JP2023181361A - Use of pcbp1 to treat hyperproliferative disease - Google Patents
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- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
Abstract
Description
関連出願の相互参照
本出願は、2018年2月5日に出願された米国仮出願第62/626,424号の利益を主張し、その内容は、あらゆる目的のために参照によりそれらの全体が組み込まれる。
CROSS-REFERENCE TO RELATED APPLICATIONS This application claims the benefit of U.S. Provisional Application No. 62/626,424, filed February 5, 2018, the contents of which are incorporated by reference in their entirety for all purposes. Incorporated.
本開示は、細胞遊走および癌転移を阻害し、かつ腫瘍負荷を減少させるための組成物および方法に関する。具体的には、本開示は、癌細胞遊走ならびに癌発生および/または転移を阻害するための癌細胞の形質導入のための方法および組成物を提供する。組成物は、インビトロ、インビボ、エクスビボ、または原位置で投与され得る。 The present disclosure relates to compositions and methods for inhibiting cell migration and cancer metastasis and reducing tumor burden. Specifically, the present disclosure provides methods and compositions for transduction of cancer cells to inhibit cancer cell migration and cancer development and/or metastasis. Compositions may be administered in vitro, in vivo, ex vivo, or in situ.
電子的に提出されたテキストファイルの説明
本明細書と共に電子的に提出されたテキストファイルの内容は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる:配列表のコンピュータ可読フォーマットコピー(ファイル名:IBEX-003/01WO_SeqList_ST25.txt、データ記録日:2019年2月5日、ファイルサイズ15キロバイト)。
Description of Electronically Submitted Text Files The contents of text files electronically submitted with this specification are incorporated herein by reference in their entirety: Computer-readable format copy of the Sequence Listing (File name: IBEX-003/01WO_SeqList_ST25.txt, data recording date: February 5, 2019, file size 15 kilobytes).
再生肝臓のホスファターゼ3(PRL-3)は発癌因子であり、その活性化は腫瘍形成および転移と関連する場合が多い。これまでの研究は、ポリ(rC)結合タンパク質(PCBP1)がPRL-3の発現を減少させ、かつ発癌の発生を阻害することが可能であり得ることを示している。 Regenerating liver phosphatase 3 (PRL-3) is an oncogenic factor, and its activation is often associated with tumorigenesis and metastasis. Previous studies have shown that poly(rC) binding protein (PCBP1) may be able to reduce the expression of PRL-3 and inhibit the development of carcinogenesis.
癌に対する新規の遺伝子療法の将来性を現実化するために、癌細胞は、癌発生、ならびに腫瘍形成および転移に関連するバイオマーカーの発現が減少するか、または予防されるように操作されなければならない。これにより、癌細胞の発生を予防し、かつ/またはそれらが転移することを防ぎ、かつ全身にわたる組織および臓器の浸潤を最小限に抑える。 To realize the promise of novel gene therapies for cancer, cancer cells must be engineered such that expression of biomarkers associated with cancer development and tumorigenesis and metastasis is reduced or prevented. It won't happen. This prevents the development of cancer cells and/or prevents them from metastasizing and minimizes invasion of tissues and organs throughout the body.
本開示は、遺伝子療法を使用して、PCBP1ポリペプチド、その変異体および/またはバリアントをコードする組成物で癌細胞をトランスフェクトまたは/および形質導入することによって、腫瘍発生、成長、細胞遊走、および/または転移を阻害する方法を提供する。 The present disclosure uses gene therapy to improve tumorigenesis, growth, cell migration, and the like by transfecting and/or transducing cancer cells with compositions encoding PCBP1 polypeptides, variants and/or variants thereof. and/or methods of inhibiting metastasis.
いくつかの態様において、本開示は、PCBP1または変異型PCBP1核酸配列を含むベクターを細胞に導入することを含む、細胞遊走を阻害する、予防する、または減少させる方法を提供する。いくつかの実施形態において、細胞遊走は、転移である。 In some embodiments, the present disclosure provides methods of inhibiting, preventing, or reducing cell migration comprising introducing into a cell a vector comprising PCBP1 or a mutant PCBP1 nucleic acid sequence. In some embodiments, cell migration is metastasis.
いくつかの態様において、本開示は、PCBP1または変異型PCBP1核酸配列を含むベクターを癌細胞に導入することを含む、癌を治療する方法を提供する。 In some embodiments, the present disclosure provides a method of treating cancer comprising introducing a vector comprising a PCBP1 or mutant PCBP1 nucleic acid sequence into a cancer cell.
いくつかの実施形態において、方法は、インビトロで実施される。いくつかの実施形態において、方法は、エクスビボで実施される。いくつかの実施形態において、方法は、インビボで実施される。 In some embodiments, the method is performed in vitro. In some embodiments, the method is performed ex vivo. In some embodiments, the method is performed in vivo.
いくつかの実施形態において、細胞は、哺乳動物である。いくつかの実施形態において、哺乳動物細胞は、ヒトである。いくつかの実施形態において、哺乳動物細胞は、臓器細胞、組織細胞、または血液細胞である。 In some embodiments, the cell is mammalian. In some embodiments, the mammalian cell is human. In some embodiments, the mammalian cell is an organ cell, tissue cell, or blood cell.
いくつかの実施形態において、哺乳動物細胞は、癌細胞である。いくつかの実施形態において、癌細胞は、黒色腫、前立腺癌、膵臓癌、膠芽腫、網膜芽腫、または乳癌由来の細胞である。 In some embodiments, the mammalian cell is a cancer cell. In some embodiments, the cancer cells are from melanoma, prostate cancer, pancreatic cancer, glioblastoma, retinoblastoma, or breast cancer.
いくつかの実施形態において、変異型PCBP1核酸配列は、野生型PCBP1と比較してリン酸化することができないか、または完全にリン酸化することができないポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、p21活性化キナーゼ(PAK)によってリン酸化されていないか、または完全にリン酸化されていない。 In some embodiments, the mutant PCBP1 nucleic acid sequence encodes a polypeptide that is unable to be phosphorylated or completely unable to be phosphorylated compared to wild-type PCBP1. In some embodiments, the mutant PCBP1 is not phosphorylated or not completely phosphorylated by p21-activated kinase (PAK).
いくつかの実施形態において、変異型PCBP1核酸は、野生型PCBP1(配列番号1)と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、または5つ以上の変異を含む。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1核酸は、野生型PCBP1(配列番号1)との少なくとも75%の同一性パーセントを有する。いくつかの実施形態において、変異型PCPB1核酸は、配列番号3の配列を含む。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1核酸は、配列番号5の配列を含む。 In some embodiments, the mutant PCBP1 nucleic acid comprises one, two, three, four, or five or more mutations compared to wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 1). In some embodiments, the mutant PCBP1 nucleic acid has a percent identity of at least 75% with wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 1). In some embodiments, the variant PCPB1 nucleic acid comprises the sequence of SEQ ID NO:3. In some embodiments, the variant PCBP1 nucleic acid comprises the sequence of SEQ ID NO:5.
いくつかの実施形態において、ベクターは、変異型PCBP1ポリペプチドをコードする変異型PCBP1核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1ポリペプチドは、野生型PCBP1と比較してリン酸化されていないか、または完全にリン酸化されていない。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1ポリペプチドは、P21活性化キナーゼ-1(PAK1)によってリン酸化されていないか、または完全にリン酸化されていない。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、リン酸化PCBP1産生を阻害または防止する。 In some embodiments, the vector comprises a mutant PCBP1 nucleic acid sequence encoding a mutant PCBP1 polypeptide. In some embodiments, the mutant PCBP1 polypeptide is not phosphorylated or not completely phosphorylated compared to wild-type PCBP1. In some embodiments, the mutant PCBP1 polypeptide is not phosphorylated or not completely phosphorylated by P21-activated kinase-1 (PAK1). In some embodiments, the mutant PCBP1 inhibits or prevents phosphorylated PCBP1 production.
いくつかの実施形態において、変異型PCBP1ポリペプチドは、野生型PCBP1(配列番号2)と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変異を含む。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1ポリペプチドは、野生型PCBP1(配列番号2)との少なくとも75%の同一性パーセントを有する。いくつかの実施形態において、変異型PCPB1ポリペプチドは、配列番号4の配列を含む。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1ポリペプチドは、配列番号6の配列を含む。 In some embodiments, the mutant PCBP1 polypeptide comprises 1, 2, 3, 4, 5, or more mutations compared to wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, the variant PCBP1 polypeptide has a percent identity of at least 75% with wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, the variant PCPB1 polypeptide comprises the sequence of SEQ ID NO:4. In some embodiments, the variant PCBP1 polypeptide comprises the sequence of SEQ ID NO:6.
いくつかの実施形態において、細胞は、野生型または変異型PCBP1核酸配列の複数のコピーを発現する。いくつかの実施形態において、細胞は、野生型または変異型PCBP1ポリペプチドの複数のコピーを発現する。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
変異型PCBP1核酸配列を含むベクターを細胞に導入することを含む、細胞遊走を阻害する、予防する、または減少させる方法。
(項目2)
変異型PCBP1核酸配列を含むベクターを癌細胞に導入することを含む、癌を治療する方法。
(項目3)
前記方法が、インビトロで実施される、項目1または2に記載の方法。
(項目4)
前記方法が、エクスビボで実施される、項目1または2に記載の方法。
(項目5)
前記方法が、インビボで実施される、項目1または2に記載の方法。
(項目6)
前記細胞が、哺乳動物である、項目1または2に記載の方法。
(項目7)
前記哺乳動物細胞が、ヒトである、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記哺乳動物細胞が、臓器細胞、組織細胞、または血液細胞である、項目6に記載の方法。
(項目9)
前記哺乳動物細胞が、癌細胞である、項目6に記載の方法。
(項目10)
前記癌細胞が、黒色腫、前立腺癌、または乳癌由来の細胞である、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記変異型PCBP1核酸配列が、完全にリン酸化されていないポリペプチドをコード
する、項目1または2に記載の方法。
(項目12)
前記変異型PCBP1が、PAKによって完全にリン酸化されていない、項目11に記載の方法。
(項目13)
前記変異型PCBP1核酸が、野生型PCBP1(配列番号1)と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変異を含む、項目1または2に記載の方法。
(項目14)
前記変異型PCBP1核酸が、野生型PCBP1(配列番号1)に対し少なくとも75%の同一性パーセントを有する、項目1または2に記載の方法。
(項目15)
前記変異型PCPB1核酸が、配列番号3の配列を含む、項目1または2に記載の方法。
(項目16)
前記変異型PCBP1核酸が、配列番号5の配列を含む、項目1または2に記載の方法。
(項目17)
前記ベクターが、変異型PCBP1ポリペプチドをコードする変異型PCBP1核酸配列を含む、項目1または2に記載の方法。
(項目18)
前記変異型PCBP1ポリペプチドが、完全にリン酸化されていない、項目17に記載の方法。
(項目19)
前記変異型PCBP1ポリペプチドが、PAKによって完全にリン酸化されていない、項目18に記載の方法。
(項目20)
前記変異型PCBP1ポリペプチドが、野生型PCBP1(配列番号2)と比較して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、またはそれ以上の変異を含む、項目17に記載の方法。(項目21)
前記変異型PCBP1ポリペプチドが、PCBP1型(配列番号2)との少なくとも75%の同一性パーセントを有する、項目17に記載の方法。
(項目22)
前記変異型PCPB1ポリペプチドが、配列番号4の配列を含む、項目17に記載の方法。
(項目23)
前記変異型PCBP1ポリペプチドが、配列番号6の配列を含む、項目17に記載の方法。
(項目24)
前記細胞が、前記PCBP1核酸配列の複数のコピーを発現する、項目1または2に記載の方法。
(項目25)
前記細胞が、PCBP1ポリペプチドの複数のコピーを発現する、項目1または2に記載の方法。
(項目26)
前記ベクターが、PCBP1の1つ、2つ、および/または3つのドメインをコードする変異型PCBP1核酸配列を含む、項目1または2に記載の方法。
(項目27)
前記変異型PBCB1の前記1つ以上のドメインが、完全にリン酸化されていない、項目26に記載の方法。
(項目28)
変異型PCBP1核酸配列を含むベクターを細胞に導入することを含む、細胞遊走および/または癌発生を経過観察するための方法。
(項目29)
前記細胞遊走が転移である、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記細胞が、治療的処置に曝露されている、項目28に記載の方法。
(項目31)
前記治療的処置が、化学療法的処置である、項目30に記載の方法。
(項目32)
前記癌細胞が、インビトロで治療的処置に曝露された、項目28に記載の方法。
(項目33)
前記癌細胞が、インビボで治療的処置に曝露された、項目28に記載の方法。
In some embodiments, the cell expresses multiple copies of a wild-type or mutant PCBP1 nucleic acid sequence. In some embodiments, the cell expresses multiple copies of a wild-type or mutant PCBP1 polypeptide.
In certain embodiments, for example, the following items are provided:
(Item 1)
A method of inhibiting, preventing or reducing cell migration comprising introducing into a cell a vector comprising a mutant PCBP1 nucleic acid sequence.
(Item 2)
A method of treating cancer comprising introducing a vector containing a mutant PCBP1 nucleic acid sequence into cancer cells.
(Item 3)
3. The method according to item 1 or 2, wherein the method is performed in vitro.
(Item 4)
3. A method according to item 1 or 2, wherein said method is performed ex vivo.
(Item 5)
3. A method according to item 1 or 2, wherein said method is carried out in vivo.
(Item 6)
The method according to item 1 or 2, wherein the cell is a mammal.
(Item 7)
7. The method according to item 6, wherein the mammalian cell is human.
(Item 8)
7. The method according to item 6, wherein the mammalian cell is an organ cell, tissue cell, or blood cell.
(Item 9)
7. The method according to item 6, wherein the mammalian cell is a cancer cell.
(Item 10)
The method according to item 9, wherein the cancer cells are cells derived from melanoma, prostate cancer, or breast cancer.
(Item 11)
3. The method according to item 1 or 2, wherein the mutant PCBP1 nucleic acid sequence encodes a polypeptide that is not completely phosphorylated.
(Item 12)
12. The method according to item 11, wherein the mutant PCBP1 is not completely phosphorylated by PAK.
(Item 13)
Item 1 or 2, wherein the mutant PCBP1 nucleic acid contains 1, 2, 3, 4, 5, or more mutations compared to wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 1). Method.
(Item 14)
3. The method of item 1 or 2, wherein the mutant PCBP1 nucleic acid has a percent identity of at least 75% to wild type PCBP1 (SEQ ID NO: 1).
(Item 15)
The method according to item 1 or 2, wherein the mutant PCPB1 nucleic acid comprises the sequence of SEQ ID NO: 3.
(Item 16)
The method according to item 1 or 2, wherein the mutant PCBP1 nucleic acid comprises the sequence of SEQ ID NO: 5.
(Item 17)
3. The method of item 1 or 2, wherein the vector comprises a mutant PCBP1 nucleic acid sequence encoding a mutant PCBP1 polypeptide.
(Item 18)
18. The method according to item 17, wherein the mutant PCBP1 polypeptide is not completely phosphorylated.
(Item 19)
19. The method according to item 18, wherein the mutant PCBP1 polypeptide is not completely phosphorylated by PAK.
(Item 20)
The method of item 17, wherein the mutant PCBP1 polypeptide comprises one, two, three, four, five, or more mutations compared to wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 2). . (Item 21)
18. The method of item 17, wherein said variant PCBP1 polypeptide has a percent identity of at least 75% with PCBP type 1 (SEQ ID NO: 2).
(Item 22)
18. The method of item 17, wherein the mutant PCPB1 polypeptide comprises the sequence SEQ ID NO: 4.
(Item 23)
18. The method of item 17, wherein the mutant PCBP1 polypeptide comprises the sequence SEQ ID NO: 6.
(Item 24)
3. The method of item 1 or 2, wherein said cell expresses multiple copies of said PCBP1 nucleic acid sequence.
(Item 25)
3. The method of item 1 or 2, wherein the cell expresses multiple copies of the PCBP1 polypeptide.
(Item 26)
3. The method of item 1 or 2, wherein the vector comprises a mutant PCBP1 nucleic acid sequence encoding one, two, and/or three domains of PCBP1.
(Item 27)
27. The method of item 26, wherein the one or more domains of the mutant PBCB1 are not completely phosphorylated.
(Item 28)
A method for monitoring cell migration and/or cancer development, which comprises introducing a vector containing a mutant PCBP1 nucleic acid sequence into cells.
