JP4008177B2 - Protein purification method - Google Patents

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Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
この出願の発明は、プロテアーゼ除去方法に関するものである。さらに詳しくは、この出願の発明は、タンパク質を大量発現させた際、目的タンパク質を分解する宿主由来のプロテアーゼを除去する方法に関するものである。
【0002】
【従来の技術とその課題】
タンパク質を得る方法としては、一般的に、ヒトの臓器、細胞株などから単離する方法、特定のアミノ酸配列に基づき化学合成によってぺプチドを調製する方法、あるいは特定のDNA断片を用いて組換えDNA技術で取得する方法などが用いられる。とくに、組換えDNA技術は、均一なタンパク質を工業的に大量に合成したり、天然には存在しない融合タンパク質を合成する方法として有用であり、近年好ましく実施されている。
【0003】
組換えDNA技術では、大腸菌、枯草菌、酵母、昆虫細胞、哺乳動物細胞、植物細胞等の宿主に、目的タンパク質を合成するDNAの断片を有する発現ベクターを導入し、目的タンパク質を大量に発現させることができる。
【0004】
しかしながら、大腸菌、枯草菌、酵母などの微生物や、動物細胞、植物細胞は、その細胞内に様々なタンパク質分解酵素(プロテアーゼ)を保有しており、組換え技術によって発現されたタンパク質を細胞破砕して抽出する際、および、抽出後には、これらのプロテアーゼが発現されたタンパク質を分解してしまうため、その活性を抑制しておく必要がある。
【0005】
プロテアーゼ活性の抑制方法としては、様々なプロテアーゼ阻害剤を添加する方法が最も一般的である。しかし、プロテアーゼ阻害剤の種類によっては、完全にプロテアーゼの活性を抑制できないものもあり、目的タンパク質を分離精製しても、時間の経過とともにタンパク質の分解が進行してしまうことが多かったのが実状である。さらに、プロテアーゼ阻害剤の添加により、精製が困難になるという問題も指摘されていた。
【0006】
したがって、この出願の発明は、以上の通りの事情に鑑みてなされたものであり、従来技術の問題点を解消し、目的タンパク質を分解させることなく、効果的かつ簡便に宿主のタンパク質大量発現系からプロテアーゼを除去する方法を提供することを目的としている。
【0007】
【課題を解決するための手段】
そこで、この出願の発明は、以下の通りの発明を提供する。
【0008】
まず第1には、この出願の発明は、タンパク質を大量発現させた宿主を、少なくとも尿素を含有する破砕溶液中で破砕した後、イオン交換クロマトグラフィーにより精製することを特徴とするプロテアーゼ除去方法を提供する。
【0009】
また、この出願の発明は、第2には、破砕方法が、物理的破砕であること、第3には、該物理的破砕が、超音波破砕であること、第4には、尿素の濃度が6M以上であること、および第5には、イオン交換クロマトグラフィーが、陽イオン交換カラムと陰イオン交換カラムを組み合せて成ることを上記プロテアーゼ除去方法の態様として提供する。
【0010】
さらに、この出願の発明は、第6には、タンパク質大量発現用宿主が、細菌であること、第7には、該細菌が大腸菌であることをその態様として提供する。
【0011】
【発明の実施の形態】
この出願の発明のプロテアーゼ除去方法は、宿主を用いて一般的な遺伝子工学的手法により大量発現されたタンパク質の精製を行う際に、しばしば問題となる宿主由来のプロテアーゼを、効果的に、かつ簡便に除去するためのものである。
【0012】
その手順としては、まず、目的タンパク質を大量発現させた宿主に少なくとも尿素を含有する破砕溶液を加え、その中で宿主の細胞膜を破砕した後、イオン交換クロマトグラフィーにより、目的タンパク質とそれを基質とするプロテアーゼを分離する。
【0013】
このとき、タンパク質の大量発現系として用いる宿主は、遺伝子工学的手法において一般的に用いられる様々なものが適用できる。具体的には、大腸菌、枯草菌、原核細胞、酵母、昆虫細胞、哺乳動物細胞、植物細胞などが挙げられる。これらは、目的タンパク質の構造、性質、用途等に応じて選択される。
【0014】
大量発現されたタンパク質を宿主から抽出させるために、遺伝子工学的手法では、通常、宿主の破砕を行う。この出願の発明のプロテアーゼ除去方法では、まず、破砕溶液の添加を行う。この破砕溶液は、少なくとも尿素を含有していればよく、その尿素濃度は、とくに限定されないが、6M以上とすることが好ましい。尿素以外の成分は特に限定されないが、目的タンパク質の性質や精製条件に応じてpHを調製した緩衝液としてもよい。
【0015】
破砕の方法としては、一般的な遺伝子組換操作において用いられる様々な方法を適用することが可能である。例えばホモジナイザー、フレンチプレス、超音波などの物理的破砕方法や、界面活性剤による細胞膜の溶解などが例示される。なかでも、薬品等の添加により精製工程を複雑化する恐れがなく、簡便で効果の高い超音波破砕が好ましい。
【0016】
菌体を破砕し、抽出した目的タンパク質は、そのままイオン交換クロマトグラフィーによって、プロテアーゼを分離、除去される。イオン交換クロマトグラフィーは、通常用いられる多種多様のものから選択されるが、とくに陽イオン交換カラムと陰イオン交換カラムを連結させて行うことが効果的で好ましい。その際、カラムの順序や種類、サイズ、能力、溶液の流量、流速等の条件は、目的タンパク質の性質とプロテアーゼの性質によって適宜変更することが可能である。好ましくは、陽イオン交換カラムを最初にし、その後陰イオン交換カラムを連結する。
【0017】
