JP2024516575A - 最適化されたtlr7リガンド及びその使用 - Google Patents

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Abstract

本開示は、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物、並びにそのような免疫調節組成物のin vitro及び治療的使用に関する。【選択図】図8

Description

関連出願の相互参照
[0001]本出願は、2021年4月16日に出願された米国仮出願第63/176,128号の利益を主張し、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ASCIIテキストファイルでの配列表の提出
[0002]ASCIIテキストファイルでの以下の提出内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる:コンピュータ可読形態(computer readable form:CRF)の配列表(ファイル名:146392053240SEQLIST.TXT、記録日:2022年4月215日、サイズ:28,786バイト)。
技術分野
[0003]本開示は、免疫調節組成物及びその使用に関する。
[0004]自然免疫系の核酸受容体は、ウイルス感染からヒト宿主を守る重要なセンチネルである。サイトゾルとエンドソームは、ウイルスRNAの感知において主要な役割を果たす細胞の2つの主要なコンパートメントである。サイトゾルでは、RIG-I様受容体はほとんどすべての細胞型で発現しており、複製副産物として生成される二本鎖RNAを感知する。エンドソームでは、TLR7やTLR8などのToll様受容体(TLR)が、主に抗原提示細胞(形質細胞様樹状細胞(pDC)、通常型樹状細胞(cDC)、骨髄系細胞、B細胞)と呼ばれる特殊な免疫細胞型によって発現され、一本鎖RNA(ssRNA)の分解産物を検出する。このようなRNA分解産物は、ウイルス、ウイルス感染細胞、壊死細胞、がん性組織、RNA含有抗体複合体、又は化学合成若しくはin vitro転写されたRNAのリポソーム製剤の食作用に由来し得る。
[0005]自然免疫細胞上のTLR7やTLR8などのToll様受容体の活性化は、炎症を誘発し、適応免疫応答を開始するために重要である。TLR7活性化のためのRNA分解に関与する酵素についてはほとんど知られていないが、TLR8活性化にはエンドソームRNase T2及びRNase 2が必要である。
[0006]TLR7とTLR8の発現パターンは異なる。TLR7はマウスとヒトの両方で発現し機能しているが、TLR8はヒトとマウスの両方で発現しているものの、ヒト細胞でのみ機能している。TLR7は、マウスでは骨髄系細胞を含むすべての抗原提示細胞によって発現されるが、ヒトではその発現はpDCとB細胞に限定されている。対照的に、TLR8はヒトではcDC、単球及びマクロファージを含む骨髄系細胞に発現している。
[0007]発現パターンの違いに加えて、TLR7及びTLR8は、活性化時に異なるサイトカインプロファイルを誘導する。ヒト単球又はcDC上のTLR8の刺激は、NF-κB依存的にTNFαやIL-6などの広範囲の炎症性サイトカインの活性化を引き起こす。一方、TLR7を介したヒトpDCの刺激は、限られたNF-κB依存性炎症性サイトカイン及び大量のIFNαなどのI型IFNを誘導する。
[0008]I型IFNは、抗ウイルス免疫、適応免疫の促進、及び抗腫瘍免疫における役割を持つ重要なサイトカインファミリーである。特に、抗腫瘍免疫におけるI型IFNの役割は、cDCの活性化によって達成され、その結果、IL-12分泌、抗原提示の増加、及び抗原特異的CD8 T細胞応答の増強が生じる。さらに、TLR7アゴニストは、マウスの免疫抑制腫瘍環境においてcDCを活性化してT細胞プライミングを開始及び増加させることにより、PD-L1標的療法などのがん免疫療法と相乗作用することが示されている。
[0009]TLR7の活性化によって誘導される特有のサイトカインプロファイル、及びTLR8と比較してヒト(つまり、pDC及びB細胞)におけるTLR7の限定的な発現は、TLR7選択的リガンドが、RNAベースの治療薬を含むデュアルTLR7/8アゴニストに関連している毒性の一部を回避し得ることを示唆している。しかし、複数のTLR8選択的リガンドが報告されている一方で、治療用のTLR7選択的RNAリガンドは非常に稀である。
[0010]したがって、当技術分野では、TLR7を選択的に活性化する増強された能力を有するRNAリガンドが必要とされている。
[0011]特許出願及び公報を含む本明細書で引用されるすべての参考文献は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
[0012]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)式II:C -U -U (式II)(式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、U、U、U、及びUはウリジンヌクレオシドであり、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、「」はホスホロチオエート結合を表し、「-」はホスホジエステル結合を表す)を含むTLR7選択的モチーフ;(b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び(c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのU及びUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのU及びUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾(mU)を有し、TLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾(fU)を有し、TLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号44のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号45のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号46のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号47のヌクレオチド配列を含む。
[0013]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここでRNAリガンドは、(a)配列番号44、45、46、又は47から選択されるヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフ、(b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列、及び(c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。
[0014]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホロチオエート結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第1のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホロチオエート結合によって連結された8つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列CG(配列番号58)、又は配列番号58に対して少なくとも約85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、ここで、「」はホスホロチオエート結合を表し、第1のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。
[0015]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホロチオエート結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第2のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホロチオエート結合によって連結された2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列CC(配列番号59)を含み、ここで、「」はホスホロチオエート結合を表し、第2のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。
[0016]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号12のヌクレオチド配列、又は配列番号12に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号44のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号13のヌクレオチド配列、又は配列番号13に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号45のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号14のヌクレオチド配列、又は配列番号14に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号46のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号15のヌクレオチド配列、又は配列番号15に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号47のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0017]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)配列番号12、13、14、又は15から選択されるヌクレオチド配列;(b)配列番号12に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号44のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;(c)配列番号13に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号45のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;(d)配列番号14に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号46のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は(e)配列番号15に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号47のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0018]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)式III:C-U-C(式III)(式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、Uはウリジンヌクレオシドであり、Cは2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、「-」はホスホジエステル結合を表す)を含むTLR7選択的モチーフ;(b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;並びに(c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのCは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのCは、2’O-メチル修飾(mC)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号42のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号43のヌクレオチド配列を含む。
[0019]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここでRNAリガンドは、(a)配列番号42又は43のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフ、(b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列、及び(c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。
[0020]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、G:Uウォブル塩基対を含む。
[0021]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は3つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はヌクレオチド配列C-G-G(配列番号60)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0022]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、ここで第2のヌクレオチド配列はヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含み、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)はTLR7選択的モチーフと塩基対形成することができ、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は約15個のヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、(a)ヌクレオチド配列G-G-C-A-G-A-A-G-C-C-G-G-G-C-C(配列番号61)、又は(b)配列番号61に対して少なくとも約85%の同一性を有し、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列を含み、ここでヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができ、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0023]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、(a)配列番号23のヌクレオチド配列、又は(b)配列番号23に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号42のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、(a)配列番号24のヌクレオチド配列、又は(b)配列番号24に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号43のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列を含む。
[0024]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)配列番号23又は24のヌクレオチド配列;(b)配列番号23に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号42のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列;又は(c)配列番号24に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号43のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列を含む。
[0025]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)式IV:C-U-U-C(式IV)(式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、「-」はホスホジエステル結合を表す)を含む第1及び第2のTLR7選択的モチーフ;(b)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;並びに(c)第1のTLR7選択的モチーフの3’末端及び第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号36のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフは、配列番号36のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号37のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフは、配列番号37のヌクレオチド配列を含む。
[0026]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここでRNAリガンドは、(a)配列番号36又は37のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ;(b)配列番号36又は37のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフ;(c)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;並びに(d)第1のTLR7選択的モチーフの3’末端及び第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。
[0027]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は第2のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列及び/又は第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって連結された5つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列及び/又は第2のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列C-A-G-A-C(配列番号67)、又は配列番号67に対して少なくとも約85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0028]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号33のヌクレオチド配列、又は配列番号33に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号36の第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は配列番号36の第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号34のヌクレオチド配列、又は配列番号34に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号37の第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は配列番号37の第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0029]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)配列番号33又は34のヌクレオチド配列、(b)配列番号33に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号36の第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は(c)配列番号34に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号37の第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0030]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)式V:U-U-C(式V)(式中、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、Cはシチジンヌクレオシドであり、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、「-」はホスホジエステル結合を表す)を含む第1のTLR7選択的モチーフ及び1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ;並びに(b)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフは、式Vを含む1つ、2つ、3つ、4つ、5つ又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフは、式Vを含む5つの追加のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つのU、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾を有する。いくつかの実施態様では、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つのU、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてのUは、2’-フルオロ修飾を有する。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号40のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてが、配列番号40のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号41のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてが、配列番号41のヌクレオチド配列を含む。
[0031]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ;(b)1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフであって、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてが、配列番号40のヌクレオチド配列を含む、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ;及び(c)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフは、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む1つ、2つ、3つ、4つ、5つ又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフは、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む5つの追加のTLR7選択的モチーフを含む。
[0032]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって連結された2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって連結された2つのシチジンヌクレオシドを含む。
[0033]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号29のヌクレオチド配列、又は配列番号29に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号40の第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号40の5つの追加のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号30のヌクレオチド配列、又は配列番号30に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号41の第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号41の5つの追加のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0034]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)配列番号29又は30のヌクレオチド配列;(b)配列番号29に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号40の6つのTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は(c)配列番号30に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号41の6つのTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0035]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)式VI:C-U-U -U (式VI)(式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、U、U、U、及びUはウリジンヌクレオシドであり、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、「」はホスホロチオエート結合を表し、「-」はホスホジエステル結合を表す)を含むTLR7選択的モチーフ;(b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び(c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのU及びUは、2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのU及びUは、2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾(mU)を有し、TLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾(fU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾(fU)を有し、TLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾(mU)を有する。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号48のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号49のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号50のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号51のヌクレオチド配列を含む。
[0036]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここでRNAリガンドは、(a)配列番号48、49、50、又は51から選択されるヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフ;(b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び(c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。
[0037]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって連結された8つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列C-C-G-A-G-C-C-G(配列番号68)、又は配列番号68に対して少なくとも約85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、ここで、「-」はホスホジエステル結合を表し、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。
[0038]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まず、第2のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって連結された2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって連結された2つのシチジンヌクレオシドを含む。
[0039]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号17のヌクレオチド配列、又は配列番号17に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号48のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号18のヌクレオチド配列、又は配列番号18に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号49のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号19のヌクレオチド配列、又は配列番号19に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号50のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号20のヌクレオチド配列、又は配列番号20に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号51のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0040]別の態様では、本明細書で提供されるのは、RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であり、ここで、RNAリガンドは、(a)配列番号17、18、19、又は20から選択されるヌクレオチド配列;(b)配列番号17に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号48のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;(c)配列番号18に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号49のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;(d)配列番号19に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号50のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は(e)配列番号20に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号51のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0041]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、薬学的に許容される担体は脂質ナノ粒子(LNP)である。いくつかの実施態様では、LNPはカチオン性脂質を含む。いくつかの実施態様では、LNPはイオン化可能な脂質を含む。
[0042]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、薬学的に許容される担体は、ポリ-L-アルギニン若しくは1,2-ジオレオイル-3-トリメチルアンモニウムプロパン(DOTAP)であるか、又はそれを含む。
[0043]前述の態様又は実施態様のいずれかと組み合わせることができるいくつかの実施態様では、免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はTLR7を発現する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は末梢血単核球(PBMC)を含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、1つ又は複数の形質細胞様樹状細胞を含む。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性を増加させる。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌を増加させる。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性の増加は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌の増加は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞におけるTLR8活性を約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満だけ増加させる。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞によるTNF-αの分泌を約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満増加させる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞内に導入される。いくつかの実施態様では、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞をさらにグアノシン又はグアノシン誘導体と接触させ、場合によってはグアノシン誘導体は2’3’環状GMPである。
[0044]別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれかのRNAリガンドを含む単離核酸である。いくつかの実施態様では、核酸は、DNA、RNA、又はDNA/RNA分子である。
[0045]別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれかのRNAリガンド、又は本明細書に記載の核酸のいずれかを含むベクターである。
[0046]別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれかを含む薬学的組成物である。
[0047]別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれかのRNAリガンド、本明細書に記載の核酸のいずれか、又は本明細書に記載のベクターのいずれかを含む宿主細胞である。
[0048]別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、又は本明細書に記載の薬学的組成物のいずれかを含むワクチン組成物である。
[0049]別の態様では、本明細書で提供されるのは、1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化するための方法であり、該方法は、1つ又は複数の細胞を、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、又は本明細書に記載の薬学的組成物のいずれかと接触させることを含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はTLR7を発現する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は末梢血単核球(PBMC)を含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、1つ又は複数の形質細胞様樹状細胞を含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞を免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞を免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性の増加は、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌の増加は、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞を免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、1つ又は複数の細胞におけるTLR8活性の約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞を免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、1つ又は複数の細胞によるTNF-αの分泌の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、方法は、1つ又は複数の細胞をグアノシン又はグアノシン誘導体と接触させることをさらに含み、場合によっては、グアノシン誘導体は2’3’環状GMPである。いくつかの実施態様では、方法は、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、イムノアッセイ、フローサイトメトリー、電気化学発光に基づく方法、質量分析法、若しくはqPCRによってIFN-α及び/若しくはTNF-αの分泌を測定すること;並びに/又はインターフェロン刺激遺伝子(ISG)の発現レベルを測定することをさらに含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞を免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触させることは、RNAリガンドを1つ又は複数の細胞に導入することを含む。
[0050]別の態様では、本明細書で提供されるのは、個体においてTLR7を選択的に活性化する方法であり、該方法は、有効量の本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、本明細書に記載の薬学的組成物のいずれか、又は本明細書に記載のワクチン組成物のいずれかを個体に投与することを含む。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、個体におけるTLR7活性の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、個体におけるIFN-αのレベルの増加をもたらす。いくつかの実施態様では、TLR7活性の増加は、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、IFN-αレベルの増加は、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、個体におけるTLR8活性の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、個体におけるTNF-αのレベルの増加をもたらす。
[0051]別の態様では、本明細書で提供されるのは、個体における免疫応答を刺激するための方法であり、該方法は、有効量の本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、本明細書に記載の薬学的組成物のいずれか、又は本明細書に記載のワクチン組成物のいずれかを個体に投与することを含む。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、個体におけるTLR7活性の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、個体におけるIFN-αのレベルの増加をもたらす。いくつかの実施態様では、TLR7活性の増加は、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、IFN-αレベルの増加は、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、個体におけるTLR8活性の増加をもたらす。いくつかの実施態様では、有効量の免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、個体におけるTNF-αのレベルの増加をもたらす。
