JP2023101778A - Intestinal dysbiosis determination system - Google Patents

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JP2023101778A JP2023091370A JP2023091370A JP2023101778A JP 2023101778 A JP2023101778 A JP 2023101778A JP 2023091370 A JP2023091370 A JP 2023091370A JP 2023091370 A JP2023091370 A JP 2023091370A JP 2023101778 A JP2023101778 A JP 2023101778A
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Japan
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intestinal
index
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bacteria
score
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Japanese (ja)
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綾 竹田
Aya Takeda
文孝 吉良
Fumitaka Kira
諭史 渡辺
Satoshi Watanabe
さとみ 浅野
Satomi Asano
結 志田
Yui Shida
紗有美 前川
Sayumi Maekawa
瑞樹 中村
Mizuki Nakamura
悠 沢井
Yu Sawai
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Cykinso Inc
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Cykinso Inc
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Abstract

To provide a method for determining intestinal dysbiosis.SOLUTION: A method for determining intestinal dysbiosis includes the steps for: setting a determination criterion value and a determination score for intestinal dysbiosis with respect to at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea constipation-related index, regarding the intestinal bacteria of a population for determining the criterion value; collating bacterial composition data obtained from an individual subject or a subject group (users) with the criterion value, and calculating a user value of the determination score for each of the indices; calculating an intestinal flora score by adding the calculated user value; and determining the intestinal dysbiosis of the user by using the intestinal flora score as an index.SELECTED DRAWING: Figure 1

Description

本発明は、腸内dysbiosisという非特異的で多様な状態を判定するためのシステム及び
判定方法に関する。
The present invention relates to a system and method for determining non-specific and diverse conditions of intestinal dysbiosis.

ヒトの腸内には、約1000種類に及ぶ腸内細菌が生息しており、これらの細菌は、栄養源
を供給したり、病原菌の繁殖を抑制することにより、ヒトの健康維持に重要な役割を果た
している。ところが、何らかの原因により、(i)腸内細菌の総菌数が著しく減少する、(ii
)その構成比が変化してしまう、(iii)通常であれば菌数レベルの低い菌種が異常に増加す
る等の異常が生じる。このような腸内細菌叢の構成異常をGut Dysbiosis(腸内ディスバ
イオシス)という(非特許文献1)。
しかし、腸内細菌叢は、疾患ごとに異なる、ライフスタイルの内容により異なる等の多
様性を有し、また、指標及び菌叢が多岐にわたっており、腸内dysbiosisの定義は研究者
間で一致していない(非特許文献1)。
Approximately 1000 types of intestinal bacteria live in the human intestine, and these bacteria play an important role in maintaining human health by supplying nutrients and suppressing the growth of pathogenic bacteria. However, for some reason, (i) the total number of intestinal bacteria is significantly reduced, (ii)
) the composition ratio changes, and iii) abnormalities such as an abnormal increase in bacterial strains whose number level is normally low. Such a structural abnormality of the intestinal flora is called Gut Dysbiosis (non-patent document 1).
However, the intestinal microflora is diverse, such as different for each disease and depending on lifestyle content, and there are a wide variety of indicators and microflora, and the definition of intestinal dysbiosis is not consistent among researchers (Non-Patent Document 1).

他方、腸内細菌の検査結果を臨床医(医療従事者)が患者にフィードバックする際に、
個々の指標や細菌の具体的特徴を説明することはできない。このため、医療従業者が患者
等に対して、総合的に「良い菌叢」なのか「悪い菌叢」なのかを簡便に説明可能にする必
要がある。
従来より、腸内細菌を用いた疾患予測システムに関する技術が知られているが(特許文
献1~5)、腸内dysbiosisという非特異的かつ多様な状態について判定する方法につい
ては未だ十分に研究が進んでいるとはいえず、腸内dysbiosisを判定することが困難であ
った。
On the other hand, when a clinician (medical worker) gives feedback to the patient about the test results of intestinal bacteria,
It is not possible to explain the specific characteristics of individual indicators or bacteria. For this reason, it is necessary for medical professionals to be able to simply explain to patients, etc., whether the bacterial flora is comprehensively "good" or "bad."
Conventionally, techniques related to disease prediction systems using intestinal bacteria have been known (Patent Documents 1 to 5), but research on methods for determining a non-specific and diverse state of intestinal dysbiosis has not progressed sufficiently, making it difficult to determine intestinal dysbiosis.

特許第5645761号Patent No. 5645761 特開2012-165716号JP 2012-165716 特表2005-523695号Special Table No. 2005-523695 特開2015-7985号JP 2015-7985 特表2014-523589号Special table 2014-523589

Walker AD, Lavley TD. Pharmacological Research 69,(2013) 75-86.Walker AD, Lavley TD. Pharmacological Research 69,(2013) 75-86.

本発明は、腸内dysbiosisという非特異的かつ多様な状態を、統一された指標、標準化
された基準で判定可能にする方法を提供することを目的とする。
An object of the present invention is to provide a method that enables determination of non-specific and diverse states of intestinal dysbiosis using unified indices and standardized criteria.

本発明者は、上記課題を解決するため鋭意研究を行った結果、腸内常在菌を利用した統
一的な指標及び標準化された基準により簡便に評価することを見出し、本発明を完成する
に至った。
すなわち、本発明は以下の通りである。
(1)腸内dysbiosis の判定方法であって、
判定基準値設定用集団の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸
管免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少な
くとも1つの指標について、腸内dysbiosisの判定基準値を設定する工程、
被験者個人又は被験者集団(ユーザ)から得られた菌組成データを、前記判定基準値と
照合して、前記それぞれの指標について判定スコアを算出する工程、
前記算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコア を算出する工程、並び

前記腸内フローラスコアを指標として、前記ユーザの腸内dysbiosisを判定する工程
を含む、前記方法。
As a result of intensive research to solve the above problems, the present inventors have found that simple evaluation can be performed using a unified index and standardized criteria using intestinal indigenous bacteria, and have completed the present invention.
That is, the present invention is as follows.
(1) A method for determining intestinal dysbiosis, comprising:
setting a criterion value for intestinal dysbiosis for at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacterium-related index, and a diarrhea-constipation-related index regarding the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value;
A step of comparing bacterial composition data obtained from an individual subject or a group of subjects (users) with the criterion value to calculate a determination score for each of the indicators;
adding the calculated determination scores to calculate an intestinal flora score; and using the intestinal flora score as an index to determine intestinal dysbiosis of the user.

(2)多様性関連指標が、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢属
菌の占有率からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、(1)に記載の方法。
(3)短鎖脂肪酸産生指標が、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群及び酪酸産生
菌の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項1に記載の方法

(4)腸管免疫関連指標が、フィーカリバクテリウム属菌、アッカーマンシア属菌、クリ
ステンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌からなる群から選ばれ
る少なくとも1つの項目を含む、(1)に記載の方法。
(5)口腔内細菌関連指標が、フソバクテリウム属菌、ストレプトコッカス属菌、口腔内
細菌占有率及びガンマプロテオバクテリア綱の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも
1つの項目を含む、(1)に記載の方法。
(6)下痢便秘関連指標が、エンテロタイプである、(1)に記載の方法。
(7)判定基準値は、前記指標に含まれるそれぞれの項目の判定基準値設定用集団の検査
値分布の比較に基づいて設定されるものである、(1)~(6)のいずれか1項に記載の
方法。
(2) The method according to (1), wherein the diversity-related index includes at least one item selected from the group consisting of diversity, FB ratio, number of species belonging to the phylum Bacteroidetes, and occupancy rate of the most dominant genus.
(3) The method according to claim 1, wherein the short-chain fatty acid production index includes at least one item selected from the group consisting of bifidobacteria, lactic acid-producing bacteria, butyric acid-producing bacteria, and the number of species of butyric acid-producing bacteria.
(4) The method according to (1), wherein the intestinal immunity-related index includes at least one item selected from the group consisting of Faecalibacterium, Akkermansia, Christensenela, Aristipes, and Clostridium.
(5) The method according to (1), wherein the oral bacteria-related index includes at least one item selected from the group consisting of Fusobacterium, Streptococcus, oral bacterial occupancy, and the number of gammaproteobacterial species.
(6) The method according to (1), wherein the diarrhea-constipation-related index is an enterotype.
(7) The criterion value is set based on a comparison of the test value distribution of the criterion value setting group for each item included in the index, (1) to (6). The method according to any one of items.

(8)腸内dysbiosisの判定システムであって、
被験者個人又は被験者集団(ユーザ)から得られた菌組成データを記憶する手段、
判定基準値設定用集団の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管
免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少なく
とも1つの指標について、腸内dysbiosisの判定基準値を記憶する手段、
前記判定基準値を前記菌組成データと照合して、前記それぞれの指標について判定ス
コアを算出する手段、
前記算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出する手段、並びに
前記腸内フローラスコアを指標として、前記ユーザの腸内dysbiosisを判定する手段
を含む、前記システム。
(9)多様性関連指標が、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢属
菌の占有率からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、(8)に記載のシステ
ム。
(10)短鎖脂肪酸産生指標が、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群及び酪酸産
生菌の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、(8)に記載のシス
テム。
(8) A system for determining intestinal dysbiosis,
means for storing bacterial composition data obtained from an individual subject or a subject group (user);
Means for storing a criterion value for intestinal dysbiosis for at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index, concerning the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value;
means for comparing the determination reference value with the bacterial composition data to calculate a determination score for each of the indicators;
The system, comprising means for calculating an intestinal flora score by adding the calculated determination scores, and means for determining intestinal dysbiosis of the user using the intestinal flora score as an index.
(9) The system according to (8), wherein the diversity-related index includes at least one item selected from the group consisting of diversity, FB ratio, the number of species belonging to the phylum Bacteroidetes, and the occupancy rate of the most dominant genus.
(10) The system according to (8), wherein the short-chain fatty acid production index includes at least one item selected from the group consisting of bifidobacteria, a group of lactic acid-producing bacteria, a group of butyric acid-producing bacteria, and the number of species of butyric acid-producing bacteria.

