JP2023536989A - 膵臓癌オルガノイドの製造方法 - Google Patents
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Abstract
本発明の膵臓癌オルガノイドの製造方法は、癌細胞と内皮細胞との相互作用、すなわち血管ニッチのクロストーク(cross-talk of vascular niche)を十分に反映するため、既存の癌オルガノイドと比較して、有機体環境に存在する癌開始細胞(Cancer initiating cells;CICs)の特性を示すことが可能で、スクリーニングされた薬物の臨床適用度および信頼度などをさらに著しく高めることができる。
Description
特許法第30条第2項適用申請有り 掲載アドレス:https://doi.org/10.1016/j.canlet.2020.10.012 掲載年月日:2020年11月12日
本発明は、膵臓癌オルガノイドの製造方法に関し、より具体的には、本発明は、癌開始細胞(Cancer initiating cells)を含むことができるように、内皮細胞とともに共培養または内皮細胞培養液を用いて製造された膵臓癌オルガノイドに関する。
2005年に疾病で死亡した計65,479人のうち、全体死亡者の26.7%が癌で死亡した。このような癌の中で、特に、膵臓癌は予後が非常に良くなく、韓国国立癌センターによれば、5年生存率が10%未満に相当する。このような膵臓癌の治療のために外科的切除術を行うことができるが、新しく診断された15%の患者だけがこのような手術が可能という限界点が存在する。
一方、高齢化によって韓国国内外の癌発生患者数が急激に増加していて、患者個々人に合わせた抗癌治療などにより癌を克服しようとする研究が活発に進められている。特に、標的治療剤の場合には、末期癌患者の抗癌剤に対する治療効率を著しく高められるため、抗癌剤に対する副作用を最小化させることができるだけでなく、治療剤に対する癌細胞の反応性を細胞シグナル伝達により予測できるという面から、その臨床的有用性が非常に高い。
しかし、1次患者標本から作製された癌細胞株の場合、患者サンプルから細胞株を確立することが非常に非効率的な上に、2次元培養に対する適応と選択過程の中で細胞株は遺伝的変異が発生して遺伝的異質性(Heterogeneity)が消えることができるという限界点が存在する。さらに、前記癌細胞株の場合、標準として使用できる組織内の他の基質の構成成分が欠乏しているという限界点も存在する。
臨床前段階で患者に癌治療剤の敏感度を検査できるHRDA(Histoculture drug response assay)の場合、少量の組織のみを使用するため、多様な抗癌剤に対する敏感度の確認が難しく、テストが1回のみ可能なため、主な癌組織の損失が大きいという限界点が存在する。
また、癌細胞株または癌患者に由来する癌細胞を動物モデルに移植する方法(Patient-derived tumor xenograft、PDTX)の場合、細胞ベースのモデルに比べて腫瘍組織の生物学的な特性をより良く模倣するというメリットが存在するが、費用、時間および資源が多く消耗し、生命倫理の問題点などによる限界点が存在する。それだけでなく、一部の癌オルガノイドの場合には、免疫成分、血管成分または正常上皮細胞を含む癌支持細胞が不足して、臨床結果を十分に裏付けられないという限界点が存在する。
このような限界点を克服するために、幹細胞または臓器細胞から分離された細胞を培養したり組換えて作製されたオルガノイド(生体外組織体構造物)が開発されている。このようなオルガノイドの場合、患者の代わりにオルガノイドに先に試験治療を施し、その結果に基づいて個別患者ごとに有用な治療効果を示す抗癌剤を選択できるというメリットが存在するが、既存の方式はその構造物の製造成功率が非常に低いという限界点が存在する。
本発明の一つの目的は、膵臓癌オルガノイドの製造方法;および前記製造方法により製造された膵臓癌オルガノイドを提供することである。
本発明の他の目的は、本発明による前記膵臓癌オルガノイドを用いて膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供することである。
しかし、本発明が解決しようとする技術的課題は以上に言及した課題に制限されず、言及されていないさらに他の課題は以下の記載から当業界における通常の知識を有する者に明確に理解されるであろう。
本発明の他の目的は、本発明による前記膵臓癌オルガノイドを用いて膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供することである。
しかし、本発明が解決しようとする技術的課題は以上に言及した課題に制限されず、言及されていないさらに他の課題は以下の記載から当業界における通常の知識を有する者に明確に理解されるであろう。
本発明の一実施形態では、膵臓癌オルガノイドの製造方法を提供する。
本発明の前記製造方法は、a)膵臓癌患者から分離された生物学的試料を解離させ、マトリゲル(Matrigel)に固定化するステップと、b)前記a)ステップでマトリゲルに固定化されたサンプルを培養して膵臓癌オルガノイドを形成するステップと、c)前記b)ステップで形成された膵臓癌オルガノイドを解離させるステップと、d)前記解離した膵臓癌オルガノイドと内皮細胞とを共培養するか;または前記解離した膵臓癌オルガノイドに内皮細胞培養液を入れて培養するステップと、を含む。
本発明の前記製造方法は、a)膵臓癌患者から分離された生物学的試料を解離させ、マトリゲル(Matrigel)に固定化するステップと、b)前記a)ステップでマトリゲルに固定化されたサンプルを培養して膵臓癌オルガノイドを形成するステップと、c)前記b)ステップで形成された膵臓癌オルガノイドを解離させるステップと、d)前記解離した膵臓癌オルガノイドと内皮細胞とを共培養するか;または前記解離した膵臓癌オルガノイドに内皮細胞培養液を入れて培養するステップと、を含む。
本発明の前記「膵臓癌」は、外分泌腫瘍と神経内分泌腫瘍とに分けられ、大多数の類型は外分泌腫瘍型であって、膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinomas;PDAC)に相当する。このようなPDAC患者の癌細胞または組織は、CD44(+)CD24(+)およびCD44(+)CD24(+)EpCAM(+)の表現型を有する癌開始細胞(Cancer initiating cells)である耐薬品性、自己再生性および差別化された能力を有する下位集団を有するため、前記PDAC患者の癌細胞は大部分転移し、化学療法、放射線療法、免疫療法のような古典的な治療法に対して耐性が非常に強いという特徴が存在する。特に、CD44(+)CD24(+)表現型を有する細胞が存在する患者の場合には、そうでない患者と比較して、予後が非常に良くない。本発明の目的上、前記膵臓癌は、膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma)であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の膵臓癌患者の場合、癌組織において内皮細胞が重要な比率を占め、前記内皮細胞の場合には、腫瘍微細環境(Tumor microenvironment)でノッチ(Notch)、TGF-β、硝酸化物(nitric oxide;NO)、ソニックヘッジホッグ(sonic hedgehog;SHH)、インテグリン(integrin)およびWnt細胞シグナル伝達経路により癌開始細胞の自己再生およびメンテナンスを支援することができる。
