JP2023545178A - Stingアゴニストと、細胞透過性ペプチド、カーゴ、及びtlrペプチドアゴニストを含む複合体との組合せ - Google Patents
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Abstract
本発明は、インターフェロン応答cGAMP相互作用因子(1)(STING)のアゴニストと、特定の抗原又は抗原エピトープを含むワクチン、即ち、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体の組合せを提供する。そのような組合せは、医薬、特に癌の予防及び/又は治療において特に有用である。更に、本発明は、例えば癌の予防及び/又は治療において有用である医薬組成物及びワクチンの等の組成物も提供する。
Description
本発明は、ワクチン接種及び免疫療法の分野、特に癌免疫療法に関する。
免疫系は、腫瘍細胞を認識し、ある程度排除することができるが、この抗腫瘍応答は、しばしば十分ではなく、非効率的である。治療的ワクチン接種によってこの弱い抗腫瘍応答を促進することは、癌治療の長年の目標であった。このように、免疫系を調整して免疫応答を高めることは、標準治療と組み合せることができるため、腫瘍学における有望な治療アプローチとなっている。
癌ワクチンは、個別化(自家)ワクチンと標準化ワクチンの2つの主要なカテゴリーに分けることができ、更に技術プラットフォームに応じて分類されることができる。現在の個別化ワクチンには、腫瘍溶解液ワクチンのほか、樹状細胞系ワクチン(以下、細胞系)が挙げられる。後者では、腫瘍溶解液を使用したパルス療法、又は腫瘍から抽出したRNAによるトランスフェクションのいずれかで抗原ローディング(loading)が起こることがである。この場合、抗原は、腫瘍特異的である、又は関連しているが、明確に定義されていない。ペプチドパルス又はProvenge(登録商標)ワクチンの製造に使用される前立腺酸性ホスファターゼ(PAP)等のタンパク質を用いて、樹状細胞には、特定された抗原で搭載(ロード;load)されることもできる。しかしながら、これらの細胞系の治療法の製造プロセスには時間と労力がかかり、一方で品質基準に到達し維持することは困難である。免疫モニタリングは更なる合併症を引き起こす。更に、大多数の自家癌ワクチンは、特定され標準化されたワクチンとは異なり、使用される抗原の同一性や量を制御することができない。
細胞系治療法(抗原提示細胞(APC)、T細胞、CAR、溶解物等)とは対照的に、サブユニットワクチン(タンパク質又はペプチド)は、生産が容易で、広範囲の患者に投与できるバッチからバッチへの再現性が著しく優れた標準化されたワクチンの開発を可能にする。更に、抗原は完全に特定されており、より良い免疫モニタリングを可能にし、ワクチン成分の望ましくない影響のリスクを低減する。
前臨床及び臨床開発で評価された異なるアプローチは、短鎖ペプチドワクチン(非特許文献1)、長鎖ペプチドワクチン(非特許文献2)、及びタンパク質が挙げられる。長鎖ペプチドやタンパク質ワクチンとは対照的に、短鎖ペプチドワクチンは半減期が非常に短く、免疫応答に悪影響を及ぼす可能性がある。
一般的に、癌ワクチンは癌患者に投与され、免疫系が腫瘍細胞を認識して死滅させる能力を強化する。治療用癌ワクチンの主な目的は、腫瘍細胞に特異的なキラーT細胞(細胞傷害性Tリンパ球とも呼ばれる)を産生することである。この目的のために、また強力な免疫応答を達成するために、ワクチンは、通常、抗原又は抗原エピトープを含み、抗原又は抗原エピトープは、腫瘍にも存在し、抗原提示細胞(APC)、特に樹状細胞(DC)に送達される必要があり、癌免疫を開始させることを可能にする。DCは、これらの腫瘍抗原を小さなペプチドに加工し、MHCクラスI又はMHCクラスII分子をT細胞に発現させた細胞表面に提示される。その後T細胞に認識され、それによって刺激を誘導するペプチドは、エピトープと呼ばれる。MHCクラスI分子とMHCクラスII分子による提示は、それぞれCD8+細胞傷害性Tリンパ球(CTLs)及びCD4+ヘルパーT(Th)細胞という2つのクラスのT細胞の活性化を可能にする。更に、完全に活性化されるためには、抗原認識T細胞の他に、抗原非特異的でAPCの表面に発現している共刺激分子とT細胞との相互作用によって提供される共刺激シグナルという第2のシグナルが必要である。したがって、効率的な治療用癌ワクチンの2つの主要な要件は、腫瘍抗原の特異性と、それらをDCに効率的に送達する能力である。
まとめると、腫瘍特異的免疫応答の誘導には、以下の3つの主要なステップが必要である:(i)抗原は、エピトープに加工される樹状細胞に送達される;(ii)樹状細胞は適切な活性化シグナルを受け取らなくてはならない;(iii)活性化された腫瘍抗原を搭載した樹状細胞は、リンパ器官においてT細胞を介した免疫応答を生成しなければならない。
腫瘍細胞は、個々の抗原の発現をダウンレギュレーションすることによって免疫系から逃れることができるため(受動免疫逃避)、マルチエピトープ抗原送達は利点をもたらす。実際、タンパク質系ワクチンは、単一のMHC対立遺伝子に制限されることなく、樹状細胞(DC)等の抗原提示細胞(APC)へのマルチエピトープ抗原送達を可能にする。別の強みは、タンパク質で搭載された樹状細胞における、最近報告された長時間持続するエピトープ提示である(非特許文献3)。更に、タンパク質は、構成エピトープのMHC制限提示を達成するためにDCによる取り込みとプロセシングを必要とする。これは、そのようなストリンジェントなプロセシング要件を持たない短鎖ペプチドによるワクチン接種の後示されたように、末梢性トレランスを誘発するリスクを減らす(非特許文献4)。
しかしながら、殆どの可溶性タンパク質は、一般にエンドリソソームで分解され、MHCクラスI分子上で交差提示されにくいため、CD8+T細胞応答に対する免疫原性が低い(非特許文献5)。更に、成熟DCは、未熟DCよりもT細胞応答のプライミング及び誘発において、より強力であるが(非特許文献6)、外因性抗原、特にMHCクラスII制限抗原を効率的に取り込む能力を失う(非特許文献7)。その結果、ワクチンとしてのペプチドパルスDCは、幾つかの制限を有する。例えば、ペプチドの分解、迅速なMHCクラスIのターンオーバー、及びDC/ペプチドの調製及び注入中のMHCクラスI分子からのペプチドの解離は、DC表面上のMHCクラスI/ペプチド複合体の短い半減期をもたらし、弱いT細胞応答につながることがある。
タンパク質系のワクチン送達の有効性を改善するために、DCへの癌ペプチドの細胞内送達のための細胞透過性ペプチドの使用が提案されている(非特許文献8)。細胞透過性ペプチド(CPP)は、細胞膜を通過し、殆どの種類の細胞に入る能力を有するペプチドである(非特許文献9)(非特許文献10))。或いは、天然のタンパク質に存在するという起源を反映するタンパク質形質導入ドメイン(PTD)とも呼ばれる。幾つかの強力なCPPは、ヒト免疫不全ウイルスのTatタンパク質、単純ヘルペスウイルスのVP22タンパク質、及び線維芽細胞増殖因子を含むタンパク質から同定されてきた(非特許文献11、非特許文献12、非特許文献13、非特許文献14、非特許文献15)。DC/TAT-TRP2によって誘導されるT細胞活性は、DC/TRP2によって誘導されるT細胞活性よりも3倍~10倍高いことが分かった(非特許文献16)。
DC上の共刺激分子のレベルを増加させ、標的抗原に対する免疫系の応答を増強するために、アジュバントが使用されることがある。アジュバントは、免疫系によって自然に認識される保存された微生物成分を模倣することによって、このタスクを達成することができる。例えば、リポ多糖類(LPS)、細菌の細胞壁の成分、二本鎖RNA(dsRNA)、一本鎖DNA(ssDNA)、非メチル化CpGジヌクレオチド含有DNA等の核酸が挙げられる。これらの存在は、抗原に対する自然免疫応答を増加させることができる。更に、このアジュバントは、抗体産生をもたらす液性免疫応答ではなく、CTLと型分極Th1(type polarized Th1)による適応免疫応答を促進するはずである。様々なアジュバントが評価されているが、ヒトへの使用について規制当局の承認を得たものは限られている。これらには、米国では、Alum、MPL(モノホスホリルリピドA)、及びASO4(Alum及びMPL)、欧州ではMF59(水中油型乳剤)、ASO4、リポソームが挙げられる(非特許文献17)。
最近では、Toll様受容体(TLR)リガンドが有望なクラスのアジュバントとして現れている(非特許文献18)。したがって、癌ワクチン研究の重要な発展は、TLR-3(poly I:C)、TLR-4(モノホスホリルリピドA;MPL)、TLR-5(フラゲリン)、TLR-7(イミキモド)、及びTLR-9(CpG)を含む、様々なTLRアゴニストからワクチン製剤までを含むことである(非特許文献19)。TLR刺激後に免疫細胞によって産生されるシグナル伝達とサイトカインの種類は、CD4+T細胞のTh1、Th2、Th17、Treg細胞への分化を制御する。殆どのTLR系アジュバントによるDC及びT細胞等の免疫細胞の刺激は、炎症誘発性サイトカインを産生し、Th1及びCD8+T応答を促進する(非特許文献20)。
ワクチンをTLRリガンドに結合させることは、(i)TLRを発現する免疫細胞による優先的な取り込み、(ii)より高い免疫応答、(iii)末梢性トレランスを誘導するリスクの低減等、非結合型ワクチンよりも幾つかの利点を提供する魅力的なアプローチである。実際、抗原を搭載した全ての抗原提示細胞が同時に活性化される。様々なグループがこのアプローチを検討し、様々なTLRリガンドが主にペプチド又はタンパク質ワクチンに化学的に結合された(非特許文献21)。ペプチドへの化学的結合は容易に行われるため、結合型ワクチンについて最もよく研究されているTLRリガンドは、TLR2アゴニストPam2Cys及びPam3Cysである(非特許文献22)。
最近では、細胞透過性ペプチド、抗原性カーゴ、自己アジュバント性を付与するTLRアゴニストの3つの要素からなる複合体を提供する、キメラタンパク質ワクチンプラットフォームが記述された(非特許文献23)。このワクチンプラットフォームは、前臨床腫瘍モデルにおいてCD8及びCD4の両方の抗原特異的免疫応答を誘発し、増加した腫瘍内白血球浸潤と共に、免疫記憶及び高いワクチン効率をもたらすことを示した(非特許文献24、非特許文献25)。
もう1つの非常に有望な戦略は、インターフェロン遺伝子の刺激因子/インターフェロン応答cGAMP相互作用因子1の刺激因子(STING)経路の標的化である。STINGは、細胞質DNAセンサーによるウイルス又は細菌のDNA分解の副産物である環状GAMPに結合することによって活性化されるアダプタータンパク質であり(非特許文献26、非特許文献27)、活性化されると、高レベルのI型インターフェロン、及びIL-6及びTNF等の他の炎症誘発性サイトカインの分泌を誘導する(非特許文献26、非特許文献28、非特許文献29)。更に、STINGシグナル伝達は、NK細胞の動員と活性化を増強し(非特許文献30)、CD4及びCD8 T細胞の走化性を促進することが示された(非特許文献31)。更に、STINGシグナル伝達は、患者由来の結腸直腸腺癌細胞で阻害されることが見出され、その抗腫瘍的役割を裏付けた(非特許文献32)。これらの性質により、合成STINGアゴニストは、腫瘍を炎症させて抗腫瘍免疫応答を誘発することを目的とした臨床研究及び前臨床腫瘍モデルで試験されてきた。STINGアゴニストの腫瘍内注射は、様々なマウス腫瘍モデルの退行を誘導する一方で、腫瘍除去したマウスの再誘発(re-challenge)に対する抵抗によって強調されるように、全身性腫瘍特異的免疫応答も誘発することが示された(非特許文献33)。更に、GM-CSF産生癌細胞ワクチン内に製剤化されたSTINGアゴニストは、幾つかのマウス腫瘍モデルの進行を遅らせることが示され、腫瘍内投与が唯一の有効な経路ではないことが示された。現在、複数の第1/2相臨床試験で、様々な固形腫瘍及びリンパ腫患者に対するSTINGアゴニストの使用が調査されている。
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上記の観点から、本発明の目的は、上記で概説した現在の癌ワクチンの欠点を克服することである。特に、特定の腫瘍に対する特異性を提供する、抗原又は抗原エピトープを含むワクチンとSTINGアゴニストの組合せを提供することが、本発明の目的である。また、各成分(例えば、単独療法として投与する場合)の抗腫瘍効果を増強又は延長するワクチンを提供することも、本発明の目的である。従って、このような組合せは、特に改善された抗腫瘍活性を有する、癌免疫療法用途のより強力なワクチンを表す。したがって、本発明は、抗腫瘍免疫応答を開始、可能、増強、及び/又は改善するための併用療法に関する。
本目的は、下記及び添付の請求項に記載されている主題によって達成される。
以下に本発明を詳細に説明するが、異なることもあるため、本発明は、本明細書に記載されている特定の方法論、プロトコル、及び試薬に限定されないことを理解すべきである。また、本明細書で使用されている用語は、添付の請求項によってのみ限定される本発明の範囲を限定することを意図していないことも理解すべきである。特に定義されていない限り、本明細書で使用されている全ての技術用語及び科学用語は、当業者が一般的に理解しているもののと同じ意味を有する。
以下に本発明を詳細に説明するが、異なることもあるため、本発明は、本明細書に記載されている特定の方法論、プロトコル、及び試薬に限定されないことを理解すべきである。また、本明細書で使用されている用語は、添付の請求項によってのみ限定される本発明の範囲を限定することを意図していないことも理解すべきである。特に定義されていない限り、本明細書で使用されている全ての技術用語及び科学用語は、当業者が一般的に理解しているもののと同じ意味を有する。
以下では、本発明の要素について説明する。これらの要素は、特定の実施形態と共に列挙されているが、これらは、追加の実施形態を作成するために、任意の方法で、任意の数で組み合わせることができることを理解すべきである。様々に記述された実施例及び好ましい実施形態は、本発明を明示的に記述された実施形態のみに限定するように解釈されるべきではない。この記載は、明示的に記述された実施形態と任意の数の開示された及び/又は好ましい要素を組み合わせた実施形態を裏付けし、包含するように理解されるべきである。更に、本出願に記載された全ての要素の任意の順列及び/又は組合せは、文脈が別段の指示をしない限り、本出願の記載によって開示されたものとみなされるべきである。
本明細書及びそれに続く請求項を通して、文脈が別に要求しない限り、「含む(comprise)」という用語、並びに「comprises」及び「comprising」のようなバリエーションは、指定された部材、整数、又は工程を含むことを意味するが、他の指定されていない部材、整数、又は工程を除外することを意味しないと理解される。「からなる(consist of)」という用語は、「含む(comprise)」という用語の特定の具体化であり、他の指定されていない部材、整数、又は工程は除外される。本発明の文脈において、「含む(comprise)」という用語は、「からなる(consist of)」という用語を含む。したがって、「含む(comprising)」という用語は、「含む(including)」及び「なる(consisting)」も含む。例えば、Xを「含む」(“comprising”X)組成物は、Xのみからなることもできれば、例えば、X+Yのように追加的なものを含むこともできる。
「a」、「an」、及び「the」という用語、並びに発明を記述する文脈(特にクレームの文脈)で使用される類似の言及は、本明細書で別段の指示がない限り、又は文脈によって明確に矛盾しない限り、単数形と複数形の両方を含むものと解釈される。本明細書での値の範囲の引用は、範囲内にあるそれぞれ別々の値を個別に参照するための簡略化された方法として機能することを単に意図している。本明細書で別段の指示がない限り、それぞれ個々の値は、本明細書で個別に引用されたかのように明細書に組み込まれている。明細書のいかなる文言も、発明の実施に不可欠な特許請求されていない要素を示すものと解釈されるべきではない。
「実質的に」という用語は、「完全に」を除外するものではない。例えば、Yを「実質的に含まない」組成物は、Yを完全に含まなくてもよい。必要に応じて、「実質的に」という用語を発明の定義から省略してもよい。
数値xに対する「約」という用語は、x±10%を意味する。
STINGアゴニストと、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せ
第1の態様では、本発明は、
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む組合せであって、成分a)~c)(即ち、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニスト)が共有結合される組合せを提供する。
第1の態様では、本発明は、
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む組合せであって、成分a)~c)(即ち、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニスト)が共有結合される組合せを提供する。
驚くべきことに、本発明者は、(i)STINGアゴニストと、(ii)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せが、抗原特異的CD8 T細胞を促進するCD4及びCD8 T細胞の両方の応答を改善し、腫瘍内免疫原性を増加させ、生存率の大幅な増加及び腫瘍増殖の減少をもたらすことを見出した。これは、STINGアゴニストと複合体が共に作用する相乗効果を示し、単独療法として投与されるその各成分の抗腫瘍効果を大幅に増加させる。
本明細書で使用される「組合せ」という用語は、その成分の任意の種類の組合せを指し、特に、(i)STINGアゴニストと(ii)本明細書に記載される複合体、並びに、任意で、更なる成分の任意の種類の組合せを指す。特に、組合せの成分は、一緒に提供される(即ち、組み合わせた方法で)。幾つかの実施形態では、組合せは、キット(例えば、(少なくとも部分的に)分離された方法で成分を含む)であることができる。他の実施形態では、組合せは、組成物(例えば、成分が1つの組成物に含まれていることができる)であることができる。
したがって、組合せの成分(i)(STINGアゴニスト)及び(ii)(複合体)(及び任意の更なる成分)のそれぞれは、別々の組成物に含まれることができる。他の実施形態では、組合せの成分(i)(STINGアゴニスト)及び(ii)(複合体)(及び任意の更なる成分)の幾つか(全てではない)は、同じ組成物に含まれることができる。或いは、組合せの全ての成分(i)(STINGアゴニスト)及び(ii)(複合体)(及び任意の更なる成分)は、同じ組成物に含まれることができる。したがって、組合せの成分(i)(STINGアゴニスト)及び(ii)(複合体)(及び任意の更なる成分)のそれぞれは、別々の容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。他の実施形態では、組合せの成分(i)(STINGアゴニスト)及び(ii)(複合体)(及び任意の更なる成分)の幾つか(全てではない)は、同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。或いは、組合せの全ての成分(i)(STINGアゴニスト)及び(ii)(複合体)(及び任意の更なる成分)は、同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。
より具体的には、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、同じ組成物及び/又は同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ組成物及び/又は同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ組成物及び/又は同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。例えば、、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ組成物及び/又は同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。
幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、別々の組成物及び/又は別々の容器(例えば、別々のシリンジ)に提供されることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物及び/又は別々の容器(例えば、別々のシリンジ)に提供されることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物及び/又は別々の容器(例えば、別々のシリンジ)に提供されることができる。例えば、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物及び/又は別々の容器(例えば、別々のシリンジ)に提供されることができる。
以下で、本発明の組合せの成分、即ち、STINGアゴニスト、及び細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体、並びにこれらの実施形態は、詳細に記載される。以下(i)~(iii)が理解される。(i)本発明の組合せの好ましい実施形態は、STINGアゴニストの好ましい実施形態を含む;(ii)本発明の組合せの好ましい実施形態は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体の好ましい実施形態を含む;及び(iii)本発明の組合せのより好ましい実施形態は、STINGアゴニストの好ましい実施形態と、細胞透過性ペプチド,少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体の好ましい実施形態とを含む。
幾つかの実施形態では、本発明の組合せ、即ち、STINGアゴニスト、並びに細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体は、更に追加の活性化合物と組み合わせて、投与されることができる(例えば、腫瘍/癌治療の文脈で)。他の実施形態では、本発明の組合せ、即ち、STINGアゴニスト、並びに細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体は、更に追加の活性化合物と組み合わせて、投与されない(例えば、腫瘍/癌治療の文脈で)。言い換えれば、本発明の組合せは、「単独」療法としても有用であることができる。
細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープを含む複合体
本発明の組合せは、以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト
を含む複合体を含み、
成分a)~c)、即ち細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストは、共有結合される。以下において、「複合体」又は「本発明の組合せに含まれる複合体」という用語を用いて、共有結合される細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体を指すこともある。
本発明の組合せは、以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト
を含む複合体を含み、
成分a)~c)、即ち細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストは、共有結合される。以下において、「複合体」又は「本発明の組合せに含まれる複合体」という用語を用いて、共有結合される細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体を指すこともある。
本発明の組合せに含まれるそのような複合体は、(i)多エピトープ細胞傷害性T細胞媒介免疫の刺激、(ii)Th細胞の誘導、及び(iii)免疫記憶の促進、を同時に提供する。これにより、本発明の組合せに含まれる複合体は、特に改善された抗腫瘍活性を有する強力なワクチンを提供する。
好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体は、ポリペプチド又はタンパク質、特に、組換えポリペプチド又は組換えタンパク質であり、好ましくは、組換え融合タンパク質又は組換え融合ポリペプチドである。
本明細書で使用される(即ち明細書を通して)「組換え」という用語は、それが(本明細書では、ポリペプチド又はタンパク質)自然に発生しないことを意味する。したがって、組換えポリペプチド又は組換えタンパク質である発明の組合せに含まれる複合体は、典型的には、成分a)~cを含み、成分a)~成分c)は異なる起源のものであることができ、即ち、この組合せにおいて自然に発生しない。幾つかの実施形態では、「組換え」という用語は、半合成又は合成起源である、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質を指す。組換えペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、組換えDNA技術を使用して結合されることができる異なる起源のDNA分子の組合せの発現から生じることがある。幾つかの例では、組換えペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、その起源又は操作によって、自然界で関連しているタンパク質の全部又は一部と関連しないことがある。更に、組換えペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、自然界で結合されるもの以外のポリペプチドと結合されることができる。組換えペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、当技術分野で知られた方法、例えば、十分に確立されたプロトコルを用いた、原核生物及び真核生物の発現系によって、製造されることができる(例えば、LaVallie,Current Protocols in Protein Science (1995)5.1.1-5.1.8;Chen et al.,Current Protocols in Protein Science(1998)5.10.1-5.10.41参照)。例えば、本発明の組合せに含まれる複合体において、成分a)~c)は、異なる起源のものであることができ、即ち、複合体の成分a)~c)は通常、自然界で共に発生しない(その成分a)~c)の組合せにより、複合体は、「組換え」であることができる)。
本発明の文脈では、即ち本出願を通して、「ペプチド」、「ポリペプチド」、「タンパク質」、及びこれらの用語のバリエーションは、それぞれ、融合タンパク質を含むペプチド、オリゴペプチド、オリゴマー又はタンパク質を指し、好ましくは通常のペプチド結合によって、又は、代わりに、例えば、等価性(isosteric)ペプチドの場合のように、修飾されたペプチド結合によって互いに結合された少なくとも2つのアミノ酸を含む。ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、L-アミノ酸及び/又はD-アミノ酸からなることができる。好ましくは、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、L-アミノ酸から(完全に)構成されるか、又はD-アミノ酸から(完全に)構成され、それによって「レトロインベルソペプチド配列」を形成する。「レトロインベルソ(ペプチド)配列」という用語は、配列の方向が反転し、各アミノ酸残基のキラリティーが反転した、線状ペプチド配列の異性体を指す(例えば、Jameson et al.,Nature,368,744-746(1994);Brady et al.,Nature,368,692-693(1994)参照)。特に、「ペプチド」、「ポリペプチド」、「タンパク質」という用語は、非ペプチド構造要素を含むペプチド類似体として定義される「ペプチド模倣体」も含み、そのペプチドは、天然の親ペプチドの生物学的作用を模倣又は拮抗することができる。ペプチド模倣体は、酵素的に切断しやすいペプチド結合等の古典的なペプチド特性がない。特に、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、これらのアミノ酸に加えて遺伝暗号で定義された20個のアミノ酸以外のアミノ酸を含むこともでき、遺伝暗号で定義された20のアミノ酸以外のアミノ酸から構成されることもできる。特に、本発明の文脈におけるペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、当業者にはよく知られている、翻訳後の成熟過程等の自然の過程、又は化学的過程によって修飾されたアミノ酸から等しく構成されることができ、そのような修飾については文献に詳しく記載されている。これらの修飾は、ポリペプチドにおいて:ペプチド骨格において、アミノ酸鎖において、更にはカルボキシ末端又はアミノ末端のどこにでも現れる。特に、ペプチド又はポリペプチドは、ユビキチン化に後に分岐したり、分岐の有無にかかわらず環状になったりすることができる。このタイプの修飾は、当業者にはよく知られている天然又は合成の翻訳後プロセスの結果であることができる。特に本発明の文脈における「ペプチド」、「ポリペプチド」、「タンパク質」という用語は、修飾されたペプチド、ポリペプチド、及びタンパク質も含む。例えば、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質の修飾は、アセチル化、アシル化、ADPリボシル化、アミド化、ヌクレオチド又はヌクレオチド誘導体の共有結合固定、脂質又は脂質誘導体の共有結合固定、ホスファチジルイノシトールの共有結合固定、共有結合性又は非共有結合性の架橋、環化、ジスルフィド結合形成、脱メチル化、ペグ化を含むグリコシル化、ヒドロキシル化、ヨウ化、メチル化、ミリストイル化、酸化、タンパク質分解プロセス、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セネロイル化(seneloylation)、硫酸化、アルギニル化又はユビキチン化等のアミノ酸付加を含むことができる。そのような修飾は、文献に完全に記載されている(Seifter et al.(1990)Analysis for protein modifications and nonprotein cofactors,Meth.Enzymol.182:626-646 and Rattan et al.,(1992)Protein Synthesis:Post-translational Modifications and Aging,Ann NY Acad Sci,663:48-62)。したがって、「ペプチド」、「ポリペプチド」、「タンパク質」という用語は、例えば、リポペプチド、リポタンパク質、糖ペプチド、糖タンパク質等を含むことが好ましい。
しかしながら、特に好ましい実施形態では、本明細書に記載される複合体は、「古典的な」ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質であり、それにより、「古典的な」ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、通常、通常のペプチド結合によって互いに結合される、遺伝暗号によって定義される20のアミノ酸から選択されたアミノ酸で構成される。
本発明の組合せに含まれる複合体がポリペプチド又はタンパク質である場合、少なくとも50、少なくとも60、少なくとも70、好ましくは少なくとも80、少なくとも90、より好ましくは少なくとも100、少なくとも110、更により好ましくは少なくとも120、少なくとも130、特に好ましくは少なくとも140、又は最も好ましくは少なくとも150のアミノ酸残基を含むことが好ましい。
本明細書で使用されるように(即ち、本出願を通して)、「配列変異体」という用語は、参照配列におけるあらゆる変更を指す。「配列変異体」という用語は、ヌクレオチド配列変異体及びアミノ酸配列変異体を含む。好ましくは、参照配列は、「配列及び配列番号の表」(配列表)に記載されている配列、即ち配列番号1~配列番号55のいずれかである。特に、配列変異体は、参照配列に対して、(配列の全長にわたって)少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を共有する。配列同一性は、以下に記載されるように計算されることができる。特に、配列変異体は、参照配列の特定の機能を保持する。特に、アミノ酸配列変異体は、参照配列内のアミノ酸の1以上が削除又は置換されたり、1以上のアミノ酸が参照アミノ酸配列の配列に挿入されたりする、変更された配列を有する。変更の結果、アミノ酸配列変異体は、参照配列に対して、少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%同一である、アミノ酸配列を有する。例えば、少なくとも90%同一である変異体配列は、参照配列の100のアミノ酸当たり、10以下の変更、即ち、削除、挿入、又は置換の任意の組み合わせを有する。
本発明の文脈では、本発明のクエリアミノ酸配列に対して、少なくとも、例えば95%の「配列同一性を共有する」アミノ酸配列は、対象アミノ酸配列が、クエリアミノ酸配列の各100のアミノ酸配列当たり5個までのアミノ酸の変更を含むことができる以外は、対象アミノ酸配列が、クエリ配列に対して同一であることを意味することを意図している。言い換えれば、クエリアミノ酸配列に対して少なくとも95%の同一性の配列を有するアミノ酸配列を得るために、対象配列のアミノ酸残基の最大5%(100のうちの5)が、好ましくは、上記の変異体又は断片の画定内で、別のアミノ酸で挿入又は置換されたり、削除されたりすることができる。当然、核酸配列でも同様に適用される。
正確な対応のない(アミノ酸又は核酸)配列については、第1の配列の「同一性(%)」は、第2の配列に関して決定されることができる。一般に、比較されるこれらの2つの配列は、配列間で最大の相関を与えるようにアライメントされることができる。これは、アライメントの程度を高めるために、一方又は両方の配列に「ギャップ」を挿入することが含むことができる。同一性(%)は、比較される各配列の長さ全体にわたって決定されることができ(いわゆるグローバルアラインメント)、同じ又は類似の長さの配列、又はより短く画定された長さ(いわゆるローカルアラインメント)の配列に特に好適であり、これは不等長の配列により適している。
2つ以上の配列の同一性と相同性を比較する方法は、当技術分野でよく知られている。2つの配列が同一である割合は、例えば数学的アルゴリズムを使用して決定されることができる。使用されることができる数学的アルゴリズムの好ましいが限定ではない例としては、Karlin et al.(1993),PNAS USA,90:5873-5877のアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、BLAST familyのプログラム、例えば、BLAST又はNBLASTプログラムに組み込まれ(Altschul et al.,1990,J.Mol.Biol.215,403-410、又はAltschul et al.(1997),Nucleic Acids Res,25:3389-3402も参照)、ワールドワイドウェブサイト(ncbi.nlm.nih.gov)のNCBIのホームページ及びFASTA(Pearson(1990),Methods Enzymol.183,63-98;Pearson and Lipman(1988),Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 85,2444-2448.)を介して入手しやすい。ある程度まで他の配列に対して同一である配列は、これらのプログラムによって特定されることができる。更に、Wisconsin Sequence Analysis Package, version 9.1(Devereux et al.,1984,Nucleic Acids Res.,387-395)で利用可能なプログラム、例えば、特にプログラム(BESTFIT及びGAP)を使用して、2つのポリヌクレオチド間の同一性(%)、並びに2つのポリペプチド配列間の同一性(%)及び相同性(%)又は同一性であることを決定することができる。BESTFITは、(Smith and Waterman(1981),J.Mol.Biol. 147,195-197.)の「局所的相同性」アルゴリズムを使用し、2つの配列間の類似性の最も良い単一の領域を見つける。
一般に、参照されたアミノ酸配列に存在する1つ以上のアミノ酸の置換は、保存的に行われることが好ましい。保存的置換の例としては、Ile、VaI、Leu、又はAla等、1つの脂肪族残基を別のものに置換する場合や、LysとArgとの間、GluとAspとの間、又はGlnとAsnとの間等、1つの極性残基を別のものに置換する場合等がある。他のこのような保存的置換、例えば、同様の疎水性特性を有する領域全体の置換がよく知られている(Kyte and Doolittle,1982,J.Mol.Biol.157(1):105-132)。本発明の文脈では、1以上のL-アミノ酸と1以上のD-アミノ酸との置換は、保存的置換とみなされる。アミノ酸置換の例を以下の表1に示す:
成分a)-細胞透過性ペプチド
細胞透過性ペプチド(CPP)は、効率的な送達、即ち、抗原提示細胞(APC)、特に樹状細胞(DC)、ひいては樹状細胞の抗原処理機構への、特に少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープの輸送及び搭載を可能にする。
細胞透過性ペプチド(CPP)は、効率的な送達、即ち、抗原提示細胞(APC)、特に樹状細胞(DC)、ひいては樹状細胞の抗原処理機構への、特に少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープの輸送及び搭載を可能にする。
「細胞透過性ペプチド」(「CPP」)という用語は、一般的に、異なる種類のカーゴ分子を細胞膜を介して輸送することができ、それによって、様々な分子カーゴ(ナノサイズの粒子から小さな化学分子及びDNAの大きな断片まで)の細胞取り込みを促進する短いペプチドを示すために使用される。細胞透過性ペプチドに結合したカーゴ分子の「細胞移行」とは、一般的に、細胞膜を通過したカーゴ分子の輸送、及びそれによって細胞内へのカーゴ分子の侵入を意味する。特定の場合に応じて、カーゴ分子はその後、細胞質内で放出されたり、細胞内小器官に向けられたり、更に細胞表面に提示されることができる。本発明の組合せに含まれる、細胞透過性ペプチド又は複合体(前記細胞透過性ペプチドを含む)の細胞透過能、又はインターナリゼーションは、生きた細胞及び固定された細胞のフローサイトメトリー又は蛍光顕微鏡観察、当該ペプチド又は複合体を形質導入した細胞の免疫細胞化学、及びウェスタンブロットを含む、当業者に知られている標準的な方法によって確認することができる。
細胞透過性ペプチドは、典型的には、高い相対的存在量の、リジン又はアルギニン等の正電荷を帯びたアミノ酸を含むアミノ酸組成物、又は極性/電荷を帯びたアミノ酸及び非極性の疎水性アミノ酸の交互パターンを含む配列を有するアミノ酸組成物を有する。これら2種類の構造は、それぞれポリカチオン性又は両親媒性と呼ばれる。細胞透過性ペプチドは、サイズ、アミノ酸配列、及び電荷が異なるが、全てのCPPには、細胞膜を転座し(translocate)、細胞の小器官又は細胞質への様々な分子カーゴの送達を促進する能力という共通の特徴を有する。現在、CPP転座の理論は、3つの主要な侵入メカニズム:膜における直接浸透;エンドサイトーシスを介した侵入;及び移行構造の形成を介した転座、を区別する。CPPの導入は現在進行中の研究分野である。細胞透過性ペプチドは、癌やウイルス阻害剤を含む様々な疾患の治療における薬物送達剤として、また細胞の標識化や画像化のための造影剤として、医学において多くの応用が見出されている。
典型的には、細胞透過性ペプチド(CPP)は、8から50残基のペプチドであり、細胞膜を通過して殆どの細胞型に入る能力を有する。或いは、天然のタンパク質に存在するという起源を反映して、タンパク質形質導入ドメイン(PTD)とも呼ばれる。Frankel及びPaboは同時に、Green及びLowensteinに、ヒト免疫不全ウイルス1(HIV-TAT)由来のトランス活性化転写活性化因子が細胞に浸透する能力について説明した(Frankel,A.D.and C.O. Pabo,Cellular uptake of the tat protein from human immunodeficiency virus.Cell,1988.55(6):p.1189-93)。1991年、キイロショウジョウバエからのアンテナペディアホメオドメイン(DNA結合ドメイン)の神経細胞への形質導入が記載された(Joliot,A.,et al.,アンテナペディアhomeobox peptide regulates neural morphogenesis. Proc Natl Acad Sci U S A, 1991. 88(5): p. 1864-8)。1994年に、アミノ酸配列RQIKIYFQNRRMKWKK(配列番号1)を有するペネトラチンと呼ばれる最初の16量体ペプチドCPPが、アンテナペディアのホメオドメインの3番目のヘリックスから特徴づけられ(Derossi,D.,etal.,The third helix of the Antennapedia homeoドメイン translocates through biological membranes.J Biol Chem,1994.269(14):p.10444-50)、その後1998年に、タンパク質の形質導入に必要なアミノ酸配列YGRKKRRQRRR(配列番号2)を有するTATの最小ドメインが同定された(Vives,E.,P.Brodin,and B.Lebleu,A truncated HIV-1 Tat protein basic ドメイン rapidly translocates through the plasma membrane and accumulates in the cell nucleus.J Biol Chem,1997.272(25):p.16010-7)。過去20年にわたって、数十のペプチドが、ウイルスタンパク質(例えばVP22(Elliott,G.and P.O’Hare,Intercellular trafficking and protein delivery by a herpesvirus structural protein.Cell,1997.88(2):p.223-33)及びZEBRA(Rothe,R.,et al.,Characterization of the cell-penetrating properties of the Epstein-Barr virus ZEBRA trans-activator.J Biol Chem,2010.285(26):p.20224-33))、又は毒液(例えば、メリチン(Dempsey,C.E.,The actions of melittin on membranes.Biochim Biophys Acta,1990.1031(2):p.143-61)、マストパラン(Konno,K.,et al.,Structure and biological activities of eumenine mastoparan-AF(EMP-AF),a new mast cell degranulating peptide in the venom of the solitary wasp(Anterhynchium flavomarginatum micado).Toxicon,2000.38(11):p.1505-15)、マウロカルシン(maurocalcin)(Esteve,E.,et al.,Transduction of the scorpion toxin maurocalcine into cells.Evidence that the toxin crosses the plasma membrane.J Biol Chem,2005.280(13):p.12833-9)、クロタミン(Nascimento,F.D.,et al.,Crotamine mediates gene delivery into cells through the binding to heparan sulfate proteoglycans.J Biol Chem,2007.282(29):p.21349-60)又はブフォリン(buforin)(Kobayashi,S.,et al.,Membrane translocation mechanism of the antimicrobial peptide buforin 2.Biochemistry,2004.43(49):p.15610-6)を含む様々な起源から記載された。ポリアルギニン(R8、R9、R10、及びR12)(Futaki, S., et al., Arginine-rich peptides. An abundant source of membrane-permeable peptides having potential as carriers for intracellular protein delivery. J Biol Chem, 2001. 276(8): p. 5836-40)又はトランスポータン(Pooga,M.,et al.,Cell penetration by transportan.FASEB J,1998.12(1):p.67-77)を含む合成CPPも設計された。上記に記載されるCPPのいずれも、本発明の組合せに含まれる複合体における細胞透過性ペプチド、即ち成分a)として、使用されることができる。特に、本発明の組合せに含まれる複合体における成分a)、即ちCPPは、アミノ酸配列YGRKKRRQRRR(配列番号2)を有するTATの最小ドメインを含むことができる。幾つかの実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体における成分a)、即ちCPPは、アミノ酸配列RQIKIYFQNRRMKWKK(配列番号1)を有するペネトラチンを含むことができる。
本発明の組成物に含まれる複合体において細胞透過性ペプチド、即ち成分a)として使用されることができる様々なCPPは、以下の概説(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012)にも開示される。言い換えれば、Milletti,F.,2012,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60において開示されるCPPは、本発明の組合せに含まれる複合体において、細胞透過性ペプチド、即ち成分a)として使用されることができる。これは、特に、カチオン性CPP、両親媒性CPP、疎水性CPPのほか、ヘパラン結合タンパク質、RNA結合タンパク質、及びDNA結合タンパク質に由来するCPP(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012の表1を参照)、シグナルペプチドに由来するCPP(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012の表2を参照)、抗菌ペプチドに由来するCPP(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012の表3を参照)、ウイルスタンパク質に由来するCPP(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012の表4を参照)、天然のタンパク質に由来するCPP(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012の表5を参照)、及び設計されたCPP及びペプチドライブラリーに由来するCPP(Milletti,F.,Cell-penetrating peptides:classes,origin,and current landscape.Drug Discov Today 17(15-16):850-60,2012の表6を参照)が挙げられる。
細胞透過性ペプチドは、エプスタイン・バール・ウイルス(EBV)の「ZEBRA」タンパク質に由来することが好ましい。「ZEBRA」(Zta、Z、EB1、又はBZLF1としても知られる)は、一般的に、エプスタイン・バール・ウイルス(EBV)の塩基性ロイシンジッパー(bZIP)転写活性化因子を指す。細胞透過性を示す、ZEBRAの最小ドメインは、ZEBRAの170残基から220残基に及ぶことが確認されている。ZEBRAのアミノ酸配列は、NCBI受入番号YP_401673で開示され、以下の配列番号3で示される245のアミノ酸を含む。
前記細胞透過性ペプチドが、以下を有することが好ましい。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の配列変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の配列変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される。
したがって、細胞透過性ペプチドは、以下を有することが好ましい。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の配列変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の配列変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される。
このような好ましいCPPは、例えば、国際公開第WO2014/041505号に開示される。
最近では、ウイルスタンパク質ZEBRAに由来するCPPが、(i)直接転座及び(ii)脂質ラフト媒介エンドサイトーシスの両方によって、生体膜を通ってタンパク質カーゴを伝達することが記載された(Rothe R,Liguori L,Villegas-Mendez A,Marques B,Grunwald D,Drouet E,et al.Characterization of the cell-penetrating properties of the Epstein-Barr virus ZEBRA trans-activator.The Journal of biological chemistry 2010;285(26):20224-33)。本発明者らは、これらの2つの侵入メカニズムが、それぞれCD8+及びCD4+T細胞へのカーゴ抗原のMHCクラスI及びII制限提示の両方を促進するはずであると仮定している。したがって、このようなCPPは、樹状細胞(DC)にマルチエピトープペプチドを送達し、その後、CTL及びTh細胞の活性化及び抗腫瘍機能を促進することができる。したがって、このようなCPPは、本発明の組合せに含まれる複合体を抗原提示細胞(APC)に効率的に送達し、マルチエピトープMHCクラスI及びII制限提示を導くことができる。
本発明の文脈において、「MHCクラスI」という用語は、主要組織適合性複合体分子の2つの主要クラスのうちの1つを示す。MHCクラスI(「MHCI」とも記される)分子は、体の全ての有核細胞上に存在する。MHCクラスIの機能は、細胞傷害性細胞(CTL)に対するエピトープを表示することである。ヒトでは、MHCクラスI分子は、α-とβ2-ミクログロブリン(b2m)の2つのポリペプチド鎖からなる。α鎖のみが多型でHLA遺伝子にコードされているが、b2mサブユニットは多型ではなくβ-2ミクログロブリン遺伝子にコードされている。本発明の文脈では、「MHCクラスII」という用語は、腫瘍組織適合性複合体分子の他の一次クラスを示す。MHCクラスII(「MHCII」とも記される)分子は、マクロファージ、樹状細胞、B細胞等の少数の特殊な細胞型にのみ存在し、これらは全て専用の抗原提示細胞(APC)である。
上述されるように、ZEBRAの最小ドメインの断片の配列変異体は、特に全長に亘って、ZEBRAの最小ドメインの断片(配列番号3の残基170から残基220)に対して、少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を、細胞透過性ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、共有することが好ましい。特に、上記で定義されたZEBRAの最小ドメインの「断片」は、その切断された配列、即ち、天然配列のアミノ酸配列と比較してN末端、C末端、及び/又は配列内(intrasequentially)で切断されたアミノ酸配列として理解されることが好ましい。更に、ZEBRAの最小ドメインのそのような「断片」は、合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の長さを有することが好ましい。
より好ましくは、上述されるように、細胞透過性ペプチドの断片又はその変異体は、MHCクラスI及び/又はMHCクラスII分子の文脈において、抗原又は抗原エピトープ等のカーゴ分子を抗原提示細胞等の細胞表面に提示する当該ペプチドの能力を更に保持する。MHCクラスI及び/又はMHCクラスII分子の文脈において、細胞透過性ペプチド又は当該細胞透過性ペプチドを含む複合体が抗原又は抗原エピトープ等のカーゴ分子を細胞表面に提示する能力は、これらのエピトープに特異的なMHC制限CD4+又はCD8+T細胞の増殖及び/又は機能を刺激する能力を含む、当業者に知られた標準的な方法によって確認することができる。
以下:
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される;
を含む、好ましい細胞透過性ペプチドは、参照された配列と比較して、少なくとも1つの保存的に置換されたアミノ酸を有するアミノ酸配列を含むことが好ましく、所定のアミノ酸残基が同様の物理化学的特性を有する残基によって置換されることを意味する。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される;
を含む、好ましい細胞透過性ペプチドは、参照された配列と比較して、少なくとも1つの保存的に置換されたアミノ酸を有するアミノ酸配列を含むことが好ましく、所定のアミノ酸残基が同様の物理化学的特性を有する残基によって置換されることを意味する。
特に好ましくは、以下:
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される;
を含む好ましい細胞透過性ペプチドは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列に対する位置189に相当する位置で、Ser(S)に置換されたCys(C)を含む。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片又はそのような断片の変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される;
を含む好ましい細胞透過性ペプチドは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列に対する位置189に相当する位置で、Ser(S)に置換されたCys(C)を含む。
したがって、そのような好ましい細胞透過性ペプチドは、以下一般式(A):
X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11SX13X14X15X16X17
の配列を含み、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を含むアミノ酸配列を有することが好ましい。
式中、X1はK、R、又はHであり、X1はK又はRであることが好ましく;
X2はR、K、又はHであり、X2はR又はKであることが好ましく;
X3はY、W、又はFであり、X3はY、W、又はFであることが好ましく;
X4はK、R、又はHであり、X4はK又はRであることが好ましく;
X5はN又はQであり;
X6はR、K、又はHであり、X6はR又はKであることが好ましく;
X7はV、I、M、L、F、又はAであり、X7はV、I、M、又はLであることが好ましく;
X8はA、V、L、I、又はGであり、X8はA又はGであることが好ましく;
X9はS又はTであり;
X10はR、K、又はHであり、X10はR又はKであることが好ましく;
X11はK、R、又はHであり、X11はK又はRであることが好ましく;
X13はR、K、又はHであり、X13はR又はKであることが好ましく;
X14はA、V、L、I、又はGであり、X14はA又はGであることが好ましく;
X15はK、R、又はHであり、X15はK又はRであることが好ましく;
X16はF、L、V、I、Y、W、又はMであり、X16はF、Y、又はWであることが好ましく;
X17はK、R、又はHであり、X17はK又はRであることが好ましい。
X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11SX13X14X15X16X17
の配列を含み、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を含むアミノ酸配列を有することが好ましい。
式中、X1はK、R、又はHであり、X1はK又はRであることが好ましく;
X2はR、K、又はHであり、X2はR又はKであることが好ましく;
X3はY、W、又はFであり、X3はY、W、又はFであることが好ましく;
X4はK、R、又はHであり、X4はK又はRであることが好ましく;
X5はN又はQであり;
X6はR、K、又はHであり、X6はR又はKであることが好ましく;
X7はV、I、M、L、F、又はAであり、X7はV、I、M、又はLであることが好ましく;
X8はA、V、L、I、又はGであり、X8はA又はGであることが好ましく;
X9はS又はTであり;
X10はR、K、又はHであり、X10はR又はKであることが好ましく;
X11はK、R、又はHであり、X11はK又はRであることが好ましく;
X13はR、K、又はHであり、X13はR又はKであることが好ましく;
X14はA、V、L、I、又はGであり、X14はA又はGであることが好ましく;
X15はK、R、又はHであり、X15はK又はRであることが好ましく;
X16はF、L、V、I、Y、W、又はMであり、X16はF、Y、又はWであることが好ましく;
X17はK、R、又はHであり、X17はK又はRであることが好ましい。
好ましくは、このようなペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質は、L-アミノ酸から(完全に)構成されるか、又はD-アミノ酸から(完全に)構成され、それによって「レトロインベルソペプチド配列」を形成する。「レトロインベルソ(ペプチド)配列」という用語は、配列の方向が反転し、各アミノ酸残基のキラリティーが反転した、線状ペプチド配列の異性体を指す(例えば、Jameson et al.,Nature,368,744-746(1994);Brady et al.,Nature,368,692-693(1994)参照)。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X1はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X2はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X3はYである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X4はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X5はNである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X6はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X7はVである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X8はAである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X9はSである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X10はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X11はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X13はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X14はAである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X15はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X16はFである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X17はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、一般式(A)に対する位置12に相当する位置のアミノ酸は、Ser(S)である。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X2はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X3はYである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X4はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X5はNである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X6はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X7はVである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X8はAである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X9はSである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X10はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X11はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X13はRである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X14はAである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X15はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X16はFである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、式中X17はKである。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、一般的に、一般式(A)によって上記で定義され、一般式(A)に対する位置12に相当する位置のアミノ酸は、Ser(S)である。
以下:
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片、又はそのような断片の変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される、
を有する好ましい細胞透過性ペプチドが、配列番号4~13のアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なわく、その配列変異体、好ましくは前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加された0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を有する配列変異体を含む又はからなることも特に好ましい。
i)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸の、前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
ii)ZEBRAの最小ドメインの断片、又はそのような断片の変異体を含むアミノ酸配列であって、前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される、
を有する好ましい細胞透過性ペプチドが、配列番号4~13のアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なわく、その配列変異体、好ましくは前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加された0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を有する配列変異体を含む又はからなることも特に好ましい。
それによって、特に好ましい細胞透過性ペプチドは、配列番号6(CPP3/Z13)、配列番号7(CPP4/Z14)、配列番号8(CPP5/Z15)、又は配列番号11(CPP8/Z18)のアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなくその配列変異体を含む又はからなるアミノ酸配列を有し、好ましくは、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加された0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を有する配列変異体を有することが好ましい。更に、より好ましい細胞透過性ペプチドは、配列番号6(CPP3/Z13)又は配列番号7(CPP4/Z14)のアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なわないその配列変異体を含む又はからなるアミノ酸配列を有し、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加された0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を有する配列変異体を有することが好ましい。更に、最も好ましい細胞透過性ペプチドは、配列番号6(CPP3/Z13)のアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なわないその配列変異体を含む又はからなるアミノ酸配列を有し、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加された0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を有する配列変異体を有することが好ましい。
好ましい一実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号6(CPP3/Z13)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
他の好ましい実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号7(CPP4/Z14)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
他の好ましい実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号8(CPP5/Z15)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
他の好ましい実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号11(CPP8/Z18)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
他の好ましい実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号7(CPP4/Z14)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
他の好ましい実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号8(CPP5/Z15)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
他の好ましい実施形態では、本発明の細胞透過性ペプチドは、配列番号11(CPP8/Z18)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する。
細胞透過性ペプチドの一次アミノ酸配列は、本発明から逸脱することなく、グリコシル化又はリン酸化等によって更に翻訳後修飾され得ることは、当業者であれば理解するであろう。
特定の実施形態では、細胞透過性ペプチドは、上述されるアミノ酸配列に加えて、以下のいずれか、又は以下の任意の組合せを更に含んでもよい。
(i)核局在化シグナル(NLS)。そのようなシグナルは、当業者にはよく知られており、Nair et al.(2003,Nucleic Acids Res.31(1):397-399)に記載される。
(ii)Kapoor et al.(2012,PLoS ONE 7(4):e35187)に記載されているもの、及びhttp://crdd.osdd.net/raghava/tumorhope/general.php?に列挙されているもの等、腫瘍ホーミングペプチドを含むターゲティングペプチド
(i)核局在化シグナル(NLS)。そのようなシグナルは、当業者にはよく知られており、Nair et al.(2003,Nucleic Acids Res.31(1):397-399)に記載される。
(ii)Kapoor et al.(2012,PLoS ONE 7(4):e35187)に記載されているもの、及びhttp://crdd.osdd.net/raghava/tumorhope/general.php?に列挙されているもの等、腫瘍ホーミングペプチドを含むターゲティングペプチド
好ましくは、細胞透過性ペプチドは、抗原又は抗原エピトープに結合し、当該抗原又は抗原エピトープの細胞移行を促進する。
本発明の組合せに含まれる複合体は、1つの単一の(single)細胞透過性ペプチド又は1超の細胞透過性ペプチドを含むことができる。本発明の組合せに含まれる複合体は、5個以下の細胞透過性ペプチドを含むことが好ましく、発明の組合せに含まれる複合体は、4個以下の細胞透過性ペプチドを含むことがより好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、3個以下の細胞透過性ペプチドを含むことが更により好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、2個以下の細胞透過性ペプチドを含むことが特に好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、1個(single)の細胞透過性ペプチドを含むことが最も好ましい。
成分b)-抗原/抗原エピトープ
本発明の組合せに含まれる複合体は、成分b)として、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープを含む。
本発明の組合せに含まれる複合体は、成分b)として、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープを含む。
一般に、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、どのような性質のものであってもよく、例えば、(i)ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質、(ii)多糖類、(iii)脂質、(iv)リポタンパク質又はリポペプチド、(v)糖脂質、(vi)核酸、及び(vii)低分子薬物又は毒素からなる群から選択されることができる。したがって、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、ペプチド、タンパク質、多糖類、脂質、リポタンパク質及び糖脂質を含むこれらの組合せ、核酸(例えば、DNA、siRNA、shRNA、アンチセンスオリゴヌクレオチド、デコイDNA、プラスミド)、又は低分子薬物(例えば、シクロスポリンA、パクリタキセル、ドキソルビシン、メトトレキサート、5-アミノレブリン酸)、又はこれらの任意の組合せ(特に、1超の抗原又は抗原エピトープが本発明の組合せに含まれる複合体に含まれている場合)であることができる。複合体に含まれる少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、(ポリ)ペプチドであることが好ましい。
本明細書で使用されるように、「抗原」は、適応免疫応答の受容体の標的として、特に抗体、T細胞受容体、及び/又はB細胞受容体の標的として機能する任意の構造物質である。「エピトープ」は、「抗原決定因子」とも呼ばれ、免疫系、特に抗体、T細胞受容体、及び/又はB細胞受容体によって認識される抗原の部分(又は断片)である。したがって、1つの抗原が少なくとも1つのエピトープを有する、即ち、単一の抗原が1以上のエピトープを有する。本発明の文脈では、「エピトープ」という用語は主に、抗原提示細胞の表面に提示され、主要組織適合性複合体(MHC)に結合するT細胞エピトープを示すために使用される。MHCクラスI分子によって提示されるT細胞エピトープは、一般的には、8~11のアミノ酸の長さのペプチドであるが、これに限定されない。MHCクラスII分子は、一般的には、12~25のアミノ酸の長さのより長いペプチドを提示するが、これに限定されない。
好ましくは、複合体は、抗原の少なくとも1つの断片を含み、当該断片は、当該抗原の少なくとも1つのエピトープを含む。本明細書で使用されるように、抗原の「断片」は、抗原の少なくとも10の連続したアミノ酸、好ましくは抗原の少なくとも15の連続したアミノ酸、より好ましくは抗原の少なくとも20の連続したアミノ酸、更により好ましくは抗原の少なくとも25の連続したアミノ酸、最も好ましくは抗原の少なくとも30の連続したアミノ酸を含む。抗原又は抗原エピトープ(又は断片)の「配列変異体」は、上記に定義される通りであり、即ち、配列変異体は、参照配列に対して、少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%同一である、(アミノ酸)配列を有する。抗原/抗原断片/エピトープの文脈において、「機能的」配列変異体は、例えば抗原(断片)に含まれるエピトープの機能が損なわれていない、又は消失されていない、即ち、免疫原性があり、好ましくは全長抗原に含まれるエピトープと同じ免疫原性を有することを意味する。幾つかの実施形態では、明細書に記載されるように、例えば、癌/腫瘍抗原(断片)に含まれるエピトープのアミノ酸配列は、変異しないので、(天然起源の)参照エピトープ配列と同一である。
好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体は、1超の抗原又は抗原エピトープ、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10以上の抗原又は抗原エピトープを含み、より好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体は、(少なくとも)2又は3個の抗原又は抗原エピトープを含み、更により好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体は、(少なくとも)4又は5個の抗原又は抗原エピトープを含む。1超の抗原又は抗原エピトープが本発明の組合せに含まれる複合体に含まれる場合、当該抗原又は抗原エピトープは、特に本発明の組合せに含まれる複合体において、例えば、他の抗原又は抗原エピトープに、及び/又は成分a)、即ち細胞透過性ペプチドに、及び/又は成分c)、即ちTLRペプチドアゴニストに共有結合されることが理解される。
複合体に含まれる様々な抗原又は抗原エピトープは、同じであっても異なっていてもよい。複合体に含まれる様々な抗原又は抗原エピトープは、互いに異なっていることが好ましく、それによって多重抗原性及び/又はマルチエピトープ複合体を提供する。
更に、1超の抗原又は抗原エピトープ、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10以上の抗原又は抗原エピトープは、本発明の組合せに含まれる複合体に連続的に配置されることが好ましい。これは、特に、複合体に含まれる全ての抗原及び/又は抗原エピトープが、成分a)、即ち細胞透過性ペプチドによっても、成分c)、即ちTLRペプチドアゴニストによっても、遮られない並び(stretch)で配置されることを意味する。むしろ、例えば、全ての抗原及び/又は抗原エピトープのこのような並びの前後に、複合体において、成分a)及び成分c)は配置される。これによって、「多重抗原性ドメイン」は形成されることができる。本明細書で使用されるように、「多重抗原性ドメイン」という用語は、少なくとも2つの(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9以上)異なる抗原(の断片)、又は少なくとも2つの(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9以上)異なる抗原の抗原エピトープを含む(ポリ)ペプチド等のドメインを指す。好ましくは、「多重抗原性ドメイン」は、少なくとも2つの(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9以上)異なる抗原の断片を含み、各断片は、少なくとも1つの抗原エピトープを含む。より好ましくは、「多重抗原性ドメイン」は、2~5個の異なる抗原の断片を含み、各断片は、少なくとも1つの抗原エピトープを含む。より更に好ましくは、「多重抗原性ドメイン」は、(正確には)3又は4個の異なる抗原の断片を含み、各断片は、少なくとも1つの抗原エピトープを含む。
このような方法で連続的に配置された抗原及び/又は抗原エピトープは、任意に、例えば、成分a)、即ち細胞透過性ペプチドでも、成分c)、即ちTLRペプチドアゴニストでもない、スペーサー又はリンカー(例えば以下のように)によって互いに結合されることができる。
しかしながら、代わりに、様々な抗原及び/又は抗原エピトープは、本発明の組合せに含まれる複合体において、任意の他の方法でも配置されることができ、例えば、2以上の抗原及び/又は抗原エピトープの間に成分a)及び/又は成分c)が配置され、即ち、成分a)と成分c)(又はその逆)との間に1以上の抗原及び/又は抗原エピトープが配置され、任意に、成分a)及び/又は成分c)のそれぞれの他端に1以上の抗原及び/又は抗原エピトープ配置される。
同じ種類の疾患、特に同じ種類の腫瘍に関連する多数の異なる抗原又は抗原エピトープが、単一の複合体によって有利に含まれることができることが理解される。或いは、同じ種類の疾患、特に同じ種類の腫瘍に関連する多数の異なる抗原又は抗原エピトープは、異なる複合体に含まれる、異なる抗原又は抗原エピトープのサブセット、特に特定の種類の疾患(例えば、腫瘍)の文脈において互いに補完するサブセットに分配されることができ、これにより、異なるサブセットを含むこのような異なる複合体が、例えば単一のワクチンで、それを必要とする対象に同時に投与されることが有利になることがある。
少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、MHCクラスI及び/又はMHCクラスIIの文脈及び/又はCD1の文脈における細胞表面で提示され、MHCクラスI及び/又はMHCクラスIIの文脈における細胞表面での提示が好まれる。「MHCクラスIの文脈(context)におけるエピトープ提示」という用語は、特に、細胞の表面のMHCクラスI分子の溝に存在するCD8+エピトープを指す。「MHCクラスIIの文脈(context)におけるエピトープ提示」という用語は、特に、細胞の表面のMHCクラスII分子の溝に存在するCD4+エピトープを指す。「CD1の文脈(context)におけるエピトープ提示」という用語は、特に、細胞の表面の分化抗原群1分子の溝に存在する脂質エピトープを指す。
有利なことに、本発明の組合せに含まれる複合体は、細胞透過性ペプチドと、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープとを含み、MHCクラスI及びMHCクラスIIコンテクストにおいて、抗原提示細胞の細胞表面における当該エピトープの輸送及び提示を可能にするので、ワクチン接種及び免疫療法において有用である。
本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも1つのCD4+エピトープ及び/又は少なくとも1つのCD8+エピトープである、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープを含むことが好ましい。
本明細書で使用される「CD4+エピトープ」又は「CD4+制限エピトープ」は、CD4+T細胞によって認識されるエピトープを示し、前記エピトープは、特に、MHCクラスII分子の溝に存在する抗原断片からなる。本発明の組合せに含まれる複合体に含まれる単一のCD4+エピトープは、約12~25のアミノ酸からなることが好ましい。また、例えば、約8~25のアミノ酸又は約6~100のアミノ酸からなることもできる。
本明細書で使用される「CD8+エピトープ」又は「CD8+制限エピトープ」という用語は、CD8+T細胞によって認識されるエピトープを示し、前記エピトープは、特に、MHCクラスI分子の溝に存在する抗原断片からなる。本発明の組合せに含まれる複合体に含まれる単一のCD8+エピトープは、約8~11のアミノ酸からなることが好ましい。また、例えば、約8~15のアミノ酸又は約6~100のアミノ酸からなることもできる。
好ましくは、少なくとも1つの抗原は、癌/腫瘍関連抗原、癌/腫瘍特異的抗原、又は病原体からの抗原性タンパク質の抗原性決定因子に対応するCD4+エピトープ及び/又はCD8+エピトープを含むことができる、又は少なくとも1つの抗原エピトープは、癌/腫瘍関連抗原、癌/腫瘍特異的抗原、又は病原体からの抗原性タンパク質の抗原性決定因子に対応するCD4+エピトープ及び/又はCD8+エピトープからなることができる。より好ましくは、少なくとも1つの抗原は、癌/腫瘍関連抗原又は癌/腫瘍特異的抗原の抗原性決定因子に対応するCD4+エピトープ及び/又はCD8+エピトープを含むことができる、又は少なくとも1つの抗原エピトープは、癌/腫瘍関連抗原又は癌/腫瘍特異的抗原の抗原性決定因子に対応するCD4+エピトープ及び/又はCD8+エピトープからなることができる。更により好ましくは、少なくとも1つの抗原は、腫瘍関連抗原又は腫瘍特異抗原の抗原性決定因子に対応するCD4+エピトープ及び/又はCD8+エピトープを含むことができる、又は少なくとも1つの抗原エピトープは、腫瘍関連抗原又は腫瘍特異抗原の抗原性決定因子に対応するCD4+エピトープ及び/又はCD8+エピトープからなることができる。
本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープを含み、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、CD4+エピトープを含む又はからなり、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、CD8+エピトープを含む又はからなる。現在では、Th細胞(CD4+)は、DCライセンス化においても、腫瘍部位におけるCTL(CD8+)の動員及び維持においても、抗腫瘍免疫応答において中心的な役割を果たすことが確立されている。したがって、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープがCD4+エピトープを含む又はからなり、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープがCD8+エピトープを含む又はからなる、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープを含む本発明の組合せに含まれる複合体は、CTL及びTh細胞の同時プライミングを可能にする統合免疫応答を提供するので、1つのCD8+エピトープのみ又は1つのCD4+エピトープのみに対する免疫よりも好ましい。
好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープを含み、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープは、少なくとも2つ、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9以上のCD4+エピトープ、及び/又は少なくとも2つ、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9以上のCD8+エピトープを含む又はからなる。それによって、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープは、好ましくは異なる抗原又は抗原エピトープであり、より好ましくは、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープは互いに異なるが、同じ種類の腫瘍に関連する。多重抗原性ワクチンは、(i)抗原消失変異体の増殖を回避する、(ii)不均一な腫瘍塊内の異なる腫瘍細胞を標的とする、(iii)患者間の腫瘍のばらつきを回避する。したがって、本発明の組合せに含まれる複合体は、特に少なくとも4つの抗原又は抗原エピトープ、特に少なくとも2つのCD8+エピトープ及び少なくとも2つのCD4+エピトープを含むことが好ましい。本発明の組合せに含まれるそのような複合体は、マルチエピトープCD8 CTL及びCD4 Th細胞を誘導して、腫瘍細胞に対抗するために相乗的に機能させ、効率的な抗腫瘍免疫を促進する。Th細胞は、ワクチン接種後に監視された長期的な細胞免疫の維持にも関与している。本発明の組合せに含まれるそのような複合体は、ポリクローナル、マルチエピトープ免疫応答、及び多機能的CD8+及びCD4+T細胞を誘導するため、有効な抗腫瘍活性を示す
本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも2つの抗原又は抗原エピトープを含むことが好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも3つの抗原又は抗原エピトープを含むことがより好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも4つの抗原又は抗原エピトープを含むことが更により好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも5つの抗原又は抗原エピトープを含むことが特に好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、少なくとも6つの抗原又は抗原エピトープを含むことが最も好ましい。複合体に含まれる抗原又は抗原エピトープは、同じでも異なっていてもよく、複合体に含まれる抗原又は抗原エピトープは、互いに異なっていることが好ましい。複合体は、少なくとも1つのCD4+エピトープ及び少なくとも1つのCD8+エピトープを含むことが好ましい。
本発明の組合せに含まれる複合体は、1超のCD4+エピトープ、例えば、同じ抗原又は異なる抗原からの2以上のCD4+エピトープを含むことが好ましく、CD8+エピトープを含まないことが好ましい。本発明の組合せに含まれる複合体は、1超のCD8+エピトープ、例えば、同じ抗原又は異なる抗原からの2以上のCD8+エピトープを含むことが好ましく、CD4+エピトープを含まないことが好ましい。しかしながら、本発明の組合せに含まれる複合体は、(i)少なくとも1つのCD4+エピトープ、例えば、同じ抗原又は異なる抗原からの2以上のCD4+エピトープ、及び(ii)1超のCD8+エピトープ、例えば、同じ抗原又は異なる抗原からの少なくとも1つのCD8+エピトープ、を含むことが最も好ましい。
少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、任意の種類の抗原又は抗原エピトープ、例えば、癌/腫瘍関連抗原、癌/腫瘍特異的抗原、及び/又はウイルス、細菌、真菌、原生動物、及び多細胞寄生抗原タンパク質を含む病原体からの抗原性タンパク質(から1つ以上のエピトープ)を含むことができるが、癌又は腫瘍エピトープが好ましい。
当業者であれば、通常、治療される疾患を考慮して抗原又は抗原エピトープを選択することを理解するであろう。したがって、抗原又は抗原エピトープは、通常、治療される疾患と関連している(又は関係している)。特定の疾患の文脈において、多数の抗原が当分野で知られている。例えば、腫瘍/癌を治療するために、当業者は、腫瘍/癌抗原(又は抗原エピトープ)、特に特定の種類の腫瘍/癌に有用である腫瘍/癌抗原(又は抗原エピトープ)を選択する。幾つかの実施形態では、患者は、議論されている特定の抗原が治療に有用であるかどうかを判断するために(又は治療に有用な抗原又は抗原エピトープを特定するために)、(例えば、分離されたサンプルを用いて、癌/腫瘍が特定の抗原を発現しているかどうかを特定することで)、特定の抗原について検査/スクリーニングを受けることができる。
少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、少なくとも1つの癌又は腫瘍エピトープを含む又はからなることが好ましい。より好ましくは、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、癌/腫瘍関連抗原又は癌/腫瘍特異的抗原の少なくとも1つのエピトープを含む又はからなることが更に好ましい。
本明細書で使用されるように「癌/腫瘍抗原/エピトープ」は、癌/腫瘍細胞によって産生される抗原/エピトープである。このようなエピトープは、典型的には、特定の種類の癌/腫瘍に特異的である(又は関連している)。例えば、癌/腫瘍エピトープは、神経膠腫エピトープを含む。特に、癌/腫瘍関連(cancer/tumor-associated)(癌/腫瘍関係(cancer/tumor-related)とも)抗原(TAA)は、癌/腫瘍細胞と正常細胞の両方によって発現される抗原である。例えば、TAAは、腫瘍細胞によって発現される1つ以上の表面タンパク質又はポリペプチド、核タンパク質又は糖タンパク質、又はそれらの断片であることができる。例えば、ヒト腫瘍関連抗原は、分化抗原(メラノサイト分化抗原等)、変異性抗原(p53等)、過剰発現した細胞抗原(HER2等)、ウイルス抗原(ヒトパピローマウイルスタンパク質等)、及び精巣と卵巣の生殖細胞で発現されるが、正常な体細胞では沈黙している癌/精巣(CT)抗原(MAGE及びNY-ESO-1等)を含む。多くのTAAは、癌や腫瘍に特異的ではなく、正常な組織でも見つかることがある。したがって、これらの抗原は、出生時から(或いはそれ以前から)存在していることがある。そのため、免疫系がこれらの抗原に対して自己耐性を獲得した可能性がある。
対して、癌/腫瘍特異的抗原(TSA)は抗原であり、癌/腫瘍細胞によって特異的に発現されるが、正常細胞では発現されない。TSAは、主要組織適合性複合体(MHC)分子の文脈で、新抗原特異的T細胞受容体(TCR)によって特異的に認識されることができる。したがって、TSAは特に新抗原が含まれる。一般的に、新抗原はネオ抗原であり、以前は存在しなかったため、免疫系にとって「新しい」ものである。ネオ抗原は、典型的には体細胞変異によるものである。癌/腫瘍の文脈は、癌/腫瘍特異的ネオ抗原では、通常、癌/腫瘍が発生する前には存在せず、癌/腫瘍特異的ネオ抗原は、通常、癌細胞/腫瘍細胞の体細胞遺伝子変異によってコードされる。免疫学的観点からは、腫瘍ネオ抗原は、真に外来のタンパク質であり、正常なヒトの臓器/組織には全く存在しない。ウイルス性の病因を持たない殆どのヒト腫瘍では、腫瘍ネオ抗原は、例えば、一塩基変異(SNV)、挿入及び欠失(インデル)、遺伝子融合、フレームシフト変異、及び構造的変異(SV)を含む様々な非同義の遺伝子変化に由来することができる。例えば、腫瘍ネオ抗原は、Trends in Molecular Medicine,November 2019,980~992ページに開示されているように、当該分野で知られているインシリコの予測ツールを使用して同定することができる。ネオ抗原は免疫系にとって新しいものであるため、これらの抗原の自己耐性のリスクは、癌/腫瘍関連抗原と比較してかなり低い。しかしながら、全ての癌の腫瘍特異的変異のセットは独特であるようである。したがって、癌/腫瘍特異的抗原、特にネオ抗原は、当業者に知られている方法、例えば癌ゲノム配列決定によって、癌と診断された対象において同定されることができる。潜在的なネオ抗原は、(癌)ゲノムのタンパク質コード部分内の変異を特定する癌ゲノム配列決定又はディープシークエンシング技術等、当業者に知られている方法によって予測されることができる。同定後、それぞれの癌/腫瘍特異的ネオ抗原及び/又は癌/腫瘍特異的ネオ抗原エピトープは、本発明の組合せに含まれる複合体において使用されることができる。
幾つかの実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体は、1以上の癌/腫瘍関連エピトープ及び/又は1以上の癌/腫瘍関連抗原を含む(ただし、癌/腫瘍特異的エピトープを含まないことが好ましい)。他の実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体は、1以上の癌/腫瘍特異的エピトープ及び/又は1以上の癌/腫瘍特異的抗原を含む(ただし癌/腫瘍関連エピトープを含まないことが好ましい)。本発明の組合せに含まれる複合体は、(i)1以上の癌/腫瘍関連エピトープ及び/又は1以上の癌/腫瘍関連抗原及び(ii)1以上の癌/腫瘍特異的エピトープ及び/又は1以上の癌/腫瘍特異的抗原の両方含むこともできる。
適切な癌/腫瘍エピトープは、例えば癌/腫瘍エピトープデータベース、例えば、van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumor antigens.Cancer Immun 2013;URL:http://www.cancerimmunity.org/peptide/から検索することができ、CD4+又はCD8+T細胞によって認識されるヒト腫瘍抗原は、その発現パターンに基づいて、又はデータベース「T抗原」(TANTIGEN version 1.0,Dec 1,2009;developed by Bioinformatics Core at Cancer Vaccine Center,Dana-Farber Cancer Institute;URL:http://cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)から、主に4つのグループに分類される。
本発明の組合せに含まれる複合体において有用な癌/腫瘍抗原の具体例としては、以下の抗原:前立腺:前立腺特異的抗原(PSA)、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、PAP、PSCA(PNAS 95(4)1735-1740 1998)、前立腺ムチン(PMA)(Beckett and Wright,1995,Int.J.Cancer 62:703-710)、プロスターゼ(Prostase)、Her-2neu、SPAS-1;メラノーマ:TRP-2、チロシナーゼ、Melan A/Mart-1、gplOO、BAGE、GAGE、GM2ガングリオシド;胸:Her2-neu、キネシン2、TATA要素調節因子1、腫瘍タンパク質D52、MAGED、ING2、HIP-55、TGF-1抗アポトーシス因子、HOM-Mel-40/SSX2、上皮抗原(LEA 135)、DF31MUC1抗原(Apostolopoulos et al.,1996 Immunol.Cell.Biol.74:457-464;Pandey et al.,1995,Cancer Res.55:4000-4003);精巣:MAGE-1,HOM-Mel-40/SSX2、NY-ESO-1;結腸直腸:EGFR、CEA;肺:MAGE D、EGFR卵巣Her-2neu;膀胱:移行細胞癌腫(TCC)(Jones et al.,1997,Anticancer Res.17:685-687)、幾つかの癌:Epha2、Epha4、PCDGF、HAAH、メソセリン;EPCAM;NY-ESO-1、糖タンパク質MUC1及びNIUC10ムチンp5(特に変異バージョン)、EGFR;種々雑多な腫瘍:癌関連血清抗原(CASA)及び癌抗原125(CA125)(Kierkegaard et al., 1995, Gynecol. Oncol. 59: 251-254)、上皮糖タンパク質40(EGP40)(Kievit et al.,1997,Int.J.Cancer71:237-245)、扁平細胞癌腫抗原(SCC)(Lozza et al.,1997 Anticancer Res.17:525-529)、カテプシンE(Mota et al.,1997,Am.J Pathol.150:1223-1229)、メラノーマ中チロシナーゼ(Fishman et al.,1997 Cancer 79:1461-1464)、脳海綿体の細胞核抗原(PCNA)(Notelet et al.,1997Surg.Neurol.47:364-370)、甲状腺乳頭癌における35kDの腫瘍関連自己抗原(Lucas et al.,1996 Anticancer Res.16:2493-2496)、CDC27(タンパク質の変異形態を含む)、抗原トリオースリン酸イソメラーゼ、707-AP、A60マイコバクテリア抗原(Macs et al.,1996,J.Cancer Res.Clin.Oncol.122:296-300)、アネキシンII、AFP、ART-4、BAGE、β-カテニン/m、BCL-2、bcr-abl、bcr-abl p190、bcr-abl p210、BRCA-1、BRCA-2、CA19-9(Tolliver and O’Brien,1997,South Med.J.90:89-90;Tsuruta at al.,1997 Urol.Int.58:20-24)、CAMEL、CAP-1、CASP-8、CDC27/m、CDK-4/m、CEA(Huang et al.,Exper Rev.ワクチン(2002)1:49-63)、CT9、CT10、Cyp-B、Dek-cain、DAM-6(MAGE-B2)、DAM-10(MAGE-B1)、EphA2(Zantek et al., Cell Growth Differ. (1999) 10:629-38; Carles-Kinch et al., Cancer Res. (2002) 62:2840-7)、EphA4(Cheng at al., 2002, Cytokine Growth Factor Rev. 13:75-85)、腫瘍関連Thomsen-Friedenreich抗原(Dahlenborg et al.,1997,Int.J Cancer 70:63-71)、ELF2M、ETV6-AML1、G250、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7B、GAGE-8、GnT-V、gp100(Zajac et al.,1997,Int.J Cancer 71:491-496)、HAGE、HER2/neu、HLA-A*0201-R170I、HPV-E7、HSP70-2M、HST-2、hTERT、hTRT、iCE、アポトーシス阻害剤(例えば、サバイビン)、KH-1腺癌抗原(Deshpande and Danishefsky,1997,Nature387:164-166)、KIAA0205、K-ras、LAGE、LAGE-1、LDLR/FUT、MAGE-1、MAGE-2、MAGE-3、MAGE-6、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-B5、MAGE-B6、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE D、MART-1、MART-1/Melan-A(Kawakami and Rosenberg,1997,Int.Rev.Immunol.14:173-192)、MC1R、MDM-2、ミオシン/m、MUC1、MUC2、MUM-1、MUM-2、MUM-3、ネオ-ポリAポリメラーゼ、NA88-A、NY-ESO-1、NY-ESO-1a(CAG-3)、PAGE-4、PAP、プロテイナーゼ3(Molldrem et al.,Blood(1996)88:2450-7;Molldrem et al.,Blood(1997)90:2529-34)、P15、p190、Pm1/RARα、PRAME、PSA、PSM、PSMA、RAGE、RAS、RCAS1、RU1、RU2、SAGE、SART-1、SART-2、SART-3、SP17、SPAS-1、TEL/AML1、TPI/m、チロシナーゼ、TARP、TRP-1(gp75)、TRP-2、TRP-2/INT2、WT-1、及びNY-ESO-1及びLAGE-1遺伝子に由来する、交互に翻訳されたNY-ESO-ORF2及びCAMELタンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。多数の他の癌抗原が本分野でよく知られている。
幾つかの実施形態では、癌/腫瘍抗原又は癌/腫瘍エピトープは、組換え癌/腫瘍抗原又は組換え癌/腫瘍エピトープであることができる。このような組換え癌/腫瘍抗原又は組換え癌/腫瘍エピトープは、天然の癌/腫瘍抗原又は天然の癌/腫瘍エピトープの全体的なアミノ酸配列の特定のアミノ酸を変化させる(追加、削除、置換)変異を導入することによって設計される。変異の導入は、癌/腫瘍抗原又は癌/腫瘍エピトープをあまり変化させないため、哺乳類の対象、好ましくはヒト又はイヌの対象に亘って普遍的に適用することはできないが、得られるアミノ酸配列が免疫応答を生成するために耐性を破壊するか、又は外来抗原と見なされるほど変化させる。別の方法は、その対応する天然の癌/腫瘍抗原又は天然の癌/腫瘍エピトープに対して、少なくとも85%~99%のアミノ酸配列同一性;好ましくは少なくとも90%~98%の配列同一性;より好ましくは少なくとも93%~98%の配列同一性;又は更に好ましくは少なくとも95%~98%の配列同一性を有する共通(consensus)組み換え癌/腫瘍抗原又は癌/腫瘍エピトープを作成することもできる。幾つかの例では、組換え癌/腫瘍抗原又は組換え癌/腫瘍エピトープは、その対応する天然の癌/腫瘍抗原又は天然の癌/腫瘍エピトープに対して、95%、96%、97%、98%、又は99%のアミノ酸配列同一性を有する。天然の癌/腫瘍抗原は、通常、特定の癌又は癌/腫瘍に関連する抗原である。癌/腫瘍抗原に応じて、癌/腫瘍抗原の共通配列は、哺乳類種間、種のサブタイプ内、ウイルス株又は血清型間で存在することができる。幾つかの癌/腫瘍抗原は、癌/腫瘍抗原の野生型アミノ酸配列と大きく異なることはない。前述のアプローチを組み合わせることで、最終的な組み換え癌/腫瘍抗原又は癌/腫瘍エピトープが、前述のように天然の癌抗原アミノ酸配列とパーセントの類似性を有する。前述のアプローチを組み合わせることで、最終的な組換え癌/腫瘍抗原又は癌/腫瘍エピトープが、前述のように天然の癌抗原アミノ酸配列とパーセントの類似性を有することができる。他の実施形態では、本明細書に記載される癌/腫瘍抗原のエピトープのアミノ酸配列は変異されないので、参照エピトープ配列と同一である。
好ましくは、前記少なくとも1つの癌/腫瘍抗原又はエピトープ(例えば、多重抗原性ドメインに含まれる)が、内分泌腫瘍、胃腸腫瘍、尿生殖器及び女性生殖器腫瘍、乳癌、頭頚部腫瘍、造血器腫瘍、皮膚腫瘍、胸部及び呼吸器腫瘍を含む腫瘍又は癌からなる群から選択される。好ましくは、本発明の多重抗原性ドメインの少なくとも1つの腫瘍エピトープ、少なくとも1つのTAA、又は少なくとも1つのTSAは、トリプルネガティブ乳癌を含む乳癌、胆道癌;膀胱癌;神経膠芽腫及び髄芽腫を含む脳癌;子宮頸癌;絨毛癌;結腸癌;子宮内膜癌;食道癌;胃癌;消化管間質腫瘍(GIST)、虫垂癌、胆管細胞癌、カルチノイド腫瘍、消化管結腸癌、肝外胆管癌、胆嚢癌、胃癌、消化管カルチノイド腫瘍、結腸直腸癌、又は転移性結腸直腸癌、急性リンパ性白血病及び骨髄性白血病を含む血液腫瘍;T細胞急性リンパ性白血病/リンパ腫;ヘアリーセル白血病;慢性骨髄性白血病、多発性骨髄腫;AIDS随伴性白血病及び成人T細胞白血病リンパ腫;ボーエン病及びパジェット病を含む上皮内腫瘍;肝臓癌;非小細胞肺癌を含む肺癌、ホジキン病及びリンパ球性リンパ腫を含むリンパ腫;神経芽細胞腫;神経膠芽腫、扁平細胞癌腫を含む口腔癌;上皮細胞、間質細胞、生殖細胞、及び間葉系細胞から生じるものを含む卵巣癌;膵臓癌;前立腺癌;直腸癌;平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫、線維肉腫、及び骨肉腫を含む肉腫;メラノーマ、メルケル細胞癌、カポジ肉腫、基底細胞癌、及び扁平細胞癌を含む皮膚癌;セミノーマ、非セミノーマ(奇形腫、絨毛癌)、間質腫瘍、及び生殖細胞腫瘍等の胚腫瘍を含む精巣癌;甲状腺癌腫及び髄様癌腫を含む甲状腺癌;及び腺癌及びウィルムス腫瘍を含む腎癌を含む腫瘍及び/又は癌からなる群から選択される。
特に、少なくとも1つの癌/腫瘍抗原又はエピトープ(例えば、多重抗原性ドメインに含まれる)は、結腸直腸癌、転移性結腸直腸癌、膵臓癌、又はトリプルネガティブ乳癌を含む乳癌(TNBC)を含む腫瘍又は癌からなる群から選択されることが好ましい。本明細書で使用される「トリプルネガティブ乳癌」という用語は、治療薬の分子標的であるエストロゲン受容体(ER)、プロゲステロン受容体(PgR)、及びHER2の全ての発現がない乳癌を指す。TNBCは、浸潤性乳癌症例の10-20%を占め、1超の分子サブタイプを含む。典型的には、TNBCに罹患した患者は、本質的に攻撃的な臨床挙動と治療のための認識される分子標的の欠如のために、他の乳癌サブタイプの患者と比較して比較的予後が悪い。トリプルネガティブ乳癌は、表現型であり、分子アッセイにおけるその主要な構成要素は、基底細胞(basal)様腫瘍、正常な乳房様腫瘍、及び最近認識された、一般的ではないが興味深いクローディン低分子サブタイプであり、BRCA1欠損サブタイプも含む。TNBCによって発現されるTAAとしては、例えば、MAGE-A3、MUC-1、PRAME、ASCL2、及びNY-ESO-1が挙げられる。
本明細書で使用される「膵癌」又は「膵臓癌」という用語は、膵臓細胞に由来する癌に関する。好ましくは、本明細書で使用される膵臓癌は、例えば、扁平上皮癌腫、粘液/粘液性癌腫、未分化/低分化癌腫、印環細胞癌腫、髄質癌腫、肝様癌腫を含む、膵管腺癌及びその形態的変異形を指す。膵臓腺癌は、予後不良で発生率が増加している致死的な状態である。膵臓癌は、一般的に高齢者の疾患である。30歳未満で診断される患者は極めて稀であり、新たに診断された患者の90%は55歳以上であり、その大多数は70代及び80代であり、女性と比較して男性の発生率が高い。膵臓癌は、メソセリン、サバイビン、及びNY-ESO-1を含む腫瘍関連抗原の発現によって特徴づけられる。
本明細書で使用されるように、結腸直腸癌(CRC、「腸癌」とも知られる)は、結腸癌及び直腸癌(CC)を含む癌である。どちらの個々の癌にも多くの共通点があるが、癌の出発点が異なる。Siegel, R., C. Desantis, and A. Jemal, Colorectal cancer statistics, 2014. CA Cancer J Clin, 2014. 64(2): p. 104-17によると、2006年から2010年の米国では、腫瘍部位による発生率は、近位結腸(結腸の最初と中間部)で僅かにより重要である。10万人に約19件の症例があり、症例の42%を占める。次いで直腸癌で28%の症例、遠位結腸(結腸の下部)で10万人に10症例の発生率である。解剖学的に、「結腸直腸癌」という用語は、(i)盲腸の癌(回盲弁の癌を含む)、虫垂、上行結腸、右結腸曲、横行結腸、脾弯曲部、下行結腸、S状結腸(S状(湾曲部)の癌を含む)等の結腸の癌、並びに結腸の重複部位の癌;(ii)結腸及び直腸の癌、S状結腸の癌等の直腸S状接合部の癌;及び(iii)直腸膨大部の癌等直腸の癌を含む。
結腸直腸癌は、盲腸の癌(回盲弁の癌を含む)、虫垂の癌、上行結腸の癌、右結腸曲の癌、横行結腸の癌、脾弯曲部の癌、下行結腸の癌、S状結腸の癌(S状(湾曲部)の癌を含む)、又はこれらの組合せ等の結腸の癌であることが好ましい。
結腸直腸癌は、(i)結腸及び直腸の癌又は(ii)直腸S状部の癌等、直腸S状接合部の癌であることも好ましい。更に、結腸直腸癌は、直腸膨大部の癌等、直腸の癌であることも好ましい。
結腸直腸癌は、例えば、細胞型等様々な細胞型を含み、結腸直腸癌は、結腸直腸腺癌、結腸直腸間質腫瘍、原発性結腸直腸リンパ腫、結腸直腸平滑筋肉腫、結腸直腸メラノーマ、結腸直腸扁平細胞癌腫、及び例えば、盲腸、虫垂、上行結腸、横行結腸、下行結腸、S状結腸及び/又は直腸のカルチノイド腫瘍等の結腸直腸カルチノイド腫瘍を含む。したがって、結腸直腸癌の好ましい種類は、結腸直腸腺癌、結腸直腸間質腫瘍、原発性結腸直腸リンパ腫、結腸直腸平滑筋肉腫、結腸直腸メラノーマ、結腸直腸扁平細胞癌腫、及び例えば、盲腸、虫垂、上行結腸、横行結腸、下行結腸、S状結腸及び/又は直腸のカルチノイド腫瘍等の結腸直腸カルチノイド腫瘍を含む。より好ましくは、結腸直腸癌は、結腸直腸腺癌又は結腸直腸カルチノイド癌腫である。更により好ましくは、結腸直腸癌は、結腸直腸腺癌である。したがって、複合体の少なくとも1つの腫瘍又は癌エピトープは、上記で開示される結腸直腸癌細胞型のいずれかから選択されることができる。
結腸直腸癌は、TMN病期分類システムに従った腫瘍の病気分類に応じて異なるTAA、又はTSAを発現するため、複合体の(多重抗原性ドメインの)少なくとも1つの腫瘍又は癌エピトープは、例えば、原発腫瘍の下記ステージ(「T」ステージ)のTAA又はTSAを含むことが好まし:TX-原発腫瘍を評価できない、T0-原発腫瘍の証拠がない、Ta-非浸潤性乳頭状癌、Tis-上皮内癌:上皮内又は固有層への浸潤、T1-腫瘍が粘膜下層に浸潤、T2-腫瘍が筋層に浸潤、T3-腫瘍が筋層を通って結腸直腸周囲pericolorectal)組織に浸潤、T4a-腫瘍が内臓腹膜の表面に侵入する、T4b-腫瘍が他の臓器や構造物に直接浸潤又は付着している;リンパ節の以下のステージ(「N」ステージ):NX-所属リンパ節を評価できない、N0-領域リンパ節転移がない、N1-領域リンパ節に1~3個の転移(N1a-1つの領域リンパ節における転移、N1b-2~3つの領域リンパ節における転移、N1c-領域リンパ節転移のない、漿膜下層、腸間膜、又は腹膜に覆われていない結腸周囲組織又は直腸周囲組織における腫瘍病巣(tumor deposit)、N2-4以上のリンパ節における転移(N2a-4~6つの領域リンパ節における転移、N2b-7つ以上の領域リンパ節における転移));及び遠隔転移の下記のステージ(「M」ステージ):M0-遠隔転移なし、M1-遠隔転移(M1a-1つの臓器又は部位(例えば、肝臓、肺、卵巣、非領域リンパ節)に限定された転移、M1b-1超の臓器/部位又は腹膜における転移)。ステージは、結腸直腸癌の以下の数値的病期分類に統合されることができる:ステージ0:Tis、N0、M0;ステージI:T1、N0、M0又はT2、N0、M0;ステージIIA:T3、N0、M0;ステージIIB:T4a、N0、M0;ステージIIC:T4b、N0、M0;ステージIIIA:T1-T2、N1/N1c、M0又はT1、N2a、M0;ステージIIIB:T3-T4a、N1/N1c、M0又はT2-T3、N2a、M0又はT1-T2、N2b、M0;ステージIIIC:T4a、N2a、M0又はT3-T4a、N2b、M0又はT4b、N1-N2、M0;ステージIVA:任意のT、任意のN、M1a及びステージIVB:任意のT、任意のN、M1b。簡単に言えば、0期では、癌は結腸又は直腸の内層を越えて増殖していない;I期では、癌は粘膜から筋肉層に拡がっている;II期では、癌は筋肉層を越えて付近の臓器の漿膜に拡がっている;III期では、癌が付近のリンパ節に拡がっているか、癌細胞がリンパ節付近の組織に拡がっている;IV期では、癌が血液やリンパ節を介して体の他の部位に転移している。
上記の結腸直腸癌細胞型の様々な腫瘍関連抗原、及びステージが報告されており、例えば、CEA、MAGE、MUC1、サバイビン、WT1、RNF43、TOMM34、VEGFR-1、VEGFR-2、KOC1、ART4、KRas、EpCAM、HER-2、COA-1 SAP、TGF-βRII、p53、ASCL2、及びSART 1-3を含む(例えば、World J Gastroenterol 2018 December 28; 24(48): 5418-5432を参照)。したがって、複合体の少なくとも1つの癌/腫瘍エピトープ/抗原は、EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、CEA、ASCL2、TGFβR2、p53、KRas、OGT、メソセリン、CASP5、COA-1、MAGE、SART、IL13Rα2、ASCL2、NY-ESO-1、MAGE-A3、PRAME、WT1からなる群から選択される抗原(のエピトープ)であることが好ましい。
メラノーマ関連抗原(MAGE)
MAGE(メラノーマ関連抗原)遺伝子ファミリーの哺乳類メンバーは、本来、正常な成体組織では完全に無症状であると説明されていたが、例外として雄の生殖細胞と、一部は胎盤がある。対照的に、これらの遺伝子は様々な種類の腫瘍で発現していた。したがって、複合体は、MAGEファミリーの抗原(「MAGE」抗原)又はそのエピトープを含むことが好ましい。MAGEファミリーのうち、特にMAGE-A3及びMAGE-D4が好ましく、MAGE-A3が特に好ましい。健康な細胞におけるMAGE-A3の正常な機能は不明である。例えば、癌/精巣抗原1.3と呼ばれることもあるMAGE-A3は、腫瘍特異的なタンパク質であり、多くの腫瘍で同定されてきた。MAGE-A3のアミノ酸配列を以下に示す。
MAGE(メラノーマ関連抗原)遺伝子ファミリーの哺乳類メンバーは、本来、正常な成体組織では完全に無症状であると説明されていたが、例外として雄の生殖細胞と、一部は胎盤がある。対照的に、これらの遺伝子は様々な種類の腫瘍で発現していた。したがって、複合体は、MAGEファミリーの抗原(「MAGE」抗原)又はそのエピトープを含むことが好ましい。MAGEファミリーのうち、特にMAGE-A3及びMAGE-D4が好ましく、MAGE-A3が特に好ましい。健康な細胞におけるMAGE-A3の正常な機能は不明である。例えば、癌/精巣抗原1.3と呼ばれることもあるMAGE-A3は、腫瘍特異的なタンパク質であり、多くの腫瘍で同定されてきた。MAGE-A3のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、本明細書に記載されるように、複合体は、配列番号14のアミノ酸配列、又はその断片又はその変異体を含むことが好ましい。
メソセリン
メソセリンは当初、卵巣癌において「mAb K1」と呼ばれる抗体に反応するタンパク質として同定されたが、悪性中皮腫や膵臓、卵巣、肺の腺癌を含む多くのヒトの癌で高発現している腫瘍抗原である。UniProtKB Q13421によるメソセリンのアミノ酸配列を以下に示す。
メソセリンは当初、卵巣癌において「mAb K1」と呼ばれる抗体に反応するタンパク質として同定されたが、悪性中皮腫や膵臓、卵巣、肺の腺癌を含む多くのヒトの癌で高発現している腫瘍抗原である。UniProtKB Q13421によるメソセリンのアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、本明細書に記載されるように、複合体は、配列番号15のアミノ酸配列、又はその断片又はその変異体を含むことが好ましい。
サバイビン
サバイビンは、アポトーシスリピート含有5のバキュロウイルス阻害剤(baculoviral inhibitor of apoptosis repeat-containing 5)又はBIRC5(UniProtKB O15392)とも呼ばれ、アポトーシス阻害剤(IAP)ファミリーの一員である。サバイビンタンパク質は、カスパーゼの活性化を阻害するように機能し、それによってアポトーシス又はプログラム細胞死の負の調節をもたらす。サバイビンのアミノ酸配列を以下に示す。
サバイビンは、アポトーシスリピート含有5のバキュロウイルス阻害剤(baculoviral inhibitor of apoptosis repeat-containing 5)又はBIRC5(UniProtKB O15392)とも呼ばれ、アポトーシス阻害剤(IAP)ファミリーの一員である。サバイビンタンパク質は、カスパーゼの活性化を阻害するように機能し、それによってアポトーシス又はプログラム細胞死の負の調節をもたらす。サバイビンのアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号16のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
サバイビンの幾つかのエピトープは、当業者にはよく知られている。好ましいサバイビンエピトープは、複合体に含まれることが好ましく、以下のエピトープを含む(以下に示されるエピトープ配列は、上記のサバイビン配列の断片である;以下のエピトープ配列は、1つのエピトープを指すこともあれば、1超の(重複する)エピトープを指すこともある)。
[配列番号17]
したがって、複合体は、配列番号17のアミノ酸配列を含むことが好ましい。
したがって、複合体は、サバイビンのエピトープを含むことが好ましい。より好ましくは、複合体は、配列番号16のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。更により好ましくは、複合体は、配列番号17のアミノ酸配列を有するペプチドを含む。
特に好ましくは、複合体は、配列番号18のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
NY-ESO-1
NY-ESO-1(「癌/精巣抗原1」、「New York食道性扁平細胞癌腫1(New York esophageal squamous cell carcinoma 1)」、UniProtKB P78358とも呼ばれる)は、多くの種類の癌で再発現するよく知られた癌精巣抗原(CTA)である。NY-ESO-1は、自発的な体液性及び細胞性の免疫応答を誘発し、制限された発現パターンによって特徴づけられているため、癌免疫応答の良い候補標的となる。NY-ESO-1特異的免疫応答は、様々な種類の癌で観察されている。NY-ESO-1のアミノ酸配列を以下に示す。
[配列番号19]
NY-ESO-1(「癌/精巣抗原1」、「New York食道性扁平細胞癌腫1(New York esophageal squamous cell carcinoma 1)」、UniProtKB P78358とも呼ばれる)は、多くの種類の癌で再発現するよく知られた癌精巣抗原(CTA)である。NY-ESO-1は、自発的な体液性及び細胞性の免疫応答を誘発し、制限された発現パターンによって特徴づけられているため、癌免疫応答の良い候補標的となる。NY-ESO-1特異的免疫応答は、様々な種類の癌で観察されている。NY-ESO-1のアミノ酸配列を以下に示す。
複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、メソセリン、サバイビン、及びNY-ESO-1からなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましい。例えば、複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、メソセリン、サバイビン、又はメソセリン及びNY-ESO-1、又はサバイビン及びNY-ESO-1から選択されるエピトープである。幾つかの実施形態では、複合体の少なくとも1つの腫瘍抗原/エピトープは、抗原メソセリンのエピトープ、又はNY-ESO-1、又はサバイビン、又はその断片、又はその配列変異体を含む。
例えば、上記で開示された、例えば、メソセリン、サバイビン、及びNY-ESO-1の少なくとも1つ、2つ、又はその全ての抗原から選択される、少なくとも1つ、例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10以上のエピトープを含む多重抗原性ドメイン含む複合体は、膵臓癌の文脈において、特に有用であることがある。
PRAME
PRAME(腫瘍で優先的に発現されるメラノーマ抗原、UniProtKB P78395)は、別名、癌/精巣抗原130(CT130)、MAPE(腫瘍で優先的に発現されるメラノーマ抗原)、及びOIP4(OPA-相互作用タンパク質4)として知られており、癌精巣抗原(CTA)ファミリーのメンバーである。正常な体細胞組織におけるPRAMEの発現は、精巣、精巣上体、子宮内膜、卵巣、副腎において発現が低い成体生殖細胞に後成的に限定されている。CTAメンバーであるNY-ESO-1と同様に、PRAMEは、メラノーマにおける免疫原性腫瘍関連抗原として同定され、その発見以来、その発現は、トリプルネガティブ乳癌を含む様々な固形及び血液学的悪性腫瘍で実証されている。PRAMEのアミノ酸配列を以下に示す。
PRAME(腫瘍で優先的に発現されるメラノーマ抗原、UniProtKB P78395)は、別名、癌/精巣抗原130(CT130)、MAPE(腫瘍で優先的に発現されるメラノーマ抗原)、及びOIP4(OPA-相互作用タンパク質4)として知られており、癌精巣抗原(CTA)ファミリーのメンバーである。正常な体細胞組織におけるPRAMEの発現は、精巣、精巣上体、子宮内膜、卵巣、副腎において発現が低い成体生殖細胞に後成的に限定されている。CTAメンバーであるNY-ESO-1と同様に、PRAMEは、メラノーマにおける免疫原性腫瘍関連抗原として同定され、その発見以来、その発現は、トリプルネガティブ乳癌を含む様々な固形及び血液学的悪性腫瘍で実証されている。PRAMEのアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号20のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
ASCL2(Achaete-scuteホモログ2)
ASCL2は、胎盤発生中の増殖栄養膜の維持に不可欠な塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス転写制御因子である。ASCL2は、腸腫瘍で過剰発現される増殖の推定制御因子であることが見出された。ASCL2のアミノ酸配列を以下に示す。
ASCL2は、胎盤発生中の増殖栄養膜の維持に不可欠な塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス転写制御因子である。ASCL2は、腸腫瘍で過剰発現される増殖の推定制御因子であることが見出された。ASCL2のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号21のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
ASCL2の幾つかのエピトープは当業者に知られている。好ましくは複合体に含まれている好ましいASCL2エピトープは、以下のエピトープ(以下に示されるエピトープ配列は、上記のASCL2配列の断片であるので、上記のASCL2配列に下線を引いて示す;以下のエピトープ配列のそれぞれは、1つのエピトープを指すこともあれば、1超の(重複する)エピトープを指すこともある)を含む。
したがって、複合体は、配列番号22のアミノ酸配列及び/又は配列番号23のアミノ酸配列を含むことが好ましい。
したがって、複合体は、ASCL2のエピトープを含むことが好ましい。複合体は、配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含むことがより好ましい。複合体は、配列番号22のアミノ酸配列を有するペプチド及び/又は配列番号23のアミノ酸配列を有するペプチドを含むことが更により好ましい。
複合体は、配列番号24のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含むことが特に好ましい。
ムチン-1(MUC-1)
MUC-1(UniProtKB P15941)は、ヒト上皮性ムチンであり、細胞接着に作用する。MUC-1のアミノ酸配列を以下に示す。
MUC-1(UniProtKB P15941)は、ヒト上皮性ムチンであり、細胞接着に作用する。MUC-1のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号25のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
MUC-1の幾つかのエピトープは当業者に知られている。好ましくは複合体に含まれている好ましいMUC-1エピトープは、以下のエピトープ(以下に示されるエピトープ配列は、上記のMUC-1配列の断片であるので、上記のMUC-1配列に下線を引いて示す;以下のエピトープ配列のそれぞれは、1つのエピトープを指すこともあれば、1超の(重複する)エピトープを指すこともある)を含む。
[配列番号26]
したがって、複合体は、配列番号26のアミノ酸配列及び/又は配列番号27のアミノ酸配列を含むことが好ましい。
トランスフォーミング増殖因子β受容体2(TGFβR2)
TGFβ受容体は、単一パスセリン/スレオニンキナーゼ受容体である。それらは、幾つかの異なるアイソフォームで存在する。TGFβR2(UniProtKB P37137)は、プロテインキナーゼドメインを有し、別の受容体タンパク質とヘテロ二量体複合体を形成し、TGF-βと結合する膜貫通タンパク質である。この受容体/リガンド複合体は、タンパク質をリン酸化し、その後、核に入り、細胞増殖に関連する遺伝子のサブセットの転写を調節する。
TGFβ受容体は、単一パスセリン/スレオニンキナーゼ受容体である。それらは、幾つかの異なるアイソフォームで存在する。TGFβR2(UniProtKB P37137)は、プロテインキナーゼドメインを有し、別の受容体タンパク質とヘテロ二量体複合体を形成し、TGF-βと結合する膜貫通タンパク質である。この受容体/リガンド複合体は、タンパク質をリン酸化し、その後、核に入り、細胞増殖に関連する遺伝子のサブセットの転写を調節する。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号28のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
癌胎児性抗原(CEA)
CEAは、細胞内接着糖タンパク質である。CEAは、通常、胎児の発育中に消化管組織で産生されるが、出生前に産生が停止する。したがって、CEAは、通常、健康な成人の血液中に非常に低いレベルでしか存在しない。CEAのアミノ酸配列を以下に示す。
CEAは、細胞内接着糖タンパク質である。CEAは、通常、胎児の発育中に消化管組織で産生されるが、出生前に産生が停止する。したがって、CEAは、通常、健康な成人の血液中に非常に低いレベルでしか存在しない。CEAのアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号29のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
CEAの幾つかのエピトープは当業者に知られている。好ましくは複合体に含まれている好ましいCEAエピトープは、以下のエピトープ(以下に示されるエピトープ配列は、上記のCEA配列の断片であるので、上記のCEA配列に下線を引いて示す;以下のエピトープ配列のそれぞれは、1つのエピトープを指すこともあれば、1超の(重複する)エピトープを指すこともある)を含む。
したがって、好ましい複合体は、配列番号30のアミノ酸配列及び/又は配列番号31のアミノ酸配列を含む。
したがって、複合体は、CEAのエピトープを含むことが好ましい。より好ましくは、複合体は、配列番号29のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。更により好ましくは、複合体は、配列番号30のアミノ酸配列を有するペプチド及び/又は配列番号31のアミノ酸配列を有するペプチドを含む。
特に好ましくは、複合体は、配列番号32のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体を含む。
P53
P53(UniProtKB P04637)は、ゲノム変異を防止する役割を有する腫瘍抑制タンパク質である。P53は、多くの抗癌機能のメカニズムを有し、アポトーシス、ゲノムの安定性、血管新生の阻害等に役割を果たす。その抗癌の役割において、p53は、以下の幾つかのメカニズムを介して機能する:DNAが損傷を受けたときに、DNA修復タンパク質を活性化する;DNA損傷認識のG1/S制御点で細胞周期を維持することで増殖を停止できる;アポトーシスを開始できる。
P53(UniProtKB P04637)は、ゲノム変異を防止する役割を有する腫瘍抑制タンパク質である。P53は、多くの抗癌機能のメカニズムを有し、アポトーシス、ゲノムの安定性、血管新生の阻害等に役割を果たす。その抗癌の役割において、p53は、以下の幾つかのメカニズムを介して機能する:DNAが損傷を受けたときに、DNA修復タンパク質を活性化する;DNA損傷認識のG1/S制御点で細胞周期を維持することで増殖を停止できる;アポトーシスを開始できる。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号33のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
キルステンRas(KRas)
V-Ki-ras2カーステンラット肉腫ウイルス癌遺伝子ホモログ及びKRASとして知られるGTPアーゼKRasは、正常な組織シグナル伝達に不可欠な機能を果たしており、KRAS遺伝子の変異は、多くの癌の発生に不可欠なステップである。他のrasサブファミリーのメンバーと同様に、KRASタンパク質はGTPアーゼであり、多くのシグナル伝達経路の初期のプレーヤーである。KRASは、通常、C末端にイソプレン基が存在するため、細胞膜に結合している。KRasのアミノ酸配列を以下に示す。
V-Ki-ras2カーステンラット肉腫ウイルス癌遺伝子ホモログ及びKRASとして知られるGTPアーゼKRasは、正常な組織シグナル伝達に不可欠な機能を果たしており、KRAS遺伝子の変異は、多くの癌の発生に不可欠なステップである。他のrasサブファミリーのメンバーと同様に、KRASタンパク質はGTPアーゼであり、多くのシグナル伝達経路の初期のプレーヤーである。KRASは、通常、C末端にイソプレン基が存在するため、細胞膜に結合している。KRasのアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号34のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
キルステンRasの幾つかのエピトープは、当業者に知られる。好ましくは、複合体に含まれる好ましいキルステンRasエピトープは、以下のエピトープを含む(以下に示されるエピトープ配列は、上記キルステンRas配列の断片であり、したがって、上記キルステンRas配列に下線で示される;以下のエピトープ配列は、1つのエピトープ又は1超の(重複する)エピトープを指すことがある)。
したがって、好ましい複合体は、配列番号35のアミノ酸配列を含む。
O結合型N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)トランスフェラーゼ(OGT)
OGT(O結合型N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)トランスフェラーゼ、O-GlcNAcトランスフェラーゼ、OGTase、O結合型N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ、ウリジンジホスホ-N-アセチルグルコサミン:ポリペプチドβ-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ、タンパク質O結合型β-N-アセチルグルコサミントランスフェラーゼ、UniProtKB O15294)は、系統名「UDP-N-アセチル-D-グルコサミン:タンパク質-O-β-N-アセチル-D-グルコサミニルトランスフェラーゼ」を有する酵素である。OGTは、細胞内タンパク質のセリン残基又はスレオニン残基に、O-グリコシド結合で単一のN-アセチルグルコサミンの付加を触媒する。OGTは、人体内の多くの生物学的機能の一部である。OGTは、AKT1のスレオニン308リン酸化を阻害し、IRS1リン酸化の速度を増加させ(セリン307とセリン632/635で)、インスリンシグナル伝達を低下させ、インスリンシグナルの成分をグリコシル化することによって、筋細胞及び脂肪細胞におけるインスリンの抵抗性に関与する。更に、OGTは、N-アセチルグルコサミンの添加により、セリン残基及びスレオニン残基の細胞内グリコシル化を触媒する。研究によると、OGT対立遺伝子は胚発生に不可欠であり、OGTは細胞内グリコシル化と胚性幹細胞の持続力に必要であることを示す。OGTは、転写制御因子及びRNAポリメラーゼIIを修飾する翻訳後修飾も触媒するが、この修飾の具体的な機能は殆ど知られていない。OGTの配列を以下に示す。
OGT(O結合型N-アセチルグルコサミン(GlcNAc)トランスフェラーゼ、O-GlcNAcトランスフェラーゼ、OGTase、O結合型N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ、ウリジンジホスホ-N-アセチルグルコサミン:ポリペプチドβ-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ、タンパク質O結合型β-N-アセチルグルコサミントランスフェラーゼ、UniProtKB O15294)は、系統名「UDP-N-アセチル-D-グルコサミン:タンパク質-O-β-N-アセチル-D-グルコサミニルトランスフェラーゼ」を有する酵素である。OGTは、細胞内タンパク質のセリン残基又はスレオニン残基に、O-グリコシド結合で単一のN-アセチルグルコサミンの付加を触媒する。OGTは、人体内の多くの生物学的機能の一部である。OGTは、AKT1のスレオニン308リン酸化を阻害し、IRS1リン酸化の速度を増加させ(セリン307とセリン632/635で)、インスリンシグナル伝達を低下させ、インスリンシグナルの成分をグリコシル化することによって、筋細胞及び脂肪細胞におけるインスリンの抵抗性に関与する。更に、OGTは、N-アセチルグルコサミンの添加により、セリン残基及びスレオニン残基の細胞内グリコシル化を触媒する。研究によると、OGT対立遺伝子は胚発生に不可欠であり、OGTは細胞内グリコシル化と胚性幹細胞の持続力に必要であることを示す。OGTは、転写制御因子及びRNAポリメラーゼIIを修飾する翻訳後修飾も触媒するが、この修飾の具体的な機能は殆ど知られていない。OGTの配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号36のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
カスパーゼ5(CASP5)
カスパーゼ5(UniProtKB P51878)は、他のタンパク質をアスパラギン酸残基でタンパク質分解的に切断する酵素で、カスパーゼと呼ばれるシステインプロテアーゼのファミリーに属する。それは、カスパーゼ1、カスパーゼ4、マウスのカスパーゼ4ホモログであるカスパーゼ11と共に、炎症性のカスパーゼであり、免疫系での役割を有する。CASP5のアミノ酸配列を以下に示す。
カスパーゼ5(UniProtKB P51878)は、他のタンパク質をアスパラギン酸残基でタンパク質分解的に切断する酵素で、カスパーゼと呼ばれるシステインプロテアーゼのファミリーに属する。それは、カスパーゼ1、カスパーゼ4、マウスのカスパーゼ4ホモログであるカスパーゼ11と共に、炎症性のカスパーゼであり、免疫系での役割を有する。CASP5のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号37のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
結腸直腸腫瘍関連抗原-1(COA-1)
COA-1は、結腸直腸及びメラノーマ細胞によって強く発現され、2003年にMaccalliらによって同定された(データは入手できず)(Maccalli,C.,et al.,Identification of a colorectal tumor-associated antigen(COA-1)recognized by CD4(+)T lymphocytes.Cancer Res,2003.63(20):p.6735-43)。その変異は、腫瘍細胞及び正常細胞の分別認識を妨げることがある。COA-1(UniProtKB Q5T124)のアミノ酸配列を以下に示す。
COA-1は、結腸直腸及びメラノーマ細胞によって強く発現され、2003年にMaccalliらによって同定された(データは入手できず)(Maccalli,C.,et al.,Identification of a colorectal tumor-associated antigen(COA-1)recognized by CD4(+)T lymphocytes.Cancer Res,2003.63(20):p.6735-43)。その変異は、腫瘍細胞及び正常細胞の分別認識を妨げることがある。COA-1(UniProtKB Q5T124)のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号38のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
T細胞により認識される扁平細胞癌腫抗原(SART)
SARTファミリー内では、SART-3が最も好ましい。したがって、複合体は、SARTファミリーの抗原(「SART」抗原)又はそのエピトープを含むことが好ましく;複合体は、SART-3又はそのエピトープを含むことがより好ましい。T細胞3によって認識される扁平細胞癌腫抗原は、癌患者においてHLA-A24拘束性(HLA-A24-restricted)及び腫瘍特異的細胞傷害性Tリンパ球を誘導することができる腫瘍エピトープを有する。SART-3は、mRNAスプライシングの調節に関与していると考えられている。
SARTファミリー内では、SART-3が最も好ましい。したがって、複合体は、SARTファミリーの抗原(「SART」抗原)又はそのエピトープを含むことが好ましく;複合体は、SART-3又はそのエピトープを含むことがより好ましい。T細胞3によって認識される扁平細胞癌腫抗原は、癌患者においてHLA-A24拘束性(HLA-A24-restricted)及び腫瘍特異的細胞傷害性Tリンパ球を誘導することができる腫瘍エピトープを有する。SART-3は、mRNAスプライシングの調節に関与していると考えられている。
IL13Rα2
IL13Rα2は、非常に高い親和性でインターロイキン13(IL-13)と結合する(それにより、それを留める(sequester)ことができる)が、IL-4結合を可能にしない。IL-13とIL-4の両方の負の調節因子として作用するが、そのメカニズムはまだ解明されていない。IL13Rα2のアミノ酸配列を以下に示す。
IL13Rα2は、非常に高い親和性でインターロイキン13(IL-13)と結合する(それにより、それを留める(sequester)ことができる)が、IL-4結合を可能にしない。IL-13とIL-4の両方の負の調節因子として作用するが、そのメカニズムはまだ解明されていない。IL13Rα2のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号39のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
IL13Rα2の幾つかのエピトープは、当業者に知られている。好ましくは複合体によって含まれる好ましいIL13Rα2エピトープは、以下のエピトープを含む(以下に示されるエピトープ配列は、上記IL13Rα2配列の断片であり、したがって、上記IL13Rα2配列に下線で示される;以下のエピトープ配列は、1つのエピトープ又は1超の(重複する)エピトープを指すことがある)。
したがって、複合体は、配列番号40のアミノ酸配列を含むことが好ましい。
KOC1
インスリン様増殖因子2 mRNA結合タンパク質3(IGF2BP3)、IMP3、KOC1、VICKZ3として知られる、KOC1(UniProtKB O00425)は、mRNA結合タンパク質である。しかながらし、発現データは入手できず、その配列は以下に示すとおりである。
インスリン様増殖因子2 mRNA結合タンパク質3(IGF2BP3)、IMP3、KOC1、VICKZ3として知られる、KOC1(UniProtKB O00425)は、mRNA結合タンパク質である。しかながらし、発現データは入手できず、その配列は以下に示すとおりである。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号41のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
TOMM34
TOMM34(UniProtKB Q15785)は、ミトコンドリアへ前駆体タンパク質を取り込むことに関与している。その多くのエピトープは、当業者に知られ、以下に示されるアミノ酸配列から選択されることができる。
TOMM34(UniProtKB Q15785)は、ミトコンドリアへ前駆体タンパク質を取り込むことに関与している。その多くのエピトープは、当業者に知られ、以下に示されるアミノ酸配列から選択されることができる。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号42のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
RNF43
RNF43(UniProtKB Q68DV7)は、RING型E3ユビキチンリガーゼであり、膜貫通ドメイン、プロテアーゼ関連ドメイン、外部ドメイン、及び細胞質RINGドメインを含むと予測されている。RNF43は、Wntシグナル伝達を負に調節すると考えられており、RNF43の発現は、Frizzled受容体のユビキチン化の増加、細胞内分布の変化をもたらし、これらの受容体の表面レベルの低下をもたらす。そのエピトープの多くは当業者に知られており、RNF43のアミノ酸配列を以下に示す。
RNF43(UniProtKB Q68DV7)は、RING型E3ユビキチンリガーゼであり、膜貫通ドメイン、プロテアーゼ関連ドメイン、外部ドメイン、及び細胞質RINGドメインを含むと予測されている。RNF43は、Wntシグナル伝達を負に調節すると考えられており、RNF43の発現は、Frizzled受容体のユビキチン化の増加、細胞内分布の変化をもたらし、これらの受容体の表面レベルの低下をもたらす。そのエピトープの多くは当業者に知られており、RNF43のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号43のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
血管内皮増殖因子(VEGF)/血管内皮増殖因子受容体(VEGFR)
血管内皮増殖因子(VEGF、UniProtKB P15692)は、もともと血管透過性因子(VPF)として知られており、脈管形成及び血管新生を刺激する細胞によって産生されるシグナルタンパク質である。血液循環が不十分な場合に、組織への酸素供給を回復するシステムの一部である。VEGFの正常な機能は、胚発生中の新しい血管、損傷後の新しい血管、運動後の筋肉、そして閉塞した血管を迂回するための新しい血管(側副血行路)を作り出すことである。VEGF(VEGFR)の受容体には、主に、VEGFR1(UniProtKB P17948)、VEGFR2(UniProtKB P35968)、及びVEGFR3(UniProtKB P35916)の3つのサブタイプがある。VEGF、VEGFR1、VEGFR2、及びVEGFR3の配列は、参照により組み込まれる。したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、VEGF、VEGFR1、VEGFR2、及びVEGFR3のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
血管内皮増殖因子(VEGF、UniProtKB P15692)は、もともと血管透過性因子(VPF)として知られており、脈管形成及び血管新生を刺激する細胞によって産生されるシグナルタンパク質である。血液循環が不十分な場合に、組織への酸素供給を回復するシステムの一部である。VEGFの正常な機能は、胚発生中の新しい血管、損傷後の新しい血管、運動後の筋肉、そして閉塞した血管を迂回するための新しい血管(側副血行路)を作り出すことである。VEGF(VEGFR)の受容体には、主に、VEGFR1(UniProtKB P17948)、VEGFR2(UniProtKB P35968)、及びVEGFR3(UniProtKB P35916)の3つのサブタイプがある。VEGF、VEGFR1、VEGFR2、及びVEGFR3の配列は、参照により組み込まれる。したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、VEGF、VEGFR1、VEGFR2、及びVEGFR3のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニット(βhCG)
ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニット(βhCG)は、着床後の胚によって産生されるホルモンである。一部の癌腫瘍はこのホルモンを産生する。そのため、患者が妊娠していないときに測定された濃度の上昇は、癌の診断につなげることができる。hCGは、黄体形成ホルモン(LH)、卵胞刺激ホルモン(FSH)、甲状腺刺激ホルモン(TSH)、及びhCGに特有のβ(ベータ)サブユニットと同一のα(アルファ)サブユニットを有するヘテロ二量体である。hCGゴナドトロピンのβサブユニット(β-hCG)は、145のアミノ酸を含み、6つの高度に相同な遺伝子によってコードされている。したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、β-hCGのアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニット(βhCG)は、着床後の胚によって産生されるホルモンである。一部の癌腫瘍はこのホルモンを産生する。そのため、患者が妊娠していないときに測定された濃度の上昇は、癌の診断につなげることができる。hCGは、黄体形成ホルモン(LH)、卵胞刺激ホルモン(FSH)、甲状腺刺激ホルモン(TSH)、及びhCGに特有のβ(ベータ)サブユニットと同一のα(アルファ)サブユニットを有するヘテロ二量体である。hCGゴナドトロピンのβサブユニット(β-hCG)は、145のアミノ酸を含み、6つの高度に相同な遺伝子によってコードされている。したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、β-hCGのアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
EpCAM
EpCAM(UniProtKB P16422)は、細胞接着を仲介する糖タンパク質である。EpCAMのアミノ酸配列を以下に示す。
EpCAM(UniProtKB P16422)は、細胞接着を仲介する糖タンパク質である。EpCAMのアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号44のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
EpCAMの幾つかのエピトープは、当業者に知られている。好ましくは複合体によって含まれる好ましいEpCAMエピトープは、以下のエピトープを含む(以下に示されるエピトープ配列は、上記EpCAM配列の断片であり、したがって、上記EpCAM配列に下線で示される;以下のエピトープ配列は、1つのエピトープ又は1超の(重複する)エピトープを指すことがある)。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号45のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
HER-2/neu
HER-2は、EGFR(上皮増殖因子受容体)のファミリーに属する。多くのHLA-Aエピトープは、当業者に知られている。HER2のアミノ酸配列は、以下に示される。
HER-2は、EGFR(上皮増殖因子受容体)のファミリーに属する。多くのHLA-Aエピトープは、当業者に知られている。HER2のアミノ酸配列は、以下に示される。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号46のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
上述されるように、Her-2の適切な癌/腫瘍エピトープは、文献から知られている、又は癌/腫瘍エピトープのデータベース(例えば、van der Bruggen P,Stroobant V,Vigneron N,Van den Eynde B.Peptide database:T cell-defined tumor antigens.Cancer Immun 2013、URL:www.cancerimmunity.org/peptide/(CD4+又はCD8+T細胞によって認識されるヒト腫瘍抗原は、その発現パターンに基づき、4つのグループに分類される);又はデータベース「Tantigen」(TANTIGEN version 1.0,Dec 1,2009;Bioinformatics Core at Cancer Vaccine Center,Dana-Farber Cancer Instituteにより開発;URL:cvc.dfci.harvard.edu/tadb/)を用いることによって同定されることができる。
WT1
細胞の発生と細胞の生存に重要な役割を果たすWT1(ウィルムス腫瘍タンパク質、UniProtKB P19544)転写制御因子。WT1をコードする遺伝子は、複合体構造によって特徴づけられ、11番染色体に位置する。細胞増殖及び分化に関与し、体の機能の連続した段階に強い影響を与える。WT1遺伝子は、例えば、多くの異なる変異を受けることがあり、また、変異なしに過剰発現することもある。ウィルムス腫瘍等の疾患の分子基盤は、先天性WT1変異であるが、この遺伝子の体細胞変異は、急性骨髄性白血病及び慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、及び急性リンパ性白血病として他の幾つかの血液腫瘍でも起こる。変異を伴わないこの遺伝子の発現増加は、白血病や固形腫瘍で観察される。WT1のアミノ酸配列を以下に示す。
細胞の発生と細胞の生存に重要な役割を果たすWT1(ウィルムス腫瘍タンパク質、UniProtKB P19544)転写制御因子。WT1をコードする遺伝子は、複合体構造によって特徴づけられ、11番染色体に位置する。細胞増殖及び分化に関与し、体の機能の連続した段階に強い影響を与える。WT1遺伝子は、例えば、多くの異なる変異を受けることがあり、また、変異なしに過剰発現することもある。ウィルムス腫瘍等の疾患の分子基盤は、先天性WT1変異であるが、この遺伝子の体細胞変異は、急性骨髄性白血病及び慢性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、及び急性リンパ性白血病として他の幾つかの血液腫瘍でも起こる。変異を伴わないこの遺伝子の発現増加は、白血病や固形腫瘍で観察される。WT1のアミノ酸配列を以下に示す。
したがって、複合体は、本明細書に記載されるように、配列番号47のアミノ酸配列、又はその断片、又はその変異体を含むことが好ましい。
複合体は、EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、及びIL13Rα2からなる群から選択される抗原のエピトープである、少なくとも1つの腫瘍エピトープを含むことが好ましい。複合体は、ASCL2、EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、及びIL13Rα2からなる群から選択される抗原のエピトープである、少なくとも1つの腫瘍エピトープを含むことがより好ましい。これらの抗原は、結腸直腸癌の文脈において特に有用である。複合体は、EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、及びIL13Rα2からなる群から選択される少なくとも1つの腫瘍抗原、又はその断片、又は腫瘍抗原の配列変異体、又はその断片の配列変異体を含むことも好ましい。複合体は、ASCL2、EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、及びIL13Rα2からなる群から選択される少なくとも1つの腫瘍抗原、又はその断片、又は腫瘍抗原の配列変異体、又はその断片の配列変異体を含むことも好ましい。
複合体は、配列番号45、26、27、17、30、31、35、40、22、及び23のいずれかのエピトープ等、EpCAM、MUC-1、サバイビン、CEA、KRas、MAGE-A3、IL13Rα2、及びASCL2からなる群から選択される抗原のエピトープである、少なくとも1つの腫瘍エピトープを含むことが好ましく;配列番号45、26、27、17、30、31、35、22、及び23のいずれかのエピトープ等、EpCAM、MUC-1、サバイビン、CEA、KRas、MAGE-A3、及びASCL2からなる群から選択される抗原のエピトープである、少なくとも1つの腫瘍エピトープを含むことがより好ましく;配列番号45、26、27、17、30、31、22、及び23のいずれかのエピトープ等、EpCAM、MUC-1、サバイビン、CEA、及びASCL2からなる群から選択される抗原のエピトープである、少なくとも1つの腫瘍エピトープを含むことが更により好ましく、配列番号45、17、30、31、22、及び23のいずれかのエピトープ等、EpCAM、サバイビン、CEA、及びASCL2からなる群から選択される抗原のエピトープである、少なくとも1つの腫瘍エピトープを含むことが最も好ましい。
幾つかの実施形態では、複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、MAGE-A3、MUC-1、PRAME、ASCL2、及びNY-ESO-1からなる群から選択される抗原のエピトープであり、少なくとも1つの腫瘍エピトープ複合体は、MAGE-A3、MUC-1、PRAME、ASCL2からなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましく、少なくとも1つの腫瘍エピトープ複合体は、MAGE-A3、MUC-1、PRAMEからなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましく、複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、MAGE-A3、MUC-1、ASCL2からなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましく、複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、MAGE-A3、ASCL2、PRAMEからなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましく、複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、MAGE-A3、MUC-1、NY-ESO-1からなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましく、複合体の少なくとも1つの腫瘍エピトープは、MAGE-A3、ASCL2、NY-ESO-1からなる群から選択される抗原のエピトープであることが好ましい。一実施形態では、複合体の多重抗原性ドメインは、抗原MAGE-A3、又はASCL2、又はMUC1、又はPRAME、又はNY-ESO-1の少なくとも1つのエピトープを含むことがより好ましい。
複合体は、
i)EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
ii)MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iii)サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iv)CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
v)KRasの1以上のエピトープ(配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
vi)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
i)EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
ii)MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iii)サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iv)CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
v)KRasの1以上のエピトープ(配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
vi)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
複合体は、
i)EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
ii)MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iii)サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iv)CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
v)KRasの1以上のエピトープ(配列番号35のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
vi)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
vii)ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
i)EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
ii)MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iii)サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
iv)CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
v)KRasの1以上のエピトープ(配列番号35のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
vi)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
vii)ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
複合体は、
-1以上のエピトープを含むEpCAMの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むMUC-1の断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むサバイビンの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むCEAの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むKRasの断片又はその機能的配列変異体;及び/又は
-1以上のエピトープを含むMAGE-A3の断片又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
-1以上のエピトープを含むEpCAMの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むMUC-1の断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むサバイビンの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むCEAの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むKRasの断片又はその機能的配列変異体;及び/又は
-1以上のエピトープを含むMAGE-A3の断片又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
複合体は、
-1以上のエピトープを含むEpCAMの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むMUC-1の断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むサバイビンの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むCEAの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むKRasの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むMAGE-A3の断片又はその機能的配列変異体;及び/又は
-1以上のエピトープを含むASCL2の断片又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
-1以上のエピトープを含むEpCAMの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むMUC-1の断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むサバイビンの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むCEAの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むKRasの断片又はその機能的配列変異体;
-1以上のエピトープを含むMAGE-A3の断片又はその機能的配列変異体;及び/又は
-1以上のエピトープを含むASCL2の断片又はその機能的配列変異体
を含むことも好ましい。
本明細書で使用されるように、抗原の「断片」は、抗原の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、抗原の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、抗原の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、抗原の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、抗原の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましい。したがって、EpCAMの断片は、EpCAM(配列番号44)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、EpCAM(配列番号44)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、EpCAM(配列番号44)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、EpCAM(配列番号44)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、EpCAM(配列番号44)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましく;MUC-1の断片は、MUC-1(配列番号25)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、MUC-1(配列番号25)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、MUC-1(配列番号25)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、MUC-1(配列番号25)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、MUC-1(配列番号25)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましく;サバイビンの断片は、サバイビン(配列番号16)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、サバイビン(配列番号16)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、サバイビン(配列番号16)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことが更に好ましく、サバイビン(配列番号16)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、サバイビン(配列番号16)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましく;CEAの断片は、CEA(配列番号29)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、CEA(配列番号29)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、CEA(配列番号29)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、CEA(配列番号29)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、CEA(配列番号29)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましく;KRasの断片は、KRas(配列番号34)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、KRas(配列番号34)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、KRas(配列番号34)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、KRas(配列番号34)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、KRas(配列番号34)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましく;MAGE-A3の断片は、MAGE-A3(配列番号14)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、MAGE-A3(配列番号14)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、MAGE-A3(配列番号14)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、MAGE-A3(配列番号14)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更により好ましく、MAGE-A3(配列番号14)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましい。更に、ASCL2の断片は、ASCL2(配列番号21)の少なくとも10の連続したアミノ酸を含み、ASCL2(配列番号21)の少なくとも15の連続したアミノ酸を含むことが好ましく、ASCL2(配列番号21)の少なくとも20の連続したアミノ酸を含むことがより好ましく、ASCL2(配列番号21)の少なくとも25の連続したアミノ酸を含むことが更に好ましく、ASCL2(配列番号21)の少なくとも30の連続したアミノ酸を含むことが最も好ましい。
そのような断片の機能的配列変異体は、少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは、少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは、少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは、少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは、少なくとも99%、参照配列に対して同一である、(アミノ酸)配列を有し、断片に含まれるエピトープの少なくとも1つ、好ましくは全てのエピトープのエピトープ機能が維持される。
好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まない。より好ましい実施形態では、そのような複合体は、ASCL2、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まない。
好ましい実施形態では、複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む。
この好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。この好ましい実施形態では、複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む。
この好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。この好ましい実施形態では、複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
他の好ましい実施形態では、複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-KRasの1以上のエピトープ(配列番号35のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含む。
この好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。この好ましい実施形態では、複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-KRasの1以上のエピトープ(配列番号35のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含む。
この好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。この好ましい実施形態では、複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
異なる好ましい実施形態では、複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-MAGE-A3 5の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む。
好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。この好ましい実施形態では、複合体は、ASCL2、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープを含まないことがより好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-MAGE-A3 5の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む。
好ましい実施形態では、複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。この好ましい実施形態では、複合体は、ASCL2、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープを含まないことがより好ましい。
好ましい実施形態では、複合体は、
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、EpCAM、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、EpCAM、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、EpCAM、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、EpCAM、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことがより好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことがより好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことがより好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことがより好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことがより好ましい。
そのような複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び/又は
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことがより好ましい。
そのような複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことが特に好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことが特に好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことがより好ましい。
複合体は、
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことも特に好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープを含まないことがより好ましい。
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号45のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-MUC-1の1以上のエピトープ(配列番号26のエピトープ及び/又は配列番号27のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含むことも特に好ましい。
そのような複合体は、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。そのような複合体は、ASCL2、HER-2、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープを含まないことがより好ましい。
最も好ましい実施形態では、複合体は、
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号41のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-EpCAMの1以上のエピトープ(配列番号41のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
更に最も好ましい実施形態では、複合体は、N末端からC末端方向に、
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、HER-2、EpCAM、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
-CEAの1以上のエピトープ(配列番号30のエピトープ及び/又は配列番号31のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ(配列番号17のエピトープ等)又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ(配列番号22のエピトープ及び/又は配列番号23のエピトープ等)又はその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、HER-2、EpCAM、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、又はIL13Rα2のいずれのエピトープも含まないことが好ましい。
複合体は、N末端からC末端方向に、
i)配列番号29のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;
ii)配列番号16のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;及び
iii)配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体
を含むことが更により好ましい。
そのような複合体は、CEA、サバイビン、ASCL2以外の更なる抗原又は更なる抗原のエピトープを含まないことが好ましく、そのような複合体は、他のいかなる(腫瘍)エピトープも含まないことがより好ましい。
i)配列番号29のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;
ii)配列番号16のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;及び
iii)配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸(好ましくは少なくとも15のアミノ酸、より好ましくは少なくとも20のアミノ酸、更により好ましくは少なくとも25のアミノ酸、及び最も好ましくは少なくとも30のアミノ酸)の長さを有するその断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体
を含むことが更により好ましい。
そのような複合体は、CEA、サバイビン、ASCL2以外の更なる抗原又は更なる抗原のエピトープを含まないことが好ましく、そのような複合体は、他のいかなる(腫瘍)エピトープも含まないことがより好ましい。
好ましくは、そのような複合体では、(i)配列番号29のアミノ酸配列を有するペプチド、又はその断片又はその変異体のC末端は、(ii)配列番号16のアミノ酸配列を有するペプチド、又はその断片又はその変異体のN末端に直接結合され、(ii)配列番号16のアミノ酸配列を有するペプチド、又はその断片又はその変異体のC末端は、(iii)配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド又はその断片又はその変異体のN末端に直接結合される。
更により好ましくは、複合体は、N末端からC末端方向に、
i)配列番号32のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体
ii)配列番号18のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;及び
iii)配列番号24のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、CEA、サバイビン、及びASCL2以外の更なる抗原又は更なる抗原のエピトープを含まないことが好ましく、そのような複合体は、他のいかなる(腫瘍)エピトープも含まないことがより好ましい。
i)配列番号32のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体
ii)配列番号18のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体;及び
iii)配列番号24のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその機能的配列変異体
を含む。
そのような複合体は、CEA、サバイビン、及びASCL2以外の更なる抗原又は更なる抗原のエピトープを含まないことが好ましく、そのような複合体は、他のいかなる(腫瘍)エピトープも含まないことがより好ましい。
好ましくは、そのような複合体では、(i)配列番号32のアミノ酸配列を有するペプチド又はその変異体のC末端は、(ii)配列番号18のアミノ酸配列を有するペプチド又はその変異体のN末端に直接結合され、(ii)配列番号18のアミノ酸配列を有するペプチド又はその変異体のC末端は、(iii)配列番号24のアミノ酸配列を有するペプチド又はその変異体のN末端に直接結合される。
最も好ましくは、複合体の多重抗原性ドメインは、配列番号48のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなる。最も好ましい実施形態では、複合体は、CEA、サバイビン、及びASCL2以外の更なる抗原又は更なる抗原のエピトープを含まず、そのような複合体は、他のいかなる(腫瘍)エピトープも含まないことが更により好ましい。
成分c)-TLRペプチドアゴニスト
本発明の組合せに含まれる複合体では、TLRペプチドアゴニストは、自己アジュバントと共に、樹状細胞に対するワクチンの標的化の増加を可能にする。本発明の組合せに含まれる複合体におけるCPP及び少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープへのTLRペプチドアゴニストの物理的結合は、抗原を内在化し、代謝し、表示する、抗原提示細胞、特に樹状細胞の同時刺激によって強化された免疫応答を提供する。
本発明の組合せに含まれる複合体では、TLRペプチドアゴニストは、自己アジュバントと共に、樹状細胞に対するワクチンの標的化の増加を可能にする。本発明の組合せに含まれる複合体におけるCPP及び少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープへのTLRペプチドアゴニストの物理的結合は、抗原を内在化し、代謝し、表示する、抗原提示細胞、特に樹状細胞の同時刺激によって強化された免疫応答を提供する。
本発明の文脈で使用されるように、「TLRペプチドアゴニスト」は、Toll様受容体(TLR)のアゴニストであり、即ち、TLRに結合し、TLRを活性化し、特に生物学的応答を生成する。更に、TLRペプチドアゴニストは、上記で定義されたペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質である。TLRペプチドアゴニストは、10~150のアミノ酸を含むことが好ましく、15~130のアミノ酸を含むことがより好ましく、20~120のアミノ酸を含むことが更により好ましく、25~110のアミノ酸を含むことが特に好ましく、30~100のアミノ酸を含むことが最も好ましい。
Toll様受容体(TLR)は、細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、及びサイトゾルドメインによって特徴づけられる膜貫通タンパク質である。馬蹄形のロイシンリッチリピート(LRR)を含む細胞外ドメインは、多様な微生物に由来する共通の分子パターンの認識に関与している。Toll様受容体は、TLR1~10を含む。TLR受容体及びその修飾体及び誘導体を活性化することができる化合物は、当該技術分野では十分に文書化されている。TLR1は、細菌リポタンパク質及びそのアセチル化された形態によって活性化されることができ、TLR2は、更に、細菌由来又は宿主由来の、グラム陽性細菌糖脂質、LPS、LPA、LTA、線毛、外膜タンパク質、熱ショックタンパク質、及びマイコバクテリアリポアラビノマンナンによって活性化されることができる。TLR3は、特にウイルス由来のdsRNA、又は化学化合物poly(LC)によって活性化されることができる。TLR4は、宿主又は細菌由来のグラム陰性のLPS、LTA、熱ショックタンパク質、ウイルスコートタンパク質、又はエンベロープタンパク質、タキソール又はその誘導体、ヒアルロナンを含むオリゴ糖、及びフィブロネクチンによって活性化されることができる。TLR5は、細菌の鞭毛やフラゲリンで活性化されることができる。TLR6は、マイコバクテリアリポタンパク質とB群連鎖球菌の熱不安定性溶解性因子(heat labile soluble factor)(GBS-F)又はスタフィロコッカス・モジュリン(staphylococcus modulins)によって活性化されることができる。TLR7は、イミダゾキノリンによって活性化されることができる。TLR9は、非メチル化CpG DNA又はクロマチン-IgG複合体によって活性化されることができる。
本発明の組合せに含まれる複合体に含まれるTLRペプチドアゴニストは、TLR1、2、4、5、6、及び/又は10のアゴニストであることが好ましい。TLRは、細胞表面(TLR1、2、4、5、6、及び10)上、又はエンドソーム等の細胞内小器官の膜(TLR3、4、7、8、及び9)上のいずれかに発現される。エンドソーム受容体のための天然リガンドは、核酸系の分子であることが判明した(TLR4を除く)。細胞表面に発現したTLR1、2、4、5、6、及び10は、細胞外微生物の分子パターンを認識する(Monie, T. P., Bryant, C. E., et al. 2009: Activating immunity: Lessons from the TLRs and NLRs. Trends Biochem. Sci. 34(11), 553-561)。TLRは、幾つかの細胞型で発現されるが、実質的に全てのTLRは、DCで発現され、これらの特殊化した細胞があらゆる可能性のある病原体や危険信号を感知することを可能にする。
しかしながら、TLR2、4、及び5は、DCの表面で構成的に発現される。したがって、本発明の組合せに含まれる複合体に含まれるTLRペプチドアゴニストは、TLR2、TLR4、及び/又はTLR5のペプチドアゴニストであることがより好ましい。TLRペプチドアゴニストは、TLR2ペプチドアゴニスト及び/又はTLR4ペプチドアゴニストであることが更により好ましい。TLRペプチドアゴニストは、TLR4ペプチドアゴニストであることが特に好ましい。TLRペプチドアゴニストは、TLR2とTLR4アゴニストの両方である1つのTLRペプチドアゴニストであることが最も好ましい。TLR2は、細菌、ウイルス、寄生生物、真菌に由来する多種多様なリガンドを検出できる。リガンド特異性は、TLR1、6、又は10等の他のTLRや、デクチン1、CD14、CD36等の非TLR分子と、TLR2との相互作用によって決定されることが多い。TLR1とのヘテロ二量体の形成は、TLR2がPam3CSK4やペプチドグリカン等の(マイコ)バクテリア由来のトリアシルリポタンパク質又はリポペプチドを同定することを可能にする(PGA; Gay, N. J., and Gangloff, M. (2007): Structure and function of Toll receptors and their ligands. Annu. Rev. Biochem. 76, 141-165; Spohn, R., Buwitt-Beckmann, U., et al. (2004): Synthetic lipopeptide adjuvants and Toll-like receptor 2-Structure-activity relationships. Vaccine 22(19), 2494-2499)。TLR2及び6のヘテロ二量体化は、ジアシルリポペプチド及びザイモサンの検出を可能にする。リポ多糖類(LPS)及びその誘導体は、TLR4及びフラジェリンのためのリガンドである(Bryant, C. E., Spring, D. R., et al. (2010) or entolimod (CBLB502) for TLR5. The molecular basis of the host response to lipopolysaccharide. Nat. Rev. Microbiol. 8(1), 8-14)。
TLR2は、微生物及び真菌によって発現される分子を含む、広く構造的に多様な範囲のリガンドと相互作用する。天然及び合成リポペプチド(例えば、マイコプラズマ・ファーメンタンス(Mycoplasma fermentas)マクロファージ活性化リポペプチド(MALP-2))、ペプチドグリカン(黄色ブドウ球菌からのもの等のPG)、様々な細菌株からのリポ多糖類(LPS)、多糖類(例えば、ザイモサン)、グラム陽性細菌からのグリコシルホスファチジル-イノシトール-アンカー構造(例えば、マイコバクテリアからのリポタイコ酸(LTA)及びリポアラビノマンナン、及び結核菌からのリポマンナン(lipomannas))を含む、多数のTLR2アゴニストが合成されてきた。特定のウイルス決定因子もTLR2を介して誘発することができる(Barbalat R, Lau L, Locksley RM, Barton GM. Toll-like receptor 2 on inflammatory monocytes induces type I interferon in response to viral but not bacterial ligands. Nat Immunol. 2009: 10(11):1200-7)。細菌のリポペプチドは、細胞壁の構造成分である。それらは、システイン残基を介してペプチドを結合させることができるアシル化されたs-グリセルシステイン部分からなる。細菌リポペプチドであるTLR2アゴニストの例としては、MALP-2、及びその合成類似体であるジ-パルミトイル-S-グリセリルシステイン(Pam2Cys)又はトリ-パルミトイル-S-グリセリルシステイン(Pam3Cys)が挙げられる。
多様なリガンドは、Salmonella minnesota R595からのモノホスホリルリピドA(MPLA)、リポ多糖類(LPS)、マンナン(カンジダ・アルビカンス)、グリコイノシトールホスホリピッド(トリパノソーマ)、ウイルス外被タンパク質(RSV及びMMTV)、及びフィブリノゲン及び熱ショックタンパク質を含む内在性抗原を含む、TLR4と相互作用する。TLR4のそのようなアゴニストは、例えば、Akira S,Uematsu S,Takeuchi O.Pathogen recognition and innate immunity.Cell.Feb 24;2006:124(4):783-801、又はKumar H,Kawai T,Akira S.Toll-like receptors and innate immunity.Biochem Biophys Res Commun.Oct 30;2009 388(4):621-5.LPSに記載され、グラム陰性細菌の外膜に見られ、TLRリガンドの中で最も広く研究されている。適切なLPS由来のTLR4アゴニストペプチドは、例えば国際公開第WO2013/120073(A1)号に記載されている。
TLR5は、(i)ほぼ全ての運動性細菌によって発現されるフラゲリン分子の領域によって引き起こされる;又は(ii)エントリモド(CBLB502)によって引き起こされる。したがって、(i)フラゲリン、又はフラゲリンに由来するペプチド又はタンパク質及び/又はフラゲリンの変異体又は断片;又は(ii)エントリモド(CBLB502)は、複合体に含まれるTLRペプチドアゴニストとしても適している。
したがって、TLRペプチドアゴニストの例としては、TLR2リポペプチドアゴニストMALP-2、Pam2Cys、及びPam3Cys又はそれらを修飾したもの、異なる形態のTLR4アゴニストLPS(例えば、髄膜炎菌野生型L3-LPS及び変異型ペンタアシル化LpxL1-LPS)、及びTLR5アゴニストフラゲリンが挙げられる。
しかしながら、複合体に含まれるTLRペプチドアゴニストは、リポペプチドでもリポタンパク質でもなく、糖ペプチドでも糖タンパク質でもないことが好ましく、複合体に含まれるTLRペプチドアゴニストは、本明細書で定義される古典的なペプチド、ポリペプチド又はタンパク質であることがより好ましい。
幾つかの実施形態では、TLRペプチドアゴニストは、(天然起源の)タンパク質の断片、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を共有するその変異体である。そのような断片は、少なくとも20又は25、好ましくは少なくとも30又は35、より好ましくは少なくとも40又は50、更により好ましくは60又は70、更により好ましくは少なくとも80又は90、例えば少なくとも100のアミノ酸の最小長さを有することができる。特に、断片は、TLRアゴニスト機能性を示す。タンパク質の断片は、タンパク質の「TLRアゴニストドメイン」を提供するように有利に選択されることができるが、タンパク質の他のドメイン(TLRアゴニストドメイン以外)を含まないことが好ましい。したがって、幾つかの実施形態では、TLRアゴニストは、別の免疫学的活性ドメイン(TLRアゴニストドメイン以外)を含まず、より好ましくは、TLRアゴニストは別の生物学的活性ドメイン(TLRアゴニストドメイン以外)含まない。例えば、幾つかの実施形態では、TLRアゴニストは、フラゲリン(TLRアゴニストの機能性に加えて、更なるドメインを含む)ではない。しかしながら、幾つかの実施形態では、TLRアゴニストは、フラゲリンのTLRアゴニストドメインを含む(フラジェリンの他のドメインは含まない)フラジェリンの断片であることができる。
好ましいTLR2ペプチドアゴニストは、国際公開第2012/048190A1号及び米国特許出願公開第13/0331546号に詳細に記載される、アネキシンII又はその免疫調節性断片(TLRアゴニスト機能性を有する)であり、特に、国際公開第WO2012/048190A1号の配列番号7のアミノ酸配列又はその断片又はその変異体を含むTLR2ペプチドアゴニストが好ましい。
したがって、配列番号49のアミノ酸配列、又は配列番号49に対して、少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の同一性があるその配列変異体を含む又はからなるTLR2ペプチドアゴニストが、成分c)、即ち複合体に含まれるTLRペプチドアゴニストとして、好ましい。
配列番号49のTLRペプチドアゴニストの特に好ましい機能的配列変異体は、配列番号50のTLRペプチドアゴニストである。
したがって、配列番号50のアミノ酸配列、又はその配列変異体を含む又はからなるTLR2ペプチドアゴニストが、上述されるように、複合体に含まれる成分c)、即ち少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストとして特に好ましい。
TLR4に関して、TLR4、特に(i)天然のLPSリガンドを模倣するペプチド(RS01:Gln-Glu-Ile-Asn-Ser-Ser-Tyr及びRS09:Ala-Pro-Pro-His-Ala-Leu-Ser)及び(ii)フィブロネクチン由来ペプチドに結合するモチーフに特に対応する、TLRペプチドアゴニストが特に好ましい。細胞糖タンパク質フィブロネクチン(FN)は、3つのエキソンの選択的スプライシングによって単一の遺伝子から生成された複数のアイソフォームを有する。これらのアイソフォームの1つは、TLR4と相互作用するエクストラドメインA(EDA)である。
更に適切なTLRペプチドアゴニストは、フィブロネクチンEDAドメイン又はその断片又はその変異体を含む。そのような適切なフィブロネクチンEDAドメイン又はその断片又はその変異体は、欧州特許第1913954B1号明細書、欧州特許出願公開2476440A1号明細書、米国特許出願公開2009/0220532A1号明細書、及び国際公開第WO2011/101332A号に開示される。したがって、上述されるように、配列番号40のアミノ酸配列、又はその配列変異体を含む又はからなるTLR4ペプチドアゴニストは、成分c)、即ち本発明の組合せに含まれる複合体に含まれる少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストとして、好ましい。
他の適切なTLRペプチドアゴニストは、本明細書に記載されるように、Hp91又はその断片又はその変異体を含む又はからなる。Hp91は、例えば、米国特許第9,539,321B2号明細書に記載されるTLR4-アゴニストであり、以下のアミノ酸配列を有する。
更に、高移動度群ボックス1タンパク質(HMGB1)及びそのペプチド断片は、TLR2アゴニストとして、特にTLR2を介した炎症活性のエンハンサーとして作用すると考えられている。そのようなHMGB1由来ペプチドは、例えば、米国特許出願第2011/0236406A1に開示される。したがって、上述されるように、TLR2ペプチドアゴニストは、配列番号51のアミノ酸配列又はその配列変異体を含む又はからなり、成分c)、即ち本発明の組合せに含まれる複合体に含まれる少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストとして、好ましい。
HMGB1及びそのペプチド断片は、単独のTLRアゴニストとして、又は(他の)TLR2/TLR4ペプチドアゴニストと組み合わせてTLR2を介した炎症活性のエンハンサーとして使用されることができる。したがって、幾つかの実施形態では、複合体は、例えば、ANAXA(配列番号49)又はその配列変異体(配列番号50等)等のTLR2/TLR4ペプチドアゴニストと組み合わせて、国際公開第WO2006/083301A1号に記載されているもの等のTLRアゴニストΔ30HMGB1又はその免疫調節性断片の一部として、含むことができる。したがって、複合体は、上記に開示されるTLRペプチドアゴニストに加えて、国際公開第WO2006/083301A1号に開示されるΔ30HMGB1(配列番号51)、その任意の免疫調節性断片、又はペプチドHp-1~HP-166のいずれか、好ましくはHp-31、Hp-46、Hp-106を含むことができる。例えば、複合体は、少なくともTLRペプチドアゴニストEDA(配列番号52)及びΔ30HMGB1(配列番号51)、又はEDA(配列番号52)及びHp-31、又はHp-46、又はHp-106を含むことができ、複合体は、少なくともTLRペプチドアゴニストANAXA(配列番号49又は50)及びΔ30HMGB1(配列番号51)、又はANAXA(配列番号49又は50)及びHp-31、又はHp-46、又はHp-106を含むことが好ましい。このような組合せの使用は、より強力な複合体の自己補助が好まれる場合に、有利であることがある。
本発明の組合せに含まれる複合体は、単一のTLRアゴニストを含むことが好ましい。他の実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体は、1超のTLRペプチドアゴニスト、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10個以上のTLRペプチドアゴニストを含むことができ、本発明の組合せに含まれる複合体は、(少なくとも)2又は3個のTLRペプチドアゴニストを含むことがより好ましく、本発明の組合せに含まれる複合体は、(少なくとも)4又は5個のTLRペプチドアゴニストを含むことが更により好ましい。1超のTLRペプチドアゴニストが複合体に含まれている場合、特に、本発明の組合せに含まれる複合体において、当該TLRペプチドアゴニストはまた、例えば他のTLRペプチドアゴニストに対して、及び/又は成分a)、即ち細胞透過性ペプチドに対して、及び/又は成分b)、即ち、抗原又は抗原エピトープに対して、共有結合されることが理解される。
特に好ましい実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体は、1つの単一のTLRペプチドアゴニストを含む。特に、この特に好ましい実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体は、1つの単一のTLRペプチドアゴニストを含み、記載された1つの単一のTLRペプチドアゴニスト以外のTLRアゴニストの特性を有する更なる成分を含まない。
複合体に含まれる様々なTLRペプチドアゴニストは、同じでも異なっていてもよい。複合体に含まれる様々なTLRペプチドアゴニストは、互いに異なっていることが好ましい。
更に、1超の抗原又は抗原エピトープ、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10個の抗原又は抗原エピトープ、又は更なるTLRペプチドアゴニスト、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10個のTLRアゴニストは、本発明の組合せに含まれる複合体において、連続して配置されることができる。これは、特に、複合体に含まれる全てTLRペプチドアゴニストは、成分a)、即ち細胞透過性ペプチドによっても、成分b)、即ち少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープによっても遮られない並びで配置されることを意味する。むしろ、複合体において、成分a)及び成分b)は、例えば、全てのTLRペプチドアゴニストのこのような並びの前後に配置される。しかしながら、このような方法で連続的に配置されたTLRペプチドアゴニストは、例えば、成分a)、即ち細胞透過性ペプチドでも、成分b)、即ち少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープでもない、以下に記載されるスペーサー又はリンカーによって、互いに結合されることができる。
若しくは、しかしながら、本発明の組合せに含まれる複合体において、様々なTLRペプチドアゴニストは、他の方法で配置されることもでき、例えば、成分a)及び/又は成分b)は、2以上のTLRペプチドアゴニスト間に配置され;即ち、1以上のTLRペプチドアゴニストは、成分a)と成分b)との間(又はその逆)に配置され;任意に、1以上のTLRペプチドアゴニストは、成分a)及び/又は成分b)のそれぞれ他端に配置される。
同じ又は異なるTLR受容体を活性化する多数の異なるTLRペプチドアゴニストは、単一の複合体に有利に含まれることができることが理解される。若しくは、同じ又は異なるTLR受容体を活性化する多数の異なるTLRペプチドアゴニストは、異なる複合体に含まれる同じ又は異なるTLR受容体を活性化する異なるTLRペプチドアゴニストのサブセットに分配されることができ、そのような異なるサブセットを含む異なる複合体は、例えば、単一のワクチンで、それを必要とする対象に対して有利に同時に投与されることができる。
複合体中の成分a)、b)、及びc)の結合及び配置
本発明の組合せに含まれる複合体において、成分a)、成分b)、成分c)は共有結合しており、即ち、複合体の3つの成分a)、成分b)、成分c)のうちの2つの成分間の結合が共有結合である。好ましくは、複合体の3つの成分a)、b)、c)のうち2つが互いに(即ち、「第1の」成分及び「第2の」成分)共有結合し、3つの成分a)、b)、c)のうち第3の成分は、3つの成分a)、b)、c)のうち第1の成分又は3つの成分a)、b)、c)のうち第2の成分のいずれかと共有結合している。これにより、線状分子を形成することが好ましい。ただし、3つの成分a)、b)、c)のそれぞれが、3つの成分a)、b)、c)の他の成分の両方と共有結合していることも考えられる。
本発明の組合せに含まれる複合体において、成分a)、成分b)、成分c)は共有結合しており、即ち、複合体の3つの成分a)、成分b)、成分c)のうちの2つの成分間の結合が共有結合である。好ましくは、複合体の3つの成分a)、b)、c)のうち2つが互いに(即ち、「第1の」成分及び「第2の」成分)共有結合し、3つの成分a)、b)、c)のうち第3の成分は、3つの成分a)、b)、c)のうち第1の成分又は3つの成分a)、b)、c)のうち第2の成分のいずれかと共有結合している。これにより、線状分子を形成することが好ましい。ただし、3つの成分a)、b)、c)のそれぞれが、3つの成分a)、b)、c)の他の成分の両方と共有結合していることも考えられる。
発明の文脈で使用される「共有結合(covalent linkage)」(共有結合(covalent bond)とも)は、原子間の電子対の共有を含む化学結合を指す。特に、共有結合(covalent linkage)」(共有結合(covalent bond)とも)は、原子が電子を共有するときの原子間の引力と反発力の安定したバランスを含む。多くの分子では、電子を共有することによって、各原子が安定な電子配置に対応する完全な外殻に相当するものを得ることができる。共有結合は、例えば、σ結合、π結合、金属間結合、アゴスティック相互作用、三中心二電子結合等、多くの種類の相互作用を含む。したがって、本発明の組合せに含まれる複合体は、「化合物」とも呼ばれ、特に「分子」と呼ばれることがある。
好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体では、成分a)、b)、c)は、架橋法等の当該技術分野で知られている任意の適切な方法で、化学的カップリングによって共有結合される。しかしながら、多くの既知の化学的架橋法は非特異的であるという事実、即ち、成分a)、b)及びc)上の特定の部位にカップリングの点を向けないという事実に注意が向けられる。したがって、非特異的な架橋剤を使用すると、機能的部位を攻撃したり、活性部位を立体的にブロックしたりして、複合体の融合成分を生物学的に不活性にすることがある。適切な保護基を使用して潜在的に反応性のある基をブロックすることは、当業者の知識と呼ばれる。又は、成分a)、b)、及びc)の架橋に適用できる化学選択的な実体である、強力で多用途のオキシム及びヒドラゾンライゲーション技術を使用することもできる。この結合技術は、例えば、Rose et al. (1994), JACS 116, 30によって記載される。
本発明の組合せに含まれる複合体の3つの成分a)、b)、及びc)のうちの2つの成分間の結合は、直接的又は間接的に、即ち、2つの成分が直接隣接していてもよく、或いは、スペーサーやリンカー等の複合体の付加的な成分によって結合されていてもよい。
本発明の組合せに含まれる複合体は、任意にスペーサー又はリンカーを含むことができ、これらは通常、非免疫性部分であり、切断可能であることが好ましく、成分a)とb)及び/又は成分a)とc)、及び/又は成分b)とc)を結合する、及び/又は連続する抗原又は抗原エピトープを結合する、及び/又は連続するTLRペプチドアゴニストを結合する、及び/又は連続する細胞透過性ペプチドを結合する、及び/又は成分b)及び/又はc)のC末端部分に配置されることができる。リンカー又はスペーサーは、好ましくは、成分の結合に加えて更なる機能性を提供することができ、好ましくは切断可能であり、より好ましくは、例えば酵素による切断によって、標的細胞内で自然に切断可能である。しかしながら、そのような更なる機能性は、特に免疫学的機能性を含まない。更なる機能性の例、特に融合タンパク質のリンカーに関しては、例えば、インビボ切断可能なリンカーも開示される、Chen X.et al.,2013:Fusion Protein linkers:Property,Design and Functionality.Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369で見ることができる。更に、Chen X.et al.,2013:Fusion Protein linkers:Property,Design and Functionality.Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369は、本発明の組合せに含まれる複合体において又は複合体に使用されるリンカーを設計するのに有用であり得る様々なリンカー、例えば柔軟なリンカー及び強固なリンカー、並びにリンカー設計ツール及びデータベースも開示する。
前記スペーサーはペプチド性であっても非ペプチド性であってもよく、スペーサーはペプチド性であることが好ましい。好ましくは、ペプチド性スペーサーは、約1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10のアミノ酸からなり、より好ましくは約1、2、3、4、又は5のアミノ酸からなる。ペプチド性スペーサーのアミノ酸配列は、成分a)、b)、又はc)のいずれかのN末端又はC末端フランキング領域のものと同一であることができる。或いは、ペプチド性スペーサーは、当該天然フランキング領域の保存的アミノ酸置換から生じるアミノ酸配列、又はプロテアーゼの既知の切断部位の配列等の非天然アミノ酸配列からなることができる。幾つかの実施形態では、ペプチド性スペーサーは、いかなるCys(C)残基も含まない。幾つかの実施形態では、リンカー配列は、少なくとも20%、より好ましくは少なくとも40%、更により好ましくは少なくとも50%のGly又はβ-アラニン残基を含む。適切なリンカー配列は、当業者が容易に選択して調製されることができ、Dアミノ酸及び/又はLアミノ酸から構成されることもできる。
幾つかの実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体は、スペーサー又はリンカー、特にペプチド性スペーサーを含み、成分a)とb)との間及び/又は成分a)とc)との間、及び/又は成分b)とc)との間に配置されることができる。このペプチド性スペーサーは、細胞浸透性ペプチドとカーゴ分子を含む複合体がインターナリゼーションされた(internalize)後、細胞機械によって切断される等、当業者によって選択されることができる。
3つの成分a)、b)、及びc)のうち2つを結合する技術は、文献に十分に記載されており、前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープの性質に依存することができる。例えば、3つの成分a)、b)、及びc)のうち2つの間の結合は、全段階的固相合成又は溶液相又は固相断片カップリング、安定アミド、チアゾリジン、オキシム及びヒドラジン結合、ジスルフィド結合、安定なチオマレイミド結合、ペプチド結合(融合タンパク質のアミノ酸間のペプチド結合を含む)、又は静電的又は疎水的相互作用によって、切断可能なジスルフィド結合を介して達成されることができる。
複合体に含まれる少なくとも1つの複合体に含まれる抗原又は抗原エピトープ、並びに複合体に含まれる任意のスペーサー又はリンカーは、ペプチド性のものであることが好ましい。本発明の組合せに含まれる複合体において、本発明の組合せに含まれる複合体の全ての成分、例えば、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質である)、少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト、及び任意のペプチド性リンカー又はスペーサーは、ペプチド結合によって結合されることがより好ましい。したがって、本発明の組合せに含まれる複合体は、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質(組換え融合タンパク質等の融合タンパク質等)であることが最も好ましい。
成分a)、b)、及びc)は、本発明の組合せに含まれる複合体に、どのように配置されてもよい。
特に、1超の細胞透過性ペプチド及び/又は1超の抗原又は抗原エピトープ及び/又は1超のTLRペプチドアゴニストが複合体に含まれる場合、1超の細胞透過性ペプチドは、非連続的に配置されることができる、即ち、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(成分b))及び/又は少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト(成分c))は、連続して配置された細胞透過性ペプチドの並びを遮ることができる、及び/又は細胞透過性ペプチドは、成分b)及び/又は成分c)と、交互に配置されることができる。同様に、1超の抗原又は抗原エピトープは、非連続的に配置されることができる、即ち、少なくとも1つの細胞透過性ペプチド(成分a))及び/又は少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト(成分c))は、連続して配置された抗原又は抗原エピトープの並びを遮ることができる、及び/又は抗原又は抗原エピトープは、成分a)及び/又は成分c)と、交互に配置されることができる。同様に、1超のTLRペプチドアゴニストは、非連続的に配置されることができる、即ち、少なくとも1つの細胞透過性ペプチド(成分a))及び/又は少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(成分b))は、連続して配置されたTLRペプチドアゴニストの並びを遮ることができる、及び/又はTLRペプチドアゴニストは、成分a)及び/又は成分b)と、交互に配置されることができる。
しかしながら、好ましくは、1超の細胞透過性ペプチドは、本発明の組合せに含まれる複合体に連続的に配置される、及び/又は1超の抗原又は抗原エピトープは、本発明の組合せに含まれる複合体に連続的に配置される、及び/又は1超のTLRペプチドアゴニストは、本発明の組合せに含まれる複合体に連続的に配置される。これは、特に、特定の成分の全ての単一ユニット、即ち、複合体に含まれる全ての細胞透過性ペプチド、全ての抗原又は抗原エピトープ、又は全てのTLRペプチドアゴニストは、他の2つの成分のいずれかによっても遮られない並びで配置されることができる。むしろ、複合体において、他の2つの成分は、例えば、当該特定の成分の全ての単一ユニットのこのような並びの前後に配置される。ただし、このような方法で連続的に配置された当該特定の成分の単一ユニットは、例えば、他の2つの構成要素のものではない、本明細書に記載されるスペーサ又はリンカーによって互いに結合されることができる。
成分a)、b)、及びc)のそれぞれが、連続的に配置されることが特に好ましい。
好ましくは、a)、b)、及びc)の3つの成分全てが主鎖/主鎖結合を介して結合されているため、特に、1以上の細胞透過性ペプチドの主鎖、1以上の抗原又は抗原エピトープの主鎖、及び1以上のTLRペプチドアゴニストの主鎖を含む、複合体の主鎖となる。言い換えれば、1以上の細胞透過性ペプチドの主鎖、1以上の抗原又は抗原エピトープの主鎖、及び1以上のTLRペプチドアゴニストの主鎖は、任意に、更なる成分(例えば、リンカー、スペーサー等)と共に、複合体の主鎖を構成する。したがって、特に、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質である場合には、成分a)、b)、及びc)の以下の配置が好ましく、当該好ましい配置は、複合体の主鎖のN末端→C末端方向に以下に示され、、3つの成分a)、b)、及びc)の全てが主鎖/主鎖結合を介して結合され、任意に、リンカー、スペーサー、又は別の追加成分によって結合されることができる。
(α)成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト);
(β)成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ);
(γ)成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ);
(δ)成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分a)(細胞透過性ペプチド);
(ε)成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト);又は
(ζ)成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分a)(細胞透過性ペプチド)
(α)成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト);
(β)成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ);
(γ)成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ);
(δ)成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分a)(細胞透過性ペプチド);
(ε)成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分a)(細胞透過性ペプチド)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト);又は
(ζ)成分b)(少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ)-成分c)(少なくとも1つのTLRペプチドアゴニスト)-成分a)(細胞透過性ペプチド)
特に、全ての3つの成分a)、b)、及びc)が主鎖/主鎖結合を介して結合される場合、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが細胞透過性ペプチドのC末端に配置されることが好ましく、これにより、細胞透過性ペプチド及び少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、更なる成分(例えば、リンカー、スペーサー)又は少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストによって任意に結合される。したがって、これは、上記配置からの配置(α)、(β)、及び(γ)に対応する、即ち上記の配置からの配置(α)、(β)、及び(γ)がより好ましい。
少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが細胞透過性ペプチドのC末端に配置されることが更により好ましく、これにより、細胞透過性ペプチド及び少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープは、少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストではなく、更なる成分(例えば、リンカー、スペーサー)によって任意に結合される。したがって、これは、上記配置からの配置(α)及び(β)に対応する、即ち上記の配置からの配置(α)及び(β)が更により好ましい。特に好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体は、組換えポリペプチド又は組換えタンパク質であり、成分a)~c)は、以下の順で、当該複合体の主鎖のN末端→C末端方向(N末端→C末端方向)で配置される。
(α)成分a)-成分b)-成分c);又は
(β)成分c)-成分a)-成分b)
成分は、更なる成分、特に、リンカー又はスペーサーによって結合されることができる。
(α)成分a)-成分b)-成分c);又は
(β)成分c)-成分a)-成分b)
成分は、更なる成分、特に、リンカー又はスペーサーによって結合されることができる。
幾つかの実施形態では、複合体の少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(又は多重抗原性ドメイン)は、複合体の細胞透過性ペプチドのC末端に位置され、細胞透過性ペプチド及び少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(又は多重抗原性ドメイン)は、任意に、更なる成分(例えば、リンカー、スペーサー)又は複合体のTLRペプチドアゴニストによって結合される。
本発明の組合せの好ましい例示複合体は、ポリペプチド又はタンパク質である。
a)細胞透過性ペプチドは、配列番号6(CPP3/Z13)、配列番号7(CPP4/Z14)、配列番号8(CPP5/Z15)、又は配列番号11(CPP8/Z18)のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体(前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質であり、好ましくは、癌/腫瘍エピトープを含む又はからなる;
c)TLRペプチドアゴニストは、TLR2ペプチドアゴニスト及び/又はTLR4ペプチドアゴニストである。
a)細胞透過性ペプチドは、配列番号6(CPP3/Z13)、配列番号7(CPP4/Z14)、配列番号8(CPP5/Z15)、又は配列番号11(CPP8/Z18)のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体(前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく)を含む又はからなるアミノ酸配列を有する;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質であり、好ましくは、癌/腫瘍エピトープを含む又はからなる;
c)TLRペプチドアゴニストは、TLR2ペプチドアゴニスト及び/又はTLR4ペプチドアゴニストである。
本発明の組合せにおいて、複合体は、配列番号54のアミノ酸配列、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなることが特に好ましい。
幾つかの実施形態では、複合体は、配列番号55のアミノ酸配列、又は少なくとも70%又は少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%又は少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、更により好ましくは少なくとも97%又は少なくとも98%、特に好ましくは少なくとも99%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなることができる。
STINGアゴニスト
インターフェロン(IFN)の刺激因子遺伝子(STING)は、379アミノ酸タンパク質であり、核酸センサーのファミリーに属し、サイトゾルDNAシグナル伝達のアダプターである。STINGは、T細胞、マクロファージ、樹状細胞(DC)等の造血細胞だけでなく、様々な内皮細胞型や上皮細胞型で発現される。STINGは、サイトゾル核酸に対する自然免疫応答の一部であり、DNAセンサー及びシグナル伝達分子として機能する。STINGは、細胞のサイトゾルで、環状ジヌクレオチド(CDN)の認識に続いて、I型IFNやその他の炎症誘発性サイトカインを含む多数の宿主防御遺伝子の転写を制御するのに不可欠である。基本状態では、STINGは二量体として存在し、N末端ドメインは、小胞体(ER)に固定され、C末端ドメインはサイトゾルに存在する。タンパク質環状GMP-AMP合成酵素(cGAS)によって生成された環状ジヌクレオチド(CDN)は、STINGの天然リガンドである(Ablasser et al,Nature 498,380-384,2013)。CDNのSTINGへの結合は、立体構造の変化を誘導し、TANK結合キナーゼ(TBK1)とインターフェロン制御因子3(IRF3)との結合及び活性化、並びにERから核周囲エンドソームへの再局在化を可能にする(Liu et al,Science 347,Issue 6227,2630-1-2630-14,2015)。TBK1による転写制御因子IRF3及びNF-kBのリン酸化は、I型IFNを含む複数のサイトカインの発現をもたらす。I型IFNの産生は、DCの活性化、腫瘍抗原に対するCD8+T細胞の効果的な交差提示、及び腫瘍特異的CD8+T細胞の腫瘍内への移動をもたらす。したがって、STING自然免疫感知経路を活性化し、I型IFNシグナル伝達を回復させる治療戦略は、代替療法に反応しない免疫応答に乏しい腫瘍(immune cold tumors)を「高める(heating up)」という腫瘍免疫原性を高める可能性を有することがある。
インターフェロン(IFN)の刺激因子遺伝子(STING)は、379アミノ酸タンパク質であり、核酸センサーのファミリーに属し、サイトゾルDNAシグナル伝達のアダプターである。STINGは、T細胞、マクロファージ、樹状細胞(DC)等の造血細胞だけでなく、様々な内皮細胞型や上皮細胞型で発現される。STINGは、サイトゾル核酸に対する自然免疫応答の一部であり、DNAセンサー及びシグナル伝達分子として機能する。STINGは、細胞のサイトゾルで、環状ジヌクレオチド(CDN)の認識に続いて、I型IFNやその他の炎症誘発性サイトカインを含む多数の宿主防御遺伝子の転写を制御するのに不可欠である。基本状態では、STINGは二量体として存在し、N末端ドメインは、小胞体(ER)に固定され、C末端ドメインはサイトゾルに存在する。タンパク質環状GMP-AMP合成酵素(cGAS)によって生成された環状ジヌクレオチド(CDN)は、STINGの天然リガンドである(Ablasser et al,Nature 498,380-384,2013)。CDNのSTINGへの結合は、立体構造の変化を誘導し、TANK結合キナーゼ(TBK1)とインターフェロン制御因子3(IRF3)との結合及び活性化、並びにERから核周囲エンドソームへの再局在化を可能にする(Liu et al,Science 347,Issue 6227,2630-1-2630-14,2015)。TBK1による転写制御因子IRF3及びNF-kBのリン酸化は、I型IFNを含む複数のサイトカインの発現をもたらす。I型IFNの産生は、DCの活性化、腫瘍抗原に対するCD8+T細胞の効果的な交差提示、及び腫瘍特異的CD8+T細胞の腫瘍内への移動をもたらす。したがって、STING自然免疫感知経路を活性化し、I型IFNシグナル伝達を回復させる治療戦略は、代替療法に反応しない免疫応答に乏しい腫瘍(immune cold tumors)を「高める(heating up)」という腫瘍免疫原性を高める可能性を有することがある。
本明細書で使用される「STINGアゴニスト」という用語は、STINGの活性を誘導、活性化、刺激、増強、又は延長する化合物を指す。概要は、例えば、Ding et al.,2020(C.Ding,Z.Song,A.Shen,T.Chen,A.Zhang.Small molecules targeting the innate immune cGAS-STING-TBK1 signaling pathway.Acta Pharm.Sin.B(2020),10.1016/j.apsb.2020.03.001,published online March 13,2020)において提供される。特に、Dingらによって2020年に記載された(参照により本明細書に組み込まれる)STINGアゴニストの具体例は、本発明の文脈におけるSTINGアゴニストとして有用であることができる。
幾つかの実施形態では、「STINGアゴニスト」という用語は、環状GMP-AMP合成酵素(cGAS)アゴニスト等の間接的に作用する(即ち、STINGと直接相互作用しない)化合物を含む。その後、活性化されたcGASは、2’,3’-cGAMPを合成し、STINGのアゴニストとして作用する。cGASアゴニストの非限定的な例としては、以下が挙げられる。
高い表面密度でdsDNAを提示する球状核酸(SNA)、特に45bpのIFN模倣(simulating)dsDNA オリゴヌクレオチドを運ぶSNAナノ構造、参照により本明細書に組み込まれる、Alexander Stegh,DDIS-03.DEVELOPMENT OF A NOVEL CLASS OF cGAS AGONISTS TO TRIGGER STING PATHWAY-DEPENDENT INNATE IMMUNE RESPONSES AGAINST GLIOBLASTOMA,Neuro-Oncology,Volume 21,Issue Supplement_6,November 2019,Page vi65に記載されるもの等;及び
HIV-1RNAゲノムに由来する26-merのDNA配列であるG3-YSD(Herzner AM.et al.,2015.Sequence-specific activation of the DNA sensor cGAS by Y-form DNA structures as found in primary HIV-1 cDNA.Nat Immunol.16(10):1025-33)
高い表面密度でdsDNAを提示する球状核酸(SNA)、特に45bpのIFN模倣(simulating)dsDNA オリゴヌクレオチドを運ぶSNAナノ構造、参照により本明細書に組み込まれる、Alexander Stegh,DDIS-03.DEVELOPMENT OF A NOVEL CLASS OF cGAS AGONISTS TO TRIGGER STING PATHWAY-DEPENDENT INNATE IMMUNE RESPONSES AGAINST GLIOBLASTOMA,Neuro-Oncology,Volume 21,Issue Supplement_6,November 2019,Page vi65に記載されるもの等;及び
HIV-1RNAゲノムに由来する26-merのDNA配列であるG3-YSD(Herzner AM.et al.,2015.Sequence-specific activation of the DNA sensor cGAS by Y-form DNA structures as found in primary HIV-1 cDNA.Nat Immunol.16(10):1025-33)
他の実施形態では、「STINGアゴニスト」という用語は、STINGと直接相互作用する化合物のみを指す。
様々な(直接的な)STINGアゴニストが当技術分野で知られている。一般に、(直接的な)STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド(CDN)及び非CDN STINGアゴニストに分類される。CDN STINGアゴニストは、STINGの天然リガンドである2’3’-cGAMPから着想を得ている。非CDN STINGアゴニストの例は、小分子STINGアゴニストが挙げられ、L.Corrales et al.(L.Corrales,L.H.Glickman,S.M.McWhirter,D.B.Kanne,K.E.Sivick,G.E.Katibah,et al.Direct activation of STING in the tumor microenvironment leads to potent and systemic tumor regression and immunity,Cell Rep,11(2015),pp.1018-1030)に記載される「化合物7」は、非CDN小分子STINGアゴニストの開発のためのプロトタイプ構造モデルとして認識される。しかしながら、(直接的な)STINGアゴニストは、環状ジヌクレオチド(CDN)系STINGアゴニストであることが好ましい。
本発明の文脈において有用なSTINGアゴニストの非限定的な例としては、以下のものが挙げられる。
国際公開第WO2014/093936A1号、国際公開第2014/189805号、及び国際公開第2014/189806号に記載されるSTINGアゴニスト、特にADU-S100(Aduro)
国際公開第WO2017/027646A1号及び国際公開第WO2018/118664A1号に記載されるSTINGアゴニスト、特にMK-1454(Merck)
国際公開第WO2018/152450A1号、国際公開第WO2018/152453A1号、及び国際公開第WO2020/036199A1号に記載されるSTINGアゴニスト、特にE-7766(Eisai)
MK-2118(Merck)
BMS-986301(Bristol-Myers Squibb)
IMSA-101(ImmuneSensor Therapeutics Inc.)、cGAMPの類似体
SB-11285(Spring Bank Pharmaceuticals)、小分子核酸ハイブリッドSTINGアゴニスト
SYNB-1891(Synlogic)、STINGを発現するように遺伝子操作された大腸菌(E.coli)細菌の非病原性株
二量体ABZIスキャフォールドを有する合成CDN STINGアゴニストであると考えられているGSK-3745417(GlaxoSmithKline)
非CDN STINGアゴニストTAK-676(Takeda)
非CDN小分子STINGアゴニストTTI-10001(Trillium Therapeutics Inc.)
国際公開第WO2014/093936A1号、国際公開第2014/189805号、及び国際公開第2014/189806号に記載されるSTINGアゴニスト、特にADU-S100(Aduro)
国際公開第WO2017/027646A1号及び国際公開第WO2018/118664A1号に記載されるSTINGアゴニスト、特にMK-1454(Merck)
国際公開第WO2018/152450A1号、国際公開第WO2018/152453A1号、及び国際公開第WO2020/036199A1号に記載されるSTINGアゴニスト、特にE-7766(Eisai)
MK-2118(Merck)
BMS-986301(Bristol-Myers Squibb)
IMSA-101(ImmuneSensor Therapeutics Inc.)、cGAMPの類似体
SB-11285(Spring Bank Pharmaceuticals)、小分子核酸ハイブリッドSTINGアゴニスト
SYNB-1891(Synlogic)、STINGを発現するように遺伝子操作された大腸菌(E.coli)細菌の非病原性株
二量体ABZIスキャフォールドを有する合成CDN STINGアゴニストであると考えられているGSK-3745417(GlaxoSmithKline)
非CDN STINGアゴニストTAK-676(Takeda)
非CDN小分子STINGアゴニストTTI-10001(Trillium Therapeutics Inc.)
したがって、STINGアゴニストは、ADU-S100、MK-1454、E-7766、MK-2118、BMS-986301、IMSA-101、SB-11285、SYNB-1891、GSK-3745417、TAK-676、及びTTI-10001からなる群から選択されることができる。これらのSTINGアゴニストの中でも、ADU-S100が好ましい。
STINGアゴニストは、参照により本明細書に組み込まれている国際公開第WO2018/060323A1号に記載されている化合物、又は参照により本明細書に組み込まれている国際公開第WO2018/172206号に記載されている化合物であることが好ましい。
STINGアゴニストは、式Iの化合物、又はその溶媒和物、又はその水和物、又はその塩であることがより好ましい。
式中、R1は、H、F、-O-C1-3アルキル、及びOHからなる群から選択され、
R2はHである、又は
R2は-CH2-であり、R1は-O-であり、-CH2-O-ブリッジを形成し、
R3は、N9窒素を介して結合された、プリン、アデニン、グアニン、キサンチン、ヒポキサンチンからなる群から選択されたプリン核酸塩基である。
R2はHである、又は
R2は-CH2-であり、R1は-O-であり、-CH2-O-ブリッジを形成し、
R3は、N9窒素を介して結合された、プリン、アデニン、グアニン、キサンチン、ヒポキサンチンからなる群から選択されたプリン核酸塩基である。
STINGアゴニストは、式(II)の化合物、又はその塩であることも好ましい(国際公開第WO2018/172206号に記載される)。
式中、Base1及びBase2は、独立して、N9窒素原子を介して結合された、プリン、アデニン、グアニン、キサンチン、ヒポキサンチンからなる群から選択される。
STINGアゴニストは、構造式I、Ia、Ib、Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II、II-1、II-2、II-3、及びII-4において上記のいずれかに示される化合物の実質的に純粋な(Sp,Sp)、(Rp,Rp)、(Sp,Rp)、又は(Rp,Sp)立体異性体、又はその塩であることもできる。STINGアゴニストは、構造式I、Ia、Ib、Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II、II-1、II-2、II-3、及びII-4において上記のいずれかに示される化合物の実質的に純粋な(Rp,Rp)立体異性体、又はその塩であることが好ましい。本明細書で使用される「実質的に純粋」という用語は、リン光体(phosphor)原子に関して、他の可能なジアステレオマーに対して、少なくとも75%純水である、1つの(Rp,Rp)、(Rp,Sp)、(Sp,Rp)、又は(Sp,Sp)ジアステレオマーを指す。好ましい実施形態では、実質的に純粋な化合物は、少なくとも85%純粋である、少なくとも90%純粋である、少なくとも95%純粋である、少なくとも97%純粋である、少なくとも99%純粋である。
幾つかの実施形態では、STINGアゴニストは、構造式I、Ia、Ib、Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II、II-1、II-2、II-3、及びII-4において上記のいずれかに示される化合物の薬学的に許容される塩である。本明細書で使用されるように、「薬学的に許容される」という表現は、健全な医学的判断の範囲内で、過剰な毒性、刺激、アレルギー反応、又はその他の問題や合併症がなく、ヒト及び動物の組織と接触して使用するのに適しており、合理的な利益/リスク比に見合った化合物、材料、組成物、及び/又は剤形を指すために使用される。本明細書で使用されるように「薬学的に許容される塩」とは、親化合物が塩基との塩を作ることによって修飾される開示された化合物の誘導体を指す。薬学的に許容される塩は、通常の化学的方法によって酸性部分を含む親化合物から合成されることができる。一般的に、このような塩は、これらの化合物の遊離酸形態を、水、又はエーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール、アセトニトリルのような有機希釈剤、又はそれらの混合物中の十分な量の適切な塩基と反応させることによって調製されることができる。或いは、例えば、本発明の化合物(遊離酸又は塩形態))の水溶液を陽イオン交換体で処理することによって、イオン交換によって塩を調製することもできる。幾つかの実施形態では、STINGアゴニストは、構造式I、Ia、Ib、Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II、II-1、II-2、II-3、及びII-4において上記のいずれかに示される化合物のナトリウム塩である。
本発明の組合せでは、複合体は、配列番号55のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、STINGアゴニストがADU-S100であることが好ましい。
本発明の組合せにおいて、複合体は、配列番号55のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、STINGアゴニストが、式Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II-1、II-2、II-3、及びII-4によって表される化合物からなる群から選択される1つの化合物、又はその溶媒和物、又は水和物であることも好ましい(上述される)。
複合体は、配列番号54のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、STINGアゴニストがADU-S100であることがより好ましい。
複合体は、配列番号54のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、前記STINGアゴニストが、式Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II-1、II-2、II-3、及びII-4によって表される化合物からなる群から選択される1つの化合物、又はその溶媒和物、又は水和物であることが更により好ましい(上述される)。
一般に、配列変異体に関しては、同一性(%)が高いほど、配列変異体はより好まれる。したがって、例えば、配列番号54又は配列番号55のアミノ酸配列における100%の同一性が最も好まれる。同様に、式Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II-1、II-2、II-3及びII-4の化合物は、一般的にその溶媒和物又は水和物よりもより好まれる。
したがって、本発明は、STINGアゴニストとの組合せでの使用のための(特に医薬における使用のための)上述される複合体も提供する。好ましくは、STINGアゴニストは、上述される通りである。癌の予防及び/又は治療等、好ましい医学的利用は、以下の通りである。
更に、本発明は、上述される複合体との組合せでの使用のための(特に医薬における使用のための)STINGアゴニストも提供する。好ましくは、STINGアゴニストは、上述される通りである。癌の予防及び/又は治療等、好ましい医学的利用は、以下の通りである。
医学的利用
上記で詳細に記載される、本発明における(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体(及び任意の更なる成分)の組合せは、医学、特に薬(medicament)に用いられることができる。
上記で詳細に記載される、本発明における(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体(及び任意の更なる成分)の組合せは、医学、特に薬(medicament)に用いられることができる。
本明細書に記載され、添付の実施例に示されているように、(i)STINGアゴニストと、(ii)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せは、抗原特異的CD8 T細胞を促進するCD4及びCD8 T細胞の両方の応答を改善し、腫瘍内免疫原性を増加させ、生存率の大幅な増加及び腫瘍増殖の減少をもたらす。これは、共に作用するSTINGアゴニスト及び複合体の相乗効果を示し、単独療法として投与されるその各成分の抗腫瘍効果を大幅に増加させることを示す。
本発明の組合せは、様々な疾患において有用であり得る。本明細書に記載される組合せは、癌、感染症、自己免疫障害、血液病、及び移植片拒絶を含む免疫療法によって治療可能なもの等、疾患又は障害の予防、治療、又は安定化のための(薬の調製のための)使用であることが好ましい。したがって、癌、感染症、自己免疫障害、血液病、及び移植片拒絶を含む免疫療法によって治療可能なもの等、疾患又は障害の予防、治療、又は安定化における使用のための、本明細書に記載される組合せが好ましい。
本発明の文脈では、本明細書に記載される本発明の組合せは、癌又は腫瘍の予防及び/又は治療に用いられることができることが特に好ましい。
したがって、本発明は、必要とする対象において、癌を治療する、又は抗腫瘍応答を開始、増強、又は延長する方法であって、前記方法が、前記対象に、有効量の上述の本発明の組合せ(即ち、有効量の(i)STINGアゴニスト;及び有効量の(ii)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体;並びに、任意に(iii)有効量の任意の更なる活性物質)を投与することを含む方法も提供する。更に、本発明は、患者において腫瘍抗原特異的T細胞による腫瘍の浸潤を増加させる方法であって、前記方法が、腫瘍又は癌に罹患している患者に、上述の本発明の組合せ(即ち、(i)STINGアゴニスト;及び(ii)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体;並びに、任意に(iii)任意の更なる活性物質)を投与することを含む方法も提供する。更に、本発明は、癌を予防及び/又は治療する併用療法であって、前記併用療法が、上述の本発明の組合せ(即ち、(i)STINGアゴニスト;及び(ii)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体;並びに、任意に(iii)任意の更なる活性物質)の投与を含む方法も提供する。
本発明の文脈で使用される「疾患」という用語は、全てが、ヒト又は動物の体又は正常な機能を損なう部分の1つの異常な(非生理学的又は病理学的な)状態を反映し、典型的には徴候と症状を区別することによって現れ、ヒト又は動物の生存期間又は生活の質の低下を引き起こすという点で、一般的に、「障害」及び「状態」(医学的状態で)という用語と同義であることを意図しており、「障害」及び「状態」(医学的状態で)という用語と交換可能に用いられる。
本明細書に記載される、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体の使用によって、治療及び/又は予防される疾患は、癌、血液学的障害、感染症、自己免疫障害、及び移植片拒絶を含むことが好ましい。そのため、癌及び感染症の治療及び/又は予防が好ましく、癌の治療及び/又は予防がより好ましい。癌については、内分泌腫瘍、胃腸腫瘍、尿生殖器又は女性生殖器腫瘍、乳癌、頭頚部腫瘍、造血器腫瘍、皮膚腫瘍、胸部又は呼吸器腫瘍、好ましくは転移性結腸直腸癌等の結腸直腸癌が好ましい。
好ましくは、本明細書に記載されるSTINGアゴニストと、本明細書に記載される細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せは、欠陥のあるアポトーシスによって引き起こされる疾患を含む、癌又は腫瘍疾患の予防、治療及び/又は寛解のために(薬剤の調製のために)使用されることができる。癌は、固形腫瘍、血液癌、又はリンパ性癌であることもある。癌は、良性の場合もあれば、転移性の場合もある。治療される癌の更に好ましい例としては、脳癌、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、食道癌、肺癌、肝臓癌、腎癌、メラノーマ、腸癌腫、肺癌腫、頭頸部扁平細胞癌腫、慢性骨髄性白血病、結腸直腸癌腫、胃癌腫、子宮内膜癌腫、骨髄性白血病、肺扁平細胞癌腫、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、膀胱腫瘍、前骨髄球性白血病、非小細胞肺癌腫、及び肉腫が挙げられる。本明細書で記載される、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体は、結腸直腸癌を治療するために使用されることが特に好ましい。
幾つかの実施形態では、癌/腫瘍は、トリプルネガティブ乳癌を含む乳癌、胆道癌;膀胱癌;神経膠芽腫及び髄芽腫を含む脳癌;子宮頸癌;絨毛癌;結腸癌;子宮内膜癌;食道癌;胃癌;消化管間質腫瘍(GIST)、虫垂癌、胆管細胞癌、カルチノイド腫瘍、消化管結腸癌、肝外胆管癌、胆嚢癌、胃癌、消化管カルチノイド腫瘍、結腸直腸癌、又は転移性結腸直腸癌、急性リンパ性白血病及び骨髄性白血病を含む血液腫瘍;T細胞急性リンパ性白血病/リンパ腫;ヘアリーセル白血病;慢性骨髄性白血病、多発性骨髄腫;AIDS随伴性白血病及び成人T細胞白血病リンパ腫;ボーエン病及びパジェット病を含む上皮内腫瘍;肝臓癌;非小細胞肺癌を含む肺癌、ホジキン病及びリンパ球性リンパ腫を含むリンパ腫;神経芽細胞腫;神経膠芽腫、扁平細胞癌腫を含む口腔癌;上皮細胞、間質細胞、生殖細胞、及び間葉系細胞から生じるものを含む卵巣癌;膵臓癌;前立腺癌;直腸癌;平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、脂肪肉腫、線維肉腫、及び骨肉腫を含む肉腫;メラノーマ、メルケル細胞癌、カポジ肉腫、基底細胞癌、及び扁平細胞癌を含む皮膚癌;セミノーマ、非セミノーマ(奇形腫、絨毛癌)、間質腫瘍、及び生殖細胞腫瘍等の胚腫瘍を含む精巣癌;甲状腺癌腫及び髄様癌腫を含む甲状腺癌;及び腺癌及びウィルムス腫瘍を含む腎癌から選択されることができる。
幾つかの実施形態では、癌/腫瘍は、聴神経神経鞘腫、肛門癌腫、星状細胞腫、基礎細胞腫、ベーチェット症候群、膀胱癌、芽細胞腫、骨癌、脳転移、脳腫瘍、脳癌(神経膠芽腫)、乳癌(乳房癌腫)、バーキットリンパ腫、カルチノイド、子宮頸癌、結腸癌腫、結腸直腸癌、子宮体癌(corpus carcinoma)、頭蓋咽頭腫(craniopharyngeomas)、CUP症候群、子宮内膜癌腫、胆嚢癌、生殖器の腫瘍(尿生殖器管の癌を含む)、神経膠芽腫、神経膠腫、頭頸部腫瘍、肝細胞腫、組織球性リンパ腫(histocytic lymphoma)、ホジキン症候群又はリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫、脳下垂体腫瘍、腸癌(小腸の腫瘍及び胃腸腫瘍を含む)、カポジ肉腫、腎癌、腎臓癌腫、喉頭癌(laryngeal cancer)又は喉頭癌(larynx cancer)、白血病(急性骨髄性白血病(AML)、赤白血病、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、及び慢性リンパ性白血病(CLL)を含む)、眼瞼腫瘍、肝臓癌、肝転移、肺癌腫(=肺癌=気管支癌)、小細胞肺癌及び非小細胞肺癌、及び肺腺癌、リンパ腫、リンパ性癌、悪性メラノーマ、乳房癌腫(=乳癌)、髄芽腫、メラノーマ、髄膜腫、菌状息肉症、腫瘍性疾患神経鞘腫、食道癌、食道性癌腫(=食道癌)、乏突起神経膠腫、卵巣癌(=卵巣癌腫)、卵巣癌腫、膵臓癌腫(=膵臓癌)、陰茎癌(penile cancer)、陰茎癌(penis cancer)、咽頭癌、下垂体腫瘍、形質細胞腫、前立腺癌(=前立腺腫瘍)、直腸癌腫、直腸腫瘍、腎癌、腎臓癌腫、網膜芽細胞腫、肉腫、シュネーベルガー(Schneeberger)疾患、皮膚癌(例えば、メラノーマ又は非メラノーマ皮膚癌、基底細胞及び扁平細胞癌腫、並びに乾癬、尋常性天疱瘡、軟部腫瘍、棘細胞腫を含む)、胃癌、精巣癌、咽頭癌、胸腺腫、甲状腺癌、舌癌、尿道癌、子宮癌、膣癌、様々なウイルス誘導腫瘍(例えば、パピローマウイルス誘導癌)(例えば、子宮頚部癌腫=子宮頸癌)、腺癌、ヘルペスウイルス誘導腫瘍(例えば、バーキットリンパ腫、EBV誘発性B細胞リンパ腫、頸部癌腫)、B型肝炎誘導腫瘍(肝細胞癌腫)、HTLV-1-及びHTLV-2-誘導リンパ腫、及び外陰癌から選択されることができる。
好ましくは、発明の組合せで治療される患者は、結腸直腸癌(CRC)、特に後期結腸直腸癌(CRC)又は後期転移性結腸直腸癌(mCRC)に罹患し、「後期」CRC、mCRCという用語は、ステージIIIC:T4a、N2a、M0又はT3-T4a、N2b、M0又はT4b、N1-N2、M0;ステージIVA:任意のT、任意のN、M1a、及びステージIVB:任意のT、任意のN、M1b(TNM病気分類)を含み、CRC又はmCRC腫瘍は、例えば、“マイクロサテライト安定(Microsatellite Stable)”(MSS)、又は“マイクロサテライト不安定(microsatellite instable)”(MSI)であることができ、CRC又はmCRC腫瘍は、MSSであることが好ましい。
現在の文脈では、「治療」及び「治療的」という用語は、生体に投与される際に少なくとも何らかの最小の生理学的効果を有することを意味することが好ましい。例えば、「治療的」抗腫瘍化合物を投与する際の生理的効果は、腫瘍増殖の阻害、腫瘍サイズの減少、又は腫瘍の再発の防止であることができる。好ましくは、癌又は腫瘍性疾患の治療において、腫瘍の増殖を阻害する、又は腫瘍サイズを減少させる、又は腫瘍の再発を防止する化合物は、治療的に有効であると考えられる。したがって、「抗腫瘍薬物」という用語は、腫瘍、腫瘍性疾患又は癌に対して治療的効果を有する治療薬を意味することが好ましい。
本明細書に記載される本発明の組合せの成分、即ち、(i)STINGアゴニスト及び(ii)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニスト(及び任意の更なる成分)を含む複合体は、通常、併用療法として投与される。これは、1つの成分(STINGアゴニスト又は複合体)が、例えば他の成分(STINGアゴニスト又は複合体のもう一方)と同じ日に投与されなかったとしても、それらの治療スケジュールが一般的に絡み合っている(intertwine)ことを意味する。これは、本発明の文脈における「組合せ」が、1つの成分(STINGアゴニスト又は複合体)による治療の開始を、他の成分(STINGアゴニスト又は複合体のもう一方)による治療が終了した後に、特に含まないことを意味する。したがって、「終了した」治療とは、特に、活性成分がもうその効果を発揮しないことを意味する。即ち、活性成分がその効果をどのくらい発揮するかに応じて、「治療」は特に、活性成分の最後の投与から数分後、数時間後、又は数日後に終了することがある。より一般的には、STINGアゴニスト及び複合体の「絡み合った」治療スケジュール、即ちSTINGアゴニスト及び複合体の複合体は、以下を意味する。
(i)複合体の最初の投与が開始する前(したがって、複合体による完全な治療)に、STINGアゴニストの全ての投与(したがって、完全なSTINGアゴニスト治療)は、1週間を超えて(好ましくは3日を超えて、より好ましくは2日を超えて、更により好ましくは1日を超えて)完了しない;又は
(ii)STINGアゴニストの最初の投与(したがって、完全なSTINGアゴニスト治療)が開始する前に、複合体の全ての投与(したがって、複合体による完全な治療)は、1週間を超えて(好ましくは3日を超えて、より好ましくは2日を超えて、更により好ましくは1日を超えて)完了しない。
(i)複合体の最初の投与が開始する前(したがって、複合体による完全な治療)に、STINGアゴニストの全ての投与(したがって、完全なSTINGアゴニスト治療)は、1週間を超えて(好ましくは3日を超えて、より好ましくは2日を超えて、更により好ましくは1日を超えて)完了しない;又は
(ii)STINGアゴニストの最初の投与(したがって、完全なSTINGアゴニスト治療)が開始する前に、複合体の全ての投与(したがって、複合体による完全な治療)は、1週間を超えて(好ましくは3日を超えて、より好ましくは2日を超えて、更により好ましくは1日を超えて)完了しない。
例えば、本明細書に記載されるSTINGアゴニストと、本明細書に記載される細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せにおいて、1つの成分(STINGアゴニスト又は複合体)は、1週間に一度投与されることができ、一方の成分(STINGアゴニスト又は複合体のもう一方)は、1か月に一度投与されることができる。この例において、本発明の意味における「組合せ」を達成するために、月に1回投与される成分は、同じ週に少なくとも1回投与され、そこでは、週に1回投与される他の成分も投与される。
上記で概説したように、本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト及び/又は複合体の投与は、複数回の連続投与、例えば複数回の注射を必要とすることがある。したがって、投与は、例えば一次免疫注射として1回、後に追加免疫注射として、少なくとも2回繰り返される場合がある。
特に、本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト及び/又は複合体は、繰り返し(又は連続して)投与されることができる。本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト及び/又は複合体は、繰り返し又は連続して、少なくとも1週間、2週間、3週間、又は4週間;2か月間、3か月間、4か月間、5か月間、6か月間、8か月間、10か月間、又は12か月間;又は2年間、3年間、4年間、又は5年間の期間投与されることができる。例えば、本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、1日2回、1日1回、2日毎、3日毎、週1回、2週間毎、3週間毎、1ヶ月に1回、又は2ヶ月毎に投与されることができる。例えば、本発明の組合せに含まれる複合体は、1日2回、1日1回、2日毎、3日毎、週1回、2週間毎、3週間毎、1ヶ月に1回、又は2ヶ月毎に投与されることができる。好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体及び/又はSTINGアゴニストは、例えば1週間に一回又は2週間毎(に1回)、繰り返し投与されることができる。
好ましくは、本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト及び/又は複合体は、同じ日に投与されることができる。例えば、本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト及び/又は複合体は、繰り返し(上述されるように、例えば、一週間毎)投与されることができ、複合体が投与される日に、STINGアゴニストも投与される。更に、このような組合せ投与の日に、任意の第3の成分も投与されることができる。
本発明において、本明細書に記載されるSTINGアゴニストと、本明細書に記載される細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せにおいて、STINGアゴニスト及び複合体は、ほぼ同時に投与されることが好ましい。
本明細書で使用される「ほぼ同時に」とは、特に同時投与を意味する、又はSTINGアゴニストの投与の直後に複合体が投与される、又は複合体の投与の直後にSTINGアゴニストが投与されることを意味する。当業者であれば、「直後」は、2回目の投与の準備に必要な時間、特に2回目の投与の場所の暴露と消毒、並びに「投与装置」(例えば、シリンジ、ポンプ等)の適切な準備に必要な時間を含むことを理解する。同時投与は、STINGアゴニストと複合体の投与期間が重複する場合、又は、例えば、30分、1時間、2時間、又はそれ以上といったより長い期間にわたって、1つの成分(STINGアゴニスト又は複合体)を例えば点滴(infusion)により投与し、一方の成分(STINGアゴニスト又は複合体)をそのような長い期間のある時点で投与する場合も含む。異なる製剤、異なる投与経路、及び/又は異なる投与部位が使用される場合、ほぼ同時のSTINGアゴニスト及び複合体の投与は、特に好ましい。
好ましくは、本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト及び本発明の組合せに含まれる複合体(並びに任意の更なる活性化合物)は、治療的有効量で投与される。本明細書で使用される「治療的有効量」は、治療される疾患又は状態の症状の緩和及び/又は予防される疾患又は状態の症状の予防に十分な量である。言い換えれば、「治療的有効量」とは、疾患又は障害の積極的な修飾を顕著に誘発するのに十分な複合体及び/又はSTINGアゴニストの量、即ち求められている組織、系、動物、又はヒトにおいて生物学的又は医学的応答を誘発する複合体及び/又はSTINGアゴニストの量を意味する。この用語は、疾患の進行を減少させる、特に腫瘍増殖又は感染を減少又は抑制し、それによって求められている応答を誘発するのに十分な複合体及び/又はSTINGアゴニストの量も含み、特にそのような応答は、複合体(即ち「阻害有効量」)に含まれる抗原又は抗原エピトープに対して向けられる免疫応答であろう。しかしながら、同時に、「治療的有効量」は、重篤な副作用を回避する、即ち、利点とリスクとの間の賢明な関係を許容するのに十分小さいことが好ましい。これらの限界の決定は、通常、賢明な医学的判断の範囲内にある。複合体及び/又はSTINGアゴニストの「治療的有効量」は、更に、治療される特定の状態と関連して、また、治療される患者の年齢及び身体状態、体重、全般の健康状態(general health)、性別、食事、投与時間、排泄速度、薬物の組合せ、特定の成分(STINGアゴニスト及び複合体)の活性、状態の重症度、治療期間、付随する治療の性質、使用される特定の薬学的に許容される担体の性質、及び担当医の知識及び経験の範囲内における同様の要因と関連して変化する。
したがって、個人に単回又は複数回投与される用量は、薬物動態学的特性、対象の状態及び特性(性別、年齢、体重、健康、サイズ)、症状の程度、同時治療、治療の頻度、及び望ましい効果を含む様々な要因によって変化する。
本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニスト(並びに任意の更なる活性化合物)は、様々な投与経路、例えば、全身的又は局所的(例えば、腫瘍内に)によって投与されることができる。全身投与の経路は、一般的に、例えば、経皮的経路、静脈内経路、筋肉内経路、動脈内経路、皮内経路、及び腹腔内経路、及び/又は鼻腔内投与経路を含む、経皮経路、経口慶雄、及び非経口経路を含む。局所投与の経路には、例えば、腫瘍内投与等、罹患部位での投与を含む。
好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、全身に投与される。幾つかの実施形態では、STINGアゴニストは、腫瘍内に投与され、複合体は、全身に投与される。
全身投与においては、非経口的投与経路が好ましい。本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、静脈内、皮内、皮下、筋肉内、鼻腔内、又は節内経路を介して投与されることがより好ましい。本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、静脈内又は皮下投与されることが更により好ましい。幾つかの実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、筋肉内投与される。
好ましくは、本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、同じ投与経路を介して、好ましくは同じ全身投与経路を介して、より好ましくは同じ非経口投与経路を介して、更に好ましくは静脈内又は皮下に投与される。
幾つかの実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、異なる投与経路を介して投与される。例えば、STINGアゴニストは腫瘍内に投与され、複合体は、例えば筋肉内又は皮下に全身に投与される。幾つかの実施形態では、本発明の組合せに含まれる複合体及び本発明の組合せに含まれるSTINGアゴニストは、異なる全身投与経路を介して投与される。例えば、STINGアゴニストは静脈内に投与され、複合体は筋肉内又は皮下等の全身に投与される。
組成物
上述されるように、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、別々の組成物で提供されることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物で提供されることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物で提供されることができる。例えば、、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物で提供されることができる。
上述されるように、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、別々の組成物で提供されることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物で提供されることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物で提供されることができる。例えば、、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の組成物で提供されることができる。
幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、同じ組成物に含まれることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ組成物に含まれることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ組成物に含まれることができる。例えば、、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ組成物に含まれることができる。
したがって、本発明はまた、組成物の組合せを提供し、第1の組成物は、上述されるSTINGアゴニストを含み(ただし、上述される複合体でないことが好ましい);第2の組成物は、上述される複合体を含む(ただし、上述されるSTINGアゴニストでないことが好ましい)。これらの組成物のそれぞれは、任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)を含むことができる。しかし、幾つかの実施形態では、STINGアゴニストを含む組成物も、複合体を含む組成物も、任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)を更に含まない。このような場合、任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)が、更に異なる組成物に含まれることができる。
更に、本発明は、上述されるSTINGアゴニスト及び上述される複合体を含む組成物も提供する。このような組成物は、任意に、任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)を更に含むことができる。しかしながら、幾つかの実施形態では、任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、更に異なる組成物に含まれることができる。
したがって、更なる態様では、本発明は、下記組成物も提供する。前記組成物は、
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む。前記複合体に含まれる成分a)~c)は、共有結合される。
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む。前記複合体に含まれる成分a)~c)は、共有結合される。
特に、本発明によるこのような組成物は、(i)上述されるSTINGアゴニスト及び(ii)上述される複合体を含む。言い換えれば、上述されるSTINGアゴニストの好ましい実施形態(本発明の組合せの文脈)は、本発明による組成物においても好ましい。したがって、上述される複合体の好ましい実施形態(本発明の組合せの文脈)は、本発明の組成物においても好ましい。
一般に、組成物は、医薬組成物及び/又はワクチン組成物であることができる。特に、そのような組成物は、当業者によく知られた薬学的に許容される担体及び/又はビヒクル、又は任意の賦形剤、緩衝剤、安定剤、又は他の材料を任意に含む(医薬)組成物であることが好ましい。本発明の文脈で使用されるように「医薬製剤」及び「医薬組成物」という用語は、特に、有効成分の生物活性が明白に有効であることを可能にするような形態である製剤であり、かつ、その製剤が投与されるであろう対象に対して毒性であるような追加の成分を含まない製剤を指す。幾つかの実施形態では、(医薬)組成物は、STINGアゴニスト及び/又は複合体(及び/又は任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外))に加えて、更なる活性成分(例えば、癌治療に関して「活性」である)を含まない。
更なる成分として、(医薬)組成物は、薬学的に許容される担体及び/又はビヒクルを特に含むことができる。本発明の文脈では、薬学的に許容される担体は、典型的には、(医薬)組成物の液体成分(basis)又は非液体成分を含む。(医薬)組成物が液体の形態で提供される場合、担体は、典型的には、パイロジェンフリーの水、等張生理食塩水、緩衝(水溶液)溶液(例えば、リン酸塩、クエン酸塩)等、緩衝溶液である。特に、(医薬品)組成物の注射は、水、又は好ましくは緩衝剤、より好ましくは水性緩衝剤を使用することができ、これらは、ナトリウム塩、好ましくは、少なくとも30mMのナトリウム塩、カルシウム塩、好ましくは、少なくとも0.05mMのカルシウム塩、任意に、カリウム塩、好ましくは少なくとも1mMのカリウム塩を含む。好ましい実施形態によれば、ナトリウム塩、カルシウム塩、及び任意のカリウム塩は、ハロゲン化物(例えば塩化物、ヨウ化物、又は臭化物)の形態で、それらの水酸化物、炭酸塩、炭酸水素塩、又は硫酸塩等の形態で生じることができる。ナトリウム塩の例としては、例えば、NaCl、NaI、NaBr、Na2CO3、NaHCO3、Na2SO4が挙げられ、任意のカリウム塩の例としては、例えば、KCl、KI、KBr、K2CO3、KHCO3、K2SO4が挙げられ、カルシウム塩の例としては、例えば、CaCl2、CaI2、CaBr2、CaCO3、CaSO4、Ca(OH)2が挙げられるが、これらに限定されない。更に、緩衝剤中に前述のカチオンの有機アニオンが含まれていることができる。より好ましい実施形態によれば、上記で定義された注射目的に適した緩衝剤は、塩化ナトリウム(NaCl)、塩化カルシウム(CaCl2)、及び任意に塩化カリウム(KCl)から選択される塩を含むことができ、更なるアニオンが塩化物に加えられて存在することができる。CaCl2は、KClのような別の塩で置き換えられることもできる。通常、注射緩衝剤中の塩は、少なくとも30mM塩化ナトリウム(NaCl)、少なくとも1mM塩化カリウム(KCl)、及び少なくとも0.05mM塩化カルシウム(CaCl2)の濃度で存在する。注射緩衝剤は、特定の参照媒体を基準として、高張性、等張、又は低張性であることができ、即ち、緩衝剤は、特定の参照媒体を基準として、より高い、同一の、又はより低い塩の含有量を有することができ、そのような濃度の前述の塩を用いることができ、浸透圧又は他の濃度効果による細胞の損傷をもたらさない。参照媒体は、例えば、血液、リンパ、サイトゾル液体、又は他の体液のような「インビボ」方法で発生する液体)、又は例えば、「インビトロ」方法で参照媒体として使用できる液体(一般的な緩衝剤又は液体)である。このような一般的な緩衝剤又は液体は、当業者には知られている。液体成分としては、生理食塩水(0.9%NaCl)及び乳酸リンゲル溶液が特に好ましい。幾つかの実施形態では、(医薬)組成物は、L-アルギニン等のアルギニンを更に含むことができる。
しかしながら、1つ以上の適合性のある固体又は液体の充填剤又は希釈剤又はカプセル化化合物を、治療される対象への投与に適した(医薬品)組成物にも使用されることができる。本明細書で使用される「適合性のある」という用語は、(医薬品)組成物のこれらの構成成分が、典型的な使用条件下で、(医薬品)組成物の医薬有効性を実質的に低下させるような相互作用が起こらないような方法で、上記で定義された複合体と混合することができることを意味する。薬学的に許容される担体、充填剤、及び希釈剤は、当然ながら、治療される対象への投与に適したものとするために、十分に高い純度及び十分に低い毒性を有していなければならない。薬学的に許容される担体、充填剤、又はその構成成分として使用できる化合物の幾つかの例は、糖(例えば、ラクトース、グルコース、及びスクロース等);デンプン(例えば、コーンスターチ又はジャガイモデンプン等);セルロース及びその誘導体(例えば、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース、酢酸セルロース等);トラガント末;麦芽;ゼラチン;獣脂;固体流動化助剤(solid glidant)(例えば、ステアリン酸、ステアリン酸マグネシウム等);硫酸カルシウム;植物油(例えば、落花生油、綿実油、ごま油、オリーブ油、コーン油、及びカカオからの油等);ポリオール(例えば、ポリプロピレングリコール、グリセロール、ソルビトール、マンニトール、及びポリエチレングリコール等);アルギン酸である。
幾つかの実施形態では、(医薬品)組成物は、注射又は注入技術を介して投与されることができる。(医薬品)組成物の滅菌注射可能な形態は、水性又は油性懸濁液であることができる。これらの懸濁液は、適切な分散剤又は湿潤剤及び懸濁剤を使用して、当該分野で知られている技術に従って製剤化されることができる。滅菌注射可能な製剤(preparation)は、例えば、1,3-ブタンジオール中の溶液のように、無毒の非経口的に許容される希釈剤又は溶媒中の滅菌注射可能な溶液又は懸濁液であることができる。使用されることができる許容されるビヒクル及び溶媒には、水、リンゲル溶液及び等張塩化ナトリウム溶液がある。更に、溶媒又は懸濁媒体として、滅菌された固定油が通常使用される。この目的のために、合成モノグリセリド-又は合成ジグリセリドを含む、あらゆる無刺激の(bland)固定油を使用することができる。オレイン酸やそのグリセリド誘導体等の脂肪酸は、オリーブ油やひまし油等の天然の薬学的に許容される油、特にそれらのポリオキシエチル化されたバージョンと同様に、注射剤の製剤に有用である。これらの油溶液又は懸濁液は、乳剤及び懸濁液を含む薬学的に許容される剤形の製剤に一般的に使用されるカルボキシメチルセルロース又は類似の分散剤等の長鎖アルコールの希釈剤又は分散剤も含むことができる。薬学的に許容される固体、液体、又はその他の剤形の製造に一般的に使用される他の一般的な界面活性剤(Tweens、Spans、及びその他の乳化剤等)又はバイオアベイラビリティ増強剤も、(医薬品)組成物の製剤化の目的で使用されることができる。
非経口注射の場合、有効成分は、パイロジェンフリーで、適切なpH、等張性、及び安定性を有する非経口的に許容される水溶液の形態であることが好ましい。当業者であれば、例えば、塩化ナトリウム注射液、リンゲル液、乳酸リンゲル液等の等張性ビヒクルを使用して、適切な溶液を調製することができる。必要に応じて、防腐剤、安定剤、緩衝剤、酸化防止剤、及び/又はその他の添加剤を含めることができる。
本明細書に記載される(医薬品)組成物は、カプセル、錠剤、水性懸濁液又は溶液を含むがこれらに限定されない任意の経口的に許容される剤形で経口投与されることもできる。経口使用のための錠剤の場合、一般的に使用される担体は、ラクトース及びコーンスターチを含む。ステアリン酸マグネシウム等の潤滑剤も、一般的に添加される。カプセル形態における経口投与において、有用な希釈剤は、ラクトース及び乾燥コーンスターチが挙げられる。経口使用のために水性懸濁液が必要とされる場合、有効成分は乳化剤や懸濁剤と組み合わされる。必要に応じて、特定の甘味料、香料、着色料を添加することもできる。
特に、治療の対象が、例えば、皮膚又はその他の到達しやすい上皮組織の疾患を含む、局所的な適用によって容易に到達しやすい領域又は臓器を含む場合に、(医薬)組成物は、局所的に投与されることもできる。これらの部位又は臓器のそれぞれに適切な局所製剤は、容易に調製される。局所投与のために、(医薬)組成物は、有効成分が1以上の担体に懸濁又は溶解された適切な軟膏で製剤化されることができる。局所投与のための担体は、鉱油、流動パラフィン、白色ワセリン、プロピレングリコール、ポリオキシエチレン、ポリオキシプロピレン化合物、乳化ワックス、及び水が挙げられるが、これらに限定されない。或いは、(医薬)組成物を適切なローション又はクリームに配合されることもできる。本発明の文脈では、適切な担体は、鉱油、ソルビタンモノステアレート、ポリソルベート60、セチルエステルワックス、セトステアリルアルコール(cetearyl alcohol)、2-オクチルドデカノール、ベンジルアルコール、及び水が挙げられるが、これらに限定されない。
この文脈において、治療の処方、例えば上記(医薬)組成物を使用する際の用量等の決定は、一般医師(practitioner)及び他の医師の責任の範囲内であり、一般的には、治療されるべき障害、個々の患者の状態、送達場所、投与方法、及び一般医師に知られている他の要因を考慮する。
したがって、(医薬)組成物は、一般的に、治療的有効量の、(医薬)組成物の成分、特に、複合体及び/又はSTINGアゴニストを含む。(医薬)組成物は、ヒトのために、また動物の医療目的のために、好ましくはヒトの医療目的のために、一般に(医薬品)組成物として、又はワクチンとして使用されることができる。
(医薬)組成物、特にワクチン組成物又は製剤は、本明細書に記載される複合体及び/又は本明細書に記載されるSTINGアゴニストを、本明細書に記載される任意の形態で含有することができる医薬品製剤として投与されることができる。例えば、(医薬)組成物、特にワクチン組成物又は製剤は、本明細書に記載される任意の形態で、本明細書に記載される複合体がロードされた抗原提示細胞(例えば、樹状細胞)を含むことができる、医薬製剤として投与されることもできる。
ワクチン及び/又は組成物は、(医薬)組成物及びその単位用量として、特に上述及び後述の従来から採用されているアジュバント、免疫調節性材料、担体、希釈剤、又は賦形剤と共に製剤化されることもでき、そのような形態では、いずれも経口使用である、錠剤又は充填カプセル等の固体、溶液、懸濁液、乳剤、エリキシル剤、又はこれらを充填したカプセル等の液体として、又は注射や持続点滴による非経口用(皮下、皮内を含む)の滅菌注射可能な溶液の形態で用いられることができる。
本発明の文脈で、特に、(医薬)組成物及びワクチンの文脈で、注射可能な組成物は、注射可能な滅菌生理食塩水又はリン酸緩衝食塩水又は当技術分野で知られる注射可能な担体に基づくことができる。そのような(医薬)組成物及びその単位剤形は、追加の活性化合物又は原理の有無にかかわらず、従来の比率で成分を含むことができ、そのような単位剤形は、使用される意図された1日の用量範囲に見合った任意の有効量の有効成分を含むことができる。
本発明の文脈における適切なアジュバント及び/又は免疫調節性材料の例としては、MPL(登録商標)(Corixa)、アルミニウム系鉱物含有アルミニウム化合物(一般的に、Alumと呼ばれる)、ASO1-4、MF59、リン酸カルシウム、リポソーム、イスコム、その安定化形態poly-ICLC(Hiltonol)を含むポリイノシン・ポリシチジン酸(polyIC)、CpGオリゴデオキシヌクレオチド、顆粒球-マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)、リポ多糖類(LPS)、モンタニド(Montanide)、ポリラクチドコグリコリド(PLG)、フラゲリン、シャボンノキのサポニン(QS21)、アミノアルキルグルコサミド化合物(例えば、RC529)、合成オリゴデオキシヌクレオチドを含む2成分抗細菌性ペプチド(例えば、IC31)、イミキモド、レシキモド、免疫賦活性配列(ISS)、モノホスホリルリピドA(MPLA)、及び線維芽細胞刺激性リポペプチド(FSL1)等が挙げられる。
組成物、特に医薬組成物及びワクチンは、水性又は油性懸濁液、溶液、乳剤、シロップ、及びエリキシル剤を含むが、これらに限定されない液体製剤であることができる。組成物は、使用前に水又は他の適切なビヒクルで、再構成するための乾燥製品として製剤化されることもできる。このような液体製剤としては、懸濁剤、乳化剤、非水性ビヒクル、及び防腐剤を含むが、これらに限定されない添加物を含むことができる。懸濁剤としては、ソルビトールシロップ、メチルセルロース、グルコース/糖シロップ、ゼラチン、ヒドロキシエチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ステアリン酸アルミニウムゲル、及び水素化食用油脂が挙げられるが、これらに限定されない。乳化剤としては、レシチン、ソルビタンモノオレアート、及びアカシアが挙げられるが、これらに限定されない。防腐剤としては、p-ヒドロキシ安息香酸メチル又はp-ヒドロキシ安息香酸プロピル、及びソルビン酸が挙げられるが、これらに限定されない。分散剤又は湿潤剤は、ポリ(エチレングリコール)、グリセロール、ウシ血清アルブミン、Tween(登録商標)、Span(登録商標)が挙げられるが、これらに限定されない。
組成物、特に医薬組成物及びワクチンは、デポ製剤として製剤化されることもでき、注入(implantation)によって又は筋肉内注射によって、投与されることができる。
組成物、特に医薬組成物及びワクチンは、固体組成物であることもでき、従来の方法で製剤化された錠剤又はロゼンジの形態であることができる。例えば、経口投与のための錠剤及びカプセルは、結合剤、充填剤、潤滑剤、崩壊剤、及び湿潤剤を含むが、これらに限定されない従来の賦形剤を含むことができる。結合剤は、シロップ、アカシア、ゼラチン、ソルビトール、トラガント、スターチの粘液、及びポリビニルピロリドンが挙げられるが、これらに限定されない。充填剤は、ラクトース、糖、結晶セルロース、トウモロコシデンプン、リン酸カルシウム、及びソルビトールが挙げられるが、これらに限定されない。潤滑剤は、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、タルク、ポリエチレングリコール、及びシリカが挙げられるが、これらに限定されない。崩壊剤としては、ジャガイモデンプン及びデンプングリコール酸ナトリウムが挙げられるが、これらに限定されない。湿潤剤としては、ラウリル硫酸ナトリウムが挙げられるが、これらに限定されない。錠剤は、当該技術分野でよく知られた方法に従ってコーティングされることができる。
組成物、特に医薬組成物及びワクチンは、徐放性形態で、又は徐放性ドラッグデリバリーシステムから投与されることもできる。
更に、組成物、特に医薬組成物及びワクチンは、反復投与によって送達用に適応させることができる。
組成物、特に医薬組成物及びワクチンの文脈において、又はそれらの製剤の文脈において有用である、更なる材料及び製剤処理技術等は、当業者に知られている。
組成物はワクチンであることが好ましい。本発明の文脈で使用されるように、「ワクチン」という用語は、自然免疫及び/又は適応免疫を、典型的には特定の疾患、好ましくは癌に提供する生物学的製剤を指す。したがって、ワクチンは、特に、治療される対象の免疫系の自然免疫応答及び/又は適応免疫応答を支持する。例えば、本明細書に記載されている複合体の抗原又は抗原エピトープは、典型的には、治療される患者の適応免疫応答をもたらすか支持し、本明細書に記載される複合体のTLRペプチドアゴニストは、自然免疫応答をもたらすか支持することができる。
ワクチンは、(医薬)組成物について上記で定義されている、薬学的に許容される担体、アジュバント、及び/又はビヒクルを含むこともできる。ワクチンの特定の文脈において、薬学的に許容される担体の選択は、原則としてワクチンの投与方法によって決定される。ワクチンは、例えば、上記のように全身的に又は局所的に投与されることができる。より好ましくは、ワクチンは、静脈内経路,腫瘍内経路、皮内経路、皮下経路、又は筋肉内経路で投与されることができる。したがって、ワクチンは、液体(又は、場合によっては固体)の形態で製剤化されることが好ましい。投与されるワクチンの適切な量は、動物モデルを用いた通例の実験によって決定されることができる。そのようなモデルとしては、いかなる制限も意味することなく、ウサギ、ヒツジ、マウス、ラット、イヌ、及び非ヒト霊長類モデルが挙げられる。注射のための好ましい単位用量形態には、水、生理食塩水、又はそれらの混合物の滅菌溶液が含まれる。そのような溶液のpHは、約7.4に調整されるべきである。注射に対して適切な担体としては、ヒドロゲル、放出を制御又は遅延させる装置、ポリ乳酸、及びコラーゲンマトリックスが挙げられる。局所投与ための適切な薬学的に許容される担体は、ローション、クリーム、ゲル等における使用に適切なものが挙げられる。ワクチンを経口投与する場合は、錠剤、カプセル等が好ましい単位用量形態である。経口投与に使用されることができる単位用量形態の調製のための薬学的に許容される担体は、当技術分野ではよく知られている。その選択は、味、コスト、及び貯蔵性等の本発明の目的にとって重要ではない二次的な考慮事項に依存し、当業者によって困難なく行われることができる。
ワクチンは、その免疫原性を更に増加させるために、1つ以上の補助物質を追加で含むことができる。それによって、上記で定義されたSTINGアゴニスト及び/又は複合体と、上記のようにワクチンに任意に含まれることができる補助物質との相乗作用は、達成されることが好ましい。様々な種類の補助物質に応じて、この点で様々なメカニズムが考慮される。例えば、樹状細胞(DC)の成熟を可能にする化合物、例えばリポ多糖類やTNF-αは、第一級の適切な補助物質を形成する。一般に、標的化された方法で、増強及び影響をされるSTINGアゴニスト又は複合体によって産生される免疫応答を可能にするGM-CSF等のサイトカイン、又は「危険信号」(LPS、GP96等)の方法で、補助物質として、免疫系に影響を与える薬剤を使用することができる。特に好ましい補助物質は、自然免疫応答を更に促進する、モノカイン、リンホカイン、インターロイキン、又はケモカイン等のサイトカインであり、IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-19、IL-20、IL-21、IL-22、IL-23、IL-24、IL-25、IL-26、IL-27、IL-28、IL-29、IL-30、IL-31、IL-32、IL-33、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、LT-β又はTNF-α、増殖因子(hGH等)が挙げられる。
一般に、本明細書に記載される(医薬)組成物、特にワクチンは、上記の医学的利用に記載されているように、医療において使用されることができる。特に、上述されるように、例えば、癌、血液学的障害、感染症、自己免疫障害、及び移植片拒絶を含む(癌が好ましい)疾患又は障害の予防及び/又は治療に使用されることができる。
キット
更なる態様では、本発明は、キット、特に部品のキットも提供する。前記キットは、
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む。前記複合体に含まれる成分a)~c)は、共有結合される。
更なる態様では、本発明は、キット、特に部品のキットも提供する。前記キットは、
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む。前記複合体に含まれる成分a)~c)は、共有結合される。
特に、本発明のそのようなキットは、(i)(本発明の組合せの文脈において)上述されるSTINGアゴニスト及び(ii)(本発明の組合せの文脈において)上述される複合体を含む。言い換えれば、(本発明の組合せの文脈において)上述されるSTINGアゴニストの好ましい実施形態も、本発明のキットにおいて好ましい。したがって、(本発明の組合せの文脈において)上述される複合体の好ましい実施形態も、本発明のキットにおいて好ましい。
キットの様々な成分は、1つ以上の容器に入れられることができる。上記の成分は、凍結乾燥又は乾燥された形で提供されるか、適切な緩衝液に溶解されることができる。例えば、キットは、例えば、各組成物が別々の容器に入れられた、上述されるSTINGアゴニストを含む(医薬)組成物及び上述される複合体を含む医薬組成物を含むことができる。
上述されるように、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。例えば、、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、同じ容器(例えば、シリンジ)に含まれることができる。
幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(ii)複合体は、別々の容器(例えば、別々のシリンジ)で提供されることができる。幾つかの実施形態では、(i)STINGアゴニスト及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の容器(例えば、別々のシリンジ)で提供されることができる。幾つかの実施形態では、(ii)複合体及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の容器(例えば、別々のシリンジ)で提供されることができる。例えば、、(i)STINGアゴニスト;(ii)複合体;及び(iii)任意の第3の成分(複合体及びSTINGアゴニスト以外)は、別々の容器(例えば、別々のシリンジ)で提供されることができる。
また、本キットは、例えば、防腐剤、成長培地、及び/又は上記成分の保存及び/又は再構成のための緩衝液、洗浄溶液等を含む追加の試薬を含むことができる。
更に、本発明のキットパーツ(kit-of-parts)は、任意に、使用説明書を含むことができる。キットは、本明細書に記載されているような疾患、例えば癌を治療するための説明書を添付文書又はラベルとして更に含むことが好ましい。
このようなキットは、本明細書に記載されるように医薬における使用、特に本明細書に記載されるように癌の予防及び/又は治療での使用が好ましい。
以下に、添付された図面の簡単な説明を提供する。これらの図は、本発明をより詳細に説明するためのものである。ただし、これらの図は、発明の主題を何らかの方法で制限するために意図したものではない。
図面の説明文を通して、文字「K」は、それぞれの実施例セクションに示されているように、Z13Mad25Anaxa(配列番号55)又はATP128(配列番号54)等、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を表す。
以下では、本発明の様々な実施形態と態様を例示する具体例を示す。しかしながら、本発明は、本明細書に記載された特定の実施形態によって範囲が限定されるものではない。当業者が本発明をより明確に理解し実践できるように、以下の準備及び実施例を示す。しかしながら、本発明は、本発明の単一の態様の例示のみとして目的とする例示された実施形態によって範囲が限定されるものではなく、機能的に同等な方法は本発明の範囲内である。実際、本明細書に記載されたものに加えて本発明の様々な修正は、前述の説明、添付の図面、及び以下の実施例により、当業者に容易に明らかになるであろう。このような修正はいずれも、添付の特許請求の範囲に含まれる。
方法
マウス
雌のC57BL/6JマウスをCharles River Laboratories(L’arbresles、フランス)から購入した。使用された全ての動物は、実験時に生後6週~10週であった。これらの研究は、動物保護に関するスイス連邦法に従って、機関及び州の獣医当局によって審査され、承認されている。
マウス
雌のC57BL/6JマウスをCharles River Laboratories(L’arbresles、フランス)から購入した。使用された全ての動物は、実験時に生後6週~10週であった。これらの研究は、動物保護に関するスイス連邦法に従って、機関及び州の獣医当局によって審査され、承認されている。
ワクチン
ワクチンコンストラクトは、Genscriptによって、社内で設計され大腸菌で産生された。ワクチンは、ワクチン緩衝剤で希釈して調製され、100μlの容量において10nmolを皮下注射することによって投与された。Z13Mad25Anaxa(配列番号55)は、HPV-16に由来するCD4及びCD8エピトープを含み、TC-1腫瘍モデルで利用された。ATP128(配列番号54)は、CEA、サバイビン、及びASCL2エピトープを含み、MC-38 CEA腫瘍モデルで利用された。
ワクチンコンストラクトは、Genscriptによって、社内で設計され大腸菌で産生された。ワクチンは、ワクチン緩衝剤で希釈して調製され、100μlの容量において10nmolを皮下注射することによって投与された。Z13Mad25Anaxa(配列番号55)は、HPV-16に由来するCD4及びCD8エピトープを含み、TC-1腫瘍モデルで利用された。ATP128(配列番号54)は、CEA、サバイビン、及びASCL2エピトープを含み、MC-38 CEA腫瘍モデルで利用された。
STINGアゴニスト
下記のSTINGアゴニスト:ADU-S100(Aduro;「STINGa」とも呼ばれる)(実施例1~7、及び9);及び異なるSTINGアゴニスト(「STINGa2」とも呼ばれる)(実施例8)を使用した。
下記のSTINGアゴニスト:ADU-S100(Aduro;「STINGa」とも呼ばれる)(実施例1~7、及び9);及び異なるSTINGアゴニスト(「STINGa2」とも呼ばれる)(実施例8)を使用した。
ADU-S100(Aduro)をDMSOに再懸濁し、1×リン酸緩衝生理食塩水(PBS、Gibco)で希釈してから注射した。STINGa2を1×リン酸緩衝生理食塩水(PBS、Gibco)に再懸濁してから注射した。
細胞株
HPV16 E6/E7及びc-H-ras癌遺伝子をトランスフェクトした、肺上皮細胞由来の細胞株である、TC-1細胞を、10%熱不活化ウシ胎仔血清(FCS)、100U/mlペニシリン/ストレプトマイシン(P/S)、1mMピルビン酸ナトリウム、MEM NEAA、及び0.4mg/mlジェネティシン(geneticin)G418を補充したRPMI1640Glutamax(商標)で維持した。
HPV16 E6/E7及びc-H-ras癌遺伝子をトランスフェクトした、肺上皮細胞由来の細胞株である、TC-1細胞を、10%熱不活化ウシ胎仔血清(FCS)、100U/mlペニシリン/ストレプトマイシン(P/S)、1mMピルビン酸ナトリウム、MEM NEAA、及び0.4mg/mlジェネティシン(geneticin)G418を補充したRPMI1640Glutamax(商標)で維持した。
MC-38 C57BL/6マウス結腸腺癌細胞株に、ヒト癌胎児性抗原(CEA)遺伝子をコードするcDNAを含むレトロウイルスコンストラクトを形質導入した。MC-38-cea-1クローンによって発現されたCEAは、天然CEAと同様の180kDaの分子量を有していた。本明細書で使用される、このMC-38-cea-1クローンは、細胞表面に高レベルのCEAを発現する(Hand et al.1993,Cancer Immunol Immunother.36:65-75)。MC-38-CEA-1細胞は、標準的な実験室技術を使用して、10%高不活化ウシ胎児血清(Life technologies)を含むDMEM培地1640Glutamax(Life Technology)で培養された(MC-38-CEA-1腫瘍移植のための培養_190115)。
B16-OVA細胞株は、Bertrand Huard,University of Grenoble-Alpes(フランス)より提供された。OVAをトランスフェクトした、マウスメラノーマ細胞由来の細胞株を、10%熱不活化ウシ胎仔血清(FCS)、100U/mlペニシリン/ストレプトマイシン(P/S)、1mMピルビン酸ナトリウム、MEM NEAA、及び1mg/mlジェネティシンG418を補充したRPMI 1640Glutamax(商標)で維持した。
インビボ腫瘍実験
C57BL/6マウスの背中に、1×105個のTC-1腫瘍細胞を皮下移植し、腫瘍移植6日目に腫瘍サイズに応じてマウスを層別化した。又は、C57BL/6Jマウスに1×105個のB16-OVA細胞を静脈内注射した。尾の付け根に、10nmolのワクチンを皮下注射することにより、マウスを2回ワクチン接種した(腫瘍移植後6日目及び13日目に)。
ワクチン接種と同時に、背下部の両側に、25μgのSTINGアゴニストを2×50μlの皮下注射で、マウスに投与した。又は、ワクチン接種と同時に、背下部の両側に、10μgのSTINGアゴニスト2を2×100μlの皮下注射で、マウスに投与した。
C57BL/6マウスの背中に、1×105個のTC-1腫瘍細胞を皮下移植し、腫瘍移植6日目に腫瘍サイズに応じてマウスを層別化した。又は、C57BL/6Jマウスに1×105個のB16-OVA細胞を静脈内注射した。尾の付け根に、10nmolのワクチンを皮下注射することにより、マウスを2回ワクチン接種した(腫瘍移植後6日目及び13日目に)。
ワクチン接種と同時に、背下部の両側に、25μgのSTINGアゴニストを2×50μlの皮下注射で、マウスに投与した。又は、ワクチン接種と同時に、背下部の両側に、10μgのSTINGアゴニスト2を2×100μlの皮下注射で、マウスに投与した。
又は、雌のC57BL/6Jマウスの背中に、5×105個のMC38-CEA 腫瘍細胞を皮下に移植し、尾の付け根で、10nmolのワクチン、25μgのSTINGa(ADU-S100)、又は上記2つの組合せの皮下注射により、2回(腫瘍移植後6日目及び13日目に)ワクチン接種をした。
腫瘍の大きさはカリパスで測定し、腫瘍が1000mm3の体積に達した時点でマウスを安楽死させた。腫瘍体積は、以下の式で計算された。
V=長さ×長さ×幅×Pi/6
V=長さ×長さ×幅×Pi/6
B16-OVA担癌マウスを20日目に殺処分し、肺を生理食塩水で灌流し、肺転移の数をカウントした。
細胞調製
頸骨及び大腿骨から骨髄を抽出し、BMDC培地(10%FCS、100U/ml P/S、50μM β-メルカプトエタノール、10mM HEPES、0.116mg/mlのL-アルギニン、MEM NEAA、及び10ng/mlのGM-CSFで補充したDMEM Glutamax)でDCを培養することにより、骨髄由来のDC(BMDC)をC57BL/6マウスから調製した。37℃、5%CO2で3日後、半量の新鮮培地を添加した。6日目に浮遊細胞を回収し、BMDC培地に再懸濁し、別々に培養した。BMDCは、9日目に回収し、エクスビボT細胞刺激に使用した。
頸骨及び大腿骨から骨髄を抽出し、BMDC培地(10%FCS、100U/ml P/S、50μM β-メルカプトエタノール、10mM HEPES、0.116mg/mlのL-アルギニン、MEM NEAA、及び10ng/mlのGM-CSFで補充したDMEM Glutamax)でDCを培養することにより、骨髄由来のDC(BMDC)をC57BL/6マウスから調製した。37℃、5%CO2で3日後、半量の新鮮培地を添加した。6日目に浮遊細胞を回収し、BMDC培地に再懸濁し、別々に培養した。BMDCは、9日目に回収し、エクスビボT細胞刺激に使用した。
移植後20日目にTC-1腫瘍を採取し、メーカーの指示に従ってMiltenyi腫瘍単離キットを用いて腫瘍浸潤性白血球(TIL)を精製した。簡単に説明すると、腫瘍組織を小さく切断し、腫瘍単離酵素(Miltenyi)を含むDMEM培地に再懸濁した。固形腫瘍プログラムを使用して加熱システム(Miltenyi)を備えたGentle MACSで、腫瘍を消化した。冷たいPBS0.5%BSA溶液を添加し、氷上で細胞を保持することにより、酵素による消化を止めた。消化された腫瘍は、残りの未消化組織を除去するために70μmに通した。製造業者のプロトコルに従って、CD45TILマイクロビーズ(Miltenyi)を使用して、CD45+細胞を精製した。精製したCD45+細胞は、フローサイトメトリー染色又はエクスビボT細胞刺激に使用した。
B16-OVA担癌マウスを生理食塩水で灌流し、採取前に肺から血液を排除した。製造業者の指示に従い、Miltenyiのマウス腫瘍単離キットを使用して肺浸潤白血球(LIL)を精製した。
フローサイトメトリー分析、エクスビボ刺激、又はTCR結合活性アッセイの前に、Ficoll-Paque gradient(GE Healthcare)を使用して、マウスから末梢血及び脾臓単核細胞懸濁液を単離した。
エクスビボT細胞再活性化
TIL、LIL、又は脾細胞を数え、条件ごとにそれぞれ1×105個の細胞又は2×106個の細胞をプレーティングした。Golgi stop(BD biosciences)及び抗CD107aの存在下で、ポジティブコントロールとしてPMA/イオノマイシン、又はネガティブコントロールとして刺激剤なしで、細胞をHPV-CD4、HPV-CD8、OVA-CD8、又はOVA-CD4エピトープペプチドと共に6時間培養した。洗浄後、細胞表面抗原のため及びfixable viability色素の染色をし、製造業者(BD biosciences)の指示に従って固定処理及び透過処理した後、細胞内サイトカインにおける細胞を染色した。
TIL、LIL、又は脾細胞を数え、条件ごとにそれぞれ1×105個の細胞又は2×106個の細胞をプレーティングした。Golgi stop(BD biosciences)及び抗CD107aの存在下で、ポジティブコントロールとしてPMA/イオノマイシン、又はネガティブコントロールとして刺激剤なしで、細胞をHPV-CD4、HPV-CD8、OVA-CD8、又はOVA-CD4エピトープペプチドと共に6時間培養した。洗浄後、細胞表面抗原のため及びfixable viability色素の染色をし、製造業者(BD biosciences)の指示に従って固定処理及び透過処理した後、細胞内サイトカインにおける細胞を染色した。
インビボ細胞傷害性アッセイ
未処置の脾細胞を採取し、HPV-E7 CD8エピトープペプチド(配列番号56)とともに、及びHPV-E7 CD8エピトープペプチド(配列番号56)なしに、37℃のDMEM完全培地で、1.5時間培養した。その後、メーカーの指示に従って、ロードされた脾細胞及びロードされていない脾細胞をそれぞれcell tracer violet(CTV)又はCFSE(いずれもThermoFisher Scientificから)で染色した。次に、脾細胞を1:1の比率で混合し、合計5×106個の細胞を、予めワクチン接種されたマウスに静脈内注射によって移植した。細胞移植の20時間後に、脾細胞を採取し、CTV又はCFSE染色細胞の生存をフローサイトメトリーによって評価した。抗原特異的死滅の割合は、以下の式で算出した。抗原特異的死滅(%)=(1-(ワクチン接種のペプチド+:ペプチド-比率/未処置のペプチド+:ペプチド-比率))*100
未処置の脾細胞を採取し、HPV-E7 CD8エピトープペプチド(配列番号56)とともに、及びHPV-E7 CD8エピトープペプチド(配列番号56)なしに、37℃のDMEM完全培地で、1.5時間培養した。その後、メーカーの指示に従って、ロードされた脾細胞及びロードされていない脾細胞をそれぞれcell tracer violet(CTV)又はCFSE(いずれもThermoFisher Scientificから)で染色した。次に、脾細胞を1:1の比率で混合し、合計5×106個の細胞を、予めワクチン接種されたマウスに静脈内注射によって移植した。細胞移植の20時間後に、脾細胞を採取し、CTV又はCFSE染色細胞の生存をフローサイトメトリーによって評価した。抗原特異的死滅の割合は、以下の式で算出した。抗原特異的死滅(%)=(1-(ワクチン接種のペプチド+:ペプチド-比率/未処置のペプチド+:ペプチド-比率))*100
エクスビボTCR結合活性アッセイ
2回目のワクチン接種の1週間後、脾臓を採取し、脾細胞を単離した(上記参照)。1×106細胞/ウェルをFN-γELIspotプレートに播種し、RAHYNIVTF(配列番号56)又はSIINFEKL(配列番号57)ペプチドの濃度を下げて一晩(O/N)刺激した。その後、製造業者の指示及び刺激ペプチドの最高濃度に対して計算された最大応答の割合に従って、ELIspoプレートを明らかにした。
2回目のワクチン接種の1週間後、脾臓を採取し、脾細胞を単離した(上記参照)。1×106細胞/ウェルをFN-γELIspotプレートに播種し、RAHYNIVTF(配列番号56)又はSIINFEKL(配列番号57)ペプチドの濃度を下げて一晩(O/N)刺激した。その後、製造業者の指示及び刺激ペプチドの最高濃度に対して計算された最大応答の割合に従って、ELIspoプレートを明らかにした。
抗体及びフローサイトメトリー
以下の抗体を使用した。CD45(30-F11)、CD11b(M1/70)、KLRG1(2F1)、CD103(M290)、NKg2a(20d5)、Ly6C(AL-21)、Ly6G(1A8)、PD-L1(MIH5)、I-A/I-E(M5/114)、CD11c(HL3)、PDCA1(927)、CD64(X54-5/7.1)、B220(RA3-6B2)、CD24(M1/69)、CD4(GK1.5)、CD25(3C7)、CD3(500A2)、NKp46(29A1.4)、TNF-α(MP6-XT22)、IFN-γ(XMG1.2)、H2-Kb(AF6-88.5)、及びH2-Db(28-14-8)は、BD Biosciencesから得た。Tim3(RMT3-23)、PD-1(29F.1A12)、CD38(90)、Gr-1(RB6-8C5)、CD206(C068C2)、CD68(FA-11)は、BioLegendから得た。Ki67(solA15)、FoxP3(FJK-16s)、T-bet(4B10)、GATA-3(TWAJ)、及びRORγt(AFKJS-9)は、ThermoFisher Scientificから得た。グランザイムB(REA226)は、Miltenyiから得た。CD8(KT15)は、MBLから得た。死滅細胞は、LIVE/DEAD Yellow又はAqua蛍光反応性染料(Life Technologies)で染色され、分析から除外した。マウスのMHC-ペプチド多量体は、Immudex(コペンハーゲン、デンマーク)から得た。Attune NxTフローサイトメーター(ThermoFisher Scientific)Kaluza(Beckman Coulter)ソフトウェアを使用して、細胞を分析した。
以下の抗体を使用した。CD45(30-F11)、CD11b(M1/70)、KLRG1(2F1)、CD103(M290)、NKg2a(20d5)、Ly6C(AL-21)、Ly6G(1A8)、PD-L1(MIH5)、I-A/I-E(M5/114)、CD11c(HL3)、PDCA1(927)、CD64(X54-5/7.1)、B220(RA3-6B2)、CD24(M1/69)、CD4(GK1.5)、CD25(3C7)、CD3(500A2)、NKp46(29A1.4)、TNF-α(MP6-XT22)、IFN-γ(XMG1.2)、H2-Kb(AF6-88.5)、及びH2-Db(28-14-8)は、BD Biosciencesから得た。Tim3(RMT3-23)、PD-1(29F.1A12)、CD38(90)、Gr-1(RB6-8C5)、CD206(C068C2)、CD68(FA-11)は、BioLegendから得た。Ki67(solA15)、FoxP3(FJK-16s)、T-bet(4B10)、GATA-3(TWAJ)、及びRORγt(AFKJS-9)は、ThermoFisher Scientificから得た。グランザイムB(REA226)は、Miltenyiから得た。CD8(KT15)は、MBLから得た。死滅細胞は、LIVE/DEAD Yellow又はAqua蛍光反応性染料(Life Technologies)で染色され、分析から除外した。マウスのMHC-ペプチド多量体は、Immudex(コペンハーゲン、デンマーク)から得た。Attune NxTフローサイトメーター(ThermoFisher Scientific)Kaluza(Beckman Coulter)ソフトウェアを使用して、細胞を分析した。
血清インターフェロンαの定量
マウス尾静脈から血液を採取し、Starstedt管を用いた遠心分離により血清を単離した。製造業者の推奨(PBL Assay Science)に従い、市販のELISAキットを用いて、IFN-αサイトカイン濃度を測定した。
マウス尾静脈から血液を採取し、Starstedt管を用いた遠心分離により血清を単離した。製造業者の推奨(PBL Assay Science)に従い、市販のELISAキットを用いて、IFN-αサイトカイン濃度を測定した。
統計分析
Prismソフトウェア(GraphPad)を用いて統計分析を行い、p<0.05であれば統計的に有意であるとみなした。
Prismソフトウェア(GraphPad)を用いて統計分析を行い、p<0.05であれば統計的に有意であるとみなした。
実施例1:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せはT細胞応答を調節する
前臨床腫瘍モデルや進行中の臨床試験では、腫瘍微小環境(TME)を炎症させるために、通常、腫瘍内(i.t.)注射によって、STINGアゴニストを投与する。これに対して、本実験では、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体を組み合わせたSTINGアゴニストの全身投与を調査した。
前臨床腫瘍モデルや進行中の臨床試験では、腫瘍微小環境(TME)を炎症させるために、通常、腫瘍内(i.t.)注射によって、STINGアゴニストを投与する。これに対して、本実験では、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及び少なくとも1つのTLRペプチドアゴニストを含む複合体を組み合わせたSTINGアゴニストの全身投与を調査した。
組合せの免疫原性を評価するために、2週間間隔(0日目と14日目)で2回、10nmolのZ13Mad25Anaxa(例示された細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体、ヒトパピローマウイルス(HPV)由来のCD4及びCD8エピトープ含有)の皮下注射によって、腫瘍がないC57BL/6マウスにワクチン接種した。ワクチン接種とほぼ同時に、背下部の両側に、2×50μl皮下注射によって、25μgのSTINGアゴニストADU-S100をマウスに投与した。最初のワクチン接種の4時間後と24時間後に血清を回収し、ELISAでIFN-α濃度を測定した。21日目に全血を回収し、多量体フローサイトメトリー染色による抗原特異的CD8 T細胞の測定に使用した。同時に、脾臓を採取し、エクスビボ刺激及び細胞内サイトカイン産生に使用した脾細胞をフローサイトメトリーで分析した。又は、TCR結合活性アッセイに脾細胞を使用した。
時系列及び結果を図1に示す。図1Aは、実験の時系列を示す。局所的な炎症のみを誘発する、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を用いたワクチン接種とは異なり、STINGaを用いた全身治療は、強力ではあるが短期間の全身性I型インターフェロン応答を誘発し、高いIFN-α血清レベルが注射後4時間でピークに達し、24時間後にはすでに減少するという特徴があった(図1B)。この全身性応答は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を同時に注射しても影響を受けなかった。Z13Mad25Anaxaのワクチン接種は、循環HPV-E7特異的CD8 T細胞を誘発することができるが、データは、STINGa治療との組合せが、抗原特異的CD8 T細胞の頻度を更に増加させることを示す(図1C)。更に、STINGa治療は、エクスビボPMA/イオノマイシン再刺激後のサイトカイン分泌を増加させ、脾臓のCD8 T細胞の割合を高くし、より良好な細胞機能性を示す(図1D~E)。更に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体と、STINGアゴニストとの組合せは、CD4 T細胞応答も調節し、脾臓の割合を僅かに増加させ、その分極(polarization)を大きく変化させた。実際、組合せ治療マウスでは、Tヘルパー1(Th1)及びTh17の割合が有意に高く、Treg及びTh2のCD4 T細胞の割合が低いことが分かり、プラスのTh1/Th2比及びTh17/Th2比となった(図1F~K)。まとめると、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体と、STINGアゴニストとの組合せは、抗原特異的CD8 T細胞を促進するCD4及びCD8 T細胞の両方の応答を改善する。それらの頻度に加えて、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体とSTINGaとの組合せ治療は、抗原特異的CD8 T細胞のエフェクター機能も高く強化した。ワクチン接種の1週間後に実施されたインビボ死滅(killing)アッセイは、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体とSTINGaとの組合せによって治療したマウスにおいて、抗原特異的細胞傷害性が有意に2.5倍増加したことを明らかにした(図1L)。更に、HPV-CD8ペプチドの濃度を低下させたエクスビボ刺激は、複合体-STINGaで刺激したT細胞で有意に高いTCR活性を示した(図1M)。
実施例2:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せ投与の安全性及び忍容性
STINGアゴニストの全身注射は、強力な全身性I型インターフェロン応答をもたらす。これは望ましくない副作用をもたらす可能性があるため、STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せ投与の安全性及び忍容性を調査した。
STINGアゴニストの全身注射は、強力な全身性I型インターフェロン応答をもたらす。これは望ましくない副作用をもたらす可能性があるため、STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せ投与の安全性及び忍容性を調査した。
この目的のために、105個のTC-1腫瘍細胞をC57BL/6マウスの背面に移植した。腫瘍が可視化された場合、基本的に実施例1に記載されるように、1週間間隔で、(i)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa);(ii)STINGアゴニスト;又は(iii)両方の組合せを2回投与して、マウスを処置した。図2に示される時点で、マウスの体温と体重を測定した。
結果を図2に示す。単剤治療でも組合せ治療でも、TC-1担癌マウスへの投与直後に体温(図2A)又は体重(図2B)の有意な変動は認められず、STINGアゴニストと、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せ投与の安全性と忍容性が確認された。
実施例3:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せは、TC-1担癌マウスにおける抗原-特異的CD8 T細胞応答を改善する
TC-1はよく知られた非炎症性(コールド、cold)腫瘍モデルであり、非常に低いCD4及びCD8 T細胞の浸潤によって特徴づけられる。STINGアゴニストと、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)との組合せ投与の効果を調査するために、TC-1非炎症性腫瘍モデルにおいて抗原特異的CD8 T細胞応答を評価した。
TC-1はよく知られた非炎症性(コールド、cold)腫瘍モデルであり、非常に低いCD4及びCD8 T細胞の浸潤によって特徴づけられる。STINGアゴニストと、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)との組合せ投与の効果を調査するために、TC-1非炎症性腫瘍モデルにおいて抗原特異的CD8 T細胞応答を評価した。
この目的のために、105個のTC-1腫瘍細胞をC57BL/6の背面に移植した。腫瘍が可視化された場合、基本的に実施例1に記載されるように、1週間間隔で、(i)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa);(ii)STINGアゴニスト;又は(iii)その組合せを2回投与して、マウスを処置した。最後の処置の1週間後、マウスを殺処分し、腫瘍を採取し、CD8 T細胞の存在と表現型をFACS染色によって分析した。
TC-1腫瘍細胞は免疫原性が低く、循環HPV特異的CD8 T細胞の割合と数が非常に低いことが、ビヒクル処理マウスで認められた(図3)。腫瘍がないマウスでの観察と同様に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を含むワクチン接種は、末梢のHPV特異的応答を有意に増加させ、STINGa単独療法は効果がなかったが、組合せ治療は抗原特異的CD8 T細胞数を増加させる。
次に、TC-1腫瘍に浸潤するHPV特異的CD8 T細胞の能力を調査した。TC-1は、よく知られた非炎症性腫瘍モデルであるため、割合(腫瘍浸潤性白血球の1%未満を示す)又は総数を考慮しても、対照腫瘍内では、合計CD8 T細胞又はHPV特異的CD8 T細胞は、殆ど検出されなかった(図4A~D)。細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を用いたワクチン接種は、CD8 T細胞腫瘍浸潤の有意な増加を誘発し、そのうち50%以上がHPV特異的であった。注目すべきことに、血中に占める割合がかなり低いにもかかわらず、HPV特異的CD8 T細胞は、腫瘍内に大量に存在しており、末梢反応の測定が腫瘍内の結果を部分的にしか予測できないことを示唆する(図3A~B)。STINGa単独療法は、CD8 T細胞の腫瘍浸潤やHPV特異性の割合を調節しなかったため、腫瘍がないマウスの脾臓での観察とは異なっていた(図1)。興味深いことに、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体と、STINGアゴニストとの組合せは、相乗効果を示し、CD8 T細胞浸潤及びHPV特異的割合の両方を増加させた。これにより、STINGアゴニストの全身投与は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体の腫瘍内効果を調節できることが確認された。
また、HPVペプチドをロードした骨髄由来樹状細胞(BMDC)によるエクスビボ刺激後に、IFNγ、TNFa、及び脱顆粒マーカーCD107aの発現を測定することによって、腫瘍浸潤性のHPV特異的CD8 T細胞の機能を監視し、対照群又はSTINGa単独療法と比較して、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体で処置したマウスで、HPV特異的サイトカイン産生及び脱顆粒CD8 T細胞の有意な増加が認められた(図5)。興味深いことに、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を用いたワクチン接種は、特に多機能CD8 T細胞の割合を増加させ、IFNγ、TNFa及び/又はCD107αを同時に産生することができた。STINGaとの組合せは、CD8 T細胞機能性を更に増加させ、重要なことに多機能細胞の頻度を増加させた。
腫瘍浸潤性T細胞機能性を更に特徴づけるために、GzBは、CD8 T細胞が癌細胞を排除するために使用する主要な武器の1つであるため、Golgi阻害剤の存在下で簡潔なエクスビボTIL培養後、グランザイムB(GzB)の細胞内産生も測定された。ビヒクル又はSTINGaを投与したマウスと比較して、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体をワクチン接種したマウスでは、GzBを生産する総CD8 T細胞又はHPV特異的CD8 T細胞の頻度と数が有意に高かった(図6)。HPV特異的CD8 T細胞内のGzB陽性の頻度は変化しなかったにもかかわらず、STINGaとの組合せは、総数を更に増加させた。重要なことは、腫瘍内コンパートメントとは逆に、サイトカイン又はGzBを産生する脾臓のHPV特異的CD8 T細胞の頻度が、全ての異なる処理で非常に低いことが観察され(図7)、CD8 T細胞が全身的に活性化されていないことを実証する。
癌特異的T細胞の有効性は、腫瘍が誘導する疲弊によって制限されることが多い。したがって、次に腫瘍内CD8 T細胞及び末梢CD8 T細胞における活性化マーカー及び疲弊マーカーの発現を解析した。T細胞の疲弊は、段階的な過程であり、最終的には細胞の機能が失われるが、これは疲弊マーカーの漸進的な発現によって監視されることができる。対照及びSTINGa単回処理マウスの腫瘍浸潤性CD8 T細胞の大部分は、PD-1のみを発現するか、疲弊マーカーを全く発現しなかったが、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体をワクチン接種したマウス、又は組合せ治療マウスでは、CD8 T細胞の大部分、特にHPV特異的細胞が、疲弊マーカーPD-1及びTim-3を発現した(図8A~B)。興味深いことに、組合せ群では、低い割合のCD8 T細胞がPD-1及びTim-3を共発現し、疲弊の少ない表現型が示唆され、サイトカイン分泌細胞の割合が高いことと相関する。更に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体をワクチン接種したマウスの高い割合は、CD38(図8C~D)、NKg2a(図8E~F)、及びTCF-1(図8G~H)も発現するCD8T細胞を示し、これらは減少したT細胞機能性に関連する他のマーカーである。図8Iは、HPV特異的CD8T細胞におけるPD1、グランザイムB、及びTCF-1の共発現を示す。
機能性解析と同様に、末梢CD8 T細胞は、疲弊の少ない表現型を示し、PD-1のみを発現する細胞が大多数を占め、一部の細胞は、まだ初期活性化マーカーKLRG1を発現し(図9)、TME内で疲弊が獲得されることを示唆する。
要約すると、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種は、HPV特異的CD8 T細胞の腫瘍浸潤及び機能性を高度に増加させるが、STINGa単独療法は、効果がなく、組合せ治療は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体の有効性を更に高める。それにもかかわらず、腫瘍内CD8 T細胞は、部分的に疲弊した表現型を有し、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストのみを含む複合体でワクチン接種したマウスと比較して、組合せ治療マウスでは進行が遅い。
実施例4:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せは、腫瘍内CD4 T細胞応答を調節する
免疫療法の研究は、CD8 T細胞に広く焦点を当てており、制御性T細胞(Treg)による免疫抑制剤としか考えられないことが多いCD4 T細胞を軽視している。しかしながら、最近の研究は、適切な抗腫瘍CD8 T細胞応答の発達における、CD4 T細胞、特に分極されたTh1及びTh17の重要性を強調する(Melssen,M.and C.L.Slingluff,Jr.(2017).“Vaccines targeting helper T cells for cancer immunotherapy.”Curr Opin Immunol 47:85-92;Muranski,P.,et al.(2008).“Tumor-specific Th17-polarized cells eradicate large established melanoma.”Blood 112(2):362-373)。
免疫療法の研究は、CD8 T細胞に広く焦点を当てており、制御性T細胞(Treg)による免疫抑制剤としか考えられないことが多いCD4 T細胞を軽視している。しかしながら、最近の研究は、適切な抗腫瘍CD8 T細胞応答の発達における、CD4 T細胞、特に分極されたTh1及びTh17の重要性を強調する(Melssen,M.and C.L.Slingluff,Jr.(2017).“Vaccines targeting helper T cells for cancer immunotherapy.”Curr Opin Immunol 47:85-92;Muranski,P.,et al.(2008).“Tumor-specific Th17-polarized cells eradicate large established melanoma.”Blood 112(2):362-373)。
その観点から、次に腫瘍内CD4 T細胞を監視した。そのために、実施例3で記載されたTC-1腫瘍モデルを使用した。
結果を図10に示す。データは、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)と、STINGアゴニスト(STINGa)との組合せで処置されたマウスにおいて、他の全ての群と比較して、CD4 T細胞による有意に増加した腫瘍浸潤を示す(図10A~B)。脾臓での観察とは異なり、STINGa単独療法は、腫瘍内CD4 T細胞の動員に影響を及ぼさなかった。興味深いことに、この増加したCD4 T細胞浸潤は、Tregによって主導されたものではなく、組合せ治療マウスではその割合が大幅に低下していたので、エフェクターCD4 T細胞によるものであった(図10C、D、G)。腫瘍内CD8と総CD4 T細胞又は制御性CD4 T細胞との比は、TMEの免疫学的状態の予測値としてしばしば用いられる。細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種は、ビヒクル又はSTINGa処理群と比較して、高いCD8/CD4 T細胞比を誘導した(図10E)。組合せ治療は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種と同様のCD8/CD4 T細胞比をもたらしたが、有意に高いCD8/Treg比を誘導し(図10F)、免疫抑制性の低いTMEを強調する。更なる分析は、組合せ治療マウスでは、腫瘍内CD4 T細胞の大部分がT-bet+Th1であるのに対し、GATA-3+Th2細胞はごく一部であり、Th1/Th2比が陽性になることが明らかになった(図10H-J)。一方、脾臓では、組合せ治療マウスで腫瘍内Th17CD4 T細胞の僅かな減少が観察された(図10K)。Th1 CD4 T細胞は通常、IFN-γ及びTNF-αの産生によって特徴付けられるため、HPVペプチドをロードしたBMDCによるエクスビボ再刺激後にフローサイトメトリーによって、サイトカインの産生を測定した。しかしながら、CD8 T細胞とは逆に、腫瘍内CD4 T細胞によるIFN-γ及びTNF-αの産生は検出されなかった(図10L)。
実施例5:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せは、腫瘍微小環境(TME)を調節する
癌細胞を直接殺す能力のため、T細胞は免疫療法の主要な標的であるが、TMEは、癌の増殖を促進又は阻害することができる異なる免疫細胞の種類によって構成される非常に複雑なネットワークである。その観点から、その免疫学的状態の完全な概要を得るために、TMEの組成を深く解剖した。この目的のために、上述されるTC-1腫瘍モデルを使用した。
癌細胞を直接殺す能力のため、T細胞は免疫療法の主要な標的であるが、TMEは、癌の増殖を促進又は阻害することができる異なる免疫細胞の種類によって構成される非常に複雑なネットワークである。その観点から、その免疫学的状態の完全な概要を得るために、TMEの組成を深く解剖した。この目的のために、上述されるTC-1腫瘍モデルを使用した。
結果を図11に示す。前述のように、TC-1は非炎症性腫瘍モデルであり、非常に低いCD4及びCD8 T細胞の浸潤によって特徴づけられ、合計で、ビヒクル処置マウスの腫瘍浸潤性CD45+細胞の2%未満を示す(図11A)。最も顕著な細胞型は、浸潤の最大75%を占める腫瘍関連マクロファージ(TAM)であり、特に免疫抑制性のTAM2は、様々な種類の癌における腫瘍増殖の促進と関連してきた。役割があまり明確ではなく、癌の種類に応じて腫瘍の促進又は制御と関連する、骨髄由来サプレッサー細胞(MDSC)は、更に15%を占め、単球型(mMDSC)が優勢である。頻度の低い他の細胞型は、樹状細胞(DC、7%)、B細胞(2%)、NK細胞及びNKT細胞(1.5%)、好中球(neutrophils)(1%)であった。細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種は、CD8 T細胞及びDC頻度の強い増加及び非Treg CD4 T細胞の出現によって特徴づけられる、TMEの大幅な修飾を誘導した。興味深いことに、DC浸潤の増加は、単球性DC(moDC)の割合の増加によっても特徴づけられ(図11B)、この特定のDC表現型は、炎症性状態においてのみ分化し、抗腫瘍T細胞応答を活性化することが示されている(Kuhn,S.,et al.(2015).“Monocyte-Derived Dendritic Cells Are Essential for CD8(+)T Cell Activation and Antitumor Responses After Local Immunotherapy.”Front Immunol 6:584)。TAM1コンパートメントは、殆ど変化しないままであるが、TAM2頻度は強く減少し、結果としてより高いTAM1/TAM2比をもたらす(図11C~E)。逆に、mMDSCの頻度は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種によって増加されるが、顆粒球性MDSCは、殆ど変化しないままである(図11F~G)。TAM2とmMDSCに対する逆効果は、単球起源の両方の集団が環境に応じてその可塑性と分化状態を変化させる能力で知られているため、細胞の再分極の可能性を示唆する。
CD8 T細胞の浸潤及び表現型に関する観察と同様に、STINGa単独の全身投与は、TMEの組成に影響を及ぼさず、これは基本的にビヒクル処置マウスと同様である。しかしながら、組合せ治療において、STINGアゴニストは、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種との相乗効果を示し、CD8及び非Treg
CD4 T細胞の浸潤を2.5倍に拡大する一方で、TAM2の頻度を減少させ、更なる炎症性の環境をもたらした。
CD4 T細胞の浸潤を2.5倍に拡大する一方で、TAM2の頻度を減少させ、更なる炎症性の環境をもたらした。
実施例6:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せはPD-L1及びMHCの腫瘍内発現を調節する
PD-1/PD-L1軸は、T細胞の疲弊につながる主要な経路であるため、抗原特異的CD8 T細胞の抗腫瘍効果を阻害し、PD-L1の発現は、STINGアゴニストによる腫瘍内治療によって腫瘍細胞上でアップレギュレートされることが示されている。更に、腫瘍細胞上のMHC-I発現のダウンレギュレーションは、免疫回避の主要なメカニズムの1つである。そのため、上述されるように、TC-1腫瘍モデルでは、MHC-IIだけでなくPD-L1及びMHC-Iの腫瘍内発現も監視された。
PD-1/PD-L1軸は、T細胞の疲弊につながる主要な経路であるため、抗原特異的CD8 T細胞の抗腫瘍効果を阻害し、PD-L1の発現は、STINGアゴニストによる腫瘍内治療によって腫瘍細胞上でアップレギュレートされることが示されている。更に、腫瘍細胞上のMHC-I発現のダウンレギュレーションは、免疫回避の主要なメカニズムの1つである。そのため、上述されるように、TC-1腫瘍モデルでは、MHC-IIだけでなくPD-L1及びMHC-Iの腫瘍内発現も監視された。