(11)腸管免疫関連指標が、フィーカリバクテリウム属菌、アッカーマンシア属菌、ク
リステンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌からなる群から選ば
れる少なくとも1つの項目を含む、(8)に記載のシステム。
(12)口腔内細菌関連指標が、フソバクテリウム属菌、ストレプトコッカス属菌、口腔
内細菌占有率及びガンマプロテオバクテリア綱の菌種数からなる群から選ばれる少なくと
も1つの項目を含む、(8)に記載のシステム。
(13)下痢便秘関連指標が、エンテロタイプである、(8)に記載のシステム。
(14)判定基準値は、前記指標に含まれるそれぞれの項目の判定基準値設定用集団の検
査値分布の比較に基づいて設定されるものである、(8)~(13)のいずれか1項に記
載のシステム。
(11) The system according to (8), wherein the intestinal immunity-related index includes at least one item selected from the group consisting of Faecalibacterium, Akkermansia, Christensenella, Aristipes, and Clostridium.
(12) The system according to (8), wherein the oral bacteria-related index includes at least one item selected from the group consisting of Fusobacterium, Streptococcus, oral bacterial occupancy, and gammaproteobacterial species count.
(13) The system according to (8), wherein the diarrhea-constipation-related indicator is an enterotype.
(14) The judgment reference value is set based on a comparison of the test value distribution of the judgment reference value setting group for each item included in the index, (8) to (13). System according to any one of items.

(15)腸内dysbiosisを判定するためのプログラムであって、コンピュータを、
判定基準値設定用集団の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸
管免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少な
くとも1つの指標について、腸内dysbiosisの判定基準値を記憶する手段、
被験者個人又は被験者集団(ユーザ)から得られた菌組成データを記憶する手段、
前記菌組成データを、前記判定基準値と照合して、前記それぞれの指標について判定ス
コアを算出する手段、
前記算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出する手段、並びに
前記腸内フローラスコアを指標として、前記ユーザの腸内dysbiosisを判定する手段
として機能させるための前記プログラム。
(16)多様性関連指標が、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢
属菌の占有率からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、(15)に記載のプ
ログラム。
(17)短鎖脂肪酸産生指標が、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群及び酪酸産
生菌の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、(15)に記載のプ
ログラム。
(18)腸管免疫関連指標が、フィーカリバクテリウム属菌、アッカーマンシア属菌、ク
リステンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌からなる群から選ば
れる少なくとも1つの項目を含む、(15)に記載のプログラム。
(19)口腔内細菌関連指標が、フソバクテリウム属菌、ストレプトコッカス属菌、口腔
内細菌占有率及びガンマプロテオバクテリア綱の菌種数からなる群から選ばれる少なくと
も1つの項目を含む、(15)に記載のプログラム。
(20)下痢便秘関連指標が、エンテロタイプである、(15)に記載のプログラム。
(21)判定基準値は、前記指標に含まれるそれぞれの項目の判定基準値設定用集団の検
査値分布の比較に基づいて設定されるものである、(16)~(20)のいずれか1項に
記載のプログラム。
(15) A program for determining intestinal dysbiosis, comprising:
Means for storing a criterion value for intestinal dysbiosis for at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index, concerning the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value;
means for storing bacterial composition data obtained from an individual subject or a subject group (user);
means for comparing the bacteria composition data with the judgment reference value to calculate a judgment score for each of the indicators;
means for calculating an intestinal flora score by adding the calculated determination scores; and said program for functioning as means for determining intestinal dysbiosis of said user using said intestinal flora score as an index.
(16) The program according to (15), wherein the diversity-related index includes at least one item selected from the group consisting of diversity, FB ratio, number of species belonging to the phylum Bacteroidetes, and occupancy rate of the most dominant genus.
(17) The program according to (15), wherein the short-chain fatty acid production index includes at least one item selected from the group consisting of bifidobacteria, a group of lactic acid-producing bacteria, a group of butyric acid-producing bacteria, and the number of species of butyric acid-producing bacteria.
(18) The program according to (15), wherein the intestinal immunity-related index includes at least one item selected from the group consisting of Faecalibacterium, Akkermansia, Christensenela, Aristipes, and Clostridium.
(19) The program according to (15), wherein the oral bacteria-related index includes at least one item selected from the group consisting of Fusobacterium, Streptococcus, oral bacterial occupancy, and gammaproteobacterial species count.
(20) The program according to (15), wherein the diarrhea-constipation-related index is an enterotype.
(21) A program according to any one of (16) to (20), wherein the criterion value is set based on a comparison of test value distributions of a criterion value setting population for each item included in the index.

本発明により、腸内dysbiosis判定方法及び判定システムが提供される。本発明の方法
によれば、各種指標により、疾患非特異的に腸内dysbiosisを判定することが可能となっ
た。
以下、本発明を詳細に説明する。
The present invention provides a method and system for determining intestinal dysbiosis. According to the method of the present invention, it has become possible to determine intestinal dysbiosis in a non-disease-specific manner using various indicators.
The present invention will be described in detail below.

本発明のシステムのブロック図である。1 is a block diagram of the system of the present invention; FIG. 本発明のシステムの動作を示すフローチャートである。4 is a flow chart showing the operation of the system of the present invention; 健常者コホートと罹患者コホートの腸内フローラスコアの分布を示す図である。FIG. 10 is a diagram showing the distribution of intestinal flora scores in a cohort of healthy subjects and a cohort of diseased subjects. 腸内フローラスコアを計算した結果を示す図である。FIG. 10 is a diagram showing the results of calculating an intestinal flora score;

1.概要
本発明の方法、システム及びプログラムは、種々の様態が存在する腸内dysbiosisとい
う非特異的な状態を、腸内常在菌を利用した統一的な指標により、あるいは標準化された
基準により、簡便に評価可能にするものである。本発明者は、個々の被験者の病歴又は服
薬歴に特異的に関連する腸内dysbiosis項目が存在することを見出した。また、個々の腸
内dysbiosis項目を重み付け加算したフローラスコアが、複数疾患に非特異的に関連する
指標であることを見出した。本発明は、このような知見に基づき完成されたものである。
1. Overview The method, system, and program of the present invention make it possible to easily evaluate the non-specific condition of intestinal dysbiosis, which has various aspects, by a unified index using indigenous bacteria or by standardized criteria. The inventors have discovered that there are intestinal dysbiosis terms that are specifically related to individual subject's medical history or medication history. We also found that the flora score, which is a weighted addition of individual intestinal dysbiosis items, is an index that is non-specifically related to multiple diseases. The present invention has been completed based on such findings.

本発明においては、腸内dysbiosisを判定するために、腸内dysbiosis採点項目につい
て、それぞれの項目ごとに判定基準値を設定する。判定基準値は、判定基準値設定用集団
の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管免疫関連指標、口腔内
細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少なくとも1つを指標とし、
それぞれの指標に対応する固有の値として割り当てられる。判定基準値設定用集団には、
健常者の集団及び罹患者集団のいずれか一方又は両者を含む。
In the present invention, in order to determine intestinal dysbiosis, a criterion value is set for each of the intestinal dysbiosis scoring items. The criterion value is at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacterium-related index, and a diarrhea-constipation-related index regarding the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value,
Assigned as a unique value corresponding to each index. In the group for setting the judgment reference value,
Includes either or both healthy and diseased populations.

次に、判定の対象ユーザである被験者個人又は被験者集団の菌組成データ(検査値)
を読み込み、菌組成データのうち、腸内dysbiosis採点項目に該当するデー標について判
定スコアを算出する。判定スコアとは、上記指標に含まれる腸内dysbiosis採点項目を、
当該判定基準値と比較することにより割り当てた値(点数)を意味する。
そして、算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出する。算出
は、例えば、判定基準値設定用集団(健常者集団及び罹患者集団)の検査値分布に基づい
た重み付け加算により行うことができる。この腸内フローラスコアに基づいて、腸内dysb
iosisを判定する。なお、判定スコアは負の値を含み得る。従って、腸内フローラスコア
の算出における「加算」には負の値の加算、すなわち減算も含まれる。
Next, the bacterial composition data (inspection values) of the subject individual or subject group who is the target user of the judgment
is read, and the judgment score is calculated for the data corresponding to the intestinal dysbiosis scoring items among the bacterial composition data. The judgment score is the intestinal dysbiosis scoring items included in the above indicators,
It means the value (score) assigned by comparing with the criterion value.
Then, the calculated determination scores are added to calculate the intestinal flora score. The calculation can be performed, for example, by weighted addition based on the test value distribution of the criteria value setting population (healthy subject population and diseased patient population). Based on this intestinal flora score, intestinal dysb
Determine iosis. Note that the determination score may include negative values. Therefore, "addition" in calculating the intestinal flora score includes addition of negative values, that is, subtraction.

腸内フローラスコアとは、ユーザが有する腸内dysbiosisを判定するための点数である
。ユーザが複数の集団である場合は、その集団における腸内フローラスコアの全体の傾向
(腸内フローラスコア分布)を抽出し、当該集団に属する個々の被験者が全体のどの位置
に属するかを判断する。例えば、腸内フローラスコア分布を、統計解析に基づいて2次元
又は3次元のグラフとして描画し、被験者が属するグラフ上の位置を判断する。判定基準
値設定用集団内を層別解析する。層別比較の結果、分布に差が出ていれば、その差が表れ
た領域又は数値を閾値として、腸内dysbiosisの判定閾値とすればよい。
The intestinal flora score is a score for determining intestinal dysbiosis of the user. When the users belong to a plurality of groups, the overall tendency of the intestinal flora score (intestinal flora score distribution) in the group is extracted, and it is determined to which position each individual subject belonging to the group belongs. For example, the intestinal flora score distribution is drawn as a two-dimensional or three-dimensional graph based on statistical analysis, and the position on the graph to which the subject belongs is determined. Perform a stratified analysis within the population for setting the judgment criteria. As a result of the stratified comparison, if there is a difference in distribution, the region or numerical value showing the difference may be used as the threshold for determining intestinal dysbiosis.

