JP5405059B2 - Cancer diagnosis support system, cancer diagnosis support information provision device, and cancer diagnosis support information provision method - Google Patents
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Description
本発明は、がんの診断支援システム、がんの診断支援情報提供装置及びがんの診断支援情報提供方法に関する。 The present invention relates to a cancer diagnosis support system , a cancer diagnosis support information providing apparatus, and a cancer diagnosis support information providing method.
従来、がん診断として、血清中の腫瘍マーカーを調べる血清診断や、生検(バイオプシイ)による組織診、細胞診が知られている。しかし、これらは信頼性が低いか、又は個々人の判断や医療機関の判定にバラツキがある。そのため、近年、診断医によるバラツキが少ないがんの画一的診断方法として、生体内で発現される遺伝子やタンパク質に基づく分子診断が検討されている。前記タンパク質に基づく分子診断としては、例えば、サイクリン依存性キナーゼ(以下、単に「CDK」ともいう)等を利用した方法が種々提案されている(例えば、特許文献1および2参照)。
Conventionally, serodiagnosis for examining tumor markers in serum, histological diagnosis by biopsy (biopsy), and cytodiagnosis are known as cancer diagnosis. However, these are not reliable, or there are variations in individual judgments and medical institution judgments. Therefore, in recent years, molecular diagnosis based on genes and proteins expressed in vivo has been examined as a uniform diagnosis method for cancer with little variation by diagnosticians. As molecular diagnosis based on the protein, various methods using, for example, cyclin-dependent kinase (hereinafter also simply referred to as “CDK”) have been proposed (see, for example,
特許文献1には、CDK1の活性値及び発現量から得られる比(CDK1比活性)とCDK2の活性値及び発現量から得られる比(CDK2比活性)を測定し、CDK2比活性/CDK1比活性を、予め設定した閾値と比較し、これらの結果に基づいてがんの悪性度を判定する方法が記載されている。また、特許文献2には、p53BP2遺伝子、カテプシンB遺伝子、カテプシンL遺伝子、Ki67/MiB1遺伝子、チミジンキナーゼ遺伝子、p27遺伝子等の所定遺伝子又はその発現産物の発現レベルを、コントロール遺伝子に対して正規化し、基準がん組織セットで見出される量と比較する患者の臨床結果を予測する方法が記載されている。
In
上記の方法では、予め設定した所定の閾値とパラメータの測定値とを比較し、その比較結果に基づいて、がんの状態の予測や臨床結果の予測が行われている。しかしながら、そのような方法では、パラメータの測定値が閾値と非常に近い場合であっても閾値を基準に判定が行われてしまう。そのため、例えば、実際には再発リスクが高い臨床検体であっても、臨床検体から得られたパラメータの測定値が閾値に比べてわずかに下回っている又は上回っているために、実際とは違う判定結果が得られることがある。そのような場合、上記の方法では正確な判定が行われているとはいえず、がんの診断においてこのような判定結果を用いた場合、正確な診断を行うことができないことがある。 In the above method, a predetermined threshold value set in advance and a measured value of a parameter are compared, and prediction of a cancer state and prediction of a clinical result are performed based on the comparison result. However, in such a method, even if the measured value of the parameter is very close to the threshold value, the determination is made based on the threshold value. Therefore, for example, even if the clinical specimen is actually at a high risk of recurrence, the measured value of the parameter obtained from the clinical specimen is slightly lower or higher than the threshold value. Results may be obtained. In such a case, it cannot be said that accurate determination is performed by the above method, and when such a determination result is used in cancer diagnosis, accurate diagnosis may not be performed.
本発明は、このような事情に鑑みてなされたものであり、医師によるがん患者の診断に際して、がん患者の悪性腫瘍の所定項目の測定値に近似する測定値を持つ他のがん患者のがんの再発率及び/又は無病生存率を診断支援情報として提供することができるがんの診断支援システム、がんの診断支援情報提供装置及びがんの診断支援情報提供方法を提供することを目的とする。 The present invention has been made in view of such circumstances, and when diagnosing a cancer patient by a doctor, another cancer patient having a measured value that approximates a measured value of a predetermined item of a malignant tumor of the cancer patient. providing cancer recurrence rate and / or disease-free survival diagnostic support information diagnosis support system for cancer that is as possible out to provide as the, diagnosis support information providing apparatus and diagnostic support information providing method for cancer cancer For the purpose.
本発明のがんの診断支援システムは、第一のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製された検体について所定の2種類の測定項目を測定して前記第一のがん患者に関する測定値を取得する測定部と、前記第一のがん患者とは異なる複数のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製されたそれぞれの検体について前記所定の2種類の測定項目を測定して生成された複数の測定値と、前記複数のがん患者それぞれの悪性腫瘍摘出後の臨床情報と、参照範囲とを含むデータを記憶する記憶部と、表示部と、前記記憶部から前記複数の測定値と参照範囲のデータを読み出して、前記2種類の測定項目を座標軸とし、前記複数の測定値と前記第一のがん患者に関する測定値がプロットされ、且つ、前記第一のがん患者に関する測定値が含まれる前記参照範囲が表示された分布図を前記表示部に表示させる制御部と、を備え、前記記憶部は、前記臨床情報として、がんの再発に関する情報及び/又は術後の生存の有無に関する情報を記憶しており、前記制御部は、前記参照範囲内にある前記複数の測定値に対応するがん患者の前記がんの再発に関する情報及び/又は前記術後の生存の有無に関する情報から求めたがんの再発率及び/又は無病生存率を示す診断支援画面を前記表示部に表示させることを特徴とする。 Diagnosis support system for cancer of the present invention is directed to the first cancer patient by measuring the predetermined two kinds of measurement items for prepared specimen using a malignant tumor collected from the first cancer patient a measurement unit take measurements, the first of said predetermined two types of measurement items for each of the specimens prepared with malignant tumors taken from different cancer patients and cancer patients a plurality of measurements generated by measuring, and clinical information after malignant tumor removal of each of the plurality of cancer patients, and serial憶部for storing data including a reference area, and Viewing section, Reading the data of the plurality of measurement values and the reference range from the storage unit, with the two types of measurement items as coordinate axes, the plurality of measurement values and the measurement values related to the first cancer patient are plotted, and Includes measurements for the first cancer patient And a control unit for displaying a view distribution in which the reference range is displayed on the display unit, wherein the storage unit, information as the clinical information, as to whether or not the survival of information about the recurrence and / or post-operative cancer And the control unit obtains from information on recurrence of the cancer of the cancer patient corresponding to the plurality of measurement values within the reference range and / or information on presence or absence of postoperative survival. wherein the display before Symbol display unit diagnosis support screen showing the recurrence rate and / or disease-free survival of cancer.
本発明のがんの診断支援システムは、上述した構成が採用されているため、第一のがん患者の悪性腫瘍の所定項目の測定値に近似する測定値を持つ他のがん患者のがんの再発率及び/又は無病生存率を診断支援情報として提供することができる。近似する測定値を持つ悪性腫瘍は、互いに性質も似ていると考えられ、当該第一のがん患者を診断する際に、本発明のがんの診断支援システムで提供される他のがん患者のがんの再発率及び/又は無病生存率を診断支援情報として利用することができる。 Since the above-described configuration is adopted in the cancer diagnosis support system of the present invention, other cancer patients having measurement values that approximate the measurement values of the predetermined items of the malignant tumor of the first cancer patient may be used. The recurrence rate and / or disease-free survival rate can be provided as diagnostic support information . Malignant tumors having similar measured values are considered to be similar in nature to each other, and other cancers provided by the cancer diagnosis support system of the present invention when diagnosing the first cancer patient. the recurrence rate and / or disease-free survival rate of cancer patients can and use the child as a diagnostic support information.
また、本発明のがんの診断支援システムでは、前記測定値は、細胞周期タンパク質の発現及び/又は前記細胞周期タンパク質の活性に関する値を含むよう構成されていることが好ましい。 In the cancer diagnosis support system of the present invention, it is preferable that the measurement value includes a value related to expression of the cell cycle protein and / or activity of the cell cycle protein.
また、前記細胞周期タンパク質は、サイクリン依存性キナーゼであるよう構成されていることが好ましい。
また、前記測定値は、第1のサイクリン依存性キナーゼ(第1CDK)の活性値と発現量との比(第1比)と、第2のサイクリン依存性キナーゼ(第2CDK)の活性値と発現量との比(第2比)であるよう構成されていることが好ましい。
The cell cycle protein is preferably configured to be a cyclin-dependent kinase.
In addition, the measured value includes the ratio between the activity value of the first cyclin-dependent kinase (first CDK) and the expression level (first ratio), and the activity value and expression of the second cyclin-dependent kinase (second CDK). It is preferable to be configured so as to be a ratio to the amount (second ratio).
また、前記臨床情報は更に、術後治療に関する情報を含むよう構成されていることが好ましい。 Moreover, the clinical information further, it is preferably configured to include information about the post-operative treatment.
本発明の記憶部及び表示部を備えたがんの診断支援情報提供装置におけるがんの診断支援情報の提供方法は、第一のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製された検体につき所定の2種類の測定項目を測定して生成された第一のがん患者に関する測定値の入力を受け付けるステップと、前記第一のがん患者と異なる複数のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製されたそれぞれの検体につき前記所定の2種類の測定項目を測定して生成された複数の測定値と参照範囲のデータを前記記憶部から読み出して、前記2種類の測定項目を座標軸とし、前記複数の測定値と前記第一のがん患者に関する測定値がプロットされ、且つ、前記第一のがん患者に関する測定値が含まれる前記参照範囲が表示された分布図を前記表示部に表示するステップと、前記参照範囲内にある前記複数の測定値に対応するがん患者のがんの再発に関する情報及び/又は術後の生存の有無に関する情報を前記記憶部から読み出し、読み出された前記がんの再発に関する情報及び/又は前記術後の生存の有無に関する情報から求めたがんの再発率及び/又は無病生存率を示す診断支援画面を前記表示部に表示するステップと、を実行することを特徴とする。 A method for providing cancer diagnosis support information in a cancer diagnosis support information providing apparatus including a storage unit and a display unit according to the present invention is a specimen prepared using a malignant tumor collected from a first cancer patient a step of accepting an input of a predetermined two first measurements of cancer patients measurement items generated by measuring per were pre Symbol taken from a plurality of cancer patients different from the first cancer patient A plurality of measurement values and reference range data generated by measuring the two predetermined measurement items for each specimen prepared using a malignant tumor are read from the storage unit, and the two measurement items A distribution diagram in which the reference range including the measurement values relating to the first cancer patient is plotted, and the plurality of measurement values and the measurement values relating to the first cancer patient are plotted. It is displayed on the display unit Reading a step, the information as to whether or not the survival of information about the recurrence and / or post-operative cancer cancer patients corresponding to the plurality of measurement values within the reference range from the storage unit, the read the Executing a step of displaying on the display unit a diagnosis support screen showing a cancer recurrence rate and / or disease-free survival rate obtained from information on cancer recurrence and / or information on whether or not there is postoperative survival. It is characterized by that.
本発明のがんの診断支援情報の提供方法では、第一のがん患者により適応した診断支援情報を提供することができ、例えば、第一の癌患者を診断する際に、第一の癌患者の悪性腫瘍の所定項目の測定値に近似する測定値を持つ他の癌患者の癌の再発率及び/又は無病生存率を診断支援情報として提供することができる。 The method for providing information for assisting cancer diagnosis of the present invention, it is possible to provide a diagnosis support information adapted by a first cancer patient, if example embodiment, when diagnosing a first cancer patient, the first The cancer recurrence rate and / or disease-free survival rate of other cancer patients having a measurement value close to the measurement value of the predetermined item of the malignant tumor of the cancer patient can be provided as diagnosis support information .
本発明のがんの診断支援システム、がんの診断支援情報提供装置及びがんの診断支援情報提供方法によれば、医師によるがん患者の診断に際して、被検がん患者の悪性腫瘍の所定項目の測定値に近似する測定値を持つ他のがん患者のがん再発率及び/又は無病生存率を診断支援情報として提供することができる。 According to the cancer diagnosis support system, the cancer diagnosis support information providing apparatus, and the cancer diagnosis support information providing method of the present invention, when a doctor diagnoses a cancer patient, the predetermined malignant tumor of the subject cancer patient is determined. other cancer recurrence rate of cancer patients and / or disease-free survival with a measurement value approximate to the measurement value of the item as possible out to provide a diagnosis support information.
以下、添付図面を参照しつつ、本発明のがんの診断支援システム(以下、単に「診断支援システム」ともいう)の実施形態を詳細に説明する。本実施形態の診断支援システムは、診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値、及び他のがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値と当該他のがん患者の悪性腫瘍摘出後の臨床情報とが対応付けられたサンプルデータに基づいて、がんの診断を支援するための情報を提供することができる。 Hereinafter, embodiments of a cancer diagnosis support system (hereinafter also simply referred to as “diagnosis support system”) of the present invention will be described in detail with reference to the accompanying drawings. The diagnosis support system of the present embodiment includes a measurement value of a predetermined measurement item related to a malignant tumor of a cancer patient to be diagnosed, a measurement value of a predetermined measurement item related to a malignant tumor of another cancer patient, and the other Information for supporting cancer diagnosis can be provided based on sample data associated with clinical information after malignant tumor removal of cancer patients.
悪性腫瘍とは、他の組織に浸潤又は転移し、身体の各所で増大することで生命を脅かす腫瘍である。悪性腫瘍には、上皮組織由来の悪性腫瘍であるがん腫、及び非上皮性組織由来の悪性腫瘍である肉腫が含まれる。前記悪性腫瘍としては、具体的には、乳房、肺、肝臓、胃、大腸、膵臓、子宮、精巣、卵巣、甲状腺、副甲状腺、リンパ系統等の位置にできる悪性腫瘍が挙げられる。また、悪性腫瘍は、乳癌、肺癌、肝臓癌、胃癌、大腸癌、膵臓癌、前立腺癌等に罹患したがん患者から採取することができる。 Malignant tumors are life-threatening tumors that invade or metastasize to other tissues and grow in various parts of the body. Malignant tumors include carcinomas that are malignant tumors derived from epithelial tissues and sarcomas that are malignant tumors derived from non-epithelial tissues. Specific examples of the malignant tumor include malignant tumors that can be located in the breast, lung, liver, stomach, large intestine, pancreas, uterus, testis, ovary, thyroid, parathyroid, lymphatic lineage, and the like. Malignant tumors can be collected from cancer patients suffering from breast cancer, lung cancer, liver cancer, stomach cancer, colon cancer, pancreatic cancer, prostate cancer and the like.
本実施形態の診断支援システムでは、診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値に近似する測定値を持つ他のがん患者の臨床情報を、前記診断対象となるがん患者に対する診断を支援するための情報(以下、「がんの診断支援情報」ともいう)として提供することができる。診断支援システムで提供される臨床情報には、例えば、前記参照範囲内に測定値を持つ他のがん患者の再発の有無の情報が含まれる。また、診断支援システムでは、前記参照範囲内に測定値を持つ他のがん患者の再発の有無の情報に基づいて算出されたる再発率やDisease Free Survival(無病生存率)等の情報を、前記臨床情報として提供することもできる。 In the diagnosis support system of the present embodiment, clinical information of other cancer patients having measurement values that approximate the measurement values of the predetermined measurement items related to the malignant tumor of the cancer patient to be diagnosed is the diagnosis target. It can be provided as information to support diagnosis for cancer patients (hereinafter also referred to as “cancer diagnosis support information”). The clinical information provided by the diagnosis support system includes, for example, information on the presence or absence of recurrence of other cancer patients having measured values within the reference range. In the diagnosis support system, information such as recurrence rate and disease free survival calculated based on information on the presence or absence of recurrence of other cancer patients having measured values within the reference range, It can also be provided as clinical information.
さらに、本実施形態の診断支援システムでは、診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値に基づいてがんの悪性度を判定し、その判定結果を、前記他のがん患者の臨床情報とともにがんの診断支援情報として提供することもできる。がんの悪性度としては、具体的には、転移のしやすさ、再発のしやすさ、予後の悪さ等が挙げられる。 Furthermore, in the diagnosis support system of the present embodiment, the malignancy of the cancer is determined based on the measurement value of the predetermined measurement item related to the malignant tumor of the cancer patient to be diagnosed, and the determination result is determined based on the determination result. It can also be provided as cancer diagnosis support information together with clinical information of cancer patients. Specific examples of the malignancy of cancer include ease of metastasis, ease of recurrence, and poor prognosis.