結果を図12に示す。ビヒクル又はSTINGa皮下注射単独療法と比較して、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニスト単独を含む複合体(Z13Mad25Anaxa)による治療、又はSTINGaとの組合せによる治療の下で、増加したPD-L1発現が見られた(図12A~B)。PD-L1の発現は、CD45-細胞とCD45+細胞の両方のコンパートメントで増加し、腫瘍細胞と免疫細胞の両方がT細胞の疲弊を促進する可能性があることを強調した。PD-L1を発現する主な免疫細胞集団は、両方のタイプのTAMとして同定された(図12C~D)。更に、腫瘍細胞でのMHC-I発現に関しては、H2-KbとH2-Dbの両方の対立遺伝子発現が、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を単独又はSTINGaと組み合わせて処置した場合、ビヒクル及びSTINGaの単独療法と比較して、腫瘍細胞によってアップレギュレートされたが(図12E~F)、この免疫回避のメカニズムは除外され、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種が、腫瘍細胞によるエピトープの提示を促進することさえできることが示唆された。同時に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を単独又はSTINGaと組み合わせたワクチン接種は、ビヒクルとSTINGAの両方の単剤療法と比較して、CD11b+細胞でのMHC-II発現が増加したため(図12G~H)、CD4 T細胞へのエピトープの提示が促進された。
全体として、これらの結果は、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種によって誘発される、非炎症性(cold)腫瘍を炎症性(hot)にすることがあるTMEの大幅な調節、及びSTINGアゴニスト単独療法では効果が観察されなかったが、腫瘍内免疫原性を更に増加させるSTINGアゴニスト処置とワクチン複合体の組合せによる相乗効果を強調している。
実施例7:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せの抗腫瘍効果
次に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体と、STINGアゴニストとの組合せの治療の抗腫瘍効果をTC-1腫瘍モデルで評価した。
次に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体と、STINGアゴニストとの組合せの治療の抗腫瘍効果をTC-1腫瘍モデルで評価した。
105個のTC-1細胞をC57BL/6マウスの背面に移植した。腫瘍が可視化された場合、上述されるように、1週間間隔で、TC-1腫瘍モデルの治療環境において、(i)細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa);(ii)STINGアゴニスト;又は(iii)その組合せを2回投与して、マウスを処置した。
結果を図13に示す。TC-1モデルにおいて、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を用いた二回のワクチン接種は、腫瘍の発生の有意な遅延、及び増加した生存期間中央値をもたらした(図13A~B)。STINGa単独療法は、腫瘍増殖に僅かな効果しか示さなかったが、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体との組合せは、この効果を大幅に高め、それによって腫瘍の発生を有意に遅らせ、生存期間中央値を向上させた。
実施例8:異なるSTINGアゴニストとのワクチン複合体の組合せの抗腫瘍効果
次に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)と、異なるSTINGアゴニストとの組合せの治療の抗腫瘍効果をTC-1腫瘍モデルで評価した。上記の実験で使用されたSTINGアゴニストADU-S100(Aduro)の代わりに、STINGアゴニストSTINGa2を使用した。
次に、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)と、異なるSTINGアゴニストとの組合せの治療の抗腫瘍効果をTC-1腫瘍モデルで評価した。上記の実験で使用されたSTINGアゴニストADU-S100(Aduro)の代わりに、STINGアゴニストSTINGa2を使用した。
上記と同様に、105個のTC-1細胞をC57BL/6マウスの背面に移植し、異なる群(対照(無処置);細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa);STINGアゴニスト STINGa2;及びその組合せ)に割り当てた。細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)による処置では、腫瘍移植後6日目(腫瘍が可視化された場合)及び13日目に、10nmolの細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad25Anaxa)を、皮下注射によりマウスに接種した。STINGアゴニストSTINGa2による治療の場合、6日目、10日目、13日目、及び17日目に、マウスは、10μgのSTINGアゴニストSTINGa2を全身投与(皮下注射)された。20日目に全血を回収し、多量体フローサイトメトリー染色による抗原特異的CD8 T細胞の測定に使用した。
図14に示されるように、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体を用いた単剤療法は、生存率を増加させ、腫瘍増殖を減少させたが、STINGアゴニスト単独療法は、僅かな改善しかもたらさなかった。しかしながら、両者の組合せは、生存率を大幅に増加させ、腫瘍増殖を減少させる相乗効果を示した。これは、上記の実施例7で記載された結果を、異なるSTINGアゴニストの全身投与で確認する。
図15に示されるように、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体によるワクチン接種は、循環HPV特異的CD8 T細胞を誘発することができる。しかしながら、STINGアゴニスト処置との組合せは、抗原特異的CD8 T細胞の頻度を更に増加させ、それによって、異なるSTINGアゴニストについての実施例1で記載された結果を確認した。
実施例9:マウスにおけるATP128免疫原性;STINGaとATP128との組合せはCEA特異的CD8 T細胞応答を誘発する
雌C57BL/6Jマウスの背面に、5×105個のMC38-CEA腫瘍細胞を皮下移植した。腫瘍移植後6日目と13日目に、10nmolのATP128、25μgのSTINGアゴニスト(ADU-S100)、又は上記2つの組合せをマウスにワクチン接種した。ATP128ワクチン及びSTINGアゴニストの両方を尾の付け根に皮下注射した。2回目のワクチン接種の1週間後に、マウスの血液を尾静脈から回収しカスタム設計された多量体を使用して、CEA特異的CD8 T細胞の頻度と総数をフローサイトメトリーで分析した。
雌C57BL/6Jマウスの背面に、5×105個のMC38-CEA腫瘍細胞を皮下移植した。腫瘍移植後6日目と13日目に、10nmolのATP128、25μgのSTINGアゴニスト(ADU-S100)、又は上記2つの組合せをマウスにワクチン接種した。ATP128ワクチン及びSTINGアゴニストの両方を尾の付け根に皮下注射した。2回目のワクチン接種の1週間後に、マウスの血液を尾静脈から回収しカスタム設計された多量体を使用して、CEA特異的CD8 T細胞の頻度と総数をフローサイトメトリーで分析した。
結果を図16に示す。ATP128による3回目のワクチン接種の1週間後に、IFN-g Elispotアッセイを実施した。ATP128ワクチン接種は、CEA特異的CD8 T細胞を誘発し、多量体染色によって監視されることができる(図16A)。多量体染色は、2回目のワクチン接種の1週間後に実施した。データは、ATP128へのSTINGアゴニストの追加が、CEA特異的CD8 T細胞応答を増強することを示す(図16B、C)。
実施例10:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せは、腫瘍がないマウスにおけるCD8 T及びCD4 T細胞末梢応答の機能性を増強させる
実施例1と同様に、腫瘍がないC57BL/6マウスで、異なる複合体(Z13Mad39Anaxa;配列番号58)を用いて、組合せの免疫原性を評価した。簡単に説明すると、1週間間隔(0日目及び7日目)で、皮下注射で、10nmolのZ13Mad39Anaxa(配列番号58;例示された細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体、卵白アルブミン由来のCD4エピトープ及びCD8エピトープ(OVA;それぞれ、配列番号59及び配列番号57)含有)の注射を腫瘍がないC57BL/6マウスにワクチン接種した。ワクチン接種とほぼ同時に、背下部の両側に、2×50μl皮下注射によって、25μgのSTINGアゴニストADU-S100をマウスに投与した。最初のワクチン接種の4時間後と24時間後に血清を回収し、ELISAでIFN-α濃度を測定した。14日目に全血を回収し、多量体フローサイトメトリー染色による抗原特異的CD8 T細胞の測定に使用した。同時に、脾臓を採取し、エクスビボ刺激及び細胞内サイトカイン産生に使用した脾細胞をフローサイトメトリーで分析した。又は、TCR結合活性アッセイに脾細胞を使用した。
実施例1と同様に、腫瘍がないC57BL/6マウスで、異なる複合体(Z13Mad39Anaxa;配列番号58)を用いて、組合せの免疫原性を評価した。簡単に説明すると、1週間間隔(0日目及び7日目)で、皮下注射で、10nmolのZ13Mad39Anaxa(配列番号58;例示された細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体、卵白アルブミン由来のCD4エピトープ及びCD8エピトープ(OVA;それぞれ、配列番号59及び配列番号57)含有)の注射を腫瘍がないC57BL/6マウスにワクチン接種した。ワクチン接種とほぼ同時に、背下部の両側に、2×50μl皮下注射によって、25μgのSTINGアゴニストADU-S100をマウスに投与した。最初のワクチン接種の4時間後と24時間後に血清を回収し、ELISAでIFN-α濃度を測定した。14日目に全血を回収し、多量体フローサイトメトリー染色による抗原特異的CD8 T細胞の測定に使用した。同時に、脾臓を採取し、エクスビボ刺激及び細胞内サイトカイン産生に使用した脾細胞をフローサイトメトリーで分析した。又は、TCR結合活性アッセイに脾細胞を使用した。
結果を図17に示す。図17Aに示されるように、2回目のワクチン接種の1週間後に、循環SIINFEKL特異的CD8 T細胞(左)及び脾臓のSIINFEKL特異的CD8 T細胞(右)を多量体染色により測定した。図17Bは、エクスビボELIspotにより測定されたSIINFEKL特異的CD8 T細胞TCR結合活性(上図)、及びSIINFEKLペプチドによるエクスビボ刺激後の、細胞内染色により測定されたCD8 T細胞による抗原特異的サイトカイン産生(下図)を示す。図17Cは、脾臓のCD4 T細胞内のTreg(FoxP3+)、Th1(T-bet+)、及びTh2(GATA-3+)の頻度、並びにTh1/Th2比(2回目のワクチン接種の1週間後にフローサイトメトリーにより測定)を示す。更に、CD4 T細胞による抗原特異的サイトカイン産生が示され、ISQAVHAAHAEINEAGR(OVA-CD4)ペプチド(配列番号59)によるエクスビボ刺激後の細胞内染色によって測定された。
要約すると、異なる複合体(本件における、卵白アルブミン(OVA)由来のCD4及びCD8エピトープを含有するZ13Mad39Anaxa対実施例1におけるHPV-E7エピトープ含有Z13Mad25Anaxa)を用いた実施例1と同様に、CD8及びCD4のT細胞応答の同様の調節が観察された。これにより、T細胞応答の調節が抗原性カーゴに依存しないことを確認する。Z13Mad39Anaxaワクチン接種は、多機能性CD8及びCD4抗原特異的T細胞を誘発し、特異的ペプチドによるエクスビボ刺激後にIFNγ及びTNFαを産生した(図17)。全体として、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体にSTINGアゴニストを加えることは、Th1に対するCD4 T細胞の分極と共に、CD8 T細胞応答の頻度と質に大きな影響を与える。
実施例11:STINGアゴニストとワクチン複合体との組合せは、B16-OVA腫瘍増殖を阻害する
その後、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad39Anaxa)と、STINGアゴニスト(STINGa)との組合せの抗腫瘍効果をB16-OVA肺転移腫瘍モデルで評価した。
その後、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad39Anaxa)と、STINGアゴニスト(STINGa)との組合せの抗腫瘍効果をB16-OVA肺転移腫瘍モデルで評価した。
簡単に説明すると、C57BL/6マウスに、105個のB16-OVA細胞を静脈内注射した。腫瘍細胞静脈内注射の3日後から、1週間間隔で、例示された細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad39Anaxa;配列番号58)、STINGアゴニスト(STINGa)、又は上記2つの組合せをマウスに2回ワクチン接種した。20日目(最後のワクチン接種から10日後)に、肺を灌流して血液を除去し、肺転移の数をカウントし、肺浸潤リンパ球(LIL)を分析した。
結果を図18及び図19に示す。実験スケジュールを図18Aに示す。図18Bに示される、肺当たりの転移性結節の数は、Z13Mad39Anaxaによるワクチン接種が、転移の数の有意な減少をもたらし、STINGa単独療法では、効果がなかったが、KISIMAとの組合せでは、転移の数を優位に更に減少したことを実証する。更に、また、フローサイトメトリーにより、肺浸潤リンパ球(LIL)の存在及び機能を分析した。ワクチン接種は、グランザイムB(GzB)、IFNγ、及びTNFαの発現によって特徴づけられる多機能OVA特異的CD8 T細胞浸潤を誘発し、STINGaの組合せにより有意に増加した(図18C)。同様のT細胞の表現型及び機能性の増加が末梢(血液及び脾臓)でより低い程度で観察されたことから、図19A及びBに示されるように、抗原特異的T細胞が腫瘍部位に広く動員されることが示唆された。腫瘍がないマウス(実施例10)で観察されたように、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体(Z13Mad39Anaxa;配列番号58)とSTINGアゴニスト(STINGa)との組合せは、腫瘍内CD4 T細胞の分極を調節し、Tregsの存在を減少させる一方で、Th1/Th2比を増加させた(図18D)。OVAペプチドによるエクスビボ刺激は、脾臓では機能的抗原特異的CD4 T細胞の存在を強調したが、肺ではそうではなかったことから、CD8 T細胞応答を助けることが二次リンパ器官で広く生じていることが示唆された(図18D及び図19C)。
これらの結果を総合すると、細胞透過性ペプチド、少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ、及びTLRペプチドアゴニストを含む複合体とSTINGアゴニストとの組合せ治療は、抗原特異的エフェクターCD8 T細胞の腫瘍内浸潤及び末梢性CD4 T細胞の機能性の両方を促進し、B16-OVA腫瘍増殖の抑制をもたらすことを示す。
Claims (118)
- (i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト;
を含む複合体と、
を含む組合せであって、前記複合体に含まれる成分a)~c)が共有結合されることを特徴とする組合せ。 - 前記複合体が(組換え)ポリペプチド又は(組換え)タンパク質である、請求項1に記載の組合せ。
- 前記細胞透過性ペプチドが、以下を有する請求項1から2のいずれかに記載の組合せ。
(1)合計で5~50のアミノ酸、好ましくは合計で10~45のアミノ酸、より好ましくは合計で15~45のアミノ酸、の前記ペプチドのアミノ酸配列の長さ;及び/又は
(2)ZEBRAの最小ドメインの断片を含むアミノ酸配列又はその変異体であって、
前記最小ドメインは、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の残基170~残基220に及び、任意に、1、2、3、4、又は5のアミノ酸が、前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される。 - 前記細胞透過性ペプチドが、配列番号3のZEBRAアミノ酸配列の位置189に相当する位置で、Ser(S)を含むアミノ酸配列を有する、請求項3に記載の組合せ。
- 前記細胞透過性ペプチドが、以下一般式(A):
X1X2X3X4X5X6X7X8X9X10X11SX13X14X15X16X17
の配列を含み、前記配列が前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、置換、削除、及び/又は追加される0、1、2、3、4、又は5のアミノ酸を含むアミノ酸配列を含む、請求項3から4のいずれかに記載の組合せ。
(式中、X1はK、R、又はHであり、X1はK又はRであることが好ましく;
X2はR、K、又はHであり、X2はR又はKであることが好ましく;
X3はY、W、又はFであり、X3はY、W、又はFであることが好ましく;
X4はK、R、又はHであり、X4はK又はRであることが好ましく;
X5はN又はQであり;
X6はR、K、又はHであり、X6はR又はKであることが好ましく;
X7はV、I、M、L、F、又はAであり、X7はV、I、M、又はLであることが好ましく;
X8はA、V、L、I、又はGであり、X8はA又はGであることが好ましく;
X9はS又はTであり;
X10はR、K、又はHであり、X10はR又はKであることが好ましく;
X11はK、R、又はHであり、X11はK又はRであることが好ましく;
X13はR、K、又はHであり、X13はR又はKであることが好ましく;
X14はA、V、L、I、又はGであり、X14はA又はGであることが好ましく;
X15はK、R、又はHであり、X15はK又はRであることが好ましく;
X16はF、L、V、I、Y、W、又はMであり、X16はF、Y、又はWであることが好ましく;
X17はK、R、又はHであり、X17はK又はRであることが好ましい。) - 前記細胞透過性ペプチドが、配列番号4~13のアミノ酸配列からなる群から選択されるアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその配列変異体を含むアミノ酸配列を有する、請求項3から5のいずれかに記載の組合せ。
- 前記細胞透過性ペプチドが、配列番号6(CPP3/Z13)、配列番号7(CPP4/Z14)、配列番号8(CPP5/Z15)、又は配列番号11(CPP8/Z18)のアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその配列変異体を含む又はからなるアミノ酸配列を有し;
好ましくは、前記細胞透過性ペプチドが、配列番号6(CPP3/Z13)のアミノ酸配列、又は前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく、少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその配列変異体を含む又はからなるアミノ酸配列を有する、請求項6に記載の組合せ。 - 前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質である、請求項1から7のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体が、1超の抗原又は抗原エピトープ、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10以上の抗原又は抗原エピトープを含む、請求項1から8のいずれかに記載の組合せ。
- 前記1超の抗原又は抗原エピトープ、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10以上の抗原又は抗原エピトープが、前記複合体の多重抗原性ドメインに連続的に配置される請求項9に記載の組合せ。
- 前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、少なくとも1つのCD4+エピトープ及び/又は少なくとも1つのCD8+エピトープである、請求項1から10のいずれかに記載の組合せ。
- 前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、少なくとも1つの腫瘍又は癌エピトープを含む又はからなる請求項1から11のいずれかに記載の組合せ。
- 前記少なくとも1つの腫瘍エピトープが、内分泌腫瘍、胃腸腫瘍、尿生殖器及び女性生殖器腫瘍、乳癌、頭頚部腫瘍、造血器腫瘍、皮膚腫瘍、胸部及び呼吸器腫瘍を含む腫瘍からなる群から選択される請求項12に記載の組合せ。
- 前記少なくとも1つの腫瘍又は癌エピトープが、肛門癌、虫垂癌、胆管細胞癌、カルチノイド腫瘍、消化管結腸癌、肝外胆管癌、胆嚢癌、胃癌、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、肝細胞癌、膵臓癌、直腸癌、結腸直腸癌、又は転移性結腸直腸癌を含む、胃腸腫瘍の腫瘍又は癌の群から選択される請求項12から13のいずれかに記載の組合せ。
- 前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、腫瘍関連抗原、腫瘍特異抗原、又は腫瘍ネオ抗原から選択され、
好ましくは、前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、結腸直腸癌又は転移性結腸直腸癌の腫瘍関連抗原、腫瘍特異抗原、又は腫瘍ネオ抗原からなる群から選択される請求項1から14のいずれかに記載の組合せ。 - 前記少なくとも1つの腫瘍又は癌エピトープが、EpCAM、HER-2、MUC-1、TOMM34、RNF43、KOC1、VEGFR、βhCG、サバイビン、CEA、TGFβR2、p53、KRas、OGT、CASP5、COA-1、MAGE、SART、IL13Rα2、ASCL2、NY-ESO-1、MAGE-A3、PRAME、WT1からなる群から選択される抗原のエピトープである、請求項12から15のいずれかに記載の組合せ。
- 前記少なくとも1つの腫瘍又は癌エピトープが、ASCL2、EpCAM、MUC-1、サバイビン、CEA、KRas、MAGE-A3、及びIL13Rα2からなる群から選択される抗原の抗原のエピトープであり、
好ましくは、前記少なくとも1つの腫瘍エピトープが、ASCL2、EpCAM、MUC-1、サバイビン、CEA、KRas、及びMAGE-A3からなる群から選択される抗原のエピトープであり、
より好ましくは、前記少なくとも1つの腫瘍エピトープが、ASCL2、EpCAM、MUC-1、サバイビン、及びCEAからなる群から選択される抗原のエピトープであり、
更により好ましくは、前記少なくとも1つの腫瘍エピトープが、ASCL2、EpCAM、サバイビン、及びCEAからなる群から選択される抗原のエピトープである、請求項12から16のいずれかに記載の組合せ。 - 前記複合体が、少なくとも2つの異なる抗原のエピトープを含む多重抗原性ドメインを含む、請求項1から17のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、サバイビンの少なくとも1つのエピトープを含む請求項18に記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号16のアミノ酸配列からなるペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から19のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号18のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から20のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号17のアミノ酸配列からなるペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から21のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、CEAの少なくとも1つのエピトープを含む、請求項18から22のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号29のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から23のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号32のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から24のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号30のアミノ酸配列を有するペプチド及び/又は配列番号31のアミノ酸配列を有するペプチドを含む、請求項18から25のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、ASCL2の少なくとも1つのエピトープを含む、請求項18から26のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から27のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号24のアミノ酸配列からなるペプチド又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から28のいずれかに記載の組合せ。
- 前記多重抗原性ドメインが、配列番号22のアミノ酸配列からなるペプチド及び/又は配列番号23のアミノ酸配列を有するペプチドを含む、請求項18から29のいずれかに記載の組合せ。
- 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
b)MUC-1の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
c)サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
e)KRasの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
f)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
g)ASCL2の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体、
を含む、請求項18から30のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
b)MUC-1の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
f)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から31のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
b)MUC-1の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
e)KRasの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体.
を含む、請求項18から32のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
c)サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
f)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から33のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
f)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から34のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
b)MUC-1の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
c)サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
f)MAGE-A3の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から35のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
b)MUC-1の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
c)サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から36のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
b)MUC-1の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から37のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から38のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
a)EpCAMの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
c)サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
d)CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び/又は
g)ASCL2の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から39のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
-サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
-CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から30のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
-サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から30のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
-CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から30のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、
-サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
-CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から30のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、N末端からC末端方向に、
-CEAの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;
-サバイビンの1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体;及び
-ASCL2の1以上のエピトープ又はその機能的配列変異体
を含む、請求項18から30及び44のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、N末端からC末端方向に、
-配列番号29のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体;
-配列番号16のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体;及び
配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド、又は少なくとも10のアミノ酸の長さを有するその断片、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体
を含む、請求項18から30、44、及び45のいずれかに記載の組合せ。 - 配列番号29のアミノ酸配列からなるペプチド又はその断片又はその変異体のC末端が、配列番号16のアミノ酸配列からなるペプチド又はその断片又はその変異体のN末端に直接結合され;
配列番号16のアミノ酸配列からなるペプチド又はその断片又はその変異体のC末端が、配列番号21のアミノ酸配列を有するペプチド又はその断片又はその変異体のN末端に直接結合される、請求項18から30、及び44から46のいずれかに記載の組合せ。 - 前記多重抗原性ドメインが、配列番号32のアミノ酸配列からなるペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体;配列番号18のアミノ酸配列からなるペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体;及び配列番号24のアミノ酸配列からなるペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から30、及び44から47のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記多重抗原性ドメインが、配列番号48のアミノ酸配列からなるペプチド、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む、請求項18から30、及び44から48のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRペプチドアゴニストが、TLR2、TLR4、及び/又はTLR5ペプチドアゴニストである、請求項1から49のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRペプチドアゴニストが、TLR2ペプチドアゴニスト及び/又はTLR4ペプチドアゴニストである、請求項1から50のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRペプチドアゴニストが、アネキシンII又はその免疫調節性断片である、請求項1から51のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRペプチドアゴニストが、配列番号49又は50のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなる、請求項1から52のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRアゴニストが、国際公開第WO2012/048190A1号の配列番号7のアミノ酸配列、又はその断片又はその変異体を含む又はからなる、請求項1から53のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRアゴニストが、配列番号52のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなる、請求項1から54のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRアゴニストが、配列番号53のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなる請求項1から55のいずれかに記載の組合せ。
- 前記TLRアゴニストが、配列番号51のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその免疫調節性断片又は(機能的)配列変異体を含む、請求項1から56のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体が、1超のTLRペプチドアゴニスト、特に2、3、4、5、6、7、8、9、10以上のTLRペプチドアゴニストを含む、請求項1から57のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体の前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(又は前記多重抗原性ドメイン)が、前記複合体の前記細胞透過性ペプチドのC末端に配置され、前記細胞透過性ペプチドと前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ(又は前記多重抗原性ドメイン)とが、任意に、更なる成分、例えば、リンカー、スペーサー、又は前記複合体の前記TLRペプチドアゴニストによって結合される、請求項1から58のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体が、ポリペプチド又はタンパク質であり、
a)前記細胞透過性ペプチドが、配列番号6(CPP3/Z13)、配列番号7(CPP4/Z14)、配列番号8(CPP5/Z15)、又は配列番号11(CPP8/Z18)のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体(前記ペプチドの細胞透過能を損なうことなく)を含む又はからなるアミノ酸配列を有し;
b)前記少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープが、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質であり、好ましくは少なくとも1つの癌エピトープを含む又はからなり;
c)前記TLRペプチドアゴニストが、TLR2ペプチドアゴニスト及び/又はTLR4ペプチドアゴニストである、
請求項1から59のいずれかに記載の組合せ。 - 前記複合体が、組換えポリペプチド又は組換えタンパク質であり、前記複合体の主鎖のN末端からC末端方向に、成分a)~c)が以下の順番:
(α)成分a)-成分b)-成分c);又は
(β)成分c)-成分a)-成分b)
で配置され、
成分は、更なる成分、特に、リンカー又はスペーサーによって結合されることができる請求項1から60のいずれかに記載の組合せ。 - 前記複合体が、配列番号54のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなる請求項1から61のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニストが環状ジヌクレオチド(CDN)系STINGアゴニストである、請求項1から62のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニストが、ADU-S100、MK-1454、E-7766、MK-2118、BMS-986301、IMSA-101、SB-11285、SYNB-1891、GSK-3745417、TAK-676、及びTTI-10001からなる群から選択される請求項1から63のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニストが、請求項65から76のいずれかで定義される化合物の実質的に純粋な(Sp,Sp)、(Rp,Rp)、(Sp,Rp)、又は(Rp,Sp)立体異性体、又はその塩であって、他の可能なジアステレオマーに対して少なくとも90%純粋である、請求項1から63のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニストが、請求項65から76のいずれかで定義される化合物の実質的に純粋な(Rp,Rp)立体異性体、又はその塩であって、他の可能なジアステレオマーに対して少なくとも90%純粋である、請求項1から63のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニストが、請求項65から78のいずれかで定義される化合物の薬学的に許容される塩である、請求項1から63のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニストが、請求項68から71又は73から76のいずれかで定義される化合物のナトリウム塩である、請求項1から63のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニスト及び前記複合体が、同じ組成物に含まれる、請求項1から80のいずれかに記載の組合せ。
- 前記STINGアゴニスト及び前記複合体が、別々の組成物に提供される、請求項1から80のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体が、配列番号55のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、
前記STINGアゴニストがADU-S100である、請求項1から64、80、及び81のいずれかに記載の組合せ。 - 前記複合体が、配列番号55のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、
前記STINGアゴニストが、式Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II-1、II-2、II-3、及びII-4によって表される化合物からなる群から選択される1つの化合物、又はその溶媒和物、又は水和物である、請求項1から63、68から71、73から76、80、及び81のいずれかに記載の組合せ。 - 前記複合体が、配列番号54のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、前記STINGがADU-S100である、請求項1から64,80、又は81のいずれかに記載の組合せ。
- 前記複合体は、配列番号54のアミノ酸配列、又は少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、又は95%の配列同一性を有するその(機能的)配列変異体を含む又はからなり、
前記STINGアゴニストが、式Ia.1、Ia.2、Ia.3、Ib.1、II-1、II-2、II-3、及びII-4によって表される化合物からなる群から選択される1つの化合物、又はその溶媒和物、又は水和物である、請求項1から63、68から71、73から76、80、及び81のいずれかに記載の組合せ。 - 医薬における使用のための、請求項1から86のいずれかに記載の組合せ。
- 癌の予防及び/又は治療における使用のための請求項1から87のいずれかに記載の組合せ。
- STINGアゴニスト及び前記複合体が、ほぼ同時に投与される、請求項87から88のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- 前記STINGアゴニスト及び前記複合体が、投与の同じ経路を介して投与される、請求項87から89のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- 前記STINGアゴニスト及び前記複合体が、投与の異なる経路を介して投与される、請求項95から99のいずれかに記載の化合物。
- 前記STINGアゴニストが、全身に投与される、請求項87から91のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- 前記複合体が、全身に投与される、請求項87から92のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- 前記複合体が、繰り返して投与される、請求項87から93のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- 前記STINGアゴニストが、繰り返して投与される、請求項87から94のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- 前記STINGアゴニスト及び前記複合体が同じ日に投与される、請求項87から95のいずれかに記載の使用のための組合せ。
- (i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含むキットであって、成分a)~c)が共有結合されることを特徴とするキット。 - 前記STINGアゴニストが、請求項63から80及び83から86のいずれかで定義される、請求項97に記載のキット。
- 前記複合体が、請求項2から62及び83から86のいずれかで定義される、請求項97から98のいずれかに記載のキット。
- 特に、前記STINGアゴニストと前記複合体との組合せを使用することにより、例えば、癌を治療する説明書を含む添付文書又はラベルを更に含む、請求項97から99のいずれかに記載のキット。
- 医薬における使用のための請求項97から100のいずれかに記載のキット。
- 癌の予防及び/又は治療における使用のための請求項97から101のいずれかに記載のキット。
- (i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を含む組成物であって、成分a)~c)が共有結合されることを特徴とする組成物。 - 前記STINGアゴニストが、請求項63から80及び83から86のいずれかで定義される、請求項103に記載の組成物。
- 前記複合体が、請求項2から62及び83から86のいずれかで定義される、請求項103から104のいずれかに記載の組成物。
- 前記組成物が、薬学的に許容される担体を含む、請求項103から105のいずれかに記載の組成物。
- 前記組成物がワクチンである、請求項103から106のいずれかに記載の組成物。
- 医薬における使用のための、請求項103から107のいずれかに記載の組成物。
- 癌の予防及び/又は治療における使用のための、請求項103から108のいずれかに記載の組成物。
- 必要とする対象において、癌を治療する、又は抗腫瘍応答を開始、増強、又は延長する方法であって、前記方法が、前記対象に、有効量の以下:
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を投与することを含む方法であって、成分a)~c)が共有結合されることを特徴とする方法。 - 患者において腫瘍抗原特異的T細胞による腫瘍の浸潤を増加させる方法であって、前記方法は、腫瘍又は癌に罹患している患者に、以下:
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体と、
を投与することを含み、成分a)~c)が共有結合されることを特徴とする方法。 - 癌を予防及び/又は治療する併用療法であって、前記併用療法は、以下:
(i)STINGアゴニストと;
(ii)以下a)~c):
a)細胞透過性ペプチド;
b)少なくとも1つの抗原又は抗原エピトープ;及び
c)TLRペプチドアゴニスト
を含む複合体との投与を含み、成分a)~c)が共有結合されることを特徴とする併用療法。 - 前記対象が癌又は腫瘍を罹患している、請求項110又は111に記載の方法、又は請求項112に記載の併用療法。
- 前記対象が、内分泌腫瘍、胃腸腫瘍、尿生殖器又は女性生殖器腫瘍、乳癌、頭頚部腫瘍、造血器腫瘍、皮膚腫瘍、胸部又は呼吸器腫瘍、好ましくは転移性結腸直腸癌等の結腸直腸癌を罹患している、請求項113に記載の方法又は併用療法。
- STINGアゴニストとの組合せにおける使用のための、請求項1から62のいずれかに定義される複合体。
- 前記STINGアゴニストが、請求項63から80のいずれかに定義されるSTINGアゴニストである、請求項114に記載の使用のための複合体。
- 請求項1から62のいずれかに定義される複合体との組合せにおける使用のための、STINGアゴニスト。
- 前記STINGアゴニストが、請求項63から80のいずれかに定義されるSTINGアゴニストである、請求項116に記載の使用のためのSTINGアゴニスト。
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