陽イオン交換カラムには、プロテアーゼが吸着するため、抽出液を通過させれば、抽出液からプロテアーゼが除去される。一方、陰イオン交換カラムには、目的タンパク質が吸着する。陽または陰イオン交換カラムに吸着しない尿素などの不純物は流出し、除去される。
【0018】
この出願の発明のプロテアーゼ除去方法では、最後に陰イオン交換カラムを陽イオン交換カラムから分離し、適当な溶媒によりカラムを洗浄することにより、目的タンパク質のみを回収できる。
【0019】
以下に実施例を示し、この出願の発明をさらに詳しく説明する。もちろんこの出願の発明は、これらの例に限定されるものではなく、様々な態様が考えられることは言うまでもない。
【0020】
【実施例】
以下の実施例、比較例において、プロテアーゼXとは、FlgFを基質とする宿主由来のプロテアーゼを示す。
【0021】
実施例1 プロテアーゼXの活性に対する阻害剤と尿素の効果
サルモネラ菌べん毛タンパク質の一つであるFlgF(Salmonella typhimurium flagellar protein)を大腸菌BL21(DE3)pLysSを宿主として、通常の遺伝子工学的手法により大量発現させた。8Mの尿素を添加し、超音波によって大腸菌の細胞膜を破砕すると同時に、プロテアーゼを変性させた。
【0022】
この溶液を、遠心分離にかけて可溶性画分を分離した。
【0023】
得られた可溶性画分を、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)により分析し、FlgFの存在を確認した。
【0024】
比較例1〜6
実施例1と同様の方法でタンパク質を大量発現させた大腸菌BL21(DE3)pLysSに、50mMのTris−HCl(pH8.0)および1mMのEDTAを混合したTE溶液(比較例1)、TE溶液にペプスタチンAを2μg/ml添加した溶液(比較例2)、TE溶液にロイペプチンを2μg/ml添加した溶液(比較例3)、TE溶液に4−(2−アミノエチル)ベンゼンスルホニルフルオライド・HCl(p−ABSF)を2mM添加した溶液(比較例4)、TE溶液にL−1−トシルアミド−2−フェニルエチルクロロメチルケトン(TPCK)を2mM添加した溶液(比較例5)、TE溶液にベーリンガーマンハイム社製のプロテアーゼインヒビターカクテルタブレット1個/50mlを加えた溶液(比較例6)を用いて、実施例1同様に超音波破砕し、遠心分離を経て可溶性画分を得た。各可溶性画分の含有成分を、SDS−PAGEによって分析し、FlgFと分解されたFlgFの存在を確認した。
【0025】
図1は、実施例1および比較例1〜6におけるSDS−PAGEのプロファイルである。これよりプロテアーゼXに対する阻害効果を比較できる。これによれば、比較例1〜6では、プロテアーゼ分解されたFlgFが可溶性画分中に存在していることが明らかであるが、実施例1の尿素を添加した溶液中で破砕、プロテアーゼ変性した系においては、分解されたFlgFは見られなかった。
【0026】
これより、尿素がプロテアーゼの活性を阻害する上で効果的であることが示された。
【0027】
実施例2、3 プロテアーゼ除去後のFlgFの安定性
実施例1と同様に、FlgF(Salmonella typhimurium flagellar protein)を大量発現させた大腸菌BL21(DE3)pLysSを、8Mの尿素溶液中で超音波によって破砕した後、遠心分離を経て可溶性画分を得た。
【0028】
HiTrapSP(陽イオン交換カラム)とHiTrapQ(陰イオン交換カラム)を連結したイオン交換カラムをTris−HCl(pH8.0)で平衡化し、この可溶性画分を通過させた。さらにTris−HCl(pH8.0)で洗浄し、陽イオン交換カラムを取り外した後、陰イオン交換カラムに吸着したFlgFを溶出した。このFlgF画分(実施例2)と、FlgF画分を37℃で1時間放置した後のもの(実施例3)を、それぞれSDS−PAGEにかけ、含有成分の分析を行なった。
【0029】
比較例7〜8
実施例2と同様の方法で、イオン交換クロマトグラフィー前のFlgF溶液(比較例7)、分離したFlgFに陽イオン交換カラムから溶出したプロテアーゼXを改めて添加し、37℃で一時間放置した溶液(比較例8)をSDS−PAGEにかけ、含有成分の分析を行なった。
【0030】
以上より、イオン交換クロマトグラフィー直後には、可溶性画分中には、FlgFのみが存在し、37℃で1時間経過後もFlgFは分解せずに安定に存在することが明らかになった。一方、分離精製後のFlgFにプロテアーゼXのみを添加した試料では、各成分由来の2つのスポットが明確に現れた。
【0031】
これより、この出願の発明のプロテアーゼ除去方法により、目的タンパク質からプロテアーゼを完全に除去することが可能であることが示された。
【0032】
【発明の効果】
以上詳しく説明した通り、この発明によって、目的タンパク質を分解させることなく、効果的かつ簡便に宿主のタンパク質大量発現系からプロテアーゼを除去する方法が提供される。
【図面の簡単な説明】
【図1】 この出願の発明の実施例において、様々なプロテアーゼ阻害剤と尿素を添加した際の、FlgF溶液のSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)の結果を示す図である。
【図2】 この出願の発明の実施例において、この出願の発明の方法でプロテアーゼを除去した後のFlgF溶液のSDS−PAGEの結果を示す図である。
[0001]
BACKGROUND OF THE INVENTION
