JP2020193952A - Method of determining presence of lung adenocarcinoma, analysis method, marker molecule and fragment thereof to be used therefor - Google Patents

Method of determining presence of lung adenocarcinoma, analysis method, marker molecule and fragment thereof to be used therefor Download PDF

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Akira Togayanai
晶 栂谷内
敦 久野
Atsushi Kuno
敦 久野
裕之 梶
Hiroyuki Kaji
裕之 梶
成松 久
Hisashi Narimatsu
久 成松
雅之 野口
Masayuki Noguchi
雅之 野口
亮太 松岡
Ryota Matsuoka
亮太 松岡
徳彦 池田
Norihiko Ikeda
徳彦 池田
俊孝 長尾
Toshitaka Nagao
俊孝 長尾
純一 前田
Junichi Maeda
純一 前田
康雄 櫻井
Yasuo Sakurai
康雄 櫻井
斉湖 吉村
Saiko Yoshimura
斉湖 吉村
省一 金山
Shoichi Kanayama
省一 金山
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Abstract

To provide a marker molecule and fragment thereof for determining whether a subject has lung adenocarcinoma or not, a method of determining the presence of lung adenocarcinoma, and an analysis method.SOLUTION: A marker molecule according to an embodiment is used to determine whether a subject has lung adenocarcinoma or not. The marker molecule is heat shock protein 47 or sulfatase-modifying factor 2.SELECTED DRAWING: Figure 1

Description

本発明の実施形態は、肺腺癌罹患判定方法、分析方法、並びにそれに使用するマーカー分子及びその断片に関する。 Embodiments of the present invention relate to a method for determining morbidity with lung adenocarcinoma, a method for analysis, and a marker molecule and a fragment thereof used therein.

日本国内における肺癌の罹患数は癌の中で2番目に多く、毎年10万人以上が罹患している。また、肺癌による死亡者数は癌の中で最も多く、毎年7万人である。肺癌の中で、肺腺癌の罹患者数は約半分の割合を占める。肺腺癌は進行が速く早期発見は難しい。従来の肺腺癌の診断方法、治療方法では生存率の改善には至っておらず、5年後の生存率は40%以下である。したがって、肺腺癌を早期に発見する方法が求められている。 The number of lung cancers in Japan is the second highest among cancers, affecting more than 100,000 people every year. In addition, the number of deaths from lung cancer is the highest among cancers, which is 70,000 every year. Among lung cancers, the number of people with lung adenocarcinoma accounts for about half. Lung adenocarcinoma progresses quickly and is difficult to detect early. The conventional diagnostic and therapeutic methods for lung adenocarcinoma have not improved the survival rate, and the survival rate after 5 years is 40% or less. Therefore, there is a need for a method for early detection of lung adenocarcinoma.

本発明が解決しようとする課題は、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別するための肺腺癌罹患判定方法、分析方法、並びにそれに使用するマーカー分子及びその断片を提供することである。 An object to be solved by the present invention is to provide a lung adenocarcinoma disease determination method, an analysis method, and a marker molecule and a fragment thereof for identifying whether or not a subject has lung adenocarcinoma. Is.

実施形態に従うマーカー分子は、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別するためのマーカー分子である。マーカー分子は、ヒートショックプロテイン47又はスルファターゼ修飾因子2である。 The marker molecule according to the embodiment is a marker molecule for identifying whether or not the subject has lung adenocarcinoma. The marker molecule is heat shock protein 47 or sulfatase modifier 2.

図1は、実施形態の肺腺癌罹患判定方法の一例を示すフローチャートである。FIG. 1 is a flowchart showing an example of the lung adenocarcinoma morbidity determination method of the embodiment. 図2は、実施形態の肺腺癌罹患判定方法の一例を示すフローチャートである。FIG. 2 is a flowchart showing an example of the lung adenocarcinoma morbidity determination method of the embodiment. 図3は、実施形態の分析方法の一例を示すフローチャートである。FIG. 3 is a flowchart showing an example of the analysis method of the embodiment. 図4は、実施形態の分析方法の一例を示すフローチャートである。FIG. 4 is a flowchart showing an example of the analysis method of the embodiment. 図5は、マーカータンパク質分子の発現解析の実験結果を示す電気泳動(ウェスタンブロッティング解析像)の写真である。FIG. 5 is a photograph of electrophoresis (Western blotting analysis image) showing the experimental results of the expression analysis of the marker protein molecule. 図6は、マーカータンパク質分子の発現解析の実験結果を示す顕微鏡写真である。FIG. 6 is a photomicrograph showing the experimental results of the expression analysis of the marker protein molecule. 図7は、マーカータンパク質分子の発現解析の実験結果を示す顕微鏡写真である。FIG. 7 is a photomicrograph showing the experimental results of the expression analysis of the marker protein molecule. 図8は、マーカータンパク質分子の発現解析の実験結果を示す電気泳動(ウェスタンブロッティング解析像)の写真である。FIG. 8 is a photograph of electrophoresis (Western blotting analysis image) showing the experimental results of the expression analysis of the marker protein molecule.

実施形態によれば、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別するためのマーカー分子が提供される。マーカー分子は、ヒートショックプロテイン47(HSP47)又はスルファターゼ修飾因子2(SUMF2)である。また、他の実施形態によれば、糖鎖を更に備えるマーカー分子が提供される。更に他の実施形態によれば、試料中のマーカー分子又はその断片を検出又は定量することを含む肺腺癌罹患判定方法及び分析方法が提供される。 According to embodiments, marker molecules are provided to identify whether a subject has lung adenocarcinoma. The marker molecule is heat shock protein 47 (HSP47) or sulfatase modifier 2 (SUMF2). Also, according to other embodiments, a marker molecule further comprising a sugar chain is provided. According to still another embodiment, there is provided a method for determining morbidity and analysis of lung adenocarcinoma, which comprises detecting or quantifying a marker molecule or a fragment thereof in a sample.

以下、実施形態のマーカー分子、肺腺癌罹患判定方法及び分析方法について説明する。 Hereinafter, the marker molecule of the embodiment, the method for determining the morbidity of lung adenocarcinoma, and the method for analysis will be described.

・マーカー分子
実施形態に従うマーカー分子は、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別するためのマーカー分子である。
-Marker molecule A marker molecule according to an embodiment is a marker molecule for identifying whether or not a subject has lung adenocarcinoma.