(Item 29)
29. The method according to item 28, wherein the cell migration is metastasis.
(Item 30)
29. The method of item 28, wherein said cells are exposed to a therapeutic treatment.
(Item 31)
31. The method of item 30, wherein the therapeutic treatment is a chemotherapeutic treatment.
(Item 32)
29. The method of item 28, wherein said cancer cells are exposed to therapeutic treatment in vitro.
(Item 33)
29. The method of item 28, wherein said cancer cells are exposed to therapeutic treatment in vivo.
PRL-3発現は、卵巣癌、前立腺癌、および胃癌を含む転移性癌において上昇することが分かっており、PRL-3の過剰発現は、より悪い肝臓癌予後と相関する(Bardelli et al.2003、Polato et al.,2005、Peng et al.2004)。PCBP1の過剰発現は、PRL-3発現を減少させることが以前に示されている(Wang et al.,2010)。本開示は、野生型PCBP1ポリペプチドまたは発現レベルよりも大きい程度までPRL-3を減少させ、したがって細胞の腫瘍形成性および遊走を減少させる新規のPCBP1変異および/または過剰発現PCBP1を提供する。 PRL-3 expression has been found to be elevated in metastatic cancers, including ovarian, prostate, and gastric cancers, and overexpression of PRL-3 correlates with worse liver cancer prognosis (Bardelli et al. 2003 , Polato et al., 2005, Peng et al. 2004). Overexpression of PCBP1 has previously been shown to reduce PRL-3 expression (Wang et al., 2010). The present disclosure provides novel PCBP1 mutations and/or overexpressed PCBP1 that reduce PRL-3 to a greater extent than wild-type PCBP1 polypeptides or expression levels, thus reducing tumorigenicity and migration of cells.
したがって、本明細書に開示される組成物および方法は、細胞遊走および/または転移を低減または予防するために、変異型PCBP1または過剰発現PCBP1で(例えば、トランスフェクションまたは形質導入を通して)遺伝子改変された細胞を含む。変異型PCBP1配列は、疾患の治療のために細胞遊走を直接予防する、阻害する、減少させる、または遅延させるために、遺伝子療法のためのベクター系に組み込まれる。 Accordingly, the compositions and methods disclosed herein involve genetically modified (e.g., through transfection or transduction) with mutant or overexpressed PCBP1 to reduce or prevent cell migration and/or metastasis. Contains cells. Mutant PCBP1 sequences are incorporated into vector systems for gene therapy to directly prevent, inhibit, reduce, or retard cell migration for the treatment of diseases.
ポリ(rC)結合タンパク質1(PCBP1)
いくつかの態様において、本開示は、転写因子ポリ(rC)結合タンパク質1(hnRNP-E1およびαCP1としても既知のPCBP1)を含有するベクターを提供し、これは、腫瘍形成を阻害するか、もしくは遅延させ、かつ/または細胞成長もしくは転移を予防することができる。いくつかの実施形態において、PCBP1は、哺乳動物PCBP1である。いくつかの実施形態において、PCBP1は、ヒトPCBP1、その変異体、フラグメント、またはバリアントである。いくつかの実施形態において、PCBP1、その変異体、フラグメント、またはバリアントは、発現タンパク質のリン酸化を防止するかまたは減少させる。いくつかの実施形態において、PCBP1は、本明細書に開示される変異型PCBP1_1またはPCBP1_2である。
Poly(rC) binding protein 1 (PCBP1)
In some embodiments, the present disclosure provides vectors containing the transcription factor poly(rC) binding protein 1 (PCBP1, also known as hnRNP-E1 and αCP1), which inhibit tumorigenesis or Cell growth or metastasis can be delayed and/or prevented. In some embodiments, PCBP1 is mammalian PCBP1. In some embodiments, PCBP1 is human PCBP1, a variant, fragment, or variant thereof. In some embodiments, PCBP1, a variant, fragment, or variant thereof prevents or reduces phosphorylation of an expressed protein. In some embodiments, the PCBP1 is a variant PCBP1_1 or PCBP1_2 disclosed herein.
いくつかの実施形態において、PCBP1は、細胞増殖または遊走を減少させる。いくつかの実施形態において、PCBP1は、細胞生存率を減少させる。いくつかの実施形態において、PCBP1は、細胞死を増加させる。いくつかの実施形態において、PCBP1は、免疫細胞の成長および/または増殖に影響を及ぼす。いくつかの実施形態において、PCBP1は、炎症を治療する。いくつかの実施形態において、炎症は、癌に関連する。 In some embodiments, PCBP1 reduces cell proliferation or migration. In some embodiments, PCBP1 decreases cell viability. In some embodiments, PCBP1 increases cell death. In some embodiments, PCBP1 affects immune cell growth and/or proliferation. In some embodiments, PCBP1 treats inflammation. In some embodiments, the inflammation is associated with cancer.
いくつかの実施形態において、PCBP1は、癌を治療する。いくつかの実施形態において、PCBP1は、腫瘍形成または転移に関連する癌バイオマーカーの発現および/または翻訳を変化させることによって癌を治療する。いくつかの実施形態において、PCBP1は、腫瘍形成または転移に関連する癌バイオマーカーの発現および/または翻訳を減少させる。いくつかの実施形態において、癌バイオマーカーとしては、PRL-3、CD44バリアント、E-カドヘリン、STAT-3、およびビメンチンが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、転移に関連する癌バイオマーカーは、PRL-3である。いくつかの実施形態において、PCBP1は、PRL-3のmRNA発現を阻害する過剰発現した野生型PCBP1または変異したPCBP1である。いくつかの実施形態において、PCBP1は、PRL-3のタンパク質発現を阻害する過剰発現した野生型PCBP1または変異したPCBP1である。 In some embodiments, PCBP1 treats cancer. In some embodiments, PCBP1 treats cancer by altering the expression and/or translation of cancer biomarkers associated with tumorigenesis or metastasis. In some embodiments, PCBP1 decreases the expression and/or translation of cancer biomarkers associated with tumorigenesis or metastasis. In some embodiments, cancer biomarkers include, but are not limited to, PRL-3, CD44 variants, E-cadherin, STAT-3, and vimentin. In some embodiments, the cancer biomarker associated with metastasis is PRL-3. In some embodiments, the PCBP1 is overexpressed wild-type PCBP1 or mutated PCBP1 that inhibits PRL-3 mRNA expression. In some embodiments, the PCBP1 is overexpressed wild-type PCBP1 or mutated PCBP1 that inhibits protein expression of PRL-3.
いくつかの実施形態において、PCBP1は、遺伝子改変(例えばトランスフェクトまたは形質導入)された細胞における細胞遊走を減少させる。いくつかの実施形態において、細胞遊走は、転移である。 In some embodiments, PCBP1 reduces cell migration in genetically modified (eg, transfected or transduced) cells. In some embodiments, cell migration is metastasis.
いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、リン酸化を有しないかまたは減少している。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、PAKリン酸化を有しないかまたは減少している。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、リン酸化PCBP1産生を阻害または防止する。 In some embodiments, the mutant PCBP1 has no or reduced phosphorylation. In some embodiments, the mutant PCBP1 has no or reduced PAK phosphorylation. In some embodiments, the mutant PCBP1 inhibits or prevents phosphorylated PCBP1 production.
いくつかの実施形態において、PCBP1は、過剰発現した野生型PCBP1である。いくつかの実施形態において、細胞は、野生型PCBP1の1つ以上のコピーで形質導入される。いくつかの実施形態において、PCBP1は、変異体である。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、単一変異体である。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、二重変異体である。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1は、三重変異体である。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1ポリペプチドは、S223L、T60A、および/もしくはT127A変異、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、単一PCBP1変異ポリペプチドは、S223L変異体(本明細書においてmPCBP1_1と称される)である。いくつかの実施形態において、二重PCBP1変異ポリペプチドは、T60A & T127A変異体(本明細書においてmPCBP1_2と称される)である。 In some embodiments, PCBP1 is overexpressed wild type PCBP1. In some embodiments, the cell is transduced with one or more copies of wild-type PCBP1. In some embodiments, PCBP1 is a mutant. In some embodiments, the mutant PCBP1 is a single mutant. In some embodiments, the mutant PCBP1 is a double mutant. In some embodiments, the mutant PCBP1 is a triple mutant. In some embodiments, the mutant PCBP1 polypeptide comprises the S223L, T60A, and/or T127A mutations, or a combination thereof. In some embodiments, the single PCBP1 variant polypeptide is the S223L variant (referred to herein as mPCBP1_1). In some embodiments, the dual PCBP1 mutant polypeptide is a T60A & T127A mutant (referred to herein as mPCBP1_2).
いくつかの実施形態において、PCBP1は、核酸である。いくつかの実施形態において、核酸は、DNAである。いくつかの実施形態において、核酸は、RNAである。いくつかの実施形態において、核酸は、mRNAである。いくつかの実施形態において、核酸は、cDNAである。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号1の核酸配列またはその変異体を含有する。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号1の完全長核酸配列またはその変異体である。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号1の核酸配列のフラグメントまたはその変異体である。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号1の核酸配列のバリアントまたはその変異体である。いくつかの実施形態において、変異型PCBP1核酸は、c668t、a178g、および/もしくはa379g変異、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、単一PCBP1変異核酸は、c668g変異体(本明細書においてmPCBP1_1と称される)である。いくつかの実施形態において、二重PCBP1変異核酸は、a178g & a379g変異体(本明細書においてmPCBP1_2と称される)である。 In some embodiments, PCBP1 is a nucleic acid. In some embodiments, the nucleic acid is DNA. In some embodiments, the nucleic acid is RNA. In some embodiments, the nucleic acid is mRNA. In some embodiments, the nucleic acid is cDNA. In some embodiments, PCBP1 contains the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or a variant thereof. In some embodiments, PCBP1 is the full length nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or a variant thereof. In some embodiments, PCBP1 is a fragment of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or a variant thereof. In some embodiments, PCBP1 is a variant of the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or a variant thereof. In some embodiments, the mutant PCBP1 nucleic acid comprises a c668t, a178g, and/or a379g mutation, or a combination thereof. In some embodiments, the single PCBP1 mutant nucleic acid is the c668g mutant (referred to herein as mPCBP1_1). In some embodiments, the double PCBP1 mutant nucleic acid is an a178g & a379g mutant (referred to herein as mPCBP1_2).
理論に束縛されるものではないが、PCBP1内のKHドメインの各々は、異なるタンパク質のmRNAに結合することが示されており、1つ以上のKHドメインの使用は、所与のタンパク質の翻訳を選択的に阻害し得る。いくつかの実施形態において、PCBP1核酸は、3つ全てのK相同(KH)ドメインをコードする。いくつかの実施形態において、PCPB1核酸は、2つのKHドメインをコードする。いくつかの実施形態において、PCPB1核酸は、1つのKHドメインをコードする。 Without wishing to be bound by theory, each of the KH domains within PCBP1 has been shown to bind to the mRNA of a different protein, and the use of more than one KH domain can inhibit the translation of a given protein. Can be selectively inhibited. In some embodiments, the PCBP1 nucleic acid encodes all three K homology (KH) domains. In some embodiments, the PCPB1 nucleic acid encodes two KH domains. In some embodiments, the PCPB1 nucleic acid encodes one KH domain.
さらに、核局在化シグナルにおける変異は、PCBP1が核内に移行する能力を変化させ、したがって、後の遺伝子発現に影響を及ぼし得る。いくつかの実施形態において、PCBP1は、一方または両方の核局在化シグナルにおける変異を含む。いくつかの実施形態において、一方または両方の核局在化シグナルの変化は、PCBP1が核内に移行する能力を阻害する。 Furthermore, mutations in nuclear localization signals can alter the ability of PCBP1 to translocate into the nucleus, thus affecting subsequent gene expression. In some embodiments, PCBP1 comprises mutations in one or both nuclear localization signals. In some embodiments, alteration of one or both nuclear localization signals inhibits the ability of PCBP1 to translocate into the nucleus.
リン酸化はまた、PCBP1の活性においても役割を果たす(例えば、非リン酸化PCBP1は、活性を欠いている可能性があるか、またはより大きい活性を示す可能性がある)。いくつかの実施形態において、PCBP1ヌクレオチド配列は、PCBP1ポリペプチドがリン酸化される能力に影響を及ぼす変異(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1ヌクレオチド配列変異(複数可)は、PCBP1ポリペプチドリン酸化を防止する。いくつかの実施形態において、非リン酸化PCBP1または完全にリン酸化されていないPCBP1ポリペプチドは、野生型レベルで活性ではない。 Phosphorylation also plays a role in the activity of PCBP1 (eg, unphosphorylated PCBP1 may lack activity or may exhibit greater activity). In some embodiments, the PCBP1 nucleotide sequence includes mutation(s) that affect the ability of the PCBP1 polypeptide to be phosphorylated. In some embodiments, the PCBP1 nucleotide sequence variation(s) prevents PCBP1 polypeptide phosphorylation. In some embodiments, unphosphorylated PCBP1 or a PCBP1 polypeptide that is not fully phosphorylated is not active at wild-type levels.
いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、多シストロン性mRNA転写物から発現する。いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、2シストロン性mRNA転写物から発現する。いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、融合タンパク質として発現する。 In some embodiments, the PCBP1 polypeptide is expressed from a polycistronic mRNA transcript. In some embodiments, the PCBP1 polypeptide is expressed from a bicistronic mRNA transcript. In some embodiments, the PCBP1 polypeptide is expressed as a fusion protein.
いくつかの実施形態において、PCBP1ヌクレオチド配列は、野生型PCBP1(配列番号1)と比較して点変異(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、PCPB1ヌクレオチド配列は、リン酸化に影響を及ぼす点変異(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1点変異は、リン酸化を増加させる。いくつかの実施形態において、PCBP1点変異は、リン酸化を減少させる。いくつかの実施形態において、PCBP1ヌクレオチド配列は、核膜移行に影響を及ぼし得る変異(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1ヌクレオチド配列は、表1に開示される点変異(複数可)を含む。 In some embodiments, the PCBP1 nucleotide sequence comprises point mutation(s) compared to wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 1). In some embodiments, the PCPB1 nucleotide sequence includes point mutation(s) that affect phosphorylation. In some embodiments, the PCBP1 point mutation increases phosphorylation. In some embodiments, the PCBP1 point mutation reduces phosphorylation. In some embodiments, the PCBP1 nucleotide sequence includes mutation(s) that can affect nuclear membrane translocation. In some embodiments, the PCBP1 nucleotide sequence comprises the point mutation(s) disclosed in Table 1.
いくつかの実施形態において、点変異は、G13A、G128C、A178G、T299C、T299A、G326A、A379G、G527A、C652T、C688T、G676A、G700A、G781T、T808G、G814T、A871G、C947T、G1033C、C1034T、G1048C、および/もしくはA127G、またはこれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。いくつかの実施形態において、リン酸化を増加させる点変異は、G13A、A178G、T299C、T299A、G326A、A379G、G527A、C652T、G781T、G814T、C947T、G1033C、C1034T、G1048C、および/もしくはG1067T、またはこれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。いくつかの実施形態において、リン酸化を減少させる点変異は、C688T、A127G、もしくはG128C、A178G、および/もしくはA379G、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。いくつかの実施形態において、点変異は、C668T、A178Gおよび/もしくはA379G、またはそれらの組み合わせである。
いくつかの実施形態において、本開示は、PCBP1(配列番号1)の模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体を提供する。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1の核酸配列と比較して1つ以上の核酸置換を含む。いくつかの実施形態において、1~20個の核酸が置換される。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1の核酸配列(例えば、配列番号1)と比較して、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、または約10個の核酸置換を含む。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1の核酸配列(例えば、配列番号1)と比較して1つ以上の核酸欠失を含む。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号3(mPCBP1_1(c668t))を含む。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号5(mPCBP1_2(a178g & a379g)を含む。 In some embodiments, the present disclosure provides mimetics, analogs, derivatives, variants, or mutants of PCBP1 (SEQ ID NO: 1). In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises one or more nucleic acid substitutions compared to the nucleic acid sequence of native PCBP1. In some embodiments, 1-20 nucleic acids are replaced. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant has about 1, about 2, about 3, about 4 , about 5, about 6, about 7, about 8, about 9, or about 10 nucleic acid substitutions. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or mutant comprises one or more nucleic acid deletions compared to the native PCBP1 nucleic acid sequence (eg, SEQ ID NO: 1). In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises SEQ ID NO: 3 (mPCBP1_1(c668t)). In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises SEQ ID NO: 5 (mPCBP1_2(a178g & a379g)).
