JP2023514795A - Methods and compositions for treating cancer - Google Patents

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Abstract

本出願は、チェックポイントインヒビターとの組み合わせにおいてFGFR3インヒビターを使用して、がん(luminal型膀胱がんのような膀胱がんが挙げられる)を処置するための組成物、方法、およびキットを提供する。いくつかの実施形態において、上記がんは、野生型FGFR3を発現する。上記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3インヒビター(例えば、アンタゴニスト的FGFR3抗体であり得る。上記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビター(PD1またはPD1リガンド(PD-L1)抗体(例えば、アンタゴニスト的PD1またはPD-L1抗体のような)が挙げられる)であり得る。The present application provides compositions, methods, and kits for treating cancer, including bladder cancer, such as luminal bladder cancer, using FGFR3 inhibitors in combination with checkpoint inhibitors. do. In some embodiments, the cancer expresses wild-type FGFR3. The FGFR3 inhibitor can be an antagonistic FGFR3 inhibitor, such as an antagonistic FGFR3 antibody. The checkpoint inhibitor can be a PD1 inhibitor (PD1 or PD1 ligand (PD-L1) antibody, such as an antagonistic PD1 or PD-L1 antibody such as).

Description

優先権の主張
本出願は、2019年3月1日出願の米国仮特許出願第62/812,929号、2019年6月3日出願の米国仮特許出願第62/856,216号、および2019年9月27日出願の米国仮特許出願第62/907,504号(これらの開示は、図面を含め、それらの全体において本明細書に参考として援用される)に基づく利益を主張する。
PRIORITY CLAIM This application is based on U.S. Provisional Patent Application No. 62/812,929 filed March 1, 2019, U.S. Provisional Patent Application No. 62/856,216 filed June 3, 2019, and U.S. Provisional Patent Application No. 62/856,216 No. 62/907,504, filed Sep. 27, 2004, the disclosures of which are hereby incorporated by reference in their entirety, including drawings.

配列表
本開示は、EFS-Webを介してASCIIフォーマットで提出され、その全体において参考として援用される配列表を含む。そのASCIIコピー(作成日:2020年3月3日)は、名称SequenceListing.txtであり、サイズが10キロバイトである。
SEQUENCE LISTING This disclosure contains a Sequence Listing which has been submitted in ASCII format via EFS-Web and is incorporated by reference in its entirety. Its ASCII copy (created on March 3, 2020) has the name SequenceListing. txt and is 10 kilobytes in size.

背景
尿路上皮細胞癌(UCC)-移行上皮癌(TCC)としても公知-は、尿路系(すなわち、腎臓、膀胱、および付属器官)において起こり、膀胱がんの最も一般的なタイプであり、全膀胱腫瘍のうちの90%を占める(Eble 2004)。それは、米国(US)において第5位の一般的ながん(Costantini 2011)、欧州において第4位の一般的ながん(Jemal 2011)であり;推定74,690件の新たな症例および15,580件の死亡が、米国で2014年に起こっており(American Cancer Society 2018)、推定136,000件の新たな症例および49,000件の死亡が、欧州で2009年に起こっている(Bellmunt 2009)。臨床研究および病理研究によって、膀胱の尿路上皮細胞癌(UCB)の2つのバリアントが同定されており、これは、別個の機構、低グレード乳頭バリアントおよび侵襲性腫瘍バリアントを介して生じる(Wu 2005; Vallot 2010)。上記低グレード乳頭バリアントは、全UCBのうちの80%を占め、尿路上皮過形成から生じる。この腫瘍タイプの5年生存率は、手術および膀胱内免疫療法で処置された場合、90%超である(American Cancer Society 2018)。上記侵襲性腫瘍バリアントは、UCBのうちの20%を表し、予後不良である。dose dense M-VAC(Sternberg 2001)またはゲムシタビン・シスプラチン(von der Maase 2000)のいずれかを伴うシスプラチンベースの化学療法は、侵襲性UCCの標準処置のままである。最初の奏効率が50~70%程度であるにもかかわらず、このがんは、代表的には急速に進行し、メジアン生存は約13~15ヶ月である(von der Maase 2000; Siefker-Radtke 2002)。UCCの新たな治療が必要とされる。
Background Urothelial cell carcinoma (UCC)--also known as transitional cell carcinoma (TCC)--occurs in the urinary system (ie, kidney, bladder, and adnexa) and is the most common type of bladder cancer. , which accounts for 90% of all bladder tumors (Eble 2004). It is the fifth most common cancer in the United States (US) (Costantini 2011) and the fourth most common cancer in Europe (Jemal 2011); an estimated 74,690 new cases and 15 , 580 deaths occurred in the United States in 2014 (American Cancer Society 2018), and an estimated 136,000 new cases and 49,000 deaths occurred in Europe in 2009 (Bellmund 2009). Clinical and pathological studies have identified two variants of urothelial cell carcinoma (UCB) of the bladder, which arise through distinct mechanisms, a low-grade papillary variant and an aggressive tumor variant (Wu 2005). ; Vallot 2010). The low-grade papillary variant accounts for 80% of all UCB and results from urothelial hyperplasia. The 5-year survival rate for this tumor type is greater than 90% when treated with surgery and intravesical immunotherapy (American Cancer Society 2018). The aggressive tumor variants represent 20% of UCB and have a poor prognosis. Cisplatin-based chemotherapy with either dose dense M-VAC (Sternberg 2001) or gemcitabine cisplatin (von der Maase 2000) remains the standard treatment for aggressive UCC. Despite an initial response rate of the order of 50-70%, this cancer typically progresses rapidly, with a median survival of about 13-15 months (von der Maase 2000; Siefker-Radtke 2002). New treatments for UCC are needed.

要旨
必要とする被験体においてがん(例えば、転移性尿路上皮がん(mUC)のような膀胱がんおよび上部尿路上皮がんが挙げられる)を処置するある特定の実施形態および方法であって、治療上有効な量のFGFR3インヒビターおよび治療上有効な量のチェックポイントインヒビター(例えば、PD1インヒビター)を投与する工程を包含する実施形態および方法が、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3を結合する。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3のリガンド、例えば、FGF1、FGF2、またはFGF9を結合する。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1を含むCDR-H1、配列番号2を含むCDR-H2、配列番号3を含むCDR-H3、配列番号7を含む重鎖可変領域、配列番号9を含む重鎖、配列番号4を含むCDR-L1、配列番号5を含むCDR-L2、配列番号6を含むCDR-L3、配列番号8を含む軽鎖可変領域、および配列番号10に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖のうちの1またはこれより多くを含む。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト的抗体は、ボファタマブである。他の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、PRO-001およびIMC-D11からなる群より選択される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、低分子汎FGFRインヒビターであり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記汎FGFRインヒビターは、インフィグラチニブ、AZD4547、LY2874455、ペミガチニブ、BGJ398、ロガラチニブ、PRN1371、Debio 1347、ARQ 087、およびJNJ-42756493からなる群より選択される。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1を結合する。他の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1のリガンド、例えば、PDL1またはPDL2を結合する。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD1抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的PD1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、CT-011、MEDI-0680、およびRMP1-14からなる群より選択される。他の実施形態において、上記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD1リガンド抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的PD1リガンド抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される。
SUMMARY In certain embodiments and methods of treating cancer in a subject in need thereof, including bladder cancer and upper urothelial cancer, such as metastatic urothelial cancer (mUC) Provided herein are embodiments and methods comprising administering a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor and a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor (eg, a PD1 inhibitor). In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor binds FGFR3. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor binds a ligand of FGFR3, eg, FGF1, FGF2, or FGF9. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody comprises a CDR-H1 comprising SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, CDR-H3 with SEQ ID NO:3, heavy chain variable region with SEQ ID NO:7, heavy chain with SEQ ID NO:9, CDR-L1 with SEQ ID NO:4, CDR- with SEQ ID NO:5 L2, CDR-L3 comprising SEQ ID NO:6, a light chain variable region comprising SEQ ID NO:8, and one or more of a light chain comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:10. In certain of these embodiments, the FGFR3 antagonistic antibody is bofatamab. In other embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody is selected from the group consisting of PRO-001 and IMC-D11. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is a small molecule pan-FGFR inhibitor, and in certain of these embodiments, the pan-FGFR inhibitor is infigatinib, AZD4547, LY2874455, pemigatinib, BGJ398 , rogaratinib, PRN1371, Debio 1347, ARQ 087, and JNJ-42756493. In certain embodiments, the PD1 inhibitor binds PD1. In other embodiments, the PD1 inhibitor binds a ligand of PD1, eg, PDL1 or PDL2. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonistic PD1 antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic PD1 antibody is nivolumab, pembrolizumab, CT-011, MEDI-0680 , and RMP1-14. In other embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonistic PD1 ligand antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic PD1 ligand antibody is MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.

ある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターおよびチェックポイントインヒビター(例えば、PD1インヒビター)を含む組成物が、本明細書で提供される。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記組成物は、薬学的組成物であり、ある特定の実施形態において、上記組成物は、1またはこれより多くの薬学的に受容可能なキャリアを含む。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3を結合する。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3のリガンド、例えば、FGF1、FGF2、またはFGF9を結合する。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1を含むCDR-H1、配列番号2を含むCDR-H2、配列番号3を含むCDR-H3、配列番号7を含む重鎖可変領域、配列番号9を含む重鎖、配列番号4を含むCDR-L1、配列番号5を含むCDR-L2、配列番号6を含むCDR-L3、配列番号8を含む軽鎖可変領域、および配列番号10に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖のうちの1またはこれより多くを含む。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト的抗体は、ボファタマブである。他の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、PRO-001およびIMC-D11からなる群より選択される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、低分子汎FGFRインヒビターであり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記汎FGFRインヒビターは、インフィグラチニブ、AZD4547、LY2874455、ペミガチニブ、BGJ398、ロガラチニブ、PRN1371、Debio 1347、ARQ 087、およびJNJ-42756493からなる群より選択される。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1を結合する。他の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1のリガンド、例えば、PDL1またはPDL2を結合する。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD1抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的PD1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、CT-011、MEDI-0680、およびRMP1-14からなる群より選択される。他の実施形態において、上記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD1リガンド抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的PD1リガンド抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される。 In certain embodiments, provided herein are compositions comprising an FGFR3 inhibitor and a checkpoint inhibitor (eg, a PD1 inhibitor). In certain of these embodiments, the composition is a pharmaceutical composition, and in certain embodiments, the composition comprises one or more pharmaceutically acceptable carriers. including. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor binds FGFR3. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor binds a ligand of FGFR3, eg, FGF1, FGF2, or FGF9. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody comprises a CDR-H1 comprising SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, CDR-H3 with SEQ ID NO:3, heavy chain variable region with SEQ ID NO:7, heavy chain with SEQ ID NO:9, CDR-L1 with SEQ ID NO:4, CDR- with SEQ ID NO:5 L2, CDR-L3 comprising SEQ ID NO:6, a light chain variable region comprising SEQ ID NO:8, and one or more of a light chain comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:10. In certain of these embodiments, the FGFR3 antagonistic antibody is bofatamab. In other embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody is selected from the group consisting of PRO-001 and IMC-D11. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is a small molecule pan-FGFR inhibitor, and in certain of these embodiments, the pan-FGFR inhibitor is infigatinib, AZD4547, LY2874455, pemigatinib, BGJ398 , rogaratinib, PRN1371, Debio 1347, ARQ 087, and JNJ-42756493. In certain embodiments, the PD1 inhibitor binds PD1. In other embodiments, the PD1 inhibitor binds a ligand of PD1, eg, PDL1 or PDL2. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonistic PD1 antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic PD1 antibody is nivolumab, pembrolizumab, CT-011, MEDI-0680 , and RMP1-14. In other embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonistic PD1 ligand antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic PD1 ligand antibody is MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.

ある特定の実施形態において、必要とする被験体において野生型FGFR3を発現するがんを処置するための方法であって、上記方法は、上記被験体に、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程を包含する方法をが、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3を結合する。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3のリガンド、例えば、FGF1、FGF2、またはFGF9を結合する。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1を含むCDR-H1、配列番号2を含むCDR-H2、配列番号3を含むCDR-H3、配列番号7を含む重鎖可変領域、配列番号9を含む重鎖、配列番号4を含むCDR-L1、配列番号5を含むCDR-L2、配列番号6を含むCDR-L3、配列番号8を含む軽鎖可変領域、および配列番号10に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖のうちの1またはこれより多くを含む。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト的抗体は、ボファタマブである。他の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、PRO-001およびIMC-D11からなる群より選択される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、低分子汎FGFRインヒビターであり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記汎FGFRインヒビターは、インフィグラチニブ、AZD4547、LY2874455、ペミガチニブ、BGJ398、ロガラチニブ、PRN1371、Debio 1347、ARQ 087、およびJNJ-42756493からなる群より選択される。ある特定の実施形態において、上記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記PD1インヒビターは、PD1を結合する。他の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1のリガンド、例えば、PDL1またはPDL2を結合する。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD1抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的PD1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、CT-011、MEDI-0680、およびRMP1-14からなる群より選択される。他の実施形態において、上記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD1リガンド抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記アンタゴニスト的PD1リガンド抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される。 In certain embodiments, a method for treating a wild-type FGFR3-expressing cancer in a subject in need thereof, said method comprising administering to said subject a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor, Provided herein are methods comprising administering in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor binds FGFR3. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor binds a ligand of FGFR3, eg, FGF1, FGF2, or FGF9. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody comprises a CDR-H1 comprising SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, CDR-H3 with SEQ ID NO:3, heavy chain variable region with SEQ ID NO:7, heavy chain with SEQ ID NO:9, CDR-L1 with SEQ ID NO:4, CDR- with SEQ ID NO:5 L2, CDR-L3 comprising SEQ ID NO:6, a light chain variable region comprising SEQ ID NO:8, and one or more of a light chain comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:10. In certain of these embodiments, the FGFR3 antagonistic antibody is bofatamab. In other embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody is selected from the group consisting of PRO-001 and IMC-D11. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is a small molecule pan-FGFR inhibitor, and in certain of these embodiments, the pan-FGFR inhibitor is infigatinib, AZD4547, LY2874455, pemigatinib, BGJ398 , rogaratinib, PRN1371, Debio 1347, ARQ 087, and JNJ-42756493. In certain embodiments, the checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor. In certain of these embodiments, the PD1 inhibitor binds PD1. In other embodiments, the PD1 inhibitor binds a ligand of PD1, eg, PDL1 or PDL2. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonistic PD1 antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic PD1 antibody is nivolumab, pembrolizumab, CT-011, MEDI-0680 , and RMP1-14. In other embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonistic PD1 ligand antibody, and in certain of these embodiments, the antagonistic PD1 ligand antibody is MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.

