JP5322242B2 - Immobilization of protein / peptide on diamond chip - Google Patents

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本発明は、化学修飾したダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップ上に蛋白質/ペプチドをその機能を損なわずに安定的に固定化する方法や該方法により得られる蛋白質/ペプチド固定化チップに関する。   The present invention relates to a method for stably immobilizing a protein / peptide on a chemically modified diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip without losing its function, and a protein / peptide immobilization chip obtained by the method.

従来、シリコン等の基板上にダイヤモンドをコーティングしたり、ダイヤモンドライクカーボン(DLC)をコーティングする技術は一般に広く利用されている。例えば、これらを利用したDNA固定化チップ(例えば、特許文献1〜4参照)、本発明者らによるダイヤモンドコーティング高密度集積タンパクチップ(例えば、非特許文献1参照)、ダイヤモンド基板上に有機単分子膜を直接的な検出部として形成してなる有機単分子膜/半導体構造を有する半導体センシングデバイス(例えば、特許文献5参照)が提案されている。その他、様々な種類のアレルゲンから抽出した、各スポットに付着させた一つの粗蛋白を有する固体の基板をアレルギー疾患患者から得た検体と反応させることによって、様々な種類のアレルゲンを同時に検出することができ、特定アレルゲンにより起こされるアレルギー反応に関連する抗体の種類を検出することができるアレルギー診断用蛋白質チップとアレルゲンの検出方法及びアレルギー誘発抗体の検出方法(例えば、特許文献6参照)が知られている。   Conventionally, a technique of coating diamond on a substrate such as silicon or coating diamond-like carbon (DLC) has been widely used. For example, a DNA immobilization chip using these (for example, see Patent Documents 1 to 4), a diamond coating high density integrated protein chip by the present inventors (for example, see Non-Patent Document 1), an organic single molecule on a diamond substrate A semiconductor sensing device having an organic monomolecular film / semiconductor structure in which a film is formed as a direct detection part (see, for example, Patent Document 5) has been proposed. In addition, various types of allergens can be detected simultaneously by reacting a solid substrate with one crude protein attached to each spot, extracted from various types of allergens, with a sample obtained from an allergic disease patient. An allergy diagnostic protein chip capable of detecting the type of antibody associated with an allergic reaction caused by a specific allergen, an allergen detection method, and an allergy-inducing antibody detection method (see, for example, Patent Document 6) are known. ing.

WO99/40173号公報WO99 / 40173 WO99/41362号公報WO99 / 41362 WO99/63072号公報WO99 / 63072 特開2005−55365号公報JP 2005-55365 A 特開2004−4007号公報Japanese Patent Laid-Open No. 2004-4007 特表2004−533625号公報Special table 2004-533625 gazette

NEW DIAMOND,Vol.20,No.3(2004),30-31NEW DIAMOND, Vol.20, No.3 (2004), 30-31

各種チップ等の基板上に蛋白質を固定する場合、一般的に蛋白質は3次元立体構造が変わりやすいため、立体構造と密接に関係すると推定される蛋白質の機能を維持するためには、特別な配慮と工夫を必要とする。蛋白質の固定化において、アフィニティークロマトグラフィーなどでの固定化法のような従来のマクロ固定化技術では、固定化によって蛋白質の大幅な失活が起こっても対象が限定されているため、検出過程でシグナルの増幅ができるため目的物質の特定が可能である。しかし、ハイスループットな高密度蛋白質チップの作製には、より微量の蛋白質をその活性、コンフォメーションを維持したままで固定化する技術を確立しなければならない。蛋白質の活性は、複雑な立体構造に依存しており、蛋白質を基板表面に固定化することで立体構造が破壊された場合、通常失活する。本発明の課題は、蛋白質の機能を損なわずにチップ基板に蛋白質/ペプチドを固定化したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができるように固定化する方法を提供することにある。   When immobilizing proteins on substrates such as various chips, special considerations are necessary to maintain the functions of proteins that are presumed to be closely related to the three-dimensional structure, since the three-dimensional structure of proteins generally changes easily. And need ingenuity. In protein immobilization, conventional macro-immobilization techniques such as affinity chromatography and other immobilization methods limit the target even if the protein is largely inactivated by immobilization. The target substance can be identified because the signal can be amplified. However, in order to produce a high-throughput high-density protein chip, it is necessary to establish a technique for immobilizing a minute amount of protein while maintaining its activity and conformation. The activity of a protein depends on a complicated three-dimensional structure, and is usually deactivated when the three-dimensional structure is destroyed by immobilizing the protein on the substrate surface. An object of the present invention is to provide a method for immobilizing a protein / peptide on a chip substrate without impairing the function of the protein, or for immobilizing the protein / peptide on the substrate without impairing the function. .

本発明者らは、化学修飾したダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質/ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行い、次いで未反応活性基のブロッキング操作を行う、チップ上に蛋白質/ペプチドを固定化する方法において、スポッティング添加剤として30%ジメチルスルホキシド(DMSO)又は30%ポリエチレングリコール(PEG)を用いたり、活性化試薬により活性化した後、MilliQ水で洗浄した後の乾燥を1時間の減圧乾燥処理により行うと、アレルゲン等の蛋白質/ペプチドの機能を損なわずにチップ基板に蛋白質/ペプチドを固定化したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができることを見い出し、本発明を完成するに至った。   The present inventors activated a chemically modified diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip with an activating reagent, spotted a protein / peptide on the chip to perform a coupling reaction, and then unreacted activity In the method of immobilizing a protein / peptide on a chip that performs group blocking operation, 30% dimethyl sulfoxide (DMSO) or 30% polyethylene glycol (PEG) was used as a spotting additive, or activated by an activating reagent. Later, after drying with MilliQ water and drying for 1 hour under reduced pressure, the protein / peptide may be immobilized on the chip substrate without damaging the function of the protein / peptide such as allergens, It has been found that it can be maintained without damage, and the present invention has been completed.

すなわち本発明は、(1)化学修飾したダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質/ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行う、チップ上に蛋白質/ペプチドを固定する方法であって、活性化試薬により活性化した後、チップを洗浄した洗浄水の乾燥処理として30〜120分間の減圧乾燥処理を行い、かつ、カップリング反応後、30〜45℃で2〜4時間乾燥させることを特徴とする蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(2)洗浄水が、MilliQ水であることを特徴とする上記(1)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(3)スポッティング添加剤としてジメチルスルホキシド(DMSO)又はポリエチレングリコール(PEG)を用いることを特徴とする上記(1)又は(2)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(4)20〜40%DMSO又は20〜40%PEGを用いることを特徴とする上記(3)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(5)30%DMSO又は30%PEGを用いることを特徴とする上記(4)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(6)活性化試薬が、WSCD・HCl及びNHSを含有する溶液であることを特徴とする上記(1)〜()のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、()カップリング反応を行った後、未反応活性基のブロッキング操作を行うことを特徴とする上記(1)〜()のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、()蛋白質/ペプチドが、抗原又は抗体であることを特徴とする上記(1)〜()のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法に関する。 That is, the present invention includes (1) activating a chemically modified diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip with an activating reagent and then spotting the protein / peptide on the chip to perform a coupling reaction. a method of securing a protein / peptide, after activation by an activating reagent, have rows vacuum drying process of 30 to 120 minutes as drying of the washing water to wash the chips and, after the coupling reaction, A protein / peptide immobilization method characterized by drying at 30 to 45 ° C. for 2 to 4 hours, or (2) Washing water is MilliQ water, The protein / peptide described in (1) above And (3) using dimethyl sulfoxide (DMSO) or polyethylene glycol (PEG) as a spotting additive The protein / peptide immobilization method according to (1) or (2) above, or (4) 20-40% DMSO or 20-40% PEG is used. An immobilization method, (5) a protein / peptide immobilization method according to (4) above, wherein 30% DMSO or 30% PEG is used , and (6 ) an activation reagent comprising WSCD · HCl and NHS The protein / peptide immobilization method according to any one of (1) to ( 5 ) above, wherein ( 7 ) the coupling reaction is performed, and then the unreacted active group is blocked ( 8 ) The protein / peptide immobilization method according to any one of (1) to ( 6 ) above, wherein ( 8 ) the protein / peptide is an antigen or an antibody. 1) to ( 7 Or a protein / peptide immobilization method according to any one of the above.