本発明の前記膵臓癌オルガノイドは、癌細胞と内皮細胞との相互作用、すなわち血管ニッチのクロストーク(cross-talk of vascular niche)を十分に反映するため、既存の膵臓癌オルガノイドと比較して、有機体環境に存在する癌開始細胞(Cancer initiating cells;CICs)の特性を示すことが可能で、膵臓癌の発達、薬物に対する耐性などを研究するのに非常に効果的に使用できる。さらに、このようなオルガノイドを用いる場合には、スクリーニングされた薬物の臨床適用度および信頼度などをさらに著しく高めることができる。
本発明の前記生物学的試料は、膵臓癌患者である個体から得られるか、個体に由来する任意の物質、生物学的体液、組織または細胞を意味するもので、例えば、全血(whole blood)、白血球(leukocytes)、末梢血液単核細胞(peripheral blood mononuclear cells)、白血球のバフィーコート(buffy coat)、血漿(plasma)および血清(serum)を含む血液、喀痰(sputum)、涙(tears)、粘液(mucus)、鼻うがい(nasal washes)、鼻腔吸引物(nasal aspirate)、呼吸(breath)、小便(urine)、精液(semen)、唾(saliva)、腹腔洗浄液(peritoneal washings)、骨盤内流体液(pelvic fluids)、嚢胞液(cystic fluid)、脳脊髄膜液(meningeal fluid)、羊水(amniotic fluid)、腺液(glandular fluid)、膵臓液(pancreatic fluid)、リンパ液(lymph fluid)、胸水(pleural fluid)、乳頭吸引物(nipple aspirate)、気管支吸引物(bronchial aspirate)、滑液(synovial fluid)、関節吸引物(joint aspirate)、器官分泌物(organ secretions)、細胞(cell)、細胞抽出物(cell extract)または脳脊髄液(cerebrospinal fluid)を含むことができるが、これに限定されるものではない。本発明の目的上、前記生物学的試料は、膵臓癌患者から分離された組織または膵臓癌細胞株であってもよく、例えば、膵臓癌患者から分離された組織であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記膵臓癌オルガノイドは、患者から組織を得た後、癌組織から解離した癌細胞を用いて1次培養を行わないため、このような過程によって発生しうる癌細胞の遺伝的変形や、試験管内で表現型的特性が消える現象を非常に効果的に防止することができる。
本発明の目的上、前記膵臓癌は、膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma)であってもよいが、これに限定されるものではない。前記膵臓管腺癌患者から得られた組織の場合、他の種類の癌と比較して、癌の起源を確認するための突然変異の分析なくても、元の癌組織に対して類似の組織学的特徴を試験管内でも非常に効果的に維持することができる。
本発明の前記d)ステップの内皮細胞は、血管内皮細胞(Vascular endothelial cell)であってもよく、例えば、ヒト臍帯静脈内皮細胞(Human umbilical vein endothelial cells;HUVECs)であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記d)ステップにおいて、膵臓癌オルガノイドと内皮細胞とは、1:1~1:6の比率で混合するものであってもよく、例えば、1:4の比率で混合するものであってもよいが、これに限定されるものではない。このように1:1~1:6の比率で混合して内皮細胞を含む膵臓癌オルガノイドを製造する場合には、腫瘍微細環境で内皮細胞と膵臓癌細胞との間の相互作用を十分に反映して癌開始細胞の特性をさらに効果的によく示すことができる。
本発明の前記d)ステップの培養液とは、細胞を公知の液体培地または固体培地で培養させて得た産物を意味し、細胞が含まれていない概念である。
本発明の前記a)ステップにおいて、解離させるステップは、コラゲナーゼ(Collagenase)を用いるものであってもよく、例えば、コラゲナーゼD(コラゲナーゼIV型)を用いるものであってもよいが、これに限定されるものではない。前記コラゲナーゼDは、トリプシン活性が低くて、組織を細胞単位に解離させる過程で細胞の損傷を最小化することができる。
本発明の前記a)ステップにおいて、解離させるステップは、コラゲナーゼ(Collagenase)を用いるものであってもよく、例えば、コラゲナーゼD(コラゲナーゼIV型)を用いるものであってもよいが、これに限定されるものではない。前記コラゲナーゼDは、トリプシン活性が低くて、組織を細胞単位に解離させる過程で細胞の損傷を最小化することができる。
本発明の前記内皮細胞を含む膵臓癌オルガノイドは、癌開始細胞が含まれたものであってもよい。本発明の目的上、前記膵臓癌オルガノイドは、癌開始細胞を維持させることができる別の成長因子を追加しない場合にも、内皮細胞との相互作用または内皮細胞の上澄液に含まれている物質によって癌開始細胞の自己再生およびメンテナンスを持続させることができる。
本発明の前記b)ステップにおいて、オルガノイドを形成するステップは、抗生剤、グルタミン、B27、N-アセチル-L-システイン、成長因子、ガストリン、細胞シグナル伝達抑制剤、PGE2(Prostaglandin E2)および添加剤から構成された群より選択される1種以上をさらに含むDMEM/F12培地において、前記a)ステップの解離したサンプルを培養する過程により行われるものであってもよい。本発明の目的上、このような培地を用いる場合には、組織から解離した細胞を1次培養する過程なくても非常に効果的に細胞を癌オルガノイド化することができる。
