JP2023526259A - がんまたは腫瘍の治療の方法 - Google Patents

がんまたは腫瘍の治療の方法 Download PDF

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Abstract

本発明は、対象におけるがんおよび/または腫瘍を治療する、阻止する、またはその進行を遅延させる方法であって、MAGE A4に結合する特性を有する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量を含む治療レジメンを対象に施すステップを含む、方法に関する。

Description

本発明は、対象におけるがんおよび/または腫瘍を治療する、阻止する、またはその進行を遅延させる方法であって、MAGE A4またはその抗原ペプチドに結合する特性を有する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量を含む治療レジメン、特に胃食道がんの治療を対象に施すステップを含む、方法に関する。
胃食道がんおよび/または腫瘍は、食道、胃-食道接合部、または胃のがんおよび/または腫瘍、すなわち胃がんを包含する。
食道がん:食道がんは、がん関連死の原因の世界第6位である。一般的に、食道がんは、食道の上皮から生じ、2つのクラス:タバコおよびアルコール消費と強いつながりがある食道扁平上皮細胞癌(ESCC)と、一般にGERDおよびバレット食道と関連した食道腺癌(EAC)との一方に分類される。食道がんは、バレット食道とつながりがあることが多い、食道の下部のがんである食道胃接合部がんまたは癌腫または腺癌(EGJ)を含む。EGJは、例えばCR2、HGF、FGFR4、ESRRB、TP53、SYNE1、およびARID1Aにおけるいくつかの遺伝子にわたる体細胞変異の数の上昇を有する、高度に変異しかつ不均一な疾患である。食道胃接合部腺癌の治療選択肢は限定されており、全体的な予後は極めて不良である。ESCC(食道扁平上皮細胞癌腫)は、世界の食道がんの全症例の60~70%を占め、症例のさらに20~30%はEAC(食道腺癌)であり、該がんの他のあまり見られない形態は、黒色腫、平滑筋肉腫、カルチノイド、およびリンパ腫を含む。一般的に、食道がんの予後はかなり不良であり、米国における全5年生存率はおよそ15%であり、ほとんどの人々は、診断から最初の1年のうちに死亡する。イングランドおよびウェールズに関する最近のデータは、10%の人々しか、少なくとも10年間食道がんを生き延びないことを示している。予後不良は、該疾患の蔓延を説明しており、ほとんどの患者が、嚥下困難等の最初の症状が現れるときまでに進行性疾患を提示することから、乏しい生存率は、早期検出の割合が低いことともつながっている。米国において、食道がんは、男性のがんによる死亡原因の第7位である。限局性疾患の根治的な治療選択肢は、手術、放射線、および化学療法を組み合わせたものである。
転移性または再発性疾患は、一般に、症状を緩和し、嚥下することを容易にするステント留置術との放射線および化学療法によって一時しのぎに管理される。
胃(gastric)および胃(stomach)がん:胃(gastric)および胃(stomach)がんは、タバコ、アルコール、およびH.ピロリ(H. pylori)、ならびに塩分のある食品または酢漬けの食品と密接につながっている。治療は、一般的に、化学療法(5-フルオロウラシル、シスプラチン、エピルビシン、エトポシド、ドセタキセル、オキサリプラチン、カペシタビン、またはイリノテカン等の薬物による)、放射線療法、または標的療法、例えばヒト上皮成長因子受容体2(HER2)阻害剤のトラスツズマブを用いた治療との手術の組み合わせを含み、HER2は、胃がんを有する患者の13~22%において過剰発現される。一部のタイプの胃リンパ腫は、H.ピロリ(H. pylori)を排除することによって治癒し得るものの、主に、該病態を有するほとんどの人々は進行性疾患を提示するため、一般的に転帰は不良であることが多い。世界的に、胃がんは、がんによる死亡原因の第3位であり、女性の2倍多く男性において生じ、米国では死亡の9%を占め、5年生存率は31.5%である。
それゆえ、食道、胃-食道接合部のがんおよび/もしくは腫瘍、または胃がんおよび/もしくは腫瘍を含めた胃食道がんおよび/または腫瘍の治療等、腫瘍および/またはがん治療のための療法であって、療法は、がん特異的であり、特に一次療法または手術後に失敗または再発している、中間期もしくは後期のがんまたは単一もしくは複数の固形腫瘍を治療し得、好ましくは療法はさらに、毒性または副作用、例えば化学療法剤の全身毒性(例えば、吐き気、嘔吐、貧血、および血小板減少症)または放射線療法に起因した組織損傷のリスクを最小限に抑えるまたは低下させる、療法を提供することが望ましい。
本発明は、対象における胃食道がんおよび/または腫瘍の治療であって、MAGE A4に結合する、特にGVYDGREHTV、配列番号2に特異的に結合する特性を有する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変T細胞の有効量を含む治療レジメンを対象に施すステップを含む、治療に関しかつそれを例示する。特に、新規の免疫療法介入の適切な標的を提供するHLA-A2制限MAGE A4ペプチドGVYDGREHTV、配列番号2;このペプチドは天然にプロセシングされ、胃食道がん細胞株から単離されている。
本発明の第1の態様によれば、対象における胃食道がんおよび/または腫瘍を治療する、阻止する、またはその進行を遅延させる方法であって、MAGE A4またはそのMAGE A4抗原ペプチドに結合する異種T細胞受容体(TCR)またはキメラ抗原受容体(CAR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量を含む治療レジメンを対象に施すステップを含む、方法が提供される。
本発明によれば、TCRまたはCARは、MAGE A4またはその抗原ペプチド、例えばヒトMAGE A4もしくは配列番号1のMAGE A4またはその抗原ペプチドに結合し得る。TCRまたはCARは、配列番号2、GVYDGREHTVを含む抗原ペプチドに結合し得る。
1つの態様において、本発明は、対象におけるがんおよび/または腫瘍を治療する、阻止する、またはその進行を遅延させるのに使用するための、MAGE A4のペプチド抗原またはその抗原ペプチドに結合する異種T細胞受容体(TCR)またはCARを発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞であって、がんおよび/または腫瘍は胃食道がんおよび/または腫瘍である、改変免疫応答性細胞を提供する。
実施形態において、TCRまたはCARは、ヒトMAGE A4もしくは配列番号1のMAGE A4またはその抗原ペプチドに結合し得る。TCRまたはCARは、配列番号2、GVYDGREHTVを含む抗原ペプチドに結合し得る。
実施形態において、前記細胞は、有効量の前記細胞を含む治療レジメンにおいて、対象に投与される。
およそ100億個の細胞の注入を受けたコホート対象に対する、MAGE-A4 CD8 T細胞注入後12週間の期間における食道胃接合部(EGJ)がんにおける標的病変の>42%の減少を実証したCTスキャン(コンピューター断層撮影スキャン)データである。 ベースライン病変SLCからの低下変化%、すなわち標的病変測定における直径の和(直径の和=非節性病変に対する長径と節性病変に対する短軸との和)の変化パーセントを示した、MAGE-A4 CD8 T細胞注入後の食道胃接合部(EGJ)がんに関する腫瘍応答の表であり、応答はRECIST v1.1によって評価された。
免疫応答性細胞
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、B、T、またはナチュラルキラー(NK)細胞を含む、リンパ系の細胞であり得る。改変免疫応答性細胞は、T細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、ならびに胚性幹細胞および多能性幹細胞(例えば、そこからリンパ系細胞が分化し得るもの)を含めたその前駆体を含めた、リンパ系の細胞であり得る。T細胞は、胸腺において成熟し、主として細胞媒介性免疫に関与し、適応免疫系にも関わるリンパ球であり得る。本発明によれば、T細胞は、それらに限定されないが、ヘルパーT細胞、細胞傷害性T細胞、メモリーT細胞(セントラルメモリーT細胞、幹細胞様メモリーT細胞(または幹様メモリーT細胞)、および2種のタイプのエフェクターメモリーT細胞:例えばTEM細胞およびTEMRA細胞を含む)、調節性T細胞(抑制性T細胞としても知られる)、ナチュラルキラーT細胞、粘膜関連インバリアントT細胞、およびガンマ-デルタT細胞を含み得る。細胞傷害性T細胞(CTLまたはキラーT細胞)は、感染した体細胞または腫瘍細胞の死を誘導し得るTリンパ球のサブセットである。対象自身のT細胞は、異種TCRまたはCARの導入により、特異的抗原を標的にするように遺伝子改変され得る。好ましくは、改変免疫応答性細胞は、T細胞、任意選択でCD4T細胞またはCD8T細胞である。したがって、改変免疫応答性細胞は、T細胞、任意選択でCD4+T細胞またはCD8+T細胞であり得るか、あるいは改変免疫応答性細胞は、改変T細胞、任意選択でCD4+T細胞;もしくはCD8+T細胞の集団、またはCD4+T細胞とCD8+T細胞との混合集団であり得る。
異種TCR/CAR
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、異種T細胞受容体(TCR)または異種キメラ抗原受容体(CAR)を発現し得る(例えば、細胞は、例えば遺伝子ノックインによって、異種TCRまたはCARをコードする核酸配列を形質導入されるまたはそれを含むように操作される)。抗原に結合すると、改変免疫応答性細胞は、抗原を持つ細胞に対してT細胞エフェクター機能および/もしくは細胞溶解効果を呈し得、かつ/または増殖および/もしくは細胞分裂を受け得る。ある特定の実施形態において、異種TCRを含む改変免疫応答性細胞は、同じがんおよび/もしくは腫瘍抗原ならびに/またはペプチド(抗原ペプチド)を標的にするキメラ抗原受容体(CAR)を含む細胞と比較して、匹敵するかまたはより優れた治療効能を呈する。異種TCRまたはCARを含む活性化された改変免疫応答性細胞は、TNFアルファ、IFNy、およびIL2を含み得るがそれらに限定されない、抗腫瘍サイトカインを分泌し得る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、異種T細胞受容体(TCR)または異種キメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸、構築物、もしくはベクター、または異種核酸、構築物、もしくはベクターを含み得る。任意選択で、TCRは、親和性増強TCR、例えば特異的ペプチド増強親和性受容体(SPEAR)TCRであり得る。
「異種」または「外因性」という用語は、細胞または宿主細胞等の特定の生物学的システムに対して外来であり、そのシステムに天然に存在せず、人工的なまたは組み換えの手段によってシステムに導入され得る、ポリペプチドまたは核酸を指す。したがって、異種であるTCRまたはCARの発現は、それによって免疫原性細胞、例えばT細胞の免疫原性特異性を変更し得、それによりそれらは、がんを有する個体のがん細胞の表面に存在する1種または複数の腫瘍もしくはがん抗原および/またはペプチドを認識するまたはそれに対する認識の向上を呈示する。免疫原性細胞またはT細胞の改変、およびそれらの後続の増大は、インビトロおよび/またはエクスビボで実施され得る。
がん/腫瘍抗原またはペプチド抗原
本発明によれば、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原は、MAGE、黒色腫関連抗原、またはMAGEA遺伝子ファミリーのメンバー、例えばMAGE A1、A2、A3、A4、A5、A6、A7、A8、A9、A10、A11、もしくはA12、またはそのペプチド抗原のうちのいずれか1種等、がん-精巣抗原であり得る。好ましくは、腫瘍抗原は、MAGE-A4、配列番号1、またはそのペプチド抗原である。好ましくは、がんおよび/または腫瘍抗原ペプチドは、アミノ酸配列GVYDGREHTV、配列番号2を含むかまたは有する。
共刺激性リガンド
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、外因性または組み換えの(例えば、細胞は、例えば遺伝子ノックインによって、共刺激性リガンドをコードする核酸配列を形質導入されるまたはそれを含むように操作される)少なくとも1種の共刺激性リガンド、任意選択で1種、2種、3種、または4種をさらに含み得る。改変免疫応答性細胞は、異種TCRまたはCAR、および少なくとも1種の外因性または異種の共刺激性リガンドを共発現し得る。異種TCRまたはCARと少なくとも1種の外因性共刺激性リガンドとの間の相互作用は、非抗原特異的シグナルおよび/または細胞の活性化を提供し得る。共刺激性リガンドは、それらに限定されないが、腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーのメンバー、および免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーリガンドを含む。TNFは、全身性炎症に関わるサイトカインであり、急性期反応を刺激する。TNFスーパーファミリーメンバーは、それらに限定されないが、神経成長因子(NGF)、CD40L(CD40L)/CD154、CD137L/4-1BBL、TNF-アルファ、CD134L/OX40L/CD252、CD27L/CD70、Fasリガンド(FasL)、CD30L/CD153、腫瘍壊死因子ベータ(TNFP)/リンホトキシン-アルファ(LTa)、リンホトキシン-ベータ(TTb)、CD257/B細胞活性化因子(BAFF)/Blys/THANK/Tall-I、グルココルチコイド誘導性TNF受容体リガンド(GITRL)、およびTNF関連アポトーシス誘導リガンド(TRAIL)、LIGHT(TNFSF14)を含む。免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーは、細胞表面の大きな群であり、細胞の認識、結合、または接着過程に関わる可溶性タンパク質である。これらのタンパク質は免疫グロブリンと構造的特質を共有し、それらは免疫グロブリンドメイン(フォールド)を所有する。免疫グロブリンスーパーファミリーリガンドは、それらに限定されないが、両方ともCD28に対するリガンドであるCD80およびCD86を含む。ある特定の実施形態において、少なくとも1種の共刺激性リガンドは、4-1BBL、CD275、CD80、CD86、CD70、OX40L、CD48、TNFRSF14、およびその組み合わせからなる群から選択される。少なくとも1種の外因性または組み換えの共刺激性リガンドは4-1BBLまたはCD80であり得、好ましくは少なくとも1種の外因性または組み換えの共刺激性リガンドは4-1BBLである。改変免疫応答性細胞は、2種の外因性または組み換えの共刺激性リガンドを含み得、好ましくは2種の外因性または組み換えの共刺激性リガンドは、4-1BBLおよびCD80である。
改変免疫応答性細胞は、免疫抑制性腫瘍微小環境を乗り越える、外因性または組み換えの(例えば、細胞は、例えば遺伝子ノックインによって、形質導入されるまたは発現するように操作される)少なくとも1種の構築物を含み得る。そのような構築物は、それらに限定されないが、環状AMPホスホジエステラーゼおよびドミナントネガティブ形質転換成長因子ベータ(TGFベータ)受容体IIであり得る。改変免疫応答性細胞、改変T細胞、または改変T細胞の集団は、前記細胞の細胞溶解活性に対して正の効果を有するサイトカインを放出するように操作され得る。そのようなサイトカインは、それらに限定されないが、インターロイキン-7、インターロイキン-15、およびインターロイキン-21を含む。
特異的結合TCR/CAR
本発明によれば、改変免疫応答性細胞、例えば改変T細胞は、任意選択で、本明細書に記載されるがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原を発現するまたは提示する、疾患状態またはがん性状態に罹患している対象、患者、またはがん患者の腫瘍細胞および/もしくは組織ならびに/またはがん細胞および/もしくは組織に結合するか、または特異的に結合する異種TCRまたはCARを発現するように改変され得る。対象、患者、またはがん患者は、その後、本発明に従った改変免疫応答性細胞もしくは改変T細胞またはその集団を用いて治療され得る。改変免疫応答性細胞または改変T細胞を用いた本発明に従った治療に対して適切ながん患者は、腫瘍および/またはがんを有する個体または対象から腫瘍および/またはがん細胞のサンプルを獲得するステップ;ならびに改変免疫応答性細胞によって発現されるTCRまたはCARに結合するものとしてがん細胞を同定するステップを含む方法によって同定され得る。
本発明によれば、異種TCRまたはCARは、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に結合するか、または特異的に結合する。本発明によれば、異種TCRまたはCARは、がん性状態と関連し、かつ/または腫瘍もしくはがん細胞もしくは組織によって提示された、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に結合するか、または特異的に結合する。
本発明によれば、がん性状態は、胃食道がんおよび/または腫瘍であり得る。特異性は、異種TCRまたはCARと、特異的標的がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原との間の結合の強度を記載し、受容体-リガンドシステムに関する結合および非結合状態間の比である解離定数Kdによって記載され得る。付加的に、異種TCRまたはCARが結合し得る異なるがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原が少なければ少ないほど、その結合特異性は大きくなる。
