JP5190819B2 - Method for producing high sucrose resistant yeast and yeast produced by this method - Google Patents
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Description
本発明は、酵母育種の分野に関連する。さらに、本発明は、本発明の方法を用いて育種された酵母を用いる、パン生地、パン、および、菓子類等の製造方法、ならびに、これら製造方法によって生産された製品に関連する。 The present invention relates to the field of yeast breeding. Furthermore, the present invention relates to methods for producing bread dough, bread, confectionery, etc., using the yeast bred using the method of the present invention, and products produced by these production methods.
パンは、その製品の製造過程でパン酵母の発酵による生地膨張を行う必要があるが、一定した品質のパンを提供するためには、パン酵母の発酵を綿密に制御することが重要である。特に、パン生地の種類及び製パン方法により、発酵を阻害する環境ストレスがパン酵母に負荷されることから、環境ストレスに対する高度耐性を有する酵母株の作出技術の確立が望まれている。菓子パン製造に用いられる高ショ糖生地には、30%(小麦粉重量あたり)を超える高い濃度のショ糖が含有され、ショ糖に由来する高浸透圧により酵母の発酵が阻害される。したがって、高糖生地条件におけるパン酵母の発酵の制御及び効率化のため、高ショ糖ストレスに対する耐性酵母の開発が期待されており、本発明はその社会ニーズに応えるものである。 Bread needs to undergo dough expansion by fermentation of baker's yeast in the production process of the product, but in order to provide a constant quality bread, it is important to closely control the fermentation of baker's yeast. In particular, depending on the type of bread dough and the bread making method, baker's yeast is subjected to environmental stress that inhibits fermentation. Therefore, establishment of a technique for producing a yeast strain having high resistance to environmental stress is desired. The high sucrose dough used for making confectionery contains a high concentration of sucrose exceeding 30% (per weight of wheat flour), and yeast fermentation is inhibited by the high osmotic pressure derived from sucrose. Therefore, development of yeast resistant to high sucrose stress is expected for the control and efficiency of baker's yeast fermentation under high sugar dough conditions, and the present invention meets the social needs.
(従来技術)
製パン業界及びイースト製造業界では、製パン時にパン酵母に負荷され発酵を阻害する環境ストレスに対する取り組みを行ってきた。特に、冷凍生地製パン法において負荷される冷凍ストレス及び菓子パン製造において負荷される高ショ糖ストレスに対する取り組みが進められた。その多くは、これら環境ストレスに対する耐性を有するパン酵母の作出によって問題解決を試みている。高糖生地製パンに最適な高ショ糖耐性酵母についても、各イーストメーカにより開発及び販売が行われてきた。
(Conventional technology)
The baking industry and yeast manufacturing industry have been working on environmental stresses that impair fermentation by being loaded on baker's yeast during baking. In particular, efforts have been made to deal with the freezing stress that is applied in the frozen dough baking method and the high sucrose stress that is applied in the manufacture of confectionery bread. Many of them try to solve the problem by producing baker's yeast having resistance to these environmental stresses. Each yeast manufacturer has also developed and sold a high sucrose resistant yeast that is optimal for high sugar dough bread.
(従来技術における問題点)
以上の様に、性能の向上した高ショ糖耐性酵母が実用化されるのと平行して、酵母の高ショ糖耐性を如何にして強めるかという研究も近年盛んに行われるようになってきた。その一つに酵母細胞内トレハロース含量の高さが酵母の高ショ糖耐性を高めているという仮説が知られている。実際、酵母のトレハロース分解系酵素を破壊し、細胞内に著量のトレハロースを蓄積するようになった酵母は高ショ糖耐性及び冷凍耐性が高まったという結果が報告されている(特許文献1)。また、細胞内に極性の高いアミノ酸を著量蓄積した酵母はストレス耐性が高まるとの報告がされている(特許文献2)。しかし、十分に高いショ糖耐性を有するパン酵母などの酵母は未だ得られていない。菓子パン製造などにおける酵母発酵の環境ストレスである高ショ糖環境においても十分に発酵力を維持できる酵母、すなわち、十分に高いショ糖耐性を有する酵母が所望されている。また、そのような酵母の育種法の開発も所望されている。
(Problems in the prior art)
As described above, in parallel with the practical application of high-sucrose-tolerant yeast with improved performance, research on how to enhance the high-sucrose tolerance of yeast has been actively conducted in recent years. . One of the hypotheses is known that the high trehalose content in yeast cells enhances the high sucrose tolerance of yeast. In fact, it has been reported that yeasts that have disrupted trehalose-degrading enzymes in yeast and have accumulated significant amounts of trehalose in cells have increased high sucrose resistance and freezing resistance (Patent Document 1). . In addition, it has been reported that yeast that accumulates a large amount of highly polar amino acids in cells has increased stress tolerance (Patent Document 2). However, yeasts such as baker's yeast having sufficiently high sucrose resistance have not been obtained yet. There is a demand for a yeast that can sufficiently maintain a fermentative power even in a high sucrose environment, which is an environmental stress of yeast fermentation in confectionery bread production, that is, a yeast having a sufficiently high sucrose resistance. Development of such a yeast breeding method is also desired.
この出願の発明に関連する先行技術文献情報としては、次のものがある。
以上にかんがみて、本発明は、高ショ糖環境においても十分に発酵力を維持できる酵母、すなわち、十分に高いショ糖耐性を有する酵母を提供すること、および、そのような酵母の育種法を提供することを課題とする。さらに、本発明は、そのような酵母を用いる、パン生地、パン、菓子類の製造方法を提供することを課題とする。 In view of the above, the present invention provides a yeast that can maintain sufficient fermentability even in a high sucrose environment, that is, a yeast having a sufficiently high sucrose resistance, and a method for breeding such a yeast. The issue is to provide. Furthermore, this invention makes it a subject to provide the manufacturing method of bread dough, bread, and confectionery using such yeast.
上記課題は、リン酸化タンパク質の脱リン酸化を触媒するホスファターゼであるOCA1遺伝子またはOCA2遺伝子を破壊することによって高ショ糖耐性株が得られることを見出すことによって、解決された。 The above problems have been solved by finding that a high sucrose resistant strain can be obtained by disrupting the OCAl gene or OCA2 gene, which is a phosphatase that catalyzes the dephosphorylation of phosphorylated protein.
従って、本発明は、以下の発明を提供する。
(項目1) 高ショ糖耐性酵母の製造方法であって、以下:
(a)配列番号1、配列番号3または配列番号9に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に変異を導入する工程、
を包含する方法。
(項目2) 項目1に記載の方法であって、ここで、前記変異導入が、遺伝子破壊である、方法。
(項目3) 項目1に記載の方法であって、さらに、
(b)前記変異型酵母と、配列番号1、配列番号3および配列番号9に変異を有さない酵母とを、ショ糖耐性について比較する工程、
を包含する方法。
(項目4) 項目1に記載の方法であって、さらに、
(c)ショ糖耐性の向上した変異型酵母を選択する工程、
を包含する方法。
(項目5) 項目1に記載の方法であって、前記酵母がパン酵母である、方法。
(項目6) 項目1に記載の方法によって製造された、酵母。
(項目7) 項目1に記載の方法によって製造された酵母を用いる、高ショ糖パン生地の製造方法。
(項目8) 項目1に記載の方法によって製造された酵母を用いる、パンの製造方法。
(項目9) 項目1に記載の方法によって製造された酵母を用いる、菓子類の製造方法。
(項目10) 高ショ糖耐性酵母の選抜方法であって、以下:
(a)配列番号1、配列番号3または配列番号9に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に変異を有する酵母を選択する工程、
を包含する方法。
(項目11) 項目10に記載の方法であって、さらに、
(b)該変異型酵母と、配列番号1、配列番号3および配列番号9に変異を有さない酵母とを、ショ糖耐性について比較する工程、
を包含する方法。
(項目12) 項目10に記載の方法であって、さらに、
(c)ショ糖耐性の向上した変異型酵母を選択する工程、
を包含する方法。
(項目13) 配列番号1に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子にホモ接合型変異を有する、二倍体高ショ糖耐性酵母。
(項目14) 配列番号3に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子にホモ接合型変異を有する、二倍体高ショ糖耐性酵母。
(項目15) 配列番号9に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子にホモ接合型変異を有する、二倍体高ショ糖耐性酵母。
(項目16) 項目13、項目14または項目15に記載の二倍体高ショ糖耐性酵母を用いる、高ショ糖パン生地の製造方法。
(項目17) 項目13、項目14または項目15に記載の二倍体高ショ糖耐性酵母を用いる、パンの製造方法。
(項目18) 項目13、項目14または項目15に記載の二倍体高ショ糖耐性酵母を用いる、菓子類の製造方法。
(項目19) 高ショ糖条件下でパン製造のための発酵を行うための組成物であって、配列番号1に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に変異を有する酵母を含有する、組成物。
(項目20) 前記酵母が配列番号1に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子にホモ接合型変異を有する二倍体酵母である、項目19に記載の組成物。
(項目21) 前記酵母が配列番号1に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズする第一の対立遺伝子に第一の変異を有し、第二の対立遺伝子に第二の変異を有する二倍体酵母である、項目19に記載の組成物。
(項目22) 項目19〜21いずれか一項に記載の組成物を用いる、高ショ糖パン生地の製造方法。
(項目23) 項目19〜21いずれか一項に記載の組成物を用いる、パンの製造方法。
(項目24) 項目19〜21いずれか一項に記載の組成物を用いる、菓子類の製造方法。
(項目25) 高ショ糖条件下でパン製造のための発酵を行うための組成物であって、配列番号3に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に変異を有する酵母を含有する、組成物。
(項目26) 前記酵母が配列番号3に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子にホモ接合型変異を有する二倍体酵母である、項目25に記載の組成物。
(項目27) 前記酵母が配列番号3に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズする第一の対立遺伝子に第一の変異を有し、第二の対立遺伝子に第二の変異を有する二倍体酵母である、項目25に記載の組成物。
(項目28) 項目25〜27いずれか一項に記載の組成物を用いる、高ショ糖パン生地の製造方法。
(項目29) 項目25〜27いずれか一項に記載の組成物を用いる、パンの製造方法。
(項目30) 項目25〜27いずれか一項に記載の組成物を用いる、菓子類の製造方法。
(項目31) 高ショ糖条件下でパン製造のための発酵を行うための組成物であって、配列番号9に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に変異を有する酵母を含有する、組成物。
(項目32) 前記酵母が配列番号9に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子にホモ接合型変異を有する二倍体酵母である、項目31に記載の組成物。
(項目33) 前記酵母が配列番号9に記載の配列を有する核酸にストリンジェントな条件でハイブリダイズする第一の対立遺伝子に第一の変異を有し、第二の対立遺伝子に第二の変異を有する二倍体酵母である、項目31に記載の組成物。
(項目34) 項目31〜33いずれか一項に記載の組成物を用いる、高ショ糖パン生地の製造方法。
(項目35) 項目31〜33いずれか一項に記載の組成物を用いる、パンの製造方法。
(項目36) 項目31〜33いずれか一項に記載の組成物を用いる、菓子類の製造方法。
Accordingly, the present invention provides the following inventions.
(Item 1) A method for producing a high sucrose resistant yeast, comprising:
(A) introducing a mutation into a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence set forth in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 or SEQ ID NO: 9,
Including the method.
(Item 2) The method according to item 1, wherein the mutation introduction is gene disruption.
(Item 3) The method according to Item 1, further comprising:
(B) comparing the mutant yeast with yeast having no mutation in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 9 for sucrose resistance;
Including the method.
(Item 4) The method according to Item 1, further comprising:
(C) selecting a mutant yeast having improved sucrose resistance;
Including the method.
(Item 5) The method according to item 1, wherein the yeast is baker's yeast.