The invention of this application relates to a protease removal method. More specifically, the invention of this application relates to a method for removing a host-derived protease that degrades a target protein when the protein is expressed in a large amount.
[0002]
[Prior art and its problems]
In general, proteins are obtained by isolating them from human organs, cell lines, etc., preparing peptides by chemical synthesis based on specific amino acid sequences, or recombining using specific DNA fragments. A method obtained by DNA technology is used. In particular, the recombinant DNA technology is useful as a method for industrially synthesizing a large amount of a uniform protein or for synthesizing a fusion protein that does not exist in nature.
[0003]
In recombinant DNA technology, an expression vector having a DNA fragment that synthesizes a target protein is introduced into a host such as Escherichia coli, Bacillus subtilis, yeast, insect cells, mammalian cells, or plant cells to express the target protein in large quantities. be able to.
[0004]
However, E. coli, Bacillus subtilis, and microorganisms such as yeast, animal cells, plant cells, owns various proteolytic enzymes (proteases) in cells thereof, the proteins expressed by recombinant technology and cell disruption During and after extraction, since the protein in which these proteases are expressed is degraded, it is necessary to suppress the activity.
[0005]
The most common method for inhibiting protease activity is to add various protease inhibitors. However, depending on the type of protease inhibitor, it may not be possible to completely inhibit the activity of the protease, and even if the target protein is separated and purified, the degradation of the protein often progressed over time. It is. Furthermore, it has been pointed out that the addition of a protease inhibitor makes purification difficult.
[0006]
Therefore, the invention of this application has been made in view of the circumstances as described above, solves the problems of the prior art, and effectively and simply eliminates the target protein and effectively and easily reduces the host protein mass expression system. It aims at providing the method of removing protease from.
[0007]
[Means for Solving the Problems]
Therefore, the invention of this application provides the following inventions.
[0008]
First of all, the invention of this application relates to a protease removal method characterized in that a host in which a large amount of protein is expressed is crushed in a crushing solution containing at least urea and then purified by ion exchange chromatography. provide.
