JP2023052910A - Compound or salt thereof having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety, and reactive group - Google Patents
Compound or salt thereof having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety, and reactive group Download PDFInfo
- Publication number
- JP2023052910A JP2023052910A JP2023015725A JP2023015725A JP2023052910A JP 2023052910 A JP2023052910 A JP 2023052910A JP 2023015725 A JP2023015725 A JP 2023015725A JP 2023015725 A JP2023015725 A JP 2023015725A JP 2023052910 A JP2023052910 A JP 2023052910A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- residue
- group
- soluble protein
- formula
- salt
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 876
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 875
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 title claims abstract description 475
- 239000000126 substance Substances 0.000 title claims abstract description 400
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 title claims abstract description 124
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims abstract description 347
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims abstract description 79
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims abstract description 79
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 56
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 866
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 359
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims description 184
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 169
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 142
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 117
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 117
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 claims description 102
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 78
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N aspartic acid group Chemical group N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 66
- 125000000291 glutamic acid group Chemical group N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)* 0.000 claims description 62
- 125000000430 tryptophan group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12 0.000 claims description 54
- 125000001909 leucine group Chemical group [H]N(*)C(C(*)=O)C([H])([H])C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 52
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims description 51
- -1 aconityl residues Chemical group 0.000 claims description 43
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims description 41
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 40
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 40
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 claims description 35
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 33
- YOFPFYYTUIARDI-ZCFIWIBFSA-N (2r)-2-aminooctanedioic acid Chemical group OC(=O)[C@H](N)CCCCCC(O)=O YOFPFYYTUIARDI-ZCFIWIBFSA-N 0.000 claims description 32
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 32
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims description 32
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims description 32
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 31
- YSFQIJDACSFIOH-UHFFFAOYSA-N 2,2-diaminopropanoic acid Chemical group CC(N)(N)C(O)=O YSFQIJDACSFIOH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 30
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims description 30
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 29
- 150000003573 thiols Chemical group 0.000 claims description 29
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 28
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 claims description 27
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 27
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 claims description 26
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 26
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 claims description 25
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 24
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 claims description 23
- 125000006575 electron-withdrawing group Chemical group 0.000 claims description 21
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims description 20
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 20
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 20
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 claims description 20
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 claims description 18
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 17
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 17
- 125000002228 disulfide group Chemical group 0.000 claims description 17
- 125000003748 selenium group Chemical group *[Se]* 0.000 claims description 17
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 16
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 16
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 16
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims description 16
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 claims description 15
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 15
- 125000000341 threoninyl group Chemical group [H]OC([H])(C([H])([H])[H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims description 15
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 claims description 14
- BLRPTPMANUNPDV-UHFFFAOYSA-N Silane Chemical group [SiH4] BLRPTPMANUNPDV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 239000004215 Carbon black (E152) Substances 0.000 claims description 12
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 claims description 12
- 150000002009 diols Chemical group 0.000 claims description 12
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 claims description 12
- 150000002466 imines Chemical group 0.000 claims description 12
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 12
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 11
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 claims description 11
- 125000004183 alkoxy alkyl group Chemical group 0.000 claims description 11
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 11
- 150000003457 sulfones Chemical class 0.000 claims description 11
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 10
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 claims description 10
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims description 9
- 125000005620 boronic acid group Chemical group 0.000 claims description 9
- 125000003917 carbamoyl group Chemical group [H]N([H])C(*)=O 0.000 claims description 9
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 9
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims description 9
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 claims description 9
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N hydroxylamine group Chemical group NO AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 9
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 9
- UYHQUNLVWOAJQW-UHFFFAOYSA-N 1,3-benzothiazole-2-carbonitrile Chemical group C1=CC=C2SC(C#N)=NC2=C1 UYHQUNLVWOAJQW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 claims description 8
- DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N Tetrazine Chemical group C1=CN=NN=N1 DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 150000001345 alkine derivatives Chemical group 0.000 claims description 8
- IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N azide group Chemical group [N-]=[N+]=[N-] IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 8
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 claims description 8
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 claims description 8
- 150000002148 esters Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 claims description 8
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N hydrazine group Chemical group NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 150000007857 hydrazones Chemical class 0.000 claims description 8
- 150000002576 ketones Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000005439 maleimidyl group Chemical group C1(C=CC(N1*)=O)=O 0.000 claims description 8
- SQDFHQJTAWCFIB-UHFFFAOYSA-N n-methylidenehydroxylamine Chemical group ON=C SQDFHQJTAWCFIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 150000002825 nitriles Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 claims description 8
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N phosphine group Chemical group P XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 229910052720 vanadium Inorganic materials 0.000 claims description 8
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 7
- 125000004093 cyano group Chemical group *C#N 0.000 claims description 7
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 claims description 7
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N phosphoramidic acid Chemical group NP(O)(O)=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 claims description 6
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 claims description 6
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L sulfate group Chemical group S(=O)(=O)([O-])[O-] QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 6
- 125000001273 sulfonato group Chemical group [O-]S(*)(=O)=O 0.000 claims description 6
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 claims description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 5
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 claims description 5
- XFXPMWWXUTWYJX-UHFFFAOYSA-N isonitrile group Chemical group N#[C-] XFXPMWWXUTWYJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 claims description 5
- 150000007970 thio esters Chemical group 0.000 claims description 5
- 125000003107 substituted aryl group Chemical group 0.000 claims description 4
- 125000005717 substituted cycloalkylene group Chemical group 0.000 claims description 4
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 claims description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 2
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 claims description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 2
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 claims 3
- 125000002009 alkene group Chemical group 0.000 claims 2
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 claims 2
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical group O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 claims 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 claims 1
- 229960000575 trastuzumab Drugs 0.000 description 65
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 37
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 35
- 238000004704 ultra performance liquid chromatography Methods 0.000 description 32
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 29
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 27
- 229960002433 cysteine Drugs 0.000 description 25
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 21
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 21
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 21
- 102100027211 Albumin Human genes 0.000 description 18
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 18
- 238000001360 collision-induced dissociation Methods 0.000 description 14
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 14
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 description 14
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 11
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 11
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 11
- 229960004641 rituximab Drugs 0.000 description 11
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 10
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 10
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 10
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 10
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 9
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 9
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 9
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 8
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 8
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 8
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 description 8
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 7
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 7
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 7
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 7
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 7
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 7
- 150000001299 aldehydes Chemical group 0.000 description 7
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 description 7
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 7
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 7
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 description 7
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 6
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 6
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 6
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 6
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 6
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 6
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 6
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 6
- 150000001336 alkenes Chemical group 0.000 description 6
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 6
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 6
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 6
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 description 6
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 6
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 description 6
- UQDJGEHQDNVPGU-UHFFFAOYSA-N serine phosphoethanolamine Chemical compound [NH3+]CCOP([O-])(=O)OCC([NH3+])C([O-])=O UQDJGEHQDNVPGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 6
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 6
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 6
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 description 5
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101000914324 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Proteins 0.000 description 5
- 108050003558 Interleukin-17 Proteins 0.000 description 5
- 102000013691 Interleukin-17 Human genes 0.000 description 5
- FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N L-homocysteine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCS FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 5
- 229940049595 antibody-drug conjugate Drugs 0.000 description 5
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 5
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 5
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 5
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 5
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 5
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 description 5
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 5
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 5
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 5
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 5
- 229960004295 valine Drugs 0.000 description 5
- 102100034608 Angiopoietin-2 Human genes 0.000 description 4
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 4
- 102100037241 Endoglin Human genes 0.000 description 4
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 4
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 4
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 4
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 4
- 229910052796 boron Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000007623 carbamidomethylation reaction Methods 0.000 description 4
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 4
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 4
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 4
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 4
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010090849 Amyloid beta-Peptides Proteins 0.000 description 3
- 102000013455 Amyloid beta-Peptides Human genes 0.000 description 3
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 description 3
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 description 3
- 108050005493 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Proteins 0.000 description 3
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 description 3
- 102000001189 Cyclic Peptides Human genes 0.000 description 3
- 108010069514 Cyclic Peptides Proteins 0.000 description 3
- 102100033553 Delta-like protein 4 Human genes 0.000 description 3
- 108010036395 Endoglin Proteins 0.000 description 3
- 102100023600 Fibroblast growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 3
- 101710182389 Fibroblast growth factor receptor 2 Proteins 0.000 description 3
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 3
- 101000924533 Homo sapiens Angiopoietin-2 Proteins 0.000 description 3
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 description 3
- 101000914321 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 7 Proteins 0.000 description 3
- 101000872077 Homo sapiens Delta-like protein 4 Proteins 0.000 description 3
- 101000777628 Homo sapiens Leukocyte antigen CD37 Proteins 0.000 description 3
- 101000617725 Homo sapiens Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 2 Proteins 0.000 description 3
- 101000801234 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18 Proteins 0.000 description 3
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- 102100031586 Leukocyte antigen CD37 Human genes 0.000 description 3
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 3
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 102100031294 Thymic stromal lymphopoietin Human genes 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100033728 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18 Human genes 0.000 description 3
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 description 3
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 3
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 3
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000013270 controlled release Methods 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 150000002367 halogens Chemical group 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 3
- 150000002527 isonitriles Chemical class 0.000 description 3
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 3
- 238000002715 modification method Methods 0.000 description 3
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 3
- 229960002429 proline Drugs 0.000 description 3
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 108010029307 thymic stromal lymphopoietin Proteins 0.000 description 3
- 229960001612 trastuzumab emtansine Drugs 0.000 description 3
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 description 2
- TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoserine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OC[C@H](N)C(O)=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 0.000 description 2
- BGFTWECWAICPDG-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(4-chlorophenyl)methyl]-4-n-[3-[bis(4-chlorophenyl)methyl]-4-(dimethylamino)phenyl]-1-n,1-n-dimethylbenzene-1,4-diamine Chemical compound C1=C(C(C=2C=CC(Cl)=CC=2)C=2C=CC(Cl)=CC=2)C(N(C)C)=CC=C1NC(C=1)=CC=C(N(C)C)C=1C(C=1C=CC(Cl)=CC=1)C1=CC=C(Cl)C=C1 BGFTWECWAICPDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001731 2-cyanoethyl group Chemical group [H]C([H])(*)C([H])([H])C#N 0.000 description 2
- UYRPRYSDOVYCOU-UHFFFAOYSA-N 2-diphenylphosphanylbenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 UYRPRYSDOVYCOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YLZOPXRUQYQQID-UHFFFAOYSA-N 3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)-1-[4-[2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidin-5-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one Chemical compound N1N=NC=2CN(CCC=21)CCC(=O)N1CCN(CC1)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F YLZOPXRUQYQQID-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100022464 5'-nucleotidase Human genes 0.000 description 2
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 2
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010028006 B-Cell Activating Factor Proteins 0.000 description 2
- 108010008014 B-Cell Maturation Antigen Proteins 0.000 description 2
- 102000006942 B-Cell Maturation Antigen Human genes 0.000 description 2
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 description 2
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 2
- 108010056102 CD100 antigen Proteins 0.000 description 2
- 102100038078 CD276 antigen Human genes 0.000 description 2
- 101710185679 CD276 antigen Proteins 0.000 description 2
- 102100025221 CD70 antigen Human genes 0.000 description 2
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 2
- 102100030340 Ephrin type-A receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 description 2
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 description 2
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical group C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 2
- 102100037362 Fibronectin Human genes 0.000 description 2
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 2
- 102000012673 Follicle Stimulating Hormone Human genes 0.000 description 2
- 108010079345 Follicle Stimulating Hormone Proteins 0.000 description 2
- ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylserin Natural products OC(=O)C(N)COP(O)(=O)OCC(O)CO ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 2
- 102100039939 Growth/differentiation factor 8 Human genes 0.000 description 2
- 102100030595 HLA class II histocompatibility antigen gamma chain Human genes 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101000678236 Homo sapiens 5'-nucleotidase Proteins 0.000 description 2
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 description 2
- 101000934356 Homo sapiens CD70 antigen Proteins 0.000 description 2
- 101100334515 Homo sapiens FCGR3A gene Proteins 0.000 description 2
- 101001082627 Homo sapiens HLA class II histocompatibility antigen gamma chain Proteins 0.000 description 2
- 101000917824 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Proteins 0.000 description 2
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 2
- 101000610604 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B Proteins 0.000 description 2
- 108010001127 Insulin Receptor Proteins 0.000 description 2
- 102100036721 Insulin receptor Human genes 0.000 description 2
- 108090000723 Insulin-Like Growth Factor I Proteins 0.000 description 2
- 102000014429 Insulin-like growth factor Human genes 0.000 description 2
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 description 2
- 102000003816 Interleukin-13 Human genes 0.000 description 2
- 108010065637 Interleukin-23 Proteins 0.000 description 2
- 102000017578 LAG3 Human genes 0.000 description 2
- 101150030213 Lag3 gene Proteins 0.000 description 2
- 102100029205 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Human genes 0.000 description 2
- 102100029193 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Human genes 0.000 description 2
- WSMYVTOQOOLQHP-UHFFFAOYSA-N Malondialdehyde Chemical group O=CCC=O WSMYVTOQOOLQHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical group ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108091008606 PDGF receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100038551 Peptide-N(4)-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase Human genes 0.000 description 2
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 102000011653 Platelet-Derived Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 2
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 description 2
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 2
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 2
- 102100027744 Semaphorin-4D Human genes 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 2
- 108010000499 Thromboplastin Proteins 0.000 description 2
- 102100030859 Tissue factor Human genes 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 2
- 102100036922 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B Human genes 0.000 description 2
- 102100040112 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B Human genes 0.000 description 2
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 2
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 2
- 102100039037 Vascular endothelial growth factor A Human genes 0.000 description 2
- QYKIQEUNHZKYBP-UHFFFAOYSA-N Vinyl ether Chemical group C=COC=C QYKIQEUNHZKYBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- 125000004453 alkoxycarbonyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004448 alkyl carbonyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 2
- 125000006615 aromatic heterocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 2
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 2
- 125000000852 azido group Chemical group *N=[N+]=[N-] 0.000 description 2
- LNQHREYHFRFJAU-UHFFFAOYSA-N bis(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) pentanedioate Chemical group O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O LNQHREYHFRFJAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 2
- ZWIBGKZDAWNIFC-UHFFFAOYSA-N disuccinimidyl suberate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCCCCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O ZWIBGKZDAWNIFC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 description 2
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 description 2
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 description 2
- 229940028334 follicle stimulating hormone Drugs 0.000 description 2
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 description 2
- 125000005597 hydrazone group Chemical group 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010024069 integrin alpha9 Proteins 0.000 description 2
- 108010021315 integrin beta7 Proteins 0.000 description 2
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020004084 membrane receptors Proteins 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N n-[3-[[6-[3-(trifluoromethyl)anilino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(NC=2N=CN=C(NC=3C=C(NC(=O)C4CC4)C=CC=3)C=2)=C1 YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002092 orthoester group Chemical group 0.000 description 2
- 108040002068 peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase activity proteins Proteins 0.000 description 2
- 150000004713 phosphodiesters Chemical group 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000010405 reoxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M sodium periodate Chemical compound [Na+].[O-]I(=O)(=O)=O JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- 102000013498 tau Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010026424 tau Proteins Proteins 0.000 description 2
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 125000000101 thioether group Chemical group 0.000 description 2
- 210000004981 tumor-associated macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 2
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 2
- FXYPGCIGRDZWNR-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[[3-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-3-oxopropyl]disulfanyl]propanoate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCSSCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O FXYPGCIGRDZWNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RCIVUMDLBQZEHP-UHFFFAOYSA-N (2-methylpropan-2-yl)oxycarbamic acid Chemical group CC(C)(C)ONC(O)=O RCIVUMDLBQZEHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SBJKKFFYIZUCET-MVHIGOERSA-N (5s)-5-[(1r)-1,2-dihydroxyethyl]oxolane-2,3,4-trione Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H]1OC(=O)C(=O)C1=O SBJKKFFYIZUCET-MVHIGOERSA-N 0.000 description 1
- IEUUDEWWMRQUDS-UHFFFAOYSA-N (6-azaniumylidene-1,6-dimethoxyhexylidene)azanium;dichloride Chemical compound Cl.Cl.COC(=N)CCCCC(=N)OC IEUUDEWWMRQUDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PJOHVEQSYPOERL-SHEAVXILSA-N (e)-n-[(4r,4as,7ar,12br)-3-(cyclopropylmethyl)-9-hydroxy-7-oxo-2,4,5,6,7a,13-hexahydro-1h-4,12-methanobenzofuro[3,2-e]isoquinoline-4a-yl]-3-(4-methylphenyl)prop-2-enamide Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1\C=C\C(=O)N[C@]1(CCC(=O)[C@@H]2O3)[C@H]4CC5=CC=C(O)C3=C5[C@]12CCN4CC1CC1 PJOHVEQSYPOERL-SHEAVXILSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-UHFFFAOYSA-N 1,4-dithiothreitol Chemical compound SCC(O)C(O)CS VHJLVAABSRFDPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BJHCYTJNPVGSBZ-YXSASFKJSA-N 1-[4-[6-amino-5-[(Z)-methoxyiminomethyl]pyrimidin-4-yl]oxy-2-chlorophenyl]-3-ethylurea Chemical compound CCNC(=O)Nc1ccc(Oc2ncnc(N)c2\C=N/OC)cc1Cl BJHCYTJNPVGSBZ-YXSASFKJSA-N 0.000 description 1
- GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4,6-dichloropyrimidine-5-carbaldehyde Chemical group NC1=NC(Cl)=C(C=O)C(Cl)=N1 GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCCN1CCOCC1 DVLFYONBTKHTER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PECYZEOJVXMISF-UHFFFAOYSA-N 3-aminoalanine Chemical group [NH3+]CC(N)C([O-])=O PECYZEOJVXMISF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010068327 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Proteins 0.000 description 1
- MJZJYWCQPMNPRM-UHFFFAOYSA-N 6,6-dimethyl-1-[3-(2,4,5-trichlorophenoxy)propoxy]-1,6-dihydro-1,3,5-triazine-2,4-diamine Chemical compound CC1(C)N=C(N)N=C(N)N1OCCCOC1=CC(Cl)=C(Cl)C=C1Cl MJZJYWCQPMNPRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 6-{[2-carboxy-4,5-dihydroxy-6-(phosphanyloxy)oxan-3-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-3-phosphanyloxane-2-carboxylic acid Chemical compound O1C(C(O)=O)C(P)C(O)C(O)C1OC1C(C(O)=O)OC(OP)C(O)C1O FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100023990 60S ribosomal protein L17 Human genes 0.000 description 1
- 102100031585 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Human genes 0.000 description 1
- 241000589291 Acinetobacter Species 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 239000000275 Adrenocorticotropic Hormone Substances 0.000 description 1
- 101710092462 Alpha-hemolysin Proteins 0.000 description 1
- 102100026882 Alpha-synuclein Human genes 0.000 description 1
- 101710197219 Alpha-toxin Proteins 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- 108010048036 Angiopoietin-2 Proteins 0.000 description 1
- 102100025668 Angiopoietin-related protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 102100027203 B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain Human genes 0.000 description 1
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 description 1
- 108010049974 Bone Morphogenetic Protein 6 Proteins 0.000 description 1
- 102000007350 Bone Morphogenetic Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010007726 Bone Morphogenetic Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100022525 Bone morphogenetic protein 6 Human genes 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 102100036848 C-C motif chemokine 20 Human genes 0.000 description 1
- 102100031650 C-X-C chemokine receptor type 4 Human genes 0.000 description 1
- 102100026094 C-type lectin domain family 12 member A Human genes 0.000 description 1
- GOXYVEMQUWNZPZ-UHFFFAOYSA-N C1=CC=C2C(=C1)C=CC(=N2)C3=CC=CC=C3S(=O)(=O)O Chemical group C1=CC=C2C(=C1)C=CC(=N2)C3=CC=CC=C3S(=O)(=O)O GOXYVEMQUWNZPZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700012439 CA9 Proteins 0.000 description 1
- 102100024217 CAMPATH-1 antigen Human genes 0.000 description 1
- 102100024210 CD166 antigen Human genes 0.000 description 1
- 102100027207 CD27 antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010065524 CD52 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 1
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 1
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 1
- 102100024155 Cadherin-11 Human genes 0.000 description 1
- 102100038518 Calcitonin Human genes 0.000 description 1
- 108090000932 Calcitonin Gene-Related Peptide Proteins 0.000 description 1
- 108010078311 Calcitonin Gene-Related Peptide Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000014468 Calcitonin Gene-Related Peptide Receptors Human genes 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 102100033868 Cannabinoid receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710187010 Cannabinoid receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100036369 Carbonic anhydrase 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100024423 Carbonic anhydrase 9 Human genes 0.000 description 1
- 108010076667 Caspases Proteins 0.000 description 1
- 102000011727 Caspases Human genes 0.000 description 1
- 108090000712 Cathepsin B Proteins 0.000 description 1
- 102000004225 Cathepsin B Human genes 0.000 description 1
- 102000003908 Cathepsin D Human genes 0.000 description 1
- 108090000258 Cathepsin D Proteins 0.000 description 1
- 108090000625 Cathepsin K Proteins 0.000 description 1
- 102000004171 Cathepsin K Human genes 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 102100023126 Cell surface glycoprotein MUC18 Human genes 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 108010082548 Chemokine CCL11 Proteins 0.000 description 1
- 101100385253 Chiloscyllium indicum GM1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108700022831 Clostridium difficile toxB Proteins 0.000 description 1
- 108010071942 Colony-Stimulating Factors Proteins 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 102400000739 Corticotropin Human genes 0.000 description 1
- 101800000414 Corticotropin Proteins 0.000 description 1
- 208000019736 Cranial nerve disease Diseases 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N D-OH-Asp Natural products OC(=O)C(N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N D-alpha-Ala Natural products CC([NH3+])C([O-])=O QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SBJKKFFYIZUCET-JLAZNSOCSA-N Dehydro-L-ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(=O)C1=O SBJKKFFYIZUCET-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 1
- SBJKKFFYIZUCET-UHFFFAOYSA-N Dehydroascorbic acid Natural products OCC(O)C1OC(=O)C(=O)C1=O SBJKKFFYIZUCET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100030074 Dickkopf-related protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710099518 Dickkopf-related protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101150076616 EPHA2 gene Proteins 0.000 description 1
- 241001115402 Ebolavirus Species 0.000 description 1
- 102100029722 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 Human genes 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 102100023688 Eotaxin Human genes 0.000 description 1
- 108010055196 EphA2 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 108010055191 EphA3 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100030324 Ephrin type-A receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100033942 Ephrin-A4 Human genes 0.000 description 1
- 108010066687 Epithelial Cell Adhesion Molecule Proteins 0.000 description 1
- 102000018651 Epithelial Cell Adhesion Molecule Human genes 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 101000740462 Escherichia coli Beta-lactamase TEM Proteins 0.000 description 1
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010048049 Factor IXa Proteins 0.000 description 1
- 108010014173 Factor X Proteins 0.000 description 1
- 108091006020 Fc-tagged proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 102100024802 Fibroblast growth factor 23 Human genes 0.000 description 1
- 102100027842 Fibroblast growth factor receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710182396 Fibroblast growth factor receptor 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100027844 Fibroblast growth factor receptor 4 Human genes 0.000 description 1
- 102000010451 Folate receptor alpha Human genes 0.000 description 1
- 108050001931 Folate receptor alpha Proteins 0.000 description 1
- 102100020997 Fractalkine Human genes 0.000 description 1
- 102000001002 Frizzled-7 Human genes 0.000 description 1
- 108050007985 Frizzled-7 Proteins 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 101710198884 GATA-type zinc finger protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100038904 GPI inositol-deacylase Human genes 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 101710088083 Glomulin Proteins 0.000 description 1
- 102400000321 Glucagon Human genes 0.000 description 1
- 108060003199 Glucagon Proteins 0.000 description 1
- DTHNMHAUYICORS-KTKZVXAJSA-N Glucagon-like peptide 1 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC=1N=CNC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C(C)C)C1=CC=CC=C1 DTHNMHAUYICORS-KTKZVXAJSA-N 0.000 description 1
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- 108010053070 Glutathione Disulfide Proteins 0.000 description 1
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 102000010956 Glypican Human genes 0.000 description 1
- 108050001154 Glypican Proteins 0.000 description 1
- 108050007237 Glypican-3 Proteins 0.000 description 1
- 101150112082 Gpnmb gene Proteins 0.000 description 1
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100034221 Growth-regulated alpha protein Human genes 0.000 description 1
- 102100040896 Growth/differentiation factor 15 Human genes 0.000 description 1
- OWXMKDGYPWMGEB-UHFFFAOYSA-N HEPPS Chemical compound OCCN1CCN(CCCS(O)(=O)=O)CC1 OWXMKDGYPWMGEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000006354 HLA-DR Antigens Human genes 0.000 description 1
- 108010058597 HLA-DR Antigens Proteins 0.000 description 1
- 102100034458 Hepatitis A virus cellular receptor 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710083479 Hepatitis A virus cellular receptor 2 homolog Proteins 0.000 description 1
- 102100021866 Hepatocyte growth factor Human genes 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 101000777636 Homo sapiens ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000693085 Homo sapiens Angiopoietin-related protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000914491 Homo sapiens B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain Proteins 0.000 description 1
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 description 1
- 101000713099 Homo sapiens C-C motif chemokine 20 Proteins 0.000 description 1
- 101000922348 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000912622 Homo sapiens C-type lectin domain family 12 member A Proteins 0.000 description 1
- 101000980840 Homo sapiens CD166 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000914511 Homo sapiens CD27 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000714525 Homo sapiens Carbonic anhydrase 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000623903 Homo sapiens Cell surface glycoprotein MUC18 Proteins 0.000 description 1
- 101001012447 Homo sapiens Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000881679 Homo sapiens Endoglin Proteins 0.000 description 1
- 101000925259 Homo sapiens Ephrin-A4 Proteins 0.000 description 1
- 101001051973 Homo sapiens Fibroblast growth factor 23 Proteins 0.000 description 1
- 101000917134 Homo sapiens Fibroblast growth factor receptor 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000854520 Homo sapiens Fractalkine Proteins 0.000 description 1
- 101001099051 Homo sapiens GPI inositol-deacylase Proteins 0.000 description 1
- 101000892862 Homo sapiens Glutamate carboxypeptidase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001069921 Homo sapiens Growth-regulated alpha protein Proteins 0.000 description 1
- 101000893549 Homo sapiens Growth/differentiation factor 15 Proteins 0.000 description 1
- 101000886562 Homo sapiens Growth/differentiation factor 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000898034 Homo sapiens Hepatocyte growth factor Proteins 0.000 description 1
- 101001019455 Homo sapiens ICOS ligand Proteins 0.000 description 1
- 101000606465 Homo sapiens Inactive tyrosine-protein kinase 7 Proteins 0.000 description 1
- 101001103039 Homo sapiens Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1 Proteins 0.000 description 1
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101000852965 Homo sapiens Interleukin-1 receptor-like 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000998120 Homo sapiens Interleukin-3 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101001076408 Homo sapiens Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 101001055222 Homo sapiens Interleukin-8 Proteins 0.000 description 1
- 101000945490 Homo sapiens Killer cell immunoglobulin-like receptor 3DL2 Proteins 0.000 description 1
- 101001133056 Homo sapiens Mucin-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000934338 Homo sapiens Myeloid cell surface antigen CD33 Proteins 0.000 description 1
- 101001103036 Homo sapiens Nuclear receptor ROR-alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000589873 Homo sapiens Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001001487 Homo sapiens Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein Proteins 0.000 description 1
- 101000595923 Homo sapiens Placenta growth factor Proteins 0.000 description 1
- 101000994669 Homo sapiens Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001098868 Homo sapiens Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 Proteins 0.000 description 1
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 description 1
- 101000835984 Homo sapiens SLIT and NTRK-like protein 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000936922 Homo sapiens Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000709472 Homo sapiens Sialic acid-binding Ig-like lectin 15 Proteins 0.000 description 1
- 101000868152 Homo sapiens Son of sevenless homolog 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000874179 Homo sapiens Syndecan-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000946860 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain Proteins 0.000 description 1
- 101000669447 Homo sapiens Toll-like receptor 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000801433 Homo sapiens Trophoblast glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000685848 Homo sapiens Zinc transporter ZIP6 Proteins 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 102100034980 ICOS ligand Human genes 0.000 description 1
- 101150088952 IGF1 gene Proteins 0.000 description 1
- 229940099539 IL-36 receptor antagonist Drugs 0.000 description 1
- 102100026120 IgG receptor FcRn large subunit p51 Human genes 0.000 description 1
- 101710177940 IgG receptor FcRn large subunit p51 Proteins 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 102100039813 Inactive tyrosine-protein kinase 7 Human genes 0.000 description 1
- 102100039615 Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1 Human genes 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 1
- 108010064593 Intercellular Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 description 1
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 1
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 1
- 102100036697 Interleukin-1 receptor-like 2 Human genes 0.000 description 1
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 description 1
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 description 1
- 102100026878 Interleukin-2 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 102100030703 Interleukin-22 Human genes 0.000 description 1
- 102100033493 Interleukin-3 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 102000017761 Interleukin-33 Human genes 0.000 description 1
- 108010067003 Interleukin-33 Proteins 0.000 description 1
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 description 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 102100037792 Interleukin-6 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 102100026236 Interleukin-8 Human genes 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- 102000036770 Islet Amyloid Polypeptide Human genes 0.000 description 1
- 108010041872 Islet Amyloid Polypeptide Proteins 0.000 description 1
- 108020003285 Isocitrate lyase Proteins 0.000 description 1
- 241000701460 JC polyomavirus Species 0.000 description 1
- 101150069255 KLRC1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100034840 Killer cell immunoglobulin-like receptor 3DL2 Human genes 0.000 description 1
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 description 1
- 150000007649 L alpha amino acids Chemical group 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N L-Alanine Natural products C[C@@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N L-Aspartic acid Natural products OC(=O)[C@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- 235000019766 L-Lysine Nutrition 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-UHFFFAOYSA-N L-Methionine Natural products CSCCC(N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N L-arginine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 229930064664 L-arginine Natural products 0.000 description 1
- 235000014852 L-arginine Nutrition 0.000 description 1
- 239000004201 L-cysteine Substances 0.000 description 1
- 235000013878 L-cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- 229930182844 L-isoleucine Natural products 0.000 description 1
- 239000004395 L-leucine Substances 0.000 description 1
- 235000019454 L-leucine Nutrition 0.000 description 1
- 229930195722 L-methionine Natural products 0.000 description 1
- 229930182821 L-proline Natural products 0.000 description 1
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 1
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 1
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 1
- 102000057248 Lipoprotein(a) Human genes 0.000 description 1
- 108010033266 Lipoprotein(a) Proteins 0.000 description 1
- 102100033486 Lymphocyte antigen 75 Human genes 0.000 description 1
- 101710157884 Lymphocyte antigen 75 Proteins 0.000 description 1
- 108010009254 Lysosomal-Associated Membrane Protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100035133 Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 Human genes 0.000 description 1
- 101100404845 Macaca mulatta NKG2A gene Proteins 0.000 description 1
- 102000007651 Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010046938 Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100028198 Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor Human genes 0.000 description 1
- 101710150918 Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor Proteins 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 208000024556 Mendelian disease Diseases 0.000 description 1
- 102000003735 Mesothelin Human genes 0.000 description 1
- 108090000015 Mesothelin Proteins 0.000 description 1
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 description 1
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 description 1
- 102100034256 Mucin-1 Human genes 0.000 description 1
- 101100262697 Mus musculus Axl gene Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 102100025243 Myeloid cell surface antigen CD33 Human genes 0.000 description 1
- 108010056852 Myostatin Proteins 0.000 description 1
- 102100022682 NKG2-A/NKG2-B type II integral membrane protein Human genes 0.000 description 1
- 102100035486 Nectin-4 Human genes 0.000 description 1
- 101710043865 Nectin-4 Proteins 0.000 description 1
- 102000015336 Nerve Growth Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010025020 Nerve Growth Factor Proteins 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000001759 Notch1 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010029755 Notch1 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000001756 Notch2 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010029751 Notch2 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000001760 Notch3 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010029756 Notch3 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 108090000526 Papain Proteins 0.000 description 1
- 102100032256 Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor Human genes 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 108010067902 Peptide Library Proteins 0.000 description 1
- 101710124951 Phospholipase C Proteins 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100035194 Placenta growth factor Human genes 0.000 description 1
- 108010071690 Prealbumin Proteins 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- 102100040918 Pro-glucagon Human genes 0.000 description 1
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010002519 Prolactin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100029000 Prolactin receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100023832 Prolyl endopeptidase FAP Human genes 0.000 description 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 102100038955 Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 Human genes 0.000 description 1
- 102100036467 Protein delta homolog 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710119301 Protein delta homolog 1 Proteins 0.000 description 1
- 208000035977 Rare disease Diseases 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 101100437153 Rattus norvegicus Acvr2b gene Proteins 0.000 description 1
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 1
- 101710100969 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 description 1
- 102100029986 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Human genes 0.000 description 1
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 description 1
- 241000725643 Respiratory syncytial virus Species 0.000 description 1
- 108091006976 SLC40A1 Proteins 0.000 description 1
- 102100025504 SLIT and NTRK-like protein 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100027732 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100034201 Sclerostin Human genes 0.000 description 1
- 108050006698 Sclerostin Proteins 0.000 description 1
- 108091058545 Secretory proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000040739 Secretory proteins Human genes 0.000 description 1
- 102100034361 Sialic acid-binding Ig-like lectin 15 Human genes 0.000 description 1
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 101000874347 Streptococcus agalactiae IgA FC receptor Proteins 0.000 description 1
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010021188 Superoxide Dismutase-1 Proteins 0.000 description 1
- 102100038836 Superoxide dismutase [Cu-Zn] Human genes 0.000 description 1
- 241000725681 Swine influenza virus Species 0.000 description 1
- 102100035721 Syndecan-1 Human genes 0.000 description 1
- 229940126547 T-cell immunoglobulin mucin-3 Drugs 0.000 description 1
- 102100035794 T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain Human genes 0.000 description 1
- 102100040347 TAR DNA-binding protein 43 Human genes 0.000 description 1
- 101710150875 TAR DNA-binding protein 43 Proteins 0.000 description 1
- 102000007000 Tenascin Human genes 0.000 description 1
- 108010008125 Tenascin Proteins 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 102100030951 Tissue factor pathway inhibitor Human genes 0.000 description 1
- 102100039360 Toll-like receptor 4 Human genes 0.000 description 1
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100026144 Transferrin receptor protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 1
- 102100030742 Transforming growth factor beta-1 proprotein Human genes 0.000 description 1
- 102100029290 Transthyretin Human genes 0.000 description 1
- 102100033579 Trophoblast glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- 102100029690 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C Human genes 0.000 description 1
- 101710178300 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C Proteins 0.000 description 1
- 102100033732 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A Human genes 0.000 description 1
- 101710187743 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A Proteins 0.000 description 1
- 102100022153 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Human genes 0.000 description 1
- 101710165473 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Proteins 0.000 description 1
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 description 1
- 108010053096 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 description 1
- 102100033178 Vascular endothelial growth factor receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100023144 Zinc transporter ZIP6 Human genes 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 230000000397 acetylating effect Effects 0.000 description 1
- 229960002964 adalimumab Drugs 0.000 description 1
- 230000001476 alcoholic effect Effects 0.000 description 1
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 229960004539 alirocumab Drugs 0.000 description 1
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005907 alkyl ester group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002776 alpha toxin Substances 0.000 description 1
- 108090000185 alpha-Synuclein Proteins 0.000 description 1
- HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N alpha-acetylene Natural products C#C HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002862 amidating effect Effects 0.000 description 1
- PLOPBXQQPZYQFA-AXPWDRQUSA-N amlintide Chemical compound C([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)CSSC1)[C@@H](C)O)C(C)C)C1=CC=CC=C1 PLOPBXQQPZYQFA-AXPWDRQUSA-N 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 229940125644 antibody drug Drugs 0.000 description 1
- 239000000611 antibody drug conjugate Substances 0.000 description 1
- 210000000628 antibody-producing cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 1
- 150000007860 aryl ester derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000005161 aryl oxy carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 229960003852 atezolizumab Drugs 0.000 description 1
- 208000037979 autoimmune inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002358 autolytic effect Effects 0.000 description 1
- 229960004669 basiliximab Drugs 0.000 description 1
- 229960003270 belimumab Drugs 0.000 description 1
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000000051 benzyloxy group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 1
- 229960000397 bevacizumab Drugs 0.000 description 1
- 238000010364 biochemical engineering Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 1
- 229940112869 bone morphogenetic protein Drugs 0.000 description 1
- 229960003735 brodalumab Drugs 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 229960001838 canakinumab Drugs 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 description 1
- 229960005395 cetuximab Drugs 0.000 description 1
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 1
- 230000001886 ciliary effect Effects 0.000 description 1
- IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N corticotropin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO)C1=CC=C(O)C=C1 IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N 0.000 description 1
- 229960000258 corticotropin Drugs 0.000 description 1
- 125000000332 coumarinyl group Chemical group O1C(=O)C(=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 208000014826 cranial nerve neuropathy Diseases 0.000 description 1
- 229960002204 daratumumab Drugs 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000022811 deglycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 235000020960 dehydroascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011615 dehydroascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 229960001251 denosumab Drugs 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- LSXWFXONGKSEMY-UHFFFAOYSA-N di-tert-butyl peroxide Chemical compound CC(C)(C)OOC(C)(C)C LSXWFXONGKSEMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012969 di-tertiary-butyl peroxide Substances 0.000 description 1
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N diisopropylamine Substances CC(C)NC(C)C UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940043279 diisopropylamine Drugs 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- LRHXBHUTQWIZTN-UHFFFAOYSA-N dimethyl heptanediimidate;dihydrochloride Chemical compound Cl.Cl.COC(=N)CCCCCC(=N)OC LRHXBHUTQWIZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZLFRJHOBQVVTOJ-UHFFFAOYSA-N dimethyl hexanediimidate Chemical compound COC(=N)CCCCC(=N)OC ZLFRJHOBQVVTOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FRTGEIHSCHXMTI-UHFFFAOYSA-N dimethyl octanediimidate Chemical compound COC(=N)CCCCCCC(=N)OC FRTGEIHSCHXMTI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LRPQMNYCTSPGCX-UHFFFAOYSA-N dimethyl pimelimidate Chemical compound COC(=N)CCCCCC(=N)OC LRPQMNYCTSPGCX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004497 dinutuximab Drugs 0.000 description 1
- 230000006334 disulfide bridging Effects 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- MOTZDAYCYVMXPC-UHFFFAOYSA-N dodecyl hydrogen sulfate Chemical compound CCCCCCCCCCCCOS(O)(=O)=O MOTZDAYCYVMXPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002224 eculizumab Drugs 0.000 description 1
- 229960000284 efalizumab Drugs 0.000 description 1
- 239000012039 electrophile Substances 0.000 description 1
- 108010087914 epidermal growth factor receptor VIII Proteins 0.000 description 1
- 125000005448 ethoxyethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000005745 ethoxymethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 1
- 229960002027 evolocumab Drugs 0.000 description 1
- 208000030533 eye disease Diseases 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000006815 folate receptor Human genes 0.000 description 1
- 108020005243 folate receptor Proteins 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000002446 fucosyl group Chemical group C1([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O1)C)* 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- MASNOZXLGMXCHN-ZLPAWPGGSA-N glucagon Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC=1NC=NC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 MASNOZXLGMXCHN-ZLPAWPGGSA-N 0.000 description 1
- 229960004666 glucagon Drugs 0.000 description 1
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 1
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YPZRWBKMTBYPTK-BJDJZHNGSA-N glutathione disulfide Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CSSC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)CC[C@H](N)C(O)=O YPZRWBKMTBYPTK-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- 229960001743 golimumab Drugs 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 208000014951 hematologic disease Diseases 0.000 description 1
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- IXCSERBJSXMMFS-UHFFFAOYSA-N hydrogen chloride Substances Cl.Cl IXCSERBJSXMMFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000041 hydrogen chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 229960000598 infliximab Drugs 0.000 description 1
- 208000037797 influenza A Diseases 0.000 description 1
- 208000037798 influenza B Diseases 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 1
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 1
- 108040006870 interleukin-10 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108040001304 interleukin-17 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000053460 interleukin-17 receptor activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010074108 interleukin-21 Proteins 0.000 description 1
- 108040006859 interleukin-5 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108040006858 interleukin-6 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108040006861 interleukin-7 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 229960005386 ipilimumab Drugs 0.000 description 1
- 125000000468 ketone group Chemical group 0.000 description 1
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 1
- 108010013555 lipoprotein-associated coagulation inhibitor Proteins 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 description 1
- 238000002824 mRNA display Methods 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- MBAXWTVHCRPVFW-UHFFFAOYSA-N methyl 3-[(3-imino-3-methoxypropyl)disulfanyl]propanimidate Chemical compound COC(=N)CCSSCCC(=N)OC MBAXWTVHCRPVFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004170 methylsulfonyl group Chemical group [H]C([H])([H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 239000010445 mica Substances 0.000 description 1
- 229910052618 mica group Inorganic materials 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 description 1
- 229950007699 mogamulizumab Drugs 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 229910000403 monosodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019799 monosodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 229960005027 natalizumab Drugs 0.000 description 1
- 229960000513 necitumumab Drugs 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960003301 nivolumab Drugs 0.000 description 1
- 239000012038 nucleophile Substances 0.000 description 1
- 229960003347 obinutuzumab Drugs 0.000 description 1
- 229960002450 ofatumumab Drugs 0.000 description 1
- 229960000470 omalizumab Drugs 0.000 description 1
- 230000000399 orthopedic effect Effects 0.000 description 1
- 108010000953 osteoblast cadherin Proteins 0.000 description 1
- YPZRWBKMTBYPTK-UHFFFAOYSA-N oxidized gamma-L-glutamyl-L-cysteinylglycine Natural products OC(=O)C(N)CCC(=O)NC(C(=O)NCC(O)=O)CSSCC(C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)CCC(N)C(O)=O YPZRWBKMTBYPTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001820 oxy group Chemical group [*:1]O[*:2] 0.000 description 1
- 125000005740 oxycarbonyl group Chemical group [*:1]OC([*:2])=O 0.000 description 1
- 229960000402 palivizumab Drugs 0.000 description 1
- 229960001972 panitumumab Drugs 0.000 description 1
- 229940055729 papain Drugs 0.000 description 1
- 235000019834 papain Nutrition 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000863 peptide conjugate Substances 0.000 description 1
- 229960002087 pertuzumab Drugs 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N phenol group Chemical group C1(=CC=CC=C1)O ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006678 phenoxycarbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000008298 phosphoramidates Chemical group 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 229920001481 poly(stearyl methacrylate) Polymers 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 235000011118 potassium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- MVCPDOUDYOUTKS-UHFFFAOYSA-N propanedithioic acid Chemical group CCC(S)=S MVCPDOUDYOUTKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 1
- 238000002818 protein evolution Methods 0.000 description 1
- 238000003506 protein modification method Methods 0.000 description 1
- 229960002633 ramucirumab Drugs 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 108091008598 receptor tyrosine kinases Proteins 0.000 description 1
- 102000027426 receptor tyrosine kinases Human genes 0.000 description 1
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012827 research and development Methods 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000002702 ribosome display Methods 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 229960004540 secukinumab Drugs 0.000 description 1
- 229960003323 siltuximab Drugs 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M sodium dihydrogen phosphate Chemical compound [Na+].OP(O)([O-])=O AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000011121 sodium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 229940031000 streptococcus pneumoniae Drugs 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 101150047061 tag-72 gene Proteins 0.000 description 1
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 238000001269 time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 229960003989 tocilizumab Drugs 0.000 description 1
- 125000002088 tosyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C([H])=C1C([H])([H])[H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-M triflate Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C(F)(F)F ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000002023 trifluoromethyl group Chemical group FC(F)(F)* 0.000 description 1
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 1
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960003824 ustekinumab Drugs 0.000 description 1
- 229960004914 vedolizumab Drugs 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
- UIYCHXAGWOYNNA-UHFFFAOYSA-N vinyl sulfide Chemical group C=CSC=C UIYCHXAGWOYNNA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010047303 von Willebrand Factor Proteins 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6889—Conjugates wherein the antibody being the modifying agent and wherein the linker, binder or spacer confers particular properties to the conjugates, e.g. peptidic enzyme-labile linkers or acid-labile linkers, providing for an acid-labile immuno conjugate wherein the drug may be released from its antibody conjugated part in an acidic, e.g. tumoural or environment
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6801—Drug-antibody or immunoglobulin conjugates defined by the pharmacologically or therapeutically active agent
- A61K47/6803—Drugs conjugated to an antibody or immunoglobulin, e.g. cisplatin-antibody conjugates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
- A61K47/6851—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K19/00—Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2887—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against CD20
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/32—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/52—Constant or Fc region; Isotype
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
- C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
Abstract
Description
本発明は、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩などに関する。 The present invention relates to compounds having an affinity for soluble proteins, cleavable moieties and reactive groups, salts thereof, and the like.
近年、抗体薬物複合体(Antibody Drug Conjugation:ADC)の研究開発が盛んに行われている。ADCはその名の通り、抗体に薬物(例、抗がん剤)をコンジュゲーションした薬剤であり、がん細胞などに対して直接的な殺細胞活性を有する。代表的なADCとしては、Immunogene社およびRoche社が共同開発したT-DM1(商品名:カドサイラ(登録商標))がある(非特許文献1~3)。
In recent years, research and development of antibody-drug conjugation (ADC) have been actively carried out. ADC, as its name suggests, is a drug in which a drug (eg, an anticancer drug) is conjugated to an antibody, and has direct cell-killing activity against cancer cells and the like. A representative ADC is T-DM1 (trade name: Kadcyla (registered trademark)) jointly developed by Immunogen and Roche (Non-Patent
T-DM1を始めとするADCは、開発当初からその不均一性が問題となっている。すなわち、抗体中に70~80程度あるLys残基に対して、低分子薬物をランダムに反応させているため、薬物抗体比(Drug Antibody Ratio:DAR)やコンジュゲーション位置が一定ではない。通常このようなランダムコンジュゲーション法になるとDARが0~8の範囲となり、薬物の結合数が異なる複数の薬剤が生じることが分かっている。近年ADCの薬物の結合数および結合位置を変化させると、体内動態や薬物の放出速度、効果が変化することが報告されている。これらのことから次世代型ADCではコンジュゲーションする薬物の個数と位置を制御することが求められている。個数および位置が一定であると、期待通りのefficacy、コンジュゲーション薬剤のバリエーション、ロット差いわゆるレギュレーションの問題が解決すると考えられている(非特許文献4)。 ADCs including the T-DM1 have had a problem of non-uniformity since the beginning of their development. That is, since low-molecular-weight drugs are randomly reacted with about 70 to 80 Lys residues in an antibody, the drug-antibody ratio (DAR) and conjugation positions are not constant. It has been found that such random conjugation methods usually result in DARs in the range of 0 to 8, resulting in multiple drugs with different binding numbers of drugs. In recent years, it has been reported that changing the binding number and binding position of a drug to an ADC changes its pharmacokinetics, drug release rate, and effect. For these reasons, next-generation ADCs are required to control the number and positions of drugs to be conjugated. If the number and position are constant, it is believed that expected efficiency, variations in conjugation drugs, and lot differences, so-called regulation problems, can be resolved (Non-Patent Document 4).
抗体の位置選択的修飾法は世界中で研究されているが、そのほとんどが遺伝子工学的手法もしくは酵素を用いた修飾法である。遺伝子工学的修飾法に関しては、位置選択性、個数選択性は制御できるものの、抗体自体の発現効率が低下(ADCを調製する際の総収率が低下)するなどの問題が指摘されている。また、抗体発現系の構築などに長い年月を要することが問題となっている(非特許文献5~7)。
Site-selective modification methods of antibodies have been studied all over the world, but most of them are modification methods using genetic engineering techniques or enzymes. With respect to genetic engineering modification methods, although site selectivity and number selectivity can be controlled, problems such as a decrease in the expression efficiency of the antibody itself (a decrease in the overall yield when preparing ADC) have been pointed out. In addition, there is a problem that it takes a long time to construct an antibody expression system (Non-Patent
また、小分子プローブを利用して細胞内のような夾雑な環境下でタンパク質を化学修飾する方法が近年報告されている。本手法は、イメージングや低分子薬物のリポジショニングを行う上で受容体の同定などに利用されている。また、ケミカルバイオロジー分野において、合成小分子プローブを用いた有機化学的なタンパク質修飾法が注目されている(非特許文献8~10)。
In recent years, a method for chemically modifying proteins using small molecule probes in a crowded environment such as inside a cell has also been reported. This method is used for identification of receptors for imaging and repositioning of low-molecular-weight drugs. In addition, in the field of chemical biology, organic chemical protein modification methods using synthetic small molecule probes have attracted attention (
最近、C-CAP(Chemical Conjugation by Affinity Peptide)法が開発された。本方法は、親和性ペプチド(Affinity
Peptide)に対してNHS活性化エステルおよび薬物が連結されたペプチド試薬を抗体と反応させる方法(すなわち、ペプチド部分を含むリンカーを介したADCの作製方法)により、抗体の位置選択的な修飾に成功している。本方法は世界で初めて、化学合成的手法により、薬物で抗体Fc領域を位置選択的に修飾することに成功したものであり、しかも実用上も良好な結果〔反応時間30分、収率70%(DAR 1の場合)、位置選択性100%〕が確認されている。ペプチド試薬を5等量程度加えることで、DARを2で制御できることが実証されており、修飾位置も制御できる点で画期的である(特許文献1)。
Recently, the C-CAP (Chemical Conjugation by Affinity Peptide) method has been developed. The method uses affinity peptides (Affinity
Succeeded in regioselective modification of antibodies by reacting peptide reagents with NHS-activated esters and drugs linked to Peptide) with antibodies (i.e., creating ADCs via linkers containing peptide moieties). are doing. This method was the first in the world to succeed in regioselectively modifying an antibody Fc region with a drug by a chemical synthesis technique, and the results were also good in practical use [reaction time: 30 minutes, yield: 70%. (for DAR 1), 100% regioselectivity] is confirmed. It has been demonstrated that the DAR can be controlled at 2 by adding about 5 equivalents of a peptide reagent, which is epoch-making in that the modification position can also be controlled (Patent Document 1).
本発明は、可溶性タンパク質の修飾、特に、可溶性タンパク質の位置選択的な修飾を可能にする技術を開発することを目的とする。 An object of the present invention is to develop a technique that enables modification of soluble proteins, in particular, site-selective modification of soluble proteins.
本発明者らは、鋭意検討した結果、(1)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および(2)その可溶性タンパク質を構成するアミノ酸残基に対する反応性基、ならびに(3)当該親和性物質と当該反応性基との間に切断性部分を含み、(4)切断性部分での切断により生体直交性官能基を反応性基側に有する構造単位(すなわち、生体直交性官能基および反応性基を含む構造単位)を生成できるという構造的特徴を有する、新規かつ独創的な設計思想に基づき開発された化合物が、可溶性タンパク質の位置特異的な修飾に有用であることを見出した(例、図1-1、図1-2、図1-3、図2)。本発明者らはまた、このような化合物を用いることにより、ペプチド部分をリンカーとして含まない、機能性物質(例、薬物)を位置選択的に有する可溶性タンパク質(例、抗体薬物複合体(ADC))を調製できることなどを見出した。潜在的な免疫原性を有し、また血中で加水分解され易いペプチド部分を含むリンカーの使用の回避は、ADCの臨床応用において望ましいものである。すなわち、本発明者らの開発した方法は世界で初めて、化学合成的手法により、しかもペプチド部分を含むリンカーを使用することなく、薬物で抗体Fc領域を位置選択的に修飾することに成功したということができる。本発明者らはまた、上記(1)~(4)のような構造的特徴を具備する種々の化合物の開発などに成功し(例、図1-1、図1-2、図1-3、図2)、本発明を完成するに至った。 As a result of intensive studies, the present inventors found that (1) an affinity substance for a soluble protein, (2) a reactive group for an amino acid residue that constitutes the soluble protein, and (3) the affinity substance and the reaction (4) a structural unit having a bioorthogonal functional group on the reactive group side by cleavage at the cleavable moiety (i.e., containing a bioorthogonal functional group and a reactive group) We have found that compounds developed based on a novel and original design concept that have structural features that can generate a structural unit) are useful for site-specific modification of soluble proteins (e.g., Fig. 1- 1, Fig. 1-2, Fig. 1-3, Fig. 2). The present inventors have also found that by using such compounds, soluble proteins (e.g., antibody-drug conjugates (ADC)) regioselectively have functional substances (e.g., drugs) that do not contain peptide moieties as linkers. ) can be prepared. Avoidance of the use of linkers containing peptide moieties that are potentially immunogenic and susceptible to hydrolysis in blood is desirable in clinical applications of ADCs. In other words, the method developed by the present inventors was the first in the world to succeed in regioselectively modifying an antibody Fc region with a drug by a chemical synthesis technique and without using a linker containing a peptide moiety. be able to. The present inventors have also succeeded in developing various compounds having the structural characteristics of (1) to (4) above (e.g., FIGS. 1-1, 1-2, 1-3 , FIG. 2), and completed the present invention.
すなわち、本発明は、以下のとおりである。 That is, the present invention is as follows.
第1の実施形態では、本発明は、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩、ならびに当該化合物またはその塩を含む、可溶性タンパク質の位置選択的修飾試薬を提供する。
〔1〕下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩。
〔2〕Lが、(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー、または(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーである、〔1〕の化合物またはその塩。
〔3〕Lが前記(i)の切断性リンカーである、〔2〕の化合物またはその塩。
〔4〕Lが前記(i)の切断性リンカーであり、かつ、Bが前記(b)の2価の基である、〔2〕または〔3〕の化合物またはその塩。
〔5〕Lが前記(ii)の切断性リンカーであり、かつ、Bが前記(a)の2価の基である、〔2〕の化合物またはその塩。
〔6〕可溶性タンパク質に対する親和性物質がペプチドである、〔1〕~〔5〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔7〕ペプチドが、モノクローナル抗体のFc領域に対する結合性ペプチドである、〔6〕の化合物またはその塩。
〔8〕結合性ペプチドが、IgGのFc領域に対する結合性ペプチドである、〔7〕の化合物またはその塩。
〔9〕前記親和性物質が、下記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域タンパク質を含み、かつ抗原結合能を有する抗体に対する親和性物質である、〔1〕~〔8〕のいずれかの化合物またはその塩:
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
〔10〕結合性ペプチドが、下記式(i):
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号94) (i)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕
によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔9〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔11〕結合性ペプチドが、下記式(i-1):
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号95) (i-1)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、又はジアミノプロピオン酸残基であり、
Gはグリシン残基であり、
Xaa2はグルタミン酸残基又はアスパラギン残基であり、
Lはロイシン残基であり、
Vはバリン残基であり、かつ
Wはトリプトファン残基である。〕
によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔9〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔12〕結合性ペプチドが、下記式(i-2):
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号96) (i-2)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、またはロイシン残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ、
Wは、トリプトファン残基である。〕によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔10〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔13〕結合性ペプチドが、下記式(v):
(X1-3)-C-(Xaa3)-(xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号102)
(v)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、ま
たはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、かつ
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔12〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔14〕結合性ペプチドは、下記式(vi):
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号103) (vi)〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕で表される、13~15アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔13〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔15〕結合性ペプチドが、下記式(vii):
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-T (配列番号104) (vii)
〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、かつ
Tは、スレオニン残基である〕で表される、13アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔14〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔16〕結合性ペプチドが、下記式(viii):
R-G-N-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号105) (viii)
〔式中、
Rは、アルギニン残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Nは、アスパラギン残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、かつ
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕で表される、13~15アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔13〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔17〕結合性ペプチドが、ヒトIgGと結合可能であることを特徴とする、〔7〕~〔16〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔18〕結合性ペプチドが、(a)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号92)のアミノ酸配列において、いずれかのアミノ酸残基が、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、およびジアミノプロピオン酸残基からなる群より選ばれる1つのアミノ酸残基により置換されており、かつ
(b)配列番号92の前記アミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む、親和性ペプチドまたはその塩である、〔7〕~〔9〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔19〕切断性部分が、(a)酸性物質、塩基性物質、還元剤、酸化剤、酵素からなる群より選ばれる1種以上の物質による処理、(b)光からなる群より選ばれる物理化学的刺激による処理、または(c)自己分解性の切断性部分を含む切断性リンカーを用いた場合の放置のいずれかにより切断可能な部分である、〔1〕~〔18〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔20〕前記切断性部分が、ジスルフィド残基、アセタール残基、ケタール残基、エステル残基、カルバモイル残基、アルコキシアルキル残基、イミン残基、三級アルキルオキシカルバメート残基、シラン残基、ヒドラゾン含有残基、フォスフォルアミデート残基、アコニチル残基、トリチル残基、アゾ残基、ビシナルジオール残基、セレン残基、電子吸引基を有する芳香族環含有残基、クマリン含有残基、スルホン含有残基、不飽和結合含有鎖残基、グリコシル残基からなる群より選ばれる、〔1〕~〔19〕のいずれかの化合物ま
たはその塩。
〔21〕前記(i)の切断性部分が、ジスルフィド残基、エステル残基、アセタール残基、ケタール残基、イミン残基、ビシナルジオール残基からなる群より選ばれる、〔2〕~〔20〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔22〕前記(ii)の切断性部分が、エステル残基、カルバモイル残基、アルコキシアルキル残基、イミン残基、三級アルキルオキシカルバメート残基、シラン残基、ヒドラゾン含有残基、フォスフォルアミデート残基、アコニチル残基、トリチル残基、アゾ残基、ビシナルジオール残基、セレン残基、電子吸引基を有する芳香族環含有残基、クマリン含有残基、スルホン含有残基、不飽和結合含有鎖残基、グリコシル残基からなる群より選ばれる、〔2〕~〔20〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔23〕切断性部分が、下記:
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、
(i)水素原子、またはハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれ、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔1〕~〔20〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔24〕前記(i)の切断性部分が、以下:
R2aは、〔23〕と同じであり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔2〕~〔19〕、〔21〕、〔23〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔25〕前記(ii)の切断性部分が、以下:
R2b、R2c、J、rは、〔23〕と同じであり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔2〕~〔19〕、〔22〕、〔23〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔26〕Lが、下記式(L1)~(L3):
La-C-Lb (L1)
La-C (L2)
C-Lb (L3)
〔式中、
LaおよびLbは、それぞれ、2価の基であり、
Cは、切断性部分である。〕のいずれか一つで表される、〔1〕~〔25〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔27〕前記LaおよびLbが、それぞれ、下記(La’)および(Lb’):
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子または基である。〕で表される、〔26〕の化合物またはその塩。
〔28〕生体直交性官能基を含む2価の基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を主鎖に含む2価の基である、〔1〕~〔27〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔29〕生体直交性官能基を含む2価の基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を側鎖に含む2価の基である、〔1〕~〔27〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔30〕生体直交性官能基が、下記:
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)で表されるいずれか一つである、〔1〕~〔29〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔31〕前記(b)の2価の基が、置換されていてもよいアルキレン、置換されていてもよいシクロアルキレン、置換されていてもよいアリール、置換されていてもよい2価の複素環基、-NRa-(Raは水素原子、または置換基を示す)、-O-、またはこれらの2以上の組み合わせからなる群より選ばれる、〔1〕~〔30〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔32〕Bが、下記式(B-1):
Yは、-NH-、-O-、-CH2-、または下記式(B-2):
VおよびV’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
V1は、生体直交性官能基を含む2価の基であり、
sは、0~10の任意の整数であり、
式(B-2)における○および●は、それぞれ、式(B-1)における○および●と同じ配向である。)であり、
Zは、酸素原子、硫黄原子、または水素原子(Zが水素原子である場合、-C(=Z)-は、-CH2-を示す。)であり、
式(B-1)における○(白丸)は、L側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はR側の部分に対する結合を示す。〕で表される、〔1〕~〔31〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔33〕反応性基が、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基のいずれか一つの側鎖に対して特異的な反応性基である、〔1〕~〔32〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔34〕反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔33〕の化合物またはその塩。
〔35〕反応性基が、下記:
R5aおよびR5cは、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子または基
であり、
R5bは、電子吸引基であり、
jは、1~5の任意の整数であり、
kは、1~4の任意の整数である。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔1〕~〔34〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔36〕AおよびRを連結する主鎖の原子数が4~20個である、〔1〕~〔35〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔37〕AおよびRを連結する主鎖が環構造を含まない、〔1〕~〔36〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔38〕L-Bで表される部分構造がペプチド部分を含まない、〔1〕~〔37〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔39〕前記式(I)で表される化合物が、下記(I’):
A-B2-L’-B1-R (I’)
〔式中、
AおよびRは、前記式(I)のものと同じであり
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1およびB2は、同一または異なって、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
B1およびB2は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕で表される化合物である、〔1〕~〔38〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔40〕前記式(I’)で表される化合物が、下記(I’’):
AおよびRは、〔1〕記載の式(I)のものと同じであり、
Cは、切断性部分であり、
p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1a’、R1b、およびR1b’は、〔27〕記載の式(La’)および(Lb’)のものと同じであり、
YおよびY’は、同一または異なって、〔32〕記載の式(B-1)のYと同じであり、
ZおよびZ’は、同一または異なって、前記式(B-1)のZと同じである。〕で表される、〔39〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔41〕下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を含む、可溶性タンパク質の位置選択的修飾試薬。
〔42〕下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である。〕で表される、抗体に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩。
〔43〕下記式(I):
下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である。〕で表される、抗体に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を含む、抗体の位置選択的修飾試薬。
In a first embodiment, the present invention provides a soluble protein regioselective modification reagent comprising an affinity substance for a soluble protein, a compound having a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof, and the compound or a salt thereof. offer.
[1] Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group.
[2] L is (i) a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety capable of generating a bioorthogonal functional group on the reactive group side by cleavage, or (ii) a bioorthogonal The compound of [1] or a salt thereof, which is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety that does not have the ability to generate a functional group on the reactive group side.
[3] The compound of [2] or a salt thereof, wherein L is the cleavable linker of (i).
[4] The compound or salt of [2] or [3], wherein L is the cleavable linker of (i) above and B is the divalent group of (b) above.
[5] The compound of [2] or a salt thereof, wherein L is the cleavable linker of (ii) above and B is the divalent group of (a) above.
[6] The compound or salt of any one of [1] to [5], wherein the substance with affinity for soluble proteins is a peptide.
[7] The compound of [6] or a salt thereof, wherein the peptide is a binding peptide to the Fc region of a monoclonal antibody.
[8] The compound of [7] or a salt thereof, wherein the binding peptide is a binding peptide to the Fc region of IgG.
[9] the affinity substance is an affinity substance for an antibody containing any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and having antigen-binding ability [1] to any one of [8] or a salt thereof:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
[10] The binding peptide has the following formula (i):
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 94) (i)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
The compound of any one of [7] to [9], which is a peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues represented by and capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG. Or its salt.
[11] the binding peptide is represented by the following formula (i-1):
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 95) (i-1)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a glutamic acid residue or an asparagine residue,
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
The compound of any one of [7] to [9], which is a peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues represented by and capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG. Or its salt.
[12] a binding peptide represented by the following formula (i-2):
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 96) (i-2)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue or a leucine residue,
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue, and
W is a tryptophan residue. ], a peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues and capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, any of [7] to [10] compound or its salt.
[13] The binding peptide has the following formula (v):
(X 1-3 )-C-(Xaa3)-(xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (sequence number 102)
(v)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue, and Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or no residue. Any one of [7] to [12], which is a peptide or a salt thereof, which comprises an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, represented by compound or its salt.
[14] The binding peptide has the following formula (vi):
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (SEQ ID NO: 103) (vi ) [In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue;
Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or none. ], and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof, [7] to [13 ] or a salt thereof.
[15] The binding peptide is represented by the following formula (vii):
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWCT (SEQ ID NO: 104) (vii)
[In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue, and T is a threonine residue], and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG. The compound or salt thereof according to any one of [7] to [14], which is a characterized peptide or a salt thereof.
[16] the binding peptide is represented by the following formula (viii):
RGNC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (SEQ ID NO: 105) (viii)
[In the formula,
R is an arginine residue,
G is a glycine residue,
N is an asparagine residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue, and Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or no residue. ], and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof, [7] to [13 ] or a salt thereof.
[17] The compound or salt of any one of [7] to [16], wherein the binding peptide is capable of binding to human IgG.
[18] any amino acid residue in the amino acid sequence of (a) FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 92) in which the binding peptide is a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, or a 2-aminosuberic acid residue; , and a diaminopropionic acid residue, and (b) having 90% or more identity to said amino acid sequence of SEQ ID NO: 92. , an affinity peptide or a salt thereof, the compound of any one of [7] to [9] or a salt thereof.
[19] The cleavable moiety is (a) treated with one or more substances selected from the group consisting of acidic substances, basic substances, reducing agents, oxidizing agents, and enzymes; The moiety of any one of [1] to [18], which is cleavable either by treatment with a chemical stimulus or (c) by leaving in the case of using a cleavable linker containing a self-cleavable cleavable moiety. compound or its salt.
[20] the cleavable moiety is a disulfide residue, an acetal residue, a ketal residue, an ester residue, a carbamoyl residue, an alkoxyalkyl residue, an imine residue, a tertiary alkyloxycarbamate residue, a silane residue; hydrazone-containing residues, phosphoramidate residues, aconityl residues, trityl residues, azo residues, vicinal diol residues, selenium residues, aromatic ring-containing residues with electron-withdrawing groups, coumarin-containing residues , a sulfone-containing residue, an unsaturated bond-containing chain residue, and a glycosyl residue, the compound or a salt thereof according to any one of [1] to [19].
[21] The cleavable moiety of (i) is selected from the group consisting of disulfide residues, ester residues, acetal residues, ketal residues, imine residues, and vicinal diol residues, [2] to [ 20] or a salt thereof.
[22] The cleavable moiety of (ii) is an ester residue, a carbamoyl residue, an alkoxyalkyl residue, an imine residue, a tertiary alkyloxycarbamate residue, a silane residue, a hydrazone-containing residue, a phosphorami date residue, aconityl residue, trityl residue, azo residue, vicinal diol residue, selenium residue, aromatic ring-containing residue with electron-withdrawing group, coumarin-containing residue, sulfone-containing residue, unsaturated The compound or salt thereof according to any one of [2] to [20], which is selected from the group consisting of bond-containing chain residues and glycosyl residues.
[23] the cleavable moiety comprises:
multiple R 2a , multiple R 2b , and multiple R 2c are the same or different,
(i) a hydrogen atom, or a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is a hydrogen atom , or a monovalent hydrocarbon group);
(vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e -(R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group); or (vii) from the group consisting of a nitro group, a sulfate group, a sulfonate group, a cyano group, or a carboxyl group chosen,
J is —CH 2 —, —O—, or —S—;
r is any integer from 1 to 4,
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. ] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of [1] to [20] or a salt thereof.
[24] The cleavable moiety of (i) above is:
R 2a is the same as [23],
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. ] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of [2] to [19], [21], [23] or a salt thereof.
[25] The cleavable moiety of (ii) above is:
R 2b , R 2c , J and r are the same as in [23],
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. ] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of [2] to [19], [22], [23] or a salt thereof.
[26] L is represented by the following formulas (L1) to (L3):
La-C-Lb (L1)
La-C (L2)
C-Lb (L3)
[In the formula,
La and Lb are each a divalent group,
C is a cleavable moiety. ], the compound or a salt thereof according to any one of [1] to [25].
[27] La and Lb are respectively the following (La') and (Lb'):
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii). ], the compound of [26] or a salt thereof.
[28] the bivalent group containing a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a tetrazine residue, a nitrone residue, a hydroxylamine residue, a nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, thioester group, α-halocarbonyl residue, isonitrile residue The compound or a salt thereof according to any one of [1] to [27], which is a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of groups, sydnon residues and selenium residues in its main chain.
[29] the bivalent group containing a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a halogen residue, a tetrazine residue, a nitrone residue, hydroxylamine residue, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, α-halocarbonyl residue, isonitrile The compound or a salt thereof according to any one of [1] to [27], which is a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of a residue, a sydnon residue and a selenium residue in its side chain.
[30] The bioorthogonal functional group is:
R 1f , single or multiple R 1g and single or multiple R 1h are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii), or electron-withdrawing groups;
・ is a bond. ), the compound or a salt thereof according to any one of [1] to [29].
[31] The divalent group (b) is optionally substituted alkylene, optionally substituted cycloalkylene, optionally substituted aryl, or optionally substituted divalent heterocyclic ring group, -NR a - (R a represents a hydrogen atom or a substituent), -O-, or a compound of any one of [1] to [30] selected from the group consisting of a combination of two or more thereof Or its salt.
[32] B is the following formula (B-1):
Y is -NH-, -O-, -CH 2 -, or the following formula (B-2):
V and V′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
V is a divalent group containing a bioorthogonal functional group;
s is any integer from 0 to 10,
○ and ● in formula (B-2) have the same orientations as ○ and ● in formula (B-1), respectively. ) and
Z is an oxygen atom, a sulfur atom, or a hydrogen atom (when Z is a hydrogen atom, -C(=Z)- represents -CH 2 -);
○ (white circle) in formula (B-1) indicates a bond to the L-side portion, and ● (black circle) indicates a bond to the R-side portion. ], the compound or a salt thereof according to any one of [1] to [31].
[33] any one of [1] to [32], wherein the reactive group is a reactive group specific to the side chain of any one of a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue; compound or its salt.
[34] the compound of [33] or a salt thereof, wherein the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue;
[35] The reactive group is the following:
R 5a and R 5c are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii);
R 5b is an electron withdrawing group,
j is any integer from 1 to 5;
k is any integer from 1 to 4. ] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of [1] to [34] or a salt thereof.
[36] The compound or salt of any one of [1] to [35], wherein the main chain connecting A and R has 4 to 20 atoms.
[37] The compound or a salt thereof according to any one of [1] to [36], wherein the main chain connecting A and R does not contain a ring structure.
[38] The compound or a salt thereof according to any one of [1] to [37], wherein the partial structure represented by LB does not contain a peptide moiety.
[39] The compound represented by the formula (I) is the following (I'):
AB2-L'-B1-R (I')
[In the formula,
A and R are the same as in formula (I) above L′ is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1 and B2 are the same or different and are (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group without a bioorthogonal functional group;
B1 and B2 may have a symmetrical structure about L'. ], the compound or a salt thereof according to any one of [1] to [38].
[40] The compound represented by the formula (I′) is the following (I″):
A and R are the same as those of formula (I) described in [1],
C is a cleavable moiety;
p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1a' , R 1b , and R 1b' are the same as those of formulas (La') and (Lb') described in [27] and
Y and Y' are the same or different and are the same as Y in formula (B-1) described in [32],
Z and Z' are the same or different and are the same as Z in formula (B-1) above. ], any one of the compounds of [39] or a salt thereof.
[41] the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a regioselective modification reagent for a soluble protein comprising a compound having an affinity for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof.
[42] the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group specific for the side chains of lysine residues. ], a compound or a salt thereof having an affinity substance for an antibody, a cleavable moiety and a reactive group.
[43] the following formula (I):
Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group specific for the side chains of lysine residues. ], an antibody regioselective modification reagent comprising an antibody-affinity substance, a cleavable moiety and a compound having a reactive group or a salt thereof.
第2に、本発明は、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩、およびその製造方法を提供する。
(可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩)
〔44〕下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔45〕可溶性タンパク質がモノクローナル抗体である、〔44〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔46〕可溶性タンパク質がIgG抗体である、〔44〕または〔45〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔47〕可溶性タンパク質がヒト由来である、〔44〕~〔46〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔48〕可溶性タンパク質が、下記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域タンパク質を含み、かつ抗原結合能を有する抗体である、〔44〕~〔47〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩:
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
〔49〕可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、
A-L-B-R’で表される構造単位が、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定の
アミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、〔44〕~〔48〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔50〕前記標的領域が、連続する1~10個のアミノ酸残基からなる領域である、〔49〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔51〕前記標的領域が、連続する1~3個のアミノ酸残基からなる領域である、〔50〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔52〕前記標的領域が、(a)ヒトIgG Fc領域における246~248位のアミノ酸残基からなる領域、(b)ヒトIgG Fc領域における288~290位のアミノ酸残基からなる領域、または(c)ヒトIgG Fc領域における317位のアミノ酸残基からなる領域である、〔51〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔53〕前記位置選択性が50%以上である、〔49〕~〔52〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔54〕前記位置選択性が70%以上である、〔53〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔55〕前記位置選択性が90%以上である、〔54〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔56〕前記特定のアミノ酸残基が、特定の位置に存在する特定のアミノ酸を中心としてそれぞれN末端側およびC末端側に対してa個(ここで、aは、1~10の任意の整数である)のアミノ酸残基の遠隔位置までの領域において、前記特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基以外に、特定のアミノ酸残基と同種のアミノ酸残基を含まない、〔49〕~〔55〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔57〕前記可溶性タンパク質が、複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質であり、
Tが、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、前記多量体タンパク質がA-L-B-R’で表される構造単位を複数個有する、〔44〕~〔56〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔58〕前記可溶性タンパク質が、複数個の重鎖を含む抗体であり、
Tが、複数個の重鎖中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、前記抗体がA-L-B-R’で表される構造単位を複数個有する、〔44〕~〔57〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔59〕重鎖の個数が2個である、〔58〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔60〕可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分が、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基に対する、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基のいずれか一つの側鎖に対して特異的な反応性基の反応により生成する部分である、〔44〕~〔59〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔61〕可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分が、リジン残基と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分である、〔44〕~〔60〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔62〕前記反応により生成する部分が、下記:
〔63〕AおよびR’を連結する主鎖の原子数が4~20個である、〔44〕~〔62〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔64〕AおよびRを連結する主鎖が環構造を含まない、〔44〕~〔53〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔65〕L-Bで表される部分構造がペプチド部分を含まない、〔44〕~〔64〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔66〕前記式(II)で表される化合物が、下記(II’):
A-B2-L’-B1-R’-T (II’)
〔式中、
A、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1およびB2は、同一または異なって、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
B1およびB2は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕で表される化合物である、〔44〕~〔65〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔67〕前記式(II’)で表される化合物が、下記(II’’):
A、R’およびTは、〔44〕記載の式(II)のものと同じであり、
Cは、切断性部分であり、
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、
(i)水素原子、またはハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれ、
YおよびY’は、同一または異なって、〔32〕記載の式(B-1)のYと同じであり、
ZおよびZ’は、同一または異なって、前記式(B-1)のZと同じである。〕で表さ
れる、〔66〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔68〕下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、抗体と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、抗体である。〕表される、抗体に対する親和性物質、および切断性部分を有する抗体またはその塩。
Second, the present invention provides affinity substances for soluble proteins and soluble proteins or salts thereof having cleavable moieties, and methods for their production.
(Affinity Substances for Soluble Proteins and Soluble Proteins with Cleavable Moieties or Salts thereof)
[44] Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof.
[45] The soluble protein of [44] or a salt thereof, wherein the soluble protein is a monoclonal antibody.
[46] The soluble protein of [44] or [45], wherein the soluble protein is an IgG antibody, or a salt thereof.
[47] The soluble protein or salt thereof of any one of [44] to [46], wherein the soluble protein is human-derived.
[48] any one of [44] to [47], wherein the soluble protein comprises any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and is an antibody having antigen-binding ability: Soluble protein or salt thereof:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
[49] the soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid in a non-target region other than the target region containing 5 or more residues,
The structural unit represented by ALBR' binds to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a regioselectivity of 30% or more [44 ] to [48] any soluble protein or a salt thereof.
[50] The soluble protein or salt thereof of [49], wherein the target region is a region consisting of 1 to 10 consecutive amino acid residues.
[51] The soluble protein of [50] or a salt thereof, wherein the target region is a region consisting of 1 to 3 consecutive amino acid residues.
[52] The target region is (a) a region consisting of amino acid residues at positions 246-248 in the human IgG Fc region, (b) a region consisting of amino acid residues at positions 288-290 in the human IgG Fc region, or ( c) the soluble protein of [51], which is a region consisting of amino acid residues at position 317 in the human IgG Fc region, or a salt thereof.
[53] The soluble protein or salt thereof according to any one of [49] to [52], wherein the regioselectivity is 50% or more.
[54] The soluble protein of [53] or a salt thereof, wherein the regioselectivity is 70% or more.
[55] The soluble protein of [54] or a salt thereof, wherein the regioselectivity is 90% or more.
[56] the specific amino acid residue is a (where a is any integer from 1 to 10 ) does not contain amino acid residues of the same kind as the specific amino acid residue other than the specific amino acid residue present at the specific position in the region up to the remote position of the amino acid residue of [49] to [ 55] any soluble protein or a salt thereof.
[57] the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins;
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of monomeric proteins, so that the multimeric protein is ALB- The soluble protein or salt thereof according to any one of [44] to [56], which has a plurality of structural units represented by R'.
[58] the soluble protein is an antibody comprising a plurality of heavy chains;
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of heavy chains, such that the antibody is represented by ALBR'. The soluble protein or salt thereof according to any one of [44] to [57], which has a plurality of structural units of
[59] The soluble protein of [58] or a salt thereof, wherein the number of heavy chains is two.
[60] the portion generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is any one of a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue for a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue; The soluble protein or salt thereof according to any one of [44] to [59], which is a moiety produced by reaction of a reactive group specific to one side chain.
[61] the moiety generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is generated by the reaction between a lysine residue and a reactive group specific for the side chain of the lysine residue; A soluble protein or a salt thereof according to any one of [44] to [60].
[62] The moiety produced by the reaction is:
[63] The soluble protein or salt thereof of any one of [44] to [62], wherein the main chain connecting A and R' has 4 to 20 atoms.
[64] The soluble protein or salt thereof of any one of [44] to [53], wherein the main chain connecting A and R does not contain a ring structure.
[65] The soluble protein or salt thereof of any one of [44] to [64], wherein the partial structure represented by LB does not contain a peptide moiety.
[66] The compound represented by the formula (II) is the following (II'):
AB2-L'-B1-R'-T (II')
[In the formula,
A, R′ and T are the same as in formula (II) above L′ is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1 and B2 are the same or different and are (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group containing no bioorthogonal functional group;
B1 and B2 may have a symmetrical structure about L'. ], a soluble protein or a salt thereof according to any one of [44] to [65].
[67] The compound represented by the formula (II') is the following (II''):
A, R' and T are the same as those of formula (II) described in [44],
C is a cleavable moiety;
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different,
(i) a hydrogen atom, or a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is a hydrogen atom , or a monovalent hydrocarbon group);
(vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e -(R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group); or (vii) from the group consisting of a nitro group, a sulfate group, a sulfonate group, a cyano group, or a carboxyl group chosen,
Y and Y' are the same or different and are the same as Y in formula (B-1) described in [32],
Z and Z' are the same or different and are the same as Z in formula (B-1) above. ], the soluble protein of [66] or a salt thereof.
[68] the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between an antibody and a reactive group specific for the side chain of a lysine residue;
T is an antibody. ] and an antibody or salt thereof having a cleavable moiety, represented by an affinity substance for an antibody.
(可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法)
〔69〕可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔70〕可溶性タンパク質が抗体であり、反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔69〕の方法。
(Affinity Substance for Soluble Protein and Method for Producing Soluble Protein Having Cleavable Portion or Salt thereof)
[69] A method for producing a soluble protein having an affinity for a soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof,
Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound having an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof, is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. and a soluble protein or salt thereof having a cleavable moiety.
[70] The method of [69], wherein the soluble protein is an antibody and the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue.
第3に、本発明は、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩、およびその製造方法を提供する。
(可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩)
〔71〕下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩。
〔72〕可溶性タンパク質がモノクローナル抗体である、〔71〕の複合体またはその塩。
〔73〕可溶性タンパク質がIgG抗体である、〔71〕または〔72〕の複合体またはその塩。
〔74〕可溶性タンパク質がヒト由来である、〔71〕~〔73〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔75〕可溶性タンパク質が、下記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域タンパク質を含み、かつ抗原結合能を有する抗体である、〔71〕~〔74〕のいずれかの複合体またはその塩:
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
〔76〕可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、
A-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、〔71〕~〔75〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔77〕前記特定のアミノ酸残基が、特定の位置に存在する特定のアミノ酸を中心としてそれぞれN末端側およびC末端側に対してa個(ここで、aは、1~10の任意の整数である)のアミノ酸残基の遠隔位置までの領域において、前記特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基以外に、特定のアミノ酸残基と同種のアミノ酸残基を含まない、〔76〕の複合体またはその塩。
〔78〕前記可溶性タンパク質が、複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質であり、
Tが、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を有する結果、前記多量体タンパク質がA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を複数個有する、〔71〕~〔77〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔79〕前記可溶性タンパク質が、複数個の重鎖を含む抗体であり、
Tが、複数個の重鎖中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を有する結果、前記抗体がA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を複数個有する、〔71〕~〔78〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔80〕機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基が、ジスルフィド残基、アセタール残基、ケタール残基、エステル残基、カルバモイル残基、アルコキシアルキル残基、イミン残基、三級アルキルオキシカルバメート残基、シラン残基、ヒドラゾン含有残基、フォスフォルアミデート残基、アコニチル残基、トリチル残基、アゾ残基、ビシナルジオール残基、セレン残基、電子吸引基を有する芳香族環含有残基、クマリン含有残基、スルホン含有残基、不飽和結合含有鎖残基、グリコシル残基からなる群より選ばれる反応部分を含む2価の基である、〔71〕~〔79〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔81〕前記反応により生成する部分が、下記:
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、
(i)水素原子、またはハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれ、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔71〕~〔80〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔82〕可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分が、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基と、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基のいずれか一つの側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分である、〔71〕~〔81〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔83〕可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分が、リジン残基と
、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分である、〔71〕~〔82〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔84〕前記反応により生成する部分が、下記:
〔85〕機能性物質が薬物または標識物質である、〔71〕~〔84〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔86〕機能性物質が低分子化合物である、〔71〕~〔85〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔87〕薬物が抗癌剤である、〔85〕または〔86〕の複合体またはその塩。
〔88〕AおよびR’を連結する主鎖の原子数が4~20個である、〔71〕~〔87〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔89〕AおよびRを連結する主鎖が環構造を含まない、〔71〕~〔88〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔90〕L-Bで表される部分構造がペプチド部分を含まない、〔71〕~〔89〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔91〕前記式(III)で表される化合物が、下記式(III’):
A-B2’(-F2)-L’-B1’(-F1)-R’-T (III’)
〔式中、
A、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1’およびB2’は、同一または異なって、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
F1およびF2は、同一または異なって、機能性物質であり、
B1’(-F1)およびB2’(-F2)は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕で表される、〔71〕~〔90〕のいずれかの複合体またはその塩。
〔92〕前記式(III’)で表される化合物が、下記(III’’):
A、R’およびTは、〔71〕記載の式(III)のものと同じであり、
Cは、切断性部分であり、
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれ、
YおよびY’は、同一または異なって、〔32〕記載の式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
ZおよびZ’は、同一または異なって、前記式(B-1)のZと同じであり、
FおよびF’は、同一または異なって、機能性物質である。〕で表される、〔91〕の複合体またはその塩。
〔93〕下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、抗体と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、抗体である。〕で表される、親和性物質、機能性物質および抗体を有する複合体またはその塩。
Thirdly, the present invention provides a conjugate or a salt thereof having an affinity substance for soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein, and a method for producing the same.
(Complex or salt thereof having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety, functional substance and soluble protein)
[71] the following formula (III):
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein, or a salt thereof.
[72] the conjugate or salt thereof of [71], wherein the soluble protein is a monoclonal antibody;
[73] the conjugate or salt thereof of [71] or [72], wherein the soluble protein is an IgG antibody;
[74] The complex or salt thereof according to any one of [71] to [73], wherein the soluble protein is derived from humans.
[75] any one of [71] to [74], wherein the soluble protein comprises any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and is an antibody having antigen-binding ability: A complex of or salts thereof:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
[76] the soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid in a non-target region other than the target region; containing 5 or more residues,
The structural unit represented by ALB'(-F)-R' binds to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more. The complex or salt thereof according to any one of [71] to [75].
[77] the specific amino acid residue is a (where a is an arbitrary integer of 1 to 10 ) does not contain amino acid residues of the same kind as the specific amino acid residue other than the specific amino acid residue present at the specific position in the region to the remote position of the amino acid residue of [76] body or its salt.
[78] the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins;
T has a structural unit represented by ALB'(-F)-R' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of monomeric proteins. As a result, the multimeric protein is A The complex or salt thereof according to any one of [71] to [77], which has a plurality of structural units represented by -LB'(-F)-R'.
[79] the soluble protein is an antibody comprising a plurality of heavy chains;
T has a structural unit represented by ALB'(-F)-R' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of heavy chains, such that the antibody has ALB The complex or salt thereof according to any one of [71] to [78], having a plurality of structural units represented by '(-F)-R'.
[80] the divalent group containing the portion generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group is disulfide residue, acetal residue, ketal residue, ester residue, carbamoyl residue, alkoxy alkyl residues, imine residues, tertiary alkyloxycarbamate residues, silane residues, hydrazone-containing residues, phosphoramidate residues, aconityl residues, trityl residues, azo residues, vicinal diol residues, Bivalent containing a reactive moiety selected from the group consisting of selenium residues, aromatic ring-containing residues having electron withdrawing groups, coumarin-containing residues, sulfone-containing residues, unsaturated bond-containing chain residues, and glycosyl residues A complex or a salt thereof according to any one of [71] to [79], which is a group.
[81] The moiety produced by the reaction is:
multiple R 2a , multiple R 2b , and multiple R 2c are the same or different,
(i) a hydrogen atom, or a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is a hydrogen atom , or a monovalent hydrocarbon group);
(vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e -(R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group); or (vii) from the group consisting of a nitro group, a sulfate group, a sulfonate group, a cyano group, or a carboxyl group chosen,
J is —CH 2 —, —O—, or —S—;
r is any integer from 1 to 4,
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. ] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of any one of [71] to [80] or a salt thereof.
[82] the moiety generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is any one of a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue and a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue; The conjugate of any one of [71] to [81] or a salt thereof, which is a moiety produced by reaction with a reactive group specific for one side chain.
[83] the moiety generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is generated by the reaction between a lysine residue and a reactive group specific for the side chain of the lysine residue; A complex or a salt thereof according to any one of [71] to [82].
[84] The moiety produced by the reaction is:
[85] The conjugate or salt thereof of any one of [71] to [84], wherein the functional substance is a drug or labeling substance.
[86] The complex or salt thereof according to any one of [71] to [85], wherein the functional substance is a low-molecular-weight compound.
[87] the conjugate or salt thereof of [85] or [86], wherein the drug is an anticancer agent;
[88] The complex or salt thereof of any one of [71] to [87], wherein the main chain connecting A and R' has 4 to 20 atoms.
[89] The complex or salt thereof of any one of [71] to [88], wherein the main chain connecting A and R does not contain a ring structure.
[90] The complex or salt thereof of any one of [71] to [89], wherein the partial structure represented by LB does not contain a peptide moiety.
[91] The compound represented by the formula (III) is represented by the following formula (III'):
A-B2'(-F2)-L'-B1'(-F1)-R'-T (III')
[In the formula,
A, R' and T are the same as in formula (II) above;
L' is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1' and B2' are the same or different and are divalent groups comprising moieties generated by reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F1 and F2 are the same or different and are functional substances;
B1' (-F1) and B2' (-F2) may have a symmetrical structure about L'. ], the complex or a salt thereof according to any one of [71] to [90].
[92] The compound represented by the formula (III') is the following (III''):
A, R' and T are the same as those of formula (III) described in [71],
C is a cleavable moiety;
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different and are selected from the group consisting of (i) to (vii);
Y and Y' are the same or different and are a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in formula (B-1) described in [32],
Z and Z' are the same or different and are the same as Z in the formula (B-1);
F and F' are the same or different and are functional substances. ], the complex of [91] or a salt thereof.
[93] the following formula (III):
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between an antibody and a reactive group specific for the side chain of a lysine residue;
T is an antibody. ], a complex having an affinity substance, a functional substance and an antibody or a salt thereof.
(可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の製造方法)
〔94〕可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の製造方法であって、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
A、L、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成することを含む、方法。
〔95〕可溶性タンパク質が抗体であり、反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔94〕の方法。
〔96〕可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
AおよびLは、前記式(I)のものと同じであり、
R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成することを含む、方法。
(Method for producing complex or salt thereof having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety, functional substance and soluble protein)
[94] A method for producing a complex or a salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A, L, R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], a conjugate having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein, or a salt thereof.
[95] The method of [94], wherein the soluble protein is an antibody, and the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue.
[96] A method for producing a complex or a salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], the compound or its salt is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. and (B) an affinity substance for said soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or reacting the salt with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A and L are the same as in formula (I) above;
R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group comprising a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], a conjugate having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein, or a salt thereof.
