JP4242647B2 - Enzymatic deprotection of amines and hydroxides - Google Patents
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Description
本発明は、アミンおよびヒドロキシド保護基を脱離する、緩和な酵素使用方法に関する。 The present invention relates to a mild method of using an enzyme that removes amine and hydroxide protecting groups.
有機合成中に、アミノおよびヒドロキシド基を保護するのに、一般にN−カルボベンジルオキシ(N−CBZ)基が用いられる。他の類似の“カルバメート”保護基も、アミノ基の保護に使用される。化学的脱保護は通常、パラジウム触媒を用いる水素添加などの方法で行なわれる。しかしながら、脱保護条件に影響されやすい他の基(たとえば水素添加中の硫黄)が存在する場合、別の脱保護法が必要となる。
(発明の概要)
During organic synthesis, N-carbobenzyloxy (N-CBZ) groups are generally used to protect amino and hydroxide groups. Other similar “carbamate” protecting groups are also used to protect amino groups. Chemical deprotection is usually performed by a method such as hydrogenation using a palladium catalyst. However, if there are other groups that are susceptible to deprotection conditions (eg sulfur during hydrogenation), another deprotection method is required.
(Summary of Invention)
かかる保護基を特異的に解放するのに有効な酵素活性をもたらすのに、本発明の選別技法(selection technique)を用い、土壌サンプルから微生物を容易に単離しうることがわかった。すなわち、緩和な条件(たとえば、室温および大気圧の水性培地)下で行なう脱保護の酵素法が使用でき、これは、影響されやすいあるいは潜在的に影響されやすい基のいずれに対する害も回避する。 It has been found that microorganisms can be easily isolated from soil samples using the selection technique of the present invention to provide effective enzymatic activity to specifically release such protecting groups. That is, an enzymatic method of deprotection performed under mild conditions (eg, aqueous medium at room temperature and atmospheric pressure) can be used, which avoids harm to either sensitive or potentially sensitive groups.
本発明は、式:
ArC*(R)H−(CH2)n−O−C(=O)−
[式中、各置換基は下記の記載と同意義である]
の基で保護されたヒドロキシドまたはアミンを脱保護する方法であって、保護ヒドロキシドまたはアミンを、該保護基の脱離に有効な酵素と接触させ;次いでアミンを回収することを特徴とする脱保護法を提供する。
The present invention has the formula:
ArC * (R) H— (CH 2 ) n —O—C (═O) —
[Wherein each substituent has the same meaning as described below]
A method for deprotecting a hydroxide or amine protected with a group comprising contacting the protected hydroxide or amine with an enzyme effective for elimination of the protecting group; and then recovering the amine Provide deprotection law.
また本発明は、保護基の脱離に有効な酵素を産生するバクテリアを単離する方法であって、上記の如く保護された、成長選別的量(geowth selective amount)のアミン化合物を有する培地で、予期されたバクテリアを成長させ;次いで該培地で成長するバクテリアを単離することを特徴とする単離法も提供する。 The present invention also relates to a method for isolating a bacterium producing an enzyme effective for elimination of a protecting group, which comprises a medium having a growth selective amount of amine compound protected as described above. Also provided is an isolation method characterized by growing the expected bacteria; then isolating the bacteria that grow on the medium.
さらに本発明は、キラル炭素に結合するアミンまたはヒドロキシドの所望エナンチオマーを分割する方法も提供する。かかる基で保護されたアミンまたはヒドロキシドは、本発明の方法によって立体−特異的に加水分解される。所望エナンチオマーは、加水分解されるものあるいは加水分解に耐性のあるもののいずれかである。
1つの具体例において、接触工程は下記の反応を実現する。
In one embodiment, the contacting step realizes the following reaction:
他の具体例において、接触は下記の反応を実現する。
さらに他の具体例において、接触は下記の反応を実現する。
(発明の詳細)
本発明は、式:
ArC*(R)H−(CH2)n−O−C(=O)−で示される、数多くのカルバメート保護基の脱離に使用することができる。ここで、RはHまたは独立してArと同じ、およびnは0または1〜4である。Arとは、5〜6個の環原子とO、NまたはSから選ばれる1〜2個のヘテロ原子を持つ芳香族またはヘテロ芳香族環を指称する。Arは、アミノ、アルカノイルオキシ、アルコキシ、アルキル、アルキルアミノ、アリル、カルボキシ、シクロアルキル、ハロ、ハロアルキル、ヒドロキシ、ヒドロキシアルキルもしくはニトロで、または(a)さらなるアリールで置換されない以外は、独立してArと同じであるAr*、(b)Ar*−アルキル−もしくは(c)Ar*O−の1つまでの基で置換されてよい。
(Details of the invention)
The present invention has the formula:
It can be used for elimination of a number of carbamate protecting groups, represented by ArC * (R) H— (CH 2 ) n —O—C (═O) —. Here, R is H or independently the same as Ar, and n is 0 or 1-4. Ar refers to an aromatic or heteroaromatic ring having 5 to 6 ring atoms and 1 to 2 heteroatoms selected from O, N or S. Ar is independently Ar, except that it is not substituted with amino, alkanoyloxy, alkoxy, alkyl, alkylamino, allyl, carboxy, cycloalkyl, halo, haloalkyl, hydroxy, hydroxyalkyl or nitro, or (a) further aryl. May be substituted with up to one group of Ar * , (b) Ar * -alkyl- or (c) Ar * O- which is the same as
C*に隣接するArの環原子は、RがAr、qが0または1〜2およびrが0または1〜2のとき、−CH2−、−O−、−NH−、−S(O)q−または−P(O)r−で置換して、R上の対応する位置に結合の橋(bridge)を形成することができる。1つの具体例において、RがHのとき、nは0である。他の具体例において、RがArと同じの場合、nは1である。後記実施例(表2参照)で示されるように、該方法は立体特異性であることから、ラセミ混合物の分割に使用できる。 The ring atom of Ar adjacent to C * is a group of —CH 2 —, —O—, —NH—, —S (O when R is Ar, q is 0 or 1-2 and r is 0 or 1-2. ) q- or -P (O) r- can be substituted to form a bond bridge at the corresponding position on R. In one embodiment, when R is H, n is 0. In other embodiments, n is 1 when R is the same as Ar. As shown in the examples below (see Table 2), the method is stereospecific and can be used to resolve racemic mixtures.