本発明の前記「抗生剤」は、膵臓癌オルガノイドを培養する過程で、バクテリア、カビ、マイクロプラズマおよび酵素などによる汚染を防止するためのものであって、例えば、アンピシリン、ペニシリン、ストレプトマイシン、スペクチノマイシン、テトラサイクリン、ネオマイシンなどであってもよく、ペニシリンおよびストレプトマイシンであってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記「グルタミン」は、細胞培養時にエネルギーを提供する必須の成分であって、例えば、アラニルグルタミンまたはグルタミンジペプチドなどであってもよく、例えば、L-アラニル-L-グルタミン(グルタマックス)であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記「B27」は、細胞の成長または生存力を助けるのに最適化された無血清補充剤に相当する。
本発明の前記「成長因子」は、細胞成長、増殖、治癒および細胞分化を刺激できるタンパク質またはステロイドホルモンであって、例えば、ノギン組換えタンパク質(Noggin recombinant protein)、表皮成長因子(Epidermal growth factor)および線維芽細胞成長因子10(fibroblast growth factor 10)であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記「成長因子」は、細胞成長、増殖、治癒および細胞分化を刺激できるタンパク質またはステロイドホルモンであって、例えば、ノギン組換えタンパク質(Noggin recombinant protein)、表皮成長因子(Epidermal growth factor)および線維芽細胞成長因子10(fibroblast growth factor 10)であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記「細胞シグナル伝達抑制剤」は、細胞内部のシグナル伝達経路の活性化を抑制するために、成長因子が受容体に結合することを妨げたり、受容体の活性化を遮断するなどの機能をするものを意味する。本発明の目的上、前記細胞シグナル伝達抑制剤は、AK抑制剤およびp38 MAPK抑制剤であってもよく、例えば、A83-01(CAS No.909910-43-6)およびSB202190(CAS No.152121-30-7)であってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記「添加剤」は、Wnt3a-条件化培地、RSPO1-条件化培地およびニコチンアミドであってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の他の実施形態では、本発明の前記製造方法により製造された膵臓癌オルガノイドを提供する。
本発明の前記膵臓癌オルガノイドは、本発明の前記製造方法により製造されるため、膵臓癌の発達、薬物に対する耐性などを研究するのに非常に効果的に使用できる。さらに、このようなオルガノイドを用いる場合には、スクリーニングされた薬物の臨床適用度および信頼度などをさらに著しく高めることができる。
本発明の他の実施形態では、本発明の前記製造方法により製造された膵臓癌オルガノイドを提供する。
本発明の前記膵臓癌オルガノイドは、本発明の前記製造方法により製造されるため、膵臓癌の発達、薬物に対する耐性などを研究するのに非常に効果的に使用できる。さらに、このようなオルガノイドを用いる場合には、スクリーニングされた薬物の臨床適用度および信頼度などをさらに著しく高めることができる。
本発明の膵臓癌オルガノイドにおいて、膵臓癌、内皮細胞、培養液、比率、コラゲナーゼなどに関連する内容は、前記膵臓癌オルガノイドの製造方法に記載されるものと同一で、本明細書の過度の複雑性を回避するために省略する。
本発明のさらに他の実施形態では、膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供する。
本発明のさらに他の実施形態では、膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供する。
本発明の前記スクリーニングする方法は、a)本発明による前記膵臓癌オルガノイドに候補物質を処理するステップと、b)候補物質の処理の有無によって膵臓癌オルガノイドに含まれた癌細胞を観察するステップとを含む、膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供する。
本発明のスクリーニング方法の前記b)ステップにおいて、癌細胞の大きさが減少または維持されるか、癌開始細胞の数が減少する場合に、前記候補物質を膵臓癌治療剤として選別することができる。
本発明のスクリーニング方法の前記b)ステップにおいて、癌細胞の大きさが減少または維持されるか、癌開始細胞の数が減少する場合に、前記候補物質を膵臓癌治療剤として選別することができる。
本発明の前記「スクリーニング」とは、多様な物質からなる候補群から目的とする特定の性質を有する物質のみを特異的に選別することを意味する。
本発明の前記「候補物質」とは、癌組織の成長または転移に対して抑制活性を有するか、癌開始細胞の死滅を誘導できると予想される未知の物質を意味する。前記候補物質は、化合物、ペプチド、タンパク質、抗体および天然抽出物などであってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記候補物質は、合成または天然化合物のライブラリー、生物学的ライブラリー、空間アドレッサブルパラレル固相または液相ライブラリー(Spatially addressable parallel solid phase or solution phase libraries)などにより得ることができる。
本発明の前記「候補物質」とは、癌組織の成長または転移に対して抑制活性を有するか、癌開始細胞の死滅を誘導できると予想される未知の物質を意味する。前記候補物質は、化合物、ペプチド、タンパク質、抗体および天然抽出物などであってもよいが、これに限定されるものではない。
本発明の前記候補物質は、合成または天然化合物のライブラリー、生物学的ライブラリー、空間アドレッサブルパラレル固相または液相ライブラリー(Spatially addressable parallel solid phase or solution phase libraries)などにより得ることができる。
本発明の膵臓癌オルガノイドの製造方法は、癌細胞と内皮細胞との相互作用、すなわち血管ニッチのクロストーク(cross-talk of vascular niche)を十分に反映するため、既存の癌オルガノイドと比較して、有機体環境に存在する癌開始細胞(Cancer initiating cells;CICs)の特性を示すことが可能で、スクリーニングされた薬物の臨床適用度および信頼度などをさらに著しく高めることができる。