本発明によれば、異種TCRまたはCARは、10、9、8、7、6、5、4、3、2種未満の異なるがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に結合し得る。
本発明によれば、異種TCRまたはCARは、任意選択で6.5~6.9または7.0~7.5のpHで、任意選択で25℃で、任意選択で表面プラズモン共鳴を用いて測定される、0.01μM~100μM、0.01μM~50μM、0.01μM~20μM、0.05μM~20μM、もしくは0.01、0.02、0.03、0.04、0.05、0.06、0.07、0.08、0.09、0.1μM、0.15μM、0.2μM、0.25μM、0.3μM、0.35μM、0.4μM、0.45μM、0.5μM、0.55μM、0.6μM、0.65μM、0.7μM、0.75μM、0.8μM、0.85μM、0.9μM、0.95μM、1.0μM、1.5μM、2.0μM、2.5μM、3.0μM、3.5μM、4.0μM、4.5μM、5.0μM、5.5μM、6.0μM、6.5μM、7.0μM、7.5μM、8.0μM、8.5μM、9.0μM、9.5μM、10.0μM;または10μM~1000μM、10μM~500μM、50μM~500μM、もしくは10、20、30、40、50、60、70、80、90、100μM、150μM、200μM、250μM、300μM、350μM、400μM、450μM、500μMの解離定数で、例えばMAGE A4またはその抗原ペプチド、例えばヒトMAGE A4もしくは配列番号1のMAGE A4またはその抗原ペプチドに、あるいは配列番号2、GVYDGREHTVを含むかまたはそれからなる抗原ペプチドに結合し得る。解離定数Kまたはkoff/konは、解離速度定数koffおよび会合速度定数konを実験的に測定することによって判定され得る。TCR解離定数は、TCRの可溶性形態を使用して測定され得、TCRは、TCRアルファ鎖可変ドメインおよびTCRベータ鎖可変ドメインを含む。したがって、本発明に従った使用のための異種TCRまたはCARは、例えば50μM、100μM、200μM、500μM等の0.01μM~100μM、好ましくは0.05μM~20.0μMの解離定数で、任意選択でペプチド提示分子、例えばHLAと、例えばHLA-A*02またはHLA-A*0201と複合体を形成して、代替的にはペプチド提示分子と複合体を形成する提示なしで、GVYDGREHTV、配列番号2を呈示するHLAに効率的にかつ/または高い親和性で結合し得る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞、例えば改変T細胞は、任意選択でがん性状態と関連し、かつ/または、腫瘍またはがん細胞もしくは組織によって提示された、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に特異的に結合し得、かつ/または高い親和性で結合し得る異種TCRまたはCARを含み得;任意選択で、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原は、任意選択でペプチド提示分子、例えばHLAと、例えばHLA-A*02またはHLA-A*0201と複合体を形成して、代替的にはペプチド提示分子、例えばHLAと複合体を形成する提示なしで(すなわち、MAGE-A4もしくはそのペプチド抗原、またはGVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE A4のペプチド抗原は、ペプチド提示分子とは無関係に提示され得る)、異種TCRまたはCARによって認識される。例えば、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原は、MAGE A4またはその抗原ペプチド、例えばヒトMAGE A4もしくは配列番号1のMAGE A4またはその抗原ペプチド、あるいは配列番号2、GVYDGREHTVを含むか、またはそれからなる抗原ペプチドである。
本発明によれば、異種T細胞受容体(TCR)またはCAR、および異種T細胞受容体(TCR)またはCARを含む改変免疫応答性細胞は、内因的に発現された腫瘍細胞表面、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に結合する特性を有し得、任意選択で、結合は、ペプチド提示または抗原提示分子、例えば主要組織適合性複合体(MHC)またはヒト白血球抗原(HLA)または主要組織適合性複合体クラス関連タンパク質(MR)1との複合体としての細胞表面抗原の提示とは無関係である。例えば、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原は、MAGE A4またはその抗原ペプチド、例えばヒトMAGE A4もしくは配列番号1のMAGE A4またはその抗原ペプチド、あるいは配列番号2、GVYDGREHTVを含むか、またはそれからなる抗原ペプチドである。
本発明によれば、TCRまたはCAR結合は、任意選択で、密接に関連したがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはペプチド抗原配列と比較して、1種のがんおよび/または腫瘍抗原、例えばヒトMAGE A4もしくは配列番号1のMAGE A4またはその抗原ペプチド、あるいは配列番号2、GVYDGREHTVを含むか、またはそれからなる抗原ペプチドに特異的であり得る。密接に関連したがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはペプチド抗原配列は、同程度もしくは同一の長さのものであり得、かつ/または同程度の数もしくは同一の数のアミノ酸残基を有し得る。密接に関連したペプチド抗原配列は、50もしくは60もしくは70もしくは80~90%の同一性、好ましくは80~90%の同一性を共有し得、かつ/または1、2、3、もしくは4個のアミノ酸残基だけ異なり得る。密接に関連したペプチド配列は、該配列を含むか、または配列GVYDGREHTV、配列番号2を有するポリペプチド配列に由来し得る。
結合親和性は、平衡法(例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)または放射免疫アッセイ(RIA))または動態(例えば、BIACORE(商標)解析)によって判定され得る。結合力とは、例えば相互作用の価数を考慮に入れた、2種の分子の互いへの複数の部位での結合の強度の総計である。本発明によれば、免疫応答性細胞は、異種TCRもしくはCARを欠くまたは代替的な異種TCRもしくはCARを有する免疫応答性細胞と比較して、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原、あるいは、腫瘍またはがん細胞もしくは組織によって提示され、かつ異種TCRもしくはCARによって認識されるがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原への親和性および/あるいは結合力の向上を示し得る。
選択的結合TCR/CAR
本発明によれば、異種TCRまたはCARは、任意選択でがん性状態と関連した、かつ/または、腫瘍またはがん細胞もしくは組織によって提示された、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に選択的に結合し得;任意選択で、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原は、任意選択でペプチド提示分子、例えば主要組織適合性複合体(MHC)またはHLA、任意選択でクラスIまたはIIと、例えばHLA-A2、またはHLA-A*02、HLA-A*02:01、HLA-A*02:02、HLA-A*02:03、HLA-A*02:04、HLA-A*02:05、HLA-A*02:06、HLA-A*02:642、もしくはHLA-A*02:07、好ましくはHLA-A*02:01もしくはHLA-A*0から選択されるものと複合体を形成して;代替的には、好ましくは腫瘍細胞またはがん細胞もしくは組織によって発現されるペプチド提示分子またはHLAと複合体を形成する提示なしで、異種TCRまたはCARによって認識される。好ましくは、がん性状態は、胃食道がんおよび/または腫瘍である。
選択的結合とは、異種TCRまたはCARが、別のものと比較して、1種のがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原により高い親和性で結合することを表す。選択的結合は、異種TCRまたはCARとの複合体における一方のリガンド抗原のもう一方のリガンド抗原による置き換えに対する平衡定数によって表される。
本発明によれば、がん性状態は、胃食道がんおよび/または腫瘍であり得る。
特異的/選択的結合TCR/CAR
本発明によれば、異種TCRまたはCAR結合は、MAGE-A4またはそのペプチド抗原であり得るがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に選択的であり、かつ/または特異的である。好ましくは、腫瘍抗原はMAGE-A4またはそのペプチド抗原である。好ましくは、がんおよび/または腫瘍抗原ペプチドは、アミノ酸配列GVYDGREHTV、配列番号2を含むかまたは有する。本発明によれば、異種TCRまたはCARは、ペプチド提示分子、例えばがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原を提示するかまたは呈示するHLA、すなわちがんおよび/または腫瘍抗原のペプチドフラグメント(pHLA)に結合し得、かつ/または特異的に結合し得、かつ/または選択的に結合し得、HLAは、すべてがHLAクラスIもしくはその特異的アレルであるMHCクラスI(A、B、およびC)に相当するか、またはHLAは、MHCクラスII(DP、DM、DO、DQ、およびDR)もしくはその特異的アレルに相当し、好ましくはHLAはクラス1であり、好ましくはアレルは、HLA-A2もしくは HLA-A*02またはHLA-A2+もしくは HLA-A*02陽性HLA、好ましくはHLA-*0201である。好ましくは、HLAは、HLA-A*02:07PでもHLA-A*02ヌルでもない。代替的に、異種TCRまたはCARは、HLAによって提示されないかまたは呈示されないがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に結合し得、かつ/または特異的に結合し得、かつ/または選択的に結合し得る。
好ましくは、異種TCRまたはCARは、免疫応答性細胞によって天然に発現されない(すなわち、TCRまたはCARは外因性または異種である)。異種TCRはαβTCRヘテロ二量体を含み得る。異種TCRまたはCARは、組み換えまたは合成または人工のTCRまたはCAR、すなわち天然に存在しないCARまたはTCRであり得る。例えば、異種TCRは、特異的ながんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に対するその親和性または結合力を増加させるように操作され得る(すなわち、親和性増強TCRまたは特異的ペプチド増強親和性受容体(SPEAR)TCR)。親和性増強TCRまたは(SPEAR)TCRは、天然に存在するTCRと比べて、1つまたは複数の変異、例えばTCRαおよびβ鎖の可変領域の超可変相補性決定領域(CDR)における1つまたは複数の変異を含み得る。これらの変異は、任意選択で腫瘍および/またはがん細胞および/または組織によって発現された場合、がんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原のペプチドフラグメントに対する、あるいはがんおよび/または腫瘍抗原のペプチドフラグメントを呈示するMHCに対するTCRの親和性を増加させ得る。親和性増強または成熟TCRを作出する適切な方法は、ファージまたは酵母ディスプレイを使用したTCR変異体のライブラリーをスクリーニングするステップを含み、当技術分野において周知である(例えば、Robbins et al J Immunol (2008) 180(9):6116;San Miguel et al (2015) Cancer Cell 28 (3) 281-283;Schmitt et al (2013) Blood 122 348-256;Jiang et al (2015) Cancer Discovery 5 901を参照されたい)。好ましい親和性増強TCRは、MAGEファミリーのがんおよび/または腫瘍抗原、例えばMAGE A4またはそのペプチド抗原、例えば配列GVYDGREHTV、配列番号2を含むかまたはそれからなるそのペプチドを発現する腫瘍またはがん細胞に結合し得る。
本発明によれば、異種TCRは、配列番号5のα鎖参照アミノ酸配列またはそのバリアントおよび配列番号7のβ鎖参照アミノ酸配列またはそのバリアントを含み得るMAGE A4 TCRであり得る。バリアントは、参照アミノ酸配列と(例えば、α鎖参照配列および/またはβ鎖参照配列のいずれかに対して)、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し得る。TCRは、配列番号6のα鎖参照ヌクレオチド配列またはそのバリアントおよび配列番号8のβ鎖参照ヌクレオチド配列またはそのバリアントによってコードされ得る。バリアントは、参照ヌクレオチド配列と(例えば、α鎖参照配列および/またはβ鎖参照配列のいずれかに対して)、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を有し得る。
本発明によれば、TCRは、TCRアルファ鎖可変ドメインおよびTCRベータ鎖可変ドメインを含み得、
(i)アルファ鎖可変ドメインは、配列
VSPFSN(αCDR1)、配列番号11、または配列番号5のアミノ酸残基48~53、
LTFSEN(αCDR2)、配列番号12、または配列番号5のアミノ酸残基71~76、および
CVVSGGTDSWGKLQF(αCDR3)、配列番号13、または配列番号5のアミノ酸残基111~125
を有するCDRを含み、かつ/あるいは
(ii)ベータ鎖可変ドメインは、配列
KGHDR(βCDR1)、配列番号14、もしくは配列番号7のアミノ酸残基46~50、
SFDVKD(βCDR2)、配列番号15、もしくは配列番号7のアミノ酸残基68~73、および
CATSGQGAYEEQFF(βCDR3)、配列番号16、もしくは配列番号7のアミノ酸残基110~123、または、それぞれそれと少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性、任意選択でそれと100%の配列同一性を有する配列
を有するCDRを含む。
したがって、TCRは、アルファ鎖可変ドメインが、配列番号9と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列、または配列番号6のアミノ酸残基1~136の配列を含み、かつ/あるいはベータ鎖可変ドメインが、配列番号10と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%もしくは100%の同一性を有するアミノ酸配列、または配列番号7のアミノ酸残基1~133の配列を含む、TCRを含み得る。
「親TCR」または「前駆体TCR」という用語は、それぞれ配列番号5および7のMAGE A4 TCR α鎖およびMAGE A4 TCR β鎖を含むTCRを指すために本明細書において使用される。前駆体TCRよりも、ペプチド-HLA複合体に対して、等しい、等価の、もしくはより高い親和性および/または等しい、等価の、もしくはより遅いオフ速度を有する、前駆体TCRと比べて変異しているかまたは改変されているTCRを提供することが望ましい。本発明によれば、異種TCRは、前駆体TCRと比べて、アルファ鎖可変ドメインおよび/またはベータ鎖可変ドメインに存在する1個を上回る変異を有し得、「操作されたTCR」または「変異体TCR」と表され得る。これらの変異は、MAGE A4またはそのペプチド抗原に対する結合親和性および/または特異性および/または選択性および/または結合力を向上させ得る。ある特定の実施形態において、アルファ鎖可変ドメインに1、2、3、4、5、6、7、もしくは8個の変異、例えば4もしくは8個の変異、および/またはベータ鎖可変ドメインに1、2、3、4、もしくは5個の変異、例えば5個の変異がある。一部の実施形態において、本発明のTCRのα鎖可変ドメインは、配列番号9のアミノ酸残基の配列と少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。一部の実施形態において、本発明のTCRのβ鎖可変ドメインは、配列番号10のアミノ酸残基の配列と少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。
本発明によれば、異種TCRは、アルファ鎖可変ドメインが、配列番号9、または配列番号5のアミノ酸残基1~136のアミノ酸配列、あるいはそのアミノ酸残基1~47、54~70、77~110、および126~136が、配列番号9のそれぞれアミノ酸残基1~47、54~70、77~110、および126~136の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有し、かつ/またはそれぞれアミノ酸残基48~53、71~76、および111~125、CDR1、CDR2、CDR3が、配列番号9のそれぞれアミノ酸残基48~53、71~76、および111~125、CDR1、CDR2、CDR3の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、もしくは99%の同一性を有する、アミノ酸配列を含む、TCRを含み得る。
本発明によれば、TCRは、アルファ鎖可変ドメインにおいて、配列の:
(i)そのアミノ酸残基1~47が、(a)配列番号9のアミノ酸残基1~47の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または(b)配列番号9の残基1~47と比べて、挿入されたもしくは欠失した1、2、もしくは3個のアミノ酸残基を有し得、
