JP3004009B1 - New nacre matrix protein and its gene - Google Patents
New nacre matrix protein and its geneInfo
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Abstract
【要約】
【課題】 新規な真珠層基質タンパク質及びそれをコー
ドする遺伝子を提供する。
【解決手段】 アコヤガイの殻体の真珠層からのアルカ
リ可溶性有機基質成分を精製することにより、14kD
及び17kDの分子量を有し稜柱層には存在せず真珠層
のみに存在する新規な真珠層基質タンパク質が得られ
る。このタンパク質のN末端アミノ酸配列に対応するオ
リゴヌクレオチドをプローブとして用いて、アコヤガイ
の外套膜組織から調製されるcDNAライブラリーよ
り、新規な真珠層基質タンパク質の遺伝子がクローニン
グされる。The present invention provides a novel nacre matrix protein and a gene encoding the same. SOLUTION: By purifying an alkali-soluble organic substrate component from a nacre of a pearl oyster shell, a 14 kD
And a novel nacre matrix protein which has a molecular weight of 17 kD and does not exist in the trabecula but only in the nacre is obtained. Using an oligonucleotide corresponding to the N-terminal amino acid sequence of this protein as a probe, a gene for a novel nacre matrix protein is cloned from a cDNA library prepared from the oyster mantle tissue.
Description
【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
【0001】[0001]
【産業上の利用分野】本発明は、新規真珠層基質タンパ
ク質及びその遺伝子に関する。更に詳細には、アコヤガ
イ(Pinctada fucata) の殻皮の真珠層から得ることがで
き、殻皮の稜柱層からは得ることができない新規真珠層
基質タンパク質、及び真珠の人工的合成を可能にし得る
該新規真珠層基質タンパク質をコードする遺伝子に関す
る。The present invention relates to a novel nacre matrix protein and its gene. More specifically, a novel nacre matrix protein that can be obtained from the nacre of the shell of the pearl oyster (Pinctada fucata), cannot be obtained from the ridge layer of the shell, and can enable artificial synthesis of pearls. The present invention relates to a gene encoding a novel nacre matrix protein.
【0002】[0002]
【従来の技術】真珠は、現在主として養殖によって生産
されている。養殖真珠は、アコヤガイの真珠層を作る外
套膜由来の組織切片(mantle piece)を、貝殻を削って作
った核とともにアコヤガイの生殖腺に移植し、移植され
た外套細胞が増殖して核を覆い、1、2年間 2の貝の養
殖後に、貝殻の裏で天然に形成されるのと同じ真珠層が
核を取り巻き真珠の珠が形成されて、生産されるもので
ある一般に、貝類の貝殻は、その外側である表面にある
方解石の結晶よりなる稜柱層、及びその内面である裏側
にあるアラレ石(aragonite) の結晶を主体とした真珠層
の層状構造からなっている。真珠層では、アラレ石をレ
ンガに例えると、このレンガを積み重ねた層状構造にな
っており、層間にはレンガを固めるセメントに相当する
コンキオリン(conchiolin)と呼ばれる層間基質が存在し
ている。コンキオリンは、アラレ石の結晶層を包むエン
ベロープタンパク質と、それを支えるシート状タンパク
質からなると考えられている。2. Description of the Related Art Pearls are currently mainly produced by aquaculture. Cultured pearls are transplanted into the gonads of pearl oysters with a mantle piece from the mantle that makes the nacre of pearl oysters, together with a nucleus made by shaving the shell, and the transplanted mantle cells proliferate and cover the nucleus, After one or two years of cultivation of two shellfish, the same nacre layer that forms naturally behind the shell surrounds the nucleus and forms a pearl bead. In general, shellfish shells are It has a laminar structure composed of calcite crystals on its outer surface, and a nacre layer mainly composed of aragonite crystals on its inner surface on the back side. In the nacre, if aragonite is compared to a brick, it has a layered structure in which the bricks are stacked, and an interlayer matrix called conchiolin corresponding to cement for solidifying the brick exists between the layers. Conchiolin is thought to consist of an envelope protein that surrounds the aragonite crystal layer and a sheet-like protein that supports it.
【0003】アコヤガイから生産される真珠の形成に
は、コンキオリンを構成するタンパク質が重要な役割を
有しており、これらのタンパク質をコードする遺伝子を
手に入れれば、バイオテクノロジーによる真珠作りの道
が開けるものと考えられている。松代らは、このコンキ
オリンの成分の一つである分子量6万のネクレイン(nac
rein) というタンパク質をコードする遺伝子のクローニ
ングに成功している (生物科学 1996 、第48巻、第3
号、 126-132頁) 。この遺伝子のクローニングは、真珠
そのものから真珠層をはがし、それから精製される分子
量6万のネクレインのN 末端アミノ酸配列をプローブと
して用いて、アコヤガイの外套膜から調製されたcDNAラ
イブラリーから達成されたものである。[0003] Proteins that constitute conchiolin play an important role in the formation of pearls produced from pearl oysters. It is considered open. Matsushiro and colleagues reported that one of the components of this conchiolin, a 60,000 molecular weight necrein (nac
rein) has been successfully cloned (Bioscience 1996, 48, 3
No. 126-132). The cloning of this gene was achieved from a cDNA library prepared from the pearl oyster mantle, using the N-terminal amino acid sequence of a 60,000 molecular weight necrein, which is obtained by removing the nacre from the pearl itself, as a probe. It is.
【0004】[0004]
【発明が解決しようとする課題】本発明者は、アコヤガ
イの真珠層と稜柱層に存在するタンパク質の違いが、真
珠の形成及び光沢に特に重要な役割を果たしていると考
え、真珠層と稜柱層に存在するタンパク質の違いを比較
検討した。その結果、真珠層には存在し、稜柱層には存
在しないタンパク質を見いだした。しかして、本発明の
目的は、アコヤガイの真珠層から得ることができ、稜柱
層からは得ることができない新規真珠層基質タンパク質
を提供することにある。更に本発明の目的は、真珠の人
工的合成を可能にし得る該新規真珠層基質タンパク質を
コードする遺伝子を提供することにある。The present inventor believes that the difference between the proteins present in the pearl layer and the trabecular layer of the pearl oyster plays a particularly important role in the formation and luster of the pearl. Were compared and examined for differences in the proteins present in the cells. As a result, they found a protein that was present in the nacre and not in the trabecula. Thus, an object of the present invention is to provide a novel nacre matrix protein which can be obtained from the pearl layer of a pearl oyster but cannot be obtained from the ridge layer. It is a further object of the present invention to provide a gene encoding the novel mother-of-pearl substrate protein that enables artificial synthesis of pearls.
【0005】[0005]
【課題を解決するための手段】本発明は、以下のi) - i
ii) の物理化学的性質を有する新規真珠層基質タンパク
質に関する: i) アコヤガイ(Pinctada fucata) の殻皮の真珠層から
得ることができ、殻皮の稜柱層からは得ることができな
い; ii) SDS-PAGE で測定した時の分子量が、 14KDa又は17K
Da である; iii) N 末端アミノ酸配列として、以下に示すアミノ酸
配列を有する; AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN 更に本発明は、以下の(a) 又は(b) に示す新規真珠層基
質タンパク質に関する: (a) 配列表の配列番号1-7 のいずれかに示すアミノ酸配
列を有する真珠層基質タンパク質; (b) 配列表の配列番号1-7 のいずれかに示すアミノ酸配
列において、 1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若
しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ真珠層基質
タンパク質としての機能を有するタンパク質。更に本発
明は、上記タンパク質をコードする遺伝子に関する。Means for Solving the Problems The present invention provides the following i) -i
ii) a novel nacre matrix protein with physicochemical properties: i) can be obtained from the nacre of the shell of the pearl oyster (Pinctada fucata) and cannot be obtained from the trabecular layer of the shell; ii) SDS The molecular weight as measured by -PAGE is 14KDa or 17K
Iii) has the following amino acid sequence as the N-terminal amino acid sequence; AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCNThe present invention further relates to a novel nacre substrate protein shown in the following (a) or (b): Nacre substrate protein having the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOS: 1-7; (b) In the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 1-7 in the sequence listing, one or several amino acids are deleted or substituted Or a protein having an added amino acid sequence and having a function as a nacre matrix protein. Further, the present invention relates to a gene encoding the above protein.
【0006】[0006]
【発明の実施の形態】[I] 本発明の新規真珠層基質タン
パク質の単離精製 本発明の新規真珠層基質タンパク質は、以下に示すよう
な方法により単離精製できる。アコヤガイの殻体から真
珠層のみを分離し、破砕して粉末化する。次いで、粉末
化した真珠層を、 Na-azide 含有のEDTAで抽出して脱灰
する。得られる抽出液を透析後、遠心し、上清を水可溶
性有機基質とし、沈殿を水不溶性有機基質とする。水不
溶性有機基質を希アルカリ水で抽出し、得られる抽出液
を透析後、遠心し、上清をアルカリ可溶性有機基質と
し、沈殿を不溶性有機基質とする。得られるアルカリ可
溶性有機基質を、ポリアクリルアミドゲルでSDS-PAGEに
付すことによって、 14KDa又は17KDa の分子量を示す本
発明の新規真珠層基質タンパク質が分離される。14KDa
又は17KDa の分子量を示すバンドから、通常の方法によ
り、本発明のタンパク質を単離することができる。アコ
ヤガイの稜柱層を用いて、上記したと同様の操作を実施
した場合には、以後に示す実施例1 に明らかにされてい
るように、稜柱層からの相当するアルカリ可溶性有機基
質からは14KDa 又は17KDa の分子量を示すタンパク質は
得られず、また相当する水可溶性有機基質からも得るこ
とができない。従って、本発明のタンパク質は真珠層に
存在し、稜柱層には存在しないタンパク質である。BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION [I] Isolation and purification of novel nacre matrix protein of the present invention The novel nacre matrix protein of the present invention can be isolated and purified by the following method. Only the nacre is separated from the pearl oyster shell, crushed and powdered. The powdered nacre is then extracted with Na-azide containing EDTA and decalcified. The obtained extract is dialyzed, centrifuged, the supernatant is used as a water-soluble organic substrate, and the precipitate is used as a water-insoluble organic substrate. The water-insoluble organic substrate is extracted with diluted alkaline water, and the resulting extract is dialyzed and centrifuged. The supernatant is used as the alkali-soluble organic substrate, and the precipitate is used as the insoluble organic substrate. By subjecting the obtained alkali-soluble organic substrate to SDS-PAGE on a polyacrylamide gel, a novel nacre substrate protein of the present invention having a molecular weight of 14 KDa or 17 KDa can be separated. 14KDa
Alternatively, the protein of the present invention can be isolated from a band having a molecular weight of 17 KDa by an ordinary method. When the same operation as described above was performed using the pearl oyster ridge layer, as shown in Example 1 below, 14 KDa or from the corresponding alkali-soluble organic substrate from the ridge layer was obtained. No protein with a molecular weight of 17 KDa is obtained, nor can it be obtained from the corresponding water-soluble organic substrates. Therefore, the protein of the present invention is a protein that exists in the nacre and not in the trabecula.
