JP5008932B2 - タンパク質のユビキチン化抑制剤 - Google Patents
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1.ユビキチン化抑制剤
本発明においては、自己ユビキチン化抑制活性を有する低分子化合物を取得する事を目的とし、in vitro ユビキチン化反応を利用して、ウェスタンブロット法によりスクリーニングを行なった。
スクリーニングの結果、シノビオリンの自己ユビキチン化反応を強く阻害する活性を有する化合物が取得された。
この化合物は、プルムバギン及びケルセチンと呼ばれる低分子化合物であり、それぞれ、式I、式IIで示される。本明細書において、プルムバギンは、「低分子化合物302」ともいう。
プルムバギン及びケルセチンを自己ユビキチン化抑制剤として使用する場合は、使用の態様は限定されるものではない。
例えば、細胞内タンパク質の相互作用を調べるための実験用試薬として、ウエスタンブロッティング、ELISA、免疫沈降等に使用することができる。
実験用試薬の場合の使用態様(使用量、使用時間、実験の対象物など)は、目的に応じて当業者が適宜設定することができる(例えば実施例を参照)。
ケルセチンは、通常の化学合成により得ることができるが、市販品を使用することもできる(シグマ・アルドリッチ社、カタログ番号Q0125)。
本発明者らは、P4HA1がシノビオリンのユビキチンリガーゼ活性によってユビキチン化されることを明らかにした。シノビオリンによりユビキチン化されたP4HA1はプロテアソームで分解される。そのため、シノビオリンのP4HA1ユビキチン化を介するプロリン4水酸化酵素活性の制御を介して、線維症の発症に関与する事が考えられた(WO2005019472)。
「薬学的に許容可能な塩」の定義は前記と同様である。
プルムバギン、ケルセチンまたはこれらの組み合わせは、線維症などの細胞増殖性疾患を治療するために医薬組成物として使用することができる。
実施例において使用された以下の物質の概要は次の通りである。
His-UbcH5C:Hisタグを融合したユビキチン結合酵素(UbcH5C)
His-UBE2G2:Hisタグを融合したユビキチン結合酵素E2G2(UBE2G2)
His-PK-HA-ubiquitin:Hisタグ、リン酸化サイト、HAタグを融合させたユビキチン
GST-Syno ΔTM:GST融合、膜貫通領域欠損シノビオリン
GST-AMFR ΔTM-HA:N末端側にGST、C末端側にHAタグを融合させた膜貫通領域欠損E3ユビキチンリガーゼ(AMFR)
FLAG-Ub:FLAGタグを融合させたユビキチン
sp-FLAG-P4HA1:シグナルペプチドとP4HA1の間にFLAGタグを付加したタンパク質
FLAG-P4HA1:シグナルペプチドを有さないFLAG融合P4HA1
本実施例は、ELISAおよびWesternを用いたin vitro自己ユビキチン化反応検出系を用いたスクリーニングにより、自己ユビキチン化抑制作用を有する事が予測される市販の化合物からシノビオリン自己ユビキチン化阻害活性を有する化合物を見出す事を目的とする。
反応後、抗HA抗体を用いたウエスタンブロット法によりユビキチン化タンパク質を検出した。
この結果より、取得された化合物には強いシノビオリン自己ユビキチン化抑制活性を有することが示された。
(1)MBP-SynoΔTM自己ユビキチン化抑制活性
本項は、MBP-Syno ΔTM-His を基質とした場合でも、低分子化合物302がシノビオリンの自己ユビキチン化反応阻害活性を有するか否かの検討を行い、そのIC50値を算出したものである。
上記反応液を37℃で30分間反応させた後、抗HA抗体を用いたウエスタンブロット法により、ユビキチン化タンパク質を検出した(図2)。また、低分子化合物302の濃度系列6.25, 12.5, 25, 50 μM存在下で、上記と同様にしてMBP-Syno ΔTM-Hisによるin vitro自己ユビキチン化反応を行った。検出後のフィルムの黒化度をImageJにより解析後、グラフ化してIC50を算出した。
本稿は、GST-Syno ΔTM又はGST-AMFRを基質とした場合において、低分子化合物302がシノビオリンの自己ユビキチン化反応阻害活性を有するか否か、及び、自己ユビキチン化反応の素過程であるE2-ubiquitin複合体形成反応に対する低分子化合物302の影響を検討したものである。
反応液を37℃で30分間の反応させた後、ユビキチン化タンパク質を7.5% SDS-PAGEで分離し、抗Flag抗体を用いたウエスタンブロット法により検出した(図4A)。
反応液を37℃で30分間反応させた後、ユビキチン化タンパク質を15% SDS-PAGEで分離し、抗Flag抗体を用いたウエスタンブロット法により検出した(図4B)。
本項では、低分子化合物302の特異性を調べることを目的とし、加熱処理したビオチン化BSA(boiled biotinylated BSA)のユビキチン化反応に与える影響を調べた。
反応液組成は以下の通りである。