さらに本発明は、(9)抗原がアレルゲンであることを特徴とする上記(8)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(10)アレルゲンがアレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドであることを特徴とする上記(9)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(11)アレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドとして、化学修飾されたペプチドを用いることを特徴とする上記(10)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(12)アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、MHCクラスII分子に結合するペプチド部分のN末端側及び/又はC末端側に少なくとも2個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチドを用いることを特徴とする上記(10)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(13)アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、アレルゲンのエピトープを含むプロテアーゼ分解ペプチドを用いることを特徴とする上記(10)〜(12)のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(14)プロテアーゼ分解ペプチドが、トリプシン分解ペプチドであることを特徴とする上記(13)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(15)アレルゲンとして、食物アレルゲンを用いることを特徴とする上記(10)〜(14)のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法や、(16)食物アレルゲンとして、カゼインナトリウム、α−カゼイン、β−カゼイン、κ−カゼイン、α−ラクトアルブミン、β−ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンから選ばれる1種又は2種以上のアレルゲンを用いることを特徴とする上記(15)記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法に関する。
Furthermore, the present invention relates to (9) the protein / peptide immobilization method according to (8) above, wherein the antigen is an allergen, and (10) the allergen is an allergen epitope or a peptide containing an allergen epitope. The protein / peptide immobilization method described in (9) above, or (11) the protein described in (10) above, wherein a chemically modified peptide is used as the allergen epitope or peptide containing allergen epitope / Peptide immobilization method and (12) peptide containing an allergen epitope containing an epitope in which at least two or more amino acids are added to the N-terminal side and / or C-terminal side of the peptide part that binds to MHC class II molecules The protein / peptide according to (10) above, wherein a peptide is used The protein / peptide immobilization method according to any one of (10) to (12) above, wherein a protease-degrading peptide containing an allergen epitope is used as an immobilization method or (13) an allergen epitope peptide (14) The protein / peptide immobilization method according to (13) above, wherein the protease degrading peptide is a trypsin degrading peptide, and (15) a food allergen is used as the allergen The protein / peptide immobilization method according to any one of (10) to (14) above, or (16) food allergens such as sodium caseinate, α-casein, β-casein, κ-casein, α-lactalbumin, β 1 selected from lactoglobulin, ovomucoid, ovalbumin, conalbumin Or (15) above, which comprises using two or more allergens relates to immobilization how the protein / peptide according.

本発明によると、ごく少量の蛋白質やペプチドを効率良く正確にチップ上に搭載でき、載せたサンプルは蛋白質/ペプチドとしての機能を維持しており、一連の操作で蛋白質/ペプチドが剥がれることなく安定的に固定されたハイスループットの蛋白/ペプチドチップを作製することができる。   According to the present invention, a very small amount of protein or peptide can be mounted on the chip efficiently and accurately, and the loaded sample maintains the function as a protein / peptide and is stable without peeling off the protein / peptide through a series of operations. Fixed high-throughput protein / peptide chips can be produced.

チップの活性化から蛍光検出までの基本操作手順を示す図である。It is a figure which shows the basic operation procedure from chip activation to fluorescence detection. 活性化処理後のスポティング前の乾燥処理条件の検討結果を示す図である。It is a figure which shows the examination result of the drying process conditions before spotting after an activation process. 蛋白質/ペプチドをスポティングする抗原チップにおける添加剤DMSOとPEGの効果を示す図である。It is a figure which shows the effect of additive DMSO and PEG in the antigen chip | tip which spots protein / peptide. ダイヤモンドライクカーボン(DLC)チップとダイヤモンドコーティング(GENE DIA)に蛋白質/ペプチドをスポティングするときの添加剤DMSOの効果を示す図である。It is a figure which shows the effect of additive DMSO when spotting protein / peptide to a diamond-like carbon (DLC) chip | tip and a diamond coating (GENE DIA). 抗原をスポティングした後の乾燥条件(3時間)の検討結果を示す図である。It is a figure which shows the examination result of the drying conditions (3 hours) after spotting an antigen. 抗原をスポティングした後の乾燥条件(終夜)の検討結果を示す図である。It is a figure which shows the examination result of the drying conditions (overnight) after spotting an antigen. 直接抗体結合法及びプロテインG 間接抗体結合法におけるグリセロールの影響を示すを示す図である。It is a figure which shows the influence of glycerol in the direct antibody binding method and the protein G indirect antibody binding method. 直接抗体結合法における抗体結合量へのDNSOの影響を示す図である。It is a figure which shows the influence of DNSO on the antibody binding amount in the direct antibody binding method. 直接抗体結合法におけるTNF−α抗原抗体結合量へのDNSOの影響を示す図である。It is a figure which shows the influence of DNSO on the TNF- (alpha) antigen antibody binding amount in the direct antibody binding method. 小児及び健常人の食物(牛乳・卵)アレルギー検査(IgG)の結果を示す図である。It is a figure which shows the result of the food (milk / egg) allergy test (IgG) of a child and a healthy person. 小児及び健常人の食物(牛乳・卵)アレルギー検査(IgG)の結果を示す図である。It is a figure which shows the result of the food (milk / egg) allergy test (IgG) of a child and a healthy person. 小児及び健常人の食物(牛乳・卵)アレルギー検査(IgE)の結果を示す図である。It is a figure which shows the result of the food (milk / egg) allergy test (IgE) of a child and a healthy person. 化学修飾したダイヤモンド/DLCチップの活性化とカップリング反応の概略を示す図である。It is a figure which shows the outline of activation and coupling reaction of the diamond / DLC chip | tip chemically modified.

本発明の蛋白質/ペプチドの固定化方法としては、化学修飾したダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質/ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行う、チップ上に蛋白質/ペプチドを固定する方法であって、スポッティング添加剤としてDMSO又はPEGを用いる方法であれば特に制限されず、上記化学修飾したダイヤモンド/DLCチップとしては、シリコン、ガラス、ステンレス、プラスチック等の基板上にダイヤモンド又はダイヤモンドライクカーボン(DLC)をコーティングしたダイヤモンド/DLCチップに、蛋白質/ペプチドをカップリング反応等により結合させることができるような化学修飾がなされたダイヤモンド/DLCチップであれば特に制限されず、例えば、かかる化学修飾としては、ダイヤモンド/DLCチップ表面を塩素処理、アンモニア処理、ジカルボン酸処理等による塩素化、アミノ化、カルボキシル化等がなされたダイヤモンド/DLCチップを例示することができるが、中でも、カルボキシル化ダイヤモンド/DLCチップを好適に例示することができる。上記化学修飾したダイヤモンド/DLCチップは、市販品(東洋鋼鈑)を利用することもできる。   In the protein / peptide immobilization method of the present invention, a chemically modified diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip is activated with an activating reagent, and then the protein / peptide is spotted on the chip for coupling reaction. Is not particularly limited as long as it is a method of immobilizing a protein / peptide on a chip and using DMSO or PEG as a spotting additive. Examples of the chemically modified diamond / DLC chip include silicon, glass, A diamond / DLC chip that has been chemically modified so that a protein / peptide can be bound by a coupling reaction or the like to a diamond / DLC chip coated with diamond or diamond-like carbon (DLC) on a substrate such as stainless steel or plastic. If special For example, as such chemical modification, a diamond / DLC chip whose surface is subjected to chlorination, amination, carboxylation, etc. by chlorination, ammonia treatment, dicarboxylic acid treatment, etc. is exemplified as such chemical modification. Among them, a carboxylated diamond / DLC chip can be preferably exemplified. A commercially available product (Toyo Kohan) may be used as the chemically modified diamond / DLC chip.

上記化学修飾したダイヤモンド/DLCチップは、活性化試薬により活性化処理に付される。例えば、カルボキシル化ダイヤモンド/DLCチップに蛋白質/ペプチドを固定化させる方法として、基盤表面に導入されたカルボキシル基(−COOH基)を利用し、アミノ基(−NH基)を持つ蛋白質/ペプチドを1-Etyl-3-(3-dimethylamino Propyl)-carbodiimide, hydrochloride (WSCD・HCl)や、N-Hydroxy- succinimide (NHS)やその他の化学架橋剤を用いて共有結合により固定化させることが好ましい。チップの活性化とカップリング反応の概略を図13に示す。 The chemically modified diamond / DLC chip is subjected to an activation treatment with an activation reagent. For example, as a method for immobilizing a protein / peptide on a carboxylated diamond / DLC chip, a protein / peptide having an amino group (—NH 2 group) using a carboxyl group (—COOH group) introduced on the substrate surface is used. It is preferable to immobilize by covalent bond using 1-Etyl-3- (3-dimethylaminopropyl) -carbodiimide, hydrochloride (WSCD · HCl), N-Hydroxy-succinimide (NHS) or other chemical crosslinking agents. An outline of chip activation and coupling reaction is shown in FIG.