本実施形態の診断支援システムにおいて測定される前記所定の測定項目は、悪性腫瘍における遺伝子及び/又はタンパク質に関する測定項目であれば特に限定されず、遺伝子やタンパク質の種類及び測定項目の種類は、がんの種類や提供する診断支援情報等によって適宜選択される。 The predetermined measurement item measured in the diagnosis support system of the present embodiment is not particularly limited as long as it is a measurement item related to a gene and / or protein in a malignant tumor, and the type of gene or protein and the type of measurement item are: The type is selected according to the type of diagnosis and diagnosis support information provided.
前記所定の測定項目としては、例えば、特表2002−504683号公報、特表2002−519681号公報、特開2002−335997号公報、上記で示した特許文献1(国際公開第2005/116241号パンフレット)等で記載されているCDKに関する測定値が挙げられる。前記CDKに関する測定値としては、具体的には、例えば、CDKの発現量、CDKの活性値、CDKの活性値と発現量との比(例えば、比活性、前記比活性の逆数等)等が挙げられる。CDK以外にも、特開2005−58113号公報、特開2006−223303号公報、上記で示した特許文献2(特表2005−519624号公報)等で、がんの再発リスクを予測するのに利用される遺伝子の発現量を所定の測定項目としてもよい。また、国際公開第2005/007846号パンフレットや特開2005−341862号公報等で、抗がん剤の感受性を予測するのに利用されている遺伝子の発現量を所定の測定項目としてもよい。
Examples of the predetermined measurement items include Japanese Patent Publication No. 2002-504683, Japanese Patent Publication No. 2002-519681, Japanese Patent Application Laid-Open No. 2002-335997, and
以下に、本実施形態の診断支援システムとして、がん患者から採取した悪性腫瘍におけるCDKの発現量及び活性値を測定し、得られた測定値に基づいてがんの悪性度(再発のしやすさ)に関する情報を提供する診断支援システムを例に挙げて説明する。
当該診断支援システムの説明に先立って、まず、[1]がんの診断におけるCDKの有用性について説明をする。
Hereinafter, as the diagnosis support system of the present embodiment, the expression level and activity value of CDK in a malignant tumor collected from a cancer patient are measured, and the malignancy of cancer (ease of recurrence) based on the obtained measurement value. A diagnosis support system that provides information on the above will be described as an example.
Prior to the description of the diagnosis support system, first, [1] the usefulness of CDK in cancer diagnosis will be described.
[1]がんの診断におけるCDKの有用性
サイクリン依存性キナーゼ(CDK)に関する測定値は、がんに罹患した患者における悪性腫瘍の状態を正確に反映する。そのため、悪性腫瘍を含む組織中における2種以上のサイクリン依存性キナーゼの発現量及び活性値を測定し、例えば、第1のCDKの活性値と発現量との比及び第2のCDKの活性値と発現量との比に基づいて、当該悪性腫瘍を含む組織の性質、がんの再発のしやすさなどを評価することができる。また、CDKに関する測定値は、類似する状態の悪性腫瘍を持つがん患者においては、それぞれ、類似する測定値を示す。そのため、悪性腫瘍を含む組織中における2種以上のサイクリン依存性キナーゼの発現量及び活性値を測定し、例えば、第1のサイクリン依存性キナーゼの活性値と発現量との比及び第2のサイクリン依存性キナーゼの活性値と発現量との比に基づいて、当該悪性腫瘍を含む組織の性質、がんの再発のしやすさなどを診断することができる。
[1] Usefulness of CDK in the diagnosis of cancer The measurement value regarding cyclin-dependent kinase (CDK) accurately reflects the state of malignant tumor in a patient suffering from cancer. Therefore, the expression level and activity value of two or more cyclin-dependent kinases in tissues including malignant tumors are measured. For example, the ratio between the activity value and expression level of the first CDK and the activity value of the second CDK Based on the ratio between the expression level and the expression level, the nature of the tissue containing the malignant tumor, the ease of recurrence of cancer, and the like can be evaluated. Moreover, the measured value regarding CDK shows a similar measured value, respectively, in a cancer patient having a malignant tumor in a similar state. Therefore, the expression levels and activity values of two or more cyclin-dependent kinases in tissues containing malignant tumors are measured, for example, the ratio between the activity value and expression level of the first cyclin-dependent kinase and the second cyclin Based on the ratio between the activity value and the expression level of the dependent kinase, the nature of the tissue including the malignant tumor, the ease of recurrence of cancer, and the like can be diagnosed.
このように、CDKに関する測定値として、例えば、ある組織が有する少なくとも1種類のCDKの活性値と発現量との比(例えば、比活性等)、及び/又は、複数のCDKの活性値と発現量とにより計算される数値〔例えば、第1CDKの活性値と発現量との比(A1)と、第2CDKの活性値と発現量との比(A2)との比(例えば、「A1/A2」又は「A2/A1」)等〕を用いることができる。 Thus, as a measurement value regarding CDK, for example, the ratio (for example, specific activity) of the activity value and expression level of at least one CDK possessed by a certain tissue, and / or the activity value and expression of a plurality of CDKs. A numerical value calculated by the amount [for example, the ratio of the ratio of the activity value of the first CDK to the expression level (A1) and the ratio of the activity value of the second CDK to the expression level (A2) (for example, “A1 / A2 Or “A2 / A1”) etc.] can be used.
ここで、再発とは、悪性腫瘍を摘出するために臓器を部分切除した後、残存臓器に同じ悪性腫瘍が再現する場合、及び原発巣から腫瘍細胞が分離して遠隔組織(遠隔臓器)へ運ばれ、そこで自立的に増殖する場合(転移再発)をいう。一般に、摘出手術後5年以内に、がんが再発する可能性がある場合に「再発しやすい」という。摘出手術後5年以内の再発を予測することは、5年以内に再発が認められる患者の死亡率は高いため、臨床的に意義がある。例えば、ステージ分類では、ステージIIIは、再発率50%であり、ステージII(再発率20%)に比べて再発しやすい。 Here, recurrence refers to the case where the same malignant tumor is reproduced in the remaining organ after partial excision of the organ to remove the malignant tumor, and the tumor cells are separated from the primary lesion and transported to the remote tissue (remote organ). It refers to the case where it proliferates autonomously (metastasis recurrence). In general, when cancer is likely to recur within 5 years after removal surgery, it is said to be “prone to relapse”. Predicting recurrence within 5 years after excision surgery is clinically significant because patients with recurrence within 5 years have a high mortality rate. For example, in stage classification, stage III has a recurrence rate of 50% and is more likely to recur than stage II (recurrence rate of 20%).
サイクリン依存性キナーゼとは、サイクリンと結合して活性化されるリン酸化酵素群の総称であり、その種類に応じて、細胞周期の所定時期で機能している。また、CDKインヒビターとは、サイクリン・CDK複合体に結合し、サイクリン・CDK複合体の活性を阻害する因子群の総称である。 Cyclin-dependent kinase is a general term for a group of phosphorylating enzymes activated by binding to cyclin, and functions at a predetermined time in the cell cycle depending on the type. The CDK inhibitor is a general term for a group of factors that bind to a cyclin / CDK complex and inhibit the activity of the cyclin / CDK complex.
ここで、細胞周期とは、細胞が増殖を開始し、DNA複製、染色体の分配、核分裂、細胞質分裂等の事象を経て、2つの娘細胞となって出発点に戻るまでのサイクルをいう。細胞周期は、図14に示されるように、G1期、S期、G2期及びM期の4期に分けられる。S期は、DNAの複製期であり、M期は、分裂期である。G1期は、有糸分裂の完了からDNA合成の開始までの期間で、細胞がS期に入るための準備点検期である。G1期にある臨界点(動物細胞ではRポイント)を過ぎると、細胞周期が始動し、通常は途中で止まることなく、一巡する。G2期は、DNA合成の終了から有糸分裂の開始までの期間で、細胞がM期に入るための準備点検期である。細胞周期の主なチェックポイントは、G1期からS期に入る直前(G1チェックポイント)、G2期から有糸分裂への移行期(G2/Mチェックポイント)である。特に、G1チェックポイントは、S期の開始に関係するため、重要である。なぜなら、G1期のある点を過ぎると、細胞は、増殖シグナルがなくなっても、増殖を停止することなく、S期→G2期→M期→G1期と細胞周期を進行させるからである。なお、増殖を停止した細胞は、G1期のDNA含量をもった休止期(G0期)に入り、細胞周期からはずれた状態となる。G0期における増殖誘導により、細胞周期内のG1期よりやや長い時間の後にS期へ進行することができる。 Here, the cell cycle refers to a cycle from when a cell starts to proliferate, undergoes events such as DNA replication, chromosome distribution, nuclear fission, cytokinesis, and the like to become two daughter cells and return to the starting point. As shown in FIG. 14, the cell cycle is divided into four phases of G 1 phase, S phase, G 2 phase and M phase. The S phase is a DNA replication phase, and the M phase is a mitotic phase. G 1 phase is the period from the completion of mitosis and the start of DNA synthesis, is a preparation period for the cell to cells enter phase S. Beyond (R point in animal cells) critical point in the G 1 phase, it starts the cell cycle, usually without stopping in the middle, a round. G 2 phase is a period until the start of mitosis from completion of DNA synthesis, which is a preparation period for the cell to cells enter phase M. The main check points of the cell cycle are immediately before entering the S phase from the G 1 phase (G 1 check point) and the transition phase from the G 2 phase to mitosis (G 2 / M check point). In particular, the G 1 checkpoint is important because it relates to the start of the S period. This is because, after passing through a certain point in the G 1 phase, even if the proliferation signal disappears, the cell advances the cell cycle from S phase to G 2 phase to M phase to G 1 phase without stopping proliferation. is there. The cells that have stopped growing enter a resting phase (G 0 phase) having a DNA content in the G 1 phase, and are in a state deviated from the cell cycle. By inducing proliferation in the G 0 phase, it is possible to proceed to the S phase after a slightly longer time than the G 1 phase in the cell cycle.
前記判定方法で用いられるサイクリン依存性キナーゼ(CDK)としては、特に限定されないが、例えば、CDK1、CDK2、CDK4、CDK6などが挙げられる。前記CDKには、さらに、サイクリンA依存性キナーゼに属するCDK、サイクリンB依存性キナーゼに属するCDK、サイクリンD依存性キナーゼに属するCDK及びサイクリンE依存性キナーゼに属するCDKなどが包含される。サイクリンA依存性キナーゼは、サイクリンAと結合して活性を示すCDKであればよく、特に限定されないが、例えば、CDK1、CDK2などが挙げられる。また、サイクリンB依存性キナーゼは、サイクリンBと結合して活性を示すCDKであればよく、特に限定されないが、例えば、CDK1などが挙げられる。サイクリンD依存性キナーゼは、サイクリンDと結合して活性を示すCDKであればよく、特に限定されないが、例えば、CDK4、CDK6などが挙げられる。サイクリンE依存性キナーゼは、サイクリンEと結合して活性を示すCDKであればよく、特に限定されないが、例えば、CDK2などが挙げられる。 The cyclin-dependent kinase (CDK) used in the determination method is not particularly limited, and examples thereof include CDK1, CDK2, CDK4, and CDK6. The CDK further includes CDK belonging to cyclin A-dependent kinase, CDK belonging to cyclin B-dependent kinase, CDK belonging to cyclin D-dependent kinase, CDK belonging to cyclin E-dependent kinase, and the like. The cyclin A-dependent kinase is not particularly limited as long as it is a CDK that binds to cyclin A and exhibits activity, and examples thereof include CDK1 and CDK2. The cyclin B-dependent kinase is not particularly limited as long as it is a CDK that binds to cyclin B and exhibits activity, and examples thereof include CDK1. The cyclin D-dependent kinase is not particularly limited as long as it is a CDK that binds to cyclin D and exhibits activity, and examples thereof include CDK4 and CDK6. The cyclin E-dependent kinase may be a CDK that binds to cyclin E and exhibits activity, and is not particularly limited, and examples thereof include CDK2.
これらのCDKは、表1に示されるように、それぞれ対応するサイクリンと結合したサイクリン・CDK複合体(以下、「活性型CDK」ともいう)となって、表1に示されるような細胞周期の所定時期を活性化している。例えば、CDK1は、サイクリンA又はBと、CDK2はサイクリンA又はEと、CDK4及びCDK6は、サイクリンD1、サイクリンD2、又はサイクリンD3と結合して活性型となる。一方、CDK活性は、表1に示されるようなCDKインヒビターによって活性が阻害されることもある。例えば、p21は、CDK1及びCDK2を阻害する。p27は、CDK2、CDK4及びCDK6を阻害する。p16は、CDK4及びCDK6を阻害する。 As shown in Table 1, each of these CDKs becomes a cyclin / CDK complex (hereinafter also referred to as “active CDK”) bound to the corresponding cyclin, and has a cell cycle as shown in Table 1. A predetermined period is activated. For example, CDK1 binds to cyclin A or B, CDK2 binds to cyclin A or E, and CDK4 and CDK6 bind to cyclin D1, cyclin D2, or cyclin D3 to be activated. On the other hand, the CDK activity may be inhibited by a CDK inhibitor as shown in Table 1. For example, p21 inhibits CDK1 and CDK2. p27 inhibits CDK2, CDK4 and CDK6. p16 inhibits CDK4 and CDK6.
前記CDKのうち、2種類以上のCDKそれぞれの発現量と活性値とを測定し、各CDKにおける発現量と活性値との比(すなわち、下記式で表されるCDK比活性又はその逆数)を求める。
CDKの比活性=CDK活性値/CDK発現量
Among the CDKs, the expression level and activity value of each of two or more types of CDKs are measured, and the ratio between the expression level and activity value of each CDK (that is, the CDK specific activity represented by the following formula or its reciprocal) Ask.
CDK specific activity = CDK activity value / CDK expression level
CDK活性値とは、所定のサイクリンと結合して、リン酸化する基質の量により示されるキナーゼ活性のレベル(単位をU(ユニット)で表わす)をいう。なお、前記CDKがリン酸化する基質としては、例えば、活性型CDK1及び活性型CDK2については、ヒストンH1、活性型CDK4及び活性型CDK6については、Rb(網膜芽細胞腫タンパク質、Retinoblastoma protein)が挙げられる。前記CDK活性値は、従来、知られている酵素活性測定方法で測定することができる。具体的には、測定試料の細胞溶解液から活性型CDKを含む試料を調製し、当該試料と32P標識したATP([γ−32P]ATP)とを用いて、基質タンパク質に32Pを取り込ませ、32P標識されたリン酸化基質の標識量を測定し、標準品で作成された検量線をもとに定量する方法がある。また放射性物質の標識を用いない方法としては、特開2002−335997号公報に開示の方法が挙げられる。この方法は、測定試料の細胞可溶化液から、目的の活性型CDKを含む試料を調製し、アデノシン 5'−O−(3−チオトリホスフェート)(ATPγS)と基質タンパク質を反応させて、該基質タンパク質のセリン残基又はスレオニン残基にモノチオリン酸基を導入し、導入されたモノチオリン酸基の硫黄原子に蛍光標識物質又は標識酵素を結合させることによって基質タンパク質を標識し、標識されたチオリン酸基に基づく標識量(蛍光標識物質を用いた場合には蛍光量)を測定し、標準品で作成された検量線に基づいて定量する方法である。
The CDK activity value refers to the level of kinase activity (unit is represented by U (unit)) indicated by the amount of a substrate that binds to a predetermined cyclin and phosphorylates. Examples of the substrate that phosphorylates CDK include histone H1 for active CDK1 and active CDK2, and Rb (retinoblastoma protein) for active CDK4 and active CDK6. It is done. The CDK activity value can be measured by a conventionally known enzyme activity measurement method. Specifically, a sample containing activated CDK is prepared from cell lysate of the measurement sample, the sample and 32 P-labeled ATP with the ([γ- 32 P] ATP) , 32 P-in substrate protein There is a method in which the amount of 32 P-labeled phosphorylated substrate is incorporated and measured, and quantified based on a calibration curve prepared with a standard product. Moreover, as a method not using the label of the radioactive substance, a method disclosed in JP-A-2002-335997 can be mentioned. In this method, a sample containing a target active CDK is prepared from a cell lysate of a measurement sample,
活性測定に供する試料は、測定対象となる悪性腫瘍を含む組織の可溶化液から目的のCDKを特異的に採取することにより調製する。この場合、目的のCDKに特異的な抗CDK抗体を用いて調製してもよいし、所定のサイクリン依存性キナーゼ(例えばサイクリンA依存性キナーゼ、サイクリンB依存性キナーゼ、サイクリンE依存性キナーゼ)の活性測定の場合には、抗サイクリン抗体を用いて調製する。いずれの場合も活性型CDK以外のCDKが試料に含まれることになる。例えばサイクリン・CDK複合体にCDKインヒビターが結合した複合体も含まれる。また、抗CDK抗体を用いた場合には、CDK単体、CDKとサイクリン及び/又はCDKインヒビターの複合体、CDKとその他の化合物との複合体等が含まれる。従って、活性値は、活性型、不活性型、各種競合反応が混在する状態下で、リン酸化された基質の単位(U)として測定される。 A sample to be used for activity measurement is prepared by specifically collecting a target CDK from a solubilized solution of a tissue containing a malignant tumor to be measured. In this case, it may be prepared using an anti-CDK antibody specific for the target CDK, or a predetermined cyclin-dependent kinase (for example, cyclin A-dependent kinase, cyclin B-dependent kinase, cyclin E-dependent kinase). In the case of activity measurement, it is prepared using an anti-cyclin antibody. In either case, a CDK other than the active CDK is included in the sample. For example, a complex in which a CDK inhibitor is bound to a cyclin / CDK complex is also included. Further, when an anti-CDK antibody is used, CDK alone, a complex of CDK and cyclin and / or CDK inhibitor, a complex of CDK and other compounds, and the like are included. Therefore, the activity value is measured as a unit (U) of a phosphorylated substrate in a state where an active type, an inactive type, and various competitive reactions coexist.