いくつかの実施形態において、天然PCBP1の核酸配列(例えば、配列番号1)と比較して、1~20個の核酸残基が欠失している。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1の核酸配列(例えば、配列番号1)と比較して、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、または約10個の核酸残基欠失を有する。いくつかの実施形態において、天然PCBP1の核酸配列(例えば、配列番号1)と比較して、1~10個の核酸残基がいずれかの末端で欠失している。いくつかの実施形態において、天然PCBP1の核酸配列と比較して、1~10個の核酸残基が両方の末端から欠失している。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体の核酸配列は、天然PCBP1の核酸配列と少なくとも約70%同一である。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体の核酸配列は、天然PCBP1の核酸配列(例えば、配列番号1)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一である。同一性の割合は、アライメントプログラムEMBOSS Needleを使用して計算され得る。 In some embodiments, 1-20 nucleic acid residues are deleted compared to the native PCBP1 nucleic acid sequence (eg, SEQ ID NO: 1). In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant has about 1, about 2, about 3, about 4 , having a deletion of about 5, about 6, about 7, about 8, about 9, or about 10 nucleic acid residues. In some embodiments, 1-10 nucleic acid residues are deleted at either end compared to the native PCBP1 nucleic acid sequence (eg, SEQ ID NO: 1). In some embodiments, 1-10 nucleic acid residues are deleted from both ends compared to the native PCBP1 nucleic acid sequence. In some embodiments, the nucleic acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or mutant is at least about 70% identical to the nucleic acid sequence of native PCBP1. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or mutant nucleic acid sequence is about 70%, about 80%, about 85%, About 90%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical. Percent identity can be calculated using the alignment program EMBOSS Needle.
いくつかの実施形態において、PCBP1は、ポリペプチドである。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号2のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号2の完全長アミノ酸配列である。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号2のアミノ酸配列のフラグメントである。いくつかの実施形態において、PCB1は、配列番号2のアミノ酸配列のバリアントである。いくつかの実施形態において、PCBP1バリアントは、配列番号4のアミノ酸配列(mPCBP1_1(S223L))を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1バリアントは、配列番号6のアミノ酸配列(mPCBP1_2T60A & T127A)を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1は、配列番号2のアミノ酸配列の機能的フラグメントまたはバリアントである。いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、3つ全てのK相同(KH)ドメインを含む。いくつかの実施形態において、PCPB1ポリペプチドは、2つのKHドメインを含む。いくつかの実施形態において、PCPB1ポリペプチドは、1つのKHドメインを含む。 In some embodiments, PCBP1 is a polypeptide. In some embodiments, PCBP1 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:2. In some embodiments, PCBP1 is the full length amino acid sequence of SEQ ID NO:2. In some embodiments, PCBP1 is a fragment of the amino acid sequence of SEQ ID NO:2. In some embodiments, PCB1 is a variant of the amino acid sequence of SEQ ID NO:2. In some embodiments, the PCBP1 variant comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 (mPCBP1_1(S223L)). In some embodiments, the PCBP1 variant comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 (mPCBP1_2T60A & T127A). In some embodiments, PCBP1 is a functional fragment or variant of the amino acid sequence of SEQ ID NO:2. In some embodiments, the PCBP1 polypeptide includes all three K homology (KH) domains. In some embodiments, the PCPB1 polypeptide includes two KH domains. In some embodiments, the PCPB1 polypeptide includes one KH domain.
いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、1つの変異K相同(KH)ドメインを含む。いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、2つの変異K相同(KH)ドメインを含む。いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチドは、3つの変異K相同(KH)ドメインを含む。いくつかの実施形態において、1つ以上のKHドメインにおける変異は、RNA結合に影響を及ぼす。 In some embodiments, the PCBP1 polypeptide comprises one mutant K homology (KH) domain. In some embodiments, the PCBP1 polypeptide comprises two mutant K homology (KH) domains. In some embodiments, the PCBP1 polypeptide comprises three mutant K homology (KH) domains. In some embodiments, mutations in one or more KH domains affect RNA binding.
いくつかの実施形態において、PCBP1ポリペプチド配列は、野生型PCBP1(配列番号2)に対するアミノ酸変異を含む。いくつかの実施形態において、PCPB1ポリペプチド配列は、リン酸化に影響を及ぼすアミノ酸変異を含む。いくつかの実施形態において、アミノ酸変異は、V5M、S43A、T60A、L100P、L100Q、C109Y、A127G、G128C、T237A、G176E、P218S、G226R、D234N、D261Y、Y270D、A272S、I291V、A316V、A345P、A345V、E350Q、S356I、またはこれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。いくつかの実施形態において、リン酸化を増加させる変異は、V5M、L100P、L100Q、C109Y、G176E、D261Y、A272S、A316V、A345P、A345V、および/もしくはE350Q、またはこれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。いくつかの実施形態において、リン酸化を減少させる変異は、S43A、T60A、T127A、および/もしくはS223L、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。いくつかの実施形態において、アミノ酸変異は、T60A、S223L、S43A、および/またはT127Aである。 In some embodiments, the PCBP1 polypeptide sequence includes amino acid mutations relative to wild-type PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, the PCPB1 polypeptide sequence includes amino acid mutations that affect phosphorylation. In some embodiments, the amino acid mutations are V5M, S43A, T60A, L100P, L100Q, C109Y, A127G, G128C, T237A, G176E, P218S, G226R, D234N, D261Y, Y270D, A272S, I291V, A316V, A345P, A34 5V , E350Q, S356I, or combinations thereof. In some embodiments, mutations that increase phosphorylation include V5M, L100P, L100Q, C109Y, G176E, D261Y, A272S, A316V, A345P, A345V, and/or E350Q, or combinations thereof. selected from the group including but not limited to. In some embodiments, mutations that reduce phosphorylation are selected from the group including, but not limited to, S43A, T60A, T127A, and/or S223L, or combinations thereof. In some embodiments, the amino acid mutation is T60A, S223L, S43A, and/or T127A.
いくつかの実施形態において、本開示は、PCBP1(配列番号2)の模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体を提供する。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1のアミノ酸配列と比較して1つ以上のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、20個を超えるアミノ酸が置換される。いくつかの実施形態において、1~20個のアミノ酸が置換される。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と比較して、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、もしくは約10個、またはそれ以上のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号4を含む。いくつかの実施形態では、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号6を含む。 In some embodiments, the present disclosure provides mimetics, analogs, derivatives, variants, or mutants of PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or mutant comprises one or more amino acid substitutions compared to the amino acid sequence of native PCBP1. In some embodiments, more than 20 amino acids are substituted. In some embodiments, 1-20 amino acids are substituted. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant has about 1, about 2, about 3, about 4, about 5, about 6, about 7, about 8, about 9, or about 10, or more amino acid substitutions. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises SEQ ID NO:4. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises SEQ ID NO:6.
いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然ペプチド治療薬のアミノ酸配列と比較して1つ以上のアミノ酸欠失を含む。いくつかの実施形態において、20個を超えるアミノ酸が欠失している。いくつかの実施形態において、天然タンパク質剤のアミノ酸配列と比較して、1~20個のアミノ酸が欠失している。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と比較して、約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、もしくは約10個、またはそれ以上のアミノ酸欠失を有する。いくつかの実施形態において、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と比較して、1~10個のアミノ酸がいずれかの末端で欠失している。いくつかの実施形態において、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と比較して、1~10個のアミノ酸が両方の末端から欠失している。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と少なくとも約70%同一である。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一である。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一であり、天然PCBP1の生物活性の全てまたはほとんどを保持する。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1のアミノ酸配列(配列番号2)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一であり、天然PCBP1と比較して生物活性が低減または改変している。 In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises one or more amino acid deletions compared to the amino acid sequence of the native peptide therapeutic. In some embodiments, more than 20 amino acids are deleted. In some embodiments, 1-20 amino acids are deleted compared to the amino acid sequence of the native protein agent. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant has about 1, about 2, about 3, about 4, about 5, about 6, about 7, about 8, about 9, or about 10, or more amino acid deletions. In some embodiments, 1-10 amino acids are deleted at either terminus compared to the amino acid sequence of native PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, 1-10 amino acids are deleted from both termini as compared to the amino acid sequence of native PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is at least about 70% identical to the amino acid sequence of native PCBP1 (SEQ ID NO: 2). In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is about 70%, about 80%, about 85%, about 90% different from the amino acid sequence of native PCBP1 (SEQ ID NO: 2). %, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical. In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is about 70%, about 80%, about 85%, about 90% different from the amino acid sequence of native PCBP1 (SEQ ID NO: 2). %, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical and retains all or most of the biological activity of native PCBP1. In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is about 70%, about 80%, about 85%, about 90% different from the amino acid sequence of native PCBP1 (SEQ ID NO: 2). %, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical and has reduced or altered biological activity compared to native PCBP1.
いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1の1つ以上のドメインのアミノ酸配列(配列番号2)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一である。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1の1つ以上のドメインのアミノ酸配列(配列番号2)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一であり、天然PCBP1の生物活性の全てまたはほとんどを保持する。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体のアミノ酸配列は、天然PCBP1の1つ以上のドメインのアミノ酸配列(配列番号2)と約70%、約80%、約85%、約90%、約95%、約96%、約97%、約98%、または約99%同一であり、天然PCBP1と比較して生物活性が低減または改変している。同一性の割合は、アライメントプログラムEMBOSS Needleを使用して計算され得る。ペアワイズアラインメントには、次のデフォルトパラメータが使用され得る:タンパク質重量マトリックス=BLOSUM62、ギャップオープン=10、ギャップ伸長=0.1。 In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is about 70%, about 80%, About 85%, about 90%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical. In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is about 70%, about 80%, is about 85%, about 90%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical and retains all or most of the biological activity of native PCBP1. In some embodiments, the amino acid sequence of the mimetic, analog, derivative, variant, or variant is about 70%, about 80%, about 85%, about 90%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical and has reduced or altered biological activity compared to native PCBP1. Percent identity can be calculated using the alignment program EMBOSS Needle. The following default parameters may be used for pairwise alignment: protein weight matrix = BLOSUM62, gap open = 10, gap extension = 0.1.
ベクターおよびプラスミド
標的組織または細胞への治療用遺伝子の効率的な送達は、遺伝子療法を成功させるための最も大きなハードルである。裸のDNAが、食細胞性免疫細胞または細胞外ヌクレアーゼによってインビボで急速に除去または分解されるため、導入遺伝子を保護する手段が所望され得る。さらに、自発的なDNA取り込みの効率が悪いため、組織または細胞移入をもたらすためのビヒクルも必要である。したがって、DNAは通常、目的の遺伝子の効果的な組織または細胞移入を保護し、媒介するために、通称ベクターである何らかのタイプの遺伝子送達ビヒクルと組み合わされる。
Vectors and Plasmids Efficient delivery of therapeutic genes to target tissues or cells is the greatest hurdle to successful gene therapy. Because naked DNA is rapidly removed or degraded in vivo by phagocytic immune cells or extracellular nucleases, means to protect the transgene may be desired. Furthermore, due to the inefficiency of spontaneous DNA uptake, a vehicle is also required to effect tissue or cell transfer. Therefore, the DNA is usually combined with some type of gene delivery vehicle, commonly called a vector, to protect and mediate effective tissue or cell transfer of the gene of interest.
遺伝子送達系は、非生物学的(例えば、哺乳動物細胞にプラスミドDNAを導入する化学的および物理的アプローチ)または生物学的(例えば、ウイルスおよび細菌)に分類され得る。非ウイルス遺伝子送達系は通常、プラスミドDNA上に担持される伝達遺伝子を伴う。用いられるプラスミドは一般に、哺乳動物細胞において複製しない。 Gene delivery systems can be classified as non-biological (eg, chemical and physical approaches to introducing plasmid DNA into mammalian cells) or biological (eg, viruses and bacteria). Non-viral gene delivery systems usually involve the transferred gene being carried on plasmid DNA. The plasmids used generally do not replicate in mammalian cells.
最も一般的に、組換えウイルスまたは裸のDNAもしくはDNA複合体が使用される。例えば、ウイルスは、修正した治療用DNAを細胞に運ぶベクターを提供するために実験室で修飾され得、そこでウイルスは、異常な遺伝子発現を改変し、かつ遺伝的疾患を治療するためにゲノムに組み込まれ得る。あるいは、ベクターは、染色体外のままであり、一時的に発現し得る。 Most commonly, recombinant viruses or naked DNA or DNA complexes are used. For example, viruses can be modified in the laboratory to provide vectors that carry modified therapeutic DNA into cells, where the virus is modified to alter the genome to alter aberrant gene expression and treat genetic diseases. can be incorporated. Alternatively, the vector may remain extrachromosomal and be expressed transiently.
いくつかの態様において、本開示は、ウイルスベクターを使用する遺伝子療法の方法を提供する。遺伝子療法で使用され得るウイルスとしては、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、複製可能ベクター、ワクシニアウイルス、および単純ヘルペスウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。遺伝子療法で使用され得るウイルスベクターとしては、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルスベクター(AAV)、複製可能ベクター、ワクシニアウイルスベクター、および単純ヘルペスウイルスベクターが挙げられるが、これらに限定されない。 In some embodiments, the present disclosure provides methods of gene therapy using viral vectors. Viruses that can be used in gene therapy include, but are not limited to, lentiviruses, retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses, replication competent vectors, vaccinia virus, and herpes simplex virus. Viral vectors that can be used in gene therapy include, but are not limited to, lentiviruses, retroviruses, adenoviruses, adeno-associated virus vectors (AAV), replication competent vectors, vaccinia virus vectors, and herpes simplex virus vectors. .
いくつかの態様において、本開示は、非ウイルスベクターを使用する遺伝子療法の方法を提供する。いくつかの態様において、本開示は、細菌ベクターを使用する遺伝子療法の方法を提供する。いくつかの実施形態において、遺伝子療法の方法は、裸の核酸(例えば、DNAまたはRNA)の注入を伴う。これは、当該技術分野において既知の任意の適切な手段を使用して実施され得る。いくつかの態様において、本開示は、細菌送達系を使用する遺伝子療法の方法を提供する。いくつかの実施形態において、細菌細胞は、生存、弱毒化、または死滅している。いくつかの実施形態において、細菌送達系は、細胞が哺乳動物細胞または分泌系に付着して、核酸および/またはタンパク質を標的哺乳動物細胞に送達する能力を利用する。いくつかの実施形態において、細菌送達系は、Salmonella typhi、Bifidobacterium種、Salmonella choleraesuis、Vibrio cholera、Listeria monocytogenes、Escherichia coli、Streptococcus pyogenes、およびSerratia marcescensから選択されるが、これらに限定されない。 In some embodiments, the present disclosure provides methods of gene therapy using non-viral vectors. In some embodiments, the present disclosure provides methods of gene therapy using bacterial vectors. In some embodiments, methods of gene therapy involve injection of naked nucleic acid (eg, DNA or RNA). This may be performed using any suitable means known in the art. In some embodiments, the present disclosure provides methods of gene therapy using bacterial delivery systems. In some embodiments, the bacterial cell is alive, attenuated, or killed. In some embodiments, bacterial delivery systems utilize the ability of cells to attach to mammalian cells or secretion systems to deliver nucleic acids and/or proteins to target mammalian cells. In some embodiments, the bacterial delivery system is Salmonella typhi, Bifidobacterium sp., Salmonella choleraesuis, Vibrio cholera, Listeria monocytogenes, Escherichia col i, Streptococcus pyogenes, and Serratia marcescens, but are not limited thereto.
いくつかの態様において、本開示は、非ウイルスおよび非細菌ベクターを使用する遺伝子療法の方法を提供する。いくつかの実施形態において、非ウイルスベクターおよび非細菌ベクターは、真核生物ベクターである。いくつかの実施形態において、真核生物ベクターは、トランスポゾン系、CRISPR系、ジンクフィンガーヌクレアーゼ系、またはTALEN(転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ)を含む。いくつかの実施形態において、トランスポゾン系は、Sleeping BeautyまたはpiggyBacまたはトランスポゾン系から選択されるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、アルギニン豊富なペプチドまたはソノポレーションなど、核酸送達のための他の方法が使用されてもよい。 In some embodiments, the present disclosure provides methods of gene therapy using non-viral and non-bacterial vectors. In some embodiments, non-viral vectors and non-bacterial vectors are eukaryotic vectors. In some embodiments, the eukaryotic vector comprises a transposon system, a CRISPR system, a zinc finger nuclease system, or a TALEN (transcription activator-like effector nuclease). In some embodiments, the transposon system is selected from, but not limited to, Sleeping Beauty or piggyBac or a transposon system. In some embodiments, other methods for nucleic acid delivery may be used, such as arginine-rich peptides or sonoporation.
