JP2024509332A - 多重特異性抗TCRδ可変部1抗体 - Google Patents

多重特異性抗TCRδ可変部1抗体 Download PDF

Info

Publication number
JP2024509332A
JP2024509332A JP2023573494A JP2023573494A JP2024509332A JP 2024509332 A JP2024509332 A JP 2024509332A JP 2023573494 A JP2023573494 A JP 2023573494A JP 2023573494 A JP2023573494 A JP 2023573494A JP 2024509332 A JP2024509332 A JP 2024509332A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
seq
amino acid
sequence
acid sequence
acid sequences
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2023573494A
Other languages
English (en)
Inventor
チュナ,ミフリバン
ウーデン,マーク
フリードマン,ジョシュア
マウント,ナタリー
Original Assignee
ガンマデルタ セラピューティクス リミテッド
エフ-スター セラピューティクス リミテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from GBGB2102224.9A external-priority patent/GB202102224D0/en
Priority claimed from GBGB2111685.0A external-priority patent/GB202111685D0/en
Application filed by ガンマデルタ セラピューティクス リミテッド, エフ-スター セラピューティクス リミテッド filed Critical ガンマデルタ セラピューティクス リミテッド
Priority claimed from PCT/EP2022/054011 external-priority patent/WO2022175414A1/en
Publication of JP2024509332A publication Critical patent/JP2024509332A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2809Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against the T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2818Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against CD28 or CD152
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2863Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against receptors for growth factors, growth regulators
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2878Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the NGF-receptor/TNF-receptor superfamily, e.g. CD27, CD30, CD40, CD95
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/32Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/40Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/21Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from primates, e.g. man
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/31Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency multispecific
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/34Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • C07K2317/732Antibody-dependent cellular cytotoxicity [ADCC]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • C07K2317/734Complement-dependent cytotoxicity [CDC]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/74Inducing cell proliferation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本発明は、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体を提供する。本発明は、かかる多重特異性抗体を含む組成物及び医薬組成物、ならびにかかる多重特異性抗体を作製する方法も提供する。本発明は、多重特異性抗体を用いる処置方法及び医学的使用も提供する。【選択図】なし

Description

本発明は、γδT細胞のT細胞受容体と特異的に結合し、EGFRに特異的に結合する多重特異性抗体ならびにその断片及びバリアントに関する。
がんに対するT細胞免疫療法への関心の高まりは、がん細胞を認識し、特にPD-1、CTLA-4、及び他の受容体により発揮される抑制経路の臨床上もたらされる拮抗作用によって抑制解除された場合に宿主保護機能性を媒介するCD8+及びCD4+のαβT細胞のサブセットの明らかな能力に集中している。しかし、αβT細胞は、移植片対宿主病を引き起こし得るMHC拘束性である。
ガンマデルタT細胞(γδT細胞)は、異なる特徴的なγδT細胞受容体(TCR)を表面に発現するT細胞のサブセットである。このTCRは1つのガンマ(γ)鎖と1つのデルタ(δ)鎖とで構成されており、鎖の各々は鎖の再構成を受けるが、αβT細胞と比較してV遺伝子の数が限られている。Vγをコードする主なTRGV遺伝子セグメントは、TRGV2、TRGV3、TRGV4、TRGV5、TRGV8、TRGV9、及びTRGV11、ならびに非機能遺伝子TRGV10、TRGV11、TRGVA、及びTRGVBである。最も頻度の高いTRDV遺伝子セグメントはVδ1、Vδ2、及びVδ3をコードし、更にVδ及びVαの両方の名称を有する幾つかのVセグメントをコードする(Adams et al.,296:30-40(2015)Cell Immunol.)。ヒトγδT細胞は、特定のγ型及びδ型が1つ以上の組織型の細胞において、排他的ではないが、広く見出されるため、ヒトγδT細胞のTCR鎖に基づいて大きく分けて分類することができる。例えば、ほとんどの血液常在性γδT細胞は、Vδ2 TCR、一般的にはVγ9Vδ2を発現する一方で、これは、組織常在性γδT細胞、例えば、皮膚におけるものにおいてはあまり一般的ではなく、組織常在性γδT細胞は、γ鎖と対合したVδ1 TCR、例えば、腸では多くの場合、Vγ4と対合したVδ1 TCRをより頻繁に使用する。
γδT細胞は、免疫監視において重要な役割を果たし、ストレスマーカーのパターンにより悪性細胞または形質転換した細胞(がん細胞など)を認識し、次いで、強力かつ選択的な細胞傷害性を発揮する。従って、γδT細胞は、免疫応答のオーケストレーターとして作用し得る。これらの細胞の生体内原位置での調節により、他の免疫療法では困難であることが判明している低変異負荷の腫瘍であっても免疫原性の増加の可能性がもたらされる。腫瘍のγδT細胞による認識は、いずれかの単一の腫瘍抗原に依存するものではなく、従って、γδT細胞のモジュレーターは、血液系悪性腫瘍及び固形悪性腫瘍の両方が含まれる、広範囲の疾患適応症において可能性を有する。γδT細胞の認識メカニズムは、MHC拘束性ではない。
WO2019147735の著者らは、一部のγδ細胞が腫瘍促進活性を有するか、またはαβT細胞により媒介される抗がん免疫応答を阻害すると仮説を立てている。同著者らは、γδT細胞が免疫抑制物質であると仮定し、従って、がんにおいては抗体を用いてこれらを除去、阻害、または遮断すべきであると提唱している。
しかしながら、抗γδ抗体がγδ細胞を遮断するか、または死滅させることにより、かかる細胞の機能を負に調節するという支配的な見解にもかかわらず、γδT細胞の浸潤と患者の予後及び/または生存との間に正相関が存在することが発見されている。
αβ TCR受容体/リガンド相互作用と比較して、vδ1 TCR受容体/リガンド相互作用に関する理解は限定的である。かかる理解がないために、これまでのvδ1 TCRを認識する抗体は、主にこの相互作用を調べるための探索的ツールである。通常、かかるツールは、TCR受容体/リガンド相互作用がvδ1+細胞の遮断、抑制、または除去をもたらすことを示唆する粗製の遮断抗体である。例えば、ツール抗体のTS8.2及びTS-1は、研究において抗γδ遮断抗体として用いられており、当該研究は、当該抗体がvδ1細胞の細胞傷害性を低減させることを示唆している。これらの研究を他のものと合わせると、生体内原位置での疾患において、vδ1細胞の細胞傷害性を有利に調節するためにかかる抗vδ1抗体を使用することはあり得ず、従って、vδ1細胞傷害性を低減するのではなく増加させる抗体の必要性が示唆される。
γδT細胞を免疫療法に利用するために、細胞を生体内原位置で増殖させる手段またはそれらを採取し、それらを再注入する前にエクスビボで増殖させる手段のいずれかが必要とされる。後者のアプローチは、外来性サイトカインの添加を使用するものが以前に記載されている。例えば、WO2017/072367及びWO2018/212808を参照のこと。薬理学的に修飾された形態のヒドロキシメチルブタ-2-エニルピロリン酸(HMBPP)または臨床的に承認されたアミノビスホスホネートを使用する、患者自身のγδT細胞を増殖させる方法が記載されている。これらのアプローチにより、250人を超えるがん患者が、一見したところ安全に処置されたが、完全寛解の発生は極めて稀である。しかしながら、多数のγδT細胞を増殖させる能力が証明されている活性化剤が依然として必要とされている。
更に、生体内原位置でVδ1+細胞を優先的に標的とするか、またはそれと結合するか、またはそれを認識するか、またはそれを特異的に調節するか、またはその数を増加させることができる結合剤または活性化剤が、薬剤として非常に望ましい可能性がある。
しかしながら、Zometa(登録商標)(ゾレドロン酸)などのアミノビスホスホネートを含め、Vδ2+細胞を調節する可能性のある薬物は存在するが、当該医薬品は、主に骨再吸収を遅延するように設計されている。また、上記Vδ2+の調節にかかわらず、Vδ1+細胞と結合するか、それを標的とするか、調節するか、活性化するか、またはその数を増加させるよう専用に設計された医薬品を開発する必要性が存在する。その理由は、例えば、Vδ2+の調節を繰り返すことが、持続性かつ進行性の疲弊表現型をもたらし得るためである。
更に、Vδ1+細胞が主に組織常在性であることを考慮すると、Vδ1+を調節することができる理想的な薬剤は、より小さい望ましくない「オフターゲット」効果及び急速な腎臓クリアランスも示すであろう。典型的に、上記の望ましくない効果は、低分子化学物質を用いる場合に顕在化し得る。例えば、(骨に対する一次的な調節効果に対する二次的効果として)別個のクラスのVδ2+細胞を調節できることが示されている上述のアミノビスホスホネートは、腎機能の悪化及び腎不全の可能性として顕在化する腎毒性と関連する(例えば、Markowitz et al.(2003)Kidney Int.64(1):281-289)。欧州医薬品庁により列挙されたZometaの追加の望ましくない効果としては、貧血、過敏反応、高血圧、心房細動、筋痛、全身痛、倦怠感、血中尿素増加、嘔吐、関節腫脹、胸痛などが挙げられる。
vδ1+細胞が見出される生体内原位置の環境も更に考慮しなければならない。例えば、非造血組織常在性γδT細胞は、組織から最初に分離されたときに強い増殖反応を示したが、これは自己由来の線維芽細胞と直接的に細胞接触していない場合のみであることが以前に示されている。非造血組織常在性T細胞(γδT細胞)が機能するためには非造血細胞(例えば、間質細胞、特に線維芽細胞)から分離されなければならないことが発見されている。その理由は、リンパ球と間質細胞または上皮細胞との直接接触が組織常在性γδT細胞の増殖を阻害すると思われるためである。生体内原位置の活性化前の細胞が更に抑制された状態で存在するという観察は、vδ1細胞がこれまで有望な治療標的とみなされなかった別の理由である。実際、本明細書に記載される発見があるまで、血液及び組織のvδ1+細胞が典型的に「休止」、「活性化前」、または「非活性化」状態とみなされる場合に、これらの細胞を生体内原位置で好適にかつ選択的に調節することができる方法は考案されていない。
よって、Vδ1+細胞を標的とし、感染症、自己免疫状態、及びがんを処置するために特別に設計された改良された薬剤が必要とされている。具体的には、Vδ1+細胞に特異的に結合すること、Vδ1+細胞を標的とすること、Vδ1+細胞を特異的に活性化すること、Vδ1+細胞の増殖及び/または細胞傷害活性を特異的に増強すること、またはVδ1+細胞の活性化を特異的に遮断することにより疾患の徴候及び症状を改善するために投与することができる薬剤が必要とされている。
様々なフォーマットの二重特異性抗体及び多重特異性抗体が、種々の治療用途のために開発されてきた。二重特異性抗体及び多重特異性抗体は、生物学的標的の種類及び作用様式に基づいて、重複するが別個のクラス分類され得る。例えば、かかる多重特異性抗体は、細胞傷害性エフェクター細胞リダイレクター(二重特異性T細胞動員抗体、二重特異性T細胞エンゲージャー、TCE、またはBiTEとしても公知)及びデュアル免疫調節剤(DI)などのクラスに分類され得る。
TCE(T細胞エンゲージャー)は、T細胞を腫瘍細胞に標的化することまたはその逆により、腫瘍に対する患者の免疫応答を増強することを意図しており、T細胞のT細胞受容体複合体の第1のエピトープ(通常はCD3)、及びがん抗原または腫瘍関連抗原(TAA)などのがん関連抗原である第2のエピトープを標的とすることにより機能する。かかる抗体は、腫瘍細胞及びT細胞に共局在して、腫瘍細胞殺傷を促進する。BiTEの例としては、CD3×CD19二重特異性抗体であるブリナツモマブ、CD3×EpCAM二重特異性抗体であるカツマクソマブ、及びCD3×HER2二重特異性抗体であるエルツマキソマブが挙げられる。BiTEなどのTCEは、通常、scFvフォーマットで提供されるが、他のフォーマットも提供されている。例えば、BiKEは、BiTEと類似しているが、CD3ではなくNK細胞上のCD16を標的とする。
T細胞受容体は、哺乳動物免疫系で最も複雑な受容体構造と説明されている。これは、幾つかのCD3鎖に近接したT細胞受容体を含む膜貫通多タンパク質受容体複合体を構成する。例えば、哺乳動物において、このような複合体の典型的なものは、T細胞受容体、CD3γ鎖、CD3δ鎖、及び2つのCD3ε鎖を含む。これらの鎖は、結合したζ鎖(ゼータ鎖)のそばでT細胞受容体(TCR)と会合し、次いで、Tリンパ球において典型的な活性化シグナルを生成する。しかしながら、代替的な複合体も報告されている。例えば、T細胞受容体及びζ鎖ホモ二量体を含むT細胞受容体複合体が記載されている。CD4及びCD8など、追加の共受容体もTCR機能を補助することができる。
受容体複合体の組成にかかわらず、前記複合体が細胞表面結合事象を細胞内リン酸化シグナル伝達カスケードに翻訳することは十分に確立されている。これらのリン酸化事象は、最終的に、サイトカインならびにグランザイム及びパーフォリンなどのエフェクタータンパク質の発現増加につながるNFAT及びNFkBなどの転写因子の活性化をもたらす。
しかしながら、このようなTCEを使用してがんを処置するのは依然として説得力のある概念であるが、これまで、初期臨床開発においてTCEを進展させようと30年間の協調努力がなされた後でさえ、このような二重特異性抗体の多くは、さえない安全性、有効性、及び製造性プロファイルを示している。実際、2020年1月の時点で、承認後撤回されていないTCEは依然としてブリナツモマブのみである。このTCE多重特異性抗体断片は、第1の結合アームでT細胞受容体複合体と結合し、第2の結合アームでCD19標的と結合する。
二重特異性T細胞動員抗体は、Lejeune et al.,2020,Front Immunol.,11:762に記載されている。しかしながら、このカテゴリーにおける既存の二重特異性抗体、特にCD3結合によりT細胞を動員するものは、シグナル伝達物質としてのCD3抗原の効力及び患者のT細胞集団におけるその遍在性を考慮すると、重度の有害作用をもたらす顕著なオフターゲット効果を有する。よって、カツマクソマブ(現在は撤回されている)などのCD3を標的とする二重特異性の例では、全身送達(例えば、静脈内)は現実的に不可能である。代わりに、手術中、腹膜内、腹腔内送達などのより制限された送達が、より頻繁に意図される。これにより、薬剤としての上記二重特異性薬の選択可能性及び使用が制限される。実際、エフェクター機能が減弱された抗CD3抗体(すなわち、CD3を標的とするが、二重特異性ではないT細胞複合体エンゲージャー)でさえ、関連する毒性により静脈内送達が困難となる。例えば、抗CD3抗体であるフォラルマブは、曝露を限定し、毒性を低減するために、現在は殆どの場合、(例えば、消化器疾患の処置における)経口送達が意図される。
早期臨床試験においてかかるTCEで観察される現在の問題の多くは、用いられる高親和性T細胞複合体結合ドメインに起因すると言われることが多い。更に、その理由は、これらのTCEの設計者が自然界でのTCR複合体の結合事象の親和性が低いことを十分に考慮せず、重度の用量制限毒性が妨げとなり、治療域が極めて狭くなったためであると提唱されている。これに関して、多数の初期TCE薬開発者が、OKT3、SP34、及びUCHT1に由来する3つの抗CD3 T細胞複合体結合ドメインに依存していたことが強調されている。そして、これらの元の結合ドメインは全て、自然界での結合事象と比べておよそ1,000倍高い親和性に等しい、1桁から2桁台前半までのnM範囲の比較的高い親和性で結合する。その結果、T細胞の活性化が、自然界でのT細胞受容体複合体の結合と比較して著しく異なる(かつ多くの場合、好ましくない)影響を受けると提唱されている。例えば、より高親和性のOKT3に基づくプラットフォームを使用するTCE開発者は、OKT3がIL-2の存在下でT細胞のアポトーシスを誘導するという事実に振り回され得る。
これらの理由により、より低親和性のT細胞複合体の結合が、T細胞と会合する二重特異性抗体治療薬の設計パラメータを決定するために考慮すべき重要事項であることが明らかになっている。
上記TCEを設計する際の別の問題は、Fc機能を減弱させる必要性である。実際、Fcγ受容体(FcγR)へのFcの結合は免疫エフェクター細胞の活性化を引き起こすため、TCEは、治療有効性を最大化し、オフターゲット毒性を最小限にするために、Fcにより媒介されるエフェクター機能の完全な抑制を通常必要とする。実際のところ、現在の医療現場で用いられているCD3を標的とする二重特異性抗体の大多数は、FcγRに対する結合活性が低減されたFcドメインを有するか、または意図的にFc領域を含まない二重特異性断片である。一般的に、減弱されていないFc機能を有するTCEは、抗体依存性細胞性細胞傷害(ADCC)作用を誘発し、これにより、抗体により認識されるγδT細胞集団を枯渇させると予想される。しかし、繰り返しになるが、毒性/安全性の複雑さを回避するためにかかる機能を減弱することにより、例えば、CD16+もしくはCD32+もしくはCD64+免疫細胞を関与させることにより、または二重特異性の半減期を低減することによって(例えば、BITEなどのより小さな二重特異性抗体断片を用いる場合)、潜在的に重要な有効性の観点も減弱される可能性がある。FcγR及びTCEの相互作用を低減する(例えば、当該相互作用を低減するように設計されたIgGフォーマットを使用する)方法は、Fcにより媒介されるTCEの固定化を低減し、固定化されたTCEとの架橋によるTCRクラスター化を低減すると予想される。
これらの問題の全てではないが一部に対処するために、Xencor(Pasadena、CA)、Macrogenics(Gaithersburg、MD)、及びGenentech(San Francisco、CA)などの多数の企業が、ごく最近、それぞれのTCEプラットフォームにおけるT細胞受容体複合体結合アームの結合親和性を低減することを報告している。しかしながら、上記結合の親和性の低減により、TCEの設計及び機能性に関して有効性の低下及び選択可能性の低下がもたらされ得る。例えば、かかるTCEにおける結合ドメインの親和性は、インビボでの分布プロファイルの決定要因となることが現在実証されている。具体的には、TCEの分布は、その親和性が最も高い標的に偏ることが通常観察される。従って、T細胞複合体に対するTCE結合ドメインの親和性を低減することにより、かかるTCEの有効性を引き起こすためにまさに必要とされる細胞であるT細胞から離れた分布に偏ることが一般的である。TCEの治療域が「極めて狭い」と言われているのは、部分的にはかかる理由のためである。
更に、特に固形腫瘍では、免疫調節治療薬に対する更なる大きなハードルが依然として存在する。例えば、現在の最先端のアプローチとしては、第1のドメインがCD3に結合し、第2のドメインがTAAを標的とする、CD3を標的とする二重特異性薬が挙げられる。しかしながら、多くの場合、これらに問題があることが証明されている。例えば、Middelburg J,et al.Overcoming Challenges for CD3-Bispecific Antibody Therapy in Solid Tumors.Cancers.2021;13(2):287は、以下を含む、固形腫瘍空間におけるT細胞と会合する多重特異性の免疫調節部分に対するこれらのハードルの一部を要約している。
i.オンターゲット・オフ腫瘍毒性問題:例えば、著者は、固形腫瘍のTAAは、多くの場合、健常な臓器の組織にも発現しており、このことが、CD3二重特異性薬を使用したマウス前臨床試験において示されたように、結果として免疫病理及び死亡を招く可能性のある臓器不全をもたらし得ることを強調している。
ii.腫瘍微小環境(TME)におけるエフェクター細胞の利用能:例えば、通常のCD3+「ナイーブ」T細胞は、樹状細胞により更に活性化されることなく主に血液系及びリンパ系に存在する。
iii.腫瘍浸潤リンパ球(TIL)がCD3+Treg細胞及び/または疲弊したCD3+細胞を含み得ることを考慮した腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の質:例えば、CD3を標的とする二重特異性薬は、活性化により誘発される細胞死によってTILアポトーシスを誘発し得、このことが強力な抗腫瘍応答を妨げる。
従って、少なくとも1つの結合ドメインがT細胞に結合し、少なくとも1つの第2の結合ドメインがTAAを標的とする、改良された多重特異性免疫調節薬が必要とされている。
また、Vδ1+細胞を標的とし、感染症、自己免疫状態、及びがんを処置するために特別に設計された改良された薬剤も必要とされている。具体的には、Vδ1+細胞に特異的に結合すること、Vδ1+細胞を標的とすること、Vδ1+細胞を特異的に活性化すること、Vδ1+細胞の増殖及び/または細胞傷害活性を特異的に増強すること、またはVδ1+細胞の活性化を特異的に遮断することにより疾患の徴候及び症状を改善するために投与することができる薬剤が必要とされている。
本発明は、TCRδ可変部1(Vδ1)に対する抗原結合部位及びEGFRに対する抗原結合部位を含む、複数の抗原結合部位を含む高親和性抗体(「多重特異性抗体」)に関する。より具体的には、本発明は、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFRに特異的な結合部位を含む、当該多重特異性抗体に関する。
本発明の多重特異性抗体は、「mAb抗体」または「mAb二乗抗体」として知られるフォーマットであり、CH3ドメインに抗原結合ループを含むように工学操作されたFc領域を含む抗体である。この改変されたFc領域は「Fcab」(抗原結合性Fc)と呼ばれる。得られたFcabを天然IgG抗体フォーマットに迅速に挿入すると、2つの異なる抗原に結合する四価mAb二重特異性抗体を作ることができる。従って、mAb抗体は、抗原結合部位をもたらすVH-VLドメイン対を含むFab領域を更に含む。本発明のmAb分子は、EGFR結合Fcab及びvδ1結合Fabを含む。
本発明の抗体は、良好な機能プロファイルを有する。特に、Vδ1T細胞の枯渇に焦点を置く従来技術の抗Vδ1抗体と異なり、本発明の抗体は、Vδ1T細胞の活性化に有用である。本発明の抗体は、それらが結合するT細胞上のTCRの下方調節を引き起こし得るが、Vδ1T細胞の枯渇を引き起こさず、むしろT細胞を刺激するため、T細胞のこのコンパートメントの活性化による恩恵を受ける治療状況において有用であり得る。Vδ1T細胞の活性化は、TCRの下方調節、活性化マーカー、例えば、CD25、Ki67、脱顆粒マーカーCD107a、NCR(自然細胞傷害性受容体)、及び/または4-1BBの変化から明らかである。Vδ1T細胞の活性化は、次に、INFγ及びTNFαなどの炎症性サイトカインの放出を引き起こして、免疫ライセンシングを促進する。驚くべきことに、TRDV1に対する適切に高い親和性を有する抗体は、Vδ1T細胞殺傷の増加を誘発し、(例えば)CD3を標的とする抗体と異なり、CD3による大規模な活性化に伴う副作用を伴うことなく高親和性抗体の供給が可能である。結果として、高親和性抗体は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)による強力な免疫賦活効果を誘発することができる。これは、Vδ1細胞の最小限の疲弊または殺傷で達成され得る。従って、本発明の多重特異性抗体は、アゴニスト抗体とみなされ得る。
本発明の多重特異性抗体に含まれるFcab領域は、典型的なモノクローナル抗体結合部位よりも小さな結合界面を有する。典型的なmAbのFabアームが柔軟なヒンジ領域によって分離されている場合、Fcabの結合部位は、近くに位置する2つの結合部位を持つコンパクトな抗体断片を形成する。Fcabの2つの抗原結合部位は、典型的なmAbの抗原結合部位と比較して、空間的にも互いに近接している。このより小さい結合界面及び2つの結合部位の柔軟性の低下に基づけば、本発明の多重特異性抗体(Fcab領域を含む)がモノクローナル抗体ベンチマークと同様の親和性及び効力でEGFRに結合でき、EGFRを阻害できることは驚くべきことである。
本発明の第1の態様によれば、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。
本発明の第2の態様では、本発明の多重特異性抗体をコードするポリヌクレオチド配列が提供される。例えば、配列番号199~222、224~247、249~259、または261~271との少なくとも70%の配列同一性を有する配列を含む、抗Vδ1の第1の結合ドメインをコードするポリヌクレオチド配列が提供される。
本発明の第3の態様では、本発明のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクターが提供される。本発明のポリヌクレオチド配列または本発明の発現ベクターを含む宿主細胞も提供される。本発明の任意の多重特異性抗体またはその抗原結合断片を産生させるための方法であって、本発明の宿主細胞を細胞培養培地で培養することを含む、当該方法も提供される。
本発明の更なる態様では、本発明の多重特異性抗体を含む組成物が提供される。本発明の多重特異性抗体と、薬学的に許容される希釈剤または担体とを含む医薬組成物も提供される。組成物及び医薬組成物は、任意により、1つ以上の治療効果のある追加の薬剤を更に含み得る。
本発明の更なる態様では、本発明の多重特異性抗体または本発明の医薬組成物を含み、任意により使用説明書及び/または追加の治療活性剤を含むキットが提供される。
本発明の更なる態様では、対象の疾患または障害を処置する方法であって、対象に、本発明の多重特異性抗体、または本発明の医薬組成物を投与することを含む方法が提供される。対象における免疫応答を調節する方法であって、対象に、本発明の多重特異性抗体、または本発明の医薬組成物を投与することを含む方法も提供される。対象への抗体の投与は、治療上有効量での投与であり得る。
本発明のなおも更なる態様では、医療に使用するための、本発明の多重特異性抗体、または本発明の医薬組成物、または本発明のキットが提供される。薬物の製造における本発明の多重特異性抗体の使用も提供される。
ファージ選択ラウンド。ADT1-7ライブラリに対するファージ選択ラウンド1~3。 ファージ選択ラウンド。ADT1-4ライブラリに対するファージ選択ラウンド1~3。 ファージ選択ラウンド。カニクイザル交差反応性バインダーを単離するための選択ストラテジーによるADT1-4ライブラリのファージ選択ラウンド1~3。 哺乳動物ディスプレイによる成熟抗体の選択の概略図。ADT1-7ライブラリのフローソーティングの概略図。 哺乳動物ディスプレイによる成熟抗体の選択の概略図。ADT1-4ライブラリ1(ヒト)のフローソーティングの概略図。 哺乳動物ディスプレイによる成熟抗体の選択の概略図。ADT1-4ライブラリ2(カニクイザル)のフローソーティングの概略図。 親和性へのS74L変化の影響。ADT1-4系列哺乳動物ディスプレイアウトプット:LC 74S(白丸)または74L(黒丸)の使用が示されたヒト解離オフレート(SPR)対ヒト抗原結合(Delfia ELISA、0.4nMヒト抗原)。結果は、SPRによる親和性の改善と、Delfia ELISAによる抗原結合による親和性の改善の間の良好な適合を強調している。これらの結果は、可変ドメインS74L修飾によって付与される結合の改善も強調している。 親和性へのS74L変化の影響。ADT1-4系列哺乳動物ディスプレイアウトプット:LC 74S(白丸)または74L(黒丸)の使用が示されたカニクイザル解離オフレート(SPR)対カニクイザル抗原結合(Delfia ELISA、10nMカニクイザル抗原)。 親和性へのS74L変化の影響。ADT1-4系列哺乳動物ディスプレイアウトプット:示されているLC 74S(白丸)または74L(黒丸)の使用を加えた、ヒト抗原解離オフレート(SPR)の改善と、カニクイザル抗原解離オフレート(SPR)との間の相関関係を示している。 CDR3の使用及び交差共有。ADT1-4(G04)系列における親和性成熟抗体間での例示的な重鎖及び軽鎖の交差共有(0.4nMヒトTRDV1のELISA結果のヒートマップが段階分けされている)。この「ヒートマップ」は、ADT1-4系列における異なる親和性成熟抗体間のCDR3配列の交差共有を示しており、この親和性成熟プロセスが、特定の重鎖及び軽鎖の対として提供される必要のない抗体配列をもたらしたことを示している。この結果は、親和性成熟抗体が軽鎖及び重鎖を交差共有できること、そして、異なるLC/HCの組み合わせが高ストリンジェンシーの抗原結合研究において同等のまたは改善された結果をもたらすことを強調している。この図には、ADT1-4(G04)親クローンも含まれている(左下)。 CDR3の使用及び交差共有。ADT1-4系列の最終選択:CDR3の使用及び交差共有と、出発親ADT1-4親G04 mAb(左下)に対するカニクイザル抗原結合「ヒートマップ」。 CDR3の使用及び交差共有。ADT1-7系列の最終選択:CDR3の使用及び交差共有と、出発ADT1-7親E07 mAb(左下)に対するヒト抗原結合「ヒートマップ」。 ADT1-4親G04と比較したADT1-4系列の結合における増強倍率。(A)組換えヒトVδ1抗原結合の増強倍率。(B)組換えカニクイザルVδ1抗原結合の増強倍率。(C)初代Vδ1 MFIの増強倍率。(D)PEER Vδ1細胞株MFIの増強倍率。 ADT1-4親E07と比較したADT1-1系列の結合における増強倍率。(A)組換えヒトVδ1抗原結合の増強倍率。(B)初代Vδ1 MFIの増強倍率。(C)PEER Vδ1細胞株MFIの増強倍率。 親クローンと比べたヒト(及びカニクイザル)抗原への結合における改善倍率。ヒト抗原への結合における改善倍率。親和性成熟クローン対親ADT1-4(G04)、0.4nMの組換えヒトL1抗原(ヒトVδ1 TCR抗原を含む)のDELFIA ELISAシグナル。 親クローンと比べたヒト(及びカニクイザル)抗原への結合における改善倍率。カニクイザル抗原(カニクイザル配列番号308(成熟、マイナスリーダー)を含むDV1/GV77)への結合における改善倍率。親和性成熟クローン対親ADT1-4(G04)、0.4nMの組換えヒトL1抗原のDELFIA ELISAシグナル。 親クローンと比べたヒト(及びカニクイザル)抗原への結合における改善倍率。ヒト抗原への結合における改善倍率。親和性成熟クローン対親ADT1-7(E07)、0.4nMの組換えヒトL1抗原のDELFIA ELISAシグナル。 親クローンと比べたヒト(及びカニクイザル)抗原に対するKDにおける改善倍率。ADT1-4(G04)系列のヒト抗原KDの改善倍率。 親クローンと比べたヒト(及びカニクイザル)抗原に対するKDにおける改善倍率。ADT1-4(G04)系列のカニクイザル抗原KDの改善倍率。 親クローンと比べたヒト(及びカニクイザル)抗原に対するKDにおける改善倍率。ADT1-7(E07)系列のヒト抗原KDの改善倍率。 ヒトVδ1抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。ADT1-4系列の表面プラズモン共鳴。 ヒトVδ1抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。ADT1-7系列の表面プラズモン共鳴。 ヒトVδ1抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。ADT1-4系列のKD値及び親クローンに対する変化倍率。 ヒトVδ1抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。ADT1-7系列のKD値及び親クローンに対する変化倍率。 ヒトVδ1抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。ADT1-4系列の親クローンに対するKDの変化倍率。 ヒトVδ1抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。ADT1-7系列の親クローンに対するKDの変化倍率。 カニクイザル抗原に対する結合親和性分析(SPRによるKD)。(A)カニクイザル抗原に対するADT1-4系列の表面プラズモン共鳴。(B)カニクイザル抗原に対するADT1-4系列のKD値。 細胞表面Vδ1 TCRに対する結合親和性(細胞表面Vδ1に対する結合のEC50)。γδ T細胞ドナーATS006に対するVδ1 mAbによる結合レベル。 細胞表面Vδ1 TCRに対する結合親和性(細胞表面Vδ1に対する結合のEC50)。γδ T細胞ドナーTS164に対するVδ1 mAbによる結合レベル。 細胞表面Vδ1 TCRに対する結合親和性(細胞表面Vδ1に対する結合のEC50)。2人のドナーの平均として表された、Vδ1陽性γδT細胞に結合するADT1-4及びADT1-7クローンからの平均50%結合値を表す棒グラフであり、これらの値は改善率(%)と共に表に示されている。 細胞表面Vδ1 TCRに対する結合親和性(細胞表面Vδ1に対する結合のEC50)。(A)及び(B)にプロットしたIC50、ならびにHEK293A、Raji細胞、及び初代血中単核細胞を含む種々の白血球サブセットを含むVδ1陰性細胞種をまとめた表。Vδ1陽性γδT細胞については、データは2人のドナーの平均として表されている。 TCR下方調節。ADT1-4系列。 TCR下方調節。ADT1-7系列。 TCR下方調節。平均TCR下方調節-2人のGD細胞ドナーからのIC50結果。 TCR下方調節。親ADT1-4クローンからの改善されたTCR下方調節の倍率。 TCR下方調節。親ADT1-7クローンからの改善されたTCR下方調節の倍率。 TCR下方調節。(C)からの50%効果値であり、改善率はADT1-4(上)及びADT1-7(下)のそれぞれの親から計算された。 TCR下方調節。(C)からの50%効果値であり、改善倍率はADT1-4(上)及びADT1-7(下)のそれぞれの親から計算された。 CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。GD細胞単独におけるADT1-4-2クローン。 CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。THP-1細胞と合わせたGD細胞におけるADT1-4-2クローン。 CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。GD細胞単独におけるADT1-7-3クローン。 CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。THP-1細胞と合わせたGD細胞におけるADT1-7-3クローン。 CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。未処理の非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理された共培養細胞からのγδ CD107a発現の増加率を表す表。 CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。未処理の、共培養γδ細胞及び非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理された共培養細胞からのγδ CD107a発現の増加率を表す表。 CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。GD細胞単独におけるADT1-4-2クローン。 CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。THP-1細胞と合わせたGD細胞におけるADT1-4-2クローン。 CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。GD細胞単独におけるADT1-7-3クローン。 CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。THP-1細胞と合わせたGD細胞におけるADT1-7-3クローン。 CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。未処理の非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理された共培養細胞からのγδ CD25発現の増加率を表す表。 CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体。未処理の、共培養γδ細胞及び非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理された共培養細胞からのγδ CD25発現の増加率を表す表。 カニクイザルTCR下方調節。(A)カニクイザルγδ-T細胞のVD1に会合してその発現を低減させるADT1-4-2及びADT1-4の能力の比較。(B)ADT1-4-2で処理した際のVD1の細胞表面発現のパーセンテージ。(C)平均及び標準偏差と組み合わせた、異なるドナーからの個々のEC50値。 Vδ1 mAbまたは対照の存在下でのγδ T細胞との24時間の共培養後の生THP-1細胞数の数量化。ADT1-4クローンのTHP-1細胞殺傷アッセイ。 Vδ1 mAbまたは対照の存在下でのγδ T細胞との24時間の共培養後の生THP-1細胞数の数量化。ADT1-7クローンのTHP-1細胞殺傷アッセイ。 Vδ1 mAbまたは対照の存在下でのγδ T細胞との24時間の共培養後の生THP-1細胞数の数量化。ADT1-4及びADT1-7クローンのTHP-1殺傷アッセイにおける平均EC50。 Vδ1 mAbまたは対照の存在下でのγδ T細胞との24時間の共培養後の生THP-1細胞数の数量化。(C)でプロットされたEC50をまとめた表。 抗体依存性細胞傷害(ADCC)に対するVδ1モノクローナル抗体。 補体依存性細胞傷害(CDC)に対するVδ1モノクローナル抗体。 クローンADT1-4-2による健常細胞の温存。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。2人の別々のドナーにおける48時間のmAb刺激後の総腫瘍浸潤γδT細胞におけるVδ1 TCR発現の減少%を示し、各事例における標的会合を裏付けている。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。2人の別々のドナーにおける72時間のmAb刺激後の総腫瘍浸潤γδT細胞におけるVδ1 TCR発現の減少%を示し、各事例における標的会合を裏付けている。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。IgG1アイソタイプ対照またはADT1-4による刺激と比較して、ADT1-4-2による48時間の刺激後のVδ1+T細胞におけるCD25及びKi67の両方の発現が増強されたことを示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。50ng/mlのIL-15の存在下でADT1-4-2またはADT1-7-3によって72時間刺激されたTILによるIFN-γ産生の実質的増加倍率を示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。ADT-1-4-2またはADT1-7-3によるTILの刺激が、この時点で17型関連サイトカインIL-6またはIL-17の分泌を増強しなかったことを示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。2人の別々のドナーにおけるmAb刺激後24時間の総腫瘍浸潤γδT細胞におけるVδ1 TCR発現の減少%を示し、酵素消化によって単離されたTILにおける標的会合を裏付けている。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。2人の別々のドナーにおけるmAb刺激後72時間の総腫瘍浸潤γδT細胞におけるVδ1 TCR発現の減少%を示し、酵素消化によって単離されたTILにおける標的会合を裏付けている。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。ADT1-4-2による72時間の刺激後のγδT細胞上のKi67発現の用量依存的な増強を示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。酵素消化によって2人の各ドナーから単離され、2ng/mlのIL-15の存在下で6.66nMの濃度のADT1-4-2で刺激されたTILによって、24時間の時点で産生されたIFN-γの増加倍率を示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。酵素消化によって2人の各ドナーから単離され、2ng/mlのIL-15の存在下で6.66nMの濃度のADT1-4-2で刺激されたTILによって、72時間の時点で産生されたIFN-γの増加倍率を示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4の濃度は、研究に使用した最高濃度(すなわち、A、C、F、G、H、I、Jについては6.66nMの濃度、B及びEについては66.6nMの濃度)に一致する。 原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果。(A)は、ADT1-4-2で10日間刺激されたγδT細胞におけるCD25及びKi67の発現の増強を示す。(B)は、ADT1-4-2による10日間の刺激後のパーフォリングランザイムBγδT細胞の実質的な増加を示す。(C)は、ADT1-4-2で腫瘍浸潤Vδ1T細胞を10日間刺激した後、CD8及びCD8の両方のαβ T細胞によるグランザイムB及びパーフォリンの発現が大幅に増強されたことを示す。(D)は、ADT1-4-2による刺激後の肺腫瘍由来TILによる、IFN-γの産生の顕著な増加、ならびにIL-17及びIL-6の産生の中程度の増加を示す。Iは、ADT1-4-2による10日間の刺激後のTILによるケモカインCCL2、CCL4及びCXCL10の産生の増強を示す。全ての事例において、対照抗RSV及び親ADT1-4は、親和性成熟したADT1-4-2と同じ濃度に一致した。 ADT1-4系列クローン(軽鎖)の配列。 ADT1-4系列クローン(重鎖)の配列。 ADT1-7系列クローン(軽鎖)の配列。 ADT1-7系列クローン(重鎖)の配列。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、それらの親mAbに匹敵する、ヒトEGFRに対する高親和性結合及びヒトVδ1結合親和性を示す。Vδ1/EGFR二重特異性バリアントを用いて表面プラズモン共鳴(SPR)分析を行い、ヒトVδ1への結合を評価した。比較の目的で、親mAb、セツキシマブ、及び陰性対照mAbを含めた。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、それらの親mAbに匹敵する、ヒトEGFRに対する高親和性結合及びヒトVδ1結合親和性を示す。Vδ1/EGFR二重特異性バリアントを用いて表面プラズモン共鳴(SPR)分析を行い、ヒトEGFR抗原への結合を評価した。比較の目的で、親mAb、セツキシマブ、及び陰性対照mAbを含めた。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFRA431標的細胞及びVδ1γδT細胞に結合する。A431細胞株及び初代Vδ1γδT細胞におけるEGFR及びVδ1の細胞表面発現。標的細胞を様々な濃度の抗体で染色した後、蛍光抗ヒトIgG検出抗体で染色した。すべてのインキュベーションステップは4℃で行い、フローサイトメトリーを使用して蛍光レベル中央値を測定することでmAb結合を判定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFR+A431標的細胞及びVδ1γδT細胞に結合する。A431細胞株または初代Vδ1γδT細胞へのVδ1/EGFR二重特異性抗体による結合のレベル。標的細胞を様々な濃度の抗体で染色した後、蛍光抗ヒトIgG検出抗体で染色した。すべてのインキュベーションステップは4℃で行い、フローサイトメトリーを使用して蛍光レベル中央値を測定することでmAb結合を判定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFR特異的T細胞の活性化及び脱顆粒を誘導し、A431標的細胞のγδT細胞媒介性細胞傷害性の増加をもたらす。A431細胞の存在下または非存在下で二重特異性抗体と共に24時間培養した後の初代Vδ1γδT細胞におけるγδTCRの細胞表面発現。全ての場合において、蛍光レベル中央値を測定するためにフローサイトメトリーを使用して蛍光を決定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。データは、2つの生物学的複製物の平均±SDとして表されている。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFR特異的T細胞の活性化及び脱顆粒を誘導し、A431標的細胞のγδT細胞媒介性細胞傷害性の増加をもたらす。様々な濃度の抗体と併せて1:1の比で24時間共培養した後の生存可能なA431細胞の数。生存率は生死判別色素により測定し、活性化ステータスはCD25抗体を使用して測定した。全ての場合において、蛍光レベル中央値を測定するためにフローサイトメトリーを使用して蛍光を決定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。データは、2つの生物学的複製物の平均±SDとして表されている。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFR特異的T細胞の活性化及び脱顆粒を誘導し、A431標的細胞のγδT細胞媒介性細胞傷害性の増加をもたらす。様々な濃度の抗体と併せて1:1の比で24時間共培養した後の初代Vδ1γδT細胞の活性化ステータス。生存率は生死判別色素により測定し、活性化ステータスはCD25抗体を使用して測定した。全ての場合において、蛍光レベル中央値を測定するためにフローサイトメトリーを使用して蛍光を決定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。データは、2つの生物学的複製物の平均±SDとして表されている。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFR特異的T細胞の活性化及び脱顆粒を誘導し、A431標的細胞のγδT細胞媒介性細胞傷害性の増加をもたらす。様々な濃度の抗体と併せて1:1の比でA431細胞と4時間共培養した後の初代Vδ1γδT細胞の脱顆粒。脱顆粒は、フルオロフォアにコンジュゲートした抗CD107α抗体を共培養開始時に細胞-抗体ミックスに直接加えることによって決定した。全ての場合において、蛍光レベル中央値を測定するためにフローサイトメトリーを使用して蛍光を決定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。データは、2つの生物学的複製物の平均±SDとして表されている。 Vδ1/EGFR二重特異性抗体は、EGFR特異的T細胞の活性化及び脱顆粒を誘導し、A431標的細胞のγδT細胞媒介性細胞傷害性の増加をもたらす。10pMの抗体及び様々な量の初代Vδ1γδT細胞と24時間共培養した後の生存可能なA431細胞の数。全ての場合において、蛍光レベル中央値を測定するためにフローサイトメトリーを使用して蛍光を決定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。データは、2つの生物学的複製物の平均±SDとして表されている。 血液由来及び腫瘍関連Vδ1 T細胞の両方における非枯渇及びCD3下方調節の更なる証拠。(A)血液由来Vδ1 T細胞におけるmAb標的会合の指標としての抗体刺激時のvδ1 TCRのMFIを示す。(B)陽性ゲーティングされた血液由来vδ1細胞におけるCD3発現のMFIを示す。vδ1抗体による刺激はvδ1細胞を会合させ、vδ1細胞上のvδ1及びCD3の両方の下方調節をもたらした。 ADCCレポーターバイオアッセイは、抗vδ1抗体の結果としてADCCを示さない。標的細胞、すなわちγδ細胞を、抗vδ1抗体、抗vδ1 LAGA抗体(Fc無効型)、及びRSVアイソタイプ対照の存在下で、ADCCバイオアッセイエフェクター細胞と共にインキュベートした。発光シグナルは相対光単位(RLU)として記録し、誘導倍率は方法に記載するように計算した。「抗vδ1抗体」、「抗vδ1 LAGA抗体」、「RSV」、「OKT3」についてはN=2のγδドナー(技術的二連(technical duplicate)で行った)。「リツキシマブ+Raji」条件(技術的二連)についてはN=1のRaji細胞株、「抗vδ1抗体+エフェクター」及び「抗vδ1 LAGA抗体+エフェクター」条件(それぞれ技術的二連及び単回(singlicate)で行った)についてはn=1のγδドナー。エフェクター:標的比は3:1。 多重特異性抗体は、Vδ1+エフェクター細胞媒介性細胞傷害性の増強を付与した。組織中心疾患関連抗原の標的化:(A~D)抗Vδ1 VL+VH結合ドメイン(第1の標的に対する)を抗EGFR結合部位(第2の標的に対する)のCH1-CH2-CH3ドメインと対合した抗Vδ1×抗TAA(EGFR)二重特異性結合部位を含む多重特異性抗体ありまたはなし(+/-)での、Vδ1+エフェクター細胞とA-431がん細胞との共培養の例。(E~H)抗Vδ1結合ドメイン(第1の標的に対する)が完全長抗体(VH-CH1-CH2-CH3/VL-CL)を含み、次いで抗EGFRセツキシマブ由来scFv結合部位(第2の標的に対する)と組み合わさった、抗Vδ1×抗TAA(EGFR)二重特異性結合部位を含む多重特異性抗体ありまたはなしでの、Vδ1+エフェクター細胞とA-431がん細胞との共培養の例。 配列アラインメント及びIgG1 CH3(EU番号付け)に対する変化を示すEGFR結合ドメイン(IgG1 CH1-CH2-CH3)の配列。 相互参照されたCH3残基の番号付けを示す表。この表はIMGT.orgから引用したものである。本明細書の他の箇所で参照されるIMGT(標準)、IMGT(エキソン)、EU、及びKabat番号付けによる修飾アミノ酸の位置は、網掛けによって強調表示されている。EGFR結合構築物の一例に見られる追加のアミノ酸挿入を記述するために必要ではあるが非慣例的な位置命名法も示されていることに留意されたい。以下の位置21.1(IMGTエキソンの縦列)/361.1(EUの縦列)/384.1(Kabatの縦列)/17.1(IMGT標準の縦列)を参照のこと。 Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性評価:6つの分子に関する発現及び分析研究。CHOでの収量。 Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性評価:6つの分子に関する発現及び分析研究。加速貯蔵条件下での安定性。 Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性評価:6つの分子に関する発現及び分析研究。凝集傾向。 Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性評価:6つの分子に関する発現及び分析研究。加速条件下での減衰プロファイル(非還元分析)。 Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性評価:6つの分子に関する発現及び分析研究。加速条件下での減衰プロファイル(還元分析)。 Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性評価:6つの分子に関する発現及び分析研究。全体のまとめ/結論。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。親和性の概要。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞への多重特異性結合に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞への多重特異性結合に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞のVδ1 TCR内部移行に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞のVδ1 TCR内部移行に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の脱顆粒に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の脱顆粒に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。この研究の全体的概要。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びVD1結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。TAAコピー数の影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。親和性の概要。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFR+結腸癌細胞株HT-29への多重特異性結合に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFR+結腸癌細胞株HT-29への多重特異性結合に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞のVδ1 TCR下方調節に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞のVδ1 TCR下方調節に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の脱顆粒に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の脱顆粒に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の41BB活性化ステータスに対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の41BB活性化ステータスに対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体及びEGFR結合アームにおける親和性をダイヤルアップ/ダウンすることによって付与される異なる効果に関する拡張研究。EGFRへの親和性及びがん細胞TAAコピー数の影響。 EGFR細胞と比したVδ1への優先的結合に対する親和性の影響。棒グラフ(A)、表(B)、及び比率(C)としての、EGFR細胞と比したVδ1への優先的結合に対する親和性の影響。 A431腫瘍細胞による多重特異性抗体の内部移行に対するEGFRへの親和性の影響。(A)(B)EGFRに対する親和性;A431腫瘍細胞による多重特異性抗体の内部移行に対する影響。(C)(D)A431腫瘍細胞による多重特異性クリアランスへの影響。 EGFリガンド結合及び腫瘍細胞増殖の多重特異性抗体による阻害に対するEGFR親和性の影響。(A)(B)EGFリガンド結合及び腫瘍細胞増殖の多重特異性抗体による阻害に対するEGFR親和性の影響。(C)(D)多重特異性薬によるEGFR+腫瘍細胞増殖の阻害に対するEGFR親和性の影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:健常なEGFR+細胞の温存。(A)(C)用量漸増効果が示されている。(B)は、(A)に記載した実験からの代表的な顕微鏡画像である。 VD1xEGFR多重特異性抗体:ADT1-4-2xFS1-67と、より親和性の低い「親」ADT1-4xFS1-67(別名G04 FS1-67)との比較。(A)TCR下方調節。ADT1-4-2xFS1-67とADT1-4xFS1-67との用量応答比較。(B)TCR下方調節の比較-結果の概要。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。Vδ1 TCR及びCD3ε下方調節に対するT細胞標的受容体の影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。Vδ1 TCR及びCD3ε下方調節に対するT細胞標的受容体の影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。Vδ1 TCR及びCD3ε下方調節に対するT細胞標的受容体の影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。活性化T細胞によるサイトカイン分泌の誘導に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。活性化T細胞によるサイトカイン分泌の誘導に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。 VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較。組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。
本発明は、γδT細胞のT細胞受容体と特異的に結合し、EGFRに特異的に結合する多重特異性抗体ならびにその断片及びバリアントを提供する。
より具体的には、本発明は、TCRδ可変部1(Vδ1)に対する抗原結合部位及びEGFRに対する抗原結合部位を含む、複数の抗原結合部位を含む高親和性抗体(「多重特異性抗体」)に関する。
本発明の多重特異性抗体は、mAbフォーマットであり、CH3ドメインに抗原結合ループを含むように工学操作されたFc領域を含む。この改変されたFc領域は「Fcab」と呼ばれる。mAb抗体は、抗原結合部位をもたらすVH-VLドメイン対を含むFab領域を更に含む。本発明のmAb分子は、EGFR結合Fcab及びvδ1結合Fabを含む。
より具体的には、本発明は、最適化された多重特異性抗体、例えば、本明細書においてG04、E07、C08、B07、C05、E04、F07、G06、G09、B09、G10、及びE01と称される親抗体などの親抗Vδ1抗体から開始される最適化された選択手順により調製された抗体の提供及び特徴付けに関する。特に本発明は、G04及びE07に由来する最適化された多重特異性抗体に関する。
定義
特に定義しない限り、本明細書において使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者により一般的に理解される意味を有する。本明細書で使用する場合、以下の用語は、それらに与えられる下記の意味を有する。
ガンマデルタ(γδ)T細胞は、表面に別個の特徴的なT細胞受容体(TCR)を発現するT細胞の小さなサブセットを表す。このTCRは、1つのガンマ(γ)鎖及び1つのデルタ(δ)鎖から構成される。各鎖は、可変(V)領域、定常(C)領域、膜貫通領域、及び細胞質尾部を含む。V領域は抗原結合部位を含む。以下の2つの主要なサブタイプのヒトγδT細胞が存在する:末梢血で優勢なもの、及び非造血組織で優勢なもの。2つのサブタイプは、細胞に存在するδ及び/またはγの種類により定義され得る。例えば、末梢血で優勢であるγδT細胞は、δ可変部2鎖(Vδ2)を主に発現する。非造血組織で優勢である(すなわち、組織常在性である)γδT細胞は、δ可変部1鎖を主に発現する。「Vδ1 T細胞」または「Vδ1+T細胞」への言及は、Vδ1鎖を有するγδT細胞、すなわち、Vδ1+細胞を指す。
「δ可変部1」への言及は、Vδ1またはVd1とも称され得る一方で、この領域を含むTCR鎖をコードするヌクレオチド、またはこの領域を含むTCRタンパク質複合体は、「TRDV1」と称され得る。γδTCRのVδ1鎖と相互作用し、かつEGFRとも相互作用する抗体またはその抗原結合断片は全て、事実上、Vδ1に結合する抗体またはその抗原結合断片であり、「抗TCRδ可変部1抗体またはその抗原結合断片」または「抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片」または「抗TRDV1抗体またはその抗原結合断片」または「抗Vδ1xEGFR抗体またはその抗原結合断片」と称され得る。
本明細書では、「δ可変部2」鎖などの他のδ鎖に更に言及する。これらは同様な様式で称され得る。例えば、δ可変部2鎖は、Vδ2と称され得る一方で、この領域を含むTCR鎖をコードするヌクレオチド、またはこの領域を含むTCRタンパク質複合体は、「TRDV2」と称され得る。好ましい実施形態では、γδTCRのVδ1鎖と相互作用する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、Vδ2などの他のδ鎖と相互作用しない。本発明において、抗体は、TRDV1に特異的であり、TRDV2(配列番号310)またはγδT細胞受容体に存在する他の抗原、例えば、TRDV3(配列番号311)に結合しない。
本明細書では、「γ可変鎖」にも言及する。これらがγ鎖またはVγと称され得る一方で、この領域を含むTCR鎖をコードするヌクレオチド、またはこの領域を含むTCRタンパク質複合体は、TRGVと称され得る。例えば、TRGV4はVγ4鎖を指す。好ましい実施形態では、γδTCRのVδ1鎖と相互作用する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、Vγ4(例えば、配列番号309)などのγ鎖と相互作用しない。好ましい実施形態では、抗体は、TRDJ、TRDC、TRGJ、またはTRGCなどのγδTCR内に見出される他のドメインとも結合または相互作用しない。
用語「T細胞受容体複合体」は、種々の抗原の認識を担うT細胞の表面に見出される「T細胞受容体」(または「TCR」)を含むタンパク質の複合体である。T細胞受容体複合体は、T細胞受容体のα鎖及びβ鎖を含むか、またはγδT細胞の場合には、T細胞受容体のγ鎖及びδ鎖、ならびに最大6本またはそれ以上の追加の鎖、例えば、CD3δ、CD3γ、CD3ε、及びCD3ζを含むかのいずれかであるが、T細胞受容体複合体の正確な構成は様々であり得る。T細胞受容体複合体は、T細胞活性化を引き起こし得る、T細胞における細胞内シグナル伝達を媒介する。
用語「抗体」は、少なくとも1つの抗原結合部位(ABS)を含む少なくとも1つの抗体可変ドメインを含む任意の抗体タンパク質構築物を包含する。抗体としては、限定されるものではないが、IgA型、IgG型、IgE型、IgD型、IgM型(及びそれらのサブタイプ)の免疫グロブリンが挙げられる。2本の同一の重(H)鎖及び2本の同一の軽(L)鎖ポリペプチドからアセンブルされた免疫グロブリンG(IgG)抗体の全体構造は十分に確立されており、哺乳類において高度に保存されている(Padlan(1994) Mol.Immunol.31:169-217)。
通常の抗体または免疫グロブリン(Ig)は、2本の重(H)鎖及び2本の軽(L)鎖の4本のポリペプチド鎖を含むタンパク質である。各鎖は、定常領域と可変ドメインに分けられる。重(H)鎖可変ドメインは本明細書ではVHと略され、軽(L)鎖可変ドメインは本明細書ではVLと略される。これらのドメイン、それに関連するドメイン及びそれに由来するドメインは、本明細書では免疫グロブリン鎖可変ドメインと称され得る。VHドメイン及びVLドメイン(VH領域及びVL領域とも称される)は、「フレームワーク領域」(「FR」)と称されるより保存されている領域と共に散在する、「相補性決定領域」(「CDR」)と称される領域に更に分割され得る。フレームワーク領域及び相補性決定領域は正確に定義されている(Kabat et al.Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition U.S.Department of Health and Human Services,(1991) NIH Publication Number 91-3242)。CDR配列の別の番号付け規則、例えば、Chothia et al.(1989) Nature 342:877-883に記載されているか、またはIMGT.orgによりまとめられているものも存在する。通常の抗体では、各VH及びVLは、アミノ末端からカルボキシ末端に向かって、FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4の順序で配置される3つのCDRと4つのFRから構成される。2本の免疫グロブリン重鎖及び2本の免疫グロブリン軽鎖の通常の抗体四量体は、例えば、ジスルフィド結合により相互に連結された免疫グロブリン重鎖及び軽鎖、ならびに同様に連結された重鎖で形成される。したがって、全抗体は2つのFabを含み、各FabはVH-VLドメイン対を含む。重鎖定常領域は、3つのドメインであるCH1、CH2、及びCH3を含む。軽鎖定常領域は、1つのドメインであるCLから構成される。重鎖の可変ドメイン及び軽鎖の可変ドメインは、抗原と相互作用する結合ドメインである。抗体の定常領域は、通常、免疫系の様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)及び古典的補体系の第1成分(C1q)が含まれる、宿主組織または因子への抗体の結合を媒介する。
「EU番号付け」とは、抗体におけるアミノ酸残基の番号付けに使用される番号付け規則を指す。抗体の各残基には、抗体の比較を可能にするために番号が割り当てられる。バリアント抗体が、野生型抗体には存在しなかった残基(例えば、挿入変異)を含む場合、挿入を示すために小数が使用される。例えば、番号361及び362で指定された残基の間に残基が挿入された場合、新しい残基にはEU番号361.1が与えられる。EU番号付けは、Kabat(Kabat et al. Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition U.S. Department of Health and Human Services, (1991) NIH Publication Number 91-3242)、Chothia(Chothia et al. (1989) Nature 342: 877-883)、またはIMGT.org.[EU番号付けをEdelman, G.M. et al., Proc. Natl. Acad. USA, 63, 78-85 (1969).(10.1073/pnas.63.1.78)へのさらなる相互参照と共に提示している]によってまとめられているような他の番号付けスキームに代わる代替的な番号付けスキームである。図33は、CH3ドメイン残基のEU番号付け、IMGT番号付け、及びKabat番号付けの間の対応関係を示す。図32は、本発明の多重特異性抗体の残基がEU番号付けスキームに従ってどのように番号付けされるかを示す。
本明細書で使用される「Fab領域」は、抗原結合部位(CDRベースの抗原結合部位としても知られる)を提供するVH-VLドメイン対を含む抗体の一部(または当該部分を含む構築物)を指す。Fab領域は、CLドメイン及びCH1ドメインを更に含み得る。したがって、2つの重鎖及び2つの軽鎖を有する従来の抗体は2つのFabを含み、各FabはVH-VLドメイン対を含む。
本明細書で使用される「Fc領域」(断片結晶化可能領域)とは、CH2及びCH3ドメインを含む抗体の一部(または当該部分を含む構築物)を指す。Fc領域は、野生型配列Fc領域及び改変されたFc領域を含む、免疫グロブリン重鎖のC末端領域である。Fc領域は二量体であるため、各々がCH2及びCH3ドメインを含む対になった重鎖定常領域を含む。
本明細書で使用する場合、抗体の「断片」(「抗体断片」、「免疫グロブリン断片」、「抗原結合断片」、または「抗原結合ポリペプチド」とも称され得る)は、第1の標的であるγδT細胞受容体のδ可変部1(Vδ1)鎖または第2の標的であるEGFRに特異的に結合する抗体(または当該部分を含む構築物)の一部(例えば、1つ以上の免疫グロブリン鎖が完全長ではないが、標的に特異的に結合する分子)を指す。抗体断片という用語に包含される結合断片の例としては、以下が挙げられる:
(i)Fab断片(VL、VH、CL、及びCH1ドメインからなる一価の断片);
(ii)F(ab′)2断片(ヒンジ領域でのジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片からなる二価の断片);
(iii)Fd断片(VH及びCH1ドメインからなる);
(iv)Fv断片(抗体の単一アームのVL及びVHドメインからなる);
(v)一本鎖可変断片(scFv)(組換え方法を使用して、VL及びVH領域が対合して、一価の分子を形成している単一のタンパク質鎖として作製されることを可能にする合成リンカーにより連結されたVL及びVHドメインからなる);
(vi)VH(VHドメインからなる免疫グロブリン鎖可変ドメイン);
(vii)VL(VLドメインからなる免疫グロブリン鎖可変ドメイン);
(viii)ドメイン抗体(dAb)(VHまたはVLドメインのいずれかからなる);
(ix)ミニボディ(CH3ドメインにより連結された一対のscFv断片からなる);及び
(x)ダイアボディ(小さなペプチドリンカーにより1つの抗体由来のVLドメインに連結された別の抗体由来のVHドメインからなるscFv断片の非共有結合性二量体からなる)、
(xi)Fc断片(CH2及びCH3ドメインからなる)、
(xii)Fcab断片(CH3ドメインに抗原結合ループを含むように工学操作されたFc断片からなる)、
(xiii)Fcabの抗原結合CH3ドメイン。
「ヒト抗体」は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び定常領域を有する抗体を指す。上記ヒト抗体を投与されたヒト対象は、上記抗体内に含まれる一次アミノ酸に対する異種間抗体応答(例えば、HAMA反応(ヒト抗マウス抗体反応)と称される)を生じない。上記ヒト抗体は、例えば、CDR、特にCDR3において、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列によりコードされないアミノ酸残基(例えば、ランダムもしくは部位特異的変異誘発、または体細胞突然変異により導入された変異)を含み得る。しかしながら、この用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系列に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植された抗体を包含することを意図しない。組換え手段により調製、発現、作製、もしくは単離されるヒト抗体、例えば、宿主細胞に形質移入された組換え発現ベクターを使用して発現された抗体、組換えヒト抗体ライブラリの組み合わせから単離された抗体、ヒト免疫グロブリン遺伝子についてトランスジェニックな動物(例えば、マウス)から単離された抗体、またはヒト免疫グロブリン遺伝子配列を他のDNA配列にスプライシングすることを含む任意の他の手段により調製、発現、作製、もしくは単離された抗体は、「組換えヒト抗体」とも称され得る。
非ヒト免疫グロブリン可変ドメインのフレームワーク領域における少なくとも1つのアミノ酸残基をヒト可変ドメイン由来の対応する残基で置換することは、「ヒト化」と称される。可変ドメインのヒト化により、ヒトにおける免疫原性が低減され得る。
「特異性」とは、特定の抗体またはその抗原結合断片が結合することができる、異なる種類の抗原または抗原決定基の数を指す。抗体の特異性は、特定の抗原を固有の分子実体として認識し、それを別の抗原と区別する抗体の能力である。抗原またはエピトープに「特異的に結合する」(または抗原もしくはエピトープに「特異的」である)抗体は、当該技術分野において十分に理解されている用語である。分子が「特異的結合」を示すと言われるのは、その分子が、他の標的と反応するよりも、特定の標的抗原またはエピトープと、より頻繁に、より急速に、より長い持続時間で、及び/またはより高い親和性で反応する場合である。抗体が標的抗原またはエピトープに「特異的に結合する」のは、それが他の物質に結合するよりも、より高い親和性で、より高い結合活性で、より容易に、及び/またはより長い持続時間で結合する場合である。
本発明の抗体は多重特異性抗体である。「多重特異性抗体」は、複数の異なるエピトープに同時または連続的に結合することができる抗体である。一般に、これらのエピトープは同じ抗原に存在しない。よって、多重特異性抗体は、複数の異なる結合ドメインを介して異なる抗原に存在するエピトープに選択的に結合する能力を有する。これは、この能力を有しない従来の単一特異性抗体とは対照的である。正確には、「単一特異性抗体」は、1つの抗原に対する結合特異性しか有しないが、この1つの抗原に対して複数の結合部位を有してもよい(例えば、完全ヒトIgG抗体の結合価は2であり、他の抗体の結合価はより高い場合があるが、抗体が1つの抗原のみを認識する場合、これは依然として単一特異性抗体と分類される)。従って、本発明の多重特異性抗体は、複数の異なる抗原に同時に及び/または連続的に結合する。
本発明の幾つかの実施形態では、抗体は二重特異性抗体である。「二重特異性抗体」は、2つの異なるエピトープに同時に及び/または連続的に結合することができる抗体である。一般に、これらのエピトープは同じ抗原に存在しない。従って、二重特異性抗体は、2つの異なる結合ドメインにより2つの異なる抗原に存在する2つの異なるエピトープに選択的に結合する能力を有する。このことは、この能力を有さない従来の単一特異性抗体とは対照的である。従って、本発明の二重特異性抗体は、2つの異なる抗原に同時に及び/または連続的に結合する。
本明細書で使用される「mAb抗体」または「mAb二乗抗体」は、ある二重特異性抗体フォーマットを指し、これによれば、二重特異性抗体は、そのCH3ドメインに抗原結合ループを含むように工学操作されたFc領域を含む。この改変されたFc領域は「Fcab」と呼ばれる。mAb抗体は、抗原結合部位をもたらすVH-VLドメイン対を含むFab領域を更に含む。
ヒトIgG1のCH3ドメインは残基341番で始まり、残基447番で終わる(EU番号付け)。残基447番(EU番号付け)は、製造中に切断されることがあるため、必ずしも最終分子に現れるとは限らない。ヒトIgG1のCH3ドメイン(配列番号563)は、それぞれ3つ及び4つのβストランドによって形成された2つのβシートで構成されている。3つの構造ループが、CH3ドメインのC末端でこれらのβストランドを接続する。本発明の抗体において、これらのループは、EGFR結合部位を形成するように改変されている。残基355~362は、CH3ドメインのストランドA及びBを接続するループである「ABループ」と定義され、残基383~391は、CH3ドメインのストランドC及びDを接続するループである「CDループ」と定義され、残基413~422は、CH3ドメインのストランドE及びFを接続するループである「EFループ」と定義された。EU番号付けが使用されている(図32を参照)。
抗原と抗原結合ポリペプチドとの解離に関する平衡定数(KD)により表される「親和性」とは、抗原決定基と抗体(またはその抗原結合断片)上の抗原結合部位との間の結合強度の尺度である。KDの値が小さいほど、抗原決定基と抗原結合ポリペプチドとの間の結合強度は強くなる。あるいは、親和性は、1/KDである親和定数(KA)としても表され得る。親和性は、関心対象の特異的抗原に応じて、既知の方法で決定され得る。例えば、KDは、表面プラズモン共鳴により決定され得る。
10-6未満のKD値は、いずれも結合を示すとみなされる。抗体またはその抗原結合断片の抗原または抗原決定基への特異的結合は、例えば、スキャッチャード分析及び/または競合結合アッセイ、例えば、放射免疫測定法(RIA)、酵素免疫測定法(EIA)、及びサンドイッチ競合アッセイ、平衡透析、平衡結合、ゲル濾過、ELISA、表面プラズモン共鳴、または分光法(例えば、蛍光アッセイを使用する)、ならびに当該技術分野において公知のそれらの様々な変形形態が含まれる、任意の好適な公知の方法で測定され得る。
「結合活性」は、抗体またはその抗原結合断片と、関連する抗原との間の結合の強さの尺度である。結合活性は、抗原決定基と抗体上のその抗原結合部位との間の親和性、及び抗体に存在する関連する結合部位の数の両方に関連する。
「生体内原位置」は、別の場所に移されるのではなく、天然または元の場所にあることを意味する。例えば、患者の生体内原位置のVδ1+細胞は、インビトロまたはエクスビボの細胞ではなく、インビボのvδ1細胞を指す。
「ヒト組織Vδ1+細胞」、ならびに「造血及び血液Vδ1+細胞」及び「腫瘍浸潤リンパ球(TIL)Vδ1+細胞」は、それぞれヒト組織もしくは造血血液系もしくはヒト腫瘍のいずれかに含まれる、またはそれらに由来するVδ1+細胞と定義される。全ての上記細胞種は、それらの(i)位置またはそれらが由来する場所、及び(ii)それらのVδ1+TCR発現により同定され得る。
「調節性抗体」は、抗体が結合する標的を発現する細胞に接触または結合した際に、限定されるものではないが、細胞周期、及び/または細胞数、及び/または細胞生存率、及び/または1種以上の細胞表面マーカー、及び/または1種以上の分泌性分子(例えば、サイトカイン、ケモカイン、ロイコトリエンなど)の分泌、及び/または機能(例えば、標的細胞または病変細胞に対する細胞傷害性)における測定可能な変化が含まれる、測定可能な変化をもたらす抗体である。細胞またはその集団を「調節する」方法とは、1つ以上の「調節された細胞」を生じさせるために、当該細胞もしくは複数の細胞またはそれらからの分泌における少なくとも1つの測定可能な変化が誘発される方法を指す。
「免疫応答」は、調節性抗体が添加された際の、免疫系(限定されるものではないが、細胞性応答、体液性応答、サイトカイン応答、ケモカイン応答が含まれる)の少なくとも1つの細胞、または1つの細胞種、または1つの内分泌経路、または1つの外分泌経路における測定可能な変化である。
「免疫細胞」は、限定されるものではないが、CD34+細胞、B細胞、CD45+(リンパ球共通抗原)細胞、αβT細胞、細胞傷害性T細胞、ヘルパーT細胞、形質細胞、好中球、単球、マクロファージ、赤血球、血小板、樹状細胞、食細胞、顆粒球、自然リンパ球系細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、及びγδT細胞が含まれる、免疫系の細胞と定義される。典型的には、コンビナトリアル細胞表面分子分析を用いて(例えば、フローサイトメトリーにより)免疫細胞を分類して、免疫細胞を同定する、または亜集団にグループ分けもしくはクラスター化して区別する。これらは次いで、追加の分析によってなおも更に細分され得る。例えば、CD45+リンパ球は、vδ陽性集団とvδ陰性集団とに更に細分され得る。
「モデル系」は、抗体またはその抗原結合断片などの医薬品が疾患の徴候または症状の改善において薬剤としてどの程度機能し得るかについての理解を助けるように設計された生体モデルまたは生物学的表現である。かかるモデルは通常、インビトロ、エクスビボ、及びインビボの病変細胞、非病変細胞、健常細胞、エフェクター細胞、及び組織などの使用を含み、これらにおいて上記薬剤の性能が研究及び比較される。
「病変細胞」は、がんなどの疾患、ウイルス感染などの感染、または炎症性状態もしくは炎症性疾患の進行に関連する表現型を示す。例えば、病変細胞は、腫瘍細胞、自己免疫組織、またはウイルスに感染した細胞であり得る。従って、上記病変細胞は、腫瘍状のもの、またはウイルスに感染したもの、または炎症性のものと定義され得る。
「健常細胞」は、疾患にかかっていない正常細胞を指す。これらは「正常」細胞または「非病変」細胞とも称され得る。非病変細胞としては、非がん性細胞、または非感染細胞、または非炎症性細胞が挙げられる。上記細胞は、薬剤によりもたらされる病変細胞特異性を測定するため、及び/または薬剤の治療指数をよりよく理解するために、関連性する病変細胞と共に用いられることが多い。
「病変細胞特異性」は、エフェクター細胞またはその集団(例えば、Vδ1+細胞集団など)が、非病変細胞または健常細胞を温存しながら、がん細胞などの病変細胞を区別し、殺傷するのに、どの程度効果的であるかの尺度である。この能力はモデル系で測定することができ、エフェクター細胞またはエフェクター細胞集団が病変細胞を選択的に殺傷または溶解する傾向を、当該エフェクター細胞が非病変細胞または健常細胞を殺傷または溶解する能力に対して比較することを含み得る。上記病変細胞特異性は、薬剤の潜在的な治療指数についての情報を提供し得る。
「増強された病変細胞特異性」は、病変細胞を特異的に殺傷する能力を更に増強するように調節された、例えば、Vδ1+細胞などのエフェクター細胞またはその集団の表現型を表す。この増強は、病変細胞の殺傷の特異性または選択性における倍率変化またはパーセント増加が含まれる、種々のかたちで測定され得る。
「ADCC」または「抗体依存性細胞性細胞傷害」は、細胞の表面抗原に結合した抗体でコーティングされた細胞に対する免疫応答を表す。これは、免疫エフェクター細胞(例えば、NK細胞など)が、細胞に結合した抗体を認識し、標的細胞の脱顆粒及び溶解を引き起こす、細胞媒介性プロセスである。通常、これはFc-Fcγ相互作用によって媒介される。細胞に結合した抗体のFc領域は、Fcγ受容体を発現するエフェクター細胞(例えば、NK細胞)を動員し、エフェクター細胞の脱顆粒及び標的細胞の死を引き起こす。
「Fc有効型」とは、機能的Fc領域(断片結晶化可能領域)、すなわち突然変異または別の方法で無効化されていないFc領域を含む抗体を指す。Fc有効型抗体は、減弱されていないFc機能を示す。Fc有効型抗体は、1つ以上のFcγ受容体への結合を低減するように改変または工学操作または構築されていない、IMGTに収載されているヒトIGHC重鎖配列を含み得る。例えば、IGHCヒンジ突然変異を介するか、またはIgG1/IgG2AもしくはIgG1/IgG4 IGHC配列のキメラもしくはハイブリッドである重鎖定常ドメインを含む抗体の構築による。
好適には、本発明の抗体またはその抗原結合断片(すなわちポリペプチド)は単離されている。「単離された」ポリペプチドは、元の環境から取り出されたものである。「単離された」という用語は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指すように使用され得る(例えば、Vδ1と特異的に結合する単離された抗体またはその断片は、Vδ1以外の抗原と特異的に結合する抗体を実質的に含まない)。「単離された」という用語は、単離された抗体が、医薬組成物の活性成分として製剤化された場合、治療的に投与されるのに十分な純度であるか、または少なくとも70~80%(w/w)の純度、より好ましくは、少なくとも80~90%(w/w)の純度、更により好ましくは、90~95%の純度、最も好ましくは、少なくとも95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%(w/w)の純度である調製物を指すように使用されてもよい。
好適には、本発明において使用されるポリヌクレオチドは単離されている。「単離された」ポリヌクレオチドは、元の環境から取り出されたものである。例えば、天然に存在するポリヌクレオチドは、それが自然系で共存する材料の一部または全てから分離されている場合、単離されている。ポリヌクレオチドは、例えば、その自然環境の一部ではないベクターにクローニングされている場合、またはそれがcDNA内に含まれる場合、単離されたとみなされる。
抗体またはその抗原結合断片は、「機能的に活性なバリアント」であり得、機能的に活性なバリアントとしては、天然に存在するアレルバリアント、及び変異体または他の任意の非天然バリアントも挙げられる。当該技術分野において公知のように、アレルバリアントは、ポリペプチドの生物学的機能を本質的に変化させない1つ以上のアミノ酸の置換、欠失、または付加を有することを特徴とする(ポリ)ペプチドの代替形態である。非限定的な例として、CDRを含有するフレームワークが改変されても、CDR自体が改変されても、上記CDRが代替のフレームワークにグラフトされても、またはN末端もしくはC末端の伸長が組み込まれても、上記機能的に活性なバリアントは依然として機能し得る。更に、CDR含有結合ドメインは、別の抗体と共有されるものなどの異なるパートナー鎖と対になっていてもよい。いわゆる「共通」軽鎖または「共通」重鎖と共有されても、上記結合ドメインは依然として機能し得る。更に、上記結合ドメインは、多量体化された場合に機能し得る。更に、「抗体またはその抗原結合断片」には、VHもしくはVLもしくは定常ドメインが異なるカノニカル配列(例えば、IMGT.orgに収載されているもの)から離れるように、またはそれに近づくように改変されており、かつ依然として機能する機能的バリアントも含まれ得る。
2つの密接に関連するポリペプチド配列を比較するために、第1のポリペプチド配列と第2のポリペプチド配列との間の「%配列同一性」が、NCBI BLAST v2.0を使用し、ポリペプチド配列での標準設定(BLASTP)を使用して算出され得る。2つの密接に関連するポリヌクレオチド配列を比較するために、第1のポリヌクレオチド配列と第2のポリヌクレオチド配列との間の「配列同一性%」が、NCBI BLAST v2.0を使用し、ヌクレオチド配列での標準設定(BLASTN)を使用して算出され得る。
ポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列は、それらの全長にわたって100%の配列同一性を共有する場合、もう一方のポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列と同じまたは「同一」であると言われる。配列内の残基は、左から右に、すなわち、ポリペプチドではN末端からC末端まで;ポリヌクレオチドでは5’末端から3’末端まで番号付けられる。
幾つかの実施形態では、配列の任意の特定の%配列同一性は、抗体の6つ全てのCDR配列なしで算出される。例えば、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、特定の重鎖可変領域配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する重鎖可変領域配列、及び/または特定の軽鎖可変領域配列に対して少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する軽鎖可変領域配列を含み得、ここで、あらゆるアミノ酸多様性は、重鎖可変領域配列及び軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域でのみ生じる。かかる実施形態では、ある特定の配列同一性を有する抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、対応する抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片の重鎖及び軽鎖の完全なCDR1、CDR2、及びCDR3配列を保持する。より具体的な例では、決して限定するものではなく、本発明のこれらの実施形態を更に説明するためだけのものであるが、配列番号15のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLを含む抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供され、ここで、あらゆるアミノ酸多様性は、重鎖可変領域配列及び軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域でのみ生じる。従って、この具体例の抗体は、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、配列番号68のアミノ酸配列を含むVHCDR3、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むVLCDR3を更に含む。
更に、本明細書において提供される多重特異性抗体は、κ軽鎖可変配列を含み、IMGT番号付けシステムによる74位にセリンではないアミノ酸残基、例えば、非極性及び/または非ヒト生殖細胞系列型の残基を保持していてもよく、例えば、それらはこの位置でロイシン残基を含み得る。例えば、決して限定するものではなく、本発明のこれらの実施形態を更に説明するためだけのものであるが、配列番号15のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLを含む抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供され、ここで、あらゆるアミノ酸多様性は、重鎖可変領域配列及び軽鎖可変領域配列のフレームワーク領域でのみ生じ、当該抗体は、IMGT番号付けシステムによる74位に非ヒト生殖細胞系列型及び/または非極性であるアミノ酸残基(例えば、この位置でのロイシン残基)を含むκ軽鎖可変配列を含む。この具体例の抗体は、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、配列番号68のアミノ酸配列を含むVHCDR3、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むVLCDR3を更に含む。
配列間の「差異」とは、第1の配列と比較した、第2の配列のある位置における単一アミノ酸残基の挿入、欠失、または置換を指す。2つのポリペプチド配列は、1つ、2つ、またはそれ以上のかかるアミノ酸の差異を含み得る。それ以外の点では第1の配列と同一(100%の配列同一性)である第2の配列における挿入、欠失、または置換は、配列同一性%の減少をもたらす。たとえば、同一の配列が9アミノ酸残基の長さである場合、第2の配列における1つの置換は、88.9%の配列同一性をもたらす。第1のポリペプチド配列及び第2のポリペプチド配列が9のアミノ酸残基長であり、6つの同じ残基を共有する場合、第1のポリペプチド配列及び第2のポリペプチド配列は、66%超の同一性を共有する(第1のポリペプチド配列及び第2のポリペプチド配列は、66.7%の同一性を共有する)。
あるいは、第1の参照ポリペプチド配列を第2の比較ポリペプチド配列と比較するために、第2の配列を生成するために第1の配列に加えられた付加、置換、及び/または欠失の数が確認され得る。「付加」とは、第1のポリペプチドの配列への1つのアミノ酸残基の付加である(第1のポリペプチドのいずれかの末端での付加が含まれる)。「置換」とは、第1のポリペプチドの配列における1つのアミノ酸残基の1つの異なるアミノ酸残基での置換である。上記置換は、保存的または非保存的であり得る。「欠失」とは、第1のポリペプチドの配列からの1つのアミノ酸残基の欠失である(第1のポリペプチドのいずれかの末端での欠失が含まれる)。
三文字コード及び一文字コードを使用すると、天然に存在するアミノ酸は、以下のように称され得る:グリシン(GまたはGly)、アラニン(AまたはAla)、バリン(VまたはVal)、ロイシン(LまたはLeu)、イソロイシン(IまたはIle)、プロリン(PまたはPro)、フェニルアラニン(FまたはPhe)、チロシン(YまたはTyr)、トリプトファン(WまたはTrp)、リジン(KまたはLys)、アルギニン(RまたはArg)、ヒスチジン(HまたはHis)、アスパラギン酸(DまたはAsp)、グルタミン酸(EまたはGlu)、アスパラギン(NまたはAsn)、グルタミン(QまたはGln)、システイン(CまたはCys)、メチオニン(MまたはMet)、セリン(SまたはSer)及びトレオニン(TまたはThr)。残基がアスパラギン酸またはアスパラギンであり得る場合、記号AsxまたはBが使用され得る。残基が任意のアミノ酸であり得る場合、記号XaaまたはXが使用され得る。残基がグルタミン酸またはグルタミンであり得る場合、記号GlxまたはZが使用され得る。文脈上別段の定めがない限り、アスパラギン酸への言及は、アスパラギン酸塩を包含し、グルタミン酸への言及は、グルタミン酸塩を包含する。
本明細書で使用する場合、ポリペプチド配列の番号付けならびにCDR及びFRの定義は、文脈で示されるように、EU及び/またはIMGTの番号付けシステムに従って定義される通りである。第1のポリペプチド配列と第2のポリペプチド配列との間の「対応する」アミノ酸残基は、文脈で示されるように、EU及び/またはIMGT番号付けシステムに従って、第2の配列におけるアミノ酸残基と同じ位置を共有する、第1の配列におけるアミノ酸残基であるが、当該第2の配列における当該アミノ酸残基は、当該第1の配列とは同一性が異なる場合がある。好適には、対応する残基は、フレームワーク及びCDRがEUまたはIMGTの定義に従って同じ長さである場合、同じ番号(及び文字)を共有する。アラインメントは、手作業で、または例えば、標準設定を使用するNCBI BLAST v2.0(BLASTPまたはBLASTN)などの配列アラインメントのための公知のコンピューターアルゴリズムを使用することによって達成され得る。
本明細書における「エピトープ」への言及は、抗体またはその抗原結合断片により特異的に結合される標的の一部を指す。エピトープは「抗原決定基」とも称され得る。抗体が別の抗体と「本質的に同じエピトープ」に結合するのは、それらの両方が同一のまたは立体的に重複するエピトープを認識する場合である。2つの抗体が同一のまたは重複するエピトープに結合するかどうかを決定するために一般的に使用される方法は、競合アッセイであり、これは、標識抗原または標識抗体のいずれかを使用する多数の様々なフォーマット(例えば、放射性標識もしくは酵素標識を使用したウェルプレート、または抗原を発現する細胞でのフローサイトメトリー)で構成され得る。抗体が別の抗体と「同じエピトープ」に結合するのは、それらの両方が同一のエピトープを認識する(すなわち、抗原と抗体との間の全ての接触点が同じである)場合である。
タンパク質標的に見出されるエピトープは、「直鎖状エピトープ」または「立体構造エピトープ」として定義され得る。直鎖状エピトープは、タンパク質抗原におけるアミノ酸の連続配列によって形成されている。立体構造エピトープは、タンパク質配列内で非連続的であるが、タンパク質が三次元構造に折り畳まれると集合されるアミノ酸から形成されている。
本明細書で使用する場合、用語「ベクター」は、核酸分子であって、それが連結されている別の核酸を輸送することができる当該核酸分子を指すことを意図する。ベクターの一種は「プラスミド」であり、これは、追加のDNA断片がライゲーションされ得る環状二本鎖DNAループを指す。別の種類のベクターは、追加のDNA断片がウイルスゲノムにライゲーションされ得るウイルスベクターである。ある特定のベクターは、それらが導入された宿主細胞内で自己複製が可能である(例えば、細菌の複製開始点を有する細菌ベクター及びエピソーム哺乳動物ベクター及び酵母ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞への導入の際に宿主細胞のゲノムに組み込まれ得、これにより、宿主ゲノムと共に複製される。更に、ある種のベクターは、それらが作動可能に連結された遺伝子の発現を誘導することができる。かかるベクターは、本明細書において「組換え発現ベクター」、または単に「発現ベクター」と称される。一般に、組換えDNA技術において有用な発現ベクターは、多くの場合プラスミドの形態である。プラスミドが最も一般的に用いられるベクターの形態であるため、本明細書では、「プラスミド」及び「ベクター」は互換的に使用され得る。しかしながら、本発明は、同等の機能を果たすウイルスベクター(例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、及びアデノ随伴ウイルス)、ならびに更にはバクテリオファージ及びファージミド系などの他の形態の発現ベクターを包含することを意図する。本明細書で使用する場合、用語「組換え宿主細胞」(または単に「宿主細胞」)は、組換え発現ベクターが導入された細胞を指すことを意図する。かかる用語は、特定の対象細胞を指すだけでなく、例えば、かかる細胞の子孫が、細胞株または細胞バンクを作製するために用いられ、次いで、これらが、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を製造するために任意に保存、提供、販売、譲渡、または利用される場合、当該子孫も指すことを意図する。
「対象」、「患者」、または「個体」への言及は、処置される対象、特に哺乳動物対象を指す。哺乳動物対象としては、ヒト、非ヒト霊長類、家畜(例えば、ウシ)、競技用動物、または愛玩動物、例えば、イヌ、ネコ、モルモット、ウサギ、ラット、またはマウスが挙げられる。幾つかの実施形態では、対象はヒトである。代替的実施形態では、対象はマウスなどの非ヒト哺乳動物である。
用語「十分量」は、所望の効果を引き起こすのに十分な量を意味する。用語「治療上有効量」は、疾患または障害の症状を改善するのに有効な量である。治療上有効量は、予防が治療とみなされ得る場合、「予防上有効量」であり得る。
疾患もしくは障害の徴候もしくは症状の重症度、このような徴候もしくは症状を対象が経験する頻度、またはその両方が(初期の時点、例えば、任意の抗体の投与前と比較して)低減される場合、当該疾患または障害は「軽減」される。
本明細書で使用する場合、「疾患または障害を処置する」とは、対象が経験する疾患または障害の少なくとも1つの徴候または症状の頻度及び/または重症度を(初期の時点、例えば、任意の抗体の投与前と比較して)低減することを意味する。
本明細書で使用する場合、「がん」は、細胞の異常な増殖または分裂を指す。一般に、がん細胞の増殖及び/または寿命は、その周囲の正常な細胞及び組織の増殖及び/または寿命を上回り、それらと協調しない。がんは、良性、前悪性、または悪性であり得る。がんは、口腔(例えば、口、舌、咽頭など)、消化器系(例えば、食道、胃、小腸、結腸、直腸、肝臓、胆管、胆嚢、膵臓など)、呼吸器系(例えば、喉頭、肺、気管支など)、骨、関節、皮膚(例えば、基底細胞、扁平細胞、髄膜腫など)、乳房、生殖器系、(例えば、子宮、卵巣、前立腺、精巣など)、泌尿器系(例えば、膀胱、腎臓、尿管など)、眼、神経系(例えば、脳など)、内分泌系(例えば、甲状腺など)、及び造血系(例えば、リンパ腫、骨髄腫、白血病、急性リンパ球性白血病、慢性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病など)が含まれる、種々の細胞及び組織において発生する。
本明細書で使用する場合、用語「約」は、本明細書で使用される場合、指定される値より10%高い値(この値を含む)まで及び10%低い値(この値を含む)までを包含し、好適には、指定される値より5%高い値(この値を含む)まで及び5%低い値(この値を含む)までを包含し、特に指定される値を包含する。「間」という用語には、指定された境界の値が含まれる。
多重特異性抗体及びその抗原結合断片
本明細書では、γδT細胞受容体(TCR)のδ可変部1鎖(Vδ1)に特異的に結合することができ、EGFRに特異的に結合することもできる、多重特異性抗体が提供される。本発明は、処置される対象に投与するための薬剤としての上記抗体の使用に関する。
一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、scFv、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、可変ドメイン(例えば、VHまたはVL)、ダイアボディ、ミニボディ、またはモノクローナル抗体である。更なる実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、scFvである。
本発明の多重特異性抗体は、任意のクラス、例えば、IgG、IgA、IgM、IgE、IgD、またはそれらのアイソタイプの抗体であり得、κ軽鎖またはλ軽鎖を含み得る。一実施形態では、抗体は、IgG抗体、例えば、アイソタイプであるIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4のうちの少なくとも1つである。更なる実施形態では、抗体は、所望の特性を付与するために改変された、例えば、エフェクター機能を低減するように、半減期を延長するように、ADCCを変化させるように、またはヒンジ安定性を改善するように変異したFcを有する、IgGフォーマットなどのフォーマットであり得る。かかる改変は、当該技術分野において周知である。
一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片はヒトである。従って、抗体またはその抗原結合断片は、ヒト免疫グロブリン(Ig)配列に由来し得る。抗体(またはその抗原結合断片)のCDR、フレームワーク、及び/または定常領域は、ヒトIg配列、特にヒトIgG配列に由来し得る。CDR、フレームワーク及び/または定常領域は、ヒトIg配列、特にヒトIgG配列について実質的に同一であり得る。ヒト抗体を使用する利点は、それらがヒトにおいて低免疫原性または非免疫原性であることである。
抗体またはその抗原結合断片は、キメラ、例えば、マウス/ヒトキメラ抗体であってもよい。
あるいは、抗体またはその抗原結合断片は、マウスなどの非ヒト種に由来する。かかる非ヒト抗体は、ヒトにおいて天然に産生される抗体バリアントに対する類似性を増加させるために改変され得、これにより、抗体またはその抗原結合断片は、部分的または完全にヒト化され得る。従って、一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片はヒト化されている。
本明細書において提供される特異的Fab領域の概要
本発明で使用される特異的な抗原結合分子(すなわち抗体)の一部の概要を以下に示すと共に、添付の配列表における割り当てられた配列番号を明示する。抗原結合性のバリアント、誘導体、及びそれらの断片も本発明の一部として提供される。配列は、付属の配列表及び添付の図に示される。配列表における配列と図22~25における配列との間に相違がある場合、図の配列が優先するものとする。
ADT1-4及びADT1-7由来のFab領域
本発明は、Fab領域が親抗体ADT1-4(配列番号1に記載の重鎖可変領域配列及び配列番号26に記載の軽鎖可変領域配列を有する)に由来する多重特異性抗体、及び親抗体ADT1-7(配列番号106に記載の重鎖可変領域配列及び配列番号118に記載の軽鎖可変領域配列を有する)に由来する抗体を提供する。ADT1-4は本明細書においてG04とも称され、ADT1-4及びG04は互換的に使用される。ADT1-7は本明細書においてE07とも称され、ADT1-7及びE07は互換的に使用される。
幾つかの実施形態では、本発明は、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体を提供する:
配列番号55~78及び133~143からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または配列番号82~105及び147~157からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
幾つかの実施形態では、本発明は、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体を提供する:
配列番号51、52、及び130からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR1;
配列番号53及び131からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号55~78及び133~143からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、ならびに
配列番号79及び144からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR1;
配列番号80及び145からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号82~105及び147~157からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアントFab領域を提供するためになされ得る。
幾つかの実施形態では、本発明は、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体を提供する:
配列番号2~25及び107~117からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~50及び119~129からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
ADT1-4由来のFab領域
本発明は、例えば、以下に記載されるような、親抗体ADT1-4(配列番号1に記載の重鎖可変領域配列及び配列番号26に記載の軽鎖可変領域配列を有する)に由来するFab領域を含む多重特異性抗体を提供する。ADT1-4は本明細書においてG04とも称され、ADT1-4及びG04は互換的に使用される。
ADT1-4に由来する特定のCDR配列を含む抗体
本明細書において提供される多重特異性抗体は、ADT1-4に由来する特定の配列を有する以下のFab領域を含む。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号55~78からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または配列番号82~105からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号55~77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または配列番号82~104からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号58、60、61、62、65、66、68、74、76、及び77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または配列番号85、87、88、89、92、93、95、101、103、及び104からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号51及び52からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR1;
配列番号53のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号55~78からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR1;
配列番号80のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号82~105からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号51及び52からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR1;
配列番号53のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号55~77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR1;
配列番号80のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号82~104からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号51及び52からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR1;
配列番号53のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号58、60、61、62、65、66、68、74、76、及び77からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR1;
配列番号80のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号85、87、88、89、92、93、95、101、103、及び104からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
a)それぞれ配列番号51、53、及び55のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び82のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
b)それぞれ配列番号51、53、及び56のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び83のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
c)それぞれ配列番号51、53、及び57のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び84のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
d)それぞれ配列番号51、53、及び58のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び85のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
e)それぞれ配列番号51、53、及び59のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び86のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
f)それぞれ配列番号51、53、及び60のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び87のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
g)それぞれ配列番号52、53、及び61のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び88のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
h)それぞれ配列番号51、53、及び62のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び89のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
i)それぞれ配列番号51、53、及び63のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び90のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
j)それぞれ配列番号51、53、及び64のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び91のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
k)それぞれ配列番号51、53、及び65のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び92のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
l)それぞれ配列番号52、53、及び66のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び93のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
m)それぞれ配列番号51、53、及び67のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び94のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
n)それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
o)それぞれ配列番号51、53、及び69のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び96のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
p)それぞれ配列番号51、53、及び70のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び97のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
q)それぞれ配列番号51、53、及び71のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び98のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
r)それぞれ配列番号51、53、及び72のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び99のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
s)それぞれ配列番号51、53、及び73のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び100のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
t)それぞれ配列番号52、53、及び74のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び101のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
u)それぞれ配列番号51、53、及び75のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び102のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
v)それぞれ配列番号51、53、及び76のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び103のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
w)それぞれ配列番号51、53、及び77のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び104のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;または
x)それぞれ配列番号51、53、及び78のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び105のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3。
多重特異性抗体は、κ軽鎖可変配列を含み得(またはκ軽鎖可変配列に由来する可変軽鎖を含む)、ここで、IMGT番号付けシステムによる当該κ軽鎖可変配列の74位の残基は、セリンではなく、例えば、74位の非ヒト生殖細胞系列残基及び/または非極性残基、例えば、74位の残基は、ロイシン残基である。
更なる実施形態は以下で提供される。
ADT1-4-105ならびにその断片及びバリアント
ある特定の実施形態は、抗体ADT1-4-105ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号55のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号82のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号55のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号82のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号55のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号82のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-105に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号55のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号82のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号55のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号55のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号55のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-105に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号55のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号82のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-107ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-107ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号56のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号83のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号56のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号83のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号56のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号83のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-107に由来するFab領域を含むバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号56のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号83のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号56のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号56のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号56のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-107に由来するFab領域を含むバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号56のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号83のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-110ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-110ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号57のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号84のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号57のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号84のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号57のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号84のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-110に由来するFab領域を含むバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号57のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号84のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号57のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号57のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号57のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-110に由来するFab領域を含むバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号57のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号84のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-112ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-112ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号58のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号85のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号58のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号85のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号58のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号85のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-112に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号58のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号85のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号58のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号58のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号58のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-112に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号58のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号85のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-117ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-117ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号59のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号86のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号59のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号86のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号59のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号86のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-117に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号59のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号86のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号59のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号59のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号59のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-117に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号59のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号86のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-19ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-19ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号60のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号87のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号60のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号87のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号60のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号87のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-19に由来するFab領域を含むバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号60のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号87のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号60のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号60のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号60のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-19に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号60のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号87のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-21ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-21ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号61のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号88のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号61のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号88のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号61のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号88のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-21に由来するFab領域を持つバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号61のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号88のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号61のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号61のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号61のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-21に由来するFab領域を含むバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号52のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号61のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号88のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-31ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-31ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号62のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号89のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号62のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号89のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号62のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号89のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-31に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号62のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号89のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号62のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号62のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号62のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-31に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号62のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号89のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-139ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-139ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号63のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号90のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号63のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号90のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号63のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号90のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-139に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号63のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号90のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号63のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号63のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号63のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-139に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号63のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号90のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-4ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-4ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号64のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号91のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号64のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号91のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号64のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号91のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-4に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号64のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号91のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号64のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号64のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号64のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-4に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号64のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号91のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-143ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-143ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号65のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号92のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号65のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号92のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号65のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号92のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-143に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号65のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号92のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号65のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号65のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号65のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-143に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号65のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号92のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-53ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-53ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号66のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号93のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号66のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号93のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号66のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号93のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-53に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号66のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号93のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号66のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号66のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号66のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-53に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号52のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号66のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号93のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-173ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-173ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号67のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号94のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号67のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号94のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号67のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号94のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-173に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号67のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号94のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号67のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号67のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号67のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-173に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号67のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号94のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-2ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-2ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号68のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号95のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号68のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号95のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号68のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号95のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-2に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号68のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号95のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号68のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号68のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号68のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-2に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号68のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号95のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-8ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-8ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号69のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号96のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号69のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号96のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号69のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号96のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-8に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号69のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号96のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号69のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号69のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号69のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-8に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号69のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号96のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-82ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-82ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号70のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号97のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号70のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号97のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号70のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号97のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-82に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号70のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号97のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号70のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号70のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号70のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-82に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号70のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号97のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-83ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-83ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号71のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号98のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号71のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号98のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号71のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号98のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-83に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号71のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号98のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号71のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号71のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号71のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-83に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号71のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号98のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-3ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-3ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号72のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号99のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号72のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号99のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号72のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号99のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-3に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号72のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号99のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号72のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号72のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号72のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-3に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号72のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号99のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-84ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-84ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号73のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号100のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号73のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号100のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号73のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号100のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-84に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号73のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号100のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号73のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号73のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号73のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-84に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号73のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号100のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-86ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-86ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号74のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号101のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号74のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号101のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号74のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号101のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-86に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号74のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号101のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号74のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号74のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号52のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号74のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-86に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号52のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号74のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号101のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-95ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-95ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号75のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号102のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号75のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号102のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号75のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号102のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-95に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号75のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号102のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号75のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号75のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号75のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-95に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号75のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号102のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-1ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-1ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号76のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号103のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号76のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号103のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号76のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号103のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-1に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号76のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号103のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号76のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号76のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号76のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-1に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号76のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号103のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-6ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-6ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号77のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号104のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号77のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号104のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号77のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号104のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-6に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号77のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号104のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-6に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号77のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号104のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4-138ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-4-138ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号78のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号105のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号78のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号105のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号78のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号105のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-4-138に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号78のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号105のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号79のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-4-138に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号51のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号53のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号78のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号79のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号80のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号105のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-4に由来する重鎖可変領域及び/または軽鎖可変領域を含む抗体
本明細書では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号2~25からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~50からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号2~24からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~49からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号5、7、8、9、12、13、15、21、23、及び24からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号30、32、33、34、37、38、40、46、48、及び49からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号2~25からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~50からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号2~24からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~49からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号5、7、8、9、12、13、15、21、23、及び24からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号30、32、33、34、37、38、40、46、48、及び49からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号2~25からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~50からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号2~24からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~49からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号5、7、8、9、12、13、15、21、23、及び24からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号30、32、33、34、37、38、40、46、48、及び49からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b)配列番号3のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号28のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)配列番号4のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号29のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)配列番号5のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号30のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)配列番号6のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号31のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)配列番号7のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号32のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)配列番号8のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号33のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)配列番号9のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号34のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)配列番号10のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号35のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)配列番号11のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号36のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
k)配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号37のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
l)配列番号13のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
m)配列番号14のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号39のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
n)配列番号15のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
o)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号41のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
p)配列番号17のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号42のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
q)配列番号18のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号43のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
r)配列番号19のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号44のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
s)配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号45のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
t)配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号46のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
u)配列番号22のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号47のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
v)配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号48のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
w)配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号49のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
x)配列番号25のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号50のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b)配列番号3のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号28のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)配列番号4のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号29のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)配列番号5のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号30のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)配列番号6のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号31のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)配列番号7のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号32のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)配列番号8のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号33のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)配列番号9のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号34のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)配列番号10のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号35のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)配列番号11のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号36のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
k)配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号37のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
l)配列番号13のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号38のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
m)配列番号14のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号39のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
n)配列番号15のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
o)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号41のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
p)配列番号17のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号42のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
q)配列番号18のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号43のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
r)配列番号19のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号44のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
s)配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号45のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
t)配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号46のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
u)配列番号22のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号47のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
v)配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号48のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
w)配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号49のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
x)配列番号25のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号50のアミノ酸配列と少なくとも96%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号2のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号27のアミノ酸配列を含む、もしくはそれからなるVL;
b)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号3のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号28のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号4のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号29のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号5のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号6のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号31のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号7のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号32のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号8のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号9のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号34のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号10のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号35のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号11のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
k)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号12のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号37のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
l)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号13のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号38のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
m)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号14のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
n)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号15のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
o)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号16のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号41のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
p)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号17のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
q)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号18のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号43のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
r)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号19のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号44のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
s)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号20のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
t)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号21のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号46のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
u)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号22のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号47のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
v)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号23のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
w)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号24のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号49のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
x)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号25のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号50のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
「両方の可変領域全体で」とは、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域の両方を考慮に入れる場合に、全体として、抗体が指定される合計数までの置換を含み得ることを意味する。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。幾つかの実施形態では、置換(存在する場合)は、可変領域配列のどの箇所でも生じ得る。好ましい実施形態では、置換(存在する場合)は、フレームワーク領域に限定され得る。従って、幾つかの実施形態では、アミノ酸置換は、CDR配列では生じない。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)配列番号2のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b)配列番号3のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号28のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)配列番号4のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号29のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)配列番号5のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)配列番号6のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号31のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)配列番号7のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号32のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)配列番号8のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)配列番号9のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号34のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)配列番号10のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号35のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)配列番号11のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
k)配列番号12のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号37のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
l)配列番号13のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号38のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
m)配列番号14のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
n)配列番号15のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
o)配列番号16のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号41のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
p)配列番号17のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
q)配列番号18のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号43のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
r)配列番号19のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号44のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
s)配列番号20のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
t)配列番号21のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号46のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
u)配列番号22のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号47のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
v)配列番号23のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
w)配列番号24のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号49のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
x)配列番号25のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号50のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
定義されたVH及び/またはVL配列(例えば、ある特定の同一性パーセント及び/または置換を有すると定義される任意のVH及び/またはVL配列)を有するFab領域に関する任意の実施形態では、好ましくは、VH配列は配列番号1ではなく、VL配列は配列番号26ではない。
ADT1-4に由来するFab領域を含む他の抗体
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)GDSVSSKSXA(配列番号158)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号53の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XWXDX(配列番号162)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号54ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号79の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号80の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXYX10111213T(配列番号166)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号81ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
ここで、X~X13の各々は、天然に存在するアミノ酸である。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)GDSVSSKSXA(配列番号159)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号53の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XWXDX(配列番号163)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号54ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号79の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号80の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXYX10111213T(配列番号167)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号81ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
ここで、XはA及びVからなる群から選択され、XはS及びTからなる群から選択され、XはV、A、及びLからなる群から選択され、XはG、E、及びDからなる群から選択され、XはY及びNからなる群から選択され、XはV、A、及びPからなる群から選択され、XはV、Y、及びRからなる群から選択され、XはK、R、及びGからなる群から選択され、XはS及びKからなる群から選択され、X10はT、Q、A、E、及びDからなる群から選択され、X11はP、H、及びDからなる群から選択され、X12はQ、R、K、W、P、E、及びIからなる群から選択され、X13はI、V、及びLからなる群から選択される。抗体は、配列番号170または171の配列を含むHFR1配列;配列番号172の配列を含むHFR2配列;配列番号173の配列を含むHFR3配列;配列番号174の配列を含むHFR4配列;配列番号175の配列を含むLFR1配列;配列番号176の配列を含むLFR2配列;配列番号177または178の配列を含むLFR3配列;及び配列番号179、180、181、または182の配列を含むLFR4配列を更に含み得る。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)GDSVSSKSXA(配列番号160)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号53の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XWXDX(配列番号164)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号54ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号79の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号80の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXYX10111213T(配列番号168)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号81ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
ここで、XはA及びVからなる群から選択され、XはS及びTからなる群から選択され、XはV、A、及びLからなる群から選択され、XはG、E、及びDからなる群から選択され、XはY及びNからなる群から選択され、XはV、A、及びPからなる群から選択され、XはV、Y、及びRからなる群から選択され、XはK、R、及びGからなる群から選択され、XはS及びKからなる群から選択され、X10はT、Q、A、E、及びDからなる群から選択され、X11はP及びHからなる群から選択され、X12はQ、R、K、W、P、E、及びIからなる群から選択され、X13はI、V、及びLからなる群から選択される。抗体は、配列番号170または171の配列を含むHFR1配列、配列番号172の配列を含むHFR2配列、配列番号173の配列を含むHFR3配列、配列番号174の配列を含むHFR4配列、配列番号175の配列を含むLFR1配列、配列番号176の配列を含むLFR2配列、配列番号177の配列を含むLFR3配列、及び配列番号179、180、181、または182の配列を含むLFR4配列を更に含み得る。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)GDSVSSKSXA(配列番号161)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号53の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XWXDX(配列番号165)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号54ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号79の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号80の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXYX10111213T(配列番号169)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号81ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
ここで、XはA及びVからなる群から選択され、XはS及びTからなる群から選択され、XはV、A、及びLからなる群から選択され、XはG及びDからなる群から選択され、XはY及びNからなる群から選択され、XはV、A、及びPからなる群から選択され、XはV、Y、及びRからなる群から選択され、XはK及びRからなる群から選択され、XはS及びKからなる群から選択され、X10はT、Q、A、及びEからなる群から選択され、X11はP及びHからなる群から選択され、X12はQ、K、W、P、及びIからなる群から選択され、X13はV及びLからなる群から選択される。抗体は、配列番号170または171の配列を含むHFR1配列;配列番号172の配列を含むHFR2配列;配列番号173の配列を含むHFR3配列;配列番号174の配列を含むHFR4配列;配列番号175の配列を含むLFR1配列;配列番号176の配列を含むLFR2配列;配列番号177の配列を含むLFR3配列;及び配列番号179または181の配列を含むLFR4配列を更に含み得る。
ADT1-7由来のFab領域
本発明は、例えば、以下に記載されるような、親抗体ADT1-7(配列番号106に記載の重鎖可変領域配列及び配列番号118に記載の軽鎖可変領域配列を有する)に由来するFab領域を含む多重特異性抗体を提供する。ADT1-7は本明細書においてE07とも称され、ADT1-7及びE07は互換的に使用される。
ADT1-7に由来する特定のCDR配列を含む抗体
本明細書において提供される多重特異性抗体は、ADT1-7に由来する特定の配列を有する以下のFab領域を含む。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号133~143からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または配列番号147~157からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号138、142、及び143からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号152、156、及び157からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR1;
配列番号131のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号133~143からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR1;
配列番号145のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号147~157からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR1;
配列番号131のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号138、142、及び143からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR1;
配列番号145のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号152、156、及び157からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
更なる実施形態は以下で提供される。
ADT1-7-10ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-10ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号133のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号147のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号133のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号147のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号133のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号147のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-10に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号133のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号147のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号133のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号147のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号133のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号147のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号133のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号147のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-10に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号133のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号147のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-15ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-15ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号134のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号148のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号134のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号148のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号134のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号148のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-15に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号134のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号148のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号134のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号148のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号134のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号148のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号134のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号148のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-15に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号134のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号148のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-17ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-17ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号135のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号149のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号135のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号149のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号135のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号149のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-17に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号135のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号149のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号135のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号149のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号135のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号149のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号135のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号149のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-17に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号135のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号149のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-18ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-18ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号136のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号150のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号136のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号150のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号136のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号150のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-18に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号136のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号150のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号136のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号150のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号136のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号150のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号136のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号150のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-18に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号136のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号150のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-19ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-19ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号137のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号151のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号137のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号151のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号137のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号151のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-19に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号137のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号151のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号137のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号151のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号137のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号151のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号137のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号151のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-19に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号137のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号151のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-20ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-20ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号138のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号152のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号138のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号152のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号138のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号152のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-20に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号138のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号152のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号138のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号152のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号138のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号152のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号138のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号152のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-20に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号138のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号152のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-22ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-22ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号139のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号153のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号139のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号153のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号139のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号153のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-22に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号139のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号153のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号139のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号153のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号139のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号153のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号139のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号153のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-22に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号139のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号153のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-23ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-23ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号140のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号154のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号140のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号154のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号140のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号154のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-23に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号140のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号154のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号140のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号154のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号140のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号154のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号140のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号154のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-23に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号140のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号154のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-42ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-42ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号141のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号155のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号141のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号155のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号141のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号155のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-42に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号141のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号155のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号141のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号155のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号141のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号155のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号141のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号155のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-42に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号141のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号155のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-3ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-3ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号142のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号156のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号142のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号156のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号142のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号156のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-3に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号142のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号156のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号142のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号156のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号142のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号156のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号142のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号156のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-3に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号142のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号156のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7-61ならびにその断片及びバリアント
特定の実施形態は、抗体ADT1-7-61ならびにその断片及びバリアントに関する。
例えば、幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号143のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号157のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。一実施形態では、配列番号143のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号157のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントが提供される。一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、配列番号143のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または配列番号157のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。
ADT1-7-61に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号143のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号157のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、多重特異性抗体が提供される。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号143のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号157のアミノ酸配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR2、及び配列番号143のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
配列番号144のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR2、及び配列番号157のアミノ酸配列に対する少なくとも90%の同一性を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び配列番号143のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;ならびに
配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び配列番号157のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。
ADT1-7-61に由来するFab領域を有するバリアント抗体を提供するためにアミノ酸置換がなされ得、例えば、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号130のアミノ酸配列を含むVHCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号131のアミノ酸配列を含むVHCDR2、及び1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号143のアミノ酸配列を含むVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号144のアミノ酸配列を含むVLCDR1、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号145のアミノ酸配列を含むVLCDR2、及び、1つもしくは2つのアミノ酸置換を任意に含む配列番号157のアミノ酸配列を含むVLCDR3を含む軽鎖可変領域。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。
あるいは、抗体は、(アミノ酸置換を含むか、または含まない)指定される配列からなってもよい。
ADT1-7に由来する重鎖可変領域及び/または軽鎖可変領域を含む抗体
本明細書では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号107~117からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号119~129からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号112、116、及び117からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号124、128、及び129からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号107~117からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号119~129からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号112、116、及び117からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号124、128、及び129からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
本明細書では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
配列番号107~117からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号119~129からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
本明細書では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体も提供される:
配列番号112、116、及び117からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号124、128、及び129からなる群から選択される配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)配列番号107のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号119のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b)配列番号108のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号120のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)配列番号109のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号121のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)配列番号110のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号122のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)配列番号111のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号123のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)配列番号112のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号124のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)配列番号113のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号125のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)配列番号114のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号126のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)配列番号115のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号127のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)配列番号116のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号128のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
k)配列番号117のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号129のアミノ酸配列と少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号107のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号119のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号108のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号120のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号109のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号121のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号110のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号122のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号111のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号123のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号112のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号124のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号113のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号125のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号114のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号126のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号115のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号127のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号116のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号128のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
k)両方の可変領域全体で最大5つ、最大4つ、最大3つ、最大2つ、もしくは1つのアミノ酸置換を任意に含む、配列番号117のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号129のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
「両方の可変領域全体で」とは、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域の両方を考慮に入れる場合に、全体として、抗体が指定される合計数までの置換を含み得ることを意味する。アミノ酸置換は、保存的アミノ酸置換であり得る。幾つかの実施形態では、置換(存在する場合)は、可変領域配列のどの箇所でも生じ得る。好ましい実施形態では、置換(存在する場合)は、フレームワーク領域に限定され得る。従って、幾つかの実施形態では、アミノ酸置換は、CDR配列では生じない。
任意により、上記の抗体は、VH及びVL配列におけるあらゆる多様性がフレームワーク領域で生じるように、対応するCDR配列を保持する。
幾つかの実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が以下を含む多重特異性抗体が提供される:
a)配列番号107のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号119のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b)配列番号108のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号120のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c)配列番号109のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号121のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d)配列番号110のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号122のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e)配列番号111のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号123のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f)配列番号112のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号124のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g)配列番号113のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号125のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h)配列番号114のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号126のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i)配列番号115のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号127のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j)配列番号116のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号128のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
k)配列番号117のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号129のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL。
ある特定のアミノ酸置換が本明細書に記載される1種以上のバリアント抗体を提供するためになされ得る。
定義されたVH及び/またはVL配列(例えば、ある特定の同一性パーセント及び/または置換を有すると定義される任意のVH及び/またはVL配列)を有するFab領域に関する任意の実施形態では、好ましくは、VH配列は配列番号106ではなく、VL配列は配列番号118ではない。
ADT1-7に由来するFab領域を含む他の抗体
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)配列番号130の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号131の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XYXAFDI(配列番号183)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号132ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号144の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号145の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXLXT(配列番号186)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号146ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
~Xの各々は天然に存在するアミノ酸である。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)配列番号130の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号131の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XYXAFDI(配列番号184)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号132ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号144の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号145の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXLXT(配列番号187)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号146ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
ここで、XはD、I、及びVからなる群から選択され、XはD及びSからなる群から選択され、XはN、E、D、Q、及びAからなる群から選択され、XはD及びEからなる群から選択され、XはT及びSからなる群から選択され、XはA、G、Y、及びSからなる群から選択され、XはS及びDからなる群から選択され、XはT、E、及びGからなる群から選択され、XはL及びDからなる群から選択される。抗体は、配列番号189の配列を含むHFR1配列;配列番号190の配列を含むHFR2配列;配列番号191の配列を含むHFR3配列;配列番号192の配列を含むHFR4配列;配列番号193及び194の配列を含むLFR1配列;配列番号195の配列を含むLFR2配列;配列番号196の配列を含むLFR3配列;ならびに配列番号197の配列を含むLFR4配列を更に含み得る。
一実施形態では、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)結合Fab領域が、
a)配列番号130の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b)配列番号131の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c)XYXAFDI(配列番号185)の配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、当該HCDR3配列が配列番号132ではない、当該HCDR3配列;
d)配列番号144の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e)配列番号145の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f)QQXLXT(配列番号188)の配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、当該LCDR3配列が配列番号146ではない、当該LCDR3配列を含む、多重特異性抗体が提供され、
ここで、XはD及びVからなる群から選択され、XはD及びSからなる群から選択され、XはD、Q、及びAからなる群から選択され、XはD及びEからなる群から選択され、XはSであり、XはA及びYからなる群から選択され、XはSであり、XはE及びGからなる群から選択され、XはL及びDからなる群から選択される。抗体は、配列番号189の配列を含むHFR1配列;配列番号190の配列を含むHFR2配列;配列番号191の配列を含むHFR3配列;配列番号192の配列を含むHFR4配列;配列番号193の配列を含むLFR1配列;配列番号195の配列を含むLFR2配列;配列番号196の配列を含むLFR3配列;及び配列番号197の配列を含むLFR4配列を更に含み得る。
配列置換を有する抗体
当業者は、様々なアミノ酸が類似の特性を有することを知っている。物質の1つ以上のかかるアミノ酸は、多くの場合、その物質の所望の活性を除去することなく、1つ以上の他のかかるアミノ酸により置換され得る。
従って、アミノ酸のグリシン、アラニン、バリン、ロイシン、及びイソロイシンは、多くの場合、互いに置換され得る(脂肪族側鎖を有するアミノ酸)。これらの可能な置換のうち、グリシン及びアラニンが(それらが比較的短い側鎖を有するため)互いに置換するために使用されることが好ましく、バリン、ロイシン、及びイソロイシンが(それらが疎水性のより大きな脂肪族側鎖を有するため)互いに置換するために使用されることが好ましい。多くの場合、互いに置換され得る他のアミノ酸としては、フェニルアラニン、チロシン、及びトリプトファン(芳香族側鎖を有するアミノ酸);リジン、アルギニン、及びヒスチジン(塩基性側鎖を有するアミノ酸);アスパラギン酸及びグルタミン酸(酸性側鎖を有するアミノ酸);アスパラギン及びグルタミン(アミド側鎖を有するアミノ酸);ならびにシステイン及びメチオニン(硫黄を含む側鎖を有するアミノ酸)が挙げられる。
「保存的」アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似の化学構造の別のアミノ酸残基と置き換えられ、ポリペプチドの機能、活性、または他の生物学的性質に対してほとんど影響を及ぼさないと予想されるアミノ酸置換である。かかる保存的置換は、好適には、以下の群内の1つのアミノ酸が同じ群内の別のアミノ酸残基により置換される置換である。