CDK発現量とは、細胞可溶化液から測定される目的のCDK量(分子個数に対応する単位)であって、タンパク質混合物から目的のタンパク質量を測定する従来公知の方法で測定できる。例えば、ELISA法、ウェスタンブロット法等を使用してもよいし、特開2003−130871号公報に開示の方法で測定することもできる。目的のタンパク質(CDK)は、特異的抗体を用いて捕捉すればよい。例えば、抗CDK1抗体を用いることにより、細胞内に存在するCDK1のすべて(CDK単体、CDKとサイクリン及び/又はCDKインヒビターの複合体、CDKとその他の化合物との複合体を含む)を捕捉できる。 The CDK expression level is the target CDK level (unit corresponding to the number of molecules) measured from the cell lysate, and can be measured by a conventionally known method for measuring the target protein level from a protein mixture. For example, an ELISA method, a Western blot method, or the like may be used, or measurement may be performed by the method disclosed in Japanese Patent Application Laid-Open No. 2003-130871. The target protein (CDK) may be captured using a specific antibody. For example, by using an anti-CDK1 antibody, it is possible to capture all of CDK1 present in the cell (including CDK alone, a complex of CDK and cyclin and / or CDK inhibitor, a complex of CDK and other compounds).
従って、前記式により算出される比活性は、細胞に存在しているCDKのうち、活性を示すCDKの割合に相当し、判定対象である悪性腫瘍細胞の増殖状態に基づくCDK活性レベルといえる。このようにして求められるCDK比活性は、測定試料調製方法に依存しない。特に生検材料から調製される測定試料(細胞可溶化液)は、実際に採取された組織中に含まれる非細胞性組織、例えば細胞外基質の多寡による影響を受けやすい。従って、このような影響を控除した比活性又はその逆数を用いる意義は大きく、従来の単なる活性値と比べて、臨床的性格との相関性が高い。 Therefore, the specific activity calculated by the above formula corresponds to the ratio of CDK showing activity among the CDKs present in the cells, and can be said to be a CDK activity level based on the proliferation state of the malignant tumor cell to be determined. The CDK specific activity thus determined does not depend on the measurement sample preparation method. In particular, a measurement sample (a cell lysate) prepared from a biopsy material is easily affected by the number of non-cellular tissues contained in the actually collected tissue, for example, extracellular matrix. Therefore, the significance of using the specific activity or the reciprocal thereof excluding such influence is large, and the correlation with the clinical character is high as compared with the conventional simple activity value.
2種類以上のCDK比活性又はその逆数を知ることにより、いずれのCDK活性が優位になっているかを知ることができ、これにより細胞周期のいずれの時期にある細胞割合がどの程度であるか、又はいずれの時期の細胞割合が優勢であるか等を知ることができる。 By knowing two or more kinds of CDK specific activities or their reciprocals, it is possible to know which CDK activity is dominant, and what is the proportion of cells in any stage of the cell cycle, Alternatively, it is possible to know at which time the cell ratio is dominant.
比活性が測定されるCDKの種類は、特に限定されず、適宜選択すればよい。一般に、がん細胞は正常な増殖制御を逸脱して増殖が活発に行われていることから、S期、G2期にある細胞割合が多いと考えられる。したがって、このような場合に組織ががん化していると考えられる。また、前記がんは、進行が早く、悪性であるといえる。さらに、異数倍体性は、異常なM期を経過したか、又はM期を経ずにG1期へ進んで、S期に入ったときに起ると考えられている。したがって、M期に存在する細胞割合が少ないことも前記がんが悪性であることを示すといえる。従って、第1のサイクリン依存性キナーゼとしてCDK1、第2のサイクリン依存性キナーゼとしてCDK2を使用し、CDK1比活性の大きさに従い群に分類し、類似したCDK1比活性を持つ群の中ではCDK2比活性値がS期の細胞比率を反映する値となる。S期にある細胞が多い場合、当該細胞が構成細胞となっている組織が臨床的に悪性、すなわち転移しやすい予後の悪い悪性のがんであると判定することができる。 The type of CDK whose specific activity is measured is not particularly limited, and may be selected as appropriate. In general, since cancer cells are actively proliferating beyond normal growth control, it is considered that the proportion of cells in the S phase and G 2 phase is large. Therefore, it is considered that the tissue is cancerous in such a case. Moreover, it can be said that the said cancer progresses rapidly and is malignant. Furthermore, aneuploidy is considered to occur when the abnormal M phase has passed or the M phase has been advanced to the G 1 phase and the S phase has been entered. Therefore, it can be said that the low proportion of cells present in the M phase also indicates that the cancer is malignant. Therefore, CDK1 is used as the first cyclin-dependent kinase, CDK2 is used as the second cyclin-dependent kinase, and the CDK1 specific activity is classified into groups according to the magnitude of the CDK1 specific activity. The activity value reflects the cell ratio in S phase. When there are many cells in the S phase, it can be determined that the tissue in which the cells are constituent cells is clinically malignant, that is, malignant cancer with a poor prognosis that easily metastasizes.
以上のことから、本実施形態の診断支援システムにおいて、診断対象となるがん患者について2種類以上のCDKの比活性を求め、前記がん患者のCDK比活性と近似したCDK比活性を持つ他のがん患者の臨床情報を提供することにより、前記診断対象となるがん患者の診断に有用な情報を提供することができる。 From the above, in the diagnosis support system of the present embodiment, the specific activity of two or more types of CDK is obtained for the cancer patient to be diagnosed, and the CDK specific activity approximates the CDK specific activity of the cancer patient. By providing clinical information of the cancer patient, it is possible to provide information useful for diagnosis of the cancer patient to be diagnosed.
[2]診断支援システム
つぎに、本発明の一実施形態に係る診断支援システムについて説明をする。本実施形態に係る診断支援システムは、所定の測定項目の測定値として前述したCDK1比活性及びCDK2比活性を使用する。具体的には、本実施形態に係る診断支援システムは、被検がん患者のCDK1及びCDK2の発現量及び活性値を取得する。取得したCDK1及びCDK2の発現量及び活性値から、CDK1比活性及びCDK2比活性を算出する。そして、算出されたCDK1比活性及びCDK2比活性に基づいて参照範囲を決定する。予め記憶されている他のがん患者のサンプルデータから、前記参照範囲内にあるCDK1比活性及びCDK2比活性を持つ他のがん患者のサンプルデータを検索し、特定する。そして、特定されたサンプルデータに基づいて再発率を算出し、さらに算出された再発率に基づいて再発のリスクを判定する。そして、算出された再発率の結果や再発リスクの判定結果を含む画面を生成し、生成した画面を表示装置に表示させる。
[2] Diagnosis Support System Next, a diagnosis support system according to an embodiment of the present invention will be described. The diagnosis support system according to the present embodiment uses the above-described CDK1 specific activity and CDK2 specific activity as measured values of predetermined measurement items. Specifically, the diagnosis support system according to the present embodiment acquires the expression levels and activity values of CDK1 and CDK2 of the subject cancer patient. CDK1 specific activity and CDK2 specific activity are calculated from the obtained expression levels and activity values of CDK1 and CDK2. Then, the reference range is determined based on the calculated CDK1 specific activity and CDK2 specific activity. The sample data of other cancer patients having CDK1 specific activity and CDK2 specific activity within the reference range are searched and specified from the sample data of other cancer patients stored in advance. Then, the recurrence rate is calculated based on the specified sample data, and the risk of recurrence is determined based on the calculated recurrence rate. Then, a screen including the calculated recurrence rate result and recurrence risk determination result is generated, and the generated screen is displayed on the display device.
図1は本発明の一実施形態に係る診断支援システムの斜視説明図である。本実施形態に係る診断支援システムは、測定装置Aと可溶化装置Bとから構成されている。測定装置Aは、測定部501とデータ処理部12とから構成されている。測定部501は、CDK1の活性値及び発現量、及びCDK2の活性値及び発現量の測定を行うものであり、装置本体部20の前方部分に配設された検出部4、チップセット部1、第1試薬セット部5及び第2試薬セット部6、前記装置本体部20の後方部分に配設された活性測定ユニット2、廃液を収容するための廃液槽7及びピペットを洗浄するためのピペット洗浄槽8、前記装置本体部20の上方に配設されており、ピペットを3方向(X方向、Y方向及びZ方向)に移動させることができる分注機構部3、前記装置本体部20の背部に配設された流体部9及び本体制御部10とで主に構成されている。前記データ処理部12は、本体制御部10と通信可能に接続されている。また、測定装置Aには、純水タンク13、洗浄液タンク14、廃液タンク15及び空圧源11が設けられている。純水タンク13には、測定終了時の流路洗浄用純水が貯留されており、配管21により流体部9に接続されており、洗浄液タンク14にはピペットを洗浄する洗浄液が貯留されており、配管22によりピペット洗浄槽8に接続されており、さらに廃液を収容するための廃液タンク15は配管23により廃液槽7に接続されている。さらに、本実施形態に係る診断支援システムにおいて、測定装置Aには、生体試料から測定装置Aで処理可能な検体を得るための可溶化装置Bが並設されている。
以下、可溶化装置B及び測定装置Aについて順に説明をする。
FIG. 1 is a perspective explanatory view of a diagnosis support system according to an embodiment of the present invention. The diagnosis support system according to the present embodiment includes a measuring device A and a solubilizing device B. The measuring apparatus A includes a measuring
Hereinafter, the solubilizing apparatus B and the measuring apparatus A will be described in order.
[可溶化装置]
可溶化装置Bは、測定装置Aによる処理に先立って、患者から摘出した組織等の生体試料から、測定装置Aで処理可能な液状の検体を調製するものであり、筐体部30、この筐体部30の前面上方に配置された操作部31、前記生体試料を押し付けたり、すりつぶしたりするための一対のペッスル34を備えた駆動部32、及び前記生体試料が収容される容器35がセットされる検体セット部33とで主に構成されている。
[Solubilizer]
The solubilizer B prepares a liquid specimen that can be processed by the measuring apparatus A from a biological sample such as a tissue extracted from a patient prior to the processing by the measuring apparatus A. An
前記駆動部32は、ペッスル34を上下動させるとともに当該ペッスル34に回転運動を与えることができ、これにより容器35内に注入された生体試料が押し付けられたり、すりつぶされたりする。そして、前記筐体部30内には、かかる駆動部32の動作を制御する制御部(図示せず)が内蔵されている。
前記操作部31には、操作ボタン31a、運転ランプ31b、装置の状態やエラーメッセージ等を表示するための表示部31cが配設されている。また、検体セット部33内には、図示しない冷却手段が配設されており、当該検体セット部33上面の凹所にセットされた容器内の生体試料を一定の温度に保っている。
可溶化装置Bにより可溶化され、さらに図示しない遠心分離機により遠心分離処理された生体試料の上澄み液は、所定の検体容器に採取されて測定装置Aの第1試薬セット部5にセットされる。
The
The
The supernatant of the biological sample solubilized by the solubilizer B and further centrifuged by a centrifuge (not shown) is collected in a predetermined specimen container and set in the first
[第1試薬セット部]
第1試薬セット部5内には、前記検体セット部33と同様に図示しない冷却手段が配設されており、当該第1試薬セット部5上面の凹所にセットされる容器内の検体や、CDK1抗原(キャリブレーション1)、CDK2抗原(キャリブレーション2)や、蛍光標識されたCDK1抗体、蛍光標識されたCDK2抗体等を一定の温度に保っている。本実施形態では、縦5列、横4列、合計20箇所の凹所が設けられており、最大20個の容器をセットすることができるようになっている。
[First reagent setting unit]
A cooling means (not shown) is arranged in the first
[第2試薬セット部]
前記第1試薬セット部5の隣には、第2試薬セット部6が配設されている。この第2試薬セット部6には、前記第1試薬セット部5と同様に複数の凹所が形成されている。これら凹所内に、バッファー、基質溶液、蛍光増強試薬等が入れられた容器がセットされる。
また、測定装置Aによる処理に先立って、チップセット部1にタンパク質固相用チップがセットされるとともに、活性測定ユニット2にカラムがセットされる。
[Second reagent set part]
Next to the first
Prior to the processing by the measuring apparatus A, the protein solid phase chip is set in the
[チップセット部]
チップセット部1は、アルミニウム製のブロックからなっており、図2〜3に示されるように、上面にタンパク質固相用チップ101を載置するための凹部102を有するとともに、底部に3つの吸引口103を有している。より詳細には、チップセット部1は、上面に長方形の第1凹部102と、この第1凹部102の底部に同じく長方形の3つの第2凹部104とを備えている。この第2凹部104は、隔壁105により互いに独立した状態にされており、前記タンパク質固相用チップ101をチップセット部1に載置したとき、互いに非連通状態になる。前記第1凹部102の底面には前記第2凹部104の周縁に長方形の枠状のゴム製弾性ガスケット106が配設されている。
[Chipset part]
The chip set
前記第2凹部104は、その底部に、十字形の溝107と、底部中心に吸引口103とを備え、前記溝107の溝底は第2凹部104の周縁から中心に向かって深くなるように傾斜している。吸引口103は、外部の吸引用空圧源11へ接続するために設けられたニップル108と連通している。このニップル108には、一端が前記吸引用空圧源11側に接続されたチューブ109の他端が接続されている。このチューブ109には、開閉バルブ110が配設されている。
そして、後に詳述するタンパク質固相用チップ101は、第1凹部102の底面ガスケット106を介して水平に装填される。タンパク質固相用チップ101の各ウェルにタンパク質含有試料液が注入又は滴下された後、吸引ポンプが作動する。
The
The protein
これにより、タンパク質固相用チップ101が第1凹部102の底面へガスケット106を介して気密的に吸着されるとともに、各ウェル内の試料液が後述する多孔質膜を介して吸引され、測定目的のタンパクが当該多孔質膜に固相形成される。なお、図2〜3において、130は、タンパク質固相用チップ101を第1凹部102の底面に押し付けて固定するための押付け機構である。この押付け機構130は、タンパク質固相用チップ101が第1凹部102上に載置された後、図中矢印方向にスライドさせることにより、その上部がタンパク質固相用チップ101の上面を押し付けて第1凹部102に固定する。
As a result, the protein solid-
前記タンパク質固相用チップ101は、図4〜5に示されるように、多孔質膜111及びろ紙112と、これら多孔質膜111及びろ紙112を挟持するための上部プレート113及び下部プレート114とで構成されている。このタンパク質固相用チップ101が、サイクリン依存性キナーゼの抗体を含む抗体溶液と、生体試料(検体)とを接触させる機能を有している。
As shown in FIGS. 4 to 5, the protein
図4〜5に示されるように、上部プレート113は、3つの互いに独立したプレート、すなわち第1上部プレート113a、第2上部プレート113b、及び第3上部プレート113cから構成されている。各上部プレートは、長方形の板状を呈しており、第1上部プレート113a及び第2上部プレート113bは、いずれもマトリックス状に4行3列に配列された12個の長円形の貫通孔115が穿設されており、第3上部プレート113cは同じくマトリックス状に4行4列に配列された16個の長円形の貫通孔115が穿設されている。各上部プレートは、複数の貫通孔が形成された、試料処理のための互いに独立した領域を有している。また、各上部プレートの底面には、短辺に沿って溝116が形成されている。
4-5, the
一方、長方形の板状の下部プレート114には、前記上部プレート113a、113b、113cの各貫通孔115に対応する位置にそれぞれマトリックス状に配列された合計40個の長円形の貫通孔117が形成されている。貫通孔117は、貫通孔115と同じ形状及び断面積を有している。下部プレート114は、前記上部プレート113a、113b、113cの各領域に対応した、複数の貫通孔が形成された領域を有している。
下部プレート114の上面には、40個の貫通孔117の周囲を1周する畝状の凸部118、及び貫通孔117を上部プレート113a、113b、113cの各領域に対応させて3つの領域に区画する隔壁119が形成されている。そして、前記凸部118及び隔壁119によりその内側に3つの長方形の多孔質膜設置領域が区画される。なお、前記上部プレート113及び下部プレート114は、例えば塩化ビニル樹脂で作製することができる。
On the other hand, a rectangular plate-like
On the upper surface of the
図2〜5に示されるように、下部プレート114の多孔質膜設置領域に多孔質膜111とろ紙(フィルター)112との積層体を載置し、ついで各上部プレート113a、113b、113cの溝116を順次対応する下部プレート114の凸部118に嵌めるようにして、当該上部プレート113a、113b、113cを下部プレート114に装着することによりタンパク質固相用チップ101を形成することができる。これにより、各貫通孔115と各貫通孔117とが互いに同軸上に配置される。
なお、前述したタンパク質固相用チップは、上部プレートが3つに分割されており、3つの領域を独立して吸引することができるが、上部プレートの数は2であってもよいし、4以上であってもよく、本発明において特に限定されるものではない。測定項目の数や検体の数を考慮して、適宜選定することができる。
2-5, the laminated body of the porous membrane 111 and the filter paper (filter) 112 is mounted in the porous membrane installation area of the
In the protein solid phase chip described above, the upper plate is divided into three, and the three regions can be sucked independently. However, the number of the upper plates may be two or four. It may be the above and is not particularly limited in the present invention. The number can be appropriately selected in consideration of the number of measurement items and the number of samples.