ある特定の実施形態において、野生型FGFR3を発現するがんを有する、必要とする被験体を処置するための方法であって、上記方法は、(a)上記被験体を、1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーに関してまたはp53発現に関してスクリーニングする工程、(b)上記被験体が上記1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーを有するか、またはp53発現を有するかを決定する工程、(c)工程(b)の決定に基づいて、(i)上記被験体が上記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有さない場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程、ならびに(ii)上記被験体が上記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を発現する場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターおよびさらなる抗がん剤と組み合わせて投与する工程を包含する方法が、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である。ある特定の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3、および配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3、および配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである。ある特定の実施形態において、上記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択されるアンタゴニスト的PD-L1抗体である。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである。ある特定の実施形態において、上記がんは、luminal型膀胱がんである。ある特定の実施形態において、上記遺伝子シグナチャーは、少なくとも以下の遺伝子を含む: FGFR3、TP63、IRS1、SEMA4B、PTPN13、およびTMPRSS4。ある特定の実施形態において、上記遺伝子シグナチャーは、少なくとも以下の遺伝子を含む: KRT5、KRT6A、KRT6B、KRT14、UPK3A、UPK3B、FOXA1、およびPPARG。ある特定の実施形態において、上記遺伝子シグナチャーは、少なくとも以下の遺伝子を含む: ACTC1、ACTG2、NCC1、DES、FLNC、MFAP4、MYH11、およびPCP4。 In certain embodiments, a method for treating a subject in need thereof having a cancer that expresses wild-type FGFR3, said method comprising: (a) said subject; (b) whether said subject has a genetic signature that correlates with said one or more cancer-associated fibroblasts; or p53 expression, (c) based on the determination of step (b), (i) if said subject does not have said gene signature or p53 expression, a therapeutically effective amount of FGFR3 administering an inhibitor in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor; and (ii) if said subject expresses said gene signature or p53 expression, a therapeutically effective amount of FGFR3 inhibitor. Provided herein are methods comprising administering in combination with an effective amount of a checkpoint inhibitor and an additional anti-cancer agent. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody. In certain embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:1, a CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:2, an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:3 and a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:7. In certain embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, a CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is bofatamab. In certain embodiments, the checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonist PD-L1 antibody selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is pembrolizumab. In certain embodiments, the cancer is luminal bladder cancer. In certain embodiments, the gene signature comprises at least the following genes: FGFR3, TP63, IRS1, SEMA4B, PTPN13, and TMPRSS4. In certain embodiments, the gene signature comprises at least the following genes: KRT5, KRT6A, KRT6B, KRT14, UPK3A, UPK3B, FOXA1, and PPARG. In certain embodiments, the gene signature comprises at least the following genes: ACTC1, ACTG2, NCC1, DES, FLNC, MFAP4, MYH11, and PCP4.

ある特定の実施形態において、膀胱がんの処置において使用するためのFGFR3インヒビターおよびチェックポイントインヒビター(例えば、PD1インヒビター)を含むキットが、本明細書で提供される。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記キットは、使用説明書をさらに含む。 In certain embodiments, provided herein are kits comprising FGFR3 inhibitors and checkpoint inhibitors (eg, PD1 inhibitors) for use in treating bladder cancer. In certain of these embodiments, the kit further comprises instructions for use.

ある特定の実施形態において、膀胱がんの処置のための医薬の製剤化において使用するためのFGFR3インヒビターおよびチェックポイントインヒビター(例えば、PD1インヒビター)の使用が、本明細書で提供される。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、1つの医薬に製剤化される。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、互いと組み合わせて投与される別個の医薬に製剤化される。 In certain embodiments, provided herein is the use of FGFR3 inhibitors and checkpoint inhibitors (eg, PD1 inhibitors) for use in the formulation of medicaments for the treatment of bladder cancer. In certain of these embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor are formulated into one medicament. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor are formulated into separate medicaments that are administered in combination with each other.

図1は、ボファタマブ投与前および投与後の2つの予後クラスターを図示する、腫瘍の22のマッチした生検物に対して行った全トランスクリプトームRNAseqの結果を示す。クラスター1は、タイプがほとんどluminal型であり、応答者の大部分を含んだ。クラスター2は、性質がよりbasal型であり、予測奏効率と一致する臨床上の利益を示した。FIG. 1 shows the results of whole transcriptome RNAseq performed on 22 matched biopsies of tumors depicting two prognostic clusters pre- and post-bofatamab administration. Cluster 1 was mostly luminal in type and contained the majority of responders. Cluster 2 was more basal in nature and demonstrated clinical benefit consistent with expected response rates.

図2は、腫瘍の22のマッチした生検物に対して行った全トランスクリプトームRNAseqの結果を示す。basalサブタイプおよびluminalサブタイプを同定するために使用した遺伝子シグナチャーを、22の対になる腫瘍を分子サブタイプに割り当てるために使用した。Figure 2 shows the results of whole transcriptome RNAseq performed on 22 matched biopsies of tumors. The genetic signatures used to identify basal and luminal subtypes were used to assign 22 paired tumors to molecular subtypes.

図3は、ボファタマブ処置後の応答者における炎症経路および免疫経路の変更を示す。FIG. 3 shows alterations of inflammatory and immune pathways in responders after bofatamab treatment.

図4は、第2系統mUCにおけるボファタマブ+ペンブロリズマブの効果を調べるフェーズ1b/フェーズ2試験デザインの模式図である。FIG. 4 is a schematic representation of the Phase 1b/Phase 2 study design investigating the effects of bofatamab plus pembrolizumab in lineage 2 mUC.

図5は、WT 対 Mut/Fusに基づくフェーズ2試験においてRECIST 1.1評価可能患者の応答性を示す。FIG. 5 shows RECIST 1.1 evaluable patient response in the WT vs. Mut/Fus based phase 2 trial.

図6は、応答者の免疫変化を示す。FIG. 6 shows immune changes in responders.

図7は、ボファタマブ(B-701)処置後のベースラインからの病変部の直径の概要(SoD)における変化を示すスパイダープロットである。このプロットは、ボファタマブが、腫瘍サイズにおける最初の見かけ上の増大、続いて、腫瘍容積の急激な低減を誘導するようであることを示す。FIG. 7 is a spider plot showing the change in summary lesion diameter (SoD) from baseline after bofatamab (B-701) treatment. This plot shows that bofatamab appears to induce an initial apparent increase in tumor size followed by a sharp reduction in tumor volume.

図8は、膀胱がん分子サブタイプの新しい定義を図示する。FIG. 8 illustrates new definitions of bladder cancer molecular subtypes.

図9は、分子サブグループに基づくフェーズ2試験におけるRECIST 1.1評価可能患者の応答性を示す。Figure 9 shows RECIST 1.1 evaluable patient response in Phase 2 study based on molecular subgroups.

図10は、分子サブタイプと併用療法への応答との間の関連性を示す。FIG. 10 shows the association between molecular subtypes and response to combination therapy.

図11は、分子サブグループによるフェーズ2試験における処置の継続期間を示す。Figure 11 shows the duration of treatment in the Phase 2 trial by molecular subgroup.

図12は、luminalサブタイプを有する男性mUC患者におけるボファタマブおよびペンブロリズマブの併用処置の結果を示す。Figure 12 shows the results of combined bofatamab and pembrolizumab treatment in male mUC patients with luminal subtype.

図13は、WT FGFR3患者 対 Mut/Fus患者の無増悪生存および全生存を示す。FIG. 13 shows progression-free survival and overall survival of WT FGFR3 patients versus Mut/Fus patients.

図14は、ボファタマブおよびペンブロリズマブの併用処置後の生存を示す。p53様腫瘍を有する患者(n=5)は、不十分な生存期間を示した。Figure 14 shows survival after combined treatment with bofatamab and pembrolizumab. Patients with p53-like tumors (n=5) showed poor survival.

詳細な説明
本発明の以下の説明は、本発明の種々の実施形態を例証することが意図されるに過ぎない。よって、考察される具体的改変は、本発明の範囲に対する限定として解釈されるべきではない。種々の等価物、変更、および改変が、本発明の範囲から逸脱することなくおこなれ得ることは当業者に明らかであり、このような等価な実施形態が本明細書に含まれるべきであることは、理解される。
DETAILED DESCRIPTION The following description of the invention is intended only to illustrate various embodiments of the invention. Therefore, the specific modifications discussed should not be construed as limitations on the scope of the invention. It will be apparent to those skilled in the art that various equivalents, modifications and alterations can be made without departing from the scope of the invention, and such equivalent embodiments are intended to be included herein. is understood.

ヒトには、4種の1回膜貫通チロシンキナーゼ線維芽細胞増殖因子レセプター(FGFR1-4)が存在する(Brooks 2012)。FGFRは、多くのがんタイプにおいて、しばしば構成的活性化を付与する変異に起因して過剰発現され、治療介入の魅力的標的になる。例えば、FGFR2b抗体FPA144(FivePrime)は、固形腫瘍、特に胃がんの処置に関して現在開発中である。がん処置に関して早期開発中の他のFGFR2モノクローナル抗体としては、GP369(Aveo)およびHuGAL-FR21(Galaxy)が挙げられる(Zhao 2010; Bai 2010)。ヒト化抗FGFR4はまた、腫瘍増殖を阻害することが報告されている(Bumbaca 2011)。 There are four single transmembrane tyrosine kinase fibroblast growth factor receptors (FGFR1-4) in humans (Brooks 2012). FGFR is overexpressed in many cancer types, often due to mutations that confer constitutive activation, making it an attractive target for therapeutic intervention. For example, the FGFR2b antibody FPA144 (FivePrime) is currently in development for the treatment of solid tumors, especially gastric cancer. Other FGFR2 monoclonal antibodies in early development for cancer treatment include GP369 (Aveo) and HuGAL-FR21 (Galaxy) (Zhao 2010; Bai 2010). Humanized anti-FGFR4 has also been reported to inhibit tumor growth (Bumbaca 2011).

FGFR3は、発がん特性および腫瘍抑制特性の両方を有する。FGFR3は頻繁に、ある特定のがんにおいて変異されるが、いくらかの正常組織においても変異され、それは、細胞増殖を制限し得、細胞分化を促進し得る(Lafitte 2013)。ヒトFGFR3アンタゴニスト的モノクローナル抗体ボファタマブ(ときおり、B-701またはBM2ともいわれる)は、臨床開発に入った最初のFGFR3標的化抗体であった。ボファタマブの可変部分は、ファージディスプレイを通じて元々同定され、次いで、ヒトIgG1骨格と組換えられた。ボファタマブは、野生型および変異型両方のFGFR3(膀胱がんおよび軟骨無形成症において見出される最も多い変異(特に、FGFR3-IIIbR248C、FGFR3-IIIbK652E、FGFR3-IIIY375C、FGFR3-IIIbS249C、およびFGFR3-IIIbG372C)ならびにFGFR3 TACC3およびFGFR3 BAIAP2L1を含む遺伝子融合を含む)に高親和性であるが、他のFGFRと交差反応性を示さずに結合する。ボファタマブは以前、t(4:14)転座多発性骨髄腫を有する患者における安全に関して評価された(Clinical Trial NCT01122875)。臨床開発または前臨床開発中または開発されていた他のFGFR3インヒビター抗体としては、以下が挙げられる: PRO-001(Prochon)、IMC-D11(ImClone)、およびADC LY3076226(Eli Lilly)。がんおよび他の疾患を処置することにおける使用のためのさらなるFGFR3抗体は、例えば、米国特許第8,187,601(Aveo)号および同第7,498,416号(Fibron)に開示されている。 FGFR3 has both oncogenic and tumor suppressor properties. FGFR3 is frequently mutated in certain cancers, but also in some normal tissues, where it can limit cell proliferation and promote cell differentiation (Lafitte 2013). The human FGFR3 antagonistic monoclonal antibody bofatamab (sometimes also referred to as B-701 or BM2) was the first FGFR3-targeting antibody to enter clinical development. The variable portion of bofatamab was originally identified through phage display and then recombined with a human IgG1 backbone. Bofatamab is effective against both wild- type and mutant FGFR3, the most common mutations found in bladder cancer and achondroplasia ( particularly FGFR3-IIIb G372C ) and gene fusions containing FGFR3 TACC3 and FGFR3 BAIAP2L1), but binds to other FGFRs without cross-reactivity. Bofatamab was previously evaluated for safety in patients with t(4:14) translocation multiple myeloma (Clinical Trial NCT01122875). Other FGFR3 inhibitor antibodies that are in or have been in clinical or preclinical development include: PRO-001 (Prochon), IMC-D11 (ImClone), and ADC LY3076226 (Eli Lilly). Additional FGFR3 antibodies for use in treating cancer and other diseases are disclosed, for example, in US Pat. Nos. 8,187,601 (Aveo) and 7,498,416 (Fibron). there is

プログラムされた細胞死タンパク質1(PD1)は、その2つのリガンドPDL1またはPDL2のいずれかによる活性化後に、組織内のT細胞エフェクター機能を制限するCD28スーパーファミリーに由来する免疫チェックポイントレセプターである(Pardoll 2012)。PD1は、抗原特異的T細胞においてアポトーシスを促進すると同時に、調節性(すなわち、サプレッサー)T細胞におけるアポトーシスを低減することによって、免疫系をダウンレギュレートする。ある特定の腫瘍細胞は、PD1のリガンドをアップレギュレートすることによって、腫瘍微小環境における抗腫瘍免疫応答を遮断する。PD1経路の遮断は、免疫系を活性化して、腫瘍を攻撃し、種々の腫瘍タイプにおける持続性の腫瘍退縮を誘導することが示された。よって、いくつかのPD1アンタゴニスト抗体は、現在承認されているかまたは臨床開発の種々の段階にある。例えば、完全ヒトIgG4モノクローナルPD1抗体であるニボルマブ(Opdivo(登録商標)、Bristol-Myers SquibbおよびOno Pharmaceutical;ONO-4538、BMS-936558、MDX-1106としても公知)は、もはや他の薬物に応答しない患者における非選択的または転移性の黒色腫んの処置に関して承認されている。ニボルマブはまた、種々の化学療法レジメンとの組み合わせにおいて、非小細胞肺がん(NSCLC)の処置に関して評価されている最中である。ヒト化IgG4 PD1抗体であるペンブロリズマブ(Keytruda(登録商標), Merck;MK-3475としても公知)は、いくつかのタイプのがん(UCC、NSCLC、および黒色腫が挙げられる)の処置に承認されている。開発中の他のPD1抗体としては、CT-011(Curetech)およびMEDI-0680/AMP-514(AstraZeneca).が挙げられる。 Programmed cell death protein 1 (PD1) is an immune checkpoint receptor from the CD28 superfamily that limits T cell effector function in tissues following activation by either of its two ligands PDL1 or PDL2 ( Pardoll 2012). PD1 downregulates the immune system by promoting apoptosis in antigen-specific T cells while simultaneously reducing apoptosis in regulatory (ie, suppressor) T cells. Certain tumor cells block anti-tumor immune responses in the tumor microenvironment by upregulating PD1 ligands. Blocking the PD1 pathway has been shown to activate the immune system to attack tumors and induce sustained tumor regression in various tumor types. Accordingly, several PD1 antagonist antibodies are currently approved or in various stages of clinical development. For example, the fully human IgG4 monoclonal PD1 antibody, nivolumab (also known as Opdivo® , Bristol-Myers Squibb and Ono Pharmaceutical; ONO-4538, BMS-936558, MDX-1106) no longer responds to other drugs. Approved for the treatment of non-selective or metastatic melanoma in patients. Nivolumab is also being evaluated for the treatment of non-small cell lung cancer (NSCLC) in combination with various chemotherapy regimens. Pembrolizumab ( Keytruda® , Merck; also known as MK-3475), a humanized IgG4 PD1 antibody, is approved for the treatment of several types of cancer, including UCC, NSCLC, and melanoma. ing. Other PD1 antibodies in development include CT-011 (Curetech) and MEDI-0680/AMP-514 (AstraZeneca). is mentioned.

