JP5636179B2 - Novel compound walkmycin, process for its production and use thereof - Google Patents
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Description
本発明は、薬剤耐性菌、植物病原細菌等の幅広い病原性細菌に対し、優れた抗菌活性、若しくは、前記細菌の有する酵素に対し、酵素阻害活性を有する新規化合物、その製造方法、及びその用途、並びに、前記新規化合物の生産菌である新規微生物に関する。 The present invention relates to a novel compound having an excellent antibacterial activity against a wide range of pathogenic bacteria such as drug-resistant bacteria and phytopathogenic bacteria, or an enzyme inhibitory activity against an enzyme possessed by the bacteria, a method for producing the same, and use thereof In addition, the present invention relates to a novel microorganism that is a microorganism producing the novel compound.
従来、多くの抗菌剤が、細菌感染症の治療薬として用いられてきている。これまでに知られる抗菌剤の多くは、細菌の核酸合成、蛋白質合成、ペプチドグリカン合成等を阻害することにより作用する。これらの標的部位は単一で、主として代謝合成経路を阻害することを目的にしているため、これらの抗菌剤に対する耐性菌が出現しやすく、特に近年では複数の抗生物質に対して耐性を示す多剤耐性菌の出現が問題となっている。
例えば、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)は、化膿性疾患、肺炎、食中毒等の起因菌として知られるが、抗生物質メチシリン等の多くの薬剤に対する耐性を獲得したメチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)の出現が、臨床上大きな問題となっている。現在、MRSAに対する代表的な治療薬としては、バンコマイシン、テイコプラニン、アルベカシン、リネゾリドなどが使用されているが、完全にMRSAを排除することは一般に困難であるとされており、また、これらのうち、バンコマイシンについては、既にバンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌(VRSA)の出現が報告されており、その使用には十分な注意が必要であるとされている。
このような薬剤耐性菌の問題を克服するために、従来の抗菌剤とは異なった新しい作用機構による微生物に対する新規抗微生物剤の開発が望まれている(例えば、非特許文献1参照)。
Conventionally, many antibacterial agents have been used as therapeutic agents for bacterial infections. Many of the antibacterial agents known so far act by inhibiting bacterial nucleic acid synthesis, protein synthesis, peptidoglycan synthesis and the like. Since these target sites are single and mainly intended to inhibit the metabolic synthesis pathway, resistant bacteria to these antibacterial agents are likely to appear, and in recent years, in particular, they have many resistances to multiple antibiotics. The emergence of drug-resistant bacteria is a problem.
For example, Staphylococcus aureus is known as a causative agent for purulent disease, pneumonia, food poisoning, etc., but the emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) that has acquired resistance to many drugs such as the antibiotic methicillin. However, it is a big clinical problem. Currently, vancomycin, teicoplanin, arbekacin, linezolid and the like are used as typical therapeutic agents for MRSA, but it is generally considered difficult to completely eliminate MRSA. Regarding vancomycin, the appearance of vancomycin-resistant Staphylococcus aureus (VRSA) has already been reported, and it is said that sufficient caution is required for its use.
In order to overcome the problem of such drug-resistant bacteria, it is desired to develop a novel antimicrobial agent against microorganisms by a new mechanism of action different from that of conventional antibacterial agents (for example, see Non-patent Document 1).
一方、細菌には、環境に応答してその変化を受容するレセプターとそれぞれの遺伝子発現を制御する情報伝達機構が知られており、その代表例が二成分制御系(two−component systems)である。二成分制御系とは、ヒスチジンキナーゼ活性を示すセンサータンパク質とDNA結合タンパク質であるレギュレーターより構成されている環境応答性の遺伝子発現制御系であり、細菌は様々な環境変化に対応すべく、種々のセンサーとレギュレーターを有している(例えば、非特許文献2参照)。
細菌の二成分制御系としては、グラム陽性菌のYycF(WalRともいう)およびYycG(WalKともいう)が関与する情報伝達系が存在し、これを阻害すると細菌が死滅することが知られており(例えば、非特許文献3〜6参照)、前記情報伝達系を阻害することによるグラム陽性細菌に抗菌力を示す抗菌剤が期待される。
また、ハクサイ、ジャガイモといった農作物に感染し、農業生産に甚大な被害をもたらす軟腐病菌の病原性は3種の二成分制御系PehS/PehR(例えば、非特許文献7参照)、PmrB/PmrA(例えば、非特許文献8参照)、ExpS/ExpA(例えば、非特許文献9参照)によって病原性が調節されていることが知られており、これら病原性を抑制することによる軟腐病菌の防除が期待される。
On the other hand, bacteria are known to have receptors that accept changes in response to the environment and information transmission mechanisms that control the expression of each gene. A typical example is a two-component system. . The two-component control system is an environmentally responsive gene expression control system composed of a sensor protein exhibiting histidine kinase activity and a regulator that is a DNA-binding protein. Bacteria are used in various ways to cope with various environmental changes. It has a sensor and a regulator (for example, refer nonpatent literature 2).
As a two-component control system of bacteria, there is an information transmission system involving YycF (also referred to as WalR) and YycG (also referred to as WalK) of Gram-positive bacteria, and it is known that if this is inhibited, the bacteria will die. (For example, refer nonpatent literatures 3-6) and the antibacterial agent which shows antibacterial power to the Gram positive bacterium by inhibiting the said information transmission system is anticipated.
In addition, pathogenicity of soft rot fungi that infects crops such as Chinese cabbage and potato and causes enormous damage to agricultural production is based on three binary control systems PehS / PehR (for example, see Non-Patent Document 7), PmrB / PmrA (for example It is known that pathogenicity is regulated by ExpS / ExpA (for example, see Non-patent document 9), and control of soft rot fungi by suppressing these pathogenicity is expected. The
上記知見があるものの、満足のいく抗菌剤、酵素活性阻害剤は未だ得られておらず、優れた抗菌剤などの開発が望まれているのが現状である。 Although there are the above findings, satisfactory antibacterial agents and enzyme activity inhibitors have not yet been obtained, and the development of excellent antibacterial agents and the like is desired at present.
本発明は、上記従来技術に鑑みて行われたものであり、以下の目的を達成することを課題とする。即ち、本発明は、細菌の二成分制御系を阻害することにより、薬剤耐性菌、植物病原細菌等の幅広い病原性細菌に対し、優れた抗菌活性、若しくは、前記細菌の有する酵素に対し、酵素阻害活性を有する化合物、及びそれらの製造方法、並びに、前記化合物の生産菌である微生物、及び前記化合物を利用した化合物含有組成物、抗菌剤、及び酵素活性阻害剤を提供することを目的とする。 The present invention has been made in view of the above-described prior art, and an object thereof is to achieve the following object. That is, the present invention provides an excellent antibacterial activity against a wide range of pathogenic bacteria such as drug-resistant bacteria and phytopathogenic bacteria by inhibiting the two-component control system of the bacteria, or an enzyme against the enzymes possessed by the bacteria. It is an object of the present invention to provide compounds having inhibitory activity, methods for producing the same, microorganisms that produce the compounds, compound-containing compositions using the compounds, antibacterial agents, and enzyme activity inhibitors. .
前記課題を解決するため、本発明者らは、細菌細胞の主要な情報伝達機構である二成分制御系に着目し、鋭意検討した結果、新規な微生物として、ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属する菌株を分離することに成功し、この菌株が、新規な構造骨格を有し、抗菌活性、若しくは、酵素阻害活性を有する化合物を産生していることを見出した。本発明者らは、前記化合物の化学構造を分析することで、これらが新規化合物であることを確認し、本発明の完成に至った。なお、本発明者らは、これらの新規化合物をウォークマイシン(Walkmycin)A、及びウォークマイシン(Walkmycin)Cと命名した。
更に、本発明者らは、前記菌株が産生する既知の化合物の中に、酵素阻害活性を有する化合物があることを見出し、本発明の完成に至った。なお、本発明者らは、この化合物をウォークマイシン(Walkmycin)Bと命名した。
In order to solve the above-mentioned problems, the present inventors have paid attention to a two-component control system which is a main information transmission mechanism of bacterial cells, and as a result of intensive studies, they belong to the genus Streptomyces as a novel microorganism. The inventors succeeded in isolating the strain and found that this strain produces a compound having a novel structural skeleton and having antibacterial activity or enzyme inhibitory activity. The inventors of the present invention have confirmed that these are novel compounds by analyzing the chemical structures of the compounds, and have completed the present invention. In addition, the present inventors named these novel compounds as Walkmycin A and Walkmycin C.
Furthermore, the present inventors have found that among known compounds produced by the strain, there are compounds having enzyme inhibitory activity, and the present invention has been completed. In addition, the present inventors named this compound Walkmycin B.
本発明は、本発明者らによる前記知見に基づくものであり、前記課題を解決するための手段としては、以下の通りである。即ち、
<1> 下記構造式(A)で表される化合物、下記構造式(C)で表される化合物、及び下記構造式(B)で表される化合物の少なくともいずれかを含むことを特徴とする酵素活性阻害剤である。
<3> 下記構造式(A)で表されることを特徴とする化合物である。
ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、下記構造式(A)で表される化合物、及び下記構造式(C)で表される化合物の少なくともいずれかを生産する能力を有する微生物を培養する培養工程と、
前記培養工程で得られた培養物から下記構造式(A)で表される化合物、及び下記構造式(C)で表される化合物の少なくともいずれかを採取する採取工程とを含み、
前記培養工程における培地に分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかを添加することを特徴とする化合物の製造方法である。
<8> 分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかが、イソロイシンである前記<5>から<7>のいずれかに記載の化合物の製造方法である。
<9> ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、下記構造式(A)で表される化合物、及び下記構造式(C)で表される化合物の少なくともいずれかを生産する能力を有することを特徴とする微生物である。
<11> 下記構造式(A)で表される化合物、及び下記構造式(C)で表される化合物の少なくともいずれかを含むことを特徴とする化合物含有組成物である。
<1> It includes at least one of a compound represented by the following structural formula (A), a compound represented by the following structural formula (C), and a compound represented by the following structural formula (B). It is an enzyme activity inhibitor.
<3> A compound represented by the following structural formula (A).
A culture process for culturing a microorganism belonging to the genus Streptomyces and having the ability to produce at least one of a compound represented by the following structural formula (A) and a compound represented by the following structural formula (C) When,
Collecting a compound represented by the following structural formula (A) and at least one of the compound represented by the following structural formula (C) from the culture obtained in the culturing step,
A method for producing a compound comprising adding at least one of a branched amino acid, a branched fatty acid, and a branched keto acid to the medium in the culturing step.
<8> The method for producing a compound according to any one of <5> to <7>, wherein at least one of the branched amino acid, the branched fatty acid, and the branched keto acid is isoleucine.
<9> It belongs to the genus Streptomyces and has the ability to produce at least one of a compound represented by the following structural formula (A) and a compound represented by the following structural formula (C). It is a microorganism.
<11> A compound-containing composition comprising at least one of a compound represented by the following structural formula (A) and a compound represented by the following structural formula (C).
本発明によれば、細菌の二成分制御系を阻害することにより、薬剤耐性菌、植物病原細菌等の幅広い病原性細菌に対し、優れた抗菌活性、若しくは、前記細菌の有する酵素に対し、酵素阻害活性を有する化合物、及びそれらの製造方法、並びに、前記化合物の生産菌である微生物、及び前記化合物を利用した化合物含有組成物、抗菌剤、及び酵素活性阻害剤を提供することができる。 According to the present invention, by inhibiting the two-component control system of bacteria, excellent antibacterial activity against a wide range of pathogenic bacteria such as drug-resistant bacteria and phytopathogenic bacteria, or against the enzymes possessed by the bacteria Compounds having inhibitory activity, methods for producing the same, microorganisms that produce the compounds, compound-containing compositions utilizing the compounds, antibacterial agents, and enzyme activity inhibitors can be provided.
(酵素活性阻害剤)
本発明の酵素活性阻害剤は、少なくとも下記構造式(A)で表される化合物、下記構造式(C)で表される化合物、及び下記構造式(B)で表される化合物の少なくともいずれかを含み、必要に応じて適宜その他の成分を含む。
前記酵素活性阻害剤は、ヒスチジンキナーゼ活性を好適に阻害することができる。
The enzyme activity inhibitor of the present invention is at least one of a compound represented by the following structural formula (A), a compound represented by the following structural formula (C), and a compound represented by the following structural formula (B). And other components as necessary.
The enzyme activity inhibitor can suitably inhibit histidine kinase activity.
<構造式(A)で表される化合物>
下記構造式(A)で表されることを特徴とする化合物は、本発明の化合物の1つである。下記構造式(A)で表される化合物は、本発明者らが分離した新規化合物である(以下、「ウォークマイシン(Walkmycin)A」と称することがある)。
A compound represented by the following structural formula (A) is one of the compounds of the present invention. The compound represented by the following structural formula (A) is a novel compound separated by the present inventors (hereinafter sometimes referred to as “Walkmycin A”).