Figure 2024509332000006
好適には、疎水性アミノ酸残基は、非極性アミノ酸である。より好適には、疎水性アミノ酸残基は、V、I、L、M、F、W、またはCから選択される。幾つかの実施形態では、疎水性アミノ酸残基は、グリシン、アラニン、バリン、メチオニン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、チロシン、またはトリプトファンから選択される。
従って、「保存的」アミノ酸置換への言及は、抗体(例えば、CDRまたはVHもしくはVL配列における)の配列内のアミノ酸のうちの1つ以上が上記のような同じ分類の別のアミノ酸で置換されるアミノ酸置換を指す。抗体の機能への悪影響を最小限にするために、CDR領域における保存的アミノ酸置換が好ましくてもよい。しかしながら、保存的アミノ酸置換は、フレームワーク領域で生じてもよい。従って、幾つかの実施形態では、CDRにおけるあらゆる置換が保存的置換であり得るが、フレームワーク領域における置換は、天然に存在するアミノ酸ともう一方の他の天然に存在するアミノ酸との置換によるものであり得る。
本明細書に記載される抗体について示されるアミノ酸配列と比較したアミノ酸欠失または挿入がなされてもよい。従って、例えば、ポリペプチドの活性に対して実質的に影響を及ぼさないか、または少なくともかかる活性を除去しないアミノ酸が除去され得る。かかる欠失は、活性を依然として保持しながらポリペプチドの全長及び分子量が低減され得るため、有利であり得る。このことは、特定の目的に必要とされるポリペプチドの量が低減されることを可能にし得、例えば、投与量レベルが低減され得る。
本明細書において提供される配列と比較したアミノ酸変化は、任意の好適な技術を使用して、例えば、部位特異的変異誘発または固相合成を使用してなされ得る。
本発明の範囲内のアミノ酸置換または挿入は、天然に存在するアミノ酸または非天然アミノ酸を使用してなされ得るが、天然に存在するアミノ酸が好ましくてもよいことが理解されよう。天然または合成アミノ酸が使用されるか否かにかかわらず、L-アミノ酸のみが存在することが好ましくてもよい。
提供される配列において任意のアミノ酸置換を含む種々の実施形態が本明細書において提供される。加えて、本発明の一実施形態では、抗体の結合ドメインまたは抗原結合ドメインにおける最大10、好適には、最大5つ、または好適には、最大2つのアミノ酸置換を含む、本発明の抗体またはその抗原結合断片が提供される。例えば、本発明の一実施形態では、Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供され、ここで、当該抗体またはその抗原結合断片は、ADT1-4-105、ADT1-4-107、ADT1-4-110、ADT1-4-112、ADT1-4-117、ADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-139、ADT1-4-4、ADT1-4-143、ADT1-4-53、ADT1-4-173、ADT1-4-2、ADT1-4-8、ADT1-4-82、ADT1-4-83、ADT1-4-3、ADT1-4-84、ADT1-4-86、ADT1-4-95、ADT1-4-1、ADT1-4-6、ADT1-4-138、ADT1-7-10、ADT1-7-15、ADT1-7-17、ADT1-7-18、ADT1-7-19、ADT1-7-20、ADT1-7-22、ADT1-7-23、ADT1-7-42、ADT1-7-3、及びADT1-7-61からなる群から選択される抗体の6つのCDR領域を含み、当該抗体またはその抗原結合断片は、その全てのCDR領域全体で最大10のアミノ酸置換、好適には、最大5つのアミノ酸置換または最大2つのアミノ酸置換を有する。本発明の別の実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供され、ここで、当該抗体またはその抗原結合断片は、ADT1-4-105、ADT1-4-107、ADT1-4-110、ADT1-4-112、ADT1-4-117、ADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-139、ADT1-4-4、ADT1-4-143、ADT1-4-53、ADT1-4-173、ADT1-4-2、ADT1-4-8、ADT1-4-82、ADT1-4-83、ADT1-4-3、ADT1-4-84、ADT1-4-86、ADT1-4-95、ADT1-4-1、ADT1-4-6、ADT1-4-138、ADT1-7-10、ADT1-7-15、ADT1-7-17、ADT1-7-18、ADT1-7-19、ADT1-7-20、ADT1-7-22、ADT1-7-23、ADT1-7-42、ADT1-7-3、及びADT1-7-61からなる群から選択される抗体のVH及びVL配列を含み、当該抗体は、そのVH及びVL配列全体で最大10のアミノ酸置換、好適には、最大5つのアミノ酸置換または最大2つのアミノ酸置換を有する。本発明の更に他の実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供され、ここで、当該抗体またはその抗原結合断片は、ADT1-4-105、ADT1-4-107、ADT1-4-110、ADT1-4-112、ADT1-4-117、ADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-139、ADT1-4-4、ADT1-4-143、ADT1-4-53、ADT1-4-173、ADT1-4-2、ADT1-4-8、ADT1-4-82、ADT1-4-83、ADT1-4-3、ADT1-4-84、ADT1-4-86、ADT1-4-95、ADT1-4-1、ADT1-4-6、ADT1-4-138、ADT1-7-10、ADT1-7-15、ADT1-7-17、ADT1-7-18、ADT1-7-19、ADT1-7-20、ADT1-7-22、ADT1-7-23、ADT1-7-42、ADT1-7-3、及びADT1-7-61からなる群から選択される抗体であり、当該抗体は、最大10のアミノ酸置換、好適には、最大5つのアミノ酸置換または最大2つのアミノ酸置換を有する。当然のことながら、置換は、元のCDRまたは出発抗体の可変鎖配列を基準にした置換である。
幾つかの実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換は、CDR領域または複数のCDR領域に存在する。他の実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換は、フレームワーク領域に存在し、すなわち、重鎖及び軽鎖可変部に存在するが、CDR領域または複数のCDR領域には存在しない。他の実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換は、重鎖可変領域及び/または軽鎖可変領域における任意の位置に存在し得る。幾つかの実施形態では、アミノ酸置換は、CDR配列では生じない。
幾つかの実施形態では、アミノ酸置換は、抗体の結合特異性及び/または親和性に悪影響を及ぼさない。従って、バリアント抗体は、それが由来する抗体と同じ(または実質的に同じ)か、または優れた機能プロファイルを有し得る。
幾つかの実施形態では、アミノ酸置換は、特定の抗原に対する抗体の結合親和性を増加させるために実行され得る。例えば、軽鎖の(可変領域の)74位のセリンの変異誘発に関する本発明の実施形態では、置換は、抗体が調製されたヒト抗原のカニクイザルホモログに対する抗体の交差反応性を増加させるためになされ得る。上記の他の置換と異なり、この置換は、好ましくは非保存的であり得る。幾つかの実施形態では、置換は、74位のセリンの非極性アミノ酸(例えば、グリシン、アラニン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸)への置換であり得る。あるいは、セリンは、非ヒト生殖細胞系列型アミノ酸(例えば、アルギニン、システイン、グルタミン、グルタミン酸、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、トレオニン、トリプトファン、チロシン、及びバリンからなる群から選択されるアミノ酸)で置換され得る。幾つかの実施形態では、セリンは、非ヒト生殖細胞系列型であり、かつ非極性であるアミノ酸、すなわち、グリシン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸で置換され得る。幾つかの実施形態では、セリンは、ロイシンで置換されていてもよい。
エピトープ
本明細書において、γδTCRのVδ1鎖のエピトープに結合する多重特異性抗体(またはその抗原結合断片)が提供される。このような結合は、場合により、活性化などのγδTCR活性に影響を及ぼし得る。本発明の多重特異性抗体は、γδTCRのVδ1鎖に特異的であり、他の抗原、例えば、γδTCRのVδ2鎖またはγδTCRのVδ3鎖のエピトープに結合しない。本発明の抗体は、少なくとも結合時にVδ1細胞に与えられるアゴニスト効果に関して、アゴニスト抗体とみなされ得る。
一実施形態では、エピトープは、γδT細胞の活性化エピトープであり得る。「活性化」エピトープは、例えば、TCR機能の活性化、例えば、細胞脱顆粒、TCR下方調節、細胞傷害性、増殖、動員、生存期間延長もしくは疲弊に対する耐性の増加、細胞内シグナル伝達、サイトカインもしくは増殖因子の分泌、表現型変化、または遺伝子発現の変化を含み得る。例えば、活性化エピトープの結合は、γδT細胞集団、好ましくは、Vδ1+T細胞集団の増大(すなわち増殖)を刺激し得る。従って、これらの抗体は、γδT細胞活性化を調節し、これにより、免疫応答を調節するために使用され得る。従って、一実施形態では、活性化エピトープの結合は、γδTCRを下方調節する。追加のまたは代替的実施形態では、活性化エピトープの結合は、γδT細胞の脱顆粒を活性化する。更なる追加のまたは代替的実施形態では、活性化エピトープの結合は、γδT細胞による殺傷を促進する。
幾つかの実施形態では、TRDV1の活性化エピトープは、抗体により結合されると、受容体の下方調節をもたらし、任意により、Vδ1細胞を活性化するものである。幾つかの実施形態では、活性化エピトープは、Vδ1細胞上の活性化マーカー、例えば、CD107a、CD25、CD69、及び/またはKi67の発現を上方調節するものである。幾つかの実施形態では、活性化エピトープは、Vδ1細胞上の活性化マーカー、例えば、CD107及びCD25、ならびに任意により、CD69及び/またはKi67の発現を上方調節するものである。幾つかの実施形態では、1種以上の活性化マーカー(例えば、CD107a)の上方調節は、がん細胞の存在下での上方調節であり得る。本発明の好ましい実施形態では、抗体は、特にTRDV1結合ドメインを介して、TRDV1の活性化エピトープに結合する。
多くの場合、T細胞受容体は他のタンパク質と複合体を形成しているため、Vδ1抗体結合によるT細胞受容体の下方調節は、T細胞受容体と会合した他のタンパク質の下方調節を引き起こし得る(すなわち、Vδ1抗体の結合がT細胞受容体複合体の下方調節を引き起こす)。例えば、幾つかの実施形態では、TRDV1の活性化エピトープは、結合時にTCR/CD3受容体複合体を下方調節するものである。このようにして、本発明の抗体は、抗体により結合されないが、T細胞受容体と複合体を形成している細胞表面タンパク質の間接的な下方調節を引き起こし得る。γδ1鎖を発現するT細胞(すなわちVδ1細胞)が全T細胞集団のほんの少数であることを考慮すると、本発明の多重特異性抗体は、Vδ1細胞におけるTCR複合体のみを下方調節することにより、TCR複合体のタンパク質、例えば、CD3を選択的に(かつ間接的に)下方調節するために使用され得る。
幾つかの実施形態では、T細胞受容体複合体活性化エピトープは、活性化時に、当該TRDV1 TCR複合体と会合していないCD3分子を下方調節することなく、T細胞受容体複合体を下方調節するものである。
エピトープは、好ましくは、γδTCRのVδ1鎖の少なくとも1つの細胞外部分、可溶性部分、親水性部分、または外部部分から構成されるか、またはそれからなる。
特に、エピトープは、γδTCRのVδ1鎖の超可変領域、特にVδ1鎖のCDR3に見出されるエピトープを含まないか、またはそれからならない。好ましい実施形態では、エピトープは、γδTCRのVδ1鎖の非可変領域内に存在する。かかる結合は、高度に可変的なTCRの配列(特にCDR3)に限定されることなく、Vδ1鎖固有の認識を可能にすることが理解されよう。抗原を認識する様々なγδTCR複合体は、Vδ1鎖の存在によってのみ、このようにして認識され得る。したがって、Vδ1鎖を含むγδTCRはいずれも、γδTCRの特異性に関係なく、本明細書で定義される多重特異性抗体を使用して認識され得ることが理解されよう。一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸1~24及び/または35~90の領域内の1つ以上のアミノ酸残基、例えば、CDR1及び/またはCDR3配列の一部ではないVδ1鎖の部分を含むか、またはそれからなる。一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸91~105(CDR3)の領域内のアミノ酸残基を含まないか、またはそれからならない。
幾つかの実施形態では、エピトープは、TRDV-1 CDR2配列におけるアミノ酸を含むか、またはそれからなる。
γδT細胞は、十分に特徴付けられたαβT細胞と同様の様式で、体細胞再構成された可変遺伝子(V)、多様性遺伝子(D)、結合遺伝子(J)、及び定常遺伝子(C)の異なるセットを利用するが、γδT細胞は、αβT細胞より少数のV、D、及びJセグメントを有する。一実施形態では、多重特異性抗体(またはその抗原結合断片)により結合されるVδ1のエピトープは、Vδ1鎖のJ領域(例えば、ヒトδ1鎖生殖細胞系列にコードされる以下の4つのJ領域のうちの1つ:配列番号301(J1*0)または302(J2*0)または303(J3*0)または304(J4*0))またはVδ1鎖のC領域(例えば、C末端膜近傍領域/膜貫通領域を含む配列番号305(C1*0))に見出されるエピトープを含まないか、またはそれからならない。一実施形態では、多重特異性抗体(またはその抗原結合断片)により結合されるVδ1のエピトープは、Vδ1鎖のN末端リーダー配列(例えば、配列番号299)に見出されるエピトープを含まないか、またはそれからならない。従って、抗体または断片は、Vδ1鎖のV領域(例えば、配列番号300)のみに結合し得る。従って、一実施形態では、エピトープは、γδTCRのV領域内のエピトープ(例えば、配列番号272のアミノ酸残基1~90)からなる。
Luoma et al.(2013) Immunity 39:1032-1042及びRCSBタンパク質データバンク登録番号:3OMZに記載されており、以下の配列番号272として示される配列に由来するVδ1配列を参照して、エピトープへの言及がなされる:
AQKVTQAQSSVSMPVRKAVTLNCLYETSWWSYYIFWYKQLPSKEMIFLIRQGSDEQNAKSGRYSVNFKKAAKSVALTISALQLEDSAKYFCALGESLTRADKLIFGKGTRVTVEPNIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKTVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESS(配列番号272)。
配列番号272は、V領域(可変ドメインとも称される)、D領域、J領域、及びTCR定常領域を含むか、またはそれからなる、可溶性TCRを表す。V領域はアミノ酸残基1~90を含むか、またはそれからなり、D領域はアミノ酸残基91~104を含むか、またはそれからなり、J領域はアミノ酸残基105~115を含むか、またはそれからなり、定常領域(T細胞受容体αに由来する)はアミノ酸残基116~209を含むか、またはそれからなる。V領域内では、CDR1は、配列番号272のアミノ酸残基25~34と定義され、CDR2は、配列番号272のアミノ酸残基50~54と定義され、CDR3は、配列番号272のアミノ酸残基93~104と定義される(Xu et al.,PNAS USA 108(6):2414-2419(2011))。
従って、本発明の一態様によれば、以下の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに結合する単離抗体またはその抗原結合断片が提供される:
(i)配列番号272のアミノ酸3~20;及び/または
(ii)配列番号272のアミノ酸37~77。
更なる実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号306のアミノ酸残基1~90のエピトープを含むか、またはそれからなる多型V領域を追加的に認識する。従って、配列番号272のアミノ酸1~90及び多型の生殖細胞系列バリアント配列(配列番号306のアミノ酸1~90)は、本明細書に記載されるエピトープを定義する場合に互換的とみなされ得る。本明細書において示される研究は、本発明の多重特異性抗体がこの生殖細胞系列配列の両方のバリアントを認識できることを実証した。一例として、本明細書で定義される多重特異性抗体またはその抗原結合断片が、配列番号272のアミノ酸1~24及び/または35~90の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなるエピトープを認識すると記述されている場合、それらは、配列番号306における同等のエピトープ(すなわち同じ位置)を追加的に認識する。
一実施形態では、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、配列番号272のアミノ酸1~90の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を認識する。より具体的には、一実施形態では、本明細書で定義される多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、ヒト生殖細胞系列型エピトープを認識し、ここで、当該生殖細胞系列は、配列番号272の71位でアラニン(A)またはバリン(V)のいずれかをコードする。
一実施形態では、エピトープは、記載される領域内の1つ以上、例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。
更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸3~20の領域内の1つ以上(例えば、5つ以上、例えば、10以上)のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。代替の実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸37~77の領域(例えば、アミノ酸50~54の領域)内の1つ以上(例えば、5つ以上、例えば、10以上)のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。更に他の実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸3~20(例えば、5~20または3~17)の領域内の1つ以上(例えば、5つ以上、例えば、10以上)のアミノ酸残基、及びアミノ酸37~77(例えば、62~77または62~69)の領域内の1つ以上(例えば、5つ以上、例えば、10以上)のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。
上記抗体(またはその抗原結合断片)は、定義される範囲内の全てのアミノ酸に結合する必要はないことが更に理解されよう。かかるエピトープは、直鎖状エピトープと称され得る。例えば、配列番号272のアミノ酸5~20の領域内のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなるエピトープに結合する抗体は、当該範囲のアミノ酸残基のうちの1つ以上、例えば、範囲内のアミノ酸(すなわち、アミノ酸5、9、16、及び20)を任意に含む、範囲の各端のアミノ酸残基(すなわち、アミノ酸5及び20)とのみ結合し得る。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基3、5、9、10、12、16、17、20、37、42、50、53、59、62、64、68、69、72、または77のうちの少なくとも1つを含むか、またはそれからなる。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基3、5、9、10、12、16、17、20、37、42、50、53、59、62、64、68、69、72、または77から選択される1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12アミノ酸を含むか、またはそれからなる。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272の以下のアミノ酸領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる:
(i)3~17;
(ii)5~20;
(iii)37~53;
(iv)50~64;
(v)59~72;
(vi)59~77;
(vii)62~69;及び/または
(viii)62~77。
更なる実施形態では、エピトープは、以下のアミノ酸領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる:配列番号272の5~20及び62~77(例えば、限定されるものではないが、親クローンE07に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態);50~64(例えば、限定されるものではないが、親クローンC08に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態);37~53及び59~72(例えば、限定されるものではないが、親クローンG04に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態);59~77(例えば、限定されるものではないが、親クローンC05に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態);または3~17及び62~69(例えば、限定されるものではないが、親クローンE01に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態)。更なる実施形態では、エピトープは、以下のアミノ酸領域内の1つ以上のアミノ酸残基からなる:配列番号272の5~20及び62~77;50~64;37~53及び59~72;59~77;または3~17及び62~69。
更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基3、5、9、10、12、16、17、62、64、68、及び69を含むか、もしくはそれからなるか、または好適には、配列番号272のアミノ酸残基3、5、9、10、12、16、17、62、64、68、及び69からなる(例えば、限定されるものではないが、親クローンE01に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態)。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77を含むか、もしくはそれからなるか、または好適には、配列番号272のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77からなる(例えば、限定されるものではないが、親クローンE07に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態)。更に他の実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77を含むか、もしくはそれからなるか、または好適には、配列番号272のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77からなる(例えば、限定されるものではないが、親クローンG04に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態)。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基50、53、59、62、及び64を含むか、もしくはそれからなるか、または好適には、配列番号272のアミノ酸残基50、53、59、62、及び64からなる(例えば、限定されるものではないが、親クローンC08に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態)。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸残基59、60、68、及び72を含むか、もしくはそれからなるか、または好適には、配列番号272のアミノ酸残基59、60、68、及び72からなる(例えば、限定されるものではないが、親クローンC05に由来する抗体、例えば、その親和性成熟したバリアントに関する実施形態)。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸37~53及び/または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸37~53及び59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基からなる。他の更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸37~53または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。かかるエピトープを有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、G04の配列の一部または全てを有し得るか、またはかかる抗体またはその抗原結合断片は、G04に由来し得る。例えば、G04の1つ以上のCDR配列、またはG04のVH及びVL配列のうちの一方もしくは両方を有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、かかるエピトープに結合し得る。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸5~20及び/または62~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸5~20及び62~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基からなる。他の更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸5~20または62~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。かかるエピトープを有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、E07の配列の一部または全てを有し得るか、またはかかる抗体またはその抗原結合断片は、E07に由来し得る。例えば、E07の1つ以上のCDR配列、またはE07のVH及びVL配列のうちの一方もしくは両方を有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、かかるエピトープに結合し得る。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸50~64の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸50~64の領域内の1つ以上のアミノ酸残基からなる。かかるエピトープを有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、C08の配列の一部または全てを有し得るか、またはかかる抗体またはその抗原結合断片は、C08に由来し得る。例えば、C08の1つ以上のCDR配列、またはC08のVH及びVL配列のうちの一方もしくは両方を有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、かかるエピトープに結合し得る。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸59~72の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。更なる実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸59~72の領域内の1つ以上のアミノ酸残基からなる。かかるエピトープを有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、C05の配列の一部または全てを有し得るか、またはかかる抗体またはその抗原結合断片は、C05に由来し得る。例えば、C05の1つ以上のCDR配列、またはC05のVH及びVL配列のうちの一方もしくは両方を有する多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、かかるエピトープに結合し得る。
一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸11~21の領域内のアミノ酸残基を含まないか、またはそれからならない。一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸21~28の領域内のアミノ酸残基を含まないか、またはそれからならない。一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸59及び60の領域内のアミノ酸残基を含まないか、またはそれからならない。一実施形態では、エピトープは、配列番号272のアミノ酸67~82の領域内のアミノ酸残基を含まないか、またはそれからならない。
親和性成熟した抗体のエピトープは、通常、親クローンについて本明細書において同定されるエピトープと同じである。カニクイザルTRDV1上のエピトープについては、親和性成熟した抗体のエピトープの位置は、通常、対応する親クローンについて同定されるエピトープと同じ位置である。「位置」への言及は、当業者が、エピトープにおけるアミノ酸の一部の同一性がヒトTRDV1と異なることを理解しているため、必要である。ヒトTRDV1とカニクイザルTRDV1との間のこれらの多様性にもかかわらず、かかる抗体は、依然として両方の抗原に特異的に結合することが可能である。
一実施形態では、エピトープは、市販の抗Vδ1抗体、例えば、TS-1またはTS8.2により結合されるエピトープと同じではない。WO2017197347に記載されるように、TS-1及びTS8.2の可溶性TCRへの結合は、δ1鎖がVδ1 J1及びVδ1 J2配列を含む場合に検出されたが、Vδ1 J3鎖への結合は検出されなかった。このことは、TS-1及びTS8.2の結合がδJ1及びδJ2領域の重要な残基を必要としていたことを示す。
本明細書における「内(within)」への言及は、定義された範囲の両端を包含する。例えば、「アミノ酸5~20の領域内」は、残基5を含み残基5から残基20を含み残基20までの全てのアミノ酸残基を指す。
どのエピトープが抗体により結合されるかを確定するための様々な技術が当該技術分野において公知である。例示的な技術としては、例えば、定型的なクロスブロッキングアッセイ、アラニンスキャニング変異分析、ペプチドブロット分析、ペプチド切断分析、結晶学的研究、及びNMR分析が挙げられる。加えて、抗原のエピトープ切除、エピトープ抽出、及び化学修飾などの方法が用いられ得る。抗体が相互作用するポリペプチド内のアミノ酸を同定するために使用され得る別の方法は、(実施例9に記載されるような)質量分析により検出される水素/重水素交換である。一般に、水素/重水素交換法は、関心対象のタンパク質を重水素で標識し、続いて、重水素で標識したタンパク質に抗体を結合させることを含む。次に、タンパク質/抗体複合体は水に移され、抗体複合体により保護されているアミノ酸内の交換可能なプロトンは、界面の一部ではないアミノ酸内の交換可能なプロトンよりも遅い速度で重水素から水素への逆交換を受ける。その結果、タンパク質/抗体の界面部分を形成するアミノ酸は、重水素を保持し得、従って、界面に含まれないアミノ酸と比較して相対的により高い質量を示す。抗体の解離後、標的タンパク質は、プロテアーゼ切断及び質量分析解析に供され、これにより、抗体が相互作用する特定のアミノ酸に対応する重水素標識残基が明らかになる。
多重特異性抗体及びその抗原結合断片は、好適には、ヒトTRDV1(配列番号272及び配列番号306の多型バリアント)及びカニクイザルにおけるオーソログであるカニクイザルTRDV1(配列番号308、UniProtKB:G7P9S6(G7P9S6_MACFA)も参照のこと)の両方に特異的に結合する。幾つかの実施形態では、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、ヒト及びカニクイザルTRDV1に特異的に結合するG04由来の抗体である。本発明の多重特異性抗体により結合されるエピトープ(例えば、限定されるものではないが、配列番号272、306、または308のいずれかのアミノ酸残基37~77内の領域において結合するもの)は、それがVδ1に特異的な(すなわち、Vδ2またはVδ3などの類似の抗原に結合しない)抗Vδ1抗体の提供を可能にするだけではなく、Vδ1の多型バリアントへの交差反応性(すなわち、配列番号272のTRDV1及び配列番号306のTRDV1(残基位置20での多型、及び一部の抗体について残基位置20が接触残基候補として同定されているか、または同定された接触残基の近くであるにもかかわらず))を提供し、ヒトVδ1とカニクイザルVδ1との間の交差反応性(配列番号272及び308のアミノ酸残基37~77の領域内に存在する残基42、50、54、59、60、68、73、75、及び76の全てがヒトTRDV1配列とカニクイザルTRDV1配列との間で異なるにもかかわらず)を提供するため、特に有利であり得ると仮定される。
ADT1-4由来の抗体のエピトープ
ADT1-4由来の抗体は、ADT1-4親抗体と同じか、または実質的に同じエピトープに結合する。従って、幾つかの実施形態、特にADT1-4親抗体に由来するか、またはADT1-4親抗体に関連する抗体に関する実施形態では、抗Vδ1抗体または抗原結合断片は、配列番号272(または配列番号306)のアミノ酸37~77の領域内、例えば、アミノ酸37~53及び/または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなるエピトープに結合する。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号272(または配列番号306)のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77を含むか、またはそれからなる。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号272(または配列番号306)のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77からなる。
ADT1-4由来の抗体は、カニクイザルTRDV1としても公知のγδT細胞受容体(TCR)のカニクイザル可変δ1(Vδ1)鎖(配列番号308)のエピトープにも結合する。従って、幾つかの実施形態、特にG04親抗体に由来するか、またはG04親抗体に関連する抗体に関する実施形態では、抗Vδ1抗体または抗原結合断片は、配列番号308のアミノ酸37~77の領域内、例えば、アミノ酸37~53及び/または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなるエピトープに結合する。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号308のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77を含むか、またはそれからなる。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号308のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77からなる。
ADT1-4由来の抗体の交差反応性、特に、本明細書において開示される抗体のTRDV1の多型バリアントに結合する能力を考慮すると、幾つかの実施形態、特にG04親抗体に由来するか、またはG04親抗体に関連する抗体に関する実施形態では、抗Vδ1抗体または抗原結合断片は、配列番号272、306、及び308のアミノ酸37~77の領域内、例えば、アミノ酸37~53及び/または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなるエピトープに結合する。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号272、306、及び308のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77を含むか、またはそれからなる。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号272、306、及び308のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77からなる。
上記のもののようなかかるエピトープを含むか、またはそれからなり、更にヒトTRDV1配列とカニクイザルTRDV1配列との間の交差反応性を提供する抗体の提供は、この2つの種由来のこれらの配列間のアミノ酸バリアントの位置を考慮すると驚くべきことである。
ADT1-7由来の抗体のエピトープ
ADT1-7由来の抗体は、ADT1-7親抗体と同じか、または実質的に同じエピトープに結合する。従って、幾つかの実施形態、特にADT1-7親抗体に由来するか、またはADT1-7親抗体に関連する抗体に関する実施形態では、抗Vδ1抗体または抗原結合断片は、配列番号272(または配列番号306)のアミノ酸5~20及び/または62~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなるエピトープに結合する。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号272(または配列番号306)のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77を含むか、またはそれからなる。幾つかの実施形態では、エピトープは、配列番号272(または配列番号306)のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77からなる。
フレームワーク及び他の配列
好適には、本発明の多重特異性抗体または抗原結合断片のVH及びVL領域は、それぞれ4つのフレームワーク領域(FR1~FR4)を含む。一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、配列番号2~25(例えば、G04に由来する軽鎖可変配列の場合)、配列番号27~50(例えば、G04に由来する重鎖可変配列の場合)、配列番号107~117(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)、または配列番号119~129(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)のいずれかにおけるフレームワーク領域との少なくとも80%の配列同一性を有する配列を含むフレームワーク領域(例えば、FR1、FR2、FR3、及び/またはFR4)を含む。一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、配列番号2~25(例えば、G04に由来する軽鎖可変配列の場合)、配列番号27~50(例えば、G04に由来する重鎖可変配列の場合)、配列番号107~117(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)、または配列番号119~129(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)のいずれかにおけるフレームワーク領域との少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、97%、または99%の配列同一性を有する配列を含むフレームワーク領域(例えば、FR1、FR2、FR3、及び/またはFR4)を含む。一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、配列番号2~25(例えば、G04に由来する軽鎖可変配列の場合)、配列番号27~50(例えば、G04に由来する重鎖可変配列の場合)、配列番号107~117(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)、または配列番号119~129(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)のいずれかにおける配列を含むフレームワーク領域(例えば、FR1、FR2、FR3、及び/またはFR4)を含む。一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、配列番号2~25(例えば、G04に由来する軽鎖可変配列の場合)、配列番号27~50(例えば、G04に由来する重鎖可変配列の場合)、配列番号107~117(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)、または配列番号119~129(例えば、E07に由来する軽鎖可変配列の場合)のいずれかにおける配列からなるフレームワーク領域(例えば、FR1、FR2、FR3、及び/またはFR4)を含む。
幾つかの実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、配列番号170もしくは171の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR1(すなわち、重鎖フレームワーク1領域)配列;配列番号172の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR2配列;配列番号173の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR3配列;配列番号174の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR4配列;配列番号175の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR1配列;配列番号176の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR2配列;配列番号177もしくは178の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR3配列;及び/または配列番号179、180、181、もしくは182の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR4配列を含み得る。
幾つかの実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、配列番号170もしくは171の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR1(すなわち、重鎖フレームワーク1領域)配列;配列番号172の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR2配列;配列番号173の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR3配列;配列番号174の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR4配列;配列番号175の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR1配列;配列番号176の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR2配列;配列番号177の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR3配列;及び/または配列番号179、180、181、もしくは182の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR4配列を含み得る。
幾つかの実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、配列番号170もしくは171の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR1(すなわち、重鎖フレームワーク1領域)配列;配列番号172の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR2配列;配列番号173の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR3配列;配列番号174の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR4配列;配列番号175の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR1配列;配列番号176の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR2配列;配列番号177の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR3配列;及び/または配列番号179もしくは181の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR4配列を含み得る。
幾つかの実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、配列番号189の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR1配列;配列番号190の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR2配列;配列番号191の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR3配列;配列番号192の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR4配列;配列番号193及び194の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR1配列;配列番号195の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR2配列;配列番号196の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR3配列;ならびに配列番号197の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR4配列を含み得る。
幾つかの実施形態では、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片は、配列番号189の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR1配列;配列番号190の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR2配列;配列番号191の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR3配列;配列番号192の配列を含むか、もしくはそれからなるHFR4配列;配列番号193の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR1配列;配列番号195の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR2配列;配列番号196の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR3配列;及び配列番号197の配列を含むか、もしくはそれからなるLFR4配列を含み得る。
VH及びVL領域の両方を含む断片では、これらは(例えば、ジスルフィド結合またはリンカーを介した)共有結合または非共有結合のいずれかにより結合していてもよい。本明細書に記載される抗体断片は、scFv、すなわち、リンカーにより連結されたVH領域及びVL領域を含む断片を含み得る。一実施形態では、VH及びVL領域は、(例えば、合成)ポリペプチドリンカーにより連結されている。ポリペプチドリンカーは、(GlySer)リンカーを含み得、ここで、n=1~8、例えば、2、3、4、5、または7である。ポリペプチドリンカーは、[(GlySer)(GlyAlaSer)リンカーを含み得、ここで、n=1~8、例えば、2、3、4、5、または7であり、m=1~8、例えば、0、1、2、または3であり、p=1~8、例えば、1、2、または3である。更なる実施形態では、リンカーは、配列番号291を含む。更なる実施形態では、リンカーは、配列番号291からなる。
翻訳、精製、及び検出を補助するためにN末端及びC末端の改変を含むscFv構築物が設計及び作製され得ることが当業者によって理解されるであろう。例えば、scFv配列のN末端では、カノニカルVH配列(例えば、最初のQVQまたはEVQ)の前に追加のメチオニン及び/またはアラニンアミノ酸残基が含まれ得る。C末端(すなわち、IMGTの定義に従って終了するカノニカル成熟VLドメイン配列のC末端)では、追加の配列、例えば、(i)定常ドメインの部分配列、及び/または(ii)精製及び検出を補助するためのHisタグ及びFlagタグなどのタグ(例えば、配列番号292~295のいずれかのタグ)を含む追加の合成配列が含まれ得る。
本明細書に記載されるように、抗体は、任意のフォーマットのものであり得る。好ましい実施形態では、抗体は、IgG1(例えば、ヒトIgG1)フォーマットのものである(すなわち、抗体はヒトIgG1抗体である)。
幾つかの実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、配列番号296もしくは配列番号307の配列を含む軽鎖定常領域(または配列番号296もしくは配列番号307との少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する配列)、及び/または配列番号297もしくは配列番号298の配列を含む重鎖定常領域(または配列番号297もしくは配列番号298との少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有する配列)を含む。幾つかの実施形態では、重鎖定常領域のエフェクター機能は、低減され得るか、または無効化され得る(エフェクター機能を無効にする変異)。エフェクター機能を減弱する好適な変異は、当業者に公知である。例えば、EU番号付けに従って、L235A及び/またはG237A変異(「LAGA」)、またはL234A及び/またはL235A変異(「LALA」)。例えば、一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、配列番号296の配列を含む軽鎖定常領域、及び/または配列番号297もしくは配列番号298の配列を含む重鎖定常領域を含む。
競合抗体
一実施形態では、抗体は、本明細書で定義される抗体もしくはその抗原結合断片と同じか、もしくは本質的に同じエピトープに結合するか、または本明細書で定義される抗体もしくはその抗原結合断片と競合する。当該技術分野において公知の定型的な方法を使用することにより、抗体が抗Vδ1参照抗体と同じエピトープに結合するかどうか、または結合について抗Vδ1参照抗体と競合するかどうかを容易に決定することができる。例えば、試験抗体が本発明の抗Vδ1参照抗体と同じエピトープに結合するかどうかを決定するために、当該参照抗体を飽和条件下でVδ1タンパク質またはペプチドに結合させる。次に、Vδ1鎖に結合する試験抗体の能力が評価される。抗Vδ1参照抗体との飽和結合後に試験抗体がVδ1に結合することができる場合、試験抗体は、抗Vδ1参照抗体とは異なるエピトープに結合すると結論付けられる。一方で、抗Vδ1参照抗体との飽和結合後に試験抗体がVδ1鎖に結合できない場合、試験抗体は、本発明の抗Vδ1参照抗体により結合されるエピトープと同じエピトープに結合し得る。
本発明は、本明細書で定義される抗体もしくはその抗原結合断片、または本明細書に記載される例示的な抗体のいずれかのCDR配列を有する抗体とVδ1への結合について競合する抗Vδ1抗体も含む。例えば、どのタンパク質、抗体、及び他のアンタゴニストがVδ1鎖への結合について本発明の抗体と競合し、及び/またはエピトープを共有するかを決定するために、本発明の抗体を用いて競合アッセイが実行され得る。これらのアッセイは、当業者に良く知られている。これらは、タンパク質、例えば、Vδ1における限られた数の結合部位についてのアンタゴニスト間またはリガンド間の競合を評価する。抗体(またはその抗原結合断片)は競合の前または後に固定化または不溶化され、Vδ1鎖に結合した試料が、例えば、デカント(抗体が事前に不溶化された場合)または遠心分離(抗体が競合反応後に沈殿した場合)することによって非結合試料から分離される。また、競合的結合は、タンパク質への抗体の結合または結合の欠如によって機能が変化するかどうか、例えば、抗体分子が、例えば、標識の酵素活性を阻害するか、または増強するかどうかによって決定され得る。当該技術分野において公知であり、本明細書に記載されるような、ELISA及び他の機能アッセイが使用され得る。
2つの抗体は、各々が他方の標的抗原への結合を競合阻害(遮断)する場合、同じまたは重複するエピトープに結合する。すなわち、1倍、5倍、10倍、20倍、または100倍過剰の一方の抗体は、競合結合アッセイで測定した場合、他方の結合を少なくとも50%、ただし好ましくは75%、90%、または更には99%阻害する。あるいは、一方の抗体の結合を低減するか、または消失させる標的抗原におけるほぼ全てのアミノ酸変異が、他方の結合を低減するか、または消失させる場合、2つの抗体は同じエピトープを有する。
次いで、観察された試験抗体の結合の欠如が実際に参照抗体と同じエピトープへの結合によるものかどうか、または立体障害(または別の現象)が観察された結合の欠如の原因であるかどうかを確認するために、追加の定型的実験(例えば、ペプチド変異分析及び結合分析)が実行され得る。この類の実験は、ELISA、RIA、表面プラズモン共鳴、フローサイトメトリー、または当該技術分野において利用可能な任意の他の定量的もしくは定性的な抗体結合アッセイを使用して実行され得る。
抗体の抗体結合特性及び薬理学的特性
本発明の多重特異性抗体は、例えば、下記で述べる様に、好ましい結合特性及び/または薬理学的特性を有し得る。
幾つかの実施形態では、抗体またはその抗原結合断片の結合親和性は、抗体またはその抗原結合断片を直接または間接的に(例えば、抗ヒトIgG Fcによる捕捉によって)センサーの表面上(例えば、高容量アミンチップまたは同等物)にコーティングすることによって確定され、ここで、抗体またはその抗原結合断片により結合される標的(すなわち、γδTCRのVδ1鎖またはEGFR)が、結合を検出するためにチップ上に流される。好適には、MASS-2機器(Sierra SPR-32とも称され得る)を30μl/分でPBS+0.02%Tween 20のランニングバッファー中25℃で使用する。
本明細書には、抗体機能を定義するために使用され得る他のアッセイが記載される。例えば、本明細書に記載される多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、γδTCRの会合により、例えば抗体結合時のγδTCRの下方調節を測定することで評価され得る。抗体またはその抗原結合断片(任意により、細胞の表面に提示される)の適用後のγδTCRの表面発現は、例えば、フローサイトメトリーにより測定され得る。本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、γδT細胞の脱顆粒を測定することによっても評価され得る。例えば、抗体またはその抗原結合断片(任意により、細胞の表面に提示される)のγδT細胞への適用後に、細胞の脱顆粒のマーカーであるCD107aの発現が、例えば、フローサイトメトリーにより測定され得る。本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、(抗体がγδT細胞の殺傷活性に影響を及ぼすかどうかを試験するために)γδT細胞による殺傷活性を測定することによっても評価され得る。例えば、標的細胞が、抗体またはその抗原結合断片(任意により、細胞の表面に提示される)の存在下でγδT細胞とインキュベートされ得る。インキュベーション後、培養物は、生きている標的細胞と死んでいる標的細胞を区別するために、細胞生死判定用色素で染色され得る。次いで、死細胞の割合が、例えば、フローサイトメトリーにより測定され得る。
さらに、本明細書では、別個のγδTCR+ve細胞及びEGFR+ve細胞を含む少なくとも2つの異なる細胞種の混合物を含むアッセイで評価される多重特異性抗体の機能を定義するために使用され得るアッセイが記載される。これらのアッセイは、本明細書に記載される多重特異性抗体の驚くべき技術的効果の一部を更に強調するのに役立ち、それによって、そのような細胞混合物を含むアッセイで多重特異性抗体の機能を評価及び定義した場合、更に増強された効果が観察される(例えば、TCR下方調節の増加)。
ヒトTRDV1に対する結合親和性(K
一般的にいえば、親和性成熟したクローン(及びそのようなクローンに由来するか、またはそれに関連する多重特異性抗体)は、それらの抗原(複数可)に対して、親クローンより高い親和性を有する。例えば、ヒトTRDV1(配列番号272または306)に対する親和性は、親抗体より少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも100%、または少なくとも500%高い親和性である。
本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約100nM未満、好ましくは、約50nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合し得る。
多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、好ましくは、約5nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合するものと更に定義され得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片(例えば、親和性成熟または別法の結果として、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来するFab領域を持つ本発明の多重特異性抗体など)では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約100nM未満、好ましくは約50nM未満のKで、ヒトTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列(ただし、ADT1-4-138を除く)に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、好ましくは、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列メンバーであるADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-53、ADT1-4-2、ADT1-4-86、ADT1-4-112、ADT1-4-143、及び/またはADT1-4-1に関連するか、またはそれらに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、好ましくは、約1nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得る。
本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約100nM未満、好ましくは、約50nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1(配列番号308)に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約100nM未満、好ましくは、約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列メンバーであるADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-53、ADT1-4-2、ADT1-4-86、ADT1-4-112、ADT1-4-143、及び/またはADT1-4-1に関連するか、またはそれらに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来するものでは、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約100nM未満、好ましくは、約50nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約100nM未満、好ましくは、約50nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列(ただし、ADT1-4-138を除く)に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約100nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1に結合し得る。好ましくは、この実施形態では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約50nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列メンバーであるADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-53、ADT1-4-2、ADT1-4-86、ADT1-4-112、ADT1-4-143、及び/またはADT1-4-1に関連するか、またはそれらに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、50nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得る。好ましくは、この実施形態では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約1nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約50nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1に結合し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-7系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片(例えば、親和性成熟または別法の結果として、ADT1-7系列に関連するか、またはそれに由来するFab領域を持つ本発明の多重特異性抗体など)では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、好ましくは約5nM未満のKで、ヒトTRDV1に結合し得る。
ヒトTRDV1に対する結合親和性を約10nM未満に増加させると、増加した結合(MFI)、改善されたvδ1 TCR下方調節、改善されたCD107A上方調節、増加した細胞傷害性、及び増加した増殖など、有利な技術的効果がもたらされることが示されている(図35L参照)。
EGFRに対する結合親和性(K
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2x747、ADT1-4-2xLEE3、ADT1-4-2xLEE2、及びADT1-4-2xLEE1は、約150nM未満のKでEGFRに結合し得る。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2x747、及びADT1-4-2xLEE3は、約20nM未満のKでEGFRに結合し得る。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、及びADT1-4-2x747は、約10nM未満のKでEGFRに結合し得る。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、及びADT1-4-2x747は、約5nM未満のKでEGFRに結合し得る。
いずれの実施形態においても、EGFRはヒトEGFRであり得る。
表7は、SPRによって決定された、本発明の例示的な多重特異性抗体のEGFR親和性の概要を提供する。





















幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2x747、ADT1-4-2xLEE3、ADT1-4-2xLEE2、及びADT1-4-2xLEE1は、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約150nM未満のKでEGFRに結合し得る。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2x747、及びADT1-4-2xLEE3は、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約20nM未満のKでEGFRに結合し得る。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、及びADT1-4-2x747は、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約10nM未満のKでEGFRに結合し得る。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体、例えば、ADT1-4-2xFS1-65、ADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xLEE、及びADT1-4-2x747は、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合し得、約5nM未満のKでEGFRに結合し得る。
EGFRに対する結合親和性を増加させると、増加した結合(MFI)、改善されたvδ1 TCR下方調節、改善された脱顆粒、増加した細胞傷害性、増加した4-1BB上方調節、及び増加した増殖など、有利な技術的効果がもたらされることが示されている(図36参照)。約1nM~約20nMの親和性の範囲内のEGFRに対する中から高の親和性を持つ本発明の多重特異性抗体(ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2xLEE3、ADT1-4-2LEE2)が機能的にクラスター化するクラスタリング効果が観察される一方で、親和性が約142nMの低親和性分子(ADT1-4-2xLEE1)は著しく損なわれ、このアッセイにおける非結合性(TCRに対して非結合性)の対照と同等である。興味深いことに、最も高い親和性のEGFR結合(約2nM未満)は、vδ1 TCR下方調節の改善、脱顆粒の改善、細胞傷害性の増加、41BB上方調節の増加、及び増殖の増加について最も高い飽和効果を付与しない。むしろ、約9nM~19nMの中域親和性分子(それぞれADT1-4-2xLEE3及びADT1-4-2xLEE2)が、抗体の飽和濃度で最も高い効果を付与する。本発明の中域親和性多重特異性抗体によって付与される、このより最適な効果については、本明細書で後述する。結果を図36に示す。
結合ドメインの親和性のダイヤルアップ及びダイヤルダウン
本明細書で提示される多重特異性抗体は、Vδ1 TCRのTRDV1ドメインに結合する少なくとも1つの第1の結合ドメインと、EGFRに結合する少なくとも1つの第2の結合ドメインとを含む。各結合ドメインは、異なる結合親和性(Kd)でその標的に結合する。これらの結合親和性は、互いとは無関係に変化させることができる。第1の結合ドメイン及び第2の結合ドメインの両方に合わせて親和性を上下に微調整すると、機能性及び付与される技術的効果に影響が及ぶ。
第1の結合ドメインの(Vδ1 TCRのTRDV1ドメインに対する)親和性:
1)第1の結合ドメインに対する親和性を高めると(約10nM超まで)、ある特定の状況においてこれらの多重特異性抗体の効果を更に増強することができる。これまでに報告されているヒトVδ1 TCRに対する天然に存在するリガンドの全てが2.9uM(MART1)から900uM(MICA)の範囲のはるかに低い親和性を示すことを考えると、これは驚くべきことである。
2)TRDV1に対する親和性が低い(約10nM未満の)多重特異性抗体の濃度を増加させると、これらの分子によって付与される、観察される低い活性(例えば、増殖効果)の一部が克服され得るが、興味深いことに、全ての効果が低親和性バリアントの濃度増加によって再現できるわけではない。
3)より高いTAAコピー数を有するがん細胞は、これらの多重特異性抗体、特に、親和性が(TRDV1に対して)低いバリアントによって付与される、観察される効果を更に増強させることができる。
第2の結合ドメインの(EGFRに対する)親和性
1)EGFRに対してより高い親和性を有する本発明の多重特異性抗体は、行われた複数の探索的研究においてより最適に機能した(実施例13~17を参照のこと)。
2)多くの機能的効果に大きな影響を与えることなく、EGFRに対する親和性が1nM~20nMの範囲となり得る、閾値効果が観察された(実施例13~17を参照のこと)。高から中程度の親和性の多重特異性抗体について観察されたこのクラスター効果または閾値効果は予想外であった。
3)がん細胞株におけるTAAコピー数がより高ければ、親和性が(EGFRに対して)より低い多重特異性抗体によって観察される低減した効果の一部が克服され得るが、これもまたある状況においてのみである(実施例13~17を参照のこと)。
4)EGFRに対して中域の親和性(9nM~20nM)を有する本発明の幾つかの多重特異性抗体は、場合によっては、飽和濃度において最高親和性バリアント(2nM未満)よりも良好に機能した。例えば、nMの抗体濃度で作業した場合、EGFRに対して中域の親和性(約8nM~20nM)を持つ多重特異性抗体は、記述されているアッセイにおける最高親和性バリアント(2nM未満、好ましくは1.5nM未満)及び最低親和性バリアント(約142nM)の両方と比較して、増強された増殖効果及び41BB活性化ステータスを付与したことが観察された。
親和性のダイヤルアップ及びダイヤルダウンは、多重特異性抗体の「ツールボックス」となり、多重特異性抗体には、低コピー数TAAシナリオに最適なものもあれば、ある特定の状況においてnM濃度/用量範囲でより最適なものもあり、高コピー数TAA癌に対してのみ選択性が高いものもある。
Figure 2024509332000009
阻害濃度(IC50)
TCR下方調節
TCR下方調節は、本明細書に記載されるアッセイにより測定され得る。例えば、試験される抗体は、γδT細胞の培養物と共に異なる濃度でインキュベートされ得、下方調節が測定される。細胞殺傷(例えば、THP-1細胞殺傷、またはA375細胞殺傷)を測定する場合、γδT細胞は、好適な細胞株、例えば、THP-1細胞またはA375細胞と共培養される。TCR下方調節は、フローサイトメトリーで測定され得る。細胞殺傷は、任意の適切な手段、例えば、フローサイトメトリーにより達成され得る。
親抗体(例えば、ADT1-7及びADT1-4)によるTCR下方調節の最初の研究では、TCR下方調節アッセイは、Fcγ受容体+ve THP-1細胞に抗体を「負荷すること」を含んだ(WO2021/032963の実施例1、実施例6、及び表5を参照のこと)。従って、この場合、抗体は、γδT細胞との共インキュベーション前に細胞表面に提示される。これにより、かかる負荷は、TCR会合時の架橋効果を利用する最大の機会をもたらす。抗体をFc受容体+ve細胞に負荷することとは別に、固体表面上に抗体を提示する同様の代替手法としては、プレート上で抗体をプレインキュベートすること(いわゆるプレート結合)、または抗体を提示する担体ビーズの使用が挙げられ得る。全てのかかるアッセイでは、固体表面に提示されたら、次いで、標的受容体(この場合、γδT細胞受容体)の会合時に抗体により与えられる技術的効果を調査及び測定することが一般的である。このようにして抗体を提示することは、特に免疫細胞受容体標的及び免疫細胞受容体複合体の抗体との会合、例えば、標的、例えば、CD3、CD28などの抗体との会合の効果を調査する場合、一般的である。
対照的に、本明細書に記載される本発明の親和性成熟した抗体では、我々は、親和性成熟の影響を最大限分析及び比較することを望んでいたため、我々は、より「可溶化」したTCR下方調節アッセイフォーマットでこれらの抗体の能力を調査した。溶液中での効果の評価も生理学的により関連し得る。これらの理由のため、特に明記しない限り、親和性成熟した抗体、多重特異性抗体、またはそれらの断片の効果が、測定されるか、または特徴付けられ、親抗体と比較される(例えば、図35を参照のこと)全ての細胞ベースのTCR下方調節実験において、可溶化アッセイフォーマットが調査される。このより厳密な可溶化アッセイを用いることによるIC50の差を以下に要約し、ここで、両方の手法による例示的な親分子(ADT1-4)のEC50値のTCR下方調節を要約する。
「提示」対「可溶化」アッセイフォーマット:
ADT1-4 IC50(THP-1細胞に負荷される):0.01~0.05ug/ml=0.065nM~0.325nM
(WO2021/032963の実施例1、実施例6、及び表5を参照のこと)