上記活性化処理後のチップはMilliQ水(超純水)で洗浄され、ペプチドのカップリング反応(固定化操作)が行われるが、この蛋白質/ペプチドの固定化操作の前処理として、十分な除湿、乾燥が蛋白質/ペプチドの固定化量と固定化量の均一性に重要な因子であり、そのため真空デシケーターで30〜120分、好ましくは1時間程度減圧乾燥処理することがきわめて好ましい。また、ペプチドのカップリング反応は、活性化処理後のチップ、好ましくは減圧乾燥処理が施されたチップに蛋白質/ペプチド溶液をスポッティングして、30〜42℃で2〜4時間、好ましくは37℃で3時間インキュベーションすることにより行うことができるが、スポッティング添加剤としてDMSOやPEGを用いると、蛋白質/ペプチドの機能を損なわずにチップ基板に蛋白質/ペプチドを固定化したり、結合量が増加したり、基板上でその機能を損なわずに維持することができる。また、スポッティング反応後、30〜42℃で2〜4時間、特に37℃で3時間乾燥させることが好ましい。この乾燥後、BSA等を用いた未反応活性基のブロッキング操作を行うことが好ましい。このような本発明の蛋白質/ペプチドの固定化方法により、本発明の蛋白質/ペプチド固定化チップを作製することができる。   The chip after the above activation treatment is washed with MilliQ water (ultra-pure water), and a peptide coupling reaction (immobilization operation) is performed. As a pretreatment for the protein / peptide immobilization operation, sufficient dehumidification is performed. Drying is an important factor for the protein / peptide immobilization amount and the uniformity of the immobilization amount. Therefore, it is highly preferable to perform a vacuum drying treatment with a vacuum desiccator for 30 to 120 minutes, preferably about 1 hour. The peptide coupling reaction is carried out by spotting the protein / peptide solution on a chip after activation treatment, preferably a chip subjected to vacuum drying treatment, at 30-42 ° C. for 2-4 hours, preferably 37 ° C. However, if DMSO or PEG is used as a spotting additive, the protein / peptide may be immobilized on the chip substrate without increasing the function of the protein / peptide, or the amount of binding may increase. It can be maintained on the substrate without impairing its function. Moreover, it is preferable to dry at 30-42 degreeC for 2 to 4 hours after a spotting reaction, especially at 37 degreeC for 3 hours. After this drying, it is preferable to perform an unreacted active group blocking operation using BSA or the like. The protein / peptide immobilization chip of the present invention can be produced by such a protein / peptide immobilization method of the present invention.

上記DMSOやPEGは、蛋白質/ペプチドをチップ基板表面に固定化する際の溶媒(0.1Mリン酸カリウム緩衝液、pH6.0)に添加して通常用いられるが、使用濃度としては、両者共に10〜50%、特に30%前後が好ましい。また、PEGとしては、分子量200〜400、好ましくは300前後のPEGを好適に例示することができる。   The above DMSO and PEG are usually used by adding to a solvent (0.1 M potassium phosphate buffer, pH 6.0) for immobilizing proteins / peptides on the chip substrate surface. 10 to 50%, particularly around 30% is preferable. Further, as PEG, a PEG having a molecular weight of 200 to 400, preferably around 300 can be suitably exemplified.

本発明の蛋白質/ペプチドの固定化方法の対象となる蛋白質/ペプチドとしては、抗原又は抗体を好適に例示することができ、抗原としては、アレルゲン、各種ガン抗原、サイトカイン等を例示することができる。上記アレルゲンとしては、免疫原性を有するものであれば特に制限されず、卵類、牛乳類、肉類、魚類、甲殻類及び軟体動物類、穀類、豆類及びナッツ類、果実類、野菜類、ビール酵母、ゼラチンなどの食物アレルゲンを好適に例示することができ、中でも乳アレルゲンの主要成分としてのαs1−カゼイン、αs2−カゼイン、β−カゼイン、κ−カゼイン、α−ラクトアルブミンや、ホエーアレルゲンの主要成分であるβ−ラクトグロブリンや、卵白アレルゲンの主要成分としてのオボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンや、小麦アレルゲンの主要成分としてのグリアジンや、そばの主要タンパク質である分子量24kDaと76kDaのタンパク質や、落花生の主要タンパク質であるArah1を具体的に例示することができる。   Examples of the protein / peptide targeted for the protein / peptide immobilization method of the present invention include antigens and antibodies, and examples of antigens include allergens, various cancer antigens, and cytokines. . The allergen is not particularly limited as long as it has immunogenicity, and eggs, milk, meat, fish, crustaceans and mollusks, cereals, beans and nuts, fruits, vegetables, beer Preferred examples include food allergens such as yeast and gelatin. Among them, αs1-casein, αs2-casein, β-casein, κ-casein, α-lactalbumin, and the main whey allergen as main components of milk allergen Β-lactoglobulin, ovomucoid, ovalbumin, conalbumin as the main component of egg white allergen, gliadin as the main component of wheat allergen, proteins with molecular weights of 24 kDa and 76 kDa, buckwheat, and peanut Arah1 which is a major protein of can be specifically exemplified.

また、アレルゲンペプチドとして、糖鎖修飾ペプチド、リン酸化ペプチド、アシール化ペプチド、アセチル化ペプチド、メチル化ペプチド、ユビキチン化ペプチド等の化学修飾ペプチドを用いることもでき、かかる化学修飾ペプチドは、天然の化学修飾ペプチドであっても、人為的な化学修飾ペプチドであってもよい。さらに、アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、MHCクラスII分子に結合する7〜15アミノ酸サイズ等のペプチド部分のN末端側及び/又はC末端側に少なくとも2個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチドを用いると、患者抗体と数倍から数十倍高感度に反応する点で好ましい。かかるMHCクラスII分子に結合するペプチド部分のN末端側及び/又はC末端側に少なくとも2個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチド等のアレルゲンエピトープを含むペプチドは、ペプチド合成により作製することもできるが、アレルゲンのエピトープを含むプロテアーゼ分解ペプチドとして作製することもできる。かかるプロテアーゼとしては、トリプシン、キモトリプシン、カテプシン、リジルエンドペプチダーゼを挙げることができる。特に、アレルゲンが食物アレルゲンのとき、トリプシン分解ペプチドをプロテアーゼ分解ペプチドとして好適に例示することができる。   Further, as the allergen peptide, a chemically modified peptide such as a sugar chain-modified peptide, a phosphorylated peptide, an asylated peptide, an acetylated peptide, a methylated peptide, or a ubiquitinated peptide can be used. It may be a modified peptide or an artificially chemically modified peptide. Furthermore, as a peptide containing an allergen epitope, an epitope-containing peptide in which at least two or more amino acids are added to the N-terminal side and / or the C-terminal side of a peptide part such as a 7-15 amino acid size that binds to an MHC class II molecule When used, it is preferable in that it reacts with a patient antibody several times to several tens of times with high sensitivity. A peptide containing an allergen epitope such as an epitope-containing peptide in which at least two or more amino acids are added to the N-terminal side and / or the C-terminal side of the peptide part that binds to such MHC class II molecule may be prepared by peptide synthesis. However, it can also be produced as a protease-degrading peptide containing an allergen epitope. Examples of such proteases include trypsin, chymotrypsin, cathepsin, and lysyl endopeptidase. In particular, when the allergen is a food allergen, a trypsin-degrading peptide can be preferably exemplified as a protease-degrading peptide.