これらの保護基は、9−フルオレニルメチルカルバメート、9−(2−スルホ)フルオレニルメチルカルバメート、9−(2,7−ジブロモ)フルオレニルメチルカルバメート、2,7−ジ−t−ブチル−[9−(10,10−ジオキソ−10,10,10,10−テトラヒドロチオキサンチル)メチルカルバメート、ベンジルカルバメート、p−メトキシベンジルカルバメート、p−ニトロベンジルカルバメート、p−ブロモベンジルカルバメート、p−クロロベンジルカルバメート、2,4−ジクロロベンジルカルバメート、9−アントリルメチルカルバメート、ジフェニルメチルカルバメート、m−クロロ−p−アシルオキシベンジルカルバメート、p−(ジヒドロキシボリル)ベンジルカルバメート、5−ベンズイソキサゾリルメチルカルバメート、2−(トリフルオロメチル)−6−クロモニルメチルカルバメート、m−ニトロベンジルカルバメート、3,5−ジメトキシベンジルカルバメート、3,4−ジメトキシ−6−ニトロベンジルカルバメート、S−ベンジルチオカルバメート、p−シアノベンジルカルバメート、2−フラニルメチルカルバメート、4−(トリメチルアンモニウム)ベンジルカルバメートおよび2,4,6−トリメチルベンジルカルバメートなどの化合物によって例示される。 These protecting groups are 9-fluorenylmethyl carbamate, 9- (2-sulfo) fluorenylmethyl carbamate, 9- (2,7-dibromo) fluorenylmethyl carbamate, 2,7-di-t-. Butyl- [9- (10,10-dioxo-10,10,10,10-tetrahydrothioxanthyl) methyl carbamate, benzyl carbamate, p-methoxybenzyl carbamate, p-nitrobenzyl carbamate, p-bromobenzyl carbamate, p -Chlorobenzylcarbamate, 2,4-dichlorobenzylcarbamate, 9-anthrylmethylcarbamate, diphenylmethylcarbamate, m-chloro-p-acyloxybenzylcarbamate, p- (dihydroxyboryl) benzylcarbamate, 5-benzisoxazolyl Methylcarbame 2- (trifluoromethyl) -6-chromonylmethyl carbamate, m-nitrobenzyl carbamate, 3,5-dimethoxybenzyl carbamate, 3,4-dimethoxy-6-nitrobenzyl carbamate, S-benzylthiocarbamate, Illustrated by compounds such as p-cyanobenzylcarbamate, 2-furanylmethylcarbamate, 4- (trimethylammonium) benzylcarbamate and 2,4,6-trimethylbenzylcarbamate.
これらなどの保護基は、GreeneおよびWutsの「Protective Groups in Organic Synthesis」(ション・ウィリー・アンド・サンズ、ニューヨーク、1991年)(特に315−348頁)などの標準テキストに記載されている。
置換基のアルキル成分はC1−C6またはC2−C6で、ここで、C1成分は化学的に不適である(たとえばアルカノイルの場合)。シクロアルキル基は、C3−C6である。ハロアルキルとは好ましくは、パーハロアルキル、好ましくはトリフルオロメチルを指称する。ハロはクロロまたはフルオロが好ましい。
Protecting groups such as these are described in standard texts such as “Protective Groups in Organic Synthesis” by Greene and Wuts (Shon Willy and Sons, New York, 1991) (especially pages 315-348).
The alkyl component of the substituent is C 1 -C 6 or C 2 -C 6 where the C 1 component is chemically unsuitable (eg in the case of alkanoyl). Cycloalkyl groups are C 3 -C 6. Haloalkyl preferably refers to perhaloalkyl, preferably trifluoromethyl. Halo is preferably chloro or fluoro.
1つの具体例において、カルバメート保護基はフェニルメチルオキシカルボニル基で、ここで、フェニルは置換可能である。フェニルメチルオキシカルボニルへの置換は、たとえば上記Arの場合に列挙したものである。 In one embodiment, the carbamate protecting group is a phenylmethyloxycarbonyl group, where phenyl is substitutable. Substitutions to phenylmethyloxycarbonyl are, for example, those listed for Ar above.
本発明で用いる酵素の源は、適切な活性を有する単離バクテリアとして単離することができる。単離の方法は好ましくは、培地での成長による選別であって、ここで、アミンが問題のカルバメート保護基、または関連カルバメート保護基で保護されたアミン化合物から、十分な成長を支持する窒素のみしか得ることができない。後記実施例により、バクテリアの非常にありきたりの源、たとえば環境または土壌サンプルから、かかるバクテリアを単離できることが示される。 The source of the enzyme used in the present invention can be isolated as an isolated bacterium having an appropriate activity. The method of isolation is preferably sorting by growth in culture medium, wherein only nitrogen that supports sufficient growth from the amine compound in which the amine is protected with the carbamate protecting group in question, or a related carbamate protecting group. Can only get. The examples below demonstrate that such bacteria can be isolated from very common sources of bacteria, such as environmental or soil samples.
後記実施例は、本発明者が識別した(identified)選別技法が、普通の実験で適切なバクテリアを単離し、これによって適切な酵素源を単離するのに有効であることを例示する。実施例は、CBZ−保護された窒素源の成長の選別によって単離されたバクテリアに関する。しかして、この実例は本発明者の理解、すなわち、脱離が求められる保護基に適合する保護基を用いる同じアプローチで、不適当な実験を伴なわずに、適切な酵素を収集できることを確立する。 The examples below illustrate that the inventor's identified sorting technique is effective in isolating appropriate bacteria in routine experimentation, thereby isolating the appropriate enzyme source. The examples relate to bacteria isolated by selection of CBZ-protected nitrogen source growth. Thus, this example establishes the inventor's understanding, that is, the same approach using a protecting group that is compatible with the protecting group that is desired to be eliminated, and that the appropriate enzyme can be collected without undue experimentation. To do.