【0007】[II] 本発明の新規真珠層基質タンパク質
の物理化学的性質 本発明の新規真珠層基質タンパク質は、上記した単離精
製法から明らかなように、以下の性質を有する。 i) アコヤガイ(Pinctada fucata) の殻皮の真珠層から
得ることができ、殻皮の稜柱層からは得ることができな
い; ii) SDS-PAGEで測定した時の分子量が、 14KDa又は17KD
a である。また、単離精製法された本発明の14KDa 及び
17KDa の分子量を示すタンパク質を、Edman 分解により
そのN 末端アミノ酸配列を決定したところ、いずれのタ
ンパク質も以下に示すアミノ酸配列を有することが分か
った。 AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN また、以後の実施例2 に明らかにされているように、本
発明のタンパク質は、アコヤガイ真珠のアラレ石結晶形
成のための有機質の核となりうる機能を有している。[II] Physicochemical properties of the novel nacre matrix protein of the present invention The novel nacre matrix protein of the present invention has the following properties as apparent from the above-mentioned isolation and purification method. i) can be obtained from the nacre of the shell of the pearl oyster (Pinctada fucata) and cannot be obtained from the ridge layer of the shell; ii) the molecular weight measured by SDS-PAGE is 14KDa or 17KD
a. Further, the isolated and purified 14KDa of the present invention and
The N-terminal amino acid sequence of a protein having a molecular weight of 17 KDa was determined by Edman degradation, and it was found that each protein had the amino acid sequence shown below. AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN Further, as clarified in Example 2 below, the protein of the present invention has a function that can be an organic nucleus for aragonite crystal formation of pearl oyster pearls.
【0008】[III] 本発明の新規真珠層基質タンパク質
をコードする遺伝子のクローニング本発明の新規真珠層
基質タンパク質をコードする遺伝子のクローニングは、
以下に述べる方法によって行うことができる。 (1) オリゴヌクレオチドプローブの合成 アコヤガイの組織から以下に記載する方法によって調製
されるcDNAライブラリーから、本発明のタンパク質をコ
ードする遺伝子を検索するためのプローブを作成する。
プローブとしては、上記した本発明のタンパク質のN 末
端アミノ酸配列に基づいて作成することができる。例え
ば、 N末端アミノ酸配列中のDRRDNGGKKKをコードする塩
基配列として以下のプローブを挙げることができる。 5'- GAYMGNMGNGAYAAYGGNGGNAARAARAAR - 3 ’ また、 N末端アミノ酸配列中のGGKKKCFFC をコードする
塩基配列として以下のプローブを挙げることができる。 5'- GGNGGNAARAARAARTGYTTYTTYTGY - 3 ’ これらのプローブは、例えば、 32P-ATPとT4PNK により
5'末端をラベル化する。[III] Cloning of the gene encoding the novel nacre matrix protein of the present invention The cloning of the gene encoding the novel nacre matrix protein of the present invention comprises:
It can be performed by the method described below. (1) Synthesis of oligonucleotide probe A probe for searching for a gene encoding the protein of the present invention is prepared from a cDNA library prepared from pearl oyster tissue by the method described below.
The probe can be prepared based on the N-terminal amino acid sequence of the protein of the present invention described above. For example, the following probe can be mentioned as a nucleotide sequence encoding DRRDNGGKKK in the N-terminal amino acid sequence. 5'-GAYMGNMGNGAYAAYGGNGGNAARAARAAR-3 'The following probe can be mentioned as a base sequence encoding GGKKKCFFC in the N-terminal amino acid sequence. 5'- GGNGGNAARAARAARTGYTTYTTYTGY-3 'These probes can be used, for example, by 32 P-ATP and T4PNK.
Label the 5 'end.
【0009】(2) cDNAライブラリーの調製 アコヤガイの外套膜組織切片(mantle piece)からtotal
RNA を単離し、そこから常法によりmRNAを抽出する。 m
RNA から、例えば、 EcoRIアダプター付きの2本鎖cDNA
を合成し、ファージベクターである、例えばLambda gt1
0 にライゲーションし、次いでin vitroパッケージング
し、 cDNA ライブラリーを調製する。 (3) プラークハイブリダイゼーション 調製されたcDNAライブラリーを、宿主大腸菌と混合し、
プレート上にまいてインキュベーションすることにより
プラークを形成する。次いで、プラーク中のファージDN
A をニトロセルロースフィルターにトランスファーし、
フィルター上のファージDNA をアルカリ処理して一本鎖
DNA とする。これに、前記した5'末端をラベル化したプ
ローブを加えてハイブリダイゼーションを行う。ハイブ
リダイゼーションの際には、前記した2 種類のプローブ
の内、まず一つのプローブでハイブリダイゼーションを
実施して一次スクリーニングを行って陽性プラークを
得、次いで、更に他の一つのプローブで再びハイブリダ
イゼーションを実施して二次スクリーニングを行って陽
性プラークを得てもよい。(2) Preparation of cDNA Library Total from mantle piece of pearl oyster mantle
RNA is isolated and mRNA is extracted therefrom by a conventional method. m
From RNA, for example, double-stranded cDNA with EcoRI adapter
And a phage vector such as Lambda gt1
Ligation to 0 followed by in vitro packaging to prepare a cDNA library. (3) Plaque hybridization prepared cDNA library, mixed with host E. coli,
Plaques are formed by plating and incubating. Then, the phage DN in the plaque
A to a nitrocellulose filter
Alkaline phage DNA on filter is single-stranded
DNA. To this, hybridization is carried out by adding the above-mentioned probe labeled with the 5 'end. At the time of hybridization, of the two types of probes described above, first, hybridization is performed with one probe to perform primary screening to obtain a positive plaque, and then hybridization is performed again with another one probe. A second screening may be performed to obtain positive plaques.
【0010】(4) シークエンシング 得られる陽性プラークから、ファージDNA である、例え
ばLambda gt10 ファージDNA を精製しEcoRI でDNA イン
サートを切り出して、プラスミドベクター、例えばpGEM
にサブクローニングする。次いで、そのプラスミドDNA
を精製しシークエンシングを行う。シークエンシング法
としては、サイクルシークエンス法が好ましい。サイク
ルシークエンス法は、 PCR反応とジデオキシ法によるシ
ークエンス反応とを同時に行う方法であり、従来法では
塩基配列決定が困難であった二本鎖DNA を従来の約1/
4の鋳型量で容易に塩基配列決定できると言う利点を持
つ。かくして、本発明の新規真珠層基質タンパク質をコ
ードする遺伝子の塩基配列が決定される。前記した5'末
端をラベル化したプローブは、本発明のタンパク質のN
末端から21-30 番目あるいは26-34 番目のアミノ酸配列
をコードするオリゴヌクレオチドであるため、得られる
遺伝子は、本発明のタンパク質のN 末端部分に対応する
5'末端部分を欠いている場合があり得る。このような場
合は、 5'RACE 法により、その5'末端部分の塩基配列を
決定することができる。5'-RACEは、未知のcDNAの5'末
端を効率的に増幅、取得する方法である。これにより、
cDNAライブラリーを作成することなくcDNAクローニング
が可能となる。具体的には、作成したcDNAの末端にアダ
プター配列を設け、このアダプター配列と目的とする遺
伝子の配列間でPCR を行い、目的遺伝子の未知の末端を
取得することができる。(4) Sequencing A phage DNA, for example, Lambda gt10 phage DNA is purified from the obtained positive plaque, and a DNA insert is cut out with EcoRI to obtain a plasmid vector, for example, pGEM.
Subcloning into Then, the plasmid DNA
Is purified and subjected to sequencing. As a sequencing method, a cycle sequencing method is preferable. The cycle sequencing method is a method in which the PCR reaction and the sequencing reaction by the dideoxy method are performed simultaneously, and double-stranded DNA, which was difficult to determine the base sequence by the conventional method, is reduced to about 1 /
There is an advantage that the nucleotide sequence can be easily determined with a template amount of 4. Thus, the nucleotide sequence of the gene encoding the novel nacre matrix protein of the present invention is determined. The probe labeled at the 5′-end is the N-terminal of the protein of the present invention.
Since it is an oligonucleotide encoding the 21-30th or 26-34th amino acid sequence from the end, the resulting gene corresponds to the N-terminal part of the protein of the present invention.
It is possible that the 5 'end is missing. In such a case, the base sequence at the 5 'end can be determined by the 5' RACE method. 5'-RACE is a method for efficiently amplifying and obtaining the 5 'end of an unknown cDNA. This allows
cDNA cloning becomes possible without creating a cDNA library. Specifically, an adapter sequence is provided at the end of the prepared cDNA, and PCR is performed between the adapter sequence and the sequence of the target gene to obtain an unknown end of the target gene.
【0011】[IV] 本発明の新規真珠層基質タンパク質
のアミノ酸配列及びそれをコードする 遺伝子 上記したクローニングを実施することにより、配列表の
配列番号1-7 に示す7種類の本発明のタンパク質をコー
ドする遺伝子が見出された。また、配列番号1-7 に示す
7 種類のコード遺伝子から、配列番号1-7 に示す7 種類
のアミノ酸配列からなる本発明のタンパク質が見出され
た。配列番号1-7 に示すそれぞれのアミノ酸配列におい
て、 1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付
加されたアミノ酸配列を有し、かつ真珠層基質タンパク
質としての機能を有するタンパク質も本発明の範囲内の
ものである。アミノ酸の欠失、置換若しくは付加は、実
質的にそのタンパク質全体の構造及び機能に影響を与え
ない程度のものであり、例えばアミノ酸の置換として
は、同様の疎水性、大きさ、電荷及び/ 又は芳香性を有
するアミノ酸同志の置換が挙げられる。このような置換
としては、例えばグリシンとプロリン、チロシンとトリ
プトファン、アスパラギンとセリンとの置換が挙げられ
る。これらのアミノ酸の欠失、置換、付加の程度は、も
とのアミノ酸配列との相同性が80% 以上のものが許容し
得る範囲である。[IV] Amino acid sequence of novel nacre matrix protein of the present invention and gene encoding the same By performing the above cloning, seven types of proteins of the present invention shown in SEQ ID NOs: 1 to 7 in the sequence listing can be obtained. The encoding gene was found. Also shown in SEQ ID NOs: 1-7
From the seven types of coding genes, a protein of the present invention consisting of the seven types of amino acid sequences shown in SEQ ID NOS: 1-7 was found. In the respective amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 1 to 7, a protein having an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added, and having a function as a nacre substrate protein is also within the scope of the present invention. Inside. Amino acid deletions, substitutions or additions are those which do not substantially affect the structure and function of the whole protein.For example, amino acid substitutions have the same hydrophobicity, size, charge and / or Substitution of aromatic amino acids may be mentioned. Such substitutions include, for example, substitutions of glycine for proline, tyrosine for tryptophan, and asparagine for serine. The degree of deletion, substitution, and addition of these amino acids is within the acceptable range if the homology with the original amino acid sequence is 80% or more.
