JP2019503012A - 3次元顕微鏡画像の区分化のためのシステムおよび方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、米国出願第15/003,302号(2016年1月21日出願)に対する優先権を主張し、上記出願の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本主題は、ハイコンテント画像システムに関し、より具体的には、そのようなシステムを使用して得られる画像を自動的に分析および区分化するためのシステムおよび方法に関する。
本明細書に引用される刊行物、特許出願、および特許を含む、全ての参考文献は、各参考文献が、個々に、かつ具体的に、参照することによって組み込まれるように示され、全体として本明細書に記載される場合と同程度に、参照することによって本明細書に組み込まれる。
Claims (20)
- 画像を区分化するシステムであって、前記システムは、
ハイコンテント撮像システムであって、前記ハイコンテント撮像システムは、画像捕捉デバイスを含む、ハイコンテント撮像システムと、
前記画像捕捉デバイスによって捕捉された画像を受信する画像取得モジュールと、
粗区分化画像を展開する粗オブジェクト検出モジュールであって、前記粗区分化画像の各ピクセルは、前記捕捉された画像内の対応するピクセルに関連付けられ、オブジェクトピクセルおよび背景ピクセルのうちの1つとして識別される、粗オブジェクト検出モジュールと、
少なくとも1つのマーカピクセルを前記粗区分化画像のピクセルから選択するマーカ識別モジュールであって、各マーカピクセルは、前記粗区分化画像内の隣接したオブジェクトピクセルの群のうちの1つのピクセルであり、前記1つのピクセルは、前記群の近隣ピクセルに対して背景ピクセルから最も遠い、マーカ識別モジュールと、
並行して動作する複数のプロセッサを備えているオブジェクト分割モジュールと
を備え、
前記オブジェクト分割モジュールは、オブジェクトピクセルに対応する区分化された画像のピクセルをマーカピクセルに関連付け、前記オブジェクトピクセルと前記マーカピクセルとの間の距離ベースのメトリックは、前記オブジェクトピクセルと前記粗区分化画像内の任意の他のマーカピクセルとの間の距離ベースのメトリックより小さい、システム。 - マスクされた画像を前記捕捉された画像から生成するヒューマンインターフェースモジュールをさらに備え、前記マスクされた画像のピクセルの色値は、前記区分化された画像内の対応するピクセルが前記マーカピクセルに関連付けられている場合、前記捕捉された画像の対応するピクセルの色値と同じである、請求項1に記載のシステム。
- 前記マーカピクセルに関連付けられている前記区分化された画像内のピクセルに従って統計を計算する測定モジュールをさらに備えている、請求項1に記載のシステム。
- 前記マーカ識別モジュールは、距離マップ画像を算出する並行して動作する複数のプロセッサを備え、前記距離マップ画像の各ピクセルに関連付けられた値は、そのようなピクセルと背景ピクセルとの間の距離を表す、請求項1に記載のシステム。
- 前記捕捉された画像は、一連の捕捉された画像のうちの1つであり、前記ハイコンテント撮像システムにおける焦点距離は、前記一連の捕捉された画像うちの連続画像間で変化させられる、請求項4に記載のシステム。
- 前記距離マップの各ピクセルの前記値は、前記一連の捕捉された画像によって表される3次元のうちのいずれかに沿ったそのようなピクセルと背景ピクセルとの間の距離を表す、請求項5に記載のシステム。
- 前記一連の捕捉された画像間のピクセル分解能は、各捕捉された画像のピクセル分解能と異なり、前記距離は、そのような分解能の差異に従って計算される、請求項6に記載のシステム。
- 前記マーカ識別モジュールは、展開すべき前記距離マップの一部を前記複数のプロセッサの各々に割り当てる、請求項4に記載のシステム。
- 前記オブジェクト分割モジュールは、プロセッサを備え、前記プロセッサは、展開すべき前記区分化された画像の一部を各プロセッサに割り当てる、請求項1に記載のシステム。
- 前記マーカ識別モジュールは、隣接したオブジェクトピクセルの群に関連付けられた複数の候補マーカピクセルを選択し、前記候補マーカピクセルのうちの1つをマーカピクセルとして選択する、請求項1に記載のシステム。
- 画像を区分化する方法であって、前記方法は、
ハイコンテント撮像システムの画像捕捉デバイスを用いて前記画像を捕捉することと、
粗区分化画像を展開することであって、前記粗区分化画像の各ピクセルは、前記捕捉された画像内の対応するピクセルに関連付けられ、オブジェクトピクセルおよび背景ピクセルのうちの1つとして識別される、ことと、
少なくとも1つのマーカピクセルを前記粗区分化画像のピクセルから選択することであって、各マーカピクセルは、前記粗区分化画像内の隣接したオブジェクトピクセルの群のうちの1つのピクセルであり、前記1つのピクセルは、前記群の近隣ピクセルに対して背景ピクセルから最も遠い、ことと、
複数のプロセッサを並行して動作させ、オブジェクトピクセルに対応する区分化された画像の各オブジェクトピクセルをマーカピクセルに関連付けることと
を含み、
前記オブジェクトピクセルと前記マーカピクセルとの間の距離ベースのメトリックは、前記オブジェクトピクセルと前記粗区分化画像内の任意の他のマーカピクセルとの間の距離ベースのメトリックより小さい、方法。 - マスクされた画像を前記捕捉された画像から生成するさらなるステップを含み、前記マスクされた画像のピクセルの色値は、前記区分化された画像内の対応するピクセルが前記マーカピクセルに関連付けられている場合、前記捕捉された画像の対応するピクセルの色値と同じである、請求項11に記載の方法。
- 前記マーカピクセルに関連付けられる前記粗区分化画像内のピクセルに従って統計を計算するさらなることを含む、請求項11に記載の方法。
- 前記距離マップ画像を算出することは、第2の複数のプロセッサを並行して動作させ、前記距離マップ画像を算出することを含む、請求項11に記載の方法。
- 前記捕捉された画像は、一連の捕捉された画像のうちの1つであり、前記ハイコンテント撮像システムにおける焦点距離は、前記一連の捕捉された画像うちの連続画像間で変化させられる、請求項14に記載の方法。
- 前記距離マップ画像の各ピクセルの値は、前記一連の捕捉された画像によって表される3次元のうちのいずれかに沿ったそのようなピクセルとオブジェクト境界との間の距離を表す、請求項15に記載の方法。
- 前記第2の複数のプロセッサを動作させることは、前記距離マップ画像の一部を前記第2の複数のプロセッサの各々に割り当て、算出することをさらに含む、請求項14に記載の方法。
- 前記一連の捕捉された画像間のピクセル分解能は、各捕捉された画像のピクセル分解能と異なり、前記距離は、そのような分解能の差異に従って計算される、請求項17に記載の方法。
- 前記第1の複数のプロセッサを動作させることは、展開すべき前記粗区分化画像の一部を各プロセッサに割り当てることを含む、請求項11に記載の方法。
- 少なくとも1つのマーカピクセルを選択することは、複数の候補ピクセルを選択することを含み、前記少なくとも1つのマーカピクセルは、前記複数の候補ピクセルから選択される、請求項11に記載の方法。
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