酵素的脱離に必然的に伴なうアミンまたはヒドロキシドが、提案基質(substrate)の所定酵素による開裂に対して耐性を有する原因の最も有望な候補(candidate)として同定される場合、該アミン(もしくは類縁体、またはヒドロキシドのアミン類縁体)の適切に保護したバージョンを、別のバクテリアの選別、このため別の酵素の選別に使用することができる。代用酵素が必要とされる場合に、異なる脱保護酵素またはそれぞれ有用な酵素を産生するバクテリア培養物の収集物を貯蔵し、スクリーニングすることができる。 When an amine or hydroxide that entails enzymatic desorption is identified as the most promising candidate for a cause that is resistant to cleavage by a given enzyme of the proposed substrate, the amine Appropriately protected versions of (or analogs, or amine analogs of hydroxides) can be used to screen for different bacteria, and therefore for different enzymes. Where surrogate enzymes are required, collections of bacterial cultures that produce different deprotection enzymes or each useful enzyme can be stored and screened.
保護し、そして脱保護すべきアミンまたはヒドロキシドが、比較的に離れた成分に結合するアミンまたはヒドロキシド部を持つ錯体分子である場合、選別法に用いるアミンモデルを、アミンまたはヒドロキシドに隣接する錯体の部分に作る(modeled)ことができる。錯体分子中で誘導化される成分が近くで類似して誘導化されるように、気をつけることが好ましい。 If the amine or hydroxide to be protected and deprotected is a complex molecule with an amine or hydroxide moiety that binds to a relatively remote component, the amine model used in the screening method is adjacent to the amine or hydroxide. Can be modeled into a complex part. It is preferred to take care that the components derivatized in the complex molecule are similarly derivatized nearby.
以下に示されるように、バクテリア全細胞、全細胞の抽出物、または精製した酵素プレパラートを用いて、本発明提供の脱保護を行なうことができる。酵素は、概して少量使用できるように、かつ酵素源が付与する不純物(たとえば純度の低いもの)が、意図される生成物のようにふるまうべき著しい量の物質を生成すべきでないので、触媒的に作用する。 As shown below, deprotection provided by the present invention can be carried out using whole bacterial cells, whole cell extracts, or purified enzyme preparations. Enzymes can be used catalytically because they can generally be used in small quantities and impurities provided by the enzyme source (eg, less pure) should not produce significant amounts of material that should behave like the intended product. Works.
すなわち、酵素源が付与する不純物は、反応後のワークアップに備えて素早く選別される。特に、抽出物を用いる場合、不純物は全般的に高分子であり、そして典型的な意図生成物は概して高分子でないので、不純物は生成物から素早く隔離される。 That is, the impurities imparted by the enzyme source are quickly selected in preparation for workup after the reaction. In particular, when using extracts, the impurities are generally polymeric and the typical intended product is generally not polymeric so that the impurities are quickly sequestered from the product.
また以下に示されるように、酵素選別法で用いる基質は、酵素活性を測定し、このため選別的微生物学的濃縮(enrichment)および伝統的たん白化学技法により酵素を単離する、軽便な手段を付与する。 Also, as shown below, the substrate used in the enzyme selection method is a convenient means of measuring enzyme activity and thus isolating the enzyme by selective microbiological enrichment and traditional protein chemistry techniques. Is granted.
保護基で保護されるアミンまたはヒドロキシドは、いずれの分子上のアミンまたはヒドロキシドのいずれであってもよい。多くの具体例において、分子上のアミンまたはヒドロキシドは、非反復性合成技法に従う大きさのものである(勿論、本発明の脱保護技法は、ペプチドあるいは核酸合成で用いられるような反復性技法においても使用できる)。 The amine or hydroxide that is protected with a protecting group may be any amine or hydroxide on any molecule. In many embodiments, the amine or hydroxide on the molecule is sized according to non-repetitive synthesis techniques (of course, the deprotection techniques of the present invention are repetitive techniques such as those used in peptide or nucleic acid synthesis). Can also be used).
1つの好ましい具体例において、アミンまたはヒドロキシドは、経口摂取後の動物に生物学的に利用しうる生活性剤(bioactive agent)の一部、あるいはかかる生活性剤の先駆物質の一部である。
1つの側面において、アミンはα−またはβ−アミノ酸が好ましく、もっとも好ましくはα−アミノ酸である。
In one preferred embodiment, the amine or hydroxide is part of a bioactive agent that is bioavailable to an animal after ingestion, or part of the precursor of such a life agent. .
In one aspect, the amine is preferably an α- or β-amino acid, most preferably an α-amino acid.
アミンはたとえば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、4−ヒドロキシプロリン、フェニルアラニン、トリプトファン、メチオニン、グリシン、セリン、ホモセリン、トレオニン、システイン、ホモシステイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リシン、α−アミノ−ε−カプロラクタム(リシンラクタム)、α−アミノ−δ,δ−ジメチル−ε−カプロラクタム、ε−メチルリシン、オルニチン、アルギニン、ヒスチジンもしくは3−メチルヒスチジン、またはこれらのアミンであって、そのアルキル部がヒドロキシもしくはアルキルで置換されたもの、そのアミノが1つまでのアルキルで置換されたもの、あるいはそのフェニル成分が上記Arの場合に列挙した基で置換されたものであってよい。 Examples of amines include alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, 4-hydroxyproline, phenylalanine, tryptophan, methionine, glycine, serine, homoserine, threonine, cysteine, homocysteine, tyrosine, asparagine, glutamine, aspartic acid, glutamic acid, lysine Α-amino-ε-caprolactam (lysine lactam), α-amino-δ, δ-dimethyl-ε-caprolactam, ε-methyllysine, ornithine, arginine, histidine or 3-methylhistidine, or an amine thereof, The alkyl moiety is substituted with hydroxy or alkyl, the amino is substituted with up to one alkyl, or the phenyl moiety is substituted with the groups listed for Ar above It may be.