(Item 6) Yeast produced by the method according to item 1.
(Item 7) A method for producing a high sucrose bread dough, wherein the yeast produced by the method according to item 1 is used.
(Item 8) A method for producing bread using the yeast produced by the method according to item 1.
(Item 9) A method for producing confectionery using the yeast produced by the method according to item 1.
(Item 10) A method for selecting a high sucrose resistant yeast, comprising:
(A) selecting a yeast having a mutation in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 or SEQ ID NO: 9,
Including the method.
(Item 11) The method according to Item 10, further comprising:
(B) comparing the mutant yeast with yeast having no mutation in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 9 for sucrose resistance;
Including the method.
(Item 12) The method according to Item 10, further comprising:
(C) selecting a mutant yeast having improved sucrose resistance;
Including the method.
(Item 13) A diploid high sucrose-resistant yeast having a homozygous mutation in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1.
(Item 14) A diploid high sucrose-resistant yeast having a homozygous mutation in a genomic gene that hybridizes to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 3 under stringent conditions.
(Item 15) A diploid high sucrose resistant yeast having a homozygous mutation in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 9.
(Item 16) A method for producing a high sucrose bread dough using the diploid high sucrose resistant yeast according to item 13, item 14 or item 15.
(Item 17) A method for producing bread using the diploid high sucrose resistant yeast according to item 13, item 14 or item 15.
(Item 18) A method for producing a confectionery using the diploid high sucrose resistant yeast according to item 13, item 14 or item 15.
(Item 19) A composition for performing fermentation for bread production under high sucrose conditions, wherein a mutation occurs in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1. A composition comprising yeast having.
(Item 20) The composition according to item 19, wherein the yeast is a diploid yeast having a homozygous mutation in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1.
(Item 21) The first allele that hybridizes under stringent conditions to the nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1 in the yeast, and the second mutation in the second allele Item 20. The composition according to Item 19, which is a diploid yeast having
(Item 22) A method for producing a high sucrose bread dough, wherein the composition according to any one of items 19 to 21 is used.
(Item 23) A method for producing bread, using the composition according to any one of items 19 to 21.
(Item 24) The manufacturing method of confectionery using the composition as described in any one of Items 19-21.
(Item 25) A composition for performing fermentation for bread production under high sucrose conditions, wherein a mutation occurs in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 3. A composition comprising yeast having.
(Item 26) The composition according to item 25, wherein the yeast is a diploid yeast having a homozygous mutation in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 3.
(Item 27) The first allele that hybridizes under stringent conditions to the nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 3 in the yeast, and the second mutation in the second allele 26. The composition according to item 25, which is a diploid yeast having
(Item 28) A method for producing a high sucrose bread dough, wherein the composition according to any one of items 25 to 27 is used.
(Item 29) A method for producing bread using the composition according to any one of items 25 to 27.
(Item 30) The manufacturing method of confectionery using the composition as described in any one of Items 25-27.
(Item 31) A composition for performing fermentation for bread production under high sucrose conditions, wherein a mutation occurs in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 9. A composition comprising yeast having.
(Item 32) The composition according to item 31, wherein the yeast is a diploid yeast having a homozygous mutation in a genomic gene that hybridizes under stringent conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 9.
(Item 33) The first allele that hybridizes under stringent conditions to the nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 9 in the yeast, and the second mutation in the second allele 32. The composition of item 31, which is a diploid yeast having
(Item 34) A method for producing a high sucrose bread dough, wherein the composition according to any one of items 31 to 33 is used.
(Item 35) The manufacturing method of bread using the composition as described in any one of items 31-33.
(Item 36) The manufacturing method of confectionery using the composition as described in any one of items 31-33.
以下に、本発明の好ましい実施形態を示すが、当業者は本発明の説明および当該分野における周知慣用技術からその実施形態などを適宜実施することができ、本発明が奏する作用および効果を容易に理解することが認識されるべきである。 Preferred embodiments of the present invention will be shown below, but those skilled in the art can appropriately implement the embodiments and the like from the description of the present invention and well-known and common techniques in the field, and the effects and effects of the present invention can be easily achieved. It should be recognized to understand.
本発明によって、高ショ糖耐性を有する酵母株を容易に得ることが可能となった。さらに、本発明によって、所定の酵母株を簡便に高ショ糖耐性株とすることも可能となった。 According to the present invention, a yeast strain having high sucrose resistance can be easily obtained. Furthermore, according to the present invention, a predetermined yeast strain can be easily made into a high sucrose resistant strain.
以下、本発明を説明する。本明細書の全体にわたり、単数形の表現は、特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。また、本明細書において使用される用語は、特に言及しない限り、当上記分野で通常用いられる意味で用いられることが理解されるべきである。したがって、他に定義されない限り、本明細書中で使用される全ての専門用語および科学技術用語は、本発明の属する分野の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。矛盾する場合、本明細書(定義を含めて)が優先する。 The present invention will be described below. Throughout this specification, it should be understood that the singular forms also include the plural concept unless specifically stated otherwise. In addition, it is to be understood that the terms used in the present specification are used in the meaning normally used in the above field unless otherwise specified. Thus, unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. In case of conflict, the present specification, including definitions, will control.
(用語の定義)
以下に本明細書において特に使用される用語の定義を列挙する。
(Definition of terms)
Listed below are definitions of terms particularly used in the present specification.
本明細書において「酵母」とは、大部分の生活環を単細胞で経過する菌類をいう。代表的な酵母としては、Saccharomyces属、Schizosaccharomyces属に属する酵母、特にSaccharomyces cerevisiae、Saccharomyces ludwigii、およびSchizosaccharomyces pombeが挙げられる。 As used herein, “yeast” refers to a fungus that passes most life cycles in a single cell. Representative yeasts include yeasts belonging to the genus Saccharomyces and Schizosaccharomyces, in particular Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces ludwigii, and Schizosaccharomyces pombe.
本明細書において「パン酵母」とは、パンの製造に使用される、Saccharomyces cerevisiaeに属し、パンの製造に使用される酵母をいう。 As used herein, “bakery yeast” refers to a yeast belonging to Saccharomyces cerevisiae used for bread production and used for bread production.
本明細書において使用する場合、用語「ショ糖濃度(%)」とは、特に単位を記載しない限り、発酵する材料中の小麦粉に対するショ糖の相対濃度をいい、より具体的には、小麦粉100gに対して添加されるショ糖のグラム数をいう。 As used herein, the term “sucrose concentration (%)” refers to the relative concentration of sucrose with respect to the flour in the material to be fermented, unless specifically stated, more specifically 100 g flour. Refers to the number of grams of sucrose added to
本明細書において使用する場合、用語「高ショ糖耐性」とは、ショ糖濃度が高い環境下において、野生型酵母と比較してより高い発酵力を示す酵母の特性をいう。代表的には、変異型酵母が「高ショ糖耐性」を有するか否かについては、50%ショ糖濃度下における発酵力を炭酸ガス発生量を指標として決定する。 As used herein, the term “high sucrose resistance” refers to a characteristic of a yeast that exhibits a higher fermentative power than an wild-type yeast in an environment with a high sucrose concentration. Typically, as to whether or not the mutant yeast has “high sucrose resistance”, the fermentability under a 50% sucrose concentration is determined using the amount of carbon dioxide generation as an index.
本明細書において、「発酵力」とは、酵母を培養した場合に、糖質を無酸素的に分解した代謝産物を生じる能力をいう。酵母の発酵には、代表的には、アルコール発酵、グリセロール発酵などが挙げられるが、これらに限定されない。発酵力を示す指標としては、例えば、パン生地から生じる炭酸ガスを測定して、パン生地の発酵力を測定するファーモグラフという方法が使用可能である。その単位としては、例えば、OD600が100である酵母が発生するガス量としてのml/100 OD600を用いることができるが、これに限定されない。上記以外の指標としては、例えば、低糖条件における発酵力(F10)、高糖状態における発酵力(F40)、およびマルトース発酵力(Fm)などが挙げられるが、これらに限定されない(これらの発酵力の指標は、酵母の流加培養によって測定される)。 In the present specification, “fermentation power” refers to the ability to produce a metabolite obtained by anaerobically degrading carbohydrates when yeast is cultured. Typically, yeast fermentation includes, but is not limited to, alcohol fermentation, glycerol fermentation, and the like. As an index indicating the fermenting power, for example, a method called “farmograph” that measures the fermenting power of bread dough by measuring carbon dioxide generated from the bread dough can be used. As the unit, for example, ml / 100 OD 600 as the amount of gas generated by yeast having an OD 600 of 100 can be used, but is not limited thereto. Examples of indexes other than the above include, but are not limited to, fermenting power under low sugar conditions (F10), fermenting power under high sugar conditions (F40), and maltose fermenting power (Fm). Are measured by yeast fed-batch culture).
本明細書において使用する場合、用語「生地」とは、パン類の発酵に供される材料のみならず、パン類の生地に添加される「種生地」をも含む。本明細書において使用する場合、用語「種生地」とは、パン生地の発酵を行うために添加される種(スタータ)であって、発酵に必要な菌および配合原材料の少なくとも一部を含む生地をいう。 As used herein, the term “dough” includes “seed dough” added to bread dough as well as materials that are subjected to bread fermentation. As used herein, the term “seed dough” refers to a seed (starter) that is added to perform fermentation of bread dough, and includes a dough that contains at least a part of the fungi necessary for fermentation and compounded raw materials. Say.
本明細書において使用する場合、用語「発酵」とは、配合原材料中の物質の少なくとも一部が、菌によって分解される現象をいう。 As used herein, the term “fermentation” refers to a phenomenon in which at least some of the substances in a compounded raw material are degraded by bacteria.
本明細書において使用する場合、用語「高ショ糖パン生地」とは、ショ糖を高濃度(限定されることはないが、例えば、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、および、60%)で含有するパン生地をいう。 As used herein, the term “high sucrose bread dough” refers to high concentrations of sucrose (including but not limited to, for example, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50 %, 55%, and 60%).
本明細書において使用する場合、用語「菓子類」とは、小麦粉を主体として、ショ糖を含み、発酵過程を経て製造される食品をいう。 As used herein, the term “confectionery” refers to a food product mainly made from wheat flour, containing sucrose, and manufactured through a fermentation process.
本明細書において使用する場合、用語「対立遺伝子」とは、特定の染色体上の同一の座を占める2つ以上の一連の異なった遺伝子のうちの1つをいう。同じ対立遺伝子が両方の座を占める場合を「ホモ接合型」といい、異なる対立遺伝子が両方の座を占める場合を「ヘテロ接合型」という。 As used herein, the term “allele” refers to one of a series of two or more different genes that occupy the same locus on a particular chromosome. The case where the same allele occupies both loci is called “homozygous”, and the case where different alleles occupy both loci is called “heterozygous”.