種々のPD1リガンド(PDL)抗体はまた、がん処置に関して開発中である。例えば、モノクローナルIgG1k PDL1抗体MEDI-4736(AstraZeneca)は、単独で、またはモノクローナルCTLA4抗体トレメリムマブ(AstraZeneca)またはMEDI-0680との組み合わせにおいてNSCLCの処置に関して現在開発中であり、モノクローナルIgG1k PDL1抗体RG7446(Roche)は、単独で、またはAvastin(登録商標)およびZelboraf(登録商標)との組み合わせにおいて種々のがんを処置することにおける使用に関して開発中であり、完全ヒトモノクローナルIgG4抗体BMS-936559/MDX-1105(BMS)は、NSCLCおよび他のがんタイプの処置に関して現在開発中であり、完全ヒトIgG1 PDL1抗体MSB0010718C(Merck Serono)は、種々のがんタイプの処置に関して開発中であり、Fc改変モノクローナルIgG1抗体MPDL3280A(Genentech)は、NSCLCの処置に関して現在開発中である。 Various PD1 ligand (PDL) antibodies are also in development for cancer treatment. For example, the monoclonal IgG1k PDL1 antibody MEDI-4736 (AstraZeneca) is currently in development for the treatment of NSCLC alone or in combination with the monoclonal CTLA4 antibody tremelimumab (AstraZeneca) or MEDI-0680, and the monoclonal IgG1k PDL1 antibody RG7446 (Roche ) is in development for use in treating various cancers alone or in combination with Avastin® and Zelboraf® , a fully human monoclonal IgG4 antibody BMS-936559/MDX-1105 (BMS) is currently in development for the treatment of NSCLC and other cancer types, the fully human IgG1 PDL1 antibody MSB0010718C (Merck Serono) is in development for the treatment of various cancer types, and the Fc-engineered monoclonal IgG1 Antibody MPDL3280A (Genentech) is currently in development for the treatment of NSCLC.

本明細書で提供される実験結果に示されるように、FGFR3インヒビターであるボファタマブは、TH1応答および免疫機能における重要なシグナル伝達分子と関連する遺伝子の活性化を誘導することが示されている。これらの結果は、ボファタマブが、免疫細胞トラフィッキング経路と関連する遺伝子を活性化することを示唆する。その結果はまた、ボファタマブが、mUCを有する患者を、ボファタマブおよびチェックポイントインヒビター(例えば、PD1インヒビター)との併用処置に対するluminal生物学で感作することを示唆する。本明細書で提供される結果は、がん関連線維芽細胞と関連する遺伝子シグナチャーが、ボファタマブおよびチェックポイントインヒビターの併用に対する耐性と関連するようであること、およびp53様腫瘍を有する患者がまた、併用処置に対する耐性を示したことをさらに示す。これは、がん関連線維芽細胞遺伝子シグナチャーを示すか、またはp53様腫瘍を有する患者が、第3の薬剤、例えば、抗線維化剤(anti-fibrotic agent)をさらに含む併用療法の候補であり得ることを示唆する。 As shown in the experimental results provided herein, the FGFR3 inhibitor bofatamab has been shown to induce activation of genes associated with key signaling molecules in TH1 responses and immune function. These results suggest that bofatamab activates genes associated with immune cell trafficking pathways. The results also suggest that bofatamab sensitizes patients with mUC in luminal biology to combined treatment with bofatamab and checkpoint inhibitors (eg, PD1 inhibitors). The results presented herein demonstrate that a genetic signature associated with cancer-associated fibroblasts appears to be associated with resistance to combined bofatamab and checkpoint inhibitors, and that patients with p53-like tumors also It is further shown that the combination treatment was tolerated. It is a candidate for combination therapy in which patients exhibiting a cancer-associated fibroblast gene signature or with p53-like tumors further include a third agent, such as an anti-fibrotic agent. Suggest to get

ある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターを投与する工程を包含する、必要とする被験体においてがんを処置する方法が、本明細書で提供される。必要とする被験体においてがんを処置するためにPD1インヒビターの有効性を増大させる方法であって、上記方法は、FGFR3インヒビターを投与する工程を包含する方法、ならびに必要とする被験体においてがんを処置するためにFGFR3インヒビターの有効性を増大させる方法であって、上記方法は、PD1インヒビターを投与する工程を包含する方法がまた、本明細書で提供される。PD1またはFGFR3インヒビターの有効性の増大とは、いずれかのインヒビターの治療効果の増大、必要とされる投与量、投与頻度、もしくは治療効果の特定のレベルを得るためのいずれかのインヒビターの投与間隔の減少、またはこれらのいくつかの組み合わせに言及し得る。 In certain embodiments, provided herein are methods of treating cancer in a subject in need thereof comprising administering an FGFR3 inhibitor and a PD1 inhibitor. 1. A method of increasing the efficacy of a PD1 inhibitor to treat cancer in a subject in need thereof, said method comprising administering an FGFR3 inhibitor and treating cancer in a subject in need thereof. Also provided herein is a method of increasing the efficacy of an FGFR3 inhibitor for treating of, the method comprising administering a PD1 inhibitor. An increase in the efficacy of a PD1 or FGFR3 inhibitor is an increase in the therapeutic effect of either inhibitor, the required dosage, frequency of administration, or interval between administrations of either inhibitor to obtain a specified level of therapeutic effect. or some combination thereof.

ある特定の実施形態において、本明細書で提供される方法は、固形腫瘍、すなわち、不連続の腫瘍塊を形成するがんを処置するために使用される。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記処置されているがんは、膀胱がん(例えば、転移性膀胱がん(mUC)または上部尿路上皮がんが挙げられる)である。 In certain embodiments, the methods provided herein are used to treat solid tumors, ie, cancers that form discrete tumor masses. In certain of these embodiments, the cancer being treated is bladder cancer, including, eg, metastatic bladder cancer (mUC) or upper urothelial cancer.

用語「処置する(treat)、「処置する(treating)」、および「処置(treatment)」とは、固形がんに関して本明細書で使用される場合、腫瘍増殖の部分的もしくは完全な阻害、腫瘍サイズの縮小、完全もしくは部分的な腫瘍根絶、悪性増殖の低減もしくは防止、がん細胞の部分的もしくは完全な根絶、またはこれらのいくつかの組み合わせに言及し得る。語句「患者(patient)」および「被験体(subject)」は、本明細書で交換可能に使用される。 The terms "treat," "treating," and "treatment," as used herein with respect to solid tumors, partially or completely inhibit tumor growth, tumor It may refer to size reduction, complete or partial tumor eradication, reduction or prevention of malignant growth, partial or complete eradication of cancer cells, or some combination thereof. The terms "patient" and "subject" are used interchangeably herein.

「必要とする被験体(subject in need thereof)」とは、本明細書で使用される場合、がんと診断された、がんを有すると疑われる、および/またはがんと関連する1もしくはこれより多くの症状を示す哺乳動物被験体、好ましくは、ヒトに言及する。ある特定の実施形態において、上記被験体は、がんの処置のために以前受容された1またはこれより多くの治療介入、例えば、化学療法を有し得る。 A "subject in need thereof," as used herein, is a person diagnosed with cancer, suspected of having cancer, and/or associated with cancer. Reference is made to mammalian subjects, preferably humans, who exhibit more symptoms than this. In certain embodiments, the subject may have one or more previously received therapeutic interventions, such as chemotherapy, for the treatment of cancer.

「FGFR3インヒビター(FGFR3 inhibitor)」とは、本明細書で使用される場合、FGFR3の活性を部分的にまたは完全に、のいずれかで阻害する任意の分子に言及する。FGFR3インヒビターは、FGFR3を特異的に阻害してもよいし、FGFR3に加えて、他のタンパク質の活性を阻害してもよい。例えば、FGFR3インヒビターは、他のFGFRの活性も阻害し得る。ある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターは、間接的な免疫調節活性を示し得る。例えば、FGFR3インヒビターは、例えば、TNFαまたはIFNγの発現および/または活性を変化させることによって、免疫細胞トラフィッキング経路に対して間接的な効果を有し得る。 "FGFR3 inhibitor" as used herein refers to any molecule that either partially or completely inhibits the activity of FGFR3. FGFR3 inhibitors may specifically inhibit FGFR3, or may inhibit the activity of other proteins in addition to FGFR3. For example, FGFR3 inhibitors can also inhibit the activity of other FGFRs. In certain embodiments, FGFR3 inhibitors may exhibit indirect immunomodulatory activity. For example, FGFR3 inhibitors can have indirect effects on immune cell trafficking pathways, eg, by altering the expression and/or activity of TNFα or IFNγ.

「アンタゴニスト抗体(antagonist antibody)」とは、本明細書で使用される場合、いずれかの分子上の結合部位および/またはアロステリック部位において、レセプターまたはその同族リガンドへの物理的結合によって、レセプターとその同族リガンドとの間の相互作用を低減する、防止する、またはそうでなければ阻害する抗体に言及する。いくつかの実施形態において、上記アンタゴニスト抗体は、上記同族リガンドによるレセプター活性の生物学的調節に他の点で関与しない特有の結合部位において相互作用する。従って、アンタゴニスト抗体は、上記レセプターまたは上記同族リガンドに対して親和性を有するが、上記レセプターへの上記同族リガンド結合と比較して、いったん結合されると生物的応答を促進するにあたって有効性を有しない。アンタゴニスト抗体の結合は、それによって、上記レセプターと上記同族リガンドとの間の相互作用を妨げ、別の点では、アゴニストの機能を阻害する。 An "antagonist antibody", as used herein, refers to a receptor and its cognate ligand by physical binding to the receptor or its cognate ligand at a binding site and/or an allosteric site on any molecule. It refers to an antibody that reduces, prevents, or otherwise inhibits interaction between its cognate ligand. In some embodiments, the antagonist antibody interacts at a unique binding site that is not otherwise involved in biological modulation of receptor activity by the cognate ligand. Thus, an antagonist antibody has affinity for the receptor or the cognate ligand, but is less effective in promoting a biological response once bound compared to the cognate ligand binding to the receptor. do not. Binding of an antagonist antibody thereby prevents interaction between the receptor and the cognate ligand, otherwise inhibiting agonist function.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3への結合によってFGFR3活性を阻害する。このようなFGFR3インヒビターの例としては、例えば、アンタゴニスト的FGFR3抗体またはその融合タンパク質、上記FGFR3リガンドの不活性形態(例えば、FGFR3リガンドの短縮型または別の方法で変異された形態)またはその融合タンパク質、低分子、siRNA、およびアプタマーが挙げられる。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3を特異的に結合する。これは、上記インヒビターが、他のFGFRへの結合をほとんどまたは全く示さないことを意味する。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3に加えて、1またはこれより多くのFGFRを結合する。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the FGFR3 inhibitor inhibits FGFR3 activity by binding to FGFR3. Examples of such FGFR3 inhibitors include, for example, antagonistic FGFR3 antibodies or fusion proteins thereof, inactive forms of said FGFR3 ligands (e.g. truncated or otherwise mutated forms of FGFR3 ligands) or fusion proteins thereof. , small molecules, siRNAs, and aptamers. In certain of these embodiments, the FGFR3 inhibitor specifically binds FGFR3. This means that the inhibitors show little or no binding to other FGFRs. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor binds one or more FGFRs in addition to FGFR3.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の好ましい実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3アンタゴニスト抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、FGFR3を特異的に結合する。用語「抗体(antibody)」とは、本明細書で使用される場合、特異的抗原(例えば、FGFR3またはPD1)に結合する免疫グロブリン分子またはその免疫学的に活性な部分に言及する。本発明の方法、組成物、およびキットにおける使用のための抗体が全長免疫グロブリン分子であるそれら実施形態において、上記抗体は、2本の重鎖および2本の軽鎖であって、各重鎖および軽鎖が、3個の相補性決定領域(CDR)を含むものを含む。上記抗体が免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分であるそれら実施形態において、上記抗体は、例えば、Fab、Fab’、Fv、Fab’、F(ab’)2、ジスルフィド連結したFv、scFv、単一ドメイン抗体(dAb)、またはダイアボディーであり得る。本発明の方法、組成物、およびキットにおける使用のための抗体としては、天然の抗体、合成抗体、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、多重特異的抗体、二重特異的抗体(bispecific antibodies)、二重特異的抗体(dual-specific antibodies)、抗イディオタイプ抗体、または特異的抗原(例えば、FGFR3またはPD1)を結合する能力を保持するこれらのフラグメントが挙げられ得る。例示的な抗体としては、IgA、IgD、IgG1、IgG2、IgG3、IgMなどが挙げられる。本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の好ましい実施形態において、FGFR3抗体は、IgG2抗体である。 In certain preferred embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the FGFR3 inhibitor is an FGFR3 antagonist antibody, and in certain of these embodiments, the FGFR3 antagonist The antibody specifically binds FGFR3. The term "antibody" as used herein refers to an immunoglobulin molecule or immunologically active portion thereof that binds to a specific antigen (eg, FGFR3 or PD1). In those embodiments where the antibody for use in the methods, compositions, and kits of the invention is a full-length immunoglobulin molecule, the antibody is two heavy chains and two light chains, each heavy chain and light chains containing three complementarity determining regions (CDRs). In those embodiments where the antibody is an immunologically active portion of an immunoglobulin molecule, the antibody is, for example, Fab, Fab', Fv, Fab', F(ab')2, disulfide-linked Fv, scFv , single domain antibodies (dAbs), or diabodies. Antibodies for use in the methods, compositions, and kits of the invention include natural antibodies, synthetic antibodies, monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, chimeric antibodies, humanized antibodies, multispecific antibodies, bispecific antibodies ( bispecific antibodies, dual-specific antibodies, anti-idiotypic antibodies, or fragments thereof that retain the ability to bind a specific antigen (eg, FGFR3 or PD1). Exemplary antibodies include IgA, IgD, IgG1, IgG2, IgG3, IgM, and the like. In certain preferred embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the FGFR3 antibody is an IgG2 antibody.

ある特定の実施形態において、本発明の方法、組成物、およびキットにおける使用のためのFGFR3アンタゴニスト抗体は、配列番号1~3に示される配列を有する1またはこれより多くの相補性決定領域(CDR)を含む重鎖可変領域を含む。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、これらのCDR配列のうちの全3個を含み、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、配列番号5~7に示される配列を有する1またはこれより多くのCDRを含む軽鎖可変領域を含む。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、これらのCDR配列のうちの全3個を含み、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、配列番号1~3および5~7に示される全6個のCDR配列を含み、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3アンタゴニスト抗体は、配列番号4の重鎖可変領域および配列番号8の軽鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記抗体は、配列番号9の重鎖および配列番号10の軽鎖を含むボファタマブである。配列番号7に示される可変領域に加えて、配列番号9の重鎖は、ヒトIgG1を構成する。同様に、配列番号10の軽鎖は、配列番号8に示される可変領域およびヒトIgκ鎖C(UniProt P01834)を含む。 In certain embodiments, the FGFR3 antagonist antibodies for use in the methods, compositions, and kits of the invention comprise one or more complementarity determining regions (CDRs) having the sequences set forth in SEQ ID NOS: 1-3. ). In certain of these embodiments, the FGFR3 antagonist antibody comprises all three of these CDR sequences, and in certain of these embodiments, the FGFR3 antagonist antibody comprises , a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:4. In certain embodiments, the FGFR3 antagonist antibody comprises a light chain variable region comprising one or more CDRs having sequences set forth in SEQ ID NOS:5-7. In certain of these embodiments, the FGFR3 antagonist antibody comprises all three of these CDR sequences, and in certain of these embodiments, the FGFR3 antagonist antibody comprises , a light chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8. In certain embodiments, the FGFR3 antagonist antibody comprises all six CDR sequences set forth in SEQ ID NOs: 1-3 and 5-7, and in certain of these embodiments, the FGFR3 antagonist antibody The antibody comprises a heavy chain variable region of SEQ ID NO:4 and a light chain variable region of SEQ ID NO:8. In certain embodiments, the antibody is bofatamab comprising the heavy chain of SEQ ID NO:9 and the light chain of SEQ ID NO:10. The heavy chain of SEQ ID NO:9, in addition to the variable region shown in SEQ ID NO:7, constitutes human IgG1. Similarly, the light chain of SEQ ID NO: 10 comprises the variable region shown in SEQ ID NO: 8 and human Igκ chain C (UniProt P01834).