ADT1-4 IC50(可溶化アッセイ、溶液中に添加される)=38.28nM
(図12参照)
本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約50nM未満、約10nM未満、または約1mM未満のTCR下方調節のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片(例えば、親和性成熟または別法の結果として、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来するFab領域を持つ本発明の多重特異性抗体など)では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約50nM未満、約10nM未満、または約1mM未満のTCR下方調節のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列(ただし、ADT1-4-138を除く)に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約1nM未満のTCR下方調節のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約0.5nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列メンバーであるADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-53、ADT1-4-2、ADT1-4-86、ADT1-4-112、ADT1-4-143、及び/またはADT1-4-1に関連するか、またはそれらに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の抗体またはその多重特異性抗原結合断片は、約1nM未満のTCR下方調節のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約0.5nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-7系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片(例えば、親和性成熟または別法の結果として、ADT1-7系列に関連するか、またはそれに由来するFab領域を持つ本発明の多重特異性抗体など)では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約50nM未満、約10nM未満、または約1mM未満のTCR下方調節のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-7系列メンバーであるADT1-7-20もしくはADT1-7-3に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約5nM未満のTCR下方調節のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約10nM未満である。
細胞殺傷
細胞殺傷は、本明細書に記載されるアッセイにより測定され得る。例えば、試験される抗体は、γδT細胞及び腫瘍細胞(例えば、THP-1細胞またはA375細胞)の共培養物と共に異なる濃度でインキュベートされ得る。細胞殺傷は、任意の適切な手段、例えば、フローサイトメトリーにより測定され得る。
本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、約5nM未満、約1nM未満、約0.1nM未満、または約0.01nM未満のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片(例えば、親和性成熟または別法の結果として、ADT1-4系列に関連するか、またはそれに由来するFab領域を持つ本発明の多重特異性抗体など)では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、約5nM未満、約1nM未満、約1nM未満、約0.1nM未満、または約0.01nM未満のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-7系列に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片(例えば、親和性成熟または別法の結果として、ADT1-7系列に関連するか、またはそれに由来するFab領域を持つ本発明の多重特異性抗体など)では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約5nM未満、約1nM未満、または約0.1nM未満のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-7系列メンバーであるADT1-7-20もしくはADT1-7-3に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、約5nM未満、約1nM未満、または約0.1nM未満のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。好ましくは、IC50は約1nM未満である。
当然のことながら、多重特異性抗体の有利な薬理学的プロファイルは、当該抗体が、種々の試験される特性について有利なK及び有利なIC50値を示すように組み合わされ得る。
例えば、幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、
●約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合し得、
●任意により、約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1(配列番号308)に結合し得、
●約50nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。
幾つかの実施形態、特にADT1-4系列に関連する実施形態では、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、
●約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し得、
●約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでカニクイザルTRDV1に結合し得、
●約50nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列(ただし、ADT1-4-138を除く)に関連するか、またはそれに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し得、
●約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでカニクイザルTRDV1に結合し得、
●約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。
幾つかの実施形態、例えば、ADT1-4系列メンバーであるADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-53、ADT1-4-2、ADT1-4-86、ADT1-4-112、ADT1-4-143、及び/またはADT1-4-1に関連するか、またはそれらに由来する多重特異性抗体またはその抗原結合断片では、本発明の多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、
●約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し得、
●約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合し得、
●約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。
幾つかの実施形態、特にADT1-7系列に関連する実施形態では、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し得、
●約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得、
●約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。
幾つかの実施形態、特にADT1-7系列であるADT1-7-20またはADT1-7-3に関する実施形態では、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し得、
●約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得、
●約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のA375細胞殺傷のIC50を有し得る。
ADT1-4系列のFab領域またはADT1-4系列に由来するFab領域を含む抗体の薬理学的特性
TRDV1への(Fab領域を介した)結合に関する抗体の薬理学的特性は、ある特定のパラメータの範囲内に収まる可能性がある。例えば、ADT1-4-105の抗体またはADT1-4-105に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-107の抗体またはADT1-4-107に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-110の抗体またはADT1-4-110に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-112の抗体またはADT1-4-112に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-117の抗体またはADT1-4-117に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-19の抗体またはADT1-4-19に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-21の抗体またはADT1-4-21に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-31の抗体またはADT1-4-31に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-139の抗体またはADT1-4-139に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-4の抗体またはADT1-4-4に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-143の抗体またはADT1-4-143に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-53の抗体またはADT1-4-53に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-173の抗体またはADT1-4-173に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-2の抗体またはADT1-4-2に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-8の抗体またはADT1-4-8に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-82の抗体またはADT1-4-82に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-83の抗体またはADT1-4-83に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-3の抗体またはADT1-4-3に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-84の抗体またはADT1-4-84に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-86の抗体またはADT1-4-86に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-95の抗体またはADT1-4-95に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約50nM未満のKを有し得る。
ADT1-4-1の抗体またはADT1-4-1に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-6の抗体またはADT1-4-6に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-4-138の抗体またはADT1-4-138に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のK及び/またはカニクイザルTRDV1に対する約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-7系列のFab領域を含む抗体の薬理学的特性
TRDV1への(Fab領域を介した)結合に関する抗体の薬理学的特性は、ある特定のパラメータの範囲内に収まる可能性がある。例えば、ADT1-7-10の抗体またはADT1-7-10に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-15の抗体またはADT1-7-15に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-17の抗体またはADT1-7-17に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-18の抗体またはADT1-7-18に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-19の抗体またはADT1-7-19に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-20の抗体またはADT1-7-20に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-7-22の抗体またはADT1-7-22に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-23の抗体またはADT1-7-23に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-42の抗体またはADT1-7-42に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKを有し得る。
ADT1-7-3の抗体またはADT1-7-3に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
ADT1-7-61の抗体またはADT1-7-61に由来する抗体(例えば、その断片、1つ以上のアミノ酸置換を有するバリアント、またはある特定の同一性パーセントを有するバリアント)は、ヒトTRDV1に対する約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKを有し得る。かかる抗体は、代替的にまたは追加的に、約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有し得る。
抗体のその他の機能特性
本発明の抗体は、良好な機能プロファイルを有する。特に、Vδ1T細胞の枯渇に焦点を置く従来技術の抗Vδ1抗体と異なり、本発明の抗体は、Vδ1T細胞の活性化に有用である。本発明の抗体は、それらが結合するT細胞上のTCRの下方調節を引き起こし得るが、Vδ1T細胞の枯渇を引き起こさず、むしろT細胞を刺激するため、T細胞のこのコンパートメントの活性化による恩恵を受ける治療状況において有用であり得る。Vδ1T細胞の活性化は、TCRの下方調節、活性化マーカー、例えば、CD25及びKi67、ならびに脱顆粒マーカーCD107aの変化から明らかである。Vδ1T細胞の活性化は、次に、INFγ及びTNFαなどの炎症性サイトカインの放出を引き起こして、免疫ライセンシングを促進する。驚くべきことに、TRDV1に対する適切に高い親和性を有する抗体は、Vδ1T細胞殺傷の増加を誘発し、(例えば)CD3を標的とする抗体と異なり、CD3による大規模な活性化に伴う副作用を伴うことなく高親和性抗体の供給が可能である。結果として、高親和性抗体は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)による強力な免疫賦活効果を誘発することができる。これは、Vδ1細胞の最小限の疲弊または殺傷で達成され得る。従って、本発明の抗体は、アゴニスト抗体とみなされ得る。
本発明の一実施形態では、
a)Vδ1T細胞上のTCRの下方調節を引き起こし、
b)CDCまたはADCCを示さず、
c)Vδ1T細胞を枯渇させないこと特徴とする、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供される。
幾つかの実施形態では、多重特異性抗Vδ1抗体または抗原結合断片は、Vδ1T細胞増殖も刺激する。
幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、Vδ1T細胞がEGFR+がん細胞などのEGFR+ve細胞の存在下にある(それと混合される、その近くにある、またはそれに隣接している)とき、Vδ1T細胞に、
(a)増強されたTCR下方調節効果;
(b)増強されたVδ1T細胞増殖効果;及び/または
(c)増強されたVδ1T細胞活性化効果
のうちの1つ以上を付与する。
多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、約10nM未満、好ましくは、約5nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合するものと更に定義され得る。
多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、上記のように良好なK及び/またはIC50値を有するものと更に定義され得る。
T細胞枯渇は、T細胞死、T細胞除去、またはT細胞低減のプロセスである。Vδ1T細胞を枯渇させない抗体または抗原結合断片への言及は、対照研究において本明細書に記載される本発明の多重特異性抗体のうちの1種以上とインキュベートされる場合(例えば、抗体がIgG1抗体として提供される場合)に、任意の適切な手段により測定される(例えば、比較対照のあるフローサイトメトリー法、または例えば、図18及び図29に記載される他の確立された対照アッセイによる)、生存Vδ1+T細胞集団の約30%未満または約20%未満(好ましくは、約10%未満)の枯渇を指す。
ADCC及びCDCは、T細胞枯渇が発生し得るメカニズムである。ADCCまたはCDCを引き起こさない本明細書における抗体または抗原結合断片への言及は、本明細書に記載される本発明の多重特異性抗体のうちの1種以上とインキュベートされる場合(例えば、抗体がIgG1抗体として提供される場合)に、任意の適切な手段により測定される(例えば、比較対照のあるフローサイトメトリー法、または例えば、図18に記載される他の確立された対照アッセイによる)、ADCC及び/またはCDCによる生存Vδ1+T細胞集団の約30%未満または約20%未満(好ましくは、約10%未満)の枯渇を指す。
一実施形態では、IL-17Aの分泌を誘発しないことを特徴とする抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が提供される。IL-17A(インターロイキン-17A)は、活性化T細胞により産生される腫瘍形成促進性サイトカインである。IL-17Aは、腫瘍成長を増強し得、抗がん免疫応答を弱め得る。図40に示すように、抗vδ1抗体は、Vδ1+ve細胞を含むヒトリンパ球を含む細胞集団に添加される場合、IL-17Aの分泌を誘発しないが、抗CD3比較抗体(OKT3など)は、かかる状況でIL17Aを誘発する。従って、IL-17Aの分泌を誘発しない本明細書における抗体または抗原結合断片への言及は、かかる状況において抗CD3比較抗体(図63G~Iにおいて用いられる抗CD3比較抗体であるOKT3に代表される)により誘発されるIL-17A分泌の約30%未満または約20%未満または約10%未満のIL-17A分泌を誘発することを指す。
抗体の改変
抗体及びその断片は、公知の方法を使用して他の点で改変され得る。本明細書に記載される抗体分子の配列改変は、当業者により容易に組み込まれ得る。以下の例は非限定的な例である。
ファージライブラリからの抗体の発見及び配列の回収の間に、所望の抗体可変ドメインがサブクローニングにより完全長IgGに再フォーマットされ得る。プロセスを加速させるために、可変ドメインは、多くの場合、制限酵素を使用して移される。これらの固有の制限部位は追加/代替のアミノ酸を導入し得、カノニカル配列から離れ得る(かかるカノニカル配列は、例えば、International ImMunoGeneTics[IMGT] Information System(http://www.imgt.orgを参照のこと)において見出され得る)。これらは、κ軽鎖またはλ軽鎖の配列改変として導入され得る。
軽鎖の改変
可変軽鎖の可変配列は、完全長IgGに再フォーマットする際に制限部位(例えば、Nhe1-Not1)を使用してクローニングされ得る。より具体的には、クローニングを補助するために、親(非親和性成熟)抗体の軽鎖N末端に追加のAla-Ser配列が導入された。好ましくは、この追加のAS配列はその後、カノニカルN末端配列を生成させるように、更なる開発の間に除去される。従って、幾つかの実施形態では、本明細書に記載される軽鎖を含む抗体は、それらのN末端にAS配列を含まない。すなわち、配列番号26、118、282~290、または313は、最初のAS配列を含まない。親和性成熟した抗体の軽鎖配列のN末端は、すでにこのASモチーフを含んでいない。
クローニングを補助するために、追加のアミノ酸改変がなされ得る。例えば、κ軽鎖を有する本明細書に記載される親抗体(すなわち、B07、C05、E04、F07、G06、G09、B09、G10、G04、及びE07)では、全長配列を調製する際のクローニングを補助するために、κ軽鎖可変ドメイン/定常ドメイン境界でバリンからアラニンへの変化が導入された。これにより、κ定常ドメインが改変された。具体的には、これにより、(NotI制限部位から)RTAAAPSで始まる定常ドメインがもたらされる。好ましくは、かかる配列は、RTVAAPSで始まるカノニカルκ軽鎖定常領域を生成させるように、更なる開発の間に改変され得る。かかる改変は、抗体の機能特性を変化させない。従って、幾つかの実施形態では、本明細書に記載されるκ軽鎖を含む抗体は、(例えば、配列番号296のように)配列RTVで始まる定常ドメインを含む。
別の例として、本明細書に記載される抗体で(具体的には、E01及びC08)は、クローニングを補助するために、λ軽鎖可変ドメイン/定常ドメインの境界で、リジンからアラニンへの配列変化が導入された。これにより、λ定常ドメインが改変された。具体的には、これにより、(NotI制限部位から)GQPAAAPSで始まる定常ドメインがもたらされる。好ましくは、この配列は、GQPKAAPSで始まるカノニカルλ軽鎖定常領域を生成させるように、更なる開発の間に改変され得る。従って、幾つかの実施形態では、本明細書に記載されるλ軽鎖を含む抗体は、配列GQPKで始まる定常ドメインを含む。
重鎖の改変
通常、ヒト可変重鎖配列は、塩基性のグルタミン(Q)または酸性のグルタミン酸(E)のいずれかで始まる。しかしながら、かかる配列は両方とも、その後、酸性アミノ酸残基であるピログルタミン酸(pE)に変換されることが知られている。QからpEへの変換は抗体の電荷変化をもたらすが、EからpEへの変換は抗体の電荷を変化させない。従って、経時的な電荷変化の変動を回避するための1つの選択肢は、最初に重鎖の開始配列をQからEに改変することである。従って、一実施形態では、重鎖のN末端にQ残基を有する本明細書に記載される抗体の重鎖は、N末端でのQからEへの改変を有し得る。特に、配列番号1、106、276~279、または312のいずれかの最初の残基は、QからEに改変され得る。この実施形態は、これらの配列を、例えば、完全長の多重特異性抗体またはその抗原結合断片に組み込む任意の実施形態にも適用されることが理解されよう。幾つかの実施形態では、重鎖のN末端のE残基をE残基に置換することが有利であり得る。従って、幾つかの実施形態では、配列番号2~25、107~117、273~275、280、または281のいずれかのN末端のE残基は、Q残基で置換され得る。
更に、IgG1定常ドメインのC末端はPGKで終わる。しかしながら、末端の塩基性リジン(K、EU447位)は、その後、(例えば、CHO細胞において)発現の間に切断されることが多い。その結果、C末端リジン残基の様々な喪失により抗体の電荷が変化する。従って、1つの選択肢は、最初にこのリジンを除去し、これにより、PGで終わる均一かつ一貫した重鎖C末端配列をもたらすことである。代替的選択肢は、末端G(EU446位)も除去することである。従って、一実施形態では、本明細書に記載される抗体の重鎖は、C末端から末端Kまたは末端GKが除去されている。
幾つかの実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、Asn297(EU番号付けスキーム)に連結された糖の変化により改変されたエフェクター機能を有する。更なる上記改変において、Asn297は、フコシル化されていないか、またはフコシル化の低減を示す(すなわち、脱フコシル化抗体または非フコシル化抗体)。フコシル化としては、分子への糖フコースの付加、例えば、N-グリカン、O-グリカン、及び糖脂質へのフコースの結合が挙げられる。従って、脱フコシル化抗体では、フコースが定常領域の糖鎖に結合していない。抗体は、抗体のフコシル化を防止または阻害するように改変され得る。典型的には、グリコシル化の改変は、標的を定めた工学操作、または標的を定めたもしくは偶然による宿主もしくはクローンの選択のいずれかにより、代替的なグリコシル化処理能力を有する宿主細胞において、上記抗体またはその抗原結合断片を発現させることを含む(例えば、実施例13を参照のこと)。これらの及び他のエフェクター改変は、本明細書に組み込まれるXinhua Wang et al.(2018) Protein & Cell 9:63-73及びPereira et al.(2018)mAbs 10(5):693-711などの最近の概説に更に説明されている。
任意のアロタイプの改変
抗体の探索中に、特定のヒトアロタイプが用いられる場合がある。任意により、抗体は、開発の間に異なるヒトアロタイプに切り替えられ得る。非限定的な例として、カッパ鎖には、3つのKm対立遺伝子を定義するKm1、Km1,2、及びKm3と称される3つのヒトアロタイプがある(アロタイプ番号付けを使用)。Km1はバリン153(IMGT V45.1)及びロイシン191(IMGT L101)と対応し、Km1,2はアラニン153(IMGT A45.1)及びロイシン191(IMGT L101)と対応し、Km3はアラニン153(IMGT A45.1)及びバリン191(IMGT V101)と対応する。従って、任意により、標準的なクローニング手法によって配列を1つのアロタイプから別のものに改変することができる。例えば、L191V(IMGT L101V)の変化により、Km1,2アロタイプがKm3アロタイプに変換される。かかるアロタイプの更なる詳細については、Jefferis and Lefranc(2009)MAbs 1(4):332-8(これは参照により本明細書に組み込まれる)を参照のこと。
従って、一実施形態では、本明細書に記載される抗体は、同じ遺伝子の別のヒトアロタイプに由来するアミノ酸置換を有する。更なる実施形態では、抗体は、c-ドメインをkm1,2からkm3アロタイプに変換するためのカッパ鎖のL191V(IMGT L101V)置換を有する。
多重特異性抗体
本発明の抗体は多重特異性である。それらは二重特異性多重特異性であり得る。多重特異性抗体は、1つの標的ポリペプチドの異なるエピトープに特異的であり得るか、または2種以上の標的ポリペプチドに特異的であり得る。従って、一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、Vδ1に対する第1の結合特異性及びEGFRに対する第2の結合特異性を含む。
特に、本発明は、TCRδ可変部1(Vδ1)に対する抗原結合部位及びEGFRに対する抗原結合部位を含む、複数の抗原結合部位を含む新しいクラスの高親和性抗体(「多重特異性抗体」)を提供する。
本発明の多重特異性抗体は、「mAb抗体」または「mAb二乗抗体」として知られるフォーマットであり、CH3ドメインに抗原結合ループを含むように工学操作されたFc領域を含む抗体である。この改変されたFc領域は「Fcab」と呼ばれる。mAb抗体は、抗原結合部位をもたらすVH-VLドメイン対を含むFab領域を更に含む。本発明のmAb分子は、EGFR結合Fcab及びvδ1結合Fabを含む。
本発明のTCEは、従来技術のTCEに勝る幾つかの利点を提供する。特に、本TCEは、全く新規かつ独特のメカニズムによりT細胞受容体複合体を標的とすることにより、従来技術のTCEに関連する多数の課題を克服し得る。実際、TRDV1ドメイン上のエピトープに結合することによってのみT細胞受容体複合体を特異的に標的とする(及び活性化する)ことにより、以下が含まれる多数の利点が実現される。
●全てのT細胞ではなくT細胞のサブセットのみと会合する(例えば、がんにおけるT-regとの会合は望ましくない場合がある)。
●主に「組織常在性」であり、その存在が、多くの場合、がん/腫瘍において予後良好と正に相関する、T細胞のサブセット(TRDV1+T細胞)のみと会合する。
●TRDV1との会合によりT細胞受容体複合体を活性化し、これにより、より高い選択可能性をもたらす(例えば、本発明の抗体におけるようなこの結合ドメインの親和性を増加させる)。例えば、CD3ではなく、TRDV1ドメインのみを介してT細胞受容体複合体と会合する組換えTCEを開発することにより、親和性の増加がより好ましい機能性をもたらし得る。例えば、高親和性TRDV1結合性TCEは、T細胞を活性化し得るが、疲弊させず、及び/または
●上記新規手段により、かつ組換えTRDV1結合ドメインを介してTCE複合体と会合することにより、有害効果の低減がもたらされ得るため、当該TCE部分におけるFc機能性を減弱させる必要性が低減され得る。一般的に、減弱されていないFc機能を有するTCEは、抗体依存性細胞性細胞傷害(ADCC)作用を誘発し、これにより、抗体により認識されるγδT細胞集団を枯渇させると予想される。しかし、繰り返しになるが、毒性/安全性の複雑さを回避するためにかかる機能を減弱することにより、例えば、CD16+もしくはCD32+もしくはCD64+免疫細胞を関与させることにより、または二重特異性の半減期を低減することによって(例えば、BITEなどのより小さな二重特異性抗体断片を用いる場合)、潜在的に重要な有効性の観点も減弱される可能性がある。FcγR及びTCEの相互作用を低減する(例えば、当該相互作用を低減するように設計されたIgGフォーマットを使用する)方法は、Fcにより媒介されるTCEの固定化を低減し、固定化されたTCEとの架橋によるTCRクラスター化を低減すると予想される。上記TCE部分におけるFc機能性を減弱する必要性が低減される場合、例えば、TRDV1 TCEが一方の結合ドメインを介してTRDV1+細胞と会合するのを可能にすること、もう一方の結合アームにより第2の細胞種(例えば、がん細胞)と会合すること、及び機能的Fcドメインを介してCD16+免疫細胞またはCD32+免疫細胞またはCD64+免疫細胞などの他のエフェクター細胞と会合することにより、更なる選択可能性がもたらされ得る。
●vδ1+T細胞を枯渇させることなくvδ1 TCRを活性化する。従って、本明細書に記載される多重特異性抗体は、vδ1T細胞の望ましくない枯渇を伴わずに、CD3/γδTCR複合体と会合し得、それを活性化し得、その下方調節及び表面発現の喪失をもたらし得る(図29を参照のこと)。これにより、血液、組織、及び腫瘍常在性Vδ1+T細胞の活性化を伴うメカニズムにより疾患または障害を処置するため、例えば、疾患または障害の少なくとも1つの兆候または症状を改善するための薬剤として本明細書に記載される多重特異性抗体を用いることが可能になる。
そこから、本発明者らは、本明細書に記載される発見により、新規クラスの組換えTCEを作製した。具体的には、本発明の発明者らは、上記T細胞受容体シグナル伝達複合体における他のドメインではなくTRDV1ドメインを介してT細胞受容体と会合する新規クラスのTCEを発見した。より具体的には、本発明の発明者らは、TRDV1上の活性化エピトープを介してこの複合体と会合し、以前に報告されたT細胞受容体複合体との高親和性の会合に関連した有害効果の一部を潜在的にもたらすことなく、より高い親和性で結合し得る新規クラスのTCEを発見した。更に、この新規クラスのTCEは、野生型Fcの機能性も許容し得る様式で会合し得、これにより、更なる有効性の可能性ももたらされる。
本発明の多重特異性抗体は、対応する単一特異性抗体と比較して改善した特性も示し得る。例えば、本発明の多重特異性抗体は、多重特異性抗体の構成部分と同じ抗原結合ドメインを有する単一特異性抗体と比較して改善した特性も示し得る。幾つかの実施形態では、例えば、組換え多重特異性抗体は、第2のエピトープを発現する病変細胞に対する、対応量の上記第1の単一特異性抗体により付与される細胞傷害性と比較して増加したγδT細胞媒介性細胞傷害性を付与する。本発明の多重特異性抗体は、依然として健常細胞を温存しながら、病変細胞に対する改善した細胞傷害性も示し得る。
幾つかの実施形態では、多重特異性抗体は、組換え宿主細胞から発現される組換え核酸のオープンリーディングフレームまたは複数のオープンリーディングフレームによりコードされるヒト組換え抗体である。幾つかの実施形態では、多重特異性抗体は、B細胞融合ハイブリドーマ技術により得られたげっ歯類抗体または他の非ヒト抗体ではない。幾つかの実施形態では、多重特異性抗体は、げっ歯類由来のハイブリドーマに見出される配列などの、非ヒト動物種でのみ見出される非ヒトIgG定常ドメイン配列を含まない。
好ましい実施形態では、本発明の多重特異性抗体(好適には二重特異性抗体)は、CD3と特異的に結合しない(または直接相互作用しない)。
本明細書における、細胞「上」に存在する抗原への言及は、細胞膜上で発現されるか、またはかかる細胞の細胞膜(の細胞外側)と会合する抗原を指す。
第2の標的エピトープはEGFRである。EGFR(上皮成長因子受容体)は、がん関連抗原であり、ErbBサブファミリーの受容体チロシンキナーゼの一例である。EGFRは複数の臓器で発現し、上皮細胞及び上皮由来の腫瘍の挙動を司るシグナル伝達の開始において重要な役割を果たす。EGFRにより媒介されるシグナル伝達は、多様な細胞経路を調節することにより、細胞の増殖、移動、生存、及び転移の制御にも関与している。他の受容体型チロシンキナーゼと同様に、EGFR活性に影響を及ぼすか、またはEGFR上方調節を引き起こす変異は、多数のがんに関連している。実際、EGFRの遺伝子変化は、固形腫瘍の最大30%で観察され、概して予後不良と関連している。細胞外ドメインへのEGFの結合を阻害すること、または細胞内チロシンキナーゼ活性を阻害することによるEGFRシグナル伝達の破壊により、EGFR発現腫瘍の増殖が制限され得る。従って、EGFR阻害薬は、抗がん剤になり得る。実際、ある特定の腫瘍細胞は、EGFRシグナル伝達に依存しており、従って、「がん遺伝子中毒」になっており、このため、この受容体は治療のための魅力的な標的となる。EGFRのエピトープに特異的に結合するモノクローナル抗体は、当該技術分野において周知である。例えば、セツキシマブは、EGFRのエピトープに特異的に結合するモノクローナル抗体である。
健常細胞の温存
γδT細胞が抗原を認識し、健常細胞と病変細胞とを区別するメカニズムは完全には理解されていないが(Ming Heng and Madalene Heng,Antigen Recognition by γδ T-Cells.Madame Curie Bioscience Database[Internet],Austin(TX):Landes Bioscience;2000-2013)、γδT細胞が健常細胞と病変細胞とを区別し、顕著な病変細胞への多種細胞傷害性(表8の細胞種の非限定的な例を参照のこと)を示すことができるという事実は、これらを活用して、改善された治療域を有する改善された薬剤を提供できることを意味する。更に、かかるγδT細胞の能力を活用することにより、特定のがん抗原、炎症性抗原、もしくは病原体抗原が未知であるか、または特定の患者の健常細胞上にも存在する場合であっても、γδT細胞を病変細胞と共局在化させることにより、健常細胞を温存しながら疾患を処置する機会が提供される。
1つの非限定的な例として、CD3xEGFR多重特異性薬に関する最近の研究は、現在または従来のアプローチの課題を強調している。具体的には、かかる従来のアプローチの使用は、あまり好ましくない毒性プロファイルをもたらし得る。その理由は、他の多数の腫瘍関連抗原(TAA)と同様に、EGFR抗原が乳癌、大腸癌、及び頭頸部癌などのがんで発現されるだけでなく、上皮細胞などの健常な組織でも発現されるからである。よって、全てのT細胞と会合してEGFR陽性細胞と共局在化させるCD3xEGFR薬剤の使用により、あまり好ましくない治療域または治療指数がもたらされ得る。その理由は、かかる薬剤が全てのT細胞と会合し、循環血液中のそれらのうちの大部分がαβT細胞(CD4+陽性、CD8+陽性など)であるからである。そして、αβT細胞がEGFR陽性細胞と共局在化すると、かかる従来のαβT細胞は、EGFR+健常細胞を温存する能力の制限、及び罹患したEGFR+病変細胞のみを殺傷する能力の制限を示す。これらのハードルは、カニクイザル(雄のみ)における毒性研究の例でさらに強調されている。Lutterbuese et al 2010(doi:10.1073/pnas.1000976107)による研究では、小さなBITE(登録商標)フォーマットのCD3xEGFR二重特異性薬が用いられた。そして、これらの分子は、より大きな抗体ベースの分子(>70Kda)と比較して低減した半減期/全身曝露プロファイルを示すため、そのような部分は比較的忍容性良好であると予想され得る。しかし、31μg/kg/日及び154μg/kg/日の連続静脈内注入による適度な「比較的高い」用量でも、注入開始後56時間以内に重篤な毒性の兆候が観察された。そのため、福祉上の理由から動物の殺処分が行われた。投与を受けた動物の組織病理学的分析では、肝臓及び腎臓の毒性の兆候が示されたが、これは、これらの臓器で低レベルのEGFRを発現する細胞のリダイレクトされた溶解の結果であり得る。さらに、両方の高用量群の動物が、EGFR陽性細胞に遭遇したT細胞によって放出されると考えられる、血清中の炎症性サイトカイン(すなわち、TNF-α、IFN-γ、IL-6、IL-5、及びIL-2)レベルの上昇を示した。リンパ球浸潤及び細胞死を含む組織病理学的変化は、EGFRを発現することが知られている全ての組織、すなわち、唾液腺、肝臓、胃、小腸、結腸、直腸、腎臓、副腎、尿管、膀胱、前立腺、及び精巣上体で認められた。
よって、かかる従来のアプローチを用いる代わりに、本明細書で提供されるのは、少なくとも1つの第1の結合ドメインが、Vδ1+細胞に特異的に結合することができ、少なくとも1つの第2の結合ドメインが、病変組織及び細胞上に存在する標的であるEGFRに特異的に結合することができる多重特異性抗体である。かかる多重特異性抗体をこのように使用することにより、第2の標的を発現する病変細胞へのVδ1+細胞の共局在化がもたらされ得る。更に、かかる疾患関連標的が、多くの場合、100%疾患特異的ではないことを考慮すると、Vδ1+エフェクター細胞を特異的に標的とし、共局在化させるこのアプローチは、従来のアプローチよりも好ましい可能性がある。その理由は、Vδ1+エフェクター細胞が病変細胞または感染細胞におけるストレスのパターンを認識することができるため、同様に同じ標的を発現する健常細胞を温存しながら病変細胞を選択的に殺傷することができる可能性があるためである。
従って、本明細書において提供される多重特異性抗体は、vδ1細胞のTCRに会合することができるが、腫瘍細胞も存在しない限り完全な活性化は起こらない。本明細書において提供される抗体がTCRに完全に会合すると部分的な下方調節が引き起こされ、本明細書において提供される抗体が結合したvδ1細胞は、腫瘍細胞などのストレスを受けた細胞の存在下でのみ完全に活性化され、細胞傷害性になると考えられる。これは、例えば実施例18及び図40に示されている。これは、本明細書に示されるアプローチの別の重要な安全上の利点となる。なぜなら、オフターゲット細胞傷害性が低減され、vδ1細胞を活性化する多重特異性抗体の効力の全てが腫瘍細胞(更にはEGFRを発現する健常細胞)の存在下でのみ誘発され、つまり健常細胞が温存されるからである。
γδT細胞が腫瘍細胞のストレスシグナルを検出することができるメカニズムの1つは、それらが発現するNCR(自然細胞傷害性受容体)に起因すると考えられている。NCRは、腫瘍細胞上のNCRリガンドに会合することができる。従って、腫瘍細胞を検出して、完全な活性化及び細胞傷害性を有効にすることができるNCRによるものが含まれる、TCR刺激を介してγδT細胞が活性化される活性化の二重メカニズムが用いられ得る。
これは、例えば、CD3を介したαβT細胞の刺激とは対照的であり、αβT細胞の刺激は、全ての刺激がTCRを介する。従って、そのような細胞は、例えばNCRを介した、抗原提示に依存しない腫瘍細胞の感知などのメカニズムを有しないため、健常細胞または形質転換細胞の区別がほぼ不可能である。従って、CD3抗体がFc有効型であれば、それらは他の免疫細胞を誘引し、これがサイトカインストーム、免疫細胞の消耗及び更には過剰活性化といった予想外の望ましい事象のカスケードを誘起し、例えば、NK細胞によるT細胞の殺傷などをもたらすことができる。本件のアプローチでは、γδT細胞がそれらのNCR感知メカニズムを介するものを含めて健常細胞と腫瘍細胞とを区別することができ、従ってこの病変細胞特異性のためにがん細胞またはウイルス感染細胞などのストレスを受けた細胞を選択的に殺傷することができるため、本明細書で提示される多重特異性抗体によるγδT細胞の刺激は、このような懸念を生じない。
第2の標的エピトープは、異なるT細胞、B細胞、腫瘍細胞、自己免疫組織細胞、またはウイルス感染細胞を含む、異なる細胞上に存在し得る。
様々な抗体由来の多重特異性フォーマットが既報であり、典型的には成分結合部分から経験的に構築される。典型的には、本明細書に記載されるような多重特異性または複数標的結合フォーマットが構築されたら、その性能が上述のモデル系(細胞殺傷、細胞増殖、健常細胞温存/病変細胞特異的モデルなど)のうちの1つ以上で測定され得る。これらはまた、任意により、上記成分部分及び他の比較分子と比較される。
このアプローチによって限定されるものではないが、概して、本発明の多重特異性抗体として抗体を構築する際、各標的(第1及び第2)に対する結合ドメインモジュールは、完全長抗体へと組み合わされるFab及びFcab結合モジュールから構築される。多重特異性抗体ならびに所望のFab及びFcab結合ドメインの修飾及び生成は、当技術分野で周知の定型的な分子生物学の方法論によって行うことができる。非限定的な例として、PCR増幅の補助の有無を問わず、オリゴヌクレオチドに基づくアプローチを用いて、所望の二重特異性抗体の所望のCH3ドメイン及び/または他の要素をコードする合成DNA配列を構築することができる。任意により、これらを次に、出発抗体重鎖(本明細書に記載のものなど)をコードするオープンリーディングフレーム(ORF)に、出発CH3配列を所望の修飾CH3配列で置換するなどの制限酵素ベースのサブクローニング方法論を介して正確にクローニングすることができる。逆に、PCR増幅の補助の有無を問わず、オリゴヌクレオチドベースのアプローチを用いて、所望のVH領域(本明細書に記載のものなど)をコードするように設計されたDNA ORF要素を生成し、次にこれを、所望のCH3ドメインコード領域を既に発現している既存の重鎖ORFカセットにサブクローニングするか、または入れ替えることができる。あるいは、ORFをコードするより大きな要素、または実に抗体重鎖全体を、オリゴヌクレオチド及び/またはPCR法を用いて出発インシリコ配列からデノボ構築して、本明細書に記載されるような多重特異性抗体のVH結合アーム及び修飾されたCH3ドメインを含む好ましい完全長重鎖をコードする最終ORF全体を生成することもできる。次いで、これを、本明細書に記載のものなどの好ましい同族κ軽鎖と組み合わせて発現、回収、及び精製することで、ヒトVδ1 TCRのTRDV1ドメインに結合し、かつヒトEGFRに結合する修飾されたCH3結合ドメインに作動可能に連結された、最終的な精製された多重特異性抗体を生成することができる。
注目すべきことに、本明細書に記載されるようなγδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つ(第1)の結合ドメインを含む多重特異性抗体は、当該第1の結合ドメインが、EGFRに対する少なくとも1つの第2の結合ドメインを含む多重特異性抗体フォーマットでフォーマットされる場合に更に増強される。
多重特異性抗体の非限定的な例:
アプローチの適用可能性を概説するために、多重特異性抗体の一連の非限定的な例を構築した。これらの多重特異性抗体は、γδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つ(第1)の結合ドメイン、及びEGFRを標的とする少なくとも1つ(第2)の結合ドメインを含んでいた。
Vδ1-EGFR多重特異性抗体(LEE)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000011
この態様では、EGFR結合部位は、残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。
この態様では、残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成する。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループには、T359E.K360E.N361G.Q362Pの突然変異が存在し得る。CDループには、N384T.G385Y.Q386Gの突然変異が存在し得る。EFループには、D413S.K414Y.S415W.Q418Y.Q419Kの突然変異が存在し得る。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号562と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号391または配列番号392を含み得る。
この態様では、多重特異性抗体は、配列番号389、または配列番号414及び配列番号432を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号400、または配列番号414及び配列番号436を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表9を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号562のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。
本開示は、上記の表の各横列の配列を有する抗体を明示的に含む。例えば、本開示には、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、Fab領域が、配列番号51の配列を含むVHCDR1、配列番号53の配列を含むVHCDR2、配列番号68の配列を含むVHCDR3、配列番号79の配列を含むVLCDR1、配列番号80の配列を含むVLCDR2、及び配列番号95の配列を含むVLCDR3を含み、Fc領域が、EGFR結合部位を含み、EGFR結合部位が、残基359~362(EU番号付け)が配列番号523を構成し、残基384~386(EU番号付け)が配列番号511を構成し、残基413~419(EU番号付け)が配列番号512を構成するCH3ドメインによって提供される、多重特異性抗体が含まれる。上記の表の各横列が同様に開示される。このような抗体は、ヒトIgG1抗体である。従って、ヒトIgG1抗体は、配列番号562の配列を含むCH3ドメインを含み得る。







本開示は、上記の表の各横列の配列を有する抗体を明示的に含む。例えば、本開示には、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、Fab領域が、配列番号15の配列を含むVH領域と、配列番号40の配列を含むVL領域とを含み、Fc領域が、EGFR結合部位を含み、EGFR結合部位が、残基359~362(EU番号付け)が配列番号523を構成し、残基384~386(EU番号付け)が配列番号511を構成し、残基413~419(EU番号付け)が配列番号512を構成するCH3ドメインによって提供される、多重特異性抗体が含まれる。上記の表の各横列が同様に開示される。このような抗体は、ヒトIgG1抗体である。従って、ヒトIgG1抗体は、配列番号562の配列を含むCH3ドメインを含み得る。
Vδ1-EGFR多重特異性抗体(LEE1)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000016
この態様では、EGFR結合部位は、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。
この態様では、残基355~362(EU番号付け)が、RDELTKNQ(配列番号513)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成する。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループは野生型(突然変異が存在しない)でもよい。CDループには、N384T.G385Y.Q386Gの突然変異が存在し得る。EFループには、D413S.K414Y.S415W.Q418Y.Q419Kの突然変異が存在し得る。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号510と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号508または配列番号509を含み得る。
この態様では、多重特異性抗体は、配列番号504、または配列番号414及び配列番号506を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号505、または配列番号414及び配列番号507を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表11を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号510のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。







Vδ1-EGFR多重特異性抗体(LEE2)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000021
この態様では、EGFR結合部位は、残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。
この態様では、残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、SNGQPENNY(配列番号525)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成する。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループには、T359E.K360E.N361G.Q362Pの突然変異が存在し得る。CDループは野生型(突然変異が存在しない)でもよい。EFループには、D413S.K414Y.S415W.Q418Y.Q419Kの突然変異が存在し得る。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号522と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号520または配列番号521を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号516、または配列番号414及び配列番号518を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号517、または配列番号414及び配列番号519を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表13を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号522のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。


Vδ1-EGFR多重特異性抗体(LEE3)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000026
この態様では、EGFR結合部位は、残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~415(EU番号付け)がSYW(配列番号533)を構成するIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。
この態様では、残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWQQGNV(配列番号534)を構成するEFループを形成する。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループには、T359E.K360E.N361G.Q362Pの突然変異が存在し得る。CDループには、N384T.G385Y.Q386Gの突然変異が存在し得る。EFループには、D413S.K414Y.S415Wの突然変異が存在し得る。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号532と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号530または配列番号531を含み得る。
この態様では、多重特異性抗体は、配列番号526、または配列番号414及び配列番号528を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号527、または配列番号414及び配列番号529を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表15を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号532のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。




















Vδ1-EGFR多重特異性抗体(FS1-67)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000031
この態様では、EGFR結合部位は、残基358~362(EU番号付け)がTDDGP(配列番号560)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。
この態様では、残基355~362(EU番号付け)が、RDETDDGP(配列番号561)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成する。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループには、L358T.T359D.K360D.N361G.Q362Pの突然変異が存在し得る。CDループには、N384T.G385Y.Q386Gの突然変異が存在し得る。EFループには、D413S.K414Y.S415W.Q418Y.Q419Kの突然変異が存在し得る。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号559と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号385または配列番号386を含み得る。
この態様では、多重特異性抗体は、配列番号388、または配列番号414及び配列番号431を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号399、または配列番号414及び配列番号435を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表17を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号559のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。
一実施形態では、本発明の多重特異性抗体はADT1-4xFS1-67ではない。


















Vδ1-EGFR多重特異性抗体(FS1-65)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000036
この態様では、EGFR結合部位は、残基358~361、361.1、及び362(EU番号付け)がLDEGGP(配列番号542)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWVK(配列番号543)を構成するIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。ここで、残基361.1は、残基361と362との間の追加の残基を示す(EU番号付け)。
この態様では、残基361.1を含む残基355~362(EU番号付け)が、RDELDEGGP(配列番号544)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWVKGNV(配列番号545)を構成するEFループを形成する。ここで、残基361.1は、残基361と362との間の追加の残基を示す(EU番号付け)。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループには、T359D.K360E.N361G.361-1G.Q362Pの突然変異が存在し得る。CDループには、N384K.G385F.Q386Gの突然変異が存在し得る。EFループには、D413S.K414Y.S415W.Q418V.Q419Kの突然変異が存在し得る。ここで、残基361-1は、残基361と362との間の追加の残基を示す(EU番号付け)。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号541と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号539または配列番号540を含み得る。
この態様では、多重特異性抗体は、配列番号535、または配列番号414及び配列番号537を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号536、または配列番号414及び配列番号538を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表19を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号541のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。

Vδ1-EGFR多重特異性抗体(747)
本発明のこの態様では、Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、当該Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、当該Fc領域が、EGFR結合部位を含む、当該多重特異性抗体が提供される。Fab領域は、VH及び同族VLドメインを具体的に含む。Fc領域は、重鎖定常ドメイン(CH1-CH2-CH3)、具体的にはCH3ドメイン内の結合ドメインを含む。
Figure 2024509332000041
この態様では、EGFR結合部位は、残基358~362(EU番号付け)がTESGP(配列番号553)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がKFG(配列番号554)を構成し、残基413~421(EU番号付け)がSNLRWTKGH(配列番号555)を構成し、残基378がバリンであるIgG1 CH3ドメインによって提供され得る。
この態様では、残基355~362(EU番号付け)が、RDETESGP(配列番号556)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、SKFGPENNY(配列番号557)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SNLRWTKGHV(配列番号558)を構成するEFループを形成し、残基378がバリンである。
この態様では、IgG1 CH3ドメインは、以下の突然変異(EU番号付け)を含み得る。ABループには、L358T.T359E.K360S.N361G.Q362Pの突然変異が存在し得る。CDループには、N384K.G385F.Q386Gの突然変異が存在し得る。EFループには、D413S.K414N.S415L.Q418T.Q419K.N421Hの突然変異が存在し得る。A378Vの突然変異も存在する。
この態様では、CH3ドメインのアミノ酸配列は、配列番号552と少なくとも90%同一、または少なくとも95%同一、または100%同一であり得る。
この態様では、重鎖定常ドメインは、配列番号550または配列番号551を含み得る。
この態様では、多重特異性抗体は、配列番号546、または配列番号414及び配列番号548を含み得る。この態様では、多重特異性抗体は、配列番号547、または配列番号414及び配列番号549を含み得る。
この態様では、Fab領域は、本明細書に記載のFab領域のいずれであってもよい(例えば、表21を参照のこと)。具体的には、この態様のFab領域は、それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含み得る。この態様のFab領域は、配列番号15を含むVH及び配列番号40を含むVLを含み得る。
この態様の一実施形態では、多重特異性抗体は、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含むFab領域と、配列番号552のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含むFc領域とを含む。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体は、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の追加のリジン(K)残基(K447、EU番号付け)を含み得る。幾つかの実施形態では、本発明の多重特異性抗体において、CH3ドメイン配列のすぐC末端側の末端グリシン(G)残基(G446、EU番号付け)が除去されていてもよい。



