−物理化学的性状−
前記構造式(A)で表される化合物の物理化学的性状としては、次の通りである。
(1) 外観は、黄色パウダー状である。
(2) 分子式は、C43H42Cl2O14で表される。
(3) 高分解能質量分析(HRESIMS:正イオンモード)による、実験値は、m/z 853.2041(M+H)+であり、計算値は、m/z 853.2041(C43H43Cl2O14として)である。
(4) 比旋光度は、[α]D 23=−120.5°(c 0.025, MeOH)である。
(5) 赤外線吸収スペクトルは、図1に示す通りである。
νmax(KBr)cm−1 : 3700〜3200、2972、2947、1684、1616、1590(sh)、1408、1379、1315、1217、1153
(6) 紫外線吸収スペクトルは、図2に示す通りである。
λmax nm(ε) :
0.005M HCl : 236(33,700)、277(35,400)、330(6,600)、412(13,600)
0.005M NaOH : 246(33,700)、267(sh)、340(7,100)、429(20,400)
(7) プロトン核磁気共鳴スペクトルとして、600MHzにおいて重クロロホルム:重メタノール=4:1の混合溶媒中で30℃にて測定したプロトンNMRスペクトルは、
図3、及び表1に示す通りである。
(8) 炭素13核磁気共鳴スペクトルとして、150MHzにおいて重メタノール中で30℃にて測定した炭素13NMRスペクトルは、図4、及び表1に示す通りである。
The physicochemical properties of the compound represented by the structural formula (A) are as follows.
(1) The appearance is yellow powder.
(2) The molecular formula is represented by C 43 H 42 Cl 2 O 14 .
(3) The experimental value by high resolution mass spectrometry (HRESIMS: positive ion mode) is m / z 853.2401 (M + H) + , and the calculated value is m / z 853.2041 (C 43 H 43 Cl 2 is as O 14).
(4) The specific rotation is [α] D 23 = −120.5 ° (c 0.025, MeOH).
(5) The infrared absorption spectrum is as shown in FIG.
ν max (KBr) cm −1 : 3700 to 3200, 2972, 2947, 1684, 1616, 1590 (sh), 1408, 1379, 1315, 1217, 1153
(6) The ultraviolet absorption spectrum is as shown in FIG.
λ max nm (ε):
0.005M HCl: 236 (33,700), 277 (35,400), 330 (6,600), 412 (13,600)
0.005M NaOH: 246 (33,700), 267 (sh), 340 (7,100), 429 (20,400)
(7) As a proton nuclear magnetic resonance spectrum, a proton NMR spectrum measured at 30 ° C. in a mixed solvent of deuterated chloroform: deuterated methanol = 4: 1 at 600 MHz is:
As shown in FIG. 3 and Table 1.
(8) As a carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, the carbon 13 NMR spectrum measured at 30 ° C. in heavy methanol at 150 MHz is as shown in FIG.
化合物が、前記構造式(A)で表される構造を有するか否かは、適宜選択した各種の分析方法により確認することができ、例えば、前記質量分析、前記赤外線吸収スペクトル、前記紫外線吸収スペクトル、前記プロトン核磁気共鳴スペクトル、前記炭素13核磁気共鳴スペクトル、等の分析を行うことにより、確認することができる。 Whether or not the compound has a structure represented by the structural formula (A) can be confirmed by various analysis methods selected as appropriate, for example, the mass spectrometry, the infrared absorption spectrum, the ultraviolet absorption spectrum. This can be confirmed by analyzing the proton nuclear magnetic resonance spectrum, the carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, and the like.
前記ウォークマイシンAは、ウォークマイシンAを生産する微生物から得られたものであってもよいし、化学合成により得られたものであってもよいが、後述する本発明の、化合物の製造方法により、得られることが好ましい。 The walkmycin A may be obtained from a microorganism that produces walkmycin A or may be obtained by chemical synthesis. However, according to the method for producing a compound of the present invention described later, It is preferable to be obtained.
前記ウォークマイシンAは、後述する試験例1〜3に示されるように、優れた抗菌活性、及び優れた酵素阻害活性を有する。そのため、前記ウォークマイシンAは、例えば、前記酵素活性阻害剤、後述する本発明の、化合物含有組成物、抗菌剤、などの有効成分として、好適に利用可能である。 The walkmycin A has excellent antibacterial activity and excellent enzyme inhibitory activity as shown in Test Examples 1 to 3 described later. Therefore, the walkmycin A can be suitably used as an active ingredient such as the enzyme activity inhibitor, the compound-containing composition of the present invention described later, and an antibacterial agent.
<構造式(C)で表される化合物>
下記構造式(C)で表されることを特徴とする化合物は、本発明の化合物の1つである。下記構造式(C)で表される化合物は、本発明者らが分離した新規化合物である(以下、「ウォークマイシン(Walkmycin)C」と称することがある)。
A compound represented by the following structural formula (C) is one of the compounds of the present invention. The compound represented by the following structural formula (C) is a novel compound isolated by the present inventors (hereinafter, sometimes referred to as “Walkmycin C”).
−物理化学的性状−
前記構造式(C)で表される化合物の物理化学的性状としては、次の通りである。
(1) 外観は、黄色パウダー状である。
(2) 分子式は、C45H46Cl2O14で表される。
(3) 高分解能質量分析(HRESIMS:正イオンモード)による、実験値は、m/z 881.2340(M+H)+であり、計算値は、m/z 881.2337(C45H47Cl2O14として)である。
(4) 比旋光度は、[α]D 23=−39.8°(c 0.025, MeOH)である。
(5) 赤外線吸収スペクトルは、図5に示す通りである。
νmax(KBr)cm−1 : 3700〜3200、2970、2939、1685、1616、1590(sh)、1408、1377、1315、1219、1161
(6) 紫外線吸収スペクトルは、図6に示す通りである。
λmax nm(ε) :
0.005M HCl : 237(27,700)、276(11,500)、328(5,500)、405(10,700)
0.005M NaOH : 245(27,500)、271(sh)、341(5,500)、424(15,000)
(7) プロトン核磁気共鳴スペクトルとして、600MHzにおいて重クロロホルム:重メタノール=4:1の混合溶媒中で30℃にて測定したプロトンNMRスペクトルは、
図7、及び表2に示す通りである。
(8) 炭素13核磁気共鳴スペクトルとして、150MHzにおいて重メタノール中で30℃にて測定した炭素13NMRスペクトルは、図8、及び表2に示す通りである。
The physicochemical properties of the compound represented by the structural formula (C) are as follows.
(1) The appearance is yellow powder.
(2) The molecular formula is represented by C 45 H 46 Cl 2 O 14 .
(3) The experimental value by high resolution mass spectrometry (HRESIMS: positive ion mode) is m / z 881.2340 (M + H) + , and the calculated value is m / z 881.2337 (C 45 H 47 Cl 2 O 14 ).
(4) Specific rotation is [α] D 23 = −39.8 ° (c 0.025, MeOH).
(5) The infrared absorption spectrum is as shown in FIG.
ν max (KBr) cm −1 : 3700 to 3200, 2970, 2939, 1685, 1616, 1590 (sh), 1408, 1377, 1315, 1219, 1161
(6) The ultraviolet absorption spectrum is as shown in FIG.
λ max nm (ε):
0.005M HCl: 237 (27,700), 276 (11,500), 328 (5,500), 405 (10,700)
0.005M NaOH: 245 (27,500), 271 (sh), 341 (5,500), 424 (15,000)
(7) As a proton nuclear magnetic resonance spectrum, a proton NMR spectrum measured at 30 ° C. in a mixed solvent of deuterated chloroform: deuterated methanol = 4: 1 at 600 MHz is:
As shown in FIG. 7 and Table 2.
(8) As a carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, a carbon 13 NMR spectrum measured at 30 ° C. in deuterated methanol at 150 MHz is as shown in FIG.
化合物が、前記構造式(C)で表される構造を有するか否かは、適宜選択した各種の分析方法により確認することができ、例えば、前記質量分析、前記赤外線吸収スペクトル、前記紫外線吸収スペクトル、前記プロトン核磁気共鳴スペクトル、前記炭素13核磁気共鳴スペクトル、等の分析を行うことにより、確認することができる。 Whether or not the compound has a structure represented by the structural formula (C) can be confirmed by various analysis methods selected as appropriate, for example, the mass spectrometry, the infrared absorption spectrum, the ultraviolet absorption spectrum. This can be confirmed by analyzing the proton nuclear magnetic resonance spectrum, the carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, and the like.
前記ウォークマイシンCは、ウォークマイシンCを生産する微生物から得られたものであってもよいし、化学合成により得られたものであってもよいが、後述する本発明の、化合物の製造方法により、得られることが好ましい。 The walkmycin C may be obtained from a microorganism that produces walkmycin C or may be obtained by chemical synthesis. However, according to the method for producing a compound of the present invention described later, It is preferable to be obtained.
前記ウォークマイシンCは、後述する試験例1〜3に示されるように、優れた抗菌活性、及び優れた酵素阻害活性を有する。そのため、前記ウォークマイシンCは、例えば、前記酵素活性阻害剤、後述する本発明の、化合物含有組成物、抗菌剤、などの有効成分として、好適に利用可能である。 The walkmycin C has excellent antibacterial activity and excellent enzyme inhibitory activity, as shown in Test Examples 1 to 3 described later. Therefore, the walkmycin C can be suitably used as an active ingredient such as, for example, the enzyme activity inhibitor, the compound-containing composition of the present invention described later, and an antibacterial agent.
<構造式(B)で表される化合物>
前記構造式(B)で表される化合物(以下、「ウォークマイシン(Walkmycin)B」と称することがある)の物理化学的性状としては、以下の通りである。
The physicochemical properties of the compound represented by the structural formula (B) (hereinafter sometimes referred to as “Walkmycin B”) are as follows.
−物理化学的性状−
前記構造式(B)で表される化合物の物理化学的性状としては、次の通りである。
(1) 外観は、黄色パウダー状である。
(2) 分子式は、C44H44Cl2O14で表される。
(3) 高分解能質量分析(HRESIMS:正イオンモード)による、実験値は、m/z 867.2180(M+H)+であり、計算値は、m/z 867.2181(C44H45Cl2O14として)である。
(4) 比旋光度は、[α]D 23=−121.7°(c 0.025, MeOH)である。
(5) 赤外線吸収スペクトルは、図9に示す通りである。
νmax(KBr)cm−1 : 3700〜3200、2974、2943、1691、1614、1587(sh)、1400、1375、1313、1220、1196、1167
(6) 紫外線吸収スペクトルは、図10に示す通りである。
λmax nm(ε) :
0.005M HCl : 235(56,200)、279(57,600)、331(9,700)、425(22,000)
0.005M NaOH : 245(46,300)、268(44,600)、341(9,200)、434(29,300)
(7) プロトン核磁気共鳴スペクトルとして、600MHzにおいて重クロロホルム:重メタノール=4:1の混合溶媒中で30℃にて測定したプロトンNMRスペクトルは、
図11、及び表3に示す通りである。
(8) 炭素13核磁気共鳴スペクトルとして、150MHzにおいて重メタノール中で30℃にて測定した炭素13NMRスペクトルは、図12、及び表3に示す通りである。
The physicochemical properties of the compound represented by the structural formula (B) are as follows.
(1) The appearance is yellow powder.
(2) The molecular formula is represented by C 44 H 44 Cl 2 O 14 .
(3) The experimental value by high resolution mass spectrometry (HRESIMS: positive ion mode) is m / z 867.2180 (M + H) + and the calculated value is m / z 867.2181 (C 44 H 45 Cl 2 is as O 14).
(4) Specific rotation is [α] D 23 = −121.7 ° (c 0.025, MeOH).
(5) The infrared absorption spectrum is as shown in FIG.
ν max (KBr) cm −1 : 3700 to 3200, 2974, 2943, 1691, 1614, 1587 (sh), 1400, 1375, 1313, 1220, 1196, 1167
(6) The ultraviolet absorption spectrum is as shown in FIG.
λ max nm (ε):
0.005M HCl: 235 (56,200), 279 (57,600), 331 (9,700), 425 (22,000)
0.005M NaOH: 245 (46,300), 268 (44,600), 341 (9,200), 434 (29,300)
(7) As a proton nuclear magnetic resonance spectrum, a proton NMR spectrum measured at 30 ° C. in a mixed solvent of deuterated chloroform: deuterated methanol = 4: 1 at 600 MHz is:
As shown in FIG. 11 and Table 3.
(8) As a carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, the carbon 13 NMR spectrum measured at 30 ° C. in deuterated methanol at 150 MHz is as shown in FIG.
化合物が、前記構造式(B)で表される構造を有するか否かは、適宜選択した各種の分析方法により確認することができ、例えば、前記質量分析、前記赤外線吸収スペクトル、前記紫外線吸収スペクトル、前記プロトン核磁気共鳴スペクトル、前記炭素13核磁気共鳴スペクトル、等の分析を行うことにより、確認することができる。 Whether or not the compound has a structure represented by the structural formula (B) can be confirmed by various analysis methods selected as appropriate, for example, the mass spectrometry, the infrared absorption spectrum, the ultraviolet absorption spectrum. This can be confirmed by analyzing the proton nuclear magnetic resonance spectrum, the carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, and the like.