配列番号1 (H1-CDR): GFTFTSTGIS. SEQ ID NO: 1 (H1-CDR): GFTFTSTGIS.

配列番号2 (H2-CDR): GRIYPTSGSTNYADSVKG. SEQ ID NO: 2 (H2-CDR): GRIYPTSGSTNYADSVKG.

配列番号3 (H3-CDR): ARTYGIYDLYVDYTEYVMDY. SEQ ID NO: 3 (H3-CDR): ARTYGIYDLYVDYTEYVMDY.

配列番号4 (L1-CDR): RASQDVDTSLA. SEQ ID NO: 4 (L1-CDR): RASQDVDTSLA.

配列番号5 (L2-CDR): SASFLYS. SEQ ID NO: 5 (L2-CDR): SASFLYS.

配列番号6 (L3-CDR): QQSTGHPQT. SEQ ID NO: 6 (L3-CDR): QQSTGHPQT.

配列番号7:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSTGISWVRQAPGKGLEWVGRIYPTSGSTNYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARTYGIYDLYVDYTEYVMDYWGQGTLV.
SEQ ID NO:7:
EVQLVESGGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFFTSTGISWVRQAPGKGLEWVGRIYPTSGSTNYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARTYGIYDLYVDYTEYVMDYWGQGTLV.

配列番号8:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVDTSLAWYKQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSTGHPQTFGQGTKVEIKR.
SEQ ID NO:8:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVDTSLAWYKQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSTGHPQTFGQGTKVEIKR.

配列番号9:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSTGISWVRQAPGKGLEWVGRIYPTSGSTNYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARTYGIYDLYVDYTEYVMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK.
SEQ ID NO:9:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSTGISWVRQAPGKGLEWVGRIYPTSGSTNYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARTYGIYDLYVDYTEYVMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK.

配列番号10:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVDTSLAWYKQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSTGHPQTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC.
SEQ ID NO: 10:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVDTSLAWYKQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSTGHPQTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC.

他の実施形態において、本発明の方法、組成物、およびキットにおける使用のためのFGFR3アンタゴニスト抗体は、PRO-001、IMC-D11、または米国特許第8,187,601号(Aveo)もしくは同第7,498,416号(Fibron)で開示されるとおりのFGFR3アンタゴニスト的抗体であり得る。ある特定の実施形態において、本発明の方法、組成物、およびキットにおける使用のためのFGFR3アンタゴニスト抗体は、凍結乾燥され得る。 In other embodiments, the FGFR3 antagonist antibody for use in the methods, compositions, and kits of the invention is PRO-001, IMC-D11, or US Pat. No. 8,187,601 (Aveo) or US Pat. FGFR3 antagonistic antibodies as disclosed in US Pat. No. 7,498,416 (Fibron). In certain embodiments, FGFR3 antagonist antibodies for use in the methods, compositions, and kits of the invention can be lyophilized.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、FGFR3のリガンド、例えば、FGF1、FGF2、またはFGF9への結合によって、FGFR3活性を阻害する。このようなFGFR3インヒビターの例としては、例えば、FGFR3リガンドを特異的に結合する抗体またはその融合タンパク質、FGFR3細胞外ドメインの全てもしくは一部を含むFGFR3の可溶性形態またはその融合タンパク質、下流のシグナル伝達に必要とされる細胞内ドメインの全てもしくは一部を欠くFGFR3の短縮化形態またはその融合タンパク質、低分子、siRNA、およびアプタマーが挙げられる。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the FGFR3 inhibitor inhibits FGFR3 activity by binding to a ligand of FGFR3, eg, FGF1, FGF2, or FGF9. Examples of such FGFR3 inhibitors include, for example, antibodies that specifically bind FGFR3 ligands or fusion proteins thereof, soluble forms of FGFR3 comprising all or part of the FGFR3 extracellular domain or fusion proteins thereof, downstream signaling truncated forms of FGFR3 or fusion proteins thereof, small molecules, siRNAs, and aptamers lacking all or part of the intracellular domain required for .

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、汎FGFRインヒビターであり、これは、汎FGFRインヒビターが、FGFR3に加えて、1またはこれより多くのFGFRに結合しその活性を阻害することを意味する。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3インヒビターは、インフィグラチニブ(BGJ398, Novartis)、AZD4547(AstraZeneca)、LY2874455(Eli Lilly)、Debio 1347(Debiopharm)、ARQ 087(ArQule)、JNJ-42756493(Janssen)、およびPRN1371(Principia)からなる群より選択される低分子汎FGFRインヒビターであり得る。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the FGFR3 inhibitor is a pan-FGFR inhibitor, which means that the pan-FGFR inhibitor comprises, in addition to FGFR3, one or more It means binding to many FGFRs and inhibiting their activity. In certain of these embodiments, the FGFR3 inhibitor is Infigratinib (BGJ398, Novartis), AZD4547 (AstraZeneca), LY2874455 (Eli Lilly), Debio 1347 (Debiopharm), ARQ 087 (ArQule), A small molecule pan-FGFR inhibitor selected from the group consisting of JNJ-42756493 (Janssen), and PRN1371 (Principia).

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、下流のチロシンキナーゼ活性を遮断することによって、FGFR3活性を阻害する。例えば、非選択的チロシンキナーゼインヒビター(例えば、ドビチニブ(dovitinib)、ルシチニブ(lucitinib)、ポナチニブ、ニンテダニブ、ポナチニブ、またはENMD-2076)は、FGFR3インヒビターとして利用され得る。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the FGFR3 inhibitor inhibits FGFR3 activity by blocking downstream tyrosine kinase activity. For example, non-selective tyrosine kinase inhibitors such as dovitinib, lucitinib, ponatinib, nintedanib, ponatinib, or ENMD-2076 can be utilized as FGFR3 inhibitors.

「PD1インヒビター(PD1 inhibitor)」とは、本明細書で使用される場合、PD1の活性を、部分的にまたは完全に、のいずれかで阻害する任意の分子に言及する。PD1インヒビターは、PD1を特異的に阻害してもよいし、PD1に加えて、他のタンパク質の活性を阻害してもよい。例えば、PD1インヒビターはまた、他の免疫チェックポイント分子の活性を阻害してもよい。 "PD1 inhibitor" as used herein refers to any molecule that inhibits, either partially or completely, the activity of PD1. A PD1 inhibitor may specifically inhibit PD1, or may inhibit the activity of other proteins in addition to PD1. For example, PD1 inhibitors may also inhibit the activity of other immune checkpoint molecules.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1への結合によって、PD1活性を阻害する。このようなPD1インヒビターの例としては、例えば、アンタゴニスト的PD1抗体またはその融合タンパク質、PD1リガンドの不活性形態(例えば、PDL1もしくはPDL2の短縮化もしくはそうでなければ変異形態)またはその融合タンパク質(例えば、AMP-224(GlaxoSmithKline, Amplimmune))、低分子、siRNA、およびアプタマーが挙げられる。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the PD1 inhibitor inhibits PD1 activity by binding to PD1. Examples of such PD1 inhibitors include, for example, antagonistic PD1 antibodies or fusion proteins thereof, inactive forms of PD1 ligand (e.g. truncated or otherwise mutated forms of PDL1 or PDL2) or fusion proteins thereof (e.g. , AMP-224 (GlaxoSmithKline, Amplimmune)), small molecules, siRNAs, and aptamers.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記PD1アンタゴニスト抗体は、PD1を特異的に結合する。ある特定の実施形態において、上記PD1アンタゴニスト的抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、CT-011、MEDI-0680、およびRMP1-14からなる群より選択される。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the PD1 inhibitor is a PD1 antibody, and in certain of these embodiments, the PD1 antagonist antibody is , specifically binds PD1. In certain embodiments, the PD1 antagonistic antibody is selected from the group consisting of nivolumab, pembrolizumab, CT-011, MEDI-0680, and RMP1-14.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1の1またはこれより多くのリガンド(すなわち、PDL1またはPDL2)への結合によって、PD1活性を阻害する。このようなPD1インヒビターの例としては、例えば、PD1リガンド抗体またはその融合タンパク質、PD1細胞外ドメインの全てもしくは一部を含むPD1の可溶性形態またはその融合タンパク質、下流のシグナル伝達に必要とされる細胞内ドメインの全てもしくは一部を欠くPD1の短縮化形態またはその融合タンパク質、低分子、siRNA、およびアプタマーが挙げられる。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the PD1 inhibitor reduces PD1 activity by binding to one or more ligands of PD1 (i.e., PDL1 or PDL2). impede Examples of such PD1 inhibitors include, for example, PD1 ligand antibodies or fusion proteins thereof, soluble forms of PD1 comprising all or part of the PD1 extracellular domain or fusion proteins thereof, cells required for downstream signaling. Included are truncated forms of PD1 lacking all or part of the endodomain or fusion proteins thereof, small molecules, siRNAs, and aptamers.

本明細書で提供される方法、組成物、およびキットのある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、PD1リガンド抗体であり、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記PD1リガンド抗体は、上記PD1リガンドを特異的に結合する。ある特定の実施形態において、上記PD1リガンド抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される。 In certain embodiments of the methods, compositions, and kits provided herein, the PD1 inhibitor is a PD1 ligand antibody, and in certain of these embodiments, the PD1 ligand antibody specifically binds the PD1 ligand. In certain embodiments, said PD1 ligand antibody is selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.

本明細書で提供される方法のある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、同じ組成物の一部として一緒に投与される。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、別個に、すなわち、別個の組成物として投与される。これらの実施形態において、上記インヒビターは、同時にまたは順次投与されてもよく、同じ投与経路または異なる投与経路を介して投与されてもよい、上記インヒビターが順次投与されるそれら実施形態において、それらは、同じ間隔または異なる間隔で投与されてもよい。例えば、一方のインヒビターは、他方より頻繁に投与されてもよいし、より長い過程にわたって投与されてもよい。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、一方のインヒビターは、第2のインヒビターの第1の投与より前に。1またはこれより多くの回数、投与されてもよい。第2のインヒビターの投与が開始される場合、第1のインヒビターの投与は、第2のインヒビターの投与の過程の全てまたは一部にわたって中止または継続されてもよい。上記FGFR3インヒビターがFGFR3アンタゴニスト抗体であるある特定の実施形態において、上記抗体は、1日あたり2回またはこれより多く、毎日、1週間あたり2回またはこれより多く、1週間に1回、2週間に1回(すなわち、隔週)、3週間に1回、または1ヶ月に1回投与され得る。ある特定の実施形態において、上記抗体は、1週間に1回、2週間に1回、または3週間に1回投与される。上記PD1インヒビターがPD1アンタゴニスト抗体である、ある特定の実施形態において、上記抗体は、1日あたり2回またはこれより多く、毎日、1週間あたり2回またはこれより多く、1週間に1回、2週間に1回(すなわち、隔週)、3週間に1回、または1ヶ月に1回投与され得る。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、2週間に1回投与される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよび/または上記PD1インヒビターは、予め決定された特定の過程にわたって投与され得る。例えば、上記FGFR3および/またはPD1インヒビターは、1日間、2日間、1週間、2週間、4週間、または8週間という過程にわたって投与され得る。他の実施形態において、上記FGFR3および/またはPD1インヒビターは、無期限に、または具体的な治療上のベンチマークが達成されるまで投与され得る。例えば、上記FGFR3および/またはPD1インヒビターは、腫瘍増殖が停止もしくは改善されるまで、1もしくはこれより多くの腫瘍が排除されるまで、またはがん細胞の数が特定のレベルに低減されるまで投与され得る。 In certain embodiments of the methods provided herein, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor are administered together as part of the same composition. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor are administered separately, ie, as separate compositions. In these embodiments, the inhibitors may be administered simultaneously or sequentially, and may be administered via the same route of administration or different routes of administration. In those embodiments in which the inhibitors are administered sequentially, they are They may be administered at the same or different intervals. For example, one inhibitor may be administered more frequently than the other, or may be administered over a longer course. In certain of these embodiments, one inhibitor precedes the first administration of the second inhibitor. It may be administered one or more times. When administration of the second inhibitor is initiated, administration of the first inhibitor may be discontinued or continued throughout all or part of the course of administration of the second inhibitor. In certain embodiments, wherein the FGFR3 inhibitor is an FGFR3 antagonist antibody, the antibody is administered twice or more per day, twice per week or more, once per week for two weeks. It can be administered once a day (ie, every other week), once every three weeks, or once a month. In certain embodiments, the antibody is administered once a week, once every two weeks, or once every three weeks. In certain embodiments, wherein the PD1 inhibitor is a PD1 antagonist antibody, the antibody is administered two or more times per day, two or more times per week, two or more times per week, two It can be administered once a week (ie, every other week), once every three weeks, or once a month. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is administered once every two weeks. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor and/or the PD1 inhibitor may be administered over a predetermined course. For example, the FGFR3 and/or PD1 inhibitor can be administered over the course of 1 day, 2 days, 1 week, 2 weeks, 4 weeks, or 8 weeks. In other embodiments, the FGFR3 and/or PD1 inhibitor can be administered indefinitely or until a specific therapeutic benchmark is achieved. For example, the FGFR3 and/or PD1 inhibitor is administered until tumor growth is arrested or ameliorated, until one or more tumors are eliminated, or until the number of cancer cells is reduced to a certain level. can be

組成物の「治療上有効な量(therapeutically effective amount)」は、本明細書で使用される場合、がんを処置中であるような被験体において所望の治療効果を生じる組成物の量である。ある特定の実施形態において、上記治療上有効な量は、最大治療効果を生じる組成物の量である。他の実施形態において、上記治療上有効な量は、最大治療効果未満である治療効果を生じる。例えば、治療上有効な量は、最大治療効果を生じる投与量と関連する1またはこれより多くの副作用を回避すると同時に、治療効果を生じる量であり得る。特定の組成物に関する治療上有効な量は、種々の要因(治療用組成物の特徴(例えば、活性、薬物動態、薬力学、およびバイオアベイラビリティー)、被験体の生理学的状態(例えば、年齢、体重、性別、疾患タイプおよびステージ、医療歴、全身的な身体的状態、所定の投与量に対する応答性、および他の現在の薬物療法)、組成物中の任意の薬学的に受容可能なキャリアの性質、ならびに投与経路が挙げられるが、これらに限定されない)に基づいて変動する。臨床分野および薬理学分野の当業者は、慣用的な実験を通じて、すなわち、組成物の投与への被験体の応答をモニターし、それに応じて投与量を調節することによって、治療上有効な量を決定し得る。さらなるガイダンスについては、例えば、Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第22版, Pharmaceutical Press, London, 2012、およびGoodman & Gilman’s The Pharmacological Basis of Therapeutics, 第12版, McGraw-Hill, New York, NY, 2011(これらの開示全体は、本明細書に参考として援用される)を参照のこと。 A "therapeutically effective amount" of a composition, as used herein, is that amount of the composition that produces the desired therapeutic effect in a subject, such as one being treated for cancer. . In certain embodiments, the therapeutically effective amount is the amount of the composition that produces maximal therapeutic effect. In other embodiments, the therapeutically effective amount produces a therapeutic effect that is less than the maximal therapeutic effect. For example, a therapeutically effective amount can be an amount that produces therapeutic effect while avoiding one or more side effects associated with doses that produce maximal therapeutic effect. A therapeutically effective amount for a particular composition depends on a variety of factors, including the characteristics of the therapeutic composition (e.g., activity, pharmacokinetics, pharmacodynamics, and bioavailability), the physiological state of the subject (e.g., age, body weight, sex, disease type and stage, medical history, general physical condition, responsiveness to prescribed doses, and other current medications), any pharmaceutically acceptable carrier in the composition. nature, and route of administration, including but not limited to). Those of ordinary skill in the clinical and pharmacological arts will determine a therapeutically effective amount through routine experimentation, i.e., by monitoring the subject's response to administration of the composition and adjusting the dosage accordingly. can decide.さらなるガイダンスについては、例えば、Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 第22版, Pharmaceutical Press, London, 2012、およびGoodman & Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 第12版, McGraw-Hill, New York, NY, 2011, the entire disclosures of which are incorporated herein by reference.

