JP2024521185A - Hla-g陽性癌を標的とするキメラ抗原受容体 - Google Patents
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Abstract
【課題】 HLA-G発現細胞の標的化に関連する方法および組成物を提供する。【解決手段】 本開示の実施形態には、特定の操作された受容体を用いたHLA-G発現細胞の標的化に関連する方法および組成物が含まれる。特定の実施形態において、NK細胞は、特定のキメラ抗原受容体構築物を用いてHLA-Gと結合するように特異的に操作される。特定の実施形態では、HLA-G標的化CARを発現するベクターは、特定の自殺遺伝子および/または1つ以上の特定のサイトカインも発現する。【選択図】 なし
Description
本出願は、2021年5月26日に出願された米国仮特許出願シリアル番号63/193,515の優先権を主張するものであり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本開示の実施形態は、少なくとも細胞生物学、分子生物学、免疫学、および癌医学を含む医学の分野を含む。
養子癌免疫療法のためのナチュラルキラー(NK)細胞の遺伝子再プログラミングは、1)事前に感作を必要としない生得的な抗腫瘍監視、2)移植片対宿主反応性を伴わない同種有効性、および3)標的腫瘍の直接的な細胞媒介性細胞毒性および細胞溶解などの臨床的に関連する用途および利点を有する。ヒトNK細胞の発達と自己寛容性、同種反応性、エフェクター機能の獲得は、免許取得、較正、武装の適応的過程である。分子レベルでは、特異的な活性化レセプターと抑制性レセプターが、細胞外シグナルを凝集し、バランスをとり、異なるエフェクター機能に統合することで、NK細胞の機能を指示している。NK細胞の機能活性と外来刺激に対する応答性は、継続的な教育の「レオスタット」モデルに従っており、したがって再プログラミングが可能である。NK細胞のエフェクター機能を方向づけるための遺伝子改変は、腫瘍細胞を殺す細胞傷害能力を利用する効果的な方法である。
HLA-Gは非古典的なHLAクラスI分子であり、健康な成人では胎盤にのみ発現する。HLA-GはNK細胞、T細胞、B細胞、単球、樹状細胞上のレセプターと相互作用し、それらの機能を阻害し、母体と胎児の間に免疫寛容状態を作り出す。HLA-Gは多くの血液腫瘍や固形腫瘍で過剰発現している。がん細胞は、HLA-Gを異常発現し、NK細胞上の阻害受容体KIR2DL4、白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーBメンバー1(LILRB1)、および白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーBメンバー2(LILRB2)と係合することにより、免疫監視から逃れる。
本開示は、特定の実施形態において、HLA-G陽性腫瘍を含む癌を標的とする細胞療法のための、ヒトNK細胞を含む細胞の遺伝子工学に関する方法および組成物に関する。
本開示の実施形態は、HLA-G(例えば、HLAクラスI組織適合抗原、アルファ鎖G、HLA G抗原、またはMHCクラスI抗原Gとしても知られている)を標的とするキメラ抗原受容体(CAR)を含む、操作された細胞受容体に関連する方法および組成物を包含する。特定の実施形態において、HLA-Gを標的とする操作された受容体は、ポリヌクレオチド、ポリペプチドの形態であり、かつ/または免疫細胞を含むあらゆる種類の細胞の表面上に含まれる。特定の場合には、細胞は免疫細胞であり、特定の実施形態において、免疫細胞は、あらゆる源由来のNK細胞、NKT細胞、インバリアントNKT細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、制御性T細胞、B細胞、マクロファージ、間葉系間質細胞(MSC)、樹状細胞等である。一部の実施形態において、免疫細胞はNK細胞である。特定の実施形態において、臍帯血(CB-NK)由来の再プログラム化NK細胞が、HLA-G分子を発現する癌を標的とするために包含される。
HLA-Gは、乳癌、結腸直腸癌、子宮頚癌、食道癌、ユーイング癌、胃癌、神経膠芽腫、肝細胞癌、肺癌、鼻咽頭癌、卵巣癌、および甲状腺癌を含む多数の癌上で発現されるため、少なくとも部分的に、開示される方法および組成物の態様のための標的抗原として利用される。加えて、HLA-G過剰発現は癌免疫回避に関与し、そしてHLA-Gは免疫チェックポイントと考えることができる。ゆえに、その標的化を用いて、腫瘍免疫回避のこの重要な機構を克服することができる。
本開示は、いくつかの新規なCAR分子を含み、これは具体的な場合には、ヒトHLA-Gを標的とするscFv(例えば、G233、26-2H11、MEM-G/1、MEM-G/9、MEM-G/11、MEM-G/13、1B8、5E6H7、1-2C3、16G1、5A6G7、87G、または3C/G4等の抗体クローン由来のscFvが挙げられる)の、またはKIR2DL4、LILRB1、もしくはLILRB2由来の細胞外ドメインの、1つ以上の活性化シグナル伝達エンドドメインとの融合を含み、場合によっては、CD3ζを単独で、または共刺激もしくはアダプターシグナル伝達ドメイン(例えば、NKG2D、OX-40、CD27、41BB、CD28、DAP10、DAP12、および/または2B4由来)と組み合わせて組み込こむことを含む。特定の場合には、同種異系CB-NK細胞は、HLA-G CARを発現するようにレトロウイルスにより形質導入される。特定の実施形態において、HLA-G CAR分子を包含する本開示の免疫細胞はまた、その生存および増殖を支持する1つ以上のタンパク質を発現する。特定の場合には、免疫細胞は、細胞の拡大および持続を促進する1つ以上のサイトカインを発現するように操作される。具体的な場合には、1つ以上のサイトカインは、インターロイキン15(IL-15)、IL-2、IL-7、IL-12、IL-18、IL-21、および/またはIL-23である。特定の態様において、CARをコードするベクターが、サイトカインもコードしており、各々が最終的に別々のポリペプチドとして産生される。他の態様において、CARおよびサイトカインは、別々のベクター上にコードされる。
本開示の特定の実施形態は、レシピエント個体に対して同種異系であり、あらゆる種類のHLA-G陽性細胞を標的とし、かつIL-15、IL-2、IL-21、IL-12、IL-23、IL-7、および/またはIL-18等の1つ以上のサイトカインを発現するように形質導入されていてもされていなくてもよい、少なくともNK細胞を含む既製の免疫細胞の使用を可能にする。
本開示の特定の実施形態において、免疫細胞における1つ以上の内因性遺伝子の発現が修飾されており、例えば、発現は、発現が部分的または完全に引き下げられ得る。修飾は、あらゆる手段によって生じ得るが、特定の実施形態において、1つ以上の遺伝子の発現が、例えば発現レベルが引き下げられることによって修飾されており、これは、少なくともCRISPRが挙げられる適切なあらゆる手段によって生じ得る。単なる例として、内因性遺伝子は、NKG2A、SIGLEC-7、LAG3、TIM3、CISH、FOXO1、TGFBR2、TIGIT、CD96、ADORA2、NR3C1、PD1、PDL-1、PDL-2、CD47、SIRPA、SHIP1、ADAM17、RPS6、4EBP1、CD25、CD40、IL21R、ICAM1、CD95、CD80、CD86、IL10R、CD5、CD7、CTLA-4、TDAG8、CD38、およびそれらの組合せからなる群から選択され得る。
本開示の実施形態は、抗HLA-Gキメラ抗原受容体(CAR)をコードし、そしてまた1つ以上のサイトカインをコードし得るポリヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、ポリヌクレオチドは、KIR2DL4細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、およびKIR2DL4細胞内ドメインではない細胞内ドメインを含むCARをコードする。一部の実施形態において、CARは、KIR2DL4タンパク質の細胞外ドメインのすべてを含む。これ以外にも、CARは、KIR2DL4タンパク質の細胞外ドメインのHLA-G結合部分を含む。特定の実施形態において、KIR2DL4細胞外ドメインは、配列番号9を含む。特定の態様において、KIR2DL4細胞外ドメインは、配列番号7によってコードされる。一部の実施形態において、KIR2DL4細胞外ドメインは、配列番号10を含む。場合によっては、KIR2DL4細胞外ドメインは、コドン最適化KIR2DL4細胞外ドメインである。特定の態様において、KIR2DL4細胞外ドメインは、配列番号8によってコードされる。一部の実施形態において、CARは、KIR2DL4細胞内ドメインの一部、例えば活性化シグナルを媒介することができるKIR2DL4細胞内ドメインの一部を含む。
本開示の追加の実施形態は、抗HLA-G CARをコードし、そしてまた1つ以上のサイトカインをコードし得るポリヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、ポリヌクレオチドは、LILRB1細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、およびLILRB1細胞内ドメインではない細胞内ドメインを含むCARをコードする。一部の実施形態において、CARは、LILRB1タンパク質の細胞外ドメインの全てを含む。これ以外にも、CARは、LILRB1タンパク質の細胞外ドメインのHLA-G結合部分を含む。一部の実施形態において、CARは、KIR2DL4細胞内ドメインの一部、例えば活性化シグナルを媒介することができるLILRB1細胞内ドメインの一部を含む。本開示の更なる実施形態は、抗HLA-G CARをコードするポリヌクレオチドを含み、CARは、LILRB2細胞外ドメインと、膜貫通ドメインと、LILRB2細胞内ドメインではない細胞内ドメインとを含む。一部の実施形態において、CARは、LILRB2タンパク質の細胞外ドメインの全てを含む。これ以外にも、CARは、LILRB2タンパク質の細胞外ドメインのHLA-G結合部分を含む。一部の実施形態において、CARは、KIR2DL4細胞内ドメインの一部、例えば活性化シグナルを媒介することができるLILRB2細胞内ドメインの一部を含む。
あらゆる膜貫通ドメインが、例えば、CD28、T細胞受容体のアルファ鎖、T細胞受容体のベータ鎖、T細胞受容体のゼータ鎖、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、ICOS/CD278、GITR/CD357、NKG2D、DAP10、DAP12、キラー免疫グロブリン様受容体(KIR)、例えば、KIR2DL2、LILRB1、LILRB2、またはそれらのあらゆる組合せ由来の膜貫通ドメインであり得る。一部の実施形態において、膜貫通ドメインは、CD28膜貫通ドメインである。CD28膜貫通ドメインは、配列番号12を含み得る。特定の場合には、CD28膜貫通ドメインは、配列番号11によってコードされる。一部の実施形態において、膜貫通ドメインは、CD8膜貫通ドメインである。CD8膜貫通ドメインは、配列番号14を含み得る。特定の場合には、CD28膜貫通ドメインは、配列番号13によってコードされる。
あらゆる細胞内ドメインが、例えば、CD3ゼータ、CD27、CD28、4-1BB、DAP12、NKG2D、OX-40(CD134)、DAP10、CD40L、2B4、DNAM、CS1、CD48、NKp30、NKp44、NKp46、もしくはNKp80、またはそれらのあらゆる組合せ由来の細胞内ドメインであり得る。一部の実施形態において、細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメインである。CD3ゼータ細胞内ドメインは、配列番号16または配列番号18を含み得る。具体的な場合には、CD3ゼータ細胞内ドメインは、配列番号15または配列番号17によってコードされる。一部の実施形態において、細胞内ドメインは、CD28細胞内ドメインである。CD28細胞内ドメインは、配列番号24を含み得る。特定の場合には、CD28細胞内ドメインは、配列番号23によってコードされる。CARは、2つ以上または3つ以上の細胞内ドメインを含み得る。特定の態様において、2つ以上の細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメイン、ならびにCD28、DAP10、DAP12、4-1BB、NKG2D、および2B4細胞内ドメインから選択される追加の細胞内ドメインを含む。特定の場合には、2つ以上の細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメインおよびCD28細胞内ドメインを含む。
一部の実施形態において、CARはさらに、シグナルペプチドを含む。特定の態様において、シグナルペプチドは、CD8、CD27、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体(GMSCF-R)、Ig重鎖、KIR(例えばKIR2DL4)、CD3、またはCD4に由来する。一部の実施形態において、シグナルペプチドはCD8シグナルペプチドである。CD8シグナルペプチドは、配列番号6を含み得る。一部の実施形態において、シグナルペプチドは、配列番号5によってコードされる。特定の態様において、CARはシグナルペプチドを含まない。
特定の実施形態において、本開示のCARをコードするポリヌクレオチドはさらに、目的の追加のポリペプチドをコードする。目的の追加のポリペプチドをコードする配列、およびCARをコードする配列は、E2A要素等の2A要素によってポリヌクレオチド上で分離され得る。特定の態様において、治療用タンパク質、ならびに/または細胞の活性、拡大、および/もしくは持続性を増強するタンパク質等の目的の1つ以上のポリペプチドが利用される。一部の実施形態において、目的の追加のポリペプチドは、増殖、拡大、および/または代謝適応度を増強する自殺遺伝子、サイトカイン、および/またはヒトもしくはウイルスタンパク質である。特定の実施形態において、目的の追加のポリペプチドは、サイトカイン、例えば、IL-15、IL-2、IL-12、IL-18、IL-21、IL-23、またはIL-7である。特定の実施形態において、サイトカインはIL-15である。
本開示の態様は、配列番号2と少なくとも75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、または99.9%の配列同一性を有する配列を含むCARをコードするポリペプチドに関する。一部の実施形態において、CARは、配列番号2を含む。一部の態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号1と少なくとも75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、または99.9%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態において、ポリヌクレオチドは、配列番号1を含む。
本開示の追加の態様は、配列番号4と少なくとも75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、または99.9%の配列同一性を有する配列を含むCARをコードするポリペプチドに関する。一部の実施形態において、CARは、配列番号4を含む。一部の態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号3と少なくとも75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、
85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、または99.9%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態において、ポリヌクレオチドは、配列番号3を含む。
85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、または99.9%の配列同一性を有する配列を含む。一部の実施形態において、ポリヌクレオチドは、配列番号3を含む。
また、本明細書中で提示されるのは、本開示のポリヌクレオチドを含むベクターである。本明細書中で企図されるベクターとして、ウイルスベクター(例えば、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レンチウイルスベクター、およびレトロウイルスベクター)および非ウイルスベクター(例えばプラスミド)が挙げられる。
本開示の実施形態は、本明細書中に包含されるあらゆるポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチドを含むあらゆる種類の免疫細胞を含む。特定の実施形態において、免疫細胞は、NK細胞、T細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、インバリアントNKT(iNKT)細胞、B細胞、マクロファージ、MSC、樹状細胞、またはそれらの混合物である。免疫細胞がNK細胞である場合、NK細胞は、臍帯血(プールされた臍帯血単位を含む)、末梢血、人工多能性幹細胞、骨髄、および/または細胞株に由来し得る。特定の態様において、NK細胞株は、NK-92細胞株、腫瘍に由来する別のNK細胞株、または健康なNK細胞もしくは前駆細胞である。
特定の実施形態において、免疫細胞は、NK細胞、例えば臍帯血に、例えば臍帯血単核細胞に由来するものである。NK細胞は、特定の場合には、CD56+NK細胞であり得る。NK細胞は、1つ以上の外因的に提供されるサイトカイン、例えば、IL-15、IL-2、IL-12、IL-18、IL-21、IL-23、IL-7、またはそれらの組合せを発現し得る。特定の実施形態は、本開示のあらゆる種類の免疫細胞の集団を含み、細胞は、あらゆる種類の適切な培地または適切な担体中に存在し得る。
例えば、特定の抗HLA-G CARを発現する細胞を、癌を寛解させるか、もしくは予防する、癌のリスクを引き下げる、癌の重症度を引き下げる、転移もしくはそのリスクを予防する、または癌の発症を遅延させる治療有効量にて投与することによって、あらゆる種類の癌を処置または予防する方法が、本明細書に包含される。
一部の実施形態において、開示されるのは、本開示のあらゆるポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチド(例えば、本開示のHLA-G CAR)を有する有効量の細胞を個体に投与することを含む、個体においてあらゆる種類のHLA-G陽性細胞を死滅させる方法である。特定の実施形態において、細胞は、NK細胞、T細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、インバリアントNKT(iNKT)細胞、B細胞、マクロファージ、間葉系間質細胞(MSC)、または樹状細胞である。NK細胞は、臍帯血、末梢血、人工多能性幹細胞、造血幹細胞、骨髄、または細胞株に由来し得る。NK細胞は、臍帯血単核細胞に由来し得る。場合によっては、HLA-G陽性細胞は、例えば造血癌または固形腫瘍に由来する、癌細胞である。細胞は、ヒトであってもなくてもよい個体に対して、同種異系であっても自己由来であってもよい。細胞は、注射によって、静脈内、動脈内、腹腔内、気管内、腫瘍内、筋肉内、内視鏡的、病変内、頭蓋内、経皮的、皮下、局所的に、灌流によって、腫瘍微小環境内に、またはそれらを組み合わせて個体に投与され得る。
本方法の特定の実施形態において、細胞は、個体に1回以上投与され得る。個体への細胞の投与間の期間は、1~24時間、1~7日、1~4週、1~12ヶ月、または1年以上であり得る。方法はさらに、有効量の追加の療法、例えば、外科手術、放射線、遺伝子療法、免疫療法、および/またはホルモン療法を個体に施す工程を含み得る。追加の療法は、場合によっては、1つ以上の抗体または抗体ベースの剤を含み得る。本方法の一部の態様において、本方法はさらに、個体においてHLA-G陽性細胞を特定する工程を含み得る。
本出願の全体を通して、用語「約」は、値が測定方法または定量方法についての誤差の固有の変動を含むことを示すのに用いられる。
用語「含む(comprising)」と組み合わせて用いられる場合の文言「a」または「an」の使用は、「1つの(one)」を意味し得るが、「1つ以上(one or more)」、「少なくとも1つ(at least one)」、および「1つ以上(one or more than one)」の意味とも一致する。
フレーズ「および/または」は、「および」または「または」を意味する。例示すると、A、B、および/またはCは、A単独、B単独、C単独、AおよびBの組合せ、AおよびCの組合せ、BおよびCの組合せ、またはA、B、およびCの組合せを含む。言い換えれば、「および/または」は、包括的なものとして機能する。
文言「含む(comprising)」(ならびに「comprise」および「comprises」等のcomprisingのあらゆる形態)、「有する(having)」(ならびに「have」および「has」等のhavingのあらゆる形態)、「含む(including)」(ならびに「includes」および「include」等のincludingのあらゆる形態)、または「含有する(containing)」(ならびに「contains」および「contain」等のcontainingのあらゆる形態)は、包括的またはオープンエンドであり、追加の列挙されていない要素または方法工程を排除しない。
組成物およびその使用方法は、本明細書の全体を通して開示される成分または工程のいずれかを「含む」、「から本質的になる」、または「からなる」ことができる。開示される成分または工程のいずれか「から本質的になる」組成物および方法は、特許請求の範囲を、特許請求される発明の基本的かつ新規な特徴に実質的に影響を及ぼさない特定の材料または工程に制限する。
本明細書中で論じられるあらゆる実施形態は、本発明のあらゆる方法または組成物に関して実施することができ、逆もまた同様であることが企図される。さらに、本発明の組成物を用いて、本発明の方法を達成することができる。
上記は、以下の発明の詳細な説明がよりよく理解され得るように、本開示の特徴および技術的利点をかなり広く概説している。特許請求の範囲の主題を形成する追加の特徴および利点を、本明細書中で以降に説明する。開示される概念および特定の実施形態は、本設計の同じ目的を実行するために他の構造を修正または設計するための基礎として容易に利用され得ることが当業者によって理解されるべきである。また、そのような等価の構成は、添付の特許請求の範囲に示される精神および範囲から逸脱しないことが当業者によって理解されるべきである。更なる目的および利点と共に、構成および操作方法の双方に関して、本明細書中で開示される設計の特徴であると考えられる新規の特徴は、添付の図面に関連して考慮される場合、以下の説明からよりよく理解されるであろう。しかしながら、各図は、例示および説明のみを目的として提供されており、本開示の制限の定義として意図されないことが明確に理解されるべきである。
以下の図面は、本明細書の一部を形成し、本発明の特定の態様をさらに実証するために含まれる。本発明は、本明細書中に提示される特定の実施形態の詳細な説明と組み合わせてこれらの図面の1つ以上を参照することによってよりよく理解され得る。
本開示の種々の実施形態が、本明細書中で示され、かつ説明されているが、そのような実施形態は、単なる例として提供されていることは、当業者であれば明らかであろう。当業者であれば、本発明から逸脱することなく、多数の変形、変更、および置換を生じさせることができる。本明細書中に記載される本開示の実施形態に対する種々の代替形態が使用され得ることを理解されたい。
I.定義の例
長年にわたる特許法の慣例に従い、本明細書において、特許請求の範囲を含め、comprisingという単語と組み合わせて使用される場合、「a」および「an」という単語は、「1つ以上」を表す。本開示のいくつかの実施形態は、本開示の1つまたは複数の要素、方法ステップ、および/または方法から構成されるか、またはこれらから本質的に構成され得る。本明細書に記載される任意の方法または組成物が、本明細書に記載される任意の他の方法または組成物に関して実施され得、異なる実施形態が組み合わされ得ることが企図される。
長年にわたる特許法の慣例に従い、本明細書において、特許請求の範囲を含め、comprisingという単語と組み合わせて使用される場合、「a」および「an」という単語は、「1つ以上」を表す。本開示のいくつかの実施形態は、本開示の1つまたは複数の要素、方法ステップ、および/または方法から構成されるか、またはこれらから本質的に構成され得る。本明細書に記載される任意の方法または組成物が、本明細書に記載される任意の他の方法または組成物に関して実施され得、異なる実施形態が組み合わされ得ることが企図される。
本明細書全体を通して、文脈上別段必要とされない限り、「comprise」、「comprises」および「comprising」という語は、記載されたステップもしくは要素またはステップもしくは要素の群を含むことを意味するが、他のステップもしくは要素またはステップもしくは要素の群を排除することを意味しないと理解される。「からなる」とは、「~からなる」という語句の後に続くものを含むこと、およびそれらに限定されることを意味する。したがって、「~からなる」という表現は、列挙された要素が必要又は必須であり、他の要素が存在しない可能性があることを示す。「から本質的になる」とは、その語句の後に列挙された要素を含むことを意味し、列挙された要素について開示で指定された活性または作用を妨げないか、またはそれに寄与しない他の要素に限定される。 従って、「本質的にからなる」という語句は、列挙された要素が必要又は必須であるが、他の要素は任意であり、列挙された要素の活性または作用に影響を及ぼすか否かに応じて存在してもしなくてもよいことを示す。
本明細書全体を通して、「一実施形態」、「1つの実施形態」、「特定の実施形態」、「関連する実施形態」、「ある実施形態」、「追加の実施形態」、または「さらなる実施形態」、またはそれらの組み合わせへの言及は、実施形態に関連して記載される特定の特徴、構造、または特性が、本発明の少なくとも1つの実施形態に含まれることを意味する。 したがって、本明細書を通じて様々な場所に前述の語句が現れるが、必ずしもすべてが同じ実施形態を指すわけではない。さらに、特定の特徴、構造、または特性は、1つまたは複数の実施形態において任意の適切な方法で組み合わせることができる。
本明細書で使用される場合、「または」および「および/または」という用語は、複数の構成要素を組み合わせて、または互いに排他的に説明するために利用される。例えば、「x、y、および/またはz」は、「x」単独、「y」単独、「z」単独、「x、y、およびz」、「(xおよびy)またはz」、「xまたは(yおよびz)」、または「xまたはyまたはz」を指すことができる。x、y、またはzが実施形態から特に除外され得ることが特に企図される。
本出願を通じて、用語「約」は、値を決定するために採用される装置または方法についての誤差の標準偏差を値が含むことを示すために、細胞および分子生物学の領域におけるその平明かつ通常の意味に従って使用される。
本明細書で使用される「操作された」という用語は、細胞、核酸、ポリペプチド、ベクターなどを含む、人の手によって生成された実体を指す。少なくともいくつかの場合において、操作された実体は合成されたものであり、天然には存在しない要素、または本開示において利用される方法で構成された要素を含む。
本明細書で使用される「単離された」という用語は、分子または生物学的物質または細胞物質が他の物質から実質的に遊離していることを指す。一態様において、用語「単離された」は、天然源に存在するような、それぞれ他のDNAもしくはRNA、またはタンパク質もしくはポリペプチド、または細胞もしくは細胞小器官、または組織もしくは器官から分離された、DNAもしくはRNAのような核酸、またはタンパク質もしくはポリペプチド、または細胞もしくは細胞小器官、または組織もしくは器官を指す。また、「単離された」という用語は、組換えDNA技術によって産生された場合には細胞材料、ウイルス材料、培養培地、または化学合成された場合には化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない核酸またはペプチドを指す。さらに、「単離された核酸」とは、断片として天然に存在せず、天然の状態では見出されない核酸断片を含むことを意味する。用語「単離された」はまた、本明細書において、他の細胞タンパク質から単離されたポリペプチドを指すために使用され、精製ポリペプチドおよび組換えポリペプチドの両方を包含することを意味する。用語「単離された」はまた、本明細書において、他の細胞または組織から単離された細胞または組織を指すために使用され、培養された細胞または組織および操作された細胞または組織の両方を包含することを意味する。
本明細書で使用される「予防する」、及び「予防する」、「予防する」等の類似の語は、疾患又は状態、例えば癌の発生又は再発の可能性を予防し、抑制し、又は低減するためのアプローチを示す。また、疾患または病態の発症もしくは再発を遅延させること、または疾患または病態の症状の発生もしくは再発を遅延させることも指す。本明細書で使用される場合、「予防」および同様の語は、疾患または状態の発症または再発の前に、疾患または状態の強度、影響、症状および/または負担を軽減することも含む。
本明細書で使用される「試料」という用語は、一般に生物学的試料を指す。試料は、個体の組織又は細胞から採取することができる。いくつかの例では、試料は、組織生検、血液(例えば、全血)、血漿、細胞外液、乾燥血斑、培養細胞、廃棄組織からなる、またはそれらに由来する。試料は、採取前に採取源から分離されていてもよい。非限定的な例としては、血液、脳脊髄液、胸水、羊水、リンパ液、唾液、尿、便、涙、汗、または粘膜排泄物、および採取前に一次供給源から分離された他の体液が挙げられる。いくつかの例では、試料は、試料調製中にその一次供給源(細胞、組織、血液などの体液、環境試料など)から分離される。試料は、その一次供給源から精製または濃縮されてもされなくてもよい。場合によっては、一次供給源はさらなる処理の前にホモジナイズされる。試料は、バフィーコート、脂質、または粒子状物質を除去するために、濾過または遠心分離される場合がある。サンプルはまた、核酸について精製または濃縮されるかもしれないし、RNaseで処理されるかもしれない。試料は、無傷、断片化、または部分的に分解された組織または細胞を含んでもよい。
本明細書で使用される「被験体」という用語は、一般に、処理または分析中の生物学的試料を有する個体であって、特定の場合には、癌を有するか、または癌を有する疑いがある個体を指す。対象は、哺乳動物、例えばヒト、実験動物(例えば、霊長類、ラット、マウス、ウサギ)、家畜(例えば、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、七面鳥、ニワトリ)、家庭用ペット(例えば、イヌ、ネコ、げっ歯類)、ウマ、およびトランスジェニック非ヒト動物を含む、方法または材料の対象である任意の生物または動物対象であり得る。対象は、例えば、良性もしくは悪性の新生物、または癌などの疾患(病状と称される場合がある)を有するか、または有する疑いのある患者であり得る。対象者は、治療中又は治療を受けたことがある。被験者が無症状の場合もある。対象者は、健康な個人であるが、癌の予防を希望している場合もある。「個体」という用語は、少なくとも場合によっては互換的に使用される。本明細書で使用される「対象」または「個人」は、医療施設に収容されていてもいなくてもよく、医療施設の外来患者として治療されていてもよい。個人は、インターネットを介して1つ以上の医療用組成物の投与を受けてもよい。個体は、ヒトまたは非ヒト動物の任意の年齢を含んでよく、したがって、成人および少年(すなわち、子供)および乳児の両方を含み、胎内の個体も含む。この用語が医学的治療の必要性を意味することは意図されておらず、したがって、個体は、臨床的であれ基礎科学研究の支援であれ、自発的であれ非自発的であれ、実験に参加することができる。
本明細書で使用される「治療」または「処置」は、疾患または病理学的状態の症状または病理学的状態に対する任意の有益なまたは望ましい効果を含み、治療される疾患または状態、例えば癌の1つまたは複数の測定可能なマーカーにおける最小限の減少さえも含み得る。治療は、任意に、疾患または病態の症状の軽減もしくは改善、または疾患または病態の進行の遅延のいずれかを含むことができる。「治療」は、必ずしも疾患もしくは状態、またはそれらに関連する症状の完全な根絶または治癒を示すものではない。
本開示は、特にHLA-G陽性癌細胞を標的とする養子細胞療法を利用する、HLA-G陽性癌の治療法を対象とする方法および組成物に関する。特定の実施形態において、HLA-G陽性癌を標的とする、あらゆる種類の遺伝子操作された哺乳動物免疫細胞(少なくともヒトNK細胞が挙げられる)が生成される。本開示は、HLA-Gに対するあらゆる種類の遺伝子操作された受容体(キメラ抗原受容体(CAR)が挙げられる)を包含する。特定の態様において、CARで使用されるHLA-G標的化細胞外ドメイン(KIR2DL4細胞外ドメインが挙げられる)を発現し、場合によっては、細胞の生存および増殖を支援するためのIL-15等の1つ以上のサイトカインも発現するレトロウイルス構築物が挙げられる、いくつかの新規の発現構築物が提供される。一部の実施形態において、CARは、KIR2DL4の細胞外ドメイン(HLA-Gに対する天然のリガンド)、およびKIR2DL4に由来しない1つ以上の追加のドメイン(例えば、膜貫通ドメイン、細胞内ドメイン)の融合物である。
II.遺伝子操作された受容体
II.遺伝子操作された受容体
本開示の免疫細胞は、HLA-Gを標的とする1つ以上の抗原結合受容体、例えば操作されたCARまたはこれ以外にも操作されたTCRを発現するように遺伝子操作され得る。例えば、免疫細胞は、HLA-Gに対する抗原特異性を有するCARおよび/またはTCRを発現するように修飾された免疫細胞であり得る。他のCARおよび/またはTCRは、HLA-G抗原受容体発現細胞と同じ細胞によって発現され得、そして異なる抗原に向けられ得る。一部の態様において、免疫細胞は、CRISPR/Cas技術を用いるCARまたはTCRのノックインによってHLA-G特異的CARまたはHLA-G特異的TCRを発現するように操作されている。
細胞の適切な修飾方法が、当該技術において知られている。例えば、前掲のSambrook and Ausubel参照。例えば、Heemskerk et al.,2008およびJohnson et al.,2009に記載されている形質導入技術を用いて、細胞は、癌抗原に対する抗原特異性を有するCARまたはTCRを発現するように形質導入され得る。
一部の態様において、細胞は、1つ以上の抗原標的化受容体(その少なくとも1つがHLA-Gに対するものである)をコードする、遺伝子操作を介して導入された1つ以上の核酸、およびそのような核酸の遺伝子操作された産物を含む。一部の実施形態において、核酸は異種である、すなわち、細胞または細胞から得られる試料において、通常存在せず、例えば、例えば操作されることとなる細胞および/またはそのような細胞が由来する生物において通常見出されない、別の生物または細胞から得られるものである。一部の実施形態において、核酸は、天然に存在せず、例えば、天然に見出されない核酸(例えばキメラ)である。