[活性測定用試料調製ユニット]
活性測定用試料調製ユニット2は、図6〜10に示されるように、それぞれがカラム201及び流体マニホールド213を備えた複数の試料調製部211からなっており、CDKの活性値を測定するのに用いられる。
[Sample preparation unit for activity measurement]
As shown in FIGS. 6 to 10, the activity measurement
図6に示されるカラム201は、塩化ビニル樹脂で作製された円筒体からなっており、内部には、液体試料中の目的物質を単離するために用いる担体206を保持する担体保持部202と、この担体保持部202に液体試料を導入する液体試料を受け入れて貯留するための液体貯留部204とを有している。前記カラム201は、外部から液体試料を注入又は採取可能な開口205を液体貯留部204の上部に備え、担体保持部202の下部に流体マニホールド213へ液体試料を導入するとともに、流体マニホールド213から液体試料を受け入れる接続流路203を有している。前記カラム201が、所定の基質を含む基質溶液と、生体試料(検体)とを接触させる手段を構成している。
A
担体206は、円柱形のモノリスシリカゲルからなっており、このモノリスシリカゲルは、粒子担体とは異なり、3次元ネットワーク状の骨格とその空隙が一体となった構造を有している。また、モノリスシリカゲルには、所定のCDK抗体が固定されている。担体206はカラム201の下部開口から担体保持部202に挿入され、Oリング207を介して固定用パイプ208によって弾性的に押圧されて支持される。なお、前記固定用パイプ208は、カラム201の下部開口から圧入され、固定用パイプ208とOリング207の孔が接続流路203を形成する。
The
また、カラム201の下端には当該カラム201を前記試料調製部211に装填して固定するための装填用フランジ209が形成されている。このフランジ209は、直径Dの円盤状のフランジの両側を幅W(W<D)になるように平行に切り欠いて形成された長円形のフランジである。
A
図7は試料調製部211の斜視図であり、同図に示されるように、試料調製部211は、L字形の支持プレート212を備え、この支持プレート212には流体マニホールド213と、シリンジポンプ214と、減速機付きステッピングモータ215とが固定されている。
ステッピングモータ215の出力軸にはスクリューシャフト216が接続されている。そして、このスクリューシャフト216に螺合する駆動アーム217がシリンジポンプ214のピストン218の先端に接続されている。ステッピングモータ215によりスクリューシャフト216が回転すると、ピストン218が上下運動するようになっている。シリンジポンプ214と流体マニホールド213とは、コネクタ219、220を介して送液チューブ250により接続されている。また、シリンジポンプ214は、コネクタ220aを介して送液チューブ220bにより、流路を満たすための液体(洗浄液)が収容されているチャンバ234(図10参照)と接続されている。
FIG. 7 is a perspective view of the
A
図8〜9に示されるように、流体マニホールド213は、前記カラム201の下部開口が接続されるカラム接続部221を備えている。
流体マニホールド213は、内部に流路223を備え、下面に、流路223とカラム接続部221との間を開閉する電磁バルブ225を備えている。また、流体マニホールド213は、側面にコネクタ220を接続するためのコネクタ接続用ねじ穴226を有しており、このねじ穴226は流路223に接続されている。
As shown in FIGS. 8 to 9, the
The
図10は試料調製部211の流体回路図であり、流体マニホールド213にシリンジポンプ214がコネクタ220を介して接続された状態を示している。そして、シリンジポンプ214には、電磁バルブ233を介してチャンバ234が接続され、当該チャンバ234には陽圧源235から陽圧が印加されている。
FIG. 10 is a fluid circuit diagram of the
ここで、カラム201を流体マニホールド213に装填する方法を説明する。
図8〜10に示されるように、流体マニホールド213の上面には、カラム201の下端を受け入れるカラム装填用凹部227が形成され、この凹部227の底部の中心がカラム接続部221に貫通するとともに底部の円周にOリング228が装着されている。また、流体マニホールド213の上面には2枚の断面L字形押さえ板229、230がカラム装填用凹部227を中心として前記幅Wより広くDより狭い間隔で平行に固定されている。
Here, a method of loading the
As shown in FIGS. 8 to 10, a
流体マニホールド213に固定されたカラム201内部の担体206を通過した検体又は試薬が流体マニホールド213内部の流路223を満たす液体(洗浄液)と接触して希釈されることを防ぐため、カラム201をカラム装填用凹部227に固定する前に電磁バルブ225を開き(電磁バルブ233は閉じる)、約16μL分だけシリンジポンプ214を吸引動作させる。これによって、カラム接続部221の液面が下がりエアギャップが形成される。
In order to prevent the specimen or reagent that has passed through the
その後、カラム201をカラム装填用凹部227に、フランジ209が押さえ板229、230の間を通るように装填し、時計方向又は反時計方向に90度だけ回転させる。これによって、フランジ209の直径Dの部分が押さえ板229、230に係合するとともに、Oリング228の弾性によりフランジ209が押さえ板229、230により固定される。なお、カラム201を除去する場合には、カラム201を押さえながら、左右いずれかの方向に90度だけ回転させればよい。
After that, the
カラム201が試料調製部211の流体マニホールド213に装填されるとき、気泡混入を防止するため当該流体マニホールド213の凹部227は手作業又は自動で分注された流体で満たされているが、カラム201の先端を凹部227に挿入するとその体積によって流体が溢れ出す。この液体が周辺へ流出することを防止するために、カラム装着用凹部227の周囲に溢れ液貯留凹部231が設けられており、溢れ液貯留凹部231の一部にピペットにより溢れ液を吸引排出するための溢れ液排出凹部232が設けられている。
各種の検体及び試薬は、ピペットを備えた分注機構部3によって、所定の箇所に、又は所定の箇所から注入又は吸引される。
When the
Various specimens and reagents are injected or aspirated into or from a predetermined location by the
ここで、カラム201の上部開口205の検体又は試薬が注入された場合の動作について説明する。開口205に検体又は試薬が注入されると、まず電磁バルブ225が開き(電磁バルブ233は閉)、シリンジポンプが吸引動作する。これによって、エアギャップと検体又は試薬は、電磁バルブ225を通過し、シリンジポンプ側に吸引される。つぎにシリンジポンプが吐出動作をする。これによって、検体又は試薬は、電磁バルブ225を通過し、カラム201内に送液される。
Here, the operation when the sample or reagent in the
[分注機構部]
分注機構部3は、図1に示されるように、ピペットX方向移動用のフレーム352と、ピペットY方向移動用のフレーム353と、ピペットZ方向移動用のプレート354とを備えている。
フレーム352は、プレート354を矢印X方向に移動させるためのスクリューシャフト355と、プレート354を支持して摺動させるためのガイドバー356と、スクリューシャフト355を回転させるステッピングモータ357を備えている。
[Dispensing mechanism]
As shown in FIG. 1, the
The
フレーム353は、フレーム352を矢印Y方向に移動させるためのスクリューシャフト358と、フレーム352を支持して摺動させるためのガイドバー359と、スクリューシャフト358を回転させるステッピングモータ361とを備えている。
また、プレート354は、ピペット362を支持するアーム368を矢印Z方向に移動させるためのスクリューシャフト367と、アーム368を支持して摺動させるためのガイドバー、スクリューシャフト367を回転させるステッピングモータ370とを備えている。
なお、本実施形態では、分注機構部3が一対のピペット362を備えているので、同時に2つの検体容器に試薬等を注入したり、同時に2つの検体容器から内容物を吸引したりすることができ、測定処理を効率よく行うことができる。
The
The
In this embodiment, since the
[流体部]
装置本体部20の背部には、図1に示されるように、前記ピペット362を洗浄するためのピペット洗浄槽8及び各試料調製部211等に接続されて流体を操作する流体部9が配設されている。この流体部9は、図10に示されるように、各試料調製部211の電磁バルブ225、洗浄液チャンバからシリンジ214に液体を充填する際に流体を制御する電磁バルブ233、ピペット362による液体の吸引、吐出の際に流体を制御する電磁バルブ、廃液槽7におけるピペット362から廃棄される液体を吸引する際に流体を制御する電磁バルブ、及びピペット洗浄槽8においてピペット362を洗浄する際に流体を制御する電磁バルブを備えている。
[Fluid part]
As shown in FIG. 1, a
[検出部]
検出部4は、タンパク質固相用チップ101の多孔質膜111に捕捉されたタンパク質量を反映する、結合した蛍光標識物質に基づく蛍光量、及びリン酸基の量を反映する蛍光標識物質に基づく蛍光量を測定するものであり、前記タンパク質固相用チップ101に励起光を照射し、発生する蛍光を検出し、検出した蛍光の強度に対応する大きさの電気信号を本体制御部10に出力する。検出部4としては、一般に用いられている、光源部、照明系及び受光系からなるものを適宜採用することができる。
[Detection unit]
The
[データ処理部]
図11は、本実施形態の診断支援システムの部分構成(診断支援システムを制御する制御系)を示すブロック図である。パーソナルコンピュータであるデータ処理部12は、図11に示されるように、制御部77と、入力部78と、表示部79とを備えている。
[Data processing section]
FIG. 11 is a block diagram illustrating a partial configuration (a control system that controls the diagnosis support system) of the diagnosis support system according to the present embodiment. As shown in FIG. 11, the
制御部77は、後述する本体制御部10に装置の動作開始信号を送信するための機能を有している。制御部77から動作開始の指令が送信されると、本体制御部10は、各試料調製部211のステッピングモータ215を駆動するための駆動信号、第1試薬セット部5の温度調節をするための駆動信号、ステッピングモータ357、361、370を駆動するための駆動信号、及び流体部9にある電磁バルブを駆動するための駆動信号を出力する。また、制御部77は、検出部4で得られた検出結果を分析するための機能を有している。検出部4で得られた検出結果は、本体制御部10へ送信される。本体制御部10は、検出部4で得られた検出結果を制御部77に送信する。
The
表示部79は、制御部77で得られた分析結果等を表示するために設けられている。
The
次に、データ処理部12として用いるパーソナルコンピュータの構成について詳細に説明する。制御部77は、図12に示すように、CPU91a、ROM91b、RAM91c、入出力インターフェース91d、画像出力インターフェース91e、通信インターフェース91f、ハードディスク91gから主として構成されている。CPU91a、ROM91b、RAM91c、入出力インターフェース91d、画像出力インターフェース91e、及び通信インターフェース91f、ハードディスク91gは、電気信号を通信することが可能であるように電気信号線(バス)で接続されている。
Next, the configuration of the personal computer used as the
CPU91aは、ROM91bに記憶されているコンピュータプログラム及びRAM91cにロードされたコンピュータプログラムを実行することが可能である。そして、CPU91aが後述するようなアプリケーションプログラム91hを実行して後述する動作を実行することにより、パーソナルコンピュータをデータ処理部12として機能させることができる。
ROM91bは、マスクROM、PROM、EPROM、EEPROM等によって構成されており、CPU91aに実行されるコンピュータプログラム及びこれに用いるデータ等が記録されている。
The
The
RAM91cは、SRAM又はDRAM等によって構成されている。RAM91cは、ROM91b及びハードディスク91gに記録されているコンピュータプログラムの読み出しに用いられる。また、これらのコンピュータプログラムを実行するときに、CPU91aの作業領域として利用される。
The
ハードディスク91gには、オペレーティングシステム及びアプリケーションプログラム等、CPU91aに実行させるための種々のコンピュータプログラム及びそのコンピュータプログラムの実行に用いるデータがインストールされている。さらに、CDK1及びCDK2の発現量及び活性値を取得し、取得されたCDK1及びCDK2の発現量及び活性値から、CDK1比活性及びCDK2比活性を算出し、算出されたCDK1比活性及びCDK2比活性に基づいて参照範囲を決定し、決定された参照範囲内にあるCDK1比活性及びCDK2比活性を持つ他のがん患者のサンプルデータを特定し、特定されたサンプルデータに基づいて再発率を算出し、算出された再発率に基づいて再発のリスクを判定し、算出された再発率の結果や再発リスクの判定結果を含む画面を生成し、生成した画面を表示部79に表示させるためのアプリケーションプログラム91hも、このハードディスク91gにインストールされている。
The
さらに、前記発現量及び活性値を取得するために、前記ハードディスク91gは、蛍光強度を発現量又は活性値に変換するための変換データである検量線を記憶する第1データベース91iを含んでいる。なお、検量線は、発現量又は活性値の測定ごとに求めるようにしてもよい。また、ハードディスク91gの第1データベース91iには、前記参照範囲を決定するための計算に用いるためのデータ、参照範囲のデフォルト値のデータ、過去に入力され用いられた参照範囲の設定値のデータが記憶されている。さらに、ハードディスク91gの第1データベース91iには、算出された再発率と比較することにより再発リスクを判定するための基準値が記憶されている。
Further, in order to acquire the expression level and activity value, the
また、ハードディスク91gは、がん患者の前記活性値や発現量等の測定値と、当該患者の再発の有無、術後治療に関する情報、生存に関する情報等の臨床情報とが対応付けられたサンプルデータを記憶する第2データベース91jを含んでいる。
The
また、ハードディスク91gには、たとえば、米マイクロソフト社が製造販売するWindows(登録商標)等のグラフィカルユーザインタフェース環境を提供するオペレーティングシステムがインストールされている。以下の説明においては、本実施形態に係るアプリケーションプログラム91hは上記オペレーティングシステム上で動作するものとしている。
The
入出力インターフェース91dは、たとえば、USB、IEEE1394、RS−232C等のシリアルインタフェース、SCSI、IDE、IEEE1284等のパラレルインタフェース、及びD/A変換器、A/D変換器等からなるアナログインタフェース等から構成されている。入出力インターフェース91dには、入力部78が接続されており、ユーザがその入力部78を使用することにより、データ処理部12にデータを入力することが可能である。
The input /
通信インターフェース91fは、たとえば、Ethernet(登録商標)インターフェースである。データ処理部12は、その通信インターフェース91fにより、所定の通信プロトコルを使用して本体制御部10との間でデータの送受信が可能である。
画像出力インターフェース91eは、LCD又はCRT等で構成された表示部79に接続されており、CPU91aから与えられた画像データに応じた映像信号を表示部79に出力するようになっている。表示部79は、入力された映像信号にしたがって、画像(画面)を表示する。
The
The
[本体制御部]
装置本体部20の背部には、各試料調製部211、検出部4、ステッピングモータ357、361、370、流体部9等に接続され、これらを制御するための本体制御部10が配設されている。
[Main unit control unit]
On the back of the apparatus
前記本体制御部10は、図13に示されるように、CPU301aと、ROM301bと、RAM301cと、通信インターフェース301dと、回路部301eとを備えている。
CPU301aは、ROM301bに記憶されているコンピュータプログラム及びRAM301cに読み出されたコンピュータプログラムを実行することが可能である。
ROM301bは、CPU301aに実行させるためのコンピュータプログラム及び当該コンピュータプログラムの実行に用いるデータ等を記憶している。
As shown in FIG. 13, the main
The
The
RAM301cは、ROM301bに記憶しているコンピュータプログラムの読み出しに用いられる。また、これらのコンピュータプログラムを実行するときに、CPU301aの作業領域として利用される。
通信インターフェース301dは、たとえば、Ethernet(登録商標)インターフェースである。本体制御部10は、その通信インターフェース301dにより、所定の通信プロトコルを使用してデータ処理部12との間でデータの送受信が可能である。
The
The
回路部301eは、複数の駆動回路と信号処理回路とを備えている(図示せず)。駆動回路は、試料調製部211、第1試薬セット部5、検出部4、ステッピングモータ357,361,370、流体部9にそれぞれ対応して設けられている。各駆動回路は、CPU301aから与えられる指示データに応じて、対応するユニット(試料調製部211に対応する駆動回路であれば、試料調製部211)を制御するための制御信号(駆動信号)を生成し、上記ユニットへ制御信号を送信する。また、ユニットに設けられたセンサの出力信号が駆動回路に与えられ、駆動回路はこの出力信号をデジタル信号に変換してCPU301aへと与える。CPU301aは、与えられたセンサの出力信号に基づいて上述の指示データを生成する。
The
信号処理回路は、検出部4に接続されている。検出部4からは、蛍光強度を示す検出信号が出力され、この検出信号が信号処理回路に与えられる。信号処理回路は、検出信号に対してノイズ除去処理、増幅処理、及びA/D変換処理等の信号処理を実行する。信号処理の結果得られた検出結果のデータは、CPU301aに与えられる。
The signal processing circuit is connected to the
[3]がんの診断支援
つぎに、本実施形態に係る診断支援システムの動作を説明する。
[3] Cancer Diagnosis Support Next, the operation of the diagnosis support system according to the present embodiment will be described.