−ウォークマイシンBの製造−
前記ウォークマイシンBの製造方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、ウォークマイシンBを生産する微生物から製造する方法、化学合成により製造する方法、などが挙げられる。
-Production of Walkmycin B-
There is no restriction | limiting in particular as a manufacturing method of the said walkmycin B, According to the objective, it can select suitably, For example, the method of manufacturing from the microorganisms which produce walkmycin B, the method of manufacturing by chemical synthesis, etc. are mentioned. It is done.
前記ウォークマイシンBを微生物から製造する方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、培養工程と、採取工程とを少なくとも含み、必要に応じて更にその他の工程を含む方法が挙げられる。 There is no restriction | limiting in particular as a method to manufacture the said walk mycin B from microorganisms, According to the objective, it can select suitably, For example, it includes a culture | cultivation process and a collection process at least, and other processes as needed. The method containing is mentioned.
−−培養工程−−
前記培養工程は、ウォークマイシンBを生産する能力を有する微生物を培養する工程である。
--Culture process--
The culturing step is a step of culturing a microorganism having an ability to produce walkmycin B.
前記微生物としては、ウォークマイシンBを生産する能力を有する限り、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、後述するストレプトマイセス・エスピー(Streptomyces sp.)MK632−100F11株(NITE P−777)が挙げられる。また、ウォークマイシンBを生産できるその他の菌株についても、常法によって、自然界より分離することが可能である。なお、前記ストレプトマイセス・エスピー(Streptomyces sp.)MK632−100F11株を含め、ウォークマイシンBを生産する生産菌を、放射線照射やその他の変異処理に供することにより、ウォークマイシンBの生産能を高めることも可能である。さらに、遺伝子工学的手法によるウォークマイシンBの生産も可能である。 The microorganism is not particularly limited as long as it has the ability to produce walkmycin B, and can be appropriately selected according to the purpose. For example, Streptomyces sp. MK632-100F11 strain described later (NITE P-777). Further, other strains capable of producing walkmycin B can be isolated from nature by a conventional method. In addition, the production ability of Walkmycin B is enhanced by subjecting the production bacteria producing Walkmycin B, including the Streptomyces sp. Strain MK632-100F11, to irradiation and other mutation treatments. It is also possible. Furthermore, walkmycin B can be produced by genetic engineering techniques.
前記培養は、ウォークマイシンBを生産する生産菌を栄養培地(以下、単に「培地」と称することがある)中に接種し、ウォークマイシンBの生産に良好な温度で培養することによって行われる。
前記栄養培地としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、従来放線菌の培養に利用されている公知のものを使用することができる。
前記栄養培地に添加する栄養源としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、窒素源として、市販されている大豆粉、ペプトン、酵母エキス、肉エキス、コーン・スティープ・リカー、硫酸アンモニウムなどが使用でき、炭素源として、トマトペースト、グリセリン、でん粉、グルコース、ガラクトース、デキストリンなどの炭水化物、脂肪などが使用できる。さらに、食塩、炭酸カルシウムなどの無機塩を培地に添加して使用することもでき、その他、必要に応じて微量の金属塩を培地に添加して使用することもできる。
これらの材料は、ウォークマイシンBを生産する生産菌が利用し、ウォークマイシンBの生産に役立つものであればよく、公知の培養材料はすべて用いることができる。
The culturing is performed by inoculating a production bacterium that produces walkmycin B in a nutrient medium (hereinafter sometimes simply referred to as “medium”) and culturing at a temperature suitable for the production of walkmycin B.
There is no restriction | limiting in particular as said nutrient medium, According to the objective, it can select suitably, For example, the well-known thing utilized conventionally for culture | cultivation of actinomycetes can be used.
The nutrient source added to the nutrient medium is not particularly limited and can be appropriately selected according to the purpose. For example, as a nitrogen source, commercially available soybean flour, peptone, yeast extract, meat extract, corn Steep liquor, ammonium sulfate, and the like can be used, and as a carbon source, carbohydrates such as tomato paste, glycerin, starch, glucose, galactose, and dextrin, fats, and the like can be used. Furthermore, inorganic salts such as salt and calcium carbonate can be added to the medium for use, and in addition, a trace amount of metal salt can be added to the medium for use.
Any of these materials may be used as long as it is useful for the production of walkomycin B and can be used by production bacteria producing walkmycin B, and all known culture materials can be used.
前記培地には、アミノ酸を添加してもよいし、添加しなくてもよいが、アミノ酸を添加しないほうが、ウォークマイシンBの生産量が多い点で、有利である。 An amino acid may or may not be added to the medium, but it is advantageous that no amino acid is added because the amount of walkmycin B produced is large.
ウォークマイシンBの生産のための種母培地としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、寒天培地上、ウォークマイシンBを生産する生産菌の斜面培養から得た生育物を使用することができる。 There is no restriction | limiting in particular as a seed | species culture medium for the production of walkmycin B, According to the objective, it can select suitably, For example, it obtained from the slope culture of the production microbe which produces walkmycin B on an agar medium. Grows can be used.
前記培養の方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、好気的条件の培養方法が好ましい。
前記培養の温度としては、ウォークマイシンBを生産する生産菌の発育が実質的に阻害されずに、ウォークマイシンBを生産しうる範囲であれば、特に制限はなく、使用する生産菌に応じて適宜選択することができるが、25℃〜35℃が好ましい。
前記培養の期間としては、特に制限はなく、ウォークマイシンBの蓄積に合わせて適宜選択することができる。通常、培養3日間〜10日間でウォークマイシンBの蓄積が最高となる。
The culture method is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the intended purpose. A culture method under aerobic conditions is preferred.
The culture temperature is not particularly limited as long as it does not substantially inhibit the growth of production bacteria producing walkmycin B and can produce walkmycin B, depending on the production bacteria used. Although it can select suitably, 25 to 35 degreeC is preferable.
There is no restriction | limiting in particular as the period of the said culture | cultivation, According to accumulation | storage of walkmycin B, it can select suitably. Usually, the accumulation of walkmycin B is highest in 3 to 10 days of culture.
前記ウォークマイシンBは、後述する試験例3に示されるように、優れた酵素阻害活性を有する。 The walkmycin B has excellent enzyme inhibitory activity as shown in Test Example 3 described later.
前記酵素活性阻害剤中のウォークマイシンA、ウォークマイシンC、及びウォークマイシンBの少なくともいずれかの含有量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記酵素活性阻害剤は、ウォークマイシンA、ウォークマイシンC、及びウォークマイシンBの少なくともいずれかそのものであってもよい。 The content of at least one of walkmycin A, walkmycin C, and walkmycin B in the enzyme activity inhibitor is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the purpose. The enzyme activity inhibitor may be at least one of walkmycin A, walkmycin C, and walkmycin B.
前記その他の成分としては、特に制限はなく、例えば、薬理学的に許容され得る担体の中から目的に応じて適宜選択することができ、例えば、エタノール、水、デンプンなどが挙げられる。前記酵素活性阻害剤中の、前記その他の成分の含有量としては、特に制限はなく、ウォークマイシンA、ウォークマイシンC、及びウォークマイシンBの効果を損なわない範囲内で、目的に応じて適宜選択することができる。
なお、前記酵素活性阻害剤は、単独で使用してもよいし、他の成分を有効成分とする医薬と併せて使用してもよい。また、前記酵素活性阻害剤は、他の成分を有効成分とする医薬中に、配合された状態で使用してもよい。
There is no restriction | limiting in particular as said other component, For example, it can select suitably from the pharmacologically acceptable support | carrier according to the objective, For example, ethanol, water, starch, etc. are mentioned. There is no restriction | limiting in particular as content of the said other component in the said enzyme activity inhibitor, In the range which does not impair the effect of Walkmycin A, Walkmycin C, and Walkmycin B, it selects suitably according to the objective. can do.
In addition, the said enzyme activity inhibitor may be used independently and may be used in combination with the pharmaceutical which uses another component as an active ingredient. Moreover, you may use the said enzyme activity inhibitor in the state mix | blended in the pharmaceutical which uses another component as an active ingredient.
前記酵素活性阻害剤は、ウォークマイシンA、ウォークマイシンC、及びウォークマイシンBの少なくともいずれかを含むことから、後述する試験例3に示されるように薬剤耐性菌、植物病原性細菌、などを含む幅広いグラム陽性細菌、及びグラム陰性細菌が有する酵素に対して優れた酵素阻害活性を有するものである。
したがって、前記酵素活性阻害剤は、薬剤耐性菌などを含む幅広いグラム陽性細菌、及びグラム陰性細菌の病原性を抑制することができ、前記細菌に起因する感染症の予防、又は治療に好適に利用可能である。また、農園芸用殺菌剤の有効成分としても好適に利用可能である。
Since the enzyme activity inhibitor includes at least one of walkmycin A, walkmycin C, and walkmycin B, it includes drug-resistant bacteria, phytopathogenic bacteria, and the like as shown in Test Example 3 described later. It has excellent enzyme inhibitory activity against enzymes possessed by a wide range of Gram-positive bacteria and Gram-negative bacteria.
Therefore, the enzyme activity inhibitor can suppress the pathogenicity of a wide range of gram-positive bacteria and gram-negative bacteria including drug-resistant bacteria, and is suitably used for the prevention or treatment of infectious diseases caused by the bacteria. Is possible. Moreover, it can utilize suitably also as an active ingredient of the agricultural and horticultural fungicide.
<剤型、投与>
−剤型−
前記酵素活性阻害剤の剤型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、粉末状、カプセル状、錠剤状、液状等の剤型とすることができる。これらの剤型の前記酵素活性阻害剤は、常法に従い製造することができる。
<Dosage form, administration>
-Dosage form-
There is no restriction | limiting in particular as a dosage form of the said enzyme activity inhibitor, According to the objective, it can select suitably, For example, it can be set as dosage forms, such as a powder form, a capsule form, a tablet form, and a liquid form. These enzyme activity inhibitors of these dosage forms can be produced according to conventional methods.
また、前記農園芸用殺菌剤として用いる場合の剤型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、通常、固体担体、液体担体、界面活性剤、その他の製剤の補助剤との混合として慣用の処方により乳剤、水和剤、液剤、フロアブル(ゾル)剤、粉剤、粒剤、微粒剤、錠剤などの適宜の形態として調整できる。
また、乳剤、水和剤、液剤、フロアブル(ゾル)剤、粉剤、粒剤、微粒剤、錠剤などの目的で各種の界面活性剤(または、乳化剤)が使用される。このような界面活性剤としては、非イオン型(ポリアルキルエーテル、ポリオキシエチレンアルキルエステル、ポリオキシエチレンソルビタンアルキルエステルなど)、陰イオン型(アルキルオコシエチレンアルキルサルフェート、アリールスルホネートなど)、陽イオン型(アルキルアミン類、ポリオキシアルキルアミン類など)、両性型(硫酸エステル塩など)が挙げられるが、もちろんこれらの例示のみに限定されるものではない。また、これらの他にポリビニルアルコール、カルボキシメチルセルロース、アラビアゴム、ポリビニルアセテート、アルギン酸ソーダ、ゼラチン、トラガカントガムなどの各種補助剤を使用することができる。
The dosage form for use as the agricultural and horticultural fungicide is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the intended purpose. Usually, it is a solid carrier, liquid carrier, surfactant, and other formulation aids. As an admixture with an agent, it can be prepared in an appropriate form such as an emulsion, a wettable powder, a liquid, a flowable (sol) agent, a powder, a granule, a fine granule, and a tablet.
Various surfactants (or emulsifiers) are used for the purpose of emulsions, wettable powders, liquids, flowable (sol) agents, powders, granules, fine granules, tablets and the like. Such surfactants include nonionic types (polyalkyl ethers, polyoxyethylene alkyl esters, polyoxyethylene sorbitan alkyl esters, etc.), anionic types (alkyl alkoxyethylene alkyl sulfates, aryl sulfonates, etc.), and cationic types. (Alkylamines, polyoxyalkylamines, etc.) and amphoteric types (sulfuric acid ester salts, etc.) are mentioned, but of course not limited to these examples. In addition to these, various adjuvants such as polyvinyl alcohol, carboxymethyl cellulose, gum arabic, polyvinyl acetate, sodium alginate, gelatin, and tragacanth gum can be used.
−投与−
前記酵素活性阻害剤の投与方法としては、特に制限はなく、例えば、前記酵素活性阻害剤の剤型などに応じて適宜選択することができ、経口又は非経口で投与することができる。
前記酵素活性阻害剤の投与量としては、特に制限はなく、投与対象個体の年齢、体重、体質、症状、他の成分を有効成分とする医薬の投与の有無など、様々な要因を考慮して適宜選択することができる。
前記酵素活性阻害剤の投与時期としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
前記酵素活性阻害剤の投与対象となる動物種としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、ヒト、サル、ブタ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ、マウス、ラット、トリなどが挙げられる。
また、前記農園芸用殺菌剤として用いる場合の投与方法、投与量、投与時期、及び投与対象としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
-Administration-
There is no restriction | limiting in particular as the administration method of the said enzyme activity inhibitor, For example, it can select suitably according to the dosage form of the said enzyme activity inhibitor, etc., It can administer orally or parenterally.