[0009]
The invention of this application is that, secondly, the crushing method is physical crushing, third, the physical crushing is ultrasonic crushing, and fourth, the concentration of urea. The fifth aspect of the present invention provides an aspect of the method for removing proteases, wherein the ion exchange chromatography is a combination of a cation exchange column and an anion exchange column.
[0010]
Further, the invention of this application, the sixth, the protein mass expression host, it is a bacterium, the seventh, provides that the bacteria is E. coli as aspects thereof.
[0011]
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
The protease removal method of the invention of this application is effective and convenient for purifying a protease derived from a host often problematic when purifying a protein expressed in large quantities by a general genetic engineering technique. It is intended to be removed.
[0012]
The procedure is as follows. First, a disruption solution containing at least urea is added to a host in which a large amount of the target protein is expressed, the cell membrane of the host is disrupted therein, and then the target protein and the substrate are separated by ion exchange chromatography. Isolate the protease.
[0013]
At this time, various hosts generally used in genetic engineering techniques can be applied as a host used as a protein mass expression system. Specific examples include Escherichia coli, Bacillus subtilis, prokaryotic cells, yeast, insect cells, mammalian cells, plant cells, and the like. These are selected according to the structure, properties, use, etc. of the target protein.
[0014]
In order to extract a protein expressed in a large amount from a host, the genetic engineering technique usually involves crushing the host. In the protease removal method of the invention of this application, first, a crushing solution is added. The crushing solution only needs to contain at least urea, and the urea concentration is not particularly limited, but is preferably 6 M or more. Components other than urea are not particularly limited, but may be a buffer whose pH is adjusted according to the properties of the target protein and purification conditions.
[0015]
As a disruption method, various methods used in general gene recombination operations can be applied. Examples include physical disruption methods such as homogenizers, French presses, and ultrasonic waves, and cell membrane lysis with a surfactant. In particular, there is no fear of complicating the purification process by adding chemicals and the like, and simple and highly effective ultrasonic crushing is preferable.
[0016]
Protease is separated and removed from the target protein extracted by crushing the microbial cells as it is, by ion exchange chromatography. The ion exchange chromatography is selected from a wide variety of commonly used ones, and it is particularly effective and preferable to carry out by connecting a cation exchange column and an anion exchange column. In this case, conditions such as column order, type, size, capacity, solution flow rate, and flow rate can be appropriately changed depending on the properties of the target protein and the protease. Preferably, the cation exchange column is first and then the anion exchange column is connected.
[0017]
Since the protease is adsorbed on the cation exchange column, the protease is removed from the extract by passing the extract. On the other hand, the target protein is adsorbed on the anion exchange column. Impurities such as urea that do not adsorb on the cation or anion exchange column flow out and are removed.
[0018]
In the protease removal method of the invention of this application, finally, only the target protein can be recovered by separating the anion exchange column from the cation exchange column and washing the column with an appropriate solvent.
[0019]
The following examples further illustrate the invention of this application in more detail. Of course, the invention of this application is not limited to these examples, and it goes without saying that various modes can be considered.
[0020]
【Example】
In the following Examples and Comparative Examples, protease X refers to a host-derived protease using FlgF as a substrate.
[0021]
Example 1 Effect of Inhibitor and Urea on Protease X Activity FlgF (Salmonella typhimurium flagellar protein), which is one of Salmonella flagellar proteins, is produced in large amounts by the usual genetic engineering technique using Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS as a host. Expressed. 8M urea was added, and the cell membrane of E. coli was disrupted by ultrasound, and at the same time, the protease was denatured.
[0022]
This solution was centrifuged to separate the soluble fraction.
[0023]
The obtained soluble fraction was analyzed by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) to confirm the presence of FlgF.
[0024]
Comparative Examples 1-6
A TE solution (Comparative Example 1) in which 50 mM Tris-HCl (pH 8.0) and 1 mM EDTA were mixed with E. coli BL21 (DE3) pLysS in which protein was expressed in a large amount in the same manner as in Example 1, A solution containing 2 μg / ml of pepstatin A (Comparative Example 2), a solution containing 2 μg / ml of leupeptin in the TE solution (Comparative Example 3), and 4- (2-aminoethyl) benzenesulfonylfluoride · HCl ( p-ABSF) with 2 mM added (Comparative Example 4), TE solution with 2 mM L-1-tosylamide-2-phenylethylchloromethylketone (TPCK) added (Comparative Example 5), and TE solution with Boehringer Mannheim Using a solution (Comparative Example 6) containing 1 protease inhibitor cocktail tablet / 50 ml manufactured by KK In the same manner as in Example 1, the mixture was sonicated and subjected to centrifugation to obtain a soluble fraction. The components contained in each soluble fraction were analyzed by SDS-PAGE to confirm the presence of FlgF and degraded FlgF.