【0012】また、本発明においては、配列番号1-7 に
示す7 種類のコード遺伝子の他に、配列番号1-7 に示す
それぞれのアミノ酸配列において、 1若しくは数個のア
ミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列を
有し、かつ真珠層基質タンパク質としての機能を有する
タンパク質をコードする遺伝子も本発明の範囲内のもの
である。更には、配列表の配列番号1-7 に示すそれぞれ
のコード遺伝子とストリンジェントな条件下でハイブリ
ダイズし、かつ真珠層基質タンパク質としての機能を有
するタンパク質をコードする遺伝子も本発明の範囲内の
ものである。このようなハイブリダイズするDNA 変異体
としては、部位特異的変異導入、変異剤処理によるラン
ダム変異、制限酵素切断によるDNA 断片の変異、欠失、
連結等により、部分的にDNA 配列が変化したものが挙げ
られる。これらのDNA 変異体が配列番号1-7 に示すそれ
ぞれのコード遺伝子とハイブリダイズする程度として
は、ストリンジェントな条件下、例えば 5 ×SSPE 0.2%SDS 5% Denhart's sol 0.1mg/ml Salmon sperm DNA 50% ホルムアミド の組成で30% ホルムアミド、42℃での一晩(12-16 時
間)インキュベーションの条件下でサザンハイブリダイ
ゼーションによりハイブリダイズするものである。In the present invention, in addition to the seven types of coding genes shown in SEQ ID NOS: 1-7, one or several amino acids are deleted or substituted in each amino acid sequence shown in SEQ ID NOs: 1-7. Alternatively, a gene encoding a protein having an added amino acid sequence and having a function as a nacre matrix protein is also within the scope of the present invention. Furthermore, a gene that hybridizes under stringent conditions with each of the encoding genes shown in SEQ ID NOs: 1 to 7 in the sequence listing and that encodes a protein having a function as a nacre substrate protein is also included in the scope of the present invention. Things. Such hybridizing DNA mutants include site-directed mutagenesis, random mutation by treatment with a mutagen, mutation of DNA fragment by restriction enzyme cleavage, deletion,
The DNA sequence may be partially changed due to ligation or the like. The degree to which these DNA mutants hybridize with the respective encoding genes shown in SEQ ID NOs: 1 to 7 is determined under stringent conditions, for example, 5 × SSPE 0.2% SDS 5% Denhart's sol 0.1 mg / ml Salmon sperm DNA 50 It hybridizes by Southern hybridization under the condition of incubation of 30% formamide at 42 ° C. overnight (12-16 hours) with the composition of% formamide.
【0013】[V] 本発明の新規真珠層基質タンパク質の
製造法 本発明のタンパク質は、前記したように、アコヤガイの
真珠層から単離精製することによって得ることができ、
また、本発明によってクローニングされたコード遺伝子
を用いた組換えDNA 法により製造することもできる。組
換えDNA 法により製造する場合には、コード遺伝子を適
当なベクターに導入して発現用の組換えベクターを構築
し、このベクターで微生物を形質転換し、得られる形質
転換体を培養し、その培養物から回収することにより、
本発明のタンパク質を製造することができる。ここで使
用する適当なベクターとしては、例えば、 pUC18, pKK2
23-3などの大腸菌での発現用プラスミドが挙げられる。
あるいは、酵母、動物細胞などの真核細胞中での発現用
に用いられる通常の発現ベクターを用いることもでき
る。発現ベクターで適当な宿主細胞、例えば大腸菌、酵
母、動物細胞などを形質転換し、得られる形質転換体を
培養することにより、本発明のタンパク質が製造され
る。[V] Method for producing novel nacre matrix protein of the present invention The protein of the present invention can be obtained by isolating and purifying from the nacre of pearl oyster, as described above.
Further, it can also be produced by a recombinant DNA method using the coding gene cloned according to the present invention. In the case of production by a recombinant DNA method, a recombinant vector for expression is constructed by introducing an encoding gene into an appropriate vector, a microorganism is transformed with this vector, and the resulting transformant is cultured. By recovering from culture,
The protein of the present invention can be produced. Suitable vectors used here include, for example, pUC18, pKK2
Plasmids for expression in Escherichia coli such as 23-3.
Alternatively, a normal expression vector used for expression in eukaryotic cells such as yeast and animal cells can also be used. The protein of the present invention is produced by transforming an appropriate host cell, for example, Escherichia coli, yeast, animal cell, or the like, with the expression vector and culturing the resulting transformant.
【0014】[0014]
【実施例】以下、本発明を実施例によって更に詳細に説
明するが本発明はこれら実施例のみに限定されるもので
はない。 実施例 1本発明の真珠層基質タンパク質の単離精製 (1) アコヤガイからの単離 アコヤガイ殻体から真珠層のみを分離し、粉末化した真
珠層100gm を0.01% Na- azide 含有の10% EDTA (pH 7.
5) 3l中で脱灰した。脱灰は、室温にて連続かくはん下
で6 日間行った。脱灰液は、 0.01 % Na-azide 含有の
dH2 O に対して、透析を4 日間行った。透析液はロータ
リーエバポレターで脱気・ 濃縮し、濃縮液を15,000 G/4
℃にて遠心分離した。遠心後の上清を水可溶性有機基質
(water soluble organic matrix = WSM)と、沈殿を水不
溶性有機基質(water insoluble organic matrix = WIS
M) と名付け、それぞれ凍結乾燥して、−20℃で保存し
た。WISMは、希アンモニア水 (pH 8.5) 中でポリトロン
ホモジェナイズした後、一晩連続かくはんし抽出した。
抽出液は、 15,000 G/4 ℃で遠心分離した。遠心後の上
清をアルカリ可溶性有機基質(alkali soluble organic
matrix = ALSM)と、沈殿を不溶性有機基質(insoluble o
rganic matrix = ISM)と名付け、それぞれ凍結乾燥し
て、−20℃で保存した。EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples, but the present invention is not limited to these examples. Example 1 Isolation and purification of nacre matrix protein of the present invention (1) Isolation from pearl oyster Only nacre was separated from pearl oyster shell, and powdered nacre 100 gm was added to 10% EDTA containing 0.01% Na-azide. (pH 7.
5) Decalcified in 3 l. Decalcification was performed at room temperature under continuous stirring for 6 days. The demineralized solution contains 0.01% Na-azide.
Dialysis was performed against dH 2 O for 4 days. The dialysate is degassed and concentrated using a rotary evaporator, and the concentrated solution is 15,000 G / 4
Centrifuged at ℃. After centrifugation, the supernatant is
(water soluble organic matrix = WSM) and precipitate in water insoluble organic matrix (WIS)
M), each was freeze-dried and stored at -20 ° C. WISM was continuously stirred overnight after polytron homogenization in dilute aqueous ammonia (pH 8.5).
The extract was centrifuged at 15,000 G / 4 ° C. After centrifugation, the supernatant is washed with an alkali soluble organic substrate (alkali soluble organic substrate).
matrix = ALSM) and precipitate insoluble organic matrix (insoluble o
rganic matrix = ISM), each was freeze-dried and stored at -20 ° C.
【0015】(2) SDS-PAGE WSM とALSMの凍結乾燥試料のそれぞれ1mg を100 μl の
SDS-PAGE用サンプルバファーに溶解し、過熱処理後、 0
1-20% の濃度勾配ポリアクリルアミドゲルでSDS-PAGEを
行った。染色には、 CBB, Silver, Stainsall を用い
た。 (3) SDS-PAGE 解析結果 SDS-PAGE 結果を図1 に示した。図1 から明らかなよう
に、真珠層中のWSM のSDS-PAGEでは、 47kD にバンドが
一本認められた他、低分子量の領域に極めて細い多くの
バンドが観察された。稜柱層中のWSM のSDS-PAGEでは、
47kD に明瞭なバンドが認められ、それより上部の60kD
にかけての領域にややスメアーな太いバンドが染色され
た。その他、低分子量の領域には、バンドは認められな
かった。真珠層中のALSMのSDS-PAGEでは、 17kD と14kD
に2 本のバンドが認められたが、高分子量の領域にはバ
ンドが認められなかった。図1には示されていないが、
稜柱層中のALSMのSDS-PAGEでは、バンドが全く出現せ
ず、タンパク質成分が存在しないことが確認された。以
上により、真珠層に存在し、稜柱層には存在しない14KD
a 又は17KDa の分子量を示す本発明のタンパク質が分離
された。(2) SDS-PAGE 1 mg of each lyophilized sample of WSM and ALSM was added to 100 μl of
Dissolve in sample buffer for SDS-PAGE,
SDS-PAGE was performed on a 1-20% gradient polyacrylamide gel. CBB, Silver and Stainsall were used for staining. (3) Results of SDS-PAGE analysis The results of SDS-PAGE are shown in FIG. As is clear from FIG. 1, one band was observed at 47 kD in SDS-PAGE of WSM in nacre, and many very narrow bands were observed in the low molecular weight region. In SDS-PAGE of WSM in the ridge column,
A clear band was observed at 47 kD, and the upper 60 kD
A slightly smeared thick band was stained in the region up to. In addition, no band was observed in the low molecular weight region. 17kD and 14kD for SDS-PAGE of ALSM in nacre
However, no band was observed in the high molecular weight region. Although not shown in FIG. 1,
In the SDS-PAGE of ALSM in the trabecular layer, no band appeared and no protein component was confirmed. As a result, 14KD is present in the nacre and not in the ridge column
Proteins of the invention exhibiting a or 17 KDa molecular weight were isolated.
【0016】実施例 2本発明のタンパク質のアコヤガイ真珠層形成に際しての
役割 実施例 1と同様にして、アコヤガイ殻体中から真珠層の
みを分離し、粉砕した後、ED TAで脱灰する。脱灰液を
透析後、遠心により、上清( 水可溶性有機基質=WSM) と
沈殿( 水不溶性有機基質=WISM)とに分けた。 WSMの主成
分はナクレインである。WISMは、ポリトロンホモジェナ
イザーで粉砕後、希アンモニア水(pH8.5) 中で一晩かく
はんし、遠心して、上清( アルカリ可溶性有機基質=ALS
M)と沈殿( 不溶性有機基質=ISM) とに分けた。ALSMの主
成分は本発明のタンパク質(14kDと17kDの分子量のタン
パク質; 以下本発明タンパク質成分という) である。AL
SMから遠心ろ過により本発明タンパク質成分を分離し、
これを結晶誘導実験に用いた。結晶誘導実験は、有機基
質成分の炭酸カルシウムの特定の結晶形と結晶形態を誘
導する能力を判定するためのものである。アコヤガイ真
珠層は六角形平板状のアラレ石結晶で、稜柱層は方解石
結晶でできているため、真珠層から抽出した成分がこの
形態をしたアラレ石結晶を誘導することが確認されれ
ば、結晶誘導機能を有することが確認される。実験に
は、無機的にアラレ石のみを作る母液と方解石のみを作
る母液とを用意して、これらの母液中に種々の有機基質
成分を添加して、形成される結晶形と結晶形態を観察し
た。この実験は24穴のマイクロプレート中で、18℃の温
度下で行われた。Example 2 In the formation of pearl oyster nacre with the protein of the present invention,
Role In the same manner as in Example 1, only the nacre is separated from the pearl oyster shell, crushed, and then decalcified with EDTA. After the demineralized solution was dialyzed, the supernatant was separated into a supernatant (water-soluble organic substrate = WSM) and a precipitate (water-insoluble organic substrate = WISM) by centrifugation. The main component of WSM is nacrein. WISM is ground with a Polytron homogenizer, stirred overnight in dilute aqueous ammonia (pH 8.5), centrifuged, and the supernatant (alkaline soluble organic substrate = ALS).