かかるアミノ酸は、LまたはDアミノ酸であってよい。さらに、かかるアミノ酸は誘導化されて、アミンもしくはカルボン酸成分との脱水反応により形成される結合を介して、あるいはアミン成分に形成される炭素−窒素結合によって、より大なる分子の一部を形成することができる。 Such amino acids may be L or D amino acids. In addition, such amino acids are derivatized to form part of a larger molecule through a bond formed by a dehydration reaction with an amine or carboxylic acid component, or by a carbon-nitrogen bond formed in the amine component. can do.
特に本発明に有用なアルファアミノ酸の他の種類は、下記式で示される。
これらのアミンの中で、下式のものが特に好ましいアミンである。
これらの化合物は、U.S.特許No.5508272でより詳しく記載されている。該特許のこれら化合物の製造および使用に関する教えを、参考までに導入する。本発明の使用に関して特に興味のある追加の化合物は、WO 00/47207およびU.S.特許No.5552397に記載されている。これら特許文献に記載の化合物の製造および使用に関する教えを、参考までに導入する。 These compounds are described in US Pat. 5508272 is described in more detail. The teachings regarding the preparation and use of these compounds in the patent are incorporated by reference. Additional compounds of particular interest for the use of the present invention include WO 00/47207 and US Patent No. No. 555297. The teachings relating to the production and use of the compounds described in these patent documents are incorporated by reference.
保護アミンまたはヒドロキシドは一般的に、
ArC*(R)H−(CH2)n−O−C(=O)−X
[式中、Xは脱離可能基、ブロモ、クロロ、トシルである]
を対応するアミンまたはヒドロキシドと反応させることによって、形成される。ArC*(R)H−(CH2)n−O−C(=O)−Xはたとえば、ArC*(R)H−(CH2)n−OHをホスゲン、カルボミル・ジアイダゾール、トリホスゲンまたは匹敵試薬と反応させることによって、形成される。
Protected amines or hydroxides are generally
ArC * (R) H— (CH 2 ) n —O—C (═O) —X
[Wherein X is a leaving group, bromo, chloro, tosyl]
Is reacted with the corresponding amine or hydroxide. ArC * (R) H— (CH 2 ) n —O—C (═O) —X is, for example, ArC * (R) H— (CH 2 ) n —OH converted to phosgene, carbomil diidazole, triphosgene or comparable reagents. It is formed by reacting with.
定義
以下に示す語句はそれぞれ、本発明の目的のため、下記の意義を有する。
生活性剤:
生活性剤は、細胞、ウイルス、組織、器官または有機体に作用しうる化学物質などの物質であって、たとえばこれらに限定されるものでないが、細胞、ウイルス、器官または有機体の機能の変化を起こす、殺虫剤または薬物(すなわち、医薬)が挙げられる。有機体は、哺乳類が好ましく、より好ましいのはヒトである。
Definitions Each of the terms shown below has the following significance for the purposes of the present invention.
Bioactive agent:
A bioactive agent is a substance such as a chemical substance that can act on a cell, virus, tissue, organ or organism, such as but not limited to a change in the function of a cell, virus, organ or organism. Pesticides or drugs (ie pharmaceuticals) that cause The organism is preferably a mammal, more preferably a human.
成長選別的量のアミン化合物を有する培地:
成長選別的量の保護アミン化合物を有する培地は、該アミン化合物以外の他のアミンの量が、成長−仲介選別法でバクテリア成長を促進するのに有効な量よりも少ない培地である。好ましい保護アミンは、本質的に単独の窒素源である。
Medium with growth selective amount of amine compound:
A medium having a growth-selective amount of a protected amine compound is a medium in which the amount of other amines other than the amine compound is less than an amount effective to promote bacterial growth in a growth-mediated selection method. Preferred protected amines are essentially a single nitrogen source.
(実施例)
実施例1:微生物の単離の選別技法
窒素の単独源としてN−α−CBZ−L−リシンを利用できる微生物を単離するのに、選別培養技法を用いる。ニュージャージー州の種々の用地から、土壌サンプルを収集する。約1gの土壌サンプルを、5mLの水に懸濁し、十分に混合し、サンプルを沈降せしめる。各種サンプルの上層液を、1%N−α−CBZ−L−リシン含有のA培地(グルコース2%、KH2PO40.2%、K2HPO40.2%、MgSO40.01%、FeSO40.001%、ZnSO40.001%、pH7.0)に接種する。
(Example)
Example 1: Selection Technique for Microorganism Isolation A selective culture technique is used to isolate microorganisms that can utilize N-α-CBZ-L-lysine as the sole source of nitrogen. Collect soil samples from various sites in New Jersey. About 1 g of soil sample is suspended in 5 mL of water and mixed well to allow the sample to settle. The upper layer solution of various samples was added to A medium containing 1% N-α-CBZ-L-lysine (glucose 2%, KH 2 PO 4 0.2%, K 2 HPO 4 0.2%, MgSO 4 0.01. %, FeSO 4 0.001%, ZnSO 4 0.001%, pH 7.0).
4日の成長後、培地が濁ってくると、ペトリ平板に入った1.5%寒天含有の上記培地に、培養物を移す。この濃縮培養技法から、8種のコロニーを単離する。1つの培養物(Z−2)をさらに、スフィンゴモナス・パウシモビリス(Sphingomonas paucimobilis)菌株として同定し、これをSphingomonas paucimobilis 菌株ATCC202027として、メリーランド州ロックビルのアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(
American Type Culture Collection)に寄託した。この培養物(菌)を、CBZ−脱保護酵素の源として使用する。
After 4 days of growth, if the medium becomes cloudy, transfer the culture to the above medium containing 1.5% agar in a Petri plate. From this enrichment culture technique, eight colonies are isolated. One culture (Z-2) was further identified as Sphingomonas paucimobilis strain, which was designated as Sphingomonas paucimobilis strain ATCC202027 (American Type Culture Collection, Rockville, Maryland)
Deposited with American Type Culture Collection. This culture (fungus) is used as a source of CBZ-deprotecting enzyme.
