment thereof, and preparation method therefor and use thereof
JPWO2013038696A1 (en) Molecular markers for early detection of pleural mesothelioma patients and their expression analysis methods
Iizuka et al. Anti-vascular endothelial growth factor receptor (VEGFR) 2 autoantibody identification in glioblastoma patient using single B cell-based antibody gene cloning
JP5716257B2 (en) Monoclonal antibody recognizing cholangiocarcinoma specific carbohydrate epitope
CN111892657A (en) Antibody and fragment thereof, kit and method for detecting blood group antigen of Mitigo
CN110579610A (en) Kit for detecting V-domain immunosuppressive factor activated by T cells
WO2024008094A1 (en) Anti-cd20-antibody monoclonal antibody and use thereof
CN114213542B (en) CPS-I antibodies and uses thereof
CN112094350B (en) Monoclonal antibody of mouse anti-cell surface glycoprotein CD326 applicable to tumor cell capture
CN116003606B (en) TIGIT nano antibody and preparation method and application thereof
JP6321921B2 (en) Anti-TLS monoclonal antibody and method for producing the same, hybridoma and method for producing the same, and anti-TLS monoclonal antibody-containing composition
CN112250767B (en) Antibody combined with Strep-Tag II label and application thereof
WO2020218121A1 (en) Cancer detection method and detection reagent
JP2018138520A (en) Anti-midkine monoclonal antibody and immunological measurement kit using the same
CN116908460A (en) GAGE2A monoclonal antibodies and uses thereof
US20120322083A1 (en) Antibody binding to abca1 polypeptide
JP2006006250A (en) Method for preparing hybridoma producing antibody recognizing three dimensional structure of cellular membrane protein
CN114686444A (en) Hybridoma cell, anti-thrombomodulin monoclonal antibody, and preparation method and application thereof

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20110228

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20130618

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20130813

A02 Decision of refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02

Effective date: 20140415

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20140714

A911 Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911

Effective date: 20140722

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20140924

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20141023

R151 Written notification of patent or utility model registration

Ref document number: 5638747

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees