JP2023552865A - conditional bispecific binding protein - Google Patents

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Abstract

本開示は、いくつかの態様において、活性プロドラッグ形態で投与される、共刺激条件付き二重特異性リダイレクト活性化構築物、すなわち「共刺激COBRA」を提供する。腫瘍プロテアーゼに曝されると、構築物は切断されて活性化し、その結果、それらは腫瘍標的抗原(TTA)及び免疫細胞(例えば、免疫細胞の1つ以上のタイプ)の両方に結合できるようになりに、それに伴って、免疫細胞が腫瘍に動員され、治療が行われる。【選択図】図1DThe present disclosure provides, in some embodiments, costimulatory conditional bispecific redirect activation constructs, or "costimulatory COBRAs," administered in active prodrug form. Upon exposure to tumor proteases, the constructs are cleaved and activated, allowing them to bind to both tumor target antigens (TTA) and immune cells (e.g., one or more types of immune cells). In response, immune cells are recruited to the tumor and treatment is carried out. [Selected diagram] Figure 1D

Description

関連出願
本出願は、米国特許法第119条(e)の下で、2020年12月14日に出願された米国仮出願第63/125,267号、表題「CONDITIONALLY BISPECIFIC BINDING PROTEINS」の利益を主張するものであり、その全体が参照により本明細書に援用される。
RELATED APPLICATIONS This application is filed under 35 U.S.C. 119(e) with the benefit of U.S. Provisional Application No. 63/125,267, filed on December 14, 2020, entitled "CONDITIONALLY BISPECIFIC BINDING PROTEINS." and is hereby incorporated by reference in its entirety.

EFS-WEBを介してテキストファイルとして提出された配列表への言及
本出願は、EFS-Webを介してASCII形式で提出された配列表を含み、その全体が参照により本明細書に援用される。上記ASCIIのコピーは、2021年12月14日に作成されたものであり、名称は「T083370010WO00-SEQ-ZJG」であり、サイズは、412,419バイトである。
Reference to a sequence listing submitted as a text file via EFS-WEB This application contains a sequence listing submitted in ASCII format via EFS-WEB, which is incorporated herein by reference in its entirety. . The above ASCII copy was created on December 14, 2021, the name is "T083370010WO00-SEQ-ZJG", and the size is 412,419 bytes.

個々の細胞または特定の細胞型を選択的に破壊することは、多くの場合、様々な臨床環境において望ましいものである。例えば、健常細胞及び健常組織を可能な限りインタクトで損傷を受けていない状態に残しつつ腫瘍細胞を特異的に破壊することは、がん治療の主要な目的である。1つのこのような方法は、腫瘍に対する免疫応答を誘導して、ナチュラルキラー(NK)細胞または細胞傷害性Tリンパ球(CTL)などの免疫エフェクター細胞に腫瘍細胞を攻撃及び破壊させることによるものである。 Selective destruction of individual cells or specific cell types is often desirable in various clinical settings. For example, the specific destruction of tumor cells while leaving healthy cells and tissues as intact and undamaged as possible is a major goal of cancer therapy. One such method is by inducing an immune response against the tumor, causing immune effector cells such as natural killer (NK) cells or cytotoxic T lymphocytes (CTLs) to attack and destroy tumor cells. be.

本開示は、いくつかの態様において、がん細胞及び免疫細胞に結合して、免疫細胞による標的となるがんの死滅を刺激する免疫細胞誘導二重特異性抗体の毒性及び副作用を軽減するための方法及び組成物を提供する。本明細書で提供するタンパク質の多くは、プロテアーゼ(例えば、腫瘍微小環境で見られるプロテアーゼ)によって活性化され得るプロドラッグである。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、腫瘍微小環境にない場合に、タンパク質が腫瘍細胞に結合可能であるが、免疫細胞には結合せず(不活性であり)、かつタンパク質が腫瘍微小環境に入ると、タンパク質中の切断可能リンカーの切断により、そのタンパク質が「活性化」し、それにより、2つの「活性」二重特異性分子が生じ、そこで、それぞれが、腫瘍細胞及び免疫細胞に結合できるように構成される。いくつかの実施形態では、2つの「活性」二重特異性分子のそれぞれは、免疫細胞上の異なる抗原に結合する。いくつかの実施形態では、2つの「活性」二重特異性分子は、同じ免疫細胞上の2つの異なる抗原に結合する。いくつかの実施形態では、2つの「活性」二重特異性分子は、2つの異なる免疫細胞(例えば、T細胞、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、及び好中球から選択される免疫細胞)に結合する。例えば、いくつかの実施形態では、第1の「活性」二重特異性分子は、第1の標的腫瘍抗原及び第1の免疫細胞抗原CD3に結合できる一方で、第2の「活性」二重特異性分子は、第2の標的腫瘍抗原及び第2の免疫細胞抗原CD28に結合する。第1の標的腫瘍抗原及び第2の標的腫瘍抗原は、同じもの、または異なるものであり得る。この腫瘍特異的活性化により、潜在的なオフターゲット副作用が軽減され、かつ2つの異なる免疫細胞抗原を標的とすることにより、例えば、共刺激分子の活性化、T細胞動員及び活性の促進、T細胞疲弊の軽減、細胞傷害作用及びIFNγ分泌の促進、マクロファージの刺激、及び/またはマクロファージの成熟の促進によって、本明細書に記載のタンパク質の抗腫瘍作用が高まる。 The present disclosure provides, in some embodiments, for reducing the toxicity and side effects of immune cell-inducing bispecific antibodies that bind to cancer cells and immune cells to stimulate targeted killing of cancer by immune cells. Provided are methods and compositions. Many of the proteins provided herein are prodrugs that can be activated by proteases, such as those found in the tumor microenvironment. In some embodiments, the proteins described herein are capable of binding to tumor cells but not immune cells (inactive) when absent from the tumor microenvironment, and Once a protein enters the tumor microenvironment, cleavage of the cleavable linker in the protein “activates” the protein, thereby creating two “active” bispecific molecules, each of which has a tumor Configured to bind to cells and immune cells. In some embodiments, each of the two "active" bispecific molecules binds a different antigen on an immune cell. In some embodiments, two "active" bispecific molecules bind two different antigens on the same immune cell. In some embodiments, the two "active" bispecific molecules bind to two different immune cells (e.g., immune cells selected from T cells, natural killer cells, macrophages, and neutrophils). . For example, in some embodiments, a first "active" bispecific molecule can bind to a first target tumor antigen and a first immune cell antigen CD3, while a second "active" bispecific molecule can bind to a first target tumor antigen and a first immune cell antigen CD3. The specificity molecule binds the second target tumor antigen and the second immune cell antigen CD28. The first target tumor antigen and the second target tumor antigen can be the same or different. This tumor-specific activation reduces potential off-target side effects and targets two different immune cell antigens, e.g. activating co-stimulatory molecules, promoting T cell recruitment and activity, Reducing cell exhaustion, promoting cytotoxicity and IFNγ secretion, stimulating macrophages, and/or promoting macrophage maturation enhances the antitumor effects of the proteins described herein.

本開示のいくつかの態様は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカーと、
(v)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカーと、
(vii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカーと、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する、タンパク質を提供する。
Some aspects of the present disclosure provide, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to a first human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
(iv) a first cleavable linker;
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(vi) a second domain linker;
(vii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to a second human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
(viii) a second cleavable linker;
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ), providing proteins.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、好中球、またはマクロファージである。いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、またはマクロファージである。いくつかの実施形態では、第1の免疫抗原は、CD3、CD28、T細胞受容体、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、T細胞免疫グロブリン及びムチンドメイン3(TIM-3)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG-3)、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、CD137、OX40、CD27、GITR(TNFRSF18)、TIGIT、誘導性T細胞共刺激(ICOS)、CD16A、CD226、CD96、CD40L、CD226、CRTAM、LFA-1、CD27、CD96、TIGIT、KIR、NKG2D、CSF1R、CD40、MARCO、VSIG4、ならびにCD163から選択される。いくつかの実施形態では、第2の免疫抗原は、CD3、CD28、T細胞受容体、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、T細胞免疫グロブリン及びムチンドメイン3(TIM-3)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG-3)、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、CD137、OX40、CD27、GITR(TNFRSF18)、TIGIT、誘導性T細胞共刺激(ICOS)、CD16A、CD226、CD96、CD40L、CD226、CRTAM、LFA-1、CD27、CD96、TIGIT、KIR、NKG2D、CSF1R、CD40、MARCO、VSIG4、ならびにCD163からなる群から選択される。 In some embodiments, the first immune cell is a T cell, natural killer (NK) cell, neutrophil, or macrophage. In some embodiments, the second immune cell is a T cell, natural killer (NK) cell, or macrophage. In some embodiments, the first immunizing antigen is CD3, CD28, T cell receptor, programmed cell death protein 1 (PD-1), cytotoxic T lymphocyte associated protein 4 (CTLA-4), T Cellular immunoglobulin and mucin domain 3 (TIM-3), lymphocyte activation gene 3 (LAG-3), killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR), CD137, OX40, CD27, GITR (TNFRSF18), TIGIT, induction and CD16A, CD226, CD96, CD40L, CD226, CRTAM, LFA-1, CD27, CD96, TIGIT, KIR, NKG2D, CSF1R, CD40, MARCO, VSIG4, and CD163. In some embodiments, the second immunizing antigen is CD3, CD28, T cell receptor, programmed cell death protein 1 (PD-1), cytotoxic T lymphocyte associated protein 4 (CTLA-4), T Cellular immunoglobulin and mucin domain 3 (TIM-3), lymphocyte activation gene 3 (LAG-3), killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR), CD137, OX40, CD27, GITR (TNFRSF18), TIGIT, induction selected from the group consisting of sexual T cell costimulation (ICOS), CD16A, CD226, CD96, CD40L, CD226, CRTAM, LFA-1, CD27, CD96, TIGIT, KIR, NKG2D, CSF1R, CD40, MARCO, VSIG4, and CD163 be done.

いくつかの実施形態では、第1のヒト免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。いくつかの実施形態では、第1のヒト免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, the first human immune cell antigen is CD3 and the second human immune cell antigen is CD28. In some embodiments, the first human immune cell antigen is CD28 and the second human immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、第1の重鎖可変領域は、(iii)の第1の制約的scFvドメイン内で第1の軽鎖可変領域のN末端に連結される。いくつかの実施形態では、第1の重鎖可変領域は、(iii)の第1の制約的scFvドメイン内で第1の軽鎖可変領域のC末端に連結される。いくつかの実施形態では、第2の重鎖可変領域は、(vii)の第2の制約的scFvドメイン内で第2の軽鎖可変領域のN末端に連結される。いくつかの実施形態では、第2の重鎖可変領域は、(vii)の第2の制約的scFvドメイン内で第2の軽鎖可変領域のC末端に連結される。 In some embodiments, the first heavy chain variable region is linked to the N-terminus of the first light chain variable region within the first constraining scFv domain of (iii). In some embodiments, the first heavy chain variable region is linked to the C-terminus of the first light chain variable region within the first constraining scFv domain of (iii). In some embodiments, the second heavy chain variable region is linked to the N-terminus of the second light chain variable region within the second constraining scFv domain of (vii). In some embodiments, the second heavy chain variable region is linked to the C-terminus of the second light chain variable region within the second constrained scFv domain of (vii).

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原は、第2のヒト標的腫瘍抗原と同じである。いくつかの実施形態では、第1のsdABD及び第2のsdABDは、同じエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のsdABD及び第2のsdABDは、異なるエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原は、第2のヒト標的腫瘍抗原と異なる。いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原は、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される。いくつかの実施形態では、第2のヒト標的腫瘍抗原は、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is the same as the second human target tumor antigen. In some embodiments, the first sdABD and the second sdABD bind to the same epitope. In some embodiments, the first sdABD and the second sdABD bind different epitopes. In some embodiments, the first human target tumor antigen is different from the second human target tumor antigen. In some embodiments, the first human target tumor antigen is selected from EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and B7H3. In some embodiments, the second human target tumor antigen is selected from EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and B7H3.

いくつかの実施形態では、第1の切断可能リンカーは、第2の切断可能リンカーと同じである。いくつかの実施形態では、第1の切断可能リンカーは、第2の切断可能リンカーと異なる。いくつかの実施形態では、第1の切断可能リンカーは、腫瘍微小環境に存在するプロテアーゼに対する切断部位を含む。いくつかの実施形態では、第2の切断可能リンカーは、腫瘍微小環境に存在するプロテアーゼに対する切断部位を含む。いくつかの実施形態では、プロテアーゼは、MMP2、MMP9、メプリン、カテプシン、グランザイム、モトリプラーゼ(Matriplase)、トロンビン、エンテロキナーゼ、KLK7-6、KLK7-13、KLK7-11、KLK7-10、及びuPAから選択される。 In some embodiments, the first cleavable linker is the same as the second cleavable linker. In some embodiments, the first cleavable linker is different than the second cleavable linker. In some embodiments, the first cleavable linker includes a cleavage site for proteases present in the tumor microenvironment. In some embodiments, the second cleavable linker includes a cleavage site for proteases present in the tumor microenvironment. In some embodiments, the protease is selected from MMP2, MMP9, meprin, cathepsin, granzyme, Matriplase, thrombin, enterokinase, KLK7-6, KLK7-13, KLK7-11, KLK7-10, and uPA. be done.

いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的切断不可能リンカー及び/または(vii)の第2の制約的切断不可能リンカーは、長さが6~10アミノ酸であり、任意選択で(iii)の第1の制約的切断不可能リンカー及び/または(vii)の第2の制約的切断不可能リンカーは、長さが8アミノ酸である。いくつかの実施形態では、(ii)の第1のドメインリンカー及び/または(vi)の第2のドメインリンカーは切断不可能リンカーである。 In some embodiments, the first constraining non-cleavable linker of (iii) and/or the second constraining non-cleavable linker of (vii) is between 6 and 10 amino acids in length, and optionally The first constraining non-cleavable linker in (iii) and/or the second constraining non-cleavable linker in (vii) are 8 amino acids in length. In some embodiments, the first domain linker of (ii) and/or the second domain linker of (vi) are non-cleavable linkers.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第1のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the first sdABD comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11.

いくつかの実施形態では、第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the second human target tumor antigen is EGFR and the second sdABD comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11.

いくつかの実施形態では、第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the second human target tumor antigen is HER2 and the second sdABD is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75- 78, 82, 85, 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第1のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is HER2 and the first sdABD is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75- 78, 82, 85, 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300.

いくつかの実施形態では、第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the second human target tumor antigen is EGFR and the second sdABD comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11.

いくつかの実施形態では、第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the second human target tumor antigen is HER2 and the second sdABD is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75- 78, 82, 85, 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号5のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、ここで、第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号96のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is HER2 and the second human target tumor antigen is HER2, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:96.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、ここで、第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号96のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is HER2, wherein the first sdABD is an amino acid of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9. and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:96.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is HER2 and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1のヒト免疫細胞抗原はCD3であり、第1の重鎖可変領域は配列番号205のアミノ酸配列を含み、かつ第1の軽鎖可変領域は配列番号206のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human immune cell antigen is CD3, the first heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205, and the first light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. Contains arrays.

いくつかの実施形態では、第2のヒト免疫細胞抗原はCD28であり、第2の重鎖可変領域は配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含み、かつ第2の軽鎖可変領域は配列番号214のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the second human immune cell antigen is CD28, the second heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216, and the second light chain variable region comprises the sequence Contains the amino acid sequence number 214.

いくつかの実施形態では、第1のヒト免疫細胞抗原はCD28であり、第1の重鎖可変領域は配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含み、かつ第1の軽鎖可変領域は配列番号214のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human immune cell antigen is CD28, the first heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216, and the first light chain variable region comprises the sequence Contains the amino acid sequence number 214.

いくつかの実施形態では、第2のヒト免疫細胞抗原はCD3であり、第2の重鎖可変領域は配列番号205のアミノ酸配列を含み、かつ第2の軽鎖可変領域は配列番号206のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the second human immune cell antigen is CD3, the second heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205, and the second light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. Contains arrays.

いくつかの実施形態では、第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号234~249のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 234-249.

本明細書に記載するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、核酸分子は、ベクターである。いくつかの実施形態では、核酸分子は、発現ベクターである。本明細書に記載するタンパク質または核酸分子を含む細胞もまた提供する。 Nucleic acid molecules are provided that include nucleotide sequences encoding the proteins described herein. In some embodiments, the nucleic acid molecule is a vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule is an expression vector. Also provided are cells containing the proteins or nucleic acid molecules described herein.

本開示の他の態様は、タンパク質の発現を可能にする条件下にて、本明細書に記載の細胞を培養することを含む、タンパク質を生成する方法を提供する。いくつかの実施形態では、方法は、タンパク質を単離することをさらに含む。 Other aspects of the present disclosure provide methods of producing proteins comprising culturing the cells described herein under conditions that allow expression of the proteins. In some embodiments, the method further includes isolating the protein.

本明細書に記載するタンパク質を含む組成物を提供する。 Compositions comprising the proteins described herein are provided.

本開示の他の態様は、本明細書に記載するタンパク質または組成物を対象に投与することを含む、がんを治療する方法を提供する。いくつかの実施形態では、対象は、ヒト対象である。 Other aspects of the disclosure provide methods of treating cancer comprising administering to a subject a protein or composition described herein. In some embodiments, the subject is a human subject.

さらに、
第1のタンパク質及び第2のタンパク質を含み、そのそれぞれが、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカーと、
(v)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカーと、
(vii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカーと、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する、組成物を本明細書で提供する。
moreover,
a first protein and a second protein, each of which, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to a first human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
(iv) a first cleavable linker;
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(vi) a second domain linker;
(vii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to a second human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
(viii) a second cleavable linker;
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv Provided herein are compositions that form a.

いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、第2のタンパク質と同一である。 In some embodiments, the first protein is the same as the second protein.

いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質内の(iv)の第1の切断可能リンカー及び(viii)の第2の切断可能リンカーが切断されると、
第1のタンパク質の第1の重鎖可変領域が第2のタンパク質の第1の軽鎖可変領域と会合し、第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性Fvを形成し、
第1のタンパク質の第1の軽鎖可変領域が第2のタンパク質の第1の重鎖可変領域と会合し、第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性Fvを形成し、
第1のタンパク質の第2の重鎖可変領域が第2のタンパク質の第2の軽鎖可変領域と会合し、第2のヒト免疫細胞抗原に結合するFvを形成し、
第1のタンパク質の第2の軽鎖可変領域が第2のタンパク質の第2の重鎖可変領域と会合し、第2のヒト免疫細胞抗原に結合するFvを形成する。
In some embodiments, when (iv) the first cleavable linker and (viii) the second cleavable linker in the first protein and the second protein are cleaved,
a first heavy chain variable region of a first protein associates with a first light chain variable region of a second protein to form an active Fv that binds to a first human immune cell antigen;
a first light chain variable region of a first protein associates with a first heavy chain variable region of a second protein to form an active Fv that binds to a first human immune cell antigen;
a second heavy chain variable region of the first protein associates with a second light chain variable region of the second protein to form an Fv that binds to a second human immune cell antigen;
A second light chain variable region of the first protein associates with a second heavy chain variable region of the second protein to form an Fv that binds a second human immune cell antigen.

いくつかの実施形態では、組成物が対象に投与されると、その対象の腫瘍微小環境において切断が起こる。 In some embodiments, when the composition is administered to a subject, cleavage occurs in the subject's tumor microenvironment.

本開示のさらに他の態様は、
(a)第1のポリペプチドの第1のホモ二量体であって、第1のポリペプチドが、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含み、
該第1のホモ二量体において、一方のポリペプチドの第1のVHが他方のポリペプチドの第1のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの第1のVLが他方のポリペプチドの第1のVHと会合し、それぞれが第1の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する、第1のホモ二量体と、
(b)第2のポリペプチドの第2のホモ二量体であって、第2のポリペプチドが、
(i)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第2のドメインリンカーと、
(iii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原と結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含み、
該第2のホモ二量体において、一方のポリペプチドの第2のVHが他方のポリペプチドの第2のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの第2のVLが他方のポリペプチドの第2のVHと会合し、それぞれが第2の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する、第2のホモ二量体と、を含む組成物を提供する。
Still other aspects of the present disclosure include:
(a) a first homodimer of a first polypeptide, the first polypeptide comprising:
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to a first human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
In the first homodimer, the first VH of one polypeptide is associated with the first VL of the other polypeptide, and the first VL of one polypeptide is associated with the first VL of the other polypeptide. a first homodimer that associates with one VH to form two active variable fragments (Fv), each capable of binding a first immunizing antigen;
(b) a second homodimer of the second polypeptide, the second polypeptide comprising:
(i) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(ii) a second domain linker;
(iii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the second light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
In the second homodimer, the second VH of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide, and the second VL of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide. a second homodimer that associates with a second VH to form two active variable fragments (Fv), each capable of binding a second immunizing antigen.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、第2の免疫細胞抗原と異なる。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原は、EGFRまたはHER2である。いくつかの実施形態では、第2のヒト標的腫瘍抗原は、EGFRまたはHER2である。 In some embodiments, the first immune cell antigen is different from the second immune cell antigen. In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28. In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3. In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR or HER2. In some embodiments, the second human target tumor antigen is EGFR or HER2.