2.腸内dysbiosis判定方法
(1)判定基準値と判定スコアの設定
本発明において、まず、判定基準値設定用集団(以下「基準値集団」ともいう。)に関
するヒト常在細菌データ及びアンケートデータを取得する。被験者の数は2人以上であれ
ば特に限定されるものではないが、統計的に有意な差異又は傾向が出る程度に十分な数で
あることが好ましい。ヒト常在細菌は、例えばヒトから採取された糞便サンプルから得る
ことができるが、大腸内視鏡検査による腸管粘膜等から採取することもできる。ヒト常在
細菌データは、公知の任意の手法により取得することができ、例えば市販のキット(Myki
nso(登録商標))などを使用することができる。
2. Intestinal dysbiosis judgment method (1) Setting of judgment standard value and judgment score
In the present invention, first, human indigenous bacteria data and questionnaire data relating to a population for determination reference value setting (hereinafter also referred to as "reference value population") are obtained. The number of subjects is not particularly limited as long as it is two or more, but it is preferable that the number is sufficient to produce a statistically significant difference or tendency. Human indigenous bacteria can be obtained, for example, from stool samples collected from humans, but can also be collected from the intestinal mucosa and the like by colonoscopy. Human indigenous bacteria data can be obtained by any known method, for example, a commercially available kit (Myki
nso (registered trademark)) can be used.

アンケートデータは、基準値集団における各被験者からの質問に対する回答のデータで
ある。アンケートは、被験者の病歴に関する質問や、糞便サンプル採取前の数日間に何を
食べたのか、食事の内容に関する質問などを含む。被験者の主観的健康感に関するアンケ
ートは、糞便サンプル採取後に所定の期間(例えば数週間~数ヶ月)空けて別途行うよう
にしてもよいし、他のアンケートと同時に行うようにしてもよい。アンケートを回収した
後は、回答内容の全て又は一部を適宜重み付け等しながら数値化し、データベースに記憶
させておく。
Questionnaire data is data of answers to questions from each subject in the reference value group. The questionnaire included questions about the subjects' medical history, what they ate in the days prior to stool sampling, and what their diet consisted of. A questionnaire regarding the subject's subjective health may be conducted separately after a predetermined period of time (for example, several weeks to several months) after collection of the stool sample, or may be conducted simultaneously with other questionnaires. After collecting the questionnaires, all or part of the answers are converted into numerical values while appropriately weighted, and stored in a database.

腸内dysbiosis採点項目は、以下の(a)及び(b)の選定基準に従って選択されるもの
である。
(a)腸内細菌データベース(データベースともいう。)に収載されている菌組成データ
、並びにこれまでに蓄積された被験者の基本属性及びアンケート情報を基にして、菌組成
の攪乱又は菌組成のバランスの安定性という観点で、特徴となる属菌及び指標を取捨選択
した。
(b)腸内細菌が病態に係わる疾患の常在菌を健常対象者と比較した文献が収載されてい
るデータベース中の先行研究と一致する知見が存在するかどうかを基準として、腸内dysb
iosisと関連する属菌及び指標を取捨選択する。
Intestinal dysbiosis scoring items are selected according to the following selection criteria (a) and (b).
(a) Based on the bacterial composition data listed in the intestinal bacteria database (also referred to as database), basic attributes of subjects accumulated so far, and questionnaire information, characteristic genus and indicators were selected from the viewpoint of disturbance of bacterial composition or stability of bacterial composition balance.
(b) Based on whether there are findings consistent with previous studies in databases containing literature comparing the indigenous bacteria of diseases in which intestinal bacteria are involved in the pathology with those of healthy subjects, intestinal dysb
Select genera and indicators associated with iosis.

このようにして取捨選択される指標は、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管
免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標である。
上記採点項目の基準値は、判定基準値設定用集団、例えば健常者コホート(データベ
ースに収載されているユーザのうち、病歴あり、下痢・便秘の訴えあり、及び年齢60歳以
上に該当する者を除いた成人集団)と罹患者コホート(データベースに収載されているユ
ーザーのうち慢性的な疾患の病歴ありに該当する成人集団)の各検査値の分布の比較に基
づき設定する。
The indicators selected in this way are diversity-related indicators, short-chain fatty acid production indicators, intestinal immunity-related indicators, oral bacteria-related indicators, and diarrhea-constipation-related indicators.
The standard values for the above scoring items are set based on a comparison of the distribution of each test value between a healthy subject cohort (users listed in the database who have a history of illness, complaints of diarrhea/constipation, and those aged 60 or older, excluding adults) and a diseased cohort (a group of adults who have a history of chronic diseases among users listed in the database).

(i) 多様性関連指標
多様性関連指標とは、菌種数と各菌の占有率の均等度を反映する指標であり、この指
標に属する項目として、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢属菌
が挙げられる。
多様性とは、サンプル内の菌種数と各菌の占有率の均等度を掛け合わせた計算値であ
る。多様性の検査値は、Shannon 指数に基づいて所定の数値範囲に換算する。数値範囲は
、例えば0~10、好ましくは3~8である。多様性の判定スコアは、多様性の検査値(換算
値)に対し、-10~10の範囲、例えば-10~10の範囲で割り当てる。
後述の表1(実施例)は、各判定項目の判定基準値と判定スコアの一覧であり、例え
ば多様性については、3~8の検査値に対し、-10~10の範囲で判定スコアが割り当てられ
ている。他の項目についても多様性と同様にして、検査値及び判定基準値、判定スコアを
設定する。
(i) Diversity-related index A diversity-related index is an index that reflects the number of bacterial species and the degree of equality of the occupancy rate of each bacterium.
Diversity is a calculated value obtained by multiplying the number of fungal species in a sample by the evenness of the occupancy of each fungus. Diversity test values are converted to a given numerical range based on the Shannon Index. The numerical range is, for example, 0-10, preferably 3-8. Diversity judgment scores are assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of -10 to 10, with respect to the test value (converted value) of diversity.
Table 1 (Examples) below is a list of criteria values and judgment scores for each judgment item. For example, for diversity, judgment scores are assigned in the range of -10 to 10 for test values of 3 to 8. As for the other items, the inspection value, the judgment reference value, and the judgment score are set in the same manner as for the diversity.

FB比とは、ヒトの腸内細菌の主要な門であるFirmicutes門とBacteroidetes門との比率
であり、Firmicutes門/Bacteroidetes門、及びBacteroidetes門/Firmicutes門の両者を含
むが、例えばFirmicutes門/Bacteroidetes門の比が採用される。FB比の検査値は、0~無
限大の数値範囲、例えば0~∞に設定(換算)する。判定スコアは、FB比の検査値(換算
値)に対し、-10~10の範囲、例えば-10~3の範囲で割り当てる。
The FB ratio is the ratio between the phylum Firmicutes and the phylum Bacteroidetes, which are the major phyla of human intestinal bacteria, and includes both the phylum Firmicutes/Bacteroidetes and the phylum Bacteroidetes/Firmicutes, and for example, the ratio of the phylum Firmicutes/Bacteroidetes is adopted. The FB ratio inspection value is set (converted) within a numerical range of 0 to infinity, for example, 0 to ∞. A judgment score is assigned to the test value (converted value) of the FB ratio in the range of -10 to 10, for example, in the range of -10 to 3.

Bacteroidetes門に属する菌種数は、0~100の数値範囲、例えば0~20に設定する。判
定スコアは、Bacteroidetes門に属する菌種数の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲
、例えば-5~3の範囲で割り当てる。
最優勢属菌の占有率とは、サンプル内で最も占有率の高い菌種の占有率の値である。
最優勢属菌の占有率は、0~1の数値範囲で1~5個、例えば2個の数値を基準値として設定
する。判定スコアは、占有率を例えば0.35及び0.4の2個の基準値を設定したとすると、0.
35以上の場合は-1~-5の判定スコア(例えば-3)、0.4以上の場合は-2~-10の判定スコア
(例えば-5)のように割り当てる。なお、最優勢属菌の占有率は、腸内では負の影響(例
えば多様性の低下、特に各菌の占有率の均等度の低下)を与えることから、検査値が大き
い値ほどマイナスの判定スコアとなる。
The number of species belonging to the phylum Bacteroidetes is set to a numerical range of 0-100, for example 0-20. A judgment score is assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 3, for the inspection value (converted value) of the number of bacterial species belonging to the phylum Bacteroidetes.
The occupancy rate of the most dominant genus is the value of the occupancy rate of the bacterial species with the highest occupancy rate in the sample.
For the occupancy rate of the most dominant genus, a numerical value of 1 to 5, for example 2, is set as a reference value within a numerical range of 0 to 1. The judgment score is 0.35 and 0.4, assuming that the occupancy rate is set to two reference values, for example.
If it is 35 or higher, it will be assigned a judgment score of -1 to -5 (eg -3), and if it is 0.4 or higher, it will be assigned a judgment score of -2 to -10 (eg -5). In addition, since the occupancy rate of the most dominant bacterium has a negative effect in the intestine (for example, a decrease in diversity, especially a decrease in the evenness of the occupancy rate of each bacterium), the larger the test value, the negative the judgment score.

(ii) 短鎖脂肪酸産生指標
短鎖脂肪酸産生指標とは、短鎖脂肪酸産生能を有することが認められている腸内細菌
群を意味し、この指標に属する項目として、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群
及び酪酸産生菌群が挙げられる。
ビフィズス菌は、糞便あたりのビフィズス菌の占有率を表す。ビフィズス菌は、0~1の
数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコアは、ビフィズス菌の検査値(換算値)に対
し、-10~10の範囲、例えば-3~7の範囲で割り当てる。
(ii) Short-chain fatty acid production index The short-chain fatty acid production index means a group of intestinal bacteria recognized to have the ability to produce short-chain fatty acids.
Bifidobacterium represents the occupancy of bifidobacteria per faeces. Bifidobacterium is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. A judgment score is assigned to the test value (converted value) of bifidobacteria in the range of -10 to 10, for example, in the range of -3 to 7.

乳酸産生菌群は、糞便あたりのラクトバチルス属菌、ペディオコッカス属菌、ロイコ
ノストック属菌、ラクトコッカス属菌から選ばれる複数の菌の占有率を表す。乳酸産生菌
群は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコアは、乳酸産生菌群の検査値(
換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-10~3の範囲で割り当てる。なお、乳酸産生菌
群は、腸内では負の影響(例えば下痢症状と正の関連を示す)を与えることから、検査値
が大きい値ほどマイナスの判定スコアとなる。
The group of lactic acid-producing bacteria represents the occupancy rate of a plurality of bacteria selected from the genus Lactobacillus, the genus Pediococcus, the genus Leuconostoc, and the genus Lactococcus per feces. The group of lactic acid-producing bacteria is set to a numerical range of 0-1, for example, 0-1. The judgment score is the test value of the lactic acid-producing bacteria group (
converted value), assign it in the range of -10 to 10, for example, in the range of -10 to 3. In addition, since the lactic acid-producing bacteria group has a negative effect in the intestine (for example, exhibits a positive relationship with diarrhea), the larger the test value, the negative the judgment score.

酪酸産生菌群は、糞便あたりのブチリシモナス属菌、コプロコッカス属菌、ロセブリ
ア属菌、ブチリシコッカス属菌、フィーカリバクテリウム属菌、から選ばれる複数の菌の
占有率を表す。酪酸産生菌群は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコアは
、酪酸産生菌群の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-5~10の範囲で割り
当てる。
酪酸産生菌の菌種数とは、上述の酪酸産生菌群に属する菌種数を意味する。
酪酸産生菌群に属する菌種数は、0~5の数値範囲、例えば0~5に設定する。
判定スコアは、酪酸産生菌の菌種数の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-
5~5の範囲で割り当てる。
The group of butyric acid-producing bacteria represents the occupancy rate of a plurality of bacteria selected from the genus Butyricococcus, the genus Coprococcus, the genus Rosebria, the genus Butyricococcus, and the genus Faecalibacterium per feces. The group of butyric acid-producing bacteria is set to a numerical range of 0-1, for example, 0-1. A judgment score is assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 10, for the test value (converted value) of the butyric acid-producing bacteria group.
The number of species of butyric acid-producing bacteria means the number of species belonging to the group of butyric acid-producing bacteria described above.
The number of species belonging to the group of butyric acid-producing bacteria is set to a numerical range of 0-5, for example, 0-5.
The judgment score is in the range of -10 to 10, for example, -
Assign in the range of 5-5.

(iii) 腸管免疫関連指標
腸管免疫関連指標とは、腸管免疫を修飾する物質を産生することが認められている腸
内細菌群を意味し、この指標に属する項目として、フィーカリバクテリウム属菌、アッカ
ーマンシア属菌、クリステンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌
が挙げられる。
フィーカリバクテリウム属菌は、糞便あたりのフィーカリバクテリウム属に属する菌
の占有率を表す。フィーカリバクテリウム属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定す
る。判定スコアは、フィーカリバクテリウム属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の
範囲、例えば-5~5の範囲で割り当てる。
(iii) Gut immunity-related index Gut immunity-related index means a group of intestinal bacteria that are recognized to produce substances that modify intestinal immunity.
Faecalibacterium represents the occupancy of Faecalibacterium per feces. Faecalibacterium is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. A judgment score is assigned to the test value (converted value) of Faecalibacterium in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 5.

アッカーマンシア属菌は、糞便あたりのアッカーマンシア属に属する菌の占有率を表す
。アッカーマンシア属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコアは、ア
ッカーマンシア属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば0~3の範囲で割
り当てる。
クリステンセネラ属菌は、糞便あたりのクリステンセネラ属に属する菌の占有率を表す
。クリステンセネラ属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコア値は、
クリステンセネラ属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば0~3の範囲で
割り当てる。
Akkermansia spp. represents the occupancy rate of bacteria belonging to the genus Akkermansia per feces. Akkermansia is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. A judgment score is assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of 0 to 3, to the test value (converted value) of Akkermansia spp.
Christensenella represents the occupancy rate of bacteria belonging to the genus Christensenella per feces. Christensenella is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. The judgment score value is
A range of -10 to 10, such as a range of 0 to 3, is assigned to the inspection value (converted value) for Christensenella.

アリスティペス属菌は、糞便あたりのアリスティペス属に属する菌の占有率を表す。ア
リスティペス属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコアは、アリステ
ィペス属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば0~3の範囲で割り当てる
Aristipes represents the occupancy rate of bacteria belonging to the genus Aristipes per feces. Aristipes is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. A determination score is assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of 0 to 3, to the test value (converted value) of the genus Aristipes.

クロストリジウム属菌は、糞便あたりのクロストリジウム属に属する菌の占有率を表す
。クロストリジウム属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコアは、ク
ロストリジウム属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-5~0の範囲で割
り当てる。なお、クロストリジウム属菌は、腸内では腸内免疫に作用する物質の種類が複
数あることから(例えば炎症を亢進するサイトカイン物質、炎症を鎮めるサイトカイン物
質等)、検査値が小さい場合と大きい場合の両者でマイナスの判定スコアを設定する。
Clostridium bacteria represent the occupancy rate of bacteria belonging to the genus Clostridium per feces. Clostridia is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. A judgment score is assigned to the test value (converted value) of Clostridium spp. in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 0. In addition, since there are multiple types of substances that act on intestinal immunity in the intestines of Clostridium spp. (for example, cytokine substances that promote inflammation, cytokine substances that suppress inflammation, etc.), a negative judgment score is set for both small and large test values.

(iv) 口腔内細菌関連指標
口腔内細菌関連指標とは、口腔内に多く存在することが認められている腸内細菌群を
意味し、この指標に属する項目として、フソバクテリウム属菌、口腔内細菌占有率及びガ
ンマプロテオバクテリア綱の菌種数が挙げられる。
フソバクテリウム属菌は、糞便あたりのフソバクテリウム属に属する菌の占有率を表
す。フソバクテリウム属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に換算する。判定スコアは、
フソバクテリウム属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-10~0の範囲
で割り当てる。なお、フソバクテリウム属菌は腸内では負の影響(例えば大腸がん患者の
腸内に多く存在する等)を与えることから、検査値が大きいほどマイナスの判定スコアと
なる。
(iv) Oral bacteria-related index The oral bacteria-related index means a group of intestinal bacteria that are recognized to be abundant in the oral cavity, and items belonging to this index include Fusobacterium spp.
Fusobacterium represents the occupancy of bacteria belonging to the genus Fusobacterium per stool. Fusobacterium is converted to a numerical range of 0-1, for example 0-1. The judgment score is
The test value (converted value) for Fusobacterium spp. is assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of -10 to 0. Since Fusobacterium spp. has a negative effect in the intestine (for example, it is abundant in the intestines of colon cancer patients), the higher the test value, the negative the judgment score.

ストレプトコッカス属菌は、糞便あたりのストレプトコッカス属に属する菌の占有率
を表す。ストレプトコッカス属菌は、0~1の数値範囲、例えば0~1に設定する。判定スコ
アは、ストレプトコッカス属菌の検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-5~0
の範囲で割り当てる。なお、ストレプトコッカス属菌は腸内では負の影響(例えば潰瘍性
大腸炎患者の腸内に多く存在する等)を与えることから、検査値が大きいほどマイナスの
判定スコアとなる。
The Streptococcus genus represents the occupancy rate of bacteria belonging to the genus Streptococcus per feces. Streptococcus is set to a numerical range of 0-1, eg 0-1. The judgment score is in the range of -10 to 10, such as -5 to 0, for the test value (converted value) of Streptococcus spp.
Allocate in the range of Since Streptococcus spp. has a negative effect in the intestine (for example, many of them are present in the intestines of patients with ulcerative colitis), the higher the test value, the negative the judgment score.

口腔内細菌占有率は、ストレプトコッカス属菌、フソバクテリウム属菌、トラブルシ
エラ属菌、クレブシエラ属菌からなる群から選ばれる複数の菌の占有率を表す。口腔内細
菌占有率は、0~1の数値範囲で1~5個、例えば1個の数値を基準値として設定する。判定
スコアは、占有率の基準値を例えば0.2(1個の数値)で設定したとすると、0.2以上の場
合は-10のように割り当てる。なお、口腔内細菌は腸内では負の影響(例えばクローン病
患者の腸内に多く存在する等)を与えることから、検査値が大きいほどマイナスの判定ス
コアとなる。
The oral bacterial occupancy rate represents the occupancy rate of a plurality of bacteria selected from the group consisting of Streptococcus, Fusobacterium, Troublesiella, and Klebsiella. The occupancy rate of oral bacteria is set in a numerical range of 0 to 1, and 1 to 5, for example, 1 is set as a reference value. Assuming that the reference value of the occupancy rate is set to, for example, 0.2 (one numerical value), the judgment score is assigned as -10 if it is 0.2 or higher. Since oral bacteria have a negative effect in the intestine (for example, many of them are present in the intestines of Crohn's disease patients), the larger the test value, the negative the judgment score.

ガンマプロテオバクテリア綱の菌種数は、糞便あたりのガンマプロテオバクテリア綱
に属する菌種数を表す。ガンマプロテオバクテリア綱の菌種数は、0~100の数値範囲、例
えば0~10に換算する。判定スコアは、ガンマプロテオバクテリア綱菌の検査値(換算値
)に対し、-10~10の範囲、例えば-7~0の範囲で割り当てる。なお、ガンマプロテオバク
テリア綱の菌種数は腸内では負の影響(例えば過敏性腸症候群患者の腸内に多く存在する
等)を与えることから、検査値が大きいほどマイナスの判定スコアとなる。
The number of strains belonging to the class Gammaproteobacteria represents the number of strains belonging to the class Gammaproteobacteria per stool. The number of gammaproteobacteria strains is converted to a numerical range of 0-100, for example, 0-10. A judgment score is assigned to the test value (converted value) of gammaproteobacteria in the range of -10 to 10, for example, in the range of -7 to 0. Since the number of species of gammaproteobacteria has a negative effect in the intestine (for example, many of them are present in the intestines of patients with irritable bowel syndrome), the larger the test value, the negative the judgment score.

