JP2022548431A - システム及び関連するポンプマニホールドアセンブリ - Google Patents

システム及び関連するポンプマニホールドアセンブリ Download PDF

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Abstract

装置は、複数のチャネルを有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、ポンプバルブ及びポンプを支持し、ポンプチャネル流体ライン、ポンプ流体ライン、及び共有流体ラインを含む、ポンプマニホールドアセンブリと、を含む。ポンプバルブ及びポンプは、対応するポンプチャネル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御するように動作可能である。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合され、対応するチャネル、対応するポンプチャネル流体ライン、及び対応するポンプ流体ラインを流体結合する第1の位置と、対応するポンプ流体ライン、共有流体ライン、及び廃棄物リザーバを流体結合する第2の位置との間で動作可能である。各ポンプは、対応するポンプ流体ラインに結合されている。

Description

(関連出願)
本出願は、2019年9月18日出願の米国仮特許出願第62/902,372号の利益及び優先権を主張するものであり、その内容は、その全体があらゆる目的のために参照により本明細書に組み込まれる。
シークエンシングプラットホームは、バルブ及びポンプを含み得る。バルブ及びポンプは、様々な流体動作を実行するために使用され得る。
第1の実装形態によると、方法は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルを、フローセルインターフェースに結合することを含む(comprise)、又は含む(include)。フローセルインターフェースは、ポンプマニホールドアセンブリに流体結合されている。この方法は、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブのうちの1つ以上及び複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、対応するポンプチャネル流体ラインを介して複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御することを含む(comprise)、又は含む(include)。ポンプマニホールドアセンブリは、複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、及び共有流体ラインを備える、又は含む。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合されている。各ポンプは、対応するポンプ流体ラインに結合されている。
第2の実装形態によると、装置は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースを備える、又は含む。装置は、複数のポンプバルブ及び複数のポンプを担持し、かつ複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、及び共有流体ラインを備える又は有する、ポンプマニホールドアセンブリを備える、又は含む。ポンプバルブ及びポンプは、対応するポンプチャネル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御するように動作可能である。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合されている。各ポンプは、対応するポンプ流体ラインに結合されている。
第3の実装形態によると、装置は、対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブを備える、又は含む。装置は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースを備える、又は含む。装置は、複数のポンプ、複数のポンプバルブ、及びキャッシュを備える又は有するポンプマニホールドアセンブリを備える、又は含む。各ポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能である。装置は、1つ以上のバルブとキャッシュとの間に動作可能に結合されたバイパス流体ラインを備える、又は含む。
第4の実装形態によると、方法は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルをフローセルインターフェースに結合することを含む(comprise)、又は含む(include)。この方法は、サンプルカートリッジをフローセルインターフェースの下流に位置付けられたサンプルカートリッジインターフェースに結合することを含む(comprise)、又は含む(include)。サンプルカートリッジは、対象とするサンプルを担持する。この方法は、サンプル装填マニホールドアセンブリの1つ以上のサンプルバルブを動作させて、フローセルの対応する出口を介して第1の方向に、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填することを含む(comprise)、又は含む(include)。この方法は、フローセルの対応する入口を介して第1の方向とは反対の第2の方向に、試薬を複数のチャネルを通して流すことを含む(comprise)、又は含む(include)。
第5の実装形態によると、装置は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースを備える、又は含む。装置は、サンプルカートリッジに結合されるように適合されたサンプルカートリッジインターフェースを備える、又は含む。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている。装置は、フローセルインターフェースとサンプルカートリッジインターフェースとの間に位置付けられ、かつ、複数のサンプルバルブを担持し、かつ複数のサンプルポート及び複数のフローセルポートを画定する、本体を備える、又は含む、サンプル装填マニホールドアセンブリを備える、又は含む。各サンプルポートは、サンプル流体ラインを介してサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合されている。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つに関連付けられている。
第6の実装形態によると、装置は、対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブを備える、又は含む。システムは、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースを備える、又は含む。装置は、複数のポートを備え又は有し、かつ対象とするサンプルを担持するサンプルカートリッジに結合されるように適合された、サンプルカートリッジインターフェースを備える、又は含む。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている。装置は、複数のポンプ及び複数のポンプバルブを備える又は有するポンプマニホールドアセンブリを備える、又は含む。各ポンプ及び対応するポンプバルブは、サンプルカートリッジインターフェースの複数のポートの各ポートとフローセルの複数のチャネルの対応するチャネルとの間の対象とするサンプルの流れを個別に制御するように動作可能である。
第7の実装形態によると、方法は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルをフローセルインターフェースに結合することを含む(comprise)、又は含む(include)。フローセルインターフェースは、ポンプマニホールドアセンブリに流体結合されている。この方法は、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブの第1のポンプバルブを第1の位置に移動させて、複数のチャネルの第1のチャネルを複数のポンプの第1のポンプと流体接続することを含む(comprise)、又は含む(include)。第1のポンプは、第1のポンプチャネル流体ラインを介して第1のチャネルに流体接続される。この方法は、第1のポンプチャネル流体ラインを介して第1のポンプを使用して第1のチャネルを通して第1の容積の第1の試薬をポンプ圧送することと、複数のポンプバルブの第1のポンプバルブを第2の位置に移動させて、ポンプ及び第1のポンプチャネル流体ラインを廃棄物リザーバと流体連通する共有流体ラインと流体接続することと、を含む(comprise)、又は含む(include)。この方法は、共有流体ラインを通して廃棄物リザーバ内に第1の容積の第1の試薬をポンプ圧送することと、複数のポンプバルブの第2のポンプバルブを第1の位置に移動させて、複数のチャネルの第2のチャネルを複数のポンプの第2のポンプと流体接続することと、を含む(comprise)、又は含む(include)。第2のポンプは、第2のポンプチャネル流体ラインを介して第2のチャネルに流体接続される。この方法は、第2のポンプチャネル流体ラインを介して第2のポンプを使用して第2のチャネル内に第2の容積の第1の試薬をポンプ圧送することと、複数のポンプバルブの第2のポンプバルブを第2の位置に移動させて、第2のポンプ及び第2のポンプチャネル流体ラインを廃棄物リザーバと流体連通する共有流体ラインと流体接続することと、を含む(comprise)、又は含む(include)。この方法は、第2の容積の第1の試薬を共有流体ラインを通して廃棄物リザーバ内にポンプ圧送することを含む(comprise)、又は含む(include)。
第8の実装形態によると、装置は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、複数のポンプバルブ及び複数のポンプを担持し、複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、及び共有流体ラインを備える、又は含む、ポンプマニホールドアセンブリと、を備える、又は含む。ポンプバルブ及びポンプは、対応するポンプチャネル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御するように動作可能である。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合され、複数のチャネルの対応するチャネル、対応するポンプチャネル流体ライン、及び対応するポンプ流体ラインを流体結合する第1の位置と、対応するポンプ流体ライン、共有流体ライン、及び破棄物リザーバを流体結合する第2の位置との間で移動可能である。各ポンプは、対応するポンプ流体ラインに結合されている。
第8の実装形態によると、装置は、対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブと、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、複数のポンプ、複数のポンプバルブ、及びキャッシュを備える、又は有するポンプマニホールドアセンブリと、を備える、又は含む。各ポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能であり得る。装置は、1つ以上のバルブとキャッシュとの間に動作可能に結合されたバイパス流体ラインを備える、又は含む。
第9の実装形態によると、方法は、第1のチャネル及び第2のチャネルを備える又は有するフローセルをフローセルインターフェースに結合することと、サンプル装填マニホールドアセンブリの1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第1の位置に移動させて、サンプルカートリッジの第1のサンプルリザーバをフローセルの第1のチャネルの出口に流体結合することと、を含む(comprise)、又は含む(include)。この方法は、第1のサンプルリザーバから第1のチャネルの出口を通してフローセルの第1のチャネル内に第1の対象とするサンプルをポンプ圧送することを含む(comprise)、又は含む(include)。第1のチャネルの入口は、中央バルブが第1の位置にあるときに、中央バルブを介して廃棄物リザーバに流体接続される。この方法は、サンプル装填マニホールドアセンブリの1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第2の位置に移動させて、サンプルカートリッジの第1のサンプルリザーバを流体的に切断し、かつ第1のチャネルの出口を廃棄物リザーバと流体接続することと、中央バルブを第2の位置に移動させて、試薬リザーバをフローセルの第1のチャネル及び第2のチャネルと流体結合することと、を含む(comprise)、又は含む(include)。この方法は、第1の容積の試薬を第1のチャネルを通して廃棄物リザーバ内にポンプ圧送することを含む(comprise)、又は含む(include)。
第10の実装形態によると、装置は、複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、中央バルブと、中央バルブに結合されており、廃棄物リザーバに結合されるように適合された補助廃棄物流体ラインと、を備える、又は含む。中央バルブは、フローセルインターフェースに結合され、複数のチャネルの入口を補助廃棄物流体ラインに流体接続する第1の位置と、試薬リザーバと複数のチャネルとを流体接続する第2の位置との間で移動可能である。装置は、サンプルカートリッジに結合されるように適合されたサンプルカートリッジインターフェースを備える、又は含む。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられ、サンプル装填マニホールドアセンブリは、フローセルインターフェースとサンプルカートリッジインターフェースとの間に位置付けられ、かつ、複数のサンプルバルブを担持し、かつ複数のサンプルポート及び複数のフローセルポートを画定する、本体を備える、又は含む。各サンプルポートは、サンプル流体ラインを介してサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合されている。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルのうちの1つに関連付けられている。サンプルバルブの各々は、対応するサンプルポートと複数のチャネルの対応する出口とを流体接続する第1の位置と、複数のチャネルの対応する出口と廃棄物リザーバとを流体結合する第2の位置との間で移動可能である。
第11の実装形態によると、装置は、対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブと、フローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、を備える、又は含む。装置は、1つ以上のポートを備え又は有し、かつ対象とするサンプルを担持するサンプルカートリッジに結合されるように適合された、サンプルカートリッジインターフェースを備える、又は含む。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている。装置は、フローセルの出口と関連付けられたフローセルインターフェース及びサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートを介してフローセルのチャネルに対象とするサンプルを装填するように適合されたポンプを備える、又は含む。
更に、前述の第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第8、第9、第10、及び第11の実装形態によれば、装置及び/又は方法は、以下のうちの任意の1つ以上を更に備え得る、又は含み得る。
