JP2022079931A - 画像処理方法及び画像処理プログラム - Google Patents
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Abstract
Description
最初に、実施形態に係る画像処理装置の撮像対象となる細胞構造体について概説する。細胞構造体は、例えば血管内皮細胞を含み、具体的な一例としては三次元類肝組織(3D肝モデル)である。3D肝モデルは、血管内皮細胞を含む間質細胞を有し、肝毒性を評価可能な組織である。3D肝モデルは、例えば、肝細胞を含み、かつ、線維芽細胞(例えば、肝星状細胞)、免疫細胞及び平滑筋細胞からなる群より選択される少なくとも1種の細胞と、血管内皮細胞と、を間質細胞として更に含む。細胞構造体は、細胞の足場材として機能する細胞外マトリックス成分を更に含んでもよく、その他の細胞構造体の形成をサポートする成分(例えば、高分子電解質)を含んでも良い。
図1は、実施形態に係る画像処理装置が備わる画像処理システムの機能の一例を示すブロック図である。図1に示されるように、画像処理システム2は、画像処理装置1、撮像装置110、第1記憶装置120、表示装置130、及び第2記憶装置140を備える。撮像装置110、第1記憶装置120、表示装置130、及び第2記憶装置140のそれぞれは、画像処理装置1と通信可能に設けられる。
次に、画像処理システム2の動作を説明する。最初に、画像処理装置1の処理対象となる撮像画像を取得する処理を説明する。図3は、実施形態に係る画像処理方法が対象とする画像の取得処理の一例を示すフローチャートである。図3に示す方法は、例えば、3D肝モデルの作製に係る細胞株、試薬及び消耗品などが用意された場合に開始される。
コンピュータを画像処理装置1として機能させるための画像処理プログラムを説明する。画像処理プログラムは、メインモジュール、取得モジュール、輪郭生成モジュール、及び骨格生成モジュールを備える。画像処理プログラムは、背景処理モジュール、及び形状検出モジュールを備えていてもよい。メインモジュールは、装置を統括的に制御する部分である。取得モジュール、輪郭生成モジュール、骨格生成モジュール、背景処理モジュール及び形状検出モジュールを実行させることにより実現される機能は、上述した画像処理装置1の取得部10、背景処理部20、輪郭抽出部30、骨格抽出部40、形状検出部50、及び表示制御部60の機能とそれぞれ同一である。
本実施形態に係る画像処理方法及び画像処理プログラムによれば、血管網構造を有する細胞構造体が撮像された画像が処理される。最初に、画像はウェーブレット変換が適用される。これにより、血管網構造の輪郭が抽出された輪郭画像が生成される(輪郭画像生成処理(S23))。続いて、輪郭画像において認識された物体の境界から物体のピクセルが繰り返し除外される。これにより、血管網構造の骨格が抽出された骨格画像が生成される(骨格画像生成処理(S25))。骨格画像が輪郭画像から生成されることにより、骨格画像が撮像画像から直接生成される場合と比べて、血管の形状をより正確に反映させた骨格が得られる。よって、この画像処理方法及び画像処理プログラムは、血管網構造の形状をより正確に把握することができる画像を生成できる。
図4に示されるフローチャートにおいて、輪郭画像生成処理(S23)を実行した場合と、輪郭画像生成処理(S23)を実行しない場合(あるいは他の処理を実行する場合)とで、結果として得られる骨格を比較した。図5の(a)~(f)は、輪郭画像生成処理及び骨格画像生成処理により取得された画像の一例を示す図である。以下では骨格画像生成処理(S25)直前の画像を元画像という。
図5の(a)は、輪郭画像生成処理(S23)を実行しなかった画像である。図5の(b)は、図5の(a)に示される画像を元画像として骨格画像生成処理(S25)を実行した画像(比較例1)である。図5の(b)に示されるように、元画像の血管網構造とは関係無く直線状の図形が表示され、骨格画像として血管網構造の骨格が適切に抽出されなかった。
図5の(c)は、図5の(a)に示される画像に対して、輪郭画像生成処理(S23)の代わりに、画素値の閾値を設定し、当該閾値以上の画素のみを白く表示し、当該閾値未満の画素を黒く表示するように二値化処理を行った画像である。図5の(d)は、図5の(c)に示される画像を元画像として骨格画像生成処理(S25)を実行した画像(比較例2)である。図5の(d)に示されるように、元画像とある程度一致した骨格が抽出された。しかしながら、例えば元画像の血管網構造の小規模な空洞を示す領域においては正確に骨格が抽出されておらず、元画像上の対応する箇所よりも著しく複雑な骨格のパターンが形成された。これは、二値化処理によって生成されたパターン上に、空洞となっている部分が存在していることが問題と考えられる。骨格画像生成処理は、画像内で認識されたオブジェクトのエッジ側から1ピクセルの幅になるまでオブジェクトを浸食する処理であるが、図5の(c)に示される元画像には白く抽出された全体のパターンの中の随所に小さな黒い点(穴)が存在している。骨格画像生成処理において、この穴をエッジの一部と認識してしまい、正確な骨格の抽出が阻害されていると考えられる。
図5の(e)は、図5の(a)に示される画像に対して、輪郭画像生成処理(S23)を実行した画像である。図5の(f)は、図5の(e)に示される画像を元画像として骨格画像生成処理(S25)を実行した画像(実施例1)である。図5の(e)に示されるように、図5の(a)に示される画像から血管の太さなどの情報は失われてしまうが、図5の(f)に示されるように、比較例1及び比較例2と比べて、元画像と一致した骨格が抽出され、特に、元画像の血管網構造の小規模な空洞を正確に表現した骨格が抽出された。このように、骨格画像生成処理で骨格を抽出する上では、必ずしも元画像の血管領域を正しく捉えられている必要はなく、おおよその輪郭さえ抽出できていればよいことが確認された。