本発明の一実施形態では、a)膵臓癌患者から分離された生物学的試料を解離させ、マトリゲル(Matrigel)に固定化するステップと、b)前記a)ステップでマトリゲルに固定化されたサンプルを培養して膵臓癌オルガノイドを形成するステップと、c)前記b)ステップで形成された膵臓癌オルガノイドを解離させるステップと、d)前記解離した膵臓癌オルガノイドと内皮細胞とを共培養するか;または前記解離した膵臓癌オルガノイドに内皮細胞培養液を入れて培養するステップと、を含む、膵臓癌オルガノイドの製造方法を提供する。
本発明の他の実施形態では、本発明による前記製造方法により製造された膵臓癌オルガノイドを提供する。
本発明のさらに他の実施形態では、本発明による前記膵臓癌オルガノイドに候補物質を処理するステップと、b)候補物質の処理の有無によって内皮細胞を含む膵臓癌オルガノイドに含まれた癌細胞を観察するステップとを含む、膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供する。
本発明のさらに他の実施形態では、本発明による前記膵臓癌オルガノイドに候補物質を処理するステップと、b)候補物質の処理の有無によって内皮細胞を含む膵臓癌オルガノイドに含まれた癌細胞を観察するステップとを含む、膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法を提供する。
以下、実施例を通じて本発明をさらに詳細に説明する。これらの実施例は単に本発明をより具体的に説明するためのものであって、本発明の要旨によって本発明の範囲がこれらの実施例によって制限されないことは当業界における通常の知識を有する者にとって自明であろう。
●実験方法
●[実験方法1]膵臓管腺癌患者サンプル
膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma;PDAC)組織と内視鏡超音波誘導微細針吸引(Endoscopic Ultrasound-Guided Fine Needle Aspiration;EUS-FNA)サンプルは韓国の延世大学医科大学セブランス病院から入手した。本出願に関連するすべての人体実験はセブランス病院機関審査委員会(institutional review board;IRB)の承認を受け、IRBの事前同意指針により供与者である膵臓癌患者の同意を予め得た。
●[実験方法1]膵臓管腺癌患者サンプル
膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma;PDAC)組織と内視鏡超音波誘導微細針吸引(Endoscopic Ultrasound-Guided Fine Needle Aspiration;EUS-FNA)サンプルは韓国の延世大学医科大学セブランス病院から入手した。本出願に関連するすべての人体実験はセブランス病院機関審査委員会(institutional review board;IRB)の承認を受け、IRBの事前同意指針により供与者である膵臓癌患者の同意を予め得た。
●[実験方法2]ヒト由来膵臓癌オルガノイドの作製
前記[実験方法1]で得られた組織試料を切断し、2mg/mlのコラゲナーゼD(Sigma Aldrich、カタログ番号:11088866001)および10%FBS(Fetal bovine serum)が含まれたDMEM(Dulbecco’s Modified Eagle’s medium)培地に前記切断された組織試料を入れて、37℃で90分間培養する過程により十分に粉砕および分解させた。その後、前記分解された組織を10%FBS(Fetal Bovine Serum)が含まれたDPBS(Distilled phosphate buffer saline)で洗浄し、成長因子減少(growth factor reduce;GFR)マトリゲル(Corning、カタログ番号:356231)に埋め込んだ(embed)。ここで、EUS-FNA(endoscopic ultrasound-guided fine needle aspiration)サンプルの場合には、少量の細胞物質を10分間400×gで遠心分離する過程により収集し、RBC溶解緩衝液(QIAGen、カタログ番号:158904)を用いてEUS-FNAサンプルを溶解させ、adDMEM/F12培地(Thermo Fisher Scientific)を用いて2回洗った。
前記[実験方法1]で得られた組織試料を切断し、2mg/mlのコラゲナーゼD(Sigma Aldrich、カタログ番号:11088866001)および10%FBS(Fetal bovine serum)が含まれたDMEM(Dulbecco’s Modified Eagle’s medium)培地に前記切断された組織試料を入れて、37℃で90分間培養する過程により十分に粉砕および分解させた。その後、前記分解された組織を10%FBS(Fetal Bovine Serum)が含まれたDPBS(Distilled phosphate buffer saline)で洗浄し、成長因子減少(growth factor reduce;GFR)マトリゲル(Corning、カタログ番号:356231)に埋め込んだ(embed)。ここで、EUS-FNA(endoscopic ultrasound-guided fine needle aspiration)サンプルの場合には、少量の細胞物質を10分間400×gで遠心分離する過程により収集し、RBC溶解緩衝液(QIAGen、カタログ番号:158904)を用いてEUS-FNAサンプルを溶解させ、adDMEM/F12培地(Thermo Fisher Scientific)を用いて2回洗った。
以後、10分間培養器で培養する過程によりマトリックスを重合化(polymerizing)した後、adDMEM/F12に下記表1に記載の成分が追加的に含まれている膵臓癌オルガノイド培養培地(培地1)を追加的に入れて、オルガノイドが形成されるまで培養した。その後、オルガノイドの形成が現れた時に、前記膵臓癌オルガノイド培養培地からPGE2が除かれた培地(培地2)に入れ替え、2回の継代が行われた後に、以下に記載のオルガノイドの特徴などを確認する実験を行った。
前記膵臓癌オルガノイドの継代のために、TrypLEエクスプレス(インビトロジェン、カタログ番号:12604013)を用いてオルガノイドを分離し、adDMEM/F12培地を用いてトリプシンが残らないように洗浄した。最終的に、膵臓癌オルガノイドの断片がGFRマトリゲルに埋め込まれているようにし、表1に記載されている膵臓癌オルガノイド培養培地(培地1)に10μMのY-27632(トクリス)を追加的に添加した。以下、このように作製されたオルガノイドを、ヒト由来膵臓癌オルガノイドという。
●[実験方法3]細胞株の培養方法
HUVECs(Human umbilical vein endothelial cells)を1%ゼラチンがコーティングされた培養皿に分注し、1×EGM-2MVシングルクォート補充パック(singlequots supplement Pack;カタログ番号:CC-4147)が含まれたEBM-2ベースの培地(Lonza、カタログ番号:CC-3156)を用いて培養した。この時、前記培地は2日または3日の周期で入れ替えた。