一実装形態によると、バイパスバルブを第1の位置に移動させて、バイパス流体ラインとポンプマニホールドアセンブリのキャッシュとを流体結合することと、バイパス流体ラインを通してキャッシュ内に第3の容積の第1の試薬又は別の試薬をポンプ圧送することと、を更に含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブのうちの1つ以上、複数のポンプのうちの1つ以上、又はキャッシュバルブを作動させることと、共有流体ラインと廃棄物リザーバと流体連通する主廃棄物流体ラインとの間、又はバイパス流体ラインと主廃棄物流体ラインとの間のうちの少なくとも1つで試薬をポンプ圧送することと、を更に含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブのうちの1つ以上及び複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの複数のチャネルのうちの1つ以上に対象とするサンプルを装填することを更に含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つ以上に対象とするサンプルを装填することは、対象とするサンプルを第1方向に流すことを含み(comprise)、又は含み(include)、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、第1の方向とは反対の第2の方向にフローセルのチャネルを通る試薬の流れを制御することを更に含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、対象とするサンプルをフローセルの1つ以上のチャネルから補助廃棄物流体ラインに流すことを更に含む(comprise)、又は含む(include)。補助廃棄物流体ラインは、フローセルインターフェースの上流にある。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリは、キャッシュを更に備え、又は含み、バイパスバルブ及びバイパスバルブとキャッシュとを結合するバイパス流体ラインを更に備える、又は含む。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリは、キャッシュバルブ及びキャッシュ流体ラインを更に備える、又は含む。キャッシュバルブは、キャッシュ流体ライン及び共有流体ラインに結合されている。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリは、廃棄物リザーバに結合された主廃棄物流体ラインを更に備える、又は含む。キャッシュバルブは、主廃棄物流体ラインに結合されている。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリは、ポンプチャネル流体ラインのうちの少なくとも1つ又は共有流体ラインのうちの1つ以上の圧力値又は流量値のうちの1つ以上を判定するように適合された複数のセンサを更に備える、又は含む。
別の実装形態によると、複数のポンプを駆動するように動作可能な一対のポンプ駆動アセンブリを更に備える、又は含む。
別の実装形態によると、サンプルカートリッジに結合されるように適合されたサンプルカートリッジインターフェースを更に備える、又は含む。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている。
別の実装形態によると、フローセルインターフェースとサンプルカートリッジインターフェースとの間に位置付けられ、かつ、複数のサンプルバルブを担持し、かつ複数のサンプルポート、複数のフローセルポート、及び複数のポンプポートを画定する、本体を備える、又は含む、サンプル装填マニホールドアセンブリを更に備える、又は含む。各サンプルポートは、サンプル流体ラインを介してサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合されている。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つに関連付けられている。各ポンプポートは、複数のポンプチャネル流体ラインの対応するポンプチャネル流体ラインに結合されている。
別の実装形態によると、サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルバルブ及びポンプマニホールドアセンブリのポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填するように動作可能である。
別の実装形態によると、各サンプルバルブは、サンプルカートリッジのポートとポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプの対応するポンプとを流体連通させ、かつポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプのポンプとフローセルの複数のチャネルの対応するチャネルとを流体連通させるように動作可能である。
別の実装形態によると、中央バルブと、中央バルブに結合されており、廃棄物リザーバに結合されるように適合された補助廃棄物流体ラインと、を更に備える、又は含む。補助廃棄物流体ラインは、フローセルインターフェースの上流に位置付けられている。
別の実装形態によると、共有ラインバルブ、バイパスバルブ、複数の専用試薬流体ライン、及び共有試薬流体ラインを更に備える、又は含む。共有試薬流体ラインは、共有ラインバルブと中央バルブとを結合しており、中央バルブを介してフローセルに1つ以上の試薬を流すように適合されている。各専用試薬流体ラインは、バイパスバルブと中央バルブとを結合しており、中央バルブを介してフローセルに試薬を流すように適合されている。
別の実装形態によると、複数のサンプルバルブを備える又は有するサンプル装填マニホールドアセンブリを更に備える、又は含む。各サンプルバルブ及びポンプマニホールドアセンブリの対応するポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに個別に装填するように動作可能である。サンプル装填マニホールドアセンブリは、フローセルの下流に位置付けられている。
別の実装形態によると、複数のチャネル及びフローセルマニホールドを備える、又は有する、フローセルを備える、又は含む、フローセルアセンブリを更に備える、又は含む。フローセルマニホールドは、入口と、複数の流体ラインと、複数の出口と、を備える、又は含む。フローセルマニホールドの各出口は、フローセルの対応するチャネルに結合されている。
別の実装形態によると、第1の対象とするサンプルを第1のサンプルリザーバからフローセルの第1のチャネル内にポンプ圧送することは、第1の対象とするサンプルをサンプルカートリッジからサンプル装填マニホールドアセンブリの対応するサンプルポートに移動させ、サンプル装填マニホールドアセンブリの関連付けられたポンプポートから出てポンプマニホールドアセンブリのポンプチャネル流体ライン内に移動させることと、第1の対象とするサンプルをポンプチャネル流体ラインから関連付けられたポンプポートを通して、かつサンプル装填マニホールドアセンブリの対応するフローセルポートを通して移動させることと、を含む(comprise)、又は含む(include)。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つと関連付けられている。
別の実装形態によると、1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第1の位置に移動させることは、サンプルカートリッジインターフェースのポートと対応するポンプとを流体結合することを含み(comprise)、又は含み(include)、1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第2の位置に移動させることは、対応するポンプとフローセルの複数のチャネルの第1のチャネルとを流体結合することを含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御することを更に含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、第1の対象とするサンプルをフローセルの第1のチャネルから補助廃棄物流体ラインに流すことを更に含む(comprise)、又は含む(include)。補助廃棄物流体ラインは、フローセルの上流にあり、中央バルブ及び廃棄物リザーバに流体結合されている。
別の実装形態によると、共有試薬流体ラインを通して、試薬をフローセルの複数のチャネルに流し、続いて、別のリージェントを専用試薬流体ラインを通してフローセルの複数のチャネルに流すことを更に含む(comprise)、又は含む(include)。
別の実装形態によると、サンプルバルブは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに個別に装填するように動作可能である。
別の実装形態によると、複数のポンプを更に備える、又は含む。サンプル装填マニホールドアセンブリの本体は、複数のポンプポートを更に画定する。各ポンプポートは、ポンプチャネル流体ラインを介して複数のポンプのうちのポンプのうちの1つに結合されている。
別の実装形態によると、各サンプルバルブは、サンプルカートリッジのポートと、複数のポンプの対応するポンプと、を流体連通させ、かつ複数のポンプのポンプとフローセルの複数のチャネルの対応するチャネルとを流体連通させるように動作可能である。
別の実装形態によると、ポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能である。
別の実装形態によると、ポンプ及びキャッシュを備えるポンプマニホールドアセンブリを更に備える、又は含む。バイパスバルブ及びバイパスバルブとキャッシュとを結合するバイパス流体ラインを更に備える、又は含む。
別の実装形態によると、共有ラインバルブ、複数の専用試薬流体ライン、及び共有試薬流体ラインを更に備える、又は含む。共有試薬流体ラインは、共有ラインバルブと中央バルブとを結合しており、フローセルに1つ以上の試薬を流すように適合されている。各専用試薬流体ラインは、バイパス流体ラインと中央バルブとを結合しており、フローセルに向かって流れるように適合されている。
別の実装形態によると、ポンプマニホールドアセンブリは、複数のポンプバルブ及びキャッシュバルブを担持し、複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、共有流体ライン、キャッシュ流体ライン、及び主廃棄物流体ラインを備える、又は含む。キャッシュ流体ラインは、キャッシュ及びキャッシュバルブに結合され、かつキャッシュとキャッシュバルブとの間に結合されている。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合されている。キャッシュバルブは、キャッシュ流体ライン、主廃棄物流体ライン、及び共有流体ラインに結合されている。
別の実装形態によると、ポンプバルブ及びポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能であり、ポンプバルブ、キャッシュバルブ、及びポンプは、バイパス流体ラインと共有流体ラインとの間の流体の流れを制御するように動作可能である。
別の実装形態によると、ポンプバルブ、キャッシュバルブ、及びポンプは、共有流体ラインと主廃棄物流体ラインとの間の流体の流れを制御するように動作可能である。
別の実装形態によると、ポンプを備える又は含む複数のポンプ及び複数のポンプバルブを備える又は有するポンプマニホールドアセンブリを更に備える、又は含む。各ポンプ及び対応するポンプバルブは、サンプルカートリッジインターフェースの1つ以上のポートの各ポートとフローセルの対応するチャネルとの間の対象とするサンプルの流れを個別に制御するように動作可能である。
別の実装形態によると、複数のサンプルバルブを備える又は有するサンプル装填マニホールドアセンブリを更に備える、又は含む。各サンプルバルブは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填するように動作可能である。
別の実装形態によると、複数のチャネル及びフローセルマニホールドを備える又は有するフローセルを備える又は含むフローセルアセンブリを更に備える、又は含む。フローセルマニホールドは、入口と、複数の流体ラインと、複数の出口と、を備える、又は含む。フローセルマニホールドの各出口は、フローセルの対応するチャネルに結合されている。
以下でより詳細に説明される、前述の概念及び更なる概念の全ての組み合わせは(かかる概念が相互に矛盾しないという前提で)、本明細書に開示される主題の一部であると考えられ、かつ/又は特定の態様の特定の利益を達成するように組み合わせることができることを理解されたい。具体的には、本開示の終わりに現れる特許請求される主題の全ての組み合わせは、本明細書に開示される主題の一部であると考えられる。
本開示の教示に従ったシステムの一実装形態の概略図を示す。
図1のシステムと共に使用することができる、シッパと、サンプルウェルを含むサンプルカートリッジと、を含む、シッパアセンブリの一実装形態の断面図である。
図1Bのシッパアセンブリの遠位部分及びサンプルカートリッジのサンプルウェルの詳細断面図である。
図1Aのシステムのフローセルレセプタクル内に受容可能なフローセルカートリッジアセンブリの一実装形態の等角拡大図を示す。
図2のフローセルアセンブリのフローセル及びフローセルマニホールドの平面図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができるフローセルアセンブリのフローセルの別の実装形態及びフローセルマニホールドの別の実装形態の平面図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができるフローセルアセンブリのフローセルの別の実装形態及びフローセルマニホールドの別の実装形態の平面図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができるフローセルアセンブリのフローセルの別の実装形態及びフローセルマニホールドの別の実装形態の平面図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができる図6Aのフローセル及びフローセルマニホールド並びに流体ラインの等角図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができる、フローセルアセンブリの一実装形態に結合されたサンプル装填マニホールドアセンブリの一実装形態の等角図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができるポンプマニホールドアセンブリの一部分の一実装形態の概略図である。
フローセルインターフェース及びポンプマニホールドアセンブリを含む、本開示の教示に従ったシステムの別の実装形態の概略図を示す。
1つ以上のバルブ、フローセルインターフェース、及びポンプマニホールドアセンブリを含む、本開示の教示に従ったシステムの別の実装形態の概略図を示す。
フローセルインターフェース、サンプル装填マニホールドアセンブリ、及びサンプルカートリッジインターフェースを含む、本開示の教示に従ったシステムの別の実装形態の概略図を示す。
1つ以上のバルブ、フローセルインターフェース、サンプルカートリッジインターフェース、及びポンプマニホールドアセンブリを含む、本開示の教示に従ったシステムの別の実装形態の概略図を示す。
図1Aのシステムと共に使用することができるフローセルカートリッジアセンブリのフローセルの別の実装形態及びフローセルマニホールドの別の実装形態の平面図を示す。
図13Aのフローセルカートリッジアセンブリの断面図を示す。
図1Aのシステム又は本明細書に開示される他のシステムのいずれかを使用してポンプ圧送動作を実行する方法のフローチャートを示す。
図1Aのシステム又は本明細書に開示される他のシステムのいずれかを使用してポンプ圧送動作を実行する別の方法のフローチャートを示す。
図1Aのシステム又は本明細書に開示される他のシステムのいずれかを使用して、対象とするサンプルの装填動作を実行する方法のフローチャートを示す。
図1Aのシステム又は本明細書に開示される他のシステムのいずれかを使用して、対象とするサンプルの装填動作を実行する別の方法のフローチャートを示す。
以下のテキストは、方法、装置、及び/又は製品の実装形態の詳細な説明を開示しているが、所有権の法的範囲は、本特許の最後に記載された特許請求の範囲によって定義されることを理解されたい。したがって、以下の「発明を実施するための形態」は、例としてのみ解釈されるべきであり、可能な全ての実装形態を説明することは、不可能ではないにしても、非現実的であろうことから、可能な全ての実装形態を説明しているわけではない。現在の技術又は本特許の出願日の後に開発された技術のいずれかを使用して、多数の代替的な実装形態が実装され得る。そのような代替的な実装形態は、依然として特許請求の範囲内に含まれるであろうことが想定される。
本明細書に開示される実装形態は、シークエンシング及び/若しくはアレイプラットフォーム又は他のシステムと共に使用するためのポンプマニホールドアセンブリ及びサンプル装填マニホールドアセンブリに関する。開示される実装形態を使用することにより、少なくともいくつかの動作中に使用される試薬の量を低減し得、少なくともいくつかの動作を実行するための実行時間の量を低減し得、検体の汚染及び/又は試薬間の汚染(例えば、クロストーク)の可能性を低減し得る。