画素値調整処理(S21)を実行した場合と、画素値調整処理(S21)を実行しない場合とで、結果として得られる骨格を比較した。図6の(a)~(d)は、階調変換処理、ノイズ除去処理、輪郭画像生成処理、及び骨格画像生成処理により取得された画像の一例を示す図である。図7の(a)~(d)は、画素値調整処理、輪郭画像生成処理、及び骨格画像生成処理により取得された画像の一例を示す図である。
図6の(a)は、階調変換処理(S17)によって生成された階調画像である。図6の(b)は、図6の(a)に示される階調画像に対してノイズ除去処理(S19)を実行して得られた除去画像である。図6の(c)は、図6の(b)に示される画像に対して画素値調整処理(S21)を実行せずに輪郭画像生成処理(S23)を実行した画像である。図6の(d)は、図6の(c)に示される画像に対して骨格画像生成処理(S25)を実行した画像(比較例3)である。図6の(d)に示されるように、画素値調整処理(S21)を実行しなかった場合、階調画像において血管網構造が明らかに視認されていない領域にまで他の血管網と繋がった血管網構造が表示されてしまい、輪郭画像として血管網構造の輪郭及び骨格が適切に抽出されなかった。これは、輪郭画像生成処理(S23)において、実際の血管領域とノイズとが区別されずに輪郭として抽出されたことに起因すると考えられる。
図7の(a)は、図6の(b)に示される除去画像と同一の除去画像に対して、画素値の分布を調整した状態の画像である。図7の(b)は、図7の(a)に示される画像の各画素の画素値に対して予め定められた画素値を減算した画像である。つまり、図7の(a)は、画素値調整処理(S21)における中間画像であり、図7の(b)は、画素値調整処理(S21)が完了して得られる調整画像である。図7の(c)は、図7の(b)に示される画像に対して輪郭画像生成処理(S23)を実行して得られた輪郭画像である。図7の(d)は、図7の(c)に示される輪郭画像に対して骨格画像生成処理(S25)を実行した画像(実施例2)である。
次に、抽出画像生成処理(S29)を実行した場合と、抽出画像生成処理(S29)を実行しない場合とで、結果として得られる骨格を比較した。図8の(a)は、撮像画像である。図8の(b)は、抽出画像生成処理(S29)の実行前の骨格画像(比較例4)である。図8の(c)は、抽出画像生成処理(S29)の実行後の抽出画像(実施例3)である。
実施形態に記載の作製処理において作製された3D肝モデル(細胞構造体)に対してシクロフォスファミドを各濃度で暴露したサンプル群の血管網の定量的な評価について説明する。図9の(a)~(f)は、図3に示されるフローチャートにより取得された撮像画像であり、それぞれシクロフォスファミドの投薬濃度が0μM、143μM、430μM、1430μM、4300μM及び14300μMである。図9の(g)~(l)は、図9の(a)~(f)に示される撮像画像に対して、図4に示されるフローチャート内の各処理を実行した結果得られた抽出画像である。
Claims (10)
- 発色させた血管網構造を有する細胞構造体が撮像された画像を取得するステップと、
ウェーブレット変換を前記画像に適用し、前記血管網構造の輪郭が抽出された輪郭画像を生成するステップと、
前記輪郭画像において認識された物体の境界から前記物体のピクセルを繰り返し除外し、所定ピクセル数の線幅を有する骨格が抽出された骨格画像を生成するステップと、
を含む、画像処理方法。 - 前記骨格画像に基づいて前記血管網構造の形状を検出するステップをさらに含む、請求項1に記載の画像処理方法。
- 前記血管網構造の形状は、前記血管網構造の長さである、請求項2に記載の画像処理方法。
- 前記画像は、前記細胞構造体の中心を含む領域が撮像された画像である、請求項1~3の何れか一項に記載の画像処理方法。
- 前記取得するステップの後、かつ、前記輪郭画像を生成するステップの前に実行され、前記画像の背景信号を除去した画像を生成するステップをさらに含む、請求項1~4の何れか一項に記載の画像処理方法。
- 前記骨格画像を生成するステップの後に実行され、前記骨格画像に描画された前記骨格のうち長さが閾値より大きい前記骨格が抽出された抽出画像を生成するステップをさらに含む、請求項1~5の何れか一項に記載の画像処理方法。
- 前記取得するステップの後、かつ、前記輪郭画像を生成するステップの前に実行され、前記画像を所定階調の画像に変換するステップをさらに含む、請求項1~6の何れか一項に記載の画像処理方法。
- 前記取得するステップの前に実行され、前記血管網構造を有する細胞を免疫染色させ、前記血管網構造を有する細胞を予め蛍光修飾させ、又は免疫染色及び蛍光修飾の組み合わせにより、前記血管網構造を発色させるステップと、
前記発色させるステップにより発色した前記血管網構造を有する細胞構造体を撮像するステップと、
をさらに含み、
前記取得するステップは、前記撮像するステップによって撮像された画像を取得する、請求項1~7の何れか一項に記載の画像処理方法。 - 前記細胞構造体は、血管内皮細胞を有する、請求項1~8の何れか一項に記載の画像処理方法。
- 発色させた血管網構造を有する細胞構造体が撮像された画像を取得するステップと、
ウェーブレット変換を前記画像に適用し、前記血管網構造の輪郭が抽出された輪郭画像を生成するステップと、
前記輪郭画像に描画された物体の境界から前記物体のピクセルを繰り返し除外し、所定ピクセル数の線幅を有する骨格が抽出された骨格画像を生成するステップと、
をコンピュータに実行させる画像処理プログラム。
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