[0052]別の態様では、本明細書で提供されるのは、個体においてTLR7を活性化するための医薬の製造における使用のためのアジュバントであり、ここで、アジュバントは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、本明細書に記載の薬学的組成物のいずれか、又は本明細書に記載のワクチン組成物のいずれかを含む。
[0053]別の態様では、本明細書で提供されるのは、個体においてTLR7を活性化するための方法における使用のためのアジュバントであり、該方法は、有効量の本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、本明細書に記載の薬学的組成物のいずれか、又は本明細書に記載のワクチン組成物のいずれかを個体に投与することを含む。
[0054]別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれか、本明細書に記載の核酸のいずれか、本明細書に記載のベクターのいずれか、本明細書に記載の薬学的組成物のいずれか、又は本明細書に記載のワクチン組成物のいずれかを含むキットである。
[0055]本明細書に記載される種々の実施態様の特性の1つ、いくつか、又はすべてを組み合わせて、本発明の他の実施態様を形成することができることを理解されたい。本発明のこれら及び他の態様は、当業者に明らかであろう。本発明のこれら及び他の実施態様は、以下の発明を実施するための形態によってさらに説明される。
[0056]特許又は出願ファイルは、カラーで作成された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面を含む本特許又は特許出願公開のコピーは、要請及び必要な手数料の支払いに応じて特許庁から提供される。
[0057]図1A~1Bは、活性化二量体としてのカニクイザルTLR7及びヒトTLR8エンドソームロイシンリッチリピートドメインの結晶構造を、結合部位#1及び#2において例示的なリガンドとともに示す。図1Aに示すように、TLR7の結合部位#1はグアノシン(G)に結合するが、結合部位#2は少なくとも2つのヌクレオチド、好ましくはピリミジンが隣接するウリジン(U)に結合する。図1Bに示すように、TLR8の結合部位#1はウリジン(U)に結合するのに対し、結合部位#2はUG二量体に結合し、UA若しくはUU二量体、あるいは潜在的にCG二量体によって占有されることもある。アスタリスクは、TLR7又はTLR8ホモ二量体の第2のサブユニットを示す。Miyake et al.,International Immunology(2018)30(2):43-51を参照。また、Zhang et al.,Immunity(2016)45:737;及びTanji et al.,Nature Structural&Molecular Biology(2015)22:109-115を参照。 図1A~1Bは、活性化二量体としてのカニクイザルTLR7及びヒトTLR8エンドソームロイシンリッチリピートドメインの結晶構造を、結合部位#1及び#2において例示的なリガンドとともに示す。図1Aに示すように、TLR7の結合部位#1はグアノシン(G)に結合するが、結合部位#2は少なくとも2つのヌクレオチド、好ましくはピリミジンが隣接するウリジン(U)に結合する。図1Bに示すように、TLR8の結合部位#1はウリジン(U)に結合するのに対し、結合部位#2はUG二量体に結合し、UA若しくはUU二量体、あるいは潜在的にCG二量体によって占有されることもある。アスタリスクは、TLR7又はTLR8ホモ二量体の第2のサブユニットを示す。Miyake et al.,International Immunology(2018)30(2):43-51を参照。また、Zhang et al.,Immunity(2016)45:737;及びTanji et al.,Nature Structural&Molecular Biology(2015)22:109-115を参照。 [0058]図2は、RNase酵素によって触媒される反応を示す。RNaseは3’リン(上部)での求核攻撃を触媒し、5’OHを持つ3’ヌクレオチドの放出を引き起こす。3’末端は2’3’シクロホスフェートによって特徴づけられる。 [0059]図3は、2’-O-メチル、2’-フルオロ、2’-デオキシ、2’-アミノ、2’-メトキシエトキシ、及びホスホロチオエート(pto)修飾の化学構造を示す。1’位の「U」又は「N」は、考えられるあらゆる核酸塩基を表す。 [0060]図4は、ヌクレオチド配列C-G-G-C-U-C-G-G-C-A-G-A-A-G-C-C-G-G-G-C-C(配列番号2;「-」はホスホジエステル結合を表す)を有するORN7023(国際公開第2010/105819号に由来)がとる二次構造を示す。ORN7023は、ボックスで示されるG:Uウォブル塩基対を含む、短い標準RNAヘアピンを形成する。ORN7023の二次構造は、RNAフォールドを使用して得られた(例えば、Gruber et al.,Nucleic Acids Research(2008)36:2s:W70-W74;Lorenz et al.,Algorithms for Molecular Biology(2011)6:1:26;及びrna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgiを参照)。 [0061]図5は、TLR7二量体内のTLR7の結合部位#2を示す。U3三量体は結合部位#2内で結合する。U1、U2、及びU3は5’から3’方向のヌクレオチドを表す。黒の三角形は、3つのヌクレオチド(U1、U2、及びU3)の2’OH部分を標識する。各TLR7サブユニットは、水色又はピンク色の陰影で示される。アスタリスクは、TLR7ホモ二量体の第2のサブユニットを示す。Zhang et al.,Cell Reports(2018)25:3371-3381を参照。 [0062]図6は、末梢血単核球(PBMC)による核酸受容体の発現及びサイトカイン分泌を示す。PBMCの主な細胞型を図6の上部に示す(cDC=従来の樹状細胞;pDC=形質細胞様樹状細胞;NK=ナチュラルキラー)。pDC及び単球によって発現されるサイトカイン誘導核酸受容体を図6の下部に示す。 [0063]図7は、実施例1に記載のRNAリガンドに応答したPBMCによるTNF-α又はIFN-α分泌のレベルを測定した実験の結果を示す。ヒトPBMCは、ポリ-L-アルギニン(p-L-アルギニン)複合体化RNAリガンド(x軸に表示)を単独で、又はグアノシンと組み合わせて刺激された(凡例で示されているように、「noG」はPBMCがp-L-アルギニン複合体化RNAリガンドのみで刺激されたことを示し、「G」はPBMCがp-L-アルギニン複合体化RNAリガンド及びグアノシンで共刺激されたことを示す)。Y軸(pg/ml)に示すように、TNF-α及びIFN-α分泌のレベルを、RNAリガンドのp-L-アルギニン送達の16時間後に測定した。「培地」は、陰性対照(p-L-アルギニン複合体化RNAリガンド又はグアノシンのいずれかによるPBMCの刺激なし)を指す。「R848」は陽性対照であり、1μg/mlの濃度のR848、レシキモドとも呼ばれる低分子TLR7/8リガンドで刺激されたPBMCを指す。 [0064]図8は、実施例1に記載の特定のRNAリガンドに応答したPBMC又はpDC枯渇PBMCによるTNF-α及びIFN-α分泌のレベルを測定した実験の結果を示す。ヒトPBMC又はpDC枯渇PBMCは、x軸に示されているように、p-L-アルギニン複合体化RNAリガンドで刺激された。Y軸(pg/ml)に示すように、TNF-α及びIFN-α分泌のレベルを、RNAリガンドのp-L-アルギニン送達の16時間後に測定した。「培地」は、陰性対照(p-L-アルギニン複合体化RNAリガンドによるPBMCの刺激なし)を指す。9.2SRNA試料は、9.2SRNAを活性化するTLR7/8と複合体を形成したp-L-アルギニンで刺激されたヒトPBMC又はpDC枯渇PBMCである。9.2S RNAは、ヌクレオチド配列A-G-C-U-U-A-A-C-C-U-G-U-C-C-U-U-C-A-A(配列番号56;「-」はホスホジエステル結合を表す)を有する陽性対照である。「IVT4」は、ヌクレオチド配列G-G-G-A-C-G-C-U-G-A-C-C-C-A-G-A-A-G-A-U-C-A-C-U-A-G-A-A-A-U-A-G-U-A-G-A-U-C-U-U-C-U-G-G-G-U-C-A-G-C-G-U-C-C-Cを有するリポフェクタミン複合体対照で刺激されたヒトPBMC又はpDC枯渇PBMCを指す。IVT4対照はin vitro転写によって生成され、クロロキン耐性があり、RIG-Iを活性化するが、TLR7/8は活性化しない。 [0065]図9は、p-L-アルギニン(pLA)と複合体を形成した示されたRNAリガンドによって形成されたナノ粒子のサイズを特徴づける実験の結果を示す。 [0066]図10A~10Bは、DOTAPで送達された実施例1に記載の示されたRNAリガンドに応答したPBMCによるTNF-α又はIFN-α分泌のレベルを測定した実験の結果を示す。ヒトPBMCを、0.6μg/ml(図10A)又は2μg/ml(図10B)の濃度のDOTAP複合体化RNAリガンド(x軸に示す)で刺激した。Y軸(pg/ml)に示すように、TNF-α及びIFN-α分泌のレベルを、RNAリガンドのDOTAP送達の16時間後に測定した。pCA、pCA-2、及びpCA-3試料は、サイトカイン応答を誘導しない陰性対照RNAオリゴヌクレオチドである。pCA、pCA-2、及びpCA-3は、ヌクレオチド配列C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A(配列番号70)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を示す。pU2G試料は、TLR7とTLR8の両方を誘導する陽性対照RNAオリゴヌクレオチドである。pU2Gはヌクレオチド配列G-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G(配列番号71)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を示す。 図10A~10Bは、DOTAPで送達された実施例1に記載の示されたRNAリガンドに応答したPBMCによるTNF-α又はIFN-α分泌のレベルを測定した実験の結果を示す。ヒトPBMCを、0.6μg/ml(図10A)又は2μg/ml(図10B)の濃度のDOTAP複合体化RNAリガンド(x軸に示す)で刺激した。Y軸(pg/ml)に示すように、TNF-α及びIFN-α分泌のレベルを、RNAリガンドのDOTAP送達の16時間後に測定した。pCA、pCA-2、及びpCA-3試料は、サイトカイン応答を誘導しない陰性対照RNAオリゴヌクレオチドである。pCA、pCA-2、及びpCA-3は、ヌクレオチド配列C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A-C-A(配列番号70)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を示す。pU2G試料は、TLR7とTLR8の両方を誘導する陽性対照RNAオリゴヌクレオチドである。pU2Gはヌクレオチド配列G-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G-U-U-G(配列番号71)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を示す。 [0067]図11は、担体なしで送達された実施例1に記載の示されたRNAリガンド(すなわち、遊離RNAリガンド)に応答したPBMCによるTNF-α又はIFN-α分泌のレベルを測定した実験の結果を示す。ヒトPBMCは遊離RNAリガンド(x軸に表示)のみで刺激された。y軸(pg/ml)に示すように、TNF-α及びIFN-αの分泌レベルを送達後16時間に測定した。pCA及びpCA-2試料は、サイトカイン応答を誘導しない陰性対照RNAオリゴヌクレオチドである(配列番号70)。pU2G_pto試料は、TLR7とTLR8の両方を誘導する陽性対照RNAオリゴヌクレオチドである。pU2G_ptoはヌクレオチド配列GG(配列番号72)を含み、ここで「」はホスホロチオエート結合を示す。 [0068]図12は、ORN7005~7012が、p-L-アルギニン単独(「2’3’cGMPなし」)と、又はp-L-アルギニン及び2’3’環状GMP(「2’3’cGMP」)複合体とともにヒトPBMCに送達された実験の結果を示す。2’3’環状GMPの最終濃度は5μg/mlで、ORNはすべて0.6μg/mlの濃度で使用された。サイトカイン分泌は図7のように測定された。PBMCは6人のヒトドナーから得られた。示された結果は2つの独立した実験を表している。 [0069]図13は、すべての条件において、RNAリガンドが2’3’環状GMP(「2’3’cGMP」)と複合体を形成したことを除いて、図8と同様に行った実験の結果を示す。2’3’環状GMPの最終濃度は5μg/mlで、RNAリガンド(ORN7005~7012)は0.6μg/mlの濃度で使用された。ヒトPBMCは3人のドナーから得られた。示された結果は1つの実験を表している。 [0070]図14は、図8で実施した実験の結果を示すが、3人の新たなドナーから得たヒトPBMCを使用した。 [0071]図15A~15Bは、RNAse切断活性に対する2’位でのRNA修飾の影響を評価した実験の結果を示す。図15Aは、ORN7009及びORN7013に対応する未修飾配列を示し、潜在的なRNAse T2切断部位を矢印で示している。矢印のサイズは、RNase T2切断のコンセンサス配列の強度、つまり切断イベントの可能性を示す。切断部位は文献に基づいている(Ostendorf et al.,(2020)52(4):591-605)。図15Bは、RNase T2及び非修飾RNAリガンド(ORN7009及びORN7013)を含む各反応物6μl、又はRNase T2及び修飾RNAリガンド(ORN7014~7017及びORN7010~7012)を含む各反応物3μlを負荷したTBE-尿素PAGEゲルを示す。「RNAseなし」対照の場合、各RNAリガンド3μlを、RNase T2を除いた同じ反応条件で12分間インキュベートした。図15Bの上のゲルは、0.2μg/mlのRNase T2とともに3、6、9又は12分間インキュベートしたRNAリガンドORN7009~7012を示す。図15Bの下のゲルは、0.5μg/mlのRNase T2とともに3、6、9又は12分間インキュベートしたRNAリガンドORN7013~7017を示す。 図15A~15Bは、RNAse切断活性に対する2’位でのRNA修飾の影響を評価した実験の結果を示す。図15Aは、ORN7009及びORN7013に対応する未修飾配列を示し、潜在的なRNAse T2切断部位を矢印で示している。矢印のサイズは、RNase T2切断のコンセンサス配列の強度、つまり切断イベントの可能性を示す。切断部位は文献に基づいている(Ostendorf et al.,(2020)52(4):591-605)。図15Bは、RNase T2及び非修飾RNAリガンド(ORN7009及びORN7013)を含む各反応物6μl、又はRNase T2及び修飾RNAリガンド(ORN7014~7017及びORN7010~7012)を含む各反応物3μlを負荷したTBE-尿素PAGEゲルを示す。「RNAseなし」対照の場合、各RNAリガンド3μlを、RNase T2を除いた同じ反応条件で12分間インキュベートした。図15Bの上のゲルは、0.2μg/mlのRNase T2とともに3、6、9又は12分間インキュベートしたRNAリガンドORN7009~7012を示す。図15Bの下のゲルは、0.5μg/mlのRNase T2とともに3、6、9又は12分間インキュベートしたRNAリガンドORN7013~7017を示す。 [0072]図16A~16Bは、図12にプロットされたIFN-αデータを、2つの別々の実験にわたる固有のヒトPBMCドナーを示す個々のデータ点で示したものである。図16A及び図16Bは、ドナー及び実験間の再現性を示すことにより、図12に見られる任意の変動に背景を与える。 図16A~16Bは、図12にプロットされたIFN-αデータを、2つの別々の実験にわたる固有のヒトPBMCドナーを示す個々のデータ点で示したものである。図16A及び図16Bは、ドナー及び実験間の再現性を示すことにより、図12に見られる任意の変動に背景を与える。
定義
[0073]本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される、単数形「a(1つの)」、「or(又は)」、及び「the(その)」は、文脈が別途明確に指示しない限り、複数の指示対象を含む。本明細書で使用される場合、「約」は、当技術分野の当業者に容易に知られる、それぞれの値又はパラメータの通常の誤差範囲を指す。本明細書における「約」に続く値又はパラメータへの言及は、その値又はパラメータ自体を対象とする実施態様を含む(且つ説明する)。本明細書に記載される本開示の態様及び実施態様は、態様及び実施態様を「含む」、態様及び実施態様「からなる」、並びに態様及び実施態様「から本質的になる」を含むことを理解されたい。
[0074]本明細書で使用される場合、「免疫調節性」という用語は、本開示の組成物又はRNAリガンドなどの薬剤が、宿主(例えば、本明細書に記載されるような個体)の免疫系を調節する能力を指す。このような調節には、限定されないが、抗体産生(例えば、抗原特異抗体産生)の増加;T細胞、B細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、マクロファージなどの免疫系細胞の活性化又は増殖;免疫刺激性サイトカインの産生又は放出(例えば、分泌)の増加;あるいは適応性、自然免疫性、細胞性又は体液性免疫応答の直接的又は間接的な増強など、1つ又は複数の免疫応答を増加させることが含まれ得る。このような調節には、限定されないが、抗原特異抗体産生の減少;免疫抑制活性を有するリンパ球又は他の細胞集団の活性化;特定の細胞機能に対して抑制作用を有するサイトカインの合成の増加;あるいは特定の適応性、自然免疫性、細胞性又は体液性免疫応答の直接的又は間接的な減少など、1つ又は複数の免疫応答を減少させることも含まれ得る。
[0075]本明細書で使用される場合、TLR7活性に関して「選択的」、「選択性」、及び「選択的に」という用語は、本開示の免疫調節組成物又はRNAリガンドなどの薬剤が、TLR7の活性を、例えば、1つ又は複数の細胞において、別のToll様受容体、例えば、TLR8などの別の分子の活性よりも高い程度で増加させる能力を指す。したがって、本開示のTLR7選択的RNAリガンド又は免疫調節組成物は、TLR7の活性を増加させる可能性があり、また別のToll様受容体、例えばTLR8などの別の分子の活性を増加させる可能性があるが、TLR7の活性の増加は、別の分子(例えばTLR8)の活性の増加よりも大きい程度になるであろう。
[0076]本明細書で使用される場合、「RNAリガンド」は、任意の長さのヌクレオチドポリマーを指す。ヌクレオチドは、リボヌクレオチド、修飾されたリボヌクレオチド若しくは塩基、及び/若しくはそれらの類縁体であっても、又はRNAポリメラーゼによって若しくは合成反応によってポリマーに組み込まれ得る任意の基質であってもよい。ポリヌクレオチドは修飾ヌクレオチドを含んでいてもよい。存在する場合には、ヌクレオチド構造に対する修飾は、ポリマーのアセンブリの前に付与されても、又は後に付与されてもよい。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド成分によって中断され得る。
[0077]本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」とは、個体に対して無毒である、活性成分以外の組成物中の成分を指す。
[0078]本明細書で使用される場合、特定の対象配列又はその特定部分に関する「パーセント(%)同一性」とは、配列を整列させ、最大配列同一性パーセントを達成するために必要であればギャップを導入した後の、対象配列(又はその特定部分)中のヌクレオチドと同一な同定配列中のヌクレオチドの割合として定義される。
[0079]「単離された」核酸は、その天然環境の構成要素から分離された核酸分子を指す。単離された核酸には、通常は核酸分子を含む細胞に含まれる核酸分子が含まれるが、核酸分子は染色体外に、又は天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在する。
[0080]「ベクター」という用語は、本明細書で使用される場合、連結している別の核酸を輸送することができる核酸分子を指す。ベクターの1つの種類は「プラスミド」であり、これは環状二本鎖DNAを指し、これに追加のDNAセグメントがライゲーションされ得る。別の種類のベクターは、ファージベクターである。別の種類のベクターは、ウイルスベクターであり、追加のDNAセグメントがウイルスゲノムにライゲーションされ得る。ある特定のベクターは、それらが導入される宿主細胞内で自己複製することができる(例えば、細菌複製起点を有する細菌ベクター及びエピソーム哺乳類ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞への導入時に宿主細胞のゲノムに組み込まれ得、それにより、宿主ゲノムとともに複製される。さらに、特定のベクターは、それらが作動可能に連結されている遺伝子の発現を指示することができる。
[0081]「宿主細胞」という用語は、外因性核酸が導入された細胞を指し、そのような細胞の子孫も含まれる。宿主細胞には、「形質転換体」及び「形質転換細胞」が含まれ、これには初代形質転換細胞及び継代数に関係なくそれに由来する子孫が含まれる。子孫は親細胞と核酸含量が完全に同一でなくてもよく、突異を含んでいてもよい。元の形質転換細胞においてスクリーニング又は選択されたのと同じ機能又は生物学的活性を有する変異子孫が本明細書に含まれる。
[0082]「個体」は哺乳動物である。哺乳動物としては、家畜動物(例えば、ウシ、ヒツジ、ネコ、イヌ及びウマ)、霊長類(例えば、ヒト及び非ヒト霊長類、例えば、サル)、ウサギ及びげっ歯類(例えば、マウス及びラット)が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施態様では、個体はヒトである。
[0083]「有効量」は、所望の治療結果又は予防結果を達成するために必要な投薬量及び期間において少なくとも有効な量を指す。有効量は、1回以上の投与で提供され得る。本明細書における有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別、及び体重、並びに個体における所望の応答を誘発する治療の能力等の要因に応じて異なり得る。有効量は、治療上有益な作用が治療の任意の毒性作用又は有害作用を上回る量でもある。予防的使用の場合、有益な又は所望の結果としては、疾患の生化学的、組織学的、及び/又は挙動的症候、その合併症、並びに疾患の発症中に現れる中間病理学的表現型を含む、疾患のリスクの排除又は低減、疾患の重症度の軽減、又は疾患の発生の遅延等の結果が挙げられる。治療的使用の場合、有益な又は所望の結果には、疾患に起因する1つ又は複数の症状の減少、疾患に罹患している者の生活の質の向上、疾患の治療に必要な他の薬剤の用量の減少、別の薬剤の効果の増強、疾患の進行の遅延、及び/又は生存期間の延長などの臨床結果が挙げられる。薬物、化合物、又は組成物の有効量は、予防的又は治療的処置を直接又は間接的に達成する十分な量である。臨床の文脈で理解されるように、有効量の薬物、化合物、又は組成物は、別の薬物、化合物、又は薬学的組成物と併用して達成される場合もあれば、達成されない場合もある。したがって、「有効量」は、1つ又は複数の治療剤の投与との関連で考慮され得、1つ又は複数の他の薬剤と併用して望ましい結果が達成され得るか、又は達成されれば、単一の薬剤は有効量で与えられると考えられ得る。
概要
[0084]本開示の特定の態様は、TLR7を選択的に活性化するRNAリガンドを含む免疫調節組成物に関する。
TLR7選択的リガンド開発の困難さ
[0085]複数のTLR8選択的リガンドが報告されているが、TLR7選択的RNAリガンドは非常に稀である。TLR7選択的リガンドを生成するために、いくつかの手法が試みられてきた。例えば、短い二本鎖RNA(dsRNA)配列内のヘアピンやG:Uウォブル塩基対などの二次構造は、TLR7を選択的に活性化すると記載されている。しかし、TLR7選択性をもたらすメカニズムは依然として不明であり、TLR7/8認識モチーフだけでは説明できない。例えば、国際公開第2010/105819号を参照。ただし、そのような二次構造は、TLR8の活性化には不利なRNase分解パターンに有利に作用する可能性がある。しかし、出願人らは、ヘアピン構造及び/又はG:Uウォブル塩基対のみに依存するリガンドは、固定二次構造としてそのような構造を必要とし、異なる送達方法によって活性が変動する可能性があることを認識していた。
[0086]出願人らは、TLR7選択的リガンドの欠如の考えられる理由は、結合部位#1及び結合部位#2と呼ばれるTLR7及びTLR8の2つのヌクレオチド結合部位の特異性である可能性があることを認識した(図1A~1B)。理論に束縛されることを望まないが、出願人らは、本開示のTLR7選択的リガンドを設計する際にこの特性を考慮した。
[0087]結合部位#1はより重要であり、RNase分解の典型的な生成物である単量体ヌクレオシド又は潜在的に3’2’シクロホスホヌクレオシドに結合する。図1A~1Bに示すように、TLR7結合部位#1はグアノシンに結合するが(図1A)、一方、TLR8結合部位#1はウリジンに結合する(図1B)。結合部位#1は、レシキモド、ガージキモド、又はイミキモドなどのある範囲の合成低分子活性化剤によっても結合される。親和性が高いため、結合部位#1に合成低分子が結合するだけでも活性化には十分である。しかし、RNAリガンドによる完全な活性化には、結合部位#2での結合も必要である。
[0088]結合部位#2は、TLR7とTLR8では質的にも空間的にも異なっている(図1A-1B)。TLR7結合部位#2は、より長いRNAオリゴリボヌクレオチドに埋め込まれ得る2つのヌクレオチド、優先的にはピリミジンが隣接するウリジンを厳密に必要とするようである(図1A)。一方、TLR8は結合部位#2でUG二量体に結合するが、より無差別的でもあり、UA若しくはUU二量体、又は潜在的にCG二量体によって占有される可能性がある(図1B)。3’末端は3’2’環状リン酸によって定義されるが、5’末端はあまり明確に定義されておらず、三量体の一部又はさらに長いオリゴの場合もある。
[0089]したがって、TLR7選択的リガンドの生成が困難なのは、少なくとも部分的には、TLR7が活性化のためにグアノシン(結合部位#1について)とウリジン(結合部位#2について)の両方を厳密に必要とするのに対し、TLR8はウリジンのみを必要とするという事実に起因している可能性がある。したがって、U又はUA制限配列はいずれもTLR8を活性化するが、TLR7は活性化しない可能性があるが、TLR7結合部位#2にウリジンが必要であるということは、選択性のための配列のみに依存する場合、TLR7を活性化する配列はTLR8リガンドを生成する可能性を持つことを意味する。
RNA修飾を使用したTLR7選択的リガンドの開発
[0090]RNaseはRNAを切断し、TLR7及び/又はTLR8活性化のリガンドとして機能するRNA分解産物を生成する酵素である。図2に示すように、RNaseは、3’リンにおける2’酸素の求核攻撃によってヌクレオチドの3’RNA分子を切断し、その結果、5’OHを有する3’ヌクレオチドが遊離し、RNase活性のマーカーとして広く使用されている2’-3’シクロホスフェートが生成される。
[0091]特定のRNA修飾はRNaseの活性を妨げる。例えば、ホスホロチオエート修飾は、骨格のリン酸にキラリティーを導入し、RNA分解を遅らせ、TLR活性化を促進することが示されている。さらに、リボース上の2’位置の修飾により、RNA骨格からRNase活性に必要な2’OHを奪い、且つ/又はヌクレアーゼの結合をブロックする可能性がある。
[0092]出願人らは、オリゴリボヌクレオチド配列内の特定の部位に特定のRNA修飾を導入することにより、RNase活性に干渉し、TLR8を活性化するRNA分解産物の形成を防止することができる一方で、TLR7を活性化するリガンドの放出を可能にすることができることを認識した。
[0093]したがって、本開示の特定の態様は、少なくとも部分的には、TLR7選択性を増強し(例えば、実施例1を参照)、高レベルのTLR7活性をもたらし(例えば、実施例2を参照)、それによってTLR7選択的リガンドを生成する際の困難を克服する、特定の部位に特定のRNA修飾を有するRNAリガンドの発見に基づいている。
開示の組成物
[0094]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物である。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、RNAリガンド、例えば、本明細書に記載のRNAリガンドを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、1つ又は複数のRNA修飾、例えば、本明細書に記載される1つ又は複数のRNA修飾を含む、本明細書に記載のTLR7選択的モチーフなどの1つ又は複数のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、例えば本明細書に記載されるような薬学的に許容される担体などの担体をさらに含む。
RNAリガンド
[0095]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、1つ又は複数のTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり、TLR7選択的モチーフは、本明細書に記載のRNA修飾の1つ又は複数を含む。
式IのTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンド
[0096]一態様では、本明細書で提供されるのは、式Iを含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり:
N-/U(式I)、
式中、Nはリボースの2’位に修飾を含む任意のヌクレオシドであり、Uはウリジンヌクレオシドであり、「-/」はホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合を表す。
[0097]いくつかの実施態様では、Nはリボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’デオキシ修飾、又は2’メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’メトキシエトキシ修飾である。
[0098]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端、TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0099]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0100]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0101]いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列の配列は、第2のヌクレオチド配列の配列と同一である。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列の配列は、第2のヌクレオチド配列の配列とは異なる。
[0102]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Iを含む2つ以上のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Iを含む2つ以上のTLR7選択的モチーフ及び少なくとも2つの追加のヌクレオチド配列を含み、追加のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。TLR7選択的モチーフ及び少なくとも2つの追加のヌクレオチド配列は、RNAリガンド上に任意の順序で配置され得る。1つの非限定的な例では、RNAリガンドは、5’から3’方向に、第1のヌクレオチド配列、式IのTLR7選択的モチーフ、式Iの1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ(例えば、タンデムで)、第2のヌクレオチド配列、式Iの1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ(例えば、タンデムで)、及び第3のヌクレオチド配列を含み得る。いくつかの実施態様では、第1、第2、及び/又は第3のヌクレオチド配列は、少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1、第2、及び/又は第3のヌクレオチド配列は、少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1、第2、及び/又は第3のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1、第2、及び/又は第3のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1、第2、及び/又は第3のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって、隣接するTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1、第2、及び/又は第3のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。当業者であれば、式Iを含む2つ以上のTLR7選択的モチーフ及び少なくとも2つの追加のヌクレオチド配列(例えば、上記のような)を含む他のRNAリガンドに到達することができ、ここで、TLR7選択的モチーフ及び少なくとも2つの追加のヌクレオチド配列は、RNAリガンド上で任意の順序で配置される。
式IIのTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンド
[0103]一態様では、本明細書で提供されるのは、式IIを含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり:
-U -U (式II)、
式中、C及びCはシチジンヌクレオシド、U、U、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、「」はホスホロチオエート結合を表し、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0104]いくつかの実施態様では、Uはリボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0105]いくつかの実施態様では、Uはリボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0106]いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0107]いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号44のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号45のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号46のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号47のヌクレオチド配列を含む。
[0108]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端、TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0109]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は8つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号58のヌクレオチド配列、又は配列番号58に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。
[0110]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号59のヌクレオチド配列、又は配列番号59に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。
[0111]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号44、45、46、及び47のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号44のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号45のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号46のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号47のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端、TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は8つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号58のヌクレオチド配列、又は配列番号58に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号59のヌクレオチド配列、又は配列番号59に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。
[0112]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号12に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号44のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号12のヌクレオチド配列を含む。
[0113]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号13に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号45のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号13のヌクレオチド配列を含む。
[0114]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号14に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号46のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号14のヌクレオチド配列を含む。
[0115]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号15に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号47のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号15のヌクレオチド配列を含む。
式IIIのTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンド
[0116]一態様では、本明細書で提供されるのは、式IIIを含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり:
-U-C(式III)、
式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、Uはウリジンヌクレオシドであり、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0117]いくつかの実施態様では、Cはリボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0118]いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号42のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号43のヌクレオチド配列を含む。
[0119]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端、TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0120]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は3つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はヌクレオチド配列C-G-G(配列番号60)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0121]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列の全部若しくは一部、及び/又はTLR7選択的モチーフの全部若しくは一部にハイブリダイズすることができるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列の全部若しくは一部、及び/又はTLR7選択的モチーフの全部若しくは一部にハイブリダイズすることができるヌクレオチド配列を含み、ハイブリダイズした配列はG:Uウォブル塩基対を形成する。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含む。いくつかの実施態様では、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。いくつかの実施態様では、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)は、TLR7選択的モチーフにハイブリダイズし、G:Uウォブル塩基対を形成する。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも3つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は15個のヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号61に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%の同一性を有し、且つ配列番号69のヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含み、ここで、配列番号69のヌクレオチド配列は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号61のヌクレオチド配列を含む。
[0122]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、G:Uウォブル塩基対を含む。
[0123]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号23のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号23に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%の同一性を有し、且つ配列番号42のTLR7選択的モチーフ及び配列番号69のヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含み、ここで、配列番号69のヌクレオチド配列は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。
[0124]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号24のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号24に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%の同一性を有し、且つ配列番号43のTLR7選択的モチーフ及び配列番号69のヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含み、ここで、配列番号69のヌクレオチド配列は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。
[0125]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号42又は43のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は3つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はヌクレオチド配列C-G-G(配列番号60)を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を表す。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列の全部若しくは一部、及び/又はTLR7選択的モチーフの全部若しくは一部にハイブリダイズすることができるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列の全部若しくは一部、及び/又はTLR7選択的モチーフの全部若しくは一部にハイブリダイズすることができるヌクレオチド配列を含み、ハイブリダイズした配列はG:Uウォブル塩基対を形成する。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含む。いくつかの実施態様では、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。いくつかの実施態様では、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)は、TLR7選択的モチーフにハイブリダイズし、G:Uウォブル塩基対を形成する。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも3つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は15個のヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号61に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%の同一性を有し、且つ配列番号69のヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含み、ここで、配列番号69のヌクレオチド配列は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号61のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、G:Uウォブル塩基対を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号23に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%の同一性を有し、且つ配列番号42のTLR7選択的モチーフ及び配列番号69のヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドであり、ここで、配列番号69のヌクレオチド配列は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、G:Uウォブル塩基対を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号24に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%の同一性を有し、且つ配列番号43のTLR7選択的モチーフ及び配列番号69のヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドであり、ここで、配列番号69のヌクレオチド配列は、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、G:Uウォブル塩基対を含む。
[0128]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号23又は24のヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、G:Uウォブル塩基対を含む。
式IVのTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンド
[0129]一態様では、本明細書で提供されるのは、式IVを含む1つ又は複数のTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり:
-U-U-C(式IV)、
式中、C及びCはシチジンヌクレオシド、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0130]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式IVを含む第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含む。
[0131]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、リボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0132]いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフのUは、リボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0133]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-アミノ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-デオキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-メトキシエトキシ修飾を含む。
[0134]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号36のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフは、配列番号36のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号37のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフは、配列番号37のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは配列番号36のヌクレオチド配列を含み、第2のTLR7選択的モチーフは配列番号37のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは配列番号37のヌクレオチド配列を含み、第2のTLR7選択的モチーフは配列番号36のヌクレオチド配列を含む。
[0135]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端、TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する1つ若しくは複数の追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0136]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は5つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列C-A-G-A-C(配列番号67)、又は配列番号67に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、ここで、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0137]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフの3’末端及び第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は5つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1及び/又は第2のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号67に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号67のヌクレオチド配列を含む。
[0138]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号33に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号36の第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は配列番号36の第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号33のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号34に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号37の第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は配列番号37の第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。
[0139]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号36又は37のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号36又は37のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフをさらに含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフの3’末端及び第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号36のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号36のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号36のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号37のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号37のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号37のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号37のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号36のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は5つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ヌクレオチド配列C-A-G-A-C(配列番号67)、又は配列番号67に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、ここで、「-」はホスホジエステル結合を表す。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は5つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1及び/又は第2のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号67に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号67のヌクレオチド配列を含む。
[0140]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号33に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号36の第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。
[0141]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号34に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号37の第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。
[0142]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号33のヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号34のヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。
式VのTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンド
[0143]一態様では、本明細書で提供されるのは、式Vを含む1つ又は複数のTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり:
-U-C(式V)、
式中、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、Cはシチジンヌクレオシドであり、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0144]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Vを含む第1のTLR7選択的モチーフと、式Vを含む1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフとを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Vを含む第1のTLR7選択的モチーフと、式Vを含む1、2、3、4、5、6、7、8、9、10又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフとを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Vを含む第1のTLR7選択的モチーフと、式Vを含む5つの追加のTLR7選択的モチーフとを含む。
[0145]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフの3’末端は、第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されており;第2のTLR7選択的モチーフの3’は第3のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されており;第3のTLR7選択的モチーフの3’は第4のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されており;第4のTLR7選択的モチーフの3’は第5のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されており;第5のTLR7選択的モチーフの3’は第6のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。
[0146]いくつかの実施態様では、式Vを含む1つ又は複数のTLR7選択的モチーフのUは、リボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、RNAリガンド内の式Vを含む各TLR7選択的モチーフは、リボースの2’位に同じ修飾を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンド内の式Vを含む各TLR7選択的モチーフは、本明細書に記載される、又は当技術分野で知られているリボースの2’位における修飾のいずれかを任意の組み合わせで含み得る。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフ及びRNAリガンド内の任意の1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンド内の第2のTLR7選択的モチーフ及び任意の1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。
[0147]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Vを含む6つのTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第2のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第3のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第3のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第4のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第4のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第5のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第5のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。いくつかの実施態様では、第6のTLR7選択的モチーフのUは、当技術分野で知られている、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾を含む。いくつかの実施態様では、第6のTLR7選択的モチーフのUは、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を含む。
[0148]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Vを含む6つのTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第3のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第4のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第5のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含み、第6のTLR7選択的モチーフのUは2’O-メチル修飾を含む。
[0149]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、式Vを含む6つのTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第2のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第3のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第4のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第5のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含み、第6のTLR7選択的モチーフのUは2’-フルオロ修飾を含む。
[0150]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号40のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフ(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10若しくはそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフのいずれか)のうちの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべて(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10若しくはそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフのいずれか)は、配列番号40のヌクレオチド配列を含む。
[0151]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号41のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフ(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10若しくはそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフのいずれか)のうちの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべて(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10若しくはそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフのいずれか)は、配列番号41のヌクレオチド配列を含む。
[0152]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号40のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号40及び配列番号41のヌクレオチド配列の任意の組み合わせを含む1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフのいずれか)を含む。
[0153]いくつかの実施態様では、第1のTLR7選択的モチーフは、配列番号41のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号40及び配列番号41のヌクレオチド配列の任意の組み合わせを含む1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフのいずれか)を含む。
[0154]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、1つ若しくは複数のTLR7選択的モチーフの5’末端、1つ若しくは複数TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する1つ若しくは複数の追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0155]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は2つのシチジンヌクレオシドを含む。
[0156]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号29に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号40の第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号40の5つの追加のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号29のヌクレオチド配列を含む。
[0157]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号30に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号41の第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号41の5つの追加のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号30のヌクレオチド配列を含む。
[0158]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフを含み、ここで1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべては、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフ及び1、2、3、4、5、6、7、8、9、10又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、第1のTLR7選択的モチーフ及び5つの追加のTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンド内のTLR7選択的モチーフは、配列番号40及び配列番号41のヌクレオチド配列の任意の組み合わせを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンド内のTLR7選択的モチーフは、配列番号40のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンド内のTLR7選択的モチーフは、配列番号41のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は2つのシチジンヌクレオシドを含む。
[0159]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号29に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号40の6つのTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。
[0160]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号30に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号41の6つのTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。
[0161]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号29又は30のヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号29のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号30のヌクレオチド配列を含む。
式VIのTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンド
[0162]一態様では、本明細書で提供されるのは、式VIを含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドであり:
-U-U -U (式VI)、
式中、C及びCはシチジンヌクレオシド、U、U、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、「」はホスホロチオエート結合を表し、「-」はホスホジエステル結合を表す。
[0163]いくつかの実施態様では、Uはリボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’メトキシエトキシ修飾である。
[0164]いくつかの実施態様では、Uはリボースの2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているリボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、当技術分野で知られているか、又は本明細書に記載されているRNase活性を阻害又はブロックする、リボースの2’位における任意の修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、修飾は2’メトキシエトキシ修飾である。
[0165]いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’O-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’O-メチル修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-フルオロ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-アミノ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-デオキシ修飾である。いくつかの実施態様では、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾であり、Uのリボース修飾は2’-メトキシエトキシ修飾である。
[0166]いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号48のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号49のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号50のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、TLR7選択的モチーフは、配列番号51のヌクレオチド配列を含む。
[0167]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端、TLR7選択的モチーフの3’末端、又はその両方に隣接する追加のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、追加のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。
[0168]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は8つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号68に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号68のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。
[0169]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は2つのシチジンヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。
[0170]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号17に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号48のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号17のヌクレオチド配列を含む。
[0171]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号18に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号49のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号18のヌクレオチド配列を含む。
[0172]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号19に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号50のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号19のヌクレオチド配列を含む。
[0173]いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、配列番号20に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号51のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号20のヌクレオチド配列を含む。
[0174]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号48、49、50、及び51のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列をさらに含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は8つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号68に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%若しくは100%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号68のヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフの5’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも1つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は少なくとも2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列のヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によって連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、94、96、97、98、99、100、若しくはそれ以上のヌクレオシド、又は100~125ヌクレオシド、125~150ヌクレオシド、150~175ヌクレオシド、175~200ヌクレオシド、200~225ヌクレオシド、225~250ヌクレオシド、250~275ヌクレオシド、若しくは275~300ヌクレオシドのいずれかを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は2つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列はウリジンヌクレオシドを含まない。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は2つのシチジンヌクレオシドを含む。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合又はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。いくつかの実施態様では、第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフの3’末端に連結されている。
[0175]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号17に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号48のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号17のヌクレオチド配列を含む。
[0176]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号18に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号49のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号18のヌクレオチド配列を含む。
[0177]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号19に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号50のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号19のヌクレオチド配列を含む。
[0178]別の態様では、本明細書で提供されるのは、配列番号20に対して少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%又は100%の同一性を有し、且つ配列番号51のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含むRNAリガンドである。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは配列番号20のヌクレオチド配列を含む。
RNA修飾
[0179]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、少なくとも1つのヌクレオチドの1つ又は複数の修飾を含むTLR7選択的モチーフを含むRNAリガンドである。1つ又は複数のヌクレオチド修飾は、修飾された塩基、修飾された糖、及び/又は修飾されたリン酸であり得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のヌクレオチド修飾は、リン酸修飾された結合であり得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の修飾は、RNase活性、例えば、エンドリボヌクレアーゼ又はエキソリボヌクレアーゼ活性を妨害する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の修飾は、RNase活性又はRNaseのRNAリガンドへの結合を阻害又はブロックする。
核酸塩基修飾
[0180]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、少なくとも1つの修飾塩基を含むTLR7選択的モチーフを含む。
[0181]いくつかの実施態様では、修飾塩基は修飾プリン又は修飾ピリミジンである。いくつかの実施態様では、修飾塩基は、2―アミノアデノシン、2,6-ジアミノプリン、イノシン、ピリジン-4-オン、ピリジン-2-オン、フェニル、シュードウラシル、2,4,6-トリメトキシベンゼン、3-メチルウラシル、ジヒドロウリジン、ナフチル、アミノフェニル、5-アルキルシチジン(例えば、5-メチルシチジン)、5-アルキルウリジン(例えば、リボチミジン)、5-ハロウリジン(例えば、5-ブロモウリジン)、6-アザピリミジン、6-アルキルピリミジン(例えば、6-メチルウリジン)、プロピン、キューソシン(quesosine)、2-チオウリジン、4-チオウリジン、ウィブトシン、ウィブトキソシン、4-アセチルシチジン、5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウリジン、5’-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウリジン、β-D-ガラクトシルキューオシン、1-メチルアデノシン、1-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアノシン、3-メチルシチジン、2-メチルアデノシン、2-メチルグアノシン、N-メチルアデノシン、7-メチルグアノシン、5-メトキシアミノメチル-2-チオウリジン、5-メチルアミノメチルウリジン、5-メチルカルボニルメチルウリジン、5-メチルオキシウリジン、5-メチル-2-チオウリジン、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデノシン、β-D-マンノシルキューオシン、ウリジン-5-オキシ酢酸、及び2-チオシチジンから選択される。
[0182]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、少なくとも1つの脱塩基ヌクレオチドを含むTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、脱塩基ヌクレオチドは、1’位に塩基以外の化学基、例えば、3’,3’結合又は5’,5’結合デオキシ脱塩基リボース誘導体を含む。
糖部分の修飾
[0183]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、修飾された糖部分を有する少なくとも1つのヌクレオチドを含むTLR7選択的モチーフを含む。いくつかの実施態様では、修飾糖部分は修飾リボース部分である。
[0184]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、当技術分野で一般に知られているリボースの類似形態、例えば、限定されないが、炭素環式糖類似体、α-アノマー糖、アラビノース、キシロース又はリキソースなどのエピマー糖、ピラノース糖、フラノース糖、セドヘプツロース、非環式類似体、及びメチルリボシドなどの塩基性ヌクレオシド類似体を含み得る。
[0185]いくつかの実施態様では、修飾リボース部分は2’位に修飾を含む。いくつかの実施態様では、リボースの2’-OHは、別の部分、例えば、アルキル、置換アルキル、アルカリル-、アリールアルキル-、-F、-Cl、-Br、-CN、-CF、-OCF、-OCN、-O-アルキル、-S-アルキル、HS-アルキル-O、-O-アルケニル、-S-アルケニル、-N-アルケニル、-SO-アルキル、-アルキル-OSH、-アルキル-OH、-O-アルキル-OH、-O-アルキル-SH、-S-アルキル-OH、-S-アルキル-SH、-アルキル-S-アルキル、-アルキル-O-アルキル、-ONO、-NO、-N、-NH、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ-、アミノアルキル-、アミノアルコキシ、アミノ酸、アミノアシル-、-ONH、-O-アミノアルキル、-O-アミノ酸、-O-アミノアシル、ヘテロシクロアルキル-、ヘテロシクロアルカリル-、アミノアルキルアミノ-、ポリアルアルキルアミノ-、置換シリル-、メトキシエチル-(MOE)、アルケニル又はアルキニルなどで置換されている。他の例示的な2’リボース修飾には、C~Ci0低級アルキル、置換低級アラルキル、O-アルカリル又はO-アラルキル、SH、SCH、SOCH、SOCH、ポリアルキルアミノ、置換シリル、レポーター基、又はインターカレーターが含まれる。いくつかの実施態様では、リボースの2’位の修飾は、2’O-メチル修飾、2’-O-アリル修飾、2’-アジド-リボース修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、リボースの2’位の修飾は、2’O-メチル修飾、2’-フルオロ修飾、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾である。いくつかの実施態様では、リボースの2’位の修飾は、2’O-メチル修飾又は2’-フルオロ修飾である。
リン酸塩及び結合修飾
[0186]いくつかの実施態様では、1つ又は複数のヌクレオチド修飾は、リン酸修飾を含む。
[0187]いくつかの実施態様では、リン酸修飾は修飾されたホスホジエステル結合修飾である。例えば、1つ又は複数のホスホジエステル結合は、限定されないが、P(O)S(「チオエート」)、P(S)S(「ジチオエート」)、(O)NR2(「アミデート」)、P(O)R、P(O)OR’、CO又はCH(「ホルムアセタール」)などの代替の結合基によって置き換えられてもよく、ここで、各R又はR’は、独立して、Hであるか、又はエーテル(-O-)結合、アリール、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、又はアラルジルを含んでいてもよい置換若しくは非置換アルキル(1~20個のC)である。他の例示的なリン酸修飾としては、メチルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホアミデート、カルバメート、ホスホルアミデート、ホスホトリエステル、又はホスホロジチオエートが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施態様では、ヌクレオチド修飾はホスホロチオエート結合修飾である。
[0188]いくつかの実施態様では、リン酸修飾は、3’末端ヌクレオチド間ホスホジエステル結合修飾、例えば、アルキル若しくはアリールホスホトリエステル、アルキル若しくはアリールホスホネート、ホスホン酸水素、ホスホルアミデート、及び/又はホスホロセレネート結合修飾である。いくつかの実施態様では、3’末端ヌクレオチド間ホスホジエステル結合修飾はホスホルアミデート修飾である。
[0189]本開示のRNAリガンドにおけるすべての結合が同一である必要はない。例えば、本開示のRNAリガンドは、ホスホジエステル、メチルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホアミデート、カルバメート、ホスホロアミデート、ホスホトリエステル、又はホスホロジチオエート結合の任意の組み合わせを含み得る。いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、ホスホジエステル結合とホスホロチオエート結合の任意の組み合わせを含む。いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、ホスホジエステル結合のみを含む。いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、ホスホロチオエート結合のみを含む。
追加のRNA修飾
[0190]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、RNAキャップ(例えば、7-メチルグアノシン(m7G)キャップ、m7Gppp5’N、2’Oメチル化m7Gキャップ、m7G(5’)ppp(5’)G、m7G(5’)ppp(5’)A、G(5’)ppp(5’)A、G(5’)ppp(5’)G、3’-0-Me-m7G(5’)ppp(5’)G、ARCA、又は当技術分野で知られている他の適切なRNAキャップ)、及び/又はテール(例えば、ポリ(A)テール);ペンダント部分、例えばタンパク質(例えば、ヌクレアーゼ、毒素、抗体、シグナルペプチド、ポリ-L-リジンなど);インターカレーター(例えば、アクリジン、ソラレンなど);キレート剤(例えば、金属、放射性金属、ホウ素、酸化性金属など);アルキル化剤、及び修飾された結合(例えば、アルファアノマー核酸など)などの修飾を含み得る。いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、固体又は半固体支持体にコンジュゲートされ得る。いくつかの実施態様では、5’及び3’末端OHは、リン酸化され得るか又はアミン若しくは1~20個の炭素原子の有機キャッピング基部分で置換され得る。他のヒドロキシルもまた、標準的な保護基に誘導体化されてもよい。
RNAリガンドの調製
[0191]例えば、本明細書に記載される1つ又は複数のRNA修飾を含む、本開示のRNAリガンドは、当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して調製され得る。
[0192]いくつかの実施態様では、適切な保護基を使用する化学合成を含むがこれに限定されない、RNA合成のためのデノボ方法が使用され得る(例えば、Masuda et al.,(2007)Nucleic Acids Symposium Series 57:3-4);the b-cyanoethyl phosphoramidite method(Beaucage S L et al.(1981)Tetrahedron Lett 22:1859);nucleoside H-phosphonate method(Garegg P et al.(1986)Tetrahedron Lett 27:4051-4;Froehler B C et al.(1986)Nucl Acid Res 14:5399-407;Garegg P et al.(1986)Tetrahedronr Lett 27:4055-8;Gaffney B L et al.(1988)Tetrahedron Lett 29:2619-22);又はUhlmann et al.(1990)Chem Rev 90:544-84、及びGoodchild J(1990)Bioconjugate Chem 1:165に開示されている合成方法を参照。これらの方法及び他の方法は、市販されている自動核酸合成装置での使用のために実施又は適合させることができる。
[0193]本開示のRNAリガンドはまた、例えば本明細書に記載されるように、宿主細胞におけるポリヌクレオチドのクローニング、プロセシング、及び/又は発現など、当技術分野で周知であり且つ慣用的な適切な組換え法を使用して調製することもできる。部位特異的突然変異誘発は、例えば、新しい制限部位を挿入したり、突然変異を導入したりするなど、核酸を変更するために使用することができる。核酸配列の転写に適した方法は公知であり、当技術分野で慣用されている。(一般的には、Current Protocols in Molecular Biology,Vol.2,Ed.Ausubel,et al.,Greene Publish.Assoc.&Wiley Interscience,Ch.13,1988;Glover,DNA Cloning,Vol.II,IRL Press,Wash.,D.C.,Ch.3,1986;Bitter,et al.,in Methods in Enzymology 153:516-544(1987);The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces,Eds.Strathern et al.,Cold Spring Harbor Press,VoIs.I and II,1982;及びSambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,1989を参照。)
[0194]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドは、in vitro転写法を使用して調製することもできる。当技術分野で認識されているように、典型的なin vitro RNA転写反応には、RNAポリメラーゼ、例えば、T7 RNAポリメラーゼ;DNAテンプレート;ヌクレオチド(NTP);マグネシウムなどのイオン、例えば酢酸マグネシウム;例えば適切なpH、例えば7~8.5の、例えばHEPES又はTrisなどの緩衝液が含まれる。いくつかの実施態様では、ジチオスレイトール(DTT)及び/又はスペルミジンなどの追加の化合物が含まれ得る。いくつかの実施態様では、転写反応中にRNase誘導分解が起こらないことを保証するために、RNase阻害剤がin vitroRNA転写反応に含まれる。いくつかの実施態様では、ピロホスファターゼが反応に含まれ、各ヌクレオチドの組込みに続いて生成する無機ピロリン酸を2単位の無機リン酸に切断する。これにより、マグネシウムが溶液中に残り、ピロリン酸マグネシウムとして沈殿することはない。in vitro RNA転写反応の生成物は、例えば以下に記載するような、当技術分野で知られている任意の適切な方法に従って精製することができる。
[0195]本開示のRNAリガンドの調製には、RNAリガンドを(例えば、反応混合物、細胞成分などから)精製又は単離する1つ又は複数の工程が含まれ得る。このような精製は、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、カラムベースの方法(例えば、mini Quick Spin DNA Columns(Roche))、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)、及び/又はRNase-Free HPLC精製など、当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して達成することができる。
[0196]本開示のRNAリガンドにおける1つ又は複数のRNA修飾の存在及び/又は量は、任意の適切な方法を使用して決定され得る。例えば、本開示のRNAリガンドは、一リン酸に消化され(例えば、ヌクレアーゼP1を使用して)、脱リン酸化され(例えば、CIAPなどの適切なホスファターゼを使用して)、得られたヌクレオシドを逆相HPLCによって分析することができる。使用され得る他の方法には、質量分析(MS)、例えば、マトリックス支援レーザー脱離/イオン化(MALDI)、タンデムMS(MS/MS)、エレクトロスプレーイオン化質量分析法(ESI-MS)、又は液体クロマトグラフィー質量分析法(LC-MS);クロマトグラフィー法、例えば、薄層クロマトグラフィー(TLC)、又は液体クロマトグラフィー(LC);逆転写ベースの方法;RNase H切断ベースの方法;ライゲーションベースの方法;ノーザンブロッティング;脱メチラーゼ促進RNA-シークエンシング;MC1リボヌクレアーゼ切断;直接RNAシークエンシング;増幅ベースのシークエンシング;及びバイサルファイトシーケンシングが挙げられる。
担体
[0197]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、例えば薬学的に許容される担体などの担体をさらに含む。
[0198]いくつかの実施態様では、担体は、RNAリガンドの1つ又は複数の細胞への細胞内輸送を促進する。いくつかの実施態様では、担体は、カチオン性化合物又はポリカチオン性化合物などのカチオン性薬剤である。いくつかの実施態様では、担体は、本開示のRNAリガンドを1つ又は複数の細胞に送達するのに適した任意の担体である。本開示の組成物において使用され得る担体の例としては、限定されないが、ポリエチレンイミン(PEI);ポリアルキレンイミン;ポリアルギニン、例えば、ポリ-L-アリギニン;ポリアミン;プロタミン;ポリリジン、例えば、ポリ-L-リジン又はPOLL;ヌクレオリン;融合ペプチド;ポリアミドアミンデンドリマー(PAMAM、Dendritech Inc.);PEG化カチオンポリマー;カチオン性ポリマーコンジュゲート(例えば、PEIコレステロール、ポリリシンコレステロールなど);スペルミン又はスペルミジン;キトサン;カチオン性デキストラン;塩基性ポリペプチド;細胞透過ペプチド(CPP)、例えば、HIV結合ペプチド、HIV-1 Tat(HIV)、Tat由来ペプチド、ペネトラチン、VP22由来又は類似ペプチド、ペスチウイルス Erns、HSV、VP22(単純ヘルペス)、MAP、KALA又はタンパク質伝達ドメイン(PTD)、PpT620、プロリンリッチペプチド、アルギニンリッチペプチド、リジンリッチペプチド、MPGペプチド、Pep-1、L-オリゴマー、カルシトニンペプチド、アンテナペディア由来ペプチド(特にショウジョウバエアンテナペディア由来)、pAntp、pIsl、FGF、ラクトフェリン、トランスポータン、ブフォリン-2、Bac715-24、SynB、SynB(1)、pVEC、hCT由来ペプチド、SAP、又はヒストン;カチオン性多糖類、例えば、キトサン;カチオン性シクロデキストリン;ポリブレン;カチオン性又はポリカチオン性ポリマー、例えばポリアミノ酸(例えば、ポリ-L-アルギニン、ポリ-L-リジン、ポリ-L-オルニチン)など;修飾ポリアミノ酸、例えばβ-アミノ酸ポリマー又は逆ポリアミドなど;修飾ポリエチレン、例えばPVP(ポリ(N-エチル-4-ビニルピリジニウムブロミド))など;修飾アクリレート、例えばpDMAEMA(ポリ(ジメチルアミノエチルメチルアクリレート))など;修飾アミドアミン、例えばpAMAM(ポリ(アミドアミン))など;修飾ポリベータアミノエステル(PBAE)、例えばジアミン末端修飾1,4ブタンジオールジアクリレート-co-5-アミノ-1-ペンタノールポリマー;デンドリマー、例えばポリプロピレンアミンデンドリマー又はpAMAM系デンドリマーなど;ポリイミン、例えば、PEI、ポリ(プロピレンイミン);ポリアリルアミン;糖骨格系ポリマー、例えば、シクロデキストリン系ポリマー、デキストラン系ポリマー、キトサンなど;シラン骨格系ポリマー、例えばPMOXA-PDMSコポリマーなど;1つ以上のカチオン性ブロック(例えば、上記のカチオン性ポリマーから選択される)と、1つ以上の親水性又は疎水性ブロック(例えば、ポリエチレングリコール)との組み合わせを含むブロックポリマーが挙げられる。
[0199]いくつかの実施態様では、担体は脂質である。
[0200]いくつかの実施態様では、担体はカチオン性脂質である。担体として使用され得るカチオン性脂質の例としては、限定されないが、ジオレオイルトリメチルアンモニウムプロパン(DOTAP)、N-[1(-2,3-ジオレオイルオキシ)プロピル]-N,N,N-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)、N,N-ジオレイル-N,N-ジメチルアンモニウムクロリド(DODAC)、リポフェクタミンTM、ジーンポーターTM、DMRIE(1,2-ジミリスチルオキシプロピル-3-ジメチルヒドロキシエチルアンモニウムブロミド)、ジ-C14-アミジン、DOTIM(1-[2-(オレオイルオキシ)エチル]-2-オレイル-3-(2-ヒドロキシエチル)イミダゾリニウムクロリド)、ジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド(DDAB)、DOGS、1,2-ジオレオイルオキシプロピル-3-ジメチル-ヒドロキシエチルアンモニウムブロミド(DORI)、N-(3-アミノプロピル)-N,N-ジメチル-2,3-ビス(ドデシルオキシ)-1-プロパンアンモニウムブロミド(GAP-DLRIE)、SAINT、DC-Chol、ビス-グアニジニウム-トレン-コレステロール(BGTC)、CTAP、1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン(DOPC)、1,2-ジオレオイル-3-ジメチルアンモニウム-プロパン(DODAP)、ジオレイルホスファチジルエタノールアミン(DOPE)、2,3-ジオレイルオキシ-N-[2(スペルミンカルボキサミド)エチル]-N,N-ジメチル-1-プロパンアミニウムトリフルオロアセテート(DOSPA)、ジオクタデシルジメチルアンモニウムブロミド(DODAB)、DOIC、DMEPC、ジミリストオキシプロピルジメチルヒドロキシエチルアンモニウムブロミド(DIMRI)、O,O-ジテトラデカノイル-N-α-トリメチルアンモニオアセチル)ジエタノールアミンクロリド(DC-6-14)、rac-[(2,3-ジオクタデシルオキシプロピル)(2-ヒドロキシエチル)]-ジメチルアンモニウムクロリド(CLIP1)、rac-[2(2,3-ジヘキサデシルオキシプロピルオキシメチルオキシ)エチル]-トリメチルアンモニウム(CLIP6)、rac-[2(2,3-ジヘキサデシルオキシプロピルオキシスクシニルオキシ)エチル]-トリメチルアンモニウム(CLIP9)、SM-102、又はオリゴフェクタミンが挙げられる。担体として使用され得る他の脂質としては、限定されないが、米国特許出願公開第2008/0085870号及び米国特許出願公開第2008/0057080号に記載されているものが挙げられ、これらは参照により本明細書に組み込まれる。
[0201]いくつかの実施態様では、担体はjetPEIである(例えば、Ami Sidi et al.,The Journal of Urology(2008)180(6):2379-2383を参照)。
[0202]いくつかの実施態様では、担体はイオン化可能な脂質である。担体として使用され得るイオン化可能な脂質の例としては、限定されないが、ALC-0315([(4-ヒドロキシブチル)アザンジイル]ジ(ヘキサン-6,1-ジイル)ビス(2-ヘキシルデカノエート))(例えば、ウェブサイト:assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/944544/COVID-19_mRNA_Vaccine_BNT162b2_UKPAR_PFIZER_BIONTECH_15Dec2020.pdfを参照)、SM-102(ヘプタデカン-9-イル 8-((2-ヒドロキシエチル)(6-オキソ-6-(ウンデシルオキシ)ヘキシル)アミノ)オクタノエート)(例えば、ウェブサイト:www.modernatx.com/sites/default/files/mRNA-1273-P301-Protocol.pdfを参照)、イミダゾールコレステロールエステル(例えば、米国特許出願公開第20200155691A1号を参照)、システイン系イオン化脂質(例えば、システイン系イオン化脂質の開示に関して参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2020214946A1号に開示されている)、脂質2,2(8,8)4C CH3(例えば、米国特許第9670152B2号を参照)、Genevant CL1(例えば、国際公開第2020219941A1号を参照)、Acuitas(A9)(例えば、Conway et al.,Molecular Therapy(2019)27(4):866-877を参照)、DLin-MC3-DMA(例えば、Jayaraman et al.,Angew Chem Int Ed Engl(2012)51(34):8529-8533を参照)、Lipid 5(例えば、Sabnis et al.,Molecular Therapy(2018)26(6):1509-1519;及びウェブサイト:investors.modernatx.com/news-releases/news-release-details/moderna-announces-positive-phase-1-results-first-systemicを参照)、C12-200(例えば、Love et al.,PNAS(2010)107(5):1864-1869を参照)、5A2-SC8(例えば、Cheng et al.,Advanced Materials(2018)30(52):1805308を参照)、DLin-KC2-DMA(例えば、Semple et al.,Nature Biotechnology(2010)28:172-176を参照)、OF-02(例えば、Fenton et al.,Advanced Materials(2016)28(15):2939-2943を参照)、306Oi10(例えば、Hajj et al.,Small(2019)15(6):1805097を参照)、cKK-E12(例えば、Dong et al.,PNAS(2014)111(11):3955-3960を参照)、SS-EC、日油株式会社(例えば、ウェブサイト:www.nofamerica.com/store/index.php?dispatch=products.view&product_id=771を参照)、TT3(例えば、Li et al.,Nano Lett(2015)15(12):8099-8107を参照)、OF-Deg-Lin(例えば、Fenton et al.,Angew Chem Int Ed Engl(2018)57(41):13582-13586を参照)、ssPalmE(例えば、Akita et al.,Journal of Controlled Release(2015)200:97-105を参照)、又はL319(Maier et al.,Molecular Therapy(2013)21(8):1570-1578)が挙げられる。
[0203]いくつかの実施態様では、担体は脂質ナノ粒子(LNP)である。特定の実施態様では、LNPは、カチオン性脂質、例えば本明細書に記載の、又は当技術分野で知られている1つ又は複数のカチオン性脂質を含む。特定の実施態様では、LNPはイオン化可能な脂質、例えば本明細書に記載の、又は当技術分野で知られている1つ又は複数のイオン化可能脂質を含む。いくつかの実施態様では、担体はポリ-L-アルギニンである。いくつかの実施態様では、担体はDOTAPである。
本開示の組成物の活性
[0204]本明細書に記載の免疫調節組成物のいずれかのいくつかの実施態様では、免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化する。
[0205]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触した1つ以上の細胞による1つ以上のI型インターフェロン(IFN)の発現又は分泌を誘導又は増加させる。I型IFNは、免疫系を制御するインターフェロンタンパク質の大きなグループである。I型IFNには、限定されないが、IFN-α(アルファ)、IFN-β(ベータ)、IFN-κ(カッパ)、IFN-δ(デルタ)、IFN-ε(イプシロン)、IFN-τ(タウ)、IFN-ω(オメガ)、及びIFN-ζ(ゼータ、リミチンとしても知られる)が含まれる。
[0206]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞による1つ又は複数のI型IFN(例えば、IFN-α、IFN-β、IFN-κ、IFN-δ、IFN-ε、IFN-τ、IFN-ω、又はIFN-ζのうちの1つ又は複数)の発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0207]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-αの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0208]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-βの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0209]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-κの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0210]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-δの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0211]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-εの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0212]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-τの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0213]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-ωの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0214]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-ζの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0215]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞におけるTLR8の活性を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2%未満、又は約1%未満、増加させる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は単球である。
[0216]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるTNFαなどの炎症性サイトカインの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2%未満、又は約1%未満、増加させる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は単球である。
[0217]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるNFk-B依存性サイトカインの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2%未満、又は約1%未満、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は単球である。
[0218]いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞によるI型IFN、炎症性サイトカイン、及び/又はNFk-B依存性サイトカインの発現又は分泌は、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して測定することができる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞によるI型IFN、炎症性サイトカイン、及び/又はNFk-B依存性サイトカインの発現又は分泌は、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、I型IFN、炎症性サイトカイン、及び/又はNFk-B依存性サイトカインのmRNAレベルに基づいて評価され得る。
[0219]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、1つ又は複数のB細胞、例えば、1つ又は複数のナイーブB細胞、活性化B細胞、及び/又はメモリーB細胞の活性を調節する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、例えば、CD69、CD80、又はCD86などのB細胞活性化マーカーの発現に基づいて評価される、1つ又は複数のB細胞の活性化を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、B細胞の増殖を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、クラススイッチ組換えを増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、抗体分泌を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、B細胞の発現又はサイトカインの分泌を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、B細胞活性化マーカー及び/又はサイトカインは、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して測定することができる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のB細胞によるB細胞活性化マーカー及び/又はサイトカインの発現又は分泌は、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、マーカー又はサイトカインのmRNAレベルに基づいて評価され得る。
[0220]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、1つ又は複数のインターフェロン刺激遺伝子(ISG)のレベルを調節する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGは、当技術分野で知られている任意のISGを含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGは、Shamith et al.,Nucleic Acids Research(2009)37,suppl_1;Schoggins and Rice,CurrOpin Virol(2011)1(6):519-525;Forster et al.,Nucleic Acids Research(2013)(データベース発行):D1040-D1046;及びLiu et al.,PNAS(2012)109(11):4239-4244に記載されている。評価され得るISGの例としては、限定されるものではないが、IFIT1、CXCL10、CXCL11、ISG15、CCL8、2’5’OAS、APOBEC3G、APOBEC3A、PKR、ISG56、Mx2、MDA5、IFI44、IRF7、OASL1、ISG20 IFIT2、IFIT3、IFITM3、OAS2、OAS3、IFI16、IRF1、MX1、又はIDOが挙げられる。
[0221]いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して評価され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、1つ又は複数のISGのmRNAレベルに基づいて評価され得る。
in vitroでの使用
[0222]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化するための方法である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0223]いくつかの実施態様では、本方法は、1つ又は複数の細胞を本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトすることを含む。いくつかの実施態様では、方法は、1つ又は複数の細胞をグアノシン又はグアノシン誘導体と接触させることをさらに含む。いくつかの実施態様では、グアノシン誘導体は、2’3’環状GMP、7-チア-8-オキソグアノシン、7-デアザグアノシン、7-アリル-8-オキソグアノシン、7-デアザ-dG,9-ヘキシルグアニン、又はそれらの任意の組み合わせである。
[0224]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドと、当技術分野で知られている、又は本明細書(例えば、「担体」のセクション)に記載されている任意の適切な担体などの担体とを含む、本開示の免疫調節組成物は、直接注入、マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、リポフェクション、微粒子銃などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して、1つ又は複数の細胞に導入され得る。いくつかの実施態様では、担体は脂質ナノ粒子(LNP)である。特定の実施態様では、LNPはカチオン性脂質を含む。特定の実施態様では、LNPはイオン化可能な脂質を含む。いくつかの実施態様では、担体はポリ-L-アルギニンである。いくつかの実施態様では、担体はDOTAPである。
TLR7活性化
[0225]いくつかの態様では、本開示の免疫調節組成物は、1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化する。
[0226]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、1つ以上の細胞による1つ以上のI型インターフェロン(IFN)の発現又は分泌を誘導又は増加させる。
[0227]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞による1つ又は複数のI型IFN(例えば、IFN-α、IFN-β、IFN-κ、IFN-δ、IFN-ε、IFN-τ、IFN-ω、又はIFN-ζのうちの1つ又は複数)の発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0228]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-αの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0229]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-βの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0230]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-κの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0231]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-δの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0232]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-εの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0233]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-τの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0234]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-ωの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0235]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるIFN-ζの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、誘導又は増加は、少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、300%、350%、400%、450%、500%、550%、600%、650%、700%、750%、800%、850%、900%、950%、1000%又はそれ以上のいずれかである。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は、形質細胞様樹状細胞である。