ポンプマニホールドアセンブリは、複数のポンプ、複数のポンプバルブ、流体ライン、及びキャッシュを含み得る。ポンプマニホールドアセンブリが複数のチャネルを備える又は有するフローセルに結合されているとき、ポンプ及びポンプバルブは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御するように動作可能であり得る。フローセルは、チャネルの各々と連通する単一の上流開口部を含み得、チャネルの各々と連通する複数の下流開口部を含み得る。ポンプマニホールドアセンブリは、フローセルの上流開口部からフローセルの下流開口部に流体を流すように適合され得る。ポンプマニホールドアセンブリはまた、フローセルの下流開口部からフローセルの上流開口部に流体を流すように適合され得る。したがって、ポンプマニホールドアセンブリは、いずれかの方向にフローセルを通って流体を流すことができる。
サンプル装填マニホールドアセンブリは、複数のサンプルバルブ及び複数のポートを含み得る。サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルバルブは、ポートを通り、かつ対象とするサンプルを担持するサンプルカートリッジとフローセルのチャネルとの間の、流体の流れを制御するように適合され得る。いくつかの実装形態では、サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルポートのうちのいくつかは、サンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合され、サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルポートのうちのいくつかは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルポートのうちのいくつかは、ポンプマニホールドアセンブリのポンプに結合されている。サンプルカートリッジは、サンプルカートリッジインターフェースに結合され得、フローセルは、フローセルインターフェースに結合され得る。
サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルバルブ及びポンプマニホールドアセンブリのポンプは、フローセルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填するように動作可能であり得る。サンプル装填アセンブリは、フローセルの下流に位置付けられ得る。したがって、対象とするサンプルは、フローセルの後部からフローセルのチャネル内に装填され得る。
図1Aは、本開示の教示に従ったシステム100の一実装形態の概略図を示す。システム100を使用して、1つ以上の対象とするサンプルに対して分析を実行することができる。サンプルは、一本鎖DNA(single stranded DNA、sstDNA)を形成するように線形化された1つ以上のDNAクラスターを含み得る。図示した実装形態では、システム100は、フローセルカートリッジアセンブリ102及びサンプルカートリッジ104を受容するように適合され、シッパマニホールドアセンブリ106、サンプル装填マニホールドアセンブリ108、及びポンプマニホールドアセンブリ110を部分的に含む。システム100はまた、駆動アセンブリ112、コントローラ114、撮像システム116、及び廃棄物リザーバ117を含む。コントローラ114は、駆動アセンブリ112及び撮像システム116に電気的かつ/又は通信可能に結合され、駆動アセンブリ112及び/又は撮像システム116に本明細書に開示されるような様々な機能を実行させるように適合されている。
サンプルカートリッジ104は、サンプルウェル260内に1つ以上の対象とするサンプル(例えば、検体)を担持し、サンプルカートリッジレセプタクル118内に受容可能であり得る。サンプルカートリッジ104は、サンプルウェル260からサンプルを引き込むために使用されるシッパアセンブリ262を含むサンプルカートリッジインターフェース119と結合可能であり得る。サンプルウェル260は、サンプルリザーバと称され得る。サンプルカートリッジ104はまた、プライムウェル264と、洗浄緩衝液及び/又は漂白剤などの洗浄溶液を含み得る1つ以上の洗浄ウェル266と、を含む。
図示した実装形態では、サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、1つ以上のサンプルバルブ120を含み、ポンプマニホルダアセンブリ110は、1つ以上のポンプ121、1つ以上のポンプバルブ122、及びキャッシュ123を含む。バルブ120、122のうちの1つ以上は、ロータリバルブ、ピンチバルブ、フラットバルブ、ソレノイドバルブ、チェックバルブ、圧電バルブ、及び/又は三方バルブによって実装され得る。他の種類の流体制御装置が、好適であることを証明され得る。ポンプ121のうちの1つ以上は、シリンジポンプ、蠕動ポンプ、及び/又はダイヤフラムポンプによって実装され得る。他の種類の流体移送装置が好適であることが証明され得る。キャッシュ123は、サーペンタインキャッシュであり得、約4ミリリットル(mL)の容積を受容するように適合され得る。キャッシュ123は、例えば、図1Aのシステム100のバイパス操作中に、1つ以上の反応成分を一時的に格納するように適合され得る。キャッシュ123がポンプマニホールドアセンブリ110に含まれているものとして示されているが、別の実装形態では、キャッシュ123は、異なる場所に位置し得る。例えば、キャッシュ123は、シッパマニホールドアセンブリ106内に、又はバイパス流体ライン145の下流の別のマニホールド内に含まれ得る。
動作中、シッパアセンブリ162は、サンプルウェル260及びサンプル装填マニホールドアセンブリ108から1つ以上のサンプルを引き込み、ポンプマニホールドアセンブリ110は、サンプルカートリッジ104から流体ライン124を通ってフローセルカートリッジアセンブリ102に向かって1つ以上の対象とするサンプルを流す。フローセルカートリッジアセンブリ102は、複数のチャネル126を有するフローセル125を含み得る(フローセル125及びチャネル126の実装形態は、図2により明確に示されている)。一実装形態では、サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、フローセル125の各チャネル126に対象とするサンプルを個別に装填する/対処するように適合され得る。チャネル126に対象とするサンプルを装填するプロセスは、図1Aのシステム100を使用して自動的に行われ得る。
図示した実装形態では、サンプルカートリッジ104及びサンプル装填マニホールドアセンブリ108は、フローセルカートリッジアセンブリ102の下流に位置付けられている。したがって、サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、フローセル125の後部からフローセル125内に対象とするサンプルを装填し得る。フローセル125の後部から対象とするサンプルを装填することは、「後部装填」と称され得る。対象とするサンプルをフローセル125内に後部装填することにより、汚染を低減し得る。図示した実装形態では、サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、フローセルカートリッジアセンブリ102とポンプマニホールドアセンブリ110との間に結合されている。
例えば、ハイブリダイゼーション緩衝液でシステム100をプライミングし、かつ/又はシステム100から空気を除去するために、ポンプ121は、フローセル125を通してハイブリダイゼーション緩衝液を引き込み、シッパアセンブリ262は、システム100がプライミングされると、ハイブリダイゼーション緩衝液をプライムウェル264内に供給する。その後、対象とするサンプルは、シッパアセンブリ162のシッパ268及びサンプルバルブ120を使用してサンプルカートリッジ104から引き出され、ポンプバルブ122及び/又はポンプ121は、選択的に作動して、対象とするサンプルをポンプマニホールドアセンブリ110に向けて付勢する。サンプルカートリッジ104は、対応するシッパ268を介して選択的に流体アクセス可能なサンプルウェル260を含み得る。したがって、各サンプルは、対応するシッパ268及び対応するサンプルバルブ120を使用して、他のサンプルから選択的に分離することができる。
サンプルウェル260のうちの1つから対象とするサンプルを引き込むために、対応する対象とするサンプルのサンプルバルブ120を開放又は解放して、サンプルウェル260を機器流体システムに流体接続することができる。対応するポンプ121を作動させて、サンプルウェル260からポンプマニホールドアセンブリ110の流体ライン及び/又は別の流体ラインなどの流体ラインに対象とするサンプルを引き込むことができる。いくつかの実装形態では、対応するポンプバルブ122を開放、閉鎖、及び/又は第1の位置から第2の位置に移動して、対応するポンプ121を対応するサンプルウェル260の対応する流体ラインに流体結合することができる。したがって、ポンプバルブ122は、対応するポンプバルブ122を使用して他のポンプ121及び/又はポンプバルブ122から選択的に分離することができる。いくつかの実装形態では、対象とするサンプルは、ポンプバルブ122及び/又はサンプルバルブ120と対応するポンプ121との間のライン容積内に一時的に格納することができる。
フローセル125の対応するチャネル126又は複数のチャネル126に向かって、かつポンプマニホールドアセンブリ110から離れる方向に対象とするサンプルを個別に流すために、サンプルバルブ120、ポンプバルブ122、及び/又はポンプ121を選択的に作動して、フローセルカートリッジアセンブリ102に向かってフローセル125のそれぞれのチャネル126に対象とするサンプルを付勢し得る。例えば、対象とするサンプルがライン容積内に吸引された後に、サンプルバルブ120を閉鎖し、それによって、ライン容積からサンプルウェル260を流体的に切断することができる。場合によっては、サンプルバルブ120を第1の位置から第2の位置に移動して、サンプル装填マニホールドアセンブリ108を介して対応するポンプ121を対応するチャネル126又は複数のチャネル126に流体結合し得る。次いで、ポンプ121は、対象とするサンプルを対応するチャネル126又は複数のチャネル126に押し込むことができる。いくつかの実装形態では、対応するポンプバルブ122を開放、閉鎖、及び/又は第2の位置から第1の位置に移動して、対応するポンプ121を対応するチャネル126又は複数のチャネル126に流体結合し得る。いくつかの実装形態では、複数のチャネル126の各チャネル126は、対象とするサンプルを受容する。他の実装形態では、チャネル126のうちの1つ以上は、対象とするサンプルを選択的に受容してもよく、チャネル126の他のチャネルは、対象とするサンプルを受容しなくてもよい。対象とするサンプルを受容しなくてもよいフローセル125のチャネル126は、例えば、代わりに洗浄緩衝液を受容してもよい。
駆動アセンブリ112は、シッパマニホールドアセンブリ106及びポンプマニホールドアセンブリ110とインターフェースして、フローセル125のサンプルと相互作用する1つ以上の試薬を、フローセルカートリッジアセンブリ102を通して流す。一実装形態では、識別可能な標識を有する可逆的ターミネータが検出ヌクレオチドに取り付けられて、サイクルごとにsstDNAによって単一のヌクレオチドが組み込まれることを可能にする。いくつかのそのような実装形態では、ヌクレオチドのうちの1つ以上は、励起されると色を発する固有の蛍光標識を有する。色(又はその欠如)を使用して、対応するヌクレオチドを検出する。図示した実装形態では、撮像システム116は、識別可能な標識(例えば、蛍光標識)のうちの1つ以上を励起し、その後、識別可能な標識の画像データを取得するように適合されている。標識は、入射光及び/又はレーザによって励起され得、画像データは、励起に応答してそれぞれの標識によって放出される1つ以上の色を含み得る。画像データ(例えば、検出データ)は、システム100によって分析され得る。撮像システム116は、対物レンズ及び/又は固体撮像装置を含む蛍光分光光度計であってもよい。固体撮像装置は、電荷結合素子(charge coupled device、CCD)及び/又は相補的金属酸化物半導体(complementary metal oxide semiconductor、CMOS)を含み得る。
画像データが得られた後、駆動アセンブリ112は、シッパマニホールドアセンブリ106及びポンプマニホールドアセンブリ110とインターフェースして、フローセル125を通して別の反応成分(例えば、試薬)を流し、それは、その後、主廃棄物流体ライン127を介して廃棄物リザーバ117によって受容され、かつ/又はそうでなければシステム100によって排出される。いくつかの反応成分は、蛍光標識及び可逆的ターミネータをsstDNAから化学的に切断するフラッシング動作を行う。次いで、sstDNAは、別のサイクルのために準備される。いくつかの実装形態では、システム100の運転間に、シッパ268は、漂白剤などの洗浄溶液又は洗浄緩衝液を含む洗浄ウェル266にシッパ268を浸漬することによって洗浄される。洗浄溶液は、ハイブリダイゼーション緩衝液を含むプライムウェル264にシッパ268を浸漬することによって除去可能である。しかしながら、シッパ268を洗浄する他の手法が好適であり得る。
主廃棄物流体ライン127は、ポンプマニホールドアセンブリ110と廃棄物リザーバ117との間に結合されるように適合されている。いくつかの実装形態では、ポンプマニホールドアセンブリ110のポンプ121及び/又はポンプバルブ122は、フローセルカートリッジアセンブリ102から流体ライン124及びサンプル装填マニホールドアセンブリ108を通して主廃棄物流体ライン127に反応成分を選択的に流すように適合されている。
図示した実装形態では、フローセルカートリッジアセンブリ102は、フローセルレセプタクル128に受容可能であり、フローセルインターフェース129と結合可能である。別の実装形態では、フローセルレセプタクル128は、除外され得、フローセルカートリッジアセンブリ102は、フローセルインターフェース129に直接結合され得る。
フローセルカートリッジアセンブリ102は、フローセルインターフェース129を介して中央バルブ130に結合されている。補助廃棄物流体ライン132は、中央バルブ130及び廃棄物リザーバ117に結合されている。いくつかの実装形態では、補助廃棄物流体ライン132は、本明細書に記載されるように、対象とするサンプルをフローセル125に後部装填するときに、中央バルブ130を介してフローセルカートリッジアセンブリ102から対象とするサンプルのいかなる余分な流体も受容して、対象とするサンプルの余分な流体を廃棄物リザーバ117に流すように適合されている。すなわち、対象とするサンプルは、フローセル125の後部から装填され得、対象とするサンプルのいかなる余分な流体も、フローセル125の前部から出得る。本明細書に記載されるように、フローセル125内に対象とするサンプルを後部装填することにより、異なるサンプルを対応するチャネル126に別個に装填することができ、単一のマニホールド(例えば、図2のフローセルマニホールド173を参照)は、フローセル125の前部を中央バルブ130に結合して、各対象とするサンプルの余分な流体を補助廃棄物流体ライン132に方向付け、第1のチャネル126の1つのサンプルの第の2チャネル126との汚染の可能性を低減することができる。対象とするサンプルがフローセル125内に装填されると、次に、単一のマニホールドを使用して、共通の試薬を各チャネル126のフローセル125の前部(例えば、上流)から送達することができ、フローセル125の後部(例えば、下流)からフローセル125を出得る。言い換えれば、対象とするサンプル及び試薬は、フローセル125のチャネル126を通って反対方向に流れることができる。
シッパマニホールドアセンブリ106を参照すると、図示した実装形態では、シッパマニホールドアセンブリ106は、共有ラインバルブ134及びバイパスバルブ136を含む。共有ラインバルブ134は、試薬セレクタバルブと称され得る。中央バルブ130及びシッパマニホールドアセンブリ106のバルブ134、136は、選択的に作動されて、流体ライン138、140、142を通る流体の流れを制御し得る。バルブ130、134、136のうちの1つ以上は、ロータリバルブ、ピンチバルブ、フラットバルブ、ソレノイドバルブ、チェックバルブ、圧電バルブなどによって実装され得る。他の流体制御装置が、好適であることを証明され得る。