本明細書で提供される方法のある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターまたはPD1インヒビターの治療上有効な量は、上記分子が、単剤療法として、すなわち、単独で投与される場合に治療応答(例えば、腫瘍増殖の低減または排除)を生成し得る投与量であり得る。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記治療上有効な量は、がん処置に最適またはほぼ最適であることが以前に決定された投与量であり得る。例えば、上記FGFR3インヒビターがボファタマブである場合、上記抗体は、2~4週間ごとに約10~50mg/kgの投与量で投与され得、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記抗体は、2~4週間ごとに約20~40mg/kgの投与量で、または3週間ごとに約30mg/kgの投与量で、投与され得る。他の実施形態において、FGFR3インヒビターまたはPD1インヒビターの治療上有効な量は、上記分子が単剤療法としての使用のために通常投与される投与量より低くてもよい(すなわち、最適未満の用量)。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、FGFR3またはPD1インヒビターの最適未満の投与量の投与は、単独で投与される場合の標準的投与量に対して、減少した副作用を生じ得る。例えば、FGFR3またはPD1インヒビターの最適未満の投与量の投与は、いずれかのインヒビター単独の最適投与量の投与に対して、掻痒、大腸炎、または肺炎の発生または重篤度の減少を生じ得る。ある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターのうちの一方は、単独で投与される場合のがん処置に最適であると決定された投与量において投与され得る一方で、他方は、単独で投与される場合の処置の最適未満である投与量で投与される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターまたはPD1インヒビターの投与量は、処置レジメンの過程にわたって変化し得る。例えば、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターのうちの一方または両方は、処置の開始時により高い投与量で投与され得(例えば、負荷フェーズ)、続いて、処置において、後により低い投与量で投与され得る。 In certain embodiments of the methods provided herein, a therapeutically effective amount of a FGFR3 inhibitor or PD1 inhibitor provides a therapeutic response ( For example, it can be a dosage that can produce a reduction or elimination of tumor growth. In certain of these embodiments, the therapeutically effective amount can be a dose previously determined to be optimal or near optimal for cancer treatment. For example, when the FGFR3 inhibitor is bofatamab, the antibody may be administered at a dose of about 10-50 mg/kg every 2-4 weeks; may be administered at a dose of about 20-40 mg/kg every 2-4 weeks, or at a dose of about 30 mg/kg every 3 weeks. In other embodiments, the therapeutically effective amount of the FGFR3 inhibitor or PD1 inhibitor may be lower than the dose at which the molecule would normally be administered for use as monotherapy (i.e., a suboptimal dose). . In certain of these embodiments, administration of suboptimal doses of FGFR3 or PD1 inhibitors may result in reduced side effects relative to standard doses when administered alone. For example, administration of suboptimal doses of FGFR3 or PD1 inhibitors may result in a reduced incidence or severity of pruritus, colitis, or pneumonia relative to administration of optimal doses of either inhibitor alone. In certain embodiments, one of the FGFR3 inhibitor and the PD1 inhibitor may be administered at a dosage determined to be optimal for cancer treatment when administered alone, while the other is administered alone. It is administered in dosages that are less than optimal for treatment when administered. In certain embodiments, the dosage of the FGFR3 inhibitor or PD1 inhibitor may vary over the course of the treatment regimen. For example, one or both of the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor can be administered at a higher dosage at the beginning of treatment (e.g., a loading phase), followed by a lower dosage later in treatment. .

FGFR3インヒビター、PD1インヒビター、またはFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターの両方を含む組成物は、当該分野で公知の任意の投与経路(非経口、経口、エアロゾル、経腸、鼻、眼科的、非経口、または経皮(例えば、局所クリーム剤または軟膏、パッチ)が挙げられるが、これらに限定されない)によって被験体に送達され得る。「非経口(parenteral)」とは、注射と概して関連付けられる投与経路(静脈内、腹腔内、皮下、眼窩下、注入、動脈内、嚢内、心臓内、皮内、筋肉内、肺内、髄腔内、胸骨内、気管内、子宮内、くも膜下、被膜下、経粘膜、または経気管が挙げられる)に言及する。上記FGFR3インヒビターがFGFR3アンタゴニスト抗体(例えば、ボファタマブが挙げられる)である、ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、静脈内投与される。上記PD1インヒビターがPD1アンタゴニスト抗体である、ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、腹腔内投与される。 Compositions comprising FGFR3 inhibitors, PD1 inhibitors, or both FGFR3 inhibitors and PD1 inhibitors can be administered by any route of administration known in the art (parenteral, oral, aerosol, enteral, nasal, ophthalmic, parenteral, or oral). It can be delivered to the subject by skins (eg, topical creams or ointments, patches, including but not limited to). "Parenteral" means routes of administration commonly associated with injection (intravenous, intraperitoneal, subcutaneous, suborbital, infusion, intraarterial, intracapsular, intracardiac, intradermal, intramuscular, intrapulmonary, intrathecal intrasternal, intrasternal, intratracheal, intrauterine, subarachnoid, subcapsular, transmucosal, or transtracheal). In certain embodiments, wherein the FGFR3 inhibitor is an FGFR3 antagonist antibody (eg, including bofatamab), the FGFR3 inhibitor is administered intravenously. In certain embodiments, wherein the PD1 inhibitor is a PD1 antagonist antibody, the PD1 inhibitor is administered intraperitoneally.

ある特定の実施形態において、FGFR3インヒビター、PD1インヒビター、またはFGFR3およびPD1インヒビターの両方を含む組成物は、経口投与単位(例えば、錠剤、丸剤、またはカプセル剤のような)へと形成され得る。ある特定の実施形態において、FGFR3インヒビター、PD1インヒビター、またはFGFR3およびPD1インヒビター組成物は、時間放出送達ビヒクル(例えば、時間放出カプセル剤のような)を介して投与され得る。「時間放出ビヒクル(time release vehicle)」とは、本明細書で使用される場合、投与の際に直ちにではなく、ある期間にわたって活性薬剤を放出する任意の送達ビヒクルに言及する。他の実施形態において、FGFR3インヒビター、PD1インヒビター、またはFGFR3およびPD1インヒビター組成物は、即時放出送達ビヒクルを介して投与され得る。 In certain embodiments, compositions comprising FGFR3 inhibitors, PD1 inhibitors, or both FGFR3 and PD1 inhibitors can be formed into oral dosage units such as tablets, pills, or capsules. In certain embodiments, an FGFR3 inhibitor, PD1 inhibitor, or FGFR3 and PD1 inhibitor composition can be administered via a time-release delivery vehicle, such as a time-release capsule. A "time release vehicle" as used herein refers to any delivery vehicle that releases an active agent over a period of time rather than immediately upon administration. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor, PD1 inhibitor, or FGFR3 and PD1 inhibitor composition can be administered via an immediate release delivery vehicle.

本明細書で提供される方法のある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターを受容する被験体は、FGFR3およびPD1インヒビターでの処置の前、処置の間、または処置の後に、さらなる治療(例えば、化学療法または免疫療法が挙げられる)、または第3の薬剤(例えば、抗線維化剤)を受容し得る。上記被験体がFGFR3およびPD1インヒビターでの処置の間にさらなる治療を受容するそれら実施形態において、上記さらなる治療は、上記FGFR3インヒビターおよび/またはPD1インヒビターと同時にまたは順次投与され得る、 In certain embodiments of the methods provided herein, the subject receiving the FGFR3 inhibitor and the PD1 inhibitor is given additional therapy ( chemotherapy or immunotherapy), or a third agent (eg, an antifibrotic agent). In those embodiments in which the subject receives additional therapy during treatment with an FGFR3 and PD1 inhibitor, the additional therapy may be administered concurrently or sequentially with the FGFR3 inhibitor and/or PD1 inhibitor.

ある特定の実施形態において、治療上有効な量のFGFR3インヒビターおよび治療上有効な量のPD1インヒビターを含む組成物が、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、これらの組成物は、1もしくはこれより多くの薬学的に受容可能なキャリアをさらに含むか、または1もしくはこれより多くの薬学的に受容可能なキャリアとの投与のために製剤化される。本明細書で開示される方法を行うことにおける使用のための、例えば、がんを処置するためのFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターを含むキットがまた、本明細書で提供される。 In certain embodiments, provided herein are compositions comprising a therapeutically effective amount of a FGFR3 inhibitor and a therapeutically effective amount of a PD1 inhibitor. In certain embodiments, these compositions further comprise one or more pharmaceutically acceptable carriers or for administration with one or more pharmaceutically acceptable carriers. It is formulated into Also provided herein are kits containing an FGFR3 inhibitor and a PD1 inhibitor for use in performing the methods disclosed herein, eg, to treat cancer.

本明細書で提供される組成物およびキットのある特定の実施形態において、FGFR3インヒビターまたはPD1インヒビターは、単独で投与される場合に、治療応答を生じ(例えば、腫瘍増殖を低減または排除し)得る投与量において、上記組成物またはキットに存在し得る。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3またはPD1インヒビターは、がん処置に最適またはほぼ最適であることが以前に決定された投与量で存在し得る。例えば、上記FGFR3インヒビターがボファタマブである場合、上記組成物またはキットは、上記被験体に対して約10~50mg/kgのボファタマブの投与量を送達するために製剤化され得、これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記組成物またはキットは、上記被験体に対して約20~40mg/kgまたは約30mg/kgのボファタマブの投与量を送達するために製剤化され得る。他の実施形態において、上記FGFR3またはPD1インヒビターは、これががん処置のための組成物またはキット中に通常存在するより低い投与量で存在し得る(すなわち、最適未満の用量)。 In certain embodiments of the compositions and kits provided herein, the FGFR3 inhibitor or PD1 inhibitor can produce a therapeutic response (e.g., reduce or eliminate tumor growth) when administered alone In dosage, it can be present in the composition or kit described above. In certain of these embodiments, the FGFR3 or PD1 inhibitor may be present at a dosage previously determined to be optimal or near optimal for cancer treatment. For example, if the FGFR3 inhibitor is bofatamab, the composition or kit can be formulated to deliver a dose of about 10-50 mg/kg of bofatamab to the subject; In certain of them, the composition or kit can be formulated to deliver a dose of bofatamab of about 20-40 mg/kg or about 30 mg/kg to the subject. In other embodiments, the FGFR3 or PD1 inhibitor may be present at a lower dosage than it would normally be present in a composition or kit for treating cancer (ie, a suboptimal dosage).

「薬学的に受容可能なキャリア(pharmaceutically acceptable carrier)」とは、本明細書で使用される場合、身体の1つの組織、器官、または部分から身体の別の組織、器官、または部分へと、目的の化合物または分子を運ぶかまたは輸送することに関与する薬学的に受容可能な物質、組成物、またはビヒクルに言及する。薬学的に受容可能なキャリアは、種々の構成要素(液体もしくは固体の充填剤、希釈剤、賦形剤、溶媒、緩衝化剤、被包化物質、界面活性剤、安定化剤、結合剤、もしくは顔料、またはこれらのいくつかの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない)を含み得る。上記キャリアの各構成要素は、これが上記組成物の他の成分と適合性でなければならず、かつこれが遭遇し得る身体の任意の組織、器官、または部分との接触に適切でなければならないという点で、「薬学的に受容可能」でなければならず、このことは、上記キャリアの各構成要素が、その治療上の利益を過度に上回る毒性、刺激、アレルギー応答、免疫原性、または任意の他の合併症のリスクを有してはならないことを意味する。 "Pharmaceutically acceptable carrier" as used herein means a carrier from one tissue, organ, or part of the body to another tissue, organ, or part of the body; Refers to a pharmaceutically acceptable substance, composition, or vehicle involved in carrying or transporting a compound or molecule of interest. Pharmaceutically acceptable carriers include various components (liquid or solid fillers, diluents, excipients, solvents, buffers, encapsulating agents, surfactants, stabilizers, binders, or pigments, or some combination thereof, including but not limited to. Each component of the carrier must be compatible with the other ingredients of the composition and suitable for contact with any tissue, organ, or part of the body it may encounter. "pharmaceutically acceptable" in that each component of the carrier exhibits toxicity, irritation, allergic response, immunogenicity, or other adverse effects that unduly outweigh its therapeutic benefits. should not be at risk of other complications of

本明細書で提供される組成物とともに使用され得る薬学的に受容可能なキャリアの例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない: (1)糖(例えば、ラクトース、グルコース、スクロース、またはマンニトール);(2)デンプン(例えば、コーンスターチおよびジャガイモデンプン);(3)セルロースおよびその誘導体(例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロースおよび酢酸セルロース);(4)粉末化トラガカント;(5)麦芽;(6)ゼラチン;(7)タルク;(8)賦形剤(例えば、カカオ脂および坐剤用ワックス);(9)油(例えば、ラッカセイ油、綿実油、サフラワー油、ゴマ油、オリーブ油、コーン油およびダイズ油);(10)グリコール(例えば、プロピレングリコール);(11)ポリオール(例えば、グリセリン、ソルビトール、マンニトールおよびポリエチレングリコール);(12)エステル(例えば、オレイン酸エチルおよびラウリン酸エチル(ethyl aurate));(13)崩壊剤(例えば、アガーまたは炭酸カルシウム);(14)緩衝化剤またはpH調節剤(例えば、水酸化マグネシウム、水酸化アルミニウム、塩化ナトリウム、乳酸ナトリウム、塩化カルシウム、およびリン酸緩衝液);(15)アルギン酸;(16)発熱物質非含有水;(17)等張性生理食塩水;(18)リンゲル液;(19)アルコール(例えば、エチルアルコールおよびプロパンアルコール);(20)パラフィン;(21)滑沢剤(例えば、タルク、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固形ポリエチレングリコール、またはラウリル硫酸ナトリウム);(22)着色剤または顔料;(23)滑剤(例えば、コロイド性二酸化ケイ素、タルク、およびデンプンまたは三塩基性リン酸カルシウム);(24)薬学的組成物において使用される他の非毒性適合性物質(例えば、アセトン);ならびに(25)これらの組み合わせ。 Examples of pharmaceutically acceptable carriers that can be used with the compositions provided herein include, but are not limited to: (1) sugars (e.g., lactose, glucose, sucrose, or mannitol); (2) starches (e.g. corn starch and potato starch); (3) cellulose and its derivatives (e.g. sodium carboxymethylcellulose, ethylcellulose and cellulose acetate); (4) powdered tragacanth; (8) excipients such as cocoa butter and suppository waxes; (9) oils such as peanut oil, cottonseed oil, safflower oil, sesame oil, olive oil, corn oil and soybean. (10) glycols (e.g. propylene glycol); (11) polyols (e.g. glycerin, sorbitol, mannitol and polyethylene glycol); (12) esters (e.g. ethyl oleate and ethyl aurate). (13) disintegrants such as agar or calcium carbonate; (14) buffers or pH modifiers such as magnesium hydroxide, aluminum hydroxide, sodium chloride, sodium lactate, calcium chloride, and phosphate buffers; (15) alginic acid; (16) pyrogen-free water; (17) isotonic saline; (18) Ringer's solution; (19) alcohols such as ethyl alcohol and propane alcohol; (21) lubricants (e.g. talc, calcium stearate, magnesium stearate, solid polyethylene glycol, or sodium lauryl sulfate); (22) colorants or pigments; (23) lubricants (e.g. colloidal silicon dioxide, talc, and starch or tribasic calcium phosphate); (24) other non-toxic compatible substances used in pharmaceutical compositions (eg, acetone); and (25) combinations thereof.

