JP4474541B2 - Vascular bundle-specific expression promoter - Google Patents

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Description

本発明は、目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター及びその使用に関するものである。   The present invention relates to a promoter for specifically expressing a target gene in a vascular bundle and use thereof.

植物細胞内で機能可能なプロモーターの下流に発現させたい目的タンパク質をコードする遺伝子を連結させた融合遺伝子を植物細胞に導入し、得られた植物細胞を通常の植物組織培養技術により再生させる方法によって、所望の形質を有する改良植物体を作出することが行われている。植物で一般に用いられるプロモーターとしては、例えば、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)35S RNA遺伝子のプロモーター、アグロバクテリウムTiプラスミド由来ノパリン合成酵素遺伝子のプロモーター(Pnos)、トウモロコシ由来ユビキチン遺伝子のプロモーター、イネ由来のアクチン遺伝子のプロモーターなどが知られている。これらのプロモーターは、植物細胞内で目的とするタンパク質を構成的(constitutive)に発現させることが知られており、汎用されている。   By introducing a fusion gene in which a gene encoding a target protein to be expressed downstream of a promoter capable of functioning in a plant cell is linked to the plant cell, and regenerating the obtained plant cell by a normal plant tissue culture technique An improved plant having a desired character has been produced. Examples of promoters generally used in plants include cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S RNA gene promoter, Agrobacterium Ti plasmid-derived nopaline synthase gene promoter (Pnos), maize-derived ubiquitin gene promoter, rice-derived actin Gene promoters are known. These promoters are known to constitutively express a target protein in plant cells, and are widely used.

しかしながら、植物を改良する場合、例えば、目的タンパク質を局所的に発現させることにより効果的な改良が行えることがあり、このような改良により新しいタイプの高機能性植物を開発する一環として、組織特異的な発現をもたらす植物プロモーターの探索が望まれている。
これまでに、植物において目的タンパク質を組織特異的に発現させることのできるプロモーターとしては、イネを例にすると、葯特異的プロモーターRA8(特許文献1)、葯又は花粉特異的プロモーターCatA(特許文献2)、雄ずい特異的プロモーターT72, T23, T42, T155, E1(特許文献3)、花器特異的プロモーターRPC213(特許文献4)、葉肉細胞特異的プロモーターrbcS(非特許文献1)、胚乳特異的プロモーターGluB-1、GluA-2(非特許文献2、3)、カルス特異的プロモーターPRO3(特許文献5)等が報告されている。
However, when plants are improved, effective improvements may be achieved by, for example, local expression of the target protein, and as a part of developing new types of highly functional plants by such improvements, tissue specific It is desired to search for plant promoters that bring about specific expression.
So far, as a promoter capable of tissue-specific expression of a target protein in a plant, rice is taken as an example, a rice cake-specific promoter RA8 (Patent Document 1), a rice cake or pollen-specific promoter CatA (Patent Document 2) ), Stamen-specific promoters T72, T23, T42, T155, E1 (patent document 3), flower organ-specific promoter RPC213 (patent document 4), mesophyll cell-specific promoter rbcS (non-patent document 1), endosperm-specific promoter GluB-1, GluA-2 (Non-patent Documents 2 and 3), callus-specific promoter PRO3 (Patent Document 5) and the like have been reported.

植物は光合成によって葉において糖(炭水化物)を生産し、また根から水分や窒素源等の養分を吸収する。植物はこれらの物質を材料あるいはエネルギー源に用いて新しい器官を次々と作って成長し、成熟期に入ると次の世代の繁殖に備えて貯蔵器官に再配分して種々の貯蔵物質として貯蔵する。このように、同化・吸収した物質の輸送(転流)、再配分による貯蔵は、光合成と共に植物の成長や生命活動維持の基盤となる機能である。維管束は、根、茎、葉を貫通する植物体の連続した構造であり、同化・吸収した物質の通路として重要な役割を担っている。   Plants produce sugars (carbohydrates) in the leaves by photosynthesis and absorb nutrients such as moisture and nitrogen sources from the roots. Plants use these substances as materials or energy sources to create and grow new organs one after another, and when matured, they are redistributed to storage organs for storage in the next generation and stored as various storage substances . In this way, the transport (commutation) and redistribution of assimilated / absorbed substances are functions that serve as the basis for plant growth and life activity maintenance as well as photosynthesis. A vascular bundle is a continuous structure of a plant that penetrates roots, stems, and leaves, and plays an important role as a passage for assimilated and absorbed substances.

一方、植物病理学的な見地からも維管束系は重要である。すなわち、植物病原細菌(イネ白葉枯れ病菌、ナス科植物青枯れ病菌、トマトかいよう病菌など)は植物の葉や根の傷口から侵入した後、維管束系に到達し、その導管内などで増殖し、発病させ、やがて植物を枯らしてしまう。また、植物の生育は、乾燥、高塩濃度、低温といったような環境ストレスの影響を顕著に受ける。環境ストレスは、植物に様々な生化学的及び生理学的な応答を引き起こす。植物は、これらの環境ストレス条件下で生き抜くために、環境ストレスに対する応答性及び順応性を獲得する。環境ストレスに応答して根などの維管束に発現する遺伝子も知られており、そのようなストレス誘導性遺伝子の機能解析や発現制御は、環境ストレス抵抗性が強化された植物の作出を図る上で重要である。   On the other hand, the vascular system is also important from the viewpoint of plant pathology. That is, phytopathogenic bacteria (such as rice white leaf blight fungus, solanaceae plant blight fungus, tomato scab fungus, etc.) enter the vascular system after invading through the leaves and root wounds of the plant and proliferate in the conduit. Causes disease and eventually kills the plant. In addition, plant growth is significantly affected by environmental stresses such as dryness, high salt concentration, and low temperature. Environmental stress causes various biochemical and physiological responses to plants. Plants acquire responsiveness and adaptability to environmental stresses in order to survive under these environmental stress conditions. Genes that are expressed in vascular bundles such as roots in response to environmental stress are also known, and functional analysis and expression control of such stress-inducible genes are aimed at creating plants with enhanced environmental stress resistance. Is important.

従って、植物における物質輸送・分配の制御、植物における物質輸送・分配機構の解明、有用物質の生産性向上、病害や環境ストレス抵抗性の付与、植物の生長制御等のために、維管束に特異的発現をもたらすプロモーターの新規開発・実用化が強く望まれている。   Therefore, it is specific to the vascular bundle to control the transport and distribution of substances in plants, elucidate the mechanism of transport and distribution of substances in plants, improve the productivity of useful substances, impart disease and environmental stress resistance, and control the growth of plants. Development and practical application of promoters that bring about specific expression are strongly desired.

特表2002-528125号Special table 2002-528125 国際公開WO00/58454International Publication WO00 / 58454 特表平06-504910号Special table hei 06-504910 国際公開WO99/43818International publication WO99 / 43818 特開2003-265182号JP2003-265182 Plant Physiol. 102, 991-1000 (1993)Plant Physiol. 102, 991-1000 (1993) Plant Mol. Biol. 30, 1207-1221 (1996)Plant Mol. Biol. 30, 1207-1221 (1996) Plant J. 4, 357-366 (1993)Plant J. 4, 357-366 (1993)

従って、本発明の目的は、目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNA、該DNAを含有する遺伝子を維管束で特異的に発現させることを可能にした組換えプラスミド、該組換えベクターを導入した形質転換植物体を提供することを目的とする。   Accordingly, an object of the present invention is to provide a DNA having promoter activity for specifically expressing a target gene in a vascular bundle, a recombinant plasmid that enables a gene containing the DNA to be specifically expressed in a vascular bundle, It aims at providing the transformed plant body which introduce | transduced the recombinant vector.