シッパマニホールドアセンブリ106は、試薬シッパ146を介して対応する数の試薬リザーバ144に結合され得る。試薬リザーバ144は、流体(例えば、試薬及び/又は別の反応成分)を含み得る。いくつかの実装形態では、シッパマニホールドアセンブリ106は、複数のポートを含む。シッパマニホールドアセンブリ106の各ポートは、試薬シッパ146のうちの1つを受容し得る。試薬シッパ146は、流体ラインと称され得る。
シッパマニホールドアセンブリ106の共有ラインバルブ134は、共有試薬流体ライン138を介して中央バルブ130に結合されている。異なる試薬は、異なる時間に共有試薬流体ライン138を通って流れることができる。一実装形態では、1つの試薬と別の試薬との間で変更する前にフラッシング動作を実行するとき、ポンプマニホールドアセンブリ110は、共有試薬流体ライン138、中央バルブ130、及びフローセルカートリッジアセンブリ102を通して洗浄緩衝液を引き込み得る。したがって、共有試薬流体ライン138は、フラッシング動作に関与し得る。1つの共有試薬流体ライン138が示されているが、任意の数の共有流体ラインがシステム100に含まれ得る。
シッパマニホールドアセンブリ106のバイパスバルブ136は、専用試薬流体ライン140、142を介して中央バルブ130に結合されている。中央バルブ130は、専用試薬流体ライン140、142に対応する1つ以上の専用ポートを有し得る。専用試薬流体ライン140、142の各々は、単一の試薬と関連付けられ得る。専用試薬流体ライン140、142を通って流れることができる流体は、シークエンシング動作中に使用され得、切断試薬、組み込み試薬、走査試薬、切断洗浄液、及び/又は洗浄緩衝液を含み得る。したがって、バイパスバルブ136に関連して1つの試薬と別の試薬との間で変更する前にフラッシング動作を実行するとき、シッパマニホールドアセンブリ106は、中央バルブ130及び/又はフローセルカートリッジアセンブリ102を通して洗浄緩衝液を引き込み得る。しかしながら、単一の試薬のみが専用試薬流体ライン140、142の各々を通って流れることができるため、専用試薬流体ライン140、142自体は、フラッシングされなくてもよい。専用試薬流体ライン140、142を含む手法は、システム100が他の試薬との有害反応を有することがある試薬を使用する場合に有利であり得る。更に、異なる試薬間で変更するときにフラッシングされる流体ラインの数又は流体ラインの長さを低減することにより、試薬消費及びフラッシュ容積を低減し、システム100のサイクル時間を減少させることができる。2つの専用試薬流体ライン140、142が示されているが、任意の数の専用流体ラインがシステム100に含まれ得る。
バイパスバルブ136はまた、バイパス流体ライン145を介してポンプマニホールドアセンブリ110のキャッシュ123に結合されている。1つ以上の試薬プライミング動作、水和動作、混合動作、及び/又は移送動作は、バイパス流体ライン145を使用して実行され得る。プライミング動作、水和動作、混合動作、及び/又は移送動作は、フローセルカートリッジアセンブリ102とは独立して実行され得る。したがって、バイパス流体ライン145を使用する動作は、例えば、フローセルカートリッジアセンブリ102内の1つ以上の対象とするサンプルのインキュベーション中に行われ得る。すなわち、共有ラインバルブ134は、バイパスバルブ136とは独立して利用することができ、それにより、共有ラインバルブ134及び/又は中央バルブ130が同時に、実質的に同時に、又はオフセット同期して他の動作を実行している間に、バイパスバルブ136は、バイパス流体ライン145及び/又はキャッシュ123を利用して、1つ以上の動作を実行することができる。したがって、システム100を使用して複数の動作を一度に実行することにより、実行時間を低減し得る。更に、バイパスバルブ136及びバイパス流体ライン145を使用して、ポンプマニホールドアセンブリ110を通してサンプルマニホールドアセンブリ108にハイブリダイゼーション緩衝液を流し、ハイブリダイゼーション緩衝液がフローセル128を通って対象とするサンプルに追従することを可能にすることができる。したがって、フローセル125を通って流れる流体の順序は、1)プライミング動作からのハイブリダイゼーション緩衝液、2)サンプルウェル260からシッパ268を介して引き込まれたサンプル、並びに3)バイパスバルブ136及びバイパス流体バルブ145を介してアクセスされるハイブリダイゼーション緩衝液であってもよい。
ここで駆動アセンブリ112を参照すると、図示した実装形態では、駆動アセンブリ112は、ポンプ駆動アセンブリ147及びバルブ駆動アセンブリ148を含む。ポンプ駆動アセンブリ147は、1つ以上のポンプ121とインターフェースして、フローセル125を通して流体をポンプ圧送するように、かつ/又はフローセルカートリッジアセンブリ102内に1つ以上の対象とするサンプルを装填するように適合され得る。バルブ駆動アセンブリ147は、バルブ120、122、130、134、136のうちの1つ以上とインターフェースして、対応するバルブ120、122、130、134、136の位置を制御するように適合され得る。一実装形態では、共有ラインバルブ134及び/又はバイパスバルブ136は、フローセル125への流れを遮断する第1の位置と、試薬リザーバ144からフローセル125への流れを可能にする第2の位置と、を有する、ロータリバルブによって実装される。しかしながら、バルブ134、136のいずれかは、任意の数の位置に位置付けて、第1の試薬、緩衝試薬、第2の試薬などのうちの任意の1つ以上をフローセルカートリッジアセンブリ102に流し得る。一例として、バイパスバルブ136は、試薬リザーバ144のうちの1つ以上からバイパスバルブ136を通って中央バルブ130への流体の流れを可能にする第1の位置と、試薬リザーバ144のうちの1つ以上からバイパスバルブ136を通ってバイパス流体ライン145内への流体の流れを可能にする第2の位置との間で回転し得る。他の構成が好適であることが証明され得る。例えば、バイパスバルブ136は、バイパス流体ライン145からバイパスバルブ136を通って試薬リザーバ144の混合リザーバへの流体の流れを可能にするように位置付け可能であり得る。
コントローラ114を参照すると、図示した実装形態では、コントローラ114は、ユーザインターフェース150と、通信インターフェース152と、1つ以上のプロセッサ154と、開示された実装形態を含む様々な機能を実行するための、1つ以上のプロセッサ154によって実行可能な命令を記憶するメモリ156と、を含む。ユーザインターフェース150、通信インターフェース133、及びメモリ156は、1つ以上のプロセッサ154に電気的かつ/又は通信可能に結合されている。
一実装形態では、ユーザインターフェース150は、ユーザからの入力を受信し、システム100の動作及び/又は行われる分析に関連付けられた情報をユーザに提供するように適合されている。ユーザインターフェース150は、タッチスクリーン、ディスプレイ、キーボード、スピーカ(複数可)、マウス、トラックボール、及び/又は音声認識システムを含み得る。タッチスクリーン及び/又はディスプレイは、グラフィカルユーザインターフェース(graphical user interface、GUI)を表示し得る。
一実装形態では、通信インターフェース152は、ネットワーク(複数可)を介してシステム100と遠隔システム(複数可)(例えば、コンピュータ)との間の通信を可能にするように適合されている。ネットワーク(複数可)としては、インターネット、イントラネット、ローカルエリアネットワーク(local-area network、LAN)、広域ネットワーク(wide-area network、WAN)、同軸ケーブルネットワーク、無線ネットワーク、有線ネットワーク、衛星ネットワーク、デジタル加入者回線(digital subscriber line、DSL)ネットワーク、セルラーネットワーク、Bluetooth接続、近距離無線通信(near field communication、NFC)接続などを挙げることができる。遠隔システムに提供される通信の一部は、システム100によって生成された、又は別の方法で取得された、分析結果、撮像データなどに関連付けられ得る。システム100に提供される通信の一部は、流体分析動作、患者記録、及び/又はシステム100によって実行されるプロトコル(複数可)に関連付けられ得る。
1つ以上のプロセッサ154及び/又はシステム100は、プロセッサベースのシステム(複数可)又はマイクロプロセッサベースのシステム(複数可)のうちの1つ以上を含み得る。いくつかの実装形態では、1つ以上のプロセッサ154及び/又はシステム100は、プログラマブルプロセッサ、プログラマブルコントローラ、マイクロプロセッサ、マイクロコントローラ、グラフィック処理ユニット(graphics processing unit、GPU)、デジタル信号プロセッサ(digital signal processor、DSP)、縮小命令セットコンピュータ(reduced-instruction set computer、RISC)、特定用途向け集積回路(application specific integrated circuit、ASIC)、フィールドプログラマブルゲートアレイ(field programmable gate array、FPGA)、フィールドプログラマブル論理デバイス(field programmable logic device、FPLD)、論理回路、及び/又は本明細書に記載されるものを含む様々な機能を実行する別の論理ベースデバイスのうちの1つ以上を含む。
メモリ156は、半導体メモリ、磁気読み取り可能メモリ、光学メモリ、ハードディスクドライブ(hard disk drive、HDD)、光学記憶ドライブ、ソリッドステート記憶デバイス、ソリッドステートドライブ(solid-state drive、SSD)、フラッシュメモリ、読み出し専用メモリ(read-only memory、ROM)、消去可能プログラマブル読み出し専用メモリ(erasable programmable read-only memory、EPROM)、電気的消去可能プログラマブル読み出し専用メモリ(electrically erasable programmable read-only memory、EEPROM)、ランダムアクセスメモリ(random-access memory、RAM)、不揮発性RAM(non-volatile RAM、NVRAM)メモリ、コンパクトディスク(compact disc、CD)、コンパクトディスク読み取り専用メモリ(compact disc read-only memory、CD-ROM)、デジタル多用途ディスク(digital versatile disk、DVD)、Blu-rayディスク、独立ディスクの冗長アレイ(redundant array of independent disks、RAID)システム、キャッシュ、及び/又は任意の持続時間にわたって(例えば、永続的に、一時的に、長期にわたって、バッファリングのために、キャッシングのために)情報が記憶される任意の他の記憶デバイス若しくは記憶ディスクのうちの1つ以上を含むことができる。
図1Bは、図1のシステム100と共に使用することができる、サンプルウェル260を含む、シッパ268及びサンプルカートリッジ104を含む、シッパアセンブリ262の一実装形態の断面図である。図示した実装形態では、シッパアセンブリ262は、キャビティ272を有する基部270と、シッパ268を含み、かつキャビティ272内に少なくとも部分的に配設されたシッパアレイ274と、矢印278によって概ね示される方向に、かつサンプルウェル260内にシッパ268を付勢するばねアセンブリ276と、を含む自動ピペッターである。ばねアセンブリ276を有することにより、シッパ268をサンプルウェル260内に付勢して、シッパ268をサンプルウェル260の下面280に隣接して位置付けることが可能となり、それによって、サンプルウェル260内のデッドボリュームが低減され、流体分析動作中により少ないサンプルを提供することが可能になる。
シッパ268を参照すると、図示した実装形態では、各シッパ268は、キャビティ272内に配設された近位部分282と、サンプルウェル260内に配設された遠位部分284と、部分282と284との間に延在する流体経路286と、を有する。ばねアセンブリ276は、近位部分282において対応するシッパ268を取り囲み、かつシッパアセンブリ262の対応するばね座290上に着座する、ばね288を含む。
図1Cを参照すると、図1Bのシッパアセンブリ262の遠位部分284及びサンプルカートリッジ104のサンプルウェル260の詳細断面図が示されている。図示した実装形態では、シッパ268は各々、遠位部分284に開口部292及び先端部293を有する。先端部293は、シッパ268の長手方向軸295に対して第1の角度で位置付けられた第1の表面294と、長手方向軸295に対して第2の角度で位置付けられた第2の表面296とによって形成されている。図示されるように、第1の角度は、約30°であり、第2の角度は、約50°である。しかしながら、表面294、296は、同じ角度を含む異なる角度で配設され得る。
第1の角度と第2の角度との差により、先端部293の先端端部297を長手方向軸295からオフセットして、開口部292を先端端部297から離間させることが可能になる。先端端部297は開口部292を越えて延在し、下面280と係合するため、開口部292は、サンプルウェル260の下面298に係合して閉塞及び/又は遮断される可能性が低い。サンプルウェル260内に存在するデッドボリュームの量を更に低減するために、サンプルウェル260の下面280は、テーパ状である。
図2は、図1Aのシステム100のフローセルレセプタクル128内に受容可能なフローセルカートリッジアセンブリ102の一実装形態の等角拡大図を示す。図示した実装形態では、フローセルカートリッジアセンブリ102は、本体158と、フローセルアセンブリ160と、フローセルカップリング162と、入口ガスケットアセンブリ164と、出口ガスケットアセンブリ166と、を含む。フローセルカップリング162は、ブラケットと称され得る。入口ガスケットアセンブリ164及び/又は出口ガスケットアセンブリ166は、図1Aのシステム100のフローセルインターフェース129とインターフェースし得るか、又は他の方法で流体結合し得る。入口ガスケットアセンブリ164は、中央バルブ130に直接結合され得、又は1つ以上の流体ラインを介して中央バルブ130に結合され得る(例えば、図6Bを参照)。
図示した実装形態では、フローセルカートリッジアセンブリ102はまた、無線周波数識別(radio frequency identification、RFID)タグ167を担持し得る。RFIDタグ167は、追跡及び/又は識別目的のために使用され得る。フローセルカートリッジアセンブリ102を追跡及び/又は識別する他の方法が好適であることが証明され得る。
フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158は、周辺壁168及び上面170を有する。周辺壁168及び上面170は、キャビティ172を画定する。キャビティ172は、上部開口部174及び下部開口部176を含む。上部開口部174は、上面170によって画定される。上部開口部174により、撮像システム116を介して、フローセル125の画像データを取得することを可能にすることができる。下部開口部176は、周辺壁168の下縁部178によって画定される。下部開口部176により、対象とするサンプルを出口ガスケットアセンブリ166を介してフローセル125のチャネル126内に装填する、及び/又は1つ以上の試薬を入口ガスケットアセンブリ164を介してフローセル125のチャネル126内に流すことを可能にすることができる。
フローセルアセンブリ160は、複数のチャネル126及びフローセルマニホールド173を有するフローセル125を含む。複数のチャネル126の各チャネル126は、対応するチャネル入口180及び対応するチャネル出口182を有する。チャネル入口180は、フローセル125の入口と称され得る。チャネル出口182は、フローセル125の出口と称され得る。しかしながら、流体の流れの方向に応じて、チャネル入口180は、フローセル125の出口として機能し得、チャネル出口182は、フローセル125の入口として機能し得る。例えば、対象とするサンプルがフローセル125の後部からチャネル126内に装填されるとき、チャネル出口182は、フローセル125の入口として機能し得る。
フローセルマニホールド173は、フローセル125に結合されるように適合されており、積層体によって形成され得る。フローセルマニホールド173は、フローセル125との機械的に可撓性の接続を提供し得る。フローセルマニホールド173は、接着剤を使用してフローセル125に結合され得る。フローセル125及びフローセルマニホールド173を結合する他の方法が好適であることが証明され得る。