M) and a precipitate (insoluble organic substrate = ISM). The main component of ALSM is the protein of the present invention (protein having a molecular weight of 14 kD and 17 kD; hereinafter, referred to as the protein component of the present invention). AL
The protein component of the present invention is separated from the SM by centrifugal filtration,
This was used for the crystal induction experiment. The crystallization induction experiment is to determine the specific crystal form of calcium carbonate as an organic substrate component and its ability to induce a crystal form. The pearl oyster pearl layer is a hexagonal plate-shaped aragonite crystal, and the ridge column layer is made of calcite crystal, so if it is confirmed that components extracted from the pearl layer induce this form of aragonite crystal, It is confirmed that it has a guiding function. In the experiment, a mother liquor that made only aragonite inorganically and a mother liquor that made only calcite were prepared, and various organic substrate components were added to these mother liquors, and the crystal forms and crystal forms formed were observed. did. This experiment was performed in a 24-well microplate at a temperature of 18 ° C.
【0017】まず、プレートの穴の底に基盤となる透析
チューブを貼り付けた場合と、何も敷かなかった場合と
の比較を行った。その結果、基盤膜がない場合には、母
液から形成される結晶と、有機基質成分を加えてできる
結晶との間に違いが認められなかった(図2 に示すよう
に、アラレ石系母液からは、針状の典型的なアラレ石結
晶が形成された。方解石系母液からは、サイコロ状の典
型的な方解石結晶が形成された) 。これに対して、透析
チューブを貼り付けた場合には、ナクレインや本発明タ
ンパク質成分を加えると、アラレ石系母液でも方解石系
母液でも、平板状のアラレ石結晶が誘導された。特に前
者では、結晶が大きく発達して層状になった。このこと
は、基盤となる膜状成分の存在があって初めて真珠層が
形成されることを意味する。引き続いて、有機基質成分
の添加量を変えたり、透析チューブにあらかじめ有機基
質成分を吸着させた上で、母液中に別の成分を添加する
などして検討を加えた。その結果、図3 及び図4 に示し
たように、本発明タンパク質成分を透析チューブに吸着
させた時に結晶の数が多くなり、そこにナクレインを添
加すると結晶のサイズが大きくなることが分かった。さ
らに、透析膜の変わりに、真珠層中から抽出したコンキ
オリン膜を基盤として実験を行った結果、膜に本発明タ
ンパク質成分を吸着させ、そこにナクレインを含む母液
を添加すると、天然の真珠層に類似した六角形平板状の
アラレ石結晶が出現した。真珠層が天然で形成される時
には、まず、不溶性のコンキオリン膜の上に有機基質を
中心とした核ができ、ここに結晶核が形成される。結晶
核から引き続いて結晶が成長し、互いに隣り合う結晶が
接触するまで成長すると真珠層に特有の平板状結晶が集
合した層になる。このため、真珠層の形成には、核形成
と結晶成長に関与するそれぞれ別々の2 成分の存在が指
摘されていた。本実験結果から、前者はN13 成分が、後
者はコンキオリンが相当する成分であることが推定され
た。First, a comparison was made between the case where a dialysis tube serving as a base was attached to the bottom of the hole of the plate and the case where nothing was laid. As a result, when there was no base film, no difference was observed between the crystals formed from the mother liquor and the crystals formed by adding the organic substrate component (as shown in Fig. 2, In this case, typical needle-like aragonite crystals were formed, and from the calcite-based mother liquor, typical dice-like calcite crystals were formed.) On the other hand, when the dialysis tube was stuck, the addition of nacrein and the protein component of the present invention induced plate-like aragonite crystals in both the aragonite-based mother liquor and the calcite-based mother liquor. Particularly in the former, the crystals developed greatly and became layered. This means that the nacre is formed only when the base film component is present. Subsequently, the amount of the organic substrate component was changed, or the organic substrate component was previously adsorbed to the dialysis tube, and then another component was added to the mother liquor for further study. As a result, as shown in FIGS. 3 and 4, it was found that when the protein component of the present invention was adsorbed to the dialysis tube, the number of crystals increased, and the size of the crystals increased when nacrine was added thereto. Furthermore, instead of a dialysis membrane, an experiment was conducted based on a conchiolin membrane extracted from the nacre, and as a result, the protein component of the present invention was adsorbed to the membrane, and when a mother liquor containing nacrein was added thereto, a natural nacre was formed. Similar hexagonal plate-like aragonite crystals appeared. When a nacre is formed naturally, a nucleus centering on an organic substrate is first formed on an insoluble conchiolin film, and a crystal nucleus is formed there. The crystal grows continuously from the crystal nucleus and grows until adjacent crystals come into contact with each other to form a layer of tabular crystals unique to the nacre. For this reason, it has been pointed out that the formation of nacres has two separate components that are involved in nucleation and crystal growth. From the results of this experiment, it was estimated that the former was an N13 component and the latter was a component corresponding to conchiolin.
【0018】以上をまとめると、真珠層の形成開始に際
してはまず、膜状のISM のシート(透析膜に対応する天
然の基盤膜) が分泌され、次に分泌された本発明タンパ
ク質成分がこの膜上に吸着して、結晶形成のための有機
質の核となり、この上に結晶核が形成される。続いてナ
クレインが分泌され、この成分が持つCAの作用により、
アラレ石結晶が成長する。結晶の成長方向はあらかじめ
規定されていて、c 軸方向には少しづつしか成長しない
(結晶成長の方向の制御因子に関しては今のところ不
明) 。やがて層が形成され、真珠層は、次のコンキオリ
ン膜に接するまで成長を続ける。ナクレインは、稜柱層
中の主成分にもなっている。稜柱層は方解石から構成さ
れているため、ナクレインは、アラレ石であれ方解石で
あれ、炭酸カルシウム結晶を成長させる働きを持つと考
えられる。一方、本発明タンパク質成分は、真珠層にほ
ぼ限って存在するため、真珠層のアラレ石結晶核形成に
は関与するが、稜柱層の方解石結晶核形成には無関係で
あると推定される。In summary, at the start of nacre formation, first, a membrane-like sheet of ISM (a natural base membrane corresponding to a dialysis membrane) is secreted, and then the secreted protein component of the present invention is separated from this membrane. Absorbed on the surface to become an organic nucleus for crystal formation, on which a crystal nucleus is formed. Subsequently, nacrein is secreted, and by the action of CA possessed by this component,
Araleite crystals grow. The crystal growth direction is predefined, and grows little by little in the c-axis direction (the factor controlling the crystal growth direction is unknown at this time). Eventually a layer is formed and the nacre continues to grow until it contacts the next conchiolin film. Nacrein is also the main component in the ridge column. Since the ridge column is composed of calcite, nacrein is thought to have the function of growing calcium carbonate crystals, whether aragonite or calcite. On the other hand, since the protein component of the present invention exists almost exclusively in the nacre, it is presumed to be involved in the formation of aragonite crystal nuclei in the nacre, but not to the formation of calcite crystal nuclei in the ridge column.
【0019】実施例 3本発明のタンパク質の遺伝子のクローニング (1) 本発明のタンパク質の単離精製 実施例1 の(1) と同様にして、アコヤガイ真珠層からAL
SMを得て凍結乾燥した。凍結乾燥品の一部200 マイクロ
グラムをサンプル緩衝液で溶かし、12% のアクリルアミ
ドでSDS-PAGEを行った。セミドライ法であるエレクトロ
ブロティングでアクリルアミド上での泳動後タンパク質
をPVDF膜にブロティングする。この後、Ponceau S 染色
する。Example 3 Cloning of the Gene of the Protein of the Present Invention (1) Isolation and Purification of the Protein of the Present Invention In the same manner as in Example 1, (1), AL
SM was obtained and lyophilized. A 200 microgram portion of the lyophilized product was dissolved in sample buffer and subjected to SDS-PAGE with 12% acrylamide. After electrophoresis on acrylamide by electroblotting, which is a semi-dry method, proteins are blotted on a PVDF membrane. Thereafter, Ponceau S staining is performed.
【0020】次いで、分子量14kD( 以下N14 と言う) ま
たは17kD( 以下N17 と言う) に相当するバンド部分のPV
DF膜をそれぞれ切り出した。この後、通常の方法に従い
PVDF膜上で還元S-アルキル化( 還元カルボキシメチル
法) を行なった。この処理後のPVDF膜を、島津のプロテ
インシークエンサーPPSQ21にかけ、PITC法(Edman分解)
を用いてタンパク質N-14, N17 のN 末端アミノ酸配列を
決定した。N14, N17のN 末端アミノ酸配列は、いずれも
以下の通りであり、同一のアミノ酸配列であった。 AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN (2) オリゴヌクレオチドプローブ配列、 その合成及び
ラベル化 N14, 17 のN 末端アミノ酸配列を元に2 種類のdegenera
te oligoプローブA 及びB をABI394 DNA synthesizerに
て合成した。その配列を以下に示す。 N 末端アミノ酸配列中のDRRDNGGKKKに相当するdegenera
te oligo プローブA:5 ’-GAYMGNMGNGAYAAYGGNGGNAARAARAAR-3 ’ N 末端アミノ酸配列中のGGKKKCFFC に相当するdegenera
te oligo プローブB:5 ’-GGNGGNAARAARAARTGYTTYTTYTGY-3’ Next, the PV of the band corresponding to a molecular weight of 14 kD (hereinafter referred to as N14) or 17 kD (hereinafter referred to as N17) is obtained.
Each DF membrane was cut out. After this, follow the usual method
Reduction S-alkylation (reduction carboxymethyl method) was performed on the PVDF membrane. The PVDF membrane after this treatment is applied to a Shimadzu protein sequencer PPSQ21, and the PITC method (Edman decomposition)
Was used to determine the N-terminal amino acid sequences of proteins N-14 and N17. The N-terminal amino acid sequences of N14 and N17 were as follows, and were identical amino acid sequences. AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN (2) Oligonucleotide probe sequence, its synthesis and labeling Two types of degenera based on the N-terminal amino acid sequence of N14, 17
The te oligo probes A and B were synthesized using an ABI394 DNA synthesizer. The sequence is shown below. Degenera corresponding to DRRDNGGKKK in the N-terminal amino acid sequence
te oligo Probe A: 5'-GAYMGNMGNGAYAAYGGNGGNAARAARAAR-3 ' degenera corresponding to GGKKKCFFC in N-terminal amino acid sequence
te oligo Probe B: 5'-GGNGGNAARAARAARTGYTTYTTYTGY-3 '
【0021】次いで、 32P-ATPとT4PNK によるオリゴヌ
クレオチドの5'末端ラベルを行った。即ち、 degenerat
ive oligo A 及びB をプローブDNA として、それぞれ約
50 ng を30-50 μCiの32P-ATP を用いて、T4ポリヌクレ
オチドキナーゼ( プロメガ社) で37℃、1 時間反応させ
標識した。 0.5MEDTA 1 μl, 10 mg/ml キャリアーRNA2
μl を加えた後フェノールクロロホルム(1:1) で抽出
し、Sephadex G-25 カラムにかけ、精製した。Next, the 5'-end of the oligonucleotide was labeled with 32P-ATP and T4PNK. That is, degenerat
Using ive oligo A and B as probe DNA, respectively
50 ng was labeled with T4 polynucleotide kinase (Promega) at 37 ° C. for 1 hour using 30-50 μCi of 32P-ATP. 0.5MEDTA 1 μl, 10 mg / ml carrier RNA2
After adding μl, the mixture was extracted with phenol-chloroform (1: 1), applied to a Sephadex G-25 column, and purified.
【0022】(3) mRNAの抽出 SV Total RNA Isolation System(プロメガ社) を用い
て、アコヤガイの外套膜組織切片(mantle piece)100 mg
から100 μg Total RNA を抽出した。さらに、この100
μg のTotal RNA をPolyATtract mRNA Isolation Syste
m (プロメガ社) にかけ10μg mRNAを抽出した。 (4) Lambda gt10 ライブラリーの作成 5 μg のmRNAをUniversal RiboClone cDNA Synthesis S
ystem(プロメガ社) を使用しEcoRI アダプター付の2 本
鎖cDNAが合成した。詳細には、Oligo(dT) プライマーと
AMV Reverse Transcriptase でファーストストランドの
合成を行い、直ちにRnaseHによるRNA 鎖の除去とDNA Po
lymerase Iによるセカンドストランドの合成を行った。
この後、T4 DNA Polymerase を用いて平潤末端にし、Ec
oRI アダプターをT4 DNA Ligase でライゲーションし
た。ライゲーション反応後、Sephacryl S-400 を用いた
ゲルろ過で過剰なアダプターを除去した。ゲルろ過後の
EcoRI 付2 本鎖cDNA 100 ng をLambda gt10 EcoRI arm
s(プロメガ社) 1 μg にライゲーションした。次いで、
Packagene Lambda DNA Packaging System( プロメガ
社) を用いてinvitroパッケージングした。(3) mRNA extraction Using a SV Total RNA Isolation System (Promega), 100 mg of mantle piece of pearl oyster
Was extracted from the sample. In addition, this 100
μg of Total RNA with PolyATtract mRNA Isolation System
m (Promega) to extract 10 μg mRNA. (4) Preparation of Lambda gt10 library 5 μg of mRNA was transferred to Universal RiboClone cDNA Synthesis S
A double-stranded cDNA with an EcoRI adapter was synthesized using ystem (Promega). Specifically, the Oligo (dT) primer and
First strand synthesis is performed using AMV Reverse Transcriptase, and RNA strand removal and DNA Po
Second strand was synthesized by lymerase I.
After this, the ends are made flat using T4 DNA Polymerase, and Ec
The oRI adapter was ligated with T4 DNA Ligase. After the ligation reaction, excess adapter was removed by gel filtration using Sephacryl S-400. After gel filtration
Transfer 100 ng of double-stranded cDNA with EcoRI to Lambda gt10 EcoRI arm
s (Promega) was ligated to 1 μg. Then
In vitro packaging was performed using Packagene Lambda DNA Packaging System (Promega).
【0023】(5) 感染とプレーティング in vitroパッケージングされたライブラリーより一部取
り、SMバファーで希釈系列を作成して、その内30μl を
宿主大腸菌C600hfl と混合して、37℃で20 min清置した
後、3 mlのソフトアガーロース(0.7%LB アガロース、あ
らかじめ50℃に温めておく) を加え、LBプレート上にま
いた。 37 ℃で12ー16時間インキュベートした。この結
果、2 x 106 のライブラリーが完成した。(5) Infection and plating A part of the in vitro packaged library was prepared, and a dilution series was prepared with an SM buffer. 30 μl of the dilution series was mixed with host E. coli C600hfl and incubated at 37 ° C. for 20 minutes. After clearing, 3 ml of soft agarose (0.7% LB agarose, pre-warmed to 50 ° C.) was added and spread on an LB plate. Incubated at 37 ° C for 12-16 hours. As a result, a 2 × 10 6 library was completed.
【0024】(6) 一次スクリーニング プラークのできたプレートを4 ℃で約30分間冷やした後
( 約30分) 、ニトロセルロースフィルター(S&S) をプレ
ートの上に空気が入らないように約3 分間清置しファー
ジDNA をニトロセルロースフィルターにトランスファー
した。その後、フィルターを剥がして、自然乾燥(約5
分間) した。その後、フィルターのファージのついた面
を上にして、以下の溶液を染み込ませた濾紙上に順次置
き、アルカリ処理、中和処理を行って、一本鎖DNA を調
製した。 1)0.5M NaOH/1.5MNaCl; 30-60秒 2)0.5M Tris-HCl(pH 7.5)/1.5M NaCl;3-5分 3)2x SSC;3-5 分 自然乾燥の後、80℃、2 時間感熱処理した。(6) Primary screening After cooling the plate on which the plaque is formed at 4 ° C. for about 30 minutes,
(About 30 minutes), the nitrocellulose filter (S & S) was kept on the plate for about 3 minutes without air, and the phage DNA was transferred to the nitrocellulose filter. Then remove the filter and air dry (approximately 5
Minutes). Thereafter, the filter was placed on a filter paper impregnated with the following solution with the phage side of the filter facing up, subjected to an alkali treatment and a neutralization treatment to prepare a single-stranded DNA. 1) 0.5M NaOH / 1.5M NaCl; 30-60 seconds 2) 0.5M Tris-HCl (pH 7.5) /1.5M NaCl; 3-5 minutes 3) 2x SSC; 3-5 minutes After natural drying, 80 ° C, Heat-treated for 2 hours.
【0025】(7) ハイブリダイゼーション ニトロセルロースフィルターを3xSSC に浸した後6xSSC-
1xDenhardt液-0.5%SDS液中で42℃で1-2 時間プレハイブ
リダイゼーションさせた。ハイブリダイセーションは、
42℃で15時間程度行った。このとき32P-ATP で5‘末端
ラベルしたプローブ Aを200,000 cpm/mlを目安として加
えた。ハイブリダイゼーション溶液の組成は、以下の通
りであった。 1M NaCl, 1xDenhardt, 50mM Tris-HCl(pH8.0), 10mMEDT
A, 0.1%SDS,50 μg/ml酵母RNA, 50μg/ml変性DNA (8) 洗浄、オートラジオグラフィー フィルターの洗浄は、6xSSC, 0.1%SDS溶液で50℃で30分
間を3 回行った。洗浄した後、フィルターをサランラッ
プで包みオートラジオグラフィーを一晩行った。この一
次スクリーニングで陽性となったプラークは13個あっ
た。(7) Hybridization After immersing the nitrocellulose filter in 3xSSC,
Prehybridization was performed at 42 ° C. for 1-2 hours in a 1 × Denhardt solution-0.5% SDS solution. Hybridization is
Performed at 42 ° C. for about 15 hours. At this time, probe A labeled at the 5 'end with 32P-ATP was added at a standard of 200,000 cpm / ml. The composition of the hybridization solution was as follows. 1M NaCl, 1xDenhardt, 50mM Tris-HCl (pH8.0), 10mMEDT
A, 0.1% SDS, 50 μg / ml yeast RNA, 50 μg / ml denatured DNA (8) Washing and autoradiography The filter was washed three times with a 6 × SSC, 0.1% SDS solution at 50 ° C. for 30 minutes. After washing, the filters were wrapped in Saran wrap and autoradiography was performed overnight. Thirteen plaques tested positive in this primary screen.
【0026】(9) 二次スクリーニング 一次スクリーニングで陽性となった13個のプラークをプ
レート上から滅菌した爪楊枝でプラーク周辺のソフトア
ガーとともにつつき0.5 mlのSMバッファーに懸濁した。
この溶液の1/100 希釈液10μl を一晩培養したC600hfl
300μl と混ぜ8ml の0.7%LBアガロースを加えて1.5%LB
アガープレート(15cm)上にまいた。この後37℃で一晩イ
ンキュベートした。この後一次スクリーニングと同じ要
領で、32P-ATP で5 ‘末端ラベルしたプローブ Bで、二
次スクリーニングを行った。一次スクリーニングで陽性
となった13個のプラークの内、二次スクリーニングの段
階で、2 個のプラークが陽性となった。(9) Secondary screening Thirteen plaques that became positive in the primary screening were plucked together with a soft agar around the plaque from a plate with a sterilized toothpick and suspended in 0.5 ml of an SM buffer.
C600hfl in which 10 μl of a 1/100 dilution of this solution was cultured overnight
Mix with 300 μl and add 8 ml 0.7% LB agarose to 1.5% LB
Sprinkled on agar plate (15 cm). This was followed by incubation at 37 ° C. overnight. Thereafter, in the same manner as in the primary screening, a secondary screening was performed using probe B labeled at the 5 'end with 32P-ATP. Of the 13 plaques that tested positive in the primary screen, 2 plaques became positive in the secondary screening stage.
【0027】(10) プラスンミドベクターへのサブクロ
ーニング 陽性プラークのSMバッファーの1/100 希釈液をXL1 Blu
e, MRF ’(Stratagene 社) に感染させ、この培養液を
λQuick spin kit(BIO 101社) を用いてLambdagt10 フ
ァージDNA を精製した。その後、EcoRI でインサートを
切り出してプラスミドベクター;pGEM(Promega社) にサ
ブクローニングし、そのプラスミドDNAをPlasmid Midi
Kit(Qiagen 社) を用いて精製し、サイクルシークエン
スのサンプルとした。こうして得られた陽性プラークの
インサートを保有するプラスミドクローンを#1’, #2’
とする。(10) Subcloning into Plasmid Vector A 1/100 dilution of the SM buffer of the positive plaque was added to XL1 Blu
e, MRF ′ (Stratagene), and Lambdagt10 phage DNA was purified from this culture using the λQuick spin kit (BIO 101). Thereafter, the insert was cut out with EcoRI, subcloned into a plasmid vector; pGEM (Promega), and the plasmid DNA was inserted into Plasmid Midi.