実施例2:Sphingomonas paucimobilis の成長
Sphingomonas paucimobilis を窒素の単独源として、N−α−CBZ−L−フェニルアラニンまたは[4S−(4α,7α,10aβ)]−オクタヒドロ−5−オキソ−4−[[(フェニルメトキシ)カルボニル]アミノ]−7H−ピリド−[2,1−b][1,3]チアゼピン−7−カルボン酸メチルエステル(化合物A)で成長させる。該Sphingomonas paucimobilis 培養物を、1%N−α−CBZ−L−フェニルアラニンまたは1%化合物A含有のA培地に接種する。2日の成長後、ペトリ平板に入った1%N−α−CBZ−L−フェニルアラニンまたは1%BMS199541、および1.5%寒天含有のA培地に、培養物を移す。
Example 2 Growth of Sphingomonas paucimobilis N-α-CBZ-L-phenylalanine or [4S- (4α, 7α, 10aβ)]-octahydro-5-oxo-4-[[( Phenylmethoxy) carbonyl] amino] -7H-pyrido- [2,1-b] [1,3] thiazepine-7-carboxylic acid methyl ester (Compound A). The Sphingomonas paucimobilis culture is inoculated into A medium containing 1% N-α-CBZ-L-phenylalanine or 1% Compound A. After 2 days of growth, transfer the cultures to A medium containing 1% N-α-CBZ-L-phenylalanine or 1% BMS199541 and 1.5% agar in petri plates.
ペトリ平板から単離したコロニーを、1%N−α−CBZ−L−フェニルアラニンおよび/または1%化合物A含有のB培地(酵母エキス0.015%、グルコース2%、KH2PO40.2%、K2HPO40.2%、MgSO40.01%およびNaCl0.2%、pH7)100mLで成長させる。培養物を回転振とう器で、28℃および280RPMにて24時間成長させる。この培養物をバイアルに入れ(2mLバイアル中培養物1mL)、今後の使用に−70℃で貯蔵する。 Colonies isolated from Petri plates were isolated from B medium containing 1% N-α-CBZ-L-phenylalanine and / or 1% Compound A (yeast extract 0.015%, glucose 2%, KH 2 PO 4 0.2). %, K 2 HPO 4 0.2%, MgSO 4 0.01% and NaCl 0.1%, pH 7). The culture is grown on a rotary shaker at 28 ° C. and 280 RPM for 24 hours. This culture is placed in a vial (1 mL of culture in a 2 mL vial) and stored at -70 ° C for future use.
1つのバイアル(B培地中1mLのSphingomonas paucimobilis を含有)を用いて、100mLのB培地を接種する。培養物を回転振とう器で、28℃および280RPMにて48時間成長させる。18000xgで15分間遠心分離を行って、細胞を採取し、今後の使用まで−70℃で貯蔵する。 One vial (containing 1 mL of Sphingomonas paucimobilis in B medium) is used to inoculate 100 mL of B medium. The culture is grown on a rotary shaker at 28 ° C. and 280 RPM for 48 hours. Cells are harvested by centrifugation at 18000 × g for 15 minutes and stored at −70 ° C. for future use.
実施例3:全細胞を用いる生体内変化
この方法では、250mLフラスコ中、25mgの基質(化合物AまたはCBZ−L−フェニルアラニン)含有の25mLのB培地にて、Sphingomonas paucimobilis を成長させる。フラスコを振とう器で、28℃および250rpmにて培養する。48時間の生体内変化後、遠心分離で細胞を取出す。
Example 3: Biotransformation using whole cells In this method, Sphingomonas paucimobilis is grown in 25 mL B medium containing 25 mg substrate (Compound A or CBZ-L-phenylalanine) in a 250 mL flask. The flask is incubated on a shaker at 28 ° C. and 250 rpm. After 48 hours of biotransformation, the cells are removed by centrifugation.
生成物の[4S−(4α,7α,10aβ)]−オクタヒドロ−5−オキソ−4−アミノ−7H−ピリド−[2,1−b][1,3]チアゼピン−7−カルボン酸メチルエステル(化合物B)またはL−フェニルアラニンを含有する上層液を、HPLCで分析する。結果を下記表1に示す。
表1:
基質 生成物 転化率(%)
化合物A 化合物B 100
CBZ−L− L−フェニルアラニン 100
フェニルアラニン
The product [4S- (4α, 7α, 10aβ)]-octahydro-5-oxo-4-amino-7H-pyrido- [2,1-b] [1,3] thiazepine-7-carboxylic acid methyl ester ( The upper layer solution containing compound B) or L-phenylalanine is analyzed by HPLC. The results are shown in Table 1 below.
Table 1:
Substrate product conversion (%)
Compound A Compound B 100
CBZ-L-L-phenylalanine 100
Phenylalanine
HPLC分析:
Vydac C−18逆相カラムを持つHewlett−Packard(HP)1090器具を用いて、HPLC分析を行なう。移動相,水中0.1%トリフルオロ酢酸(TFA)含有の溶剤Aおよびアセトニトリル70%/水30%中0.1%TFA含有の溶剤B。基質と生成物の分離に、以下に示す溶剤AおよびBの勾配を用いる。
HPLC analysis:
HPLC analysis is performed using a Hewlett-Packard (HP) 1090 instrument with a Vydac C-18 reverse phase column. Mobile phase, solvent A containing 0.1% trifluoroacetic acid (TFA) in water and solvent B containing 0.1% TFA in 70% acetonitrile / 30% water. The following solvent A and B gradients are used to separate the substrate and product.
0分:100%A、0〜15分:50%B、15〜25分:100%B、25〜26分:0%B、および26〜30分:0%B。流速は1mL/分。カラム温度は周囲温度で、検出波長は215nm。これらの条件下で、化合物A、化合物B、CBZ−L−フェニルアラニンおよびL−フェニルアラニンそれぞれの保持時間は、15.48分、7.28分、16.99分および7.35分である。他の全てのCBZ−含有化合物も、これらの条件を用いて分析した。 0 min: 100% A, 0-15 min: 50% B, 15-25 min: 100% B, 25-26 min: 0% B, and 26-30 min: 0% B. The flow rate is 1 mL / min. The column temperature is ambient and the detection wavelength is 215 nm. Under these conditions, the retention times of Compound A, Compound B, CBZ-L-phenylalanine and L-phenylalanine are 15.48 minutes, 7.28 minutes, 16.99 minutes and 7.35 minutes, respectively. All other CBZ-containing compounds were also analyzed using these conditions.