HUVECs(Human umbilical vein endothelial cells)を1%ゼラチンがコーティングされた培養皿に分注し、1×EGM-2MVシングルクォート補充パック(singlequots supplement Pack;カタログ番号:CC-4147)が含まれたEBM-2ベースの培地(Lonza、カタログ番号:CC-3156)を用いて培養した。この時、前記培地は2日または3日の周期で入れ替えた。
また、ヒト膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma;PDAC)細胞株に相当するAsPC1、Mia PACA2およびPANC1細胞株を韓国細胞株銀行から購入した。前記AsPC1細胞株は10%FBSを含むRPMI1640を用いて培養し、Mia PACA2およびPANC1は10%FBSを含むDMEMを用いて培養した。
●[実験方法4]膵臓癌オルガノイドおよびHUVECsの共培養方法
図4に示されるように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドとHUVECsとを共培養して、HUVECsが含まれた膵臓癌オルガノイド(以下、「ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステム」という)を構築した。具体的には、前記[実験方法2]で製造された膵臓癌オルガノイドをTypLEエクスプレスを用いて解離させた後、CellTrackerブルーCMAC染料を用いて染色し、製造会社のプロトコルによりCFSE(Carboxyfluorescein succinimidyl ester、Thermo)を用いてHUVECsを染色した。その後、前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドとHUVECsとを1:4の比率(5×105の細胞数:2×106の細胞数)で混合した。以後、前記細胞混合物を丸底超低圧付着プレート(round-bottom ultra-low attachment plates;corning)に入れて、10%マトリゲルが含まれた培地1を入れた後に、100×gで3分間遠心分離し、1日間追加的に培養して凝集体(aggregate)を形成した。
図4に示されるように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドとHUVECsとを共培養して、HUVECsが含まれた膵臓癌オルガノイド(以下、「ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステム」という)を構築した。具体的には、前記[実験方法2]で製造された膵臓癌オルガノイドをTypLEエクスプレスを用いて解離させた後、CellTrackerブルーCMAC染料を用いて染色し、製造会社のプロトコルによりCFSE(Carboxyfluorescein succinimidyl ester、Thermo)を用いてHUVECsを染色した。その後、前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドとHUVECsとを1:4の比率(5×105の細胞数:2×106の細胞数)で混合した。以後、前記細胞混合物を丸底超低圧付着プレート(round-bottom ultra-low attachment plates;corning)に入れて、10%マトリゲルが含まれた培地1を入れた後に、100×gで3分間遠心分離し、1日間追加的に培養して凝集体(aggregate)を形成した。
前記凝集体をGFRマトリゲルに埋め込み、十分に凝固された時、前記凝集体を基礎培地を用いて洗浄した後に、グルタマックスおよび5%のFBSが含まれたadDMEM/F12培地で3日間培養する過程により第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムを構築した。
ここで、WntおよびNotch細胞シグナル伝達体系の抑制を確認するための実験の場合には、前記凝集体をGFRマトリゲルに埋め込む時に、細胞シグナル伝達抑制剤である100nMのWnt-C59または200μMのDAPTを追加的に含ませて3日間培養した。また、細胞の表現型を確認するためには、TrypLEエクスプレスを用いて前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムの凝集体を十分に細胞単一化させた後に、下記の[5-1]に記載のフローサイトメトリー分析により分析した。
●[実験方法5]HUVECs培養液を用いたヒト由来膵臓癌オルガノイドの培養
●[実験方法5]HUVECs培養液を用いたヒト由来膵臓癌オルガノイドの培養
HUVECsをGM-2MVに分注した後、95%コンフルエンス(confluence)に到達するまで培養した。前記HUVECsを2回洗浄し、培地を5%ウシ胎児血清およびグルタマックスが含まれたadDMEM/F12に入れ替えた後に、3日間37℃の培養器で培養した。
一方、対照群の場合、細胞(HUVECs)が含まれていないプレートに5%ウシ胎児血清およびグルタマックスが含まれたadDMEM/F12を3日間37℃の培養器に置いた。
このように得られた培養液を4℃で遠心分離した後、上層液を集めて0.22μmのフィルタにより濾過して、上澄液に相当する培養液を得た。Wnt-C59およびDAPTを前処理するHUVECコンディショニング培地(CM)の場合、HUVEC細胞をWnt-C59およびDAPT処理後、1日間培養し、細胞を洗浄した後に2回洗浄後、5%ウシ胎児血清およびグルタマックスが含まれたadDMEM/F12に入れ替え、3日間培養した。その後、先に記載されたものと同様の方法で上澄液に相当する培養液を得た。
前記得られた培養液を[実験方法2]で製造された膵臓癌オルガノイドに入れる過程により第2ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムを製造した。
このように得られた培養液を4℃で遠心分離した後、上層液を集めて0.22μmのフィルタにより濾過して、上澄液に相当する培養液を得た。Wnt-C59およびDAPTを前処理するHUVECコンディショニング培地(CM)の場合、HUVEC細胞をWnt-C59およびDAPT処理後、1日間培養し、細胞を洗浄した後に2回洗浄後、5%ウシ胎児血清およびグルタマックスが含まれたadDMEM/F12に入れ替え、3日間培養した。その後、先に記載されたものと同様の方法で上澄液に相当する培養液を得た。
前記得られた培養液を[実験方法2]で製造された膵臓癌オルガノイドに入れる過程により第2ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムを製造した。
●[実験方法6]測定、染色および分析方法
●[6-1]フローサイトメトリー分析(Flow cytometry)