対象は、分析に供される動物、即ち、後述する試料を提供する動物である。対象は、何らかの疾患を有する動物であってもよいし、健常な動物であってもよい。例えば、対象は、肺癌に罹患している可能性がある動物又は肺癌に罹患した動物である。動物は、例えば、哺乳類である。哺乳類は、例えば、サル及びヒト等の霊長類、マウス、ラット及びモルモット等の齧歯類、イヌ、ネコ及びウサギ等の伴侶動物、ウマ、ウシ及びブタ等の家畜動物、或いは展示動物などに属する動物である。 The subject is an animal to be analyzed, i.e., an animal that provides a sample described below. The subject may be an animal having some disease or a healthy animal. For example, the subject is an animal that may have lung cancer or an animal that has lung cancer. Animals are, for example, mammals. Mammals belong to, for example, primates such as monkeys and humans, rodents such as mice, rats and guinea pigs, companion animals such as dogs, cats and rabbits, domestic animals such as horses, cows and pigs, or exhibited animals. It is an animal.

肺腺癌は、非小細胞肺癌のうち、浸潤性腺癌、前浸潤性病変、微小浸潤性腺癌等に分けられる肺癌の1つである。 Lung adenocarcinoma is one of non-small cell lung cancers, which is classified into invasive adenocarcinoma, preinvasive lesion, microinvasive adenocarcinoma and the like.

実施形態に従うマーカー分子はSerpin H1で、遺伝子「serpin family H member 1」(国立生物工学情報センター(NCBI)のGene ID 871)にコードされるタンパク質であり、47 kDa heat shock protein、Arsenic-transactivated protein 3、Cell proliferation-inducing gene 14 protein、Rheumatoid arthritis-related antigen RA-A47などとも称される。以下では、このマーカー分子を「HSP47」又は「ヒートショックプロテイン47」と称する。 The marker molecule according to the embodiment is Serpin H1, a protein encoded by the gene "serpin family H member 1" (Gene ID 871 of the National Center for Bioengineering Information (NCBI)), 47 kDa heat shock protein, Arsenic-transactivated protein. 3, Cell proliferation-inducing gene 14 protein, Rheumatoid arthritis-related antigen RA-A47, etc. Hereinafter, this marker molecule will be referred to as “HSP47” or “heat shock protein 47”.

或いは、マーカー分子は、スルファターゼ修飾因子2(Sulfatase−modifying factor 2)で、遺伝子「sulfatase modifying factor 2」(国立生物工学情報センター(NCBI)のGene ID 25870)にコードされるタンパク質であり、C-alpha-formylglycine-generating enzyme 2とも称される。以下ではこのマーカー分子を「SUMF2」と称する。 Alternatively, the marker molecule is a sulfatase-modifying factor 2 and is a protein encoded by the gene "sulfatase modeling factor 2" (National Center for Biotechnology Information (NCBI) Gene ID 25870). Also called alpha-formylglycine-generating enzyme 2. Hereinafter, this marker molecule will be referred to as "SUMF2".

なお、上記のタンパク質と45%以上のアミノ酸配列相同性を持つタンパク質アイソフォームを実施形態のマーカー分子とみなしてもよい。80%以上の相同性を持てばより好ましい。90%以上の相同性を持てば更に好ましい。 A protein isoform having 45% or more amino acid sequence homology with the above protein may be regarded as the marker molecule of the embodiment. It is more preferable to have a homology of 80% or more. It is more preferable to have a homology of 90% or more.

更なる実施形態において、マーカー分子は、糖鎖を備えるHSP47又はSUMF2であってもよい。糖鎖は、Hippeastrum Hybrid Lectin(HHL)に対して結合能を有する糖鎖(以下、「HHL結合性糖鎖」と称する)である。HHLは、アマリリスレクチン(AL)とも称されるレクチンである。HHLに対して結合能を有することが確認されている糖鎖は、例えば、Lectin Frontier Database(https://acgg.asia/lfdb2/index.action?request_locale=en)に示されている。 In a further embodiment, the marker molecule may be HSP47 or SUMF2 with a sugar chain. The sugar chain is a sugar chain having a binding ability to Hippeastrum Hybrid Lectin (HHL) (hereinafter, referred to as “HHL binding sugar chain”). HHL is a lectin also called amaryllis lectin (AL). Sugar chains that have been confirmed to have binding ability to HHL are shown, for example, in the Lectin Frontier Database (https://acgg.asia/lfdb2/index.action?request_locale=en).

糖鎖は、HSP47又はSUMF2に含まれるアスパラギンに結合している。本発明の発明者らは、肺腺癌の臨床試料におけるHSP47又はSUMF2は、正常な試料の場合と比較して、以下の表1に示す特定の位置のアスパラギンに上記糖鎖が結合していることを見出した。表中、「糖鎖付加位置周辺のペプチド配列」の下線は、「糖鎖付加位置」のN(アスパラギン)残基を示す。

Figure 2020193952
The sugar chain is bound to asparagine contained in HSP47 or SUMF2. The inventors of the present invention found that HSP47 or SUMF2 in a clinical sample of lung adenocarcinoma has the above-mentioned sugar chain bound to asparagine at a specific position shown in Table 1 below as compared with the case of a normal sample. I found that. In the table, the underline of "peptide sequence around the glycosylated position" indicates the N (asparagine) residue of the "glycosylated position".
Figure 2020193952

糖鎖は、例えば、HSP47又はSUMF2に含まれる表1に記載の「糖鎖付加位置周辺のペプチド配列」に相当するアミノ酸配列のNXT又はNXSのN(アスパラギン)に結合している(NXT又はNXSはアスパラギン結合型糖鎖付加位置のコンセンサス配列である)。ここで、Xは任意のアミノ酸である。上述しHSP47又はSUMF2のアイソフォームにおいては、糖鎖は、例えば、該アイソフォームの、表1の「糖鎖付加位置周辺のペプチド配列」に相当する配列のアスパラギンに結合していてもよい。 The sugar chain is bound to N (asparagine) of NXT or NXS of the amino acid sequence corresponding to the "peptide sequence around the glycosylation position" shown in Table 1 contained in, for example, HSP47 or SUMF2 (NXT or NXS). Is a consensus sequence of asparagine-linked glycosylated positions). Here, X is an arbitrary amino acid. In the above-mentioned isoform of HSP47 or SUMF2, the sugar chain may be bound to, for example, asparagine having a sequence corresponding to the “peptide sequence around the sugar chain addition position” in Table 1 of the isoform.

例えば、HSP47の主要なトランスクリプト(Gene ID 871)では、糖鎖は、120位及び/または125位のアスパラギンに結合している。 For example, in the major transcript of HSP47 (Gene ID 871), the sugar chain is bound to asparagine at positions 120 and / or 125.

SUMF2は、例えば、1分子につき1箇所の糖鎖付加位置を含む。 SUMF2 contains, for example, one sugar chain addition position per molecule.