[0236]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞におけるTLR8の活性を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2%未満、又は約1%未満、増加させる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は単球である。
[0237]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるTNFαなどの炎症性サイトカインの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2%未満、又は約1%未満、増加させる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は単球である。
[0238]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、本開示の免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされた1つ又は複数の細胞によるNFk-B依存性サイトカインの発現又は分泌を、例えば、免疫調節組成物と接触及び/又は免疫調節組成物でトランスフェクトされていない対応する1つ又は複数の細胞と比較して(例えば、陰性対照又は細胞培養培地のみで処置された対応する1つ又は複数の細胞と比較して)、約50%未満、約40%未満、約30%未満、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、約2%未満、又は約1%未満、誘導又は増加させる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト細胞である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞はヒト末梢血単核球である。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞は単球である。
[0239]いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞によるI型IFN、炎症性サイトカイン、及び/又はNFk-B依存性サイトカインの発現又は分泌は、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して測定することができる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数の細胞によるI型IFN、炎症性サイトカイン、及び/又はNFk-B依存性サイトカインの発現又は分泌は、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、I型IFN、炎症性サイトカイン、及び/又はNFk-B依存性サイトカインのmRNAレベルに基づいて評価され得る。
[0240]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、1つ又は複数のB細胞、例えば、1つ又は複数のナイーブB細胞、活性化B細胞、及び/又はメモリーB細胞の活性を調節する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、例えば、CD69、CD80、又はCD86などのB細胞活性化マーカーの発現に基づいて評価される、1つ又は複数のB細胞の活性化を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、B細胞の増殖を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、クラススイッチ組換えを増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、抗体分泌を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、B細胞の発現又はサイトカインの分泌を増加又は増強する。いくつかの実施態様では、B細胞活性化マーカー及び/又はサイトカインは、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して測定することができる。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のB細胞によるB細胞活性化マーカー及び/又はサイトカインの発現又は分泌は、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、マーカー又はサイトカインのmRNAレベルに基づいて評価され得る。
[0241]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物は、1つ又は複数のインターフェロン刺激遺伝子(ISG)のレベルを調節する。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGは、当技術分野で知られている任意のISGを含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGは、Shamith et al.,Nucleic Acids Research(2009)37,suppl_1;Schoggins Rice,CurrOpin Virol(2011)1(6):519-525;Forster et al.,Nucleic Acids Research(2013)(データベース発行):D1040-D1046;Liu et al.,PNAS(2012)109(11):4239-4244に記載されている。評価され得るISGの例としては、限定されるものではないが、IFIT1、CXCL10、CXCL11、ISG15、CCL8、2’5’OAS、APOBEC3G、APOBEC3A、PKR、ISG56、Mx2、MDA5、IFI44、IRF7、OASL1、ISG20 IFIT2、IFIT3、IFITM3、OAS2、OAS3、IFI16、IRF1、MX1、又はIDOが挙げられる。
[0242]いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して評価され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、1つ又は複数のISGのmRNAレベルに基づいて評価され得る。
薬学的組成物
[0243]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、本発明の免疫調節組成物を含む薬学的組成物である。このような薬学的組成物は、1つ又は複数の任意の薬学的に許容される添加物(Remington’s Pharmaceutical Sciences 第16版、Osol、A.Ed.(1980))を含んでもよく、凍結乾燥製剤又は水溶液の形態であってもよい。
[0244]薬学的に許容される添加物は、一般に、使用される用量及び濃度ではレシピエントに対して無毒である。本開示の薬学的組成物に使用され得る例示的な薬学的に許容される添加物は、リン酸塩、クエン酸塩及び他の有機酸等の1つ又は複数の緩衝液;アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(例えばオクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド;ヘキサメトニウムクロリド;塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、フェノール、ブチル又はベンジルアルコール;アルキルパラベン類、例えばメチル又はプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;及びm-クレゾール);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質、例えば血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン;親水性ポリマー類、例えばポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリジン;単糖類、二糖類、及びグルコース、マンノース又はデキストリンを含む他の炭水化物;キレート剤、例えばEDTA;糖、例えばスクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトール;塩形成対イオン、例えばナトリウム;金属錯体(例えばZn-タンパク質錯体);及び/又は界面活性剤が挙げられる。
[0245]本開示の薬学的組成物に使用され得る例示的な薬学的に許容される添加物は、さらに、1つ又は複数の間質性薬物分散剤、例えば、可溶性中性活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)、例えば、ヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質、例えば、rHuPH20(HYLENEX(登録商標)、Baxter International,Inc.)を含む。rHuPH20を含む特定の例示的なsHASEGP及び使用方法は、米国特許出願公開第2005/0260186号及び第2006/0104968号に記載されている。一態様では、sHASEGPは、コンドロイチナーゼなどの1つ又は複数の追加のグリコサミノグリカナーゼと組み合わされる。
[0246]本開示の薬学的組成物の有効成分は、コロイド薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル)又はマクロエマルジョンにおいて、例えば、コアセルベーション法又は界面重合によって調製されたマイクロカプセル、例えば、それぞれ、ヒドロキシメチルセルロース又はゼラチンマイクロカプセル及びポリ-(メチルメタクリレート)マイクロカプセルに封入され得る。このような技法は、Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980)に開示されている。
[0247]徐放性製剤を調製してもよい。徐放性製剤の好適な例としては、固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、このマトリックスは、例えば、フィルム又はマイクロカプセル等の成型物品の形態である。
[0248]いくつかの実施態様では、本開示の薬学的組成物は、グアノシン又はグアノシン誘導体を含む。いくつかの実施態様では、グアノシン誘導体は、2’3’環状GMP、7-チア-8-オキソグアノシン、7-デアザグアノシン、7-アリル-8-オキソグアノシン、7-デアザ-dG,9-ヘキシルグアニン、又はそれらの任意の組み合わせである。
[0249]in vivo投与に使用される製剤は、一般に無菌である。無菌性は、例えば、無菌濾過膜を通した濾過によって容易に達成され得る。
[0250]いくつかの実施態様では、本開示の薬学的組成物はワクチン組成物である。ワクチン組成物は、投与すると、病原体又はがん細胞などの罹患細胞を認識して攻撃する細胞性免疫応答などの免疫応答を誘導する薬学的組成物を指す。ワクチンは、疾患の予防や治療のために使用されることがある。本開示のワクチン組成物は、本開示のRNAリガンド、薬学的に許容される担体、例えばポリ-L-アルギニン又はDOTAP、並びに薬学的に許容される添加物、本明細書に記載される任意の追加の薬剤、化合物、分子又は成分、及び/又は当技術分野で知られている任意の適切な追加の薬剤のうちの1つ又は複数を含み得る。
[0251]いくつかの実施態様では、本開示の薬学的組成物はアジュバント組成物である。アジュバント組成物は、投与すると、病原体又はがん細胞などの罹患細胞を認識して攻撃する細胞性免疫応答などの免疫応答を増強する任意の物質又は物質の組み合わせを指す。アジュバントは、疾患の予防や治療のために使用されることがある。本開示のアジュバント組成物は、本開示のRNAリガンド、薬学的に許容される担体、例えばポリ-L-アルギニン又はDOTAP、並びに薬学的に許容される添加物、本明細書に記載される任意の追加の薬剤、化合物、分子又は成分、及び/又は当技術分野で知られている任意の適切な追加の薬剤のうちの1つ又は複数を含み得る。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物、又は本開示の薬学的組成物は、ワクチン、例えば、抗ウイルスワクチン、抗細菌ワクチン、又は抗がんワクチンなどの別の治療のためのアジュバントとして使用され得る。
追加の治療剤
[0252]いくつかの実施態様では、本開示の薬学的組成物は、治療される特定の適応症に必要とされる複数の有効成分、好ましくは互いに悪影響を及ぼさない相補的活性を有する活性成分を含有し得る。例えば、本開示の免疫調節組成物(すなわち、本開示のRNAリガンドを含む)に加えて、薬学的組成物中に、追加の薬剤、例えば別の免疫調節組成物、核酸、タンパク質又はポリペプチド(例えば、抗体又はその断片)、ワクチン又はワクチン組成物、アジュバント、及び/又は1つ若しくは複数の薬物、例えば、化学療法剤、細胞傷害性剤、サイトカイン、成長阻害剤、抗ホルモン剤、及び/又は心臓保護剤を含めることが望ましい場合がある。いくつかの実施態様では、本開示の薬学的組成物は、本開示の免疫調節組成物と、免疫賦活性剤、抗ウイルス剤、抗生物質、抗真菌剤、抗寄生虫剤、抗菌剤、抗腫瘍剤、ケモカイン、成長因子、抗血管新生因子、化学療法剤、抗体、遺伝子サイレンシング剤、又はサイトカイン(例えば、IFN-α及び/又はIFN-βなどのI型IFN)のうちの1つ又は複数とを含む。そのような分子又は薬剤は、意図される目的に有効な量で組み合わせて適切に存在する。
核酸、ベクター及び宿主細胞
[0253]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドのいずれかを含むヌクレオチド配列を有する単離された核酸が提供される。いくつかの実施態様では、かかる核酸を含む1つ又は複数のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。いくつかの実施態様では、かかる核酸又はベクターを含む宿主細胞も提供される。いくつかの実施態様では、宿主細胞は真核細胞又は原核細胞である。本開示の宿主細胞には、単離された細胞、in vitro培養細胞、及びex vivo培養細胞も含まれるが、これらに限定されない。
[0254]いくつかの実施態様では、本開示のRNAリガンドを作製する方法が提供される。いくつかの実施態様では、本方法は、RNAリガンドの発現に適した条件下で、RNAリガンドを含む核酸又はベクターを含む本開示の宿主細胞を培養することを含む。いくつかの実施態様では、RNAリガンドは、続いて宿主細胞(又は宿主細胞培養培地)から回収される。本開示のRNAリガンドの組換え産生のために、RNAリガンドを含む核酸が単離され、さらなるクローニング及び/又は宿主細胞での発現のために1つ又は複数のベクターに挿入される。このような核酸は、従来の手順を使用して容易に単離及び配列決定され得る。
[0255]本開示のRNAリガンドを含む核酸配列を含む適切なベクターとしては、限定されないが、クローニングベクター及び発現ベクターが挙げられる。適切なクローニングベクターは、標準的な技術に従って構築することができ、あるいは当技術分野で利用可能な多数のクローニングベクターから選択することができる。選択されるクローニングベクターは使用する宿主細胞に応じて異なるが、有用なクローニングベクターは一般に自己複製能力を有し、特定の制限エンドヌクレアーゼに対する単一の標的を保有することができ、且つ/又はベクターを含むクローンを選択する際に使用できるマーカーの遺伝子を保有することができる。適切な例としては、プラスミド及び細菌ウイルス、例えば、pUC18、pUC19、Bluescript(例えば、pBS SK+)及びその誘導体、mp18、mp19、pBR322、pMB9、ColE1、pCR1、RP4、ファージDNA、並びにpSA3及びpAT28などのシャトルベクターが挙げられる。これら及び他の多くのクローニングベクターは、BioRad、Strategene、Invitrogenなどの市販ベンダーから入手可能である。
[0256]本開示のRNAリガンド、核酸又はベクターのクローニング又は発現に適した宿主細胞には、原核細胞又は真核細胞が含まれる。例えば、糸状菌又は酵母などの真核微生物を使用することができる。植物及び昆虫からの細胞も宿主細胞として使用され得る。昆虫細胞と組み合わせて使用できるバキュロウイルス株が数多く同定されている。植物細胞培養物も宿主として利用することができる。脊椎動物細胞も、宿主として使用され得る。例えば、懸濁液中で増殖するように適合されている哺乳動物細胞株が有用であり得る。有用な哺乳動物宿主細胞株の他の例は、SV40(COS-7)により形質転換されたサル腎臓CV1株;ヒト胚性腎臓株(例えば、Graham et al.,J.Gen Virol.36:59(1977))に記載される293又は293細胞);ベビーハムスター腎細胞(BHK);マウスセルトリ細胞(例えば、Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980)に記載されるTM4細胞);サル腎臓細胞(CV1);アフリカ緑猿腎臓細胞(VERO-76);ヒト子宮頸がん細胞(HELA);イヌ腎臓細胞(MDCK);水牛ラット肝臓細胞(BRL 3A);ヒト肺細胞(W138);ヒト肝細胞(Hep G2);マウス乳腺腫瘍(MMT060562);例えば、Mather et al.,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982)に記載されるTRI細胞;MRC5細胞;及びFS4細胞である。他の有用な哺乳動物宿主細胞株には、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞及び骨髄腫細胞株が含まれる。
治療方法
[0257]本明細書で提供されるのは、本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物のin vivo治療的使用である。
[0258]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して、個体においてTLR7を選択的に活性化するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を個体に投与することを含む。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、例えば本明細書に記載されるように、単剤として、又は1つ若しくは複数の追加の治療剤と組み合わせて投与される。本明細書で提供される個体においてTLR7を選択的に活性化するための方法は、感染症、免疫障害、がんなどの特定の疾患、障害、又は症状の予防又は治療、及び/又は個体における免疫系の調節において用途を見出すことができる。
[0259]本明細書で使用される場合、「予防する(preventing)」、「予防(prevention)」、「予防する(prevent)」などには、個体における特定の疾患、障害、又は状態の発生又は再発に関して予防を提供することが含まれる。個体は、特定の疾患、障害、又は状態にかかりやすい、あるいはかかる疾患、障害、又は状態を発症する危険性があるが、まだその疾患、障害、又は状態と診断されていない場合がある。疾患、障害、又は状態を発症する「危険性のある」個体は、検出可能な疾患又は疾患の症状を有している場合もあれば、有していない場合もあり、本明細書に記載される治療方法の前に検出可能な疾患又は疾患の症状を示していた場合もあれば、示していない場合もある。「危険性がある」とは、個体が1つ以上の危険因子を有していることを示し、この危険因子は、当該技術分野で知られているように、特定の疾患、障害、又は状態の発症と相関する測定可能なパラメータである。これらの危険因子を1つ以上持つ個体は、これらの危険因子を1つ以上持たない個体よりも、特定の疾患、障害、又は状態を発症する確率が高くなる。
[0260]本明細書で使用される場合、「治療する(treat)」、「治療する(treating)」、「治療(treat)」などは、臨床病理の経過中に治療される個体の自然な経過を変えるように設計された臨床的介入を指す。治療の望ましい効果としては、進行速度の低下、病理学的状態の改善又は緩和、及び特定の疾患、障害、又は状態の寛解又は予後の改善が挙げられる。例えば、特定の疾患、障害、又は状態に関連する1つ又は複数の症状が緩和又は除去された場合、その個体は首尾よく「治療」されたことになる。
[0261]本明細書で使用される場合、「治療的有効量」とは、特定の疾患、障害、又は状態の測定可能な改善をもたらすのに必要な、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物などの薬剤の少なくとも最小量である。本明細書における治療的有効量は、患者の疾患状態、年齢、性別、及び体重、並びに個体における所望の応答を誘発する薬剤の能力などの要因に応じて異なり得る。治療的有効量はまた、薬剤の任意の毒性又は有害効果が治療上有益な効果によって上回る量である。
感染
[0262]TLR7などのToll様受容体やI型IFNは、ウイルス、細菌、寄生虫、真菌などの病原体による感染に対する自然免疫系及び適応免疫系の応答の制御におけるいくつかの既知の役割を有する。例えば、Lester and Li,J Mol Biol(2014)426(6):1246-1264;MacNab et al.,Nat Rev Immunol(2020)15(2):87-103を参照。したがって、TLR7を選択的に活性化する本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、ウイルス感染症、細菌感染症、寄生虫感染症、及び/又は真菌感染症の予防又は治療において用途を見出すことができる。
[0263]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるウイルス感染症を予防又は治療するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物;又は治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、ウイルス感染症を予防又は治療するための1つ又は複数の追加の薬剤と組み合わせて、個体に投与することを含む。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得るウイルス感染症の例としては、限定されないが、呼吸器ウイルス、例えば、アデノウイルス、インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、コロナウイルス、及びライノウイルスなど;おたふく風邪、麻疹、及びその他の小児期ウイルス、例えば、パラミクソウイルス、風疹ウイルス、風疹、パルボウイルス、及び水痘など;天然痘(痘瘡)などのポックスウイルス;エンテロウイルス、例えば、ポリオウイルス、コクサッキーウイルスA及びB、エコーウイルス、エコーウイルス、及びA型肝炎など;肝炎ウイルス、例えば、A型、B型、C型、D型、及びE型肝炎ウイルスなど;ヘルペスウイルス、例えば、ヒト単純ヘルペスウイルス1(HHSV1、HSV-1)、ヒト単純ヘルペスウイルス2(HHSV2、HSV-2)、ヒトサイトメガロウイルス(HCMV)、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、水痘・帯状疱疹ウイルス(VZV)、ヒトヘルペスウイルス6型(HHV6)、ヒトヘルペスウイルス7型(HHSV7、HHV7)、及びヒトヘルペスウイルス8型(HHSV8、HHV8)など;リッサウイルスなどのラブドウイルス;パポバウイルス、例えば、ヒトパピローマウイルス(HPV)、及びJCウイルス、BKウイルスなど;レトロウイルス、例えば、HIV-1、HIV-2、及びヒトTリンパ球ウイルス(HTLV)など;アルボウイルス、例えば、デングウイルス、黄熱病、日本脳炎ウイルス、西ナイルウイルス、ダニ媒介性脳炎、ベシクロウイルス、ロスリバーウイルス、シンドビスウイルス、及びフレボウイルスなど;プリオン;並びに限定されないが、エボラウイルス、マールブルグウイルス、ラッサウイルス、アフリカ豚コレラウイルス、モルビリウイルス、ハンタウイルス、リッサウイルス、及び重症急性呼吸器症候群(SARS)を含む他のウイルス感染症が挙げられる。
[0264]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における細菌感染症を予防又は治療するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物;又は治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、細菌感染症を予防又は治療するための1つ又は複数の追加の薬剤と組み合わせて、個体に投与することを含む。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る細菌感染症の例としては、限定されないが、ストレプトコッカス・アガラクチア、大腸菌、リステリア菌、肺炎球菌、インフルエンザ菌、髄膜炎菌、クレブシエラ属、黄色ブドウ球菌、肺炎球菌、結核菌、クリプトコッカス・ネオフォルマンス、又は破傷風菌が挙げられる。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る細菌感染症の他の例としては、限定されないが、皮膚感染症、例えば、黄色ブドウ球菌、化膿性連鎖球菌、又はプロピオニバクテリウム・アクネスなど;耳感染症、例えば、肺炎球菌、カタル球菌、インフルエンザ菌、緑膿菌、黄色ブドウ球菌など;眼感染症、例えば、黄色ブドウ球菌、肺炎球菌、化膿性連鎖球菌、インフルエンザ菌、腸球菌、腸内細菌科、緑膿菌、カタル球菌、ペプトストレプトコッカス、緑色連鎖球菌、ジフテリア菌、プロテウス・ミラビリス、肺炎桿菌、セラチア・マルセセンス、大腸菌、エロモナス・ハイドロフィラ、モラクセラ菌、パスツレラ・マルトシダ、アシネトバクター、バチルス、クラミジア・トラコマチス、クロストリジウム、淋菌、髄膜炎菌、又は表皮ブドウ球菌など;気道感染症、例えば、肺炎球菌、黄色ブドウ球菌、マイコプラズマ肺炎、クラミドフィラ・ニューモニエ、化膿連鎖球菌、大腸菌、ストレプトコッカス・アガラクチア、クラミジア・トラコマチス、マイコプラズマ肺炎、又はヘモフィルス・インフルエンザエなど;あるいは、胃腸感染症、例えば、ミュータンス連鎖球菌、ストレプトコッカス・ソブリナス、連鎖球菌属、ラクトバチルス・カゼイ、放線菌属、フソバクテリウム属、プレボテラ・インターメディア、トレポネーマ・デンティコラ、又はビフィドバクテリウム属などが挙げられる。
[0265]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における真菌感染症を予防又は治療するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物;又は治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、真菌感染症を予防又は治療するための1つ又は複数の追加の薬剤と組み合わせて、個体に投与することを含む。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る真菌感染症の例としては、限定されないがアブシジア・コリムビフェラ(Absidia corymbifera)、アクレモニウム・ファルシフォルメ(Acremoniumfalciforme)、A.キリエンセ(A.kiliense)、A.レシフェイ(A.recifei)、A.デルマチチジス(Ajellomyces dermatitidis)、A.カプスラータ(A.capsulata)、アスペルギルス属(Aspergillus spp.)、(例えば、A.フラーブス(A.flavus)、A.フミガーツス(A.fumigatus)、A・ニデュランス(A.nidulans)、A・ニガー(A.niger)、A.テレウス(A.terreus)),カンジダ属菌(Candida spp.)(例えば、C.アルビカンス(C.albicans)、C.グラブラタ(C.glabrata)、C.guillermondii、C.クルーセイ(C.krusei)、C.パラプシローシス(C.parapsilosis)、C.ke yr、C.トロピカリス(C.tropicalis)),C.ネオフォルマンス(C.neoformans)、カニンガメラ・エレガンス(Cunninghamella elegans)、エモンシア・パルヴァ(Emmonsia parva)、エピデルモフィトン・フロッコッサム(Epidermophyton floccosum)、エクソフィアリア・デルミティディス(Exophialia dermitidis)、E.ウェルネッキー(E.werneckii)、E.ジェアンセルメイ(E.jeanselmei)、E.スピニフェラ(E.spinifera)、E.・リチャードシエ(E.richardsiae)、フィロバシディエラ・ネオフォルマンス(Filobasidiella neoformans)、フォンセカイア・コンパクタ(Fonsecaea compacta)、フォンセケア・ペドロソイ(F.pedrosoi)、ヒストプラスマ・カプスラツム(Histoplasma capsulatum)、レプトスフェリア・セネガレンシス(Leptoshaeria senegarlensis)、マズレラ・マイセトマティス(Madurella mycetomatis)、M.グリセア(M.grisea)、マラセジア・フルフル(Malassezia furfur)、ミクロスポルム属(Microsporum spp)、ネオテスツジナ・ロサチイ(Neotestudina rosatii)、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、ペニシリウム・マルネッフェイ(Penicillium marneffei)、フィアロフォラ・ヴェルコーサ(Phialophora verrucosa)、Piedraia hortae、ニューモシスチス・カリニ(Pneumocystis carinii)、シュードアレシェリア・ボイジイ(Pseudallescheria boydii)、ピレノケータ・ロメロイ(Pyrenochaeta romeroi)、リゾムコール・プシルス(Rhizomucor pusillus)、スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)、トリコフィトン属(Trichophyton spp)、トリコスポロン・ベゲリイ(Trichosporon beigelii)、又はキシロヒョウファ・バンティアナ(Xylohypha bantiana)が挙げられる。
[0266]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における寄生虫感染症を予防又は治療するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物;又は治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、寄生虫感染症を予防又は治療するための1つ又は複数の追加の薬剤と組み合わせて、個体に投与することを含む。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る寄生虫感染症の例としては、腸内寄生虫感染症などの寄生虫感染症が挙げられるが、これらに限定されない。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る寄生虫感染症の他の例としては、限定されないが、アカントアメーバ、アフリカ睡眠病(アフリカトリパノソーマ症)、肺胞性エキノコックス症(エキノコックス症、包虫症)、アメーバ症(赤痢アメーバ)、アメリカトリパノソーマ症(シャーガス病)、鉤虫症(鉤虫)、住血線虫症(住血線虫属)、アニサキス症(アニサキス、偽テラノバ)、回虫症(回虫、腸回虫)、バベシア症(バベシア)、バランティディア症(バランティジウム)、バラムチア、ベイリサスカリア症(ベイリサスカリス、アライグマ回虫)、ビルハルジア(住血吸虫症)、ヒトブラストシスチス感染症、毛細血管症(キャピラリア)、セカリア皮膚炎(水泳者かゆみ症)、シャーガス病(アメリカトリパノソーマ症)、メニール鞭毛虫、肝吸虫症(肝吸虫)、皮膚幼虫移行症、鉤虫症、クリプトスポリジウム症(クリプトスポリジウム)、シクロスポリジウム症(シクロスポラ)、嚢虫症(神経嚢虫症)、シストイソスポーラ(シストイソスポーラ症)、イソスポラ症、二核アメーバ、裂頭条虫症(裂頭条虫)、瓜実条虫感染症、イヌ糸状虫症(イヌ糸状虫)、DPDx、メジナ虫症(ギニアワーム病)、瓜実条虫、エキノコックス症(嚢胞性、肺胞胞状疾患)、象皮病(フィラリア症、リンパ性フィラリア症)、小形アメーバ、大腸アメーバ、エントアメーバ・ディスパー、エンタメーバ・ハルトマン、赤痢アメーバ(アメーバ症)、エンタメーバ・ポレッキ、腸蟯虫症(蟯虫)、肝蛭症(肝蛭属)、肥大吸虫症(肥大吸虫)、フィラリア症、ジアルジア症(ジアルジア属)、顎口虫症(顎口虫)、異形吸虫症(異形吸虫)、包虫症、膜様条虫症(膜様条虫)、腸回虫(回虫症、回虫感染症)、ヨードアメーバ、イソスポーラ属、カラアザール(リーシュマニア症、リーシュマニア)、角膜炎(アカントアメーバ)、肝吸虫症(肝吸虫症、オピストルキス症、肝蛭症)、ロア症(ロアロア)、リンパ性フィラリア症、マラリア(マラリア原虫)、微胞子虫症(微胞子虫)、ダニ、シラミ、ハエ幼虫症、ネグレリア、神経嚢虫症(嚢虫症)、眼幼虫移行症(トキソカリア症、トキソカラ症、内臓幼虫移行症)、オンコセルカ症(河川盲目症)、オピストルキス症(オピストルキス)、肺吸虫症(肺吸虫)、ペディキュラ症、ケジラミ症、腸蟯虫症、ニューモシスティスジロベシ肺炎、シュードテラノバ症(アニサキス症、アニサキス)、ベイリサスカリス症(ベイリサスカリス)、サッピニア、肉胞子虫症(肉胞子虫症)、住血吸虫症(ビルハルツ症)、睡眠病(トリパノソーマ症)、土壌伝染性蠕虫症、糞線虫症(糞線虫類)、条虫症(条虫)、トキソプラズマ症(トキソプラズマ)、旋毛虫症(旋毛虫症)、旋毛虫症(旋毛虫症)、トリコモナス症(トリコモナス)、又は鞭虫症(鞭虫、鞭虫属)が挙げられる。
免疫疾患
[0267TLR7などのToll様受容体、及びI型IFNは、免疫不全、自己免疫疾患、アレルギーなどの免疫疾患の免疫病理学におけるいくつかの既知の役割を有する。例えば、Uematsu and Akira,Expert Opin Biol Ther(2006)6(3):203-14;Crow et al.,Annual Review of Pathology:Mechanisms of Disease-Type I Interferons in Autoimmune Disease(2019)14:369-393;及びWang et al.,Front Immunol(2017)8:1431を参照。したがって、TLR7を選択的に活性化する本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、免疫不全、自己免疫疾患又はアレルギーなどの免疫疾患の予防又は治療において用途を見出すことができる。
[0268]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における免疫疾患を予防又は治療するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物;又は治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、免疫疾患を予防又は治療するための1つ又は複数の追加の薬剤と組み合わせて、個体に投与することを含む。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る免疫疾患の例には、限定されないが、自己免疫疾患、免疫不全症、及びアレルギーが含まれる。
[0269]本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得るアレルギーの非限定的な例としては、季節性アレルギー、肥満細胞症、通年性アレルギー、アナフィラキシー、食物アレルギー、アレルギー性鼻炎、又はアトピー性皮膚炎が挙げられる。
[0270]本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る免疫不全の非限定的な例には、原発性免疫不全症、例えば、重症複合免疫不全症(SCID)、ディジョージ症候群、高免疫グロブリンE症候群(ジョブ症候群としても知られる)、共通可変免疫不全症(CVID)、慢性肉芽腫性疾患(CGD)、ウィスコット・アルドリッチ症候群(WAS)、自己免疫リンパ増殖性症候群(ALPS)、高IgM症候群、白血球粘着不全症(LAD)、NF-κB必須修飾因子(NEMO)変異、選択的免疫グロブリンA欠損症、X連鎖無ガンマグロブリン血症、X連鎖リンパ増殖性疾患(XLP)、及び運動失調・毛細血管拡張症など;続発性免疫不全症、例えば、後天性免疫不全症候群(AIDS);薬物誘発性の免疫不全又は免疫抑制;又は慢性血液透析、外傷若しくは外科的処置によって引き起こされる免疫抑制が挙げられる。
[0271]本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得る自己免疫障害の非限定的な例には、狼瘡、強皮症、溶血性貧血、血管炎、1型糖尿病、バセドウ病、関節炎(関節リウマチ、若年性関節リウマチ、変形性関節症、乾癬性関節炎を含む)、多発性硬化症、糖尿病、グッドパスチャー症候群、悪性貧血、ミオパチー、セリアック病、炎症性腸疾患、再生不良性貧血、ライム病、脳脊髄炎、重症筋無力症、全身性エリテマトーデス、自己免疫性甲状腺炎、皮膚炎(アトピー性皮膚炎、湿疹性皮膚炎を含む)、乾癬、シェーグレン症候群、クローン病、アフタ性潰瘍、虹彩炎、結膜炎、角結膜炎、潰瘍性大腸炎、喘息、アレルギー性喘息、皮膚エリテマトーデス、膣炎、直腸炎、薬疹、ハンセン病好転反応、ハンセン病結節性紅斑、自己免疫性ブドウ膜炎、アレルギー性脳脊髄炎、急性壊死性出血性脳症、特発性両側性進行性感音性難聴、純赤血球貧血、特発性血小板減少症、多発性軟骨炎、ウェゲナー肉芽腫症、慢性活動性肝炎、スティーブンス・ジョンソン症候群、特発性スプルー、扁平苔癬、サルコイドーシス、原発性胆汁性肝硬変、後部ぶどう膜炎、及び間質性肺線維症が挙げられる。
がん
[0272]TLR7などのToll様受容体、及びI型IFNは、抗腫瘍免疫応答の制御におけるいくつかの既知の役割を有する。例えば、Urban-Wojciuk et al.,Front.Immunol(2019)10:2388;Musella et al.,(2017)6(5):e1314424;及びZitvogel et al.,Nature Reviews Immunology(2015)15:405-414を参照。したがって、TLR7を選択的に活性化する本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、がんの予防又は治療において用途を見出すことができる。
[0273]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるがんを予防又は治療するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物;又は治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、がんを予防又は治療するための1つ又は複数の追加の薬剤と組み合わせて、個体に投与することを含む。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得るがんの例には、限定されないが、癌腫、肉腫、リンパ腫、白血病、胚細胞腫瘍、及び芽細胞腫が挙げられる。本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物を使用して予防又は治療され得るがんの具体例としては、限定されないが、骨肉腫、筋肉肉腫、例えば、軟骨肉腫、ユーイング肉腫、骨悪性線維性組織球腫/骨肉腫、骨肉腫、横紋筋肉腫、及び心臓がんなど;脳及び神経系のがん、例えば、星状細胞腫、脳幹神経膠腫、毛様細胞性星状細胞腫、上衣腫、原始神経外胚葉腫瘍、小脳星状細胞腫、大脳星状細胞腫、神経膠芽腫、神経膠腫、髄芽腫、神経芽腫、希突起膠腫、松果体星状細胞腫、下垂体腺腫、視覚路、及び視床下部神経膠腫など;乳がん、例えば、浸潤性小葉がん、管状がん、浸潤性篩状がん、髄様がん、男性乳がん、葉状腫瘍、及び炎症性乳がんなど;内分泌系がん、例えば、副腎皮質がん、島細胞がん(膵内分泌)、多発性内分泌、腫瘍形成症候群、副甲状腺がん、褐色細胞腫、甲状腺がん、及びメルケル細胞がんなど;眼のがん、例えば、ブドウ膜黒色腫及び網膜芽細胞腫など;消化器がん、例えば、肛門がん、虫垂がん、胆管がん、カルチノイド腫瘍、胃腸がん、結腸がん、