CARおよび組換えTCRが挙げられる例示的な抗原受容体、ならびに当該受容体を操作して細胞中に導入する方法として、例えば、国際公開第2000/14257号、国際公開第2013/126726号、国際公開第2012/129514号、国際公開第2014/031687号、国際公開第2013/166321号、国際公開第2013/071154号、国際公開第2013/123061号、米国特許出願公開第2002/131960号明細書、米国特許出願公開第2013/287748号明細書、米国特許出願公開第2013/0149337号明細書、米国特許第6,451,995号明細書、米国特許第7,446,190号明細書、米国特許第8,252,592号明細書、米国特許第8,339,645号、米国特許第8,398,282号明細書、米国特許第7,446,179号明細書、米国特許第6,410,319号明細書、米国特許第7,070,995号明細書、米国特許第7,265,209号明細書、米国特許第7,354,762号明細書、米国特許第7,446,191号明細書、米国特許第8,324,353号明細書、および米国特許第8,479,118号明細書、ならびに欧州特許出願公開第2537416号明細書に記載されているもの、ならびに/またはSadelain et al.,2013;Davila et al.,2013;Turtle et al.,2012;Wu et al.,2012によって記載されているものが挙げられる。一部の態様において、遺伝子操作された抗原受容体として、米国特許第7,446,190号明細書に記載されているCAR、および国際公開第2014/055668号に記載されているものが挙げられる。
A.キメラ抗原受容体
A.キメラ抗原受容体
特定の実施形態において、a)1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメイン、b)膜貫通ドメイン、およびc)HLA-Gに特異的に結合することが挙げられる、HLA-Gを標的とする少なくとも1つの抗原結合領域を含む細胞外ドメインを少なくとも含むHLA-G特異的CARが利用される。一部の実施形態において、抗原結合領域は、抗体またはその機能的断片である。他の場合には、CARの抗原結合領域は、抗体またはその機能的断片ではない(例えば、KIR2DL4、LILRB1、またはLILRB2等のHLA-Gに対するリガンド)。一部の実施形態において、CARの抗原結合領域は、KIR2DL4細胞外ドメインまたはその抗原結合部分である。一部の実施形態において、CARの抗原結合領域は、LILRB1細胞外ドメインまたはその抗原結合部分である。一部の実施形態において、CARの抗原結合領域は、LILRB2細胞外ドメインまたはその抗原結合部分である。一部の実施形態において、HLA-G特異的CARはHLA-Gのみに結合するが、他の場合では、単一ポリペプチドとしてのCARは、2つ以上の抗原結合ドメインを含むことによって二重特異性であり、その一方はHLA-Gに結合し、他方は別の非同一抗原に結合する。
一部の実施形態において、操作された抗原受容体として、活性化もしくは刺激CAR、または共刺激CARが挙げられるCARが挙げられる(国際公開第2014/055668号参照)。CARは一般に、一部の態様においてリンカーおよび/または膜貫通ドメインを介して、1つ以上の細胞内シグナル伝達構成要素に連結される細胞外抗原(またはリガンド)結合ドメインを含む。そのような分子は、典型的には、天然抗原受容体を介したシグナル、共刺激受容体と組み合わせたそのような受容体を介したシグナル、および/または共刺激受容体単独を介したシグナルを模倣するか、またはこれに近似する。
キメラ構築物は、裸のDNAとして、または適切なベクター内にあって免疫細胞中に導入され得ると考えられる。裸のDNAを用いるエレクトロポレーションによって細胞を安定して形質移入する方法が、当該技術において知られている。例えば、米国特許第6,410,319号明細書参照。裸のDNAは、一般に、発現に適した向きにプラスミド発現ベクター内に含有される、キメラ受容体をコードするDNAを指す。
これ以外にも、ウイルスベクター(例えば、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、またはレンチウイルスベクター)を用いて、キメラCAR構築物を免疫細胞中に導入することができる。本開示の方法に従って用いるのに適したベクターは、免疫細胞において非複製性である。細胞内に維持されるウイルスのコピー数が、細胞の生存率を維持するほど十分に低い、ウイルスに基づく多数のベクター、例えば、HIV、SV40、EBV、HSV、またはBPVに基づくベクターが知られている。
本開示の特定の実施形態は、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメイン、膜貫通ドメイン、および1つ以上のシグナル伝達モチーフを含む細胞外ドメインを含む、場合によっては免疫原性(hCAR)を引き下げるためにヒト化されたCARが挙げられる、HLA-G特異的CARポリペプチドをコードする核酸が挙げられる核酸の使用に関する。特定の実施形態において、HLA-G特異的CARは、1つ以上の抗原間の共有空間を含むエピトープを認識し得る。特定の実施形態において、結合領域は、モノクローナル抗体の相補性決定領域、モノクローナル抗体の可変領域、および/またはそれらの抗原結合断片を含み得る。別の実施形態において、その特異性は、受容体に結合するペプチド(例えばサイトカイン)に由来する。
ヒトHLA-G CAR核酸は、ヒト患者のための細胞免疫療法を強化するのに用いられるヒト遺伝子であり得ると考えられる。特定の実施形態において、本開示は、全長HLA-G特異的CAR cDNAまたはコード領域を含む。抗原結合領域またはドメインは、特定のヒトモノクローナル抗体に由来する単鎖可変断片(scFv)のVH鎖およびVL鎖の断片、例えば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,109,304号明細書に記載されるものを含み得る。また、断片は、ヒト抗原特異的抗体の任意の数の異なる抗原結合ドメインであり得る。より具体的な実施形態において、断片は、ヒト細胞内での発現のためのヒトコドン使用頻度に最適化された配列によってコードされるHLA-G特異的scFvである。
構成は、ダイアボディまたはマルチマー等の多量体であり得る。マルチマーは、軽鎖および重鎖の可変部分の、ダイアボディへの交差対合によって形成される可能性が最も高い。構築物のヒンジ部分は、完全に欠失されることから、第1のシステインが維持されること、セリン置換ではなくプロリンになること、第1のシステインまで切断されることまで、多数の選択肢を有し得る。Fc部分は欠失され得る。安定かつ/または二量体化するあらゆるタンパク質が、この目的を果たし得る。Fcドメインの1つのみ、例えばヒト免疫グロブリン由来のCH2またはCH3ドメインのいずれかを用いることができる。二量体化を向上させるように修飾されたヒト免疫グロブリンのヒンジ、CH2およびCH3領域を用いることもできる。免疫グロブリンのヒンジ部分のみを用いることもできる。CD8アルファの一部を用いることもできる。
一部の実施形態において、疾患細胞型上で発現されるHLA-G等のHLA-Gに対する特異性を有するHLA-G特異的CARが構築される。ゆえに、CARは、典型的には、その細胞外部分に、1つ以上のHLA-G結合分子、例えば、1つ以上の抗原結合断片、ドメイン、抗体可変ドメイン、および/またはあらゆる種類の抗体分子を含む。ヒトHLA-G核酸の例が、受託番号NM_002127でNational Center for Biotechnology InformationのGenBank(登録商標)データベースにある。ヒトHLA-Gポリペプチドの例が、受託番号NP_002118でGenBank(登録商標)にある。当業者であれば、少なくともポリペプチドの知識および日常的な実施に基づいて、HLA-Gに対するscFvを含む抗体を生成することができるが、多数の抗HLA-G scFvおよびモノクローナル抗体が、当該技術において既に存在する。一部の実施形態において、HLA-G特異的scFvは、1つ以上の抗体クローン由来のscFVである。
一部の実施形態において、HLA-G特異的CARは、モノクローナル抗体(mAb)の可変重鎖(VH)および可変軽鎖(VL)に由来する単鎖抗体断片(scFv)等の抗体分子の抗原結合部分を含む。特定の実施形態において、抗体またはその機能的断片は、G233、26-2H11、MEM-G/1、MEM-G/9、MEM-G/11、MEM-G/13、1B8、5E6H7、1-2C3、16G1、5A6G7、87G、または3C/G4であるか、またはそれらに由来する。また、抗体は、HLA-Gに対してデノボで生成されるものであってもよく、scFv配列は、そのようなデノボ抗体から得られ得るか、または誘導され得る。
特定の実施形態において、抗HLA-G CARは、HLA-Gに対するリガンドであるか、またはこれを含む細胞外ドメインを含む。特定の実施形態において、抗HLA-G CARは、KIR2DL4、LILRB1、LILR2、またはそれらの断片もしくは模倣物由来の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態において、抗HLA-G CARは、KIR2DL4細胞外ドメインまたはその抗原結合部分を含む。一部の実施形態において、抗HLA-G CARは、配列番号4を含む細胞外ドメインを含む。
キメラ受容体をコードするオープンリーディングフレームの配列は、ゲノムDNA源、cDNA源から得ることもできるし、(例えばPCRを介して)合成することもできるし、それらの組合せであってもよい。ゲノムDNAのサイズおよびイントロンの数に応じて、cDNAまたはその組合せを用いることが望ましい場合がある。というのも、イントロンがmRNAを安定させることがわかっているからである。また、mRNAを安定させるために内因性または外因性の非コード領域を用いることがさらに有利である場合がある。
一部の態様において、抗原特異的結合または認識構成要素が、1つ以上の膜貫通および細胞内シグナル伝達ドメインに連結される。一部の実施形態において、CARは、CARの細胞外ドメインに融合される膜貫通ドメインを含む。一実施形態において、CAR内のドメインの1つと天然に結合する膜貫通ドメインが用いられる。一部の例において、膜貫通ドメインは、そのようなドメインの、同じまたは異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインへの結合を回避して、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小限に抑えるように、アミノ酸置換によって選択または修飾される。一部の実施形態における膜貫通ドメインは、天然源または合成源のいずれかに由来する。源が天然である場合、一部の態様におけるドメインは、あらゆる膜結合タンパク質または膜貫通タンパク質に由来する。膜貫通領域として、T細胞受容体のアルファ鎖、ベータ鎖、またはゼータ鎖、CD28、DAP12、DAP10、NKG2D、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、ICOS/CD278、KIR2DL4等のKIR、GITR/CD357等に由来するものが挙げられる(すなわち、少なくともこれらの膜貫通領域を含む)。これ以外にも、一部の実施形態における膜貫通ドメインは、合成である。一部の態様において、合成膜貫通ドメインは、ロイシンおよびバリン等の疎水性残基を主に含む。一部の態様において、フェニルアラニン、トリプトファン、およびバリンのトリプレットが、合成膜貫通ドメインの各末端にて見出される。
一部の実施形態において、HLA-G CAR核酸は、膜貫通ドメインおよび1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメイン等の他の共刺激受容体をコードする配列を含む。CD3ζおよび/またはFcεRIγによって開始され得るような一次T細胞活性化シグナルに加えて、キメラ受容体の、標的抗原との結合後の免疫エフェクタ細胞増殖およびエフェクタ機能用の追加の刺激シグナルが利用され得る。例えば、インビボ持続性を向上させ、かつ養子免疫療法の治療的成功を向上させるのに役立ち得る、細胞の活性化の増強のためのヒト共刺激受容体の一部または全部が利用され得る。例として、DAP12、DAP10、NKG2D、CD2、CD28、CD27、4-1BB、(CD137)、OX40、ICOS、(CD278)、CD30、HVEM、CD40、LFA-1(CD11a/CD18)、ICAM-1、および/または活性化シグナルを誘導することができるKIR2DL4細胞質ドメインの一部等の分子由来の共刺激ドメインが挙げられるが、代替の特定の実施形態において、列挙されるこれらのいずれか1つが、CARでの使用から除外され得る。
特定の実施形態において、NK細胞等の免疫細胞を遺伝子修飾するための本明細書中で開示されるプラットフォーム技術は、(i)エレクトロポレーションデバイス(例えばヌクレオフェクタ)を用いる非ウイルス遺伝子導入、(ii)エンドドメインを介してシグナル伝達するCAR(例えば、CD28/CD3-ζ、CD137/CD3-ζ、または他の組合せ)、(iii)HLA-G認識ドメインを細胞表面に連結する可変長の細胞外ドメインを有するCAR、および場合によっては、(iv)CAR+免疫細胞をロバストかつ数値的に拡大させることができるようなK562由来の人工抗原提示細胞(aAPC)を含む(Singh et al.,2008;Singh et al.,2011)。
B.特定のCAR実施形態の例
B.特定のCAR実施形態の例
特定の実施形態において、特定のHLA-G CAR分子が、本明細書中に包含される。場合によっては、CARのHLA-G結合ドメインはscFvであり、そしてHLA-Gに結合するあらゆるscFvが、本明細書中で利用され得る。場合によっては、CARのHLA-G結合ドメインは、HLA-Gのリガンド(例えば、KIR2DL4、LILRB1、またはLILRB2)由来の結合ドメインであり、HLA-Gに結合するあらゆるドメインが、本明細書で利用され得る。抗HLA-G scFvがCARの細胞外ドメインに利用される場合、scFvの可変重鎖および可変軽鎖は、N末端からC末端の方向において、あらゆる順序であり得る。例えば、可変重鎖は、可変軽鎖のN末端側にあり得、またはその逆も同じである。CAR内のHLA-Gに結合するscFvおよび/またはリガンドは、コドン最適化されていてもされていなくてもよい。特定の実施形態において、ベクターは、HLA-G特異的CARをコードし、そしてまた1つ以上の他の分子をコードする。例えば、ベクターは、HLA-G特異的CARをコードし得、そしてまた、別の目的のタンパク質、例えば、別の操作された抗原受容体、自殺遺伝子、および/または特定のサイトカインをコードしてよい。
同じ分子上で、HLA-G特異的CARは、1つ以上の抗原特異的細胞外ドメイン、特異的ヒンジ、特異的膜貫通ドメイン、1つ以上の特異的共刺激ドメイン、および1つ以上の特異的活性化シグナルを含んでよい。例えば2つの異なる抗原(そのうちの1つがHLA-Gである)を標的とするのに、複数の抗原特異的細胞外ドメインが利用される場合、2つの抗原特異的細胞外ドメイン間にリンカーが存在し得る。
特定のCAR分子の特定の実施形態において、CARは、DAP10、DAP12、4-1BB、NKG2D、または他の共刺激ドメイン(本明細書中で細胞質内ドメインと称され得る)を利用してよい。場合によっては、CD3ゼータは、いかなる共刺激ドメインもなしに利用される。特定のCAR分子の特定の実施形態において、CARは、例えば、DAP12、DAP10、4-1BB、2B4、OX40、CD27、NKG2D、CD8、またはCD28から、適切なあらゆる膜貫通ドメインを利用してよい。
特定の実施形態において、操作された特定のHLA-G特異的受容体をコードする配列を含む発現構築物が存在する。特定の実施形態において、あらゆるHLA-G CARは、以下のうちの1つを含み得る:(a)CD8シグナルペプチド、KIR2DL4細胞外ドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD3ゼータ細胞内ドメイン;または(b)CD8シグナルペプチド、KIR2DL4細胞外ドメイン、CD8膜貫通ドメイン、CD28細胞内ドメイン、およびCD3ゼータ細胞内ドメイン。
具体的な配列の実施形態の例を、以下に提供する。
1.抗原特異的細胞外ドメイン
1.抗原特異的細胞外ドメイン
特定の実施形態において、抗原特異的細胞外ドメインは、HLA-G特異的抗体のKIR2DL4細胞外ドメインおよび/または抗HLA-G抗原結合領域を含む。具体的な配列の実施形態の例を、以下に提供する。
具体的な実施形態において、KIR2DL4細胞外ドメインヌクレオチド配列は、以下のように利用される。:
TGGGCACACGTGGGTGGTCAGGACAAGCCCTTCTGCTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCAAGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTCACTATCGTCGTGGGTTCAACATCTTCACGCTGTACAAGAAAGATGGGGTCCCTGTCCCTGAGCTCTACAACAGAATATTCTGGAACAGTTTCCTCATTAGCCCTGTGACCCCAGCACACGCAGGGACCTACAGATGTCGAGGTTTTCACCCGCACTCCCCCACTGAGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCCTGGTGATCATGGTCACAGGTCTATATGAGAAACCTTCGCTTACAGCCCGGCTGGGCCCCACGGTTCGCGCAGGAGAGAACGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCAGAGCTCCTTTGACATCTACCATCTATCCAGGGAGGGGGAAGCCCATGAACTTAGGCTCCCTGCAGTGCCCAGCATCAATGGAACATTCCAGGCCGACTTCCCTCTGGGTCCTGCCACCCACGGAGAGACCTACAGATGCTTCGGCTCTTTCCATGGATCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCCTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCTAGTAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTTCAAAACTGGTATCGCCAGACACCTGCAT (配列番号:7)
TGGGCACACGTGGGTGGTCAGGACAAGCCCTTCTGCTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCAAGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTCACTATCGTCGTGGGTTCAACATCTTCACGCTGTACAAGAAAGATGGGGTCCCTGTCCCTGAGCTCTACAACAGAATATTCTGGAACAGTTTCCTCATTAGCCCTGTGACCCCAGCACACGCAGGGACCTACAGATGTCGAGGTTTTCACCCGCACTCCCCCACTGAGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCCTGGTGATCATGGTCACAGGTCTATATGAGAAACCTTCGCTTACAGCCCGGCTGGGCCCCACGGTTCGCGCAGGAGAGAACGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCAGAGCTCCTTTGACATCTACCATCTATCCAGGGAGGGGGAAGCCCATGAACTTAGGCTCCCTGCAGTGCCCAGCATCAATGGAACATTCCAGGCCGACTTCCCTCTGGGTCCTGCCACCCACGGAGAGACCTACAGATGCTTCGGCTCTTTCCATGGATCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCCTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCTAGTAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTTCAAAACTGGTATCGCCAGACACCTGCAT (配列番号:7)
本開示に包含される任意のポリヌクレオチドは、配列番号:7、または配列番号:7と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上の%で同一である配列を含み得る。
特定の実施形態では、コドン最適化KIR2DL4細胞外ドメインヌクレオチド配列が、以下のように利用される。:
TGGGCTCACGTTGGCGGCCAGGATAAGCCTTTTTGTTCTGCCTGGCCTAGCGCCGTGGTTCCTCAAGGTGGACACGTGACCCTGCGGTGTCACTACAGACGGGGCTTCAACATCTTCACCCTGTACAAGAAAGACGGCGTGCCCGTGCCTGAGCTGTACAACAGAATCTTCTGGAACAGCTTCCTGATCAGCCCCGTGACACCAGCTCACGCCGGCACATACAGATGCAGAGGCTTTCACCCTCACAGCCCCACAGAGTGGTCCGCTCCATCTAACCCTCTGGTCATCATGGTCACCGGCCTGTACGAGAAGCCTAGCCTGACAGCTAGACTGGGCCCTACAGTTAGAGCCGGCGAGAATGTGACCCTGTCCTGTAGCAGCCAGAGCAGCTTCGACATCTACCACCTGTCTAGAGAGGGCGAAGCCCACGAACTGAGACTGCCTGCCGTGCCTAGCATCAATGGCACCTTCCAGGCCGATTTTCCACTGGGACCTGCCACACACGGCGAGACTTACAGATGCTTTGGCAGCTTCCACGGCAGCCCTTACGAGTGGTCTGATCCTAGCGATCCTCTGCCTGTGTCCGTGACAGGCAATCCTAGCAGCAGCTGGCCTTCTCCAACCGAGCCTAGCTTTAAGACCGGAATCGCCCGGCATCTGCAC (配列番号:8)
TGGGCTCACGTTGGCGGCCAGGATAAGCCTTTTTGTTCTGCCTGGCCTAGCGCCGTGGTTCCTCAAGGTGGACACGTGACCCTGCGGTGTCACTACAGACGGGGCTTCAACATCTTCACCCTGTACAAGAAAGACGGCGTGCCCGTGCCTGAGCTGTACAACAGAATCTTCTGGAACAGCTTCCTGATCAGCCCCGTGACACCAGCTCACGCCGGCACATACAGATGCAGAGGCTTTCACCCTCACAGCCCCACAGAGTGGTCCGCTCCATCTAACCCTCTGGTCATCATGGTCACCGGCCTGTACGAGAAGCCTAGCCTGACAGCTAGACTGGGCCCTACAGTTAGAGCCGGCGAGAATGTGACCCTGTCCTGTAGCAGCCAGAGCAGCTTCGACATCTACCACCTGTCTAGAGAGGGCGAAGCCCACGAACTGAGACTGCCTGCCGTGCCTAGCATCAATGGCACCTTCCAGGCCGATTTTCCACTGGGACCTGCCACACACGGCGAGACTTACAGATGCTTTGGCAGCTTCCACGGCAGCCCTTACGAGTGGTCTGATCCTAGCGATCCTCTGCCTGTGTCCGTGACAGGCAATCCTAGCAGCAGCTGGCCTTCTCCAACCGAGCCTAGCTTTAAGACCGGAATCGCCCGGCATCTGCAC (配列番号:8)
本開示に包含される任意のポリヌクレオチドは、配列番号:8、または配列番号:8と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列を含み得る。
KIR2DL4細胞外ドメインアミノ酸配列の例は以下の通りである。:
WAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARLGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLH (配列番号:9)
WAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARLGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLH (配列番号:9)
本開示に包含される任意のポリペプチドは、配列番号:9、または配列番号:9と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列を含み得る。
KIR2DL4細胞外ドメインアミノ酸配列の追加の例は以下の通りである。:
WAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLH (配列番号:10)
WAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLH (配列番号:10)
本開示に包含される任意のポリペプチドは、配列番号:9、または配列番号:9と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列を含み得る。
具体例において、CAR分子中に利用されるKIR2DL4の領域は、以下のアミノ酸を含むか、以下からなるか、または以下から本質的になる。
配列表の配列番号9又は10(配列番号:9又は配列番号:10)の1-50,1-51,1-52,1-53,1-54,1-55,1-56,1-57,1-58,1-59,1-60,1-61,1-62,1-63,1-64,1-65,1-66,1-67,1-68,1-69,1-70,1-71,1-72,1-73,1-74,1-75,1-76,1-77,1-78,1-79,1-80,1-81,1-82,1-83,1-84,1-85,1-86,1-87,1-88,1-89,1-90,1-91,1-92,1-93,1-94,1-95,1-96,1-97,1-98,1-99,1-100,1-101,1-102,1-103,1-104,1-105,1-106,1-107,1-108,1-109,1-110,1-111,1-112,1-113,1-114,1-115,1-116,1-117,1-118,1-119,1-120,1-121,1-122,1-123,1-124,1-125,1-126,1-127,1-128,1-129,1-130,1-131,1-132,1-133,1-134,1-135,1-136,1-137,1-138,1-139,1-140,1-141,1-142,1-143,1-144,1-145,1-146,1-147,1-148,1-149,1-150,1-151,1-152,1-153,1-154,1-155,1-156,1-157,1-158,1-159,1-160,1-161,1-162,1-163,1-164,1-165,1-166,1-167,1-168,1-169,1-170,1-171,1-172,1-173,1-174,1-175,1-176,1-177,1-178,1-179,1-180,1-181,1-182,1-183,1-184,1-185,1-186,1-187,1-188,1-189,1-190,1-191,1-192,1-193,1-194,1-195,1-196,1-197,1-198,1-199,1-200,1-201,1-202,1-203,1-204,1-205,1-206,1-207,1-208,1-209,1-210,1-211,1-212,1-213,1-214,1-215,1-216,1-217,1-218,1-219,1-220,又はすべて(1-221);特定の実施形態において、これらの範囲のそのようなアミノ酸は連続している。 いくつかの実施形態において、配列番号:9または配列番号:10の領域は、N末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上のアミノ酸のような、N末端での切断を有するものが利用される。 特定の態様において、そのN末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上のアミノ酸の切断があり、C末端で切断がある。
配列表の配列番号9又は10(配列番号:9又は配列番号:10)の1-50,1-51,1-52,1-53,1-54,1-55,1-56,1-57,1-58,1-59,1-60,1-61,1-62,1-63,1-64,1-65,1-66,1-67,1-68,1-69,1-70,1-71,1-72,1-73,1-74,1-75,1-76,1-77,1-78,1-79,1-80,1-81,1-82,1-83,1-84,1-85,1-86,1-87,1-88,1-89,1-90,1-91,1-92,1-93,1-94,1-95,1-96,1-97,1-98,1-99,1-100,1-101,1-102,1-103,1-104,1-105,1-106,1-107,1-108,1-109,1-110,1-111,1-112,1-113,1-114,1-115,1-116,1-117,1-118,1-119,1-120,1-121,1-122,1-123,1-124,1-125,1-126,1-127,1-128,1-129,1-130,1-131,1-132,1-133,1-134,1-135,1-136,1-137,1-138,1-139,1-140,1-141,1-142,1-143,1-144,1-145,1-146,1-147,1-148,1-149,1-150,1-151,1-152,1-153,1-154,1-155,1-156,1-157,1-158,1-159,1-160,1-161,1-162,1-163,1-164,1-165,1-166,1-167,1-168,1-169,1-170,1-171,1-172,1-173,1-174,1-175,1-176,1-177,1-178,1-179,1-180,1-181,1-182,1-183,1-184,1-185,1-186,1-187,1-188,1-189,1-190,1-191,1-192,1-193,1-194,1-195,1-196,1-197,1-198,1-199,1-200,1-201,1-202,1-203,1-204,1-205,1-206,1-207,1-208,1-209,1-210,1-211,1-212,1-213,1-214,1-215,1-216,1-217,1-218,1-219,1-220,又はすべて(1-221);特定の実施形態において、これらの範囲のそのようなアミノ酸は連続している。 いくつかの実施形態において、配列番号:9または配列番号:10の領域は、N末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上のアミノ酸のような、N末端での切断を有するものが利用される。 特定の態様において、そのN末端で1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはそれ以上のアミノ酸の切断があり、C末端で切断がある。
LILRB1の細胞外ドメインのアミノ酸配列は以下の通りである。:
GHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRLYREKKTALWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHAGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTGAYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVILQCDSQVAFDGFSLCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRAIFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSGPSGGPSSPTTGPTSTSGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGV (配列番号:48)
GHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRLYREKKTALWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHAGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTGAYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVILQCDSQVAFDGFSLCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRAIFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSGPSGGPSSPTTGPTSTSGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGV (配列番号:48)
LILRB2の細胞外ドメインのアミノ酸配列は以下の通りである:
QTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRLYREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRARWSELSDPLVLVMTGAYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKAGAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVSGPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGV (配列番号:49)
QTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRLYREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRARWSELSDPLVLVMTGAYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEEEHPQCLNSQPHARGSSRAIFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKAGAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVSGPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGV (配列番号:49)
具体的な実施形態において、抗原特異的細胞外ドメインは、scFvであってもなくてもよいHLA-G特異的抗体の抗HLA-G抗原結合領域を含む。
特定の実施形態において、抗原特異的細胞外ドメインは、MEM-G11のHLA-Gモノクローナル抗体の抗体を含む。このような場合、MEM-G/11配列は、可変領域および定常領域を含む以下の軽鎖配列を含む。:
DIVLTQSPASLDVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQKPGQSPKLLIYLASNRESGVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSREFPTFGAGTKLELKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC(配列番号:50)。ここで、定常領域には下線が引かれている。具体的な実施形態において、このような軽鎖配列は、RASKSVSTSGYSYMH(配列番号:51)のCDR1;LASNRES(配列番号:52)のCDR2;およびQHSREFPT(配列番号:53)のCDR3を含み得る。
MEM-G/11可変軽鎖配列は、以下を含む。
DIVLTQSPASLDVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQKPGQSPKLLIYLASNRESGVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSREFPTFGAGTKLELK (配列番号:54).