・マーカー分子の断片
マーカー分子は、タンパク質の断片であってもよい。断片は、HSP47又はSUMF2の一部からなるオリゴペプチド又はポリペプチドの断片である。マーカー分子の断片は例えば、これらのタンパク質をトリプシン消化した際に得られる断片であってもよい。断片のアミノ酸の長さは、特に限定はしないが、好ましくは、5〜100アミノ酸、8〜80アミノ酸又は8〜50アミノ酸である。
-Shards of marker molecules The marker molecules may be fragments of proteins. The fragment is a fragment of an oligopeptide or polypeptide consisting of a part of HSP47 or SUMF2. The fragment of the marker molecule may be, for example, a fragment obtained when these proteins are trypsin digested. The length of the amino acid of the fragment is not particularly limited, but is preferably 5 to 100 amino acids, 8 to 80 amino acids, or 8 to 50 amino acids.

例えば、マーカー分子の断片は、糖鎖付加位置のアスパラギン残基を少なくとも1つ含む。このような断片の前記アスパラギン残基には、HHL結合性糖鎖が結合していてもよい。例えば、HSP47の断片は、そのアミノ酸配列中に120位及び/又は125位のアスパラギン残基を含み、そこに糖鎖が結合している。或いは、SUMF2の断片は配列NRTを含み、そのNに糖鎖が結合している。 For example, a fragment of a marker molecule contains at least one asparagine residue at the glycosylated position. An HHL-binding sugar chain may be bound to the asparagine residue of such a fragment. For example, the fragment of HSP47 contains asparagine residues at positions 120 and / or 125 in its amino acid sequence, to which sugar chains are bound. Alternatively, the fragment of SUMF2 contains the sequence NRT, to which a sugar chain is attached.

断片は、上述したHSP47又はSUMF2のアイソフォームの断片であってもよい。アイソフォーム断片は、例えば、表1の「糖鎖付加位置周辺のペプチド配列」に相当する配列のアスパラギンを少なくとも1つ含み、そこに糖鎖が結合したものであってもよい。マーカー分子は、上記HSP47又はSUMF2の断片と、更なるペプチドとを含むものであってもよい。 The fragment may be a fragment of the above-mentioned HSP47 or SUMF2 isoform. The isoform fragment may contain, for example, at least one asparagine having a sequence corresponding to the “peptide sequence around the sugar chain addition position” in Table 1, and a sugar chain may be bound thereto. The marker molecule may contain the fragment of HSP47 or SUMF2 and an additional peptide.

本発明の発明者らは、以上に説明した実施形態のマーカー分子が肺腺癌の病変から発現、又はより多く発現し、正常な肺の組織では発現しない、又は発現量がより少ないことを見出した。したがって、実施形態のマーカー分子又はその断片を用いることによって、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別することができる。 The inventors of the present invention have found that the marker molecules of the embodiments described above are expressed or more expressed from lesions of lung adenocarcinoma and not expressed or expressed less in normal lung tissue. It was. Therefore, by using the marker molecule of the embodiment or a fragment thereof, it is possible to identify whether or not the subject has lung adenocarcinoma.

・肺腺癌罹患判定方法
実施形態の肺腺癌罹患判定方法は、対象由来の試料から、マーカー分子、即ち、HSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量することによって、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定することを含む。
-Lung adenocarcinoma morbidity determination method In the lung adenocarcinoma morbidity determination method of the embodiment, the subject is lung adenocarcinoma by detecting or quantifying a marker molecule, that is, HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof from a sample derived from the subject. Includes determining whether or not you have the disease.

図1は、当該肺腺癌罹患判定方法の一例を示す概略フローチャートである。当該肺腺癌罹患判定方法の一例は、以下の工程を含む:(S1)対象由来の試料を用意すること、(S2)試料からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量すること、及び(S4)前記検出又は定量の結果に従って、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定すること。 FIG. 1 is a schematic flowchart showing an example of the lung adenocarcinoma morbidity determination method. An example of the lung adenocarcinoma morbidity determination method includes the following steps: (S1) preparing a sample derived from the subject, (S2) detecting or quantifying HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof from the sample, and (S4) To determine whether or not the subject has lung adenocarcinoma according to the result of the detection or quantification.

工程(S1)において、対象由来の試料を用意する。試料は、例えば、対象の体液、細胞、組織又は肺洗浄液であることが好ましい。体液は、例えば、血液、血清、血球、血漿、間質液、尿、便、汗、唾液、口腔内粘膜、喀痰、リンパ液、髄液、涙液、母乳、羊水、精液、細胞の抽出液又は胸水などである。体液は、血液、血清、血漿、間質液、リンパ液、細胞の抽出液、痰又は胸水であることが好ましい。細胞は、対象から採取され、培養された細胞又はその上清であってもよい。また、細胞株化した培養細胞でもよい。試料は、手術などの治療時や内視鏡などによる検査時の洗浄液も含む。 In the step (S1), a sample derived from the target is prepared. The sample is preferably, for example, a body fluid, cell, tissue or lung lavage fluid of interest. Body fluids include, for example, blood, serum, blood cells, plasma, interstitial fluid, urine, stool, sweat, saliva, oral mucosa, sputum, lymph, cerebrospinal fluid, tears, breast milk, sheep water, semen, cell extracts or For example, cerebrospinal fluid. The body fluid is preferably blood, serum, plasma, interstitial fluid, lymph, cell extract, sputum or pleural effusion. The cell may be a cell collected from a subject and cultured, or a supernatant thereof. Further, it may be a cell-lined cultured cell. The sample also includes a cleaning solution during treatment such as surgery or examination by an endoscope or the like.

試料は、対象から採取したものを必要に応じて希釈若しくは濃縮、ヘパリンのような血液凝固阻止剤の添加又は抽出等の処理を行なった後に使用してもよい。或いは、そのような前処理を行なうことなく、そのまま使用してもよい。試料の採取は、当該分野の公知の方法に基づいて行なえばよい。試料は、採取後直ちに利用してもよいし、培養したものであってもよいし、冷凍又は冷蔵により一定期間保存した後、必要に応じて解凍等の処理を行なったものであってもよい。 The sample may be used after treatment such as diluting or concentrating the sample collected from the subject, adding or extracting a blood coagulation inhibitor such as heparin, as necessary. Alternatively, it may be used as it is without performing such pretreatment. The sample may be collected based on a method known in the art. The sample may be used immediately after collection, may be cultured, or may be stored for a certain period of time by freezing or refrigerating, and then thawed or the like as necessary. ..