(ii)アミノ酸残基48~53が、VSPFSN、CDR1、配列番号11、もしくは配列番号9のアミノ酸残基48~53であり、
(iii)そのアミノ酸残基54~70が、(a)配列番号9のアミノ酸残基54~70の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または(b)配列番号9のアミノ酸残基54~70の配列と比べて、挿入されたもしくは欠失した1、2、もしくは3個のアミノ酸残基を有し得、
(iv)アミノ酸残基71~76が、LTFSEN、CDR2、配列番号12、もしくは配列番号9のアミノ酸残基71~76であり得、
(v)そのアミノ酸残基77~110が、配列番号9のアミノ酸残基77~110の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または配列番号9のアミノ酸残基77~110の配列と比べて、1、2、もしくは3個の挿入、欠失、もしくは置換を有し得、
(vi)アミノ酸残基111~125が、CVVSGGTDSWGKLQF、CDR3、配列番号13、もしくは配列番号9のアミノ酸残基111~125であり得、
(vii)そのアミノ酸残基126~136が、配列番号9のアミノ酸残基126~136の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または配列番号9のアミノ酸残基126~136の配列と比べて、1、2、もしくは3個の挿入、欠失、もしくは置換を有し得る、
TCRを含み得る。
本発明によれば、TCRは、ベータ鎖可変ドメインが、配列番号10のアミノ酸配列、またはそのアミノ酸残基1~45、51~67、74~109、124~133が、配列番号10のそれぞれアミノ酸残基1~45、51~67、74~109、124~133の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し、かつアミノ酸残基46~50、68~73、および110~123が、配列番号10のそれぞれアミノ酸残基46~50、68~73、および110~123、CDR1、CDR2、CDR3の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有する、アミノ酸配列を含む、TCRを含み得る。
本発明によれば、TCRは、ベータ鎖可変ドメインにおいて、配列の:
(i)そのアミノ酸残基1~45が、(a)配列番号10のアミノ酸残基1~45の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または(b)配列番号10の残基1~45と比べて、挿入されたもしくは欠失した1、2、もしくは3個のアミノ酸残基を有し得、
(ii)アミノ酸残基46~50が、KGHDR、CDR1、配列番号14、もしくは配列番号10のアミノ酸残基46~50であり、
(iii)そのアミノ酸残基51~67が、(a)配列番号10のアミノ酸残基51~67の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または(b)配列番号10のアミノ酸残基51~67の配列と比べて、挿入されたもしくは欠失した1、2、もしくは3個のアミノ酸残基を有し得、
(iv)アミノ酸残基68~73が、SFDVKD、CDR2、配列番号15、もしくは配列番号10のアミノ酸残基68~73であり得、
(v)そのアミノ酸残基74~109が、配列番号10のアミノ酸残基74~109の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または配列番号10のアミノ酸残基74~109の配列と比べて、1、2、もしくは3個の挿入、欠失、もしくは置換を有し得、
(vi)アミノ酸残基110~123が、CATSGQGAYEEQFF、CDR3、配列番号16、もしくは配列番号10のアミノ酸残基110~123であり得、
(vii)そのアミノ酸残基124~133が、配列番号10のアミノ酸残基124~133の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または配列番号10のアミノ酸残基124~133の配列と比べて、1、2、もしくは3個の挿入、欠失、もしくは置換を有し得る、
TCRを含み得る。
本発明によれば、TCRは、配列番号9のアルファ鎖可変ドメインおよび/または配列番号10のベータ鎖可変ドメインを含むTCRを含み得る。本発明によれば、TCRは、配列番号5のアルファ鎖および/または配列番号7のベータ鎖を含むTCRを含み得る。
アミノ酸およびヌクレオチド配列同一性は、一般的に、アルゴリズムGAP(GCG Wisconsin Package(商標)、Accelrys、San Diego CA)を参照して規定される。GAPは、合致の数を最大限に高め、かつギャップの数を最小限に抑える、Needleman&Wunschアルゴリズム(J. Mol. Biol. (48): 444-453 (1970))を使用して、2種の完全な配列をアラインする。一般的に、ギャップ創出ペナルティ=12およびギャップ伸長ペナルティ=4を用いた、初期設定パラメーターが使用される。GAPの使用が好まれ得るが、他のアルゴリズム、例えば、一般的に初期設定パラメーターを採用した、BLAST、psiBLAST、もしくはTBLASTN(Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215: 405-410の方法を使用する)、FASTA(Pearson and Lipman (1988) PNAS USA 85: 2444-2448の方法を使用する)、またはSmith-Watermanアルゴリズム(Smith and Waterman (1981) J. Mol Biol. 147: 195-197)を使用し得る。
特定のアミノ酸バリアントは、1個のアミノ酸、2、3、4、5~10、10~20、または20~30個のアミノ酸の挿入、付加、置換、または欠失の分、参照配列と異なり得る。一部の実施形態において、バリアント配列は、挿入された、欠失した、または置換された1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個、またはそれを上回る残基を有する参照配列を含み得る。例えば、最高15個、最高20個、最高30個、または最高40個の残基が挿入され得るか、欠失し得るか、または置換され得る。
一部の好ましい実施形態において、バリアントは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個、またはそれを上回る保存的置換の分、参照配列と異なり得る。保存的置換は、同様の特性を有する異なるアミノ酸でのアミノ酸の置き換えを伴う。例えば、脂肪族残基は別の脂肪族残基によって置き換えられ得るか、非極性残基は別の非極性残基によって置き換えられ得るか、酸性残基は別の酸性残基によって置き換えられ得るか、塩基性残基は別の塩基性残基によって置き換えられ得るか、極性残基は別の極性残基によって置き換えられ得るか、または芳香族残基は別の芳香族残基によって置き換えられ得る。保存的置換は、例えば、以下の群内のアミノ酸間のものであり得る:
アラニンおよびグリシン;
グルタミン酸、アスパラギン酸、グルタミン、およびアスパラギン
アルギニンおよびリジン;
アスパラギン、グルタミン、グルタミン酸、およびアスパラギン酸
イソロイシン、ロイシン、およびバリン;
フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファン
セリン、トレオニン、およびシステイン。
CD8α共受容体
本発明によれば、異種TCRまたはCARを発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞は、異種共受容体をさらに発現または提示し得る(例えば、細胞は、例えば遺伝子ノックインによって、共受容体をコードする核酸配列を形質導入されるまたはそれを含むように操作される)。異種共受容体はCD8共受容体であり得る。CD8共受容体は、CD8-αおよびCD8-β鎖またはCD8-αおよびCD8-α鎖を含む、CD8鎖の二量体またはペアを含み得る。好ましくは、CD8共受容体は、CD8-αおよびCD8-α鎖を含むCD8αα共受容体である。CD8α共受容体は、配列番号3と少なくとも80%の同一性のアミノ酸配列、配列番号3、またはそのバリアントを含み得る。CD8α共受容体はホモ二量体であり得る。好ましくは、異種TCRまたはCARを発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞は、本明細書に規定されるCD8共受容体である異種共受容体をさらに発現するまたは提示する(例えば、細胞は、例えば遺伝子ノックインによって、共受容体をコードする核酸配列を形質導入されるまたはそれを含むように操作される)。
CD8共受容体は、クラス1MHCに結合し、TCRシグナル伝達を強化する。本発明によれば、CD8共受容体は、配列番号3の参照アミノ酸配列を含み得るか、またはそのバリアントであり得る。バリアントは、参照アミノ酸配列の配列番号3と少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を有し得る。CD8共受容体は、配列番号4の参照ヌクレオチド配列によってコードされ得るか、またはそのバリアントであり得る。バリアントは、参照ヌクレオチド配列の配列番号4と少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、または少なくとも99%の配列同一性を有するヌクレオチド配列を有し得る。
本発明によれば、異種CD8共受容体は、Ig様V型ドメインに、配列;
(i)VLLSNPTSG、CDR1、配列番号17、もしくは配列番号3のアミノ酸残基45~53、
(ii)YLSQNKPK、CDR2、配列番号18、もしくは配列番号3のアミノ酸残基72~79、
(iii)LSNSIM、CDR3、配列番号19、もしくは配列番号3のアミノ酸残基80~117、
または、それと少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、もしくは99%の配列同一性を有する配列
を有するCDRを含む、CD8共受容体を含み得る。
本発明によれば、異種CD8共受容体は、配列番号3のアミノ酸配列の残基22~135、またはそのアミノ酸残基22~44、54~71、80~117、124~135が、配列番号3のそれぞれアミノ酸残基22~44、54~71、80~117、124~135、CDR1、CDR2、CDR3の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し、かつアミノ酸残基45~53、72~79、および118~123が、配列番号3のそれぞれアミノ酸残基45~53、72~79、および118~123の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはIg様V型ドメインに含む、CD8共受容体を含み得る。
本発明によれば、CD8共受容体は、配列の、またはIg様V型ドメインにおける配列の:
(i)そのアミノ酸残基22~44が、(a)配列番号3のアミノ酸残基22~44の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または(b)配列番号3の残基22~44と比べて、挿入されたもしくは欠失した1、2、もしくは3個のアミノ酸残基を有し得、
(ii)アミノ酸残基45~53が、VLLSNPTSG、配列番号17、CDR1、もしくは配列番号3のアミノ酸残基45~53であり、
(iii)そのアミノ酸残基54~71が、(a)配列番号3のアミノ酸残基54~71の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または(b)配列番号3のアミノ酸残基54~71の配列と比べて、挿入されたもしくは欠失した1、2、もしくは3個のアミノ酸残基を有し得、
(iv)アミノ酸残基72~79が、YLSQNKPK、CDR2、配列番号18、もしくは配列番号3のアミノ酸残基72~79であり得、
(v)そのアミノ酸残基80~117が、配列番号3のアミノ酸残基80~117の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または配列番号3のアミノ酸残基80~117の配列と比べて、1、2、もしくは3個の挿入、欠失、もしくは置換を有し得;
(vi)アミノ酸残基118~123が、LSNSIM、CDR3、配列番号19、もしくは配列番号3のアミノ酸残基80~117であり得、
(vii)そのアミノ酸残基124~135が、配列番号3のアミノ酸残基124~135の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、もしくは95%の同一性を有し得るか、または配列番号3のアミノ酸残基124~135の配列と比べて、1、2、もしくは3個の挿入、欠失、もしくは置換を有し得る、
CD8共受容体を含み得る。
異種CD8共受容体を発現する改変免疫応答性細胞は、異種CD8共受容体を発現しない改変免疫応答性細胞と比べて、任意選択でHLA上に提示された場合の抗原ペプチド、腫瘍またはがん抗原に対してまたはそれによる刺激時に、本明細書に開示されるアッセイによって判定可能な親和性および/もしくは結合力の向上ならびに/またはT細胞活性化の向上を示し得る。改変免疫応答性細胞の異種CD8は、MHCと相互作用し得るか、または特異的に結合し得、MHCは、クラスIもしくはクラスII、好ましくはクラスI主要組織適合性複合体(MHC)、HLA-I分子であり得るか、またはMHCクラスI HLA-A/B2M二量体を有するものであり得、好ましくはCD8-αは、好ましくはCD8のIgV様ドメインを介して、クラスI MHCのα部分(残基223~229)と相互作用する。したがって、異種CD8は、異種CD8を欠く免疫応答性細胞と比較して、任意選択で抗原提示細胞、樹状細胞、および/または腫瘍もしくはがん細胞、腫瘍もしくはがん組織の表面での、HLA pMHCIまたはpHLAによって結合されたかまたは提示されたHLAおよび/または抗原ペプチドへの免疫応答性細胞のTCR結合を向上させる。したがって、異種CD8は、異種CD8を欠く細胞と比較して、任意選択で抗原提示細胞、樹状細胞、および/または腫瘍もしくはがん細胞、または腫瘍もしくはがん組織の表面での、免疫応答性細胞の細胞(TCR)/ペプチド-主要組織適合性複合体クラスI(pMHCI)相互作用のオフ速度(koff)、それゆえその半減期を向上させ得るか、または増加させ得、それによって、ライゲーション親和性および/または結合力の向上も提供し得る。異種CD8は、免疫応答性細胞表面でTCRを組織化することを向上させて、pHLA結合における共同性を可能にし得、治療的結合力の向上を提供し得る。したがって、異種CD8共受容体改変免疫応答性細胞は、亜鉛依存的様式でLCK(リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ)に結合し得るか、または相互作用し得、NFAT、NF-κB、およびAP-1のような転写因子の活性化につながる。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、異種CD8共受容体を欠く免疫応答性細胞と比較して、任意選択でがん細胞または組織の腫瘍によって提示されるがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原に任意選択で応答して、CD40Lの発現、サイトカイン産生、細胞傷害活性、樹状細胞成熟の誘導、または樹状細胞サイトカイン産生の誘導の向上または増加を有し得る。
療法
胃食道がんおよび/または腫瘍は、食道、胃-食道接合部、または胃のがんおよび/または腫瘍、すなわち胃がんを包含する。
本発明によれば、がんおよび/または腫瘍は、胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば食道がん、癌腫、または腫瘍であり得、それは、原発性、続発性、再発性、転移性、または進行性であり得る。好ましくは、食道がん、癌腫、または腫瘍は、任意選択で胃食道逆流性疾患GERDまたはバレット食道と関連した、食道扁平上皮細胞癌(ESCC)、食道腺癌(EAC)、または食道胃接合部がん、癌腫、腺癌、もしくは腫瘍(EGJ)のうちのいずれか1種から選択され得る。
したがって、がんおよび/または腫瘍は、胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば食道扁平上皮細胞癌、または平滑筋肉腫、悪性黒色腫、横紋筋肉腫、もしくはリンパ腫等の非上皮腫瘍であり得る。
したがって、がんおよび/または腫瘍は、胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば上部、中部、または下部接合部食道がん、癌腫、または腫瘍であり得る。
したがって、がんおよび/または腫瘍は、胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば、リンパ節を伴うか、または例えばリンパ節、肝臓、肺、骨、もしくは頭頸部がんに転移している食道がん、癌腫、または腫瘍であり得る。
したがって、それは、胃食道がんおよび/または腫瘍であり得、例えばかつ/あるいは食道がんおよび/もしくは腫瘍、癌腫、または腫瘍は、MAGEタンパク質、ペプチド、抗原、またはそのペプチド抗原、任意選択で本明細書に記載されるMAGE-A4タンパク質、ペプチド、抗原、またはそのペプチド抗原を発現し得る。本発明によれば、がんおよび/または腫瘍は、任意選択で白金含有化学療法の後に疾患進行を有し、任意選択で本明細書に記載されるMAGE-A4タンパク質、ペプチド、抗原、またはそのペプチド抗原(例えば、GVYDGREHTV、配列番号2を含む、MAGE A4のペプチド抗原)を発現する、再発性または転移性HNSCCであり得る。
食道胃接合部がんが下部接合部食道がんである場合、それは、胃に広がる高い可能性を有する。したがって、本発明によれば、がんは、胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば胃(stomach)または胃(gastric)がん、癌腫、または腫瘍であり得、それは、原発性、続発性、再発性、転移性、または進行性であり得る。