プロテアーゼ切断前の本開示のタンパク質の一般的な概略図の例を示す。不活性(例えば、プロテアーゼ切断前の)タンパク質構築物を示す。概して、N末端からC末端まで、構築物は、第1の抗腫瘍標的抗原(抗TTA)ドメインと、ドメインリンカーと、第1の抗CD3可変ドメイン(図1Aに示すように、これはVHドメインであるように本明細書に記載されているが、これらの構成要素は異なる順番であってもよい)と、制約的切断不可能リンカー(CNCL;この場合、8アミノ酸長の切断不可能リンカー(NCL-8))と、第2の抗CD3可変ドメイン(これも、この例ではVLドメイン)と、切断可能リンカー(CL;この場合、15アミノ酸長のMMP9切断可能リンカー)と、第2のα腫瘍標的抗原(抗TTA)ドメインと、ドメインリンカーと、第1の抗CD28可変ドメイン(図1Aに示すように、これはVLドメインであるように本明細書に記載されているが、これらの構成要素は異なる順番であってもよい)と、制約的切断不可能リンカー(CNCL;この場合、8アミノ酸長の切断不可能リンカー(NCL-8))と、第2の抗CD28可変ドメイン(これも、この実施形態ではVHドメイン)と、任意の切断可能リンカー(CL;この場合、15アミノ酸長のMMP9切断可能リンカー)と、半減期延長ドメイン(HSA-sdABD)と、任意のC末端ヒスチジンタグ(H6)とを含有する。Figure 3 shows an example of a general schematic diagram of a protein of the present disclosure prior to protease cleavage. Inactive (eg, prior to protease cleavage) protein construct is shown. Generally, from the N-terminus to the C-terminus, the construct includes a first anti-tumor targeting antigen (anti-TTA) domain, a domain linker, and a first anti-CD3 variable domain (as shown in Figure 1A, this is a VH domain). Although described herein as such, these components may be in a different order) and a constrained non-cleavable linker (CNCL; in this case, an 8 amino acid long non-cleavable linker (NCL). -8)), a second anti-CD3 variable domain (also a VL domain in this example), a cleavable linker (CL; in this case a 15 amino acid long MMP9 cleavable linker), and a second alpha tumor. These components include a target antigen (anti-TTA) domain, a domain linker, and a first anti-CD28 variable domain (described herein as a VL domain, as shown in Figure 1A). may be in different orders), a constrained non-cleavable linker (CNCL; in this case, an 8 amino acid long non-cleavable linker (NCL-8)), and a second anti-CD28 variable domain (also VH domain in this embodiment), an optional cleavable linker (CL; in this case the 15 amino acid long MMP9 cleavable linker), a half-life extension domain (HSA-sdABD), and an optional C-terminal histidine tag (H6 ). プロテアーゼ切断後の本開示のタンパク質の一般的な概略図の例を示す。第2の切断部位が存在する図1Aの構築物の切断生成物を示す。Figure 3 shows an example of a general schematic diagram of a protein of the present disclosure after protease cleavage. The cleavage product of the construct of FIG. 1A is shown where a second cleavage site is present. プロテアーゼ切断後の本開示のタンパク質の一般的な概略図の例を示す。活性抗CD3 Fv、ゆえに活性二重特異性T細胞誘導分子を形成し、腫瘍細胞及びT細胞(図2A~2Bに示すような)もしくは他のCD3発現細胞型のいずれかの両方と結合して、それらを活性化する、2つの抗CD3切断生成物構成要素のホモ二量体化を示す。形成される他のホモ二量体は、腫瘍細胞及びT細胞(図2A~2Bに示すような)もしくは他のCD28発現細胞型のいずれかの両方と結合して、それらを活性化する、二重特異性抗CD28結合ドメインである。Figure 3 shows an example of a general schematic diagram of a protein of the present disclosure after protease cleavage. Active anti-CD3 Fv, thus forming an active bispecific T-cell inducing molecule, binds both tumor cells and T cells (as shown in Figures 2A-2B) or other CD3-expressing cell types. , showing homodimerization of two anti-CD3 cleavage product components, activating them. Other homodimers formed bind to and activate both tumor cells and T cells (as shown in Figures 2A-2B) or other CD28-expressing cell types. A heavy specific anti-CD28 binding domain. プロテアーゼ切断前及び後の本開示のタンパク質の一般的な概略図の例を示す。図1A~1Cのそれぞれにおけるタンパク質の予想されるドメイン構造を示す。例示的タンパク質の予測される分子内折り畳み構造であり、この際、抗CD3 VHが抗CD28 VLと対になり、かつ抗CD3 VLが抗CD28 VHと対になり、その結果、活性CD3またはCD28結合ドメインを形成しない。タンパク質が切断されると、抗CD3及び抗CD28ドメインのホモ二量体化が可能となる。Figure 3 shows examples of general schematic diagrams of proteins of the present disclosure before and after protease cleavage. The predicted domain structures of the proteins in each of Figures 1A-1C are shown. Predicted intramolecular folds of exemplary proteins, in which an anti-CD3 VH is paired with an anti-CD28 VL, and an anti-CD3 VL is paired with an anti-CD28 VH, resulting in active CD3 or CD28 binding. Does not form a domain. Cleavage of the protein allows homodimerization of the anti-CD3 and anti-CD28 domains. 本開示のタンパク質の二重特異性作用機序の一般的な概略図を示す。一方がCD3に結合し、もう一方がCD28に結合する、得られた活性ホモ二量体は、同じT細胞に結合して、腫瘍細胞の細胞崩壊のためにT細胞を非特異的に活性する場合がある。各二量体の1つのsdABDのみが、がん細胞抗原に結合する一方で、ホモ二量体の他の腫瘍標的化sdABが、同じく腫瘍細胞に結合可能である。Figure 2 shows a general schematic diagram of the bispecific mode of action of the proteins of the present disclosure. The resulting active homodimers, one bound to CD3 and the other to CD28, bind to the same T cells and non-specifically activate the T cells for cytolysis of tumor cells. There are cases. Only one sdABD of each dimer binds to cancer cell antigens, while the other tumor-targeting sdAB of the homodimer is also capable of binding to tumor cells. 本開示のタンパク質の二重特異性作用機序の一般的な概略図を示す。一方がCD3に結合し、もう一方がCD28に結合する、得られた活性ホモ二量体は、同じT細胞に結合して、腫瘍細胞の細胞崩壊のためにT細胞を非特異的に活性する場合がある。各ホモ二量体の腫瘍標的化sdABDの両方が、がん細胞抗原に結合している。Figure 2 shows a general schematic diagram of the bispecific mode of action of the proteins of the present disclosure. The resulting active homodimers, one bound to CD3 and the other to CD28, bind to the same T cells and non-specifically activate the T cells for cytolysis of tumor cells. There are cases. Both tumor-targeting sdABDs of each homodimer are bound to cancer cell antigens. 本開示のタンパク質の二重特異性作用機序の一般的な概略図を示す。活性抗CD28ホモ二量体もまた、腫瘍微小環境によって反応不顕性になったか、疲弊した、がん特異的T細胞に結合できることを示す。活性抗CD28ホモ二量体は、T細胞の不活性状態を破り、それを再活性化して、腫瘍細胞の細胞崩壊を誘導する。Figure 2 shows a general schematic diagram of the bispecific mode of action of the proteins of the present disclosure. We show that active anti-CD28 homodimers are also able to bind to cancer-specific T cells rendered subclinical or exhausted by the tumor microenvironment. Active anti-CD28 homodimers break the inactive state of T cells and reactivate them, inducing cytolysis of tumor cells. 本明細書に記載するタンパク質の概略図である。本明細書に記載するタンパク質の8つの異なる構造の例を示す(形態1~8)。各構築物は、N末端からC末端の、抗CD3制約的Fv VH及びVLドメイン、抗CD28制約的Fv VH及びVLドメイン、ならびに抗CD3制約的Fv及び抗CD28制約的Fvの位置が異なる。FIG. 2 is a schematic diagram of the proteins described herein. Examples of eight different structures of the proteins described herein are shown (forms 1-8). Each construct differs in the position of the anti-CD3-restricted Fv VH and VL domains, the anti-CD28-restricted Fv VH and VL domains, and the anti-CD3-restricted Fv and anti-CD28-restricted Fv from N-terminus to C-terminus. 本明細書に記載するタンパク質の概略図である。図3Aと同様の再構成されたドメインを含むが、そのそれぞれは、EGFR結合である、TTA単一ドメイン抗体結合ドメイン(TTA-sdABD)を含む。HEK293細胞で一過的に発現する場合に観察される発現レベルも示す。FIG. 2 is a schematic diagram of the proteins described herein. Contains rearranged domains similar to FIG. 3A, but each of which includes a TTA single domain antibody binding domain (TTA-sdABD) that is EGFR-binding. Expression levels observed when transiently expressed in HEK293 cells are also shown. は、切断されていない不活性T細胞エンゲージャー及び共刺激構築物(A)切断時の活性二重特異性T細胞エンゲージャー構築物(B)及び切断時の活性二重特異性共刺激構築物(C)を含む制約的タンパク質構築物の例を示す。構築物は、標的腫瘍抗原(TTA)単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD;「TTA-sdABD」)を含む。Inactive T-cell engager and co-stimulatory constructs (A) inactive when cleaved (B) bispecific T-cell engager constructs active upon cleavage (B) and bispecific co-stimulatory constructs active upon cleavage (C) An example of a constrained protein construct comprising: The construct includes a target tumor antigen (TTA) single domain antigen binding domain (sdABD; "TTA-sdABD"). A、Bは、組換えにより生成した活性抗CD28制約的構築物の例を示す。A, B show examples of recombinantly produced active anti-CD28 restricted constructs. 抗CD3活性二量体及び抗CD28活性二量体の両方による増殖によって測定した際のヒトT細胞のin vitro活性化を示す。抗CD3活性二量体(Pro201)は、標的(EGFR)がプレートに固定化されている場合に抗αCD3抗体と同様にT細胞を刺激できることを示す。In vitro activation of human T cells as measured by proliferation by both anti-CD3 and anti-CD28 active dimers. We show that the anti-CD3 active dimer (Pro201) can stimulate T cells similarly to anti-αCD3 antibodies when the target (EGFR) is immobilized on the plate. 抗CD3活性二量体及び抗CD28活性二量体の両方による増殖によって測定した際のヒトT細胞のin vitro活性化を示す。T細胞を最適以下の量(200ピコモル(pM))のPro201/抗CD3活性二量体と共に抗CD28抗体または抗CD28活性ホモ二量体のいずれかによって共刺激する。In vitro activation of human T cells as measured by proliferation by both anti-CD3 and anti-CD28 active dimers. T cells are costimulated with either anti-CD28 antibodies or anti-CD28 active homodimers with suboptimal amounts (200 picomolar (pM)) of Pro201/anti-CD3 active dimers. 抗CD3活性二量体及び抗CD28活性二量体の両方による増殖によって測定した際のヒトT細胞のin vitro活性化を示す。プレートと、ビーズとに固定化された標的分子を伴う抗CD28(Pro938)及び抗CD3(Pro201)活性ホモ二量体による、T細胞の共刺激を示す。In vitro activation of human T cells as measured by proliferation by both anti-CD3 and anti-CD28 active dimers. Figure 3 shows costimulation of T cells by anti-CD28 (Pro938) and anti-CD3 (Pro201) active homodimers with target molecules immobilized on plates and beads. 最適以下の量の抗CD3/Pro201を伴う種々の抗CD28活性二量体によるHT29細胞のT細胞依存性細胞傷害活性を示す。Aでは、標的細胞を、まずPro201で処置し、次いで、抗CD28活性ホモ二量体の濃度を漸増させながら、ヒトT細胞と混合した。Bでは、抗CD28活性ホモ二量体を標的細胞と共にインキュベートし、その後T細胞及びPro201と混合した。どちらの状況でも、細胞傷害作用が、抗EGFR抗CD28活性ホモ二量体で観察されたが、架橋抗CD28抗体では観察されなかった。Figure 3 shows T cell-dependent cytotoxic activity of HT29 cells by various anti-CD28 active dimers with suboptimal amounts of anti-CD3/Pro201. In A, target cells were first treated with Pro201 and then mixed with human T cells at increasing concentrations of anti-CD28 active homodimer. In B, anti-CD28 active homodimers were incubated with target cells and then mixed with T cells and Pro201. In both situations, cytotoxic effects were observed with anti-EGFR anti-CD28 active homodimers, but not with cross-linked anti-CD28 antibodies. 疲弊したT細胞の刺激の結果を示す。Aは、疲弊したT細胞の調製及び刺激の概略図を示す。ヒト初期静止T細胞を、Bに示すような表示されているマーカーの発現を介してそれらが疲弊表現型を示すまで、抗CD3及びIL-10で広範に刺激した。疲弊したT細胞は、FACSを介して増殖及び生存率を追跡するために、事前にCell Trace Violetで標識し、次いで、EGFR結合ビーズの存在下で試験分子と共にインキュベートした。Cは、疲弊したT細胞がCD3及びCD28の両方を刺激することによってのみ増殖し、CD3単独では増殖しないことを示す。The results of stimulation of exhausted T cells are shown. A shows a schematic diagram of exhausted T cell preparation and stimulation. Human early resting T cells were extensively stimulated with anti-CD3 and IL-10 until they displayed an exhausted phenotype via expression of the indicated markers as shown in B. Exhausted T cells were pre-labeled with Cell Trace Violet and then incubated with test molecules in the presence of EGFR-conjugated beads to track proliferation and viability via FACS. C shows that exhausted T cells proliferate only by stimulating both CD3 and CD28, but not with CD3 alone. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖に影響を与えることを示す。使用した抗CD3及び抗CD28活性二量体分子の概略的表現である。Pro938及びPro1034は、sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VH/VL)-sdABD(EGFR)の構成を有し、Pro935及びPro1035は、sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VL/VH)-sdABD(EGFR)の構成を有する。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation of exhausted T cells. Schematic representation of the anti-CD3 and anti-CD28 active dimeric molecules used. Pro938 and Pro1034 have the configuration of sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VH/VL)-sdABD(EGFR), and Pro935 and Pro1035 have the configuration of sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VL/VH)-sdABD(EGFR) It has the following configuration. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖に影響を与えることを示す。抗CD28活性二量体分子Pro935またはPro938をPro201と共に投与すると、T細胞増殖が用量依存的に増加し、Pro201+Pro935では最大増殖指数が1.7であり、Pro201+Pro938では最大増殖指数が2.4であることを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation of exhausted T cells. Administration of anti-CD28 active dimeric molecules Pro935 or Pro938 together with Pro201 results in a dose-dependent increase in T cell proliferation, with a maximal proliferation index of 1.7 for Pro201+Pro935 and 2.4 for Pro201+Pro938. Show that. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖に影響を与えることを示す。抗CD28活性二量体分子Pro1034またはPro1035をPro201と共に投与すると、T細胞増殖が用量依存的に増加し、Pro201+Pro1034処置では最大増殖指数が2.1となり、Pro201+Pro1035では最大増殖指数が1.5であることを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation of exhausted T cells. Administration of anti-CD28 active dimeric molecules Pro1034 or Pro1035 together with Pro201 results in a dose-dependent increase in T cell proliferation, with Pro201+Pro1034 treatment having a maximal proliferation index of 2.1 and Pro201+Pro1035 having a maximal proliferation index of 1.5. Show that. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖に影響を与えることを示す。これらのタンパク質のいずれかを単独で投与すると、最大増殖指数が1.1未満の非常に低いレベルの増殖しかもたらさないことを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation of exhausted T cells. We show that administration of either of these proteins alone results in very low levels of proliferation with a maximum proliferation index of less than 1.1. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖及び生存率に影響を与えることを示す。使用した活性二量体分子の概略的表現を示す。Pro1134は、sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VH/VL)の構成を有し、Pro1135は、sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VL/VH)の構成を有する。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation and survival of exhausted T cells. A schematic representation of the active dimeric molecules used is shown. Pro1134 has a configuration of sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VH/VL), and Pro1135 has a configuration of sdABD(EGFR)-scFv(CD28 VL/VH). 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖及び生存率に影響を与えることを示す。Pro201+Pro1134では最大増殖指数が3.8、Pro201+Pro1135では最大増殖指数が3.6と、Pro201+Pro1134が、Pro201+Pro1135よりも増殖を誘導する効力がわずかに高いことを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation and survival of exhausted T cells. Pro201+Pro1134 has a maximum proliferation index of 3.8, and Pro201+Pro1135 has a maximum proliferation index of 3.6, indicating that Pro201+Pro1134 has a slightly higher proliferation-inducing efficacy than Pro201+Pro1135. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖及び生存率に影響を与えることを示す。Pro201、Pro1134、またはPro1135の単独による処置は、濃度が約100pMを超えるまで増殖を誘導するのに十分でなく、また最大増殖指数は1.8未満であることを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation and survival of exhausted T cells. Treatment with Pro201, Pro1134, or Pro1135 alone is not sufficient to induce proliferation at concentrations above about 100 pM, and the maximal proliferation index is shown to be less than 1.8. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖及び生存率に影響を与えることを示す。Pro201+Pro1134では最大生存率が47%、Pro201+Pro1135では最大生存率が33%と、Pro201+Pro1134は、Pro201+Pro1135よりも生細胞の割合を増加させる効力がより高いことを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation and survival of exhausted T cells. Pro201+Pro1134 had a maximum survival rate of 47%, and Pro201+Pro1135 had a maximum survival rate of 33%, indicating that Pro201+Pro1134 has a higher efficacy in increasing the percentage of viable cells than Pro201+Pro1135. 抗CD3及び抗CD28内のVH及びVLドメインの方向が疲弊したT細胞の増殖及び生存率に影響を与えることを示す。Pro201、Pro1134、またはPro1135は、単独で細胞生存率を高めるが、Pro1134またはPro1135のいずれかを伴ったPro201よりもその程度は低いことを示す。We show that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 and anti-CD28 influences the proliferation and survival of exhausted T cells. We show that Pro201, Pro1134, or Pro1135 alone increase cell viability, but to a lesser extent than Pro201 with either Pro1134 or Pro1135. 抗CD3及び抗CD28活性二量体分子の両方の分子が単一の標的化sdABDを有する場合に活性であり、抗CD3内のVH及びVLドメインの方向がT細胞活性化に影響を与えることを示す。使用した分子の概略的表現を示す。Pro861は、sdABD(EGFR)-抗CD3(VH/VL)構築物であり、Pro863は、sdABD(EGFR)-抗CD3(VL/VH)構築物である。We demonstrate that both anti-CD3 and anti-CD28 active dimeric molecules are active when they have a single targeting sdABD, and that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 influences T cell activation. show. A schematic representation of the molecules used is shown. Pro861 is a sdABD(EGFR)-anti-CD3(VH/VL) construct and Pro863 is a sdABD(EGFR)-anti-CD3(VL/VH) construct. 抗CD3及び抗CD28活性二量体分子の両方の分子が単一の標的化sdABDを有する場合に活性であり、抗CD3内のVH及びVLドメインの方向がT細胞活性化に影響を与えることを示す。疲弊したT細胞がCD3及びCD28活性二量体の両方の存在下では増殖したが、二量体のいずれかを単独で投与した場合は増殖しなかったことを示す。結果はまた、Pro861+Pro1134はPro863+Pro1134よりも効力が高かったことを示している。結果はまた、Pro861+Pro1134はPro863+Pro1134よりも効力が高かったことを示している。加えて、疲弊を誘導する前の凍結T細胞は、構築物による処置後のT細胞増殖にほとんど影響を及ぼさなかった。We demonstrate that both anti-CD3 and anti-CD28 active dimeric molecules are active when they have a single targeting sdABD, and that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 influences T cell activation. show. Figure 3 shows that exhausted T cells proliferated in the presence of both CD3 and CD28 active dimers, but not when either dimer was administered alone. The results also show that Pro861+Pro1134 was more potent than Pro863+Pro1134. The results also show that Pro861+Pro1134 was more potent than Pro863+Pro1134. In addition, frozen T cells prior to inducing exhaustion had little effect on T cell proliferation following treatment with the construct. 抗CD3及び抗CD28活性二量体分子の両方の分子が単一の標的化sdABDを有する場合に活性であり、抗CD3内のVH及びVLドメインの方向がT細胞活性化に影響を与えることを示す。抗CD3または抗CD28活性二量体のいずれかは、単独でも生存率をサポートできるが、両方を組み合わせると、効力が最大となることを示す。結果はまた、Pro861+Pro1134はPro863+Pro1134よりも効力が高かったことを示している。We demonstrate that both anti-CD3 and anti-CD28 active dimeric molecules are active when they have a single targeting sdABD, and that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 influences T cell activation. show. Although either anti-CD3 or anti-CD28 active dimers can support viability alone, the combination of both shows the greatest efficacy. The results also show that Pro861+Pro1134 was more potent than Pro863+Pro1134. 抗CD3及び抗CD28活性二量体分子の両方の分子が単一の標的化sdABDを有する場合に活性であり、抗CD3内のVH及びVLドメインの方向がT細胞活性化に影響を与えることを示す。各処置による増殖及び生存率のEC50及び最大値を示す。We demonstrate that both anti-CD3 and anti-CD28 active dimeric molecules are active when they have a single targeting sdABD, and that the orientation of the VH and VL domains within anti-CD3 influences T cell activation. show. The EC50 and maximum values for proliferation and survival by each treatment are shown. MMP9切断部位が第2のEGFR結合ドメインと不活性VLiドメインとの間に位置するT細胞エンゲージャーであるPro186の構造を示す。Pro186は、活性抗CD3二量体の形成を阻害するために、不活性VLi-VHiを使用する。The structure of Pro186, a T cell engager, where the MMP9 cleavage site is located between the second EGFR binding domain and the inactive VLi domain is shown. Pro186 uses inactive VLi-VHi to inhibit the formation of active anti-CD3 dimers. Pro646の構造を示す。Pro646内のMMP9プロテアーゼ切断部位は、抗CD3VLドメインと第2のEGFR結合ドメインとの間、及びVHiドメインとHSAドメインとの間に位置する。Pro186ホモ活性二量体は抗CD3活性ホモ二量体に会合した4つの抗EGFR sdAbを有するのに対して(図12)、この分子は、抗CD3活性ホモ二量体に会合した2つの抗EGFR sdAbを有する。The structure of Pro646 is shown. The MMP9 protease cleavage site within Pro646 is located between the anti-CD3 VL domain and the second EGFR binding domain and between the VHi domain and the HSA domain. The Pro186 homoactive dimer has four anti-EGFR sdAbs associated with an anti-CD3 active homodimer (Figure 12), whereas this molecule has two anti-EGFR sdAbs associated with an anti-CD3 active homodimer. with EGFR sdAb. 共刺激COBRAの構造であるPro1136を示す。MMP9プロテアーゼ切断部位が抗CD3VLドメインと第2のEGFR結合ドメインとの間(Pro646と同一)、及び抗CD28 VLドメインとHSAドメインとの間に位置する。活性抗CD3及び抗CD28活性二量体の形成を相互に阻害するために、不活性VLi及びVHiを抗CD28VH-VLで置き換えた。この分子は、Pro646と類似のタンパク質分解制約を有するが、抗CD3及び抗CD28活性二量体の両方を形成する能力を含んでいる。The structure of costimulatory COBRA, Pro1136, is shown. MMP9 protease cleavage sites are located between the anti-CD3 VL domain and the second EGFR binding domain (identical to Pro646) and between the anti-CD28 VL domain and the HSA domain. In order to mutually inhibit the formation of active anti-CD3 and anti-CD28 active dimers, inactive VLi and VHi were replaced with anti-CD28VH-VL. This molecule has similar proteolytic constraints as Pro646, but includes the ability to form both anti-CD3 and anti-CD28 active dimers. 抗CD3 EGFR及び抗CD28 EGFR構築物による処置により、より高い効力で疲弊したT細胞の増殖及び生存率を増加させることを示す。使用した分子の概略図を示す。We show that treatment with anti-CD3 EGFR and anti-CD28 EGFR constructs increases the proliferation and survival of exhausted T cells with higher efficacy. A schematic diagram of the molecules used is shown. 抗CD3 EGFR及び抗CD28 EGFR構築物による処置により、より高い効力で疲弊したT細胞の増殖及び生存率を増加させることを示す。抗CD28活性二量体であるPro1134と組み合わせた未変性及び事前に切断されたPro646のみが、増殖を誘導できたことを示す。We show that treatment with anti-CD3 EGFR and anti-CD28 EGFR constructs increases the proliferation and survival of exhausted T cells with higher efficacy. We show that only native and pre-cleaved Pro646 in combination with the anti-CD28 active dimer Pro1134 was able to induce proliferation. 抗CD3 EGFR及び抗CD28 EGFR構築物による処置により、より高い効力で疲弊したT細胞の増殖及び生存率を増加させることを示す。活性抗CD3二量体を形成する切断されたPro646と、抗CD28活性二量体であるPro1134との組み合わせが、疲弊したT細胞の生存率を誘導する場合に最も高い効力を呈することを示す。We show that treatment with anti-CD3 EGFR and anti-CD28 EGFR constructs increases the proliferation and survival of exhausted T cells with higher efficacy. We show that the combination of cleaved Pro646, which forms an active anti-CD3 dimer, and Pro1134, an anti-CD28 active dimer, exhibits the highest efficacy in inducing survival of exhausted T cells. 抗CD3 EGFR及び抗CD28 EGFR構築物による処置により、より高い効力で疲弊したT細胞の増殖及び生存率を増加させることを示す。各処置による増殖及び生存率のEC50値を示す。We show that treatment with anti-CD3 EGFR and anti-CD28 EGFR constructs increases the proliferation and survival of exhausted T cells with higher efficacy. EC50 values for proliferation and survival for each treatment are shown. 本明細書に記載する条件付き活性タンパク質の異なる多様体(図3Bに示した概略図)の影響を示す。切断されたPro1136、切断されたPro1138、切断されたPro1140、及び切断されたPro1142は、疲弊したT細胞のT細胞増殖を誘導したが、切断されていないPro1136、切断されていないPro1138、切断されていないPro1140、及び切断されていないPro1142は、疲弊したT細胞のT細胞増殖を誘導しなかったことを示す。Figure 3 shows the effect of different variants of conditionally active proteins described herein (schematic diagram shown in Figure 3B). Cleaved Pro1136, cleaved Pro1138, cleaved Pro1140, and cleaved Pro1142 induced T cell proliferation in exhausted T cells, whereas uncleaved Pro1136, uncleaved Pro1138, and cleaved Pro1136 induced T cell proliferation in exhausted T cells. Indicates that absent Pro1140 and uncleaved Pro1142 did not induce T cell proliferation of exhausted T cells. 本明細書に記載する条件付き活性タンパク質の異なる多様体(図3Bに示した概略図)の影響を示す。切断されたPro1136、切断されたPro1138、切断されたPro1140、及び切断されたPro1142が、切断されていないPro1136、切断されていないPro1138、切断されていないPro1140、及び切断されていないPro1142よりもより高い効力でT細胞生存率を誘導したことを示す。Figure 3 shows the effect of different variants of conditionally active proteins described herein (schematic diagram shown in Figure 3B). cleaved Pro1136, cleaved Pro1138, cleaved Pro1140, and cleaved Pro1142 are higher than uncleaved Pro1136, uncleaved Pro1138, uncleaved Pro1140, and uncleaved Pro1142 This shows that the efficacy induced T cell survival rate. 本明細書に記載する条件付き活性タンパク質の異なる多様体(図3Bに示した概略図)の影響を示す。切断された及び切断されていないPro1136、Pro1138、Pro1140、及びPro1142の増殖及び細胞生存率のEC50を示す。Figure 3 shows the effect of different variants of conditionally active proteins described herein (schematic diagram shown in Figure 3B). EC50 of proliferation and cell viability of cleaved and uncleaved Pro1136, Pro1138, Pro1140, and Pro1142 are shown. 本明細書に記載する条件付き活性タンパク質の異なる多様体(図3Bに示した概略図)の影響を示す。プロテアーゼ切断を伴う、及び伴わないPro186、Pro646及びPro1136COBRA分子のin vitro細胞傷害作用における比較を示す。COBRAを、標準的なTDCCアッセイにて、10:1の比率(ヒトT細胞:HT29腫瘍細胞株)で、様々な濃度で試験した。この試験した一連の分子では、事前に切断されたPro186が最も効力が高かった。事前に切断されたPro646では、活性は少なくとも10分の1であったが、これはおそらく、Pro186は4つの抗EGFR sdAbを形成し得るのに対して、その抗CD3活性二量体が、2つしか抗EGFR sdAbを有していないためである。Pro1136は、Pro646よりも約5倍効力が高かった。Figure 3 shows the effect of different variants of conditionally active proteins described herein (schematic diagram shown in Figure 3B). Figure 2 shows a comparison of the in vitro cytotoxic effects of Pro186, Pro646 and Pro1136 COBRA molecules with and without protease cleavage. COBRA was tested at various concentrations in a standard TDCC assay at a ratio of 10:1 (human T cells:HT29 tumor cell line). In this series of molecules tested, pre-cleaved Pro186 was the most potent. With pre-cleaved Pro646, the activity was at least 10-fold lower, probably because Pro186 can form 4 anti-EGFR sdAbs, whereas its anti-CD3 active dimer has 2 This is because only a few have anti-EGFR sdAb. Pro1136 was approximately 5 times more potent than Pro646. 本明細書に記載する条件付き活性タンパク質の異なる多様体(図3Bに示した概略図)の影響を示す。ヒト結腸直腸腺癌(HT29)細胞を標的とする、切断されたPro1136~Pro1143(図3Bに示す概略図)の効力のT細胞依存性細胞傷害活性(TDCC)アッセイによる定量化を示す。Pro186は、陽性対照として使用する。結果は、このアッセイにおいて、Pro1136及びPro1137が、Pro1138及びPro1139よりも約10倍高い効力を有することを示している。このアッセイにおいてPro1140及びPro1141の効力は、Pro1136及びPro1137の約100分の1である。このアッセイにおいてPro1142及びPro1143の効力は、Pro1136及びPro1137の約1000分の1である。Figure 3 shows the effect of different variants of conditionally active proteins described herein (schematic diagram shown in Figure 3B). Figure 3 shows quantification of the potency of truncated Pro1136-Pro1143 (schematic diagram shown in Figure 3B) targeting human colorectal adenocarcinoma (HT29) cells by T cell-dependent cytotoxicity (TDCC) assay. Pro186 is used as a positive control. The results show that Pro1136 and Pro1137 have approximately 10 times higher potency than Pro1138 and Pro1139 in this assay. The potency of Pro1140 and Pro1141 in this assay is approximately 100 times lower than that of Pro1136 and Pro1137. The potency of Pro1142 and Pro1143 in this assay is approximately 1000 times lower than that of Pro1136 and Pro1137. COBRA機能に対する代替的抗EGFR sdAbの影響を示す。この実験は、図16で示したものと同様のものであるが、試験した共刺激COBRAは、標的化ドメインが代替的抗EGFR sdAb hG8に置き換えられている点が異なる。切断されたPro1184(抗CD3 VH-VL/抗CD28 VH-VL)と、切断されたPro1185(抗CD3 VH-VL VLi-VHi)とを比較すると、前者は、その効力が約2倍であり、これは、前者が通常の抗CD3活性二量体だけではなく、抗CD28 scFvも含有するが、後者は抗CD3活性二量体しか有していないことが理由である。Pro1192(抗CD28 VH-VL/抗CD3 VH-VL)は、その効力がPro1184の約60分の1であり、このことは、抗CD28 VH-VLのN末端側に抗CD3 VH-VLがあると、効力が増大することを示唆している。予想通り、Pro1186(抗CD28 VH-VL/VHi-VLi)は、その効力が、抗CD3 VH-VLまたは抗CD3 VH-VL及び抗CD28 VH-VLの両方を含む構築物の数千分の1であった。Figure 3 shows the effects of alternative anti-EGFR sdAbs on COBRA function. This experiment is similar to that shown in Figure 16, except that the costimulatory COBRA tested has the targeting domain replaced with the alternative anti-EGFR sdAb hG8. Comparing cleaved Pro1184 (anti-CD3 VH-VL/anti-CD28 VH-VL) and cleaved Pro1185 (anti-CD3 VH-VL VLi-VHi), the former has approximately twice the potency; This is because the former contains not only the usual anti-CD3 active dimer but also anti-CD28 scFv, whereas the latter contains only the anti-CD3 active dimer. The efficacy of Pro1192 (anti-CD28 VH-VL/anti-CD3 VH-VL) is approximately 1/60 that of Pro1184, which means that anti-CD3 VH-VL is located on the N-terminal side of anti-CD28 VH-VL. This suggests that the efficacy increases. As expected, Pro1186 (anti-CD28 VH-VL/VHi-VLi) is several thousand times less potent than anti-CD3 VH-VL or constructs containing both anti-CD3 VH-VL and anti-CD28 VH-VL. there were. HER2またはEGFRを標的とするsdABDを含有する抗CD3及び抗CD28活性二量体分子が、疲弊したT細胞の増殖を誘導することを示す。Aは、使用した活性二量体分子の概略的表現を示す。Pro1176は、sdABD(HER2)-抗CD3(VH/VL)構築物であり、Pro1179は、sdABD(HER2)-抗CD28(VH/VL)構築物である。Bは、Pro1176+Pro1134処置は、Pro1134単独よりも増殖の増加をもたらし、かつPro861+Pro1179による処置は、Pro861単独よりも増殖の増加をもたらすことを示す。We show that anti-CD3 and anti-CD28 active dimeric molecules containing sdABDs that target HER2 or EGFR induce proliferation of exhausted T cells. A shows a schematic representation of the active dimeric molecules used. Pro1176 is a sdABD(HER2)-anti-CD3(VH/VL) construct and Pro1179 is a sdABD(HER2)-anti-CD28(VH/VL) construct. B shows that Pro1176+Pro1134 treatment results in increased proliferation over Pro1134 alone, and treatment with Pro861+Pro1179 results in increased proliferation over Pro861 alone. 抗HER2 sdABDを含む条件付き活性タンパク質を示す。Aは、条件付き活性タンパク質の様々な構造を示す。種々の構築物は、抗CD3 VH-VL及び抗CD28 VH-VLの異なるN末端からC末端への方向を有し、かつ2つの抗sdABDか、または1つの抗HER2 sdABD及び1つの抗EGFR sdABDを有する。1つの抗HER2 sdABD及び1つの抗EGFR sdABDを有する構築物は、そのN末端か、MMP9~15切断部位とNCLとの間に、抗HER2 sdABDまたは抗EGFR sdABDを有する場合がある。Bは、抗CD28 sdABDの代わりにFLAG不活化sdABDを含む対照条件付き活性タンパク質を示す。全ての対照構築物は、抗EGFR sdABDを有する。Conditionally active proteins containing anti-HER2 sdABD are shown. A shows various structures of conditionally active proteins. The various constructs have different N-terminal to C-terminal orientations of anti-CD3 VH-VL and anti-CD28 VH-VL, and either two anti-sdABDs or one anti-HER2 sdABD and one anti-EGFR sdABD. have A construct with one anti-HER2 sdABD and one anti-EGFR sdABD may have an anti-HER2 sdABD or an anti-EGFR sdABD at its N-terminus or between the MMP9-15 cleavage site and the NCL. B shows a control conditionally active protein containing FLAG-inactivated sdABD instead of anti-CD28 sdABD. All control constructs have anti-EGFR sdABD. ヒトHER2を過剰発現するヒトBリンパ芽球細胞様細胞(huHER2-RAJI細胞)を標的とする、抗CD28 VH-VL、抗CD3 VH-VL、及び抗HER2 sdABD(hu1156)を含む条件付き活性多重特異性タンパク質の効力のTDCCアッセイによる定量化を示す。N末端からC末端まで、Pro1265は、抗CD28 VH-VL及び抗CD3 VH-VLを含む。N末端からC末端まで、Pro1266は、抗CD3 VH-VL及び抗CD28 VH-VLを含む。結果は、Pro1265及びPro1266がCD3/CD28の位置に関係なく、同様のTDCC効力を有することを示している。A conditional active multiplex containing anti-CD28 VH-VL, anti-CD3 VH-VL, and anti-HER2 sdABD (hu1156) targeting human B lymphoblastoid cell-like cells that overexpress human HER2 (huHER2-RAJI cells) Quantification of specificity protein potency by TDCC assay is shown. From the N-terminus to the C-terminus, Pro1265 contains anti-CD28 VH-VL and anti-CD3 VH-VL. From N-terminus to C-terminus, Pro1266 contains anti-CD3 VH-VL and anti-CD28 VH-VL. The results show that Pro1265 and Pro1266 have similar TDCC potency regardless of CD3/CD28 position. Uppsala 87 Malignant Glioma(U87MG)細胞を死滅させる場合、Pro1136が、Pro186及びPro1267よりも高い効力を有することを示す。これらの細胞は、EGFRを発現しているが、HER2を発現していない。Pro1136は、図3Bに示したものであり、抗EGFR sdABD、抗CD28 VH-VL、及び抗CD3 VH-VLを含む。Pro186は、抗EGFR sdABD、FLAG不活化VL-VH、及び抗CD3 VH-VLを含む。Pro1267は、抗EGFR sdABD、抗HER2 sdABD、抗CD28 VH-VL、及び抗CD3 VH-VLを含む。結果は、切断されたPro1136は、切断されたPro1267及び切断されたPro186よりも効力が約3倍高いことを示している。このことは、抗CD28 VH-VLを有していないPro186、及びU87-MG細胞に結合不可なHER2に連結された抗CD28 VH-VLを有するPro1267と比較した場合に、Pro1136が、U87-MG細胞に結合可能なEGFRに連結された抗CD28 VH-VLを有するのと同時に、抗EGFR sdABDに連結された抗CD3 VH-VLと、腫瘍細胞に結合するsdABDに連結された抗CD28 VH-VLとの両方を有すると、効力が高くなることを示唆している。We show that Pro1136 has higher potency than Pro186 and Pro1267 in killing Uppsala 87 Malignant Glioma (U87MG) cells. These cells express EGFR but not HER2. Pro1136 is shown in Figure 3B and includes anti-EGFR sdABD, anti-CD28 VH-VL, and anti-CD3 VH-VL. Pro186 includes anti-EGFR sdABD, FLAG-inactivated VL-VH, and anti-CD3 VH-VL. Pro1267 includes anti-EGFR sdABD, anti-HER2 sdABD, anti-CD28 VH-VL, and anti-CD3 VH-VL. The results show that truncated Pro1136 is approximately 3 times more potent than truncated Pro1267 and truncated Pro186. This indicates that Pro1136 does not bind to U87-MG cells when compared with Pro186, which does not have anti-CD28 VH-VL, and Pro1267, which has anti-CD28 VH-VL linked to HER2, which cannot bind to U87-MG cells. At the same time as having an anti-CD28 VH-VL linked to EGFR capable of binding to cells, an anti-CD3 VH-VL linked to an anti-EGFR sdABD and an anti-CD28 VH-VL linked to an sdABD that binds to tumor cells. This suggests that having both of these results in higher efficacy. U87MG(EGFRのみ)細胞の死滅における追加のCD28活性二量体に起因して、Pro1140が、Pro1270、Pro1271、及びPro1272よりも効力が少なくとも3倍高いことを示す。Pro1140は、図3Bに示したものであり、抗EGFR sdABDに連結された抗CD3 VH-VL及び抗EGFR sdABDに連結された抗CD28 VH-VLを含む。Pro1270、Pro1271、及びPro1272の全ては、抗EGFR sdABDに連結された抗CD3 VH-VLを含むが、Pro1270は、抗HER2 sdABDに連結された抗CD28 VH-VLを含み、Pro1271は、抗EGFR sdABDに連結されたFLAG不活化 VL-VHを含み、かつPro1272は、抗EGFR sdABDに連結されたFLAG不活化 VH-VLを含む。このことは、抗EGFR sdABDに連結された抗CD3 VH-VL及び腫瘍細胞に結合するsdABDに連結された抗CD28 VH-VLの両方を有すると、効力が高くなることを示唆している。We show that Pro1140 is at least 3 times more potent than Pro1270, Pro1271, and Pro1272 due to the additional CD28 active dimer in killing U87MG (EGFR only) cells. Pro1140 is shown in Figure 3B and includes an anti-CD3 VH-VL linked to an anti-EGFR sdABD and an anti-CD28 VH-VL linked to an anti-EGFR sdABD. Pro1270, Pro1271, and Pro1272 all contain an anti-CD3 VH-VL linked to an anti-EGFR sdABD, whereas Pro1270 contains an anti-CD28 VH-VL linked to an anti-HER2 sdABD, and Pro1271 contains an anti-EGFR sdABD. and Pro1272 contains a FLAG-inactivated VH-VL linked to an anti-EGFR sdABD. This suggests that having both an anti-CD3 VH-VL linked to an anti-EGFR sdABD and an anti-CD28 VH-VL linked to an sdABD that binds to tumor cells increases efficacy.

今日の進歩により、T細胞の表面上のCD3及びがん細胞の表面上の腫瘍抗原などの重要な生理学的標的に同時に結合する、免疫細胞誘導部位の十分な利点が明らかとなっている。この一例として、二重特異性生物学的薬物がCD3及び腫瘍抗原に結合することにより、T細胞から細胞毒が放出され、それにより、腫瘍細胞が死滅する「T細胞エンゲージャーメカニズム」がある。 Current advances have revealed the full advantage of immune cell induction moieties that simultaneously bind to important physiological targets such as CD3 on the surface of T cells and tumor antigens on the surface of cancer cells. An example of this is the "T cell engager mechanism" in which bispecific biological drugs bind to CD3 and tumor antigens, resulting in the release of cytotoxins from T cells, thereby killing tumor cells.

免疫細胞誘導部位で使用されるような多くの抗原結合タンパク質は、重大なオフターゲット副作用を引き起こす可能性がある。したがって、オフターゲット相互作用を避けるために疾患組織の近傍のタンパク質のみを活性化する必要がある。患部組織の近傍内の免疫細胞誘導部位を活性化する戦略については、例えば、その全体が参照により援用されるUS20190076524にて開示されている。 Many antigen-binding proteins, such as those used in immune cell induction sites, can cause serious off-target side effects. Therefore, it is necessary to activate only proteins in the vicinity of diseased tissues to avoid off-target interactions. Strategies for activating immune cell induction sites within the vicinity of affected tissues are disclosed, for example, in US20190076524, which is incorporated by reference in its entirety.

本開示は、いくつかの態様において、がん細胞及び免疫細胞に結合して、免疫細胞による標的となるがんの死滅を刺激する免疫細胞誘導二重特異性抗体の毒性及び副作用を軽減するための方法及び組成物を提供する。本明細書で提供するタンパク質の多くは、プロテアーゼ(例えば、腫瘍微小環境で見られるプロテアーゼ)によって活性化され得るプロドラッグである。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、腫瘍微小環境にない場合に、タンパク質が腫瘍細胞に結合可能であるが、免疫細胞には結合せず(不活性であり)、かつタンパク質が腫瘍微小環境に入ると、タンパク質中の切断可能リンカーの切断により、そのタンパク質が「活性化」し、それにより、2つの「活性」二重特異性分子が生じ、そこで、それぞれが、腫瘍細胞及び免疫細胞に結合できるように構成される。いくつかの実施形態では、2つの「活性」二重特異性分子のそれぞれは、免疫細胞上の異なる抗原に結合する。いくつかの実施形態では、2つの「活性」二重特異性分子は、同じ免疫細胞上の2つの異なる抗原に結合する。いくつかの実施形態では、2つの「活性」二重特異性分子は、2つの異なる免疫細胞(例えば、T細胞、ナチュラルキラー細胞、及びマクロファージから選択される免疫細胞)に結合する。例えば、いくつかの実施形態では、第1の「活性」二重特異性分子は、第1の標的腫瘍抗原及び第1の免疫細胞抗原CD3に結合できる一方で、第2の「活性」二重特異性分子は、第2の標的腫瘍抗原及び第2の免疫細胞抗原CD28に結合する。第1の標的腫瘍抗原及び第2の標的腫瘍抗原は、同じもの、または異なるものであり得る。この腫瘍特異的活性化により、潜在的なオフターゲット副作用が軽減され、かつ2つの異なる免疫細胞抗原を標的とすることにより、例えば、共刺激分子の活性化、T細胞動員及び活性の促進、T細胞疲弊の軽減、細胞傷害作用及びIFNγ分泌の促進、マクロファージの刺激、及び/またはマクロファージの成熟の促進によって、本明細書に記載のタンパク質の抗腫瘍作用が高まる。 The present disclosure provides, in some embodiments, for reducing the toxicity and side effects of immune cell-inducing bispecific antibodies that bind to cancer cells and immune cells to stimulate targeted killing of cancer by immune cells. Provided are methods and compositions. Many of the proteins provided herein are prodrugs that can be activated by proteases, such as those found in the tumor microenvironment. In some embodiments, the proteins described herein are capable of binding to tumor cells but not immune cells (inactive) when absent from the tumor microenvironment, and Once a protein enters the tumor microenvironment, cleavage of the cleavable linker in the protein “activates” the protein, thereby creating two “active” bispecific molecules, each of which has a tumor Configured to bind to cells and immune cells. In some embodiments, each of the two "active" bispecific molecules binds a different antigen on an immune cell. In some embodiments, two "active" bispecific molecules bind two different antigens on the same immune cell. In some embodiments, the two "active" bispecific molecules bind to two different immune cells (eg, immune cells selected from T cells, natural killer cells, and macrophages). For example, in some embodiments, a first "active" bispecific molecule can bind to a first target tumor antigen and a first immune cell antigen CD3, while a second "active" bispecific molecule can bind to a first target tumor antigen and a first immune cell antigen CD3. The specificity molecule binds the second target tumor antigen and the second immune cell antigen CD28. The first target tumor antigen and the second target tumor antigen can be the same or different. This tumor-specific activation reduces potential off-target side effects and targets two different immune cell antigens, e.g. activating co-stimulatory molecules, promoting T cell recruitment and activity, Reducing cell exhaustion, promoting cytotoxicity and IFNγ secretion, stimulating macrophages, and/or promoting macrophage maturation enhances the antitumor effects of the proteins described herein.

I. 定義
本出願をより完全に理解することができるように、いくつかの定義を以下に記載する。このような定義は、文法上の等価物を包含することを意図している。
I. DEFINITIONS To enable a more complete understanding of this application, some definitions are provided below. Such definitions are intended to encompass grammatical equivalents.

「アミノ酸」及び「アミノ酸同一性」とは、本明細書で使用する場合、特定の所定の位置に存在し得る20種の天然アミノ酸のうちの1種または任意の非天然類似体のことを意味する。多くの実施形態では、「アミノ酸」とは、20種の天然アミノ酸のうちの1種のことを意味する。本明細書において「タンパク質」とは、少なくとも2つの共有結合したアミノ酸のことを意味し、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド及びペプチドが挙げられる。 "Amino acid" and "amino acid identity" as used herein refer to one of the 20 natural amino acids or any non-natural analog that may be present at a particular given position. do. In many embodiments, "amino acid" refers to one of the twenty naturally occurring amino acids. As used herein, "protein" refers to at least two covalently bonded amino acids, and includes proteins, polypeptides, oligopeptides, and peptides.

本明細書において「アミノ酸修飾」とは、ポリペプチド配列におけるアミノ酸置換、挿入及び/または欠失、またはタンパク質に化学的に結合した部位に対する改変のことを意味する。例えば、修飾は、タンパク質に結合した改変糖質またはPEG構造であってもよい。分かりやすくするためだが、特に明記しない限り、アミノ酸修飾は常に、DNAがコードするアミノ酸、例えば、DNA及びRNAにコドンを有する20種のアミノ酸に対するものである。本明細書における好ましいアミノ酸修飾は置換である。 As used herein, "amino acid modification" refers to amino acid substitution, insertion and/or deletion in a polypeptide sequence, or modification to a site chemically bonded to a protein. For example, the modification may be a modified carbohydrate or PEG structure attached to the protein. For clarity, unless otherwise specified, amino acid modifications are always to DNA-encoded amino acids, such as the 20 amino acids that have codons in DNA and RNA. Preferred amino acid modifications herein are substitutions.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、免疫細胞抗原及び標的腫瘍抗原(TTA)、例えば、本明細書で概要を示す標的細胞受容体などに特異的に結合する。「特異的結合」、または特定の抗原もしくはエピトープ「~に特異的に結合する」もしくは「~に特異的な」とは、非特異的相互作用とは測定可能に異なる結合のことを意味する。特異的結合は、例えば、一般的には、結合活性を有さない類似構造の分子である対照分子の結合と比較した、分子の結合を求めることにより測定することができる。例えば、特異的結合は、標的に類似した対照分子との競合により測定することができる。 In some embodiments, the protein specifically binds to an immune cell antigen and a target tumor antigen (TTA), such as the target cell receptors outlined herein. "Specific binding" or "binds specifically to" or "specific for" a particular antigen or epitope means binding that is measurably different from non-specific interactions. Specific binding can be measured, for example, by determining the binding of a molecule compared to the binding of a control molecule, which is generally a molecule of similar structure that does not have binding activity. For example, specific binding can be determined by competition with a control molecule similar to the target.

特定の抗原またはエピトープに対する特異的結合は、例えば、抗原またはエピトープに対する少なくとも約10-4M、少なくとも約10-5M、少なくとも約10-6M、少なくとも約10-7M、少なくとも約10-8M、少なくとも約10-9M、あるいは少なくとも約10-10M、少なくとも約10-11M、少なくとも約10-12M、またはそれ以上のKD(KDとは、特定の抗体-抗原相互作用の解離速度のことを意味する)を有する抗体により示され得る。一般的に、抗原に特異的に結合する抗体は、対照分子と比較して20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、5,000倍、10,000倍またはそれ以上の倍数より大きな、抗原またはエピトープに対するKDを有する。 Specific binding to a particular antigen or epitope may include, for example, at least about 10 -4 M, at least about 10 -5 M, at least about 10 -6 M, at least about 10 -7 M, at least about 10 -8 to the antigen or epitope. M, at least about 10 -9 M, alternatively at least about 10 -10 M, at least about 10 -11 M, at least about 10 -12 M, or greater KD (KD refers to the dissociation of a particular antibody-antigen interaction). (meaning speed). Generally, an antibody that specifically binds to an antigen will bind 20-fold, 50-fold, 100-fold, 500-fold, 1000-fold, 5,000-fold, 10,000-fold, or more than a control molecule. Has a large KD for an antigen or epitope.

同様に、特定の抗原またはエピトープに対する特異的結合は、例えば、対照と比較して、少なくとも20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、5,000倍、10,000倍またはそれ以上の倍数より大きな、抗原またはエピトープに対するKaを有する抗体により示され得る(Ka(またはKA)とは、特定の抗体-抗原相互作用の会合速度のことを意味する)。結合親和性は通常、当技術分野において周知のとおり、BiacoreアッセイまたはOctetを用いて測定される。 Similarly, specific binding to a particular antigen or epitope is, for example, at least 20-fold, 50-fold, 100-fold, 500-fold, 1000-fold, 5,000-fold, 10,000-fold or more compared to a control. (Ka (or KA) refers to the rate of association of a particular antibody-antigen interaction). Binding affinity is typically measured using Biacore assays or Octet, as is well known in the art.

「位置」とは、本明細書で使用する場合、タンパク質の配列内の場所のことを意味する。順に、または確立された方式、例えば、抗体ナンバリング用のEUインデックスに従って、位置に番号を振ってもよい。 "Position," as used herein, refers to a location within the sequence of a protein. Positions may be numbered sequentially or according to an established scheme, eg, the EU index for antibody numbering.

「標的抗原」とは、本明細書で使用する場合、任意の抗体の可変領域が特異的に結合する分子のことを意味する。標的抗原は、タンパク質、糖質、脂質または他の化学物質であってもよい。標的腫瘍抗原を含む様々な好適で例示的な標的抗原については本明細書に記載している。 "Target antigen" as used herein refers to a molecule to which the variable region of any antibody specifically binds. Target antigens may be proteins, carbohydrates, lipids or other chemicals. A variety of suitable exemplary target antigens are described herein, including target tumor antigens.

「標的細胞」とは、本明細書で使用する場合、標的抗原を発現する細胞のことを意味する。標的細胞は、TTAを発現する腫瘍細胞か、または免疫細胞、例えば、CD3及び/またはCD28などの免疫細胞抗原を発現するT細胞のいずれかである。 "Target cell" as used herein refers to a cell that expresses a target antigen. The target cells are either tumor cells expressing TTA or immune cells, eg, T cells expressing immune cell antigens such as CD3 and/or CD28.

「単鎖可変断片(scFv)」、「Fv」または「Fvドメイン」または「Fv領域」とは、本明細書で使用する場合、一般的に、常にではないが、抗体に由来する抗原結合ドメインのVLドメイン及びVHドメインを含むポリペプチドのことを意味する。Fvドメインは、VHドメイン及びVLドメインを含有し、そのVHドメイン及びVLドメインのそれぞれが抗原に結合することとなるCDRを含有する場合、通常、本明細書で論じるように「抗原結合ドメイン」すなわち「ABD」を形成する。「活性Fv」は、可変重ドメイン及び可変軽ドメインを有し、その可変重ドメイン及び可変軽ドメインのそれぞれが、同じ抗原、例えば、CD3またはCD28に結合するCDRを含むものである。したがって、活性Fvは、その抗原に結合することができる。「不活性Fv」または「非生産的Fv」は、可変重ドメイン及び可変軽ドメインを有するが、抗原に結合しないものを指す。場合によっては、「不活性Fv」は、Fv内のVH及びVLを会合させない制約的リンカーと共に単鎖ポリペプチドに存在する(「制約的Fv」とも呼ばれる)。この場合、第2フレームワーク領域が可変重ドメイン及び可変軽ドメインを対にする強い傾向があるため、別の制約的不活性Fvとの分子内会合により、例えば、抗原に結合しない2つの不活性Fvが形成される。したがって、この場合、「不活性Fv」または「非生産的Fv」は、Fvに会合しているVH及びVLを有するものの、対応する活性VH及びVLが互いに会合していないため、Fvは抗原結合ドメインではない。例えば、図1に示すように、CD3を対象とするFv内のVH及びVLがCD28を対象とするFv内のVL及びVHに結合し、それぞれ、不活性分子を(例えば、CD3またはCD28のいずれにも結合しない分子)を形成する。 "Single chain variable fragment (scFv)", "Fv" or "Fv domain" or "Fv region" as used herein generally, but not always, refers to an antigen-binding domain derived from an antibody. A polypeptide comprising a VL domain and a VH domain. An Fv domain contains a VH domain and a VL domain, and when each of the VH and VL domains contains CDRs that result in antigen binding, it is typically referred to as an "antigen-binding domain" or Form “ABD”. An "active Fv" is one that has a variable heavy domain and a variable light domain, each of which contains CDRs that bind to the same antigen, eg, CD3 or CD28. Therefore, active Fv is capable of binding its antigen. "Inactive Fv" or "non-productive Fv" refers to one that has a variable heavy domain and a variable light domain, but does not bind antigen. In some cases, an "inactive Fv" is present in a single chain polypeptide with a constraining linker that does not allow the VH and VL within the Fv to associate (also referred to as a "constrained Fv"). In this case, the strong tendency of the second framework region to pair variable heavy and light domains may result in intramolecular association with another constraining inactive Fv, e.g. Fv is formed. Therefore, in this case, "inactive Fv" or "non-productive Fv" has VH and VL associated with Fv, but the corresponding active VH and VL are not associated with each other, so that Fv does not bind to antigen. Not a domain. For example, as shown in Figure 1, VH and VL in Fvs directed to CD3 bind to VLs and VHs in Fvs directed to CD28, respectively, and each generates an inactive molecule (e.g., either CD3 or CD28). molecules that do not bind to other molecules).

以下で論じるように、Fvドメインは、多くの方法で、タンパク質内で組織化させることができ、かつscFv形態、制約的Fv形態、制約的scFv形態、偽性Fv形態などで「活性」または「不活性」(本明細書においては、「非生産的」とも称する場合がある)とすることができる。加えて、本明細書で論じるように、VH及びVLを含有するFvドメインは、ABDであり得/ABDを形成することができ、VH及びVLドメインを含有しない他のABDは、sdABDを使用して形成され得る。 As discussed below, Fv domains can be organized within a protein in a number of ways and can be "active" or "active" in scFv form, restricted Fv form, restricted scFv form, pseudo-Fv form, etc. "inert" (herein sometimes also referred to as "non-productive"). In addition, as discussed herein, Fv domains containing VH and VL can be/form ABDs, and other ABDs that do not contain VH and VL domains use sdABDs. It can be formed by

本明細書において「可変ドメイン」とは、カッパ免疫グロブリン遺伝子座、ラムダ免疫グロブリン遺伝子座及び重鎖免疫グロブリン遺伝子座をそれぞれ構成する、Vκ遺伝子、Vλ遺伝子及び/またはVH遺伝子のいずれかによって実質的にコードされる1つ以上のIgドメインを含む、免疫グロブリンの領域のことを意味する。場合によっては、sdFv(本明細書ではsdABDとも称される)などの単一可変ドメインを使用することができる。 As used herein, the term "variable domain" is defined as substantially variable by any of the Vκ gene, Vλ gene, and/or VH gene, which constitute the kappa immunoglobulin locus, the lambda immunoglobulin locus, and the heavy chain immunoglobulin locus, respectively. refers to the region of an immunoglobulin that contains one or more Ig domains encoded by In some cases, a single variable domain can be used, such as sdFv (also referred to herein as sdABD).

可変重(VH)ドメイン及び可変軽(VL)ドメインの両方を利用する実施形態では、それぞれのVH及びVLは、アミノ末端からカルボキシ末端へ、以下の順序、FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4で並んだ3つの超可変領域(「相補性決定領域」、「CDR」)及び4つの「フレームワーク領域」すなわち「FR」からなる。それゆえ、VHドメインは、構造vhFR1-vhCDR1-vhFR2-vhCDR2-vhFR3-vhCDR3-vhFR4を有し、VLドメインは、構造vlFR1-vlCDR1-vlFR2-vlCDR2-vlFR3-vlCDR3-vlFR4を有する。本明細書でより詳細に記載するとおり、vhFR領域及びvlFR領域は自己集合して、Fvドメインを形成する。一般に、タンパク質のプロドラッグ形態では、同じFvドメイン内のVHドメイン及びVLドメインがVHドメインとVLドメインとの間の制約的リンカーの存在により自己会合することができない「制約的Fvドメイン」、ならびに自己会合するときにCDRが抗原結合ドメインを形成しない「不活性Fvドメイン」が存在する。 In embodiments utilizing both variable heavy (VH) and variable light (VL) domains, each VH and VL are in the following order, from amino-terminus to carboxy-terminus: FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3- It consists of three hypervariable regions (“complementarity determining regions”, “CDRs”) arranged in CDR3-FR4 and four “framework regions” or “FRs”. Therefore, the VH domain has the structure vhFR1-vhCDR1-vhFR2-vhCDR2-vhFR3-vhCDR3-vhFR4, and the VL domain has the structure vlFR1-vlCDR1-vlFR2-vlCDR2-vlFR3-vlCDR3-vlFR4. As described in more detail herein, the vhFR and vlFR regions self-assemble to form an Fv domain. Generally, in prodrug forms of a protein, the VH and VL domains within the same Fv domain cannot self-associate due to the presence of a constraining linker between the VH and VL domains, as well as "constrained Fv domains". There are "inactive Fv domains" in which the CDRs do not form an antigen binding domain when assembled.

超可変領域は、抗原結合特異性を付与するものであり、一般的に、軽鎖可変領域のおよそアミノ酸残基24~34(LCDR1、「L」は軽鎖を表す)、50~56(LCDR2)及び89~97(LCDR3)、ならびに重鎖可変領域のおよそ31~35B(HCDR1、「H」は重鎖を表す)、50~65(HCDR2)及び95~102(HCDR3)からのアミノ酸残基を包含し(Kabat et al.,SEQUENCES OF PROTEINS OF IMMUNOLOGICAL INTEREST,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991))、及び/または超可変ループを形成するアミノ酸残基(例えば、軽鎖可変領域の残基26~32(LCDR1)、50~52(LCDR2)及び91~96(LCDR3)、ならびに、重鎖可変領域の残基26~32(HCDR1)、53~55(HCDR2)及び96~101(HCDR3))を包含する(Chothia and Lesk(1987)J.Mol.Biol.196:901-917)。タンパク質の特定のCDRについて以下に説明する。 The hypervariable regions are those that confer antigen-binding specificity and are generally approximately amino acid residues 24-34 (LCDR1, "L" stands for light chain), 50-56 (LCDR2) of the light chain variable region. ) and 89-97 (LCDR3), and amino acid residues from approximately 31-35B (HCDR1, "H" represents heavy chain), 50-65 (HCDR2) and 95-102 (HCDR3) of the heavy chain variable region. (Kabat et al., SEQUENCES OF PROTEINS OF IMMUNOLOGICAL INTEREST, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health , Bethesda, Md. (1991)), and/or amino acid residues forming hypervariable loops ( For example, residues 26-32 (LCDR1), 50-52 (LCDR2), and 91-96 (LCDR3) of the light chain variable region, and residues 26-32 (HCDR1), 53-55 ( HCDR2) and 96-101 (HCDR3)) (Chothia and Lesk (1987) J. Mol. Biol. 196:901-917). Specific CDRs of proteins are described below.

当業者であれば理解するように、CDRの厳密なナンバリング及び配置は、個別のナンバリングシステムの間で異なり得る。しかしながら、可変重配列及び/または可変軽配列の本開示が、会合する(固有の)CDRの本開示を含むということを理解すべきである。それゆえ、それぞれの可変重領域の本開示は、vhCDR(例えばvhCDR1、vhCDR2及びvhCDR3)の開示であり、それぞれの可変軽領域の本開示は、vlCDR(例えばvlCDR1、vlCDR2及びvlCDR3)の開示である。 As those skilled in the art will appreciate, the exact numbering and arrangement of CDRs may vary between individual numbering systems. However, it should be understood that this disclosure of variable heavy and/or variable light sequences includes this disclosure of associated (unique) CDRs. Therefore, this disclosure of each variable heavy region is a disclosure of a vhCDR (e.g., vhCDR1, vhCDR2, and vhCDR3), and this disclosure of each variable light region is a disclosure of a vlCDR (e.g., vlCDR1, vlCDR2, and vlCDR3). .

CDRナンバリングの有用な比較は以下のとおりであり、Lafranc et al.,Dev.Comp.Immunol.27(1):55-77(2003)を参照されたい。
A useful comparison of CDR numbering is as follows, Lafranc et al. , Dev. Comp. Immunol. 27(1):55-77 (2003).

本明細書の全体にわたり、可変ドメインの残基(およそ、軽鎖可変領域の残基1~107、及び重鎖可変領域の残基1~113)に言及する場合、Kabatナンバリングシステムを一般的に使用し、Fc領域にはEUナンバリングシステム(例えば、Kabat et al.,supra(1991))を使用する。 Throughout this specification, when referring to variable domain residues (approximately residues 1-107 of the light chain variable region and residues 1-113 of the heavy chain variable region), the Kabat numbering system is generally used. and the EU numbering system (eg, Kabat et al., supra (1991)) is used for the Fc region.

本開示は、多数の異なるCDRセットを提供する。この場合、免疫細胞抗原に結合するドメイン(例えば、CD3またはCD28に結合するscFv)の文脈における「完全なCDRセット」とは、3つのCDR(例えば、vhCDR1、vhCDR2、及びvhCDR3)を含む重鎖可変領域と、CDR(例えば、vlCDR1、vlCDR2、vlCDR3)を含む軽鎖可変領域とを含む構成要素を意味する。当業者であれば理解するように、CDRのそれぞれのセット、VH CDR及びVL CDRは、個別に及びセットとしての両方で、抗原に結合することができる。例えば、制約的Fvドメインにおいて、vhCDRは、例えばCD3に結合することができ、vlCDRはCD3に結合することができるが、制約的形態では、vhCDR及びvlCDRはCD3に結合することができない。 This disclosure provides a number of different CDR sets. In this case, a "complete CDR set" in the context of an immune cell antigen-binding domain (e.g., an scFv that binds CD3 or CD28) means a heavy chain that includes three CDRs (e.g., vhCDR1, vhCDR2, and vhCDR3). It refers to a component that includes a variable region and a light chain variable region that includes CDRs (eg, vlCDR1, vlCDR2, vlCDR3). As one of ordinary skill in the art will appreciate, each set of CDRs, VH CDRs and VL CDRs, both individually and as a set, can bind to an antigen. For example, in a restricted Fv domain, a vhCDR can bind, for example, to CD3, and a vlCDR can bind to CD3, whereas in a restricted form, vhCDR and vlCDR cannot bind to CD3.

本明細書において「単一ドメインFv」、「sdFv」または「sdABD」とは、一般的にラクダ科抗体技術に基づいて、CDRを3つのみ有する抗原結合ドメインのことを意味する。Protein Engineering 9(7):1129-35(1994);Rev Mol Biotech 74:277-302(2001);Ann Rev Biochem 82:775-97(2013)を参照されたい。sdABDは、一般的に3つのCDRのセットを含む単一の重鎖可変領域を含む。sdABDはまた、当技術分野において「VHH」ドメインまたはナノボディと呼ばれることもある。本明細書で概説するように、2つの一般的なタイプのsdABD、すなわちTTAに結合し、そのようなものとして注釈が付けられるsdABD(一般名称にはsdABD-TTA、または、例えば、EGFRに結合するものにはsdABD-EGFR、FOLR1に結合するものにはsdABD-FOLR1など)、及びHSAに結合するsdABD(「sdABD-HSA」)が本明細書で使用される。 As used herein, "single domain Fv", "sdFv" or "sdABD" refers to an antigen binding domain having only three CDRs, generally based on camelid antibody technology. See Protein Engineering 9(7):1129-35 (1994); Rev Mol Biotech 74:277-302 (2001); Ann Rev Biochem 82:775-97 (2013). sdABDs generally contain a single heavy chain variable region that includes a set of three CDRs. sdABD is also sometimes referred to in the art as a "VHH" domain or nanobody. As outlined herein, there are two general types of sdABDs, namely sdABDs that bind to TTA and are annotated as such (common names include sdABD-TTA, or, for example, sdABDs that bind to EGFR). sdABD-EGFR for those that bind to FOLR1, sdABD-FOLR1 for those that bind to FOLR1), and sdABD that binds to HSA (“sdABD-HSA”) are used herein.

これらのCDRは、より大きな可変軽ドメインまたは可変重ドメインの一部であってもよい。加えて、本明細書においてより十分に概説されるように、可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、本明細書の部位の形態及び構成に応じて、別々のポリペプチド鎖上、またはscFv配列の場合は単一ポリペプチド鎖上にあり得る。 These CDRs may be part of larger variable light or variable heavy domains. In addition, as more fully outlined herein, the variable heavy and light domains may be on separate polypeptide chains, or in the case of scFv sequences, depending on the configuration and configuration of the sites herein. may be on a single polypeptide chain.

CDRは、抗原結合部位、またはより具体的にはエピトープ結合部位の形成に寄与する。「エピトープ」とは、パラトープとして知られている可変領域の特定の抗原結合部位と相互作用する決定基のことを意味する。エピトープは、アミノ酸または糖側鎖などの分子の集合であり、通常、特定の構造特性に加えて特定の荷電特性を有する。単一の抗原は2つ以上のエピトープを有していてもよい。 CDRs contribute to the formation of antigen binding sites, or more specifically epitope binding sites. "Epitope" refers to a determinant that interacts with a specific antigen-binding site of a variable region, known as a paratope. Epitopes are collections of molecules such as amino acids or sugar side chains and usually have specific structural as well as specific charge characteristics. A single antigen may have more than one epitope.

エピトープは、結合に直接関与するアミノ酸残基(エピトープの主要抗原構成要素とも称される)、及び結合に直接関与しない他のアミノ酸残基、例えば特異的に抗原に結合するペプチドにより効果的に阻害されるアミノ酸残基(すなわち、そのアミノ酸残基は、特異的に抗原に結合するペプチドのフットプリント内にある)を含んでもよい。 Epitopes are effectively inhibited by amino acid residues that are directly involved in binding (also referred to as the major antigenic component of the epitope) and other amino acid residues that are not directly involved in binding, such as peptides that specifically bind to the antigen. (ie, the amino acid residue is within the footprint of the peptide that specifically binds the antigen).

エピトープは立体配座または直鎖状のいずれかであってもよい。立体配座エピトープは、直鎖状ポリペプチド鎖の異なるセグメントに由来する、空間的に並べられたアミノ酸により生成される。直鎖状エピトープは、ポリペプチド鎖内の隣接アミノ酸残基により生成されるエピトープである。立体配座エピトープと非立体配座エピトープは、変性溶媒の存在下で前者に対する結合は失われるが後者に対しては失われないという点で区別することができる。 Epitopes may be either conformational or linear. Conformational epitopes are generated by spatially ordered amino acids from different segments of a linear polypeptide chain. Linear epitopes are epitopes generated by adjacent amino acid residues within a polypeptide chain. Conformational and nonconformational epitopes can be distinguished in that binding to the former but not the latter is lost in the presence of denaturing solvents.

エピトープは通常、固有の空間立体配座で、少なくとも3つ、より一般的には少なくとも5つ、または8~10のアミノ酸を含む。同一のエピトープを認識する抗体については、一方の抗体がもう一方の抗体の標的抗原への結合を阻害する能力を示す単純なイムノアッセイ、例えば「ビニング」により検証することができる。以下で概要を示すとおり、タンパク質は、本明細書で列挙する抗原結合ドメイン及び抗体だけではなく、列挙した抗原結合ドメインが結合するエピトープとの結合において競合する抗原結合ドメイン及び抗体も含む。 Epitopes usually contain at least 3, more usually at least 5, or 8-10 amino acids in a unique spatial conformation. Antibodies that recognize the same epitope can be tested by simple immunoassays, such as "binning", that demonstrate the ability of one antibody to inhibit the binding of another antibody to a target antigen. As outlined below, proteins include not only the antigen binding domains and antibodies listed herein, but also antigen binding domains and antibodies that compete for binding to the epitope bound by the listed antigen binding domains.

「抗原結合ドメイン」(ABD)という用語は、標的分子(抗原)上の所与の標的エピトープまたは所与の標的部位に(特異的に)結合する、またはそれらと相互作用する、またはそれらを認識するドメインを特徴としている。ABDは、VH及びVLドメインを含有するscFvであるか、または本明細書で定義するようなsdABDであってよい。概して、標的腫瘍抗原(TTA)及びヒト血清アルブミン(HSA)に結合するABDは、sdABD(「TTA-sdABD」または「HSA-sdABD」)であり、その一方で、免疫細胞抗原(例えば、CD3またはCD28)に結合するABDは、VHドメインとVLドメインとの両方を含有するscFvである。 The term "antigen binding domain" (ABD) refers to a domain that (specifically) binds to, interacts with, or recognizes a given target epitope or a given target site on a target molecule (antigen). It is characterized by a domain that The ABD may be an scFv containing VH and VL domains, or an sdABD as defined herein. Generally, the ABD that binds target tumor antigen (TTA) and human serum albumin (HSA) is an sdABD (“TTA-sdABD” or “HSA-sdABD”), whereas it binds to immune cell antigens (e.g., CD3 or The ABD that binds to CD28) is an scFv that contains both a VH and a VL domain.

「ドメイン」とは、本明細書で使用する場合、本明細書で概要を示す構造及び/または機能を有するタンパク質配列のことを意味する。本明細書に記載するタンパク質のドメインとしては、標的腫瘍抗原結合ドメイン(TTAドメイン)、免疫細胞結合ドメイン、リンカードメイン、及び半減期延長ドメインが挙げられる。 "Domain" as used herein refers to a protein sequence having the structure and/or function outlined herein. Domains of the proteins described herein include target tumor antigen binding domains (TTA domains), immune cell binding domains, linker domains, and half-life extension domains.

本明細書において「ドメインリンカー」とは、本明細書で概要を示す2つのドメインを連結するアミノ酸配列のことを意味する。ドメインリンカーは、切断可能リンカー、制約的切断可能リンカー、切断不可能リンカー、制約的切断不可能リンカー、scFvリンカーなどであってもよい。 As used herein, "domain linker" refers to an amino acid sequence that connects two domains as outlined herein. A domain linker can be a cleavable linker, a constrained cleavable linker, a non-cleavable linker, a constrained non-cleavable linker, a scFv linker, etc.

本明細書において「切断可能リンカー」(「CL」)とは、本明細書で概要を示す疾患組織においてプロテアーゼ、好ましくはヒトプロテアーゼによって切断され得るアミノ酸配列のことを意味する。切断可能リンカーは一般的に、少なくとも長さが3アミノ酸であり、必要な可撓性に応じて、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15またはそれ以上のアミノ酸がタンパク質に使用される。いくつかの切断可能リンカー配列について、図13に示す。 By "cleavable linker" ("CL") herein is meant an amino acid sequence that can be cleaved by a protease, preferably a human protease, in the diseased tissues outlined herein. Cleavable linkers are generally at least 3 amino acids in length, with lengths of 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or More amino acids are used in proteins. Several cleavable linker sequences are shown in FIG.

本明細書において「切断不可能リンカー」(「NCL」)とは、通常の生理学的条件下においてヒトプロテアーゼによって切断され得ないアミノ酸配列のことを意味する。 As used herein, "non-cleavable linker" ("NCL") refers to an amino acid sequence that cannot be cleaved by human proteases under normal physiological conditions.

本明細書において「制約的切断不可能リンカー」(「CNCL」)とは、2つのドメインが互いに有意に相互作用し得ず、かつ生理学的条件下においてヒトプロテアーゼによって有意に切断されないような状態で、本明細書で概要を示す2つのドメインを連結する短いポリペプチドのことを意味する。 As used herein, a "constraint non-cleavable linker" ("CNCL") is defined as a linker in which two domains cannot significantly interact with each other and are not significantly cleaved by human proteases under physiological conditions. , refers to a short polypeptide that connects the two domains outlined herein.

本明細書において「制約的scFvドメイン」とは、活性重可変ドメイン及び活性軽可変ドメインが相互作用して、CD3などの免疫細胞抗原と結合する活性Fvを形成し得ないような状態で、本明細書で概要を示す制約的リンカーと共有結合で連結した活性可変重ドメイン及び活性可変軽ドメインを含むscFvドメインのことを意味する。それゆえ、制約的Fvドメインは、scFvに類似してはいるが、制約的リンカーの存在によって抗原に結合することができないドメインである(ただし、それらは、他の可変ドメイン(例えば、不活性な可変ドメインまたは異なる抗原を標的とする可変ドメイン)と分子内で集合して、偽性Fvドメインを形成することができる)。 As used herein, a "restrictive scFv domain" refers to a condition in which the active heavy variable domain and the active light variable domain cannot interact to form an active Fv that binds to immune cell antigens such as CD3. Refers to an scFv domain comprising an active variable heavy domain and an active variable light domain covalently linked with a constraint linker as outlined herein. Constrained Fv domains are therefore domains that are similar to scFvs but are unable to bind antigen due to the presence of a constraining linker (although they are similar to other variable domains (e.g. inactive variable domains or variable domains that target different antigens) to form pseudo Fv domains).

本明細書で使用する場合、「プロテアーゼ切断部位」とは、プロテアーゼが認識して切断するアミノ酸配列を指す。好適なプロテアーゼ切断部位については、以下で概説し、図13に示す。 As used herein, "protease cleavage site" refers to an amino acid sequence that is recognized and cleaved by a protease. Suitable protease cleavage sites are outlined below and shown in FIG. 13.

本明細書で使用する場合、「プロテアーゼ切断ドメイン」とは、「プロテアーゼ切断部位」、ならびに、個々のプロテアーゼ切断部位間の任意のリンカー、及びプロテアーゼ切断部位(複数可)とタンパク質の構築物の他の機能性構成要素(例えば、V、V、標的抗原結合ドメイン(複数可)、半減期延長ドメインなど)との間の任意のリンカーを組み込んだペプチド配列のことを意味する。本明細書で概説するように、プロテアーゼ切断ドメインはまた、必要に応じて、例えば可撓性を付与するために追加のアミノ酸を含んでもよい。 As used herein, "protease cleavage domain" refers to "protease cleavage sites," as well as any linkers between individual protease cleavage sites, and any linkers between protease cleavage site(s) and other constructs of a protein. It refers to a peptide sequence that incorporates any linkers between functional components (eg, V H , V L , target antigen binding domain(s), half-life extension domain, etc.). As outlined herein, the protease cleavage domain may also optionally include additional amino acids, eg, to confer flexibility.

II. タンパク質
本開示は、いくつかの態様において、本明細書では「共刺激条件付き二重特異性リダイレクト活性化」構築物、すなわち「共刺激COBRA」と称するタンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、それぞれがTTAに結合可能な2つのsdABDと、2つの制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインとを含み、その2つの制約的scFvドメインのそれぞれは、VH及びVLを含み、該VHと該VLとは、会合している場合に免疫細胞抗原に結合可能である。しかし、制約的scFvドメイン内のVH及びVLは、VHとVLとの間の短ペプチドリンカーの存在によって互いに会合することができない(すなわち、「制約的」である)。さらに、2つの制約的scFvドメインが分子内で会合し、免疫細胞抗原に結合しない2つの不活性Fvを形成する。いくつかの実施形態では、2つのsdABDは、同じTTAに結合する。いくつかの実施形態では、2つの制約的scFvドメインは、同じ免疫細胞抗原(例えば、同じ免疫細胞または異なる免疫細胞上の同じ免疫細胞抗原)に結合する。いくつかの実施形態では、2つの制約的scFvドメインは、異なる免疫細胞抗原(例えば、同じ免疫細胞または異なる免疫細胞上の異なる免疫細胞抗原)に結合する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、1つ以上の切断可能リンカー(例えば、腫瘍微小環境に存在するプロテアーゼによって切断可能なリンカー)をさらに含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、半減期延長ドメイン(例えば、ヒト血清アルブミン(HSA)に結合可能なsdABD)をさらに含む。
II. Proteins The present disclosure provides, in some aspects, a protein referred to herein as a "Costimulatory Conditional Bispecific Redirect Activation" construct, or "Costimulatory COBRA." In some embodiments, the proteins described herein include two sdABDs, each capable of binding TTA, and two constraining single chain variable fragment (scFv) domains, wherein the two constraining scFv Each of the domains includes a VH and a VL, which when associated are capable of binding an immune cell antigen. However, the VH and VL within a constrained scFv domain cannot associate with each other (ie, are "constrained") due to the presence of a short peptide linker between the VH and VL. Furthermore, two restrictive scFv domains associate intramolecularly to form two inactive Fvs that do not bind to immune cell antigens. In some embodiments, the two sdABDs bind to the same TTA. In some embodiments, the two restrictive scFv domains bind the same immune cell antigen (eg, the same immune cell antigen on the same or different immune cells). In some embodiments, the two restrictive scFv domains bind different immune cell antigens (eg, different immune cell antigens on the same immune cell or different immune cells). In some embodiments, the proteins described herein further include one or more cleavable linkers (eg, linkers that are cleavable by proteases present in the tumor microenvironment). In some embodiments, the proteins described herein further include a half-life extending domain (eg, sdABD capable of binding human serum albumin (HSA)).