(1)可溶化装置Bによる前処理
測定装置Aによる処理に先立って、がん患者から摘出した悪性腫瘍を含む組織から、可溶化装置Bを用いて液状の検体を採取する。その手順としては、まず、前記組織がピンセットを用いて容器に投入される。ついで、この容器が図1に示される可溶化装置Bの検体セット部33にセットされ、操作部31のスタートボタンが押されると、ペッスル34が所定位置まで下降し、容器内の組織を当該容器の底部に押し付ける。
(1) Pretreatment with solubilizer B Prior to the treatment with the measuring device A, a liquid specimen is collected from the tissue containing the malignant tumor extracted from the cancer patient using the solubilizer B. As the procedure, first, the tissue is put into a container using tweezers. Next, when this container is set in the sample setting section 33 of the solubilizer B shown in FIG. 1 and the start button of the
この状態で、可溶化液(界面活性剤及びタンパク質分解酵素阻害剤等を含有する緩衝液等)が自動又はマニュアルで容器内に注入される。その後、ペッスル34の回転により前記組織がすりつぶされる。所定時間経過後にペッスル34の駆動を停止させ、さらに当該ペッスル34を上方に移動させた後に容器が検体セット部33から取り出される。次に、容器内の可溶化された内容物が遠心分離機にかけられ、上澄み液が検体としてマニュアルで採取される。
In this state, a solubilizing solution (such as a buffer containing a surfactant and a protease inhibitor) is automatically or manually injected into the container. Thereafter, the tissue is ground by the rotation of the
(2)測定装置Aへの検体等のセッティング
前記上澄み液を2つの検体容器に入れ、互いに異なる希釈倍率で希釈した後に、当該検体容器を第1試薬セット部5の所定位置にセットする。2つの検体のうち、一方は発現量測定用の検体であり、他方は活性値測定用の検体である。
また、前記タンパク質固相用チップ101がチップセット部1にセットされるとともに、8つのカラム201が活性測定ユニット2の試料調製部211にそれぞれにセットされる。
(2) Setting of sample or the like in measuring apparatus A The supernatant liquid is put into two sample containers and diluted at different dilution ratios, and then the sample container is set at a predetermined position of the first
In addition, the protein
(3)診断支援システムによる処理の全体フロー
診断支援システムによる処理の全体のフローを図15〜図20に示す。なお、以下のフローチャート中の判断において、「Yes」及び「No」を図示しない場合は、下がYes、右(左)がNoである。また、以下に説明する処理は、制御部77及び本体制御部10によって制御される処理である。
(3) Overall Flow of Processing by Diagnosis Support System FIGS. 15 to 20 show an overall flow of processing by the diagnosis support system. In addition, in the determination in the following flowchart, when “Yes” and “No” are not illustrated, the bottom is Yes and the right (left) is No. The processes described below are processes controlled by the
まず、装置本体20の電源が投入されると、本体制御部10の初期化が行われる(ステップS1)。この初期化動作では、プログラムの初期化や装置本体20の駆動部分の原点位置復帰等が行われる。
First, when the apparatus
パーソナルコンピュータであるデータ処理部12の電源が投入されると、制御部77の初期化が行われる(ステップS201)。この初期化動作では、プログラムの初期化等が行われる。初期化が完了すると、入力用画面の表示を指示するための入力画面表示ボタンを含むメニュー画面(図示せず)が表示部79に表示される。ユーザは、入力部78を操作することによって、メニュー画面の入力用画面の表示を指示するための入力画面ボタンを選択することができる。
When the
つぎに、ステップS202において、データ処理部12の制御部77によって、入力用画面が表示中であるか否かの判断が行われる。制御部77は、入力用画面が表示中であると判断した場合(Yes)にはステップS205へ処理を進め、入力用画面が表示中でないと判断した場合(No)にはステップS203へ処理を進める。
ついで、ステップS203において、データ処理部12の制御部77によって、入力用画面の表示指示が行われたか否か(すなわち、メニュー画面の入力用画面の表示を指示するための入力画面ボタンが選択されたか否か)が判断される。制御部77は、入力用画面の表示指示が行われたと判断した場合(Yes)にはステップS204へ処理を進め、入力用画面の表示指示が行われなかったと判断した場合(No)にはステップS301へ処理を進める。
Next, in step S202, the
In step S203, the
ついで、ステップS204において、データ処理部12の制御部77によって、入力用画面が表示部79に表示される。
In step S <b> 204, the input screen is displayed on the
つぎに、ステップS205において、ユーザが入力部78を操作することによって、被検がん患者のID番号や年齢などの検体情報が入力される。その後、ステップS206において、入力部78で入力された情報が、ハードディスク91gに記憶される。そして、ユーザが、パーソナルコンピュータ12の入力部78を操作して入力用画面に表示されたスタートボタンを選択することにより、測定開始の指示が行われる。
Next, in step S205, when the user operates the
ついで、ステップS207において、制御部77によって、測定開始の指示が行われたか否かが判断される。制御部77は、測定開始の指示が行われたと判断した場合(Yes)には、ステップS208へ処理を進め、測定開始の指示が行われなかったと判断した場合(No)にはステップS301へ処理を進める。そして、ステップS208において、測定開始信号が制御部77から本体制御部10へ送信される。
ついで、ステップS2において、本体制御部10によって測定開始信号の受信が行われたか否かの判断をする。本体制御部10が、測定開始信号の受信が行われたと判断した場合(Yes)にはステップS3へ処理を進め、測定開始信号の受信が行われなかったと判断した場合(No)にはステップS8へ処理を進める。
In step S207, the
Next, in step S2, it is determined whether or not the measurement control signal has been received by the main
ついで、ステップS3において、発現量測定用試料の調製処理が行われる。このステップS3では、第1試薬セット部5にセットした検体容器から検体が吸引される。そして、吸引された検体に所定の処理が施されて、発現量測定用試料が調製される。
さらに、ステップS4において、活性値測定用試料の調製処理が行われる。ここでは、第1試薬セット部5にセットした検体容器から検体が吸引される。そして、吸引された検体に所定の処理が施されて、活性値測定用試料が調製される。
Next, in step S3, a preparation process for the expression level measurement sample is performed. In step S3, the sample is aspirated from the sample container set in the first
Furthermore, in step S4, a preparation process for the activity value measurement sample is performed. Here, the sample is aspirated from the sample container set in the first
ついで、ステップS5において、発現量測定用試料及び活性値測定用試料を含むタンパク質固相用チップ101がセットされたチップセット部1が、図1に示される位置から検出部4の中に移動する。
ついで、ステップS6において、タンパク質固相用チップ101の各ウェルに励起光が照射され、前記各試料から放射される蛍光が検出される。
そして、ステップS7において、検出された検出結果が、本体制御部10からパーソナルコンピュータ12の制御部77に送信される。
Next, in step S5, the chip set
In step S6, each well of the protein
In step S <b> 7, the detected detection result is transmitted from the main
つぎに、ステップS209において、制御部77によって、検出結果の受信が行われたか否かが判断される。制御部77は、検出結果の受信が行われたと判断した場合(Yes)には、ステップS210に処理を進める。一方、検出結果の受信が行われなかった場合には、制御部77は再びステップS209の処理を実行する。
Next, in step S209, the
そして、ステップS210において、制御部77によって、取得した検出結果から解析処理が実行される。
In step S210, the
その後、ステップS211において、制御部77によって、ステップS210で算出された再発率の結果、及び判定された再発リスクの結果等の解析結果が出力され、表示部79に表示される。
Thereafter, in step S211, the
図21及び図22に、診断支援情報の表示画面の一例を示す。
図21に例示される表示画面において、表示部401には、診断対象となるがん患者のID番号、年齢等が表示される。また、情報表示部402には、診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値として、CDK1比活性値及びCDK2比活性値が表示される。表示ボタンアイコン403は、無治療、ホルモン療法、化学療法等の悪性腫瘍摘出後の治療群毎の情報の表示画面(図22)に移行するための表示ボタンアイコンである。悪性腫瘍摘出後の治療群毎の情報の表示画面(図22)は、ユーザが、表示ボタンアイコン403を押すと、図21の画面が表示されるウィンドウとは別のウィンドウとして表示される。なお、別ウィンドウとして表示されるのではなく、図21の画面から図22の画面に切り替わって表示されるようにしてもよい。分布図表示部404には、他のがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値として、CDK1比活性値とCDK2比活性値との分布図が表示される。この分布図には、診断対象となるがん患者の悪性腫瘍のCDK1比活性値及びCDK2比活性値に対応する点が描画されている。さらに、分布図には、被検がん患者の測定値601(悪性腫瘍のCDK1比活性値及びCDK2比活性値)に基づいて決定された参照範囲602が描画されている。
なお、図21に例示される表示画面において、分布図表示部404には、CDK1比活性値とCDK2比活性値との2次元分布図に代えて、3次元分布図が表示されてもよい。この場合、CDK1比活性値とCDK2比活性値とに加え、他のパラメータが座標軸となる。
図22は、悪性腫瘍摘出後のホルモン治療群の情報の表示画面の例を示す。情報表示部405には、再発率、再発リスク等の情報が表示される。
本実施形態の診断支援システムによれば、近似する比活性を示す他のがん患者の再発の有無の情報に基づき、再発率が算出される。ここで算出された再発率は、診断対象となるがん患者の予想される再発率として示すことができる。したがって、ユーザは、本実施形態の診断支援システムにより、より精度の高い診断支援情報を得ることができる。情報表示部406には、Disease Free Survival(無病生存率)等の情報が表示される。
FIG. 21 and FIG. 22 show examples of display screens for diagnosis support information.
In the display screen illustrated in FIG. 21, the
In the display screen illustrated in FIG. 21, the distribution
FIG. 22 shows an example of a display screen for information on hormone treatment groups after malignant tumor removal. The
According to the diagnosis support system of the present embodiment, the recurrence rate is calculated based on information on the presence or absence of recurrence of other cancer patients exhibiting similar specific activities. The recurrence rate calculated here can be shown as an expected recurrence rate of a cancer patient to be diagnosed. Therefore, the user can obtain more accurate diagnosis support information by the diagnosis support system of the present embodiment. The
ついで、ステップS301において、制御部77によって、再発リスクを判定するための基準値や、参照範囲を決定するための値(半径)等の設定値の入力画面が表示中であるか否かの判断が行われる。制御部77は、設定値の入力画面が表示中であると判断した場合(Yes)にはステップS305へ処理を進め、設定値の入力画面が表示中でないと判断した場合(No)にはステップS302へ処理を進める。
In step S301, the
ついで、ステップS302において、制御部77によって、設定値の入力画面の表示指示が行われたか否かが判断される。制御部77は、設定値の入力画面の表示指示が行われたと判断した場合(Yes)にはステップS303へ処理を進め、設定値の入力画面の表示指示が行われていないと判断した場合(No)にはステップS307へ処理を進める。
ついで、ステップS303において、制御部77のRAM91gが、ハードディスク91gの第1データベース91iに記憶されている再発リスクを判定するための基準値や参照範囲を決定するための値(半径)等のデータを読み出す。
In step S302, the
In step S303, the
そして、ステップS304において、制御部77によって、設定値の入力画面が表示部79に表示される。ここで、ユーザが入力部78を操作することによって、基準値や参照範囲を決定するための値(半径)等の設定値について新たな値が入力される。
In step S <b> 304, the
ついで、ステップS305において、制御部77によって、設定値の入力が行われたか否かが判断される。制御部77は、設定値の入力が行われたと判断した場合(Yes)にはステップS306へ処理を進め、設定値の入力が行われなかったと判断した場合(No)にはステップS307へ処理を進める。
ついで、ステップS306において、入力された新たな設定値がハードディスク91gの第1データベース91iに記憶される。
In step S305, the
In step S306, the input new setting value is stored in the first database 91i of the
ついで、ステップS307において、制御部77によって、シャットダウンする指示を受け付けているか否かが判断される。制御部77は、シャットダウンする指示を受け付けていると判断した場合(Yes)にはステップS308に処理を進め、シャットダウンする指示を受け付けていないと判断した場合(No)にはステップS202に戻る。そして、ステップS308において、シャットダウン信号が制御部77から本体制御部10へ送信される。ついで、ステップS309において、制御部77によりパーソナルコンピュータ12のシャットダウンの処理が行われ、処理が完了する。
In step S307, the
また、ステップS8において、本体制御部10によって、シャットダウン信号の受信が行われたか否かの判断が行われる。本体制御部10は、シャットダウン信号の受信が行われたと判断した場合(Yes)にはステップS9に処理を進め、シャットダウン信号の受信が行われていないと判断した場合(No)にはステップS2に戻る。そして、ステップS9において、本体制御部10により、装置本体20のシャットダウンが行われ、処理が終了する。
In step S8, the main
(4)発現量測定用試料の調製処理
前記ステップS3における発現量測定用試料の調製処理の一例のフローを図17に示す。
まず、ステップS21において、タンパク質固相用チップの各ウェルに予め貯留している保存液が排出され、各ウェル内が洗浄される。洗浄は、分注機構部3のピペットを介して洗浄液を上方から各ウェルに注入し、ついでタンパク質固相用チップの下方から陰圧により注入された洗浄液を、多孔質膜を通して吸引することによって行われる。以下の洗浄工程も同様である。
(4) Expression Level Measurement Sample Preparation Processing FIG. 17 shows a flow of an example of expression level measurement sample preparation processing in Step S3.