好ましくは、胃(stomach)または胃(gastric)がん、癌腫、または腫瘍は、胃癌、胃腺癌、胃リンパ腫、節外性辺縁帯B細胞リンパ腫(MALT型)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、胃の間葉腫瘍、遺伝性びまん性胃がんのうちのいずれか1種から選択され得る。
したがって、がんは、胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば、リンパ節を伴うか、または例えば肝臓、肺、骨、腹部の内膜、およびリンパ節に転移している胃(stomach)または胃(gastric)がん、癌腫、または腫瘍であり得る。
したがって、胃(stomach)または胃(gastric)がん、癌腫、または腫瘍は、MAGEタンパク質、ペプチド、抗原、またはそのペプチド抗原、任意選択で本明細書に記載されるMAGE-A4タンパク質、ペプチド、抗原、またはそのペプチド抗原を発現し得る。本発明によれば、がんは、任意選択で白金含有化学療法の後に疾患進行を有し、任意選択で本明細書に記載されるMAGE-A4タンパク質、ペプチド、抗原、またはそのペプチド抗原(例えば、GVYDGREHTV、配列番号2を含む、MAGE A4のペプチド抗原)を発現する、再発性または転移性HNSCCであり得る。
標準ケア
胃食道がんおよび/または腫瘍は、食道、胃-食道接合部、または胃のがんおよび/または腫瘍、すなわち胃がんを包含する。
任意選択で食道胃接合部(EGJ)がんおよび/または腫瘍を含む、胃食道がんおよび/または腫瘍に対する標準ケアは、全身性白金ベース化学療法であり得、シスプラチンまたはカルボプラチン化学療法治療、代替的にシスプラチン、フルオロウラシル、およびロイコボリン、またはシスプラチンおよびエトポシド、またはカルボプラチンおよびパクリタキセル、またはシスプラチンおよびカペシタビンの組み合わせのうちのいずれか、代替的に白金フルオロピリミジンダブレットおよび任意選択でアントラサイクリンから選択され得る。代替的に、標準ケアは、ECF(エピルビシン、シスプラチン、5-FU)、ECX(エピルビシン、シスプラチン、カペシタビン)、EOF(エピルビシン、オキサリプラチン、5-FU)、およびEOX(エピルビシン、オキサリプラチン、カペシタビン)のうちのいずれか1種を用いた治療から選択され得る。
代替的に、標準ケアは、ラパチニブ、FLOT/FOLFIRI化学療法、5-フルオロウラシル、エピルビシン、エトポシド、ドセタキセル、オキサリプラチン、カペシタビンもしくはイリノテカン、イホスファミド、マイトマイシン(mytomycin)C、ビンデシン、ビンブラスチン、エトポシド、ゲムシタビン、またはパクリタキセル(タキソール)もしくはドセタキセル等のタキサンのうちのいずれか1種を用いた治療から選択され得る。代替的に、標準ケアは、例えば、トラスツズマブ、ラパチニブ、またはペルツズマブ(pertuzamab)のうちのいずれか等のヒト上皮成長因子受容体2(HER2)阻害剤、あるいは例えばラムシルマブまたはベバシズマブ等の血管内皮成長因子(VEGF)阻害剤、あるいはパニツムマブまたはセツキシマブ等のEGFR阻害剤抗体、あるいはオナルツズマブまたはリロツムマブ等のヒト肝細胞成長因子HGFおよび/またはMet阻害剤、あるいはニボルマブ、ペムブロリズマブ、アベルマブ、アテゾリズマブ、またはセツキシマブ等のPD1、PD-L1阻害剤、あるいはフルオロウラシル、メトトレキサート、シスプラチン、カルボプラチン、またはパクリタキセル(タキソール)もしくはドセタキセル等のタキサンのうちのいずれか1種との組み合わせでのセツキシマブを用いた標的療法から選択され得る。
したがって、本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用は、プラセボ治療と比較して、または治療なしと比較して、または治療前と比較して、または標準ケアを含む治療と比較して、対象におけるMAGE-A4発現または濃度の低下を提供する。
疾患バイオマーカー
本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用および/またはキットは、治療前の疾患バイオマーカー発現もしくは濃度と比較して、またはプラセボ治療もしくは治療なしと比較して、または標準ケアを含む治療と比較して、発現または濃度の対象疾患バイオマーカー変化によって判定される、対象における胃食道がんおよび/または腫瘍の治療、阻止、またはその進行の遅延を提供する。
ベースライン(治療前)からの疾患バイオマーカーレベルの変化は、治療への応答と相関し、がんおよび/または腫瘍治療の治療効力および成功に相当する。
胃食道がんの疾患バイオマーカーは、糖鎖抗原(CA)72-4、CA19-9糖脂質抗原、アルファ-フェトプロテイン、糖鎖抗原(CA)12-5、SLE、BCA-225、hCG、ペプシノーゲンI/II、癌胎児性抗原(CEA)、HER2がん原遺伝子、CD44、またはCA19-9のうちのいずれか1種または複数を含み得、それは、胃食道がんおよび/または腫瘍に対して臨床業務において頻繁に使用されるバイオマーカーである。
胃食道がんの疾患バイオマーカーは、VEGF-Aまたはアンジオポエチン-2(Ang-2)の発現レベルまたは血漿レベル、EGFR、間葉上皮転換因子受容体(MET)、肝細胞成長因子(HGF)、FGFR1、FGFR2、FGFR3、およびFGFR4(線維芽細胞成長因子受容体)のうちのいずれかの過剰発現または遺伝子増幅、FGFRの遺伝子増幅は、受容体過剰発現、染色体転座、および点変異、またはキナーゼ活性の増強を誘導する、PD-1、PD-L1の発現レベル、プログラム死リガンド1および2(PD-L1/2)のレベルの上昇、TP53、PTEN、ARID1A、APC、CTNNB1、CDH1、PI3KCA、およびKMT2C等、胃食道がんおよび/または腫瘍における公知のがん関連遺伝子における遺伝子変異のうちのいずれか1つも含み得る。
胃食道がんおよび/または腫瘍の疾患バイオマーカーは、以下の遺伝子(腫瘍シリーズ)TP53、ELMO1、DOCK2、CDKN2A、ARID1A、SMAD4、PIK3CA、KRAS、HER2、EGFR、CND1、METのうちのいずれかにおける遺伝子変異、欠失、またはコピー数変更のうちのいずれか1つまたは複数からも選択され得る。
EBV陽性亜型胃食道がんおよび/または腫瘍バイオマーカーは、CXXC4、TIMP2、およびPLXND1のうちのいずれかを含み得る。COL9A2、EYA1、およびZNF365は、EBV陽性、またはBMP(骨形成タンパク質)の体細胞変異、またはJAK2、MET、ERBB2、PIK3CAのうちのいずれかの増幅もしくは変異、またはARID1AもしくはBCOにおける変異において高度にメチル化される。
胃食道がんおよび/または腫瘍の疾患バイオマーカーは、CXCケモカイン受容体2(CXCR2)発現もしくはmRNA発現、CCケモカイン受容体4(CCR4)発現もしくはmRNA発現、CCケモカイン受容体7(CCR7)発現もしくはmRNA発現、腫瘍細胞由来DNAにおけるヘテロ接合性の検出された喪失、シトシン-リン酸-グアニン(CpG)リッチなプロモーター領域の過剰メチル化の存在もしくはレベル、メタロプロテイナーゼ発現、例えばMMP-1またはゼラチナーゼのMMP-2もしくはMMP-9またはストロメライシン、MMP-3およびMMP-10、インターロイキンIL-6およびIL-8レベルもしくは発現、MAGE-A1、2、3、4、5、6、サイトケラチン(例えば、CK6、16、または17)の発現、またはアクチンもしくはミオシン濃度もしくは発現レベル、真核生物翻訳因子4E(eIF4E)の過剰発現、DNA修復遺伝子、例えばヌクレオチド除去修復(NER)群のものにおける変異レベルのうちのいずれか1つまたは複数からも選択され得る。
胃食道がんおよび/または腫瘍の疾患バイオマーカーは、未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)転座の存在またはレベル、上皮成長因子受容体(EGFR)変異の存在またはレベル、Kirstenラット肉腫ウイルスがん遺伝子ホモログ(KRAS)変異の存在またはレベル、ヒト上皮成長因子受容体-2(HER2/neu)発現、B-Rafがん原遺伝子セリン/トレオニンキナーゼ(BRAF)変異の存在またはレベル、C-KITがん原遺伝子変異の存在またはレベル、MAGE-A1、2、3、4、5、6の発現、ヤヌスキナーゼ2(JAK2)変異の存在またはレベルのうちのいずれか1つまたは複数からさらに選択され得る。
胃食道がんおよび/または腫瘍のさらなる疾患バイオマーカーは、EML4-ALKチロシンキナーゼ融合、DNAメチル化の変更、ヒストン尾部修飾等のエピジェネティック変化、または腫瘍抑制の不活性化を引き起こすマイクロRNA調節、c-MET、NKX2-1、LKB1、PIK3CA、およびBRAFの変異および増幅のうちのいずれか1つを含み得る。
胃食道がんおよび/または腫瘍の疾患バイオマーカーは、循環腫瘍細胞(CTC)、セルフリーDNA、マイクロRNA、セルフリーRNA、および本明細書に記載される生物学的サンプル中を循環し得るエクソソーム等の細胞由来小胞も含み得る。CTCは、血流中を循環している播種性腫瘍細胞であり、それらの存在は、がんまたは進行性もしくは転移性疾患と臨床的に関連する。
本発明によれば、疾患バイオマーカーは、例えば本明細書に記載される対象の生物学的サンプルにおいて測定され得る。
生物学的サンプル
生物学的サンプルは、疾患バイオマーカーまたはがんもしくは腫瘍(例えば、胃食道がんおよび/または腫瘍、すなわち食道、胃-食道接合部、または胃のがんおよび/または腫瘍、すなわち胃がん)由来の細胞もしくは遺伝物質を含有し得る任意の対象または患者体液、例えば、循環腫瘍細胞(CTC)、セルフリーDNA、マイクロRNA、セルフリーRNA、およびエクソソーム等の細胞由来小胞を含有する、がんを有する患者または対象由来の、血液、血清、血漿、尿、組織、細胞、細胞培養物、唾液、痰、脳脊髄液、肺、鼻腔、気管支、気管支肺胞、食道胃管または消化管由来の洗浄物または流体、胃もしくは食道胃(esophagastric)洗浄液または胃液、末梢血サンプルであり得る。CTCは、血流中を循環している、原発性腫瘍または転移のいずれかに由来する、単細胞としての、またはそれほど多くはないが細胞クラスターとしての播種性腫瘍細胞である。CTCの存在は、他の疾患バイオマーカーのように、腫瘍および/またはがん、進行性もしくは転移性疾患と臨床的に関連する。例えば、胃食道がんおよび/または腫瘍において、疾患バイオマーカーまたはバイオマーカーまたはMAGE-A4もしくはそれに対する抗体は、生物学的サンプル、例えば体液、例えば食道胃管または消化管由来の流体、胃もしくは食道胃洗浄液または胃液において、MAGE-A4発現がんおよび/または腫瘍および/または組織のバイオマーカーとして検出され得る。
治療効果
血清サイトカインおよび可溶性因子解析ならびに腫瘍のT細胞浸潤
本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用は、治療前の血清サイトカインおよび/もしくはインターフェロンレベルもしくは濃度と比較して、またはプラセボ治療もしくは治療なしもしくは標準ケアを含む治療と比較して、対象における血清サイトカインおよび/またはインターフェロンレベルまたは濃度の増加を提供する。
したがって、本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用は、例えば、がんおよび/もしくは腫瘍またはがんおよび/もしくは腫瘍抗原に応答して免疫応答を誘発する能力によって測定される、がんおよび/または腫瘍免疫原性の向上または増強、例えばサイトカインおよび/またはインターフェロンの分泌の増加、T細胞増殖の増加、抗原応答性、標的細胞殺傷、T細胞活性化、CD28シグナル伝達、腫瘍のT細胞浸潤、樹状細胞により提示された抗原を認識しかつ結合する能力の増加によって判断される、治療もしくは介入の前のそのようなレベルと比べて、またはプラセボと比較して、または治療なしと比べて、または標準ケアを含む治療と比べて、例えば少なくとも10%、代替的に20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、120%、150%、200%、またはそれを上回る割合の増強を提供する。
がんの免疫療法の効力は、活性化された腫瘍特異的T細胞による腫瘍の浸潤によって条件付けられる。これらのT細胞の活性は、今度は、免疫抑制環境(例えば、調節性T細胞)の腫瘍における存在によって影響を受けるであろう。それゆえ、腫瘍の内側の「免疫ランドスケープ」についての直接評価は、T細胞免疫療法の効力をモニターするのに大きな価値があり、T細胞注入の前および後の腫瘍の免疫状態を評価する腫瘍生検によって定量化され得る。したがって、本発明は、治療前もしくは治療なしと比較して、または標準ケアを含む治療と比較して、例えばT-regのレベル、骨髄由来抑制細胞(MDSC)、PD-L1タンパク質発現、CCL3、IL8、IL1β、CXCL10、もしくはsIL2Rαから選択される血清サイトカインレベル、またはPD-1、CTLA-4、TIM-3、LAG-3、BTLA、もしくはTIGITから選択される阻害性受容体のレベルの低下によって判定される、腫瘍のT細胞浸潤の向上および/またはT細胞抑圧因子の低下を提供する。代替的に、治療前もしくは治療なしと比較して、または本明細書において前に記載される標準ケアを含む治療と比較して、インターフェロン-γ、インターロイキン-6、インターロイキン-10、サイトカイン産生、例えばIL-2、TNF-α、IFN-γ、およびグランザイムB、もしくはNK細胞等の自然免疫細胞、適応免疫細胞(CD4およびCD8)のレベルの増加、または例えばKi67発現レベルによって判断されるT細胞における増殖の向上から判定される。
腫瘍サイズおよび腫瘍量
本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用は、例えば腫瘍サイズまたは腫瘍数の測定によって判定される、治療前またはプラセボを用いた治療または治療なしまたは標準ケアを含む治療と比較して、腫瘍成長もしくは腫瘍成長速度を低下させるか、または治療の休止後に腫瘍サイズを維持するレベルまたは応答、あるいは腫瘍数または腫瘍量のレベルまたは応答の向上あるいは増強、好ましくは、治療前、プラセボを用いた治療、または治療なし、または標準ケアを含む治療と比べて、少なくとも10%、代替的に20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、120%、150%、200%、またはそれを上回る割合の向上または増強を提供する。好ましくは、レベルまたは応答の向上または増強は、レベルもしくは応答の継続的向上もしくは増強であり得、かつ/あるいは治療継続期間と少なくとも同じ継続期間、治療継続期間の長さの少なくとも1.5、2.0、2.5、もしくは3.0倍、またはそれを上回る割合を有し得る。そのようなレベルまたは応答の向上または増強は、RECIST 1.1測定[E.A. Eisenhauer., et.al., EUROPEAN JOURNAL OF CANCER 45 (2009) 228-247]から、または腫瘍関連循環フリーDNA(cfDNA)もしくはエクソソーム(安定なmRNAの供給源)を判定する腫瘍生検もしくは液体生検(末梢血由来の血漿)によって判断され得る。エクソソーム(腫瘍細胞および免疫細胞を含めたすべての細胞によって産生される)およびcfDNA(死につつある腫瘍細胞によって産生される)を使用して、腫瘍量および免疫応答の両方をモニターし得る。エクソソームおよびcfDNAの解析は、(a)エクソソームおよびcfDNAからの全体的腫瘍量の推定および遺伝子プロファイリング(MAGE-A4 mRNAの発現または変異プロファイリングを含む)、(b)エクソソームからの免疫応答(細胞傷害性および調節性免疫細胞による遺伝子発現)の全身査定を可能にし得る。
前述によれば、標準ケア治療は、胃食道がんおよび/または腫瘍に対して本明細書において上で記載される通りであり得る。
MAGE-A4 TCR+細胞持続性
本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用は、例えば、本明細書に記載される、異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する注入された操作されかつ改変された免疫応答性細胞の持続性の測定によって判定される、治療前、プラセボを用いた治療、または治療なし、または標準ケアを含む治療と比較して、対象における胃食道がんおよび/または腫瘍の治療効果の向上、および治療、阻止、またはその進行の遅延の向上を提供する。注入された操作されかつ改変された免疫応答性細胞の持続性は、治療効果と相関し、長期にわたる安全性評価尺度でもある。細胞持続性は、qPCRまたはフローサイトメトリー(FCM)によって判定され得る。例えば、凍結された対象PBMCから抽出されたDNAからの導入遺伝子のPCRによる、MAGE-A4またはMAGE-A4+CD8 TCR+細胞の定量化は、凍結された対象PBMCからのFCMによるMAGE-A4またはMAGE-A4+CD8 TCR発現細胞の定量化と同じように、評価尺度として使用され得る。T細胞表現型および活性は、様々なアッセイ、例えば、
・注入前および後の細胞産物におけるおよび対象血液における、T細胞系統の判定のための表現型解析
・対象PBMC由来のT細胞の老化および活性化状態の定量化
・注入されたT細胞、例えばMAGE-A4またはMAGE-A4+CD8 TCR+T細胞のインビボ機能を反映する可溶性因子の定量化
・治療の時間枠の前および/または間の、それらの細胞の潜在的機能性を査定するための、種々の時点における対象の形質導入細胞のエクスビボ活性
によって判定され得る。
T細胞機能