具体的な態様において、MEM-G/11可変軽鎖配列をコードするポリヌクレオチドは、以下を含む。:
Gatattgtgctgacccagagcccggcgagcctggatgtgagcctgggccagcgcgcgaccattagctgccgcgcgagcaaaagcgtgagcaccagcggctatagctatatgcattggtatcagcagaaaccgggccagagcccgaaactgctgatttatctggcgagcaaccgcgaaagcggcgtgccggcgcgctttagcggcagcggcagcggcaccgattttaccctgaacattcatccggtggaagaagaagatgcggcgacctattattgccagcatagccgcgaatttccgacctttggcgcgggcaccaaactggaactgaaa (配列番号:55)
Gatattgtgctgacccagagcccggcgagcctggatgtgagcctgggccagcgcgcgaccattagctgccgcgcgagcaaaagcgtgagcaccagcggctatagctatatgcattggtatcagcagaaaccgggccagagcccgaaactgctgatttatctggcgagcaaccgcgaaagcggcgtgccggcgcgctttagcggcagcggcagcggcaccgattttaccctgaacattcatccggtggaagaagaagatgcggcgacctattattgccagcatagccgcgaatttccgacctttggcgcgggcaccaaactggaactgaaa (配列番号:55)
具体的な態様において、MEM-G/11配列は、可変領域および定常領域を含む以下の重鎖配列を含み得る:
KVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSAAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK (配列番号:56)
ここで、定常領域には下線が引かれている。具体的な実施形態において、このような重鎖配列は、GFPFSDY(配列番号:57)のCDR1;SDDDDY(配列番号:58)のCDR2;およびGIYYGSSPFAY(配列番号:59)のCDR3を含んでなり得る。
ここで、定常領域には下線が引かれている。具体的な実施形態において、このような重鎖配列は、GFPFSDY(配列番号:57)のCDR1;SDDDDY(配列番号:58)のCDR2;およびGIYYGSSPFAY(配列番号:59)のCDR3を含んでなり得る。
MEM-G/11可変重鎖配列は、以下を含み得る:
KVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSA (配列番号:60).具体的な態様において、MEM-G/11可変重鎖配列をコードするポリヌクレオチドは、以下を含み得る:
Aaagtgcagctggtggaaagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcctgaaactgagctgcagcgcgagcggctttccgtttagcgattattatatgtattgggtgcgccagaccccggaaaaacgcctggaatgggtggcgaccattagcgatgatgatgattatacctattatccggatagcatgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaacctgtatctgcagatgagcagcctgaaaagcgaagataccgcgatgtattattgcagccgcggcatttattatggcagcagcccgtttgcgtattggggccagggcaccctggtgaccgtgagcgcg (配列番号:61).
KVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSA (配列番号:60).具体的な態様において、MEM-G/11可変重鎖配列をコードするポリヌクレオチドは、以下を含み得る:
Aaagtgcagctggtggaaagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcctgaaactgagctgcagcgcgagcggctttccgtttagcgattattatatgtattgggtgcgccagaccccggaaaaacgcctggaatgggtggcgaccattagcgatgatgatgattatacctattatccggatagcatgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaacctgtatctgcagatgagcagcctgaaaagcgaagataccgcgatgtattattgcagccgcggcatttattatggcagcagcccgtttgcgtattggggccagggcaccctggtgaccgtgagcgcg (配列番号:61).
具体的な実施形態では、抗原特異的細胞外ドメインは、87GクローンのHLA-Gモノクローナル抗体の抗体からなる。 このような場合、配列は、可変領域および定常領域を含む以下の軽鎖配列から構成され得る。
ETTVTQSPASLSVATGEKVTIRCITSTDIDDDMNWYQQKPGEPPKLLISEDNILRPGVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCLQSDNMPLTFGGGTRLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC(配列番号:62), ここで、定常領域には下線が引かれている。 特定の実施形態において、このような軽鎖配列は、ITSTDIDDDMN(配列番号:63)のCDR1;EDNILRP(配列番号:64)のCDR2;およびLQSDNMPLT(配列番号:65)のCDR3を含んでなることができる。
87G可変軽鎖配列は、以下を含み得る。
ETTVTQSPASLSVATGEKVTIRCITSTDIDDDMNWYQQKPGEPPKLLISEDNILRPGVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCLQSDNMPLTFGGGTRLEIK (配列番号:66). 87G可変軽鎖配列をコードし得るポリヌクレオチドは、以下を含む:
Gaaaccaccgtgacccagagcccggcgagcctgagcgtggcgaccggcgaaaaagtgaccattcgctgcattaccagcaccgatattgatgatgatatgaactggtatcagcagaaaccgggcgaaccgccgaaactgctgattagcgaagataacattctgcgcccgggcgtgccgagccgctttagcagcagcggctatggcaccgattttgtgtttaccattgaaaacaccctgagcgaagatgtggcggattattattgcctgcagagcgataacatgccgctgacctttggcggcggcacccgcctggaaattaaa (配列番号:67).
具体的な例では、配列は可変領域と定常領域を含む以下の重鎖配列からなることがある:
EVKLVESGGSLVQPGGSLKLSCAASGFSFSSYTMSWVRQTPKKRLEWVAYVSNGAGTTYYPDSLKGRFTISRDNAKNTLHLLMTSLKSEDTAIYYCARHYYGSYHFDYWGQGTTLIVSSAKTTAPSVYPLAPVCGGTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPALLQSGLYTLSSSVTVTSNTWPSQTITCNVAHPASSTKVDKKIEPRVPITQNPCPPLKECPPCAAPDLLGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPMVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNRALPSPIEKTISKPRGPVRAPQVYVLPPPAEEMTKKEFSLTCMITGFLPAEIAVDWTSNGRTEQNYKNTATVLDSDGSYFMYSKLRVQKSTWERGSLFACSVVHEGLHNHLTTKTISRSLGK (配列番号:68)、ここで、定常領域には下線が引かれている。具体的な実施形態において、このような重鎖配列は、GFSFSSY(配列番号:69)のCDR1;SNGAGT(配列番号:70)のCDR2;およびHYYGSYHFDY(配列番号:71)のCDR3を含んでなり得る。
いくつかの実施形態において、87G可変重鎖配列は、以下を含む。
EVKLVESGGSLVQPGGSLKLSCAASGFSFSSYTMSWVRQTPKKRLEWVAYVSNGAGTTYYPDSLKGRFTISRDNAKNTLHLLMTSLKSEDTAIYYCARHYYGSYHFDYWGQGTTLIVSS (配列番号:72)。 特定の態様において、87G可変重鎖配列をコードするポリヌクレオチドは、以下を含む:
Gaagtgaaactggtggaaagcggcggcagcctggtgcagccgggcggcagcctgaaactgagctgcgcggcgagcggctttagctttagcagctataccatgagctgggtgcgccagaccccgaaaaaacgcctggaatgggtggcgtatgtgagcaacggcgcgggcaccacctattatccggatagcctgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaccctgcatctgctgatgaccagcctgaaaagcgaagataccgcgatttattattgcgcgcgccattattatggcagctatcattttgattattggggccagggcaccaccctgattgtgagcagc (配列番号:73)
本開示に包含される任意のポリヌクレオチドは、配列番号:55、61、67、もしくは73、または配列番号:55、61、67、もしくは73とそれぞれ少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列を含み得る。
本開示に包含される任意のポリペプチドは、配列番号:50-54、56-60、62-66、または68-72、あるいは配列番号:50-54、56-60、62-66、または68-72とそれぞれ少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、またはそれ以上%同一である配列を含み得る。
2.膜貫通ドメイン
2.膜貫通ドメイン
任意の適切な膜貫通ドメインが、本開示のHLA-G特異的CARにおいて利用され得る。例としては、少なくとも、DAP10、DAP12、CD28、NKG2D、CD3イプシロン、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD28、CD33、CD37、CD45、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、またはCD154由来の膜貫通ドメイン、T細胞受容体aまたはb鎖由来の膜貫通ドメイン、CD3ゼータ鎖由来の膜貫通ドメイン、ICOS由来の膜貫通ドメイン、それらの機能的誘導体、およびそれらの組み合わせが挙げられる。具体的には、DAP10、DAP12、CD28、CD8、またはNKG2D由来の膜貫通ドメインが利用される。いくつかの実施形態において、キラー免疫グロブリン様受容体(KIR)由来の膜貫通ドメインが利用され、例えば、阻害性KIR由来の膜貫通ドメイン(例えば、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DL4、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3)、または活性化KIR(例えば、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS3、KIR2DS4、KIR2DS5、KIR3DS1)からの膜貫通ドメインが利用される。特定の膜貫通ドメイン配列の例を以下に示す。:
CD28膜貫通ドメインの塩基配列:
TTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTG (配列番号:11)
TTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTG (配列番号:11)
CD28膜貫通ドメインのアミノ酸配列:
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV (配列番号:12)
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV (配列番号:12)
CD8膜貫通ドメインの塩基配列:
accacaacaccagcacctagacctccaactccagctcctacaatcgccagccagcctctgtctctgaggcctgaagcttgtagacctgctgctggcggagccgtgcataccagaggactggatttcgcctgcgatatctacatctgggcccctctggctggaacatgtggcgtgctgctgctgagcctcgtgatcaca (配列番号:13)
accacaacaccagcacctagacctccaactccagctcctacaatcgccagccagcctctgtctctgaggcctgaagcttgtagacctgctgctggcggagccgtgcataccagaggactggatttcgcctgcgatatctacatctgggcccctctggctggaacatgtggcgtgctgctgctgagcctcgtgatcaca (配列番号:13)
CD8膜貫通ドメインアミノ酸配列:
TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVIT (配列番号:14)
TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVIT (配列番号:14)
4-1BB 膜貫通ドメイン塩基配列:
ATCATCTCCTTCTTTCTTGCGCTGACGTCGACTGCGTTGCTCTTCCTGCTGTTCTTCCTCACGCTCCGTTTCTCTGTTGTT (配列番号:25)
ATCATCTCCTTCTTTCTTGCGCTGACGTCGACTGCGTTGCTCTTCCTGCTGTTCTTCCTCACGCTCCGTTTCTCTGTTGTT (配列番号:25)
4-1BB 膜貫通ドメイン アミノ酸配列:
IISFFLALTSTALLFLLFFLTLRFSVV (配列番号:26)
IISFFLALTSTALLFLLFFLTLRFSVV (配列番号:26)
DAP10 膜貫通ドメイン 塩基配列:
CTCCTGGCAGGCCTCGTGGCTGCTGATGCGGTGGCATCGCTGCTCATCGTGGGGGCGGTGTTC (配列番号:27)
CTCCTGGCAGGCCTCGTGGCTGCTGATGCGGTGGCATCGCTGCTCATCGTGGGGGCGGTGTTC (配列番号:27)
DAP10 膜貫通ドメインアミノ酸配列:
LLAGLVAADAVASLLIVGAVF (配列番号:28)
LLAGLVAADAVASLLIVGAVF (配列番号:28)
DAP12 膜貫通ドメイン塩基配列:
GGCGTGCTGGCAGGGATCGTGATGGGAGACCTGGTGCTGACAGTGCTCATTGCCCTGGCCGTG (配列番号:29)
GGCGTGCTGGCAGGGATCGTGATGGGAGACCTGGTGCTGACAGTGCTCATTGCCCTGGCCGTG (配列番号:29)
DAP12 膜貫通ドメイン アミノ酸配列:
GVLAGIVMGDLVLTVLIALAV (配列番号:30)
GVLAGIVMGDLVLTVLIALAV (配列番号:30)
NKG2D 膜貫通ドメイン 塩基配列:
GCGGTGATGATTATTTTTCGCATTGGCATGGCGGTGGCGATTTTTTGCTGCTTTTTTTTTCCG (配列番号:31)
GCGGTGATGATTATTTTTCGCATTGGCATGGCGGTGGCGATTTTTTGCTGCTTTTTTTTTCCG (配列番号:31)
NKG2D 膜貫通ドメイン アミノ酸配列:
AVMIIFRIGMAVAIFCCFFFP (配列番号:32)
AVMIIFRIGMAVAIFCCFFFP (配列番号:32)
本開示に包含される任意のポリヌクレオチドは、配列番号:11、13、25、27、29、もしくは31、または配列番号:11、13、25、27、29、もしくは31と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列からなり得る。本開示に包含される任意のポリペプチドは、配列番号:12、14、16、28、30、もしくは32、または配列番号:12、14、16、28、30、もしくは32と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上同一である配列を含み得る。
3.細胞内ドメイン
3.細胞内ドメイン
1つまたは複数の細胞内ドメイン(適切な場合には、本明細書においてシグナル活性化ドメインまたはコスティミュレイトリードメインとも呼ばれ得る)は、本開示の特定の抗HLA-G CARにおいて利用されても利用されなくてもよい。具体例としては、CD3ゼータ、4-1BB、NKG2D、OX-40、CD27、DAP10、DAP12、B7-1/CD80、CD28、2B4、4-1BBL、B7-2/CD86、CTLA-4、B7-H1/PD-L1、ICOS、B7-H2、PD-l、B7-H3、PD-L2、B7-H4、PDCD6、BTLA、またはそれらの組み合わせからの細胞内ドメインが挙げられる。いくつかの実施形態において、本開示のCARの細胞内ドメインは、KIR2DL4細胞内ドメインではない。
本開示のCARにおいて使用され得る特定の細胞内ドメインの例を以下に示す。:
CD3ゼータ 細胞内ドメイン塩基配列の例:
acgcgtaagaagttcagcaggagcgcagacgcccccgcgtaccagcagggccagaaccagctctataacgagctcaatctaggacgaagagaggagtacgatgttttggacaaaagacgtggccgggaccctgagatggggggaaagccgagaaggaagaaccctcaggaaggcctgtacaatgaactgcagaaagataagatggcggaggcctacagtgagattgggatgaaaggcgagcgccggaggggcaaggggcacgatggcctttaccagggtctcagtacagccaccaaggacacctacgacgcccttcacatgcaggccctgccccctcgcgga (配列番号:15)
acgcgtaagaagttcagcaggagcgcagacgcccccgcgtaccagcagggccagaaccagctctataacgagctcaatctaggacgaagagaggagtacgatgttttggacaaaagacgtggccgggaccctgagatggggggaaagccgagaaggaagaaccctcaggaaggcctgtacaatgaactgcagaaagataagatggcggaggcctacagtgagattgggatgaaaggcgagcgccggaggggcaaggggcacgatggcctttaccagggtctcagtacagccaccaaggacacctacgacgcccttcacatgcaggccctgccccctcgcgga (配列番号:15)
CD3ゼータ細胞内ドメインアミノ酸配列の例:
TRKKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRG (配列番号:16)
CD3ゼータ細胞内ドメイン 塩基配列の例:
AAACGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGA (配列番号:17)
AAACGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGA (配列番号:17)
CD3ゼータ細胞内ドメインアミノ酸配列の例:
KRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRG (配列番号:18)
4-1BB 細胞内ドメイン 塩基配列:
AAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTG (配列番号:33)
AAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTG (配列番号:33)
4-1BB 細胞内ドメイン アミノ酸配列:
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL (配列番号:34)
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL (配列番号:34)
DAP10細胞内ドメイン塩基配列:
CTTTGCGCACGCCCACGCCGCAGCCCCGCCCAAGAAGATGGCAAAGTCTACATCAACATGCCAGGCAGGGGC (配列番号:35)
CTTTGCGCACGCCCACGCCGCAGCCCCGCCCAAGAAGATGGCAAAGTCTACATCAACATGCCAGGCAGGGGC (配列番号:35)
DAP10細胞内ドメインアミノ酸配列:
LCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRG (配列番号:36)
LCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRG (配列番号:36)
DAP12細胞内ドメイン塩基配列:
TACTTCCTGGGCCGGCTGGTCCCTCGGGGGCGAGGGGCTGCGGAGGCAGCGACCCGGAAACAGCGTATCACTGAGACCGAGTCGCCTTATCAGGAGCTCCAGGGTCAGAGGTCGGATGTCTACAGCGACCTCAACACACAGAGGCCGTATTACAAA (配列番号:37)
TACTTCCTGGGCCGGCTGGTCCCTCGGGGGCGAGGGGCTGCGGAGGCAGCGACCCGGAAACAGCGTATCACTGAGACCGAGTCGCCTTATCAGGAGCTCCAGGGTCAGAGGTCGGATGTCTACAGCGACCTCAACACACAGAGGCCGTATTACAAA (配列番号:37)
DAP12細胞内ドメインアミノ酸配列:
YFLGRLVPRGRGAAEAATRKQRITETESPYQELQGQRSDVYSDLNTQRPYYK (配列番号:38)
YFLGRLVPRGRGAAEAATRKQRITETESPYQELQGQRSDVYSDLNTQRPYYK (配列番号:38)
NKG2D 細胞内ドメイン 塩基配列:
AGCGCGAACGAACGCTGCAAAAGCAAAGTGGTGCCGTGCCGCCAGAAACAGTGGCGCACCAGCTTTGATAGCAAAAAACTGGATCTGAACTATAACCATTTTGAAAGCATGGAATGGAGCCATCGCAGCCGCCGCGGCCGCATTTGGGGCATG (配列番号:39)
AGCGCGAACGAACGCTGCAAAAGCAAAGTGGTGCCGTGCCGCCAGAAACAGTGGCGCACCAGCTTTGATAGCAAAAAACTGGATCTGAACTATAACCATTTTGAAAGCATGGAATGGAGCCATCGCAGCCGCCGCGGCCGCATTTGGGGCATG (配列番号:39)
NKG2D 細胞内ドメイン アミノ酸配列:
SANERCKSKVVPCRQKQWRTSFDSKKLDLNYNHFESMEWSHRSRRGRIWGM (配列番号:40)
SANERCKSKVVPCRQKQWRTSFDSKKLDLNYNHFESMEWSHRSRRGRIWGM (配列番号:40)
本開示に含まれるポリヌクレオチドは以下を含み得る。
配列番号:15, 17, 33, 35, 37, or 39 または配列番号:15、17、33、35、37、または39と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、またはそれ以上%同一である配列を含む。本開示に包含される任意のポリペプチドは、以下を含み得る。配列番号:16, 18, 34, 36, 38, または40、あるいは配列番号:16、18、34、36、38、または40と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、またはそれ以上%同一である配列。
配列番号:15, 17, 33, 35, 37, or 39 または配列番号:15、17、33、35、37、または39と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、またはそれ以上%同一である配列を含む。本開示に包含される任意のポリペプチドは、以下を含み得る。配列番号:16, 18, 34, 36, 38, または40、あるいは配列番号:16、18、34、36、38、または40と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、またはそれ以上%同一である配列。
4.ヒンジ
CARのいくつかの実施形態では、1つ以上の細胞外抗原結合ドメインと貫通ドメインとの間にヒンジ領域が存在する。具体的な実施形態において、ヒンジは、例えば、10~20、10~15、11~20、11~15、12~20、12~15、または15~20アミノ酸のような特定の長さを有する。ヒンジは任意の適切なヒンジであってよく、場合によってはIgG、またはCD28由来のヒンジを含む。具体的な実施形態では、ヒンジは、IgG FcのCH2-CH3ドメインとCH1ドメインとを連結する小さな可撓性ポリペプチドである。例えば、様々なIgGサブクラス(IgG1~4、修飾されていてもいなくてもよい)のCH2-CH3ヒンジ(一部または全部)を利用することができる。しかしながら、場合によっては、CH2-CH3ヒンジ全体が利用されるのではなく、ヒンジの一部が利用される(CH3単体またはCH3の一部単体など)。特定の実施態様において、IgG1由来のCH2-CH3ヒンジが利用され、場合によってはCH2-CH3ヒンジ全体が利用され(229アミノ酸全て)、CH3ヒンジ(119アミノ酸)だけが利用され、または短いヒンジ(12アミノ酸)が利用される。
特定の場合には、CARの効率を最適化するために、スペーサーおよび/またはヒンジの同一性または長さを変更することができる。例えば、Hudecekら(2014)及びJonnalagaddaら(2015)を参照されたい。特定の実施形態において、HLA-G CARは、例えば、IgG4ヒンジ+CH3を利用するか、又はCD8aストークを利用する。
したがって、具体的な実施形態において、利用されるIgGヒンジ領域は、典型的にはIgG1またはIgG4であり、場合によっては、CARはIgG FcのCH2-CH3ドメインを含む。IgG Fcドメインの使用は、CARに柔軟性を与えることができ、免疫原性が低く、抗Fc試薬を用いたCAR発現の検出を容易にし、異なるスペーサー長に対応するために1つ以上のCH2またはCH3モジュールを除去することを可能にする。しかしながら、一実施形態では、FcγR結合を回避するための特定のスペーサーの変異は、例えば可溶性および細胞表面Fcガンマレセプターの結合を回避するために、CAR+T細胞の生着および抗腫瘍効力を改善し、なおかつ抗原特異的溶解を媒介する活性を維持する可能性がある。例えば、CH2領域を修飾したIgG4-Fcスペーサーを用いることができる。例えば、CH2領域は、点変異および/または欠失を含む、変異されていてもよい。特定の改変は、CH2領域内の2つの部位(L235E;N297Q)で実証されており、かつ/またはCH2欠失を組み込んでいる(Jonnalagadda et al,2015)。具体的な実施形態では、IgG4ヒンジ-CH2-CH3ドメイン(長さ229aa)又はヒンジドメインのみ(長さ12aa)を採用することができる(Hudececk et al.,2015)。
特定の実施形態において、ヒンジは、IgG、CD28、CD-8α、4-1BB、0X40、CD3ゼータ、T細胞受容体a鎖またはb鎖からのものである、CD3ゼータ鎖、CD28、CD3e、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、ICOS、またはCD154である。
利用され得るヒンジの特定の配列の例には、少なくとも以下が含まれる:
IgG Hinge 塩基配列:
GTACGGTCACTGTCTCTTCACAGGATCCCGCCGAGCCCAAATCTCCTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAACCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAAAAAGATCCCAAATT (配列番号:41)
GTACGGTCACTGTCTCTTCACAGGATCCCGCCGAGCCCAAATCTCCTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAACCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAAAAAGATCCCAAATT (配列番号:41)
IgG Hinge アミノ酸配列:
TVTVSSQDPAEPKSPDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEAL (配列番号:42)
TVTVSSQDPAEPKSPDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEAL (配列番号:42)
CD28 Hinge 塩基配列:
ATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCC (配列番号:43)
ATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCC (配列番号:43)
CD28 Hinge アミノ酸配列:
IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP (配列番号:44)
IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP (配列番号:44)
本開示に包含される任意のポリヌクレオチドは、配列番号:41もしくは43、または配列番号:41もしくは43と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列を含み得る。本開示に包含される任意のポリペプチドは、配列番号:42もしくは44、または配列番号:42もしくは44と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99、もしくはそれ以上%同一である配列を含み得る。
5.その他のタンパク質
5.その他のタンパク質
いくつかの実施形態では、1つ以上の他のタンパク質が、本開示の抗HLA-G CARとともに利用される。1つまたは複数の他のタンパク質は、CAR自体および/またはCARを発現する任意の種類の細胞の効力を促進することを含む、任意の理由で利用され得る。場合によっては、他のタンパク質は、他のタンパク質(複数可)がCARまたは細胞の活性に直接的または間接的に影響を及ぼすか否かにかかわらず、治療としてCARを発現する細胞を受ける個体の治療を容易にする。場合によっては、他のタンパク質は、自殺遺伝子、1つ以上のサイトカイン、またはその両方である。特定の実施形態では、1つ以上の他のタンパク質はベクターから産生され、最終的に2つの別々のポリペプチドとして産生される。例えば、抗HLA-G CARおよび他のタンパク質(複数可)は、例えば、2A配列またはIRESによって分離され得る。
特定の実施形態では、IL-15のようなサイトカインが、抗HLA-G CARと共に利用される。
IL-15塩基配列の一例は以下の通りである:
IL-15 塩基配列:
GCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGACAATT (配列番号:21)
GCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGACAATT (配列番号:21)
IL-15 アミノ酸配列:
ISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号:22)
ISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号:22)
同じベクター中のCARおよび別のタンパク質が、2つの異なるポリペプチドに産生されることが意図される場合には、特定の2A配列が利用され得る。
一例では、E2A 塩基配列は以下のように利用される:
CAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCC (配列番号:19)
CAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCC (配列番号:19)
E2A アミノ酸配列は、以下を利用し得る:
QCTNYALLKLAGDVESNPGP (配列番号:20)
QCTNYALLKLAGDVESNPGP (配列番号:20)
他の2Aの例は、以下を利用し得る。:
T2A: EGRGSLLTCGDVEENPGP (配列番号:45)
P2A: ATNFSLLKQAGDVEENPGP (配列番号:46)
F2A: VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP (配列番号:47)
本開示はまた、任意のタイプの免疫エフェクター細胞における発現を含む、特定のCAR分子を包含する。
一例では、CD8シグナルペプチド、KIR2DL4細胞外ドメイン、CD28膜貫通ドメイン、およびCD3ゼータ細胞内ドメインを含む抗HLA-G CARが利用される。ベクターにおいて、CARは、2A配列によってCARから分離され得るようなIL-15と共に発現され得る。具体的な例では、このようなCARおよびIL-15構築物は、以下の塩基配列を有することができる:
CD8SP-KIR2DL4EC_CD28 TMD-CD3ゼータ_IL15
ATGGCCCTGCCTGTGACAGCTCTGCTCCTCCCTCTGGCCCTGCTGCTCCATGCCGCCAGACCCTGGGCACACGTGGGTGGTCAGGACAAGCCCTTCTGCTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCAAGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTCACTATCGTCGTGGGTTCAACATCTTCACGCTGTACAAGAAAGATGGGGTCCCTGTCCCTGAGCTCTACAACAGAATATTCTGGAACAGTTTCCTCATTAGCCCTGTGACCCCAGCACACGCAGGGACCTACAGATGTCGAGGTTTTCACCCGCACTCCCCCACTGAGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCCTGGTGATCATGGTCACAGGTCTATATGAGAAACCTTCGCTTACAGCCCGGCTGGGCCCCACGGTTCGCGCAGGAGAGAACGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCAGAGCTCCTTTGACATCTACCATCTATCCAGGGAGGGGGAAGCCCATGAACTTAGGCTCCCTGCAGTGCCCAGCATCAATGGAACATTCCAGGCCGACTTCCCTCTGGGTCCTGCCACCCACGGAGAGACCTACAGATGCTTCGGCTCTTTCCATGGATCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCCTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCTAGTAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTTCAAAACTGGTATCGCCAGACACCTGCATTTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGACGCGTAAGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGC (配列番号:1)
CD8SP-KIR2DL4EC_CD28 TMD-CD3ゼータ_IL15
ATGGCCCTGCCTGTGACAGCTCTGCTCCTCCCTCTGGCCCTGCTGCTCCATGCCGCCAGACCCTGGGCACACGTGGGTGGTCAGGACAAGCCCTTCTGCTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCAAGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTCACTATCGTCGTGGGTTCAACATCTTCACGCTGTACAAGAAAGATGGGGTCCCTGTCCCTGAGCTCTACAACAGAATATTCTGGAACAGTTTCCTCATTAGCCCTGTGACCCCAGCACACGCAGGGACCTACAGATGTCGAGGTTTTCACCCGCACTCCCCCACTGAGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCCTGGTGATCATGGTCACAGGTCTATATGAGAAACCTTCGCTTACAGCCCGGCTGGGCCCCACGGTTCGCGCAGGAGAGAACGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCAGAGCTCCTTTGACATCTACCATCTATCCAGGGAGGGGGAAGCCCATGAACTTAGGCTCCCTGCAGTGCCCAGCATCAATGGAACATTCCAGGCCGACTTCCCTCTGGGTCCTGCCACCCACGGAGAGACCTACAGATGCTTCGGCTCTTTCCATGGATCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCCTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCTAGTAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTTCAAAACTGGTATCGCCAGACACCTGCATTTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGACGCGTAAGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGC (配列番号:1)
CD8SP-KIR2DL4EC_CD28 TMD-CD3ゼータ_IL15に対応するアミノ酸配列は以下の通りである:
MALPVTALLLPLALLLHAARPWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARLGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLHFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVTRKKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号:2)
MALPVTALLLPLALLLHAARPWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARLGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLHFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVTRKKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号:2)