いくつかの態様において、本開示は、ナノ粒子を使用する遺伝子療法の方法を提供する。いくつかの実施形態において、ナノ粒子は、脂質ベースのナノ粒子である。いくつかの実施形態において、脂質ベースのナノ粒子は、固体脂質ナノ粒子(SLN)である。いくつかの実施形態において、脂質ベースのナノ粒子は、非構造化脂質担体(NLC)である。いくつかの実施形態において、ナノ粒子は、ポリマーベースのナノ粒子である。いくつかの実施形態において、ポリマーベースのナノ粒子は、ナノスフェアまたはナノカプセルである。 In some embodiments, the present disclosure provides methods of gene therapy using nanoparticles. In some embodiments, the nanoparticles are lipid-based nanoparticles. In some embodiments, the lipid-based nanoparticles are solid lipid nanoparticles (SLNs). In some embodiments, the lipid-based nanoparticle is a non-structured lipid carrier (NLC). In some embodiments, the nanoparticles are polymer-based nanoparticles. In some embodiments, the polymer-based nanoparticles are nanospheres or nanocapsules.
プラスミドDNAベースのベクターは、遺伝子療法において一般的に使用され、DNAの大きいセグメントを収容することができ、遺伝子移入および発現に影響を及ぼす様々な調節エレメントの操作を可能にする。最も基本的には、発現プラスミドは、発現カセットと骨格を含む。発現カセットは、目的の遺伝子(複数可)と、標的細胞における発現に必要な任意の調節配列とを含む転写単位である。骨格は、選択可能マーカー(例えば、抗生物質耐性遺伝子または栄養要求性選択遺伝子)と、細菌におけるプラスミドの産生に必要な複製起点とを含み得る。 Plasmid DNA-based vectors are commonly used in gene therapy and can accommodate large segments of DNA, allowing manipulation of various regulatory elements that affect gene transfer and expression. Most basically, an expression plasmid contains an expression cassette and a backbone. An expression cassette is a transcription unit containing the gene(s) of interest and any regulatory sequences necessary for expression in the target cell. The scaffold may contain a selectable marker (eg, an antibiotic resistance gene or an auxotrophic selection gene) and an origin of replication necessary for production of the plasmid in bacteria.
任意の適切なプラスミドが、本明細書に開示される方法で使用され得る。いくつかの実施形態において、プラスミドは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態において、プラスミドは、アデノ随伴ウイルス(AAV)プラスミドである。いくつかの実施形態において、代表的なプラスミドは、図1A~Bに開示される。発現カセットにおける遺伝子の発現を駆動するために、任意の適切なプロモーターが使用され得る。 Any suitable plasmid can be used in the methods disclosed herein. In some embodiments, the plasmid is a lentiviral vector. In some embodiments, the plasmid is an adeno-associated virus (AAV) plasmid. In some embodiments, representative plasmids are disclosed in FIGS. 1A-B. Any suitable promoter can be used to drive expression of the genes in the expression cassette.
いくつかの実施形態において、プラスミドは、レトロウイルスプロモーターを含む。いくつかの実施形態において、プラスミドは、ウイルスプロモーターを含む。いくつかの実施形態において、プラスミドは、哺乳動物プロモーターを含む。いくつかの実施形態において、哺乳動物プロモーターは、ヒトプロモーターである。いくつかの実施形態において、プロモーターは、組織または細胞特異的である。いくつかの実施形態において、組織特異的プロモーターは、ヒト形質導入α-サブユニットプロモーター、GANT2、VMD2、ヒトIRBP、K14、IRS2、およびグリア線維性酸性タンパク質(GFAP)プロモーターから選択される。選択されたプロモーターがキメラプロモーターとして使用され得る(例えば、光受容体間レチノイド結合タンパク質(IRBP)プロモーターと共に)。いくつかの実施形態において、組織または細胞特異的プロモーターは、膵臓細胞、膵臓β細胞、皮膚細胞、角質細胞、光受容体細胞、上皮細胞、内皮細胞、および/または癌細胞(例えば、乳癌細胞、前立腺癌細胞、白血病細胞、リンパ腫細胞、神経癌細胞、膠芽腫など)に特異的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、網膜または眼組織もしくは細胞に特異的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、造血細胞に特異的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、肝臓組織または細胞に特異的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、肺組織または細胞に特異的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、筋肉組織または細胞に特異的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、HIV感染細胞に特異的である。 In some embodiments, the plasmid includes a retroviral promoter. In some embodiments, the plasmid includes a viral promoter. In some embodiments, the plasmid includes a mammalian promoter. In some embodiments, the mammalian promoter is a human promoter. In some embodiments, the promoter is tissue or cell specific. In some embodiments, the tissue-specific promoter is selected from the human transducing α-subunit promoter, GANT2, VMD2, human IRBP, K14, IRS2, and glial fibrillary acidic protein (GFAP) promoter. Selected promoters can be used as chimeric promoters (eg, with the interphotoreceptor retinoid binding protein (IRBP) promoter). In some embodiments, tissue- or cell-specific promoters are expressed in pancreatic cells, pancreatic beta cells, skin cells, corneocytes, photoreceptor cells, epithelial cells, endothelial cells, and/or cancer cells (e.g., breast cancer cells, specific for prostate cancer cells, leukemia cells, lymphoma cells, nerve cancer cells, glioblastoma, etc.). In some embodiments, the promoter is specific for retinal or ocular tissues or cells. In some embodiments, the promoter is specific for hematopoietic cells. In some embodiments, the promoter is specific for liver tissue or cells. In some embodiments, the promoter is lung tissue or cell specific. In some embodiments, the promoter is muscle tissue or cell specific. In some embodiments, the promoter is specific for HIV-infected cells.
いくつかの実施形態において、プロモーターは、誘導性プロモーターである。いくつかの実施形態において、プロモーターは、ドキシサイクリン、テトラサイクリン、IPTG、エクジソン、またはラパマイシンが挙げられるが、これらに限定されない任意の適切な組成または刺激によって誘導される。いくつかの実施形態において、誘導性プロモーターは、TRE3G、テトラサイクリン、Lac、エクジソン、およびラパマイシンプロモーターが挙げられるが、これらに限定されない、当業者に既知のいずれかから選択される。いくつかの実施形態において、プロモーターは、構成的である。いくつかの実施形態において、プロモーターは、合成プロモーターであるか、またはエンハンサー要素を含む。いくつかの実施形態において、プロモーターは、ハイブリッドプロモーターである。いくつかの実施形態において、ハイブリッドプロモーターは、遺伝子の調節領域を含む。 In some embodiments, the promoter is an inducible promoter. In some embodiments, the promoter is inducible by any suitable composition or stimulus including, but not limited to, doxycycline, tetracycline, IPTG, ecdysone, or rapamycin. In some embodiments, the inducible promoter is selected from any known to those of skill in the art, including, but not limited to, TRE3G, tetracycline, Lac, ecdysone, and rapamycin promoters. In some embodiments, the promoter is constitutive. In some embodiments, the promoter is a synthetic promoter or includes an enhancer element. In some embodiments, the promoter is a hybrid promoter. In some embodiments, the hybrid promoter includes the regulatory region of the gene.
いくつかの実施形態において、プロモーターは、Ef1a、CAG、sv40、CMV、RSV、Oct4、Rex1、Nanog、GANT2、VMD2、hIRBP、TETプロモーター、CAATボックス、GCボックス、GT-1モチーフ、I-ボックス、ATが豊富な配列、RBCS1、TRE3G、GAL1、Lap267、ラパマイシン、CD11a、CD11b、CD18、ベータ-グロビンプロモーター/LCR、免疫グロブリンプロモーター、PEPCKプロモーター、アルブミンプロモーター、hAAT、SPC、SP-A、MCK、VLC1、HIV-LTR、Tat/Rev応答性エレメント、Tat誘導性エレメント、およびFMR1が挙げられるが、これらに限定されない群から選択される。 In some embodiments, the promoter is Efla, CAG, sv40, CMV, RSV, Oct4, Rex1, Nanog, GANT2, VMD2, hIRBP, TET promoter, CAAT box, GC box, GT-1 motif, I-box, AT-rich sequences, RBCS1, TRE3G, GAL1, Lap267, rapamycin, CD11a, CD11b, CD18, beta-globin promoter/LCR, immunoglobulin promoter, PEPCK promoter, albumin promoter, hAAT, SPC, SP-A, MCK, VLC1 , HIV-LTR, Tat/Rev responsive element, Tat inducible element, and FMR1.
いくつかの実施形態において、プラスミドは、遺伝子療法を介して導入される遺伝子の全てを含む。いくつかの実施形態において、プラスミドは、PCBP1を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1は、変異型PCBP1である。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号3を含む。いくつかの実施形態において、模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号5を含む。いくつかの実施形態において、PCBP1模倣体、類似体、誘導体、バリアント、または変異体は、配列番号4または配列番号6のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする。 In some embodiments, the plasmid contains all of the genes introduced via gene therapy. In some embodiments, the plasmid comprises PCBP1. In some embodiments, PCBP1 is a mutant PCBP1. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises SEQ ID NO:3. In some embodiments, the mimetic, analog, derivative, variant, or variant comprises SEQ ID NO:5. In some embodiments, the PCBP1 mimetic, analog, derivative, variant, or variant encodes a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 6.
いくつかの実施形態において、本開示のベクターの導入は、細胞内の遺伝子コピー数を増加させる。いくつかの実施形態において、本開示のベクターの導入は、細胞内の遺伝子発現を増加させる。いくつかの実施形態において、本開示のベクターの導入は、細胞内のポリペプチド発現を増加させる。いくつかの実施形態において、遺伝子は、PCBP1またはその変異体である。 In some embodiments, introduction of a vector of the present disclosure increases gene copy number within a cell. In some embodiments, introduction of a vector of the present disclosure increases gene expression within a cell. In some embodiments, introduction of a vector of the present disclosure increases polypeptide expression within a cell. In some embodiments, the gene is PCBP1 or a variant thereof.
疾患および障害
本明細書に開示される組成物および方法は、任意の適切な細胞または組織の種類に用いられ得る。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法は、インビトロで実施される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法は、エクスビボで実施される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法は、単離細胞に実施される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法は、細胞培養に実施される。いくつかの実施形態において、単離細胞または細胞培養細胞は、対象から採取され、次いで、トランスフェクションまたは形質導入後に移植される。いくつかの実施形態において、細胞は、癌細胞である。
Diseases and Disorders The compositions and methods disclosed herein can be used on any suitable cell or tissue type. In some embodiments, the methods disclosed herein are performed in vitro. In some embodiments, the methods disclosed herein are performed ex vivo. In some embodiments, the methods disclosed herein are performed on isolated cells. In some embodiments, the methods disclosed herein are performed in cell culture. In some embodiments, isolated cells or cell culture cells are harvested from a subject and then transplanted after transfection or transduction. In some embodiments, the cell is a cancer cell.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物および方法は、インビボで用いられる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法は、原位置で用いられる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法は、眼、網膜、心臓、血液、白血球、赤血球、血小板、硝子体液、強膜、網膜、虹彩、角膜、骨格筋肉、心筋、平滑筋、軟骨、腱、骨、表皮、臓器、肝臓、心臓、腎臓、肺、胃、胃腸管、結腸、膀胱、卵巣、睾丸、膵臓、骨髄、脳、ニューロン、および/または腺が挙げられるが、これらに限定されない、身体の任意の適切な部分における細胞遊走を減少させるために使用される。 In some embodiments, the compositions and methods disclosed herein are used in vivo. In some embodiments, the methods disclosed herein are used in situ. In some embodiments, the methods disclosed herein are directed to the eye, retina, heart, blood, white blood cells, red blood cells, platelets, vitreous humor, sclera, retina, iris, cornea, skeletal muscle, cardiac muscle, smooth muscle. , cartilage, tendons, bones, epidermis, organs, liver, heart, kidneys, lungs, stomach, gastrointestinal tract, colon, bladder, ovaries, testicles, pancreas, bone marrow, brain, neurons, and/or glands. Used to reduce cell migration in any suitable part of the body, including but not limited to.
任意の適切な疾患の治療、予防、改善、または遅延のために、本明細書に開示される組成物および方法が使用され得る。例えば、治療、予防、改善、または遅延が可能な疾患は、細胞遊走によって特徴付けられる。 The compositions and methods disclosed herein can be used for the treatment, prevention, amelioration, or delay of any suitable disease. For example, diseases that can be treated, prevented, ameliorated, or delayed are characterized by cell migration.