It was purified using Kit (Qiagen) and used as a sample for cycle sequencing. Plasmid clones containing the positive plaque insert thus obtained were # 1 'and # 2'
And
【0028】(11) シークエンシング サイクルシークエンス反応を利用して塩基配列決定を行
った。ここでは、pGEM(Promega社) にサブクローニング
したインサート cDNA をBigDye Terminator Cycle Sequ
encing FS Ready Reaction Kit( 使用Kit)(ABI) を用い
て、T7 promoter sequence primerとSP6 Promorter se
quence primer でインサート cDNA の両方向からシーク
エンスした。使用したシークエンサーはABI PRISM 377
DNA Sequencer である。シークエンスプライマーは以下
の配列である。 T7 promorter sequence primer; 5 ’-TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG-3 ’ SP6 promorter sequence primer; 5 ’-TAT TTA GGT GAC ACT ATA G-3’ かくして得られる#1’, #2’のクローンのシークエンス
データはそれぞれ配列表の配列番号8 及び9 に示した通
りであった。 (12) 5’端への延長 5 ’-RACE(rapid amplification of cDNA ends) 法を用
いたMarathon cDNA Amplification Kit(Clontech社) で
#1’, 2 ’の5 ’端のsequenceを有するcDNAフラグメン
トを得た。このとき、はじめのファーストストランドcD
NAを作成するのに用いられたアンチセンスプライマーの
配列は、#1' が5'-CATCGATGTACTCTTCCCGGAATTC-3' であ
り、#2' が5'- GAATCAAGGAAGTTTACTTGTCAT-3' であっ
た。Nested PCR用の1st アンチセンスプライマーは、そ
れぞれ#1' が5'-CCATTTCCGTTTCCGTAACCTCCA-3'であり、
#2' が5'- AGAATTCACCATTTCCGTTTCCGT-3' であった。Ne
sted PCR用の2nd アンチセンスプライマーは、それぞれ
#1' が5'- TATAAGGACTTGAGGTAATTTAAT-3' であり、#2'
が5'- ACCTCCATATAAAGACTTGAGGT-3'であった。上記の方
法に習い、得られたPCR 産物について、それぞれサブク
ローニング、シークエンスを行った。このフラグメント
の配列と#1’, #2’の配列を解析ソフトであるMacVecto
r6.0.1( 帝人システムテクノロジー) とLasergene(帝人
システムテクノロジー) でアッセンブルしオープンリー
ディングフレーム(ORF) 解析した。その結果、それぞれ
配列表の配列番号1 及び2 に示したオープンリーディン
グフレームを有するDNA の塩基配列が明らかになった。
また、これらの塩基配列から本発明のタンパク質は、配
列番号1 及び2 に示したアミノ酸配列を有することが明
らかになった。(11) Sequencing The nucleotide sequence was determined using a cycle sequencing reaction. Here, the insert cDNA subcloned into pGEM (Promega) was used for BigDye Terminator Cycle Sequence.
T7 promoter sequence primer and SP6 promorterase using the FS FS Ready Reaction Kit (Kit used) (ABI).
The insert cDNA was sequenced from both directions using quence primer. The sequencer used was ABI PRISM 377
DNA Sequencer. The sequence primer has the following sequence. T7 promorter sequence primer; 5'-TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG-3 'SP6 promorter sequence primer; 5'-TAT TTA GGT GAC ACT ATA G-3' Sequence of clones # 1 'and # 2' thus obtained The data were as shown in SEQ ID NOs: 8 and 9 in the sequence listing, respectively. (12) Extension to 5 'end Using Marathon cDNA Amplification Kit (Clontech) using 5'-RACE (rapid amplification of cDNA ends) method
CDNA fragments having sequences at the 5 'end of # 1' and 2 'were obtained. At this time, the first first strand CD
In the sequence of the antisense primer used for preparing NA, # 1 ′ was 5′-CATCGATGTACTCTTCCCGGAATTC-3 ′ and # 2 ′ was 5′-GAATCAAGGAAGTTTACTTGTCAT-3 ′. 1st antisense primer for nested PCR, # 1 'is 5'-CCATTTCCGTTTCCGTAACCTCCA-3', respectively
# 2 'was 5'-AGAATTCACCATTTCCGTTTCCGT-3'. Ne
2nd antisense primer for sted PCR
# 1 'is 5'-TATAAGGACTTGAGGTAATTTAAT-3' and # 2 '
Was 5'-ACCTCCATATAAAGACTTGAGGT-3 '. Following the above method, the obtained PCR products were subcloned and sequenced, respectively. MacVecto, an analysis software, analyzes the sequence of this fragment and the sequence of # 1 'and # 2'
Assembled with r6.0.1 (Teijin System Technology) and Lasergene (Teijin System Technology) and analyzed for open reading frame (ORF). As a result, the nucleotide sequences of the DNAs having the open reading frames shown in SEQ ID NOs: 1 and 2 in the sequence listing were revealed.
Further, from these nucleotide sequences, it was revealed that the protein of the present invention has the amino acid sequences shown in SEQ ID NOS: 1 and 2.
【0029】(13) 他のDNA 変異体の検索 得られた上記遺伝子配列#1,#2 よりCDS(蛋白をコードす
る領域) を増幅できるように以下のRT-PCR用のプライマ
ーを作成した。 1)センスプライマー TTC TGT GAG GCG GCG CCT GGA ATC 3)アンチセンスプライマー GTT CAT ACT TTA CTA TAT AAT TTT ACA これより、#1,#2 に類似するが若干のアミノ酸配列が変
異した配列や、若干のアミノ酸の欠失、挿入した配列が
得られる可能性があるからである。まずSV Total RNA I
solation System(プロメガ社) を用いて、外套膜組織切
片(mantle piece)100mg からTotal RNA を、引き続い
て、PolyATtract mRNA Isolation System(プロメガ社)
にかけ10μgmRNA を抽出精製した。このmRNA、5 μg を
Universal Ribo Clone cDNA Synthesis System(プロメ
ガ社) を使用し、Oligo(dT) プライマーとAMV Reverse
Transcriptase でファーストストランドの合成を行っ
た。このファーストランドcDNAをPCR のtemplateとし
て、95℃、30秒のディネーチャー、55℃、30秒のアーニ
リング、68℃、30秒のPCR サイクルでサーマルサイクラ
ーで増幅反応を行った。このPCR 増幅産物を精製して、
上記pGEMベクターにサブクローニングして、大腸菌のト
ランスフォーメーションを行った。インサート陽性のク
ローンを5 個選び、その大腸菌をミニカルチャーしてプ
ラスミド精製を行った。このプラスミドDNA を既に記述
したT7プロモーター シークエンス プライマーとSP6
Promorter sequence primer Big Dye Terminator 法で
インサートの両方向からABI377を用いて、シークエンシ
ングを行った。既に記述した解析ソフトMac Vector6.0.
1(帝人システムテクノロジー) とLasergene(帝人システ
ムテクノロジー) でアッセンブルした。かくして配列番
号3-7 に示したDNA 配列及びアミノ酸配列が得られた。
検索プログラムとしてNCBIのBLAST 2.0 を用いたGeneba
nkのデータベースの検索の結果、配列番号1-7 に示した
DNA 配列と相同性のある遺伝子は発見できなかった。従
って、本発明にて得られた遺伝子は新規遺伝子であるこ
とが判明した。配列番号1-7 に示したアミノ酸配列の相
同性を調べるためアラインメントを行った。その結果を
図5 に示した。(13) Search for other DNA mutants The following RT-PCR primers were prepared so that CDS (protein coding region) could be amplified from the obtained gene sequences # 1 and # 2. 1) Sense primer TTC TGT GAG GCG GCG CCT GGA ATC 3) Antisense primer GTT CAT ACT TTA CTA TAT AAT TTT ACA From this, a sequence similar to # 1, # 2 but with some amino acid sequence mutation, This is because there is a possibility that a sequence in which amino acids have been deleted or inserted may be obtained. First, SV Total RNA I
Total RNA was isolated from 100 mg of mantle piece using manipulating the solation system (Promega), followed by PolyATtract mRNA Isolation System (Promega).
Then, 10 μg mRNA was extracted and purified. 5 μg of this mRNA
Using the Universal Ribo Clone cDNA Synthesis System (Promega), Oligo (dT) primer and AMV Reverse
First strand synthesis was performed with Transcriptase. Using this first-land cDNA as a template for PCR, amplification reaction was carried out with a thermal cycler using a 95 ° C, 30-second denature, 55 ° C, 30-second annealing, 68 ° C, 30-second PCR cycle. Purify this PCR amplification product,
E. coli was transformed by subcloning into the above pGEM vector. Five insert-positive clones were selected, the E. coli was mini-cultured, and plasmid purification was performed. This plasmid DNA was prepared using the previously described T7 promoter sequencing primer and SP6.
Promorter sequence primer Sequencing was performed using ABI377 from both directions of the insert by the Big Dye Terminator method. Analysis software Mac Vector6.0 already described.
Assembled with 1 (Teijin System Technology) and Lasergene (Teijin System Technology). Thus, the DNA sequence and amino acid sequence shown in SEQ ID NOs: 3-7 were obtained.
Geneba using NCBI's BLAST 2.0 as a search program
As a result of searching the nk database, it was shown in SEQ ID NOs: 1-7.
No gene with homology to the DNA sequence could be found. Therefore, it was found that the gene obtained in the present invention was a novel gene. Alignment was performed to examine the homology of the amino acid sequences shown in SEQ ID NOS: 1-7. The results are shown in FIG.
【0030】[0030]
【発明の効果】本発明により、アコヤガイの殻皮の真珠
層から得ることができ、殻皮の稜柱層からは得ることが
できない新規真珠層基質タンパク質、及びそれをコード
する遺伝子が得られた。かかる遺伝子は、真珠の人工的
合成を可能にし得るものである。Industrial Applicability According to the present invention, a novel nacre matrix protein which can be obtained from the pearl layer of the pearl oyster shell but cannot be obtained from the ridge column of the husk, and a gene encoding the same are obtained. Such a gene could enable artificial synthesis of pearls.