本明細書において、「ストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド」とは、当該分野で慣用される周知の条件をいう。本発明のポリヌクレオチド中から選択されたポリヌクレオチドをプローブとして、コロニー・ハイブリダイゼーション法、プラーク・ハイブリダイゼーション法あるいはサザンブロットハイブリダイゼーション法等を用いることにより、そのようなポリヌクレオチドを得ることができる。具体的には、コロニーあるいはプラーク由来のDNAを固定化したフィルターを用いて、0.7〜1.0MのNaCl存在下、65℃でハイブリダイゼーションを行った後、0.1〜2倍濃度のSSC(saline−sodium citrate)溶液(1倍濃度のSSC溶液の組成は、150mM 塩化ナトリウム、15mM クエン酸ナトリウムである)を用い、65℃条件下でフィルターを洗浄することにより同定できるポリヌクレオチドを意味する。ハイブリダイゼーションは、Molecular Cloning 2nd ed.,Current Protocols in Molecular Biology,Supplement 1〜38、DNA Cloning 1:Core Techniques,A Practical Approach,Second Edition,Oxford University Press(1995)等の実験書に記載されている方法に準じて行うことができる。ここで、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列からは、好ましくは、A配列のみまたはT配列のみを含む配列が除外される。「ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチド」とは、上記ハイブリダイズ条件下で別のポリヌクレオチドにハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドをいう。ハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとして具体的には、本発明で具体的に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするDNAの塩基配列と少なくとも60%以上の相同性を有するポリヌクレオチド、好ましくは80%以上の相同性を有するポリヌクレオチド、さらに好ましくは95%以上の相同性を有するポリヌクレオチドを挙げることができる。 In the present specification, “polynucleotide hybridizing under stringent conditions” refers to well-known conditions commonly used in the art. Such a polynucleotide can be obtained by using colony hybridization method, plaque hybridization method, Southern blot hybridization method or the like using a polynucleotide selected from among the polynucleotides of the present invention as a probe. Specifically, hybridization was performed at 65 ° C. in the presence of 0.7 to 1.0 M NaCl using a filter on which DNA derived from colonies or plaques was immobilized, and then 0.1 to 2 times the concentration. Means a polynucleotide that can be identified by washing the filter under conditions of 65 ° C. using a SSC (saline-sodium citrate) solution (composition of 1-fold concentration of SSC solution is 150 mM sodium chloride, 15 mM sodium citrate) To do. Hybridization was performed in Molecular Cloning 2nd ed. , Current Protocols in Molecular Biology, Supplements 1-38, DNA Cloning 1: Core Techniques, A Practical Approach, Second Edition, Oxford Universe. Here, the sequence containing only the A sequence or only the T sequence is preferably excluded from the sequences that hybridize under stringent conditions. The “hybridizable polynucleotide” refers to a polynucleotide that can hybridize to another polynucleotide under the above hybridization conditions. Specifically, the hybridizable polynucleotide is a polynucleotide having at least 60% homology with the base sequence of DNA encoding a polypeptide having the amino acid sequence specifically shown in the present invention, preferably 80% The polynucleotide which has the above homology, More preferably, the polynucleotide which has 95% or more of homology can be mentioned.
本明細書において「高度にストリンジェントな条件」は、核酸配列において高度の相補性を有するDNA鎖のハイブリダイゼーションを可能にし、そしてミスマッチを有意に有するDNAのハイブリダイゼーションを除外するように設計された条件をいう。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーは、主に、温度、イオン強度、およびホルムアミドのような変性剤の条件によって決定される。このようなハイブリダイゼーションおよび洗浄に関する「高度にストリンジェントな条件」の例は、0.0015M塩化ナトリウム、0.0015Mクエン酸ナトリウム、65〜68℃、または0.015M塩化ナトリウム、0.0015Mクエン酸ナトリウム、および50%ホルムアミド、42℃である。このような高度にストリンジェントな条件については、Sambrooket al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual、第2版、Cold Spring Harbor Laboratory(ColdSpring Harbor,N,Y.1989);およびAnderson et al.、Nucleic Acid Hybridization:a Practicalapproach、IV、IRL Press Limited(Oxford,England).Limited,Oxford,Englandを参照のこと。必要により、よりストリンジェントな条件(例えば、より高い温度、より低いイオン強度、より高いホルムアミド、または他の変性剤)を、使用してもよい。他の薬剤が、非特異的なハイブリダイゼーションおよび/またはバックグラウンドのハイブリダイゼーションを減少する目的で、ハイブリダイゼーション緩衝液および洗浄緩衝液に含まれ得る。そのような他の薬剤の例としては、0.1%ウシ血清アルブミン、0.1%ポリビニルピロリドン、0.1%ピロリン酸ナトリウム、0.1%ドデシル硫酸ナトリウム(NaDodSO4またはSDS)、Ficoll、Denhardt溶液、超音波処理されたサケ精子DNA(または別の非相補的DNA)および硫酸デキストランであるが、他の適切な薬剤もまた、使用され得る。これらの添加物の濃度および型は、ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに実質的に影響を与えることなく変更され得る。ハイブリダイゼーション実験は、通常、pH6.8〜7.4で実施されるが;代表的なイオン強度条件において、ハイブリダイゼーションの速度は、ほとんどpH独立である。Anderson et al.、Nucleic Acid Hybridization:a Practical Approach、第4章、IRL Press Limited(Oxford,England)を参照のこと。 As used herein, “highly stringent conditions” are designed to allow hybridization of DNA strands having a high degree of complementarity in nucleic acid sequences and to exclude hybridization of DNA having significant mismatches. Say conditions. Hybridization stringency is primarily determined by temperature, ionic strength, and the conditions of denaturing agents such as formamide. Examples of “highly stringent conditions” for such hybridization and washing are 0.0015 M sodium chloride, 0.0015 M sodium citrate, 65-68 ° C., or 0.015 M sodium chloride, 0.0015 M citric acid. Sodium, and 50% formamide, 42 ° C. For such highly stringent conditions, see Sambrook et al. , Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory (Cold Spring Harbor, N, Y. 1989); and Anderson et al. Nucleic Acid Hybridization: a Practical Approach, IV, IRL Press Limited (Oxford, England). See Limited, Oxford, England. If necessary, more stringent conditions (eg, higher temperature, lower ionic strength, higher formamide, or other denaturing agents) may be used. Other agents can be included in the hybridization and wash buffers for the purpose of reducing non-specific hybridization and / or background hybridization. Examples of such other agents include 0.1% bovine serum albumin, 0.1% polyvinyl pyrrolidone, 0.1% sodium pyrophosphate, 0.1% sodium dodecyl sulfate (NaDodSO 4 or SDS), Ficoll, Denhardt's solution, sonicated salmon sperm DNA (or another non-complementary DNA) and dextran sulfate, but other suitable agents can also be used. The concentration and type of these additives can be varied without substantially affecting the stringency of the hybridization conditions. Hybridization experiments are usually performed at pH 6.8-7.4; however, at typical ionic strength conditions, the rate of hybridization is almost pH independent. Anderson et al. , Nucleic Acid Hybridization: a Practical Approach, Chapter 4, IRL Press Limited (Oxford, England).
DNA二重鎖の安定性に影響を与える因子としては、塩基の組成、長さおよび塩基対不一致の程度が挙げられる。ハイブリダイゼーション条件は、当業者によって調整され得、これらの変数を適用させ、そして異なる配列関連性のDNAがハイブリッドを形成するのを可能にする。完全に一致したDNA二重鎖の融解温度は、以下の式によって概算され得る。
Tm(℃)=81.5+16.6(log[Na+])+0.41(%G+C)−600/N−0.72(%ホルムアミド)
ここで、Nは、形成される二重鎖の長さであり、[Na+]は、ハイブリダイゼーション溶液または洗浄溶液中のナトリウムイオンのモル濃度であり、%G+Cは、ハイブリッド中の(グアニン+シトシン)塩基のパーセンテージである。不完全に一致したハイブリッドに関して、融解温度は、各1%不一致(ミスマッチ)に対して約1℃ずつ減少する。
Factors that affect the stability of the DNA duplex include base composition, length, and degree of base pair mismatch. Hybridization conditions can be adjusted by one of ordinary skill in the art to apply these variables and to allow different sequence related DNAs to form hybrids. The melting temperature of a perfectly matched DNA duplex can be estimated by the following equation:
T m (° C.) = 81.5 + 16.6 (log [Na + ]) + 0.41 (% G + C) −600 / N−0.72 (% formamide)
Where N is the length of the duplex formed, [Na + ] is the molar concentration of sodium ions in the hybridization or wash solution, and% G + C is the (guanine + Cytosine) base percentage. For imperfectly matched hybrids, the melting temperature decreases by about 1 ° C. for each 1% mismatch.
本明細書において「中程度にストリンジェントな条件」とは、「高度にストリンジェントな条件」下で生じ得るよりも高い程度の塩基対不一致を有するDNA二重鎖が、形成し得る条件をいう。代表的な「中程度にストリンジェントな条件」の例は、0.015M塩化ナトリウム、0.0015M クエン酸ナトリウム、50〜65℃、または0.015M 塩化ナトリウム、0.0015M クエン酸ナトリウム、および20%ホルムアミド、37〜50℃である。例として、0.015Mナトリウムイオン中、50℃の「中程度にストリンジェントな」条件は、約21%の不一致を許容する。 As used herein, “moderately stringent conditions” refers to conditions under which a DNA duplex having a higher degree of base pair mismatch than can be generated under “highly stringent conditions”. . Examples of representative “moderately stringent conditions” are 0.015 M sodium chloride, 0.0015 M sodium citrate, 50-65 ° C., or 0.015 M sodium chloride, 0.0015 M sodium citrate, and 20 % Formamide, 37-50 ° C. As an example, a “moderately stringent” condition of 50 ° C. in 0.015 M sodium ion tolerates a mismatch of about 21%.
本明細書において「高度」にストリンジェントな条件と「中程度」にストリンジェントな条件との間に完全な区別は存在しないことがあり得ることが、当業者によって理解される。例えば、0.015Mナトリウムイオン(ホルムアミドなし)において、完全に一致した長いDNAの融解温度は、約71℃である。65℃(同じイオン強度)での洗浄において、これは、約6%不一致を許容にする。より離れた関連する配列を捕獲するために、当業者は、単に温度を低下させ得るか、またはイオン強度を上昇し得る。 It will be appreciated by those skilled in the art that there may not be a complete distinction between “highly” stringent conditions and “moderate” stringent conditions herein. For example, at 0.015M sodium ion (no formamide), the melting temperature of a perfectly matched long DNA is about 71 ° C. In washing at 65 ° C. (same ionic strength), this allows about 6% mismatch. In order to capture more distant related sequences, one of ordinary skill in the art can simply decrease the temperature or increase the ionic strength.
約20ヌクレオチドまでのオリゴヌクレオチドプローブについて、1MNaClにおける融解温度の適切な概算は、
Tm=(1つのA−T塩基につき2℃)+(1つのG−C塩基対につき4℃)
によって提供される。なお、6×クエン酸ナトリウム塩(SSC)におけるナトリウムイオン濃度は、1Mである(Suggsら、Developmental Biology Using Purified Genes、683頁、BrownおよびFox(編)(1981)を参照のこと)。
For oligonucleotide probes up to about 20 nucleotides, a reasonable estimate of the melting temperature in 1M NaCl is
Tm = (2 ° C. for one AT base) + (4 ° C. for one GC base pair)
Provided by. The sodium ion concentration in 6 × sodium citrate (SSC) is 1 M (see Suggs et al., Developmental Biology Using Purified Genes, page 683, Brown and Fox (ed.) (1981)).