本明細書では、タンパク質内の切断可能リンカーのうち1つ以上が切断されていない場合には、本明細書にて開示するタンパク質が不活性であることが企図される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載する切断されていない、不活性なタンパク質はTTAに結合可能であるが、免疫細胞抗原には結合できない。タンパク質は、例えば、疾患特有の微小環境または対象の血液中で、プロテアーゼ切断部位を含有する内部切断可能リンカーで切断されて、活性化される。切断されると、切断生成物の断片が2つの二量体(例えば、ホモ二量体)を形成し、そのそれぞれは、TTAと免疫細胞抗原との両方に結合可能な二重特異性分子であり、それにより1つ以上の免疫細胞が刺激され、及び/または活性化される。いくつかの実施形態では、2つの二量体(例えば、ホモ二量体)は異なるTTAに結合する。いくつかの実施形態では、2つの二量体(例えば、ホモ二量体)は、同じTTAに結合するが、TTA内の異なるエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、2つの二量体(例えば、ホモ二量体)は、異なる免疫細胞抗原に結合する(例えば、一方はCD3に結合し、他方はCD28に結合する)。 It is contemplated herein that a protein disclosed herein is inactive if one or more of the cleavable linkers within the protein are not cleaved. In some embodiments, the uncleaved, inactive proteins described herein are capable of binding TTA but not immune cell antigens. The protein is activated by cleavage with an internal cleavable linker containing a protease cleavage site, for example, in the disease-specific microenvironment or in the subject's blood. Upon cleavage, the cleavage product fragments form two dimers (e.g., homodimers), each of which is a bispecific molecule capable of binding both TTA and immune cell antigens. , thereby stimulating and/or activating one or more immune cells. In some embodiments, the two dimers (eg, homodimers) bind different TTAs. In some embodiments, the two dimers (eg, homodimers) bind to the same TTA, but to different epitopes within the TTA. In some embodiments, the two dimers (eg, homodimers) bind different immune cell antigens (eg, one binds CD3 and the other binds CD28).

いくつかの実施形態では、T細胞の応答の特異性は、T細胞受容体複合体による抗原(主要組織適合遺伝子複合体、MHCに関連して提示される)の認識によって媒介される。T細胞受容体複合体の一部として、CD3は、CD3γ(ガンマ)鎖、CD3δ(デルタ)鎖、2つのCD3e(イプシロン)鎖、及び2つのCD3ζ(ゼータ)を含むタンパク質複合体であり、細胞表面に存在する。CD3分子は、T細胞受容体(TCR)のα(アルファ)鎖及びβ(ベータ)鎖に会合して、TCR複合体を構成する。CD3に結合するFvドメインなどによるT細胞上のCD3のクラスター化は、T細胞受容体の関与と類似するが、そのクローンに典型的な特異性とは無関係のT細胞活性化をもたらす。 In some embodiments, the specificity of the T cell response is mediated by recognition of the antigen (presented in association with the major histocompatibility complex, MHC) by the T cell receptor complex. As part of the T cell receptor complex, CD3 is a protein complex that includes a CD3 gamma (gamma) chain, a CD3 delta (delta) chain, two CD3e (epsilon) chains, and two CD3ζ (zeta) chains, which Exists on the surface. The CD3 molecule associates with the α (alpha) and β (beta) chains of the T cell receptor (TCR) to form the TCR complex. Clustering of CD3 on T cells, such as by Fv domains that bind CD3, results in T cell activation similar to T cell receptor engagement but independent of the specificity typical of its clones.

しかしながら、当技術分野において周知のとおり、CD3活性化により、多くの毒性副作用が起こる可能性があるため、本開示は、腫瘍細胞の存在下でのみ、本開示のポリペプチドが有効にCD3に結合することを目的としている。この際、特定のプロテアーゼが存在することによりタンパク質のプロドラッグポリペプチドが切断されて、活性CD3結合ドメインがもたらされる。それゆえ、抗CD3 FvドメインのCD3への結合は、プロテアーゼレベルが高い疾患細胞または組織の微小環境、例えば本明細書に記載の腫瘍微小環境のみにCD3 FvドメインのCD3への結合を制限するプロテアーゼ切断ドメインによって制御される。 However, as is well known in the art, CD3 activation can result in a number of toxic side effects; therefore, the present disclosure provides that the polypeptides of the present disclosure effectively bind to CD3 only in the presence of tumor cells. It is intended to. In this case, the presence of a specific protease cleaves the prodrug polypeptide of the protein, yielding an active CD3 binding domain. Therefore, binding of the anti-CD3 Fv domain to CD3 restricts the binding of the CD3 Fv domain to CD3 only to the diseased cell or tissue microenvironment where levels of proteases are high, such as the tumor microenvironment described herein. Controlled by the cleavage domain.

いくつかの実施形態では、制約的抗CD3 scFvに加えて、本明細書に記載するタンパク質は、制約的抗CD28 scFvも含む場合がある。当技術分野で知られているように、CD28刺激が、種々の抗腫瘍T細胞、NK細胞、樹状細胞、好中球、マクロファージ、及び内皮細胞を活性化することが明らかとなっている。CD28がTreg細胞を抑制できることがこれまでに観察されている。本明細書にて開示するタンパク質にこれらの新規なCD28共刺激部位を加えることで、T細胞誘導CD3二重特異性分子を介した直接的な腫瘍細胞の死滅だけではなく、他の抗腫瘍関連細胞型の刺激、T細胞疲弊の阻害、及び長期的、持続的かつ全身的な免疫応答の誘導も可能になる。 In some embodiments, in addition to a restrictive anti-CD3 scFv, the proteins described herein may also include a restrictive anti-CD28 scFv. As is known in the art, CD28 stimulation has been shown to activate a variety of anti-tumor T cells, NK cells, dendritic cells, neutrophils, macrophages, and endothelial cells. It has been previously observed that CD28 can suppress Treg cells. The addition of these novel CD28 co-stimulatory sites to the proteins disclosed herein not only promotes direct tumor cell killing via the T cell-inducing CD3 bispecific molecule, but also promotes other anti-tumor associations. Stimulation of cell types, inhibition of T cell exhaustion, and induction of long-term, sustained and systemic immune responses are also possible.

本開示のタンパク質は、「プロドラッグ(不活性)」形態で構築される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するこのようなプロドラッグタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1の標的腫瘍抗原(TTA、例えば、ヒトTTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1の免疫細胞抗原(例えば、ヒト免疫細胞抗原)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1の免疫細胞抗原(例えば、ヒト免疫細胞抗原)に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカーと、
(v)第2の標的腫瘍抗原(TTA、例えば、ヒトTTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカーと、
(vii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2の免疫細胞抗原(例えば、ヒト免疫細胞抗原)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、さらに第2の制約的scFvドメインが第2の免疫細胞抗原(例えば、ヒト免疫細胞抗原)に結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカーと、
(ix)半減期延長ドメイン(例えば、ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABD)と、を含み
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
The proteins of the present disclosure are constructed in "prodrug (inactive)" form. In some embodiments, such prodrug proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first target tumor antigen (TTA, e.g., human TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains that are capable of binding a first immune cell antigen (e.g., a human immune cell antigen) when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated. wherein the first heavy chain variable region and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain is associated with a first immune cell antigen. a first constraining single chain variable fragment (scFv) domain that does not bind to a human immune cell antigen (e.g., a human immune cell antigen);
(iv) a first cleavable linker;
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second target tumor antigen (TTA, e.g., human TTA);
(vi) a second domain linker;
(vii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains that are capable of binding a second immune cell antigen (e.g., a human immune cell antigen) when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated. but the first heavy chain variable region and the first light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain a second constraining single chain variable fragment (scFv) domain that does not bind an antigen (e.g., a human immune cell antigen);
(viii) a second cleavable linker;
(ix) a half-life extending domain (e.g., a third sdABD that binds human serum albumin (HSA)); and (iii) the first heavy chain variable region of (vii) comprises a second light chain variable region of (vii) intramolecularly associate with the region to form a variable fragment (Fv) that does not bind to the first immune cell antigen or the second immune cell antigen;
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

科学的理論に拘束されないが、(iii)の第1の重鎖可変領域と(vii)の第2の軽鎖可変領域との分子内会合、及び/または(vii)の第2の重鎖可変領域と(iii)の第1の軽鎖可変領域との分子内会合が、本明細書に記載のプロドラッグタンパク質を安定化し(例えば、安定した発現をもたらし)、かつプロドラッグタンパク質が活性化する前に、異なるプロドラッグタンパク質同士の分子間の制約的scFvの二量体化を防ぐ。 Without being bound by scientific theory, an intramolecular association between (iii) the first heavy chain variable region and (vii) the second light chain variable region; and/or (vii) the second heavy chain variable region; The intramolecular association of the region and the first light chain variable region of (iii) stabilizes the prodrug protein described herein (e.g., results in stable expression) and activates the prodrug protein. prior to the intermolecular restriction of scFv dimerization between different prodrug proteins.

プロドラッグ(不活性)形態のタンパク質は、そのようなプロドラッグタンパク質のうち1つ以上を含む組成物中で対象に投与される場合に、(iv)の第1の切断可能リンカーが(例えば、腫瘍微小環境におけるプロテアーゼによって)切断されると、活性化され得る。プロドラッグタンパク質を活性化することは、(iv)の第1の切断可能リンカーで少なくとも2つの同一のプロドラッグタンパク質(互いに同一である第1のタンパク質及び第2のタンパク質)を切断することを含む。プロドラッグタンパク質内の(viii)の第2の切断可能リンカーの切断により、半減期延長ドメインが解放されるが、これは任意であり、プロドラッグタンパク質の活性化には必須ではない。 The prodrug (inactive) form of the protein is such that when the first cleavable linker of (iv) is administered to a subject in a composition comprising one or more of such prodrug proteins (e.g. Once cleaved (by proteases in the tumor microenvironment), it can be activated. Activating the prodrug proteins comprises cleaving at least two identical prodrug proteins (a first protein and a second protein that are identical to each other) with the first cleavable linker of (iv). . Cleavage of the second cleavable linker (viii) within the prodrug protein releases the half-life extension domain, but is optional and not required for activation of the prodrug protein.

(iv)の第1の切断可能リンカーでの各プロドラッグタンパク質の切断により、第1のTTAに結合する第1のsdABD、第1のドメインリンカー、及び第1の制約的scFvドメインを含む第1のポリペプチド、ならびに第2のTTAに結合する第2のsdABD、第2のドメインリンカー、及び第2の制約的sdFvドメインを含む第2のポリペプチドが結果として生じる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、(viii)の第2の切断可能リンカーが切断されない場合、半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)を追加的に含む場合がある。逆に、いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、(viii)の第2の切断可能リンカーが切断される場合、半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)を含まない場合がある。 (iv) Cleavage of each prodrug protein with the first cleavable linker results in a first sdABD binding to the first TTA, a first domain linker, and a first The result is a second polypeptide comprising a second sdABD that binds to a second TTA, a second domain linker, and a second constraining sdFv domain. In some embodiments, the second polypeptide additionally comprises a half-life extension domain (e.g., a third sdABD that binds HSA) when the second cleavable linker of (viii) is not cleaved. There are cases. Conversely, in some embodiments, the second polypeptide has a half-life extension domain (e.g., a third sdABD that binds HSA) when the second cleavable linker of (viii) is cleaved. It may not be included.

2つのプロドラッグタンパク質(すなわち、切断前は同一である第1のプロドラッグタンパク質及び第2のプロドラッグタンパク質)内の(iv)の第1の切断可能リンカー及び任意選択で(viii)の第2の切断可能リンカーが切断されると、第1のタンパク質の第1の重鎖可変領域が第2のタンパク質の第1の軽鎖可変領域と会合し、第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性Fvを形成し、第1のタンパク質の第1の軽鎖可変領域が第2のタンパク質の第1の重鎖可変領域と会合し、第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性Fvを形成し、第1のタンパク質の第2の重鎖可変領域が第2のタンパク質の第2の軽鎖可変領域と会合し、第2のヒト免疫細胞抗原に結合するFvを形成し、かつ第1のタンパク質の第2の軽鎖可変領域が第2のタンパク質の第2の重鎖可変領域に会合し、第2のヒト免疫細胞抗原に結合するFvを形成する。 (iv) a first cleavable linker and optionally (viii) a second cleavable linker within two prodrug proteins (i.e., a first prodrug protein and a second prodrug protein that are identical before cleavage); upon cleavage of the cleavable linker, the first heavy chain variable region of the first protein associates with the first light chain variable region of the second protein, resulting in activation of binding to the first human immune cell antigen. a first light chain variable region of a first protein associates with a first heavy chain variable region of a second protein to form an active Fv that binds to a first human immune cell antigen; a second heavy chain variable region of the first protein associates with a second light chain variable region of the second protein to form an Fv that binds a second human immune cell antigen; A second light chain variable region associates with a second heavy chain variable region of a second protein to form an Fv that binds a second human immune cell antigen.

そのようなものであるから、いくつかの実施形態では、プロドラッグ(不活性)タンパク質の切断断片が集合して2つの二量体(第1の二量体及び第2の二量体)を構築し、各二量体はTTA及び免疫細胞抗原に結合可能な二重特異性分子となる。 As such, in some embodiments, the truncated fragments of the prodrug (inactive) protein assemble to form two dimers (a first dimer and a second dimer). Assemble, each dimer becomes a bispecific molecule capable of binding TTA and immune cell antigens.

いくつかの実施形態では、第1の二量体は、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含む第1のポリペプチドの二量体化を介して形成され(プロドラッグタンパク質の切断生成物)、
該第1の二量体において、一方のポリペプチドの第1のVHが他方のポリペプチドの第1のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの第1のVLが他方のポリペプチドの第1のVHと会合し、それぞれが第1の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する。
In some embodiments, the first dimer is
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to a first human immune cell antigen. (a cleavage product of a prodrug protein);
In the first dimer, the first VH of one polypeptide is associated with the first VL of the other polypeptide, and the first VL of one polypeptide is associated with the first VL of the other polypeptide. to form two active variable fragments (Fv), each capable of binding the first immunizing antigen.

いくつかの実施形態では、第2の二量体は、
(i)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第2のドメインリンカーと、
(iii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原と結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
任意選択で(viii)の第2の切断可能リンカーが切断される場合に、半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)と、を含む第2のポリペプチドの二量体化を介して形成され(プロドラッグタンパク質の切断生成物)、
該第2の二量体において、一方のポリペプチドの第2のVHが他方のポリペプチドの第2のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの第2のVLが他方のポリペプチドの第2のVHと会合し、それぞれが第2の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する。
In some embodiments, the second dimer is
(i) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(ii) a second domain linker;
(iii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the second light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
dimerization of a second polypeptide comprising a half-life extension domain (e.g., a third sdABD that binds HSA), optionally when the second cleavable linker of (viii) is cleaved; (prodrug protein cleavage product),
In the second dimer, the second VH of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide, and the second VL of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide. to form two active variable fragments (Fv), each capable of binding a second immunizing antigen.

第1の二量体はホモ二量体であることを理解すべきである。第2の二量体は、いくつかの実施形態において、例えば、第2の二量体を形成する両方のポリペプチドが半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)を含有する場合、または第2の二量体を形成する両方のポリペプチドが半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)を含有しない場合に、ホモ二量体である。いくつかの実施形態では、第2の二量体は、例えば、第2の二量体を形成する一方のポリペプチドが半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)を含有し、かつ第2の二量体を形成する他方のポリペプチドが半減期延長ドメイン(例えば、HSAに結合する第3のsdABD)を含有しない場合に、ヘテロ二量体である場合がある。 It should be understood that the first dimer is a homodimer. The second dimer, in some embodiments, e.g., both polypeptides forming the second dimer contain a half-life extension domain (e.g., a third sdABD that binds HSA) is a homodimer if, or if both polypeptides forming the second dimer do not contain a half-life extending domain (eg, a third sdABD that binds HSA). In some embodiments, the second dimer includes, for example, one polypeptide forming the second dimer that contains a half-life extension domain (e.g., a third sdABD that binds HSA). , and the other polypeptide forming the second dimer does not contain a half-life extending domain (eg, a third sdABD that binds HSA).

プロドラッグ形態または活性形態での本明細書に記載するタンパク質の構成要素の非限定的例を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(i)の第1のsdABDによって結合される第1のTTAは、(v)の第2のsdABDによって結合される第2のTTAとは異なる。この場合、第1のsdABD(i)は、(v)の第2のsdABDとは異なる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(i)の第1のsdABDによって結合される第1のTTAは、(v)の第2のsdABDによって結合される第2のTTAと同じである。第1のTTAが第2のTTAと同じである場合、(i)の第1のsdABDは、(v)の第2のsdABDと同じである場合があるか、または異なる場合があることを理解すべきである。例えば、(i)の第1のsdABD及び(v)の第2のsdABDは、同じTTAの異なるエピトープに結合する場合がある。別の例では、(i)の第1のsdABD及び(v)の第2のsdABDは、同じTTAの同じエピトープに結合するが、異なるアミノ酸配列を有する場合がある。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び(v)の第2のsdABDは、同じである(すなわち、同じアミノ酸配列を含む)。 Non-limiting examples of components of the proteins described herein in prodrug or active form are provided. In some embodiments, in the proteins described herein, the first TTA bound by the first sdABD of (i) is a second TTA bound by the second sdABD of (v) It is different from. In this case, the first sdABD (i) is different from the second sdABD in (v). In some embodiments, in the proteins described herein, the first TTA bound by the first sdABD of (i) is a second TTA bound by the second sdABD of (v) is the same as Understand that if the first TTA is the same as the second TTA, the first sdABD in (i) may be the same as the second sdABD in (v) or may be different. Should. For example, the first sdABD in (i) and the second sdABD in (v) may bind to different epitopes of the same TTA. In another example, the first sdABD of (i) and the second sdABD of (v) may bind to the same epitope of the same TTA, but have different amino acid sequences. In some embodiments, the first sdABD of (i) and the second sdABD of (v) are the same (ie, contain the same amino acid sequence).

いくつかの実施形態では、第1のTTA及び/または第2のTTAは、a4-インテグリン、A33、ACVRL 1/ALKl、ADAM17、ALK、APRIL、B7H3、BCMA、C242、CA9、CA125、カドヘリン-19、CAIX、CanAg、炭酸脱水素酵素IX、CCN1、CCR4、CD123、CD133、CD137(4-1BB)、CD138/シンデカンル、CD19、CD2、CD20、CD22、CD30、CD33、CD37、CD38、CD4、CD40、CD44、CD45、CD48、CD5、CD52、CD56、CD59、CD70、CD70b、CD71、CD74、CD79b、CD80、CD86、CD98、CEA、CEACAM、CEACAM1、CK8、c-Kit、クローディン-1(CLDN1)、CLDN18(CLDN18.2を含む)、CLDN6、c-met/HGFR、c-RET、Cripto、CTLA-4、CXCR4、DKK-1、DLL3、DLL4、TRAIL-R2/DR5、DRS、EGFL7、EGFR、EGFRvIII、エンドグリン、ENPP3、EpCAM、EphA2、エピシアリン、FAP、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、フィブロネクチンエクストラドメインB、FLT-3、flt4、葉酸受容体1、FOLR1、グアニリルシクラーゼC(GCC)、GD2、GD3、グリピカン-3、グリピカン、GM3、GPNMB、GPR49、GRP78、Her2/Neu、HER3/ERBB3、HLA-DR、ICAM-1、IGF-1R、IGFR、IL-3Ra、インテグリンa5b1、インテグリンa6b4、インテグリンaV、インテグリンanb3、ルイスY、ルイスy/b抗原、LFL2、LIV-1、LRCC15、Ly6E、LYPD3、MCP-1、メソテリン、MMP-9、MUC1、MUC18、MUC5A、MUC5AC、ミオスタチン、NaPi2b、ニューロピリン1、NGcGM3、NRP1、P-カドヘリン、PCLA、PD-1、PDGFRa、PD-L1、PD-L2、ホスファチジルセリン、PIVKA-II、PLVAP、PRLR、プロガストリン、PSCA、PSMA、RANKL、RG1、シグレック-15、SLAMF6、SLAMF7、SLC44A4、STEAP-1、TACSTD-2、テネイシンC、TPBG、TRAIL-R1/DR4、TROP-2、TWEAKR、TYRP1、VANGL2、VEGF、VEGF-C、VEGFR-2、及びVEGF-R2から選択される。 In some embodiments, the first TTA and/or the second TTA is a4-integrin, A33, ACVRL 1/ALKl, ADAM17, ALK, APRIL, B7H3, BCMA, C242, CA9, CA125, cadherin-19 , CAIX, CanAg, carbonic anhydrase IX, CCN1, CCR4, CD123, CD133, CD137 (4-1BB), CD138/syndecanl, CD19, CD2, CD20, CD22, CD30, CD33, CD37, CD38, CD4, CD40, CD44, CD45, CD48, CD5, CD52, CD56, CD59, CD70, CD70b, CD71, CD74, CD79b, CD80, CD86, CD98, CEA, CEACAM, CEACAM1, CK8, c-Kit, claudin-1 (CLDN1), CLDN18 (including CLDN18.2), CLDN6, c-met/HGFR, c-RET, Cripto, CTLA-4, CXCR4, DKK-1, DLL3, DLL4, TRAIL-R2/DR5, DRS, EGFL7, EGFR, EGFRvIII , endoglin, ENPP3, EpCAM, EphA2, episialin, FAP, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, fibronectin extra domain B, FLT-3, flt4, folate receptor 1, FOLR1, guanylyl cyclase C (GCC), GD2 , GD3, glypican-3, glypican, GM3, GPNMB, GPR49, GRP78, Her2/Neu, HER3/ERBB3, HLA-DR, ICAM-1, IGF-1R, IGFR, IL-3Ra, integrin a5b1, integrin a6b4, integrin aV, integrin anb3, Lewis Y, Lewis y/b antigen, LFL2, LIV-1, LRCC15, Ly6E, LYPD3, MCP-1, mesothelin, MMP-9, MUC1, MUC18, MUC5A, MUC5AC, myostatin, NaPi2b, neuropilin 1, NGcGM3, NRP1, P-cadherin, PCLA, PD-1, PDGFRa, PD-L1, PD-L2, phosphatidylserine, PIVKA-II, PLVAP, PRLR, progastrin, PSCA, PSMA, RANKL, RG1, Siglec- 15, SLAMF6, SLAMF7, SLC44A4, STEAP-1, TACSTD-2, tenascin C, TPBG, TRAIL-R1/DR4, TROP-2, TWEAKR, TYRP1, VANGL2, VEGF, VEGF-C, VEGFR-2, and VEGF- Selected from R2.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、B7H3、CD19、CD20、CD22、CD38、BCMA、LRRC15及びFAPから選択される。いくつかの実施形態では、第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、B7H3、CD19、CD20、CD22、CD38、BCMA、LRRC15及びFAPから選択される。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、及びB7H3から選択される。いくつかの実施形態では、第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、及びB7H3から選択される。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3から選択される。いくつかの実施形態では、第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3から選択される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供するTTAのうち任意の1つは、ヒトTTAである。 In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, B7H3, CD19, CD20, CD22, CD38, BCMA, LRRC15, and FAP. In some embodiments, the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, B7H3, CD19, CD20, CD22, CD38, BCMA, LRRC15, and FAP. In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, and B7H3. In some embodiments, the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, and B7H3. In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3. In some embodiments, the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3. In some embodiments, any one of the TTAs provided herein is a human TTA.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、B7H3、CD19、CD20、CD22、CD38、BCMA、LRRC15及びFAPから選択され、かつ第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、B7H3、CD19、CD20、CD22、CD38、BCMA、LRRC15及びFAPから選択され、ここで、第1のTTAは第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、及びB7H3から選択され、かつ第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、及びB7H3から選択され、ここで、第1のTTAは第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、及びLyPD3から選択され、かつ第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、及びLyPD3から選択され、ここで、第1のTTAは第2のTTAと同じである。 In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, B7H3, CD19, CD20, CD22, CD38, BCMA, LRRC15, and FAP; TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, B7H3, CD19, CD20, CD22, CD38, BCMA, LRRC15 and FAP, where the first TTA is the same as the second TTA It is. In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, and B7H3, and the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, selected from LyPD3, EpCAM, and B7H3, where the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, and LyPD3, and the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, and LyPD3. , where the first TTA is the same as the second TTA.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、B7H3、CD19、CD20、CD22、CD38、BCMA、LRRC15及びFAPから選択され、かつ第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、B7H3、CD19、CD20、CD22、CD38、BCMA、LRRC15及びFAPから選択され、ここで、第1のTTAは第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、及びB7H3から選択され、かつ第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、LyPD3、EpCAM、及びB7H3から選択され、ここで、第1のTTAは第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、及びLyPD3から選択され、かつ第2のTTAは、EGFR、HER2、TROP2、CA9、FOLR1、及びLyPD3から選択され、ここで、第1のTTAは第2のTTAと異なる。 In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, B7H3, CD19, CD20, CD22, CD38, BCMA, LRRC15, and FAP; The TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, B7H3, CD19, CD20, CD22, CD38, BCMA, LRRC15 and FAP, where the first TTA is different from the second TTA . In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, LyPD3, EpCAM, and B7H3, and the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, selected from LyPD3, EpCAM, and B7H3, where the first TTA is different from the second TTA. In some embodiments, the first TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, and LyPD3, and the second TTA is selected from EGFR, HER2, TROP2, CA9, FOLR1, and LyPD3. , where the first TTA is different from the second TTA.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるEGFRのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR, the second TTA is EGFR, and the first sdABD binds a different epitope of EGFR than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is EGFR, the second TTA is EGFR, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるHER2のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2, the second TTA is HER2, and the first sdABD binds a different epitope of HER2 than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is HER2, the second TTA is HER2, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはTROP2であり、第2のTTAはTROP2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはTROP2であり、第2のTTAはTROP2であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTROP2のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはTROP2であり、第2のTTAはTROP2であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is TROP2 and the second TTA is TROP2. In some embodiments, the first TTA is TROP2, the second TTA is TROP2, and the first sdABD binds a different epitope of TROP2 than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is TROP2, the second TTA is TROP2, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはFOLR1であり、第2のTTAはFOLR1である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはFOLR1であり、第2のTTAはFOLR1であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるFOLR1のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはFOLR1であり、第2のTTAはFOLR1であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is FOLR1 and the second TTA is FOLR1. In some embodiments, the first TTA is FOLR1, the second TTA is FOLR1, and the first sdABD binds a different epitope of FOLR1 than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is FOLR1, the second TTA is FOLR1, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはCA9であり、第2のTTAはCA9である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはCA9であり、第2のTTAはCA9であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるCA9のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはCA9であり、第2のTTAはCA9であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is CA9 and the second TTA is CA9. In some embodiments, the first TTA is CA9, the second TTA is CA9, and the first sdABD binds a different epitope of CA9 than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is CA9, the second TTA is CA9, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはLyPD3であり、第2のTTAはLyPD3である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはLyPD3であり、第2のTTAはLyPD3であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるLyPD3のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはLyPD3であり、第2のTTAはLyPD3であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is LyPD3 and the second TTA is LyPD3. In some embodiments, the first TTA is LyPD3, the second TTA is LyPD3, and the first sdABD binds to a different epitope of LyPD3 than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is LyPD3, the second TTA is LyPD3, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはEpCAMであり、第2のTTAはEpCAMである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEpCAMであり、第2のTTAはEpCAMであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるEpCAMのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEpCAMであり、第2のTTAはEpCAMであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is an EpCAM and the second TTA is an EpCAM. In some embodiments, the first TTA is EpCAM, the second TTA is EpCAM, and the first sdABD binds a different epitope of EpCAM than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is EpCAM, the second TTA is EpCAM, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはB7H3であり、第2のTTAはB7H3である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはB7H3であり、第2のTTAはB7H3であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるB7H3のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAはB7H3であり、第2のTTAはB7H3であり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDと同じである(例えば、同じアミノ酸配列を有する)。 In some embodiments, the first TTA is B7H3 and the second TTA is B7H3. In some embodiments, the first TTA is B7H3, the second TTA is B7H3, and the first sdABD binds a different epitope of B7H3 than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is B7H3, the second TTA is B7H3, and the first sdABD is the same (eg, has the same amino acid sequence) as the second sdABD.

いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはTROP2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはTROP2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはFOLR1である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはFOLR1であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEpCAMであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEpCAMである。 In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is TROP2. In some embodiments, the first TTA is TROP2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is FOLR1. In some embodiments, the first TTA is FOLR1 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EpCAM and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EpCAM.

EGFRに結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つに記載されている抗EGFR sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind to EGFR and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is an antibody set forth in any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11. Contains CDR1, CDR2, and CDR3 of EGFR sdABD. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is at least 80% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11. (eg, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical amino acid sequences. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9.

HER2に結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つに記載されている抗HER2 sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind to HER2 and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, CDR1 of an anti-HER2 sdABD described in any one of 75-78, 82, 85, 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300 , CDR2, and CDR3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, and at least 80% (e.g., at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical amino acid sequences. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75-78, 82, 85, 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:96.

TROP2に結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号145、149、153、156、160、及び164のうち任意の1つに記載されている抗TROP2 sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号145、149、153、156、160、及び164のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号145、149、153、156、160、及び164のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind TROP2 and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is set forth in any one of SEQ ID NOs: 145, 149, 153, 156, 160, and 164. Contains CDR1, CDR2, and CDR3 of anti-TROP2 sdABD. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) has the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 145, 149, 153, 156, 160, and 164. an amino acid sequence that is at least 80% (eg, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical to In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) has the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 145, 149, 153, 156, 160, and 164. including.

CA9に結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号186、190、194、及び198のうち任意の1つに記載されている抗CA9 sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号186、190、194、及び198のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号186、190、194、及び198のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind to CA9 and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is an antibody set forth in any one of SEQ ID NOs: 186, 190, 194, and 198. Contains CDR1, CDR2, and CDR3 of CA9 sdABD. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is at least 80% identical to the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 186, 190, 194, and 198. (eg, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical amino acid sequences. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 186, 190, 194, and 198.

FOLR1に結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号33、37、及び41のうち任意の1つに記載されている抗FOLR1 sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号33、37、及び41のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号33、37、及び41のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind to FOLR1 and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is an anti-FOLR1 sdABD set forth in any one of SEQ ID NOs: 33, 37, and 41. CDR1, CDR2, and CDR3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) has an amino acid sequence of at least 80% (e.g. , at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical amino acid sequences. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 33, 37, and 41.

LyPD3に結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号125、128、130、134、138、及び301のうち任意の1つに記載されている抗LyPD3 sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号125、128、130、134、138、及び301のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号125、128、130、134、138、及び301のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind to LyPD3 and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is set forth in any one of SEQ ID NOs: 125, 128, 130, 134, 138, and 301. Contains CDR1, CDR2, and CDR3 of anti-LyPD3 sdABD. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) has the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 125, 128, 130, 134, 138, and 301. an amino acid sequence that is at least 80% (eg, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical to In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) has the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 125, 128, 130, 134, 138, and 301. including.

EpCAMに結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用することができるsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号15、19、23、27、及び29のうち任意の1つに記載されている抗EpCAM sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号15、19、23、27、及び29のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号15、19、23、27、及び29のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that can be coupled to EpCAM and used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is set forth in any one of SEQ ID NOs: 15, 19, 23, 27, and 29. Contains CDR1, CDR2, and CDR3 of anti-EpCAM sdABD. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) has at least the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 15, 19, 23, 27, and 29. 80% (eg, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical amino acid sequences. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 15, 19, 23, 27, and 29. .

B7H3に結合し、かつ(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDとして使用され得るsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号168、172、174、176、178、180、及び182のうち任意の1つに記載されている抗B7H3 sdABDのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号168、172、174、176、178、180、及び182のうち任意の1つのアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABD及び/または(v)の第2のsdABDは、配列番号168、172、174、176、178、180、及び182のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。 Non-limiting examples of sdABDs that bind B7H3 and can be used as (i) the first sdABD and/or (v) the second sdABD are presented in Table 3. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is any one of SEQ ID NOs: 168, 172, 174, 176, 178, 180, and 182. CDR1, CDR2, and CDR3 of the anti-B7H3 sdABD described in . In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is any one of SEQ ID NOs: 168, 172, 174, 176, 178, 180, and 182. An amino acid sequence that is at least 80% (eg, at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) identical to an amino acid sequence. In some embodiments, the first sdABD of (i) and/or the second sdABD of (v) is any one of SEQ ID NOs: 168, 172, 174, 176, 178, 180, and 182. Contains amino acid sequence.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号5のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号5のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、ここで、第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号96のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is HER2 and the second human target tumor antigen is HER2, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:96.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、ここで、第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号96のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is EGFR and the second human target tumor antigen is HER2, wherein the first sdABD is an amino acid of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9. and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:96.