第4に、本発明は、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質の製造方法を提供する。
〔97〕生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔98〕Lが、(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー、または(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーである、〔97〕の方法。
〔99〕Lが前記(i)の切断性リンカーであり、
L1が、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基であり、
Bが、前記(a)または(b)の2価の基である、〔98〕の方法。
〔100〕Lが前記(i)の切断性リンカーであり、
L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基であり、
Bが前記(b)の2価の基である、〔98〕または〔99〕の方法。
〔101〕Lが前記(ii)の切断性リンカーであり、
L1が(i’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bが前記(a)の2価の基である、〔98〕の方法。
〔102〕可溶性タンパク質が抗体であり、反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔97〕~〔101〕のいずれか一項記載の方法。
〔103〕生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
Fourth, the present invention provides methods for producing soluble proteins with bioorthogonal functional groups.
[97] A method for producing a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof, comprising:
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], cleaving the cleavable portion of a soluble protein having an affinity for soluble proteins and a soluble protein having a cleavable portion or a salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] or a salt thereof having a bioorthogonal functional group.
[98] L is (i) a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety capable of generating a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group upon cleavage, or (ii) a bioorthogonal The method of [97], wherein the cleavable linker is a divalent group containing a cleavable moiety that does not have the ability to generate a functional group on the side of the reactive group.
[99] L is the cleavable linker of (i) above;
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group;
The method of [98], wherein B is the divalent group of (a) or (b).
[100] L is the cleavable linker of (i);
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group;
The method of [98] or [99], wherein B is the divalent group of (b).
[101] L is the cleavable linker of (ii);
L1 is (i′) a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group;
The method of [98], wherein B is the divalent group of (a) above.
[102] the method of any one of [97] to [101], wherein the soluble protein is an antibody, and the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue;
[103] A method for producing a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof, comprising:
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], the compound or its salt is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. and (B) an affinity substance for said soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or cutting the cleavable portion of the salt,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] or a salt thereof having a bioorthogonal functional group.
第5に、本発明は、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。
〔104〕機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、あるいは
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、
下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔105〕前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む方法である、〔104〕の方法。
〔106〕前記生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種の機能性物質と反応させて、
下記式(V2):
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む方法である、〔104〕の方法。
〔107〕可溶性タンパク質が抗体であり、反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔104〕~〔106〕のいずれかの方法。
〔108〕機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
A、L、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔109〕機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク
質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
AおよびLは、前記式(I)のものと同じであり、
R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること、ならびに
(C)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔110〕機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種以上の機能性物質と反応させて、
下記式(V2)
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔111〕機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(C)前記生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種以上の機能性物質と反応させて、
下記式(V2)
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
Fifthly, the present invention provides a method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[104] A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], or cleaving the cleavable portion of a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein or a salt thereof, or the following formula (IV):
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], by reacting a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with a functional substance,
Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[105] cleaving the cleavable portion of the complex having the affinity substance for the soluble protein, the cleavable portion, the functional substance and the soluble protein or a salt thereof,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ], which comprises producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[106] reacting the soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with one or two functional substances,
The following formula (V2):
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ], which comprises producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[107] the method of any one of [104] to [106], wherein the soluble protein is an antibody and the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue;
[108] A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A, L, R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and (B) the affinity substance for the soluble protein, the cleavable moiety , cleaving a cleavable portion of a complex having a functional agent and a soluble protein or a salt thereof,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[109] A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound having an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof, is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], and producing a soluble protein or a salt thereof having a cleavable moiety,
(B) reacting an affinity substance for the soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A and L are the same as in formula (I) above;
R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and (C) the affinity substance for the soluble protein, the cleavable moiety , cleaving a cleavable portion of a complex having a functional agent and a soluble protein or a salt thereof,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[110] A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], cleaving the cleavable portion of a soluble protein having an affinity for soluble proteins and a soluble protein having a cleavable portion or a salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ], and (B) the soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof represented by one or more functions by reacting with a substance,
The following formula (V2)
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
[111] A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], the compound or its salt is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], and producing a soluble protein or a salt thereof having a cleavable moiety,
(B) cleaving a cleavable portion of a soluble protein having an affinity for said soluble protein and a soluble protein having a cleavable portion or a salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. and (C) the soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof represented by one or more functions by reacting with a substance,
The following formula (V2)
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
第6に、本発明は、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、およびその製造方法を提供する。
(生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩)
〔1〕生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であって、
可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ
生体直交性官能基が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔2〕下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔3〕可溶性タンパク質がモノクローナル抗体である、〔1〕または〔2〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔4〕可溶性タンパク質がIgG抗体である、〔1〕~〔3〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔5〕可溶性タンパク質がヒト由来である、〔1〕~〔4〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔6〕可溶性タンパク質が、下記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域タンパク質を含み、かつ抗原結合能を有する抗体である、〔1〕~〔5〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩:
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
〔7〕前記標的領域が、連続する1~10個のアミノ酸残基からなる領域である、〔1〕~〔6〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔8〕前記標的領域が、連続する1~3個のアミノ酸残基からなる領域である、〔1〕~〔7〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔9〕前記標的領域が、(a)ヒトIgG Fc領域における246~248位のアミノ酸残基からなる領域、(b)ヒトIgG Fc領域における288~290位のアミノ酸残基からなる領域、または(c)ヒトIgG Fc領域における317位のアミノ酸残基からなる領域である、〔8〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔10〕前記位置選択性が50%以上である、〔1〕~〔9〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔11〕前記位置選択性が70%以上である、〔10〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔12〕前記位置選択性が90%以上である、〔11〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔13〕前記特定のアミノ酸残基が、特定の位置に存在する特定のアミノ酸を中心としてそれぞれN末端側およびC末端側に対してa個(ここで、aは、1~10の任意の整数である)のアミノ酸残基の遠隔位置までの領域において、前記特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基以外に、特定のアミノ酸残基と同種のアミノ酸残基を含まない、〔1〕~〔12〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔14〕前記可溶性タンパク質が、複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質であり、
多量体タンパク質に含まれる複数の単量体タンパク質中の前記位置に存在する複数の特定のアミノ酸残基において生体直交性官能基を有する結果、前記多量体タンパク質が複数の生体直交性官能基を有する、〔1〕、〔3〕~〔13〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔15〕前記可溶性タンパク質が、複数の重鎖を含む抗体であり、
抗体に含まれる複数の重鎖中の前記位置に存在する複数の特定のアミノ酸残基において生体直交性官能基を有する結果、抗体が複数の生体直交性官能基を有する、〔1〕、〔3〕~〔14〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔16〕前記可溶性タンパク質が、複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質であり、
Tが、複数の単量体タンパク質中の対応する複数の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、多量体タンパク質がA-L-B-R’で表される構造単位を複数有する、〔2〕~〔13〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔17〕前記可溶性タンパク質が、複数の重鎖を含む抗体であり、
Tが、複数の重鎖中の対応する複数の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、抗体がA-L-B-R’で表される構造単位を複数有する、〔2〕~〔13〕、〔16〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔18〕重鎖の個数が2個である、〔15〕または〔17〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔19〕L1が、下記式(L1-1)~(L1-2):
C1-Lb (L1-1)
C1 (L1-2)
〔式中、
Lbは、2価の基であり、
C1は、生体直交性官能基、または生体直交性官能基以外の基である。〕のいずれか一つで表される、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔18〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔20〕前記Lbが、下記式(Lb’):
pは、0~10の任意の整数であり、
qは、0~10の任意の整数であり、
Xは、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在しない)であり、
R1a、およびR1bは、同一または異なって、水素原子、または上述する置換基からなる群より選ばれる。
○(白丸)は、C1に対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。〕で表される、〔19〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔21〕生体直交性官能基を含む2価の基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を主鎖に含む2価の基である、〔1〕~〔20〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔22〕生体直交性官能基を含む2価の基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を側鎖に含む2価の基である、〔1〕~〔20〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔23〕生体直交性官能基が、下記:
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)で表されるいずれか一つである、〔1〕~〔22〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔24〕前記(b)の2価の基が、置換されていてもよいアルキレン、置換されていてもよいシクロアルキレン、置換されていてもよいアリール、置換されていてもよい2価の複素環基、-NRa-(Raは水素原子、または置換基を示す)、-O-、またはこれらの2以上の組み合わせからなる群より選ばれる、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔23〕のいずれかの化合物またはその塩。
〔25〕Bが、下記式(B-1):
Yは、-NH-、-O-、-CH2-、または下記式(B-2):
VおよびV’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
V1は、生体直交性官能基を含む2価の基であり、
sは、0~10の任意の整数であり、
式(B-2)における○および●は、それぞれ、式(B-1)における○および●と同じ配向である。)であり、
Zは、酸素原子、硫黄原子、または水素原子(Zが水素原子である場合、-C(=Z)-は、-CH2-を示す。)であり、
式(B-1)における○(白丸)は、L側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はR側の部分に対する結合を示す。〕で表される、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔24〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔26〕生体直交性官能基が、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基のいずれか一つの側鎖を介して可溶性タンパク質に結合している、〔1〕~〔25〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔27〕生体直交性官能基が、リジン残基の側鎖を介して可溶性タンパク質に結合している、〔26〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔28〕反応性基が、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基のいずれか一つの側鎖に対して特異的な反応性基である、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔26〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔29〕反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔28〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔30〕反応性基が、下記:
R5aおよびR5cは、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子または基であり、
R5bは、電子吸引基であり、
jは、1~5の任意の整数であり、
kは、1~4の任意の整数である。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔29〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔31〕生体直交性官能基および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖の原子数が2~10個であるリンカーを介して生体直交性官能基が可溶性タンパク質に結合している、〔1〕~〔30〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔32〕生体直交性官能基および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖が環構造を含まないリンカーを介して生体直交性官能基が可溶性タンパク質に結合している、〔1〕~〔31〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔33〕L1末端部分およびR’を連結する主鎖の原子数が2~10個である、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔32〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔34〕AおよびRを連結する主鎖が環構造を含まない、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔33〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔35〕L1-Bで表される部分構造がペプチド部分を含まない、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔34〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔36〕前記式(IV)で表される可溶性タンパク質が、下記(IV’):
C1は、生体直交性官能基、または生体直交性官能基以外の基である。
p、q、X、R1aおよびR1bは、前記式(Lb’)のものと同じであり、
YおよびZは、前記のものと同じであり、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じである。〕で表される、〔2〕~〔13〕、〔16〕~〔35〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔37〕生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であって
、
可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ
生体直交性官能基が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合しており、
生体直交性官能基がリジン残基の側鎖を介して可溶性タンパク質に結合しており、
可溶性タンパク質が、複数の重鎖を含む抗体であり、
抗体に含まれる複数の重鎖中の前記位置に存在する複数の特定のアミノ酸残基において生体直交性官能基を有する結果、抗体が複数の生体直交性官能基を有する、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔38〕下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、抗体と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
Sixthly, the present invention provides a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group, and a method for producing the same.
(Soluble protein or salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group)
[1] A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
[2] Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
[3] The soluble protein of [1] or [2] or a salt thereof, wherein the soluble protein is a monoclonal antibody.
[4] The soluble protein of [1] to [3] or a salt thereof, wherein the soluble protein is an IgG antibody.
[5] The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [4], wherein the soluble protein is of human origin.
[6] any one of [1] to [5], wherein the soluble protein comprises any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and is an antibody having antigen-binding ability: Soluble protein or salt thereof:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
[7] The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [6], wherein the target region is a region consisting of 1 to 10 consecutive amino acid residues.
[8] The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [7], wherein the target region is a region consisting of 1 to 3 consecutive amino acid residues.
[9] the target region is (a) a region consisting of amino acid residues at positions 246-248 in the human IgG Fc region, (b) a region consisting of amino acid residues at positions 288-290 in the human IgG Fc region, or ( c) The soluble protein of [8], which is a region consisting of amino acid residues at position 317 in the human IgG Fc region, or a salt thereof.
[10] The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [9], wherein the regioselectivity is 50% or more.
[11] The soluble protein or salt thereof of [10], wherein the regioselectivity is 70% or more.
[12] The soluble protein or salt thereof of [11], wherein the regioselectivity is 90% or more.
[13] the specific amino acid residue is a (where a is an arbitrary integer of 1 to 10 ) does not contain amino acid residues of the same type as the specific amino acid residue other than the specific amino acid residue present at the specific position in the region up to the remote position of the amino acid residue of [1] to [ 12] any soluble protein or a salt thereof.
[14] the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins,
Having a bioorthogonal functional group at a plurality of specific amino acid residues present at the positions in a plurality of monomeric proteins contained in the multimeric protein results in the multimeric protein having a plurality of bioorthogonal functional groups. , [1], [3] to [13] or a soluble protein or a salt thereof.
[15] the soluble protein is an antibody comprising a plurality of heavy chains;
[1], [3], wherein the antibody has a plurality of bioorthogonal functional groups as a result of having bioorthogonal functional groups at a plurality of specific amino acid residues present at the positions in the plurality of heavy chains contained in the antibody; ] to [14] any soluble protein or a salt thereof.
[16] the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins,
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of monomeric proteins, resulting in a multimeric protein represented by ALBR' A soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [13], having a plurality of structural units represented.
[17] the soluble protein is an antibody comprising a plurality of heavy chains;
T has structural units represented by ALBR' in corresponding multiple target regions in multiple heavy chains, resulting in an antibody having a structure represented by ALBR' A soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16], which has multiple units.
[18] The soluble protein of [15] or [17], which has two heavy chains, or a salt thereof.
[19] L1 is represented by the following formulas (L1-1) to (L1-2):
C1-Lb (L1-1)
C1 (L1-2)
[In the formula,
Lb is a divalent group,
C1 is a bioorthogonal functional group or a group other than a bioorthogonal functional group. ], the soluble protein of any one of [2] to [13] and [16] to [18] or a salt thereof.
[20] Lb is represented by the following formula (Lb'):
p is any integer from 0 to 10,
q is any integer from 0 to 10,
X is a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent; when X is a single bond, R 1a and R 1b are absent);
R 1a and R 1b are the same or different and are selected from the group consisting of a hydrogen atom or the substituents described above.
O (white circle) indicates binding to C1 and ● (filled circle) indicates binding to B. ], the soluble protein of [19] or a salt thereof.
[21] the bivalent group containing a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a tetrazine residue, a nitrone residue, a hydroxylamine residue, a nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, thioester group, α-halocarbonyl residue, isonitrile residue The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [20], which is a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of groups, sydnon residues and selenium residues in its main chain.
[22] the bivalent group containing a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a halogen residue, a tetrazine residue, a nitrone residue, hydroxylamine; residue, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, α-halocarbonyl residue, isonitrile The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [20], which is a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of residues, sydnon residues and selenium residues in its side chain.
[23] the bioorthogonal functional group is:
R 1f , single or multiple R 1g and single or multiple R 1h are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii), or electron-withdrawing groups;
・ is a bond. ), the soluble protein or a salt thereof according to any one of [1] to [22].
[24] The divalent group (b) is optionally substituted alkylene, optionally substituted cycloalkylene, optionally substituted aryl, or optionally substituted bivalent heterocyclic ring group, -NR a - (R a represents a hydrogen atom or a substituent), -O-, or selected from the group consisting of a combination of two or more thereof [2] to [13], [16] to The compound of [23] or a salt thereof.
[25] B is the following formula (B-1):
Y is -NH-, -O-, -CH 2 -, or the following formula (B-2):
V and V′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
V is a divalent group containing a bioorthogonal functional group;
s is any integer from 0 to 10,
○ and ● in formula (B-2) have the same orientations as ○ and ● in formula (B-1), respectively. ) and
Z is an oxygen atom, a sulfur atom, or a hydrogen atom (when Z is a hydrogen atom, -C(=Z)- represents -CH 2 -);
○ (white circle) in formula (B-1) indicates a bond to the L-side portion, and ● (black circle) indicates a bond to the R-side portion. ], a soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16] to [24].
[26] any one of [1] to [25], wherein the bioorthogonal functional group is bound to a soluble protein via a side chain of any one of a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue; soluble protein or a salt thereof.
[27] The soluble protein of [26] or a salt thereof, wherein the bioorthogonal functional group is bound to the soluble protein via a side chain of a lysine residue.
[28] the reactive group is a reactive group specific to any one side chain of a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue, [2] to [13], [16] The soluble protein or salt thereof according to any one of ~[26].
[29] The soluble protein or salt thereof of any one of [2] to [13] and [16] to [28], wherein the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue .
[30] the reactive group is:
R 5a and R 5c are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii);
R 5b is an electron withdrawing group,
j is any integer from 1 to 5;
k is any integer from 1 to 4. A soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16] to [29] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of ].
[31] the bioorthogonal functional group is bound to the soluble protein via a linker having a main chain of 2 to 10 atoms that connects the bioorthogonal functional group and the side chain of a specific amino acid residue; A soluble protein or a salt thereof according to any one of [1] to [30].
[32] The bioorthogonal functional group is bound to a soluble protein via a linker in which the main chain connecting the bioorthogonal functional group and the side chain of a specific amino acid residue does not contain a ring structure, [1]- [31] Any soluble protein or salt thereof.
[33] The soluble protein or salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16] to [32], wherein the main chain connecting the L1 terminal portion and R' has 2 to 10 atoms.
[34] The soluble protein or salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16] to [33], wherein the main chain connecting A and R does not contain a ring structure.
[35] The soluble protein or salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16] to [34], wherein the partial structure represented by L1-B does not contain a peptide moiety.
[36] The soluble protein represented by the formula (IV) is the following (IV'):
C1 is a bioorthogonal functional group or a group other than a bioorthogonal functional group.
p, q, X, R 1a and R 1b are the same as in formula (Lb′) above;
Y and Z are the same as above;
R' and T are the same as in formula (IV) above. ], a soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [13] and [16] to [35].
[37] A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
bioorthogonal functional groups are attached to soluble proteins through the side chains of lysine residues,
the soluble protein is an antibody comprising multiple heavy chains;
A bioorthogonal functional group in which the antibody has a plurality of bioorthogonal functional groups as a result of having a bioorthogonal functional group at a plurality of specific amino acid residues present at the positions in the plurality of heavy chains contained in the antibody. A soluble protein having regioselectivity or a salt thereof.
[38] Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between an antibody and a reactive group specific for the side chain of a lysine residue;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
(生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法)
本発明はまた、上記〔1〕~〔38〕の可溶性タンパク質のうち、式(IV)またはその下位の式による特定を要する、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。
〔39〕生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表され、かつ
L1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
(Method for producing soluble protein or salt thereof regioselectively having bioorthogonal functional group)
The present invention also provides a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group, which requires specification by formula (IV) or subordinate formulas thereof, among the soluble proteins [1] to [38] above. A manufacturing method is provided.
[39] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group, comprising:
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A method comprising producing a soluble protein or salt thereof regioselectively having an attached bioorthogonal functional group.
好ましくは、上記〔39〕の方法は、以下であってもよい。
〔40〕可溶性タンパク質が抗体であり、反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔39〕の方法。
〔41〕生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質(ここで、可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。)と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表され、かつ
L1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表され、かつ
L1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
Preferably, the method of [39] above may be as follows.
[40] The method of [39], wherein the soluble protein is an antibody, and the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue.
[41] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group, comprising:
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ] A compound or a salt thereof represented by a soluble protein (here, the soluble protein contains one or more specific amino acid residues in the target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and containing 5 or more of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region),
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein Generating a soluble protein or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein and a cleavable moiety attached thereto, and (B) having an affinity substance for said soluble protein and a cleavable moiety cleaving a cleavable portion of the soluble protein or salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A method comprising producing a soluble protein or salt thereof regioselectively having an attached bioorthogonal functional group.
第7に、本発明は、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、およびその製造方法を提供する。
(機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩)
〔1〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であって、
可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ
機能性物質が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔2〕下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつ
F-(L1-B)’-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔3〕前記可溶性タンパク質またはその塩が、下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1、F、R’およびTは、前記式(V)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基である。〕で表され、かつL1-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩である、〔2〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔4〕前記可溶性タンパク質またはその塩が、下記式(V2):
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
F、B、R’およびTは、前記式(V)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基である。〕で表され、かつF-L1’-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、あるいは
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(V)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表され、かつFa-L1’-B’(-Fb)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であるである、〔2〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔5〕の可溶性タンパク質がモノクローナル抗体である、〔1〕~〔4〕のいずれかの可溶タンパク質またはその塩。
〔6〕可溶性タンパク質がIgG抗体である、〔1〕~〔5〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔7〕可溶性タンパク質がヒト由来である、〔1〕~〔6〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔8〕可溶性タンパク質が、下記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域タンパク質を含み、かつ抗原結合能を有する抗体である、〔1〕~〔7〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩:
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
〔9〕前記標的領域が、連続する1~10個のアミノ酸残基からなる領域である、〔1〕~〔8〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔10〕前記標的領域が、連続する1~3個のアミノ酸残基からなる領域である、〔9〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔11〕前記標的領域が、(a)ヒトIgG Fc領域における246~248位のアミノ酸残基からなる領域、(b)ヒトIgG Fc領域における288~290位のアミノ酸残基からなる領域、または(c)ヒトIgG Fc領域における317位のアミノ酸残基からなる領域である、〔10〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔12〕前記位置選択性が50%以上である、〔1〕~〔11〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔13〕前記位置選択性が70%以上である、〔12〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔14〕前記位置選択性が90%以上である、〔13〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔15〕前記特定のアミノ酸残基が、特定の位置に存在する特定のアミノ酸を中心としてそれぞれN末端側およびC末端側に対してa個(ここで、aは、1~10の任意の整数である)のアミノ酸残基の遠隔位置までの領域において、前記特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基以外に、特定のアミノ酸残基と同種のアミノ酸残基を含まない、〔1〕~〔14〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔16〕前記可溶性タンパク質が、複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質であり、
多量体タンパク質に含まれる複数の単量体タンパク質中の前記位置に存在する複数の特定のアミノ酸残基において機能性物質を有する結果、前記多量体タンパク質が複数の機能性物質を有する、〔1〕、〔5〕~〔15〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔17〕前記可溶性タンパク質が、複数の重鎖を含む抗体であり、
抗体に含まれる複数の重鎖中の前記位置に存在する複数の特定のアミノ酸残基において機能性物質を有する結果、抗体が複数の機能性物質を有する、〔1〕、〔5〕~〔16〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔18〕前記可溶性タンパク質が、複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質であり、
Tが、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、前記多量体タンパク質がA-L-B-R’で表される構造単位を複数個有する、〔2〕~〔15〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔19〕前記可溶性タンパク質が、複数個の重鎖を含む抗体であり、
Tが、複数個の重鎖中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、前記抗体がA-L-B-R’で表される構造単位を複数個有する、〔2〕~〔15〕、〔18〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔20〕重鎖の個数が2個である、〔17〕または〔19〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔21〕L1が、下記式(L1-1)~(L1-2):
C1-Lb (L1-1)
C1 (L1-2)
〔式中、
Lbは、2価の基であり、
C1は、生体直交性官能基、または生体直交性官能基以外の基である。〕のいずれか一つで表される、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔20〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔22〕前記Lbが、下記式(Lb’):
pは、0~10の任意の整数であり、
qは、0~10の任意の整数であり、
Xは、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在しない)であり、
R1a、およびR1bは、同一または異なって、水素原子、または上述する置換基からなる群より選ばれる。
○(白丸)は、C1に対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。〕で表される、〔21〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔23〕生体直交性官能基を含む2価の基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を主鎖に含む2価の基である、〔1〕~〔22〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔24〕生体直交性官能基を含む2価の基が、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる
群より選ばれる生体直交性官能基を側鎖に含む2価の基である、〔1〕~〔22〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔25〕生体直交性官能基が、下記:
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)で表されるいずれか一つである、〔1〕~〔24〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔26〕前記(b)の2価の基が、置換されていてもよいアルキレン、置換されていてもよいシクロアルキレン、置換されていてもよいアリール、置換されていてもよい2価の複素環基、-NRa-(Raは水素原子、または置換基を示す)、-O-、またはこれらの2以上の組み合わせからなる群より選ばれる、〔1〕~〔25〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔27〕Bが、下記式(B-1):
Yは、-NH-、-O-、-CH2-、または下記式(B-2):
VおよびV’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
V1は、生体直交性官能基を含む2価の基であり、
sは、0~10の任意の整数であり、
式(B-2)における○および●は、それぞれ、式(B-1)における○および●と同じ配向である。)であり、
Zは、酸素原子、硫黄原子、または水素原子(Zが水素原子である場合、-C(=Z)-は、-CH2-を示す。)であり、
式(B-1)における○(白丸)は、L側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はR側の部分に対する結合を示す。〕で表される、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔26〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔28〕反応性基が、リジン残基、チロシン残基、またはトリプトファン残基のいずれか一つの側鎖に対して特異的な反応性基である、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔27〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔29〕反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔28〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔30〕反応性基が、下記:
R5aおよびR5cは、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子または基であり、
R5bは、電子吸引基であり、
jは、1~5の任意の整数であり、
kは、1~4の任意の整数である。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔29〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔31〕機能性物質および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖の原子数が2~10個であるリンカーを介して生体直交性官能基が可溶性タンパク質に結合している、〔1〕~〔30〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔32〕機能性物質および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖が環構造を含まないリンカーを介して生体直交性官能基が可溶性タンパク質に結合している、〔1〕~〔31〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔33〕L1末端部分およびR’を連結する主鎖の原子数が2~10個である、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔32〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔34〕AおよびRを連結する主鎖が環構造を含まない、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔33〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔35〕L1-Bで表される部分構造がペプチド部分を含まない、〔2〕~〔15〕、〔
18〕~〔34〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔36〕前記式(V1)、(V2)および(V3)で表される、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩が、それぞれ、下記(V1’)、(V2’)および(V3’):
C1は、生体直交性官能基、または生体直交性官能基以外の基である。
p、q、X、R1aおよびR1bは、前記式(Lb’)のものと同じであり、
Y’は、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
Zは、前記式(B-1)のものと同じであり、
F、R’およびTは、前記式(V)のものと同じである。〕、
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分である。
p、q、X、R1aおよびR1bは、前記式(Lb’)のものと同じであり、
YおよびZは、前記式(B-1)のものと同じであり、
F、R’およびTは、前記式(V)のものと同じである。〕、あるいは
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分である。
p、q、X、R1aおよびR1bは、前記式(Lb’)のものと同じであり、
Y’は、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
Zは、前記式(B-1)のものと同じであり、
FaおよびFbは、同一または異なる機能性物質であり、
R’およびTは、前記式(V)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩である、〔2〕~〔15〕、〔18〕~〔35〕のいずれかの可溶性タンパク質またはその塩。
〔37〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であって、
可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ
機能性物質が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合しており、
機能性物質がリジン残基の側鎖を介して可溶性タンパク質に結合しており、
可溶性タンパク質が、複数の重鎖を含む抗体であり、
抗体に含まれる複数の重鎖中の前記位置に存在する複数の特定のアミノ酸残基において機能性物質を有する結果、抗体が複数の機能性物質を有する、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔38〕下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、抗体のリジン残基と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、抗体であり、
抗体は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつF-(L1-B)’-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。
〔39〕前記可溶性タンパク質またはその塩が、下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1、F、R’およびTは、前記式(V)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基である。〕で表され、かつL1-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩である、〔38〕の可溶性タンパク質またはその塩。
〔40〕前記可溶性タンパク質またはその塩が、下記式(V2):
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
F、B、R’およびTは、前記式(V)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基である。〕で表され、かつF-L1’-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、あるいは
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(V)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表され、かつFa-L1’-B’(-Fb)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標
的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩である、〔38〕の可溶性タンパク質またはその塩。
Seventhly, the present invention provides a soluble protein or a salt thereof that regioselectively has a functional substance, and a method for producing the same.
(Soluble protein or its salt having a functional substance regioselectively)
[1] A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
[2] Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
[3] the soluble protein or a salt thereof represented by the following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1, F, R' and T are the same as in formula (V) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-B'(-F)-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein The soluble protein or its salt of [2], which is a soluble protein or its salt that regioselectively has a functional substance bound with the regioselectivity of
[4] the soluble protein or a salt thereof represented by the following formula (V2):
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
F, B, R' and T are the same as in formula (V) above;
L1' is a divalent group that includes a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group that includes a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by FL1′-BR′ is located at 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein or a salt thereof regioselectively bound to a functional substance, or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (V) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ] and a structural unit represented by Fa-L1′-B′(-Fb)-R′ for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein The soluble protein or salt thereof of [2], which is a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance bound with a regioselectivity of 30% or more.
The soluble protein of any one of [1] to [4] or a salt thereof, wherein the soluble protein of [5] is a monoclonal antibody.
[6] The soluble protein of any one of [1] to [5], wherein the soluble protein is an IgG antibody, or a salt thereof.
[7] The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [6], wherein the soluble protein is human-derived.
[8] any one of [1] to [7], wherein the soluble protein comprises any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and is an antibody having antigen-binding ability: Soluble protein or salt thereof:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
[9] The soluble protein or salt thereof of [1] to [8], wherein the target region is a region consisting of 1 to 10 consecutive amino acid residues.
[10] The soluble protein or salt thereof of [9], wherein the target region is a region consisting of 1 to 3 consecutive amino acid residues.
[11] The target region is (a) a region consisting of amino acid residues at positions 246-248 in the human IgG Fc region, (b) a region consisting of amino acid residues at positions 288-290 in the human IgG Fc region, or ( c) The soluble protein of [10] or a salt thereof, which is a region consisting of amino acid residues at position 317 in the human IgG Fc region.
[12] The soluble protein or salt thereof of [1] to [11], wherein the regioselectivity is 50% or more.
[13] The soluble protein or salt thereof of [12], wherein the regioselectivity is 70% or more.
[14] The soluble protein or salt thereof of [13], wherein the regioselectivity is 90% or more.
[15] the specific amino acid residue is a (where a is an arbitrary integer of 1 to 10 ) does not contain amino acid residues of the same type as the specific amino acid residue other than the specific amino acid residue present at the specific position in the region up to the remote position of the amino acid residue of [1] to [ 14] soluble protein or a salt thereof.
[16] the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins,
The multimeric protein has a plurality of functional substances as a result of having a functional substance at a plurality of specific amino acid residues present at the positions in a plurality of monomer proteins contained in the multimeric protein [1] , the soluble protein or a salt thereof according to any one of [5] to [15].
[17] the soluble protein is an antibody comprising a plurality of heavy chains;
[1], [5] to [16], wherein the antibody has a plurality of functional substances as a result of having a functional substance at a plurality of specific amino acid residues present at the positions in the plurality of heavy chains contained in the antibody. ] or a salt thereof.
[18] the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins,
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of monomeric proteins, so that the multimeric protein is ALB- A soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [15], having a plurality of structural units represented by R'.
[19] the soluble protein is an antibody comprising a plurality of heavy chains;
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of heavy chains, such that the antibody is represented by ALBR'. a soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [15] and [18], which has a plurality of structural units of
[20] The soluble protein of [17] or [19], which has two heavy chains, or a salt thereof.
[21] L1 is represented by the following formulas (L1-1) to (L1-2):
C1-Lb (L1-1)
C1 (L1-2)
[In the formula,
Lb is a divalent group,
C1 is a bioorthogonal functional group or a group other than a bioorthogonal functional group. ], the soluble protein of any one of [2] to [15] and [18] to [20] or a salt thereof.
[22] Lb is represented by the following formula (Lb'):
p is any integer from 0 to 10,
q is any integer from 0 to 10,
X is a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent; when X is a single bond, R 1a and R 1b are absent);
R 1a and R 1b are the same or different and are selected from the group consisting of a hydrogen atom or the substituents described above.
O (white circle) indicates binding to C1 and ● (filled circle) indicates binding to B. ], the soluble protein of [21] or a salt thereof.
[23] the bivalent group containing a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a tetrazine residue, a nitrone residue, a hydroxylamine residue, a nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, thioester group, α-halocarbonyl residue, isonitrile residue The soluble protein or a salt thereof according to any one of [1] to [22], which is a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of groups, sydnon residues, and selenium residues in its main chain.
[24] the bivalent group containing a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a halogen residue, a tetrazine residue, a nitrone residue, hydroxylamine; residue, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, α-halocarbonyl residue, isonitrile The soluble protein or salt thereof according to any one of [1] to [22], which is a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of a residue, a sydnon residue and a selenium residue in its side chain.
[25] The bioorthogonal functional group is:
R 1f , single or multiple R 1g and single or multiple R 1h are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii), or electron-withdrawing groups;
・ is a bond. ), the soluble protein or a salt thereof according to any one of [1] to [24].
[26] The divalent group (b) is optionally substituted alkylene, optionally substituted cycloalkylene, optionally substituted aryl, or optionally substituted divalent heterocyclic ring soluble of any of [1] to [25] selected from the group consisting of a group, -NR a - (R a represents a hydrogen atom or a substituent), -O-, or a combination of two or more thereof protein or its salt.
[27] B is the following formula (B-1):
Y is -NH-, -O-, -CH 2 -, or the following formula (B-2):
V and V′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
V is a divalent group containing a bioorthogonal functional group;
s is any integer from 0 to 10,
○ and ● in formula (B-2) have the same orientations as ○ and ● in formula (B-1), respectively. ) and
Z is an oxygen atom, a sulfur atom, or a hydrogen atom (when Z is a hydrogen atom, -C(=Z)- represents -CH 2 -);
○ (white circle) in formula (B-1) indicates a bond to the L-side portion, and ● (black circle) indicates a bond to the R-side portion. ], a soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [15] and [18] to [26].
[28] the reactive group is a reactive group specific to any one side chain of a lysine residue, a tyrosine residue, or a tryptophan residue, [2] to [15], [18] The soluble protein or salt thereof according to any one of ~[27].
[29] The soluble protein of any one of [2] to [15] and [18] to [28], wherein the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue, or a salt thereof .
[30] the reactive group is:
R 5a and R 5c are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii);
R 5b is an electron withdrawing group,
j is any integer from 1 to 5;
k is any integer from 1 to 4. A soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [15] and [18] to [29] corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of ].
[31] A bioorthogonal functional group is bound to a soluble protein via a linker having a main chain of 2 to 10 atoms that connects the functional substance and the side chain of a specific amino acid residue, [1 ] to [30] any soluble protein or a salt thereof.
[32] The bioorthogonal functional group is bound to the soluble protein via a linker in which the main chain connecting the functional substance and the side chain of a specific amino acid residue does not contain a ring structure, [1] to [31] ] or a salt thereof.
[33] The soluble protein or salt thereof according to any one of [2] to [15] and [18] to [32], wherein the main chain connecting the L1 terminal portion and R' has 2 to 10 atoms.
[34] The soluble protein or salt thereof according to any one of [2] to [15] and [18] to [33], wherein the main chain connecting A and R does not contain a ring structure.
[35] the partial structure represented by L1-B does not contain a peptide moiety, [2] to [15], [
18] to [34] any one of the soluble protein or a salt thereof.
[36] The soluble proteins or salts thereof regioselectively having a functional substance represented by the formulas (V1), (V2) and (V3) are the following (V1′), (V2′) and (V3'):
C1 is a bioorthogonal functional group or a group other than a bioorthogonal functional group.
p, q, X, R 1a and R 1b are the same as in formula (Lb′) above;
Y' is a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the formula (B-1),
Z is the same as in formula (B-1) above,
F, R' and T are the same as in formula (V) above. ],
C1' is the moiety generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group.
p, q, X, R 1a and R 1b are the same as in formula (Lb′) above;
Y and Z are the same as in formula (B-1) above,
F, R' and T are the same as in formula (V) above. 〕,or
C1' is the moiety generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group.
p, q, X, R 1a and R 1b are the same as in formula (Lb′) above;
Y' is a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the formula (B-1),
Z is the same as in formula (B-1) above,
Fa and Fb are the same or different functional substances,
R' and T are the same as in formula (V) above. A soluble protein or a salt thereof according to any one of [2] to [15] and [18] to [35], which is a soluble protein or a salt thereof that regioselectively has a functional substance represented by ].
[37] A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
the functional substance is attached to the soluble protein via the side chain of the lysine residue,
the soluble protein is an antibody comprising multiple heavy chains;
A soluble antibody regioselectively having a functional substance as a result of having a functional substance at a plurality of specific amino acid residues present at the above positions in a plurality of heavy chains contained in the antibody. protein or its salt.
[38] Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a lysine residue of an antibody and a reactive group specific for the side chain of a lysine residue;
T is an antibody;
The antibody contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and 5 specific amino acid residues in a non-target region other than the target region. including more than ] and the structural unit represented by F-(L1-B)'-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance bound thereto with regioselectivity.
[39] the soluble protein or a salt thereof represented by the following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1, F, R' and T are the same as in formula (V) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-B'(-F)-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein The soluble protein of [38] or a salt thereof, which is a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance that is regioselectively bound to
[40] the soluble protein or a salt thereof represented by the following formula (V2):
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
F, B, R' and T are the same as in formula (V) above;
L1' is a divalent group that includes a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group that includes a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by FL1′-BR′ is located at 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein or a salt thereof regioselectively bound to a functional substance, or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (V) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group comprising a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ] and a structural unit represented by Fa-L1′-B′(-Fb)-R′ for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein The soluble protein or its salt of [38], which is a soluble protein or its salt regioselectively having a functional substance bound with a regioselectivity of 30% or more.
(機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法)
本発明はまた、上記〔1〕~〔40〕の可溶性タンパク質のうち、式(V)またはその下位の式による特定を要する、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。
〔41〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、あるいは
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む可溶性タンパク質である。〕で表され、かつA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、
下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価
の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’およびTは、前記式(III)または(IV)のものと同じである。〕で表され、かつF-(L1-B)’-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
(Method for Producing a Soluble Protein Having a Functional Substance Regioselectively or a Salt Thereof)
The present invention also provides a method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance, which requires specification by formula (V) or subordinate formulas thereof, among the soluble proteins of [1] to [40] above. I will provide a.
[41] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and 5 of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region It is a soluble protein containing more than ] and the structural unit represented by ALB'(-F)-R' is 30 for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group bound with a regioselectivity of 10% or more is reacted with a functional substance,
Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' and T are the same as in formula (III) or (IV) above. ] and the structural unit represented by F-(L1-B)'-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance regioselectively attached to
好ましくは、上記〔41〕の方法は、以下であってもよい。
〔42〕前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表され、かつL1-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む方法である、〔41〕の方法。
〔43〕前記生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種の機能性物質と反応させて、
下記式(V2):
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表され、かつF-L1’-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表され、かつFa-L1’-B’(-Fb)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む方法である、〔41〕の方法。
〔44〕可溶性タンパク質が抗体であり、反応性基が、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である、〔41〕~〔43〕のいずれかの方法。
〔45〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつA-L-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
A、L、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表され、かつA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表され、かつL1-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔46〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を位置選択的に有する化合物またはその塩を、可溶性タンパク質(ここで、可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。)と反応させ
て、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表され、かつA-L-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
AおよびLは、前記式(I)のものと同じであり、
R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表され、かつA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩を生成すること、ならびに
(C)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表され、かつL1-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔47〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつA-L-B-R’で表され
る構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種以上の機能性物質と反応させて、
下記式(V2)
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表され、かつF-L1’-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表され、かつFa-L1’-B’(-Fb)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
〔48〕機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法であって、
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質(ここで、可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。)と反応させて
、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表され、かつA-L-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(C)前記生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種以上の機能性物質と反応させて、
下記式(V2):
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表され、かつF-L1’-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表され、かつFa-L1’-B’(-Fb)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。
Preferably, the method of [41] above may be as follows.
[42] cleaving the cleavable portion of a complex or a salt thereof regioselectively comprising the affinity substance for the soluble protein, the cleavable portion, the functional substance and the soluble protein,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ] and the structural unit represented by L1-B'(-F)-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein The method of [41], which comprises producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance that regioselectively binds to
[43] reacting a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group with one or two functional substances,
The following formula (V2):
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and the structural unit represented by FL1′-BR′ is located at 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein having a functional substance regioselectively bound thereto, or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ] and a structural unit represented by Fa-L1′-B′(-Fb)-R′ for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein The method of [41], which comprises producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance bound with a regioselectivity of 30% or more.
[44] the method of any one of [41] to [43], wherein the soluble protein is an antibody, and the reactive group is a reactive group specific to the side chain of a lysine residue;
[45] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
(A) the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A, L, R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and the structural unit represented by ALB'(-F)-R' is 30 for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. (B) generating a complex or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein bound with regioselectivity of greater than or equal to %; cleaving the cleavable portion of a complex or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ] and the structural unit represented by L1-B'(-F)-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance regioselectively attached to
[46] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound or a salt thereof regioselectively having an affinity substance, a cleavable moiety and a reactive group for a soluble protein represented by containing one or more specific amino acid residues in a target region consisting of residues, and containing five or more of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region),
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and the structural unit represented by ALBR' is 30% or more position selection for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein and a cleavable moiety,
(B) reacting a substance having an affinity for the soluble protein and a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a cleavable moiety with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A and L are the same as in formula (I) above;
R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and the structural unit represented by ALB'(-F)-R' is 30 for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. (C) generating a complex or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein bound with regioselectivity of ≥%; cleaving the cleavable portion of a complex or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ] and the structural unit represented by L1-B'(-F)-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance regioselectively attached to
[47] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
(A) the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group attached thereto, and (B) a soluble protein or a salt thereof regioselectively bearing said bioorthogonal functional group; by reacting with a species or two or more functional substances,
The following formula (V2)
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and the structural unit represented by FL1′-BR′ is located at 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein or a salt thereof regioselectively bound with a functional substance, or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ] and a structural unit represented by Fa-L1′-B′(-Fb)-R′ for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A method comprising producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance bound with a regioselectivity of 30% or more.
[48] A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ] A compound or a salt thereof represented by a soluble protein (here, the soluble protein contains one or more specific amino acid residues in the target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and containing 5 or more of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region),
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and the structural unit represented by ALBR' is 30% or more position selection for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein and a cleavable moiety,
(B) cleaving the affinity substance for the soluble protein and the cleavable portion of the soluble protein or salt thereof regioselectively having the cleavable portion,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group attached thereto, and (C) a soluble protein or a salt thereof regioselectively bearing said bioorthogonal functional group; by reacting with a species or two or more functional substances,
The following formula (V2):
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and the structural unit represented by FL1′-BR′ is located at 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein or a salt thereof regioselectively bound with a functional substance, or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ] and a structural unit represented by Fa-L1′-B′(-Fb)-R′ for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A method comprising producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance bound with a regioselectivity of 30% or more.
(I)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する本発明の化合物またはその塩は、例えば、可溶性タンパク質の位置選択的な修飾に有用である。
(II)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を(位置選択的に)有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩、(III)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を(位置選択的に)有する本発明の複合体またはその塩、ならびに(IV)生体直交性官能基を(位置選択的に)有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、例えば、機能性物質を(位置選択的に)有する可溶性タンパク質またはその塩の調製のための中間体として有用である。
(V)機能性物質を(位置選択的に)有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、例えば、医薬、または試薬(例、診断薬、研究用試薬)として有用である。特に、可溶性タンパク質が抗体である場合、機能性物質を(位置選択的に)有する本発明の抗体またはその塩は、これらの用途に適している。
(I) The compounds of the present invention or salts thereof having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group are useful, for example, for regioselective modification of soluble proteins.
(II) an affinity substance for a soluble protein and a soluble protein of the present invention or a salt thereof having (regioselectively) a cleavable moiety, (III) an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble The complex of the present invention having a protein (regioselectively) or a salt thereof, and (IV) the soluble protein of the present invention having a bioorthogonal functional group (regioselectively) or a salt thereof are functional substances, for example (regioselectively) as an intermediate for the preparation of soluble proteins or salts thereof.
(V) The soluble protein or salt thereof of the present invention having (regioselectively) a functional substance is useful, for example, as a drug or reagent (eg, diagnostic agent, research reagent). In particular, when the soluble protein is an antibody, the antibody or salt thereof of the present invention having a functional substance (regioselectively) is suitable for these uses.
1.可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩
1-1.概要
本発明は、式(I)で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩を提供する。
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕
1. A compound or salt thereof containing an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group 1-1. SUMMARY The present invention provides compounds or salts thereof of formula (I) that include an affinity agent for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group.
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ]
本発明に関連して提示される式(I)および他の式において、-(ハイフン)は、その両側に存在する2つの単位が共有結合していることを示す。したがって、式(I)では、Aは、Lと共有結合しており、Lは、AおよびBと共有結合しており、Bは、LおよびRと共有結合しており、Rは、Bと共有結合している。 In formula (I) and other formulas presented in connection with the present invention, a - (hyphen) indicates that the two units on either side of it are covalently linked. Thus, in formula (I), A is covalently bonded to L, L is covalently bonded to A and B, B is covalently bonded to L and R, and R is covalently bonded to B. are covalently bonded.
1-2.可溶性タンパク質に対する親和性物質(A)
式(I)において、Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質である。親和性物質とは、標的に対して非共有結合による結合能を有する物質である。
1-2. Affinity substance for soluble protein (A)
In formula (I), A is an affinity substance for soluble proteins. An affinity substance is a substance that has the ability to bind to a target by non-covalent bonding.
本発明で用いられる親和性物質は、分泌タンパク質とも呼称される可溶性タンパク質を標的とする。このような可溶性タンパク質としては、例えば、抗体、可溶性受容体、リガンド、アルブミン、エリスロポエチン(EPO)、血管内皮細胞増殖因子(Anti-VEGF)、骨形成タンパク質、卵胞刺激ホルモン(FSH)、グルカゴン、顆粒状コロニー刺激因子、顆粒状マクロファージコロニー刺激因子、繊毛性ゴナドトロビン、インスリン、インターロイキン、インターフェロン、血小板由来成長因子(PDGF)、増殖因子(TGFファミリー、FGFファミリー)が挙げられる。可溶性タンパク質は、生体分子(例、糖)で修飾されたタンパク質(例、糖タンパク質)であっても、生体分子で未修飾のタンパク質であってもよい。 The affinity agents used in the present invention target soluble proteins, also called secreted proteins. Examples of such soluble proteins include antibodies, soluble receptors, ligands, albumin, erythropoietin (EPO), vascular endothelial growth factor (Anti-VEGF), bone morphogenetic proteins, follicle stimulating hormone (FSH), glucagon, granules, colony-stimulating factor, granular macrophage colony-stimulating factor, ciliary gonadotrobin, insulin, interleukin, interferon, platelet-derived growth factor (PDGF), growth factor (TGF family, FGF family). Soluble proteins may be proteins modified with biomolecules (eg sugars) (eg glycoproteins) or unmodified with biomolecules.
親和性物質の標的である可溶性タンパク質はまた、天然由来タンパク質、または人工タンパク質である。 Soluble proteins that are targets of affinity agents are also naturally occurring or artificial proteins.
天然由来タンパク質としては、例えば、生物およびウイルス由来のタンパク質が挙げられる。生物由来のタンパク質としては、例えば、哺乳動物、鳥類(例、ニワトリ)等の動物、昆虫、微生物、植物、菌類、および魚類由来のタンパク質が挙げられる。好ましくは、天然由来タンパク質は、哺乳動物由来のタンパク質である。哺乳動物としては、例えば、霊長類(例、ヒト、サル、チンパンジー)、齧歯類(例、マウス、ラット、モルモット、ハムスター、ウサギ)、愛玩動物(例、イヌ、ネコ)、家畜(例、ウシ、ブタ、ヤギ)、使役動物(例、ウマ、ヒツジ)が挙げられる。天然由来タンパク質は、より好ましくは、霊長類または齧歯類由来のタンパク質であり、さらにより好ましくは、本発明の臨床応用の観点から、ヒト由来のタンパク質である。ウイルス由来のタンパク質としては、例えば、インフルエンザウイルス(例、トリインフルエンザウイルス、ブタインフルエンザウイルス)、エイズウイルス、エボラウイルス、ファージウイルスが挙げられる。 Naturally derived proteins include, for example, proteins derived from organisms and viruses. Examples of biological proteins include proteins derived from mammals, animals such as birds (eg, chickens), insects, microorganisms, plants, fungi, and fish. Preferably, the naturally occurring protein is a mammalian protein. Examples of mammals include primates (e.g., humans, monkeys, chimpanzees), rodents (e.g., mice, rats, guinea pigs, hamsters, rabbits), pets (e.g., dogs, cats), livestock (e.g., cattle, pigs, goats), working animals (eg horses, sheep). The naturally occurring protein is more preferably a primate- or rodent-derived protein, and even more preferably a human-derived protein from the viewpoint of clinical application of the present invention. Virus-derived proteins include, for example, influenza virus (eg, avian influenza virus, swine influenza virus), AIDS virus, Ebola virus, and phage virus.
人工タンパク質としては、例えば、天然由来タンパク質の改変タンパク質(例、置換、欠失および挿入からなる群より選ばれる1以上のアミノ酸残基の変異が天然由来タンパク質に導入されたタンパク質)、融合タンパク質、および人工的に設計されたモノクローナル抗体が挙げられる。人工的に設計されたモノクローナル抗体としては、例えば、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、所定の糖鎖が付加された抗体(例、N型糖鎖結合コンセンサス配列等の糖鎖結合コンセンサス配列を有するように改変された抗体)、二重特異性抗体、scFv抗体、Fab抗体、F(ab‘)2抗体、VHH抗体、Fc領域タンパク質、Fc融合タンパク質が挙げられる。 Artificial proteins include, for example, modified proteins of naturally occurring proteins (e.g., proteins in which one or more amino acid residue mutations selected from the group consisting of substitutions, deletions and insertions are introduced into naturally occurring proteins), fusion proteins, and artificially designed monoclonal antibodies. Artificially designed monoclonal antibodies include, for example, chimeric antibodies, humanized antibodies, human antibodies, antibodies to which a predetermined sugar chain has been added (e.g., a sugar chain-binding consensus sequence such as an N-type sugar chain-binding consensus sequence). antibodies engineered to have), bispecific antibodies, scFv antibodies, Fab antibodies, F(ab') 2 antibodies, VHH antibodies, Fc region proteins, Fc fusion proteins.
親和性物質の標的である可溶性タンパク質はさらに、単量体タンパク質、または多量体(例、二量体、三量体、または四量体)タンパク質であってもよい。親和性物質の標的であるタンパク質が多量体タンパク質である場合、多量体タンパク質は、ホモ多量体、またはヘテロ多量体である。多量体タンパク質は、共有結合(例、ジスルフィド結合)を介して多量体を形成するタンパク質(例、ジスルフィド結合を介して、軽鎖および重鎖からなる単位が2つ連結している構造を有する抗体)であっても、非共有結合(すなわち、会合)を介して多量体を形成するタンパク質であってもよいが、共有結合を介して多量体を形成するタンパク質が好ましい。親和性物質の標的である多量体タンパク質としては、例えば、2価の抗体(例、IgG、IgD、IgE)、4価以上の抗体(例、IgA抗体、IgM抗体)、アルブミンが挙げられる。 The soluble protein that is the target of the affinity agent may also be a monomeric protein or a multimeric (eg, dimer, trimer, or tetramer) protein. When the protein that is the target of the affinity substance is a multimeric protein, the multimeric protein is a homomultimer or a heteromultimer. A multimeric protein is a protein that forms a multimer via a covalent bond (e.g., disulfide bond) (e.g., an antibody having a structure in which two units consisting of a light chain and a heavy chain are linked via a disulfide bond. ) or proteins that form multimers through non-covalent bonds (ie association), but proteins that form multimers through covalent bonds are preferred. Multimeric proteins that are targets of affinity substances include, for example, bivalent antibodies (eg, IgG, IgD, IgE), tetravalent or higher antibodies (eg, IgA antibodies, IgM antibodies), and albumin.
親和性物質の標的である可溶性タンパク質はまた、任意のアミノ酸残基から構成されていてもよいが、好ましくは、タンパク質を通常構成する天然の20種のL-α-アミノ酸残基から構成される。このようなアミノ酸残基としては、例えば、L-アラニン(A)、L-アスパラギン(N)、L-システイン(C)、L-グルタミン(Q)、L-イソロイ
シン(I)、L-ロイシン(L)、L-メチオニン(M)、L-フェニルアラニン(F)、L-プロリン(P)、L-セリン(S)、L-スレオニン(T)、L-トリプトファン(W)、L-チロシン(Y)、L-バリン(V)、L-アスパラギン酸(D)、L-グルタミン酸(E)、L-アルギニン(R)、L-ヒスチジン(H)、またはL-リジン(K)、及びグリシン(G)が挙げられる(以下、Lの表記を省略)。可溶性タンパク質は、例えば100個以上、好ましくは120個以上、より好ましくは150個以上、さらにより好ましくは180個以上、特に好ましくは200個以上のアミノ酸残基から構成されていてもよい。可溶性タンパク質はまた、例えば1000個以下、好ましくは900個以下、より好ましくは800個以下、さらにより好ましくは700個以下、特に好ましくは600個以下であってもよい。より具体的には、可溶性タンパク質は、例えば100~1000個、好ましくは120~900個、より好ましくは150~800個、さらにより好ましくは180~700個以上、特に好ましくは200~600個のアミノ酸残基から構成されていてもよい。可溶性タンパク質が抗体(例、上述したような人工的に設計されたモノクローナル抗体)である場合、上記個数のアミノ酸残基は、抗体の重鎖のアミノ酸残基に相当するものであってもよい。
The soluble protein that is the target of the affinity substance may also be composed of any amino acid residue, but preferably is composed of the 20 naturally occurring L-α-amino acid residues that normally constitute proteins. . Such amino acid residues include, for example, L-alanine (A), L-asparagine (N), L-cysteine (C), L-glutamine (Q), L-isoleucine (I), L-leucine ( L), L-methionine (M), L-phenylalanine (F), L-proline (P), L-serine (S), L-threonine (T), L-tryptophan (W), L-tyrosine (Y ), L-valine (V), L-aspartic acid (D), L-glutamic acid (E), L-arginine (R), L-histidine (H), or L-lysine (K), and glycine (G ) (hereinafter, the notation of L is omitted). A soluble protein may be composed of, for example, 100 or more, preferably 120 or more, more preferably 150 or more, still more preferably 180 or more, particularly preferably 200 or more amino acid residues. Soluble proteins may also be, for example, 1000 or less, preferably 900 or less, more preferably 800 or less, even more preferably 700 or less, particularly preferably 600 or less. More specifically, soluble proteins are, for example, 100 to 1000, preferably 120 to 900, more preferably 150 to 800, even more preferably 180 to 700 or more, particularly preferably 200 to 600 amino acids. It may be composed of residues. When the soluble protein is an antibody (eg, an artificially designed monoclonal antibody as described above), the above number of amino acid residues may correspond to the amino acid residues of the heavy chain of the antibody.
親和性物質の標的である可溶性タンパク質はさらに、後述するような反応性基が反応できる側鎖または末端(N末端および/またはC末端)、好ましくは側鎖を有する特定のアミノ酸残基を1つの位置または複数の位置(好ましくは複数の位置)で含むタンパク質である。このような特定のアミノ酸残基としては、例えば、後述するような14種のアミノ酸残基が挙げられるが、好ましくは、リジン残基、チロシン残基、トリプトファン残基、およびシステイン残基からなる群より選ばれるアミノ酸残基である。本発明の化合物が可溶性タンパク質を位置選択的に修飾できることに鑑みると、このような特定のアミノ酸残基を複数の位置で含む可溶性タンパク質が好ましい。複数の位置としては、2以上の位置である限り特に限定されないが、例えば3以上の位置、好ましくは5以上の位置、より好ましくは10以上の位置、さらにより好ましくは20以上の位置、特に好ましくは30以上の位置であってもよい。複数の位置はまた、例えば200以下の位置、好ましくは180以下の位置、より好ましくは150以下の位置、さらにより好ましくは120以下の位置、特に好ましくは100以下の位置であってもよい。より具体的には、複数の位置は、例えば3~200の位置、好ましくは5~180の位置、より好ましくは10~150の位置、さらにより好ましくは20~120の位置、特に好ましくは30~100の位置であってもよい。このような特定のアミノ酸残基を複数の位置で含む可溶性タンパク質であっても、本発明の化合物は、特定の一の位置に存在する特定のアミノ酸残基を位置選択的に修飾することができる。例えば、ヒトIgG1のリジン残基数は、可変領域中のアミノ酸組成にもよるが、一般的には70~90個程度と言われている。本発明では、このようなヒトIgG1の特定の位置に存在するリジン残基を位置選択的に修飾することに成功している。 The soluble protein that is the target of the affinity substance further includes a specific amino acid residue having a side chain or terminus (N-terminus and/or C-terminus), preferably a side chain, with which a reactive group as described below can react. It is a protein comprising at a position or at multiple positions (preferably at multiple positions). Such specific amino acid residues include, for example, the 14 amino acid residues described below, preferably the group consisting of lysine, tyrosine, tryptophan, and cysteine residues. It is an amino acid residue selected from In view of the ability of the compounds of the present invention to regioselectively modify soluble proteins, soluble proteins containing such specific amino acid residues at multiple positions are preferred. The plurality of positions is not particularly limited as long as it is 2 or more positions, but for example, 3 or more positions, preferably 5 or more positions, more preferably 10 or more positions, still more preferably 20 or more positions, particularly preferably may be 30 or more positions. The plurality of positions may also be, for example, 200 positions or less, preferably 180 positions or less, more preferably 150 positions or less, even more preferably 120 positions or less, particularly preferably 100 positions or less. More specifically, the plurality of positions is, for example, 3 to 200 positions, preferably 5 to 180 positions, more preferably 10 to 150 positions, even more preferably 20 to 120 positions, particularly preferably 30 to There may be 100 positions. Even in a soluble protein containing such specific amino acid residues at multiple positions, the compounds of the present invention can regioselectively modify a specific amino acid residue present at a specific position. . For example, the number of lysine residues in human IgG1 is generally said to be about 70-90, depending on the amino acid composition in the variable region. The present invention has succeeded in regioselectively modifying a lysine residue present at such a specific position in human IgG1.
より具体的には、本発明では、抗体等のタンパク質の機能を維持しつつ(すなわち、タンパク質を変性させずにネイティブなフォールディングを維持しつつ)、タンパク質中の特定の位置に存在するアミノ酸残基を修飾する観点から、タンパク質の表面に露出しているアミノ酸残基の位置選択的な修飾が好ましい。例えば、ヒトIgG1等のヒトIgGでは、露出リジン残基および露出チロシン残基は、以下の位置に存在する(EU numberingによる;http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/Numbering/Hu_IGHGnber.htmlを参照)。(1)露出リジン残基
CH2ドメイン(246位、248位、274位、288位、290位、317位、320位、322位、338位)
CH3ドメイン(360位、414位、439位)
(2)露出チロシン残基
CH2ドメイン(278位、296位、300位)
CH3ドメイン(436位)
したがって、ヒトIgG1等のヒトIgGがリジン残基またはチロシン残基で修飾される場合、上記位置での修飾が好ましい。
More specifically, in the present invention, amino acid residues present at specific positions in proteins while maintaining the functions of proteins such as antibodies (that is, maintaining native folding without denaturing the proteins) From the viewpoint of modification, site-selective modification of amino acid residues exposed on the protein surface is preferred. For example, in human IgG, such as human IgG1, exposed lysine residues and exposed tyrosine residues are present at the following positions (according to EU numbering; see http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/Numbering/Hu_IGHGnber.html reference). (1) exposed lysine residue CH2 domain (
CH3 domain (positions 360, 414, 439)
(2) exposed tyrosine residue CH2 domain (278, 296, 300)
CH3 domain (position 436)
Therefore, when human IgG, such as human IgG1, is modified at lysine or tyrosine residues, modification at these positions is preferred.
好ましくは、ヒトIgG1等のヒトIgGがリジン残基またはチロシン残基で修飾される場合、上記(1)および(2)の位置のなかでも、表面への露出性が高い以下の位置に存在するリジン残基またはチロシン残基が修飾されてもよい。
(1’)露出リジン残基
CH2ドメイン(246位、248位、274位、288位、290位、317位、320位、322位)
CH3ドメイン(360位、414位、439位)
(2’)露出チロシン残基
CH2ドメイン(278位、296位、300位)
CH3ドメイン(436位)
したがって、ヒトIgG1等のヒトIgGがリジン残基またはチロシン残基で修飾される場合、上記位置での修飾がより好ましい。
Preferably, when human IgG such as human IgG1 is modified with a lysine residue or a tyrosine residue, among the positions (1) and (2) above, the following positions with high surface exposure are present: Lysine or tyrosine residues may be modified.
(1′) exposed lysine residues CH2 domain (
CH3 domain (positions 360, 414, 439)
(2′) exposed tyrosine residues CH2 domain (positions 278, 296, 300)
CH3 domain (position 436)
Therefore, when human IgG, such as human IgG1, is modified at lysine or tyrosine residues, modification at these positions is more preferred.
より好ましくは、ヒトIgG1等のヒトIgGがリジン残基で修飾される場合、上記(1)の位置のなかでも、本発明において効率的に修飾することができるCH2ドメイン中の所定の位置(例、246位、248位、288位、290位、317位)に存在するリジン残基が修飾されてもよい。 More preferably, when human IgG such as human IgG1 is modified with a lysine residue, among the positions of (1) above, a predetermined position in the CH2 domain that can be efficiently modified in the present invention (e.g. , 246, 248, 288, 290, 317) may be modified.
特定の実施形態では、親和性物質の標的である可溶性タンパク質は、上述したように特定のアミノ酸残基を複数の位置で含む場合、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において特定のアミノ酸残基を5個以上含むものであってもよい。標的領域は、好ましくは1~30個、より好ましくは1~20個、さらにより好ましくは1~10個、1~5個、または1~3個(すなわち、1個、2個、もしくは3個)のアミノ酸残基からなるものであってもよい。特に好ましくは、標的領域は、特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基からなる領域であってもよい。このような特定の位置は、標的タンパク質および親和性物質の種類などによっても変動するが、例えば、抗体の定常領域中の特定領域(例、CH1、CH2、CH3)中の特定の位置であってもよく、好ましくは抗体のCH2中の位置であってもよい。より具体的には、標的領域は、ヒトIgG FcにおけるEu
numberingに従う下記残基であってもよい:
(1)Lys248残基(以下、本明細書では単に「Lys248」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の18番目の残基に相当する)またはLys246残基(以下、本明細書では単に「Lys246」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の16番目の残基に相当する)
:
(2)Lys288残基(以下、本明細書では単に「Lys288」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の58番目の残基に相当する)またはLys290残基(以下、本明細書では単に「Lys290」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の60番目の残基に相当する);
(3)Lys317残基(以下、本明細書では単に「Lys317」とも表記し、ヒトIgG CH2領域(配列番号1)の87番目の残基に相当する)。
In certain embodiments, when the soluble protein targeted by the affinity substance contains specific amino acid residues at multiple positions as described above, in the target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, It may contain one or more specific amino acid residues and five or more specific amino acid residues in a non-target region other than the target region. The target regions are preferably 1-30, more preferably 1-20, even more preferably 1-10, 1-5 or 1-3 (
It may be the following residues according to numbering:
(1) Lys248 residue (hereinafter simply referred to as “Lys248” in this specification and corresponds to the 18th residue of the human IgG CH2 region (SEQ ID NO: 1)) or Lys246 residue (hereinafter referred to as “Lys248” in this specification) Also simply referred to as "Lys246", it corresponds to the 16th residue of the human IgG CH2 region (SEQ ID NO: 1))
:
(2) Lys288 residue (hereinafter simply referred to as “Lys288” in this specification, corresponding to the 58th residue of the human IgG CH2 region (SEQ ID NO: 1)) or Lys290 residue (hereinafter referred to as “Lys288” in this specification) also simply referred to as "Lys290", corresponding to the 60th residue of the human IgG CH2 region (SEQ ID NO: 1);
(3) Lys317 residue (hereinafter also simply referred to as “Lys317” in this specification, which corresponds to the 87th residue of the human IgG CH2 region (SEQ ID NO: 1)).
本発明によれば、上記標的領域における特定のアミノ酸残基を高度に位置選択的に修飾することができる。このような位置選択性は、例えば30%以上、好ましくは40%以上、より好ましくは50%以上、さらにより好ましくは60%以上、特に好ましくは70%
以上、80%以上、90%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上、または100%以上であってもよい。
According to the present invention, specific amino acid residues in the target region can be highly regioselectively modified. Such regioselectivity is, for example, 30% or more, preferably 40% or more, more preferably 50% or more, even more preferably 60% or more, particularly preferably 70%.
80% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 100% or more.
標的領域はまた、特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基が、当該特定の位置を中心としてそれぞれN末端側およびC末端側に対してa個(ここで、aは、1~10の任意の整数である)のアミノ酸残基の遠隔位置までの領域において、当該特定の位置に存在する特定のアミノ酸残基以外に、特定のアミノ酸残基と同種のアミノ酸残基を含まないものであってもよい。aは、好ましくは1~5の整数であり、より好ましくは1~3の整数であり、さらにより好ましくは1または2であり、特に好ましくは1である。 The target region also has a specific amino acid residue present at a specific position on the N-terminal side and the C-terminal side of the specific position (where a is any number from 1 to 10). (which is an integer of ) does not contain amino acid residues of the same type as the specific amino acid residue other than the specific amino acid residue present at the specific position in the region to the remote position of the amino acid residue good too. a is preferably an integer of 1 to 5, more preferably an integer of 1 to 3, even more preferably 1 or 2, particularly preferably 1;
好ましい実施形態では、可溶性タンパク質に対する親和性物質は、抗体に対する親和性物質である。抗体は、ポリクローナル抗体、またはモノクローナル抗体である。抗体のアイソタイプとしては、例えば、IgG(例、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)、IgM、IgA、IgD、IgE、およびIgYが挙げられる。抗体は、全長抗体、または抗体断片(例、F(ab’)2、Fab’、Fab、Fv、単鎖抗体)であるが、全長抗体が好ましい。 In a preferred embodiment, the affinity agent for soluble proteins is an affinity agent for antibodies. Antibodies are polyclonal antibodies or monoclonal antibodies. Antibody isotypes include, for example, IgG (eg, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4), IgM, IgA, IgD, IgE, and IgY. Antibodies are full length antibodies or antibody fragments (eg, F(ab') 2 , Fab', Fab, Fv, single chain antibodies), but full length antibodies are preferred.
抗体は、任意の抗原に対する抗体である。例えば、このような抗原は、上述したような生物またはウイルスにおいて見出される成分であってもよい。このような抗原としてはまた、例えば、タンパク質〔オリゴペプチド、ポリペプチドを含む。糖等の生体分子で修飾されたタンパク質(例、糖タンパク質)であってもよい〕、糖鎖、核酸、低分子化合物が挙げられる。 An antibody is an antibody against any antigen. For example, such antigens may be components found in organisms or viruses as described above. Such antigens also include, for example, proteins [oligopeptides, polypeptides. proteins modified with biomolecules such as sugars (eg, glycoproteins)], sugar chains, nucleic acids, and low-molecular-weight compounds.
好ましくは、抗体は、タンパク質を抗原とする抗体であってもよい。タンパク質としては、例えば、細胞膜受容体、細胞膜受容体以外の細胞膜タンパク質(例、細胞外基質タンパク質)、リガンド、可溶性受容体が挙げられる。 Preferably, the antibody may be an antibody whose antigen is a protein. Proteins include, for example, cell membrane receptors, cell membrane proteins other than cell membrane receptors (eg, extracellular matrix proteins), ligands, and soluble receptors.
より具体的には、抗体の抗原であるタンパク質は、疾患標的タンパク質であってもよい。疾患標的タンパク質としては、例えば、以下が挙げられる。 More specifically, the protein that is the antigen of the antibody may be a disease target protein. Disease target proteins include, for example:
(1)がん領域
PD-L1、GD2、PDGFRα(血小板由来成長因子受容体)、CD22、HER2、ホスファチジルセリン(PS)、EpCAM、フィブロネクチン、PD-1、VEGFR-2、CD33、HGF、gpNMB、CD27、DEC-205、葉酸受容体、CD37、CD19、Trop2、CEACAM5、S1P、HER3、IGF-1R、DLL4、TNT-1/B、CPAAs、PSMA、CD20、CD105(エンドグリン)、ICAM-1、CD30、CD16A、CD38、MUC1、EGFR、KIR2DL1,2,、NKG2A、tenascin-C、IGF(Insulin-like growth factor)、CTLA-4、mesothelin、CD138、c-Met、Ang2、VEGF-A、CD79b、ENPD3、葉酸受容体α、TEM-1、GM2、グリピカン3、macrophage inhibitory factor、CD74、Notch1、Notch2、Notch3、CD37、TLR-2、CD3、CSF-1R、FGFR2b、HLA-DR、GM-CSF、EphA3、B7-H3、CD123、gpA33、Frizzled7受容体、DLL4、VEGF、RSPO、LIV-1、SLITRK6、Nectin-4、CD70、CD40、CD19、SEMA4D(CD100)、CD25、MET、Tissue Factor、IL-8、EGFR、cMet、KIR3DL2、Bst1(CD157)、P-カドヘリン、CEA、GITR、TAM(tumor associated macrophage)、CEA、DLL4、Ang2、CD73、FGFR2、CXCR4、LAG-3、GITR、Fucosyl GM1、IGF-1、Angiopoietin 2、CS
F-1R、FGFR3、OX40、BCMA、ErbB3、CD137(4-1BB)、PTK7、EFNA4、FAP、DR5、CEA、Ly6E、CA6、CEACAM5、LAMP1、tissue factor、EPHA2、DR5、B7-H3、FGFR4、FGFR2、α2-PI、A33、GDF15、CAIX、CD166、ROR1、GITR、BCMA、TBA、LAG-3、EphA2、TIM-3、CD-200、EGFRvIII、CD16A、CD32B、PIGF、Axl、MICA/B、Thomsen-Friedenreich、CD39、CD37、CD73、CLEC12A、Lgr3、トランスフェリン受容体、TGFβ、IL-17、5T4、RTK、Immune Suppressor Protein、NaPi2b、ルイス血液型B抗原、A34、Lysil-Oxidase、DLK-1、TROP-2、α9インテグリン、TAG-72(CA72-4)、CD70
(1) Cancer area PD-L1, GD2, PDGFRα (platelet-derived growth factor receptor), CD22, HER2, phosphatidylserine (PS), EpCAM, fibronectin, PD-1, VEGFR-2, CD33, HGF, gpNMB, CD27, DEC-205, folate receptor, CD37, CD19, Trop2, CEACAM5, S1P, HER3, IGF-1R, DLL4, TNT-1/B, CPAAs, PSMA, CD20, CD105 (endoglin), ICAM-1, CD30, CD16A, CD38, MUC1, EGFR, KIR2DL1,2, NKG2A, tenascin-C, IGF (Insulin-like growth factor), CTLA-4, mesothelin, CD138, c-Met, Ang2, VEGF-A, CD79b, ENPD3, folate receptor α, TEM-1, GM2, glypican 3, macrophage inhibitory factor, CD74, Notch1, Notch2, Notch3, CD37, TLR-2, CD3, CSF-1R, FGFR2b, HLA-DR, GM-CSF, EphA3, B7-H3, CD123, gpA33, Frizzled7 receptor, DLL4, VEGF, RSPO, LIV-1, SLITRK6, Nectin-4, CD70, CD40, CD19, SEMA4D (CD100), CD25, MET, Tissue Factor, IL- 8, EGFR, cMet, KIR3DL2, Bst1 (CD157), P-cadherin, CEA, GITR, TAM (tumor associated macrophage), CEA, DLL4, Ang2, CD73, FGFR2, CXCR4, LAG-3, GITR, Fucosyl GM1, IGF -1, angiopoietin 2, CS
F-1R, FGFR3, OX40, BCMA, ErbB3, CD137 (4-1BB), PTK7, EFNA4, FAP, DR5, CEA, Ly6E, CA6, CEACAM5, LAMP1, tissue factor, EPHA2, DR5, B7-H3, FGFR4, FGFR2, α2-PI, A33, GDF15, CAIX, CD166, ROR1, GITR, BCMA, TBA, LAG-3, EphA2, TIM-3, CD-200, EGFRvIII, CD16A, CD32B, PIGF, Axl, MICA/B, Thomsen-Friedenreich, CD39, CD37, CD73, CLEC12A, Lgr3, Transferrin Receptor, TGFβ, IL-17, 5T4, RTK, Immune Suppressor Protein, NaPi2b, Lewis Blood Group B Antigen, A34, Lysil-Oxidase, DLK-1, TROP-2, α9 integrin, TAG-72 (CA72-4), CD70
(2)自己免疫疾患・炎症性疾患
IL-17、IL-6R、IL-17R、INF-α、IL-5R、IL-13、IL-23、IL-6、ActRIIB、β7-Integrin、IL-4αR、HAS、Eotaxin-1、CD3、CD19、TNF-α、IL-15、CD3ε、Fibronectin、IL-1β、IL-1α、IL-17、TSLP(Thymic Stromal Lymphopoietin)、LAMP(Alpha4 Beta 7 Integrin)、IL-23、GM-CSFR、TSLP、CD28、CD40、TLR-3、BAFF-R、MAdCAM、IL-31R、IL-33、CD74、CD32B、CD79B、IgE(免疫グロブリンE)、IL-17A、IL-17F、C5、FcRn、CD28、TLR4、MCAM、B7RP1、CXCR1,2 Ligands、IL-21、Cadherin-11、CX3CL1、CCL20、IL-36R、IL-10R、CD86、TNF-α、IL-7R、Kv1.3、α9インテグリン、LIFHT
(2) Autoimmune diseases/inflammatory diseases IL-17, IL-6R, IL-17R, INF-α, IL-5R, IL-13, IL-23, IL-6, ActRIIB, β7-Integrin, IL- 4αR, HAS, Eotaxin-1, CD3, CD19, TNF-α, IL-15, CD3ε, Fibronectin, IL-1β, IL-1α, IL-17, TSLP (Thymic Stromal Lymphopoietin), LAMP (
(3)脳神経疾患
CGRP、CD20、βアミロイド、βアミロイドプロトフィブリン、Calcitonin Gene-Related Peptide Receptor、LINGO(Ig Domain Containing1)、αシヌクレイン、細胞外tau、CD52、インスリン受容体、tauタンパク、TDP-43、SOD1、TauC3、JCウイルス
(3) Cranial nerve disease CGRP, CD20, β-amyloid, β-amyloid protofibrin, Calcitonin Gene-Related Peptide Receptor, LINGO (Ig Domain Containing 1), α-synuclein, extracellular tau, CD52, insulin receptor, tau protein, TDP-43 , SOD1, TauC3, JC virus
(4)感染症
Clostridium Difficile toxin B、サイトメガロウイルス、RSウイルス、LPS、S.Aureus Alpha-toxin、M2eタンパク、Psl、PcrV、S.Aureus toxin、インフルエンザA、Alginate、黄色ブドウ球菌、PD-L1、インフルエンザB、アシネトバクター、F-protein、Env、CD3、病原性大腸菌、クレブシエラ、肺炎球菌
(4) infectious diseases Clostridium difficile toxin B, cytomegalovirus, respiratory syncytial virus, LPS, S. Aureus Alpha-toxin, M2e protein, Psl, PcrV, S. Aureus toxin, Influenza A, Alginate, Staphylococcus aureus, PD-L1, Influenza B, Acinetobacter, F-protein, Env, CD3, Pathogenic Escherichia coli, Klebsiella, Streptococcus pneumoniae
(5)遺伝性・希少疾患
アミロイドAL、SEMA4D(CD100)、インスリン受容体、ANGPTL3、IL4、IL13、FGF23、副腎皮質刺激ホルモン、トランスサイレチン、ハンチンチン
(5) Hereditary/rare diseases Amyloid AL, SEMA4D (CD100), insulin receptor, ANGPTL3, IL4, IL13, FGF23, adrenocorticotropic hormone, transthyretin, huntingtin
(6)眼疾患
Factor D、IGF-1R、PGDFR、Ang2、VEGF-A、CD-105(Endoglin)、IGF-1R、βアミロイド
(6) eye disease Factor D, IGF-1R, PGDFR, Ang2, VEGF-A, CD-105 (Endoglin), IGF-1R, β amyloid
(7)骨・整形外科領域
Sclerostin、Myostatin、Dickkopf-1、GDF8、RNAKL、HAS、Siglec-15
(7) Bone/orthopedic Sclerostin, Myostatin, Dickkopf-1, GDF8, RNAKL, HAS, Siglec-15
(8)血液疾患
vWF、Factor IXa、Factor X、IFNγ、C5、BMP-6、Ferroportin、TFPI
(8) Blood diseases vWF, Factor IXa, Factor X, IFNγ, C5, BMP-6, Ferroportin, TFPI
(9)その他の疾患
BAFF(B cell activating factor)、IL-1β、PCSK9、NGF、CD45、TLR-2、GLP-1、TNFR1、C5、CD40、LPA、プロラクチン受容体、VEGFR-1、CB1、Endoglin、PTH1R、CXCL1、CXCL8、IL-1β、AT2-R、IAPP
(9) Other diseases BAFF (B cell activating factor), IL-1β, PCSK9, NGF, CD45, TLR-2, GLP-1, TNFR1, C5, CD40, LPA, prolactin receptor, VEGFR-1, CB1, Endoglin, PTH1R, CXCL1, CXCL8, IL-1β, AT2-R, IAPP
より好ましい実施形態では、可溶性タンパク質に対する親和性物質は、モノクローナル抗体に対する親和性物質である。モノクローナル抗体のアイソタイプは、抗体について上述したものと同様であるが、IgG(例、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)が好ましい。好ましくは、モノクローナル抗体は、全長モノクローナル抗体である。 In a more preferred embodiment, the affinity agent for soluble proteins is an affinity agent for monoclonal antibodies. Isotypes for monoclonal antibodies are similar to those described above for antibodies, but IgG (eg, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4) is preferred. Preferably, the monoclonal antibody is a full-length monoclonal antibody.
さらにより好ましい実施形態では、可溶性タンパク質に対する親和性物質は、全長モノクローナル抗体であるキメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体(例、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4等のIgG)に対する親和性物質である。 In an even more preferred embodiment, the affinity agent for a soluble protein is an affinity agent for a full-length monoclonal antibody, a chimeric antibody, a humanized antibody, or a human antibody (e.g., IgG such as IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, etc.). .
特に好ましい実施形態では、可溶性タンパク質に対する親和性物質は、下記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域タンパク質を含み、かつ抗原結合能を有する抗体に対する親和性物質である:
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。
In a particularly preferred embodiment, the affinity substance for a soluble protein is an affinity substance for an antibody that contains any one Fc region protein selected from the group consisting of (A) to (C) below and has antigen-binding ability. be:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
配列番号1のアミノ酸配列は、Fc領域タンパク質である。このようなFc領域タンパク質は、分泌能を有することが知られている。したがって、上記(A)~(C)のFc領域タンパク質は、分泌能を有することができる。また、このようなFc領域タンパク質を含む抗体は、抗原結合能を有することができる。配列番号1における18位のアミノ酸残基は、任意のアミノ酸残基であるが、好ましくは中性アミノ酸残基であり、より好ましくは後述するような非極性側鎖を有するアミノ酸残基であり、さらにより好ましくはロイシン、イソロイシンまたはアラニンであり、特に好ましくはロイシンまたはアラニンである。配列番号1における19位のアミノ酸残基は、任意のアミノ酸残基であるが、好ましくは中性アミノ酸残基または酸性アミノ酸残基であり、より好ましくは非極性側鎖を有するアミノ酸残基または酸性アミノ酸残基であり、さらにより好ましくはロイシンまたはグルタミン酸である。配列番号1における21位のアミノ酸残基は、任意のアミノ酸残基であるが、好ましくは中性アミノ酸残基であり、より好ましくは非極性側鎖を有するアミノ酸残基であり、さらにより好ましくはグリシンまたはアラニンである。配列番号1における140位のアミノ酸残基は、任意のアミノ酸残基であるが、好ましくは酸性アミノ酸残基であり、より好ましくはグルタミン酸またはアスパラギン酸である。配列番号1における142位のアミノ酸残基は、任意のアミノ酸残基であるが、好ましくは中性アミノ酸残基であり、より好ましくは非極性側鎖を有するアミノ酸残基であり、さらにより好ましくはメチオニン、ロイシンまたはイソロイシンであり、特に好ましくはメチオニンまたはロイシンである。配列番号1における177位のアミノ酸残基は、任意のアミノ酸残基である
が、好ましくは中性アミノ酸残基であり、より好ましくは後述するような非荷電性極性側鎖を有するアミノ酸残基または非極性側鎖を有するアミノ酸残基であり、さらにより好ましくはスレオニン、アラニンまたはグリシンであり、特に好ましくはスレオニンまたはアラニンである。
The amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 is the Fc region protein. Such Fc region proteins are known to have secretory ability. Therefore, the Fc region proteins (A) to (C) above can have secretory ability. Antibodies comprising such Fc region proteins can also have antigen-binding ability. The amino acid residue at
好ましい実施形態では、配列番号1のアミノ酸配列は、配列番号2または配列番号41のアミノ酸配列における220~449位のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列であってもよい。 In a preferred embodiment, the amino acid sequence of SEQ ID NO:1 may be an amino acid sequence consisting of amino acid residues at positions 220-449 in the amino acid sequence of SEQ ID NO:2 or SEQ ID NO:41.
別の好ましい実施形態では、配列番号1のアミノ酸配列は、配列番号3のアミノ酸配列における7~236位のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列であってもよい。 In another preferred embodiment, the amino acid sequence of SEQ ID NO:1 may be an amino acid sequence consisting of amino acid residues at positions 7-236 in the amino acid sequence of SEQ ID NO:3.
特定の実施形態では、上述したようなアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質を含む抗体は、上述したようなアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質、および抗体の定常領域を含む抗体であってもよい。このような抗体の定常領域としては、キメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体(例、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4等のIgG)の定常領域であってもよい。 In certain embodiments, an antibody comprising an Fc region protein comprising an amino acid sequence as described above may be an antibody comprising an Fc region protein comprising an amino acid sequence as described above and an antibody constant region. The constant region of such an antibody may be a chimeric antibody, a humanized antibody, or a human antibody (eg, IgG such as IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, etc.).
Fc領域タンパク質(B)では、アミノ酸残基の欠失、置換、付加および挿入からなる群より選ばれる1、2、3または4種の変異により、1個または数個のアミノ酸残基が改変され得る。アミノ酸残基の変異は、アミノ酸配列中の1つの領域に導入されてもよいが、複数の異なる領域に導入されてもよい。用語「1個または数個」は、タンパク質の活性を大きく損なわない個数を示す。用語「1個または数個」が示す数は、例えば、1~100個、好ましくは1~80個、より好ましくは1~50個、1~30個、1~20個、1~10個または1~5個(例、1個、2個、3個、4個、または5個)である。 In the Fc region protein (B), one or several amino acid residues are modified by 1, 2, 3 or 4 mutations selected from the group consisting of deletion, substitution, addition and insertion of amino acid residues. obtain. Amino acid residue mutations may be introduced in one region in the amino acid sequence, but may also be introduced in a plurality of different regions. The term "one or several" indicates the number that does not significantly impair the activity of the protein. The number indicated by the term "one or several" is, for example, 1 to 100, preferably 1 to 80, more preferably 1 to 50, 1 to 30, 1 to 20, 1 to 10 or 1 to 5 (eg, 1, 2, 3, 4, or 5).
Fc領域タンパク質(C)では、配列番号1のアミノ酸配列との同一性%は、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上または99%以上であってもよい。本発明では、ペプチドまたはポリペプチド(タンパク質)の同一性%の算出は、アルゴリズムblastpにより行うことができる。より具体的には、ポリペプチドの同一性の算定%は、National Center for Biotechnology Information(NCBI)において提供されているアルゴリズムblastpにおいて、デフォルト設定のScoring Parameters(Matrix:BLOSUM62;Gap Costs:Existence=11 Extension=1;Compositional Adjustments:Conditional compositional score matrix adjustment)を用いて行うことができる。また、ポリヌクレオチド(遺伝子)の同一性%の算出は、アルゴリズムblastnにより行うことができる。より具体的には、ポリヌクレオチドの同一性%の算定は、NCBIにおいて提供されているアルゴリズムblastnにおいて、デフォルト設定のScoring Parameters(Match/Mismatch Scores=1,-2;Gap Costs=Linear)を用いて行うことができる。 For the Fc region protein (C), the % identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 is 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 91% or more, 92% or more, 93% % or more, 94% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, or 99% or more. According to the present invention, the calculation of % identity of a peptide or polypeptide (protein) can be performed with the algorithm blastp. More specifically, the percentage identity of a polypeptide is calculated using the default Scoring Parameters (Matrix: BLOSUM62; Gap Costs: Existence=11 Extension = 1; Compositional Adjustments: Conditional compositional score matrix adjustment). Calculation of percent identity of polynucleotides (genes) can also be performed by the algorithm blastn. More specifically, the % identity of the polynucleotide is calculated using the default Scoring Parameters (Match/Mismatch Scores = 1, -2; Gap Costs = Linear) in the algorithm blastn provided in NCBI. It can be carried out.
分泌能における分泌は、分泌タンパク質の分泌(いわゆる可溶性)と同じ意味である。したがって、「分泌能を有する」とは、通常の抗体と同様に、可溶性タンパク質として機能することを意味する。 Secretion in secretory capacity is synonymous with secretion of secretory proteins (so-called soluble). Therefore, "having secretory ability" means functioning as a soluble protein, like a normal antibody.
上記Fc領域タンパク質を含む抗体は、目的の特性(例、分泌能、抗原結合能)を保持する限り、特定の部位に、変異が導入されていてもよい。目的の特性を保持し得る、変異
が導入されてもよいアミノ酸残基の位置は、当業者に明らかである。具体的には、当業者は、1)同種の特性を有する複数のタンパク質のアミノ酸配列を比較し、2)相対的に保存されている領域、および相対的に保存されていない領域を明らかにし、次いで、3)相対的に保存されている領域および相対的に保存されていない領域から、それぞれ、機能に重要な役割を果たし得る領域および機能に重要な役割を果たし得ない領域を予測できるので、構造・機能の相関性を認識することができる。したがって、当業者は、上記Fc領域タンパク質を含む抗体のアミノ酸配列において変異が導入されてもよいアミノ酸残基の位置を特定できる。
Antibodies comprising the Fc region protein may have mutations introduced at specific sites as long as the desired properties (eg, secretion ability, antigen-binding ability) are maintained. The positions of amino acid residues that may be mutated that may retain the properties of interest will be apparent to those skilled in the art. Specifically, one skilled in the art can 1) compare the amino acid sequences of multiple proteins with similar properties, 2) identify regions that are relatively conserved, and regions that are relatively non-conserved, and 3) since relatively conserved and relatively non-conserved regions can predict regions that may and may not play an important role in function, respectively. Recognize the relationship between structure and function. Therefore, those skilled in the art can identify the positions of amino acid residues that may be mutated in the amino acid sequence of the antibody containing the Fc region protein.
アミノ酸残基が置換により変異される場合、アミノ酸残基の置換は、保存的置換であってもよい。本明細書中で用いられる場合、用語「保存的置換」とは、所定のアミノ酸残基を、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換することをいう。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該分野で周知である。例えば、このようなファミリーとしては、塩基性側鎖を有するアミノ酸(例、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖を有するアミノ酸(例、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電性極性側鎖を有するアミノ酸(例、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖を有するアミノ酸(例、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β位分岐側鎖を有するアミノ酸(例、スレオニン、バリン、イソロイシン)、芳香族側鎖を有するアミノ酸(例、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)、ヒドロキシル基(例、アルコール性、フェノール性)含有側鎖を有するアミノ酸(例、セリン、スレオニン、チロシン)、および硫黄含有側鎖を有するアミノ酸(例、システイン、メチオニン)が挙げられる。好ましくは、アミノ酸の保存的置換は、アスパラギン酸とグルタミン酸との間での置換、アルギニンとリジンとヒスチジンとの間での置換、トリプトファンとフェニルアラニンとの間での置換、フェニルアラニンとバリンとの間での置換、ロイシンとイソロイシンとアラニンとの間での置換、およびグリシンとアラニンとの間での置換であってもよい。 When amino acid residues are mutated by substitution, the substitution of amino acid residues may be conservative substitutions. As used herein, the term "conservative substitution" refers to the replacement of a given amino acid residue with an amino acid residue having a similar side chain. Families of amino acid residues with similar side chains are well known in the art. For example, such families include amino acids with basic side chains (e.g. lysine, arginine, histidine), amino acids with acidic side chains (e.g. aspartic acid, glutamic acid), amino acids with uncharged polar side chains. (e.g. asparagine, glutamine, serine, threonine, tyrosine, cysteine), amino acids with non-polar side chains (e.g. glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine, tryptophan), β branched side chains (e.g. threonine, valine, isoleucine), amino acids with aromatic side chains (e.g. tyrosine, phenylalanine, tryptophan, histidine), amino acids with hydroxyl group (e.g. alcoholic, phenolic) containing side chains (e.g. serine, threonine, tyrosine), and amino acids with sulfur-containing side chains (eg, cysteine, methionine). Preferably, conservative amino acid substitutions are between aspartic acid and glutamic acid, between arginine and lysine and histidine, between tryptophan and phenylalanine, between phenylalanine and valine. , between leucine, isoleucine and alanine, and between glycine and alanine.