図示した実装形態では、フローセルマニホールド173は、単一の入口184と、複数の流体ライン186(流体ライン186は、図3により明確に示されている)と、複数の出口188と、を含む。入口184は、フローセルマニホールド入口と称され得る。フローセルマニホールド173の入口184は、流体ライン186を介して出口188の各々に結合されている。流体ライン186は、フローセルアセンブリ160が追加のバルブ動作を使用しないで流体の流れを制御することを可能にすることができる。
流体ライン186は、流れ分割のために適合され得、流れスプリッタと称され得る。一実装形態では、入口184を通って流れる流体は、フローセル125のチャネル126間で実質的に等しく分割され得る。いくつかの実装形態では、フローセルマニホールド173及び/又は流体ライン186は、図1Aのシステム100の流れ抵抗及び/又は動作圧力を低減するように適合され得る。流体ライン186は、約300マイクロメートル(μm)の高さを有し得る。流体ライン186の他の高さが好適であることが証明され得る。別の実装形態では、フローセルマニホールド173は、除外され得、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158が、流体ライン186、入口184、及び複数の出口188を含み得る。一例として、流体ライン186、入口184、及び複数の出口188は、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158に成形及び/又はエンボス加工され得る(例えば、図13A及び図13Bを参照)。
フローセルマニホールド173はまた、入口位置合わせ孔190及び出口位置合わせ孔192を含み得る。入口位置合わせ孔190は、入口184のいずれかの側に位置付けられ得、出口位置合わせ孔192は、フローセルマニホールド173の出口188に隣接して位置付けられ得る。入口位置合わせ孔190及び/又は出口位置合わせ孔192は、フローセルマニホールド173のインターフェースと称され得る。
フローセルカップリング162は、突出部194を含む。突出部194は、フローセル125に対してフローセルマニホールド173を固定するように、フローセルマニホールド173の出口位置合わせ孔192によって受容可能である。フローセルカップリング162は、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158とのスナップ嵌め接続を形成するように適合された端部部分196を含み得、又は本体158に対して所定の許容差内で浮遊し得る。フローセルカップリング162とフローセルアセンブリ102の本体158との間の結合により、フローセル125及びフローセルマニホールド173をフローセルカートリッジアセンブリ102の本体158のキャビティ172内に保持するのを支援し得る。
図示した実装形態では、フローセルカップリング162は、クレードル197を含む。クレードル197は、半円形の切り取り部であり、テーパ面を含み得る。クレードル197は、フローセルカートリッジアセンブリ102に対してRFIDタグ167を受容する及び/又は固定するように適合され得る。いくつかの実装形態では、クレードル197は、省略され得る。
入口ガスケットアセンブリ164は、第1の部分198と、第2の部分202と、入口ガスケット204と、を含む。入口ガスケット204は、フローセルマニホールド173の入口184に隣接して結合されるように、かつフローセル125のチャネル126と図1Aのシステム100の構成要素との間の流体連通を可能にするように適合され得る。入口ガスケットアセンブリ164の第1の部分198は、突出部206を含み、入口ガスケットアセンブリ164の第2の部分202は、レセプタクル208を含む。突出部206は、フローセルマニホールド173の入口位置合わせ孔190、及び入口ガスケットアセンブリ164の第2の部分202のレセプタクル208によって受容されるように適合されている。突出部206とレセプタクル208との間の相互作用により、例えば、スナップ嵌め接続を介して、入口ガスケットアセンブリ164の第1及び第2の部分198、202を一緒に結合することができる。別の実装形態では、突出部206は、位置合わせ目的のためにレセプタクル208内に受容され得る。入口ガスケットアセンブリ164の第1の部分198の側部210は、入口ガスケットアセンブリ164の第2の部分202及び/又はフローセルカートリッジアセンブリ102の本体158とのスナップ嵌め接続を形成するように適合され得る。
出口ガスケットアセンブリ166は、複数のガスケット212及び本体214を含む。本体214は、ガスケット212を担持し得る。複数のガスケット212の各ガスケット212は、フローセル125のチャネル出口182のうちの1つに隣接して結合され、かつフローセル125のチャネル126とシステム100の構成要素との間の流体連通を可能にするように適合されている。出口ガスケットアセンブリ166の本体214の側部216は、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158とのスナップ嵌め接続を形成するように適合され得る。
図3~図5及び図6A及び図6Bは、図1Aのシステム100と共に使用することができるフローセルアセンブリ160の異なる実装形態を示す。図3~図5並びに図6A及び図6Bに示されるフローセルアセンブリ160のチャネル126は、約18.7マイクロリットル(μL)~約32.4μLの容積を有し得る。他の容積が好適であることが証明され得る。
図3は、図2のフローセルアセンブリ160のフローセル125及びフローセルマニホールド173の平面図を示す。
図4は、図1Aのシステム100と共に使用することができるフローセルアセンブリ160のフローセル125の別の実装形態及びフローセルマニホールド173の別の実装形態の平面図を示す。図3の実装形態とは対照的に、図4のフローセルアセンブリ160のチャネル126の幅は、より小さくてもよい。図4のフローセルマニホールド173の流体ライン186の間隔及び/又はサイズは、それに応じて調整することができる。
図5は、図1Aのシステム100と共に使用することができるフローセルアセンブリ160のフローセル125の別の実装形態及びフローセルマニホールド173の別の実装形態の平面図を示す。開示される他の実装形態とは対照的に、図5のフローセル125は、チャネル126のうちの2つを含み、フローセルマニホールド173は、流体ライン186のうちのより少ないものを含む。フローセルマニホールド173の流体ライン186は、フローセルマニホールド173の入口184とフローセル125のチャネル126とを流体結合する。図5のフローセル125は、2つのチャネル126を含むが、1つを含む任意の他の数のチャネル126が含まれ得る。
図6Aは、図1Aのシステム100と共に使用することができるフローセルアセンブリ160のフローセル125の別の実装形態及びフローセルマニホールド173の別の実装形態の平面図を示す。開示される他の実装形態とは対照的に、図6Aのフローセルマニホールド173の入口184は、フローセルマニホールド173の出口188と実質的に一直線になっており、流体ライン186は、それに応じて配設されている。したがって、図6Aのフローセルマニホールド173の高さHは、図3、図4、及び図5に示されるフローセルマニホールド173の高さよりも低くてもよい。
図6Bは、図6Aのフローセル125及びフローセルマニホールド173の等角図を示す。図示した実装形態では、流体ライン213は、ガスケット204を介してフローセルマニホールド173の入口184に結合されている。流体ライン213は、図1Aのシステム100の一部であってもよく、カップリング215を含む。流体ライン213のカップリング215は、例えば、中央バルブ130とフローセル125との間の流体連通を可能にするために、中央バルブ130のポートに結合され得る。
図7は、図1Aのシステム100と共に使用するための、フローセルアセンブリ160の一実装形態に結合されたサンプル装填マニホールドアセンブリ108の一実装形態の等角図を示す。図示した実装形態では、サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、第1の面218と、第1の面218と反対側の第2の面219と、を有する、本体217を含む。第1の面218は、複数のサンプルポート220及び複数のフローセルポート222を画定する。サンプルポート220の各々は、別個のサンプル流体ライン223を介してサンプルカートリッジインターフェース119の対応するポートに結合されている。同様に、フローセルポート222の各々は、別個のフローセル流体ライン224を介して、フローセル125の対応するチャネル126に結合されている。フローセル流体ライン224は、フローセルインターフェース129のポートに結合され得る。別個の流体ライン223、224が、同じサンプルポート220とサンプルカートリッジインターフェース119のポートとを結合すること、並びにフローセルポート222とフローセル125のチャネル126及び/又はフローセルインターフェース129のポートとを結合することに言及されているが、1つの流体ラインを使用して、2つ以上のポートを流体結合することができる。
サンプル装填マニホールドアセンブリ108の第2の面219は、ポンプポート226を画定する。各ポンプポート226は、別個のポンプチャネル流体ライン230を介してポンプマニホールドアセンブリ110の対応するポート228に結合されている(ポンプマニホールドアセンブリ110の対応するポート228は、図8により明確に示されている)。
サンプル装填マニホールドアセンブリ108のサンプルバルブ120は、対象とするサンプルがサンプルカートリッジ104から得られ、かつフローセル125のチャネル126のうちの1つ以上に装填されることを可能にするように、作動可能である。サンプルカートリッジ104から対象とするサンプルを得るために、サンプルバルブ120のうちの1つ以上が、サンプルカートリッジ104とポンプマニホールドアセンブリ110とを流体連通する第1の位置に作動される。サンプルバルブ120の第1の位置では、対象とするサンプルは、サンプル流体ライン223を通ってサンプルポート220に向かってその中に流れ、ポンプポート226から出てポンプマニホールドアセンブリ110のポンプチャネル流体ライン230内に流れることができる。
対象とするサンプルを出口ガスケットアセンブリ166を介してフローセル125のチャネル126のうちの1つ以上に個別に配置するために、サンプルバルブ120のうちの1つ以上は、ポンプマニホールドアセンブリ110とフローセル125とを流体連通する第2の位置に作動可能である。サンプルバルブ120の第2の位置では、対象とするサンプルは、ポンプチャネル流体ライン230からサンプル装填マニホールドアセンブリ108のポンプポート226内に流れ、サンプル装填マニホールドアセンブリ108のフローセルポート222から出てフローセル流体ライン224を介してフローセル125の対応するチャネル126に向かって流れることができる。ポンプマニホールドアセンブリ110は、実質的に均一な移送を可能にするために、比較的遅い速度で対象とするサンプルをフローセル125内に供給するように適合され得る。対象とするサンプルがフローセル125のチャネル126内に装填されているとき、中央バルブ130は、フローセル125を補助廃棄物流体ライン132に通気するように位置付けられ得る。対象とするサンプルがフローセル125に供給された後、播種のためにインキュベーションプロセスを実行し得る。いくつかの実装形態では、100マイクロリットル(μL)の対象とするサンプルが、フローセル125のチャネル126内に一度に配置され、インキュベートされ、播種される。他の容積が好適であることが証明され得る。チャネル126内により少量の対象とするサンプルを漸増的に配置し、インキュベートし、及び播種するプロセスは、閾値回数繰り返され得る。
サンプルカートリッジ104から対象とするサンプルを得る前に、いくつかの実装形態では、ポンプマニホールドアセンブリ110は、緩衝液でプライミングされ得る。緩衝液は、バイパス流体ライン145から得られ得る。ポンプマニホールドアセンブリ110を緩衝液でプライミングすることにより、例えば、対象とするサンプルをフローセル125内に供給する行程をポンプマニホールドアセンブリ110に提供することができる。
図8は、図1Aのシステム100と共に使用するための、ポンプマニホールドアセンブリ110の一部分の一実装形態の概略図である。図示した実装形態では、ポンプマニホールドアセンブリ110は、ポンプバルブ122と、キャッシュバルブ234と、ポンプ121とを担持する、本体232を含む。ポンプ121は、シリンジポンプであってもよく、約500マイクロリットル(μL)の容積を受容するように適合され得る。他の容積が好適であることが証明され得る。
ポンプバルブ122、キャッシュバルブ234、及び/又はポンプ121は、フローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126への流体の流れを個別に制御するように動作可能である。図示した実装形態では、2つのポンプ駆動アセンブリ147が提供される。ポンプ駆動アセンブリ147は、ポンプ121のうちの1つ以上を個別に作動させて、開示される動作のうちの1つ以上を実行するように適合され得る。一実装形態では、ポンプ駆動アセンブリ147のうちの一方は、ポンプ121のうちの2つを動作させ得、ポンプ駆動アセンブリ147の他方は、ポンプ121のうちの6つを動作させ得る。他の構成が好適であることが証明され得る。
ポンプバルブ122、キャッシュバルブ234、及び/又はポンプ121は、バイパス流体ライン145及び/又は主廃棄物流体ライン127を通して1つ以上の試薬を流すように動作可能であり得る。ポンプマニホールドアセンブリ110の本体232はまた、複数のセンサ236、237を担持し得る。センサ236、237は、圧力センサ又は流量センサを含み得る。他の種類のセンサが好適であることが証明され得る。別の実装形態では、センサ236、237及び/又はキャッシュバルブ234のうちの1つ以上が除外され得る。いくつかのそのような実装形態では、バイパス流体ライン145も除外することができる。他の構成が好適であることが証明され得る。
ポンプマニホールドアセンブリ110は、キャッシュ123、ポンプチャネル流体ライン230、複数のポンプ流体ライン238、共有流体ライン240、キャッシュ流体ライン242、及び主廃棄物流体ライン127を含む。キャッシュ流体ライン242は、キャッシュ123及びキャッシュバルブ234に結合され、かつキャッシュ123とキャッシュバルブ234との間に結合されている。ポンプチャネル流体ライン230及びポンプ流体ライン238は、ポンプチャネル流体ラインと総称されることがある。図示した実装形態では、各ポンプバルブ122は、対応するポンプチャネル流体ライン230、対応するポンプ流体ライン238、及び共有流体ライン240に結合されている。各ポンプ121は、対応するポンプ流体ライン238に結合されている。ポンプ121は、ポンプチャネル流体ライン230及びフローセル125のチャネル126のうちの1つへの流体の流れを個別に制御するように動作可能である。
キャッシュバルブ234は、キャッシュ流体ライン242、主廃棄物流体ライン127、及び共有流体ライン240に結合されている。センサ236、237は、ポンプチャネル流体ライン230のうちの少なくとも1つ又は共有流体ライン240のうちの1つ以上の圧力値又は流量値のうちの1つ以上を判定するように適合され得る。5つのセンサ236は、ポンプチャネル流体ライン230に結合されている。センサ236は、異なって位置付けられ得る。ゼロ個のセンサを含む追加のセンサ又はより少ないセンサが好適であることが証明され得る。
ポンプ121のうちの1つ以上を使用して、フローセル125から流体を引き込み、又はフローセル125に向かって流体を付勢するために、ポンプバルブ122のうちの1つ以上は、ポンプチャネル流体ライン230とポンプ流体ライン238とを流体連通する第1の位置に作動され得、ポンプ121のうちの1つ以上は、流体を移動させるように作動され得る。
ポンプ121のうちの1つ以上を使用して反応成分を廃棄物リザーバ117に向かって移動させるために、ポンプバルブ122のうちの1つ以上は、ポンプ流体ライン238と共有流体ライン240とを流体連通する第2の位置に作動され得、キャッシュバルブ234は、共有流体ライン240と主廃棄物流体ライン127とを流体連通する第1の位置に作動され得、ポンプ121のうちの1つ以上は、流体を移動させるように作動され得る。