本発明者らは、上記課題を解決すべく、イネゲノム配列情報、イネESTの出現頻度情報、イネ完全長cDNA配列情報等(http://www.dna.affrc.go.jp/)を参考にしつつ鋭意研究を重ねた結果、種々の組織に特異的な発現パターンを有すると期待されるイネ遺伝子を約100種選定し、選定された各遺伝子の5’上流域をポリメラーゼ連鎖反応(PCR)で増幅した断片の中から、維管束において特異的に目的タンパク質を発現させるプロモーター活性を有するDNA断片を得ることに成功し、本発明を完成させるに至った。   In order to solve the above problems, the present inventors refer to rice genome sequence information, rice EST appearance frequency information, rice full-length cDNA sequence information, etc. (http://www.dna.affrc.go.jp/). As a result of extensive research, we selected about 100 rice genes that are expected to have expression patterns specific to various tissues, and polymerase chain reaction (PCR) was performed on the 5 'upstream region of each selected gene. From the amplified fragments, the present inventors have succeeded in obtaining a DNA fragment having a promoter activity that specifically expresses the target protein in the vascular bundle, thereby completing the present invention.

即ち、本発明は以下の発明を包含する。
(1) 以下の(a)、(b)又は(c)に示す、プロモーターとして機能しうるDNA。
(a)配列表の配列番号1に示す塩基配列からなるDNA
(b)配列表の配列番号1に示す塩基配列において、1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列からなり、かつ目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNA
(c)配列表の配列番号1に示す塩基配列の一部の塩基配列からなり、かつ目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNA
(2) (1)に記載のDNAと相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNA。
(3) (1)又は(2)に記載のDNAを含有する組換えベクター。
(4) (1)又は(2)に記載のDNAと目的タンパク質をコードする遺伝子を含有する組換えベクター。
(5) (3)又は(4)に記載の組換えベクターを導入した形質転換植物体。
That is, the present invention includes the following inventions.
(1) DNA which can function as a promoter, as shown in the following (a), (b) or (c).
(A) DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing
(B) a promoter activity consisting of a base sequence in which one or several bases are deleted, substituted or added in the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing and specifically expressing the target gene in the vascular bundle; DNA
(C) DNA comprising a part of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing and having a promoter activity for specifically expressing the target gene in the vascular bundle
(2) A DNA having a promoter activity that hybridizes with a DNA comprising a base sequence complementary to the DNA according to (1) under stringent conditions and specifically expresses a target gene in a vascular bundle.
(3) A recombinant vector containing the DNA according to (1) or (2).
(4) A recombinant vector containing the DNA according to (1) or (2) and a gene encoding a target protein.
(5) A transformed plant into which the recombinant vector according to (3) or (4) has been introduced.

本発明によれば、目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNAが提供される。このプロモーター活性を有するDNAを利用すれば、維管束における水、栄養塩、糖の輸送(転流)や吸収の制御、光合成産物の貯蔵器官である果実や塊茎、塊根、種子などの肥大(成長)の促進、環境ストレス抵抗性遺伝子の発現による環境ストレス抵抗性の付与・向上、耐病虫害性遺伝子の発現による耐病虫害性の付与・向上などが可能となる。   According to the present invention, DNA having a promoter activity that specifically expresses a target gene in a vascular bundle is provided. By using DNA with this promoter activity, control of transport (translocation) and absorption of water, nutrients, and sugars in the vascular bundle, and enlargement (growth) of fruits, tubers, tuberous roots, seeds, etc., which are storage organs for photosynthetic products ), Imparting and improving environmental stress resistance by expressing an environmental stress resistance gene, and imparting and improving disease resistance by expressing a disease resistant insect gene.

1.プロモーター及びその単離
本発明に係るプロモーターとして機能しうるDNA(以下、「プロモーター」という)は、配列番号1に示す塩基配列からなるDNAである。
1. Promoter and Isolation thereof DNA capable of functioning as a promoter according to the present invention (hereinafter referred to as “promoter”) is a DNA comprising the base sequence shown in SEQ ID NO: 1.

本発明のDNAは、目的タンパク質をコードする遺伝子(以下、「目的遺伝子」という)の翻訳開始点の5’側に挿入することにより、該目的遺伝子の維管束における発現を誘導し、又は該目的遺伝子を維管束において高レベルで発現させることができる。   The DNA of the present invention induces the expression of the target gene in the vascular bundle by inserting it on the 5 ′ side of the translation start point of the gene encoding the target protein (hereinafter referred to as “target gene”), or The gene can be expressed at high levels in the vascular bundle.

また、本発明のDNAには、配列番号1に示す塩基配列において1以上の塩基が置換、欠失、付加又は挿入された塩基配列からなり、かつ目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNAも含まれる。ここで、置換、欠失、付加又は挿入されてもよい塩基の数は特に限定されないが、好ましくは1個〜数個である。例えば、配列番号1に示す塩基配列の1〜10個、好ましくは1〜5個の塩基が欠失してもよく、配列番号1に示す塩基配列に1〜10個、好ましくは1〜5個の塩基が付加してもよく、あるいは、配列番号1に示す塩基配列の1〜10個、好ましくは1〜5個の塩基が他の塩基に置換してもよい。   In addition, the DNA of the present invention comprises a promoter comprising a nucleotide sequence in which one or more bases are substituted, deleted, added or inserted in the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1, and which specifically expresses a target gene in a vascular bundle Active DNA is also included. Here, the number of bases that may be substituted, deleted, added or inserted is not particularly limited, but is preferably 1 to several. For example, 1 to 10, preferably 1 to 5 bases of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1 may be deleted, and 1 to 10, preferably 1 to 5 nucleotide sequences shown in SEQ ID NO: 1. May be added, or 1 to 10, preferably 1 to 5 bases of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 may be substituted with other bases.

さらに、本発明のDNAには、配列番号1に示す塩基配列の一部の塩基配列からなり、かつ目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性を有するDNAも含まれる。
配列番号1に示す塩基配列からなるDNAにおけるプロモーター活性に必須な部分は、該DNAの様々な欠失体、例えば、5’上流側から様々な長さに欠損させたDNA断片をベータグルクロニダーゼ(GUS)遺伝子等のリポーター遺伝子を融合させたプラスミドを宿主に導入し、プロモーター活性を測定することによって特定でき、そのような活性部分の特定のための手法は、当業者には公知である。
Furthermore, the DNA of the present invention includes a DNA consisting of a part of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 and having a promoter activity for specifically expressing the target gene in the vascular bundle.
The essential part of the promoter activity in the DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 is a variety of deletions of the DNA, for example, DNA fragments deficient in various lengths from the 5 ′ upstream side to beta-glucuronidase (GUS ) It can be identified by introducing a plasmid fused with a reporter gene such as a gene into a host and measuring the promoter activity. Techniques for identifying such an active moiety are known to those skilled in the art.

このような変異体DNAは、目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター活性(以下、「維管束特異的プロモーター活性」という)を有していればよく、その活性の大きさは特に限定されないが、配列番号1に示す塩基配列からなるDNAの維管束特異的プロモーター活性を実質的に保持することが好ましい。「配列番号1に示す塩基配列からなるDNAの維管束特異的プロモーター活性を実質的に保持する」とは、該プロモーター活性を利用した実際の使用態様において、配列番号1に示す塩基配列からなるDNAと、同一の条件でほぼ同様の利用が可能な程度の活性が維持されていることをいう。   Such a mutant DNA only needs to have a promoter activity for specifically expressing the target gene in the vascular bundle (hereinafter referred to as "vascular bundle-specific promoter activity"), and the magnitude of the activity is particularly limited. However, it is preferable that the vascular bundle-specific promoter activity of the DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 is substantially retained. “Substantially retains the vascular-specific promoter activity of DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1” means that the DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the actual usage mode using the promoter activity. And that the activity is maintained to the extent that the same use is possible under the same conditions.

本発明において「維管束特異的プロモーター活性」とは、維管束において、同じ植物体の他の組織又は器官の少なくとも1種におけるよりも目的遺伝子を優先的かつ高度に発現させる活性をいう。
また、上記「維管束」とは、一般的には、根、茎、葉を貫通する植物体の連続した構造をいい、本発明の「維管束」には、根などの植物体地下部組織の維管束系、茎や葉脈などの地上部組織(シュート)の維管束系の両方が含まれる。
In the present invention, “vascular bundle-specific promoter activity” refers to an activity that preferentially and highly expresses a target gene in a vascular bundle over at least one other tissue or organ of the same plant.
The “vascular bundle” generally refers to a continuous structure of a plant that penetrates roots, stems, and leaves, and the “vascular bundle” of the present invention includes a plant subsurface tissue such as a root. Vascular system, and vascular system of terrestrial tissues (shoots) such as stems and veins are included.