実施例4:Sphingomonas paucimobilis
ATCC 202027の細胞抽出物を用いるCBZの脱保護
Sphingomonas paucimobilis ATCC 202027の細胞抽出物の調製:
細胞抽出物の調製を、4〜7℃で実施する。細胞を50mMリン酸カリウム緩衝剤(pH7.0)で洗い、洗った細胞(100g)を、500mLの緩衝剤A(50mMリン酸塩緩衝剤、pH7.0、10%グリセロールおよび2mM−DTTを含有)に懸濁する。
Example 4: Sphingomonas paucimobilis
Deprotection of CBZ using cell extract of ATCC 202027 Preparation of cell extract of Sphingomonas paucimobilis ATCC 202027:
Cell extract preparation is performed at 4-7 ° C. Cells were washed with 50 mM potassium phosphate buffer (pH 7.0) and washed cells (100 g) containing 500 mL Buffer A (50 mM phosphate buffer, pH 7.0, 10% glycerol and 2 mM DTT). ).
かかる細胞懸濁液に、イソプロパノール中の1mMフッ化フェニルメチルスルホニル(PMSF)を加える。細胞懸濁液(20%W/V、湿潤細胞)をミクロフルイダイザー(Microfluidizer、ミクロ流動化装置)(Microfluidics,Inc.)に12000psiで通し(2回通過)、砕解した細胞を25000xgで4℃にて30分間遠心分離する。遠心分離後に得られる上層液を、細胞抽出物と称す。 To this cell suspension is added 1 mM phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF) in isopropanol. The cell suspension (20% W / V, wet cells) is passed through a microfluidizer (Microfluidizer, Microfluidics, Inc.) at 12000 psi (2 passes) and the dissociated cells are 4 × 25000 × g. Centrifuge for 30 minutes at ° C. The upper layer liquid obtained after centrifugation is referred to as a cell extract.
細胞抽出物を用いるCBZ−脱保護:
各種化合物からのCBZ−基の脱保護に、細胞抽出物を用いる。それは、各種の方法でCBZ−基を脱保護するのに有用である。種々のDおよびL−CBZ−保護アミノ酸を、細胞抽出物と共に42℃で18〜20時間培養する。0.4%トリフルオロ酢酸(TFA)含有の2容量の50%アセトニトリルを加えて、反応を止める。下記表2に示される結果より、酵素はCBZ−保護L−アミノ酸のCBZ−基を加水分解するのに特異的であるのが認められる。
CBZ-deprotection using cell extract:
Cell extracts are used for deprotection of CBZ-groups from various compounds. It is useful for deprotecting the CBZ-group in various ways. Various D and L-CBZ-protected amino acids are cultured with cell extracts at 42 ° C. for 18-20 hours. The reaction is stopped by adding 2 volumes of 50% acetonitrile containing 0.4% trifluoroacetic acid (TFA). From the results shown in Table 2 below, it can be seen that the enzyme is specific for hydrolyzing the CBZ-group of the CBZ-protected L-amino acid.
表2:
基質 生成物 転化率(%)
N−α−CBZ−L−チロシン L−チロシン 100
N−α−CBZ−D−チロシン D−チロシン 1.58
O−α−CBZ−L−チロシン L−チロシン 100
N−α−CBZ−L−ロイシン L−ロイシン 100
N−α−CBZ−D−ロイシン D−ロイシン 1.2
N−α−CBZ−L−フェニルアラニン L−フェニルアラニン 100
N−α−CBZ−D−フェニルアラニン D−フェニルアラニン 0
N−α−CBZ−L−リシン L−リシン 52
N−ε−CBZ−D−リシン D−リシン 7
N−α−ε−(CBZ)2−L−リシン L−リシン 24
N−α−CBZ−L−プロリン L−プロリン 100
N−α−CBZ−D−プロリン D−プロリン 0
化合物A 化合物B 95
Table 2:
Substrate product conversion (%)
N-α-CBZ-L-tyrosine L-tyrosine 100
N-α-CBZ-D-tyrosine D-tyrosine 1.58
O-α-CBZ-L-tyrosine L-tyrosine 100
N-α-CBZ-L-leucine L-leucine 100
N-α-CBZ-D-leucine D-leucine 1.2
N-α-CBZ-L-phenylalanine L-phenylalanine 100
N-α-CBZ-D-phenylalanine D-phenylalanine 0
N-α-CBZ-L-lysine L-lysine 52
N-ε-CBZ-D-lysine D-lysine 7
N-α-ε- (CBZ) 2 -L-lysine L-lysine 24
N-α-CBZ-L-proline L-proline 100
N-α-CBZ-D-proline D-proline 0
Compound A Compound B 95
実施例5:CBZ−脱保護酵素の精製と、該精製した酵素のCBZ−含有化合物からのCBZ−基の脱保護における使用
酵素アッセイ
0.5mgの化合物AまたはCBZ−フェニルアラニンを50mM−リン酸塩緩衝剤(pH7)中、45℃にて0.4mLの細胞抽出物/画分と共に18時間培養する。0.4%TFA含有の1mLの50%アセトニトリルを加えて、反応を止める。サンプルを濾過し、生成物と出発物質をHPLCで分析する
Example 5: Purification of CBZ-deprotection enzyme and use of the purified enzyme in deprotection of CBZ-group from CBZ-containing compounds
Enzyme assay 0.5 mg of compound A or CBZ-phenylalanine is cultured in 50 mM phosphate buffer (pH 7) at 45 ° C. with 0.4 mL of cell extract / fraction for 18 hours. The reaction is stopped by adding 1 mL of 50% acetonitrile containing 0.4% TFA. Filter sample and analyze product and starting material by HPLC
たん白アッセイ
Bio−Radたん白アッセイを用いて、たん白濃度を測定する。アッセイは、製造(Bio−Rad)プロトコルに従って行った。
酵素の精製
全ての精製ステップは、室温で実施する。酵素の精製は、基質としてCBZ−L−フェニルアラニンを用い実施する。
Protein Assay Protein concentration is measured using the Bio-Rad protein assay. The assay was performed according to the manufacturing (Bio-Rad) protocol.
