JP2020529777A - 大規模、高密度、高ノイズネットワークから構造を抽出するためのシステム及び方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2017年8月1日に出願された「大規模、高密度、高ノイズネットワークにおける構造を抽出するためのシステム及び方法(Systems and Methods for Extracting Structure in Large, Dense and Noisy Networks)」という名称の米国仮特許出願第62/539,758号に対する優先権を主張する、2018年7月31日に出願された「大規模、高密度、高ノイズネットワークから構造を抽出するためのシステム及び方法(Systems and Methods for Extracting Structure from Large, Dense, and Noisy Networks)」という名称の米国特許出願第16/050,138号の利益を主張するものであり、この文献の内容はその全体が引用により本明細書に組み入れられる。
表1
表2
ここでの第2の等式は、
ここでの
この方程式は、モジュラリティ行列(modularity matrix)と呼ばれる。なお、行列の行及び列の各々の要素を合計すると、常に固有値0の固有ベクトル(1,1,1,...)を
この結果、以下のように表せる方程式4を見出すことができ、
固有値がβ1≧β2≧…βnという減少順でラベル付けされると仮定する。
適切な分割を選択することにより、モジュラリティを最大化することである。このことは、最大の(すなわち最も大きな正の)固有値を伴う方程式4の合計に関してできるだけ
比例するように選択することもできる。これにより、固有ベクトルが直交するので、最大固有値β1を伴う項に全ての重みが加えられ、他の項は自動的にゼロになる。
si=+1に設定し、そうでなければsi=−1に設定することによって実現される。換言すれば、対応する要素が正である全てのノードが1つのグループに入り、残りは全て他のグループに入る。これにより、ネットワークを分割するアルゴリズムが得られる。すなわち、このアルゴリズムは、モジュラリティ行列の主要固有ベクトル(leading eigenvector)を計算し、このベクトルの要素の符号に従ってノードを2つのグループに分割する。説明するアルゴリズムは、主要固有ベクトルの要素の符号のみを利用するが、その大きさも情報を伝える。大きさが大きな要素に対応するノードは、(例えば、方程式4によって示すように)モジュラリティに大きく寄与し、小さな要素については逆である。或いは、ネットワークを2つのグループに最適に分割することができ、ノードを1つのグループから他のグループに移動させる場合、このノードのベクトル要素は、モジュラリティがどれほど減少するかについて示唆し、大きさが大きな要素に対応するノードは、大きなモジュラリティペナルティを伴わないと移動できないのに対し、小さな要素に対応するノードは、比較的低コストで移動することができる。従って、主要固有ベクトルの要素は、各ノードが割り当て先のコミュニティにいかにしっかりと属しているかについての測定単位となり、大きなベクトル要素を有するノードは、そのコミュニティの強力な中心メンバであるのに対し、小さな要素を有するノードは両面性が高い。
すると、Sの伝導性はφ=s/v、又は同等にφ=s/(s+2e)であり、ここでのeは、両エンドポイントSを有するエッジの数である。より形式的には、AがグラフGの隣接行列である場合、以下のようになり、
ここでは
Claims (20)
- ネットワークから構造を抽出する方法であって、
複数のノードと、該複数のノードのうちの1又は複数のノードを互いに連結して、連結されたノード間の関係の強さを定める1又は複数のエッジとを含むネットワークを規定するエッジリストをプロセッサにより受け取るステップと、
所定のフィルタパラメータに基づいて前記エッジリストから1又は複数のノードをプロセッサによりフィルタ処理することによって、フィルタ処理済みネットワークを形成するステップと、
ダイクストラ法を利用して、前記フィルタ処理済みネットワーク内の1又は複数の異なる連結成分を識別するステップと、
前記フィルタ処理済みネットワークの前記1又は複数の異なる連結成分の各々を、前記1又は複数の異なる連結成分内における追加構造の存在について分析するステップであって、前記追加構造は更なる異なる連結成分に分解される、ステップと、
前記異なる連結成分の各々のツリー走査を実行するステップであって、前記ツリー走査からの結果として得られた階層構造は局所的モジュラリティ最適条件を決定するために融合される、ステップと、
前記局所的モジュラリティ最適条件に応答して、前記ネットワーク内の1又は複数の構造成分を生成するステップと、
を含む方法。 - 第2の所定のフィルタパラメータに基づいて前記ネットワークをフィルタ処理するか否かを決定するステップと、
前記ネットワーク内の前記1又は複数の構造成分のノード間の伝導性に基づいて、前記方法の別の反復を完了するステップと、
を更に含む、請求項1に記載の方法。 - 第1の反復における前記所定のフィルタパラメータは、第2の反復における第2の所定の連結数よりも少ない第1の所定の連結数を含む、請求項2に記載の方法。
- 前記ツリー走査を実行した後に、前記所定のフィルタパラメータに基づいてフィルタ処理された前記1又は複数のノードのうちのフィルタ処理済みノードを再接続させるステップを更に含み、前記フィルタ処理済みノードを再接続させるステップは投票プロセスに基づき、前記フィルタ処理済みノードは、前記フィルタ処理済みノードと、前記1又は複数の構造成分の前記1又は複数のノードとの間の関係の強さに基づいて、前記1又は複数の構造成分のうちの1つの構造成分に再接続される、請求項1に記載の方法。
- 前記1又は複数のエッジの各々の長さは、連結されたノードの間の関係の強さに反比例する、請求項1に記載の方法。
- 前記1又は複数の異なる連結成分の各成分を分析するステップは、モジュラリティスペクトル分解法を利用する、請求項1に記載の方法。