上記(A)~(C)からなる群より選ばれるいずれか一つのFc領域を含む抗体としては、例えば、キメラ抗体(例、リツキシマブ、バシリキシマブ、インフリキシマブ、セツキシマブ、シルツキシマブ、ディヌツキシマブ、オルタトキサシマブ)、ヒト化抗体(例、ダクリヅマブ、パリビズマブ、トラスツズマブ、アレンツズマブ、オマリヅマブ、エファリヅマブ、ベバシヅマブ、ナタリヅマブ(IgG4)、トシリヅマブ、エクリヅマブ(IgG2)、モガムリヅマブ、ペルツヅマブ、オビヌツヅマブ、ベドリヅマブ、ペンプロリヅマブ(IgG4)、メポリヅマブ、エロツヅマブ、ダラツムマブ、イケセキヅマブ(IgG4)、レスリヅマブ(IgG4)、アテゾリヅマブ)、ヒト抗体(例、アダリムマブ、パニツムマブ、ゴリムマブ、ウステキヌマブ、カナキヌマブ、オファツムマブ、デノスマブ(IgG2)、イピリムマブ、ベリムマブ、ラキシバクマブ、ラムシルマブ、ニボルマブ(IgG4)、セクキヌマブ、エボロクマブ(IgG2)、アリロクマブ、ネシツムマブ、ブロダルマブ(IgG2)、オララツマブ)が挙げられる(IgGサブタイプに言及していない場合、IgG1であることを示す)。 Antibodies comprising any one Fc region selected from the group consisting of (A) to (C) above include, for example, chimeric antibodies (e.g., rituximab, basiliximab, infliximab, cetuximab, siltuximab, dinutuximab, ortatoxasimab) , humanized antibodies (e.g., daclidumab, palivizumab, trastuzumab, alentuzumab, omalizumab, efalizumab, bevacizumab, natalizumab (IgG4), tocilizumab, eculizumab (IgG2), mogamulizumab, pertuzumab, obinutuzumab, vedolizumab, penprolizumab, erpolizumab (IgG4), daratumumab, ikesekizumab (IgG4), resulizumab (IgG4), atezolizumab), human antibodies (e.g., adalimumab, panitumumab, golimumab, ustekinumab, canakinumab, ofatumumab, denosumab (IgG2), ipilimumab, belimumab, ruxibakumab, ramucirumab, nivolumab (IgG4) secukinumab, evolocumab (IgG2), alirocumab, necitumumab, brodalumab (IgG2), olalatumab) (where no IgG subtype is mentioned, IgG1 is indicated).
上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質としては、例えば、ペプチド(オリゴペプチド、ポリペプチド、およびタンパク質を含む)、低分子化合物、核酸、核酸-ペプチド複合体、ペプチド-低分子化合物複合体、核酸―低分子複合体挙げられる。 Substances with affinity for soluble proteins as described above include, for example, peptides (including oligopeptides, polypeptides, and proteins), low-molecular-weight compounds, nucleic acids, nucleic acid-peptide complexes, peptide-low-molecular-weight compound complexes, nucleic acids - including low-molecular-weight complexes.
特定の実施形態では、上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質は、ペプチド(オリゴペプチド、ポリペプチド、タンパク質を含む。糖タンパク質であってもよい)であってもよい。このようなペプチドとしては、例えば、以下が報告されている:
(1)ヒトIgG全般(すなわち、ヒトIgG1、IgG2、IgG3およびIgG4。
以下同様)の特定領域(CH2領域)に親和性を有するIgG結合ペプチド(例、国際公開第2016/186206号、国際公開2013/027796号、国際公開第2008/054030号を参照);
(2)ヒトIgG全般の特定領域(CH2領域)に親和性を有するProteinA Mimetic(PAM) peptide(例、Fassina G et al.,JOURNAL OF MOLECULAR RECOGNITION,1996,VOL.6,564-569を参照);
(3)ヒトIgG全般の特定領域(CH2領域)に親和性を有するEPIHRSTLTALL(配列番号9)(例、Ehrlich G.K et al.,J.Biochem.Biophys.Methods,2001,VOL.49,443-454を参照);
(4)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有する(NH2-Cys1-X1-X2-X3-X4)2-Lys-Gly-OH(例、Ruvo M et al.,ChemBioChem,2005,VOL.6,1242-1253を参照);
(5)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するFARLVSSIRY(配列番号10)、FGRLVSSIRY(配列番号11)、およびTWKTSRISIF(配列番号12)(例、Krook M et al.,Journal of Immunological Methods,1998,VOL.221,151-157を参照);
(6)ヒトIgG全般の特定領域に親和性を有するQSYP(配列番号13)(例、Jacobs J.M. et al.,Bio.Techniques,2003,VOL.34,132-141を参照);
(7)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するHWRGWV(配列番号14)、HYFKFD(配列番号15)、およびHFRRHL(配列番号16)(例、Carbonell R.G. et al.,Journal of Chromatography A,2009,VOL.1216,910-918を参照);
(8)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するDAAG(配列番号17)(例、Lund L.N. et al.,Journal of Chromatography A,2012,VOL.1225,158-167を参照);
(9)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するFc-I、Fc-II、およびFc-III(例、Warren L.Delano et al.,Science,2000,VOL.287,1279-1283;国際公開2001/045746号を参照);ならびに
(10)ヒトIgG全般の特定領域(Fc領域)に親和性を有するNARKFYKG(配列番号18)、およびNKFRGKYK(配列番号19)(例、Biochemical
Engineering Journal,2013,VOL.79,33-40を参照)。
In certain embodiments, the affinity agent for a soluble protein as described above may be a peptide (including oligopeptides, polypeptides, proteins, which may be glycoproteins). For example, the following peptides have been reported:
(1) human IgG in general (ie, human IgG1, IgG2, IgG3 and IgG4;
IgG-binding peptides (e.g., WO 2016/186206, WO 2013/027796, see WO 2008/054030) that have affinity for a specific region (CH2 region) of hereinafter the same);
(2) Protein A mimetic (PAM) peptide having affinity for a specific region (CH2 region) of human IgG in general (see, for example, Fassina G et al., JOURNAL OF MOLECULAR RECOGNIZATION, 1996, VOL.6, 564-569) ;
(3) EPIHRSTTALL (SEQ ID NO: 9) having affinity for a specific region (CH2 region) of general human IgG (e.g., Ehrlich GK et al., J. Biochem. Biophys. Methods, 2001, VOL. 49, 443 -454);
(4) (NH2-Cys1-X1-X2-X3-X4) 2-Lys-Gly-OH (e.g., Ruvo M et al., ChemBioChem, 2005) that has affinity for a specific region (Fc region) of human IgG in general , VOL.6, 1242-1253);
(5) FARLVSSIRY (SEQ ID NO: 10), FGRLVSSIRY (SEQ ID NO: 11), and TWKTSRISIF (SEQ ID NO: 12) having affinity for specific regions (Fc regions) of general human IgG (eg, Krook M et al., Journal of Immunological Methods, 1998, VOL.221, 151-157);
(6) QSYP (SEQ ID NO: 13) having affinity for specific regions of human IgG in general (see, for example, Jacobs JM et al., Bio.Techniques, 2003, VOL.34, 132-141);
(7) HWRGWV (SEQ ID NO: 14), HYFKFD (SEQ ID NO: 15), and HFRRHL (SEQ ID NO: 16) having affinity for a specific region (Fc region) of general human IgG (eg, Carbonell RG et al. , Journal of Chromatography A, 2009, VOL.1216, 910-918);
(8) DAAG (SEQ ID NO: 17) having affinity for a specific region (Fc region) of general human IgG (e.g., Lund LN et al., Journal of Chromatography A, 2012, VOL.1225, 158-167 );
(9) Fc-I, Fc-II, and Fc-III having affinity for a specific region (Fc region) of general human IgG (e.g., Warren L. Delano et al., Science, 2000, VOL.287, 1279 -1283; see WO 2001/045746); and (10) NARKFYKG (SEQ ID NO: 18) and NKFRGKYK (SEQ ID NO: 19) with affinity to specific regions (Fc regions) of human IgG in general (e.g., Biochemical
Engineering Journal, 2013, VOL. 79, 33-40).
別の特定の実施形態では、上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質は、ペプチド以外の物質であってもよい。このような物質としては、例えば、ヒトIgG(例、ヒトIgG1~4)の特定領域(CH2領域、特にLys340の側鎖)に親和性を有するアプタマー〔例、GGUGCUおよびGGUGAU等のGGUG(C/A)(U/T)モチーフ含有アプタマー〕が報告されている(例、国際公開第2007/004748号公報;Nomura Y et al.,Nucleic Acids Res.,2010 Nov;38(21):7822-9;Miyakawa S et al.,RNA.,2008 Jun;14(6):1154-63を参照)。 In another particular embodiment, the affinity substance for soluble proteins as described above may be substances other than peptides. Such substances include, for example, aptamers having affinity for specific regions (CH2 region, especially the side chain of Lys340) of human IgG (e.g., human IgG1-4) [e.g., GGUGs such as GGUGCU and GGUGAU (C/ A) (U / T) motif-containing aptamers] have been reported (e.g., International Publication No. 2007/004748; Nomura Y et al., Nucleic Acids Res., 2010 Nov; 38(21): 7822-9 Miyakawa S et al., RNA., 2008 Jun;14(6):1154-63).
上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質は、当該分野における任意の公知の方法により得ることができる。例えば、可溶性タンパク質全体、または可溶性タンパク質中の部分ペプチド(例、タンパク質表面露出領域が判明している場合、当該領域中に存
在する部分ペプチド)を用いて、抗体を作製することにより(例、ハイブリドーマ法)、または親和性物質を入手可能なライブラリ(例、ペプチドライブラリ、抗体ライブラリ、抗体産生細胞ライブラリ、アプタマーライブラリ、ファージライブラリ、mRNAライブラリ、cDNAライブラリ)から親和性物質をスクリーニングすることにより(例、ファージディスプレイ法、SELEX法、mRNAディスプレイ法、リボソームディスプレイ法、cDNAディスプレイ法、酵母ディスプレイ法)、取得することができる。また、可溶性タンパク質に対する親和性物質が抗体のFc領域(可溶性領域)に対する親和性物質である場合、各種抗体(例、IgG、IgA、IgM、IgD、IgE)のFc領域の特定領域(例、CH1、CH2、CH3)中に存在する部分ペプチドを用いることにより、抗体のFc領域中の任意の部分に対して選択的に結合することができる親和性物質(例、抗体、アプタマー)を効率的に取得することができる。このようにして取得される親和性物質のなかには、親和的結合能が相対的に強いものおよび弱いものが混在する。しかし、親和的結合能が弱い親和性物質であっても、過剰量で用いることにより、その親和的結合能を補強することができる。
Affinity substances for soluble proteins as described above can be obtained by any known method in the art. For example, by using a whole soluble protein or a partial peptide in the soluble protein (e.g., when the surface-exposed region of the protein is known, a partial peptide present in the region) to produce an antibody (e.g., hybridoma method), or by screening affinity substances from libraries where affinity substances are available (e.g., peptide libraries, antibody libraries, antibody-producing cell libraries, aptamer libraries, phage libraries, mRNA libraries, cDNA libraries) (e.g., phage display method, SELEX method, mRNA display method, ribosome display method, cDNA display method, yeast display method). Further, when the substance with affinity for soluble proteins is a substance with affinity for the Fc region (soluble region) of an antibody, a specific region (eg, CH1 , CH2, CH3), an affinity substance (e.g., antibody, aptamer) capable of selectively binding to any portion in the Fc region of an antibody can be efficiently produced. can be obtained. Among the affinity substances obtained in this way, there is a mixture of those with relatively strong and weak affinity binding abilities. However, even an affinity substance with weak affinity binding ability can be used in an excessive amount to reinforce the affinity binding ability.
上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質は、下記式(i)で表されるIgG結合性ペプチドまたはその塩であってもよい(例、実施例および国際公開第2016/186206号)。
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号94) (i)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕
によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩。
Xaa1およびXaa2はそれぞれ異なるアミノ酸残基であることが好ましい。
The affinity substance for soluble proteins as described above may be an IgG-binding peptide represented by the following formula (i) or a salt thereof (eg, Examples and WO 2016/186206).
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 94) (i)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
A peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues represented by and capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
Xaa1 and Xaa2 are preferably different amino acid residues.
本明細書において、N末端またはC末端のX1-3という表記は、システイン(CまたはCys)以外の独立的に任意のアミノ酸残基Xが1~3個連続していることを意味し、それを構成するアミノ酸残基は同じか、または異なる残基であるが、好ましくは3個すべてが同じ残基でない配列からなる。同様に、X2もシステイン(CまたはCys)以外の独立的に任意のアミノ酸残基Xが2個連続していることを意味し、それを構成するアミノ酸残基は同じか、または異なる残基であるが、好ましくは当該2個連続しているアミノ酸残基は同じ残基でない配列からなる。後述するX1もシステイン(CまたはCys)以外の独立的に任意のアミノ酸残基Xが1個存在することを意味する。 As used herein, the notation X 1-3 at the N-terminus or C-terminus means that 1 to 3 consecutive arbitrary amino acid residues X independently other than cysteine (C or Cys), The amino acid residues that constitute it are the same or different residues, but preferably consist of a sequence in which all three are not the same residues. Similarly, X2 also means that two consecutive arbitrary amino acid residues X other than cysteine (C or Cys) are consecutive, and the amino acid residues constituting it are the same or different residues. However, preferably the two consecutive amino acid residues consist of a sequence that is not the same residue. X1, which will be described later, also means that there is one independently arbitrary amino acid residue X other than cysteine (C or Cys).
また、本明細書において、ペプチドの各アミノ酸配列の中に離間した少なくとも2つのシステイン残基は、ジスルフィド結合により環状ペプチドを形成することができる。通常、上記式(i)等の式のペプチドにおいて、外側の2つのシステイン残基は、ジスルフィド結合している。あるいは、上記式(i)等の式のペプチドにおいて、外側の2つのシステイン残基中のスルフィド基は、以下で表されるカルボニル基含有リンカーにより連結さ
れていてもよい。
Also herein, at least two cysteine residues spaced in each amino acid sequence of the peptide can form a cyclic peptide through disulfide bonds. Generally, in peptides of formulas such as formula (i) above, the outer two cysteine residues are disulfide-bonded. Alternatively, in the peptide of the formula (i) above, the sulfide groups in the two outer cysteine residues may be linked by a carbonyl group-containing linker shown below.
上記で表されるカルボニル基含有リンカーの破線部分は、スルフィド基との結合部分を意味する。当該リンカーは、通常のジスルフィド結合よりも、還元反応等に対して安定である。このペプチドは、例えば、国際公開第2016/186206号に記載される方法により、調製することができる。 The dashed portion of the carbonyl group-containing linker represented above means the portion that binds to the sulfide group. The linker is more stable against reduction reactions and the like than ordinary disulfide bonds. This peptide can be prepared, for example, by the method described in WO2016/186206.
特定の実施形態では、上記式(i)の親和性物質は、下記式(i-1)で表されるIgG結合性ペプチドまたはその塩であってもよい(例、国際公開第2016/186206号)。
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号95) (i-1)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gはグリシン残基であり、
Xaa2はグルタミン酸残基またはアスパラギン残基であり、
Lはロイシン残基であり、
Vはバリン残基であり、かつ
Wはトリプトファン残基である。〕
によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩。
Xaa1およびXaa2はそれぞれ異なるアミノ酸残基であることが好ましい。
In certain embodiments, the affinity substance of formula (i) above may be an IgG-binding peptide represented by formula (i-1) below or a salt thereof (eg, International Publication No. 2016/186206 ).
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 95) (i-1)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a glutamic acid residue or an asparagine residue,
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
A peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues represented by and capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
Xaa1 and Xaa2 are preferably different amino acid residues.
別の特定の実施形態では、上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質は、下記式(i-2)で表されるIgG結合性ペプチドまたはその塩であってもよい(例、実施例)。
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号96) (i-2)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、またはロイシン残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能である
ペプチドまたはその塩。
このような特定の構造を有する国際公開第2016/186206号に未開示の親和性物質は、ヒトIgG FcにおけるEu numberingに従うLys248残基またはLys246残基、あるいはLys248残基またはLys246残基以外の他のアミノ酸残基の位置選択的な修飾に有用である(実施例)。
In another specific embodiment, the affinity substance for soluble proteins as described above may be an IgG-binding peptide represented by the following formula (i-2) or a salt thereof (eg, Examples).
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 96) (i-2)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue or a leucine residue,
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof.
The affinity substance not disclosed in WO 2016/186206 having such a specific structure is Lys248 or Lys246 according to Eu numbering in human IgG Fc, or other than Lys248 or Lys246 (Example).
式(i-1)のペプチドのアミノ酸配列においてアミノ酸残基Xをさらに特定した式(i-1’)および式(i-1’’)で表されるペプチドを以下に示す。 Peptides represented by formula (i-1′) and formula (i-1″) in which amino acid residue X is further specified in the amino acid sequence of the peptide of formula (i-1) are shown below.
すなわち、式(i-1’)で表されるペプチドは、
(X1-3)-C-(X1)-Y-H-(Xaa1)-G-N-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号97) (i-1’)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Yは、チロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Nは、アスパラギン残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕
で表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIg Gおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とする。
That is, the peptide represented by formula (i-1') is
(X 1-3 )-C-(X1)-YH-(Xaa1)-GNLVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 97) (i-1′)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
Y is a tyrosine residue;
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
N is an asparagine residue,
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
式(i-1’’)で表されるペプチドは、
(X1-3)-C-A-(X1)-H-(Xaa1)-G-E-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号98) (i-1’’)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Aは、アラニン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Eは、グルタミン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕
で表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とする。
The peptide represented by formula (i-1'') is
(X 1-3 )-CA-(X1)-H-(Xaa1)-GELVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 98) (i-1″ )
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
A is an alanine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
E is a glutamic acid residue,
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
また、式(i-1)のペプチドのアミノ酸配列においてアミノ酸残基Xをさらに特定した式(ii)で表されるペプチドを以下に示す。 A peptide represented by formula (ii), in which amino acid residue X is further specified in the amino acid sequence of the peptide of formula (i-1), is shown below.
すなわち、式(ii)で表されるペプチドは、
(X1-3)-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)
-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号99) (ii)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、グルタミン酸残基またはアスパラギン残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、セリン残基またはスレオニン残基であり、かつ
Xaa4は、チロシン残基またはトリプトファン残基である。〕
で表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とする。
That is, the peptide represented by formula (ii) is
(X 1-3 )-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)
-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 99) (ii)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a glutamic acid residue or an asparagine residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa3 is an alanine, serine or threonine residue, and Xaa4 is a tyrosine or tryptophan residue. ]
and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
式(i)等の式のペプチドのアミノ酸配列において、17アミノ酸残基とした場合、N末端から1番目および2番目、ならびに16番目および17番目のアミノ酸残基Xは欠失していてもよく、そのようなペプチドは13アミノ酸長からなる。 In the amino acid sequence of the peptide of the formula such as formula (i), when 17 amino acid residues are used, the 1st and 2nd, and 16th and 17th amino acid residues X from the N-terminus may be deleted. , such a peptide consists of 13 amino acids in length.
本明細書で使用する「17アミノ酸残基とした場合」とは、ペプチドのアミノ酸残基をアミノ酸番号で呼ぶときに、式(i)のペプチド等について最長のアミノ酸長である17残基のN末端から順番に1番目から17番目まで番号づけするために便宜的に表現した用語である。 As used herein, the phrase "assuming 17 amino acid residues" refers to N of 17 residues, which is the longest amino acid length for peptides such as those of formula (i), when the amino acid residues of the peptide are referred to by amino acid number. It is a term used for convenience in order to number from 1st to 17th in order from the end.
また、式(i-1)のペプチドのアミノ酸配列においてアミノ酸残基Xをさらに特定した式(iii)で表されるペプチドを以下に示す。 A peptide represented by formula (iii), in which amino acid residue X is further specified in the amino acid sequence of the peptide of formula (i-1), is shown below.
すなわち、式(iii)で表されるペプチドは、
(X1-3)-C-A-Y-H-(Xaa1)-G-E-L-V-W-C-(X1-3)
(配列番号100) (iii)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Aは、アラニン残基であり、
Yは、チロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Eは、グルタミン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕
で表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とする。
That is, the peptide represented by formula (iii) is
(X 1-3 )-CAYH-(Xaa1)-GEL-VWC-(X 1-3 )
(SEQ ID NO: 100) (iii)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
A is an alanine residue,
Y is a tyrosine residue;
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
E is a glutamic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
式(iii)のペプチドのアミノ酸配列において、17アミノ酸残基とした場合、N末端から1番目および2番目、ならびに16番目および17番目のアミノ酸残基Xは欠失し
ていてもよく、そのようなペプチドは13アミノ酸長からなる。
In the amino acid sequence of the peptide of formula (iii), when 17 amino acid residues are used, the 1st and 2nd amino acid residues and the 16th and 17th amino acid residues X from the N-terminus may be deleted. A typical peptide consists of 13 amino acids in length.
さらに、上記の各式のペプチドのアミノ酸配列のシステイン(C)以外のアミノ酸残基、すなわち、17アミノ酸残基とした場合、N末端から1~3、5、6、15~17番目の各アミノ酸残基は、以下のものから選択されることが好ましい。ここで、各大文字のアルファベットは、アミノ酸の一文字表記である:
1番目のアミノ酸残基=S、G、Fまたは、なし
2番目のアミノ酸残基=D、G、A、S、P、ホモシステインまたは、なし
3番目のアミノ酸残基=S、D、T、N、EまたはR、
15番目のアミノ酸残基=S、TまたはD、
16番目のアミノ酸残基=H、G、Y、T、N、D、F、ホモシステインまたは、なし、
17番目のアミノ酸残基=Y、F、H、Mまたは、なし。
5番目のアミノ酸残基=AまたはT、
6番目のアミノ酸残基=YまたはW。
Furthermore, amino acid residues other than cysteine (C) in the amino acid sequence of the peptides of the above formulas, that is, when 17 amino acid residues, the 1st to 3rd, 5th, 6th, 15th to 17th amino acids from the N-terminus Preferably, residues are selected from: where each capital letter is the single-letter code for an amino acid:
1st amino acid residue = S, G, F or none 2nd amino acid residue = D, G, A, S, P, homocysteine or none 3rd amino acid residue = S, D, T, N, E or R,
15th amino acid residue = S, T or D,
16th amino acid residue = H, G, Y, T, N, D, F, homocysteine or none;
17th amino acid residue = Y, F, H, M or none.
5th amino acid residue = A or T,
6th amino acid residue = Y or W;
また、式(i-1)のペプチドのアミノ酸配列においてアミノ酸残基Xをさらに特定した式(iv)で表されるペプチドを以下に示す。 A peptide represented by formula (iv), in which amino acid residue X is further specified in the amino acid sequence of the peptide of formula (i-1), is shown below.
すなわち、式(iv)で表されるペプチドは、
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-T (配列番号101) (iv)
〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、グルタミン酸残基またはアスパラギン残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Tは、スレオニン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基またはスレオニン残基であり、かつ、
Xaa4は、チロシン残基またはトリプトファン残基である。〕で表される、13アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とする。
That is, the peptide represented by formula (iv) is
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWCT (SEQ ID NO: 101) (iv)
[In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a glutamic acid residue or an asparagine residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
T is a threonine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a threonine residue, and
Xaa4 is a tyrosine or tryptophan residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG.
式(i-1)のペプチドの具体例のいくつかを以下の(1)~(19)に列挙するが、これらに制限されないことはいうまでもない:
(1)DCAYH(Xaa1)GELVWCT(配列番号20);
(2)GPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号21);
(3)RCAYH(Xaa1)GELVWCS(配列番号22);
(4)GPRCAYH(Xaa1)GELVWCSFH(配列番号23);
(5)SPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号24);
(6)GDDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号25);
(7)GPSCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号26);
(8)GPDCAYH(Xaa1)GELVWCSFH(配列番号27);
(9)GPDCAYH(Xaa1)GELVWCTHH(配列番号28);
(10)GPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFY(配列番号29);
(11)SPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFY(配列番号30);
(12)SDDCAYH(Xaa1)GELVWCTFY(配列番号31);
(13)RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTYH(配列番号32);
(14)G(Xaa2)DCAYH(Xaa1)GELVWCT(Xaa2)H(配列番号33);
(15)RRGPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号34);
(16)DCTYH(Xaa1)GNLVWCT(配列番号35);
(17)DCAYH(Xaa1)GNLVWCT(配列番号36);
(18)DCTYH(Xaa1)GELVWCT(配列番号37);および
(19)DCAWH(Xaa1)GELVWCT(配列番号38)。
〔式中、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Xaa2は、ホモシステインであり、
好ましくは、ホモシステイン同士は、互いにジスルフィド結合を形成している。〕。
Some specific examples of peptides of formula (i-1) are listed in (1) to (19) below, but needless to say, they are not limited to:
(1) DCAYH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO: 20);
(2) GPDCAYH (Xaa1) GELVWCTFH (SEQ ID NO: 21);
(3) RCAYH(Xaa1)GELVWCS (SEQ ID NO: 22);
(4) GPRCAYH(Xaa1)GELVWCSFH (SEQ ID NO: 23);
(5) SPDCAYH (Xaa1)GELVWCTFH (SEQ ID NO: 24);
(6) GDDCAYH (Xaa1) GELVWCTFH (SEQ ID NO: 25);
(7) GPSCAYH(Xaa1)GELVWCTFH (SEQ ID NO: 26);
(8) GPDCAYH (Xaa1) GELVWCSFH (SEQ ID NO: 27);
(9) GPDCAYH (Xaa1) GELVWCTHH (SEQ ID NO: 28);
(10) GPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFY (SEQ ID NO: 29);
(11) SPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFY (SEQ ID NO: 30);
(12) SDDCAYH(Xaa1)GELVWCTFY (SEQ ID NO: 31);
(13) RGNCAYH (Xaa1) GQLVWCTYH (SEQ ID NO: 32);
(14) G(Xaa2)DCAYH(Xaa1)GELVWCT(Xaa2)H (SEQ ID NO: 33);
(15) RRGPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH (SEQ ID NO: 34);
(16) DCTYH(Xaa1)GNLVWCT (SEQ ID NO: 35);
(17) DCAYH(Xaa1)GNLVWCT (SEQ ID NO: 36);
(18) DCTYH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO:37); and (19) DCAWH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO:38).
[In the formula,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
Xaa2 is homocysteine;
Preferably, the homocysteines form disulfide bonds with each other. ].
式(i-1)のペプチドの好ましい具体例としては、以下が挙げられる:
(1)DCAYH(Xaa1)GELVWCT(配列番号20);
(2)GPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号21);
(13)RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTYH(配列番号22);
(14)G(Xaa2)DCAYH(Xaa1)GELVWCT(Xaa2)H(配列番号33);および
(15)RRGPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH(配列番号34)。
〔式中、
Xaa1は、リジン残基であり、
Xaa2は、ホモシステインであり、
好ましくは、システイン同士および/またはホモシステイン同士は、互いにジスルフィド結合を形成している。〕
Preferable specific examples of the peptide of formula (i-1) include the following:
(1) DCAYH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO: 20);
(2) GPDCAYH (Xaa1) GELVWCTFH (SEQ ID NO: 21);
(13) RGNCAYH (Xaa1) GQLVWCTYH (SEQ ID NO: 22);
(14) G(Xaa2)DCAYH(Xaa1)GELVWCT(Xaa2)H (SEQ ID NO:33); and (15) RRGPDCAYH(Xaa1)GELVWCTFH (SEQ ID NO:34).
[In the formula,
Xaa1 is a lysine residue,
Xaa2 is homocysteine;
Preferably, cysteines and/or homocysteines form disulfide bonds with each other. ]
上記(13)のペプチドは、RGNCAYHKGQLVWCTYH(配列番号39)であってもよい。 The peptide of (13) above may be RGNCAYHKGQLVWCTYH (SEQ ID NO: 39).
別の特定の実施形態では、上記式(i)の親和性物質は、下記式(v)で表されるIgG結合性ペプチドまたはその塩であってもよい(例、実施例)。
(X1-3)-C-(Xaa3)-(xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号102)
(v)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、かつ
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩。
In another specific embodiment, the affinity substance of formula (i) above may be an IgG-binding peptide represented by formula (v) below or a salt thereof (eg, Examples).
(X 1-3 )-C-(Xaa3)-(xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (sequence number 102)
(v)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue, and Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or no residue. ] and is capable of binding to human IgG, or a salt thereof.
このような特定の構造を有する国際公開第2016/186206号に未開示の親和性物質は、ヒトIgG FcにおけるEu numberingに従うLys248残基またはLys246残基、あるいはLys248残基またはLys246残基以外の他のアミノ酸残基の位置選択的な修飾に有用である(実施例)。好ましくは、Xaa3、Xaa1、Xaa2、Xaa5、Xaa6、およびXaa7のいずれか一つが、リジン残基である。Xaa1は、好ましくは、アルギニン残基、またはロイシン残基であってもよい。あるいは、Xaa1は、好ましくは、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、より好ましくは、リジン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基であってもよい。 The affinity substance not disclosed in WO 2016/186206 having such a specific structure is Lys248 or Lys246 according to Eu numbering in human IgG Fc, or other than Lys248 or Lys246 (Example). Preferably, any one of Xaa3, Xaa1, Xaa2, Xaa5, Xaa6 and Xaa7 is a lysine residue. Xaa1 may preferably be an arginine residue or a leucine residue. Alternatively, Xaa1 is preferably a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue, more preferably a lysine residue or an aspartic acid residue. , or glutamic acid residues.
式(v)のペプチドのアミノ酸配列において、17アミノ酸残基とした場合、N末端から1番目および2番目、ならびに16番目および17番目のアミノ酸残基Xは欠失していてもよく、そのようなペプチドは13アミノ酸長からなる。 In the amino acid sequence of the peptide of formula (v), when 17 amino acid residues are used, the 1st and 2nd, and 16th and 17th amino acid residues X from the N-terminus may be deleted. A typical peptide consists of 13 amino acids in length.
さらに、上記式(v)のペプチドのアミノ酸配列のシステイン(C)以外のアミノ酸残基、すなわち、17アミノ酸残基とした場合、N末端から1~3番目の各アミノ酸残基は、以下のものから選択されることが好ましい。ここで、各大文字のアルファベットは、アミノ酸の一文字表記である:
1番目のアミノ酸残基=R、S、G、Fまたは、なし(好ましくは、R、または、なし)
2番目のアミノ酸残基=D、G、A、S、P、ホモシステインまたは、なし(好ましくは、G、またはなし)
3番目のアミノ酸残基=S、D、T、N、EまたはR(好ましくは、N、またはD)。
Furthermore, when amino acid residues other than cysteine (C) in the amino acid sequence of the peptide of the above formula (v), that is, 17 amino acid residues, each of the 1st to 3rd amino acid residues from the N-terminus has the following: is preferably selected from where each capital letter is the single-letter code for an amino acid:
1st amino acid residue = R, S, G, F or none (preferably R or none)
2nd amino acid residue = D, G, A, S, P, homocysteine or none (preferably G or none)
3rd amino acid residue = S, D, T, N, E or R (preferably N or D).
式(v)のペプチドの具体例のいくつかを以下の(16)~(34)に列挙するが、これらに制限されないことはいうまでもない:
(16)RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTYH(配列番号73)
(17)RGNCAWH(Xaa1)GQLVWCTYH(配列番号74)
(18)RGNCAWH(Xaa1)GELVWCTYH(配列番号75)
(19)RGNCKWH(Xaa1)GQLVWCTYH(配列番号76)
(20)RGNCKYH(Xaa1)GELVWCTYH(配列番号77)
(21)RGNCKYH(Xaa1)GQLVWCTYH(配列番号78)
(22)DCKWH(Xaa1)GELVWCT(配列番号79)
(23)DCKYH(Xaa1)GELVWCT(配列番号80)
(24)DCKWH(Xaa1)GELVWCT(配列番号81)
(25)DCKWH(Xaa1)GQLVWCT(配列番号82)
(26)DCKYH(Xaa1)GELVWCT(配列番号83)
(27)DCKYH(Xaa1)GQLVWCT(配列番号84)
(28)DCKWH(Xaa1)GQLVWCT(配列番号85)
(29)DCKYH(Xaa1)GQLVWCT(配列番号86)
(30)RGNCAWH(Xaa1)GQLVWCKYH(配列番号87)
(31)RGNCAWH(Xaa1)GELVWCKYH(配列番号88)
(32)RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTKH(配列番号89)
(33)RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTYK(配列番号90)
(34)RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTKH(配列番号91)。
〔式中、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基である。〕。
好ましくは、Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基であり、より好ましくはリジン残基である。
Some specific examples of peptides of formula (v) are listed in (16) to (34) below, but are of course not limited to:
(16) RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTYH (SEQ ID NO: 73)
(17) RGNCAWH(Xaa1)GQLVWCTYH (SEQ ID NO: 74)
(18) RGNCAWH(Xaa1)GELVWCTYH (SEQ ID NO: 75)
(19) RGNCKWH(Xaa1)GQLVWCTYH (SEQ ID NO: 76)
(20) RGNCKYH (Xaa1) GELVWCTYH (SEQ ID NO: 77)
(21) RGNCKYH(Xaa1)GQLVWCTYH (SEQ ID NO: 78)
(22) DCKWH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO: 79)
(23) DCKYH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO: 80)
(24) DCKWH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO: 81)
(25) DCKWH(Xaa1)GQLVWCT (SEQ ID NO: 82)
(26) DCKYH(Xaa1)GELVWCT (SEQ ID NO: 83)
(27) DCKYH(Xaa1)GQLVWCT (SEQ ID NO: 84)
(28) DCKWH(Xaa1)GQLVWCT (SEQ ID NO: 85)
(29) DCKYH(Xaa1)GQLVWCT (SEQ ID NO: 86)
(30) RGNCAWH(Xaa1)GQLVWCKYH (SEQ ID NO: 87)
(31) RGNCAWH(Xaa1)GELVWCKYH (SEQ ID NO: 88)
(32) RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTKH (SEQ ID NO: 89)
(33) RGNCAYH(Xaa1)GQLVWCTYK (SEQ ID NO: 90)
(34) RGNCAYH (Xaa1) GQLVWCTKH (SEQ ID NO: 91).
[In the formula,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue. ].
Xaa1 is preferably an arginine residue, a leucine residue or a lysine residue, more preferably a lysine residue.
また、IgG結合性ペプチドは、広義の一次構造として、下記の式(vi):
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号103) (vi)〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕で表される、13~15アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドである(例、実施例および国際公開第2016/186206号)。
好ましくは、Xaa3、Xaa1、Xaa2、Xaa5、Xaa6、およびXaa7のいずれか一つが、リジン残基である。Xaa1は、好ましくは、リジン残基、アルギニン残基、またはロイシン残基であり、Xaa2は、、好ましくは、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基である。。
Further, the IgG-binding peptide has the following formula (vi) as a broad primary structure:
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (SEQ ID NO: 103) (vi ) [In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue;
Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or none. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG (e.g., Examples and International Publication No. 2016 /186206).
Preferably, any one of Xaa3, Xaa1, Xaa2, Xaa5, Xaa6 and Xaa7 is a lysine residue. Xaa1 is preferably a lysine, arginine, or leucine residue, and Xaa2 is preferably a lysine, glutamine, or glutamic acid residue. .
特定の実施形態では、IgG結合性ペプチドは、下記の式(vii):
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-T (配列番号104) (vii)
〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、かつ
Tは、スレオニン残基である。〕で表される、13アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドである(例、国際公開第2016/186206号)。好ましくは、Xaa3、Xaa1、およびXaa2のいずれか一つが、リジン残基である。Xaa1は、好ましくは、リジン残基、アルギニン残基、またはロイシン残基であり、Xaa2は、好ましくは、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基である。
In certain embodiments, the IgG binding peptide has formula (vii) below:
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWCT (SEQ ID NO: 104) (vii)
[In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue and T is a threonine residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG (eg, International Publication No. 2016/186206). Preferably, any one of Xaa3, Xaa1 and Xaa2 is a lysine residue. Xaa1 is preferably a lysine, arginine, or leucine residue, and Xaa2 is preferably a lysine, glutamine, or glutamic acid residue.
別の特定の実施形態では、IgG結合性ペプチドは、下記の式(viii):
R-G-N-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号105) (viii)
〔式中、
Rは、アルギニン残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Nは、アスパラギン残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、かつ
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕で表される、13~15アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチド(例、実施例)。このような特定の構造を有する国際公開第2016/186206号に未開示の化合物は、ヒトIgG FcにおけるEu numberingに従うLys248残基またはLys246残基、あるいはLys248残基またはLys246残基以外の他のアミノ酸残基の位置選択的な修飾に有用である(実施例)。好ましくは、Xaa3、Xaa1、Xaa2、Xaa5、Xaa6、およびXaa7のいずれか一つが、リジン残基である。Xaa1は、好ましくは、アルギニン残基、またはロイシン残基であってもよい。あるいは、Xaa1は、好ましくは、リジン残基、アルギニン残基、またはロイシン残基であり、Xaa2は、好ましくは、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基である。
In another specific embodiment, the IgG binding peptide has formula (viii) below:
RGNC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (SEQ ID NO: 105) (viii)
[In the formula,
R is an arginine residue,
G is a glycine residue,
N is an asparagine residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue, and Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or no residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG (eg, Examples). Compounds not disclosed in WO 2016/186206 having such a specific structure are Lys248 or Lys246 residues according to Eu numbering in human IgG Fc, or other amino acids other than Lys248 or Lys246 residues Useful for regioselective modification of residues (Examples). Preferably, any one of Xaa3, Xaa1, Xaa2, Xaa5, Xaa6 and Xaa7 is a lysine residue. Xaa1 may preferably be an arginine residue or a leucine residue. Alternatively, Xaa1 is preferably a lysine, arginine or leucine residue, and Xaa2 is preferably a lysine, glutamine or glutamic acid residue.
ペプチドは、各アミノ酸配列の中に離間した少なくとも2つのシステイン(C)残基がジスルフィド結合して環状ペプチドを形成し、各システイン残基のN末端側およびC末端側には1または2個のシステイン以外の任意のアミノ酸残基を有していても良い。各システイン残基のN末端側およびC末端側には1または2個のアミノ酸残基を有する場合にお
いて、17アミノ酸残基とした場合、N末端から1~2、16~17番目の各アミノ酸残基は、上記例示のものである。また、上記ペプチドを構成するアミノ酸はL体またはD体のいずれであってもよいが、L体が好ましい(実施例ではペプチドを構成するアミノ酸残基は全てL体である)。
The peptide has at least two cysteine (C) residues spaced apart in each amino acid sequence disulfide-bonded to form a cyclic peptide, with one or two cysteine (C) residues at the N-terminal and C-terminal sides of each cysteine residue. It may have any amino acid residue other than cysteine. When each cysteine residue has 1 or 2 amino acid residues on the N-terminal side and the C-terminal side, and 17 amino acid residues, each of the 1st to 2nd and 16th to 17th amino acid residues from the N-terminus The groups are those exemplified above. In addition, the amino acids constituting the peptide may be either L-form or D-form, but the L-form is preferred (in the Examples, all the amino acid residues forming the peptide are L-form).
上記のとおり、IgG結合性ペプチドにおいて、上記Xaaのアミノ酸残基が架橋剤によって容易に修飾できるアミノ酸残基(リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基等のタンパク質構成アミノ酸、あるいはジアミノプロピオン酸残基または2-アミノスベリン酸残基等の非タンパク質構成アミノ酸)である場合、これらのアミノ酸のなかでもリジン残基が好ましい。このような架橋剤としては、例えば、DSG(disuccinimidyl glutarate、ジスクシンイミジルグルタレート)、DSS(disuccinimidyl suberate、ジスクシンイミジルスベレート)等のスクシンイミジル基を好ましくは2以上含む架橋剤、DMA(dimethyl adipimidate・2HCl、アジプイミド酸ジメチル二塩酸塩)、DMP(dimethyl pimelimidate・2 HCl、ピメルイミド酸ジメチル二塩酸塩)、及びDMS(dimethyl suberimidate・2
HCl、スベルイミド酸ジメチル二塩酸塩)等のイミド酸部分を好ましくは2以上含む架橋剤、並びにDTBP(dimethyl 3,3’-dithiobispropionimidate・2HCl、3,3’-ジチオビスプロピオンイミド酸ジメチル二塩酸塩)及びDSP(dithiobis(succinimidyl propionate)、ジチオビススクシンイミジルプロピオン酸)等のSS結合を有する架橋剤が挙げられる(例、国際公開第2016/186206号)。IgG結合性ペプチドを架橋剤によって修飾する際の部位特異性を高めるため、IgG結合性ペプチドは、その配列中にXaa1と同じ残基を、全く有さないか、ほとんど有さない(例えば、1個または2個しか有さない)ことが好ましい。例えば、Xaa1がリジン残基である場合には、IgG結合性ペプチドは、その配列中にXaa1以外の場所にリジン残基を全く有さないか、ほとんど有さないことが好ましい。
As described above, in the IgG-binding peptide, the Xaa amino acid residue can be easily modified with a cross-linking agent (lysine residue, cysteine residue, aspartic acid residue, or protein-constituting amino acid residue such as glutamic acid residue). , or non-proteinogenic amino acids such as diaminopropionic acid residues or 2-aminosuberic acid residues), among these amino acids, lysine residues are preferred. Examples of such cross-linking agents include cross-linking agents containing preferably two or more succinimidyl groups such as DSG (disuccinimidyl glutarate), DSS (disuccinimidyl suberate), and DMA ( dimethyl adipimidate.2HCl, dimethyl adipimidate dihydrochloride), DMP (dimethyl pimelimidate.2 HCl, dimethylpimelimidate dihydrochloride), and DMS (dimethyl suberimidate.2
and DTBP (
IgG結合性ペプチドは、IgGのFcドメインに結合する。IgG結合性ペプチドは、上記Xaa1等の上記Xaaのアミノ酸残基において、IgG Fcの特定の領域、すなわち、ヒトIgG FcにおけるEu numberingに従うLys248残基またはLys246残基、好ましくはLys248と近接する(実施例および国際公開第2016/186206号を参照)。あるいは、IgG結合性ペプチドにおいて、上記Xaaのアミノ酸残基は、ヒトIgG FcにおけるEu numberingに従うLys248残基またはLys246残基以外の他のアミノ酸残基と近接することができる。 IgG binding peptides bind to the Fc domain of IgG. The IgG-binding peptide is close to a specific region of IgG Fc, that is, Lys248 or Lys246 according to Eu numbering in human IgG Fc, preferably Lys248, in the amino acid residues of Xaa such as Xaa1 (implementation see Examples and WO2016/186206). Alternatively, in the IgG-binding peptide, the Xaa amino acid residue can be adjacent to other amino acid residues other than the Lys248 or Lys246 residue according to Eu numbering in human IgG Fc.
より具体的には、上記式(i)~(viii)で表されるペプチドは、以下のとおりである。
(1’)RGNCAYHKGQLVWCTYH(配列番号39)
(2’)RGNCKYHRGQLVWCTYH(配列番号42)
(3’)RGNCAWHRGKLVWCTYH(配列番号43)
(4’)RGNCKWHRGELVWCTYH(配列番号44)
(5’)RGNCKWHRGQLVWCTYH(配列番号45)
(6’)RGNCKYHLGELVWCTYH(配列番号46)
(7’)RGNCKYHLGQLVWCTYH(配列番号47)
(8’)DCKWHLGELVWCT(配列番号48)
(9’)DCKYHLGELVWCT(配列番号49)
(10’)DCKWHRGELVWCT(配列番号50)
(11’)DCKWHLGQLVWCT(配列番号51)
(12’)DCKYHRGELVWCT(配列番号52)
(13’)DCKYHLGQLVWCT(配列番号53)
(14’)DCKWHRGQLVWCT(配列番号54)
(15’)DCKYHRGQLVWCT(配列番号55)
(16’)RGNCAWHLGQLVWCKYH(配列番号56)
(17’)RGNCAWHLGELVWCKYH(配列番号57)
(18’)RGNCAYHLGQLVWCTKH(配列番号58)
(19’)RGNCAYHLGQLVWCTYK(配列番号59)
(20’)RGNCAYHRGQLVWCTKH(配列番号60)
More specifically, the peptides represented by formulas (i) to (viii) above are as follows.
(1′) RGNCAYHKGQLVWCTYH (SEQ ID NO: 39)
(2′) RGNCKYHRGQLVWCTYH (SEQ ID NO: 42)
(3′) RGNCAWHRGKLVWCTYH (SEQ ID NO: 43)
(4′) RGNCKWHRGELVWCTYH (SEQ ID NO: 44)
(5′) RGNCKWHRGQLVWCTYH (SEQ ID NO: 45)
(6′) RGNCKYHLGELVWCTYH (SEQ ID NO: 46)
(7′) RGNCKYHLGQLVWCTYH (SEQ ID NO: 47)
(8′) DCKWHLGELVWCT (SEQ ID NO: 48)
(9') DCKYHLGELVWCT (SEQ ID NO: 49)
(10') DCKWHRGELVWCT (SEQ ID NO: 50)
(11′) DCKWHLGQLVWCT (SEQ ID NO: 51)
(12') DCKYHRGELVWCT (SEQ ID NO: 52)
(13') DCKYHLGQLVWCT (SEQ ID NO: 53)
(14') DCKWHRGQLVWCT (SEQ ID NO: 54)
(15') DCKYHRGQLVWCT (SEQ ID NO: 55)
(16') RGNCAWHLGQLVWCKYH (SEQ ID NO: 56)
(17') RGNCAWHLGELVWCKYH (SEQ ID NO: 57)
(18′) RGNCAYHLGQLVWCTKH (SEQ ID NO: 58)
(19′) RGNCAYHLGQLVWCTYK (SEQ ID NO: 59)
(20') RGNCAYHRGQLVWCTKH (SEQ ID NO: 60)
また、上述したような可溶性タンパク質に対する親和性物質は、
(a)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号92)のアミノ酸配列において、いずれかのアミノ酸残基が、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、およびジアミノプロピオン酸残基(架橋剤によって容易に修飾できるアミノ酸残基)からなる群より選ばれる1つのアミノ酸残基(好ましくは、リジン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基、より好ましくはリジン残基)により置換されており、かつ
(b)配列番号92の前記アミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む、親和性ペプチドであってもよい。
In addition, the affinity substance for soluble proteins as described above,
(a) in the amino acid sequence of FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 92), any amino acid residue is a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, and a diaminopropionic acid residue ( amino acid residue that can be easily modified by a cross-linking agent) (preferably a lysine residue, an aspartic acid residue, or a glutamic acid residue, more preferably a lysine residue) and (b) an amino acid sequence having 90% or more identity to said amino acid sequence of SEQ ID NO:92.
好ましくは、(a)および(b)の特性を有する上記アミノ酸配列は、本明細書中に記載されるようなヒトIgGと結合可能である。 Preferably, said amino acid sequences having properties (a) and (b) are capable of binding human IgG as described herein.
配列番号92のアミノ酸配列からなるペプチドは、ペプチド試薬合成上の都合により、Z34Cとして知られている親和性ペプチドにおいてN末端から数えて26番目と28番目の2つのK(リジン)をR(アルギニン)に変更したものであり、さらにN末端をアセチル化し、かつC末端をアミド化して用いることができる。より具体的には、このような親和性ペプチドとしては、Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号92)が挙げられる。このような特定の構造を有する親和性物質は、ヒトIgG FcにおけるEu numberingに従うLys248残基またはLys246残基、Lys288またはLys290、Lys317、あるいはそれら残基以外の他のアミノ酸残基の位置選択的な修飾に有用である(実施例)。なお、上記Z34Cのアミノ酸配列は、FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNAKIKSIRDDC(配列番号93)である(例、Starovasnik, M. A. et al.,Structural mimicry of a native protein by a minimized binding domain.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,94,10080-10085(1997)を参照)。
A peptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 92 is an affinity peptide known as Z34C in which two K (lysine) at
親和性ペプチドは、ヒトIgG(例、上述したようなヒトIgG。好ましくはヒトIgG1)に対する親和性を有することができる。上記親和性ペプチドは、5位および34位のシステイン残基がジスルフィド結合して環状ペプチドを形成していてもよい。
The affinity peptide can have affinity for human IgG (eg, human IgG as described above, preferably human IgG1). The affinity peptide may form a cyclic peptide by disulfide bonding of cysteine residues at
架橋剤によって修飾が容易であるアミノ酸残基が導入される位置としては、ヒトIgG1等のヒトIgGに対する親和性を有する限り任意の位置を利用することができる。このような位置については、当業者であれば容易に同定することができる。好ましくは、架橋剤によって容易に修飾できるアミノ酸残基が導入される位置は、ジスルフィド結合していてもよい5位および34位のシステイン残基以外のアミノ酸残基である。より好ましくは、架橋剤によって容易に修飾できるアミノ酸残基が導入される位置としては、例えば、1位、3位、6位、7位、13位、20位、24位、31位、および32位のアミノ酸残基が挙げられる。
Any position can be used as the position into which an amino acid residue that can be easily modified with a cross-linking agent is introduced, as long as it has affinity for human IgG such as human IgG1. Such positions can be readily identified by those skilled in the art. Preferably, the position where the amino acid residue that can be easily modified by a cross-linking agent is introduced is an amino acid residue other than the cysteine residues at
好ましくは、(a)および(b)の特性を有する上記アミノ酸配列は、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、およびジアミノプロピオン酸残基(架橋剤によって容易に修飾できるアミノ酸残基)からなる群より選ばれる1つの特定のアミノ酸残基(好ましくは、リジン残基、アスパラギン酸残基、またはグルタミン酸残基であり、より好ましくはリジン残基)を所定の位置に有し、かつ、天然タンパク質を構成する通常の20種のアミノ酸残基(好ましくは、リジン残基、アスパラギン酸残基、およびグルタミン酸残基以外の17種のアミノ酸残基であり、より好ましくはリジン残基以外の19種のアミノ酸残基)の変異を当該所定の位置以外の位置に有することもまた好ましい。このような所定の位置は、特に限定されず、例えば、1位、3位、6位、7位、13位、20位、24位、31位、および32位が挙げられる。(a)および(b)の特性を有する上記アミノ酸配列は、5位および34位の2つのシステイン残基が維持されており、これらの2つのシステイン残基はジスルフィド結合により結合していてもよい。配列番号92の前記アミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列は、アミノ酸残基の欠失、置換、付加および挿入からなる群より選ばれる1、2、3または4種の変異(好ましくは置換)により、1~3個(好ましくは1または2個、より好ましくは1個)のアミノ酸残基が改変されたものであってもよい。アミノ酸残基の変異は、アミノ酸配列中の1つの領域に導入されてもよいが、複数の異なる領域に導入されてもよい。
Preferably, said amino acid sequence having the properties of (a) and (b) comprises a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue and a diaminopropionic acid residue ( one specific amino acid residue (preferably a lysine residue, an aspartic acid residue, or a glutamic acid residue, more preferably a lysine residue) selected from the group consisting of easily modifiable amino acid residues) and 20 normal amino acid residues that constitute natural proteins (preferably 17 amino acid residues other than lysine residues, aspartic acid residues, and glutamic acid residues, and more It is also preferred to have mutations of 19 amino acid residues (preferably 19 amino acid residues other than lysine residues) at positions other than the predetermined positions. Such predetermined positions are not particularly limited, and include, for example, 1st, 3rd, 6th, 7th, 13th, 20th, 24th, 31st and 32nd positions. The amino acid sequence having the characteristics of (a) and (b) maintains two cysteine residues at
より好ましくは、(a)および(b)の特性を有する上記アミノ酸配列は、以下(c)または(d)であってもよい。
(c)以下(1)~(9)のアミノ酸配列からなる群より選ばれるアミノ酸配列:
(1)KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号61);
(2)FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号62);
(3)FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号63);
(4)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC(配列番号64);
(5)FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC(配列番号65);
(6)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC(配列番号68);
(7)FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号70);
(8)FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC(配列番号71);および
(9)FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC(配列番号72);あるいは
(d)上記(1)~(9)のいずれかのアミノ酸配列において、1つのリジン残基および2つのシステイン残基以外の位置(例、1位、3位、6位、7位、13位、20位、24位、31位、および32位の位置)において、リジン残基以外の19種のアミノ酸残基の変異を有する、上記(1)~(9)のいずれかのアミノ酸配列に対して90%以上の同一性(上述したような個数のアミノ酸残基の修飾であってもよい)を有するアミノ酸配列。(d)の上記アミノ酸配列は、5位および34位の2つのシステイン残基が維持されていることが好ましく、これらの2つのシステイン残基はジスルフィド結合により結合していてもよい。(d)の上記アミノ酸配列を有する親和性ペプチドは、本明細書中に記載されるようなヒトIgGと結合可能であることが好ましい。
More preferably, the above amino acid sequence having properties (a) and (b) may be (c) or (d) below.
(c) an amino acid sequence selected from the group consisting of the following amino acid sequences (1) to (9):
(1) KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 61);
(2) FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 62);
(3) FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 63);
(4) FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 64);
(5) FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 65);
(6) FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC (SEQ ID NO: 68);
(7) FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 70);
(8) FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 71); and (9) FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 72); or (d) one lysine residue and two cysteines in the amino acid sequence of any of (1) to (9) above. 19 amino acid residues other than lysine residues at positions other than residues (e.g., positions 1, 3, 6, 7, 13, 20, 24, 31, and 32) Amino acids having 90% or more identity to the amino acid sequence of any one of (1) to (9) above (which may be modifications of the number of amino acid residues as described above), which have mutations in groups arrangement. The above amino acid sequence of (d) preferably maintains two cysteine residues at
上記親和性ペプチドは、配列番号92の前記アミノ酸配列または上記(1)~(9)のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有する限り、架橋剤によって修飾が容易である1つのアミノ酸残基の導入以外にも、さらなるアミノ酸残基の変異を有していてもよい。さらなるアミノ酸の変異を導入できる位置については、当業者であれば容易に同定することができる。このような位置としては、例えば、5位および34位のシステイン残基以外の位置を利用することができる。例えば、1位のフェニルアラニン残基、6位のアルギニン残基、13位のロイシン残基、20位のグルタミン酸残基、24位のアスパラギン残基、または31位のアルギニン残基(架橋剤によって容易に修飾できるアミノ酸残基が既に導入された位置を除く)であっても利用することができる。さらなるアミノ酸の変異により導入できるアミノ酸としては、例えば、アラニン(A)、アスパラギン(N)、システイン(C)、グルタミン(Q)、グリシン(G)、イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、フェニルアラニン(F)、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、トリプトファン(W)、チロシン(Y)、バリン(V)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、アルギニン(R)、ヒスチジン(H)、およびリジン(L)が挙げられる。好ましくは、リジン以外のこれらの19種のアミノ酸が利用されてもよい。アミノ酸はL体またはD体のいずれであってもよいが、L体が好ましい(実施例ではペプチドを構成するアミノ酸残基は全てL体である)。
As long as the affinity peptide has 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 92 or the amino acid sequences of (1) to (9) above, one amino acid residue that can be easily modified with a cross-linking agent. In addition to the introduction of the group, it may have additional amino acid residue mutations. Positions at which additional amino acid mutations can be introduced can be readily identified by those skilled in the art. As such positions, for example, positions other than the 5- and 34-position cysteine residues can be used. For example, a phenylalanine residue at
配列番号92の前記アミノ酸配列または(1)~(9)の前記アミノ酸配列に対する同一性%の程度は、上述したとおりに決定することができる。同一性%の程度は、好ましくは92%以上、より好ましくは94%以上、さらにより好ましくは95%以上、特に好ましくは97%以上(すなわち、配列番号92のアミノ酸配列に対して、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、およびジアミノプロピオン酸残基からなる群より選ばれる1つのアミノ酸残基の変異のみを有するもの)であってもよい。 The degree of % identity to said amino acid sequence of SEQ ID NO: 92 or said amino acid sequences of (1)-(9) can be determined as described above. The percent identity is preferably 92% or higher, more preferably 94% or higher, even more preferably 95% or higher, and particularly preferably 97% or higher (that is, with respect to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 92, the lysine residue , aspartic acid residue, glutamic acid residue, 2-aminosuberic acid residue, and diaminopropionic acid residue).
親和性物質がペプチドである場合、ペプチドの末端にあるアミノ基およびカルボキシ基は、保護されていてもよい。N-末端アミノ基の保護基としては、例えば、アルキルカルボニル基(アシル基)(例、アセチル基、プロポキシ基、tert-ブトキシカルボニル基等のブトキシカルボニル基)、アルキルオキシカルボニル基(例、フルオレニルメトキシカルボニル基)、アリールオキシカルボニル基、アリールアルキル(アラルキル)オキシカルボニル基(例、ベンジルオキシカルボニル基)が挙げられる。N-末端アミノ基の保護基としては、アセチル基が好ましい。C-末端カルボキシ基の保護基としては、例えば、エステルまたはアミドを形成可能な基が挙げられる。エステルまたはアミドを形成可能な基としては、例えば、アルキルオキシ基(例、メチルオキシ、エチルオキシ、プロピルオキシ、ブチルオキシ、ペンチルオキシ、ヘキシルオキシ)、アリールオキシ基(例、フェニルオキシ、ナフチルオキシ)、アラルキルオキシ基(例、ベンジルオキシ)、アミノ基が挙げられる。C-末端カルボキシ基の保護基としては、アミノ基が好ましい。親和性物質が2以上のシステイン残基を含むペプチドである場合、システイン残基の側鎖にあるチオール基を介してジスルフィド結合が形成されていてもよい。 When the affinity substance is a peptide, the terminal amino group and carboxy group of the peptide may be protected. Examples of protective groups for the N-terminal amino group include alkylcarbonyl groups (acyl groups) (eg, acetyl, propoxy, butoxycarbonyl groups such as tert-butoxycarbonyl groups), alkyloxycarbonyl groups (eg, fluorescein nylmethoxycarbonyl group), aryloxycarbonyl group, arylalkyl(aralkyl)oxycarbonyl group (eg, benzyloxycarbonyl group). An acetyl group is preferred as the protective group for the N-terminal amino group. Protecting groups for the C-terminal carboxy group include, for example, groups capable of forming esters or amides. Groups capable of forming esters or amides include, for example, alkyloxy groups (e.g., methyloxy, ethyloxy, propyloxy, butyloxy, pentyloxy, hexyloxy), aryloxy groups (e.g., phenyloxy, naphthyloxy), aralkyl An oxy group (eg, benzyloxy) and an amino group can be mentioned. As a protective group for the C-terminal carboxyl group, an amino group is preferred. When the affinity substance is a peptide containing two or more cysteine residues, disulfide bonds may be formed via thiol groups on the side chains of the cysteine residues.
1-3.リンカー(L)
式(I)において、Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーである。
1-3. Linker (L)
In formula (I), L is a cleavable linker, a divalent group containing a cleavable moiety.
Lで表される切断性リンカーは、切断性部分を含む2価の基である。切断性部分は、タンパク質の変性・分解(例、アミド結合の切断)を引き起こし得ない条件(温和な条件)下での特定の処理により切断可能な部位である。したがって、切断性部分は、温和な条件下での特定の切断処理により切断可能な部位(アミド結合以外の結合)であるということができる。このような特定の処理としては、例えば、(a)酸性物質、塩基性物質、還元
剤、酸化剤、酵素からなる群より選ばれる1種以上の物質による処理、(b)光からなる群より選ばれる物理化学的刺激による処理、または(c)自己分解性の切断性部分を含む切断性リンカーを用いた場合の放置が挙げられる。このような切断性リンカーおよびその切断条件は、当該分野における技術常識である(例、G.Leriche,L. Chisholm,A.Wagner,Bioorganic & Medicinal Chemistry.20,571(2012);Feng P. et al.,Jounal of American Chemical Society.132,1500(2010).;Bessodes M. et al.,Journal of Controlled Release, 99,423(2004).;DeSimone,J.M.,Journal of American Chemical Society.132,17928(2010);Thompson,D.H.,Journal
of Controlled Release,91,187(2003);Schoenmarks,R.G.,Journal of Controlled Release,95,291(2004))。このような切断性部分としては、例えば、ジスルフィド残基、アセタール残基、ケタール残基、エステル残基、カルバモイル残基、アルコキシアルキル残基、イミン残基、三級アルキルオキシカルバメート残基(例、tert-ブチルオキシカルバメート残基)、シラン残基、ヒドラゾン含有残基(例、ヒドラゾン残基、アシルヒドラゾン残基、ビスアリールヒドラゾン残基)、フォスフォルアミデート残基、アコニチル残基、トリチル残基、アゾ残基、ビシナルジオール残基、セレン残基、電子吸引基を有する芳香族環含有残基、クマリン含有残基、スルホン含有残基、不飽和結合含有鎖残基、グリコシル残基が挙げられる。
A cleavable linker represented by L is a divalent group containing a cleavable moiety. A cleavable moiety is a site that can be cleaved by a specific treatment under conditions (mild conditions) that do not cause protein denaturation/degradation (eg, cleavage of amide bonds). Therefore, the cleavable moiety can be said to be a site (bonds other than amide bonds) that can be cleaved by specific cleavage treatment under mild conditions. Examples of such specific treatments include (a) treatment with one or more substances selected from the group consisting of acidic substances, basic substances, reducing agents, oxidizing agents, and enzymes; treatment with a chosen physico-chemical stimulus, or (c) leaving when using a cleavable linker comprising a self-cleavable cleavable moiety. Such cleavable linkers and cleavage conditions thereof are common technical knowledge in the art (e.g., G. Leriche, L. Chisholm, A. Wagner, Bioorganic & Medicinal Chemistry. 20, 571 (2012); Feng P. et al., Journal of American Chemical Society.132, 1500 (2010).; Bessodes M. et al., Journal of Controlled Release, 99, 423 (2004).; 132, 17928 (2010); Thompson, D. H., Journal
of Controlled Release, 91, 187 (2003); G. , Journal of Controlled Release, 95, 291 (2004)). Such cleavable moieties include, for example, disulfide residues, acetal residues, ketal residues, ester residues, carbamoyl residues, alkoxyalkyl residues, imine residues, tertiary alkyloxycarbamate residues (e.g., tert-butyloxycarbamate residue), silane residue, hydrazone-containing residue (e.g. hydrazone residue, acylhydrazone residue, bisarylhydrazone residue), phosphoramidate residue, aconityl residue, trityl residue , an azo residue, a vicinal diol residue, a selenium residue, an aromatic ring-containing residue having an electron withdrawing group, a coumarin-containing residue, a sulfone-containing residue, an unsaturated bond-containing chain residue, and a glycosyl residue. be done.
電子吸引基を有する芳香族環基は、アリール、アラルキル、芳香族複素環基、芳香族複素環基を有するアルキルからなる群より選ばれる芳香族環基を有するものが好ましく、アラルキル、芳香族複素環基を有するアルキルがより好ましい。電子吸引基は、環の2位に結合していることが好ましい。さらにより好ましくは、電子吸引基を有する芳香族環含有残基は、例えば、2位に電子吸引基を有するアラルキル(例、ベンジル)である。電子吸引基としては、例えば、ハロゲン原子、ハロゲン原子で置換されたアルキル(例、トリフルオロメチル)、ボロン酸残基、メシル、トシル、トリフレート、ニトロ、シアノ、フェニル基、ケト基(例、アシル)が挙げられる。 The aromatic ring group having an electron-withdrawing group preferably has an aromatic ring group selected from the group consisting of aryl, aralkyl, aromatic heterocyclic group, and alkyl having an aromatic heterocyclic group. Alkyl having a cyclic group is more preferred. The electron withdrawing group is preferably attached to the 2-position of the ring. Even more preferably, the aromatic ring-containing residue with an electron withdrawing group is, for example, aralkyl with an electron withdrawing group at the 2-position (eg benzyl). Examples of electron-withdrawing groups include halogen atoms, halogen-substituted alkyls (e.g., trifluoromethyl), boronic acid residues, mesyl, tosyl, triflate, nitro, cyano, phenyl groups, keto groups (e.g., acyl).
切断性部分としての残基の名称に関連して接頭語、接尾語等の用語として見出されるアルキル、アシル(すなわち、アルキルカルボニル)、アルコキシ(すなわち、アルキルオキシ)、アリール、アラルキル等の基の定義、例、および好ましい例は、後述するものと同様である。 Definitions of groups such as alkyl, acyl (i.e. alkylcarbonyl), alkoxy (i.e. alkyloxy), aryl, aralkyl etc. found as prefixes, suffixes etc. terms in connection with the name of the residue as cleavable moiety. , examples, and preferred examples are the same as those described below.
エステル残基としては、例えば、炭素原子および酸素原子から構成される通常のエステル残基〔例、アルキルエステル(例、tert-ブチルオキシカルボニル等の三級アルキルオキシカルボニル)、アリールエステル(例、フェナシルエステル、2-(ジフェニルホスフィノ)ベンゾエート)、グリコシルエステル残基、オルトエステル残基、硫黄原子および酸素原子を含むエステル残基(例、α-チオフェニルエステル残基、アルキルチオエステル残基等のチオエステル残基)、リン原子および酸素原子を含むエステル残基(例、ホスホジエステル残基、ホスホトリエステル残基)、活性化エステル残基(例、N-ヒドロキシスクシンイミド残基)が挙げられる。 Ester residues include, for example, ordinary ester residues composed of carbon and oxygen atoms [eg, alkyl esters (eg, tertiary alkyloxycarbonyl such as tert-butyloxycarbonyl), aryl esters (eg, phenoxycarbonyl), silester, 2-(diphenylphosphino)benzoate), glycosyl ester residue, orthoester residue, ester residue containing sulfur atom and oxygen atom (e.g., α-thiophenyl ester residue, alkylthioester residue, etc.) thioester residues), ester residues containing phosphorus and oxygen atoms (eg, phosphodiester residues, phosphotriester residues), activated ester residues (eg, N-hydroxysuccinimide residues).
スルホン含有残基としては、例えば、スルホン残基、キノリニルベンゼンスルフォナート残基が挙げられる。 Sulfone-containing residues include, for example, sulfone residues and quinolinylbenzenesulfonate residues.
シラン残基は、好ましくは、アルキル、アリール、アラルキル、およびアルコキシからなる群より選ばれる基を有するシラン残基である。このようなシラン残基としては、例え
ば、ジアルキルジアルコキシシラン残基(例、ジメチルジアルコキシシラン、ジエチルジアルコキシシラン)、またはジアリールジアルコキシシラン残基(例、ジフェニルジアルコキシシラン)が挙げられる。
The silane residue is preferably a silane residue having groups selected from the group consisting of alkyl, aryl, aralkyl and alkoxy. Such silane residues include, for example, dialkyldialkoxysilane residues (eg, dimethyldialkoxysilane, diethyldialkoxysilane) or diaryldialkoxysilane residues (eg, diphenyldialkoxysilane).
アルコキシアルキル(すなわち、アルキルオキシアルキル)残基としては、後述するアルキルオキシおよびアルキルを組み合せた基であり(アルキルオキシおよびアルキルの定義、例および好ましい例は、後述するものと同様)、例えば、メトキシメチル残基、エトキシメチル残基、メトキシエチル残基、エトキシエチル残基が挙げられるが、これらに限定されない。 Alkoxyalkyl (i.e., alkyloxyalkyl) residues are groups in which alkyloxy and alkyl are combined as described below (definition, examples and preferred examples of alkyloxy and alkyl are the same as those described below), such as methoxy Examples include, but are not limited to, methyl residues, ethoxymethyl residues, methoxyethyl residues, ethoxyethyl residues.
不飽和結合含有鎖残基は、炭素原子のみからなる不飽和結合部分を含む残基(例、炭素原子間二重結合を有する最小単位であるビニル(エテニル)、または炭素原子間三重結合を有する最小単位であるアセチレニル(エチニル))、または炭素原子およびヘテロ原子(例、窒素原子、硫黄原子、酸素原子)からなる不飽和結合部分(例、アルデヒド、シアノ)を含む残基である。不飽和結合含有鎖残基としては、例えば、ビニルエーテル残基、シアノエチル残基、エチレン残基、マロンジアルデヒド残基が挙げられる。 An unsaturated bond-containing chain residue is a residue containing an unsaturated bond portion consisting only of carbon atoms (e.g. vinyl (ethenyl), which is the smallest unit having a double bond between carbon atoms, or a triple bond between carbon atoms acetylenyl (ethynyl), which is the smallest unit, or a residue containing an unsaturated bond moiety (eg, aldehyde, cyano) consisting of a carbon atom and a heteroatom (eg, nitrogen atom, sulfur atom, oxygen atom). Unsaturated bond-containing chain residues include, for example, vinyl ether residues, cyanoethyl residues, ethylene residues, and malondialdehyde residues.
酸性物質(求電子試薬とも称される)としては、例えば、塩酸、硫酸、硝酸等の無機酸性物質、およびギ酸、酢酸、4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンプロパンスルホン酸、3-モルホリノプロパンスルホン酸、リン酸二水素ナトリウム、クエン酸、ドデシル硫酸、N-ドデカノイルサルコシン酸、トリフルオロ酢酸等の有機酸性物質が挙げられる。酸性物質により切断可能な部位としては、例えば、アルキルオキシアリールアルキル残基、三級アルキルオキシカルバメート残基、アセタール残基、シラン残基、イミン残基、ビニルエーテル残基、β―チオプロピオネート残基、トリチル残基、ヒドラゾン残基、アコニチル残基、オルトエステル残基、カルバモイル残基、2-(ジフェニルホスフィノ)ベンゾエート残基が挙げられる。 Examples of acidic substances (also called electrophiles) include inorganic acidic substances such as hydrochloric acid, sulfuric acid and nitric acid, and formic acid, acetic acid, 4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazinepropanesulfonic acid, 3- Examples include organic acidic substances such as morpholinopropanesulfonic acid, sodium dihydrogen phosphate, citric acid, dodecylsulfuric acid, N-dodecanoylsarcosic acid, and trifluoroacetic acid. Sites cleavable by acidic substances include, for example, alkyloxyarylalkyl residues, tertiary alkyloxycarbamate residues, acetal residues, silane residues, imine residues, vinyl ether residues, and β-thiopropionate residues. groups, trityl residues, hydrazone residues, aconityl residues, orthoester residues, carbamoyl residues, 2-(diphenylphosphino)benzoate residues.
塩基性物質(求核試薬とも称される)としては、例えば、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、酢酸ナトリウム、酢酸カリウム、酢酸アンモニウム等の無機塩基性物質、およびトリエチルアミン、N,N‘-ジイソプロピルアミン等の有機塩基性物質が挙げられる。塩基性物質により切断可能な部位としては、例えば、シラン残基、シアノエチル残基、スルホン残基、エチレン残基、グリコシルジスクシネート残基、α-チオフェニルエステル残基、不飽和ビニルスルフィド残基、マロンジアルデヒド残基、アシルヒドラゾン残基、アルキルチオエステル残基が挙げられる。 Examples of basic substances (also referred to as nucleophiles) include inorganic basic substances such as sodium hydroxide, potassium hydroxide, sodium acetate, potassium acetate and ammonium acetate, and triethylamine, N,N'-diisopropylamine. organic basic substances such as Sites cleavable by basic substances include, for example, silane residues, cyanoethyl residues, sulfone residues, ethylene residues, glycosyldisuccinate residues, α-thiophenyl ester residues, and unsaturated vinyl sulfide residues. , malondialdehyde residues, acylhydrazone residues, and alkylthioester residues.
還元剤としては、例えば、システイン、ジチオトレイトール、還元型グルタチオン、ヒドロキシルアミン、β-メルカプトエタノールが挙げられる。還元剤により切断可能な部位としては、例えば、ジスルフィド残基、アルコキシアルキル残基、アゾ残基が挙げられる。 Examples of reducing agents include cysteine, dithiothreitol, reduced glutathione, hydroxylamine, and β-mercaptoethanol. Sites that can be cleaved by a reducing agent include, for example, disulfide residues, alkoxyalkyl residues, and azo residues.
酸化剤としては、例えば、過ヨウ素酸ナトリウム、酸化型グルタチオンが挙げられる。酸化剤により切断可能な部位としては、例えば、ビシナルジオール残基、セレン残基が挙げられる。 Examples of oxidizing agents include sodium periodate and oxidized glutathione. Sites that can be cleaved by an oxidizing agent include, for example, vicinal diol residues and selenium residues.
酵素としては、例えば、トリプシン、パパイン、TEV、トロンビン、カテプシンB、カテプシンD、カテプシンK、カスパーゼ、プロテアーゼ、マトリックスメタロプロテアーゼ、リパーゼ、エンドグリコシターゼ、PNガーゼFが挙げられる。酵素により切断可能な部位としては、例えば、エステル残基、ホスホジエステル残基、グリコシル残基が挙げられる。 Enzymes include trypsin, papain, TEV, thrombin, cathepsin B, cathepsin D, cathepsin K, caspase, protease, matrix metalloprotease, lipase, endoglycosidase, PN gauze F, for example. Enzymatically cleavable sites include, for example, ester residues, phosphodiester residues, and glycosyl residues.
光により切断可能な部位としては、例えば、2-ニトロベンジル残基、フェナシルエステル残基、8-キノリンベンゼンスルホナート残基、クマリン残基、ホスホトリエステル残基、ビスアリールヒドラゾン残基、ビマンジチオプロピオン酸残基が挙げられる。 Sites cleavable by light include, for example, 2-nitrobenzyl residue, phenacyl ester residue, 8-quinolinebenzenesulfonate residue, coumarin residue, phosphotriester residue, bisarylhydrazone residue, biman A dithiopropionic acid residue can be mentioned.
自己分解性の切断性部分としては、例えば、活性化エステル残基(例、N-ヒドロキシスクシンイミド残基)が挙げられる。 Autolytic cleavable moieties include, for example, activated ester residues (eg, N-hydroxysuccinimide residues).
より具体的には、切断性部分は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、水素原子、または後述する置換基からなる群より選ばれ、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はA(または後述するLa)に対する結合を示し、●(黒丸)はB(または後述するLb)に対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がA(または後述するLa)に対する結合を示し、○がB(または後述するLb)に対する結合を示していてもよい。〕
More specifically, the cleavable moiety may correspond to any one chemical structure selected from the group consisting of:
the plurality of R 2a , the plurality of R 2b , and the plurality of R 2c are the same or different and are selected from the group consisting of hydrogen atoms or substituents described later;
J is —CH 2 —, —O—, or —S—;
r is any integer from 1 to 4,
O (white circle) indicates binding to A (or La, which will be described later), and ● (black circle) indicates binding to B (or Lb, which will be described later).
If the chemical structure is asymmetrical around the cleavage site, ● may indicate the bond to A (or La, which will be described later), and O may indicate the bond to B (or Lb, which will be described later). ]
Jは、-CH2-、-O-、または-S-である。jは、好ましくは-CH2-または-O-であり、より好ましくは好ましくは-CH2-である。 J is -CH 2 -, -O-, or -S-. j is preferably -CH 2 - or -O-, more preferably -CH 2 -.
rは、1~4の任意の整数であり、好ましくは1~3の任意の整数であり、より好ましくは1または2である。 r is any integer from 1 to 4, preferably any integer from 1 to 3, more preferably 1 or 2.
一実施形態では、切断性リンカーは、(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー、もしくは(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであってもよい。 In one embodiment, the cleavable linker is (i) a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety capable of cleaving to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group, or (ii) It may be a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety that does not have the ability to cleave to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group.
(i)の切断性部分としては、例えば、ジスルフィド残基、エステル残基、アセタール残基、ケタール残基、イミン残基、ビシナルジオール残基が挙げられる。 Cleavable moieties of (i) include, for example, disulfide residues, ester residues, acetal residues, ketal residues, imine residues, and vicinal diol residues.
より具体的には、(i)の切断性部分は、例えば、以下:
複数のR2aは、同一または異なって、水素原子、または後述する置換基からなる群より選ばれ、
○(白丸)はA(または後述するLa)に対する結合を示し、●(黒丸)はB(または後述するLb)に対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がA(または後述するLa)に対する結合を示し、○がB(または後述するLb)に対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
More specifically, the cleavable moieties of (i) are, for example:
a plurality of R 2a are the same or different and are selected from the group consisting of hydrogen atoms or substituents described later;
O (white circle) indicates binding to A (or La, which will be described later), and ● (black circle) indicates binding to B (or Lb, which will be described later).
If the chemical structure is asymmetrical around the cleavage site, ● may indicate the bond to A (or La, which will be described later), and O may indicate the bond to B (or Lb, which will be described later). ] may correspond to any one chemical structure selected from the group consisting of
(ii)の切断性部分としては、例えば、エステル残基、カルバモイル残基、アルコキシアルキル残基、イミン残基、三級アルキルオキシカルバメート残基、シラン残基、ヒドラゾン含有残基、フォスフォルアミデート残基、アコニチル残基、トリチル残基、アゾ残基、ビシナルジオール残基、セレン残基、電子吸引基を有する芳香族環含有残基、クマリン含有残基、スルホン含有残基、不飽和結合含有鎖残基、グリコシル残基が挙げられる。 Cleavable moieties of (ii) include, for example, ester residues, carbamoyl residues, alkoxyalkyl residues, imine residues, tertiary alkyloxycarbamate residues, silane residues, hydrazone-containing residues, phosphoramidate residue, aconityl residue, trityl residue, azo residue, vicinal diol residue, selenium residue, aromatic ring-containing residue with electron-withdrawing group, coumarin-containing residue, sulfone-containing residue, unsaturated bond Including chain residues, glycosyl residues.
より具体的には、(ii)の切断性部分は、例えば、以下:
複数のR2b、複数のR2c、J、rは、水素原子、または後述する置換基からなる群より選ばれ、
○(白丸)はA(または後述するLa)に対する結合を示し、●(黒丸)はB(または後述するLb)に対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がA(または後述するLa)に対する結合を示し、○がB(または後述するLb)に対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
More specifically, the cleavable moieties of (ii) are, for example:
Multiple R 2b , multiple R 2c , J, r are selected from the group consisting of hydrogen atoms or substituents described later,
O (white circle) indicates binding to A (or La, which will be described later), and ● (black circle) indicates binding to B (or Lb, which will be described later).
If the chemical structure is asymmetrical around the cleavage site, ● may indicate the bond to A (or La described later) and O may indicate the bond to B (or Lb described later). ] may correspond to any one chemical structure selected from the group consisting of
特定の実施形態では、切断性リンカー(L)は、下記式(L1)~(L3)のいずれか一つで表されてもよい:
La-C-Lb (L1)
La-C (L2)
C-Lb (L3)
〔式中、
LaおよびLbは、それぞれ、2価の基であり、
Cは、切断性部分である。〕
In certain embodiments, the cleavable linker (L) may be represented by any one of formulas (L1)-(L3) below:
La-C-Lb (L1)
La-C (L2)
C-Lb (L3)
[In the formula,
La and Lb are each a divalent group,
C is a cleavable moiety. ]
2価の基としては、例えば、置換基を有していてもよい2価の炭化水素基、置換基を有していてもよい2価の複素環基、-C(=O)-、-NRa-(Raは水素原子、または置換基を示す)、-O-、-S-、-C(=S)-、およびこれらの2以上(例えば2~8、好ましくは2~6、より好ましくは2~4)の組み合わせからなる基が挙げられる。 As the divalent group, for example, a divalent hydrocarbon group which may have a substituent, a divalent heterocyclic group which may have a substituent, -C (= O) -, - NR a — (R a represents a hydrogen atom or a substituent), —O—, —S—, —C(═S)—, and two or more of these (for example, 2 to 8, preferably 2 to 6, Groups consisting of a combination of 2 to 4) are more preferred.
2価の炭化水素基としては、直鎖、分岐鎖、または環状の2価の炭化水素基であり、好ましくは直鎖または分岐鎖の2価の炭化水素基である。2価の炭化水素基としては、例え
ば、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、アリーレンが挙げられる。
The divalent hydrocarbon group is a straight-chain, branched-chain or cyclic divalent hydrocarbon group, preferably a straight-chain or branched-chain divalent hydrocarbon group. Divalent hydrocarbon groups include, for example, alkylene, alkenylene, alkynylene, and arylene.
アルキレンとしては、炭素原子数1~12のアルキレンが好ましく、炭素原子数1~6のアルキレンがより好ましく、炭素原子数1~4のアルキレンが特に好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。アルキレンは、直鎖、分岐鎖、または環状のいずれであってもよいが、直鎖のアルキレンが好ましい。このようなアルキレンとしては、例えば、メチレン、エチレン、プロピレン、ブチレン、ペンチレン、へキシレンが挙げられる。 As alkylene, alkylene having 1 to 12 carbon atoms is preferable, alkylene having 1 to 6 carbon atoms is more preferable, and alkylene having 1 to 4 carbon atoms is particularly preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Alkylene may be linear, branched, or cyclic, but linear alkylene is preferred. Such alkylenes include, for example, methylene, ethylene, propylene, butylene, pentylene, hexylene.
アルケニレンとしては、炭素原子数2~12のアルケニレンが好ましく、炭素原子数2~6のアルケニレンがより好ましく、炭素原子数2~4のアルケニレンが特に好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。アルケニレンは、直鎖、分岐鎖、または環状のいずれであってもよいが、直鎖のアルケニレンが好ましい。このようなアルケニレンとしては、例えば、エチレニレン、プロピニレン、ブテニレン、ペンテニレン、へキセニレンが挙げられる。 As alkenylene, alkenylene having 2 to 12 carbon atoms is preferable, alkenylene having 2 to 6 carbon atoms is more preferable, and alkenylene having 2 to 4 carbon atoms is particularly preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Alkenylene may be linear, branched or cyclic, but linear alkenylene is preferred. Examples of such alkenylene include ethylenylene, propynylene, butenylene, pentenylene, and hexenylene.
アルキニレンとしては、炭素原子数2~12のアルキニレンが好ましく、炭素原子数2~6のアルキニレンがより好ましく、炭素原子数2~4のアルキニレンが特に好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。アルキニレンは、直鎖、分岐鎖、または環状のいずれであってもよいが、直鎖のアルキニレンが好ましい。このようなアルキニレンとしては、例えば、エチニレン、プロピニレン、ブチニレン、ペンチニレン、へキシニレンが挙げられる。 As alkynylene, alkynylene having 2 to 12 carbon atoms is preferable, alkynylene having 2 to 6 carbon atoms is more preferable, and alkynylene having 2 to 4 carbon atoms is particularly preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Alkynylene may be linear, branched, or cyclic, but linear alkynylene is preferred. Examples of such alkynylene include ethynylene, propynylene, butynylene, pentynylene, and hexynylene.
アリーレンとしては、炭素原子数6~24のアリーレンが好ましく、炭素原子数6~18のアリーレンがより好ましく、炭素原子数6~14のアリーレンがさらに好ましく、炭素原子数6~10のアリーレンがさらにより好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。アリーレンとしては、例えば、フェニレン、ナフチレン、アントラセニレンが挙げられる。 As arylene, arylene having 6 to 24 carbon atoms is preferable, arylene having 6 to 18 carbon atoms is more preferable, arylene having 6 to 14 carbon atoms is more preferable, and arylene having 6 to 10 carbon atoms is even more preferable. preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Arylene includes, for example, phenylene, naphthylene and anthracenylene.
2価の複素環基は、2価の芳香族複素環基、または2価の非芳香族複素環基である。複素環を構成するヘテロ原子として、酸素原子、硫黄原子、窒素原子、リン原子、ホウ素原子およびケイ素原子からなる群から選択される1種以上を含むことが好ましく、酸素原子、硫黄原子および窒素原子からなる群から選択される1種以上を含むことがより好ましい。 A divalent heterocyclic group is a divalent aromatic heterocyclic group or a divalent non-aromatic heterocyclic group. The heteroatom constituting the heterocyclic ring preferably contains one or more selected from the group consisting of an oxygen atom, a sulfur atom, a nitrogen atom, a phosphorus atom, a boron atom and a silicon atom, and an oxygen atom, a sulfur atom and a nitrogen atom. It is more preferable to contain one or more selected from the group consisting of
2価の芳香族複素環基としては、炭素原子数3~21の2価の芳香族複素環基が好ましく、炭素原子数3~15の2価の芳香族複素環基がより好ましく、炭素原子数3~9の2価の芳香族複素環基がさらに好ましく、炭素原子数3~6の2価の芳香族複素環基がさらにより好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。より具体的には、2価の芳香族複素環基としては、例えば、ピレンジイル、ピロールジイル、フランジイル、チオフェンジイル、ピリジンジイル、ピリダジンジイル、ピリミジンジイル、ピラジンジイル、トリアジンジイル、ピロリンジイル、ピペリジンジイル、トリアゾールジイル、プリンジイル、アントラキノンジイル、カルバゾールジイル、フルオレンジイル、キノリンジイル、およびイソキノリンジイルが挙げられる。 The divalent aromatic heterocyclic group is preferably a divalent aromatic heterocyclic group having 3 to 21 carbon atoms, more preferably a divalent aromatic heterocyclic group having 3 to 15 carbon atoms. A divalent aromatic heterocyclic group having 3 to 9 carbon atoms is more preferable, and a divalent aromatic heterocyclic group having 3 to 6 carbon atoms is even more preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. More specifically, divalent aromatic heterocyclic groups include, for example, pyrenediyl, pyrroldiyl, furandiyl, thiophenediyl, pyridinediyl, pyridazinediyl, pyrimidinediyl, pyrazinediyl, triazinediyl, pyrrolinediyl, piperidinediyl, triazole Diyl, purinediyl, anthraquinonediyl, carbazolediyl, fluorenediyl, quinolinediyl, and isoquinolinediyl.
2価の非芳香族複素環基としては、炭素原子数3~21の非芳香族複素環基が好ましく、炭素原子数3~15の非芳香族複素環基がより好ましく、炭素原子数3~9の非芳香族複素環基がさらに好ましく、炭素原子数3~6の非芳香族複素環基がさらにより好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。より具体的には、2価の非芳香族複素環基としては、例えば、ピロールジオンジイル、ピロリンジオンジイル、オキシラン
ジイル、アジリジンジイル、アゼチジンジイル、オキセタンジイル、チエタンジイル、ピロリジンジイル、ジヒドロフランジイル、テトラヒドロフランジイル、ジオキソランジイル、テトラヒドロチオフェンジイル、イミダゾリジンジイル、オキサゾリジンジイル、ピペリジンジイル、ジヒドロピランジイル、テトラヒドロピランジイル、テトラヒドロチオピランジイル、モルホリンジイル、チオモルホリンジイル、ピペラジンジイル、ジヒドロオキサジンジイル、テトラヒドロオキサジンジイル、ジヒドロピリミジンジイル、およびテトラヒドロピリミジンジイルが挙げられる。
The divalent non-aromatic heterocyclic group is preferably a non-aromatic heterocyclic group having 3 to 21 carbon atoms, more preferably a non-aromatic heterocyclic group having 3 to 15 carbon atoms, and 3 to 3 carbon atoms. Non-aromatic heterocyclic groups of 9 are more preferred, and non-aromatic heterocyclic groups of 3 to 6 carbon atoms are even more preferred. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. More specifically, divalent non-aromatic heterocyclic groups include, for example, pyrroldionediyl, pyrrolinedionediyl, oxranediyl, aziridinediyl, azetidinediyl, oxetanediyl, thietanediyl, pyrrolidinediyl, dihydrofurandiyl, and tetrahydrofurandiyl. , dioxolanediyl, tetrahydrothiophenediyl, imidazolidinediyl, oxazolidinediyl, piperidinediyl, dihydropyrandiyl, tetrahydropyrandiyl, tetrahydrothiopyrandiyl, morpholindiyl, thiomorpholindiyl, piperazinediyl, dihydrooxazinediyl, tetrahydrooxazinediyl, dihydro Pyrimidinediyl, and tetrahydropyrimidinediyl.
LaおよびLbで表される2価の基は、例えば1~5個、好ましくは1~3個、より好ましくは1もしくは2個の置換基を有していてもよい。このような置換基は、上記RaおよびRbで表される置換基と同様である。このような置換基としては、例えば、以下が挙げられる:
(i)ハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、およびカルボキシル基。
The divalent groups represented by La and Lb may have, for example, 1 to 5, preferably 1 to 3, more preferably 1 or 2 substituents. Such substituents are the same as the substituents represented by R a and R b above. Such substituents include, for example:
(i) a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is a hydrogen atom or (vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d —C(═O)—NR e — (R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group);
(vii) nitro, sulfate, sulfonate, cyano, and carboxyl groups;
ハロゲン原子としては、例えば、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子が挙げられる。 Halogen atoms include, for example, fluorine, chlorine, bromine and iodine atoms.
1価の炭化水素基としては、例えば、1価の鎖状炭化水素基、1価の脂環式炭化水素基、および1価の芳香族炭化水素基が挙げられる。 Examples of monovalent hydrocarbon groups include monovalent chain hydrocarbon groups, monovalent alicyclic hydrocarbon groups, and monovalent aromatic hydrocarbon groups.