上記のような変異体DNAを取得するための遺伝子変異導入は、Kunkel法又は Gapped duplex法等の公知手法又はこれに準ずる方法によって行うことができ、例えば部位特異的突然変異誘発法を利用した変異導入用キット(例えばMutant-K(TAKARA社製)やMutant-G(TAKARA社製))、TAKARA社のLA PCR in vitro Mutagenesis シリーズキットを利用することができる。   The introduction of gene mutation for obtaining mutant DNA as described above can be carried out by a known technique such as the Kunkel method or the Gapped duplex method or a method analogous thereto, for example, mutation using site-directed mutagenesis. Kits for introduction (for example, Mutant-K (manufactured by TAKARA) or Mutant-G (manufactured by TAKARA)) and LA PCR in vitro Mutagenesis series kits by TAKARA can be used.

さらに、当業者であれば、配列番号1に示す塩基配列の全部又は一部からなるDNAを用いて、配列番号1に示す塩基配列からなるDNAと同様の機能、すなわち、維管束特異的プロモーター活性を有する他の塩基配列からなるDNAを種々の生物から新たに取得し、利用することも容易である。このような他の塩基配列からなるDNAの取得は、例えば、配列番号1に示す塩基配列の全部又は一部からなるDNAと相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズさせるハイブリダイゼーション、該塩基配列の一部をプライマーとして用いるPCR等によって行うことができる。ここで、ストリンジェントな条件とは、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。例えば、相同性が高い核酸、すなわち配列番号1に示す塩基配列と90%以上、好ましくは95%以上の相同性を有する塩基配列からなるDNAの相補鎖がハイブリダイズし、それより相同性が低い核酸の相補鎖がハイブリダイズしない条件が挙げられる。より具体的には、ナトリウム濃度が10〜300mM、好ましくは15〜75mMであり、温度が25℃〜70℃、好ましくは42℃〜55℃での条件をいう。   Furthermore, those skilled in the art can use the DNA consisting of all or part of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 and use the same function as the DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1, ie, vascular-specific promoter activity. It is also easy to newly obtain and use DNA consisting of other base sequences having For obtaining such a DNA consisting of another base sequence, for example, it is hybridized under stringent conditions with a DNA consisting of a base sequence complementary to the DNA consisting of all or part of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1. It can be performed by hybridization, PCR using a part of the base sequence as a primer, or the like. Here, stringent conditions refer to conditions under which so-called specific hybrids are formed and non-specific hybrids are not formed. For example, a highly homologous nucleic acid, that is, a complementary strand of DNA consisting of a nucleotide sequence having a homology of 90% or more, preferably 95% or more, with the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1 hybridizes and has a lower homology. A condition in which the complementary strand of the nucleic acid does not hybridize is mentioned. More specifically, the sodium concentration is 10 to 300 mM, preferably 15 to 75 mM, and the temperature is 25 ° C to 70 ° C, preferably 42 ° C to 55 ° C.

上記のように取得した変異体DNAやハイブリダイゼーションにより得られるホモログがプロモーターとしての活性を有するか否かは、種々のレポーター遺伝子、例えばベータグルクロニダーゼ(GUS)、ルシフェラーゼ(LUC)、Green fluorescent protein(GFP)、
クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)、ベータガラクトシダーゼ(LacZ)、ノパリン合成酵素(NOS)、オクトピン合成酵素(OCS)等の遺伝子を上記プロモーターの下流域に連結したベクターを作製し、該ベクターを用いて従来から周知慣用されている種々の形質転換法(後述)により植物細胞のゲノムに挿入した後、該レポーター遺伝子の発現を測定することにより確認できる。
Whether the mutant DNA obtained as described above or the homolog obtained by hybridization has activity as a promoter depends on various reporter genes such as beta glucuronidase (GUS), luciferase (LUC), green fluorescent protein (GFP ),
A vector in which genes such as chloramphenicol acetyltransferase (CAT), beta galactosidase (LacZ), nopaline synthase (NOS), octopine synthase (OCS), etc. are linked to the downstream region of the above promoter is prepared, It can be confirmed by measuring the expression of the reporter gene after insertion into the genome of a plant cell by various transformation methods (to be described later) that have been well known and conventionally used.

例えば、レポーター遺伝子がGUSの場合には、宿主細胞内でのプロモーター活性は、(i)ヒストケミカルなGUS染色による方法(EMBO J. 6, 3901-3907 (1987))により、及び/又は(ii)蛍光基質を用いるCastle&Morrisの方法(Plant Molecular Biology Manual, B5, 1-16 (1994); S.B.Gelvin & R.A.Schilperoort, Kluwer Academic Publishers)に従ってGUS活性を測定し、さらにBradfordの方法(Anal. Biochem. 72, 248-254(1976))に従ってタンパク質量を測定して、GUS活性をタンパク量当たりに換算する(nmole 4-MU/min/mg proteinとして算出する)ことにより、それぞれ確認することができる。   For example, when the reporter gene is GUS, the promoter activity in the host cell is determined by (i) a method by histochemical GUS staining (EMBO J. 6, 3901-3907 (1987)) and / or (ii) ) GUS activity was measured according to the Castle & Morris method (Plant Molecular Biology Manual, B5, 1-16 (1994); SBGelvin & RASchilperoort, Kluwer Academic Publishers) using a fluorescent substrate, and Bradford's method (Anal. Biochem. 72). , 248-254 (1976)), and the GUS activity can be confirmed by converting the GUS activity per protein amount (calculated as nmole 4-MU / min / mg protein).

本発明のプロモーターは、イネ(日本晴)の第1番染色体ゲノムに存在し、配列番号3に示すアミノ酸配列を有するMYB様転写因子をコードするイネ遺伝子〔DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp):アクセッション番号AP003452〕の塩基配列(配列番号2)に基づき、該遺伝子(以下、本明細書において「イネMYB遺伝子」という)の5’上流ゲノム領域(あるいは配列)を単離することによって取得できる。プロモーター領域を単離する方法としては、特に限定されないが、例えば、インバースPCR、ゲノムDNAライブラリーから単離する方法等を例示することができる。   The promoter of the present invention is a rice gene [DDBJ (http: //www.ddbj.nig) encoding a MYB-like transcription factor having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 that is present in the chromosome 1 genome of rice (Nipponbare). .ac.jp): accession number AP003452] based on the base sequence (SEQ ID NO: 2), the 5 ′ upstream genomic region (or sequence) of the gene (hereinafter referred to as “rice MYB gene” in the present specification) It can be obtained by releasing. The method for isolating the promoter region is not particularly limited, and examples thereof include inverse PCR, a method for isolating from a genomic DNA library, and the like.

インバースPCRによる場合は、上記のイネMYB遺伝子の塩基配列情報に基づいて一対のプライマーを合成し、これら一対のプライマーと所定の制限酵素で処理した後にセルフライゲーションさせたゲノムDNA断片とを用いてPCRを行うことによって、イネMYB遺伝子の上流領域を増幅することができる。その後、イネMYB遺伝子の上流領域をクローニングし塩基配列を決定することによって、イネMYB遺伝子のプロモーター領域の単離、及び塩基配列(配列番号1)の決定を行うことができる。   In the case of inverse PCR, a pair of primers is synthesized based on the above-mentioned rice MYB gene base sequence information, PCR is performed using these paired primers and genomic DNA fragments that have been treated with a predetermined restriction enzyme and then self-ligated. Can be used to amplify the upstream region of the rice MYB gene. Thereafter, by cloning the upstream region of the rice MYB gene and determining the base sequence, the promoter region of the rice MYB gene can be isolated and the base sequence (SEQ ID NO: 1) can be determined.