注目すべきことに、γδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの(第1の)結合ドメイン、及びEGFRを標的とする少なくとも1つの(第2の)結合ドメインを含む上記例の全てにおいて、対照及び構成部分と比べて機能の増強が観察された(本明細書における実施例2、及び6~10を参照のこと)。
まとめると、これらの非限定的な例は、本明細書に記載される多重特異性抗体またはその抗原結合断片の柔軟性を強調している。これらの非限定的な例は、生殖細胞系列Vδ1鎖(例えば、配列番号272のアミノ酸1~90)を標的とする抗体またはその断片が、多重特異性抗体を形成させるためのEGFR結合ドメインと組み合わされることにより更に改良され得る、多重特異性抗体アプローチの概略を示す。
一実施形態では、γδTCRのVδ1鎖(第1の標的)を標的とする多重特異性抗体結合ドメインは、(i)各々が重鎖(VH-CH1-CH2-CH3)及び同族の軽鎖パートナー(VL-CL)を含む1つもしくは2つ以上の抗体結合ドメイン、及び/または(ii)各々が重鎖可変ドメイン(VH、またはVH-CH1)及び同族の軽鎖可変ドメインパートナー(VL、またはVL-VC)を含む1つもしくは2つ以上の抗体結合ドメイン、及び/または(iii)各々がCDRを含む抗体断片を含む1つもしくは2つ以上の抗体結合ドメインを含み得る。
一実施形態では、γδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの第1の抗体由来の結合ドメインを含み、これがEGFRを標的とする少なくとも1つの第2の抗体結合ドメインに作動可能に連結されている多重特異性抗体が提供される。任意により、上記結合ドメインは、少なくとも1つ以上のVH及び同族のVL結合ドメイン、または1つ以上のVH-CH1-CH2-CH3及び同族のVL-CL結合ドメイン、または1つ以上の抗体断片の結合ドメインを含む。γδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの第1の抗体由来結合ドメインを含む上記多重特異性抗体は、EGF受容体に結合し、EU番号付けに従って以下の重鎖修飾のうちの1つ以上を含む、第2の結合ドメインに作動可能に連結されている:L358T及び/または(T359DもしくはT359E)及び/または(K360DもしくはK360E[「LEE」]もしくはK360S)及び/またはN361G及び/またはQ362P及び/または361.1G(ここで、361.1は、361と362との間の追加の残基である)及び/またはA378V及び/または(N384TもしくはN384K)及び/または(G385YもしくはG385F)及び/またはQ386G及び/またはD413S及び/または(K414YもしくはK414N)及び/または(S415WもしくはS415L)及び/または(Q418YもしくはQ418TもしくはQ418V)及び/またはQ419K及び/またはN421H。
このような重鎖修飾は有利であることが分かっている。例えば、EGFRに結合する第2の結合ドメインに作動可能に連結されたγδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの第1の抗体由来結合ドメインを含み、野生型L358ならびにT359E及びK360E重鎖修飾を含む多重特異性抗体は、多数の利点を有する。第一に、このような重鎖修飾は、未修飾の重鎖配列に存在する二重異性化のリスクをなくす。異性化モチーフは、抗体の親和性、効力、安定性、及び均一性を低減させる可能性のある欠点であり、製品開発または製造における問題を引き起こす可能性がある。さらに、T358Lの変化は、ADT1-4-2xFS1-67などの分子のABループ内のトレオニンをロイシンに戻す。ロイシンはその位置で標準的な野生型ヒト配列に対応し、より保存されたAB修飾ループ配列をもたらす。追加の驚くべき所見は、EGF受容体に結合する第2の結合ドメインに作動可能に連結されたγδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの第1の抗体由来結合ドメインを含み、かつL358ならびにT359E及びK360E重鎖修飾を含む多重特異性抗体が、T358ならびにD359及びD360を含むことを除いては同一である関連性の高い抗体と比べて一過性のCHO細胞における発現の改善をもたらすということである。この改善された発現プロファイルは、L358ならびにE359及びE360(配列番号389に組み込まれたものなど)を有する重鎖CH3ドメインを含む本発明のCH3修飾多重特異性抗体のCHO細胞からの採集時力価が、配列番号388に組み込まれたものなどのT358、D359及びD360重鎖修飾を含むことを除いては同一の抗体と比較して大幅に増加し得ることを意味する。異性化リスクをなくすことで発現が改善するとは予想されないため、これは驚くべきことである。図34Aを参照されたい。いずれの実施形態においても、本発明の多重特異性抗体は、359位、360位、及び361位(EU番号付け)にわたる追加のDD及びDGの高リスク異性化デュアルアミノ酸モチーフを含まなくてもよい。むしろ、より具体的には、任意の実施形態において、本発明の多重特異性抗体は、T359E、K360E、N361Gの修飾を含む修飾されたABループを含み得る。より具体的には、任意の実施形態において、本発明の多重特異性抗体は、359位及び360位に二重負電荷を含むCH3修飾ABループを含むことができ、この二重負電荷はアスパラギン酸(D、Asp)の代わりにグルタミン酸(E、Glu)によって提供される。
γδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの第1の抗体由来結合ドメインを含む多重特異性抗体は、配列番号385もしくは配列番号386もしくは配列番号391もしくは配列番号392もしくは配列番号520もしくは配列番号521もしくは配列番号530もしくは配列番号531、もしくは配列番号539もしくは配列番号540、もしくは配列番号508もしくは配列番号509、もしくは配列番号550もしくは配列番号551、またはそれらの機能的に同等な結合性バリアントを含み、かつEGFRを標的とする、第2の結合ドメインに作動可能に連結されている。任意により、多重特異性抗体は、配列番号389;または配列番号414及び配列番号432;または配列番号400;または配列番号414及び配列番号436;または配列番号516;または配列番号414及び配列番号518;または配列番号517;または配列番号414及び配列番号519;配列番号526;または配列番号414及び配列番号528;または配列番号527;または配列番号414及び配列番号529;または配列番号535;または配列番号414及び配列番号537;または配列番号536;または配列番号414及び配列番号538;または配列番号504;または配列番号414及び配列番号506;または配列番号505;または配列番号414及び配列番号507;または配列番号388;または配列番号414及び配列番号431;または配列番号399;または配列番号414及び配列番号435;または配列番号546;または配列番号414及び配列番号548;または配列番号547;または配列番号414及び配列番号549;または配列番号378;または配列番号425及び配列番号426;または配列番号379;または配列番号421及び配列番号437;または配列番号380;または配列番号423及び配列番号427を含む。
本発明の一態様では、本発明の多重特異性抗体は、疾患または障害を処置するために、例えば、疾患または障害の少なくとも1つの徴候または症状を改善するために、治療上有効量で使用され得る。
一実施形態では、本明細書に記載されるようなγδTCRのVδ1鎖に結合する多重特異性抗体フォーマットの抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法が提供され、ここで、当該多重特異性抗体は、当該多重特異性実体によりVδ1+細胞にもたらされる(例えば、当該Vδ1+表現型及び/または細胞傷害性及び/または病変細胞特異性及び/またはそれらの増強に対する)効果を測定するために、Vδ1+細胞に適用される。
併用療法
本発明の多重特異性抗体は、ある特定の併用療法に使用され得る。幾つかの実施形態では、多重特異性抗体は、例えば、AFP、AKAP-4、ALK、αフェトプロテイン、アンドロゲン受容体、B7H3、BAGE、BCA225、BCAA、Bcr-abl、β-カテニン、β-HCG、β-ヒト絨毛性ゴナドトロピン、BORIS、BTAA、CA 125、CA 15-3、CA 195、CA 19-9、CA 242、CA 27.29、CA 72-4、CA-50、CAM 17.1、CAM43、カルボニックアンヒドラーゼIX、癌胎児性抗原、CD22、CD33/IL3Ra、CD68\P1、CDK4、CEA、コンドロイチン硫酸プロテオグリカン4(CSPG4)、c-Met、CO-029、CSPG4、サイクリンB1、シクロフィリンC関連タンパク質、CYP1B1、E2A-PRL、EGFR、EGFRvIII、ELF2M、EpCAM、EphA2、エフリンB2、エプスタイン・バーウイルス抗原EBVA、ERG(TMPRSS2ETS融合遺伝子)、ETV6-AML、FAP、FGF-5、Fos関連抗原1、フコシルGM1、G250、Ga733\EpCAM、GAGE-1、GAGE-2、GD2、GD3、神経膠腫関連抗原、GloboH、糖脂質F77、GM3、GP 100、GP 100(Pmel 17)、H4-RET、HER-2/neu、HER-2/Neu/ErbB-2、高分子量黒色腫関連抗原(HMW-MAA)、HPV E6、HPV E7、hTERT、HTgp-175、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、イディオタイプ、IGF-I受容体、IGF-II、IGH-IGK、インスリン成長因子(IGF)-I、腸カルボキシルエステラーゼ、K-ras、LAGE-1a、LCK、レクチン反応性AFP、レグマイン、LMP2、M344、MA-50、Mac-2結合タンパク質、MAD-CT-1、MAD-CT-2、MAGE、MAGE A1、MAGE A3、MAGE-1、MAGE-3、MAGE-4、MAGE-5、MAGE-6、MART-1、MART-1/MelanA、M-CSF、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)、メソテリン、MG7-Ag、ML-IAP、MN-CA IX、MOV18、MUC1、Mum-1、hsp70-2、MYCN、MYL-RAR、NA17、NB/70K、神経/グリア抗原2(NG2)、好中球エラスターゼ、nm-23H1、NuMa、NY-BR-1、NY-CO-1、NY-ESO、NY-ESO-1、NY-ESO-1、OY-TES1、p15、p16、p180erbB3、p185erbB2、p53、p53変異体、Page4、PAX3、PAX5、PDGFR-β、PLAC1、ポリシアル酸、前立腺癌腫瘍抗原-1(PCTA-1)、前立腺特異抗原、前立腺酸性ホスファターゼ(PAP)、プロテイナーゼ3(PR1)、PSA、PSCA、PSMA、RAGE-1、Ras、Ras変異体、RCAS1、RGS5、RhoC、ROR1、RU1、RU2(AS)、SART3、SDCCAG16、sLe(a)、精子タンパク質17、SSX2、STn、サバイビン、TA-90、TAAL6、TAG-72、テロメラーゼ、チログロブリン、Tie 2、TLP、Tn、TPS、TRP-1、TRP-2、TRP-2、TSP-180、チロシナーゼ、VEGF、VEGFR2、VISTA、WT1、XAGE 1、43-9F、5T4、及び791Tgp72からなる群から選択される、がん抗原またはがん関連抗原のモジュレーターと組み合わされ得る。
幾つかの実施形態では、多重特異性抗体は、例えば、B7-1(CD80)、B7-2(CD86)、B7-DC(CD273)、B7-H1(CD274)、B7-H2(CD275)、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、B7-H5(VISTA)、BTLA(CD272)、CD137、CD137L、CD24、CD27、CD28、CD38、CD40、CD40L(CD154)、CD54、CD59、CD70、CTLA4(CD152)、CXCL9、GITR(CD357)、HVEM(CD270)、ICAM-1(CD54)、ICOS(CD278)、LAG-3(CD223)、OX40(CD134)、OX40L(CD252)、PD-1(CD279)、PD-L1(CD274)、TIGIT、CD314、CD334、CD335、CD337、及びTIM-3(CD366)からなる群から選択される免疫調節性抗原のモジュレーターと組み合わされ得る。
幾つかの実施形態では、多重特異性抗体は、例えば、CD1a、CD1b、CD1c、CD1d、CD1e、CD2、CD3、CD3d、CD3e、CD3g、CD4、CD5、CD6、CD7、CD8、CD8a、CD8b、CD9、CD10、CD11a、CD11b、CD11c、CD11d、CD13、CD14、CD15、CD16、CD16a、CD16b、CD17、CD18、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD25、CD26、CD27、CD28、CD29、CD30、CD31、CD32A、CD32B、CD33、CD34、CD35、CD36、CD37、CD38、CD39、CD40、CD41、CD42、CD42a、CD42b、CD42c、CD42d、CD43、CD44、CD45、CD46、CD47、CD48、CD49a、CD49b、CD49c、CD49d、CD49e、CD49f、CD50、CD51、CD52、CD53、CD54、CD55、CD56、CD57、CD58、CD59、CD60a、CD60b、CD60c、CD61、CD62E、CD62L、CD62P、CD63、CD64a、CD65、CD65s、CD66a、CD66b、CD66c、CD66d、CD66e、CD66f、CD68、CD69、CD70、CD71、CD72、CD73、CD74、CD75、CD75s、CD77、CD79A、CD79B、CD80、CD81、CD82、CD83、CD84、CD85A、CD85B、CD85C、CD85D、CD85F、CD85G、CD85H、CD85I、CD85J、CD85K、CD85M、CD86、CD87、CD88、CD89、CD90、CD91、CD92、CD93、CD94、CD95、CD96、CD97、CD98、CD99、CD100、CD101、CD102、CD103、CD104、CD105、CD106、CD107、CD107a、CD107b、CD108、CD109、CD110、CD111、CD112、CD113、CD114、CD115、CD116、CD117、CD118、CD119、CD120、CD120a、CD120b、CD121a、CD121b、CD122、CD123、CD124、CD125、CD126、CD127、CD129、CD130、CD131、CD132、CD133、CD134、CD135、CD136、CD137、CD138、CD139、CD140A、CD140B、CD141、CD142、CD143、CD144、CDw145、CD146、CD147、CD148、CD150、CD151、CD152、CD153、CD154、CD155、CD156、CD156a、CD156b、CD156c、CD157、CD158、CD158A、CD158B1、CD158B2、CD158C、CD158D、CD158E1、CD158E2、CD158F1、CD158F2、CD158G、CD158H、CD158I、CD158J、CD158K、CD159a、CD159c、CD160、CD161、CD162、CD163、CD164、CD165、CD166、CD167a、CD167b、CD168、CD169、CD170、CD171、CD172a、CD172b、CD172g、CD173、CD174、CD175、CD175s、CD176、CD177、CD178、CD179a、CD179b、CD180、CD181、CD182、CD183、CD184、CD185、CD186、CD187、CD188、CD189、CD190、CD191、CD192、CD193、CD194、CD195、CD196、CD197、CDw198、CDw199、CD200、CD201、CD202b、CD203c、CD204、CD205、CD206、CD207、CD208、CD209、CD210、CDw210a、CDw210b、CD211、CD212、CD213a1、CD213a2、CD214、CD215、CD216、CD217、CD218a、CD218b、CD219、CD220、CD221、CD222、CD223、CD224、CD225、CD226、CD227、CD228、CD229、CD230、CD231、CD232、CD233、CD234、CD235a、CD235b、CD236、CD237、CD238、CD239、CD240CE、CD240D、CD241、CD242、CD243、CD244、CD245、CD246、CD247、CD248、CD249、CD250、CD251、CD252、CD253、CD254、CD255、CD256、CD257、CD258、CD259、CD260、CD261、CD262、CD263、CD264、CD265、CD266、CD267、CD268、CD269、CD270、CD271、CD272、CD273、CD274、CD275、CD276、CD277、CD278、CD279、CD280、CD281、CD282、CD283、CD284、CD285、CD286、CD287、CD288、CD289、CD290、CD291、CD292、CDw293、CD294、CD295、CD296、CD297、CD298、CD299、CD300A、CD300C、CD301、CD302、CD303、CD304、CD305、CD306、CD307、CD307a、CD307b、CD307c、CD307d、CD307e、CD308、CD309、CD310、CD311、CD312、CD313、CD314、CD315、CD316、CD317、CD318、CD319、CD320、CD321、CD322、CD323、CD324、CD325、CD326、CD327、CD328、CD329、CD330、CD331、CD332、CD333、CD334、CD335、CD336、CD337、CD338、CD339、CD340、CD344、CD349、CD351、CD352、CD353、CD354、CD355、CD357、CD358、CD360、CD361、CD362、CD363、CD364、CD365、CD366、CD367、CD368、CD369、CD370、及びCD371からなる群から選択されるCD抗原のモジュレーターと組み合わされ得る。
幾つかの実施形態では、モジュレーターは拮抗性または作動性であり得る。好適なモジュレーターとしては、抗体、融合タンパク質、または低分子が挙げられる。
イムノコンジュゲート
本発明の多重特異性抗体は、細胞毒素または化学療法剤などの治療用部分にコンジュゲートされ得る。かかるコンジュゲートは、イムノコンジュゲートと称され得る。本明細書で使用する場合、用語「イムノコンジュゲート」は、細胞毒素、放射性薬剤、サイトカイン、インターフェロン、標的部分もしくはレポーター部分、酵素、毒素、ペプチドもしくはタンパク質、または治療薬などの別の部分に化学的または生物学的に連結されている抗体を指す。抗体は、その標的と結合することができる限り、分子に沿った任意の位置で、細胞毒素、放射性薬剤、サイトカイン、インターフェロン、標的部分もしくはレポーター部分、酵素、毒素、ペプチド、または治療薬に連結されていてよい。イムノコンジュゲートの例としては、抗体-薬物コンジュゲート及び抗体-毒素融合タンパク質が挙げられる。一実施形態では、薬剤は、Vδ1に対する第2の異なる抗体であり得る。ある特定の実施形態では、抗体は、腫瘍細胞またはウイルス感染細胞に特異的な薬剤にコンジュゲートされ得る。抗Vδ1抗体にコンジュゲートされ得る治療用部分の種類は、処置されるべき状態及び達成されるべき所望の治療効果を考慮したものになる。一実施形態では、薬剤は、Vδ1以外の分子に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片であり得る。
カニクイザル交差反応性
好適には、多重特異性抗体は、ヒトTRDV1(配列番号272)(多型バリアント、すなわち配列番号306が含まれる)及びカニクイザルTRDV1(配列番号308)の両方に対する交差反応性を示す。交差反応性は、前臨床評価におけるインビボ動物試験に使用され得る抗体を提供するのに明らかに有用である。
驚くべきことに、本発明の発明者らは、抗体、例えば、抗Vδ1xEGFR抗体及びその抗原結合断片のカニクイザル抗原への結合の増加を付与し得るフレームワーク変異を同定した。このフレームワーク変異は、抗体またはその抗原結合断片の対応するヒト型抗原に対する親和性に悪影響を及ぼさない。この変異は、κ軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムに従って74位のセリン残基のセリンではない残基(例えば、非ヒト生殖細胞系列型及び/または非極性残基)への変異である。非極性アミノ酸は、グリシン、アラニン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択され得る。非生殖細胞系列型アミノ酸は、アルギニン、システイン、グルタミン、グルタミン酸、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、トレオニン、トリプトファン、チロシン、及びバリンからなる群から選択され得る。非極性かつ非生殖細胞系列型アミノ酸(すなわち、非極性であり、非生殖細胞系列型であるアミノ酸)は、グリシン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択され得る。幾つかの実施形態では、変異は、κ軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムに従って74位のセリン残基のロイシン残基への変異である。変異は、鎖の全長が変化しないような直接的置換である。従って、IMGT番号付けシステムに従って74位のセリンが除去され、別のアミノ酸と直接置き換えられる(例えば、非ヒト生殖細胞系列型及び/または非極性アミノ酸、例えば、ロイシン)。置換は、当業者に公知の任意の好適な方法により達成され得る。
本明細書における、IMGT番号付けに従って74位にセリンではない残基を含むκ軽鎖可変配列を含む抗体への言及は、LFR1領域、LCDR1領域、LFR2領域、LCDR2領域、LFR3領域、LCDR3領域、及びLFR4領域を含む軽鎖可変配列を含む抗体であって、当該LFR3領域がIMGT番号付けに従って74位にセリンではない残基(例えば、非極性及び/または非ヒト生殖細胞系列型残基、例えば、ロイシン残基)を含む、当該抗体と代替的に定義され得る。このような代替的定義は、IMGT番号付けに従って74位にセリンではない残基(例えば、非ヒト生殖細胞系列型及び/または非極性残基、例えば、ロイシン残基)を含むκ軽鎖可変配列を含む、本明細書において開示される全ての抗体に適用される。
従って、本発明は、軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムに従って74位の残基がセリン以外(例えば、非極性及び/または非ヒト生殖細胞系列型残基、例えば、ロイシン残基)であるκ軽鎖可変配列を含む抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)xEGFR多重特異性抗体またはその抗原結合断片を提供する。幾つかの実施形態では、軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムに従って74位の残基は、ロイシンである。好適には、抗体はIgG抗体であり得る。例えば、抗体はIgG1抗体であり得る。
本明細書において提供される抗Vδ1xEGFR多重特異性抗体及びその抗原結合断片は、軽鎖可変配列の(IMGT番号付けシステムに従って)74位での置換により提供され得る。例えば、本明細書に記載される抗Vδ1xEGFR多重特異性抗体ならびにその抗原結合断片及びバリアントは、IMGT番号付けシステムに従って74位にセリン以外の残基(例えば、非極性及び/または非ヒト生殖細胞系列型残基、例えば、ロイシン残基)を含むκ軽鎖可変配列を含み得る。幾つかの実施形態では、本明細書に記載される抗Vδ1xEGFR多重特異性抗体ならびにその抗原結合断片及びバリアントは、IMGT番号付けシステムに従って74位にロイシン残基を含むκ軽鎖可変配列を含み得る。κ軽鎖のIMGT番号付けシステムに従って74位での変異を含む実施形態は、ADT1-4に由来する抗体に特に関連し得るが、変異は他の抗体に同様に適用可能である。例えば、異なるκ/λ軽鎖生殖細胞系列全体で軽鎖74位が高度に保存されていないことが観察される。更に、異なる軽鎖生殖細胞系列が、非極性(例えば、アラニン)から極性中性(例えば、セリン)、負または正荷電(例えば、それぞれアスパラギン酸またはアスパラギン)までの範囲の極性及び/または電荷が異なるアミノ酸をこの位置で含有することに留意されたい。任意の所与の位置でのアミノ酸の極性/電荷がタンパク質構造に影響を及ぼし得ることは十分に理解されている。例えば、極性及び電荷の変化が、疎水性及びアミノ酸がより表面に露出されるか、またはより埋め込まれる傾向に影響を及ぼし得ることは十分に理解されている。それにもかかわらず、この注目すべき発見は、軽鎖74位での非保存的アミノ酸変化が、選択された標的に対する親和性を10倍超に改変し得ることを強調する。従って、本明細書において概説される親和性の改善とは別に、この知識を利用することにより、親和性をより広範囲に増強または抑制する新規なアプローチが提供され得る。例えば、74位の残基をより極性の残基から非極性残基に、または例えば、非極性残基からより荷電した残基に変化させることを含む方法は、任意の所与の抗体について親和性を増強または抑制することを所望する場合、複雑な/扱いにくい突然変異誘発法、例えば、飽和突然変異誘発などより好ましい場合がある。
本発明の別の実施形態では、抗体またはその抗原結合断片を変異させる方法であって、IMGT番号付けシステムに従って軽鎖可変配列の74位にセリンを有するκ軽鎖を含む抗体を提供すること、ならびに当該セリンを異なる残基、例えば、非ヒト生殖細胞系列型及び/または非極性アミノ酸、例えば、ロイシンに変異させることを含む、当該方法も提供される。幾つかの実施形態では、抗体は、抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)抗体またはその抗原結合断片である。幾つかの実施形態では、抗体は、軽鎖可変配列の74位に変異が導入される前後の両方で、配列番号1と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号26と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVLを有する抗体である。幾つかの実施形態では、抗体は、74位の変異を除いては配列1と100%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、74位の変異を除いては配列番号26と100%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを有する抗体である。
幾つかの実施形態では、抗体は、軽鎖可変配列の74位に変異が導入される前後の両方で、配列番号106と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号118と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVLを有する抗体である。幾つかの実施形態では、抗体は、74位の変異を除いては配列106と100%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、74位の変異を除いては配列番号118と100%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを有する抗体である。
幾つかの実施形態では、抗体は、以下を含む抗体である:
変異が導入される前後の両方で、配列番号273のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号282のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号274のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号283のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号275のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号284のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号276のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号285のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号277のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号286のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号278のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号287のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号279のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号288のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号280のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号289のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;
変異が導入される前後の両方で、配列番号281のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号290のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL;または
変異が導入される前後の両方で、配列番号312のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号313のアミノ酸配列と少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%同一なアミノ酸配列を含むVL。
幾つかの実施形態では、抗体は、以下を含む抗体である:
配列番号273のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号282のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号274のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号283のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号275のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号284のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号276のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号285のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号277のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号286のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号278のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号287のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号279のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号288のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号280のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号289のアミノ酸配列を含むVL;
配列番号281のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号290のアミノ酸配列を含むVL;または
配列番号312のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号313のアミノ酸配列を含むVL。
かかる方法により作製される抗体は、74位での変異を除いて、指定されるVH及びVL配列に対する100%の同一性を有する。
幾つかの実施形態では、74位での変異は、抗体またはその抗原結合断片の相同なカニクイザル(cyno monkey)抗原に対する親和性を増加させる。抗体またはその抗原結合断片の親和性の増加は、(同じまたは実質的に同じ条件下で測定される場合の)変異が導入される前の抗体またはその抗原結合断片の親和性と比較した増加である。幾つかの実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、変異が導入される前後で、γδT細胞受容体(TCR)のヒト可変δ1(Vδ1)鎖(例えば、配列番号272及び306)に結合する抗TCRδ可変部1(抗Vδ1)抗体またはその抗原結合断片であり、当該抗体は、変異が導入された後で、γδT細胞受容体(TCR)のカニクイザル可変δ1(Vδ1)鎖(例えば、配列番号308)に対する増加した親和性を有する。
ポリヌクレオチド配列及び発現ベクター
本発明の一態様では、本発明の多重特異性抗体をコードするポリヌクレオチドが提供される。一実施形態では、ポリヌクレオチドは、配列番号199~222、224~247、249~259、または261~271のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含むか、またはそれからなる。更なる実施形態では、ポリヌクレオチドは、配列番号199~222、224~247、249~259、または261~271のいずれかを含むか、またはそれからなる。更なる態様では、上記ポリヌクレオチドを含むcDNAが提供される。
本発明の一態様では、コードされる免疫グロブリン鎖可変ドメインのCDR1、CDR2、及び/またはCDR3をコードする、配列番号199~222、224~247、249~259、または261~271の一部のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む、またはそれからなるポリヌクレオチドが提供される。
本発明の一態様では、コードされる免疫グロブリン鎖可変ドメインのFR1、FR2、FR3、及び/またはFR4をコードする、配列番号199~222、224~247、249~259、または261~271の一部のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性を有する配列を含む、またはそれからなるポリヌクレオチドが提供される。
本発明は、本発明のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター及びプラスミドも提供する。幾つかの実施形態では、発現ベクターは、配列番号199~222または249~259(重鎖可変領域をコードする)のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性、または100%の同一性を有する配列を含む。幾つかの実施形態では、発現ベクターは、配列番号224~247または261~271(軽鎖可変領域をコードする)のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性、または100%の同一性を有する配列を含む。かかる発現ベクターは、本明細書に開示される本発明の多重特異性抗体を提供する様々なアミノ酸配列の組合せに従って、重鎖可変配列及び軽鎖可変配列を適切に組み合わせた対で使用され得る。幾つかの実施形態では、発現ベクターは、配列番号199~222または249~259(重鎖可変領域をコードする)のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性、または100%の同一性を有する配列を含み、配列番号224~247または261~271(軽鎖可変領域をコードする)のいずれかと少なくとも70%、例えば、少なくとも80%、例えば、少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、例えば、少なくとも99%の配列同一性、または100%の同一性を有する配列を更に含む。ここでも、配列は、本発明の多重特異性抗体をコードするために本明細書に記載されるように特定の対で提供され得る。
本発明は、任意により1つ以上のアミノ酸置換を含む本明細書に開示される任意のバリアント抗体配列が含まれる、本明細書に開示される全ての抗体配列をコードするポリヌクレオチド配列及び発現ベクター及びプラスミドも提供する。
本発明のポリヌクレオチド及び発現ベクターは、コードされるアミノ酸配列を参照して記載されてもよい。従って、一実施形態では、ポリヌクレオチドは、配列番号1~197のいずれか1つのアミノ酸配列をコードする配列を含むか、またはそれからなる。
多重特異性抗体またはその抗原結合断片を発現させるために、本明細書に記載される軽鎖及び重鎖の一部または全長をコードするポリヌクレオチドは、遺伝子が転写制御配列及び翻訳制御配列に作動可能に連結されるように発現ベクターに挿入される。従って、本発明の一態様では、本明細書で定義されるポリヌクレオチド配列を含む発現ベクターが提供される。一実施形態では、発現ベクターは、配列番号199~222または249~259のいずれかのVH領域を含む。別の実施形態では、発現ベクターは、配列番号224~247または261~271のいずれかのVL領域を含む。
本明細書に記載されるヌクレオチド配列は、翻訳、精製、及び検出を補助するためのアミノ酸残基をコードする追加の配列を含み得るが、使用される発現系に応じて代替的な配列が使用され得ることが理解されよう。これらの任意の配列は、代替的な設計、翻訳、精製、または検出戦略が採用される場合、除去、改変、または置換され得る。
ポリペプチドのアミノ酸配列に関して無変化であるが、特定の宿主における翻訳に好ましいコドンを提供するポリペプチドをコードするDNAまたはcDNAとなるように、変異がなされ得る。例えば、E.coli及びS.cerevisiaeならびに哺乳動物、特にヒトにおける核酸の翻訳に好ましいコドンが公知である。
ポリペプチドの変異は、例えば、ポリペプチドをコードする核酸に対する置換、付加、または欠失により達成され得る。ポリペプチドをコードする核酸に対する置換、付加、または欠失は、例えば、エラープローンPCR、シャッフリング、オリゴヌクレオチド指定突然変異誘発、アセンブリPCR、PCR突然変異誘発、インビボ突然変異誘発、カセット突然変異誘発、再帰アンサンブル突然変異誘発、指数アンサンブル突然変異誘発、部位特異的突然変異誘発、遺伝子再構築、人工遺伝子合成、遺伝子部位飽和突然変異誘発(GSSM)、合成ライゲーション再構築(SLR)、またはそれらの方法の組み合わせが含まれる、多数の方法により導入され得る。核酸に対する改変、付加、または欠失は、組換え、再帰的配列組換え、ホスホロチオエート修飾DNA突然変異誘発、ウラシル含有テンプレート突然変異誘発、ギャップ二重鎖突然変異誘発、ポイントミスマッチ修復突然変異誘発、修復欠損宿主株突然変異誘発、化学的突然変異誘発、放射性突然変異誘発、欠失突然変異誘発、制限選択突然変異誘発、制限精製突然変異誘発、アンサンブル突然変異誘発、キメラ核酸多量体作製、またはそれらの組み合わせを含む方法によっても導入され得る。
特に、人工遺伝子合成が使用され得る。本発明のポリペプチドをコードする遺伝子は、例えば、固相DNA合成により人工的に生成され得る。前駆体テンプレートDNAを必要とせずに、遺伝子全体が新たに合成され得る。所望のオリゴヌクレオチドを得るために、構成単位が、生成物の配列により必要とされる順序で、伸長しているオリゴヌクレオチド鎖に逐次的に結合される。鎖の構築が完了すると、生成物が固相から溶液中に放出され、脱保護され、収集される。目的のオリゴヌクレオチドを高純度で得るために、生成物は、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)により単離され得る。
発現ベクターとしては、例えば、プラスミド、レトロウイルス、コスミド、酵母人工染色体(YAC)、及びエプスタイン・バーウイルス(EBV)由来のエピソームが挙げられる。ポリヌクレオチドは、ベクター内の転写制御配列及び翻訳制御配列がポリヌクレオチドの転写及び翻訳を制御する意図された機能を果たすように、ベクターにライゲーションされる。発現及び/または制御配列としては、プロモーター、エンハンサー、転写ターミネーター、コード配列の5’側の開始コドン(すなわちATG)、イントロンのスプライシングシグナル、及び終止コドンが挙げられ得る。発現ベクター及び発現制御配列は、使用される発現宿主細胞と適合するように選択される。例えば、配列は、合成リンカー(例えば、配列番号291をコードする)により連結されたVH領域及びVL領域を含む、本発明の抗体の一本鎖可変断片バージョンをコードするヌクレオチド配列を含み得る。本発明のポリヌクレオチドまたは発現ベクターは、VH領域、VL領域、またはその両方(任意によりリンカーを含む)を含み得ることが理解されよう。従って、VH領域及びVL領域をコードするポリヌクレオチドが別々のベクターに挿入され得、あるいは両方の領域をコードする配列が同じ発現ベクターに挿入される。ポリヌクレオチド(複数可)は、標準的方法(例えば、ポリヌクレオチド及びベクターの相補的制限部位のライゲーション、または制限部位が存在しない場合は平滑末端ライゲーション)により発現ベクターに挿入される。
便利なベクターは、機能的に完全なヒトCHまたはCL免疫グロブリン配列をコードするものであり、本明細書に記載されるように、任意のVH配列またはVL配列が容易に挿入され得、発現され得るように工学操作された適切な制限部位を有する。発現ベクターは、宿主細胞からの抗体(またはその抗原結合断片)の分泌を促進するシグナルペプチドもコードし得る。ポリヌクレオチドは、シグナルペプチドが抗体のアミノ末端にインフレームで連結されるようにベクターにクローンニングされ得る。シグナルペプチドは、免疫グロブリンシグナルペプチドまたは異種シグナルペプチド(すなわち、非免疫グロブリンタンパク質由来のシグナルペプチド)であり得る。
本発明の一態様では、本明細書で定義されるポリヌクレオチドまたは発現ベクターを含む細胞(例えば、組換え宿主細胞などの宿主細胞)が提供される。細胞は、抗体またはその抗原結合断片の軽鎖をコードする第1のベクター、及び抗体またはその抗原結合断片の重鎖をコードする第2のベクターを含み得ることが理解されよう。あるいは、重鎖及び軽鎖の両方が、細胞に導入される同じ発現ベクターにコードされる。
一実施形態では、ポリヌクレオチドまたは発現ベクターは、抗体またはその抗原結合断片に融合された膜アンカーまたは膜貫通ドメインをコードし、ここで、当該抗体またはその抗原結合断片は細胞の細胞外表面に提示される。
形質転換は、ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための任意の公知の方法によるものであり得る。異種ポリヌクレオチドを哺乳動物細胞に導入する方法は当該技術分野において周知であり、デキストラン媒介性形質移入、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレン媒介性形質移入、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、リポソームへのポリヌクレオチド(複数可)のカプセル化、遺伝子銃による注入、及び核へのDNAの直接的マイクロインジェクションが挙げられる。更に、核酸分子は、ウイルスベクターによって哺乳動物細胞に導入され得る。
発現のための宿主として利用可能な哺乳動物細胞株は、当該技術分野において周知であり、American Type Culture Collection(ATCC)から入手可能な多数の不死化細胞株が挙げられる。これらとしては、とりわけ、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、NSO、SP2細胞、HeLa細胞、ベビーハムスター腎臓(BHK)細胞、サル腎臓細胞(COS)、ヒト肝細胞癌細胞(例えば、Hep G2)、A549細胞、3T3細胞、及び多数の他の細胞株が挙げられる。哺乳動物宿主細胞としては、ヒト、マウス、ラット、イヌ、サル、ブタ、ヤギ、ウシ、ウマ、及びハムスターの細胞が挙げられる。どの細胞株が高い発現レベルを有するかを決定することによって、特に好ましい細胞株が選択される。使用され得る他の細胞株は、Sf9細胞などの昆虫細胞株、両生類細胞、細菌細胞、植物細胞、及び真菌細胞である。scFv及びFv断片などの抗体の抗原結合断片は、当該技術分野において公知の方法を使用してE.coliで単離及び発現され得る。
抗体は、宿主細胞における抗体の発現、より好ましくは、宿主細胞が増殖する培養培地への抗体の分泌を可能にするのに十分な期間、宿主細胞を培養することにより産生される。抗体は、標準的なタンパク質精製法を使用して培養培地から回収され得る。
本発明の抗体(または断片)は、例えば、Green and Sambrook,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(2012) 4th Edition Cold Spring Harbour Laboratory Pressに開示されている技術を使用して取得及び操作され得る。
モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術を使用して、特定の抗体産生B細胞を、組織培養で増殖する能力及び抗体鎖合成の欠如のために選択される骨髄腫(B細胞癌)細胞と融合させることによって産生され得る。
決定された抗原対して指向されたモノクローナル抗体は、例えば、
a)ハイブリドーマを形成させるために、決定された抗原で、不死化細胞で、及び好ましくは、骨髄腫細胞で事前に免疫された動物の末梢血から得られたリンパ球を不死化すること、
b)形成された不死化細胞(ハイブリドーマ)を培養し、所望の特異性を有する抗体を産生する細胞を回収することにより取得され得る。
あるいは、ハイブリドーマ細胞を使用する必要はない。本明細書に記載される標的抗原に結合することができる抗体は、例えば、当該技術分野において公知のファージディスプレイ、酵母ディスプレイ、リボソームディスプレイ、または哺乳動物ディスプレイ技術を使用する定型的な実務によって、好適な抗体ライブラリから単離され得る。従って、モノクローナル抗体は、例えば、以下のステップを含むプロセスにより取得され得る:
a)ベクターに、特にファージ及びより具体的には糸状バクテリオファージに、リンパ球、特に動物(好適には決定された抗原で以前に免疫されている)の末梢血リンパ球から取得されたDNAまたはcDNA配列をクローン化するステップ、
b)抗体の産生を可能にする条件で、上記のベクターで原核細胞を形質転換するステップ、
c)抗体を抗原親和性選択に供することより抗体を選択するステップ、
d)所望の特異性を有する抗体を回収するステップ。
任意により、本明細書に記載され、かつγδのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする単離されたポリヌクレオチドも、疾患の徴候または症状を改善するための薬剤として用いられるのに十分な量を作製するように容易に製造され得る。このように薬剤として用いられる場合、通常、目的のポリヌクレオチドはまず、対象または患者において上記抗体またはその抗原結合断片を発現するように設計された発現ベクターまたは発現カセットに作動可能に連結される。かかる発現カセット及びポリヌクレオチドの送達方法または「核酸ベース」薬剤と称される場合があるものは、当該技術分野において周知である。最近の概説については、Hollevoet and Declerck(2017) J.Transl.Med. 15(1):131を参照のこと。
抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントの産生のための方法であって、細胞内でプラスミドまたはベクターのコード核酸配列を発現させるための条件下で細胞培養培地中の本発明の宿主細胞を培養することを含む、当該方法も提供される。本方法は、細胞培養上清から抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントを取得することを更に含み得る。次いで、取得された抗体は、医薬組成物へと製剤化され得る。更に、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントを発現する細胞を作製する方法であって、本発明のプラスミドまたはベクターを上記細胞に形質移入することを含む、当該方法が提供される。次いで、上記細胞は、抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片もしくはバリアントの産生のために培養され得る。
医薬組成物
本発明の更なる態様によれば、本明細書で定義される多重特異性抗体を含む組成物が提供される。かかる実施形態では、組成物は、他の賦形剤と任意に組み合わされた抗体を含み得る。1種以上の追加の活性薬剤(例えば、本明細書において言及される疾患を処置するのに好適な活性薬剤)を含む組成物も含まれる。
本発明の更に別の態様では、本明細書で定義される抗体またはその抗原結合断片を、薬学的に許容される希釈剤または担体と共に含む医薬組成物が提供される。本発明の多重特異性抗体は、対象に投与するのに好適な医薬組成物に組み込むことができる。典型的に、医薬組成物は、本発明の抗体と、薬学的に許容される担体とを含む。本明細書で使用する場合、「薬学的に許容される担体」としては、生理的に適合可能なあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤及び抗真菌薬剤、等張剤、ならびに吸収遅延剤などが挙げられる。薬学的に許容される担体の例としては、水、生理食塩水、塩、リン酸緩衝食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノールなどのうちの1つ以上、及びそれらの組み合わせが挙げられる。多くの場合、等張剤、例えば、糖類、マンニトール、ソルビトールなどの多価アルコール、または塩化ナトリウムを組成物に含めることが好ましい。抗体またはその抗原結合断片の貯蔵寿命または有効性を増強する、薬学的に許容される物質、例えば、湿潤剤または少量の補助剤、例えば、湿潤剤もしくは乳化剤、防腐剤、または緩衝剤。
本発明の組成物は種々の形態であり得る。これらとしては、例えば、液体、半固体、及び固体の剤形、例えば、溶液(例えば、注射剤及び注入剤)、分散体または懸濁液、錠剤、丸剤、粉末、リポソーム、及び坐剤が挙げられる。好ましい形態は、意図される投与様式及び治療用途に依存する。典型的な好ましい組成物は、注射剤または注入剤の形態である。
好ましい投与様式は、非経口(例えば、静脈内、皮下、腹腔内、筋肉内、クモ膜下腔内)である。好ましい実施形態では、抗体は、静脈内注入または注射により投与される。別の好ましい実施形態では、抗体は、筋肉内注射または皮下注射により投与される。
治療用組成物は、通常、製造及び貯蔵条件下で無菌かつ安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルション、分散体、リポソーム、または高薬物濃度に適した他の規則構造として製剤化され得る。
本明細書に記載される疾患の処置のための治療法において、かかる疾患の処置に通常使用される他の確立された治療法の補助として、またはそれと併用して、本発明の医薬組成物を使用することは本発明の範囲内である。
本発明の更なる態様では、抗体、組成物、または医薬組成物は、少なくとも1種の活性薬剤と共に、逐次的に、同時に、または別々に投与される。
処置方法
本発明の更なる態様によれば、薬物として使用するための、本明細書で定義される単離された多重特異性抗体が提供される。本明細書における、薬物としてまたは療法において「使用するための」抗体への言及は、対象への抗体の投与に限定される。
一実施形態では、多重特異性抗体は、がんの処置に使用するためのものである。一実施形態では、本発明は、多重特異性抗体を対象に投与するステップを含む、それを必要とする対象の疾患または障害を処置する方法である。種々の実施形態において、疾患または障害は、がんである。一実施形態では、多重特異性抗体は、がんの処置に使用するためのものであり、健常細胞を温存しながら病変細胞の死をもたらす。更なる実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、がんの処置に使用するためのものである。
一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、がんの処置に使用するためのものである。更なる実施形態では、抗体またはその抗原結合断片は、がんの処置に使用するためのものである。
本発明の更なる態様によれば、薬剤として使用するための本明細書で定義される医薬組成物が提供される。一実施形態では、医薬組成物は、がんの処置に使用するためのものである。更なる実施形態では、医薬組成物は、がんの処置に使用するためのものである。
本発明の更なる態様によれば、本明細書で定義される治療上有効量の単離された多重特異性抗体を投与することを含む、それを必要とする対象における免疫応答を調節する方法が提供される。種々の実施形態では、対象における免疫応答を調節することは、γδT細胞に結合するか、もしくはγδT細胞を標的とすること、γδT細胞を活性化すること、γδT細胞の増殖を引き起こすか、もしくは増加させること、γδT細胞の増大を引き起こすか、もしくは増加させること、γδT細胞の脱顆粒を引き起こすか、もしくは増加させること、γδT細胞による殺傷活性を引き起こすか、もしくは増加させること、健常細胞を温存しながらγδT細胞による殺傷活性を引き起こすか、もしくは増加させること、γδT細胞の細胞傷害性を引き起こすか、もしくは増加させること、健常細胞を温存しながらγδT細胞の細胞傷害性を引き起こすか、もしくは増加させること、γδT細胞の動員を引き起こすか、もしくは増加させること、γδT細胞の生存率を増加させること、またはγδT細胞の疲弊に対する抵抗性を増加させることを含む。対象における免疫応答を調節することは、第2の抗原に結合するか、またはそれを標的とすることを更に含み得る。例えば、幾つかの実施形態では、第2の抗原の結合は、特にそれが免疫調節性抗原である場合、TRDV1への多重特異性抗体の結合による免疫調節に加えて、第2の抗原による免疫調節を刺激し得る。よって、免疫応答の調節は、TRDV1抗原の会合を介して調節される第1のシグナル伝達経路と、第2の免疫調節性抗原の会合を介して調節される第2のシグナル伝達経路との、2つの異なるシグナル伝達経路を介する調節を含み得る。
本発明の更なる態様によれば、本明細書で定義される治療上有効量の多重特異性抗体を投与することを含む、それを必要とする対象のがんを処置する方法が提供される。あるいは、治療上有効量の医薬組成物が投与される。
本発明の更なる態様によれば、例えば、がんの処置における薬剤の製造のための本明細書で定義される抗体またはその抗原結合断片の使用が提供される。
一実施形態では、抗体またはその抗原結合断片が対象に投与され、対象は、がんを有する。
本発明の更なる態様によれば、薬剤として使用するための本明細書で定義される医薬組成物が提供される。一実施形態では、医薬組成物が対象に投与され、対象は、がんを有する。
本発明の更なる態様によれば、本明細書で定義される治療上有効量の単離された多重特異性抗体を対象に投与する方法が提供され、対象は、がんを有する。あるいは、治療上有効量の医薬組成物が投与される。
本発明の更なる態様によれば、例えば、対象に投与される薬剤の製造のための本明細書で定義される抗体またはその抗原結合断片の使用が提供され、対象は、がんを有する。
種々の実施形態では、開示される方法及び組成物により処置され得るがんとしては、限定されるものではないが、急性リンパ芽球性、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、虫垂癌、基底細胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、脳幹神経膠腫、脳腫瘍、脳腫瘍、脳幹神経膠腫、中枢神経系非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍、中枢神経系胚芽腫、小脳星状細胞腫、大脳星状細胞腫/悪性神経膠腫、頭蓋咽頭腫、上衣芽細胞腫、上衣腫、髄芽細胞腫、髄上皮腫、中間型松果体実質腫瘍、テント上原始神経外胚葉性腫瘍及び松果体芽腫、視覚路及び視床下部神経膠腫、脳脊髄腫瘍、乳癌、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、消化管カルチノイド腫瘍、中枢神経系非定型奇形腫様/ラブドイド腫瘍、中枢神経系胚芽腫、中枢神経系リンパ腫、小脳星状細胞腫大脳星状細胞腫/悪性神経膠腫、子宮頸癌、脊索腫、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性障害、結腸癌、大腸癌、頭蓋咽頭腫、皮膚T細胞リンパ腫、食道癌、ユーイングファミリー腫瘍、性腺外生殖細胞腫瘍、肝外胆管癌、眼内黒色腫、網膜芽細胞腫、胆嚢癌、胃癌(胃がん)、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(gist)、生殖細胞腫瘍、妊娠性絨毛性腫瘍、神経膠腫、神経膠腫脳幹、神経膠腫大脳星状細胞腫、視覚路及び視床下部の神経膠腫、ヘアリーセル白血病、頭頸部癌、肝細胞(肝臓)癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、視床下部及び視覚路の神経膠腫、眼内黒色腫、膵島細胞腫瘍、腎臓(腎細胞)癌、ランゲルハンス細胞組織球症、喉頭癌、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、ヘアリーセル白血病、口唇癌及び口腔癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、エイズ関連リンパ腫、バーキットリンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、骨の悪性線維性組織球腫及び骨肉腫、髄芽細胞腫、黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、原発不明の転移性頸部扁平上皮癌、口腔癌(mouth cancer)、多発性内分泌腫瘍症候群、多発性骨髄腫/形質細胞腫瘍、真菌症、菌状息肉腫、骨髄異形成症候群、骨髄異形成/骨髄増殖性疾患、骨髄性白血病、骨髄性白血病、急性骨髄性白血病、多発性骨髄腫、骨髄増殖性障害、鼻腔癌及び副鼻腔癌、鼻咽腔癌、神経芽細胞腫、非小細胞肺癌、口腔癌(oral cancer)、口腔癌(oral cavity cancer)、中咽頭癌、骨肉腫及び骨の悪性線維性組織球腫、卵巣癌、卵巣上皮癌、卵巣生殖細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍、膵癌、膵癌、乳頭腫症、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌(pharyngeal cancer)、褐色細胞腫、中間型松果体実質腫瘍、松果体芽腫及びテント上原始神経外胚葉性腫瘍、下垂体腫瘍、形質細胞腫瘍/多発性骨髄腫、胸膜肺芽腫、原発性中枢神経系リンパ腫、前立腺癌、直腸癌、腎細胞(腎臓)癌、腎盂及び尿管、第15染色体のnut遺伝子が関与する呼吸器癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、肉腫、ユーイングファミリー腫瘍、カポジ肉腫、軟部組織肉腫、子宮肉腫、セザリー症候群、皮膚癌(非黒色腫)、皮膚癌(黒色腫)、メルケル細胞皮膚癌、小細胞肺癌、小腸癌、軟部組織肉腫、扁平上皮癌、頸部扁平上皮癌、胃がん(胃癌)、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、T細胞リンパ腫、精巣癌、咽頭癌(throat cancer)、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行細胞癌、妊娠性絨毛性腫瘍、尿道癌、子宮癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、ならびにウィルムス腫瘍が挙げられる。種々の実施形態では、開示される方法及び組成物により処置され得るがんが処置される一方で、健常細胞は温存される。
種々の実施形態では、開示される方法及び組成物により処置され得るがんは、EGFR陽性(EGFR+)癌を含む。
一実施形態において、本発明は、本明細書で定義される多重特異性抗体を投与するステップを含む、対象における少なくとも1つのγδT細胞を活性化する方法である。
一実施形態において、本発明は、本明細書で定義される多重特異性抗体を対象に投与するステップを含む、対象におけるγδT細胞の増殖を引き起こすまたは増加させる方法である。
一実施形態において、本発明は、本明細書で定義される多重特異性抗体を対象に投与するステップを含む、対象におけるγδT細胞の脱顆粒を引き起こすまたは増加させる方法である。
一実施形態では、本発明は、対象におけるγδT細胞殺傷活性(例えば、T細胞による殺傷活性)を引き起こすか、または増強する方法であって、本明細書で定義される抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片を当該対象に投与するステップを含む、当該方法である。一実施形態では、本発明は、健常細胞を温存しながら対象におけるγδT細胞殺傷活性(例えば、T細胞による殺傷活性)を引き起こすか、または増強する方法であって、本明細書で定義される抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片を当該対象に投与するステップを含む、当該方法である。
一実施形態では、本発明は、対象におけるγδT細胞の細胞傷害性を引き起こすか、または増強する方法であって、本明細書で定義される抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片を当該対象に投与するステップを含む、当該方法である。一実施形態では、本発明は、健常細胞を温存しながら対象におけるγδT細胞の細胞傷害性を引き起こすか、または増強する方法であって、本明細書で定義される抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片を当該対象に投与するステップを含む、当該方法である。
一実施形態において、本発明は、本明細書で定義される多重特異性抗体を対象に投与するステップを含む、対象におけるγδT細胞の動員を引き起こすまたは増加させる方法である。
一実施形態において、本発明は、本明細書で定義される多重特異性抗体を対象に投与するステップを含む、対象におけるγδT細胞の生存率を増加させる方法である。
一実施形態において、本発明は、本明細書で定義される多重特異性抗体を対象に投与するステップを含む、対象におけるγδT細胞の消耗に対する抵抗性を増加させる方法である。
本発明の更なる態様によれば、対象における免疫応答を刺激する方法が提供され、この方法は、免疫応答を刺激するのに有効な量で多重特異性抗体を対象に投与することを含む。
多重特異性抗体またはその抗原結合断片の使用
本発明の更なる態様によれば、γδT細胞(特にVδ1T細胞)の抗原認識、活性化、シグナル伝達、または機能を研究するための、本明細書に記載される多重特異性抗体の使用が提供される。本明細書に記載されるように、抗体は、γδT細胞機能を調査するために使用され得るアッセイにおいて活性があることが示された。かかる抗体は、γδT細胞の増殖を誘発するのにも有用であり得、従って、γδT細胞(例えば、Vδ1T細胞)を増殖させる方法において使用され得る。
Vδ1鎖に結合する抗体は、γδT細胞を検出するために使用され得る。例えば、抗体は、検出可能な標識もしくはレポーター分子で標識されてもよく、または試料中のVδ1T細胞を選択的に検出及び/または単離するための捕捉リガンドとして使用されてもよい。標識抗体は、当該技術分野において公知の多くの方法、例えば、免疫組織染色及びELISAにおいて有用である。
検出可能な標識またはレポーター分子は、放射性同位体、例えば、H、14C、32P、35S、もしくは125l;蛍光部分もしくは化学発光部分、例えば、フルオレセインイソチオシアネートもしくはローダミン;または酵素、例えば、アルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、ワサビペルオキシダーゼ、もしくはルシフェラーゼであり得る。本発明の多重特異性抗体に適用された蛍光標識は、次いで、蛍光活性化セルソーティング(FACS)法において使用され得る。
従って、種々の実施形態では、本発明は、インビボでγδT細胞を調節する方法、インビボでγδT細胞に結合する方法、インビボでγδT細胞を標的とする方法、インビボでγδT細胞を活性化する方法、インビボでγδT細胞を増殖させる方法、インビボでγδT細胞を増大させる方法、インビボでγδT細胞を検出する方法、インビボでγδT細胞の脱顆粒を引き起こす方法、インビボでγδT細胞による殺傷活性を引き起こす方法、インビボで抗体またはその抗原結合断片を選択する方法を含み、当該方法は、本明細書に記載されるように対象に多重特異性抗体またはその抗原結合断片を投与するステップを含む。
γδT細胞を調節するための薬物
本明細書に記載される多重特異性抗体は、患者の生体内原位置で(すなわち、インビボで)δ可変部1鎖(Vδ1)T細胞を調節するために使用され得るか、または調節するのに有用であり得る。多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、かかる目的のための薬物に含まれ得る。
Vδ1T細胞の調節は以下を含み得る:
- 例えば、Vδ1T細胞の数を選択的に増加させることによるVδ1T細胞の増殖、またはVδ1T細胞の生存の促進;
- 例えば、Vδ1T細胞の効力を増強すること、すなわち標的細胞の殺傷を増加させることによる、Vδ1T細胞の刺激;
- 例えば、Vδ1T細胞の持続性を増加させることによる、Vδ1T細胞の疲弊の防止;
- Vδ1T細胞の脱顆粒;
- NCR発現の増加;
- 例えば、Vδ1TCR細胞表面発現の下方調節、すなわち、Vδ1TCR内部移行もしくはVδ1TCRタンパク質の発現の減少を引き起こすか、もしくはVδ1TCRの結合を遮断することによる、Vδ1T細胞の免疫調節;及び/または
- TCR/CD3複合体の下方調節。
Vδ1T細胞の枯渇に焦点を当てる先行技術の抗Vδ1抗体とは異なり、本発明の抗体は、TRDV1結合ドメインを介したVδ1T細胞の活性化に有用である。本発明の抗体は、それらが結合するT細胞上のTCRの下方調節を引き起こし得るが、Vδ1T細胞の枯渇を引き起こさず、むしろT細胞を刺激するため、T細胞のこのコンパートメントの活性化による恩恵を受ける治療状況において有用であり得る。Vδ1T細胞の活性化は、TCRの下方調節、CD3の下方調節、活性化マーカー、例えば、CD25及びKi67ならびに脱顆粒マーカーCD107aの変化から明らかである。Vδ1T細胞の活性化は、次に、INFγ及びTNFαなどの炎症性サイトカインの放出を引き起こして、免疫ライセンシングを促進する。
Vδ1+細胞上の免疫細胞マーカーを調節する薬物
抗体またはその抗原結合断片は、患者に投与されると、Vδ1+細胞の免疫細胞マーカーを調節し得る。
本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、γδT細胞の調節を測定することによって、その治療的使用に対する適合性が評価され得る。例えば、Vδ1+T細胞またはモデル系の細胞に存在するCD25またはCD69またはCD107aのレベルの変化を測定することによる。かかるマーカーは、多くの場合、リンパ球調節(例えば、増殖または脱顆粒)のマーカーとして使用されており、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片の適用後に、例えば、フローサイトメトリーにより測定され得る。驚くべきことに、かかる評価において(例えば、実施例7、17、18を参照のこと)、本明細書に記載される抗体が、標的Vδ1+T細胞における測定可能により高レベルのCD25またはCD69またはCD107aレベルをもたらしたことが観察された。場合により、モデル系で試験されたVδ1+細胞またはその集団の表現型の変化は、次いで、代替的な比較抗体(例えば、OKT-3、TS8.2など)が上記の同等なγδT細胞に適用された場合の表現型の変化と比較され得る。
従って、本発明の一態様では、治療的使用についてγδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、ならびにVδ1+細胞の表面上のCD25及び/またはCD69及び/またはCD107aのレベルに対する効果を決定することを含む、当該方法が提供される。CD25、CD69、及び/またはCD107aのレベルに対する効果は、一定期間にわたって決定/測定され得る。この効果は、同じ期間にわたって上記抗体が上記細胞に適用されない場合のVδ1+細胞の表面上のCD25及び/またはCD69及び/またはCD107aのレベルと比較して測定され得ることが理解されよう。本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される多重特異性抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に当該抗体を添加し、次いで、上記Vδ1+細胞の表面上のCD25またはCD69またはCD107aのレベル(または発現)を測定することによる、当該方法が提供される。
Vδ1+細胞の増殖特性または数を調節する薬物
抗体またはその抗原結合断片は、患者に投与されると、Vδ1+細胞の増殖特性を調節し得る。例えば、抗体またはその抗原結合断片は、Vδ1+細胞を増殖させ得る。
γδT増殖を測定する代替的アプローチは、Vδ1+細胞を含有するモデル系に、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を適用した場合の当該細胞の相対数における経時的な変化を測定することを含み得る。驚くべきことに、かかる評価において、本明細書に記載される抗体が、上記Vδ1+T細胞の数を測定可能に増加させることができたことが観察された(例えば、実施例10、17、及び18を参照のこと)。場合により、この数の変化は、次いで、代替的な比較抗体(例えば、抗OKT3)が上記モデル系に適用される場合に観察される数の変化と比較され得る。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、及び集団内のVδ1+細胞の数に対する効果を決定することを含む、当該方法が提供される。細胞数に対する効果は、一定期間にわたって決定/測定され得る。この効果は、同じ期間にわたって上記抗体が細胞集団に適用されない場合に観察される細胞数に対する効果と比較して測定され得ることが理解されよう。本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に上記抗体を適用し、次いで、上記細胞の数を経時的に測定することによる、当該方法が提供される。
Vδ1+細胞の増殖能力及び数を調節する薬剤
γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される理想的な治療抗体またはその抗原結合断片は、インビボでVδ1+細胞の増殖を増強できるものであり得る。そのため、かかる抗体は、対象または患者におけるVδ1+細胞数を特異的に増加させるように設計された薬物として用いられ得る。例を以下に示す。
がん:
Vδ1+細胞数の相対的増加は、多数のがんについて転帰の改善に関連する正の予後指標として報告されている(例えば、Gentles et al(2015)Nature Immunology 21:938-945、Wu et al.(2019)Sci.Trans.Med.11(513):eaax9364、Catellani et al.(2007)Blood 109(5):2078-2085を参照のこと)。一実施形態では、がん患者内の生体内原位置でVδ1+細胞の相対数または絶対数を増加させることができる薬物が本明細書において提供される。
病原性感染/寄生虫感染/ウイルス感染:
Vδ1+細胞の濃縮は、多数の後天性病原性感染/寄生虫感染/ウイルス感染に対する宿主防御において観察される。最近の総説については、Zhao et al.(2018)Immunol.Res.2018:5081634を参照のこと。更に、Vδ1+の数の増加は、種々のDNAウイルス及びRNAウイルスの感染を防ぐとも考えられている。例えば、数の増加は、同種異系移植片に関連するCMV感染においても防御的であると考えられている(van Dorp et al.(2011)Biology of Blood and Marrow Transplantation 17(2):S217を参照のこと)。更に、Vδ+細胞数は、コロナウイルス感染患者において増加する(Poccia et al.(2006)J.Infect.Dis.193(9):1244-1249)。
別の実施形態では、病原性感染症を有する対象または患者におけるVδ1+細胞の相対数または絶対数を増加させることができる薬剤が本明細書において提供される。
幹細胞移植:
Vδ1+細胞数の増加は、疾患再発の減少、ウイルス感染の減少、全生存率及び無症候生存率の上昇、ならびに造血幹細胞移植中の全般的に良好な臨床転帰にも関連している(例えば、Aruda et al.(2019)Blood 3(21):3436-3448及びGodder et al.(2007)Bone Marrow Transplantation 39:751-757を参照のこと)。従って、別の実施形態では、幹細胞移植を補助する処置レジメンの一部として、対象におけるVδ1+細胞の相対数または絶対数を増加させることができる薬物が本明細書において提供される。
従って、生体内原位置でVδ1+細胞の数を優先的または特異的に増加させることができる薬物が非常に望ましい。
Vδ1+細胞のサイトカイン分泌を維持するか、または誘発するか、または増加させる薬剤
サイトカインは、免疫系の特定の細胞によって分泌されるタンパク質、ペプチド、または糖タンパク質の大きなグループである。それらは、免疫、炎症、及び造血を媒介し、制御するシグナル伝達分子のカテゴリーである。幾つかのサイトカインは、腫瘍及び細胞の微小環境、自己免疫組織及び関連する微小環境、またはウイルスに感染した組織もしくは細胞の環境の直接的または間接的な調節を通じて、疾患の徴候及び症状を改善させることに関係付けられてきた。例示的な炎症誘発性サイトカインとしては、腫瘍壊死因子α(TNFα)及びインターフェロンγ(IFNγ)が挙げられる。
しかしながら、かかるサイトカインの多くは、全身投与すると好ましくない毒性を示す。例えば、TNFαは、移植された腫瘍の出血性壊死を誘発することができ、他の化学療法薬と組み合わせると相乗的な抗腫瘍効果を発揮することが報告されているが、全身性組換えヒトTNFα(rhTNFα)を用いる様々な臨床試験は、低血圧、悪寒、静脈炎、血小板減少、白血球減少及び肝毒性、発熱、疲労、悪心/嘔吐、倦怠感及び脱力感、頭痛、胸部絞扼感、腰背痛、下痢、ならびに息切れを含む重大な用量制限副作用を明らかにしている。
組換えIFNγの使用にも同様の全身毒性の課題がある。例えば、がんの状況において、IFNγは、MHCクラスI及びIIの上方調節を含む好ましい多面的効果を発揮して、抗腫瘍免疫を刺激し、T細胞浸潤を増加させ、抗血管新生効果を付与し、ケモカイン/サイトカインの分泌を誘発し、直接的ながん細胞増殖抑制効果を発揮し得るが、有害な副作用も観察されている。有害な副作用としては、発熱、頭痛、寒気、疲労、下痢、悪心、嘔吐、食欲不振、肝トランスアミナーゼの一時的増加、ならびに顆粒球数及び白血球数の一時的減少が挙げられる。
全身性組換えTNFα及びIFNγの可能性及び制限の両方に関する最近の概説については、Shen et al.(2018)Cell Prolif.51(4):e12441を参照のこと。
よって、かかるサイトカインの、より生体内原位置で制御された、より局所化された、より組織特異的または細胞特異的な産生が必要である。例えば、炎症誘発性サイトカインのより制御された発現または誘導が、「冷たい」腫瘍を「熱い」腫瘍に変えることができる1つのアプローチとして提唱されている。熱い腫瘍は、CD45+T細胞の数または密度の増加も観察されるため、場合により、「T細胞炎症性」とも称される。最近の概説については、Bonaventura et al.(2019) Front.Immunol.10:168を参照のこと。
このような理由で、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される理想的な治療抗体またはその抗原結合断片は、インビボでVδ1+細胞におけるサイトカインの分泌を維持するか、または増強するか、または誘発することができるものであり得る。そのため、かかる抗体は、対象または患者において、より局所的で全身性ではない様式でサイトカインを特異的に増加させるか、または誘発するように設計された薬物として、かつ上記対象または患者におけるVδ1+細胞の分布とよりよく相関するものとして用いられ得る。
注目すべきことに、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体がVδ1+細胞に適用される場合、顕著に高いレベルのサイトカイン分泌が観察される。より具体的には、また非限定的な例として、顕著に高いレベルのTNFα及びIFNγが観察される。例えば、実施例15を参照のこと。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、及び当該細胞集団により産生された少なくとも1種のサイトカインの量を決定することを含む、当該方法が提供される。産生されたサイトカインの量は、一定期間にわたって決定/測定されてもよく、任意により、同じ期間にわたって上記抗体が細胞集団に適用されない場合に観察される量と比較されてもよい。一実施形態では、抗体を細胞集団に投与した場合に産生されるサイトカインの観察されるレベルは、抗体を適用しない場合に産生されるサイトカインのレベルと比較して、約10%超、約20%超、約30%超、約50%超、約100%超、約150%超、約200%超、約250%超、約300%超、約350%超、約400%超、約450%超、約500%超、約1000%超である。本発明の更なる態様では、サイトカインは、炎症誘発性サイトカインである。本発明の更なる態様では、サイトカインは、TNF-αサイトカインである。本発明の更なる態様では、IFN-γサイトカインである。
本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に上記抗体を適用し、次いで、生成された少なくとも1種のサイトカインのレベルを測定することによる、当該方法が提供される。本発明の更なる態様では、測定されるサイトカインは、TNF-αサイトカイン及び/またはIFN-γサイトカインである。
本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に上記抗体またはその抗原結合断片を適用し、産生された炎症誘発性サイトカインの量及び/または腫瘍もしくは腫瘍微小環境に存在するCD45+T細胞の数もしくは密度を決定することによって、当該抗体がより冷たいか、または冷たい腫瘍を調節して、より熱いか、または熱い腫瘍にする効果を測定することによる、当該方法が提供される。
Vδ1+細胞のグランザイムB活性を維持するか、または誘発するか、または増加させる薬剤
グランザイムBは、ナチュラルキラー細胞(NK細胞)及び細胞傷害性T細胞の顆粒に一般的に見出されるセリンプロテアーゼである。グランザイムBは、これらの細胞によってポア形成タンパク質パーフォリンと共に分泌され、病変細胞などの標的細胞のアポトーシスを媒介する。
モデル系において標的病変細胞(例えば、がん細胞)との共培養でVδ1+細胞をインキュベートすると、溶解前の標的病変細胞においてグランザイムBレベル及び活性のレベルを測定することができる。注目すべきことに、かかるモデル系で、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を、Vδ1+細胞及びがん細胞のかかる共培養物に適用すると、細胞死前の疾患がん細胞においてより高いグランザイムBレベル及び活性が観察される(例えば、実施例16を参照のこと)。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価するための方法であって、Vδ1+細胞及び病変細胞(例えば、がん細胞)を含む共培養物に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、ならびに共培養物中の病変細胞により産生されたグランザイムBの量に対する効果を測定することを含む、当該方法が提供される。産生されたサイトカインの量は、一定期間にわたって決定/測定されてもよく、任意により、同じ期間にわたって上記抗体が上記共培養物に適用されない場合に観察される量と比較されもよい。一実施形態では、上記抗体が上記共培養物に適用される場合に測定されるグランザイムBのレベルは、上記抗体が適用されない場合に観察されるグランザイムBレベルと比較して、約10%超、約20%超、約30%超、約40%超、約50%超、約70%超、約80%超、約90%超、約100%超、約200%超である。
本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞及び病変細胞を含む共培養物に上記抗体を適用し、次いで、病変細胞におけるグランザイムBの量または活性を測定することによる、当該方法が提供される。
ポリクローナルVδ1+細胞集団を増大させる薬剤
理想的な抗体薬剤は、Vδ1+細胞の増大が超可変CDR3配列レベルでクローン的に集中しすぎないことを保証するように設計されたものでもあり得る。従って、理想的な抗体薬物は、特定のまたは「プライベートな」δ1+CDR3配列パラトープに結合することによってVδ1+細胞の増殖を誘発することを回避するように設計され得る。むしろ、抗体は、Vδ1+細胞のサブセットのみで提示される配列に結合するのではなく、全てのVδ1+T細胞受容体に存在する保存された生殖細胞系列型配列を介して、かつガンマ鎖に依存しない様式で結合し得る。
従って、理想的な抗体薬剤は、Vδ1+細胞の増大を刺激して、CDR3配列の混合物を含む複数のVδ1+細胞を発生させ得る。この結果、δ可変1鎖上に異なるCDR3配列を提示するVδ1+細胞のインビボで増大した異種ポリクローナル集団がもたらされる。注目すべきことに、Vδ1+細胞を含有する免疫細胞の出発集団に本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を添加する方法によって作製された、増大したVδ1+細胞集団の分析において、抽出されたRNAのCDR3超可変領域を通して配列決定するように設計されたRNAseqベースの方法によって、高度のポリクローナル性が観察されている(例えば、実施例10を参照のこと)。
従って、一態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞を含む細胞集団に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、及び増大したVδ1+細胞のポリクローナル性を決定することを含む、当該方法が提供される。抗体薬剤は、複数のVδ1+CDR3配列を含有する増大したポリクローナル集団を発生させることが望ましい。ポリクローナル性は、当該技術分野において公知の方法を使用して、例えば、上記Vδ1+細胞のVδ1鎖超可変CDR3の内容を分析することができる核酸シーケンシング手法により決定され得る。
ポリクローナルVδ1+細胞を長時間増大させる薬剤
理想的な抗体薬剤は、一次Vδ1+細胞をインビボで疲弊させることなく、かかる細胞の増殖を増強するか、または促進するか、または刺激することができてもよい。例えば、比較として、OKT3などの抗CD3薬剤(例えば、ムロノマブ)は、CD3陽性T細胞を増大させることができる一方で、疲弊させ得るか、またはアネルギーを誘発し得る。本明細書に記載される、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体が生存Vδ1+細胞の持続的な細胞分裂を引き起こす能力を評価するために、より長期の増殖研究を行った。注目すべきことに、これらの研究により、本明細書に記載される、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体が、生存しており、かつ依然として機能的に細胞傷害性であるVδ1+細胞の細胞分裂/増殖を40日以上引き起こすことができることが明らかになった(例えば、実施例10を参照のこと)。
一実施形態では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、当該抗体またはその抗原結合断片を細胞集団に適用すること、及びVδ1+細胞の分裂が起こる時間の長さをモニタリングすることを含む、当該方法が提供される。理想的には、抗体は、5~60日間、例えば、少なくとも7~45日間、7~21日間、または7~18日間にわたってVδ1+細胞の分裂を刺激することができる。
更なる実施形態では、γδTCRのVδ1鎖に結合し、患者に投与される場合にVδ1+細胞の分裂を刺激して、その数を少なくとも2倍の数、少なくとも5倍の数、少なくとも10倍の数、少なくとも25倍の数、少なくとも50倍の数、少なくとも60倍の数、少なくとも70倍の数、少なくとも80倍の数、少なくとも90倍の数、少なくとも100倍の数、少なくとも200倍の数、少なくとも300倍の数、少なくとも400倍の数、少なくとも500倍の数、600倍の数、または少なくとも1,000倍の数に増加させることができる、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片が提供される。
本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞、またはVδ1+細胞を含有する混合細胞集団に上記抗体を適用し、次いで、Vδ1+細胞数を経時的に測定することによる、当該方法が提供される。
Vδ1+免疫細胞を標的とすることによって非Vδ1+免疫細胞を調節する薬剤
本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、他の免疫細胞のVδ1+細胞による調節を測定することによっても評価され得る。例えば、ヒト組織αβ細胞及びγδT細胞を含むものなどの免疫細胞の混合集団を含むモデル系に、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を適用した後に、非γδT細胞「画分」で観察される変化が測定され得る。更に、上記モデルにおける非γδ細胞型に対する効果は、フローサイトメトリーによって測定され得る。例えば、γδT細胞及び非γδT細胞を含む混合培養物に、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を添加した際の、CD8+αβT細胞の数の相対変化を測定することによる。任意により、非γδT細胞CD8+リンパ球集団の数または表現型において観察される変化は、次いで、代替的な比較抗体(例えば、OKT-3)が上記混合集団に適用される場合の数の変化と比較され得る。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞及びVδ1陰性免疫細胞を含む免疫細胞または組織の混合集団に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、及び当該Vδ1陰性免疫細胞に対する効果を測定することを含む、当該方法が提供される。この効果は、一定期間にわたって決定/測定されてもよく、任意により、同じ期間にわたって上記抗体が適用されない場合にVδ1陰性細胞において観察される効果と比較されてもよい。この効果は、Vδ1陰性免疫細胞の数の変化として測定され得る。例えば、抗体は、Vδ1陰性免疫細胞の数を、上記抗体が適用されない場合に観察されるレベルと比較して、約10%超、約20%超、約30%超、約40%超、約50%超、約70%超、約80%超、約90%超、約100%超、約500%超増加させ得る。
本発明の更なる態様では、調節されるVδ1陰性細胞は、CD45+細胞である。本発明の更なる態様では、調節される細胞は、αβT細胞である。本発明の更なる態様では、調節されるαβ+細胞は、CD8+リンパ球である。本発明の更なる態様では、調節されるαβT細胞またはその集団は、細胞分裂の増強の証拠を示す。本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞及びVδ1陰性免疫細胞を含む免疫細胞の混合集団に上記抗体を投与し、次いで、上記多重特異性抗体またはその抗原結合断片により調節されたVδ1+細胞によりVδ1陰性細胞集団に付与された効果を測定することによる、当該方法が提供される。
任意により、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片によりもたらされる「Vδ1+細胞による免疫系調節」において、Vδ1+細胞数の付随する増加も観察される。そして、この理論に拘束されるものではないが、Vδ1+細胞数の上記増加は、αβT細胞などの共存するVδ1陰性免疫細胞の付随する増殖を引き起こす原因となり得る可能性がある。代替の仮説は、Vδ1+T細胞からの抗体誘導性サイトカイン分泌がVδ1陰性免疫細胞の増殖を刺激するというものであり得る。
本発明の更なる態様では、αβ+CD8+リンパ球集団の観察される増加は、OKT3抗体または代替的な抗Vδ1抗体などの比較抗体と比較される。本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+T細胞及びαβT細胞を含む免疫細胞の混合集団に上記抗体を適用し、次いで、CD8+αβ+T細胞リンパ球の数を経時的に測定することによる、当該方法が提供される。
腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調節する薬剤
本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、モデル系において腫瘍浸潤集団(TIL)に付与される効果を測定することによっても評価され得る。驚くべきことに(例えば、実施例18を参照のこと)、かかる評価において、本明細書に記載される抗体は、ヒト腫瘍におけるTIL集団を測定可能に調節した。例えば、γδ+リンパ球TIL集団または非γδリンパ球TIL集団の数または表現型のいずれかにおける変化が、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片をヒト腎細胞癌などのヒト腫瘍に適用した後に測定される。任意により、γδ+リンパ球TIL集団または非γδリンパ球TIL集団のいずれかの数または表現型において観察される変化は、次いで、代替的な比較抗体(例えば、OKT-3)が上記モデル系に適用される場合に観察される変化と比較され得る。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、ヒト腫瘍に存在するか、またはヒト腫瘍に由来するTILに当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、及びTILの数に対する効果を決定することを含む、当該方法が提供される。この効果は、一定期間にわたって決定/測定されてもよく、任意により、同じ期間にわたって上記抗体が適用されない場合に観察されるTIL数と比較されてもよい。この効果は、TILの数の増加であり得る。例えば、抗体は、TILの数を、上記抗体が適用されない場合に観察されるTILの数と比較して、約10%超、約20%超、約30%超、約40%超、約50%超、約70%超、約80%超、約90%超、約100%超増加させ得る。更なる態様では、数が観察されるTILは、γδ+リンパ球TIL細胞及び/または非γδリンパ球TIL細胞である。
本発明の更なる態様では、γδTCR細胞抗体のVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、ヒト腫瘍に存在するか、またはヒト腫瘍に由来するTILまたは複数のTILに上記抗体を適用し、次いで、TILまたは複数のTIL細胞の数の変化を一定期間にわたって測定することによる、当該方法が提供される。
ヒトVδ1+細胞の細胞傷害性を調節する薬剤
本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、Vδ1+細胞による細胞傷害性に対してもたらされる効果を測定することによっても評価され得る。驚くべきことに、本明細書に記載される抗体のかかる評価において(例えば、実施例19及び27を参照のこと)、測定可能に増強されたVδ1+細胞による細胞傷害性が観察された。例えば、Vδ1+細胞及び上記がん細胞を含む混合培養物を含むモデル系に抗体またはその抗原結合断片を適用した後に、がん細胞の数の低減、または殺傷されたがん細胞の数の増加が観察される。任意により、がん細胞の数の低減または殺傷されたがん細胞の数の増加は、次いで、代替的な比較抗体(例えば、OKT-3)が上記モデル系に適用される場合の転帰と比較され得る。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞及びがん細胞を含む混合細胞集団に抗体またはその抗原結合断片を適用すること、及びがん細胞に対するVδ1+細胞の細胞傷害性を測定することを含む、当該方法が提供される。細胞傷害性は、一定期間にわたる死んだがん細胞の数の増加によって測定されてもよく、任意により、同じ期間にわたって上記抗体が混合細胞集団に適用されない場合に観察される死んだがん細胞の数と比較されてもよい。例えば、上記抗体が適用される場合に観察される死細胞の増加は、上記抗体が適用されない場合に観察される死細胞の数と比較して、約10%超、約20%超、約30%超、約40%超、約50%超、約70%超、約80%超、約90%超、約100%超、約200%超、約500%超であり得る。
本発明の更なる態様では、γδTCR細胞のVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、ヒトVδ1+細胞及びがん細胞を含む免疫細胞の上記混合集団に上記抗体を添加し、次いで、死んだがん細胞の増加を経時的に測定することによる、当該方法が提供される。
Vδ1+細胞標的対エフェクター細胞比(T:E比)を調節する薬剤
本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、薬剤候補として当該抗体を評価するためのモデル系で標的細胞の50%(EC50)が殺傷される標的細胞対エフェクター細胞比を決定することにより、当該抗体がどのくらいVδ1+細胞によるがん細胞傷害性を増強するかを測定することによっても評価され得る。例えば、標的がん細胞をヒトVδ1+エフェクター細胞と共に含む混合培養物。驚くべきことに、かかる評価において(例えば、実施例19を参照のこと)、本明細書に記載される抗体は、モデル系におけるEC50 T:E比を有利に改変する。かかる改変は、設定した期間でがん細胞の50%の殺傷を観察するのに必要とされるVδ1+細胞の数として測定され得る。これはまた、上記がん細胞に対する細胞傷害性の変化または改善倍率または向上パーセントとしても報告され得る。任意により、本発明の抗体によりもたらされるT:E比は、次いで、代替的な比較抗体(例えば、OKT-3)が上記モデル系に適用される場合のT:E比と比較され得る。幾つかの場合では、本発明の多重特異性抗体は、単一特異性抗体と比較してより低いE:T比であってもがん細胞傷害性を改善する機会を提供する。
従って、本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、ヒトVδ1+細胞及びがん細胞を含む混合細胞集団に当該抗体またはその抗原結合断片を適用すること、ならびにがん細胞の50%を殺傷するのに必要とされるVδ1+細胞の数を測定することを含む、当該方法が提供される。これは、任意により同じ期間にわたって、上記抗体が適用されることなくがん細胞の50%を殺傷するのに必要とされるVδ1+細胞の数と比較して測定され得る。例えば、上記抗体が適用される場合にがん細胞の50%を殺傷するのに必要とされるVδ1+細胞の数の低減は、上記抗体が適用されない場合にがん細胞の50%を殺傷するのに必要とされるVδ1+細胞の数と比較して、約10%超、約20%超、約30%超、約40%超、約50%超、約70%超、約80%超、約90%超、約100%超、約200%超、約500%超であり得る。
本発明の更なる態様では、Vδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞に加えてがん細胞を含む上記細胞集団に上記抗体を添加し、次いで、がん細胞の50%を殺傷するのに必要とされるVδ1+細胞の数を測定することによる、当該方法が提供される。
Vδ1+細胞のEC50細胞傷害性を増強する薬剤
ヒトVδ1+細胞またはその集団において観察される細胞傷害性の増強を測定する代替的方法は、条件A(例えば、出発対照)において設定した期間にわたってがん細胞の50%を殺傷するのに必要とされる細胞の数を測定し、これを条件B(例えば、本明細書に記載される本発明の抗体の適用時)において設定した期間にわたってがん細胞の50%を殺傷するのに必要とされる細胞の数と比較することである。
かかるパラメータを測定するための種々の方法が存在することは理解されているが、理解を助けるために、以下の非限定的な仮定例について概説する。
仮定上、エフェクター細胞傷害性の増強は以下の通りに測定され得る。条件A(対照処置)では、設定した時間(例えば、5時間)にわたってがん細胞の50%を殺傷するのに1000個のVδ1+細胞が必要とされることが観察される。条件B(例えば、本明細書に記載される本発明の抗体の適用)では、同じ時間にわたってがん細胞の50%を殺傷するのに500個のVδ1+細胞が必要とされたことが観察される。従って、この例では、抗体の適用によってVδ1+細胞集団の細胞傷害性が200%増強された。
(1000/500)×100=200%
例えば(例えば、実施例19~21を参照のこと)、驚くべきことに、本明細書に記載される本発明の多重特異性抗体について、かかるパーセンテージの増強が観察された。
本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較する方法であって、Vδ1+細胞及びがん細胞を含む免疫細胞の上記混合集団に上記抗体を添加し、上記細胞混合物に上記抗体を適用しない同等の実験または対照実験に対する細胞傷害性の相対的変化またはパーセント変化を決定することによる、当該方法が提供される。
健常細胞を温存しながらVδ1+細胞の病変細胞特異性を増強する薬剤
本明細書に記載される多重特異性抗体またはその抗原結合断片を評価するための別のアプローチは、当該抗体がどのくらい病変細胞特異的な細胞傷害性を調節するかを測定することである。驚くべきことに、かかる研究において、かかる抗体が、健常細胞または非病変細胞を温存しながら、がん細胞などの病変細胞のVδ1+細胞特異的殺傷を特異的に増強し得ることが発見された(例えば、実施例19及び27などを参照のこと)。がんの症状を改善するために患者に投与される理想的な抗体薬剤は、健常細胞を温存しながら、病変細胞に対して特異的に増強された細胞傷害性を付与する。そして、がん細胞などの病変細胞に対して特異的にエフェクター細胞傷害性を増強する薬剤は、上記病変細胞に対して特異的にエフェクター細胞傷害性を選択的に増強しない薬剤よりも高い治療指数(TI)を示すと言われ得る。治療指数は、治療可能比とも称され、薬物の相対的安全性の定量的測定値である。これは、治療効果を引き起こす治療薬の量と、例えば、関連するか、または関連性のある健常細胞集団の望ましくない死滅をもたらすことによって毒性を引き起こす量との比較である。本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、モデル系において健常細胞以上に病変細胞を選択的に殺傷するVδ1+細胞の能力を変化させるか、または増強するか、または倍増させる能力を測定することによって評価され得る。例えば、上記モデル系は、Vδ1+エフェクター細胞、がん細胞、及び対照細胞(例えば、健常細胞)を含み得る。場合により、本発明の多重特異性抗体によって付与される選択的な病変細胞の殺傷における向上倍率を、代替的なコンパレータ抗体(例えばOKT-3)を前記モデル系に適用した場合に観察される向上倍率と比較してもよい。
Vδ1+細胞の病変細胞特異性及び病変細胞特異性の増強は、Vδ1+細胞、病変細胞、及び健常細胞を含む培養物において測定され得る。例えば、病変細胞に対するVδ1+特異性は、Vδ1+細胞により殺傷されるがん細胞の数を観察し、次いで、Vδ1+細胞により殺傷される健常細胞の数を比較することによって測定され得る。かかる比較は、Vδ1+細胞も含むモデル系に同数の病変細胞及び健常細胞を含めること、例えば、「三種培養」によって管理され得る。例えば、分析または機器の制限により、3つ以上の細胞種(Vδ1+細胞、病変細胞、及び非病変細胞を含む)の全てを単一のアッセイで並行して区別し、追跡する能力が低減される場合には、代替的な比較方法も検討され得る。上記の例では、1つの実験において病変細胞に対するVδ1+細胞傷害性を比較し、次いで、別個の同等な実験において健常細胞に対するVδ1+細胞の細胞傷害性を比較することにより、かかる研究の代替アプローチが提供される。
本発明の別の態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する抗体またはその抗原結合断片を評価する方法であって、Vδ1+細胞及び標的細胞を含む細胞集団に当該抗体またはその抗原結合断片を投与すること、ならびに当該標的細胞に対する細胞の細胞傷害性の特異性を測定することを含む、当該方法が提供される。一実施形態では、第1の標的細胞種に対する細胞傷害性の特異性は、第2の標的細胞種に対して観察される細胞傷害性と比較されてもよく、従って、この方法は、異なる標的細胞種を使用して繰り返されてもよい。本発明の更なる態様では、第1の標的細胞種は病変細胞であり、第2の標的細胞種は、健常細胞または第1の標的細胞種とは異なる疾患を有する細胞などの対照細胞である。
本発明の更なる態様では、γδTCRのVδ1鎖に結合する本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片を選択するか、または特徴付けるか、または比較するための方法であって、(i)第1の細胞種及び(ii)第2の細胞種に対するVδ1+細胞の細胞傷害性に対して上記抗体により付与される効果が測定及び比較される、当該方法が提供される。本発明の更なる態様では、これにより、第2の細胞種に対するものよりも第1の細胞種に対する特異的な細胞傷害性を増強する抗体が選択される。本発明の更なる態様では、第1の細胞種は病変細胞であり、第2の細胞種は健常細胞である。
本明細書に記載されるように、アッセイに使用される多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、表面に、例えば、Fc受容体を含む細胞などの細胞の表面に提示され得る。例えば、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、TIB-202(商標)細胞(American Type Culture Collection(ATCC)から入手可能)などのTHP-1細胞の表面に提示され得る。あるいは、多重特異性抗体またはその抗原結合断片は、アッセイにおいて直接使用され得る。
このような機能アッセイでは、「EC50」または「50パーセント有効濃度」とも称される50%濃度を算出することによって結果が評価され得る。用語「IC50」は阻害濃度を指す。EC50及びIC50の両方が、フローサイトメトリー法などの当該技術分野において公知の方法を使用して測定され得る。場合によっては、EC50及びIC50は、同じ値であるか、または同等とみなされ得る。例えば、ある特定の細胞種の50%を阻害する(例えば、殺傷する)のに必要とされるエフェクター細胞の有効濃度(EC)は、50%阻害濃度(IC)ともみなされ得る。誤解を避けるために言及すると、抗体に言及する場合、本出願におけるEC50値は、IgG1フォーマットの抗体を使用して掲示される。かかる値は、抗体フォーマットの分子量に基づいて、以下の通りに相当値に容易に変換され得る。
(μg/ml)/(kDa単位のMW)=μM
本明細書に記載される親クローンの抗体(または断片)結合時のγδTCR下方調節のEC50は、0.50μg/ml未満、例えば、0.40μg/ml未満、0.30μg/ml未満、0.20μg/ml未満、0.15μg/ml未満、0.10μg/ml未満、0.06μg/ml未満、または0.05μg/ml未満であり得る。好ましい実施形態では、抗体(または断片)結合時のγδTCR下方調節のEC50は、0.10μg/ml未満である。特に、抗体(または断片)結合時のγδTCR下方調節のEC50は、0.06μg/ml未満、例えば、0.05μg/ml未満、0.04μg/ml未満、または0.03μg/ml未満であり得る。特に、上記EC50値は、抗体がIgG1フォーマットで測定される場合のものである。例えば、γδTCR下方調節のEC50値は、(例えば、実施例6及び27のアッセイに記載されるように)フローサイトメトリーを使用して測定され得る。
抗体(または断片)結合時のγδT細胞脱顆粒のEC50は、0.050μg/ml未満、例えば、0.040μg/ml未満、0.030μg/ml未満、0.020μg/ml未満、0.015μg/ml未満、0.010μg/ml未満、または0.008μg/ml未満であり得る。特に、抗体(または断片)結合時のγδT細胞脱顆粒のEC50は、0.005μg/ml未満、例えば、0.002μg/ml未満であり得る。好ましい実施形態では、抗体(または断片)結合時のγδT細胞脱顆粒のEC50は、0.007μg/ml未満である。特に、上記EC50値は、抗体がIgG1フォーマットで測定される場合のものである。例えば、γδT細胞脱顆粒のEC50値は、(例えば、実施例7のアッセイに記載されるように)フローサイトメトリーを使用してCD107a発現(すなわち細胞脱顆粒のマーカー)を検出することにより測定され得る。一実施形態において、CD107a発現は、抗ヒトCD107a BV421(クローンH4A3)(BD Biosciences)などの抗CD107a抗体を使用して測定される。
抗体(または断片)結合時のγδT細胞による殺傷のEC50は、0.50μg/ml未満、例えば、0.40μg/ml未満、0.30μg/ml未満、0.20μg/ml未満、0.15μg/ml未満、0.10μg/ml未満、または0.07μg/ml未満であり得る。好ましい実施形態では、抗体(または断片)結合時のγδT細胞による殺傷のEC50は、0.10μg/ml未満である。特に、抗体(または断片)結合時のγδT細胞による殺傷のEC50は、0.060μg/ml未満、例えば、0.055μg/ml未満、特に0.020μg/ml未満であり得る。特に、上記EC50値は、抗体がIgG1フォーマットで測定される場合のものである。例えば、γδT細胞による殺傷のEC50値は、(例えば、実施例8のアッセイに記載されるように)抗体、γδT細胞、及び標的細胞のインキュベーション後にフローサイトメトリーを使用して、死細胞の割合を(すなわち細胞生死判定用色素を使用して)検出することにより測定され得る。一実施形態では、標的細胞の死滅は、細胞生死判定用色素であるViability Dye eFluor(商標)520(ThermoFisher)を使用して測定される。
これらの態様で説明されるアッセイにおいて、抗体またはその抗原結合断片は、THP-1細胞、例えば、TIB-202(商標)(ATCC)などの細胞の表面に提示され得る。任意により、THP-1細胞は、CellTracker(商標)Orange CMTMR(ThermoFisher)などの色素で標識される。
Vδ1TCRに関連するCD3分子を下方調節する薬剤
T細胞/CD3複合体に異なる様式で会合する抗体が本明細書において提供される。具体的には、これらの抗体は、Vδ1+細胞上でのみ発現されるVδ1TCRのTRDV1ドメインを介して会合することができる。そうすることで、かかる薬剤は異なる様式で機能する。その結果、この会合事象により、TCRに会合したCD3分子複合体が下方調節され得る。かかるCD3の下方調節は、T細胞の活性化と同義であり得る。しかしながら、このようにTRDV1ドメインを介してT細胞/CD3複合体と会合することにより、Vδ1TCRと会合したCDR3分子のみが下方調節される。このメカニズムは図29に明示されている。
よって、一実施形態では、抗体により細胞表面上のTRDV1を有するVδ1TCR及び会合したCD3分子複合体を下方調節する方法、ならびにこの目的のためのかかる抗体の使用が提供される。
幾つかの実施形態では、TRDV1ドメインを介してT細胞/CD3複合体と会合することができる多重特異性TCEも本明細書において提供される。現在の多重特異性TCEフォーマットの薬剤は、通常、CD3結合事象を介してT細胞に会合し、それを活性化する。これは、T細胞の表面からのCD3分子複合体の下方調節をもたらし得る。しかしながら、TCEがこのような会合及び下方調節を介してT細胞を過剰に刺激する可能性もあることも十分に理解されている。CD3分子複合体は、1つのクラスのT細胞に特異的ではないため、正確に狙える標的ではない。CD3を介して全てのT細胞(主にαβサブタイプ)を刺激すると、結果としてサイトカインの過剰産生をもたらし、急性のサイトカインフレア(いわゆるサイトカインストーム)を引き起こし得る。更に、CD3を介して全てのT細胞に会合し、それを活性化する非標的化アプローチでは、逆説的にT細胞が過剰に活性化される可能性があり、これは慢性的なT細胞の疲弊及び/またはT細胞死につながる。実際、本明細書において提供されるアプローチがエフェクター集団と特異的に相互作用するのに対し、この非特異的な汎T細胞活性化は、エフェクターT細胞及び制御性T細胞の両方の活性化を引き起こす。従って、この「強力な」アプローチは、選択的なT細胞のみを上方調節することが望まれ得る場合には決して理想的とは言えない。
対照的に、本明細書において、T細胞/CD3複合体と異なる様式で会合する多重特異性抗体、特にT細胞エンゲージャーが提供される。具体的には、これらのTCEは、Vδ1+細胞上でのみ発現されるVδ1TCRのTRDV1ドメインを介して会合することができる。そうすることで、かかるTCEベースの薬剤は異なる様式で機能する。まず、これらのTCEは、TRDV-1エピトープとの会合を介してTCRを下方調節することができる。その結果、この会合事象により、TCRに会合したCD3分子複合体が下方調節される。かかるCD3の下方調節は、T細胞の活性化と同義であり得る。しかしながら、このようにTRDV1ドメインを介してT細胞/CD3複合体と会合することにより、Vδ1TCRと会合したCDR3分子のみが下方調節される。Vδ1細胞を特異的に標的とし、活性化するこのアプローチにより、上記の問題(例えば、サイトカインストーム、T細胞の疲弊/枯渇、及びADCC)の多くを回避することが可能となる。繰り返しになるが、このメカニズムは図29に明示されている。
「強力な」CD3アプローチによるT細胞の刺激は、ADCCなどのFcγ受容体により引き起こされるメカニズムを介したT細胞の枯渇にも寄与し得る。従って、現在の医療現場で用いられているCD3を標的とする二重特異性抗体の大多数は、FcγRに対する結合活性が低減されたFcドメインを有するか、または意図的にFc領域を含まない二重特異性断片である。CD3標的化療法では、T細胞受容体複合体結合アームの結合親和性が低減されている場合もある。
この親和性の低減により、TCEの設計及び機能性に関して有効性の低下及び選択可能性の低下がもたらされ得る。例えば、かかるTCEにおける結合ドメインの親和性は、インビボでの分布プロファイルの決定要因となることが知られている。具体的には、TCEの分布は、その親和性が最も高い標的に偏ることが通常観察される。従って、T細胞複合体に対するTCE結合ドメインの親和性を低減することにより、かかるTCEの有効性を引き起こすためにまさに必要とされる細胞であるT細胞から離れた分布に偏ることが一般的である。TCEの治療域が「極めて狭い」と言われているのは、部分的にはかかる理由のためである。本明細書において提供されるアプローチは、vδ1細胞を特異的に標的とし、それを活性化し、これにより、Fc機能を除去するか、または親和性を低減する必要性が回避される。これは例えば、図37及び実施例15に示されており、これは例えば、本発明の高親和性EGFRバリアントと比較して、用量制限皮膚毒性を更に低減する可能性を示している。
更に、本明細書において提供されるアプローチでは、抗体はvδ1細胞のTCRに会合するが、腫瘍細胞も存在しない限り完全な活性化は起こらない。本明細書において提供される抗体がTCRに完全に会合すると部分的な下方調節が引き起こされ、本明細書において提供される抗体が結合したvδ1細胞は、腫瘍微小環境でのみ完全に活性化され、細胞傷害性になる。これは、本発明のアプローチの別の重要な安全上の利点となる。なぜなら、オフターゲット細胞傷害性が低減され、vδ1細胞を活性化させる本発明の抗体の効力の全てが腫瘍細胞の存在下でのみ誘発されるからである。
γδT細胞が腫瘍細胞のストレスシグナルを検出することができるメカニズムの1つは、それらが発現するNCR(自然細胞傷害性受容体)に起因すると考えられている。NCRは、腫瘍細胞上のNCRリガンドに会合することができる。従って、TCR刺激を介してγδT細胞が活性化され、NCRが腫瘍細胞を検出して、完全な活性化及び細胞傷害性を有効にする活性化の二重メカニズムが用いられる。
これは、CD3を介したαβT細胞の刺激とは対照的であり、αβT細胞の刺激は、すべての刺激がTCRを介する。従って、そのような細胞は、NCRを介した抗原提示に依存しない腫瘍細胞の感知をしないため、健常細胞または形質転換細胞の区別がほぼ不可能である。従って、CD3抗体がFc有効型である場合、それらは他の免疫細胞を誘引し、このことがサイトカインストーム、免疫細胞の疲弊及び更には過剰活性化などの予測不可能かつの望ましくない事象のカスケードを引き起こし得、これにより、例えば、T細胞を殺傷するNK細胞などがもたらされる。本発明のアプローチでは、本明細書において提供される抗体によるγδT細胞の刺激は、γδT細胞(及びNK細胞などの他の免疫細胞の両方)が、例えば、NCRによる検出メカニズムにより、健常細胞と腫瘍細胞とを区別することができ、従って、この病変細胞特異性のためにがん細胞またはウイルス感染細胞などのストレスを受けた細胞を選択的に殺傷することができるため、かかる問題を引き起こさない。
例えば、ヒト及びカニクイザルの両方のvδ1抗原(配列番号1及び配列番号172)に対する特異性を有する、本明細書で提示される抗vδ1 Fc有効型多重特異性抗体を用いた初期のカニクイザル研究では、用量漸増反復投与インビボ研究において、測定された全てのパラメータにより、安全かつ忍容性良好であることが見出された。サイトカインの放出または体重減少など、T細胞活性化に通常関連する副作用は観察されなかった。
これらの所見は、本明細書に記載されるアプローチの別の利点も強調している。具体的には、CD3エンゲージャーなどに代表されるTCEとは異なり、本発明のTCE二重特異性薬は、任意により、例えば、VH-CH1-CH2-CH3フォーマットの重鎖をVL-CLフォーマットの同族軽鎖と共に含む、全長抗体として設計され得る。より小さい二重特異性フォーマット(例えば、70KDa未満)とは異なり、かかる全長二重特異性フォーマットは、インビボでより長い半減期を示すことができ、これにより、より低頻度な投与レジメンが必要とされる。かかるフォーマットにより観察される半減期がより長いのは、サイズの増加(70KDa超)を含む種々の理由によるものであり、サイズの増加は、かかるフォーマットが腎臓により濾過されないことを意味する(糸球体の孔径のカットオフ値は60~70KDa)。一実施形態では、多重特異性抗体は、約70KDaより大きくてもよく、IMGTに収載されているヒトIGHC配列(例えば、IGHA、IGHD、IGHD、IGHM、IGHG配列)を含み得る。かかるIgG1フォーマットは、FcRnメカニズムにより再利用もされ得る。特にTCE二重特異性薬でのこのような全長抗体フォーマットの明らかな欠点は、かかるフォーマットが、クリアランス率の低下、曝露の増加、及びより慢性的な曝露に起因する好ましくない安全性プロファイルを示すことである。
従って、本発明のアプローチは、NK細胞によるγδT細胞の殺傷またはその逆などのオフターゲット効果の懸念のないFc機能の実現性を可能にする。従って、本発明のアプローチは、腫瘍環境外での副次的損傷を抑えるためにCD3親和性の低減、Fc機能の除去などの対策が必要であるという制約をもつCD3指向性アプローチよりも優れている。本明細書で提供される多重特異性抗体、特にT細胞エンゲージャーは、損傷の可能性なしにvδ1細胞に結合することができ、完全な活性化及び細胞傷害性の増強は、vδ1細胞が腫瘍細胞と密接に接触している場合にのみ起こる。
従って、一実施形態では、TCE多重特異性抗体により細胞表面上のTRDV1を有するVδ1TCR及び会合したCD3分子複合体を下方調節する方法、ならびにこの目的のためのかかる多重特異性抗体の使用が提供される。
本発明の他の特徴及び利点は、本明細書において提供される説明から明らかとなるであろう。しかしながら、この説明及び特定の例は、本発明の好ましい実施形態を示してはいるが、当業者には様々な変更及び修正が明らかになるので、例示のためにのみ与えられていることが理解されよう。次に、本発明を、以下の非限定的な実施例を用いて説明する。
実施例1:表
WO2021/032963の実施例1~19に記載されているように親抗体クローンを調製した。
親クローンのCDRの配列を以下の表23に示す。
SPR分析によって決定された親クローンのK値は次のとおりであった。
親クローンのうち5つについて、水素-重水素交換を使用してエピトープマッピングを実施した。エピトープマッピング結果の概要を表25に提示する。
実施例2:多重特異性抗体は、Vδ1+エフェクター細胞媒介性細胞傷害性の増強を付与した;組織中心疾患関連抗原の標的化。
細胞傷害性/効力アッセイ研究を行って、Vδ1+エフェクター細胞及びA-431がん細胞の共培養物に対する多重特異性抗体の効果を調査した。A-431(EGFR++;ATCC)標的細胞を384ウェルイメージングプレート(Perkin Elmer)に1,000細胞/ウェルで播種し、DMEM(10%FCS)において37℃で一晩インキュベートした。示されている抗体及び多重特異性抗体を10μg/mlに希釈してアッセイプレートに加えた(最終アッセイ濃度2μg/ml)。増大した皮膚由来Vδ1γδT細胞を組織培養フラスコから剥離し、ある範囲のE:T比(最高E:T比60:1)となるように系列希釈した後、アッセイプレートに加えた。A-431細胞を、抗体または対照の存在下、30℃、5%COでVδ1γδT細胞と共にインキュベートした。24時間のインキュベーション後、Hoechst 33342(ThermoFisher)を加えて細胞を染色した(最終2μM)。生きているA-431細胞の数を決定するため、9つの視野を10倍拡大率でキャプチャするOpera Phenixハイコンテントプラットフォームを使用して共焦点像を取得した。生細胞数は、生細胞染色のサイズ、形態、質感、及び強度に基づいて数量化した。エフェクター/標的(E:T)時間経過研究により、示されている対照、コンパレータ、抗体及び多重特異性抗体ありまたはなしのモデル系において標的細胞の50%が殺傷されるET比を決定した。結果を図31に提示する。
第1に、図31(A~D)は、抗Vδ1 VL+VH結合ドメイン(第1の標的に対する)を抗EGFR結合部位(第2の標的に対する)のCH1-CH2-CH3ドメインと組み合わせた抗Vδ1×抗TAA(EGFR)二重特異性結合部位を含む多重特異性抗体ありまたはなしで、Vδ1+/A-431共培養物を研究した共培養結果の例を提示する。用いた対照及びコンパレータは示されているとおりである;左から右:mAbなし=抗体の添加なし;D1.3=D1.3対照;D1.3 IgG LAGA=D1.3+L235A、G237A;D1.3 FS1-67=EGFR結合定常ドメインとL235A、G237Aを含むD1.3可変ドメイン;セツキシマブ(インハウスで生成した)。より具体的には、図31(A)は、前述の対照、コンパレータ、及び次の試験品:C08-LAGA=L235A、G237Aを含む1252_P01_C08;C08 FS1-67=L235A、G237Aを含有するEGFR結合ドメインと組み合わせた1252_P01_C08を用いた5時間の共培養の結果を提示する。図31(B)は、前述の対照、コンパレータ、及び次の試験品:G04-LAGA=L235A、G237Aを含む1245_P02_G04;G04 FS1-67=L235A、G237Aを含有するEGFR結合ドメインと組み合わせた1245_P02_G04を用いた5時間の共培養の同等のデータを提示する。図31(C)は、対照、コンパレータ、及び次の試験品:E07-LAGA=L235A、G237Aを含む1245_P01_E07;E07 FS1-67=L235A、G237Aを含有するEGFR結合ドメインと組み合わせた1245_P01_E07を用いた5時間の共培養の同等のデータを提示する。図31(D)は、5時間、12時間、及び24時間にわたる、対照、コンパレータ、及び試験品の存在下のVδ1γδT細胞の細胞傷害性の向上率をまとめた表を提示する。本明細書に記載される抗体またはその断片を多重特異性フォーマットで提示した場合、450%を超える増強が観察され得る。
第2に、図31(E~H)は、抗Vδ1結合ドメイン(第1の標的に対する)が完全長抗体(VH-CH1-CH2-CH3/VL-CL)を含み、次いで抗EGFR scFv結合部位(第2の標的に対する)と組み合わさった、抗Vδ1×抗TAA(EGFR)二重特異性結合部位を含む多重特異性抗体ありまたはなしで、Vδ1+/A-431共培養物を研究した結果の例を提示する。用いた対照及びコンパレータは示されているとおりである;左から右:mAbなし=抗体の添加なし;D1.3=対照;D1.3 IgG LAGA=D1.3+L235A、G237A;D1.3 LAGAセツキシマブ=L235A、G237AとC末端セツキシマブ由来scFvを含むD1.3;セツキシマブ(インハウスで生成した)。より具体的には、図31(E)は、前述の対照、コンパレータ、及び次の試験品:C08-LAGA=L235A、G237Aを含む1252_P01_C08;C08 LAGAセツキシマブ=L235A、G237A及びC末端セツキシマブ由来scFvを含む1252_P01_C08を用いた5時間の共培養を提示する。図31(F)は、前述の対照、コンパレータ、及び次の試験品:G04-LAGA=L235A、G237Aを含む1245_P02_G04;G04 LAGAセツキシマブ=L235A、G237A及びC末端セツキシマブ由来scFvを含む1245_P02_G04を用いた5時間の培養を提示する。図31(G)は、対照、コンパレータ、及び次の試験品:E07-LAGA=L235A、G237Aを含む1245_P01_E07;E07 LAGAセツキシマブ=L235A、G237A及びC末端セツキシマブ由来scFvを含む1245_P01_E07を用いた5時間の培養を提示する。図31(H)は、5時間、12時間、及び24時間にわたる、対照、コンパレータ、及び試験品の存在下のVδ1γδT細胞の効力の向上率をまとめた表を提示する。本明細書に記載される抗体またはその断片を多重特異性フォーマットで提示した場合、300%を超える増強が観察され得る。
実施例3:哺乳動物ディスプレイ
親和性成熟のために2つのクローンを選択した。上記実施例は、クローンADT1-4(G04)及びクローンADT1-7(E07)に由来する親和性成熟したクローンの調製及び特徴付けについて記述している。
ヒト抗Vδ1モノクローナル抗体の親和性成熟
親抗Vd1モノクローナル抗体を生成するために用いたファージディスプレイにより、上述のように、10nM~1μMの範囲の親和性を有する抗体がもたらされた。次いで、親抗体のクローンADT1-4(G04)及びクローンADT1-7(E07)をインビトロで親和性成熟させると、驚くべきことに、優れた標的会合のための100倍改善された親和性が達成された。親抗体のインビトロ親和性成熟は、標的化されたCDR3変異誘発を使用した親抗体配列の多様化の次に、ファージ及び哺乳動物ディスプレイプラットフォームを使用して親和性が改善された抗体の選択的濃縮を行う、2ステッププロセスを介して達成された。Kunkel変異誘発(Kunkel et al.,1987、Sidhu and Weiss,2004)及びRCA増幅を使用して、クローンADT1-4及びADT1-7のVH及びVL CDR3の2量体ライブラリを作成した。Agilentプライマー合成技術を使用して、VH及びVL CDR3における指定された位置におけるアミノ酸の単置換及び二重置換の全ての組み合わせを組み込んだ。特定の位置に組み込むべき異なるアミノ酸の数を指定した。システイン及びメチオニンは省略した。クローンのCDRに加えた変更を以下の表26にまとめる。