The dosage of the enzyme activity inhibitor is not particularly limited, taking into consideration various factors such as the age, weight, constitution, symptom of the administration subject individual, and the presence or absence of administration of a drug containing other ingredients as active ingredients. It can be selected appropriately.
There is no restriction | limiting in particular as an administration time of the said enzyme activity inhibitor, According to the objective, it can select suitably.
The animal species to be administered with the enzyme activity inhibitor is not particularly limited and can be appropriately selected according to the purpose. For example, human, monkey, pig, cow, sheep, goat, dog, cat, mouse , Rats, birds and the like.
Moreover, there is no restriction | limiting in particular as an administration method in the case of using as said agricultural and horticultural fungicide, dosage amount, administration time, and administration object, According to the objective, it can select suitably.
(化合物の製造方法)
本発明の化合物、即ちウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの製造方法は、培養工程と、採取工程とを少なくとも含み、必要に応じて更にその他の工程を含む。
(Method for producing compound)
The production method of the compound of the present invention, that is, walkmycin A and walkmycin C includes at least a culture step and a collection step, and further includes other steps as necessary.
<培養工程>
前記培養工程は、ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する能力を有する微生物を培養する工程である。
前記培養工程では、培地に分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかを添加する。なお、前記分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかは、それらの前駆体であってもよい。
<Culture process>
The culturing step is a step of culturing a microorganism belonging to the genus Streptomyces and capable of producing at least one of walkmycin A and walkmycin C.
In the culturing step, at least one of a branched amino acid, a branched fatty acid, and a branched keto acid is added to the medium. Note that at least one of the branched amino acid, the branched fatty acid, and the branched keto acid may be a precursor thereof.
前記微生物としては、ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する能力を有する限り、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、本発明者らの分離したストレプトマイセス・エスピー(Streptomyces sp.)MK632−100F11株(NITE P−777、詳細は後述する本発明の微生物の項目に記す)が挙げられる。また、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産できるその他の菌株についても、常法によって、自然界より分離することが可能である。なお、前記ストレプトマイセス・エスピー(Streptomyces sp.)MK632−100F11株を含め、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する生産菌を、放射線照射やその他の変異処理に供することにより、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産能を高めることも可能である。さらに、遺伝子工学的手法によるウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産も可能である。 The microorganism is not particularly limited as long as it belongs to the genus Streptomyces and has the ability to produce at least one of walkmycin A and walkmycin C, and can be appropriately selected according to the purpose. For example, the Streptomyces sp. MK632-100F11 strain (NITE P-777, the details of which are described in the item of the microorganism of the present invention described later) isolated by the present inventors can be mentioned. In addition, other strains capable of producing at least one of walkmycin A and walkmycin C can be isolated from the natural world by conventional methods. By subjecting the producing bacteria producing at least one of walkmycin A and walkmycin C, including the Streptomyces sp. Strain MK632-100F11, to irradiation and other mutation treatments , Walkmycin A, and / or walkmycin C can also be produced. Furthermore, at least one of walkmycin A and walkmycin C can be produced by genetic engineering techniques.
前記培養は、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する生産菌(以下、単に「ウォークマイシン類生産菌」と称することがある)を栄養培地(以下、単に「培地」と称することがある)中に接種し、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産に良好な温度で培養することによって行われる。
前記栄養培地としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、従来放線菌の培養に利用されている公知のものを使用することができる。
前記栄養培地に添加する栄養源としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、窒素源として、市販されている大豆粉、ペプトン、酵母エキス、肉エキス、コーン・スティープ・リカー、硫酸アンモニウムなどが使用でき、炭素源として、トマトペースト、グリセリン、でん粉、グルコース、ガラクトース、デキストリンなどの炭水化物、脂肪などが使用できる。さらに、食塩、炭酸カルシウムなどの無機塩を培地に添加して使用することもでき、その他、必要に応じて微量の金属塩を培地に添加して使用することもできる。
これらの材料は、ウォークマイシン類生産菌が利用し、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産に役立つものであればよく、公知の培養材料はすべて用いることができる。
In the culture, a production bacterium that produces at least one of walkmycin A and walkmycin C (hereinafter sometimes simply referred to as “walkmycin-producing bacterium”) is referred to as a nutrient medium (hereinafter simply referred to as “medium”). Inoculation) and culturing at a good temperature for the production of walkmycin A and / or walkmycin C.
There is no restriction | limiting in particular as said nutrient medium, According to the objective, it can select suitably, For example, the well-known thing utilized conventionally for culture | cultivation of actinomycetes can be used.
The nutrient source added to the nutrient medium is not particularly limited and can be appropriately selected according to the purpose. For example, as a nitrogen source, commercially available soybean flour, peptone, yeast extract, meat extract, corn Steep liquor, ammonium sulfate, and the like can be used, and as a carbon source, carbohydrates such as tomato paste, glycerin, starch, glucose, galactose, and dextrin, fats, and the like can be used. Furthermore, inorganic salts such as salt and calcium carbonate can be added to the medium for use, and in addition, a trace amount of metal salt can be added to the medium for use.
Any of these materials may be used as long as they are utilized by a walkmycin-producing bacterium and are useful for the production of at least one of walkmycin A and walkmycin C, and all known culture materials can be used.
前記培地には、分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかを添加する。前記分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかを添加することにより、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産量を増やすことができる。
前記分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかとしては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。前記分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかは、1種単独で使用してもよいし、2種以上を併用してもよい。
前記分岐アミノ酸の具体例としては、バリン、ロイシン、イソロイシンが挙げられる。
前記分岐脂肪酸の具体例としては、3−methyl butanoic acid、4−methyl pentanoic acid、3−methyl pentanoic acidが挙げられる。
前記分岐ケト酸の具体例としては、3−methyl−2−oxobutanoic acid、4−methyl−2−oxopentanoic acid、3−methyl−2−oxopentanoic acidが挙げられる。
これらの中でも、バリン、ロイシン、イソロイシンが好ましく、イソロイシンがより好ましい。前記イソロイシンであると、前記ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産量が多い点で、有利である。
At least one of a branched amino acid, a branched fatty acid, and a branched keto acid is added to the medium. By adding at least one of the branched amino acid, branched fatty acid, and branched keto acid, the production amount of at least one of walkmycin A and walkmycin C can be increased.
There is no restriction | limiting in particular as at least any one of the said branched amino acid, branched fatty acid, and branched keto acid, According to the objective, it can select suitably. At least one of the branched amino acids, branched fatty acids, and branched keto acids may be used alone or in combination of two or more.
Specific examples of the branched amino acid include valine, leucine and isoleucine.
Specific examples of the branched fatty acid include 3-methyl butanoic acid, 4-methyl pentanoic acid, and 3-methyl pentanoic acid.
Specific examples of the branched keto acid include 3-methyl-2-oxobutanoic acid, 4-methyl-2-oxopentanoic acid, and 3-methyl-2-oxopentanoic acid.
Among these, valine, leucine and isoleucine are preferable, and isoleucine is more preferable. The isoleucine is advantageous in that it produces a large amount of at least one of the walkmycin A and the walkmycin C.
前記分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかの添加量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、培地全体に対して、0.1質量%〜20質量%が好ましく、0.25質量%〜5質量%がより好ましく、0.5質量%〜1質量%が特に好ましい。
なお、前記分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかは、少なくとも前記ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産させるための培地(以下、「生産培地」と称することがある。)に添加されていればよい。
The addition amount of at least one of the branched amino acid, branched fatty acid, and branched keto acid is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the intended purpose. 20 mass% is preferable, 0.25 mass%-5 mass% is more preferable, 0.5 mass%-1 mass% is especially preferable.
Note that at least one of the branched amino acid, branched fatty acid, and branched keto acid is at least a medium for producing at least one of the walkmycin A and the walkmycin C (hereinafter referred to as “production medium”). As long as it is added.
ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産のための種母培地としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、寒天培地上、ウォークマイシン類生産菌の斜面培養から得た生育物を使用することができる。 There is no restriction | limiting in particular as a seed | species culture medium for the production of at least any one of walkmycin A and walkmycin C, According to the objective, it can select suitably, For example, a walkmycin production bacteria on an agar medium The growth obtained from the slant culture can be used.
前記培養の方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、好気的条件の培養方法が好ましい。
前記培養の温度としては、ウォークマイシン類生産菌の発育が実質的に阻害されずに、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産しうる範囲であれば、特に制限はなく、使用する生産菌に応じて適宜選択することができるが、25℃〜35℃が好ましい。
前記培養の期間としては、特に制限はなく、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの蓄積に合わせて適宜選択することができる。通常、培養3日間〜10日間でウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの蓄積が最高となる。
The culture method is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the intended purpose. A culture method under aerobic conditions is preferred.
The culture temperature is not particularly limited as long as it does not substantially inhibit the growth of walkmycin-producing bacteria and can produce at least one of walkmycin A and walkmycin C. Although it can select suitably according to the production microbe to perform, 25 to 35 degreeC is preferable.
There is no restriction | limiting in particular as the period of the said culture | cultivation, It can select suitably according to accumulation | storage of at least any one of walkmycin A and walkmycin C. Usually, accumulation of at least one of walkmycin A and walkmycin C is highest in 3 days to 10 days of culture.
<採取工程>
前記採取工程は、前記培養工程で得られた培養物からウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを採取する工程である。
前記ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCは、上述した物理化学的性状を有するので、その性状に従って培養物から採取することができる。
<Collection process>
The collecting step is a step of collecting at least one of walkmycin A and walkmycin C from the culture obtained in the culturing step.
Walkmycin A and walkmycin C have the physicochemical properties described above, and can be collected from the culture according to their properties.
前記採取の方法としては、特に制限はなく、微生物の生産する代謝物を採取するのに用いられる方法を適宜選択することができる。例えば、水と混ざらない溶媒により抽出する方法、各種吸着剤に対する吸着親和性の差を利用する方法、ゲルろ過、向流分配を利用したクロマトグラフィーなどを単独、又は組み合わせる方法、などが挙げられる。
また、分離した菌体からは、適当な有機溶媒を用いた抽出方法や、菌体破砕による溶出方法などにより、前記ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCを菌体から抽出し、上記と同様に単離精製して採取することができる。
The collection method is not particularly limited, and a method used for collecting a metabolite produced by a microorganism can be appropriately selected. For example, a method of extracting with a solvent that is not mixed with water, a method of using a difference in adsorption affinity for various adsorbents, a method of gel filtration, chromatography using countercurrent distribution, etc., alone or in combination can be mentioned.
From the separated cells, the walkmycin A and walkmycin C are extracted from the cells by an extraction method using an appropriate organic solvent or an elution method by disrupting the cells. It can be collected after separation and purification.
以上のようにして前記製造方法を行うことができ、これにより、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCを得ることができる。 The production method can be carried out as described above, whereby walkmycin A and walkmycin C can be obtained.
(微生物)
本発明の微生物は、ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、上述した本発明の化合物、即ちウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する能力を有することを特徴とする。前記微生物は、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する能力を有し、そのために、上述した本発明の化合物の製造方法において、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの生産菌として使用され得る微生物であれば、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
(Microorganism)
The microorganism of the present invention belongs to the genus Streptomyces , and is characterized by having the ability to produce at least one of the above-described compounds of the present invention, namely, walkmycin A and walkmycin C. The microorganism has the ability to produce at least one of walkmycin A and walkmycin C. Therefore, in the above-described method for producing a compound of the present invention, at least one of walkmycin A and walkmycin C is used. As long as it is a microorganism that can be used as a producing bacterium, there is no particular limitation, and it can be appropriately selected according to the purpose.
このような微生物の中でも、特に、財団法人 微生物化学研究会 微生物化学研究センターにおいて、山梨県北杜市の土壌より分離された放線菌で、MK632−100F11株の菌株番号が付された微生物を使用することが好ましい。前記MK632−100F11株の菌学的性状は、以下の通りである。 Among such microorganisms, in particular, in the Microbial Chemistry Research Center of the Foundation for Microbial Chemistry, a microorganism with the strain number MK632-2F11 is used, which is an actinomycete isolated from the soil of Hokuto City, Yamanashi Prefecture. It is preferable. The mycological properties of the MK632-100F11 strain are as follows.
1.形態
MK632−100F11株は、分枝した基生菌糸より、比較的長い直状の気菌糸を伸長する。成熟した胞子鎖は、10個〜50個の長円形の胞子を連鎖する。胞子の大きさは、約0.5μm〜0.6μm×1.2μm〜1.7μmで、胞子の表面は平滑である。輪生枝、菌糸束、胞子のう、及び運動性胞子は認められない。
1. Form The strain MK632-100F11 extends a relatively long straight aerial hyphae from the branched basic hyphae. A mature spore chain links 10 to 50 oval spores. The size of the spore is about 0.5 μm to 0.6 μm × 1.2 μm to 1.7 μm, and the surface of the spore is smooth. No roticular branches, mycelial bundles, spore capsules, or motile spores are observed.