一例では、CD8シグナルペプチド、コドン最適化KIR2DL4細胞外ドメイン、CD8 膜貫通ドメイン、CD3 ゼータ細胞内ドメイン、およびCD28コスティミュレイトリードメインを含む抗HLA-G CARが利用される。ベクターにおいて、CARは、2A配列によってCARから分離され得るようなIL-15と共に発現され得る。具体例では、このようなCARおよびIL-15構築物は、以下の塩基配列を有することができる:
CD8SPcoKIR2L4_EC_CD8tmd28Z15
ATGGGGATGGCATTGCCTGTTACAGCTCTGCTGCTGCCTCTGGCTCTGCTTCTGCATGCTGCTAGACCTTGGGCTCACGTTGGCGGCCAGGATAAGCCTTTTTGTTCTGCCTGGCCTAGCGCCGTGGTTCCTCAAGGTGGACACGTGACCCTGCGGTGTCACTACAGACGGGGCTTCAACATCTTCACCCTGTACAAGAAAGACGGCGTGCCCGTGCCTGAGCTGTACAACAGAATCTTCTGGAACAGCTTCCTGATCAGCCCCGTGACACCAGCTCACGCCGGCACATACAGATGCAGAGGCTTTCACCCTCACAGCCCCACAGAGTGGTCCGCTCCATCTAACCCTCTGGTCATCATGGTCACCGGCCTGTACGAGAAGCCTAGCCTGACAGCTAGACTGGGCCCTACAGTTAGAGCCGGCGAGAATGTGACCCTGTCCTGTAGCAGCCAGAGCAGCTTCGACATCTACCACCTGTCTAGAGAGGGCGAAGCCCACGAACTGAGACTGCCTGCCGTGCCTAGCATCAATGGCACCTTCCAGGCCGATTTTCCACTGGGACCTGCCACACACGGCGAGACTTACAGATGCTTTGGCAGCTTCCACGGCAGCCCTTACGAGTGGTCTGATCCTAGCGATCCTCTGCCTGTGTCCGTGACAGGCAATCCTAGCAGCAGCTGGCCTTCTCCAACCGAGCCTAGCTTTAAGACCGGAATCGCCCGGCATCTGCACACCACAACACCAGCACCTAGACCTCCAACTCCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCTGAAGCTTGTAGACCTGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACCAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGATATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGCGTGCTGCTGCTGAGCCTCGTGATCACAAAACGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGA (配列番号:3)
CD8SPcoKIR2L4_EC_CD8tmd28Z15
ATGGGGATGGCATTGCCTGTTACAGCTCTGCTGCTGCCTCTGGCTCTGCTTCTGCATGCTGCTAGACCTTGGGCTCACGTTGGCGGCCAGGATAAGCCTTTTTGTTCTGCCTGGCCTAGCGCCGTGGTTCCTCAAGGTGGACACGTGACCCTGCGGTGTCACTACAGACGGGGCTTCAACATCTTCACCCTGTACAAGAAAGACGGCGTGCCCGTGCCTGAGCTGTACAACAGAATCTTCTGGAACAGCTTCCTGATCAGCCCCGTGACACCAGCTCACGCCGGCACATACAGATGCAGAGGCTTTCACCCTCACAGCCCCACAGAGTGGTCCGCTCCATCTAACCCTCTGGTCATCATGGTCACCGGCCTGTACGAGAAGCCTAGCCTGACAGCTAGACTGGGCCCTACAGTTAGAGCCGGCGAGAATGTGACCCTGTCCTGTAGCAGCCAGAGCAGCTTCGACATCTACCACCTGTCTAGAGAGGGCGAAGCCCACGAACTGAGACTGCCTGCCGTGCCTAGCATCAATGGCACCTTCCAGGCCGATTTTCCACTGGGACCTGCCACACACGGCGAGACTTACAGATGCTTTGGCAGCTTCCACGGCAGCCCTTACGAGTGGTCTGATCCTAGCGATCCTCTGCCTGTGTCCGTGACAGGCAATCCTAGCAGCAGCTGGCCTTCTCCAACCGAGCCTAGCTTTAAGACCGGAATCGCCCGGCATCTGCACACCACAACACCAGCACCTAGACCTCCAACTCCAGCTCCTACAATCGCCAGCCAGCCTCTGTCTCTGAGGCCTGAAGCTTGTAGACCTGCTGCTGGCGGAGCCGTGCATACCAGAGGACTGGATTTCGCCTGCGATATCTACATCTGGGCCCCTCTGGCTGGAACATGTGGCGTGCTGCTGCTGAGCCTCGTGATCACAAAACGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGA (配列番号:3)
CD8SPcoKIR2L4_EC_CD8tmd28Z15に対応するアミノ酸配列は以下の通りである。:
MGMALPVTALLLPLALLLHAARPWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARLGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLHTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITKRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号:4)
MGMALPVTALLLPLALLLHAARPWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIFTLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVTGLYEKPSLTARLGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARHLHTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITKRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS (配列番号:4)
いくつかの実施形態では、抗HLA-G抗体を利用する特定のCARが採用される。特定の態様において、CARをコードする構築物は、誘導性カスパーゼ9、MEM-G/11抗体(可変重鎖が可変軽鎖のN末端にある)、CD28ヒンジ、CD28コスティミュレイトリードメイン、およびCD3ゼータを含むCARを含み、発現構築物はIL-15も発現する。別個のポリペプチドは2A配列で分離されていてもよい。このような構築物の例示的な配列は以下の通りである:
iC9MEMVHVL28HingeCD28CD3ZIL15
iC9MEMVHVL28HingeCD28CD3ZIL15
ATGCTCGAGGGAGTGCAGGTGGAAACCATCTCCCCAGGCGACGGGCGCACCTTCCCCAAGCGCGGCCAGACCTGCGTGGTGCACTACACCGGGATGCTTGAAGATGGAAAGAAAGTTGATTCCTCCCGGGACAGAAACAAGCCCTTTAAGTTTATGCTAGGCAAGCAGGAGGTGATCCGAGGCTGGGAAGAAGGGGTTGCCCAGATGAGTGTGGGTCAGAGAGCCAAACTGACTATATCTCCAGATTATGCCTATGGTGCCACTGGGCACCCAGGCATCATCCCACCACATGCCACTCTCGTCTTCGATGTGGAGCTTCTAAAACTGGAATCTGGCGGTGGATCCGGAGTCGACGGATTTGGTGATGTCGGTGCTCTTGAGAGTTTGAGGGGAAATGCAGATTTGGCTTACATCCTGAGCATGGAGCCCTGTGGCCACTGCCTCATTATCAACAATGTGAACTTCTGCCGTGAGTCCGGGCTCCGCACCCGCACTGGCTCCAACATCGACTGTGAGAAGTTGCGGCGTCGCTTCTCCTCGCTGCATTTCATGGTGGAGGTGAAGGGCGACCTGACTGCCAAGAAAATGGTGCTGGCTTTGCTGGAGCTGGCGCAGCAGGACCACGGTGCTCTGGACTGCTGCGTGGTGGTCATTCTCTCTCACGGCTGTCAGGCCAGCCACCTGCAGTTCCCAGGGGCTGTCTACGGCACAGATGGATGCCCTGTGTCGGTCGAGAAGATTGTGAACATCTTCAATGGGACCAGCTGCCCCAGCCTGGGAGGGAAGCCCAAGCTCTTTTTCATCCAGGCCTGTGGTGGGGAGCAGAAAGATCATGGGTTTGAGGTGGCCTCCACTTCCCCTGAAGACGAGTCCCCTGGCAGTAACCCCGAGCCAGATGCCACCCCGTTCCAGGAAGGTTTGAGGACCTTCGACCAGCTGGACGCCATATCTAGTTTGCCCACACCCAGTGACATCTTTGTGTCCTACTCTACTTTCCCAGGTTTTGTTTCCTGGAGGGACCCCAAGAGTGGCTCCTGGTACGTTGAGACCCTGGACGACATCTTTGAGCAGTGGGCTCACTCTGAAGACCTGCAGTCCCTCCTGCTTAGGGTCGCTAATGCTGTTTCGGTGAAAGGGATTTATAAACAGATGCCTGGTTGCTTTAATTTCCTCCGGAAAAAACTTTTCTTTAAAACATCAGCTTCGCGAGCCGAGGGCAGGGGAAGTCTTCTAACATGCGGGGACGTGGAGGAAAATCCCGGGCCCATGGAGTTTGGGCTGAGCTGGCTTTTTCTTGTGGCTATTTTAAAAGGTGTCCAGTGCTCTAGAGAGaaagtgcagctggtggaaagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcctgaaactgagctgcagcgcgagcggctttccgtttagcgattattatatgtattgggtgcgccagaccccggaaaaacgcctggaatgggtggcgaccattagcgatgatgatgattatacctattatccggatagcatgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaacctgtatctgcagatgagcagcctgaaaagcgaagataccgcgatgtattattgcagccgcggcatttattatggcagcagcccgtttgcgtattggggccagggcaccctggtgaccgtgagcgcgTTGGAAATAAAGGGCTCTACAAGCGGCTCAGGAAAACCTGGATCAGGCGAAGGGTCTACGgatattgtgctgacccagagcccggcgagcctggatgtgagcctgggccagcgcgcgaccattagctgccgcgcgagcaaaagcgtgagcaccagcggctatagctatatgcattggtatcagcagaaaccgggccagagcccgaaactgctgatttatctggcgagcaaccgcgaaagcggcgtgccggcgcgctttagcggcagcggcagcggcaccgattttaccctgaacattcatccggtggaagaagaagatgcggcgacctattattgccagcatagccgcgaatttccgacctttggcgcgggcaccaaactggaactgaaaCaCGTACGccCCATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCCAAATTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGAGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCACGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGA (配列番号:74)
iC9MEMVHVL28HingeCD28CD3ZIL15のポリペプチドの例としては、以下のものを挙げることができる:
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREKVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSALEIKGSTSGSGKPGSGEGSTDIVLTQSPASLDVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQKPGQSPKLLIYLASNRESGVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSREFPTFGAGTKLELKHVRPIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:75)
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREKVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSALEIKGSTSGSGKPGSGEGSTDIVLTQSPASLDVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQKPGQSPKLLIYLASNRESGVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSREFPTFGAGTKLELKHVRPIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:75)
具体的な例では、CARをコードする構築物は、誘導性カスパーゼ9、MEM-G/11抗体(可変重鎖が可変軽鎖のN末端にある)、CD28ヒンジ、DAP10コスティミュレイトリードメイン、およびCD3ゼータを含むCARを含み、発現構築物はIL-15も発現する。別個のポリペプチドは2A配列で分離されていてもよい。このような構築物の例示的な配列は以下の通りである:
iC9MEMVHVL28HingeDAP10CD3ZIL15
iC9MEMVHVL28HingeDAP10CD3ZIL15
ATGCTCGAGGGAGTGCAGGTGGAAACCATCTCCCCAGGCGACGGGCGCACCTTCCCCAAGCGCGGCCAGACCTGCGTGGTGCACTACACCGGGATGCTTGAAGATGGAAAGAAAGTTGATTCCTCCCGGGACAGAAACAAGCCCTTTAAGTTTATGCTAGGCAAGCAGGAGGTGATCCGAGGCTGGGAAGAAGGGGTTGCCCAGATGAGTGTGGGTCAGAGAGCCAAACTGACTATATCTCCAGATTATGCCTATGGTGCCACTGGGCACCCAGGCATCATCCCACCACATGCCACTCTCGTCTTCGATGTGGAGCTTCTAAAACTGGAATCTGGCGGTGGATCCGGAGTCGACGGATTTGGTGATGTCGGTGCTCTTGAGAGTTTGAGGGGAAATGCAGATTTGGCTTACATCCTGAGCATGGAGCCCTGTGGCCACTGCCTCATTATCAACAATGTGAACTTCTGCCGTGAGTCCGGGCTCCGCACCCGCACTGGCTCCAACATCGACTGTGAGAAGTTGCGGCGTCGCTTCTCCTCGCTGCATTTCATGGTGGAGGTGAAGGGCGACCTGACTGCCAAGAAAATGGTGCTGGCTTTGCTGGAGCTGGCGCAGCAGGACCACGGTGCTCTGGACTGCTGCGTGGTGGTCATTCTCTCTCACGGCTGTCAGGCCAGCCACCTGCAGTTCCCAGGGGCTGTCTACGGCACAGATGGATGCCCTGTGTCGGTCGAGAAGATTGTGAACATCTTCAATGGGACCAGCTGCCCCAGCCTGGGAGGGAAGCCCAAGCTCTTTTTCATCCAGGCCTGTGGTGGGGAGCAGAAAGATCATGGGTTTGAGGTGGCCTCCACTTCCCCTGAAGACGAGTCCCCTGGCAGTAACCCCGAGCCAGATGCCACCCCGTTCCAGGAAGGTTTGAGGACCTTCGACCAGCTGGACGCCATATCTAGTTTGCCCACACCCAGTGACATCTTTGTGTCCTACTCTACTTTCCCAGGTTTTGTTTCCTGGAGGGACCCCAAGAGTGGCTCCTGGTACGTTGAGACCCTGGACGACATCTTTGAGCAGTGGGCTCACTCTGAAGACCTGCAGTCCCTCCTGCTTAGGGTCGCTAATGCTGTTTCGGTGAAAGGGATTTATAAACAGATGCCTGGTTGCTTTAATTTCCTCCGGAAAAAACTTTTCTTTAAAACATCAGCTTCGCGAGCCGAGGGCAGGGGAAGTCTTCTAACATGCGGGGACGTGGAGGAAAATCCCGGGCCCATGGAGTTTGGGCTGAGCTGGCTTTTTCTTGTGGCTATTTTAAAAGGTGTCCAGTGCTCTAGAGAGaaagtgcagctggtggaaagcggcggcggcctggtgaaaccgggcggcagcctgaaactgagctgcagcgcgagcggctttccgtttagcgattattatatgtattgggtgcgccagaccccggaaaaacgcctggaatgggtggcgaccattagcgatgatgatgattatacctattatccggatagcatgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaacctgtatctgcagatgagcagcctgaaaagcgaagataccgcgatgtattattgcagccgcggcatttattatggcagcagcccgtttgcgtattggggccagggcaccctggtgaccgtgagcgcgTTGGAAATAAAGGGCTCTACAAGCGGCTCAGGAAAACCTGGATCAGGCGAAGGGTCTACGgatattgtgctgacccagagcccggcgagcctggatgtgagcctgggccagcgcgcgaccattagctgccgcgcgagcaaaagcgtgagcaccagcggctatagctatatgcattggtatcagcagaaaccgggccagagcccgaaactgctgatttatctggcgagcaaccgcgaaagcggcgtgccggcgcgctttagcggcagcggcagcggcaccgattttaccctgaacattcatccggtggaagaagaagatgcggcgacctattattgccagcatagccgcgaatttccgacctttggcgcgggcaccaaactggaactgaaaCCGTACGCCATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCCAAATTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGCTTTGCGCACGCCCACGCCGCAGCCCCGCCCAAGAAGATGGCAAAGTCTACATCAACATGCCAGGCAGGGGCCGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGA (配列番号:76).
iC9MEMVHVL28HingeDAP10CD3ZIL15によってコードされるポリペプチドの例は以下であり得る:
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREKVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSALEIKGSTSGSGKPGSGEGSTDIVLTQSPASLDVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQKPGQSPKLLIYLASNRESGVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSREFPTFGAGTKLELKPYAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVLCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRGRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:77)
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREKVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCSASGFPFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVATISDDDDYTYYPDSMKGRFTISRDNAKNNLYLQMSSLKSEDTAMYYCSRGIYYGSSPFAYWGQGTLVTVSALEIKGSTSGSGKPGSGEGSTDIVLTQSPASLDVSLGQRATISCRASKSVSTSGYSYMHWYQQKPGQSPKLLIYLASNRESGVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHSREFPTFGAGTKLELKPYAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVLCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRGRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:77)
具体的な例では、CARをコードする構築物は、誘導性カスパーゼ9、87G抗体(可変重鎖が可変軽鎖のN末端)からなるCAR、CD28ヒンジ、CD28コスティミュレイトリードメイン、およびCD3ゼータからなり、発現構築物はIL-15も発現する。 別個のポリペプチドは2A配列で分離されていてもよい。このような構築物の例示的な配列は以下の通りである:
iC9-87GVHVL28HingeCD28CD3ZIL15
iC9-87GVHVL28HingeCD28CD3ZIL15
ATGCTCGAGGGAGTGCAGGTGGAAACCATCTCCCCAGGCGACGGGCGCACCTTCCCCAAGCGCGGCCAGACCTGCGTGGTGCACTACACCGGGATGCTTGAAGATGGAAAGAAAGTTGATTCCTCCCGGGACAGAAACAAGCCCTTTAAGTTTATGCTAGGCAAGCAGGAGGTGATCCGAGGCTGGGAAGAAGGGGTTGCCCAGATGAGTGTGGGTCAGAGAGCCAAACTGACTATATCTCCAGATTATGCCTATGGTGCCACTGGGCACCCAGGCATCATCCCACCACATGCCACTCTCGTCTTCGATGTGGAGCTTCTAAAACTGGAATCTGGCGGTGGATCCGGAGTCGACGGATTTGGTGATGTCGGTGCTCTTGAGAGTTTGAGGGGAAATGCAGATTTGGCTTACATCCTGAGCATGGAGCCCTGTGGCCACTGCCTCATTATCAACAATGTGAACTTCTGCCGTGAGTCCGGGCTCCGCACCCGCACTGGCTCCAACATCGACTGTGAGAAGTTGCGGCGTCGCTTCTCCTCGCTGCATTTCATGGTGGAGGTGAAGGGCGACCTGACTGCCAAGAAAATGGTGCTGGCTTTGCTGGAGCTGGCGCAGCAGGACCACGGTGCTCTGGACTGCTGCGTGGTGGTCATTCTCTCTCACGGCTGTCAGGCCAGCCACCTGCAGTTCCCAGGGGCTGTCTACGGCACAGATGGATGCCCTGTGTCGGTCGAGAAGATTGTGAACATCTTCAATGGGACCAGCTGCCCCAGCCTGGGAGGGAAGCCCAAGCTCTTTTTCATCCAGGCCTGTGGTGGGGAGCAGAAAGATCATGGGTTTGAGGTGGCCTCCACTTCCCCTGAAGACGAGTCCCCTGGCAGTAACCCCGAGCCAGATGCCACCCCGTTCCAGGAAGGTTTGAGGACCTTCGACCAGCTGGACGCCATATCTAGTTTGCCCACACCCAGTGACATCTTTGTGTCCTACTCTACTTTCCCAGGTTTTGTTTCCTGGAGGGACCCCAAGAGTGGCTCCTGGTACGTTGAGACCCTGGACGACATCTTTGAGCAGTGGGCTCACTCTGAAGACCTGCAGTCCCTCCTGCTTAGGGTCGCTAATGCTGTTTCGGTGAAAGGGATTTATAAACAGATGCCTGGTTGCTTTAATTTCCTCCGGAAAAAACTTTTCTTTAAAACATCAGCTTCGCGAGCCGAGGGCAGGGGAAGTCTTCTAACATGCGGGGACGTGGAGGAAAATCCCGGGCCCATGGAGTTTGGGCTGAGCTGGCTTTTTCTTGTGGCTATTTTAAAAGGTGTCCAGTGCTCTAGAGAGgaagtgaaactggtggaaagcggcggcagcctggtgcagccgggcggcagcctgaaactgagctgcgcggcgagcggctttagctttagcagctataccatgagctgggtgcgccagaccccgaaaaaacgcctggaatgggtggcgtatgtgagcaacggcgcgggcaccacctattatccggatagcctgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaccctgcatctgctgatgaccagcctgaaaagcgaagataccgcgatttattattgcgcgcgccattattatggcagctatcattttgattattggggccagggcaccaccctgattgtgagcagcTTGGAAATAAAGGGCTCTACAAGCGGCTCAGGAAAACCTGGATCAGGCGAAGGGTCTACGgaaaccaccgtgacccagagcccggcgagcctgagcgtggcgaccggcgaaaaagtgaccattcgctgcattaccagcaccgatattgatgatgatatgaactggtatcagcagaaaccgggcgaaccgccgaaactgctgattagcgaagataacattctgcgcccgggcgtgccgagccgctttagcagcagcggctatggcaccgattttgtgtttaccattgaaaacaccctgagcgaagatgtggcggattattattgcctgcagagcgataacatgccgctgacctttggcggcggcacccgcctggaaattaaaCaCGTACGccCCATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCCAAATTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGAGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCACGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGA (配列番号:78)
iC9-87GVHVL28HingeCD28CD3ZIL15によってコードされるポリペプチドの一例は、以下を含み得る:
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREEVKLVESGGSLVQPGGSLKLSCAASGFSFSSYTMSWVRQTPKKRLEWVAYVSNGAGTTYYPDSLKGRFTISRDNAKNTLHLLMTSLKSEDTAIYYCARHYYGSYHFDYWGQGTTLIVSSLEIKGSTSGSGKPGSGEGSTETTVTQSPASLSVATGEKVTIRCITSTDIDDDMNWYQQKPGEPPKLLISEDNILRPGVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCLQSDNMPLTFGGGTRLEIKHVRPIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:79)
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREEVKLVESGGSLVQPGGSLKLSCAASGFSFSSYTMSWVRQTPKKRLEWVAYVSNGAGTTYYPDSLKGRFTISRDNAKNTLHLLMTSLKSEDTAIYYCARHYYGSYHFDYWGQGTTLIVSSLEIKGSTSGSGKPGSGEGSTETTVTQSPASLSVATGEKVTIRCITSTDIDDDMNWYQQKPGEPPKLLISEDNILRPGVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCLQSDNMPLTFGGGTRLEIKHVRPIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:79)
具体的な例では、CARをコードする構築物は、誘導性カスパーゼ9、87G抗体(可変重鎖が可変軽鎖のN末端にある)、CD28ヒンジ、DAP10コスティミュレイトリードメイン、およびCD3ゼータを含むCARを含み、発現構築物はIL-15も発現する。 別個のポリペプチドは2A配列で分離されていてもよい。このような構築物の例示的な配列は以下の通りである:
iC9-87GVHVL28HingeDAP10CD3ZIL15
iC9-87GVHVL28HingeDAP10CD3ZIL15
ATGCTCGAGGGAGTGCAGGTGGAAACCATCTCCCCAGGCGACGGGCGCACCTTCCCCAAGCGCGGCCAGACCTGCGTGGTGCACTACACCGGGATGCTTGAAGATGGAAAGAAAGTTGATTCCTCCCGGGACAGAAACAAGCCCTTTAAGTTTATGCTAGGCAAGCAGGAGGTGATCCGAGGCTGGGAAGAAGGGGTTGCCCAGATGAGTGTGGGTCAGAGAGCCAAACTGACTATATCTCCAGATTATGCCTATGGTGCCACTGGGCACCCAGGCATCATCCCACCACATGCCACTCTCGTCTTCGATGTGGAGCTTCTAAAACTGGAATCTGGCGGTGGATCCGGAGTCGACGGATTTGGTGATGTCGGTGCTCTTGAGAGTTTGAGGGGAAATGCAGATTTGGCTTACATCCTGAGCATGGAGCCCTGTGGCCACTGCCTCATTATCAACAATGTGAACTTCTGCCGTGAGTCCGGGCTCCGCACCCGCACTGGCTCCAACATCGACTGTGAGAAGTTGCGGCGTCGCTTCTCCTCGCTGCATTTCATGGTGGAGGTGAAGGGCGACCTGACTGCCAAGAAAATGGTGCTGGCTTTGCTGGAGCTGGCGCAGCAGGACCACGGTGCTCTGGACTGCTGCGTGGTGGTCATTCTCTCTCACGGCTGTCAGGCCAGCCACCTGCAGTTCCCAGGGGCTGTCTACGGCACAGATGGATGCCCTGTGTCGGTCGAGAAGATTGTGAACATCTTCAATGGGACCAGCTGCCCCAGCCTGGGAGGGAAGCCCAAGCTCTTTTTCATCCAGGCCTGTGGTGGGGAGCAGAAAGATCATGGGTTTGAGGTGGCCTCCACTTCCCCTGAAGACGAGTCCCCTGGCAGTAACCCCGAGCCAGATGCCACCCCGTTCCAGGAAGGTTTGAGGACCTTCGACCAGCTGGACGCCATATCTAGTTTGCCCACACCCAGTGACATCTTTGTGTCCTACTCTACTTTCCCAGGTTTTGTTTCCTGGAGGGACCCCAAGAGTGGCTCCTGGTACGTTGAGACCCTGGACGACATCTTTGAGCAGTGGGCTCACTCTGAAGACCTGCAGTCCCTCCTGCTTAGGGTCGCTAATGCTGTTTCGGTGAAAGGGATTTATAAACAGATGCCTGGTTGCTTTAATTTCCTCCGGAAAAAACTTTTCTTTAAAACATCAGCTTCGCGAGCCGAGGGCAGGGGAAGTCTTCTAACATGCGGGGACGTGGAGGAAAATCCCGGGCCCATGGAGTTTGGGCTGAGCTGGCTTTTTCTTGTGGCTATTTTAAAAGGTGTCCAGTGCTCTAGAGAGgaagtgaaactggtggaaagcggcggcagcctggtgcagccgggcggcagcctgaaactgagctgcgcggcgagcggctttagctttagcagctataccatgagctgggtgcgccagaccccgaaaaaacgcctggaatgggtggcgtatgtgagcaacggcgcgggcaccacctattatccggatagcctgaaaggccgctttaccattagccgcgataacgcgaaaaacaccctgcatctgctgatgaccagcctgaaaagcgaagataccgcgatttattattgcgcgcgccattattatggcagctatcattttgattattggggccagggcaccaccctgattgtgagcagcTTGGAAATAAAGGGCTCTACAAGCGGCTCAGGAAAACCTGGATCAGGCGAAGGGTCTACGgaaaccaccgtgacccagagcccggcgagcctgagcgtggcgaccggcgaaaaagtgaccattcgctgcattaccagcaccgatattgatgatgatatgaactggtatcagcagaaaccgggcgaaccgccgaaactgctgattagcgaagataacattctgcgcccgggcgtgccgagccgctttagcagcagcggctatggcaccgattttgtgtttaccattgaaaacaccctgagcgaagatgtggcggattattattgcctgcagagcgataacatgccgctgacctttggcggcggcacccgcctggaaattaaaCCGTACGCCATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCCAAATTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGCTTTGCGCACGCCCACGCCGCAGCCCCGCCCAAGAAGATGGCAAAGTCTACATCAACATGCCAGGCAGGGGCCGCGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAAAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGACCGCAGTGTACTAATTATGCTCTCTTGAAATTGGCTGGAGATGTTGAGAGCAATCCCGGGCCCATGCGCATTAGCAAGCCCCACCTGCGGAGCATCAGCATCCAGTGCTACCTGTGCCTGCTGCTGAACAGCCACTTCCTGACCGAGGCCGGCATCCACGTGTTCATCCTGGGCTGCTTCAGCGCCGGACTGCCCAAGACCGAGGCCAACTGGGTGAACGTGATCAGCGACCTGAAGAAGATCGAGGACCTGATCCAGAGCATGCACATCGACGCCACCCTGTACACCGAGAGCGACGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAACTGCAGGTGATCAGCCTGGAAAGCGGCGACGCCAGCATCCACGACACCGTGGAGAACCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGAGCAGCAACGGCAACGTGACCGAGAGCGGCTGCAAAGAGTGCGAGGAACTGGAAGAGAAGAACATCAAAGAGTTTCTGCAGAGCTTCGTGCACATCGTGCAGATGTTCATCAACACCAGCTGA (配列番号:80).
iC9-87GVHVL28HingeDAP10CD3ZIL15によってコードされるポリペプチドの例は以下を含み得る:
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREEVKLVESGGSLVQPGGSLKLSCAASGFSFSSYTMSWVRQTPKKRLEWVAYVSNGAGTTYYPDSLKGRFTISRDNAKNTLHLLMTSLKSEDTAIYYCARHYYGSYHFDYWGQGTTLIVSSLEIKGSTSGSGKPGSGEGSTETTVTQSPASLSVATGEKVTIRCITSTDIDDDMNWYQQKPGEPPKLLISEDNILRPGVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCLQSDNMPLTFGGGTRLEIKPYAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVLCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRGRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:81).
C.T細胞受容体(TCR)
MLEGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKVDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLESGGGSGVDGFGDVGALESLRGNADLAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFMVEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAVYGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVASTSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPGFVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQMPGCFNFLRKKLFFKTSASRAEGRGSLLTCGDVEENPGPMEFGLSWLFLVAILKGVQCSREEVKLVESGGSLVQPGGSLKLSCAASGFSFSSYTMSWVRQTPKKRLEWVAYVSNGAGTTYYPDSLKGRFTISRDNAKNTLHLLMTSLKSEDTAIYYCARHYYGSYHFDYWGQGTTLIVSSLEIKGSTSGSGKPGSGEGSTETTVTQSPASLSVATGEKVTIRCITSTDIDDDMNWYQQKPGEPPKLLISEDNILRPGVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCLQSDNMPLTFGGGTRLEIKPYAIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPKFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVLCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRGRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGPQCTNYALLKLAGDVESNPGPMRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEANWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS* (配列番号:81).