工程(S2)において、試料からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量する。この工程は、特定のタンパク質を検出又は定量する公知の何れかの方法を用いて行うことができる。例えば、検出又は定量は、マーカー分子と結合するレクチン、抗体、ペプチド及びアプタマーからなる群から選択されるプローブを用いて行われる。また例えば、質量分析等の分析対象タンパク質を直接検出する方法、或いは分析対象タンパク質を抗体などの分子プローブに結合させて得られた複合体を検出する方法により行われる。そのような方法は、例えば、凝固時間法;希釈ラッセル蛇毒法;Bethesda法;フローサイトメトリー法;プロテアーゼ法、免疫阻害法、G3−CNP法、DGGR基質法、TMP基質法、発色性合成基質法などの酵素法(UV法);ビウレット法、BCG法、BCP改良法、笠原法、カラーレート法、合成基質比色法などの比色法;RIA固相法、EIA法、ELISA法、CLIA法、CLEIA法などの抗体標識法;免疫比濁法(TIA法)、Latex近赤外比濁法(LPIA)、ネフェロメトリー法(NIA法)などの沈着法;ラテックス凝集法(LA法)、固定血小板凝集法などの凝集法;SDS-PAGE法、キャピラリー電気泳動法、二次元電気泳動法などの電気泳動法;HPLC法、ウエスタンブロット法、ドットブロット法などの分析系;試験紙法;ピロガロールレッド法;スルホサリチル酸法などを含む。 In the step (S2), HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof is detected or quantified from the sample. This step can be performed using any known method of detecting or quantifying a particular protein. For example, detection or quantification is performed using a probe selected from the group consisting of lectins, antibodies, peptides and aptamers that bind to marker molecules. Further, for example, it is carried out by a method of directly detecting the protein to be analyzed such as mass spectrometry, or a method of detecting a complex obtained by binding the protein to be analyzed to a molecular probe such as an antibody. Such methods include, for example, coagulation time method; diluted Russell serpentine method; Blotting method; flow cytometry method; protease method, immunoinhibition method, G3-CNP method, DGGR substrate method, TMP substrate method, color-developing synthetic substrate method. Enzymatic methods such as (UV method); colorimetric methods such as biuret method, BCG method, BCP improvement method, Kasahara method, color rate method, synthetic substrate colorimetric method; RIA solid phase method, EIA method, ELISA method, CLIA method. , Antibody labeling method such as CLEIA method; Immunity turbidimetric method (TIA method), Latex near infrared turbidimetric method (LPIA), Neferometry method (NIA method) and other deposition methods; Latex aggregation method (LA method), Aggregation methods such as fixed platelet aggregation; Electrophoresis methods such as SDS-PAGE, capillary electrophoresis, and two-dimensional electrophoresis; analytical systems such as HPLC, Western blotting, and dot blotting; test strip method; pyrogallol Red method; includes sulfosalicylic acid method and the like.

工程(S3)において、工程(S2)の検出の結果に従って、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定する。例えば、決定は次のように行うことができる。工程(S2)において、試料からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片が検出された場合に、対象が肺腺癌に罹患していると決定する。或いは、試料からのHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片の検出量が予め設定された閾値よりも多い場合に、対象が肺腺癌に罹患していると決定する。閾値は、例えば、肺腺癌であることが知られている対象からの標準試料において、HSP47若しくはSUMF2を定量することによって決定することができる。 In step (S3), it is determined whether or not the subject has lung adenocarcinoma according to the results of detection in step (S2). For example, the decision can be made as follows. In step (S2), if HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof is detected in the sample, it is determined that the subject has lung adenocarcinoma. Alternatively, a subject is determined to have lung adenocarcinoma if the amount of HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof detected in the sample is greater than a preset threshold. The threshold can be determined, for example, by quantifying HSP47 or SUMF2 in a standard sample from a subject known to have lung adenocarcinoma.

例えば、工程(S3)は、工程(S2)でウエスタンブロット法を用いる場合、得られたバンドの濃さを数値化し、予め定められた閾値よりもバンドが濃いか薄いかを決定することにより行われる。 For example, in step (S3), when Western blotting is used in step (S2), the obtained band density is quantified and it is determined whether the band is darker or lighter than a predetermined threshold value. Be told.

以上に説明した肺腺癌罹患判定方法により、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別することができる。 By the lung adenocarcinoma morbidity determination method described above, it is possible to identify whether or not the subject has lung adenocarcinoma.

更なる実施形態において、肺腺癌罹患判定方法は、糖鎖を備えるマーカー分子、即ち、HHL結合性糖鎖を備えるHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量することによって、対象が肺腺癌に罹患しているか否か決定することを含む。 In a further embodiment, the lung adenocarcinoma prevalence determination method involves detecting or quantifying a marker molecule comprising a sugar chain, i.e., HSP47 or SUMF2 having an HHL-binding sugar chain and / or a fragment thereof. Includes determining whether or not you have cancer.

例えば、前記検出又は定量は、糖鎖を備えるマーカー分子と結合するレクチン、抗体、ペプチド及びアプタマーからなる群から選択されるプローブを用いて行われる。また例えば、前記検出又は定量は、HHLを用いて行われる。 For example, the detection or quantification is performed using a probe selected from the group consisting of lectins, antibodies, peptides and aptamers that bind to marker molecules comprising sugar chains. Further, for example, the detection or quantification is performed using HHL.

図2は、HHLを用いる肺腺癌罹患判定方法の一例を示す概略フローチャートである。肺腺癌罹患判定方法の一例は、以下の工程を含む:(S11)対象由来の試料を用意すること、(S12)試料中のHHL結合性糖鎖を備える糖タンパク質又はその断片を、HHLを用いて分離し、前記糖タンパク質又はその断片を含むHHL(+)画分を得ること、(S13)HHL(+)画分からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量すること、及び(S14)前記検出又は定量の結果に従って、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定すること。以下、各工程について詳細に説明する。 FIG. 2 is a schematic flowchart showing an example of a lung adenocarcinoma morbidity determination method using HHL. An example of a method for determining the morbidity of lung adenocarcinoma includes the following steps: (S11) Preparing a sample derived from a subject, (S12) Glycoprotein or a fragment thereof having an HHL-binding sugar chain in the sample, HHL. To obtain an HHL (+) fraction containing the glycoprotein or a fragment thereof, (S13) to detect or quantify HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof from the (S13) HHL (+) fraction, and (S14). ) Determine if the subject has lung adenocarcinoma according to the results of the detection or quantification. Hereinafter, each step will be described in detail.

工程(S11)において、対象由来の試料を用意する。この工程は上記工程(S1)と同じ方法で行うことができる。 In the step (S11), a sample derived from the target is prepared. This step can be performed by the same method as the above step (S1).

工程(S12)において、HHLを用いてHHL結合性糖鎖を備える糖タンパク質又はその断片を分離する。分離する方法としては、例えばHHL−アガロースやビオチン化したHHLを介して、結合能を有する糖タンパク質と複合体を形成する。この複合体を遠心分離やストレプトアビジンマグネットビーズなどの磁気ビーズによる回収を行う。 In step (S12), HHL is used to separate glycoproteins or fragments thereof having HHL-binding sugar chains. As a method of separation, for example, a complex is formed with a glycoprotein having a binding ability via HHL-agarose or biotinylated HHL. This complex is centrifuged or recovered with magnetic beads such as streptavidin magnet beads.