細胞表面染色のために、前記[実験方法4]の凝集体から単一化された細胞を1%のFBSおよび0.1%BSA(MP bio)が含まれたFACS緩衝液(dPBS;Gibco)に集めた後、Fc受容体ブロッカー(Fc receptor blocker、Milteni Biotec)を用いて遮断した。その後、CD44-APCcy7(Biolegend)、CD24-Pecy7、およびEpCAM-PerCPcy5.5を用いて前記細胞を染色した後に、LSR IIを用いてフローサイトメトリー分析を行い、FlowJoとDIVAソフトウェアにより分析した。
●[6-1]フローサイトメトリー分析(Flow cytometry)
細胞表面染色のために、前記[実験方法4]の凝集体から単一化された細胞を1%のFBSおよび0.1%BSA(MP bio)が含まれたFACS緩衝液(dPBS;Gibco)に集めた後、Fc受容体ブロッカー(Fc receptor blocker、Milteni Biotec)を用いて遮断した。その後、CD44-APCcy7(Biolegend)、CD24-Pecy7、およびEpCAM-PerCPcy5.5を用いて前記細胞を染色した後に、LSR IIを用いてフローサイトメトリー分析を行い、FlowJoとDIVAソフトウェアにより分析した。
●[6-2]免疫蛍光染色(Immunofluorescence staining)
前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドまたはヒト由来または細胞株由来膵臓癌オルガノイドシステムをPBS(0.1%グルタルアルデヒド(Glutaraldehyde)が含まれた1%のパラホルムアルデヒド(Paraformaldehyde)に入れて、10分間培養する過程により固定化した。その後、10mM NaBH4が含まれたPBSを用いて少なくとも3回以上洗浄した。すべてのサンプルは1時間常温で1%のBSA(Bovine serum albumin)を用いて遮断させ、CD44抗体で染色された膵臓癌オルガノイドまたは膵臓癌オルガノイドシステムの場合、PBSで3回洗浄した。
前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドまたはヒト由来または細胞株由来膵臓癌オルガノイドシステムをPBS(0.1%グルタルアルデヒド(Glutaraldehyde)が含まれた1%のパラホルムアルデヒド(Paraformaldehyde)に入れて、10分間培養する過程により固定化した。その後、10mM NaBH4が含まれたPBSを用いて少なくとも3回以上洗浄した。すべてのサンプルは1時間常温で1%のBSA(Bovine serum albumin)を用いて遮断させ、CD44抗体で染色された膵臓癌オルガノイドまたは膵臓癌オルガノイドシステムの場合、PBSで3回洗浄した。
以後、前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドまたはヒト由来または細胞株由来膵臓癌オルガノイドシステムに二次抗体およびDAPI(4,6-diamidino-2-phenylindole)を入れて1時間培養し、PBSを用いて3回洗浄した後に、Zeiss LSM710レーザスキャンコンフォーカルローカル顕微鏡を用いて観察した。
●[6-3]統計分析
実験の結果値は平均±SEM値で提示されるように計算した。互いに異なる2つの標本に対する統計的比較のためにMann-Whitney U検定を用いており、多数の標本を比較して統計的有意性を評価するためにDunnettの多重比較テストを用いた。統計的に有意な値は0.05未満に設定し、統計パッケージSPSSバージョン25(SPSS Inc.、Chicago、IL)とグラフパッドプリズム8を用いて統計テストを行った。
実験の結果値は平均±SEM値で提示されるように計算した。互いに異なる2つの標本に対する統計的比較のためにMann-Whitney U検定を用いており、多数の標本を比較して統計的有意性を評価するためにDunnettの多重比較テストを用いた。統計的に有意な値は0.05未満に設定し、統計パッケージSPSSバージョン25(SPSS Inc.、Chicago、IL)とグラフパッドプリズム8を用いて統計テストを行った。
●[実験方法7]ウィント活性分析(Wnt activity assay)
HEK 293 STF細胞(ATCC、CRL-3249)を白色の96-ウェルプレートに分注し、10%FBSおよび200μg/mlのG-418が含まれたDMEMで培養した。その後、50%コンディショニングされた培地および対照群培地とともに48時間培養した。
HEK 293 STF細胞(ATCC、CRL-3249)を白色の96-ウェルプレートに分注し、10%FBSおよび200μg/mlのG-418が含まれたDMEMで培養した。その後、50%コンディショニングされた培地および対照群培地とともに48時間培養した。
製造業者が提供する指針によりBright-Gloルシフェラーゼアッセイシステム(Luciferase Assay System、promega)を用いてルシフェラーゼシグナルを測定した。
●実験結果
●[実験結果1]癌開始細胞の濃縮の確認
●[1-1]ヒト由来膵臓癌オルガノイドの表現型および外形の確認
前記[実験方法2]のヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD24(+)CD44(+)およびCD24(+)CD44(+)ESA(+)に相当する表現型を確認して、その結果を図1の(A)および(B)、図2および図3に示した。
図1の(A)および(B)に示すように、顕微鏡観察(A)およびフローサイトメトリー分析(B)ともにおいて、ヒト由来膵臓癌オルガノイド中にCD24(+)CD44(+)表現型を有する細胞が73.3%に相当し、CD24(+)CD44(+)表現型を有する細胞中にESA(+)表現型である細胞が99.5%に相当した。
●[実験結果1]癌開始細胞の濃縮の確認
●[1-1]ヒト由来膵臓癌オルガノイドの表現型および外形の確認
前記[実験方法2]のヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD24(+)CD44(+)およびCD24(+)CD44(+)ESA(+)に相当する表現型を確認して、その結果を図1の(A)および(B)、図2および図3に示した。
図1の(A)および(B)に示すように、顕微鏡観察(A)およびフローサイトメトリー分析(B)ともにおいて、ヒト由来膵臓癌オルガノイド中にCD24(+)CD44(+)表現型を有する細胞が73.3%に相当し、CD24(+)CD44(+)表現型を有する細胞中にESA(+)表現型である細胞が99.5%に相当した。
図2に示すように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD24(+)CD44(+)に相当する癌開始細胞(CIC)は計69.2±3.5%であり、CD24(+)CD44(+)細胞の99.5±0.3%がESA(+)細胞であることを確認した。