C.T細胞受容体(TCR)
一部の実施形態において、遺伝子操作されたHLA-G標的化抗原受容体は、組換えTCRおよび/もしくは天然に存在するT細胞からクローニングされたTCR、またはそれらの1つ以上の部分を含む。「T細胞受容体」または「TCR」は、可変α鎖およびβ鎖(それぞれTCRαおよびTCRβとしても知られている)または可変γ鎖およびδ鎖(それぞれTCRγおよびTCRδとしても知られている)を含有し、かつMHC受容体に結合した抗原ペプチドに特異的に結合することができる分子を指す。一部の実施形態において、TCRはαβ形態である。
典型的には、αβおよびγδ形態で存在するTCRは、一般に構造的に類似しているが、それらを発現するT細胞は、異なる解剖学的位置または機能を有し得る。TCRは、細胞の表面上で、または可溶性の形態で見出され得る。一般に、TCRは、T細胞(またはTリンパ球)の表面上で見出され、そこで一般に、主要組織適合性複合体(MHC)分子に結合した抗原の認識を担う。一部の実施形態において、TCRはまた、定常ドメイン、膜貫通ドメイン、および/または短い細胞質尾部を含有し得る(例えば、Janeway et al,1997参照)。例えば、一部の態様において、TCRの各鎖は、1つのN末端免疫グロブリン可変ドメイン、1つの免疫グロブリン定常ドメイン、膜貫通領域、およびC末端に短い細胞質尾部を有し得る。一部の実施形態において、TCRは、シグナル伝達の媒介に関与するCD3複合体のインバリアントタンパク質と関連する。特に明記しない限り、用語「TCR」は、その機能的TCR断片を包含すると理解されるべきである。当該用語はまた、αβ形態またはγδ形態のTCRを含む、インタクトTCRまたは全長TCRを包含する。
ゆえに、本明細書における目的のために、TCRへの言及は、あらゆるTCRまたは機能的断片、例えばMHC分子に結合した特定の抗原性ペプチド、すなわち、MHC-ペプチド複合体に結合するTCRの抗原結合部分を含む。互換的に用いられ得るTCRの「抗原結合部分」または「抗原結合断片」は、TCRの構造ドメインの一部を含有するが、完全なTCRが結合する抗原(例えば、MHC-ペプチド複合体)に結合する分子を指す。場合によっては、抗原結合部分は、例えば、一般に各鎖が3つの相補性決定領域を含有する場合、特定のMHC-ペプチド複合体に結合するための結合部位を形成するのに十分なTCRの可変ドメイン、例えばTCRの可変α鎖および可変β鎖を含有する。
一部の実施形態において、TCR鎖の可変ドメインは結合して、ループ、または免疫グロブリンに類似する相補性決定領域(CDR)を形成する。これにより、抗原認識が付与され、TCR分子の結合部位を形成することによってペプチド特異性が決定され、そしてペプチド特異性が決定される。典型的には、免疫グロブリンと同様に、CDRは、フレームワーク領域(FR)によって分離されている(例えば、Jores et al.,1990;Chothia et al.,1988;Lefranc et al.,2003参照)。一部の実施形態において、CDR3は、プロセシングされた抗原の認識を担う主要なCDRであるが、アルファ鎖のCDR1は、抗原性ペプチドのN末端部分と相互作用することも示されており、ベータ鎖のCDR1は、ペプチドのC末端部分と相互作用する。CDR2は、MHC分子を認識すると考えられている。一部の実施形態において、β鎖の可変領域は、更なる超可変性(HV4)領域を含有し得る。
一部の実施形態において、TCR鎖は、定常ドメインを含有する。例えば、免疫グロブリンと同様に、TCR鎖の細胞外部分(例えば、α鎖、β鎖)は、2つの免疫グロブリンドメイン、N末端の可変ドメイン(例えば、VaまたはVp;典型的には、Kabatナンバリング(Kabat et al.,‘‘Sequences of Proteins of Immunological Interest’’,US Dept.Health and Human Services,Public Health Service National Institutes of Health,1991,5th ed.)に基づくアミノ酸1~116)、および細胞膜に隣接する1つの定常ドメイン(例えば、α鎖定常ドメインまたはCa、典型的にはKabatに基づくアミノ酸117~259、β鎖定常ドメインまたはCp、典型的にはKabatに基づくアミノ酸117~295)を含有し得る。例えば、場合によっては、2本の鎖によって形成されるTCRの細胞外部分は、2つの膜近位定常ドメイン、およびCDRを含有する2つの膜遠位可変ドメインを含有する。TCRドメインの定常ドメインは、システイン残基がジスルフィド結合を形成して2本の鎖間を連結する短い連結配列を含有する。一部の実施形態において、TCRは、TCRが定常ドメイン内に2つのジスルフィド結合を含有するように、α鎖およびβ鎖のそれぞれに追加のシステイン残基を有し得る。
一部の実施形態において、TCR鎖は、膜貫通ドメインを含有し得る。一部の実施形態において、膜貫通ドメインは、正に帯電している。場合によっては、TCR鎖は、細胞質尾部を含有する。場合によっては、この構造は、TCRがCD3等の他の分子と結合することを可能にする。例えば、膜貫通領域を有する定常ドメインを含有するTCRは、タンパク質を細胞膜内に固定して、CD3シグナル伝達装置または複合体のインバリアントサブユニットと結合し得る。
一般に、CD3は、哺乳動物において3本の異なる鎖(γ、δ、およびε)およびζ鎖を有し得る多タンパク質複合体である。例えば、哺乳動物において、複合体は、CD3γ鎖、CD3δ鎖、2本のCD3ε鎖、およびCD3ζ鎖のホモ二量体を含有し得る。CD3γ鎖、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖は、単一の免疫グロブリンドメインを含有する免疫グロブリンスーパーファミリーの高度に関連する細胞表面タンパク質である。CD3γ鎖、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の膜貫通領域は、負に帯電しており、このことは、これらの鎖が正に帯電したT細胞受容体鎖と結合するのを可能にする特徴である。CD3γ鎖、CD3δ鎖、およびCD3ε鎖の細胞内尾部はそれぞれ、免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフまたはITAMとして知られている単一の保存モチーフを含有するが、各CD3ζ鎖は3つを有する。一般に、ITAMは、TCR複合体のシグナル伝達能力に関与する。これらのアクセサリ分子は、負に帯電した膜貫通領域を有しており、TCRからのシグナルを細胞中に伝達する役割を果たす。CD3鎖およびζ鎖は、TCRと共に、T細胞受容体複合体として知られているものを形成する。
一部の実施形態において、TCRは、2本の鎖αおよびβ(または任意選択でγおよびδ)のヘテロ二量体であり得るか、または単鎖TCR構築物であり得る。一部の実施形態において、TCRは、ジスルフィド結合等によって連結された2つの別個の鎖(αおよびβ鎖またはγおよびδ鎖)を含有するヘテロ二量体である。一部の実施形態において、標的抗原(例えば癌抗原)に対するTCRが特定されて、細胞中に導入される。一部の実施形態において、TCRをコードする核酸は、公的に入手可能なTCR DNA配列のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅等によって、種々の源から得られ得る。一部の実施形態において、TCRは、生物学的源から、例えば、T細胞(例えば細胞傷害性T細胞)、T細胞ハイブリドーマ、または他の公的に利用可能な源等由来の細胞から得られる。一部の実施形態において、T細胞は、インビボ単離細胞から得られ得る。一部の実施形態において、高親和性T細胞クローンが患者から単離されて、TCRが単離され得る。一部の実施形態において、T細胞は、培養されたT細胞ハイブリドーマまたはクローンであり得る。一部の実施形態において、標的抗原に対するTCRクローンは、ヒト免疫系遺伝子(例えば、ヒト白血球抗原系、またはHLA)により操作されたトランスジェニックマウスにおいて生成された。例えば、腫瘍抗原(例えば、Parkhurst et al.,2009およびCohen et al.,2005参照)参照。一部の実施形態において、ファージディスプレイを用いて、標的抗原(例えば、Varela-Rohena et al.,2008およびLi,2005参照)に対するTCRを単離する。一部の実施形態において、TCRまたはその抗原結合部分は、TCRの配列の知識から合成的に生成され得る。
III.サイトカイン
III.サイトカイン
1つ以上のサイトカインが、遺伝子操作された1つ以上のHLA-G標的化受容体、例えばHLA-G特異的CARと共に利用さてもよい。場合によっては、1つ以上のサイトカインが、操作された受容体と同じベクター分子上に存在するが、他の場合には、別個のベクター分子上に存在する。特定の実施形態において、1つ以上のサイトカインが、操作された受容体と同じベクターから共発現される。1つ以上のサイトカインが、HLA-G特異的受容体とは別個のポリペプチドとして生成され得る。一例として、インターロイキン-15(IL-15)が利用される。IL-15が使用され得る。なぜなら、例えば、組織に制限されており、かつ病的条件下でのみ血清中で、または全身的に何らかのレベルにて観察されるからである。IL-15は、養子療法に望ましいいくつかの属性を有する。IL-15は、ナチュラルキラー細胞の発生および細胞増殖を誘導し、腫瘍内在細胞の機能的抑制の緩和を介して、確立された腫瘍の根絶を促進し、かつ活性化誘導細胞死を阻害する恒常性サイトカインである。IL-15に加えて、他のサイトカインが想定される。これらとして、サイトカイン、ケモカイン、ならびにヒト用途に用いられる細胞の活性化および増殖に寄与する他の分子が挙げられるが、これらに限定されない。一例として、1つ以上のサイトカインは、IL-15、IL-12、IL-2、IL-18、IL-21、IL-23、IL-7、またはそれらの組合せである。IL-15を発現するNK細胞が利用され得、そして継続的な支援サイトカインシグナル伝達が可能であり、これは、注入後の生存に有用である。
特定の実施形態において、NK細胞は、1つ以上の外因的に提供されるサイトカインを発現する。サイトカインは、NK細胞に外因的に提供され得る。なぜなら、細胞内の発現ベクターから発現され、かつ/または細胞の培養培地中に提供されるからである。代わりの場合には、細胞中の内因性サイトカインは、サイトカインのプロモータ部位での遺伝子組換え等の内因性サイトカインの発現の調節操作によって上方制御される。サイトカインが発現構築物上で細胞に提供される場合、サイトカインは、自殺遺伝子と同じベクターからコードされ得る。サイトカインは、自殺遺伝子とは別個のポリペプチド分子として、そして細胞の操作された受容体とは別個のポリペプチドとして発現され得る。一部の実施形態において、本開示は、特にNK細胞における、CARおよび/またはTCRベクターの、IL-15との共利用に関する。
IV.自殺遺伝子
IV.自殺遺伝子
特定の実施形態において、自殺遺伝子は、あらゆる種類の細胞療法と共に利用されて、その使用を制御し、かつ所望の事象および/または時間での細胞療法の終了を可能にする。自殺遺伝子は、必要に応じて形質導入細胞の死を誘発する目的で、形質導入細胞に使用される。本開示によって包含されるベクターを有するように修飾された本開示のHLA-G標的化細胞は、1つ以上の自殺遺伝子を含み得る。一部の実施形態において、本明細書中で用いられる用語「自殺遺伝子」は、プロドラッグまたは他の剤の投与により、その宿主細胞を死滅させる化合物への遺伝子産物の移行をもたらす遺伝子として定義される。他の実施形態において、自殺遺伝子は、所望の場合、自殺遺伝子産物を標的とする剤(抗体等)によって標的とされる遺伝子産物をコードする。
用いられ得る自殺遺伝子/プロドラッグの組合せの例として、単純ヘルペスウイルス-チミジンキナーゼ(HSV-tk)およびガンシクロビル、アシクロビル、またはFIAU;酸化還元酵素およびシクロヘキシミド;シトシンデアミナーゼおよび5-フルオロシトシン;チミジンキナーゼチミジラート(thymidilate)キナーゼ(Tdk::Tmk)およびAZT;ならびにデオキシシチジンキナーゼおよびシトシンアラビノシドがある。大腸菌(E.coli)プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、いわゆる、プロドラッグ6-メチルプリンデオキシリボシドを毒性プリン6-メチルプリンに変換する自殺遺伝子が用いられ得る。プロドラッグ療法に用いられる自殺遺伝子の他の例として、大腸菌(E.coli)シトシンデアミナーゼ遺伝子およびHSVチミジンキナーゼ遺伝子がある。
また、例示的な自殺遺伝子として、CD20、CD52、EGFRv3、または誘導性カスパーゼ9が挙げられる。一実施形態において、EGFRバリアントIII(EGFRv3)の切断型バージョンが、セツキシマブによって除去され得る自殺抗原として用いられ得る。本開示に用いられ得る、当該技術において知られている更なる自殺遺伝子として、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ(PNP)、シトクロムp450酵素(CYP)、カルボキシペプチダーゼ(CP)、カルボキシルエステラーゼ(CE)、ニトロレダクターゼ(NTR)、グアニンリボシルトランスフェラーゼ(XGRTP)、グリコシダーゼ酵素、メチオニン-α、γ-リアーゼ(MET)、およびチミジンホスホリラーゼ(TP)が挙げられる。
特定の実施形態において、HLA-G標的化CARをコードするベクター、または本明細書中で包含されるNK細胞内のあらゆるベクターが、1つ以上の自殺遺伝子を含む。自殺遺伝子は、HLA-G標的化CARと同じベクター上にあってもなくてもよい。自殺遺伝子がHLA-G標的化CARと同じベクター上に存在する場合、自殺遺伝子およびCARは、例えば、IRESまたは2A要素によって分離され得る。
V.ベクター
V.ベクター
HLA-G標的化CARは、ウイルスベクターまたは非ウイルスベクターが挙げられる適切なあらゆるベクターによってレシピエント免疫細胞に送達され得る。ウイルスベクターの例として、少なくともレトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、またはアデノ随伴ウイルスベクターが挙げられる。非ウイルスベクターの例として、少なくともプラスミド、トランスポゾン、脂質、ナノ粒子等が挙げられる。
免疫細胞が、HLA-G標的化受容体をコードするベクターにより形質導入され、そしてまた、自殺遺伝子および/またはサイトカインおよび/または任意選択の治療用遺伝子産物等の別の遺伝子の、細胞中への形質導入を必要とする場合、HLA-G標的化受容体、自殺遺伝子、サイトカイン、および任意選択の治療用遺伝子は、同じベクターに含まれても含まれなくてもよい。場合によっては、HLA-G標的化CAR、自殺遺伝子、サイトカイン、および任意選択の治療用遺伝子は、同じウイルスベクター分子等の同じベクター分子から発現される。そのような場合、HLA-G標的化CAR、自殺遺伝子、サイトカイン、および任意選択の治療用遺伝子の発現は、同じ調節要素によって調節されてもされなくてもよい。HLA-G標的化CAR、自殺遺伝子、サイトカイン、および任意選択の治療用遺伝子は、同じベクター上にある場合、別個のポリペプチドとして発現されてもされなくてもよい。これらは、別個のポリペプチドとして発現される場合、例えば、2A要素またはIRES要素によってベクター上で分離され得る(または双方の種類が、1回以上、同じベクター上で用いられ得る)。
A.一般的な実施形態
A.一般的な実施形態
当業者であれば、本開示の抗原受容体の発現のための標準的な組換え技術(例えば、いずれも参照により本明細書に組み込まれるSambrook et al.,2001およびAusubel et al.,1996参照)によってベクターを構築するのに十分な知識があろう。
1.調節要素
1.調節要素
本開示において有用なベクターに含まれる発現カセットは、特に、タンパク質コード配列に作動可能に連結された真核生物転写プロモータ、介在配列を含むスプライスシグナル、および転写終結/ポリアデニル化配列を(5’から3’方向に)含有する。真核細胞におけるタンパク質コード遺伝子の転写を制御するプロモータおよびエンハンサは、多数の遺伝要素で構成され得る。細胞機構は、各要素によって伝達される調節情報を集めて組み込むことができ、異なる遺伝子が、転写調節の異なる、多くの場合複雑なパターンを進化させることを可能にする。本開示に関連して用いられるプロモータとして、例えば、構成的プロモータ、誘導性プロモータ、および組織特異的プロモータが挙げられる。ベクターが癌治療の生成に利用される場合、プロモータは、低酸素の条件下で有効であり得る。
2.プロモータ/エンハンサ
2.プロモータ/エンハンサ
本明細書中で提供される発現構築物は、抗原受容体および他のシストロン遺伝子産物の発現を駆動するためのプロモータを含む。プロモータは、一般に、RNA合成のための開始部位を配置するように機能する配列を含む。この最もよく知られている例が、TATAボックスであるが、TATAボックスを欠くいくつかのプロモータ、例えば、哺乳動物末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ遺伝子用のプロモータ、およびSV40後期遺伝子用のプロモータにおいて、開始部位自体を覆う別個の要素が、開始の場所を固定するのに役立つ。追加のプロモータ要素が、転写開始の頻度を調節する。典型的には、これは、開始部位の上流の領域内に位置決めされているが、いくつかのプロモータは、開始部位の下流にも機能的要素を含有することが示されている。コード配列をプロモータの「制御下」に置くために、転写リーディングフレームの転写開始部位の5’末端が、選択されたプロモータの「下流」(すなわち3’側)に配置される。「上流」プロモータは、DNAの転写を刺激して、コードされたRNAの発現を促進する。
プロモータ要素間の間隔は高頻度で、要素が互いに対して反転または移動した場合にプロモータ機能が保存されるほどフレキシブルである。tkプロモータにおいて、例えば、プロモータ要素間の間隔は、活性が落ち始める前の50bpまで広げることができる。プロモータに応じて、個々の要素は、転写を活性化するように協働的に、または独立して機能し得るようである。プロモータは、核酸配列の転写活性化に関与するシス作用性調節配列を指す「エンハンサ」と併用されてもされなくてもよい。
プロモータは、コードセグメントおよび/またはエクソンの上流に位置決めされた5’非コード配列を単離することによって得られ得るように、核酸配列と本来関連しているものであり得る。そのようなプロモータは、「内因性」と称され得る。同様に、エンハンサは、核酸配列と天然に結合して、当該配列の下流または上流のいずれかに位置決めされるものであり得る。これ以外にも、特定の利点が、コード核酸セグメントを、組換えまたは異種プロモータ(その天然環境において、核酸配列と通常関連しないプロモータを指す)の制御下に配置することによって得られることとなる。また、組換えまたは異種エンハンサは、その天然環境において核酸配列と通常関連しないエンハンサを指す。そのようなプロモータまたはエンハンサとして、他の遺伝子のプロモータまたはエンハンサ、ならびに他のあらゆるウイルスまたは原核細胞もしくは真核細胞から単離されたプロモータまたはエンハンサ、ならびに「天然に存在」しない、すなわち、異なる転写調節領域の異なる要素、および/または発現を変更する変異を含有するプロモータまたはエンハンサが挙げられ得る。例えば、組換えDNA構築に最も一般的に用いられるプロモータとして、β-ラクタマーゼ(ペニシリナーゼ)、ラクトース、およびトリプトファン(trp-)プロモータ系が挙げられる。プロモータおよびエンハンサの核酸配列を合成的に生成することに加えて、配列は、本明細書中で開示される組成物と関連して、PCR(商標)が挙げられる組換えクローニングおよび/または核酸増幅技術を用いて生成され得る。さらに、ミトコンドリア、葉緑体等の非核オルガネラ内の配列の転写および/または発現を指示する制御配列も同様に使用することができると考えられる。
当然のことながら、発現のために選択された細胞小器官、細胞型、組織、器官、または生物におけるDNAセグメントの発現を効果的に指令するプロモータおよび/またはエンハンサを使用することが重要であろう。分子生物学の当業者であれば、一般に、タンパク質発現のためのプロモータ、エンハンサ、および細胞型の組合せの使用を知っている(例えば、参照により本明細書に組み込まれるSambrook et al.1989参照)。使用されるプロモータは、組換えタンパク質および/またはペプチドの大規模生産において有利である等、導入されたDNAセグメントの高レベル発現を指示するのに適切な条件下で構成的、組織特異的、誘導性、かつ/または有用であり得る。プロモータは、異種または内因性であり得る。
加えて、あらゆるプロモータ/エンハンサの組合せ(例えば、epd.isb-sibi.ch/のワールド・ワイド・ウェブを介した、Eukaryotic Promoter Data Base EPDBに従う)を用いて発現を駆動することもできる。T3、T7、またはSP6細胞質発現系の使用が、別の可能な実施形態である。真核細胞は、適切な細菌ポリメラーゼが、送達複合体の一部として、または追加の遺伝子発現構築物として提供されるならば、特定の細菌プロモータからの細胞質転写を支持することができる。
プロモータの非限定的な例として、初期または後期ウイルスプロモータ、例えばSV40初期または後期プロモータ、サイトメガロウイルス(CMV)最初期プロモータ、ラウス肉腫ウイルス(RSV)初期プロモータ、真核細胞プロモータ、例えば、ベータアクチンプロモータ、GADPHプロモータ、メタロチオネインプロモータ、および連結された応答要素プロモータ、例えば、サイクリックAMP応答要素プロモータ(cre)、血清応答要素プロモータ(sre)、ホルボールエステルプロモータ(TPA)、および最小TATAボックス付近の応答要素プロモータ(tre)が挙げられる。ヒト成長ホルモンプロモータ配列(例えば、GenBank(登録商標)、受託番号X05244、ヌクレオチド283~341に記載されるヒト成長ホルモン最小プロモータ)またはマウス乳腺腫瘍プロモータ(ATCC、Cat番号ATCC 45007から入手可能)を用いることも可能である。特定の実施形態において、プロモータは、CMV IE、デクチン-1、デクチン-2、ヒトCD11c、F4/80、SM22、RSV、SV40、Ad MLP、ベータ-アクチン、MHCクラスI、またはMHCクラスIIプロモータである。しかしながら、治療用遺伝子の発現を駆動するのに有用な他のあらゆるプロモータが、本開示の実施に使用可能である。
特定の態様において、本開示の方法はまた、エンハンサ配列、すなわち、プロモータの活性を増大させ、かつシスで、そしてその向きに拘わらず、比較的長い距離(標的プロモータから最大数キロベース離れている)にわたってすら作用する潜在性を有する核酸配列に関する。しかしながら、エンハンサ機能は、必ずしもそのような長い距離に限定されない。というのも、所与のプロモータに近接して機能する場合もあるからである。
3.開始シグナルおよび連結された発現
3.開始シグナルおよび連結された発現
また、特定の開始シグナルが、コード配列の効率的な翻訳のために、本開示において提供される発現構築物に用いられ得る。当該シグナルは、ATG開始コドンまたは隣接配列を含む。ATG開始コドンを含む外因性翻訳制御シグナルを提供する必要がある場合がある。当業者であれば、これを決定して、必要なシグナルを提供することが容易にできよう。挿入物全体の翻訳を確実にするために、開始コドンは、所望のコード配列のリーディングフレームと「インフレーム」でなければならないことは周知である。外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、天然または合成のいずれかであり得る。発現の効率は、適切な転写エンハンサ要素を含めることによって増強され得る。
特定の実施形態において、内部リボソーム進入部位(IRES)要素が、多遺伝子またはポリシストロン性メッセージをもたらすのに用いられる。IRES要素は、5’メチル化Cap依存性翻訳のリボソームスキャニングモデルを迂回して、内部部位にて翻訳を開始することができる。ピコルナウイルス科の2つのメンバー(ポリオおよび脳心筋炎)由来のIRES要素、ならびに哺乳動物メッセージ由来のIRESが記載されている。IRES要素は、異種オープンリーディングフレームに連結され得る。それぞれがIRESによって分離されてポリシストロン性メッセージをもたらす、多数のオープンリーディングフレームが、一緒に転写され得る。IRES要素のおかげで、各オープンリーディングフレームは、効率的な翻訳のためのリボソームにアクセス可能である。多遺伝子が、単一のプロモータ/エンハンサを用いて効率的に発現されて、単一のメッセージを転写することができる。
本明細書中の他の箇所で詳述するように、特定の2A配列要素を用いて、本開示中で提供される構築物中での遺伝子の連結発現または共発現をもたらすことができる。例えば、切断配列を用いて、オープンリーディングフレームを連結して単一シストロンを形成することによって、遺伝子を共発現させることができる。例示的な切断配列として、ウマ鼻炎Aウイルス(E2A)またはF2A(口蹄疫ウイルス2A)または「2A様」配列(例えば、トセア・アシグナ(Thosea asigna)ウイルス2A;T2A)またはブタテッショウウイルス-1(P2A)がある。特定の実施形態において、単一のベクターでは、多数の2A配列は同一ではないが、代替の実施形態において、同じベクターは、2つ以上の同じ2A配列を利用する。2A配列の例が、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2011/0065779号明細書に記載されている。
4.複製起点
4.複製起点
ベクターを宿主細胞内で増殖させるために、ベクターは、1つ以上の複製起点部位(しばしば「ori」と称される)、例えば、上記のEBVのoriPに対応する核酸配列、または複製が開始される特定の核酸配列である、プログラミングにおける機能が類似するか、または高い、遺伝子操作されたoriPを含有してよい。これ以外にも、上記の他の染色体外で複製するウイルスの複製起点、または自己複製配列(ARS)が使用され得る。
5.選択およびスクリーニング可能マーカー
5.選択およびスクリーニング可能マーカー
一部の実施形態において、本開示のHLA-G標的化受容体構築物を含むNK細胞は、発現ベクター内にマーカーを含めることによって、インビトロまたはインビボで特定され得る。そのようなマーカーは、発現ベクターを含有する細胞の容易な特定を可能にする、細胞に特定可能な変化を付与することとなる。一般に、選択マーカーは、選択を可能にする特性を付与するものである。陽性選択マーカーは、マーカーの存在が選択を可能にするものであり、陰性選択マーカーは、その存在が選択を妨げるものである。陽性選択マーカーの例として、薬物耐性マーカーがある。
通常、薬物選択マーカーを含めることは、形質転換体のクローニングおよび特定に役立ち、例えば、ネオマイシン、ピューロマイシン、ハイグロマイシン、DHFR、GPT、ゼオシン、およびヒスチジノールに対する耐性を付与する遺伝子が、有用な選択マーカーである。条件の実施に基づいて形質転換体の識別を可能にする表現型を付与するマーカーに加えて、その基礎が比色分析であるGFP等のスクリーニング可能マーカーが挙げられる他の種類のマーカーも考えられる。これ以外にも、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(tk)またはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)等の陰性選択マーカーとしてのスクリーニング可能酵素が利用され得る。また、当業者であれば、おそらくFACS分析と組み合わせて、免疫学的マーカーを使用する方法を知っているであろう。用いられるマーカーは、遺伝子産物をコードする核酸と同時に発現され得る限り、重要ではないと考えられている。選択マーカーおよびスクリーニング可能マーカーの更なる例が、当業者に周知である。
B.マルチシストロン性ベクター
B.マルチシストロン性ベクター
特定の実施形態において、HLA-G標的化受容体、任意選択の自殺遺伝子、任意選択のサイトカイン、および/または任意選択の治療用遺伝子は、マルチシストロン性ベクターから発現される(本明細書中で用いられる用語「シストロン」は、遺伝子産物が生成され得る核酸配列を指す)。特定の実施形態において、マルチシストロン性ベクターは、HLA-G標的化受容体、自殺遺伝子、ならびに少なくとも1つのサイトカインおよび/もしくは操作された受容体、例えばT細胞受容体、ならびに/または追加の非HLA-G標的化CARをコードする。場合により、マルチシストロン性ベクターは、少なくとも1つのHLA-G標的化CAR、少なくとも1つのTNF-アルファ変異体、および少なくとも1つのサイトカインをコードする。サイトカインは、ヒトもしくはマウス等、またはあらゆる種の特定の種類のサイトカインであり得る。特定の場合には、サイトカインは、IL15、IL12、IL2、IL18、および/またはIL21である。
特定の実施形態において、本開示は、多数のシストロンを実質的に同一のレベルで発現する能力を有するポリシストロン性ベクターを利用するフレキシブルなモジュール系(本明細書中で用いられる用語「モジュール」は、例えば標準的な組換え技術を用いることによる、シストロン全体の、またはシストロンの構成要素のそれぞれの除去および置換等によって、その互換性を可能にするシストロンまたはシストロンの構成要素を指す)を提供する。当該系は、多遺伝子の組合せ発現(過剰発現が挙げられる)を可能にする細胞工学に用いられ得る。特定の実施形態において、ベクターによって発現される遺伝子の1つ以上が、1つ、2つ、またはそれを超える抗原受容体を含む。多遺伝子は、CAR、TCR、サイトカイン、ケモカイン、ホーミング受容体、CRISPR/Cas9媒介性遺伝子変異、デコイ受容体、サイトカイン受容体、キメラサイトカイン受容体等を含み得るが、これらに限定されない。ベクターはさらに、以下を含み得る:(1)1つ以上のレポーター、例えば、細胞アッセイおよび動物イメージング等のための蛍光もしくは酵素レポーター;(2)1つ以上のサイトカインもしくは他のシグナル伝達分子;および/または(3)自殺遺伝子。
特定の場合には、ベクターは、2A切断部位等のあらゆる種類の切断部位によって分離された少なくとも4つのシストロンを含み得る。ベクターは、pUC19骨格内にpsiパッケージング配列を有する、3’および5’LTRを含むモロニーマウス白血病ウイルス(MoMLVまたはMMLV)ベースであってもなくてもよい。ベクターは、3つ以上の2A切断部位を有する4つ以上のシストロン、および遺伝子交換のための多数のORFを含み得る。当該系は、一部の実施形態において、サブクローニングによる迅速な組込みのための制限部位の側面に位置する多遺伝子(7つ以上)のコンビナトリアル過剰発現を可能にし、そしてまた、少なくとも3つの2A自己切断部位を含む。ゆえに、当該系は、多数のCAR、TCR、シグナル伝達分子、サイトカイン、サイトカイン受容体、および/またはホーミング受容体の発現を可能にする。また、当該系は、限定されないが、レンチウイルス、アデノウイルスAAV、および非ウイルスプラスミドが挙げられる他のウイルスベクターおよび非ウイルスベクターに使用され得る。
また、系のモジュール性は、ポリシストロン性発現ベクター内の4つのシストロンのそれぞれへの遺伝子の効率的なサブクローニング、および迅速な試験等のための遺伝子の交換を可能にする。ポリシストロン性発現ベクター内に戦略的に位置決めされた制限部位は、遺伝子を効率的に交換することを可能にする。
本開示の実施形態は、例えば、ベクターのモジュール使用を促進するために同一性および位置が特異的に選択される1つ以上の制限酵素部位を利用すること等による、1つ以上のシストロン(または1つ以上のシストロンの構成要素)の除去および置換を可能にすることによって、ベクターの少なくとも一部がモジュールであるポリシストロン性ベクターを利用する系を包含する。また、ベクターは、多数のシストロンが単一のポリペプチドに翻訳されて、別個のポリペプチドにプロセシングされることによって、ベクターが実質的に等モル濃度で別個の遺伝子産物を発現する利点を付与する実施形態を有する。
本開示のベクターは、モジュラリティがベクターの1つ以上のシストロンを変えることができるように、かつ/または1つ以上の特定のシストロンの1つ以上の構成要素を変えることができるように構成されている。ベクターは、1つ以上のシストロンの末端の側面に位置し、かつ/または特定のシストロンの1つ以上の構成要素の末端の側面に位置する、固有の制限酵素部位を利用するように設計され得る。
本開示の実施形態は、それぞれが1つ以上の制限酵素部位の側面に位置する少なくとも2つ、少なくとも3つ、または少なくとも4つのシストロンを含むポリシストロン性ベクターを含み、少なくとも1つのシストロンは、少なくとも1つの抗原受容体をコードする。場合によっては、2つ、3つ、4つ、またはそれを超えるシストロンが単一のポリペプチドに翻訳されて、別々のポリペプチドに切断されるが、他の場合では、多数のシストロンが単一のポリペプチドに翻訳されて、別々のポリペプチドに切断される。ベクター上の隣接するシストロンが、2A自己切断部位等の自己切断部位によって分離され得る。場合によっては、各シストロンは、ベクターから別個のポリペプチドを発現する。特定の場合には、ベクター上の隣接するシストロンが、IRES要素によって分離されている。
特定の実施形態において、本開示は、例えば、1つ、2つ、またはそれを超える抗原受容体を含み得る多数のシストロンの、過剰発現が挙げられるコンビナトリアル発現を可能にする細胞工学用の系を提供する。特定の実施形態において、本明細書中に記載されるポリシストロニックベクターの使用により、ベクターは、同じmRNAから等モルレベルの多遺伝子産物を生成することが可能となる。多遺伝子は、CAR、TCR、サイトカイン、ケモカイン、ホーミング受容体、CRISPR/Cas9媒介性遺伝子変異、デコイ受容体、サイトカイン受容体、キメラサイトカイン受容体等を含み得るが、これらに限定されない。ベクターは、細胞アッセイおよび動物イメージング等のための1つ以上の蛍光または酵素レポーターをさらに含み得る。また、ベクターは、ベクターを有する細胞がもはや必要とされない場合の、またはこれが提供される宿主にとって有害となる場合の、当該細胞の終結のための自殺遺伝子産物を含み得る。