1価の鎖状炭化水素基とは、鎖状構造のみで構成された炭化水素基を意味し、主鎖に環状構造を含まない。ただし、鎖状構造は直鎖状であっても分岐状であってもよい。1価の鎖状炭化水素基としては、例えば、アルキル、アルケニル、アルキニルが挙げられる。アルキル、アルケニル、およびアルキニルは、直鎖状、または分岐状のいずれであってもよい。 A monovalent chain hydrocarbon group means a hydrocarbon group composed only of a chain structure, and the main chain does not contain a cyclic structure. However, the chain structure may be linear or branched. Examples of monovalent chain hydrocarbon groups include alkyl, alkenyl, and alkynyl. Alkyl, alkenyl and alkynyl can be straight or branched.
アルキルとしては、炭素原子数1~12のアルキルが好ましく、炭素原子数1~6のアルキルがより好ましく、炭素原子数1~4のアルキルがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数1~12のアルキルとしては、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、i-プロピル、n-ブチル、s-ブチル、イソブチル、t-ブチル、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、デシル、ドデシルが挙げられる。 The alkyl is preferably an alkyl having 1 to 12 carbon atoms, more preferably an alkyl having 1 to 6 carbon atoms, and still more preferably an alkyl having 1 to 4 carbon atoms. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Examples of alkyl having 1 to 12 carbon atoms include methyl, ethyl, n-propyl, i-propyl, n-butyl, s-butyl, isobutyl, t-butyl, pentyl, hexyl, heptyl, octyl, nonyl and decyl. , dodecyl.
アルケニルとしては、炭素原子数2~12のアルケニルが好ましく、炭素原子数2~6のアルケニルがより好ましく、炭素原子数2~4のアルケニルがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数2~12のアルケニルとしては、例えば、ビニル、プロペニル、n-ブテニルが挙げられる。 Alkenyl is preferably alkenyl having 2 to 12 carbon atoms, more preferably alkenyl having 2 to 6 carbon atoms, and even more preferably alkenyl having 2 to 4 carbon atoms. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Examples of alkenyl having 2 to 12 carbon atoms include vinyl, propenyl and n-butenyl.
アルキニルとしては、炭素原子数2~12のアルキニルが好ましく、炭素原子数2~6のアルキニルがより好ましく、炭素原子数2~4のアルキニルがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数2~12のアルキニルとしては
、例えば、エチニル、プロピニル、n-ブチニルが挙げられる。
Alkynyl is preferably alkynyl having 2 to 12 carbon atoms, more preferably alkynyl having 2 to 6 carbon atoms, and even more preferably alkynyl having 2 to 4 carbon atoms. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Examples of alkynyl having 2 to 12 carbon atoms include ethynyl, propynyl and n-butynyl.
1価の鎖状炭化水素基としては、アルキルが好ましい。 Alkyl is preferred as the monovalent chain hydrocarbon group.
1価の脂環式炭化水素基とは、環構造として脂環式炭化水素のみを含み、芳香族環を含まない炭化水素基を意味し、脂環式炭化水素は単環、多環のいずれであってもよい。ただし、脂環式炭化水素のみで構成されている必要はなく、その一部に鎖状構造を含んでいてもよい。1価の脂環式炭化水素基としては、例えば、シクロアルキル、シクロアルケニル、シクロアルキニルが挙げられ、これらは、単環、多環のいずれであってもよい。 A monovalent alicyclic hydrocarbon group means a hydrocarbon group that contains only an alicyclic hydrocarbon as a ring structure and does not contain an aromatic ring. may be However, it does not have to be composed only of alicyclic hydrocarbons, and may partially contain a chain structure. Examples of monovalent alicyclic hydrocarbon groups include cycloalkyl, cycloalkenyl, and cycloalkynyl, which may be either monocyclic or polycyclic.
シクロアルキルとしては、炭素原子数3~12のシクロアルキルが好ましく、炭素原子数3~6のシクロアルキルがより好ましく、炭素原子数5~6のシクロアルキルがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数3~12のシクロアルキルとしては、例えば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルが挙げられる。 As cycloalkyl, cycloalkyl having 3 to 12 carbon atoms is preferable, cycloalkyl having 3 to 6 carbon atoms is more preferable, and cycloalkyl having 5 to 6 carbon atoms is even more preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Examples of cycloalkyl having 3 to 12 carbon atoms include cyclopropyl, cyclobutyl, cyclopentyl and cyclohexyl.
シクロアルケニルとしては、炭素原子数3~12のシクロアルケニルが好ましく、炭素原子数3~6のシクロアルケニルがより好ましく、炭素原子数5~6のシクロアルケニルがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数3~12のシクロアルケニルとしては、例えば、シクロプロペニル、シクロブテニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニルが挙げられる。 As cycloalkenyl, cycloalkenyl having 3 to 12 carbon atoms is preferable, cycloalkenyl having 3 to 6 carbon atoms is more preferable, and cycloalkenyl having 5 to 6 carbon atoms is even more preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Cycloalkenyl having 3 to 12 carbon atoms includes, for example, cyclopropenyl, cyclobutenyl, cyclopentenyl and cyclohexenyl.
シクロアルキニルとしては、炭素原子数3~12のシクロアルキニルが好ましく、炭素原子数3~6のシクロアルキニルがより好ましく、炭素原子数5~6のシクロアルキニルがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数3~12のシクロアルキニルとしては、例えば、シクロプロピニル、シクロブチニル、シクロペンチニル、シクロヘキシニルが挙げられる。 As cycloalkynyl, cycloalkynyl having 3 to 12 carbon atoms is preferable, cycloalkynyl having 3 to 6 carbon atoms is more preferable, and cycloalkynyl having 5 to 6 carbon atoms is even more preferable. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Cycloalkynyl having 3 to 12 carbon atoms includes, for example, cyclopropynyl, cyclobutynyl, cyclopentynyl and cyclohexynyl.
1価の脂環式炭化水素基としては、シクロアルキルが好ましい。 Cycloalkyl is preferred as the monovalent alicyclic hydrocarbon group.
1価の芳香族炭化水素基とは、芳香族環構造を含む炭化水素基を意味する。ただし、芳香族環のみで構成されている必要はなく、その一部に鎖状構造や脂環式炭化水素を含んでいてもよく、芳香族環は単環、多環のいずれであってもよい。1価の芳香族炭化水素基としては、炭素原子数6~12のアリールが好ましく、炭素原子数6~10のアリールがより好ましく、炭素原子数6のアリールがさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。炭素原子数6~12のアリールとしては、例えば、フェニル、ナフチルが挙げられる。 A monovalent aromatic hydrocarbon group means a hydrocarbon group containing an aromatic ring structure. However, it does not have to be composed only of aromatic rings, and may contain a chain structure or alicyclic hydrocarbon in part, and the aromatic ring may be monocyclic or polycyclic. good. The monovalent aromatic hydrocarbon group is preferably an aryl having 6 to 12 carbon atoms, more preferably an aryl having 6 to 10 carbon atoms, and still more preferably an aryl having 6 carbon atoms. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Examples of aryl having 6 to 12 carbon atoms include phenyl and naphthyl.
1価の芳香族炭化水素基としては、フェニルが好ましい。 Phenyl is preferred as the monovalent aromatic hydrocarbon group.
これらの中でも、1価の炭化水素基としては、アルキル、シクロアルキル、アリールが好ましく、アルキルがより好ましい。 Among these, the monovalent hydrocarbon group is preferably alkyl, cycloalkyl or aryl, more preferably alkyl.
アラルキルとは、アリールアルキルをいう。アリールアルキルにおけるアリールおよびアルキルの定義、例および好ましい例は、上述したとおりである。アラルキルとしては、炭素原子数3~15のアラルキルが好ましい。このようなアラルキルとしては、例えば、ベンゾイル、フェネチル、ナフチルメチル、ナフチルエチルが挙げられる。 Aralkyl refers to arylalkyl. Definitions, examples and preferred examples of aryl and alkyl in arylalkyl are as described above. As aralkyl, aralkyl having 3 to 15 carbon atoms is preferable. Such aralkyls include, for example, benzoyl, phenethyl, naphthylmethyl, naphthylethyl.
1価の複素環基とは、複素環式化合物の複素環から水素原子1個を除いた基をいう。1価の複素環基は、1価の芳香族複素環基、または1価の非芳香族複素環基である。複素環
基を構成するヘテロ原子として、酸素原子、硫黄原子、窒素原子、リン原子、ホウ素原子及びケイ素原子からなる群から選択される1種以上を含むことが好ましく、酸素原子、硫黄原子及び窒素原子からなる群から選択される1種以上を含むことがより好ましい。
A monovalent heterocyclic group refers to a group obtained by removing one hydrogen atom from a heterocyclic ring of a heterocyclic compound. A monovalent heterocyclic group is a monovalent aromatic heterocyclic group or a monovalent non-aromatic heterocyclic group. The heteroatom constituting the heterocyclic group preferably contains one or more selected from the group consisting of an oxygen atom, a sulfur atom, a nitrogen atom, a phosphorus atom, a boron atom and a silicon atom, and an oxygen atom, a sulfur atom and a nitrogen atom. More preferably, it contains one or more selected from the group consisting of atoms.
1価の芳香族複素環基としては、炭素原子数3~15の芳香族複素環基が好ましく、炭素原子数3~9の芳香族複素環基がより好ましく、炭素原子数3~6の芳香族複素環基がさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。1価の芳香族複素環基としては、例えば、ピレニル、ピロリル、フラニル、チオフェニル、ピリジニル、ピリダジニル、ピリミジニル、ピラジニル、トリアジニル、ピロリニル、ピペリジニル、トリアゾニル、プリニル、カルバゾニル、フルオレニル、キノリニル、及びイソキノリニルが挙げられる。 The monovalent aromatic heterocyclic group is preferably an aromatic heterocyclic group having 3 to 15 carbon atoms, more preferably an aromatic heterocyclic group having 3 to 9 carbon atoms, and an aromatic heterocyclic group having 3 to 6 carbon atoms. Group heterocyclic groups are more preferred. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Monovalent aromatic heterocyclic groups include, for example, pyrenyl, pyrrolyl, furanyl, thiophenyl, pyridinyl, pyridazinyl, pyrimidinyl, pyrazinyl, triazinyl, pyrrolinyl, piperidinyl, triazonyl, purinyl, carbazonyl, fluorenyl, quinolinyl, and isoquinolinyl. .
1価の非芳香族複素環基としては、炭素原子数3~15の非芳香族複素環基が好ましく、炭素原子数3~9の非芳香族複素環基がより好ましく、炭素原子数3~6の非芳香族複素環基がさらに好ましい。上記炭素原子数に置換基の炭素原子数は含まれない。1価の非芳香族複素環基としては、例えば、オキシラニル、アジリジニル、アゼチジニル、オキセタニル、チエタニル、ピロリジニル、ジヒドロフラニル、テトラヒドロフラニル、ジオキソラニル、テトラヒドロチオフェニル、イミダゾリジニル、オキサゾリジニル、ピペリジニル、ジヒドロピラニル、テトラヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、モルホリニル、チオモルホリニル、ピペラジニル、ジヒドロオキサジニル、テトラヒドロオキサジニル、ジヒドロピリミジニル、及びテトラヒドロピリミジニルが挙げられる。 The monovalent non-aromatic heterocyclic group is preferably a non-aromatic heterocyclic group having 3 to 15 carbon atoms, more preferably a non-aromatic heterocyclic group having 3 to 9 carbon atoms, and 3 to 3 carbon atoms. 6 non-aromatic heterocyclic groups are more preferred. The above number of carbon atoms does not include the number of carbon atoms of substituents. Examples of monovalent non-aromatic heterocyclic groups include oxiranyl, aziridinyl, azetidinyl, oxetanyl, thietanyl, pyrrolidinyl, dihydrofuranyl, tetrahydrofuranyl, dioxolanyl, tetrahydrothiophenyl, imidazolidinyl, oxazolidinyl, piperidinyl, dihydropyranyl, tetrahydro Pyranyl, tetrahydrothiopyranyl, morpholinyl, thiomorpholinyl, piperazinyl, dihydrooxazinyl, tetrahydrooxazinyl, dihydropyrimidinyl, and tetrahydropyrimidinyl.
これらの中でも、1価の複素環基としては、5員または6員の複素環基が好ましい。 Among these, the monovalent heterocyclic group is preferably a 5- or 6-membered heterocyclic group.
好ましくは、置換基は、以下であってもよい:
(i’)ハロゲン原子;
(ii’)炭素原子数1~12のアルキル、フェニル、もしくはナフチル;
(iii’)炭素原子数3~15のアラルキル;
(iv’)5員または6員の複素環;
(v’)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);または
(vi’)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);
(vii’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
Preferably, the substituents may be:
(i') a halogen atom;
(ii') alkyl having 1 to 12 carbon atoms, phenyl, or naphthyl;
(iii') aralkyl having 3 to 15 carbon atoms;
(iv') a 5- or 6-membered heterocyclic ring;
(v') R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is hydrogen or (vi') NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C (=O)- O—, or R d —C(═O)—NR e — (R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or alkyl having 1 to 12 carbon atoms.);
(vii') the same groups as listed in (vii) above.
より好ましくは、置換基は、以下であってもよい:
(i’’)ハロゲン原子;
(ii’’)炭素原子数1~12のアルキル;
(iii’’)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);または
(iv’’)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~12のアルキルを示す。);
(v’’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
More preferably, the substituents may be:
(i'') a halogen atom;
(ii'') alkyl having 1 to 12 carbon atoms;
(iii'') R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is represents a hydrogen atom or alkyl having 1 to 12 carbon atoms.); or (iv'') NR d R e —, NR d R e —C(=O)—, NR d R e —C(=O )—O—, or R d —C(═O)—NR e — (R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or alkyl having 1 to 12 carbon atoms.);
(v'') The same groups as listed in (vii) above.
さらにより好ましくは、置換基は、以下であってもよい:
(i’’’)ハロゲン原子;
(ii’’’)炭素原子数1~6のアルキル;
(iii’’’)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは炭素原子数1~6のアルキルを示す。);または
(iv’’’)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~6のアルキルを示す。);
(v’’’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
Even more preferably, the substituents may be:
(i''') a halogen atom;
(ii''') alkyl having 1 to 6 carbon atoms;
(iii''') R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is , a hydrogen atom, or alkyl having 1 to 6 carbon atoms . ) ; =O)-O-, or R d -C(=O)-NR e - (R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or alkyl having 1 to 6 carbon atoms);
(v''') the same groups as those enumerated in (vii) above.
特に好ましくは、置換基は、以下であってもよい:
(i’’’’)ハロゲン原子;
(ii’’’’)炭素原子数1~4のアルキル;
(iii’’’’)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは炭素原子数1~4のアルキルを示す。);または
(iv’’ ’’)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは炭素原子数1~4のアルキルを示す。);
(v’’’’)上記(vii)で列挙したものと同じ基。
Particularly preferably, the substituents may be:
(i'''') a halogen atom;
(ii'''') alkyl having 1 to 4 carbon atoms;
(iii'''') R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O-(R c represents a hydrogen atom or alkyl having 1 to 4 carbon atoms.); or (iv'''') NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e - C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e - (R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or alkyl having 1 to 4 carbon atoms. );
(v'''') the same groups as listed in (vii) above.
特定の実施形態では、LaおよびLbは、それぞれ、下記(La’)および(Lb’):
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、水素原子、または上述する置換基からなる群より選ばれる。〕で表されてもよい。
In certain embodiments, La and Lb are (La') and (Lb'), respectively:
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different and are selected from the group consisting of a hydrogen atom or the substituents described above. ] may be represented.
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、好ましくは0~8の整数であり、より好ましくは0~6の整数であり、さらにより好ましくは0~4の整数であり、特に好ましくは0、1または2である。好ましくは、pおよびp’は、同一である。 p and p' are the same or different and are any integer from 0 to 10, preferably an integer from 0 to 8, more preferably an integer from 0 to 6, still more preferably an integer from 0 to 4 It is an integer, particularly preferably 0, 1 or 2. Preferably p and p' are the same.
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、好ましくは0~8の整数であり、より好ましくは0~6の整数であり、さらにより好ましくは0~4の整数であり、特に好ましくは0、1または2である。好ましくは、qおよびq’は、同一である。 q and q' are the same or different and are any integer from 0 to 10, preferably an integer from 0 to 8, more preferably an integer from 0 to 6, still more preferably an integer from 0 to 4 It is an integer, particularly preferably 0, 1 or 2. Preferably q and q' are the same.
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合であり、好ましくは炭素原子または単結合である。好ましくは、XおよびX’は、同一である。 X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond, preferably a carbon atom or a single bond. Preferably X and X' are the same.
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、水素原子、または後述する置換基からなる群より選ばれる。置換基の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。好ましくは、R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、水素原子である。 R 1a , R 1b , R 1a' and R 1b' are the same or different and are selected from the group consisting of hydrogen atoms or substituents described later. Definitions, examples and preferred examples of substituents are as described above. Preferably, R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are hydrogen atoms.
1-4.(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基(B)
式(I)において、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基である。
1-4. (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group, or (b) a divalent group (B) that does not contain a bioorthogonal functional group
In formula (I), B is (a) a divalent group that contains a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not contain a bioorthogonal functional group.
生体直交性官能基とは、生体構成成分(例、アミノ酸、核酸、脂質、糖、リン酸)とは反応しない、もしくは生体構成成分に対する反応の速度が遅いが、生体構成成分以外の成分に対して選択的に反応する基をいう。生体直交性官能基は、当該技術分野において周知である(例、Sharpless K.B.et al.,Angew.Chem.Int.Ed.40,2004(2015);Bertozzi C.R.et al.,Science 291,2357(2001);Bertozzi C.R.et al.,Nature Chemical Biology 1,13(2005)を参照)。
Bioorthogonal functional groups do not react with biological constituents (e.g., amino acids, nucleic acids, lipids, sugars, phosphoric acids), or react slowly with biological constituents, but react with components other than biological constituents. A group that selectively reacts with Bioorthogonal functional groups are well known in the art (e.g., Sharpless KB et al., Angew. Chem. Int. Ed. 40, 2004 (2015); Bertozzi C. R. et al., Science 291, 2357 (2001); Bertozzi CR et al.,
親和性物質の標的が可溶性タンパク質である場合、生体直交性官能基は、タンパク質に対する生体直交性官能基である。タンパク質に対する生体直交性官能基とは、タンパク質を構成する天然の20種のアミノ酸残基の側鎖と反応せずに、所定の官能基と反応する基である。タンパク質を構成する天然の20種のアミノ酸は、アラニン(A)、アスパラギン(N)、システイン(C)、グルタミン(Q)、グリシン(G)、イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、フェニルアラニン(F)、プロリン(P)、セリン(S)、スレオニン(T)、トリプトファン(W)、チロシン(Y)、バリン(V)、アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E)、アルギニン(R)、ヒスチジン(H)、およびリジン(L)である。これらの天然の20種のアミノ酸のうち、側鎖がない(すなわち、水素原子である)グリシン、ならびに側鎖が炭化水素基である(すなわち、硫黄原子、窒素原子、および酸素原子からなる群より選ばれるヘテロ原子を側鎖に含まない)アラニン、イソロイシン、ロイシン、フェニルアラニン、およびバリンは、通常の反応に対して不活性である。したがって、タンパク質に対する生体直交性官能基は、通常の反応に対して不活性である側鎖を有するこれらのアミノ酸の側鎖に加えて、アスパラギン、グルタミン、メチオニン、プロリン、セリン、スレオニン、トリプトファン、チロシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、アルギニン、ヒスチジン、およびリジンの側鎖に対しても反応できない官能基である。 If the target of the affinity agent is a soluble protein, the bioorthogonal functional group is a bioorthogonal functional group to the protein. A bioorthogonal functional group for a protein is a group that reacts with a predetermined functional group without reacting with the side chains of the 20 naturally occurring amino acid residues that constitute the protein. The 20 natural amino acids that make up proteins are alanine (A), asparagine (N), cysteine (C), glutamine (Q), glycine (G), isoleucine (I), leucine (L), methionine (M ), phenylalanine (F), proline (P), serine (S), threonine (T), tryptophan (W), tyrosine (Y), valine (V), aspartic acid (D), glutamic acid (E), arginine ( R), histidine (H), and lysine (L). Of these 20 naturally occurring amino acids, glycine without a side chain (i.e., a hydrogen atom) and from the group consisting of a sulfur atom, a nitrogen atom, and an oxygen atom, in which the side chain is a hydrocarbon group (i.e., Alanine, isoleucine, leucine, phenylalanine, and valine, which do not contain the selected heteroatom in their side chains, are inert to normal reactions. Bioorthogonal functional groups for proteins are thus asparagine, glutamine, methionine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine, in addition to those amino acid side chains with side chains that are inert to normal reactions. , aspartic acid, glutamic acid, arginine, histidine, and lysine.
タンパク質に対して反応できないこのような生体直交性官能基としては、例えば、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルケン残基(換言すれば、炭素原子間二重結合を有する最小単位であるビニレン(エテニレン)部分を有していればよい。以下同様)、アルキン残基(換言すれば、炭素原子間三重結合を有する最小単位であるエチニレン部分を有していればよい。以下同様)、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル基、α―ハロカルボニル残基(例、α位にフッ素原子、塩素原子、臭素原子またはヨウ素原子を有するカルボニル残基。以下同様)、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基が挙げられる。タンパク質としては、遊離のチオール(システイン)を含み得るタンパク質(例、抗体以外のタンパク質)、および遊離のチオールを含み得ないタンパク質(例、抗体)が存在する。遊離のチオールを含み得ないタンパク質にお
いては、チオールが生体直交性官能基として機能する。したがって、親和性物質の標的である可溶性タンパク質が遊離のチオールを含み得ないタンパク質(例、抗体)である場合、生体直交性官能基にはチオールが含まれることが好ましい。また、可溶性タンパク質が遊離のチオールを含み得るタンパク質(例、抗体以外のタンパク質)である場合、生体直交性官能基にはチオールが含まれないことが好ましい。1種または2種以上(例、2種、3種、4種)の生体直交性官能基が2価の基に含まれていてもよいが、好ましくは、1種の生体直交性官能基が2価の基に含まれていてもよい。
Such bioorthogonal functional groups that cannot react with proteins include, for example, azide residues, aldehyde residues, thiol residues, alkene residues (in other words, the smallest unit having a double bond between carbon atoms It suffices if it has a certain vinylene (ethynylene) moiety, hereinafter the same), alkyne residue (in other words, it suffices if it has an ethynylene moiety, which is the minimum unit having a triple bond between carbon atoms, hereinafter the same) , halogen residue, tetrazine residue, nitrone residue, hydroxylamine residue, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, thioester group, α-halocarbonyl residue (e.g., a carbonyl residue having a fluorine atom, chlorine atom, bromine atom or iodine atom at the α-position; the same shall apply hereinafter), isonitrile residue, sydone residue , selenium residues. Proteins include proteins that can contain free thiols (cysteine) (eg, proteins other than antibodies) and proteins that cannot contain free thiols (eg, antibodies). Thiols function as bioorthogonal functional groups in proteins that cannot contain free thiols. Therefore, when the soluble protein that is the target of the affinity substance is a protein (eg, antibody) that cannot contain free thiols, the bioorthogonal functional group preferably contains thiols. Also, when the soluble protein is a protein that can contain free thiols (eg, proteins other than antibodies), it is preferred that the bioorthogonal functional groups do not contain thiols. One or more (e.g., two, three, four) bioorthogonal functional groups may be contained in the divalent group, but preferably one bioorthogonal functional group is It may be contained in a divalent group.
一実施形態では、生体直交性官能基を含む2価の基は、アジド残基、アルデヒド基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を主鎖に含む2価の基であってもよい。 In one embodiment, the divalent groups comprising bioorthogonal functional groups are azide residues, aldehyde groups, thiol residues, alkyne residues, alkene residues, tetrazine residues, nitrone residues, hydroxylamine residues, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, thioester group, α-halocarbonyl residue, isonitrile It may be a divalent group containing, in its main chain, a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of residues, sydnon residues, and selenium residues.
別の実施形態では、生体直交性官能基を含む2価の基は、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基を側鎖に含む2価の基であってもよい。 In another embodiment, the divalent group comprising a bioorthogonal functional group is an azide residue, an aldehyde residue, a thiol residue, an alkyne residue, an alkene residue, a halogen residue, a tetrazine residue, a nitrone residue. , hydroxylamine residue, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, α-halocarbonyl residue It may be a divalent group containing a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of groups, isonitrile residues, sydnon residues, and selenium residues in the side chain.
より具体的には、生体直交性官能基は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)
More specifically, the bioorthogonal functional group may correspond to any one chemical structure selected from the group consisting of:
R 1f , single or multiple R 1g and single or multiple R 1h are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii), or electron-withdrawing groups;
・ is a bond. )
電子吸引基としては、例えば、上述したものが挙げられるが、ハロゲン原子、ボロン酸残基、メシル、トシル、トリフレートが好ましい。 Examples of the electron-withdrawing group include those described above, and halogen atoms, boronic acid residues, mesyl, tosyl, and triflate are preferred.
一実施形態では、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であってもよい。2価の基に含まれる生体直交性官能基の数は、単一または複数であり、例えば1~5、好ましくは1~3、より好ましくは1または2、さらにより好ましくは1である。2価の基に含まれる生体直交性官能基の数が複数である場合、複数の生体直交性官能基は、同種であっても異種であってもよいが、単純な構造の採用等の観点では、同種であることが好ましい。 In one embodiment, B may be (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group. The number of bioorthogonal functional groups contained in the divalent group may be single or multiple, eg 1-5, preferably 1-3, more preferably 1 or 2, even more preferably 1. When the number of bioorthogonal functional groups contained in the divalent group is plural, the plural bioorthogonal functional groups may be of the same type or different types. Preferably, they are of the same type.
特定の実施形態では、Bは、(a1)生体直交性官能基を主鎖に含む2価の基であってもよい。生体直交性官能基を主鎖に含む2価の基は、アジド残基、アルデヒド基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、チオエステル基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基自体を2価の基とするもの、またはこのような2価の生体直交性官能基のいずれか一方の末端または両端に上述した2価の基が連結されている基である。連結されるべき2価の基の定義、例および好ましい例は、上述した2価の基と同様である。 In certain embodiments, B may be (a1) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group in its backbone. Bivalent groups containing bioorthogonal functional groups in the main chain include azide residues, aldehyde groups, thiol residues, alkyne residues, alkene residues, tetrazine residues, nitrone residues, hydroxylamine residues, and nitrile residues. group, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, thioester group, α-halocarbonyl residue, isonitrile residue , a sydnon residue, and a selenium residue, a bioorthogonal functional group itself being a divalent group, or at either end or both ends of such a bivalent bioorthogonal functional group It is a group to which the divalent groups described above are linked. The definition, examples and preferred examples of the divalent group to be linked are the same as for the divalent group described above.
別の特定の実施形態では、Bは、(a2)生体直交性官能基を側鎖に含む2価の基であってもよい。生体直交性官能基を側鎖に含む2価の基は、アジド残基、アルデヒド残基、チオール残基、アルキン残基、アルケン残基、ハロゲン残基、テトラジン残基、ニトロン残基、ヒドロキシルアミン残基、ニトリル残基、ヒドラジン残基、ケトン残基、ボロン酸残基、シアノベンゾチアゾール残基、アリル残基、ホスフィン残基、マレイミド残基、ジスルフィド残基、α―ハロカルボニル残基、イソニトリル残基、シドノン残基、セレン残基からなる群より選ばれる生体直交性官能基またはそれを含む基で置換された2価の基である。置換されるべき2価の基の定義、例および好ましい例は、上述した2価の基と同様である。 In another particular embodiment, B may be (a2) a divalent group containing a bioorthogonal functional group in its side chain. Bivalent groups containing bioorthogonal functional groups in side chains include azide residues, aldehyde residues, thiol residues, alkyne residues, alkene residues, halogen residues, tetrazine residues, nitrone residues, hydroxylamine residue, nitrile residue, hydrazine residue, ketone residue, boronic acid residue, cyanobenzothiazole residue, allyl residue, phosphine residue, maleimide residue, disulfide residue, α-halocarbonyl residue, isonitrile It is a divalent group substituted with a bioorthogonal functional group selected from the group consisting of a residue, a sydnon residue and a selenium residue, or a group containing the same. The definition, examples and preferred examples of the divalent group to be substituted are the same as for the divalent group described above.
別の実施形態では、Bは、(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であってもよい。このような2価の基は、置換されていてもよいアルキレン、置換されていてもよいシクロアルキレン、置換されていてもよいアリール、置換されていてもよい2価の複素環基、-NRa-(Raは水素原子、または置換基を示す)、-O-、およびこれらの2以上の組み合わせ(例えば2~8、好ましくは2~6、より好ましくは2~4)からなる基であってもよい。置換されていてもよい場合の置換基、およびRaの置換基は、生体直交性官能基以外の置換基である。このような置換基としては、例えば、アルキル、シクロアルキル、アラルキル、1価の複素環基、ヒドロキシル、アミノ、アルキルオキシ(アルコキシ)、シクロアルキルオキシ、アラルキルオキシが挙げられる。このような置換基の数は、例えば1~5個、好ましくは1~3個、より好ましくは1もしくは2個、さらにより好ましくは1個である。 In another embodiment, B may be (b) a divalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. Such divalent groups include optionally substituted alkylene, optionally substituted cycloalkylene, optionally substituted aryl, optionally substituted divalent heterocyclic group, —NR a - (R a represents a hydrogen atom or a substituent), -O-, and a group consisting of a combination of two or more thereof (for example, 2 to 8, preferably 2 to 6, more preferably 2 to 4). may The optionally substituted substituents and the substituents of R a are substituents other than bioorthogonal functional groups. Such substituents include, for example, alkyl, cycloalkyl, aralkyl, monovalent heterocyclic groups, hydroxyl, amino, alkyloxy (alkoxy), cycloalkyloxy, aralkyloxy. The number of such substituents is, for example, 1 to 5, preferably 1 to 3, more preferably 1 or 2, still more preferably 1.
生体直交性官能基以外の置換基について、アルキル、シクロアルキル、アラルキル、1価の複素環基の定義、例および好ましい例は、上述したとおりである。 Definitions, examples and preferred examples of alkyl, cycloalkyl, aralkyl and monovalent heterocyclic groups for substituents other than bioorthogonal functional groups are as described above.
生体直交性官能基以外の置換基について、アルキルオキシ(アルコキシ)におけるアルキル、シクロアルキルオキシにおけるシクロアルキル、およびアラルキルオキシにおけるアラルキルの定義、例および好ましい例は、上述したとおりである。より具体的には、アルキルオキシとしては、例えば、メチルオキシ、エチルオキシ、プロピルオキシ(例、n
-プロピルオキシ、iso-プロピルオキシ)、ブチルオキシ(例、n-ブチルオキシ、iso-ブチルオキシ、sec-ブチルオキシ、tert-ブチルオキシ)、ペンチルオキシ(例、n-ペンチルオキシ)、ヘキシルオキシ(例、n-ヘキシルオキシ)が挙げられる。シクロアルキルオキシとしては、例えば、シクロプロピルオキシ、シクロブチルオキシ、シクロペンチルオキシ、シクロヘキシルオキシが挙げられる。アラルキルオキシとしては、例えば、ベンゾイルオキシ、フェネチルオキシ、ナフチルメチルオキシ、ナフチルエチルオキシが挙げられる。
Regarding substituents other than bioorthogonal functional groups, definitions, examples and preferred examples of alkyl in alkyloxy (alkoxy), cycloalkyl in cycloalkyloxy, and aralkyl in aralkyloxy are as described above. More specifically, alkyloxy includes, for example, methyloxy, ethyloxy, propyloxy (eg, n
-propyloxy, iso-propyloxy), butyloxy (e.g. n-butyloxy, iso-butyloxy, sec-butyloxy, tert-butyloxy), pentyloxy (e.g. n-pentyloxy), hexyloxy (e.g. n-hexyl) oxy). Cycloalkyloxy includes, for example, cyclopropyloxy, cyclobutyloxy, cyclopentyloxy and cyclohexyloxy. Aralkyloxy includes, for example, benzoyloxy, phenethyloxy, naphthylmethyloxy, naphthylethyloxy.
生体直交性官能基を含まない2価の基はまた、反応に対して高度に不活性な基であってもよい。したがって、このような2価の基は、炭素原子および水素原子のみから構成される基であってもよい。このような2価の基は、アルキレン、シクロアルキレン、またはアリール、およびこれらの2以上の組み合わせ(例えば2または3)である。生体直交性官能基を含まない2価の基が反応に対して高度に不活性な基である場合、このような2価の基は、反応に対して高度に不活性な置換基として、アルキレン、シクロアルキレン、およびアリールからなる群より選ばれる置換基を有していてもよい。反応に対して高度に不活性な置換基の数は、例えば1~5個、好ましくは1~3個、より好ましくは1もしくは2個である。 A divalent group that does not contain a bioorthogonal functional group may also be a group that is highly inert to reactions. Such divalent groups may therefore be groups composed only of carbon and hydrogen atoms. Such divalent groups are alkylene, cycloalkylene, or aryl, and combinations of two or more thereof (eg, 2 or 3). When the divalent group that does not contain a bioorthogonal functional group is a group that is highly inert to the reaction, such a divalent group can be alkylene as the highly inert substituent to the reaction. , cycloalkylene, and aryl. The number of substituents highly inert to the reaction is, for example, 1-5, preferably 1-3, more preferably 1 or 2.
特定の実施形態では、Bは、下記式(B-1):
Yは、-NH-、-O-、-CH2-、または下記式(B-2):
VおよびV’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
V1は、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
sは、0~10の任意の整数であり、
式(B-2)における○および●は、それぞれ、式(B-1)における○および●と同じ配向である。)であり、
Zは、酸素原子、硫黄原子、または水素原子(Zが水素原子である場合、-C(=Z)-は、-CH2-を示す。)であり、
式(B-1)における○(白丸)は、L側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はR側の部分に対する結合を示す。〕で表されてもよい。
In certain embodiments, B is the following formula (B-1):
Y is -NH-, -O-, -CH 2 -, or the following formula (B-2):
V and V′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
V is (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group without a bioorthogonal functional group;
s is any integer from 0 to 10,
○ and ● in formula (B-2) have the same orientations as ○ and ● in formula (B-1), respectively. ) and
Z is an oxygen atom, a sulfur atom, or a hydrogen atom (when Z is a hydrogen atom, -C(=Z)- represents -CH 2 -);
○ (white circle) in formula (B-1) indicates a bond to the L-side portion, and ● (black circle) indicates a bond to the R-side portion. ] may be represented.
Yは、-NH-、-O-、-CH2-、または上記式(B-2)で表される基である。構造の簡便化等の観点から、Yは、-NH-、-O-、または-CH2-であってもよい。あるいは、炭素原子を基調とした構造の設計等の観点からは、Yは、-CH2-、または上記式(B-2)で表される基であってもよい。 Y is —NH—, —O—, —CH 2 —, or a group represented by formula (B-2) above. From the viewpoint of structural simplification, Y may be -NH-, -O-, or -CH 2 -. Alternatively, from the viewpoint of designing a structure based on a carbon atom, Y may be —CH 2 — or a group represented by the above formula (B-2).
Zは、酸素原子、硫黄原子、または水素原子であるが、好ましくは酸素原子または硫黄
原子である。
Z is an oxygen atom, a sulfur atom, or a hydrogen atom, preferably an oxygen atom or a sulfur atom.
VおよびV’は、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、好ましくは-CH2-、または単結合である。 V and V' are -NH-, -O-, -CH 2 -, or a single bond, preferably -CH 2 -, or a single bond.
V1は、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基である。このような2価の基は、上述したものと同様である。 V1 is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group. Such divalent groups are the same as those described above.
好ましくは、V1における2価の基は、置換されていてもよい2価の炭化水素基、または置換されていてもよい2価の複素環基である。2価の炭化水素基の定義、例および好ましい例は、上述したものと同様であるが、V1の場合、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、シクロアルキレン、シクロアルケニレン、シクロアルキニレン、アリーレンが好ましい。例えば、生体直交性官能基を含有する部分で置換されていない場合、アルケニレン、アルキニレン、シクロアルケニレン、シクロアルキニレンが好ましい。一方、生体直交性官能基を含有する部分で置換されている場合、アルキレン、シクロアルキレン、アリーレンが好ましい。これらの基の例および好ましい例は、上述したとおりである。2価の複素環基の定義、例および好ましい例は、上述したものと同様であるが、V1の場合、5員または6員の複素環基が好ましい。5員または6員の複素環基の例および好ましい例は、上述したものと同様である。置換基の定義、例および好ましい例は、上述したとおりである。V1は、(a)生体直交性官能基を、例えば1~5個、好ましくは1~3個、より好ましくは1個または2個、さらにより好ましくは1個有していてもよい。2価の基に含まれる生体直交性官能基の数が複数である場合、複数の生体直交性官能基は、同種であっても異種であってもよい。単純な構造の採用、および反応性の向上等の観点では、同種であることが好ましい。差別化された反応の確保等の観点では、異種であることが好ましい。V1はまた、(b)置換基を1~5個、好ましくは1~3個、より好ましくは1もしくは2個を有していてもよい。 Preferably, the divalent group for V1 is an optionally substituted divalent hydrocarbon group or an optionally substituted divalent heterocyclic group. The definition, examples and preferred examples of the divalent hydrocarbon group are the same as those described above, but in the case of V1, alkylene, alkenylene, alkynylene, cycloalkylene, cycloalkenylene, cycloalkynylene and arylene are preferred. For example, alkenylene, alkynylene, cycloalkenylene, cycloalkynylene are preferred if they are not substituted with moieties containing bioorthogonal functional groups. On the other hand, when substituted with moieties containing bioorthogonal functional groups, alkylene, cycloalkylene and arylene are preferred. Examples and preferred examples of these groups are as described above. The definition, examples and preferred examples of the divalent heterocyclic group are the same as those described above, but in the case of V1, a 5- or 6-membered heterocyclic group is preferred. Examples and preferred examples of the 5- or 6-membered heterocyclic group are the same as those mentioned above. Definitions, examples and preferred examples of substituents are as described above. V1 may have (a) bioorthogonal functional groups, for example 1 to 5, preferably 1 to 3, more preferably 1 or 2, even more preferably 1. When the number of bioorthogonal functional groups contained in the divalent group is plural, the plural bioorthogonal functional groups may be of the same type or different types. From the viewpoint of adopting a simple structure and improving reactivity, it is preferable that they are of the same type. From the viewpoint of ensuring differentiated reactions, etc., it is preferable that the cells are of different types. V1 may also have 1 to 5, preferably 1 to 3, more preferably 1 or 2 (b) substituents.
sは、0~10の任意の整数であり、好ましくは0~8の整数であり、より好ましくは0~6の整数であり、さらにより好ましくは0~4の整数であり、特に好ましくは0、1または2である。 s is any integer from 0 to 10, preferably an integer from 0 to 8, more preferably an integer from 0 to 6, even more preferably an integer from 0 to 4, particularly preferably 0 , 1 or 2.
さらに特定の実施形態では、V1は、下記式(B-3):
GおよびG’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、単結合、または下記式(B-4):
WおよびW’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
W1は、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
tは、0~10の任意の整数である。
式(B-4)における○(白丸)は、式(B-3)における結合手(・)の方向に対する結合を示し、●(黒丸)はb側の方向に対する結合を示す。)で表される基であり、
Hは、-CH2-、-C=O-、-C=S-、-NH-、または単結合であり、
Iは、2価の炭化水素基、2価の複素環、または単結合であり、
bは、下記:
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)で表されるいずれか一つの基である。〕で表される基を側鎖として有する2価の基であってもよい。このような2価の基は、2価の炭化水素基、または2価の複素環基であり、好ましくは、置換されていてもよい2価の炭化水素基であり、より好ましくは、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、シクロアルキレン、シクロアルケニレン、シクロアルキニレン、またはアリーレンであり、さらより好ましくは、アルキレン、シクロアルキレン、またはアリーレンであり、特に好ましくはアルキレンである。これらの基の例および好ましい例は、上述したとおりである。これらの基は、上記側鎖以外の置換基で置換されていてもよい。このような置換基の数は、1~5個、好ましくは1~3個、より好ましくは1もしくは2個である。置換基の例および好ましい例は、上述したとおりである。
In a more specific embodiment, V1 has the following formula (B-3):
G and G' are the same or different, -NH-, -O-, -CH 2 -, a single bond, or the following formula (B-4):
W and W′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
W1 is (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group without a bioorthogonal functional group;
t is any integer from 0-10.
○ (white circle) in formula (B-4) indicates a bond in the direction of the bond (·) in formula (B-3), and ● (black circle) indicates a bond in the b-side direction. ) is a group represented by
H is —CH 2 —, —C═O—, —C═S—, —NH—, or a single bond;
I is a divalent hydrocarbon group, a divalent heterocyclic ring, or a single bond;
b is:
R 1f , single or multiple R 1g and single or multiple R 1h are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii), or electron-withdrawing groups;
・ is a bond. ) is any one group represented by ] as a side chain may be a divalent group. Such a divalent group is a divalent hydrocarbon group or a divalent heterocyclic group, preferably an optionally substituted divalent hydrocarbon group, more preferably alkylene, It is alkenylene, alkynylene, cycloalkylene, cycloalkenylene, cycloalkynylene or arylene, more preferably alkylene, cycloalkylene or arylene, particularly preferably alkylene. Examples and preferred examples of these groups are as described above. These groups may be substituted with substituents other than the above side chains. The number of such substituents is 1-5, preferably 1-3, more preferably 1 or 2. Examples and preferred examples of substituents are as described above.
GおよびG’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、単結合、または上記式(B-4)で表される基である。構造の簡便化等の観点から、GおよびG’は、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であってもよい。あるいは、炭素原子を基調とした構造の設計等の観点からは、GおよびG’は、-CH2-、単結合、または上記式(B-4)で表される基であってもよい。 G and G' are the same or different and are -NH-, -O-, -CH 2 -, a single bond, or a group represented by formula (B-4) above. From the viewpoint of structural simplification, G and G' may be -NH-, -O-, -CH 2 -, or a single bond. Alternatively, from the viewpoint of designing a structure based on a carbon atom, G and G' may be —CH 2 —, a single bond, or a group represented by formula (B-4) above.
Hは、-CH2-、-C=O-、-C=S-、-NH-、または単結合である。好ましくは、Hは、-CH2-、または単結合である。 H is -CH 2 -, -C=O-, -C=S-, -NH-, or a single bond. Preferably H is -CH 2 - or a single bond.
Iは、2価の炭化水素基、2価の複素環、または単結合である。2価の炭化水素基、および2価の複素環は、置換基で置換されていても、置換されていなくてもよい。2価の炭化水素基、2価の複素環、および置換基の定義、例および好ましい例は、V1において上述したものと同様である。 I is a divalent hydrocarbon group, a divalent heterocyclic ring, or a single bond. A divalent hydrocarbon group and a divalent heterocyclic ring may or may not be substituted with a substituent. Definitions, examples and preferred examples of the divalent hydrocarbon group, divalent heterocyclic ring, and substituent are the same as those described above for V1.
WおよびW’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、好ましくは-CH2-、または単結合である。 W and W' are the same or different and are -NH-, -O-, -CH 2 - or a single bond, preferably -CH 2 - or a single bond.
W1は、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基である。このような2価の基は、上述したものと同様である。 W1 is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group. Such divalent groups are the same as those described above.
tは、0~10の任意の整数であり、好ましくは0~8の整数であり、より好ましくは0~6の整数であり、さらにより好ましくは0~4の整数であり、特に好ましくは0、1または2である。 t is any integer from 0 to 10, preferably an integer from 0 to 8, more preferably an integer from 0 to 6, even more preferably an integer from 0 to 4, particularly preferably 0 , 1 or 2.
1-5.反応性基(R)
式(I)において、Rは、可溶性タンパク質に対する反応性基である。このような反応性基は、当該技術分野において技術常識である。
1-5. Reactive group (R)
In formula (I), R is a reactive group for soluble proteins. Such reactive groups are common technical knowledge in the technical field.
反応性基は、生体直交性官能基と同種または異種の基である。 Reactive groups are the same or different groups as the bioorthogonal functional groups.
例えば、Bが、(a)生体直交性官能基を含む2価の基である場合、反応性基は、その生体直交性官能基と異種の基であってもよい。反応性基が生体直交性官能基と同種の基であれば、可溶性タンパク質に対する反応性基の反応特異性が確保されないためである。また、そもそも生体直交性官能基は、可溶性タンパク質を構成する天然の20種のアミノ酸残基の側鎖と反応し得ない基のためである。 For example, if B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group, the reactive group may be a group dissimilar to the bioorthogonal functional group. This is because if the reactive group is the same kind of group as the bioorthogonal functional group, the reaction specificity of the reactive group with respect to the soluble protein cannot be ensured. In addition, the bioorthogonal functional group is originally a group that cannot react with side chains of 20 natural amino acid residues that constitute soluble proteins.
より具体的には、タンパク質を構成する上述したような天然の20種のアミノ酸のうち、側鎖がないグリシン、ならびに側鎖が炭化水素基であるアラニン、イソロイシン、ロイシン、フェニルアラニン、およびバリンは、通常の反応に対して不活性である。したがって、タンパク質に対する反応性基は、アスパラギン、グルタミン、メチオニン、プロリン、セリン、スレオニン、トリプトファン、チロシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、アルギニン、ヒスチジン、およびリジンからなる14種のアミノ酸のいずれか1種または2種以上(例、2種、3種、4種)の側鎖に対して反応できる基である。タンパク質のアミノ酸組成等の条件に応じて、1種または2種以上(例、2種、3種、4種)の反応性基が式(I)で表される化合物に含まれていてもよいが、好ましくは、1種の反応性基が式(I)で表される化合物に含まれていてもよい。 More specifically, among the 20 natural amino acids that constitute proteins, glycine without a side chain, and alanine, isoleucine, leucine, phenylalanine, and valine with a hydrocarbon group in the side chain are Inactive to normal reactions. Thus, reactive groups for proteins are any one or two of the 14 amino acids consisting of asparagine, glutamine, methionine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine, aspartic acid, glutamic acid, arginine, histidine, and lysine. It is a group capable of reacting with the above (eg, 2, 3, 4) side chains. Depending on conditions such as the amino acid composition of the protein, one or more (e.g., two, three, four) reactive groups may be contained in the compound represented by formula (I). However, preferably one reactive group may be included in the compound of formula (I).
好ましくは、反応性基は、タンパク質を構成する上述したような14種のアミノ酸のうちのいずれか1種のアミノ酸の側鎖と反応できる基である。 Preferably, the reactive group is a group capable of reacting with the side chain of any one of the 14 amino acids that constitute proteins.
より好ましくは、反応性基は、リジン、チロシン、トリプトファン、またはシステインのいずれか1種のアミノ酸の側鎖に対して特異的な反応性基であってもよい。 More preferably, the reactive group may be a reactive group specific for the side chain of any one of lysine, tyrosine, tryptophan, or cysteine amino acids.
さらにより好ましくは、反応性基は、リジン、チロシン、またはトリプトファンのいずれか1種のアミノ酸の側鎖に対して特異的な反応性基であってもよい。 Even more preferably, the reactive group may be a reactive group specific for the side chain of any one of lysine, tyrosine or tryptophan amino acids.
また、タンパク質がヒトIgG1等のヒトIgGである場合、反応性基は、リジンまたはチロシンの側鎖に対して特異的な反応性基であることが好ましい。 Also, when the protein is human IgG, such as human IgG1, the reactive group is preferably a reactive group specific for the side chains of lysine or tyrosine.
リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基は、リジン残基の側鎖中に存在するアミノ基(NH2)と特異的に反応できる基であり、例えば、活性化エステル残基(例、N-ヒドロキシスクシンイミド残基)、ビニルスルホン残基、スルホニルクロライド残基、イソシアネート残基、イソチオシアネート残基、アルデヒド残基、1,4,7,10-テトラ
アザシクロドデカン-1,4,7,10-テトラ酢酸残基、2-イミノ-2-メトキシエチル残基、ジアゾニウムテレフタル酸残基が挙げられる。
A reactive group specific for the side chain of a lysine residue is a group capable of specifically reacting with an amino group (NH 2 ) present in the side chain of a lysine residue, such as an activated ester residue (e.g., N-hydroxysuccinimide residue), vinyl sulfone residue, sulfonyl chloride residue, isocyanate residue, isothiocyanate residue, aldehyde residue, 1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4 , 7,10-tetraacetic acid residue, 2-imino-2-methoxyethyl residue, and diazonium terephthalic acid residue.
リジン残基の側鎖に対して特異的な上述の反応性基と、リジン残基の側鎖中に存在するアミノ基(NH2)との間の反応により生成する連結部分としては、例えば、アミド残基、ウレア残基、ピリジン残基、カルバメート残基、スルホンアミド残基が挙げられる。 The linking moiety generated by the reaction between the above-mentioned reactive group specific to the side chain of the lysine residue and the amino group (NH 2 ) present in the side chain of the lysine residue includes, for example, Amide residues, urea residues, pyridine residues, carbamate residues, sulfonamide residues can be mentioned.
より具体的には、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
R5aおよびR5cは、水素原子、または上述した置換基であり、
R5bは、電子吸引基であり、
jは、1~5の任意の整数であり、
kは、1~4の任意の整数である。〕
More specifically, the reactive group specific for the side chain of a lysine residue may correspond to any one chemical structure selected from the group consisting of:
R 5a and R 5c are hydrogen atoms or substituents as described above,
R 5b is an electron withdrawing group,
j is any integer from 1 to 5;
k is any integer from 1 to 4. ]
R5aおよびR5cは、水素原子、または上述した置換基である。置換基の定義、例、および好ましい例は、上述したものと同様である。 R5a and R5c are hydrogen atoms or substituents as described above. Definitions, examples and preferred examples of substituents are the same as those described above.
R5bは、電子吸引基である。このような電子吸引基としては、例えば、上述したものが挙げられるが、ハロゲン原子、ボロン酸残基、メシル、トシル、トリフレートが好ましい。 R5b is an electron withdrawing group. Examples of such electron-withdrawing groups include those described above, and halogen atoms, boronic acid residues, mesyl, tosyl, and triflate are preferred.
jは、1~5の任意の整数であり、好ましくは1~3の整数であり、より好ましくは1または2である。 j is any integer from 1 to 5, preferably an integer from 1 to 3, more preferably 1 or 2;
kは、1~4の任意の整数であり、好ましくは1~3の整数であり、より好ましくは1または2である。 k is any integer from 1 to 4, preferably an integer from 1 to 3, more preferably 1 or 2.
リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である上記化学構造と、リジン残基の側鎖中に存在するアミノ基(NH2)との間の反応により生成する連結部分は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
チロシン残基の側鎖に対して特異的な反応性基は、チロシン残基の側鎖中に存在するフェノール性ヒドロキシル基(OH)のオルト位の原子と特異的に反応できる基であり、例えば、ジアゾニウム残基、ジアゾジカルボキレート残基、2,3-ジヒドロ-1H-ピラジン-6-オン残基が挙げられる。 A reactive group specific for the side chain of a tyrosine residue is a group capable of specifically reacting with an atom ortho to a phenolic hydroxyl group (OH) present in the side chain of a tyrosine residue, e.g. , diazonium residue, diazodicarboxylate residue, 2,3-dihydro-1H-pyrazin-6-one residue.
より具体的には、チロシン残基の側鎖に対して特異的な反応性基は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
R4aは、水素原子、または上述した置換基である。置換基の定義、例、および好ましい例は、上述したものと同様である。 R 4a is a hydrogen atom or a substituent as described above. Definitions, examples and preferred examples of substituents are the same as those described above.
チロシン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である上記化学構造と、チロシン残基の側鎖中に存在するフェノール性ヒドロキシル基(OH)のオルト位の原子との間の反応により生成する連結部分は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
R4aは、水素原子、または上述した置換基である。置換基の定義、例、および好ましい例は、上述したものと同様である。 R 4a is a hydrogen atom or a substituent as described above. Definitions, examples and preferred examples of substituents are the same as those described above.
トリプトファン残基の側鎖に対して特異的な反応性基は、トリプトファン残基の側鎖中
に存在するインドール基の3位の環構成原子と特異的に反応できる基であり、例えば、9-アザビシクロ[3.3.1]ノナン-3-オン-N-オキシル残基が挙げられる。
The reactive group specific to the side chain of tryptophan residue is a group capable of specifically reacting with the 3-position ring-constituting atom of the indole group present in the side chain of tryptophan residue, for example, 9- and azabicyclo[3.3.1]nonan-3-one-N-oxyl residues.
より具体的には、トリプトファン残基の側鎖に対して特異的な反応性基は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
トリプトファン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である上記化学構造と、トリプトファン残基の側鎖中に存在するインドール基の3位の環構成原子との間の反応により生成する連結部分は、下記からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応していてもよい。
特に好ましくは、反応性基は、リジンの側鎖に対して特異的な反応性基であってもよい。 Particularly preferably, the reactive group may be a reactive group specific for the side chain of lysine.
1-6.部分構造「L-B」
1-6-1.AおよびRを連結する部分構造「L-B」中の主鎖の長さ
式(I)において、A(親和性物質)およびR(反応性基)を連結する主鎖(L-B中の直鎖部分)の長さは、可溶性タンパク質および親和性物質の種類、ならびに可溶性タンパク質における親和性物質の標的部位と、Rが反応して結合すべきである、上述したような標的領域(例、特定の位置)中の特定のアミノ酸残基の位置および数との関係などの種々の因子に応じて、適宜設計することができる。式(I)で表される化合物は、親和性物質が可溶性タンパク質に会合し、次いで、L-Bを介して親和性物質と共有結合している反応性基が、上記標的部位の近傍に存在する特定のアミノ酸残基の側鎖中の基(例、リジン残基の側鎖中のアミノ基)と反応することにより、可溶性タンパク質と共有結合することができる。このとき、Rが反応して結合すべきである特定のアミノ酸残基の近傍領域、上記標的部位の近傍領域、および当該特定のアミノ酸残基と上記標的部位との間の領域において当該特定のアミノ酸残基が他に存在しない場合、主鎖の長さを厳密に制御せずとも、反応性基は、当該特定のアミノ酸残基に対して位置選択的に結合することができる。勿論、このような領域において当該特定のアミノ酸残基が他に存在する場合であっても、主鎖の長さを制御することにより、反応性基は、当該特定のアミノ酸残基に対して位置選択的に結合することができる。
1-6. Partial structure "LB"
1-6-1. Length of main chain in partial structure “LB” connecting A and R In formula (I), main chain connecting A (affinity substance) and R (reactive group) (L The length of the linear portion) is determined by the type of soluble protein and affinity substance, and the target region of the affinity substance in the soluble protein to which R should react and bind, as described above (e.g., It can be appropriately designed according to various factors such as the relationship with the position and number of specific amino acid residues in the specific position). In the compound represented by formula (I), an affinity substance is associated with a soluble protein, and then a reactive group covalently bonded to the affinity substance via LB is present in the vicinity of the target site. can be covalently attached to soluble proteins by reacting with groups in the side chains of specific amino acid residues (eg, amino groups in the side chains of lysine residues). At this time, the specific amino acid in the region near the specific amino acid residue to which R should react and bind, the region near the target site, and the region between the specific amino acid residue and the target site If the residue is not otherwise present, the reactive group can be regioselectively attached to that particular amino acid residue without strict control of backbone length. Of course, by controlling the length of the backbone, the reactive group can be positioned relative to the particular amino acid residue, even if the particular amino acid residue is otherwise present in such regions. Can be selectively bound.
AおよびRを連結する主鎖の長さは、可溶性タンパク質およびそれに対する親和性物質の種類、ならびに可溶性タンパク質中の標的部位中の特定のアミノ酸残基の位置および数の関係などの因子に応じて変動し得るが、約5Å以上、好ましくは約7.5Å、より好ま
しくは約10.5Å以上であってもよい。このような主鎖の長さはまた、例えば約30Å以下、好ましくは約23Å以下、より好ましくは約16.5Å以下であってもよい。より具体的には、このような主鎖の長さは、例えば約5.0~30Å、好ましくは約7.5~23Å、より好ましくは約10.5~16.5Åであってもよい。
The length of the backbone linking A and R depends on factors such as the type of soluble protein and its affinity substance, and the position and number of specific amino acid residues in the target site in the soluble protein. Although it can vary, it may be about 5 Å or greater, preferably about 7.5 Å or greater, and more preferably about 10.5 Å or greater. Such backbone lengths may also be, for example, about 30 Å or less, preferably about 23 Å or less, more preferably about 16.5 Å or less. More specifically, the length of such backbone may be, for example, about 5.0-30 Å, preferably about 7.5-23 Å, more preferably about 10.5-16.5 Å.
ところで、原子間の長さ(距離)の関係については、下表のとおりであることが、当該技術分野における技術常識である。したがって、当業者であれば、下表の原子間の長さを参考にして、上述したような主鎖の長さ(Å)に対応する個数の原子を有する主鎖を適宜設計することができる。 By the way, it is common general knowledge in this technical field that the relationship of the length (distance) between atoms is as shown in the table below. Therefore, a person skilled in the art can appropriately design a main chain having the number of atoms corresponding to the length (Å) of the main chain as described above, referring to the interatomic lengths shown in the table below. .
より具体的には、AおよびRを連結する主鎖の長さは、主鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。主鎖を構成する原子数は、例えば4個(約5.0Å)以上、好ましくは6個(約7.5Å)、より好ましくは8個(約10.5Å)以上であってもよい。主鎖の原子数はまた、例えば20個(約30Å)以下、好ましくは16個(約23Å)以下、より好ましくは12個(約16.5Å)以下であってもよい。より具体的には、主鎖の原子数は、例えば4~20個、好ましくは6~16個、より好ましくは8~12個であってもよい。 More specifically, the length of the main chain connecting A and R can also be defined as the number of atoms constituting the main chain (excluding hydrogen atoms and substituents). The number of atoms constituting the main chain may be, for example, 4 (about 5.0 Å) or more, preferably 6 (about 7.5 Å), more preferably 8 (about 10.5 Å) or more. The number of atoms in the backbone may also be, for example, 20 (about 30 Å) or less, preferably 16 (about 23 Å) or less, more preferably 12 (about 16.5 Å) or less. More specifically, the number of atoms in the main chain may be, for example, 4-20, preferably 6-16, more preferably 8-12.
主鎖が環構造を含まない構造である場合、主鎖の原子数は、鎖状構造中の原子数を数えることにより決定することができる。 When the main chain is a structure that does not contain a ring structure, the number of atoms in the main chain can be determined by counting the number of atoms in the chain structure.
一方、主鎖が環構造を含む構造である場合、主鎖の原子数と上述した長さとは必ずしも対応せず、主鎖の原子数により規定され得る長さは、上述した長さよりも短くなる傾向がある。このような場合であっても、主鎖の長さを規定する観点から、主鎖の原子数を便宜的に数えることができる。具体的には、このような場合における主鎖の原子数は、主鎖において2価の環構造を含まない鎖状構造中の原子数に加えて、環構造中の2つの結合手を連絡する最短経路の原子数を数えることにより決定することができる(例えば、以下(a)~(d)の太字経路を参照)。
(a)の場合、最短経路は太字経路であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、2である。
(b)の場合、最短経路は太字経路であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、3である。
(c)の場合、いずれの経路も最短経路(等距離)であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、4である。
(d)の場合、縮合部位の経路が最短経路であるため、主鎖の原子数として数えられる2価の環構造中の原子数は、4である。
On the other hand, when the main chain has a structure containing a ring structure, the number of atoms in the main chain does not necessarily correspond to the length described above, and the length that can be defined by the number of atoms in the main chain is shorter than the length described above. Tend. Even in such a case, the number of atoms in the main chain can be conveniently counted from the viewpoint of defining the length of the main chain. Specifically, the number of atoms in the main chain in such cases is the number of atoms in the chain structure that does not contain a divalent ring structure in the main chain, plus the number of atoms that connect two bonds in the ring structure. It can be determined by counting the number of atoms in the shortest path (see, eg, bold-faced paths in (a)-(d) below).
In the case of (a), since the shortest route is the bold-faced route, the number of atoms in the divalent ring structure counted as the number of atoms in the main chain is 2.
In the case of (b), since the shortest route is the bold-faced route, the number of atoms in the divalent ring structure counted as the number of atoms in the main chain is 3.
In the case of (c), all paths are the shortest paths (equidistant), so the number of atoms in the divalent ring structure counted as the number of atoms in the main chain is 4.
In the case of (d), the number of atoms in the divalent ring structure counted as the number of atoms in the main chain is 4, since the path of the condensation site is the shortest path.
好ましくは、L-Bで表されるAとRとの連結部分(側鎖を除く)は、2価の環構造を含まない鎖状構造であってもよい。この場合、L-Bで表されるAとRとの連結鎖部分において2価の環基が含まれないようにLおよびBを適宜設計することができる。 Preferably, the linking portion between A and R represented by LB (excluding the side chain) may be a chain structure that does not contain a divalent ring structure. In this case, L and B can be appropriately designed so that the linking chain portion between A and R represented by LB does not contain a divalent ring group.
1-6-2.部分構造「L-B」の具体的構造
上記式(I)において、LおよびBは、互いに連関し得る構造である。したがって、上記式(I)において、LおよびBは、「L-B」で表される部分構造として規定することができる。
1-6-2. Specific Structure of Partial Structure “LB” In the above formula (I), L and B are structures that can be associated with each other. Therefore, in the above formula (I), L and B can be defined as a partial structure represented by "LB".
一実施形態では、切断性リンカーは、(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー、もしくは(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであってもよい。 In one embodiment, the cleavable linker is (i) a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety capable of cleaving to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group, or (ii) It may be a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety that does not have the ability to cleave to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group.
特定の実施形態では、Lが上記(i)の切断性リンカーである場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基である。 In certain embodiments, when L is the cleavable linker of (i) above, B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group, or (b) free of a bioorthogonal functional group. It is a divalent group.
好ましくは、Lが上記(i)の切断性リンカーである場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基である。この場合、(i)において生成される生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と同種であっても異種であってもよい。より単純な構造の採用、および/または単一の機能性物質に対する反応性の向上等の観点では、(i)において生成される生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と同種であってもよい。一方、2種以上の機能性物質に対する差別化された反応性の確保、および反応における一部の生体直交性官能基の不使用等の観点では、(i)において生成される生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と異種であってもよい。 Preferably, when L is the cleavable linker of (i) above, B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group. In this case, the bioorthogonal functional group produced in (i) may be the same or different from the bioorthogonal functional group in (a). From the viewpoint of adopting a simpler structure and/or improving reactivity with a single functional substance, the bioorthogonal functional group generated in (i) is different from the bioorthogonal functional group in (a). They may be of the same species. On the other hand, from the viewpoint of ensuring differentiated reactivity with two or more functional substances and not using some of the bioorthogonal functional groups in the reaction, the bioorthogonal functional groups generated in (i) may be heterologous to the bioorthogonal functional groups in (a).
あるいは、Lが上記(i)の切断性リンカーである場合、Bは、(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であってもよい。この場合、式(I)で表される化合物またはその塩は、より単純な構造を有することになるので、合成が容易である。 Alternatively, when L is the cleavable linker of (i) above, B may be (b) a divalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. In this case, the compound represented by formula (I) or a salt thereof has a simpler structure, and is easy to synthesize.
別の特定の実施形態では、Lが上記(ii)の切断性リンカーである場合、Bは、(a
)生体直交性官能基を含む2価の基である。
In another specific embodiment, when L is the cleavable linker of (ii) above, B is (a
) is a divalent group containing a bioorthogonal functional group.
特定の実施形態では、L-Bで表される部分構造は、好ましくは、ペプチド部分を含まない。この場合、本発明の化合物を用いて得られる本発明の機能性物質を有する可溶性タンパク質(例、抗体薬物複合体)は、免疫原性を有し得るペプチド部分をリンカーとして含み得ないという利点がある。 In certain embodiments, the substructure represented by LB preferably does not include peptide moieties. In this case, the advantage is that the soluble protein (eg, antibody drug conjugate) having the functional substance of the present invention obtained using the compound of the present invention may not contain a peptide moiety that may have immunogenicity as a linker. be.
特定の実施形態では、「L-B」で表される部分構造は、AおよびRを連結する主鎖(L-B中の直鎖部分)の中心位置に存在する原子(例、主鎖を構成する原子数が奇数の場合)、または当該主鎖の中心位置に存在する結合部位(例、主鎖を構成する原子数が偶数の場合)を基準として、対称構造〔例、シス型(すなわち、Z)、トランス型(すなわち、E)〕を有していてもよい。例えば、中心位置に存在する結合部位を、上述したような切断リンカー中の切断性部分として設計することもできる。「L-B」で表される部分構造が対称構造を有する場合、「L-B」で表される部分構造は、容易に合成することができる。例えば、反応して切断性部分を形成できる官能基を一方の末端に有する同じ2価の基(例、SH基を一方の末端に有する鎖状の2価の基)を互いに反応させることにより、主鎖の中心位置に切断性部分を含む対称構造(鎖状の2価の基-S-S-鎖状の2価の基)を実現することができる。 In a specific embodiment, the partial structure represented by "LB" is an atom (e.g., the main chain If the number of atoms constituting the main chain is an odd number), or the binding site that exists at the central position of the main chain (e.g., if the number of atoms constituting the main chain is an even number), the symmetrical structure [e.g. , Z), trans (ie, E)]. For example, a centrally located binding site can be designed as a cleavable moiety in a cleavable linker as described above. When the partial structure represented by "LB" has a symmetrical structure, the partial structure represented by "LB" can be easily synthesized. For example, by reacting the same divalent groups having at one end a functional group capable of reacting to form a cleavable moiety (e.g., a chain divalent group having an SH group at one end), A symmetrical structure (chained divalent group—S—S—chained divalent group) containing a cleavable moiety at the central position of the main chain can be realized.
したがって、「L-B」で表される部分構造は、「B2-L’-B1」で表される部分構造(すなわち、Lが、B2-L’で表される2価の基であり、BがB1である。)であってもよい。この場合、上記式(I)で表される化合物は、下記式(I’)で表される化合物として規定することができる。
A-B2-L’-B1-R (I’)
〔式中、
AおよびRは、前記式(I)のものと同じであり
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1およびB2は、同一または異なって、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
B1およびB2は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕
Therefore, the partial structure represented by "LB" is the partial structure represented by "B2-L'-B1" (that is, L is a divalent group represented by B2-L', B is B1.). In this case, the compound represented by the above formula (I) can be defined as a compound represented by the following formula (I').
AB2-L'-B1-R (I')
[In the formula,
A and R are the same as in formula (I) above L′ is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1 and B2 are the same or different and are (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group containing no bioorthogonal functional group;
B1 and B2 may have a symmetrical structure about L'. ]
B1およびB2は、同一または異なって、Bの定義、例および好ましい例と同様である。 B1 and B2 are the same or different and have the same definitions, examples and preferred examples of B.
特定の実施形態では、L’は、下記式(L1’)~(L3’)のいずれか一つで表されてもよい:
La’-C’-Lb’ (L1’)
La’-C’ (L2’)
C’-Lb’ (L3’)
〔式中、
La’およびLb’は、それぞれ、2価の基であり、
C’は、切断性部分である。〕
In certain embodiments, L' may be represented by any one of formulas (L1') to (L3') below:
La'-C'-Lb'(L1')
La'-C'(L2')
C'-Lb'(L3')
[In the formula,
La' and Lb' are each a divalent group,
C' is a cleavable moiety. ]
La’およびLb’で表される2価の基は、それぞれ、La’およびLb’で表される2価の基の定義、例および好ましい例と同様である。 The divalent groups represented by La' and Lb' are the same as the definition, examples and preferred examples of the divalent groups represented by La' and Lb', respectively.
C’で表される切断性部分は、Cで表される切断性部分の定義、例および好ましい例と同様である。 The cleavable moiety represented by C' is the same as the definition, examples and preferred examples of the cleavable moiety represented by C.
別の特定の実施形態では、L-Bで表される構造単位は、下記式(LB’)で表されて
もよい。
C、p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1a’、R1b、R1b’、Y、Y’、ZおよびZ’の定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
○(白丸)は、Aに対する結合を示し、●(黒丸)は、Rに対する結合を示す。〕
In another specific embodiment, the structural unit represented by LB may be represented by the following formula (LB').
Definitions, examples and preferred examples of C, p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1a' , R 1b , R 1b' , Y, Y', Z and Z' are given above. is the same as
O (white circle) indicates a bond to A and ● (filled circle) indicates a bond to R. ]
したがって、上記式(I)は、下記式(I’’)として規定することができる。
A、R、C、p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1b、R1a’、R1b’、Y、Y’、ZおよびZ’の定義、例および好ましい例は、上述したものと同じである。〕
Therefore, the above formula (I) can be defined as the following formula (I'').
Definitions, examples and preferences of A, R, C, p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1b , R 1a' , R 1b' , Y, Y', Z and Z' Examples are the same as described above. ]
上記式(LB’)および(I’’)において、C=ZにおけるC(炭素原子)からC=Z’におけるC(炭素原子)までの長さは、AおよびRを連結する主鎖の長さと同様である。これらの式において、C=ZにおけるCからC=Z’におけるCまでの長さはまた、C=ZにおけるCからC=Z’におけるCを連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。このような原子数は、AおよびRを連結する主鎖を構成する原子数と同様である。C=ZにおけるCからC=Z’におけるCを連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、環構造を含んでいなくても含んでいてもよいが、環構造を含んでいないことが好ましい。当該連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、好ましくは、ペプチド部分を含まないものであってもよい。 In the above formulas (LB') and (I''), the length from C (carbon atom) in C=Z to C (carbon atom) in C=Z' is the length of the main chain connecting A and R is the same as In these formulas, the length from C in C=Z to C in C=Z' also refers to the connecting chain of the substructure connecting C in C=Z to C in C=Z' (hydrogen atoms and substituents ) can also be defined as the number of atoms constituting The number of such atoms is the same as the number of atoms constituting the main chain connecting A and R. The connecting chain of the partial structure connecting C in C=Z to C in C=Z' (excluding hydrogen atoms and substituents) may or may not contain a ring structure, but may contain a ring structure. preferably not included. The linking chain (excluding hydrogen atoms and substituents) may preferably be free of peptide moieties.
1-8.製造方法
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩は、適宜調製することができる。可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物は、式(I)、好ましくは式(I’)、より好ましくは式(I’’)で表される。
1-8. Production Method A compound or a salt thereof containing an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group can be prepared as appropriate. A compound comprising an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group is represented by formula (I), preferably formula (I'), more preferably formula (I'').
親和性物質としては、任意の官能基を有するものを適宜選択することができる。したがって、当該官能基と反応することができる反応性基を利用することにより、親和性物質を、L-B-Rで表される構造単位、またはR-L-B-Rで表される構造単位(2つの反応性基は同一または異なる)と反応させて、A-L-B-Rで表される構造単位を調製することができる。例えば、このような反応は、適切な反応系、例えば有機溶媒系または水溶液系において、適温(例、約15~200℃)で行うことができる。反応系は、適切な触媒を含んでいてもよい。反応時間は、例えば1分~20時間、好ましくは10分~15時間、より好ましくは20分~10時間、さらにより好ましくは30分~8時間である。 As the affinity substance, one having any functional group can be appropriately selected. Therefore, by utilizing a reactive group capable of reacting with the functional group, the affinity substance can be converted into a structural unit represented by LBR or a structure represented by RLB A structural unit represented by ALBR can be prepared by reacting units (wherein the two reactive groups are the same or different). For example, such reactions can be carried out in a suitable reaction system, such as an organic solvent system or an aqueous system, at a suitable temperature (eg, about 15-200° C.). The reaction system may contain a suitable catalyst. The reaction time is, for example, 1 minute to 20 hours, preferably 10 minutes to 15 hours, more preferably 20 minutes to 10 hours, still more preferably 30 minutes to 8 hours.
反応系において、親和性物質(X)に対する、L-B-Rで表される構造単位、または
R-L-B-Rで表される構造単位(Y)のモル比率(Y/X)は、当該構造単位および親和性物質の種類、当該構造単位によって修飾されるべき親和性物質中の部位の数等に応じて変動することから特に限定されないが、例えば0.1~50であり、好ましくは0.5~40であり、より好ましくは1~35であり、さらにより好ましくは2~25であり、特に好ましくは3~15である。
In the reaction system, the molar ratio (Y/X) of the structural unit represented by LBR or the structural unit (Y) represented by RLBR to the affinity substance (X) is , the types of the structural unit and the affinity substance, the number of sites in the affinity substance to be modified by the structural unit, and the like, but are not particularly limited, but are preferably 0.1 to 50, for example. is 0.5 to 40, more preferably 1 to 35, even more preferably 2 to 25, and particularly preferably 3 to 15.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の生成の確認は、その具体的な原料および生成物の分子量にもよるが、例えば、電気泳動法、クロマトグラフィー(例、ゲル濾過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィー、HPLC)、または質量分析により、好ましくは、質量分析により行うことができる。可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩は、クロマトグラフィー(例、上述したクロマトグラフィー、およびアフィニティークロマトグラフィー)等の任意の方法により適宜精製することができる。 Confirmation of production of a soluble protein or salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein and a cleavable moiety can be performed, for example, by electrophoresis, chromatography (e.g., Gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, reverse phase column chromatography, HPLC) or mass spectrometry, preferably mass spectrometry. Affinity agents for soluble proteins and soluble proteins or salts thereof containing cleavable moieties can be suitably purified by any method such as chromatography (eg, chromatography as described above, and affinity chromatography).
1-9.その他
後述の発明〔例、式(II)~(v)およびその下位概念の式、ならびに部分構造式(例、(L1)~(L3)、(La’)、(Lb’)、(B-1)~(B-4))で表される発明〕では、任意の記号(例、A、L、B、R)、当該記号で表される用語、およびそれらの詳細(例えば、定義、例および好ましい例)は、上記式(I)で表される化合物またはその塩の発明と共通する。また、後述の発明を規定することができる特定の部分(例、切断性部分、切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する部分)、特定の基(例、生体直交性官能基、2価の基、アルキル基、置換基、電子吸引基)、および特定の数値、ならびに塩等の任意の技術要素(例、定義、例および好ましい例)についても、上記で説明したものと共通にすることができる。したがって、これらの事項は、特に言及することなく、後述の発明において適宜援用することができる。同様に、後述の発明で述べた特定の発明の技術要素は、本発明および他の発明の技術要素として、適宜援用することができる。
1-9. Other inventions described later [e.g., formulas (II) to (v) and subordinate concept formulas thereof, and partial structural formulas (e.g., (L1) to (L3), (La'), (Lb'), (B- 1) to (B-4))], arbitrary symbols (eg, A, L, B, R), terms represented by the symbols, and their details (eg, definitions, examples and preferred examples) are in common with the invention of the compound represented by formula (I) or a salt thereof. In addition, specific moieties (e.g., cleavable moieties, moieties having the ability to generate bioorthogonal functional groups on the reactive group side by cleavage), specific groups (e.g., bioorthogonal functional groups, divalent groups, alkyl groups, substituents, electron withdrawing groups), and specific numerical values, as well as optional technical elements such as salts (eg, definitions, examples and preferred examples) are also described above. can be made in common. Therefore, these matters can be used as appropriate in the invention described later without particular reference. Similarly, the technical elements of specific inventions described in the later-described inventions can be appropriately incorporated as the technical elements of the present invention and other inventions.
2.可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩
2-1.概要
本発明は、式(II)で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を提供する。
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕
2. Soluble protein containing affinity substance for soluble protein and cleavable moiety or salt thereof 2-1. SUMMARY The present invention provides a soluble protein or salt thereof comprising an affinity agent for a soluble protein and a cleavable moiety of formula (II).
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker, which is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ]
2-2.可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分(R’)
可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分において、可溶性タンパク質および反応性基の定義、例および好ましい例は、上述したとおりである。可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分は、当該技術分野において技術常識であり、可溶性タンパク質および反応性基の種類に応じて適宜決定することができる。
2-2. Moiety (R') generated by reaction between soluble protein and reactive group
Definitions, examples and preferred examples of the soluble protein and the reactive group in the moiety generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group are given above. The portion generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is common technical knowledge in the technical field, and can be appropriately determined according to the type of soluble protein and reactive group.
好ましくは、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分は、可溶性
タンパク質に含まれ得る14種のアミノ酸(アスパラギン、グルタミン、メチオニン、プロリン、セリン、スレオニン、トリプトファン、チロシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、アルギニン、ヒスチジン、およびリジン)のうちのいずれか1種のアミノ酸の側鎖と、それに対する反応性基との間の反応により生成する部分である。
Preferably, the moieties generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group are 14 amino acids that can be contained in the soluble protein (asparagine, glutamine, methionine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine, aspartic acid, glutamic acid, arginine, histidine, and lysine), the moiety generated by the reaction between the side chain of any one amino acid and a reactive group thereto.
より好ましくは、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分は、リジン、チロシン、トリプトファン、またはシステインのいずれか1種のアミノ酸の側鎖と、それに対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であってもよい。 More preferably, the moiety generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is an amino acid side chain of any one of lysine, tyrosine, tryptophan, or cysteine and a reactive group specific thereto. It may be a portion generated by a reaction between.
さらにより好ましくは、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分は、リジン、チロシン、またはトリプトファンのいずれか1種のアミノ酸の側鎖と、それに対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であってもよい。リジン、チロシン、またはトリプトファンのいずれか1種のアミノ酸の側鎖と、それに対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分としては、例えば、上記「1-5.反応性基(R)」で述べた連結部分および/または化学構造が挙げられる。 Even more preferably, the moiety generated by the reaction between the soluble protein and the reactive group is an amino acid side chain of any one of lysine, tyrosine, or tryptophan and a reactive group specific therefor. It may be a portion generated by a reaction between Examples of the portion generated by the reaction between the side chain of any one of lysine, tyrosine, or tryptophan and a reactive group specific thereto include the above-mentioned "1-5. Reactive group (R)” linking moieties and/or chemical structures.
さらに一層より好ましくは、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分は、リジンまたはチロシンの側鎖と、それに対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であってもよい(特に、可溶性タンパク質がヒトIgG1等のヒトIgGである場合)。リジンまたはチロシンの側鎖と、それに対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分としては、例えば、上記「1-5.反応性基(R)」で述べた連結部分および/または化学構造が挙げられる。 Even more preferably, the moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group is a moiety generated by reaction between a lysine or tyrosine side chain and a reactive group specific therefor. (particularly if the soluble protein is human IgG, such as human IgG1). Examples of the moiety generated by the reaction between the side chain of lysine or tyrosine and the reactive group specific thereto include the linking moiety and the and/or chemical structures.
特に好ましくは、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分は、リジンの側鎖と、それに対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であってもよい。 Particularly preferably, the moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group may be a moiety generated by reaction between a side chain of lysine and a reactive group specific therefor. .
2-3.部分構造「L-B」
部分構造「L-B」の詳細は、上記「1-6.部分構造「L-B」」で述べたとおりである。
2-3. Partial structure "LB"
The details of the partial structure “LB” are as described above in “1-6. Partial structure “LB””.
特定の実施形態では、「L-B」で表される部分構造は、「B2-L’-B1」で表される部分構造(すなわち、Lが、B2-L’で表される2価の基であり、BがB1である。)であってもよい。この場合、上記式(II)で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩は、下記式(II’)で表されることができる。
A-B2-L’-B1-R’-T (II’)
〔式中、
A、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1およびB2は、同一または異なって、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
B1およびB2は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕
In certain embodiments, the substructure represented by "LB" is a substructure represented by "B2-L'-B1" (i.e., L is a divalent and B is B1). In this case, the affinity substance for the soluble protein represented by the above formula (II) and the soluble protein containing the cleavable moiety or a salt thereof can be represented by the following formula (II').
AB2-L'-B1-R'-T (II')
[In the formula,
A, R' and T are the same as in formula (II) above L' is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1 and B2 are the same or different and are (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group without a bioorthogonal functional group;
B1 and B2 may have a symmetrical structure about L'. ]
上記式(II’)において、L’は、上述した式(L1’)~(L3’)のいずれか一つで表されてもよい。 In formula (II') above, L' may be represented by any one of formulas (L1') to (L3') described above.
別の特定の実施形態では、L-Bで表される構造単位は、下記式(LB’)で表されてもよい。
C、p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1a’、R1b、R1b’、Y、Y’、ZおよびZ’の定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
○(白丸)は、Aに対する結合を示し、●(黒丸)は、R’に対する結合を示す。〕
In another specific embodiment, the structural unit represented by LB may be represented by the following formula (LB').
Definitions, examples and preferred examples of C, p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1a' , R 1b , R 1b' , Y, Y', Z and Z' are given above. is the same as
O (open circle) indicates binding to A and ● (filled circle) indicates binding to R'. ]
したがって、上記式(II)は、下記式(II’’)として規定することができる。
A、R’、T、C、p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1b、R1a’、R1b’、Y、Y’、ZおよびZ’の定義、例および好ましい例は、上述したものと同じである。〕
Therefore, the above formula (II) can be defined as the following formula (II'').
definitions of A, R′, T, C, p, p′, q, q′, X, X′, R 1a , R 1b , R 1a′ , R 1b′ , Y, Y′, Z and Z′; Examples and preferred examples are the same as described above. ]
上記式(LB’)および(II’’)において、C=ZにおけるC(炭素原子)からC=Z’におけるC(炭素原子)までの長さは、上述したようなAおよびRを連結する主鎖の長さと同様である。これらの式において、C=ZにおけるCからC=Z’におけるCまでの長さはまた、C=ZにおけるCからC=Z’におけるCを連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。このような原子数は、AおよびRを連結する主鎖を構成する原子数と同様である。C=ZにおけるCからC=Z’におけるCを連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、環構造を含んでいなくても含んでいてもよいが、環構造を含んでいないことが好ましい。当該連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、好ましくは、ペプチド部分を含まないものであってもよい。 In formulas (LB') and (II'') above, the length from C (carbon atom) in C=Z to C (carbon atom) in C=Z' connects A and R as described above. It is the same as the main chain length. In these formulas, the length from C in C=Z to C in C=Z' also refers to the connecting chain of the substructure connecting C in C=Z to C in C=Z' (hydrogen atoms and substituents ) can also be defined as the number of atoms constituting The number of such atoms is the same as the number of atoms constituting the main chain connecting A and R. The connecting chain of the partial structure connecting C in C=Z to C in C=Z' (excluding hydrogen atoms and substituents) may or may not contain a ring structure, but may contain a ring structure. preferably not included. The linking chain (excluding hydrogen atoms and substituents) may preferably be free of peptide moieties.
2-4.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の結合部位(位置選択性)
可溶性タンパク質以外の部分構造(例、A-L-B-R’)は、可溶性タンパク質(T)における上述したような標的領域に位置選択的に結合させることができる。
2-4. Binding sites of partial structures other than soluble proteins possessed by soluble proteins (regioselectivity)
Partial structures other than soluble proteins (eg, ALBR') can be regioselectively bound to target regions as described above in soluble proteins (T).
本明細書において、「位置選択的」または「位置選択性」とは、可溶性タンパク質において特定のアミノ酸残基が特定の領域に偏在していないにもかかわらず、可溶性タンパク質中の特定のアミノ酸残基と結合できる所定の構造単位が、可溶性タンパク質中の特定の領域に偏在することをいう。したがって、「位置選択的に有する」、「位置選択的な結合」、「位置選択性での結合」等の位置選択性に関連する表現は、1個以上の特定のアミノ酸残基を含む標的領域における所定の構造単位の保有率または結合率が、標的領域における当該特定のアミノ酸残基と同種である複数個のアミノ酸残基を含む非標的領域における当該構造単位の保有率または結合率よりも有意なレベルで高いことを意味する。このような位置選択的な結合または保有は、可溶性タンパク質中の特定のアミノ酸残基に対して所定の構造単位をランダムに反応させるのではなく、可溶性タンパク質中の標的領域における特定のアミノ酸残基に対して所定の構造単位を優先的に反応させることができる本発明
により達成することができる。
As used herein, "regioselectivity" or "regioselectivity" refers to specific amino acid residues in a soluble protein, even though the specific amino acid residues are not unevenly distributed in a specific region in the soluble protein. It means that a predetermined structural unit capable of binding to is unevenly distributed in a specific region in a soluble protein. Thus, expressions related to regioselectivity such as "regioselectively having", "regioselectively binding", "regioselectively binding", etc., refer to target regions comprising one or more specific amino acid residues. is significantly higher than the retention or binding rate of a given structural unit in a non-target region containing multiple amino acid residues that are homologous to the specific amino acid residue in the target region It means that it is high at a certain level. Such regioselective binding or retention is directed to specific amino acid residues in a target region in a soluble protein rather than randomly reacting a given structural unit to specific amino acid residues in a soluble protein. This can be achieved by the present invention in which a predetermined structural unit can be reacted preferentially.
具体的には、Tが、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む場合、可溶性タンパク質以外の部分構造は、当該標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合させることができる。標的領域および位置選択性の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。 Specifically, T contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region When it contains 5 or more amino acid residues, the partial structure other than the soluble protein can bind to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more. . Definitions, examples and preferred examples of target regions and regioselectivity are provided above.
2-5.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数
可溶性タンパク質(T)が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造(例、A-L-B-R’)の個数は、変動することができる。例えば、Tが複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質である場合、Tは、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、T以外の部分構造を有することができる。その結果、Tは、T以外の部分構造を複数個有することができる。したがって、式(II)、(II’)、または(II’’)で表される構造は、Tが、T以外の部分構造を1個または複数個有していてもよいことを示す。Tが有する、T以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質の種類、および可溶性タンパク質とそれに対して導入される構造単位との反応比率等の条件を適宜設定することで調節することができる。このような個数は、可溶性タンパク質の種類によっても異なるが、例えば1~8、好ましくは1~4、より好ましくは1または2であってもよい。
2-5. Number of partial structures other than soluble protein possessed by soluble protein The number of partial structures (eg, ALBR') possessed by the soluble protein (T) other than the soluble protein can vary. For example, if T is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins, T can have substructures other than T in the corresponding plurality of target regions in the plurality of monomeric proteins. . As a result, T can have multiple partial structures other than T. Therefore, the structure represented by formula (II), (II'), or (II'') indicates that T may have one or more partial structures other than T. The number of partial structures other than T that T has can be adjusted by appropriately setting conditions such as the type of soluble protein and the reaction ratio between the soluble protein and structural units introduced therein. Such number may vary depending on the type of soluble protein, but may be, for example, 1 to 8, preferably 1 to 4, more preferably 1 or 2.
特定の実施形態では、可溶性タンパク質が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質が、複数個の単量体タンパク質から構成される多量体タンパク質である場合、複数個であってもよい。本発明によれば、複数個の単量体タンパク質の同一標的領域に対して可溶性タンパク質以外の部分構造を複数個導入することができる。 In certain embodiments, if the soluble protein is a multimeric protein composed of a plurality of monomeric proteins, the number of partial structures other than the soluble protein possessed by the soluble protein may be more than one. good. According to the present invention, a plurality of partial structures other than soluble proteins can be introduced into the same target region of a plurality of monomeric proteins.
好ましい実施形態では、可溶性タンパク質は、複数個の重鎖を含む抗体であってもよい。抗体の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。重鎖の個数は、抗体の種類によって異なる。例えば、IgG、IgE、およびIgDは、2個の重鎖を有することができる。IgAは、2個または4個の重鎖を有することができる。IgMは、8個の重鎖を有することができる。抗体(可溶性タンパク質)が保有する、抗体以外の部分構造の個数は、DARと同義のものとして考慮することができる。本発明では、抗体が保有する、抗体以外の部分構造の個数は、IgG、IgE、およびIgDについては1個または2個(好ましくは2個)であり、IgAについては1~4個(好ましくは4個)であり、IgMについては1~8個(好ましくは8個)であってもよい。 In preferred embodiments, the soluble protein may be an antibody comprising multiple heavy chains. Definitions, examples and preferred examples of antibodies are given above. The number of heavy chains varies depending on the type of antibody. For example, IgG, IgE, and IgD can have two heavy chains. IgA can have two or four heavy chains. IgM can have 8 heavy chains. The number of non-antibody partial structures possessed by an antibody (soluble protein) can be considered synonymous with DAR. In the present invention, the number of partial structures other than antibodies possessed by antibodies is 1 or 2 (preferably 2) for IgG, IgE, and IgD, and 1 to 4 (preferably 4), and for IgM may be 1 to 8 (preferably 8).
2-6.製造方法
本発明は、以下を含む、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(A1)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩を可溶性タンパク質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
2-6. Methods of Making The present invention provides methods of making a soluble protein or salt thereof comprising an affinity agent for a soluble protein and a cleavable moiety, comprising:
(A1) reacting a compound or a salt thereof containing a soluble protein affinity substance, a cleavable moiety and a reactive group with a soluble protein to produce a soluble protein affinity substance and a soluble protein comprising a cleavable moiety or a salt thereof; to generate.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物は、式(I)、好ましくは式(I’)、より好ましくは式(I’’)で表される。可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質は、式(II)、好ましくは式(II’)、より好ましくは式(II’’)で表される。 A compound comprising an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group is represented by formula (I), preferably formula (I'), more preferably formula (I''). The affinity agent for soluble proteins and the soluble protein comprising the cleavable moiety is represented by formula (II), preferably formula (II'), more preferably formula (II'').