また、ゲノムDNAライブラリーから単離する場合には、イネMYB遺伝子を含むcDNAをプローブとして、定法に従って調製したゲノムDNAライブラリーからイネMYB遺伝子を含むゲノムDNAをスクリーニングする。その後、スクリーニングしたゲノムDNAの塩基配列を決定することによってイネMYB遺伝子の上流領域に存在するプロモーター領域を特定することができ、さらに、該プロモーター領域のみをPCR等によって増幅してクローニングすることによって単離することができる。   In the case of isolation from a genomic DNA library, genomic DNA containing rice MYB gene is screened from a genomic DNA library prepared according to a conventional method using cDNA containing rice MYB gene as a probe. Thereafter, by determining the base sequence of the screened genomic DNA, the promoter region existing in the upstream region of the rice MYB gene can be identified. Further, only the promoter region is amplified by PCR or the like and cloned. Can be separated.

いったん本発明のプロモーターの塩基配列が確定されると、その後は化学合成によって、あるいはその塩基配列の一部からなるDNAをプライマーとして合成し、イネの全DNAを鋳型として用いて、該プライマーを用いるPCRによって容易に得ることができる。   Once the base sequence of the promoter of the present invention has been determined, the subsequent synthesis is carried out by chemical synthesis or by using a DNA consisting of a part of the base sequence as a primer, and using the rice total DNA as a template. It can be easily obtained by PCR.

さらに、単離したプロモーター領域(配列番号1)の一部を用いてプロモーター活性を測定することによって、単離したプロモーター領域(配列番号1)において、プロモーター活性に寄与している領域を特定することができる。プロモーター領域の一部は、該プロモーター領域の一部をPCRによって増幅する方法、プロモーター領域を所定の制限酵素で処理して断片化する方法等を適宜使用して得ることができる。   Further, by measuring the promoter activity using a part of the isolated promoter region (SEQ ID NO: 1), the region contributing to the promoter activity in the isolated promoter region (SEQ ID NO: 1) is specified. Can do. A part of the promoter region can be obtained by appropriately using a method in which a part of the promoter region is amplified by PCR, a method in which the promoter region is treated with a predetermined restriction enzyme, and fragmented.

得られたプロモーター領域の一部は、発現量を定量できる遺伝子の上流に組み込み、該遺伝子の発現量を定量することによってプロモーター活性を測定することができる。すなわち、得られたプロモーター領域の一部及び所定の遺伝子を組み込んでなる組換えベクターを構築し、該組換えベクターを用いて形質転換した細胞における該遺伝子の発現量を定量することによって、得られたプロモーター領域の一部におけるプロモーター活性を測定することができる。   A part of the obtained promoter region can be incorporated upstream of a gene whose expression level can be quantified, and the promoter activity can be measured by quantifying the expression level of the gene. That is, it can be obtained by constructing a recombinant vector incorporating a part of the obtained promoter region and a predetermined gene, and quantifying the expression level of the gene in cells transformed with the recombinant vector. Promoter activity in a part of the promoter region can be measured.

2. 組換えベクター
本発明の組換えベクターは、上記1.のプロモーターに目的遺伝子を連結した遺伝子を適当なベクターに導入することにより構築することができる。ここで、ベクターとしては、アグロバクテリウムを介して植物に目的遺伝子を導入することができる、pBI系、pPZP系(Hajdukiewicz P, Svab Z, Maliga P.: The small, versatile pPZP family of Agrobacterium binary vectors for plant transformation., Plant Mol Biol., 25: 989-94, 1994)、pCAMBIA系(http://www.cambia.org/main/r_et_camvec.htm)、pSMA系のベクターなどが好適に用いられる。特にpBI系のバイナリーベクター又は中間ベクター系が好適に用いられ、例えば、pBI121、pBI101、pBI101.2、pBI101.3等が挙げられる。バイナリーベクターとは大腸菌(Escherichia coli)及びアグロバクテリウムにおいて複製可能なシャトルベクターで、バイナリーベクターを保持するアグロバクテリムを植物に感染させると、ベクター上にあるLB配列とRB配列より成るボーダー配列で囲まれた部分のDNAを植物核DNAに組み込むことが可能である(EMBO Journal, 10(3), 697-704 (1991))。一方、pUC系のベクターは、植物に遺伝子を直接導入することができ、例えば、pUC18、pUC19、pUC9等が挙げられる。また、カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)、インゲンマメモザイクウイルス(BGMV)、タバコモザイクウイルス(TMV)等の植物ウイルスベクターも用いることができる。
2. Recombinant vector The recombinant vector of the present invention comprises the above-mentioned 1. The gene can be constructed by introducing a gene in which the target gene is linked to the above promoter into an appropriate vector. Here, as a vector, a target gene can be introduced into a plant via Agrobacterium, pBI system, pPZP system (Hajdukiewicz P, Svab Z, Maliga P .: The small, versatile pPZP family of Agrobacterium binary vectors for plant transformation., Plant Mol Biol., 25: 989-94, 1994), pCAMBIA (http://www.cambia.org/main/r_et_camvec.htm), pSMA vectors, and the like are preferably used. In particular, pBI binary vectors or intermediate vector systems are preferably used, and examples thereof include pBI121, pBI101, pBI101.2, pBI101.3 and the like. A binary vector is a shuttle vector that can replicate in Escherichia coli and Agrobacterium. When a plant is infected with Agrobacterium that holds the binary vector, it is a border sequence consisting of LB and RB sequences on the vector. It is possible to incorporate the enclosed DNA into plant nuclear DNA (EMBO Journal, 10 (3), 697-704 (1991)). On the other hand, a pUC vector can directly introduce a gene into a plant, and examples thereof include pUC18, pUC19, and pUC9. Plant virus vectors such as cauliflower mosaic virus (CaMV), kidney bean mosaic virus (BGMV), and tobacco mosaic virus (TMV) can also be used.

ベクターに目的遺伝子を挿入するには、まず、精製されたDNAを適当な制限酵素で切断し、適当なベクター DNAの制限酵素部位又はマルチクローニングサイトに挿入してベクターに連結する方法などが採用される。   In order to insert a target gene into a vector, first, a method in which the purified DNA is cleaved with an appropriate restriction enzyme, inserted into an appropriate vector DNA restriction enzyme site or a multicloning site, and then ligated to the vector is employed. The

目的遺伝子としては、対象となる植物における内因性遺伝子、または外来遺伝子であって、その遺伝子産物の発現が維管束において所望される任意の遺伝子をいう。かかる遺伝子としては、糖、窒素源、イオンなどのトランスポーター遺伝子、有用物質(医薬、色素、芳香成分など)生産遺伝子、植物生長制御(促進/抑制)遺伝子、糖代謝関連遺伝子、耐病虫害性〔昆虫食害抵抗性、カビ(菌類)及び細菌病抵抗性、ウイルス(病)抵抗性など〕遺伝子、環境ストレス(低温、高温、乾燥、塩、光障害、紫外線)抵抗性遺伝子等が挙げられるが、これらに限定はされない。   The target gene refers to any gene that is an endogenous gene in a target plant or a foreign gene, and expression of the gene product is desired in the vascular bundle. Such genes include transporter genes such as sugars, nitrogen sources and ions, useful substance (pharmaceuticals, pigments, aromatic components, etc.) production genes, plant growth control (promotion / suppression) genes, sugar metabolism-related genes, pest resistance [ Insect food damage resistance, mold (fungi) and bacterial disease resistance, virus (disease) resistance, etc.) genes, environmental stress (low temperature, high temperature, dryness, salt, light damage, ultraviolet light) resistance genes, etc. These are not limited.

上記の目的遺伝子は、その遺伝子の機能が発揮されるようにベクターに組み込まれることが必要である。そこで、ベクターには、目的遺伝子の上流、内部、あるいは下流に、本発明のプロモーター、エンハンサー、イントロン、ポリA付加シグナル、5'-UTR配列、選抜マーカー遺伝子などを連結することができる。   The target gene described above needs to be incorporated into a vector so that the function of the gene is exhibited. Therefore, the promoter, enhancer, intron, poly A addition signal, 5′-UTR sequence, selectable marker gene and the like of the present invention can be linked to the vector upstream, inside, or downstream of the target gene.

エンハンサーとしては、例えば、目的遺伝子の発現効率を高めるために用いられ、CaMV35Sプロモーター内の上流側の配列を含むエンハンサー領域などが挙げられる。   Examples of the enhancer include an enhancer region that is used to increase the expression efficiency of the target gene and includes an upstream sequence in the CaMV35S promoter.