特定の実施形態において、ベクターは、ウイルスベクター(例えば、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、またはアデノ随伴ウイルスベクター)または非ウイルスベクターである。ベクターは、モロニーマウス白血病ウイルス(MMLV)5’LTR、3’LTR、および/またはpsiパッケージング要素を含み得る。特定の場合には、psiパッケージングは、5’LTRと抗原受容体コード配列との間に組み込まれる。ベクターは、pUC19配列を含んでも含まなくてもよい。ベクターの一部の態様において、少なくとも1つのシストロンは、サイトカイン(例えば、IL-15、IL-7、IL-21、IL-23、IL-18、IL-12、またはIL-2)、ケモカイン、サイトカイン受容体、および/またはホーミング受容体をコードする。
2A切断部位がベクターに利用される場合、2A切断部位は、P2A、T2A、E2A、および/またはF2A部位を含み得る。
制限酵素部位は、いかなる種類のものであってもよく、その認識部位に任意の数の塩基、例えば4~8塩基を含んでもよい;認識部位内の塩基数は、少なくとも4、5、6、7、8、またはそれを超えてもよい。切断された場合の部位は、平滑切断末端または粘着末端を生成し得る。制限酵素は、例えば、I型、II型、III型、またはIV型のものであり得る。制限酵素部位は、利用可能なデータベース、例えばIntegrated relational Enzyme database(IntEnz)またはBRENDA(The Comprehensive Enzyme Information System)から得ることができる。
例示的なベクターは、環状であってよく、慣例により、位置1(円の上部の12時の位置、残りの配列は時計回りの方向にある)が5’LTRの出発点に設定される。
自己切断性2Aペプチドが利用される実施形態において、2Aペプチドは、真核細胞における翻訳中にポリペプチドの「切断」を媒介する18~22アミノ酸(aa)長のウイルスオリゴペプチドであり得る。呼称「2A」は、ウイルスゲノムの特定の領域を指し、様々なウイルス2Aが一般的に、それらが由来するウイルスの後に命名されている。最初に発見された2AはF2A(口蹄疫ウイルス)であり、その後、E2A(ウマ鼻炎Aウイルス)、P2A(ブタテッショウウイルス-1 2A)、およびT2A(トセア・アシグナ(Thosea asigna)ウイルス2A)も特定された。2A媒介「自己切断」の機構は、2AのC末端でのグリシル-プロリルペプチド結合の形成をスキップするリボソームスキッピングであることが発見された。
特定の場合には、ベクターはγ-レトロウイルス移入ベクターであり得る。レトロウイルス移入ベクターは、pUC19プラスミド(HindIIIとEcoRIの制限酵素部位間の大きな断片(2.63kb))等のプラスミドに基づく骨格を含み得る。骨格は、5’LTR、psiパッケージング配列、および3’LTRを含むモロニーマウス白血病ウイルス(MoMLV)由来のウイルス構成要素を有し得る。LTRは、レトロウイルスプロウイルスの両側に見出される長い末端反復配列であり、移入ベクターの場合、HLA-G標的化CARおよび関連する構成要素等の目的の遺伝的カーゴを囲っている。また、ヌクレオカプシドによるパッケージング用の標的部位であるpsiパッケージング配列は、シスで組み込まれて、5’LTRとCARコード配列との間に挟まれている。ゆえに、トランスファベクターの例の基本構造は、pUC19配列-5’LTR-psiパッケージング配列-目的の遺伝的カーゴ-3’LTR-pUC19配列のように構成され得る。また、当該系は、限定されないが、レンチウイルス、アデノウイルスAAV、および非ウイルスプラスミドが挙げられる他のウイルスベクターおよび非ウイルスベクターに使用され得る。
VI.細胞
VI.細胞
本開示は、HLA-G標的化受容体をコードし、かつ少なくとも1つのサイトカインおよび/または少なくとも1つの自殺遺伝子をもコードし得る少なくとも1つのベクターを有するあらゆる種類の免疫細胞または幹細胞を包含する。場合によっては、様々なベクターが、自殺遺伝子および/またはサイトカインをコードするのと対比して、CARをコードする。NK細胞が挙げられる免疫細胞は、臍帯血(複数の源からプールされた臍帯血が挙げられる)、末梢血、人工多能性幹細胞(iPSC)、造血幹細胞(HSC)、骨髄、またはそれらの混合物に由来し得る。NK細胞は、例えば、以下に限定されないが、NK-92細胞等の細胞株に由来し得る。NK細胞は、CD56+NK細胞等の臍帯血単核細胞であり得る。
本開示は、従来のT細胞、ガンマ-デルタT細胞、NK TおよびインバリアントNKT細胞、制御性T細胞、マクロファージ、B細胞、樹状細胞、間葉系間質細胞(MSC)、またはそれらの混合物が挙げられる、あらゆる種類の免疫細胞または他の細胞を包含する。
場合によっては、細胞は、適切なあらゆる比率が挙げられる有効量のユニバーサル抗原提示細胞(UAPC)の存在下で拡大した。細胞は、UAPCと、10:1~1:10;9:1~1:9;8:1~1:8;7:1~1:7;6:1~1:6;5:1~1:5;4:1~1:4;3:1~1:3;2:1~1:2;または1:1の比率(例えば1:2の比率が挙げられる)にて培養され得る。場合によっては、NK細胞を、例えば10~500、10~400、10~300、10~200、10~100、10~50、100~500、100~400、100~300、100~200、200~500、200~400、200~300、300~500、300~400、または400~500U/mLの濃度でのIL-2の存在下で、拡大させた。
ベクターによる遺伝子修飾の後に、NK細胞は、直ちに注入されてもよいし、保存されてもよい。特定の態様において、遺伝子修飾後、細胞中への遺伝子導入後の約1、2、3、4、5日以内に、またはそれを超えて、細胞をバルク集団としてエクスビボで数日間、数週間、または数ヶ月間増殖させることができる。更なる態様において、トランスフェクタントがクローニングされて(クローンは、単一の組み込まれたか、またはエピソームによって維持された発現カセットまたはプラスミドの存在を示す)、HLA-G標的化CARの発現がエクスビボで拡大する。拡大のために選択されたクローンは、HLA-G発現標的細胞を特異的に認識して溶解する能力を実証する。組換え免疫細胞は、IL-2、または共通のガンマ鎖に結合する他のサイトカイン(例えば、IL-7、IL-12、IL-15、IL-21、IL-23等)による刺激によって拡大させることができる。組換え免疫細胞は、人工抗原提示細胞による刺激によって拡大し得る。更なる態様において、遺伝子修飾細胞は、凍結保存され得る。
本開示の実施形態は、本明細書中に包含される1つ以上のHLA-G標的化CARおよび1つ以上の自殺遺伝子を発現する細胞を包含する。NK細胞は、特定の実施形態において、1つ以上のHLA-G標的化CARおよび1つ以上の操作された、分泌不能な膜結合TNF-アルファ変異体ポリペプチドをコードする組換え核酸を含む。特定の実施形態において、1つ以上のHLA-G標的化CARおよびTNF-アルファ変異体ポリペプチドを発現することに加えて、細胞はまた、1つ以上の治療用遺伝子産物をコードする核酸を含む。
細胞は、個体から直接得られてもよいし、保管所または他の貯蔵施設から得られてもよい。治療法としての細胞は、治療法として細胞が提供される個体に対して自己由来であっても同種異系であってもよい。
細胞は、医学的症状について治療を必要とする個体に由来し得、そしてHLA-G標的化CAR、任意選択の自殺遺伝子、任意選択のサイトカイン、および任意選択の治療用遺伝子産物を(例えば、養子細胞療法のための形質導入および拡大のための標準的な技術を用いて)発現させる操作の後に、最初に供給された個体に戻され得る。場合によっては、細胞は、個体または別の個体に後に用いるために保存される。
免疫細胞は、細胞の集団内に含まれ得、当該集団は、大部分が、1つ以上のHLA-G標的化受容体および/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインで形質導入されていてよい。細胞集団は、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%の、1つ以上のHLA-G標的化受容体および/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインを形質導入した免疫細胞を含み得る。1つ以上のHLA-G標的化受容体および/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインは、別個のポリペプチドであり得る。
免疫細胞は、特定の目的に関してモジュールであるという意図のために、1つ以上のHLA-G標的化受容体および/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインと共に生成され得る。例えば、HLA-G標的化CARおよび/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインを発現する(またはその後の形質導入のために変異体をコードする核酸が分配されている)細胞が、例えば商業的流通用に生成され得、ユーザは、意図される目的に応じて、1つ以上の他の目的の遺伝子(治療用遺伝子が挙げられる)を発現するように細胞を修飾することができる。例えば、HLA-G陽性癌が挙げられるHLA-G陽性細胞の処置に関心がある個体が、自殺遺伝子発現細胞(または異種サイトカイン発現細胞)を得るか、または生成して、HLA-G特異的scFvを含む受容体を発現するように修飾することができ、またはその逆も同じである。
特定の実施形態において、NK細胞が利用されて、1つ以上のHLA-G標的化CARおよび/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインを発現する、形質導入されたNK細胞のゲノムが修飾され得る。ゲノムは、あらゆる様式で修飾され得るが、特定の実施形態において、ゲノムは、例えば、CRISPR遺伝子編集によって修飾される。細胞のゲノムは、あらゆる目的について細胞の有効性を増強するように修飾され得る。
VII.HLA-G特異的CAR細胞の遺伝子編集
VII.HLA-G特異的CAR細胞の遺伝子編集
特定の実施形態において、少なくとも、操作されたHLA-G特異的受容体を含む細胞は、細胞内での1つ以上の内因性遺伝子の発現を修飾するように遺伝子編集されている。特定の場合には、HLA-G特異的CAR細胞は、1つ以上の内因性遺伝子の発現の阻害(ノックアウトと称され得る)が挙げられる、1つ以上の内因性遺伝子の発現レベルの引下げがあるように修飾されている。そのような細胞は、拡大させてもさせなくてもよい。
特定の場合には、HLA-G特異的CAR細胞の1つ以上の内因性遺伝子が修飾されて、例えば、発現が破壊されて、発現が部分的または完全に引き下げられる。特定の場合には、1つ以上の遺伝子が、本開示のプロセスを用いてノックダウンまたはノックアウトされる。特定の場合には、多遺伝子がノックダウンまたはノックアウトされ、これは、それらの生成における同じ工程において起こっても起こらなくてもよい。HLA-G特異的CAR細胞において編集される遺伝子は、いかなる種類のものであってもよいが、特定の実施形態において、当該遺伝子は、遺伝子産物が、HLA-G特異的CAR細胞(一例として、臍帯血に由来するもの等のHLA-G特異的CAR NK細胞が挙げられる)の活性および/または増殖を阻害する遺伝子である。特定の場合には、HLA-G特異的CAR細胞内で編集される遺伝子は、HLA-G特異的CAR細胞が腫瘍微小環境においてより効果的に作用することを可能にする。特定の場合には、遺伝子は、NKG2A、SIGLEC-7、LAG3、TIM3、CISH、FOXO1、TGFBR2、TIGIT、CD96、ADORA2、NR3C1、PD1、PDL-1、PDL-2、CD47、SIRPA、SHIP1、ADAM17、RPS6、4EBP1、CD25、CD40、IL21R、ICAM1、CD95、CD80、CD86、IL10R、CD5、CD7、およびCD38の1つ以上である。特定の実施形態において、TGFBR2、CISH、および/またはCD38遺伝子は、HLA-G特異的CAR細胞においてノックアウトまたはノックダウンされる。
一部の実施形態において、遺伝子編集は、1つ以上のDNA結合核酸を用いて実行され、例えばRNAガイドエンドヌクレアーゼ(RGEN)を介した変更である。例えば、変更は、クラスター化して規則的な配置の短い回文配列リピート(CRISPR)およびCRISPR関連(Cas)タンパク質を用いて実行され得る。一部の実施形態において、Cas9の代わりにCpF1が利用される。一般に、「CRISPR系」は、集合的に、Cas遺伝子をコードする配列、tracr(トランス活性化CRISPR)配列(例えば、tracrRNAまたは活性部分tracrRNA)、tracr-mate配列(「直接反復」、内因性CRISPR系の文脈においてtracrRNAプロセスド部分直接反復を包含する)、ガイド配列(内因性CRISPR系の文脈において「スペーサ」とも称される)、ならびに/またはCRISPR遺伝子座からの他の配列および転写物が挙げられる、CRISPR関連(「Cas」)遺伝子の発現に関与するか、またはCRISPR関連(「Cas」)遺伝子の活性を指示する転写物および他の要素を指す。
CRISPR/CasヌクレアーゼまたはCRISPR/Casヌクレアーゼ系は、DNAに配列特異的に結合する非コードRNA分子(ガイド)RNA、およびヌクレアーゼ機能性(例えば2つのヌクレアーゼドメイン)を有するCasタンパク質(例えばCas9)を含み得る。CRISPR系の1つ以上の要素が、I型、II型、またはIII型CRISPR系に由来し得、例えば、化膿連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)等の、内因性CRISPR系を含む特定の生物に由来する。
一部の態様において、CasヌクレアーゼおよびgRNA(標的配列に特異的なcrRNA、および固定tracrRNAの融合物が挙げられる)が細胞中に導入される。一般に、gRNAの5’末端の標的部位が、相補的塩基対合を用いて、Casヌクレアーゼを標的部位、例えば遺伝子に標的化する。標的部位は、典型的にはNGGまたはNAG等のプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列のすぐ5’側の位置に基づいて選択され得る。この点において、gRNAは、ガイドRNAの最初の20、19、18、17、16、15、14、14、12、11、または10ヌクレオチドを、標的DNA配列に対応するように修飾することによって、所望の配列に標的化される。一般に、CRISPR系は、標的配列の部位にてCRISPR複合体の形成を促進する要素を特徴とする。典型的には、「標的配列」は、一般に、ガイド配列が相補性を有するように設計されている配列であって、標的配列とガイド配列との間のハイブリダイゼーションがCRISPR複合体の形成を促進する配列を指す。ハイブリダイゼーションを引き起こして、CRISPR複合体の形成を促進するのに十分な相補性があるならば、完全な相補性は必ずしも必要とされない。
CRISPR系は、本明細書中で論じられるように、標的部位にて二本鎖切断(DSB)を、続いて破壊または変更を誘導することができる。他の実施形態において、「ニッカーゼ」とみなされるCas9バリアントが用いられて、標的部位にて一本鎖にニックを入れる。対になったニッカーゼは、例えば特異性を向上させるのに用いられ得、それぞれ、ニックが同時に導入されると、5’オーバーハングが導入されるように、一対の異なるgRNA標的化配列によって導かれる。他の実施形態において、触媒的に不活性なCas9は、遺伝子発現に影響を及ぼすように、転写リプレッサまたは活性化因子等の異種エフェクタドメインに融合される。
標的配列は、あらゆるポリヌクレオチド、例えばDNAまたはRNAポリヌクレオチドを含み得る。標的配列は、細胞の核または細胞質内、例えば細胞の細胞小器官内に位置決めされ得る。一般に、標的配列を含む標的遺伝子座中への組換えに用いられ得る配列または鋳型が、「編集鋳型」または「編集ポリヌクレオチド」または「編集配列」と称される。一部の態様において、外因性鋳型ポリヌクレオチドが、編集鋳型と称される場合がある。一部の態様において、組換えは相同組換えである。
典型的には、内因性CRISPR系の文脈において、CRISPR複合体の形成(標的配列にハイブリダイズされて、1つ以上のCasタンパク質と複合体形成されるガイド配列を含む)は、標的配列内またはその近傍(例えば、標的配列から1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、50、またはそれを超える塩基対以内)で一方または双方の鎖の切断をもたらす。また、tracr配列は、野生型tracr配列(例えば、野生型tracr配列の約20、26、32、45、48、54、63、67、85、またはそれを超えるヌクレオチド)の全部または一部を含み得るか、またはそれからなり得るが、例えば、tracr配列の少なくとも一部に沿った、ガイド配列に作動可能に連結されたtracr mate配列の全部または一部とのハイブリダイゼーションによって、CRISPR複合体の一部を形成し得る。tracr配列は、ハイブリダイズしてCRISPR複合体の形成に関与するのに十分な、tracr mate配列に対する相補性(最適にアラインメントされたときのtracr mate配列の長さに沿って少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の配列相補性等)を有する。
CRISPR系の要素の発現が1つ以上の標的部位にてCRISPR複合体の形成を指示するように、CRISPR系の1つ以上の要素の発現を駆動する1つ以上のベクターが細胞中に導入され得る。また、構成要素は、タンパク質および/またはRNAとして細胞に送達され得る。例えば、Cas酵素、tracr-mate配列に連結されたガイド配列、およびtracr配列がそれぞれ、別個のベクター上の別個の調節要素に作動可能に連結され得る。これ以外にも、同じまたは異なる調節要素から発現される要素の2つ以上が、単一のベクター内で、第1のベクター内に含まれないCRISPR系のあらゆる構成要素を提供する1つ以上の追加のベクターと組み合わされ得る。ベクターは、制限エンドヌクレアーゼ認識配列等の1つ以上の挿入部位(「クローニング部位」とも称される)を含み得る。一部の実施形態において、1つ以上の挿入部位は、1つ以上のベクターの1つ以上の配列要素の上流および/または下流に位置決めされている。多数の異なるガイド配列が用いられる場合、単一の発現構築物が用いられて、CRISPR活性を、細胞内の多数の異なる、対応する標的配列に標的化し得る。
ベクターは、Casタンパク質等のCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に連結された調節要素を含み得る。Casタンパク質の非限定的な例として、Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas6、Cas7、Cas8、Cas9(Csn1およびCsx12としても知られている)、Cas10、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1、Cse2、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csfl、Csf2、Csf3、Csf4、Cpf1(Cas12a)、それらのホモログ、またはそれらの修飾バージョンが挙げられる。これらの酵素は知られている。例えば、化膿連鎖球菌(S.pyogenes)Cas9タンパク質のアミノ酸配列は、受託番号Q99ZW2でSwissProtデータベース内に見出され得る。
CRISPR酵素は、Cas9(例えば、化膿連鎖球菌(S.pyogenes)または肺炎連鎖球菌(S.pneumonia)由来)であってよい。場合によっては、Cas9の代わりにCpf1(Cas12a)がエンドヌクレアーゼとして用いられてもよい。CRISPR酵素は、標的配列内かつ/または標的配列の相補体内等の標的配列の位置での一方または双方の鎖の切断を指示し得る。ベクターは、変異CRISPR酵素が、標的配列を含有する標的ポリヌクレオチドの一方または双方の鎖を切断する能力を欠くように、対応する野生型酵素に対して変異したCRISPR酵素をコードし得る。例えば、化膿連鎖球菌(S.pyogenes)由来のCas9のRuvCI触媒ドメインにおけるアスパラギン酸からアラニンへの置換(D10A)が、Cas9を、双方の鎖を切断するヌクレアーゼからニッカーゼ(一本鎖を切断する)に変換する。一部の実施形態において、Cas9ニッカーゼが、DNA標的のセンス鎖およびアンチセンス鎖をそれぞれ標的とするガイド配列、例えば2つのガイド配列と組み合わせて用いられ得る。この組合せは、双方の鎖にニックを入れて、NHEJまたはHDRを誘導するのに用いられるのを可能にする。
一部の実施形態において、CRISPR酵素をコードする酵素コード配列が、真核細胞等の特定の細胞における発現のためにコドン最適化されている。真核細胞は、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、または非ヒト霊長類が挙げられるがこれらに限定されない哺乳動物等の特定の生物のものであり得るか、またはそれらに由来し得る。一般に、コドン最適化とは、目的の宿主細胞における発現を、ネイティブアミノ酸配列を維持しながら、ネイティブ配列の少なくとも1つのコドンを、当該宿主細胞の遺伝子においてより頻繁に、または最も頻繁に用いられるコドンで置換することによって増強するために核酸配列を修飾するプロセスを指す。種々の種が、特定のアミノ酸の特定のコドンについて、特定のバイアスを示す。コドンバイアス(生物間のコドン使用頻度の差異)は、多くの場合、メッセンジャーRNA(mRNA)の翻訳効率と相関し、これは、とりわけ、翻訳されることとなるコドンの特性、および特定の転移RNA(tRNA)分子の利用可能性に依存すると考えられる。細胞における選択されたtRNAの優位性は、一般に、ペプチド合成において最も頻繁に用いられるコドンの反映である。したがって、コドン最適化に基づいて、所与の生物における最適な遺伝子発現のために遺伝子を調整することができる。
一般に、ガイド配列は、標的配列とハイブリダイズして、標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指示するのに十分な、標的ポリヌクレオチド配列との相補性を有するあらゆるポリヌクレオチド配列である。一部の実施形態において、ガイド配列とその対応する標的配列との間の相補性の程度は、適切なアラインメントアルゴリズムを用いて最適にアラインメントされた場合、約50%、60%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%、またはそれを超える。
最適なアラインメントは、配列をアラインするのに適したあらゆるアルゴリズムの使用により決定することができ、その非限定的な例として、Smith-Watermanアルゴリズム、Needleman-Wunschアルゴリズム、Burrows-Wheeler Transformに基づくアルゴリズム(例えば、Burrows Wheeler Aligner)、Clustal W、Clustal X、BLAT、Novoalign(Novocraft Technologies)、ELAND(Illumina,San Diego,Calif.)、SOAP(soap.genomics.org.cnにて入手可能)、およびMaq(maq.sourceforge.netにて入手可能)が挙げられる。
CRISPR酵素は、1つ以上の異種タンパク質ドメインを含む融合タンパク質の一部であり得る。CRISPR酵素融合タンパク質は、追加のあらゆるタンパク質配列、および任意選択で2つのあらゆるドメイン間のリンカー配列を含み得る。CRISPR酵素に融合され得るタンパク質ドメインの例として、限定されないが、エピトープタグ、レポーター遺伝子配列、ならびに以下の活性:メチラーゼ活性、デメチラーゼ活性、転写活性化活性、転写抑制活性、転写放出因子活性、ヒストン修飾活性、RNA切断活性、および核酸結合活性のうちの1つ以上を有するタンパク質ドメインが挙げられる。エピトープタグの非限定的な例として、ヒスチジン(His)タグ、V5タグ、FLAGタグ、インフルエンザヘマグルチニン(HA)タグ、Mycタグ、VSV-Gタグ、およびチオレドキシン(Trx)タグが挙げられる。レポーター遺伝子の例として、グルタチオン-5-トランスフェラーゼ(GST)、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)ベータガラクトシダーゼ、ベータ-グルクロニダーゼ、ルシフェラーゼ、緑色蛍光タンパク質(GFP)、HcRed、DsRed、シアン蛍光タンパク質(CFP)、黄色蛍光タンパク質(YFP)、および青色蛍光タンパク質(BFP)が挙げられる自己蛍光タンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。CRISPR酵素は、マルトース結合タンパク質(MBP)、Sタグ、Lex A DNA結合ドメイン(DBD)融合物、GAL4A DNA結合ドメイン融合物、および単純ヘルペスウイルス(HSV)BP16タンパク質融合物が挙げられるがこれらに限定されないDNA分子または他の細胞分子に結合するタンパク質またはタンパク質の断片をコードする遺伝子配列に融合され得る。CRISPR酵素を含む融合タンパク質の一部を形成し得る追加のドメインが、参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2011/0059502号明細書に記載されている。
VIII.処置方法
VIII.処置方法
種々の実施形態において、その表面上で内因性HLA-Gを発現する疾患細胞または他の細胞が、医学的症状を有する個体において医学的症状を向上させるために、あるいは個体において医学的症状のリスクを引き下げるか、または重症度および/もしくは発症を遅延させるために標的とされる。特定の場合には、内因性HLA-Gを発現する癌細胞が、癌細胞を死滅させる目的で標的とされる。
本明細書中で企図されるHLA-G標的化CAR構築物、核酸配列、ベクター、免疫細胞等、および/またはそれらを含む医薬組成物が、腫瘍性疾患等の癌性疾患の予防、処置、または寛解に用いられる。特定の実施形態において、本開示の医薬組成物は、例えば、HLA-Gを発現し、かつ固形腫瘍であってもなくてもよい癌が挙げられる癌の予防、寛解、および/または処置に特に有用であり得る。
HLA-G標的化受容体が利用される免疫細胞は、特定の実施形態において、NK細胞、T細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、またはNKTもしくはインバリアントNKT(iNKT)、あるいは哺乳動物用の細胞療法のために操作されたインバリアントNKT細胞であり得る。細胞がNK細胞である場合、NK細胞療法は、いかなる種類のものであってもよく、NK細胞は、いかなる種類のものであってもよい。特定の実施形態において、細胞は、1つ以上のHLA-G標的化CARおよび/または1つ以上の自殺遺伝子および/または1つ以上のサイトカインを発現するように操作されたNK細胞である。特定の実施形態において、細胞は、HLA-G標的化CARを形質導入したNK細胞である。
特定の実施形態において、本開示は、部分的には、標準的なベクターおよび/または遺伝子送達系を用いて単独で、またはあらゆる組合せで、そして少なくとも一部の態様において、薬学的に許容される担体または賦形剤と共に投与され得るHLA-G CAR発現細胞、HLA-G標的化CAR構築物、HLA-G標的化CAR核酸分子、およびHLA-G標的化CARベクターを企図する。特定の実施形態において、投与後、核酸分子またはベクターは、対象のゲノム中に安定して組み込まれ得る。
特定の実施形態において、特定の細胞または組織に特異的であり、かつNK細胞内で持続するウイルスベクターが用いられ得る。適切な医薬担体および賦形剤が、当該技術において周知である。本開示に従って調製される組成物は、上記の特定された疾患の予防もしくは処置または遅延のために用いられ得る。
さらに、本開示は、腫瘍性疾患の予防、処置、または寛解のための方法であって、それを必要とする対象に、本明細書中で企図されるような、かつ/または本明細書中で企図されるようなプロセスによって生成されるHLA-G標的化CAR、核酸配列、ベクターを発現する有効量の細胞を投与する工程を含む方法に関する。
例示的なHLA-G標的化CAR細胞の組成物の投与の可能な適応症は、例えば、B細胞悪性腫瘍、多発性骨髄腫、乳癌、神経膠芽腫、腎癌、膵臓癌、または肺癌が挙げられる腫瘍性疾患が挙げられる癌性疾患である。HLA-G標的化CAR細胞の組成物の投与のための例示的な適応症は、HLA-Gを発現するあらゆる悪性腫瘍が挙げられる癌性疾患である。本開示の組成物の投与は、例えば、微小残存病変、早期癌、進行癌、ならびに/または転移癌および/もしくは難治性癌が挙げられる、全てのステージ(I、II、III、またはIV)および種類の癌に有用である。
本開示はさらに、他の化合物、例えば、二重特異性抗体構築物、標的毒素、または免疫細胞を介して作用する他の化合物との同時投与プロトコルを包含する。本発明の化合物の同時投与のための臨床レジメンは、他の成分の投与と同時、前、または後の同時投与を包含し得る。特定の併用療法として、化学療法、放射線、外科手術、ホルモン療法、または他の種類の免疫療法が挙げられる。
実施形態は、本明細書中で定義されるHLA-G標的化CAR構築物、本明細書中で定義される核酸配列、本明細書中で定義されるベクター、および/または本明細書中で定義される宿主細胞(免疫細胞等)を含むキットに関する。また、本開示のキットは、単独で、または医学的処置もしくは介入を必要とする個体に投与されることとなる更なる薬剤と組み合わせて、本明細書中で先に記載されるような医薬組成物を含むことが企図される。
A.医薬組成物
A.医薬組成物
また、本明細書中で提供されるのは、形質導入されたNK細胞および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物および製剤である。形質導入された細胞は、個体への移入に適した培地、および/または個体への移入前を含む凍結保存等の保存に適した培地中に含まれ得る。
本明細書中に記載される医薬組成物および製剤は、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、所望の純度を有する活性成分(細胞等)を、1つ以上の任意選択の薬学的に許容される担体(Remington’s Pharmaceutical Sciences 22nd edition,2012)と混合することによって調製され得る。薬学的に許容される担体は、一般に、使用される投与量および濃度にて、レシピエントに対して非毒性であり、以下に限定されないが:リン酸、クエン酸、および他の有機酸等のバッファ;アスコルビン酸およびメチオニンが挙げられる酸化防止剤;防腐剤(オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル、またはベンジルアルコール;メチルまたはプロピルパラベン等のアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾール等);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリン等のタンパク質;ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジン等のアミノ酸;単糖類、二糖類、およびグルコース、マンノース、もしくはデキストリンが挙げられる他の炭水化物;EDTA等のキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース、もしくはソルビトール等の糖;ナトリウム等の塩形成対イオン;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質複合体);ならびに/またはポリエチレングリコール(PEG)等の非イオン性界面活性剤が挙げられる。本明細書中の例示的な薬学的に許容される担体としてさらに、間質性薬物分散剤、例えば、可溶性の中性活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)、例えばヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質、例えばrHuPH20(HYLENEX(登録商標)、Baxter International,Inc.)が挙げられる。rHuPH20が挙げられる特定の例示的なsHASEGPおよび使用方法が、米国特許出願公開第2005/0260186号明細書および米国特許出願公開第2006/0104968号明細書に記載されている。一態様において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼ等の1つ以上の追加のグリコサミノグリカナーゼと組み合わされる。
B.併用療法
B.併用療法
特定の実施形態において、本実施形態の組成物および方法は、少なくとも1つの追加の療法と組み合わせた免疫細胞集団(NK細胞集団が挙げられる)を包含する。追加の療法として、放射線療法、外科手術(例えば、乳腺腫瘤摘出術および乳房切除術)、化学療法、遺伝子療法、DNA療法、ウイルス療法、RNA療法、免疫療法、骨髄移植、ナノ療法、モノクローナル抗体療法、ホルモン療法、腫瘍溶解性ウイルス、または前述の組合せがあり得る。追加の療法は、アジュバント療法またはネオアジュバント療法の形態であり得る。
一部の実施形態において、追加の療法は、小分子酵素阻害剤または抗転移剤の投与である。一部の実施形態において、追加の療法は、副作用制限剤(例えば、処置の副作用の発生および/または重症度を軽減することが意図される剤、例えば嘔吐抑制剤、その他)の投与である。一部の実施形態において、追加の療法は放射線療法である。一部の実施形態において、追加の療法は外科手術である。一部の実施形態において、追加の療法は、放射線療法および外科手術の組合せである。一部の実施形態において、追加の療法はガンマ線照射である。一部の実施形態において、追加の療法は、PBK/AKT/mTOR経路を標的とする療法、HSP90阻害剤、チューブリン阻害剤、アポトーシス阻害剤、および/または化学予防剤である。追加の療法は、当該技術において知られている1つ以上の化学療法剤であり得る。
特定の実施形態において、本開示の本発明の細胞療法に加えて、個体は、外科手術、放射線、免疫療法(本開示の細胞療法以外)、ホルモン療法、遺伝子療法、化学療法等のうちの1つ以上が挙げられる、癌用の特定の追加の療法が施されていてもよく、施されてもよく、かつ/または施されることとなる。