2.各種培地における生育状態
色の記載について[ ]内に示す標準は、コンティナー・コーポレーション・オブ・アメリカのカラー・ハーモニー・マニュアル(Container Corporation of Americaのcolor harmony manual)を用いた。
(1)イースト・麦芽寒天培地(ISP−培地2、30℃培養)
黄[2 lc, Gold]の発育上に、茶白[3 cb, Sand]の気菌糸を着生し、黄の可溶性色素を産生する。
(2)オートミール寒天培地(ISP−培地3、30℃培養)
うす黄[1 1/2 gc, Dusty Yellow]の発育上に、明るい茶灰[3 dc, Natural]の気菌糸を着生する。可溶性色素は、黄を帯びる。
(3)スターチ・無機塩寒天培地(ISP−培地4、30℃培養)
黄[1 1/2 lc, Gold]の発育上に、茶白[5 cb]の気菌糸を着生する。可溶性色素は、黄を帯びる。
(4)グリセリン・アスパラギン寒天培地(ISP−培地5、30℃培養)
にぶ黄[2 le, Mustard]の発育上に、茶白[5 cb]の気菌糸を着生する。黄の可溶性色素を産生する。発育の色及び可溶性色素は、0.05モル塩酸の添加及び0.05モル水酸化ナトリウムの添加による変化は認められない。
(5)シュクロース・硝酸塩寒天培地(30℃培養)
うす黄[2 ca, Lt Ivory]の発育上に、茶白[3 cb, Sand]の気菌糸を着生する。可溶性色素は、かすかに黄を帯びる。
2. Regarding the description of the color of growth in various media The standard shown in [] was the color harmony manual of Container Corporation of America (color harmony manual of Container Corporation of America).
(1) Yeast / malt agar medium (ISP-medium 2, 30 ° C. culture)
On the growth of yellow [2 lc, Gold], aerial hyphae of brown [3 cb, Sand] are grown to produce a soluble pigment of yellow.
(2) Oatmeal agar medium (ISP-medium 3, 30 ° C. culture)
On the growth of light yellow [1 1/2 gc, Dusty Yellow], aerial mycelium of bright tea ash [3 dc, Natural] is grown. Soluble pigments are yellowish.
(3) Starch / inorganic salt agar medium (ISP-medium 4, 30 ° C. culture)
On the growth of yellow [1 1/2 lc, Gold], aerial mycelium of brown [5 cb] is grown. Soluble pigments are yellowish.
(4) Glycerin / asparagine agar medium (ISP-medium 5, 30 ° C. culture)
On the development of nib yellow [2 le, Mustard], aerial mycelium of brown [5 cb] is grown. Produces a soluble pigment of yellow. The growth color and soluble pigment are not affected by the addition of 0.05 molar hydrochloric acid and 0.05 molar sodium hydroxide.
(5) Sucrose / Nitrate agar medium (30 ° C culture)
On the development of light yellow [2 ca, Lt Ivory], aerial mycelia of white [3 cb, Sand] are grown. Soluble pigments are slightly yellowish.
3.生理的性質
(1)生育温度範囲
グルコース・アスパラギン寒天培地(グルコース 1.0%、L−アスパラギン 0.05%、リン酸水素二カリウム 0.05%、ひも寒天 3.0%、pH7.0)を用い、7℃、16℃、24℃、27℃、30℃、37℃、及び45℃の各温度で試験した結果、7℃、及び45℃での生育は認められず、16℃〜37℃の範囲で生育した。生育至適温度は、27℃〜30℃である。
(2)スターチの加水分解(スターチ・無機塩寒天培地、ISP−培地4、30℃培養)
培養後3日目にはスターチの加水分解が認められ、その作用は中等度である。
3. Physiological properties (1) Growth temperature range Glucose / asparagine agar (glucose 1.0%, L-asparagine 0.05%, dipotassium hydrogen phosphate 0.05%, string agar 3.0%, pH 7.0) As a result of testing at 7 ° C., 16 ° C., 24 ° C., 27 ° C., 30 ° C., 37 ° C., and 45 ° C., growth at 7 ° C. and 45 ° C. was not observed, and 16 ° C. to 37 ° C. It grew in the range of ° C. The optimal growth temperature is 27 ° C to 30 ° C.
(2) Starch hydrolysis (starch / inorganic salt agar medium, ISP-medium 4, 30 ° C. culture)
On the third day after culturing, starch hydrolysis is observed and its action is moderate.
4.菌体成分
細胞壁中の2,6−ジアミノピメリン酸は、LL−型である。
4). Cell component 2,6-diaminopimelic acid in the cell wall is LL-type.
5.16S rRNA遺伝子解析
16S rRNA遺伝子の部分塩基配列(1459bp)を決定し、DNAデータベースに登録された公知菌株のデータと比較した。その結果、MK632−100F11株の塩基配列は以下に示すように、ストレプトマイセス(Streptomyces)属放線菌の16S rRNA遺伝子と高い相同性を示した。即ち、Streptomyces pseudovenezuelae(99%)、S. novaecaesareae(99%)、S. canus(99%)、S. galilaeus(99%)、S. lavovariabilis(99%)、S. regalis(99%)等である。なお、括弧内は塩基配列の相同値を表記した。
5. 16S rRNA gene analysis The partial base sequence (1459 bp) of the 16S rRNA gene was determined and compared with the data of known strains registered in the DNA database. As a result, the base sequence of MK632-100F11 strain showed high homology with the 16S rRNA gene of Streptomyces genus Streptomyces as shown below. Streptomyces pseudovenezuelae (99%), S. novaecaesareae (99%), S. et al . canus (99%), S. canis . galilaeus (99%), S. Lavovariabilis (99%), S. regalis (99%). In addition, the homologous value of the base sequence is described in parentheses.
以上の性状を要約すると、MK632−100F11株は、その形態上、よく分枝した基生菌糸より、比較的長い直状の気菌糸を伸長し、長円形の胞子を連鎖する。種々の培地で、うす黄〜黄の発育上に茶白〜明るい茶灰の気菌糸を着生する。黄の可溶性色素を産生する。生育至適温度は、27℃〜30℃付近である。スターチの水解性は中等度である。
MK632−100F11株の細胞壁中の2,6−ジアミノピメリン酸は、LL−型である。
MK632−100F11株の16S rRNA遺伝子の部分塩基配列を解析し、公知菌株のデータと比較したところ、ストレプトマイセス属放線菌と高い相同性を示した。
Summarizing the above properties, the MK632-100F11 strain extends a relatively long straight aerial hyphae from the well-branched basic hyphae and links oval spores. In various media, aerial hyphae of brown to bright brown ash are grown on light yellow to yellow growth. Produces a soluble pigment of yellow. The optimum growth temperature is around 27 ° C to 30 ° C. The water disintegration of starch is moderate.
2,6-Diaminopimelic acid in the cell wall of the MK632-100F11 strain is LL-type.
When the partial base sequence of 16S rRNA gene of MK632-2F11 strain was analyzed and compared with the data of known strains, it showed high homology with Streptomyces spp.
以上の結果より、前記MK632−100F11株は、ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属するものと考えられる。そこで、前記MK632−100F11株をストレプトマイセス・エスピー(Streptomyces sp.)MK632−100F11株とした。
なお、前記MK632−100F11株は、独立行政法人製品評価技術基盤機構 特許微生物寄託センターに寄託申請し、平成21年7月1日、NITE P−777として受託された。
From the above results, it is considered that the MK632-100F11 strain belongs to the genus Streptomyces . Therefore, the strain MK632-2F11 was designated as Streptomyces sp. MK632-2F11.
The MK632-100F11 strain was applied for deposit at the Patent Microorganism Deposit Center, National Institute of Technology and Evaluation, and was commissioned as NITE P-777 on July 1, 2009.
なお、他の菌にも見られるように、前記MK632−100F11株は、性状が変化し易いが、例えば、前記MK632−100F11株に由来する突然変異株(自然発生、又は誘発性)、形質接合体、遺伝子組換体などであっても、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを生産する能力を有するものは、本発明の微生物に含まれる。 As seen in other bacteria, the MK632-2100F11 strain is susceptible to changes in properties, but for example, mutant strains (naturally occurring or inducible) derived from the MK632-2100F11 strain, Even if it is a body, a recombinant, etc., what has the capability to produce at least any one of walkmycin A and walkmycin C is contained in the microorganisms of this invention.
(化合物含有組成物)
本発明の化合物含有組成物は、少なくとも前記ウォークマイシンA、及び前記ウォークマイシンCの少なくともいずれかを含み、必要に応じて適宜その他の成分を含む。
(Compound-containing composition)
The compound-containing composition of the present invention contains at least one of the walkmycin A and the walkmycin C, and optionally contains other components as necessary.
前記化合物含有組成物中のウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの含有量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記化合物含有組成物は、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかそのものであってもよい。 The content of at least one of walkmycin A and walkmycin C in the compound-containing composition is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the purpose. The compound-containing composition may be at least one of walkmycin A and walkmycin C.
前記その他の成分としては、特に制限はなく、例えば、薬理学的に許容され得る担体の中から目的に応じて適宜選択することができ、例えば、エタノール、水、デンプンなどが挙げられる。前記化合物含有組成物中の、前記その他の成分の含有量としては、特に制限はなく、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの効果を損なわない範囲内で、目的に応じて適宜選択することができる。
なお、前記化合物含有組成物は、単独で使用してもよいし、他の成分を有効成分とする医薬と併せて使用してもよい。また、前記化合物含有組成物は、他の成分を有効成分とする医薬中に、配合された状態で使用してもよい。
There is no restriction | limiting in particular as said other component, For example, it can select suitably from the pharmacologically acceptable support | carrier according to the objective, For example, ethanol, water, starch, etc. are mentioned. There is no restriction | limiting in particular as content of the said other component in the said compound containing composition, In the range which does not impair the effect of Walkmycin A and Walkmycin C, it can select suitably according to the objective. .
In addition, the said compound containing composition may be used independently, and may be used in combination with the pharmaceutical which uses another component as an active ingredient. Moreover, you may use the said compound containing composition in the state mix | blended in the pharmaceutical which uses another component as an active ingredient.
前記化合物含有組成物は、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを含むことから、抗菌作用、及び、酵素活性阻害作用の少なくともいずれかを有するものである。 Since the compound-containing composition contains at least one of walkmycin A and walkmycin C, it has at least one of an antibacterial action and an enzyme activity inhibitory action.
(抗菌剤)
本発明の抗菌剤は、少なくとも前記ウォークマイシンA、及び前記ウォークマイシンCの少なくともいずれかを含み、必要に応じて適宜その他の成分を含む。
(Antimicrobial agent)
The antibacterial agent of the present invention includes at least one of the walkmycin A and the walkmycin C, and optionally includes other components as necessary.
前記抗菌剤中のウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかの含有量としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記抗菌剤は、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかそのものであってもよい。 The content of at least one of walkmycin A and walkmycin C in the antibacterial agent is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the purpose. The antibacterial agent may be at least one of walkmycin A and walkmycin C.
前記その他の成分としては、特に制限はなく、例えば、薬理学的に許容され得る担体の中から目的に応じて適宜選択することができ、例えば、エタノール、水、デンプンなどが挙げられる。前記抗菌剤中の、前記その他の成分の含有量としては、特に制限はなく、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの効果を損なわない範囲内で、目的に応じて適宜選択することができる。
なお、前記抗菌剤は、単独で使用してもよいし、他の成分を有効成分とする医薬と併せて使用してもよい。また、前記抗菌剤は、他の成分を有効成分とする医薬中に、配合された状態で使用してもよい。
There is no restriction | limiting in particular as said other component, For example, it can select suitably from the pharmacologically acceptable support | carrier according to the objective, For example, ethanol, water, starch, etc. are mentioned. There is no restriction | limiting in particular as content of the said other component in the said antibacterial agent, It can select suitably according to the objective within the range which does not impair the effect of Walkmycin A and Walkmycin C.
In addition, the said antibacterial agent may be used independently and may be used in combination with the pharmaceutical which uses another component as an active ingredient. Moreover, you may use the said antibacterial agent in the state mix | blended in the pharmaceutical which uses another component as an active ingredient.
前記抗菌剤は、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCの少なくともいずれかを含むことから、後述する試験例1及び2に示されるように薬剤耐性菌などに対して優れた抗菌活性を有するものである。
したがって、前記抗菌剤は、薬剤耐性菌などに起因する感染症の予防、又は治療に好適に利用可能である。また、前記抗菌剤は、農園芸用殺菌剤としても好適に利用可能である。
Since the antibacterial agent includes at least one of walkmycin A and walkmycin C, the antibacterial agent has excellent antibacterial activity against drug-resistant bacteria as shown in Test Examples 1 and 2 described later. .
Therefore, the antibacterial agent can be suitably used for the prevention or treatment of infectious diseases caused by drug-resistant bacteria. The antibacterial agent can also be suitably used as an agricultural and horticultural fungicide.