いくつかの実施形態では、第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、ここで、第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、かつ第2のsdABDは配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first human target tumor antigen is HER2 and the second human target tumor antigen is EGFR, wherein the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96; and the second sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、第1の免疫細胞抗原は、第2の免疫細胞抗原と異なる。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原及び第2の免疫細胞抗原は、同じ免疫細胞で発現するが、第1の免疫細胞抗原は、第2の免疫細胞抗原と異なる。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原及び第2の免疫細胞抗原は、異なる免疫細胞で発現し、かつ第1の免疫細胞抗原は、第2の免疫細胞抗原と異なる。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first immune cell antigen is different from the second immune cell antigen. In some embodiments, the first immune cell antigen and the second immune cell antigen are expressed on the same immune cell, but the first immune cell antigen is different from the second immune cell antigen. In some embodiments, the first immune cell antigen and the second immune cell antigen are expressed on different immune cells, and the first immune cell antigen is different from the second immune cell antigen.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原及び/または第2の免疫細胞抗原は、T細胞、ナチュラルキラー細胞(NK細胞)、マクロファージ、B細胞、好中球、及び単核細胞から選択される免疫細胞で発現する抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原及び/または第2の免疫細胞抗原は、T細胞、ナチュラルキラー細胞(NK細胞)、及びマクロファージから選択される免疫細胞で発現する抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はT細胞で発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はT細胞で発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はT細胞で発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はNK細胞で発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はT細胞で発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はマクロファージで発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はNK細胞で発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はNK細胞で発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はNK細胞で発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はT細胞で発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はNK細胞で発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はマクロファージで発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はマクロファージで発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はマクロファージで発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はマクロファージで発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はT細胞で発現する異なる抗原である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はマクロファージで発現する抗原であり、第2の免疫細胞抗原はNK細胞で発現する異なる抗原である。 In some embodiments, the first immune cell antigen and/or the second immune cell antigen are selected from T cells, natural killer cells (NK cells), macrophages, B cells, neutrophils, and mononuclear cells. It is an antigen expressed by immune cells that are exposed to the immune system. In some embodiments, the first immune cell antigen and/or the second immune cell antigen are antigens expressed on immune cells selected from T cells, natural killer cells (NK cells), and macrophages. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on T cells and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on T cells. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on T cells and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on NK cells. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on T cells and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on macrophages. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on NK cells and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on NK cells. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on NK cells and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on T cells. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on NK cells and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on macrophages. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on macrophages and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on macrophages. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on macrophages and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on T cells. In some embodiments, the first immune cell antigen is an antigen expressed on macrophages and the second immune cell antigen is a different antigen expressed on NK cells.

本明細書に記載するタンパク質において、第1の免疫細胞抗原及び/または第2免疫細胞抗原として使用され得るT細胞で発現する抗原の非限定的例としては、CD3、CD28、T細胞受容体、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、T細胞免疫グロブリン及びムチンドメイン3(TIM-3)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG-3)、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、CD137(4-1BBとしても知られている)、OX40、CD27、GITR(TNFRSF18)、TIGIT、誘導性T細胞共刺激(ICOS)、NKG2D、CD226、CD96、ならびにCD40Lが挙げられる。本明細書に記載するタンパク質において、第1の免疫細胞抗原及び/または第2免疫細胞抗原として使用され得るNK細胞で発現する抗原の非限定的例としては、CD16A、CD28、NKG2D、CD226、CRTAM、LFA-1、CD27、CD96、TIGIT、及びKIRが挙げられる。本明細書に記載するタンパク質において、第1の免疫細胞抗原及び/または第2免疫細胞抗原として使用され得るマクロファージで発現する抗原の非限定的例としては、CSF1R、CD40、MARCO、VSIG4、及びCD163が挙げられる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供する免疫細胞抗原のうち任意の1つは、ヒト免疫細胞抗原である。 Non-limiting examples of antigens expressed on T cells that can be used as first and/or second immune cell antigens in the proteins described herein include CD3, CD28, T cell receptor, programmed cell death protein 1 (PD-1), cytotoxic T lymphocyte-associated protein 4 (CTLA-4), T cell immunoglobulin and mucin domain 3 (TIM-3), lymphocyte activation gene 3 (LAG-3) ), killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR), CD137 (also known as 4-1BB), OX40, CD27, GITR (TNFRSF18), TIGIT, inducible T cell costimulation (ICOS), NKG2D, CD226 , CD96, and CD40L. Non-limiting examples of antigens expressed on NK cells that can be used as first and/or second immune cell antigens in the proteins described herein include CD16A, CD28, NKG2D, CD226, CRTAM. , LFA-1, CD27, CD96, TIGIT, and KIR. Non-limiting examples of antigens expressed on macrophages that can be used as first and/or second immune cell antigens in the proteins described herein include CSF1R, CD40, MARCO, VSIG4, and CD163. can be mentioned. In some embodiments, any one of the immune cell antigens provided herein is a human immune cell antigen.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28. In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、任意の既知の免疫細胞抗原抗体(例えば、CD3またはCD28に結合する抗体)の重鎖可変領域(VH)及び軽鎖可変領域(VL)を含む場合がある。そのようなものであるから、第1のVHと第1のVLとは、会合している場合、第1の免疫細胞抗原に結合可能であり、かつ第2のVHと第2のVLとは、会合している場合、第2の免疫細胞抗原に結合可能である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) is any known immune cell antigen. It may include the heavy chain variable region (VH) and light chain variable region (VL) of an antibody (eg, an antibody that binds CD3 or CD28). As such, the first VH and the first VL are capable of binding to the first immune cell antigen when associated, and the second VH and the second VL are , when associated, is capable of binding a second immune cell antigen.

本明細書に記載するタンパク質において、第1の制約的scFvドメイン内で第1のVHと第1のVLとが会合することを防ぐこと、例えば、第1の「制約的切断不可能リンカー(CNCL)」で第1のVHと第1のVLとを連結させることにより、第1の免疫細胞抗原に結合しない第1の制約的scFvドメインが結果として生じることも理解される。同様に、第2の制約的scFvドメイン内で第2のVHと第2のVLとが会合することを防ぐこと、例えば、第2の「制約的切断不可能リンカー」で第2のVHと第2のVLとを連結させることにより、第2の免疫細胞抗原に結合しない第2の制約的scFvドメインが結果として生じる。制約的切断不可能リンカーは短すぎるため、制約的scFvドメイン内で、第1のVHと第1のVLとを会合させるか、または第2のVHと第2のVLとを会合させることができない。いくつかの実施形態では、第1のCNCL及び/または第2のCNCLは、6~10アミノ酸長(例えば、6、7、8、9、または10アミノ酸長である)。第1のCNCL及び/または第2のCNCLのアミノ酸配列の非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、第1のCNCL及び/または第2のCNCLは、GGGSGGGSの配列(配列番号302)を有する。 In the proteins described herein, preventing association of a first VH and a first VL within a first constrained scFv domain, e.g. It is also understood that joining the first VH and the first VL with a ")" results in a first restrictive scFv domain that does not bind to the first immune cell antigen. Similarly, preventing the association of a second VH and a second VL within a second constrained scFv domain, e.g. Linking the two VLs results in a second restrictive scFv domain that does not bind to a second immune cell antigen. The restrictive non-cleavable linker is too short to allow association of the first VH and the first VL or the association of the second VH and the second VL within the restrictive scFv domain. . In some embodiments, the first CNCL and/or the second CNCL are 6-10 amino acids long (eg, 6, 7, 8, 9, or 10 amino acids long). Non-limiting examples of amino acid sequences of the first CNCL and/or the second CNCL are provided in Table 3. In some embodiments, the first CNCL and/or the second CNCL have a sequence of GGGSGGGS (SEQ ID NO: 302).

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD3に結合する抗体の非限定的例としては、ムロモナブ-CD3(OKT3)、オテリキシズマブ(TRX4)、テプリズマブ(MGA031)、ビジリズマブ(Nuvion)、ブリナツモマブ、フォラルマブ、SP34もしくはI2C、TR-66もしくはX35-3、VIT3、BMA030(BW264/56)、CLB-T3/3、CRIS7、YTH12.5、F111-409、CLB-T3.4.2、TR-66、WT32、SPv-T3b、11D8、XIII-141、XIII-46、XIII-87、12F6、T3/RW2-8C8、T3/RW2-4B6、OKT3D、M-T301、SMC2、F101.01、UCHT-1及びWT-31が挙げられる。会合している場合に、CD3に結合し、かつ(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインで使用され得るVH及びVLの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号199に記載されているvhCDR1、配列番号200に記載されているvhCDR2、及び配列番号201に記載されているvhCDR3を含むVHと、配列番号202に記載されているvlCDR1、配列番号203に記載されているvlCDR2、及び配列番号204に記載されているvlCDR3を含むVLとを含む。いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号205のアミノ酸配列に対して少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号206のアミノ酸配列に対して少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号205のアミノ酸配列を含むVHと、配列番号206のアミノ酸配列を含むVLとを含む。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind to CD3 include muromonab-CD3 (OKT3), otelixizumab (TRX4), teplizumab (MGA031), vigilizumab (Nuvion), blinatumomab, foralumab, SP34 or I2C, TR-66 or X35-3 , VIT3, BMA030 (BW264/56), CLB-T3/3, CRIS7, YTH12.5, F111-409, CLB-T3.4.2, TR-66, WT32, SPv-T3b, 11D8, XIII-141, XIII-46, XIII-87, 12F6, T3/RW2-8C8, T3/RW2-4B6, OKT3D, M-T301, SMC2, F101.01, UCHT-1 and WT-31. Non-limiting examples of VH and VL that, when associated, bind to CD3 and can be used in the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) are presented in Table 3. In some embodiments, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) is vhCDR1 set forth in SEQ ID NO: 199, vhCDR1 set forth in SEQ ID NO: 200. VH containing vhCDR2 described in SEQ ID NO: 201 and vhCDR3 described in SEQ ID NO: 201, vlCDR1 described in SEQ ID NO: 202, vlCDR2 described in SEQ ID NO: 203, and vlCDR3 described in SEQ ID NO: 204. Contains VL. In some embodiments, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) is at least 80% (e.g., at least VH comprising an amino acid sequence that is at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) and at least 80% (e.g., at least 80%, at least 85%) %, at least 90%, at least 95%, or at least 99%). In some embodiments, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) comprises a VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205 and an amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. VL containing the array.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD28に結合する抗体の非限定的例としては、セラリズマブ、ウトミルマブ(PF-05082566)、ES101(二重特異性PD-L1×CD28抗体)、PRS-343(HER2×CD28二重特異性抗体)ウレルマブ(BMS-663513)、ならびに参照により本明細書に援用される米国特許第7939638号に記載されているようなTGN1412及びTGN1112が挙げられる。会合している場合に、CD28に結合し、かつ(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインで使用され得るVH及びVLの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号207に記載されているvhCDR1、配列番号208または配列番号215に記載されているvhCDR2、及び配列番号209に記載されているvhCDR3を含むVHと、配列番号210に記載されているvlCDR1、配列番号211に記載されているvlCDR2、及び配列番号212に記載されているvlCDR3を含むVLとを含む。いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列に対して少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号配列番号214のアミノ酸配列に対して少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)であるアミノ酸配列を含むVLと、を含む。いくつかの実施形態では、(iii)の第1の制約的scFvドメイン及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含むVHと、配列番号配列番号214のアミノ酸配列を含むVLとを含む。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind to CD28 include seralizumab, utmilumab (PF-05082566), ES101 (bispecific PD-L1 x CD28 antibody), PRS-343 (HER2 x CD28 bispecific antibody) urelumumab (BMS-663513), as well as TGN1412 and TGN1112 as described in US Pat. No. 7,939,638, which is incorporated herein by reference. Non-limiting examples of VH and VL that, when associated, bind to CD28 and can be used in the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) are presented in Table 3. In some embodiments, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) is vhCDR1 set forth in SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 208, or SEQ ID NO: VH containing vhCDR2 described in SEQ ID NO:215 and vhCDR3 described in SEQ ID NO:209, vlCDR1 described in SEQ ID NO:210, vlCDR2 described in SEQ ID NO:211, and vlCDR2 described in SEQ ID NO:212. VL containing vlCDR3. In some embodiments, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) is at least 80% relative to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216. (e.g., at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) and at least 80% (e.g., at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%). In some embodiments, the first restrictive scFv domain of (iii) and/or the second restrictive scFv domain of (vii) comprises a VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216; VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、PD-1に結合する抗体の非限定的例としては、ペムブロリズマブ、ドスタルリマブ、及びニボルマブが挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind PD-1 include pembrolizumab, dostarlimab, and nivolumab.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CTLA-4に結合する抗体の非限定的例としては、イピリムマブが挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds CTLA-4 includes ipilimumab.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、TIM-3に結合する抗体の非限定的例としては、TSR-022及びSym023が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind TIM-3 include TSR-022 and Sym023.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、LAG-3に結合する抗体の非限定的例としては、BMS-986016が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds LAG-3 includes BMS-986016.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、KIRに結合する抗体の非限定的例としては、リリルマブが挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds to a KIR includes rililumab.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD137に結合する抗体の非限定的例としては、ウトミルマブ及びウレルマブが挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind CD137 include utomilumumab and urelumumab.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、OX40に結合する抗体の非限定的例としては、PF-045-18600及びBMS-986178が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind OX40 include PF-045-18600 and BMS-986178.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD27に結合する抗体の非限定的例としては、バリルマブが挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds CD27 includes valilumab.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、GITRに結合する抗体の非限定的例としては、GWN323またはBMS-986156が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind GITR include GWN323 or BMS-986156.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、TIGITに結合する抗体の非限定的例としては、OMP-313M32、MTIG7192A、BMS-986207、及びMK-7684が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind TIGIT include OMP-313M32, MTIG7192A, BMS-986207, and MK-7684.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、ICOSに結合する抗体の非限定的例としては、JTX-2011が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds ICOS includes JTX-2011.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CSF1Rに結合する抗体の非限定的例としては、マクツズマブ(mactuzumab)/RG7155及びIMC-CS4が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind to CSF1R include mactuzumab/RG7155 and IMC-CS4.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD40に結合する抗体の非限定的例としては、CP-870,893が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind CD40 include CP-870,893.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD16Aに結合する抗体の非限定的例としては、NTM-1633及びAFM13が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from Non-limiting examples of antibodies that bind CD16A include NTM-1633 and AFM13.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD96に結合する抗体の非限定的例としては、GSK6097608が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds to CD96 includes GSK6097608.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、CD40Lに結合する抗体の非限定的例としては、BG9588が挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds CD40L includes BG9588.

(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVH及び第1のVL及び/または(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVH及び第2のVLが由来し得る、LFA-1に結合する抗体の非限定的例としては、エファリズマブが挙げられる。 (iii) the first VH and first VL of the first restrictive scFv domain and/or the second VH and second VL of the second restrictive scFv domain of (vii) may be derived from A non-limiting example of an antibody that binds LFA-1 includes efalizumab.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、第1のVLのN末端に連結された第1のVHを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、第1のVLのC末端に連結された第1のVHを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises a first VH linked to the N-terminus of the first VL. In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises a first VH linked to the C-terminus of the first VL.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、第2のVLのN末端に連結された第2のVHを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、第2のVLのC末端に連結された第2のVHを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the second constraining scFv domain of (vii) comprises a second VH linked to the N-terminus of the second VL. In some embodiments, in the proteins described herein, the second constraining scFv domain of (vii) comprises a second VH linked to the C-terminus of the second VL.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインの第1のVHと第1のVLとは、第1のCNCLを介して連結される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first VH and first VL of the first constraining scFv domain of (iii) are linked via a first CNCL. . In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. including. In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH including.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(vii)の第2の制約的scFvドメインの第2のVHと第2のVLとは、第2のCNCLを介して連結される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the second VH and second VL of the second constraining scFv domain of (vii) are linked via a second CNCL. . In some embodiments, in the proteins described herein, the second constraining scFv domain of (vii) comprises, from the N-terminus to the C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL. including. In some embodiments, in the proteins described herein, the second constraining scFv domain of (vii) comprises, from the N-terminus to the C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH including.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. and (vii) the second constrained scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. and (vii) the second constrained scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH and (vii) the second constrained scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含む。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH and (vii) the second constrained scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from the N-terminus to the C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL, wherein the first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from the N-terminus to the C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL, wherein the first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH, wherein a first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVH-第1のCNCL-第1のVLを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) comprises, from N-terminus to C-terminus, first VH-first CNCL-first VL. and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH, wherein a first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from the N-terminus to the C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL, wherein the first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVH-第2のCNCL-第2のVLを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from the N-terminus to the C-terminus, a second VH-a second CNCL-a second VL, wherein the first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH, wherein a first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第1のVL-第1のCNCL-第1のVHを含み、かつ(vii)の第2の制約的scFvドメインは、N末端からC末端まで、第2のVL-第2のCNCL-第2のVHを含み、ここで、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first constraining scFv domain of (iii) is arranged from N-terminus to C-terminus: first VL-first CNCL-first VH and (vii) the second restrictive scFv domain comprises, from N-terminus to C-terminus, a second VL-a second CNCL-a second VH, wherein a first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、少なくとも1つのプロテアーゼによって切断されるアミノ酸配列を含む少なくとも1つのプロテアーゼ切断部位を含む。場合によっては、本明細書に記載するタンパク質は、少なくとも1つのプロテアーゼによって切断される、1、2、3または4個以上のプロテアーゼ切断部位を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、少なくとも1つのプロテアーゼによって切断される、2個のプロテアーゼ切断部位を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iv)の第1の切断可能リンカー及び(viii)の第2の切断可能リンカーは異なる(例えば、異なるプロテアーゼによって切断可能であるか、または単一のプロテアーゼによって切断可能であるが、異なるアミノ酸配列を有する)。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iv)の第1の切断可能リンカー及び(viii)の第2の切断可能リンカーは同じである(すなわち、単一のプロテアーゼによって切断可能である)。 In some embodiments, the proteins described herein include at least one protease cleavage site that includes an amino acid sequence that is cleaved by at least one protease. In some cases, the proteins described herein contain one, two, three, or more protease cleavage sites that are cleaved by at least one protease. In some embodiments, the proteins described herein include two protease cleavage sites that are cleaved by at least one protease. In some embodiments, in the proteins described herein, the first cleavable linker of (iv) and the second cleavable linker of (viii) are different (e.g., cleavable by different proteases or , or cleavable by a single protease, but with a different amino acid sequence). In some embodiments, in the proteins described herein, the first cleavable linker of (iv) and the second cleavable linker of (viii) are the same (i.e., cleavable by a single protease). possible).

プロテアーゼは、いくつかの疾患細胞及び疾患組織、例えばプロテアーゼが豊富な微小環境、すなわちプロテアーゼリッチ微小環境を生成する腫瘍細胞またはがん細胞によって分泌されることが知られている。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iv)の第1の切断可能リンカー及び/または(viii)の第2の切断可能リンカーは、対象の血液中のプロテアーゼによって切断可能である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iv)の第1の切断可能リンカー及び/または(viii)の第2の切断可能リンカーは、腫瘍が腫瘍微小環境に分泌するプロテアーゼによって切断可能である。プロテアーゼとしては、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギン酸プロテアーゼ、スレオニンプロテアーゼ、グルタミン酸プロテアーゼ、メタロプロテアーゼ、アスパラギンペプチドリアーゼ、血清プロテアーゼ、カテプシン(例えば、カテプシンB、カテプシンC、カテプシンD、カテプシンE、カテプシンK、カテプシンL、カテプシンS)、カリクレイン、hK1、hK10、hK15、KLK7、グランザイムB、プラスミン、コラゲナーゼ、IV型コラゲナーゼ、ストロメリシン、XA因子、キモトリプシン様プロテアーゼ、トリプシン様プロテアーゼ、エラスターゼ様プロテアーゼ、サブチリシン様プロテアーゼ、アクチニダイン、ブロメライン、カルパイン、カスパーゼ(例えば、カスパーゼ3)、Mir1-CP、パパイン、HIV-1プロテアーゼ、HSVプロテアーゼ、CMVプロテアーゼ、キモシン、レニン、ペプシン、マトリプターゼ、レグマイン、プラスメプシン、ネペンテシン、メタロエキソペプチダーゼ、メタロエンドペプチダーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼ(MMP)、MMP1、MMP2、MMP3、MMP8、MMP9、MMP13、MMP11、MMP14、メプリン、ウロキナーゼプラスミノーゲン活性化因子(uPA)、エンテロキナーゼ、前立腺特異抗原(PSA、hK3)、インターロイキン-1β変換酵素、トロンビン、FAP(FAP-α)、ジペプチジルペプチダーゼ、及びジペプチジルペプチダーゼIV(DPPIV/CD26)、が挙げられるがこれらに限定されない。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(iv)の第1の切断可能リンカー及び/または(viii)の第2の切断可能リンカーは、MMP9によって切断可能である。(iv)の第1の切断可能リンカー及び/または(viii)の第2の切断可能リンカーとして本明細書に記載するタンパク質で使用され得る切断可能リンカーの非限定的例を、表3に提示する。 Proteases are known to be secreted by some diseased cells and tissues, such as tumor cells or cancer cells that generate a protease-rich microenvironment. In some embodiments, in the proteins described herein, the first cleavable linker of (iv) and/or the second cleavable linker of (viii) are cleavable by a protease in the blood of the subject. It is. In some embodiments, in the proteins described herein, the first cleavable linker of (iv) and/or the second cleavable linker of (viii) is a protease secreted by the tumor into the tumor microenvironment. It can be cut by Proteases include serine protease, cysteine protease, aspartate protease, threonine protease, glutamate protease, metalloprotease, asparagine peptide lyase, serum protease, cathepsin (e.g. cathepsin B, cathepsin C, cathepsin D, cathepsin E, cathepsin K, cathepsin L, cathepsin S), kallikrein, hK1, hK10, hK15, KLK7, granzyme B, plasmin, collagenase, type IV collagenase, stromelysin, factor XA, chymotrypsin-like protease, trypsin-like protease, elastase-like protease, subtilisin-like protease, actinidine, Bromelain, calpain, caspase (e.g. caspase 3), Mir1-CP, papain, HIV-1 protease, HSV protease, CMV protease, chymosin, renin, pepsin, matriptase, legumain, plasmepsin, nepenthesin, metalloexopeptidase, metalloendo Peptidase, matrix metalloprotease (MMP), MMP1, MMP2, MMP3, MMP8, MMP9, MMP13, MMP11, MMP14, meprin, urokinase plasminogen activator (uPA), enterokinase, prostate-specific antigen (PSA, hK3), These include, but are not limited to, interleukin-1β converting enzyme, thrombin, FAP (FAP-α), dipeptidyl peptidase, and dipeptidyl peptidase IV (DPPIV/CD26). In some embodiments, in the proteins described herein, the first cleavable linker of (iv) and/or the second cleavable linker of (viii) are cleavable by MMP9. Non-limiting examples of cleavable linkers that can be used in the proteins described herein as the first cleavable linker of (iv) and/or the second cleavable linker of (viii) are provided in Table 3. .

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(ii)の第1のドメインリンカー及び/または(vi)の第2のドメインリンカーは切断不可能リンカーである。いくつかの実施形態では、(ii)の第1のドメインリンカーは、(vi)の第2のドメインリンカーと同じである。いくつかの実施形態では、(ii)の第1のドメインリンカーは、(vi)の第2のドメインリンカーと異なる。いくつかの実施形態では、ドメインの機能性を維持するために、ドメインを連結させるのに使用されるドメインリンカーは、一般的により長く、(例えば、対象におけるプロテアーゼによって)切断されない可撓性リンカーである。本明細書に記載するタンパク質のドメインリンカーとして使用するのに適しているリンカーの例としては、(GS)n(配列番号303)、(GGS)n(配列番号304)、(GGGS)n(配列番号305)、(GGSG)n(配列番号306)、(GGSGG)n(配列番号307)、または(GGGGS)n(配列番号308)が挙げられるが、これらに限定されない。この際、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である。いくつかの実施形態では、(ii)の第1のドメインリンカー及び/または(vi)の第2のドメインリンカーの長さは、約15アミノ酸である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the first domain linker of (ii) and/or the second domain linker of (vi) is a non-cleavable linker. In some embodiments, the first domain linker in (ii) is the same as the second domain linker in (vi). In some embodiments, the first domain linker in (ii) is different from the second domain linker in (vi). In some embodiments, to maintain domain functionality, the domain linkers used to join the domains are generally longer and flexible linkers that are not cleaved (e.g., by proteases in a subject). be. Examples of linkers suitable for use as domain linkers for the proteins described herein include (GS)n (SEQ ID NO: 303), (GGS)n (SEQ ID NO: 304), (GGGS)n (SEQ ID NO: 303), (GGGS)n (SEQ ID NO: 304), 305), (GGSG)n (SEQ ID NO: 306), (GGSG)n (SEQ ID NO: 307), or (GGGGS)n (SEQ ID NO: 308). In this case, n is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10. In some embodiments, the length of the first domain linker of (ii) and/or the second domain linker of (vi) is about 15 amino acids.

いくつかの実施形態では、本明細書にて開示するタンパク質において、(ix)の半減期延長ドメインは、限定はされないが、HSA結合ドメイン、Fcドメイン、及び小分子を含む、当技術分野において知られている任意の既知の半減期延長ドメインとすることができる。 In some embodiments, in the proteins disclosed herein, the half-life extension domain of (ix) is a domain known in the art, including, but not limited to, HSA binding domains, Fc domains, and small molecules. can be any known half-life extension domain that has been

ヒト血清アルブミン(HSA)(分子質量約67kDa)は、約50mg/mL(600μM)で存在する血漿中で最も豊富なタンパク質であり、ヒトにおいて約20日間の半減期を有する。HSAは、血漿pHを維持する働きをし、コロイド血圧に寄与し、多くの代謝物及び脂肪酸の担体として機能し、血漿中の主要な薬物輸送タンパク質としての役割を果たす。アルブミンとの非共有結合性会合は、短命タンパク質の消失半減期を延長する。例えば、アルブミン結合ドメインをFab断片に組換え融合すると、マウス及びウサギにそれぞれ静脈内投与した際、Fab断片を単独で投与した場合と比較して、in vivoクリアランスが25分の1及び58分の1になり、かつ半減期が26倍及び37倍延長した。別の例では、インスリンが脂肪酸でアシル化されてアルブミンとの会合を促進する場合、ウサギまたはブタに皮下注射されたときに持続的な効果が観察された。まとめると、これらの試験は、アルブミン結合と持続作用との間の関連性を示している。 Human serum albumin (HSA) (molecular mass approximately 67 kDa) is the most abundant protein in plasma, present at approximately 50 mg/mL (600 μM), and has a half-life of approximately 20 days in humans. HSA serves to maintain plasma pH, contributes to colloidal blood pressure, acts as a carrier for many metabolites and fatty acids, and serves as a major drug transport protein in the plasma. Non-covalent association with albumin extends the elimination half-life of short-lived proteins. For example, recombinant fusion of an albumin-binding domain to a Fab fragment results in 25-fold and 58-fold lower in vivo clearance than the Fab fragment alone when administered intravenously to mice and rabbits, respectively. 1, and the half-life was extended by 26 and 37 times. In another example, when insulin is acylated with fatty acids to promote association with albumin, sustained effects were observed when injected subcutaneously into rabbits or pigs. Collectively, these studies demonstrate a link between albumin binding and sustained action.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、(xi)の半減期延長ドメインは、HSAに特異的に結合するドメインを含む。いくつかの実施形態では、HSA結合ドメインは、ペプチドである。さらなる実施形態では、HSA結合ドメインは、小分子である。抗原結合タンパク質のHSA結合ドメインが、いくつかのの実施形態では、かなり小さく、25kD以下、20kD以下、15kD以下、または10kD以下であることが企図される。ある特定の例では、HSA結合ドメインは、それがペプチドまたは小分子である場合、5kD以下である。 In some embodiments, in the proteins described herein, the half-life extension domain of (xi) comprises a domain that specifically binds HSA. In some embodiments, the HSA binding domain is a peptide. In further embodiments, the HSA binding domain is a small molecule. It is contemplated that the HSA binding domain of the antigen binding protein is, in some embodiments, quite small, no more than 25 kD, no more than 20 kD, no more than 15 kD, or no more than 10 kD. In certain examples, the HSA binding domain is 5 kD or less if it is a peptide or small molecule.

いくつかの実施形態では、半減期延長ドメインは、HSAに結合するsdABDからの単一ドメイン抗原結合ドメインである。HSAに結合するsdABDの非限定的例を、表3に提示する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質において、HSAに結合する(ix)の第3のsdABDは、配列番号217に記載されているCDR1、配列番号218に記載されているCDR2、及び配列番号219に記載されているCDR3を含む。いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列と少なくとも80%(例えば、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the half-life extension domain is a single domain antigen binding domain from sdABD that binds HSA. Non-limiting examples of sdABDs that bind HSA are presented in Table 3. In some embodiments, in the proteins described herein, the third sdABD of (ix) that binds HSA is CDR1 set forth in SEQ ID NO: 217, CDR2 set forth in SEQ ID NO: 218, and CDR3 set forth in SEQ ID NO: 219. In some embodiments, the third sdABD of (ix) has at least 80% (e.g., at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99%) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220. ) Contain the same amino acid sequence. In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

タンパク質の半減期延長ドメインは、抗原結合タンパク質自体の改変した薬理動態及び薬物動態を提供する。上記のとおり、半減期延長ドメインは消失半減期を延長する。半減期延長ドメインはまた、抗原結合タンパク質の組織分布、浸透及び拡散の改変を含む、薬理学的特性を改変させる。いくつかの実施形態では、半減期延長ドメインは、半減期延長結合ドメインを含まないタンパク質と比較して、改善された組織(腫瘍を含む)標的化、組織浸透、組織分布、組織内の拡散及び増強した有効性を提供する。一実施形態では、治療法は、低減した量の抗原結合タンパク質を効果的かつ効率的に利用し、サイトカイン放出症候群またはサイトカインストームの可能性の低減など、副作用の低減をもたらす。 Half-life extending domains of proteins provide altered pharmacokinetics and pharmacokinetics of the antigen binding protein itself. As mentioned above, half-life extension domains extend elimination half-life. The half-life extension domain also alters the pharmacological properties of the antigen binding protein, including altering its tissue distribution, penetration, and diffusion. In some embodiments, the extended half-life domain provides improved tissue (including tumor) targeting, tissue penetration, tissue distribution, diffusion within tissues and Provides enhanced effectiveness. In one embodiment, the therapeutic method effectively and efficiently utilizes reduced amounts of antigen binding protein, resulting in reduced side effects, such as reduced likelihood of cytokine release syndrome or cytokine storm.

さらに、半減期延長ドメイン、例えば、HSA結合ドメインの特徴は、HSAに対するHSA結合ドメインの結合親和性を含む。上記HSA結合ドメインの親和性は、特定のポリペプチド構築物における特定の消失半減期を目標とするように選択され得る。したがって、いくつかの実施形態では、HSA結合ドメインは、高い結合親和性を有する。他の実施形態では、HSA結合ドメインは、中程度の結合親和性を有する。さらに他の実施形態では、HSA結合ドメインは、低いまたはわずかな結合親和性を有する。例示的な結合親和性は、10nM以下(高)、10nM~100nM(中)、及び100nM超(低)のKD濃度を含む。上記のとおり、HSAへの結合親和性は、表面プラズモン共鳴(SPR)などの既知の方法によって決定される。 Additionally, characteristics of the half-life extension domain, eg, the HSA binding domain, include the binding affinity of the HSA binding domain for HSA. The affinity of the HSA binding domain can be selected to target a particular elimination half-life in a particular polypeptide construct. Thus, in some embodiments, the HSA binding domain has high binding affinity. In other embodiments, the HSA binding domain has intermediate binding affinity. In yet other embodiments, the HSA binding domain has low or negligible binding affinity. Exemplary binding affinities include KD concentrations of 10 nM or less (high), 10 nM to 100 nM (medium), and greater than 100 nM (low). As mentioned above, binding affinity to HSA is determined by known methods such as surface plasmon resonance (SPR).

加えて、特定のABDのC末端配列に由来するヒトにおける免疫原性が存在し得ることは、当技術分野において既知である。したがって、一般的に、特にタンパク質のC末端がsdABD(例えば、多くの構築物のsdABD-HSAドメイン)で終わる場合、患者の自然免疫系によるタンパク質のクリアランスの可能性を低減するためにC末端キャッピング配列が加えられる。切断後、残りのリンカーのアミノ酸は、ヒト血清抗体に対抗するブロッキングペプチドとして機能する。C末端キャッピング配列の非限定的例については、参照により本明細書に援用される米国特許第10858418にて提示されている。 Additionally, it is known in the art that there may be immunogenicity in humans from the C-terminal sequence of certain ABDs. Therefore, C-terminal capping sequences are generally used to reduce the likelihood of clearance of the protein by the patient's innate immune system, especially when the C-terminus of the protein ends in sdABD (e.g., the sdABD-HSA domain of many constructs). is added. After cleavage, the remaining linker amino acids function as a blocking peptide against human serum antibodies. Non-limiting examples of C-terminal capping sequences are provided in US Pat. No. 1,085,8418, which is incorporated herein by reference.

いくつかの実施形態では、ヒスチジンタグ(His6またはHis10のいずれか)が、使用される場合がある。本明細書に記載するタンパク質のうち任意の1つ(例えば、表3に列挙した配列番号234~249のうち任意の1つのアミノ酸配列を含むタンパク質)は、精製の目的で(例えば、C末端において)His6C末端タグをさらに含む場合があるが、これらの配列は、参照により本明細書に援用される、Hollandら、DOI 10.1007/s10875-013-9915-0及び米国特許第10808040号に記載されているように、ヒトにおける免疫原性を低減するために使用することもできる。 In some embodiments, a histidine tag (either His6 or His10) may be used. Any one of the proteins described herein (e.g., a protein comprising an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 234-249 listed in Table 3) may be used for purification purposes (e.g., at the C-terminus). ), which sequences are described in Holland et al., DOI 10.1007/s10875-013-9915-0 and US Pat. No. 10808040, which are incorporated herein by reference. It can also be used to reduce immunogenicity in humans, as has been described.

本明細書に記載するプロドラッグ形態でのタンパク質の非限定的例について、以下に提示する。 Non-limiting examples of proteins in prodrug form as described herein are provided below.

A. 構成1(例えば、表3のPro1136、Pro1184、Pro1265、Pro1267、及びPro1269)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのN末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3からなる群から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのN末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
A. Configuration 1 (e.g., Pro1136, Pro1184, Pro1265, Pro1267, and Pro1269 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the N-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from the group consisting of B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the N-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD3であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第1のVLのN末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the N-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD28であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第2のVLのN末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD28, and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the N-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号234、242、244、246、及び248のうち任意の1つと少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号234、242、244、246、及び248のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号234、242、244、246、及び248のうち任意の1つのアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein has at least 85% (e.g., at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) contain identical amino acid sequences. In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 234, 242, 244, 246, and 248. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 234, 242, 244, 246, and 248.