本発明の蛋白質/ペプチドの固定化方法により作製される蛋白質/ペプチド固定化チップを用いると、イムノアッセイにより有利にアレルゲンエピトープの判定を行うことができる。かかるイムノアッセイとしては、蛋白質/ペプチド固定化チップに捕捉された検体中のアレルゲン認識抗体を検出することができる公知のイムノアッセイであれば特に制限されないが、標識2次抗体を用いるELISAが好ましく、標識2次抗体としては、Cy3,Cy5,FITC,ローダミン等の蛍光標識2次抗体、ペルオキシダーゼ,アルカリフォスファターゼ等の酵素標識2次抗体、磁気ビーズ標識2次抗体、赤外標識2次抗体を例示することができ、2次抗体としては抗IgG抗体又は抗IgE抗体を例示することができるが、Cy3標識抗IgG抗体やCy3標識抗IgE抗体を好適に挙げることができる。そして、上記2次抗体としては、抗体のFab断片やF(ab’)断片等も使用することがき、例えば、Fab断片は抗体をパパイン等で処理することにより、またF(ab’)断片はペプシン等で処理することにより調製することができる。 When the protein / peptide immobilization chip prepared by the protein / peptide immobilization method of the present invention is used, allergen epitopes can be advantageously determined by immunoassay. Such an immunoassay is not particularly limited as long as it is a known immunoassay capable of detecting an allergen-recognizing antibody in a sample captured on a protein / peptide-immobilized chip, but an ELISA using a labeled secondary antibody is preferable, and labeled 2 Examples of secondary antibodies include fluorescently labeled secondary antibodies such as Cy3, Cy5, FITC and rhodamine, enzyme-labeled secondary antibodies such as peroxidase and alkaline phosphatase, magnetic bead-labeled secondary antibodies, and infrared-labeled secondary antibodies. As the secondary antibody, an anti-IgG antibody or an anti-IgE antibody can be exemplified, and a Cy3-labeled anti-IgG antibody or a Cy3-labeled anti-IgE antibody can be preferably exemplified. As the secondary antibody, an antibody Fab fragment, F (ab ′) 2 fragment or the like can be used. For example, the Fab fragment can be obtained by treating the antibody with papain or the like, and F (ab ′) 2. Fragments can be prepared by treating with pepsin or the like.

以下、実施例により本発明をより具体的に説明するが、本発明の技術的範囲はこれらの例示に限定されるものではない。   EXAMPLES Hereinafter, although an Example demonstrates this invention more concretely, the technical scope of this invention is not limited to these illustrations.

1.実験材料
ジーンシリコンC4(3mm×3mm)、ジーンスライドDLC(東洋鋼鈑)、96穴マイクロプレートU底(Greiner)、384穴マイクロプレート平底(NUNC)を購入して用いた。オボムコイド(OVM)(SIGMA)、フロイントの完全アジュバント(DIFCO)、ネンブタール(大日本製薬)、Hybond-C Gridded membranes(Amersham)、スキムミルク、Peroxidase-F(ab’)goat anti rabbit IgG(H+L)(ZYMED)、ECL(Amersham)、CNBr-cativated Sepharose 4B(Pharmacia)、ImmunoPure IgG Purification Kit(PIERCE)、7MGuanigine-HCl(pH8.6)、Dithiothreitol(DTT)、トリプシン(SigmaまたはPromega)、α-Cyano-4-hydroxycinnamic acid(Sigma)、Non-immunized rabbit IgG、Goat anti-rabbit IgG(H+L)Cy3,Cy5conjugate(ZYMED)、抗ヒトIgG抗体(Fc specific)Cy3,Cy5conjugate(ZYMED)、抗ヒトIgE抗体(Fc specific)Cy3,Cy5conjugate(ZYMED)、WSCD・HCl (ペプチド研究所)、NHS(ペプチド研究所)、DMSO(和光純薬)、防腐剤(0.5%チメロサール)を購入して用いた。
1. Experimental Materials Gene silicon C4 (3 mm × 3 mm), Gene slide DLC (Toyo Kohan), 96-well microplate U bottom (Greiner), and 384-well microplate flat bottom (NUNC) were purchased and used. Ovomucoid (OVM) (SIGMA), Freund's complete adjuvant (DIFCO), Nembutal (Dainippon Pharmaceutical), Hybond-C Gridded membranes (Amersham), skim milk, Peroxidase-F (ab ') 2 goat anti rabbit IgG (H + L ) (ZYMED), ECL (Amersham), CNBr-cativated Sepharose 4B (Pharmacia), ImmunoPure IgG Purification Kit (PIERCE), 7M Guanigine-HCl (pH 8.6), Dithiothreitol (DTT), Trypsin (Sigma or Promega), α- Cyano-4-hydroxycinnamic acid (Sigma), Non-immunized rabbit IgG, Goat anti-rabbit IgG (H + L) Cy3, Cy5conjugate (ZYMED), anti-human IgG antibody (Fc specific) Cy3, Cy5conjugate (ZYMED), anti-human Purchase and use IgE antibody (Fc specific) Cy3, Cy5conjugate (ZYMED), WSCD / HCl (Peptide Research Laboratories), NHS (Peptide Research Laboratories), DMSO (Wako Pure Chemicals), antiseptic (0.5% thimerosal) It was.

2.基本操作
ダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップによる抗原(アレルゲン)の検出と特異抗体の定量における諸条件を検討するため、以下に示す(1)〜(6)の一連の操作を行った。チップの活性化から蛍光検出までの基本操作手順を図1に示す。
2. Basic operation In order to examine various conditions in the detection of an antigen (allergen) using a diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip and the quantification of a specific antibody, the following series of operations (1) to (6) were performed. The basic operation procedure from chip activation to fluorescence detection is shown in FIG.

(1)DLCチップの活性化
DLCチップを96穴マイクロプレートに入れ、MilliQ水で1回洗浄後、50μLの活性化試薬(100mMWSC,20mM NHS,0.1M リン酸カリウム緩衝液;pH6.0)をプレートに分注し、室温で30分間遮光した状態で振とうしながら反応させた。反応液を吸引除去後、MilliQ水でチップを十分に洗浄し、8連チューブにチップを移し卓上遠心機を用いチップの水分を直ちに完全に除去した。
(1) Activation of DLC chip The DLC chip is placed in a 96-well microplate, washed once with MilliQ water, and then 50 μL of activation reagent (100 mM WSC, 20 mM NHS, 0.1 M potassium phosphate buffer; pH 6.0) Was dispensed onto a plate and allowed to react with shaking in the dark at room temperature for 30 minutes. After removing the reaction solution by suction, the chip was thoroughly washed with MilliQ water, the chip was transferred to an 8 tube, and the moisture of the chip was immediately and completely removed using a tabletop centrifuge.

(2)抗原(アレルゲン)のカップリング反応
0.1Mリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)にDMSOを30%の濃度で添加し、この溶液にスポッティングを行うアレルゲンを溶解した。アレルゲンはSTAMPUMANマイクロアレイヤー(日本レーザー電子)を用いてスポッティングした。チップをマイクロアレイヤーのサンプリング用ホルダーにセットしてスポット操作を行った。スポット後、チップを37℃の条件下にクールインキュベーター:CN−25A(三菱電機エンジニアリング)でインキュベートした。
(2) Coupling reaction of antigen (allergen) DMSO was added to 0.1 M potassium phosphate buffer (pH 6.0) at a concentration of 30%, and the allergen to be spotted was dissolved in this solution. Allergens were spotted using a STAMPUMAN microarrayer (Japan Laser Electronics). The chip was set on a microarrayer sampling holder and spot operation was performed. After spotting, the chip was incubated at 37 ° C. in a cool incubator: CN-25A (Mitsubishi Electric Engineering).

(3)未反応活性基のブロッキング操作
チップを96穴マイクロプレートに移し、50mMのTTBS[0.05% Tween20,20mM Tris−HCl(pH7.5),150mM NaCl]を加え、プレートシェーカーを用いて洗浄作業を行った。固定化反応後に残存する活性基を処理するため、150mMのNaCl含有1MTris−HCl(pH8.0)を加え、遮光した状態下に1時間室温で反応させ未反応基を完全に不活性化した。さらに、チップへの抗体の非特異的反応をブロックするため、遮光条件下に0.1%BSAを含むPBS溶液と4℃で一晩反応させた。
(3) Blocking operation of unreacted active groups The chip was transferred to a 96-well microplate, 50 mM TTBS [0.05% Tween 20, 20 mM Tris-HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl] was added, and a plate shaker was used. A cleaning operation was performed. In order to treat the active groups remaining after the immobilization reaction, 150 mM NaCl-containing 1M Tris-HCl (pH 8.0) was added, and the reaction was allowed to proceed at room temperature for 1 hour in a light-shielded state to completely inactivate unreacted groups. Furthermore, in order to block the nonspecific reaction of the antibody to the chip, it was reacted overnight at 4 ° C. with a PBS solution containing 0.1% BSA under light-shielding conditions.