バイパス流体ライン145を通して受容した1つ以上の反応成分を使用して混合動作を実行するために、ポンプバルブ122は、ポンプ流体ライン238と共有流体ライン240とを流体連通する第2の位置に作動され得、キャッシュバルブ234は、キャッシュ流体ライン242と共有流体ライン240とを流体結合する第2の位置に作動され得、ポンプ121のうちの1つ以上は、流体を移動させるように作動され得る。いくつかの実装形態では、ポンプ121の全てを使用して、より大容量の反応成分(複数可)をバイパス流体ライン145を通して移送して、共有流体ライン240をプライミングすることができる。次いで、後続の流体移送の精度を高めるために、例えば、残りのポンプ121がアイドル状態である間に、ポンプ121のうちの2つを使用することができる。1つのポンプ121を使用することを含む、異なる数のポンプ121が代わりに使用され得る。
図9は、本開示の教示に従ったシステム300の別の実装形態の概略図を示す。図示した実装形態では、システム300は、フローセルインターフェース128及びポンプマニホールドアセンブリ110を含む。フローセルインターフェース128は、複数のチャネル126を有するフローセル125に結合されるように適合されている。ポンプマニホールドアセンブリ110は、ポンプバルブ122及びポンプ121を担持する。システム300は、2つのポンプバルブ122及び2つのポンプ121を含むが、システム300に異なる数のバルブ122及び/又はポンプ121を提供することが好適であることが証明され得る。
図示した実装形態では、ポンプマニホールドアセンブリ110は、ポンプチャネル流体ライン230、ポンプ流体ライン238、及び共有流体ライン240を含む。ポンプバルブ122及びポンプ121は、対応するポンプチャネル流体ライン230を介してフローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126を通る流体の流れを個別に制御するように動作可能であり得る。各ポンプバルブ122は、対応するポンプチャネル流体ライン238、対応するポンプ流体ライン230、及び共有流体ライン240に結合され得る。各ポンプ121は、対応するポンプ流体ライン238に結合され得る。他の流体ライン構成が好適であることが証明され得る。
図10は、本開示の教示に従ったシステム400の別の実装形態の概略図を示す。図示した実装形態では、システム400は、バルブ130、134、及び/又は136のうちの1つ以上、フローセルインターフェース128、ポンプマニホールドアセンブリ110、並びにバイパス流体ライン145を含む。バルブ130、134及び/又は136は、対応する試薬リザーバ144に結合されるように適合されている。フローセルインターフェース128は、複数のチャネル126を有するフローセル125に結合されるように適合されている。ポンプマニホールドアセンブリ110は、ポンプ121、ポンプバルブ122、及びキャッシュ123を含む。各ポンプ121は、フローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126の流体の流れを個別に制御するように動作可能であり得る。バイパス流体ライン145は、1つ以上のバルブ130、134、136とキャッシュ123との間で動作可能に結合されている。他の流体ライン構成が好適であることが証明され得る。
図11は、本開示の教示に従ったシステム500の別の実装形態の概略図を示す。図示した実装形態では、システム500は、フローセルインターフェース128、サンプルカートリッジインターフェース119、及びサンプル装填マニホールドアセンブリ108を含む。フローセルインターフェース119は、複数のチャネル126を有するフローセル125に結合されるように適合されている。サンプルカートリッジインターフェース119は、サンプルカートリッジ104に結合されるように適合されており、サンプルカートリッジインターフェース119は、フローセルインターフェース128の下流に位置付けられている。サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、フローセルインターフェース128とサンプルカートリッジインターフェース129との間に位置付けられている。
サンプル装填マニホールドアセンブリ108は、複数のサンプルバルブ120を担持し、かつサンプルポート220及びフローセルポート222を画定する、本体217を含む。各サンプルポート220は、サンプル流体ライン223のうちの1つを介して、サンプルカートリッジインターフェース119の対応するポート502に結合されている。各フローセルポート222は、フローセルインターフェース119の対応するポート504に結合されている。フローセルインターフェース119のポート504は、フローセル流体ライン224を介してフローセル125のチャネル126の対応する1つと関連付けられている。
図12は、本開示の教示に従ったシステム600の別の実装形態の概略図を示す。図示した実装形態では、システム600は、バルブ130、134、及び/又は136のうちの1つ以上、フローセルインターフェース128、サンプルカートリッジインターフェース119、並びにポンプマニホールドアセンブリ110を含む。バルブ130、134、及び/又は136のうちの1つ以上は、対応する試薬リザーバ144に結合されるように適合され得る。フローセルインターフェース128は、複数のチャネル126を有するフローセル125に結合されるように適合されている。サンプルカートリッジインターフェース128は、複数のポート502を含み、対象とするサンプルを担持するサンプルカートリッジ104に結合されるように適合されている。サンプルカートリッジインターフェース119は、フローセルインターフェース128の下流に位置付けられている。
図示した実装形態では、ポンプマニホールドアセンブリ110は、ポンプ121及びポンプバルブ122を含む。各ポンプ121及び対応するポンプバルブ122は、サンプルカートリッジインターフェース119の複数のポート502の各ポート502とフローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126との間の対象とするサンプルによる流れを個別に制御するように動作可能である。
図13Aは、図1Aのシステム100と共に使用することができるフローセルカートリッジアセンブリ102のフローセル125の別の実装形態及びフローセルマニホールド173の別の実装形態の平面図を示す。開示される他の実装形態とは対照的に、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158は、流体ライン186、入口184、及び複数の出口188を画定する。図示した実装形態では、流体ライン186はまた、例えば、流体ライン124及び/又はサンプル装填マニホールドアセンブリ108との流体連通を可能にするために、フローセル125のチャネル126のチャネル出口182に結合されている。
図13Bは、図13Aのフローセルカートリッジアセンブリ102の断面図を示す。図示した実装形態では、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158は、レセプタクル250を画定する。内側ガスケット252及び外側ガスケット254は、レセプタクル250内に配設されている。内側ガスケット254は、フローセル125と噛み合い係合して、フローセルカートリッジアセンブリ102の本体158の流体ライン186とフローセルのチャネル126との間の流体連通を可能にするように適合され得る。外側ガスケット254は、システム100のフローセルインターフェース129と噛み合い係合して、システム100とフローセルカートリッジアセンブリ102との間の流体連通を可能にするように適合され得る。
図14~図17は、図1Aのシステム100又は本明細書に開示される他のシステム300、400、500、及び/若しくは600のいずれかを使用して、ポンプ圧送動作及び/又は対象とするサンプルの装填動作を実行する方法のフローチャートを示す。図14及び図16のフローチャートでは、実線で囲まれたブロックは、プロセス1200及び1400の実装形態に含まれ得、破線で囲まれたブロックは、プロセスの実装形態において任意選択的であり得る。しかしながら、図14~図17でブロックの境界が提示される方法にかかわらず、ブロックの実行の順序は、変更され得、並びに/又は説明されるブロックのうちのいくつかは、変更、省略、組み合わせ、及び/若しくは複数のブロックに細分化され得る。
図14のプロセス1200は、複数のチャネル126を有するフローセル125がフローセルインターフェース129に結合されることから始まる(ブロック1202)。ブロック1204では、ポンプマニホールドアセンブリ110の複数のポンプバルブ122のうちの1つ以上及び複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させて、フローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126に対象とするサンプルを装填する。
ポンプマニホールドアセンブリ110の複数のポンプバルブ122のうちの1つ以上及び複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させて、対応するポンプチャネル流体ライン230を介して複数のチャネル126の各チャネル126を通る流体の流れを個別に制御する(ブロック1206)。複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させることは、対象とするサンプルを第1の方向に各チャネル126内に流すことを含み得る。複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させることはまた、フローセル125のチャネル126を通して第1の方向とは反対の第2の方向に試薬を流すことを含み得る。ポンプマニホールドアセンブリ110は、複数のポンプチャネル流体ライン230、複数のポンプ流体ライン238、及び共有流体ライン240を含み得る。各ポンプバルブ122は、対応するポンプチャネル流体ライン230、対応するポンプ流体ライン238、及び共有流体ライン240に結合され得る。各ポンプ121は、対応するポンプ流体ライン238に結合され得る。
ポンプマニホールドアセンブリ110の複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させて、バイパス流体ライン145とポンプマニホールドアセンブリ110のキャッシュ123との間の流体の流れを制御する(ブロック1208)。いくつかの実装形態では、バイパス流体ライン145は、キャッシュ123とバイパスバルブ136とを結合する。
ブロック1210では、ポンプマニホールドアセンブリ110のポンプバルブ122のうちの1つ以上、ポンプ121のうちの1つ以上、又はキャッシュバルブ234を動作させて、共有流体ライン240と主廃棄物流体ライン127との間、又はバイパス流体ライン145と主廃棄物流体ライン127との間のうちの少なくとも1つの流体の流れを制御する。ポンプマニホールドアセンブリ110のポンプ121のうちの1つ以上を動作させて、対象とするサンプルをフローチャネル125のチャネル126から補助廃棄物流体ライン132内に流す(ブロック1212)。
図15のプロセス1300は、複数のチャネル126を有するフローセル125がフローセルインターフェース129に結合されることから始まる(ブロック1302)。ブロック1304では、ポンプマニホールドアセンブリ110の複数のポンプバルブ122のうちの1つ以上及び複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させて、対応するポンプチャネル流体ライン230を介して複数のチャネル126の各チャネル126を通る流体の流れを個別に制御する。ポンプマニホールドアセンブリ110は、複数のポンプチャネル流体ライン230、複数のポンプ流体ライン238、及び共有流体ライン240を含み得る。各ポンプバルブ122は、対応するポンプチャネル流体ライン230、対応するポンプ流体ライン238、及び共有流体ライン240に結合され得る。各ポンプ121は、対応するポンプ流体ライン238に結合され得る。
図16のプロセス1400は、複数のチャネル126を有するフローセル125がフローセルインターフェース129に結合されることから始まる(ブロック1402)。ブロック1404では、サンプルカートリッジ104が、サンプルカートリッジインターフェース119に結合される。サンプルカートリッジインターフェース119は、フローセルインターフェース129の下流に位置付けられ得る。サンプルカートリッジ104は、対象とするサンプルを担持し得る。サンプル装填マニホールドアセンブリ108のサンプルバルブ120のうちの1つ以上を動作させて、フローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126に対象とするサンプルを個別に装填する(ブロック1406)。
いくつかの実装形態では、1つ以上のサンプルバルブ120を動作させることは、対象とするサンプルをサンプルカートリッジ104からサンプル装填マニホールドアセンブリ108の対応するサンプルポート220に移動させ、サンプル装填マニホールドアセンブリ108の関連付けられたポンプポート226から出てポンプマニホールドアセンブリ110の対応するポンプチャネル流体ライン230に移動させることを含む。1つ以上のサンプルバルブ120を動作させることはまた、対象とするサンプルを対応するポンプチャネル流体ライン230から関連付けられたポンプポート226を通して、かつサンプル装填マニホールドアセンブリ108のフローセルポート222を通して移動させることを含み得る。各フローセルポート222は、フローセルインターフェース119の対応するポート502に結合され、フローセル125の複数のチャネル126のチャネル126のうちの1つと関連付けられ得る。
サンプル装填マニホールドアセンブリ108の各サンプルバルブ120は、サンプルカートリッジインターフェース119のポート502のうちの1つとポンプ121のうちの1つ以上とを流体連通させ、かつポンプ121とフローセル125の複数のチャネル126の対応するチャネル126とを流体連通させるように動作可能であり得る。いくつかの実装形態では、1つ以上のサンプルバルブ120を動作させることは、対象とするサンプルを第1の方向にフローセル125の各チャネル126内に流すことを含む。プロセス1400はまた、フローセル125のチャネル126を通る試薬の流れを、第1の方向とは反対の第2の方向に制御することも含み得る。
ブロック1408では、複数のポンプ121のうちの1つ以上を動作させて、フローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126の流体の流れを個別に制御する。試薬は、共有試薬流体ライン138を通してフローセル125のチャネル126に流され得、続いて、別の試薬が、専用試薬流体ライン140及び/又は142を通してフローセル125のチャネル126に流され得る(ブロック1410)。ブロック1412では、対象とするサンプルは、フローセル125のチャネル126から補助廃棄物流体ライン132に流される。
図17のプロセス1500は、複数のチャネル126を有するフローセル125がフローセルインターフェース129に結合されることから始まる(ブロック1502)。ブロック1504では、サンプルカートリッジ104が、サンプルカートリッジインターフェース119に結合される。サンプルカートリッジインターフェース119は、フローセルインターフェース129の下流に位置付けられ得る。サンプルカートリッジ104は、1つ以上の対象とするサンプルを担持し得る。サンプル装填マニホールドアセンブリ108のサンプルバルブ120のうちの1つ以上を動作させて、フローセル125の複数のチャネル126の各チャネル126に対応する対象とするサンプル又は同じ対象とするサンプルを個別に装填する(ブロック1506)。
方法は、複数のチャネルを有するフローセルをフローセルインターフェースに結合することであって、フローセルインターフェースが、ポンプマニホールドアセンブリに流体結合されている、ことと、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブの第1のポンプバルブを第1の位置に移動させて、複数のチャネルの第1のチャネルを複数のポンプの第1のポンプと流体接続することと、を含む。第1のポンプは、第1のポンプチャネル流体ラインを介して第1のチャネルに流体接続される。この方法は、第1のポンプチャネル流体ラインを介して第1のポンプを使用して第1のチャネルを通して第1の容積の第1の試薬をポンプ圧送することと、複数のポンプバルブの第1のポンプバルブを第2の位置に移動させて、ポンプ及び第1のポンプチャネル流体ラインを廃棄物リザーバと流体連通する共有流体ラインと流体接続することと、を含む。この方法は、共有流体ラインを通して廃棄物リザーバ内に第1の容積の第1の試薬をポンプ圧送することと、複数のポンプバルブの第2のポンプバルブを第1の位置に移動させて、複数のチャネルの第2のチャネルを複数のポンプの第2のポンプと流体接続することと、を含む。第2のポンプは、第2のポンプチャネル流体ラインを介して第2のチャネルに流体接続される。この方法は、第2のポンプチャネル流体ラインを介して第2のポンプを使用して第2のチャネル内に第2の容積の第1の試薬をポンプ圧送することと、複数のポンプバルブの第2のポンプバルブを第2の位置に移動させて、第2のポンプ及び第2のポンプチャネル流体ラインを廃棄物リザーバと流体連通する共有流体ラインと流体接続することと、を含む。この方法は、共有流体ラインを通して、第2の容積の第1の試薬を廃棄物リザーバ内にポンプ圧送することを含む。