配列番号2、4または10に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその改変体もしくはフラグメントなどのタンパク質をコードする天然の核酸は、例えば、配列番号1、3または9の核酸配列の一部またはその改変体を含むPCRプライマーおよびハイブリダイゼーションプローブを有するcDNAライブラリーから容易に分離される。配列番号2、4または10のアミノ酸配列を有するポリペプチドまたはその改変体もしくはフラグメントなどをコードする核酸は、本質的に1%ウシ血清アルブミン(BSA);500mM リン酸ナトリウム(NaPO4);1mM EDTA;42℃の温度で 7% SDS を含むハイブリダイゼーション緩衝液、および本質的に2×SSC(600mM NaCl;60mM クエン酸ナトリウム);50℃の0.1% SDSを含む洗浄緩衝液によって定義される低ストリンジェント条件下、さらに好ましくは本質的に50℃の温度での1%ウシ血清アルブミン(BSA);500mM リン酸ナトリウム(NaPO4);15%ホルムアミド;1mM EDTA; 7% SDS を含むハイブリダイゼーション緩衝液、および本質的に50℃の1×SSC(300mM NaCl;30mM クエン酸ナトリウム);1% SDSを含む洗浄緩衝液によって定義される低ストリンジェント条件下、最も好ましくは本質的に50℃の温度での1%ウシ血清アルブミン(BSA);200mM リン酸ナトリウム(NaPO4);15%ホルムアミド;1mM EDTA;7%SDSを含むハイブリダイゼーション緩衝液、および本質的に65℃の0.5×SSC(150mM NaCl;15mM クエン酸ナトリウム);0.1% SDSを含む洗浄緩衝液によって定義される低ストリンジェント条件下に配列番号1または3に示す配列の1つまたはその一部とハイブリダイズし得る。 A natural nucleic acid encoding a protein such as a polypeptide having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, 4 or 10 or a variant or fragment thereof is, for example, a part of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1, 3 or 9 or its Easily separated from cDNA libraries with PCR primers and hybridization probes containing variants. A nucleic acid encoding a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, 4 or 10 or a variant or fragment thereof is essentially 1% bovine serum albumin (BSA); 500 mM sodium phosphate (NaPO 4 ); 1 mM EDTA Defined by a hybridization buffer containing 7% SDS at a temperature of 42 ° C., and essentially 2 × SSC (600 mM NaCl; 60 mM sodium citrate); a wash buffer containing 0.1% SDS at 50 ° C. Hybridization comprising 1% bovine serum albumin (BSA) under low stringent conditions, more preferably essentially at a temperature of 50 ° C .; 500 mM sodium phosphate (NaPO 4 ); 15% formamide; 1 mM EDTA; 7% SDS Buffer, and essentially 50 ° C. 1 × SSC (300 mM NaCl; 30 mM sodium citrate); 1% bovine serum albumin (BSA) under low stringent conditions defined by a wash buffer containing 1% SDS, most preferably essentially at a temperature of 50 ° C. ); 200 mM sodium phosphate (NaPO 4 ); 15% formamide; 1 mM EDTA; hybridization buffer containing 7% SDS, and essentially 0.5 × SSC at 65 ° C. (150 mM NaCl; 15 mM sodium citrate); It can hybridize with one or a portion of the sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 3 under low stringency conditions as defined by a wash buffer containing 0.1% SDS.
本明細書において配列(アミノ酸または核酸など)の「同一性」、「相同性」および「類似性」のパーセンテージは、比較ウィンドウで最適な状態に整列された配列2つを比較することによって求められる。ここで、ポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列の比較ウィンドウ内の部分には、2つの配列の最適なアライメントについての基準配列(他の配列に付加が含まれていればギャップが生じることもあるが、ここでの基準配列は付加も欠失もないものとする)と比較したときに、付加または欠失(すなわちギャップ)が含まれる場合がある。同一の核酸塩基またはアミノ酸残基がどちらの配列にも認められる位置の数を求めることによって、マッチ位置の数を求め、マッチ位置の数を比較ウィンドウ内の総位置数で割り、得られた結果に100を掛けて同一性のパーセンテージを算出する。検索において使用される場合、相同性については、従来技術において周知のさまざまな配列比較アルゴリズムおよびプログラムの中から、適当なものを用いて評価する。このようなアルゴリズムおよびプログラムとしては、TBLASTN、BLASTP、FASTA、TFASTAおよびCLUSTALW(Pearson and Lipman,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85(8):2444−2448、 Altschul et al.,1990,J.Mol.Biol.215(3):403−410、Thompson et al.,1994,Nucleic Acids Res.22(2):4673−4680、Higgins et al.,1996,Methods Enzymol.266:383−402、Altschul et al.,1990,J.Mol.Biol.215(3):403−410、Altschul et al.,1993,Nature Genetics 3:266−272)があげられるが、何らこれに限定されるものではない。特に好ましい実施形態では、従来技術において周知のBasic Local Alignment Search Tool(BLAST)(たとえば、Karlin and Altschul,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:2267−2268、Altschul et al.,1990,J.Mol.Biol.215:403−410、Altschul et al.,1993,Nature Genetics 3:266−272、Altschul et al.,1997,Nuc.Acids Res.25:3389−3402を参照のこと)を用いてタンパク質および核酸配列の相同性を評価する。特に、5つの専用BLASTプログラムを用いて以下の作業を実施することによって比較または検索が達成され得る。 As used herein, the percentage of “identity”, “homology” and “similarity” of sequences (such as amino acids or nucleic acids) is determined by comparing two sequences that are optimally aligned in a comparison window. . Here, the reference sequence for the optimal alignment of the two sequences (a gap may occur if the other sequences contain additions, in the part of the polynucleotide or polypeptide sequence within the comparison window, Reference sequences herein shall contain no additions or deletions) and may include additions or deletions (ie gaps). Find the number of match positions by determining the number of positions where the same nucleobase or amino acid residue is found in both sequences, and divide the number of match positions by the total number of positions in the comparison window. Is multiplied by 100 to calculate the percent identity. When used in a search, homology is assessed using an appropriate one from a variety of sequence comparison algorithms and programs well known in the art. Such algorithms and programs include TBLASTN, BLASTP, FASTA, TFASTA and CLUSTALW (Pearson and Lipman, 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 (8): 2444-2448, Altschul et al., 1990 ,. J. Mol.Biol.215 (3): 403-410, Thompson et al., 1994, Nucleic Acids Res.22 (2): 4673-4680, Higgins et al., 1996, Methods Enzymol.266: 383-402. Altschul et al., 1990, J. Mol.Biol.215 (3): 403-410, Altschul et al. 1993, Nature Genetics 3: 266-272), but is not limited thereto. In a particularly preferred embodiment, the Basic Local Alignment Tool (BLAST) known in the prior art (eg, Karlin and Altschul, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 2267-2268, Altschul et al., 1990). J. Mol. Biol. 215: 403-410, Altschul et al., 1993, Nature Genetics 3: 266-272, Altschul et al., 1997, Nuc. Acids Res.25: 3389-3402). Used to assess protein and nucleic acid sequence homology. In particular, a comparison or search can be achieved by performing the following operations using five dedicated BLAST programs.
(1) BLASTPおよびBLAST3でアミノ酸のクエリー配列をタンパク質配列データベースと比較;
(2) BLASTNでヌクレオチドのクエリー配列をヌクレオチド配列データベースと比較;
(3) BLASTXでヌクレオチドのクエリー配列(両方の鎖)を6つの読み枠で変換した概念的翻訳産物をタンパク質配列データベースと比較;
(4) TBLASTNでタンパク質のクエリー配列を6つの読み枠(両方の鎖)すべてで変換したヌクレオチド配列データベースと比較;
(5) TBLASTXでヌクレオチドのクエリ配列を6つの読み枠で変換したものを、6つの読み枠で変換したヌクレオチド配列データベースと比較。
(1) Compare amino acid query sequence with protein sequence database in BLASTP and BLAST3;
(2) Compare nucleotide query sequence with nucleotide sequence database at BLASTN;
(3) Comparison of a conceptual translation product obtained by converting a nucleotide query sequence (both strands) with BLASTX in six reading frames with a protein sequence database;
(4) Compare protein query sequence with TBLASTN to nucleotide sequence database converted in all six reading frames (both strands);
(5) Comparison of nucleotide query sequence converted by TBLASTX in 6 reading frames with nucleotide sequence database converted in 6 reading frames.
BLASTプログラムは、アミノ酸のクエリ配列または核酸のクエリ配列と、好ましくはタンパク質配列データベースまたは核酸配列データベースから得られた被検配列との間で、「ハイスコアセグメント対」と呼ばれる類似のセグメントを特定することによって相同配列を同定するものである。ハイスコアセグメント対は、多くのものが従来技術において周知のスコアリングマトリックスによって同定(すなわち整列化)されると好ましい。好ましくは、スコアリングマトリックスとしてBLOSUM62マトリックス(Gonnet et al.,1992,Science 256:1443−1445、Henikoff and Henikoff,1993,Proteins 17:49−61)を使用する。このマトリックスほど好ましいものではないが、PAMまたはPAM250マトリックスも使用できる(たとえば、Schwartz and Dayhoff,eds.,1978,Matrices for Detecting Distance Relationships: Atlas of Protein Sequence and Structure,Washington: National Biomedical Research Foundationを参照のこと)。BLASTプログラムは、同定されたすべてのハイスコアセグメント対の統計的な有意性を評価し、好ましくはユーザー固有の相同率などのユーザーが独自に定める有意性の閾値レベルを満たすセグメントを選択する。統計的な有意性を求めるKarlinの式を用いてハイスコアセグメント対の統計的な有意性を評価すると好ましい(Karlin and Altschul,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:2267−2268参照のこと)。 The BLAST program identifies similar segments called “high-score segment pairs” between an amino acid query sequence or nucleic acid query sequence, and preferably a test sequence obtained from a protein sequence database or nucleic acid sequence database. Thus, a homologous sequence is identified. High score segment pairs are preferably identified (ie, aligned) by a scoring matrix well known in the art. Preferably, a BLOSUM62 matrix (Gonnet et al., 1992, Science 256: 1443-1445, Henikoff and Henikoff, 1993, Proteins 17: 49-61) is used as the scoring matrix. Although not as preferred as this matrix, a PAM or PAM250 matrix can also be used (see, for example, Schwartz and Dayhoff, eds., 1978, Matrixes for Detection Distance Relationships: Atlas of Protein Sequence and Stance and Stance. about). The BLAST program evaluates the statistical significance of all identified high score segment pairs and preferably selects segments that meet a user-defined threshold level of significance, such as a user-specific homology rate. It is preferred to evaluate the statistical significance of high score segment pairs using Karlin's formula for statistical significance (see Karlin and Altschul, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 2267-2268). about).
本明細書において遺伝子(例えば、核酸配列、アミノ酸配列など)の「相同性」とは、2以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。また、本明細書において配列(核酸配列、アミノ酸配列など)の同一性とは、2以上の対比可能な配列の、互いに対する同一の配列(個々の核酸、アミノ酸など)の程度をいう。従って、ある2つの遺伝子の相同性が高いほど、それらの配列の同一性または類似性は高い。2種類の遺伝子が相同性を有するか否かは、配列の直接の比較、または核酸の場合ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーション法によって調べられ得る。2つの遺伝子配列を直接比較する場合、その遺伝子配列間でDNA配列が、代表的には少なくとも50%同一である場合、好ましくは少なくとも70%同一である場合、より好ましくは少なくとも80%、90%、95%、96%、97%、98%または99%同一である場合、それらの遺伝子は相同性を有する。本明細書において、遺伝子(例えば、核酸配列、アミノ酸配列など)の「類似性」とは、上記相同性において、保存的置換をポジティブ(同一)とみなした場合の、2以上の遺伝子配列の、互いに対する同一性の程度をいう。従って、保存的置換がある場合は、その保存的置換の存在に応じて相同性と類似性とは異なる。また、保存的置換がない場合は、相同性と類似性とは同じ数値を示す。 As used herein, “homology” of genes (eg, nucleic acid sequences, amino acid sequences, etc.) refers to the degree of identity of two or more gene sequences with each other. In the present specification, the identity of sequences (nucleic acid sequences, amino acid sequences, etc.) refers to the degree of two or more comparable sequences that are identical to each other (individual nucleic acids, amino acids, etc.). Therefore, the higher the homology between two genes, the higher the sequence identity or similarity. Whether two genes have homology can be examined by direct sequence comparison or, in the case of nucleic acids, hybridization methods under stringent conditions. When directly comparing two gene sequences, the DNA sequence between the gene sequences is typically at least 50% identical, preferably at least 70% identical, more preferably at least 80%, 90% , 95%, 96%, 97%, 98% or 99% are identical, the genes are homologous. In the present specification, “similarity” of genes (for example, nucleic acid sequences, amino acid sequences, etc.) refers to two or more gene sequences when the conservative substitution is regarded as positive (identical) in the above homology. The degree of identity with each other. Thus, when there is a conservative substitution, homology and similarity differ depending on the presence of the conservative substitution. When there is no conservative substitution, homology and similarity indicate the same numerical value.