免疫細胞療法は、追加の癌治療に対して前、間、後に、または種々の組合せで施され得る。施用は、同時~数分~数日~数週に及ぶ間隔であり得る。免疫細胞療法が、追加の治療剤とは別に患者に施される実施形態において、当業者であれば、一般に、2つの化合物が、有利に組み合わされた効果を患者に対してなお発揮することができるように、重要な期間が各送達時間の間に失効しないことを確実にするであろう。そのような場合、互いに約12~24または72時間以内、より具体的には互いに約6~12時間以内に抗体療法および抗癌療法が患者に施され得ると考えられる。一部の状況では、それぞれの投与の間に数日(2、3、4、5、6、または7)~数週(1、2、3、4、5、6、7、または8)が経過する場合、処置期間を大きく延長することが望ましい場合がある。
種々の組合せを使用することができる。以下の例では、免疫細胞療法は「A」であり、抗癌療法は「B」である。
A/B/A B/A/B B/B/A A/A/B A/B/B B/A/A A/B/B/B B/A/B/B
B/B/B/A B/B/A/B A/A/B/B A/B/A/B A/B/B/A B/B/A/A
B/A/B/A B/A/A/B A/A/A/B B/A/A/A A/B/A/A A/A/B/A
A/B/A B/A/B B/B/A A/A/B A/B/B B/A/A A/B/B/B B/A/B/B
B/B/B/A B/B/A/B A/A/B/B A/B/A/B A/B/B/A B/B/A/A
B/A/B/A B/A/A/B A/A/A/B B/A/A/A A/B/A/A A/A/B/A
本実施形態のあらゆる化合物または細胞療法を患者に施すには、もしあれば剤の毒性を考慮して、そのような化合物の投与のための一般的なプロトコルに従うこととなる。したがって、一部の実施形態において、併用療法に起因する毒性を監視する工程が存在する。
1.化学療法
1.化学療法
多種多様な化学療法剤が、本実施形態に従って用いられ得る。用語「化学療法」は、癌を処置するための薬物の使用を指す。「化学療法剤」は、癌の処置の際に投与される化合物または組成物を意味するのに用いられる。当該剤または薬物は、細胞内の活性様式によって、例えば、細胞周期に影響を及ぼすか、そしてどの段階で影響を及ぼすかで分類される。これ以外にも、剤は、DNAを直接架橋する能力、DNA中にインターカレートする能力、または核酸合成に影響を及ぼすことによって染色体異常および有糸分裂異常を誘導する能力に基づいて特徴付けられ得る。
化学療法剤の例として、アルキル化剤、例えば、チオテパおよびシクロホスファミド;スルホン酸アルキル、例えば、ブスルファン、インプロスルファン、およびピポスルファン;アジリジン、例えば、ベンゾドーパ、カルボコン、メツレドーパ(meturedopa)、およびウレドーパ;エチレンイミンおよびメチルアメラミン(アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド、およびトリメチロメラミンが挙げられる);アセトゲニン(とりわけ、ブラタシンおよびブラタシノン);カンプトテシン(合成類似体トポテカンが挙げられる);ブリオスタチン;カリスタチン;CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシン、およびビゼレシン合成類似体が挙げられる);クリプトフィシン(特に、クリプトフィシン1およびクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成類似体、KW-2189およびCB1-TM1が挙げられる);エレウテロビン;パンクラチスタチン;サルコジクチン;スポンジスタチン;ナイトロジェンマスタード、例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロフォスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシドヒドロクロリド、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロフォスファミド、およびウラシルマスタード;ニトロソウレア、例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、およびラニムスチン;抗生物質、例えば、エンジイン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、とりわけ、カリケアマイシンガンマII(calicheamicin gammaII)およびカリケアマイシンオメガII(calicheamicin omegaII));ダイネマイシン(ダイネマイシンAが挙げられる);ビスホスホナート、例えばクロドロナート;エスペラマイシン;ならびにネオカルジノスタチンクロモフォアおよび関連する色素タンパク質エンジインアンチビオティッククロモフォア、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オートラルマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン(モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルホリノ-ドキソルビシン、2-ピロリノ-ドキソルビシン、およびデオキシドキソルビシンが挙げられる)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、例えばマイトマイシンC、ミコフェノール酸、ノガラルナイシン(nogalarnycin)、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、クエラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、およびゾルビシン;代謝拮抗薬、例えば、メトトレキサートおよび5-フルオロウラシル(5-FU);葉酸類似体、例えば、デノプテリン、プテロプテリン、およびトリメトレキサート;プリン類似体、例えば、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、およびチオグアニン;ピリミジン類似体、例えば、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、およびフロクスウリジン;アンドロゲン、例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、およびテストラクトン;抗副腎剤(anti-adrenals)、例えば、ミトタンおよびトリロスタン;葉酸補充剤、例えばフロリン酸;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトラキサート;デフォファミン;デメコルシン;ジアジクォン;エルフォルミチン;酢酸エリプチニウム;エポチロン;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシウレア;レンチナン;ロニダミン(lonidainine);マイタンシノイド、例えば、マイタンシンおよびアンサマイトシン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダンモル(mopidanmol);ニトラエリン(nitraerine);ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ロソキサントロン;ポドフィリン酸;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK多糖複合体;ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクオン;2,2’,2’’-トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン(とりわけ、T-2トキシン、ベラキュリンA、ロリジンA、およびアングイジン);ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン;アラビノシド(「Ara-C」);シクロホスファミド;タキソイド、例えば、パクリタキセルおよびドセタキセルゲムシタビン;6-チオグアニン;メルカプトプリン;白金配位錯体、例えば、シスプラチン、オキサリプラチン、およびカルボプラチン;ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP-16);イホスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;ビノレルビン;ノバントロン;テニポシド;エダトレキサート;ダウノマイシン;アミノプテリン;ゼロダ;イバンドロナート;イリノテカン(例えばCPT-11);トポイソメラーゼ阻害剤RFS 2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイド、例えばレチノイン酸;カペシタビン;カルボプラチン、プロカルバジン、プリカマイシン(plicomycin)、ゲムシタビン、ナベルビン、ファルネシル-タンパク質トランスフェラーゼ阻害剤、トランス白金、ならびに先のいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体が挙げられる。
2.放射線療法
2.放射線療法
DNA損傷を引き起こし、かつ広く用いられてきた他の因子として、γ線、X線、および/または腫瘍細胞への放射性同位体の指向性送達として一般に知られているものが挙げられる。また、マイクロ波、陽子ビーム照射(米国特許第5,760,395号明細書および米国特許第4,870,287号明細書)、およびUV照射等の他の形態のDNA損傷因子が企図される。これらの因子は全て、DNA、DNAの前駆体、DNAの複製および修復、ならびに染色体のアセンブリおよび維持に対する広範囲の損傷に影響を及ぼす可能性が最も高い。X線の線量範囲は、長期間(3~4週)の50~200レントゲンの1日線量から、2000~6000レントゲンの単回線量に及ぶ。放射性同位体の線量範囲は、広く変動し、同位体の半減期、放たれる放射線の強度および種類、ならびに新生物細胞による取込みによって決まる。
3.免疫療法
3.免疫療法
当業者であれば、CARの追加の免疫療法が、単独で、または実施形態の方法と併用され得、もしくは組み合わせて用いられ得ることを理解するであろう。本明細書に包含されるあらゆる抗体が、二重特異性抗体または多重特異性抗体が挙げられる、CAR以外の治療分子に使用され得る。癌処置の文脈において、免疫療法は、一般に、癌細胞を標的として破壊するための免疫エフェクタ細胞または剤および分子の使用に依存する。リツキシマブ(RITUXAN(登録商標))がそのような例である。免疫エフェクタは、例えば、腫瘍細胞の表面上のいくつかのマーカーに特異的な抗体であり得る。抗体は単独で、療法のエフェクタとして機能し得るか、または他の細胞を動員して細胞死に実際に影響を及ぼし得る。また、抗体は、薬物または毒素(化学療法剤、放射性核種、リシンA鎖、コレラ毒素、百日咳毒素、その他)にコンジュゲートされて、標的化剤として機能し得る。これ以外にも、エフェクタは、腫瘍細胞標的と直接的または間接的に相互作用する表面分子を担持するリンパ球であり得る。種々のエフェクタ細胞として、細胞傷害性T細胞およびNK細胞が挙げられる。
抗体-薬物コンジュゲートは、癌治療薬の開発への画期的なアプローチとして出現した。癌は、世界における主要な死因の1つである。抗体-薬物コンジュゲート(ADC)は、細胞死滅薬物に共有結合したモノクローナル抗体(MAb)を含む。このアプローチは、抗原標的に対するMAbの高い特異性を、高度に強力な細胞傷害性薬物と組み合わせて、抗原レベルが富化された腫瘍細胞にペイロード(薬物)を送達する「武装」MAbをもたらす。また、薬物の標的送達は、正常組織における曝露を最小限に抑えて、毒性の低下および治療指数の改善をもたらす。FDAによる2011年のADCETRIS(登録商標)(ブレンツキシマブベドチン)および2013年のKADCYLA(登録商標)(トラスツズマブエムタンシンまたはT-DM1)という2つのADC薬物の承認は、当該アプローチを検証した。現在、癌処置のための臨床試験の種々の段階において、30を超えるADC薬物候補が存在する(Leal et al.,2014)。抗体工学およびリンカー-ペイロード最適化がますます成熟してきているので、新しいADCの発見および開発は、このアプローチおよび標的化MAbの生成に適した新しい標的の同定および検証にますます依存している。ADC標的についての2つの基準は、腫瘍細胞における発現の上方制御/高いレベル、およびロバストな内在化である。
免疫療法の一態様において、腫瘍細胞は、標的化に適した、すなわち他の細胞の大部分に存在しない何らかのマーカーを有していなければならない。多くの腫瘍マーカーが存在し、これらはいずれも、本実施形態の文脈における標的化に適し得る。一般的な腫瘍マーカーとして、CD20、癌胎児性抗原、チロシナーゼ(p97)、gp68、TAG-72、HMFG、シアリルルイス抗原、MucA、MucB、PLAP、ラミニン受容体、erb B、およびp155が挙げられる。免疫療法の代替的な態様は、抗癌効果を免疫刺激効果と組み合わせるものである。また、IL-2、IL-4、IL-12、GM-CSF、ガンマ-IFN等のサイトカイン、MIP-1、MCP-1、IL-8等のケモカイン、およびFLT3リガンド等の増殖因子が挙げられる免疫刺激分子が存在する。
現在調査中または使用中の免疫療法の例として、免疫アジュバント、例えば、ウシ型結核菌(Mycobacterium bovis)、熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falciparum)、ジニトロクロロベンゼン、および芳香族化合物(米国特許第5,801,005号明細書および米国特許第5,739,169号明細書;Hui and Hashimoto,1998;Christodoulides et al.,1998);サイトカイン療法、例えば、インターフェロンα、β、およびγ、IL-1、GM-CSF、ならびにTNF(Bukowski et al.,1998;Davidson et al.,1998;Hellstrand et al.,1998);遺伝子療法、例えば、TNF、IL-1、IL-2、およびp53(Qin et al.,1998;Austin-Ward and Villaseca,1998;米国特許第5,830,880号明細書および米国特許第5,846,945号明細書);ならびにモノクローナル抗体、例えば、抗CD20、抗ガングリオシドGM2、および抗p185(Hollander,2012;Hanibuchi et al.,1998;米国特許第5,824,311号明細書)がある。1つ以上の抗癌療法が、本明細書中に記載される抗体療法と共に使用され得ることが企図される。
一部の実施形態において、免疫療法は、免疫チェックポイント阻害剤であり得る。免疫チェックポイントは、シグナル(例えば共刺激分子)を強くするか、またはシグナルを弱くする。免疫チェックポイント遮断によって標的とされ得る阻害性免疫チェックポイントとして、アデノシンA2A受容体(A2AR)、B7-H3(CD276としても知られている)、BおよびTリンパ球アテニュエータ(BTLA)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4、CD152としても知られている)、インドールアミン2,3-ジオキシゲナーゼ(IDO)、キラー細胞免疫グロブリン(KIR)、リンパ球活性化遺伝子-3(LAG3)、プログラム死1(PD-1)、T細胞免疫グロブリンドメインおよびムチンドメイン3(TIM-3)、ならびにT細胞活性化のVドメインIgサプレッサ(VISTA)が挙げられる。特に、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-1軸および/またはCTLA-4を標的とする。
免疫チェックポイント阻害剤は、小分子等の薬物、リガンドもしくは受容体の組換え形態であり得るか、または特に、ヒト抗体(例えば、国際公開第2015/016718号;Pardoll,Nat Rev Cancer,12(4):252-64,2012;双方とも参照により本明細書に組み込まれる)等の抗体である。免疫チェックポイントタンパク質またはその類似体の知られている阻害剤が用いられ得、特にキメラ化、ヒト化、またはヒト形態の抗体が用いられ得る。当業者が知っている代替的かつ/または同等の名称が、本開示において言及される特定の抗体に用いられ得る。そのような代替的かつ/または同等の名称は、本開示の文脈において交換可能である。例えば、ラムブロリズマブは、MK-3475およびペンブロリズマブという代替的かつ同等の名称でも知られていることが知られている。
一部の実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、PD-1の、そのリガンド結合パートナーへの結合を阻害する分子である。特定の態様において、PD-1リガンド結合パートナーは、PDL1および/またはPDL2である。別の実施形態において、PDL1結合アンタゴニストは、PDL1の、その結合パートナーへの結合を阻害する分子である。特定の態様において、PDL1結合パートナーは、PD-1および/またはB7-1である。別の実施形態において、PDL2結合アンタゴニストは、PDL2の、その結合パートナーへの結合を阻害する分子である。特定の態様において、PDL2結合パートナーはPD-1である。アンタゴニストは、抗体、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。例示的な抗体が、米国特許第8,735,553号明細書、米国特許第8,354,509号明細書、および米国特許第8,008,449号明細書に記載されており、これらは全て、参照により本明細書に組み込まれる。本明細書中で提供される方法に用いられる他のPD-1軸アンタゴニストが、米国特許出願公開第2014/0294898号明細書、米国特許出願公開第2014/022021号明細書、および米国特許出願公開第2011/0008369号明細書(全て、参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、当該技術において知られている。
一部の実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、抗PD-1抗体(例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体)である。一部の実施形態において、抗PD-1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、およびCT-011からなる群から選択される。一部の実施形態において、PD-1結合アンタゴニストは、イムノアドヘシン(例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリン配列のFc領域)に融合されたPDL1またはPDL2の細胞外またはPD-1結合部分を含むイムノアドヘシン)である。一部の実施形態において、PD-1結合アンタゴニストはAMP-224である。ニボルマブは、MDX-1106-04、MDX-1106、ONO-4538、BMS-936558、およびOPDIVO(登録商標)としても知られており、国際公開第2006/121168号に記載される抗PD-1抗体である。ペンブロリズマブは、MK-3475、Merck 3475、ラムブロリズマブ、KEYTRUDA(登録商標)、およびSCH-900475としても知られており、国際公開第2009/114335号に記載される抗PD-1抗体である。CT-011は、hBATまたはhBAT-1としても知られており、国際公開第2009/101611号に記載される抗PD-1抗体である。AMP-224は、B7-DCIgとしても知られており、国際公開第2010/027827号および国際公開第2011/066342号に記載されるPDL2-Fc融合可溶性受容体である。
本明細書中で提供される方法において標的とされ得る別の免疫チェックポイントは、CD152としても知られている細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)である。ヒトCTLA-4の完全なcDNA配列は、Genbank寄託番号L15006を有する。CTLA-4は、T細胞の表面上に見出され、抗原提示細胞の表面上のCD80またはCD86に結合した場合に、「オフ」スイッチとして作用する。CTLA4は、ヘルパーT細胞の表面上に発現されて、阻害性シグナルをT細胞に伝達する免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーである。CTLA4は、T細胞共刺激タンパク質CD28に類似しており、双方の分子は、抗原提示細胞上のそれぞれB7-1およびB7-2とも呼ばれるCD80およびCD86に結合する。CTLA4は阻害シグナルをT細胞に伝達するが、CD28は刺激シグナルを伝達する。また、細胞内CTLA4は、制御性T細胞において見出され、その機能にとって重要であり得る。T細胞受容体およびCD28を介したT細胞活性化は、B7分子の阻害性受容体であるCTLA-4の発現の増大をもたらす。
一部の実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、抗CTLA-4抗体(例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、またはキメラ抗体)、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドである。
本方法での使用に適した抗ヒトCTLA-4抗体(またはそれに由来するVHおよび/またはVLドメイン)は、当該技術において周知の方法を用いて生成され得る。これ以外にも、当該技術において認識されている抗CTLA-4抗体が用いられ得る。例えば、米国特許第8,119,129号明細書、国際公開第01/14424号、国際公開第98/42752号、国際公開第00/37504号(CP675,206号明細書、トレメリムマブとしても知られている;以前はチシリムマブ)、米国特許第6,207,156号明細書;Hurwitゼータl.(1998)Proc Natl Acad Sci USA 95(17):10067-10071;Camacho et al.(2004)J Clin Oncology 22(145):Abstract No.2505(抗体CP-675206);およびMokyr et al.(1998)Cancer Res 58:5301-5304に開示される抗CTLA-4抗体が、本明細書中で開示される方法に用いられ得る。前述の刊行物の各々の教示は、参照により本明細書に組み込まれる。また、CTLA-4への結合について、これらの当該技術において認識されている抗体のいずれかと競合する抗体が用いられ得る。例えば、ヒト化CTLA-4抗体は、国際公開第2001/014424号、国際公開第2000/037504号、および米国特許第8,017,114号明細書(全て、参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
例示的な抗CTLA-4抗体は、イピリムマブ(10D1、MDX-010、MDX-101、およびYervoy(登録商標)としても知られている)またはその抗原結合断片およびバリアント(例えば、国際公開第01/14424号参照)である。他の実施形態において、抗体は、イピリムマブの重鎖および軽鎖のCDRまたはVRを含む。したがって、一実施形態において、抗体は、イピリムマブのVH領域のCDR1、CDR2、およびCDR3ドメイン、ならびにイピリムマブのVL領域のCDR1、CDR2、およびCDR3ドメインを含む。別の実施形態において、抗体は、上記の抗体と同じ、CTLA-4上のエピトープとの結合について競合し、かつ/またはこれに結合する。別の実施形態において、抗体は、上述の抗体と少なくとも約90%の可変領域アミノ酸配列同一性(例えば、イピリムマブと少なくとも約90%、95%、または99%の可変領域同一性)を有する。
CTLA-4を調節するための他の分子として、米国特許第5,844,905号明細書、米国特許第5,885,796号明細書、ならびに国際公開第1995/001994号および国際公開第1998/042752号(全て、参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているようなCTLA-4リガンドおよび受容体、ならびに米国特許第8,329,867号明細書(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるようなイムノアドヘシンが挙げられる。
4.外科手術
4.外科手術
癌を患う人のおよそ60%が、予防的な、診断的な、または病期分類する(staging)根治目的の手術および緩和手術が挙げられる何らかの種類の外科手術を受けることとなる。根治目的の手術として、癌性組織の全てまたは一部が物理的に除去、切除、かつ/または破壊される切除が挙げられ、本実施形態の処置、化学療法、放射線療法、ホルモン療法、遺伝子療法、免疫療法、および/または代替療法等の他の療法と組み合わせて用いられ得る。腫瘍切除術は、腫瘍の少なくとも一部の物理的除去を指す。腫瘍切除術に加えて、外科手術による処置として、レーザー手術、凍結手術、電気手術、および顕微鏡下手術(Mohs手術)が挙げられる。
癌性細胞、組織、または腫瘍の一部または全部を切除すると、体内に空洞が形成され得る。処置は、追加の抗癌療法による領域の灌流、直接注射、または局所施用によって達成され得る。そのような処置は、例えば、1、2、3、4、5、6、もしくは7日毎、または1、2、3、4、および5週毎、または1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、もしくは12ヶ月毎に繰り返され得る。これらの処置は、同様に、投与量を変えるものであってもよい。
5.その他の薬剤
5.その他の薬剤
他の薬剤が、本実施形態の特定の態様と組み合わせて用いられて、処置の治療有効性を向上させることができると考えられる。これらの追加の剤として、細胞表面受容体およびGAP接合部の上方制御に影響を及ぼす剤、細胞増殖抑制剤および分化剤、細胞接着の阻害剤、アポトーシス誘導因子に対する過剰増殖性細胞の感受性を増大させる剤、または他の生物学的剤が挙げられる。GAP接合部の数を増やすことによる細胞間シグナル伝達の増大が、隣接する過剰増殖性細胞集団に及ぼす抗過剰増殖効果を増大させるであろう。他の実施形態において、細胞増殖抑制剤または分化剤が、本実施形態の特定の態様と組み合わせて用いられて、処置の抗過剰増殖効果を向上させることができる。細胞接着の阻害剤が、本実施形態の有効性を向上させると考えられる。細胞接着阻害剤の例として、焦点接着キナーゼ(FAK)阻害剤およびロバスタチンがある。さらに、アポトーシスに対する過剰増殖性細胞の感受性を増大させる他の剤、例えば抗体c225が、本実施形態の特定の態様と組み合わせて用いられて、処置効力を向上させることができると考えられる。
IX.タンパク質
IX.タンパク質
本明細書中で用いられる「タンパク質」または「ポリペプチド」は、少なくとも3つのアミノ酸残基を含む分子を指す。本明細書中で用いられる用語「野生型」は、生物において天然に生じる分子の内因性バージョンを指す。一部の実施形態において、野生型バージョンのタンパク質またはポリペプチドが使用される。しかしながら、本開示の多くの実施形態において、修飾タンパク質またはポリペプチドが、免疫応答を生じさせるのに使用される。上記の用語は、互換的に用いられ得る。「修飾タンパク質」または「修飾ポリペプチド」または「バリアント」は、その化学構造、特にそのアミノ酸配列が野生型タンパク質またはポリペプチドに対して変化しているタンパク質またはポリペプチドを指す。一部の実施形態において、修飾/バリアントタンパク質またはポリペプチドは、少なくとも1つの修飾された活性または機能を有する(タンパク質またはポリペプチドが、多数の活性または機能を有し得ることを認識する)。修飾/バリアントタンパク質またはポリペプチドは、1つの活性または機能に関して変更され得るが、他の点では、免疫原性等の野生型の活性または機能を保持し得ることが特に企図される。
タンパク質が本明細書で具体的に言及される場合、一般に、天然(野生型)もしくは組換え(修飾)タンパク質、または任意選択で、任意のシグナル配列が除去されているタンパク質を指す。タンパク質は、天然の生物から直接単離されてもよいし、組換えDNA/外因性発現方法によって生成されてもよいし、固相ペプチド合成(SPPS)または他のインビトロ方法によって生成されてもよい。特定の実施形態において、ポリペプチド(例えば、抗体またはその断片)をコードする核酸配列を組み込んだ単離核酸セグメントおよび組換えベクターが存在する。用語「組換え」は、ポリペプチド、または特定のポリペプチドの名称と共に用いられ得、これは一般に、インビトロで操作されたか、またはそのような分子の複製産物である核酸分子から生成されるポリペプチドを指す。
特定の実施形態において、タンパク質またはポリペプチド(野生型または改変型)のサイズは、以下を含み得るが、これらに限定されない。
5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 725, 750, 775, 800, 825, 850, 875, 900, 925, 950, 975, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400, 1500, 1750, 2000, 2250, 2500 アミノ酸残基以上、およびそこから誘導可能な任意の範囲、または本明細書に記載または参照される対応するアミノ酸配列の誘導体である。ポリペプチドは、切断によって変異され、対応する野生型よりも短くされ、また、特定の機能(例えば、標的化または局在化のため、免疫原性の増強のため、精製の目的のためなど)を有する異種タンパク質またはポリペプチド配列を融合または結合させることによって改変され得ることが企図される。本明細書で使用される場合、用語「ドメイン」は、タンパク質またはポリペプチドの任意の別個の機能的または構造的単位を指し、一般に、当業者に認識可能な構造または機能を有するアミノ酸の配列を指す。
5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 725, 750, 775, 800, 825, 850, 875, 900, 925, 950, 975, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400, 1500, 1750, 2000, 2250, 2500 アミノ酸残基以上、およびそこから誘導可能な任意の範囲、または本明細書に記載または参照される対応するアミノ酸配列の誘導体である。ポリペプチドは、切断によって変異され、対応する野生型よりも短くされ、また、特定の機能(例えば、標的化または局在化のため、免疫原性の増強のため、精製の目的のためなど)を有する異種タンパク質またはポリペプチド配列を融合または結合させることによって改変され得ることが企図される。本明細書で使用される場合、用語「ドメイン」は、タンパク質またはポリペプチドの任意の別個の機能的または構造的単位を指し、一般に、当業者に認識可能な構造または機能を有するアミノ酸の配列を指す。
本開示のポリペプチド、タンパク質、またはこのようなポリペプチドもしくはタンパク質をコードするポリヌクレオチドは、以下を含み得る。
配列番号1~81のいずれかと、1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 又は 50 (またはその誘導可能な範囲)以上の変異アミノ酸または核酸置換であるか、
または少なくとも 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 又は 100% (またはそこから派生する範囲)と、類似、同一、または相同であるか
最大で、3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 300, 400, 500, 550, 1000 あるいはそれ以上の連続するアミノ酸又は核酸又はその誘導される範囲。
配列番号1~81のいずれかと、1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 又は 50 (またはその誘導可能な範囲)以上の変異アミノ酸または核酸置換であるか、
または少なくとも 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 又は 100% (またはそこから派生する範囲)と、類似、同一、または相同であるか
最大で、3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 300, 400, 500, 550, 1000 あるいはそれ以上の連続するアミノ酸又は核酸又はその誘導される範囲。
いくつかの実施形態において、タンパク質、ポリペプチド、またはポリヌクレオチドは、以下を含み得る。
配列番号1~81の配列のいずれかの 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000(またはその誘導可能な範囲)の連続するアミノ酸またはヌクレオチド。
配列番号1~81の配列のいずれかの 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000(またはその誘導可能な範囲)の連続するアミノ酸またはヌクレオチド。
いくつかの実施形態において、ポリペプチド、タンパク質、またはポリヌクレオチドは、少なくとも、多くとも、または正確に、以下を含み得る。
配列表の配列番号1~81のいずれかの配列と
1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000 (またはその誘導可能な範囲)連続するアミノ酸またはヌクレオチドであって、配列番号:1~81のそれぞれ、少なくとも、多くとも、または正確に60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 又は 100% (またはその誘導可能な範囲)は、配列番号S:1-81のいずれか1つと類似、同一、または相同である。
配列表の配列番号1~81のいずれかの配列と