肝外胆管がん、胆嚢がん、胃(gastric)(胃(stomach))がん、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、肝細胞がん、膵臓がん、島細胞がん、及び直腸がんなど;泌尿生殖器がん及び婦人科がん、例えば、膀胱がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、性腺外胚細胞腫瘍、卵巣がん、卵巣上皮がん(表面上皮間質腫瘍)、卵巣胚細胞腫瘍、陰茎がん、腎細胞がん、腎盂及び尿管、移行上皮がん、前立腺がん、精巣がん、妊娠性絨毛腫瘍、尿管及び腎盂、移行上皮がん、尿道がん、子宮肉腫、膣がん、外陰がん、及びウィルムス腫瘍など;頭頸部がん、例えば、食道がん、頭頸部がん、上咽頭がん、口腔がん、中咽頭がん、副鼻腔及び鼻腔がん、咽頭がん、唾液腺がん、及び下咽頭がんなど;造血がん、例えば、急性混合白血病、急性好酸球性白血病、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、急性骨髄性樹状細胞白血病、エイズ関連リンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、B細胞性前リンパ球性白血病、バーキットリンパ腫、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、皮膚T細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、肝脾T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、ヘアリー細胞白血病、血管内大細胞型B細胞リンパ腫、大顆粒リンパ球性白血病、リンパ形質細胞性リンパ腫、リンパ腫様肉芽腫症、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、マスト細胞白血病、縦隔大細胞型B細胞リンパ腫、多発性骨髄腫/形質細胞腫瘍、骨髄異形成症候群、粘膜関連リンパ組織リンパ腫、菌状息肉症、結節性辺縁帯B細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、前駆体Bリンパ芽球性白血病、原発性中枢神経系リンパ腫、原発性皮膚濾胞性リンパ腫、原発性皮膚免疫細胞腫、原発性滲出性リンパ腫、形質芽球性リンパ腫、セザリー症候群、脾臓辺縁帯リンパ腫、T細胞前リンパ球性白血病など;皮膚がん、例えば、基底細胞癌、扁平上皮癌、皮膚付属器腫瘍(脂腺癌など)、黒色腫、メルケル細胞癌、皮膚原発肉腫(隆起性皮膚線維肉腫など)、皮膚原発リンパ腫(菌状息肉腫など);胸部がん及び呼吸器がん、気管支腺腫/カルチノイド、小細胞肺がん、中皮腫、非小細胞肺がん、胸膜肺芽腫、喉頭がん、胸腺腫、胸腺癌など;エイズ関連がん;カポジ肉腫;
類上皮血管内皮腫(EHE);線維形成性小円形細胞腫瘍及び脂肪肉腫が挙げられる。
免疫応答の増強
[0274]TLR7などのToll様受容体及びI型IFNは、体液性免疫、適応免疫、抗原特異的T細胞応答の制御を含むがこれらに限定されない、免疫系の制御におけるいくつかの既知の役割を有する。例えば、Le Bon et al.,Immunity(2001)14(4):461-470;Fitzgerald and Kagan,Cell(2020)180(6):1044-1066;及びLi et al.,Front Immunol(2019)10:2191を参照。したがって、TLR7を選択的に活性化する本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、個体における体液性免疫、適応免疫、B細胞応答、及び/又は抗原特異的T細胞応答を増加、誘導、又は増強することに用途を見出すことができる。
[0275]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における体液性免疫を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0276]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における適応免疫を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0277]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における抗原特異的T細胞応答(例えば、CD8+T細胞)を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0278]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるB細胞の活性化及び/又は増殖を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0279]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体における樹状細胞(例えば、cDC、形質細胞様樹状細胞)の活性化及び/又は増殖を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0280]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるIL-12産生を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0281]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるT細胞プライミングを増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0282]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるB細胞クラススイッチ組換えを増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0283]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるB細胞抗体分泌を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0284]いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、個体におけるB細胞サイトカイン分泌を増加、誘導、又は増強するための方法である。いくつかの実施態様では、本方法は、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を;又は1つ若しくは複数の追加の薬剤と組み合わせた、治療的有効量の本開示の免疫調節組成物若しくは薬学的組成物を、個体に投与することを含む。
[0285]本明細書に記載されるいずれかの治療方法のいくつかの実施態様では、本方法は、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、個体から得られた試料においてTLR7活性のレベルを測定することをさらに含む。いくつかの実施態様では、方法は、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、個体から得られた試料において1つ又は複数のI型IFN(例えば、IFN-α、IFN-β、IFN-κ、IFN-δ、IFN-ε、IFN-τ、IFN-ω、又はIFN-ζのうちの1つ又は複数)のレベルを測定することをさらに含む。いくつかの実施態様では、方法は、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、個体から得られた試料においてIFN-αのレベルを測定することをさらに含む。[0285]いくつかの実施態様では、方法は、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、個体から得られた試料において1つ又は複数のインターフェロン刺激遺伝子(ISG)のレベルを測定することをさらに含む。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGは、当技術分野で知られている任意のISG、例えば、Shamith et al.,Nucleic Acids Research(2009)37,suppl_1;Schoggins and Rice,CurrOpin Virol(2011)1(6):519-525;Forster et al.,Nucleic Acids Research(2013)(database issue):D1040-D1046;Liu et al.,PNAS(2012)109(11):4239-4244に記載されている1つ又は複数のISGを含む。評価され得るISGの例としては、限定されるものではないが、IFIT1、CXCL10、CXCL11、ISG15、CCL8、2’5’OAS、APOBEC3G、APOBEC3A、PKR、ISG56、Mx2、MDA5、IFI44、IRF7、OASL1、ISG20 IFIT2、IFIT3、IFITM3、OAS2、OAS3、IFI16、IRF1、MX1、又はIDOが挙げられる。
[0286]いくつかの実施態様では、試料は血液試料、血漿試料、又は血清試料である。いくつかの実施態様では、試料は、例えば脾臓、1つ若しくは複数のリンパ節、又は腫瘍からの組織生検である。いくつかの実施態様では、I型IFNのレベルは、酵素結合免疫吸着法、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して測定され得る。いくつかの実施態様では、I型IFNのレベルは、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、I型IFNのmRNAレベルに基づいて評価され得る。いくつかの実施態様では、I型IFNのレベルは、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)、qPCR、又は組織試料中のRNAレベルを測定するための当技術分野で知られている他の任意の適切な方法によって評価され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して評価され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、1つ又は複数のISGのmRNAレベルに基づいて、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して評価され得る。
投与量及び投与
投与量
[0287]本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の用量及び所望の濃度は、想定される特定の使用、例えば、本明細書に記載される治療方法のいずれかに応じて変化し得る。適切な投与量又は投与経路の決定は、十分に当業者の技術の範囲内である。動物実験は、ヒトの治療に有効な投与量を決定するための信頼できる指針を提供する。有効用量の種間スケーリングは、Mordenti,J.and Chappell,W.“The Use of Interspecies Scaling in Toxicokinetics,”In Toxicokinetics and New Drug Development,Yacobi et al.,Eds,Pergamon Press,New York 1989,pp.42-46に記載されている原則に従って行うことができる。
[0288]本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物のいずれかのin vivo投与については、通常の投与量は、個体の体重及び投与経路に基づいて変動し得る。治療すべき疾患、障害、又は状態の重症度に応じて、数日以上にわたる反復投与の場合、所望の症状抑制が達成されるまで治療が継続される。
[0289]本開示の特定の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の用量は、本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の投与を受けた個体において経験的に決定され得る。いくつかの実施態様では、個体は、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の増分用量が与えられる。
[0290]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の有効性を評価するために、本開示の疾患、障害、又は状態のいずれかの臨床症状をモニターすることができる。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の有効性を評価するために、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、TLR7活性のレベルが、個体から得られた試料において測定され得る。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の有効性を評価するために、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、1つ又は複数のI型IFN(例えば、IFN-α、IFN-β、IFN-κ、IFN-δ、IFN-ε、IFN-τ、IFN-ω、又はIFN-ζ)が、個体から得られた試料において測定され得る。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の有効性を評価するために、IFN-αのレベルが、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、個体から得られた試料においてIFN-αのレベルが測定され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のインターフェロン刺激遺伝子(ISG)のレベルが、個体が本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の1つ又は複数の用量を受ける前及び/又は後に、個体から得られた試料において測定され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGは、当技術分野で知られている任意のISG、例えば、Shamith et al.,Nucleic Acids Research(2009)37,suppl_1;Schoggins and Rice,CurrOpin Virol(2011)1(6):519-525;Forster et al.,Nucleic Acids Research(2013)(database issue):D1040-D1046;Liu et al.,PNAS(2012)109(11):4239-4244に記載されている1つ又は複数のISGを含む。評価され得るISGの例としては、限定されるものではないが、IFIT1、CXCL10、CXCL11、ISG15、CCL8、2’5’OAS、APOBEC3G、APOBEC3A、PKR、ISG56、Mx2、MDA5、IFI44、IRF7、OASL1、ISG20 IFIT2、IFIT3、IFITM3、OAS2、OAS3、IFI16、IRF1、MX1、又はIDOが挙げられる。
[0291]いくつかの実施態様では、試料は血液試料、血漿試料、又は血清試料である。いくつかの実施態様では、試料は、例えば脾臓、1つ若しくは複数のリンパ節、又は腫瘍からの組織生検である。いくつかの実施態様では、I型IFNのレベルは、酵素結合免疫吸着法、イムノブロッティング、Luminexアッセイ(例えば、www.rndsystems.com/what-luminex-assayを参照)、ビーズベースのイムノアッセイなどのイムノアッセイ、Meso Scale Discovery(MSD)などの電気化学発光ベースの方法、フローサイトメトリーにより分析されるサイトカインの細胞内染色、又は質量分析法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して測定され得る。いくつかの実施態様では、I型IFNのレベルは、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して、I型IFNのmRNAレベルに基づいて評価され得る。いくつかの実施態様では、I型IFNのレベルは、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)、qPCR、又は組織試料中のRNAレベルを測定するための当技術分野で知られている他の任意の適切な方法によって評価され得る。いくつかの実施態様では、1つ又は複数のISGのレベルは、1つ又は複数のISGのmRNAレベルに基づいて、例えば、qPCR、RNA配列決定、マイクロアレイベースの方法、又は当技術分野で知られているmRNAを測定するための他の任意の適切な方法を使用して評価され得る。
[0292]本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の投与は、例えば、レシピエントの生理学的状態、投与の目的が治療的であるか予防的であるか、及び当業者に知られている他の要因に依存して、連続的又は断続的であり得る。本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物の投与は、事前に選択された期間にわたって本質的に連続的であり得るか、又は一連の間隔をあけた投与であり得る。
[0293]異なる製剤が異なる治療及び異なる疾患、障害、又は症状に対して有効であること、及び、特定の器官又は組織を治療することを意図とした投与では、別の器官又は組織への送達とは異なる方法での送達が必要であり得ることは、本開示の範囲内である。さらに、投与量は、1回若しくは複数回の別々の投与によって、又は連続的注入によって投与され得る。病態に応じて数日間以上にわたる反復投与の場合、治療は、疾患症状の所望される抑制が生じるまで持続される。しかしながら、他の投与レジメンが有用であってもよい。この治療法の進行は、従来の技術及びアッセイによって容易にモニターされる。
投与
[0294]本開示のRNAリガンドを含む本開示の免疫調節組成及び/又は薬学的組成物は、既知の方法、例えば、ボーラスとしての静脈内投与又は一定期間にわたる連続的注入による投与、筋肉内、腹腔内、脳脊髄内、頭蓋内、脊髄内、皮下、関節内、滑膜内、静脈内、動脈内、くも膜下腔内、経口、局所、又は吸入経路による投与などに従って、それを必要とする個体に投与され得る。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、静脈内注入によって投与される。いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物は、局所注射によって、例えば組織内又は器官内に投与される。本開示の免疫調節組成物又は組成物の投与は、例えば、免疫調節組成物又は薬学的組成物を標的器官又は組織に送達するためにカテーテル、注射器、又は同様の装置を使用するなど、当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して実施することができる。
[0295]本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物は、当技術分野で知られている任意の適切な形態で投与され得る。例えば、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物は、リポソーム、ポリマー微粒子、又はエマルジョンとして投与するために製剤化され得る。
[0296]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物は、リポソームとして投与するために製剤される。様々な両親媒性脂質が水性環境下で二重層を形成し、RNAリガンドを含む水性コアをリポソームとして封入することができる。これらの脂質は、アニオン性、カチオン性又は双性イオン性の親水性頭部基を有することができる。使用され得る脂質には、本明細書、例えば「担体」セクションに記載される、又は当技術分野で知られている任意の脂質が含まれる。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、限定されないが、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルコリン、ホスファチジルセリン、及びホスファチジルグリセロールなどの1つ又は複数のリン脂質を含む。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、限定されないが、DOTAP、1,2-ジステアリルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(DSDMA)、1,2-ジオレイルオキシ-N,Nジメチル-3-アミノプロパン(DODMA)、1,2-ジリノレイルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(DLinDMA)、DOTMA、又は1,2-ジリノレニルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(DLenDMA)などの1つ又は複数のカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、アシル双性イオン脂質、エーテル双性イオン脂質、DPPC、DOPC、又はドデシルホスホコリンなどの1つ又は複数の双性イオン脂質を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、飽和及び/又は不飽和脂質を含む。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、単一の脂質又は脂質の混合物を含む。いくつかの実施態様では、混合物は、(i)アニオン性脂質の混合物、(ii)カチオン性脂質の混合物、(iii)双性イオン性脂質の混合物、(iv)アニオン性脂質とカチオン性脂質の混合物、(v)アニオン性脂質と双性イオン性脂質の混合物、(vi)双性イオン性脂質とカチオン性脂質の混合物、又は(vii)アニオン性脂質、カチオン性脂質及び双性イオン性脂質の混合物を含み得る。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、コレステロールなどの非両親媒性脂質を含む。いくつかの実施態様では、本開示のリポソーム内の脂質は、ポリエチレングリコールの共有結合によって修飾され得る(すなわち、ペグ化)。例えば、Heyes et al.(2005)J Controlled Release 107:276-87を参照。いくつかの実施態様では、本開示のリポソームは、多重層小胞(MLV)、小型単層小胞(SUV)、大型単層小胞(LUV)、又はそれらの混合物である。MLVは各小胞内に複数の二重層を持ち、複数の別々の水性コンパートメントを形成する。SUVとLUVは、水性コアをカプセル化した単一の二重層を有する。SUVは通常、50nm未満の直径を有し、LUVは50nm超の直径を有する。リポソームの調製には、例えば、Weissing V(ed.).Liposomes:Methods and Protocols,Vol.1,Springer,12,29-50(2010);and Functional Polymer Colloids and Microparticles volume 4(Microspheres,microcapsules&liposomes)(eds.Arshady&Guyot).Citus Books,2002に記載されているような任意の適切な方法を使用することができる。
[0297]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物は、ポリマー微粒子として投与するために製剤される。様々なポリマーが微粒子を形成し、RNAをカプセル化したり吸着したりすることができる。使用され得るポリマーには、本明細書、例えば「担体」セクションに記載される、又は当技術分野で知られている任意のポリマー若しくはポリマー分子若しくは薬剤が含まれる。本開示の微粒子において使用され得るポリマーの例としては、限定されないが、ポリ(α-ヒドロキシ酸)、ポリヒドロキシ酪酸、ポリラクトン(ポリカプロラクトンを含む)、ポリジオキサノン、ポリバレロラクトン、ポリオルトエステル、ポリ酸無水物、ポリシアノアクリレート、チロシン由来のポリカーボネート、ポリビニルピロリジノン、ポリエステルアミド、ポリアミノ酸(例えば、ポリ-L-アルギニン、ポリ-L-リジン、ポリ-L-オルニチン)、及びそれらの組み合わせが挙げられる。適切な微粒子を調製する技術は当技術分野でよく知られている。RNAの吸着を促進するために、微粒子にはカチオン性界面活性剤及び/又は脂質が含まれていてもよい。ポリマー微粒子を作製する別の方法は、例えば国際公開第2009/132206号に開示されているように、成形及び硬化によるものである。
[0298]いくつかの実施態様では、本開示の免疫調節組成物又は薬学的組成物は、エマルジョンとして投与するために製剤される。本開示のエマルジョンは、限定されないが、動物、植物、又は合成源からの油などの1つ又は複数の油を含んでもよい。エマルジョンは、油の組み合わせからなることもある。エマルジョンの水性成分は水、例えば注射用水であってもよく、さらなる成分、例えば溶質を含んでいてもよい。例えば、緩衝液を形成するための塩、例えば、ナトリウム塩などのクエン酸塩又はリン酸塩を含んでもよい。典型的な緩衝液には、リン酸緩衝液;トリス緩衝液;ホウ酸緩衝液;コハク酸緩衝液;ヒスチジン緩衝液;又はクエン酸緩衝液が含まれる。いくつかの実施態様では、エマルジョンは、本明細書に記載されるか当技術分野で知られている任意のカチオン性脂質などのカチオン性脂質を含む。いくつかの実施態様では、エマルジョンは、非イオン性界面活性剤及び/又は双性イオン性界面活性剤を含む。そのような界面活性剤としては、限定されないが、ポリオキシエチレンソルビタンエステル界面活性剤(一般にTweensと呼ばれる)、例えば、ポリソルベート20及びポリソルベート80;エチレンオキシド(EO)、プロピレンオキシド(PO)、及び/又はブチレンオキシド(BO)の共重合体、例えば線状EO/POブロック共重合体;オクトキシノール-9(Triton X-100、又はt-オクチルフェノキシポリエトキシエタノール)などのオクトキシノール;(オクチルフェノキシ)ポリエトキシエタノール(IGEPAL CA-630/NP-40);ホスファチジルコリン(レシチン)などのリン脂質;ラウリル、セチル、ステアリル及びオレイルアルコールから誘導されるポリオキシエチレン脂肪酸エーテル(Brij界面活性剤として知られている)、例えばトリエチレングリコールモノラウリルエーテル(Brij 30);ポリオキシエチレン-9-ラウリルエーテル;及びソルビタンエステル(一般にSpanとして知られている)、例えばソルビタントリオレエート(Span 85)及びソルビタンモノラウレートが挙げられる。いくつかの実施態様では、エマルジョンは、本明細書に記載される、及び/又は当技術分野で知られている任意の適切な界面活性剤の混合物を含む。油と界面活性剤の絶対量とその比率は、エマルジョンを形成しながらも広い範囲内で変えることができる。当業者であれば、所望のエマルジョンを得るために成分の相対比率を変えることができる。液滴サイズは、動的光散乱及び/又は単一粒子光学センシングなどの当技術分野で知られている任意の方法、例えば、Particle Sizing Systems(米国サンタバーバラ)から入手可能なAccusizerTM及びNicompTMシリーズの装置、Malvern Instruments(英国)のZetasizerTM装置、又は堀場製作所(日本、京都)の粒度分布分析装置を使用して評価することができる。本開示のエマルジョンは、顕微溶液化法又は熱法などの当技術分野で知られている任意の適切な方法を使用して調製することができる。
[0299]本開示の免疫調節組成物及び/又は薬学的組成物の投与は、別の化合物、組成物、若しくは薬剤と組み合わせて、又は併用して実施することができる。このような投与には、同時投与及び/又は異なる時間での投与が含まれる。併用又は組み合わせての投与はまた、異なる投与頻度又は間隔での投与、及び同じ投与経路又は異なる投与経路を用いた投与を含む、共製剤としての投与又は別個の組成物としての投与を包含する。
キット
[0300]本開示は、本開示の免疫調節組成物、核酸、ベクター、薬学的組成物、又はワクチン組成物を含むキットも提供する。本開示のキットは、本開示の免疫調節組成物、核酸、ベクター、薬学的組成物、又はワクチン組成物を含む1つ又は複数の容器を含み得る。いくつかの実施態様では、キットは、本開示の方法に従って使用するための説明書をさらに含む。いくつかの実施態様では、これらの説明書は、本開示の任意の方法に従って、本明細書に記載される疾患、障害、又は状態を有する個体を予防し、リスクを低減し、又は治療するための、本開示の免疫調節組成物、核酸、ベクター、薬学的組成物、又はワクチン組成物の投与又は使用の説明を含む。説明書には通常、目的の治療のための投与量、投与スケジュール、投与経路に関する情報が含まれている。
[0301]いくつかの実施態様では、キットは、(例えば、同じ容器内又は1つ若しくは複数の追加の容器内に)追加の薬剤、例えば別の免疫調節組成物、核酸、タンパク質又はポリペプチド(例えば、抗体又はその断片)、ワクチン又はワクチン組成物、アジュバント、及び/又は1つ若しくは複数の薬物、例えば、化学療法剤、細胞傷害性剤、サイトカイン、成長阻害剤、抗ホルモン剤、及び/又は心臓保護剤をさらに含んでもよい。いくつかの実施態様では、キットは、(例えば、同じ容器内又は1つ若しくは複数の追加の容器内に)免疫賦活性剤、抗ウイルス剤、抗生物質、抗真菌剤、抗寄生虫剤、抗菌剤、抗腫瘍剤、ケモカイン、成長因子、抗血管新生因子、化学療法剤、抗体、遺伝子サイレンシング剤、又はサイトカイン(例えば、IFN-α及び/又はIFN-βなどのI型IFN)のうちの1つ又は複数をさらに含んでもよい。いくつかの実施態様では、キットは、本開示の免疫調節組成物、核酸、ベクター、薬学的組成物、又はワクチン組成物を、本開示の任意の方法に従って、追加の薬剤、例えば、別の免疫調節組成物、核酸、タンパク質又はポリペプチド(例えば、抗体又はその断片)、ワクチン又はワクチン組成物、アジュバント、1つ又は複数の薬物、例えば、化学療法剤、細胞傷害性剤、サイトカイン、成長阻害剤、抗ホルモン剤、心臓保護剤、免疫刺激剤、抗ウイルス剤、抗生物質、抗真菌剤、抗寄生虫剤、抗細菌剤、抗腫瘍剤、ケモカイン、成長因子、抗血管新生因子、化学療法剤、抗体、遺伝子サイレンシング剤、又はサイトカイン(例えば、IFN-α及び/又はIFN-βなどのI型IFN)と組み合わせて使用するための説明書をさらに含んでもよい。説明書には通常、目的の治療のための投与量、投与スケジュール、投与経路に関する情報が含まれている。
[0302]キット内の容器は、単位用量、バルクパッケージ(例えば、複数回用量パッケージ)、又はサブユニット用量であり得る。
[0303]本開示のキットに提供される説明書は、典型的には、ラベル又は添付文書(例えば、キットに含まれる紙シート)に書かれた説明書であるが、機械読み取り可能な説明書(例えば、磁気又は光学記憶ディスクに記録された説明書)も本開示内容に含まれる。ラベル又は添付文書は、免疫調節組成物、核酸、ベクター、薬学的組成物、又はワクチン組成物、及び任意の追加の薬剤が、例えば、本開示の疾患、障害、又は状態を治療又は予防するために使用されることを示す。本明細書に記載されている方法のいずれかを実践するための説明書が提供され得る。
[0304]本開示のキットは、適切な包装に入っている。適切な包装には、バイアル、ボトル、瓶、柔軟な包装(例えば、密封されたマイラー又はビニール袋)などが含まれるが、これらに限定されない。また、吸入器、鼻腔投与装置(例えば、噴霧器)、又はミニポンプなどの注入装置などの特定の装置と組み合わせて使用するためのパッケージも企図される。キットは、滅菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、皮下注射針によって穿刺可能なストッパーを有する静脈用溶液袋又はバイアルであり得る)。容器は、滅菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、皮下注射針によって穿刺可能なストッパーを有する静脈用溶液袋又はバイアルであり得る)。
[0305]キットは任意で、緩衝液や解釈情報などの追加コンポーネントを提供する場合がある。通常、キットは、容器と、容器上の、又は容器に付随するラベル若しくは添付文書とを含む。
[0306]本開示全体にわたるすべての引用は、参照により明示的に本明細書に組み込まれる。
実施例
[0307]本開示は、以下の実施例を参照することによってより完全に理解されるであろう。しかしながら、それらは、本開示の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書に記載の実施例及び実施態様が、例示を目的とするものに過ぎないこと、並びにそれを考慮に入れた様々な改変又は変更が当業者に提案され、本出願の趣旨及び範囲内並びに添付の特許請求の範囲内に含まれるべきであることを理解されたい。
[0308]以下の実施例に示す塩基配列において、アスタリスク()はホスホロチオエート結合を示し、「-」はホスホジエステル結合を示す。
実施例1:TLR7選択的RNAリガンドの設計。
[0309]この実施例は、TLR8を活性化する可能性のあるウリジン単量体の生成を回避するために、特定のヌクレオチドでRNase切断をブロックするRNA修飾を有するTLR7選択的リガンドの設計について説明する。
A.RNase切断をブロックするRNA修飾を伴うTLR7選択的リガンドを生成するための初期RNA配列の選択
[0310]最大のTLR7選択性を達成するために、TLR8よりもTLR7に対してある程度の選択性を有することが知られているRNA配列を選択して、TLR7選択性リガンドを生成した。
ORN7013
[0311]最初に選択されたRNA配列は、オリゴリボヌクレオチド7013(ORN7013)と呼ばれ、ヌクレオチド配列CC(配列番号1)を有し、Forsbachetal.,JImmunology(2008)180:3729-3738に由来している。ORN7013は非刺激性配列が隣接する4つのウリジンを含み、完全にホスホロチオエート修飾されている。
ORN7023
[0312]第2の選択されたRNA配列は、Hartmannらによって国際公開第2010/105819号に記載されているように、R2153に由来し、本明細書ではORN7023と呼ばれる。ORN7023は、ヌクレオチド配列C-G-G-C-U-C-G-G-C-A-G-A-A-G-C-C-G-G-G-C-C(配列番号2)を有し、G:Uウォブル塩基対を含む、下線を引いた配列の対形成によって短い標準RNAヘアピンを形成する(図4)。
ORN7005及びORN7009
[0313]追加の選択されたRNA配列には、ヌクレオチド配列U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C(配列番号3)を有するORN7005、及びヌクレオチド配列C-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C(配列番号4)を有するORN7009が含まれていた。ORN7005及びORN7009は、それぞれpU1C及びpU2Cに由来した(例えば、Zhang et al.,2018,Cell Reports 25,3371-3381を参照)。ORN7005及びORN7009は、ホスホジエステル(PDE)骨格に基づいている。ORN7005及びORN7009は、TLR8結合部位#2で最も活性であるUGモチーフを含まず(例えば、Tanji et al Nat Struct Mol Biol.2015 eb;22(2):109-15を参照)、TLR7の活性化を達成するには、別個の薬剤としてのグアノシンの投与が必要である可能性がある。
ORN7001
[0314]最後に、TLR7結合部位#1のグアノシン供給源として機能し、結合部位#2のTLR8結合を回避するために、アデノシンが隣接するグアノシンを含むタンデム配列を含む追加のリガンドを新規に設計した。ORN7001と呼ばれるこの新規に設計されたリガンドは、ヌクレオチド配列C-A-G-A-C-C-U-U-C-C-A-G-A-C-C-U-U-C(配列番号5)を有する。ORN7001の配列はまた、TLR7結合部位#2に対する2つの潜在的なモチーフ:C-U-U(配列番号54)及びU-U-C(配列番号55)を有する、C/UリッチC-U-U-Cモチーフ(配列番号32)を含む。
[0315]TLR7選択的リガンドを生成するために選択された最初のRNA配列の概要を表1に示す。
表1.TLR7選択的リガンドの生成のために選択されたRNA配列。
Figure 2024516575000002
B.TLR7選択的リガンドを生成するための骨格修飾に適した、選択されたRNA配列内の位置の選択
[0316]図5に示すように、結合部位#2でTLR7によって結合されるRNA三量体(U-U-U)の中央のウリジンは、2’OH(2’OH2)を含む結合ポケットに深く埋め込まれている。この2’OHの修飾はTLR7活性に影響を与える可能性があり、そのため修飾できない可能性が高いことを示唆している。対照的に、隣接するヌクレオチドの2’OH部分(2’OH及び2’OH)は、結合ポケットのより開いた部分に位置しているように見える(図5)。そこで、ウリジン単量体となり得るすべてのウリジンの5’直下のヌクレオチドの修飾が追求された。
[0317]RNase耐性を達成するために、嵩高ではないがヌクレアーゼ耐性の低い2’-フルオロ修飾と、ヌクレアーゼ耐性だが嵩高な2’-O-メチル修飾の両方が追求された。2’-フルオロ修飾は、RNA骨格からRNase活性に必要な2’OHを奪うが、依然としてエキソヌクレアーゼの標的となる可能性がある。対照的に、2’-O-メチル化は、任意のヌクレアーゼの結合をブロックする嵩高い修飾を導入する。例えば、図3を参照。
C.RTLR7選択的リガンドを生成するためのRNA修飾の導入
[0318]特定のヌクレオチドでのRNase媒介切断を特異的にブロックするRNA修飾を、上記の選択されたRNA配列に導入した。修飾の目的は、TLR7結合部位#2(すなわち、配列N-U-N(配列番号6)、NN(配列番号63)、又はN-UN(配列番号64)を有し、ここでNは任意のリボヌクレオチドを表す)に結合し、TLR8結合部位#1のリガンドである単量体Uに分解されないRNA三量体分解産物の生成を可能にすることであった。
ORN7013修飾
[0319]以下に示すように、Forsbach et al.,J Immunology(2008)180:3729-3738に由来するORN7013のヌクレオチド配列(配列番号1)は、TLR7及びTLR8を活性化し得る下線が引かれたモチーフCC(配列番号7)を含む。
C(配列番号1)
[0320]CCモチーフ(配列番号7)は、TLR7結合部位#2モチーフであるCU(配列番号8)、UU(配列番号9)、又はUC(配列番号10)に分解することができ、さらにTLR8結合部位#1リガンドである単量体Uに分解することができる。
[0321]TLR7選択的リガンドを生成するために、CCモチーフ(配列番号7)のU及びUを修飾した。これにより、TLR7結合部位#2モチーフ内の中央のUを通常の(すなわち、未修飾の)リボヌクレオチドとして保存することが可能になった(例えば、図5を参照)。CCモチーフ(配列番号7)のU及びUの修飾により、UとU、及びUとUの間の結合が生じ、RNase分解から保護されるため、単量体Uの生成が防止される。このRNase分解からの保護により、UとUの間、及びUとUの間のホスホロチオエート結合のホスホジエステル結合への交換も可能になった。これにより、特に2つのそれぞれのヌクレオチド間の既に修飾された空間の修飾が減少した。
[0322]上述のCCモチーフ(配列番号7)の修飾により、新しいモチーフCX-UX-UC(配列番号11)がもたらされ、Xは2’-フルオロ-U又は2’O-メチル-Uを表す。未修飾のUがTLR7結合部位#2モチーフの中央のUであると仮定すると、残りのモチーフはX-U (配列番号53)及びX-U (配列番号52)となるであろう。表2に示すように、2つの異なる修飾を有する2つの修飾部位の組み合わせにより、ORN7014~7017(配列番号12~15に対応)と呼ばれる、個々のモチーフを有する4つのORNが得られた。
表2.TLR7選択的リガンドを生成するためのORN7013の修飾。
Figure 2024516575000003
[0323]Forsbach et al.,J Immunology(2008)180:3729-3738に由来するORN7013も、ホスホロチオエート修飾を減らすために修飾された。具体的には、CCモチーフ(配列番号7)のヌクレオチドを除くすべてのヌクレオチドは、ホスホロチオエート修飾骨格ではなくホスホジエステル骨格によって連結されていた。これにより、ヌクレオチド配列C-C-G-A-G-C-C-G- C-C-C(配列番号16)を有するORN7022が得られた。ORN7014~7017に相当する修飾ORNは、ORN7022に基づいて設計され、配列番号17~20に対応するORN7018~ORN7021が得られた(表3)。
表3.TLR7選択的リガンドを生成するための、ホスホロチオエート結合を減少させたORN7013の追加修飾。
Figure 2024516575000004
ORN7023修飾
[0324]以下に示すように、国際公開第2010/105819号(Hartmannら)に由来するORN7023のヌクレオチド配列(配列番号2)は、ORN7023のヌクレオチド4~6:C-U-C(配列番号21)からなるTLR7結合部位#2モチーフを1つだけ含む(下線):
C-G-G-C-U-C-G-G-C-A-G-A-A-G-C-C-G-G-G-C-C(配列番号2)