いくつかの実施形態において、癌または制御されていない細胞増殖を治療するために、本明細書に開示される組成物および方法が使用され得る。いくつかの実施形態において、転移または制御されていない細胞遊走の予防、阻害、改善、または減少のために、本明細書に開示される組成物および方法が使用される。いくつかの実施形態において、癌は、固形癌である。いくつかの実施形態において、癌は、非固形癌である。いくつかの実施形態において、本開示は、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、副腎皮質癌、AIDS関連癌、肛門癌、虫垂癌、星細胞腫(例えば、小児小脳または大脳)、基底細胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨腫瘍(例えば、骨肉腫、悪性線維性組織球腫)、脳幹部神経膠腫、脳癌、脳腫瘍(例えば、膠芽腫、小脳星細胞腫、大脳星細胞腫/悪性神経膠腫、上衣腫、髄芽腫、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、視覚路および視床下部神経膠腫)、乳癌、気管支腺腫/カルチノイド、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、中枢神経系リンパ腫、小脳星細胞腫、子宮頸癌、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性骨髄増殖性障害、結腸癌、皮膚T細胞性リンパ腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、ユーウイング肉腫、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管癌、眼癌、胆嚢癌、胃(腹部)癌、消化管間質腫瘍(GIST)、胚細胞腫瘍(例えば、頭蓋外、性腺外、卵巣)、妊娠性絨毛腫瘍、神経膠腫(例えば、脳幹、大脳星細胞腫、視覚路および視床下部)、胃カルチノイド、頭頸部癌、心臓癌、肝細胞(肝臓)癌、下咽頭癌、視床下部および視覚路神経膠腫、眼内黒色腫、膵島細胞癌(内分泌膵臓)、腎臓癌(腎細胞癌)、喉頭癌、白血病(例えば、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、有毛細胞)、口唇および口腔癌、脂肪肉腫、肝臓癌、肺癌(例えば、非小細胞、小細胞)、リンパ腫(例えば、AIDS関連、バーキット、皮膚T細胞ホジキン、非ホジキン、中枢神経系原発)、髄芽腫、黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、口腔癌(mouth cancer)、多発性内分泌腫瘍症候群、多発性骨髄腫、菌状息肉症、骨髄異形成症候群、骨髄異形成/骨髄増殖性疾患、骨髄性白血病(myelogenous leukemia)、骨髄性白血病(myeloid leukemia)、骨髄増殖性障害、慢性、鼻腔および副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、非小細胞肺癌、口腔癌(oral cancer)、口腔咽頭癌、骨肉腫、卵巣癌、膵臓癌、膵臓癌、副鼻腔および鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌(pharyngeal cancer)、褐色細胞腫、松果体星細胞腫および/または胚腫、松果体芽腫およびテント上原始神経外胚葉性腫瘍、下垂体腺腫、形質細胞腫瘍/多発性骨髄腫、胸膜肺芽腫、中枢神経系原発リンパ腫、前立腺癌、直腸癌、腎細胞癌(腎臓癌)、腎盂および尿管、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、肉腫(例えば、ユーイングファミリー、カポジ、軟組織、子宮)、セザリー症候群、皮膚癌(例えば、非黒色腫、黒色腫、メルケル細胞)、小細胞肺癌、小腸癌、軟組織肉腫、扁平上皮癌、頸部扁平上皮癌、胃癌、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、T細胞リンパ腫、精巣癌、咽頭癌(throat cancer)、胸腺腫および胸腺癌、甲状腺癌、栄養膜腫瘍、尿管癌および腎盂癌、尿道癌、子宮癌、子宮肉腫、膣癌、視覚路および視床下部神経膠腫、外陰部癌、ワルデンストレームマクログロブリン血症、ならびにウィルムス腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない癌に関する。いくつかの実施形態において、本開示の組成物でトランスフェクトまたは形質導入された細胞は、これらの種類の癌のうちの1つ以上から得られる。 In some embodiments, the compositions and methods disclosed herein can be used to treat cancer or uncontrolled cell growth. In some embodiments, the compositions and methods disclosed herein are used to prevent, inhibit, ameliorate, or reduce metastasis or uncontrolled cell migration. In some embodiments, the cancer is a solid cancer. In some embodiments, the cancer is a non-solid cancer. In some embodiments, the present disclosure provides treatment for acute lymphoblastic leukemia (ALL), acute myeloid leukemia (AML), adrenocortical carcinoma, AIDS-related cancers, anal cancer, appendiceal cancer, astrocytomas (e.g., pediatric cerebellum or cerebrum), basal cell carcinoma, cholangiocarcinoma, bladder cancer, bone tumors (e.g. osteosarcoma, malignant fibrous histiocytoma), brainstem glioma, brain cancer, brain tumors (e.g. glioblastoma, cerebellar star) Cytoma, cerebral astrocytoma/malignant glioma, ependymoma, medulloblastoma, supratentorial primitive neuroectodermal tumor, visual tract and hypothalamic glioma), breast cancer, bronchial adenoma/carcinoid, Burkitt's lymphoma, Carcinoid tumor, central nervous system lymphoma, cerebellar astrocytoma, cervical cancer, chronic lymphocytic leukemia (CLL), chronic myeloid leukemia (CML), chronic myeloproliferative disorder, colon cancer, cutaneous T-cell lymphoma, fibroplasia Small round cell tumors, endometrial cancer, ependymomas, esophageal cancers, Ewing sarcoma, extragonadal germ cell tumors, extrahepatic cholangiocarcinomas, eye cancers, gallbladder cancers, gastric (abdominal) cancers, gastrointestinal stromal tumors ( GIST), germ cell tumors (e.g. extracranial, extragonadal, ovarian), gestational trophoblastic tumors, gliomas (e.g. brainstem, cerebral astrocytomas, visual tract and hypothalamus), gastric carcinoids, head and neck cancers, Heart cancer, hepatocellular (liver) cancer, hypopharyngeal cancer, hypothalamic and visual tract glioma, intraocular melanoma, islet cell carcinoma (endocrine pancreas), kidney cancer (renal cell carcinoma), laryngeal cancer, leukemia (e.g. , acute lymphocytic leukemia, acute myeloid leukemia, chronic lymphocytic leukemia, chronic myeloid leukemia, hair cell), lip and oral cavity cancer, liposarcoma, liver cancer, lung cancer (e.g., non-small cell, small cell), lymphoma (e.g., AIDS-related, Burkitt, cutaneous T-cell Hodgkin, non-Hodgkin, central nervous system primary), medulloblastoma, melanoma, Merkel cell carcinoma, mesothelioma, metastatic cervical squamous cell carcinoma, oral cancer (mouth cancer), multiple endocrine tumor syndrome, multiple myeloma, mycosis fungoides, myelodysplastic syndrome, myelodysplastic/myeloproliferative disease, myeloid leukemia, myeloid leukemia, bone marrow proliferative disorders, chronic, nasal and paranasal sinus cancer, nasopharyngeal cancer, neuroblastoma, non-Hodgkin's lymphoma, non-small cell lung cancer, oral cancer, oropharyngeal cancer, osteosarcoma, ovarian cancer, pancreatic cancer, Pancreatic cancer, sinus and nasal cavity cancer, parathyroid cancer, penile cancer, pharyngeal cancer, pheochromocytoma, pineal astrocytoma and/or germinoma, pineoblastoma and supratentorial extraneural cancer. Germinal tumor, pituitary adenoma, plasma cell tumor/multiple myeloma, pleuropulmonary blastoma, primary central nervous system lymphoma, prostate cancer, rectal cancer, renal cell carcinoma (kidney cancer), renal pelvis and ureter, retinoblast cancer, rhabdomyosarcoma, salivary gland cancer, sarcoma (e.g. Ewing family, Kaposi, soft tissue, uterine), Sézary syndrome, skin cancer (e.g. non-melanoma, melanoma, Merkel cell), small cell lung cancer, small intestine cancer, Soft tissue sarcoma, squamous cell carcinoma, squamous cell carcinoma of the neck, gastric cancer, supratentorial primitive neuroectodermal tumor, T cell lymphoma, testicular cancer, throat cancer, thymoma and thymic carcinoma, thyroid cancer, trophoblastic tumor , ureteral and renal pelvis cancer, urethral cancer, uterine cancer, uterine sarcoma, vaginal cancer, visual tract and hypothalamic glioma, vulvar cancer, Waldenström macroglobulinemia, and Wilms tumor. Relating to, but not limited to, cancer. In some embodiments, cells transfected or transduced with compositions of the present disclosure are obtained from one or more of these types of cancer.
投与
本開示の組成物は、任意の適切な手段を介して投与され得る。いくつかの実施形態において、核酸投与経路は、経皮、注射、筋肉内、皮下、経口、経鼻、膣内、直腸、経粘膜、腸内、非経口、局所、硬膜外、脳内、脳血管内、動脈内、関節内、皮内、病巣内、眼内、骨内、腹腔内、髄腔内、子宮内、静脈内、膀胱内注入、または硝子体内である。
Administration Compositions of the present disclosure may be administered via any suitable means. In some embodiments, the route of nucleic acid administration is transdermal, injection, intramuscular, subcutaneous, oral, nasal, intravaginal, rectal, transmucosal, enteral, parenteral, topical, epidural, intracerebral, Intracerebrovascular, intraarterial, intraarticular, intradermal, intralesional, intraocular, intraosseous, intraperitoneal, intrathecal, intrauterine, intravenous, intravesical, or intravitreal.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法を使用して組成物でトランスフェクトまたは形質導入された組成物または細胞は、患者に投与される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される方法を使用して作られた組成物でトランスフェクトまたは形質導入された組成物または細胞は、疾患または障害の治療、予防、改善、またはその発症の遅延のために患者に投与される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物の投与は、対象における細胞遊走を予防する、減少させる、改善する、または遅延させる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物の投与は、対象における細胞遊走を予防する、減少させる、改善する、または遅延させ、かつ疾患または障害を治療する、予防する、改善する、またはその発症を遅延させる。いくつかの実施形態において、疾患または障害は、癌または転移性癌である。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組成物の投与は、対象における腫瘍質量/負荷を減少させる。 In some embodiments, compositions or cells transfected or transduced with compositions using the methods disclosed herein are administered to a patient. In some embodiments, compositions or cells transfected or transduced with compositions made using the methods disclosed herein are used to treat, prevent, ameliorate, or treat a disease or disorder. Administered to patients to delay onset. In some embodiments, administration of the compositions disclosed herein prevents, reduces, ameliorates, or slows cell migration in a subject. In some embodiments, administration of a composition disclosed herein prevents, reduces, ameliorates, or slows cell migration in a subject and treats, prevents, or ameliorates a disease or disorder. or delay its onset. In some embodiments, the disease or disorder is cancer or metastatic cancer. In some embodiments, administration of a composition disclosed herein reduces tumor mass/burden in a subject.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞は、患者に1回投与される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞は、患者に約2回、約3回、約4回、約5回、約6回、約7回、約8回、約9回、約10回、約20回、約40回、またはそれ以上投与される。本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞は、疾患または障害の症状が改善するまで投与される。 In some embodiments, the vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein are administered once to a patient. In some embodiments, the vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein are administered to a patient about 2 times, about 3 times, about 4 times, about 5 times, about 6 times, about 7 times, about 8 times. The administration may be administered twice, about 9 times, about 10 times, about 20 times, about 40 times, or more. The vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein are administered until the symptoms of the disease or disorder ameliorate.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクターまたは核酸の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者と比較して、処置患者における細胞遊走または増殖を予防する、改善する、減少させる、または遅延させる。いくつかの実施形態において、細胞遊走または増殖は、1日目~10年目に処置患者において予防される、改善する、減少する、または遅延する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるプラスミドまたはベクターの投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における細胞遊走または増殖と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に細胞遊走または増殖を予防する、改善する、減少させる、または遅延させる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸またはベクターの投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における細胞遊走または増殖と比較して、約1日、約1週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、細胞遊走または増殖を防止する、改善する、減少させる、または遅延させる。 In some embodiments, administration of a vector or nucleic acid disclosed herein prevents, ameliorates, or reduces cell migration or proliferation in a treated patient as compared to an untreated patient or the same patient prior to treatment. cause or delay. In some embodiments, cell migration or proliferation is prevented, ameliorated, reduced, or delayed in the treated patient from day 1 to year 10. In some embodiments, administration of a plasmid or vector disclosed herein is performed on about day 1, on about day 2, as compared to cell migration or proliferation in an untreated patient or the same patient before treatment. Approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, approximately 6th week, About 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about 60th week, about 70th week, Preventing, ameliorating, reducing, or retarding cell migration or proliferation at about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of a nucleic acid or vector disclosed herein reduces cell migration or proliferation by about 1 day, about 1 week, about 1 Preventing cell migration or proliferation for months, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more to make, improve, reduce, or delay.
いくつかの実施形態において、細胞遊走または増殖は、他の細胞遊走または増殖阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%減少する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の細胞遊走または増殖予防/阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、細胞遊走または増殖を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の細胞遊走または増殖予防/阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、細胞遊走または増殖を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。 In some embodiments, cell migration or proliferation is about 1%, about 5%, about 10%, about 20% compared to controls or patients or in vitro cells treated with other cell migration or proliferation inhibition methods. %, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1st day, approximately 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, about 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about At 60 weeks, about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years, reduce cell migration or proliferation by about 1%; about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1. About 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, Reduce cell migration or proliferation by about 1%, about 5%, about 10% for about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more , about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクターまたは核酸の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者と比較して、処置患者における腫瘍質量または負荷を低減する。いくつかの実施形態において、腫瘍質量/負荷は、1日目~10年目に処置患者において減少する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるプラスミドまたはベクターの投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における腫瘍質量または負荷と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に腫瘍質量または負荷を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸またはベクターの投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における腫瘍質量または負荷と比較して、約1日、約1週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、腫瘍質量または負荷を低減する。 In some embodiments, administration of a vector or nucleic acid disclosed herein reduces tumor mass or burden in a treated patient compared to an untreated patient or the same patient prior to treatment. In some embodiments, tumor mass/burden is reduced in treated patients from day 1 to year 10. In some embodiments, administration of a plasmid or vector disclosed herein is performed on about day 1, on about day 2, as compared to tumor mass or burden in an untreated patient or the same patient before treatment. Approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, approximately 6th week, About 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about 60th week, about 70th week, The tumor mass or burden is reduced at about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of a nucleic acid or vector disclosed herein provides about 1 day, about 1 week, about 1 reducing tumor mass or burden for a period of 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more do.
いくつかの実施形態において、腫瘍質量または負荷は、他の腫瘍質量または負荷低減方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%減少する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の腫瘍質量または負荷低減方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、腫瘍質量または負荷を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の腫瘍質量または負荷低減方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、腫瘍質量または負荷を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。 In some embodiments, the tumor mass or burden is about 1%, about 5%, about 10%, about 20% compared to controls or patients or in vitro cells treated with other tumor mass or burden reduction methods. %, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein is administered for about 1 day compared to controls or patients treated with other tumor mass or burden reduction methods or cells in vitro. 2nd day, 3rd day, 4th day, 5th day, 6th day, 1st week, 2nd week, 3rd week, 4th week, 5th day 6th week, 7th week, 8th week, 9th week, 10th week, 20th week, 30th week, 40th week, 50th week, 60th week At about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years, the tumor mass or burden is reduced by about 1%, about 5 %, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1 About 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 Reduce tumor mass or burden by about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞は、インビトロで処置細胞における癌バイオマーカー発現を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、処置患者における癌バイオマーカー発現を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、1日目~10年目に、処置患者またはインビトロ細胞における癌バイオマーカー発現を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の癌バイオマーカー発現阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に癌バイオマーカー発現を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるプラスミド、ベクター、または細胞の投与は、他の癌バイオマーカー発現阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1日、2日、3日、4日、5日、6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、癌バイオマーカー発現を低減する。 In some embodiments, the vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein reduce cancer biomarker expression in treated cells in vitro. In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein reduces cancer biomarker expression in treated patients. In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein reduces cancer biomarker expression in treated patients or in vitro cells from day 1 to year 10. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein is administered for about 1 day compared to controls or patients or cells in vitro treated with other cancer biomarker expression inhibition methods. 2nd day, 3rd day, 4th day, 5th day, 6th day, 1st week, 2nd week, 3rd week, 4th week, 5th day 6th week, 7th week, 8th week, 9th week, 10th week, 20th week, 30th week, 40th week, 50th week, 60th week reducing cancer biomarker expression at about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of plasmids, vectors, or cells disclosed herein is administered for about 1 day compared to controls or patients or cells in vitro treated with other cancer biomarker expression inhibition methods. , 2 days, 3 days, 4 days, 5 days, 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 The cancer biomarker expression is reduced for months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more.
いくつかの実施形態において、癌バイオマーカー発現は、他の癌バイオマーカー発現阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%減少する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の癌バイオマーカー発現阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、癌バイオマーカー発現を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の癌バイオマーカー発現阻害方法で処置された対照または患者またはインビトロ細胞と比較して、約1、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、癌バイオマーカー発現を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。 In some embodiments, cancer biomarker expression is about 1%, about 5%, about 10%, about 20% compared to controls or patients or in vitro cells treated with other cancer biomarker expression inhibition methods. %, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein is administered for about 1 day compared to controls or patients or cells in vitro treated with other cancer biomarker expression inhibition methods. 2nd day, 3rd day, 4th day, 5th day, 6th day, 1st week, 2nd week, 3rd week, 4th week, 5th day 6th week, 7th week, 8th week, 9th week, 10th week, 20th week, 30th week, 40th week, 50th week, 60th week At about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years, reduce cancer biomarker expression by about 1%, about 5 %, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1 About 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 Reduce cancer biomarker expression by about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、インビトロまたはエクスビボ臓器または組織における転移を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、組織、臓器、または処置患者における転移を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、1日目~10年目に、処置患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織における転移を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の転移阻害方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に転移を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の転移阻害方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、転移または腫瘍形成を低減する。 In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein reduces metastasis in an organ or tissue in vitro or ex vivo. In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein reduces metastasis in a tissue, organ, or treated patient. In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein reduces metastasis in treated patients or in vitro or ex vivo organs or tissues from day 1 to year 10. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1st day, approximately 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, about 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about Metastasis is reduced at 60 weeks, about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months , about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more.
いくつかの実施形態において、転移は、他の転移阻害方法で処置された対照または患者と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%減少する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の転移阻害方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、転移を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の転移阻害方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、転移を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%低減する。 In some embodiments, the metastasis is about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40% compared to controls or patients treated with other metastasis inhibition methods. , about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1st day, approximately 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, about 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about At 60 weeks, about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years, about 1%, about 5% of metastases , about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week , about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or For about 10 years or more, about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80% , about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、組織、臓器、または処置患者における細胞死を増加させる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクター、核酸、または細胞の投与は、1日目~10年目に、処置患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織における細胞死を増加させる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の細胞死滅方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に転移を低減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の細胞死滅方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、細胞死を増加させる。 In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein increases cell death in a tissue, organ, or treated patient. In some embodiments, administration of vectors, nucleic acids, or cells disclosed herein increases cell death in the treated patient or in vitro or ex vivo organ or tissue from day 1 to year 10. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1st day, approximately 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, about 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about Metastasis is reduced at 60 weeks, about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months , increases cell death over a period of about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more.
いくつかの実施形態において、細胞死は、他の細胞死滅方法で処置された対照または患者と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%増加する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の細胞死滅方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、細胞死を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%増加させる。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、他の細胞死滅方法で処置された対照もしくは患者、またはインビトロもしくはエクスビボ臓器もしくは組織と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、細胞死を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%増加させる。 In some embodiments, the cell death is about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40% compared to controls or patients treated with other cell killing methods. %, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1st day, approximately 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, about 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about At 60 weeks, about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years, reduce cell death by about 1%, about 5 %, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week , about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or Reduce cell death by about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80% over about 10 years or more %, about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者と比較して、処置患者における疾患または障害の症状を軽減する。いくつかの実施形態において、疾患または障害の症状は、1日目~10年目に処置患者において測定される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における疾患または障害の症状と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に疾患または障害の症状を軽減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における疾患または障害の症状と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、疾患または障害の症状を軽減する。 In some embodiments, administration of a nucleic acid, vector, or cell disclosed herein reduces symptoms of a disease or disorder in a treated patient as compared to an untreated patient or the same patient prior to treatment. In some embodiments, symptoms of the disease or disorder are measured in the treated patient from day 1 to year 10. In some embodiments, the administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides a reduction in symptoms of the disease or disorder in an untreated patient or in the same patient prior to treatment on about day 1, at 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, approximately 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about 60th week, about Reducing symptoms of a disease or disorder at 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein reduces the symptoms of the disease or disorder by about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, Alleviating symptoms of a disease or disorder for about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more.