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物または
その塩は、反応性基を有するため、可溶性タンパク質と反応することができる。このような反応は、タンパク質の変性・分解(例、アミド結合の切断)を引き起こし得ない条件(温和な条件)下で適宜行うことができる。例えば、このような反応は、適切な反応系、例えば緩衝液中において、室温(例、約15~30℃)で行うことができる。緩衝液のpHは、例えば5~9であり、好ましくは5.5~8.5であり、より好ましくは6.0~8.0である。緩衝液は、適切な触媒を含んでいてもよい。反応時間は、例えば1分~20時間、好ましくは10分~15時間、より好ましくは20分~10時間、さらにより好ましくは30分~8時間である。このような反応の詳細については、例えば、G.J.L.Bernardes et al.,Chem.Rev.,115,2174(2015);G.J.L.Bernardes et al.,Chem.Asian.J.,4,630(2009);B.G.Davies et al.,Nat.Commun.,5,4740(2014);A.Wagner et al.,Bioconjugate.Chem.,25,825(2014)を参照のこと。
Compounds or salts thereof containing affinity substances for soluble proteins, cleavable moieties and reactive groups can react with soluble proteins because they have reactive groups. Such a reaction can be appropriately carried out under conditions (mild conditions) that do not cause protein denaturation/decomposition (eg, cleavage of amide bonds). For example, such reactions can be carried out at room temperature (eg, about 15-30° C.) in a suitable reaction system, eg, a buffer. The pH of the buffer is, for example, 5-9, preferably 5.5-8.5, more preferably 6.0-8.0. The buffer may contain a suitable catalyst. The reaction time is, for example, 1 minute to 20 hours, preferably 10 minutes to 15 hours, more preferably 20 minutes to 10 hours, still more preferably 30 minutes to 8 hours. For details of such reactions, see, for example, G.I. J. L. Bernardes et al. , Chem. Rev. , 115, 2174 (2015); J. L. Bernardes et al. , Chem. Asian. J. , 4, 630 (2009); G. Davies et al. , Nat. Commun. , 5, 4740 (2014); Wagner et al. , Bioconjugate. Chem. , 25, 825 (2014).
反応系において、可溶性タンパク質(X)に対する、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩(Y)のモル比率(Y/X)は、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物および可溶性タンパク質(例、抗体)の種類、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物によって修飾されるべき可溶性タンパク質中の部位の数(例、DAR)等に応じて変動することから特に限定されないが、例えば0.1~100であり、好ましくは0.5~80であり、より好ましくは1~70であり、さらにより好ましくは2~50であり、特に好ましくは3~30である。 In the reaction system, the molar ratio (Y/X) of the soluble protein-affinity substance, the cleavable moiety and the compound containing the reactive group or its salt (Y) to the soluble protein (X) is , types of compounds and soluble proteins (e.g., antibodies) containing cleavable moieties and reactive groups, affinity substances for soluble proteins, sites in soluble proteins to be modified by compounds containing cleavable moieties and reactive groups. Although it is not particularly limited because it varies depending on the number (eg, DAR) etc., it is, for example, 0.1 to 100, preferably 0.5 to 80, more preferably 1 to 70, and even more preferably is 2-50, particularly preferably 3-30.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の生成の確認は、その具体的な原料および生成物の分子量にもよるが、例えば、電気泳動法、クロマトグラフィー(例、ゲル濾過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィー、HPLC)、または質量分析により、好ましくは、質量分析により行うことができる。位置選択性の確認は、例えば、ペプチドマッピングにより行うことができる。ペプチドマッピングは、例えば、プロテアーゼ(例、トリプシン、キモトリプシン、)処理および質量分析により行うことができる。プロテアーゼとしては、エンドプロテアーゼが好ましい。このようなエンドプロテアーゼとしては、例えば、トリプシン、キモトリプシン、Glu-C、Lys-N、Lys-C、Asp-Nが挙げられる。可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数の確認は、例えば、電気泳動法、クロマトグラフィー、または質量分析により、好ましくは、質量分析により行うことができる。可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩は、クロマトグラフィー(例、上述したクロマトグラフィー、およびアフィニティークロマトグラフィー)等の任意の方法により適宜精製することができる。 Confirmation of production of a soluble protein or salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein and a cleavable moiety can be performed, for example, by electrophoresis, chromatography (e.g., Gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, reverse phase column chromatography, HPLC) or mass spectrometry, preferably mass spectrometry. Confirmation of regioselectivity can be performed, for example, by peptide mapping. Peptide mapping can be performed, for example, by protease (eg, trypsin, chymotrypsin) treatment and mass spectrometry. As the protease, an endoprotease is preferred. Such endoproteases include, for example, trypsin, chymotrypsin, Glu-C, Lys-N, Lys-C, Asp-N. Confirmation of the number of partial structures other than the soluble protein that the soluble protein has can be performed, for example, by electrophoresis, chromatography, or mass spectrometry, preferably by mass spectrometry. Affinity agents for soluble proteins and soluble proteins or salts thereof containing cleavable moieties can be suitably purified by any method such as chromatography (eg, chromatography as described above, and affinity chromatography).
3.可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩
3-1.概要
本発明は、式(III)で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を提供する。
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩。
3. Complex or salt thereof having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety, functional substance and soluble protein 3-1. Overview The present invention provides a conjugate or salt thereof having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein represented by Formula (III).
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein, or a salt thereof.
式(III)または他の式において、R’は、Fではなく、B’に共有結合している。 In formula (III) or other formulas, R' is covalently attached to B' instead of F.
3-2.機能性物質(F)
機能性物質としては、可溶性タンパク質に任意の機能を付与する物質である限り特に限定されず、例えば、薬物、標識物質、安定化剤が挙げられるが、好ましくは薬物または標識物質である。機能性物質はまた、単一の機能性物質であってもよく、または2以上の機能性物質が連結された物質であってもよい。
3-2. Functional substance (F)
The functional substance is not particularly limited as long as it imparts an arbitrary function to the soluble protein. Examples thereof include drugs, labeling substances, and stabilizers, preferably drugs or labeling substances. A functional substance may also be a single functional substance, or a substance in which two or more functional substances are linked.
薬物としては、任意の疾患に対する薬物であってもよい。このような疾患としては、例えば、癌(例、肺癌、胃癌、大腸癌、膵臓癌、腎臓癌、肝臓癌、甲状腺癌、前立腺癌、膀胱癌、卵巣癌、子宮癌、骨癌、皮膚癌、脳腫瘍、黒色腫)、自己免疫疾患・炎症性疾患(例、アレルギー疾患、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス)、脳神経疾患(例、脳梗塞、アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症)、感染症(例、細菌感染症、ウイルス感染症)、遺伝性・希少疾患(例、遺伝性球状赤血球症、非ジストロフィー筋緊張症)、眼疾患(例、加齢黄斑変性症、糖尿病網膜症、網膜色素変性症)、骨・整形外科領域の疾患(例、変形性関節症)、血液疾患(例、白血病、紫斑病)、その他の疾患(例、糖尿病、高脂血症等の代謝異常症、肝臓疾患、腎疾患、肺疾患、循環器系疾患、消化器官系疾患)が挙げられる。可溶性タンパク質が所定の疾患の標的タンパク質に対する抗体である場合、薬物は、当該所定の疾患に関連する薬物(例、当該所定の疾患を治療する薬物、当該所定の疾患の標的タンパク質に対する抗体の使用に伴う副作用を緩和する薬物)であってもよい。 The drug may be a drug for any disease. Such diseases include, for example, cancer (e.g., lung cancer, stomach cancer, colon cancer, pancreatic cancer, kidney cancer, liver cancer, thyroid cancer, prostate cancer, bladder cancer, ovarian cancer, uterine cancer, bone cancer, skin cancer, brain tumor, melanoma), autoimmune diseases/inflammatory diseases (e.g., allergic diseases, rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus), cranial nerve diseases (e.g., cerebral infarction, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, amyotrophic lateral sclerosis), Infectious diseases (e.g., bacterial infections, viral infections), hereditary/rare diseases (e.g., hereditary spherocytosis, non-dystrophic myotonia), eye diseases (e.g., age-related macular degeneration, diabetic retinopathy, retinitis pigmentosa), bone/orthopedic diseases (e.g., osteoarthritis), blood diseases (e.g., leukemia, purpura), other diseases (e.g., diabetes, metabolic disorders such as hyperlipidemia) , liver disease, renal disease, pulmonary disease, circulatory system disease, digestive system disease). When the soluble protein is an antibody against a target protein of a given disease, the drug is a drug related to the given disease (e.g., a drug for treating the given disease, an antibody against the target protein of the given disease drugs that alleviate associated side effects).
より具体的には、薬物は、抗癌剤である。抗癌剤としては、例えば、化学療法剤、毒素、放射性同位体またはそれを含む物質が挙げられる。化学療法剤としては、例えば、DNA損傷剤、代謝拮抗薬、酵素阻害剤、DNAインターカレート剤、DNA切断剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNA結合阻害剤、チューブリン結合阻害剤、細胞傷害性ヌクレオシド、白金化合物が挙げられる。毒素としては、例えば、細菌毒素(例、ジフテリア毒素)、植物毒素(例、リシン)が挙げられる。放射性同位体としては、例えば、水素原子の放射性同位体(例、3H)、炭素原子の放射性同位体(例、14C)、リン原子の放射性同位体(例、32P)、硫黄原子の放射性同位体(例、35S)、イットリウムの放射性同位体(例、90Y)、テクネチウムの放射性同位体(例、99mTc)、インジウムの放射性同位体(例、111In)、ヨウ素原子の放射性同位体(例、123I、125I、129I、131I)、サマリウムの放射性同位体(例、153Sm)、レニウムの放射性同位体(例、186Re)、アスタチンの放射性同位体(例、211At)、ビスマスの放射性同位体(例、212Bi)が挙げられる。 More specifically, the drug is an anticancer agent. Anti-cancer agents include, for example, chemotherapeutic agents, toxins, radioactive isotopes or substances containing the same. Chemotherapeutic agents include, for example, DNA damaging agents, antimetabolites, enzyme inhibitors, DNA intercalating agents, DNA cleaving agents, topoisomerase inhibitors, DNA binding inhibitors, tubulin binding inhibitors, cytotoxic nucleosides, A platinum compound is mentioned. Toxins include, for example, bacterial toxins (eg, diphtheria toxin), plant toxins (eg, ricin). Radioisotopes include, for example, a hydrogen atom radioisotope (e.g., 3 H), a carbon atom radioisotope (e.g., 14 C), a phosphorus atom radioisotope (e.g., 32 P), and a sulfur atom radioisotope (e.g., 32 P). Radioisotopes (e.g. 35 S ), yttrium radioisotopes (e.g. 90 Y), technetium radioisotopes (e.g. 99m Tc), indium radioisotopes (e.g. 111 In), iodine atom radioactivity Isotopes (e.g., 123 I, 125 I, 129 I, 131 I), radioisotopes of samarium (e.g., 153 Sm), radioisotopes of rhenium (e.g., 186 Re), radioisotopes of astatine (e.g., 211 At), and radioactive isotopes of bismuth (eg, 212 Bi).
標識物質としては、例えば、酵素(例、ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ルシフェラーゼ、βガラクトシダーゼ)、親和性物質(例、ストレプトアビジン、ビオチン、ジゴキシゲニン、アプタマー)、蛍光物質(例、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、緑色蛍光タンパク質、赤色蛍光タンパク質)、発光物質(例、ルシフェリン、エクオリン、アクリジニウムエステル、トリス(2,2’-ビピリジル)ルテニウム、ルミノール)、放射性同位体(例、上述したもの)またはそれを含む物質が挙げられる。 Examples of labeling substances include enzymes (e.g., peroxidase, alkaline phosphatase, luciferase, β-galactosidase), affinity substances (e.g., streptavidin, biotin, digoxigenin, aptamers), fluorescent substances (e.g., fluorescein, fluorescein isothiocyanate, rhodamine , green fluorescent protein, red fluorescent protein), luminescent substances (e.g., luciferin, aequorin, acridinium ester, tris(2,2'-bipyridyl)ruthenium, luminol), radioisotopes (e.g., those described above) or A substance containing
機能性物質はまた、高分子化合物、中分子化合物、または低分子化合物であり、好まし
くは、低分子化合物である。低分子化合物とは、分子量1500以下の化合物をいう。低分子化合物は、天然化合物または合成化合物である。低分子化合物の分子量は、1200以下、1000以下、900以下、800以下、700以下、600以下、500以下、400以下、または300以下であってもよい。低分子化合物の分子量はまた、30以上、40以上、または50以上であってもよい。低分子化合物は、上述したような薬物または標識物質であってもよい。また、低分子化合物としては、例えば、アミノ酸、オリゴペプチド、ビタミン、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、単糖、オリゴ糖、脂質、脂肪酸、およびそれらの塩が挙げられる。
The functional substance is also a high-molecular compound, a medium-molecular compound, or a low-molecular compound, preferably a low-molecular compound. A low-molecular-weight compound means a compound having a molecular weight of 1,500 or less. Small compounds are natural or synthetic compounds. The molecular weight of the low molecular compound may be 1200 or less, 1000 or less, 900 or less, 800 or less, 700 or less, 600 or less, 500 or less, 400 or less, or 300 or less. The molecular weight of the small molecule compound may also be 30 or greater, 40 or greater, or 50 or greater. A low-molecular-weight compound may be a drug or labeling substance as described above. Examples of low-molecular-weight compounds include amino acids, oligopeptides, vitamins, nucleosides, nucleotides, oligonucleotides, monosaccharides, oligosaccharides, lipids, fatty acids, and salts thereof.
3-3.機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基(B’) 3-3. A divalent group (B') comprising a moiety generated by a reaction between a functional substance and a bioorthogonal functional group
B’は、(a)の生体直交性官能基が機能性物質と反応していることを除き、上述したBにおける(a)生体直交性官能基を含む2価の基と同様である。したがって、B’における2価の基および直交性官能基の定義、例および好ましい例は、Bにおけるものと同様である。 B' is the same as (a) the divalent group containing the bioorthogonal functional group in B described above, except that the bioorthogonal functional group (a) reacts with the functional substance. Therefore, definitions, examples and preferred examples of divalent groups and orthogonal functional groups in B' are the same as in B.
機能性物質は、その構造に応じた種々の官能基を有する。機能性物質が、生体直交性官能基と反応し易い官能基を有する場合、機能性物質の当該官能基と生体直交性官能基とを適宜反応させることができる。生体直交性官能基と反応し易い官能基は、生体直交性官能基の具体的な種類によっても異なり得る。当業者であれば、適切な官能基を、生体直交性官能基と反応し易い官能基として適宜選択することができる。生体直交性官能基と反応し易い官能基としては、例えば、生体直交性官能基がチオールの場合はマレイミドおよびジスルフィドが挙げられ、生体直交性官能基がアルキンの場合はアジドが挙げられ、生体直交性官能基がアルデヒドまたはケトンの場合はヒドラジンが挙げられるが、これらに限定されない。 A functional substance has various functional groups according to its structure. When the functional substance has a functional group that readily reacts with the bioorthogonal functional group, the functional group of the functional substance and the bioorthogonal functional group can be appropriately reacted. Functional groups that are reactive with bioorthogonal functional groups may also vary depending on the specific type of bioorthogonal functional group. A person skilled in the art can appropriately select an appropriate functional group as a functional group that readily reacts with the bioorthogonal functional group. Functional groups that readily react with bioorthogonal functional groups include, for example, maleimide and disulfide when the bioorthogonal functional group is thiol, and azide when the bioorthogonal functional group is alkyne. Examples include, but are not limited to, hydrazine when the functional group is an aldehyde or ketone.
一方、機能性物質が、生体直交性官能基と反応し易い官能基を有しない場合、機能性物質として、所望の官能基を有するように誘導体化されたものを使用することができる。例えば、機能性物質が可溶性タンパク質である場合、可溶性タンパク質が天然に有しない官能基を有するように誘導体化されたものを使用することができる。この場合、可溶性タンパク質の誘導体化は、本発明の方法により行われてもよい。この場合、所望の生体直交性官能基を位置選択的に有するように誘導体化された可溶性タンパク質を、機能性物質として使用することができる。 On the other hand, when the functional substance does not have a functional group that readily reacts with the bioorthogonal functional group, the functional substance derivatized to have a desired functional group can be used. For example, when the functional substance is a soluble protein, it can be used that is derivatized to have a functional group not naturally possessed by the soluble protein. In this case derivatization of the soluble protein may be performed by the method of the invention. In this case, a soluble protein regioselectively derivatized to have the desired bioorthogonal functional groups can be used as the functional substance.
誘導体化は、当該分野における技術常識である(例、国際公開第2004/010957号、米国特許出願公開第No.2006/0074008号明細書、米国特許出願公開第2005/0238649号明細書)。例えば、誘導体化は、上述したような架橋剤を用いて行われてもよい。あるいは、誘導体化は、所望の官能基を有する特定のリンカーを用いて行われてもよい。例えば、このようなリンカーは、適切な環境(例、細胞内または細胞外)において機能性物質と可溶性タンパク質とをリンカーの切断により分離可能なものであってもよい。このようなリンカーとしては、例えば、特定のプロテアーゼ〔例、細胞内プロテアーゼ(例、リソソーム、またはエンドソーム中に存在するプロテアーゼ)、細胞外プロテアーゼ(例、分泌性プロテアーゼ)〕で分解されるペプチジルリンカー(例、米国特許第6,214,345号;Dubowchik et al.,Pharm.Therapeutics 83:67-123(1999))、生体内に存在する局所酸性部位で切断され得るリンカー(例、米国特許第5,622,929号、同第5,122,368号;同第5,824,805号)が挙げられる。リンカーは、自壊的(self-immolative)であってもよい(例、国際公開第02/083180号、国際公開第WO04/043493号、国際公開第05/112919号)。本発明では、
誘導体化された機能性物質も、単に「機能性物質」と呼称することができる。
Derivatization is common knowledge in the art (eg, WO2004/010957, US2006/0074008, US2005/0238649). For example, derivatization may be performed using a cross-linking agent as described above. Alternatively, derivatization may be performed with specific linkers bearing desired functional groups. For example, such a linker may be capable of separating the functional substance and the soluble protein in an appropriate environment (eg, intracellular or extracellular) by cleaving the linker. Such linkers include, for example, peptidyl linkers ( Dubowchik et al., Pharm.Therapeutics 83:67-123 (1999)), linkers that can be cleaved at local acidic sites present in vivo (e.g., US Patent No. 5 , 622,929, 5,122,368; 5,824,805). Linkers may be self-immolative (eg, WO02/083180, WO04/043493, WO05/112919). In the present invention,
A derivatized functional substance can also be simply referred to as a "functional substance".
機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基において、機能性物質および生体直交性官能基の定義、例および好ましい例は、上述したとおりである。機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分は、当該技術分野において技術常識であり、機能性物質(機能性物質が誘導体化されている場合、その誘導体化部分)および生体直交性官能基の種類に応じて適宜決定することができる。 Definitions, examples and preferred examples of the functional substance and the bioorthogonal functional group in the divalent group containing the moiety generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group are as described above. The moieties generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group are common general knowledge in the art, and the functional substance (when the functional substance is derivatized, its derivatized portion) and It can be appropriately determined according to the type of bioorthogonal functional group.
機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基は、特に限定されるわけではないが、例えば、ジスルフィド残基、アセタール残基、ケタール残基、エステル残基、カルバモイル残基、アルコキシアルキル残基、イミン残基、三級アルキルオキシカルバメート残基、シラン残基、ヒドラゾン含有残基、フォスフォルアミデート残基、アコニチル残基、トリチル残基、アゾ残基、ビシナルジオール残基、セレン残基、電子吸引基を有する芳香族環含有残基、クマリン含有残基、スルホン含有残基、不飽和結合含有鎖残基、グリコシル残基からなる群より選ばれる残基を含む2価の基であってもよい。 The divalent group including the portion generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group is not particularly limited, but examples include disulfide residues, acetal residues, ketal residues, esters residues, carbamoyl residues, alkoxyalkyl residues, imine residues, tertiary alkyloxycarbamate residues, silane residues, hydrazone-containing residues, phosphoramidate residues, aconityl residues, trityl residues, azo residues group, a vicinal diol residue, a selenium residue, an aromatic ring-containing residue having an electron-withdrawing group, a coumarin-containing residue, a sulfone-containing residue, an unsaturated bond-containing chain residue, and a glycosyl residue. It may be a divalent group containing a residue that can be
機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基はまた、特に限定されるわけではないが、例えば、下記:
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、上述した水素原子または置換基であり、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はF側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はB’側の部分に対する結合
を示す。
化学構造が、切断性部分を中心にして非対称である場合、●がB’側の部分に対する結合を示し、○がF側の部分に対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する残基を含む2価の基であってもよい。
Divalent groups, including moieties generated by reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group, are also not particularly limited and include, but are not limited to:
the plurality of R 2a , the plurality of R 2b , and the plurality of R 2c are the same or different and are hydrogen atoms or substituents as described above;
J is —CH 2 —, —O—, or —S—;
r is any integer from 1 to 4,
O (white circle) indicates a bond to the F-side moiety, and ● (black circle) indicates a bond to the B'-side moiety.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavable moiety, the circle may indicate the bond to the B' side moiety and the circle to the F side moiety. ] may be a divalent group containing a residue corresponding to any one chemical structure selected from the group consisting of
3-4.部分構造「L-B’(-F)」
部分構造「L-B’(-F)」の詳細は、BがB’(-F)に変更されていることを除き、上記「1-6.部分構造「L-B」」で述べたとおりである。
3-4. Partial structure "LB'(-F)"
The details of the partial structure "LB'(-F)" are as described in "1-6. Partial structure "LB"" above, except that B is changed to B'(-F). That's right.
一実施形態では、切断性リンカーは、(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー、もしくは(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであってもよい。 In one embodiment, the cleavable linker is (i) a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety capable of cleaving to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group, or (ii) It may be a cleavable linker that is a divalent group comprising a cleavable moiety that does not have the ability to cleave to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group.
特定の実施形態では、切断性リンカーは、上記(ii)の切断性リンカーであってもよい。既にB’は機能性物質(F)と結合しているため、生体直交性官能基を反応性基側に生成する必要がないためである。 In certain embodiments, the cleavable linker may be the cleavable linker of (ii) above. This is because B' is already bound to the functional substance (F), so there is no need to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group.
別の特定の実施形態では、L-B’(-F)で表される部分構造は、B2’(-F2)-L’-B1’(-F1)で表される部分構造(すなわち、Lは、B2’(-F2)-L’であり、B’は、B1’である。)であってもよい。この場合、上記式(III)で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩は、下記式(III’)で表されることができる。A-B2’(-F2)-L’-B1’(-F1)-R’-T (III’)
〔式中、
A、R’およびTは、前記式(III)のものと同じであり、
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1’およびB2’は、同一または異なって、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
F1およびF2は、同一または異なって、機能性物質であり、
B1’(-F1)およびB2’(-F2)は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕。
In another specific embodiment, the substructure represented by LB'(-F) is the substructure represented by B2'(-F2)-L'-B1'(-F1) (i.e., L is B2'(-F2)-L' and B' is B1'). In this case, the complex or salt thereof having the affinity substance for the soluble protein, the cleaving moiety, the functional substance and the soluble protein represented by the above formula (III) is represented by the following formula (III'). can be done. A-B2'(-F2)-L'-B1'(-F1)-R'-T (III')
[In the formula,
A, R' and T are the same as in formula (III) above;
L' is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1' and B2' are the same or different and are divalent groups comprising moieties generated by reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F1 and F2 are the same or different and are functional substances;
B1' (-F1) and B2' (-F2) may have a symmetrical structure about L'. ].
B1’およびB2’は、同一または異なって、B’の定義、例および好ましい例と同様である。 B1' and B2' are the same or different and have the same definitions, examples and preferred examples of B'.
上記式(III’)において、L’は、上述した式(L1’)~(L3’)のいずれか一つで表されてもよい。 In formula (III') above, L' may be represented by any one of formulas (L1') to (L3') described above.
別の特定の実施形態では、L-B’(-F)で表される構造単位は、下記式(LB’(F)’)で表されてもよい。
C、F1、F2、p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1a’、R1b、R1b’、ZおよびZ’の定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
YおよびY’は、同一または異なって、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
○(白丸)は、Aに対する結合を示し、●(黒丸)は、R’に対する結合を示す。〕
In another specific embodiment, the structural unit represented by LB'(-F) may be represented by the following formula (LB'(F)').
Definitions, examples and preferred examples of C, F1, F2, p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1a' , R 1b , R 1b' , Z and Z' are given above. is the same as
Y and Y' are the same or different and are a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the formula (B-1),
O (open circle) indicates binding to A and ● (filled circle) indicates binding to R'. ]
より具体的には、YおよびY’における、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基は、-N(-)-、-CH(-)-、または上記式(B-2)から水素原子を一つ除いた基である。構造の簡便化等の観点から、Yは、-N(-)-、または-CH(-)-であってもよい。あるいは、炭素原子を基調とした構造の設計等の観点からは、Yは、-CH(-)-、または上記式(B-2)から水素原子を一つ除いた基であってもよい。 More specifically, in Y and Y', the residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the formula (B-1) is -N(-)-, -CH(-)-, or the above formula It is a group obtained by removing one hydrogen atom from (B-2). From the viewpoint of structural simplification, Y may be -N(-)- or -CH(-)-. Alternatively, from the viewpoint of designing a structure based on carbon atoms, Y may be -CH(-)- or a group obtained by removing one hydrogen atom from the above formula (B-2).
上記式(B-2)から水素原子を一つ除いた基は、下記式(B-2’):
VおよびV’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
V1は、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
sは、0~10の任意の整数であり、
式(B-2’)における○および●は、それぞれ、式(B-1)における○および●と同じ配向である。)である。〕から水素原子を一つ除いた基である。式(B-2’)におけるsの定義、例および好ましい例は、式(B-2)のものと同様である。したがって、式(B-2’)では、VおよびV’の一方が、-N(-)-、または-CH(-)-であってもよい。あるいは、式(B-2’)では、V1は、上記(a)または(b)の2価の基から水素原子が一つ除かれた3価の基であってもよい。あるいは、式(B-2’)では、s個の-CH2-のうちの一つが-CH(-)-であってもよい。
The group obtained by removing one hydrogen atom from the above formula (B-2) is represented by the following formula (B-2′):
V and V′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
V is (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group without a bioorthogonal functional group;
s is any integer from 0 to 10,
○ and ● in formula (B-2′) have the same orientations as ○ and ● in formula (B-1), respectively. ). ] with one hydrogen atom removed. The definition, examples and preferred examples of s in formula (B-2') are the same as those in formula (B-2). Therefore, in formula (B-2'), one of V and V' may be -N(-)- or -CH(-)-. Alternatively, in formula (B-2′), V1 may be a trivalent group obtained by removing one hydrogen atom from the divalent group (a) or (b) above. Alternatively, in formula (B-2'), one of the s -CH 2 - may be -CH(-)-.
この場合、上記式(III)は、下記式(III’’)として規定することができる。
A、R、C、F1、F2、p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1b、R1a’、R1b’、Y、Y’、ZおよびZ’の定義、例および好ましい例は、上述したものと同じである。〕
In this case, the above formula (III) can be defined as the following formula (III'').
Definitions of A, R, C, F1, F2, p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1b , R 1a' , R 1b' , Y, Y', Z and Z' , examples and preferred examples are the same as described above. ]
上記式(LB’(F)’)および(III’’)において、C=ZにおけるC(炭素原子)からC=Z’におけるC(炭素原子)までの長さは、上述したようなAおよびRを連結する主鎖の長さと同様である。これらの式において、C=ZにおけるCからC=Z’におけるCまでの長さはまた、C=ZにおけるCからC=Z’におけるCを連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。このような原子数は、AおよびRを連結する主鎖を構成する原子数と同様である。C=ZにおけるCからC=Z’におけるCを連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置
換基を除く)は、環構造を含んでいなくても含んでいてもよいが、環構造を含んでいないことが好ましい。当該連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、好ましくは、ペプチド部分を含まないものであってもよい。
In the above formulas (LB′(F)′) and (III″), the length from C (carbon atom) at C=Z to C (carbon atom) at C=Z′ is A and It is the same as the length of the main chain connecting Rs. In these formulas, the length from C in C=Z to C in C=Z' also refers to the connecting chain of the substructure connecting C in C=Z to C in C=Z' (hydrogen atoms and substituents ) can also be defined as the number of atoms constituting The number of such atoms is the same as the number of atoms constituting the main chain connecting A and R. The connecting chain of the partial structure connecting C in C=Z to C in C=Z' (excluding hydrogen atoms and substituents) may or may not contain a ring structure, but may contain a ring structure. preferably not included. The linking chain (excluding hydrogen atoms and substituents) may preferably be free of peptide moieties.
3-5.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の結合部位(位置選択性)
可溶性タンパク質以外の部分構造(例、A-L-B’(-F)-R’)は、可溶性タンパク質(T)における上述したような標的領域に位置選択的に結合させることができる。具体的には、Tが、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む場合、可溶性タンパク質以外の部分構造は、当該標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合させることができる。標的領域および位置選択性の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。
3-5. Binding sites of partial structures other than soluble proteins possessed by soluble proteins (regioselectivity)
A partial structure other than a soluble protein (eg, ALB'(-F)-R') can be regioselectively bound to the target region as described above in the soluble protein (T). Specifically, T contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region When it contains 5 or more amino acid residues, the partial structure other than the soluble protein can bind to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more. . Definitions, examples and preferred examples of target regions and regioselectivity are provided above.
3-6.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数
可溶性タンパク質(T)が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造(例、A-L-B’(-F)-R’)の個数は、変動することができる。例えば、Tが複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質である場合、Tは、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、T以外の部分構造を有することができる。その結果、Tは、T以外の部分構造を複数個有することができる。したがって、式(III)、(III’)、または(III’’)で表される構造は、Tが、T以外の部分構造を1個または複数個有していてもよいことを示す。Tが有する、T以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質の種類、および可溶性タンパク質とそれに対して導入される構造単位との反応比率等の条件を適宜設定することで調節することができる。このような個数は、可溶性タンパク質の種類によっても異なるが、例えば1~8、好ましくは1~4、より好ましくは1または2であってもよい。
3-6. Number of partial structures other than soluble protein possessed by soluble protein The number of partial structures other than soluble protein possessed by soluble protein (T) (e.g., ALB'(-F)-R') varies. can do. For example, if T is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins, T can have substructures other than T in the corresponding plurality of target regions in the plurality of monomeric proteins. . As a result, T can have multiple partial structures other than T. Therefore, the structure represented by formula (III), (III'), or (III'') indicates that T may have one or more partial structures other than T. The number of partial structures other than T that T has can be adjusted by appropriately setting conditions such as the type of soluble protein and the reaction ratio between the soluble protein and structural units introduced therein. Such number may vary depending on the type of soluble protein, but may be, for example, 1 to 8, preferably 1 to 4, more preferably 1 or 2.
特定の実施形態では、可溶性タンパク質が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質が、複数個の単量体タンパク質から構成される多量体タンパク質である場合、複数個であってもよい。本発明によれば、複数個の単量体タンパク質の同一標的領域に対して可溶性タンパク質以外の部分構造を複数個導入することができる。 In certain embodiments, if the soluble protein is a multimeric protein composed of a plurality of monomeric proteins, the number of partial structures other than the soluble protein possessed by the soluble protein may be more than one. good. According to the present invention, a plurality of partial structures other than soluble proteins can be introduced into the same target region of a plurality of monomeric proteins.
好ましい実施形態では、可溶性タンパク質は、複数個の重鎖を含む抗体であってもよい。抗体の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。本発明では、抗体が保有する、抗体以外の部分構造の個数は、IgG、IgE、およびIgDについては1個または2個(好ましくは2個)であり、IgAについては1~4個(好ましくは4個)であり、IgMについては1~8個(好ましくは8個)であってもよい。 In preferred embodiments, the soluble protein may be an antibody comprising multiple heavy chains. Definitions, examples and preferred examples of antibodies are given above. In the present invention, the number of partial structures other than antibodies possessed by antibodies is 1 or 2 (preferably 2) for IgG, IgE, and IgD, and 1 to 4 (preferably 4), and for IgM may be 1 to 8 (preferably 8).
3-7.製造方法
本発明は、以下を含む、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の製造方法を提供する:
(B1)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること。
3-7. Methods of Production The present invention provides methods of producing a conjugate or salt thereof having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein, including:
(B1) A conjugate having an affinity substance for a soluble protein and a soluble protein containing a cleavable portion or a salt thereof with a functional substance to obtain a soluble protein-affinity substance, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein To produce the body or its salts.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質は、式(II)、好ましくは式(II’)、より好ましくは式(II’’)で表される。可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有
する複合体は、式(III)、好ましくは式(III’)、より好ましくは式(III’’)で表される。
The affinity agent for the soluble protein and the soluble protein comprising the cleavable moiety are represented by formula (II), preferably formula (II'), more preferably formula (II''). A conjugate comprising an affinity agent for a soluble protein, a cleaving moiety, a functional agent and a soluble protein is represented by formula (III), preferably formula (III'), more preferably formula (III'').
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩は、機能性物質に対して反応することができる生体直交性官能基を有するため、機能性物質と反応することができる。このような反応は、上記「2-6.製造方法」で述べたような、タンパク質の変性・分解(例、アミド結合の切断)を引き起こし得ない条件(温和な条件)下で適宜行うことができる。 Affinity agents for soluble proteins, and soluble proteins or salts thereof that include cleavable moieties have bioorthogonal functional groups that can react with functional agents, and thus can react with functional agents. Such a reaction can be appropriately carried out under conditions (mild conditions) that do not cause protein denaturation/degradation (e.g., cleavage of amide bonds), as described in "2-6. Production method" above. can.
反応系において、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩(X)に対する機能性物質(Y)のモル比率(Y/X)は、可溶性タンパク質(例、抗体)および機能性物質の種類、機能性物質によって修飾されるべき可溶性タンパク質中の部位の数(例、DAR)等に応じて変動することから特に限定されないが、例えば0.1~100であり、好ましくは0.5~80であり、より好ましくは1~70であり、さらにより好ましくは2~50であり、特に好ましくは3~30である。 In the reaction system, the molar ratio (Y/X) of the affinity substance for the soluble protein and the functional substance (Y) to the soluble protein containing the cleavable moiety or salt thereof (X) is determined by the soluble protein (e.g., antibody) and Although it is not particularly limited because it varies depending on the type of functional substance, the number of sites in the soluble protein to be modified by the functional substance (eg, DAR), etc., it is, for example, 0.1 to 100, preferably 0.5 to 80, more preferably 1 to 70, even more preferably 2 to 50, and particularly preferably 3 to 30.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の生成の確認は、その具体的な原料および生成物の分子量にもよるが、例えば、電気泳動法、クロマトグラフィー(例、ゲル濾過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィー、HPLC)、または質量分析により、好ましくは、質量分析により行うことができる。位置選択性の確認、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数の確認、および精製は、上記「2-6.製造方法」で述べた方法により適宜行うことができる。 Confirmation of the production of a conjugate having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a conjugate having a soluble protein or a salt thereof, depends on the specific starting material and the molecular weight of the product, but for example by electrophoresis. , chromatography (eg, gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, reversed-phase column chromatography, HPLC), or mass spectrometry, preferably mass spectrometry. Confirmation of regioselectivity, confirmation of the number of partial structures other than the soluble protein, and purification can be carried out as appropriate by the method described in "2-6. Production method" above.
本発明はまた、以下を含む、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の製造方法を提供する:
(B2)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩を可溶性タンパク質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を生成すること;および
(B3)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること。
The present invention also provides a method for producing a conjugate or salt thereof having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein, comprising:
(B2) reacting a compound or a salt thereof containing an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group with the soluble protein to produce an affinity substance for the soluble protein and a soluble protein containing the cleavable moiety or a salt thereof; and (B3) reacting the affinity agent for the soluble protein and the soluble protein comprising the cleavable moiety or a salt thereof with the functional agent to produce the affinity agent for the soluble protein, the cleavable moiety, the functional agent and Producing a conjugate with a soluble protein or a salt thereof.
上記(B2)の工程は、上記「2-6.製造方法」で述べた上記(A1)の工程と同様にして行うことができる。上記(B3)の工程は、上記(B1)の工程と同様にして行うことができる。上記(B2)および(B3)の工程は、別々に行うことができる。あるいは、上記(B2)および(B3)の工程は、可溶性タンパク質中の反応標的である特定のアミノ酸残基と反応性基との反応対、および機能性物質中の官能基と生体直交性官能基との反応対の組合せに応じて、同時に行うことができる。 The above step (B2) can be performed in the same manner as the above step (A1) described in "2-6. Production method" above. The step (B3) above can be performed in the same manner as the step (B1) above. The steps (B2) and (B3) above can be performed separately. Alternatively, the above steps (B2) and (B3) are carried out by a reaction pair between a specific amino acid residue that is a reaction target in a soluble protein and a reactive group, and a functional group in a functional substance and a bioorthogonal functional group. can be performed simultaneously, depending on the combination of reaction pairs with
4.生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩
4-1.製造方法の概要
本発明は、式(IV)で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕
4. Soluble protein or salt thereof having bioorthogonal functional group 4-1. Outline of Production Method The present invention provides a method for producing a soluble protein having a bioorthogonal functional group represented by formula (IV) or a salt thereof.
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ]
4-2.(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基(L1)
式(IV)において、L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。このような1価の基は、上述したような切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーの切断により生成し得る1価の基である。したがって、L1は、上述したような切断性部分の残基または化学構造の切断により生成し得る1価の基であってもよい。より具体的には、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基は、上述した(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーの切断により生成し得る1価の基であってもよく、(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基は、(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーの切断により生成し得る1価の基であってもよい。
4-2. (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group (L1) containing no bioorthogonal functional group
In formula (IV), L1 is (i') a monovalent group that includes a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not include a bioorthogonal functional group. Such monovalent groups are monovalent groups that can be generated by cleavage of a cleavable linker, which is a divalent group containing a cleavable moiety as described above. Thus, L1 may be a residue of a cleavable moiety as described above or a monovalent group that can be generated by cleavage of a chemical structure. More specifically, (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group is a cleavable moiety having the ability to generate a bioorthogonal functional group on the reactive group side by cleavage as described above (i). It may be a monovalent group that can be generated by cleavage of a cleavable linker that is a bivalent group containing (ii′) a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group, (ii) bio It may be a monovalent group that can be generated by cleavage of a cleavable linker, which is a divalent group containing a cleavable moiety that does not have the ability to generate an orthogonal functional group on the reactive group side.
特定の実施形態では、L1は、下記式(L1-1)または(L1-2)のいずれか一つで表されてもよい:
C1-Lb (L1-1)
C1 (L1-2)
〔式中、
Lbは、2価の基であり、
C1は、生体直交性官能基、または生体直交性官能基以外の基である。〕
In certain embodiments, L1 may be represented by any one of formula (L1-1) or (L1-2) below:
C1-Lb (L1-1)
C1 (L1-2)
[In the formula,
Lb is a divalent group,
C1 is a bioorthogonal functional group or a group other than a bioorthogonal functional group. ]
2価の基としては、例えば、置換基を有していてもよい2価の炭化水素基、置換基を有していてもよい2価の複素環基、-C(=O)-、-NRa-(Raは水素原子、または置換基を示す)、-O-、-S-、-C(=S)-、およびこれらの2以上(例えば2~8、好ましくは2~6、より好ましくは2~4)の組み合わせからなる基が挙げられる。2価の炭化水素基、2価の複素環基、および置換基の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。 As the divalent group, for example, a divalent hydrocarbon group which may have a substituent, a divalent heterocyclic group which may have a substituent, -C (= O) -, - NR a — (R a represents a hydrogen atom or a substituent), —O—, —S—, —C(═S)—, and two or more of these (for example, 2 to 8, preferably 2 to 6, Groups consisting of combinations of 2 to 4) are more preferred. Definitions, examples, and preferred examples of the divalent hydrocarbon group, the divalent heterocyclic group, and the substituent are as described above.
生体直交性官能基の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。 Definitions, examples and preferred examples of bioorthogonal functional groups are given above.
生体直交性官能基以外の基としては、例えば、上述した置換基のうち、生体直交性官能基以外のものが挙げられる。生体直交性官能基以外のこのような基としては、例えば、アルキル、シクロアルキル、アラルキル、1価の複素環基、ヒドロキシル、アミノ、アルキルオキシ(アルコキシ)、シクロアルキルオキシ、アラルキルオキシ)が挙げられる。これらの基およびこれらの基の構成要素(例、アルキルオキシ(アルコキシ)におけるアルキル、シクロアルキルオキシにおけるシクロアルキル、およびアラルキルオキシにおけるアラルキル)の定義、例および好ましい例については、上述したものと同様である。 Examples of the groups other than the bioorthogonal functional groups include, among the substituents described above, those other than the bioorthogonal functional groups. Such groups other than bioorthogonal functional groups include, for example, alkyl, cycloalkyl, aralkyl, monovalent heterocyclic groups, hydroxyl, amino, alkyloxy (alkoxy), cycloalkyloxy, aralkyloxy). . Definitions, examples and preferred examples of these groups and constituents of these groups (e.g., alkyl in alkyloxy (alkoxy), cycloalkyl in cycloalkyloxy, and aralkyl in aralkyloxy) are the same as those described above. be.
特定の実施形態では、Lbは、下記(Lb’):
pは、0~10の任意の整数であり、
qは、0~10の任意の整数であり、
Xは、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在しない)であり、
R1a、およびR1bは、同一または異なって、水素原子、または上述する置換基からなる群より選ばれる。
○(白丸)は、C1に対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。〕で表されてもよい。
In certain embodiments, Lb is (Lb'):
p is any integer from 0 to 10,
q is any integer from 0 to 10,
X is a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent; when X is a single bond, R 1a and R 1b are absent);
R 1a and R 1b are the same or different and are selected from the group consisting of a hydrogen atom or the substituents described above.
O (white circle) indicates binding to C1 and ● (filled circle) indicates binding to B. ] may be represented.
p、q、およびX、ならびにR1a、およびR1b(置換基)の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。 Definitions, examples and preferred examples of p, q and X, and R 1a and R 1b (substituents) are as described above.
4-3.部分構造「L1-B」
4-3-1.L1末端部分およびR’を連結する部分構造「L1-B」の長さ
式(IV)において、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造(「L1-B」中の直鎖部分)の長さ(あるいは、式(IV)等の特定の式に限定されない、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩における、生体直交性官能基および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖の原子数。以下同様)は、上記「1-6-1.AおよびRを連結する部分構造「L-B」中の主鎖の長さ」で述べたような種々の因子に応じて、適宜設計することができる。
4-3. Partial structure "L1-B"
4-3-1. Length of partial structure "L1-B" connecting L1 terminal portion and R' B”) length (or bioorthogonal functional groups in soluble proteins or salts thereof regioselectively having bioorthogonal functional groups, not limited to specific formulas such as formula (IV) and the number of atoms in the main chain connecting the side chains of specific amino acid residues; It can be designed as appropriate according to various factors as described in .
切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の長さは、例えば約2.5Å以上、好ましくは約4Å以上、より好ましくは約5Å以上であってもよい。部分構造の長さはまた、例えば約15Å以下、好ましくは約12Å以下、より好ましくは約8Å以下であってもよい。より具体的には、部分構造の長さは、例えば約2.5~15Å、好ましくは約4~12Å、より好ましくは約5~8Åであってもよい。 The length of the partial structure connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal portion) generated by cleavage and R' may be, for example, about 2.5 Å or more, preferably about 4 Å or more, more preferably about 5 Å or more. . Substructure lengths may also be, for example, about 15 Å or less, preferably about 12 Å or less, more preferably about 8 Å or less. More specifically, the substructure length may be, for example, about 2.5-15 Å, preferably about 4-12 Å, more preferably about 5-8 Å.
より具体的には、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の長さは、部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。連結鎖を構成する原子数は、例えば2個(約2.5Å)以上、好ましくは3個(約4Å)以上、より好ましくは4個(約5Å)以上であってもよい。連結鎖を構成する原子数はまた、例えば10個(約15Å)以下、好ましくは8個(約12Å)以下、より好ましくは6個(約8Å)以下であってもよい。より具体的には、連結鎖を構成する原子数は、例えば2~10個、好ましくは3~8個、より好ましくは4~6個であってもよい。 More specifically, the length of the partial structure connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal portion) and R′ generated by cleavage is the atoms constituting the connecting chain of the partial structure (excluding hydrogen atoms and substituents) It can also be specified as a number. The number of atoms constituting the linking chain may be, for example, 2 (about 2.5 Å) or more, preferably 3 (about 4 Å) or more, more preferably 4 (about 5 Å) or more. The number of atoms constituting the linking chain may also be, for example, 10 (about 15 Å) or less, preferably 8 (about 12 Å) or less, more preferably 6 (about 8 Å) or less. More specifically, the number of atoms constituting the connecting chain may be, for example, 2-10, preferably 3-8, more preferably 4-6.
切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の連結鎖が2価の環構造を含まない鎖状構造である場合、連結鎖の原子数は、連結鎖中の原子数を数えることにより決定することができる。 When the connecting chain of the partial structure connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal portion) and R' generated by cleavage is a chain structure that does not contain a divalent ring structure, the number of atoms in the connecting chain is can be determined by counting the number of atoms of
一方、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の連結鎖が2価の環構造を含む構造である場合、連結鎖の原子数と上述した長さとは必ずしも対応せず、連結鎖の原子数により規定され得る長さは、上述した長さよりも短くなる傾向がある。このような場合であっても、原子数により連結鎖の長さを規定する観点から、連結鎖の原子数を便宜的に数えることができる。具体的には、このような場合における連結鎖の原子数は、上述したように、連結鎖において2価の環構造を含まない鎖状構造中の原子数に加えて、2価の環構造中の2つの結合手を連絡する最短経路の原子数を数えることにより決定してもよい。 On the other hand, when the connecting chain of the partial structure connecting the L1 terminal portion (or the C1 terminal portion) and R′ generated by cleavage has a structure containing a divalent ring structure, the number of atoms of the connecting chain and the length described above are Not necessarily corresponding, the length that can be defined by the number of atoms in the linking chain tends to be shorter than the lengths mentioned above. Even in such a case, the number of atoms in the linking chain can be conveniently counted from the viewpoint that the length of the linking chain is defined by the number of atoms. Specifically, the number of atoms in the linking chain in such a case is, as described above, in addition to the number of atoms in the chain structure that does not contain a divalent ring structure in the linking chain, may be determined by counting the number of atoms in the shortest path connecting two bonds of .
好ましくは、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の連結鎖は、2価の環構造を含まない鎖状構造であってもよい。この場合、切断により生成した末端部分およびR’を連結する部分構造の連結鎖において2価の環基が含まれないようにL1-Bを適宜設計することができる。 Preferably, the linking chain of the partial structure linking the L1 terminal portion (or C1 terminal portion) and R' generated by cleavage may be a chain structure that does not contain a divalent ring structure. In this case, L1-B can be appropriately designed so that the connecting chain of the partial structure connecting the terminal portion and R' generated by cleavage does not contain a divalent cyclic group.
特定の実施形態では、L1-Bで表される部分構造は、好ましくは、ペプチド部分を含まない。この場合、本発明の生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質を用いて得られる本発明の機能性物質を有する可溶性タンパク質(例、抗体薬物複合体)は、免疫原性を有し得るペプチド部分をリンカーとして含み得ないという利点がある。 In certain embodiments, the substructure represented by L1-B preferably does not contain peptide moieties. In this case, the soluble protein having the functional substance of the present invention (eg, antibody-drug conjugate) obtained using the soluble protein having the bioorthogonal functional group of the present invention contains a peptide portion that can have immunogenicity. It has the advantage that it cannot be included as a linker.
4-3-2.部分構造「L1-B」の具体的構造
上記式(IV)において、L1およびBは、互いに連関し得る構造である。したがって、上記式(IV)において、L1およびBは、「L1-B」で表される部分構造として規定することができる。
4-3-2. Specific Structure of Partial Structure “L1-B” In the above formula (IV), L1 and B are structures that can be associated with each other. Therefore, in the above formula (IV), L1 and B can be defined as a partial structure represented by "L1-B".
特定の実施形態では、L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基である場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基である。 In certain embodiments, when L is (i′) a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group, B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group, or (b) a bio It is a divalent group that does not contain an orthogonal functional group.
好ましくは、L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基である場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基である。この場合、(i’)における生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と同種であっても異種であってもよい。より単純な構造の採用、および/または単一の機能性物質に対する反応性の向上等の観点では、(i’)における生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と同種であってもよい。一方、2種以上の機能性物質に対する差別化された反応性の確保等、および反応における一部の生体直交性官能基の不使用の観点では、(i’)における生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と異種であってもよい。 Preferably, when L1 is (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group, B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group. In this case, the bioorthogonal functional group in (i') may be the same as or different from the bioorthogonal functional group in (a). From the viewpoint of adopting a simpler structure and/or improving reactivity with a single functional substance, the bioorthogonal functional group in (i′) is the same as the bioorthogonal functional group in (a). There may be. On the other hand, from the viewpoint of ensuring differentiated reactivity with two or more functional substances, and not using some bioorthogonal functional groups in the reaction, the bioorthogonal functional group in (i′) is It may be different from the bioorthogonal functional group in (a).
あるいは、L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基である場合、Bは、(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であってもよい。この場合、式(IV)で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩は、より単純な構造を有することになるので、合成が容易である。 Alternatively, when L1 is (i') a monovalent group containing a bioorthogonal functional group, B may be (b) a divalent group containing no bioorthogonal functional group. In this case, the soluble protein having a bioorthogonal functional group represented by formula (IV) or a salt thereof has a simpler structure and is therefore easier to synthesize.
別の特定の実施形態では、L1が(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基である。 In another particular embodiment, when L1 is (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group, then B is (a) a divalent group that contains a bioorthogonal functional group.
特定の実施形態では、L1-Bで表される構造単位は、下記式(L1B’)で表されてもよい。
C1、p、q、X、R1a、R1b、Y、およびZの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
●(黒丸)は、R’に対する結合を示す。〕
In certain embodiments, the structural unit represented by L1-B may be represented by the following formula (L1B').
The definitions, examples and preferred examples of C1, p, q, X, R 1a , R 1b , Y and Z are the same as described above,
● (filled circle) indicates a bond to R′. ]
したがって、上記式(IV)は、下記式(IV’)として規定することができる。
C1、p、q、X、R1a、R1b、Y、Z、R’、およびTの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じである。〕
Therefore, the above formula (IV) can be defined as the following formula (IV').
The definitions, examples and preferred examples of C1, p, q, X, R 1a , R 1b , Y, Z, R' and T are the same as described above. ]
上記式(L1B’)および(IV’)において、C=ZにおけるCからC1までの長さは、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の長さと同様である。これらの式において、C=ZにおけるCからC1までの長さはまた、C=ZにおけるCからC1までの部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。このような原子数は、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端)およびR’を連結する部分構造(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数と同様である。C=ZにおけるCからC1を連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、環構造を含んでいなくても含んでいてもよいが、環構造を含んでいないことが好ましい。当該連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、好ましくは、ペプチド部分を含まないものであってもよい。 In the above formulas (L1B') and (IV'), the length from C to C1 in C=Z is the length of the partial structure connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal portion) generated by cleavage and R'. It is the same. In these formulas, the length from C to C in C=Z is also defined as the number of atoms constituting the connecting chain (excluding hydrogen atoms and substituents) of the substructure from C to C in C=Z can also The number of such atoms is the same as the number of atoms constituting the partial structure (excluding hydrogen atoms and substituents) connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal) generated by cleavage and R'. The connecting chain (excluding hydrogen atoms and substituents) of the partial structure connecting C to C1 in C=Z may or may not contain a ring structure, but may not contain a ring structure. preferable. The linking chain (excluding hydrogen atoms and substituents) may preferably be free of peptide moieties.
4-4.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の結合部位(位置選択性)
可溶性タンパク質以外の部分構造(例、L1-B-R’)は、可溶性タンパク質(T)における上述したような標的領域に位置選択的に結合させることができる。具体的には、Tが、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む場合、可溶性タンパク質以外の部分構造は、当該標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合させることができる。標的領域および位置選択性の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。
4-4. Binding sites of partial structures other than soluble proteins possessed by soluble proteins (regioselectivity)
Partial structures other than soluble proteins (eg, L1-BR') can be regioselectively bound to target regions as described above in soluble proteins (T). Specifically, T contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region When it contains 5 or more amino acid residues, the partial structure other than the soluble protein can bind to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more. . Definitions, examples and preferred examples of target regions and regioselectivity are provided above.
4-5.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数
可溶性タンパク質(T)が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造(例、L1-B-R’)の個数は、変動することができる。例えば、Tが複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質である場合、Tは、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、T以外の部分構造を有することができる。その結果、Tは、T以外の部分構造を複数個有することができる。したがって、式(IVI)、(IV’)、またはIV’’)で表される構造は、Tが、T以外の部分構造を1個または複数個有していてもよいことを示す。Tが有する、T以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質の種類、および可溶性タンパク質とそれに対して導入される構造単位との反応比率等の条件を適宜設定することで調節することができる。このような個数は、可溶性タンパク質の種類によっても異なるが、例えば1~8、好ましくは1~4、より好ましくは1または2であってもよい。
4-5. Number of partial structures other than soluble protein possessed by soluble protein The number of partial structures (eg, L1-BR') possessed by the soluble protein (T) other than the soluble protein can vary. For example, if T is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins, T can have substructures other than T in the corresponding plurality of target regions in the plurality of monomeric proteins. . As a result, T can have multiple partial structures other than T. Therefore, the structure represented by formula (IVI), (IV'), or IV'') indicates that T may have one or more partial structures other than T. The number of partial structures other than T that T has can be adjusted by appropriately setting conditions such as the type of soluble protein and the reaction ratio between the soluble protein and structural units introduced therein. Such number may vary depending on the type of soluble protein, but may be, for example, 1 to 8, preferably 1 to 4, more preferably 1 or 2.
特定の実施形態では、可溶性タンパク質が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質が、複数個の単量体タンパク質から構成される多量体タンパク質である場合、複数個であってもよい。本発明によれば、複数個の単量体タンパク質の同一標的領域に対して可溶性タンパク質以外の部分構造を複数個導入することができる。 In certain embodiments, if the soluble protein is a multimeric protein composed of a plurality of monomeric proteins, the number of partial structures other than the soluble protein possessed by the soluble protein may be more than one. good. According to the present invention, a plurality of partial structures other than soluble proteins can be introduced into the same target region of a plurality of monomeric proteins.
好ましい実施形態では、可溶性タンパク質は、複数個の重鎖を含む抗体であってもよい。抗体の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。本発明では、抗体が保有する、抗体以外の部分構造の個数は、IgG、IgE、およびIgDについては1個または2個(好ましくは2個)であり、IgAについては1~4個(好ましくは4個)であり、IgMについては1~8個(好ましくは8個)であってもよい。 In preferred embodiments, the soluble protein may be an antibody comprising multiple heavy chains. Definitions, examples and preferred examples of antibodies are given above. In the present invention, the number of partial structures other than antibodies possessed by antibodies is 1 or 2 (preferably 2) for IgG, IgE, and IgD, and 1 to 4 (preferably 4), and for IgM may be 1 to 8 (preferably 8).
4-6.製造方法
本発明は、以下を含む、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(C1)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
4-6. Methods of Making The present invention provides methods of making soluble proteins or salts thereof having bioorthogonal functional groups, including:
(C1) Cleavage of a soluble protein or salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein and a cleavable moiety to produce a soluble protein or salt thereof having a bioorthogonal functional group.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質は、式(II)、好ましくは式(II’)、より好ましくは式(II’’)で表される。生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質は、式(IV)、好ましくは式(IV’)、より好ましくは式(IV’’)で表される。 The affinity agent for soluble proteins and the soluble protein comprising the cleavable moiety is represented by formula (II), preferably formula (II'), more preferably formula (II''). Soluble proteins with bioorthogonal functional groups are represented by formula (IV), preferably formula (IV'), more preferably formula (IV'').
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩は、上述したような切断処理により切断することができる切断性部分を有するため、切断することができる。このような切断反応は、上記「2-6.製造方法」で述べたような、タンパク質の変性・分解(例、アミド結合の切断)を引き起こし得ない条件(温和な条件)下で適宜行うことができる。 A soluble protein having an affinity for a soluble protein and a soluble protein containing a cleavable moiety or a salt thereof can be cleaved because it has a cleavable moiety that can be cleaved by the cleavage treatment as described above. Such a cleavage reaction should be appropriately carried out under conditions (mild conditions) that do not cause protein denaturation/degradation (e.g., amide bond cleavage) as described in "2-6. Production method" above. can be done.
切断処理としては、例えば、(a)酸性物質、塩基性物質、還元剤、酸化剤、酵素からなる群より選ばれる1種以上の物質による処理、(b)光からなる群より選ばれる物理化学的刺激による処理、または(c)自己分解性の切断性部分を含む切断性リンカーを用いた場合の放置が挙げられる。このような切断処理の条件は、当該分野における技術常識である(例、G.Leriche,L. Chisholm,A.Wagner,Bioorganic & Medicinal Chemistry.20,571(2012);Feng P. et al.,Jounal of American Chemical Society.132,1500(2010).;Bessodes M.
et al.,Journal of Controlled Release, 99,423(2004).;DeSimone,J.M.,Journal of American Chemical Society.132,17928(2010);Thompson,D.H.,Journal of Controlled Release,91,187(2003);Schoenmarks,R.G.,Journal of Controlled Release,95,291(2004))。
Examples of the cleavage treatment include (a) treatment with one or more substances selected from the group consisting of acidic substances, basic substances, reducing agents, oxidizing agents, and enzymes; (c) leaving when using a cleavable linker comprising an autolytic cleavable moiety. Conditions for such cutting treatment are common technical knowledge in the art (eg, G. Leriche, L. Chisholm, A. Wagner, Bioorganic & Medicinal Chemistry. 20, 571 (2012); Feng P. et al., Journal of American Chemical Society.132, 1500 (2010).;
et al. , Journal of Controlled Release, 99, 423 (2004). DeSimone, J.; M. , Journal of American Chemical Society. 132, 17928 (2010); Thompson, D.; H. , Journal of Controlled Release, 91, 187 (2003); G. , Journal of Controlled Release, 95, 291 (2004)).
生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の生成の確認は、その具体的な原料および生成物の分子量にもよるが、例えば、電気泳動法、クロマトグラフィー(例、ゲル濾過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィー、HPLC)、または質量分析により、好ましくは、質量分析により行うことができる。位置選択性の確認、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数の確認、および精製は、上記「2-6.製造方法」で述べた方法により適宜行うことができる。 Confirmation of the production of soluble proteins or salts thereof with bioorthogonal functional groups, depending on the specific starting material and the molecular weight of the product, can be performed, for example, by electrophoresis, chromatography (e.g., gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, reversed-phase column chromatography, HPLC), or mass spectrometry, preferably mass spectrometry. Confirmation of regioselectivity, confirmation of the number of partial structures other than the soluble protein, and purification can be carried out as appropriate by the method described in "2-6. Production method" above.
本発明はまた、以下を含む、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(C2)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物
またはその塩を可溶性タンパク質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を生成すること;および
(C3)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
The present invention also provides a method for producing a soluble protein or salt thereof having a bioorthogonal functional group, comprising:
(C2) reacting a compound or a salt thereof containing an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group with a soluble protein to produce an affinity substance for the soluble protein and a soluble protein containing the cleavable moiety or a salt thereof; and (C3) cleaving the soluble protein or salt thereof comprising an affinity substance for the soluble protein and the cleavable moiety to produce a soluble protein or salt thereof having a bioorthogonal functional group. matter.
上記(C2)の工程は、上記「2-6.製造方法」で述べた上記(A1)の工程と同様にして行うことができる。上記(C3)の工程は、上記(C1)の工程と同様にして行うことができる。上記(C2)および(C3)の工程は、別々に行うことができる。あるいは、上記(C2)および(C3)の工程は、反応性基と、切断により生成され得る生体直交性官能基との組合せ(非反応性)等の因子に応じて、同時に行うことができる。 The above step (C2) can be performed in the same manner as the above step (A1) described in "2-6. Production method" above. The step (C3) can be performed in the same manner as the step (C1). The above steps (C2) and (C3) can be performed separately. Alternatively, steps (C2) and (C3) above can be performed simultaneously, depending on factors such as the combination of reactive groups and bioorthogonal functional groups that can be generated by cleavage (non-reactive).
5.機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法
5-1.概要
本発明は、式(V)で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕
5. Method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof 5-1. Overview The present invention provides a method for producing a soluble protein having a functional substance represented by formula (V) or a salt thereof.
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ]
5-2.部分構造「F-(L1-B)’」
5-2-1.FおよびR’を連結する部分構造「L1-B」の長さ
式(V)において、FおよびR’を連結する部分構造「L1-B」(「L1-B」中の直鎖部分)の長さ(あるいは、式(V)等の特定の式に限定されない、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩における、機能性物質および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖の原子数、または機能性物質が生体直交性官能基を介して可溶性タンパク質に結合している場合には、生体直交性官能基および特定のアミノ酸残基の側鎖を連結する主鎖の原子数。以下同様)は、上記「1-6-1.AおよびRを連結する部分構造「L-B」中の主鎖の長さ」で述べたような種々の因子に応じて、適宜設計することができる。
5-2. Partial structure "F-(L1-B)'"
5-2-1. Length of partial structure "L1-B" connecting F and R' length (or main linking side chain of a functional substance and a specific amino acid residue in a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance, which is not limited to a specific formula such as formula (V) The number of atoms in the chain, or if the functional agent is attached to a soluble protein via a bioorthogonal functional group, the atoms of the backbone linking the bioorthogonal functional group and the side chain of a particular amino acid residue. hereinafter the same) is appropriately designed according to various factors as described in the above “1-6-1. Length of the main chain in the partial structure “LB” connecting A and R” can do.
FおよびR’を連結する部分構造の長さは、例えば約2.5Å以上、好ましくは約4Å以上、より好ましくは約5Å以上であってもよい。部分構造の長さはまた、例えば約15Å以下、好ましくは約12Å以下、より好ましくは約8Å以下であってもよい。より具体的には、部分構造の長さは、例えば約2.5~15Å、好ましくは約4~12Å、より好ましくは約5~8Åであってもよい。 The length of the partial structure connecting F and R' may be, for example, about 2.5 Å or longer, preferably about 4 Å or longer, more preferably about 5 Å or longer. Substructure lengths may also be, for example, about 15 Å or less, preferably about 12 Å or less, more preferably about 8 Å or less. More specifically, the substructure length may be, for example, about 2.5-15 Å, preferably about 4-12 Å, more preferably about 5-8 Å.
より具体的には、FおよびR’を連結する部分構造の長さは、部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。連結鎖を構成する原子数は、例えば2個(約2.5Å)以上、好ましくは3個(約4Å)以上、より好ましくは4個(約5Å)以上であってもよい。連結鎖を構成する原子数はまた、例えば1
0個(約15Å)以下、好ましくは8個(約12Å)以下、より好ましくは6個(約8Å)以下であってもよい。より具体的には、連結鎖を構成する原子数は、例えば2~10個、好ましくは3~8個、より好ましくは4~6個であってもよい。
More specifically, the length of the partial structure connecting F and R' can also be defined as the number of atoms constituting the connecting chain (excluding hydrogen atoms and substituents) of the partial structure. The number of atoms constituting the linking chain may be, for example, 2 (about 2.5 Å) or more, preferably 3 (about 4 Å) or more, more preferably 4 (about 5 Å) or more. The number of atoms constituting the connecting chain is also, for example, 1
It may be 0 (about 15 Å) or less, preferably 8 (about 12 Å) or less, more preferably 6 (about 8 Å) or less. More specifically, the number of atoms constituting the linking chain may be, for example, 2-10, preferably 3-8, more preferably 4-6.
FおよびR’を連結する部分構造の連結鎖が2価の環構造を含まない鎖状構造である場合、連結鎖の原子数は、連結鎖中の原子数を数えることにより決定することができる。 When the connecting chain of the partial structure connecting F and R' is a chain structure that does not contain a divalent ring structure, the number of atoms in the connecting chain can be determined by counting the number of atoms in the connecting chain. .
一方、FおよびR’を連結する部分構造の連結鎖が2価の環構造を含む構造である場合、連結鎖の原子数と上述した長さとは必ずしも対応せず、連結鎖の原子数により規定され得る長さは、上述した長さよりも短くなる傾向がある。このような場合であっても、原子数により連結鎖の長さを規定する観点から、連結鎖の原子数を便宜的に数えることができる。具体的には、このような場合における連結鎖の原子数は、上述したように、連結鎖において2価の環構造を含まない鎖状構造中の原子数に加えて、2価の環構造中の2つの結合手を連絡する最短経路の原子数を数えることにより決定してもよい。 On the other hand, when the connecting chain of the partial structure connecting F and R' is a structure containing a divalent ring structure, the number of atoms of the connecting chain does not necessarily correspond to the length described above, and is defined by the number of atoms of the connecting chain. The lengths that can be used tend to be shorter than the lengths mentioned above. Even in such a case, the number of atoms in the linking chain can be conveniently counted from the viewpoint that the length of the linking chain is defined by the number of atoms. Specifically, the number of atoms in the linking chain in such a case is, as described above, in addition to the number of atoms in the chain structure that does not contain a divalent ring structure in the linking chain, may be determined by counting the number of atoms in the shortest path connecting two bonds of .
好ましくは、FおよびR’を連結する部分構造の連結鎖は、2価の環構造を含まない鎖状構造であってもよい。FおよびR’を連結する部分構造の連結鎖において2価の環基が含まれないようにL1-Bを適宜設計することができる。 Preferably, the connecting chain of the partial structure connecting F and R' may be a chain structure that does not contain a divalent ring structure. L1-B can be appropriately designed so that the connecting chain of the partial structure connecting F and R' does not contain a divalent cyclic group.
特定の実施形態では、L1-Bで表される部分構造は、好ましくは、ペプチド部分を含まない。この場合、本発明の機能性物質を有する可溶性タンパク質(例、抗体薬物複合体)は、免疫原性を有し得るペプチド部分をリンカーとして含まないという利点がある。 In certain embodiments, the substructure represented by L1-B preferably does not contain peptide moieties. In this case, the soluble protein (eg antibody drug conjugate) with the functional substance of the invention has the advantage that it does not contain a potentially immunogenic peptide moiety as a linker.
5-2-2.部分構造「F-(L1-B)’」の具体的構造
式(V)において、F-(L1-B)’におけるL1およびBは、互いに連関し得る構造である。したがって、上記式(V)において、L1およびBは、「L1-B」で表される部分構造として規定することができる。
5-2-2. Specific Structure of Partial Structure “F-(L1-B)′” In formula (V), L1 and B in F-(L1-B)′ are structures that can be associated with each other. Therefore, in the above formula (V), L1 and B can be defined as a partial structure represented by "L1-B".
また、F-(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分である。反応に供された生体直交性官能基は、式(V)において、存在しない。したがって、式(V)において、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方は、存在しない。機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分と同じである。したがって、本明細書において、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分の例(残基の名称)および具体例(化学構造式)は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分について上述したものと同じである。 Further, the structural unit represented by F-(L1-B)' is generated by reaction between the functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). This is the part to do. A bioorthogonal functional group subjected to reaction is absent in formula (V). Thus, in formula (V) either or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a) are absent. The moiety generated by the reaction between the functional agent and either or both of the bioorthogonal functional groups in (i′) and (a) is the reaction between the functional agent and the bioorthogonal functional group is the same as the part generated by Therefore, herein, examples of moieties generated by reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i′) and (a) (names of residues) and Specific examples (chemical structural formulas) are the same as those described above for moieties generated by reactions between functional substances and bioorthogonal functional groups.
一実施形態では、L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基である場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基である。 In one embodiment, when L1 is (i′) a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group, B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group, or (b) a bioorthogonal It is a divalent group that does not contain a sexual functional group.
好ましい実施形態では、L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基である場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基である。この場合、(i’)における生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と同種であっても異種であってもよい。より単純な構造の採用、および/または単一の機能性物質に対する反応性の向上等の観点では、(i’)における生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と同種であってもよい。一方、2種以上の機能性物質に対する差別化された反応性の確保、およ
び反応における一部の生体直交性官能基の不使用等の観点では、(i’)における生体直交性官能基は、(a)における生体直交性官能基と異種であってもよい。
In a preferred embodiment, when L1 is (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group, B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group. In this case, the bioorthogonal functional group in (i′) may be the same or different from the bioorthogonal functional group in (a). From the viewpoint of adopting a simpler structure and/or improving reactivity with a single functional substance, the bioorthogonal functional group in (i′) is the same as the bioorthogonal functional group in (a). There may be. On the other hand, from the viewpoint of ensuring differentiated reactivity with two or more functional substances and not using some bioorthogonal functional groups in the reaction, the bioorthogonal functional group in (i′) is It may be different from the bioorthogonal functional group in (a).
別の好ましい実施形態では、L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基である場合、Bは、(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であってもよい。この場合、式(V)で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩は、より単純な構造を有することになるので、合成が容易である。 In another preferred embodiment, when L is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group, B may be (b) a divalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. good. In this case, the soluble protein having a functional substance represented by formula (V) or a salt thereof has a simpler structure, and is easy to synthesize.
別の実施形態では、L1が(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である場合、Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基である。 In another embodiment, when L1 is (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group, B is (a) a divalent group that contains a bioorthogonal functional group.
特定の実施形態では、(i’)および(a)における生体直交性官能基が異種である場合、式(V)で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩は、式(V1)または(V2)で表されてもよい。 In certain embodiments, when the bioorthogonal functional groups in (i′) and (a) are different, the soluble protein or salt thereof having a functional agent represented by formula (V) is represented by formula (V1 ) or (V2).
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B' is a divalent group comprising a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ]
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ]
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基である。機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分と同じである。したがって、本明細書において、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分の例(残基の名称)および具体例(化学構造式)は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分について上述したものと同じである。したがって、機能性物質が生体直交性官能基と反応するので、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基(L1’)は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基と表現することもできる(以下同様)。L1’における、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基の定義、例および好ましい例は、B’における、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基のものと同様であってもよい。 L1' is a divalent group that includes a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group that includes a bioorthogonal functional group. The moiety generated by the reaction between the functional substance and (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group is the moiety generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group. are the same. Therefore, in the present specification, examples (residue name) and specific examples (chemical structure Formula ) is the same as described above for moieties generated by reactions between functional agents and bioorthogonal functional groups. Therefore, since the functional agent reacts with the bioorthogonal functional group, a divalent functional agent comprising a moiety produced by reaction between the functional agent and (i′) a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group. The group (L1') can also be expressed as a divalent group including a moiety generated by a reaction between a functional substance and a bioorthogonal functional group (same below). Definitions, examples and preferred examples of the divalent group including the portion generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group in L1' are the functional substance and the bioorthogonal functional group in B' It may be the same as that of a divalent group including a moiety generated by a reaction between and.
別の特定の実施形態では、(i’)および(a)における生体直交性官能基が同種また
は異種である場合、式(V)で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩は、式(V3)で表されてもよい。
In another specific embodiment, when the bioorthogonal functional groups in (i') and (a) are the same or different, the soluble protein having a functional agent represented by formula (V) or a salt thereof is , may be represented by the formula (V3).
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ]
特定の実施形態では、上記式(V1)において、L1-B’(-F)で表される構造単位は、下記式(L1B’(F))で表されてもよい。
F、C1、p、q、X、R1a、R1b、およびZの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
Y’は、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
●(黒丸)は、R’に対する結合を示す。〕
In certain embodiments, the structural unit represented by L1-B'(-F) in formula (V1) above may be represented by formula (L1B'(F)) below.
The definitions, examples and preferred examples of F, C1, p, q, X, R 1a , R 1b and Z are the same as described above,
Y' is a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the formula (B-1),
● (filled circle) indicates a bond to R′. ]
前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基の定義、例および好ましい例は、上述したものと同様である。 The definition, examples and preferred examples of the residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in formula (B-1) are the same as those described above.
したがって、上記式(V1)は、下記式(V1’)として規定することができる。
F、C1、p、q、X、R1a、R1b、Z、R’、およびTの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
Y’は、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基である。〕
Therefore, the above formula (V1) can be defined as the following formula (V1').
The definitions, examples and preferred examples of F, C1, p, q, X, R 1a , R 1b , Z, R′, and T are the same as described above,
Y' is a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the above formula (B-1). ]
特定の実施形態では、上記式(V2)において、F-L1’-Bで表される構造単位は、下記式(FL1’B)で表されてもよい。
F、p、q、X、R1a、R1b、Y、およびZの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分であり、
●(黒丸)は、R’に対する結合を示す。〕
In certain embodiments, the structural unit represented by FL1′-B in formula (V2) above may be represented by formula (FL1′B) below.
The definitions, examples and preferred examples of F, p, q, X, R 1a , R 1b , Y and Z are the same as described above,
C1' is a moiety generated by a reaction between a functional substance and a bioorthogonal functional group;
● (filled circle) indicates a bond to R′. ]
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分である。C1’における、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分の定義、例および好ましい例は、上記「3-3.機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基(B’)」で述べたものと同様である(以下同様)。 C1' is the moiety generated by the reaction between the functional agent and the bioorthogonal functional group. The definition, examples and preferred examples of the portion generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group in C1′ are described in the above “3-3. Between the functional substance and the bioorthogonal functional group divalent group (B′) containing a moiety generated by reaction” (the same shall apply hereinafter).
したがって、上記式(V2)は、下記式(V2’)として規定することができる。
F、p、q、X、R1a、R1b、Y、Z、R’、およびTの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分である。〕
Therefore, the above formula (V2) can be defined as the following formula (V2').
The definitions, examples and preferred examples of F, p, q, X, R 1a , R 1b , Y, Z, R′ and T are the same as described above,
C1' is the moiety generated by the reaction between the functional substance and the bioorthogonal functional group. ]
特定の実施形態では、上記式(V3)において、Fa-L1’-B’(-Fb)で表される構造単位は、下記式(FaL1’B’(Fb))で表されてもよい。
Fa、Fb、p、q、X、R1a、R1b、およびZの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分であり、
Y’は、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
●(黒丸)は、R’に対する結合を示す。〕
In certain embodiments, the structural unit represented by Fa-L1'-B'(-Fb) in formula (V3) above may be represented by the following formula (FaL1'B'(Fb)).
The definitions, examples and preferred examples of Fa, Fb, p, q, X, R 1a , R 1b and Z are the same as described above,
C1' is a moiety generated by a reaction between a functional substance and a bioorthogonal functional group;
Y' is a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the formula (B-1),
● (filled circle) indicates a bond to R′. ]
したがって、上記式(V3)は、下記式(V3’)として規定することができる。
Fa、Fb、p、q、X、R1a、R1b、Z、R’、およびTの定義、例および好ましい例は、上述したものと同じであり、
C1’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分であり、
Y’は、前記式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基である。〕
Therefore, the above formula (V3) can be defined as the following formula (V3').
The definitions, examples and preferred examples of Fa, Fb, p, q, X, R 1a , R 1b , Z, R′ and T are the same as described above,
C1' is a moiety generated by a reaction between a functional substance and a bioorthogonal functional group;
Y' is a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in the above formula (B-1). ]
上記式(L1B’(F))、(FL1’B)、および(FaL1’B’(F2))、ならびに(V1’)、(V2’)および(V3’)において、C=ZにおけるCからC1までの長さは、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端部分)およびR’を連結する部分構造の長さと同様である。これらの式において、C=ZにおけるCからC1までの長さはまた、C=ZにおけるCからC1までの部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数として規定することもできる。このような原子数は、切断により生成したL1末端部分(またはC1末端)およびR’を連結する部分構造(水素原子および置換基を除く)を構成する原子数と同様である。C=ZにおけるCからC1を連結する部分構造の連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、環構造を含んでいなくても含んでいてもよいが、環構造を含んでいないことが好ましい。当該連結鎖(水素原子および置換基を除く)は、好ましくは、ペプチド部分を含まないものであってもよい。 In the above formulas (L1B'(F)), (FL1'B), and (FaL1'B'(F2)), and (V1'), (V2') and (V3'), from C at C=Z The length up to C1 is the same as the length of the partial structure connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal portion) generated by cleavage and R'. In these formulas, the length from C to C in C=Z is also defined as the number of atoms constituting the connecting chain (excluding hydrogen atoms and substituents) of the substructure from C to C in C=Z can also The number of such atoms is the same as the number of atoms constituting the partial structure (excluding hydrogen atoms and substituents) connecting the L1 terminal portion (or C1 terminal) generated by cleavage and R'. The connecting chain (excluding hydrogen atoms and substituents) of the partial structure connecting C to C1 in C=Z may or may not contain a ring structure, but may not contain a ring structure. preferable. The linking chain (excluding hydrogen atoms and substituents) may preferably be free of peptide moieties.
5-3.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の結合部位(位置選択性)
可溶性タンパク質以外の部分構造(例、F-(L1-B)’-R’)は、可溶性タンパク質(T)における上述したような標的領域に位置選択的に結合させることができる。具体的には、Tが、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む場合、可溶性タンパク質以外の部分構造は、当該標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合させることができる。標的領域および位置選択性の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。
5-3. Binding sites of partial structures other than soluble proteins possessed by soluble proteins (regioselectivity)
A partial structure other than a soluble protein (eg, F-(L1-B)'-R') can be regioselectively bound to the target region as described above in the soluble protein (T). Specifically, T contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region When it contains 5 or more amino acid residues, the partial structure other than the soluble protein can bind to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more. . Definitions, examples and preferred examples of target regions and regioselectivity are provided above.
5-4.可溶性タンパク質が有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数
可溶性タンパク質(T)が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造(例、F-(L1-B)’-R’)の個数は、変動することができる。例えば、Tが複数の単量体タンパク質を含む多量体タンパク質である場合、Tは、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、T以外の部分構造を有することができる。その結果、Tは、T以外の部分構造を複数個有することができる。したがって、式(V)、(V1)、(V2)、(V3)、(V1’)、(V2’)、または(V3’)で表される構造は、Tが、T以外の部分構造を1個または複数個有していてもよいことを示す。Tが有する、T以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質の種類、および可溶性タンパク質とそれに対して導入される構造単位との反応比率等の条件を適宜設定することで調節することができる。このような個数は、可溶性タンパク質の種類によっても異なるが、例えば1~8、好ましくは1~4、より好ましくは1または2であってもよい。
5-4. Number of partial structures other than soluble protein possessed by soluble protein The number of partial structures other than soluble protein possessed by soluble protein (T) (e.g., F-(L1-B)'-R') may vary. can be done. For example, if T is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins, T can have substructures other than T in the corresponding plurality of target regions in the plurality of monomeric proteins. . As a result, T can have multiple partial structures other than T. Therefore, structures represented by formulas (V), (V1), (V2), (V3), (V1′), (V2′), or (V3′) are those in which T is a partial structure other than T Indicates that one or more may be provided. The number of partial structures other than T that T has can be adjusted by appropriately setting conditions such as the type of soluble protein and the reaction ratio between the soluble protein and structural units introduced therein. Such number may vary depending on the type of soluble protein, but may be, for example, 1 to 8, preferably 1 to 4, more preferably 1 or 2.
特定の実施形態では、可溶性タンパク質が保有する、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数は、可溶性タンパク質が、複数個の単量体タンパク質から構成される多量体タンパク質である場合、複数個であってもよい。本発明によれば、複数個の単量体タンパク質の同一標的領域に対して可溶性タンパク質以外の部分構造を複数個導入することができる。 In certain embodiments, if the soluble protein is a multimeric protein composed of a plurality of monomeric proteins, the number of partial structures other than the soluble protein possessed by the soluble protein may be more than one. good. According to the present invention, a plurality of partial structures other than soluble proteins can be introduced into the same target region of a plurality of monomeric proteins.
好ましい実施形態では、可溶性タンパク質は、複数個の重鎖を含む抗体であってもよい。抗体の定義、例、および好ましい例は、上述したとおりである。本発明では、抗体が保有する、抗体以外の部分構造の個数は、IgG、IgE、およびIgDについては1個または2個(好ましくは2個)であり、IgAについては1~4個(好ましくは4個)であり、IgMについては1~8個(好ましくは8個)であってもよい。 In preferred embodiments, the soluble protein may be an antibody comprising multiple heavy chains. Definitions, examples and preferred examples of antibodies are given above. In the present invention, the number of partial structures other than antibodies possessed by antibodies is 1 or 2 (preferably 2) for IgG, IgE, and IgD, and 1 to 4 (preferably 4), and for IgM may be 1 to 8 (preferably 8).
5-5.製造方法
本発明は、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。
本製造方法は、(D)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を原料として使用する方法(図2の反応(3)を参照)、および(E)生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を原料として使用する方法(図2の反応(5)を参照)に分類することができる。
5-5. Production Method The present invention provides a method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
(D) a method of using as raw materials a complex or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein (see reaction (3) in FIG. 2); and (E) a method using a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof as a starting material (see reaction (5) in FIG. 2).
(D)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を原料として使用する方法は、以下を含む:
(D1)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
(D) A method of using a conjugate having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein or a salt thereof as a raw material includes:
(D1) cleaving the cleavable portion of a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein or a salt thereof to produce a soluble protein having a functional substance or a salt thereof .
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体は、式(III)、好ましくは式(III’)、より好ましくは式(III’’)で表される。機能性物質を有する可溶性タンパク質は、式(V)、好ましくは式(V1)、(V2)、または(V3)、より好ましくは式(V1’)、(V2’)、または(V3’)で表される。 A conjugate comprising an affinity agent for a soluble protein, a cleaving moiety, a functional agent and a soluble protein is represented by formula (III), preferably formula (III'), more preferably formula (III''). A soluble protein having a functional substance is of formula (V), preferably of formula (V1), (V2) or (V3), more preferably of formula (V1'), (V2') or (V3') expressed.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩は、上述したような切断処理により切断することができる切断性部分を有するため、切断することができる。このような切断反応は、上記「4-6.製造方法」で述べたような様式において行うことができる。 A complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein or a salt thereof can be cleaved because it has a cleavable portion that can be cleaved by the above-described cleavage treatment. . Such a cleavage reaction can be carried out in the manner described in "4-6. Production method" above.
機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の生成の確認は、その具体的な原料および生成物の分子量にもよるが、例えば、電気泳動法、クロマトグラフィー(例、ゲル濾過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、逆相カラムクロマトグラフィー、HPLC)、または質量分析により、好ましくは、質量分析により行うことができる。位置選択性の確認、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数の確認、および精製は、上記「2-6.製造方法」で述べた方法により適宜行うことができる。 Confirmation of the production of a soluble protein having a functional substance or a salt thereof depends on the specific starting material and the molecular weight of the product, but for example, electrophoresis, chromatography (e.g., gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, chromatography, reversed-phase column chromatography, HPLC), or mass spectrometry, preferably mass spectrometry. Confirmation of regioselectivity, confirmation of the number of partial structures other than the soluble protein, and purification can be carried out as appropriate by the method described in "2-6. Production method" above.
本発明はまた、以下を含む、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(D2)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること;および
(D3)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
The present invention also provides a method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof, comprising:
(D2) A conjugate having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, or a salt thereof containing a soluble protein affinity substance and a cleavable portion, or a salt thereof, with a functional substance to obtain a soluble protein-affinity substance, a cleavable portion, a functional substance, and a soluble protein and (D3) cleaving the cleavable portion of a complex having an affinity for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein or a salt thereof to yield a functional agent. to produce a soluble protein or a salt thereof having
上記(D2)の工程は、上記「3-7.製造方法」で述べた上記(B1)の工程と同様にして行うことができる。上記(D3)の工程は、上記(D1)の工程と同様にして行うことができる。上記(D2)および(D3)の工程は、別々に行うことができる。あるいは、上記(D2)および(D3)の工程は、切断性部分、機能性物質および生体直交性官能基との組合せ等の因子に応じて、同時に行うことができる。 The above step (D2) can be performed in the same manner as the above step (B1) described in "3-7. Manufacturing method". The step (D3) can be performed in the same manner as the step (D1). The above steps (D2) and (D3) can be performed separately. Alternatively, steps (D2) and (D3) above can be performed simultaneously, depending on factors such as combination with cleavable moieties, functional agents and bioorthogonal functional groups.
本発明はさらに、以下を含む、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(D4)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩を可溶性タンパク質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を生成すること;
(D5)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること;および
(D6)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
The present invention further provides a method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof, comprising:
(D4) reacting a compound or a salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group with the soluble protein to produce an affinity substance for the soluble protein and a soluble protein comprising the cleavable moiety or a salt thereof; to generate;
(D5) A conjugate having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, or a salt thereof containing a soluble protein affinity substance, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein by reacting with a functional substance and (D6) cleaving the cleavable portion of a complex having an affinity for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein or a salt thereof to yield a functional agent. to produce a soluble protein or a salt thereof having
上記(D4)の工程は、上記「2-6.製造方法」で述べた上記(A1)の工程と同様にして行うことができる。上記(D5)および(D6)の工程は、上記(D2)および(D3)の工程と同様にして行うことができる。上記(D5)の工程は、上記「3-7.製造方法」で述べた上記(B1)の工程と同様にして行うことができる。上記(D6)の工程は、上記(D1)の工程と同様にして行うことができる。上記(D4)~(D6)の工程は、別々に行うことができる。あるいは、上記(D4)~(D6)の工程の少なくとも一部は、反応性基、切断性部分、機能性物質および生体直交性官能基との組合せ等の因子に応じて、同時に行うことができる。 The above step (D4) can be performed in the same manner as the above step (A1) described in "2-6. Production method" above. The steps (D5) and (D6) above can be performed in the same manner as the steps (D2) and (D3) above. The above step (D5) can be performed in the same manner as the above step (B1) described in the above "3-7. Manufacturing method". The step (D6) can be performed in the same manner as the step (D1). The above steps (D4) to (D6) can be performed separately. Alternatively, at least some of the steps (D4) to (D6) above can be performed simultaneously, depending on factors such as the combination with reactive groups, cleavable moieties, functional agents and bioorthogonal functional groups. .
(E)生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を原料として使用する方法は、以下を含む:
(E1)生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
(E) A method using a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof as a raw material includes:
(E1) Reacting a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with a functional substance to produce a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質は、式(IV)、好ましくは式(IV’)で表される。機能性物質を有する可溶性タンパク質は、式(V)、好ましくは式(V1)、(V2)、または(V3)、より好ましくは式(V1’)、(V2’)、または(V3’)で表される。 Soluble proteins with bioorthogonal functional groups are represented by formula (IV), preferably formula (IV'). A soluble protein having a functional substance is of formula (V), preferably of formula (V1), (V2) or (V3), more preferably of formula (V1'), (V2') or (V3') expressed.
生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質はまたはその塩は、生体直交性官能基を有するため、機能性物質と反応することができる。このような反応は、上記「3-7.製造方法」で述べたような様式において行うことができる。 A soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof can react with a functional agent because it has a bioorthogonal functional group. Such a reaction can be carried out in the manner described in "3-7. Production method" above.
機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の生成の確認は、上述したような方法により行うことができる。位置選択性の確認、可溶性タンパク質以外の部分構造の個数の確認、および精製は、上記「2-6.製造方法」で述べた方法により適宜行うことができる。 Confirmation of production of a soluble protein having a functional substance or a salt thereof can be performed by the methods described above. Confirmation of regioselectivity, confirmation of the number of partial structures other than the soluble protein, and purification can be carried out as appropriate by the method described in "2-6. Production method" above.
本発明はまた、以下を含む、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(E2)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること;および
(E3)生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
The present invention also provides a method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof, comprising:
(E2) Cleavage of a soluble protein or salt thereof comprising an affinity agent for a soluble protein and a cleavable moiety to produce a soluble protein or salt thereof having a bioorthogonal functional group; and (E3 ) reacting a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with a functional agent to produce a soluble protein having a functional agent or a salt thereof;
上記(E2)の工程は、上記「4-6.製造方法」で述べた上記(C1)の工程と同様にして行うことができる。上記(E3)の工程は、上記(E1)の工程と同様にして行うことができる。上記(E2)および(E3)の工程は、別々に行うことができる。あるいは、上記(E2)および(E3)の工程は、切断性部分、機能性物質および生体直交性官能基との組合せ等の因子に応じて、同時に行うことができる。 The above step (E2) can be performed in the same manner as the above step (C1) described in "4-6. Production method" above. The step (E3) can be performed in the same manner as the step (E1). The above steps (E2) and (E3) can be performed separately. Alternatively, steps (E2) and (E3) above can be performed simultaneously, depending on factors such as combination with cleavable moieties, functional agents and bioorthogonal functional groups.