本発明、ならびに本発明の方法、治療、および使用は、治療前、プラセボを用いた治療と比較して、または治療なしと比較して、または標準ケアを含む治療と比較して、T細胞機能の増強を提供する。好ましくは、T細胞機能は、例えばCD8+T細胞からのγ-インターフェロンの分泌の増加、T細胞増殖の増加、内部シグナル伝達の増加、抗原応答性の増加、サイトカインおよび/またはインターフェロンの分泌の増加、標的細胞殺傷の増加、T細胞活性化の増加、CD28シグナル伝達の増加、腫瘍に浸潤するT細胞能力の増加、樹状細胞により提示された抗原を認識しかつ結合する能力の増加によって判断される、少なくとも10%、代替的に20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、120%、150%、200%、またはそれを上回る割合増強される。
本発明、ならびに本発明の方法および使用によれば、腫瘍免疫または腫瘍による免疫認識の回避は弱められ得、腫瘍認識および免疫系による攻撃の向上をもたらし、それによって、例えば腫瘍結合、腫瘍縮小、および腫瘍クリアランスによって測定される腫瘍免疫を治療する。したがって、本発明は、腫瘍免疫の治療を提供し、かつ/または、例えば腫瘍結合、腫瘍縮小、もしくは腫瘍クリアランスによって測定される、治療前、プラセボによる治療と比較して、もしくは治療なしと比較して、もしくは標準ケアを含む治療と比較して、少なくとも10%、代替的に20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、120%、150%、200%、もしくはそれを上回る割合増強される腫瘍免疫の治療を提供する。
T細胞活性の文脈において、「機能不全」という用語は、抗原刺激への免疫応答性の低下の状態を指し、T細胞は、抗原、例えばがんおよび/もしくは腫瘍抗原またはそのペプチド抗原を認識し得かつ結合し得るが、免疫応答を進行させることまたはがん進行および/もしくは腫瘍成長と闘うことにおいて有効性の低下を示す、T細胞疲弊および/またはアネルギーを含む。機能不全のT細胞は、T細胞機能不全障害に特徴的であるように、抗原認識を、増殖、サイトカインおよびインターフェロン産生、もしくは標的細胞殺傷等の下流のT細胞エフェクター機能に変える損なわれた能力、ならびに/または抗原認識への明白な不応性もしくは無応答性を示す。「T細胞機能不全障害」は、PD-1を通じたT細胞シグナル伝達の不充分な増加;増殖する能力および/もしくはサイトカインを産生する能力ならびに/または細胞溶解活性の減少を有するT細胞;T細胞アネルギー;腫瘍免疫と関連付けられ得るか、またはそれとして検出され得る。
「T細胞疲弊」は、がんへの応答の一部としての継続的TCRシグナル伝達に起因したT細胞機能不全の状態を含み、腫瘍への最適な応答を阻止する。疲弊は、細胞内在性の負の調節的(共刺激性)経路を通じて(例えば、PD-1、PD-1軸、B7-H3、B7-H4)、または細胞外在性の負の調節的経路を通じて(免疫調節性サイトカイン)、効果を見い出し得る。T細胞疲弊は、乏しいエフェクター機能、阻害性受容体の継続的発現、および機能的エフェクターまたはメモリーT細胞のものとは違う転写の活性の変更によって特徴付けられる。T細胞アネルギーは、T細胞受容体を通じた欠損したシグナル伝達、および共刺激の状況においてさらに多い、結果として生じる抗原刺激への無応答性の状態を通じて生じ、その結果として、そのようなT細胞は、クローン増大を受けず、かつ/またはエフェクター機能を取得しない。
治療および投与
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、任意選択で単回用量としてまたは1回を上回る用量として、連続的にまたは間欠的に投与され得る。
したがって、改変免疫応答性細胞は、単回用量としてまたは1回を上回る用量(複数回用量)として投与され得る。改変免疫応答性細胞は、約5億から、細胞約10億個、細胞約20億個、細胞約30億個、細胞約40億個、細胞約50億個、細胞約60億個、細胞約70億個、細胞約80億個、細胞約90億個、細胞約100億個、細胞約110億個、細胞約120億個、細胞約130億個、細胞約140億個、細胞約150億個、細胞約160億個、細胞約170億個、細胞約180億個、細胞約190億個、細胞約200億個、または細胞約210億個のうちのいずれか1つまでの間の用量で投与され得る。改変免疫応答性細胞は、細胞約1億~約2億個、細胞約3億~約4億個、細胞約5億~約6億個、細胞約7億~約8億個、または細胞約9億~約10億個、任意選択で細胞約5億~約10億個、細胞約20億~約50億個、または細胞約60億~約100億個の用量で投与され得る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、静脈内に、筋肉内に、皮下に、局部的に、経口的に、経皮的に、腹腔内に、眼窩内に、埋め込みによって、吸入によって、髄腔内に、脳室内に、もしくは鼻腔内に、または静脈内注入によって投与され得る。好ましくは、改変免疫応答性細胞は、静脈内にまたは静脈内注入によって投与され得る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、
(a)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける単回用量、
(b)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける1回または複数回の用量、
(c)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれの1日目における単回用量、
(d)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれの1日目における用量を含む、1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける1回または複数回の用量、
(e)少なくとも1回の用量が各サイクルの1日目におけるものである、1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける1回または複数回の用量、
(f)単回用量
として投与され得る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は投薬サイクルにおいて投与され得、投薬サイクルは、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28週間のうちのいずれか、または1ヶ月間、2ヶ月間、3ヶ月間、4ヶ月間、5ヶ月間、6ヶ月間、7ヶ月間、8ヶ月間、9ヶ月間、10ヶ月間、11ヶ月間、もしくは12ヶ月間のうちのいずれかであり得る(例えば、以前の最後の投薬以降)。したがって、投薬サイクルは、10~12週間、11~13週間、14~17週間、18~21週間、22~24週間、24~27週間、28~30週間、3ヶ月間、4ヶ月間、5ヶ月間、6ヶ月間のうちのいずれかであり得る(例えば、以前の最後の投薬以降)。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は投薬サイクルにおいて投与され得、投薬サイクルは、
(a)改変免疫応答性細胞の以前の投与後の疾患進行、および/または
(b)改変免疫応答性細胞の以前の投与の12週間以上後
におけるものであり得るか、またはそこから始まり得るか、またはそこから再開し得、
(c)腫瘍および/もしくはがんは、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原を発現し、かつ/または
(d)MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原は、対象生物学的サンプルにおいて検出され、かつ/もしくは正常範囲を上回る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は投薬サイクルにおいて投与され得、投薬サイクルは、
(a)改変免疫応答性細胞の以前の投与後の確定効果もしくは完全奏効もしくは部分奏効、または(b)改変免疫応答性細胞の以前の投与後の、2、3、もしくは4ヶ月間を上回るかもしくはそれに等しい期間の安定疾患、それに続く疾患進行、および/または
(c)改変免疫応答性細胞の以前の投与の12週間を上回るかもしくはそれに等しい後
におけるものであり得るか、またはそこから始まり得るか、またはそこから再開し得、
(d)腫瘍および/もしくはがんは、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原を発現し、かつ/または
(e)MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原は、対象生物学的サンプルにおいて検出され、かつ/もしくは正常範囲を上回る。
腫瘍および/またはがんは、免疫組織化学によって判定される腫瘍および/またはがん細胞の、免疫組織化学における1+の強度を上回るかもしくはそれに等しいレベルで、かつ/または10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、もしくは50%を上回るかもしくはそれに等しい、好ましくは30もしくは32%を上回るかもしくはそれに等しい免疫組織化学による抗原発現頻度で、MAGE-A4および/またはそのペプチド抗原を発現し得る。正常範囲を上回る対象生物学的サンプルMAGE-A4および/またはそのペプチド抗原は、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、150、200、250、300、350、400、450、または500ng/mLを上回り得るかまたはそれに等しくあり得る、好ましくは50または100ng/mLを上回り得るかまたはそれに等しくあり得る。
本発明によれば、用量は、固定用量または可変用量であり得る。例えば、1回を上回る用量が投与される場合、すなわち複数回用量の場合、用量は、固定され得るかまたは可変であり得、例えば1回を上回る用量が投与される場合、用量は、例えば各投薬サイクルにおいて増量され得るかまたは増加し得、すなわち増加するレベルの用量、例えば次第に、例えば細胞1億個から5億個まで10億個まで50億個まで100億個までであり得る。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は、好ましくは、細胞約50億~約100億個の単回用量として投与される。
本発明によれば、改変免疫応答性細胞は指定の期間投与され得、改変免疫応答性細胞投薬サイクルが指定の期間施され得ることを意味する。指定の期間は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48ヶ月間のうちのいずれか、好ましくは24ヶ月間であり得る。
本発明によれば、方法は、
(a)改変免疫応答性細胞が単回用量として投与され、
(b)疾患の状態が、改変免疫応答性細胞投与の後の期間に判定され、改変免疫応答性細胞投与の前の状態と比較され、進行疾患が判定された場合には、
(c)改変免疫応答性細胞が単回用量として投与され、任意選択で腫瘍および/もしくはがんは、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原を発現し、かつ/またはMAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原は、対象生物学的サンプルにおいて検出され、かつ/もしくは正常範囲を上回る、
ステップを含み得る。好ましくは、期間は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48週間を上回るかまたはそれに等しく、好ましくは12週間を上回るかまたはそれに等しい。
本発明によれば、方法は、
(a)改変免疫応答性細胞が単回用量として投与され、
(b)疾患の状態が、改変免疫応答性細胞投与の後の第1および後の第2の期間に判定され、改変免疫応答性細胞投与の前の状態と比較され、第1の期間の後に安定疾患が判定され、第2の期間の後に進行疾患が判定された場合には、
(c)改変免疫応答性細胞が単回用量として投与され、任意選択で腫瘍および/もしくはがんは、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原を発現し、かつ/またはMAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原は、対象生物学的サンプルにおいて検出され、かつ/もしくは正常範囲を上回る、
ステップを含み得る。好ましくは、第1の期間は、1、2、3、4、5、6、7、8ヶ月間のうちのいずれか1つを上回るかまたはそれに等しく、好ましくは4ヶ月間を上回るかまたはそれに等しい。
好ましくは、第2の期間は、第1の期間の後の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48ヶ月間のうちのいずれか1つを上回るかまたはそれに等しく、好ましくは4ヶ月間を上回るかまたはそれに等しい。
本発明によれば、「完全奏効」(CR)は、すべての標的病変または腫瘍が、消失していると査定されたかまたは測定された場合に判定される。「部分奏効」(PR)は、例えば対照または治療前比較物を参照して、標的病変または腫瘍の最長径の和(SLD)の少なくとも30%の減少の測定がある場合に判定される。「進行疾患」(PD)は、治療が開始された以降の、例えば対照もしくは治療前比較物を参照して、標的病変もしくは腫瘍の最長径の和(SLD)の少なくとも20%の増加の測定、または1つもしくは複数の新たな病変の存在がある場合に判定される。「安定疾患」(SD)は、治療が開始された以降の最小SLDを参照として選んで、PRに対する品質までの標的病変または腫瘍の最長径の和(SLD)の十分な低下または減少も、PDに対する品質までの十分な増加もないと判定される場合に判定される。
本発明によれば、治療前の対象は、免疫組織化学によって判定される腫瘍および/またはがん細胞の、免疫組織化学における1+の強度を上回るかもしくはそれに等しい腫瘍および/もしくはがん細胞MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原発現、ならびに/または10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、もしくは50%を上回るかもしくはそれに等しく、好ましくは30もしくは32%を上回るかもしくはそれに等しい免疫組織化学による抗原発現頻度を含み得、非がん性MAGE-A4および/またはそのペプチド抗原発現は、免疫組織化学による任意の強度における非がん性または非腫瘍組織に対する細胞の1、2、3、5、6、7、8、9、10%未満であるかまたはそれに等しく、好ましくは1%または5%未満であるかまたはそれに等しい。
本発明によれば、治療前の対象は、10、25、50、100、200、300、または400ng/mLを上回るかまたはそれに等しく、好ましくは50ng/mlを上回るかまたはそれに等しい生物学的サンプルレベルMAGE-A4および/またはそのペプチド抗原を含み得、MAGE-A4発現は、免疫組織化学による任意の強度における非がん性または非腫瘍組織に対する細胞の1、2、3、5、7、9%未満であるかもしくはそれに等しいか、または10%未満、好ましくは1もしくは5%未満であるかもしくはそれに等しい。
本発明によれば、治療前の対象は、0~1の米国東海岸癌臨床試験グループ(Eastern Cooperative Oncology Group)(ECOG)、ならびに/または固形腫瘍における応答評価基準(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors)(RECIST)1.1に従った測定可能な疾患(胃食道がんおよび/または腫瘍)、ならびに/または組織学的に確定された胃食道がんおよび/もしくは腫瘍を含み得る。
本発明によれば、治療前の対象は、HLA-A*02陽性であると判定され、かつ/または対象のがんもしくは腫瘍は、好ましくは本明細書において上で記載される、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原の発現、例えばMAGE-A4 RNAもしくはタンパク質の発現を示す。
本発明によれば、治療前に、対象が、
(a)HLA-A遺伝子型が、唯一のHLA-A*02アレルとしてのHLA-A*02:07Pである、
(b)HLA-A遺伝子型が、唯一のHLA-A*02アレルとしての任意のA*02ヌルアレルのHLA-A*である、または
(c)症候性CNS転移
のうちのいずれか1つまたは複数を有する場合には、対象は治療の適格性がない。
本発明によれば、対象は、例えばHLA-A*02:01、HLA-A*02:02、HLA-A*02:03、HLA-A*02:04、HLA-A*02:05、HLA-A*02:06、HLA-A*02:642、またはHLA-A*02:07、好ましくはHLA-A*02:01またはHLA-A*02:642から選択されるHLA-A*02に陽性であり得、かつ/または胃食道がんおよび/もしくは腫瘍は、MAGE-A4、MAGE-A4のペプチド抗原、GVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE-A4のペプチド抗原を発現する。
本発明によれば、対象は、好ましくは本明細書に記載される標準ケア治療に不忍容であり得、付加的にまたは代替的に、対象ならびに/またはがんおよび/もしくは腫瘍は、例えば本明細書に記載される標準ケア治療を用いた治療に以前に失敗したことがあり得るか、あるいは手術(切除)、放射線療法、標的療法、免疫療法、もしくは化学療法、または手術(切除)、放射線療法、放射線療法、標的療法、もしくは免疫療法との併用化学療法のうちのいずれかを用いた治療に以前に失敗したことがあり得るか;あるいは、任意選択で化学的および/または熱的な経皮的アブレーションならびに動脈内化学動脈塞栓療法(chemoembolotherapy)から選択される、局所領域療法を用いた治療に以前に失敗したことがあり得る。
本発明によれば、胃食道がんおよび/または腫瘍であるがんは、原発性がん、続発性がん、再燃性がんまたは難治性がんまたは再発性がんまたは局所再発性がん、進行性もしくは局所進行性もしくは転移性がん、手術もしくは放射線療法選択肢を有しない切除不能がんもしくは局所限局性がん、または手術不可能ながん、移植もしくは局所領域療法に適していないがん、あるいはその任意の組み合わせであり得る。対象は、再燃性がんまたは難治性がんまたは再発性がんまたは局所再発性がんまたは転移性がんまたは局所限局性もしくは手術不可能ながん、あるいはその任意の組み合わせを有し得る。