[0025]
FIG. 1 is an SDS-PAGE profile in Example 1 and Comparative Examples 1-6. From this, the inhibitory effect on protease X can be compared. According to this, in Comparative Examples 1 to 6, it is clear that the protease-degraded FlgF is present in the soluble fraction, but it was crushed and protease-modified in the solution of Example 1 to which urea was added. In the system, no degraded FlgF was seen.
[0026]
From this, it was shown that urea is effective in inhibiting the activity of protease.
[0027]
Example 2, 3 Stability of FlgF after removal of protease As in Example 1, E. coli BL21 (DE3) pLysS in which a large amount of FlgF (Salmonella typhimurium flagellar protein) was expressed was disrupted by ultrasonication in an 8 M urea solution. After that, a soluble fraction was obtained through centrifugation.
[0028]
An ion exchange column connected with HiTrapSP (cation exchange column) and HiTrapQ (anion exchange column) was equilibrated with Tris-HCl (pH 8.0), and the soluble fraction was passed through. After further washing with Tris-HCl (pH 8.0) and removing the cation exchange column, FlgF adsorbed on the anion exchange column was eluted. The FlgF fraction (Example 2) and the one after the FlgF fraction was allowed to stand at 37 ° C. for 1 hour (Example 3) were each subjected to SDS-PAGE to analyze the contained components.
[0029]
Comparative Examples 7-8
In the same manner as in Example 2, the FlgF solution before ion exchange chromatography (Comparative Example 7), protease X eluted from the cation exchange column was added again to the separated FlgF, and the solution was allowed to stand at 37 ° C. for 1 hour ( Comparative Example 8) was subjected to SDS-PAGE, and the components contained therein were analyzed.
[0030]
From the above, it was revealed that immediately after ion-exchange chromatography, only FlgF was present in the soluble fraction, and FlgF was stably present without decomposition even after 1 hour at 37 ° C. On the other hand, in the sample in which only the protease X was added to FlgF after separation and purification, two spots derived from each component appeared clearly.
[0031]
From this, it was shown that the protease can be completely removed from the target protein by the protease removal method of the invention of this application.
[0032]
【The invention's effect】
As described above in detail, the present invention provides a method for removing protease from a host protein mass expression system effectively and simply without degrading the target protein.
[Brief description of the drawings]
FIG. 1 is a diagram showing the results of SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) of a FlgF solution when various protease inhibitors and urea are added in Examples of the invention of this application.
FIG. 2 is a diagram showing the results of SDS-PAGE of a FlgF solution after removing a protease by the inventive method of the present application in the inventive example of the present application.

Claims (5)

タンパク質を大量発現させた宿主を、6M濃度以上の尿素を含有する破砕溶液中で破砕した後、変性プロテアーゼを吸着するイオン交換クロマトグラフィーにより破砕物からプロテアーゼを除去し、次いで未分解のタンパク質を吸着するイオン交換クロマトグラフィーによりタンパク質を精製することを特徴とするタンパク質精製方法。A host in which a large amount of protein is expressed is crushed in a crushing solution containing urea of 6 M concentration or more, and then protease is removed from the crushed material by cation exchange chromatography that adsorbs denatured protease, and then undegraded protein is removed. A protein purification method comprising purifying a protein by adsorbing anion exchange chromatography. 破砕方法が、物理的破砕であることを特徴とする請求項1のタンパク質精製方法。The protein purification method according to claim 1, wherein the crushing method is physical crushing. 破砕方法が、超音波破砕であることを特徴とする請求項2のタンパク質精製方法。3. The protein purification method according to claim 2, wherein the crushing method is ultrasonic crushing. タンパク質大量発現用宿主が、細菌であることを特徴とする請求項1ないしのいずれかのタンパク質精製方法。The protein purification method according to any one of claims 1 to 3 , wherein the host for protein mass expression is a bacterium. タンパク質大量発現用細菌が、大腸菌であることを特徴とする請求項のタンパク質精製方法。The protein purification method according to claim 4 , wherein the bacterium for mass protein expression is Escherichia coli.
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