本発明はさらに、以下を含む、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する:
(E4)可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を含む化合物またはその塩を可溶性タンパク質と反応させて、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩を生成すること;
(E5)可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を含む可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること;および
(E6)生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること。
The present invention further provides a method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof, comprising:
(E4) reacting a compound or a salt thereof comprising an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group with a soluble protein to produce an affinity substance for a soluble protein and a soluble protein comprising a cleavable moiety or a salt thereof; to generate;
(E5) Cleavage of a soluble protein or salt thereof comprising an affinity agent for a soluble protein and a cleavable moiety to produce a soluble protein or salt thereof having a bioorthogonal functional group; and (E6 ) reacting a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with a functional agent to produce a soluble protein having a functional agent or a salt thereof;
上記(E4)の工程は、上記「2-6.製造方法」で述べた上記(A1)の工程と同様にして行うことができる。上記(E5)および(E6)の工程は、上記(E2)および(E3)の工程と同様にして行うことができる。上記(E4)~(E6)の工程は、別々に行うことができる。あるいは、上記(E4)~(E6)の工程の少なくとも一部は、反応性基、切断性部分、機能性物質および生体直交性官能基との組合せ等の因子に応じて、同時に行うことができる。 The above step (E4) can be performed in the same manner as the above step (A1) described in the above “2-6. Manufacturing method”. The steps (E5) and (E6) above can be performed in the same manner as the steps (E2) and (E3) above. The above steps (E4) to (E6) can be performed separately. Alternatively, at least some of the steps (E4)-(E6) above can be performed simultaneously, depending on factors such as the combination with reactive groups, cleavable moieties, functional agents and bioorthogonal functional groups. .
6.生体直交性官能基を位置特異的に有する特定の可溶性タンパク質またはその塩、およびその製造方法
本発明はまた、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を提供する。生体直交性官能基を位置選択的に有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ生体直交性官能基が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩である。
6. Specific Soluble Proteins Regiospecifically Having Bioorthogonal Functional Groups or Salts Thereof, and Production Methods Thereof The present invention also provides soluble proteins or salts thereof regioselectively having bioorthogonal functional groups. The soluble protein or a salt thereof of the present invention regioselectively having a bioorthogonal functional group has one or more specific amino acid residues in the target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues. and 5 or more of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region, and the bioorthogonal functional group is included in the target region via a linker that does not contain a peptide portion. It is a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group, which is bound to one or more specific amino acid residues with regioselectivity of 30% or more.
特定の実施形態では、生体直交性官能基を位置選択的に有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であってもよい。
In certain embodiments, a soluble protein of the invention or a salt thereof regioselectively bearing a bioorthogonal functional group has the following formula (IV):
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
本発明はまた、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。 The present invention also provides a method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group.
従来の方法では、上記のような、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパ
ク質またはその塩を製造することはできなかったが、本発明者らが開発した方法によれば、このような生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を製造することができる。生体直交性官能基、位置選択性、可溶性タンパク質、標的領域、リンカー等の要件、ならびにL1における(i’)および(ii’)、Bにおける(a)および(b)、R’、およびT、ならびにそれらの要件の一部の技術要素の定義、例および好ましい例は、上述したもの同様である。製造方法の工程の詳細もまた、位置選択性およびこれに関する技術要素(例、標的領域)を必須の要件としていることを除き、「4.生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法」で述べたものと同様である。
With conventional methods, it was not possible to regioselectively produce a soluble protein or a salt thereof having a bioorthogonal functional group as described above. Soluble proteins or salts thereof regioselectively possessing bioorthogonal functional groups can be produced. requirements such as bioorthogonal functional groups, regioselectivity, soluble proteins, targeting regions, linkers, and (i′) and (ii′) in L1, (a) and (b) in B, R′, and T, Definitions, examples and preferred examples of the technical elements and some of those requirements are the same as those described above. The details of the steps of the production method are also described in "4. Production of a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof, except that regioselectivity and technical elements related thereto (e.g., target region) are essential requirements. method”.
7.機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩、およびその製造方法
本発明はまた、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を提供する。機能性物質を位置選択的に有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ機能性物質が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩である。
7. Soluble Protein Regioselectively Having a Functional Substance or its Salt, and Production Method Thereof The present invention also provides a soluble protein having a functional substance regioselectively or a salt thereof. The soluble protein or salt thereof of the present invention having a functional substance regioselectively contains one or more specific amino acid residues in the target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, At least one of the functional substances contained in the target region via a linker that does not contain a peptide portion, and contains 5 or more of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region. is a soluble protein or a salt thereof that regioselectively has a functional substance that binds to a specific amino acid residue of , with a regioselectivity of 30% or more.
特定の実施形態では、機能性物質を位置選択的に有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつ
F-(L1-B)’-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩であってもよい。
In certain embodiments, the soluble protein or salt thereof of the present invention regioselectively possessing a functional agent has the following formula (V):
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the
本発明はまた、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法を提供する。 The present invention also provides a method for producing a soluble protein having a functional substance regioselectively or a salt thereof.
従来の方法では、上記のような、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を製造することはできなかったが、本発明者らが開発した方法によれば、このような機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を製造することができる。機能性物質、位置選択性、可溶性タンパク質、標的領域、リンカー等の要件、ならびにL1における(i’)および(ii’)、Bにおける(a)および(b)、(L1
-B)’、F,R’、およびT、ならびにそれらの要件の一部の技術要素の定義、例および好ましい例は、上述したものと同様である。製造方法の工程の詳細もまた、位置選択性およびこれに関する技術要素(例、標的領域)を必須の要件としていることを除き、「5.機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩の製造方法」で述べたものと同様である。
With conventional methods, it was not possible to produce soluble proteins or salts thereof regioselectively having functional substances as described above. A soluble protein or a salt thereof regioselectively possessing a soluble substance can be produced. Requirements for functional substances, regioselectivity, soluble proteins, target regions, linkers, etc., and (i′) and (ii′) in L1, (a) and (b) in B, (L1
-B) ', F, R', and T, and definitions, examples and preferred examples of some of their requirements are the same as those described above. The details of the steps of the production method are also described in "5. Method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof", except that regioselectivity and related technical elements (e.g., target region) are essential requirements. is the same as described in .
8.塩
本発明において、塩としては、例えば、無機酸との塩、有機酸との塩、無機塩基との塩、有機塩基との塩、およびアミノ酸との塩が挙げられる。無機酸との塩としては、例えば、塩化水素、臭化水素、リン酸、硫酸、硝酸との塩が挙げられる。有機酸との塩としては、例えば、ギ酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、乳酸、酒石酸、フマル酸、シュウ酸、マレイン酸、クエン酸、コハク酸、リンゴ酸、ベンゼンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸との塩が挙げられる。無機塩基との塩としては、例えば、アルカリ金属(例、ナトリウム、カリウム)、アルカリ土類金属(例、カルシウム、マグネシウム)、および亜鉛、アルミニウム等の他の金属、ならびにアンモニウムとの塩が挙げられる。有機塩基との塩としては、例えば、トリメチルアミン、トリエチルアミン、プロピレンジアミン、エチレンジアミン、ピリジン、エタノールアミン、モノアルキルエタノールアミン、ジアルキルエタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミンとの塩が挙げられる。アミノ酸との塩としては、例えば、塩基性アミノ酸(例、アルギニン、ヒスチジン、リジン、オルニチン)、および酸性アミノ酸(例、アスパラギン酸、グルタミン酸)との塩が挙げられる。塩は、好ましくは、無機酸(例、塩化水素)との塩、または有機酸(例、トリフルオロ酢酸)との塩である。
8. Salts In the present invention, salts include, for example, salts with inorganic acids, salts with organic acids, salts with inorganic bases, salts with organic bases, and salts with amino acids. Salts with inorganic acids include, for example, salts with hydrogen chloride, hydrogen bromide, phosphoric acid, sulfuric acid, and nitric acid. Examples of salts with organic acids include formic acid, acetic acid, trifluoroacetic acid, lactic acid, tartaric acid, fumaric acid, oxalic acid, maleic acid, citric acid, succinic acid, malic acid, benzenesulfonic acid, and p-toluenesulfonic acid. salt of Salts with inorganic bases include, for example, salts with alkali metals (eg, sodium, potassium), alkaline earth metals (eg, calcium, magnesium), and other metals such as zinc, aluminum, and ammonium. . Salts with organic bases include, for example, salts with trimethylamine, triethylamine, propylenediamine, ethylenediamine, pyridine, ethanolamine, monoalkylethanolamine, dialkylethanolamine, diethanolamine, and triethanolamine. Examples of salts with amino acids include salts with basic amino acids (eg, arginine, histidine, lysine, ornithine) and acidic amino acids (eg, aspartic acid, glutamic acid). The salt is preferably a salt with an inorganic acid (eg hydrogen chloride) or an organic acid (eg trifluoroacetic acid).
9.用途
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する本発明の化合物またはその塩は、例えば、可溶性タンパク質の位置選択的な修飾に有用である。したがって、本発明は、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を含む、可溶性タンパク質の位置選択的修飾試薬を提供する。
9. Uses Compounds of the present invention or salts thereof having affinity for soluble proteins, cleavable moieties and reactive groups are useful, for example, for regioselective modification of soluble proteins. Accordingly, the present invention provides regioselective modification reagents for soluble proteins, including compounds having an affinity for soluble proteins, cleavable moieties and reactive groups or salts thereof.
本発明の位置選択的修飾試薬は、他の成分をさらに含む組成物の形態で提供されてもよい。このような他の成分としては、例えば、溶液、安定化剤(例、酸化防止剤、保存剤)が挙げられる。溶液としては、水溶液が好ましい。水溶液としては、例えば、水(例、蒸留水、滅菌蒸留水、精製水、生理食塩水)、緩衝液(例、リン酸水溶液、Tris-塩酸緩衝液、炭酸-重炭酸緩衝液、ホウ酸水溶液、グリシン-水酸化ナトリウム緩衝液、クエン酸緩衝液)が挙げられるが、緩衝液が好ましい。溶液のpHは、例えば5.0~9.0、好ましくは5.5~8.5である。本発明の位置選択的修飾試薬は、液状または粉末状(例、凍結乾燥粉末)において提供することができる。 The regioselective modification reagent of the present invention may be provided in the form of a composition that further contains other components. Such other ingredients include, for example, solutions, stabilizers (eg, antioxidants, preservatives). As the solution, an aqueous solution is preferred. Aqueous solutions include, for example, water (eg, distilled water, sterilized distilled water, purified water, physiological saline), buffers (eg, phosphoric acid aqueous solution, Tris-hydrochloric acid buffer, carbonate-bicarbonate buffer, boric acid aqueous solution). , glycine-sodium hydroxide buffer, citrate buffer), but buffers are preferred. The pH of the solution is, for example, 5.0-9.0, preferably 5.5-8.5. The regioselective modification reagents of the invention can be provided in liquid or powder form (eg, lyophilized powder).
可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を(位置選択的に)有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を(位置選択的に)有する本発明の複合体またはその塩、ならびに生体直交性官能基を(位置選択的に)有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、例えば、機能性物質を(位置選択的に)有する可溶性タンパク質またはその塩の調製のための中間体として有用である。 The affinity substance for soluble protein, and the soluble protein or salt thereof of the present invention having (regioselectively) a cleavable moiety, the affinity substance for soluble protein, the cleavable moiety, the functional substance and the soluble protein (regioselectively The conjugate of the present invention or a salt thereof having (regioselectively) a soluble protein of the present invention having a bioorthogonal functional group (regioselectively) or a salt thereof having, for example, a soluble It is useful as an intermediate for the preparation of proteins or salts thereof.
機能性物質を(位置選択的に)有する本発明の可溶性タンパク質またはその塩は、例えば、医薬、または試薬(例、診断薬、研究用試薬)として有用である。特に、可溶性タンパク質が抗体である場合、機能性物質を(位置選択的に)有する本発明の抗体またはその塩は、これらの用途に適している。 The soluble protein or salt thereof of the present invention having a functional substance (regioselectively) is useful, for example, as a drug or reagent (eg, diagnostic agent, research reagent). In particular, when the soluble protein is an antibody, the antibody or salt thereof of the present invention having a functional substance (regioselectively) is suitable for these uses.
特に、機能性物質を(位置選択的に)有する本発明の抗体またはその塩は、医薬として有用である。抗体薬物複合体(ADC)の薬物の結合数および結合位置を変化させると、体内動態や薬物の放出速度、効果が変化することが上記のとおり報告されている。これらのことから次世代型ADCではコンジュゲーションする薬物の個数と位置を制御することが求められている。個数および位置が一定であると、期待通りのefficacy、コンジュゲーション薬剤のバリエーション、ロット差いわゆるレギュレーションの問題が解決すると考えられている。機能性物質を有する本発明の抗体またはその塩は、このようなレギュレーションの問題を解決することができる。したがって、機能性物質を有する本発明の抗体またはその塩は、医薬組成物の形態において提供されてもよい。このような医薬組成物は、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩に加えて、医薬上許容され得る担体を含んでいてもよい。医薬上許容され得る担体としては、例えば、ショ糖、デンプン、マンニット、ソルビット、乳糖、グルコース、セルロース、タルク、リン酸カルシウム、炭酸カルシウム等の賦形剤、セルロース、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、ポリプロピルピロリドン、ゼラチン、アラビアゴム、ポリエチレングリコール、ショ糖、デンプン等の結合剤、デンプン、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルスターチ、炭酸水素ナトリウム、リン酸カルシウム、クエン酸カルシウム等の崩壊剤、ステアリン酸マグネシウム、エアロジル、タルク、ラウリル硫酸ナトリウム等の滑剤、クエン酸、メントール、グリシルリシン・アンモニウム塩、グリシン、オレンジ粉等の芳香剤、安息香酸ナトリウム、亜硫酸水素ナトリウム、メチルパラベン、プロピルパラベン等の保存剤、クエン酸、クエン酸ナトリウム、酢酸等の安定剤、メチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ステアリン酸アルミニウム等の懸濁剤、界面活性剤等の分散剤、水、生理食塩水、オレンジジュース等の希釈剤、カカオ脂、ポリエチレングリコール、白灯油等のベースワックスなどが挙げられるが、それらに限定されるものではない。機能性物質を有する本発明の抗体またはその塩はまた、安定性を実現する任意の修飾(例、PEG化)を有していてもよい。 In particular, the antibody or salt thereof of the present invention having a functional substance (regioselectively) is useful as a pharmaceutical. As described above, it has been reported that changes in the binding number and binding position of the drug in the antibody-drug conjugate (ADC) change the pharmacokinetics, drug release rate, and effect. For these reasons, next-generation ADCs are required to control the number and positions of drugs to be conjugated. It is believed that a constant number and position solves the problem of expected efficiency, variations in conjugation drugs, lot differences, so-called regulation. Antibodies or salts thereof of the present invention having functional substances can solve such regulation problems. Accordingly, the antibody or salt thereof of the present invention having a functional substance may be provided in the form of a pharmaceutical composition. Such pharmaceutical compositions may contain a pharmaceutically acceptable carrier in addition to the soluble protein having a functional substance or a salt thereof. Pharmaceutically acceptable carriers include, for example, excipients such as sucrose, starch, mannitol, sorbitol, lactose, glucose, cellulose, talc, calcium phosphate, calcium carbonate, cellulose, methylcellulose, hydroxypropylcellulose, polypropylpyrrolidone. , gelatin, gum arabic, polyethylene glycol, sucrose, starch and other binders, starch, carboxymethylcellulose, hydroxypropyl starch, sodium hydrogen carbonate, calcium phosphate, calcium citrate and other disintegrants, magnesium stearate, aerosil, talc, lauryl Lubricants such as sodium sulfate, citric acid, menthol, glycyrrhizin ammonium salt, glycine, fragrances such as orange powder, preservatives such as sodium benzoate, sodium hydrogen sulfite, methylparaben, propylparaben, citric acid, sodium citrate, acetic acid Stabilizers such as methylcellulose, polyvinylpyrrolidone, aluminum stearate, suspending agents such as surfactants, dispersing agents such as surfactants, diluents such as water, physiological saline, orange juice, cacao butter, polyethylene glycol, white kerosene, etc. Examples include, but are not limited to, base waxes. Antibodies or salts thereof of the present invention having functional agents may also have optional modifications (eg, PEGylation) that provide stability.
経口投与に好適な製剤は、水、生理食塩水、オレンジジュースのような希釈液に有効量のリガンドを溶解させた液剤、有効量のリガンドを固体や顆粒として含んでいるカプセル剤、サッシェ剤または錠剤、適当な分散媒中に有効量の有効成分を懸濁させた懸濁液剤、有効量の有効成分を溶解させた溶液を適当な分散媒中に分散させ乳化させた乳剤等である。 Formulations suitable for oral administration include liquid formulations in which an effective amount of the ligand is dissolved in a diluent such as water, saline or orange juice, capsules, sachets or tablets containing an effective amount of the ligand as a solid or granules. Examples include tablets, suspensions in which an effective amount of the active ingredient is suspended in a suitable dispersion medium, and emulsions in which a solution in which an effective amount of the active ingredient is dissolved is dispersed and emulsified in a suitable dispersion medium.
医薬組成物は、非経口的な投与(例、静脈内注射、皮下注射、筋肉注射、局所注入、腹腔内投与)に好適である。このような非経口的な投与に好適な医薬組成物としては、水性および非水性の等張な無菌の注射液剤があり、これには抗酸化剤、緩衝液、制菌剤、等張化剤等が含まれていてもよい。また、水性および非水性の無菌の懸濁液剤が挙げられ、これには懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定化剤、防腐剤等が含まれていてもよい。 The pharmaceutical composition is suitable for parenteral administration (eg, intravenous injection, subcutaneous injection, intramuscular injection, local injection, intraperitoneal administration). Pharmaceutical compositions suitable for such parenteral administration include aqueous and non-aqueous isotonic sterile injection solutions containing antioxidants, buffers, bacteriostatic agents, tonicity agents. etc. may be included. Also included are aqueous and non-aqueous sterile suspensions, which may contain suspending agents, solubilizers, thickeners, stabilizers, preservatives and the like.
医薬組成物の投与量は、有効成分の種類・活性、病気の重篤度、投与対象となる動物種、投与対象の薬物受容性、体重、年齢等によって異なるが、適宜設定することができる。 The dose of the pharmaceutical composition varies depending on the type and activity of the active ingredient, severity of disease, animal species to be administered, drug acceptability, body weight, age, etc. of the subject, but can be set as appropriate.
次に実施例を示して本発明をさらに詳細に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。 EXAMPLES Next, the present invention will be described in more detail with reference to examples, but the present invention is not limited to the following examples.
[実施例1:IgG1 Fc結合性ペプチドの合成]
(1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
(1-1)可溶性タンパク質に対する親和性物質(Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド)の合成
可溶性タンパク質に対する親和性物質であるAc-RGNCAYHKGQLVWCTY
H-NH2(配列番号39)のペプチドをFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はBiotage社製Syro waveを使用した。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用した。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin,HL、アルギニン(R)、システイン(C)、ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈殿を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.1%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.1%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行った。
[Example 1: Synthesis of IgG1 Fc-binding peptide]
(1) Synthesis of IgG1 Fc-binding peptide (1-1) Synthesis of substance with affinity for soluble protein (peptide of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39)) Ac-RGNCAYHKGQLVWCTY which is an affinity substance for soluble protein
A peptide of H—NH 2 (SEQ ID NO:39) was synthesized by Fmoc solid-phase synthesis. Syrowave manufactured by Biotage was used as a peptide synthesizer. All the reagents used were those manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin, HL, arginine (R), cysteine (C), and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.1% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. The fraction containing the product was collected, concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, and then lyophilized.
MS (ESI) m/z:z=3 693[M+3H]3+,z=4 520[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 693 [M+3H] <3+> , z=4 520 [M+4H] <4+>
(1-2)Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチドにおける4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(1-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し100mMとした後、2M NH3-MeOHを2等量、過酸化水素水を1等量加え室温で12時間攪拌を行った。反応溶液に0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し逆相分取クロマトグラフィーで溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行った。5mg~100mgのスケールでいずれも収率は90%以上であった。 After dissolving the peptide synthesized in (1-1) in DMSO to 100 mM, 2 equivalents of 2M NH 3 -MeOH and 1 equivalent of aqueous hydrogen peroxide were added and stirred at room temperature for 12 hours. A 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, elution was performed by reverse phase preparative chromatography, and each fraction was confirmed by LC-MS. The fraction containing the product was collected, concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, and then lyophilized. Yields were above 90% on a scale of 5 mg to 100 mg.
MS(ESI) m/z:z=3 692[M+3H]3+,z=4 519[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z = 3 692 [M+3H] 3+ , z = 4 519 [M+4H] 4+
[実施例2:切断性リンカーの合成とIgG1 Fc結合性ペプチドとの連結]
(2)切断性リンカーの合成とペプチドとの連結
(2-1)チオエステルリンカーの合成とペプチドとの連結
(2-1-1)チオエステルリンカーの合成
(2) Synthesis of cleavable linker and ligation with peptide (2-1) Synthesis of thioester linker and ligation with peptide (2-1-1) Synthesis of thioester linker
コハク酸無水物(0.2g,2mmol)とN,N’-ジメチルアミノピリジン(12.2mg,0.1mmol)をアセトニトリル:ピリジン=9:1溶媒に溶解させ、アル
ゴンガスで置換した。tert-ブチル-3-スルファニルプロパノエート(0.3g,
2.2mmol)を加え、室温で16時間攪拌した。反応液を酢酸エチルで希釈し、0.1M塩酸水溶液、水、食塩水で洗浄後、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより4-(3-tert-ブトキシ-3-オキソ-プロピル)スルファニル-4-オキソ-ブタン酸(0.47g,1.8mmol)を得た。
Succinic anhydride (0.2 g, 2 mmol) and N,N'-dimethylaminopyridine (12.2 mg, 0.1 mmol) were dissolved in a solvent of acetonitrile:pyridine=9:1 and purged with argon gas. tert-butyl-3-sulfanylpropanoate (0.3 g,
2.2 mmol) was added and stirred at room temperature for 16 hours. The reaction solution was diluted with ethyl acetate, washed with 0.1M hydrochloric acid aqueous solution, water and brine, added with anhydrous magnesium sulfate, and allowed to stand for 5 minutes. Magnesium sulfate was removed by filtration and concentration under reduced pressure gave 4-(3-tert-butoxy-3-oxo-propyl)sulfanyl-4-oxo-butanoic acid (0.47 g, 1.8 mmol). .
1H NMR(400MHz,Chloroform-d) δ 3.12(t,J=7.0Hz,2H),2.91(t,J=6.9Hz,2H),2.72(t,J=6.9Hz,2H),2.55(t,J=7.0Hz,2H),1.46(s,9H).
MS(ESI) m/z:263[M+H]+
1 H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 3.12 (t, J=7.0 Hz, 2H), 2.91 (t, J=6.9 Hz, 2H), 2.72 (t, J=6 .9 Hz, 2 H), 2.55 (t, J=7.0 Hz, 2 H), 1.46 (s, 9 H).
MS (ESI) m/z: 263 [M+H] +
4-(3-tert-ブトキシ-3-オキソ-プロピル)スルファニル-4-オキソ-ブタン酸(0.47g,1.8mmol)に酢酸エチル5mLを加え溶解した。その後、N,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(0.39g,1.9mmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(0.22g,1.9mmol)を加え1時間攪拌した。生じた白色結晶をろ過し母液を減圧下濃縮することで(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)
4-(3-tert-ブトキシ-3-オキソ-プロピル)スルファニル-4-オキソ-ブタノエート(0.61g,1.7mmol)を得た。
5 mL of ethyl acetate was added to dissolve 4-(3-tert-butoxy-3-oxo-propyl)sulfanyl-4-oxo-butanoic acid (0.47 g, 1.8 mmol). After that, N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (0.39 g, 1.9 mmol) and N-hydroxysuccinimide (0.22 g, 1.9 mmol) were added and stirred for 1 hour. The resulting white crystals are filtered and the mother liquor is concentrated under reduced pressure to give (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl).
4-(3-tert-butoxy-3-oxo-propyl)sulfanyl-4-oxo-butanoate (0.61 g, 1.7 mmol) was obtained.
MS(ESI) m/z:360[M+H]+ MS (ESI) m/z: 360 [M+H] +
(2-1-2)チオエステルリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(42mg,20.3μmol、ただし、4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル) 4-(3-tert-ブトキシ-3-オキソ-プロピル)スルファニル-4-オキソ-ブタノエ
ート(0.61g,1.7mmol)をアセトニトリル1mLに溶解した溶液中に加えた。室温で12時間攪拌した後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結-tBu体(41.7mg,18μmol)を得た。
The peptide (42 mg, 20.3 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that the two cysteines at the 4th and 14th positions each form an intramolecular disulfide bond. (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 4-(3-tert-butoxy-3-oxo-propyl)sulfanyl-4-oxo -Butanoate (0.61 g, 1.7 mmol) was added into a solution in 1 mL of acetonitrile. After stirring at room temperature for 12 hours, 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and elution was performed by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide linker-linked-tBu form (41.7 mg, 18 μmol).
MS(ESI) m/z:z=3 773[M+3H]3+,z=4 580[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 773 [M+3H] <3+> , z=4 580 [M+4H] <4+>
上記ペプチドリンカー連結物(41.7mg,18μmol)をジクロロメタン1.0mL中に溶解し、トリフルオロ酢酸を1.0mL加え室温中で1時間攪拌した。減圧濃縮を行った後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体(40.7mg,18μmol)を得た。 The above peptide linker conjugate (41.7 mg, 18 μmol) was dissolved in 1.0 mL of dichloromethane, 1.0 mL of trifluoroacetic acid was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. After concentrating under reduced pressure, 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and elution was performed by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide linker conjugate-carboxylic acid form (40.7 mg, 18 μmol).
MS(ESI) m/z:z=3 755[M+3H]3+,z=4 566[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 755 [M+3H] <3+> , z=4 566 [M+4H] <4+>
上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体(40.7mg,18μmol)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、N,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(37.1mg,0.18mmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(20.7mg,0.18mmol)を加え1時間攪拌した。生じた白色結晶をろ過し母液に0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドチオエステルリンカー連結物-NHS活性化体(5.2mg,2.24μmol)を得た。 The above peptide linker conjugate-carboxylic acid form (40.7 mg, 18 μmol) was dissolved in 1 mL of N,N'-dimethylformamide, and N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (37.1 mg, 0.18 mmol) and N-hydroxysuccinimide were added. (20.7 mg, 0.18 mmol) was added and stirred for 1 hour. The resulting white crystals were filtered, and 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the mother liquor and eluted by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide thioester linker conjugate-NHS activated product (5.2 mg, 2.24 μmol). .
MS(ESI) m/z:z=3 787[M+3H]3+,z=4 590[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 787 [M+3H] <3+> , z=4 590 [M+4H] <4+>
(2-2)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(10mg,4.8μmol、ただし、4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(0.2g,0.48mmol)を1mLに溶解した溶液に加え室温で12時間攪拌した。0.5%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(8.6mg,3.63μmol)を得た。 The peptide (10 mg, 4.8 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that the two cysteines at the 4th and 14th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in 1 mL of N,N'-dimethylformamide, and added to a solution of di(N-succinimidyl) 3,3'-dithiodipropionate (0.2 g, 0.48 mmol) dissolved in 1 mL. and stirred for 12 hours. A 0.5% trifluoroacetic acid aqueous solution was added, and elution was performed by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide disulfide linker conjugate-NHS activated product (8.6 mg, 3.63 μmol). .
MS (ESI) m/z:z=3 789[M+3H]3+,z=4 592[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 789 [M+3H] <3+> , z=4 592 [M+4H] <4+>
(2-3)アセタールリンカーの合成とペプチドの連結
(2-3-1)アセタールリンカーの合成
ペンタエリトリトール(1.98g,14.3mmol)、ジメトキシプロピオン酸メチル(6.0g,31.7mmol)とp-トルエンスルホン酸・一水和物(33.0mg,0.143mmol)を混合し、130℃で16時間攪拌した。16時間後室温に戻し、析出した結晶をろ過により回収しメチル 2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]アセテート(3.04g,10mmol)を得た。 Pentaerythritol (1.98 g, 14.3 mmol), methyl dimethoxypropionate (6.0 g, 31.7 mmol) and p-toluenesulfonic acid monohydrate (33.0 mg, 0.143 mmol) were mixed, and 130 °C for 16 hours. After 16 hours, the temperature was returned to room temperature, the precipitated crystals were collected by filtration, and methyl 2-[9-(2-methoxy-2-oxo-ethyl)-2,4,8,10-tetraoxospiro[5.5]undecane was obtained. -3-yl]acetate (3.04 g, 10 mmol) was obtained.
MS (ESI) m/z:305[M+H]+ MS (ESI) m/z: 305 [M+H] +
メチル 2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]アセテート(50mg,0.164m
mol)をメタノール1mLに溶解し、氷冷下1M NaOH aq.を0.49mL加え、室温へと昇温後2時間攪拌した。陽イオン交換樹脂を添加し中性にした後、フィルトレーションにより樹脂を取り除き2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]酢酸(32mg,0.116mmol)を得た。
Methyl 2-[9-(2-methoxy-2-oxo-ethyl)-2,4,8,10-tetraoxospiro[5.5]undecane-3-yl]acetate (50mg, 0.164m
mol) was dissolved in 1 mL of methanol and dissolved in 1 M NaOH aq. 0.49 mL was added, and the temperature was raised to room temperature, followed by stirring for 2 hours. After neutralization by adding a cation exchange resin, the resin was removed by filtration and 2-[9-(2-methoxy-2-oxo-ethyl)-2,4,8,10-tetraoxospiro[5 .5]undecane-3-yl]acetic acid (32 mg, 0.116 mmol) was obtained.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6) δ 4.85(t,J=5.4Hz,2H),4.26(dd,J=11.3,2.4Hz,2H),3.67-3.61(m,2H),3.60(s,8H),3.42(d,J=11.6Hz,2H),2.69-2.56(m,4H).
MS(ESI) m/z:277[M+H]+
1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 4.85 (t, J = 5.4 Hz, 2H), 4.26 (dd, J = 11.3, 2.4 Hz, 2H), 3.67- 3.61 (m, 2H), 3.60 (s, 8H), 3.42 (d, J=11.6Hz, 2H), 2.69-2.56 (m, 4H).
MS (ESI) m/z: 277 [M+H] +
2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]酢酸(32mg,0.116mmol)を酢酸エチル1mLに溶解し、N,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(37.1mg,0.18mmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(20.7mg,0.18mmol)を加え1時間攪拌した。生じた白色結晶をろ過し母液を減圧下濃縮後、水を加え中性のアセトニトリルおよび水を溶媒として逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル) 2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]アセテート(13mg,27.6μmol)を得た。 2-[9-(2-Methoxy-2-oxo-ethyl)-2,4,8,10-tetraoxospiro[5.5]undecane-3-yl]acetic acid (32 mg, 0.116 mmol) was added to ethyl acetate. The solution was dissolved in 1 mL, N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (37.1 mg, 0.18 mmol) and N-hydroxysuccinimide (20.7 mg, 0.18 mmol) were added and stirred for 1 hour. The resulting white crystals were filtered, the mother liquor was concentrated under reduced pressure, water was added, and neutral acetonitrile and water were used as solvents for elution by reverse phase preparative chromatography. The fraction containing the product is collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying, (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 2-[9-(2-methoxy- 2-Oxo-ethyl)-2,4,8,10-tetraoxospiro[5.5]undecane-3-yl]acetate (13 mg, 27.6 μmol) was obtained.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6) δ 4.79(t,J=5.3Hz,2H),4.24(dd,J=11.2,2.3Hz,2H),3.60-3.48(m,4H),3.34(d,J=11.5Hz,2H),2.33(d,J=5.3Hz,4H).
MS(ESI) m/z:471[M+H]+
1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 4.79 (t, J = 5.3 Hz, 2H), 4.24 (dd, J = 11.2, 2.3 Hz, 2H), 3.60- 3.48 (m, 4H), 3.34 (d, J=11.5Hz, 2H), 2.33 (d, J=5.3Hz, 4H).
MS (ESI) m/z: 471 [M+H] +
(2-3-2)アセタールリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(10mg,4.8μmol、ただし、4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチ
ルホルムアミド1mLに溶解し、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル) 2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]アセテート(13mg,27.6μmol)を1mLに溶解した溶液に加え室温で12時間攪拌した。水を加え中性のアセトニトリルおよび水を溶媒として逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドアセタールリンカー連結物-NHS活性化体(8.6mg,3.63μmol)を得た。
The peptide (10 mg, 4.8 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that the two cysteines at the 4th and 14th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in 1 mL of N,N′-dimethylformamide, and (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 2-[9-(2-methoxy-2-oxo-ethyl)-2,4 , 8,10-tetraoxospiro[5.5]undecane-3-yl]acetate (13 mg, 27.6 μmol) dissolved in 1 mL was added and stirred at room temperature for 12 hours. Water was added and neutral acetonitrile and water were used as solvents for elution by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide acetal linker conjugate-NHS activated product (8.6 mg, 3.63 μmol). .
MS(ESI) m/z:z=3 810[M+3H]3+,z=4 608[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 810 [M+3H] <3+> , z=4 608 [M+4H] <4+>
[実施例3:IgG1 Fc結合性ペプチド試薬によるIgG1 Fcの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析]
(3-1)チオエステルリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG1 Fcの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析
IgG1 Fcは、R&D社製 IgG1 Fc,Human,Recombinant,Carrier-free(製品番号:110-HG-100)を用いた。実施例2の(2-1)で合成したペプチドチオエステルリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.4mMとした。IgG1 Fc 15μgを0.1M 酢酸ナトリウムバッファー(pH4.7)15μLに溶解し、0.4mMのペプチド試薬を7μL(IgG1 Fcに対して5等量)加え、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のIgG1 Fcはm/z 28270にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが一つ導入されたm/z 30532にピークが観測された。
[Example 3: Specific modification of IgG1 Fc by IgG1 Fc-binding peptide reagent and analysis by MALDI-TOFMS]
(3-1) Specific modification of IgG1 Fc with a thioester linker-binding peptide reagent and analysis by MALDI-TOFMS IgG1 Fc is manufactured by R & D Co. IgG1 Fc, Human, Recombinant, Carrier-free (product number: 110-HG-100 ) was used. The peptide thioester linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (2-1) of Example 2 was dissolved in N,N'-dimethylformamide to a concentration of 0.4 mM. 15 μg of IgG1 Fc was dissolved in 15 μL of 0.1 M sodium acetate buffer (pH 4.7), 7 μL of 0.4 mM peptide reagent (5 equivalents to IgG1 Fc) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 28270 for the raw material IgG1 Fc, and a peak was observed at m/z 30532 for the product into which one binding peptide was introduced.
(3-2)ジスルフィドリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG1 Fcの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析
IgG1 Fcは、R&D社製 IgG1 Fc,Human,Recombinant,Carrier-free(製品番号:110-HG-100)を用いた。実施例2の(2-2)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.4mMとした。IgG1 Fc 20μgを0.1M 酢酸ナトリウムバッファー(pH4.7)40μLに溶解し、0.4mMのペプチド試薬を10.7μL(IgG1 Fcに対して6等量)加え、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のIgG1 Fcはm/z 28183にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが一つ導入されたm/z 30418にピークが観測された。
(3-2) Specific modification of IgG1 Fc with a disulfide linker-binding peptide reagent and analysis by MALDI-TOFMS IgG1 Fc is manufactured by R & D Co. IgG1 Fc, Human, Recombinant, Carrier-free (product number: 110-HG-100 ) was used. The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (2-2) of Example 2 was dissolved in N,N'-dimethylformamide to a concentration of 0.4 mM. 20 μg of IgG1 Fc was dissolved in 40 μL of 0.1 M sodium acetate buffer (pH 4.7), 10.7 μL of 0.4 mM peptide reagent (6 equivalents to IgG1 Fc) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 28183 for the raw material IgG1 Fc, and a peak was observed at m/z 30418 for the product into which one binding peptide was introduced.
(3-3)アセタールリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG1 Fcの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析
IgG1 Fcは、R&D社製 IgG1 Fc,Human,Recombinant,Carrier-free(製品番号:110-HG-100)を用いた。実施例2の(2-3)で合成したペプチドアセタールリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.4mMとした。IgG1 Fc 20μgを0.1M 酢酸ナトリウムバッファー(pH4.7)40μLに溶解し、0.4mMのペプチド試薬を10.7μL(IgG1 Fcに対して6等量)加え、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料
のIgG1 Fcはm/z 28183にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが一つ導入されたm/z 30541にピークが観測された。
(3-3) Specific modification of IgG1 Fc with an acetal linker-binding peptide reagent and analysis by MALDI-TOFMS IgG1 Fc is manufactured by R & D Co. IgG1 Fc, Human, Recombinant, Carrier-free (product number: 110-HG-100 ) was used. The peptide acetal linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (2-3) of Example 2 was dissolved in N,N'-dimethylformamide to a concentration of 0.4 mM. 20 μg of IgG1 Fc was dissolved in 40 μL of 0.1 M sodium acetate buffer (pH 4.7), 10.7 μL of 0.4 mM peptide reagent (6 equivalents to IgG1 Fc) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 28183 for the raw material IgG1 Fc, and a peak was observed at m/z 30541 for the product into which one binding peptide had been introduced.
[実施例4:IgG1 Fc-ペプチド複合体のリンカー切断とMALDI-TOFMSによる解析]
(4-1)チオエステルリンカーの切断とMALDI-TOFMSによる解析
0.2M PBSバッファー(pH7.0)、25mMシステイン溶液40μLに、実施例3の(3-1)で合成したIgG1 Fc-ペプチドチオエステルリンカー複合体を溶解し、室温で16時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.0)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料の結合性ペプチドが一つ導入された複合体はm/z
30541にピークが観測され、反応後はm/z 28397にピークが観測された。
[Example 4: Linker cleavage of IgG1 Fc-peptide complex and analysis by MALDI-TOFMS]
(4-1) Cleavage of thioester linker and analysis by MALDI-TOFMS 0.2 M PBS buffer (pH 7.0), 40 μL of 25 mM cysteine solution, IgG1 Fc-peptide thioester linker synthesized in (3-1) of Example 3 The complex was dissolved and stirred at room temperature for 16 hours. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.0) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, the m/z
A peak was observed at 30541 and a peak was observed at m/z 28397 after the reaction.
(4-2)チオエステルリンカーの切断とMALDI-TOFMSによる解析
0.2M PBSバッファー(pH7.0)40μLに、実施例3の(3-2)で合成したIgG1 Fc-ペプチドジスルフィドリンカー複合体を溶解し、10mM D,L-ジチオトレイトール 12.5μL(Fcに対して10等量)を添加し室温で16時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.0)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料の結合性ペプチドが一つ導入された複合体はm/z 30418にピークが観測され、反応後はm/z 28183にピークが観測された。
(4-2) Cleavage of thioester linker and analysis by MALDI-TOFMS Dissolve the IgG1 Fc-peptide disulfide linker complex synthesized in (3-2) of Example 3 in 40 μL of 0.2 M PBS buffer (pH 7.0). Then, 12.5 μL of 10 mM D,L-dithiothreitol (10 equivalents to Fc) was added and stirred at room temperature for 16 hours. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.0) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 30418 for the complex into which one starting binding peptide had been introduced, and a peak was observed at m/z 28183 after the reaction.
(4-3)アセタールリンカーの切断とMALDI-TOFMSによる解析
任意のバッファー(pH3.0~pH6.0)に、実施例3の(3-3)で合成したIgG1 Fc-ペプチドアセタールリンカー複合体を溶解し、室温で攪拌することで、アセタール構造が分解し、アルデヒドがIgG1 Fc上に残る。これをMALDI-TOFMSにより質量を測定することができる。
(4-3) Cleavage of acetal linker and analysis by MALDI-TOFMS The IgG1 Fc-peptide acetal linker complex synthesized in (3-3) of Example 3 was added to an arbitrary buffer (pH 3.0 to pH 6.0). Upon dissolution and stirring at room temperature, the acetal structure decomposes leaving the aldehyde on the IgG1 Fc. The mass of this can be measured by MALDI-TOFMS.
[実施例5:抗HER2 IgG抗体トラスツズマブと抗CD20抗体リツキシマブの特異的修飾とMALDI-TOFMSおよびHIC-HPLCによる解析]
(5-1)抗HER2 IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析
実施例2の(2-2)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.4mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)200μLに溶解させ、0.4mMのペプチド試薬を50.7μL(抗体に対して6等量)を加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブはm/z 147569にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入されたm/z 151848にピークが観測された。
[Example 5: Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and anti-CD20 antibody rituximab and analysis by MALDI-TOFMS and HIC-HPLC]
(5-1) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by MALDI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (2-2) of Example 2 is N,N'-dimethylformamide to 0.4 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 200 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 50.7 μL of 0.4 mM peptide reagent (6 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 147569 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at m/z 151848 for the product into which two binding peptides were introduced.
(5-2)抗HER2 IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(5-1)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(5-2) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (5-1) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ+ペプチド試薬 12等量(反応後Amicon10Kにより溶媒置換);
b:トラスツズマブ+ペプチド試薬12等量;
c:トラスツズマブ+ペプチド試薬6等量;
d:トラスツズマブ原料;
e:ペプチド試薬のみ;
f:DMFのみ。
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab +
b: Trastuzumab + 12 equivalents of peptide reagent;
c: Trastuzumab + 6 equivalents of peptide reagent;
d: trastuzumab raw material;
e: peptide reagent only;
f: DMF only.
Retension Time 9.417分はトラスツズマブ原料、10.943分および13.063分はペプチド試薬由来のピーク、0.44分はDMFであることが分かる(図3、4)。トラスツズマブにペプチド試薬を6等量反応させたところ9.417分のピークが消失し、9.99分および10.237分のピークが出現した(図3、4)。またペプチド試薬を12等量加えたところ9.99分のピークが消失したことから、9.99分のピークはペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図3、4)。aをMALDI-TOFMSにより解析したところ(5-1)で示したようにm/z 151848のMSピークを示したペプチド試薬がトラスツズマブに対して2つ導入されたピークが観測された(図3、4)。 Retension Time 9.417 minutes is the trastuzumab raw material, 10.943 minutes and 13.063 minutes are peaks derived from peptide reagents, and 0.44 minutes is DMF (Figs. 3 and 4). When trastuzumab was reacted with 6 equivalents of the peptide reagent, the peak at 9.417 minutes disappeared and peaks at 9.99 minutes and 10.237 minutes appeared (Figs. 3 and 4). When 12 equivalents of the peptide reagent were added, the peak at 9.99 minutes disappeared, suggesting that the peak at 9.99 minutes was a compound in which one peptide had been introduced into trastuzumab (Figs. 3 and 4). . When a was analyzed by MALDI-TOFMS, as shown in (5-1), two peaks were observed in which two peptide reagents were introduced into trastuzumab showing MS peaks of m/z 151848 (Fig. 3, 4).
(5-3)抗CD20抗体リツキシマブの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析
実施例2の(2-2)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し0.4mMとした。抗CD20抗体リツキシマブ500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH5.5)200μLに溶解させ、0.4mMのペプチド試薬を50.7μL(抗体に対して6等量)を加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のリツキシマブはm/z 144002にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入されたm/z 148169にピークが観測された。
(5-3) Specific Modification of Anti-CD20 Antibody Rituximab and Analysis by MALDI-TOFMS It was dissolved to 0.4 mM. 500 µg of anti-CD20 antibody rituximab was dissolved in 200 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), 50.7 µL of 0.4 mM peptide reagent (6 equivalents to the antibody) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 144002 for the raw material rituximab, and a peak was observed at m/z 148169 for the product into which two binding peptides were introduced.
(5-4)抗CD20抗体リツキシマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(5-3)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M (NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(5-4) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-CD20 Antibody Rituximab The antibody/peptide complex produced in (5-3) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
a~fのサンプルについては以下の条件で反応させた。
a:リツキシマブ+ペプチド試薬 12等量(反応後Amicon10Kにより溶媒置換);
b:リツキシマブ+ペプチド試薬12等量;
c:リツキシマブ+ペプチド試薬6等量;
d:リツキシマブ原料;
e:ペプチド試薬のみ;
f:DMFのみ。
Samples a to f were reacted under the following conditions.
a: Rituximab +
b: Rituximab + 12 equivalents of peptide reagent;
c: Rituximab + 6 equivalents of peptide reagent;
d: Rituximab raw material;
e: peptide reagent only;
f: DMF only.
Retension Time 9.417分はリツキシマブ原料、10.94分およ
び13.02分はペプチド試薬由来のピーク、0.44分はDMFであることが分かる(図5、6)。リツキシマブにペプチド試薬を6等量反応させたところ10.36分のピークが消失し、10.763分および10.94分のピークが出現した(図5、6)。またペプチド試薬を12等量加えたところ10.763分のピークが消失したことから、10.763分のピークはペプチドがリツキシマブに1個導入された化合物であると考えられる(図5、6)。aをMALDI-TOFMSにより解析したところ(5-1)で示したようにm/z 148169のペプチド試薬がリツキシマブに対して2つ導入されたピークが観測された(図5、6)。
Retension Time 9.417 minutes is the Rituximab raw material, 10.94 minutes and 13.02 minutes are peaks derived from the peptide reagent, and 0.44 minutes is DMF (Figs. 5 and 6). When rituximab was reacted with 6 equivalents of the peptide reagent, the peak at 10.36 minutes disappeared and peaks at 10.763 minutes and 10.94 minutes appeared (Figs. 5 and 6). When 12 equivalents of the peptide reagent were added, the peak at 10.763 minutes disappeared, suggesting that the peak at 10.763 minutes was a compound in which one peptide was introduced into rituximab (Figs. 5 and 6). . When a was analyzed by MALDI-TOFMS, two peaks with m/z 148169 peptide reagent introduced into rituximab were observed as shown in (5-1) (FIGS. 5 and 6).
[実施例6:トラスツズマブ・ペプチド複合体およびリツキシマブ・ペプチド複合体の切断、および再酸化、およびそれらの生成物のMALDI-TOFMSとRP-HPLCによる解析]
(6-1)トラスツズマブ・ペプチド複合体のリンカー切断と再酸化、およびそれらの生成物のMALDI-TOFMSによる解析
先ず、実施例5の(5-1)で合成したトラスツズマブ・ペプチド複合体400μgを60mMリン酸バッファー(pH8.0)に溶解し、72μMとした後、20mM D,L-ジチオトレイトール 10.0μL(トラスツズマブ・ペプチド複合体に対して60等量)を添加し室温で16時間攪拌して、リンカー中のジスルフィド結合を切断した。
[Example 6: Cleavage and reoxidation of trastuzumab-peptide complexes and rituximab-peptide complexes, and analysis of their products by MALDI-TOFMS and RP-HPLC]
(6-1) Linker Cleavage and Reoxidation of Trastuzumab Peptide Complex, and Analysis of Their Products by MALDI-TOFMS First, 400 μg of the trastuzumab peptide complex synthesized in (5-1) of Example 5 was After dissolving in phosphate buffer (pH 8.0) to 72 μM, 10.0 μL of 20 mM D,L-dithiothreitol (60 equivalents to trastuzumab peptide complex) was added and stirred at room temperature for 16 hours. to cleave the disulfide bond in the linker.
次に、リンカー中のジスルフィド結合とともに切断された抗体中のジスルフィド結合を再度結合させるため、再酸化の工程を行った(Jagath R Junutula et al.,NATURE BIOTECHNOLOGY,26(8),925-932(2008))。具体的には、反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.0)へと溶媒置換し、トラスツズマブ・ペプチド複合体の濃度を18μMとした後、10mM デヒドロアスコルビン酸 6.4μL(トラスツズマブ・ペプチド複合体に対して20等量)加えて3時間攪拌することにより、再酸化を行った。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物はチオプロピオニル基が二つ導入されたm/z 145329にピークが観測された。 Next, a reoxidation step was performed in order to rebond the disulfide bonds in the antibody that had been cleaved together with the disulfide bonds in the linker (Jagath R Junutula et al., NATURE BIOTECHNOLOGY, 26(8), 925-932 ( 2008)). Specifically, the reaction solution was solvent-exchanged with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.0) using Amicon 10K to adjust the concentration of the trastuzumab-peptide complex to 18 µM, and then 6.4 µL of 10 mM dehydroascorbic acid (trastuzumab-peptide complex) was added. 20 equivalents relative to the peptide conjugate) and stirred for 3 hours to effect reoxidation. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, a peak was observed at m/z 145329 where two thiopropionyl groups were introduced into the product.
(6-2)トラスツズマブ・ペプチド複合体のリンカー切断と再酸化により得られる生成物のRP-HPLCによる解析
(6-1)の反応をRP-HPLCにより解析した。カラムはTSK gel,Protein C4-300(TOSOH) 4.6x150mm 3.0μmを使用した。A_Buffer:0.1% TFA、B_Buffer:0.1% TFA,80% ACNにて流速は1.0ml/min、グラジエントをB20→60%,20min(データ採取30min)、カラム温度は60℃、サーモスタット温度は10℃、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(6-2) Analysis by RP-HPLC of Products Obtained by Linker Cleavage and Reoxidation of Trastuzumab-Peptide Complex The reaction in (6-1) was analyzed by RP-HPLC. The column used was TSK gel, Protein C4-300 (TOSOH) 4.6×150 mm 3.0 μm. A_Buffer: 0.1% TFA, B_Buffer: 0.1% TFA, 80% ACN, flow rate 1.0 ml/min, gradient B20→60%, 20 min (
a~fのサンプルについては以下の条件で反応させている。
a:トラスツズマブ;
b:トラスツズマブ+ペプチド試薬6等量;
c:トラスツズマブをDTTにより還元;
d:buffer pH8.0,抗体濃度72μMでD,L-ジチオトレイトールにより還元;
e:dをデヒドロアスコルビン酸により再酸化3時間後;
f:dをデヒドロアスコルビン酸により再酸化24時間後。
Samples a to f were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab;
b: Trastuzumab + 6 equivalents of peptide reagent;
c: reduction of trastuzumab with DTT;
d: reduction with D,L-dithiothreitol at buffer pH 8.0, antibody concentration 72 μM;
e: After 3 hours of reoxidation of d with dehydroascorbic acid;
f: 24 hours after reoxidation of d with dehydroascorbic acid.
b、d、およびeまたはfの順番で反応しており、軽鎖と重鎖に分解した後(d)、デヒドロアスコルビン酸により再酸化しeまたはfになった(図7)。また、ピークのRetention Timeから、トラスツズマブの軽鎖と修飾体の軽鎖が同じ位置にでて
きており、重鎖のリテンションタイムがずれていることから、重鎖が修飾されていることが分かる(図7)。
It reacted in the order of b, d, and e or f, and after decomposing into light chain and heavy chain (d), it was reoxidized by dehydroascorbic acid to become e or f (Fig. 7). In addition, from the peak retention time, the light chain of trastuzumab and the light chain of the modified product appear at the same position, and the heavy chain retention time is shifted, indicating that the heavy chain is modified ( Figure 7).
(6-3)リツキシマブ・ペプチド複合体のリンカー切断とMALDI-TOFMSによる解析
実施例5の(5-3)で合成したリツキシマブ・ペプチド複合体400μgを60mMリン酸バッファー(pH8.0)に溶解し、72μMとした後、20mM D,L-ジチオトレイトール 10.0μL(リツキシマブ・ペプチド複合体に対して60等量)を添加し室温で16時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.0)へと溶媒置換し、濃度を18μMとした後、10mM デヒドロアスコルビン酸6.4μL(リツキシマブ・ペプチド複合体に対して20等量)加えて3時間攪拌して、リンカー中のジスルフィド結合を切断した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物はチオプロピオニル基が二つ導入されたm/z 144783にピークが観測された。
(6-3) Linker Cleavage of Rituximab/Peptide Complex and Analysis by MALDI-
[実施例7:トラスツズマブおよびリツキシマブのチオール導入体への蛍光標識と蛍光標識率の算出]
(7-1)トラスツズマブのチオール導入体への蛍光標識と蛍光標識率の算出
実施例6の(6-1)で合成した、トラスツズマブのチオール導入体を20mM PBSバッファーに溶解し0.3mMとした後、Thermo Fisher製 DyLight550(0.94mM、DMFに溶解)を20μL添加し、室温で12時間攪拌した。反応後、Dy Removal Columnにより蛍光色素を除去した。BECKMAN COULTER製DU 800 SPECTROPHOTOMETERにより280nmと557nmの吸光度を測定した。吸光度より、蛍光標識率を算出したところ、2であった。
[Example 7: Fluorescent labeling of thiol-introduced trastuzumab and rituximab and calculation of fluorescent labeling rate]
(7-1) Fluorescent Labeling of Trastuzumab Thiol Transducer and Calculation of Fluorescent Labeling Rate The trastuzumab thiol transductant synthesized in (6-1) of Example 6 was dissolved in 20 mM PBS buffer to a concentration of 0.3 mM. After that, 20 μL of DyLight550 (0.94 mM, dissolved in DMF) manufactured by Thermo Fisher was added and stirred at room temperature for 12 hours. After the reaction, the fluorescent dye was removed with a Dy Removal Column. Absorbance at 280 nm and 557 nm was measured with a
(7-2)リツキシマブのチオール導入体への蛍光標識と蛍光標識率の算出
実施例6の(6-3)で合成した、リツキシマブのチオール導入体を20mM PBSバッファーに溶解し0.3mMとした後、Thermo Fisher製 DyLight550(0.94mM、DMFに溶解)を20μL添加し、室温で12時間攪拌した。反応後、Dy Removal Columnにより蛍光色素を除去した。BECKMAN
COULTER製DU 800 SPECTROPHOTOMETERにより280nmと557nmの吸光度を測定した。吸光度より、蛍光標識率を算出したところ、2であった。
(7-2) Fluorescent labeling of rituximab thiol derivative and calculation of fluorescent labeling rate The rituximab thiol derivative synthesized in (6-3) of Example 6 was dissolved in 20 mM PBS buffer to a concentration of 0.3 mM. After that, 20 μL of DyLight550 (0.94 mM, dissolved in DMF) manufactured by Thermo Fisher was added and stirred at room temperature for 12 hours. After the reaction, the fluorescent dye was removed with a Dy Removal Column. BECKMAN
Absorbance at 280 nm and 557 nm was measured with a
[実施例8:IgG1 Fcおよびトラスツズマブのチオール導入体のペプチドマッピング]
(8-1)IgG1 Fcおよびトラスツズマブ、リツキシマブのチオール導入体のトリプシン処理
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに8M尿素を含む100mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を40μL分注し、サンプル溶液を12μL、100mM炭酸水素アンモニウム緩衝液に溶解した2%のProteaseMAX(プロテアーゼ消化促進剤 ProteaseMAXTM Surfactant)を2μL加え、撹拌、混合した。その後、20mMのジチオスレイトール水溶液 20μLを加えて65℃で15分間加温後、30mMのヨード酢酸水溶液 42μLを添加し、遮光下室温で30分間反応させた。反応後、100mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を150μL加えて撹拌し、100mM炭酸水素アンモニウム緩衝液に溶解した2%のProteaseMAXを1.4μL加え、100μg/mLのトリプシン水溶液(Proteomics Grade, Code No.T6567-5x20μg(SIGMA))を10μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、10%トリフルオロ酢酸水溶液15μL、2%アセトニトリルを
含む0.01%トリフルオロ酢酸水溶液を4.6μL加え、LC-MS/MS測定に使用した。
[Example 8: Peptide mapping of IgG1 Fc and thiol derivatives of trastuzumab]
(8-1) IgG1 Fc and trastuzumab, trypsin treatment of rituximab thiol introducer Dispense 40 μL of 100 mM ammonium bicarbonate buffer containing 8 M urea into a 1.5 mL low-adsorption microtest tube,
(8-2)IgG1 Fcおよびトラスツズマブのチオール導入体のGlu-C処理
1.5mL低吸着マイクロテストチューブに8M 尿素を含む100mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を20μL分注し、サンプル溶液を8μL加え、撹拌、混合した。その後、100mMのジチオスレイトール水溶液5μLを加えて65℃で15分間加温後、200mMヨード酢酸水溶液6μLを添加し、遮光下室温で30分間反応させた。反応後、100mMのジチオスレイトール水溶液2μLを加え、さらに、100mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を3μL加えて撹拌し、200μg/mLのGlu-C Protease水溶液(PierceTM Glu-C Protease,MS Grade、製品番号:90054)を5μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、10%トリフルオロ酢酸水溶液4μL加え、LC-MS/MS測定に使用した。
(8-2) Glu-C treatment of IgG1 Fc and trastuzumab thiol-introducer Dispense 20 μL of 100 mM ammonium bicarbonate buffer containing 8 M urea into a 1.5 mL low-adsorption microtest tube, add 8 μL of the sample solution, and stir. , mixed. Then, 5 μL of 100 mM dithiothreitol aqueous solution was added, and after heating at 65° C. for 15 minutes, 6 μL of 200 mM iodoacetic acid aqueous solution was added, and the reaction was allowed to proceed for 30 minutes at room temperature in the dark. After the reaction, 2 μL of 100 mM dithiothreitol aqueous solution is added, and 3 μL of 100 mM ammonium hydrogen carbonate buffer is added and stirred, and 200 μg/mL Glu-C Protease aqueous solution (Pierce ™ Glu-C Protease, MS Grade, product number :90054) was added and enzymatically digested at 37°C for 18 hours. After digestion, 4 μL of 10% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and used for LC-MS/MS measurement.
(8-3)IgG1 FcおよびトラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(分析装置)
ナノHPLC:EASY-nLC 1000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
質量分析計:トライブリッド質量分析計Orbitrap Fusion(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
(8-3) IgG1 Fc and LC-MS/MS measurement conditions for trastuzumab (analyzer)
Nano HPLC: EASY-nLC 1000 (Thermo Fisher Scientific)
Mass spectrometer: Tribrid mass spectrometer Orbitrap Fusion (Thermo Fisher Scientific)
(HPLC分析条件)
トラップカラム:Acclaim PepMap(登録商標) 100,75μmx2cm,nanoViper(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
分析カラム:ESI-column(NTCC-360/75-3-125,75μm×12.5cm,3μm(日京テクノス株式会社))
移動相A:0.1%ギ酸水溶液
移動相B:0.1%ギ酸、アセトニトリル溶液
ローディング溶液:0.1%トリフルオロ酢酸水溶液
流速:300nL/min
サンプル注入量:2μL(IgG1 Fc)、3μL(トラスツズマブ)
グラジエント条件(B%):2%(0.0-0.5分)、2%→45%(0.5-33.5分)、45%→75%(33.5-35.5分)、75%(35.5-45.0分)
(HPLC analysis conditions)
Trap column:
Analysis column: ESI-column (NTCC-360/75-3-125, 75 μm×12.5 cm, 3 μm (Nikkyo Technos Co., Ltd.))
Mobile phase A: 0.1% formic acid aqueous solution Mobile phase B: 0.1% formic acid, acetonitrile solution Loading solution: 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution Flow rate: 300 nL/min
Sample injection volume: 2 μL (IgG1 Fc), 3 μL (trastuzumab)
Gradient conditions (B%): 2% (0.0-0.5 minutes), 2% → 45% (0.5-33.5 minutes), 45% → 75% (33.5-35.5 minutes ), 75% (35.5-45.0 min)
(質量分析計分析条件)
イオン化法:ESI, Positiveモード
スキャンタイプ:Data Dependent Aquisition
Activation Type:Collision Induced Dissociation(CID)
データの取得は付属ソフトであるXcalibur 3.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)およびThermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(Mass spectrometer analysis conditions)
Ionization method: ESI, Positive mode Scan type: Data Dependent Aquisition
Activation Type: Collision Induced Dissociation (CID)
Acquisition of data was carried out using attached software Xcalibur 3.0 (Thermo Fisher Scientific) and Thermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0 (Thermo Fisher Scientific).
(8-4)IgG1 Fcおよびトラスツズマブの修飾部位の解析条件
LC-MS/MS測定結果に対する修飾部位解析については、Proteome Discoverer version 1.4(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(8-4) Analysis Conditions for Modified Sites of IgG1 Fc and Trastuzumab Modified site analysis for LC-MS/MS measurement results was performed using Proteome Discoverer version 1.4 (Thermo Fisher Scientific).
Proteome Discovererでの解析は、Sequest HTを検索エ
ンジンとして使用し、プリカーサーイオンの範囲を350~5000Daとした。また、消化酵素に関しては、サンプルに合わせ、トリプシンまたはGlu-Cを消化酵素として設定し、Maximum Missed Cleavage Sitesは0とした。また、プリカーサーおよびフラグメントイオンのMass Toleranceは、それぞれ10ppmおよび0.5Daとした。Static Modificationにはヨード酢酸によるシステイン残基の修飾として、Carboxymethyl(+58.005Da)を設定した。Dynamic Modificationsについては、メチオニンの酸化(+15.995Da)およびリジン残基への修飾体(ヨード酢酸によるCarboxymethyl化を受けたチオール導入体(+146.004Da)を設定した。
Analyzes on Proteome Discoverer used Sequest HT as the search engine with a precursor ion range of 350-5000 Da. As for the digestive enzyme, trypsin or Glu-C was set as the digestive enzyme according to the sample, and Maximum Missed Cleavage Sites was set to 0. Also, the mass tolerances of precursor and fragment ions were set to 10 ppm and 0.5 Da, respectively. Carboxymethyl (+58.005 Da) was set as Static Modification as modification of cysteine residue with iodoacetic acid. For Dynamic Modifications, oxidation of methionine (+15.995 Da) and modifications to lysine residues (thiol-introduced carboxymethylated with iodoacetic acid (+146.004 Da) were set.
また、修飾部位の検索対象のアミノ酸配列のデータとして、図8に示される(1)~(3)を用いた。 In addition, (1) to (3) shown in FIG. 8 were used as the amino acid sequence data to be searched for the modification site.
(8-5)IgG1 FcおよびトラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC/MS/MSを用いた解析の結果、トラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨード酢酸によるCarboxymethyl化を受けたチオール導入体(+146.004Da))を含むアミノ酸26残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPK(配列番号5)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 998.14874、理論値:998.14859、3価)が観測され(図9)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位のリジン残基の修飾を示す、2価のb24に相当するm/z 1375.59(理論値:1375.14)のプロダクトイオンが確認された(図10)。また、トラスツズマブのGlu-C Protease消化によるリジン残基への修飾部位(ヨード酢酸によるCarboxymethyl化を受けたチオール導入体(+146.004Da))を含むアミノ酸16残基からなるペプチド、LLGGPSVFLFPPKPKD(配列番号6)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 929.49573、理論値:929.49527、2価)が観測され(図11)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける248位のリジン残基の修飾を示す、2価のy3に相当するm/z 505.22(理論値:505.20)のプロダクトイオンが確認された(図12)。
(8-5) IgG1 Fc and trastuzumab modification site analysis results by LC-MS/MS As a result of analysis using LC/MS/MS, modification sites to lysine residues by trypsin digestion of trastuzumab (Carboxymethyl by iodoacetic acid MS spectrum of a peptide fragment of THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPK (SEQ ID NO: 5) consisting of 26 amino acid residues containing a thiol-introduced thiol (+146.004 Da)) (actual value: m / z 998.14874, theoretical value: 998 .14859, trivalent) was observed (Fig. 9), and m / z 1375.59 (theoretical value : 1375.14) was confirmed (Fig. 10). In addition, a peptide consisting of 16 amino acid residues containing a modification site to a lysine residue by Glu-C Protease digestion of trastuzumab (thiol-introduced carboxymethylated with iodoacetic acid (+146.004 Da)), LLGGPSVFLFPPKPKD (SEQ ID NO: 6 ) of the peptide fragment (actual value: m / z 929.49573, theoretical value: 929.49527, bivalent) was observed (Fig. 11), and from the CID spectrum, the lysine residue at position 248 in EU numbering of the heavy chain A product ion with m/z 505.22 (theoretical value: 505.20) corresponding to divalent y3, indicating modification of the group, was confirmed (Fig. 12).
さらに、IgG1 Fcのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨード酢酸によるCarboxymethyl化を受けたチオール導入体(+146.004Da))を含むアミノ酸26残基からなるペプチド、THTCPPCPAPEAEGAPSVFLFPPKPK(配列番号7)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 994.12885、理論値:994.12433、3価)が観測され(図13)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位のリジン残基の修飾を示す、2価のb24に相当するm/z 1369.16(理論値:1369.10)のプロダクトイオンが確認された(図14)。また、IgG1 FcのGlu-C Protease消化によるリジン残基への修飾部位(ヨード酢酸によるCarboxymethyl化を受けたチオール導入体(+146.004Da))を含むアミノ酸23残基からなるペプチド、GAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPE(配列番号8)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 892.12604、理論値:892.12611、3価)が観測され(図15)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける248位のリジン残基の修飾を示す、2価のb12に相当するm/z 620.27(理論値:619.85)のプロダクトイオンが確認された(図16)。
以上より、EU numberingにおける246位および248位のリジン残基を
含むペプチドフラグメントへの修飾が確認された(図9~16)。
Furthermore, THTCPPCPAPEAEGAPSVFLFPPKPK (SEQ ID NO: 7), a peptide consisting of 26 amino acid residues containing a modification site to a lysine residue by tryptic digestion of IgG1 Fc (thiol-introduced carboxymethylated with iodoacetic acid (+146.004 Da)). The MS spectrum of the peptide fragment (actual value: m / z 994.12885, theoretical value: 994.12433, trivalent) was observed (Fig. 13), and from the CID spectrum, the lysine residue at position 246 in EU numbering of the heavy chain A product ion with m/z 1369.16 (theoretical value: 1369.10) corresponding to divalent b24, indicating the modification, was confirmed (Fig. 14). In addition, a peptide consisting of 23 amino acid residues containing a site for modification of lysine residues by Glu-C Protease digestion of IgG1 Fc (thiol-introduced carboxymethylated by iodoacetic acid (+146.004 Da)), GAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPE (SEQ ID NO: The MS spectrum of the peptide fragment of 8) (actual value: m / z 892.12604, theoretical value: 892.12611, trivalent) was observed (Fig. 15), and from the CID spectrum, the lysine at position 248 in the EU numbering of the heavy chain A product ion with m/z 620.27 (theory: 619.85) corresponding to divalent b12 was identified, indicating a residue modification (Figure 16).
From the above, modification to peptide fragments containing lysine residues at positions 246 and 248 in EU numbering was confirmed (FIGS. 9 to 16).
[実施例9:位置選択的トラスツズマブ-DM1コンジュゲートの合成、および平均DARの解析]
(9-1)位置選択的T-DM1*(トラスツズマブ-DM1)コンジュゲートの合成
実施例6の(6-1)で合成した生体直行性官能基が二つ導入された化合物0.35mgを200μLの100mM PBS、10mM EDTAバッファーに溶解させ、1.75mg/mLとしたのち、10μLのN,N’-ジメチルホルムアミドとDM-1(Abzena社製)をN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し5mMとしたものを4.8μL添加し20℃で2時間攪拌した。2時間後、N-アセチルシステインを100mM PBS、10mM EDTAバッファーに溶解させて50mMとしたものを1μL添加しさらに20℃で1時間攪拌した。反応後、NAP-5カラムにより抽出し、DM-1を取り除いた。
Example 9 Synthesis of Regioselective Trastuzumab-DM1 Conjugates and Analysis of Average DAR
(9-1) Synthesis of regioselective T-DM1* (trastuzumab-DM1)
(9-2)SoloVPEによる反応後の抗体濃度測定
280nmの波長で吸光度を測定し、モル吸光係数より抗体濃度を算出したところ、0.48mg/mLであった。溶液量は0.7mLであったので、収量は0.336mgと算出できる。
(9-2) Measurement of Antibody Concentration after Reaction with SoloVPE Absorbance was measured at a wavelength of 280 nm, and the antibody concentration was calculated from the molar extinction coefficient to be 0.48 mg/mL. Since the solution volume was 0.7 mL, the yield can be calculated as 0.336 mg.
(9-3)Q-TOFMSによるDARの算出
Q-TOFMSはアジレント社製のAgilent 6550 coupled to
Agilent 1290 UPLC with DAD detector, Autosampler cooling and Thermostatted column compartmentを使用した。ソフトウェアはMassHunterを使用し、DARを算出した。生成物はDM-1が2つ導入された149945にピークが観測され、平均DARは2と算出された(図23)。
(9-3) Calculation of DAR by Q-TOFMS Q-TOFMS is Agilent 6550 coupled to
An Agilent 1290 UPLC with DAD detector, Autosampler cooling and Thermostatted column compartment was used. DAR was calculated using MassHunter software. As for the product, a peak was observed at 149945 where two DM-1s were introduced, and the average DAR was calculated to be 2 (Fig. 23).
本実施例で用いたDM1*は、以下である。
Exact Mass: 925.3876
DM1* used in this example is as follows.
Exact Mass: 925.3876
[実施例10:Biacoreによる結合性評価]
(10―1)ELISAによる抗原HER2への結合性評価
実施例9の(9-1)で合成した位置選択的T-DM1(トラスツズマブ-DM1)コンジュゲートの抗原HER2への結合性をELISAにより評価した。コントロールとし
てカドサイラ(T-DM1)も評価した。その結果、カドサイラの解離定数(KD値)は6.372±0.76pMであり、位置選択的T-DM1(トラスツズマブ-DM1)コンジュゲートは6.684±0.17pMであった。したがって、本手法により合成されたADCは抗原結合性を維持していると考えられる。
[Example 10: Binding evaluation by Biacore]
(10-1) Evaluation of binding property to antigen HER2 by ELISA The binding property of the regioselective T-DM1 (trastuzumab-DM1) conjugate synthesized in (9-1) of Example 9 to antigen HER2 was evaluated by ELISA. bottom. Kadcyla (T-DM1) was also evaluated as a control. As a result, the dissociation constant (KD value) of Kadcyla was 6.372±0.76 pM and that of the regioselective T-DM1 (trastuzumab-DM1) conjugate was 6.684±0.17 pM. Therefore, it is considered that the ADC synthesized by this method maintains antigen-binding ability.
(10―2)BiacoreによるFcRnへの結合性評価
実施例9の(9-1)で合成した位置選択的T-DM1(トラスツズマブ-DM1)コンジュゲートのneonatal Fc receptor(FcRn)への結合性をELISAにより評価した。抗体のFcRNへの結合性がより高い場合、抗体がより長い血中半減期を有することが知られている。コントロールとしてカドサイラ(T-DM1)も評価した。その結果、カドサイラの解離定数(KD値)は1.65±0.05μMであり、位置選択的T-DM1(トラスツズマブ-DM1)コンジュゲートは0.258±0.001μMであった。したがって、本手法により合成されたADCはFcRn結合性を維持していると考えられ、既存のADCであるカドサイラよりも6倍程度FcRnへの親和性が高くなっていることが分かった。
(10-2) Binding evaluation to FcRn by Biacore The binding to the neonatal Fc receptor (FcRn) of the regioselective T-DM1 (trastuzumab-DM1) conjugate synthesized in (9-1) of Example 9 was evaluated. Evaluated by ELISA. It is known that antibodies have a longer blood half-life when they have higher binding to FcRN. Kadcyla (T-DM1) was also evaluated as a control. As a result, the dissociation constant (KD value) of Kadcyla was 1.65±0.05 μM and that of the regioselective T-DM1 (trastuzumab-DM1) conjugate was 0.258±0.001 μM. Therefore, it is considered that the ADC synthesized by this method maintains FcRn-binding ability, and it was found that the affinity to FcRn is about 6 times higher than that of the existing ADC Kadcyla.
[実施例11:(1)種々の切断性リンカーの合成、ならびに(2)合成したリンカーとIgG1 Fc結合性ペプチドとの連結による、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体、ペプチド-マレイミド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体、ペプチド-アジド修飾エステルリンカー連結物-NHS活性化体、およびペプチドアセタールリンカー連結物-NHS活性化体)の合成]
(11-1)チオエステルリンカーの合成とペプチドとの連結
(11-1-1)チオエステルリンカーの合成
(11-1) Synthesis of thioester linker and linking with peptide (11-1-1) Synthesis of thioester linker
6-アジドヘキサン酸(300mg,1.91mmol)をTHF溶媒(20mL)に溶解させ、0℃にてクロロ炭酸イソブチル(284μL,2.10mmol)、N-メチルモルホリン(273μL,2.48mmol)を加え30分攪拌し、6-アジドヘキサン酸の混合酸無水物を調製した。室温にて4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-アミノ-ブタン酸(362mg、2.10mmol)を1M水酸化ナトリウム水溶液(2.10mL)に溶解させたのち、前述の6-アジドヘキサン酸の混合酸無水物のTHF溶液を室温にて滴下した。室温にて16時間攪拌した後、6M塩酸水溶液を加え、系内のpHを3.0に調整した。反応液を酢酸エチルで希釈し、水、食塩水で洗浄後、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより粗生成物を得たのち、カラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン:メタノール=10:1)にて精製した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することにより、4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ-ブタン酸(352mg,1.07mmol)を得た。 6-Azidohexanoic acid (300 mg, 1.91 mmol) was dissolved in THF solvent (20 mL), and isobutyl chlorocarbonate (284 μL, 2.10 mmol) and N-methylmorpholine (273 μL, 2.48 mmol) were added at 0°C. After stirring for 30 minutes, a mixed anhydride of 6-azidohexanoic acid was prepared. After dissolving 4-(tert-butoxy-oxo)-2-amino-butanoic acid (362 mg, 2.10 mmol) in 1 M aqueous sodium hydroxide solution (2.10 mL) at room temperature, the above 6-azidohexanoic acid of the mixed acid anhydride in THF was added dropwise at room temperature. After stirring at room temperature for 16 hours, a 6M hydrochloric acid aqueous solution was added to adjust the pH of the system to 3.0. The reaction mixture was diluted with ethyl acetate, washed with water and brine, added with anhydrous magnesium sulfate, and allowed to stand for 5 minutes. After removing magnesium sulfate by filtration and concentrating under reduced pressure to obtain a crude product, it was purified by column chromatography (dichloromethane:methanol=10:1). Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to give 4-(tert-butoxy-oxo)-2-(6-azidohexy-1-oxo)amino-butanoic acid (352 mg, 1.07 mmol). Obtained.
1H NMR(400MHz,Chloroform-d) δ 6.56(d,J=7
.6Hz,1H),4.76(ddd,J=7.6,5.2,4.8Hz,1H),3.22(t,3.6Hz,2H),2.90(dd,J=17.2,4.8Hz,1H),2.70(dd,J=17.2,5.2Hz,1H),2.22(t,J=7.2Hz,2H),1.53-1.65(m,4H),1.37(s,9H),1.36-1.31(m,2H).
MS(ESI) m/z:351[M+Na]+
1 H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 6.56 (d, J=7
. 6Hz, 1H), 4.76 (ddd, J = 7.6, 5.2, 4.8Hz, 1H), 3.22 (t, 3.6Hz, 2H), 2.90 (dd, J = 17 .2, 4.8 Hz, 1 H), 2.70 (dd, J=17.2, 5.2 Hz, 1 H), 2.22 (t, J=7.2 Hz, 2 H), 1.53-1. 65 (m, 4H), 1.37 (s, 9H), 1.36-1.31 (m, 2H).
MS (ESI) m/z: 351 [M+Na] +
4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ-ブタン酸(50.0mg,0.152mmol)をTHF(1.5mL)に溶解させ、0℃にてクロロ炭酸イソブチル(30.9μL,0.228mmol)、N-メチルモルホリン(28.5μL,0.258mmol)を加え30分攪拌し、対応する混合酸無水物を調製した。室温にてメルカプトプロピオン酸(32.3mg、0.456mmol)をTHF(ml)に溶解させたのち、前述の混合酸無水物のTHF溶液を室温にて滴下した。室温にて16時間攪拌した後、1M水酸化ナトリウム水溶液を加え、系内のpHを9.0に調整した。反応液を水と酢酸エチルで洗浄し、水相を回収した。水相に6M塩酸水溶液を加え、系内のpHを3.0に調整した後、酢酸エチルによる分液抽出を行った後、有機相を食塩水で洗浄後、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより、3-[4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ-1-オキソ]スルファニル-プロパン酸(60.1mg,0.144mmol)を得た。 4-(tert-butoxy-oxo)-2-(6-azidohexy-1-oxo)amino-butanoic acid (50.0 mg, 0.152 mmol) was dissolved in THF (1.5 mL) and chloroformed at 0°C. Isobutyl carbonate (30.9 μL, 0.228 mmol) and N-methylmorpholine (28.5 μL, 0.258 mmol) were added and stirred for 30 minutes to prepare the corresponding mixed acid anhydride. After dissolving mercaptopropionic acid (32.3 mg, 0.456 mmol) in THF (ml) at room temperature, the above THF solution of mixed acid anhydride was added dropwise at room temperature. After stirring at room temperature for 16 hours, 1M sodium hydroxide aqueous solution was added to adjust the pH of the system to 9.0. The reaction solution was washed with water and ethyl acetate, and the aqueous phase was recovered. A 6M hydrochloric acid aqueous solution was added to the aqueous phase to adjust the pH of the system to 3.0, followed by liquid separation and extraction with ethyl acetate. placed. 3-[4-(tert-butoxy-oxo)-2-(6-azidohexy-1-oxo)amino-1-oxo]sulfanyl-propanoic acid was obtained by removing magnesium sulfate by filtration and concentrating under reduced pressure. (60.1 mg, 0.144 mmol) was obtained.
1H NMR(400MHz,Chloroform-d) δ 6.69(d,J=9.6Hz,1H),4.89(dt,J=9.6,4.4Hz,1H),3.22(t,8.5Hz,2H),3.07(t,7.2Hz,2H),2.82-2.60(m,3H),2.29-2.22(m,3H),1.70-1.52(m,4H),1.42-1.39(m,2H),1.40(s,9H).
MS(ESI) m/z:439[M+H]+
1 H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 6.69 (d, J = 9.6 Hz, 1 H), 4.89 (dt, J = 9.6, 4.4 Hz, 1 H), 3.22 (t , 8.5Hz, 2H), 3.07 (t, 7.2Hz, 2H), 2.82-2.60 (m, 3H), 2.29-2.22 (m, 3H), 1.70 −1.52 (m, 4H), 1.42-1.39 (m, 2H), 1.40 (s, 9H).
MS (ESI) m/z: 439 [M+H] +
(11-1-2)チオエステルリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(20.0mg,9.64μmol、ただし、4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、3-[4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ-1-オキソ]-スルファニル-プロパン酸(60.1mg,0.144mmol)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(25.9mg,0.135mmol)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(18.2mg,0.135mmol)をDMF1mLに溶解させ、系中に加えた。室温で12時間攪拌した後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結-tBu体(15mg,7.23μmol)を得た。
The peptide (20.0 mg, 9.64 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that two cysteines at
MS(ESI) m/z:z=2 1237[M+2H]2+,z=3 824[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1237 [M+2H] <2+> , z=3 824 [M+3H] <3+>
上記ペプチドリンカー連結物(10.0mg,4.82μmol)をジクロロメタン0.250mL中に溶解し、トリフルオロ酢酸を0.250mL加え室温中で1時間攪拌した。減圧濃縮を行った後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体(6.2mg,2.57μmol)を得た。 The above peptide linker conjugate (10.0 mg, 4.82 μmol) was dissolved in 0.250 mL of dichloromethane, 0.250 mL of trifluoroacetic acid was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. After concentrating under reduced pressure, 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and elution was performed by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide linker conjugate-carboxylic acid form (6.2 mg, 2.57 μmol).
MS(ESI) m/z:z=2 1208[M+2H]2+,z=3 806[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1208 [M+2H] <2+> , z=3 806 [M+3H] <3+>
上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体(5.7mg,2.36μmol)をN,
N’-ジメチルホルムアミド0.5mLに溶解し、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(9.1mg,47.2μmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(8.1mg,70.8μmol)を加え16時間攪拌した。反応液に0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体(3.0mg,1.19μmol)を得た。
The peptide linker conjugate-carboxylic acid form (5.7 mg, 2.36 μmol) was
1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide hydrochloride (9.1 mg, 47.2 μmol), N-hydroxysuccinimide (8.1 mg, 70.8 μmol) was dissolved in 0.5 mL of N′-dimethylformamide. ) was added and stirred for 16 hours. A 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction mixture, and the mixture was eluted by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide-azido-modified thioester linker conjugate-NHS activated form (3.0 mg, 1.19 μmol). got
MS(ESI) m/z:z=2 1257[M+2H]2+,z=3 838[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1257 [M+2H] <2+> , z=3 838 [M+3H] <3+>
上記ペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体(3.0mg,1.20μmol)をN,N’-ジメチルホルムアミド0.5mLに溶解し、上記ジベンゾシクロオクチン-マレイミド(0.6mg,1.2μmol)を加え16時間攪拌した。反応液に0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド-マレイミド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体(2.8mg,0.95μmol)を得た。 The peptide-azido-modified thioester linker conjugate-NHS activator (3.0 mg, 1.20 μmol) was dissolved in 0.5 mL of N,N′-dimethylformamide, and the dibenzocyclooctyne-maleimide (0.6 mg, 1 .2 μmol) was added and stirred for 16 hours. A 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction mixture, and the mixture was eluted by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to give the above peptide-maleimide-modified thioester linker conjugate-NHS activated form (2.8 mg, 0.95 μmol). got
MS(ESI) m/z:z=2 1471[M+2H]2+,z=3 981[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1471 [M+2H] <2+> , z=3 981 [M+3H] <3+>
(11-2)エステルリンカーの合成とペプチドとの連結
(11-2-1)エステルリンカーの合成
4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-[(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ]-ブタン酸(50mg,0.152mmol)をTHF(1.5mL)に溶解させ、0℃にてクロロ炭酸イソブチル(22.7μL,0.167mmol)、N-メチルモルホリン(21.7μL,0.198mmol)を加え30分攪拌し、対応する混合酸無水物を調製した。室温にて水素化ホウ素ナトリウム(28.7mg、0.76mmol)を1M水酸化ナトリウム水溶液(1.0ml)に溶解させたのち、前述の混合酸無水物のTHF溶液を室温にて滴下した。室温にて16時間攪拌した後、系内に酢酸エチルを加え、水、食塩水で洗浄後、有機相を回収し、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより粗生成物を得たのち、カラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン:メタノール=10:1)にて精製した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することにより、tert-ブチル 4-ヒドロキシ-3-[(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ]-ブタノエート(38.1mg,0.121mmol)を得た。 4-(tert-butoxy-oxo)-2-[(6-azidohexy-1-oxo)amino]-butanoic acid (50 mg, 0.152 mmol) was dissolved in THF (1.5 mL) and chloroformed at 0°C. Isobutyl carbonate (22.7 μL, 0.167 mmol) and N-methylmorpholine (21.7 μL, 0.198 mmol) were added and stirred for 30 minutes to prepare the corresponding mixed acid anhydride. After dissolving sodium borohydride (28.7 mg, 0.76 mmol) in 1M sodium hydroxide aqueous solution (1.0 ml) at room temperature, the THF solution of the above mixed acid anhydride was added dropwise at room temperature. After stirring at room temperature for 16 hours, ethyl acetate was added to the system, and after washing with water and brine, the organic phase was recovered, anhydrous magnesium sulfate was added, and the mixture was allowed to stand for 5 minutes. After removing magnesium sulfate by filtration and concentrating under reduced pressure to obtain a crude product, it was purified by column chromatography (dichloromethane:methanol=10:1). Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to give tert-butyl 4-hydroxy-3-[(6-azidohexy-1-oxo)amino]-butanoate (38.1 mg, 0.121 mmol). Obtained.
1H NMR(400MHz,Chloroform-d) δ 6.36(d,J=7.2Hz,1H),4.20(m,1H),3.69(dt,12.4,4.4Hz,2H),3.27(t,J=6.8Hz,2H),2.50(d,J=6.0Hz,2H),2.22(t,J=7.2Hz,2H),1.53-1.72(m,4H),1.41(s,9H),1.40-1.38(m,2H).
MS(ESI) m/z:337[M+Na]+
1 H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 6.36 (d, J=7.2 Hz, 1 H), 4.20 (m, 1 H), 3.69 (dt, 12.4, 4.4 Hz, 2 H ), 3.27 (t, J = 6.8 Hz, 2H), 2.50 (d, J = 6.0 Hz, 2H), 2.22 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 1.53 −1.72 (m, 4H), 1.41 (s, 9H), 1.40-1.38 (m, 2H).
MS (ESI) m/z: 337 [M+Na] +
tert-ブチル-4-ヒドロキシ-3-[(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ]-ブタノエート(70.4mg,0.224mmol)をTHF(2.2mL)に溶解させ、室温にてコハク酸無水物(67.3mg,0.673mmol)、N,N-ジメチルアミノピリジン(82.2mg,0.673mmol)を加え、室温にて16時間攪拌した後、1M水酸化ナトリウム水溶液を加え、系内のpHを9.0に調整した。反応液に水と酢酸エチルを加え分液操作をしたのち、水相を回収した。水相に6M塩酸水溶液を加
え、系内のpHを3.0に調整した後、酢酸エチルによる分液抽出を行った後、有機相を食塩水で洗浄後、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより、4-[4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ]オキシ-4-オキソ-プロパン酸(78.9mg,0.190mmol)を得た。
tert-Butyl-4-hydroxy-3-[(6-azidohexy-1-oxo)amino]-butanoate (70.4 mg, 0.224 mmol) was dissolved in THF (2.2 mL) and succinic anhydride was added at room temperature. (67.3 mg, 0.673 mmol) and N,N-dimethylaminopyridine (82.2 mg, 0.673 mmol) were added and stirred at room temperature for 16 hours. The pH was adjusted to 9.0. After water and ethyl acetate were added to the reaction liquid and liquid separation was performed, the aqueous phase was recovered. A 6M hydrochloric acid aqueous solution was added to the aqueous phase to adjust the pH of the system to 3.0, followed by liquid separation and extraction with ethyl acetate. placed. 4-[4-(tert-butoxy-oxo)-2-(6-azidohexy-1-oxo)amino]oxy-4-oxo-propanoic acid was obtained by removing magnesium sulfate by filtration and concentrating under reduced pressure. (78.9 mg, 0.190 mmol) was obtained.
1H NMR(400MHz,Chloroform-d) δ 6.28(d,J=8.0Hz,2H),4.52(m,1H),4.29(dd,J=11.2,4.4,1H),4.15(dd,J=11.2,5.6),3.28(m,2H),2.66(m,4H),2.49(d,J=6.4Hz,2H),2.18(t,J=7.2,2H),1.72-1.50(m,4H),1.42(s,9H),1.41-1.38(m,2H).
MS(ESI) m/z:415[M+H]+
1 H NMR (400 MHz, Chloroform-d) δ 6.28 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 4.52 (m, 1H), 4.29 (dd, J = 11.2, 4.4 , 1H), 4.15 (dd, J = 11.2, 5.6), 3.28 (m, 2H), 2.66 (m, 4H), 2.49 (d, J = 6.4Hz , 2H), 2.18 (t, J = 7.2, 2H), 1.72-1.50 (m, 4H), 1.42 (s, 9H), 1.41-1.38 (m , 2H).
MS (ESI) m/z: 415 [M+H] +
(11-2-2)エステルリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(20mg,9.63μmol、ただし、4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、(4-[4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(6-アジドヘキシ-1-オキソ)アミノ]オキシ-4-オキソ-プロパン酸(39.9mg,96.3μmol)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(25.8mg,0.135mmol)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(18.2mg,0.135mmol)をDMF1mLに溶解させ、系中に加えた。室温で12時間攪拌した後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結-tBu体(18.2mg,7.36μmol)を得た。 The peptide (20 mg, 9.63 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that the two cysteines at the 4th and 14th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in 1 mL of N,N′-dimethylformamide, and (4-[4-(tert-butoxy-oxo)-2-(6-azidohexy-1-oxo)amino]oxy-4-oxo- Propanoic acid (39.9 mg, 96.3 μmol), 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (25.8 mg, 0.135 mmol), 1-hydroxybenzotriazole (18.2 mg, 0.135 mmol). 135 mmol) was dissolved in 1 mL of DMF and added into the system.After stirring at room temperature for 12 hours, 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and eluted by reverse phase preparative chromatography.The fraction containing the product was collected. After removing only acetonitrile by concentrating under reduced pressure, lyophilization was performed to obtain the peptide linker-linked-tBu derivative (18.2 mg, 7.36 μmol).
MS(ESI) m/z:z=2 1236[M+2H]2+,z=3 824[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1236 [M+2H] <2+> , z=3 824 [M+3H] <3+>
上記ペプチドリンカー連結物(16.5mg,6.67μmol)をジクロロメタン1.0mL中に溶解し、トリフルオロ酢酸を1.0mL加え室温中で1時間攪拌した。減圧濃縮を行った後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体(15.2mg,6.29μmol)を得た。 The above peptide linker conjugate (16.5 mg, 6.67 μmol) was dissolved in 1.0 mL of dichloromethane, 1.0 mL of trifluoroacetic acid was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. After concentrating under reduced pressure, 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and elution was performed by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide linker conjugate-carboxylic acid form (15.2 mg, 6.29 μmol).