本明細書では、アミノ酸配列および塩基配列の類似性、同一性および相同性の比較は、配列分析用ツールであるFASTAを用い、デフォルトパラメータを用いて算出される。 In this specification, the comparison of similarity, identity and homology between amino acid sequences and base sequences is calculated using FASTA, which is a sequence analysis tool, and using default parameters.
(基本技術)
本明細書において使用される技術は、そうではないと具体的に指示しない限り、当該分野の技術範囲内にある、微生物学、発酵工学、生化学、遺伝子工学、分子生物学、遺伝学および関連する分野における周知慣用技術を使用する。そのような技術は、例えば、以下に列挙した文献および本明細書において他の場所おいて引用した文献においても十分に説明されている。
(Basic technology)
The techniques used herein are within the technical scope of the art, unless otherwise specifically indicated, microbiology, fermentation engineering, biochemistry, genetic engineering, molecular biology, genetics and related Well-known and conventional techniques in the field are used. Such techniques are well described, for example, in the documents listed below and in references cited elsewhere herein.
本明細書において使用される代表的な基本技術を以下に説明するが、これらはあくまで例示であり、本発明が以下の説明に限定されることは意図しない。 Representative basic techniques used in this specification will be described below, but these are merely examples, and the present invention is not intended to be limited to the following description.
(流加培養)
流加培養の条件は、当該分野において周知である。代表的な流加培養を以下に例示するが、流加培養の条件は、これに限定されない。流加培養条件を適宜変化させることは、当業者が容易になし得ることである。
(Fed-batch culture)
The conditions for fed-batch culture are well known in the art. Although typical fed-batch culture is illustrated below, the conditions of fed-batch culture are not limited to this. A person skilled in the art can easily change the fed-batch culture conditions as appropriate.
例えば、代表的な流加培養は、YMPD培地(0.3% イーストエキス、0.3% マルトエキス、0.5% ペプトン、3% グルコース)で培養した酵母菌体1.2gを種酵母として、所定の培地に播種した後、糖蜜溶液(260g/Lの糖に相当する廃糖蜜に19.49g/Lの尿素、および52g/LのKH2PO4を添加した溶液)を用いて30℃で連続流加することによって行われる。 For example, typical fed-batch culture uses 1.2 g yeast cells cultured in YMPD medium (0.3% yeast extract, 0.3% malt extract, 0.5% peptone, 3% glucose) as seed yeast. After seeding in a predetermined medium, a molasses solution (a solution obtained by adding 19.49 g / L urea and 52 g / L KH 2 PO 4 to waste molasses corresponding to 260 g / L sugar) at 30 ° C. This is done by continuously feeding in.
流加培養の条件は当該分野において周知であり、当業者は、流加培養条件を適宜選択・改変し得る。 The conditions for fed-batch culture are well known in the art, and those skilled in the art can appropriately select and modify the fed-batch culture conditions.
(本明細書において用いられる一般的技術)
本明細書において用いられる分子生物学的手法、生化学的手法、微生物学的手法、糖鎖科学的手法は、当該分野において周知であり慣用されるものであり、例えば、Maniatis,T.et al.(1989).Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harborおよびその3rd Ed.(2001);Ausubel,F.M.,et al. eds,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons Inc.,NY,10158(2000);Innis,M.A.(1990).PCR Protocols:A Guide to Methods and Applications,Academic Press;Innis,M.A.et al.(1995).PCR Strategies,Academic Press;Sninsky,J.J.et al.(1999).PCR Applications:Protocols for Functional Genomics,Academic Press;Gait,M.J.(1985).Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach,IRL Press;Gait,M.J.(1990).Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach,IRL Press;Eckstein,F.(1991).Oligonucleotides and Analogues:A Practical Approac ,IRL Press;Adams,R.L.et al.(1992).The Biochemistry of the Nucleic Acids,Chapman & Hall;Shabarova,Z.et al.(1994).Advanced Organic Chemistry of Nucleic Acids,Weinheim;Blackburn,G.M.et al.(1996).Nucleic Acids in Chemistry and Biology,Oxford University Press;Hermanson,G.T.(1996).Bioconjugate Techniques,Academic Press;Method in Enzymology 230、242、247、Academic Press、1994;別冊実験医学「遺伝子導入&発現解析実験法」羊土社、1997などに記載されており、これらは本明細書において関連する部分(全部であり得る)が参考として援用される。
(General techniques used in this specification)
Molecular biological techniques, biochemical techniques, microbiological techniques, and glycoscience techniques used in this specification are well known and commonly used in the art, and are described in, for example, Maniatis, T. et al. et al. (1989). Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor and its 3rd Ed. (2001); Ausubel, F .; M.M. , Et al. eds, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons Inc. NY, 10158 (2000); Innis, M .; A. (1990). PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Academic Press; A. et al. (1995). PCR Strategies, Academic Press; Sinsky, J. et al. J. et al. et al. (1999). PCR Applications: Protocols for Functional Genomics, Academic Press; Gait, M .; J. et al. (1985). Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press; Gait, M .; J. et al. (1990). Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press; Eckstein, F .; (1991). Oligonucleotides and Analogues: A Practical Approc, IRL Press; Adams, R .; L. et al. (1992). The Biochemistry of the Nucleic Acids, Chapman &Hall; Shabarova, Z. et al. et al. (1994). Advanced Organic Chemistry of Nucleic Acids, Weinheim; Blackburn, G .; M.M. et al. (1996). Nucleic Acids in Chemistry and Biology, Oxford University Press; Hermanson, G .; T.A. (1996). Bioconjugate Techniques, Academic Press; Methods in Enzymology 230, 242, 247, Academic Press, 1994; Related parts (which may be all) are incorporated by reference.
(遺伝子工学)
本発明において用いられ得る酵母に対する「組み換えベクター」としては、YEp、YCp、YIpなどが挙げられるが、これに限定されない。なお、E.coliに使用されるベクターとしては、例えば、pGEM−T、pUC、pBluescriptなどが例示される。
(Genetic engineering)
“Recombinant vectors” for yeast that can be used in the present invention include, but are not limited to, YEp, YCp, YIp and the like. In addition, E.I. Examples of vectors used for E. coli include pGEM-T, pUC, pBluescript, and the like.
本明細書において、核酸分子を細胞に導入する技術は、どのような技術でもよく、例えば、形質転換、形質導入、トランスフェクションなどが挙げられる。そのような核酸分子の導入技術は、当該分野において周知であり、かつ、慣用されるものであり、例えば、Ausubel F.A.ら編(1988)、Current Protocols in Molecular Biology、Wiley、New York、NY;Sambrook Jら(1987)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2nd Ed.およびその第三版,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY、別冊実験医学「遺伝子導入&発現解析実験法」羊土社、1997などに記載される。遺伝子の導入は、ノーザンブロット、ウェスタンブロット分析のような本明細書に記載される方法または他の周知慣用技術を用いて確認することができる。 In this specification, any technique may be used for introducing a nucleic acid molecule into a cell, and examples thereof include transformation, transduction, and transfection. Such a technique for introducing a nucleic acid molecule is well known in the art and commonly used. For example, Ausubel F. et al. A. (1988), Current Protocols in Molecular Biology, Wiley, New York, NY; Sambrook J et al. (1987) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed. And its third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, a separate volume of experimental medicine “Gene Transfer & Expression Analysis Experimental Method” Yodosha, 1997, and the like. Gene transfer can be confirmed using the methods described herein, such as Northern blot, Western blot analysis, or other well-known conventional techniques.
本明細書において使用される場合、組換えベクターの導入方法としては、DNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、塩化カルシウム法、エレクトロポレーション法[Methods.Enzymol.,194,182(1990)]、リポフェクション法、スフェロプラスト法[Proc.Natl.Acad.Sci.USA,84,1929(1978)]、酢酸リチウム法[J.Bacteriol.,153,163(1983)]、Proc.Natl.Acad.Sci.USA,75,1929(1978)記載の方法、およびパーティクルガン(遺伝子銃)を用いる方法などが例示される。 As used herein, any method for introducing a DNA can be used as a method for introducing a recombinant vector. For example, a calcium chloride method, an electroporation method [Methods. Enzymol. , 194, 182 (1990)], lipofection method, spheroplast method [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 1929 (1978)], lithium acetate method [J. Bacteriol. , 153, 163 (1983)], Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929 (1978), and a method using a particle gun (gene gun).
(好ましい実施形態の説明)
(1.OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の一倍体変異株の作製)
OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の一倍体変異株を作製する方法としては、例えば、(1)ランダムな変異誘発を行い、多数の候補変異株からOCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子変異株を単離する方法、および、(2)OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子を標的とする変異誘発を行う方法、が挙げられるが、これに限定されない。 OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の変異遺伝子は、野生型遺伝子の酵素活性を、全く有さないタンパク質、10%以下有するタンパク質、20%以下有するタンパク質、30%以下有するタンパク質、40%以下有するタンパク質、50%以下有するタンパク質、60%以下有するタンパク質、70%以下有するタンパク質、または、80%以下有するタンパク質をコードする遺伝子である。OCA1タンパク質、OCA2タンパク質およびALD2タンパク質の酵素活性の測定法は、周知である。
(Description of Preferred Embodiment)
(1. Preparation of haploid mutants of OCA1 gene, OCA2 gene or ALD2 gene)
As a method for preparing an OCA1 gene, OCA2 gene or ALD2 gene haploid mutant, for example, (1) random mutagenesis is performed, and OCA1 gene, OCA2 gene or ALD2 gene mutant is selected from a large number of candidate mutants. Examples include, but are not limited to, isolation methods and (2) mutagenesis targeting OCA1, OCA2 or ALD2 genes. The OCA1 gene, OCA2 gene or ALD2 gene mutant gene is a protein having no enzyme activity of the wild-type gene, a protein having 10% or less, a protein having 20% or less, a protein having 30% or less, a protein having 40% or less , A protein having 50% or less, a protein having 60% or less, a protein having 70% or less, or a protein having 80% or less. Methods for measuring enzyme activities of OCA1, OCA2 and ALD2 proteins are well known.
(1.1.ランダムな変異誘発を用いる方法)
ランダムな変異誘発法としては、例えば、変異誘発剤(例えば、ニトロソグアニジンが挙げられるが、これに限定されない)を用いる方法、紫外線・γ線照射を用いる方法、および、トランスポゾンによるランダムな挿入変異を誘発する方法、が挙げられるが、これに限定されない。これらランダムな変異誘発の後に、OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子に変異を含み、その結果、これら遺伝子の遺伝子産物の量が減少するか、および/または、遺伝子産物の活性が低下した変異株を単離する。
(1.1. Method using random mutagenesis)
Random mutagenesis methods include, for example, a method using a mutagen (such as, but not limited to, nitrosoguanidine), a method using ultraviolet / γ-ray irradiation, and a random insertion mutation by transposon. Include, but are not limited to, methods of triggering. After these random mutagenesis, a mutant strain containing a mutation in the OCA1, OCA2 or ALD2 gene, resulting in a decrease in the amount of the gene product of these genes and / or a decrease in the activity of the gene product. Isolate.