好ましくは、胃食道がんおよび/または腫瘍は、手術不可能および/または転移性および/または進行性および/または局所進行性の胃食道がんおよび/または腫瘍、例えば食道、胃-食道接合部のがんおよび/もしくは腫瘍、または胃がんおよび/もしくは腫瘍のうちのいずれか、好ましくは食道扁平上皮細胞癌(ESCC)、食道腺癌(EAC)、または食道胃接合部がん、癌腫、腺癌、もしくは腫瘍(EGJ)、または胃(stomach)もしくは胃(gastric)がん、癌腫、もしくは腫瘍のうちのいずれか、好ましくは手術不可能または転移性または進行性または局所進行性の食道胃接合部がん、癌腫、腺癌、または腫瘍(EGJ)である。
対象は胃食道がんおよび/または腫瘍に対する先行治療を受けていない、代替的に対象は胃食道がんおよび/もしくは腫瘍に対する先行治療を受けており、かつ/または先行治療に応答していない、本発明に従った治療法または使用がさらに提供される。
本発明によれば、先行治療は、全身および/または局所療法、例えば手術、放射線療法、凍結療法、レーザー療法、局部療法、化学療法、ホルモン療法、標的薬、または免疫療法のうちのいずれか1種または複数を含み得る。したがって、先行治療は、局所療法、例えば手術、放射線療法、凍結療法、レーザー療法、局部療法のうちのいずれか1種もしくは複数、および/または全身療法、例えば化学療法、ホルモン療法、標的薬、もしくは免疫療法のうちのいずれか1種もしくは複数を含み得る。本発明によれば、先行治療は、局所領域疾患の初期診断に対する全身療法、再発性もしくは転移性疾患の診断後の全身療法、オリゴ転移性疾患後の全身療法、または局所再発性疾患後の全身療法のうちのいずれか1種を含み得る。
したがって、治療が胃食道がんおよび/または腫瘍のものである場合、先行治療は、例えば進行疾患または許容されない毒性または不忍容性に起因して、例えば失敗した、アジュバントの、局所進行性の、または転移性の設定における原発性腫瘍の治療に対する、本明細書に記載される関連する標準ケアを含み得る。したがって、治療が胃食道がんおよび/または腫瘍のものである場合、先行治療は、例えば進行疾患または許容されない毒性または不忍容性に起因して、例えば失敗した、アジュバントの、局所進行性の、または転移性の設定における原発性腫瘍の治療に対する、シスプラチンまたはカルボプラチン化学療法から選択され得る全身性白金含有化学療法を含み得る。したがって、治療が胃食道がんおよび/または腫瘍のものである場合、先行治療は、シスプラチン、フルオロウラシル、およびロイコボリン、またはシスプラチンおよびエトポシド、またはカルボプラチンおよびパクリタキセル、またはシスプラチンおよびカペシタビンの組み合わせ、代替的に白金フルオロピリミジンダブレットおよび任意選択でアントラサイクリン;任意選択で白金ベースの化学療法中または後の、ペムブロリズマブまたはニボルマブ等の免疫チェックポイント阻害剤;トラスツズマブ、セツキシマブ、ベバシズマブ、またはラムシルマブ等の標的療法または標的抗体療法のうちのいずれかを含み得;任意選択で、例えば進行疾患または許容されない毒性または不忍容性に起因して、例えば先行治療は失敗している。
本発明によれば、先行治療は、PD-1軸結合アンタゴニスト、PD-L1結合アンタゴニスト、またはPD-1結合アンタゴニストを含み得る。したがって、先行治療は、
(a)PD-L1とPD-1との間および/またはPD-L1とB7-1との間の結合を阻害する抗PD-L1抗体、
(b)がん細胞表面のPD-L1が、シグナルを細胞内経路に変換するのを阻害する抗PD-L1抗体、
(c)PD-L1とPD-1との間および/またはPD-L2とPD-1との間の結合を阻害する抗PD-1抗体、
(d)T細胞表面のPD-1が、シグナルを細胞内経路に変換するのを阻害する抗PD-1抗体、
(e)
(i)デュルバルマブ、イミフィンジ(Imfinzi)、またはMEDI4736、
(ii)アテゾリズマブ、テセントリク(Tecentriq)、またはMPDL3280A、
(iii)アベルマブ、バベンチオ(Bavencio)、またはMSB0010718C、
(iv)MDX-1105、BMS-936559
から選択されるPD-L1結合アンタゴニスト、
(f)
(i)ペムブロリズマブ、キイトルーダ(Keytruda)、ランブロリズマブ、またはMK-3475、
(ii)セミプリマブ、リブタヨ(Libtayo)、またはREGN-2810、
(iii)BMS/ONO、ニボルマブ、オプジーボ、ONO-4538、BMS-936558、またはMDX1106
から選択されるPD-1結合アンタゴニスト
を含み得る。
本発明によれば、先行治療は、上皮成長因子受容体アンタゴニスト、任意選択でセツキシマブを含み得る。本発明によれば、先行治療が化学療法を含む場合、これは、任意選択でリポプラチン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、トリプラチンテトラニトレート、フェナントリプラチン、サトラプラチン、ピコプラチンから選択される1種または複数の白金化合物を含み得る。付加的にまたは代替的に、先行治療が化学療法を含む場合、これは、メトトレキサート、カペシタビン、タキサン、アントラサイクリン、パクリタキセル、ドセタキセル、パクリタキセルタンパク質結合粒子、ドキソルビシン、エピルビシン、5-フルオロウラシル、シクロホスファミド、アファチニブ、ビンクリスチン、エトポシド、またはその組み合わせから選択される1種または複数の化学療法剤を含み得る。付加的にまたは代替的に、先行治療が化学療法を含む場合、これは、FEC:5-フルオロウラシル、エピルビシン、シクロホスファミド;FAC:5-フルオロウラシル、ドキソルビシン、シクロホスファミド;AC:ドキソルビシン、シクロホスファミド;EC:エピルビシン、シクロホスファミドから選択される1種または複数の化学療法剤を含み得る。本発明によれば、先行治療は、ソラフェニブ、PD1もしくはPD-L1アンタゴニストもしくは阻害剤、レゴラフェニブ、カボザンチニブ、スニチニブ、ブリバニブ、エベロリムス、チバンチニブ、リニファニブ、または任意選択で化学的および/もしくは熱的な経皮的アブレーションならびに動脈内化学動脈塞栓療法から選択される局所領域療法のうちのいずれか1種または複数を含み得、任意選択で、例えば進行疾患または許容されない毒性または不忍容性に起因して、例えば先行治療は失敗している。
本発明によれば、対象は、最後の治療以降12ヶ月未満のもしくはそれに等しい、または最後の治療以降6ヶ月未満のもしくはそれに等しい再発において先行治療を受けていなくてもよい。本発明によれば、対象は、最後の治療以降12ヶ月未満のもしくはそれに等しい再発において、または最後の治療以降6ヶ月未満のもしくはそれに等しい再発において、いかなる先行アジュバント療法(手術、それに続く放射線および/または化学療法)も受けていなくてもよい。
本発明によれば、治療は、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または本明細書に記載される標準ケアを含む治療と比較して等の対照と比較して、
(a)無増悪生存期間、
(b)無増悪期間、
(c)奏効期間、
(d)全生存期間、
(e)客観的奏効もしくは客観的奏効率、
(f)全奏効もしくは全奏効率、
(g)部分奏効もしくは部分奏効率、
(h)完全奏効もしくは完全奏効率;
(i)安定疾患率もしくは安定疾患中央値
(j)無増悪生存期間中央値、
(k)無増悪期間中央値、
(l)奏効期間中央値、または
(m)全生存期間中央値;
(n)客観的奏効中央値もしくは客観的奏効率中央値、
(o)全奏効中央値もしくは全奏効率中央値、
(p)部分奏効中央値もしくは部分奏効率中央値、
(q)完全奏効中央値もしくは完全奏効率中央値、
(r)安定疾患率中央値もしくは安定疾患中央値、
を延長するか、または向上させるか、または有効に延長するか、または有効に向上させる。
本発明によれば、治療は、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または本明細書に記載される標準ケアを含む治療と比較して等の対照と比較して、
(a)最良総合効果(BOR)、(b)確定効果までの時間(TTR)、(c)奏効期間(DoR)、(d)安定疾患期間(DoSD)、(e)無増悪生存期間(PFS)、または(f)全生存期間(OS)
のうちのいずれか1つまたは複数を延長するか、または向上させるか、または有効に延長するか、または有効に向上させる。
最良総合効果(BOR)は、T細胞注入の日から疾患進行まで記録された最良効果として規定され得る。確定効果までの時間(TTR)は、T細胞注入と確定効果の初日との間の期間として規定され得る。奏効期間(DoR)は、確定効果の初日からPD、進行疾患(または死亡)の日までの期間として規定され得る。安定疾患期間(DoSD)は、T細胞注入の日からPD、進行疾患(または死亡)の日までの期間として規定され得る。無増悪生存期間(PFS)は、T細胞注入日と、RECIST v1.1に基づく疾患進行または任意の原因に起因した死亡の最早日との間の間隔として規定され得る。全生存期間(OS)は、T細胞注入と任意の原因に起因した死亡との間の期間として規定され得る。
「無増悪生存期間」(PFS)とは、治療(または無作為化)から最初の疾患進行または死亡までの時間を指す。「無増悪期間」(TTP)は、治療されているがんまたは腫瘍以外の原因により死亡する患者をカウントしないが、その他の点ではPFSと等価である。「奏効期間」(DoR)とは、がん、腫瘍、または病変が、成長せずにまたは広がらずに、治療に応答し続ける時間の長さである。本発明によれば、DoR、TTP、およびPFSは、固形腫瘍における応答評価基準(RECIST)によって査定され得るか、あるいは進行の決定因子としてのCA-125レベル(がん抗原125)によって、または任意選択で対象生物学的サンプル、がん、および/もしくは腫瘍組織もしくは細胞における疾患バイオマーカーもしくはMAGE-A4の発現、すなわちMAGE-A4タンパク質、ペプチド、もしくはmRNAを参照することによって査定され得る。奏効期間、率、読み出し、評価尺度、または時点は、治療が始まる日、例えば改変免疫応答性細胞が対象に投与される日、または標準ケアもしくはプラセボの投与の日から測定され得る。
本発明によれば、PFSおよび/もしくはTTPおよび/もしくはDoR、またはその中央値は、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または例えば本明細書に記載される標準ケアを含む治療(対照)と比較して、少なくとも1、2、3、または4週間、1ヶ月間、2ヶ月間、2.3ヶ月間、2.5ヶ月間、2.9ヶ月間、3ヶ月間、3.5ヶ月間、3.8ヶ月間、4ヶ月間、4.5ヶ月間、5ヶ月間、6ヶ月間、7ヶ月間、8ヶ月間、9ヶ月間、10ヶ月間、11ヶ月間、12ヶ月間、16ヶ月間、18ヶ月間、20ヶ月間、22ヶ月間、2年間、3年間、4年間、5年間、6年間、7年間、8年間、9年間、10年間延長され得るか、または向上し得る。
1つの実施形態において、PFSおよび/もしくはTTPおよび/もしくはDoR、またはその中央値は、対照と比較して、約2.9ヶ月間~3.8ヶ月間延長される。1つの実施形態において、PFSおよび/もしくはTTPおよび/もしくはDoR、またはその中央値は、対照と比較して、少なくとも約3.8ヶ月間延長される。別の実施形態において、PFSおよび/もしくはTTPおよび/もしくはDoR、またはその中央値は、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または例えば本明細書に記載される標準ケアを含む治療(対照)と比較して、約2.3ヶ月間延長され、1つの実施形態において、PFSおよび/もしくはTTPおよび/もしくはDoR、またはその中央値は約6ヶ月間延長される。
「全生存期間」とは、規定の期間生き続けている対象を指す。本発明によれば、全生存期間またはその中央値は、本発明に従った方法もしくは治療の始動から、または初期診断から、約1ヶ月間、2ヶ月間、2.3ヶ月間、2.5ヶ月間、2.9ヶ月間、3ヶ月間、3.5ヶ月間、3.8ヶ月間、4ヶ月間、4.5ヶ月間、5ヶ月間、約6ヶ月間、約7ヶ月間、約8ヶ月間、約9ヶ月間、約10ヶ月間、約11ヶ月間、約12ヶ月間、約1.5年間、約2年間、約3年間、約4年間、約5年間、約6年間、約7年間、約8年間、約9年間、約10年間のうちのいずれかほどまたはそれを上回って向上するか、または延長され、任意選択で生存期間解析に使用される事象は、任意の原因による死亡であり得る。「生存期間」は、生き続けている対象を指し、無増悪生存期間(PFS)および全生存期間(OS)を含む。「全生存期間」とは、疾患を有すると診断された対象が依然として生きている、診断の日、または疾患、腫瘍、および/もしくはがんに対する治療の開始のいずれかからの時間の長さである。生存期間は、カプラン-マイヤー法によって推定され得、生存期間の任意の差は、層別ログ-ランク検定を使用して計算され;「生存期間を延長すること」または「生存の可能性を増加させること」は、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または例えば本明細書に記載される標準ケアを含む治療と比較して、治療された対象におけるPFSおよび/またはOSを増加させることを意味する。本発明によれば、全生存期間または生存期間は、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または標準ケアを含む治療(対照)と比較して、約1ヶ月間、2ヶ月間、2.3ヶ月間、2.5ヶ月間、2.9ヶ月間、3ヶ月間、3.5ヶ月間、3.8ヶ月間、4ヶ月間、4.5ヶ月間、5ヶ月間、6ヶ月間、7ヶ月間、8ヶ月間、9ヶ月間、10ヶ月間、11ヶ月間、12ヶ月間、16ヶ月間、18ヶ月間、20ヶ月間、22ヶ月間、2年間、3年間、4年間、5年間、6年間、7年間、8年間、9年間、10年間の少なくともいずれか延長され得るか、または向上し得る。
「客観的奏効率」(ObRR)とは、任意選択で標的病変または腫瘍の最長径の和(SLD)によってかつ最小期間で判定される、所定の量の腫瘍サイズ低下を有する対象の割合である。「全奏効率(ORR)」は、療法への部分または完全奏効を有する対象の割合として規定され;安定疾患を含まない。ORRは、一般的に、指定の期間にわたる完全奏効(CR)と部分奏効(PR)との和として規定される。本発明によれば、ObRRおよび/またはORRおよび/またはPRおよび/またはCRおよび/またはSDは、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または例えば本明細書に記載される標準ケアを含む治療と比較して、少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%延長され得るか、または向上し得る。
本発明によれば、方法は、対象由来のサンプル、生物学的サンプルにおけるバイオマーカーの発現レベルを判定するステップであって、バイオマーカーのレベルを参照レベルと比較して、治療に応答する対象の可能性を判定するか、または治療への応答の対象のレベルを判定し、サンプルは、治療の前、間、または後のいずれかに獲得される、ステップをさらに含み得る。参照レベルは、対象の治療前のレベルであり得るか、またはがんの存在もしくはがんの存在の欠如と関連したレベルであり得る。バイオマーカーは、T-エフェクター関連遺伝子、例えばCD8A、パーフォリン(PRF1)、グランザイムA(GZMA)、グランザイムB(GZMB)、インターフェロン-γ(IFN-v)、CXCL9、またはCXCL10であり得る。バイオマーカーは、活性化ストローマ関連遺伝子、例えば形質転換成長因子-β(TGF-β)、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、ポドプラニン(podplanin)(PDPN)、コラーゲン遺伝子、またはビグリカン(BGN)であり得る。バイオマーカーは、myelokJ由来抑制細胞関連遺伝子、例えばCD68、CD163、FOXP3、またはアンドロゲン調節遺伝子1であり得る。代替的に、バイオマーカーは、PD-L1、CD8、またはアンドロゲン受容体(AR)遺伝子であり得る。代替的に、バイオマーカーは、本明細書において前に記載される疾患バイオマーカーであり得る。
本発明によれば、対象は、異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の投与前に、リンパ枯渇化学療法を受ける。リンパ枯渇化学療法は、シクロホスファミドおよび/またはフルダラビンの投与を含み得る。好ましくは、シクロホスファミドは、約100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、または850mg/m/d[d=日]、好ましくは約500または600mg/m/dの用量で投与され、好ましくは投与は、1日間、2日間(×2d)、3日間(×3d)、4日間(×4d)、または5日間(×5d)である。好ましくは、フルダラビンは、約5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、または85mg/m/dの用量で投与され、好ましくは投与は、1日間、2日間(×2d)、3日間(×3d)、4日間(×4d)、または5日間(×5d)である。好ましくは、リンパ枯渇化学療法は、任意選択で500mg/m/d×3dのシクロホスファミドおよび20mg/m2/d×3dのフルダラビンの用量での、または600mg/m/d×3dのシクロホスファミドおよび30mg/m/d×4dのフルダラビンの用量での、シクロホスファミドおよびフルダラビンの投与を含む。本発明によれば、リンパ枯渇化学療法は、異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の投与の3、4、5、6、7、8、9、10日前に、好ましくは7~5または7~4日前に投与され得る。シクロホスファミドおよびフルダラビンの投与は、逐次的に別個であっても同時であってもよく、投与は、静脈内にまたは静脈内注入によって投与され得る。