<剤型、投与>
−剤型−
前記化合物含有組成物、及び抗菌剤の剤型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、粉末状、カプセル状、錠剤状、液状等の剤型とすることができる。これらの剤型の前記化合物含有組成物、及び抗菌剤は、常法に従い製造することができる。
<Dosage form, administration>
-Dosage form-
There is no restriction | limiting in particular as a dosage form of the said compound containing composition and an antibacterial agent, According to the objective, it can select suitably, For example, it is set as dosage forms, such as a powder form, a capsule form, a tablet form, and a liquid Can do. These compound-containing compositions and antibacterial agents in these dosage forms can be produced according to conventional methods.
また、前記農園芸用殺菌剤として用いる場合の剤型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、通常、固体担体、液体担体、界面活性剤、その他の製剤の補助剤との混合として慣用の処方により乳剤、水和剤、液剤、フロアブル(ゾル)剤、粉剤、粒剤、微粒剤、錠剤などの適宜の形態として調整できる。
また、乳剤、水和剤、液剤、フロアブル(ゾル)剤、粉剤、粒剤、微粒剤、錠剤などの目的で各種の界面活性剤(または、乳化剤)が使用される。このような界面活性剤としては、非イオン型(ポリアルキルエーテル、ポリオキシエチレンアルキルエステル、ポリオキシエチレンソルビタンアルキルエステルなど)、陰イオン型(アルキルオコシエチレンアルキルサルフェート、アリールスルホネートなど)、陽イオン型(アルキルアミン類、ポリオキシアルキルアミン類など)、両性型(硫酸エステル塩など)が挙げられるが、もちろんこれらの例示のみに限定されるものではない。また、これらの他にポリビニルアルコール、カルボキシメチルセルロース、アラビアゴム、ポリビニルアセテート、アルギン酸ソーダ、ゼラチン、トラガカントガムなどの各種補助剤を使用することができる。
The dosage form for use as the agricultural and horticultural fungicide is not particularly limited and may be appropriately selected depending on the intended purpose. Usually, it is a solid carrier, liquid carrier, surfactant, and other formulation aids. As an admixture with an agent, it can be prepared in an appropriate form such as an emulsion, a wettable powder, a liquid, a flowable (sol) agent, a powder, a granule, a fine granule, and a tablet.
Various surfactants (or emulsifiers) are used for the purpose of emulsions, wettable powders, liquids, flowable (sol) agents, powders, granules, fine granules, tablets and the like. Such surfactants include nonionic types (polyalkyl ethers, polyoxyethylene alkyl esters, polyoxyethylene sorbitan alkyl esters, etc.), anionic types (alkyl alkoxyethylene alkyl sulfates, aryl sulfonates, etc.), and cationic types. (Alkylamines, polyoxyalkylamines, etc.) and amphoteric types (sulfuric acid ester salts, etc.) are mentioned, but of course not limited to these examples. In addition to these, various adjuvants such as polyvinyl alcohol, carboxymethyl cellulose, gum arabic, polyvinyl acetate, sodium alginate, gelatin, and tragacanth gum can be used.
−投与−
前記化合物含有組成物、及び抗菌剤の投与方法としては、特に制限はなく、例えば、前記化合物含有組成物、及び抗菌剤の剤型などに応じて適宜選択することができ、経口又は非経口で投与することができる。
前記化合物含有組成物、及び抗菌剤の投与量としては、特に制限はなく、投与対象個体の年齢、体重、体質、症状、他の成分を有効成分とする医薬の投与の有無など、様々な要因を考慮して適宜選択することができる。
前記化合物含有組成物、及び抗菌剤の投与時期としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
前記化合物含有組成物、及び抗菌剤の投与対象となる動物種としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、ヒト、サル、ブタ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ、マウス、ラット、トリなどが挙げられる。
また、前記農園芸用殺菌剤として用いる場合の投与方法、投与量、投与時期、及び投与対象としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。
-Administration-
The administration method of the compound-containing composition and the antibacterial agent is not particularly limited, and can be appropriately selected depending on, for example, the compound-containing composition, the dosage form of the antibacterial agent, orally or parenterally. Can be administered.
The dosage of the compound-containing composition and the antibacterial agent is not particularly limited, and includes various factors such as the age, weight, constitution, symptom of the administration target individual, and the presence / absence of administration of a drug containing other ingredients as active ingredients. Can be selected as appropriate.
There is no restriction | limiting in particular as an administration time of the said compound containing composition and an antibacterial agent, According to the objective, it can select suitably.
There is no restriction | limiting in particular as an animal species used as the administration target of the said compound containing composition and an antibacterial agent, For example, a human, a monkey, a pig, a cow, a sheep, a goat, a dog can be selected suitably , Cats, mice, rats, birds and the like.
Moreover, there is no restriction | limiting in particular as an administration method in the case of using as said agricultural and horticultural fungicide, dosage amount, administration time, and administration object, According to the objective, it can select suitably.
以下に実施例、比較例、及び試験例を挙げて本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例、及び試験例に何ら限定されるものではない。また、以下の実施例、比較例、及び試験例中、「%」は、特に明記のない限り「質量%」を表す。 EXAMPLES The present invention will be specifically described below with reference to examples, comparative examples, and test examples, but the present invention is not limited to these examples and test examples. In the following examples, comparative examples, and test examples, “%” represents “% by mass” unless otherwise specified.
(実施例1:化合物の製造)
−培養工程−
寒天斜面培地に培養したストレプトマイセス エスピー(Streptomyces sp.)MK632−100F11株(NITE P−777として寄託)を、ガラクトース 2%、デキストリン 2%、グリセリン 1%、バクトソイトン(ディフコ社製) 1%、コーン・スティープ・リカー 0.5%、硫酸アンモニウム 0.2%、炭酸カルシウム 0.2%を含む液体培地(pH7.0に調整)を三角フラスコ(500mL容)に110mLずつ分注して、常法により120℃で20分滅菌した培地に接種した。その後に30℃で2日間回転振とう培養し、種母培養液を得た。
(Example 1: Production of compound)
-Culture process-
Streptomyces sp. MK632-2100F11 strain (deposited as NITE P-777) cultured on an agar slant medium, galactose 2%, dextrin 2%, glycerin 1%, Bacto Soyton (manufactured by Difco) 1%, Dispense 110 mL of a liquid medium (adjusted to pH 7.0) containing 0.5% corn steep liquor, 0.2% ammonium sulfate and 0.2% calcium carbonate into an Erlenmeyer flask (500 mL volume). Inoculated into medium sterilized at 120 ° C. for 20 minutes. Thereafter, it was subjected to rotary shaking culture at 30 ° C. for 2 days to obtain a seed culture solution.
グリセリン 2.0%、デキストリン 2.0%、L−イソロイシン 1.0%、酵母エキス(日本製薬製) 0.3%、バクトソイトン(ディフコ社製) 1.0%、硫酸アンモニウム 0.2%、炭酸カルシウム 0.2%を含む液体培地(pH7.0に調整)を三角フラスコ(500mL容)に110mLずつ分注して、常法により120℃で20分滅菌し、生産培地とした。この生産培地に、上記の種母培養液の2体積%量を接種し、27℃、5日間回転振とう培養した(180rpm)。 Glycerin 2.0%, dextrin 2.0%, L-isoleucine 1.0%, yeast extract (Nippon Pharmaceutical Co., Ltd.) 0.3%, bacto soyton (Difco) 1.0%, ammonium sulfate 0.2%, carbonic acid A liquid medium containing 0.2% calcium (adjusted to pH 7.0) was dispensed 110 mL each into an Erlenmeyer flask (500 mL volume) and sterilized at 120 ° C. for 20 minutes by a conventional method to obtain a production medium. This production medium was inoculated with 2% by volume of the above-mentioned seed culture medium, and cultured at 27 ° C. for 5 days with rotary shaking (180 rpm).
−採取工程−
このようにして得られた培養液5リットルを遠心分離して、培養ろ液と菌体に分離した。続いて、菌体は、2.7リットルのメタノールを加えてよく撹拌し、菌体からウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCをメタノールで抽出し、ウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCを含む菌体抽出液3リットルを得た。菌体抽出液3リットルを減圧下でメタノールを溜去し、この抽出液に2リットルの精製水を加えた。この抽出物に精製水を合わせ1Mの塩酸でpHを3.0に調整した後、等量の酢酸エチルを加え、酢酸エチル抽出を行った。酢酸エチル層を分離し、水を加え水洗し、続いて、無水硫酸ナトリウムで脱水を行った後、減圧下で濃縮乾固を行いウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCを含む粗抽出物1.5gを得た。
-Sampling process-
The culture broth 5 liters thus obtained was centrifuged to separate it into a culture filtrate and cells. Subsequently, the cells were added with 2.7 liters of methanol and stirred well, and walkmycin A, walkmycin B, and walkmycin C were extracted from the cells with methanol, and walkmycin A, walkmycin B, and 3 liters of a bacterial cell extract containing walkmycin C was obtained. Methanol was distilled off from 3 liters of the bacterial cell extract under reduced pressure, and 2 liters of purified water was added to the extract. Purified water was combined with this extract and the pH was adjusted to 3.0 with 1 M hydrochloric acid, and then an equal amount of ethyl acetate was added to perform extraction with ethyl acetate. The ethyl acetate layer was separated, washed with water after adding water, followed by dehydration with anhydrous sodium sulfate, followed by concentration to dryness under reduced pressure, and crude extraction containing walkmycin A, walkmycin B, and walkmycin C 1.5 g of product was obtained.
前記粗抽出物をメタノールで溶解し、セファデックスLH−20(内径36mm×480mm、ファルマシア バイオテク社製)カラムにのせ、クロマトグラフィーを行った。550mL溶媒を展開した後、1フラクションを3gずつ分画すると、活性画分はフラクション3から21に溶出され、これを集めて減圧下で濃縮乾固し、55.7mgのウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCの混合物を得た。
前記ウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCの混合物を少量のメタノールに溶解し、C18逆層カラムクロマトグラフィー(Capcell pak UG120、内径30mm×長さ250mm、資生堂製)でウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCをそれぞれ分離した。即ち、展開溶媒として、アセトニトリル:水:トリフルオロ酢酸=70:30:0.001を用い、流速15mL/分でクロマトグラフィーを行うと、ウォークマイシンAは36分〜38分に、ウォークマイシンBは41分〜43分にウォークマイシンCは48分〜51分に溶出し、これらを集めて減圧下で濃縮乾固し、純粋なウォークマイシンAを3.3mgと、ウォークマイシンBを6.4mgと、ウォークマイシンCを3.0mgとを得た。
The crude extract was dissolved in methanol and placed on a Sephadex LH-20 (inner diameter 36 mm × 480 mm, Pharmacia Biotech) column for chromatography. After developing 550 mL of solvent, fractions of 3 g each were fractionated, and the active fraction was eluted into fractions 3 to 21, which were collected and concentrated to dryness under reduced pressure to give 55.7 mg of walkmycin A, walkmycin. A mixture of B and Walkmycin C was obtained.
The mixture of walkmycin A, walkmycin B, and walkmycin C was dissolved in a small amount of methanol, and walkmycin A and walk were subjected to C18 reverse layer column chromatography (Capcell pak UG120, inner diameter 30 mm × length 250 mm, manufactured by Shiseido). Mycin B and walkmycin C were separated from each other. That is, when chromatography is performed using acetonitrile: water: trifluoroacetic acid = 70: 30: 0.001 as a developing solvent at a flow rate of 15 mL / min, walkmycin A is obtained in 36 to 38 minutes, and walkmycin B is obtained. From 41 minutes to 43 minutes, walkmycin C elutes from 48 minutes to 51 minutes, and these were collected and concentrated to dryness under reduced pressure to give 3.3 mg of pure walkmycin A and 6.4 mg of walkmycin B. , Walkmycin C was obtained as 3.0 mg.
得られたウォークマイシンAの物理化学的性状を測定したところ、以下の通りであり、これらのことから、ウォークマイシンAが、下記構造式(A)で表される構造を有する新規化合物であることが確認された。
(1) 外観は、黄色パウダー状である。
(2) 分子式は、C43H42Cl2O14で表される。
(3) 高分解能質量分析(HRESIMS:正イオンモード)による、実験値は、m/z 853.2041(M+H)+であり、計算値は、m/z 853.2041(C43H43Cl2O14として)である。
(4) 比旋光度は、[α]D 23=−120.5°(c 0.025, MeOH)である。
(5) 赤外線吸収スペクトルは、図1に示す通りである。
νmax(KBr)cm−1 : 3700〜3200、2972、2947、1684、1616、1590(sh)、1408、1379、1315、1217、1153
(6) 紫外線吸収スペクトルは、図2に示す通りである。
λmax nm(ε) :
0.005M HCl : 236(33,700)、277(35,400)、330(6,600)、412(13,600)
0.005M NaOH : 246(33,700)、267(sh)、340(7,100)、429(20,400)
(7) プロトン核磁気共鳴スペクトルとして、600MHzにおいて重クロロホルム:重メタノール=4:1の混合溶媒中で30℃にて測定したプロトンNMRスペクトルは、
図3、及び表4に示す通りである。
(8) 炭素13核磁気共鳴スペクトルとして、150MHzにおいて重メタノール中で30℃にて測定した炭素13NMRスペクトルは、図4、及び表4に示す通りである。
(1) The appearance is yellow powder.