ターミネーターとしては、前記プロモーターにより転写された遺伝子の転写を終結できる配列であればよく、例えば、ノパリン合成酵素(NOS)遺伝子のターミネーター、オクトピン合成酵素(OCS)遺伝子のターミネーター、CaMV 35S ターミネーター等が挙げられる。   The terminator may be any sequence that can terminate transcription of the gene transcribed by the promoter, and examples thereof include nopaline synthase (NOS) gene terminator, octopine synthase (OCS) gene terminator, CaMV 35S terminator and the like. It is done.

選抜マーカー遺伝子としては、例えば、ハイグロマイシン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、ビアラホス耐性遺伝子、ブラストサイジンS耐性遺伝子、アセト乳酸合成酵素(Acetolactate synthase)遺伝子などが挙げられる。
また、選抜マーカー遺伝子は、上記のように目的遺伝子とともに同一のプラスミドに連結させて組換えベクターを調製してもよいが、あるいは、選抜マーカー遺伝子をプラスミドに連結して得られる組換えベクターと、目的遺伝子をプラスミドに連結して得られる組換えベクターとを別々に調製してもよい。別々に調製した場合は、各ベクターを宿主にコトランスフェクト(共導入)する。
Examples of the selection marker gene include a hygromycin resistance gene, a kanamycin resistance gene, a bialaphos resistance gene, a blasticidin S resistance gene, an acetolactate synthase gene, and the like.
Alternatively, the selection marker gene may be prepared by ligating the same gene together with the target gene as described above to prepare a recombinant vector, or alternatively, a recombinant vector obtained by linking the selection marker gene to a plasmid, A recombinant vector obtained by ligating the target gene to a plasmid may be prepared separately. When prepared separately, each vector is co-transfected (co-introduced) into the host.

3.形質転換植物体
上記2.で調製した組換えベクターを用いて、対象植物を形質転換し、形質転換植物体を調製することができる。
形質転換植物体を調製する際には、既に報告され、確立されている種々の方法を適宜利用することができ、その好ましい例として、アグロバクテリウム法、PEG−リン酸カルシウム法、エレクトロポレーション法、リポソーム法、パーティクルガン法、マイクロインジェクション法等が挙げられる。アグロバクテリウム法を用いる場合は、プロトプラストを用いる場合、組織片を用いる場合、及び植物体そのものを用いる場合(in planta法)がある。プロトプラストを用いる場合は、Tiプラスミドをもつアグロバクテリウムと共存培養する方法、スフェロプラスト化したアグロバクテリウムと融合する方法(スフェロプラスト法)、組織片を用いる場合は、対象植物の無菌培養葉片(リーフディスク)に感染させる方法やカルスに感染させる等により行うことができる。また種子あるいは植物体を用いるin planta法を適用する場合、すなわち植物ホルモン添加の組織培養を介さない系では、吸水種子、幼植物(幼苗)、鉢植え植物などへのアグロバクテリウムの直接処理等にて実施可能である。
3. Transformed plant body 2. Using the recombinant vector prepared in Step 1, a target plant can be transformed to prepare a transformed plant body.
In preparing a transformed plant body, various methods already reported and established can be used as appropriate. Preferred examples thereof include the Agrobacterium method, the PEG-calcium phosphate method, the electroporation method, Examples include the liposome method, particle gun method, and microinjection method. When the Agrobacterium method is used, there are a case where a protoplast is used, a case where a tissue piece is used, and a case where a plant body itself is used (in planta method). When using protoplasts, co-culture with Agrobacterium with Ti plasmid, fusing with spheroplasted Agrobacterium (spheroplast method), and when using tissue fragments, aseptic culture of the target plant It can be performed by infecting leaf pieces (leaf discs) or infecting callus. In addition, when the in planta method using seeds or plants is applied, that is, in systems that do not involve tissue culture with the addition of plant hormones, for direct treatment of Agrobacterium to water-absorbing seeds, seedlings (plant seedlings), potted plants, etc. Can be implemented.

遺伝子が植物体に組み込まれたか否かの確認は、PCR法、サザンハイブリダイゼーション法、ノーザンハイブリダイゼーション法、ウェスタンブロッティング法等により行うことができる。例えば、形質転換植物体からDNAを調製し、DNA特異的プライマーを設計してPCRを行う。PCRを行った後は、増幅産物についてアガロースゲル電気泳動、ポリアクリルアミドゲル電気泳動又はキャピラリー電気泳動等を行い、臭化エチジウム、SYBR Green液等により染色し、そして増幅産物を1本のバンドとして検出することにより、形質転換されたことを確認することができる。また、予め蛍光色素等により標識したプライマーを用いてPCRを行い、増幅産物を検出することもできる。さらに、マイクロプレート等の固相に増幅産物を結合させ、蛍光又は酵素反応等により増幅産物を確認する方法でもよい。   Whether or not a gene has been incorporated into a plant can be confirmed by PCR, Southern hybridization, Northern hybridization, Western blotting, or the like. For example, DNA is prepared from a transformed plant, PCR is performed by designing a DNA-specific primer. After PCR, the amplified product is subjected to agarose gel electrophoresis, polyacrylamide gel electrophoresis, capillary electrophoresis, etc., stained with ethidium bromide, SYBR Green solution, etc., and the amplified product is detected as a single band. By doing so, it can confirm that it transformed. Moreover, PCR can be performed using a primer previously labeled with a fluorescent dye or the like to detect an amplification product. Furthermore, the amplification product may be bound to a solid phase such as a microplate, and the amplification product may be confirmed by fluorescence or enzymatic reaction.

本発明において形質転換に用いられる植物としては、イネ、ムギ、トウモロコシ、ネギ、ユリ、ラン等の単子葉植物、ダイズ、ナタネ、トマト、バレイショ、キク、バラ、カーネーション、ペチュニア、カスミソウ、シクラメン等の双子葉植物などの植物が挙げられ、特に限定はされない。好ましくは、本発明のDNAが単離されたイネ科の植物、例えば、イネ、オオムギ、コムギ、トウモロコシ、サトウキビ、シバ、ソルガム、アワ、及びヒエなどの植物が挙げられる。   Plants used for transformation in the present invention include monocotyledonous plants such as rice, wheat, corn, leek, lily, orchid, soybean, rapeseed, tomato, potato, chrysanthemum, rose, carnation, petunia, gypsophila, cyclamen and the like. Plants such as dicotyledonous plants can be mentioned, and are not particularly limited. Preferably, plants of the family Gramineae from which the DNA of the present invention has been isolated, for example, plants such as rice, barley, wheat, corn, sugarcane, buckwheat, sorghum, millet and millet.

本発明において、形質転換の対象とする植物材料としては、例えば、根、茎、葉、種子、胚、胚珠、子房、茎頂(植物の芽の先端の生長点)、葯、花粉等の植物組織やその切片、未分化のカルス、それを酵素処置して細胞壁を除いたプロプラスト等の植物培養細胞が挙げられる。またin planta法適用の場合、吸水種子や植物体全体を利用し得る。   In the present invention, examples of plant materials to be transformed include roots, stems, leaves, seeds, embryos, ovules, ovaries, shoot tips (growth points at the tips of plant buds), buds, pollen and the like. Examples thereof include plant tissue cells and slices thereof, undifferentiated callus, and plant cultured cells such as proplasts obtained by removing the cell wall by enzyme treatment. In the case of applying the in planta method, water-absorbing seeds or the entire plant body can be used.

また、本発明において形質転換植物体とは、植物体全体、植物器官(例えば根、茎、葉、花弁、種子、種子、実等)、植物組織(例えば表皮、師部、柔組織、木部、維管束等)、植物培養細胞のいずれをも意味するものである。   In the present invention, the transformed plant body means the whole plant body, plant organ (eg, root, stem, leaf, petal, seed, seed, fruit, etc.), plant tissue (eg, epidermis, phloem, soft tissue, xylem). And vascular bundles) and plant cultured cells.