本発明は、任意選択で治療前またはプラセボを用いた治療または治療なしまたは本明細書に記載される標準ケアを含む治療と比較して、治療の方法ならびにそれに関する態様および実施形態および特質を参照して本明細書において前に記載されるように、MAGE-A4もしくはMAGE-A4のペプチド抗原、またはGVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE-A4のペプチド抗原に結合する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量を含む治療レジメンを対象に施すステップを含む、胃食道がんおよび/または腫瘍を有する対象において、
(a)例えば対象生物学的サンプルにおける対象MAGE-A4発現または濃度を低下させる、
(b)免疫機能を増強する、
(c)腫瘍成長もしくは腫瘍成長速度を低下させるか、または治療の休止後に腫瘍サイズを維持するか、または腫瘍数もしくは腫瘍量を低下させる、
(d)血清サイトカインおよび/またはインターフェロンレベルまたは濃度を増加させる、
(e)T細胞持続性を向上させる、
(f)腫瘍のT細胞浸潤を向上させる、
(g)胃食道がんおよび/または腫瘍の有効な治療を指し示す疾患バイオマーカーの変化を誘導する、
方法をさらに提供する。
したがって、本発明は、免疫機能を増強する方法であって、任意選択で治療前またはプラセボを用いた治療または治療なしまたは本明細書に記載される標準ケアを含む治療と比較して、治療の方法ならびにそれに関する態様および実施形態および特質を参照して本明細書において前に記載されるように、MAGE-A4もしくはMAGE-A4のペプチド抗原、またはGVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE-A4のペプチド抗原に結合する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量を含む治療レジメンを対象に施すステップを含む、胃食道がんおよび/または腫瘍を有する対象において、それぞれ、
(a)対象におけるCD8 T細胞は、プライミング、活性化、増殖、および/または細胞溶解活性の増強を有する、
(b)CD8 T細胞の数は対象において上昇する、
(c)対象におけるがんおよび/または腫瘍細胞は、MHCクラスI抗原の発現の上昇を選択的に有し、任意選択で対象のPBMC細胞は、MHCクラスI抗原の発現の上昇を有しない、
(d)対象における抗原提示細胞は、成熟および活性化の増強を有し、任意選択で抗原提示細胞は樹状細胞である、
(e)対象におけるIL-10および/またはIL-8の血清レベルは低下する、
(f)対象のがんおよび/または腫瘍は、T細胞浸潤のレベルの上昇を有する、
(g)対象のT細胞は、T細胞PD-1発現のレベルの低下を有する
方法を提供する。
したがって、前述および治療された対象を参照すると、(a)CD8 T細胞活性化は、ガンマ-IFN CD8 T細胞の頻度の上昇および/または細胞溶解活性の増強によって特徴付けられ得る;(b)抗原提示細胞の成熟は、CD83樹状細胞の頻度の増加によって特徴付けられ得る;(c)抗原提示細胞の活性化は、樹状細胞上のCD80およびCD86の発現の上昇によって特徴付けられ得る;(d)CD8 T細胞は、抗原特異的CD8 T細胞であり得る。
本発明によれば、
(a)MAGE-A4もしくはMAGE-A4のペプチド抗原、またはGVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE-A4のペプチド抗原に結合する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量、ならびに対象における胃食道がんおよび/または腫瘍を治療するか、またはその進行を遅延させるために改変免疫応答性細胞を使用するための使用説明書を含む添付文書を含むキット、
(b)MAGE-A4もしくはMAGE-A4のペプチド抗原、またはGVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE-A4のペプチド抗原に結合する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量、ならびに本明細書において前に記載される胃食道がんおよび/または腫瘍を有する対象において、
(i)例えば対象生物学的サンプルにおける対象MAGE-A4発現または濃度を低下させる、
(ii)免疫機能を増強する、
(iii)腫瘍成長もしくは腫瘍成長速度を低下させるか、または治療の休止後に腫瘍サイズを維持するか、または腫瘍数もしくは腫瘍量を低下させる、
(iv)血清サイトカインおよび/またはインターフェロンレベルまたは濃度を増加させる、
(v)T細胞持続性を向上させる、
(vi)腫瘍のT細胞浸潤を向上させる、あるいは
(vii)胃食道がんおよび/または腫瘍の有効な治療を指し示す疾患バイオマーカーの変化を誘導する
方法において改変免疫応答性細胞を使用するための使用説明書を含む添付文書を含むキット
が提供される。
本発明は、以下の図および実施例を参照することによってさらに記載されるであろう。
[実施例1]
MAGE-A4陽性食道胃接合部(EGJ)がん、胃がんを有するHLA-A2+対象におけるMAGE-A4に特異的な増強TCR、MAGE-A4 CD8 TCRを発現する自家T細胞についての安全性および抗腫瘍活性を評価する、第I相、非盲検、臨床試験
方法
以下は、HLA-A*02、および食道胃接合部(EGJ)がん、胃がんに対してMAGE-A4陽性の手術不可能な局所進行性または転移性の腫瘍を有する対象における遺伝子操作されたADP-A2M4CD8 SPEAR T細胞についてのヒト研究を提示する。
疾患は、RECIST v1.1基準に従って記録された、組織学的にまたは細胞遺伝学的に確定されたおよび/または測定可能な疾患であった。HLA型に基づいて適格性があり、かつMAGE-A4基準を満たした対象を、全般的健康状態、パフォーマンスステータス、および病期についてスクリーニングした。スクリーニングの後、すべての適格性基準を満たす対象は、自家MAGE-A4 CD8 TCR担持T細胞の製造のための細胞を獲得するために、白血球アフェレーシスを受けた。適格性がある対象は、リンパ枯渇の前に要されるECOGパフォーマンスステータス0~1、充分な臓器機能、および測定可能な疾患を有し、かつ
(a)対象は、少なくとも1つのHLA-A*02内包アレルに陽性である。
(b)対象は、手術不可能または転移性(進行性)の食道(扁平上皮または腺癌)、食道胃接合部(EGJ)、または胃がんを有する。
(c)対象は、フルオロピリミジン(例えば、フルオロウラシルまたはカペシタビン)および/または白金レジメンを受けたことがあり得る。
(d)対象がんおよび/または腫瘍は、Her2neu増幅を有し得るが、失敗している(進行疾患または許容されない毒性)またはトラスツズマブを拒絶している。
(e)対象は、多くても3種の先行する全身性レジメンを受けたことがあり得る。
(f)対象は、転移性(進行性)の食道(扁平上皮または腺癌)、食道胃接合部(EGJ)、または胃がんの組織学的にまたは細胞学的に確定された診断を有する。
対象の除外は、主にHLA-A遺伝子型、すなわち対象が、内包アレルHLA-A*02:07PまたはHLA-A*02ヌルアレルの一方以外の任意のHLA-A*02アレルに陽性であるかどうかに基づく(HLA-A*02:07PまたはHLA-A*02ヌルアレルは、両方とも低い活性を有するアレルであり、そのため、これらのアレルが対象の唯一の02アレルである場合には、彼らは適格性がないことになる)。除外される対象は、症候性CNS転移、または活性自己免疫もしくは免疫媒介性疾患、または感染症を有する者を付加的に含む。
白血球アフェレーシスの後、細胞に、その後、MAGE-A4抗原(特に、特異的MAGE-A4抗原ペプチド、配列番号2)に特異的なMAGE-A4 CD8 TCR T細胞(配列番号5、7+配列番号3)を形質導入し、後の使用のために、細胞を増大させかつ凍結保存する。MAGE-A4 CD8 TCR T細胞が使用可能であり次第、対象は、-7~-5日目または-7~-4日目にシクロホスファミド+フルダラビンを用いたリンパ枯渇化学療法を受け、その後に1日目に形質導入細胞の注入が続いた。
3つの対象コホートを、用量漸増を有しないそれぞれ1億~50億個の形質導入細胞を用いた投薬で治療した:
100mn個の細胞用量、(シクロホスファミド:500mg/m/d)×3d;(フルダラビン:20mg/m/d)×3d
1bn個の細胞用量、(シクロホスファミド:500mg/m/d)×3d;(フルダラビン:20mg/m/d)×3d
5bn個の細胞用量、(シクロホスファミド:600mg/m/d)×3d;(フルダラビン:30mg/m/d)×4d
対象は、注入後7日間入院し、その後、疾患進行または早期介入離脱まで、4、8、16、24週目に、および3ヶ月に1回実施されるCTおよびMRIで安全性、T細胞持続性、サイトカイン産生についてモニターされ、毎年の長期追跡調査は15年間の期間計画される。
対象は、彼/彼女がT細胞注入を受け、その後進行したまたは疾患進行の前に死亡した場合、研究の介入期を完了したと見なされることになる。任意選択で、第2のT細胞注入が与えられ得、彼らが疾患のさらなる進行を有するまで、彼らは研究の介入期にとどまるであろう。進行が立証され次第、全生存期間以外のさらなる効力査定は実施されない。研究の介入部を完了したすべての対象は、FDAおよびEMA規則に従って、注入後15年間の遅延性有害事象(AE)の観察のために長期追跡調査(LTFU)期に入ることになる。この研究は、最後の生きた対象がLTFUを完了した時点で完了と見なされる。
MAGE-A4 CD8 TCR T細胞の安全性および忍容性を評価するために、用量制限毒性(DLT)の発生率をモニターし、最適に忍容される用量域、有害事象(AE)、および重度有害事象(SAE);化学、血液学、および凝固を含めた検査室査定;ならびにECGおよび心臓トロポニンを含めた心臓査定についての判定を行う。
調査の間、腫瘍MAGE-A4発現および抗腫瘍活性に対するバイオマーカーとしてMAGE-A4を評価する。これを実施して、ベースライン時およびMAGE-A4 CD8 TCR T細胞注入後の腫瘍レベルにおける抗原発現のレベルを相関させる。療法後の腫瘍における経時的なMAGE-A4発現を査定して、MAGE-A4 CD8 TCR T細胞に対する腫瘍免疫または耐性を判定する。付加的に、サイトカイン放出症候群(CRS)および他の有害事象(AE)との関連で、循環サイトカインを測定しかつ評価した。付加的に、MAGE-A4 CD8 TCR T細胞注入の後、MAGE-A4 TCRベクターコピー数およびMAGE-A4 CD8 TCR形質導入T細胞数によって測定される、MAGE-A4 CD8 TCR操作T細胞の血清レベル持続性の判定によって、形質導入細胞持続性を査定する。対象血液および腫瘍における遺伝子改変T細胞上の特異的表面マーカーの平均発現を、蛍光強度によって測定した。遺伝子改変T細胞の殺傷プロファイルおよびサイトカインプロファイルを、血液および腫瘍におけるフローサイトメトリーを使用して評価した。対象サンプルのバイオマーカーは、サイトカイン遺伝子における多型およびサイトカイン産生を含む。
MAGE-A4 CD8 TCR T細胞の抗腫瘍活性を評価するために、以下の評価項目をRECIST v1.1によってモニターする;確定された完全奏効(CR)または部分奏効(PR)を有する対象の割合として規定される全奏効率(ORR)。付加的な評価項目を、奏効期間(DoR)、安定疾患期間(SD)、無増悪生存期間(PFS)、全生存期間(OS)についてモニターする。奏効期間の査定および全生存期間の査定によって、治療の効力について評価を行った。
(a)最初のT細胞注入投薬、およびCRまたはPRについての最初の文書化された証拠、および最初の応答までの時間の査定による治療の効力についての評価の日
(b)最初の文書化された疾患進行または任意の原因に起因した死亡までの、CRまたはPRについての最初の文書化された証拠の日
(c)最初の文書化された疾患進行または任意の原因に起因した死亡までの、安定疾患(SD)についての最初の文書化された証拠の日
(d)最初のT細胞注入の日、および疾患、進行、または任意の原因に起因した死亡の最早日
(e)最初のT細胞注入の日と任意の原因に起因した死亡の日との間
に関する間隔も査定した。
任意の長期追跡調査有害事象(AE)、悪性腫瘍、神経学的障害、リウマチ学的または他の自己免疫障害、血液学的障害、感染症を有する対象の数および%による、治療の効力についての評価。
化学、血液学、および凝固を含めた検査室査定、ならびに抗MAGE-A4 TCR抗体、重度有害事象(SAE)、用量制限毒性(DLT)NCI CTCAE、および最適に忍容される用量域を含めた有害事象(AE)、ならびにPCRベースのアッセイを使用した、周辺における遺伝子改変T細胞の持続性およびT細胞PBMCにおける異種TCR発現の保持についての評価を通じて、安全性および忍容性応答について対象を付加的にモニターした。
結果
図1におけるデータは、HER2陰性である、GEJのステージ4の腺癌を有する31歳の男性についてのCTスキャンであり、対象は先行する不成功の化学療法、標的療法、および免疫療法レジメン(ラムシルマブ+パクリタキセル、アテゾリズマブ+BL-8040、FLOT/FOLFIRI化学療法)を受けていた。対象は、ベースライン時に中度のMAGE-A4発現(IHS 3+)および大きな疾患負荷を有し;ベースライン病変SLDは66cmであり、対象は、約100億個のMAGE-A4 CD8 TCR T細胞の最初の注入を提供され、有害反応は最小であり、細胞傷害性化学療法および/またはがん免疫療法を受けたがん患者によって典型的に経験されるものと一致していた。腫瘍は、RECIST 1.1によって、およびT細胞注入の日の後数週間の測定期間にわたる標的病変の直径の和によって、8週目の時点で42%を上回る減少を示した。これは、図2に示されるように、18週目の時点で51%を上回る減少に進行した。データは、食道胃接合部(EGJ)がん治療に対する腫瘍サイズ低下(51%の低下)の観点から、18週間の応答の効力を裏付ける。データは、大動脈大静脈リンパ節について示されており、等価のデータが、門脈周囲リンパ節、腹水、および測定不能の(nonmeaurable)腹膜転移(met)に対するCTによって獲得され、ベースラインからの等価の低下が、大動脈大静脈リンパ節に関して観察された。
注入後8~12週間の期間にわたって、MAGE-A4 CD8 TCR T細胞を含む形質導入リンパ球(lymphocycte)の絶対濃度は、高いレベル(46~53%)で保持され、治療用T細胞の永続性を示した。
配列
配列番号1、MAGE A4
Figure 2023526259000001
配列番号2、MAGE A4ペプチド
GVYDGREHTV
配列番号3;(CD8α)太字で下線を引かれたCDR、斜体で下線を引かれたシグナル配列
Figure 2023526259000002
配列番号4;(CD8α)
Figure 2023526259000003
配列番号5;(MAGE A4 TCR α鎖)太字で下線を引かれたCDR
Figure 2023526259000004
配列番号6;(MAGE A4 TCR α鎖コード配列)
Figure 2023526259000005
配列番号7;(MAGE A4 TCR β鎖)太字で下線を引かれたCDR
Figure 2023526259000006
配列番号8;(MAGE A4 TCR β鎖コード配列)
Figure 2023526259000007
配列番号9;(MAGE A4 TCR α鎖可変領域)136AA-太字で下線を引かれたCDR
MKKHLTTFLVILWLYFYRGNGKNQVEQSPQSLIILEGKNCTLQCNYTVSPFSNLRWYKQDTGRGPVSLTILTFSENTKSNGRYTATLDADTKQSSLHITASQLSDSASYICVVSGGTDSWGKLQFGAGTQVVVTPD
配列番号10;(MAGE A4 TCR β鎖可変領域)133AA-太字で下線を引かれたCDR
MASLLFFCGAFYLLGTGSMDADVTQTPRNRITKTGKRIMLECSQTKGHDRMYWYRQDPGLGLRLIYYSFDVKDINKGEISDGYSVSRQAQAKFSLSLESAIPNQTALYFCATSGQGAYEEQFFGPGTRLTVLE
配列番号11;CDR1 MAGE A4 TCR α鎖、(残基48~53)
VSPFSN
配列番号12;CDR2 MAGE A4 TCR α鎖、(残基71~76)
LTFSEN
配列番号13;CDR3 MAGE A4 TCR α鎖、(残基111~125)
CVVSGGTDSWGKLQF
配列番号14;CDR1 MAGE A4 TCR β鎖、(残基46~50)
KGHDR
配列番号15;CDR2 MAGE A4 TCR β鎖、(残基68~73)
SFDVKD
配列番号16;CDR3 MAGE A4 TCR β鎖、(残基110~123)
CATSGQGAYEEQFF
配列番号17;CDR1 CD8α(残基45~53)
VLLSNPTSG
配列番号18;CDR2 CD8α(残基72~79)
YLSQNKPK
配列番号19;CDR3 CD8α(残基118~123)
LSNSIM

Claims (47)

  1. 対象におけるがんおよび/または腫瘍を治療する、阻止する、またはその進行を遅延させる方法であって、GVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE A4のペプチド抗原に結合する異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する改変免疫応答性細胞の有効量を含む治療レジメンを前記対象に施すステップを含み、前記がんおよび/または腫瘍は胃食道がんおよび/または腫瘍である、方法。
  2. MAGE A4の前記ペプチド抗原が、配列GVYDGREHTV、配列番号2を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記異種TCRが、前記ペプチド抗原に特異的かつ/または選択的に結合する、請求項1または2に記載の方法。