バイパスバルブを第1の位置に移動させて、バイパス流体ラインとポンプマニホールドアセンブリのキャッシュとを流体結合することと、バイパス流体ラインを通してキャッシュ内に第3の容積の第1の試薬又は別の試薬をポンプ圧送することと、を更に含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブのうちの1つ以上、複数のポンプのうちの1つ以上、又はキャッシュバルブを作動させることと、共有流体ラインと廃棄物リザーバと流体連通する主廃棄物流体ラインとの間、又はバイパス流体ラインと主廃棄物流体ラインとの間のうちの少なくとも1つで試薬をポンプ圧送することと、を更に含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブのうちの1つ以上及び複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの複数のチャネルのうちの1つ以上に対象とするサンプルを装填すること、を更に含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つ以上に対象とするサンプルを装填することが、対象とするサンプルを第1の方向に流すことを含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。この方法は、ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、第1の方向とは反対の第2の方向にフローセルのチャネルを通る試薬の流れを制御することを更に含む。
ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの1つ以上のチャネルから補助廃棄物流体ラインに対象とするサンプルを流すことであって、補助廃棄物流体ラインが、フローセルインターフェースの上流にある、こと、を更に含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
複数のチャネルを有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、複数のポンプバルブ及び複数のポンプを担持し、複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、及び共有流体ラインを備える、ポンプマニホールドアセンブリと、を備える装置。ポンプバルブ及びポンプは、対応するポンプチャネル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御するように動作可能である。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合され、複数のチャネルの対応するチャネル、対応するポンプチャネル流体ライン、及び対応するポンプ流体ラインを流体結合する第1の位置と、対応するポンプ流体ライン、共有流体ライン、及び破棄物リザーバを流体結合する第2の位置との間で移動可能である。各ポンプは、対応するポンプ流体ラインに結合されている。
ポンプマニホールドアセンブリが、キャッシュを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。装置は、バイパスバルブ及びバイパスバルブとキャッシュとを結合するバイパス流体ラインを更に備える。
ポンプマニホールドアセンブリが、キャッシュバルブ及びキャッシュ流体ラインを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。キャッシュバルブは、キャッシュ流体ライン及び共有流体ラインに結合されている。
ポンプマニホールドアセンブリが、廃棄物リザーバに結合された主廃棄物流体ラインを更に備え、キャッシュバルブが、主廃棄物流体ラインに結合されている、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
ポンプマニホールドアセンブリが、ポンプチャネル流体ラインのうちの少なくとも1つ又は共有流体ラインのうちの1つ以上の圧力値又は流量値のうちの1つ以上を判定するように適合された複数のセンサを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
複数のポンプを駆動するように動作可能な一対のポンプ駆動アセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
サンプルカートリッジに結合されるように適合されたサンプルカートリッジインターフェースを更に備え、サンプルカートリッジインターフェースが、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
フローセルインターフェースとサンプルカートリッジインターフェースとの間に位置付けられ、かつ、複数のサンプルバルブを担持し、かつ複数のサンプルポート、複数のフローセルポート、及び複数のポンプポートを画定する、本体を備える、又は含む、サンプル装填マニホールドアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。各サンプルポートは、サンプル流体ラインを介してサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合されている。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つに関連付けられている。各ポンプポートは、複数のポンプチャネル流体ラインの対応するポンプチャネル流体ラインに結合されている。
サンプル装填マニホールドアセンブリのサンプルバルブ及びポンプマニホールドアセンブリのポンプが、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填するように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
各サンプルバルブが、サンプルカートリッジのポートとポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプの対応するポンプとを流体連通させ、かつポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプのポンプとフローセルの複数のチャネルの対応するチャネルとを流体連通させるように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
中央バルブと、中央バルブに結合されており、廃棄物リザーバに結合されるように適合された、補助廃棄物流体ラインとを更に備え、補助廃棄物流体ラインが、フローセルインターフェースの上流に位置付けられている、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
共有ラインバルブ、バイパスバルブ、複数の専用試薬流体ライン、及び共有試薬流体ラインを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。共有試薬流体ラインは、共有ラインバルブと中央バルブとを結合しており、中央バルブを介してフローセルに1つ以上の試薬を流すように適合されている。各専用試薬流体ラインは、バイパスバルブと中央バルブとを結合しており、中央バルブを介してフローセルに試薬を流すように適合されている。
装置は、対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブと、複数のチャネルを有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、を備える。装置は、複数のポンプ、複数のポンプバルブ、及びキャッシュを有するポンプマニホールドアセンブリを備える。各ポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能であり、バイパス流体ラインは、1つ以上のバルブとキャッシュとの間に動作可能に結合されている。
複数のサンプルバルブを有するサンプル装填マニホールドアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。各サンプルバルブ及びポンプマニホールドアセンブリの対応するポンプは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに個別に装填するように動作可能である。サンプル装填マニホールドアセンブリは、フローセルの下流に位置付けられている。
複数のチャネルを有するフローセル及びフローセルマニホールドを含むフローセルアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。フローセルマニホールドは、入口と、複数の流体ラインと、複数の出口と、を含む。フローセルマニホールドの各出口は、フローセルの対応するチャネルに結合されている。
方法は、第1のチャネル及び第2のチャネルを有するフローセルをフローセルインターフェースに結合することと、サンプル装填マニホールドアセンブリの1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第1の位置に移動させて、サンプルカートリッジの第1のサンプルリザーバをフローセルの第1のチャネルの出口に流体結合することと、を含む。この方法は、第1のサンプルリザーバから第1のチャネルの出口を通してフローセルの第1のチャネル内に第1の対象とするサンプルをポンプ圧送することを含む。第1のチャネルの入口は、中央バルブが第1の位置にあるときに、中央バルブを介して廃棄物リザーバに流体接続される。この方法は、サンプル装填マニホールドアセンブリの1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第2の位置に移動させて、サンプルカートリッジの第1のサンプルリザーバを流体的に切断し、かつ第1のチャネルの出口を廃棄物リザーバと流体接続することと、中央バルブを第2の位置に移動させて、試薬リザーバをフローセルの第1のチャネル及び第2のチャネルと流体結合することと、を含む。この方法は、第1の容積の試薬を第1のチャネルを通して廃棄物リザーバ内にポンプ圧送することを含む。
第1の対象とするサンプルを第1のサンプルリザーバからフローセルの第1のチャネル内にポンプ圧送することが、第1の対象とするサンプルをサンプルカートリッジからサンプル装填マニホールドアセンブリの対応するサンプルポートに移動させ、サンプル装填マニホールドアセンブリの関連付けられたポンプポートから出てポンプマニホールドアセンブリのポンプチャネル流体ライン内に移動させることと、第1の対象とするサンプルをポンプチャネル流体ラインから関連付けられたポンプポートを通して、かつサンプル装填マニホールドアセンブリの対応するフローセルポートを通して移動させることと、を含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセルの複数のチャネルのうちのチャネルのうちの1つと関連付けられている。
1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第1の位置に移動させることが、サンプルカートリッジインターフェースのポートと対応するポンプとを流体結合することを含み、1つ以上のサンプルバルブの第1のサンプルバルブを第2の位置に移動させることが、対応するポンプとフローセルの複数のチャネルの第1のチャネルとを流体結合することを含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御することを更に含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
第1の対象とするサンプルをフローセルの第1のチャネルから補助廃棄物流体ラインに流すことを更に含み、補助廃棄物流体ラインが、フローセルの上流にあり、中央バルブ及び廃棄物リザーバに流体結合されている、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
共有試薬流体ラインを通して、試薬をフローセルの複数のチャネルに流し、続いて、別の試薬を専用試薬流体ラインを通してフローセルの複数のチャネルに流すことを更に含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の方法。
複数のチャネルを有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、中央バルブと、中央バルブに結合されており、廃棄物リザーバに結合されるように適合された補助廃棄物流体ラインと、を備える装置。中央バルブは、フローセルインターフェースに結合され、複数のチャネルの入口を補助廃棄物流体ラインに流体接続する第1の位置と、試薬リザーバと複数のチャネルとを流体接続する第2の位置との間で移動可能である。装置は、サンプルカートリッジに結合されるように適合されたサンプルカートリッジインターフェースを備える。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている。装置は、フローセルインターフェースとサンプルカートリッジインターフェースとの間に位置付けられ、かつ、複数のサンプルバルブを担持し、かつ複数のサンプルポート及び複数のフローセルポートを画定する、本体を備える、サンプル装填マニホールドアセンブリを備える。各サンプルポートは、サンプル流体ラインを介してサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合されている。各フローセルポートは、フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセル流体ラインを介してフローセルの複数のチャネルのうちの1つに関連付けられている。サンプルバルブの各々は、対応するサンプルポートと複数のチャネルの対応する出口とを流体接続する第1の位置と、複数のチャネルの対応する出口と廃棄物リザーバとを流体結合する第2の位置との間で移動可能である。
サンプルバルブが、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに個別に装填するように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
複数のポンプを更に備え、サンプル装填マニホールドアセンブリの本体が、複数のポンプポートを更に画定する、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。各ポンプポートは、ポンプチャネル流体ラインを介して複数のポンプのうちのポンプのうちの1つに結合されている。
各サンプルバルブが、サンプルカートリッジのポートと複数のポンプの対応するポンプとを流体連通させ、かつ複数のポンプのポンプとフローセルの複数のチャネルの対応するチャネルとを流体連通させるように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
ポンプが、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
ポンプ及びキャッシュを備えるポンプマニホールドアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。バイパスバルブ及びバイパスバルブとキャッシュとを結合するバイパス流体ラインを更に備える。
共有ラインバルブ、複数の専用試薬流体ライン、及び共有試薬流体ラインを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。共有試薬流体ラインは、共有ラインバルブと中央バルブとを結合しており、フローセルに1つ以上の試薬を流すように適合されている。各専用試薬流体ラインは、バイパス流体ラインと中央バルブとを結合しており、フローセルに向かって流れるように適合されている。