First, in step S21, the preserving solution stored in advance in each well of the protein solid phase chip is discharged, and the inside of each well is washed. The washing is performed by injecting the washing solution into each well from above through the pipette of the
つぎに、第1試薬セット部5にセットされた検体容器から発現量測定用の検体がピペットで吸引され、この検体は所定の複数のウェルに注入され、ついで検体がタンパク質固相用チップの下方から陰圧により吸引される。これにより、タンパク質固相用チップの多孔質膜にタンパク質が固相化される(ステップS22)。
ついで、ステップS21と同様にして前記所定のウェル内が洗浄液で洗浄される。これによって、タンパク質以外の成分がタンパク質固相用チップの多孔質膜から取り除かれる(ステップS23)。
Next, a sample for expression level measurement is aspirated from the sample container set in the first
Next, the inside of the predetermined well is cleaned with a cleaning liquid in the same manner as in step S21. Thereby, components other than protein are removed from the porous membrane of the protein solid phase chip (step S23).
その後、ブロッキング液が前記所定のウェル内に注入され、15分以上(例えば、30分間)放置された後にウェル内に残っているブロッキング液が排出される(ステップS24)。これにより、タンパク質が固相化されていない多孔質膜の部位に、蛍光標識されたCDK1抗体(蛍光標識CDK1抗体)、及び蛍光標識されたCDK2抗体(蛍光標識CDK2抗体)が固相化するのを防止することができる。なお、蛍光標識CDK1抗体及び蛍光標識CDK2抗体としては、市販品を使用することができる。 Thereafter, a blocking solution is injected into the predetermined well, and the blocking solution remaining in the well after being left for 15 minutes or longer (for example, 30 minutes) is discharged (step S24). As a result, the fluorescently labeled CDK1 antibody (fluorescently labeled CDK1 antibody) and the fluorescently labeled CDK2 antibody (fluorescently labeled CDK2 antibody) are immobilized on the portion of the porous membrane where the protein is not immobilized. Can be prevented. Commercially available products can be used as the fluorescently labeled CDK1 antibody and the fluorescently labeled CDK2 antibody.
つぎに、蛍光標識CDK1抗体及び蛍光標識CDK2抗体がそれぞれ所定のウェルに注入される。その際、それぞれの蛍光標識抗体について、2つのウェルに注入される。20〜30分経過して、蛍光標識抗体と多孔質膜に固相化されたタンパク質(CDK1、又はCDK2)との反応が終了した後に注入した蛍光標識が排出される(ステップS25)。
最後に、ステップS23と同様にして、前記所定のウェル内が洗浄液で洗浄される(ステップS26)。そして、本体制御部10は、図15で示されるメインルーチンのステップS4へと処理をリターンする。
Next, a fluorescently labeled CDK1 antibody and a fluorescently labeled CDK2 antibody are respectively injected into predetermined wells. At that time, each fluorescently labeled antibody is injected into two wells. After 20 to 30 minutes, the injected fluorescent label is discharged after the reaction between the fluorescently labeled antibody and the protein (CDK1 or CDK2) immobilized on the porous membrane is completed (step S25).
Finally, in the same manner as in step S23, the inside of the predetermined well is cleaned with a cleaning solution (step S26). Then, the main
(5)活性値測定用試料の調製処理
前記ステップS4における活性値測定用試料の調製処理の一例のフローを図18に示す。なお、この活性値測定用試料の調製処理においては、図1に示される活性測定ユニット2として、図中手前側に4つの試料調製部211を備え、図中奥側にも4つの試料調製部211を備えたものが用いられる。この活性測定ユニット2の各試料調製部211を、図中奥側の左から第1試料調製部(Ac1)、第2試料調製部(Ac2)、第3試料調製部(Ac3)、第4試料調製部(Ac4)とし、また、図中手前の左から第5試料調製部(Ac5)、第6試料調製部(Ac6)、第7試料調製部(Ac7)、第8試料調製部(Ac8)とする。
(5) Activity Value Measurement Sample Preparation Process FIG. 18 shows a flow of an example of the activity value measurement sample preparation process in step S4. In the activity value measurement sample preparation process, the
まず、第1〜第8試料調製部(Ac1〜Ac8)のそれぞれについて、開口205に、分注機構部3のピペットで洗浄用の試薬であるバッファーが注入される。そして、第1〜第8試料調製部(Ac1〜Ac8)のそれぞれについて、シリンジポンプ214及び電磁バルブ225が前述したように動作することにより、液体貯留部204のバッファーは、担体206を通過し流路223へ引き込まれた後、再び担体206を通過して液体貯留部204へ戻される。全てのカラム201中の液体貯留部204へ戻されたバッファーは、分注機構部3のピペットで吸引され廃棄される(ステップS31)。
First, for each of the first to eighth sample preparation sections (Ac1 to Ac8), a buffer that is a cleaning reagent is injected into the
つぎに、免疫沈降(抗体とCDKとの免疫反応)をさせる(ステップS32)。まず、第1試薬セット部5にセットされた1つの検体容器から、活性値測定用の検体1が一方のピペットで、活性値測定用の検体2が他方のピペットで吸引される。
そして、検体容器から吸引された活性値測定用の検体1は、図23に示されるように、まず、第1試料調製部(Ac1)の液体貯留部204に注入される。そして、検体1は、シリンジポンプ214及び電磁バルブ225が前述したように動作することにより、第1試料調製部(Ac1)の担体206に送液される。その際、ピストン218を上下に1往復(吸引→排出)させることにより、検体1は、カラム201の担体206を1往復する。
Next, immunoprecipitation (immune reaction between antibody and CDK) is performed (step S32). First, from one sample container set in the first
Then, the
一方、検体容器から吸引された活性値測定用の検体2は、まず、第5試料調製部(Ac5)の液体貯留部204に注入される。そして、検体2は、前記と同様に、第5試料調製部(Ac5)の担体206に送液される。
第1試料調製部(Ac1)及び第5試料調製部(Ac5)のカラム201の担体206には、CDK1の抗体もCDK2の抗体も固定されていない。従って、第1試料調製部(Ac1)及び第5試料調製部(Ac5)では、CDK1及びCDK2は固相化されず、第1試料調製部(Ac1)のカラム201には、CDK1及びCDK2を含む検体1が貯留され、第5試料調製部(Ac5)のカラム201には、CDK1及びCDK2を含む検体2が貯留される。
On the other hand, the
Neither CDK1 antibody nor CDK2 antibody is immobilized on the
つぎに、第1試料調製部(Ac1)のカラム201に貯留された検体1は、ピペットによって吸引され、第3試料調製部(Ac3)の液体貯留部204に注入される。そして、検体1は、前記と同様に、第3試料調製部(Ac3)の担体206に送液される。
一方、第5試料調製部(Ac5)のカラム201に貯留された検体2は、ピペットによって吸引され、第4試料調製部(Ac4)の液体貯留部204に注入される。そして、検体2は、前記と同様に、第4試料調製部(Ac4)の担体206に送液される。
Next, the
On the other hand, the
第3試料調製部(Ac3)及び第4試料調製部(Ac4)のカラム201の担体206には、CDK1の抗体が固定されている。従って、第3試料調製部(Ac3)及び第4試料調製部(Ac4)では、CDK1は固相化されるが、CDK2は固相化されず、第3試料調製部(Ac3)のカラム201には、CDK1を含まずCDK2を含む検体1が貯留され、第4試料調製部(Ac4)のカラム201には、CDK1を含まずCDK2を含む検体2が貯留される。
CDK1 antibody is immobilized on the
つぎに、第3試料調製部(Ac3)のカラム201に貯留された検体1は、ピペットによって吸引され、第7試料調製部(Ac7)の液体貯留部204に注入される。そして、検体1は、前記と同様に、第7試料調製部(Ac7)の担体206に送液される。
Next, the
一方、第4試料調製部(Ac4)のカラム201に貯留された検体2は、ピペットによって吸引され、第8試料調製部(Ac8)の液体貯留部204に注入される。そして、検体2は、前記と同様に、第8試料調製部(Ac8)の担体206に送液される。
第7試料調製部(Ac7)及び第8試料調製部(Ac8)のカラム201の担体206には、CDK2の抗体が固定されている。従って、第7試料調製部(Ac7)及び第8試料調製部(Ac8)では、CDK2が固相化されるので、第7試料調製部(Ac7)のカラム201には、CDK1もCDK2も含まない検体1が貯留され、第8試料調製部(Ac8)のカラム201には、CDK1もCDK2も含まない検体2が貯留される。
On the other hand, the
A CDK2 antibody is immobilized on the
第7試料調製部(Ac7)及び第8試料調製部(Ac8)のカラム201に貯留された検体1及び検体2は、それぞれピペットによって吸引され、廃液槽7に廃棄される。
そして、第1試料調製部(Ac1)及び第5試料調製部(Ac5)は、バックグラウンドの活性測定用に、第3試料調製部(Ac3)及び第4試料調製部(Ac4)は、CDK1の活性測定用に、第7試料調製部(Ac7)及び第8試料調製部(Ac8)は、CDK2の活性測定用に使用される。
The
The first sample preparation unit (Ac1) and the fifth sample preparation unit (Ac5) are used for background activity measurement, and the third sample preparation unit (Ac3) and the fourth sample preparation unit (Ac4) are used for CDK1. For the activity measurement, the seventh sample preparation unit (Ac7) and the eighth sample preparation unit (Ac8) are used for the activity measurement of CDK2.
このように、カラム内に残った検体を他のカラムに注入することによって、少ない検体量で、バックグラウンド活性測定、CDK1活性測定及びCDK2活性測定が可能となる。
ついで、検体中の不要成分を洗浄して取り除くために、バッファー1がカラム201に送液される(ステップS33)。
Thus, by injecting the sample remaining in the column into another column, the background activity measurement, the CDK1 activity measurement and the CDK2 activity measurement can be performed with a small sample amount.
Next, in order to wash away unnecessary components in the specimen, the
その後、前記バッファー1はステップS25で実行される酵素反応に影響を与えることから、かかる酵素反応のためのコンディションを作ることを主目的に、バッファー2がカラム201に送液されて、前記バッファー1の成分が洗い流される(ステップS34)。
つぎに、基質HistonH1とATPγSとを含む基質反応液がカラム201に注入され、ピストン219が1往復させられる(ステップS35)。カラム201中にカラム201の下側から押し出された液は、そのまま貯留される。このステップによって、CDK1又はCDK2を酵素として、HistonH1にリン酸基が導入される。そして、このリン酸基の量は、CDK1又はCDK2の酵素として働きの強さ(すなわち活性値)に左右されることから、前記リン酸基の量を測定することによって、CDK1又はCDK2の活性値を求めることができる。なお、図23に示される第1試料調製部(Ac1)及び第5試料調製部(Ac5)を使用して求められるバックグラウンド活性値は、後述するように、バックグラウンド補正をするために用いられる。
Thereafter, since the
Next, a substrate reaction solution containing the substrate Histon H1 and ATPγS is injected into the
ついで、蛍光標識化試薬が、ピペットを用いてカラム201の上方より直接カラム201内に分注され、HistonH1に導入されたリン酸基に蛍光標識物質が結合させられる(ステップS36)。その際、ピペットが、所定の時間、カラム内の液体の吸入及び吐出を繰り返すことにより、カラム201内の液体が撹拌される。
ステップS26の開始から所定時間(例えば、20分間)経過後に反応停止液が前記蛍光標識化試薬と同様にカラム201に直接分注される。そして、ステップS26と同じく所定の時間、カラム内の液体の吸入及び吐出を繰り返すことによりカラム201内の液体が撹拌される(ステップS37)。これにより、蛍光標識の結合が停止する。
Next, the fluorescent labeling reagent is dispensed directly into the
After a predetermined time (for example, 20 minutes) has elapsed from the start of step S26, the reaction stop solution is directly dispensed into the
つぎに、第1試料調製部(Ac1),第3試料調製部(Ac3),第4試料調製部(Ac4),第5試料調製部(Ac5),第7試料調製部(Ac7)、及び第8試料調製部(Ac8)のカラム201内の液体が、それぞれ、タンパク質固相用チップ101の6つのウェルに分注された後に当該タンパク質固相用チップ101が下方から吸引される(ステップS38)。これによって、蛍光標識物質が結合したリン酸基を有するHistonH1がタンパク質固相用チップ101の多孔質膜に固相化される。
Next, the first sample preparation unit (Ac1), the third sample preparation unit (Ac3), the fourth sample preparation unit (Ac4), the fifth sample preparation unit (Ac5), the seventh sample preparation unit (Ac7), and the After the liquid in the
ついで、前記発現量測定用試料の調製処理におけるステップS21と同様にしてウェルの洗浄が行なわれる(ステップS39)。
最後に、HistonH1に導入されたリン酸基に結合しなかった蛍光標識物質に基づく蛍光を消光(バックグラウンド消光)させるための消光用試薬がウェルに分注され、排出する操作が6回繰り返される(ステップS40)。そして、本体制御部10は、図15で示されるメインルーチンのステップS5へと処理をリターンする。
Next, the wells are washed in the same manner as in step S21 in the expression level measurement sample preparation process (step S39).
Finally, the quenching reagent for quenching the fluorescence (background quenching) based on the fluorescent labeling substance that has not been bound to the phosphate group introduced into the Histon H1 is dispensed into the well, and the discharge operation is repeated six times. (Step S40). Then, the main
(6)解析処理
解析処理のステップ(ステップS210)では、図19及び図20に示されるように、検出部で得られた蛍光強度から解析がなされ、その解析結果が表示部79に出力される。
まず、ステップS401において、制御部77は、検出部4の受光系から本体制御部10を介して、CDK1の活性、CDK1の発現、CDK2の活性、CDK2の発現、バックグラウンドの活性、及びバックグラウンドの発現のそれぞれについて、2回ずつ蛍光強度を取得する。
(6) Analysis Process In the analysis process step (step S210), as shown in FIGS. 19 and 20, an analysis is performed from the fluorescence intensity obtained by the detection unit, and the analysis result is output to the
First, in step S401, the
ついで、ステップS402において、制御部77は、各項目について2つずつ得られた蛍光強度の平均値を算出する。
つぎに、ステップS403において、CDK1活性の蛍光強度(平均値)からバックグラウンド活性(平均値)が差し引かれる。さらに、CDK2活性の蛍光強度(平均値)からバックグラウンド活性(平均値)が差し引かれる。これにより、CDK1活性及びCDK2活性についてバックグラウンド補正が行なわれる。CDK1発現及びCDK2発現についても同様にしてバックグラウンド補正が行なわれる。
Next, in step S402, the
Next, in step S403, the background activity (average value) is subtracted from the fluorescence intensity (average value) of the CDK1 activity. Furthermore, the background activity (average value) is subtracted from the fluorescence intensity (average value) of CDK2 activity. This provides background correction for CDK1 activity and CDK2 activity. Background correction is similarly performed for CDK1 expression and CDK2 expression.
ついで、ステップS404において、制御部77は、それぞれの項目について、検量線を用いて発現量及び活性値を取得する。なお、この検量線は、蛍光強度を発現量又は活性値に変換するためのデータである。この検量線は、試薬のロットが変更されたときに、発現量又は活性値が既知である2種類以上の検体を用いて予め作成され、制御部77のハードディスク91gに記憶される。
つぎに、ステップS405において、制御部77は、以下の式:
CDK1比活性=CDK1活性値/CDK1発現量
CDK2比活性=CDK2活性値/CDK2発現量
に従い、CDK1比活性及びCDK2比活性を算出する。
Next, in step S404, the
Next, in step S405, the
CDK1 specific activity = CDK1 activity value / CDK1 expression level CDK1 specific activity and CDK2 specific activity are calculated according to CDK2 specific activity = CDK2 activity value / CDK2 expression level.