【0031】[0031]
【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> Hayashi Nakanobu and Masuo Masanori <120> New pearl layer matrix protein and gene thereof <130> DA-02679 <160> 9 <210> 1 <211> 697 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct tac 102 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 25 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gat agg cgg gat aat ggg ggc aag aaa tat tgt ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Arg Asp Asn Gly Gly Lys Lys Tyr Cys Phe Cys Arg 45 50 55 tac gct tgg tct cca tgg caa tgt aat gag gaa gag agg tat gag tgg 246 Tyr Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Asn Glu Glu Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 ctt aga tgt gga atg agg ttc tac tcc ttg tgc tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly Met Arg Phe Tyr Ser Leu Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gac aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac ggt aac gga tta aat tac 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Leu Asn Tyr 90 95 100 105 ctc aag tcc tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc cgg 390 Leu Lys Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Arg 110 115 120 gaa gag tac atc gat gaa cgg tat gac aat taa aattcctgct acggattctt 443 Glu Glu Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Asn Stop 125 130 gaattttacc ctcatttaat acagtgtcag acttaacctt gacttttatg ttctgaaaat 503 aggaacgaaa cttcatgact gtatttctct atagctagaa tcttagaaaa tgtcaaagtt 563 tgaccttgct ggtgtgtaag gaaagaaaaa aatgtagtca actatgtatt acgaatatat 623 ctgaaaattc aatctcagat gtaaaattat atagtaaagt atgaacaaaa aaaaaaaaaa 683 aaaaaaaaaa aaaa 697 <210> 2 <211> 695 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct tac 102 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 25 30 35 40 gag aga gat agg cgg gac aat ggt ggc aag aaa tgt tgc ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Arg Asp Asn Gly Gly Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 246 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga gat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asp Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 390 Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 105 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccct 444 Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 504 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttgg ccttgctggt gtgtaaggaa 564 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 624 aaattatata gtaaagtatg aagccagatt tcaaaacaaa gcaaaaaaaa aaaaaaaaaa 684 aaaaaaaaaa a 695 <210> 3 <211> 698 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct tac 102 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg atc cct tat gac att 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 25 30 35 40 gag aga gac aga tat gat aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 tac gct tgg tct cca tgg caa tgt aat gag gaa gag agg tat gag tgg 246 Tyr Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Asn Glu Glu Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 ctt aga tgt gga atg agg ttc tac tcc ttg tgc tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly Met Arg Phe Tyr Ser Leu Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gac aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac ggt aac gga tta aat tac 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Leu Asn Tyr 90 95 100 ctc aag tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg 390 Leu Lys Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp 105 110 115 120 gaa gag tac atc gat gaa cgg tat gac aat taa aattcctgct acggattctt 443 Glu Glu Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Asn Stop 125 130 gaattttacc ctcatttaat acagtgtcag acttaacctt gacttttatg ttctgaaaat 503 aggaacgaaa cttcatgact gtatttctct atagctagaa tcttagaaaa tgtcaaagtt 563 tgaccttgct ggtgtgtaag gaaagaaaaa aatgtagtca actatgtatt acgaatatat 623 ctgaaaattc aatctcagat gtaaaattat atagtaaagt atgaacttca aaaaaaaaaa 683 aaaaaaaaaa aaaaa 698 <210> 4 <211> 678 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct tac 102 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg atc cct tac gac atc 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 25 30 35 40 gag aga gac aga tat gat aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 tac gct tgg tct cca tgg caa tgt aat gag gaa gag agg tat gag tgg 246 Tyr Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Asn Glu Glu Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 ctt aga tgt gga atg agg ttc tac tcc ttg tgc tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly Met Arg Phe Tyr Ser Leu Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gac aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac ggt aac gga tta aat tac 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Leu Asn Tyr 90 95 100 ctc aag tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg 390 Leu Lys Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp 105 110 115 120 gaa gag tat atc gat gaa cgg tat gac aat taa aattcctgct acggattctt 443 Glu Glu Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Asn Stop 125 130 gaattttacc ctcatttaat acagtgtcag acttaacctt gacttttatg ttctgaaaat 503 aggaacgaaa cttcatgact gcatttcaca cgaagaaggg gtcagacttt atcaagaatt 563 tcatgagtaa agacggtaaa gatctaacac agcatggaaa agagctactt gaccagcttg 623 ccgggaaaga taaaaatgaa ctaaaaagta acggggcaaa aaaaaaaaaa aaaaa 678 <210> 5 <211> 644 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> ttctgtgagg cggcgcctgg aatc atg acg tgc aca ctt cgt tgg aca att 51 Met Thr Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct ttc 99 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Phe 10 15 20 25 cgt acg aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 147 Arg Thr Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gac aga tat gac aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 195 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 243 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 291 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 339 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 tct tta tat gga ggt tac ggg aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 387 Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 105 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccct 441 Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 130 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 501 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttga ccttgctggt gtgtaaggaa 561 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 621 aaattatata gtaaagtatg aac 644 <210> 6 <211> 645 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> tttctgtgag gcggcgcctg gaatc atg acg tgc aca ctt cgt tgg aca att 52 Met Thr Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct ttc 100 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Phe 10 15 20 25 cgt acg aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 148 Arg Thr Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gac aga tat gac aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 196 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 244 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 292 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 340 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 105 tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 388 Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccct 442 Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 130 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 502 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttga ccttgctggt gtgtaaggaa 562 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 622 aaattatata gtaaagtatg aac 645 <210> 7 <211> 645 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> cttctgtgag gcggcgcctg gaatc atg acg tgc aca ctt cgt tgg aca att 52 Met Thr Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct ttc 100 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Phe 10 15 20 25 cgt acg aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 148 Arg Thr Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gac aga tat gac aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 196 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 244 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 292 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 340 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 105 tct tta tgt gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 388 Ser Leu Cys Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccct 442 Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 130 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 502 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttga ccttgctggt gtgtaaggaa 562 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 622 aaattatata gtaaagtatg aac 645 <210> 8 <211> 550 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gataggcggg ataatggggg caagaaatat tgtttctgta gatacgcttg gtctccatgg 60 caatgtaatg aggaagagag gtatgagtgg cttagatgtg gaatgaggtt ctactccttg 120 tgctgttaca ccgatgatga caacggtaac ggaaatggca acggtaacgg taacggatta 180 aattacctca agtccttata tggaggttac ggaaacggaa atggtgaatt ccgggaagag 240 tacatcgatg aacggtatga caattaaaat tcctgctacg gattcttgaa ttttaccctc 300 atttaataca gtgtcagact taaccttgac ttttatgttc tgaaaatagg aacgaaactt 360 catgactgta tttctctata gctagaatct tagaaaatgt caaagtttga ccttgctggt 420 gtgtaaggaa agaaaaaaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat 480 ctcagatgta aaattatata gtaaagtatg aacaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540 atgtacaaaa 550 <210> 9 <211> 547 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gatcgtaggg acaatggtgg caagaaatgt tgcttctgta gaaacgcttg gtctccatgg 60 caatgtaaag aggacgagag gtatgagtgg ctaagatgtg gacataaatt ctactacatg 120 tgttgttaca ccgatgatga taacggtaac ggagatggca acggtaacgg atttaattac 180 ctcaagtctt tatatggagg ttacggaaac ggaaatggtg aattctggga agagtacatc 240 gatgaacggt atgacaagta aacttccttg attcttgaat tttaccctca cagtgtccga 300 ctaaaccatg acttttatgt tcttaaataa gaacgaaact acatgtatct ctctatagct 360 tgtatcttag aaaatatttt ttgtttggcc ttgctggtgt gtaaggaaag gagagaatgt 420 agtcaactat gtattacgaa tatatctgaa aattcaatct cagatgtaaa attatatagt 480 aaagtatgaa gccagatttc aaaacaaagc aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaat 540 gtacaaa 547[Sequence List] SEQUENCE LISTING <110> Hayashi Nakanobu and Masuo Masanori <120> New pearl layer matrix protein and gene there <130> DA-02679 <160> 9 <210> 1 <211> 697 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct gac c Thrg Aca tca Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 25 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gat agg cgg gat aat ggg ggc aag aaa tat tgt ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Arg Asp Asn Gly Gly Lys Lys Tyr Cys Phe Cys Arg 45 50 55 tac gct tgg tct cca tgg caa tgt aat gag gag agg tat gag tgg 246 Tyr Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Asn Glu Glu Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 ctt aga tgt gga atg agg ttc tac tcc ttg tgc tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly Met Arg Phe Tyr Ser Leu Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gac aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac ggt aac gga tta aat tac 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Leu Asn Tyr 90 95 100 105 ctc aag tcc tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc cgg 390 Leu Lys Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Arg 110 115 120 gaa gag tac atc gat gaa cgg tat gac aat taa aattcctgct acggattp yr Glu Glu Glu arg Tyr Asp Asn Stop 125 130 gaattttacc ctcatttaat acagtgtcag acttaacctt gacttttatg ttctgaaaat 503 aggaacgaaa cttcatgact gtatttctct atagctagaa tcttagaaaa tgtcaaagtt 563 tgaccttgct ggtgtgtaag gaaagaaaaa aatgtagtca actatgtatt acgaatatat 623 ctgaaaattc aatctcagat gtaaaattat atagtaaagt atgaacaaaa aaaaaaaaaa 683 aaaaaaaaaa aaaa 697 <210> 2 <211> 695 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct cat ct gct Ala Leu Val Leu Leu Gly I le Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 25 30 35 40 gag aga gat agg cgg gac aat ggt ggc aag aaa tgt tgc ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Arg Asp Asn Gly Gly Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tgg 246 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga gat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asp Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 390 Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 105 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccp Tyr Gyr L ys Stop 125 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 504 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttgg ccttgctggt gtgtaaggaa 564 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 624 aaattatata gtaaagtatg aagccagatt tcaaaacaaa gcaaaaaaaa aaaaaaaaaa 684 aaaaaaaaaa a 695 <210> 3 <211> 698 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca ctt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct Leca Val Acacact Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg atc cct tat gac att 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 25 30 35 40 gag aga gac aga tat gat aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 tac gct tgg tct cca tgg caa tgt aat gag gaga gag tat gag tgg 246 Tyr Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Asn Glu Glu Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 ctt aga tgt gga atg agg ttc tac tcc ttg tgc tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly Met Arg Phe Tyr Ser Leu Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gac aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac ggt aac gga tta aat tac 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Leu Asn Tyr 90 95 100 ctc aag tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc Leu Lys Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp 105 110 115 120 gaa gag tac atc gat gaa cgg tat gac aat taa aattcctgct acggattctt 443 Glu Glu Tlu Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Asn Stop cct att gac acttaacctt gacttttatg ttctgaaaat 503 aggaacgaaa cttcatgact gtatttctct atagctagaa tcttagaaaa tgtcaaagtt 563 tgaccttgct ggtgtgtaag gaaagaaaaa aatgtagtca actatgtatt acgaatatat 623 ctgaaaattc aatctcagat gtaaaattat atagtaaagt atgaacttca aaaaaaaaaa 683 aaaaaaaaaa aaaaa 698 <210> 4 <211> 678 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gtcttctgtg aggcggcgcc tggaatc atg aag tgc aca c tt cgt tgg aca att 54 Met Lys Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct tac 102 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Tyr 10 15 20 cat aag aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg atc cct tac gac atc 150 His Lys Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 25 30 35 40 gag aga gac aga tat gat aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 198 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 tac gct tgg tct cca tgg caa tgt aat gag gaa gag agg tat gag tgg 246 Tyr Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Asn Glu Glu Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 ctt aga tgt gga atg agg ttc tac tcc ttg tgc tgt tac acc gat gat 294 Leu Arg Cys Gly Met Arg Phe Tyr Ser Leu Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gac aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac ggt aac gga tta aat tac 342 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Leu Asn Tyr 90 95 100 ctc aag tct tta tat gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa 390 Leu Lys Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp 105 110 115 120 gaa gag tat atc gat gaa cgg tat gac aat taa aattcctgct acggattctt 443 Glu Glu Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Asn Stop 125 130 gaattttag ctcatgca tca tca tca tca t gatt gag cttcatgact gcatttcaca cgaagaaggg gtcagacttt atcaagaatt 563 tcatgagtaa agacggtaaa gatctaacac agcatggaaa agagctactt gaccagcttg 623 ccgggaaaga taaaaatgaa ctaaaaagta acggggcaaa aaaaaaaaaa aaaaa 678 <210> 5 <211> 644 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> ttctgtgagg cggcgcctgg aatc atg acg tgc aca ctt cgt tgg aca att 51 Met Thr Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct ttc 99 Thr Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Phe 10 15 20 25 cgt acg aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 147 Arg Thr Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gac aga tat gac aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 195 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 243 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 291 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 339 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 tct tta tat gga ggt tac ggg aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 387 Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Glu Glu trp Glu Glu 105 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccct 441 Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 130 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 501 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttga ccttgctggt gtgtaaggaa 561 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 621 aaattatata gtaaagtatg aac 644 <210> 6 <211> 645 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> tttctgtgag gcggcgcctg gaatc atg acg tgc aca ctt cgt tgg aca att 52 Met Thr Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga Ala Leu Val Leu Leu Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Phe 10 15 20 25 cgt acg aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 148 Arg Thr Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gac aga tat gac aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 196 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 244 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 292 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 340 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 105 tct tta ta t gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 388 Ser Leu Tyr Gly Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgatta ttcttgaatt Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 130 cacagtgtcc gactaaacca tgacttttat gttcttaaat aagaacgaaa ctacatgtat 502 ctctctatag cttgtatctt agaaaatatt ttttgtttga ccttgctggt gtgtaaggaa 562 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 622 aaattatata gtaaagtatg aac 645 <210> 7 <211> 645 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> cttctgtgag gcggcgcctg gaatc atg acg tgc aca ctt cgt tgg aca att 52 Met Thr Cys Thr Leu Arg Trp Thr Ile 1 5 aca gct ttg gtt ttg ctc ggc att tgc cat tta gct aga cca gct Lectu Leu Val 100 Thr Gly Ile Cys His Leu Ala Arg Pro Ala Phe 10 15 20 25 cgt acg aag tgc gga cgt tac tca tac tgc tgg ata ccc tac gac ata 148 Arg Thr Lys Cys Gly Arg Tyr Ser Tyr Cys Trp Ile Pro Tyr Asp Ile 30 35 40 gag aga gac aga tat gac aac ggt gac aag aaa tgt tgt ttc tgt aga 196 Glu Arg Asp Arg Tyr Asp Asn Gly Asp Lys Lys Cys Cys Phe Cys Arg 45 50 55 aac gct tgg tct cca tgg caa tgt aaa gag gac gag agg tat gag tgg 244 Asn Ala Trp Ser Pro Trp Gln Cys Lys Glu Asp Glu Arg Tyr Glu Trp 60 65 70 cta aga tgt gga cat aaa ttc tac tac atg tgt tgt tac acc gat gat 292 Leu Arg Cys Gly His Lys Phe Tyr Tyr Met Cys Cys Tyr Thr Asp Asp 75 80 85 gat aac ggt aac gga aat ggc aac ggt aac gga ttt aat tac ctc aag 340 Asp Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Asn Gly Phe Asn Tyr Leu Lys 90 95 100 105 tct tta tgt gga ggt tac gga aac gga aat ggt gaa ttc tgg gaa gag 388 Ser Leu Cys Gly Tyr Gly Asn Gly Asn Gly Glu Phe Trp Glu Glu 110 115 120 tac atc gat gaa cgg tat gac aag taa acttccttga ttcttgaatt ttaccct 442 Tyr Ile Asp Glu Arg Tyr Asp Lys Stop 125 130 cacagtgtcc gactaaacca tcactatg gataaacta tcactatcat gc ccttgctggt gtgtaaggaa 562 aggagagaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat ctcagatgta 622 aaattatata gtaaagtatg aac 645 <210> 8 <211> 550 <212> DNA <213> Pinctada fucata <400> gataggcggg ataatggggg caagaaatat tgtttctgta gatacgcttg gtctccatgg 60 caatgtaatg aggaagagag gtatgagtgg cttagatgtg gaatgaggtt ctactccttg 120 tgctgttaca ccgatgatga caacggtaac ggaaatggca acggtaacgg taacggatta 180 aattacctca agtccttata tggaggttac ggaaacggaa atggtgaatt ccgggaagag 240 tacatcgatg aacggtatga caattaaaat tcctgctacg gattcttgaa ttttaccctc 300 atttaataca gtgtcagact taaccttgac ttttatgttc tgaaaatagg aacgaaactt 360 catgactgta tttctctata gctagaatct tagaaaatgt caaagtttga ccttgctggt 420 gtgtaaggaa agaaaaaaat gtagtcaact atgtattacg aatatatctg aaaattcaat 480 ctcagatgta aaattatata gtaaagtatg aacaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540 atgtacaaaa 550 <210> 9 <211> 547 <212> DNA <213 > Pinctada fucata <400> gatcgtaggg acaatggtgg caagaaatgt tgcttctgta gaaacgcttg gtctccatgg 60 caatgtaaag aggacgagag gtatgagtgg ctaagatgtg gacataaatt ctactacatg 120 tgttgttaca ccgatgagcag attgaccag tattogatcaat gg ac ggaaatggtg aattctggga agagtacatc 240 gatgaacggt atgacaagta aacttccttg attcttgaat tttaccctca cagtgtccga 300 ctaaaccatg acttttatgt tcttaaataa gaacgaaact acatgtatct ctctatagct 360 tgtatcttag aaaatatttt ttgtttggcc ttgctggtgt gtaaggaaag gagagaatgt 420 agtcaactat gtattacgaa tatatctgaa aattcaatct cagatgtaaa attatatagt 480 aaagtatgaa gccagatttc aaaacaaagc aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaat 540 gtacaaa 547
【図1】図1は、電気泳動の結果を示す写真であり、具
体的には、真珠層からのアルカリ可溶性有機基質、及び
真珠層並びに稜柱層からの水可溶性基質のSDS-PAGEの結
果を示す写真である。FIG. 1 is a photograph showing the results of electrophoresis. Specifically, FIG. 1 shows the results of SDS-PAGE of an alkali-soluble organic substrate from nacre and a water-soluble substrate from nacre and trabecula. It is a photograph shown.
【図2】図2は、結晶構造を示す写真であり、具体的に
は、通常の無機的に形成されるアラレ石を示す写真であ
る。FIG. 2 is a photograph showing a crystal structure, specifically, a photograph showing a normal inorganically formed aragonite.
【図3】図3は、結晶構造を示す写真であり、具体的に
は、本発明の真珠層基質タンパク質の機能を示す写真で
ある。FIG. 3 is a photograph showing a crystal structure, and more specifically, a photograph showing the function of the nacre matrix protein of the present invention.
【図4】図4は、結晶構造を示す写真であり、具体的に
は、本発明の真珠層基質タンパク質の機能を示す写真で
ある。FIG. 4 is a photograph showing a crystal structure, specifically, a photograph showing the function of the nacre matrix protein of the present invention.
【図5】図5は、本発明で得られる7種類のタンパク質
のアミノ酸配列のアラインメントを示す図である。図7
において、#1.aa 〜#7.aa は、それぞれ配列番号1〜7
のアミノ酸配列を指す。FIG. 5 is a view showing alignment of amino acid sequences of seven kinds of proteins obtained by the present invention. FIG.
Wherein # 1.aa to # 7.aa correspond to SEQ ID NOs: 1 to 7, respectively.
Refers to the amino acid sequence of
フロントページの続き (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12N 15/09 ZNA C07K 14/435 BIOSIS(DIALOG) WPI(DIALOG) GenBank/EMBL/DDBJContinued on the front page (58) Fields investigated (Int. Cl. 7 , DB name) C12N 15/09 ZNA C07K 14/435 BIOSIS (DIALOG) WPI (DIALOG) GenBank / EMBL / DDBJ
Claims (5)
する新規真珠層基質タンパク質: i) アコヤガイ(Pinctada fucata) の殻皮の真珠層から
得ることができ、殻皮の稜柱層からは得ることができな
い; ii) SDS-PAGE で測定した時の分子量が、14KDa 又は17K
Da である; iii) N 末端アミノ酸配列として、以下に示すアミノ酸
配列を有する; AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN1. A novel nacre matrix protein having the following physicochemical properties of i) -iii): i) obtainable from the nacre of the shell of the pearl oyster (Pinctada fucata), and from the trabecular layer of the shell Cannot be obtained; ii) The molecular weight as measured by SDS-PAGE is 14KDa or 17K
Da); iii) has the following amino acid sequence as the N-terminal amino acid sequence; AFHTKKGRYSYCWIPYDIEEDRRDNGGKKKCFFCN
質タンパク質: (a) 配列表の配列番号1-7 のいずれかに示すアミノ酸配
列を含む真珠層基質タンパク質; (b) 配列表の配列番号1-7 のいずれかに示すアミノ酸配
列において、 1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若
しくは付加されたアミノ酸配列を含み、かつアコヤガイ
真珠のアラレ石結晶形成のための有機質の核となりうる
機能を有するタンパク質。2. A novel nacre matrix protein represented by the following (a) or (b): (a) a nacre matrix protein comprising an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 1-7 in the sequence listing; (b) In the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 1 to 7 in the sequence listing, one or several amino acids are deleted, substituted or added, including an amino acid sequence, and an organic substance for aragonite crystal formation of pearl oyster pearl. A protein that has a core function.
遺伝子。[3] a gene encoding the protein of [2];
コード遺伝子である、請求項3 記載の遺伝子。4. The gene according to claim 3, which is a coding gene represented by any one of SEQ ID NOs: 1 to 7 in the sequence listing.
コード遺伝子とストリンジェントな条件下でハイブリダ
イズし、かつアコヤガイ真珠のアラレ石結晶形成のため
の有機質の核となりうる機能を有するタンパク質をコー
ドする遺伝子。5. It hybridizes under stringent conditions with the coding gene shown in any one of SEQ ID NOs: 1-7 in the sequence listing, and has a function of being a core of organic matter for aragonite crystal formation of pearl oyster pearls. Gene encoding a protein.
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