FGFR3インヒビター、PD1インヒビター、またはFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターの組み合わせを含む組成物は、適切な投与形態(例えば、水性もしくは非水性液体中の液剤もしくは懸濁物、水中油型もしくは油中水型の液体エマルジョン、カプセル剤、カシェ剤、丸剤、錠剤、ロゼンジ、散剤、粒剤、エリキシル剤もしくはシロップ剤、または香錠が挙げられる)へと製剤化され得る。ある特定の実施形態において、上記組成物は、時間放出送達ビヒクル(例えば、時間放出カプセル剤のような)として製剤化され得る。「時間放出ビヒクル」とは、本明細書で使用される場合、投与の際に直ちにではなく、ある期間にわたって活性薬剤を放出する任意の送達ビヒクルに言及する。他の実施形態において、上記組成物は、即時放出送達ビヒクルを介して製剤化され得る。 Compositions comprising FGFR3 inhibitors, PD1 inhibitors, or combinations of FGFR3 inhibitors and PD1 inhibitors may be prepared in suitable dosage forms, such as solutions or suspensions in aqueous or non-aqueous liquids, oil-in-water or water-in-oil liquids. emulsions, capsules, cachets, pills, tablets, lozenges, powders, granules, elixirs or syrups, or pastilles). In certain embodiments, the composition can be formulated as a time-release delivery vehicle, such as a time-release capsule. A "time-release vehicle," as used herein, refers to any delivery vehicle that releases an active agent over a period of time rather than immediately upon administration. In other embodiments, the composition can be formulated via an immediate release delivery vehicle.

ある特定の実施形態において、本明細書で開示される方法を行うためのキットが、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、本明細書で提供されるキットは、FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターを含む。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、単一の組成物でキットに存在し得る。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、別個の組成物中に存在し得る。上記キットは、さらなる治療用または非治療用の組成物を含み得る。ある特定の実施形態において、上記キットは、有形媒体の中に説明書を含む。 In certain embodiments, provided herein are kits for performing the methods disclosed herein. In certain embodiments, kits provided herein comprise an FGFR3 inhibitor and a PD1 inhibitor. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor may be present in a kit in a single composition. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor may be present in separate compositions. The kit may contain additional therapeutic or non-therapeutic compositions. In certain embodiments, the kit includes instructions in a tangible medium.

ある特定の実施形態において、がんの処置における使用のためのFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターが、本明細書で提供される。PD1インヒビターとの組み合わせでのがんの処置における使用のためのFGFR3インヒビター、およびFGFR3インヒビターとの組み合わせでのがんの処置における使用のためのPD1インヒビターが、本明細書で提供される。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記がんは、尿路上皮がん(例えば、mUC)である。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記がんは、luminal型膀胱がんである。例えば、ある特定の遺伝子シグナチャーを有するがんの処置を必要とする被験体は、本開示のFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターでの処置の候補であり得る。別の例として、別のある特定の遺伝子シグナチャーを有するがんの処置を必要とする被験体は、本開示のFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターでの処置の候補でなくてもよく、むしろ本開示の第3の薬剤を含む処置を有してもよい。いくつかの実施形態において、上記別のある特定の遺伝子シグナチャーは、がん関連線維芽細胞と関連する遺伝子シグナチャー、およびp53様腫瘍を含む。ある特定の実施形態において、上記遺伝子シグナチャーは、FGFR3遺伝子シグナチャーであり、少なくとも以下の遺伝子: FGFR3、TP63、IRS1、SEMA4B、PTPN13、およびTMPRSS4を含む。ある特定の実施形態において、上記遺伝子シグナチャーは、p53様遺伝子シグナチャーであり、少なくとも以下の遺伝子: KRT5、KRT6A、KRT6B、KRT14、UPK3A、UPK3B、FOXA1、およびPPARGを含む。ある特定の実施形態において、上記遺伝子シグナチャーは、がん関連線維芽細胞(CAF)遺伝子シグナチャーであり、少なくとも以下の遺伝子: ACTC1、ACTG2、NCC1、DES、FLNC、MFAP4、MYH11、およびPCP4を含む。 In certain embodiments, provided herein are FGFR3 inhibitors and PD1 inhibitors for use in treating cancer. Provided herein are FGFR3 inhibitors for use in treating cancer in combination with PD1 inhibitors, and PD1 inhibitors for use in treating cancer in combination with FGFR3 inhibitors. In certain of these embodiments, the cancer is urothelial carcinoma (eg, mUC). In certain of these embodiments, the cancer is luminal bladder cancer. For example, a subject in need of treatment for cancer with a particular genetic signature may be a candidate for treatment with FGFR3 inhibitors and PD1 inhibitors of the present disclosure. As another example, a subject in need of treatment with a cancer having another particular genetic signature may not be a candidate for treatment with the FGFR3 inhibitors and PD1 inhibitors of this disclosure, but rather You may have a treatment that includes three drugs. In some embodiments, the certain other specific gene signatures include gene signatures associated with cancer-associated fibroblasts and p53-like tumors. In certain embodiments, the gene signature is the FGFR3 gene signature and includes at least the following genes: FGFR3, TP63, IRS1, SEMA4B, PTPN13, and TMPRSS4. In certain embodiments, the gene signature is a p53-like gene signature and includes at least the following genes: KRT5, KRT6A, KRT6B, KRT14, UPK3A, UPK3B, FOXA1, and PPARG. In certain embodiments, the gene signature is a cancer-associated fibroblast (CAF) gene signature and includes at least the following genes: ACTC1, ACTG2, NCC1, DES, FLNC, MFAP4, MYH11, and PCP4.

ある特定の実施形態において、野生型FGFR3を発現するがんを有する、必要とする被験体を処置するための方法であって、上記方法は、(a)上記被験体を、1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーまたはp53発現に関してスクリーニングする工程、(b)上記被験体が1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーを有するか、またはp53発現を有するかを決定する工程、(c)工程(b)の決定に基づいて、(i)上記被験体が上記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有しない場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程、および(ii)上記被験体が遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有する場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターおよびさらなる抗がん剤と組み合わせて投与する工程を包含する方法が、本明細書で提供される。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である。ある特定の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3、および配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3、および配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の実施形態において、上記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである。ある特定の実施形態において、上記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択されるアンタゴニスト的PD-L1抗体である。ある特定の実施形態において、上記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである。ある特定の実施形態において、上記がんは、luminal型膀胱がんである。 In certain embodiments, a method for treating a subject in need thereof having a cancer that expresses wild-type FGFR3, said method comprising: (a) said subject; (b) the subject has a genetic signature that correlates with one or more cancer-associated fibroblasts or p53 (c) based on the determination of step (b), if (i) said subject does not have said gene signature or p53 expression, a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor; administering in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor, and (ii) if said subject has a gene signature or p53 expression, a therapeutically effective amount of a FGFR3 inhibitor, and a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor; Methods are provided herein that include administering in combination with a point inhibitor and an additional anticancer agent. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody. In certain embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:1, a CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:2, an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:3 and a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:7. In certain embodiments, the antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, a CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8. In certain embodiments, the FGFR3 inhibitor is bofatamab. In certain embodiments, the checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is an antagonist PD-L1 antibody selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A. In certain embodiments, the PD1 inhibitor is pembrolizumab. In certain embodiments, the cancer is luminal bladder cancer.

ある特定の実施形態において、がんを処置するための医薬の製造におけるFGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターの使用が、本明細書で提供される。PD1インヒビターとの組み合わせにおいてがんを処置するための医薬の製造におけるFGFR3インヒビターの使用、およびFGFR3インヒビターとの組み合わせにおいてがんを処置するための医薬の製造におけるPD1インヒビターの使用がまた、本明細書で提供される。 In certain embodiments, provided herein is the use of FGFR3 inhibitors and PD1 inhibitors in the manufacture of a medicament for treating cancer. The use of a FGFR3 inhibitor in the manufacture of a medicament for treating cancer in combination with a PD1 inhibitor and the use of a PD1 inhibitor in the manufacture of a medicament for treating cancer in combination with a FGFR3 inhibitor are also provided herein. provided in

用語「約(about)」とは、本明細書で使用される場合、述べられた値または値の範囲の10%以内を意味する。 The term "about," as used herein, means within 10% of the stated value or range of values.

当業者は、本明細書で記載される種々の実施形態が、組み合わされ得ることを認識する。例えば、本明細書で開示される処置の種々の方法からの工程は、処置の満足のいくレベルまたは改善されたレベルを達成するために組み合わされ得る。 Those skilled in the art will recognize that the various embodiments described herein can be combined. For example, steps from various methods of treatment disclosed herein may be combined to achieve a satisfactory or improved level of treatment.

前述から、本発明の特定の実施形態が例証のために本明細書で記載されているが、種々の改変が本発明の範囲から逸脱することなく行われ得ることは、認識される。よって、本発明は、添付の請求項によるとおり以外に限定されない。 From the foregoing, it will be appreciated that although specific embodiments of the invention have been described herein for purposes of illustration, various modifications can be made without departing from the scope of the invention. Accordingly, the invention is not limited except as by the appended claims.

以下の実施例は、特許請求される発明をよりよく例証するために提供され、本発明の範囲を限定するとして解釈されるべきではない。特定の材料が言及される程度まで、実施例は例証を目的とするに過ぎず、本発明を限定することは意図されない。当業者は、発明能力の行使なしに、および本発明の範囲から逸脱することなく、等価な手段または反応物を開発し得る。多くのバリエーションが本明細書で記載される手順において行われ得ると同時に本発明の境界内になお留まることは、理解される。このようなバリエーションが、本発明の範囲内に含まれることは、本発明者らの意図である。 The following examples are provided to better illustrate the claimed invention and should not be construed as limiting the scope of the invention. To the extent specific materials are mentioned, the examples are for illustrative purposes only and are not intended to limit the invention. A person skilled in the art may develop equivalent means or reactants without exercising inventive capacity and without departing from the scope of the invention. It is understood that many variations can be made in the procedures described herein while still remaining within the scope of the invention. It is the intent of the inventors that such variations are included within the scope of the present invention.

実施例1: ボファタマブおよびペンブロリズマブでの併用療法で処置された野生型および変異FGFR3転移性尿路上皮がんにおける遺伝子発現プロフィール
転移性尿路上皮がん(mUC)を有する患者の中で、FGFR3変異(mutFGFR3)は、膀胱がん患者のうちの15~20%および上部尿路がんのうちのおよそ35%に存在する。研究から、これらの腫瘍が、免疫療法に対してよりFGFR阻害に対してより良好に応答し得ることが示唆される。
Example 1: Gene expression profiles in wild-type and mutated FGFR3 metastatic urothelial carcinoma treated with combination therapy with bofatamab and pembrolizumab FGFR3 mutations among patients with metastatic urothelial carcinoma (mUC) (mutFGFR3) is present in 15-20% of bladder cancer patients and approximately 35% of upper urinary tract cancers. Studies suggest that these tumors may respond better to FGFR inhibition than to immunotherapy.

mUCの以前の処置に失敗した患者を、ボファタマブで処置した。患者を、処置前および処置の14日後に生検をして、ボファタマブの負荷用量(25mg/kg)で処置し、続いて、mutFGFR3または遺伝子注入ありおよびなしの患者のコホートに、ペンブロリズマブでの併用療法を行った。コア生検物(2×18Gまたは3~4×20G)を、10% 中性緩衝化ホルマリン中で固定し、パラフィン中に包埋した。次いで、上記生検のコアを、これらのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルのパラフィンブロックから単離した。 Patients who had failed previous treatments for mUC were treated with bofatamab. Patients were biopsied before and 14 days after treatment and treated with a loading dose of bofatamab (25 mg/kg) followed by cohorts of patients with and without mutFGFR3 or gene injection in combination with pembrolizumab. underwent therapy. Core biopsies (2×18 G or 3-4×20 G) were fixed in 10% neutral buffered formalin and embedded in paraffin. The biopsy cores were then isolated from paraffin blocks of these formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples.

DNAおよびRNAを、Ion Torrent platformで全トランスクリプトームRNAseqおよびDNA配列決定のためにサンプルから単離した。全トランスクリプトームRNAseqを、Ion Torrent’s AmpliSeqRNAプラットフォーム(Thermo Fisher, Inc.)およびIon Proton sequencer(Thermo Fisher, Inc)を使用して、処置前のおよび処置後の生検物をマッチさせて、22名の患者(17名はWT、5名はMut Fusion)に由来するサンプルに対して行った。次いで、RNAを、SuperScript(登録商標) VILOTMキットを使用して、cDNAへと転写した。cDNAを、Ion Ampliseq Transcriptome Human Gene Expression Coreパネルを使用して増幅し、続いて、アンプリコンへのアダプターおよびバーコードのライゲーションならびに精製を行った。精製したライブラリーを、Ion Library Quantificationキット(Thermo Fisher, Inc.)を使用して定量した。次いで、ライブラリーを100pMへと希釈し、プールし、エマルジョンPCRを使用してIon SphereTM粒子(ISP)上で増幅させ、IonChef(Thermo Fisher, Inc)に対して富化した。テンプレート陽性ISPを、その後、Ion PIチップへと載せ、Proton機器で実行した。がん関連遺伝子の標的化DNA配列決定を、AmpliSeq Comprehensive Cancerパネル(409腫瘍抑制遺伝子およびFGFR3を含むがん遺伝子)またはIon AmpliSeqTM Cancer Hotspotパネル v2を使用して行った。 DNA and RNA were isolated from samples for whole transcriptome RNAseq and DNA sequencing on the Ion Torrent platform. Whole-transcriptome RNAseq was performed using Ion Torrent's AmpliSeq RNA platform (Thermo Fisher, Inc.) and the Ion Proton sequencer (Thermo Fisher, Inc.) to match pre- and post-treatment biopsies Samples from 22 patients (17 WT, 5 Mut Fusion) were performed. RNA was then transcribed into cDNA using the SuperScript® VILO kit. cDNA was amplified using the Ion Ampliseq Transcriptome Human Gene Expression Core panel, followed by ligation of adapters and barcodes into amplicons and purification. Purified libraries were quantified using the Ion Library Quantification kit (Thermo Fisher, Inc.). The library was then diluted to 100 pM, pooled, amplified on Ion Sphere particles (ISP) using emulsion PCR, and enriched for IonChef (Thermo Fisher, Inc). Template-positive ISPs were then loaded onto an Ion PI chip and run on the Proton instrument. Targeted DNA sequencing of cancer-related genes was performed using the AmpliSeq Comprehensive Cancer panel (oncogenes including 409 tumor suppressor genes and FGFR3) or the Ion AmpliSeq Cancer Hotspot panel v2.