各ライブラリのサイズを表27に示す。
変異誘発されたVH及びVL CDR3ライブラリの生成
好適な培養液量から、適切な過剰のライブラリメンバーをカバーする変異誘発ライブラリを調製した。溶液相選択を使用する、Schofield et al.(2007)に記載されているファージディスプレイ技術を使用して、親和性成熟を行った。選択は、ヒト及びカニクイザル抗原を使用して、溶液中で行った。より高い親和性を有する変異体ライブラリからバインダーを単離するために、抗原濃度を制御して、漸増するストリンジェンシーで一連の選択を行った。図1に示すように、ヒト及びカニクイザル抗原を用いた複数ラウンドのファージディスプレイ選択を各クローンに対して行った。ADT1-4系列の場合、選択に使用した抗原濃度は、ヒトでは100nm~10pM、カニクイザル抗原では100nM及び10nMの範囲であった。ADT1-7系列については、ヒト抗原を10nM~1pMの濃度で使用し、カニクイザル抗原を100nM~100pMの濃度で使用した。図1は、ADT1-7ライブラリ(iA)、ADT1-4ライブラリ(iB)、及びカニクイザル交差反応性バインダーを単離するための選択ストラテジーによるADT1-7ライブラリ(iC)のファージ選択ラウンドを示す。
ポリクローナルファージELISAを使用して、選択の進行を評価した。ヒトDV1/GV4及びカニクイザルDV1/GV76を、150ng/ウェル、50μL/ウェルで一晩コーティングした。カニクイザルDV2/GV76及びHSAを対照として使用した。ADT4-1ライブラリからのアウトプットのみが、ヒト及びカニクイザルDV1抗原の両方に対して交差反応性であった。ADT1-7からのアウトプットはヒト抗原に対してのみ反応性であった。選択されたアウトプットをモノクローナルファージELISAによって更に特徴付けた。その概要を表28に示す。薄灰色及び濃灰色のボックスは、それぞれヒト抗原またはカニクイザル抗原のいずれかを用いて選択が実行されたことを示す。矢印は、ヒトまたはカニクイザルのVD1に対するバインダーとして分類されるクローンのパーセンテージに関する指標を提供する(上向きは高く、下向きは低い)。
配列多様性を表29にまとめる。薄灰色及び濃灰色のボックスは、それぞれヒト抗原またはカニクイザル抗原のいずれかを用いて選択が実行されたことを示す。矢印は多様性のレベルに関する指標を提供する(上向きは高く、下向きは低い)。
IgG哺乳動物ディスプレイライブラリの生成
哺乳動物ディスプレイ用の最終ライブラリを形成するために、次のADT1-4選択をポーリングした:
- ADT1-4ライブラリ1(ヒト)を作成するためのSEL2409、2412、及び2413
- ADT1-4ライブラリ2(カニクイザル)を作成するためのSEL 2418、2420、及び2415
- ADT1-7ライブラリを作成するためのSEL2370及び2404。
その後、プールを哺乳動物ディスプレイに進めた。一本鎖可変断片抗体(scFv)集団を、元の可変重鎖(VH)と可変軽鎖(VL)との対合を維持しながら、まとめてIgGフォーマットに変換した。次に、IgGフォーマットの抗体を哺乳動物ディスプレイドナーベクターにクローニングし、これを、TALEヌクレアーゼ対をコードするプラスミドとコトランスフェクトして、単一の染色体座位でのヌクレアーゼ指向性抗体遺伝子組み込みを可能にした。ファージアウトプットの多様性(10超のクローン)をカバーする哺乳動物ディスプレイ抗体ライブラリをHEK293細胞で作成した。細胞表面に抗体を発現している安定な細胞集団を、トランスフェクション2日後(2dpt)にブラストサイジンの添加によって選択した。細胞表面に抗体を発現している細胞を、磁気活性化細胞選別(MACS)による選別によって濃縮した(7dpt)。抗Fc-PEに続いて抗PEマイクロビーズで細胞を標識し、Midi MACS磁石(Miltenyi Biotec)及びLSカラムを使用して選別した。これらの細胞集団を選択に進めた。
哺乳動物ディスプレイによる成熟抗体の選択
抗体発現細胞を濃縮するためのMACSに続いて、TRDV1バインダーを同定するために2つのストラテジーを採用した。主なストラテジーには、Fc発現及び抗原結合に基づく二色蛍光選別が含まれた。もう1つには、高親和性の交差反応性バインダーを単離する可能性を最大化するための、カニクイザル抗原及びヒト抗原の両方の結合に基づく二色蛍光選別が含まれた。プロセスの概要を図2に示す。
配列、特異性、親和性のランキング及び特徴付け
8つの異なる選別された集団からゲノムDNAを抽出した。選択されたIgGをコードするDNAを増幅し、可溶性IgG1発現ベクターにクローニングした。8回の異なる選択から合計1472個のクローンが選択された。pDNAをExpi293細胞にトランスフェクトした。トランスフェクションの5日後に上清を採取し、発現した抗体の親和性を捕捉ELISAでヒト及びカニクイザルのTRDV1結合に関してランク付けした。各選択のストランドから合計93個の抗DV1抗体を、配列及びSPRオフレート分析のために選択した。さらに、これらのクローンを、ヒトTRDV1、ヒトTRDV1(A→V)、ヒトTRDV2、カニクイザルTRDV1及びBSAへの結合について、直接ELISAによって調べた。
実施例4:ヒト抗原及びカニクイザル抗原に対する結合親和性
細胞で発現された組換え抗原及びvδ1TCRへの結合:ADT1-4系列
複数の研究を行って、標的抗原に対する抗vδ1抗体の結合を調査した。vd1 TCR抗原に対するvd1 mAbの結合をELISAによって試験した。1ウェル当たり1ugのヒト抗原または1ugのカニクイザル抗原を96ウェルイムノアッセイプレート(SLS #475904)に固定化し、次いで、非特異的結合を防止するためにBSAでブロックした。1.3pmol(20ng)の各mAbを加え、室温で1時間インキュベートした。ProteinA-HRP(Abcam #Ab7456)をTMB基質(Fisher #12750000)及び停止液(Biolegend #423001)と共に使用して、450nMでの吸光度を測定することにより、抗原に対するmAbの結合を検出した。アッセイ及びプレート間のばらつきの両方の陽性対照として、親対照を含めた。ヒットは、親mAbよりも高い吸光度測定値を示すmAbとして同定された。図5Aは、1.3pmolの抗体がヒトvδ1抗原に結合したときの、親ADT1-4結合吸光度と比較した成熟ADT1-4クローンの吸光度の増加倍率を示す。図5Bは、1.3pmolの抗体がカニクイザルvδ1抗原に結合したときの、親ADT1-4結合吸光度と比較した成熟ADT1-4クローンの吸光度の増加倍率を示す。
内因性vd1-TCRへのmAbの結合について、フローサイトメトリーを使用して試験した。皮膚vd1細胞(ドナーATS006;ADT増大E0000113)またはPEER vδ1細胞株を3×10^5細胞/ウェルで96ウェル丸底プレートに播種し、3ug/mlの試験mAbを含む50ulのFACSバッファー(v/v:PBS中で2%のFCS、0.1%のNaAzide、及び1mMのEDTA)に4℃で15分間再懸濁した。細胞をペレット化し、二次抗hmIgG-APC抗体(Miltenyi #130-119-772)をFACSバッファー中に1/100で加え、4℃で更に20分間インキュベートした。細胞を洗浄し、CellFix(BD #340181)で固定し、フローサイトメトリーによって分析した。vd1表現型の割合(%)及び平均蛍光強度を計算した(Inivai Technologies、Flowlogicv7.2)。陽性対照として、親抗体を含めた。図5Cは、初代皮膚由来ヒトvδ1細胞に結合する親ADT1-4と比較した成熟型ADT1-4クローンの平均蛍光強度の増加倍率を示す。図5Dは、形質転換されたPEER vδ1細胞株に結合する親ADT1-4と比較した成熟型ADT1-4クローンの平均蛍光強度の増加倍率を示す。
細胞で発現された組換え抗原及びvδ1TCRへの結合:ADT1-7系列:
複数の研究を行って、標的抗原に対するADT1-7成熟型抗vδ1抗体の結合を調査した。vδ1 TCR抗原に対するvd1 mAbの結合をELISAによって試験した。1ウェル当たり1ugの抗原を96ウェルイムノアッセイプレート(SLS #475904)に固定化し、次いで、非特異的結合を防止するためにBSAでブロックした。滴定した6.7pmol(100ng)、1.3pmol(20ng)、及び0.27pmol(4ng)のmAbを加え、室温で1時間インキュベートした。ProteinA-HRP(Abcam #Ab7456)をTMB基質(Fisher #12750000)及び停止液(Biologend #423001)と共に使用して、450nMでの吸光度を測定することにより、抗原に対するmAbの結合を検出した。アッセイ及びプレート間のばらつきの両方の陽性対照として、親対照を含めた。ヒットは、親mAbよりも高い吸光度測定値を示すmAbとして同定された。図6Aは、1.3pmolの抗体がヒトvδ1抗原に結合したときの、親ADT1-4結合吸光度と比較した成熟ADT1-4クローンの吸光度の増加倍率を示す。
内因性vd1-TCRへのmAbの結合について、フローサイトメトリーを使用して試験した。皮膚vδ1細胞(ドナーATS006;ADT増大E0000113)またはPEER vδ1細胞株を3×10^5細胞/ウェルで96ウェル丸底プレートに播種し、3ug/mlの試験mAbを含む50ulのFACSバッファー(v/v:PBS中で2%のFCS、0.1%のNaAzide、及び1mMのEDTA)に4℃で15分間再懸濁した。細胞をペレット化し、二次抗hmIgG-APC抗体(Miltenyi #130-119-772)をFACSバッファー中に1/100で加え、4℃で更に20分間インキュベートした。細胞を洗浄し、CellFix(BD #340181)で固定し、フローサイトメトリーによって分析した。vd1表現型の割合(%)及び平均蛍光強度を計算した(Inivai Technologies、Flowlogicv7.2)。陽性対照として、親抗体を含めた。図6Bは、初代皮膚由来ヒトvδ1細胞に結合する親ADT1-4と比較した成熟型ADT1-4クローンの平均蛍光強度の増加倍率を示す。図6Cは、形質転換されたPEER vδ1細胞株に結合する親ADT1-7と比較した成熟型ADT1-7クローンの平均蛍光強度の増加倍率を示す。
親クローンと比べた改善倍率
解離増強ランタニド蛍光イムノアッセイ(DELFIA)
ヒト抗原及びカニクイザル抗原に対する親和性成熟mAbの結合における改善を確認するために、プレートに直接コーティングした抗原(50μLのPBS中3μg/mLの抗原、4℃で一晩(Nunc #437111)を用いてDELFIAイムノアッセイを行った。検出のために、DELFIA Eu-N1抗ヒトIgG(Perkin Elmer #1244-330)を、50μLの3%MPBS(PBS+3%(w/V)脱脂粉乳)中1/500の希釈度で二次抗体として使用した。展開には50μLのDELFIA増強溶液(Perkin Elmer #4001-0010)を用いた。
DELFIAイムノアッセイを使用して目的の抗体の親和性のランク付けを行った。DELFIAイムノアッセイでは、プレート上にコーティングしたGタンパク質により抗体を捕捉し、ヒト可溶性ビオチン化L1(DV1-GV4)抗原を0.4nMで加え、カニクイザル抗原DV1/GV77を10nMで加えた(3MPBS)。検出には50μLのストレプトアビジン-Eu(アッセイバッファー中1:500、Perkin Elmer)を使用し、DELFIA増強溶液でシグナルを発生させた。D1.3 hIgG1(England et al.(1999)J.Immunol.162:2129-2136に記載されている)を陰性対照として使用した。結果を図7A~Cに示す。
SPR分析 - IgG捕捉
SPR分析を使用して、親クローンと比較した親和性成熟クローンのKD値を比較した。使用機器:MASS-2(Sierra Sensors);チップ:アミン高容量(Sierra Sensors);ランニングバッファーPBS+0.02% Tween 20。実験は室温または37℃で行い、Gタンパク質をチップにカップリングした。ヒトDV1-GV4については50nM~0.2nM、カニクイザルDV1-77については100nM~1nMの範囲の希釈系列で、抗原を細胞上に流した。120秒の会合、600秒の解離、50μL/分の流速、10mMグリシンpH1.5での再生、ソフトウェアSierra Analyzerを使用したLangmuir 1:1結合による動力学的フィッティング。結果を図8A~Cに示す。
結合親和性分析(SPRによるKD)
Vδ1抗原に対するVδ1モノクローナル抗体の結合親和性
標的(すなわち、γδTCRのVδ1鎖)に対する抗体の結合親和性は、Reichert 4SPR機器(Reichert Technologies)を使用したSPR分析によって確立される。抗体(1.5ug/mL)をPlanar Protein A Sensor Chip(Reichert Technologies)にコーティングして、およそ500uRIUのベースラインの増加をもたらす。抗原(例えばL1(DV1-GV4)を、300nM~3.7nMの1:3希釈系列で、会合180秒、解離600秒、流速25μL/分、ランニングバッファーPBS+0.05%Tween 20のパラメータを用いて細胞上に流した。実験はすべて室温で行った。定常状態のフィッティングは、ソフトウェアTraceDrawer(Reichert Technologies)を使用したLangmuir 1:1結合に従って決定した。
ヒト抗原
親和性成熟したVδ1 mAbは、表面プラズモン共鳴(SPR)分析によって決定した場合、いずれの親よりも、ヒトVδ1抗原に対して大幅に増強された親和性を示す(図9)。(A、B)ADT1-4(A)またはADT1-7(B)親mAb及びそれらの親和性成熟誘導体を用いて表面プラズモン共鳴(SPR)分析を行って、ヒトVδ1抗原に対する結合親和性を決定した。Vδ1と親和性成熟したmAbとの結合相互作用は、Langmuir 1:1結合に従ってモデル化した。(C、D)は、(A)及び(B)に示されているセンサグラムから導出された、Vδ1標的化抗体の平衡解離定数(KD)をまとめた表である。データは、2つの異なるSPR機器で行った2つの反復試験の平均として表されている。(E、F)親であるADT1-4またはADT1-7と比較した、Vδ1抗原に対する親和性成熟誘導体の平衡解離定数(KD)における増加倍率を表す棒グラフ。
結論:このデータは、ADT1-4及びADT1-7の親和性成熟誘導体が、親抗体よりもヒトVδ1抗原に対して有意に高い親和性を示すことを実証する。
カニクイザル抗原
表面プラズモン共鳴分析は、ADT1-4系列の親和性成熟したVδ1 mAbが、親抗体よりもカニクイザルVδ1抗原に対して大幅に増強された親和性を示すことを実証する(図10)。(A)ADT1-4親抗体及び親和性成熟誘導体を用いて表面プラズモン共鳴(SPR)分析を行って、カニクイザルVδ1抗原に対する結合親和性を決定した。Vδ1と親和性成熟したmAbとの結合相互作用は、Langmuir 1:1結合に従ってモデル化した。(B)は、(A)に示されたセンサグラムから導出された、Vδ1標的化抗体の平衡解離定数(KD)をまとめた表である。データは、2つの異なるSPR機器で行った2つの反復試験の平均として表されている。結果を図10A及び10Bに示す。
結論:このデータは、ADT1-4の親和性成熟誘導体が、親抗体よりもカニクイザルVδ1抗原に対して有意に高い親和性を示すことを実証する。
細胞表面Vδ1 TCRに対する結合親和性(細胞表面Vδ1に対する結合のEC50)
図11A~Dに示すように、親和性成熟したVδ1 mAbは、Vδ1陽性γδT細胞に対して大幅に増強された親和性を示し、Vδ1を欠く細胞に対しては明らかな結合を示さない。(A、B)2つのγδT細胞ドナー、ATS006(A)及びTS164(B)に対するVδ1 mAbによる結合のレベル。γδT細胞を様々な濃度のVδ1 mAbで染色し、続いて蛍光抗ヒトIgG検出抗体(xxx)で染色した。すべてのインキュベーションステップは4℃で行い、フローサイトメトリーを使用して蛍光レベル中央値を測定することでmAb結合を判定した。対数4パラメータ用量応答曲線のフィッティングはGraphPad Prism 9を使用して行った。(C)2人のドナーの平均として表された、Vδ1陽性γδT細胞に結合するADT1-4及びADT1-7クローンからの平均EC50を表す棒グラフ。(D)は、(A)及び(B)でプロットされたEC50、ならびにHEK293A、Raji細胞、及び初代血中単核細胞を含む種々の白血球サブセットを含むVδ1陰性細胞種をまとめた表である。Vδ1陽性γδT細胞については、データは2人のドナーの平均として表されている。
結論:このデータは、ADT1-4及びADT1-7の親和性成熟誘導体が、Vδ1陽性γδT細胞に対しては親mAbよりも有意に高い親和性を示す一方で、Vδ1陰性細胞のHEK293T、Raji、またはPBMC中のCD8、CD4、NK、CD19、もしくは単球細胞に対する結合は示さないことを実証する。
Vδ1モノクローナル抗体の標的細胞結合
様々な標的細胞をアッセイして、Vδ1 mAb結合の特異性及び親和性を決定した。これには、増大した皮膚由来のVδ1γδT細胞、HEK293T細胞、Raji細胞、及びヒト初代血中単核細胞内の複数の白血球サブセットが含まれた。接着細胞または半接着細胞(皮膚由来Vδ1γδT細胞、HEK293T)を組織培養フラスコから剥離し、PBSに再懸濁した。同様に、非接着細胞種(Raji、PBMC)を採取し、PBSに再懸濁した。v底96ウェルプレートにウェル当たり細胞100,000個の最終密度で細胞を播種した。細胞を遠心分離にかけ、製造元の説明書に従って細胞ペレットをFcRブロッキング試薬に再懸濁し、4℃で20分間インキュベートしてから更に洗浄した。Vδ1 mAb、抗RSV IgG対照、及び抗CD3 OKT3をPBSで500nMに希釈し、PBSで1:5に系列希釈して6.4pMとし、細胞に加えた後、4℃で20分間のインキュベーションを行った。細胞表面に結合したmAbの量を決定するために、APCにコンジュゲートされたマウス抗ヒトIgG二次抗体(製品コード..、希釈度1:100)で細胞を染色した。Vδ1γδT細胞、HEK293T、及びRajiについても、生死判別色素のみで細胞を染色した。PBMCについては、αβサブセット、NK細胞、B細胞、及び単球細胞の区別が可能になるように、CD4、CD8、CD56、CD11b、及びCD19に対するコンジュゲート抗体(全て1:100)も含めた。4℃で20分間のインキュベーション後、細胞を2回洗浄し、MACSQuantを使用して蛍光を測定した。IC50を図11Dに示す。
ADT1-4系列のKD値のまとめ(ヒト及びカニクイザル)
以下の表は、ADT1-4系列の24クローン及びADT1-4親クローン(G04)のKD値を提供する(ヒトTRDV1及びカニクイザルTRDV1への結合について)。
Figure 2024509332000053
ADT1-7系列のKD値のまとめ(ヒトのみ)
以下の表は、ADT1-7系列の11クローン及びADT1-7親クローン(E07)のKD値を提供する(ヒトTRDV1への結合のみ)。
Figure 2024509332000054