Enzyme purification All purification steps are performed at room temperature. The enzyme is purified using CBZ-L-phenylalanine as a substrate.
上記調製の細胞抽出物を、DEAE−セルロース(緩衝剤Aで予め平衡化)と共に2時間回分吸着させる。活性酵素を含有するフォロースルー(follow−through)を、絶えず撹拌しながら、硫酸アンモニウム(516g/L)で2時間沈殿せしめる。遠心分離(15000rpm、4℃)で得られる生成沈殿物を、1M硫酸アンモニウム含有の緩衝剤A中で可溶化し、フェニルセファロース(phenylsepharose)(1M硫酸アンモニウム含有の緩衝剤Aで予め平衡させた20mLカラム)に装填する。 The cell extract prepared above is adsorbed batchwise for 2 hours with DEAE-cellulose (previously equilibrated with buffer A). The follow-through containing the active enzyme is precipitated with ammonium sulfate (516 g / L) for 2 hours with constant stirring. The resulting precipitate obtained by centrifugation (15000 rpm, 4 ° C.) is solubilized in buffer A containing 1M ammonium sulfate and phenylsepharose (20 mL column pre-equilibrated with buffer A containing 1M ammonium sulfate). To load.
カラムを、1M硫酸アンモニウム含有の緩衝剤A、0.5M硫酸アンモニウムおよび0.2M硫酸アンモニウムで連続して洗う。最後に、緩衝剤Aで酵素を溶離する。活性酵素含有の画分をプールし(30mL)、Amicon PM−10膜で濃縮する(8mL)。次いで酵素を、S−200ゲル−濾過カラム(400mLカラム)に装填する。 The column is washed successively with buffer A containing 1M ammonium sulfate, 0.5M ammonium sulfate and 0.2M ammonium sulfate. Finally, the enzyme is eluted with buffer A. Fractions containing active enzyme are pooled (30 mL) and concentrated on an Amicon PM-10 membrane (8 mL). The enzyme is then loaded onto an S-200 gel-filtration column (400 mL column).
酵素を流速0.8mL/分にて、緩衝剤Aで溶離する。これらのステップで、酵素を150倍以上に精製し、この場合の比活性は13.9ユニット/mgたん白である(下記表3)。ユニットは、μモルの形成生成物/分/たん白mgで定義される。酵素は、SDS−PAGEによる測定で、分子量〜154000ダルトン、サブユニット分子量45000ダルトンの二量体たん白である。 The enzyme is eluted with buffer A at a flow rate of 0.8 mL / min. In these steps, the enzyme is purified 150 times or more, and the specific activity in this case is 13.9 units / mg protein (Table 3 below). Units are defined as μmol formed product / min / mg protein. The enzyme is a dimeric protein having a molecular weight of -154,000 daltons and a subunit molecular weight of 45,000 daltons as determined by SDS-PAGE.
表3:CBZ−脱保護酵素の精製
容量 活性 たん白 比活性 精製
ステップ mL U/mL mg/mL U/mg 倍数
細胞抽出物 500 0.142 1.8 0.08 1.00
DE52−フォロースルー 700 0.182 0.58 0.32 4.00
硫酸アンモニウム沈殿 60 2.496 7.45 0.34 4.25
フェニルセファロースカラム 28 0.117 0.13 0.90 11.41
S−200ゲル−濾過カラム 7 0.139 0.01 13.90 176.20
Table 3: Purification of CBZ-deprotecting enzymes
Volume Activity Protein Specific activity Purification
Step mL U / mL mg / mL U / mg multiple Cell extract 500 0.142 1.8 0.08 1.00
DE52-Follow-through 700 0.182 0.58 0.32 4.00
Ammonium sulfate precipitation 60 2.496 7.45 0.34 4.25
Phenyl Sepharose column 28 0.117 0.13 0.90 11.41
S-200 gel-filtration column 7 0.139 0.01 13.90 176.20
このセクションの記載に準じ調製した精製酵素を用いて、下記表4に示すCBZ−含有化合物を脱保護した。
表4:
基 質 生成物 転化率(%)
化合物A 化合物B 100
CBZ−L−フェニルアラニン L−フェニルアラニン 100
The purified enzyme prepared according to the description in this section was used to deprotect the CBZ-containing compounds shown in Table 4 below.
Table 4:
Substrate product conversion rate (%)
Compound A Compound B 100
CBZ-L-phenylalanine L-phenylalanine 100
実施例6:250mgプレップ・バッチの化合物Aの酵素脱保護
細胞抽出物を、上記セクションの記載に準じ調製する。250mLの細胞抽出物に、化合物A250mgを加え、28℃および95rpmで培養する。40時間の反応後、250mLのアセトニトリルを加える。基質と生成物をHPLCで分析する。化合物Bのモル収率は、87%であった。
Example 6: Enzymatic deprotection of Compound A in a 250 mg prep batch Cell extracts are prepared as described in the section above. To 250 mL of cell extract, 250 mg of Compound A is added and cultured at 28 ° C. and 95 rpm. After 40 hours of reaction, 250 mL of acetonitrile is added. Substrate and product are analyzed by HPLC. The molar yield of compound B was 87%.