RNA-Seq遺伝子発現分析を、Torrent Suite SoftwareにおいてAmpliSeqRNA分析プラグインを使用して行った。このプラグインは、生の配列リードを、Torrent Mapping Alignment Program(TMAP)を使用して、20,802 RefSeq転写物を含むヒト参照ゲノム(hg19 Ampliseq Transcriptome_ERCC_V1.fasta)に対して整列させる。次いで、1遺伝子あたりにマッピングされたリードの数を計数して、生のカウントファイルを生成し、1遺伝子あたりのリードを、100万個のマップされた遺伝子あたり(RPM)のファイルに正規化した。腫瘍サブタイプ割り当てを、MD Anderson 1近傍法(oneNN)分類子を使用して行った。8個の腫瘍が部分奏効(PR)を示し、4個が病状安定化(SD)を示し、7個が症状進行(PD)を示し、3個が分類されなかった(図1)。 RNA-Seq gene expression analysis was performed using the AmpliSeq RNA analysis plugin in Torrent Suite Software. This plugin aligns raw sequence reads against the human reference genome (hg19 Ampliseq Transcriptome_ERCC_V1.fasta) containing 20,802 RefSeq transcripts using the Torrent Mapping Alignment Program (TMAP). The number of mapped reads per gene was then counted to generate a raw count file and the reads per gene were normalized to files per million mapped genes (RPM). . Tumor subtype assignments were made using the MD Anderson 1 nearest neighbor (oneNN) classifier. Eight tumors showed partial response (PR), four showed stable disease (SD), seven showed progressive disease (PD), and three were not classified (Figure 1).

処置前腫瘍と処置後腫瘍との間で差次的発現(DE)に関する試験を行うために、BioconductorパッケージDESeqと負の二項回帰モデル(Negative Binomial model)とを使用した。Benjamini-Hochberg法を使用して、偽発見率(FDR)を制御した。ベースライン組織の目的変数なしのクラスター分析(unsupervised cluster analysis)から、2つのクラスターの存在が明らかになった: クラスター1は、クラスター2(2個のPR、4個のSD、6個のPD)と比較して、応答者(6個のPR、1個のSD)に関して富化された(図1)。クラスター1および2に由来する有意に差次的に発現された遺伝子を抽出し、Ingenuity Pathway Analysis(Sigma)によって分析した。 To test for differential expression (DE) between pre- and post-treatment tumors, the Bioconductor package DESeq and the Negative Binomial model were used. The Benjamini-Hochberg method was used to control for false discovery rate (FDR). An unsupervised cluster analysis of baseline tissues revealed the presence of two clusters: Cluster 1 followed by Cluster 2 (2 PRs, 4 SDs, 6 PDs). were enriched for responders (6 PRs, 1 SD) compared to 1 (Fig. 1). Significantly differentially expressed genes from clusters 1 and 2 were extracted and analyzed by Ingenuity Pathway Analysis (Sigma).

経路分析を行うために、免疫浸潤の公開された遺伝子発現シグナチャー特性、炎症性細胞トラフィッキング、IFN経路活性か、TH1経路活性化、およびFGFR3遺伝子発現シグナチャーを評価した。機能分析および経路分析を、ゲノムデータにおいて目的のネットワークおよび経路を同定するためのデータベースを含む、Ingenuity Pathway Analysis(IPA)ソフトウェア(Ingenuity(登録商標) Systems, CA)を使用して行った。IPA内の「上流の調節因子における分子タイプとしての転写因子(transcriptional factors as molecule type in upstream regulator)」カテゴリーを使用して、膀胱腫瘍サブタイプの生物学的特性を解釈した。上流の調節因子分析のために、IPAは、重複p値(overlap p value)および活性化zスコアに関する統計分析を行う。IPA知識データベースに基づいて、p値およびzスコアを、各転写因子のどの程度多くの標的が重複しているか(p値)および遺伝子リスト中の標的の既知の効果(活性化または阻害)の一致の程度(zスコア)に基づいて計算し得る。 To perform pathway analysis, published gene expression signature features of immune infiltration, inflammatory cell trafficking, IFN pathway activity or TH1 pathway activation, and FGFR3 gene expression signature were evaluated. Functional and pathway analyzes were performed using Ingenuity Pathway Analysis (IPA) software ( Ingenuity® Systems, Calif.), which contains a database for identifying networks and pathways of interest in genomic data. The "transcription factors as molecule type in upstream regulator" category within IPA was used to interpret the biological characteristics of bladder tumor subtypes. For upstream regulator analysis, IPA performs statistical analysis on overlap p-values and activation z-scores. Based on the IPA knowledge database, p-values and z-scores were calculated by matching how many targets for each transcription factor overlap (p-value) and the known effects (activation or inhibition) of targets in the gene list. (z-score).

basalおよびluminalサブタイプを同定するために使用される遺伝子シグナチャーを、22個の対化した腫瘍を分子サブタイプに割り当てるために、ベースライン組織に対して使用した(図2)。応答する腫瘍のうち、6個がluminalであり、2個がbasalであった(図2);Denrauer 2014もまた参照のこと。応答者における差次的発現分析は、ボファタマブが、炎症および免疫経路、ならびに免疫細胞トラフィッキングに影響を与えることを示した(図3)。 The gene signatures used to identify basal and luminal subtypes were used against baseline tissue to assign 22 paired tumors to molecular subtypes (Fig. 2). Of the responding tumors, 6 were luminal and 2 were basal (Fig. 2); see also Denrauer 2014. Differential expression analysis in responders showed that bofatamab affected inflammatory and immune pathways and immune cell trafficking (Figure 3).

まとめると、これらのデータは、luminal生物学が、mutFGFR3の存在または非存在にかかわらず、ボファタマブおよびペンブロリズマブでの併用処置に対して被験体を感作し得ることを示す。このことは、wtFGFR3 mUCにおけるこの組み合わせの役割を示唆する。basal生物学を有する腫瘍に対するその組み合わせの効果はまた、有効性を確認した。これらの生物学的効果はまた、早期ステージ膀胱がん、例えば、筋層非浸潤性膀胱がん(NMIBC)において重要であり得る。ボファタマブが免疫細胞トラフィッキングに対して効果を有する場合、それはまた、BCG処置後またはBCG処置との組み合わせのいずれかにおいて、NMIBCでの利益を示し得る。 Collectively, these data demonstrate that luminal biology can sensitize subjects to combined treatment with bofatamab and pembrolizumab, regardless of the presence or absence of mutFGFR3. This suggests a role for this combination in wtFGFR3 mUC. The effect of the combination on tumors with basal biology also confirmed efficacy. These biological effects may also be important in early stage bladder cancer, such as non-muscle invasive bladder cancer (NMIBC). If bofatamab has an effect on immune cell trafficking, it may also show benefit in NMIBC, either after or in combination with BCG treatment.

実施例2: mUCを有する被験体におけるボファタマブ単剤療法およびペンブロリズマブとの併用療法の臨床評価
FIERCE-22フェーズ1b/2臨床試験を、ペンブロリズマブとの組み合わせにおけるボファタマブを評価するためにデザインした。図4は、その試験の模式図を示す。被験体は、生検前および生検後を対にして、2週間の導入期間にわたってボファタマブ単剤療法を受け、続いて、併用療法を開始した。導入期間後、併用療法を開始した。
Example 2: Clinical Evaluation of Bofatamab Monotherapy and Combination Therapy with Pembrolizumab in Subjects With mUC A FIERCE-22 Phase 1b/2 clinical trial was designed to evaluate bofatamab in combination with pembrolizumab. FIG. 4 shows a schematic diagram of the test. Subjects received bofatamab monotherapy for a two-week run-in period in pre-biopsy and post-biopsy pairings, followed by initiation of combination therapy. After the run-in period, combination therapy was initiated.

最初の中間分析を、26名の患者の登録後に計画した。28名の患者が試験に登録した。2回目の中間分析を、52名の患者の登録後に計画する。登録の資格を得るために、mUC患者は、抗PD-/L1ナイーブであるとともに、測定可能な疾患、2より大きいECOG、および以前の白金ベースの化学療法の1またはこれより多くの系統に際しても進行する、または(ネオ)補助化学療法の12ヶ月間以内の再発が必要であった。最初の28名の患者の人数構成および処置履歴を、表1に示す。
表1: ベースライン人数構成および処置履歴:

Figure 2023514795000002
A first interim analysis was planned after enrollment of 26 patients. Twenty-eight patients were enrolled in the study. A second interim analysis is planned after enrollment of 52 patients. To be eligible for enrollment, mUC patients must be anti-PD-/L1 naive as well as measurable disease, ECOG greater than 2, and prior platinum-based chemotherapy on 1 or more lines. Progression or recurrence within 12 months of (neo)adjuvant chemotherapy was required. The demographics and treatment histories of the first 28 patients are shown in Table 1.
Table 1: Baseline population composition and treatment history:
Figure 2023514795000002

主要エンドポイントは、安全性および有効性であった。全奏功率(ORR)を、RECIST 1.1を使用して調査者が評価した。任意の生検した病変は、非標的とみなして評価を開始した。最初の28名の患者の性質を、表2に示す。メジアン処置曝露を、患者の大部分は8回またはこれより多くの処置サイクルを開始して延長した。
表2: 性質-フェーズ2:

Figure 2023514795000003
* 貧血増悪および気管気管支炎 Primary endpoints were safety and efficacy. Overall response rate (ORR) was assessed by investigators using RECIST 1.1. Any biopsied lesion was considered non-target and began evaluation. The disposition of the first 28 patients is shown in Table 2. Median treatment exposure was extended with the majority of patients starting 8 or more treatment cycles.
Table 2: Properties - Phase 2:
Figure 2023514795000003
* Exacerbation of anemia and tracheobronchitis

フェーズ2の最初の28名の患者の臨床応答を表3に示し、RECIST 1.1からの評価可能な集団の臨床応答を表4に示す。
表3: 臨床応答-フェーズ2:

Figure 2023514795000004
表4: 臨床応答-RECIST 1.1 評価可能集団:
Figure 2023514795000005
* 1名の患者は、PRを確認する前に同意を撤回し、1名の患者は、次のスキャン時に偽性進行を有した。
¶ mut/fusにおける患者は、追跡がおよそ4ヶ月短い。 The clinical responses of the first 28 patients in Phase 2 are shown in Table 3 and the clinical responses of the evaluable population from RECIST 1.1 are shown in Table 4.
Table 3: Clinical Response - Phase 2:
Figure 2023514795000004
Table 4: Clinical Responses - RECIST 1.1 Evaluable Population:
Figure 2023514795000005
* 1 patient withdrew consent before confirmation of PR and 1 patient had pseudoprogression at subsequent scan.
¶ Patients in mut/fus have approximately 4 months less follow-up.

フェーズ1bおよび2における36名の患者のうちの15%超または少なくとも15%で最も一般的に起こる処置により発現した有害事象(TEAE)を表5に示す。高リン酸血症または眼もしくは爪の毒性の症例は報告されなかった。TEAEの大部分は、主にグレード1であり、試験に際して早期に起こり、試験処置の途中で解決した。
表5: フェーズ1b/2の患者のうちの≧15%において一般に起こるTEAE:

Figure 2023514795000006
* 8名のフェーズ1b患者を含む。
¶ 4名のうちの1名は、フェーズ1bにおいて起こった。 The most common treatment-emergent adverse events (TEAEs) occurring in >15% or at least 15% of the 36 patients in Phases 1b and 2 are shown in Table 5. No cases of hyperphosphatemia or ocular or nail toxicity were reported. The majority of TEAEs, primarily Grade 1, occurred early on study and resolved during study treatment.
Table 5: TEAEs commonly occurring in ≧15% of Phase 1b/2 patients:
Figure 2023514795000006
* Includes 8 Phase 1b patients.
¶ 1 of 4 occurred in Phase 1b.

フェーズ1bおよび2の36名の患者のうちの15%超または少なくとも15%において最も一般に起こるボファタマブ関連TEAEを表6に示す。グレード3またはこれより大きいボファタマブ関連TEAEは報告されなかった。最も一般的なボファタマブ関連TEAEは、疲労および下痢であった。
表6: フェーズ1b/2の患者のうちの≧15%におけるボファタマブ関連TEAE

Figure 2023514795000007
* 8名のフェーズ1b患者を含む。 The most common bofatamab-related TEAEs occurring in >15% or at least 15% of the 36 patients in Phases 1b and 2 are shown in Table 6. No bofatamab-related TEAEs of grade 3 or greater were reported. The most common bofatamab-associated TEAEs were fatigue and diarrhea.
Table 6: Bofatamab-related TEAEs in ≧15% of Phase 1b/2 patients
Figure 2023514795000007
* Includes 8 Phase 1b patients.

ボファタマブの導入期間は、十分に寛容され、対にした生検物は、患者の大部分(80%)から安全に得られた。ペンブロリズマブとの併用療法はまた、十分に寛容された。ボファタマブの用量低減は起こらず、中断は、303サイクルにわたって6回の中断で希であった。≧2名の患者において起こる重篤なAEは、尿路感染症(n=2; 6%)および急性腎障害(n=2; 6%)であった。全ての重篤なSEは、ボファタマブとは関連しなかった。 The bofatamab lead-in period was well tolerated and paired biopsies were safely obtained from the majority (80%) of patients. Combination therapy with pembrolizumab was also well tolerated. No dose reductions of bofatamab occurred and interruptions were infrequent with 6 interruptions over 303 cycles. Serious AEs occurring in >2 patients were urinary tract infection (n=2; 6%) and acute kidney injury (n=2; 6%). All serious SEs were unrelated to bofatamab.

RECIST 1.1-評価可能フェーズ2試験集団において、ORRは、ペンブロリズマブ単独のもののおよそ2倍であった。評価可能な病変を有する全22名の患者のORRは、40%であった(22名のうち9名)。WTのORRは、40%(15名のうち6名)であり、Mut/Fusに関しては43%(7名のうちの3名)であった。従って、応答は、FGFR3 Mut/FusまたはWT状態にかかわらず、同様であった(図5、図13)。無増悪生存(PFS)傾向は、併用療法で処置した患者にとって有利であるようである(5.9ヶ月; 95% CI 3.6, 8.0) 対 ペンブロリズマブ単独(2.1ヶ月; 95% CI 2.0, 2.2)。DORは、CPI単独で以前に報告されたものより短く、OSを推測するものではないようである。メジアンOSは達成されておらず、全WT患者が少なくとも12ヶ月の追跡期間にわたって追跡されている。 In the RECIST 1.1-Evaluable Phase 2 study population, the ORR was approximately double that of pembrolizumab alone. The ORR for all 22 patients with evaluable disease was 40% (9 of 22). The ORR for WT was 40% (6 out of 15) and 43% (3 out of 7) for Mut/Fus. Therefore, the response was similar regardless of FGFR3 Mut/Fus or WT status (Fig. 5, Fig. 13). Progression-free survival (PFS) trends appear to favor patients treated with combination therapy (5.9 months; 95% CI 3.6, 8.0) versus pembrolizumab alone (2.1 months; 95%) CI 2.0, 2.2). DOR is shorter than previously reported for CPI alone and does not appear to be an inference of OS. Median OS has not been achieved and all WT patients have been followed for at least 12 months of follow-up.