(4)抗原(アレルゲン)認識抗体の捕捉反応
ブロッキングバッファーを吸引除去し、抗体希釈バッファー[60mg/mLBSA,PBS(pH7.4)、0.05%Tween20]で種々の濃度に1次抗体を希釈した後、チップの入ったプレートに分注し遮光条件下に室温で5時間振とうしながら反応させた。
(4) Antigen (allergen) recognition antibody capture reaction The blocking buffer is aspirated and the primary antibody is diluted to various concentrations with antibody dilution buffer [60 mg / mL BSA, PBS (pH 7.4), 0.05% Tween 20]. After that, the solution was dispensed to a plate containing chips and reacted while shaking at room temperature for 5 hours under light-shielding conditions.

(5)2次抗体の反応
1次抗体反応液を吸引除去し、洗浄バッファーを加え、プレートシェーカーを用いて洗浄作業を行った。次に蛍光標識した2次抗体を、0.1%BSAを含むPBS溶液で1.5μg/mLに希釈し、チップの入ったプレートに分注して遮光条件下に室温で1時間振とうして反応させた。
(5) Reaction of secondary antibody The primary antibody reaction solution was removed by suction, a washing buffer was added, and washing was performed using a plate shaker. Next, the fluorescently labeled secondary antibody is diluted to 1.5 μg / mL with a PBS solution containing 0.1% BSA, dispensed onto a plate containing the chip, and shaken at room temperature for 1 hour under light-shielded conditions. And reacted.

(6)抗原チップに捕捉された抗体の検出
2次抗体との反応後、反応液を吸引除去し、洗浄バッファーとMilliQ水でチップを洗浄し、水分を除去するためにスピンダウンを行った。次にFLA−8000蛍光スキャナー:FLA−8000(FUJIFILM)を用いて蛍光強度を測定し、各チップから得られたスポットの蛍光強度の数値化を行った。
(6) Detection of antibody captured on antigen chip After reaction with the secondary antibody, the reaction solution was removed by suction, the chip was washed with a washing buffer and MilliQ water, and spin-down was performed to remove moisture. Next, the fluorescence intensity was measured using a FLA-8000 fluorescence scanner: FLA-8000 (FUJIFILM), and the fluorescence intensity of the spots obtained from each chip was digitized.

蛋白質/ペプチドを化学修飾したダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップチップ上にスポッティングしてカップリング反応を行い、次いで未反応活性基のブロッキング操作を行う、チップ上に蛋白質/ペプチドを固定する方法において、蛋白質/ペプチドの機能を損なわずにチップ基板に蛋白質/ペプチドを固定化したり、結合量を増加させたり、基板上でその機能を損なわずに維持するための至適条件について検討した。   A method of immobilizing a protein / peptide on a chip by spotting on a chemically modified protein / peptide diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip chip, performing a coupling reaction, and then blocking unreacted active groups The optimum conditions for immobilizing the protein / peptide on the chip substrate without increasing the function of the protein / peptide, increasing the binding amount, or maintaining the function on the substrate without impairing the function were studied.

1.蛋白質/ペプチドをスポッティングする前処理条件の検討
上記基本操作(1)におけるチップの活性化反応後、チップをMilliQ水で洗浄し、次いで基本操作(2)のカップリング反応による蛋白質/ペプチドの固定化操作が行われるが、この蛋白質/ペプチドの固定化操作の前処理として、十分な除湿、乾燥が蛋白質/ペプチドの固定化量と固定化量の均一性に及ぼす影響について調べた。
1. Examination of pretreatment conditions for spotting protein / peptide After the chip activation reaction in the basic operation (1), the chip is washed with MilliQ water, and then the protein / peptide is immobilized by the coupling reaction in the basic operation (2). As the pretreatment for the protein / peptide immobilization operation, the influence of sufficient dehumidification and drying on the protein / peptide immobilization amount and the uniformity of the immobilization amount was examined.

上記基本操作(1)における遠心脱水後のチップの乾燥処理条件について検討した。抗原としては、各種濃度(50,75,100,200fmol/スポット)のオボムコイドを用い、また、1次抗体としては10倍希釈の患者血清を、2次抗体としては1.5μg/mlのCy3標識ヤギ抗ヒトIgE抗体を用いた。乾燥処理としては、1)真空デシケーターで1時間減圧乾燥処理、2)37〜42℃で1時間の加温乾燥処理、3)室温(RT)で1時間の乾燥処理、をそれぞれ比較した。結果を図2に示す。これらの結果から、1時間減圧乾燥処理で、蛋白質/ペプチドの固定化量の増加と均一性において至適条件が得られた。   The conditions for drying the chips after centrifugal dehydration in the basic operation (1) were examined. As an antigen, various concentrations (50, 75, 100, 200 fmol / spot) of ovomucoid are used, 10-fold diluted patient serum is used as the primary antibody, and 1.5 μg / ml of Cy3 label is used as the secondary antibody. Goat anti-human IgE antibody was used. As the drying treatment, 1) vacuum drying treatment with a vacuum desiccator for 1 hour, 2) heating drying treatment at 37 to 42 ° C. for 1 hour, and 3) drying treatment at room temperature (RT) for 1 hour were respectively compared. The results are shown in FIG. From these results, optimal conditions were obtained in the increase in the amount of protein / peptide immobilization and homogeneity after drying under reduced pressure for 1 hour.

2.蛋白質/ペプチドを固定化する際の溶媒の検討
蛋白質/ペプチドの活性は、複雑な立体構造に依存しており、蛋白質/ペプチドを基板表面に固定化する際の溶媒(0.1Mリン酸カリウム緩衝液、pH6.0)に添加する添加剤が重要である。そこで、添加剤として、1)一般に蛋白質の安定化剤として使用される10〜30%のグリセロール、2)20〜40%のDMSO、3)20〜40%のPEG(分子量300)を、それぞれ用いた場合の蛋白質/ペプチドの固定化量と固定化量の均一性に及ぼす影響について、基板の種類[ダイヤモンドコーティング(GENE DIA)、ダイヤモンドライクカーボン(DLC)チップ]、基板の素材(シリコン、ガラス、ステンレス)も加味して調べてみた。
2. Examination of Solvent for Immobilizing Protein / Peptide The activity of protein / peptide depends on complex three-dimensional structure. Solvent for immobilizing protein / peptide on the substrate surface (0.1M potassium phosphate buffer) The additive added to the liquid, pH 6.0) is important. Therefore, as additives, 1) 10-30% glycerol, which is generally used as a protein stabilizer, 2) 20-40% DMSO, 3) 20-40% PEG (molecular weight 300) are used respectively. As for the immobilization amount of protein / peptide and the effect on the uniformity of the immobilization amount, the substrate type [Diamond coating (GENE DIA), diamond-like carbon (DLC) chip], substrate material (silicon, glass, (Stainless steel) was also examined.

抗原(アレルゲン)としては、100fmol/スポットのα−カゼイン、β−カゼイン、κ-カゼイン、α−ラクトアルブミン、β―ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンを用いた。また、1次抗体としては10倍希釈の患者血清を、2次抗体としては1.5μg/mlのCy3標識ヤギ抗ヒトIgE抗体を用いた。   As an antigen (allergen), 100 fmol / spot α-casein, β-casein, κ-casein, α-lactalbumin, β-lactoglobulin, ovomucoid, ovalbumin, and conalbumin were used. Further, 10-fold diluted patient serum was used as the primary antibody, and 1.5 μg / ml of Cy3-labeled goat anti-human IgE antibody was used as the secondary antibody.

まず、上記基本操作(2)における30%DMSOに代えて10〜30%のグリセロールを用いた結果、10〜30%のグリセロールは、蛋白質/ペプチドのスポティング添加剤としては、基板の種類(ダイヤモンドコーティング、ダイヤモンドライクカーボンチップ)、基板の素材(シリコン、ガラス、ステンレス)を問わず、全てにおいて効果がないことがわかった。   First, as a result of using 10-30% glycerol instead of 30% DMSO in the above basic operation (2), 10-30% glycerol was used as a protein / peptide spotting additive as a substrate type (diamond It turned out to be ineffective in all cases, regardless of coating, diamond-like carbon chips) and substrate materials (silicon, glass, stainless steel).