  4. 前記ペプチド抗原が、胃食道がんおよび/もしくは腫瘍と関連し、かつ/または腫瘍および/もしくはがん細胞もしくは組織によって提示される、請求項1から3のいずれか一項に記載の方法。
  5. 前記がんおよび/または腫瘍が、MAGE A4発現がんおよび/もしくは腫瘍であり、かつ/またはMAGE A4もしくはそのペプチド抗原、またはGVYDGREHTV、配列番号2を含むMAGE A4のペプチド抗原を発現する、請求項1から4のいずれか一項に記載の方法。
  6. 前記ペプチド抗原が、ペプチド提示分子、任意選択で主要組織適合性複合体(MHC)またはヒト白血球抗原(HLA)、任意選択でクラスIまたはクラスIIと複合体化される、請求項1から5のいずれか一項に記載の方法。
  7. 前記ペプチド提示分子が、任意選択でHLA*02、HLA-A*02:01、HLA-A*02:02、HLA-A*02:03、HLA-A*02:04、HLA-A*02:05、HLA-A*02:06、HLA-A*02:642、またはHLA-A*02:07、好ましくはHLA-A*02:01またはHLA-A*02から選択されるHLA-A*02である、請求項6に記載の方法。
  8. 前記異種TCRが、前記ペプチド抗原および/もしくは前記ペプチド提示分子、ならびに/またはその複合体に特異的かつ/または選択的に結合する、請求項1から6のいずれか一項に記載の方法。
  9. 前記ペプチド抗原が、ペプチド提示分子とは無関係に提示される、請求項1から5のいずれか一項に記載の方法。
  10. 前記異種TCRが、TCRアルファ鎖可変ドメインおよびTCRベータ鎖可変ドメインを含み、
    (i)前記アルファ鎖可変ドメインは、配列
    VSPFSN(αCDR1)、配列番号11、もしくは配列番号5のアミノ酸残基48~53、またはそれと少なくとも50%の配列同一性を有する配列、
    LTFSEN(αCDR2)、配列番号12、もしくは配列番号5のアミノ酸残基71~76、またはそれと少なくとも50%の配列同一性を有する配列、および
    CVVSGGTDSWGKLQF(αCDR3)、配列番号13、もしくは配列番号5のアミノ酸残基111~125、またはそれと少なくとも50%の配列同一性を有する配列
    を有するCDRを含み、
    (ii)前記ベータ鎖可変ドメインは、配列
    KGHDR(βCDR1)、配列番号14、もしくは配列番号7のアミノ酸残基46~50、またはそれと少なくとも50%の配列同一性を有する配列、
    SFDVKD(βCDR2)、配列番号15、もしくは配列番号7のアミノ酸残基68~73、またはそれと少なくとも50%の配列同一性を有する配列、および
    CATSGQGAYEEQFF(βCDR3)、配列番号16、もしくは配列番号7のアミノ酸残基110~123、またはそれと少なくとも50%の配列同一性を有する配列
    を有するCDRを含む、
    請求項1から9のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記異種TCRが、
    (a)前記アルファ鎖可変ドメインが、配列番号9と少なくとも80%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ/もしくは前記ベータ鎖可変ドメインが、配列番号10と少なくとも80%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、
    (b)前記アルファ鎖可変ドメインが、配列番号9を含むアミノ酸配列を含み、かつ/もしくは前記ベータ鎖可変ドメインが配列番号10を含む、
    (c)前記アルファ鎖が、配列番号5と少なくとも80%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ/もしくは前記ベータ鎖が、配列番号6と少なくとも80%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、または
    (d)前記アルファ鎖が、配列番号5を含むアミノ酸配列を含み、かつ/もしくは前記ベータ鎖が、配列番号6を含むアミノ酸配列を含む、
    TCRを含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 異種TCRを発現するまたは提示する前記改変免疫応答性細胞が、異種共受容体をさらに発現または提示し、任意選択で前記共受容体はCD8共受容体である、請求項1から11のいずれか一項に記載の方法。
  13. 前記異種CD8共受容体が、ヘテロ二量体またはホモ二量体、CD8αbヘテロ二量体またはCD8ααホモ二量体である、請求項12に記載の方法。
  14. 前記異種CD8共受容体が、
    (a)アミノ酸配列VLLSNPTSG、配列番号17と少なくとも80%の配列同一性のCDR1、アミノ酸配列YLSQNKPK、配列番号18と少なくとも80%の配列同一性のCDR2、およびアミノ酸配列LSNSIM、配列番号19と少なくとも80%の配列同一性のCDR3、
    (b)アミノ酸配列VLLSNPTSG、配列番号17のCDR1、アミノ酸配列YLSQNKPK、配列番号18のCDR2、およびアミノ酸配列LSNSIM、配列番号19のCDR3、
    (c)配列番号3のアミノ酸番号22~235、もしくは配列番号3の22~135と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列、または
    (d)配列番号3のアミノ酸番号22~235、もしくは配列番号3の22~135と100%の配列同一性を有するアミノ酸配列
    のうちのいずれか1つを含む、請求項10または11のいずれか一項に記載の方法。
  15. 異種TCRを発現するまたは提示する前記改変免疫応答性細胞が、異種共刺激性リガンド、任意選択で4-1BBLまたはCD80をさらに発現するまたは提示する、請求項1から14のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記改変免疫応答性細胞が、(a)B細胞、T細胞、またはナチュラルキラー(NK)細胞、(b)T細胞、任意選択でCD4T細胞および/またはCD8T細胞である、請求項1から15のいずれか一項に記載の方法。
  17. 前記改変免疫応答性細胞が、CD4+T細胞;もしくはCD8+T細胞の集団、またはCD4+T細胞とCD8+T細胞との混合集団である、請求項1から16のいずれか一項に記載の方法。
  18. 前記改変免疫応答性細胞が、連続的にまたは間欠的に投与される、請求項1から17のいずれか一項に記載の方法。
  19. 前記改変免疫応答性細胞が、複数回用量として投与されるか、または単回用量として投与される、請求項1から18のいずれか一項に記載の方法。
  20. 前記単回または複数回用量が、1回または複数回の投薬サイクルにおいて投与され、任意選択で前記用量は、固定用量または可変用量であり得る、請求項19に記載の方法。
  21. 前記改変免疫応答性細胞が、細胞約5億~約10億個、細胞約20億~約50億個、または細胞約60億~約100億個の用量で投与される、請求項1から20のいずれか一項に記載の方法。
  22. 前記改変免疫応答性細胞が、
    (a)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける単回用量、
    (b)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける1回または複数回の用量、
    (c)1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれの1日目における単回用量、
    (d)少なくとも1回の用量が各サイクルの1日目におけるものである、1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける1回または複数回の用量、
    (e)少なくとも1回の用量が各サイクルの1日目におけるものである、1回または複数回の投薬サイクルのそれぞれにおける1回または複数回の用量、
    (f)単回用量
    として投与される、請求項1から21のいずれか一項に記載の方法。
  23. 前記投薬サイクルが、2~6ヶ月間であるか、または疾患進行におけるものである、請求項20から22のいずれか一項に記載の方法。
  24. 前記投薬サイクルが、
    (a)改変免疫応答性細胞の以前の投与後の疾患進行、および改変免疫応答性細胞の以前の投与の12週間以上後
    におけるものであり、
    (b)前記腫瘍および/もしくはがんは、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原を発現し、かつ/または
    (c)MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原は、対象生物学的サンプルにおいて検出され、かつ/もしくは正常範囲を上回る、
    請求項20から23のいずれか一項に記載の方法。
  25. 前記投薬サイクルが、
    (a)改変免疫応答性細胞の以前の投与後の完全もしくは部分奏効、または(b)改変免疫応答性細胞の以前の投与後の4ヶ月間を上回るもしくはそれに等しい期間の安定疾患、それに続く疾患進行;および(c)改変免疫応答性細胞の以前の投与の12週間を上回るもしくはそれに等しい後
    におけるものであり、
    (d)前記腫瘍および/もしくはがんは、MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原を発現し、かつ/または
    (e)MAGE-A4および/もしくはそのペプチド抗原は、対象生物学的サンプルにおいて検出され、かつ/もしくは正常範囲を上回る、
    請求項20から23のいずれか一項に記載の方法。
  26. 前記改変免疫応答性細胞が静脈内にまたは静脈内注入によって投与される、請求項1から25のいずれか一項に記載の方法。
  27. 治療前に、前記対象が、0~1の米国東海岸癌臨床試験グループ(ECOG)、ならびに/または固形腫瘍における応答評価基準(RECIST)1.1に従った測定可能な疾患、ならびに/または組織学的に確定された胃食道がんおよび/もしくは腫瘍を有する、請求項1から26のいずれか一項に記載の方法。
  28. 治療前に、前記対象が、
    (a)HLA-A遺伝子型が、唯一のHLA-A*02アレルとしてのHLA-A*02:07bである、
    (b)HLA-A遺伝子型が、唯一のHLA-A*02アレルとしての任意のA*02ヌルアレルのHLA-A*である、または
    (c)症候性CNS転移
    のうちのいずれか1つまたは複数を有する場合には、前記対象は前記治療から除外される、請求項1から27のいずれか一項に記載の方法。
  29. 前記対象が、標準ケア治療、任意選択で全身性白金ベース化学療法治療に不忍容である、請求項1から28のいずれか一項に記載の方法。
  30. 前記胃食道がんおよび/または腫瘍が、標準ケア治療、任意選択で全身性白金ベース化学療法治療を用いた治療に以前に失敗したことがある、請求項1から29のいずれか一項に記載の方法。
  31. 前記胃食道がんおよび/または腫瘍が、手術(切除)、放射線療法、標的療法、免疫療法、もしくは化学療法、または手術(切除)、放射線療法、放射線療法、標的療法、チェックポイント阻害剤、もしくは免疫療法との併用化学療法のうちのいずれかを用いた治療に以前に失敗したことがある、請求項1から30のいずれか一項に記載の方法。
  32. 前記対象が、原発性がん、続発性がん、再燃性がんまたは難治性がんまたは再発性がんまたは局所再発性がんまたは転移性がん、手術もしくは放射線療法選択肢を有しない切除不能がんもしくは局所限局性がん、または手術不可能ながんを有するか、あるいは前記胃食道がんおよび/または腫瘍が、原発性がん、続発性がん、再燃性がんまたは難治性がんまたは再発性がんまたは局所再発性がんまたは転移性がん、手術もしくは放射線療法選択肢を有しない切除不能がんもしくは局所限局性がん、または手術不可能ながんであり、任意選択で前記がんは移植または局所領域療法に適していない、請求項1から31のいずれか一項に記載の方法。
  33. 前記胃食道がんおよび/または腫瘍が、食道扁平上皮細胞癌(ESCC)、食道腺癌(EAC)、食道胃接合部がん、癌腫、腺癌、もしくは腫瘍(EGJ)、または胃(stomach)もしくは胃(gastric)がん、癌腫、もしくは腫瘍のうちのいずれか、任意選択で転移性および/または進行性および/または局所進行性および/または再発性のESCC、EAC、EGJ、または胃(stomach)もしくは胃(gastric)がん、癌腫、もしくは腫瘍である、請求項1から32のいずれか一項に記載の方法。
  34. 異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する前記改変免疫応答性細胞の投与前に、前記対象がリンパ枯渇化学療法を受ける、請求項1から33のいずれか一項に記載の方法。
  35. 前記リンパ枯渇化学療法が、任意選択で500mg/m/d×3dのシクロホスファミドおよび20mg/m/d×3dのフルダラビンの用量での、または600mg/m/d×3dのシクロホスファミドおよび30mg/m2/d×4dのフルダラビンの用量での、シクロホスファミドおよびフルダラビンの投与を含む、請求項34に記載の方法。
  36. 前記リンパ枯渇化学療法が、異種T細胞受容体(TCR)を発現するまたは提示する前記改変免疫応答性細胞の投与の7~5または7~4日前に投与される、請求項34または35に記載の方法。
  37. 前記対象が、がんおよび/または腫瘍に対する先行治療を受けていない、請求項1から36のいずれか一項に記載の方法。
  38. 前記対象が、先行するがんおよび/もしくは腫瘍治療を受けており、かつ/または先行するがんおよび/もしくは腫瘍治療に応答しておらず、任意選択で前記先行治療は、胃食道がんおよび/または腫瘍に対するものである、請求項1から36のいずれか一項に記載の方法。
  39. 前記先行治療が、全身および/または局所療法、任意選択で手術、放射線療法、凍結療法、レーザー療法、局部療法のうちのいずれか1種もしくは複数、および/または全身療法、例えば化学療法、ホルモン療法、標的薬、標的化学療法、もしくは免疫療法のうちのいずれか1種もしくは複数を含む、請求項38に記載の方法。
  40. 前記先行治療が、PD-L1結合アンタゴニストまたはPD-1結合アンタゴニストを含み、任意選択でPD-1軸結合アンタゴニストまたはPD-L1結合アンタゴニストは抗体である、請求項39に記載の方法。
  41. 前記先行治療が、上皮成長因子受容体アンタゴニスト、任意選択でセツキシマブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、もしくはアファチニブのうちのいずれか、または例えばラムシルマブもしくはベバシズマブ等の血管内皮成長因子(VEGF)阻害剤、またはパニツムマブもしくはセツキシマブ等のEGFR阻害剤抗体、またはオナルツズマブもしくはリロツムマブ等のヒト肝細胞成長因子HGFおよび/もしくはMet阻害剤を含む、請求項39に記載の方法。
  42. 前記先行治療が、任意選択でリポプラチン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、トリプラチンテトラニトレート、フェナントリプラチン、サトラプラチン、ピコプラチンのうちのいずれかから選択される白金化合物を含む化学療法を含む、請求項39に記載の方法。
  43. 前記先行治療が、メトトレキサート、カペシタビン、タキサン、アントラサイクリン、パクリタキセル、ドセタキセル、パクリタキセルタンパク質結合粒子、ドキソルビシン、エピルビシン、5-フルオロウラシル、シクロホスファミド、アファチニブ、ビンクリスチン、エトポシド、またはその組み合わせのうちのいずれかから選択される化学療法剤を含む化学療法を含む、請求項39に記載の方法。
  44. 前記先行治療が、FEC:5-フルオロウラシル、エピルビシン、シクロホスファミド;FAC:5-フルオロウラシル、ドキソルビシン、シクロホスファミド;AC:ドキソルビシン、シクロホスファミド;EC:エピルビシン、シクロホスファミドのうちのいずれかから選択される化学療法剤を含む化学療法を含む、請求項39に記載の方法。
  45. 前記対象が、最後の治療以降12ヶ月未満のもしくはそれに等しい、または最後の治療以降6ヶ月未満のもしくはそれに等しい再発において先行治療を受けていない、請求項39から44のいずれか一項に記載の方法。
  46. 前記対象が、最後の治療以降12ヶ月未満のもしくはそれに等しい再発において、または最後の治療以降6ヶ月未満のもしくはそれに等しい再発において、いかなる先行アジュバント療法(例えば、手術、それに続く放射線および/または化学療法)または局所領域療法も受けていない、請求項39から44のいずれか一項に記載の方法。
  47. 前記治療が、プラセボ治療と比較して、または治療前と比較して、または治療なしと比較して、または標準ケアを含む治療、任意選択で全身性白金ベース化学療法治療と比較して、
    (a)無増悪生存期間、
    (b)無増悪期間、
    (c)奏効期間、
    (d)全生存期間、
    (e)客観的奏効もしくは客観的奏効率、
    (f)全奏効もしくは全奏効率、
    (g)部分奏効もしくは部分奏効率、
    (h)完全奏効もしくは完全奏効率;
    (i)安定疾患率もしくは安定疾患中央値
    (j)無増悪生存期間中央値、
    (k)無増悪期間中央値、
    (l)奏効期間中央値、または
    (m)全生存期間中央値;
    (n)客観的奏効中央値もしくは客観的奏効率中央値、
    (o)全奏効中央値もしくは全奏効率中央値、
    (p)部分奏効中央値もしくは部分奏効率中央値、
    (q)完全奏効中央値もしくは完全奏効中央値、
    (r)安定疾患率中央値もしくは安定疾患中央値
    を有効に延長するか、または向上させる、請求項1から46のいずれか一項に記載の方法。
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