植物培養細胞を対象とする場合において、得られた形質転換細胞から形質転換体を再生させるためには既知の組織培養法により器官又は個体を再生させればよい。このような操作は、植物細胞から植物体への再生方法として一般的に知られている方法により、当業者であれば容易に行うことができる。植物細胞から植物体への再生については、例えば、以下のように行うことができる。   When plant cultured cells are targeted, in order to regenerate a transformant from the obtained transformed cells, an organ or an individual may be regenerated by a known tissue culture method. Such an operation can be easily performed by those skilled in the art by a method generally known as a method for regenerating plant cells from plant cells. Regeneration from plant cells to plants can be performed, for example, as follows.

まず、形質転換の対象とする植物材料して植物組織又はプロトプラストを用いた場合、これらを無機要素、ビタミン、炭素源、エネルギー源としての糖類、植物生長調節物質(オーキシン、サイトカイニン等の植物ホルモン)等を加えて滅菌したカルス形成用培地中で培養し、不定形に増殖する脱分化したカルスを形成させる(以下「カルス誘導」という)。このように形成されたカルスをオーキシン等の植物生長調節物質を含む新しい培地に移しかえて更に増殖(継代培養)させる。   First, when plant materials or protoplasts are used as plant materials to be transformed, these are inorganic elements, vitamins, carbon sources, sugars as energy sources, plant growth regulators (plant hormones such as auxin and cytokinin) And so on, and cultured in a sterilized callus formation medium to form dedifferentiated callus that grows irregularly (hereinafter referred to as “callus induction”). The callus thus formed is transferred to a new medium containing a plant growth regulator such as auxin, and further grown (subcultured).

カルス誘導は寒天等の固型培地で行い、継代培養は例えば液体培養で行うと、それぞれの培養を効率良くかつ大量に行うことができる。次に、上記の継代培養により増殖したカルスを適当な条件下で培養することにより器官の再分化を誘導し(以下、「再分化誘導」という)、最終的に完全な植物体を再生させる。再分化誘導は、培地におけるオーキシンやサイトカイニン等の植物生長調節物質、炭素源等の各種成分の種類や量、光、温度等を適切に設定することにより行うことができる。かかる再分化誘導により、不定胚、不定根、不定芽、不定茎葉等が形成され、更に完全な植物体へと育成させる。あるいは、完全な植物体になる前の状態(例えばカプセル化された人工種子、乾燥胚、凍結乾燥細胞及び組織等)で貯蔵等を行ってもよい。   When callus induction is performed in a solid medium such as agar and subculture is performed in, for example, liquid culture, each culture can be performed efficiently and in large quantities. Next, callus grown by the above subculture is cultured under appropriate conditions to induce organ redifferentiation (hereinafter referred to as “redifferentiation induction”), and finally regenerates a complete plant body. . Redifferentiation induction can be performed by appropriately setting the types and amounts of various components such as plant growth regulators such as auxin and cytokinin, carbon sources, and the like, light, temperature and the like in the medium. By such redifferentiation induction, somatic embryos, adventitious roots, adventitious shoots, adventitious foliage, etc. are formed and further grown into complete plants. Alternatively, storage or the like may be performed in a state before becoming a complete plant body (for example, encapsulated artificial seeds, dried embryos, freeze-dried cells and tissues).

本発明の形質転換植物体は、形質転換処理を施した再分化当代である「T1世代」のほか、その植物の種子から得られた後代である「T2世代」、薬剤選抜あるいはサザン法等による解析によりトランスジェニックであることが判明した「T2世代」植物の花を自家受粉して得られる次世代(T3世代)などの後代植物をも含む。   The transformed plant body of the present invention is not only the “T1 generation” which is the regenerated generation after the transformation treatment, but also the “T2 generation” which is a progeny obtained from the seed of the plant, the drug selection or the Southern method, etc. This includes progeny plants such as the next generation (T3 generation) obtained by self-pollination of "T2 generation" plants that have been found to be transgenic by analysis.

以下、実施例によって本発明を更に具体的に説明するが、これらの実施例は本発明を限定するものでない。   EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples, but these examples do not limit the present invention.

(実施例1) イネMYB遺伝子プロモーター配列の単離及び形質転換用ベクターへの導入
(1)プロモーターの単離
配列番号2に示す塩基配列を有するイネMYB遺伝子(DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp):アクセッション番号AP003452)の5’上流域に位置するプロモーター配列の単離をゲノミックPCR法にて行った。イネ(品種:日本晴)幼植物体の緑葉よりDNeasy Plant Mini Kit(キアゲン社)を使って抽出したゲノムDNAを鋳型とし、DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp:アクセッション番号AP003452)に登録されているイネゲノム配列情報から設計されたプライマーMYB-5[5’- TGCAAGCTTCTGACCATGATTTAGTACAG -3’(下線部はHindIII制限酵素認識部位):配列番号4]とMYB-3 [5’- ATGCCCATGGCGCCGGCCTCGTACCAAT -3’(下線部は、NcoI制限酵素認識部位):配列番号5]をプライマーとして用い、PCRを行った。MYB遺伝子のゲノム配列の情報から予測される翻訳開始コドンATGのAの位置を+1、ひとつ前の塩基の位置を-1とすると、プライマーは、MYB遺伝子の-2143位から-3位に位置する2141塩基対[配列番号1において7位(1-6位はHindIII認識配列)の塩基から2147位(2148-2153位はNcoI認識配列)までの塩基に対応]の配列を増幅するように設計した。また、プライマーは増幅断片のクローニングを容易にするため、増幅断片の5’末端(MYB-5)及び3’末端(MYB-3)に、それぞれ唯一のHindIII及びNcoI制限酵素認識部位を導入した。
Example 1 Isolation of rice MYB gene promoter sequence and introduction into transformation vector (1) Isolation of promoter
Genomic isolation of a promoter sequence located in the 5 'upstream region of the rice MYB gene (DDBJ (http://www.ddbj.nig.ac.jp): accession number AP003452) having the base sequence shown in SEQ ID NO: 2 PCR was performed. DDBJ (http://www.ddbj.nig.ac.jp: Accession number) Using genomic DNA extracted from green leaves of rice (variety: Nipponbare) plantlets using DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen) as a template AP003452) Primer MYB-5 [5'-TGC AAGCTT CTGACCATGATTTAGTACAG -3 '(underlined part is HindIII restriction enzyme recognition site) designed from rice genome sequence information: SEQ ID NO: 4] and MYB-3 [5' -PCR was performed using ATGC CCATGG CGCCGGCCTCGTACCAAT-3 '(underlined is the NcoI restriction enzyme recognition site): SEQ ID NO: 5] as a primer. If the position of A in the translation start codon ATG predicted from the genomic sequence information of the MYB gene is +1 and the position of the previous base is -1, the primer is positioned from the -2143 position to the -3 position of the MYB gene. Designed to amplify the sequence of 2141 base pairs [corresponds to the base from position 7 (SEQ ID NO: 1 is HindIII recognition sequence) to base 2147 (position 2148-2153 is NcoI recognition sequence)] did. In addition, in order to facilitate cloning of the amplified fragment, a unique HindIII and NcoI restriction enzyme recognition site was introduced into the 5 ′ end (MYB-5) and 3 ′ end (MYB-3) of the amplified fragment, respectively.

PCR後、増幅断片(約2.1kb)をEx Taqポリメラーゼ(Takara)を用いてdATP存在下で72℃、5分間処理して末端にAを付加し、Promega社のpGEM-T easy vector systemを用いてpGEM-T easyベクターにクローニングした。
クローニング後、インサートの塩基配列を解読し、上記の登録イネゲノム配列情報と同一であることを確認した。配列番号1にその塩基配列を示す。なお、配列番号1の塩基配列において1位〜6位までの塩基配列、2148位〜2153位までの塩基配列がクローニングに用いた制限酵素部位である。
以上のイネ遺伝子プロモーター配列のクローニング手順を図1に示す。
After PCR, the amplified fragment (about 2.1 kb) is treated with Ex Taq polymerase (Takara) in the presence of dATP at 72 ° C for 5 minutes to add A to the end, and using Promega pGEM-T easy vector system And cloned into the pGEM-T easy vector.
After cloning, the base sequence of the insert was decoded and confirmed to be the same as the above registered rice genome sequence information. SEQ ID NO: 1 shows the base sequence. In the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, the nucleotide sequence from position 1 to position 6 and the nucleotide sequence from position 2148 to position 2153 are the restriction enzyme sites used for cloning.
The cloning procedure of the rice gene promoter sequence described above is shown in FIG.