そこで、1)30%DMSO、2)30%PEG、3)ブランク(−)について同様に調べた。結果を図3に示す。その結果、30%DMSOと30%PEGをそれぞれ蛋白質/ペプチドのスポッティング添加剤として添加することで、蛋白質/ペプチドの結合量と抗体との反応性が保たれ、高い反応性が実現できた。30%DMSOと30%PEGの間では、わずかに30%PEGの方がスポティング効率の高いことが判明した。この場合、基板の種類(ダイヤモンドコーティング、ダイヤモンドライクカーボンチップ)、基板の素材(シリコン、ガラス、ステンレス)で共通していることがわかった。   Therefore, 1) 30% DMSO, 2) 30% PEG, and 3) blank (-) were examined in the same manner. The results are shown in FIG. As a result, by adding 30% DMSO and 30% PEG as protein / peptide spotting additives, the reactivity between the binding amount of the protein / peptide and the antibody was maintained, and high reactivity was realized. It was found that between 30% DMSO and 30% PEG, only 30% PEG had a higher spotting efficiency. In this case, it was found that the substrate type (diamond coating, diamond-like carbon chip) and the substrate material (silicon, glass, stainless steel) were common.

次ぎに、蛋白質/ペプチドのスポッティング添加剤として30%DMSOを添加した場合における、シリコンをコーティングしたダイヤジーン(GENE DIA)とダイヤモンドライクカーボン(DLC)の各チップにおける蛋白質/ペプチドの結合量と抗体との反応性を調べた。上記基本操作(1)におけるチップの活性化後、ウサギIgG又は抗マウスTNF−α抗体を、30%DMSO/0.1M MES(pH4.5)で1.5μg/mlに希釈し、室温又は37℃で1時間遮光してカップリング反応を行った。未反応の蛋白質は0.05%Tween20を含有するTBSで10回洗浄して除去した。洗浄液を加えた後30秒間静置し吸引除去した。ブロッキングは、150mMNaCl含有1M Tris−HCl(pH8.0)を加え、室温で1時間遮光した状態下に反応させた後、0.1%BSAを含むPBS溶液中で4℃で一晩反応させた。2次抗体にはアルカリフォスファターゼ(AP)標識抗ウサギIgG(H+L)に対するヤギのF(ab’)フラグメントを用いた。APの基質としてはpNPPを0.1Mの2−アミノ−2−メチル−1,3−プロパンジオール緩衝液(pH10.3)で2mg/mlに調整し、室温で5分間反応させた後、0.75NのNaOHで反応を停止させ、405nmの吸光度を測定した。結果を図4に示す。 Next, when 30% DMSO is added as a protein / peptide spotting additive, the amount of protein / peptide binding and antibody in each of silicon coated diamond gene (GENE DIA) and diamond-like carbon (DLC) chips The reactivity of was investigated. After activation of the chip in the above basic operation (1), rabbit IgG or anti-mouse TNF-α antibody was diluted to 1.5 μg / ml with 30% DMSO / 0.1 M MES (pH 4.5), and the room temperature or 37 The coupling reaction was carried out at 1 ° C for 1 hour with light shielding. Unreacted protein was removed by washing 10 times with TBS containing 0.05% Tween20. After adding the cleaning solution, the solution was allowed to stand for 30 seconds and removed by suction. For blocking, 1 M Tris-HCl (pH 8.0) containing 150 mM NaCl was added, and the mixture was reacted at room temperature for 1 hour under light-shielded conditions, and then reacted overnight at 4 ° C. in a PBS solution containing 0.1% BSA. . As the secondary antibody, an F (ab ′) 2 fragment of goat against alkaline phosphatase (AP) -labeled anti-rabbit IgG (H + L) was used. As a substrate for AP, pNPP was adjusted to 2 mg / ml with 0.1 M 2-amino-2-methyl-1,3-propanediol buffer (pH 10.3) and reacted at room temperature for 5 minutes. The reaction was stopped with .75N NaOH and the absorbance at 405 nm was measured. The results are shown in FIG.

図4は、30%DMSO添加の有りと無しの条件でスポッティングした後、室温(RT)か37℃の条件でカップリング反応をした後、酵素標識した抗IgG抗体と1時間反応して測定した結果を示している。その結果、30%DMSOを添加してスポッティングすることで抗体の結合量が増加することがわかった。なお、10%DMSOでは反応温度の影響がほとんど見られなかった。また、基板の素材(シリコン、ガラス、ステンレス)にかかわらず共通の結果が得られた。   FIG. 4 shows the measurement after spotting with and without addition of 30% DMSO, followed by a coupling reaction at room temperature (RT) or 37 ° C., and then reacting with an enzyme-labeled anti-IgG antibody for 1 hour. Results are shown. As a result, it was found that adding 30% DMSO and spotting increased the amount of antibody binding. In 10% DMSO, the reaction temperature hardly affected the reaction. In addition, common results were obtained regardless of the substrate material (silicon, glass, stainless steel).

3.蛋白質/ペプチドをスポティングする際の反応温度の検討
蛋白質/ペプチドを固定化する際に、DLCとジーンダイヤでは4℃よりも室温か37℃において結合量は多かった。室温と37℃の間では37℃の方が幾分固定化量が多かった(図4)。
3. Examination of reaction temperature when spotting protein / peptide When DLC / gene diamond was immobilized, the binding amount was higher at room temperature or 37 ° C than at 4 ° C. Between room temperature and 37 ° C., the amount of immobilization was somewhat higher at 37 ° C. (FIG. 4).

4.蛋白質/ペプチドをスポッティングする際の時間の検討
蛋白質/ペプチドを固定化する際に、DLCとジーンダイヤでは固定化反応の反応時間(1hr,3hr,一晩)について至適条件を検討した。その結果、37℃(42℃まで)の反応温度条件で3時間反応させることで、チップ上での蛋白質/ペプチドの結合量が最も多く、バラツキなく安定して結合させることができた。
4). Examination of the time for spotting the protein / peptide When immobilizing the protein / peptide, DLC and Gene Diamond examined the optimum conditions for the reaction time of the immobilization reaction (1 hr, 3 hr, overnight). As a result, the reaction was performed for 3 hours at a reaction temperature of 37 ° C. (up to 42 ° C.), and the amount of protein / peptide binding on the chip was the largest and could be stably bound without variation.

5.スポティング後の乾燥処理条件の検討
抗原として各種濃度(50,75,100,200fmol/スポット)のオボムコイドをスポティングした後、4℃,室温(RT),37℃の各温度条件にてチップを3時間乾燥した。1M Tris−HCl(pH8)/150mM NaCl,及びBSAでブロッキング処理後、患者プール血清を60%BSAを含むPBS/0.05%Tween20溶液で10倍希釈して室温で5時間反応させた。二次抗体として約1.5μg/mLのCy3標識ヤギ抗ヒトIgE抗体を用いて1時間反応させ蛍光検出した。結果を図5に示す。また、3時間の乾燥処理を終夜乾燥処理に代える以外は同様にして蛍光検出した。結果を図6に示す。
5. Examination of drying treatment conditions after spotting After spotting ovomucoid at various concentrations (50, 75, 100, 200 fmol / spot) as an antigen, the chip was placed at 4 ° C, room temperature (RT), and 37 ° C. Dry for 3 hours. After blocking with 1M Tris-HCl (pH 8) / 150 mM NaCl and BSA, the patient pool serum was diluted 10-fold with a PBS / 0.05% Tween 20 solution containing 60% BSA and reacted at room temperature for 5 hours. About 1.5 μg / mL of Cy3-labeled goat anti-human IgE antibody was used as a secondary antibody for 1 hour to detect fluorescence. The results are shown in FIG. Further, fluorescence was detected in the same manner except that the drying treatment for 3 hours was replaced with the drying treatment overnight. The results are shown in FIG.

図5及び6に示される結果から、スポッティング後の処理条件は37℃,3時間で蛋白質/ペプチドの固定化量の増加と均一性において至適条件が得られた。   From the results shown in FIGS. 5 and 6, the optimum treatment conditions after spotting were obtained at 37 ° C. for 3 hours in terms of increase in protein / peptide immobilization amount and uniformity.

スポッティング添加剤として、グリセロールまたはジメチルスルフォキシド(DMSO)を添加することで、微量なタンパク質を、生物学的機能を維持した状態で固定化することができるかについて詳細に検討を行った。   It was examined in detail whether a small amount of protein can be immobilized while maintaining biological function by adding glycerol or dimethyl sulfoxide (DMSO) as a spotting additive.