[0325]C-U-Cモチーフ(配列番号21)の中央のUは未修飾のままである必要があると仮定されていたため(例えば、図5を参照)、モチーフ内のCは2’フルオロ-又は2’-O-メチル修飾で修飾され、修飾されたモチーフ:D-U-C(配列番号22)(Dは2’-フルオロ-C又は2’O-メチル-Cのいずれかを表す)をもたらした。これにより、モチーフfC-U-C(配列番号42)を有する2’-フルオロ-C修飾ORN7023F(配列番号23)、及びモチーフmC-U-C(配列番号43)を有する2’O-メチル-C-修飾ORN7023Ome(配列番号24)が得られた。
[0326]2’未修飾配列及びホスホジエステル結合からホスホロチオエート結合に変換された骨格を含む、ORN7023の追加バージョンが生成された(ORN7024;配列番号25)。
[0327]ORN7023に由来する修飾ORNを表4にまとめた。
表4.TLR7選択的リガンドを生成するためのORN7023の修飾。
Figure 2024516575000005
ORN7005修飾
[0328]pU1Cに由来するORN7005(Zhang et al.,2018,Cell Reports 25,3371-3381を参照)は、次のヌクレオチド配列を有する:
U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C-U-C(配列番号3)
[0329]ORN7005のヌクレオチド配列(配列番号3)では、切断を回避し未修飾のU残基を保存するために、すべてのC残基が2’O-メチル修飾又は2’-フルオロ修飾のいずれかで修飾されていた。これにより、2’O-メチル修飾ORN7006(配列番号26)、及び2’-フルオロ修飾ORN7007(配列番号27)が得られた。さらに、ホスホロチオエート修飾によって与えられる制限されたRNase耐性が活性を増加させることができるかどうかを試験するために、ORN7005の完全ホスホロチオエート修飾バージョンが生成され、ORN7008(配列番号28)が得られた。
[0330]ORN7005に由来する修飾ORNを表5にまとめた。
表5.TLR7選択的リガンドを生成するためのORN7005の修飾。
Figure 2024516575000006
ORN7009修飾
[0331]pU2Cに由来するORN7009(Zhang et al.,2018,Cell Reports 25,3371-3381を参照)は、次のヌクレオチド配列を有する:
C-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C-U-U-C(配列番号4)
[0332]ORN7009のヌクレオチド配列(配列番号4)は、複数のU-U-Cリピート(配列番号39)を含む。ORN7009の各U-U-Cリピート(配列番号39)の最初のUは、2’O-メチル修飾又は2’-フルオロ修飾のいずれかで修飾された。これにより、修飾されたmU-U-Cリピート(配列番号40)を有する2’O-メチル修飾ORN7010(配列番号29)、及び修飾されたfU-U-Cリピート(配列番号41)を有する2’-フルオロ修飾ORN7011(配列番号30)が得られた。さらに、ホスホロチオエート修飾によって与えられる制限されたRNase耐性が活性を増加させることができるかどうかを試験するために、ORN7009の完全ホスホロチオエート修飾バージョンが生成され、ORN7012(配列番号31)が得られた。
[0333]ORN7009に由来する修飾ORNを表6にまとめた。
表6.TLR7選択的リガンドを生成するためのORN7009の修飾。
Figure 2024516575000007
ORN7001修飾
[0334]上述のように新規に設計されたORN7001のヌクレオチド配列(配列番号5)は、2つのC-U-U-Cモチーフ(配列番号32)を含む:
C-A-G-A-C-C-U-U-C-C-A-G-A-C-C-U-U-C(配列番号5)
[0335]ORN7001のC-U-U-Cモチーフ(配列番号32)の最初のUは、2-フルオロ又は2’-O-メチル修飾で修飾され、その結果、修飾されたモチーフC-mU-U-C(配列番号36)を有するORN7002(配列番号33)及び修飾されたモチーフC-fU-U-C(配列番号37)を有するORN7003(配列番号34)が得られた。さらに、C-U-U-Cモチーフ全体(配列番号32)がホスホロチオエートで修飾された修飾ORNがORN7001から生成され、その結果、修飾モチーフCC(配列番号38)を有するORN7004(配列番号35)が得られた。
[0336]ORN7001に由来する修飾ORNを表7にまとめた。
表7.TLR7選択的リガンドを生成するためのORN7001の修飾。
Figure 2024516575000008
実施例2:TLR7選択的RNAリガンドの生成と機能的特徴づけ。
[0337]本実施例は、実施例1に記載されたRNAリガンドのTLR7選択性及び活性を評価した実験について記載する。これらの実験の結果は、ORN7013(Forsbach et al.,J Immunology(2008)180:3729-3738に由来)及びORN7023(国際公開第2010/105819号に由来)に由来する特定の修飾RNAリガンドが、TLR7選択性及び活性を増強したことを示した。
材料及び方法
RNA生産
[0338]RNAオリゴマーは、Integrated DNA Technologies社(IDT)によって合成され、HPLCで精製された。
[0339]IVT4の生産のために、DNAオリゴヌクレオチドIVT4-fwd(5’T-T-G-T-A-A-T-A-C-G-A-C-T-C-A-C-T-A-T-A-G-G-G-A-C-G-C-T-G-A-C-C-C-A-G-A-A-G-A-T-C-T-A-C-T-A-G-A-A-A-T-A-G-T-A-G-A-T-C-T-T-C-T-G-G-G-T-C-A-G-C-G-T-C-C-C3’;配列番号65)及びIVT4-rev(5’G-G-G-A-C-G-C-T-G-A-C-C-C-A-G-A-A-G-A-T-C-T-A-C-T-A-T-T-T-C-T-A-G-T-A-G-A-T-C-T-T-C-T-G-G-G-T-C-A-G-C-G-T-C-C-C-T-A-T-A-G-T-G-A-G-T-C-G-T-A-T-T-A-C-A-A3’;配列番号66)を、アニーリング緩衝液(25mMトリス-HCl、25mM NaCl、pH7.4)中で、95℃まで3分間加熱し、15分間かけて室温まで冷却することによりアニーリングした。次いで、このテンプレートを、マニュアルに従ってTranscriptAid T7 High Yield Transcription Kitを使用してin vitro転写に使用した。次いで、mini Quick Spin DNA Columns(Roche)を使用してRNAを精製した。
PBMC単離
末梢血単核球(PBMC)は、健康な成人ドナーからのバフィーコートから得られた。最初に、バフィーコート試料を等量のリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で希釈した。次に、PBMCを、Lymphoprep密度勾配培地(STEMCELL Technologies)及びSepMate-50チューブ(STEMCELL Technologies)を使用した密度勾配遠心分離によって単離した。試料を1000gで15分間遠心分離した。遠心分離後、上層を新しいチューブに注いで集め、PBSで希釈し、450xgで5分間遠心分離した。赤血球を溶解するために、細胞ペレットを10mLの塩化アンモニウム-カリウム(ACK)溶解緩衝液で再懸濁し、室温で8分間インキュベートした。溶解後、細胞をPBSで洗浄し、2つの70μmセルストレーナーに通した。生細胞数は、Vi-CELL細胞計数器(Beckman Coulter)を用いて測定した。PBMCを、10%熱不活化ウシ胎児血清、1%L-グルタミン、及び1XPen/Strepを含むRPMI培地中で1ウェルあたり4x10細胞の濃度で96ウェル丸底プレートに播種した。
pDCの枯渇
[0341]形質細胞様樹状細胞(pDC)枯渇実験のために、PBMCを上記のように単離した。pDCは、CD303 Microbead Kit、ヒト(Miltenyi Biotec)を使用して枯渇させた。
PBMCの刺激
[0342]グアノシンは、ポリ-L-アルギニン(p-L-アルギニン)複合体化RNAの添加前の約20分~約30分の間に加えた。
[0343]p-L-アルギニン-RNA複合体を生成するために、0.2μgのRNAを15μlのPBSに添加し、0.38μgのp-L-アルギニン(>70000kDa、Sigma #P3892)を加えた(ウェルあたり)。上下にピペッティングして混合した後、反応液を10分間インキュベートし、再度上下にピペッティングし、細胞に加えた。いくつかの実験では、RNAリガンドを最終濃度0.6μg/mlで使用した。「+2’3’cGMP」と示されている場合、eMoleculesから購入した2’3’環状GMPをRNAリガンドと一緒に複合体化させた。2’3’環状GMPの最終濃度は5μg/mlであった。p-L-アルギニンは、核酸:p-L-アルギニンの質量比を一定に保つように調整された。
[0344]IVT4のリポフェクタミン2000トランスフェクションでは、反応ごとに0.5μlのリポフェクタミン2000(Thermo Fisher Scientific)を25μlのOpti-MEMに加えた。混合物をよく混合し、室温で5分間インキュベートした。インキュベーション中に、2ngのIVT4を25μlのOpti-MEMに加えた。リポフェクタミン/Opti-MEM混合物を希釈したIVT4に加え、ピペッティングで上下に混合した。混合物を室温で20分間インキュベートし、次いで細胞に加えた。
[0345]DOTAP-RNA複合体を生成するために、DOTAPとOpti-MEM、又はRNAとOpti-MEMを含むマスターミックスを作成し、室温で5分間インキュベートした。次いで、2つのマスターミックスを、最終的なRNA:DOTAP質量比1:5で混合した。次いで、細胞に添加する前に、混合物を室温で20分間インキュベートした。
サイトカイン検出
[0346]細胞培養上清は、刺激の15~18時間後に回収し、-80℃で保存した。細胞培養上清中のサイトカインは、BD OptEIAヒトTNF ELISAセット(BD Biosciences)、及びInvitrogen IFNアルファヒトマッチ抗体ペアキット(Thermo Fisher Scientific)又はヒトIFNアルファマルチサブタイプELISAキット(PBL Assay Science)を用いて検出した。
粒子分布
[0347]粒子サイズは、動的光散乱法(Wyatt Technology)によって測定された。試料を384ウェルプレートの複数のウェルに配置し、各ウェルを5秒間10回測定した。Z平均が報告された。
RNase切断
[0348]切断アッセイは、以下の修正を加えて、Ostendorf et al.,(2020)52(4):591-605に記載されているように実施した。0.5μgの各RNAリガンドを15μlの反応液中で組換えRNase T2(Origene)とともにインキュベートした。反応物を3、6、9、及び12分間インキュベートする4点の時間コースを実行した。反応は100mM Tris-HCL(pH7.5)で停止させた。2XTBE-尿素試料緩衝液(Thermo LC6876)を加え、反応物を70℃で3分間インキュベートした。次いで、反応物を15%TBE-尿素PAGEゲルにロードし、150Vで1.5時間実行した。ゲルは、SYBR Gold(Invitrogen)を用いて1:10Kで染色された。
結果
特定の修飾RNAリガンドはPBMCにおけるTLR7選択性と活性を増強する
[0349]TLR7及びTLR8の活性化に対する実施例1に記載のRNAリガンドの効果を試験するために、p-L-アルギニン複合体送達、DOTAPを用いた送達、又は担体を用いない送達を使用して、PBMCをRNAリガンドで刺激した。TLR7及びTLR8の活性は、酵素結合免疫吸着法(ELISA)によるIFN-α又はTNF-αの測定に基づいて評価された。
[0350]この設定において、図6に示すように、低分子RNAによって誘導されるIFN-αは、pDCによって発現されるTLR7、又は単球によって発現されるRIG-Iに由来する。対照的に、TNF-α分泌は単球に由来し、TLR8活性化の指標として機能する。この図に示されるように、p-L-アルギニンの送達により、活性化のほとんどがTLRに限定される。
p-L-アルギニン送達
[0351]最初に、p-L-アルギニン複合体送達を使用したTLR7及びTLR8活性化に対するRNAリガンドの効果を試験した。
[0352]図7に示すように、ORN7005(Zhang et al.,2018のpU1Cに由来)、ORN7009(Zhang et al.,2018のpU2Cに由来)、及びORN7001(新規に設計されたリガンド)は、IFN-α分泌を誘導しないか、又はわずかなIFN-α分泌しか誘導せず、TLR7活性が限定的であることを示している。さらに、ORN7005、ORN7009、及びORN7001に由来するいくつかの修飾ORNは、TNF-α分泌によって証明されるように、顕著なTLR8活性を示した。ORN7005-7008及びORN7009-7012は、外因性グアノシンがTLR7結合部位#1のリガンドとして提供された場合に、TLR7活性を示すことが予測された。この状態において観察されたIFN-α分泌の欠如は予想外であった。技術的なエラーを排除するために、ORN7005~7008及びORN7009~7012の実験が次の変更を加えて繰り返された:(1)グアノシンは、RNA分解産物を模倣したグアノシン誘導体2’3’環状GMP(2’3’cGMP)に置き換えられた;(2)2’3’cGMPは、細胞培養培地に直接添加されるのではなく、p-L-アルギニン複合体に含有させた;及び(3)IFN-αの検出には、より感度の高いELISAキットが使用された。図12に示すように、ORN7005~7008及びORN7009~7012では、TLR7結合部位#1のリガンドとして2’3’cGMPと同時送達すると、TLR7を活性化してIFN-α分泌を誘導する能力が著しく増強された。注目すべきことに、ドナーや実験ごとにばらつきがあった;具体的には、1人のドナーは、ORN7005単独に対して予想外に高いIFN-α応答を示した(図16A~16B)。しかし、データ全体を総合すると、RNAリガンドがグアノシン類似体と対になった場合にIFN-α産生が増加する傾向は依然として一貫している。2’-フルオロ及び2’O-メチル修飾バージョン(すなわち、ORN7006、ORN7007、ORN7010、ORN7011)は、2’3’GMPと同時送達された場合、測定可能なTNF-αがほとんど又は全くなく、強力なIFN-α誘導を実証し、TLR7選択性を示している。
[0353]対照的に、図7に示すように、ORN7013(Forsbach et al.,J Immunology(2008)180:3729-3738に由来)の限定されたTLR7選択性及び活性が確認された。さらに、ORN7014~7017(ORN7013の修飾バージョン)に導入された修飾は、ORN7013と比較して、維持された(又はより低い)IFN-α分泌レベル及び大幅に減少したTNF-α分泌レベルによって示されるように、ORN7013と比較してTLR7選択性をさらに高めることが判明した。ORN7013に由来するホスホジエステル結合ORN(ORN7022及びORN7018~7021)は、ポリ-L-アルギニンを使用して送達された場合、TLR7活性を欠いていた。
[0354]同様に、図7に示すように、ORN7023(国際公開第2010/105819号に由来)への修飾の導入は、活性をさらに増加させながら、TLR7選択性を維持した(図7のORN7023F及びORN7023Omeを参照)。しかし、ORN7023由来のホスホロチオエート修飾RNAリガンドであるORN7024は活性が低下していた。
DOTAP送達
[0355]次に、DOTAP送達を使用したTLR7及びTLR8の活性化に対するRNAリガンドの効果を、2つの異なる濃度のRNAリガンド、0.6μg/ml及び2μg/mlで試験した。
[0356]図10A~10Bに示すように、ORN7001(新規に設計されたリガンド)は、それぞれIFN-α及びTNF-αの分泌によって示される、TLR7及びTLR8活性を誘導した。ORN7001の2’O-メチル修飾バージョンであるORN7002は活性が低下していた。対照的に、ORN7001の2’-フルオロ修飾バージョンであるORN7003は、ORN7001と比較してTLR7活性を維持したが、TLR8活性は消失した。ORN7001のホスホロチオエート結合バージョンであるORN7004は、TLR7活性をわずかに増加させ、TLR8活性を顕著に増加させた。
[0357]ORN7005(Zhang et al.,2018のpU1Cに由来)及びORN7009(Zhang et al.,2018のpU2Cに由来)は、TLR7ではなくTLR8を活性化した。ORN7005とORN7009のホスホロチオエート修飾(すなわち、それぞれORN7008とORN7012)は、TLR8の活性化をさらに増加させた。ORN7005とORN7009の2’O-メチル修飾バージョン(すなわち、それぞれORN7006とORN7010)は、TLR8とTLR7の両方の活性化を低下させた。さらに、ORN7005の2’フルオロ修飾バージョン(すなわちORN7007)も活性を低下させた。ORN7009の2’-フルオロ修飾バージョンであるORN7011は、2μg/mlという高濃度でTLR7活性を有していたが(図10B)、TLR8活性はなかった。重要なことは、これらのRNAリガンド(すなわち、ORN7005~ORN7012)のTLR7活性は、TLR7結合部位#1のリガンドとして働くグアノシン又はグアノシン誘導体が存在しないため、この設定では最適でない可能性があるということである。したがって、グアノシン又はグアノシン誘導体とRNAリガンド-DOTAP複合体との同時送達は、p-L-アルギニン複合体送達の設定において観察されたように、TLR7活性を増強する可能性がある(図12)。
[0358]ORN7013(Forsbach et al.,J Immunology(2008)180:3729-3738に由来)及びその修飾バージョンORN7014~ORN7017は、TLR8を活性化し、TLR7を活性化しないか、又は活性を有しなかった。ORN7013の2’-フルオロ修飾及びホスホジエステル結合バージョンであるORN7019は、0.6μg/mlの濃度で選択的なTLR7活性化を示した(図10A)。しかしながら、ORN7019はまた、2μg/mlの濃度でTLR8活性を有していた(図10B)。ORN7013のホスホジエステル結合バージョンであるORN7022は、0.6μg/ml及び2μg/mlの濃度の両方でTLR7及びTLR8の両方を活性化した(図10A~10B)。ORN7013(Forsbach et al.,J Immunology(2008)180:3729-3738に由来)に基づく他のすべてのRNAリガンドは、DOTAPを使用して送達された場合、TLR7活性化が低かったか、又はまったく活性化されなかった。
[0359]したがって、これらの結果は、DOTAPを用いて送達した場合、ポリ-L-アルギニンを用いた送達と比較して、異なるスペクトルのRNAリガンドが最も高い活性を示したことを示している。
担体なしの送達
[0360]最後に、担体なしの送達を使用したTLR7及びTLR8の活性化に対するRNAリガンドの効果を、RNAリガンドの濃度10μg/mlで試験した。図11に示すように、RNAリガンドはいずれも、担体なしで送達された場合、再現性のあるTLR7又はTLR8の活性化を示さなかった。
修飾RNAリガンドの活性はpDCにおいて発現されるTLR7に特異的である
[0361]PBMCにおいて、TLR7活性化に伴うIFN-α分泌は専らpDCに由来し、一方、RIG-I(短い二本鎖5’三リン酸RNAのセンサー)の活性化に伴うIFN-α分泌は単球に依存する。そこで、上記のRNAリガンドのTLR7対RIG-I特異性を確認するために、RNAリガンドのトランスフェクション前にpDCをPBMCから枯渇させた。
[0362]図8及び13~14に示すように、IFN-αの分泌はpDC枯渇によって抑制され、RIG-IではなくRNAリガンドによるTLR7の活性化がIFN-αの分泌の原因であることが示された。RIG-Iは主に単球によって発現されるため、RIG-Iリガンド3P-RNA(IVT4)のリポフェクタミン媒介トランスフェクション後のIFN-α分泌は、pDC枯渇後も維持された。
修飾RNAリガンドの活性はナノ粒子の構造の違いによって引き起こされるものではない
[0363]ポリ-L-アルギニンと複合体化したオリゴヌクレオチドによる刺激後のIFN-α対IL-12p70の生成は、おそらく粒子サイズの変化に起因して、時間依存性であることが以前に報告されており、例えば、Wimmenauer V.Identifikation immunstimulatorischer Nukleinsaeureliganden zur Stimulation von Rezeptoren der angeborenen Immunantwort.2009.ボン・ライニッシュ・フリードリヒ・ヴィルヘルムス大学博士論文を参照。オンライン版は次のWebサイトで入手できる:nbn-resolve.org/urn:nbn:de:hbz:5N-17312(特に62及び66ページを参照)。
[0364]特定の配列によって誘導されるIFN-α又はTNF-αの生成が粒子サイズの違いによるものかどうかを決定するために、動的光散乱法を使用して様々なRNA-ポリ-L-アルギニン複合体の粒子サイズを分析した。図9に示すように、TLR7選択的で高活性なORN7023Omeを含む粒子は、TLR8活性なORN7012、TLR7選択性が低く活性なORN7013、中程度に選択的で活性なORN7015、TLR7選択的だが活性が弱いORN7016、及び陰性対照のpCAを含む粒子と同様の挙動を示した。インキュベーション時間はすべてのオリゴリボヌクレオチドで同じ(10分)であり、10分の時点では直径が同程度であったことから、図9に示す結果は、異なるオリゴリボヌクレオチド間で見られるTLR7選択性と活性の範囲は、粒子サイズの違いによるものではないことを示唆している。
修飾RNAリガンドのRNase媒介分解は2’フルオロ及び2’-O-メチル修飾によって阻害される
[0365]2’位のRNA修飾がRNAse切断活性を妨げるかどうかを評価するために、組換えRNase T2を様々なRNAリガンドとインキュベートすることにより、一連のin vitro切断アッセイを実行した。RNAse T2は遍在的に発現しており、重要なことは、それがTLR7を発現する細胞型において活性であることである。さらに、RNAse T2はTLR8の活性化に重要であることが確認されている(Ostendorf et al,(2020)52(4):591-605)。
[0366]各RNAリガンドを最適量のRNase T2とインキュベートする時間経過を実行し、各反応からの分解生成物をTBE-尿素PAGEゲル上で視覚化した。ORN7013-7017と7009-7012が試験された。
[0367]それぞれの場合において、ゲル上の完全なRNAリガンドレベルの減少によって見られるように、非修飾RNAリガンド(すなわち、ORN7013及びORN7009)はより速く分解された(図15A~15B)。注目すべきことに、ORN7010~7012は、RNase活性に対してより強力な保護を示した。これは、おそらく、それらが、ORN7014~7017と比較して、それらの配列により、より高い割合の2’-修飾ウリジンを有するという事実によるものである(図15B)。
配列
表8
Figure 2024516575000009
Figure 2024516575000010
Figure 2024516575000011
Figure 2024516575000012

Claims (152)

  1. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドは:
    (a)式IIを含むTLR7選択的モチーフ:
    -U -U (式II)、
    (式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、U、U、U、及びUはウリジンヌクレオシドであり、
    は、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、
    は、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、
    」はホスホロチオエート結合を表し、「-」はホスホジエステル結合を表す);
    (b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び
    (c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  2. TLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項1に記載の免疫調節組成物。
  3. TLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項1に記載の免疫調節組成物。
  4. TLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項1に記載の免疫調節組成物。
  5. TLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項1に記載の免疫調節組成物。
  6. TLR7選択的モチーフのU及びUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項1~3のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  7. TLR7選択的モチーフのU及びUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項1及び4~5のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  8. TLR7選択的モチーフのUが2’O-メチル修飾(mU)を有し、TLR7選択的モチーフのUが2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項1~2及び5のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  9. TLR7選択的モチーフのUが2’-フルオロ修飾(fU)を有し、TLR7選択的モチーフのUが2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項1及び3~4のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  10. TLR7選択的モチーフが、配列番号44のヌクレオチド配列を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  11. TLR7選択的モチーフが、配列番号45のヌクレオチド配列を含む、請求項1及び4~5のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  12. TLR7選択的モチーフが、配列番号46のヌクレオチド配列を含む、請求項1~2及び5のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  13. TLR7選択的モチーフが、配列番号47のヌクレオチド配列を含む、請求項1及び3~4のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  14. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号44、45、46、及び47からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフ、
    (b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び
    (c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  15. 第1のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホロチオエート結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第1のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第1のヌクレオチド配列がホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項1~14のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  16. 第1のヌクレオチド配列が、ホスホロチオエート結合によって連結された8つのヌクレオシドを含む、請求項15に記載の免疫調節組成物。
  17. 第1のヌクレオチド配列が、ヌクレオチド配列CG(配列番号58)、又は配列番号58に対して少なくとも約85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、
    ここで、「」はホスホロチオエート結合を表し、
    第1のヌクレオチド配列はホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項1~16のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  18. 第2のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホロチオエート結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第2のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第2のヌクレオチド配列がホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項1~17のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  19. 第2のヌクレオチド配列が、ホスホロチオエート結合によって連結された2つのヌクレオシドを含む、請求項18に記載の免疫調節組成物。
  20. 第2のヌクレオチド配列が、ヌクレオチド配列CC(配列番号59)を含み、
    ここで、「」はホスホロチオエート結合を表し、
    第2のヌクレオチド配列がホスホロチオエート結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項1~19のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  21. RNAリガンドが、配列番号12のヌクレオチド配列、又は配列番号12に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号44のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項1~3、6、10、及び14~20のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  22. RNAリガンドが、配列番号13のヌクレオチド配列、又は配列番号13に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号45のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項1、4~5、7、11及び14~20のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  23. RNAリガンドが、配列番号14のヌクレオチド配列、又は配列番号14に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号46のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項1、2、5、8、12、及び14~20のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  24. RNAリガンドが、配列番号15のヌクレオチド配列、又は配列番号15に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号47のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項1、3~4、9、及び13~20のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  25. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号12、13、14、又は15からなる群から選択されるヌクレオチド配列;
    (b)配列番号12に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号44のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;
    (c)配列番号13に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号45のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;
    (d)配列番号14に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号46のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は
    (e)配列番号15に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号47のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  26. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)式IIIを含むTLR7選択的モチーフ:
    -U-C(式III)、
    (式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、Uはウリジンヌクレオシドであり、
    は2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、
    「-」はホスホジエステル結合を表す);
    (b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;並びに
    (c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  27. TLR7選択的モチーフのCが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項26に記載の免疫調節組成物。
  28. TLR7選択的モチーフのCが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項26に記載の免疫調節組成物。
  29. TLR7選択的モチーフが、配列番号42のヌクレオチド配列を含む、請求項26に記載の免疫調節組成物。
  30. TLR7選択的モチーフが、配列番号43のヌクレオチド配列を含む、請求項26に記載の免疫調節組成物。
  31. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号42又は43のヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフ、
    (b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び
    (c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  32. RNAリガンドが二本鎖RNAヘアピン構造をとることができる、請求項26~31のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  33. 前記RNAリガンドがG:Uウォブル塩基対を含む、請求項26~32のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  34. 第1のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、第1のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、請求項26~33のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  35. 第1のヌクレオチド配列が3つのヌクレオシドを含む、請求項34に記載の免疫調節組成物。
  36. 第1のヌクレオチド配列内のヌクレオシドがホスホジエステル結合によって連結されている、請求項34又は請求項35に記載の免疫調節組成物。
  37. 第1のヌクレオチド配列がヌクレオチド配列C-G-G(配列番号60)を含み、「-」がホスホジエステル結合を表す、請求項26~36のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  38. 第2のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    ここで第2のヌクレオチド配列がヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含み、
    ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)はTLR7選択的モチーフと塩基対形成することができ、
    第2のヌクレオチド配列は、ホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項26~37のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  39. 第2のヌクレオチド配列が約15個のヌクレオシドを含む、請求項38に記載の免疫調節組成物。
  40. 第2のヌクレオチド配列内のヌクレオシドがホスホジエステル結合によって連結されている、請求項38又は請求項39に記載の免疫調節組成物。
  41. 第2のヌクレオチド配列が、
    (a)ヌクレオチド配列G-G-C-A-G-A-A-G-C-C-G-G-G-C-C(配列番号61)、又は
    (b)配列番号61に対して少なくとも約85%の同一性を有し、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列を含み、
    「-」はホスホジエステル結合を表す、
    請求項26~40のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  42. RNAリガンドが、
    (a)配列番号23のヌクレオチド配列、又は
    (b)配列番号23に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号42のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列
    を含む、請求項26~27、29、及び31~41のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  43. RNAリガンドが、
    (a)配列番号24のヌクレオチド配列、又は
    (b)配列番号24に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号43のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列
    を含む、請求項26、28、及び30~41のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  44. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号23又は24のヌクレオチド配列;
    (b)配列番号23に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号42のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列;又は
    (c)配列番号24に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号43のTLR7選択的モチーフ及びヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)を含むヌクレオチド配列であって、ヌクレオチド配列G-G-G(配列番号69)が、TLR7選択的モチーフと塩基対形成することができる、前記ヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  45. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)式IVを含む第1及び第2のTLR7選択的モチーフ:
    -U-U-C(式IV)、
    (式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、Uは、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、「-」はホスホジエステル結合を表す);