(v) 下痢便秘関連指標
下痢便秘関連指標とは、下痢症状および便秘症状と強い関連を示す菌組成タイプ(エン
テロタイプ)を意味し、この指標に属する項目として、下痢型エンテロタイプ、便秘型エ
ンテロタイプ及びエンテロタイプR型が挙げられる。
(v) Diarrhea-constipation-related index The diarrhea-constipation-related index means a bacterial composition type (enterotype) that is strongly related to diarrhea symptoms and constipation symptoms, and items belonging to this index include diarrhea enterotypes, constipation enterotypes, and enterotype R.

エンテロタイプR型は、ルミノコッカス属菌優勢な菌組成を表す。エンテロタイプR型は
、0~1の数値範囲、例えば0~1に換算する。判定スコアは、エンテロタイプR型の検査値
(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-5~5の範囲で割り当てる。なお、エンテロタ
イプR型は下痢症状および便秘症状と強い関連を示す菌組成タイプとして負の影響(例え
ば便秘症状が増えるなど)を与えることから、検査値が大きいほどマイナスの判定スコア
となる。
Enterotype R represents a Ruminococcus dominant bacterial composition. Enterotype R forms are scaled to a numerical range of 0-1, eg 0-1. A determination score is assigned to the enterotype R test value (converted value) in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 5. Enterotype R has a negative impact (for example, an increase in constipation symptoms) as a bacterial composition type that is strongly associated with diarrhea and constipation symptoms, so the higher the test value, the negative the judgment score.

下痢型エンテロタイプは、下痢症状と強い関連を示す菌組成タイプを表す。下痢型エン
テロタイプは、0~1の数値範囲、例えば0~1に換算する。判定スコアは、下痢型エンテロ
タイプの検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-5~5の範囲で割り当てる。
便秘型エンテロタイプは、便秘症状と強い関連を示す菌組成タイプを表す。便秘型エン
テロタイプは、0~1の数値範囲、例えば0~1に換算する。判定スコアは、便秘型エンテロ
タイプの検査値(換算値)に対し、-10~10の範囲、例えば-5~5の範囲で割り当てる。
Diarrheal enterotype represents a bacterial composition type that is strongly associated with diarrhea symptoms. Diarrheal enterotypes are converted to a numerical range of 0-1, eg 0-1. Determination scores are assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 5, for the test values (converted values) of diarrhea type enterotypes.
The constipation enterotype represents a bacterial composition type that is strongly associated with symptoms of constipation. The constipation type enterotype is converted to a numerical range of 0-1, eg 0-1. Determination scores are assigned in the range of -10 to 10, for example, in the range of -5 to 5, for the test values (converted values) of constipation type enterotypes.

(2)腸内フローラスコア計算及び判定
本項では、各ユーザの腸内dysbiosis採点項目の検査値を計算するために、多様性関連
指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指
標からなる群から選ばれる少なくとも1つの指標を適宜選択する。次に、選択した指標に
含まれる採点項目を適宜選択する。本発明においては、上記関連指標に含まれるすべての
採点項目(18項目)を採用することが好ましい。
次に、各検査値を判定基準値と比較照合して、採点項目のスコア(すなわち判定スコア
)を、重み付け加算等の方法により計算する。
(2) Intestinal Flora Score Calculation and Determination In this section, at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index is appropriately selected in order to calculate test values for intestinal dysbiosis scoring items for each user. Next, the scoring items included in the selected index are selected as appropriate. In the present invention, it is preferable to employ all the scoring items (18 items) included in the above related indicators.
Next, each inspection value is compared with the judgment reference value, and the score of the marking item (that is, the judgment score) is calculated by a method such as weighted addition.

計算後、それぞれの判定スコア同士を加算し、腸内フローラスコアを算出する。腸内フ
ローラスコアは、腸内dysbiosisを判定するための基礎情報となる。腸内dysbiosisを判定
するための腸内フローラスコアの閾値は、健常者群と罹患者群のスコア分布に基づいて1
~99の範囲で適宜設定することができる。例えば、腸内フローラスコアの閾値を50とする
と、50点未満であれば、被験者は腸内dysbiosisである、又は腸内dysbiosisのリスクがあ
ると判定される。
After the calculation, the respective judgment scores are added to calculate the intestinal flora score. The intestinal flora score provides basic information for determining intestinal dysbiosis. The intestinal flora score threshold for determining intestinal dysbiosis is 1 based on the score distribution of healthy and diseased subjects.
It can be set appropriately within the range of ~99. For example, if the intestinal flora score threshold is 50, the subject is determined to have intestinal dysbiosis or be at risk of intestinal dysbiosis if the score is less than 50 points.

ところで、本発明においては、予め規定された数の被験者(1次母標本)において統計
解析処理を行い、腸内dysbiosis判定項目とユーザデータとの間の相関関係を調べ、その
結果をデータベース(DB)に記憶させておく。従って、被験者個人(一人)の検査又は
判定を行う場合、上記複数の被験者由来のデータを母標本として、当該被験者個人の被験
者のデータが、データベースに記憶させておいた母標本のデータのどこに位置するか又は
当てはまるかを調べることによって、当該被験者個人に対する腸内dysbiosisを判定する
ことができる。なお、上記被験者個人のデータを母標本の値に組み込み、再度統計解析処
理した後、当該被験者個人が母標本のどこに位置するかを調べるようにしてもよい。
By the way, in the present invention, statistical analysis processing is performed on a predetermined number of subjects (primary population sample), the correlation between intestinal dysbiosis criteria and user data is examined, and the results are stored in a database (DB). Therefore, in the case of testing or determining an individual subject (one person), intestinal dysbiosis for the individual subject can be determined by using the data derived from the plurality of subjects as a mother sample and examining where the subject data of the individual subject is positioned or applies to the data of the mother sample stored in the database. It should be noted that after incorporating the data of the individual subject into the values of the mother sample and performing statistical analysis processing again, it is possible to examine where the individual subject is positioned in the mother sample.

3.情報処理装置、プログラム
次に、図面を用いて本発明の一実施形態に係る情報処理装置、及びプログラムに関して
以下説明する。
図1は、本実施形態に係る情報処理装置10を含む腸内dysbiosis判定システム1の概
略構成図である。なお、以下では被験者集団又は被験者個人を「ユーザ」として説明する
3. Information Processing Apparatus and Program Next, an information processing apparatus and a program according to an embodiment of the present invention will be described below with reference to the drawings.
FIG. 1 is a schematic configuration diagram of an intestinal dysbiosis determination system 1 including an information processing device 10 according to this embodiment. In the following description, a group of subjects or an individual subject is referred to as a "user".

情報処理装置10は、CPU、ROM、RAM、及び入出力インターフェースなどを備
えたサーバー型コンピュータである。情報処理装置10は、インターネット又はLANな
どのネットワーク20を介して、複数のユーザ機器30a~30n(総称して「ユーザ機
器30」とする。)と通信可能に接続されている。
The information processing apparatus 10 is a server computer including a CPU, ROM, RAM, input/output interfaces, and the like. The information processing apparatus 10 is communicably connected to a plurality of user devices 30a to 30n (collectively referred to as "user devices 30") via a network 20 such as the Internet or LAN.

情報処理装置10は、調査対象とする又は着目するユーザ(「対象ユーザ」という。)
の腸内dysbiosis採点項目を、データベースに記憶された健常者腸内dysbiosis採点項目と
照合し、その比較結果に基づき判定スコアを算出する。そして、情報処理装置10は、算
出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出し、算出された腸内フロー
ラスコアに基づき、対象ユーザが腸内dysbiosisであるかを判定する。そして、情報処理
装置10は、ユーザの腸内dysbiosis判定結果を、ユーザ機器30に送信するものである
The information processing apparatus 10 selects a user (referred to as a “target user”) to be investigated or to be focused on.
The intestinal dysbiosis scoring items are compared with the intestinal dysbiosis scoring items of healthy subjects stored in the database, and the determination score is calculated based on the comparison results. Then, the information processing apparatus 10 adds the calculated determination scores to calculate an intestinal flora score, and determines whether the target user has intestinal dysbiosis based on the calculated intestinal flora score. Then, the information processing device 10 transmits the user's intestinal dysbiosis determination result to the user device 30 .

ユーザ機器30は、情報の入力手段や表示手段などを備えたコンピュータ、又はスマー
トフォン若しくはタブレットなどの機器であり、ネットワーク20を介して情報処理装置
10と通信可能に接続される。ユーザ機器30は、ブラウザ又はアプリケーションなどを
通じて、情報処理装置10から受信した各種情報をディスプレイ上に表示したり、情報処
理装置10に送る情報を入力するためのインターフェースを提供する。
The user device 30 is a device such as a computer, a smart phone, a tablet, or the like, which includes information input means and display means, etc., and is connected to the information processing apparatus 10 via the network 20 so as to be communicable. The user device 30 displays various types of information received from the information processing apparatus 10 on a display and provides an interface for inputting information to be sent to the information processing apparatus 10 through a browser, an application, or the like.

情報処理システム1には、ユーザの糞便から採取される複数種類のヒト腸内細菌を検査
し、その情報を提供する検査機関40が含まれていてもよい。情報処理装置10は、ユー
ザの識別情報と関連付けられた当該ユーザのヒト腸内細菌に関する情報(ヒト腸内細菌デ
ータ)を検査機関40からネットワーク20を介して取得する。なお、情報処理装置10
は、ネットワーク20を介さずに検査機関40からヒト腸内細菌データを直接取得するよ
うにしてもよい。また、ヒト腸内細菌データが検査機関40からユーザ機器30に送られ
る場合には、情報処理装置10は、ユーザ機器30からヒト腸内細菌データを取得するよ
うにしてもよい。さらに、検査機関40と情報処理装置10とは同じ機関に属するもので
あってもよいし、それぞれ別の機関に属するものであってもよい。
The information processing system 1 may include an inspection agency 40 that inspects a plurality of types of human intestinal bacteria collected from the feces of the user and provides the information. The information processing apparatus 10 acquires information (human intestinal bacterium data) related to the user's human intestinal bacteria associated with the user's identification information from the laboratory 40 via the network 20 . Note that the information processing device 10
may obtain human intestinal bacteria data directly from the laboratory 40 without going through the network 20 . Further, when the human intestinal bacteria data is sent from the testing institution 40 to the user device 30 , the information processing apparatus 10 may acquire the human intestinal bacteria data from the user device 30 . Furthermore, the inspection agency 40 and the information processing device 10 may belong to the same agency, or may belong to different agencies.