いくつかの実施形態において、疾患または障害の症状は、未処置患者または処置前の同じ患者における疾患または障害の症状と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%軽減される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における疾患または障害の症状と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、疾患または障害の症状を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%軽減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における疾患または障害の症状と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、疾患または障害の症状を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%軽減する。 In some embodiments, the symptoms of the disease or disorder are about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, compared to the symptoms of the disease or disorder in an untreated patient or in the same patient before treatment. reduced by about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, the administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein provides a reduction in symptoms of the disease or disorder in an untreated patient or in the same patient prior to treatment on about day 1, at 2nd day, approximately 3rd day, approximately 4th day, approximately 5th day, approximately 6th day, approximately 1st week, approximately 2nd week, approximately 3rd week, approximately 4th week, approximately 5th week, approximately 6th week, about 7th week, about 8th week, about 9th week, about 10th week, about 20th week, about 30th week, about 40th week, about 50th week, about 60th week, about At about 70 weeks, about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years, about 1%, about 5%, Reduce by about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein reduces the symptoms of the disease or disorder by about 1 day, about 2 days, about 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, About 1%, about 5%, about 10%, about 20% of symptoms of a disease or disorder for about 5 months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more %, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本明細書に開示されるベクターまたは核酸の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者と比較して、処置患者における癌の症状を軽減する。いくつかの実施形態において、癌の症状は、1日目~10年目に処置患者において測定される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における癌の症状と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に癌の症状を軽減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における癌の症状と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、癌の症状を軽減する。 In some embodiments, administration of a vector or nucleic acid disclosed herein reduces symptoms of cancer in a treated patient compared to an untreated patient or the same patient prior to treatment. In some embodiments, cancer symptoms are measured in treated patients from day 1 to year 10. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein is administered at about 1 day, about 2 days, compared to the symptoms of cancer in an untreated patient or in the same patient before treatment. 3rd day, 4th day, 5th day, 6th day, 1st week, 2nd week, 3rd week, 4th week, 5th day, 6th day 7th week, 8th week, 9th week, 10th week, 20th week, 30th week, 40th week, 50th week, 60th week, 70th week reducing cancer symptoms at about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein improves symptoms of cancer by about 1 day, about 2 days, About 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 The symptoms of the cancer are reduced for months, about 6 months, about 1 year, about 2 years, about 5 years, or about 10 years, or more.
いくつかの実施形態において、癌の症状は、未処置患者または処置前の同じ患者における癌の症状と比較して、約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%軽減される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における癌の症状と比較して、約1日目、約2日目、約3日目、約4日目、約5日目、約6日目、約1週目、約2週目、約3週目、約4週目、約5週目、約6週目、約7週目、約8週目、約9週目、約10週目、約20週目、約30週目、約40週目、約50週目、約60週目、約70週目、約80週目、約90週目、約100週目、約1年目、約2年目、または約3年目に、癌の症状を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%軽減する。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される核酸、ベクター、または細胞の投与は、未処置患者または処置前の同じ患者における癌の症状と比較して、約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約1ヶ月、約2ヶ月、約3ヶ月、約4ヶ月、約5ヶ月、約6ヶ月、約1年、約2年、約5年、もしくは約10年、またはそれ以上にわたって、癌の症状を約1%、約5%、約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、または約100%軽減する。 In some embodiments, the symptoms of cancer are about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30%, compared to the symptoms of cancer in an untreated patient or the same patient before treatment. reduced by about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein is administered at about 1 day, about 2 days, compared to the symptoms of cancer in an untreated patient or in the same patient before treatment. 3rd day, 4th day, 5th day, 6th day, 1st week, 2nd week, 3rd week, 4th week, 5th day, 6th day 7th week, 8th week, 9th week, 10th week, 20th week, 30th week, 40th week, 50th week, 60th week, 70th week About 1%, about 5%, about 10% of cancer symptoms at about 80 weeks, about 90 weeks, about 100 weeks, about 1 year, about 2 years, or about 3 years Reduce by about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%. In some embodiments, administration of the nucleic acids, vectors, or cells disclosed herein improves symptoms of cancer by about 1 day, about 2 days, About 3 days, about 4 days, about 5 days, about 6 days, about 1 week, about 2 weeks, about 3 weeks, about 4 weeks, about 1 month, about 2 months, about 3 months, about 4 months, about 5 Reduce symptoms of cancer by about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30% over a period of about 1%, about 5%, about 10%, about 20%, about 30% %, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, or about 100%.
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示の組成物でトランスフェクトされた細胞を正確に追跡する方法を提供する。いくつかの実施形態において、これらの細胞は、細胞の挙動を決定するためにトレースされる。いくつかの実施形態において、これらの細胞は、それらの遊走を決定するためにトレースされる。いくつかの実施形態において、これらの細胞は、それらの転移(またはその欠如)を決定するためにトレースされる。いくつかの実施形態において、これらの細胞は、インビトロまたはインビボのいずれかで投与される任意の薬物に対するそれらの応答を決定するためにトレースされる。いくつかの実施形態において、細胞はまた、治療薬に曝露される。いくつかの実施形態において、治療薬は、化学療法薬である。いくつかの実施形態において、細胞は、インビトロで治療薬に曝露される。いくつかの実施形態において、細胞は、インビボで治療薬に曝露される。 In some embodiments, the present disclosure provides methods for accurately tracking cells transfected with compositions of the present disclosure. In some embodiments, these cells are traced to determine cell behavior. In some embodiments, these cells are traced to determine their migration. In some embodiments, these cells are traced to determine their metastasis (or lack thereof). In some embodiments, these cells are traced to determine their response to any drug administered either in vitro or in vivo. In some embodiments, the cells are also exposed to a therapeutic agent. In some embodiments, the therapeutic agent is a chemotherapeutic agent. In some embodiments, the cells are exposed to the therapeutic agent in vitro. In some embodiments, the cells are exposed to the therapeutic agent in vivo.
同時投与
いくつかの実施形態において、患者は、追加の療法に供される。いくつかの実施形態において、患者は、抗癌療法の一部として本開示の組成物で治療される。いくつかの実施形態において、抗癌療法は、放射線療法、化学療法、免疫療法、ホルモン療法、幹細胞移植、およびCAR-T療法から選択されるが、これらに限定されない。抗癌療法は、本開示の組成物の投与の前、それと同時、またはその後に投与され得る。
Co-administration In some embodiments, the patient is subjected to additional therapy. In some embodiments, a patient is treated with a composition of the present disclosure as part of anti-cancer therapy. In some embodiments, anti-cancer therapy is selected from, but not limited to, radiation therapy, chemotherapy, immunotherapy, hormone therapy, stem cell transplantation, and CAR-T therapy. Anti-cancer therapy may be administered before, concurrently with, or after administration of the compositions of the present disclosure.
キット
本開示はまた、細胞遊走または転移を減少させる、予防する、改善する、または遅延させるためのキットを提供する。いくつかの実施形態において、キットは、本開示のベクターまたは核酸を含む。キットは、記載の試薬の使用を指示するラベルまたは印刷された説明書をさらに含むことができる。キットは、試験される処置をさらに含むことができる。キットは、インビトロおよびインビボの細胞遊走または転移の予防、減少、改善、または遅延のために適用される。
Kits The present disclosure also provides kits for reducing, preventing, ameliorating, or slowing cell migration or metastasis. In some embodiments, the kit includes a vector or nucleic acid of the present disclosure. The kit can further include a label or printed instructions directing the use of the described reagents. The kit can further include the treatment to be tested. The kit is applied for the prevention, reduction, amelioration or delay of cell migration or metastasis in vitro and in vivo.
別途定義されない限り、本明細書の全ての技術用語および科学用語は、本開示が属する当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本開示の実施または試験において本明細書に記載されるものと類似または同等の任意の方法および材料が使用され得るが、好ましい方法および材料が本明細書に記載される。 Unless defined otherwise, all technical and scientific terms herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this disclosure belongs. Although any methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used in the practice or testing of the present disclosure, the preferred methods and materials are described herein.
本明細書で使用される場合、「抗癌遺伝子」は、癌遺伝子の発現または活性を予防する、遅延させる、阻害する、または別様に改変する任意の遺伝子を指す。いくつかの実施形態において、抗癌遺伝子は、腫瘍抑制遺伝子である。いくつかの実施形態において、抗癌遺伝子は、転移に関連する癌バイオマーカーの発現を減少させる。 As used herein, "anti-cancer gene" refers to any gene that prevents, retards, inhibits, or otherwise modifies the expression or activity of an oncogene. In some embodiments, the anti-oncogene is a tumor suppressor gene. In some embodiments, the anti-cancer gene reduces expression of cancer biomarkers associated with metastasis.
「a」、「an」、および「the」などの単数形は、便宜上、本出願全体を通して使用されるが、文脈または明示的な記述がそうでないことを示す場合を除き、単数形は、複数形を含むよう意図されることを理解されたい。全ての数値範囲は、その数値範囲内のどの数値点も含むと理解され、どの数値点も個別に列挙するものとして解釈されるべきである。同じ構成要素または特性に向けられた全ての範囲の端点は包括的であり、独立して組み合わせ可能であることが意図される。 Singular forms such as "a," "an," and "the" are used throughout this application for convenience and unless context or explicit statement indicates otherwise, singular forms refer to plural forms. It should be understood that it is intended to include shapes. All numerical ranges are to be understood to include any numerical point within that numerical range, and each numerical point should be construed as individually recited. The endpoints of all ranges directed to the same component or property are intended to be inclusive and independently combinable.
本明細書で使用される場合、「含む」という単語およびその変化形は、リスト内の項目の列挙が、本技術の材料、組成物、デバイス、および方法においても有用であり得る他の同様の項目を除外しないように、非限定的であることが意図される。同様に、「できる」および「してもよい」という用語ならびにそれらの変化形は、1つの実施形態がある特定の要素または特徴を含むことができる、または含み得る列挙が、それらの要素または特徴を含まない本技術の他の実施形態を除外しないように、非限定的であることが意図される。本開示を説明および請求するために、含む(including)、含有する、または有するなどの用語の同義語として、オープンエンドな用語「含む(comprising)」が本明細書で使用されるが、本技術またはその実施形態は、代替的に、列挙される成分「からなる」または「から本質的になる」などのより限定的な用語を使用して説明され得る。 As used herein, the word "comprising" and variations thereof mean that the enumeration of items in the list includes other similar It is intended to be non-limiting so as not to exclude any items. Similarly, the terms "can" and "may" and variations thereof mean that an embodiment can include or may include a particular element or feature. is intended to be non-limiting and not to exclude other embodiments of the present technology that do not include. Although the open-ended term "comprising" is used herein as a synonym for terms including, containing, or having to describe and claim the present disclosure, the present technology or embodiments thereof may alternatively be described using more restrictive terminology such as "consisting of" or "consisting essentially of" the listed ingredients.
「約」という用語は、数として表される量を指すために本明細書で使用される場合、参照される数値表示の「正確に」プラスまたはマイナス最大10%を含む。「約」という用語が、ある値の範囲に関して使用される場合、「約」という用語は、その範囲の最小値および最大値の両方を指す(例えば、「約1~50μm」は、「約1μm~約50μm」を意味する)。「密接に関連している」という用語は、組成物の2つ以上の構成成分間の空間関係を説明するために本明細書で使用される場合、例えば、混合物、コーティング、およびマトリックス中などで密接に混合されている構成成分を指す。 The term "about" when used herein to refer to a quantity expressed as a number includes "exactly" plus or minus up to 10% of the referenced numerical expression. When the term "about" is used in reference to a range of values, the term "about" refers to both the minimum and maximum values of the range (e.g., "about 1 to 50 μm" refers to "about 1 μm"), and the term "about" refers to both the minimum and maximum values of the range. ~about 50 μm”). The term "intimately associated" when used herein to describe the spatial relationship between two or more components of a composition, such as in mixtures, coatings, and matrices. Refers to components that are intimately mixed.
「形質導入」および「トランスフェクション」という用語は、本明細書で互換的に使用され、細胞への遺伝物質の導入を指す。任意の適切な遺伝子修飾手段が、本開示によって想定される。 The terms "transduction" and "transfection" are used interchangeably herein and refer to the introduction of genetic material into a cell. Any suitable genetic modification means are contemplated by this disclosure.
本開示は、以下の非限定的な実施例によってさらに例示される。 The present disclosure is further illustrated by the following non-limiting examples.
実施例1-PCBP1変異ポリペプチドを発現するベクターの構築
研究は、PRL-3のmRNA発現が、卵巣癌、胃癌を含む転移性癌において上昇し、PRL-3の過剰発現が、肝臓癌予後と負の相関関係があることを示している(Bardelli et al.2003、Polato et al.,2005、Peng et al.2004)。PCBP1は、PRL-3発現を調節することが知られており、PCBP1発現とPRL-3発現との間の逆相関は、PCBP1がPRL-3のmRNA翻訳を抑制し得ることを示唆する。PRL-3の下方調節には、Akt(pSer473)のリン酸化活性形態の下方調節が伴う(Wang et al.2010)。例えば、Akt-2(pSer474)リン酸化の増加を示す癌細胞はまた、PCBP1発現の有意な低減も示す(Brown et al.,2016)。
Example 1 - Construction of a vector expressing PCBP1 mutant polypeptide Studies have shown that PRL-3 mRNA expression is elevated in metastatic cancers, including ovarian cancer and gastric cancer, and that overexpression of PRL-3 is associated with liver cancer prognosis. It has been shown that there is a negative correlation (Bardelli et al. 2003, Polato et al., 2005, Peng et al. 2004). PCBP1 is known to regulate PRL-3 expression, and the inverse correlation between PCBP1 and PRL-3 expression suggests that PCBP1 may suppress PRL-3 mRNA translation. Downregulation of PRL-3 is accompanied by downregulation of the phosphorylated active form of Akt (pSer473) (Wang et al. 2010). For example, cancer cells that exhibit increased Akt-2 (pSer474) phosphorylation also exhibit significantly reduced PCBP1 expression (Brown et al., 2016).
図1Aおよび1Bに示されるように、レンチウイルス遺伝子療法ベクター(LVV)、または/およびPCBP1遺伝子をそれぞれ含有するAAV系を生成した。このベクター系は、ヒト伸長因子-1α(EF1a)プロモーター、およびmRNA分子からのタンパク質翻訳の内部開始を提供するIRESエレメントを含有する。したがって、IRESモチーフが、単一のPCBPC-IRES-GFP mRNAからの第2の遺伝子の独立した別個の翻訳を開始することができる2シストロン性mRNAが作製される。以下の表2の戦略に基づいて、PAK1によるタンパク質のリン酸化を減少させるように設計されたいくつかのPCBP1変異体を構築した。PCBP1変異ヌクレオチド配列を図1A~Bに示されるベクターにクローニングして、ベクターA(mPCBP1_1、S223L)およびベクターB(mPCBP1_2、T60A & T127A)を作った。各PCBP1変異体における変異は、PAK1によるPCBP1リン酸化を防止する。異なる遺伝子のオンは、適切なプロモーター(複数可)によって駆動される。PAK1は、アミノ酸60および127の両方でPCBP1をリン酸化するため、これらの部位での変異は、PAK1によるPCBP1リン酸化を防止する。
実施例2-PCBP1変異体は、内因性野生型よりも高いレベルで発現する
PCBP1 S223LおよびPCBP1 T60A & T127A変異が転写レベルに影響を及ぼしたかどうかを試験するために、黒色腫細胞におけるPCBP1発現をqRT-PCRによって決定した。図2は、群間の倍率変化の分析を示す(ddct)。GFP発現と野生型PCBP1発現(wPCBP1_0)との比較は、PCBP1発現レベルが4.012倍大きかったことを示す。GFP発現とPCBP1 S223L(mPCBP1_1)の発現との比較は、PCBP1 S223L発現レベルが3.97倍大きかったことを示す。GFP発現とPCBP1 S223L変異体の発現との比較は、PCBP1 T60A & T127A(mPCBP1_2)発現レベルが4.02倍大きかったことを示す。野生型PCBP1および2つの変異型は、同様のmRNA発現を示す。このアッセイで使用したハウスキーピング遺伝子は、GAPDHである。
Example 2 - PCBP1 mutants are expressed at higher levels than the endogenous wild type To test whether the PCBP1 S223L and PCBP1 T60A & T127A mutations affected transcription levels, PCBP1 expression in melanoma cells was Determined by qRT-PCR. Figure 2 shows the analysis of fold change between groups (ddct). Comparison of GFP expression and wild type PCBP1 expression (wPCBP1_0) shows that PCBP1 expression level was 4.012 times greater. Comparison of GFP expression and PCBP1 S223L (mPCBP1_1) expression shows that PCBP1 S223L expression level was 3.97 times greater. Comparison of GFP expression with that of the PCBP1 S223L mutant shows that the PCBP1 T60A & T127A (mPCBP1_2) expression level was 4.02 times greater. Wild type PCBP1 and the two mutant forms show similar mRNA expression. The housekeeping gene used in this assay is GAPDH.