    (b)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;並びに
    (c)第1のTLR7選択的モチーフの3’末端及び第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  46. 第1のTLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項45に記載の免疫調節組成物。
  47. 第2のTLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項45又は請求項46に記載の免疫調節組成物。
  48. 第1のTLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項45に記載の免疫調節組成物。
  49. 第2のTLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項45又は請求項48に記載の免疫調節組成物。
  50. 第1のTLR7選択的モチーフが、配列番号36のヌクレオチド配列を含む、請求項45に記載の免疫調節組成物。
  51. 第2のTLR7選択的モチーフが、配列番号36のヌクレオチド配列を含む、請求項45又は請求項50に記載の免疫調節組成物。
  52. 第1のTLR7選択的モチーフが、配列番号37のヌクレオチド配列を含む、請求項45に記載の免疫調節組成物。
  53. 第2のTLR7選択的モチーフが、配列番号37のヌクレオチド配列を含む、請求項45又は請求項52に記載の免疫調節組成物。
  54. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号36又は37のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ;
    (b)配列番号36又は37のヌクレオチド配列を含む第2のTLR7選択的モチーフ;
    (c)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;並びに
    (d)第1のTLR7選択的モチーフの3’末端及び第2のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  55. 第1のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第1のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第1のヌクレオチド配列がホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項45~54のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  56. 第2のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第2のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第2のヌクレオチド配列がホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は第2のTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項45~55のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  57. 第1のヌクレオチド配列及び/又は第2のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によって連結された5つのヌクレオシドを含む、請求項55又は請求項56に記載の免疫調節組成物。
  58. 第1のヌクレオチド配列及び/又は第2のヌクレオチド配列が、ヌクレオチド配列C-A-G-A-C(配列番号67)、又は配列番号67に対して少なくとも約85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、ここで「-」はホスホジエステル結合を表す、請求項45~57のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  59. RNAリガンドが、配列番号33のヌクレオチド配列、又は配列番号33に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号36の第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は配列番号36の第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項45~47、50~51、及び54~58のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  60. RNAリガンドが、配列番号34のヌクレオチド配列、又は配列番号34に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号37の第1のTLR7選択的モチーフ及び/又は配列番号37の第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項45、48~49、及び52~58のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  61. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号33又は34のヌクレオチド配列;
    (b)配列番号33に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号36の第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は
    (c)配列番号34に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号37の第1及び第2のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  62. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)式V:U-U-C(式V)
    (式中、U及びUはウリジンヌクレオシドであり、Cはシチジンヌクレオシドであり、
    は、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、
    「-」はホスホジエステル結合を表す)
    を含む第1のTLR7選択的モチーフ及び1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ;並びに
    (b)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  63. 1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフが、式Vを含む1つ、2つ、3つ、4つ、5つ又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフを含む、請求項62に記載の免疫調節組成物。
  64. 1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフが、式Vを含む5つの追加のTLR7選択的モチーフを含む、請求項62又は請求項63に記載の免疫調節組成物。
  65. 第1のTLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項62~64のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  66. 1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つのU、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項62~65のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  67. 第1のTLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾を有する、請求項62~64のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  68. 1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つのU、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてのUが、2’-フルオロ修飾を有する、請求項62~64及び67のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  69. 第1のTLR7選択的モチーフが、配列番号40のヌクレオチド配列を含む、請求項62~64のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  70. 1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてが、配列番号40のヌクレオチド配列を含む、請求項62~64及び69のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  71. 第1のTLR7選択的モチーフが、配列番号41のヌクレオチド配列を含む、請求項62~64のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  72. 1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのうちの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてが、配列番号41のヌクレオチド配列を含む、請求項62~64及び71のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  73. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む第1のTLR7選択的モチーフ;
    (b)1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフであって、1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフの少なくとも1つ、又は1つ若しくは複数の追加のTLR7選択的モチーフのすべてが、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む、1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフ;及び
    (c)第1のTLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  74. 1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフが、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む1つ、2つ、3つ、4つ、5つ又はそれ以上の追加のTLR7選択的モチーフを含む、請求項73に記載の免疫調節組成物。
  75. 1つ又は複数の追加のTLR7選択的モチーフが、配列番号40又は41のヌクレオチド配列を含む5つの追加のTLR7選択的モチーフを含む、請求項73又は請求項74に記載の免疫調節組成物。
  76. 第1のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第1のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第1のヌクレオチド配列がホスホジエステル結合によって第1のTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項62~75のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  77. 第1のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によって連結された2つのヌクレオシドを含む、請求項76に記載の免疫調節組成物。
  78. 第1のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によって連結された2つのシチジンヌクレオシドを含む、請求項76又は請求項77に記載の免疫調節組成物。
  79. RNAリガンドが、配列番号29のヌクレオチド配列、又は配列番号29に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号40の第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号40の5つの追加のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項62~66、69~70、及び73~78のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  80. RNAリガンドが、配列番号30のヌクレオチド配列、又は配列番号30に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号41の第1のTLR7選択的モチーフ及び配列番号41の5つの追加のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項62~64、67~68、及び71~78のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  81. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号29又は30のヌクレオチド配列;
    (b)配列番号29に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号40の6つのTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は
    (c)配列番号30に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号41の6つのTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  82. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)式VIを含むTLR7選択的モチーフ:
    -U-U -U (式VI)、
    (式中、C及びCはシチジンヌクレオシドであり、U、U、U、及びUはウリジンヌクレオシドであり、
    は、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、
    は、2’O-メチル修飾(mU)、2’-フルオロ修飾(fU)、2’-アミノ修飾、2’-デオキシ修飾、又は2’-メトキシエトキシ修飾を有し、
    」はホスホロチオエート結合を表し、「-」はホスホジエステル結合を表す);
    (b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び
    (c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  83. TLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項82に記載の免疫調節組成物。
  84. TLR7選択的モチーフのUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項82に記載の免疫調節組成物。
  85. TLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項82に記載の免疫調節組成物。
  86. TLR7選択的モチーフのUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項82に記載の免疫調節組成物。
  87. TLR7選択的モチーフのU及びUが、2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項82~84のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  88. TLR7選択的モチーフのU及びUが、2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項82及び85~86のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  89. TLR7選択的モチーフのUが2’O-メチル修飾(mU)を有し、TLR7選択的モチーフのUが2’-フルオロ修飾(fU)を有する、請求項82~83及び86のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  90. TLR7選択的モチーフのUが2’-フルオロ修飾(fU)を有し、TLR7選択的モチーフのUが2’O-メチル修飾(mU)を有する、請求項82及び84~85のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  91. TLR7選択的モチーフが、配列番号48のヌクレオチド配列を含む、請求項82~84のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  92. TLR7選択的モチーフが、配列番号49のヌクレオチド配列を含む、請求項82及び85~86のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  93. TLR7選択的モチーフが、配列番号50のヌクレオチド配列を含む、請求項82~83及び86のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  94. TLR7選択的モチーフが、配列番号51のヌクレオチド配列を含む、請求項82及び84~85のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  95. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号48、49、50、及び51からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含むTLR7選択的モチーフ、
    (b)TLR7選択的モチーフの5’末端に連結された第1のヌクレオチド配列;及び
    (c)TLR7選択的モチーフの3’末端に連結された第2のヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  96. 第1のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第1のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第1のヌクレオチド配列がホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項82~95のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  97. 第1のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によって連結された8つのヌクレオシドを含む、請求項96に記載の免疫調節組成物。
  98. 第1のヌクレオチド配列が、ヌクレオチド配列C-C-G-A-G-C-C-G(配列番号68)、又は配列番号68に対して少なくとも約85%の同一性を有するヌクレオチド配列を含み、
    ここで、「-」はホスホジエステル結合を表し、
    第1のヌクレオチド配列はホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項82~97のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  99. 第2のヌクレオチド配列が、1つのヌクレオシド、又はホスホジエステル結合によって連結された少なくとも2つのヌクレオシドを含み、
    第2のヌクレオチド配列がウリジンヌクレオシドを含まず、
    第2のヌクレオチド配列がホスホジエステル結合によってTLR7選択的モチーフに連結されている、
    請求項82~98のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  100. 第2のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によって連結された2つのヌクレオシドを含む、請求項99に記載の免疫調節組成物。
  101. 第2のヌクレオチド配列が、ホスホジエステル結合によって連結された2つのシチジンヌクレオシドを含む、請求項100に記載の免疫調節組成物。
  102. RNAリガンドが、配列番号17のヌクレオチド配列、又は配列番号17に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号48のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項82~84、87、91、及び95~101のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  103. RNAリガンドが、配列番号18のヌクレオチド配列、又は配列番号18に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号49のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項82、85~86、88、92、及び95~101のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  104. RNAリガンドが、配列番号19のヌクレオチド配列、又は配列番号19に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号50のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項82、83、86、89、93、及び95~101のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  105. RNAリガンドが、配列番号20のヌクレオチド配列、又は配列番号20に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号51のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列を含む、請求項82、84~85、90、及び94~101のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  106. RNAリガンド及び薬学的に許容される担体を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物であって、ここでRNAリガンドが、
    (a)配列番号17、18、19、又は20からなる群から選択されるヌクレオチド配列;
    (b)配列番号17に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号48のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;
    (c)配列番号18に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号49のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;
    (d)配列番号19に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号50のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列;又は
    (e)配列番号20に対して少なくとも約85%の同一性を有し、且つ配列番号51のTLR7選択的モチーフを含むヌクレオチド配列
    を含む、TLR7を選択的に活性化する免疫調節組成物。
  107. 薬学的に許容される担体が脂質ナノ粒子(LNP)である、請求項1~106のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  108. LNPがカチオン性脂質を含む、請求項107に記載の免疫調節組成物。
  109. LNPがイオン化可能な脂質を含む、請求項107又は請求項108に記載の免疫調節組成物。
  110. 薬学的に許容される担体が、ポリ-L-アルギニン若しくは1,2-ジオレオイル-3-トリメチルアンモニウムプロパン(DOTAP)であるか、又はそれを含む、請求項1~109のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  111. 免疫調節組成物が、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化する、請求項1~110のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  112. 1つ又は複数の細胞がTLR7を発現する、請求項111に記載の免疫調節組成物。
  113. 1つ又は複数の細胞が末梢血単核球(PBMC)を含む、請求項111又は請求項112に記載の免疫調節組成物。
  114. 1つ又は複数の細胞が、1つ又は複数の形質細胞様樹状細胞を含む、請求項111~113のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  115. 免疫調節組成物が、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性を増加させる、請求項1~114のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  116. 免疫調節組成物が、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌を増加させる、請求項1~115のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  117. 免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性の増加は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である、請求項115に記載の免疫調節組成物。
  118. 免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌の増加は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である、請求項116に記載の免疫調節組成物。
  119. 免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞におけるTLR8活性を約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満だけ増加させる、請求項1~118のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  120. 免疫調節組成物は、免疫調節組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞によるTNF-αの分泌を約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満増加させる、請求項1~119のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  121. RNAリガンドが、免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞内に導入される、請求項111~120のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  122. 免疫調節組成物と接触させた1つ又は複数の細胞をさらにグアノシン又はグアノシン誘導体と接触させ、場合によってはグアノシン誘導体は2’3’環状GMPである、請求項111~121のいずれか一項に記載の免疫調節組成物。
  123. 請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物のRNAリガンドを含む、単離された核酸。
  124. 核酸が、DNA、RNA、又はDNA/RNA分子である、請求項123に記載の免疫調節組成物。
  125. 請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物のRNAリガンド、又は請求項123若しくは請求項124に記載の核酸を含むベクター。
  126. 請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物を含む薬学的組成物。
  127. 請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物のRNAリガンド、請求項123若しくは請求項124に記載の核酸、又は請求項125に記載のベクターを含む宿主細胞。
  128. 請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物又は請求項126に記載の薬学的組成物を含むワクチン組成物。
  129. 1つ又は複数の細胞においてTLR7を選択的に活性化するための方法であって、1つ又は複数の細胞を、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、又は請求項126に記載の薬学的組成物と接触させることを含む、方法。
  130. 1つ又は複数の細胞がTLR7を発現する、請求項129に記載の方法。
  131. 1つ又は複数の細胞が末梢血単核球(PBMC)を含む、請求項129又は請求項130に記載の方法。
  132. 1つ又は複数の細胞が、1つ又は複数の形質細胞様樹状細胞を含む、請求項129~131のいずれか一項に記載の方法。
  133. 1つ又は複数の細胞を、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物又は請求項126に記載の薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性の増加をもたらす、請求項129~132のいずれか一項に記載の方法。
  134. 1つ又は複数の細胞を、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物又は請求項126に記載の薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌の増加をもたらす、請求項129~133のいずれか一項に記載の方法。
  135. 1つ又は複数の細胞におけるTLR7活性の増加が、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である、請求項133に記載の方法。
  136. 1つ又は複数の細胞によるIFN-αの分泌の増加が、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である、請求項134に記載の方法。
  137. 1つ又は複数の細胞を、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物又は請求項126に記載の薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、1つ又は複数の細胞におけるTLR8活性の約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の増加をもたらす、請求項129~136のいずれか一項に記載の方法。
  138. 1つ又は複数の細胞を、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物又は請求項126に記載の薬学的組成物と接触させると、免疫調節組成物又は薬学的組成物と接触していない対応する1つ又は複数の細胞と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、1つ又は複数の細胞によるTNF-αの分泌の増加をもたらす、請求項129~137のいずれか一項に記載の方法。
  139. 1つ又は複数の細胞をグアノシン又はグアノシン誘導体と接触させることをさらに含み、場合によっては、グアノシン誘導体は2’3’環状GMPである、請求項129~138のいずれか一項に記載の方法。
  140. 酵素結合免疫吸着法(ELISA)、イムノブロッティング、イムノアッセイ、フローサイトメトリー、電気化学発光に基づく方法、質量分析法、若しくはqPCRによってIFN-α及び/若しくはTNF-αの分泌を測定すること;並びに/又はインターフェロン刺激遺伝子(ISG)の発現レベルを測定することをさらに含む、請求項134~139のいずれか一項に記載の方法。
  141. 1つ又は複数の細胞を、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物又は請求項126に記載の薬学的組成物と接触させることが、RNAリガンドを1つ又は複数の細胞に導入することを含む、請求項129~140のいずれか一項に記載の方法。
  142. 個体においてTLR7を選択的に活性化するための方法であって、有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与することを含む、個体においてTLR7を選択的に活性化するための方法。
  143. 個体において免疫応答を刺激するための方法であって、有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与することを含む、個体において免疫応答を刺激するための方法。
  144. 有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、個体においてTLR7活性の増加をもたらす、請求項142又は請求項143に記載の方法。
  145. 有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、個体におけるIFN-αのレベルの増加をもたらす、請求項142~144のいずれか一項に記載の方法。
  146. TLR7活性の増加が、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である、請求項144に記載の方法。
  147. IFN-αレベルの増加が、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約100%、又はそれ以上の増加である、請求項145に記載の方法。
  148. 有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、個体におけるTLR8活性の増加をもたらす、請求項142~147のいずれか一項に記載の方法。
  149. 有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与すると、免疫調節組成物、薬学的組成物、又はワクチン組成物を投与されなかった対応する個体と比較して、約20%未満、約15%未満、約10%未満、約5%未満、又は約1%未満の、個体におけるTNF-αのレベルの増加をもたらす、請求項142~148のいずれか一項に記載の方法。
  150. 個体においてTLR7を活性化するための医薬の製造における使用のためのアジュバントであって、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を含む、個体においてTLR7を活性化するための医薬の製造における使用のためのアジュバント。
  151. 個体においてTLR7を選択的に活性化するための方法における使用のためのアジュバントであって、該方法が、有効量の、請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を個体に投与することを含む、個体においてTLR7を選択的に活性化するための方法における使用のためのアジュバント。
  152. 請求項1~122のいずれか一項に記載の免疫調節組成物、請求項123若しくは請求項124に記載の核酸、請求項125に記載のベクター、請求項126に記載の薬学的組成物、又は請求項128に記載のワクチン組成物を含むキット。
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PT2311848E (pt) 2002-12-23 2013-10-03 Vical Inc Vacinas à base de polinucleótido optimizadas por codão contra a infecção do citomegalovírus humano
US7871607B2 (en) 2003-03-05 2011-01-18 Halozyme, Inc. Soluble glycosaminoglycanases and methods of preparing and using soluble glycosaminoglycanases
TW200533750A (en) * 2004-02-19 2005-10-16 Coley Pharm Group Inc Immunostimulatory viral RNA oligonucleotides
US20060024670A1 (en) 2004-05-18 2006-02-02 Luke Catherine J Influenza virus vaccine composition and methods of use
WO2006063252A2 (en) * 2004-12-09 2006-06-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inducing an immune response in a mammal and methods of avoiding an immune response to oligonucleotide agents such as short interfering rnas
EP1924284A1 (en) * 2005-09-14 2008-05-28 Hartmann, Gunther Compositions comprising immunostimulatory rna oligonucleotides and methods for producing said rna oligonucleotides
EP2357231A2 (en) * 2007-07-09 2011-08-17 Idera Pharmaceuticals, Inc. Stabilized immune modulatory RNA (SIMRA) compounds
WO2009132206A1 (en) 2008-04-25 2009-10-29 Liquidia Technologies, Inc. Compositions and methods for intracellular delivery and release of cargo
JP2012517226A (ja) * 2009-02-10 2012-08-02 イデラ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド Tlr7の合成rnaベースのアゴニスト
AU2010225129A1 (en) 2009-03-17 2010-09-23 Gunther Hartmann TLR7 ligand and uses thereof
WO2011038031A1 (en) * 2009-09-22 2011-03-31 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Dual targeting sirna agents
US9593077B2 (en) 2013-11-18 2017-03-14 Arcturus Therapeutics, Inc. Ionizable cationic lipid for RNA delivery
EP3538068A1 (en) 2016-11-10 2019-09-18 Translate Bio, Inc. Improved ice-based lipid nanoparticle formulation for delivery of mrna
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