MS(ESI) m/z:z=2 1208[M+2H]2+,z=3 805[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1208 [M+2H] <2+> , z=3 805 [M+3H] <3+>
上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体(3.0mg,1.21μmol)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(4.7mg,24.3μmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(4.2mg,36.4μmol)を加え16時間攪拌した。反応液に0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド-アジド修飾エステルリンカー連結物-NHS活性化体(3.0mg,1.19μmol)を得た。 The peptide linker conjugate-carboxylic acid form (3.0 mg, 1.21 μmol) was dissolved in 1 mL of N,N'-dimethylformamide, and 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (4. 7 mg, 24.3 μmol) and N-hydroxysuccinimide (4.2 mg, 36.4 μmol) were added and stirred for 16 hours. A 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction mixture, and the mixture was eluted by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product are collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide-azido modified ester linker conjugate-NHS activated product (3.0 mg, 1.19 μmol). got
MS(ESI) m/z:z=2 1257[M+2H]2+,z=3 837[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1257 [M+2H] <2+> , z=3 837 [M+3H] <3+>
(11-3)アセタールリンカーの合成とペプチドの連結
(11-3-1)アセタールリンカーの合成
3,9-ビス(2-シアノエチル)-2,4,8,10-[5.5]テトラオキサスピロウンデカン(200mg,0.752mmol)を8M水酸化ナトリウム水溶液20mLに溶解させ、100℃で16時間攪拌した。16時間後室温に戻し、水相に6M塩酸水
溶液を加え、系内のpHを7.0に調整した後、アセトニトリル、食塩水を順次加え分液操作を行った。アセトニトリル相を回収後、無水硫酸ナトリウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸ナトリウムを取り除き、減圧下濃縮することにより、2,4,8,10-[5.5]テトラオキサスピロウンデカン-3,9-ジプロパン酸(151mg,0.497mmol)を得た。
3,9-bis(2-cyanoethyl)-2,4,8,10-[5.5]tetraoxaspiroundecane (200 mg, 0.752 mmol) was dissolved in 20 mL of 8 M aqueous sodium hydroxide solution and stirred at 100° C. for 16 Stirred for hours. After 16 hours, the temperature was returned to room temperature, and a 6M hydrochloric acid aqueous solution was added to the aqueous phase to adjust the pH of the system to 7.0. After recovering the acetonitrile phase, anhydrous sodium sulfate was added and the mixture was allowed to stand for 5 minutes. Sodium sulfate was removed by filtration and concentration under reduced pressure gave 2,4,8,10-[5.5]tetraoxaspironedecane-3,9-dipropanoic acid (151 mg, 0.497 mmol). .
MS(ESI) m/z:327[M+Na]+ MS (ESI) m/z: 327 [M+Na] +
2-[9-(2-メトキシ-2-オキソ-エチル)-2,4,8,10-テトラオキソスピロ[5.5]ウンデカン-3-イル]酢酸(30.0mg,0.099mmol)を酢酸エチル0.5mLに溶解し、N,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(22.4mg,0.109mmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(31.2mg,0.271mmol)を加え2時間攪拌した。生じた白色結晶をろ過し母液を減圧下濃縮し、ビス(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)2,4,8,10-[5.5]テトラオキサスピロウンデカン-3,9-ジプロパノエート(15mg,31.8μmol)を得た。 2-[9-(2-Methoxy-2-oxo-ethyl)-2,4,8,10-tetraoxospiro[5.5]undecane-3-yl]acetic acid (30.0 mg, 0.099 mmol) It was dissolved in 0.5 mL of ethyl acetate, N,N'-dicyclohexylcarbodiimide (22.4 mg, 0.109 mmol) and N-hydroxysuccinimide (31.2 mg, 0.271 mmol) were added, and the mixture was stirred for 2 hours. The resulting white crystals were filtered, and the mother liquor was concentrated under reduced pressure to give bis(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)-2,4,8,10-[5.5]tetraoxaspironedecane-3,9- Dipropanoate (15 mg, 31.8 μmol) was obtained.
MS(ESI) m/z:521[M+Na]+ MS (ESI) m/z: 521 [M+Na] +
(11-3-2)アセタールリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(3.0mg,1.45μmol、ただし、4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチルホルムアミド0.3mLに溶解し、(ビス(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)2,4,8,10-[5.5]テトラオキサスピロウンデカン-3,9-ジプロパノエート(14.4mg,28.9μmol)を加え室温で12時間攪拌した。水を加え中
性のアセトニトリルおよび水を溶媒として逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドアセタールリンカー連結物-NHS活性化体(2.8mg,1.14μmol)を得た。
The peptide (3.0 mg, 1.45 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that two cysteines at
MS(ESI) m/z:z=2 1729[M+2H]2+,z=3 819[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1729 [M+2H] <2+> , z=3 819 [M+3H] <3+>
[実施例12:種々の化合物による抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾、ならびにESI-TOFMSによる解析]
(12-1)アジド修飾チオエステルリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例11の(11-1-2)で合成したペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)120μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)39.8μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を2.4μL(抗体に対して12等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148225にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入された153018にピークが観測された。
[Example 12: Modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab with various compounds and analysis by ESI-TOFMS]
(12-1) Specific modification of IgG antibody trastuzumab with azide-modified thioester linker-binding peptide reagent and analysis by ESI-TOFMS Peptide synthesized in (11-1-2) of Example 11-azido-modified thioester linker conjugate- The activated NHS was dissolved in N,N'-dimethylformamide to 4 mM. Dissolve 120 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 39.8 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 2.4 μL of 4 mM peptide reagent (12 equivalents to the antibody), and incubate at room temperature for 1 hour. Stirred for hours. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148225 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 153018 for the product into which two binding peptides were introduced.
(12-2)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(12-1)で生成した抗体・ペプチド複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖に結合性ペプチドが導入された52995および53156にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(12-2) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of the anti-HER2
(12-3)マレイミド修飾チオエステルリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例11の(11-1-2)で合成したペプチド-マレイミド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)120μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)39.8μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を2.4μL(抗体に対して12等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148225にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入された153901にピークが観測された。
(12-3) Specific modification of IgG antibody trastuzumab with maleimide-modified thioester linker-binding peptide reagent and analysis by ESI-TOFMS Peptide synthesized in (11-1-2) of Example 11-maleimide-modified thioester linker conjugate- The activated NHS was dissolved in N,N'-dimethylformamide to 4 mM. Dissolve 120 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 39.8 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 2.4 μL of 4 mM peptide reagent (12 equivalents to the antibody), and incubate at room temperature for 1 hour. Stirred for hours. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148225 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 153901 for the product into which two binding peptides were introduced.
(12-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(12-3)で生成した抗体・ペプチド複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは50594、50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖に結合性ペプチドが導入された53421および53600にピークが観察
され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(12-4) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of the anti-HER2
(12-5)アジド修飾エステルリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例11の(11-2-2)で合成したペプチド-アジド修飾エステルリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)120μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)39.8μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を2.4μL(抗体に対して12等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148225にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入された153028にピークが観測された。
(12-5) Specific modification of IgG antibody trastuzumab with azide-modified ester linker-binding peptide reagent and analysis by ESI-TOFMS Peptide synthesized in (11-2-2) of Example 11-azido-modified ester linker conjugate- The activated NHS was dissolved in N,N'-dimethylformamide to 4 mM. Dissolve 120 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 39.8 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 2.4 μL of 4 mM peptide reagent (12 equivalents to the antibody), and incubate at room temperature for 1 hour. Stirred for hours. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148225 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 153028 for the product into which two binding peptides were introduced.
(12-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(12-5)で生成した抗体・ペプチド複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは50594および50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖に結合性ペプチドが導入された52994および53154にピークが確認され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(12-6) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of the anti-HER2
(12-7)アセタールリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例11の(11-3-2)で合成したペプチド-アセタールリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)120μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH
5.5)39.8μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を2.4μL(抗体に対して12等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148238にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入された153522にピークが観測された。
(12-7) Specific modification of IgG antibody trastuzumab with acetal linker-binding peptide reagent and analysis by ESI-TOFMS Peptide synthesized in (11-3-2) of Example 11-acetal linker conjugate-NHS activated product was dissolved in N,N'-dimethylformamide to 4 mM. 120 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 50 mM sodium acetate buffer (pH
5.5) Dissolved in 39.8 μL, added 2.4 μL of 4 mM peptide reagent (12 equivalents to the antibody), and stirred at room temperature for 1 hour. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148238 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 153522 for the product into which two binding peptides were introduced.
(12-8)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(12-7)で生成した抗体・ペプチド複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖に結合性ペプチドが導入された52940および53103にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(12-8) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of anti-HER2
[実施例13:トラスツズマブ・ペプチド複合体の切断、およびそれらの生成物のESI-TOFMSによる解析]
(13-1)トラスツズマブ・ペプチド複合体のリンカー切断、および生成物のESI-TOFMSによる解析
先ず、実施例12の(12-1)で合成したトラスツズマブ・ペプチド複合体40μgを100mM Tris・塩酸バッファー(pH8.5)に溶解し、2.0μMとした後、室温で48時間攪拌して、リンカー中のチオエステル結合を切断した。ESI-TOF
MSにより質量を測定したところ、トラスツズマブ・ペプチド複合体は153018にピークが観測され、生成物はアジドが二つ導入された148729にピークが観測された。
Example 13 Cleavage of Trastuzumab Peptide Complexes and Analysis of Their Products by ESI-TOFMS
(13-1) Linker Cleavage of Trastuzumab-Peptide Complex and ESI-TOFMS Analysis of Product pH 8.5) to 2.0 μM, and stirred at room temperature for 48 hours to cleave the thioester bond in the linker. ESI-TOF
When the mass was measured by MS, a peak was observed at 153018 for the trastuzumab-peptide complex, and a peak was observed at 148729 for the product into which two azides were introduced.
(13-2)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(13-1)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブ・ペプチド複合体は52995および53155に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖にアジドが導入された50850および51010にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(13-2) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(13-3)トラスツズマブ・ペプチド複合体のリンカー切断、および生成物のESI-TOFMSによる解析
先ず、実施例12の(12-3)で合成したトラスツズマブ・ペプチド複合体20μgを100mM Tris・塩酸バッファー(pH8.5)に溶解し、2.0μMとした後、室温で48時間攪拌して、リンカー中のチオエステル結合を切断した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、トラスツズマブ・ペプチド複合体は153901にピークが観測され、生成物はマレイミドが二つ導入された149476にピークが観測された。
(13-3) Linker Cleavage of Trastuzumab-Peptide Complex and ESI-TOFMS Analysis of Product pH 8.5) to 2.0 μM, and stirred at room temperature for 48 hours to cleave the thioester bond in the linker. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 153901 for the trastuzumab-peptide complex, and a peak was observed at 149476 for the product into which two maleimides were introduced.
(13-4)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(13-3)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、トラスツズマブ・ペプチド複合体は53421、および53600に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖にマレイミドが導入された51278および51439にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(13-4) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(13-5)エステルリンカーの切断とESI-TOFMSによる解析
任意のバッファー(pH4.5~9.0)に、実施例12の(12-5)で合成した抗体・ペプチドエステルリンカー複合体を溶解し、エステラーゼ系酵素を加え室温で攪拌することで、エステル構造が加水分解し、アジド基が抗体上に残る。これをESI-TOFMSにより質量を測定することができる。
(13-5) Cleavage of ester linker and analysis by ESI-TOFMS Dissolve the antibody/peptide ester linker conjugate synthesized in (12-5) of Example 12 in any buffer (pH 4.5 to 9.0). Then, by adding an esterase enzyme and stirring at room temperature, the ester structure is hydrolyzed and the azide group remains on the antibody. The mass of this can be measured by ESI-TOFMS.
(13-6)トラスツズマブ・ペプチド複合体のリンカー切断、および生成物のESI-TOFMSによる解析
先ず、実施例12の(12-7)で合成したトラスツズマブ・ペプチド複合体20μgを100mM グリシン・塩酸バッファー(pH2.0)に溶解し、2.0μMとした後、室温で攪拌して、リンカー中のアセタール結合を切断した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、トラスツズマブ・ペプチド複合体は1535223にピークが観測され、生成物はアルデヒドが二つ導入された148452にピークが観測された。
(13-6) Linker Cleavage of Trastuzumab-Peptide Complex and ESI-TOFMS Analysis of Product pH 2.0) to 2.0 μM, and then stirred at room temperature to cleave the acetal bond in the linker. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 1535223 for the trastuzumab-peptide complex, and a peak was observed at 148452 for the product into which two aldehydes were introduced.
(13-7)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(13-1)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料の抗体・ペプチド複合体は52940,および53103に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、
生成物は重鎖にアルデヒドが導入された50683および50845にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(13-7) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
As for the product, peaks were observed at 50683 and 50845 where aldehyde was introduced into the heavy chain, and a light chain peak was observed at 23440 which was the same as the raw material.
[実施例14:トラスツズマブ-アジド導入体と低分子化合物とのコンジュゲーション](14-1)トラスツズマブのアジド導入体と低分子化合物とのコンジュゲーション
実施例13の(13-1)で合成した、トラスツズマブのアジド導入体を20mM PBSバッファーに溶解し0.3mMとした後、Sigma Aldrich製 Dibenzocyclooctyne-Cy3(0.94mM、DMFに溶解)を20μL添加し、室温で12時間攪拌した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換し反応を停止した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブのアジド導入体は148706にピークが観測され、生成物は低分子が二つ導入された150688にピークが観測された。
[Example 14: Conjugation of trastuzumab-azide derivative and low molecular compound] (14-1) Conjugation of trastuzumab azide derivative and low molecular compound Synthesized in (13-1) of Example 13, After dissolving the azide derivative of trastuzumab in 20 mM PBS buffer to 0.3 mM, 20 μL of Sigma Aldrich's Dibenzocycloctyne-Cy3 (0.94 mM, dissolved in DMF) was added and stirred at room temperature for 12 hours. The solvent of the reaction solution was replaced with 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4) using Amicon 10K to terminate the reaction. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148706 for the azide-introduced trastuzumab starting material, and a peak was observed at 150688 for the product into which two low molecules were introduced.
(14-2)トラスツズマブ-低分子化合物複合体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(14-1)で生成した抗体・低分子複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブのアジド導入体は50850および51010に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖に低分子が導入された51834および51990にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(14-2) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis of trastuzumab-low molecular compound complex under reducing
[実施例15:トラスツズマブのアジド導入体のペプチドマッピング]
(15-1)トラスツズマブのアジド導入体(実施例14)のトリプシン処理
1.5mL低吸着マイクロテストチューブにサンプル溶液を10μL、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、20%トリフルオロエタノールに溶解した20mMのジチオスレイトール水溶液10μLを加えて65℃で1時間加温後、50mMのヨードアセトアミド水溶液10μLを添加し、遮光下室温で30分間300rpmで振盪し反応させた。反応後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を40μL加えて撹拌し、20ng/μLのトリプシン水溶液(Proteomics Grade, Code No.T6567-5x20μg(SIGMA))を10μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、20%トリフルオロ酢酸水溶液2μL添加し反応を止めた。その後、終濃度0.25%トリフルオロ酢酸水溶液となるように2倍希釈し、LC-MS/MS測定に使用した。
[Example 15: Peptide mapping of azide derivative of trastuzumab]
(15-1) Trypsin treatment of trastuzumab azide derivative (Example 14) 10 μL of sample solution in 1.5 mL low-adsorption microtest tube, 50 mM ammonium bicarbonate buffer, 20 mM dithio dissolved in 20% trifluoroethanol After adding 10 μL of threitol aqueous solution and heating at 65° C. for 1 hour, 10 μL of 50 mM iodoacetamide aqueous solution was added and reacted by shaking at 300 rpm for 30 minutes at room temperature in the dark. After the reaction, 40 μL of 50 mM ammonium bicarbonate buffer was added and stirred, and 10 μL of 20 ng/μL trypsin aqueous solution (Proteomics Grade, Code No. T6567-5×20 μg (SIGMA)) was added for enzymatic digestion at 37° C. for 18 hours. After digestion, 2 μL of 20% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to stop the reaction. After that, it was diluted two-fold to an aqueous solution of trifluoroacetic acid with a final concentration of 0.25%, and used for LC-MS/MS measurement.
(15-2)トラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(分析装置)
ナノHPLC:EASY-nLC 1000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
質量分析計:トライブリッド質量分析計Orbitrap Fusion(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
(15-2) Trastuzumab LC-MS/MS measurement conditions (analytical device)
Nano HPLC: EASY-nLC 1000 (Thermo Fisher Scientific)
Mass spectrometer: Tribrid mass spectrometer Orbitrap Fusion (Thermo Fisher Scientific)
(HPLC分析条件)
トラップカラム:Acclaim PepMap(登録商標) 100,75μmx2cm(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
分析カラム:ESI-column(NTCC-360/75-3-125,75μm×12.5cm,3μm(日京テクノス株式会社))
移動相A:0.1%ギ酸水溶液
移動相B:0.1%ギ酸、アセトニトリル溶液
ローディング溶液:0.1%トリフルオロ酢酸水溶液
流速:300nL/min
サンプル注入量:1μL
グラジエント条件(B%):2%(0.0-0.5分)、2%→30%(0.5-23.5分)、30%→75%(23.5-25.5分)、75%(25.5-35.0分)
(HPLC analysis conditions)
Trap column: Acclaim PepMap® 100, 75 μm x 2 cm (Thermo Fisher Scientific)
Analysis column: ESI-column (NTCC-360/75-3-125, 75 μm×12.5 cm, 3 μm (Nikkyo Technos Co., Ltd.))
Mobile phase A: 0.1% formic acid aqueous solution Mobile phase B: 0.1% formic acid, acetonitrile solution Loading solution: 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution Flow rate: 300 nL/min
Sample injection volume: 1 μL
Gradient conditions (B%): 2% (0.0-0.5 minutes), 2% → 30% (0.5-23.5 minutes), 30% → 75% (23.5-25.5 minutes ), 75% (25.5-35.0 min)
(質量分析計分析条件)
イオン化法:ESI, Positiveモード
スキャンタイプ:Data Dependent Aquisition
Activation Type:Collision Induced Dissociation(CID)
データの取得は付属ソフトであるXcalibur 3.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)およびThermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(Mass spectrometer analysis conditions)
Ionization method: ESI, Positive mode Scan type: Data Dependent Aquisition
Activation Type: Collision Induced Dissociation (CID)
Acquisition of data was carried out using attached software Xcalibur 3.0 (Thermo Fisher Scientific) and Thermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0 (Thermo Fisher Scientific).
(15-3)トラスツズマブの修飾部位の解析条件
LC-MS/MS測定結果に対する修飾部位解析については、Proteome Discoverer version 1.4(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(15-3) Analysis Conditions for Modified Site of Trastuzumab Modified site analysis for LC-MS/MS measurement results was performed using Proteome Discoverer version 1.4 (Thermo Fisher Scientific).
Proteome Discovererでの解析は、Sequest HTを検索エンジンとして使用し、プリカーサーイオンの範囲を350~5000Da、Total Intensity Thresholdを50000とした。また、トリプシンを消化酵素として設定し、Maximum Missed Cleavage Sitesは3とした。また、プリカーサーおよびフラグメントイオンのMass Toleranceは、それぞれ5ppmおよび0.5Daとした。Static Modificationにはヨードアセトアミドによるシステイン残基の修飾として、Carbamidomethyl(+57.021Da)を設定した。Dynamic Modificationsについては、メチオニンの酸化(+15.995Da)およびリジン残基への修飾体(アジド導入体(+254.102Da)、アミン導入体(+228.111Da))を設定した。さらに、Peptide ConfidenceがHighのもののみとなるようフィルターをかけた。 The analysis with Proteome Discoverer used Sequest HT as a search engine, with a precursor ion range of 350-5000 Da and a Total Intensity Threshold of 50000. Also, trypsin was set as a digestive enzyme, and Maximum Missed Cleavage Sites was set to 3. Also, the mass tolerances of precursor and fragment ions were set to 5 ppm and 0.5 Da, respectively. Carbamidomethyl (+57.021 Da) was set as Static Modification as modification of cysteine residue with iodoacetamide. For Dynamic Modifications, methionine oxidation (+15.995 Da) and modifications to lysine residues (azide introduction (+254.102 Da), amine introduction (+228.111 Da)) were set. Furthermore, a filter was applied so that Peptide Confidence was High only.
また、修飾部位の検索対象のアミノ酸配列のデータとして、図24に示される(1)~(3)を用いた。 In addition, (1) to (3) shown in FIG. 24 were used as the amino acid sequence data to be searched for the modification site.
(15-4)トラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC-MS/MSを用いた解析の結果、トラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(アジド導入体(+254.102Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号40)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 979.49982、理論値:979.49975、4価)が観測され(図25)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位のリジン残基の修飾を示す、2価のy19に相当するm/z 1192.87(理論値:1192.64)のプロダクトイオンが確認された(図26)。
(15-4) Analysis results of modification site by LC-MS/MS of trastuzumab As a result of analysis using LC-MS/MS, modification site to lysine residue by trypsin digestion of trastuzumab (azide introduction (+254.102 Da )) containing 33 amino acid residues, a peptide fragment of THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR (SEQ ID NO: 40) MS spectrum (actual value: m / z 979.49982, theoretical value: 979.49975, tetravalent) was observed (Fig. 25), the product ion of m / z 1192.87 (theoretical value: 1192.64) corresponding to divalent y19, which indicates the modification of the lysine residue at position 246 in the EU numbering of the heavy chain from the CID spectrum, was confirmed. (Fig. 26).
[実施例16:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(16-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCKYHRGQLVWCTYH-NH2(配列番号42)の配列をFmo
c固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(36.4mg,16.8μmol)を得た。
[Example 16: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(16-1) Synthesis of IgG1 Fc-binding peptide The sequence of Ac-RGNCKYHRGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 42) was
c Synthesized by the solid-phase synthesis method. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (36.4 mg, 16.8 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 721.80 [M+3H]3+, z=4 541.60 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 721.80 [M+3H] <3+> , z=4 541.60 [M+4H] <4+>
(16-2)Ac-RGNCKYHRGQLVWCTYH-NH2(配列番号42)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(16-1)で合成したペプチド(36.4mg,16.8μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し2M NH3-MeOH(17.0μL,33.6μmol)、過酸化水素水(34.0μL,0.336mmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(20.3mg,9.40μmol)を得た。 The peptide (36.4 mg, 16.8 µmol) synthesized in (16-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), and 2M NH 3 -MeOH (17.0 µL, 33.6 µmol), hydrogen peroxide solution (34. 0 μL, 0.336 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to terminate the reaction, dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution, and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% fluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (20.3 mg, 9.40 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 721.25 [M+3H]3+, z=4 541.20 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 721.25 [M+3H] <3+> , z=4 541.20 [M+4H] <4+>
(16-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(16-2)で合成したAc-RGNCKYHRGQLVWCTYH-NH2(配列番号42)(20.3mg,9.40μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(228mg,0.563mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(6.80mg,2.78μmol)を得た。
Ac-RGNCKYHRGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 42) (20.3 mg, 9.40 μmol) synthesized in (16-2), provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=3 817.60 [M+3H]3+, z=4 613.45 [M+4H]4+
HPLC純度:100%
MS (ESI) m/z: z=3 817.60 [M+3H] <3+> , z=4 613.45 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 100%
(16-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とMALDI-TOFMSによる解析
(16-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。MALDI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブ由来ピークは確認されず、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152639にピークが観測された。
(16-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by MALDI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (16-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by MALDI-TOFMS, no peak derived from the raw material trastuzumab was confirmed, and a peak at 152639 was observed for a product into which one binding peptide had been introduced.
(16-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(16-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,p
H7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(16-5) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (16-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer : 0.1M PiNa, 2.3M ( NH4 ) 2SO4 , p
H7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.454分はトラスツズマブ原料、9.845分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、10.173分はペプチドがトラスツズマブに2個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.541分はトラスツズマブ原料、9.936分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、10.254分はペプチドがトラスツズマブに2個導入された化合物であると考えられる(図27)。
In the case of
[実施例17:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(17-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCAWHRGKLVWCTYH-NH2(配列番号43)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテル加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(64.8mg,30.5μmol)を得た。
[Example 17: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(17-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCAWHRGKLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 43) was synthesized by the Fmoc solid-phase synthesis method. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (64.8 mg, 30.5 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 710.45 [M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=3 710.45 [M+3H] 3+
(17-2)Ac-RGNCAWHRGKLVWCTYH-NH2(配列番号43)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(17-2)で合成したペプチド(64.8mg,30.5μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(31.0μL,61.0μmol)、過酸化水素水(62.0μL,610μmol)を加え室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(35.3mg,16.6μmol)を得た。 The peptide (64.8 mg, 30.5 µmol) synthesized in (17-2) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (31.0 µL, 61.0 µmol), hydrogen peroxide solution (62 .0 μL, 610 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the target product (35.3 mg, 16.6 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 709.75 [M+3H]3+, z=4 532.55 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 709.75 [M+3H] <3+> , z=4 532.55 [M+4H] <4+>
(17-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(17-2)で合成したAc-RGNCAWHRGKLVWCTYH-NH2(配列番号43)(35.3mg,16.6μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(269mg,0.664mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去
した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(17.5mg,7.25μmol)を得た。
Ac-RGNCAWHRGKLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 43) (35.3 mg, 16.6 μmol) synthesized in (17-2), provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=3 806.20 [M+3H]3+, z=4 604.90 [M+4H]4+
HPLC純度:100%
MS (ESI) m/z: z=3 806.20 [M+3H] <3+> , z=4 604.90 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 100%
(17-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(17-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148235にピークが観測され、結合性ペプチドが導入された生成物由来のピークは観測されなかった。
(17-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (17-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148235 for the raw material trastuzumab, and no peak derived from the product into which the binding peptide had been introduced was observed.
(17-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(17-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50594、50753および、原料と同じ23435に軽鎖ピークが観測された。
(17-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(17-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(17-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(17-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (17-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.469分はトラスツズマブ原料、10.180分はペプチド由来のピークであると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.563分はトラスツズマブ原料、10.270分はペプチド由来のピークであると考えられる(図28)。
In the case of
[実施例18:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当
該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(18-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCKWHRGELVWCTYH-NH2(配列番号44)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(77.8mg,35.6μmol)を得た。
[Example 18: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(18-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCKWHRGELVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 44) was synthesized by the Fmoc solid-phase synthesis method. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (77.8 mg, 35.6 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 729.70 [M+H]+, z=4 547.60 [M+H]+ MS (ESI) m/z: z = 3 729.70 [M+H] + , z = 4 547.60 [M+H] +
(18-2)Ac-RGNCKWHRGELVWCTYH-NH2(配列番号44)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(18-1)で合成したペプチド(77.8mg,35.6μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(71.0μL,142μmol)、過酸化水素水(145μL,1.42mmol)を加え室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(40.0mg,18.3μmol)を得た。 The peptide (77.8 mg, 35.6 µmol) synthesized in (18-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (71.0 µL, 142 µmol), hydrogen peroxide solution (145 µL, 1 .42 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the target product (40.0 mg, 18.3 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 729.00 [M+3H]3+, z=4 547.05 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 729.00 [M+3H] <3+> , z=4 547.05 [M+4H] <4+>
(18-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(18-2)で合成したAc-RGNCKWHRGELVWCTYH-NH2(配列番号44)(40.0mg,18.3μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(296mg,0.733mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶媒で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(20.0mg,8.09μmol)を得た。
Ac-RGNCKWHRGELVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 44) synthesized in (18-2) (40.0 mg, 18.3 μmol, provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=3 825.55 [M+3H]3+, z=4 619.45 [M+4H]4+
HPLC純度:31%
MS (ESI) m/z: z=3 825.55 [M+3H] <3+> , z=4 619.45 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 31%
(18-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(18-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148222にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が150583にピークが観測された。
(18-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (18-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148222 for the starting trastuzumab and a peak at 150583 for the product into which one binding peptide was introduced.
(18-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(18-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が
導入された50680、50719および、原料と同じ23438に軽鎖ピークが観測された。
(18-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(18-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(18-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(18-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (18-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.462分はトラスツズマブ原料、10.142分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.554分はトラスツズマブ原料、10.230分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図29)。
In the case of UV225 nm, Retension Time 9.462 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 10.142 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into trastuzumab. In the case of
[実施例19:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(19-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCKWHRGQLVWCTYH-NH2(配列番号45)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(74.1mg,34.0μmol)を得た。
[Example 19: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(19-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCKWHRGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 45) was synthesized by the Fmoc solid-phase synthesis method. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (74.1 mg, 34.0 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 729.40 [M+3H]3+, z=4 547.35 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 729.40 [M+3H] <3+> , z=4 547.35 [M+4H] <4+>
(19-2)Ac-RGNCKWHRGQLVWCTYH-NH2(配列番号45)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(19-2)で合成したペプチド(74.1mg,34.0μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(67.8μL,0.136mmol)、過酸化水素水(139μL,1.36mmol)を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(38.2mg,17.5μmol)を得た。 The peptide (74.1 mg, 34.0 μmol) synthesized in (19-2) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (67.8 μL, 0.136 mmol), and hydrogen peroxide solution (139 μL). , 1.36 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (38.2 mg, 17.5 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 728.80 [M+3H]3+, z=4 546.85 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 728.80 [M+3H] <3+> , z=4 546.85 [M+4H] <4+>
(19-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(19-2)で合成したAc-RGNCKWHRGQLVWCTYH-NH2(配列番号45)(38.2mg,17.5μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(283mg,0.70mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去し
た後、0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(16.5mg,6.68μmol)を得た。
Ac-RGNCKWHRGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 45) synthesized in (19-2) (38.2 mg, 17.5 μmol, provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=3 825.25 [M+3H]3+, z=4 619.25 [M+4H]4+
HPLC純度:100%
MS (ESI) m/z: z=3 825.25 [M+3H] <3+> , z=4 619.25 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 100%
(19-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(19-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148064にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が150600にピークが観測された。
(19-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (19-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148064 for the raw material trastuzumab and a peak at 150600 for the product into which one binding peptide was introduced.
(19-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(19-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50683、50717および、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(19-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(19-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(19-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(19-5) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (19-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.458分はトラスツズマブ原料、10.137分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.550分はトラスツズマブ原料、10.225分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図30)。
In the case of UV225 nm, Retension Time 9.458 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 10.137 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into trastuzumab. In the case of
[実施例20:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(20-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCKYHLGELVWCTYH-NH2(配列番号46)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(34.5mg,16.3μmol)を得た。
[Example 20: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(20-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCKYHLGELVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 46) was synthesized by Fmoc solid-phase synthesis. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (34.5 mg, 16.3 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 707.80 [M+3H]3+, z=4 531.10 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 707.80 [M+3H] <3+> , z=4 531.10 [M+4H] <4+>
(20-2)Ac-RGNCKYHLGELVWCTYH-NH2(配列番号46)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(20-1)で合成したペプチド(34.5mg,16.3μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(17.0μL,32.6μmol)、過酸化水素水(33.0μL,0.326mmol)を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(15.6mg,7.37μmol)を得た。 The peptide synthesized in (20-1) (34.5 mg, 16.3 μmol) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (17.0 μL, 32.6 μmol), hydrogen peroxide solution (33 .0 μL, 0.326 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the target product (15.6 mg, 7.37 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 707.10 [M+3H]3+, z=4 530.60 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 707.10 [M+3H] <3+> , z=4 530.60 [M+4H] <4+>
(20-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(20-2)で合成したAc-RGNCKYHLGELVWCTYH-NH2(配列番号46)(15.6mg,7.37μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(119mg,0.295mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(5.00mg,2.08μmol)を得た。
Ac-RGNCKYHLGELVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 46) synthesized in (20-2) (15.6 mg, 7.37 μmol, provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=2 1204.85 [M+2H]2+, z=3 803.50 [M+3H]3+
HPLC純度:70%
MS (ESI) m/z: z=2 1204.85 [M+2H] <2+> , z=3 803.50 [M+3H] <3+>
HPLC Purity: 70%
(20-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(20-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。
(20-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (20-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer.
(20-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(20-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(20-5) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (20-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.581分にトラスツズマブ原料のピーク、10.089分にピークが観測された。UV280nmの場合、Retension Time 9.663分にトラスツズマブ原料のピーク、10.307分にピークが観測された(図31)。
In the case of
[実施例21:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(21-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCKYHLGQLVWCTYH-NH2(配列番号47)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(53.0mg,25.0μmol)を得た。
[Example 21: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(21-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCKYHLGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 47) was synthesized by the Fmoc solid-phase synthesis method. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (53.0 mg, 25.0 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 707.40 [M+3H]3+, z=4 530.80 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 707.40 [M+3H] <3+> , z=4 530.80 [M+4H] <4+>
(21-2)Ac-RGNCKYHLGQLVWCTYH-NH2(配列番号47)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(21-1)で合成したペプチド(53.0mg,25.0μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(25.0μL,50.0μmol)、
過酸化水素水(51.0μL,0.500mmol)を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(23.2mg,10.9μmol)を得た。
The peptide (53.0 mg, 25.0 μmol) synthesized in (21-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (25.0 μL, 50.0 μmol),
A hydrogen peroxide solution (51.0 μL, 0.500 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (23.2 mg, 10.9 μmol).
MS (ESI) m/z: z=3 706.75 [M+3H]3+, z=4 530.35 [M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 706.75 [M+3H] <3+> , z=4 530.35 [M+4H] <4+>
(21-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(21-2)で合成したAc-RGNCKYHLGQLVWCTYH-NH2(配列番号47)(23.2mg,10.9μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(176mg,0.436mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(6.40mg,2.66 μmol)を得た。
Ac-RGNCKYHLGQLVWCTYH-NH 2 (SEQ ID NO: 47) (23.2 mg, 10.9 μmol) synthesized in (21-2), provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=2 1204.30 [M+2H]2+, z=3 803.15 [M+3H]3+
HPLC純度:61%
MS (ESI) m/z: z=2 1204.30 [M+2H] <2+> , z=3 803.15 [M+3H] <3+>
HPLC Purity: 61%
(21-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(21-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラス
ツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148069にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は150515にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は152972にピークが観測された。
(21-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (21-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148069 for the raw material trastuzumab, a peak was observed at 150515 for the product into which one binding peptide was introduced, and two binding peptides were introduced. A peak was observed at 152,972.
(21-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(21-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50683、50844、および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(21-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(21-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(21-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(21-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (21-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.454分はトラスツズマブ原料、9.877分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、10.230分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.540分はトラスツズマブ原料、9.966分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、10.317分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図32)。
In the case of UV225 nm, the retention time of 9.454 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 9.877 minutes is considered to be the compound in which one peptide was introduced into trastuzumab, and 10.230 minutes is considered to be the compound into which two peptides were introduced. In the case of
[実施例22:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(22-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKWHLGELVWCT-NH2(配列番号48)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(71.1mg,43.6μmol)を得た。
MS(ESI)m/z:z=2 816.350[M+2H]2+
[Example 22: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(22-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKWHLGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 48) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (71.1 mg, 43.6 μmol) was obtained.
MS (ESI) m/z: z=2 816.350 [M+2H] 2+
(22-2)Ac-DCKWHLGELVWCT-NH2(配列番号48)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(22-1)で合成したペプチド(71.1mg,43.6μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(43.6μL,87.2μmol)、過酸化水素水(88.8μL,87.2μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(31.6mg,19.4μmol)を得た。 The peptide (71.1 mg, 43.6 μmol) synthesized in (22-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (43.6 μL, 87.2 μmol), hydrogen peroxide solution (88 .8 μL, 87.2 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (31.6 mg, 19.4 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 815.350[M+2H]2+ MS (ESI) m/z: z=2 815.350 [M+2H] 2+
(22-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(22-2)で合成したAc-DCKWHLGELVWCT-NH2(配列番号48)(31.6mg,19.4μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(312mg,776μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NH
S活性化体(14.2mg,7.40μmol)を得た。
Ac-DCKWHLGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 48) synthesized in (22-2) (31.6 mg, 19.4 μmol, provided that the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), and di(N-succinimidyl) 3,3′-dithiodipropionate (312 mg, 776 μmol) was dissolved in acetonitrile (2.00 mL). The mixture was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product are collected and concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, followed by lyophilization to give the peptide disulfide linker conjugate-NH
S-activated form (14.2 mg, 7.40 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 960.05[M+2H]2+
HPLC純度:70%
MS (ESI) m/z: z=2 960.05 [M+2H] 2+
HPLC Purity: 70%
(22-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(22-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。
(22-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (22-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer.
(22-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(22-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(22-5) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (22-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 11.193分、11.981分にピークが観測された。UV280nmの場合、Retension Time 11.257分、12.057分にピークが観測された(図33)。
In the case of
[実施例23:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(23-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKYHLGELVWCT-NH2(配列番号49)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(28.0mg,17.4μmol)を得た。
[Example 23: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(23-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKYHLGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 49) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (28.0 mg, 17.4 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 804.80[M+2H]2+ MS (ESI) m/z: z=2 804.80 [M+2H] 2+
(23-2)Ac-DCKYHLGELVWCT-NH2(配列番号49)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(23-1)で合成したペプチド(28.0mg,17.4μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(17.4μL,34.8μmol)、過酸化水素水(35.4μL,348μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(18.0mg,11.2μmol)を得た。 The peptide (28.0 mg, 17.4 μmol) synthesized in (23-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (17.4 μL, 34.8 μmol), hydrogen peroxide solution (35 .4 μL, 348 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (18.0 mg, 11.2 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 803.90[M+2H]2+ MS (ESI) m/z: z=2 803.90 [M+2H] 2+
(23-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(23-2)で合成したAc-DCKYHLGELVWCT-NH2(配列番号49)(18.0mg,11.2μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(181mg,448μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NH
S活性化体(2.75mg,1.45μmol)を得た。
Ac-DCKYHLGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 49) synthesized in (23-2) (18.0 mg, 11.2 μmol, provided that the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), and di(N-succinimidyl) 3,3′-dithiodipropionate (181 mg, 448 μmol) was dissolved in acetonitrile (2.00 mL). The mixture was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product are collected and concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, followed by lyophilization to give the peptide disulfide linker conjugate-NH
S-activated form (2.75 mg, 1.45 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 948.55[M+2H]2+
HPLC純度:75%
MS (ESI) m/z: z=2 948.55 [M+2H] 2+
HPLC Purity: 75%
(23-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(23-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は150001にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は151618にピークが観測された。
(23-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (23-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 150001 for the product into which one binding peptide was introduced, and a peak was observed at 151618 for the product into which two binding peptides were introduced.
(23-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(23-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50682、50845および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(23-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(23-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(23-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(23-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (23-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 10.347分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.015分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 10.434分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.100分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図34)。
In the case of
[実施例24:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(24-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKWHRGELVWCT-NH2(配列番号50)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(52.8mg,31.5μmol)を得
た。
[Example 24: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(24-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKWHRGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 50) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (52.8 mg, 31.5 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 837.85[M+2H]2+,z=3 558.90[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 837.85 [M+2H] <2+> , z=3 558.90 [M+3H] <3+>
(24-2)Ac-DCKWHRGELVWCT-NH2(配列番号50)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(24-1)で合成したペプチド(52.8mg,31.5μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(31.5μL,63.0μmol)、過酸化水素水(64.0μL,630μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(26.9mg,16.1μmol)を得た。 The peptide (52.8 mg, 31.5 µmol) synthesized in (24-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (31.5 µL, 63.0 µmol), hydrogen peroxide solution (64 .0 μL, 630 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (26.9 mg, 16.1 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 836.75[M+2H]2+,z=3 558.25[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 836.75 [M+2H] <2+> , z=3 558.25 [M+3H] <3+>
(41-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(24-2)で合成したAc-DCKWHRGELVWCT-NH2(配列番号50)(26.9mg,16.1μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、そ
れぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(260mg,644μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(8.40mg,4.28μmol)を得た。
Ac-DCKWHRGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 50) synthesized in (24-2) (26.9 mg, 16.1 μmol, provided that the two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=2 981.50[M+2H]2+,z=3 654.70[M+3H]3+
HPLC純度:78%
MS (ESI) m/z: z=2 981.50 [M+2H] <2+> , z=3 654.70 [M+3H] <3+>
HPLC Purity: 78%
(24-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(24-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は150268にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は152295にピークが観測された。
(24-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (24-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 150268 for the product into which one binding peptide was introduced, and a peak was observed at 152295 for the product into which two binding peptides were introduced.
(24-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(24-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50682、50841および、原料と同じ23438に軽鎖ピークが観測された。
(24-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(24-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(24-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(24-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (24-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 10.749分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.679分はペプチドが2個導入された化
合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 10.849分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.782分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図35)。
In the case of UV225 nm, the compound with a retention time of 10.749 minutes and 11.679 minutes is considered to be a compound in which one peptide was introduced into trastuzumab, and a compound in which two peptides were introduced. In the case of
[実施例25:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(25-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKWHLGQLVWCT-NH2(配列番号51)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(68.5mg,42.0μmol)を得た。
[Example 25: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(25-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKWHLGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 51) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (68.5 mg, 42.0 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 815.90[M+2H]2+,z=3 544.25[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 815.90 [M+2H] <2+> , z=3 544.25 [M+3H] <3+>
(25-2)Ac-DCKWHLGQLVWCT-NH2(配列番号51)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(25-1)で合成したペプチド(68.5mg,42.0μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(42.0μL,84.0μmol)、過酸化水素水(85.7μL,840μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(30.6mg,18.8μmol)を得た。 The peptide (68.5 mg, 42.0 μmol) synthesized in (25-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (42.0 μL, 84.0 μmol), hydrogen peroxide solution (85 .7 μL, 840 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (30.6 mg, 18.8 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 814.90[M+2H]2+ MS (ESI) m/z: z=2 814.90 [M+2H] 2+
(25-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(25-2)で合成したAc-DCKWHLGQLVWCT-NH2(配列番号51)(30.6mg,18.8μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(304mg,752μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(4.10mg,2.14μmol)を得た。 Ac-DCKWHLGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 51) (30.6 mg, 18.8 μmol) synthesized in (25-2), provided that the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), and di(N-succinimidyl) 3,3′-dithiodipropionate (304 mg, 752 μmol) was dissolved in acetonitrile (2.00 mL). The mixture was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and then freeze-dried to obtain the peptide disulfide linker conjugate-NHS activated product (4.10 mg, 2.14 μmol). .
MS(ESI)m/z:z=2 959.45[M+2H]2+
HPLC純度:74%
MS (ESI) m/z: z=2 959.45 [M+2H] 2+
HPLC Purity: 74%
(25-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(42-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は150025にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は151878にピークが観測された。
(25-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (42-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 150025 for the product into which one binding peptide was introduced, and a peak was observed at 151878 for the product into which two binding peptides were introduced.
(25-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(25-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が
導入された50682、50844および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(25-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(25-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(25-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(25-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (25-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 10.761分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.722分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 10.849分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.807分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図36)。
In the case of UV225 nm, the compound with a retention time of 10.761 minutes and 11.722 minutes is considered to be a compound in which one peptide was introduced into trastuzumab, and a compound in which two peptides were introduced. In the case of
[実施例26:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(26-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKYHRGELVWCT-NH2(配列番号52)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(100mg,60.8μmol)を得た。
[Example 26: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(26-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKYHRGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 52) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (100 mg, 60.8 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 826.35[M+2H]2+,z=3 551.25[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 826.35 [M+2H] <2+> , z=3 551.25 [M+3H] <3+>
(26-2)Ac-DCKYHRGELVWCT-NH2(配列番号52)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(26-1)で合成したペプチド(100mg,60.8μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(60.8μL,122μmol)、過酸化水素水(125μL,1.22mmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリル
の混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(74.5mg,45.2μmol)を得た。
The peptide (100 mg, 60.8 μmol) synthesized in (26-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (60.8 μL, 122 μmol), hydrogen peroxide solution (125 μL, 1.22 mmol). ) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (74.5 mg, 45.2 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 825.30[M+2H]2+,z=3 550.60[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 825.30 [M+2H] <2+> , z=3 550.60 [M+3H] <3+>
(26-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(26-2)で合成したAc-DCKYHRGELVWCT-NH2(配列番号52)(74.5mg,45.2μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(731mg,1.81mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(23.0mg,18.9μmol)を得た。 Ac-DCKYHRGELVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 52) (74.5 mg, 45.2 μmol) synthesized in (26-2), provided that the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), and di(N-succinimidyl) 3,3′-dithiodipropionate (731 mg, 1.81 mmol) was dissolved in acetonitrile (2.00 mL). The solution was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and then lyophilized to obtain the peptide disulfide linker conjugate-NHS activated product (23.0 mg, 18.9 μmol). .
MS(ESI)m/z:z=2 970.00[M+2H]2+
HPLC純度:69%
MS (ESI) m/z: z=2 970.00 [M+2H] 2+
HPLC Purity: 69%
(26-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(26-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは147074にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ
導入された生成物は150062にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は151873にピークが観測された。154562に副生成物によるピークが観測された。
(26-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (26-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 147074 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 150062 for the product into which one binding peptide was introduced. A peak was observed at 151,873. A by-product peak was observed at 154,562.
(26-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(26-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(26-5) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (26-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.464分はトラスツズマブ原料、10.309分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、10.962分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.564分はトラスツズマブ原料、10.395分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.054分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図37)。
In the case of UV225 nm, the retention time of 9.464 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 10.309 minutes is considered to be the compound in which one peptide is introduced into trastuzumab, and 10.962 minutes is the compound into which two peptides are introduced. In the case of
実施例27:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(27-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKYHLGQLVWCT-NH2(配列番号53)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(85.6mg,53.3μmol)を得た。
Example 27: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) with an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(27-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKYHLGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 53) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (85.6 mg, 53.3 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 804.45[M+2H]2+,z=3 536.60[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 804.45 [M+2H] <2+> , z=3 536.60 [M+3H] <3+>
(27-2)Ac-DCKYHLGQLVWCT-NH2(配列番号53)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(27-1)で合成したペプチド(85.6mg,53.3μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(53.5μL,107μmol)、過酸化水素水(109μL,1.07mmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応
溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(34.2mg,21.3μmol)を得た。
The peptide (85.6 mg, 53.3 µmol) synthesized in (27-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (53.5 µL, 107 µmol), hydrogen peroxide solution (109 µL, 1 .07 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (34.2 mg, 21.3 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 803.40[M+2H]2+ MS (ESI) m/z: z=2 803.40 [M+2H] 2+
(27-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(27-2)で合成したAc-DCKYHLGQLVWCT-NH2(配列番号53)(34.2mg,21.3μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(345mg,852μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(12.0mg,6.34μmol)を得た。 Ac-DCKYHLGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 53) synthesized in (27-2) (34.2 mg, 21.3 μmol, provided that the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), and di(N-succinimidyl) 3,3′-dithiodipropionate (345 mg, 852 μmol) was dissolved in acetonitrile (2.00 mL). The mixture was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and then lyophilized to obtain the peptide disulfide linker conjugate-NHS activated product (12.0 mg, 6.34 μmol). .
MS(ESI)m/z:z=2 948.00[M+2H]2+
HPLC純度:80%
MS (ESI) m/z: z=2 948.00 [M+2H] 2+
HPLC Purity: 80%
(27-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(27-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止
させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは147285にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は150031にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は151947にピークが観測された。154885に副生成物によるピークが観測された。
(27-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (27-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 147285 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 150031 for the product into which one binding peptide was introduced. A peak was observed at 151,947. A peak due to a by-product was observed at 154885.
(27-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(27-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50685、50847にピークが観測された。
(27-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(27-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(27-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(27-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (27-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.468分はトラスツズマブ原料、10.360分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.045分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.575分はトラスツズマブ原料、10.449分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.137分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図38)。
In the case of UV225 nm, the retention time of 9.468 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 10.360 minutes is considered to be the compound in which one peptide was introduced into trastuzumab, and 11.045 minutes is the compound into which two peptides were introduced. In the case of
[実施例28:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(28-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKWHRGQLVWCT-NH2(配列番号54)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(89.4mg,57.4μmol)を得た。
[Example 28: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(28-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKWHRGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 54) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (89.4 mg, 57.4 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 837.30[M+2H]2+,z=3 558.60[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 837.30 [M+2H] <2+> , z=3 558.60 [M+3H] <3+>
(28-2)Ac-DCKWHRGQLVWCT-NH2(配列番号54)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(28-1)で合成したペプチド(89.4mg,57.4μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(53.5μL,107μmol)、過酸化水素水(109μL,1.07mmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(64.4mg,38.5μmol)を得た。 The peptide (89.4 mg, 57.4 μmol) synthesized in (28-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (53.5 μL, 107 μmol), hydrogen peroxide solution (109 μL, 1 .07 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and then lyophilized to obtain the above peptide (64.4 mg, 38.5 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 836.35[M+2H]2+,z=3 558.00[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 836.35 [M+2H] <2+> , z=3 558.00 [M+3H] <3+>
(28-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(28-2)で合成したAc-DCKWHRGQLVWCT-NH2(配列番号54)(64.4mg,38.5μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(623mg,1.54mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-N
HS活性化体(21.8mg,11.1μmol)を得た。
Ac-DCKWHRGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 54) (64.4 mg, 38.5 μmol) synthesized in (28-2), provided that the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond. ) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), and di(N-succinimidyl) 3,3′-dithiodipropionate (623 mg, 1.54 mmol) was dissolved in acetonitrile (2.00 mL). The solution was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product are collected and concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, followed by lyophilization to obtain the peptide disulfide linker conjugate-N.
HS activated form (21.8 mg, 11.1 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 981.05[M+2H]2+,z=3 654.25[M+3H]3+
HPLC純度:82%
MS (ESI) m/z: z=2 981.05 [M+2H] <2+> , z=3 654.25 [M+3H] <3+>
HPLC Purity: 82%
(28-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(28-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは147548にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は150261にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は152112にピークが観測された。154824に副生成物によるピークが観測された。
(28-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (28-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 147548 for the raw material trastuzumab, a peak was observed at 150261 for the product into which one binding peptide was introduced, and two binding peptides were introduced. A peak was observed at 152112. A by-product peak was observed at 154,824.
(28-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(28-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50684、50845にピークが観測された。
(28-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(28-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(28-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(28-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (28-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.477分はトラスツズマブ原料、10.714分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.650分は副生成物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.573分はトラスツズマブ原料、10.812分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.742分は副生成物であると考えられる(図39)。
In the case of UV225 nm, the retention time of 9.477 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 10.714 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into trastuzumab, and 11.650 minutes is considered to be a by-product. In the case of
[実施例29:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(47-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-DCKYHRGQLVWCT-NH2(配列番号55)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(93.6mg,56.7μmol)を得た。
[Example 29: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(47-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-DCKYHRGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 55) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (93.6 mg, 56.7 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 825.80[M+2H]2+,z=3 550.90[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 825.80 [M+2H] <2+> , z=3 550.90 [M+3H] <3+>
(29-2)Ac-DCKYHRGQLVWCT-NH2(配列番号55)の2位と12位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(29-1)で合成したペプチド(93.6mg,56.7μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(56.5μL,113μmol)、過酸化水素水(115μL,1.13mmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(71.6mg,46.2μmol)を得た。 The peptide (93.6 mg, 56.7 μmol) synthesized in (29-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (56.5 μL, 113 μmol), hydrogen peroxide solution (115 μL, 1 .13 mmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (71.6 mg, 46.2 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 824.85[M+2H]2+,z=3 550.25[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 824.85 [M+2H] <2+> , z=3 550.25 [M+3H] <3+>
(29-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(29-2)で合成したAc-DCKYHRGQLVWCT-NH2(配列番号55)
(71.6mg,46.2μmol、ただし2番目と12番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(747mg,1.85mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(25.5mg,13.2μmol)を得た。
Ac-DCKYHRGQLVWCT-NH 2 (SEQ ID NO: 55) synthesized in (29-2)
(71.6 mg, 46.2 μmol, where the two cysteines at the 2nd and 12th positions each form an intramolecular disulfide bond) was dissolved in N,N-dimethylformamide (1.00 mL), A solution of di(N-succinimidyl),3′-dithiodipropionate (747 mg, 1.85 mmol) dissolved in acetonitrile (2.00 mL) was added and stirred at room temperature for 24 hours. After removing acetonitrile by concentrating under reduced pressure, this was dissolved in 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% acetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and then lyophilized to obtain the peptide disulfide linker conjugate-NHS activated product (25.5 mg, 13.2 μmol). .
MS(ESI)m/z:z=2 969.45[M+2H]2+,z=3 646.75[M+3H]3+
HPLC純度:82%
MS (ESI) m/z: z=2 969.45 [M+2H] <2+> , z=3 646.75 [M+3H] <3+>
HPLC Purity: 82%
(29-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(29-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、結合性ペプチドが一つ導入された生成物は149884にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物は151873にピークが観測された。
(29-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (29-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 149884 for the product into which one binding peptide was introduced, and a peak was observed at 151873 for the product into which two binding peptides were introduced.
(29-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(29-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50682、50844にピークが観測された。
(29-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(29-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(29-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHIC-HPLCにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(29-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (29-4) and the starting antibody were analyzed by HIC-HPLC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 10.292分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、10.949分はペプチドが2個導入された化
合物であると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 10.381分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物、11.038分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図40)。
In the case of UV225 nm, the compound with a retention time of 10.292 minutes and 10.949 minutes is considered to be a compound in which one peptide was introduced into trastuzumab, and a compound in which two peptides were introduced. In the case of
[実施例30:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(30-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCAWHLGQLVWCKYH-NH2(配列番号56)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(54.2mg,25.7μmol)を得た。
[Example 30: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(30-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCAWHLGQLVWCKYH-NH 2 (SEQ ID NO: 56) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (54.2 mg, 25.7 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=3 705.05[M+3H]3+,z=4 529.10[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 705.05 [M+3H] <3+> , z=4 529.10 [M+4H] <4+>
(30-2)Ac-RGNCAWHLGQLVWCKYH-NH2(配列番号56)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(30-1)で合成したペプチド(54.2mg,25.7μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(25.7μL,51.4μmol)、過酸化水素水(52.5μL,514μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(13.3mg,5.54μmol)を得た。 The peptide (54.2 mg, 25.7 μmol) synthesized in (30-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (25.7 μL, 51.4 μmol), hydrogen peroxide solution (52 .5 μL, 514 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (13.3 mg, 5.54 μmol).
MS(ESI)m/z:z=3 704.45[M+3H]3+,z=4 528.60[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 704.45 [M+3H] <3+> , z=4 528.60 [M+4H] <4+>
(30-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(30-2)で合成したAc-RGNCAWHLGQLVWCKYH-NH2(配列番号56)(13.3mg,5.54μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(89.6mg,222μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(7.00mg,2.92μmol)を得た。
Ac-RGNCAWHLGQLVWCKYH-NH 2 (SEQ ID NO: 56) (13.3 mg, 5.54 μmol) synthesized in (30-2), provided that the two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=3 800.90[M+3H]3+ , z=4 600.80[M+4H]4+
HPLC純度:69%
MS (ESI) m/z: z=3 800.90 [M+3H] <3+> , z=4 600.80 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 69%
(30-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(30-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148788にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が151375にピークが観測された。
(30-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (30-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148788 for the raw material trastuzumab and a peak at 151375 for the product into which one binding peptide was introduced.
(30-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(30-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。
ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50593、50756および、原料と同じ23337に軽鎖ピークが観測された。
(30-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
When the mass was measured by ESI-TOFMS, light chain peaks were observed at 50593 and 50756 where a thiopropionyl group was introduced into the heavy chain of the product and at 23337 which was the same as the raw material.
(30-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-HPLC解析
(30-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはButyl-NPR(TOSOH)4.6x350mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は1.0ml/min、グラジエントをB 0→100%,12min(データ採取20min)、カラム温度は25℃、サーモスタット温度はRT、検出器はUV225nm(Ch1)、280nm(Ch2)の2波長で検出した。
(30-6) HIC-HPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (30-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Butyl-NPR (TOSOH) 4.6×350 mm 2.5 μm column was used. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 1.0 ml/min,
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
UV225nmの場合、Retension Time 9.556分はトラスツズマブ原料、10.259分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物由来のピークであると考えられる。UV280nmの場合、Retension Time 9.549分はトラスツズマブ原料、10.382分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物由来のピークであると考えられる(図41)。
In the case of UV225 nm, Retension Time 9.556 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 10.259 minutes is considered to be a peak derived from a compound in which one peptide is introduced into trastuzumab. In the case of
[実施例31:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(31-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCAWHLGELVWCKYH-NH2(配列番号57)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(34.0mg,16.1μmol)を得た。
[Example 31: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(31-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCAWHLGELVWCKYH-NH 2 (SEQ ID NO: 57) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (34.0 mg, 16.1 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=3 705.40[M+3H]3+,z=4 529.30[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 705.40 [M+3H] <3+> , z=4 529.30 [M+4H] <4+>
(31-2)Ac-RGNCAWHLGELVWCKYH-NH2(配列番号57)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(31-1)で合成したペプチド(34.0mg,16.1μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(16.1μL,32.2μmol)、過酸化水素水(32.9μL,322μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオ
ロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(13.6mg,6.40μmol)を得た。
The peptide (34.0 mg, 16.1 μmol) synthesized in (31-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (16.1 μL, 32.2 μmol), hydrogen peroxide solution (32 .9 μL, 322 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (13.6 mg, 6.40 μmol).
MS(ESI)m/z:z=3 704.85[M+3H]3+,z=4 528.80[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 704.85 [M+3H] <3+> , z=4 528.80 [M+4H] <4+>
(31-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(31-2)で合成したAc-RGNCAWHLGELVWCKYH-NH2(配列番号57)(13.6mg,6.40μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(104mg,256μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(1.5mg,0.63μmol)を得た。
Ac-RGNCAWHLGELVWCKYH-NH 2 (SEQ ID NO: 57) synthesized in (31-2) (13.6 mg, 6.40 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=3 801.45[M+3H]3+,z=4 601.50[M+4H]4+
HPLC純度:77%
MS (ESI) m/z: z=3 801.45 [M+3H] <3+> , z=4 601.50 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 77%
(31-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(31-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止
させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148219にピークが観測され、結合性ペプチドが導入された生成物由来のピークは観測されなかった。
(31-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (31-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148219 for the raw material trastuzumab, and no peak derived from the product into which the binding peptide had been introduced was observed.
(31-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(31-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50592、50762および、原料と同じ23338に軽鎖ピークが観測された。
(31-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(31-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(31-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA50% B50%→A0%
B100%,12min(データ採取15min)、カラム温度は室温、サーモスタット温度は室温、検出器は280nmの波長で検出した。
(31-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (31-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A50% B50%→A0 %
B100%, 12 min (
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 6.8590分はトラスツズマブ原料、8.0655分はペプチド由来のピークであると考えられる(図42)。 Retension Time 6.8590 min is considered to be the trastuzumab raw material and 8.0655 min is the peptide derived peak (Figure 42).
[実施例32:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(32-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCAYHLGQLVWCTKH-NH2(配列番号58)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(36.7mg,18.1μmol)を得た。
[Example 32: Synthesis of compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety and reactive group, and modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(32-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCAYHLGQLVWCTKH-NH 2 (SEQ ID NO: 58) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (36.7 mg, 18.1 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=3 676.75[M+3H]3+,z=4 507.80[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 676.75 [M+3H] <3+> , z=4 507.80 [M+4H] <4+>
(32-2)Ac-RGNCAYHLGQLVWCTKH-NH2(配列番号58)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(32-1)で合成したペプチド(36.7mg,18.1μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(18.1μL,36.2μmol)、過酸化水素水(37.0μL,362μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(18.2mg,8.99μmol)を得た。 The peptide (36.7 mg, 18.1 μmol) synthesized in (32-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (18.1 μL, 36.2 μmol), hydrogen peroxide solution (37 .0 μL, 362 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (18.2 mg, 8.99 μmol).
MS(ESI)m/z:z=3 676.00[M+3H]3+,z=4 507.30[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 676.00 [M+3H] <3+> , z=4 507.30 [M+4H] <4+>
(32-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(32-2)で合成したAc-RGNCAYHLGQLVWCTKH-NH2(配列番号58)(18.2mg,8.99μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(145mg,360μmol)をアセトニトリル(1.50mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(3.00mg,1.30μmol)を得た。
Ac-RGNCAYHLGQLVWCTKH-NH 2 (SEQ ID NO: 58) synthesized in (32-2) (18.2 mg, 8.99 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=3 772.45[M+3H]3+
HPLC純度:90%
MS (ESI) m/z: z=3 772.45 [M+3H] 3+
HPLC Purity: 90%
(32-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(32-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,
N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148077にピークが観測され、 結合性ペプチドが一つ導入された生成物が150281にピークが観測された。
(32-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS activator synthesized in (32-3) is N,
It was dissolved in N'-dimethylformamide to 21.6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148077 for the raw material trastuzumab and a peak at 150281 for the product into which one binding peptide was introduced.
(32-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(32-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(32-5) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (32-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 11.1800分はトラスツズマブ原料、11.8682分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図43)。 Retension Time 11.1800 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 11.8682 minutes is considered to be a compound in which one peptide was introduced into trastuzumab (Fig. 43).
[実施例33:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(33-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCAYHLGQLVWCTYK-NH2(配列番号59)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(52.1mg,25.4μmol)を得た。
[Example 33: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(33-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCAYHLGQLVWCTYK-NH 2 (SEQ ID NO: 59) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (52.1 mg, 25.4 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=2 1027.3[M+2H]2+,z=3 685.45[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1027.3 [M+2H] <2+> , z=3 685.45 [M+3H] <3+>
(33-2)Ac-RGNCAYHLGQLVWCTYK-NH2(配列番号59)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(33-1)で合成したペプチド(52.1mg,25.4μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(25.4μL,50.8μmol)、
過酸化水素水(51.9μL,508μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(4.70mg,2.29μmol)を得た。
The peptide (52.1 mg, 25.4 µmol) synthesized in (33-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), and 2M NH 3 -MeOH (25.4 µL, 50.8 µmol),
A hydrogen peroxide solution (51.9 μL, 508 μmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (4.70 mg, 2.29 μmol).
MS(ESI)m/z:z=2 1026.5[M+2H]2+, z=3 684.75[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1026.5 [M+2H] <2+> , z=3 684.75 [M+3H] <3+>
(33-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(33-2)で合成したAc-RGNCAYHLGQLVWCTYK-NH2(配列番号59)(4.70mg,2.29μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(0.50mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(37.0mg,91.6μmol)をアセトニトリル(1.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(5.00mg,2.14μmol)を得た。
Ac-RGNCAYHLGQLVWCTYK-NH 2 (SEQ ID NO: 59) synthesized in (33-2) (4.70 mg, 2.29 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=3 781.20[M+3H]3+
HPLC純度:79%
MS (ESI) m/z: z=3 781.20 [M+3H] 3+
HPLC Purity: 79%
(33-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(33-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30
等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148223にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が150488にピークが観測された。
(33-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (33-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30
equivalent volume) and stirred at room temperature for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148223 for the starting trastuzumab and a peak at 150488 for the product into which one binding peptide was introduced.
(33-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(33-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(33-5) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (33-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 11.1867分はトラスツズマブ原料、12.2550分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図44)。 Retension Time 11.1867 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 12.2550 minutes is considered to be a compound in which one peptide was introduced into trastuzumab (Fig. 44).
[実施例34(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(34-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-RGNCAYHRGQLVWCTKH-NH2(配列番号60)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物(66.3mg,32.0μmol)を得た。
[Example 34 (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) synthesis, modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound, and analysis thereof]
(34-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-RGNCAYHRGQLVWCTKH-NH 2 (SEQ ID NO: 60) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. The desired product (66.3 mg, 32.0 μmol) was obtained.
MS(ESI)m/z:z=3 691.10[M+3H]3+,z=4 518.55[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 691.10 [M+3H] <3+> , z=4 518.55 [M+4H] <4+>
(34-2)Ac-RGNCAYHRGQLVWCTKH-NH2(配列番号60)の4位と14位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(34-1)で合成したペプチド(66.3mg,32.0μmol)をDMSO(5.00mL)に溶解し、2M NH3-MeOH(32.0μL,64.0μmol)、過酸化水素水(65.4μL,640μmol)を加え室温で20時間攪拌を行った。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニト
リルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド(40.0mg,19.3μmol)を得た。
The peptide (66.3 mg, 32.0 μmol) synthesized in (34-1) was dissolved in DMSO (5.00 mL), 2M NH 3 -MeOH (32.0 μL, 64.0 μmol), hydrogen peroxide solution (65 .4 μL, 640 μmol) was added and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the above peptide (40.0 mg, 19.3 μmol).
MS(ESI)m/z:z=3 690.40[M+3H]3+,z=4 518.05[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 690.40 [M+3H] <3+> , z=4 518.05 [M+4H] <4+>
(34-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(34-2)で合成したAc-RGNCAYHRGQLVWCTKH-NH2(配列番号60)(40.0mg,19.3μmol、ただし4番目と14番目の2つのシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(312mg,772μmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(4.50mg,1.91μmol)を得た。
Ac-RGNCAYHRGQLVWCTKH-NH 2 (SEQ ID NO: 60) synthesized in (34-2) (40.0 mg, 19.3 μmol, provided that the two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=3 786.85[M+3H]3+,m/z: z=4 590.45[M+4H]4+
HPLC純度:78%
MS (ESI) m/z: z=3 786.85 [M+3H] <3+> , m/z: z=4 590.45 [M+4H] <4+>
HPLC Purity: 78%
(34-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(34-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したと
ころ、原料のトラスツズマブは148081にピークが観測された。
(34-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (34-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148081 for the raw material trastuzumab.
(34-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(34-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50682、50844および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(34-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(34-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(34-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(34-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (34-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 10.0610分はトラスツズマブ原料由来の化合物であると考えられる。また、11.0666分にピークが確認された(図45)。 The Retension Time 10.0610 minutes is believed to be a compound derived from the trastuzumab source. A peak was also confirmed at 11.0666 minutes (Fig. 45).
[実施例35:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(35-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号61)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(47.0mg,11.0μmol)を得た。
[Example 35: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(35-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence Ac-KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 61) was synthesized by Fmoc solid-phase synthesis. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (47.0 mg, 11.0 μmol).
MS (ESI) m/z: z=5 853.35 [M+5H]5+, z=6 711.25 [M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z=5 853.35 [M+5H] <5+> , z=6 711.25 [M+6H] <6+>
(35-2)Ac-KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号61)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(35-1)で合成したペプチド(47.0mg,11.0μmol)をDMSO(1.10mL)に溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0(11.0mL)を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型(34.0mg,55.0μmol)を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(18.1mg,4.25μmol)を得た。 The peptide (47.0 mg, 11.0 μmol) synthesized in (35-1) was dissolved in DMSO (1.10 mL), and 0.1 M Tris-HCl pH 8.0 (11.0 mL) was added. Glutathione oxidized form (34.0 mg, 55.0 μmol) was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (18.1 mg, 4.25 μmol).
MS (ESI) m/z: z=5 852.95 [M+5H]5+, z=6 710.95 [M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z=5 852.95 [M+5H] <5+> , z=6 710.95 [M+6H] <6+>
(35-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(35-2)で合成したAc-KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号61)(18.1mg,4.25μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00 mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(69.0mg,0.170mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(4.00mg,0.80μmol)を得た。
Ac-KNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 61) synthesized in (35-2) (18.1 mg, 4.25 μmol, provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=5 910.85 [M+5H]5+, z=6 759.20 [M+6H]6+
HPLC純度:60%
MS (ESI) m/z: z=5 910.85 [M+5H] <5+> , z=6 759.20 [M+6H] <6+>
HPLC Purity: 60%
(35-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(35-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148234にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152672にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が157107にピークが確認された。
(35-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (35-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. Dissolve 500 µg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 171 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148234 for the raw material trastuzumab, a peak was observed at 152672 for the product into which one binding peptide was introduced, and two binding peptides were introduced. A peak was confirmed at 157,107.
(35-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(35-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50684、50844にピークが観測された。
(35-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(35-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(35-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(35-5) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (35-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 10.0542分はトラスツズマブ原料、9.4481分はペプチドが1個導入された化合物、8.5522分はペプチドが2つ導入された化合物であると考えられる(図46)。 Retension Time 10.0542 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 9.4481 minutes to the compound into which one peptide was introduced, and 8.5522 minutes to the compound into which two peptides were introduced (Fig. 46).
[実施例36:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(36-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号62)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(76.3mg,18.0μmol)を得た。
[Example 36: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(36-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 62) was synthesized by the Fmoc solid-phase synthesis method. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elution was performed with the mixed solution, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (76.3 mg, 18.0 μmol).
MS (ESI) m/z: z=5 851.45 [M+5H]5+, z=6 709.75 [M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z=5 851.45 [M+5H] <5+> , z=6 709.75 [M+6H] <6+>
(36-2)Ac-FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号62)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(36-1)で合成したペプチド(76.3mg,18.0μmol)をDMSO(1.80mL)に溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0(18.0mL)を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型(55.0mg,89.5μmol)を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%
を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(28.5mg,6.71μmol)を得た。
The peptide (76.3 mg, 18.0 μmol) synthesized in (36-1) was dissolved in DMSO (1.80 mL), and 0.1 M Tris-HCl pH 8.0 (18.0 mL) was added. Glutathione oxidized form (55.0 mg, 89.5 μmol) was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , trifluoroacetic acid 0.05%
and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (28.5 mg, 6.71 μmol).
MS (ESI) m/z: z=5 851.05 [M+5H]5+, z=6 709.40 [M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z=5 851.05 [M+5H] <5+> , z=6 709.40 [M+6H] <6+>
(36-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(36-2)で合成したAc-FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号62)(28.5mg,6.71μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(108mg,0.268mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(7.10mg,1.56μmol)を得た。
Ac-FNMQCQKRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 62) synthesized in (36-2) (28.5 mg, 6.71 μmol, provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=5 909.05 [M+5H]5+, z=6 757.70 [M+6H]6+
HPLC純度:87%
MS (ESI) m/z: z=5 909.05 [M+5H] <5+> , z=6 757.70 [M+6H] <6+>
HPLC Purity: 87%
(36-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSに
よる解析
(36-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを10mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148232にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152664にピークが観測された。
(36-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (36-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 10 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148232 for the starting trastuzumab and a peak at 152664 for the product into which one binding peptide was introduced.
(36-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(36-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50681にピークが観測された。
(36-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(36-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(36-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(36-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (36-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.6620分はトラスツズマブ原料、10.3237分はペプチドが1個導入された化合物であると考えられる(図47)。 Retension Time 9.6620 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 10.3237 minutes is considered to be a compound into which one peptide has been introduced (Fig. 47).
[実施例37:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(37-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号63)の配列をFmoc固相合成法により合成した。ペプチド合成装置はCEM社製Liberty Blueを使用。試薬は全て渡辺化学工業製のものを使用。ResinはFmoc-NH-SAL-PEG Resin HL、アルギニン(R)、システイン(C)ヒスチジン(H)はダブルカップリングを行った。Resinからの切り出しはトリフルオロ酢酸:水:トリイソプロピルシラン:エタンジチオール=94:2.5:1.0:2.5の溶液中3時間攪拌の条件で行った。切り出し後Resinをフィルトレーションにより除去し、トリフルオロ酢酸を除去した。生成した結晶中にジエチルエーテルを加えエーテル沈澱を行い、生成した白色結晶をフィルトレーションにより回収した。これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-M
Sにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(67.4mg,15.7μmol)を得た。
[Example 37: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(37-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence Ac-FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 63) was synthesized by Fmoc solid-phase synthesis. Liberty Blue manufactured by CEM was used as a peptide synthesizer. All reagents used are manufactured by Watanabe Chemical Industry. Resin was Fmoc-NH-SAL-PEG Resin HL, arginine (R), cysteine (C) and histidine (H) were double-coupled. Cutting from Resin was performed in a solution of trifluoroacetic acid:water:triisopropylsilane:ethanedithiol=94:2.5:1.0:2.5 under stirring conditions for 3 hours. After cutting out, the resin was removed by filtration, and the trifluoroacetic acid was removed. Diethyl ether was added to the resulting crystals for ether precipitation, and the resulting white crystals were collected by filtration. This was dissolved in an aqueous 0.05% trifluoroacetic acid solution and subjected to reversed-phase high performance liquid chromatography using octadodecyl chemically bonded silica gel as a packing material. Elute with the mixed solution and separate each fraction by LC-M.
Confirmed by S. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (67.4 mg, 15.7 μmol).
MS (ESI) m/z: z=5 860.10 [M+5H]5+, z=6 716.95 [M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z=5 860.10 [M+5H] <5+> , z=6 716.95 [M+6H] <6+>
(37-2)Ac-FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号63)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(37-1)で合成したペプチド(67.4mg,15.7μmol)をDMSO(1.50mL)に溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0(15.0mL)を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型(48.0mg,78.5μmol)を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(16.1mg,3.75μmol)を得た。 The peptide (67.4 mg, 15.7 μmol) synthesized in (37-1) was dissolved in DMSO (1.50 mL), and 0.1 M Tris-HCl pH 8.0 (15.0 mL) was added. Glutathione oxidized form (48.0 mg, 78.5 μmol) was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (16.1 mg, 3.75 μmol).
MS (ESI) m/z: z=5 859.75 [M+5H]5+, z=6 716.60 [M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z=5 859.75 [M+5H] <5+> , z=6 716.60 [M+6H] <6+>
(37-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(37-2)で合成したAc-FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号63)(16.1mg,3.75μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(61.0mg,0.150mmol)をアセトニトリル(2.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(5.30mg,1.16μmol)を得た。
Ac-FNMQCQRRFYEAKHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 63) synthesized in (37-2) (16.1 mg, 3.75 μmol, provided that two cysteines at
MS (ESI) m/z: z=5 917.60 [M+5H]5+, z=6 764.85 [M+6H]6+
HPLC純度:54%
MS (ESI) m/z: z=5 917.60 [M+5H] <5+> , z=6 764.85 [M+6H] <6+>
HPLC Purity: 54%
(37-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(34-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し21.6mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを10mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)46.9μLに溶解させ、21.6mMのペプチド試薬を4.7μL(抗体に対して30等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148238にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152703にピークが観測された。
(37-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (34-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide. 6 mM. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 46.9 μL of 10 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 4.7 μL of 21.6 mM peptide reagent (30 equivalents to the antibody), and warm to room temperature. and stirred for 1 hour. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148238 for the raw material trastuzumab and a peak at 152703 for the product into which one binding peptide was introduced.
(37-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(37-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50682にピークが観測された。
(37-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(37-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(37-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(37-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (37-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 30等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.5802分はトラスツズマブ原料、9.1031分はペプチドが1個導入された化合物であると考えられる(図48)。 Retension Time 9.5802 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, and 9.1031 minutes is considered to be a compound into which one peptide has been introduced (Fig. 48).
[実施例38:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(38-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC-NH2(配列番号64)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物を得た。
[Example 38: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(38-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 64) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. got the target.
(38-2)Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC-NH2(配列番号64)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(38-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型を加えて室温で20時間攪拌した
。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(20.0mg,4.66μmol)を得た。
The peptide synthesized in (38-1) was dissolved in DMSO, and 0.1M Tris-HCl pH 8.0 was added. Glutathione oxidized form was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (20.0 mg, 4.66 μmol).
MS(ESI)m/z:z=4 1074.15[M+4H]4+,z=5 859.65[M+5H]5+ MS (ESI) m/z: z = 4 1074.15 [M+4H] 4+ , z = 5 859.65 [M+5H] 5+
(38-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(38-2)で合成したAc-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC-NH2(配列番号64)(20.0mg,4.66μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(75.4mg,186μmol)をアセトニトリル(1.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(9.00mg,1.96μmol)を得た。
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRKARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 64) synthesized in (38-2) (20.0 mg, 4.66 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z: z=5 917.45[M+5H]5+,z=6 764.65[M+6H]6+
HPLC純度:100%
MS (ESI) m/z: z=5 917.45 [M+5H] <5+> , z=6 764.65 [M+6H] <6+>
HPLC Purity: 100%
(38-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(38-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148070にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152538にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が157165にピークが観測された。
(38-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (38-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. Dissolve 500 µg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 171 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148070 for the raw material trastuzumab, a peak was observed at 152538 for the product into which one binding peptide was introduced, and two binding peptides were introduced. A peak was observed at 157,165.
(38-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(38-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニルが導入された50685、50847および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(38-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(38-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(38-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(38-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (38-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.7820分はトラスツズマブ原料、9.3370分はペプチドが1個導入された化合物、8.7313分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図49)。 Retension Time 9.7820 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 9.3370 minutes to the compound into which one peptide was introduced, and 8.7313 minutes to the compound into which two peptides were introduced (Fig. 49).
[実施例39:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(39-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号65)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物を得た。
[Example 39: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(39-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 65) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. got the target.
(39-2)Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号65)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(39-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(23.0mg,5.38μmol)を得た。 The peptide synthesized in (39-1) was dissolved in DMSO, and 0.1M Tris-HCl pH 8.0 was added. Glutathione oxidized form was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (23.0 mg, 5.38 μmol).
MS(ESI)m/z:z=4 1070.55[M+4H]4+,z=5 856.55[M+5H]5+ MS (ESI) m/z: z = 4 1070.55 [M+4H] 4+ , z = 5 856.55 [M+5H] 5+
(39-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(39-2)で合成したAc-FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号65)(23.0mg,5.38μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成して
いる)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(87.0mg,215μmol)をアセトニトリル(1.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(16.0mg,3.50μmol)を得た。
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNKEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 65) synthesized in (39-2) (23.0 mg, 5.38 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=5 914.45[M+5H]5+,z=6 762.15[M+6H]6+
HPLC純度:83%
MS (ESI) m/z: z = 5 914.45 [M+5H] 5+ , z = 6 762.15 [M+6H] 6+
HPLC Purity: 83%
(39-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(39-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を4.2μL(抗体に対して5等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148065にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152525にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が156978にピークが観測された。
(39-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (39-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. Dissolve 500 μg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 171 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 4.2 μL of 4 mM peptide reagent (5 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148065 for the raw material trastuzumab, a peak was observed at 152525 for the product into which one binding peptide was introduced, and two binding peptides were introduced. A peak was observed at 156,978.
(39-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(39-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(39-5) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (39-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 5等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.2124分はペプチドが1個導入された化合物、8.6157分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図50)。 Retension Time 9.2124 minutes is considered to be a compound into which one peptide was introduced, and 8.6157 minutes is considered to be a compound into which two peptides were introduced (Fig. 50).
[実施例40:トラスツズマブのチオール導入体のペプチドマッピング]
(40-1)トラスツズマブのチオール導入体のトリプシン処理
1.5mL低吸着マイクロテストチューブにサンプル溶液を10μL、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、40%トリフルオロエタノールに溶解した20mMのジチオスレイトール水溶液10μLを加えて65℃で1時間加温後、50mMのヨードアセトアミド水溶液10μLを添加し、遮光下室温で30分間300rpmで振盪し反応させた。反応後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を40μL加えて撹拌し、20ng/μLのト
リプシン水溶液(Proteomics Grade, Code No.T6567-5x20μg(SIGMA))を10μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、20%トリフルオロ酢酸水溶液を2μL添加し反応を止め、LC-MS/MS測定を実施した。
[Example 40: Peptide mapping of thiol-introducer of trastuzumab]
(40-1) Trypsin treatment of
(40-2)トラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(分析装置)
ナノHPLC:EASY-nLC 1000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
質量分析計:トライブリッド質量分析計Orbitrap Fusion(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
(40-2) Trastuzumab LC-MS/MS measurement conditions (analytical device)
Nano HPLC: EASY-nLC 1000 (Thermo Fisher Scientific)
Mass spectrometer: Tribrid mass spectrometer Orbitrap Fusion (Thermo Fisher Scientific)
(HPLC分析条件)
トラップカラム:Acclaim PepMap(登録商標) 100,75μmx2cm(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
分析カラム:ESI-column(NTCC-360/75-3-125,75μm×12.5cm,3μm(日京テクノス株式会社))
移動相A:0.1%ギ酸水溶液
移動相B:0.1%ギ酸、アセトニトリル溶液
ローディング溶液:0.1%トリフルオロ酢酸水溶液
流速:300nL/min
サンプル注入量:1μL
グラジエント条件(B%):2%(0.0-0.5分)、2%→30%(0.5-23.5分)、30%→75%(23.5-25.5分)、75%(25.5-35.0分)
(HPLC analysis conditions)
Trap column:
Analysis column: ESI-column (NTCC-360/75-3-125, 75 μm×12.5 cm, 3 μm (Nikkyo Technos Co., Ltd.))
Mobile phase A: 0.1% formic acid aqueous solution Mobile phase B: 0.1% formic acid, acetonitrile solution Loading solution: 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution Flow rate: 300 nL/min
Sample injection volume: 1 μL
Gradient conditions (B%): 2% (0.0-0.5 minutes), 2% → 30% (0.5-23.5 minutes), 30% → 75% (23.5-25.5 minutes ), 75% (25.5-35.0 min)
(質量分析計分析条件)
イオン化法:ESI, Positiveモード
スキャンタイプ:Data Dependent Aquisition
Activation Type:Collision Induced Dissociation(CID)
データの取得は付属ソフトであるXcalibur 3.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)およびThermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(Mass spectrometer analysis conditions)
Ionization method: ESI, Positive mode Scan type: Data Dependent Aquisition
Activation Type: Collision Induced Dissociation (CID)
Acquisition of data was carried out using attached software Xcalibur 3.0 (Thermo Fisher Scientific) and Thermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0 (Thermo Fisher Scientific).
(40-3)トラスツズマブの修飾部位の解析条件
LC-MS/MS測定結果に対する修飾部位解析については、Proteome Discoverer version 1.4(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(40-3) Analysis Conditions for Modified Site of Trastuzumab Modified site analysis for LC-MS/MS measurement results was performed using Proteome Discoverer version 1.4 (Thermo Fisher Scientific).
Proteome Discovererでの解析は、Sequest HTを検索エンジンとして使用し、プリカーサーイオンの範囲を350~5000Da、Total Intensity Thresholdを50000とした。また、トリプシンを消化酵素として設定し、Maximum Missed Cleavage Sitesは3とした。また、プリカーサーおよびフラグメントイオンのMass Toleranceは、それぞれ5ppmおよび0.5Daとした。Static Modificationにはヨードアセトアミドによるシステイン残基の修飾として、Carbamidomethyl(+57.021Da)を設定した。Dynamic Modificationsについては、メチオニンの酸化(+15.995Da)およびリジン残基への修飾体(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体
(+145.019Da))を設定した。さらに、Peptide ConfidenceがHighのもののみとなるようフィルターをかけた。
The analysis with Proteome Discoverer used Sequest HT as a search engine, with a precursor ion range of 350-5000 Da and a Total Intensity Threshold of 50000. Also, trypsin was set as a digestive enzyme, and Maximum Missed Cleavage Sites was set to 3. Also, the mass tolerances of precursor and fragment ions were set to 5 ppm and 0.5 Da, respectively. Carbamidomethyl (+57.021 Da) was set as Static Modification as modification of cysteine residue with iodoacetamide. Dynamic Modifications were set for oxidation of methionine (+15.995 Da) and modification to lysine residues (thiol introduction (+145.019 Da) after carbamidomethylation with iodoacetamide). Furthermore, a filter was applied so that Peptide Confidence was High only.
また、修飾部位の検索対象のアミノ酸配列のデータとして、図8に示される(1)、(3)を用いた。 In addition, (1) and (3) shown in FIG. 8 were used as the amino acid sequence data to be searched for the modification site.
(40-4)トラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC-MS/MSを用いた解析の結果、実施例39のバインダーペプチドを用いて修飾したトラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を含むアミノ酸19残基からなるペプチド、VVSVLTVLHQDWLNGKEYK(配列番号66)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 791.74872、理論値791.74753、3価)が観測され(図51)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける317位のリジン残基の修飾を示す、2価のb18に相当するm/z 1114.35(理論値:1114.06)のプロダクトイオンが確認された(図52)。また、トリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を含むアミノ酸28残基からなるペプチド、EEQYDSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYK(配列番号67)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 886.93408、理論値:886.93215、4価)が観測され(図53)、CIDスペクトルより同じく重鎖の317位のリジン残基の修飾を示す、2価のy14に相当するm/z 938.70(理論値:938.46)のプロダクトイオンが確認された(図54)。
(40-4) Trastuzumab modification site analysis results by LC-MS/MS As a result of analysis using LC-MS/MS, trastuzumab modified with the binder peptide of Example 39 was converted to a lysine residue by tryptic digestion. MS spectrum of a peptide fragment of VVSVLTVLHQDWLNGKEYK (SEQ ID NO: 66), a peptide consisting of 19 amino acid residues containing a modified site (thiol-introduced with iodoacetamide (+145.019 Da)) (obtained value: m / z 791.74872, theoretical value 791.74753, trivalent) was observed (Fig. 51), and the m/ A product ion with z 1114.35 (theoretical value: 1114.06) was confirmed (Fig. 52). In addition, a peptide fragment of EEQYDSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYK (SEQ ID NO: 67), a peptide consisting of 28 amino acid residues containing a modification site to a lysine residue by trypsin digestion (a thiol introduction (+145.019 Da) subjected to carbamidomethylation with iodoacetamide), was obtained. MS spectrum (actual value: m / z 886.93408, theoretical value: 886.93215, tetravalent) was observed (Fig. 53), and the CID spectrum also shows modification of the lysine residue at position 317 of the heavy chain, 2 A product ion with m/z 938.70 (theoretical value: 938.46) corresponding to the valence y14 was confirmed (Fig. 54).
[実施例41:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(41-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC-NH2(配列番号68)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物を得た。
[Example 41: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(41-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 68) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. got the target.
(41-2)Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC-NH2(配列番号68)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(41-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフ
ルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(20.0mg,4.70μmol)を得た。
The peptide synthesized in (41-1) was dissolved in DMSO, and 0.1M Tris-HCl pH 8.0 was added. Glutathione oxidized form was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (20.0 mg, 4.70 μmol).
MS(ESI)m/z:z=4 1063.65[M+4H]4+,z=5 851.15[M+5H]5+ MS (ESI) m/z: z = 4 1063.65 [M+4H] 4+ , z = 5 851.15 [M+5H] 5+
(41-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(41-2)で合成したAc-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC-NH2(配列番号68)(20.0mg,4.70μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(76.0mg,188μmol)をアセトニトリル(1.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(12.0mg,2.63μmol)を得た。
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIKDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 68) synthesized in (41-2) (20.0 mg, 4.70 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=5 908.95[M+5H]5+,z=6 757.75[M+6H]6+
HPLC純度:83%
MS (ESI) m/z: z = 5 908.95 [M+5H] 5+ , z = 6 757.75 [M+6H] 6+
HPLC Purity: 83%
(41-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSに
よる解析
(41-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液をNAP-5カラムに添加し、反応を停止させ20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148234にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152648にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が157083にピークが観測された。
(41-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (41-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. Dissolve 500 µg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 171 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. The reaction solution was added to a NAP-5 column to stop the reaction and replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148234 for the raw material trastuzumab, a peak was observed at 152648 for the product into which one binding peptide was introduced, and two binding peptides were introduced. A peak was observed at 157,083.
(41-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(41-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50686、50847および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(41-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(41-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(41-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(41-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (41-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.7202分はトラスツズマブ原料、9.2689分はペプチドが1個導入された化合物、8.7994分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図55)。 The retention time of 9.7202 minutes is considered to be the trastuzumab raw material, 9.2689 minutes to the compound into which one peptide was introduced, and 8.7994 minutes to the compound into which two peptides were introduced (Fig. 55).
[実施例42:トラスツズマブのチオール導入体のペプチドマッピング]
(42-1)トラスツズマブのチオール導入体のトリプシン処理
(40-1)と同じ処理を行った。
[Example 42: Peptide mapping of thiol-introducer of trastuzumab]
(42-1) Trastuzumab thiol derivative was treated with trypsin in the same manner as (40-1).
(42-2)トラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(40-2)と同じ測定条件を用いた。
(42-2) The same measurement conditions as the LC-MS/MS measurement conditions for trastuzumab (40-2) were used.
(42-3)トラスツズマブの修飾部位の解析条件
(40-3)と同じ解析条件を用いた。
(42-3) Analysis conditions for modified site of trastuzumab The same analysis conditions as (40-3) were used.
(42-4)トラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC-MS/MSを用いた解析の結果、実施例41のバインダーペプチドを用いて修飾したトラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨードアセトアミ
ドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を含むアミノ酸18残基からなるペプチド、FNWYVDGVEVHNAKTKPR(配列番号69)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 769.04688、理論値:769.04457、3価)が観測され(図56)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける288位もしくは290位のリジン残基の修飾を示す、2価のy12に相当するm/z 741.15(理論値:740.89)のプロダクトイオンが確認された(図57)。
(42-4) Results of Analysis of Modified Sites of Trastuzumab by LC-MS/MS As a result of analysis using LC-MS/MS, trastuzumab modified with the binder peptide of Example 41 was converted to lysine residues by tryptic digestion. MS spectrum of a peptide fragment of FNWYVDGVEVHNAKTKPR (SEQ ID NO: 69), a peptide consisting of 18 amino acid residues containing a modified site (thiol-introduced with iodoacetamide (+145.019 Da)) (obtained value: m / z 769.04688, theoretical value: 769.04457, trivalent) was observed (Fig. 56), and the CID spectrum indicates modification of the lysine residue at position 288 or 290 in EU numbering of the heavy chain, to divalent y12 The corresponding product ion with m/z 741.15 (theoretical value: 740.89) was confirmed (Fig. 57).