(2) The molecular formula is represented by C 43 H 42 Cl 2 O 14 .
(3) The experimental value by high resolution mass spectrometry (HRESIMS: positive ion mode) is m / z 853.2401 (M + H) + , and the calculated value is m / z 853.2041 (C 43 H 43 Cl 2 is as O 14).
(4) The specific rotation is [α] D 23 = −120.5 ° (c 0.025, MeOH).
(5) The infrared absorption spectrum is as shown in FIG.
ν max (KBr) cm −1 : 3700 to 3200, 2972, 2947, 1684, 1616, 1590 (sh), 1408, 1379, 1315, 1217, 1153
(6) The ultraviolet absorption spectrum is as shown in FIG.
λ max nm (ε):
0.005M HCl: 236 (33,700), 277 (35,400), 330 (6,600), 412 (13,600)
0.005M NaOH: 246 (33,700), 267 (sh), 340 (7,100), 429 (20,400)
(7) As a proton nuclear magnetic resonance spectrum, a proton NMR spectrum measured at 30 ° C. in a mixed solvent of deuterated chloroform: deuterated methanol = 4: 1 at 600 MHz is:
As shown in FIG. 3 and Table 4.
(8) As a carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, the carbon 13 NMR spectrum measured at 30 ° C. in deuterated methanol at 150 MHz is as shown in FIG.
また、得られたウォークマイシンCの物理化学的性状を測定したところ、以下の通りであり、これらのことから、ウォークマイシンCが、下記構造式(C)で表される構造を有する新規化合物であることが確認された。
(1) 外観は、黄色パウダー状である。
(2) 分子式は、C45H46Cl2O14で表される。
(3) 高分解能質量分析(HRESIMS:正イオンモード)による、実験値は、m/z 881.2340(M+H)+であり、計算値は、m/z 881.2337(C45H47Cl2O14として)である。
(4) 比旋光度は、[α]D 23=−39.8°(c 0.025, MeOH)である。
(5) 赤外線吸収スペクトルは、図5に示す通りである。
νmax(KBr)cm−1 : 3700〜3200、2970、2939、1685、1616、1590(sh)、1408、1377、1315、1219、1161
(6) 紫外線吸収スペクトルは、図6に示す通りである。
λmax nm(ε) :
0.005M HCl : 237(27,700)、276(11,500)、328(5,500)、405(10,700)
0.005M NaOH : 245(27,500)、271(sh)、341(5,500)、424(15,000)
(7) プロトン核磁気共鳴スペクトルとして、600MHzにおいて重クロロホルム:重メタノール=4:1の混合溶媒中で30℃にて測定したプロトンNMRスペクトルは、
図7、及び表5に示す通りである。
(8) 炭素13核磁気共鳴スペクトルとして、150MHzにおいて重メタノール中で30℃にて測定した炭素13NMRスペクトルは、図8、及び表5に示す通りである。
(1) The appearance is yellow powder.
(2) The molecular formula is represented by C 45 H 46 Cl 2 O 14 .
(3) The experimental value by high resolution mass spectrometry (HRESIMS: positive ion mode) is m / z 881.2340 (M + H) + , and the calculated value is m / z 881.2337 (C 45 H 47 Cl 2 O 14 ).
(4) Specific rotation is [α] D 23 = −39.8 ° (c 0.025, MeOH).
(5) The infrared absorption spectrum is as shown in FIG.
ν max (KBr) cm −1 : 3700 to 3200, 2970, 2939, 1685, 1616, 1590 (sh), 1408, 1377, 1315, 1219, 1161
(6) The ultraviolet absorption spectrum is as shown in FIG.
λ max nm (ε):
0.005M HCl: 237 (27,700), 276 (11,500), 328 (5,500), 405 (10,700)
0.005M NaOH: 245 (27,500), 271 (sh), 341 (5,500), 424 (15,000)
(7) As a proton nuclear magnetic resonance spectrum, a proton NMR spectrum measured at 30 ° C. in a mixed solvent of deuterated chloroform: deuterated methanol = 4: 1 at 600 MHz is:
As shown in FIG. 7 and Table 5.
(8) As a carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, a carbon 13 NMR spectrum measured at 30 ° C. in deuterated methanol at 150 MHz is as shown in FIG.
また、得られたウォークマイシンBの物理化学的性状を測定したところ、以下の通りであり、これらのことから、ウォークマイシンBが、下記構造式(B)で表される構造を有する化合物であることが確認された。
(1) 外観は、黄色パウダー状である。
(2) 分子式は、C44H44Cl2O14で表される。
(3) 高分解能質量分析(HRESIMS:正イオンモード)による、実験値は、m/z 867.2180(M+H)+であり、計算値は、m/z 867.2181(C44H45Cl2O14として)である。
(4) 比旋光度は、[α]D 23=−121.7°(c 0.025, MeOH)である。
(5) 赤外線吸収スペクトルは、図9に示す通りである。
νmax(KBr)cm−1 : 3700〜3200、2974、2943、1691、1614、1587(sh)、1400、1375、1313、1220、1196、1167
(6) 紫外線吸収スペクトルは、図10に示す通りである。
λmax nm(ε) :
0.005M HCl : 235(56,200)、279(57,600)、331(9,700)、425(22,000)
0.005M NaOH : 245(46,300)、268(44,600)、341(9,200)、434(29,300)
(7) プロトン核磁気共鳴スペクトルとして、600MHzにおいて重クロロホルム:重メタノール=4:1の混合溶媒中で30℃にて測定したプロトンNMRスペクトルは、
図11、及び表6に示す通りである。
(8) 炭素13核磁気共鳴スペクトルとして、150MHzにおいて重メタノール中で30℃にて測定した炭素13NMRスペクトルは、図12、及び表6に示す通りである。
(1) The appearance is yellow powder.
(2) The molecular formula is represented by C 44 H 44 Cl 2 O 14 .
(3) The experimental value by high resolution mass spectrometry (HRESIMS: positive ion mode) is m / z 867.2180 (M + H) + and the calculated value is m / z 867.2181 (C 44 H 45 Cl 2 is as O 14).
(4) Specific rotation is [α] D 23 = −121.7 ° (c 0.025, MeOH).
(5) The infrared absorption spectrum is as shown in FIG.
ν max (KBr) cm −1 : 3700 to 3200, 2974, 2943, 1691, 1614, 1587 (sh), 1400, 1375, 1313, 1220, 1196, 1167
(6) The ultraviolet absorption spectrum is as shown in FIG.
λ max nm (ε):
0.005M HCl: 235 (56,200), 279 (57,600), 331 (9,700), 425 (22,000)
0.005M NaOH: 245 (46,300), 268 (44,600), 341 (9,200), 434 (29,300)
(7) As a proton nuclear magnetic resonance spectrum, a proton NMR spectrum measured at 30 ° C. in a mixed solvent of deuterated chloroform: deuterated methanol = 4: 1 at 600 MHz is:
As shown in FIG. 11 and Table 6.
(8) As a carbon 13 nuclear magnetic resonance spectrum, a carbon 13 NMR spectrum measured at 30 ° C. in deuterated methanol at 150 MHz is as shown in FIG.
(比較例1:化合物の製造)
−培養工程−
実施例1の培養工程において、生産培地のL−イソロイシンを用いなかった以外は、実施例1と同様にして培養工程を行った。
(Comparative Example 1: Production of compound)
-Culture process-
In the culturing step of Example 1, the culturing step was performed in the same manner as in Example 1 except that L-isoleucine as a production medium was not used.
−採取工程−
このようにして得られた培養液5リットルを遠心分離して、培養ろ液と菌体に分離した。続いて、菌体は、2.7リットルのメタノールを加えてよく撹拌し、菌体からウォークマイシンA、ウォークマイシンB、及びウォークマイシンCをメタノールで抽出し、ウォークマイシンBと、微量のウォークマイシンA、及びウォークマイシンCを含む菌体抽出液3リットルを得た。菌体抽出液3リットルを減圧下でメタノールを溜去し、この抽出液に2リットルの精製水を加えた。この抽出物に精製水を合わせた溶液に等量の酢酸エチルを加え、酢酸エチル抽出を行った。酢酸エチル層を分離し、無水硫酸ナトリウムで脱水を行った後、減圧下で濃縮乾固を行いウォークマイシンBを含む粗抽出物2.0gを得た。
-Sampling process-
The culture broth 5 liters thus obtained was centrifuged to separate it into a culture filtrate and cells. Subsequently, the cells were added with 2.7 liters of methanol and stirred well, and walkmycin A, walkmycin B, and walkmycin C were extracted from the cells with methanol. 3 liters of bacterial cell extract containing A and walkmycin C was obtained. Methanol was distilled off from 3 liters of the bacterial cell extract under reduced pressure, and 2 liters of purified water was added to the extract. An equal amount of ethyl acetate was added to a solution obtained by combining purified water with purified water, followed by extraction with ethyl acetate. The ethyl acetate layer was separated, dehydrated with anhydrous sodium sulfate, and concentrated to dryness under reduced pressure to obtain 2.0 g of a crude extract containing walkmycin B.
前記粗抽出物をメタノールで溶解し、セファデックスLH−20(内径36mm×480mm、ファルマシア バイオテク社製)カラムにのせ、クロマトグラフィーを行った。550mL溶媒を展開した後、1フラクションを3gずつ分画すると、活性画分はフラクション3から23に溶出され、これを集めて減圧下で濃縮乾固し、99.7mgのウォークマイシンBを含む粗生成物を得た。
前記ウォークマイシンBを含む粗生成物を少量のメタノール:クロロホルム=10:3の混合溶液に加温し溶解した。これを、5℃の条件下で一昼夜静置すると純粋なウォークマイシンBが析出した。これを集め44.8mgのウォークマイシンBを得た。
また、得られたウォークマイシンBの物理化学的性状を測定したところ、前記実施例1で得られたウォークマイシンBと同様の結果であり、これらのことから、ウォークマイシンBが、前記構造式(B)で表される構造を有する化合物であることが確認された。
なお、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCは、生産量が微量であり、精製することができなかった。
The crude extract was dissolved in methanol and placed on a Sephadex LH-20 (inner diameter 36 mm × 480 mm, Pharmacia Biotech) column for chromatography. After developing 550 mL of solvent, fractions of 1 g each were fractionated, and the active fraction was eluted into fractions 3 to 23. These fractions were collected and concentrated to dryness under reduced pressure, and crude fractions containing 99.7 mg of walkmycin B were collected. The product was obtained.
The crude product containing the walkmycin B was dissolved by heating in a small amount of a mixed solution of methanol: chloroform = 10: 3. When this was allowed to stand overnight at 5 ° C., pure walkmycin B was precipitated. This was collected to obtain 44.8 mg of walkmycin B.
Moreover, when the physicochemical property of the obtained walkmycin B was measured, it was the same result as the walkmycin B obtained in the Example 1. From these results, the walkmycin B has the structural formula ( It was confirmed that the compound had a structure represented by B).
In addition, walkmycin A and walkmycin C were produced in a very small amount and could not be purified.
前記実施例1、及び比較例1の結果から、培養工程における培養培地に分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかを添加しなかった比較例1では、ウォークマイシンBは、精製することが可能な量が生産されたが、ウォークマイシンA、及びウォークマイシンCは、生産量が微量であり、精製物を得ることができないことがわかった。 From the results of Example 1 and Comparative Example 1, Walkmycin B is purified in Comparative Example 1 in which at least one of a branched amino acid, a branched fatty acid, and a branched keto acid was not added to the culture medium in the culturing step. However, it was found that Walkmycin A and Walkmycin C were produced in a small amount, and a purified product could not be obtained.
また、得られたウォークマイシンA〜Cの抗菌活性、及び酵素阻害活性を、以下の試験例1〜3で確認した。 Moreover, the antibacterial activity and enzyme inhibitory activity of the obtained walkmycin A to C were confirmed in the following Test Examples 1 to 3.
(試験例1:抗菌活性−1)
バンコマイシン耐性腸球菌、及びバンコマイシン感受性腸球菌に対するウォークマイシンA〜Cの抗菌スペクトルを、日本化学療法学会標準法に基づき、ミュラ・ヒントン寒天培地上で倍数希釈法により測定した。最小発育阻止濃度(MIC)の測定結果を表7に示す。
また、参考として、バンコマイシンでも同様に測定した。結果を表7に示す。
(Test Example 1: Antibacterial activity-1)
The antibacterial spectrum of walkmycin A to C against vancomycin-resistant enterococci and vancomycin-sensitive enterococci was measured by a multiple dilution method on a Mura Hinton agar medium based on the standard method of the Japanese Society of Chemotherapy. Table 7 shows the measurement results of the minimum inhibitory concentration (MIC).
For reference, the same measurement was performed with vancomycin. The results are shown in Table 7.