これら遺伝子の遺伝子産物の定量法としては、これら遺伝子から発現したmRNAをノザンハイブリダイゼーションで測定する方法、これら遺伝子から発現したタンパク質を抗OCA1抗体、抗ALD2抗体または抗OCA2抗体で測定する方法、および、これら遺伝子から発現したタンパク質のホスファターゼ活性を測定する方法が挙げられるが、これに限定されない。また、トランスポゾンを用いた場合、目的の変異株は、OCA1遺伝子内部、OCA2遺伝子内部またはALD2遺伝子内部にトランスポゾンを含むため、OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の両端からこれら遺伝子を増幅するPCRプライマーを用いてOCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子を増幅し、その遺伝子内にトランスポゾン配列が含まれるか否かを指標として、目的の変異株単離の指標とすることが可能である。 Methods for quantifying the gene products of these genes include methods for measuring mRNA expressed from these genes by Northern hybridization, methods for measuring proteins expressed from these genes with anti-OCA1, anti-ALD2 or anti-OCA2 antibodies, and A method for measuring the phosphatase activity of proteins expressed from these genes is mentioned, but the method is not limited thereto. When transposon is used, the target mutant strain contains transposon inside the OCA1 gene, the OCA2 gene, or the ALD2 gene, so PCR primers that amplify these genes from both ends of the OCA1, OCA2 gene, or ALD2 gene should be used. The OCA1 gene, OCA2 gene or ALD2 gene can be used to amplify the gene, and whether or not a transposon sequence is contained in the gene can be used as an index for isolation of the target mutant strain.
OCA1タンパク質およびOCA2タンパク質のホスファターゼ活性の基質は、チロンシン基リン酸化タンパク質であるので、そのホスファターゼ活性の測定を行い、目的の変異株単離の指標とすることが可能である。ホスファターゼ活性の測定は、例えば、アイソトープ標識されたプロテインチロシンフォスファターゼ基質からのアイソトープの遊離を測定することによって、可能である。また、ALD2タンパク質であるアルデヒドデヒドロゲナーゼは、アルデヒドを酸化してカルボン酸にする反応を触媒する酵素であることから、そのデヒドロゲナーゼ活性の測定を行い、目的の変異株単離の指標とすることが可能である。アルデヒドデヒドロゲナーゼ活性は、例えば、50mM Na−ピロリン酸緩衝液(pH 9.0)中、1mM NAD+および5mM プロピオンアルデニドを基質としてNADHの生成をA340の増加で測定する。粗酵素サンプルの場合は、ピラゾール1mMを添加して測定する。 Since the substrate for the phosphatase activity of the OCA1 protein and the OCA2 protein is a thyronsin group phosphorylated protein, it is possible to measure the phosphatase activity and use it as an index for isolating the target mutant strain. Phosphatase activity can be measured, for example, by measuring isotope release from an isotope-labeled protein tyrosine phosphatase substrate. Aldehyde dehydrogenase, an ALD2 protein, is an enzyme that catalyzes the reaction to oxidize aldehyde to carboxylic acid, so its dehydrogenase activity can be measured and used as an index for the isolation of the target mutant It is. Aldehyde dehydrogenase activity, e.g., measured in 50 mM Na-pyrophosphate buffer (pH 9.0), the generation of NADH with 1 mM NAD + and 5mM propionaldehyde aldehyde acetonide as a substrate with increasing A 340. In the case of a crude enzyme sample, 1 mM pyrazole is added for measurement.
(1.2.OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子を標的とする変異誘発を行う方法)
酵母は高い確率で相同組換えを起こす生物種であるため、その相同組換えを利用して、目的の遺伝子を標的とする変異誘発を行うことが可能である。例えば、目的とする遺伝子(OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子、あるいは、これらのホモログ)の両端((a)5’非翻訳領域および/または読み取り枠のアミノ末端領域、ならびに、(b)3’非翻訳領域および/または読み取り枠のカルボキシル末端領域)の配列が、OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子とは異なる遺伝子(例えば、URA3遺伝子)を挟むように連結して、遺伝子破壊ベクターを構築する。このベクターから、上記に示した、〔目的遺伝子の両端+その両端に挟まれた異なる遺伝子〕というDNA断片を増幅し、宿主酵母を形質転換する。宿主酵母においては、導入されたDNA断片が相同組換えによってゲノムDNAの配列と置き換わる株が生じる。その変異株は、ゲノム中に、標的遺伝子とは異なる遺伝子を有するため、その標的遺伝子とは異なる遺伝子により生じる表現型の変化(例えば、ウラシル要求性からウラシル非要求性への変化)を指標として、目的の相同組換えが生じた株を単離する。さらに、単離された株が実際に、目的の相同組換えを生じた株であることを、PCRによって確認する。その結果、ゲノムDNA中の目的遺伝子(OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子)が破壊された株が単離される。
(1.2. Method of performing mutagenesis targeting OCA1 gene or OCA2 gene)
Since yeast is a biological species that undergoes homologous recombination with a high probability, it is possible to carry out mutagenesis targeting a target gene using the homologous recombination. For example, both ends ((a) 5 ′ untranslated region and / or amino terminal region of the open reading frame, and (b) 3 ′ untranslated region) of the target gene (OCA1 gene or OCA2 gene, or homologs thereof) And / or the carboxyl terminal region of the open reading frame) is ligated so as to sandwich a gene (for example, URA3 gene) different from the OCA1 gene or OCA2 gene to construct a gene disruption vector. From this vector, the above-mentioned DNA fragment of [the both ends of the target gene + different genes sandwiched between the ends] is amplified, and the host yeast is transformed. In the host yeast, a strain is produced in which the introduced DNA fragment is replaced with the sequence of genomic DNA by homologous recombination. Since the mutant has a gene different from the target gene in the genome, the phenotypic change caused by a gene different from the target gene (for example, change from uracil requirement to uracil non-requirement) is used as an indicator. The strain in which the desired homologous recombination has occurred is isolated. Furthermore, it is confirmed by PCR that the isolated strain is actually the strain that has produced the desired homologous recombination. As a result, a strain in which the target gene (OCA1 gene or OCA2 gene) in the genomic DNA is disrupted is isolated.
以上の操作によって、OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子を標的とする変異誘発が可能である。 By the above operation, mutagenesis targeting the OCA1 gene or the OCA2 gene is possible.
(2.OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の二倍体変異株の作製)
OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の二倍体ホモ接合型変異株を作製する方法としては、例えば、(1)OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子の一倍体変異株を異なる接合型の一倍体より作製し、それらの一倍体変異株を交雑して二倍体変異株を作製する方法、および、(2)異なる2つの選択マーカーを用い、第一の選択マーカーを用いて第一の対立遺伝子に変異を導入し、その後、その変異株を用いて、第二の選択マーカーを用いて第二の対立遺伝子に変異を導入する方法、が挙げられるがこれらに限定されない。
(2. Production of diploid mutants of OCA1, OCA2 or ALD2 genes)
Examples of a method for producing a diploid homozygous mutant of the OCA1 gene, OCA2 gene or ALD2 gene include, for example, (1) a haploid mutant of an OCA1, OCA2 or ALD2 gene and a single conjugated mutant. A method for producing a diploid mutant by crossing these haploid mutants, and (2) using two different selectable markers, using the first selectable marker and the first Examples include, but are not limited to, a method of introducing a mutation into an allele and then introducing a mutation into the second allele using the mutant strain and a second selectable marker.
(3.OCA1遺伝子、OCA2遺伝子またはALD2遺伝子以外の遺伝子に変異を有する高ショ糖耐性変異株の改変)
高ショ糖耐性を付与する変異として、トレハロース分解酵素であるNTH1及びATH1への変異が公知である。これら変異株を親株として、OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子に変異を導入し、さらに、高いショ糖耐性を有する変異株を単離することが可能である。
(3. Modification of highly sucrose resistant mutants having mutations in genes other than the OCA1, OCA2 and ALD2 genes)
As mutations imparting high sucrose resistance, mutations to trehalose-degrading enzymes NTH1 and ATH1 are known. With these mutant strains as parent strains, mutations can be introduced into the OCA1 gene or OCA2 gene, and mutant strains having high sucrose resistance can be isolated.
本明細書において引用された、科学文献、特許、特許出願などの参考文献は、その全体が、各々具体的に記載されたのと同じ程度に本明細書において参考として援用される。 References such as scientific literature, patents and patent applications cited herein are hereby incorporated by reference in their entirety to the same extent as if each was specifically described.
以上、本発明を、理解の容易のために好ましい実施形態を示して説明してきた。以下に、実施例に基づいて本発明を説明するが、上述の説明および以下の実施例は、例示の目的のみに提供され、本発明を限定する目的で提供したのではない。従って、本発明の範囲は、本明細書に具体的に記載された実施形態にも実施例にも限定されず、特許請求の範囲によってのみ限定される。 The present invention has been described with reference to the preferred embodiments for easy understanding. In the following, the present invention will be described based on examples, but the above description and the following examples are provided only for the purpose of illustration, not for the purpose of limiting the present invention. Accordingly, the scope of the present invention is not limited to the embodiments or examples specifically described in the present specification, but is limited only by the scope of the claims.
以下に実施例を示して本発明をさらに詳しく説明するが、この発明は以下の例に限定されるものではない。 The present invention will be described in more detail with reference to the following examples, but the present invention is not limited to the following examples.
(実施例1:高ショ糖耐性関連遺伝子および変異株の同定)
約5,000株の非必須遺伝子破壊株から構成される酵母遺伝子破壊株セットは、EUROSCARF(European Saccharomyces cerevisiae archive for functional analysis)から頒布を受けた。これを用いて、酵母の高ショ糖耐性に関与する遺伝子に関する遺伝子機能の網羅的な検索を行った。高ショ糖耐性変異株は、30%のショ糖を含有する培地(30%ショ糖、5%マルトース、0.25%硫酸アンモニウム、0.5%尿素、1.6%リン酸二水素カリウム、0.5%リン酸一水素ナトリウム12水和物、0.06%硫酸マグネシウム、0.00225%ニコチン酸、0.0005%パントテン酸、0.00025%チアミン、0.000125%ピリドキシン、0.0001%リボフラビン、0.00005%葉酸、0.003%イソロイシン、0.015%バリン、0.002%アデニンヘミスルフェイト塩、0.002%塩酸アルギニン、0.002%ヒスチジン塩酸一水和物、0.01%ロイシン、0.003%塩酸リジン、0.002%メチオニン、0.005%フェニルアラニン、0.02%トレオニン、0.002%トリプトファン、0.003%チロシン、0.002%ウラシル)を用いる高ショ糖環境で野生型および各種変異型酵母を培養し、ファーモグラフ法によって生成された炭酸ガスを測定して発酵力を決定して、野生型株よりも発酵力が高い株を選択することによって行った。
(Example 1: Identification of high sucrose resistance-related genes and mutants)
A set of yeast gene disruption strains composed of about 5,000 non-essential gene disruption strains was distributed from EUROSCARF (European Saccharomyces cerevisiae archive for functional analysis). Using this, an exhaustive search of gene functions related to genes involved in high sucrose resistance in yeast was performed. A high sucrose resistant mutant is a medium containing 30% sucrose (30% sucrose, 5% maltose, 0.25% ammonium sulfate, 0.5% urea, 1.6% potassium dihydrogen phosphate, 0% 0.5% sodium monohydrogen phosphate dodecahydrate, 0.06% magnesium sulfate, 0.00225% nicotinic acid, 0.0005% pantothenic acid, 0.00025% thiamine, 0.000125% pyridoxine, 0.0001% Riboflavin, 0.00005% folic acid, 0.003% isoleucine, 0.015% valine, 0.002% adenine hemisulfate salt, 0.002% arginine hydrochloride, 0.002% histidine hydrochloride monohydrate, 01% leucine, 0.003% lysine hydrochloride, 0.002% methionine, 0.005% phenylalanine, 0.02% threonine, 0.00 % Tryptophan, 0.003% tyrosine, 0.002% uracil) in a high sucrose environment and cultivating wild-type and various mutant yeasts, and measuring the carbon dioxide produced by the fermographic method to determine the fermentative power The determination was performed by selecting a strain having higher fermentative power than the wild type strain.