B. 構成2(例えば、表3のPro1137)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのN末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのC末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
B. Configuration 2 (e.g. Pro1137 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the N-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the C-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD3であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第1のVLのN末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the N-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD28であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第2のVLのC末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD28, and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the C-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号235と少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号235のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号235のアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence that is at least 85% (eg, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) identical to SEQ ID NO: 235. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 235. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 235.

C. 構成3(例えば、表3のPro1138)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのC末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのN末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
C. Configuration 3 (e.g. Pro1138 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the C-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the N-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD3であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第1のVLのC末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the C-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD28であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第2のVLのN末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD28, and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the N-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号236と少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号236のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号236のアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence that is at least 85% (eg, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) identical to SEQ ID NO: 236. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236.

D. 構成4(例えば、表3のPro1139)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのC末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのC末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
D. Configuration 4 (e.g. Pro1139 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the C-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the C-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD3であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第1のVLのC末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the C-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD28であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第2のVLのC末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD28, and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the C-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号239と少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号239のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号239のアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence that is at least 85% (eg, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) identical to SEQ ID NO: 239. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 239. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 239.

E. 構成5(例えば、表3のPro1140、Pro1192、Pro1266、Pro1268、及びPro1270)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのN末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのN末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
E. Configuration 5 (e.g., Pro1140, Pro1192, Pro1266, Pro1268, and Pro1270 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the N-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the N-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD28であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第1のVLのN末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the N-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD3であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第2のVLのN末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD3, and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the N-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号238、243、245、247、及び249のうち任意の1つと少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号Pro1140、Pro1192、Pro1266、Pro1268、及びPro1270のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号Xのうち任意の1つのアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein has at least 85% (e.g., at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) contain identical amino acid sequences. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: Pro1140, Pro1192, Pro1266, Pro1268, and Pro1270. In some embodiments, the protein is comprised of any one amino acid sequence of SEQ ID NO:X.

F. 構成6(例えば、表3のPro1141)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのC末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3からなる群から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのN末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
F. Configuration 6 (e.g. Pro1141 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the C-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from the group consisting of B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the N-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD28であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第1のVLのC末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the C-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD3であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第2のVLのN末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD3, and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the N-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号239と少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号239のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号239のアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence that is at least 85% (eg, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) identical to SEQ ID NO: 239. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 239. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 239.

G. 構成(例えば、表3のPro1142)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのN末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのC末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
G. Configuration (e.g. Pro1142 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the N-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the C-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD28であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第1のVLのN末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the N-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD3であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第2のVLのC末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD3 and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the C-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号240と少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号240のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号240のアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence that is at least 85% (eg, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) identical to SEQ ID NO: 240. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 240. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 240.

H. 構成(例えば、表3のPro1143)
いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質は、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第1のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(iii)第1のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第1のVLのC末端に連結された第1のVHを含む第1の制約的scFvドメインであって、該第1のVHと該第1のVLとが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD28)に結合しない、第1の制約的scFvドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(v)第2のヒトTTAに結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)であって、該第2のヒトTTAは、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3からなる群から選択される、第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカー(例えば、切断不可能リンカー)と、
(vii)第2のCNCL(例えば、長さが8アミノ酸であるCNCL)を介して第2のVLのC末端に連結された第2のVHを含む第2の制約的scFvドメインであって、該第2のVHと該第2のVLとが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原(例えば、CD3)に結合しない、第2の制約的scFvドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカー(例えば、MMP9切断部位またはその多様体など、表3に提示するプロテアーゼ切断部位を含む切断可能リンカー)と、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
H. Configuration (e.g. Pro1143 in Table 3)
In some embodiments, the proteins described herein include, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA), the first human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3; a first single domain antigen binding domain (sdABD) selected from FOLR1, EpCAM, and B7H3;
(ii) a first domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(iii) a first constrained scFv domain comprising a first VH linked to the C-terminus of the first VL via a first CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the first VH and the first VL are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen (e.g., CD28), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind a first human immune cell antigen (e.g., CD28); a restrictive scFv domain;
(iv) a first cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site as provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds to a second human TTA, the second human TTA comprising EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM, and a second single domain antigen binding domain (sdABD) selected from the group consisting of B7H3;
(vi) a second domain linker (e.g., a non-cleavable linker);
(vii) a second constrained scFv domain comprising a second VH linked to the C-terminus of the second VL via a second CNCL (e.g., a CNCL that is 8 amino acids in length); When the second VH and the second VL are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen (e.g., CD3), but not the first heavy chain variable region. the first light chain variable region is not associated within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind a second human immune cell antigen (e.g., CD3); a restrictive scFv domain;
(viii) a second cleavable linker (e.g., a cleavable linker comprising a protease cleavage site provided in Table 3, such as an MMP9 cleavage site or a variant thereof);
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じである。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと同じであり、かつ第1のsdABDは、第2のsdABDとは異なるTTAのエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のTTAは、第2のTTAと異なる。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはEGFRであり、第2のTTAはHER2である。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはEGFRである。いくつかの実施形態では、第1のTTAはHER2であり、第2のTTAはHER2である。 In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA. In some embodiments, the first TTA is the same as the second TTA and the first sdABD binds a different epitope of the TTA than the second sdABD. In some embodiments, the first TTA is different than the second TTA. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is EGFR and the second TTA is HER2. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is EGFR. In some embodiments, the first TTA is HER2 and the second TTA is HER2.

いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(v)の第2のsdABDは、配列番号5、配列番号9、または配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、(i)の第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、(v)の第2のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 9, or SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:5. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:9. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. In some embodiments, the first sdABD of (i) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96 and the second sdABD of (v) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD28であり、(iii)の第1の制約的scFvドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む第1のVLのC末端に融合された、配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含む第1のVHを含む。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28, and the first restrictive scFv domain of (iii) is fused to the C-terminus of the first VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. and a first VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216.

いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD3であり、(vii)の第2の制約的scFvドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む第2のVLのC末端に融合された、配列番号205のアミノ酸配列を含む第2のVHを含む。 In some embodiments, the second immune cell antigen is CD3 and the second restrictive scFv domain of (vii) is fused to the C-terminus of a second VL comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206. It also includes a second VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205.

いくつかの実施形態では、(ix)の第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。 In some embodiments, the third sdABD of (ix) comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220.

いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号241と少なくとも85%(例えば、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%)同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号241のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、配列番号241のアミノ酸配列で構成される。 In some embodiments, the protein comprises an amino acid sequence that is at least 85% (eg, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, or at least 99%) identical to SEQ ID NO: 241. In some embodiments, the protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 241. In some embodiments, the protein is comprised of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 241.

III. 生成方法
いくつかの態様において、本開示は、本明細書に記載するタンパク質のうち任意の1つをコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、核酸分子は、ベクターである。いくつかの実施形態では、核酸分子は、発現ベクター(例えば、ヒト細胞などの哺乳動物細胞でのタンパク質の発現に適した発現ベクター)である。
III. Methods of Production In some embodiments, the present disclosure provides nucleic acid molecules that include a nucleotide sequence encoding any one of the proteins described herein. In some embodiments, the nucleic acid molecule is a vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule is an expression vector (eg, an expression vector suitable for expression of a protein in mammalian cells, such as human cells).

当業者によって理解されるように、核酸組成物は、タンパク質の形態によって決まる。概して、本明細書に記載するタンパク質は、生成用の単一の発現ベクター内の単一の核酸分子によってコードされる。 As will be understood by those skilled in the art, nucleic acid composition depends on the form of the protein. Generally, the proteins described herein are encoded by a single nucleic acid molecule within a single expression vector for production.

当技術分野で既知のように、タンパク質の構成要素をコードする核酸は、本明細書にて開示するプロドラッグ組成物を生成するために使用される宿主細胞に応じて、発現ベクターに組み込むことができる。一般的に、核酸は、任意の数の調節要素(プロモーター、複製起点、選択可能なマーカー、リボソーム結合部位、誘導因子など)に作動可能に連結されている。発現ベクターは、染色体外または組み込みベクターであり得る。 As is known in the art, nucleic acids encoding protein components can be incorporated into expression vectors depending on the host cell used to produce the prodrug compositions disclosed herein. can. Generally, the nucleic acid is operably linked to any number of regulatory elements (promoters, origins of replication, selectable markers, ribosome binding sites, inducers, etc.). Expression vectors can be extrachromosomal or integrated vectors.

次いで、本明細書にて開示するプロドラッグをコードする核酸及び/または発現ベクターは、多くの実施形態で使用される哺乳動物細胞(例えば、CHO細胞、293細胞)で、哺乳動物、細菌、酵母、昆虫及び/または真菌細胞を含む、当技術分野において知られている任意の数の異なる型の宿主細胞に形質転換される。 Nucleic acids and/or expression vectors encoding the prodrugs disclosed herein are then isolated in mammalian cells (e.g., CHO cells, 293 cells) used in many embodiments, in mammalian, bacterial, yeast cells. The host cells may be transformed into any number of different types of host cells known in the art, including insect, insect, and/or fungal cells.

本明細書に記載するプロドラッグ組成物は、発現ベクター(複数可)を含む宿主細胞を培養することによって生成される。一旦生成されると、タンパク質Aアフィニティークロマトグラフィー工程及び/またはイオン交換クロマトグラフィー工程を含む、従来の抗体精製工程が行われる。 The prodrug compositions described herein are produced by culturing host cells containing the expression vector(s). Once produced, conventional antibody purification steps are performed, including protein A affinity chromatography steps and/or ion exchange chromatography steps.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質の活性は、共刺激アッセイによって測定することができる。例えば、健康なドナーから単離されたヒトT細胞は、事前にCell Trace Violetで標識され、次いで、様々な濃度で抗体またはタンパク質と共に、標的保有ビーズと共に、またはプレート上でインキュベートされる。増殖は、FACSによる染色の比例損失によって測定することができる。 In some embodiments, the activity of the proteins described herein can be measured by costimulatory assays. For example, human T cells isolated from healthy donors are prelabeled with Cell Trace Violet and then incubated with antibodies or proteins at various concentrations, with target-bearing beads, or on plates. Proliferation can be measured by proportional loss of staining by FACS.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質の活性は、T細胞依存性細胞傷害活性アッセイを介して測定することができる。例えば、健康なドナーから単離されたヒトT細胞は、様々な濃度でタンパク質と共に、ホタルルシフェラーゼで事前に標識された標的保有腫瘍細胞株と共に、インキュベートされ得る。細胞傷害作用は、照度計を使用してルシフェラーゼレベルの変化を観察することによって測定することができる。 In some embodiments, the activity of the proteins described herein can be measured via a T cell-dependent cytotoxic activity assay. For example, human T cells isolated from a healthy donor can be incubated with the protein at various concentrations and with a target-bearing tumor cell line pre-labeled with firefly luciferase. Cytotoxic effects can be measured by observing changes in luciferase levels using a luminometer.

IV. 組成物及び使用方法
本開示は、いくつかの態様において、本明細書に記載するタンパク質のうち任意の1つ以上を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質を含む組成物は、所望の純度を有するタンパク質を、任意の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤と混合することによって(概して、Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.[1980]で概説されているように)、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、保存向けに調製される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載するタンパク質を含む組成物は、例えば、疾病(例えば、がん)の治療のための、対象への投与向けに調製される。
IV. Compositions and Methods of Use The present disclosure provides, in some aspects, compositions that include any one or more of the proteins described herein. In some embodiments, a composition comprising a protein described herein is prepared by mixing a protein having a desired purity with any pharmaceutically acceptable carrier, excipient, or stabilizer. They are prepared for storage (as generally reviewed in Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. [1980]) in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions. In some embodiments, compositions comprising proteins described herein are prepared for administration to a subject, eg, for the treatment of a disease (eg, cancer).

本開示の他の態様は、本明細書に記載するタンパク質を含む組成物を、それを必要とする対象に投与することによる、がんを治療する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載する対象への投与向けの組成物は、第1のタンパク質及び第2のタンパク質を含み、ここで、該第1のタンパク質及び該第2のタンパク質は、同じ(同一の構築物)であり、第1のタンパク質及び第2のタンパク質のそれぞれは、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカーと、
(v)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカーと、
(vii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカーと、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
(iii)の第1の重鎖可変領域が(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
(vii)の第2の重鎖可変領域が(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、第1の免疫細胞抗原または第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する。
Other aspects of the disclosure provide methods of treating cancer by administering a composition comprising the proteins described herein to a subject in need thereof. In some embodiments, a composition described herein for administration to a subject comprises a first protein and a second protein, wherein the first protein and the second protein are , are the same (identical construct), and each of the first protein and the second protein has, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to a first human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
(iv) a first cleavable linker;
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(vi) a second domain linker;
(vii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to a second human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of
(viii) a second cleavable linker;
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii), and the variable fragment (Fv ),
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii), and the variable fragment (Fv ) to form.

いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原は、CD3またはCD28である。いくつかの実施形態では、第2の免疫細胞抗原は、CD3またはCD28である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はCD3であり、第2の免疫細胞抗原はCD28である。いくつかの実施形態では、第1の免疫細胞抗原はCD28であり、第2の免疫細胞抗原はCD3である。 In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3 or CD28. In some embodiments, the second immune cell antigen is CD3 or CD28. In some embodiments, the first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28. In some embodiments, the first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3.

いくつかの実施形態では、第1の切断可能リンカー及び第2の切断可能リンカーのそれぞれは、対象の腫瘍微小環境に存在するプロテアーゼの切断部位(例えば、MMP9切断部位)を含む。 In some embodiments, each of the first cleavable linker and the second cleavable linker includes a cleavage site for a protease present in the tumor microenvironment of the subject (eg, an MMP9 cleavage site).

いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質内の(iv)の第1の切断可能リンカー及び(viii)の第2の切断可能リンカーが切断されると、第1のタンパク質の第1の重鎖可変領域が第2のタンパク質の第1の軽鎖可変領域と会合し、第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性結合部位を形成し、第1のタンパク質の第1の軽鎖可変領域が第2のタンパク質の第1の重鎖可変領域と会合し、第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性結合部位を形成し、第1のタンパク質の第2の重鎖可変領域が第2のタンパク質の第2の軽鎖可変領域と会合し、第2のヒト免疫細胞抗原に結合する活性結合部位を形成し、かつ第1のタンパク質の第2の軽鎖可変領域が第2のタンパク質の第2の重鎖可変領域に会合し、第2のヒト免疫細胞抗原に結合する活性結合部位を形成する。そのようなものであるから、プロドラッグ(不活性)タンパク質の切断断片が集合して2つのホモ二量体(第1のホモ二量体及び第2のホモ二量体)を構築し、各ホモ二量体はTTA及び免疫細胞抗原に結合可能な二重特異性分子となる。 In some embodiments, when the first cleavable linker of (iv) and the second cleavable linker of (viii) in the first protein and the second protein are cleaved, the The first heavy chain variable region associates with the first light chain variable region of the second protein to form an active binding site that binds to the first human immune cell antigen; the chain variable region associates with the first heavy chain variable region of the second protein to form an active binding site that binds to the first human immune cell antigen; associates with a second light chain variable region of a second protein to form an active binding site that binds to a second human immune cell antigen; It associates with the second heavy chain variable region of the protein and forms an active binding site that binds a second human immune cell antigen. As such, the truncated fragments of the prodrug (inactive) protein assemble to construct two homodimers (a first homodimer and a second homodimer), each The homodimer becomes a bispecific molecule capable of binding TTA and immune cell antigens.

いくつかの実施形態では、第1のホモ二量体は、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、第1の制約的scFvドメインが第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含む第1のポリペプチドのホモ二量体化を介して形成され(プロドラッグタンパク質の切断生成物)、
該第1のホモ二量体において、一方のポリペプチドの第1のVHが他方のポリペプチドの第1のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの第1のVLが他方のポリペプチドの第1のVHと会合し、それぞれが第1の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する。
In some embodiments, the first homodimer is
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the first heavy chain variable region and the first light chain variable region are associated, they are capable of binding a first human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to a first human immune cell antigen. a constrained single chain variable fragment (scFv) domain of (a cleavage product of a prodrug protein);
In the first homodimer, the first VH of one polypeptide is associated with the first VL of the other polypeptide, and the first VL of one polypeptide is associated with the first VL of the other polypeptide. one VH to form two active variable fragments (Fv), each capable of binding the first immunizing antigen.

いくつかの実施形態では、第2のホモ二量体は、
(i)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第2のドメインリンカーと、
(iii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、該第2の重鎖可変領域と該第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、該第1の重鎖可変領域と該第1の軽鎖可変領域とが第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、第2の制約的scFvドメインが第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含む第2のポリペプチドのホモ二量体化を介して形成され(プロドラッグタンパク質の切断生成物)、
該第2のホモ二量体において、一方のポリペプチドの第2のVHが他方のポリペプチドの第2のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの第2のVLが他方のポリペプチドの第2のVHと会合し、それぞれが第2の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する。
In some embodiments, the second homodimer is
(i) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(ii) a second domain linker;
(iii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the first light chain variable region do not associate within a second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to a second human immune cell antigen. (cleavage product of the prodrug protein);
In the second homodimer, the second VH of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide, and the second VL of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide. 2 VHs to form two active variable fragments (Fv), each capable of binding a second immunizing antigen.

いくつかの実施形態では、本明細書に記載する組成物は、1つ以上の適切な投与経路を介して、当技術分野において知られている種々の方法のうち1つ以上を使用して、それを必要とする対象に投与される。投与経路及び/または投与様式は、所望の結果に応じて変動するであろう。許容可能な投与経路とは、目的の治療的使用と併せて臨床医によって考慮され得る当技術分野において知られている任意の投与経路、例えば、典型的には目的の作用部位への注射または目的の作用部位に連通する注射に関連する非経口投与(例えば、静脈内投与)によるものを指す場合がある。 In some embodiments, the compositions described herein are administered via one or more suitable routes of administration using one or more of a variety of methods known in the art. It is administered to a subject who needs it. The route and/or mode of administration will vary depending on the desired result. Acceptable routes of administration include any route of administration known in the art that may be considered by the clinician in conjunction with the intended therapeutic use, such as injection or administration, typically at the intended site of action. may refer to parenteral administration (e.g., intravenous administration) involving injection that communicates with the site of action of

いくつかの実施形態では、組成物は、1回または複数回、同じ対象に投与される。 In some embodiments, the composition is administered to the same subject one or more times.

本明細書で使用する場合、用語「治療」、「治療すること」または「治療法」、及びその文法的変形は、当業者によって一般に理解されているものと同じ意味を有する。いくつかの実施形態では、これらの用語は、有益な臨床結果または所望の臨床結果を得るためのアプローチを指す。この用語は、病態、障害または疾患の発症または発症速度を遅らせること、それに関連する症状を低減または軽減すること、病態の完全なまたは部分的な後退を引き起こすこと、または上記のいずれかの組み合わせを指す場合がある。本開示の目的のために、有益な臨床結果または所望の臨床結果としては、検出可能または検出不可能にかかわらず、症状の軽減または緩和、疾患の程度の減弱、疾患状態の安定化(例えば、悪化しないこと)、疾患進行の遅延または緩徐化、疾患状態の緩和または緩解、及び(部分的であるか完全であるかにかかわらず)寛解が挙げられるが、これに限定されない。「治療」、「治療すること」または「治療法」はまた、治療を受けていない場合に予想される生存期間に比べて、生存期間を延長することを含む場合がある。したがって、治療を必要とする対象(例えば、ヒト)は、問題の疾患または障害に既に罹患している対象である場合がある。用語「治療」、「治療すること」または「治療法」には、未治療の状態と比べた、病理学的状態または症状の重症度の増大の阻害または軽減が含まれるが、必ずしも関連する疾患または病態の完全な休止を意味するわけではない。 As used herein, the terms "therapy," "treating," or "therapy," and grammatical variations thereof, have the same meanings as commonly understood by those of ordinary skill in the art. In some embodiments, these terms refer to an approach to obtaining a beneficial or desired clinical result. This term refers to slowing the onset or rate of development of a condition, disorder or disease, reducing or alleviating the symptoms associated therewith, causing complete or partial regression of the condition, or any combination of the above. It may refer to For purposes of this disclosure, beneficial or desired clinical outcomes include reducing or alleviating symptoms, attenuating the extent of the disease, stabilizing the disease state, whether detectable or undetectable, e.g. including, but not limited to, slowing or slowing of disease progression, alleviation or remission of disease status, and remission (whether partial or complete). "Treatment", "treating" or "therapy" may also include prolonging survival as compared to expected survival if not receiving treatment. Thus, a subject (eg, a human) in need of treatment may be one already suffering from the disease or disorder in question. The terms "treatment," "treating," or "therapy" include inhibiting or reducing an increase in the severity of a pathological condition or symptom, but not necessarily the associated disease, as compared to an untreated condition. or does not mean a complete cessation of the pathology.

いくつかの実施形態では、組成物は、有効な量で対象に投与される。「有効な量」とは、本明細書にて開示するような疾患、障害、または病態を治療及び/または予防するのに有効な量である。いくつかの実施形態では、有効な量とは、ターゲットの病態の予防もしくは治療、または病態に関連する症状の有益な軽減など、少なくとも1つの所望の治療効果を対象において生じさせる組成物(例えば、治療組成物、化合物、または薬剤)の量または用量である。この量は、種々の要因に応じて変化し、そのような要因としては、治療組成物の特性(活性、薬物動態、薬理動態、及びバイオアベイラビリティを含む)、対象の生理学状態(年齢、性別、疾患の種類、病期、全身の身体的状態、所与の投薬量に対する反応性、及び薬物の種類を含む)、製剤における薬学的に許容される担体(複数可)の性質、及び投与経路が挙げられるがこれらに限定されない。臨床及び薬理学的分野の当業者であれば、例えば、組成物の投与に対する対象の反応をモニタリングし、それに応じて投薬量を調節することによって、有効な量を評価できるであろう(例えば、Remington:The Science and Practice of Pharmacy(Gennaro A,ed.,Mack Publishing Co.,Easton,PA,U.S.,19th ed.,1995)を参照されたい)。 In some embodiments, the composition is administered to the subject in an effective amount. An "effective amount" is an amount effective to treat and/or prevent a disease, disorder, or condition as disclosed herein. In some embodiments, an effective amount refers to a composition that produces at least one desired therapeutic effect in a subject, such as prevention or treatment of the target condition, or beneficial alleviation of symptoms associated with the condition (e.g., therapeutic composition, compound, or drug). This amount will vary depending on a variety of factors, including the characteristics of the therapeutic composition (including activity, pharmacokinetics, pharmacodynamics, and bioavailability), the physiological state of the subject (age, gender, the nature of the pharmaceutically acceptable carrier(s) in the formulation, and the route of administration. These include, but are not limited to: Those skilled in the clinical and pharmacological arts will be able to assess the effective amount, for example, by monitoring the subject's response to administration of the composition and adjusting the dosage accordingly (e.g., Remington: The Science and Practice of Pharmacy (Gennaro A, ed., Mack Publishing Co., Easton, PA, U.S., 19th ed., 1995).

本明細書で使用する場合、用語「対象」とは、任意の生物、一般的には、ヒト及び動物などの哺乳動物対象を指す。用語「対象」及び「患者」は、同じ意味で用いられる。いくつかの実施形態では、対象は、霊長類(例えば、ヒトもしくは非ヒト霊長類)、または家畜(例えば、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギなど)などの哺乳動物である。 As used herein, the term "subject" refers to any living organism, generally a mammalian subject, such as humans and animals. The terms "subject" and "patient" are used interchangeably. In some embodiments, the subject is a mammal, such as a primate (eg, human or non-human primate) or a domestic animal (eg, cow, horse, pig, sheep, goat, etc.).

実施例1:CD3及びCD28免疫細胞結合ドメインを含む条件付き活性多重特異性免疫細胞エンゲージャー
本実施例では、本明細書に記載する条件付き活性多重特異性タンパク質の切断によって生成される活性ホモ二量体が、T細胞増殖を誘導し、かつがん細胞を死滅させることができることを実証する。
Example 1: A conditionally active multispecific immune cell engager comprising CD3 and CD28 immune cell binding domains. We demonstrate that the peptide is capable of inducing T cell proliferation and killing cancer cells.

最近の研究で、腫瘍標的抗原結合ドメイン及び免疫細胞結合ドメインを含む二重特異性分子を使用して、T細胞を腫瘍に動員させることができることが明らかとなっている。これらの二重特異性分子には、臨床の場にそれらを実装する際に少なくとも2つの課題がある。第1に、多くの二重特異性分子が腫瘍微小環境の外側で活性化し、それにより好ましくない副作用が生じる。第2に、動員されたT細胞は、疲弊し始め、それによりがん細胞を死滅させるT細胞の能力が低下する。 Recent studies have shown that bispecific molecules containing tumor targeting antigen binding domains and immune cell binding domains can be used to recruit T cells to tumors. These bispecific molecules present at least two challenges in implementing them in clinical settings. First, many bispecific molecules are activated outside the tumor microenvironment, resulting in undesirable side effects. Second, the recruited T cells begin to become exhausted, thereby reducing their ability to kill cancer cells.

この場合に、条件付き活性多重特異性タンパク質を、これらの課題を克服するために設計して、試験した。これらの多重特異性タンパク質は、腫瘍関連プロテアーゼによって切断されると腫瘍微小環境で活性化されるプロドラッグである。これらのタンパク質は、標的腫瘍抗原抗体結合ドメイン(TTA-ABD)及び条件付き活性αCD3及びαCD28免疫細胞結合ドメインを含む。以下に示すように、CD3及びCD28の結合により、T細胞増殖が増加し、かつがん死滅効力が増大する。 In this case, conditionally active multispecific proteins were designed and tested to overcome these challenges. These multispecific proteins are prodrugs that become active in the tumor microenvironment upon cleavage by tumor-associated proteases. These proteins include target tumor antigen antibody binding domains (TTA-ABD) and conditionally active αCD3 and αCD28 immune cell binding domains. As shown below, binding of CD3 and CD28 increases T cell proliferation and increases cancer killing efficacy.

概して、CD3結合ドメイン(「Fv」)は、従来よりFvを形成するCD3可変重ドメインとCD3可変軽ドメインとの間のリンカーが短すぎるため、2つの活性可変ドメインが分子内で互いに結合することができない制約的形態であり、これは、「制約的切断不可能リンカー」(CNCL)と呼ばれる。これは、「抗CD3制約的Fv」と呼ばれる。同様に、プロドラッグ(例えば、切断されていない)形態では、タンパク質は、抗CD28可変重ドメインと抗CD28可変軽ドメインとの間のCNCLリンカーが短すぎるために、2つの活性可変ドメインが分子内で互いに結合することができない状態の、同じく制約的形態の抗CD28Fvドメインも含む。これは、「抗CD28制約的Fv」と呼ばれる。 In general, CD3 binding domains (“Fv”) are traditionally characterized by the fact that the linker between the CD3 variable heavy domain and the CD3 variable light domain that forms the Fv is too short, allowing the two active variable domains to bind to each other intramolecularly. This is called a "constraint non-cleavable linker" (CNCL). This is called "anti-CD3-restricted Fv." Similarly, in its prodrug (e.g., uncleaved) form, the protein has a CNCL linker between the anti-CD28 variable heavy and anti-CD28 variable light domains that is too short so that the two active variable domains are intramolecularly It also contains anti-CD28 Fv domains, also in a restricted form, incapable of binding to each other. This is called "anti-CD28 restricted Fv".

可変重(VH)ドメインと可変軽(VL)ドメインとは、対となることが好ましい。理論に縛られることなく、本明細書では、以下に提示しかつ説明するin vitro及びin vivoデータによって裏付けられるように、図1Aのタンパク質は、抗CD3制約的Fv VHが抗CD28制約的Fv VLと相互作用して、第1の「非生産的Fv」または「不活性Fv」を形成し、かつ抗CD28制約的Fv VHが抗CD3制約的Fv VLと相互作用して、第2の「非生産的Fv」または「不活性Fv」を形成し、それにより安定を保ちながら、いずれの抗原にも結合しないように分子内で構築されるものと考える(図1D)。すなわち、これらの不活性Fvは、VH及びVLの両方を含有するとはいえ、VHがある抗原(例えば、CD3)に特異性のあるCDRを有し、かつVLが異なる抗原(例えば、CD28)に特異性のあるCDRを有することが理由で、それらは抗原に結合不可能である。 Preferably, the variable heavy (VH) domain and the variable light (VL) domain form a pair. Without being bound by theory, the proteins of Figure 1A are shown herein to be similar to the anti-CD3-restricted Fv VH and the anti-CD28-restricted Fv VL, as supported by the in vitro and in vivo data presented and described below. and the anti-CD28-restricted Fv VH interacts with the anti-CD3-restricted Fv VL to form a second "non-productive Fv" or "inactive Fv". It is assumed that the Fv is constructed intramolecularly to form a "productive Fv" or an "inactive Fv", thereby remaining stable and not binding to any antigen (FIG. 1D). That is, although these inactive Fvs contain both a VH and a VL, the VH has a CDR specific for one antigen (e.g., CD3) and the VL has a CDR specific for a different antigen (e.g., CD28). Because they have specific CDRs, they are unable to bind antigens.

腫瘍プロテアーゼの存在下で、切断部位(複数可)が切断され、それにより同一の制約的Fvの分子間ホモ二量体化が可能となり、それぞれ活性抗CD3結合Fv及び活性抗CD28Fvが生じる(図1B~1C)。すなわち、不活性Fvは、ばらばらになり、次いで、抗原に結合できるFvが生じ、それに伴って、例えば、CD3またはCD28のいずれかに対する抗原結合ドメインとなる。切断は、タンパク質がTTA-ABDを介して標的細胞に結合する前または後に起こり得る。 In the presence of tumor protease, the cleavage site(s) are cleaved, thereby allowing intermolecular homodimerization of the same constrained Fv, resulting in active anti-CD3-binding Fv and active anti-CD28 Fv, respectively (Figure 1B-1C). That is, the inactive Fv is broken apart, which then yields an Fv capable of binding antigen and, with it, an antigen binding domain for either CD3 or CD28, for example. Cleavage can occur before or after the protein binds to the target cell via the TTA-ABD.

図2A及び2Bは、切断された(活性化した)タンパク質の作用機序を示す。図2Aでは、2つの新しい構築物、例えば、ホモ二量体抗CD3及びホモ二量体抗CD28が、標的T細胞に結合可能である。この場合、CD8+であるT細胞は活性化して、毒性を高め、疲弊を解消し、IFNγ及び/またはTNFαの一方またはその両方の分泌を増加させることができる。同様に、CD4+のT細胞の場合、これらの細胞は活性化して、増殖を増加させ、分化を増加させ、アポトーシスへの抵抗性を増大させ、かつIFNγ及び/またはIL-2の一方またはその両方の分泌を増加させることができる。本明細書で概説したT細胞エンゲージャーの活性を測定するための好適なアッセイとしては、TDCCアッセイ及びJurkat NFAT Lucアッセイが挙げられる。 Figures 2A and 2B show the mechanism of action of the cleaved (activated) protein. In Figure 2A, two new constructs, eg, homodimeric anti-CD3 and homodimeric anti-CD28, are able to bind to target T cells. In this case, T cells that are CD8+ can be activated to increase toxicity, reverse exhaustion, and increase secretion of IFNγ and/or TNFα. Similarly, in the case of CD4+ T cells, these cells are activated to increase proliferation, increase differentiation, increase resistance to apoptosis, and increase IFNγ and/or IL-2. can increase the secretion of Suitable assays for measuring T cell engager activity as outlined herein include the TDCC assay and the Jurkat NFAT Luc assay.

図2Bでは、抗CD28ホモ二量体が、異なる標的細胞に結合可能である。場合によっては、これらは、細胞傷害作用及びIFNγ分泌を増大させるNK細胞である場合がある。場合によっては、これらは、細胞を刺激し、及び/または成熟を促進する樹状細胞またはマクロファージである場合がある。場合によっては、これらは、T細胞動員を促進する腫瘍内皮細胞である場合がある。CD28活性を評価するための好適なアッセイとしては、HEK CD28アッセイ、NFAT Lucアッセイ、IL2及びIFNγ分泌に対するNK細胞アッセイが挙げられる。 In Figure 2B, anti-CD28 homodimers are able to bind to different target cells. In some cases, these may be NK cells that increase cytotoxicity and IFNγ secretion. In some cases, these may be dendritic cells or macrophages that stimulate the cells and/or promote maturation. In some cases, these may be tumor endothelial cells that promote T cell recruitment. Suitable assays for assessing CD28 activity include the HEK CD28 assay, the NFAT Luc assay, and the NK cell assay for IL2 and IFNγ secretion.

制約的形態の抗CD3VH及びVL、ならびに制約的形態の抗CD28VH及びVLをそれぞれが含む8つの異なるタンパク質多様体について検討した(図3A)。タンパク質多様体は、抗CD28VH及びVLのN末端からC末端への方向を入れ替えることと、抗CD3VH及びVLのN末端からC末端への方向を入れ替えることと、抗CD3制約的Fv及び抗CD28制約的FvのN末端からC末端への方向を入れ替えることと、及びこれらの組み合わせによって、N末端からC末端のタンパク質のドメインを再構成する。図3Aのタンパク質は、本明細書に記載のいずれかのTTA-ABDを含むことが想定されている。図3Bは、図3Aと同様の再構成されたドメインを含むが、そのそれぞれは、EGFR結合である、TTA単一ドメイン抗体結合ドメイン(TTA-sdABD)を含む。 Eight different protein variants were studied, each containing restricted forms of anti-CD3 VH and VL and restricted forms of anti-CD28 VH and VL (Figure 3A). Protein variants swap the N-terminus to C-terminus orientation of anti-CD28 VH and VL, swap the N-terminus to C-terminus orientation of anti-CD3 VH and VL, and anti-CD3-restricted Fv and anti-CD28-restricted Fv. By switching the direction from the N-terminus to the C-terminus of the target Fv, and by a combination thereof, the domain of the protein from the N-terminus to the C-terminus is reconstituted. It is envisioned that the protein in Figure 3A includes any TTA-ABD described herein. Figure 3B contains reconstituted domains similar to Figure 3A, but each of which includes a TTA single domain antibody binding domain (TTA-sdABD) that is EGFR-binding.