[実施例43:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(43-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号70)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物を得た。
[Example 43: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(43-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 70) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. got the target.
(43-2)Ac-FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号70)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(43-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(20.0mg,4.67μmol)を得た。 The peptide synthesized in (43-1) was dissolved in DMSO, and 0.1M Tris-HCl pH 8.0 was added. Glutathione oxidized form was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (20.0 mg, 4.67 μmol).
MS(ESI)m/z:z=5 848.30[M+5H]5+,z=6 707.10[M+6H]6+ MS (ESI) m/z: z = 5 848.30 [M+5H] 5+ , z = 6 707.10 [M+6H] 6+
(43-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(43-2)で合成したAc-FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号70)(20.0mg,4.67μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(0.50mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(76.0mg,188μmol)をアセトニトリル(0.60mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(9.00mg,1.97μmol)を得た。
Ac-FNKQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 70) synthesized in (43-2) (20.0 mg, 4.67 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=6 761.85[M+6H]6+
HPLC純度:85%
MS (ESI) m/z: z=6 761.85 [M+6H] 6+
HPLC Purity: 85%
(43-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(43-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ1000μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)342μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を17.0μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH 2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が156963にピークが確認された。
(43-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (43-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. 1000 µg of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab was dissolved in 342 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), 17.0 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The reaction solution was replaced with 100 mM sodium citrate buffer (pH 2.9) to stop the reaction, and further replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak at 156963 was confirmed for a product into which two binding peptides had been introduced.
(43-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(43-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50686、50847および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(43-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(43-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(43-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(43-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (43-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 8.6251分はペプチドが2個導入された化合物であると考えられる(図58)。 Retension Time 8.6251 minutes is considered to be a compound into which two peptides were introduced (Fig. 58).
[実施例44:トラスツズマブのチオール導入体のペプチドマッピング]
(44-1)トラスツズマブのチオール導入体のトリプシン処理
1.5mL低吸着マイクロテストチューブにサンプル溶液を10μL、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、40%トリフルオロエタノールに溶解した20mMのジチオスレイトール水溶液10μLを加えて65℃で1時間加温後、50mMのヨードアセトアミド水溶液10μLを添加し、遮光下室温で30分間300rpmで振盪し反応させた。反応後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液を40μL加えて撹拌し、20ng/μLのトリプシン水溶液を10μL添加して37℃で18時間酵素消化した。消化後、20%トリフルオロ酢酸水溶液2μL添加し反応を止めた。その後、50mM炭酸水素アンモニウム緩衝液、0.5%トリフルオロ酢酸を用いて10倍希釈し、LC-MS/MS測定に使用した。
[Example 44: Peptide mapping of thiol-introducer of trastuzumab]
(44-1) Trypsin treatment of thiol introducer of
(44-2)トラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(分析装置)
ナノHPLC:EASY-nLC 1000(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
質量分析計:トライブリッド質量分析計Orbitrap Fusion(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
(44-2) Trastuzumab LC-MS/MS measurement conditions (analytical device)
Nano HPLC: EASY-nLC 1000 (Thermo Fisher Scientific)
Mass spectrometer: Tribrid mass spectrometer Orbitrap Fusion (Thermo Fisher Scientific)
(HPLC分析条件)
トラップカラム:Acclaim PepMap(登録商標) 100,75μmx2cm(サーモフィッシャーサイエンティフィック)
分析カラム:ESI-column(NTCC-360/75-3-125,75μm×12.5cm,3μm(日京テクノス株式会社))
移動相A:0.1%ギ酸水溶液
移動相B:0.1%ギ酸、アセトニトリル溶液
ローディング溶液:0.1%トリフルオロ酢酸水溶液
流速:300nL/min
サンプル注入量:1μL
グラジエント条件(B%):2%(0.0-0.5分)、2%→30%(0.5-23.5分)、30%→75%(23.5-25.5分)、75%(25.5-35.0分)
(HPLC analysis conditions)
Trap column:
Analysis column: ESI-column (NTCC-360/75-3-125, 75 μm×12.5 cm, 3 μm (Nikkyo Technos Co., Ltd.))
Mobile phase A: 0.1% formic acid aqueous solution Mobile phase B: 0.1% formic acid, acetonitrile solution Loading solution: 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution Flow rate: 300 nL/min
Sample injection volume: 1 μL
Gradient conditions (B%): 2% (0.0-0.5 minutes), 2% → 30% (0.5-23.5 minutes), 30% → 75% (23.5-25.5 minutes ), 75% (25.5-35.0 min)
(質量分析計分析条件)
イオン化法:ESI, Positiveモード
スキャンタイプ:Data Dependent Aquisition
Activation Type:Collision Induced Dissociation(CID)
データの取得は付属ソフトであるXcalibur 3.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)およびThermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(Mass spectrometer analysis conditions)
Ionization method: ESI, Positive mode Scan type: Data Dependent Aquisition
Activation Type: Collision Induced Dissociation (CID)
Acquisition of data was carried out using attached software Xcalibur 3.0 (Thermo Fisher Scientific) and Thermo Orbitrap Fusion Tune Application 2.0 (Thermo Fisher Scientific).
(44-3)トラスツズマブの修飾部位の解析条件
LC-MS/MS測定結果に対する修飾部位解析については、Proteome Discoverer version 1.4(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いて行った。
(44-3) Analysis Conditions for Modified Site of Trastuzumab Modified site analysis for LC-MS/MS measurement results was performed using Proteome Discoverer version 1.4 (Thermo Fisher Scientific).
Proteome Discovererでの解析は、Sequest HTを検索エンジンとして使用し、プリカーサーイオンの範囲を350~5000Daとした。また、トリプシンを消化酵素として設定し、Maximum Missed Cleavage
Sitesは3とした。また、プリカーサーおよびフラグメントイオンのMass Toleranceは、それぞれ5ppmおよび0.5Daとした。Static Modificationにはヨードアセトアミドによるシステイン残基の修飾として、Carbamidomethyl(+57.021Da)を設定した。Dynamic Modificationsについては、メチオニンの酸化(+15.995Da)およびリジン残基への修飾体(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を設定した。さらに、Peptide ConfidenceがHighのもののみとなるようフィルターをかけた。実施例43のみ、Total Intensity Thresholdを32000とした。
Analyzes on Proteome Discoverer used Sequest HT as the search engine with a precursor ion range of 350-5000 Da. In addition, trypsin is set as a digestive enzyme and Maximum Missed Cleavage
Sites was set to 3. Also, the mass tolerances of precursor and fragment ions were set to 5 ppm and 0.5 Da, respectively. Carbamidomethyl (+57.021 Da) was set as Static Modification as modification of cysteine residue with iodoacetamide. Dynamic Modifications were set for oxidation of methionine (+15.995 Da) and modification to lysine residues (thiol introduction (+145.019 Da) after carbamidomethylation with iodoacetamide). Furthermore, a filter was applied so that Peptide Confidence was High only. The Total Intensity Threshold was set to 32000 only for Example 43.
また、修飾部位の検索対象のアミノ酸配列のデータとして、図8に示される(1)、(3)を用いた。 In addition, (1) and (3) shown in FIG. 8 were used as the amino acid sequence data to be searched for the modification site.
(44-4)トラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC-MS/MSを用いた解析の結果、トラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号40)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 952.23145、理論値:952.22900、4価)が観測され(図59)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位のリジン残基の修飾を示す、2価のy15に相当するm/z 968.30(理論値:968.01)のプロダクトイオンが確認された(図60)。
(44-4) Results of analysis of modified site of trastuzumab by LC-MS/MS As a result of analysis using LC-MS/MS, the modified site of lysine residue by tryptic digestion of trastuzumab (carbamidomethylated by iodoacetamide) MS spectrum of a peptide fragment of THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR (SEQ ID NO: 40) consisting of 33 amino acid residues containing a thiol derivative (+145.019 Da)) (actual value: m / z 952.23145, theoretical value: 952.22900, tetravalent) was observed (Fig. 59), and m/z 968.30 (theoretical value: 968. 01) was confirmed (Fig. 60).
[実施例45:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(45-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号71)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目的物を得た。
[Example 45: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(45-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 71) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. got the target.
(45-2)Ac-FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号71)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(45-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(20.0mg,4.67μmol)を得た。 The peptide synthesized in (45-1) was dissolved in DMSO, and 0.1M Tris-HCl pH 8.0 was added. Glutathione oxidized form was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (20.0 mg, 4.67 μmol).
MS(ESI)m/z:z=3 692.70[M+3H]3+,z=4 519.80[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 692.70 [M+3H] <3+> , z=4 519.80 [M+4H] <4+>
(45-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(45-2)で合成したAc-FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH2(配列番号71)(20.0mg,4.67μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(0.50mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(76.0mg,188μmol)をアセトニトリル(0.60mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(5.50mg,1.20μmol)を得た。
Ac-FNMQCKRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC-NH 2 (SEQ ID NO: 71) synthesized in (45-2) (20.0 mg, 4.67 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=6 762.40[M+6H]6+
HPLC純度:100%
MS (ESI) m/z: z=6 762.40 [M+6H] 6+
HPLC Purity: 100%
(45-3)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(45-2)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH 2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148226にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152662にピークが確認された。
(45-3) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (45-2) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. 500 µg of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab was dissolved in 171 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), 8.5 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The reaction solution was replaced with 100 mM sodium citrate buffer (pH 2.9) to stop the reaction, and further replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148226 for the raw material trastuzumab, and a peak at 152662 was confirmed for the product into which one binding peptide had been introduced.
(45-4)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(45-3)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50686、50847および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(45-4) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(45-5)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(45-3)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(45-5) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (45-3) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.8954分はトラスツズマブ原料、9.4892分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図61)。 Retension Time 9.8954 minutes is considered to be a trastuzumab raw material, and 9.4892 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into trastuzumab (Fig. 61).
[実施例46:トラスツズマブのチオール導入体のペプチドマッピング]
(46-1)トラスツズマブのチオール導入体のトリプシン処理
(44-1)と同じ処理を行った。
[Example 46: Peptide mapping of thiol-introducer of trastuzumab]
(46-1) Trypsin treatment of thiol-introducer of trastuzumab The same treatment as in (44-1) was performed.
(46-2)トラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(44-2)と同じ測定条件を用いた。
(46-2) Trastuzumab LC-MS/MS measurement conditions The same measurement conditions as in (44-2) were used.
(46-3)トラスツズマブの修飾部位の解析条件
(44-3)と同じ解析条件を用いた。
(46-3) Analysis Conditions for Modified Site of Trastuzumab The same analysis conditions as in (44-3) were used.
(46-4)トラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC-MS/MSを用いた解析の結果、トラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR(配列番号40)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 952.22968、理論値:952.22900、4価)が観測され(図62)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける246位のリジン残基の修飾を示す、2価のy12に相当するm/z 764.60(理論値:764.40)のプロダクトイオンが確認された(図63)。
(46-4) Results of modification site analysis of trastuzumab by LC-MS/MS As a result of analysis using LC-MS/MS, the site of modification of lysine residues by trypsin digestion of trastuzumab (carbamidomethylation by iodoacetamide) MS spectrum of a peptide fragment of THTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISR (SEQ ID NO: 40) consisting of 33 amino acid residues containing a thiol derivative (+145.019 Da)) (actual value: m / z 952.22968, theoretical value: 952.22900, tetravalent) was observed (Fig. 62), and m/z 764.60 (theoretical value: 764.60) corresponding to bivalent y12, which indicates modification of the lysine residue at position 246 in EU numbering of the heavy chain from the CID spectrum. 40) was confirmed (Fig. 63).
[実施例47:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)の合成、ならびに当該化合物を用いた抗HER2IgG抗体トラスツズマブの修飾およびその解析]
(47-1)IgG1 Fc結合性ペプチドの合成
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC-NH2(配列番号72)の配列を実施例1と同様にFmoc固相合成法により合成した。目
的物を得た。
[Example 47: Synthesis of a compound (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, and modification of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab using the compound and its analysis]
(47-1) Synthesis of IgG1 Fc-Binding Peptide The sequence of Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC-NH 2 (SEQ ID NO: 72) was synthesized in the same manner as in Example 1 by the Fmoc solid-phase synthesis method. got the target.
(47-2)Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC-NH2(配列番号72)の5位と34位のCysでの分子内ジスルフィド結合の形成
(47-1)で合成したペプチドをDMSOに溶解し、0.1M Tris-HCl pH 8.0を加えた。この溶液にグルタチオン酸化型を加えて室温で20時間攪拌した。反応溶液に2Mトリフルオロ酢酸水溶液を加え反応を停止し、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸0.05%を含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、目的物(24.5mg,5.71μmol)を得た。 The peptide synthesized in (47-1) was dissolved in DMSO, and 0.1M Tris-HCl pH 8.0 was added. Glutathione oxidized form was added to this solution and stirred at room temperature for 20 hours. A 2M trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction solution to stop the reaction, and the solution was dissolved in a 0.05% trifluoroacetic acid aqueous solution and subjected to reversed-phase high-performance liquid chromatography using octadodecyl-bonded silica gel as a packing material. , eluted with a mixed solution of water and acetonitrile containing 0.05% trifluoroacetic acid, and each fraction was confirmed by LC-MS. Fractions containing the product were collected, concentrated under reduced pressure to remove acetonitrile, and freeze-dried to obtain the desired product (24.5 mg, 5.71 μmol).
MS(ESI)m/z:z=3 692.70[M+3H]3+,z=4 519.80[M+4H]4+ MS (ESI) m/z: z=3 692.70 [M+3H] <3+> , z=4 519.80 [M+4H] <4+>
(47-3)ジスルフィドリンカーとペプチドの連結
(47-2)で合成したAc-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC-NH2(配列番号72)(24.5mg,5.71μmol、ただし5番目と34番目の2つのシステインはそれぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している)をN,N-ジメチルホルムアミド(1.00mL)に溶解し、3,3’-ジチオジプロピオン酸ジ(N-スクシンイミジル)(92.2mg,228μmol)をアセトニトリル(1.00mL)に溶解した溶液を加え、室温で24時間攪拌した。減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、これを0.05%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、オクタドデシル基化学結合型シリカゲルを充填剤とする逆相高速液体クロマトグラフィーに付し、トリフルオロ酢酸を0.05%含有する水とアセトニトリルの混合溶液で溶出し、各フラクションをLC-MSにより確認した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルを除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体(7.50mg,1.64μmol)を得た。
Ac-FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRKDC-NH 2 (SEQ ID NO: 72) synthesized in (47-2) (24.5 mg, 5.71 μmol, provided that two cysteines at
MS(ESI)m/z:z=6 762.40[M+6H]6+
HPLC純度:84%
MS (ESI) m/z: z=6 762.40 [M+6H] 6+
HPLC Purity: 84%
(47-4)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
(47-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2IgG抗体トラスツズマブ500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH 2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148087にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が152694にピークが確認され,結合性ペプチドが二つ導入された生成物が157160にピークが確認された。
(47-4) Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in (47-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and bottom. 500 µg of the anti-HER2 IgG antibody trastuzumab was dissolved in 171 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), 8.5 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The reaction solution was replaced with 100 mM sodium citrate buffer (pH 2.9) to stop the reaction, and further replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148087 for the raw material trastuzumab, and a peak was confirmed at 152694 for the product into which one binding peptide was introduced. A peak was confirmed at 157,160.
(47-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(47-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液5μL(抗体に対して等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物は重鎖にチオプロピオニル基が導入された50686、50847および、原料と同じ23439に軽鎖ピークが観測された。
(47-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(47-6)抗HER2IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾のHIC-UPLC解析
(47-4)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(47-6) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Anti-HER2 IgG Antibody Trastuzumab The antibody/peptide complex produced in (47-4) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:トラスツズマブ原料
b:トラスツズマブ+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Trastuzumab raw material b: Trastuzumab + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 9.5796分はトラスツズマブ原料、9.1199分はペプチドがトラスツズマブに1個導入された化合物であると考えられる(図64)。 Retension Time 9.5796 minutes is considered to be a trastuzumab raw material, and 9.1199 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into trastuzumab (Fig. 64).
[実施例48:トラスツズマブのチオール導入体のペプチドマッピング]
(48-1)トラスツズマブのチオール導入体のトリプシン処理
(44-1)と同じ処理を行った。
[Example 48: Peptide mapping of thiol-introducer of trastuzumab]
(48-1) Trastuzumab thiol derivative was treated with trypsin in the same manner as (44-1).
(48-2)トラスツズマブのLC-MS/MS測定条件
(44-2)と同じ測定条件を用いた。
(48-2) The same measurement conditions as the LC-MS/MS measurement conditions for trastuzumab (44-2) were used.
(48-3)トラスツズマブの修飾部位の解析条件
(44-3)と同じ解析条件を用いた。
(48-3) Analysis conditions for modified site of trastuzumab The same analysis conditions as (44-3) were used.
(48-4)トラスツズマブのLC-MS/MSによる修飾部位の解析結果
LC-MS/MSを用いた解析の結果、トラスツズマブのトリプシン消化によるリジン残基への修飾部位(ヨードアセトアミドによるCarbamidomethyl化を受けたチオール導入体(+145.019Da))を含むアミノ酸33残基からなるペプチド、FNWYVDGVEVHNAKTKPR(配列番号69)のペプチドフラグメントのMSスペクトル(実測値:m/z 769.04529、理論値:769.04457、3価)が観測され(図65)、CIDスペクトルより重鎖のEU numberingにおける290位のリジン残基の修飾を示す、2価のy8に相当するm/z 549.11(理論値:548.79)のプロダクトイオンが確認された(図66)。
(48-4) LC-MS/MS analysis results of modification site of trastuzumab As a result of analysis using LC-MS/MS, the modification site of trastuzumab to a lysine residue by trypsin digestion (carbamidomethylation by iodoacetamide) MS spectrum of a peptide fragment of FNWYVDGVEVHNAKTKPR (SEQ ID NO: 69), a peptide consisting of 33 amino acid residues containing a thiol-introduced (+145.019 Da)) (actual value: m / z 769.04529, theoretical value: 769.04457, trivalent) was observed (Fig. 65), and m/z 549.11 (theoretical value: 548. 79) was confirmed (Fig. 66).
[実施例49:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)を用いたヒトIgG2抗体の修飾およびその解析]
(49-1)ヒトIgG2抗体の特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例(2-2)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。ヒトIgG2抗体(RayBiotech社製)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH 2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のIgG2抗体は153047にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が155129にピークが確認され,結合性ペプチドが二つ導入された生成物が157699にピークが確認された。
[Example 49: Modification of a human IgG2 antibody using a compound having an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a compound having a reactive group (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) and its analysis]
(49-1) Specific modification of human IgG2 antibody and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in Example (2-2) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and dissolved at 4 mM. and Dissolve 500 μg of human IgG2 antibody (manufactured by RayBiotech) in 171 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 μL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. The reaction solution was replaced with 100 mM sodium citrate buffer (pH 2.9) to stop the reaction, and further replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 153047 for the starting IgG2 antibody, and a peak was confirmed at 155129 for the product into which one binding peptide had been introduced, indicating that two binding peptides had been introduced. A peak was confirmed at 157,699 for the product.
(49-2)ヒトIgG2抗体の特異的修飾のHIC-UPLC解析
(49-1)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(49-2) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Human IgG2 Antibody The antibody/peptide complex produced in (49-1) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:ヒトIgG2抗体原料
b:ヒトIgG2抗体+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等
量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Human IgG2 antibody raw material b: Human IgG2 antibody + peptide disulfide linker conjugate-
Retension Time 9.0209分はヒトIgG2抗体原料、10.2043分はペプチドがヒトIgG2抗体に1個導入された化合物であると考えられる(図67)。 Retension Time 9.0209 minutes is considered to be a human IgG2 antibody raw material, and 10.2043 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into a human IgG2 antibody (Fig. 67).
[実施例50:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)を用いたヒトIgG2抗体の修飾およびその解析]
(50-1)ヒトIgG2抗体の特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例(43-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体
はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。ヒトIgG2抗体(RayBiotech社製)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH
2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のIgG2抗体は153047にピークが観測され、結合性ペプチドが一つ導入された生成物が157652にピークが確認され,結合性ペプチドが二つ導入された生成物が165043にピークが確認された。
[Example 50: Modification of a human IgG2 antibody using a compound having an affinity for a soluble protein, a cleavable moiety, and a reactive group (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) and its analysis]
(50-1) Specific modification of human IgG2 antibody and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in Example (43-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and dissolved at 4 mM. and Dissolve 500 μg of human IgG2 antibody (manufactured by RayBiotech) in 171 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 μL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. 100 mM sodium citrate buffer (pH
2.9) to stop the reaction, and then replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 153047 for the starting IgG2 antibody, and a peak was confirmed at 157652 for the product into which one binding peptide had been introduced, indicating that two binding peptides had been introduced. A peak was confirmed at 165,043 for the product.
(50-2)ヒトIgG2抗体の特異的修飾のHIC-UPLC解析
(50-1)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(50-2) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Human IgG2 Antibody The antibody/peptide complex produced in (50-1) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:ヒトIgG2抗体原料
b:ヒトIgG2抗体+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: Human IgG2 antibody raw material b: Human IgG2 antibody + peptide disulfide linker conjugate-
Retension Time 9.0209分はヒトIgG2抗体原料、8.3882分はペプチドがヒトIgG2抗体に1個導入された化合物であると考えられる(図68)。 Retension Time 9.0209 minutes is considered to be a human IgG2 antibody raw material, and 8.3882 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into a human IgG2 antibody (Fig. 68).
[実施例51:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)を用いたヒトIgG4抗体の修飾およびその解析]
(51-1)ヒトIgG4抗体の特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例(2-2)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。ヒトIgG4抗体(RayBiotech社製)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH 2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のIgG2抗体は154618にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が159130にピークが確認され
た。
[Example 51: Modification of a human IgG4 antibody using a compound having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) and its analysis]
(51-1) Specific modification of human IgG4 antibody and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in Example (2-2) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and dissolved at 4 mM. and Dissolve 500 µg of human IgG4 antibody (manufactured by RayBiotech) in 171 µL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 µL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. The reaction solution was replaced with 100 mM sodium citrate buffer (pH 2.9) to stop the reaction, and further replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 154618 for the starting IgG2 antibody and a peak at 159130 for the product into which two binding peptides were introduced.
(51-2)ヒトIgG4抗体の特異的修飾のHIC-UPLC解析
(51-1)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(51-2) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Human IgG4 Antibody The antibody/peptide complex produced in (51-1) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:ヒトIgG4抗体原料
b:ヒトIgG4抗体+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: human IgG4 antibody raw material b: human IgG4 antibody + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 10.3154分はヒトIgG4抗体原料、11.2450分はペプチドがヒトIgG4抗体に1個導入された化合物であると考えられる(図69)。 Retension Time 10.3154 minutes is considered to be a human IgG4 antibody raw material, and 11.2450 minutes is considered to be a compound in which one peptide is introduced into a human IgG4 antibody (Fig. 69).
[実施例52:可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体)を用いたヒトIgG4抗体の修飾およびその解析]
(52-1)ヒトIgG4抗体の特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例(43-3)で合成したペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体
はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。ヒトIgG2抗体(RayBiotech社製)500μgを50mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 5.5)171μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を8.5μL(抗体に対して10等量)加えて、室温で1時間攪拌した。反応液を100mMクエン酸ナトリウムバッファー(pH
2.9)に置換して反応を停止させ、さらに20mMPBSバッファーに置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のIgG2抗体は154618にピークが観測され、結合性ペプチドが二つ導入された生成物が163530にピークが確認された。
[Example 52: Modification of a human IgG4 antibody using a compound having an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a compound having a reactive group (peptide disulfide linker conjugate-NHS activator) and its analysis]
(52-1) Specific modification of human IgG4 antibody and analysis by ESI-TOFMS The peptide disulfide linker conjugate-NHS-activated product synthesized in Example (43-3) was dissolved in N,N'-dimethylformamide and dissolved at 4 mM. and Dissolve 500 μg of human IgG2 antibody (manufactured by RayBiotech) in 171 μL of 50 mM sodium acetate buffer (pH 5.5), add 8.5 μL of 4 mM peptide reagent (10 equivalents to the antibody), and stir at room temperature for 1 hour. bottom. 100 mM sodium citrate buffer (pH
2.9) to stop the reaction, and then replaced with 20 mM PBS buffer. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 154,618 for the starting IgG2 antibody, and a peak at 163,530 for the product into which two binding peptides had been introduced was confirmed.
(52-2)ヒトIgG4抗体の特異的修飾のHIC-UPLC解析
(52-1)で生成した抗体・ペプチド複合体と原料の抗体をHICにより解析した。カラムはProtein-Pak Hi Res HIC Column(Waters)4.6x100mm 2.5μmを使用した。A_Buffer:0.1M PiNa,2.3M(NH4)2SO4,pH7.0、B_Buffer:0.1M PiNa,pH7.0にて流速は0.6ml/min、グラジエントをA60% B40%→A0%
B100%,16min(データ採取20min)、カラム温度は40℃、サーモスタット温度は40℃、検出器は280nmの波長で検出した。
(52-2) HIC-UPLC Analysis of Specific Modification of Human IgG4 Antibody The antibody/peptide complex produced in (52-1) and the starting antibody were analyzed by HIC. A Protein-Pak Hi Res HIC Column (Waters) 4.6×100 mm 2.5 μm was used as the column. A_Buffer: 0.1 M PiNa, 2.3 M (NH 4 ) 2 SO 4 , pH 7.0, B_Buffer: 0.1 M PiNa, pH 7.0, flow rate 0.6 ml/min, gradient A60% B40%→A0 %
B100%, 16 min (20 min of data collection), column temperature of 40° C., thermostat temperature of 40° C., detector at wavelength of 280 nm.
サンプルについては以下の条件で反応させた。
a:ヒトIgG4抗体原料
b:ヒトIgG4抗体+ペプチドジスルフィドリンカー連結物-NHS活性化体 10等量;
The samples were reacted under the following conditions.
a: human IgG4 antibody raw material b: human IgG4 antibody + peptide disulfide linker conjugate-NHS activated
Retension Time 10.3154分はヒトIgG4抗体原料、8.8645分はペプチドがヒトIgG4抗体に1個導入された化合物であると考えられる(図7
0)。
Retension Time 10.3154 minutes is considered to be a human IgG4 antibody raw material, and 8.8645 minutes is a compound in which one peptide is introduced into a human IgG4 antibody (Fig. 7
0).
[実施例53:(1)切断性リンカーの合成、ならびに(2)合成したリンカーとIgG1 Fc結合性ペプチドとの連結による、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物(ペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体)の合成]
(53-1)チオエステルリンカーの合成とペプチドとの連結
(53-1-1)チオエステルリンカーの合成
(53-1) Synthesis of thioester linker and linking with peptide (53-1-1) Synthesis of thioester linker
5-アジドペンタン酸(200mg,1.40mmol)をTHF溶媒(12mL)に溶解させ、0℃にてピバロイルクロリド( 206μL,1.68mmol)、N-メチルモルホリン(230μL,2.10mmol)を加え30分攪拌し、5-アジドペンタン酸の混合酸無水物を調整した。室温にて4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-アミノ-ブタン酸(344mg、1.82mmol)を1M水酸化ナトリウム水溶液(1.82mL)に溶解させたのち、前述の5-アジドペンタン酸の混合酸無水物のTHF溶液を室温にて滴下した。室温にて16時間攪拌した後、6M塩酸水溶液を加え、系内のpHを3.0に調整した。反応液を酢酸エチルで希釈し、水、食塩水で洗浄後、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより粗生成物を得たのち、カラムクロマトグラフィー(ジクロロメタン:メタノール=10:1)にて精製した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することにより、4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(5-アジドペンタ-1-オキソ)アミノ-ブタン酸(320mg,1.02mmol)を得た。 5-Azidopentanoic acid (200 mg, 1.40 mmol) was dissolved in THF solvent (12 mL), and pivaloyl chloride (206 μL, 1.68 mmol) and N-methylmorpholine (230 μL, 2.10 mmol) were added at 0°C. The mixture was added and stirred for 30 minutes to prepare a mixed acid anhydride of 5-azidopentanoic acid. After dissolving 4-(tert-butoxy-oxo)-2-amino-butanoic acid (344 mg, 1.82 mmol) in 1 M aqueous sodium hydroxide solution (1.82 mL) at room temperature, the above 5-azidopentanoic acid of the mixed acid anhydride in THF was added dropwise at room temperature. After stirring at room temperature for 16 hours, a 6M hydrochloric acid aqueous solution was added to adjust the pH of the system to 3.0. The reaction mixture was diluted with ethyl acetate, washed with water and brine, added with anhydrous magnesium sulfate, and allowed to stand for 5 minutes. After removing magnesium sulfate by filtration and concentrating under reduced pressure to obtain a crude product, it was purified by column chromatography (dichloromethane:methanol=10:1). Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to give 4-(tert-butoxy-oxo)-2-(5-azidopenta-1-oxo)amino-butanoic acid (320 mg, 1.02 mmol). Obtained.
MS(ESI) m/z:337[M+Na]+ MS (ESI) m/z: 337 [M+Na] +
4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(5-アジドペンタ-1-オキソ)アミノ-ブタン酸(154mg,0.490mmol)をTHF(4.9mL)に溶解させ、0℃にてクロロ炭酸イソブチル( 83.6μL,0.637mmol)、N-メチルモルホリン(108μL,0.980mmol)を加え30分攪拌し、対応する混合酸無水物
を調整した。室温にてメルカプトプロピオン酸(128μL、1.47mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(253μL、1.47mmol)を、前述の混合酸無水物のTHF溶液を室温にて滴下した。室温にて16時間攪拌した後、1M水酸化ナトリウム水溶液を加え、系内のpHを9.0に調整した。反応液を水と酢酸エチルで洗浄し、水相を回収した。水相に6M塩酸水溶液を加え、系内のpHを3.0に調整した後、酢酸エチルによる分液抽出を行った後、有機相を食塩水で洗浄後、無水硫酸マグネシウムを加え5分静置した。フィルトレーションにより硫酸マグネシウムを取り除き、減圧下濃縮することにより、3-[4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(5-アジドペンタ-1-オキソ)アミノ-1-オキソ]スルファニル-プロパン酸(108mg,0.268mmol)を得た。
4-(tert-butoxy-oxo)-2-(5-azidopenta-1-oxo)amino-butanoic acid (154 mg, 0.490 mmol) was dissolved in THF (4.9 mL) and isobutyl chlorocarbonate was added at 0°C. (83.6 μL, 0.637 mmol) and N-methylmorpholine (108 μL, 0.980 mmol) were added and stirred for 30 minutes to prepare the corresponding mixed acid anhydride. Mercaptopropionic acid (128 μL, 1.47 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (253 μL, 1.47 mmol) were added dropwise at room temperature, and the THF solution of the aforementioned mixed acid anhydride was added dropwise at room temperature. After stirring at room temperature for 16 hours, 1M sodium hydroxide aqueous solution was added to adjust the pH of the system to 9.0. The reaction solution was washed with water and ethyl acetate, and the aqueous phase was recovered. A 6M hydrochloric acid aqueous solution was added to the aqueous phase to adjust the pH of the system to 3.0, followed by liquid separation and extraction with ethyl acetate. placed. 3-[4-(tert-butoxy-oxo)-2-(5-azidopent-1-oxo)amino-1-oxo]sulfanyl-propanoic acid was obtained by removing magnesium sulfate by filtration and concentrating under reduced pressure. (108 mg, 0.268 mmol) was obtained.
MS(ESI) m/z:403[M+H]+ MS (ESI) m/z: 403 [M+H] +
(53-1-2)チオエステルリンカーとペプチドの連結
実施例1-2で合成したAc-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2(配列番号39)のペプチド(31.8mg,15.3μmol、ただし、4番目と14番目の2つのホモシステインは、それぞれ分子内でジスルフィド結合を形成している。)をN,N’-ジメチルホルムアミド1mLに溶解し、3-[4-(tert-ブトキシ-オキソ)-2-(5-アジドペンタ-1-オキソ)アミノ-1-オキソ]-スルファニル-プロパン酸(61.7mg,0.153mmol)、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(29.4mg,0.153mmol)、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(10.4mg,0.0766mmol)をDMF1mLに溶解させ、系中に加えた。室温で2時間攪拌した後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結-tBu体(2.5mg,1.02μmol)を得た。
The peptide (31.8 mg, 15.3 μmol) of Ac-RGNCAYHKGQLVWCTYH-NH2 (SEQ ID NO: 39) synthesized in Example 1-2, provided that the two homocysteines at
MS(ESI) m/z:z=2 1230[M+2H]2+,z=3 820[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1230 [M+2H] <2+> , z=3 820 [M+3H] <3+>
上記ペプチドリンカー連結物(2.5mg,1.02μmol)をジクロロメタン0.250mL中に溶解し、トリフルオロ酢酸を0.250mL加え室温中で1時間攪拌した。減圧濃縮を行った後、0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体を得た。 The above peptide linker conjugate (2.5 mg, 1.02 μmol) was dissolved in 0.250 mL of dichloromethane, 0.250 mL of trifluoroacetic acid was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. After concentrating under reduced pressure, 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added and elution was performed by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product were collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide linker conjugate-carboxylic acid form.
MS(ESI) m/z:z=2 1202[M+2H]2+,z=3 802[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1202[M+2H] <2+> , z=3 802[M+3H] <3+>
上記ペプチドリンカー連結物-カルボン酸体をN,N’-ジメチルホルムアミド0.5mLに溶解し、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩(2.0mg,10.2μmol)、N-ヒドロキシスクシンイミド(1.2mg,10.2μmol)を加え16時間攪拌した。反応液に0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を加え逆相分取クロマトグラフィーにより溶出した。生成物が含まれるフラクションを回収し、減圧下濃縮することによりアセトニトリルのみ除去した後、凍結乾燥を行い、上記ペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体(0.5mg,0.2μmol)を得た。 The peptide linker conjugate-carboxylic acid form was dissolved in 0.5 mL of N,N'-dimethylformamide, and 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide hydrochloride (2.0 mg, 10.2 μmol), N-Hydroxysuccinimide (1.2 mg, 10.2 μmol) was added and stirred for 16 hours. A 0.1% trifluoroacetic acid aqueous solution was added to the reaction mixture, and the mixture was eluted by reverse phase preparative chromatography. Fractions containing the product are collected and concentrated under reduced pressure to remove only acetonitrile, followed by freeze-drying to obtain the peptide-azido-modified thioester linker conjugate-NHS activated form (0.5 mg, 0.2 μmol). got
MS(ESI) m/z:z=2 1251[M+2H]2+,z=3 834[M+3H]3+ MS (ESI) m/z: z=2 1251 [M+2H] <2+> , z=3 834 [M+3H] <3+>
[実施例54:抗HER2 IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾、ならびにESI-TOFMSによる解析]
(54-1)アジド修飾チオエステルリンカー結合性ペプチド試薬によるIgG抗体トラスツズマブの特異的修飾とESI-TOFMSによる解析
実施例53の(53-1-2)で合成したペプチド-アジド修飾チオエステルリンカー連結物-NHS活性化体はN,N’-ジメチルホルムアミドに溶解し4mMとした。抗HER2 IgG抗体トラスツズマブ(中外製薬)1.48mgを60mM酢酸ナトリウムバッファー(pH 4.7)555μLに溶解させ、4mMのペプチド試薬を50μL(抗体に対して20等量)加えて、室温で1時間攪拌し、100mMクエン酸により反応を停止した。反応液をAmicon 10Kにより9.57mM PBSバッファー(pH7.4)へと溶媒置換した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは148225にピークが観測され、生成物は結合性ペプチドが二つ導入された153143にピークが観測された。
[Example 54: Specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab and analysis by ESI-TOFMS]
(54-1) Specific modification of IgG antibody trastuzumab with azide-modified thioester linker-binding peptide reagent and analysis by ESI-TOFMS Peptide synthesized in (53-1-2) of Example 53-azido-modified thioester linker conjugate- The activated NHS was dissolved in N,N'-dimethylformamide to 4 mM. Dissolve 1.48 mg of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab (Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) in 555 μL of 60 mM sodium acetate buffer (pH 4.7), add 50 μL of 4 mM peptide reagent (20 equivalents to the antibody), and incubate at room temperature for 1 hour. The reaction was quenched with 100 mM citric acid by stirring. The reaction solution was solvent-exchanged with Amicon 10K to 9.57 mM PBS buffer (pH 7.4). When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148225 for the raw material trastuzumab, and a peak was observed at 153143 for the product into which two binding peptides were introduced.
(54-2)抗HER2 IgG抗体トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(54-1)で生成した抗体・ペプチド複合体のPBS溶液に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料のトラスツズマブは50595,50757に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖に結合性ペプチドが導入された52981および53143にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(54-2) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of specific modification of anti-HER2 IgG antibody trastuzumab 2.0 μL of (2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride solution (100 equivalents to the antibody) was added and stirred at room temperature for 20 minutes. When the mass was measured by ESI-TOFMS, the raw material trastuzumab had heavy chain peaks at 50595 and 50757, and a light chain peak at 23440. A light chain peak was observed at 23440, the same as the starting material.
(54-3)チオエステルリンカーの切断とESI-TOFMSによる解析
任意のバッファー(pH4.5~pH9.0)に、(54-1)で合成した抗体・ペプチドチオエステルリンカー複合体を溶解し、ヒドロキシルアミン水溶液を加え室温で攪拌することで、チオエステル構造が加水分解し、アジド基が抗体上に残る。これをESI-TOFMSにより質量を測定することができる。
(54-3) Cleavage of thioester linker and analysis by ESI-TOFMS The antibody/peptide thioester linker complex synthesized in (54-1) was dissolved in any buffer (pH 4.5 to pH 9.0), and hydroxylamine By adding an aqueous solution and stirring at room temperature, the thioester structure is hydrolyzed, leaving an azide group on the antibody. The mass of this can be measured by ESI-TOFMS.
(54-4)トラスツズマブ・ペプチド複合体のリンカー切断、および生成物のESI-TOFMSによる解析
先ず、(54-1)で合成したトラスツズマブ・ペプチド複合体120μgを0.5Mヒドロキシルアミン水溶液(0.5Mヒドロキシルアミン、9.56mMのPBS、4.8g/mLのEDTAを純水に溶解させた水溶液(pH7.2))に溶解し、室温で攪拌して、リンカー中のチオエステル結合を切断した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、生成物はアジドが二つ導入された148469にピークが観測された。
(54-4) Linker Cleavage of Trastuzumab-Peptide Complex and ESI-TOFMS Analysis of Product Hydroxylamine, 9.56 mM PBS, and 4.8 g/mL EDTA were dissolved in pure water (pH 7.2) and stirred at room temperature to cleave the thioester bond in the linker. When the mass was measured by ESI-TOFMS, a peak was observed at 148469 where two azides were introduced into the product.
(54-5)トラスツズマブの特異的修飾体の還元条件でのESI-TOFMS解析による重鎖選択性の確認
(54-4)で生成した抗体・ペプチド複合体に7mMトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩溶液2.0μL(抗体に対して100等量)を加えて、室温で20分攪拌した。ESI-TOFMSにより質量を測定したところ、原料の抗体・ペプチド複合体は52981,および53143に重鎖ピーク、23440に軽鎖ピークが観測され、生成物は重鎖にアジドが導入された50836および50999にピークが観察され、原料と同じ23440に軽鎖ピークが観測された。
(54-5) Confirmation of heavy chain selectivity by ESI-TOFMS analysis under reducing conditions of a specific modification of
(まとめ)
以上の結果をまとめると、以下のとおりである。
(summary)
The above results are summarized as follows.
また、抗体について、246位及び/又は248位のリジン残基(例、実施例8、15、44、46)、288位及び/又は290位のリジン残基(例、実施例42、実施例48)、317位のリジン残基(例、実施例40)を始めとする特定のアミノ酸残基の位置選択的な修飾が可能であることが示された。 Further, for antibodies, lysine residues at positions 246 and / or 248 (e.g., Examples 8, 15, 44, 46), lysine residues at positions 288 and / or 290 (e.g., Example 42, Examples 48), it was shown that regioselective modification of specific amino acid residues including the lysine residue at position 317 (eg, Example 40) is possible.
さらに、下記式(I)で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する下記の化合物について、実施例の一部を例に挙げて説明すると以
下の表3のとおりである。
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕
Lは、(i)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有する切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー、または(ii)切断により生体直交性官能基を反応性基側に生成する能力を有しない切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーである。
Furthermore, the following compounds having an affinity substance for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group, represented by the following formula (I), will be explained by taking some of the examples as examples, as shown in Table 3 below. That's right.
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ]
L is (i) a cleavable linker that is a divalent group that includes a cleavable moiety that has the ability to generate a bioorthogonal functional group on the side of the reactive group upon cleavage, or (ii) a bioorthogonal functional group upon cleavage is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety that does not have the ability to generate a on the side of a reactive group.
可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する種々の化合物は、上述のように、可溶性タンパク質に対する親和性物質(A)、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカー(L)、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基(B)、可溶性タンパク質に対する反応性基(R)の種類を適宜変更することにより、周知の有機合成方法にしたがって調製することができる。本発明において調製することができる、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物のさらなる例と、それにより製造することができる生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質(抗体)との関係は、以下のとおりである。 A variety of compounds having affinity substances for soluble proteins, cleavable moieties and reactive groups, as described above, have an affinity substance for soluble proteins (A), a cleavable linker which is a divalent group comprising a cleavable moiety. Types of (L), (a) divalent groups containing bioorthogonal functional groups, or (b) divalent groups without bioorthogonal functional groups (B), reactive groups for soluble proteins (R) can be prepared according to well-known organic synthesis methods by appropriately changing Further examples of compounds with affinity agents for soluble proteins, cleavable moieties and reactive groups that can be prepared in the present invention and soluble proteins (antibodies) with bioorthogonal functional groups that can be produced thereby The relationship with is as follows.
以上より、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物において、親和性物質の種類、親和性物質と反応性基との間のリンカーの長さ、およびリンカーが導入される親和性物質中の位置等の因子を適宜調節することにより、抗体を位置選択的に修飾できることが示された。 From the above, in a compound having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group, the type of affinity substance, the length of the linker between the affinity substance and the reactive group, and the linker are introduced It was shown that the antibody can be regioselectively modified by appropriately adjusting factors such as the position in the affinity substance.
本発明は、例えば、位置選択的に修飾された可溶性タンパク質の製造に有用である。 The present invention is useful, for example, for producing regioselectively modified soluble proteins.
Claims (117)
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩。 Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group.
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。 Claims 1 to 8, wherein the affinity substance is an affinity substance for an antibody that contains any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and has antigen-binding ability: A compound or salt thereof according to any one of:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号94) (i)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ
Wは、トリプトファン残基である。〕
によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、請求項7~9のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (i):
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 94) (i)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
A peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues and capable of binding to human IgG and / or rabbit IgG, represented by any one of claims 7 to 9. compound or its salt.
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号95) (i-1)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、リジン残基、システイン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、又はジアミノプロピオン酸残基であり、
Gはグリシン残基であり、
Xaa2はグルタミン酸残基又はアスパラギン残基であり、
Lはロイシン残基であり、
Vはバリン残基であり、かつ
Wはトリプトファン残基である。〕
によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、請求項7~9のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (i-1):
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 95) (i-1)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is a lysine residue, a cysteine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a glutamic acid residue or an asparagine residue,
L is a leucine residue,
V is a valine residue and W is a tryptophan residue. ]
A peptide or a salt thereof comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 17 amino acid residues and capable of binding to human IgG and / or rabbit IgG, represented by any one of claims 7 to 9. compound or its salt.
(X1-3)-C-(X2)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(X1-3) (配列番号96) (i-2)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、またはロイシン残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、かつ、
Wは、トリプトファン残基である。〕によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、請求項7~10のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (i-2):
(X 1-3 )-C-(X 2 )-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(X 1-3 ) (SEQ ID NO: 96) (i-2)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue or a leucine residue,
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue, and
W is a tryptophan residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof, according to any one of claims 7 to 10. or a salt thereof.
(X1-3)-C-(Xaa3)-(xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号102)
(v)
〔式中、
Xは、同一または異なって、システイン以外の任意のアミノ酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、かつ
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕によって表される、13~17アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であるペプチドまたはその塩である、請求項7~12のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (v):
(X 1-3 )-C-(Xaa3)-(xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (sequence number 102)
(v)
[In the formula,
X is the same or different and is any amino acid residue other than cysteine;
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue, and Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or no residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof, according to any one of claims 7 to 12. or a salt thereof.
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号103) (vi)〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕で表される、13~15アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドまたはその塩である、請求項7~13のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (vi):
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (SEQ ID NO: 103) (vi ) [In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue;
Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or none. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof, comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 15 amino acid residues. A compound according to any one of claims or a salt thereof.
D-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-T (配列番号104) (vii)
〔式中、
Dは、アスパラギン酸残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、かつ
Tは、スレオニン残基である〕で表される、13アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドまたはその塩である、請求項7~14のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (vii):
DC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWCT (SEQ ID NO: 104) (vii)
[In the formula,
D is an aspartic acid residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue, and T is a threonine residue], and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG. The compound or its salt according to any one of claims 7 to 14, which is a characterized peptide or its salt.
R-G-N-C-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-L-V-W-C-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (配列番号105) (viii)
〔式中、
Rは、アルギニン残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Nは、アスパラギン残基であり、
Cは、システイン残基であり、
Xaa3は、アラニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa4は、トリプトファン残基、またはチロシン残基であり、
Hは、ヒスチジン残基であり、
Xaa1は、アルギニン残基、ロイシン残基、リジン残基、アスパラギン酸残基、グルタミン酸残基、2-アミノスベリン酸残基、またはジアミノプロピオン酸残基であり、
Gは、グリシン残基であり、
Xaa2は、リジン残基、グルタミン残基、グルタミン酸残基、アスパラギン残基、またはアスパラギン酸残基であり、
Lは、ロイシン残基であり、
Vは、バリン残基であり、
Wは、トリプトファン残基であり、
Xaa5は、スレオニン残基、またはリジン残基であり、
Xaa6は、チロシン残基、リジン残基、または無しであり、かつ
Xaa7は、ヒスチジン残基、リジン残基、または無しである。〕で表される、13~15アミノ酸残基からなるアミノ酸配列を含み、かつヒトIgGおよび/またはウサギIgGと結合可能であることを特徴とするペプチドまたはその塩である、請求項7~13のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The binding peptide has the following formula (viii):
RGNC-(Xaa3)-(Xaa4)-H-(Xaa1)-G-(Xaa2)-LVWC-(Xaa5)-(Xaa6)-(Xaa7) (SEQ ID NO: 105) (viii)
[In the formula,
R is an arginine residue,
G is a glycine residue,
N is an asparagine residue,
C is a cysteine residue,
Xaa3 is an alanine residue or a lysine residue,
Xaa4 is a tryptophan residue or a tyrosine residue,
H is a histidine residue,
Xaa1 is an arginine residue, a leucine residue, a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, or a diaminopropionic acid residue;
G is a glycine residue,
Xaa2 is a lysine residue, a glutamine residue, a glutamic acid residue, an asparagine residue, or an aspartic acid residue;
L is a leucine residue,
V is a valine residue,
W is a tryptophan residue,
Xaa5 is a threonine residue or a lysine residue,
Xaa6 is a tyrosine residue, a lysine residue, or no residue, and Xaa7 is a histidine residue, a lysine residue, or no residue. ] and is capable of binding to human IgG and/or rabbit IgG, or a salt thereof, comprising an amino acid sequence consisting of 13 to 15 amino acid residues. A compound according to any one of claims or a salt thereof.
びジアミノプロピオン酸残基からなる群より選ばれる1つのアミノ酸残基により置換されており、かつ
(b)配列番号92の前記アミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列を含む、親和性ペプチドまたはその塩である、請求項7~9のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 In the amino acid sequence of (a) FNMQCQRRFYEALHDPNLNEEQRNARIRSIRDDC (SEQ ID NO: 92), any of the amino acid residues of the binding peptide is a lysine residue, an aspartic acid residue, a glutamic acid residue, a 2-aminosuberic acid residue, and a diamino acid residue. Affinity comprising an amino acid sequence substituted by one amino acid residue selected from the group consisting of propionic acid residues and (b) having 90% or more identity to said amino acid sequence of SEQ ID NO:92 The compound or its salt according to any one of claims 7 to 9, which is a peptide or its salt.
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、
(i)水素原子、またはハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれ、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、請求項1~20のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The cleavable portion is:
multiple R 2a , multiple R 2b , and multiple R 2c are the same or different,
(i) a hydrogen atom, or a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is a hydrogen atom , or a monovalent hydrocarbon group);
(vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e -(R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group); or (vii) from the group consisting of a nitro group, a sulfate group, a sulfonate group, a cyano group, or a carboxyl group chosen,
J is —CH 2 —, —O—, or —S—;
r is any integer from 1 to 4,
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. 21. The compound or salt thereof according to any one of claims 1 to 20, which corresponds to any one chemical structure selected from the group consisting of:
R2aは、請求項23と同じであり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、請求項2~19、21、23のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The cleavable moiety of (i) above is:
R 2a is the same as in claim 23,
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. The compound or salt thereof according to any one of claims 2 to 19, 21 and 23, which corresponds to any one chemical structure selected from the group consisting of:
R2b、R2c、J、rは、請求項23と同じであり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、請求項2~19、22、23のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The cleavable moiety of (ii) above is:
R 2b , R 2c , J, r are the same as in claim 23,
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. 24. The compound or salt thereof according to any one of claims 2 to 19, 22 and 23, which corresponds to any one chemical structure selected from the group consisting of:
La-C-Lb (L1)
La-C (L2)
C-Lb (L3)
〔式中、
LaおよびLbは、それぞれ、2価の基であり、
Cは、切断性部分である。〕のいずれか一つで表される、請求項1~25のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 L is the following formulas (L1) to (L3):
La-C-Lb (L1)
La-C (L2)
C-Lb (L3)
[In the formula,
La and Lb are each a divalent group,
C is a cleavable moiety. ], the compound or a salt thereof according to any one of claims 1 to 25.
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子または基である。〕で表される、請求項26記載の化合物またはその塩。 Said La and Lb are respectively the following (La') and (Lb'):
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii). ], The compound or its salt of Claim 26.
R1f、単一もしくは複数のR1gおよび単一もしくは複数のR1hは、同一もしくは異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子もしくは基、または電子吸引基であり、
・は、結合手である。)で表されるいずれか一つである、請求項1~29のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The bioorthogonal functional groups are:
R 1f , single or multiple R 1g and single or multiple R 1h are the same or different and are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii), or electron-withdrawing groups;
・ is a bond. ), the compound or a salt thereof according to any one of claims 1 to 29.
Yは、-NH-、-O-、-CH2-、または下記式(B-2):
VおよびV’は、同一または異なって、-NH-、-O-、-CH2-、または単結合であり、
V1は、生体直交性官能基を含む2価の基であり、
sは、0~10の任意の整数であり、
式(B-2)における○および●は、それぞれ、式(B-1)における○および●と同じ配向である。)であり、
Zは、酸素原子、硫黄原子、または水素原子(Zが水素原子である場合、-C(=Z)-は、-CH2-を示す。)であり、
式(B-1)における○(白丸)は、L側の部分に対する結合を示し、●(黒丸)はR側の部分に対する結合を示す。〕で表される、請求項1~31のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 B is the following formula (B-1):
Y is -NH-, -O-, -CH 2 -, or the following formula (B-2):
V and V′ are the same or different and are —NH—, —O—, —CH 2 —, or a single bond;
V is a divalent group containing a bioorthogonal functional group;
s is any integer from 0 to 10,
○ and ● in formula (B-2) have the same orientations as ○ and ● in formula (B-1), respectively. ) and
Z is an oxygen atom, a sulfur atom, or a hydrogen atom (when Z is a hydrogen atom, -C(=Z)- represents -CH 2 -);
○ (white circle) in formula (B-1) indicates a bond to the L-side portion, and ● (black circle) indicates a bond to the R-side portion. ], the compound or a salt thereof according to any one of claims 1 to 31.
R5aおよびR5cは、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれる原子または基であり、
R5bは、電子吸引基であり、
jは、1~5の任意の整数であり、
kは、1~4の任意の整数である。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、請求項1~34のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The reactive groups are:
R 5a and R 5c are atoms or groups selected from the group consisting of (i) to (vii);
R 5b is an electron withdrawing group,
j is any integer from 1 to 5;
k is any integer from 1 to 4. 35. The compound or salt thereof according to any one of claims 1 to 34, which corresponds to any one chemical structure selected from the group consisting of:
A-B2-L’-B1-R (I’)
〔式中、
AおよびRは、前記式(I)のものと同じであり
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1およびB2は、同一または異なって、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
B1およびB2は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕で表される化合物である、請求項1~38のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The compound represented by the formula (I) is the following (I'):
AB2-L'-B1-R (I')
[In the formula,
A and R are the same as in formula (I) above L′ is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1 and B2 are the same or different and are (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group containing no bioorthogonal functional group;
B1 and B2 may have a symmetrical structure about L'. ], the compound or a salt thereof according to any one of claims 1 to 38.
AおよびRは、請求項1記載の式(I)のものと同じであり、
Cは、切断性部分であり、
p、p’、q、q’、X、X’、R1a、R1a’、R1b、およびR1b’は、請求項27記載の式(La’)および(Lb’)のものと同じであり、
YおよびY’は、同一または異なって、請求項32記載の式(B-1)のYと同じであり、
ZおよびZ’は、同一または異なって、前記式(B-1)のZと同じである。〕で表される、請求項39のいずれか一項記載の化合物またはその塩。 The compound represented by the formula (I′) is the following (I″):
A and R are the same as those of formula (I) described in claim 1,
C is a cleavable moiety;
p, p', q, q', X, X', R 1a , R 1a' , R 1b and R 1b' are the same as in formulas (La') and (Lb') according to claim 27 and
Y and Y' are the same or different and are the same as Y in formula (B-1) according to claim 32,
Z and Z' are the same or different and are the same as Z in formula (B-1) above. 40. A compound or a salt thereof according to any one of claims 39, which is represented by:
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を含む、可溶性タンパク質の位置選択的修飾試薬。 Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a regioselective modification reagent for a soluble protein comprising a compound having an affinity for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof.
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である。〕で表される、抗体に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩。 Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group specific for the side chains of lysine residues. ], a compound or a salt thereof having an affinity substance for an antibody, a cleavable moiety and a reactive group.
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基である。〕で表される、抗体に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を含む、抗体の位置選択的修飾試薬。 Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group specific for the side chains of lysine residues. ], an antibody regioselective modification reagent comprising an antibody-affinity substance, a cleavable moiety and a compound having a reactive group or a salt thereof.
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩。 Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof.
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。 The soluble protein comprises any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and is an antibody having antigen-binding ability, according to any one of claims 44 to 47 Soluble protein or its salt:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
A-L-B-R’で表される構造単位が、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、請求項44~48のいずれか一項記載の可溶性タンパク質またはその塩。 The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region including 5 or more
The structural unit represented by ALBR' binds to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a regioselectivity of 30% or more. The soluble protein or salt thereof according to any one of 44-48.
Tが、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、前記多量体タンパク質がA-L-B-R’で表される構造単位を複数個有する、請求項44~56のいずれか一項記載の可溶性タンパク質またはその塩。 the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins;
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of monomeric proteins, so that the multimeric protein is ALB- The soluble protein or salt thereof according to any one of claims 44 to 56, which has a plurality of structural units represented by R'.
Tが、複数個の重鎖中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B-R’で表される構造単位を有する結果、前記抗体がA-L-B-R’で表される構造単位を複数個有する、請求項44~57のいずれか一項記載の可溶性タンパク質またはその塩。 wherein said soluble protein is an antibody comprising multiple heavy chains;
T has a structural unit represented by ALBR' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of heavy chains, such that the antibody is represented by ALBR'. The soluble protein or salt thereof according to any one of claims 44 to 57, having a plurality of structural units.
A-B2-L’-B1-R’-T (II’)
〔式中、
A、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1およびB2は、同一または異なって、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
B1およびB2は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕で表される化合物である、請求項44~65のいずれか一項記載の可溶性タンパク質またはその塩。 The compound represented by the formula (II) is the following (II'):
AB2-L'-B1-R'-T (II')
[In the formula,
A, R′ and T are the same as in formula (II) above L′ is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1 and B2 are the same or different and are (a) a divalent group containing a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group containing no bioorthogonal functional group;
B1 and B2 may have a symmetrical structure about L'. ], the soluble protein or a salt thereof according to any one of claims 44 to 65.
A、R’およびTは、請求項44記載の式(II)のものと同じであり、
Cは、切断性部分であり、
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、
(i)水素原子、またはハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれ、
YおよびY’は、同一または異なって、請求項32記載の式(B-1)のYと同じであり、
ZおよびZ’は、同一または異なって、請求項32記載の式(B-1)のZと同じである。〕で表される、請求項66記載の可溶性タンパク質またはその塩。 The compound represented by the formula (II') is the following (II''):
A, R' and T are the same as in formula (II) according to claim 44;
C is a cleavable moiety;
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different,
(i) a hydrogen atom, or a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(=O)-O- (R c is a hydrogen atom , or a monovalent hydrocarbon group);
(vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e -(R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group); or (vii) from the group consisting of a nitro group, a sulfate group, a sulfonate group, a cyano group, or a carboxyl group chosen,
Y and Y' are the same or different and are the same as Y in formula (B-1) according to claim 32,
Z and Z' are the same or different and are the same as Z in the formula (B-1) described in claim 32. ], the soluble protein or its salt according to claim 66.
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、抗体と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、抗体である。〕表される、抗体に対する親和性物質、および切断性部分を有する抗体またはその塩。 Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between an antibody and a reactive group specific for the side chain of a lysine residue;
T is an antibody. ] and an antibody or salt thereof having a cleavable moiety, represented by an affinity substance for an antibody.
下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein affinity substance and a soluble protein or salt thereof having a cleavable moiety, comprising:
Formula (I) below:
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound having an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof, is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. and a soluble protein or salt thereof having a cleavable moiety.
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩。 Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein, or a salt thereof.
(A)配列番号1のアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;
(B)配列番号1のアミノ酸配列において、1もしくは数個のアミノ酸残基が挿入、付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質;または
(C)配列番号1のアミノ酸配列と90%以上の同一性を示すアミノ酸配列を含むFc領域タンパク質。 The soluble protein comprises any one Fc region protein selected from the group consisting of the following (A) to (C) and is an antibody having antigen-binding ability, according to any one of claims 71 to 74 Complexes or their salts:
(A) an Fc region protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(B) an Fc region protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acid residues are inserted, added, deleted or substituted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1; or (C) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and 90 An Fc region protein comprising an amino acid sequence exhibiting greater than or equal to % identity.
A-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、請求項71~75のいずれか一項記載の複合体またはその塩。 The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region including 5 or more
The structural unit represented by ALB'(-F)-R' binds to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more. The conjugate or salt thereof according to any one of claims 71 to 75, wherein
Tが、複数個の単量体タンパク質中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を有する結果、前記多量体タンパク質がA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を複数個有する、請求項71~77のいずれか一項
記載の複合体またはその塩。 the soluble protein is a multimeric protein comprising a plurality of monomeric proteins;
T has a structural unit represented by ALB'(-F)-R' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of monomeric proteins. As a result, the multimeric protein is A 78. The complex or salt thereof according to any one of claims 71 to 77, which has a plurality of structural units represented by -LB'(-F)-R'.
Tが、複数個の重鎖中の対応する複数個の標的領域において、A-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を有する結果、前記抗体がA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位を複数個有する、請求項71~78のいずれか一項記載の複合体またはその塩。 wherein said soluble protein is an antibody comprising multiple heavy chains;
T has a structural unit represented by ALB'(-F)-R' in a plurality of corresponding target regions in a plurality of heavy chains, such that the antibody has ALB The complex or salt thereof according to any one of claims 71 to 78, which has a plurality of structural units represented by '(-F)-R'.
複数のR2a、複数のR2b、および複数のR2cは、同一または異なって、
(i)水素原子、またはハロゲン原子;
(ii)1価の炭化水素基;
(iii)アラルキル;
(iv)1価の複素環基;
(v)Rc-O-、Rc-C(=O)-、Rc-O-C(=O)-、もしくはRc-C(
=O)-O-(Rcは、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);
(vi)NRdRe-、NRdRe-C(=O)-、NRdRe-C(=O)-O-、もしくはRd-C(=O)-NRe-(RdおよびReは、同一もしくは異なって、水素原子、もしくは一価の炭化水素基を示す。);または
(vii)ニトロ基、硫酸基、スルホン酸基、シアノ基、もしくはカルボキシル基
からなる群より選ばれ、
Jは、-CH2-、-O-、または-S-であり、
rは、1~4の任意の整数であり、
○(白丸)はAに対する結合を示し、●(黒丸)はBに対する結合を示す。
化学構造が、切断部位を中心にして非対称である場合、●がAに対する結合を示し、○がBに対する結合を示していてもよい。〕からなる群より選ばれるいずれか一つの化学構造に対応する、請求項71~80のいずれか一項記載の複合体またはその塩。 The moieties produced by the reaction are:
multiple R 2a , multiple R 2b , and multiple R 2c are the same or different,
(i) a hydrogen atom, or a halogen atom;
(ii) a monovalent hydrocarbon group;
(iii) aralkyl;
(iv) a monovalent heterocyclic group;
(v) R c -O-, R c -C(=O)-, R c -O-C(=O)-, or R c -C(
=O)-O- (R c represents a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group);
(vi) NR d R e -, NR d R e -C(=O)-, NR d R e -C(=O)-O-, or R d -C(=O)-NR e -(R d and R e are the same or different and represent a hydrogen atom or a monovalent hydrocarbon group); or (vii) from the group consisting of a nitro group, a sulfate group, a sulfonate group, a cyano group, or a carboxyl group chosen,
J is —CH 2 —, —O—, or —S—;
r is any integer from 1 to 4,
O (white circle) indicates binding to A, and ● (filled circle) indicates binding to B.
If the chemical structure is asymmetric about the cleavage site, the circle may indicate the bond to A and the circle may indicate the bond to B. 81. The complex or salt thereof according to any one of claims 71 to 80, which corresponds to any one chemical structure selected from the group consisting of:
A-B2’(-F2)-L’-B1’(-F1)-R’-T (III’)
〔式中、
A、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L’は、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B1’およびB2’は、同一または異なって、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
F1およびF2は、同一または異なって、機能性物質であり、
B1’(-F1)およびB2’(-F2)は、L’を中心にした対称構造を有していてもよい。〕で表される、請求項71~90のいずれか一項記載の複合体またはその塩。 The compound represented by the formula (III) is represented by the following formula (III'):
A-B2'(-F2)-L'-B1'(-F1)-R'-T (III')
[In the formula,
A, R' and T are the same as in formula (II) above;
L' is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B1' and B2' are the same or different and are divalent groups comprising moieties generated by reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F1 and F2 are the same or different and are functional substances;
B1' (-F1) and B2' (-F2) may have a symmetrical structure about L'. ], the complex or a salt thereof according to any one of claims 71 to 90.
A、R’およびTは、請求項71記載の式(III)のものと同じであり、
Cは、切断性部分であり、
pおよびp’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
qおよびq’は、同一または異なって、0~10の任意の整数であり、
XおよびX’は、同一または異なって、炭素原子、窒素原子、または単結合(ここで、Xが窒素原子である場合、R1bは存在せず、X’が窒素原子である場合、R1b’は存在しない。Xが単結合である場合、R1aおよびR1bは存在せず、X’が単結合である場合、R1a’およびR1b’は存在しない)であり、
R1a、R1b、R1a’およびR1b’は、同一または異なって、前記(i)~(vii)からなる群より選ばれ、
YおよびY’は、同一または異なって、請求項32記載の式(B-1)のYから水素原子を一つ除いた残基であり、
ZおよびZ’は、同一または異なって、前記式(B-1)のZと同じであり、
FおよびF’は、同一または異なって、機能性物質である。〕で表される、請求項91記載の複合体またはその塩。 The compound represented by the formula (III') is the following (III''):
A, R' and T are the same as in formula (III) according to claim 71;
C is a cleavable moiety;
p and p' are the same or different and any integer from 0 to 10;
q and q' are the same or different and any integer from 0 to 10;
X and X' are the same or different and are a carbon atom, a nitrogen atom, or a single bond (wherein when X is a nitrogen atom, R 1b is absent, and when X' is a nitrogen atom, R 1b ' is absent.If X is a single bond, R 1a and R 1b are absent, and if X' is a single bond, R 1a' and R 1b' are absent);
R 1a , R 1b , R 1a′ and R 1b′ are the same or different and are selected from the group consisting of (i) to (vii);
Y and Y' are the same or different and are a residue obtained by removing one hydrogen atom from Y in formula (B-1) according to claim 32,
Z and Z' are the same or different and are the same as Z in the formula (B-1);
F and F' are the same or different and are functional substances. ], or a salt thereof according to claim 91.
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、抗体に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、抗体と、リジン残基の側鎖に対して特異的な反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、抗体である。〕で表される、親和性物質、機能性物質および抗体を有する複合体
またはその塩。 Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for the antibody;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between an antibody and a reactive group specific for the side chain of a lysine residue;
T is an antibody. ], a complex having an affinity substance, a functional substance and an antibody or a salt thereof.
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
A、L、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a complex or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A, L, R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], a conjugate having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein, or a salt thereof.
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
AおよびLは、前記式(I)のものと同じであり、
R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a complex or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional substance and a soluble protein,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], the compound or its salt is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. and (B) an affinity substance for said soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or reacting the salt with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A and L are the same as in formula (I) above;
R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], a conjugate having an affinity agent for a soluble protein, a cleavable moiety, a functional agent and a soluble protein, or a salt thereof.
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein or a salt thereof having a bioorthogonal functional group, comprising:
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], cleaving the cleavable portion of a soluble protein having an affinity for soluble proteins and a soluble protein having a cleavable portion or a salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] or a salt thereof having a bioorthogonal functional group.
L1が、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基であり、
Bが、前記(a)または(b)の2価の基である、請求項98記載の方法。 L is the cleavable linker of (i) above,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group;
99. The method of claim 98, wherein B is the divalent group of (a) or (b).
L1が(i’)生体直交性官能基を含む1価の基であり、
Bが前記(b)の2価の基である、請求項98または99記載の方法。 L is the cleavable linker of (i) above,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group;
100. The method of claim 98 or 99, wherein B is the divalent group of (b).
L1が(i’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bが前記(a)の2価の基である、請求項98記載の方法。 L is the cleavable linker of (ii) above,
L1 is (i′) a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group;
99. The method of claim 98, wherein B is the divalent group of (a).
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein or a salt thereof having a bioorthogonal functional group, comprising:
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], the compound or its salt is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. and (B) an affinity substance for said soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or cutting the cleavable portion of the salt,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] or a salt thereof having a bioorthogonal functional group.
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、あるいは
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、
下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能
基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], or cleaving the cleavable portion of a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein or a salt thereof, or the following formula (IV):
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], by reacting a soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with a functional substance,
Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む方法である、請求項104記載の方法。 cleaving the cleavable portion of a complex having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein or a salt thereof,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. 105. The method according to claim 104, which is a method comprising producing a soluble protein having a functional substance represented by ] or a salt thereof.
下記式(V2):
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む方法である、請求項104記載の方法。 reacting the soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof with one or two functional substances,
The following formula (V2):
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. 105. The method according to claim 104, which is a method comprising producing a soluble protein having a functional substance represented by ] or a salt thereof.
(A)下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
A、L、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ] and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A, L, R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and (B) the affinity substance for the soluble protein, the cleavable moiety , cleaving a cleavable portion of a complex having a functional agent and a soluble protein or a salt thereof,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分および反応性基を有する化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を、機能性物質と反応させて、
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
AおよびLは、前記式(I)のものと同じであり、
R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の
基であり、
Fは、機能性物質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩を生成すること、ならびに
(C)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(V1):
L1-B’(-F)-R’-T (V1)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
B’、F、R’およびTは、前記式(III)のものと同じである。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group comprising a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], a compound having an affinity for soluble proteins, a cleavable moiety and a reactive group or a salt thereof, is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], and producing a soluble protein or a salt thereof having a cleavable moiety,
(B) reacting an affinity substance for the soluble protein and a soluble protein having a cleavable moiety or a salt thereof with a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A and L are the same as in formula (I) above;
R' and T are the same as in formula (II) above;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ] and (C) the affinity substance for the soluble protein, the cleavable moiety , cleaving a cleavable portion of a complex having a functional agent and a soluble protein or a salt thereof,
The following formula (V1):
L1-B'(-F)-R'-T (V1)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B', F, R' and T are the same as in formula (III) above. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
(A)下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(B)前記生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種以上の機能性物質と反応させて、
下記式(V2)
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (II):
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], cleaving the cleavable portion of a soluble protein having an affinity for soluble proteins and a soluble protein having a cleavable portion or a salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ], and (B) the soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof represented by one or more functions by reacting with a substance,
The following formula (V2)
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
(A)下記式(I):
A-L-B-R (I)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
Rは、前記可溶性タンパク質に対する反応性基である。〕で表される化合物またはその塩を、可溶性タンパク質と反応させて、
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
A、L、およびBは、前記式(I)のものと同じであり
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質である。〕で表される、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、
(B)前記可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表される、生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成すること、ならびに
(C)前記生体直交性官能基を有する可溶性タンパク質またはその塩を、1種または2種以上の機能性物質と反応させて、
下記式(V2)
F-L1’-B-R’-T (V2)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、機能性物質と、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質である。〕、または
下記式(V3):
Fa-L1’-B’(-Fb)-R’-T (V3)
〔式中、
R’およびTは、前記式(IV)のものと同じであり、
L1’は、前記式(V2)のものと同じであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
FaおよびFbは、それぞれ、同一または異なる機能性物質である。〕で表される、機能性物質を有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof,
(A) the following formula (I):
A-L-B-R (I)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R is a reactive group for said soluble protein. ], the compound or its salt is reacted with a soluble protein,
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A, L, and B are the same as in formula (I) above R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein. ], and producing a soluble protein or a salt thereof having a cleavable moiety,
(B) cleaving a cleavable portion of a soluble protein having an affinity for said soluble protein and a soluble protein having a cleavable portion or a salt thereof,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. and (C) the soluble protein having a bioorthogonal functional group or a salt thereof represented by one or more functions by reacting with a substance,
The following formula (V2)
FL1'-B-R'-T (V2)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is a divalent group comprising a moiety produced by a reaction between a functional agent and (i') a monovalent group comprising a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance. ], or the following formula (V3):
Fa-L1'-B'(-Fb)-R'-T (V3)
[In the formula,
R' and T are the same as in formula (IV) above;
L1' is the same as in formula (V2) above,
B' is a divalent group comprising a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
Fa and Fb are the same or different functional substances, respectively. ], comprising producing a soluble protein having a functional substance or a salt thereof.
可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ
生体直交性官能基が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。 A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region 5 or more bioorthogonal functional groups with a regioselectivity of 30% or more for one or more specific amino acid residues contained in the target region via a linker that does not contain a peptide moiety A soluble protein or salt thereof having a regioselectively attached bioorthogonal functional group.
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。 Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region 5 or more. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A soluble protein or salt thereof having a regioselectively attached bioorthogonal functional group.
下記式(II):
A-L-B-R’-T (II)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(a)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつL1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、および切断性部分を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩の切断性部分を切断して、
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
B、R’およびTは、前記式(II)のものと同じであり、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基である。〕で表され、かつ
L1-B-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group, comprising:
Formula (II) below:
A-LB-R'-T (II)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (a) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region 5 or more. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein cleaving the bound affinity substance for the soluble protein and the cleavable portion of the soluble protein or salt thereof regioselectively carrying the cleavable portion,
Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
B, R' and T are the same as in formula (II) above;
L1 is (i') a monovalent group that contains a bioorthogonal functional group or (ii') a monovalent group that does not contain a bioorthogonal functional group. ] and the structural unit represented by L1-BR' has a regioselectivity of 30% or more with respect to one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A method comprising producing a soluble protein or salt thereof regioselectively having an attached bioorthogonal functional group.
可溶性タンパク質が、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含み、かつ
機能性物質が、ペプチド部分を含まないリンカーを介して、前記標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。 A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region 5 or more, and the functional substance binds to one or more specific amino acid residues contained in the target region with a position selectivity of 30% or more via a linker that does not contain a peptide portion. A soluble protein or a salt thereof that regioselectively has a functional substance.
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつ
F-(L1-B)’-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩。 Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region 5 or more. ] and the structural unit represented by F-(L1-B)'-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance bound thereto with regioselectivity.
下記式(III):
A-L-B’(-F)-R’-T (III)
〔式中、
Aは、可溶性タンパク質に対する親和性物質であり、
Lは、切断性部分を含む2価の基である切断性リンカーであり、
B’は、機能性物質と生体直交性官能基との間の反応により生成する部分を含む2価の基であり、
Fは、機能性物質であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、可溶性タンパク質であり、
前記可溶性タンパク質は、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む。〕で表され、かつA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、可溶性タンパク質に対する親和性物質、切断性部分、機能性物質および可溶性タンパク質を位置選択的に有する複合体またはその塩の切断性部分を切断して、あるいは
下記式(IV):
L1-B-R’-T (IV)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
R’は、可溶性タンパク質と反応性基との間の反応により生成する部分であり、
Tは、連続する1~50個のアミノ酸残基からなる標的領域中において特定のアミノ酸残基を1個以上含み、かつ、前記標的領域以外の非標的領域中において前記特定のアミノ酸残基を5個以上含む可溶性タンパク質である。〕で表され、かつA-L-B’(-F)-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、生体直交性官能基を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を機能性物質と反応させて、
下記式(V):
F-(L1-B)’-R’-T (V)
〔式中、
L1は、(i’)生体直交性官能基を含む1価の基、または(ii’)生体直交性官能基を含まない1価の基であり、
Bは、(a)生体直交性官能基を含む2価の基、または(b)生体直交性官能基を含まない2価の基であり、
(L1-B)’で表される構造単位は、機能性物質と、(i’)および(a)における生体直交性官能基のいずれか一方または双方との間の反応により生成する部分を含む2価の構造単位であり、
Fは、機能性物質であり、
R’およびTは、前記式(III)または(IV)のものと同じである。〕で表され、かつF-(L1-B)’-R’で表される構造単位が、前記可溶性タンパク質の標的領域中に含まれる1個以上の特定のアミノ酸残基に対して30%以上の位置選択性で結合している、機能性物質を位置選択的に有する可溶性タンパク質またはその塩を生成することを含む、方法。 A method for producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance,
Formula (III) below:
ALB'(-F)-R'-T (III)
[In the formula,
A is an affinity substance for soluble proteins;
L is a cleavable linker that is a divalent group containing a cleavable moiety;
B' is a divalent group that includes a moiety generated by a reaction between a functional agent and a bioorthogonal functional group;
F is a functional substance,
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T is a soluble protein,
The soluble protein contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and the specific amino acid residue in a non-target region other than the target region 5 or more. ] and the structural unit represented by ALB'(-F)-R' is 30 for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. cleaving the cleavable portion of a complex or a salt thereof regioselectively having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable portion, a functional substance and a soluble protein bound with a regioselectivity of ≥%, or Formula (IV) below:
L1-B-R'-T (IV)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
R' is a moiety generated by reaction between a soluble protein and a reactive group;
T contains one or more specific amino acid residues in a target region consisting of 1 to 50 consecutive amino acid residues, and 5 of the specific amino acid residues in a non-target region other than the target region It is a soluble protein containing more than ] and the structural unit represented by ALB'(-F)-R' is 30 for one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein. A soluble protein or a salt thereof regioselectively having a bioorthogonal functional group bound with a regioselectivity of 10% or more is reacted with a functional substance,
Formula (V) below:
F-(L1-B)'-R'-T (V)
[In the formula,
L1 is (i′) a monovalent group containing a bioorthogonal functional group or (ii′) a monovalent group not containing a bioorthogonal functional group;
B is (a) a divalent group that includes a bioorthogonal functional group or (b) a divalent group that does not include a bioorthogonal functional group;
The structural unit represented by (L1-B)' includes a moiety generated by a reaction between a functional substance and either one or both of the bioorthogonal functional groups in (i') and (a). is a divalent structural unit,
F is a functional substance,
R' and T are the same as in formula (III) or (IV) above. ] and the structural unit represented by F-(L1-B)'-R' accounts for 30% or more of one or more specific amino acid residues contained in the target region of the soluble protein producing a soluble protein or a salt thereof regioselectively having a functional substance regioselectively attached to
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2017090679 | 2017-04-28 | ||
JP2017090679 | 2017-04-28 | ||
PCT/JP2018/017345 WO2018199337A1 (en) | 2017-04-28 | 2018-04-27 | Compound having substance that has affinity for soluble protein, cleavable moiety, and reactive group, or salt thereof |
JP2019514691A JP7222347B2 (en) | 2017-04-28 | 2018-04-27 | A compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019514691A Division JP7222347B2 (en) | 2017-04-28 | 2018-04-27 | A compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2023052910A true JP2023052910A (en) | 2023-04-12 |
JP2023052910A5 JP2023052910A5 (en) | 2023-04-25 |
Family
ID=63918939
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019514691A Active JP7222347B2 (en) | 2017-04-28 | 2018-04-27 | A compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group |
JP2023015725A Pending JP2023052910A (en) | 2017-04-28 | 2023-02-03 | Compound or salt thereof having affinity substance for soluble protein, cleavable moiety, and reactive group |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019514691A Active JP7222347B2 (en) | 2017-04-28 | 2018-04-27 | A compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20200190165A1 (en) |
EP (1) | EP3617235A4 (en) |
JP (2) | JP7222347B2 (en) |
KR (2) | KR20240046307A (en) |
CN (1) | CN110637036A (en) |
AU (1) | AU2018259856A1 (en) |
CA (1) | CA3061467A1 (en) |
WO (1) | WO2018199337A1 (en) |
Families Citing this family (26)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11472865B2 (en) * | 2017-06-16 | 2022-10-18 | Kagoshima University | IgG-binding peptide, and specific modification of antibody with said peptide |
WO2019240287A1 (en) * | 2018-06-14 | 2019-12-19 | 味の素株式会社 | Compound comprising substance having affinity for antibody, cleavage site and reactive group, or salt thereof |
AU2019285354A1 (en) * | 2018-06-14 | 2021-01-07 | Ajinomoto Co., Inc. | Substance having affinity for antibody, and compound or salt thereof having bioorthogonal functional group |
CN113227124A (en) * | 2018-10-31 | 2021-08-06 | 味之素株式会社 | Compound having affinity substance, cleavable moiety and reactive group for antibody, or salt thereof |
EP3915973A4 (en) * | 2019-01-23 | 2023-02-01 | ABTIS Co., Ltd. | Compound for preparation of antibody-payload conjugate and use thereof |
KR102563319B1 (en) * | 2019-03-08 | 2023-08-03 | 앱티스 주식회사 | Site-specific antibody conjugation, and antibody-drug conjugate as its embodiment |
CN114585638A (en) | 2019-10-24 | 2022-06-03 | 国立大学法人鹿儿岛大学 | Method for producing 1-valent CCAP product |
JP2023504825A (en) * | 2019-12-03 | 2023-02-07 | デビオファーム リサーチ アンド マニュファクチャリング ソシエテ アノニム | reactive conjugate |
WO2022078566A1 (en) * | 2020-10-12 | 2022-04-21 | Debiopharm Research & Manufacturing S.A. | Reactive conjugates |
AU2022208654A1 (en) | 2021-01-18 | 2023-08-03 | Ajinomoto Co., Inc. | Compound or salt thereof, and antibody produced using same |
KR20230133289A (en) | 2021-01-18 | 2023-09-19 | 아지노모토 가부시키가이샤 | Compounds or salts thereof, and antibodies obtained therefrom |
CN116964076A (en) | 2021-03-11 | 2023-10-27 | 味之素株式会社 | Compounds or salts thereof, and antibodies derived therefrom |
WO2022196675A1 (en) | 2021-03-16 | 2022-09-22 | 味の素株式会社 | Complex or salt thereof, and method for manufacturing same |
CN113292633B (en) * | 2021-05-13 | 2023-08-29 | 中国科学技术大学 | Hydrazine modification method for visible light induced glycine derivative |
EP4349373A1 (en) | 2021-06-01 | 2024-04-10 | Ajinomoto Co., Inc. | Conjugate of antibody and functional substance or salt of said conjugate, and compound for use in production of said conjugate or salt of said compound |
US20230201365A1 (en) | 2021-07-09 | 2023-06-29 | Bright Peak Therapeutics Ag | Modified cd20 antibodies and uses thereof |
US20230201364A1 (en) | 2021-07-09 | 2023-06-29 | Bright Peak Therapeutics Ag | Antibody conjugates and manufacture thereof |
US20230250181A1 (en) | 2021-07-09 | 2023-08-10 | Bright Peak Therapeutics Ag | Modified checkpoint inhibitors and uses thereof |
KR20240041378A (en) | 2021-07-09 | 2024-03-29 | 브라이트 피크 테라퓨틱스 아게 | Conjugates of checkpoint inhibitors and IL-2 and uses thereof |
EP4366779A1 (en) | 2021-07-09 | 2024-05-15 | Bright Peak Therapeutics AG | Modified tnf-antibodies and uses thereof |
CN117916251A (en) | 2021-09-08 | 2024-04-19 | 国立大学法人鹿儿岛大学 | Compound, salt of compound, antibody-modifying reagent, method for producing modified antibody, and modified antibody |
AU2022353331A1 (en) | 2021-09-30 | 2024-04-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Regioselective conjugate of functional substance and antibody or salt of said conjugate, and antibody derivative and compound for use in production of said conjugate, or salt of said antibody derivative and compound |
AU2022357933A1 (en) | 2021-09-30 | 2024-04-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Conjugate of antibody and functional substance or salt thereof, and antibody derivative and compound or salts thereof to be used in producing conjugate or salt thereof |
WO2023161854A1 (en) | 2022-02-23 | 2023-08-31 | Bright Peak Therapeutics Ag | Immune antigen specific il-18 immunocytokines and uses thereof |
CN116836235A (en) * | 2022-03-25 | 2023-10-03 | 中国科学院上海药物研究所 | Affinity fragment-directed cleavable fragments, their design, synthesis and use in the preparation of site-directed drug conjugates |
WO2023234416A1 (en) * | 2022-06-02 | 2023-12-07 | 味の素株式会社 | Affinity substance, compound, and antibody and their salts |
Family Cites Families (24)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FI102355B1 (en) | 1988-02-11 | 1998-11-30 | Bristol Myers Squibb Co | A method for preparing anthracycline immunoconjugates having a linking spacer |
US5622929A (en) | 1992-01-23 | 1997-04-22 | Bristol-Myers Squibb Company | Thioether conjugates |
US6214345B1 (en) | 1993-05-14 | 2001-04-10 | Bristol-Myers Squibb Co. | Lysosomal enzyme-cleavable antitumor drug conjugates |
DK0871490T3 (en) | 1995-12-22 | 2003-07-07 | Bristol Myers Squibb Co | Branched hydrazone linkers |
JP3825502B2 (en) * | 1996-06-11 | 2006-09-27 | 日本油脂株式会社 | Modified protein production method and contact lens dirt remover |
AU1519699A (en) * | 1997-11-07 | 1999-05-31 | Conjuchem, Inc. | Affinity markers for human serum albumin |
ES2270893T3 (en) | 1999-12-24 | 2007-04-16 | Genentech, Inc. | PROCEDURE AND COMPOSITIONS TO EXTEND THE AVERAGE LIFE OF BIOACTIVE COMPOUNDS. |
EP1243276A1 (en) | 2001-03-23 | 2002-09-25 | Franciscus Marinus Hendrikus De Groot | Elongated and multiple spacers containing activatible prodrugs |
CA2494105C (en) | 2002-07-31 | 2013-04-02 | Seattle Genetics, Inc. | Drug conjugates and their use for treating cancer, an autoimmune disease or an infectious disease |
EP1560599A1 (en) | 2002-11-14 | 2005-08-10 | Syntarga B.V. | Prodrugs built as multiple self-elimination-release spacers |
KR101520209B1 (en) | 2003-11-06 | 2015-05-13 | 시애틀 지네틱스, 인크. | Monomethylvaline compounds capable of conjugation to ligands |
NZ550934A (en) | 2004-05-19 | 2010-05-28 | Medarex Inc | Chemical linkers and conjugates thereof |
CA2614145A1 (en) | 2005-07-05 | 2007-01-11 | Ribomic Inc. | Nucleic acid capable of binding to immunoglobulin g and use thereof |
US8372950B2 (en) | 2006-11-02 | 2013-02-12 | Kagoshima University | IgG binding peptide |
CA2794631A1 (en) * | 2010-03-31 | 2011-10-06 | Universite De Geneve | Stabilized antibody preparations and uses thereof |
WO2013027796A1 (en) | 2011-08-24 | 2013-02-28 | 大塚化学株式会社 | IgG-BINDING PEPTIDE AND METHOD FOR DETECTING AND PURIFYING IgG USING SAME |
KR101641206B1 (en) * | 2013-06-24 | 2016-07-22 | 에이비엘바이오 주식회사 | An antibody-drug conjugate having improved stability, and use thereof |
AU2015274506C1 (en) * | 2014-06-12 | 2022-10-13 | CSPC Megalith Biopharmaceutical Co., Ltd. | Homogenous antibody drug conjugates via enzymatic methods |
US20160000933A1 (en) * | 2014-07-01 | 2016-01-07 | Andrei POLUKHTIN | Conjugated biological molecules and their preparation |
JP5827769B1 (en) | 2015-03-27 | 2015-12-02 | 義徳 川窪 | Cleaning device |
EP3299383A4 (en) * | 2015-05-20 | 2019-01-23 | Kagoshima University | SPECIFIC MODIFICATION OF ANTIBODY WITH IgG-BINDING PEPTIDE |
TWI703158B (en) * | 2015-09-18 | 2020-09-01 | 美商希佛隆公司 | Antibodies that specifically bind to tl1a |
WO2017191817A1 (en) * | 2016-05-02 | 2017-11-09 | 味の素株式会社 | Azide group-containing fc protein |
SG11201810923YA (en) * | 2016-06-13 | 2019-01-30 | Univ Kagoshima | SITE-SPECIFIC RADIOISOTOPE-LABELED ANTIBODY USING IgG-BINDING PEPTIDE |
-
2018
- 2018-04-27 CA CA3061467A patent/CA3061467A1/en active Pending
- 2018-04-27 JP JP2019514691A patent/JP7222347B2/en active Active
- 2018-04-27 EP EP18791007.0A patent/EP3617235A4/en active Pending
- 2018-04-27 WO PCT/JP2018/017345 patent/WO2018199337A1/en active Application Filing
- 2018-04-27 KR KR1020247010619A patent/KR20240046307A/en active Search and Examination
- 2018-04-27 KR KR1020197031664A patent/KR20200002858A/en not_active Application Discontinuation
- 2018-04-27 CN CN201880027775.4A patent/CN110637036A/en active Pending
- 2018-04-27 AU AU2018259856A patent/AU2018259856A1/en active Pending
-
2019
- 2019-10-25 US US16/663,791 patent/US20200190165A1/en active Pending
-
2023
- 2023-02-03 JP JP2023015725A patent/JP2023052910A/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2018259856A2 (en) | 2019-11-28 |
AU2018259856A1 (en) | 2019-11-14 |
US20200190165A1 (en) | 2020-06-18 |
JP7222347B2 (en) | 2023-02-15 |
KR20200002858A (en) | 2020-01-08 |
JPWO2018199337A1 (en) | 2020-03-12 |
EP3617235A4 (en) | 2020-12-16 |
EP3617235A1 (en) | 2020-03-04 |
CN110637036A (en) | 2019-12-31 |
CA3061467A1 (en) | 2019-10-24 |
WO2018199337A1 (en) | 2018-11-01 |
KR20240046307A (en) | 2024-04-08 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7222347B2 (en) | A compound or a salt thereof having an affinity substance for a soluble protein, a cleavable moiety and a reactive group | |
EP3882261A1 (en) | Compound comprising substance with affinity for antibody, cleavage site and reactive group, or salt thereof | |
JP7413999B2 (en) | Compounds having affinity for antibodies, cleavable moieties, and reactive groups, or salts thereof | |
WO2019240288A1 (en) | Substance having affinity for antibody, and compound or salt thereof having bioorthogonal functional group | |
EP4279500A1 (en) | Compound or salt thereof, and antibody produced using same | |
WO2023054706A1 (en) | Conjugate of antibody and functional substance or salt thereof, and antibody derivative and compound or salts thereof to be used in producing conjugate or salt thereof | |
WO2023054714A1 (en) | Regioselective conjugate of functional substance and antibody or salt of said conjugate, and antibody derivative and compound for use in production of said conjugate, or salt of said antibody derivative and compound | |
EP4310096A1 (en) | Complex or salt thereof, and method for manufacturing same | |
WO2023234416A1 (en) | Affinity substance, compound, and antibody and their salts | |
WO2022191283A1 (en) | Compound or salt thereof, and antibody obtained using same | |
JP2024010532A (en) | Compound or salt thereof |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230306 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20230306 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230414 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20240423 |