ポンプマニホールドアセンブリが、複数のポンプバルブ及びキャッシュバルブを担持し、複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、共有流体ライン、キャッシュ流体ライン、及び主廃棄物流体ラインを含む、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。キャッシュ流体ラインは、キャッシュ及びキャッシュバルブに結合され、かつキャッシュとキャッシュバルブとの間に結合されている。各ポンプバルブは、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び共有流体ラインに結合されている。キャッシュバルブは、キャッシュ流体ライン、主廃棄物流体ライン、及び共有流体ラインに結合されている。
ポンプバルブ及びポンプが、フローセルの複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能であり、ポンプバルブ、キャッシュバルブ、及びポンプが、バイパス流体ラインと共有流体ラインとの間の流体の流れを制御するように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
ポンプバルブ、キャッシュバルブ、及びポンプが、共有流体ラインと主廃棄物流体ラインとの間の流体の流れを制御するように動作可能である、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。
装置は、対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブと、フローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、を備える。装置は、1つ以上のポートを有し、かつ対象とするサンプルを担持するサンプルカートリッジに結合されるように適合された、サンプルカートリッジインターフェースを備える。サンプルカートリッジインターフェースは、フローセルインターフェースの下流に位置付けられている。装置は、フローセルの出口と関連付けられたフローセルインターフェース及びサンプルカートリッジインターフェースの対応するポートを介してフローセルのチャネルに対象とするサンプルを装填するように適合されたポンプを備える。
このポンプを含む複数のポンプ及び複数のポンプバルブを有するポンプマニホールドアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。各ポンプ及び対応するポンプバルブは、サンプルカートリッジインターフェースの1つ以上のポートの各ポートとフローセルの対応するチャネルとの間の対象とするサンプルの流れを個別に制御するように動作可能である。
複数のサンプルバルブを有するサンプル装填マニホールドアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。各サンプルバルブは、フローセルの複数のチャネルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填するように動作可能である。
複数のチャネルを有するフローセル及びフローセルマニホールドを含むフローセルアセンブリを更に備える、前述の実装形態のうちのいずれか1つ以上及び/又は以下に開示される実装形態のうちのいずれか1つ以上に記載の装置。フローセルマニホールドは、入口と、複数の流体ラインと、複数の出口と、を含む。フローセルマニホールドの各出口は、フローセルの対応するチャネルに結合されている。
前述の説明は、当業者が本明細書に記載される様々な構成を実践することを可能にするために提供されている。主題技術は、様々な図及び構成を参照して具体的に説明されてきたが、これらは例示目的のみのためであり、主題技術の範囲を限定するものとして解釈されるべきではないことを理解されたい。
本明細書で使用するとき、単数形で記載され、かつ単語「a」又は「an」に続く要素又は工程は、かかる除外が明示的に記載されていない限り、複数のこれらの要素又は工程を除外しないものとして理解されるべきである。更に、「1つの実装形態」への言及は、また記載された特徴を組み込む追加の実装形態の存在を除外するものとして解釈されることを意図するものではない。更に、反対に明示的に記載されない限り、特定の特性を有する1つの要素又は複数の要素を「備える(comprising)」、「含む(including)」、又は「有する(having)」実装形態は、その特性を有するか否かにかかわらず、追加の要素を含み得る。更に、用語「備える(comprising)」、「含む(including)」、「有する(having)」などは、本明細書において互換的に使用される。
本明細書全体を通して使用される用語「実質的に」、「およそ」、及び「約」は、処理のばらつきなどによる小さな変動を説明及び考慮するために使用される。例えば、それらは、±5%以下、例えば±2%以下、例えば±1%以下、例えば±0.5%以下、例えば±0.2%以下、例えば±0.1%以下、例えば±0.05%以下)を指すことができる。
主題技術を実施するための多くの他の方法が存在し得る。本明細書に記載される様々な機能及び要素は、主題技術の範囲から逸脱することなく、示されるものとは異なって分割され得る。これらの実装形態に対する様々な修正は、当業者には容易に明らかであり得、本明細書で定義される一般的な原理は、他の実装形態に適用することができる。したがって、主題技術の範囲から逸脱することなく、当業者によって、多くの変更及び修正を主題技術に行うことができる。例えば、異なる数の所与のモジュール又はユニットが用いられ得、異なる種類若しくは複数の種類の所与のモジュール又はユニットが用いられ得、所与のモジュール又はユニットが追加され得、あるいは所与のモジュール又はユニットが省略され得る。
下線付き及び/又はイタリック体の見出し及び副見出しは、便宜上のみのために使用され、主題技術を限定するものではなく、主題技術の説明の解釈と関連して言及されない。当業者に既知である、又は後に知られることになる、本開示全体を通して記載される様々な実装形態の要素に対する全ての構造的及び機能的等価物は、参照により本明細書に明示的に組み込まれ、主題技術に包含されることが意図される。更に、本明細書に開示された何物も、そのような開示が上記の説明において明示的に記載されているかどうかにかかわらず、公開専用であることを意図するものではない。
以下でより詳細に説明される、前述の概念及び更なる概念の全ての組み合わせは(かかる概念が相互に矛盾しないという前提で)、本明細書に開示される主題の一部であると考えられることを理解されたい。具体的には、本開示の終わりに現れる特許請求される主題の全ての組み合わせは、本明細書に開示される主題の一部であると考えられる。

Claims (21)

  1. 方法であって、
    複数のチャネルを有するフローセルをフローセルインターフェースに結合することであって、前記フローセルインターフェースが、ポンプマニホールドアセンブリに流体結合されている、結合することと、
    前記ポンプマニホールドアセンブリの複数のポンプバルブの第1のポンプバルブを第1の位置に移動させて、前記複数のチャネルの第1のチャネルを複数のポンプの第1のポンプと流体接続することであって、前記第1のポンプが、第1のポンプチャネル流体ラインを介して前記第1のチャネルに流体接続される、流体接続することと、
    第1の体積の第1の試薬を前記第1のポンプチャネル流体ラインを介して前記第1のポンプを使用して前記第1のチャネルを通してポンプ輸送することと、
    前記複数のポンプバルブの前記第1のポンプバルブを第2の位置に移動させて、前記ポンプ及び前記第1のポンプチャネル流体ラインを廃棄物リザーバと流体連通する共有流体ラインと流体接続することと、
    前記第1の体積の前記第1の試薬を前記共有流体ラインを介して前記廃棄物リザーバ内にポンプ輸送することと、
    複数のポンプバルブの第2のポンプバルブを第1の位置に移動させて、前記複数のチャネルの第2のチャネルを前記複数のポンプの第2のポンプと流体接続することであって、前記第2のポンプが、第2のポンプチャネル流体ラインを介して前記第2のチャネルに流体接続される、流体接続することと、
    第2の体積の前記第1の試薬を前記第2のポンプチャネル流体ラインを介して前記第2のポンプを使用して前記第2のチャネル内にポンプ輸送することと、
    前記複数のポンプバルブの前記第2のポンプバルブを第2の位置に移動させて、前記第2のポンプ及び前記第2のポンプチャネル流体ラインを前記廃棄物リザーバと流体連通する前記共有流体ラインと流体接続することと、
    前記第2の体積の前記第1の試薬を前記共有流体ラインを介して前記廃棄物リザーバ内にポンプ輸送することと、を含む、方法。
  2. バイパスバルブを第1の位置に移動させて、バイパス流体ラインと前記ポンプマニホールドアセンブリのキャッシュとを流体結合することと、第3の体積の前記第1の試薬又は別の試薬を前記バイパス流体ラインを通して前記キャッシュ内にポンプ輸送することと、を更に含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記ポンプマニホールドアセンブリの前記複数のポンプバルブのうちの1つ以上、前記複数のポンプのうちの1つ以上、又はキャッシュバルブを作動させることと、前記共有流体ラインと、前記廃棄物リザーバと流体連通する主廃棄物流体ラインとの間、又は前記バイパス流体ラインと、前記主廃棄物流体ラインとの間のうちの少なくとも1つで試薬をポンプ輸送することと、を更に含む、請求項2に記載の方法。
  4. 前記ポンプマニホールドアセンブリの前記複数のポンプバルブのうちの1つ以上及び前記複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、前記フローセルの前記複数のチャネルのうちの1つ以上に対象とするサンプルを装填することを更に含む、請求項3に記載の方法。
  5. 前記複数のポンプのうちの前記1つ以上を動作させて、前記フローセルの前記複数のチャネルの前記チャネルのうちの1つ以上に前記対象とするサンプルを装填することが、前記対象とするサンプルを第1の方向に流すことを含み、前記ポンプマニホールドアセンブリの前記複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、前記フローセルの前記チャネルを通る試薬の流れを前記第1の方向とは反対の第2の方向に制御することを更に含む、請求項4に記載の方法。
  6. 前記ポンプマニホールドアセンブリの前記複数のポンプのうちの1つ以上を動作させて、前記フローセルの前記1つ以上のチャネルから補助廃棄物流体ライン内に前記対象とするサンプルを流すことを更に含み、前記補助廃棄物流体ラインが、前記フローセルインターフェースの上流にある、請求項5に記載の方法。
  7. 装置であって、
    複数のチャネルを有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、
    複数のポンプバルブ及び複数のポンプを支持し、複数のポンプチャネル流体ライン、複数のポンプ流体ライン、及び共有流体ラインを備えるポンプマニホールドアセンブリであって、前記ポンプバルブ及び前記ポンプが、対応するポンプチャネル流体ラインを介して前記フローセルの前記複数のチャネルの各チャネルを通る流体の流れを個別に制御するように動作可能であり、各ポンプバルブが、対応するポンプチャネル流体ライン、対応するポンプ流体ライン、及び前記共有流体ラインに結合され、前記複数のチャネルの対応するチャネル、対応するポンプチャネル流体ライン、及び対応するポンプ流体ラインを流体結合する第1の位置と、対応するポンプ流体ライン、前記共有流体ライン、及び廃棄物リザーバを流体結合する第2の位置との間で移動可能であり、各ポンプが、対応するポンプ流体ラインに結合されている、ポンプマニホールドアセンブリと、を備える、装置。
  8. 前記ポンプマニホールドアセンブリが、キャッシュを更に備え、バイパスバルブ及び前記バイパスバルブと前記キャッシュとを結合するバイパス流体ラインを更に備える、請求項7に記載の装置。
  9. 前記ポンプマニホールドアセンブリが、キャッシュバルブ及びキャッシュ流体ラインを更に備え、前記キャッシュバルブが、前記キャッシュ流体ライン及び前記共有流体ラインに結合されている、請求項8に記載の装置。
  10. 前記ポンプマニホールドアセンブリが、前記廃棄物リザーバに結合された主廃棄物流体ラインを更に備え、前記キャッシュバルブが、前記主廃棄物流体ラインに結合されている、請求項9に記載の装置。
  11. 前記ポンプマニホールドアセンブリが、前記ポンプチャネル流体ラインのうちの少なくとも1つ又は前記共有流体ライン、のうちの1つ以上の圧力値又は流量値のうちの1つ以上を判定するように適合された複数のセンサを更に備える、請求項7~10のいずれか一項に記載の装置。
  12. 前記複数のポンプを駆動するように動作可能な一対のポンプ駆動アセンブリを更に備える、請求項7~11のいずれか一項に記載の装置。
  13. サンプルカートリッジに結合されるように適合されたサンプルカートリッジインターフェースを更に備え、前記サンプルカートリッジインターフェースが、前記フローセルインターフェースの下流に配置されている、請求項7~12のいずれか一項に記載の装置。
  14. 前記フローセルインターフェースと前記サンプルカートリッジインターフェースとの間に配置され、かつ複数のサンプルバルブを支持し、かつ複数のサンプルポート、複数のフローセルポート、及び複数のポンプポートを画定する、本体を備える、サンプル装填マニホールドアセンブリを更に備え、各サンプルポートが、サンプル流体ラインを介して前記サンプルカートリッジインターフェースの対応するポートに結合されており、各フローセルポートが、前記フローセルインターフェースの対応するポートに結合され、フローセル流体ラインを介して前記フローセルの前記複数のチャネルの前記チャネルのうちの1つと関連付けられており、各ポンプポートが、前記複数のポンプチャネル流体ラインの対応するポンプチャネル流体ラインに結合されている、請求項13に記載の装置。
  15. 前記サンプル装填マニホールドアセンブリの前記サンプルバルブ及び前記ポンプマニホールドアセンブリのポンプが、前記フローセルの前記複数のチャネルの各チャネルに対象とするサンプルを個別に装填するように動作可能である、請求項14に記載の装置。
  16. 各サンプルバルブが、前記サンプルカートリッジのポートと前記ポンプマニホールドアセンブリの前記複数のポンプの対応するポンプとを流体連通させ、かつ前記ポンプマニホールドアセンブリの前記複数のポンプのポンプと前記フローセルの前記複数のチャネルの対応するチャネルとを流体連通させるように動作可能である、請求項14又は15に記載の装置。
  17. 中央バルブと、前記中央バルブに結合されており、前記廃棄物リザーバに結合されるように適合された補助廃棄物流体ラインと、を更に備え、前記補助廃棄物流体ラインが、前記フローセルインターフェースの上流に配置されている、請求項7~16のいずれか一項に記載の装置。
  18. 共有ラインバルブ、バイパスバルブ、複数の専用試薬流体ライン、及び共有試薬流体ラインを更に備え、前記共有試薬流体ラインが、前記共有ラインバルブと前記中央バルブとを結合しており、前記中央バルブを介して前記フローセルに1つ以上の試薬を流すように適合されており、各専用試薬流体ラインが、前記バイパスバルブと前記中央バルブとを結合しており、前記中央バルブを介して前記フローセルに試薬を流すように適合されている、請求項17に記載の装置。
  19. 装置であって、
    対応する試薬リザーバに結合されるように適合された1つ以上のバルブと、
    複数のチャネルを有するフローセルに結合されるように適合されたフローセルインターフェースと、
    複数のポンプ、複数のポンプバルブ、及びキャッシュを有するポンプマニホールドアセンブリであって、各ポンプが、前記フローセルの前記複数のチャネルの各チャネルの流体の流れを個別に制御するように動作可能である、ポンプマニホールドアセンブリと、
    前記1つ以上のバルブと前記キャッシュとの間に動作可能に結合されたバイパス流体ラインと、を備える、装置。
  20. 複数のサンプルバルブを有するサンプル装填マニホールドアセンブリを更に備え、各サンプルバルブ及び前記ポンプマニホールドアセンブリの対応するポンプが、前記フローセルの前記複数のチャネルの各チャネルに個別に装填するように動作可能であり、前記サンプル装填マニホールドアセンブリが、前記フローセルの下流に配置されている、請求項19に記載の装置。
  21. 前記複数のチャネルを有する前記フローセル及びフローセルマニホールドを含むフローセルアセンブリを更に備え、前記フローセルマニホールドが、入口と、複数の流体ラインと、複数の出口と、を含み、前記フローセルマニホールドの各出口が、前記フローセルの対応するチャネルに結合されている、請求項19又は20に記載の装置。
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