HHLに結合した糖タンパク質又はその断片の分離は、例えば、クロマトグラフィー、緩衝液による洗浄及び/又は遠心等の公知の方法により行うことができる。それよって、HHLに結合しなかった不要物質が除去される。その結果、HHL結合性糖鎖を備える糖タンパク質及び/又はその断片を含むHHL(+)画分が得られる。 Separation of the glycoprotein bound to HHL or a fragment thereof can be performed by a known method such as chromatography, washing with a buffer solution and / or centrifugation. Thereby, unnecessary substances that did not bind to HHL are removed. As a result, an HHL (+) fraction containing a glycoprotein having an HHL-binding sugar chain and / or a fragment thereof is obtained.

工程(S13)において、HHL(+)画分からHSP47若しくはSUMF2を検出又は定量する。工程(S13)は、上記工程(S2)に記載した方法を用いて行うことができる。検出又は定量は、抗体を使用したサンドイッチELISA検出を用いて、HHL−マーカー分子−抗体などの複合体の検出により行うことが好ましい。 In step (S13), HSP47 or SUMF2 is detected or quantified from the HHL (+) fraction. The step (S13) can be performed by using the method described in the above step (S2). Detection or quantification is preferably carried out by detection of a complex such as HHL-marker molecule-antibody using sandwich ELISA detection using an antibody.

工程(S14)において、工程(S13)の結果に従って対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定する。この工程は、例えば、上記工程(S3)と同様に行うことができる。 In step (S14), it is determined whether or not the subject has lung adenocarcinoma according to the result of step (S13). This step can be performed in the same manner as the above step (S3), for example.

・分析方法
実施形態の分析方法は、対象由来の試料から、実施形態のマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量することによって、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定するための情報を得る方法である。「対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定するための情報」を以下単に「情報」とも記す。
-Analytical method The analytical method of the embodiment is to determine whether or not the subject has lung adenocarcinoma by detecting or quantifying the marker molecule and / or a fragment thereof of the embodiment from the sample derived from the subject. It is a method to obtain the information of. "Information for determining whether or not a subject has lung adenocarcinoma" is also simply referred to as "information" below.

図3は、マーカー分子を用いた分析方法の一例を示す概略フローチャートである。分析方法の一例は、以下の工程を含む:(S21)試料を用意すること、(S22)試料からマーカー分子、即ち、HSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量すること。(S21)、(S22)は、それぞれ上記工程(S1)、(S2)と同様の方法で行うことができる。 FIG. 3 is a schematic flowchart showing an example of an analysis method using a marker molecule. An example of an analytical method comprises the following steps: (S21) preparing a sample, (S22) detecting or quantifying a marker molecule, ie, HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof, from the sample. (S21) and (S22) can be performed in the same manner as in the above steps (S1) and (S2), respectively.

この例の場合、試料は、上記の何れかの試料であってもよいし、株化された細胞又は市販の細胞、或いはその上清、抽出物若しくは洗浄液等であってもよい。例えば、試料は、細胞又は組織を含むか、或いは細胞又は組織の上清、抽出物若しくは洗浄液を含む。 In the case of this example, the sample may be any of the above samples, established cells or commercially available cells, or a supernatant, extract, washing solution, or the like thereof. For example, the sample comprises cells or tissues, or contains supernatants, extracts or lavage fluids of cells or tissues.

情報とは、例えば、工程(S22)の検出又は定量の結果に従って得られる、マーカー分子が試料に存在するか否かの情報、或いは試料中におけるその存在量の情報である。例えば、このような情報から、試料の由来となる対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定することができる。或いは、上記情報から、試料に含まれる又は試料の由来となる細胞又は組織が肺腺癌の病変であるかどうかなどを決定することができる。 The information is, for example, information on whether or not a marker molecule is present in a sample, or information on its abundance in a sample, which is obtained according to the result of detection or quantification in step (S22). For example, from such information, it is possible to determine whether or not the subject from which the sample is derived has lung adenocarcinoma. Alternatively, from the above information, it can be determined whether the cells or tissues contained in the sample or from which the sample is derived are lesions of lung adenocarcinoma.

更なる実施形態において、分析方法は、対象に由来する試料からHHL結合性糖鎖を備えるマーカー分子又はその断片を検出又は定量することによって、対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定するための情報を得る方法である。例えば、前記検出又は定量は、HHLを用いて行われる。 In a further embodiment, the analytical method determines whether a subject has lung adenocarcinoma by detecting or quantifying a marker molecule or fragment thereof comprising an HHL-binding sugar chain from a sample derived from the subject. It is a way to get information to do. For example, the detection or quantification is performed using HHL.

図4は、HHLを用いて行われる分析方法の一例を示す概略フローチャートである。分析方法の一例は、以下の工程を含む:(S31)対象由来の試料を用意すること、(S32)試料中のHHL結合性糖鎖を備える糖タンパク質又はその断片を、HHLを用いて分離し、前記糖タンパク質又はその断片を含むHHL(+)画分を得ること、(S33)HHL(+)画分からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量すること。(S31)〜(S33)は、それぞれ上記工程(S11)〜(S13)と同様の方法で行うことができる。 FIG. 4 is a schematic flowchart showing an example of an analysis method performed using HHL. An example of an analytical method includes the following steps: (S31) preparing a sample from the subject, (S32) separating a glycoprotein or fragment thereof having an HHL-binding sugar chain in the sample using HHL. To obtain an HHL (+) fraction containing the glycoprotein or a fragment thereof, and to detect or quantify HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof from the (S33) HHL (+) fraction. (S31) to (S33) can be performed in the same manner as in the above steps (S11) to (S13), respectively.

[例]
以下に、実施形態のマーカー分子を同定した実験について説明する。
[Example]
The experiment for identifying the marker molecule of the embodiment will be described below.

1.HSP47及びSUMF2の同定
肺腺癌特的マーカーを同定するために、培養細胞株及び表2に記載の3症例の患者由来組織において質量分析による(グライコ)プロテオクミス解析を行った。

Figure 2020193952
1. 1. Identification of HSP47 and SUMF2 In order to identify specific markers for lung adenocarcinoma, a mass spectrometric (Glyco) proteocumis analysis was performed on cultured cell lines and the patient-derived tissues of the three cases shown in Table 2.
Figure 2020193952

この解析は以下のように行った。
(1)糖鎖切除と糖鎖付加位置安定同位体標識
試料の腫瘍部組織からプローブで捕集された糖タンパク質群をプロテアーゼで消化して得られたペプチド群を、同じプローブで再捕集した。あるいは、試料の腫瘍部組織の粗タンパク質混合物を分離することなくプロテアーゼ消化して得られた粗ペプチド群より、直接プローブで捕集した。得られた糖ペプチド群を、同位体酸素でラベルされた水の中でグリコペプチダーゼ等の酵素で処理して糖鎖を解離した。それにより、糖鎖結合部位のアスパラギンをアスパラギン酸に変換した。このときに水中の同位体酸素(18O)がペプチドに取り込まれる(この方法は「IGOT」と称される)。
This analysis was performed as follows.
(1) Glycosylation and glycosylation position-stable isotope labeling The peptide group obtained by digesting the glycoprotein group collected with a probe from the tumor tissue of the sample with a protease was recollected with the same probe. .. Alternatively, the crude peptide group obtained by protease digestion without separating the crude protein mixture of the tumor tissue of the sample was collected directly with a probe. The obtained glycopeptide group was treated with an enzyme such as glycopeptidase in water labeled with isotope oxygen to dissociate the sugar chain. As a result, asparagine at the sugar chain binding site was converted to aspartic acid. At this time, the isotope oxygen ( 18 O) in water is incorporated into the peptide (this method is referred to as "IGOT").