その結果、実験室酵母であるBY4743株において、OCA1遺伝子(読み取り枠の核酸配列を配列番号1、アミノ酸配列を配列番号2として示す)及びOCA2遺伝子(読み取り枠の核酸配列を配列番号3、アミノ酸配列を配列番号4として示す)の遺伝子破壊により高ショ糖耐性が著しく向上する可能性が示唆された。 As a result, in the BY4743 strain, which is a laboratory yeast, the OCA1 gene (the reading frame nucleic acid sequence is shown as SEQ ID NO: 1, the amino acid sequence is shown as SEQ ID NO: 2) and the OCA2 gene (reading frame nucleic acid sequence is SEQ ID NO: 3, amino acid sequence). It was suggested that the high sucrose tolerance may be remarkably improved by gene disruption of (shown as SEQ ID NO: 4).
OCA1およびOCA2は細胞周期の制御に関連するプロテインホスファターゼであることは公知であるが、ショ糖耐性との関連については、教示も示唆もされていない。 Although OCAl and OCA2 are known to be protein phosphatases associated with cell cycle control, there is no teaching or suggestion regarding their association with sucrose resistance.
(実施例2:実用酵母を用いる、OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子に変異を有する高ショ糖耐性変異株の作製)
実用酵母Y244株において、OCA1遺伝子及びOCA2遺伝子の遺伝子破壊を行い、遺伝子破壊株を取得した。
(Example 2: Production of a high sucrose resistant mutant having a mutation in the OCA1 gene or OCA2 gene using a practical yeast)
In the practical yeast Y244 strain, gene disruption of the OCA1 gene and OCA2 gene was carried out to obtain a gene disrupted strain.
OCA1遺伝子破壊株の作製法を図1に示す。OCA1増幅のために、正方向プライマーとして核酸配列(TTGATGAGCTTATGACTTAC:配列番号5)を有するOCA1forプライマー、および、逆方向プライマーとして核酸配列(ATGATGACGTGGATGAGTCG:配列番号6)を有するOCA1revプライマーを用いた。S.cerevisiaeのS288C株の染色体DNAを鋳型としてこれらプライマー対を用いて、OCA1遺伝子を増幅した。増幅断片をpGEM−Tベクターに連結したベクターを調製後、さらにそのベクターからHindIII断片を切除し、YEp24のHindIII断片(URA3遺伝子の読み取り枠を含む)を連結した。OCA1forプライマーおよびOCA1revプライマーを用いて、OCA1遺伝子とURA3遺伝子との融合遺伝子であるOCA1::URA3をPCR増幅し、その増幅断片をY244株のウラシル要求性突然変異株に形質転換し、OCA1遺伝子破壊株を、ウラシル非要求性を指標に単離した。OCA1遺伝子破壊株が作製されたことを、OCA1forプライマーおよびOCA1revプライマーを用いるPCRによって確認した。結果を図2に示す。OCA1遺伝子破壊株からは、約3.2kbの断片が増幅された。 A method for producing an OCA1 gene disruption strain is shown in FIG. For OCA1 amplification, an OCA1for primer having a nucleic acid sequence (TTGATGAGCTTATGACTTAC: SEQ ID NO: 5) as a forward primer and an OCA1rev primer having a nucleic acid sequence (ATGATGACGTGGATGAGTCG: SEQ ID NO: 6) as a reverse primer were used. The OCA1 gene was amplified using these primer pairs using the chromosomal DNA of S. cerevisiae S288C strain as a template. After preparing a vector in which the amplified fragment was ligated to the pGEM-T vector, the HindIII fragment was excised from the vector, and the YEp24 HindIII fragment (including the URA3 gene reading frame) was ligated. OCA1 :: URA3, which is a fusion gene of OCA1 gene and URA3 gene, was PCR amplified using the OCA1for primer and OCA1rev primer, and the amplified fragment was transformed into a uracil-requiring mutant strain of Y244 strain to disrupt the OCA1 gene Strains were isolated using uracil non-requirement as an indicator. It was confirmed by PCR using an OCA1for primer and an OCA1rev primer that an OCA1 gene disrupted strain was produced. The results are shown in FIG. A fragment of about 3.2 kb was amplified from the OCA1 gene disruption strain.
OCA2遺伝子破壊株の作製法を図3および図4に示す。OCA2増幅のために、正方向プライマーとして核酸配列(GTTCCATTTGGTTTATCAGC:配列番号7)を有するOCA2forプライマー、および、逆方向プライマーとして核酸配列(GATATCAGCGCCGGTTCCAT:配列番号8)を有するOCA2revプライマーを用いた。S.cerevisiaeのS288C株の染色体DNAを鋳型としてこれらプライマー対を用いて、OCA2遺伝子を増幅した。増幅断片をpGEM−Tベクターに連結したベクターを調製後、さらにそのベクターからHindIII断片を切除し、YEp24のHindIII断片(URA3遺伝子の読み取り枠を含む)を連結した。OCA2forプライマーおよびOCA2revプライマーを用いて、OCA2遺伝子とURA3遺伝子との融合遺伝子であるOCA2::URA3をPCR増幅し、その増幅断片をY244株のウラシル要求性突然変異株に形質転換し、OCA2遺伝子破壊株を、ウラシル非要求性を指標に単離した。OCA2遺伝子破壊株が作製されたことを、OCA2forプライマーおよびOCA2revプライマーを用いるPCRによって確認した。結果を図5に示す。OCA2遺伝子破壊株からは、約3.1kbの断片が増幅された。 A method for producing an OCA2 gene disruption strain is shown in FIGS. For OCA2 amplification, an OCA2for primer having a nucleic acid sequence (GTTCCATTTGGTTTATCAGC: SEQ ID NO: 7) as a forward primer and an OCA2rev primer having a nucleic acid sequence (GATATCAGCGCCGGTTCCAT: SEQ ID NO: 8) as a reverse primer were used. The OCA2 gene was amplified using the chromosomal DNA of S. cerevisiae S288C strain as a template and these primer pairs. After preparing a vector in which the amplified fragment was ligated to the pGEM-T vector, the HindIII fragment was excised from the vector, and the YEp24 HindIII fragment (including the URA3 gene reading frame) was ligated. Using the OCA2for primer and OCA2rev primer, OCA2 :: URA3, which is a fusion gene of the OCA2 gene and the URA3 gene, was PCR-amplified, and the amplified fragment was transformed into a uracil-requiring mutant of the Y244 strain to disrupt the OCA2 gene. Strains were isolated using uracil non-requirement as an indicator. It was confirmed by PCR using an OCA2for primer and an OCA2rev primer that an OCA2 gene disrupted strain was produced. The results are shown in FIG. A fragment of about 3.1 kb was amplified from the OCA2 gene disruption strain.
これら酵母株、Y244株、Y244株のOCA1遺伝子破壊株であるY312株、および、Y244株のOCA2遺伝子破壊株であるY313株を、独立行政法人 製品評価技術基盤機構の特許微生物寄託センターに寄託した。それぞれの寄託番号は、NITE AP−274、NITE AP−275、およびNITE AP−276である。 These yeast strains, Y244 strain, Y244 strain Y312 strain, which is the OCA1 gene disruption strain, and Y244 strain OCA2 gene disruption strain, were deposited at the Patent Microorganism Depositary Center of the National Institute of Technology and Evaluation. . The respective deposit numbers are NITE AP-274, NITE AP-275, and NITE AP-276.
(実施例3:実用酵母から作製した、OCA1遺伝子またはOCA2遺伝子に変異を有する高ショ糖耐性変異株の特徴付け)
実施例2において作製した変異株の特徴付けを行った。野生株、OCA1破壊株、および、OCA2破壊株を、5%ショ糖濃度を含む培地を用いる非ストレス条件下(5%ショ糖、5%マルトース、0.25%硫酸アンモニウム、0.5%尿素、1.6%リン酸二水素カリウム、0.5%リン酸一水素ナトリウム12水和物、0.06%硫酸マグネシウム、0.00225%ニコチン酸、0.0005%パントテン酸、0.00025%チアミン、0.000125%ピリドキシン、0.0001%リボフラビン、0.00005%葉酸)、および、50%ショ糖濃度を含む培地を用いるストレス条件下(50%ショ糖、5%マルトース、0.25%硫酸アンモニウム、0.5%尿素、1.6%リン酸二水素カリウム、0.5%リン酸一水素ナトリウム12水和物、0.06%硫酸マグネシウム、0.00225%ニコチン酸、0.0005%パントテン酸、0.00025%チアミン、0.000125%ピリドキシン、0.0001%リボフラビン、0.00005%葉酸)にて30℃、120分間、90rpmで振盪培養し、炭酸ガス発生量をファーモグラフ法にて測定した。結果を図6および図7に示す。
(Example 3: Characterization of a high sucrose-resistant mutant strain having a mutation in the OCA1 gene or OCA2 gene prepared from a practical yeast)
The mutant strain prepared in Example 2 was characterized. Wild strains, OCAl disrupted strains, and OCA2 disrupted strains were subjected to non-stress conditions (5% sucrose, 5% maltose, 0.25% ammonium sulfate, 0.5% urea, using a medium containing 5% sucrose concentration. 1.6% potassium dihydrogen phosphate, 0.5% sodium monohydrogen phosphate dodecahydrate, 0.06% magnesium sulfate, 0.00225% nicotinic acid, 0.0005% pantothenic acid, 0.00025% thiamine , 0.000125% pyridoxine, 0.0001% riboflavin, 0.00005% folic acid), and stress conditions using a medium containing 50% sucrose concentration (50% sucrose, 5% maltose, 0.25% ammonium sulfate) 0.5% urea, 1.6% potassium dihydrogen phosphate, 0.5% sodium monohydrogen phosphate dodecahydrate, 0.06% magnesium sulfate, .00225% nicotinic acid, 0.0005% pantothenic acid, 0.00025% thiamine, 0.000125% pyridoxine, 0.0001% riboflavin, 0.00005% folic acid) at 30 ° C. for 120 minutes with shaking at 90 rpm. The amount of carbon dioxide gas generated was measured by a farm graph method. The results are shown in FIG. 6 and FIG.
その結果、実用酵母に由来するOCA1遺伝子破壊株及びOCA2遺伝子破壊株は、野生型の酵母と比較して、著しく高い(約1.5倍)高ショ糖耐性を示した。また、通常のパン生地発酵力も高く維持していたことから、OCA1遺伝子破壊及びOCA2遺伝子破壊は高ショ糖耐性実用酵母の作成に適する方法であることが示された。 As a result, the OCA1 gene-disrupted strain and the OCA2 gene-disrupted strain derived from the practical yeast showed extremely high (about 1.5 times) high sucrose resistance compared to the wild-type yeast. Moreover, since the normal bread dough fermentation power was also maintained high, it was shown that OCA1 gene disruption and OCA2 gene disruption are suitable methods for the production of high-sucrose resistant practical yeast.
(実施例4:実用酵母を用いる、ALD2遺伝子に変異を有する高ショ糖耐性変異株の作製)
非必須遺伝子の遺伝子破壊株セットを用いたストレス耐性株のスクリーニングにより、実験室株において、ALD2遺伝子破壊株が、乾燥および高ショ糖ストレスに対して、著しい耐性を示すことが示唆された。そのため、実用酵母Y244株においてALD2遺伝子を破壊し、ストレス耐性が向上するかどうか検討した。遺伝子破壊は以下のように行った。
(Example 4: Production of a high sucrose resistant mutant having a mutation in the ALD2 gene using a practical yeast)
Screening for stress-resistant strains using a set of gene-disrupted strains of non-essential genes suggested that ALD2 gene-disrupted strains show significant resistance to drought and high sucrose stress in laboratory strains. Therefore, we examined whether the ALD2 gene was disrupted in the practical yeast strain Y244 and stress tolerance was improved. The gene disruption was performed as follows.