プロテアーゼによる切断により、図3A及び3Bのタンパク質は、それぞれがTTA-ABD(またはTTA-sdABD)と免疫細胞結合ドメインとを含む2つの活性ホモ二量体を形成する。例えば、図4A~4Cは、切断前のタンパク質(図4A)、及び切断後に生成する2つのホモ二量体(図4B~4C)を示している。1つのホモ二量体は、二量体化された抗CD28制約的Fv、及び二量体の各半分に1つずつ、2つのEGFR TTA-sdABDを含む。別のホモ二量体は、二量体化された抗CD3制約的Fv、及び二量体の各半分に1つずつ、2つのEGFR TTA-sdABDを含む。別の例では、切断されたタンパク質により、図4B及び4Cのホモ二量体に類似するが、ホモ二量体の各半分が、1つはVLのN末端にもう1つがVHのC末端に、2つのEGFR TTA-sdABDを含む、2つのホモ二量体(図5A~5B)が生じる。次に、各ホモ二量体の有効性を試験した。 Upon protease cleavage, the proteins of Figures 3A and 3B form two active homodimers, each containing a TTA-ABD (or TTA-sdABD) and an immune cell binding domain. For example, Figures 4A-4C show the protein before cleavage (Figure 4A) and the two homodimers produced after cleavage (Figures 4B-4C). One homodimer contains dimerized anti-CD28 restricted Fv and two EGFR TTA-sdABDs, one in each half of the dimer. Another homodimer contains a dimerized anti-CD3 restricted Fv and two EGFR TTA-sdABDs, one in each half of the dimer. In another example, with a truncated protein, each half of the homodimer, one at the N-terminus of VL and one at the C-terminus of VH, resembles the homodimer of Figures 4B and 4C, but , two homodimers (Figures 5A-5B) are generated, containing two EGFR TTA-sdABDs. Next, the effectiveness of each homodimer was tested.

αCD3ホモ二量体及びαCD28ホモ二量体の有効性は、T細胞増殖アッセイを使用して試験した。Pro201タンパク質は、EGFR TTA-sdABDを含むαCD3ホモ二量体を形成する制約的αCD3Fvを含む。Pro201ホモ二量体をまず抗CD3抗体と比較した。結果は、抗CD3抗体のEC50の約2倍の範囲内でPro201がT細胞増殖を誘導したことを示している(図6A)。ホモ二量体を形成する複数の制約的αCD28Fv(Pro935、Pro936、Pro937、Pro938及びPro939)もまた、最適以下の量のPro201(200pM、Pro201)の存在下でT細胞増殖を誘導する能力について試験した。結果は、約839.2pMのEC50でPro938が最大レベルのT細胞増殖を誘導したことを示している(図6B)。抗CD28抗体は、Pro938ほど多くのT細胞増殖を誘導しなかったが、抗CD28抗体のEC50は282.4pMであった。図6Cは、in vitroのT細胞増殖アッセイでのPro201及びPro201+Pro938の活性が、EGFRがどのように固定化されるかによって変化することを示している。ビーズ固定化EGFRは、プレート固定化EGFRよりもEC50が著しく低かった(約2桁)。 The efficacy of αCD3 and αCD28 homodimers was tested using a T cell proliferation assay. The Pro201 protein contains a restricted αCD3Fv that forms an αCD3 homodimer containing the EGFR TTA-sdABD. The Pro201 homodimer was first compared to an anti-CD3 antibody. The results show that Pro201 induced T cell proliferation within approximately twice the EC50 of anti-CD3 antibody (Figure 6A). Multiple restricted αCD28Fv (Pro935, Pro936, Pro937, Pro938 and Pro939) that form homodimers were also tested for their ability to induce T cell proliferation in the presence of suboptimal amounts of Pro201 (200 pM, Pro201). did. The results show that Pro938 induced maximal levels of T cell proliferation with an EC50 of approximately 839.2 pM (Figure 6B). Although the anti-CD28 antibody did not induce as much T cell proliferation as Pro938, the EC50 of the anti-CD28 antibody was 282.4 pM. Figure 6C shows that the activity of Pro201 and Pro201+Pro938 in an in vitro T cell proliferation assay varies depending on how EGFR is immobilized. Bead-immobilized EGFR had a significantly lower EC50 (approximately 2 orders of magnitude) than plate-immobilized EGFR.

最適以下濃度のPro201の存在下での制約的αCD28Fv(Pro935、Pro936、Pro938及びPro939)の有効性を、HT29細胞(ヒト結腸直腸腺癌)を用いて細胞傷害性アッセイを使用して、さらに測定した(図7A)。図7Aでは、抗CD28ホモ二量体による処置の前に、HT29細胞をPro201で事前に処置した。結果は、試験した全ての制約的αCD28Fvが、抗CD28結合抗体単独よりも有効性が高いことを示した。Pro935及びPro938は、EC50が約0.4~1.0pMで細胞傷害作用が最も高かった。図7Bでは、Pro201による処置の前にαCD28ホモ二量体でHT29細胞を処置した。結果は、図7Aに示したものと類似するものであり、これは、αCD28ホモ二量体とαCD3ホモ二量体とががんに結合する順番はがん細胞の死滅には重要ではない可能性があることを示唆している。 The efficacy of restricted αCD28Fv (Pro935, Pro936, Pro938 and Pro939) in the presence of suboptimal concentrations of Pro201 was further determined using a cytotoxicity assay with HT29 cells (human colorectal adenocarcinoma). (Figure 7A). In Figure 7A, HT29 cells were pretreated with Pro201 before treatment with anti-CD28 homodimer. The results showed that all restricted αCD28Fv tested were more effective than anti-CD28 binding antibodies alone. Pro935 and Pro938 had the highest cytotoxic effect with an EC50 of about 0.4 to 1.0 pM. In Figure 7B, HT29 cells were treated with αCD28 homodimer before treatment with Pro201. The results are similar to those shown in Figure 7A, indicating that the order in which αCD28 and αCD3 homodimers bind to cancer may not be important for cancer cell killing. It suggests that there is a sex.

全体的に、これらの結果は、本明細書に記載する条件付き活性多重特異性タンパク質の切断によって生成される活性ホモ二量体が、T細胞増殖を誘導し、かつがん細胞を死滅させることができることを実証している。 Overall, these results demonstrate that active homodimers generated by cleavage of the conditionally active multispecific proteins described herein induce T cell proliferation and kill cancer cells. It has been proven that it can be done.

実施例2:CD3及びCD28免疫細胞結合ドメインを含む条件付き活性多重特異性免疫細胞エンゲージャーの引き続きの開発
本実施例では、CD3及びCD28免疫細胞結合ドメインを含む免疫細胞エンゲージャーが、T細胞増殖及び生存率を高め、がんの死滅においてより高い効力を示すことを実証する。
Example 2: Continued development of a conditionally active multispecific immune cell engager comprising CD3 and CD28 immune cell binding domains In this example, an immune cell engager comprising CD3 and CD28 immune cell binding domains and increase survival rates and demonstrate higher efficacy in killing cancer.

固形癌を治療する場合の重大な課題は、T細胞が疲弊した表現型を示すのを遅らせるか、または停止させることである。この状態では、T細胞は抗がん応答を発達させることができず、PD1、LAG3、及びTIM3などのT細胞表面疲弊マーカーを提示する。これは、宿主の免疫系から逃れるために多くの腫瘍によって下方調節されて、追加の共刺激シグナルを伴わないことにより、TCR/CD3刺激が過度になることが原因であると思われる。抗CD3制約的Fv、抗CD28制約的Fv、及びTTA-sdABDを含む条件付き活性分子で疲弊したT細胞を刺激することにより、腫瘍に対する疲弊表現型及び標的T細胞を回復させることができる可能性があると仮説を立てた。 A critical challenge in treating solid tumors is to slow or stop T cells from displaying an exhausted phenotype. In this state, T cells are unable to develop anti-cancer responses and display T cell surface exhaustion markers such as PD1, LAG3, and TIM3. This is likely due to excessive TCR/CD3 stimulation without additional co-stimulatory signals, which is down-regulated by many tumors to escape the host's immune system. By stimulating exhausted T cells with conditionally active molecules including anti-CD3-restricted Fv, anti-CD28-restricted Fv, and TTA-sdABD, it may be possible to restore the exhausted phenotype and target T cells to tumors. I hypothesized that there is.

疲弊したT細胞型は、ヒト初期静止T細胞を単離して、それらを抗CD3及びIL-10と共に長時間インキュベートすることによって、in vitroで生成することができる(図8A)。試験前に、in vitroで調製した疲弊したT細胞を、FACS分析を介して生存率及び増殖の両方を追跡するために、事前にCell-Trace Violetで標識する。次いで、これらの細胞を、EGFR結合ビーズの存在下で様々な濃度で、記載した分子と共にインキュベートする。疲弊したT細胞は、試験分子及びEGFR(sdABDの標的)が存在しない限り応答しない。その後、これらのT細胞は、予想される細胞表面マーカーを発現するだけではなく(図8B)、抗CD3のみの活性化に応答しない。ただし、これらの疲弊したT細胞は、抗CD3及び抗CD28刺激の組み合わせには応答する(図8C)。 Exhausted T cell types can be generated in vitro by isolating human early resting T cells and incubating them for extended periods with anti-CD3 and IL-10 (FIG. 8A). Prior to testing, exhausted T cells prepared in vitro are pre-labeled with Cell-Trace Violet to track both viability and proliferation via FACS analysis. These cells are then incubated with the described molecules at various concentrations in the presence of EGFR-binding beads. Exhausted T cells will not respond unless the test molecule and EGFR (the target of sdABD) are present. These T cells then not only express the expected cell surface markers (FIG. 8B) but also do not respond to anti-CD3 activation alone. However, these exhausted T cells respond to combined anti-CD3 and anti-CD28 stimulation (Figure 8C).

T細胞疲弊の救出に対する抗CD3及び抗CD28構築物の有効性を、図6及び表1及び表2に記載するタンパク質構築物を使用してin vitroで研究した。in vitroで調製したヒトの疲弊したT細胞を、EGFRコーティングビーズの存在下で、2個のEGFR sdABDを含有する抗CD3-EGFR活性二量体分子(Pro201)及び/または2個のEGFR sdABDを含有する抗CD28-EGFR活性二量体分子であるPro938(VH/VL)、Pro935(VL/VH)、Pro1034(VH/VL)、及びPro1035(VL/VH)を用いて、同じ濃度で、及び濃度を漸増させて刺激した(図9A~9C)。結果は、Pro938+Pro201は、Pro935+Pro201よりも総T細胞増殖をより多く誘導することを示しているが、Pro935+Pro201はEC50がより低い(図9B)。結果はまた、Pro1034+Pro201は、Pro1035+Pro201よりも総T細胞増殖をより多く誘導することを示しているが、Pro1035+Pro201はEC50がより低い(図9C)。これらの制約的Fvのいずれかを単独で投与すると、αCD3制約的Fvを伴うαCD28制約的Fvの投与と比較して、T細胞増殖の程度ははるかに低く、かつ効力も低かった(図9D)。
The efficacy of anti-CD3 and anti-CD28 constructs in rescuing T cell exhaustion was studied in vitro using the protein constructs described in FIG. 6 and Tables 1 and 2. Human exhausted T cells prepared in vitro were treated with an anti-CD3-EGFR active dimeric molecule containing two EGFR sdABDs (Pro201) and/or two EGFR sdABDs in the presence of EGFR-coated beads. using anti-CD28-EGFR active dimeric molecules containing Pro938 (VH/VL), Pro935 (VL/VH), Pro1034 (VH/VL), and Pro1035 (VL/VH) at the same concentration; Stimulation was performed at increasing concentrations (Figures 9A-9C). The results show that Pro938+Pro201 induces more total T cell proliferation than Pro935+Pro201, but Pro935+Pro201 has a lower EC50 (FIG. 9B). The results also show that Pro1034+Pro201 induces more total T cell proliferation than Pro1035+Pro201, although Pro1035+Pro201 has a lower EC50 (Figure 9C). Administration of either of these restrictive Fvs alone resulted in much lower T cell proliferation and less efficacy compared to administration of αCD28-restricted Fvs with αCD3-restricted Fvs (Figure 9D) .

T細胞増殖及び活性化について、各単量体に1個のEGFR sdABDを含有する抗CD28-EGFR活性二量体分子のPro1134(VH/VL)またはPro1135(VL/VH)と組み合わせて、Pro201を使用してさらに研究した(図10A、表2)。結果は、Pro1134+Pro201は、Pro1135+Pro201と比較して、T細胞増殖が増加し(図10B)、T細胞活性化が増加した(図10D)ことを示している。先に明らかとなったように、Pro201、Pro1134またはPro1135を単独で投与した場合、たとえあったとしてもT細胞増殖の誘導は著しく少ないものであった(図10C)。しかし、Pro201、Pro1134またはPro1135の単独での投与は、T細胞生存率を高めるのに十分であった(図10E)。全体的に、これらの結果は、Pro1134(VH/VL)は、Pro1135(VL/VH)よりも活性が高いことを示唆している。 For T cell proliferation and activation, Pro201 was combined with Pro1134 (VH/VL) or Pro1135 (VL/VH), anti-CD28-EGFR active dimeric molecules containing one EGFR sdABD in each monomer. (Fig. 10A, Table 2). The results show that Pro1134+Pro201 had increased T cell proliferation (Figure 10B) and increased T cell activation (Figure 10D) compared to Pro1135+Pro201. As previously revealed, when Pro201, Pro1134 or Pro1135 were administered alone, there was significantly less, if any, induction of T cell proliferation (FIG. 10C). However, administration of Pro201, Pro1134 or Pro1135 alone was sufficient to increase T cell survival (Figure 10E). Overall, these results suggest that Pro1134 (VH/VL) is more active than Pro1135 (VL/VH).

疲弊したT細胞の増殖及び生存率に対するCD3シグナル伝達とCD28シグナル伝達との組み合わせをさらに評価するために、2つの追加の構築物、単一の抗EGFR sdABD及び抗CD3(VH/VL)を含んでいるPro861、または単一の抗EGFR sdABD及び抗CD3(VL/VH)を含んでいるPro863を設計した(図11A、及び表1)。これらの抗CD3分子を、単一の抗EGFRsdAb及び抗CD28(VH/VL)を含むPro1134と組み合わせて試験する場合、分子の対は、図3A及び図3Bに記載した多重特異性分子のサブセットのタンパク質分解切断によって形成される2つの活性二量体を模倣する。結果は、Pro861、Pro863、またはPro1134は、単独では実質的なT細胞増殖を誘導することができなかったが、Pro861+Pro1134またはPro863+Pro1134は、新鮮な、または疲弊の誘発前に凍結されていたT細胞の増殖の顕著な増加を誘導したことを示している(図11B)。両方の活性二量体を与えた場合にのみ、疲弊したT細胞の増殖が生じた。Pro861、Pro863、またはPro1134のいずれかを単独で用いて新鮮なT細胞の最大の生存率が誘導されたが、最も高い効力は、Pro861+Pro1134またはPro863+Pro1134が加えられた場合に達成された(図11C及び11D)。Pro186と同様に、Pro646は、不活性VHi及びVLiドメインに融合した、抗CD3 VH及びVLドメインに隣接する2つの抗EGFRドメイン、ならびに半減期を延長させるヒト血清アルブミン(HSA)sdABDを含む(図12及び13)。しかし、Pro646は、内側の抗EGFR sdABDの前に切断部位がある共刺激COBRA中間分子である(図13)。Pro646は、条件付きでプロテアーゼによって活性化され、切断後、抗CD3-EGFR活性ホモ二量体を形成することができる(図13)。この分子の切断されたバージョンは、単独では疲弊したT細胞の増殖を誘導することはできなかった(図15B)。抗CD28-EGFR活性二量体であるPro1134(図15A)と同等に加えた場合にのみ、Pro646は最大限の増殖を刺激することができた。Pro646またはPro1134は、単独で生存率を高めることができたが、両方の分子を一緒にすると、最も高い効力を示した(図15C~15D)。 To further evaluate the combination of CD3 and CD28 signaling on the proliferation and viability of exhausted T cells, we included two additional constructs, a single anti-EGFR sdABD and an anti-CD3 (VH/VL). We designed Pro861 containing a single anti-EGFR sdABD and anti-CD3 (VL/VH) (FIG. 11A and Table 1). When these anti-CD3 molecules are tested in combination with a single anti-EGFRsdAb and Pro1134 containing anti-CD28 (VH/VL), the pair of molecules represents a subset of the multispecific molecules described in Figures 3A and 3B. Mimics two active dimers formed by proteolytic cleavage. The results showed that Pro861, Pro863, or Pro1134 alone were unable to induce substantial T cell proliferation, but that Pro861+Pro1134 or Pro863+Pro1134 induced T cells that were fresh or frozen before induction of exhaustion. This shows that a significant increase in proliferation was induced (FIG. 11B). Proliferation of exhausted T cells occurred only when both active dimers were given. Maximum viability of fresh T cells was induced using either Pro861, Pro863, or Pro1134 alone, but the highest efficacy was achieved when Pro861+Pro1134 or Pro863+Pro1134 was added (Figures 11C and 11D). Similar to Pro186, Pro646 contains two anti-EGFR domains flanking anti-CD3 VH and VL domains, fused to inactive VHi and VLi domains, and a human serum albumin (HSA) sdABD that extends half-life (Figure 12 and 13). However, Pro646 is a costimulatory COBRA intermediate molecule with a cleavage site in front of the inner anti-EGFR sdABD (Figure 13). Pro646 is conditionally activated by proteases and can form anti-CD3-EGFR active homodimers after cleavage (Figure 13). A truncated version of this molecule alone was unable to induce proliferation of exhausted T cells (Figure 15B). Pro646 was able to stimulate maximal proliferation only when added equivalently to the anti-CD28-EGFR active dimer Pro1134 (FIG. 15A). Although Pro646 or Pro1134 alone were able to increase survival, both molecules together showed the highest efficacy (Figures 15C-15D).

次に、図3Bに概説した共刺激COBRA分子内の抗CD3 scFv及び抗CD28 scFvの相対位置及び配置が、タンパク質生成、条件付き活性化、T細胞増殖、T細胞生存、及びT細胞依存性細胞傷害作用にどのように影響を及ぼしたかを測定した。パラメータは、抗CD3 VH及びVL、抗CD28 VH及びVLのN末端からC末端への順序、ならびに抗CD28 scFv及び抗CD3 scFvの順で変化させた(図3B)。結果は、試験した各構築物が、実用的な研究用途に十分な量で得られることを示した(図3B)。次に、Pro1136、Pro1138、Pro1140及びPro1142を、疲弊したT細胞のT細胞増殖及び生存の条件付き活性化及び誘導について試験した(図16A~16B)。結果は、切断されていない分子がこのアッセイでは不活性であったことから、試験した全てのタンパク質が増殖の刺激において非常に条件的であることを示した。対照的に、事前に切断されたタンパク質は、観察された最大増殖は分子間でいくらか異なるものの、互いに2倍の範囲内の効力を示した。また、切断されたタンパク質の効力は、同族の切断されていない分子の効力よりも200倍を上回る高さであったため、これら4つの分子はT細胞生存の刺激において非常に条件的であった。これらの実験による結果は、Pro1136及びPro1140は、T細胞増殖及びT細胞生存率の両方に対して最大の複合効果を有することを示している(図16C)。 The relative position and arrangement of anti-CD3 scFv and anti-CD28 scFv within the co-stimulatory COBRA molecule, outlined in Figure 3B, then influences protein production, conditional activation, T cell proliferation, T cell survival, and T cell dependent cell development. We measured how it affected the injury effect. Parameters were varied in the order of anti-CD3 VH and VL, anti-CD28 VH and VL from N-terminus to C-terminus, and anti-CD28 scFv and anti-CD3 scFv (Figure 3B). The results showed that each construct tested was obtained in sufficient quantities for practical research use (Figure 3B). Next, Pro1136, Pro1138, Pro1140 and Pro1142 were tested for conditional activation and induction of T cell proliferation and survival of exhausted T cells (Figures 16A-16B). The results showed that all proteins tested were highly conditional in stimulating proliferation, as the uncleaved molecules were inactive in this assay. In contrast, the pre-cleaved proteins exhibited efficacies within twofold of each other, although the maximum proliferation observed varied somewhat between molecules. These four molecules were also highly conditional in stimulating T cell survival, as the potency of the cleaved protein was more than 200 times higher than that of the cognate uncleaved molecule. Results from these experiments show that Pro1136 and Pro1140 have the greatest combined effect on both T cell proliferation and T cell viability (Figure 16C).

次に、MMP9切断部位が第2のEGFR結合ドメインと不活性VLiドメインとの間に位置し、活性抗CD3二量体の形成を阻害するために不活性VLi-VHiを使用するT細胞エンゲージャーであるPro186(図13)の腫瘍死滅効率を、αCD3制約的Fv及びαCD28制約的Fvの両方を含む本明細書に記載するタンパク質Pro1136(図15)と比較した。Pro1136は、Pro186と類似した効力でHT29細胞(結腸直腸腺癌)を死滅させる(図16D)。未変性及び事前に切断されたタンパク質を、標準的なTDCCアッセイにて、10:1の比率(ヒトT細胞:HT29腫瘍細胞株)で、様々な濃度で試験した。MMP9の切断された分子の全ては、それらの未変性の切断されていないタンパク質よりも少なくとも20倍を超える活性がある。この試験した一連の分子では、事前に切断されたPro186が最も効力が高かった(図16D)。事前に切断されたPro646では、活性は少なくとも10分の1であったが、これはおそらく、そのCD3活性二量体が、Pro186では活性二量体内で4つの抗EGFR sdAbが形成され得るのに対して、2つしか抗EGFR sdAbを有していないためである。一方、Pro1136もまた、Pro646と同じαCD3活性ホモ二量体を形成するが、その効力はPro646よりも5倍を超え、かつ効力はPro186のちょうど2分の1である。これは、Pro1136が、抗EGFR CD28活性ホモ二量体も形成することができ、これによりCD28受容体を介してさらにT細胞を共刺激して、それらの細胞傷害活性を高めることができるためである可能性が高い。 The MMP9 cleavage site is then located between the second EGFR binding domain and the inactive VLi domain, and the T cell engager uses the inactive VLi-VHi to inhibit the formation of active anti-CD3 dimers. The tumor killing efficiency of Pro186 (Figure 13) was compared to the protein Pro1136 described herein (Figure 15), which contains both αCD3-restricted Fv and αCD28-restricted Fv. Pro1136 kills HT29 cells (colorectal adenocarcinoma) with similar potency as Pro186 (Figure 16D). Native and pre-cleaved proteins were tested at various concentrations in a standard TDCC assay at a ratio of 10:1 (human T cells:HT29 tumor cell line). All cleaved molecules of MMP9 are at least 20 times more active than their native, uncleaved protein. In this series of molecules tested, pre-cleaved Pro186 was the most potent (Figure 16D). With pre-cleaved Pro646, the activity was at least 10-fold lower, probably because its CD3 active dimer is present, whereas with Pro186 four anti-EGFR sdAbs can be formed within the active dimer. In contrast, this is because there are only two anti-EGFR sdAbs. On the other hand, Pro1136 also forms the same αCD3 active homodimer as Pro646, but its potency is more than five times that of Pro646, and its potency is just half that of Pro186. This is because Pro1136 can also form anti-EGFR CD28 active homodimers, which can further co-stimulate T cells via the CD28 receptor and increase their cytotoxic activity. There is a high possibility that there is.

図3Bに概説したこの一連の8個の共刺激COBRA分子もまた、T細胞依存性細胞傷害性アッセイにてHT29標的細胞に対するそれらの活性について試験した。結果は、異なる抗CD3 VL及びVHならびに抗CD28 VL及びVH方向、それに加えて、分子内に抗CD3 Fv及び抗CD28 Fvの相対位置を有する、8つの分子の全てが、アッセイにおいて活性であったことを示している(図16E)。1番目の位置に抗CD3(VH/VL)Fv、及び2番目の位置に抗CD28(VH/VLまたはVL/VH)Fvを有するPro1136及びPro1137は最も効力が高く、1番目の位置に抗CD3(VL/VH)Fv、及び2番目の位置に抗CD28(VH/VLまたはVL/VH)Fvを有するPro1138及びPro1139は、およそ10倍低い効力を示した(図16E)。 This series of eight costimulatory COBRA molecules outlined in Figure 3B were also tested for their activity against HT29 target cells in a T cell-dependent cytotoxicity assay. The results showed that all eight molecules with different anti-CD3 VL and VH and anti-CD28 VL and VH orientations, as well as relative positions of anti-CD3 Fv and anti-CD28 Fv within the molecule, were active in the assay. This shows that (Fig. 16E). Pro1136 and Pro1137, which have an anti-CD3 (VH/VL) Fv in the first position and an anti-CD28 (VH/VL or VL/VH) Fv in the second position, are the most potent; (VL/VH) Fv, and Pro1138 and Pro1139 with anti-CD28 (VH/VL or VL/VH) Fv in the second position showed approximately 10-fold lower potency (FIG. 16E).

Pro1136及びPro646に類似しているが、異なる抗EGFR sdABD(hG8)を含む分子を設計し、T細胞依存性細胞傷害性アッセイにてHT29標的細胞に関して試験した。Pro646及びPro1136の抗EGFRドメインを、hG8抗EGFRドメインに置き換えて、それぞれPro1185及びPro1184を作成した(図17)。Pro646及びPro1136と同様に、Pro1185及びPro1184の切断により、がん細胞死滅が約10倍増加した。Pro1184は、Pro1185よりも殺傷能力が約2倍高い。抗CD28 VH-VLのみを含むPro1186は、最も低いTDCC活性を示し、Pro1184及びPro1185の数千分の1であった。全体として、これらの結果は、免疫細胞を活性化させ、がんを死滅させるCD3及びCD28免疫細胞結合ドメインを含む免疫細胞エンゲージャー(例えば、Pro1136)の実用性を実証している。 A molecule containing a similar but different anti-EGFR sdABD (hG8) to Pro1136 and Pro646 was designed and tested on HT29 target cells in a T cell-dependent cytotoxicity assay. The anti-EGFR domains of Pro646 and Pro1136 were replaced with the hG8 anti-EGFR domain to create Pro1185 and Pro1184, respectively (Figure 17). Similar to Pro646 and Pro1136, cleavage of Pro1185 and Pro1184 increased cancer cell killing approximately 10-fold. Pro1184 is approximately twice as lethal as Pro1185. Pro1186, containing only anti-CD28 VH-VL, showed the lowest TDCC activity, several thousand times lower than Pro1184 and Pro1185. Overall, these results demonstrate the utility of immune cell engagers (eg, Pro1136) containing CD3 and CD28 immune cell binding domains to activate immune cells and kill cancer.

方法
疲弊したT細胞アッセイ
StemCell Technology Kitを使用してネガティブセレクションを介してヒトドナーから単離した新鮮なT細胞を、まず、それぞれ50ng/mLの抗CD3(SP34)及び抗CD28(自社製造TGN1412)抗体と共に5日間インキュベートした。刺激されたT細胞を洗浄後、50ng/mLの抗CD3及び10ng/mLのIL-10(R&D Systems)で5日間処置し、後者を2日後に補充することにより疲弊を誘導した。5日後、新しい疲弊したT細胞を、穏やかに洗浄した後、Cell Trace Violet(Life Technologies)で、10分間37℃で染色した。疲弊し、かつ染色したT細胞を、洗浄した後、5×10~1×10細胞/mLになるように再懸濁させた。細胞を試験分子及び抗原コーティングビーズと共に、10ng/mLのIL-10の常時存在下で5日間インキュベートし、2日後に新鮮なIL-10を補充した。細胞を洗浄し、フローサイトメトリーのために、0.5ug/mLヨウ化プロピジウムを含むFACS緩衝液に再懸濁させた。生存率及び増殖率を分析した。
Methods Exhausted T Cell Assay Fresh T cells isolated from human donors via negative selection using the StemCell Technology Kit were first incubated with anti-CD3 (SP34) and anti-CD28 (in-house manufactured TGN1412) antibodies at 50 ng/mL each. and incubated for 5 days. After washing, the stimulated T cells were treated with 50 ng/mL anti-CD3 and 10 ng/mL IL-10 (R&D Systems) for 5 days, and exhaustion was induced by supplementing the latter 2 days later. After 5 days, fresh exhausted T cells were stained with Cell Trace Violet (Life Technologies) for 10 minutes at 37°C after gentle washing. Exhausted and stained T cells were washed and resuspended at 5×10 5 to 1×10 6 cells/mL. Cells were incubated with test molecules and antigen-coated beads in the constant presence of 10 ng/mL IL-10 for 5 days and supplemented with fresh IL-10 after 2 days. Cells were washed and resuspended in FACS buffer containing 0.5 ug/mL propidium iodide for flow cytometry. Survival and proliferation rates were analyzed.

実施例3:抗HER2 sdABDを含む条件付き活性タンパク質
本明細書に記載する条件付き活性多重特異性タンパク質は、sdABDを交換して異なる腫瘍抗原に結合させることによって、多数の異なるがんタイプを標的とする可能性がある。これを実証するために、抗HER2 sdABD、または抗HER2 sdABD及び抗EGFR sdABDを含むようにタンパク質を改変し、その後、HER2発現がん細胞を死滅させる効力について試験した。結果は、条件付き活性多重特異性タンパク質を改変して、複数の異なるがん細胞型を標的とし、死滅させることができることを実証している。
Example 3: Conditionally Active Protein Containing an Anti-HER2 sdABD The conditionally active multispecific protein described herein targets a number of different cancer types by swapping the sdABD to bind different tumor antigens. There is a possibility that To demonstrate this, proteins were modified to include anti-HER2 sdABD, or anti-HER2 sdABD and anti-EGFR sdABD, and then tested for efficacy in killing HER2-expressing cancer cells. The results demonstrate that conditionally active multispecific proteins can be engineered to target and kill multiple different cancer cell types.

最初のアッセイでは、HER2 sdABDを含む2つの活性二量体分子、すなわち、HER2 sdABD及び抗CD3(VH/VL)を含有するPro1176と、HER2 sdABD及び抗CD28(VH/VL)を含有するPro1179とを生成した(図18A)。Pro1176を、抗EGFR sdABD及び抗CD28(VH/VL)を含有するPro1134と組み合わせ、かつ、Pro1179を、抗EGFR sdABD及びCD3(VH/VL)を含有するPro861と組み合わせて、T細胞増殖アッセイにてそれらの活性について試験した。Pro861+Pro1179の組み合わせによる処置は、Pro861単独よりも高い増殖を示し、かつPro1176+Pro1134の組み合わせによる処置は、Pro1134単独よりも高い増殖を示した(図18B)。これらの結果は、活性二量体分子がEGFRまたはHER2に結合することによってT細胞増殖を刺激できることを示している。 In the first assay, two active dimeric molecules containing HER2 sdABD were tested, namely Pro1176 containing HER2 sdABD and anti-CD3 (VH/VL) and Pro1179 containing HER2 sdABD and anti-CD28 (VH/VL). (Fig. 18A). Pro1176 in combination with Pro1134 containing anti-EGFR sdABD and anti-CD28 (VH/VL) and Pro1179 in combination with Pro861 containing anti-EGFR sdABD and CD3 (VH/VL) in T cell proliferation assays. They were tested for their activity. Treatment with the Pro861+Pro1179 combination showed higher proliferation than Pro861 alone, and treatment with the Pro1176+Pro1134 combination showed higher proliferation than Pro1134 alone (FIG. 18B). These results indicate that active dimeric molecules can stimulate T cell proliferation by binding to EGFR or HER2.