1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000 (またはその誘導可能な範囲)連続するアミノ酸またはヌクレオチドであって、配列番号:1~81のそれぞれ、少なくとも、多くとも、または正確に60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 又は 100% (またはその誘導可能な範囲)は、配列番号S:1-81のいずれか1つと類似、同一、または相同である。
ある態様では、配列番号1~49のいずれかのうち、以下の位置で始まる核酸分子またはポリペプチドであって、
1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000
そして、配列番号1~81のいずれかの配列の少なくとも、あるいは最大で、又は正確に、2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000 (またはその誘導可能な範囲)の連続するアミノ酸またはヌクレオチドを含む。
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そして、配列番号1~81のいずれかの配列の少なくとも、あるいは最大で、又は正確に、2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637, 638, 639, 640, 641, 642, 643, 644, 645, 646, 647, 648, 649, 650, 651, 652, 653, 654, 655, 656, 657, 658, 659, 660, 661, 662, 663, 664, 665, 666, 667, 668, 669, 670, 671, 672, 673, 674, 675, 676, 677, 678, 679, 680, 681, 682, 683, 684, 685, 686, 687, 688, 689, 690, 691, 692, 693, 694, 695, 696, 697, 698, 699, 700, 701, 702, 703, 704, 705, 706, 707, 708, 709, 710, 711, 712, 713, 714, 715, 716, 717, 718, 719, 720, 721, 722, 723, 724, 725, 726, 727, 728, 729, 730, 731, 732, 733, 734, 735, 736, 737, 738, 739, 740, 741, 742, 743, 744, 745, 746, 747, 748, 749, 750, 751, 752, 753, 754, 755, 756, 757, 758, 759, 760, 761, 762, 763, 764, 765, 766, 767, 768, 769, 770, 771, 772, 773, 774, 775, 776, 777, 778, 779, 780, 781, 782, 783, 784, 785, 786, 787, 788, 789, 790, 791, 792, 793, 794, 795, 796, 797, 798, 799, 800, 801, 802, 803, 804, 805, 806, 807, 808, 809, 810, 811, 812, 813, 814, 815, 816, 817, 818, 819, 820, 821, 822, 823, 824, 825, 826, 827, 828, 829, 830, 831, 832, 833, 834, 835, 836, 837, 838, 839, 840, 841, 842, 843, 844, 845, 846, 847, 848, 849, 850, 851, 852, 853, 854, 855, 856, 857, 858, 859, 860, 861, 862, 863, 864, 865, 866, 867, 868, 869, 870, 871, 872, 873, 874, 875, 876, 877, 878, 879, 880, 881, 882, 883, 884, 885, 886, 887, 888, 889, 890, 891, 892, 893, 894, 895, 896, 897, 898, 899, 900, 901, 902, 903, 904, 905, 906, 907, 908, 909, 910, 911, 912, 913, 914, 915, 916, 917, 918, 919, 920, 921, 922, 923, 924, 925, 926, 927, 928, 929, 930, 931, 932, 933, 934, 935, 936, 937, 938, 939, 940, 941, 942, 943, 944, 945, 946, 947, 948, 949, 950, 951, 952, 953, 954, 955, 956, 957, 958, 959, 960, 961, 962, 963, 964, 965, 966, 967, 968, 969, 970, 971, 972, 973, 974, 975, 976, 977, 978, 979, 980, 981, 982, 983, 984, 985, 986, 987, 988, 989, 990, 991, 992, 993, 994, 995, 996, 997, 998, 999, 又は 1000 (またはその誘導可能な範囲)の連続するアミノ酸またはヌクレオチドを含む。
様々な遺伝子のヌクレオチドならびにタンパク質、ポリペプチドおよびペプチド配列は、以前に開示されており、そして公知のコンピュータ化されたデータベースにおいて見出され得る。2つの一般的に使用されるデータベースは、National Center for Biotechnology InformationのGenbankおよびGenPeptデータベース(ワールドワイドウェブ上のncbi.nlm.nih.gov/)およびThe Universal Protein Resource(UniProt;ワールドワイドウェブ上のuniprot.org)である。これらの遺伝子のコード領域は、本明細書中に開示される技術、または当業者に公知であろう技術を用いて増幅および/または発現され得る。
本開示の組成物において、1mlあたり約0.001mg~約10mgの総ポリペプチド、ペプチド、および/またはタンパク質が存在することが企図される。組成物中のタンパク質の濃度は、約、少なくとも約、または多くとも約0.001、0.010、0.050、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0. 8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、9.5、10.0mg/ml以上(またはそこから派生する任意の範囲)。
X.本開示のキット
X.本開示のキット
本明細書中に記載されるあらゆる組成物が、キット内に含まれ得る。非限定的な例において、細胞、細胞を生成するための試薬、ベクター、ならびにベクターおよび/またはその構成要素を生成するための試薬がキット内に含まれ得る。特定の実施形態において、NK細胞がキットに含まれてもよく、これは、HLA-G標的化受容体、任意選択のサイトカイン、または任意選択の自殺遺伝子を発現してもしなくてもよい。そのようなキットは、細胞の操作のための1つ以上の試薬を有していても有していなくてもよい。そのような試薬として、例えば、小分子、タンパク質、核酸、抗体、バッファ、プライマー、ヌクレオチド、塩、および/またはそれらの組合せが挙げられる。1つ以上のHLA-G標的化CAR、自殺遺伝子産物、および/またはサイトカインをコードするヌクレオチドがキット内に含まれ得る。サイトカイン、またはモノクローナル抗体が挙げられる抗体等のタンパク質がキット内に含まれ得る。操作されたCAR受容体の構成要素をコードするヌクレオチドが、当該構成要素を生成するための試薬を含めて、キット内に含められ得る。
特定の態様において、キットは、本開示のNK細胞療法および別の癌治療も含む。場合によっては、キットは、細胞療法の実施形態に加えて、例えば、化学療法、ホルモン療法、および/または免疫療法等の第2の癌治療も含む。キットは、個体の特定の癌に合わせて調整され得、かつ個体に対するそれぞれの第2の癌治療を含み得る。
キットは、本開示の適切に等分された組成物を含み得る。キットの構成要素は、水性媒体または凍結乾燥形態のいずれかでパッケージされ得る。キットの容器手段として、一般に、その中に構成要素が配置され得、好ましくは適切に等分され得る、少なくとも1つのバイアル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジ、または他の容器手段が挙げられる。キット内に複数の構成要素が存在する場合、キットはまた、一般に、追加の構成要素が別々に配置され得る第2、第3、または他の追加の容器を含有し得る。しかしながら、構成要素の種々の組合せがバイアル内に含まれ得る。本発明のキットはまた、典型的には、組成物および他のあらゆる試薬容器を商業的販売のために密閉して収容するための手段を含む。そのような容器として、所望のバイアルが保持される射出またはブロー成形プラスチック容器が挙げられ得る。
XI.実施例
以下の実施例は、本発明の特定の実施形態を実証するために含まれる。以下の実施例に開示される技術は、本発明者らによって発見された技術が、本発明の実施において十分に機能することを表すので、その実施のための特定の様式を構成すると考えることができることが当業者によって理解されるべきである。しかしながら、当業者であれば、本開示に照らして、開示される特定の実施形態において多くの変更を行うことができ、そして本発明の精神および範囲から逸脱することなく同様な、または類似の結果を依然として得ることができることを理解すべきである。
実施例1
HLA-G標的化キメラ抗原受容体
以下の実施例は、本発明の特定の実施形態を実証するために含まれる。以下の実施例に開示される技術は、本発明者らによって発見された技術が、本発明の実施において十分に機能することを表すので、その実施のための特定の様式を構成すると考えることができることが当業者によって理解されるべきである。しかしながら、当業者であれば、本開示に照らして、開示される特定の実施形態において多くの変更を行うことができ、そして本発明の精神および範囲から逸脱することなく同様な、または類似の結果を依然として得ることができることを理解すべきである。
実施例1
HLA-G標的化キメラ抗原受容体
サイトカインIL-15の生成に加えて、HLA-G標的化キメラ抗原受容体(CAR)の生成用の発現構築物を作製した。発現構築物は、以下の通りであった。
臍帯血由来ナチュラルキラー(CB-NK)細胞に、異なる構築物を形質導入して、CAR発現を確認した(図2)。CARの活性を、HLA-G陽性AML細胞株OCI-AML13に対して試験した。TNFα、IFNγ、およびCD107aの細胞内サイトカイン染色(図3)および51Cr放出アッセイ(図4)によって、活性を確認した。
図5において、HEK293T細胞に、ヒトHLA-Gに対するMEM-G/11クローンおよび87Gクローンモノクローナル抗体にそれぞれ由来する2つのHLA-G CAR構築物、MG構築物およびGG構築物を形質移入した。Alexa-Fluor 647親和性精製F(ab’)2断片ヤギ抗ヒトIgG(H+L)抗体で染色すると、双方の構築物が、HEK293T膜上での陽性発現を示した。臍帯血由来のNK細胞に、HLA-G CAR構築物(MG)を形質導入した(2つの実験-MG1およびMG22)か、または形質導入しなかった(NT)。ウイルス形質導入効率を、Alexa-Fluor647親和性精製F(ab’)2断片ヤギ抗ヒトIgG(H+L)抗体によるIgGヒンジ部分の染色を介してチェックした。双方とも、NTと比較して、陽性染色を示した(図6)。図7において、HLA-G CAR NK細胞および非形質導入(NT)NK細胞を、OCI-AML3細胞と1:1(E:T)の比で22時間共培養して、Incucyteシステムにより画像化した。図7は、経時的な腫瘍標的の平均蛍光強度の減少を表すグラフを提供する。一番上の線は、形質導入されていない細胞である;MG1の線は、期間の終わりの一番下の線である。HLA-G CAR NK細胞は、NT-NK細胞と比較して、より効率的に死滅させる。図8Aおよび図8Bにおいて、HLA-G CAR(MGクローン)発現NK細胞および非形質導入(NT)NK細胞を、GSC20スフェロイドと4:1(E:T)の比で73時間共培養して、Incucyteシステムにより画像化した。図8Aは、NT-NK細胞と比較して、HLA-G CARを形質導入したCB-NK細胞(MG1およびMG2-2リピート)と共培養したmCherryを経時的に発現するGSC20スフェロイドの平均蛍光強度の減少を表すグラフを提供する。CB31 NT(4:1)の線は、一番上の線である。図8Bは、NT-NKおよびHLA-G CAR構築物と共培養したGSC20スフェロイドの代表的な画像を提供する。HLA-G CAR構築物(MG)発現NK細胞および非形質導入(NT)NK細胞を、OCI-AML3細胞またはGSC-20細胞と1:1および2:1(E:T)の比で4時間共培養して、CD56、CD3、およびTNF-αについて染色した。MG構築物を有する細胞は、NTと比較して、TNF-αの有意な分泌を示す。
本明細書中で開示かつ特許請求される方法は全て、本開示に照らして、過度の実験をすることなく構成かつ実行することができる。本発明の組成物および方法を、好ましい実施形態に関して説明してきたが、本発明の概念、精神、および範囲から逸脱することなく、本明細書中に記載される方法、および方法の工程または工程の順序に変形を加えることは、当業者に明らかであろう。より詳細には、化学的にも生理学的にも関連する特定の剤を、本明細書中に記載される剤に置き換えてもよいが、同じまたは同様の結果が達成されることは明らかであろう。当業者に明らかな、そのような全ての類似の置換および修正は、添付の特許請求の範囲によって定義される本発明の精神、範囲、および概念にあると見なされる。
Claims (110)
- 抗HLA-Gキメラ抗原受容体(CAR)をコードするポリヌクレオチドであって、前記CARは、
(a)HLA-G特異的抗体のKIR2DL4細胞外ドメインまたは抗HLA-G抗原結合領域、
(b)膜貫通ドメイン、および
(c)KIR2DL4細胞内ドメインではない細胞内ドメイン
を含む、ポリヌクレオチド。 - 前記CARは、前記KIR2DL4細胞外ドメインを含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記KIR2DL4細胞外ドメインは配列番号9を含む、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記KIR2DL4細胞外ドメインは、配列番号7によってコードされる、請求項2または3に記載のポリヌクレオチド。
- 前記KIR2DL4細胞外ドメインは配列番号10を含む、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記KIR2DL4細胞外ドメインは、コドン最適化KIR2DL4細胞外ドメインである、請求項2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記KIR2DL4細胞外ドメインは、配列番号8によってコードされる、請求項6に記載のポリヌクレオチド。
- 前記CARは、HLA-G特異的抗体の前記抗HLA-G抗原結合領域を含む、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- HLA-G特異的抗体の前記抗HLA-G抗原結合領域は、G233、26-2H11、MEM-G/1、MEM-G/9、MEM-G/11、MEM-G/13、1B8、5E6H7、1-2C3、16G1、5A6G7、87G、および3C/G4からなる群から選択される抗体クローン由来のscFvを含む、請求項1または8に記載のポリヌクレオチド。
- HLA-G特異的抗体の前記抗HLA-G抗原結合領域は、MEM-G/11または87G由来のscFvを含む、請求項1、8、または9に記載のポリヌクレオチド。
- 前記CARは、配列番号55、61、67、および73のうちの1つ以上を含む配列によってコードされる、請求項1~10のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記CARは、配列番号50~54、56~60、62~66、および68~72のうちの1つ以上を含む配列を含む、請求項1~10のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号74、76、78、または80のうちの1つ以上の配列を含む発現構築物としてさらに定義される、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号75、77、79、または81のうちの1つ以上の配列をコードする発現構築物としてさらに定義される、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは、CD28、T細胞受容体のアルファ鎖、T細胞受容体のベータ鎖、T細胞受容体のゼータ鎖、CD3ゼータ、CD3イプシロン、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、ICOS/CD278、GITR/CD357、NKG2D、DAP10、DAP12、または任意の阻害性もしくは活性化KIR由来の膜貫通ドメインである、請求項1~14のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは、CD28膜貫通ドメインである、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは配列番号12を含む、請求項16に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは、配列番号11によってコードされる、請求項15または16に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは、CD8膜貫通ドメインである、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは配列番号14を含む、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- 前記膜貫通ドメインは、配列番号13によってコードされる、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは、CD3ゼータ、CD27、CD28、4-1BB、DAP12、NKG2D、OX-40(CD134)、DAP10、CD40L、2B4、DNAM、CS1、CD48、NKp30、NKp44、NKp46、またはNKp80由来の細胞内ドメインである、請求項1~21のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメインである、請求項22に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは配列番号16を含む、請求項23に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは、配列番号15によってコードされる、請求項23または24に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは配列番号18を含む、請求項23に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは、配列番号17によってコードされる、請求項26に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは、CD28細胞内ドメインである、請求項22に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは配列番号24を含む、請求項28に記載のポリヌクレオチド。
- 前記細胞内ドメインは、配列番号23によってコードされる、請求項28または29に記載のポリヌクレオチド。
- 前記CARは、2つ以上の細胞内ドメインを含む、請求項1~30のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記2つ以上の細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメイン、ならびにCD28、DAP10、DAP12、4-1BB、NKG2D、および2B4細胞内ドメインから選択される追加の細胞内ドメインを含む、請求項31に記載のポリヌクレオチド。
- 前記2つ以上の細胞内ドメインは、CD3ゼータ細胞内ドメインおよびCD28細胞内ドメインを含む、請求項31または32に記載のポリヌクレオチド。
- シグナルペプチドをさらに含む、請求項1~33のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記シグナルペプチドは、CD8、CD27、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体(GMSCF-R)、Ig重鎖、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)CD3、またはCD4由来のシグナルペプチドである、請求項34に記載のポリヌクレオチド。
- 前記シグナルペプチドはCD8シグナルペプチドである、請求項35に記載のポリヌクレオチド。
- 前記シグナルペプチドは配列番号6を含む、請求項36に記載のポリヌクレオチド。
- 前記シグナルペプチドは、配列番号5によってコードされる、請求項36または37に記載のポリヌクレオチド。
- 前記CARは、
(a)CD8シグナルペプチド、KIR2DL4細胞外ドメイン、CD28膜貫通ドメイン、およびCD3ゼータ細胞内ドメイン;または
(b)CD8シグナルペプチド、コドン最適化KIR2DL4細胞外ドメイン、CD8膜貫通ドメイン、およびCD3ゼータ細胞内ドメイン
を含む、請求項1~38のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。 - 目的の追加のポリペプチドをさらにコードする、請求項1~39のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 目的の前記追加のポリペプチドをコードする配列、および前記CARをコードする配列は、2A要素によって前記ポリヌクレオチド上で分離されている、請求項40に記載のポリヌクレオチド。
- 前記2A要素はE2A要素である、請求項41に記載のポリヌクレオチド。
- 前記E2A要素は配列番号20を含む、請求項42に記載のポリヌクレオチド。
- 前記E2A要素は、配列番号19によってコードされる、請求項42または43に記載のポリヌクレオチド。
- 目的の前記追加のポリペプチドは、治療用タンパク質、または細胞の活性、拡大、および/もしくは持続性を増強するタンパク質である、請求項40~44のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 目的の前記追加のポリペプチドは、増殖、拡大、および/または代謝適応度を増強する自殺遺伝子、サイトカイン、またはヒトもしくはウイルスタンパク質である、請求項40~45のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 目的の前記追加のポリペプチドはサイトカインである、請求項40~46のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記サイトカインは、IL-15、IL-2、IL-12、IL-18、IL-21、IL-23、またはIL-7である、請求項47に記載のポリヌクレオチド。
- 前記サイトカインはIL-15である、請求項48に記載のポリヌクレオチド。
- 前記サイトカインは配列番号22を含む、請求項49に記載のポリヌクレオチド。
- 前記サイトカインは、配列番号21によってコードされる、請求項49または50に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号2と少なくとも95%の配列同一性を有する配列をコードする、請求項1~51のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号2のポリペプチドをコードする、請求項52に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号1と少なくとも95%の配列同一性を有する配列を含む、請求項52または53に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号1を含む、請求項54に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号4と少なくとも95%の配列同一性を有する配列をコードする、請求項1~55のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号4をコードする、請求項56に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号3と少なくとも95%の配列同一性を有する配列を含む、請求項56または57に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号3を含む、請求項58に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1~59のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- ウイルスベクターである、請求項60に記載のベクター。
- 前記ウイルスベクターは、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レンチウイルスベクター、またはレトロウイルスベクターである、請求項61に記載のベクター。
- 非ウイルスベクターである、請求項60に記載のベクター。
- 前記非ウイルスベクターはプラスミドである、請求項63に記載のベクター。
- 請求項1~52のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドまたは請求項60~64のいずれか一項に記載のベクターを含む免疫細胞。
- 前記免疫細胞は、ナチュラルキラー(NK)細胞、T細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、インバリアントNKT(iNKT)細胞、B細胞、マクロファージ、間葉系間質細胞、または樹状細胞である、請求項65に記載の免疫細胞。
- NK細胞である、請求項66に記載の免疫細胞。
- 前記NK細胞は、臍帯血、末梢血、人工多能性幹細胞、造血幹細胞、骨髄、または細胞株に由来する、請求項67に記載の免疫細胞。
- 前記NK細胞は細胞株に由来し、前記NK細胞株はNK-92である、請求項68に記載の免疫細胞。
- 前記NK細胞は、臍帯血単核細胞に由来する、請求項68に記載の免疫細胞。
- 前記NK細胞はCD56+NK細胞である、請求項67~70のいずれか一項に記載の免疫細胞。
- 前記NK細胞は組換えサイトカインを発現する、請求項67~71のいずれか一項に記載の免疫細胞。
- 前記サイトカインは、IL-15、IL-2、IL-12、IL-18、IL-21、IL-7、またはIL-23である、請求項72に記載の免疫細胞。
- 前記サイトカインはIL-15である、請求項73に記載の免疫細胞。
- 前記免疫細胞内での1つ以上の内因性遺伝子の発現が修飾されている、請求項65~74のいずれか一項に記載の免疫細胞。
- 前記1つ以上の遺伝子は、NKG2A、SIGLEC-7、LAG3、TIM3、CISH、FOXO1、TGFBR2、TIGIT、CD96、ADORA2、NR3C1、PD1、PDL-1、PDL-2、CD47、SIRPA、SHIP1、ADAM17、RPS6、4EBP1、CD25、CD40、IL21R、ICAM1、CD95、CD80、CD86、IL10R、CD5、CD7、CTLA-4、TDAG8、CD38、またはそれらの組合せを含む、請求項75に記載の免疫細胞。
- 請求項65~76のいずれか一項に記載の免疫細胞を含む免疫細胞の集団。
- 個体においてHLA-G陽性細胞を死滅させる方法であって、請求項1~59のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを有する有効量の細胞を前記個体に投与することを含む、方法。
- 前記ポリヌクレオチドを有する前記細胞は免疫細胞である、請求項78に記載の方法。
- 前記免疫細胞は、NK細胞、T細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、インバリアントNKT(iNKT)細胞、B細胞、マクロファージ、樹状細胞、またはそれらの混合物である、請求項79に記載の方法。
- 前記免疫細胞はNK細胞を含み、前記NK細胞は、臍帯血、末梢血、人工多能性幹細胞、造血幹細胞、骨髄、細胞株、またはそれらの混合物に由来する、請求項80に記載の方法。
- 前記NK細胞は、臍帯血単核細胞に由来する、請求項81に記載の方法。
- 前記免疫細胞は、前記個体に対して同種異系である、請求項79~82のいずれか一項に記載の方法。
- 前記免疫細胞は、前記個体に対して自己由来である、請求項79~82のいずれか一項に記載の方法。
- 前記個体はヒトである、請求項78~84のいずれか一項に記載の方法。
- 前記個体は癌を有する、請求項78~85のいずれか一項に記載の方法。
- 前記個体は、乳癌、急性骨髄性白血病、多発性骨髄腫、または膠芽腫を有する、請求項86に記載の方法。
- 前記ポリヌクレオチドを有する前記細胞を、前記個体に1回以上投与する、請求項78~87のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリヌクレオチドを有する前記細胞の、前記個体への投与間の期間は、1~24時間、1~7日、1~4週、1~12ヶ月、または1年以上である、請求項88に記載の方法。
- 前記個体に有効量の追加の療法を施す工程をさらに含む、請求項78~89のいずれか一項に記載の方法。
- 前記追加の療法は、外科手術、放射線、遺伝子療法、免疫療法、またはホルモン療法を含む、請求項90に記載の方法。
- 前記ポリヌクレオチドを有する前記細胞は、注射によって、静脈内、動脈内、腹腔内、気管内、腫瘍内、筋肉内、内視鏡的、病変内、頭蓋内、経皮的、皮下、局所的に、灌流によって、腫瘍微小環境内に、またはそれらを組み合わせて前記個体に投与される、請求項78~91のいずれか一項に記載の方法。
- 前記個体においてHLA-G陽性癌を特定することをさらに含む、請求項78~92のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリヌクレオチドを有する前記細胞を生成することをさらに含む、請求項78~93のいずれか一項に記載の方法。
- 物質の組成物として、配列番号1、配列番号3、配列番号74、配列番号76、配列番号78、または配列番号80を含むポリヌクレオチド。
- 物質の組成物として、配列番号2、配列番号4、配列番号75、配列番号77、配列番号79、または配列番号81を含むポリペプチド。
- 抗体部分が、配列番号55、配列番号61、配列番号67、または配列番号73によってコードされる、抗体-薬物コンジュゲート。
- 抗体部分が、配列番号50~54、56~60、62~66、および68~72のうちの1つ以上を含む配列を含む、抗体-薬物コンジュゲート。
- 前記抗体は、毒素、化学療法薬、放射性核種、小分子、および/またはリシンA鎖にコンジュゲートされている、請求項97または98に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
- 前記毒素は、コレラ毒素および/または百日咳毒素である、請求項99に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
- HLA-G特異的抗体を含む二重特異性または多重特異性抗体。
- 前記HLA-G特異的抗体の抗HLA-G抗原結合領域が、G233、26-2H11、MEM-G/1、MEM-G/9、MEM-G/11、MEM-G/13、1B8、5E6H7、1-2C3、16G1、5A6G7、87G、および3C/G4からなる群から選択される抗体クローン由来のscFvを含む、請求項101に記載の抗体。
- 前記HLA-G特異的抗体の一部または全部が、配列番号55、61、67、もしくは73によってコードされるか、または配列番号55、61、67、もしくは73と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99%、もしくはそれを超えて同一である配列である、請求項101または102に記載の抗体。
- 前記HLA-G特異的抗体は、配列番号50~54、56~60、62~66、もしくは68~72、または配列番号50~54、56~60、62~66、もしくは68~72と少なくとも70、75、80、85、90、95、96、97、98、99%、もしくはそれを超えて同一である配列を含む、請求項101~103のいずれか一項に記載の抗体。
- CD3特異的抗体を含む、請求項101~104のいずれか一項に記載の抗体。
- 請求項97~100のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲートを含み、かつ/または請求項101~105のいずれか一項に記載の抗体を含む細胞。
- 前記細胞は免疫エフェクタ細胞である、請求項106に記載の複数の細胞。
- 前記免疫エフェクタ細胞は、NK細胞、NK T細胞、インバリアントNKT細胞、ガンマデルタT細胞、アルファベータT細胞、制御性T細胞、B細胞、マクロファージ、間葉系間質細胞(MSC)、樹状細胞、またはそれらの混合物である、請求項107に記載の複数。
- 薬学的に許容される賦形剤に含まれる、請求項107または108に記載の複数。
- 個体において癌を処置または予防する方法であって、請求項107~109のいずれか一項に記載の細胞の有効量を前記個体に送達する工程を含む方法。
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