実施例3-黒色腫細胞におけるPCBP1の発現
黒色腫細胞を4つの群に分割し、各群を、A)GFPのみ、B)野生型PCBP1(wPCBP1_0-IRES-GFP)およびGFP、3)PCBP1 S223LおよびGFP(mPCBP1_1-IRES-GFP)、またはD)PCBP1 T60A &
T127A(mPCBP1_2-IRES-GFP)を含有するベクターで、インビトロでトランスフェクトした。リポフェクタミンキット(Invitrogen Inc.)を使用した、野生型PCBP1または変異型PCBP1のいずれかを含有するレンチウイルスベクターのトランスフェクション後24~48時間、GFPの発現が観察された(図2)。トランスフェクション率は、それぞれ約90%であった(データは図示せず)。GFP発現レベルの変動は、異なるベクターに起因する可能性がある。理論に束縛されるものではないが、ベクターでは、PCBP1はGFPの上流にある。PCBP1効率が100%であるとき、下流遺伝子(GFP)は、より低い発現効率(例えば、約60%~80%)を示す。対照ベクターがGFPのみを含有し、PCBP1配列を含有しないため、GFP発現効率はより高い。PCBP1およびGFPが互いに相互作用することを示す証拠はない。
Example 3 - Expression of PCBP1 in Melanoma Cells Melanoma cells were divided into four groups, each group containing: A) GFP only, B) wild type PCBP1 (wPCBP1_0-IRES-GFP) and GFP, 3) PCBP1 S223L and GFP (mPCBP1_1-IRES-GFP), or D) PCBP1 T60A &
Transfected in vitro with a vector containing T127A (mPCBP1_2-IRES-GFP). Expression of GFP was observed 24-48 hours after transfection of lentiviral vectors containing either wild-type or mutant PCBP1 using the Lipofectamine kit (Invitrogen Inc.) (Figure 2). . Transfection rates were approximately 90% in each case (data not shown). Variations in GFP expression levels may be due to different vectors. Without wishing to be bound by theory, PCBP1 is upstream of GFP in the vector. When PCBP1 efficiency is 100%, the downstream gene (GFP) exhibits lower expression efficiency (eg, about 60%-80%). The GFP expression efficiency is higher because the control vector contains only GFP and no PCBP1 sequence. There is no evidence that PCBP1 and GFP interact with each other.
ウエスタンブロットについては、PCPB1処置後に短時間、細胞培養皿を氷上に置き、細胞を氷冷PBSで3回洗浄した。次いで、氷冷溶解緩衝液(プロテアーゼ阻害剤を含有する)を細胞に添加した。付着細胞を皿から削り取り、細胞懸濁液を予め冷却したマイクロ遠心分離管に移し、それを4℃で30分間絶えず撹拌し、次いで遠心分離した。遠心分離後、管を氷上に置き、上清を新鮮な管に吸引し、ペレットを廃棄した。タンパク質定量化後、等体積の2×Laemmli試料緩衝液を添加することによって、各細胞溶解物のタンパク質濃度を決定した。試料を、この試料緩衝液中で100℃において5分間沸騰させた。処置群および対照群からの等量のタンパク質を、分子量マーカーと共にSDS-PAGEゲルの各ウェルに装填した。試験したタンパク質濃度は、細胞溶解物もしくは組織ホモジネートから約20~30μg、または約10~100ngの精製タンパク質の範囲であった。ゲルを100Vで1~2時間電気泳動した。次いで、ゲル上のタンパク質を、転写緩衝液およびBio-Rad Semi-Transfer系(Bio-Rad,CA)を使用して、活性ニトロセルロース膜に転写した。ブロッキング緩衝液を室温で1時間または4℃で一晩使用することによって膜をブロックし、次いで、TBST緩衝液で3回(5分/各洗浄)洗浄した後、抗体染色を開始した。次いで、膜を化学発光基質と共に約5分間インキュベートして、キットメーカーの推奨に従ってタンパク質シグナルを可視化した(図3および図6を参照)。 For Western blots, cell culture dishes were placed on ice briefly after PCPB1 treatment, and cells were washed three times with ice-cold PBS. Ice-cold lysis buffer (containing protease inhibitors) was then added to the cells. Adherent cells were scraped from the dish and the cell suspension was transferred to a pre-chilled microcentrifuge tube, which was constantly agitated for 30 min at 4°C and then centrifuged. After centrifugation, the tubes were placed on ice, the supernatant was aspirated into a fresh tube, and the pellet was discarded. After protein quantification, the protein concentration of each cell lysate was determined by adding an equal volume of 2× Laemmli sample buffer. Samples were boiled in this sample buffer at 100°C for 5 minutes. Equal amounts of protein from treatment and control groups were loaded into each well of an SDS-PAGE gel along with molecular weight markers. The protein concentrations tested ranged from about 20-30 μg, or about 10-100 ng of purified protein from cell lysates or tissue homogenates. Gels were electrophoresed at 100V for 1-2 hours. The proteins on the gel were then transferred to an activated nitrocellulose membrane using transfer buffer and the Bio-Rad Semi-Transfer system (Bio-Rad, Calif.). Membranes were blocked by using blocking buffer for 1 hour at room temperature or overnight at 4°C and then washed three times (5 min/each wash) with TBST buffer before antibody staining was started. The membrane was then incubated with the chemiluminescent substrate for approximately 5 minutes to visualize the protein signal according to the kit manufacturer's recommendations (see Figures 3 and 6).
図3は、異なる形態のPCBP1をコードする遺伝子療法ベクターでトランスフェクトした細胞におけるPRL-3タンパク質発現を示す。図3に示されるように、野生型PCBP1を含有するベクターによる黒色腫細胞のトランスフェクションは、GFPのみのベクターと比較してPRL-3発現を減少させる。PCBP1変異体のいずれかを含有するベクターによる細胞のトランスフェクションは、PRL-3発現をさらに減少させ、二重のPCBP1 T60A & T127A変異体は、単一のPCBP1 S223L変異体によるトランスフェクションよりもさらに大きい程度までPRL-3発現を減少させる。 Figure 3 shows PRL-3 protein expression in cells transfected with gene therapy vectors encoding different forms of PCBP1. As shown in Figure 3, transfection of melanoma cells with a vector containing wild-type PCBP1 reduces PRL-3 expression compared to a GFP-only vector. Transfection of cells with vectors containing either of the PCBP1 mutants further reduced PRL-3 expression, with the double PCBP1 T60A & T127A mutant even more so than transfection with the single PCBP1 S223L mutant. Reduces PRL-3 expression to a large extent.
実施例4-変異型PCBP1によるトランスフェクションは、黒色腫細胞遊走を減少させる
変異型、脱リン酸化PCBP1変異体の細胞遊走に対する効果を、細胞遊走アッセイを使用して試験した。簡潔に、GFPのみ、野生型PCBP1(wPCBP1_0-IRES-GFP)およびGFP、またはPCBP1 T60A & T127A(mPCBP1_2-IRES-GFP)でトランスフェクトした黒色腫細胞を、トランスフェクション後5日間観察した。
Example 4 - Transfection with mutant PCBP1 reduces melanoma cell migration The effect of mutant, dephosphorylated PCBP1 variants on cell migration was tested using a cell migration assay. Briefly, melanoma cells transfected with GFP alone, wild-type PCBP1 (wPCBP1_0-IRES-GFP) and GFP, or PCBP1 T60A & T127A (mPCBP1_2-IRES-GFP) were observed for 5 days post-transfection.
各処置群または/および対照からの同数の細胞を、リポフェクタミンキット(Invitrogen Inc)を使用したマーカータンパク質をコードするベクター(すなわち、GFP)によるトランスフェクションのために、24(または6)ウェルプレートに播種した。次いで、GFPでトランスフェクトした細胞を、トリプシン(0.1%)を含有する培地によって懸濁し、培養培地によって洗浄した。次いで、同量の細胞数(例えば、各個々の群からの約80,000個の細胞)を再配置し、96ウェルプレートの各ウェルに同量の細胞数を含有する100μLの装填体積で、Oris遊走アッセイプレート(Oris Cell Migration Assay kit)上に均一に分布した。次いで、Oris(商標)Cell Seeding Stopper(OCS)を含有する皿の各ウェルを加湿チャンバ(37℃、5%CO2)内で5~10時間(細胞株依存的)インキュベートして、細胞付着を可能にした。細胞をカウントする前に、Oris(商標)Stopperツールを使用してOCSを除去して、「円検出ゾーン(CDZ)」と呼ばれる、このCDZの内側に遊走した任意の新しい細胞を新しい遊走細胞として検出するための領域を作った。次いで、CDZ内でGFPを発現する細胞を、マイクロプレートリーダー(Molecular Devices,LLC)を使用して、または/および蛍光顕微鏡(BD Biosciences)下で、各時点でカウントした。 Equal numbers of cells from each treatment group or/and control were plated in 24 (or 6) wells for transfection with a vector encoding a marker protein (i.e., GFP) using the Lipofectamine kit (Invitrogen Inc). plated. The GFP-transfected cells were then suspended in medium containing trypsin (0.1%) and washed with culture medium. Equal numbers of cells (e.g., approximately 80,000 cells from each individual group) were then repopulated in a 100 μL loading volume containing the same number of cells in each well of a 96-well plate. Evenly distributed on Oris migration assay plates (Oris Cell Migration Assay kit). Each well of the dish containing Oris™ Cell Seeding Stopper (OCS) was then incubated in a humidified chamber (37°C, 5% CO2) for 5-10 hours (cell line dependent) to allow cell attachment. I made it. Before counting cells, use the Oris™ Stopper tool to remove the OCS and identify any new cells that have migrated inside this CDZ, called the "Circle Detection Zone (CDZ)", as new migrated cells. Created an area for detection. Cells expressing GFP within the CDZ were then counted at each time point using a microplate reader (Molecular Devices, LLC) or/and under a fluorescence microscope (BD Biosciences).
細胞を、GFP発現の蛍光顕微鏡法によって可視化および分析した。GFPは、各トランスフェクトした細胞における遺伝子の発現を反映するが、GFPの強度は、時間と共に強度のレベルを減少させる可能性があるが、結果に示されるように、5日間にわたって蛍光強度はあまり失われなかった。各ウェルの強度を示す細胞総数を、同じ時間(日)点(例えば、0日目または5日目)で測定した。GFPを有する細胞は、蛍光色素で免疫染色することによってではなく、GFPを含む遺伝子をコードするベクターによって形質導入されたため、蛍光シグナルは、基質から剥離されない。蛍光シグナルを示さない細胞は、本開示のベクターでトランスフェクションされず、したがって、この分析においてカウントされず、限定されない。 Cells were visualized and analyzed by fluorescence microscopy for GFP expression. Although GFP reflects the expression of the gene in each transfected cell, the intensity of GFP may decrease the level of intensity over time, as shown in the results, the fluorescence intensity is less Not lost. The total number of cells representing the intensity of each well was determined at the same time point (eg, day 0 or day 5). Because the GFP-bearing cells were transduced with the vector encoding the GFP-containing gene rather than by immunostaining with a fluorescent dye, the fluorescent signal is not stripped from the substrate. Cells that do not show a fluorescent signal were not transfected with the vectors of this disclosure and therefore are not counted and are not limited in this analysis.
この細胞遊走アッセイの結果は、図4A~Cに示される。図4Bにおいて、白い点線の円は、円検出ゾーン(CDZ)である。A列は、1日目であり、B列は、5日目の細胞遊走ウェルであり(CDZは白い点線である)、C列は、B列からの拡大CDZである。表3は、二重T60A&T127A変異体が、野生型PCBP1およびGFPのみの細胞の両方と比較して、CDZ内で減少した正味細胞遊走を示す、細胞遊走アッセイからの定量化されたデータを示す。
図4A~4Cは、ウェル当たりの細胞の割合に調整された細胞遊走を示す。GFP群における遊走細胞の割合(ウェル当たり)(11.076)は、野生型PCBP1(wPCBP1_0)およびPCBP1 T60A & T127A(mPCBP1_2)よりも有意に高かった。これらの3つの群のうち、mPCBP1_2は、ウェル当たりの遊走細胞の最低の割合を示した(2.082)。これらの値を以下のように計算した。 Figures 4A-4C show cell migration adjusted to the percentage of cells per well. The percentage of migrated cells (per well) in the GFP group (11.076) was significantly higher than wild type PCBP1 (wPCBP1_0) and PCBP1 T60A & T127A (mPCBP1_2). Among these three groups, mPCBP1_2 showed the lowest percentage of migrated cells per well (2.082). These values were calculated as follows.
各時点において、細胞総数をマイクロプレートリーダーによって検出した(基準分母として)。細胞を、円検出ゾーン(CDZ)の領域内で、時点当たりの遊走細胞としてもカウントした(分子として)。CDZ内の調整された正味細胞差を、以下に示される式に従って計算した。
実施例5-変異型PCBP1によるトランスフェクションは、乳癌細胞遊走を減少させる
MCF-7細胞株からの乳癌細胞を、GFPのみ、野生型PCBP1(wPCBP1_0-IRES-GFP)およびGFP、またはPCBP1 T60A & T127A(mPCBP1_2-IRES-GFP)を含有するベクターでトランスフェクトし、トランスフェクション後5日間観察した。これらの細胞の遊走は、上記で詳述したように観察した。表4は、異なるトランスフェクトした細胞のCDZ内の正味細胞遊走を示す。図7A~Cは、ウェル当たりの細胞の割合に調整された細胞遊走を示す。GFP群における遊走細胞の割合(ウェル当たり)は、野生型PCBP1(wPCBP1_0)およびPCBP1 T60A & T127A(mPCBP1_2)よりも有意に高かった。これらの3つの群のうち、mPCBP1_2は、ウェル当たりの遊走細胞の最低の割合を示した。
実施例6-腫瘍転移を阻害するPCBP1変異体の使用
癌遺伝子療法を研究する動物モデルの設計:
実験設計:癌細胞株(すなわち、MCF-7、乳癌モデル-BCのためのATCC)は、マウスにおいて腫瘍形成性であり、免疫不全動物(すなわち、Charles River Lab,NCからのヌードマウス株:BALB/c)における乳癌(BC)腫瘍成長を研究するために使用され得る。これらの細胞を使用して、治療有効性を試験するためのインビボ精密法を開発する。これは最初に、標識された遺伝子を有する、すなわち、赤色蛍光タンパク質(RFP)をコードするベクターによって安定して形質導入される注射可能な癌細胞株のために調製される。これにより、蛍光バイオイメージングシステムまたは蛍光顕微鏡によって例示またはモニタリングされる、癌細胞の成長および遊走をモニタリングすることが可能になる。癌細胞を調製した後、それらをマウスに皮下注射して、1週間後に乳癌腫瘍を発生させる。この新しい方法を使用することによって、AAV-PCBP1mなどの遺伝子治療ベクターの治療後、癌細胞を、それらの転移中に精密にトレースおよび研究する。
Example 6 - Use of PCBP1 variants to inhibit tumor metastasis Design of animal models to study cancer gene therapy:
Experimental Design: Cancer cell lines (i.e., MCF-7, breast cancer model - ATCC for BC) are tumorigenic in mice and immunodeficient animals (i.e., nude mouse line from Charles River Lab, NC: BALB). /c) can be used to study breast cancer (BC) tumor growth. These cells will be used to develop precision in vivo methods for testing therapeutic efficacy. It is first prepared for an injectable cancer cell line that is stably transduced by a vector carrying a labeled gene, ie, encoding red fluorescent protein (RFP). This allows for monitoring cancer cell growth and migration, exemplified or monitored by fluorescence bioimaging systems or fluorescence microscopy. After preparing the cancer cells, they are injected subcutaneously into mice to develop breast cancer tumors one week later. By using this new method, cancer cells will be precisely traced and studied during their metastasis after treatment with gene therapy vectors such as AAV-PCBP1m.