なお、ステップS405は、制御部77が、CDK1比活性及びCDK2比活性に代えて、以下の式:
CDK1比活性の逆数=CDK1発現量/CDK1活性値
CDK2比活性の逆数=CDK2発現量/CDK2活性値
に従って、CDK1比活性の逆数及びCDK2比活性の逆数を算出するステップとしてもよい。
In step S405, the
The reciprocal number of CDK1 specific activity = CDK1 expression level / CDK1 activity value The inverse number of CDK2 specific activity = CDK2 expression level / CDK2 activity value may be calculated as the step of calculating the reciprocal number of CDK1 specific activity and the reciprocal number of CDK2 specific activity.
その後、ステップS406において、制御部77は、参照範囲を決定する。この参照範囲は、診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値(CDK1比活性及びCDK2比活性)に近似する測定値(CDK1比活性及びCDK2比活性)を持つサンプルデータを含む領域である。ここで、参照範囲は、測定値を中心として、予め設定された半径の円として決定される。
Thereafter, in step S406, the
つぎに、ステップS407において、制御部77は、ハードディスク91gの第2データベース91jから、他のがん患者の前記活性値や発現量等の測定値と、当該他の患者の臨床情報とが対応付けられたサンプルデータを読み出す。
Next, in step S407, the
ついで、ステップS408において、制御部77は、ステップS406で決定された参照範囲内に測定値(CDK1比活性及びCDK2比活性)を持つサンプルデータを検索し、特定する。
すなわち、ステップS408では、第2データベース91jにある全サンプルデータのうち、測定値(CDK1比活性及びCDK2比活性)が前記参照範囲内にあるものを特定する処理が行われる。
Next, in step S408, the
In other words, in step S408, a process is performed for identifying the sample values in the
ついで、ステップS409において、制御部77は、ステップS408で特定されたサンプルデータに基づいて、再発率を算出する。具体的には、ステップS408で特定された他のがん患者のサンプルデータに基づいて、参照範囲内に測定値を持つ他のがん患者の総数を集計し、そのうち再発したがん患者が含まれる割合を算出することによって、再発率を算出することができる。なお、ここで再発率は、参照範囲内に測定値を持つ他のがん患者の総数を100としたときの百分率(%)で示される。
Next, in step S409, the
その後、ステップS410及びステップS411において、算出された再発率と予め設定された基準値とを比較することにより、再発リスクの判定が行われる。
まず、ステップS410においては、制御部77は、再発率が第1基準値未満であるか否かを判断し、Yesの場合は、ステップS411に処理を進め、一方、Noの場合は再発リスクが「高」であると判定される。ここで、第1基準値は、14%とした。
Thereafter, in step S410 and step S411, the recurrence risk is determined by comparing the calculated recurrence rate with a preset reference value.
First, in step S410, the
ステップS411においては、制御部77は、再発率が第2基準値未満であるか否かを判断し、Yesの場合は、再発リスクが「低」であると判定され、一方、Noの場合は判定を中止すると判断される。ここで、第2基準値は、5%とした。
In step S411, the
なお、前記基準値は、1つであってもよく、3つ以上であってもよい。また、再発リスクは、前記のように、「高」と「低」との2段階で判定してもよく、さらに、細分化させて、例えば、再発リスク「高」、「中」および「低」のように、3段階以上で判定してもよい。 The reference value may be one, or may be three or more. In addition, as described above, the risk of recurrence may be determined in two stages, “high” and “low”. Further, the risk of recurrence may be further divided into, for example, a recurrence risk of “high”, “medium”, and “low”. As shown in FIG.
その後、ステップS211において、制御部77は、表示部の表示画面に、図21及び図22に示されるように、再発率、再発リスク等を判定する根拠となるCDK1比活性及びCDK2比活性が分布図上にプロットされて表示され、かつ参照範囲がこの分布図上に表示させるとともに、個体番号、年齢等の診断対象となるがん患者の個体情報や、悪性腫瘍の所定項目の測定値、再発率、再発リスクの判定結果等を表示させる(ステップS211)。図21に例示される表示画面の分布図は、横軸にCDK1比活性を対数(log)表示し、縦軸にCDK2比活性を対数(log)表示している。また、図22に例示される表示画面には、ホルモン療法を行なった場合のDisease Free Survival(無病生存率)、再発率、再発リスクの判定結果(図中、「リスク判定」)等が表示される。そして、制御部77は、図15に示されるメインルーチンのステップS211へ処理をリターンする。
Thereafter, in step S211, the
なお、上述した実施形態においては、ステップS401において制御部77が、CDK1の活性、CDK1の発現、CDK2の活性、CDK2の発現、バックグラウンドの活性、及びバックグラウンドの発現のそれぞれについて、2回ずつ蛍光強度を取得し、各項目について2つずつ得られた蛍光強度の平均値を算出する構成としたが、これに限定されるものではなく、CDK1の活性、CDK1の発現、CDK2の活性、CDK2の発現、バックグラウンドの活性、及びバックグラウンドの発現のそれぞれについて、3回ずつ以上の蛍光強度を取得し、それぞれの項目の蛍光強度の平均値を算出する構成としてもよい。また、CDK1の活性、CDK1の発現、CDK2の活性、CDK2の発現、バックグラウンドの活性、及びバックグラウンドの発現のそれぞれについて、1回ずつ蛍光強度を取得するようにしてもよい。この場合は、ステップS403において、CDK1の活性および発現並びにCDK2の活性および発現のバックグラウンド補正が、それぞれの項目の平均値ではなく、1つずつ取得された各項目の蛍光強度を用いて行われる。
In the above-described embodiment, in step S401, the
また、本実施形態においては、医師等の使用者が参照範囲の半径を適宜設定し、その設定した半径の円として参照範囲が決定されるようにした。参照範囲は、統計学上信頼性を確保しうる最低限必要なサンプル数が確保できる大きさに決定されることが望ましい。したがって、信頼性を確保する観点から、参照範囲内に最低限必要なサンプル数が確保できるように、表示画面への参照範囲の表示と同時に、この参照範囲内に含まれるサンプル数の情報を表示させてもよい。これにより、使用者は画面に表示されたこのサンプル数の情報を参照して、参照範囲の半径を、適切なサンプル数を確保することができるものに容易に設定し直すことができる。 In the present embodiment, a user such as a doctor sets the radius of the reference range as appropriate, and the reference range is determined as a circle with the set radius. It is desirable that the reference range is determined to have a size that can secure a minimum necessary number of samples that can ensure statistical reliability. Therefore, from the viewpoint of ensuring reliability, information on the number of samples included in this reference range is displayed at the same time as the display of the reference range on the display screen so that the minimum required number of samples can be secured within the reference range. You may let them. Accordingly, the user can easily reset the radius of the reference range to a value that can ensure an appropriate number of samples by referring to the information on the number of samples displayed on the screen.
また、診断支援システムが、参照範囲の半径を自動的に決定してもよい。また、診断支援システムが自動で半径を設定する場合には、例えば、
(I) 診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値を中心点として、医療上、統計学的に意義のある数のがん患者についてのデータを包含する所定の大きさを有する領域を設定すること、
(II) 診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値を含み、かつシステムによる測定誤差・標準偏差を包含する所定の大きさを有する領域を設定すること、又は
(III) 診断対象となるがん患者の悪性腫瘍に関する所定の測定項目の測定値を含み、1つの試料に関し、1つの所定の測定項目に対して1回以上測定することにより得られた測定値の測定誤差・標準偏差を包含する所定の大きさを有する領域を設定すること
が可能な半径を設定するようにすることが好ましい。
Further, the diagnosis support system may automatically determine the radius of the reference range. When the diagnosis support system automatically sets the radius, for example,
(I) A predetermined size that includes data on a number of cancer patients that are medically statistically significant, centered on the measurement value of a predetermined measurement item related to a malignant tumor of a cancer patient to be diagnosed Setting an area having
(II) setting a region having a predetermined size including a measurement error / standard deviation by a system, including a measurement value of a predetermined measurement item regarding a malignant tumor of a cancer patient to be diagnosed; or
(III) Measured values obtained by measuring at least once for a given measurement item for one sample, including measured values for a given measurement item for malignant tumors of cancer patients to be diagnosed It is preferable to set a radius capable of setting an area having a predetermined size including the measurement error and standard deviation.
制御部77が、参照範囲を、前記(I)のように決定することにより、より医療上意義のある高い精度の診断支援情報を提供することができる。また、制御部77が、参照範囲を、前記(II)のように決定することにより、システムによる測定誤差に起因する精度の低下を防ぐことができる。さらに、制御部77が、参照範囲を、(III)のように決定することにより、測定方法による測定値のバラツキに起因する精度の低下を防ぐことができる。ステップS406においては、このように参照範囲が決定されるため、高い精度の診断支援情報を提供することができる。
By determining the reference range as described in (I) above, the
また、本実施形態では、参照範囲を、測定値を中心とした円とする構成としたが、測定値を中心とした方形や楕円等の他の形状であってもよい。 In the present embodiment, the reference range is a circle centered on the measured value, but may be another shape such as a rectangle or an ellipse centered on the measured value.
以下に、前述した診断システムを用いて、診断対象となる5人のがん患者(がん患者1〜5)から採取した悪性腫瘍を分析して得られた結果を示した。 Below, the result obtained by analyzing the malignant tumor extract | collected from five cancer patients (cancer patients 1-5) used as a diagnostic object using the diagnostic system mentioned above was shown.
(参考例)
乳癌の患者の悪性腫瘍におけるCDK1及びCDK2それぞれの活性値と発現量とを測定した。得られた活性値と発現量とから、CDK1の比活性、CDK2の比活性及びCDK1の比活性とCDK2の比活性との比を算出した。つぎに、縦軸を、CDK2の比活性のlog値、横軸を、CDK1の比活性のlog値とし、分布図を作成した。
(Reference example)
The activity values and expression levels of CDK1 and CDK2 in malignant tumors of breast cancer patients were measured. From the obtained activity value and expression level, the specific activity of CDK1, the specific activity of CDK2, and the ratio of the specific activity of CDK1 and the specific activity of CDK2 were calculated. Next, the vertical axis is the log value of the specific activity of CDK2, and the horizontal axis is the log value of the specific activity of CDK1, and a distribution diagram is prepared.
リスク判定に使用する基準値として、以下の基準値を設定した。
1.)CDK1の比活性とCDK2の比活性との比(比活性比)が5.0
2.)低位基準値:CDK1の比活性が6
3.)中位基準値:CDK1の比活性が20
4.)高位基準値:CDK1の比活性が90
The following reference values were set as reference values used for risk assessment.
1. ) Ratio of specific activity of CDK1 and CDK2 (specific activity ratio) is 5.0
2. ) Low standard value: CDK1 specific activity is 6
3. ) Intermediate standard value: CDK1 specific activity is 20
4). ) High reference value: CDK1 specific activity is 90
前記4つの基準値により区分けされる8つの領域を、再発リスク「高」(H)、再発リスク「中」(I)又は再発リスク「低」(L)にいずれかに設定している。具体的には、前記比活性比に係る基準値よりも大きく、中位基準値よりも大きい領域を「高」(H)領域とした。また、前記比活性比に係る基準値よりも大きく、中位基準値よりも小さく、低位基準値よりも大きい領域を「中」(I)領域としている。さらに、前記比活性比に係る基準値よりも大きく、低位基準値よりも小さい領域を「低」(L)領域とした。一方、前記比活性比に係る基準値よりも小さい領域については、高位基準値よりも大きい領域を「高」(H)領域とし、当該高位基準値よりも小さい領域を「低」(L)領域とした。 The eight areas classified by the four reference values are set to any one of recurrence risk “high” (H), recurrence risk “medium” (I), and recurrence risk “low” (L). Specifically, a region that is larger than the reference value related to the specific activity ratio and larger than the middle reference value is defined as a “high” (H) region. Further, a region that is larger than the reference value related to the specific activity ratio, smaller than the middle reference value, and larger than the lower reference value is defined as a “medium” (I) region. Further, a region that is larger than the reference value related to the specific activity ratio and smaller than the lower reference value is defined as a “low” (L) region. On the other hand, for a region smaller than the reference value related to the specific activity ratio, a region larger than the high reference value is set as a “high” (H) region, and a region smaller than the high reference value is set as a “low” (L) region. It was.
(実施例1)
がん患者1の悪性腫瘍のCDK1及びCDK2それぞれの活性値と発現量とを測定し、CDK1及びCDK2それぞれの比活性の対数(log)値を算出した。その結果、CDK1の比活性の対数(log)値は、1.7で、CDK2の比活性の対数(log)値は、1.8であった。また、無治療の群+ホルモン療法の群+アンスラサイクリンによる化学療法の群の検体の大規模臨床試験結果を参照データセットとし、参考例に従って、がん患者1の再発リスクを判定したところ、「低」(L)領域に属することがわかった。
Example 1
The activity values and expression levels of CDK1 and CDK2 of the malignant tumor of
つぎに、算出された比活性の対数(log)値に基づき、無治療の群+ホルモン療法の群+アンスラサイクリンによる化学療法の群の検体の大規模臨床試験結果を参照データセットとし、本発明の診断支援システムにより、参考例のように、分布図を作製し、再発率を算出した。 Next, based on the logarithm (log) value of the calculated specific activity, the results of a large-scale clinical trial of samples in the untreated group + hormonal therapy group + anthracycline chemotherapy group were used as a reference data set. Using the diagnosis support system, a distribution map was prepared and the recurrence rate was calculated as in the reference example.
がん患者1の測定値についての参照範囲の大きさ(半径)は、0.3とした。図24〜図27に、本発明の診断支援システムによる診断支援情報の例を示す。図24においては、悪性腫瘍のCDK1及びCDK2の測定値の分布図を示す。図24には、参考例による閾値701に基づき、「高」(H)領域、「中」(I)領域、「低」(L)領域を併せて表示している。また、図25〜図27においては、各治療を行なった場合に予測される生存曲線の結果を示す。図25〜図27に示される各生存曲線のグラフでは、縦軸が無病生存率を示し、横軸が観察期間(日)を示している。なお、再発リスクの判定基準は、再発率が14%以上である場合、「High Risk」、再発率が5%未満である場合、「Low Risk」とした。
The size (radius) of the reference range for the measured value of
図24に示される分布図においては、がん患者1の測定値601が表示され、さらに、参照範囲602が表示されている。図24に示されるように、このがん患者1の測定値601は、参考例の再発リスク判定によれば、「低」(L)領域に属しているが、本実施形態の診断支援システムによれば、近似の測定値を持つ閾値付近や「高」(H)領域に属する他のがん患者の情報が診断支援情報として提供される。そのため、より適切な判断が可能になる。本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者1と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報から、がん患者1に対して無治療である場合、再発率が9.1%であることが予測された。同様に、がん患者1に対してホルモン療法が施された場合には、再発率が3.8%であることが予測された。さらに、がん患者1に対してアンスラサイクリンによる化学療法が施された場合には、再発率が75%であることが予測され、がん患者1の悪性腫瘍に対しては、アンスラサイクリンによる化学療法が有効ではない可能性が予測された。
In the distribution chart shown in FIG. 24, the
図25および図26それぞれに示されるように、がん患者1に対して、無治療の場合には、約800日間で無病生存率が低下することが予想されるが、ホルモン治療が施される場合には、少なくとも約2200日まで無病生存率が維持されることが予想される。このように、本実施形態の診断支援システムによれば、がん患者1に対しては、ホルモン治療が有効な手段の1つであるという判断をするための指標となる情報を提供できる。一方、図25および図27それぞれに示されるように、がん患者1に対して、無治療の場合には、約800日間で無病生存率が低下することが予想され、アンスラサイクリンによる化学療法が施される場合には、約100日間で無病生存率が低下することが予想された。このように、本実施例の診断支援システムによれば、がん患者1に対しては、アンスラサイクリン治療が有効ではない可能性があるという判断をするための指標となる情報を提供できる。
As shown in FIG. 25 and FIG. 26, respectively, in the case of no treatment for
また、これらの結果より、本実施形態の診断支援システムによれば、それぞれの患者に応じた診断支援情報が提供でき、例えば、将来採用する治療法による再発率を高い精度で予測でき、それぞれの患者に対して、より適した治療法を選択するための情報を提供できることが示唆される。 From these results, according to the diagnosis support system of the present embodiment, it is possible to provide diagnosis support information corresponding to each patient, for example, it is possible to predict the recurrence rate due to a treatment method to be adopted in the future with high accuracy, It suggests that the patient can be provided with information to select a more appropriate treatment.