1.方法
(1)タンパク質のカップリング、洗浄およびブロッキング
1.5ml平底アシストチューブ内においてチップを100mM WSC、20mM NHSにより活性化した後、直接抗体結合法あるいはプロテインG間接抗体結合法においてそれぞれタンパク質のカップリングを行った。直接抗体結合法として、ウサギIgGあるいは抗マウスTNF−α抗体を0.1M MES(pH4.5)にて1.5μg/mLに希釈後、カップリング反応をおこなった。また、プロテインG間接抗体結合法として、プロテインGを0.1M MES(pH4.5)にて20μg/mLに希釈調製し、プロテインG分子をカップリングした。未反応のタンパク質は0.05%Tween20を含有するTBSで10回洗浄することにより除去した。洗浄は、洗浄液を加えた後30秒間静置し、吸引除去した。ブロッキングは150mM NaCl含有1M Tris−HCl(pH8.0)を加え、室温で1時間反応させた後、0.1%BSAを含むPBS溶液中で4℃で一晩反応させた。さらにプロテインG間接抗体結合法の場合、ウサギIgGあるいは抗マウスTNF−α抗体を0.1%BSAを含むPBSで0.5μg/mL希釈調製し、室温で1時間振とうさせることによりチップ上に抗体分子を固定化させた。
1. Method (1) Protein Coupling, Washing and Blocking After activating the chip with 100 mM WSC and 20 mM NHS in a 1.5 ml flat-bottomed assist tube, protein coupling in the direct antibody binding method or protein G indirect antibody binding method, respectively. Went. As a direct antibody binding method, a rabbit IgG or anti-mouse TNF-α antibody was diluted with 0.1M MES (pH 4.5) to 1.5 μg / mL, and then a coupling reaction was performed. In addition, as a protein G indirect antibody binding method, protein G was diluted to 20 μg / mL with 0.1 M MES (pH 4.5), and protein G molecules were coupled. Unreacted protein was removed by washing 10 times with TBS containing 0.05% Tween20. For washing, the washing solution was added and left still for 30 seconds, followed by suction removal. For blocking, 1M Tris-HCl (pH 8.0) containing 150 mM NaCl was added and reacted at room temperature for 1 hour, and then reacted overnight at 4 ° C. in a PBS solution containing 0.1% BSA. Further, in the case of protein G indirect antibody binding method, rabbit IgG or anti-mouse TNF-α antibody is diluted with PBS containing 0.1% BSA at 0.5 μg / mL and shaken at room temperature for 1 hour on the chip. Antibody molecules were immobilized.

(2)チップ上に固定化された抗体分子の検出
チップ上に固定化した抗体分子の結合量は、酵素標識2次抗体を用いて標識された酵素の活性測定により検量線から定量算定した。2次抗体にはAP標識抗ウサギIgG(H+L)に対するヤギのF(ab’)2フラグメントを用いた。APの基質としては、pNPPを0.1M 2-amino-2-methyl-1,3-propandiol緩衝液(pH10.3)で2mg/mLに調製し、室温で5分反応させた後、0.75N NaOHで反応を停止させ、405nmの吸光度を測定した。
(2) Detection of antibody molecules immobilized on the chip The amount of antibody molecules immobilized on the chip was quantitatively calculated from the calibration curve by measuring the activity of the enzyme labeled with the enzyme-labeled secondary antibody. As the secondary antibody, a goat F (ab ′) 2 fragment against AP-labeled anti-rabbit IgG (H + L) was used. As a substrate for AP, pNPP was prepared to 2 mg / mL with 0.1 M 2-amino-2-methyl-1,3-propandiol buffer (pH 10.3), reacted at room temperature for 5 minutes, The reaction was stopped with 75N NaOH and the absorbance at 405 nm was measured.

(3)抗体チップに捕捉されたTNF−α抗原の検出
チップ上に固定化した抗体分子が捕捉する抗原分子の結合量は、Biosource社のマウスTNF−αイムノアッセイキットを用いて測定した。抗原溶液はマウスTNF−αを0.05%Tween20含有ブロッキング溶液で6250pg/mLに調製し、抗体チップと室温で90分間反応させた後、ビオチン化抗マウスTNF−α抗体と反応させるABC法により検出した。
(3) Detection of TNF-α antigen captured on antibody chip The binding amount of the antigen molecule captured by the antibody molecule immobilized on the chip was measured using a mouse TNF-α immunoassay kit manufactured by Biosource. The antigen solution was prepared by preparing mouse TNF-α with a blocking solution containing 0.05% Tween 20 to 6250 pg / mL, reacting with the antibody chip at room temperature for 90 minutes, and then reacting with biotinylated anti-mouse TNF-α antibody by the ABC method. Detected.

2.結果
(1)グリセロールの影響について
まず、直接抗体結合法において抗体のカップリング時におけるグリセロール添加の影響を検討した。DLCの場合、30%グリセロール存在下では抗体結合量が減少したのに対して、ジーンダイヤを用いた場合、抗体結合量が増加した(図7参照)。この差は、DLCとジーンダイヤの各基板表面の物理化学的特性によるものと推測されるが、さらに検討が必要である。さらに、プロテインG間接抗体結合法においても、DLCの場合30%グリセロール存在下では抗体結合量は減少した(図7参照)。これより、グリセロールの添加は、タンパク質の安定化には適切ではないと考えられた。
2. Results (1) Effect of glycerol First, the effect of glycerol addition during antibody coupling in the direct antibody binding method was examined. In the case of DLC, the amount of antibody binding decreased in the presence of 30% glycerol, whereas the amount of antibody binding increased when Gene Diamond was used (see FIG. 7). This difference is presumed to be due to the physicochemical characteristics of the DLC and gene diamond substrate surfaces, but further investigation is required. Furthermore, in the protein G indirect antibody binding method, the amount of antibody binding decreased in the presence of 30% glycerol in the case of DLC (see FIG. 7). Therefore, it was considered that the addition of glycerol is not appropriate for protein stabilization.

(2)DMSOの影響について
次に、直接抗体結合法において抗体のカップリング時にグリセロールではなくDMSOを添加した場合の影響について検討した。DLC、ジーンダイヤともに30%DMSO添加時において抗体結合量は飛躍的に増加した(図8参照)。データは示していないが、10%DMSOでは影響はほとんど見られなかった。しかし、DLCとジーンダイヤでは反応温度による違いが見られ、DLCでは室温よりも37℃において抗体結合量は多かったのに対し、ジーンダイヤでは反対の結果が得られた。さらに、抗体結合量だけでなく抗体の活性が維持されているかを検討するために、直接抗体結合法により固定化した抗TNF−α抗体が抗原であるTNF−αを捕捉できるかを解析した。その結果、30%DMSO存在下において抗体だけでなく、抗原結合量も増加することが確認できた(図9参照)。これより、30%DMSO存在下において微量の抗体でも固定化量が増加することにより抗原捕捉能力が増加することが明らかになった。
(2) Effect of DMSO Next, the effect of adding DMSO instead of glycerol during antibody coupling in the direct antibody binding method was examined. In both DLC and Gene Diamond, the amount of antibody binding increased dramatically when 30% DMSO was added (see FIG. 8). Although no data is shown, 10% DMSO had little effect. However, there was a difference in reaction temperature between DLC and Gene Diamond, and DLC had a higher amount of antibody binding at 37 ° C. than room temperature, whereas Gene Diamond gave the opposite result. Furthermore, in order to examine whether not only the antibody binding amount but also the activity of the antibody is maintained, it was analyzed whether the anti-TNF-α antibody immobilized by the direct antibody binding method can capture the antigen TNF-α. As a result, it was confirmed that not only the antibody but also the antigen binding amount increased in the presence of 30% DMSO (see FIG. 9). From this, it has been clarified that the antigen-capturing ability is increased by increasing the amount of immobilization even with a small amount of antibody in the presence of 30% DMSO.