実施例7:CBZ−含有化合物の酵素脱保護
前セクションの記載に準じ、Sphingomonas paucimobilis ATCC 202027から調製した細胞抽出物を用い、[(3S)−ヘキサヒドロ−2−オキソ−1−[2−オキソ−2−(1−ピロリジニル)エチル]−1H−アゼピン−3−イル]カルバミン酸フェニルメチルエステル(化合物C)を脱保護して、(S)−1−[(3−アミノヘキサヒドロ−2−オキソ−1H−アゼピン−1−イル)アセチル]ピロリジン(化合物D)を形成せしめる。
Example 7: Enzymatic deprotection of CBZ-containing compounds A cell extract prepared from Sphingomonas paucimobilis ATCC 202027 was used as described in the previous section and [(3S) -hexahydro-2-oxo-1- [2-oxo- 2- (1-Pyrrolidinyl) ethyl] -1H-azepin-3-yl] carbamic acid phenylmethyl ester (Compound C) was deprotected to give (S) -1-[(3-aminohexahydro-2-oxo -1H-azepin-1-yl) acetyl] pyrrolidine (Compound D) is formed.
実施例8:CBZ−含有化合物の酵素脱保護
前セクションの記載に準じ、Sphingomonas paucimobilis ATCC 202027から調製した細胞抽出物を用い、6−[(フェニルメトキシ)カルボニル]アミノ]ヘキサヒドロ−2,2−ジメチル−7−オキソ−1H−アゼピン−1−酢酸エチルエステル・塩酸塩1を脱保護して、6−アミノヘキサヒドロ−2,2−ジメチル−7−オキソ−1H−アゼピン−1−酢酸エチルエステル・塩酸塩(化合物E)とする。
Example 8: Enzymatic deprotection of CBZ-containing compounds 6-[(Phenylmethoxy) carbonyl] amino] hexahydro-2,2-dimethyl using a cell extract prepared from Sphingomonas paucimobilis ATCC 202027 as described in the previous section. -7-oxo-1H-azepine-1-acetic acid ethyl ester / hydrochloride 1 is deprotected to give 6-aminohexahydro-2,2-dimethyl-7-oxo-1H-azepine-1-acetic acid ethyl ester It is referred to as hydrochloride (compound E).
注として、本明細書で引用した、これらに限定されるものでないが、特許および特許出願を含む刊行物や参考文献について、たとえこれらの個々の刊行物や参考文献が、十分な記載で本明細書に導入されていると明確かつ個別的に示されていても、上記引用部分の全体を完全に、参考までに本明細書に導入する。この出願の優先権主張の基礎になるいずれの特許出願も、上記の刊行物や参考文献と同様に、参考までに本明細書に導入する。 As a note, for publications and references including, but not limited to, patents and patent applications cited herein, these individual publications and references are hereby fully described. The entire cited portion is hereby incorporated by reference in its entirety, even if it is clearly and individually indicated as being introduced in the document. Any patent application that serves as a basis for priority claim of this application is incorporated herein by reference, as well as the above-mentioned publications and references.
本発明を好ましい具体例についてこれを強調して説明したが、好ましい工夫や方法でのバリエーションを使用しうること、および本明細書で明記したものと別の方法で本発明を実施しうることを意図していることについては、当業者にとって自明である。よって、本発明は、特許請求の範囲で規定される精神および技術的範囲に含まれる全ての改変を包含するものである。 While this invention has been described with emphasis on preferred embodiments, it should be understood that variations in preferred inventions and methods may be used and that the invention may be practiced otherwise than as specifically described herein. The intention is obvious to those skilled in the art. Accordingly, this invention includes all modifications encompassed within the spirit and scope of the invention as defined by the appended claims.
Claims (9)
ArC*(R)H−(CH2)n−O−C(=O)−
[式中、RはHまたは独立してArと同じ、およびnは0または1〜4で、Arとは、5〜6個の環原子を有する芳香族またはヘテロ芳香族環を指称し、そのヘテロ芳香族環はO、NまたはSから選ばれる1〜2個のヘテロ原子を持ち、かつアミノ、アルカノイルオキシ、アルコキシ、アルキル、アルキルアミノ、アリル、カルボキシ、シクロアルキル、ハロ、ハロアルキル、ヒドロキシ、ヒドロキシアルキルもしくはニトロで、または(i)さらなるアリールで置換されない以外は、独立してArと同じであるAr*、(ii)Ar*−アルキル−もしくは(iii)Ar*O−の1つまでの基で置換することができ;C*に結合する環原子に隣接するArの環原子は、RがAr、qが0または1〜2およびrが0または1〜2のとき、−CH2−、−O−、−NH−、−S(O)q−または−P(O)r−で置換して、R上の対応する位置に結合の橋を形成することができる]
の基で保護されたヒドロキシドまたはアミンを脱保護する方法であって、
保護ヒドロキシドまたはアミンを、スフィンゴモナス・パウシモビリスから得られる酵素と接触させ該保護基を直接除去し;次いで
ヒドロキシド及びアミンを回収する
ことを特徴とする脱保護法。formula:
ArC * (R) H— (CH 2 ) n —O—C (═O) —
[Wherein R is H or independently the same as Ar, and n is 0 or 1 to 4, Ar represents an aromatic or heteroaromatic ring having 5 to 6 ring atoms, The heteroaromatic ring has 1 to 2 heteroatoms selected from O, N or S and is amino, alkanoyloxy, alkoxy, alkyl, alkylamino, allyl, carboxy, cycloalkyl, halo, haloalkyl, hydroxy, hydroxy Up to one group of Ar * , (ii) Ar * -alkyl- or (iii) Ar * O-, independently of alkyl or nitro, or (i) independently substituted with further aryl The ring atom of Ar adjacent to the ring atom bonded to C * is —CH when R is Ar, q is 0 or 1-2 and r is 0 or 1-2. 2— , —O—, —NH—, —S (O) q— or —P (O) r— can be substituted to form a bond bridge at the corresponding position on R]
A method for deprotecting a hydroxide or amine protected with a group of
A deprotection process characterized in that a protected hydroxide or amine is contacted with an enzyme obtained from Sphingomonas pausobibilis to directly remove the protecting group; and then the hydroxide and amine are recovered.
である請求項8に記載の脱保護法。The reaction
The deprotection method according to claim 8.
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---|---|---|---|---|
US4182654A (en) * | 1974-09-18 | 1980-01-08 | Pierce Chemical Company | Production of polypeptides using polynucleotides |
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