- 前記所定のフィルタパラメータは、ノードに連結されたエッジの数を定める所定の値である、請求項1に記載の方法。
- ネットワークから構造を抽出するためのシステムであって、
プロセッサと、
前記プロセッサに結合されて機械可読命令セットを記憶した非一時的プロセッサ可読メモリと、
を含み、前記機械可読命令セットは、前記プロセッサによって実行されたときに、該プロセッサに、
複数のノードと、該複数のノードのうちの1又は複数のノードを互いに連結して、連結されたノード間の関係の強さを定める1又は複数のエッジとを含むネットワークを規定するエッジリストを受け取ることと、
所定のフィルタパラメータに基づいて前記エッジリストから1又は複数のノードをフィルタ除去することによって、フィルタ処理済みネットワークを形成することと、
ダイクストラ法を利用して、前記フィルタ処理済みネットワーク内の1又は複数の異なる連結成分を識別することと、
前記フィルタ処理済みネットワークの前記1又は複数の異なる連結成分の各々を、前記1又は複数の異なる連結成分内における追加構造の存在について分析することであって、前記追加構造は更なる異なる連結成分に分解される、分析することと、
前記異なる連結成分の各々のツリー走査を実行することであって、前記ツリー走査からの結果として得られた階層構造は局所的モジュラリティ最適条件を決定するために融合される、実行することと、
前記局所的モジュラリティ最適条件に応答して、前記ネットワーク内の1又は複数の構造成分を生成することと、
を行わせる、システム。 - 前記機械可読命令セットは、実行時に、前記プロセッサに、
第2の所定のフィルタパラメータに基づいて前記ネットワークをフィルタ処理するか否かを決定することと、
前記ネットワーク内の前記1又は複数の構造成分のノード間の伝導性に基づいて、前記方法の別の反復を完了することと、
を更に行わせる、請求項8に記載のシステム。 - 第1の反復における前記所定のフィルタパラメータは、第2の反復における第2の所定の連結数よりも少ない第1の所定の連結数を含む、請求項9に記載のシステム。
- 前記機械可読命令セットは、実行時に、前記プロセッサに、前記ツリー走査を実行した後に、前記所定のフィルタパラメータに基づいてフィルタ処理された前記1又は複数のノードのうちのフィルタ処理済みノードを再接続させることを更に行わせ、前記フィルタ処理済みノードを再接続させることは投票プロセスに基づき、前記フィルタ処理済みノードは、前記フィルタ処理済みノードと、前記1又は複数の構造成分の前記1又は複数のノードとの間の関係の強さに基づいて、前記1又は複数の構造成分のうちの1つの構造成分に再接続される、請求項8に記載のシステム。
- 前記1又は複数のエッジの各々は、連結されたノード間の関係の強さを定める値を含む、請求項8に記載のシステム。
- 前記1又は複数の異なる連結成分の各成分の分析は、モジュラリティスペクトル分解法を利用する、請求項8に記載のシステム。
- 前記所定のフィルタパラメータは、ノードに連結されたエッジの数を定める所定の値である、請求項8に記載のシステム。
- 前記1又は複数のエッジのうちの第1のエッジは、第1の長さを含み、前記1又は複数のエッジのうちの第2のエッジは、前記第1のエッジの前記第1の長さよりも長い第2の長さを含み、前記第2のエッジよりも短い長さを有する前記第1の長さよりも弱い関係を定める、請求項8に記載のシステム。
- ネットワークから構造を抽出するための、命令を含むコンピュータプログラム製品であって、該命令は、コンピュータによって実行されたときに、該コンピュータに、
複数のノードと、該複数のノードのうちの1又は複数のノードを互いに連結して、連結されたノード間の関係の強さを定める1又は複数のエッジとを含むネットワークを規定するエッジリストを受け取るステップと、
所定のフィルタパラメータに基づいて前記エッジリストから1又は複数のノードをフィルタ除去することによって、フィルタ処理済みネットワークを形成するステップと、
ダイクストラ法を利用して、前記フィルタ処理済みネットワーク内の1又は複数の異なる連結成分を識別するステップと、
前記フィルタ処理済みネットワークの前記1又は複数の異なる連結成分の各々を、前記1又は複数の異なる連結成分内における追加構造の存在について分析するステップであって、前記追加構造は更なる異なる連結成分に分解される、ステップと、
前記異なる連結成分の各々のツリー走査を実行するステップであって、前記ツリー走査からの結果として得られた階層構造は局所的モジュラリティ最適条件を決定するために融合される、ステップと、
前記局所的モジュラリティ最適条件に応答して、前記ネットワーク内の1又は複数の構造成分を生成するステップと、
を実行させる、コンピュータプログラム製品。 - 第2の所定のフィルタパラメータに基づいて前記ネットワークをフィルタ処理するか否かを決定するステップと、
前記ネットワーク内の前記1又は複数の構造成分のノード間の伝導性に基づいて、前記方法の別の反復を完了するステップと、
を更に含む、請求項16に記載のコンピュータプログラム。 - 第1の反復における前記所定のフィルタパラメータは、第2の反復における第2の所定の連結数よりも少ない第1の所定の連結数を含む、請求項17に記載のコンピュータプログラム。
- 前記ツリー走査を実行した後に、前記所定のフィルタパラメータに基づいてフィルタ処理された前記1又は複数のノードのうちのフィルタ処理済みノードを再接続させるステップを更に含み、前記フィルタ処理済みノードを再接続させるステップは投票プロセスに基づき、前記フィルタ処理済みノードは、前記フィルタ処理済みノードと、前記1又は複数の構造成分の前記1又は複数のノードとの間の関係の強さに基づいて、前記1又は複数の構造成分のうちの1つの構造成分に再接続される、請求項16に記載のコンピュータプログラム。
- 前記分析するステップは、モジュラリティスペクトル分解法を利用する、請求項16に記載のコンピュータプログラム。
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