(試験例2:抗菌活性−2)
メチシリン耐性ブドウ球菌、バンコマイシン低感受性メチシリン耐性ブドウ球菌、及びメチシリン感受性ブドウ球菌に対するウォークマイシンA〜Cの抗菌スペクトルを、日本化学療法学会標準法に基づき、ミュラ・ヒントン寒天培地上で倍数希釈法により測定した。最小発育阻止濃度(MIC)の測定結果を表8に示す。
また、参考として、オキサシリンでも同様に測定した。結果を表8に示す。
(Test Example 2: Antibacterial activity-2)
Antibacterial spectrum of walkmycin A to C against methicillin-resistant staphylococci, vancomycin-insensitive methicillin-resistant staphylococci, and methicillin-sensitive staphylococci by multiple dilution method on Mura Hinton agar medium based on the Japanese Society of Chemotherapy Standard Method did. Table 8 shows the measurement results of the minimum inhibitory concentration (MIC).
For reference, oxacillin was also measured in the same manner. The results are shown in Table 8.
表7〜8の結果から、ウォークマイシンA〜Cは、バンコマイシン耐性腸球菌、バンコマイシン感受性腸球菌、メチシリン耐性ブドウ球菌、バンコマイシン低感受性メチシリン耐性ブドウ球菌、及びメチシリン感受性ブドウ球菌に対して、抗菌活性を有していることがわかった。
ウォークマイシンA〜Cの中でも、ウォークマイシンA、及びCは、ウォークマイシンBよりも優れた抗菌活性を有していることがわかった。
From the results of Tables 7-8, walkmycin AC has antimicrobial activity against vancomycin-resistant enterococci, vancomycin-sensitive enterococci, methicillin-resistant staphylococci, vancomycin-insensitive methicillin-resistant staphylococci, and methicillin-sensitive staphylococci. I found it.
Among walkomycins A to C, walkmycins A and C were found to have antibacterial activity superior to walkmycin B.
(試験例3:酵素阻害活性)
−(1)YycGヒスチジンキナーゼ活性阻害試験−
枯草菌168株(B. subtilis 168)のYycGに対する、ウォークマイシンA〜Cの酵素阻害活性を調べた。
ヒスチジンキナーゼ活性の測定は、Biosci. Biotechnol. Biochem., 64, 919−923, 2000に報告された方法にしたがって行った。
YycGのキナーゼ活性ドメインのみを含む領域(N−末端から207番目のアミノ酸から611番目のアミノ酸を含む)をPCR法により枯草菌168株の染色体DNAから調製し、発現ベクターpET−21a(+)にクローニングした。このようにして得られたプラスミドpET−yycGtruを大腸菌に形質転換した株の培養液から、YycGのヒスチジンキナーゼ活性ドメインを発現させたタンパク質(YycG−207−611)を精製した。
ヒスチジンキナーゼ活性測定のための反応溶液の組成は、0.5μM YycG−207−611、50mM Tris−HCl(pH8.5)、100mM KCl、100mM NH4Cl、5mM MgCl2であり、この反応溶液に2.5μM ATP−10μCi[γ−32P]ATP混合溶液を加えて10μLとし、反応を開始し、30℃で10分間インキュベート後、反応を終了させ、SDS−ポリアクリルアミド電気泳動を行った。阻害活性を調べる際は、ATP混合溶液を加える前に所定の濃度のウォークマイシンA〜Cを反応溶液中に加え、30℃で5分間インキュベートし、枯草菌のYycGに対する50%阻害濃度(IC50)を求めた。結果を表9に示す。
(Test Example 3: Enzyme inhibition activity)
-(1) YycG histidine kinase activity inhibition test-
The enzyme inhibitory activity of walkmycin AC on YycG of B. subtilis 168 strain ( B. subtilis 168) was examined.
Measurement of histidine kinase activity was performed as described in Biosci. Biotechnol. Biochem. 64, 919-923, 2000.
A region including only the kinase active domain of YycG (including amino acids 207 to 611 from the N-terminal) was prepared from the chromosomal DNA of Bacillus subtilis 168 strain by PCR, and expressed in expression vector pET-21a (+). Cloned. A protein (YycG-207-611) in which the histidine kinase active domain of YycG was expressed was purified from the culture solution of the strain obtained by transforming Escherichia coli with the plasmid pET-yycGtru thus obtained.
The composition of the reaction solution for measuring histidine kinase activity was 0.5 μM YycG-207-611, 50 mM Tris-HCl (pH 8.5), 100 mM KCl, 100 mM NH 4 Cl, 5 mM MgCl 2. 2.5 μM ATP-10 μCi [γ- 32 P] ATP mixed solution was added to make 10 μL, the reaction was started, incubated at 30 ° C. for 10 minutes, the reaction was terminated, and SDS-polyacrylamide electrophoresis was performed. When investigating the inhibitory activity, a predetermined concentration of walkomycin A to C was added to the reaction solution before adding the ATP mixed solution, incubated at 30 ° C. for 5 minutes, and Bacillus subtilis 50% inhibitory concentration against YycG (IC 50 ) The results are shown in Table 9.
−(2)VicKヒスチジンキナーゼ活性阻害試験−
う蝕菌(Streptococcus mutans)のVicKに対する、ウォークマイシンA〜Cの酵素阻害活性を調べた。
ヒスチジンキナーゼ活性の測定は、Biosci. Biotechnol. Biochem., 64, 919−923, 2000に報告された方法を改変して行った。
VicKのキナーゼ活性ドメインのみを含む領域(N−末端から31番目のアミノ酸から450番目のアミノ酸を含む)をPCR法により、う蝕菌の染色体DNAから調製し、発現ベクターpET22b(+)にクローニングした。このようにして得られたプラスミドpET−SMvicK31−450を大腸菌に形質転換した株の培養液から、VicKのヒスチジンキナーゼ活性ドメインのみを発現させたタンパク質(VicK−31−450)を精製した。
ヒスチジンキナーゼ活性測定のための反応溶液の組成は、0.5μM VicK−31−450、50mM Tris−HCl(pH7.5)、50mM KCl、10mM MgCl2であり、この反応液 7μLにウォークマイシンA〜Cを 1μL加え、25℃で5分間インキュベートした。その後、[32P]ATPを含む12.5μM ATPを2μL加え(終濃度2.5μM)反応を開始し、25℃で20分間インキュベート後、反応を終了させ、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動を行うことによって、う蝕菌のVicKに対する50%阻害濃度(IC50)を求めた。結果を表9に示す。
-(2) VicK histidine kinase activity inhibition test-
The enzyme inhibitory activity of walkmycin A to C against VicK of Streptococcus mutans was examined.
Measurement of histidine kinase activity was performed as described in Biosci. Biotechnol. Biochem. 64, 919-923, 2000, which was modified.
A region containing only the kinase active domain of VicK (including the 31st to 450th amino acids from the N-terminal) was prepared from the cartilage chromosomal DNA by PCR and cloned into the expression vector pET22b (+). . A protein (VicK-31-450) in which only the histidine kinase active domain of VicK was expressed was purified from the culture solution of the strain obtained by transforming the plasmid pET-SMvicK31-450 thus obtained into E. coli.
The composition of the reaction solution for measuring the histidine kinase activity was 0.5 μM VicK-31-450, 50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM KCl, 10 mM MgCl 2. 1 μL of C was added and incubated at 25 ° C. for 5 minutes. Thereafter, 2 μL of 12.5 μM ATP containing [ 32 P] ATP is added (final concentration 2.5 μM) to start the reaction. After incubation at 25 ° C. for 20 minutes, the reaction is terminated, and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis is performed. Thus, a 50% inhibitory concentration (IC 50 ) of caries bacteria against VicK was determined. The results are shown in Table 9.
−(3)PehSヒスチジンキナーゼ活性阻害試験−
軟腐病菌MAFF301393株(Erwinia carotovora subsp. carotovora MAFF301393)のPehSに対する、ウォークマイシンA〜Cの酵素阻害活性を調べた。
ヒスチジンキナーゼ活性の測定は、Biosci. Biotechnol. Biochem., 64, 919−923, 2000に報告された方法にしたがって行った。
PehSのキナーゼ活性ドメインのみを含む領域(N−末端から209番目のアミノ酸から484番目のアミノ酸を含む)をPCR法により軟腐病菌MAFF301393株の染色体DNAから調製し、発現ベクターpET−21a(+)にクローニングした。このようにして得られたプラスミドpET−pehScM2−2を大腸菌に形質転換した株の培養液から、PehSヒスチジンキナーゼ活性ドメインのみを発現させたタンパク質(PehS−209−484)を精製した。
ヒスチジンキナーゼ活性測定のための反応溶液の組成は、4μM PehS−209−484、50mM Tris−HCl(pH8.5)、100mM KCl、100mM NH4Cl、5mM MgCl2であり、この反応溶液に2.5μM ATP−10μCi[γ−32P]ATP混合溶液を加えて10μLとし、反応を開始し、30℃で20分間インキュベート後、反応を終了させ、SDS−ポリアクリルアミド電気泳動を行った。阻害活性を調べる際は、ATP混合溶液を加える前に所定の濃度のウォークマイシンA〜Cを反応溶液中に加え、30℃で5分間インキュベートし、軟腐病菌のPehSに対する50%阻害濃度(IC50)を求めた。結果を表9に示す。
-(3) PehS histidine kinase activity inhibition test-
For PehS of soft rot MAFF301393 strain (Erwinia carotovora subsp. Carotovora MAFF301393) , it was examined enzyme inhibitory activity of the walk mycin A through C.
Measurement of histidine kinase activity was performed as described in Biosci. Biotechnol. Biochem. 64, 919-923, 2000.
A region containing only the kinase active domain of PehS (including amino acids 209 to 484 from the N-terminal) was prepared from the chromosomal DNA of the soft rot fungus MAFF301393 by the PCR method, and the expression vector pET-21a (+) was prepared. Cloned. A protein (PehS-209-484) in which only the PehS histidine kinase active domain was expressed was purified from the culture solution of the strain obtained by transforming the plasmid pET-pehScM2-2 thus obtained into E. coli.
The composition of the reaction solution for histidine kinase activity measurement, 4μM PehS-209-484,50mM Tris-HCl (pH8.5), 100mM KCl, a 100mM NH 4 Cl, 5mM MgCl 2 , 2 in the reaction solution. 5 μM ATP-10 μCi [γ- 32 P] ATP mixed solution was added to make 10 μL, the reaction was started, incubated at 30 ° C. for 20 minutes, the reaction was terminated, and SDS-polyacrylamide electrophoresis was performed. When investigating the inhibitory activity, a predetermined concentration of walkomycin A to C was added to the reaction solution before adding the ATP mixed solution, incubated at 30 ° C. for 5 minutes, and the 50% inhibitory concentration (IC 50) against soft rot fungus PehS. ) The results are shown in Table 9.
表9の結果から、ウォークマイシンA〜Cは、グラム陽性細菌、及びグラム陰性細菌が有するヒスチジンキナーゼに対して、阻害活性を有していることがわかった。ウォークマイシンA〜Cは、特にYycGに対して強い阻害活性を有していることがわかった。
また、ウォークマイシンA〜Cの中でも、ウォークマイシンA、及びCは、ウォークマイシンBよりも優れた酵素阻害活性を有していることがわかった。
From the results in Table 9, it was found that walkomycins A to C have an inhibitory activity against histidine kinase possessed by gram positive bacteria and gram negative bacteria. It was found that walkomycins A to C have particularly strong inhibitory activity against YycG.
Moreover, it turned out that walkmycin A and C have the enzyme inhibitory activity superior to walkmycin B among walkmycin AC.
本発明の新規化合物(ウォークマイシンA、及びウォークマイシンC)は、優れた抗菌活性、及び優れた酵素阻害活性を有することから、新たな抗菌剤、酵素活性阻害剤として好適に利用できる。また、本発明の化合物(ウォークマイシンB)は、優れた酵素阻害活性を有することから、新たな酵素活性阻害剤として好適に利用できる。 Since the novel compounds (walkomycin A and walkmycin C) of the present invention have excellent antibacterial activity and excellent enzyme inhibitory activity, they can be suitably used as new antibacterial agents and enzyme activity inhibitors. Moreover, since the compound of the present invention (walkomycin B) has excellent enzyme inhibitory activity, it can be suitably used as a new enzyme activity inhibitor.
NITE P−777 NITE P-777
Claims (7)
ストレプトマイセス(Streptomyces)属に属し、下記構造式(A)で表される化合物、及び下記構造式(C)で表される化合物の少なくともいずれかを生産する能力を有する微生物を培養する培養工程と、
前記培養工程で得られた培養物から下記構造式(A)で表される化合物、及び下記構造式(C)で表される化合物の少なくともいずれかを採取する採取工程とを含み、
前記培養工程における培地に分岐アミノ酸、分岐脂肪酸、及び分岐ケト酸の少なくともいずれかを添加することを特徴とする化合物の製造方法。
A culture process for culturing a microorganism belonging to the genus Streptomyces and having the ability to produce at least one of a compound represented by the following structural formula (A) and a compound represented by the following structural formula (C) When,
Collecting a compound represented by the following structural formula (A) and at least one of the compound represented by the following structural formula (C) from the culture obtained in the culturing step,
A method for producing a compound, comprising adding at least one of a branched amino acid, a branched fatty acid, and a branched keto acid to the medium in the culturing step.
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