まず、プラスミドベクターYEp24のURA3配列を鋳型に、ALD2-URA3 FORプライマー(5'-TATCGAAATCCCACAATTGAAAATCTCTTTAAAGCAACCGTTCAATTCAATTCATCA-3')およびALD2-URA3REVプライマー(5'-TATGTGAACTGCTTTTGTTTGAAGATAGGTATCAACACCACGTCATTATAAAAATCAT-3')を用いて、URA3断片の増幅を行った。これらのプライマーは、URA3相同配列の5’側にALD2周辺領域と相同な40bの配列を付加してある。この増幅断片を用いて、Y244株のウラシル要求性突然変異株を形質転換し、ウラシル非要求性を指標にしてALD2遺伝子破壊株を単離した。その概要を、図8に示した。 First, ALD2-URA3 FOR primer (5'-TATCGAAATCCCACAATTGAAAATCTCTTTAAAGCAACCGTTCAATTCAATTCATCA-3 ') and ALD2-URA3REV primer (5'-TATGTGAACTGCTTTTGTTTGAAGATAGGTATCAACACC) It was. These primers have a 40b sequence homologous to the ALD2 peripheral region added to the 5 'side of the URA3 homologous sequence. Using this amplified fragment, a uracil-requiring mutant of Y244 strain was transformed, and an ALD2 gene disruption strain was isolated using uracil non-requiring as an index. The outline is shown in FIG.
(実施例5:実用酵母から作製した、ALD2遺伝子に変異を有する高ショ糖耐性変異株の特徴付け)
実施例4において作製した変異株の特徴付けを行った。野生株、ALD2破壊株に対して、以下の手順で乾燥ストレスを負荷した: 1)細胞を400mLのYPD培地(200mL×2)中、30℃で24時間培養した;2)培養した細胞を、磁器乾燥版(ニッカトー株式会社)を使用して、含水量が68%になるまで脱水した(市販の圧縮酵母と同様になる); 3)細胞を、通風乾燥機(エスベック)を使用し、37℃、24時間風乾して、含水量を5%にした(乾燥酵母製品と同様になる);4)液体発酵(LF)培地(パン生地と類似する培地)中でのガス産生を、ファーモグラフII(ATTO株式会社)を使用して、測定した。
(Example 5: Characterization of a high sucrose-resistant mutant having a mutation in the ALD2 gene prepared from a practical yeast)
The mutant strain prepared in Example 4 was characterized. The wild-type strain and the ALD2-disrupted strain were subjected to drought stress by the following procedure: 1) Cells were cultured in 400 mL of YPD medium (200 mL × 2) at 30 ° C. for 24 hours; 2) The cultured cells were Using a porcelain dry plate (Nikkato Co., Ltd.), dehydrated until the water content was 68% (similar to commercially available compressed yeast); 3) Using a ventilated dryer (ESBEC), 37 Air-dried for 24 hours at a temperature of 5% (similar to dry yeast product); 4) Gas production in liquid fermentation (LF) medium (medium similar to bread dough) Measurement was performed using II (ATTO Corporation).
次に、50%ショ糖濃度を含む培地を用いるストレス条件下(50%ショ糖、5%マルトース、0.25%硫酸アンモニウム、0.5%尿素、1.6%リン酸二水素カリウム、0.5%リン酸一水素ナトリウム12水和物、0.06%硫酸マグネシウム、0.00225%ニコチン酸、0.0005%パントテン酸、0.00025%チアミン、0.000125%ピリドキシン、0.0001%リボフラビン、0.00005%葉酸)にて30℃、120分間、90rpmで振盪培養し、炭酸ガス発生量をファーモグラフ法にて測定した。結果を図9に示す。 Next, stress conditions using a medium containing a 50% sucrose concentration (50% sucrose, 5% maltose, 0.25% ammonium sulfate, 0.5% urea, 1.6% potassium dihydrogen phosphate, 0. 5% sodium monohydrogen phosphate dodecahydrate, 0.06% magnesium sulfate, 0.00225% nicotinic acid, 0.0005% pantothenic acid, 0.00025% thiamine, 0.000125% pyridoxine, 0.0001% riboflavin , 0.00005% folic acid) at 30 ° C. for 120 minutes with shaking at 90 rpm, and the amount of carbon dioxide generated was measured by the farming method. The results are shown in FIG.
その結果、ALD2破壊株は極めて優れた乾燥ストレス耐性および高ショ糖ストレス耐性を有することが明らかとなった。 As a result, it was revealed that the ALD2-disrupted strain has extremely excellent drought stress tolerance and high sucrose stress tolerance.
以上のように、本発明の好ましい実施形態を用いて本発明を例示してきたが、本発明は、この実施形態に限定して解釈されるべきものではない。本発明は、特 許請求の範囲によってのみその範囲が解釈されるべきであることが理解される。当業者は、本発明の具体的な好ましい実施形態の記載から、本発明の記載および技術常識に基づいて等価な範囲を実施することができることが理解される。本明細書において引用した特許、特許出願および文献は、その内容自体が具体的に本 明細書に記載されているのと同様にその内容が本明細書に対する参考として援用されるべきであることが理解される。 As mentioned above, although this invention has been illustrated using preferable embodiment of this invention, this invention should not be limited and limited to this embodiment. It is understood that the scope of the present invention should be interpreted only by the scope of the patent claims. It is understood that those skilled in the art can implement an equivalent range based on the description of the present invention and the common general technical knowledge from the description of specific preferred embodiments of the present invention. Patents, patent applications, and documents cited in this specification should be incorporated by reference as if the contents themselves were specifically described in the present specification. Understood.
本発明の酵母を用いることによって、高ショ糖環境であっても高い発酵力を発揮する酵母を単離することが可能となる。そのような酵母を用いることによっ て、従来、十分な発酵を行うことが困難であった菓子類製造などにおける高ショ糖環境での発酵の効率を高めることが可能となる。 By using the yeast of the present invention, it is possible to isolate a yeast that exhibits high fermentability even in a high sucrose environment. By using such a yeast, it is possible to increase the efficiency of fermentation in a high sucrose environment in the manufacture of confectionery and the like for which it has been difficult to perform sufficient fermentation.
配列番号1 OCA1遺伝子の核酸配列
配列番号2 OCA1遺伝子のアミノ酸配列
配列番号3 OCA2遺伝子の核酸配列
配列番号4 OCA2遺伝子のアミノ酸配列
配列番号5 OCA1forプライマー
配列番号6 OCA1revプライマー
配列番号7 OCA2forプライマー
配列番号8 OCA2revプライマー
配列番号9 ALD2遺伝子の核酸配列
配列番号10 ALD2遺伝子のアミノ酸配列
配列番号11 ALD2−URA3 FORプライマー
配列番号12 ALD2−URA3 REVプライマー
SEQ ID NO: 1 OCA1 gene nucleic acid sequence SEQ ID NO: 2 OCA1 gene amino acid sequence SEQ ID NO: 3 OCA2 gene nucleic acid sequence SEQ ID NO: 4 OCA2 gene amino acid sequence SEQ ID NO: 5 OCA1 for primer SEQ ID NO: 6 OCA1 rev primer SEQ ID NO: 7 OCA2 for primer SEQ ID NO: 8 OCA2rev primer SEQ ID NO: 9 ALD2 gene nucleic acid sequence SEQ ID NO: 10 ALD2 gene amino acid sequence SEQ ID NO: 11 ALD2-URA3 FOR primer SEQ ID NO: 12 ALD2-URA3 REV primer
Claims (28)
(a)配列番号1、配列番号3、および、配列番号9からなる群から選択される配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子を破壊する工程;
(b)工程(a)で遺伝子破壊をした変異型酵母と、遺伝子破壊をしていない酵母とを、ショ糖耐性について比較する工程;ならびに、
(c)ショ糖耐性の向上した変異型酵母を選択する工程、
を包含する方法。 A method of manufacturing a tio sugar tolerant yeast, the following:
(A) a step of destroying a genomic gene that hybridizes under high stringency conditions to a nucleic acid having a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 9 ;
(B) comparing the mutant yeast that has undergone gene disruption in step (a) with the yeast that has not undergone gene disruption for sucrose resistance; and
(C) selecting a mutant yeast having improved sucrose resistance;
Including the method.
(a)配列番号1、配列番号3、および、配列番号9からなる群から選択される配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子を破壊した酵母を選択する工程;
(b)工程(a)で選択した変異型酵母と、遺伝子破壊をしていない酵母とを、ショ糖耐性について比較する工程;ならびに、
(c)ショ糖耐性の向上した変異型酵母を選択する工程、
を包含する方法。 A selection method of tio glucose tolerance yeast, the following:
(A) selecting a yeast having a disrupted genomic gene that hybridizes under high stringency conditions to a nucleic acid having a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 9 ;
(B) comparing the mutant yeast selected in step (a) with yeast that has not undergone gene disruption for sucrose resistance; and
(C) selecting a mutant yeast having improved sucrose resistance;
Including the method.
ここで、該酵母は、請求項1に記載の方法によって製造されたショ糖耐性酵母であり、かつ、配列番号1に記載の配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に遺伝子破壊変異を有する酵母である、
組成物。 A composition for performing fermentation for bread production under high sucrose conditions, the composition comprising yeast and at least a portion of the ingredients
Here, the yeast is a sucrose-resistant yeast produced by the method according to claim 1, and is a genomic gene that hybridizes under high stringency conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1. a yeast having a gene disruption mutation in,
Composition.
ここで、該酵母は請求項6に記載の方法によって選抜されたショ糖耐性酵母であり、かつ、配列番号1に記載の配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に遺伝子破壊変異を有する酵母である、 Here, the yeast is a sucrose-resistant yeast selected by the method according to claim 6, and is a genomic gene that hybridizes to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 1 under highly stringent conditions. A yeast having a gene disruption mutation,
組成物。Composition.
ここで、該酵母は、請求項1に記載の方法によって製造されたショ糖耐性酵母であり、かつ、配列番号3に記載の配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に遺伝子破壊変異を有する酵母である、
組成物。 A composition for performing fermentation for bread production under high sucrose conditions, the composition comprising yeast and at least a portion of the ingredients
Here, the yeast is a sucrose-resistant yeast produced by the method according to claim 1, and is a genomic gene that hybridizes under high stringency conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 3. a yeast having a gene disruption mutation in,
Composition.
ここで、該酵母は、請求項6に記載の方法によって選抜されたショ糖耐性酵母であり、かつ、配列番号3に記載の配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に遺伝子破壊変異を有する酵母である、 Here, the yeast is a sucrose-resistant yeast selected by the method according to claim 6, and a genomic gene that hybridizes under high stringency conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 3. A yeast having a gene disruption mutation in
組成物。Composition.
ここで、該酵母は、請求項1に記載の方法によって製造されたショ糖耐性酵母であり、かつ、配列番号9に記載の配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に遺伝子破壊変異を有する酵母である、
組成物。 A composition for performing fermentation for bread production under high sucrose conditions, the composition comprising yeast and at least a portion of the ingredients
Here, the yeast is a sucrose-resistant yeast produced by the method according to claim 1, and is a genomic gene that hybridizes under high stringency conditions to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 9. a yeast having a gene disruption mutation in,
Composition.
ここで、該酵母は、請求項6に記載の方法によって選抜されたショ糖耐性酵母であり、かつ、配列番号9に記載の配列を有する核酸に高度にストリンジェントな条件でハイブリダイズするゲノム遺伝子に遺伝子破壊変異を有する酵母である、 Here, the yeast is a sucrose-resistant yeast selected by the method of claim 6, and a genomic gene that hybridizes to a nucleic acid having the sequence of SEQ ID NO: 9 under highly stringent conditions A yeast having a gene disruption mutation in
組成物。Composition.
The manufacturing method of confectionery using the composition as described in any one of Claims 23-25 .
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