手順を、BC研究の例と共に以下のように実施する。 The procedure is carried out as follows with an example of a BC study.
(1)RFPを、RFPレポーター遺伝子の安定した長期発現のために、RFP遺伝子を細胞ゲノムに組み込むためのレンチウイルス骨格を使用することなどによって、BC細胞株((MCF-7、ATCC)に送達する。細胞へのRFP軽質導入に成功したことを(蛍光顕微鏡またはFACSを使用することによって)確認した後、BC細胞を選択および注射する。 (1) RFP was delivered to a BC cell line (MCF-7, ATCC), such as by using a lentiviral scaffold to integrate the RFP gene into the cell genome, for stable long-term expression of the RFP reporter gene. After confirming the successful introduction of RFP into the cells (by using fluorescence microscopy or FACS), select and inject BC cells.
(2)マウスを4つの群(n=6)に分割する。RFP-BC細胞を、全ての群において同じ条件(同じ細胞数、注入時間)でマウスの脇腹に注射する。BC腫瘍サイズを毎日または週2回、評価および記録する。実験設計および期待される転帰は、以下の表5に記載されるとおりになる。
治療用遺伝子を含有するベクターを、腫瘍に直接注射する。マウスを、処置の3週間後、組織学的研究のために屠殺する。腫瘍組織を、RFP、GFP、PRL-3、PCBP1、およびSOX2(BC細胞マーカー)の免疫組織化学(IHC)アッセイのために抽出する。上記の表に記載されるように、これらの組織上でRFPおよびGFPを検出して、BC細胞成長およびベクター送達を確認する。腫瘍形成性および転移研究のために追加の組織(肺、肝臓、脳、および膵臓を含む)を抽出する。これらの組織内でRFPおよびGFPを検出して、BCがこれらの組織内に遊走したかどうかをモニタリングする。qRT-PCR、WB、およびIHCも実施する。プロテオミクス研究を、質量分析技術と組み合わせた二次元ゲル電気泳動によって行って、対照対PCBP1変異体形質導入で、マウスにおけるタンパク質発現を比較する。実験群間の差を、スチューデントのt検定を使用して比較する。統計的有意性を、P<0.05として決定する。 The vector containing the therapeutic gene is injected directly into the tumor. Mice are sacrificed for histological studies 3 weeks after treatment. Tumor tissue will be extracted for immunohistochemistry (IHC) assay of RFP, GFP, PRL-3, PCBP1, and SOX2 (BC cell markers). Detect RFP and GFP on these tissues to confirm BC cell growth and vector delivery as described in the table above. Extract additional tissues (including lung, liver, brain, and pancreas) for tumorigenicity and metastasis studies. RFP and GFP are detected within these tissues to monitor whether BCs have migrated into these tissues. qRT-PCR, WB, and IHC will also be performed. Proteomic studies are performed by two-dimensional gel electrophoresis combined with mass spectrometry techniques to compare protein expression in control versus PCBP1 mutant transduced mice. Differences between experimental groups are compared using Student's t-test. Statistical significance is determined as P<0.05.
(3)処置後の結果についての転帰の分析は、以下の表6のように予想され得る。
実施例7-腫瘍細胞においてPCBP1を発現することによる膠芽腫の治療
PRL3 mRNAのレベルの上昇は、膠芽腫細胞において見られる。図11に示されるように、正常な脳皮質細胞株における発現と比較して、6つの異なる膠芽腫細胞株(U138MG、M059K、M059J、U118MG、U87、およびLN229)においてPRL-3発現の上昇を検出した。細胞株U87およびLN229は、PRL-3 mRNA発現の最大の増加を示し、さらなる試験のために選択された。
Example 7 - Treatment of Glioblastoma by Expressing PCBP1 in Tumor Cells Elevated levels of PRL3 mRNA are found in glioblastoma cells. As shown in Figure 11, increased PRL-3 expression in six different glioblastoma cell lines (U138MG, M059K, M059J, U118MG, U87, and LN229) compared to expression in normal brain cortical cell lines. was detected. Cell lines U87 and LN229 showed the greatest increase in PRL-3 mRNA expression and were selected for further testing.
野生型または変異型PCBP1の過剰発現は、膠芽腫細胞におけるPRL3発現を減少させる
以前に実証したように、野生型または変異型PCBP1の発現は、転移に関連する遺伝子、PRL-3の発現を減少させ、細胞遊走を阻害した。PCBP1配列の過剰発現の効果を試験するために、膠芽腫細胞におけるAP-PCBP1の発現を可能にする膠芽腫細胞特異的プロモーター、グリア線維性酸性タンパク質(GFAP)の制御下において、本開示の野生型または変異型PCBP1配列を含有するrAAV9発現ベクターで、6つの異なる膠芽腫細胞株をトランスフェクトした(図12を参照)。図13~16は、膠芽腫細胞におけるこのベクター発現の特異性を示す。図13は、phGFAP-LacZベクターで処置されたLN299膠芽腫細胞の免疫組織化学分析を示す。図14は、phGFAP-LacZベクターで処置されたLN299膠芽腫細胞の免疫組織化学分析を示す。図13Bおよび14Bに示されるように、GFAPプロモーターによって駆動されるLacZ遺伝子を、両方のトランスフェクトされた膠芽腫細胞株における抗β-ガラクトシダーゼ特異的抗体、A11132(1:700の希釈におけるThermoFisher)によって検出する。しかしながら、β-ガラクトシダーゼは、腎臓(図15)または眼(図16)細胞において検出されず、このベクターが膠芽腫細胞においてのみそのカーゴを発現することを示す。LacZ mRNA発現レベルの比較が図17に示される。
Overexpression of wild-type or mutant PCBP1 reduces PRL3 expression in glioblastoma cells. As previously demonstrated, expression of wild-type or mutant PCBP1 reduces the expression of PRL-3, a gene associated with metastasis. decreased and inhibited cell migration. To test the effect of overexpression of the PCBP1 sequence, the present disclosure under the control of a glioblastoma cell-specific promoter, glial fibrillary acidic protein (GFAP), which allows expression of AP-PCBP1 in glioblastoma cells. Six different glioblastoma cell lines were transfected with rAAV9 expression vectors containing wild-type or mutant PCBP1 sequences (see Figure 12). Figures 13-16 demonstrate the specificity of this vector expression in glioblastoma cells. Figure 13 shows immunohistochemical analysis of LN299 glioblastoma cells treated with phGFAP-LacZ vector. Figure 14 shows immunohistochemical analysis of LN299 glioblastoma cells treated with phGFAP-LacZ vector. As shown in Figures 13B and 14B, the LacZ gene driven by the GFAP promoter was transfected with anti-β-galactosidase-specific antibody A11132 (ThermoFisher at a dilution of 1:700) in both transfected glioblastoma cell lines. Detected by. However, β-galactosidase was not detected in kidney (Figure 15) or eye (Figure 16) cells, indicating that this vector expresses its cargo only in glioblastoma cells. A comparison of LacZ mRNA expression levels is shown in FIG. 17.
1)GFPのみ、2)野生型PCBP1、3)mPCBP1_1、または4)mPCBP1_2を含有する2マイクログラムのAAVベクターを、LN229およびU87膠芽腫細胞株にトランスフェクトし、Vybrant MTTキットを使用することによって細胞増殖を試験した。図18A~Bに示されるように、野生型PCBP1またはいずれかの変異体の過剰発現は、AAV-GFPベクター対照による非処置と比較して、膠芽腫細胞の増殖を有意に阻害する。さらに、PCBP1 mRNAの過剰発現は、図19および20に示されるように、培養物中の死細胞の数を増加させる。AAV-GFPおよびAAV-PCBP1および変異体によるトランスフェクション後、LIVE/DEAD(商標)Viability Kit(Thermofisher,Inc.)を使用して、死および生U87膠芽腫細胞を分析した。図19Aは、対照で処置した細胞培養物が、野生型または変異型PCPB1配列を含有するベクターでトランスフェクトした細胞よりも有意に多くの生細胞を含有していることを示し、図19Bは、これらのPCBP1細胞培養物が、対照で処置した細胞培養物より有意に多くの死細胞を含有していることを示す。図20A~Dは、GFP対照ベクターまたはPCBP1配列を含有するベクターのいずれかによるトランスフェクション後の生/死U87細胞の染色を示す。図21に示されるように、全ての形態のPCBP1による処置は、U87膠芽腫細胞株におけるPRL3タンパク質発現を下方制御し、mPCBP1_2で処置した細胞においてPRL3発現の最大の減少が観察された。 Transfecting 2 micrograms of AAV vectors containing 1) GFP only, 2) wild-type PCBP1, 3) mPCBP1_1, or 4) mPCBP1_2 into LN229 and U87 glioblastoma cell lines using the Vybrant MTT kit. Cell proliferation was tested by. As shown in Figures 18A-B, overexpression of wild-type PCBP1 or either mutant significantly inhibits glioblastoma cell proliferation compared to non-treatment with AAV-GFP vector controls. Furthermore, overexpression of PCBP1 mRNA increases the number of dead cells in the culture, as shown in Figures 19 and 20. After transfection with AAV-GFP and AAV-PCBP1 and mutants, dead and live U87 glioblastoma cells were analyzed using the LIVE/DEAD™ Viability Kit (Thermofisher, Inc.). Figure 19A shows that control-treated cell cultures contain significantly more viable cells than cells transfected with vectors containing wild-type or mutant PCPB1 sequences; We show that these PCBP1 cell cultures contain significantly more dead cells than control-treated cell cultures. Figures 20A-D show staining of live/dead U87 cells after transfection with either the GFP control vector or the vector containing PCBP1 sequences. As shown in Figure 21, treatment with all forms of PCBP1 downregulated PRL3 protein expression in the U87 glioblastoma cell line, with the greatest reduction in PRL3 expression observed in cells treated with mPCBP1_2.
これらの結果は、U87細胞株に特異的ではなく、他の膠芽腫細胞株でも実証された。野生型または変異型PCBP1によるLN299膠芽腫細胞のトランスフェクションは、細胞培養物中の死細胞の数を増加させ(図22および23)、PRL3タンパク質発現のレベルを減少させた(図24)。この場合もやはり、mPCBP1_2での処置は、PRL3タンパク質発現の最大の減少を示した(図24)。M059J(図25)、M059K(図26)、U118MG(図27)、およびU138MG(図28)膠芽腫細胞株において、細胞生存率に対する同様の効果が観察された。 These results were not specific to the U87 cell line and were also demonstrated in other glioblastoma cell lines. Transfection of LN299 glioblastoma cells with wild-type or mutant PCBP1 increased the number of dead cells in the cell culture (Figures 22 and 23) and decreased the level of PRL3 protein expression (Figure 24). Again, treatment with mPCBP1_2 showed the greatest reduction in PRL3 protein expression (Figure 24). Similar effects on cell viability were observed in M059J (Figure 25), M059K (Figure 26), U118MG (Figure 27), and U138MG (Figure 28) glioblastoma cell lines.
野生型または変異型PCBP1の過剰発現は、膠芽腫細胞におけるSTAT3発現を減少させる
PRL3と同様に、癌のマーカーであるSTAT3の発現は、野生型または変異型PCBP1配列を含有するベクターでトランスフェクトした膠芽腫細胞において減少した。図29および30は、野生型PCBP1、mPCBP1_1、またはmPCBP1_2でトランスフェクトしたU87およびLN299膠芽腫細胞において、STAT3タンパク質発現レベルが減少し、mPCBP1_2処置細胞が、STAT3タンパク質レベルの最大の減少を示していることを示す。
Overexpression of wild-type or mutant PCBP1 reduces STAT3 expression in glioblastoma cells. Similar to PRL3, expression of STAT3, a cancer marker, is reduced by transfection with vectors containing wild-type or mutant PCBP1 sequences. decreased in glioblastoma cells. Figures 29 and 30 show that STAT3 protein expression levels are reduced in U87 and LN299 glioblastoma cells transfected with wild-type PCBP1, mPCBP1_1, or mPCBP1_2, with mPCBP1_2-treated cells showing the greatest reduction in STAT3 protein levels. Show that there is.
実施例8-腫瘍細胞においてPCBP1を発現することによる卵巣癌および前立腺癌の治療
PCBP1過剰発現の効果が膠芽腫細胞に限定されないことを実証するために、SKOV3卵巣癌細胞株を、野生型または変異型PCBP1配列を含有するベクターでトランスフェクトした。SKOV3細胞を、GFP、PCBP1、mPCBP1_1、またはmPCBP1_2を含有する0.5μgまたは2.0μgのレンチベクターのいずれかでトランスフェクトした。MTT(Thermofisher Inc.)を使用して細胞増殖をアッセイした。図31に示されるように、3つ全てのPCBP1含有ベクターのトランスフェクションは、用量依存的に細胞増殖の阻害を増加させた。さらに、図32は、野生型または変異型PCBP1配列によるトランスフェクションが、PRL3 mRNA発現を減少させることを示す。
Example 8 - Treatment of Ovarian and Prostate Cancer by Expressing PCBP1 in Tumor Cells To demonstrate that the effects of PCBP1 overexpression are not limited to glioblastoma cells, the SKOV3 ovarian cancer cell line was isolated from wild-type or Transfected with a vector containing the mutant PCBP1 sequence. SKOV3 cells were transfected with either 0.5 μg or 2.0 μg of lentivector containing GFP, PCBP1, mPCBP1_1, or mPCBP1_2. Cell proliferation was assayed using MTT (Thermofisher Inc.). As shown in Figure 31, transfection of all three PCBP1-containing vectors increased inhibition of cell proliferation in a dose-dependent manner. Furthermore, FIG. 32 shows that transfection with wild-type or mutant PCBP1 sequences reduces PRL3 mRNA expression.
野生型または変異型PCBP1配列を含有するベクターでトランスフェクトしたDU145前立腺癌細胞においても同様の結果が観察された。図33は、PCBP1を過剰発現する細胞が、対照細胞と比較して、細胞増殖の有意な減少を示したことを示す。図34は、PRL3タンパク質発現レベルが同様に減少し、mPCBP1_2変異体が最大の減少を示していることを示す。 Similar results were observed in DU145 prostate cancer cells transfected with vectors containing wild-type or mutant PCBP1 sequences. Figure 33 shows that cells overexpressing PCBP1 showed a significant decrease in cell proliferation compared to control cells. Figure 34 shows that PRL3 protein expression levels are similarly reduced, with the mPCBP1_2 mutant showing the greatest reduction.
実施例9-野生型または変異型PCBP1の過剰発現は、非癌性細胞に対して毒性ではない
PCBP1の過剰発現が非癌性細胞に対して毒性はないことを実証するために、野生型または変異型PCBP1を含有するベクターで2つの正常な細胞型をトランスフェクトし、乳酸デヒドロゲナーゼ(LH)アッセイを実施した。乳酸デヒドロゲナーゼは、損傷した細胞から培地に放出され、したがって、LHのレベルの上昇は、細胞毒性および細胞溶解のバイオマーカーである。正常な脳細胞(HCN-2)および正常な乳房細胞(MCF10A)をそれぞれ、1)GFPのみ(例えば、PCBP1処置なし)、2)野生型PCBP1、3)mPCBP1_1、および4)mPCBP1_2を含有するベクターでトランスフェクトした。図33~34は、PCBP1での処置による正常な脳および乳房細胞の有意な死滅は示さない。
Example 9 - Overexpression of wild-type or mutant PCBP1 is not toxic to non-cancerous cells To demonstrate that overexpression of PCBP1 is not toxic to non-cancerous cells, wild-type or mutant Two normal cell types were transfected with vectors containing mutant PCBP1 and lactate dehydrogenase (LH) assays were performed. Lactate dehydrogenase is released into the medium from injured cells, and therefore increased levels of LH are a biomarker of cytotoxicity and cell lysis. Normal brain cells (HCN-2) and normal breast cells (MCF10A) were incubated with vectors containing 1) GFP alone (e.g., no PCBP1 treatment), 2) wild-type PCBP1, 3) mPCBP1_1, and 4) mPCBP1_2, respectively. was transfected with. Figures 33-34 show no significant killing of normal brain and breast cells by treatment with PCBP1.
参照による援用
引用される全ての参考文献、出願、出版物、特許、および特許公開は、全ての目的のために参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
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