(2)植物形質転換用バイナリーTiプラスミドベクターの構築
上記のプロモーター配列をイネに導入するために、植物形質転換用バイナリーTiプラスミドベクターpSMAHdN627-M2GUSを構築した(図2)。図2に示すように、本バイナリーベクターには、T-DNA上に植物用選抜マーカー遺伝子として、アグロバクテリウムTiプラスミド由来Nos(ノパリン合成酵素遺伝子)プロモーター::大腸菌由来HPT(ハイグロマシン耐性)遺伝子のコード領域::Tiプラスミド由来TiaaM(トリプトファンモノオキシゲナーゼ遺伝子)ターミネーターを配置し、形質転換された植物体がハイグロマイシンB耐性を示すようにした。また、その隣接部位にベータグルクロニダーゼ(GUS)遺伝子のコード領域::Tiプラスミド由来Nosターミネーターから構成されるキメラ遺伝子を配置し、GUS遺伝子の5’上流側にプロモーター配列を挿入できるようにマルチクローニング部位を設けた。また、left border(LB)配列とright border(RB)の配列の外側には、微生物細胞で機能し得るスペクチノマイシン耐性(SpR)遺伝子、大腸菌で機能するpBR322由来(ColE1型)複製開始領域、アグロバクテリウム細胞内においてプラスミドが安定に保持されるための配列Sta、及び複製開始領域Repを設けた。
(2) Construction of Binary Ti Plasmid Vector for Plant Transformation In order to introduce the above promoter sequence into rice, a binary Ti plasmid vector pSMAHdN627-M2GUS for plant transformation was constructed (FIG. 2). As shown in FIG. 2, this binary vector has an Agrobacterium Ti plasmid-derived Nos (nopaline synthase gene) promoter :: E. coli-derived HPT (hygromachine resistance) gene as a plant selection marker gene on T-DNA. The coding region of :: Ti plasmid-derived TiaaM (tryptophan monooxygenase gene) terminator was placed so that the transformed plant body was resistant to hygromycin B. In addition, a chimeric gene composed of a beta glucuronidase (GUS) gene coding region :: Ti plasmid-derived Nos terminator is placed in the adjacent site, and a multicloning site is inserted so that a promoter sequence can be inserted 5 'upstream of the GUS gene. Was provided. Also, outside of the left border (LB) and right border (RB) sequences, a spectinomycin resistance (Sp R ) gene that can function in microbial cells, a pBR322-derived (ColE1 type) replication initiation region that functions in E. coli The sequence Sta for stably maintaining the plasmid in Agrobacterium cells and the replication initiation region Rep were provided.

(3)バイナリーベクターへのプロモーター配列の導入
pGEM-T easyベクターをHindIII及びNcoIで二重消化することにより、イネMYB遺伝子のプロモーター断片を切り出し、(2)で構築したpSMAHdN627-M2GUSベクターの対応する部位にクローニングした。得られたプラスミドをpSMAHdN627-MYBGUSと命名し、バイオラッド社のE. coliパルサーを用いたエレクトロポレーション法(0.2 cmキュベット、パルス条件:2.4kV/cm、25μF、200Ω)により、アグロバクテリウムEHA105系統に導入した。
(3) Introduction of promoter sequence into binary vector
The pGEM-T easy vector was double-digested with HindIII and NcoI to excise the rice MYB gene promoter fragment and cloned into the corresponding site of the pSMAHdN627-M2GUS vector constructed in (2). The resulting plasmid was named pSMAHdN627-MYBGUS, and was electroporated using a Biorad E. coli pulsar (0.2 cm cuvette, pulse conditions: 2.4 kV / cm, 25 μF, 200Ω) by Agrobacterium EHA105 It was introduced into the system.

(実施例2) イネ形質転換
イネの形質転換は超迅速形質転換法(WO 01/06844 A1 (2001)参照)により行った。イネ(品種:日本晴)種子を、70 %エタノール、続いて次亜塩素酸ナトリウムで殺菌し、滅菌蒸留水ですすいで水を切った後、胚が上向きになるようN6D寒天培地〔N6 salts 及びvitamins (Chu C.C., C.S.Wang, C.C.Sun, C. Hsu, K.C. Yin, C.Y. Chu, Establishment of an efficient medium for anther culture of rice through comparative experiments on the nitrogen sources, Sci. Sinica, 18, 659-668 (1975))、30 g/L ショ糖、 0.3 g/L カザミノ酸、2.8 g/L プロリン、2 mg/L 2,4-D, 2 g/L ゲルライト、pH5.7〕に置床し、30℃かつ明条件下で5日間培養した。
(Example 2) Rice transformation Rice was transformed by an ultra-rapid transformation method (see WO 01/06844 A1 (2001)). Rice (variety: Nipponbare) seeds are sterilized with 70% ethanol followed by sodium hypochlorite, rinsed with sterile distilled water, drained, and N6D agar medium [N6 salts and vitamins so that the embryos face up (Chu CC, CSWang, CCSun, C. Hsu, KC Yin, CY Chu, Establishment of an efficient medium for anther culture of rice through comparative experiments on the nitrogen sources, Sci. Sinica, 18, 659-668 (1975)), 30 g / L sucrose, 0.3 g / L casamino acid, 2.8 g / L proline, 2 mg / L 2,4-D, 2 g / L gellite, pH 5.7) at 30 ° C under bright conditions For 5 days.