本発明のチップ上に蛋白質/ペプチドを固定する方法(上記基本方法)で作製したチップを用い、実際に小児を対象とした食物アレルギーの検体の解析を行った。徳島大学の倫理委員会の承認と香川国立小児病院の倫理委員会の承認の上で、十分なインフォームドコンセントのもとに承諾の得られた臨床検体を香川小児病院(伊藤道徳先生)から供与いただき、食物アレルギーの無い健常人コントロールとの比較を行った。最初に卵と牛乳のアレルゲン成分を検定する目的で、シリコンを基板としたDLCチップに、アレルゲンのタンパク質をそれぞれ1スポット当たり10fmolをスポッティングし、血清を100倍に希釈し反応を行い、2次抗体にCy3標識したヤギ抗ヒトIgG抗体を用い検出した。可能な限り強く免疫したウサギ血清の希釈率は、ヒト血清では参考にならない為、図には示していないが患者と健常人からそれぞれ1検体を選択して50、100、200、400、800、1600倍に希釈してチップとの反応性を検定した。その結果、チップとの反応性において非特異的反応が少なく測定可能な希釈は400−1600倍希釈の範囲と判断された。   Using a chip produced by the method of immobilizing proteins / peptides on the chip of the present invention (the basic method described above), food allergy samples were actually analyzed for children. After receiving approval from the University of Tokushima Ethics Committee and approval from the Kagawa National Children's Hospital, clinical specimens were obtained from Kagawa Children's Hospital (Prof. Michinori Ito) with sufficient informed consent. We compared the results with healthy controls without food allergies. First, in order to test allergen components of egg and milk, 10 fmol of each allergen protein per spot was spotted on a DLC chip using silicon as a substrate, and the serum was diluted 100 times to react. Detection was carried out using a Cy3-labeled goat anti-human IgG antibody. Since the dilution rate of rabbit serum immunized as strongly as possible is not helpful for human serum, it is not shown in the figure, but one sample is selected from each patient and healthy person, and 50, 100, 200, 400, 800, The reactivity with the chip was assayed by diluting 1600 times. As a result, the measurable dilution with less nonspecific reaction in the reactivity with the chip was determined to be in the range of 400-1600 times dilution.

患者血清を1000倍に希釈した測定結果を図10に示した。患者のほとんどはミルクアレルギーで、α−,β−,κ−カゼインとそれぞれの反応強度をもって反応を示した。中にはα−ラクトアルブミン(lactoalbumin)とも反応している患者も認められたが、その比率はカゼインに比較して少数であった。しかしミルクアレルギーを主訴とするアレルギー患者であっても、卵の成分であるOVM、オボアルブミン(Ovalubumin),コンアルブミン(Conalubumin)に対しても反応性を示す患者が見いだされた(図11参照)。ダイヤモンド/DLCチップを用いた上記の測定系では、1マイクロリッターの血清で少なくとも18−25項目が定性、定量測定可能であり、従来の検査法が定性的検査のみで1検査当たり250〜500マイクロリッターを必要としていた検査法と比較すると、患者負担と利便性の点で優れていると推定された。   The measurement results obtained by diluting patient serum 1000 times are shown in FIG. Most of the patients were milk allergic and reacted with α-, β-, and κ-casein with their respective reaction intensities. Some patients also reacted with α-lactoalbumin, but the proportion was small compared to casein. However, even those who are allergic to chief complaints of milk allergies have been found to be reactive with egg components such as OVM, ovalbumin, and conalubumin (see FIG. 11). . In the above measurement system using a diamond / DLC chip, at least 18-25 items can be qualitatively and quantitatively measured with 1 microliter of serum, and the conventional test method is only qualitative test, and 250 to 500 micron per test. It was estimated that it was superior in terms of patient burden and convenience compared to the testing method that required liters.

上記IgGの場合と同様に、卵と牛乳のアレルゲン成分を検定する目的で、シリコンを基板としたDLCチップに、アレルゲンのタンパク質をそれぞれ1スポット当たり100fmolをスポッティングし、血清を10倍に希釈し反応を行い、2次抗体にCy3標識したヤギ抗ヒトIgE抗体を用い検出した。測定結果を図12に示した。   As in the case of IgG described above, for the purpose of testing allergen components of eggs and milk, 100 fmol of each allergen protein was spotted per spot on a DLC chip using silicon as a substrate, and the serum was diluted 10 times and reacted. The detection was performed using a goat anti-human IgE antibody labeled with Cy3 as the secondary antibody. The measurement results are shown in FIG.

Claims (16)

化学修飾したダイヤモンド/DLC(Diamond-like Carbon)チップを活性化試薬により活性化した後、蛋白質/ペプチドを前記チップ上にスポッティングしてカップリング反応を行う、チップ上に蛋白質/ペプチドを固定する方法であって、活性化試薬により活性化した後、チップを洗浄した洗浄水の乾燥処理として30〜120分間の減圧乾燥処理を行い、かつ、カップリング反応後、30〜45℃で2〜4時間乾燥させることを特徴とする蛋白質/ペプチドの固定化方法。 A method of immobilizing a protein / peptide on a chip by activating a chemically modified diamond / DLC (Diamond-like Carbon) chip with an activating reagent and then spotting the protein / peptide on the chip to perform a coupling reaction Then, after being activated with an activating reagent, a drying treatment for 30 to 120 minutes is performed as a drying treatment for washing water for washing the chip, and after the coupling reaction, 2 to 4 hours at 30 to 45 ° C. A method for immobilizing a protein / peptide characterized by drying. 洗浄水が、MilliQ水であることを特徴とする請求項1記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 2. The protein / peptide immobilization method according to claim 1, wherein the washing water is MilliQ water. スポッティング添加剤としてジメチルスルホキシド(DMSO)又はポリエチレングリコール(PEG)を用いることを特徴とする請求項1又は2記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 3. The protein / peptide immobilization method according to claim 1, wherein dimethyl sulfoxide (DMSO) or polyethylene glycol (PEG) is used as a spotting additive. 20〜40%DMSO又は20〜40%PEGを用いることを特徴とする請求項3記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The protein / peptide immobilization method according to claim 3, wherein 20-40% DMSO or 20-40% PEG is used. 30%DMSO又は30%PEGを用いることを特徴とする請求項4記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The method for immobilizing a protein / peptide according to claim 4, wherein 30% DMSO or 30% PEG is used. 活性化試薬が、WSCD・HCl及びNHSを含有する溶液であることを特徴とする請求項1〜5のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 6. The protein / peptide immobilization method according to any one of claims 1 to 5, wherein the activating reagent is a solution containing WSCD.HCl and NHS. カップリング反応を行った後、未反応活性基のブロッキング操作を行うことを特徴とする請求項1〜6のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The protein / peptide immobilization method according to any one of claims 1 to 6, wherein an unreacted active group is blocked after the coupling reaction. 蛋白質/ペプチドが、抗原又は抗体であることを特徴とする請求項1〜7のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The method for immobilizing a protein / peptide according to any one of claims 1 to 7, wherein the protein / peptide is an antigen or an antibody. 抗原がアレルゲンであることを特徴とする請求項8記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 9. The protein / peptide immobilization method according to claim 8, wherein the antigen is an allergen. アレルゲンがアレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドであることを特徴とする請求項9記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 10. The protein / peptide immobilization method according to claim 9, wherein the allergen is an allergen epitope or a peptide containing an allergen epitope. アレルゲンエピトープ又はアレルゲンエピトープを含むペプチドとして、化学修飾されたペプチドを用いることを特徴とする請求項10記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 11. The protein / peptide immobilization method according to claim 10, wherein a chemically modified peptide is used as the allergen epitope or the peptide containing the allergen epitope. アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、MHCクラスII分子に結合するペプチド部分のN末端側及び/又はC末端側に少なくとも2個以上のアミノ酸が付加されたエピトープ含有ペプチドを用いることを特徴とする請求項10記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The epitope-containing peptide to which at least two or more amino acids are added to the N-terminal side and / or the C-terminal side of a peptide portion that binds to an MHC class II molecule is used as a peptide containing an allergen epitope. The protein / peptide immobilization method described. アレルゲンエピトープを含むペプチドとして、アレルゲンのエピトープを含むプロテアーゼ分解ペプチドを用いることを特徴とする請求項10〜12のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The method for immobilizing a protein / peptide according to any one of claims 10 to 12, wherein a protease-degrading peptide containing an allergen epitope is used as the peptide containing an allergen epitope. プロテアーゼ分解ペプチドが、トリプシン分解ペプチドであることを特徴とする請求項13記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 14. The protein / peptide immobilization method according to claim 13, wherein the protease-degrading peptide is a trypsin-degrading peptide. アレルゲンとして、食物アレルゲンを用いることを特徴とする請求項10〜14のいずれか記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。 The method for immobilizing a protein / peptide according to any one of claims 10 to 14, wherein a food allergen is used as the allergen. 食物アレルゲンとして、カゼインナトリウム、α−カゼイン、β−カゼイン、κ−カゼイン、α−ラクトアルブミン、β−ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミンから選ばれる1種又は2種以上のアレルゲンを用いることを特徴とする請求項15記載の蛋白質/ペプチドの固定化方法。
As a food allergen, one or more allergens selected from sodium caseinate, α-casein, β-casein, κ-casein, α-lactalbumin, β-lactoglobulin, ovomucoid, ovalbumin, and conalbumin are used. The method for immobilizing a protein / peptide according to claim 15.
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