なお、前記生存曲線は、他のがん患者の臨床情報のうち、生存・死去の情報から作成された生存曲線であってもよい。 The survival curve may be a survival curve created from survival / death information among clinical information of other cancer patients.
(実施例2)
がん患者2の悪性腫瘍のCDK1及びCDK2それぞれの活性値と発現量とを測定し、CDK1及びCDK2それぞれの比活性の対数(log)値を算出した。その結果、CDK1の比活性の対数(log)値は、1.5で、CDK2の比活性の対数(log)値は、2.5であった。また、無治療+ホルモン治療の群の検体の大規模臨床試験結果(332検体)を参照データセットとし、参考例に従って、がん患者2の再発リスクを判定したところ、「高」(H)領域に属することがわかった。
(Example 2)
The activity values and expression levels of CDK1 and CDK2 of the malignant tumor of
つぎに、算出された比活性の対数(log)値に基づき、無治療+ホルモン治療の群の検体の大規模臨床試験結果(332検体)を参照データセットとし、本実施形態の診断支援システムにより、分布図を作製し、再発率を算出した。がん患者2の測定値についての参照範囲の大きさ(半径)は、0.15とした。
Next, based on the logarithm (log) value of the calculated specific activity, a large-scale clinical test result (332 samples) of samples in the group of no treatment + hormone treatment is used as a reference data set, and the diagnosis support system of the present embodiment A distribution map was prepared and the recurrence rate was calculated. The size (radius) of the reference range for the measured value of
図28に、本実施形態の診断支援システムによる診断支援情報の例を示す。本実施形態の診断支援システムによれば、図28に示されるように、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者2と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報が、参照範囲内に示され、がん患者2をより適切に診断をするのに有用な情報として提供できる。
FIG. 28 shows an example of diagnosis support information by the diagnosis support system of this embodiment. According to the diagnosis support system of the present embodiment, as shown in FIG. 28, information on other cancer patients having measured values approximate to those of the
また、がん患者2について、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者2と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報によれば、参照範囲内には、再発ありの患者が2名、再発なしが9名含まれる。これに基づき再発率を予測したところ、18.2%であることが予測された。
Moreover, according to the information of other cancer patients having a measured value approximate to the
(実施例3)
前記実施例2と同様に、がん患者3の悪性腫瘍のCDK1及びCDK2それぞれの活性値と発現量とを測定した。その結果、CDK1の比活性の対数(log)値は、1.5で、CDK2の比活性の対数(log)値は、2であった。また、参考例に従って、当該被検がん患者の再発リスクを判定したところ、「高」(H)領域に属していた。
(Example 3)
In the same manner as in Example 2, the activity values and expression levels of CDK1 and CDK2 of the malignant tumor of
図29に、本実施形態の診断支援システムによる診断支援情報の例を示す。本実施形態の診断支援システムによれば、図29に示されるように、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者3と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報が、参照範囲内に示され、がん患者3をより適切に診断をするのに有用な情報として提供できる。
FIG. 29 shows an example of diagnosis support information by the diagnosis support system of the present embodiment. According to the diagnosis support system of the present embodiment, as shown in FIG. 29, information of other cancer patients having measured values approximate to those of the
さらに、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者3と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報から、再発率を予測した。その結果、参照範囲内には、再発ありの患者が4名、再発なしの患者が21名含まれている。これに基づき、再発率が16.0%であることが予測された。このように、参考例に従って判断した場合、がん患者3は、前記実施例2のがん患者2と同様に、「高」(H)領域に属すると判断されていたが、本実施形態の診断支援システムによれば、本実施例のがん患者3と実施例2のがん患者2とでは予測される再発率が異なっている。さらに詳しく説明すると、実施例2のがん患者2の測定値(CDK1の比活性およびCDK2の比活性)は、参考例による「高」(H)領域の中でも「低」(L)領域や「中」(I)領域との境界から離れた位置に存在しており、本実施例のがん患者3の測定値は、参考例による「高」(H)領域の中でも「低」(L)との境界付近に存在している。そして、実施例2のがん患者2について上記実施形態に係る診断支援システムにより得られた再発率は18.2%であり、その一方、本実施例のがん患者3について上記実施形態に係る診断支援システムにより得られた再発率は16%である。このことから、上記実施形態に係る診断支援システムでは、がん患者の測定値に対応した再発率を得ることができる、つまり、がん患者の悪性腫瘍の状態を正確に反映した再発率を予測可能であることが分かる。
Furthermore, the recurrence rate was predicted from information on other cancer patients having measured values approximate to those of the
(実施例4)
前記実施例2と同様に、がん患者4の悪性腫瘍のCDK1及びCDK2それぞれの活性値と発現量とを測定した。その結果、CDK1の比活性の対数(log)値は、0.5で、CDK2の比活性の対数(log)値は、1であった。また、参考例に従って、がん患者4の再発リスクを判定したところ、「低」(L)領域に属することがわかった。
Example 4
In the same manner as in Example 2, the activity values and the expression levels of CDK1 and CDK2 of the malignant tumor of
図30に、本実施形態の診断支援システムによる診断支援情報の例を示す。図30に示されるように、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者4と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報が、参照範囲内に示され、がん患者4をより適切に診断をするのに有用な情報として提供できる。
FIG. 30 shows an example of diagnosis support information by the diagnosis support system of this embodiment. As shown in FIG. 30, information of other cancer patients having measured values approximate to the
さらに、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者4と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報から、再発率を予測した。その結果、参照範囲内には、再発ありの患者が0名、再発なしの患者が8名含まれる。したがって、再発率が、0%であることが予測された。
Furthermore, the recurrence rate was predicted from information of other cancer patients having measured values approximate to those of the
(実施例5)
前記実施例2と同様に、がん患者5の悪性腫瘍のCDK1及びCDK2それぞれの活性値と発現量とを測定した。その結果、CDK1の比活性の対数(log)値は、1.2で、CDK2の比活性の対数(log)値は、1.5であった。また、参考例に従って、がん患者5の再発リスクを判定したところ、「低」(L)領域に属することがわかった。
(Example 5)
In the same manner as in Example 2, the activity values and expression levels of CDK1 and CDK2 of the malignant tumor of
図31に、本実施形態の診断支援システムによる診断支援情報の例を示す。図31に示されるように、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者5と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報が、参照範囲内に示され、当該被検がん患者をより適切に診断をするのに有用な情報として提供できる。
FIG. 31 shows an example of diagnosis support information by the diagnosis support system of this embodiment. As shown in FIG. 31, information of other cancer patients having measured values approximate to the
ついで、本実施形態の診断支援システムにより提供されたがん患者5と近似の測定値を持つ他のがん患者の情報から、再発率を予測した。その結果、参照範囲内には、再発ありの患者が1名、再発なしの患者が10名含まれる。これに基づき、再発率が、9.1%であることが予測された。このように、参考例に従って判断した場合、本実施例5の被検がん患者は、前記実施例4の被検がん患者と同様に、「低」(L)に属すると判断されていたが、本実施形態の診断支援システムによれば、本実施例のがん患者5と実施例4のがん患者4とでは予測される再発率が異なっている。さらに詳しく説明すると、実施例4のがん患者4の測定値は、参考例による「低」(L)領域の中でも「高」(H)領域や「中」(I)領域との境界から離れた位置に存在しており、本実施例のがん患者5の測定値は、参考例による「低」(L)領域の中でも「中」(I)領域との境界付近に存在している。そして、実施例4のがん患者4について上記実施形態に係る診断支援システムにより得られた再発率は0%であり、その一方、本実施例のがん患者5について上記実施形態に係る診断支援システムにより得られた再発率は9.1%である。このことから、上記実施形態に係る診断支援システムでは、がん患者の測定値に対応した再発率を得ることができる、つまり、がん患者の悪性腫瘍の状態を正確に反映した再発率を予測可能であることが分かる。
Next, the recurrence rate was predicted from information on other cancer patients having measured values approximate to those of the
1 チップセット部
2 活性測定ユニット
3 分注機構部
4 検出部
5 第1試薬セット部
6 第2試薬セット部
7 廃液槽
8 ピペット洗浄槽
9 流体部
10 本体制御部
11 空圧源
12 パーソナルコンピュータ(データ処理部)
13 純水タンク
14 洗浄液タンク
15 廃液タンク
20 装置本体部
30 筐体部
31 操作部
32 駆動部
33 検体セット部
34 ペッスル
77 制御部
78 入力部
79 表示部
91a CPU
91b ROM
91c RAM
91d 入力出力インターフェース
91e 画像出力インターフェース
91f 通信インターフェース
91g ハードディスク
101 タンパク質固相用チップ
111 多孔質膜
112 ろ紙
113 上部プレート
114 下部プレート
115 貫通孔
117 貫通孔
201 カラム
202 担体保持部
206 担体
211 試料調製部
213 流体マニホールド
301a CPU
301b ROM
301c RAM
301d 通信インターフェース
301e 回路部
A 測定装置
B 可溶化装置
401 表示部
402 情報表示部
403 表示ボタンアイコン
404 分布図表示部
405 情報表示部
406 情報表示部
501 測定部
601 患者の測定値
602 参照範囲
701 閾値
DESCRIPTION OF
DESCRIPTION OF
91b ROM
91c RAM
91d
301b ROM
301c RAM
Claims (11)
第一のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製された検体について所定の2種類の測定項目を測定して前記第一のがん患者に関する測定値を取得する測定部と、
前記第一のがん患者とは異なる複数のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製されたそれぞれの検体について前記所定の2種類の測定項目を測定して生成された複数の測定値と、前記複数のがん患者それぞれの悪性腫瘍摘出後の臨床情報と、参照範囲と、を含むデータを記憶する記憶部と、
表示部と、
前記記憶部から前記複数の測定値と参照範囲のデータを読み出して、前記2種類の測定項目を座標軸とし、前記複数の測定値と前記第一のがん患者に関する測定値がプロットされ、且つ、前記第一のがん患者に関する測定値が含まれる前記参照範囲が表示された分布図を前記表示部に表示させる制御部と、を備え、
前記記憶部は、前記臨床情報として、がんの再発に関する情報及び/又は術後の生存の有無に関する情報を記憶しており、
前記制御部は、前記参照範囲内にある前記複数の測定値に対応するがん患者の前記がんの再発に関する情報及び/又は前記術後の生存の有無に関する情報から求めたがんの再発率及び/又は無病生存率を示す診断支援画面を前記表示部に表示させる、がんの診断支援システム。 A cancer diagnosis support system,
A measurement unit take measurements relating to the first cancer patient by measuring the predetermined two kinds of measurement items for prepared specimen using a malignant tumor collected from the first cancer patient,
A plurality of measurement values generated by measuring the two predetermined measurement items for each specimen prepared using a malignant tumor collected from a plurality of cancer patients different from the first cancer patient When a serial憶部for storing data including the clinical information after malignant tumor removal of each of the plurality of cancer patients, and the reference range, and
And Viewing section,
Reading the data of the plurality of measurement values and the reference range from the storage unit, with the two types of measurement items as coordinate axes, the plurality of measurement values and the measurement values related to the first cancer patient are plotted, and and a control unit for displaying the reference range is displayed distribution graph includes measurements of the first cancer patient on the display unit,
The storage unit stores information on the recurrence of cancer and / or information on the presence or absence of postoperative survival as the clinical information,
The control unit has a cancer recurrence rate obtained from information on the recurrence of the cancer and / or information on the presence or absence of postoperative survival of the cancer patient corresponding to the plurality of measurement values within the reference range. and / or is displayed before Symbol display unit diagnosis support screen showing the disease-free survival, cancer diagnosis support system.
第一のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製された検体について所定の2種類の測定項目を測定して生成された第一のがん患者に関する測定値の入力を受け付ける入力受付部と、
前記第一のがん患者とは異なる複数のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製されたそれぞれの検体について前記所定の2種類の測定項目を測定して生成された複数の測定値と、前記複数のがん患者それぞれの悪性腫瘍摘出後の臨床情報と、参照範囲と、を含むデータを記憶する記憶部と、
表示部と、
前記記憶部から前記複数の測定値と参照範囲のデータを読み出して、前記2種類の測定項目を座標軸とし、前記複数の測定値と前記第一のがん患者に関する測定値がプロットされ、且つ、前記第一のがん患者に関する測定値が含まれる前記参照範囲が表示された分布図を前記表示部に表示させる制御部と、を備え、
前記記憶部は、前記臨床情報として、がんの再発に関する情報及び/又は術後の生存の有無に関する情報を記憶しており、
前記制御部は、前記参照範囲内にある前記複数の測定値に対応するがん患者の前記がんの再発に関する情報及び/又は前記術後の生存の有無に関する情報から求めたがんの再発率及び/又は無病生存率を示す診断支援画面を前記表示部に表示させる、がんの診断支援情報提供装置。 A cancer diagnosis support information providing device,
An input receiving unit that receives input of measurement values relating to a first cancer patient generated by measuring two predetermined measurement items for a sample prepared using a malignant tumor collected from a first cancer patient When,
A plurality of measurement values generated by measuring the two predetermined measurement items for each specimen prepared using a malignant tumor collected from a plurality of cancer patients different from the first cancer patient A storage unit for storing data including clinical information after removal of each malignant tumor of each of the plurality of cancer patients, and a reference range;
A display unit;
Reading the data of the plurality of measurement values and the reference range from the storage unit, with the two types of measurement items as coordinate axes, the plurality of measurement values and the measurement values related to the first cancer patient are plotted, and and a control unit for displaying the reference range is displayed distribution graph includes measurements of the first cancer patient on the display unit,
The storage unit stores information on the recurrence of cancer and / or information on the presence or absence of postoperative survival as the clinical information,
The control unit has a cancer recurrence rate obtained from information on the recurrence of the cancer and / or information on the presence or absence of postoperative survival of the cancer patient corresponding to the plurality of measurement values within the reference range. And / or a cancer diagnosis support information providing apparatus for displaying a diagnosis support screen indicating a disease-free survival rate on the display unit.
第一のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製された検体につき所定の2種類の測定項目を測定して生成された第一のがん患者に関する測定値の入力を受け付けるステップと、
前記第一のがん患者と異なる複数のがん患者から採取された悪性腫瘍を用いて調製されたそれぞれの検体につき前記所定の2種類の測定項目を測定して生成された複数の測定値と参照範囲のデータを前記記憶部から読み出して、前記2種類の測定項目を座標軸とし、前記複数の測定値と前記第一のがん患者に関する測定値がプロットされ、且つ、前記第一のがん患者に関する測定値が含まれる前記参照範囲が表示された分布図を前記表示部に表示するステップと、
前記参照範囲内にある前記複数の測定値に対応するがん患者のがんの再発に関する情報及び/又は術後の生存の有無に関する情報を前記記憶部から読み出し、読み出された前記がんの再発に関する情報及び/又は前記術後の生存の有無に関する情報から求めたがんの再発率及び/又は無病生存率を示す診断支援画面を前記表示部に表示するステップと、
を実行する、がんの診断支援情報の提供方法。 A method for providing cancer diagnosis support information in a cancer diagnosis support information providing apparatus comprising a storage unit and a display unit ,
Receiving input of measurement values relating to a first cancer patient generated by measuring two predetermined measurement items for a specimen prepared using a malignant tumor collected from a first cancer patient;
Before SL plurality of measurements generated by measuring the predetermined two kinds of measurement items per first respective analyte malignant tumors taken from different cancer patients cancer patient were prepared using the And reference range data from the storage unit, the two types of measurement items as coordinate axes, the plurality of measurement values and the measurement values related to the first cancer patient are plotted, and the first Displaying a distribution map on which the reference range including measurement values related to cancer patients is displayed on the display unit ;
The information on the recurrence of cancer of the cancer patient corresponding to the plurality of measurement values within the reference range and / or the information on the presence or absence of postoperative survival is read from the storage unit, and the read cancer information Displaying on the display unit a diagnosis support screen showing a recurrence rate and / or disease-free survival rate of cancer obtained from information on recurrence and / or information on the presence or absence of postoperative survival;
The execution, provides a method of diagnosis support information for cancer.
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