(2)標識ペプチドのLC/MSショットガン分析
IGOTで標識されたペプチドをLCで分離し、MSに導入し、タンデム質量分析法により、ペプチドの配列を網羅的に同定した。
(2) LC / MS Shotgun Analysis of Labeled Peptides The IGOT-labeled peptides were separated by LC, introduced into MS, and the peptide sequences were comprehensively identified by tandem mass spectrometry.

(3)ペプチドの同定
例えば、標準技術集(特許庁編)、質量分析の3−6−2−2 アミノ酸配列解析に示されるMS/MSイオンサーチ法により、得られたペプチド混合物のMS/MS ペプチド測定結果を、データベースに登録されたMS/MSスペクトルと比較してすることによりペプチドの配列を検索することができる。検索においては、以下のアミノ酸の修飾を勘案した:メチオニン残基側鎖の酸化、アミノ末端グルタミンのピロ化(脱アミド化、環化)、アミノ末端の脱アミノ化(カルバミドメチルシステイン)、アスパラギン残基側鎖の脱アミド化(ただし、安定同位体酸素の取り込みが生じたもの)。
(3) Peptide identification For example, MS / MS of a peptide mixture obtained by the MS / MS ion search method shown in 3-6-2-2 Amino Acid Sequence Analysis of Mass Spectrometry, Standard Technology Collection (edited by Patent Office). The peptide sequence can be searched by comparing the peptide measurement result with the MS / MS spectrum registered in the database. In the search, the following amino acid modifications were taken into consideration: oxidation of the methionine residue side chain, pyrolation of amino-terminal glutamine (deamidation, cyclization), deamidation of amino-terminal (carbamide methylcysteine), asparagine residue. Deamidation of the base chain (however, the uptake of stable isotope oxygen occurred).

(4)糖鎖結合位置の同定
MS/MSイオンサーチ法によって同定されたペプチドのうち、アスパラギン残基側鎖に脱アミド化(安定同位体取り込み)が生じ、かつN結合型糖鎖付加のコンセンサス配列(Asn-Xaa-[Ser/Thr]、ただしXaaはProでない)を含むペプチドを候補糖ペプチドとした。但し、XaaがLys/Argであり、同定されたペプチド配列がこの位置で切断されている場合、タンパク質全体のアミノ酸配列を参照し、Xaaの次の残基が[Ser/Thr]であることが確認できた場合はこのペプチドも含めた。また、該糖ペプチドのコンセンサス配列アスパラギン残基を糖鎖結合部位とした。
(4) Identification of sugar chain binding position Among the peptides identified by the MS / MS ion search method, deamidation (stable isotope uptake) occurs in the asparagine residue side chain, and there is a consensus of N-binding sugar chain addition. Peptides containing the sequence (Asn-Xaa- [Ser / Thr], but Xaa is not Pro) were selected as candidate glycopeptides. However, if Xaa is Lys / Arg and the identified peptide sequence is cleaved at this position, refer to the amino acid sequence of the entire protein and the next residue of Xaa may be [Ser / Thr]. If confirmed, this peptide was also included. In addition, the consensus sequence asparagine residue of the glycopeptide was used as a sugar chain binding site.

(5)候補タンパク質の更なる絞込み
上記プロテオミクス解析を行った結果から以下のステップにより、候補タンパク質更に絞込んだ。
(5) Further narrowing down of candidate proteins From the results of the above proteomics analysis, the candidate proteins were further narrowed down by the following steps.

ステップ1:培養細胞株(PL16T、HCC827、H1650、H1975細胞)及び表1に記載の3症例の患者由来組織、及び間質部から糖タンパク質を同定する。 Step 1: Glycoproteins are identified from the cultured cell lines (PL16T, HCC827, H1650, H1975 cells) and the patient-derived tissues of the three cases shown in Table 1 and the stroma.

ステップ2:ステップ1で同定された糖タンパク質から、患者由来組織間質部、及び前癌病変モデル培養細胞株PL16Tで同定された糖タンパク質を排除する。
上記の手順でリストアップされた候補タンパク質について、生化学的実験結果から、HSP47、SUMF2が見出された。
Step 2: From the glycoprotein identified in step 1, the glycoprotein identified in the patient-derived tissue stroma and the precancerous lesion model cultured cell line PL16T is excluded.
For the candidate proteins listed in the above procedure, HSP47 and SUMF2 were found from the results of biochemical experiments.

2.組織におけるマーカー分子の発現解析
(糖鎖を備えるマーカー分子の発現解析)
表3に示す5症例の癌および正常組織のHHL(+)画分を用いて、糖鎖を備えるマーカー分子のウエスタンブロット解析を行った。

Figure 2020193952
2. 2. Expression analysis of marker molecules in tissues (expression analysis of marker molecules with sugar chains)
Western blot analysis of marker molecules with sugar chains was performed using the HHL (+) fractions of 5 cases of cancer and normal tissues shown in Table 3.
Figure 2020193952