抗HER2 sdABDを含む条件付き活性多重特異性タンパク質構築物のパネルを設計した(図19A)。これらのタンパク質は、抗CD3 VH-VL、CD28 VH-VL、抗HER2 sdABD、及び場合によっては、抗EGFR sdABDを含む。Pro1265及びPro1266の両方は、抗CD3 VH-VL、CD28 VH-VL、及び抗HER2 sdABDを含むが、抗CD3 VH-VL及びCD28 VH-VLのN末端からC末端の位置を、タンパク質間で入れ替えた。Pro1267及びPro1268の両方は、抗CD3 VH-VL、CD28 VH-VL、抗HER2 sdABD及び抗EGFR sdABDを含むが、抗CD3 VH-VL及びCD28 VH-VLのN末端からC末端の位置を、タンパク質間で入れ替えた。加えて、Pro1267及びPro1268では、抗EGFR sdABDは、各タンパク質のN末端にあり、抗HER2 sdABDは、MMP9~15切断部位のC末端側で、MMP9~15切断部位とNCLとの間に位置する。Pro1269及びPro1270は、Pro1267及びPro1268と類似するが、抗HER2 sdABDが各タンパク質のN末端にあり、かつ抗EGFR sdABDがMMP9~15切断部位のC末端側で、MMP9~15切断部位とNCLとの間に位置する。図19Bは、抗CD28 VH-VLをFLAG不活化VH-VLによって置き換えた場合のアッセイで使用した対照タンパク質を示している。 A panel of conditionally active multispecific protein constructs containing anti-HER2 sdABD was designed (Figure 19A). These proteins include anti-CD3 VH-VL, CD28 VH-VL, anti-HER2 sdABD, and in some cases anti-EGFR sdABD. Both Pro1265 and Pro1266 contain anti-CD3 VH-VL, CD28 VH-VL, and anti-HER2 sdABD, but the N- to C-terminal positions of anti-CD3 VH-VL and CD28 VH-VL are swapped between the proteins. Ta. Both Pro1267 and Pro1268 include anti-CD3 VH-VL, CD28 VH-VL, anti-HER2 sdABD and anti-EGFR sdABD, but the N-terminal to C-terminal positions of anti-CD3 VH-VL and CD28 VH-VL are exchanged between. Additionally, for Pro1267 and Pro1268, the anti-EGFR sdABD is located at the N-terminus of each protein, and the anti-HER2 sdABD is located C-terminal to the MMP9-15 cleavage site and between the MMP9-15 cleavage site and the NCL. . Pro1269 and Pro1270 are similar to Pro1267 and Pro1268, but the anti-HER2 sdABD is at the N-terminus of each protein, and the anti-EGFR sdABD is at the C-terminal side of the MMP9-15 cleavage site and connects the MMP9-15 cleavage site with the NCL. located in between. Figure 19B shows the control protein used in the assay where anti-CD28 VH-VL was replaced by FLAG-inactivated VH-VL.

HER2を過剰発現しているがEGFRを発現していないヒトHER2-RAJI細胞に対する、抗HER2条件付き活性多重特異性タンパク質の効力を、T細胞依存性細胞傷害活性(TDCC)アッセイを使用して定量化した。Pro1265及びPro1266の効力を比較して、抗CD28 VH-VL及び抗CD3 VH-VLのN末端からC末端への位置が効力にどのように影響を及ぼすかを測定した(図20)。結果は、Pro1265及びPro1266が、それぞれ0.1267及び0.1454のEC50でがん細胞を死滅させることを示している。加えて、抗CD28 VH-VL及び抗CD3 VH-VLのN末端からC末端への位置は、効力にほとんど影響を及ぼさなかった。Pro1267構築物は、切断後に抗CD28Fvに連結される抗HER2 sdABDと、切断後に抗CD3Fvに連結される抗EGFR sdABDを含んでいるが、その効力は、Pro1265及びPro1266の約100分の1であった。 Efficacy of anti-HER2 conditionally active multispecific protein against human HER2-RAJI cells overexpressing HER2 but not EGFR was quantified using a T cell-dependent cytotoxicity (TDCC) assay. It became. The potency of Pro1265 and Pro1266 was compared to determine how the N-terminus to C-terminus position of anti-CD28 VH-VL and anti-CD3 VH-VL affects potency (Figure 20). Results show that Pro1265 and Pro1266 kill cancer cells with an EC50 of 0.1267 and 0.1454, respectively. In addition, the N-terminus to C-terminus position of anti-CD28 VH-VL and anti-CD3 VH-VL had little effect on potency. Although the Pro1267 construct contains an anti-HER2 sdABD that is linked to anti-CD28Fv after cleavage and an anti-EGFR sdABD that is linked to anti-CD3Fv after cleavage, its potency was approximately 100 times lower than that of Pro1265 and Pro1266. .

次に、抗HER2 sdABD及び抗EGFR sdABDを含むタンパク質の効力について、EGFRを発現するがHER2を発現しないがん細胞を使用してさらに研究した。EGFR発現(U87MG)細胞を使用してTDCCアッセイで、効力を測定した(図21)。結果は、Pro1136(切断後に抗CD3 Fvに連結される抗EGFR sdABDと、切断後に抗CD28 Fvに連結される抗EGFR sdABDとを含む。図3Bを参照)は、Pro1267(切断後に抗CD28に連結される抗HER2 sdABDと、切断後に抗CD3 Fvに連結される抗EGFR sdABDを含む)よりも効力が高いことを示した。しかし、Pro1267の効力は、切断後に抗CD3に連結される2つの抗EGFR sdABDを含むが、抗CD28 VH-VLを含まないPro186と類似するものであった。Pro1140とPro1270とを比較した場合に、同様の結果が観察された。切断後に抗CD3 Fv及び抗CD28 Fvの両方に連結されるEGFR sdABDを有するPro1140は、切断後に抗CD3 Fvに連結されるEGFR sdABDと、切断後に抗CD28 Fvに連結されるHER2 sdABDとを含有するPro1270よりも効力が少なくとも3倍高かった(図22)。Pro1140はまた、抗CD3 Fvに連結された1つのEGFR sdABDと、それぞれ不活性VL/VHまたはVH/VLに連結された第2のEGFR sdABDとを含有するPro1271またはPro1272の両方よりも効力が少なくとも3倍高かった(図22)。これらの結果は、抗CD3及び抗CD28を含む分子が、抗CD3のみを含有する分子よりも活性が高いことを示唆している。加えて、抗CD3及び抗CD28の両方を含有する分子は、切断後に形成される二量体が標的細胞に結合可能な場合のみ、効力が高い。 The efficacy of proteins containing anti-HER2 sdABD and anti-EGFR sdABD was then further studied using cancer cells that express EGFR but not HER2. Efficacy was determined in a TDCC assay using EGFR expressing (U87MG) cells (Figure 21). The results show that Pro1136 (contains an anti-EGFR sdABD that is linked to anti-CD3 Fv after cleavage, and an anti-EGFR sdABD that is linked to anti-CD28 Fv after cleavage; see Figure 3B), Pro1267 (contains an anti-EGFR sdABD that is linked to anti-CD28 after cleavage; (including anti-HER2 sdABD, which is linked to anti-CD3 Fv after cleavage) and anti-EGFR sdABD, which is linked to anti-CD3 Fv after cleavage. However, the efficacy of Pro1267 was similar to Pro186, which contains two anti-EGFR sdABDs linked to anti-CD3 after cleavage, but no anti-CD28 VH-VL. Similar results were observed when comparing Pro1140 and Pro1270. Pro1140 with an EGFR sdABD linked to both anti-CD3 Fv and anti-CD28 Fv after cleavage contains an EGFR sdABD linked to anti-CD3 Fv after cleavage and a HER2 sdABD linked to anti-CD28 Fv after cleavage It was at least 3 times more potent than Pro1270 (Figure 22). Pro1140 is also at least at least more potent than both Pro1271 or Pro1272, which contain one EGFR sdABD linked to an anti-CD3 Fv and a second EGFR sdABD linked to an inactive VL/VH or VH/VL, respectively. It was three times higher (Figure 22). These results suggest that molecules containing anti-CD3 and anti-CD28 are more active than molecules containing only anti-CD3. In addition, molecules containing both anti-CD3 and anti-CD28 are highly potent only if the dimer formed after cleavage is capable of binding to target cells.

結論として、抗HER2条件付き活性多重特異性タンパク質は、抗HER2 sdABDがMMP9切断部位とNCLとの間ではなくタンパク質のN末端に位置する場合に、わずかに高い効力を有するように見える。抗CD3 VH-VL及び抗CD28 VH-VLを含有する抗EGFR条件付き活性多重特異性タンパク質は、抗CD28 VH-VLを含まないものよりも、U87MG細胞(EGFRのみ)に対して少なくとも3~7倍高い効力を有する。 In conclusion, the anti-HER2 conditionally active multispecific protein appears to have slightly higher potency when the anti-HER2 sdABD is located at the N-terminus of the protein rather than between the MMP9 cleavage site and the NCL. Anti-EGFR conditionally active multispecific proteins containing anti-CD3 VH-VL and anti-CD28 VH-VL are at least 3-7 more active against U87MG cells (EGFR only) than those without anti-CD28 VH-VL. It has twice the potency.

Claims (57)

タンパク質であって、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが前記第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、前記第1の制約的scFvドメインが前記第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、前記第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカーと、
(v)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカーと、
(vii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、前記第2の重鎖可変領域と前記第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが前記第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、前記第2の制約的scFvドメインが前記第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、前記第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカーと、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
前記(iii)の第1の重鎖可変領域が前記(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、前記第1の免疫細胞抗原または前記第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
前記(vii)の第2の重鎖可変領域が前記(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、前記第1の免疫細胞抗原または前記第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する、前記タンパク質。
A protein, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, in which said first heavy chain variable region and said first light chain variable region are capable of binding to a first human immune cell antigen when said first heavy chain variable region and said first light chain variable region are associated; the heavy chain variable region of and the first light chain variable region do not associate within the first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to the first human immune cell antigen. , the first constrained single chain variable fragment (scFv) domain;
(iv) a first cleavable linker;
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(vi) a second domain linker;
(vii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when said second heavy chain variable region and said second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; the heavy chain variable region of and the first light chain variable region do not associate within the second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to the second human immune cell antigen. , said second constrained single chain variable fragment (scFv) domain;
(viii) a second cleavable linker;
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii) and does not bind to the first immune cell antigen or the second immune cell antigen. forming a variable fragment (Fv);
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii) and does not bind to the first immune cell antigen or the second immune cell antigen. Said protein forming a variable fragment (Fv).
前記第1の免疫細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、好中球、またはマクロファージである、請求項1に記載のタンパク質。 2. The protein of claim 1, wherein the first immune cell is a T cell, natural killer (NK) cell, neutrophil, or macrophage. 前記第2の免疫細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、またはマクロファージである、請求項1または請求項2に記載のタンパク質。 The protein according to claim 1 or 2, wherein the second immune cell is a T cell, a natural killer (NK) cell, or a macrophage. 前記第1の免疫抗原は、CD3、CD28、T細胞受容体、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、T細胞免疫グロブリン及びムチンドメイン3(TIM-3)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG-3)、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、CD137、OX40、CD27、GITR(TNFRSF18)、TIGIT、誘導性T細胞共刺激(ICOS)、CD16A、CD226、CD96、CD40L、CD226、CRTAM、LFA-1、CD27、CD96、TIGIT、KIR、NKG2D、CSF1R、CD40、MARCO、VSIG4、ならびにCD163から選択される、請求項1~3のいずれか1項に記載のタンパク質。 The first immunizing antigen includes CD3, CD28, T cell receptor, programmed cell death protein 1 (PD-1), cytotoxic T lymphocyte associated protein 4 (CTLA-4), T cell immunoglobulin and mucin domain. 3 (TIM-3), lymphocyte activation gene 3 (LAG-3), killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR), CD137, OX40, CD27, GITR (TNFRSF18), TIGIT, inducible T cell costimulation ( ICOS), CD16A, CD226, CD96, CD40L, CD226, CRTAM, LFA-1, CD27, CD96, TIGIT, KIR, NKG2D, CSF1R, CD40, MARCO, VSIG4, and CD163. Protein according to any one of the above. 前記第2の免疫抗原は、CD3、CD28、T細胞受容体、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、T細胞免疫グロブリン及びムチンドメイン3(TIM-3)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG-3)、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、CD137、OX40、CD27、GITR(TNFRSF18)、TIGIT、誘導性T細胞共刺激(ICOS)、CD16A、CD226、CD96、CD40L、CD226、CRTAM、LFA-1、CD27、CD96、TIGIT、KIR、NKG2D、CSF1R、CD40、MARCO、VSIG4、ならびにCD163からなる群から選択される、請求項1~4のいずれか1項に記載のタンパク質。 The second immunizing antigen includes CD3, CD28, T cell receptor, programmed cell death protein 1 (PD-1), cytotoxic T lymphocyte associated protein 4 (CTLA-4), T cell immunoglobulin and mucin domain. 3 (TIM-3), lymphocyte activation gene 3 (LAG-3), killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR), CD137, OX40, CD27, GITR (TNFRSF18), TIGIT, inducible T cell costimulation ( 2. ICOS), CD16A, CD226, CD96, CD40L, CD226, CRTAM, LFA-1, CD27, CD96, TIGIT, KIR, NKG2D, CSF1R, CD40, MARCO, VSIG4, and CD163. -4. The protein according to any one of items 4 to 4. 前記第1のヒト免疫細胞抗原はCD3であり、前記第2の免疫細胞抗原はCD28である、請求項1~5のいずれか1項に記載のタンパク質。 Protein according to any one of claims 1 to 5, wherein the first human immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28. 前記第1のヒト免疫細胞抗原はCD28であり、前記第2の免疫細胞抗原はCD3である、請求項1~5のいずれか1項に記載のタンパク質。 Protein according to any one of claims 1 to 5, wherein the first human immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3. 前記第1の重鎖可変領域は、前記(iii)の第1の制約的scFvドメイン内で前記第1の軽鎖可変領域のN末端に連結される、請求項1~7のいずれか1項に記載のタンパク質。 Any one of claims 1 to 7, wherein the first heavy chain variable region is linked to the N-terminus of the first light chain variable region within the first constraining scFv domain of (iii). Proteins described in. 前記第1の重鎖可変領域は、前記(iii)の第1の制約的scFvドメイン内で前記第1の軽鎖可変領域のC末端に連結される、請求項1~7のいずれか1項に記載のタンパク質。 Any one of claims 1 to 7, wherein the first heavy chain variable region is linked to the C-terminus of the first light chain variable region within the first constraining scFv domain of (iii). Proteins described in. 前記第2の重鎖可変領域は、前記(vii)の第2の制約的scFvドメイン内で前記第2の軽鎖可変領域のN末端に連結される、請求項1~9のいずれか1項に記載のタンパク質。 Any one of claims 1 to 9, wherein the second heavy chain variable region is linked to the N-terminus of the second light chain variable region within the second constraining scFv domain of (vii). Proteins described in. 前記第2の重鎖可変領域は、前記(vii)の第2の制約的scFvドメイン内で前記第2の軽鎖可変領域のC末端に連結される、請求項1~9のいずれか1項に記載のタンパク質。 Any one of claims 1 to 9, wherein the second heavy chain variable region is linked to the C-terminus of the second light chain variable region within the second constraining scFv domain of (vii). Proteins described in. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原は、前記第2のヒト標的腫瘍抗原と同じであり、任意選択で、
(a)前記第1のsdABD及び前記第2のsdABDが、同じエピトープに結合するか、または
(b)前記第1のsdABD及び前記第2のsdABDが、異なるエピトープに結合する、請求項1~11のいずれか1項に記載のタンパク質。
The first human target tumor antigen is the same as the second human target tumor antigen, and optionally,
(a) the first sdABD and the second sdABD bind to the same epitope; or (b) the first sdABD and the second sdABD bind to different epitopes. 12. The protein according to any one of 11.
前記第1のヒト標的腫瘍抗原は、前記第2のヒト標的腫瘍抗原と異なる、請求項1~11のいずれか1項に記載のタンパク質。 Protein according to any one of claims 1 to 11, wherein the first human target tumor antigen is different from the second human target tumor antigen. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原は、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、請求項1~13のいずれか1項に記載のタンパク質。 Protein according to any one of claims 1 to 13, wherein the first human target tumor antigen is selected from EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM and B7H3. 前記第2のヒト標的腫瘍抗原は、EGFR、HER2、Trop2、CA9、LyPD3、FOLR1、EpCAM、及びB7H3から選択される、請求項1~13のいずれか1項に記載のタンパク質。 Protein according to any one of claims 1 to 13, wherein the second human target tumor antigen is selected from EGFR, HER2, Trop2, CA9, LyPD3, FOLR1, EpCAM and B7H3. 前記第1の切断可能リンカーは、前記第2の切断可能リンカーと同じである、請求項1~15のいずれか1項に記載のタンパク質。 Protein according to any one of claims 1 to 15, wherein the first cleavable linker is the same as the second cleavable linker. 前記第1の切断可能リンカーは、前記第2の切断可能リンカーと異なる、請求項1~15のいずれか1項に記載のタンパク質。 A protein according to any one of claims 1 to 15, wherein the first cleavable linker is different from the second cleavable linker. 前記第1の切断可能リンカーは、腫瘍微小環境に存在するプロテアーゼに対する切断部位を含む、請求項1~17のいずれか1項に記載のタンパク質。 18. A protein according to any one of claims 1 to 17, wherein the first cleavable linker contains a cleavage site for a protease present in the tumor microenvironment. 前記第2の切断可能リンカーは、腫瘍微小環境に存在するプロテアーゼに対する切断部位を含む、請求項1~17のいずれか1項に記載のタンパク質。 A protein according to any one of claims 1 to 17, wherein the second cleavable linker comprises a cleavage site for proteases present in the tumor microenvironment. 前記プロテアーゼは、MMP2、MMP9、メプリン、カテプシン、グランザイム、モトリプラーゼ(Matriplase)、トロンビン、エンテロキナーゼ、KLK7-6、KLK7-13、KLK7-11、KLK7-10、及びuPAから選択される、請求項18または請求項19に記載のタンパク質。 18. The protease is selected from MMP2, MMP9, meprin, cathepsin, granzyme, Matriplase, thrombin, enterokinase, KLK7-6, KLK7-13, KLK7-11, KLK7-10, and uPA. or the protein according to claim 19. 前記(iii)の第1の制約的切断不可能リンカー及び/または前記(vii)の第2の制約的切断不可能リンカーは、長さが6~10アミノ酸であり、任意選択で前記(iii)の第1の制約的切断不可能リンカー及び/または前記(vii)の第2の制約的切断不可能リンカーは、長さが8アミノ酸である、請求項1~20のいずれか1項に記載のタンパク質。 The first constrained non-cleavable linker of said (iii) and/or the second constrained non-cleavable linker of said (vii) are between 6 and 10 amino acids in length, and optionally said (iii) and/or the second constraining non-cleavable linker of (vii) is 8 amino acids in length. protein. 前記(ii)の第1のドメインリンカー及び/または前記(vi)の第2のドメインリンカーは、切断不可能リンカーである、請求項1~21のいずれか1項に記載のタンパク質。 The protein according to any one of claims 1 to 21, wherein the first domain linker (ii) and/or the second domain linker (vi) are non-cleavable linkers. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ前記第1のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項1~22のいずれか1項に記載のタンパク質。 Any one of claims 1-22, wherein the first human target tumor antigen is EGFR and the first sdABD comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11. Protein according to item 1. 前記第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ前記第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項23に記載のタンパク質。 24. The protein of claim 23, wherein the second human target tumor antigen is EGFR and the second sdABD comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11. 前記第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ前記第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項23に記載のタンパク質。 The second human target tumor antigen is HER2 and the second sdABD is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75-78, 82, 85 , 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ前記第1のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項1~22のいずれか1項に記載のタンパク質。 The first human target tumor antigen is HER2 and the first sdABD is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75-78, 82, 85 , 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300. of protein. 前記第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ第2のsdABDは、配列番号4、5、及び9~11のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項26に記載のタンパク質。 27. The protein of claim 26, wherein the second human target tumor antigen is EGFR and the second sdABD comprises an amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 4, 5, and 9-11. 前記第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ前記第2のsdABDは、配列番号45、48~52、54、58、60、63、66、68、72、75~78、82、85、89、95、96、99、103、104、108、112、116、117、121、299、及び300のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項26に記載のタンパク質。 The second human target tumor antigen is HER2 and the second sdABD is SEQ ID NO: 45, 48-52, 54, 58, 60, 63, 66, 68, 72, 75-78, 82, 85 , 89, 95, 96, 99, 103, 104, 108, 112, 116, 117, 121, 299, and 300. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ前記第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、前記第1のsdABDは、配列番号5のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2のsdABDは配列番号5のアミノ酸配列を含む、請求項1~28のいずれか1項に記載のタンパク質。 the first human target tumor antigen is EGFR, the second human target tumor antigen is EGFR, the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, and the second sdABD comprises: Protein according to any one of claims 1 to 28, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ前記第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、前記第1のsdABDは、配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2のsdABDは配列番号9のアミノ酸配列を含む、請求項1~28のいずれか1項に記載のタンパク質。 the first human target tumor antigen is EGFR, the second human target tumor antigen is EGFR, the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, and the second sdABD comprises: Protein according to any one of claims 1 to 28, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ前記第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、前記第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2のsdABDは配列番号96のアミノ酸配列を含む、請求項1~28のいずれか1項に記載のタンパク質。 the first human target tumor antigen is HER2, the second human target tumor antigen is HER2, the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96, and the second sdABD comprises Protein according to any one of claims 1 to 28, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、かつ前記第2のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、前記第1のsdABDは、配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2のsdABDは配列番号96のアミノ酸配列を含む、請求項1~28のいずれか1項に記載のタンパク質。 the first human target tumor antigen is EGFR, the second human target tumor antigen is HER2, the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9, and the first human target tumor antigen 29. The protein according to any one of claims 1 to 28, wherein the sdABD of No. 2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原はHER2であり、かつ前記第2のヒト標的腫瘍抗原はEGFRであり、前記第1のsdABDは、配列番号96のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2のsdABDは配列番号5または配列番号9のアミノ酸配列を含む、請求項1~28のいずれか1項に記載のタンパク質。 the first human target tumor antigen is HER2, the second human target tumor antigen is EGFR, the first sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 96, and the second sdABD Protein according to any one of claims 1 to 28, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 9. 前記第1のヒト免疫細胞抗原はCD3であり、前記第1の重鎖可変領域は配列番号205のアミノ酸配列を含み、かつ前記第1の軽鎖可変領域は配列番号206のアミノ酸配列を含む、請求項1~33のいずれか1項に記載のタンパク質。 the first human immune cell antigen is CD3, the first heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205, and the first light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206; Protein according to any one of claims 1 to 33. 前記第2のヒト免疫細胞抗原はCD28であり、前記第2の重鎖可変領域は配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2の軽鎖可変領域は配列番号214のアミノ酸配列を含む、請求項34に記載のタンパク質。 The second human immune cell antigen is CD28, the second heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216, and the second light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. 35. The protein of claim 34, comprising the sequence. 前記第1のヒト免疫細胞抗原はCD28であり、前記第1の重鎖可変領域は配列番号213または配列番号216のアミノ酸配列を含み、かつ前記第1の軽鎖可変領域は配列番号214のアミノ酸配列を含む、請求項1~33のいずれか1項に記載のタンパク質。 The first human immune cell antigen is CD28, the first heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 213 or SEQ ID NO: 216, and the first light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 214. 34. A protein according to any one of claims 1 to 33, comprising the sequence. 前記第2のヒト免疫細胞抗原はCD3であり、前記第2の重鎖可変領域は配列番号205のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2の軽鎖可変領域は配列番号206のアミノ酸配列を含む、請求項36に記載のタンパク質。 the second human immune cell antigen is CD3, the second heavy chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 205, and the second light chain variable region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 206; 37. Protein according to claim 36. 前記第3のsdABDは、配列番号220のアミノ酸配列を含む、請求項1~37のいずれか1項に記載のタンパク質。 38. The protein of any one of claims 1 to 37, wherein the third sdABD comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220. 配列番号234~249のうち任意の1つのアミノ酸配列を含む、請求項1~38のいずれか1項に記載のタンパク質。 The protein according to any one of claims 1 to 38, comprising any one amino acid sequence of SEQ ID NOs: 234 to 249. 請求項1~39のいずれか1項に記載のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、核酸分子。 A nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence encoding a protein according to any one of claims 1 to 39. 前記核酸分子は、ベクターであり、任意選択で前記核酸分子は、発現ベクターである、請求項40に記載の核酸分子。 41. The nucleic acid molecule of claim 40, wherein the nucleic acid molecule is a vector, and optionally the nucleic acid molecule is an expression vector. 請求項1~37のいずれか1項に記載のタンパク質、または請求項40もしくは請求項41に記載の核酸分子を含む、細胞。 A cell comprising a protein according to any one of claims 1 to 37 or a nucleic acid molecule according to claim 40 or claim 41. 前記タンパク質の発現を可能にする条件下にて、請求項42に記載の細胞を培養することを含む、タンパク質を生成する方法。 43. A method of producing a protein comprising culturing a cell according to claim 42 under conditions that allow expression of the protein. 前記タンパク質を単離することをさらに含む、請求項43に記載の方法。 44. The method of claim 43, further comprising isolating the protein. 請求項1~39のいずれか1項に記載のタンパク質を含む、組成物。 A composition comprising a protein according to any one of claims 1 to 39. 請求項1~39のいずれか1項に記載のタンパク質または請求項45に記載の組成物を対象に投与することを含む、がんを治療する方法。 A method of treating cancer comprising administering to a subject a protein according to any one of claims 1 to 39 or a composition according to claim 45. 前記対象は、ヒト対象である、請求項46に記載の方法。 47. The method of claim 46, wherein the subject is a human subject. 組成物であって、
第1のタンパク質及び第2のタンパク質を含み、そのそれぞれが、N末端からC末端まで、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが前記第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、前記第1の制約的scFvドメインが前記第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、前記第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(iv)第1の切断可能リンカーと、
(v)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(vi)第2のドメインリンカーと、
(vii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、前記第2の重鎖可変領域と前記第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが前記第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、前記第2の制約的scFvドメインが前記第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、前記第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、
(viii)第2の切断可能リンカーと、
(ix)ヒト血清アルブミン(HSA)に結合する第3のsdABDと、を含み、
前記(iii)の第1の重鎖可変領域が前記(vii)の第2の軽鎖可変領域と分子内で会合し、前記第1の免疫細胞抗原または前記第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成し、
前記(vii)の第2の重鎖可変領域が前記(iii)の第1の軽鎖可変領域と分子内で会合し、前記第1の免疫細胞抗原または前記第2の免疫細胞抗原と結合しない可変断片(Fv)を形成する、前記組成物。
A composition,
a first protein and a second protein, each of which, from the N-terminus to the C-terminus,
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, in which said first heavy chain variable region and said first light chain variable region are capable of binding to a first human immune cell antigen when said first heavy chain variable region and said first light chain variable region are associated; the heavy chain variable region of and the first light chain variable region do not associate within the first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to the first human immune cell antigen. , the first constrained single chain variable fragment (scFv) domain;
(iv) a first cleavable linker;
(v) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(vi) a second domain linker;
(vii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constraining non-cleavable linker (CNCL); domains, when said second heavy chain variable region and said second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; the heavy chain variable region of and the first light chain variable region do not associate within the second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to the second human immune cell antigen. , said second constrained single chain variable fragment (scFv) domain;
(viii) a second cleavable linker;
(ix) a third sdABD that binds human serum albumin (HSA);
The first heavy chain variable region of (iii) is intramolecularly associated with the second light chain variable region of (vii) and does not bind to the first immune cell antigen or the second immune cell antigen. forming a variable fragment (Fv);
The second heavy chain variable region of (vii) is intramolecularly associated with the first light chain variable region of (iii) and does not bind to the first immune cell antigen or the second immune cell antigen. Said composition forming a variable fragment (Fv).
前記第1のタンパク質は、前記第2のタンパク質と同一である、請求項48に記載の組成物。 49. The composition of claim 48, wherein the first protein is the same as the second protein. 前記第1のタンパク質及び前記第2のタンパク質内の前記(iv)の第1の切断可能リンカー及び前記(viii)の第2の切断可能リンカーが切断されると、
前記第1のタンパク質の前記第1の重鎖可変領域が前記第2のタンパク質の前記第1の軽鎖可変領域と会合し、前記第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性Fvを形成し、
前記第1のタンパク質の前記第1の軽鎖可変領域が前記第2のタンパク質の前記第1の重鎖可変領域と会合し、前記第1のヒト免疫細胞抗原に結合する活性Fvを形成し、
前記第1のタンパク質の前記第2の重鎖可変領域が前記第2のタンパク質の前記第2の軽鎖可変領域と会合し、前記第2のヒト免疫細胞抗原に結合するFvを形成し、
前記第1のタンパク質の前記第2の軽鎖可変領域が前記第2のタンパク質の前記第2の重鎖可変領域と会合し、前記第2のヒト免疫細胞抗原に結合するFvを形成する、請求項48または請求項49に記載の組成物。
When the first cleavable linker of (iv) and the second cleavable linker of (viii) in the first protein and the second protein are cleaved,
the first heavy chain variable region of the first protein associates with the first light chain variable region of the second protein to form an active Fv that binds to the first human immune cell antigen;
the first light chain variable region of the first protein associates with the first heavy chain variable region of the second protein to form an active Fv that binds to the first human immune cell antigen;
the second heavy chain variable region of the first protein associates with the second light chain variable region of the second protein to form an Fv that binds to the second human immune cell antigen;
4. The second light chain variable region of the first protein associates with the second heavy chain variable region of the second protein to form an Fv that binds to the second human immune cell antigen. 50. The composition according to claim 48 or claim 49.
前記組成物が対象に投与されると、前記対象の腫瘍微小環境において前記切断が起こる、請求項50に記載の組成物。 51. The composition of claim 50, wherein the cleavage occurs in a tumor microenvironment of the subject when the composition is administered to the subject. 組成物であって、
(a)第1のポリペプチドの第1のホモ二量体であって、前記第1のポリペプチドが、
(i)第1のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第1の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第1のドメインリンカーと、
(iii)第1の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第1の軽鎖可変領域に連結された第1の重鎖可変領域を含む第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第1のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、前記第1の重鎖可変領域と前記第1の軽鎖可変領域とが前記第1の制約的scFvドメイン内で会合せず、前記第1の制約的scFvドメインが前記第1のヒト免疫細胞抗原に結合しない、前記第1の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含み、
前記第1のホモ二量体において、一方のポリペプチドの前記第1のVHが他方のポリペプチドの前記第1のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの前記第1のVLが他方のポリペプチドの前記第1のVHと会合し、それぞれが前記第1の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する、前記第1のホモ二量体と、
(b)第2のポリペプチドの第2のホモ二量体であって、前記第2のポリペプチドが、
(i)第2のヒト標的腫瘍抗原(TTA)に結合する第2の単一ドメイン抗原結合ドメイン(sdABD)と、
(ii)第2のドメインリンカーと、
(iii)第2の制約的切断不可能リンカー(CNCL)を介して第2の軽鎖可変領域に連結された第2の重鎖可変領域を含む第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインであって、前記第2の重鎖可変領域と前記第2の軽鎖可変領域とが会合している場合に、それらは第2のヒト免疫細胞抗原に結合可能であるが、前記第2の重鎖可変領域と前記第2の軽鎖可変領域とが前記第2の制約的scFvドメイン内で会合せず、前記第2の制約的scFvドメインが前記第2のヒト免疫細胞抗原に結合しない、前記第2の制約的単鎖可変断片(scFv)ドメインと、を含み、
前記第2のホモ二量体において、一方のポリペプチドの前記第2のVHが他方のポリペプチドの前記第2のVLと会合し、かつ一方のポリペプチドの前記第2のVLが他方のポリペプチドの前記第2のVHと会合し、それぞれが前記第2の免疫抗原に結合可能な2つの活性可変断片(Fv)を形成する、前記第2のホモ二量体と、を含む、前記組成物。
A composition,
(a) a first homodimer of a first polypeptide, the first polypeptide comprising:
(i) a first single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a first human target tumor antigen (TTA);
(ii) a first domain linker;
(iii) a first constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a first heavy chain variable region linked to a first light chain variable region via a first constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, in which said first heavy chain variable region and said first light chain variable region are capable of binding to a first human immune cell antigen when said first heavy chain variable region and said first light chain variable region are associated; the heavy chain variable region of and the first light chain variable region do not associate within the first restrictive scFv domain, and the first restrictive scFv domain does not bind to the first human immune cell antigen. , the first constrained single chain variable fragment (scFv) domain;
In the first homodimer, the first VH of one polypeptide associates with the first VL of the other polypeptide, and the first VL of one polypeptide associates with the first VL of the other polypeptide. said first homodimer associated with said first VH of a peptide to form two active variable fragments (Fv) each capable of binding said first immunizing antigen;
(b) a second homodimer of a second polypeptide, the second polypeptide comprising:
(i) a second single domain antigen binding domain (sdABD) that binds a second human target tumor antigen (TTA);
(ii) a second domain linker;
(iii) a second constrained single chain variable fragment (scFv) comprising a second heavy chain variable region linked to a second light chain variable region via a second constrained non-cleavable linker (CNCL); domains, when the second heavy chain variable region and the second light chain variable region are associated, they are capable of binding a second human immune cell antigen; and the second light chain variable region do not associate within the second restrictive scFv domain, and the second restrictive scFv domain does not bind to the second human immune cell antigen. , said second constrained single chain variable fragment (scFv) domain;
In the second homodimer, the second VH of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide, and the second VL of one polypeptide is associated with the second VL of the other polypeptide. said second homodimer associated with said second VH of a peptide to form two active variable fragments (Fv) each capable of binding said second immunizing antigen. thing.
前記第1の免疫細胞抗原は、前記第2の免疫細胞抗原と異なる、請求項52に記載の組成物。 53. The composition of claim 52, wherein the first immune cell antigen is different from the second immune cell antigen. 前記第1の免疫細胞抗原はCD3であり、前記第2の免疫細胞抗原はCD28である、請求項52または請求項53に記載の組成物。 54. The composition of claim 52 or claim 53, wherein the first immune cell antigen is CD3 and the second immune cell antigen is CD28. 前記第1の免疫細胞抗原はCD28であり、前記第2の免疫細胞抗原はCD3である、請求項52または請求項53に記載の組成物。 54. The composition of claim 52 or claim 53, wherein the first immune cell antigen is CD28 and the second immune cell antigen is CD3. 前記第1のヒト標的腫瘍抗原は、EGFRまたはHER2である、請求項52~55のいずれか1項に記載の組成物。 56. The composition of any one of claims 52-55, wherein said first human target tumor antigen is EGFR or HER2. 前記第2のヒト標的腫瘍抗原は、EGFRまたはHER2である、請求項52~55のいずれか1項に記載の組成物。 56. The composition of any one of claims 52-55, wherein said second human target tumor antigen is EGFR or HER2.
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