一方、イネMYB遺伝子プロモーター断片を挿入したプラスミドpSMAHdN627-MYBGUSを保持するアグロバクテリウムEHA105系統を、25 mg/Lクロラムフェニコール、25 mg/Lリファンピシン、及び100 mg/Lスペクチノマイシンを含むLB寒天培地にて28 ℃で3日間培養した。続いて増殖した菌体をミクロスパーテルで少量かきとり、20 mg/Lアセトシリンゴンを含むAAM液体培地 〔Hiei, Y., Ohta, S., Komari, T., Kumashiro, T., Efficient transformation of rice (Oryza sativa L.) mediated by Agrobacterium and sequence analysis of the boundaries of the T-DNA, Plant J., 6, 271-282 (1994)〕に懸濁した。このアグロバクテリウム懸濁液に、N6D培地で5日間培養したイネ発芽種子を浸し、菌液をよく切ったあと、20 mg/Lアセトシリンゴンを含むAAM寒天培地に置床し、25℃の暗条件下で3日間培養した(共存培養)。共存培養後のイネ発芽種子を滅菌水、続いて500 mg/Lカルベニシリンを含む滅菌水で洗浄し、滅菌ろ紙上で余分な水分を切った後にシュート基部を四分割し、500 mg/Lカルベニシリン及び30 mg/LハイグロマイシンBを含むN6D寒天培地に置床し、30℃の明条件下で14日間培養した。その後、成長してきたシュート基部を、組換え体再分化及び選択培地〔植物体再分化培地:MS salts及びvitamins (Murashige, T., Skoog, F., A revised medium for rapid growth and bioassays with tobacco tissue cultures, Physiol. Plant, 15, 473-497 (1962))、 30 g/l ショ糖、30 g/l ソルビトール、2 g/l カザミノ酸、0.02 mg/l NAA、2 mg/l カイネチン、2 g/l ゲルライト、pH 5.8〕に、300 mg/Lカルベニシリン + 30 mg/LハイグロマイシンBを添加したもの; Toki, S., 1997, Rapid and Efficient Agrobacterium-mediated transfomation of rice, Plant Mol Biol. Rep., 15: 16-21参照〕に移し、30℃かつ明条件下で14日間培養し、さらにこの操作をもう一度繰り返し、ハイグロマイシン耐性を有する植物体を再分化させた。このようにして得られた再分化個体をMSホルモンフリー寒天培地〔MS salts 及びvitamins(Murashige, T.ら、前掲)、30g/l ショ糖、4 g/l ゲルライト、pH5.8〕に移植し、30℃、明条件下で1〜2週間生育させ、シュート(地上部)の伸長、及び発根とその伸長を促した。シャーレ(直径9 cm)内で形質転換体のシュート及び根の長さが約10 cmあるいはそれ以上の長さに到達した際、培養土に移植し、遺伝子組換え体育成用グロースチャンバーにて明期14時間(30℃)- 暗期10時間(25℃)のサイクルでさらに生育させた。   On the other hand, the Agrobacterium EHA105 strain carrying the plasmid pSMAHdN627-MYBGUS with the rice MYB gene promoter fragment inserted was LB containing 25 mg / L chloramphenicol, 25 mg / L rifampicin, and 100 mg / L spectinomycin. The cells were cultured on an agar medium at 28 ° C. for 3 days. Subsequently, the grown cells are scraped in a small amount with microspatel, and AAM liquid medium containing 20 mg / L acetosyringone [Hiei, Y., Ohta, S., Komari, T., Kumashiro, T., Efficient transformation of rice (Oryza sativa L.) mediated by Agrobacterium and sequence analysis of the boundaries of the T-DNA, Plant J., 6, 271-282 (1994)]. Rice seeds cultured for 5 days in N6D medium were immersed in this Agrobacterium suspension, and the bacterial solution was thoroughly cut off, then placed on an AAM agar medium containing 20 mg / L acetosyringone and darkened at 25 ° C. Cultivation was performed under conditions for 3 days (co-culture). Wash the rice germinated seeds after co-cultivation with sterilized water, followed by sterilized water containing 500 mg / L carbenicillin. It was placed on an N6D agar medium containing 30 mg / L hygromycin B and cultured for 14 days under light conditions at 30 ° C. Thereafter, the grown shoot base was transformed into a recombinant redifferentiation and selective medium [plant regeneration medium: MS salts and vitamins (Murashige, T., Skoog, F., A revised medium for rapid growth and bioassays with tobacco tissue. cultures, Physiol. Plant, 15, 473-497 (1962)), 30 g / l sucrose, 30 g / l sorbitol, 2 g / l casamino acid, 0.02 mg / l NAA, 2 mg / l kinetin, 2 g / l Gelrite, pH 5.8] with 300 mg / L carbenicillin + 30 mg / L hygromycin B added; Toki, S., 1997, Rapid and Efficient Agrobacterium-mediated transformation of rice, Plant Mol Biol. Rep. , 15: 16-21], and cultured for 14 days at 30 ° C. and in light conditions, and this operation was repeated once more to redifferentiate plants having hygromycin resistance. The redifferentiated individuals thus obtained were transplanted to MS hormone-free agar medium [MS salts and vitamins (Murashige, T. et al., Supra), 30 g / l sucrose, 4 g / l gellite, pH 5.8]. It was grown for 1 to 2 weeks at 30 ° C. under light conditions to promote the elongation of the shoot (aboveground part) and the rooting and elongation. When the length of the shoots and roots of the transformants reached about 10 cm or more in a petri dish (9 cm in diameter), they were transplanted to the culture soil and clarified in the growth chamber for growing the recombinants. Further growth was carried out in a cycle of 14 hours (30 ° C.)-dark 10 hours (25 ° C.).

(実施例3) 植物組織切片の作製とGUS染色による導入遺伝子の発現の観察
イネに導入したイネMYB遺伝子プロモーターの活性を観察するため、GUS酵素活性の組織化学的染色を実施した。実験に用いた植物組織材料のうち、カルス、花器官、根についてはイネ個体あるいはカルス(培養細胞)から切り取った材料をそのまま反応液に浸漬した。葉身については展開葉を5〜10 mmの幅で切り取り5%の寒天に包埋し、マイクロスライサー(堂阪イーエム、DTK1000)を用いて80μmの厚さの切片を作製した〔植物細胞工学 第4巻281-285頁(1992)〕。稈基部については、根を切り取った稈(かん:イネ科植物の茎を表す用語)の根元から5-10 mmの組織を切り取り、また茎頂については前出の稈基部の直上部分を10 mmほど切り取り、葉身と同様の方法で80μmの厚さの切片を作製した。こうして作製した植物材料をGUS活性測定用の反応液〔50 mMリン酸ナトリウムバッファー(pH 7.0)、1 mM 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-glucuronide (X-Gluc)、5%(v/v) メタノール、10μg/mlシクロヘキシミド、1 mMジチオスレイトール〕に浸漬し、37℃で穏やかに振盪しながら24時間置いた。その後、100%エタノールで反応液を置換して反応を停止し、さらに24時間静置することにより緑色組織の細胞より葉緑素を除去した。次にエタノールを純水で置換した後、実体顕微鏡あるいは光学顕微鏡で染色パターンを観察した。
その結果、稈基部、葉身、根において維管束で活性が観察された。カルス、頴花(葯、中心柱の子房の部分)においても活性が観察された。(図3)。
(Example 3) Preparation of plant tissue section and observation of transgene expression by GUS staining In order to observe the activity of the rice MYB gene promoter introduced into rice, histochemical staining of GUS enzyme activity was performed. Of the plant tissue materials used in the experiment, callus, flower organs, and roots were directly immersed in the reaction solution after being cut from rice individuals or callus (cultured cells). For leaf blades, the developed leaves were cut to a width of 5-10 mm, embedded in 5% agar, and 80 μm-thick sections were prepared using a microslicer (Dosaka EM, DTK1000). 4 281-285 (1992)]. For the heel base, cut 5-10 mm of tissue from the root of the cut potato (cane: a term representing the stem of the grass family), and for the shoot apex, the portion immediately above the heel base is 10 mm. A section having a thickness of 80 μm was prepared in the same manner as the blade. The plant material thus prepared was used as a reaction solution for measuring GUS activity (50 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0), 1 mM 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-glucuronide (X-Gluc), 5% (v / v) methanol, 10 μg / ml cycloheximide, 1 mM dithiothreitol] and placed at 37 ° C. with gentle shaking for 24 hours. Thereafter, the reaction solution was replaced with 100% ethanol to stop the reaction, and the mixture was further allowed to stand for 24 hours to remove chlorophyll from the cells of the green tissue. Next, after replacing ethanol with pure water, the staining pattern was observed with a stereomicroscope or an optical microscope.
As a result, activity was observed in the vascular bundle at the heel base, leaf blades, and roots. Activity was also observed in callus and bud flowers (anther, the ovary part of the central pillar). (Figure 3).

本発明のイネ遺伝子プロモーターのクローニング手順を示す。The cloning procedure of the rice gene promoter of this invention is shown. 植物形質転換用バイナリーTiプラスミドベクター:pSMAHdN627-M2GUSの構造を示す。The structure of a binary Ti plasmid vector for plant transformation: pSMAHdN627-M2GUS is shown. イネMYB遺伝子プロモーターを導入した植物から調製した各植物材料におけるGUS染色結果を示す。The GUS dyeing | staining result in each plant material prepared from the plant which introduce | transduced the rice MYB gene promoter is shown.

Claims (4)

以下の(a)又は(b)に示すDNAからなる、目的遺伝子を維管束で特異的に発現させるプロモーター。
(a)配列表の配列番号1に示す塩基配列からなるDNA
(b)配列表の配列番号1に示す塩基配列において、1若しくは数個の塩基が欠失、置換
若しくは付加された塩基配列からなるDNA
A promoter comprising the DNA shown in the following (a) or (b) and specifically expressing a target gene in a vascular bundle.
(A) DNA consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1 in the sequence listing
(B) in the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1, one or several bases are deleted, ing substituted or added in the nucleotide sequence DNA
請求項に記載のプロモーターを含有する組換えベクター。 A recombinant vector containing the promoter according to claim 1 . 請求項に記載のプロモーターと目的タンパク質をコードする遺伝子を含有する組換えベクター。 A recombinant vector comprising the promoter according to claim 1 and a gene encoding a target protein. 請求項2又は3に記載の組換えベクターを導入した形質転換植物体。 A transformed plant into which the recombinant vector according to claim 2 or 3 is introduced.
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