導入期間のボファタマブ単剤療法は、応答者における炎症応答および免疫変化、ならびに免疫経路変更と関連する遺伝子のアップレギュレーションを誘導した(図6)。臨床応答は、分子サブグループと相関し、増大した奏功率(8名のうちの6名)は、luminal下位群において(すなわち、免疫学的に非炎症性(immunologically cold)であった腫瘍を有する被験体において)観察された(図7~12)。これは、併用療法が、このサブタイプにとって特に有効であり得ることを示唆する。がん関連線維芽細胞(CAF)の存在は、応答の欠如と関連する考えられる機構であるようである。p53様腫瘍を有する患者は、不十分にしか応答しないようである(図14)。 Bofatamab monotherapy during the run-in period induced inflammatory responses and immune alterations in responders, as well as upregulation of genes associated with immune pathway alterations (Fig. 6). Clinical responses correlated with molecular subgroups, with increased response rates (6 of 8) in the luminal subgroup (i.e., with tumors that were immunologically cold). subjects) were observed (FIGS. 7-12). This suggests that combination therapy may be particularly effective for this subtype. The presence of cancer-associated fibroblasts (CAFs) appears to be a possible mechanism associated with the lack of response. Patients with p53-like tumors appear to respond poorly (Figure 14).

ボファタマブは、FGFR3阻害を通じて免疫学的変化を生じる。予備的サブタイプ試験において、ボファタマブとペンブロリズマブとの併用は、p53様群を除いて膀胱がんサブタイプにおける応答を改善する。処置に対する耐性は、患者のp53様下位群と関連し得る。いくらかの患者は、RECIST 1.1進行を超える処置から継続した臨床上の利益を得た。
参考文献

Figure 2023514795000008
Bofatamab produces immunological changes through FGFR3 inhibition. In a preliminary subtype study, the combination of bofatamab and pembrolizumab improves response in bladder cancer subtypes, with the exception of the p53-like group. Resistance to treatment may be associated with a p53-like subgroup of patients. Some patients had continued clinical benefit from treatment beyond RECIST 1.1 progression.
References
Figure 2023514795000008

ある特定の実施形態において、膀胱がんの処置のための医薬の製剤化において使用するためのFGFR3インヒビターおよびチェックポイントインヒビター(例えば、PD1インヒビター)の使用が、本明細書で提供される。これらの実施形態のうちのある特定のものにおいて、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、1つの医薬に製剤化される。他の実施形態において、上記FGFR3インヒビターおよびPD1インヒビターは、互いと組み合わせて投与される別個の医薬に製剤化される。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
必要とする被験体において野生型FGFR3を発現するluminal型膀胱がんを処置する方法であって、前記方法は、前記被験体に、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程を包含する方法。
(項目2)
前記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3インヒビターである、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記アンタゴニスト的FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である、項目2に記載の方法。
(項目4)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、および配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含む、項目3に記載の方法。
(項目5)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、項目4に記載の方法。
(項目6)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、および配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、項目3に記載の方法。
(項目7)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである、項目1に記載の方法。
(項目9)
前記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである、項目1に記載の方法。
(項目10)
前記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD-L1抗体である、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記アンタゴニスト的PD-L1抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される、項目10に記載の方法。
(項目12)
前記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである、項目9に記載の方法。
(項目13)
必要とする被験体において野生型FGFR3を発現するluminal型膀胱がんを処置する方法であって、前記方法は、治療上有効な量のアンタゴニスト的FGFR3インヒビターを、治療上有効な量のPD1インヒビターと組み合わせて投与する工程を包含する方法。
(項目14)
前記アンタゴニスト的FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である、項目13に記載の方法。
(項目15)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3、および配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3、および配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、項目14に記載の方法。
(項目17)
前記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである、項目13に記載の方法。
(項目18)
前記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD-L1抗体である、項目13に記載の方法。
(項目19)
前記アンタゴニスト的PD-L1抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される、項目18に記載の方法。
(項目20)
前記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである、項目13に記載の方法。
(項目21)
野生型FGFR3を発現するがんを有する、必要とする被験体を処置する方法であって、前記方法は、
(a)前記被験体を、1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーに関してまたはp53発現に関してスクリーニングする工程;
(b)前記被験体が、前記1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーを有するかまたはp53発現を有するかを決定する工程;
(c)前記工程(b)の決定に基づいて、
(i)前記被験体が前記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有しない場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程、および
(ii)前記被験体が前記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有する場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターおよびさらなる抗がん剤と組み合わせて投与する工程、
を包含する方法。
(項目22)
前記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である、項目21に記載の方法。
(項目23)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3、および配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、項目21に記載の方法。
(項目24)
前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3、および配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、項目21に記載の方法。
(項目25)
前記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである、項目21に記載の方法。
(項目26)
前記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである、項目21に記載の方法。
(項目27)
前記PD1インヒビターは、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択されるアンタゴニスト的PD-L1抗体である、項目26に記載の方法。
(項目28)
前記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである、項目21に記載の方法。
(項目29)
前記がんは、luminal型膀胱がんである、項目21に記載の方法。
In certain embodiments, provided herein is the use of FGFR3 inhibitors and checkpoint inhibitors (eg, PD1 inhibitors) for use in the formulation of medicaments for the treatment of bladder cancer. In certain of these embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor are formulated into one medicament. In other embodiments, the FGFR3 inhibitor and PD1 inhibitor are formulated into separate medicaments that are administered in combination with each other.
The present invention provides, for example, the following items.
(Item 1)
1. A method of treating a luminal-type bladder cancer that expresses wild-type FGFR3 in a subject in need thereof, said method comprising administering to said subject a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor, a therapeutically effective amount of A method comprising administering in combination with a checkpoint inhibitor.
(Item 2)
2. The method of item 1, wherein said FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 inhibitor.
(Item 3)
3. The method of item 2, wherein the antagonistic FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody.
(Item 4)
The antagonistic FGFR3 antibody comprises CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:1, CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:2, and CDR-H3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:3. 4. The method of item 3, comprising:
(Item 5)
5. The method of item 4, wherein said antagonistic FGFR3 antibody comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:7.
(Item 6)
The antagonistic FGFR3 antibody comprises CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, and CDR-L3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6. 4. The method of item 3, comprising:
(Item 7)
7. The method of item 6, wherein said antagonistic FGFR3 antibody comprises a light chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:8.
(Item 8)
The method of item 1, wherein the FGFR3 inhibitor is bofatamab.
(Item 9)
The method of item 1, wherein the checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor.
(Item 10)
10. The method of item 9, wherein said PD1 inhibitor is an antagonistic PD-L1 antibody.
(Item 11)
11. The method of item 10, wherein said antagonistic PD-L1 antibody is selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.
(Item 12)
10. The method of item 9, wherein the PD1 inhibitor is pembrolizumab.
(Item 13)
A method of treating a luminal-type bladder cancer expressing wild-type FGFR3 in a subject in need thereof, said method comprising combining a therapeutically effective amount of an antagonistic FGFR3 inhibitor with a therapeutically effective amount of a PD1 inhibitor. A method comprising administering in combination.
(Item 14)
14. The method of item 13, wherein said antagonistic FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody.
(Item 15)
The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, a CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, a CDR-H3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 3, and 15. The method of item 14, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:7.
(Item 16)
The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, a CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, a CDR-L3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6, and 15. The method of item 14, comprising a light chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8.
(Item 17)
14. The method of item 13, wherein said FGFR3 inhibitor is bofatamab.
(Item 18)
14. The method of item 13, wherein said PD1 inhibitor is an antagonistic PD-L1 antibody.
(Item 19)
19. The method of item 18, wherein said antagonistic PD-L1 antibody is selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.
(Item 20)
14. The method of item 13, wherein the PD1 inhibitor is pembrolizumab.
(Item 21)
A method of treating a subject in need thereof having a cancer that expresses wild-type FGFR3, said method comprising:
(a) screening said subject for a genetic signature that correlates with one or more cancer-associated fibroblasts or for p53 expression;
(b) determining whether said subject has a genetic signature or has p53 expression that correlates with said one or more cancer-associated fibroblasts;
(c) based on the determination of step (b) above,
(i) if said subject does not have said gene signature or p53 expression, administering a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor; and
(ii) if said subject has said gene signature or p53 expression, administering a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor and an additional anti-cancer agent;
A method that encompasses
(Item 22)
22. The method of item 21, wherein said FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody.
(Item 23)
The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, a CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, a CDR-H3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 3, and 22. The method of item 21, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:7.
(Item 24)
The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, a CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, a CDR-L3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6, and 22. The method of item 21, comprising a light chain variable region comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:8.
(Item 25)
22. The method of item 21, wherein said FGFR3 inhibitor is bofatamab.
(Item 26)
22. The method of item 21, wherein the checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor.
(Item 27)
27. The method of item 26, wherein said PD1 inhibitor is an antagonistic PD-L1 antibody selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A.
(Item 28)
22. The method of item 21, wherein the PD1 inhibitor is pembrolizumab.
(Item 29)
22. The method of item 21, wherein the cancer is luminal bladder cancer.

Claims (29)

必要とする被験体において野生型FGFR3を発現するluminal型膀胱がんを処置する方法であって、前記方法は、前記被験体に、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程を包含する方法。 1. A method of treating a luminal-type bladder cancer that expresses wild-type FGFR3 in a subject in need thereof, said method comprising administering to said subject a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor, a therapeutically effective amount of A method comprising administering in combination with a checkpoint inhibitor. 前記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3インヒビターである、請求項1に記載の方法。 2. The method of claim 1, wherein said FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 inhibitor. 前記アンタゴニスト的FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である、請求項2に記載の方法。 3. The method of claim 2, wherein said antagonistic FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody. 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、および配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3を含む、請求項3に記載の方法。 The antagonistic FGFR3 antibody comprises CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:1, CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:2, and CDR-H3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:3. 4. The method of claim 3, comprising: 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、請求項4に記載の方法。 5. The method of claim 4, wherein said antagonistic FGFR3 antibody comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:7. 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、および配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項3に記載の方法。 The antagonistic FGFR3 antibody comprises CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, and CDR-L3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6. 4. The method of claim 3, comprising: 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項6に記載の方法。 7. The method of claim 6, wherein said antagonistic FGFR3 antibody comprises a light chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:8. 前記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである、請求項1に記載の方法。 2. The method of claim 1, wherein the FGFR3 inhibitor is bofatamab. 前記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである、請求項1に記載の方法。 2. The method of claim 1, wherein the checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor. 前記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD-L1抗体である、請求項9に記載の方法。 10. The method of claim 9, wherein said PD1 inhibitor is an antagonistic PD-L1 antibody. 前記アンタゴニスト的PD-L1抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される、請求項10に記載の方法。 11. The method of claim 10, wherein said antagonistic PD-Ll antibody is selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A. 前記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである、請求項9に記載の方法。 10. The method of claim 9, wherein the PD1 inhibitor is pembrolizumab. 必要とする被験体において野生型FGFR3を発現するluminal型膀胱がんを処置する方法であって、前記方法は、治療上有効な量のアンタゴニスト的FGFR3インヒビターを、治療上有効な量のPD1インヒビターと組み合わせて投与する工程を包含する方法。 A method of treating a luminal-type bladder cancer expressing wild-type FGFR3 in a subject in need thereof, said method comprising combining a therapeutically effective amount of an antagonistic FGFR3 inhibitor with a therapeutically effective amount of a PD1 inhibitor. A method comprising administering in combination. 前記アンタゴニスト的FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である、請求項13に記載の方法。 14. The method of claim 13, wherein said antagonistic FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody. 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3、および配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、請求項14に記載の方法。 The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, a CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, a CDR-H3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 3, and 15. The method of claim 14, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:7. 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3、および配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項14に記載の方法。 The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, a CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, a CDR-L3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6, and 15. The method of claim 14, comprising a light chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:8. 前記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである、請求項13に記載の方法。 14. The method of claim 13, wherein the FGFR3 inhibitor is bofatamab. 前記PD1インヒビターは、アンタゴニスト的PD-L1抗体である、請求項13に記載の方法。 14. The method of claim 13, wherein said PD1 inhibitor is an antagonistic PD-L1 antibody. 前記アンタゴニスト的PD-L1抗体は、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択される、請求項18に記載の方法。 19. The method of claim 18, wherein said antagonistic PD-Ll antibody is selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A. 前記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである、請求項13に記載の方法。 14. The method of claim 13, wherein the PD1 inhibitor is pembrolizumab. 野生型FGFR3を発現するがんを有する、必要とする被験体を処置する方法であって、前記方法は、
(a)前記被験体を、1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーに関してまたはp53発現に関してスクリーニングする工程;
(b)前記被験体が、前記1もしくはこれより多くのがん関連線維芽細胞と相関する遺伝子シグナチャーを有するかまたはp53発現を有するかを決定する工程;
(c)前記工程(b)の決定に基づいて、
(i)前記被験体が前記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有しない場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターと組み合わせて投与する工程、および
(ii)前記被験体が前記遺伝子シグナチャーまたはp53発現を有する場合、治療上有効な量のFGFR3インヒビターを、治療上有効な量のチェックポイントインヒビターおよびさらなる抗がん剤と組み合わせて投与する工程、
を包含する方法。
A method of treating a subject in need thereof having a cancer that expresses wild-type FGFR3, said method comprising:
(a) screening said subject for a genetic signature that correlates with one or more cancer-associated fibroblasts or for p53 expression;
(b) determining whether said subject has a genetic signature or has p53 expression that correlates with said one or more cancer-associated fibroblasts;
(c) based on the determination of step (b) above,
(i) if said subject does not have said gene signature or p53 expression, administering a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor; and (ii) said subject. administering a therapeutically effective amount of an FGFR3 inhibitor in combination with a therapeutically effective amount of a checkpoint inhibitor and an additional anti-cancer agent when the body has said gene signature or p53 expression;
A method that encompasses
前記FGFR3インヒビターは、アンタゴニスト的FGFR3抗体である、請求項21に記載の方法。 22. The method of claim 21, wherein said FGFR3 inhibitor is an antagonistic FGFR3 antibody. 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号1に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H2、配列番号3に示されるアミノ酸配列を含むCDR-H3、および配列番号7に示されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む、請求項21に記載の方法。 The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-H1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, a CDR-H2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, a CDR-H3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 3, and 22. The method of claim 21, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:7. 前記アンタゴニスト的FGFR3抗体は、配列番号4に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L2、配列番号6に示されるアミノ酸配列を含むCDR-L3、および配列番号8に示されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項21に記載の方法。 The antagonistic FGFR3 antibody has a CDR-L1 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:4, a CDR-L2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:5, a CDR-L3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:6, and 22. The method of claim 21, comprising a light chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:8. 前記FGFR3インヒビターは、ボファタマブである、請求項21に記載の方法。 22. The method of claim 21, wherein said FGFR3 inhibitor is bofatamab. 前記チェックポイントインヒビターは、PD1インヒビターである、請求項21に記載の方法。 22. The method of claim 21, wherein said checkpoint inhibitor is a PD1 inhibitor. 前記PD1インヒビターは、MEDI-4736、RG7446、BMS-936559、MSB0010718C、およびMPDL3280Aからなる群より選択されるアンタゴニスト的PD-L1抗体である、請求項26に記載の方法。 27. The method of claim 26, wherein said PD1 inhibitor is an antagonistic PD-L1 antibody selected from the group consisting of MEDI-4736, RG7446, BMS-936559, MSB0010718C, and MPDL3280A. 前記PD1インヒビターは、ペンブロリズマブである、請求項21に記載の方法。 22. The method of claim 21, wherein the PD1 inhibitor is pembrolizumab. 前記がんは、luminal型膀胱がんである、請求項21に記載の方法。 22. The method of claim 21, wherein the cancer is luminal bladder cancer.
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