各症例の組織からのHHL(+)画分のタンパク質を破砕後、SIGMA社製 CelLytic MEM Protein Extraction kit 付属の可溶解液にて溶解した組織ライセートを使用してWestern Blotを行った。なお、各症例の組織ライセートのタンパク質濃度は、PierceのMicroBCAキットを使用して測定し、全ての症例で同じ量のタンパク質を電気泳動した。タンパク質を泳動したゲルからPVDFメンブランに転写し、ウェスタンブロッティング解析を常法に従って行った。抗体にはそれぞれ抗HSP47抗体(Enzo社、カタログ番号:ADI-SPA-470-D)または抗HSP47抗体(proteintech社、カタログ番号:11210-1-AP)を使用した。結果を図5に示す。左はHSP47、右はSUMF2の検出結果を示している。試料はそれぞれ、左から順に、肺腺癌培養細胞株NCI−H1650から抽出したタンパク質、プロテイン・マーカー、表3に示した5つの患者由来組織である。患者由来組織は、それぞれ、正常組織(N)と腫瘍組織(T)から抽出したタンパク質を解析した。 After crushing the protein of the HHL (+) fraction from the tissue of each case, Western blotting was performed using a tissue lysate dissolved in a soluble solution attached to the CelLytic MEM Protein Extraction kit manufactured by SIGMA. The protein concentration of tissue lysate in each case was measured using Pierce's MicroBCA kit, and the same amount of protein was electrophoresed in all cases. The gel from which the protein was electrophoresed was transferred to PVDF membrane, and Western blotting analysis was performed according to a conventional method. Anti-HSP47 antibody (Enzo, catalog number: ADI-SPA-470-D) or anti-HSP47 antibody (proteintech, catalog number: 11210-1-AP) was used as the antibody, respectively. The results are shown in FIG. The left shows the detection results of HSP47, and the right shows the detection results of SUMF2. The samples are, in order from the left, proteins extracted from the lung adenocarcinoma cultured cell line NCI-H1650, protein markers, and five patient-derived tissues shown in Table 3. For patient-derived tissues, proteins extracted from normal tissues (N) and tumor tissues (T) were analyzed, respectively.

本解析結果は、糖鎖を備えるHSP47が、病期に拠らず腫瘍組織特異的に発現していることを示す。糖鎖を備えるSUMF2についても、正常組織と比較して腫瘍組織における発現が顕著である。 The results of this analysis show that HSP47 having a sugar chain is specifically expressed in tumor tissue regardless of the stage. The expression of SUMF2 having a sugar chain is also remarkable in tumor tissue as compared with normal tissue.

(マーカー分子の発現解析)
以下に、糖鎖の有無を考慮しないHSP47及びSUMF2の発現解析を行った例について説明する。
(Expression analysis of marker molecules)
An example in which the expression analysis of HSP47 and SUMF2 without considering the presence or absence of sugar chains was performed will be described below.

(1)免疫染色
肺腺癌症例(T1bN0Mx, Stage IA, Acinar)FFPEブロックの免疫染色を行った。Target Retrieval Solution(DAKO社製)pH9で賦活化した後、抗HSP47抗体または抗SUMF2抗体で染色した。2次抗体および発色には、REAL(登録商標)EnVision(登録商標)Detection System、Peroxidase/DAB+、DAB kit(DAKO社製)を用い、抗体インキュベーション後の洗浄には、Wash Buffer(DAKO社製)を用いた。それぞれDAKO社インストラクションに従った。染色結果を図6、図7に示す。
(1) Immunostaining Pulmonary adenocarcinoma cases (T1bN0Mx, Stage IA, Acinar) Immunostaining of FFPE block was performed. Target Retrieval Solution (manufactured by DAKO) After activation at pH 9, staining with anti-HSP47 antibody or anti-SUMF2 antibody. REAL (registered trademark) EnVision (registered trademark) Detection System, Peroxidase / DAB +, and DAB kit (manufactured by DAKO) were used for the secondary antibody and color development, and Wash Buffer (manufactured by DAKO) was used for washing after antibody incubation. Was used. Each followed the DAKO instructions. The dyeing results are shown in FIGS. 6 and 7.

HSP47、SUMF2共に、正常細胞に比して、糖鎖の有無に関わらず腫瘍細胞における発現が顕著であることが分かる。 It can be seen that both HSP47 and SUMF2 are more prominently expressed in tumor cells regardless of the presence or absence of sugar chains, as compared with normal cells.

(2)ウエスタンブロット解析
表3に示す5症例の癌および正常組織を用いて、HHLによる分画を行わずにマーカー分子のウエスタンブロット解析を行った。解析方法は、HHLによる分画を行わないこと以外、上記の方法と同じである。結果を図8に示す。
(2) Western blot analysis Using the 5 cases of cancer and normal tissues shown in Table 3, Western blot analysis of marker molecules was performed without fractionation by HHL. The analysis method is the same as the above method except that fractionation by HHL is not performed. The results are shown in FIG.

本解析結果は、HSP47が、病期に拠らず腫瘍組織(T)特異的に発現していることを示す。SUMF2についても、正常組織(N)と比較して腫瘍組織(T)における発現が顕著である。 The results of this analysis show that HSP47 is specifically expressed in tumor tissue (T) regardless of the stage. The expression of SUMF2 in the tumor tissue (T) is more remarkable than that in the normal tissue (N).

以上のように、肺腺癌の組織においてはHSP47及びSUMF2の発現は、正常な肺組織における発現と比べて顕著であり、HSP47及びSUMF2が肺腺癌のマーカー分子として機能することが明らかとなった。 As described above, the expression of HSP47 and SUMF2 in lung adenocarcinoma tissue is remarkable as compared with the expression in normal lung tissue, and it is clarified that HSP47 and SUMF2 function as marker molecules for lung adenocarcinoma. It was.

Claims (21)