Figure 2024509332000055

Figure 2024509332000056
実施例5.機能の特徴付け
TCR下方調節に対するVδ1モノクローナル抗体
TCR発現を測定することによって、γδT細胞受容体と会合した結果それを下方調節するADT mAbの能力を評価する。皮膚γδT細胞(ドナーATS006及びTS164由来)を、96ウェル丸底プレートに、γδ培地中3×10^5細胞/mlで、PBSで希釈した漸増濃度の試験mAb(0.00067~67nMの範囲)または最高濃度(67nM)の対応するアイソタイプ対照(hIgG1、RSV)と共に播種した。細胞を37℃の加湿CO2チャンバ内で2時間インキュベートした。細胞を洗浄し、死細胞(Thermo Fisher #15580607)及びそれらのVD1 TCR(Miltenyi #130-117-697)について4℃で30分間染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences #340181)に再懸濁した後、4℃の暗所で一晩インキュベートした。翌日、MACS Quant Analyzer 16を使用したフローサイトメトリーにより、蛍光強度中央値(MFI)により決定されるVD1 TCRの発現レベルを測定した。
結果を図12に示す。これは、親和性成熟したVδ1 mAbが、それらの親クローン及びOKT3よりも効果的にVδ1 TCRに結合し、それを下方調節することを示している。(A及びB)。γδ細胞をVδ1 mAb及びOKT3と2時間インキュベートした後、Vδ1 TCRをa-Vδ1 TCR-PE-Vio770で染色する前のγδTCR発現の数量化。α-Vδ1染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、TCR陽性ゲートから計算した後、TCR陽性の未処理γδ細胞のMFIから%MFIを計算した。上のグラフはADT1-4系列からのデータを表し、下のグラフはADT1-7系列からのデータを表す。(C)は、(A)から計算されたIC50値を表す棒グラフである。(D及びE)。親ADT1-4(左)及びADT1-7(右)からの改善倍率として提示された、(B)のIC50値を表す棒グラフ。(F)ADT1-4(上)及びADT1-7(下)のそれぞれの親から計算された改善率と共に(B)からのIC50値を表す表。(G)ADT1-4(上)及びADT1-7(下)のそれぞれの親から計算された改善倍率と共に(B)からのIC50値を表す表。
CD107a発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体
CD107a発現を測定することによって、VD1 γδ細胞と会合してそれを活性化するADT mAbの能力を評価する。皮膚γδT細胞(ドナーATS006由来)を、96ウェル丸底プレートに、γδ培地中6×10^5細胞/mlで、1.2×10^6細胞/mlのTHP-1細胞(ATCC-TIB-202)、及びPBSで希釈した漸増濃度の試験mAb(0.00067~67nMの範囲)または最高濃度(67nM)の対応するアイソタイプ対照(hIgG1、RSV)と共に播種した。細胞を37℃の加湿CO2チャンバ内で2時間インキュベートした。細胞を洗浄し、死細胞(Thermo Fisher #15580607)、VD1 TCR(Miltenyi #130-117-697)、及びaCD107a(Miltenyi #130-112-610)について4℃で30分間染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄した後、4℃の暗所で一晩インキュベートした。翌日、MACS Quant Analyzer 16を使用したフローサイトメトリーにより、蛍光強度中央値(MFI)により決定されるVD1 TCR及びCD107aの発現レベルを測定した。
結果を図13に示す。これは、親和性成熟したVδ1 mAbが標的細胞の存在下でのみ活性化を誘導することを示している。(A及びB)γδ細胞をADT1-4-2単独(上)及びTHP-1細胞(下)と共に1:2の標的対エフェクター比で2時間インキュベートした後、Vδ1 TCR及びCD107aをそれぞれa-Vδ1 TCR-PE-Vio770及びa-CD107a-VioBlueで染色する前の、γδ TCR発現(黒)及びCD107a発現(灰色)の数量化。Vδ1染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、TCR陽性ゲートから計算した後、TCR陽性で未処理の非共培養γδ細胞のMFIから%MFIを計算した。CD107a染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、「NOT THP-1」ゲートから計算した後、未処理の非共培養γδ細胞のCD107a MFIから%MFIを計算した。(C及びD)γδ細胞をADT1-7-3単独(上)及びTHP-1細胞(下)と共に1:2の標的対エフェクター比で2時間インキュベートした後、Vδ1 TCR及びCD107aをそれぞれa-Vδ1 TCR-PE-Vio770及びa-CD107a-VioBlueで染色する前の、γδ TCR発現(黒)及びCD107a発現(灰色)の数量化。Vδ1染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、TCR陽性ゲートから計算した後、TCR陽性で未処理の非共培養γδ細胞のMFIから%MFIを計算した。CD107a染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、「NOT THP-1」ゲートから計算した後、未処理の非共培養γδ細胞のCD107a MFIから%MFIを計算した。(E)未処理の非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理した共培養細胞からのγδ CD107a発現の増加率を表す表。(F)未処理の、共培養γδ細胞及び非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理した共培養細胞からのγδ CD107a発現の増加率を表す表。
CD25発現によって測定されるγδ活性化に対するVδ1モノクローナル抗体
CD25発現を測定することによって、VD1 γδ細胞と会合してそれを活性化するADT mAbの能力を評価する。皮膚γδT細胞(ドナーATS006由来)を、96ウェル丸底プレートに、γδ培地中6×10^5細胞/mlで、1.2×10^6細胞/mlのTHP-1細胞(ATCC-TIB-202)、及びPBSで希釈した漸増濃度の試験mAb(0.00067~67nMの範囲)または最高濃度(67nM)の対応するアイソタイプ対照(hIgG1、RSV)と共に播種した。細胞を37℃の加湿CO2チャンバ内で24時間インキュベートした。細胞を洗浄し、死細胞(Thermo Fisher #15580607)、VD1 TCR(Miltenyi #130-117-697)、及びCD25(Miltenyi #130-113-280)について4℃で30分間染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄した後、4℃の暗所で一晩インキュベートした。翌日、MACS Quant Analyzer 16を使用したフローサイトメトリーにより、蛍光強度中央値(MFI)により決定されるVD1 TCR及びCD107aの発現レベルを測定した。
結果を図14に示す。これは、親和性成熟したVδ1 mAbが標的細胞の存在下でのみ活性化を誘導することを示している。(A及びB)γδ細胞をRSV(67nMで添加)及びADT1-4-2単独(上)ならびにTHP-1細胞(下)と共に1:2の標的対エフェクター比で24時間インキュベートした後、Vδ1 TCR及びCD25をそれぞれa-Vδ1 TCR-PE-Vio770及びa-CD25-VioBlueで染色する前の、γδ TCR発現(黒)及びCD25発現(灰色)の数量化。Vδ1染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、TCR陽性ゲートから計算した後、TCR陽性で未処理の非共培養γδ細胞のMFIから%MFIを計算した。CD25染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、「NOT THP-1」ゲートから計算した後、未処理の非共培養γδ細胞のCD25 MFIから%MFIを計算した。(C及びD)γδ細胞をRSV(67nMで添加)及びADT1-7-3単独(上)ならびにTHP-1細胞(下)と共に1:2の標的対エフェクター比で2時間インキュベートした後、Vδ1 TCR及びCD25をそれぞれa-Vδ1 TCR-PE-Vio770及びa-CD25-VioBlueで染色する前の、γδ TCR発現(黒)及びCD25発現(灰色)の数量化。Vδ1染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、TCR陽性ゲートから計算した後、TCR陽性で未処理の非共培養γδ細胞のMFIから%MFIを計算した。CD25染色のMFIをフローサイトメトリーを使用して取得し、「NOT THP-1」ゲートから計算した後、未処理の非共培養γδ細胞のCD25 MFIから%MFIを計算した。(E)未処理の非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理した共培養細胞からのγδ CD25発現の増加率を表す表。(F)未処理の、共培養γδ細胞及び非共培養γδ細胞と比較した、最高濃度のVδ1 mAbで処理した共培養細胞からのγδ CD25発現の増加率を表す表。
カニクイザルTCR下方調節
カニクイザルvδ1γδT細胞に結合してそのTCR下方調節を誘導するADT1-4-2の能力を調査するために、複数の研究を行った。これらの研究では、カニクイザルのPBMCを新鮮な血液から収集し、14日間培養してγδ-T細胞を増殖させた。代替的に、抗αβ抗体(クローンR73)でコーティングされた磁気ビーズを使用してαβ-T細胞を全PBMC集団から枯渇させ、その後インビトロで増大させた。増大は次の通りであった。U底96ウェルプレートの各ウェルで、10%のFCS、抗生物質(P/S)、及びサイトカインのカクテル(IFNγ、IL21、IL4、IL1β及びIL15)を含むRPMI-1640培地中に、250,000個の細胞を加えた。7日後、10%のFCS、抗生物質(P/S)、ならびにサイトカインIL21及びIL15を含む10μlの新鮮培地を細胞に添加した。続いて11日目に、10%のFCS、抗生物質(P/S)及びIL15を含む新鮮培地と100μlの培地を交換した。14日目に細胞を収集し、TCR下方調節アッセイに供した。このアッセイは、細胞を様々な濃度の抗体と2時間混合することからなる。インキュベーション時間後、CD3、TCR-αβ、TCR-γδ、及びVD1のマーカーについてフローサイトメトリー分析のために細胞を染色した。生細胞集団を区別するために、生/死細胞色素も含めた。CD3+、TCR-γδ+、及びVD1+細胞集団をゲーティングすることによってフローサイトメトリー分析を行い、VD1平均蛍光強度をVD1+ゲート内で測定した。アイソタイプ対照(抗RSV)または抗体なしを、最高濃度のみで陰性対照として使用した。データは、抗体を含まない対照に対して正規化した。図15(A)は、カニクイザルγδ-T細胞上のVD1に会合し、その発現を低減させるADT1-4-2及びADT1-4の能力の比較を示す。結果は、ADT1-4-2で処理した際にはVD1発現の用量応答低減があったが(33.3nMで最大76%)、ADT1-4抗体ではそれがなかったことを示す。この特定のアッセイでは、αβ-T細胞が枯渇した集団からγδ-T細胞を増大させた。500倍の濃度範囲を使用した。図15(B)は、ADT1-4-2で処理した際のVD1の細胞表面発現のパーセンテージを示す。このアッセイでは、γδ-T細胞の増大は全PBMC集団からのものであった。10,000倍の濃度範囲を使用した。データは、一例として2人の異なるドナー(AD8170及びAM945BA)におけるVD1細胞発現の用量応答低減を示している。合計4人のドナーを試験し、GraphPad Prismの非線形フィット曲線関数を使用してEC50を個別に抽出した。図15(C)は、平均及び標準偏差と組み合わせた、異なるドナーの個々のEC50値を示す。平均は3.83±2.23nMである。
抗体:
CD3-AF700(BD Bioscience、クローンSP34-2、参照:557917)
TCR-αβ-AF647(BioLegend、クローンR73、参照:201116)
TCR-γδ-BV421(BioLegend、クローンB1、参照:331218)
VD1-PE(eBioscience、クローンTS8.2、参照:12-5679-42)
親和性成熟クローンの増強された細胞傷害性
ADT1-4及びADT1-7両方のVδ1クローンの親和性成熟は、インビトロTHP-1殺傷アッセイにおいてVδ1γδT細胞の細胞傷害効果を有意に増強する
THP-1細胞殺傷アッセイ
Vδ1 mAb及び抗RSV IgG対照をPBSで1μg/mlに希釈し、PBSで1:10に系列希釈した後、384ウェルのウルトライメージングアッセイプレート(Perkin Elmer)に加えた。RPMI、10%FCS(Invitrogen)で培養したTHP-1細胞(ATCC)を、[0.5μM]のCellTrace CFSE生細胞色素で20分間染色した。増大した皮膚由来Vδ1γδT細胞を組織培養フラスコから剥離し、基礎増殖培地に再懸濁した後、懸濁状態でTHP-1細胞と1:1で混合した。細胞懸濁液を384ウェルアッセイプレートに播種して、最終的な細胞播種密度をウェル当たりTHP-1細胞1,000個、及びウェル当たりVδ1γδT細胞2,000個とした。最終アッセイ容量で200ng/ml~0.2pg/mlの範囲の濃度までmAbを希釈した。THP-1及びVδ1γδT細胞を、Vδ1 mAbの存在下、37℃、5%COで24時間培養した。24時間後の生きているTHP-1細胞の数を決定するため、9つの視野を10倍拡大率でキャプチャするOpera Phenixハイコンテントプラットフォームを使用して共焦点像を取得した。生細胞数は、生細胞染色のサイズ、形態、質感及び強度に基づいて数量化した。
図16は、親和性成熟したVδ1 mAbが、親クローンと比較して、THP-1高含量細胞傷害性アッセイにおいて増強された効力を示すことを示す。(A及びB)Vδ1 mAbまたは対照の存在下でのγδ T細胞との24時間の共培養後の生THP-1細胞数の数量化[エフェクター:標的比2:1]。細胞数は、γδT細胞なしの対照(100%)に対するパーセンテージとして正規化した。OKT3(抗CD3抗体)及び抗RSVアイソタイプ対照をアッセイ対照として含めた。細胞数は、生細胞に対するハイコンテント共焦点顕微鏡法を使用して計算した。グラフは、親ADT1-4(A)及びADT1-7(B)クローンを表すものである。(C)OKT3対照、ならびにADT1-4及びADT1-7クローンからの平均EC50を表す棒グラフ。データは、n=3の生物学的複製物の平均±標準偏差として表されている。(D)は、(C)にプロットされたEC50をまとめた表である。データは、ADT1-4及びADT1-7親クローンと比較した平均値、標準偏差、変化倍率、及び改善率として表されている。
抗体依存性細胞傷害(ADCC)に対するVδ1モノクローナル抗体
3人のドナー由来の増大した皮膚由来Vδ1γδT細胞を組織培養フラスコから剥離し、基礎増殖培地に再懸濁し、白色96ウェルプレートにウェル当たり20,000細胞の最終密度で播種した。Raji細胞を同様にウェル当たり20,000個で播種し、CD20標的化抗体リツキシマブによって誘導されるADCCの陽性対照として使用した。mAbを希釈し、1~100nMの範囲の最終濃度で各ウェルに加えた。FcγRIIIa+ ADD Bioassayエフェクター細胞を解凍し、62,500個の細胞を各ウェルに加えた後、37℃、5%COで4.5時間インキュベートした。ルシフェリンを含むBio-Glo試薬を各ウェルに加えた後、更に10分間インキュベートし、プレートリーダーを使用して発光を測定した。
図17は、Vδ1標的化mAbが、無視できる抗体依存性細胞傷害(ADCC)を誘導することを示す。ADCCは、FcγRIIIa+エフェクター細胞内のルシフェラーゼ活性の誘導によって下流のNFATシグナル伝達を測定するサロゲートレポーターアッセイを使用して測定される。エフェクター細胞を、3人のγδT細胞ドナー(エフェクター:標的比3)及び様々な濃度のモノクローナル抗体と共培養した。CD20Raji細胞及びリツキシマブを陽性対照として含めた。4.5時間の共培養後に生物発光を測定した。データは、3つの生物学的複製物(3人のγδT細胞ドナー)の平均±SDとして表されている。
結論:このデータは、ADT1-4親及び親和性成熟誘導体ADT1-4-2がADCCを誘導しないことを示しており、これは、NFATシグナル伝達がルシフェラーゼ活性を誘導するFcγRIIIa+エフェクターレポーター細胞株を介して実証された。ただし、OKT3は高レベルのADCC特異的シグナル伝達を誘導するようである。
補体依存性細胞傷害(CDC)に対するVδ1モノクローナル抗体
増大した皮膚由来Vδ1γδT細胞を組織培養フラスコから剥離し、基礎増殖培地に再懸濁し、白色96ウェルプレートにウェル当たり75,000細胞の最終密度で播種した。Raji細胞を同様にウェル当たり75,000個で播種し、CD20標的化抗体リツキシマブによって誘導されるCDCの陽性対照として使用した。mAbを希釈し、1~100nMの範囲の最終濃度で各ウェルに加えた。ヒト血清を、新鮮なまま、または熱不活化して、最終濃度40%まで加えた。熱不活化は、血清を56℃の水浴中で30分間温め、続いて氷上で冷却することによって行った。次いで培養物を37℃、5%COで24時間インキュベートした。24時間後、生細胞の数を決定するために、細胞を採取し、1:1000の希釈度のxx生死判別色素で20分間染色した。MACSQuantを使用して蛍光を測定し、生死判別色素の陰性染色に基づいて生細胞数を数量化した。
結果を図18に示す。これは、Vδ1標的化mAbが補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導しないことを示している。40%ヒト血清及び50nM抗CD3 OKT3または抗Vδ1 ADT1-4-2、ならびに様々な濃度のモノクローナル抗体と培養した後の生存γδT細胞の数。血清は新鮮な状態で使用するか、または事前に熱不活化した。CD20Raji細胞及びリツキシマブを陽性対照として含めた。24時間の共培養後に生死判別色素によって生存率を測定した。データは、3つの生物学的複製物の平均±SDとして表されている。
結論:このデータは、ADT1-4-2が補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導せず、補体含有血清の存在下でVδ1陽性細胞の細胞傷害性が増加しないことを実証する。ただし、リツキシマブは、CD20陽性Raji細胞に対する強いCDC刺激を示す。
健常細胞の温存
複数の研究を行って、健常細胞に対する細胞傷害性に関する、抗vδ1抗体によるvδ1細胞の刺激/活性化の効果を調査した。これは、抗vδ1クローンADT1-4-2をPBMCとインキュベートしてから単球の細胞傷害性及びアポトーシスを評価することによって試験した。
凍結保存されたヒト末梢血単核細胞(PBMC)を3人の健康なドナーから商業的に調達した。PBMCを、丸底96ウェル組織培養プレートに、10ng/mlのIL15を含む250ulの完全培地(10%FCS、pen/strep、非必須アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、及びHEPESを補ったRPMI)中、250,000細胞/ウェルで播種した。滴定vδ1抗体ADT1-4-2を6.6nMの最終濃度まで加えた。RSV IgG、IgG2α、及びOKT3抗体を対照として含めた。刺激は20時間にわたって行った。フローサイトメトリー分析をエンドポイントで実施して、vδ1細胞に対する各条件での単球表現型及びアポトーシス性単球を決定した。細胞はまず、生きている一重項でゲーティングし、続いてCD14(Miltenyi 130-110-523)でゲーティングして、単球を同定した。次に、陽性のApoTracker Green染色(Biolegend 427402)によってアポトーシス性単球を同定した。
図19A(左上パネル)は、標的会合の指標としての抗体刺激時のvδ1 TCR染色のMFIを示す。図19B(右上パネル)及び19C(下パネル)は、抗体刺激後のエンドポイントの単球表現型及びアポトーシス性単球(それぞれ)を示す。vδ1抗体クローンADT1-4-2での刺激によってVδ1細胞が会合したが、健常な単球の細胞傷害性は引き起こされなかった。
実施例6.原発腫瘍生検からのTIL集団に対する抗Vδ1抗体の効果
抗Vδ1抗体は、腫瘍浸潤リンパ球の活性化、増殖、及び細胞傷害性を促進した。
抗Vδ1抗体によって付与されるヒト腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の調節を調査するために、複数の研究を行った。これらの研究では、ヒト腎細胞癌(RCC)腫瘍生検が新鮮な状態で輸送され、受領時に処理された。生検は、約2mmの大きさの小片に切断され、TILは、Kupper及びClarke(Clarke et al,2006)によって最初に記述された方法を応用した方法を使用して取得された。具体的には、最大4つの2mmの生検を9mm×9mm×1.5mmのCellfoamマトリクスに配置し、24ウェルプレートのウェルごとに1つのマトリクスを配置した。次に、4%ヒト血漿、β-メルカプトエタノール(50μM)、ペニシリン(100U/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、アンホテリシンB(2.5μg/ml)、HEPES(10mM)、ピルビン酸Na(1mM)、MEM非必須アミノ酸溶液(1X)及びIL-15(2ng/ml、Miltenyi Biotech)を添加した2mlのイスコフ改変ダルベッコ培地(IMDM)で生検を行った。1mlの培地を3~4日ごとに吸引し、2×濃縮IL-15を含有する1mlの完全培地と交換した。10日後または11日後にTILを採取し、70μMナイロンセルストレーナーに通し、300×gで5分間遠心分離し、計数のために完全培地に再懸濁した。次いで、96ウェルプレートにウェル当たり400,000個の細胞をプレーティングした後、抗Vδ1抗体で刺激した。2ng/mlまたは50ng/mlの濃度のIL-15の存在下で、ADT1-4、ADT1-4-2、ADT1-7-3、またはRSV IgG1アイソタイプ対照抗体によってTILを刺激した。
図20(A及びB)は、2人の別々のドナーにおける48時間(A)または72時間(B)のmAb刺激後の総腫瘍浸潤γδT細胞におけるVδ1 TCR発現の減少%を示し、各事例における標的会合を裏付けている。腫瘍浸潤Vδ1細胞をCD25及びKi67の発現について分析した。図20(C)は、IgG1アイソタイプ対照またはADT1-4による刺激と比較して、ADT1-4-2による48時間の刺激後のVδ1T細胞におけるCD25及びKi67両方の発現が増強されたことを示す。mAbで刺激されたTILの培養物からの上清を、MSDによってサイトカイン産生について分析した。図20(D)は、50ng/mlのIL-15の存在下でADT1-4-2またはADT1-7-3によって72時間刺激されたTILによるIFN-γ産生の実質的増加倍率を示す。図20(E)は、ADT-1-4-2またはADT1-7-3によるTILの刺激が、この時点で17型関連サイトカインIL-6またはIL-17の分泌を増強しなかったことを示す。
代替的に、異なるドナーからの生検材料を受領時に酵素消化して単一細胞懸濁液を得た。具体的には、最大1gの組織を、MiltenyiのTumour Dissociation Kitの酵素(関連細胞表面分子の切断を防止するために0.2倍濃度で使用した酵素Rを除いては製造元が推奨する濃度)を補った4.7mlのRPMIと共に、Miltenyi Cチューブに入れた。C管は、加熱ブロックが取り付けられたgentleMACS(商標)Octo Dissociatorに配置された。小腫瘍の解離のためにプログラム37C_h_TDK_1を選択した。1時間後、消化物を70μMフィルターで濾過し、4%ヒト血漿を含む完全IMDMを加えて酵素活性をクエンチした。次に、細胞を2回洗浄し、計数のために完全IMDMに再懸濁させた。細胞数に応じて、ウェル当たり2×10または4×10個の細胞を48ウェルプレートにプレーティングし、2ng/mlの濃度のIL-15の存在下で、ADT1-4、ADT1-4-2、またはRSV IgG1アイソタイプ対照抗体によって刺激した。酵素消化によって単離されたTILを、mAb刺激の24~72時間後にフローサイトメトリーによって分析した。図20(F及びG)は、2人の別々のドナーにおけるmAb刺激後24時間(F)または72時間(G)の総腫瘍浸潤γδT細胞におけるVδ1 TCR発現の減少%を示し、酵素消化によって単離されたTILにおける標的会合を裏付けている。図20(H)は、ADT1-4-2による72時間の刺激後のγδT細胞上のKi67発現の用量依存的な増強を示す。mAbで刺激されたTILの培養物からの上清を、MSDによってサイトカイン産生について分析した。図20(I及びJ)は、酵素消化によって2人の各ドナーから単離され、2ng/mlのIL-15の存在下で6.66nMの濃度のADT1-4-2で刺激されたTILによって、24時間(I)及び72時間(J)の2つの時点で産生されたIFN-γの増加倍率を示す。まとめると、これらの総合結果は、親和性成熟した抗Vδ1抗体が、刺激後72時間以内に腫瘍浸潤γδT細胞による活性化、増殖、及び抗腫瘍原性サイトカイン産生を推進できることを強調している。
別の実験では、肺腫瘍由来のTILをグリッドマトリクス上で単離し、2ng/mlのIL-15の存在下でADT1-4、ADT1-4-2、またはIgG1アイソタイプ対照によって10日間刺激した。図21(A)は、ADT1-4-2で10日間刺激されたγδT細胞におけるCD25及びKi67の発現の増強を示す。図21(B)は、ADT1-4-2による10日間の刺激後のパーフォリングランザイムBγδT細胞の実質的な増加を示す。より長期間にわたるmAbでの刺激により、抗Vδ1抗体で刺激されたVδ1T細胞を介したαβ T細胞の免疫ライセンシングの分析が可能になった。図21(C)は、ADT1-4-2で腫瘍浸潤Vδ1T細胞を10日間刺激した後、CD8及びCD8の両方のαβ T細胞によるグランザイムB及びパーフォリンの発現が大幅に増強されたことを示す。mAbと共に10日間培養したTILからの上清をMSDによって分析した。図21(D)は、ADT1-4-2による刺激後の肺腫瘍由来TILによる、IFN-γの産生の顕著な増加、ならびにIL-17及びIL-6の産生の中程度の増加を示す。図21(E)は、ADT1-4-2による10日間の刺激後のTILによるケモカインCCL2、CCL4及びCXCL10の産生の増強を示す。まとめると、これらの結果は、抗Vδ1抗体が腫瘍浸潤γδT細胞の活性化及び細胞傷害性を推進でき、それによって腫瘍浸潤αβT細胞の細胞傷害性が推進され得ることを強調している。
実施例7.ヒトVδ1及びヒトEGFR抗原に対するVδ1-EGFR二重特異性抗体の結合親和性
標的(すなわち、γδTCRのVδ1鎖及びEGFR)に対する抗体の結合親和性は、Reichert 4SPR機器(Reichert Technologies)を使用したSPR分析によって確立される。抗体(1.5ug/mL)をPlanar Protein A Sensor Chip(Reichert Technologies)にコーティングして、およそ500uRIUのベースラインの増加をもたらす。組換えヒトVδ1ヘテロ二量体またはヒトEGFRを、100nMの濃度で、会合180秒、解離480秒、流速25μL/分、ランニングバッファーPBS+0.05%Tween 20のパラメータを用いて細胞上に流した。実験はすべて室温で行った。結果を図26A及び26Bに示す。
結論:このデータは、Vδ1/EGFR二重特異性抗体が、ヒトEGFR結合能の導入にもかかわらず、その調製に使用された単特異性抗Vδ1抗体のものに匹敵するヒトVδ1への結合を示すことを実証する。
実施例8. Vδ1-EGFR二重特異性抗体の標的細胞結合
EGFR/Vδ1二重特異性抗体の結合の特異性及び親和性を決定するために、EGFR陽性A431及びVδ1陽性初代γδT細胞をアッセイした。標的細胞を組織培養フラスコから剥離し、PBSに再懸濁し、v底96ウェルプレートにウェル当たり細胞100,000個の最終密度で播種した。細胞を遠心分離にかけ、製造元の説明書に従って細胞ペレットをFcRブロッキング試薬に再懸濁し、4℃で20分間インキュベートしてから更に洗浄した。抗体をPBSで500nMに希釈し、PBSで1:10に系列希釈して50pMとし、細胞に加えた後、4℃で20分間のインキュベーションを行った。細胞表面に結合したmAbの量を決定するために、生死判別色素に加えて、APCにコンジュゲートされたマウス抗ヒトIgG二次抗体(希釈度1:100)で細胞を染色した。4℃で20分間のインキュベーション後、細胞を2回洗浄し、MACSQuantを使用して蛍光を測定した。結果を図27に示す。
結論:このデータは、Vδ1/EGFR二重特異性抗体が、EGFR陽性A431細胞株への結合の導入にもかかわらず、その調製に使用された単特異性抗Vδ1抗体のものに匹敵するVδ1陽性γδT細胞への結合を示すことを実証する。
実施例9.インビトロでのγδT細胞の活性化及び標的細胞傷害性の評価
増大した皮膚由来Vδ1γδT細胞及びA431細胞を組織培養フラスコから剥離し、基礎増殖培地に再懸濁し、所望のエフェクター:標的比に応じた適切な細胞希釈度で96ウェルプレートに播種した。mAbを希釈し、規定濃度で各ウェルに加えた。次いで培養物を37℃、5%CO2で4時間(D)または24時間(A~C、E)インキュベートした。生細胞の数を決定するために、細胞を採取し、1:1000の希釈度の生死判別色素で20分間染色した。CD25の状態を決定するために、細胞を採取した後、細胞表面を抗CD25抗体で染色した。脱顆粒を測定するために、フルオロフォアにコンジュゲートした抗CD107α抗体を共培養開始時に細胞-抗体ミックスに直接加えた。2回の洗浄及び細胞固定の後、MACSQuantを使用して蛍光を測定し、生細胞数及び蛍光強度中央値を決定した。結果を図28に示す。
結論:このデータは、Vδ1/EGFR二重特異性抗体が初代Vδ1陽性γδT細胞の活性化及び脱顆粒を誘導し、EGFR陽性A431細胞株の細胞媒介性溶解を増加させることを実証する。
実施例10.本発明の抗体により付与されるγδT細胞活性化及び非枯渇効果の更なる評価
複数の研究を行って、vδ1細胞におけるCD3の下方調節に関する、抗vδ1抗体によるvδ1細胞の刺激/活性化の効果を調査した。これは、抗vδ1クローンADT1-4-2をPBMCと共にインキュベートし、次いで表現型解析によりTCRを分析することによって試験した。
凍結保存されたヒト末梢血単核細胞(PBMC)を商業的に調達し、丸底96ウェル組織培養プレートに、10ng/mlのIL15を含む250ulの完全培地(10%FCS、pen/strep、非必須アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、及びHEPESを補ったRPMI)中、250,000細胞/ウェルで播種した。滴定vδ1抗体ADT1-4-2を、1ug/ml(6.67nM)、0.01ug/ml(0.067nM)、または0.0001ug/ml(0.00067nM)の最終濃度まで加えた。一致する濃度の対照としてRSV IgG抗体を含めた。3日毎に培地及び抗体を補充しながら、培養物を14日間インキュベートした。各条件でvδ1細胞及びTCR発現の表現型解析を行うために、エンドポイントでフローサイトメトリー分析を行った。細胞はまず、生きている一重項でゲーティングし、続いて汎γδ(Miltenyi REA592;130-113-508)でゲーティングし、これはvδ1(Miltenyi REA173;130-100-553)のための親ゲートであり、これ自体がCD3(Miltenyi REA613;130-113-142)のための親ゲートであった。細胞集団を陽性染色によって同定し、次いでMFIによって試料間の各マーカーの相対的な発現レベルを同定した。
図29Aは、mAb標的会合の指標としての抗体刺激時のvδ1 TCRのMFIを示す。図29Bは、陽性ゲーティングされたvδ1細胞におけるCD3発現のMFIを示す。vδ1抗体クローンADT1-4-2による刺激はvδ1細胞を会合させ、vδ1細胞上のvδ1及びCD3の両方の下方調節をもたらした。
実施例11:抗vδ1抗体はADCCを誘導しない。
ADCC Reporter Bioassay(Promega)を使用して、抗vδ1抗体によって誘導されるADCC(抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性)のレベルを対照抗体と比較して評価した。
ADCCは、抗体でタグ付けされた標的細胞をエフェクター細胞が殺傷する生物学的現象を指す。エフェクター細胞は、そのFcγ受容体を介して抗体に結合し、続いて標的細胞を殺傷する。ここで提示するADCCレポーターバイオアッセイは、NFAT(活性化T細胞核内因子)経路による遺伝子転写の活性化を介してADCCの早期開始を検出することにより、アッセイ内で試験される抗体の潜在的なADCC作用メカニズムを明らかにする。このレポーターアッセイは、NFAT経路に連結した高親和性FcγRIIIa受容体を発現するエフェクター細胞(Jurkats)を利用する工学操作系であり、活性化されるとホタルルシフェラーゼ酵素のさらなる活性化を誘導するように、さらに工学操作されている。ルシフェラーゼ活性は、発生するADCCのレベルに相関し得る発光の読み取り値によって数量化される。
このアッセイは、抗vδ1抗体、または好適には多重特異性抗体の抗vδ1アームが、ADCC反応を推進するかどうかを理解するために利用した。利用した標的細胞は、vδ1γδTCRを介して抗vδ1抗体に結合するγδ細胞であった。ADCC作用メカニズムが存在する場合、抗vδ1抗体は、アッセイエフェクター細胞上のFcγ受容体と結合し、発光シグナルを生成する。シグナルが生成されなければ、これはADCCが発生していないことを示唆する。
このアッセイには、ADCC Reporter Bioassay Kit(Promega)を用いた。Bio-Glo Luciferaseアッセイバッファーのボトル1本を解凍し、基質ボトルに移した。この混合物を4~6時間室温に保った。次の抗体:抗vδ1抗体(ADT1-4-2)、同じ抗vδ1抗体だがFc無効型(L235A、G237A)(ADT1-4-2 LAGA)、リツキシマブ、RSV及びOKT3について、10nM~0.01nM(最終濃度)の範囲の抗体濃度(3X濃度)で希釈プレートを調製した。標的細胞(γδ細胞)をウェル当たり25μlで2つのアッセイプレートに播種した。次いで、抗体希釈プレートから適切な抗体溶液25μlを適切なウェルに移した。エフェクター細胞(工学操作されたJurkat細胞)を温かいアッセイバッファーに解凍し、4mlのアッセイバッファーに再懸濁し、25μlのエフェクター細胞溶液を各ウェルにピペットで入れた。次いで、プレートを37℃で4.5時間インキュベートした。インキュベーション期間の後、プレートを室温まで平衡化させ、その後、75μlのBio-Glo Luciferase Assay試薬を各ウェルに加え、プレートを室温で10分間インキュベートした。次いで、Biotek H4プレートリーダーを使用してプレートを読み取り、プレートから発光シグナル(相対光単位RLUとして)を収集した。誘導倍率は、次の等式を使用して計算した:誘導倍率=RLU(誘導-バックグラウンド)/RLU(無抗体対照-バックグラウンド)。
陽性対照としてOKT3(抗CD3抗体)を使用した。追加の陽性対照として、対照ウェルにはγδ細胞の代わりにRaji細胞を播種した。Raji細胞は、抗CD20抗体であるリツキシマブと併用すると強力なADCC反応を示すように使用される一般的に許容されている細胞株である。内部対照として、かつ抗vδ1抗体がγδ細胞におけるvδ1結合の非存在下でADCCを駆動するかどうかを理解するために、本発明の抗vδ1抗体と、同じ抗vδ1抗体だがFc無効型(L235A、G237A)とを、エフェクター細胞単独と共に加えた。
結果を図30に示す。
結論:Raji細胞と共にリツキシマブを使用した陽性対照では強力なADCC反応が示され、γδ細胞に対するOKT3ではさらに強力なADCC反応が示された。対照的に、本発明の抗vδ1抗体、同じ抗vδ1抗体だがFc無効型でもあるL235A、G237A、またはRSV陰性対照を使用したいずれの条件でもADCC反応は検出されなかった。これは、この系において、vδ1に結合する本発明の抗体(抗vδ1 mAbまたは抗vδ1多重特異性抗体など)がADCC作用機序の証拠を示さないことを実証する。注目すべきことに、Fc有効型抗Vδ1抗体でさえγδT細胞を枯渇させず、そのため、例えば高Fcγ腫瘍環境において、本明細書で提示される抗Vδ1抗体のFc機能を維持し、機能性を付加するオプションが提供される。これは、かかる抗Vδ1抗体が本明細書に記載されるような二重特異性抗体フォーマットに含まれる適性をさらに明らかにしている。
実施例12:Vδ1xEGFR多重特異性抗体の製造可能性/安定性の評価
本明細書に記載される新規Vδ1×EGFR多重特異性分子の製造可能性/安定性についての理解を深めるために、本発明者らは、様々な方法によってこれらの分子のパネルを評価した。複数の研究により、驚くべき違いが明らかになった。それについてこれから概説する。
(A)CHOでの収量
方法:まず、標準的なCHO発現プラットフォーム(「CHOプラットフォーム1」)で多重特異性抗体を産生した。このプラットフォームは、重鎖カセット及び軽鎖カセットを含む標準的な発現ベクターを備える。懸濁に適合させたCHO K1細胞(元々ATCCからのものを懸濁培養での無血清増殖に適合させた)を製造に用いた。シード細胞は、既知組成で動物成分を含まない無血清培地で増殖させた。次いで細胞にベクター及びトランスフェクション試薬をトランスフェクトし、細胞を更に増殖させた。上清を遠心分離によって採取し、MabSelect(商標)SuRe(商標)を使用して抗体を精製した後に製剤した。
結論:このプラットフォームで発現させた2つの分子の収量比較を図34Aに示す。これは、ADT1-4-2xLEEについて観察された、ADT1-4-2xFS1-67(矢印で示す)と比較して優れた発現及び回収率を強調している。次いで、代替CHOプラットフォーム(「CHOプラットフォーム2」)で更なる比較を行った。この代替プラットフォームでは、各分子の収量がより同等であった。
(B)加速貯蔵条件下の安定性
方法:上記の「CHOプラットフォーム2」で産生した抗体を、典型的な抗体製剤バッファー中2mg/mlで製剤し、加速ストレス条件(37℃)下で研究した。次いで、Uncleプラットフォーム及び標準プロトコル(Unchained Labs,CA,USA)を使用した標準icIEF法によって分子を分析した。
結論:図34Bは、ほとんどの分子が比較的安定しているように見えるのに対し、ADT1-4-2xFS1-67分子(矢印で示す)ではわずか48時間後に塩基性種の顕著な増加が認められたことを示している。この図34BのADT1-4-2xLEE分子によって例示されるように、他の分子ではそのような増加は観察されなかった。この所見は、ADT1-4-2xLEE分子がより安定した(例えば、より熱的に安定な)Vδ1xEGFR多重特異性抗体であることを示している。ADT1-4-2xFS1-67とADT1-4-2xLEEとの唯一の配列の違いが位置L358.T359.K360にあることを考慮すると、これは、γδTCRのVδ1鎖を標的とする少なくとも1つの第1の抗体由来結合ドメインと、EGF受容体に結合する第2の結合ドメインとを含み、かつL358.E359E.E360を含むVδ1xEGFR多重特異性抗体が、場合によっては、代わりにT358.D359.D360をこれらの位置に含むVδ1xEGFR二重特異性薬と比べてより好ましいバリアントであることを示唆している(全ての番号付けはEUに従う)。
(C)凝集傾向
方法:Uncle及び標準プロトコル(Unchained Labs,CA,USA)を使用して、多重特異性抗体の融解プロファイルを評価した。
結論:図34Cは、ADT1-4-2xFS1-65分子については、凝集の開始が融解より前に起こり、その結果、有意なデルタ(矢印で示す)が生じたことを強調している。これは、凝集の開始が融解の開始とより同時であった他の分子とは対照的であった。同時の融解/凝集は通常、より安定な分子を示す。
(D)加速条件下のより高い濃度における減衰プロファイル(非還元分析)
方法:2mg/mlでの凝集傾向を調査した研究では有意差が明らかにならなかったが、5mg/ml(加速条件下、37℃で18日間)の研究では、Maurice及び標準プロトコル(Unchained Labs,CA,USA)を用いて非還元CE-SDSによって分析すると、異なる分子における顕著な変化が明らかになった。
結論:このような分析により、分析された二重特異性分子のうちの複数において(ただし全てではない)、非モノマー不純物の出現における顕著な増加が認められた。この研究の例示的な結果及び表形式でまとめられた結果を図34Dに示す(顕著な変化は矢印で示されている)。
(E)加速条件下の高濃度における減衰プロファイル(還元分析)
上記(D)の研究は、非還元条件下で分析した場合にADT1-4-2xFS1-67が加速条件下でより安定なプロファイルを示したことを強調しているが、還元CE-SDS条件下で分析すると(ここでもUncle及び標準プロトコル、Unchained Labs,CA,USAを使用)、この同じADT1-4-2xFS1-67分子は、ADT1-4-2xLEEによって図34Eに例示されている他の多重特異性分子と比べて独特の非定型プロファイルを示した。ADT1-4-2xLEEは、37℃で18日間の後に観察された「ショルダリング」の増加を示さず(これはADT1-4-2xFS1-67にのみ特有)、これはADT1-4-2xLEEのより好ましい特性を示唆している可能性がある。
実施例13:VD1xEGFR多重特異性抗体のVD1結合アームにおける親和性のダイヤルアップ/ダウン。
これらの研究では、一連の多重特異性抗体を作出し、ここで、
(i)Vδ1+に対する親和性を約0.2nM~20nMの間でダイヤルアップ/ダウンし、
(ii)EGFRに対する親和性は約1nMで一定に保った。
次に、これらの分子の効果について、一連の実験で研究した。対照のD1.3xEGFR多重特異性分子もこの一連の研究に含めた。この対照は、(Vδ1 TCRの代わりに)ニワトリリゾチームに結合するmAb D1.3の第1の結合ドメインと、約1nMの親和性でEGFRに結合する第2の結合ドメインとを含んでいた。
(A)親和性の概要。
このパネルの多重特異性分子の命名法及び親和性を提示する。
実施例13のSPR方法:標的(ヒトVδ1)に対する抗体の結合親和性を、4SPR機器(Reichert Technologies)を使用したSPR分析によって確立した。抗体(1.5μg/mL)をPlanar Protein A Sensor Chip(Reichert Technologies)にコーティングして、およそ500uRIUのベースラインの増加をもたらした。ヒトVδ1抗原を、最高濃度50nMの1:3の希釈系列で、会合180秒、解離900秒、流速25μL/分、ランニングバッファーPBS+0.05% Tween-20のパラメータを用いて細胞上に流した。各注入後に、20mMリン酸を使用してチップ表面を再生した。実験はすべて室温で行った。定常状態のフィッティングは、TraceDrawerソフトウェア(Reichert Technologies)を使用したLangmuir 1:1結合に従って決定した。
(B)(C)組織常在性Vδ1+細胞への多重特異性結合に対するvδ1 TCR親和性の影響。
この分子パネルを用いたこの最初の実験では、Vδ1 TCRに対する親和性の役割を調査した。
方法:皮膚組織由来のVδ1+エフェクター細胞を、10nM~0.13pMの濃度範囲までPBSで系列希釈した抗体と共インキュベートした。細胞を20分間4℃でインキュベートした。細胞を洗浄し、抗ヒトFc二次抗体(Jackson Immunoresearch)及び死細胞用生死判別色素(eFlour 780、Invitrogen)によって4℃で20分間染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:提示された結合データは、Vδ1親和性の増加と、組織常在性Vδ1+細胞への多重特異性抗体の結合レベルの上昇との間に、強い相関関係があることを示唆している。図35B、及び図35Bの結果を表形式で示す図35Cを参照されたい。このデータは、高親和性の分子が、飽和濃度で増強された効果を付与することを強調している。注目すべきことに、高親和性のバリアントによって付与される効果は、抗体の低親和性のバリアントをより高い濃度で用いても、模倣も再現もできない。これは、Vδ1 TCRに対して(不自然に)高い親和性を持つ分子が、親和性の低い分子では著しく高い濃度(例えば100倍)でも模倣できない異なる効果を付与することを示唆している。この発見についても、本明細書で更に説明する。
次に、これらの分子の更なる効果について、以下の一連の実験で研究した。皮膚組織由来のVδ1+エフェクター細胞を、次のようにEGFR+A375黒色腫癌細胞株と共インキュベートした。
●まず、アッセイセットアップの約16時間前に、EGFR+標的細胞をマルチウェル組織培養プレートに播種した。
●翌日、EGFR+標的細胞に加える前に、抗体を基礎増殖の濃度範囲まで系列希釈した。
●皮膚由来のVδ1γδT細胞を培養フラスコから剥離し、細胞懸濁液をアッセイプレートに播種し、共培養物を37℃、5%CO2で規定期間にわたってインキュベートした。
●各事例で説明したように、選択した読み取り値に応じて細胞を処理及び分析した。
これらの研究の結果は次のように示される:
(D)(E)組織常在性Vδ1+細胞のVδ1 TCR内部移行に対するvδ1 TCR親和性の影響。
Vδ1+エフェクター細胞をEGFR+がん細胞と共インキュベートするこの最初の分析では、多重特異性抗体会合後のVδ1 TCR内部移行の誘導に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり2.5×10^4個のEGFR+標的細胞に2.5×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、Vδ1γδT細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ抗体濃度は10nM~0.13pMの範囲であった。37℃、5%CO2で4時間のインキュベーション後、細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)及びVδ1 TCR(MiltenyiBiotec)の表面発現について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:MFIの低減を図35Dに示す。これらの結果は、抗体会合時のTCR下方調節の増加を示している。また、親和性が高いほど、MFIシグナルの低減(従ってTCRの下方調節)が大きくなることも発見された。注目すべきことに、100倍以上の低親和性分子(ADT1-4-138xADT3-2)を加えても、同等のシグナル低減は誘導できなかった。これは、TRDV1標的に対する不自然に高い親和性がTCR下方調節を更に増強し得ることを示唆している。これはまた、非常に高い親和性の結合がTCR機能に異なる影響を与えることも示唆している。より最適な飽和下方調節効果を達成するためにこのような高い親和性が必要である理由については、推測することしかできない。これは、より親和性の高い分子の滞留時間の延長(オフレートの低下による)が、おそらく高レベルのTCR架橋を介してより高い飽和効果を付与するという、均質なVδ1+集団に対する確率的影響である可能性がある。別の可能性は、Vδ1+細胞のサブセットが、より親和性の低い分子によって付与されるTCR下方調節効果を受けにくいというものである。図35Dの所見の要約を表形式で示す(図35Eを参照のこと)。これは、高い親和性が飽和濃度で異なる効果をもたらすこと、そして、より親和性の低い分子によって付与される低減した効果が、より高い濃度での投与では補償できないということを更に強調している。
(F)(G)組織常在性Vδ1+細胞の脱顆粒に対するvδ1 TCR親和性の影響。
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与される脱顆粒効果に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり2.5×10^4個のEGFR+標的細胞に2.5×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、Vδ1γδT細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ多重特異性抗体濃度は10nM~0.13pMの範囲であった。さらに、CD107aに特異的なフルオロフォア結合抗体(MiltenyiBiotec)を共インキュベーションの開始時に加えた。37℃、5%CO2で4時間のインキュベーション後、細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。図35Fを参照されたい。
結論:これらの研究は、親和性の増加が最適な効果を付与することを重ねて実証する。CD107a上方調節の増加と親和性の増加との間には、直接的相関関係が観察される。繰り返しになるが、このデータは、Vδ1 TCRに対する不自然に高い親和性によって、著しく異なる、より好ましい効果が推進され、この効果は、Vδ1に対する親和性が低い分子では、はるかに高い濃度で投与しても再現できないことを示唆している。図35Fの結果の要約を表形式で示す(図35Gを参照のこと)。繰り返しになるが、この要約は、飽和濃度での高親和性の分子が、低親和性の分子と比べて(はるかに高い濃度で用いた場合でも)、異なる、より増強された飽和効果を付与するという発見を強調している。
(H)(I)EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対するvδ1 TCR親和性の影響
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与される細胞溶解効果に焦点を当てる。
方法:384ウェルCellCarrier Ultraプレート(PerkinElmer)のウェル当たり4×10^3個のEGFR+標的細胞に4×10^3個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。最終アッセイ抗体濃度は5nM~0.03pMの範囲であった。37℃、5%CO2で24時間インキュベートした後、細胞をHoechst 33342(Invitrogen)で、また死細胞について(DRAQ7、Abcam)、37℃で1時間染色した。Opera Phenixシステム(PerkinElmer)で細胞をイメージングし、線形回帰モデル(Harmony 4.9)を使用して、生細胞染色のサイズ、形態、質感及び強度、ならびにDRAQ7染色の非存在に基づいて、生存標的細胞の量を決定した。
結論:ここで提示されたデータは、Vδ1親和性が最も高い分子が、EGFR+がん細胞に対して最も強力で細胞溶解性があることを実証する。図35Hを参照されたい。更に、Vδ1親和性が最も低い多重特異性抗体(20nM)と、中/高Vδ1親和性の多重特異性抗体(それぞれ1.2nM及び0.2nM)との間で質的な差異が観察され、顕著に異なる飽和効果が観察された。これは、不自然に高い親和性が、著しく異なる増強された効果を付与することを示唆している。これらの効果は、Vδ1 TCRに対する親和性が低い分子を使用した場合、はるかに高い(例えば100倍の)濃度で投与しても模倣することができない。図35Hからの結果の要約を表形式で示す(図35Iを参照のこと)。これは、飽和濃度での高親和性の分子が、低親和性の分子と比べて(はるかに高い濃度で送達された場合でも)、異なる、より増強された効果を付与するという発見を強調している。
(J)(K)組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対するvδ1 TCR親和性の影響。
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与されるVδ1+細胞の増殖の誘導に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり1.5×10^4個のEGFR+標的細胞に3×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、標的細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ多重特異性抗体濃度は2nM~0.25pMの範囲であった。細胞を37℃、5%CO2で、5日間または7日間インキュベートした。サイトカイン(IL-2、IL-15、IL-4、及びIL-21;単位が必要)を添加した完全培地を3日目及び5日目に加えた。細胞を洗浄し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した。翌日、MACS Quant Analyzer 10を使用したフローサイトメトリーにより、事象の数を測定した。
結論:これらの研究は、増加した親和性がより増強された効果をもたらし、Vδ1 T細胞の増殖誘導の増加と親和性の増加との間に直接的相関関係が観察されるという所見を更に強固にする。図35J(及び図35Kの表形式の概要)を参照されたい。これは、最も低いEC50及びEC95、ならびに最も高い最大細胞数を示す、最高の親和性の反復において最も明らかである。より親和性の高い分子は、Vδ1 T細胞増殖の増殖の推進においてより強力である。興味深いことに、より親和性の高い分子によって付与される他の技術的効果とは多少異なるが、この事例では、より親和性の低い分子のバリアントは、100倍高い濃度で送達された場合に同様の効果を付与することができる。
(L)この研究の全体的概要
図35Lを参照されたい。
この概要は、以下の点を強調する。
(i)Vδ1+TCRに対する比較的高い親和性(10nM未満)を有する本発明の抗体によって付与される有利な技術的効果;及び
(ii)より親和性の低い分子(10nM超)によって付与される低減した効果のうち、濃度を100倍以上に増加させることによって補償できるものはどれか。
(M)TAAコピー数の影響。
図35Lにまとめた上記の所見は、幾つかの興味深い結果を強調している。具体的には以下の点である。
(i)高親和性分子(Vδ1 TCRに対する)は、低親和性分子バリアントと比べて増強された効果をもたらし、
(ii)低親和性バリアントによって付与される低減した効果は、これらの分子の濃度を増加させることによって常に補償できるとは限らない。
しかしながら、本発明者らは次に、そのようなアッセイにおける第2の標的(この事例ではEGFR)に対するコピー数の影響を調査した。(図35Mを参照のこと)。これらの研究では、上記で概説したものと同じ方法論を用いたが、コピー数の低いTAAがん細胞株(A375)を、極めて高いコピー数を示すがん細胞株(A431)に置き換えた。従って初代Vδ1+細胞と独特の高コピー数EGFR+がん細胞株との共インキュベーションを伴うこの同等の研究では、興味深いことに、異なる所見が明らかになった。具体的に述べると、場合によっては、より親和性の低いバリアントによって観察される低調な効果は、より高いTAAコピー数のがん細胞株と組み合わされば、アッセイにおけるこれらのバリアントの濃度を増加させることによって克服され得る。高親和性分子は、アッセイに用いられるがん細胞株のEGFRコピー数に関係なく、同様の濃度で同様の効果を示すが、より親和性の低い分子の場合、より高いコピー数のがん細胞株の使用と組み合わせた分子の濃度の増加の組み合わせにより、補償効果がもたらされた。このような状況でより高濃度の低親和性バリアントを使用することで初めて、より親和性の低い分子によって付与される飽和CD107a上方調節及び飽和TCR下方調節が、より親和性の高い分子の飽和効果を模倣することができる。
これは、以下の場合に、より親和性の低い分子の低減した効果が「回復」され得ることを示唆している。
(a)非常に高いTAA標的細胞株がアッセイに使用され、
(b)100倍(またはそれ以上)増加した濃度の分子が用いられる場合。
これらの所見の背後にあるメカニズムは推測することしかできないが、Vδ1 TCRに対してより高い親和性を有する本発明の分子の利点が重ねて強調される。例えば、標的がん細胞株が正常なEGFR TAAレベルを有する場合、より親和性の低いバリアントの有効性は大幅に低減する。これは、より高い用量では克服できない可能性がある。さらに、EGFR TAAの場合、コピー数が極めて高いEGFRがんは、ほとんどのがんにおいて少数であることがよく理解されている。例えば、ある特定の乳癌(例えば、Kim et al 201310.1371/journal.pone.0079014)または頭頸部癌(例えば、Licitra et al 2011 DOI: 10.1093/annonc/mdq588)または胃癌(例えば、Zhang et al 2015 doi.org/10.3892/ol.2015.3875)に関する最近の研究を参照されたい。したがって、より親和性の低いバリアントと比べて勝っている、本発明の非天然高親和性抗体の増加した有用性及び驚くべき利点は非常に明らかである。
実施例14:VD1xEGFR多重特異性抗体のEGFR結合アームにおける親和性のダイヤルアップ/ダウン。
一連の多重特異性抗体を作出し、ここで、
(i)EGFRへの親和性をダイヤルアップ/ダウンし、
(ii)Vδ1に対する親和性は約0.2nMで一定に保った。
この調査のための出発EGFR結合ドメイン(FS1-67)は既報である(WO2018015448)。この結合ドメインを更に修飾する動機の1つは、本発明の多重特異性抗体に用いる場合のこのドメインの親和性を更に微調整する試みであった。そうすることで、本発明者らは、EGFR結合ドメイン内の特定のアミノ酸を野生型ヒト免疫グロブリン配列に戻すと、他のものよりもEGFR標的に対する親和性に影響が及ぶことを発見した。この調査の結果、EGFRに対する約1nMの結合から約140nMまでの範囲の様々な親和性オプションを備えた、より微調整された結合ドメインのパネルが発見された。異なるEGFR結合ドメインは、本発明の多重特異性抗体に組み込まれた場合に、様々な特徴的な特性を付与した。従って、この多重特異性抗体のパネルは、親和性の役割を調査及び決定する際に非常に貴重であることも証明された。
この研究には、示されている場合には、多重特異性D1.3xFS1-67対照(EGFR親和性が1nMの第2の結合ドメインと、第1の結合ドメインに含まれるニワトリリゾチームに対する結合ドメインとを含む)も含まれる。
(A)親和性の概要
このパネルの多重特異性分子の命名法及び親和性を提示する。
実施例14のSPR方法:ヒトEGFRについては、組換えタンパク質(Stratech;10001-H08H-SIB-100ug)をカルボキシルメチルデキストランセンサーチップ(Reichert Technologies)にカップリングして、およそ500uRIUのベースラインの増加をもたらした。会合180秒、解離660秒、流速25μL/分、ランニングバッファーPBS-Tのパラメータを用いて、濃度範囲の抗体(7.5~200nM)をPBS-Tバッファーに注入した。各注入後に、20mMリン酸を使用してチップ表面を再生した。実験はすべて室温で行った。定常状態のフィッティングは、TraceDrawerソフトウェア(Reichert Technologies)を使用したLangmuir 1:1結合に従って決定した。
結論:結果の要約を図36Aに示す。この研究では、出発時のCH3ベースのFS1-67結合モジュールは、ABループに5つ、CDループに3つ、及びEFループに5つの修飾を含む。この分子の親和性を様々な程度で変更しようと試みると、幾つかの興味深い発見があった。例えば、ABループ内の5つのアミノ酸全てを野生型配列に戻すと、EGFR結合親和性に最も大きな影響があることが発見された(破線の黒い四角形で示されるADT1-4-2xLEE1)。確かに、野生型免疫グロブリン配列へのCDループの完全な復帰またはEFループの(部分的な)復帰(それぞれ、ADT1-4-2xLEE2及びADT1-4-2xLEE3)と比較すると、ABループの変更が最も影響の強いものであった。実際、幾つかの尺度(後述)により、ABループを野生型配列に戻すと、結合親和性及び特異性が失われる結果となった。したがって、FS1-67のABループに見られる非保存的アミノ酸がトレオニン(極性)からロイシン(非極性)に戻るように修飾された場合に、親和性が影響を受けなかったのは予想外であった。これは、ADT1-4-2 LEE分子(黒い実線の長方形で強調表示、1つの変化-親和性/機能への影響は無視できる)を、ADT1-4-2 LEE1分子(黒い点線の長方形で強調表示、5つの変化-親和性/機能への影響が最も大きい)と比較することによって強調される。とはいえ、結果として得られる、ABループへの変更を4つだけ含むADT1-4-2xLEEには、追加の修飾も組み込まれていた。したがって、結合ループにおけるこれらの他の(保存的)変化(D3659E、D360E)も高い親和性の保持に寄与したということは、驚くべきことではあるが、あり得ないとはいえない。いずれにせよ、そのような修飾を野生型に戻すと、結果として得られる本発明の多重特異性抗体における免疫原性のリスクが低減する可能性があることを考慮すると、358位の(そしてABループへの4アミノ酸変化の一部としての)野生型ロイシンは、それぞれADT1-4-2xFS1-67、ADT1-4-2xFS1-65、及びADT1-4-2x747に組み込まれた、出発時のFS1-67、FS1-65または747のEGFR結合ドメインに見られる5つ(またはそれ以上)のアミノ酸変化よりも好ましいと考えられる。
(B)(C)EGFR+結腸癌細胞株HT-29への多重特異性結合に対するEGFR親和性の影響。
方法:PBSで500nM~0.13pMの範囲の濃度に系列希釈した抗体とEGFR+HT-29標的細胞を4度で20分間インキュベートすることにより、EGFRxVδ1多重特異性抗体の例示的結合を決定した。洗浄後、細胞を抗ヒトIgG二次抗体(Jackson Immunoresearch)及び生/死色素(eFluor 780、Invitrogen)と共に更に20分間インキュベートしてから、洗浄し、CellFixを使用して固定した。フローサイトメトリー(MACSQuant Analyser 10、Miltenyi Biotech)を使用して、各細胞種に結合した抗体の量を決定した。
結論:提示されたデータは、EGFR親和性の増加と、EGFR+HT-29がん細胞への多重特異性抗体の結合レベルの上昇との間に、強く直接的かつ段階的な相関関係が観察されたことを示唆している。図36Bを参照されたい。図36Cは、図36Bの結果を表形式で示す。
次に、これらの分子の更なる効果について、以下の一連の実験で研究した。簡潔に述べると、皮膚組織由来のVδ1+エフェクター細胞を、次のようにEGFR+A375黒色腫癌細胞株と共インキュベートした;アッセイセットアップの約16時間前に、EGFR+標的細胞をマルチウェル組織培養プレートに播種した。翌日、EGFR+標的細胞に加える前に、抗体を基礎増殖の濃度範囲まで系列希釈した。皮膚由来のVδ1γδT細胞を培養フラスコから剥離し、細胞懸濁液をアッセイプレートに播種し、共培養物を37℃、5%CO2で規定期間にわたってインキュベートした。各事例で説明したように、選択した読み取り値に応じて細胞を処理及び分析した。これらの研究の結果は次のように示される:
(D)(E)組織常在性Vδ1+細胞のVδ1 TCR下方調節に対するEGFR親和性の影響。
この次の分析は、多重特異性抗体会合後のVδ1 TCR内部移行の誘導に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり2.5×10^4個のA375 EGFR+標的細胞に2.5×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、Vδ1γδT細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ抗体濃度は10nM~0.13pMの範囲であった。37℃、5%CO2で4時間のインキュベーション後、細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)及びVδ1 TCR(MiltenyiBiotec)の表面発現について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:Vδ1 TCR MFIの低減は、TCR下方調節の増加を示しており、具体的には、EGFRに対する親和性が高いほど、このシグナルの低減が大きいことが発見された。しかし、注目すべきことに、EGFR親和性とTCR下方調節の誘導との間の関係は、段階的な相関関係ではなく、親和性の閾値に依存するものと見受けられた。具体的には、EGFRに対してそれぞれ約1nM、約9nM、及び約19nMの親和性を示した3つの分子(ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2xLEE2、及びADT1-4-2xLEE3)は、密接にクラスター化し、同様のTCR下方調節効果及び関連するEC50値を付与した。これら3つの分子は、ADT1-4-2xLEE1とは大きく異なっていた。前述したように、この分子は野生型免疫グロブリンABループを含み、約140nMという最低の親和性を示す。この分子は、他の3つの分子と比較すると、本事例のように高親和性抗Vδ1 TCR ADT1-4-2結合ドメインと組み合わせた場合でも、望ましいTCR下方調節効果を付与しない。これは、ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2xLEE2、及びADT1-4-2xLEE3などの多重特異性抗体がクラスター化し、ADT1-4-2xLEE1などのEGFR親和性の低い分子から分離されている、閾値効果または急勾配の勾配効果が存在することを示唆する。これは、これらの多重特異性抗体によって付与された結合効果が、2つの対照的な群に更にクラスター化されるのではなく、第2の結合標的であるEGFRに対するそれぞれの親和性によって段階分けされた、以前に見られた、より浅く、より段階的な親和性/結合事象(上記の図36Bを参照のこと)とは対照的である。図36Dを参照されたい。図36Eは、図36Dの結果を表形式で示す。
(F)(G)組織常在性Vδ1+細胞の脱顆粒に対するEGFR親和性の影響
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与される脱顆粒効果に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり2.5×10^4個のEGFR+標的細胞に2.5×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、Vδ1γδT細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ多重特異性抗体濃度は10nM~0.13pMの範囲であった。さらに、CD107aに特異的なフルオロフォア結合抗体(MiltenyiBiotec)を共インキュベーションの開始時に加えた。37℃、5%CO2で4時間のインキュベーション後、細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant 16フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:これらの研究は、EGFRに対する親和性の増加が最適な効果をもたらし、CD107a上方調節の増加と親和性の増加との間に相関関係が観察されることを重ねて実証する。この関係は、親和性の閾値に依存する。TCRの下方調節と同様に、約1nMから約19nMのEGFR親和性範囲を有する多重特異性抗体が機能的にクラスター化し、より親和性の低い分子(ADT1-4-2xLEE1)と比較して有意に高いレベルのCD107aを誘導した。このデータは、EGFRに対して高から中程度の親和性を有する本発明の多重特異性抗体が、ある特定のシナリオにおいて著しく異なる、より有利な効果を推進し、この効果は、EGFRに対してより低い親和性を有する分子では、はるかに高い濃度(例えば1,000倍)で投与しても再現できないことを示唆している。結果を図36Fに示し、図36Gに表形式でまとめる。
(H)(I)組織常在性Vδ1+細胞の41BB活性化ステータスに対するEGFR親和性の影響。
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与されるVδ1+細胞の活性化誘導マーカー41BBの増加に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり2×10^4個のEGFR+標的細胞に2×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、Vδ1+γδT細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ多重特異性抗体濃度は100pM~0.13pMの範囲であった。37℃、5%CO2で24時間のインキュベーション後、細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)及び41BB(MiltenyiBiotec)の表面発現について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:ここで提示したデータ(図36H及び図36Iの表形式の概要を参照のこと)は、EGFRに対してより高い親和性を有する本発明の多重特異性抗体が、Vδ1+細胞の41BB活性化の増加を刺激するのに最も有効であることを実証する。前述した幾つかの他の研究と同様に、EGFR親和性が最も低い多重特異性抗体(約140nM)と、EGFR親和性が中から高の多重特異性抗体(約20nMの閾値未満のもの)との間には、親和性が低いと顕著なVδ1+細胞活性化を誘導できないという有意な質的差異が再び観察された。このことは、この場合は41BB上方調節によって測定される、中から高の親和性が機能的にクラスター化される閾値を示唆している。繰り返しになるが、これらの効果は、EGFRに対する親和性が低い分子を使用した場合、はるかに高い(例えば1,000倍の)濃度で投与しても再現することができない。しかしながら、興味深いことに、最も高い親和性の分子(ADT1-4-2xLEE、約1nM)の飽和における41BBレベルの上昇は、約9nM~19nMの間の本発明の中域多重特異性分子(ADT1-4-2xLEE2及びADT1-4-2 LEE3)について観察されたものよりも低かったことも観察された。この観察、つまり最高の親和性が常に最も好ましいとは限らないということについては、本明細書で更に後述する。
(J)(K)EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対するEGFR親和性の影響
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与される細胞溶解効果に焦点を当てる。
方法:384ウェルCellCarrier Ultraプレート(PerkinElmer)のウェル当たり4×10^3個のEGFR+標的細胞に4×10^3個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。最終アッセイ抗体濃度は5nM~0.03pMの範囲であった。37℃、5%CO2で24時間インキュベートした後、細胞をHoechst 33342(Invitrogen)で、また死細胞について(DRAQ7、Abcam)、37℃で1時間染色した。Opera Phenixシステム(PerkinElmer)で細胞をイメージングし、線形回帰モデル(Harmony 4.9)を使用して、生細胞染色のサイズ、形態、質感及び強度、ならびにDRAQ7染色の非存在に基づいて、生存標的細胞の量を決定した。
結論:このデータは、EGFR親和性がより高い分子が、EGFR+がん細胞に対して最も強力で細胞溶解性があることを実証する。繰り返しになるが、EGFR親和性が最も低い多重特異性抗体(約140nM)とEGFR親和性が中から高の多重特異性抗体(約1nM~19nM)との間で有意な質的差異が観察された。実際、測定可能な標的殺傷が低EGFR親和性分子(ADT1-4-2xLEE1)によって誘導されることはなかった。したがって、これは、約1nM~約19nMの分子(ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2xLEE3、ADT1-4-2xLEE2)がクラスター化されたより最適な機能的効果を付与する閾値効果が観察される別の例である。これらの効果は、EGFRに対する親和性が低い分子を使用した場合、はるかに高い(例えば10,000倍の)濃度で投与しても再現することができない。結果を図36Jに示し、図36Kに表形式でまとめる。
(L)(M)組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対するEGFR親和性の影響;
この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与されるVδ1+細胞の増殖の誘導に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり1.5×10^4個のEGFR+標的細胞に3×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、標的細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ多重特異性抗体濃度は2nM~0.25pMの範囲であった。細胞を37℃、5%CO2で、5日間または7日間インキュベートした。サイトカイン(IL-2、IL-15、IL-4、及びIL-21;単位が必要)を添加した完全培地を3日目及び5日目に加えた。細胞を洗浄し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した。翌日、MACS Quant Analyzer 10を使用したフローサイトメトリーにより、事象の数を測定した。
結論:これらの研究は、増加した親和性がより最適な効果をもたらし、Vδ1 T細胞の増殖誘導の増加と親和性の増加との間に直接的相関関係が観察されることを重ねて実証する。繰り返しになるが、約1nM~約19nMの親和性の範囲内のEGFRに対する中から高の親和性を持つ本発明の多重特異性抗体(ADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2xLEE3、ADT1-4-2LEE2)が機能的にクラスター化するクラスタリング効果が観察される一方で、親和性が約140nMの低親和性分子(ADT1-4-2xLEE1)は著しく損なわれ、このアッセイにおける非結合性(TCRに対して非結合性)の対照と同等である。興味深いことに、また41BB効果と同様に(図36H参照)、EGFRに対する親和性が約1nMの最も高い親和性は、最も高い飽和効果を付与しない。むしろ、約9nM~19nMの中域親和性分子(それぞれADT1-4-2xLEE3及びADT1-4-2xLEE2)が、抗体の飽和濃度で最も高い増殖効果を付与する。本発明の中域親和性多重特異性抗体によって付与される、このより最適な効果については、本明細書で後述する。結果を図36Lに示し、図36Mに表形式でまとめる。
(N)EGFRに対する親和性及びがん細胞TAAコピー数の影響
これらの研究は、本発明の多重特異性抗体のEGFRに対する親和性の影響を強調する。
次に、これらの効果を、Vδ1+細胞/EGFR+がん細胞の共インキュベーション研究において低コピー数のA375細胞株ではなく極めて高コピー数のA431細胞株を代わりに用いた場合に観察された効果と比較した。
この比較の概要を図36Nに示す。A431によって代表されるEGFRコピー数が極めて高いがんでは、約140nMの低親和性の多重特異性抗体(ADT1-4-2xLEE1)によって観察される低減した効果の一部が「回復」される可能性があることが発見された。しかし、この回復は依然として段階的であり、より低い親和性の分子は依然として、中~高親和性バリアントであるADT1-4-2xLEE、ADT1-4-2xLEE2、及びADT1-4-2xLEE3と「クラスター化」しない。とはいえ、この観察は興味深いものであり、低親和性バリアントが、より高いコピー数のEGFRを有するがん細胞に対してより機能的である(従ってより選択的である)ことを示唆している。
好適には、単特異性フォーマットで提供される場合の抗体の機能特性は、さらに第2の抗原に特異的に結合する本発明の多重特異性抗体によって共有される。
実施例15:EGFR細胞と比したVδ1細胞への優先的結合に対する親和性の影響
この次の実験では、それぞれの結合ドメインの親和性をダイヤルアップ及びダイヤルダウンすることが、分子の分布及び優先的結合にどのように影響するかを調査する。具体的には、この研究では、それぞれのVδ1及びEGFR標的に対する結合親和性の変化が、本発明の多重特異性抗体の結合優先傾向にどのように影響するかを調査した。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり2×10^4個のEGFR+標的細胞に2×10^4個のVδ1 T細胞を加えて、共培養を確立した。次いで、示されている「制限」量(16pM)の各多重特異性抗体を加え、細胞を20分間4℃でインキュベートした。細胞を抗ヒトIgG二次抗体(Jackson Immunoresearch)及び生/死色素(eFluor 780、Invitrogen)と共に更に20分間インキュベートしてから、洗浄し、固定した(BD Cell fix)。フローサイトメトリー(MACS Quant Analyzer 10、Miltenyi Biotech)を使用して、各細胞種に結合した抗体の量を決定した。
結論:図37(A)は、EGFR細胞と比したVδ1への優先的結合に対する親和性の影響を棒グラフ形式で示す:2つの細胞種間の相対分布が図示の各抗体について示されている。このデータは、Vδ1親和性の変更が結合の比率及び分布プロファイルにわずかな影響しか及ぼさないことを実証する。対照的に、EGFR結合ドメインに対する親和性が変更されると、より顕著な効果があるように見受けられる。具体的には、より低いEGFR親和性を持つ多重特異性抗体はVδ1結合に対して強い優先傾向を示し、最も低いEGFRバインダーのADT1-4-2xLEE1(Kd、140nM)はVδ1細胞に対する最大の優先傾向を示している。まとめると、これらの結果は、それぞれの結合ドメインの親和性をダイヤルアップ及びダイヤルダウンすることによって、異なる細胞標的/組織分布プロファイルを選択及び指向できる可能性があることを示している。さらに、これらの所見を本明細書における他の所見と組み合わせると、本発明のEGFR中親和性抗体(約9nM~約19nM)が、より親和性の高いバリアント(EGFRに対して約1nMの親和性)と様々な面で同様の効果を示す一方で、そのような本発明の中親和性多重特異性抗体は他の面で異なり、ある特定の状況ではより有利な腫瘍媒介抗体クリアランス、分布及びEGF遮断プロファイルを提供し得ることが示唆される。このことにより、本発明の高親和性EGFRバリアントと比較して、用量制限皮膚毒性を更に低減する可能性が高まる可能性がある。図37Bは、表形式で示された図(A)の結果を示し、図37Cは、パート(A/B)の結果を比として示す。
実施例16:EGFRに対する親和性;A431腫瘍細胞による多重特異性抗体の内部移行に対する影響
(A)(B)この分析は、ある特定の多重特異性抗体(及びコンパレータ)の内部移行に焦点を当てる。前述のように、一連の多重特異性抗体を作出し、ここで、
(i)EGFRに対する親和性を、EGFRに対する約1nMの結合から約140nMの範囲の様々な親和性オプションでダイヤルアップ/ダウンし、
(ii)(ii)Vδ1に対する親和性は約0.2nMで一定に保った。
この研究には、示されている場合には、単特異性RSV IgGコンパレータ(RSVタンパク質への結合ドメインを含む)、多重特異性D1.3xFS1-67対照(EGFR親和性が1nMの第2の結合ドメインと、第1の結合ドメインに含まれるニワトリリゾチームに対する結合ドメインとを含む)も含まれる。
方法:384ウェルCellCarrier Ultraプレート(PerkinElmer)のウェル当たり4×10^3個のEGFR+A431腫瘍細胞を用いて培養を確立した。製造元の説明に従ってLightning Link抗体コンジュゲーションキット(Abcam)を使用して、抗体をCy5フルオロフォアで共有結合的に標識した。抗体を加える前に、Cy5フィルターセットを使用して、Opera Phenixシステム(PerkinElmer)で細胞をイメージングした。次いで、最終濃度1nMの標識抗体を加え、15分間隔で更に8.5時間、Opera Phenixにより細胞をイメージングした。Harmony 4.9分析を使用して、細胞内領域内のCy5の強度を決定した。
結論:このデータは、より低いEGFR親和性の多重特異性分子が、標的A431腫瘍細胞において最も少ないEGFR媒介性内部移行を示すことを実証する。EGFR親和性が最も低い多重特異性抗体(約140nM;抗体なしの対照と同等)と高EGFR親和性の多重特異性抗体(約1nM)との間で有意な質的差異が観察された。具体的には、EGFR標的親和性と観察された抗体内部移行レベルとの間の正の相関関係が発見された。これは、EGFRに対して約1nM~約140nMの範囲にわたる本発明の分子のEGFR親和性に関連する段階的効果の一例を表す。結果を図38Aに示し、図38Bに表形式で示す。
(C)(D)この分析は、本発明に記載の多重特異性抗体のクリアランスに焦点を当てる。この場合のクリアランスとは、EGFR媒介性抗体内部移行によるA431細胞培養物の培地からの抗体の除去を指す。
方法:96ウェル平底TC処理プレートのウェル当たり2×10^4個のEGFR+A431腫瘍細胞を用いて培養を確立した。最終アッセイ抗体濃度は5nM~1.6pMの範囲であった。37℃、5%CO2で24時間インキュベートした後、上清を採取し、更なる分析のために貯蔵した。多重特異性抗体濃度はインハウスELISAによって決定した。簡潔に述べると、プレートに直接コーティングした後にブロッキングバッファーでブロッキングした1ugのVδ1抗原を用いてELISAを行った。採取した上清をプレートに加え、洗浄し、抗ヒトFc-HRPを1/2000希釈度で二次抗体として使用した。50μLのTMB溶液を用いて展開し、マイクロプレートリーダー(Tecan)を使用して450nMで吸光度を測定した。
結論:このデータは、より低いEGFR親和性の多重特異性分子が、最も少ないEGFR媒介性抗体クリアランスを示すことを実証する。EGFR親和性が最も低い多重特異性抗体(約140nM;抗体なしの対照と同等)と高EGFR親和性の多重特異性抗体(約1nM)との間で有意差が観察された。更に、これは、EGFR標的親和性と観察された抗体クリアランスレベルとの間の正の相関関係を示している。繰り返しになるが、これらの所見は、EGFRに対する多重特異性抗体の親和性と、EGFR標的に対する約1nM~約140nMの範囲にわたる分子のEGFR媒介性内部移行との間の直接的で段階的な相関関係を強調している。結果を図38Cに示し、図38Dに表形式で示す。
実施例17:EGFリガンド結合及び腫瘍細胞増殖の多重特異性抗体による阻害に対するEGFR親和性の影響
(A)(B)この分析は、本発明に記載の多重特異性抗体(及びコンパレータ)によるEGFR陽性腫瘍細胞へのEGFの結合の阻害(または遮断)に焦点を当てる。この研究には、示されている場合には、単特異性RSV IgGコンパレータ(RSVタンパク質への結合ドメインを含む)も含まれる。
方法:PBSで250nM~3.2pMの範囲の濃度に系列希釈した抗体と3×10^4個のEGFR+A431標的細胞を4度で30分間インキュベートすることにより、EGFRxVδ1多重特異性抗体によって媒介されるEGF遮断を決定した。細胞を洗浄し、最終濃度40ug/mLのEGF(EGF-AF647、Life Tech)をウェルごとに加えた。次いで、細胞を4℃で1時間インキュベートし、洗浄し、生/死色素(eFluor 520、Fisher)で染色し、4度で更に20分間インキュベートした。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、4℃の暗所で一晩インキュベートした。翌日、MACS Quant Analyzer 10を使用したフローサイトメトリーにより、EGFの遮断を測定した。
結論:図39A及び39Bに示されるMFIの低減は、EGFR陽性A431細胞へのEGF結合の遮断の増加を示す。記載されている多重特異性抗体については、EGFR標的親和性と観察されたEGF遮断レベルとの間に直接的相関関係がある。これは、約1nM~約140nMの範囲のEGFRに対する親和性を有する分子によって付与される段階的効果の更なる例を表す。
(C)(D)この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与される腫瘍細胞増殖の阻害に焦点を当てる。
方法:簡潔に述べると、EGFR+A431細胞を384ウェルイメージングプレート(Perkin Elmer)に播種して最終的な播種密度をウェル当たり標的細胞2×10^3個とした後、37℃、5%CO2で一晩インキュベートした。抗体を基礎増殖培地に希釈し、1:5に系列希釈した後、アッセイプレートに加えて最終アッセイ濃度を500nM~0.05pMとした。細胞を24時間培養した後にHoechst(1:1000最終、Invitrogen)及びDRAQ7(1:300最終、Abcam)で染色した。生きている標的細胞の数を決定するため、9つの視野を10倍拡大率でキャプチャするOpera Phenixハイコンテントプラットフォームを使用して共焦点像を取得した。生細胞数は、生細胞染色のサイズ、形態、質感及び強度、ならびにDRAQ7染色の非存在に基づいて数量化した。
結論:図39C及び39Dに提示したデータは、EGFRに対してより高い親和性を有する本発明の多重特異性抗体が、EGFR陽性腫瘍細胞の増殖を阻害するのに最も有効であることを実証する。繰り返しになるが、これは、EGFR標的親和性と観察された腫瘍増殖阻害レベルとの間の明らかな正の相関関係を示している。したがって、これは、EGFR標的に対する親和性(約1nM~約140nMの範囲)と相関する段階的効果を強調する別の例である。
実施例18:健常なEGFR+細胞の温存 - VD1xEGFR多重特異性抗体
方法:EGFR+標的細胞傷害性に対するEGFR-Vδ1二重特異性抗体の効果を、Opera Phenix(Perkin Elmer)のハイコンテント共焦点イメージングを使用して決定した。簡潔に述べると、EGFR+A375細胞(黒色腫)及びHUVEC(ヒト臍帯静脈内皮細胞)を384ウェルイメージングプレート(Perkin Elmer)に播種して最終的な播種密度をウェル当たり標的細胞5000個とした後、37℃、5%CO2で一晩インキュベートした。抗体を基礎増殖培地に希釈し、1:5に系列希釈した後、アッセイプレートに加えて最終アッセイ濃度を1nM~0.0005pMとした。増大した皮膚由来Vδ1γδT細胞を組織培養フラスコから剥離し、基礎増殖培地に再懸濁した後、アッセイプレートに1:1のエフェクター:標的比でウェル当たり細胞5000個を加えた。細胞を24時間共培養した後にHoechst 33342(1:1000最終、Invitrogen)及びDRAQ7(1:300最終、Abcam)で染色した。生きている標的細胞の数を決定するため、9つの視野を10倍拡大率でキャプチャするOpera Phenixハイコンテントプラットフォームを使用して共焦点像を取得した。生細胞数は、生細胞染色のサイズ、形態、質感及び強度、ならびにDRAQ7染色の非存在に基づいて数量化した。結果を図40A~Cに示す。
用量漸増効果を図40Aに示す。このデータは、健常細胞と悪性細胞とを区別するVδ1 T細胞の生来の能力を強調するのに役立つ。本発明の多重特異性抗体は、同等のEGFRコピー数を発現する健常細胞を「温存」しながら、Vδ1 T細胞をリダイレクトしてEGFR+腫瘍細胞を殺傷させる。(A)の表形式の結果を図40Cに示す。
健常なHUVEC細胞の「温存」と併せて、A375腫瘍細胞のT細胞誘導性細胞傷害を示す(A)に記載の実験からの代表的な顕微鏡画像を図40Bに示す。画像はグレースケールで示されており、細胞核はHoechst 33342で染色されている。
実施例19:VD1xEGFR多重特異性抗体:ADT1-4-2xFS1-67と、より親和性の低い「親」ADT1-4xFS1-67(別名G04 FS1-67)との用量応答比較。
本発明者らは、「親」(非親和性成熟型)G04 FS1-67多重特異性抗体が、Vδ1+細胞及び標的A431細胞を含む共培養物において様々な望ましい技術的効果を付与することを以前に実証した(WO2021032963)。
具体的には、本発明者らは、この多重特異性抗体がA431細胞に対する細胞傷害性を、200%を超えて増強できることを観察した。この一連の実験では、より親和性の低い「親」の第1のVδ1結合ドメイン(約126nM)及び高親和性(約1nM)のEGFR結合を含むG04 FS1-67(配列番号379)を、同等の多重特異性抗体だが親和性成熟バリアントの第1のVδ1結合ドメインADT1-4-2(親和性約0.2nM)(配列番号414)を含むものと比較した。
方法:この分析では、示されているようにVδ1+エフェクター細胞をEGFR+がん細胞と共インキュベートし、多重特異性抗体会合後のVδ1 TCR内部移行の誘導を測定した。U底96ウェルプレートのウェル当たり2.5×10^4個のEGFR+標的細胞に2.5×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、共培養を確立した。添加前に、Vδ1γδT細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ抗体濃度は10nM~0.13pMの範囲であった。37℃、5%CO2で4時間のインキュベーション後、細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)及びVδ1 TCR(MiltenyiBiotec)の表面発現について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:この比較の結果は図41A(及び図41Bの表形式)に示されており、本明細書の他の箇所に記載されている発見と一致する。MFIの低減(したがってTCRの下方調節)が示されており、この比較研究は、(i)Vδ1親和性が不自然に高い本発明の多重特異性抗体が、より親和性の低いバリアント(この場合はG04 FS1-67)と比較した場合に増強された効果を付与すること、及び(ii)これらの増強された効果が、A375などの低コピー数TAA標的がん細胞を用いた研究で特に顕著であることを更に裏付ける。このデータはまた、より低いvd1親和性を持つ分子(この場合はG04 FS1-67コンパレータ)については、この分子を100倍多く加えても、Vδ1/A375共培養物中で同等のTCR下方調節効果が達成できないことを重ねて強調している。
実施例20:VD1xEGFR多重特異性抗体:CD3xEGFR多重特異性抗体との比較
コンパレータ多重特異性抗体を作出し、ここで、
(i)EGFRに対する親和性は約0.2nMで一定に保ち、
(ii)Vδ1を標的とする可変ドメインは、CD3εに特異的な可変ドメイン(OKT3由来)で置換した。
次いで、この分子(CD3/ADT3-2と称する)を、本明細書の他の箇所で前述したVδ1xEGFR多重特異性ADT1-4-2/ADT3-2(別名ADT1-4-2xLEE)と比較した。この比較の動機の1つは、Vδ1 TCRを標的とする多重特異性TCE(T細胞エンゲージャー)によって付与されるT細胞活性化と、CD3ε共受容体を介して会合するものによって付与されるT細胞活性化との違いを比較することであった。そうすることで、本発明者らは、Vδ1 TCRを介してT細胞に会合する多重特異性TCEが、CD3εを介してT細胞に会合する多重特異性TCEと比較して特徴的な効果を付与することを発見した。これらの効果は、次の一連の実験で示される。これらの研究には、多重特異性D1.3xFS1-67対照(EGFR親和性が1nMの第2の結合ドメインと、第1の結合ドメインに含まれるニワトリリゾチームに対する結合ドメインとを含む)も含まれる。
(A)(B)CD3xEGFR多重特異性抗体への分化;Vδ1 TCR及びCD3εの下方調節に対するT細胞標的受容体の影響。次の実験は、異なるT細胞受容体(Vδ1またはCD3ε)を標的とすることが、多重特異性抗体会合後のVδ1 TCR内部移行の誘導にどのように影響するかを決定する。
方法:図42Aに示す凡例に示すように、様々なT細胞集団をアッセイした。これらには、PBMC、及び皮膚組織または末梢血から直接単離された精製Vδ1γδ T細胞が含まれた。U底96ウェルプレートのウェル当たり2×10^4個のA375 EGFR+A375腫瘍細胞に2×10^4個のT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。次いで、最終濃度1nMの抗体を加え、培養物を37℃、5%CO2で4時間インキュベートした。細胞を採取し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)、Vδ1 TCR(Miltenyi)、CD3ε(Miltenyi)の表面発現について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した後、MACSQuant Analyser 10フローサイトメーター(Miltenyi)で分析した。
結論:MFIの低減を図42Aに示す。驚くべきことに、皮膚及び末梢血の両方から精製されたVδ1 T細胞集団で示されたように、CD3εを介するよりもVδ1を介したTCR複合体の抗体会合を介して、より強力なTCR下方調節が観察された。逆に、CD3εを介したT細胞の会合は、少数のVδ1細胞集団(このドネーションでは0.08%)のみを含むPBMCにおいて、より強力なCD3の下方調節を誘導した。PBMCにおけるCD3ベースのTCEの顕著な効果は、この従来のストラテジーの強引なアプローチを強調している。具体的には、CD3ベースのTCEは、Treg、CD4+、及びCD8+T細胞を含む、PBMCに存在する全てのCD3+細胞に影響する。対照的に、第1のVδ1結合ドメインを介してT細胞に会合する本発明の多重特異性抗体は、典型的には血液よりも組織に多く存在する非常に望ましい細胞のVδ1+CD3サブセットに対してのみ選択的である。
(B)Vδ1 TCR下方調節に対するT細胞標的受容体の影響。(A)の表形式の結果を図42Bに示す。これは、Vδ1 TCRを多重特異性薬で直接標的とすることによるTCR下方調節の誘導が、この複合体をCD3ε共受容体によって標的とすることよりも優れていることを強調している。
(C)CD3ε下方調節に対するT細胞標的受容体の影響。(A)の表形式の結果を図42Cに示す。これは、特に未分画のPBMCにおいて、CD3ベースのTCEがCD3レベルに与える影響がより顕著であることを強調している。
(D)(E)EGFR+がん細胞に対する多重特異性細胞溶解機能に対する影響。この次の実験は、異なるT細胞受容体(Vδ1またはCD3ε)に会合することが、腫瘍標的細胞を溶解するT細胞集団の刺激にどのように影響するかを決定する。
方法:上記のように、PBMC、または皮膚組織もしくは末梢血から直接単離した精製γδ T細胞を含む、様々なT細胞集団を評価した。384ウェルCellCarrier Ultraプレート(PerkinElmer)にウェル当たり4×10^3個のA375 EGFR+A375腫瘍細胞を播種することにより、培養を確立した。様々な量のT細胞を加えて、エフェクターと標的の比率を10~0.08の間で変化させた。次いで、最終濃度1nMの抗体を加え、培養物を37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。細胞をHoechst 33342(Invitrogen)で、また死細胞(DRAQ7、Abcam)について、37℃で1時間染色し、Opera Phenixシステム(PerkinElmer)でイメージングした。線形回帰モデル(Harmony 4.9)を使用して、生細胞染色のサイズ、形態、質感及び強度、ならびにDRAQ7染色の非存在に基づいて、生存腫瘍細胞の量を決定した。
結論:図42Dに示されるデータは、Vδ1 T細胞集団のみを特異的にリダイレクトしてEGFR+腫瘍細胞を殺傷させる、Vδ1を標的とする多重特異性抗体の独特の能力を実証する。これは、CD3ベースのTCEが未分画PBMCもEGFR+細胞にリダイレクトするというここでの観察によって実証されるように、より無差別に機能するCD3ベースのTCEとは対照的である。(D)の表形式の結果を図42Eに示す。これは、CD3ベースのTCEと比したVδ1ベースのTCEの優れた特異性を更に強調している。
(F)活性化T細胞によるサイトカイン分泌の誘導に対する影響。この次の実験は、異なるT細胞受容体(Vδ1またはCD3ε)または標的集団を標的とすることが、活性化T細胞のサイトカイン分泌プロファイルにどのように影響するかを決定する。
方法:PBMC、または2人の健康なドナーの末梢血から直接精製されたγδ T細胞を含む、様々なT細胞集団をアッセイした。U底96ウェルプレートのウェル当たり2×10^4個のA375 EGFR+A375腫瘍細胞に2×10^4個のT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。次いで、最終濃度1nMの抗体を加え、培養物を37℃、5%CO2で48時間インキュベートした。上清を採取し、細胞を除去し、LEGENDplexサイトカインビーズアレイキット(BioLegend,CA,USA)を使用してサイトカイン濃度を決定した。
結論:図42F及び42Gに示されるデータは、Vδ1+T細胞の特異的活性化と、未分画PBMC内の全てのCD3+T細胞のより広範な活性化との間の、有意な量的及び質的な差異を示している。特筆すべき差異の1つは、PBMC内のCD3ベースのTCEによってのみ誘導されるIL-17Aレベルの248倍の上昇である。対照的に、CD3ベースまたはVδ1ベースのTCEで刺激されたγδT細胞は、IL-17Aを産生しない。IL17Aは、腫瘍成長を増強し得、抗がん免疫応答を弱め得るサイトカインである。これは、Vδ1+T細胞サブセットの独特のサイトカイン分泌プロファイルを強調している。さらに、全てのT細胞集団において、CD3ベースのTCEは、多くのサイトカイン(最も顕著なのはTNFa)のレベルの著しい上昇を誘導した。繰り返しになるが、これは、CD3+細胞に対する、より包括的な誘導効果を含む、CD3ベースのTCEによって付与される、あまり調整されていない、より強引な効果を強調している。
(H)組織常在性Vδ1+細胞の増殖に対する影響。この次の分析は、本発明の多重特異性抗体によって付与されるVδ1+細胞の増殖の誘導に焦点を当てる。
方法:U底96ウェルプレートのウェル当たり1.5×10^4個のEGFR+標的細胞に3×10^4個のVδ1γδT細胞を加えて、上記のように共培養を確立した。添加前に、標的細胞を[0.5μM]のCellTrace Violet生細胞色素で20分間染色した。最終アッセイ多重特異性抗体濃度は2nM~0.25pMの範囲であった。細胞を37℃、5%CO2で、5日間または7日間インキュベートした。サイトカイン(IL-2、IL-15、IL-4、及びIL-21;単位が必要)を添加した完全培地を3日目及び5日目に加えた。細胞を洗浄し、死細胞(eFlour 780、Invitrogen)について20分間4℃で染色した。細胞をFACSバッファーで洗浄し、Cell Fix(BD sciences)に再懸濁した。翌日、MACS Quant Analyzer 10を使用したフローサイトメトリーにより、事象の数を測定した。
結論:この研究は、Vδ1ベースのTCEが、Vδ1 T細胞の増殖の誘導において、同等のCD3ベースのTCEと比べて明らかに優れていることを実証し、Vδ1二重特異性薬は、10分の1以下の用量で増殖を誘導すると共に、飽和濃度でより顕著な効果を示した。図42H及びIを参照されたい。これらの図は、CD3εを介した刺激と比較すると、Vδ1 T細胞の抗体媒介刺激によって付与される増殖効果が増加することを強調している。
実施形態
本発明は、少なくとも以下の番号付けられた実施形態を含む。
1.
Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、前記Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、前記Fc領域が、EGFR結合部位を含む、前記多重特異性抗体。
2.
前記EGFR結合部位が、
a.残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、
b.残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、
c.残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~415(EU番号付け)がSYW(配列番号533)を構成するか、
d.残基358~361、361.1及び362(EU番号付け)がLDEGGP(配列番号542)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWVK(配列番号543)を構成するか、
e.残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、
f.残基358~362(EU番号付け)がTDDGP(配列番号560)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、または
g.残基358~362(EU番号付け)がTESGP(配列番号553)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がKFG(配列番号554)を構成し、残基413~421(EU番号付け)がSNLRWTKGH(配列番号555)を構成し、残基378がバリンであるCH3ドメインによって提供される、実施形態1に記載の多重特異性抗体。
3.
a.残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、
b.残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、SNGQPENNY(配列番号525)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、
c.残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWQQGNV(配列番号534)を構成するEFループを形成するか、
d.残基355~362(EU番号付け)が、RDELDEGGP(配列番号544)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWVKGNV(配列番号545)を構成するEFループを形成するか、
e.残基355~362(EU番号付け)が、RDELTKNQ(配列番号513)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、
f.残基355~362(EU番号付け)が、RDETDDGP(配列番号561)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、または
g.残基355~362(EU番号付け)が、RDETESGP(配列番号556)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、SKFGPENNY(配列番号557)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SNLRWTKGHV(配列番号558)を構成するEFループを形成する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
4.
前記CH3ドメインが、前記EGFR結合部位を含むように工学操作されたヒトIgG CH3ドメインである、実施形態1に記載の多重特異性抗体。
5.
前記Fc領域が、前記EGFR結合部位を含むように工学操作された前記CH3ドメインを含むヒトIgG Fc領域である、実施形態2に記載の抗体。
6.
前記CH3ドメインのアミノ酸配列が、
a.配列番号562;
b.配列番号522;
c.配列番号532;
d.配列番号541;
e.配列番号510;
f.配列番号559;または
g.配列番号552
と少なくとも90%同一であるか、または少なくとも95%同一であるか、または100%同一である、先行実施形態のいずれかに記載の抗体。
7.
前記抗体が、Fc有効型である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
8.
重鎖定常ドメインが、
a.配列番号391もしくは配列番号392;
b.配列番号520もしくは配列番号521;
c.配列番号530もしくは配列番号531;
d.配列番号539もしくは配列番号540;
e.配列番号508もしくは配列番号509;
f.配列番号385もしくは配列番号386;または
g.配列番号550もしくは配列番号551
を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
9.
a.配列番号389;または配列番号414及び配列番号432;
b.配列番号400;または配列番号414及び配列番号436;
c.配列番号516;または配列番号414及び配列番号518;
d.配列番号517;または配列番号414及び配列番号519;
e.配列番号526;または配列番号414及び配列番号528;
f.配列番号527;または配列番号414及び配列番号529;
g.配列番号535;または配列番号414及び配列番号537;
h.配列番号536;または配列番号414及び配列番号538;
i.配列番号504;または配列番号414及び配列番号506;
j.配列番号505;または配列番号414及び配列番号507;
k.配列番号388;または配列番号414及び配列番号431;
l.配列番号399;または配列番号414及び配列番号435;
m.配列番号546;または配列番号414及び配列番号548;
n.配列番号547;または配列番号414及び配列番号549;
o.配列番号378;または配列番号425及び配列番号426;
p.配列番号379;または配列番号421及び配列番号437;
q.配列番号380;または配列番号423及び配列番号427を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
10.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fc領域が、約150nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトEGFRに結合する、前記多重特異性抗体。
11.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fc領域が、約20nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトEGFRに結合する、前記多重特異性抗体。
12.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fc領域が、約10nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトEGFRに結合する、前記多重特異性抗体。
13.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fc領域が、約5nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトEGFRに結合する、前記多重特異性抗体。
14.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fc領域が、約3nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でEGFRに結合する、前記多重特異性抗体。
15.
前記Fab領域が、
配列番号55~78及び133~143からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または
配列番号82~105及び147~157からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
16.
前記Fab領域が、
配列番号51、52、及び130からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1;
配列番号53及び131からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR2;及び
配列番号55~78及び133~143からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域、及び/または
配列番号79及び144からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1;
配列番号80及び145からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR2;及び
配列番号82~105及び147~157からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、実施形態15に記載の多重特異性抗体。
17.
前記Fab領域が、
配列番号2~25及び107~117からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
配列番号27~50及び119~129からなる群から選択される配列に対する少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域を含む、実施形態15または16に記載の多重特異性抗体。
18.
前記Fab領域が、
a.配列番号55~78のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3;及び/または
b.配列番号82~105のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む、実施形態1~10のうちの1つに記載の多重特異性抗体。
19.
前記Fab領域が、
a.配列番号55~78のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3;及び/または
b.配列番号82~105のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
20.
前記Fab領域が、
a.配列番号51もしくは配列番号52に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1;
b.配列番号53に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR2;
c.配列番号79に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1;及び/または
d.配列番号80に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR2を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
21.
前記Fab領域が、
a.配列番号51もしくは配列番号52のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1;
b.配列番号53のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR2;
c.配列番号79のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1;及び/または
d.配列番号80のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR2を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
22.
前記Fab領域が、
a.それぞれ配列番号51、53、及び55のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び82のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
b.それぞれ配列番号51、53、及び56のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び83のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
c.それぞれ配列番号51、53、及び57のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び84のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
d.それぞれ配列番号51、53、及び58のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び85のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
e.それぞれ配列番号51、53、及び59のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び86のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
f.それぞれ配列番号51、53、及び60のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び87のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
g.それぞれ配列番号52、53、及び61のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び88のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
h.それぞれ配列番号51、53、及び62のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び89のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
i.それぞれ配列番号51、53、及び63のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び90のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
j.それぞれ配列番号51、53、及び64のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び91のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
k.それぞれ配列番号51、53、及び65のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び92のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
l.それぞれ配列番号52、53、及び66のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び93のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
m.それぞれ配列番号51、53、及び67のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び94のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
n.それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
o.それぞれ配列番号51、53、及び69のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び96のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
p.それぞれ配列番号51、53、及び70のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び97のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
q.それぞれ配列番号51、53、及び71のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び98のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
r.それぞれ配列番号51、53、及び72のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び99のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
s.それぞれ配列番号51、53、及び73のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び100のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
t.それぞれ配列番号52、53、及び74のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び101のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
u.それぞれ配列番号51、53、及び75のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び102のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
v.それぞれ配列番号51、53、及び76のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び103のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
w.それぞれ配列番号51、53、及び77のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び104のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;または
x.それぞれ配列番号51、53、及び78のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び105のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
23.
前記Fab領域が、
a.配列番号2~25のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH;及び/または
b.配列番号27~50のいずれか1つに対する少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
24.
前記Fab領域が、
a.配列番号2~25のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH;及び/または
b.配列番号27~50のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
25.
前記Fab領域が、
a.配列番号2に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号27に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b.配列番号3に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号28に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c.配列番号4に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号29に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d.配列番号5に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号30に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e.配列番号6に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号31に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f.配列番号7に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号32に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g.配列番号8に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号33に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h.配列番号9に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号34に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i.配列番号10に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号35に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j.配列番号11に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号36に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
k.配列番号12に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号37に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
l.配列番号13に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号38に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
m.配列番号14に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号39に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
n.配列番号15に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号40に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
o.配列番号16に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号41に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
p.配列番号17に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号42に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
q.配列番号18に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号43に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
r.配列番号19に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号44に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
s.配列番号20に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号45に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
t.配列番号21に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号46に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
u.配列番号22に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号47に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
v.配列番号23に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号48に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
w.配列番号24に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号49に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
x.配列番号25に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号50に対する少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
26.
前記Fab領域が、
a.配列番号2のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b.配列番号3のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号28のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c.配列番号4のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号29のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d.配列番号5のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e.配列番号6のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号31のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f.配列番号7のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号32のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g.配列番号8のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h.配列番号9のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号34のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i.配列番号10のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号35のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j.配列番号11のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
k.配列番号12のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号37のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
l.配列番号13のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号38のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
m.配列番号14のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
n.配列番号15のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号40のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
o.配列番号16のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号41のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
p.配列番号17のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
q.配列番号18のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号43のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
r.配列番号19のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号44のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
s.配列番号20のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
t.配列番号21のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号46のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
u.配列番号22のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号47のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
v.配列番号23のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
w.配列番号24のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号49のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
x.配列番号25のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号50のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
27.
前記Fab領域が、IMGT番号付けシステムによる74位にセリン以外のアミノ酸残基を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
28.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、グリシン、アラニン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態27に記載の多重特異性抗体。
29.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、アルギニン、システイン、グルタミン、グルタミン酸、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、トレオニン、トリプトファン、チロシン、及びバリンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態27に記載の多重特異性抗体。
30.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、グリシン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態27に記載の多重特異性抗体。
31.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基がロイシン残基である、実施形態27に記載の多重特異性抗体。
32.
前記Fab領域が、ADT1-4-105、ADT1-4-107、ADT1-4-110、ADT1-4-112、ADT1-4-117、ADT1-4-19、ADT1-4-21、ADT1-4-31、ADT1-4-139、ADT1-4-4、ADT1-4-143、ADT1-4-53、ADT1-4-173、ADT1-4-2、ADT1-4-8、ADT1-4-82、ADT1-4-83、ADT1-4-3、ADT1-4-84、ADT1-4-86、ADT1-4-95、ADT1-4-1、ADT1-4-6、及びADT1-4-138からなる群から選択される、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
33.
前記Fab領域が、6つ全てのCDR領域全体で1~10個、1~5個、または1~2個のアミノ酸置換を含む、実施形態32に記載の多重特異性抗体。
34.
前記Fab領域が、6つ全てのCDR領域全体で最大2個または最大1個のアミノ酸置換を含む、実施形態32または33に記載の多重特異性抗体。
35.
前記Fab領域が、6つ全てのCDR領域全体で1個または2個のアミノ酸置換を含む、実施形態32~34のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
36.
前記Fab領域が、1つ以上のフレームワーク領域に1~10個、1~5個、または1~2個のアミノ酸置換を含む、実施形態32~35のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
37.
前記Fab領域が、1つ以上のフレームワーク領域に最大2個または最大1個のアミノ酸置換を含む、実施形態32~36のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
38.
前記Fab領域が、1つ以上のフレームワーク領域に1個または2個のアミノ酸置換を含む、実施形態36~37のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
39.
前記アミノ酸置換が保存的アミノ酸置換である、実施形態32~39のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
40.
前記Fab領域が、
a. GDSVSSKSXAの配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b. 配列番号53の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c. XWXDXの配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、前記HCDR3配列が配列番号54ではない、前記HCDR3配列;
d. 配列番号79の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e. 配列番号80の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f. QQXYX10111213Tの配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、前記LCDR3配列が配列番号81ではない、前記LCDR3配列を含み、
~X13の各々が天然に存在するアミノ酸である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
41.
a. XがA及びVからなる群から選択され、
b. XがS及びTからなる群から選択され、
c. XがV、A、及びLからなる群から選択され、
d. XがG、E、及びDからなる群から選択され、
e. XがY及びNからなる群から選択され、
f. XがV、A、及びPからなる群から選択され、
g. XがV、Y、及びRからなる群から選択され、
h. XがK、R、及びGからなる群から選択され、
i. XがS及びKからなる群から選択され、
j. X10がT、Q、A、E、及びDからなる群から選択され、
k. X11がP、H、及びDからなる群から選択され、
l. X12がQ、R、K、W、P、E、及びIからなる群から選択され、
m. X13がI、V、及びLからなる群から選択される、実施形態40に記載の多重特異性抗体。
42.
前記Fab領域が、
n.配列番号170または171の配列を含むか、またはそれからなるHFR1配列;
o.配列番号172の配列を含むか、またはそれからなるHFR2配列;
p.配列番号173の配列を含むか、またはそれからなるHFR3配列;
q.配列番号174の配列を含むか、またはそれからなるHFR4配列;
r.配列番号175の配列を含むか、またはそれからなるLFR1配列;
s.配列番号176の配列を含むか、またはそれからなるLFR2配列;
t.配列番号177または178の配列を含むか、またはそれからなるLFR3配列;及び
u.配列番号179、180、181、または182の配列を含むか、またはそれからなるLFR4配列を更に含む、実施形態40または実施形態41に記載の多重特異性抗体。
43.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、
a.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合し、
b.任意により、約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1(配列番号308)に結合し、及び/または
c.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、前記多重特異性抗体。
44.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、
a.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKDでヒトTRDV1に結合し、
b.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKDでカニクイザルTRDV1に結合する、及び/または
c.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50及び約100nM未満(約50nM未満)のTCR下方調節のIC90を有する、前記多重特異性抗体。
45.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、
a.その前記Fab領域が、約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合し、
b.任意により、その前記Fab領域が、約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1(配列番号308)に結合し、
及び/または、
c.その前記Fc領域が、約150nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトEGFRに結合する、前記多重特異性抗体。
46.
前記多重特異性抗体が、約5nM未満のKでヒトTRDV1に特異的に結合し、約150nM未満、約20nM未満、約10nM未満、または約5nM未満のKでヒトEGFRに特異的に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
47.
前記多重特異性抗体が、約5nM未満のKでヒトTRDV1に特異的に結合し、約5nM未満のKでヒトEGFRに特異的に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
48.
a. XがA及びVからなる群から選択され、
b. XがS及びTからなる群から選択され、
c. XがV、A、及びLからなる群から選択され、
d. XがG、E、及びDからなる群から選択され、
e. XがY及びNからなる群から選択され、
f. XがV、A、及びPからなる群から選択され、
g. XがV、Y、及びRからなる群から選択され、
h. XがK、R、及びGからなる群から選択され、
i. XがS及びKからなる群から選択され、
j. X10がT、Q、A、E、及びDからなる群から選択され、
k. X11がP及びHからなる群から選択され、
l. X12がQ、R、K、W、P、E、及びIからなる群から選択され、
m. X13がI、V、及びLからなる群から選択される、実施形態40に記載の多重特異性抗体。
49.
前記Fab領域が、
a.配列番号170または171の配列を含むか、またはそれからなるHFR1配列;
b.配列番号172の配列を含むか、またはそれからなるHFR2配列;
c.配列番号173の配列を含むか、またはそれからなるHFR3配列;
d.配列番号174の配列を含むか、またはそれからなるHFR4配列;
e.配列番号175の配列を含むか、またはそれからなるLFR1配列;
f.配列番号176の配列を含むか、またはそれからなるLFR2配列;
g.配列番号177の配列を含むか、またはそれからなるLFR3配列;及び
h.配列番号179、180、181、または182の配列を含むか、またはそれからなるLFR4配列を更に含む、実施形態48に記載の多重特異性抗体。
50.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでカニクイザルTRDV1に結合し、
c.約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、前記多重特異性抗体。
51.
a. XがA及びVからなる群から選択され、
b. XがS及びTからなる群から選択され、
c. XがV、A、及びLからなる群から選択され、
d. XがG及びDからなる群から選択され、
e. XがY及びNからなる群から選択され、
f. XがV、A、及びPからなる群から選択され、
g. XがV、Y、及びRからなる群から選択され、
h. XがK及びRからなる群から選択され、
i. XがS及びKからなる群から選択され、
j. X10がT、Q、A、及びEからなる群から選択され、
k. X11がP及びHからなる群から選択され、
l. X12がQ、K、W、P、及びIからなる群から選択され、
m. X13がV及びLからなる群から選択される、実施形態40に記載の多重特異性抗体。
52.
前記Fab領域が、
a.配列番号170または171の配列を含むか、またはそれからなるHFR1配列;
b.配列番号172の配列を含むか、またはそれからなるHFR2配列;
c.配列番号173の配列を含むか、またはそれからなるHFR3配列;
d.配列番号174の配列を含むか、またはそれからなるHFR4配列;
e.配列番号175の配列を含むか、またはそれからなるLFR1配列;
f.配列番号176の配列を含むか、またはそれからなるLFR2配列;
g.配列番号177の配列を含むか、またはそれからなるLFR3配列;及び
h.配列番号179または181の配列を含むか、またはそれからなるLFR4配列を更に含む、実施形態51に記載の多重特異性抗体。
53.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合し、
c.約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、前記多重特異性抗体。
54.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸37~53及び/または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
55.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77を含む、前記多重特異性抗体。
56.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77からなる、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
57.
前記Fab領域が、
a.配列番号133~143のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3;及び/または
b.配列番号147~157のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む、実施形態1~10のうちの1つに記載の多重特異性抗体。
58.
前記Fab領域が、
c.配列番号133~143のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3;及び/または
d.配列番号147~157のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む、実施形態57に記載の多重特異性抗体。
59.
前記Fab領域が、
a.配列番号130に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1;
b.配列番号131に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR2;
c.配列番号144に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1;及び/または
d.配列番号145に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR2を更に含む、実施形態57~58のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
60.
前記Fab領域が、
a.配列番号130のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1;
b.配列番号131のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR2;
c.配列番号144のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1;及び/または
d.配列番号145のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR2を更に含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
61.
前記Fab領域が、
a.それぞれ配列番号130、131、及び133のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び147のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
b.それぞれ配列番号130、131、及び134のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び148のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
c.それぞれ配列番号130、131、及び135のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び149のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
d.それぞれ配列番号130、131、及び136のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び150のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
e.それぞれ配列番号130、131、及び137のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び151のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
f.それぞれ配列番号130、131、及び138のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び152のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
g.それぞれ配列番号130、131、及び139のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び153のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
h.それぞれ配列番号130、131、及び140のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び154のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
i.それぞれ配列番号130、131、及び141のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び155のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
j.それぞれ配列番号130、131、及び142のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び156のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;または
k.それぞれ配列番号130、131、及び143のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び157のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含む、実施形態57~60のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
62.
前記Fab領域が、
a.配列番号107~117のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH;及び/または
b.配列番号119~129のいずれか1つに対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、実施形態57~61のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
63.
前記Fab領域が、
a.配列番号107~117のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH;及び/または
b.配列番号119~129のいずれか1つのアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、実施形態57~62のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
64.
前記Fab領域が、
a.配列番号107に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号119に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b.配列番号108に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号120に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c.配列番号109に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号121に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d.配列番号110に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号122に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e.配列番号111に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号123に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f.配列番号112に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号124に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g.配列番号113に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号125に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h.配列番号114に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号126に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i.配列番号115に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号127に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j.配列番号116に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号128に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
k.配列番号117に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号129に対する少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、実施形態57~63のいずれかに記載の多重特異性抗体。
65.
前記Fab領域が、
a.配列番号107のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号119のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b.配列番号108のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号120のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c.配列番号109のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号121のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d.配列番号110のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号122のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e.配列番号111のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号123のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f.配列番号112のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号124のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g.配列番号113のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号125のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h.配列番号114のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号126のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i.配列番号115のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号127のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
j.配列番号116のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号128のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
k.配列番号117のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号129のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、実施形態57~64のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
66.
前記Fab領域が、IMGT番号付けシステムによる74位にセリン以外のアミノ酸残基を有するκ軽鎖可変配列を含む、実施形態57~65のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
67.
前記軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、グリシン、アラニン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態66に記載の多重特異性抗体。
68.
前記軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、アルギニン、システイン、グルタミン、グルタミン酸、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、トレオニン、トリプトファン、チロシン、及びバリンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態66に記載の多重特異性抗体。
69.
前記軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、グリシン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態66に記載の多重特異性抗体。
70.
前記軽鎖可変配列のIMGT番号付けシステムによる74位の前記残基がロイシン残基である、実施形態66に記載の多重特異性抗体。
71.
前記Fab領域が、ADT1-7-10、ADT1-7-15、ADT1-7-17、ADT1-7-18、ADT1-7-19、ADT1-7-20、ADT1-7-22、ADT1-7-23、ADT1-7-42、ADT1-7-3、及びADT1-7-61からなる群から選択される、実施形態57~70のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
72.
前記Fab領域が、6つ全てのCDR領域全体で1~10個、1~5個、または1~2個のアミノ酸置換を含む、実施形態71に記載の多重特異性抗体。
73.
前記Fab領域が、6つ全てのCDR領域全体で最大2個または最大1個のアミノ酸置換を含む、実施形態71または72に記載の多重特異性抗体。
74.
前記Fab領域が、6つ全てのCDR領域全体で1個または2個のアミノ酸置換を含む、実施形態71~73のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
75.
前記Fab領域が、1つ以上のフレームワーク領域に1~10個、1~5個、または1~2個のアミノ酸置換を含む、実施形態71~74のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
76.
前記Fab領域が、1つ以上のフレームワーク領域に最大2個または最大1個のアミノ酸置換を含む、実施形態71~75のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
77.
前記Fab領域が、1つ以上のフレームワーク領域に1個または2個のアミノ酸置換を含む、実施形態71~76のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
78.
前記アミノ酸置換が保存的アミノ酸置換である、実施形態71~6077のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
79.
前記Fab領域が、
a. 配列番号130の配列を含むか、またはそれからなるHCDR1配列;
b. 配列番号131の配列を含むか、またはそれからなるHCDR2配列;
c. XYXAFDIの配列を含むか、またはそれからなるHCDR3配列であって、前記HCDR3配列が配列番号132ではない、前記HCDR3配列;
d. 配列番号144の配列を含むか、またはそれからなるLCDR1配列;
e. 配列番号145の配列を含むか、またはそれからなるLCDR2配列;及び
f. QQXLXTの配列を含むか、またはそれからなるLCDR3配列であって、前記LCDR3配列が配列番号146ではない、前記LCDR3配列を含み、
~Xの各々が天然に存在するアミノ酸である、実施形態1~14のうちの1つに記載の多重特異性抗体。
80.
a. XがD、I、及びVからなる群から選択され、
b. XがD及びSからなる群から選択され、
c. XがN、E、D、Q、及びAからなる群から選択され、
d. XがD及びEからなる群から選択され、
e. XがT及びSからなる群から選択され、
f. XがA、G、Y、及びSからなる群から選択され、
g. XがS及びDからなる群から選択され、
h. XがT、E、及びGからなる群から選択され、
i. XがL及びDからなる群から選択される、実施形態79に記載の多重特異性抗体。
81.
前記Fab領域が、
a.配列番号189の配列を含むか、またはそれからなるHFR1配列;
b.配列番号190の配列を含むか、またはそれからなるHFR2配列;
c.配列番号191の配列を含むか、またはそれからなるHFR3配列;
d.配列番号192の配列を含むか、またはそれからなるHFR4配列;
e.配列番号193及び194の配列を含むか、またはそれからなるLFR1配列;
f.配列番号195の配列を含むか、またはそれからなるLFR2配列;
g.配列番号196の配列を含むか、またはそれからなるLFR3配列;及び
h.配列番号197の配列を含むか、またはそれからなるLFR4配列を更に含む、実施形態79または実施形態80に記載の多重特異性抗体。
82.
前記抗体またはその抗原結合断片が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、実施形態57~81のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
83.
a. XがD及びVからなる群から選択され、
b. XがD及びSからなる群から選択され、
c. XがD、Q、及びAからなる群から選択され、
d. XがD及びEからなる群から選択され、
e. XがSであり、
f. XがA及びYからなる群から選択され、
g. XがSであり、
h. XがE及びGからなる群から選択され、
i. XがL及びDからなる群から選択される、実施形態79に記載の多重特異性抗体。
84.
前記Fab領域が、
a.配列番号189の配列を含むか、またはそれからなるHFR1配列;
b.配列番号190の配列を含むか、またはそれからなるHFR2配列;
c.配列番号191の配列を含むか、またはそれからなるHFR3配列;
d.配列番号192の配列を含むか、またはそれからなるHFR4配列;
e.配列番号193の配列を含むか、またはそれからなるLFR1配列;
f.配列番号195の配列を含むか、またはそれからなるLFR2配列;
g.配列番号196の配列を含むか、またはそれからなるLFR3配列;及び
h.配列番号197の配列を含むか、またはそれからなるLFR4配列を更に含む、実施形態83に記載の多重特異性抗体。
85.
実施形態57~84のいずれか1つに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、及び/または
b.約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、前記多重特異性抗体。
86.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号271のアミノ酸5~20及び/または62~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含む、実施形態57~85のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
87.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77を含む、実施形態57~86のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
88.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77からなる、実施形態57~87のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
89.
前記Fab領域が、親抗Vδ1抗体の親和性成熟したバリアントに由来し、前記親抗Vδ1抗体が、配列番号1のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号26のアミノ酸配列を含むVL配列を含む、実施形態1~14のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
90.
前記Fab領域が、先行実施形態のいずれかで定義されたとおりである、実施形態89に記載の多重特異性抗体。
91.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、
a.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKDでヒトTRDV1に結合し、
b.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKDでカニクイザルTRDV1に結合し、及び/または
c.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、前記多重特異性抗体。
92.
Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKDでカニクイザルTRDV1に結合し、及び/または
c.約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
93.
Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合し、及び/または
c.約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
94.
前記Fab領域が、親抗Vδ1抗体の親和性成熟したバリアントに由来し、前記親抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が、配列番号106のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号118のアミノ酸配列を含むVL配列を含む、実施形態1~14のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
95.
前記Fab領域が、先行実施形態のいずれか1つで定義されたとおりである、実施形態94に記載の多重特異性抗体。
96.
前記抗体またはその抗原結合断片が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、及び/または
b.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
97.
前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、及び/または
b.約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
98.
前記Fab領域が、親抗Vδ1抗体の親和性成熟したバリアントであり、前記親抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が、
a.配列番号273のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号282のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
b.配列番号274のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号283のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
c.配列番号275のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号284のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
d.配列番号276のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号285のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
e.配列番号277のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号286のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
f.配列番号278のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号287のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
g.配列番号279のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号288のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
h.配列番号280のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号289のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;
i.配列番号281のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号290のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVL;または
j.配列番号312のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVH、及び配列番号313のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLを含む、実施形態1~14のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
99.
前記親和性成熟したバリアントが、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖への結合について、例えば、Kdで測定される場合、前記親抗体より少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも100%、少なくとも500%、またはより好ましくは、少なくとも約1000%高い親和性を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
100.
前記親和性成熟したバリアントが、対応する前記親のVH及びVL配列と少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも96%同一なVH及びVL配列を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
101.
前記親和性バリアントが、前記親抗体配列と比較して最大20個、例えば最大15個、例えば最大10個のアミノ酸置換を含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
102.
前記Fab領域が、IMGT番号付けシステムによる74位の残基がセリン残基ではないκ軽鎖可変配列を含む、実施形態1~14のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
103.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、グリシン、アラニン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態102に記載の多重特異性抗体。
104.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、アルギニン、システイン、グルタミン、グルタミン酸、グリシン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、トレオニン、トリプトファン、チロシン、及びバリンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態102に記載の多重特異性抗体。
105.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基が、グリシン、バリン、メチオニン、ロイシン、及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸である、実施形態102に記載の多重特異性抗体。
106.
IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基がロイシン残基である、実施形態102に記載の多重特異性抗体。
107.
前記抗体がIgG抗体である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
108.
前記抗体がIgG1抗体である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
109.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号562のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
110.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号522のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
111.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号532のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
112.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号541のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
113.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号510のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
114.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号559のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
115.
前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号552のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
116.
前記Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖に特異的に結合し、先行実施形態のいずれかに記載の抗体またはその抗原結合断片とγδT細胞受容体(TCR)の前記可変δ1(Vδ1)鎖への結合を競合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
117.
前記抗体が、Fc有効型である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
118.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、
a. それが結合するVδ1T細胞上のTCRの下方調節を引き起こし、
b. CDCまたはADCCを示さず、
c. Vδ1T細胞を枯渇させないことを特徴とする、前記多重特異性抗体。
119.
前記抗体が、ADCC及び/またはCDCを介して、生存可能なVδ1 T+細胞集団の約30%未満、または約20%未満、または約10%未満の枯渇を引き起こす、実施形態118に記載の多重特異性抗体。
120.
前記抗体が、IL-17Aの分泌を誘導しない、実施形態118に記載の多重特異性抗体。
121.
前記抗体が、同等のCD3抗体によって誘導されるIL-17A分泌の約30%未満、または約20%未満、または約10%未満を誘導する、実施形態118に記載の多重特異性抗体。
122.
前記Fab領域が、約10nM未満のKDでヒトTRVD1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
123.
前記Fab領域が、約5nM未満のKDでヒトTRVD1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
124.
前記Fab領域が、約100nM未満のKDでカニクイザルTRVD1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
125.
前記Fab領域が、約50nM未満のKDでカニクイザルTRVD1に結合する、実施形態115に記載の多重特異性抗体。
126.
前記Fab領域が、約10nM未満のKDでγδ T細胞受容体(TCR)のヒト可変δ1(Vδ1)鎖に特異的に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
127.
前記Fab領域が、実施形態1~126のいずれか1つで定義されたとおりである、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
128.
前記Fab領域が、約100nM未満または約50nM未満のKDでγδ T細胞受容体(TCR)のカニクイザル可変δ1(Vδ1)鎖に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
129.
前記Fab領域が、約50nM未満、好ましくは約10nM未満のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
130.
前記多重特異性抗体が、約10nM未満、好ましくは約5nM未満のA375細胞殺傷のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
131.
前記Fab領域が、Vδ1 T細胞増殖を刺激する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
132.
前記Fab領域が、約100nM未満のKDでヒトTVRD1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
133.
前記Fab領域が、約50nM未満のKDでヒトTVRD1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
134.
前記Fab領域が、約10nM未満のKでヒトTRDV1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
135.
前記Fab領域が、約5nM未満のKでヒトTRDV1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
136.
前記Fab領域が、約1nM未満のKでヒトTRDV1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
137.
前記Fab領域が、約100nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
138.
前記Fab領域が、約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
139.
前記Fab領域が、約50nM未満、約10nM未満、約5nM未満、約1nM未満、または約0.5nM未満のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
140.
前記Fab領域が、
a.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合し、
b.任意により、約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1(配列番号308)に結合し、
c.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
141.
前記Fab領域が、
a.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでカニクイザルTRDV1に結合し、
c.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50及び約100nM未満(約50nM未満)のTCR下方調節のIC90を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
142.
前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、及び/または
b.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)のKでカニクイザルTRDV1に結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
143.
前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約1nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約50nM未満のKでカニクイザルTRDV1に結合し、
c.約1nM未満(好ましくは、約0.5nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
144.
前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
145.
前記Fab領域が、
a.約10nM未満(好ましくは、約5nM未満)のKでヒトTRDV1に結合し、
b.約5nM未満(好ましくは、約1nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
146.
前記Fab領域がヒトFab領域である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
147.
前記抗体が、mAbである、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
148.
前記抗体がモノクローナル抗体である、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
149.
前記Fab領域が、γδTCRのVδ1鎖のV領域内のエピトープにのみ結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
150.
前記Fab領域が、配列番号272、配列番号306または配列番号308のアミノ酸残基1~90内のエピトープにのみ結合する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
151.
前記Fab領域が、γδTCRのVδ1鎖のCDR3に見出されるエピトープに結合しない、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
152.
先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、その前記Fab領域が、配列番号272のアミノ酸91~105の領域(CDR3)内のエピトープに結合しない、前記多重特異性抗体。
153.
前記Fab領域が、
(i)配列番号272のアミノ酸3~20;及び/または
(ii)配列番号272のアミノ酸37~77の領域内のエピトープに結合する、先行実施形態のいずれか記載の多重特異性抗体。
154.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸37~53及び/または59~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含む、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
155.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77を含む、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
156.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基37、42、50、53、59、64、68、69、72、73、及び77からなる、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
157.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸5~20及び/または62~77の領域内の1つ以上のアミノ酸残基を含む、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
158.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77を含む、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
159.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、配列番号272のアミノ酸残基5、9、16、20、62、64、72、及び77からなる、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
160.
前記Fab領域が結合する前記エピトープが、γδT細胞の活性化エピトープである、実施形態153に記載の多重特異性抗体。
161.
前記活性化エピトープの結合が、(i)前記γδTCRを下方調節し、(ii)前記γδT細胞の脱顆粒を活性化し、及び/または(iii)γδT細胞による殺傷を促進する、実施形態160に記載の多重特異性抗体。
162.
前記活性化エピトープの結合が、CD107a、CD25、CD69、及び/またはKi67の発現を上方調節する、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
163.
前記多重特異性抗体が、約70KDaよりも大きい、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
164.
前記抗体が、配列番号54を有するVHCDR3及び配列番号81を有するVLCDR3を含まず、及び/または前記抗体が、配列番号132を有するVHCDR3及び配列番号146を有するVLCDR3を含まない、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
165.
前記抗体が、配列番号1を有するVH領域及び配列番号26を有するVL領域を含まず、及び/または前記抗体が、配列番号106を有するVH領域及び配列番号118を有するVL領域を含まない、先行実施形態のいずれかに記載の多重特異性抗体。
166.
先行実施形態のいずれかにおいて定義されたような前記多重特異性抗体をコードするポリヌクレオチド配列。
167.
配列番号199~222、224~247、249~259、または261~271との少なくとも70%の配列同一性を有する配列を含む、抗Vδ1の第1の結合ドメインをコードするポリヌクレオチド配列。
168.
実施形態166または実施形態167において定義されたような前記ポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。
169.
実施形態166もしくは実施形態167において定義されたような前記ポリヌクレオチド配列、または実施形態168において定義されたような前記発現ベクターを含む宿主細胞であって、任意により、前記宿主細胞が組換え宿主細胞である、前記宿主細胞。
170.
VH配列をコードする第1のポリヌクレオチド配列と、VL配列をコードする第2のポリヌクレオチド配列とを含む、実施形態169に記載の宿主細胞。
171.
VH配列をコードする第1のポリヌクレオチド配列を含む第1の発現ベクター、及びVL配列をコードする第2のポリヌクレオチド配列を含む第2の発現ベクターを含む、実施形態169に記載の宿主細胞。
172.
VH配列をコードする第1のポリヌクレオチド配列と、VL配列をコードする第2のポリヌクレオチド配列とを含む発現ベクターを含む、実施形態169に記載の宿主細胞。
173.
前記ポリヌクレオチドまたは発現ベクターが、前記抗体またはその抗原結合断片に融合された膜アンカーまたは膜貫通ドメインをコードし、前記抗体またはその抗原結合断片が、前記細胞の細胞外表面上に提示される、実施形態169~172のいずれか1つに記載の宿主細胞。
174.
実施形態1~165のいずれか1つに記載のいずれかの多重特異性抗体を産生させるための方法であって、実施形態169~173のいずれか1つに記載の宿主細胞を細胞培養培地で培養することを含む前記方法。
175.
前記多重特異性抗体を前記培養培地から単離することを更に含む、実施形態174に記載の方法。
176.
実施形態1~165のいずれか1つにおいて定義されたような前記多重特異性抗体またはその抗体結合断片を含む組成物。
177.
実施形態1~165のいずれか1つにおいて定義されたような前記多重特異性抗体と、薬学的に許容される希釈剤または担体とを含む、医薬組成物。
178.
実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体または実施形態177に記載の医薬組成物を含むキット。
179.
治療効果のある追加の薬剤を更に含む、実施形態178に記載のキット。
180.
使用説明書を更に含む、実施形態178または実施形態179に記載のキット。
181.
対象の疾患または障害を処置する方法であって、前記対象に、実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体、または実施形態177に記載の医薬組成物を投与することを含む前記方法。
182.
前記疾患または障害が、がんである、実施形態181に記載の方法。
183.
前記がんが、EGFR陽性癌である、実施形態182に記載の方法。
184.
同時にまたは任意の順序で逐次的に、第2の薬剤を前記対象に投与することを更に含む、実施形態181~183のいずれか1つに記載の方法。
185.
対象における免疫応答を調節する方法であって、前記対象に、実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体、または実施形態177に記載の医薬組成物を投与することを含む前記方法。
186.
前記対象が、がんを有する、実施形態185に記載の方法。
187.
対象における免疫応答を調節することが、γδT細胞を活性化すること、γδT細胞の増殖を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の増大を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の脱顆粒を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞による殺傷活性を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞傷害性を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の動員を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の生存率を増加させること、及びγδT細胞の疲弊に対する抵抗性を増加させることからなる群から選択される少なくとも1つを含む、実施形態185または186に記載の方法。
188.
病変細胞は殺傷されると共に健常細胞が温存される、実施形態181~187のいずれか1つに記載の方法。
189.
医療に使用するための、実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体、または実施形態177に記載の医薬組成物、または実施形態178~179のいずれか1つに記載のキット。
190.
がんの処置に使用するための、実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体、または実施形態177に記載の医薬組成物、または実施形態178~179のいずれか1つに記載のキット。
191.
薬物の製造における、実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体の使用。
192.
がんの処置のための薬物の製造における、実施形態1~165のいずれか1つに記載の多重特異性抗体の使用。