ヒト腸内細菌データは、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管免疫関連指標、口
腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少なくとも1つの指標を
含む。これらの指標の詳細は、前記した通りである。
The human intestinal bacteria data includes at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index. The details of these indicators are as described above.

情報処理装置10は、ROMに記憶された又はRAMに置かれたプログラムとCPUと
が協働するなどして実現される機能部として、情報取得部101、採点項目抽出部102
、判定基準値設定部103、比較部104、腸内フローラスコア計算部105、及び判定
部106を含む。また、情報処理装置10は、ROM(又はRAM)に設けられた記憶部
110を備え、記憶部110は、腸内細菌データベース(DB)111、採点項目情報デ
ータベース(DB)112、及び判定基準データベース(DB)113を含む。
The information processing apparatus 10 includes an information acquisition unit 101 and a scoring item extraction unit 102 as functional units realized by cooperation between a program stored in a ROM or placed in a RAM and a CPU.
, a determination reference value setting unit 103 , a comparison unit 104 , an intestinal flora score calculation unit 105 , and a determination unit 106 . The information processing apparatus 10 also includes a storage unit 110 provided in a ROM (or RAM), and the storage unit 110 includes an intestinal bacteria database (DB) 111, a scoring item information database (DB) 112, and a judgment criteria database (DB) 113.

情報取得部101は、ネットワーク20を介してユーザ機器30及び/又は検査機関4
0から各種情報を取得し、記憶部110に記憶させる。ユーザ機器30及び/又は検査機
関40から受信する情報には、ユーザの腸内細菌データ、ユーザに対する質問(アンケー
ト)への回答に関する情報(アンケートデータ)、及びユーザ識別情報(ユーザの氏名、
生年月日、住所、電話番号、ユーザが使用するメールアドレス、又はユーザに設定された
ID等)などが含まれる。なお、ユーザ識別情報には当該ユーザが使用するユーザ機器3
0の識別子が含まれていてもよい。
The information acquisition unit 101 receives the user device 30 and/or the inspection agency 4 via the network 20.
Various information is acquired from 0 and stored in the storage unit 110 . The information received from the user device 30 and/or the testing institution 40 includes the user's intestinal bacteria data, information (questionnaire data) on answers to questions (questionnaire) to the user, and user identification information (user's name,
date of birth, address, telephone number, e-mail address used by the user, ID set for the user, etc.). The user identification information includes the user device 3 used by the user.
0 identifiers may be included.

情報取得部101は、ユーザの腸内細菌データを受信すると、ユーザ識別情報と関連付
けて腸内細菌情報DB111に記憶させる。腸内細菌情報DB111には、このようにし
て複数のユーザから集められた腸内細菌データが記憶されている。腸内細菌情報DB11
1には、ユーザ識別データ及びアンケート情報データが含まる。情報取得部101は、ユ
ーザのアンケートデータを受信すると、ユーザ識別情報と関連付けて採点項目DB112
に記憶させる。採点項目DB112には、このようにしてユーザから集めたアンケートデ
ータが記憶されている。判定基準DB113には、後述する判定基準値設定部104によ
り特徴を抽出する統計解析処理により得られた情報が記憶されている。当該情報は、統計
解析処理の対象となったユーザ母標本の構成員及び構成員の数に応じて変わるものである
ため、これらを識別する情報と関連付けて記憶されている。
Upon receiving the user's intestinal bacteria data, the information acquisition unit 101 stores the data in the intestinal bacteria information DB 111 in association with the user identification information. The intestinal bacteria information DB 111 stores intestinal bacteria data collected from a plurality of users in this way. Intestinal bacteria information DB11
1 includes user identification data and questionnaire information data. When the information acquisition unit 101 receives the user's questionnaire data, it associates it with the user identification information to obtain the scoring item DB 112 .
be memorized. The scoring item DB 112 stores questionnaire data collected from users in this manner. The criterion DB 113 stores information obtained by statistical analysis processing for extracting features by the criterion value setting unit 104, which will be described later. Since this information changes according to the number of members of the user population sample subjected to statistical analysis processing, it is stored in association with the information identifying them.

ユーザへ提供される質問(アンケート)は、ユーザの氏名、年齢、身長、体重、BMI
値、家族構成、仕事の種類、生活環境、運動頻度、睡眠充足度、食事習慣、体質、病歴、
採便時の健康状態、採便時の薬歴、及び採便時の精神状態に関する情報が含まれていても
よい。
アンケートデータについては、情報処理装置10からユーザ機器30に質問(アンケー
ト)に関する情報を送信し、ユーザ機器30から当該質問への回答に関する情報を情報取
得部101が受信するようにしてもよいし、検査機関40にてアンケートデータを扱う場
合には、情報取得部101は、検査機関40からアンケートデータを取得するようにして
もよい。
The questions (questionnaire) provided to the user include the user's name, age, height, weight, BMI
value, family composition, type of work, living environment, exercise frequency, sleep satisfaction, dietary habits, constitution, medical history,
Information regarding the health condition at the time of stool collection, medication history at the time of stool collection, and mental state at the time of stool collection may be included.
Regarding the questionnaire data, the information processing apparatus 10 may transmit information about a question (questionnaire) to the user device 30, and the information obtaining unit 101 may receive information about the answer to the question from the user device 30. When the inspection agency 40 handles the questionnaire data, the information acquisition unit 101 may acquire the questionnaire data from the inspection agency 40.

図2は、本実施形態に係る情報処理装置10による処理フローチャートである。
ステップS1において、情報処理装置10の情報取得部101がユーザからヒト腸内細
菌データ及びアンケートデータを取得し、腸内細菌情報DB111に記憶させる。
ステップS2において、採点項目抽出部102は、腸内細菌情報DB111に記憶され
た情報から、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管免疫関連指標、口腔内細菌関連
指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少なくとも1つの指標、又は当該指標
に含まれる採点項目を抽出し、採点項目情報DB112に記憶する。また、ステップS2
において、判定基準値設定部103は、採点項目情報DB112に記憶された情報から、
各採点項目における判定基準値と判定スコアを設定し、判定基準DBに記憶させる。
FIG. 2 is a processing flowchart by the information processing apparatus 10 according to this embodiment.
In step S<b>1 , the information acquisition unit 101 of the information processing apparatus 10 acquires human intestinal bacteria data and questionnaire data from the user, and stores them in the intestinal bacteria information DB 111 .
In step S2, the scoring item extraction unit 102 extracts at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index, or a scoring item included in the index, from the information stored in the intestinal bacteria information DB 111, and stores it in the scoring item information DB 112. Also, step S2
, the criterion value setting unit 103 determines from the information stored in the scoring item information DB 112,
A determination criterion value and a determination score for each scoring item are set and stored in the determination criterion DB.

ステップS3において、比較部104は、腸内細菌情報DB111及び採点項目情報D
B112から、判定基準値設定用集団(健常者集団又は罹患者集団)及び対象者の腸内細
菌に関する各指標の検査値と、当該指標における基準値を抽出し、健常者集団と対象者と
の間で基準値と検査値とを比較照合する。
In step S3, the comparison unit 104 checks the intestinal bacteria information DB 111 and the scoring item information D
From B112, the test value of each index related to the intestinal bacteria of the population for setting the judgment reference value (healthy subject population or affected population) and the subject's intestinal bacteria, and the reference value of the index are extracted, and the reference value and the test value are compared and collated between the healthy subject population and the subject.

ステップS4において、腸内フローラスコア計算部105は、対象ユーザに割り当てら
れた判定スコアを加算し(負の値の場合は減算を含む)、腸内フローラスコアを計算する

ステップS5において、判定部106は、対象ユーザにおける腸内dysbiosisを判定す
る。判定部106による判定は、判定基準値と判定スコアを所定の範囲で変えながら(ス
テップS2)、複数の各指標の特徴を抽出するものである(ステップS2~5の繰り返し
)。
In step S4, the intestinal flora score calculation unit 105 adds the judgment score assigned to the target user (including subtraction in the case of a negative value) to calculate the intestinal flora score.
In step S5, the determination unit 106 determines intestinal dysbiosis in the target user. Judgment by the judging unit 106 is to extract the characteristics of each of the plurality of indices while changing the judgment reference value and the judgment score within a predetermined range (step S2) (repeating steps S2 to S5).

ここで、対象ユーザは、採点項目抽出部102により特徴を抽出するのに用いたユーザ
母標本に含まれる者であってもよいし、当該ユーザ母標本に含まれない新規なユーザ(一
個人)であってもよい。ステップS5において、判定部106は、対象ユーザがどのよう
な腸内dysbiosisに属するか又はリスクがあるかの判定結果に応じて、当該対象ユーザに
対する結果を生成し、対象ユーザのユーザ機器30に送信する。
Here, the target user may be a person included in the user population used for extracting features by the scoring item extraction unit 102, or may be a new user (one individual) not included in the user population. In step S5, the determination unit 106 generates a result for the target user according to the determination result as to what kind of intestinal dysbiosis the target user belongs to or is at risk for, and transmits the result to the user device 30 of the target user.

以下、本発明を実施例によりさらに具体的に説明する。但し、本発明はこれら実施例に
限定されるものではない。
EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to Examples. However, the present invention is not limited to these examples.