反応液中のタンパク質を7.5% SDS-PAGEによる分離後、PVDF膜に転写し、ストレプトアビジン/ HRPを用いたウエスタンブロットを行った(図 5)。
本項では、低分子化合物302について、自己ユビキチン化活性阻害の特異性を明らかにするため、RING型E3ユビキチンリガーゼであるSYNO ΔTM, AMFR ΔTM-HA, MDM2又はARIH1の自己ユビキチン化反応に与える影響を調べた。
反応液中のタンパク質を7.5% SDS-PAGEによる分離後、PVDF膜に転写し、抗HA抗体を用いたウエスタンブロットを行った(図6)。
本実施例では、低分子化合物302の作用機序の解明を試みることを目的とし、プルダウン・アッセイ(pull-down assay)による低分子化合物とシノビオリンとの相互作用を解析した。
Interacting proteinsとは、 GST-ΔSynoとHis-UBE2G2との相互作用タンパク質、又はGST-ΔSynoとboiled biotinylated BSAとの相互作用タンパク質をいう。
本実施例では、低分子化合物302がユビキチンリガーゼ特異的か否かを調べることを目的として、GST活性に与える影響を調べた。
その結果、302の濃度に依存してGST活性が阻害された(図9)。
本実施例では、低分子化合物302のリウマチ滑膜細胞(RASC)に対する細胞増殖抑制活性を測定した。
COS7細胞に、sp-FLAG-P4HA1、HA-Ubおよび野生型シノビオリン又は3S変異体(シノビオリンのRINGドメインの307、309、329のヒスチジンをセリンに変異させた変異体)を発現するプラスミドをFuGene6でトランスフェクションした。48時間後に、野生型シノビオリンをトランスフェクションした細胞に1、10、100 μMの低分子化合物302を処理した。コントロールとして最終濃度0.1%となるようにDMSOを加えた。12時間後に細胞を回収し、高塩濃度バッファー(high salt buffer) (7.5 mM Tris-HCl (pH7.5), 420 mM NaCl, 0.5 % NP-40, 1 mM PMSF, 0.5 mM DTT)を用いて細胞を溶解し、14,000rpmにて遠心して上清を回収した。回収した上清に水を加えて塩濃度を150 mM にした後に、抗FLAG抗体アガロースビーズ(M2, Sigma)を加え、4℃にて2時間撹拌した。ビーズを洗浄バッファー (150 mM Tris-HCl (pH7.5)、0.5 % NP-40、150 mM NaCl、1 mM PMSF、0.5 mM DTT)で5回洗浄し、30μLのSDS-PAGE バッファーを加えて5分間煮沸した。
COS7細胞に、FLAG-P4HA1、シノビオリンおよびHA-Ubを発現するプラスミド(pcDNA3-)をFuGene6(Roche)を用いてトランスフェクションした。トランスフェクション48時間後にケルセチンを最終濃度1, 10, 20, 50 μMとなるように加えた。コントロール群には最終濃度0.1%のDMSOを加えた。6時間後に細胞を回収し、high salt buffer (7.5 mM Tris-HCl (pH7.5), 420 mM NaCl, 0.5 % NP-40, 1 mM PMSF, 0.5 mM DTT)を用いて細胞を溶解し、14,000rpmで遠心して上清を回収した。回収した上清に水を加えて塩濃度を150 mM にした後に、抗FLAG抗体アガロースビーズ(M2, Sigma)を加え、4℃にて2時間撹拌した。ビーズを洗浄バッファー(150 mM Tris-HCl (pH7.5)、0.5 % NP-40、150 mM NaCl、1 mM PMSF、0.5 mM DTT)で5回洗浄し、30μLのSDS-PAGEバッファーを加えて5分間煮沸した。
(i) 低分子化合物302及びケルセチンはシノビオリンの自己ユビキチン化を強く抑制する効果を有する。
(ii) 低分子化合物302におけるシノビオリンの自己ユビキチン化阻害活性のIC50は20μMである。
(iii) 低分子化合物302は、シノビオリン同士の相互作用により生じるシノビオリンの自己ユビキチン化を抑制する。
(iv) 低分子化合物302は、RING型E3ユビキチンリガーゼの自己ユビキチン化反応を抑制する。
E2ユビキチン複合体形成には影響を与えない。
(v) 低分子化合物302は、非常に低いIC50値でリウマチ滑膜細胞に対する細胞増殖抑制効果を示した。
Claims (5)
- プルムバギン及びケルセチンからなる群から選ばれる少なくとも1つ、その製薬上許容可能な塩又はこれらの水和物を含む、タンパク質のユビキチン化抑制剤。
- タンパク質のユビキチン化がシノビオリンの自己ユビキチン化である請求項1記載の抑制剤。
- 自己ユビキチン化は、シノビオリン同士の相互作用により生じるものである請求項2に記載の抑制剤。
- タンパク質のユビキチン化は、該タンパク質にシノビオリンが結合することにより生じるものである請求項1に記載の抑制剤。
- プルムバギン、その製薬上許容可能な塩又はこれらの水和物を含む、線維症治療剤。
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