図3に示すように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD44が非常に高い水準に発現し、前記オルガノイドを構成している細胞は中心の空いている3次元円形(ルーメン構造)形態で構成されていることを確認した。
前記結果を通して、ヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD24(-)CD44(-)細胞より、CD24(+)CD44(+)およびCD24(+)CD44(+)ESA(+)細胞の方が高い水準に濃縮されていることが分かる。
図3に示すように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD44が非常に高い水準に発現し、前記オルガノイドを構成している細胞は中心の空いている3次元円形(ルーメン構造)形態で構成されていることを確認した。
前記結果を通して、ヒト由来膵臓癌オルガノイドにおいてCD24(-)CD44(-)細胞より、CD24(+)CD44(+)およびCD24(+)CD44(+)ESA(+)細胞の方が高い水準に濃縮されていることが分かる。
●[1-2]膵臓癌オルガノイドの癌開始細胞の維持確認
人工的な幹細胞支援因子によって癌開始細胞が維持されるか否かを確認するために、前記[実験方法2]のヒト由来膵臓癌オルガノイドを5%のFBSおよびグルタマックスが含まれたadDMEM/F12培地である基礎培地で培養し、細胞数および表現型を観察して、その結果を図4に示した。
図4に示すように、基礎培地で3日間培養した時、癌開始細胞の数が減少した。
人工的な幹細胞支援因子によって癌開始細胞が維持されるか否かを確認するために、前記[実験方法2]のヒト由来膵臓癌オルガノイドを5%のFBSおよびグルタマックスが含まれたadDMEM/F12培地である基礎培地で培養し、細胞数および表現型を観察して、その結果を図4に示した。
図4に示すように、基礎培地で3日間培養した時、癌開始細胞の数が減少した。
前記結果を通して、Wnt、EGFおよびFGFのような因子によって膵臓癌オルガノイドの癌開始細胞が拡大できることが分かる。
●[実験結果2]オルガノイド形成可能性評価
ヒト由来膵臓癌オルガノイドから分離されたCD24(+)CD44(-)またはCD24(-/low)CD44(-)細胞のオルガノイド形成能を評価した。
具体的には、図5に図式化されたように、前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドからCD24(-low)CD44(-)、CD24(+)CD44(-)およびCD24(+)CD44(+)細胞をそれぞれフローサイトメトリー分析(FACS)により分離し、11日間前記培地1および2を用いて培養した。その後、フローサイトメトリー分析および蛍光顕微鏡分析を行って、その結果を図6および7に示した。
ヒト由来膵臓癌オルガノイドから分離されたCD24(+)CD44(-)またはCD24(-/low)CD44(-)細胞のオルガノイド形成能を評価した。
具体的には、図5に図式化されたように、前記ヒト由来膵臓癌オルガノイドからCD24(-low)CD44(-)、CD24(+)CD44(-)およびCD24(+)CD44(+)細胞をそれぞれフローサイトメトリー分析(FACS)により分離し、11日間前記培地1および2を用いて培養した。その後、フローサイトメトリー分析および蛍光顕微鏡分析を行って、その結果を図6および7に示した。
図6および図7に示すように、CD24(+)CD44(-)およびCD24(-/low)CD44(-)を培養して製造されたオルガノイドもCD44を発現し(図6)、CD24(+)CD44(-)およびCD24(-/low)CD44(-)細胞だけでなく、CD24(+)CD44(+)細胞も円形と真ん中の空いているルーメン構造に再構成された(図7)。
前記結果を通して、Wnt、EGFおよびFGFを含むオルガノイド培養培地は、CD24(+)CD44(+)癌開始細胞およびCD24(+)CD44(+)ESA(+)癌開始細胞の拡張を誘導することができ、CD24(+)CD44(-)およびCD24(-/low)CD44(-)細胞はCD44(+)である癌開始細胞に再プログラミングできることが分かる。
●[実験結果3]内皮細胞と癌開始細胞との相互作用の確認
内皮細胞によって癌開始細胞の自己再生およびメンテナンスが維持されるかを確認するために、前記[実験方法4]の第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムおよびヒト由来膵臓癌オルガノイドを成長因子が除かれた環境で培養した後、細胞形態および表現型を観察して、その結果を図9~図12に示した。
図9に示すように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドと比較して、第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムにおいてオルガノイド自体の大きさが著しく大きいことを確認した。
内皮細胞によって癌開始細胞の自己再生およびメンテナンスが維持されるかを確認するために、前記[実験方法4]の第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムおよびヒト由来膵臓癌オルガノイドを成長因子が除かれた環境で培養した後、細胞形態および表現型を観察して、その結果を図9~図12に示した。
図9に示すように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドと比較して、第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムにおいてオルガノイド自体の大きさが著しく大きいことを確認した。
また、図10~12に示すように、ヒト由来膵臓癌オルガノイドと比較して、第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムにおいて癌開始細胞の表現型に相当するCD24(+)CD44(+)が多数存在し(図10および図11)、このような表現型を有する100%の細胞がESA陽性細胞であることを確認(図12)した。
●[実験結果4]内皮細胞と癌開始細胞との相互作用で関与する細胞シグナル伝達の確認
第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムにおいて細胞シグナル伝達を抑制した時、オルガノイドの形成過程を確認して、その結果を図13の(A)および(B)と図14に示した。