(1)腸内dysbiosis採点項目の選定
<選定基準1>
Cykinsoに所属する医師、研究者が、腸内細菌データベースに収載されている菌組成デー
タと複数の被験者の各々の基本属性とアンケート情報を査読して、菌組成の攪乱、菌組成
バランスの安定性という視点で、特徴となる属菌、指標を取捨選択した。
<選定基準2>
海外のDisbiomeデータベースに収載されている先行研究と一致する知見が存在するかど
うかを基準に、腸内dysbiosisと関連する属菌、指標を取捨選択した。
(1) Selection of intestinal dysbiosis scoring items <Selection criteria 1>
Doctors and researchers belonging to Cykinso peer-reviewed the bacterial composition data listed in the intestinal bacteria database and the basic attributes and questionnaire information of multiple subjects, and selected characteristic genus and indicators from the viewpoint of disturbance of bacterial composition and stability of bacterial composition balance.
<Selection Criteria 2>
Genus and indicators related to intestinal dysbiosis were selected based on the existence of findings consistent with previous studies listed in overseas Disbiome databases.

選定された採点項目は以下の通りである。
1. 多様性
2. FB比
3. ビフィズス菌
4. 乳酸産生菌群
5. 酪酸産生菌群
6. エンテロタイプ
7. Bacteroidetes門の菌種数
8. ガンマプロテオバクテリア綱の菌種数
9. フィーカリバクテリウム属菌
10. アッカーマンシア属菌
11. クリステンセネラ属菌
12. アリスティペス属菌
13. クロストリジウム属菌
14. フソバクテリウム属菌
15. ストレプトコッカス属菌
16. 口内細菌(Streptococcus, Fusobacterium, Trabulsiella, Klebsiella)占有率
17. 最優勢属菌の占有率
18. 酪酸産生菌種数
The selected scoring items are as follows.
1. Diversity
2.FB ratio
3. Bifidobacterium
4. Lactic acid-producing bacteria
5. Butyrate-producing bacteria
6. Enterotype
7. Number of Bacteroidetes Species
8. Number of Species of Gammaproteobacteria
9. Faecalibacterium
10. Akkermansia
11. Christensenella
12. Aristipes spp.
13. Clostridia
14. Fusobacterium
15. Streptococcus
16. Oral Bacteria (Streptococcus, Fusobacterium, Trabulsiella, Klebsiella) Occupancy
17. Occupancy of the most dominant genus
18. Number of species of butyric acid-producing bacteria

判定基準値の具体例を表1に示す。
Table 1 shows specific examples of the criterion values.

<判定基準値設定例>
ビフィズス菌の場合、健常者の中央値が5.75であるため、以下の判定基準値と判定スコア
を設定している。
検査値が0以上~0.03未満の場合:3点減点
検査値が0.03以上~0.06未満の場合:3点加点
検査値が0.06以上~0,1未満の場合:5点加点
検査値が0.1以上の場合:7点加点
<Example of judgment reference value setting>
In the case of bifidobacteria, the median value for healthy subjects is 5.75, so the following criteria and scores are set.
If the test value is 0 or more and less than 0.03: 3 points deducted If the test value is 0.03 or more and less than 0.06: 3 points added If the test value is 0.06 or more and less than 0.1: 5 points added If the test value is 0.1 or more: 7 points added

(2)フローラスコアの算出
腸内dysbiosis採点項目の判定基準値と判定スコアは、健常者コホートと罹患者コホート
の検査値の分布の比較に基づいて設定した。
なお、健常者コホートは、データベースに収載されているユーザのうち、アンケートの
回答で以下に該当する者を除いた成人の集団とした。
「病歴あり」、「下痢・便秘の訴えあり」、「年齢が60歳以上」
(2) Calculation of Flora Score Criteria values and judgment scores for intestinal dysbiosis scoring items were set based on a comparison of the distribution of test values between a cohort of healthy subjects and a cohort of affected subjects.
The cohort of healthy subjects was defined as a group of adults, excluding users listed in the database who responded to the questionnaire as follows.
"Medical history", "Complaints of diarrhea/constipation", "Age over 60"

(3)フローラスコア計算アルゴリズム
Step 1では、各ユーザのビフィズス菌、酪酸産生菌、乳酸産生菌の検査値を計算した。
(i) ビフィズス菌=0.013、(ii) 酪酸産生菌=0.0643、(iii) 乳酸産生菌=0.0001
Step 2では、前記表1のビフィズス菌、酪酸産生菌、乳酸産生菌の基準値と照合し、各
項目の判定スコアを計算した。この場合、減点の多さが腸内dysbiosisの傾向を示す。
(i) ビフィズス菌=-3、(ii) 酪酸産生菌=3、(iii) 乳酸産生菌=-3
Step 3では、複数採点項目の判定スコアを重み付け加算等の方法により腸内フローラス
コアを計算した。この場合、基準点を60として各項目の判定スコアを加算する。
・腸内フローラスコア=58.5
(3) Flora score calculation algorithm
In Step 1, the test values for bifidobacteria, butyrate-producing bacteria, and lactic acid-producing bacteria for each user were calculated.
(i) Bifidobacteria = 0.013, (ii) Butyrate-producing bacteria = 0.0643, (iii) Lactic acid-producing bacteria = 0.0001
In Step 2, the reference values for bifidobacteria, butyric acid-producing bacteria, and lactic acid-producing bacteria in Table 1 above were compared, and the judgment scores for each item were calculated. In this case, the large number of demerit points indicates the tendency of intestinal dysbiosis.
(i) Bifidobacteria = -3, (ii) Butyrate-producing bacteria = 3, (iii) Lactic acid-producing bacteria = -3
In Step 3, the intestinal flora score was calculated by a method such as weighted addition of the judgment scores of multiple scoring items. In this case, the reference point is 60, and the judgment scores for each item are added.
・Intestinal flora score = 58.5

(4)結果及び考察
結果を図3に示す。
腸内フローラスコアが50点未満を示すことが、複数疾患に共通して非特異的に存在する腸
内dysbiosisを強く反映していることを見出した。
本発明者は、個々の病歴、服薬歴に関連する約半数の腸内dysbiosis項目が、複数の疾
患に非特異的に応答する細菌及び細菌群であることを示した。
従って、選定した腸内dysbiosis項目で見出された多くの関連は、疾患特異的ではなく
、むしろ健康及び疾患に対して非特異的で共通の応答のバイオマーカーとなる可能性が高
い。
(4) Results and discussion The results are shown in FIG.
We found that an intestinal flora score of less than 50 points strongly reflects intestinal dysbiosis, which is common and nonspecific in multiple diseases.
The present inventors have shown that approximately half of the intestinal dysbiosis items related to individual medical histories and medication histories are bacteria and bacterial groups that non-specifically respond to multiple diseases.
Therefore, many of the associations found in the selected intestinal dysbiosis items are likely not disease-specific, but rather biomarkers of non-specific and common responses to health and disease.

本実施例では、項目ごとに疾患特異的/非特異的な特徴を確認することを目的として、
解析を行った。解析は一般化線形モデルおよびロジスティック回帰分析により行った。
In this example, for the purpose of confirming disease-specific/non-specific features for each item,
I did the analysis. Analysis was performed by generalized linear model and logistic regression analysis.

結果を図4に示す。
図4のカテゴリ1番目の行は、多様性関連指標における疾患特異的/非特異的な腸内dy
sbiosisの強さを示すヒートマップである。各パネルにおいて、疾患と正の関連を示す箇
所が赤色、疾患と負の関連を示す箇所が青色、色の濃さが関連の強さを示す図である。
高血圧、潰瘍性大腸炎の場合、多様性全般が低いことが分かる。
The results are shown in FIG.
The first row of the category in Fig. 4 shows disease-specific/non-specific intestinal dyscytosis in diversity-related indices.
A heat map showing the intensity of sbiosis. In each panel, portions showing a positive association with the disease are shown in red, portions showing a negative association with the disease are blue, and the intensity of the color indicates the strength of the association.
In the case of hypertension and ulcerative colitis, it can be seen that the overall diversity is low.

図4のカテゴリ2番目の行は、短鎖脂肪酸産生に係わる指標における疾患特異的/非特
異的な腸内dysbiosisの強さを示すヒートマップである。
糖尿病の場合(図5)、乳酸産生菌が多く、酪酸産生菌が少ないことが分かる。
The second row of the category in FIG. 4 is a heat map showing the intensity of disease-specific/non-specific intestinal dysbiosis in indices related to short-chain fatty acid production.
In the case of diabetes (Fig. 5), it can be seen that there are many lactic acid-producing bacteria and few butyric acid-producing bacteria.

図4のカテゴリ3番目の行は、腸管免疫に係わる指標における疾患特異的/非特異的な
腸内dysbiosisの強さを示すヒートマップである。
糖尿病と脂質異常症の両者で、クリステンセネラ属菌が少ないことが分かった。
The third row of the category in FIG. 4 is a heat map showing the intensity of disease-specific/non-specific intestinal dysbiosis in indices related to intestinal immunity.
Both diabetes and dyslipidemia were found to have low levels of Christensenella spp.

図4のカテゴリ4番目の行は、口腔内細菌に係わる指標における疾患特異的/非特異的
な腸内dysbiosisの強さを示すヒートマップである。
脂質異常症の場合、フソバクテリウム属菌とストレプトコッカス属菌の両者が多いことが
分かった。
The fourth row of the category in FIG. 4 is a heat map showing the intensity of disease-specific/non-specific intestinal dysbiosis in indices related to oral bacteria.
In the case of dyslipidemia, both Fusobacterium and Streptococcus were found to be prevalent.

図4のカテゴリ5番目の行は、下痢便秘に係わる指標における疾患特異的/非特異的な
腸内dysbiosisの強さを示すヒートマップである。
高血圧、脂質異常症、糖尿病の3疾患でエンテロタイプR型が少ないことが分かった。
The fifth row of the category in FIG. 4 is a heat map showing the strength of disease-specific/non-specific intestinal dysbiosis in indices related to diarrhea and constipation.
It was found that enterotype R was low in three diseases: hypertension, dyslipidemia, and diabetes.