Claims (45)

  1. Fab領域及びFc領域を含む多重特異性抗体であって、前記Fab領域が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖のエピトープに特異的な結合部位を含み、前記Fc領域が、EGFR結合部位を含む、前記多重特異性抗体。
  2. 前記EGFR結合部位が、
    a.残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、
    b.残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、
    c.残基359~362(EU番号付け)がEEGP(配列番号523)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~415(EU番号付け)がSYW(配列番号533)を構成するか、
    d.残基358~361、361.1及び362(EU番号付け)がLDEGGP(配列番号542)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWVK(配列番号543)を構成するか、
    e.残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、
    f.残基358~362(EU番号付け)がTDDGP(配列番号560)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、または
    g.残基358~362(EU番号付け)がTESGP(配列番号553)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がKFG(配列番号554)を構成し、残基413~421(EU番号付け)がSNLRWTKGH(配列番号555)を構成し、残基378がバリンであるCH3ドメインによって提供される、請求項1に記載の多重特異性抗体。
  3. 前記EGFR結合部位が、
    a.残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、
    b.残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、SNGQPENNY(配列番号525)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、
    c.残基355~362(EU番号付け)が、RDELEEGP(配列番号524)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWQQGNV(配列番号534)を構成するEFループを形成するか、
    d.残基355~362(EU番号付け)が、RDELDEGGP(配列番号544)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWVKGNV(配列番号545)を構成するEFループを形成するか、
    e.残基355~362(EU番号付け)が、RDELTKNQ(配列番号513)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、
    f.残基355~362(EU番号付け)が、RDETDDGP(配列番号561)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成するか、または
    g.残基355~362(EU番号付け)が、RDETESGP(配列番号556)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、SKFGPENNY(配列番号557)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SNLRWTKGHV(配列番号558)を構成するEFループを形成し、残基378がバリンであるCH3ドメインによって提供される、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  4. 前記EGFR結合部位が、
    a.残基358~362(EU番号付け)がTDDGP(配列番号560)を構成し、残基384~386(EU番号付け)がTYG(配列番号511)を構成し、残基413~419(EU番号付け)がSYWRWYK(配列番号512)を構成するか、または
    b.残基355~362(EU番号付け)が、RDETDDGP(配列番号561)を構成するABループを形成し、残基383~391(EU番号付け)が、STYGPENNY(配列番号514)を構成するCDループを形成し、残基413~422(EU番号付け)が、SYWRWYKGNV(配列番号515)を構成するEFループを形成する、CH3ドメインによって提供されない、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  5. 前記CH3ドメインが、前記EGFR結合部位を含むように工学操作されたヒトIgG CH3ドメインである、請求項1に記載の多重特異性抗体。
  6. 前記Fc領域が、前記EGFR結合部位を含むように工学操作された前記CH3ドメインを含むヒトIgG Fc領域である、請求項2に記載の多重特異性抗体。
  7. 前記CH3ドメインのアミノ酸配列が、
    a.配列番号562;
    b.配列番号522;
    c.配列番号532;
    d.配列番号541;
    e.配列番号510;
    f.配列番号559;または
    g.配列番号552
    と少なくとも90%同一であるか、または少なくとも95%同一であるか、または100%同一である、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  8. 前記抗体が、Fc有効型である、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  9. 前記Fc領域が、
    a.配列番号391もしくは配列番号392;
    b.配列番号520もしくは配列番号521;
    c.配列番号530もしくは配列番号531;
    d.配列番号539もしくは配列番号540;
    e.配列番号508もしくは配列番号509;
    f.配列番号385もしくは配列番号386;または
    g.配列番号550もしくは配列番号551
    を含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  10. a.配列番号389;または配列番号414及び配列番号432;
    b.配列番号400;または配列番号414及び配列番号436;
    c.配列番号516;または配列番号414及び配列番号518;
    d.配列番号517;または配列番号414及び配列番号519;
    e.配列番号526;または配列番号414及び配列番号528;
    f.配列番号527;または配列番号414及び配列番号529;
    g.配列番号535;または配列番号414及び配列番号537;
    h.配列番号536;または配列番号414及び配列番号538;
    i.配列番号504;または配列番号414及び配列番号506;
    j.配列番号505;または配列番号414及び配列番号507;
    k.配列番号388;または配列番号414及び配列番号431;
    l.配列番号399;または配列番号414及び配列番号435;
    m.配列番号546;または配列番号414及び配列番号548;
    n.配列番号547;または配列番号414及び配列番号549;
    o.配列番号378;または配列番号425及び配列番号426;
    p.配列番号379;または配列番号421及び配列番号437;
    q.配列番号380;または配列番号423及び配列番号427
    を含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  11. a.配列番号385もしくは配列番号386;
    b.配列番号378;もしくは配列番号425及び配列番号426;
    c.配列番号379;もしくは配列番号421及び配列番号437;または
    d.配列番号380;もしくは配列番号423及び配列番号427
    を含まない、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  12. 前記多重特異性抗体が、約150nM未満、約20nM未満、約10nM未満、または約5nM未満の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトEGFRに結合する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  13. 前記Fab領域が、
    配列番号51、52、及び130からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR1;
    配列番号53及び131からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR2;及び
    配列番号68、55~67、69~78、及び133~143からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVHCDR3を含む重鎖可変領域;及び/または
    配列番号79及び144からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR1;
    配列番号80及び145からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR2;及び
    配列番号95、82~94、96~105、及び147~157からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなるVLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  14. 前記Fab領域が、
    a.それぞれ配列番号51、53、及び68のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び95のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    b.それぞれ配列番号51、53、及び55のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び82のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    c.それぞれ配列番号51、53、及び56のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び83のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    d.それぞれ配列番号51、53、及び57のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び84のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    e.それぞれ配列番号51、53、及び58のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び85のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    f.それぞれ配列番号51、53、及び59のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び86のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    g.それぞれ配列番号51、53、及び60のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び87のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    h.それぞれ配列番号52、53、及び61のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び88のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    i.それぞれ配列番号51、53、及び62のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び89のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    j.それぞれ配列番号51、53、及び63のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び90のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    k.それぞれ配列番号51、53、及び64のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び91のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    l.それぞれ配列番号51、53、及び65のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び92のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    m.それぞれ配列番号52、53、及び66のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び93のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    n.それぞれ配列番号51、53、及び67のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び94のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    o.それぞれ配列番号51、53、及び69のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び96のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    p.それぞれ配列番号51、53、及び70のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び97のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    q.それぞれ配列番号51、53、及び71のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び98のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    r.それぞれ配列番号51、53、及び72のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び99のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    s.それぞれ配列番号51、53、及び73のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び100のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    t.それぞれ配列番号52、53、及び74のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び101のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    u.それぞれ配列番号51、53、及び75のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び102のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    v.それぞれ配列番号51、53、及び76のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び103のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    w.それぞれ配列番号51、53、及び77のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び104のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    x.それぞれ配列番号51、53、及び78のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号79、80、及び105のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    y.それぞれ配列番号130、131、及び133のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び147のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    z.それぞれ配列番号130、131、及び134のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び148のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    aa.それぞれ配列番号130、131、及び135のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び149のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    bb.それぞれ配列番号130、131、及び136のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び150のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    cc.それぞれ配列番号130、131、及び137のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び151のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    dd.それぞれ配列番号130、131、及び138のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び152のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    ee.それぞれ配列番号130、131、及び139のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び153のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    ff.それぞれ配列番号130、131、及び140のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び154のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    gg.それぞれ配列番号130、131、及び141のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び155のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;
    hh.それぞれ配列番号130、131、及び142のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び156のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3;または
    ii.それぞれ配列番号130、131、及び143のアミノ酸配列を含むVHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3、ならびにそれぞれ配列番号144、145、及び157のアミノ酸配列を含むVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3を含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  15. 前記Fab領域が、
    配列番号15、2~14、16~25、及び107~117からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる重鎖可変領域;及び/または
    配列番号40、27~39、41~50、及び119~129からなる群から選択される配列に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の同一性を有する配列を含むか、もしくはそれからなる軽鎖可変領域を含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  16. 前記Fab領域が、
    a.配列番号15に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号40に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    b.配列番号2に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号27に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    c.配列番号3に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号28に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    d.配列番号4に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号29に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    e.配列番号5に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号30に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    f.配列番号6に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号31に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    g.配列番号7に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号32に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    h.配列番号8に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号33に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    i.配列番号9に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号34に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    j.配列番号10に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号35に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    k.配列番号11に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号36に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    l.配列番号12に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号37に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    m.配列番号13に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号38に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    n.配列番号14に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号39に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    o.配列番号16に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号41に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    p.配列番号17に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号42に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    q.配列番号18に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号43に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    r.配列番号19に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号44に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    s.配列番号20に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号45に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    t.配列番号21に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号46に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    u.配列番号22に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号47に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    v.配列番号23に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号48に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    w.配列番号24に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号49に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    x.配列番号25に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号50に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    y.配列番号107に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号119に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    z.配列番号108に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号120に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    aa.配列番号109に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号121に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    bb.配列番号110に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号122に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    cc.配列番号111に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号123に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    dd.配列番号112に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号124に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    ee.配列番号113に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号125に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    ff.配列番号114に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号126に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    gg.配列番号115に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号127に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;
    hh.配列番号116に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号128に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;または
    ii.配列番号117に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、及び配列番号129に対する少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、もしくは100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVLを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  17. 前記Fab領域が、IMGT番号付けシステムによる74位にセリン以外のアミノ酸残基を含み、任意により、IMGT番号付けシステムによる74位の前記残基がロイシン残基である、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  18. 前記Fab領域が、
    a. GDSVSSKSXA(配列番号158)の配列を含むHCDR1配列;
    b. 配列番号53の配列を含むHCDR2配列;
    c. XWXDX(配列番号162)の配列を含むHCDR3配列であって、前記HCDR3配列が配列番号54ではない、前記HCDR3配列;
    d. 配列番号79の配列を含むLCDR1配列;
    e. 配列番号80の配列を含むLCDR2配列;及び
    f. QQXYX10111213T(配列番号166)の配列を含むLCDR3配列であって、前記LCDR3配列が配列番号81ではない、前記LCDR3配列を含み、
    ~X13の各々が天然に存在するアミノ酸であるか、
    または前記抗体もしくはその抗原結合断片が、
    a. 配列番号130の配列を含むHCDR1配列;
    b. 配列番号131の配列を含むHCDR2配列;
    c. XYXAFDIの配列を含むHCDR3配列であって、前記HCDR3配列が配列番号132ではない、前記HCDR3配列;
    d. 配列番号144の配列を含むLCDR1配列;
    e. 配列番号145の配列を含むLCDR2配列;及び
    f. QQXLXTの配列を含むLCDR3配列であって、前記LCDR3配列が配列番号146ではない、前記LCDR3配列を含み、
    ~Xの各々が天然に存在するアミノ酸である、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  19. 前記Fab領域が、親抗Vδ1 Fab領域の親和性成熟したバリアントであり、前記親抗Vδ1 Fab領域が、
    a.配列番号1のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号26のアミノ酸配列を含むVL配列;
    b.配列番号106のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号118のアミノ酸配列を含むVL配列;
    c.配列番号273のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号282のアミノ酸配列を含むVL;
    d.配列番号274のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号283のアミノ酸配列を含むVL;
    e.配列番号275のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号284のアミノ酸配列を含むVL;
    f.配列番号276のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号285のアミノ酸配列を含むVL;
    g.配列番号277のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号286のアミノ酸配列を含むVL;
    h.配列番号278のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号287のアミノ酸配列を含むVL;
    i.配列番号279のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号288のアミノ酸配列を含むVL;
    j.配列番号280のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号289のアミノ酸配列を含むVL;
    k.配列番号281のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号290のアミノ酸配列を含むVL;または
    l.配列番号312のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号313のアミノ酸配列を含むVLを含み、
    任意により、
    前記親和性成熟した抗体が、γδT細胞受容体(TCR)の可変δ1(Vδ1)鎖への結合について、例えば、Kdで測定される場合、前記親抗体より少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも100%、少なくとも500%、もしくはより好ましくは、少なくとも約1000%高い親和性を有し、
    前記親和性成熟した抗Vδ1抗体もしくはその抗原結合断片が、対応する親VH及びVL配列と少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも96%同一なVH及びVL配列を含み、及び/または
    前記親和性成熟した抗Vδ1抗体もしくはその抗原結合断片が、親抗体配列と比較して最大20、例えば、最大15、例えば、最大10のアミノ酸置換を含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  20. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号562のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  21. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号522のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  22. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号532のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  23. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号541のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  24. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号510のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  25. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号559のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  26. 前記Fab領域が、配列番号15のアミノ酸配列を含むVH及び配列番号40のアミノ酸配列を含むVL配列を含み、前記Fc領域が、配列番号552のアミノ酸配列を含むCH3ドメインを含む、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  27. 先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、
    a. それが結合するVδ1T細胞上のTCRの下方調節を引き起こし、
    b. CDCまたはADCCを示さず、
    c. Vδ1T細胞を枯渇させないことを特徴とする、前記多重特異性抗体。
  28. 前記多重特異性抗体が、ADCC及び/またはCDCを介して、生存可能なVδ1 T+細胞集団の約30%未満、または約20%未満、または約10%未満の枯渇を引き起こす、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  29. 前記抗体またはその抗原結合断片が、約10nM未満のKDでヒトTRVD1に結合し、任意により、前記抗体またはその抗原結合断片が、約100nM未満のKDでカニクイザルTRVD1に結合する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  30. 約10nM未満のKDでγδ T細胞受容体(TCR)のヒト可変δ1(Vδ1)鎖に特異的に結合する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、任意により、前記抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が、約100nM未満のKDでγδ T細胞受容体(TCR)のカニクイザル可変δ1(Vδ1)鎖に結合する、及び/または約150nM未満のKでヒトEGFRに特異的に結合する、前記多重特異性抗体。
  31. 約10nM未満のKDでγδ T細胞受容体(TCR)のヒト可変δ1(Vδ1)鎖に特異的に結合する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体であって、任意により、前記抗Vδ1抗体またはその抗原結合断片が、約100nM未満のKDでγδ T細胞受容体(TCR)のカニクイザル可変δ1(Vδ1)鎖に結合する、及び/または約20nM未満のKでヒトEGFRに特異的に結合する、前記多重特異性抗体。
  32. a.約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でヒトTRDV1(配列番号272または306)に結合し、
    b.任意により、約100nM未満(好ましくは、約50nM未満)の結合親和性(例えば表面プラズモン共鳴により測定される、K)でカニクイザルTRDV1(配列番号308)に結合し、
    c.約50nM未満(好ましくは、約10nM未満)のTCR下方調節のIC50を有する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  33. 前記Fab領域が、配列番号272、配列番号306及び/または配列番号308のアミノ酸残基1~90内のエピトープにのみ結合する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  34. 前記Fab領域が、
    (i)配列番号272、配列番号306、及び/または配列番号308のアミノ酸3~20;及び/または
    (ii)配列番号272、配列番号306、及び/または配列番号308のアミノ酸37~77の領域内のエピトープに結合する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  35. 前記Fab領域が、γδT細胞の活性化エピトープに結合し、任意により、前記活性化エピトープの結合が、(i)前記γδTCRを下方調節し、(ii)前記γδT細胞の脱顆粒を活性化し、及び/または(iii)γδT細胞による殺傷を促進する、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  36. 前記活性化エピトープの結合が、CD107a、CD25、CD69、及び/またはKi67の発現を上方調節する、請求項16に記載の多重特異性抗体。
  37. 前記多重特異性抗体が、二重特異性抗体である、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  38. 前記多重特異性抗体が、二重特異性抗体ではない、先行請求項のいずれかに記載の多重特異性抗体。
  39. 請求項1~38のいずれか1項において定義されたような前記多重特異性抗体と、薬学的に許容される希釈剤または担体とを含む、医薬組成物。
  40. 対象の疾患もしくは障害を処置する方法、または対象における免疫応答を調節する方法であって、前記対象に、請求項1~38のいずれか1項に記載の多重特異性抗体、または請求項39に記載の医薬組成物を投与することを含む前記方法。
  41. 前記疾患もしくは障害ががんであるか、または免疫応答が調節される前記対象ががんを有する、請求項40に記載の方法。
  42. 前記がんが、EGFR陽性癌である、請求項41に記載の方法。
  43. 対象における免疫応答を調節することが、γδT細胞を活性化すること、γδT細胞の増殖を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の増大を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の脱顆粒を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞による殺傷活性を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞傷害性を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の動員を引き起こすか、または増加させること、γδT細胞の生存率を増加させること、及びγδT細胞の疲弊に対する抵抗性を増加させることからなる群から選択される少なくとも1つを含む、請求項40に記載の方法。
  44. 病変細胞は殺傷されると共に健常細胞が温存される、請求項40~43のいずれか1項に記載の方法。
  45. がんの処置に使用するための、請求項1~38のいずれか1項に記載の多重特異性抗体、または請求項23に記載の医薬組成物。
JP2023573494A 2021-02-17 2022-02-17 多重特異性抗TCRδ可変部1抗体 Pending JP2024509332A (ja)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB2102224.9 2021-02-17
GBGB2102224.9A GB202102224D0 (en) 2021-02-17 2021-02-17 Anti-TRC delta variable 1 antibodies
GB2111685.0 2021-08-14
GBGB2111685.0A GB202111685D0 (en) 2021-08-14 2021-08-14 Anti-tcr delta variable 1 antibodies
PCT/EP2022/054011 WO2022175414A1 (en) 2021-02-17 2022-02-17 Multispecific anti-tcr delta variable 1 antibodies

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2024509332A true JP2024509332A (ja) 2024-02-29

Family

ID=87849871

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2023573494A Pending JP2024509332A (ja) 2021-02-17 2022-02-17 多重特異性抗TCRδ可変部1抗体

Country Status (10)

Country Link
US (1) US20240132599A1 (ja)
EP (1) EP4294529A1 (ja)
JP (1) JP2024509332A (ja)
KR (1) KR20230160254A (ja)
AU (1) AU2022222299A1 (ja)
BR (1) BR112023016587A2 (ja)
CO (1) CO2023011973A2 (ja)
IL (1) IL305266A (ja)
MX (1) MX2023009544A (ja)
PE (1) PE20240591A1 (ja)

Also Published As

Publication number Publication date
BR112023016587A2 (pt) 2024-01-23
US20240132599A1 (en) 2024-04-25
CO2023011973A2 (es) 2023-12-20
EP4294529A1 (en) 2023-12-27
PE20240591A1 (es) 2024-03-21
AU2022222299A1 (en) 2023-09-07
IL305266A (en) 2023-10-01
MX2023009544A (es) 2023-11-28
KR20230160254A (ko) 2023-11-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR20220084020A (ko) 항-tcr 델타 가변 1 항체의 치료적 용도
US20220306739A1 (en) Materials and methods for modulating an immune response
US20210284731A1 (en) Methods and materials for modulating an immune response
EP4265642B1 (en) Multispecific anti-tcr delta variable 1 antibodies
WO2022175414A9 (en) Multispecific anti-tcr delta variable 1 antibodies
JP2024509332A (ja) 多重特異性抗TCRδ可変部1抗体
TW202342536A (zh) 多特異性抗TCRδ可變1抗體
CN118234754A (zh) 多特异性抗TCRδ可变1抗体
CN117999282A (zh) 抗TCRδ可变1抗体

Legal Events

Date Code Title Description
RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20231222