対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別するためのマーカー分子であって、ヒートショックプロテイン47(以下、「HSP47」と称する)又はスルファターゼ修飾因子2(以下、「SUMF2」と称する)であるマーカー分子。 A marker molecule for identifying whether or not a subject has lung adenocarcinoma, which is a heat shock protein 47 (hereinafter referred to as "HSP47") or a sulfatase modifier 2 (hereinafter referred to as "SUMF2"). A marker molecule that is. 更に、Hippeastrum Hybrid Lectin(HHL)に対して結合能を有する糖鎖を備える請求項1に記載のマーカー分子。 The marker molecule according to claim 1, further comprising a sugar chain having a binding ability to Hippeastrum Hybrid Lectin (HHL). 前記マーカー分子がHSP47であり、前記糖鎖は前記HSP47中のSLSNSTARNVTWK(配列番号2)に含まれるNXT又はNXSのN(アスパラギン)に結合しており、ここで、Xは任意のアミノ酸である請求項2に記載のマーカー分子。 The marker molecule is HSP47, and the sugar chain is bound to N (asparagine) of NXT or NXS contained in SLSNSTARNVTWK (SEQ ID NO: 2) in HSP47, where X is an arbitrary amino acid. Item 2. The marker molecule. 前記マーカー分子がSUMF2であり、前記糖鎖は前記SUMF2中のGQVYPWGNWFQPNRTNLWQGK(配列番号1)に含まれるNXT又はNXSのN(アスパラギン)に結合しており、ここで、Xは任意のアミノ酸である請求項2に記載のマーカー分子。 The marker molecule is SUMF2, and the sugar chain is bound to N (asparagine) of NXT or NXS contained in GQVYPWGNWFQPRNRTNLWQGK (SEQ ID NO: 1) in SUMF2, where X is an arbitrary amino acid. Item 2. The marker molecule. 前記マーカー分子が国立生物工学情報センター(NCBI)のGene ID 871の遺伝子にコードされるタンパク質であるHSP47であり、前記糖鎖は、HSP47の120位及び125位のアスパラギンに結合している請求項2又は3に記載のマーカー分子。 The claim that the marker molecule is HSP47, which is a protein encoded by the gene of Gene ID 871 of the National Center for Biotechnology Information (NCBI), and the sugar chain is bound to asparagine at positions 120 and 125 of HSP47. The marker molecule according to 2 or 3. 対象が肺腺癌に罹患しているか否かを識別するためのマーカー分子断片であって、HSP47又はSUMF2の断片であるマーカー分子の断片。 A fragment of a marker molecule for identifying whether or not a subject has lung adenocarcinoma, which is a fragment of HSP47 or SUMF2. 更に、HHLに対して結合能を有する糖鎖を備える請求項6に記載のマーカー分子の断片。 The fragment of the marker molecule according to claim 6, further comprising a sugar chain having a binding ability to HHL. 対象由来の試料から、HSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量することによって、前記対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定することを含む肺腺癌罹患判定方法。 Lung adenocarcinoma prevalence determination including determining whether or not the subject has lung adenocarcinoma by detecting or quantifying a marker molecule and / or a fragment thereof which is HSP47 or SUMF2 from a sample derived from the subject. Method. (S1)対象由来の試料を用意すること、
(S2)前記試料からHSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量すること、及び
(S3)前記検出又は定量の結果に従って、前記対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定すること
を含む請求項8に記載の方法。
(S1) Prepare a sample derived from the target,
(S2) Detecting or quantifying a marker molecule and / or a fragment thereof which is HSP47 or SUMF2 from the sample, and (S3) Whether or not the subject has lung adenocarcinoma according to the result of the detection or quantification. 8. The method of claim 8, comprising determining.
前記検出又は定量は、前記マーカー分子と結合する抗体、ペプチド及びアプタマーからなる群から選択されるプローブを用いて行われる請求項8又は9に記載の方法。 The method of claim 8 or 9, wherein the detection or quantification is carried out using a probe selected from the group consisting of antibodies, peptides and aptamers that bind to the marker molecule. 対象由来の試料から、HHLに対して結合能を有する糖鎖を備えるHSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量することによって、前記対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定することを含む肺腺癌罹患判定方法。 Whether or not the subject suffers from lung adenocarcinoma by detecting or quantifying a marker molecule and / or a fragment thereof which is HSP47 or SUMF2 having a sugar chain capable of binding to HHL from a sample derived from the subject. A method for determining lung adenocarcinoma morbidity, which comprises determining whether or not. 前記検出又は定量は、前記マーカー分子と結合するレクチン、抗体、ペプチド及びアプタマーからなる群から選択されるプローブを用いて行われる請求項11に記載の方法。 The method of claim 11, wherein the detection or quantification is performed using a probe selected from the group consisting of lectins, antibodies, peptides and aptamers that bind to the marker molecule. 前記検出又は定量は、HHLを用いて行われる請求項12に記載の方法。 The method of claim 12, wherein the detection or quantification is performed using HHL. (S11)対象由来の試料を用意すること、
(S12)前記試料中のHHLに対して結合能を有する糖鎖を備えるHSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子又はその断片を、前記HHLを用いて分離し、前記マーカー分子又はその断片を含むHHL(+)画分を得ること、
(S13)前記HHL(+)画分からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量すること、及び
(S14)前記検出又は定量の結果に従って、前記対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定すること
を含む請求項13に記載の方法。
(S11) Preparing a sample derived from the target,
(S12) A marker molecule or fragment thereof, which is HSP47 or SUMF2 having a sugar chain capable of binding to HHL in the sample, is separated using the HHL, and HHL (+) containing the marker molecule or the fragment thereof. ) Get a fraction,
(S13) Detecting or quantifying HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof from the HHL (+) fraction, and (S14) Whether or not the subject has lung adenocarcinoma according to the result of the detection or quantification. 13. The method of claim 13, comprising determining.
対象由来の試料から、HSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量することによって、前記対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定するための情報を得ることを含む分析方法。 By detecting or quantifying a marker molecule and / or a fragment thereof which is HSP47 or SUMF2 from a sample derived from a subject, it is included to obtain information for determining whether or not the subject has lung adenocarcinoma. Analysis method. (S21)前記試料を用意すること、
(S22)試料からHSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量すること
を含む請求項15に記載の方法。
(S21) Preparing the sample,
(S22) The method according to claim 15, which comprises detecting or quantifying a marker molecule and / or a fragment thereof which is HSP47 or SUMF2 from a sample.
前記検出又は定量は、前記マーカー分子と結合する抗体、ペプチド及びアプタマーからなる群から選択されるプローブを用いて行われる請求項15又は16に記載の方法。 The method of claim 15 or 16, wherein the detection or quantification is performed using a probe selected from the group consisting of antibodies, peptides and aptamers that bind to the marker molecule. 対象由来の試料から、HHLに対して結合能を有する糖鎖を備えるHSP47若しくはSUMF2であるマーカー分子及び/又はその断片を検出又は定量することによって、前記対象が肺腺癌に罹患しているか否かを決定するための情報を得ることを含む分析方法。 Whether or not the subject suffers from lung adenocarcinoma by detecting or quantifying a marker molecule and / or a fragment thereof which is HSP47 or SUMF2 having a sugar chain capable of binding to HHL from a sample derived from the subject. An analytical method that involves obtaining information to determine if. 前記検出又は定量は、前記マーカー分子と結合するレクチン、抗体、ペプチド及びアプタマーからなる群から選択されるプローブを用いて行われる請求項18に記載の方法。 The method of claim 18, wherein the detection or quantification is performed using a probe selected from the group consisting of lectins, antibodies, peptides and aptamers that bind to the marker molecule. 前記検出又は定量は、HHLを用いて行われる請求項19に記載の方法。 The method of claim 19, wherein the detection or quantification is performed using HHL. (S31)前記試料を用意すること、
(S32)前記試料中のHHLに対して結合能を有する糖鎖を備えるHSP47若しくはSUMF2であるマーカー分又はその断片を、前記HHLを用いて分離し、前記マーカー分又はその断片を含むHHL(+)画分を得ること、
(S33)HHL(+)画分からHSP47若しくはSUMF2及び/又はその断片を検出又は定量すること
を含む請求項20に記載の方法。
(S31) Preparing the sample,
(S32) A marker component or a fragment thereof, which is HSP47 or SUMF2 having a sugar chain capable of binding to HHL in the sample, is separated using the HHL, and the HHL (+) containing the marker component or the fragment thereof is separated. ) Get a fraction,
(S33) The method of claim 20, comprising detecting or quantifying HSP47 or SUMF2 and / or a fragment thereof from the HHL (+) fraction.
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