1:本発明のシステム、10:情報処理装置、20:ネットワーク、30:ユーザ機器、
40:検査機関、
101:情報取得部、102:採点項目抽出部、103:判定基準値設定部、104:比
較部、105:腸内フローラスコア計算部、106:判定部
110:記憶部、111:腸内細菌情報DB、112:採点項目情報DB,113:判定
基準DB
1: System of the Present Invention, 10: Information Processing Device, 20: Network, 30: User Device,
40: inspection agency,
101: Information acquisition unit 102: Scoring item extraction unit 103: Criterion value setting unit 104: Comparison unit 105: Intestinal flora score calculation unit 106: Judgment unit 110: Storage unit 111: Intestinal bacteria information DB 112: Scoring item information DB 113: Criteria DB

Claims (21)

腸内dysbiosisの判定方法であって、
判定基準値設定用集団の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸
管免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少な
くとも1つの指標について、腸内dysbiosisの判定基準値を設定する工程、
被験者個人又は被験者集団(ユーザ)から得られた菌組成データを、前記判定基準値と
照合して、前記それぞれの指標について判定スコアを算出する工程、
前記算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出する工程、並びに
前記腸内フローラスコアを指標として、前記ユーザの腸内dysbiosisを判定する工程
を含む、前記方法。
A method for determining intestinal dysbiosis, comprising:
setting a criterion value for intestinal dysbiosis for at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacterium-related index, and a diarrhea-constipation-related index regarding the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value;
A step of comparing bacterial composition data obtained from an individual subject or a group of subjects (users) with the criterion value to calculate a determination score for each of the indicators;
The above method, comprising: calculating an intestinal flora score by adding the calculated determination scores; and determining intestinal dysbiosis of the user using the intestinal flora score as an index.
多様性関連指標が、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢属菌の
占有率からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項1に記載の方法。
2. The method according to claim 1, wherein the diversity-related index includes at least one item selected from the group consisting of diversity, FB ratio, the number of species belonging to the phylum Bacteroidetes, and the occupancy rate of the most dominant genus.
短鎖脂肪酸産生指標が、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群及び酪酸産生菌の
菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項1に記載の方法。
2. The method according to claim 1, wherein the short-chain fatty acid production index includes at least one item selected from the group consisting of bifidobacteria, lactic acid-producing bacteria, butyric acid-producing bacteria, and the number of species of butyric acid-producing bacteria.
腸管免疫関連指標が、フィーカリバクテリウム属菌、アッカーマンシア属菌、クリステ
ンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌からなる群から選ばれる少
なくとも1つの項目を含む、請求項1に記載の方法。
The method according to claim 1, wherein the intestinal immunity-related index includes at least one item selected from the group consisting of Faecalibacterium, Akkermansia, Christensenela, Aristipes, and Clostridium.
口腔内細菌関連指標が、フソバクテリウム属菌、ストレプトコッカス属菌、口腔内細菌
占有率及びガンマプロテオバクテリア綱の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つ
の項目を含む、請求項1に記載の方法。
The method according to claim 1, wherein the oral bacteria-related index includes at least one item selected from the group consisting of Fusobacterium, Streptococcus, oral bacterial occupancy, and gammaproteobacterial species count.
下痢便秘関連指標が、エンテロタイプである、請求項1に記載の方法。 2. The method of claim 1, wherein the diarrhea-constipation-related indicator is an enterotype. 判定基準値は、前記指標に含まれるそれぞれの項目の判定基準値設定用集団の検査値分
布の比較に基づいて設定されるものである、請求項1~6のいずれか1項に記載の方法。
The method according to any one of claims 1 to 6, wherein the criterion value is set based on a comparison of the test value distribution of the criterion value setting group for each item included in the index.
腸内dysbiosisの判定システムであって、
被験者個人又は被験者集団(ユーザ)から得られた菌組成データを記憶する手段、
判定基準値設定用集団の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸管
免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少なく
とも1つの指標について、腸内dysbiosisの判定基準値を記憶する手段、
前記判定基準値を前記菌組成データと照合して、前記それぞれの指標について判定ス
コアを算出する手段、
前記算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出する手段、並びに
前記腸内フローラスコアを指標として、前記ユーザの腸内dysbiosisを判定する手段
を含む、前記システム。
A system for determining intestinal dysbiosis,
means for storing bacterial composition data obtained from an individual subject or a subject group (user);
Means for storing a criterion value for intestinal dysbiosis for at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index, concerning the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value;
means for comparing the determination reference value with the bacterial composition data to calculate a determination score for each of the indicators;
The system, comprising means for calculating an intestinal flora score by adding the calculated determination scores, and means for determining intestinal dysbiosis of the user using the intestinal flora score as an index.
多様性関連指標が、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢属菌の
占有率からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項8に記載のシステム
9. The system according to claim 8, wherein the diversity-related index includes at least one item selected from the group consisting of diversity, FB ratio, the number of species belonging to the phylum Bacteroidetes, and the occupancy rate of the most dominant genus.
短鎖脂肪酸産生指標が、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群及び酪酸産生菌の
菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項8に記載のシステム
9. The system according to claim 8, wherein the short-chain fatty acid production index includes at least one item selected from the group consisting of bifidobacteria, lactic acid-producing bacteria, butyric acid-producing bacteria, and the number of species of butyric acid-producing bacteria.
腸管免疫関連指標が、フィーカリバクテリウム属菌、アッカーマンシア属菌、クリステ
ンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌からなる群から選ばれる少
なくとも1つの項目を含む、請求項8に記載のシステム。
9. The system according to claim 8, wherein the intestinal immunity-related index includes at least one item selected from the group consisting of Faecalibacterium, Akkermansia, Christensenela, Aristipes, and Clostridium.
口腔内細菌関連指標が、フソバクテリウム属菌、ストレプトコッカス属菌、口腔内細菌
占有率及びガンマプロテオバクテリア綱の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つ
の項目を含む、請求項8に記載のシステム。
The system according to claim 8, wherein the oral bacteria-related index includes at least one item selected from the group consisting of Fusobacterium, Streptococcus, oral bacterial occupancy, and gammaproteobacterial species count.
下痢便秘関連指標が、エンテロタイプである、請求項8に記載のシステム。 9. The system of claim 8, wherein the diarrhea-constipation-related indicator is an enterotype. 判定基準値は、前記指標に含まれるそれぞれの項目の判定基準値設定用集団の検査値分
布の比較に基づいて設定されるものである、請求項8~13のいずれか1項に記載のシス
テム。
The system according to any one of claims 8 to 13, wherein the criterion value is set based on a comparison of test value distributions of a criterion value setting population for each item included in the index.
腸内dysbiosisを判定するためのプログラムであって、コンピュータを、
判定基準値設定用集団の腸内細菌に関する、多様性関連指標、短鎖脂肪酸産生指標、腸
管免疫関連指標、口腔内細菌関連指標及び下痢便秘関連指標からなる群から選ばれる少な
くとも1つの指標について、腸内dysbiosisの判定基準値を記憶する手段、
被験者個人又は被験者集団(ユーザ)から得られた菌組成データを記憶する手段、
前記菌組成データを、前記判定基準値と照合して、前記それぞれの指標について判定ス
コアを算出する手段、
前記算出された判定スコア同士を加算して腸内フローラスコアを算出する手段、並びに
前記腸内フローラスコアを指標として、前記ユーザの腸内dysbiosisを判定する手段
として機能させるための前記プログラム。
A program for determining intestinal dysbiosis, comprising:
Means for storing a criterion value for intestinal dysbiosis for at least one index selected from the group consisting of a diversity-related index, a short-chain fatty acid production index, an intestinal immunity-related index, an oral bacteria-related index, and a diarrhea-constipation-related index, concerning the intestinal bacteria of the population for setting the criterion value;
means for storing bacterial composition data obtained from an individual subject or a subject group (user);
means for comparing the bacteria composition data with the judgment reference value to calculate a judgment score for each of the indicators;
means for calculating an intestinal flora score by adding the calculated determination scores; and said program for functioning as means for determining intestinal dysbiosis of said user using said intestinal flora score as an index.
多様性関連指標が、多様性、FB比、Bacteroidetes門に属する菌種数及び最優勢属菌の
占有率からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項15に記載のプログ
ラム。
16. The program according to claim 15, wherein the diversity-related index includes at least one item selected from the group consisting of diversity, FB ratio, the number of species belonging to the phylum Bacteroidetes, and the occupancy rate of the most dominant genus.
短鎖脂肪酸産生指標が、ビフィズス菌、乳酸産生菌群、酪酸産生菌群及び酪酸産生菌の
菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つの項目を含む、請求項15に記載のプログ
ラム。
16. The program according to claim 15, wherein the short-chain fatty acid production index includes at least one item selected from the group consisting of bifidobacteria, lactic acid-producing bacteria, butyric acid-producing bacteria, and the number of species of butyric acid-producing bacteria.
腸管免疫関連指標が、フィーカリバクテリウム属菌、アッカーマンシア属菌、クリステ
ンセネラ属菌、アリスティペス属菌及びクロストリジウム属菌からなる群から選ばれる少
なくとも1つの項目を含む、請求項15に記載のプログラム。
16. The program according to claim 15, wherein the intestinal immunity-related index includes at least one item selected from the group consisting of Faecalibacterium, Akkermansia, Christensenella, Aristipes, and Clostridium.
口腔内細菌関連指標が、フソバクテリウム属菌、ストレプトコッカス属菌、口腔内細菌
占有率及びガンマプロテオバクテリア綱の菌種数からなる群から選ばれる少なくとも1つ
の項目を含む、請求項15に記載のプログラム。
16. The program according to claim 15, wherein the oral bacteria-related index includes at least one item selected from the group consisting of Fusobacterium, Streptococcus, oral bacterial occupancy, and gammaproteobacterial species count.
下痢便秘関連指標が、エンテロタイプである、請求項15に記載のプログラム。 16. The program according to claim 15, wherein the diarrhea-constipation-related index is an enterotype. 判定基準値は、前記指標に含まれるそれぞれの項目の判定基準値設定用集団の検査値分
布の比較に基づいて設定されるものである、請求項16~20のいずれか1項に記載のプ
ログラム。

The program according to any one of claims 16 to 20, wherein the judgment reference value is set based on a comparison of the test value distribution of the judgment reference value setting group for each item included in the index.

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