図13の(A)および(B)と、図14に示すように、ウィント(Wnt)またはノッチ(Notch)細胞シグナル伝達を抑制する場合、オルガノイドシステムにおいてオルガノイドの形成が抑制された(図13の(A))。さらに、オルガノイドシステムに含まれた癌開始細胞もその数が著しく減少することを確認した(図13の(B)および図14)。
第1ヒト由来膵臓癌オルガノイドシステムにおいて細胞シグナル伝達を抑制した時、オルガノイドの形成過程を確認して、その結果を図13の(A)および(B)と図14に示した。
図13の(A)および(B)と、図14に示すように、ウィント(Wnt)またはノッチ(Notch)細胞シグナル伝達を抑制する場合、オルガノイドシステムにおいてオルガノイドの形成が抑制された(図13の(A))。さらに、オルガノイドシステムに含まれた癌開始細胞もその数が著しく減少することを確認した(図13の(B)および図14)。
前記結果を通して、膵臓癌オルガノイドシステムに存在する癌開始細胞は、内皮細胞との相互作用によって自己再生およびメンテナンスされ、このような現象はウィントおよびノッチ細胞シグナル伝達によって起こるものであることが分かる。
●[実験結果5]HUVECsの上澄液を用いたヒト由来オルガノイドシステムの特徴の確認
癌開始細胞のメンテナンスにおいて内皮細胞のウィントおよびノッチリガンドのような分泌タンパク質の役割を評価するために、膵臓癌オルガノイドを5%ウシ胎児血清を含むHUVECs細胞のコンディショニング培地(CM)とともにadDMEM/F12で培養し、その形態を顕微鏡により確認し、細胞の表現型をフローサイトメトリー分析により確認して、その結果を図15および図16に示した。ここで、前記[実験方法5]に記載されたように、対照群は細胞(HUVECs)なしに培養液のみを単独で37℃の培養器で培養したものを使用した。
癌開始細胞のメンテナンスにおいて内皮細胞のウィントおよびノッチリガンドのような分泌タンパク質の役割を評価するために、膵臓癌オルガノイドを5%ウシ胎児血清を含むHUVECs細胞のコンディショニング培地(CM)とともにadDMEM/F12で培養し、その形態を顕微鏡により確認し、細胞の表現型をフローサイトメトリー分析により確認して、その結果を図15および図16に示した。ここで、前記[実験方法5]に記載されたように、対照群は細胞(HUVECs)なしに培養液のみを単独で37℃の培養器で培養したものを使用した。
図15および図16に示すように、癌開始細胞の表現型を有するCD44+細胞が対照群コンディショニング培地(control CM)を用いて培養した場合と比較して、HUVECs細胞のコンディショニング培地(HEVEC CM)を用いて培養した場合に著しく増加していることを確認した。
以上、本発明の特定部分を詳細に記述したが、当業界における通常の知識を有する者にとってこのような具体的な技術は単に好ましい実施形態に過ぎず、よって、本発明の範囲が制限されるわけではない点は明らかである。したがって、本発明の実質的な範囲は添付した請求項とその等価物によって定義される。
本発明の膵臓癌オルガノイドの製造方法は、癌細胞と内皮細胞との相互作用、すなわち血管ニッチのクロストーク(cross-talk of vascular niche)を十分に反映するため、既存の癌オルガノイドと比較して、有機体環境に存在する癌開始細胞(Cancer initiating cells;CICs)の特性を示すことが可能で、スクリーニングされた薬物の臨床適用度および信頼度などをさらに著しく高めることができる。
Claims (12)
- a)膵臓癌患者から分離された生物学的試料を解離させ、マトリゲル(Matrigel)に固定化するステップと、
b)前記a)ステップでマトリゲルに固定化されたサンプルを培養して膵臓癌オルガノイドを形成するステップと、
c)前記b)ステップで形成された膵臓癌オルガノイドを解離させるステップと、
d)前記解離した膵臓癌オルガノイドと内皮細胞とを共培養するか;または前記解離した膵臓癌オルガノイドに内皮細胞培養液を入れて培養するステップと、を含む、膵臓癌オルガノイドの製造方法。 - 前記d)ステップの内皮細胞は、血管内皮細胞(Vascular endothelial cell)である、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 前記d)ステップにおいて、前記共培養は、膵臓癌オルガノイドと内皮細胞とを1:1~1:6の比率で混合して培養するものである、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 前記a)ステップにおいて、解離させるステップは、コラゲナーゼ(Collagenase)を用いるものである、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 前記内皮細胞を含む膵臓癌オルガノイドは、癌開始細胞(Cancer initiating cells;CICs)が含まれたものである、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 前記d)ステップにおいて、前記共培養または培養液を入れて培養するステップは、内皮細胞によって膵臓癌オルガノイドに含まれた癌開始細胞の自己再生およびメンテナンスが誘導されるものである、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 前記膵臓癌は、膵臓管腺癌(Pancreatic ductal adenocarcinoma)である、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 前記b)ステップのオルガノイドを形成するステップは、抗生剤、グルタミン、B27、N-アセチル-L-システイン、成長因子、ガストリン、細胞シグナル伝達抑制剤およびPGE2(Prostaglandin E2)から構成された群より選択される1種以上をさらに含むDMEM/F12培地において、前記a)ステップの解離したサンプルを培養する過程により行われるものである、請求項1に記載の膵臓癌オルガノイドの製造方法。
- 請求項1~8のいずれか1項に記載の製造方法により製造された膵臓癌オルガノイド。
- a)請求項9に記載の膵臓癌オルガノイドに候補物質を処理するステップと、
b)候補物質の処理の有無によって内皮細胞を含む膵臓癌オルガノイドに含まれた癌細胞を観察するステップとを含む、膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法。 - 前記b)ステップにおいて、癌細胞の大きさが減少または維持されるか、癌開始細胞の数が減少する場合に、前記候補物質を膵臓癌治療剤として選別するものである、請求項10に記載の膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法。
- 前記膵臓癌は、膵臓管腺癌である、請求項10に記載の膵臓癌治療剤をスクリーニングする方法。
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