JP2018538287A5

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Publication number: JP2018538287A5
Application number: JP2018529219A
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Filing date: 2016-12-13
Publication date: 2020-01-30

Description

＜参照による組み込み＞
本明細書で言及される出願公開、特許、および特許出願はすべて、あたかも個々の出願公開、特許、あるいは特許出願がそれぞれ参照により組み込まれるように具体的かつ個々に指示されるかのような同じ程度、参照により本明細書に組み込まれる。
本願は以下の発明を包含する。
［項目１］被験体の細胞によって標的タンパク質又は機能的ＲＮＡの発現を増加させることにより、被験体の多発性嚢胞腎を処置する方法であって、
細胞は、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体）を有し、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接するエクソン、３’スプライス部位に隣接するエクソンを含み、及び、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードし、
前記方法は、
標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）に、被験体の細胞を接触させる工程を含み、これによって、保持されたイントロンは、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、被験体の細胞中の標的タンパク質あるいは機能的ＲＮＡの発現を増加させる、方法。
［項目２］保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体）を有する細胞により、ＰＣ−２である標的タンパク質の発現を増加させる方法であって、
ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン、保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソンを含み、及び、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体はＰＣ−２タンパク質をコードし、
前記方法は、
ＰＣ−２タンパク質をコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分に相補的なアンチセンスオリゴマー（ＡＳＯ）に、被験体の細胞を接触させる工程を含み、これによって、保持されたイントロンは、ＰＣ−２タンパク質をコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体から構成的にスプライシングされ、それにより、ＰＣ−２タンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、細胞中のＰＣ−２タンパク質の発現を増加させる、方法。
［項目３］標的タンパク質はＰＣ−２である、項目１に記載の方法。
［項目４］標的タンパク質又は機能的ＲＮＡは、被験体において量あるいは活性が不足している標的タンパク質あるいは機能的ＲＮＡを機能的に増大させるか、これに取って代わる、補償タンパク質あるいは補償機能的ＲＮＡである、項目１に記載の方法。
［項目５］細胞は、ＰＣ−２タンパク質の不足している量又は活性によって引き起こされた疾病を抱える被験体中のものであるか、該被検体からのものである、項目２に記載の方法。
［項目６］標的タンパク質の不足している量は、標的タンパク質のハプロ不全によって引き起こされ、ここで、被験体は機能的な標的タンパク質をコードする第１の対立遺伝子と、標的タンパク質が生成されない第２の対立遺伝子、あるいは非機能的標的タンパク質をコードする第２の対立遺伝子とを有し、ここで、アンチセンスオリゴマーは、第１の対立遺伝子から転写されたＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合する、項目１〜５のいずれか１つに記載の方法。
［項目７］被験体は、標的タンパク質の量又は機能の不足に起因する障害により引き起こされた疾病を抱えており、ここで、被験体は、
（ａ）
（ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで生成され、
（ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した形態で生成され、あるいは、
（ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、
第１の変異対立遺伝子と、
（ｂ）
（ｉ）標的タンパク質が野生型対立遺伝子からの生成と比較して、減少したレベルで生成され、
（ｉｉ）標的タンパク質が同等の野性型タンパク質と比較して機能が低下した形態で生成され、あるいは、
（ｉｉｉ）標的タンパク質が生成されない、
第２の変異対立遺伝子とを有し、
ここで、被験体が第１の変異対立遺伝子（ａ）（ｉｉｉ）を有するとき、第２の変異対立遺伝子は（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（ｉｉ）であり、ここで、被験体が第２の変異対立遺伝子（ｂ）（ｉｉｉ）を有するとき、第１の変異対立遺伝子は（ａ）（ｉ）あるいは（ａ）（ｉｉ）であり、ここで、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、（ａ）（ｉ）あるいは（ａ）（ｉｉ）である第１の変異対立遺伝子、及び／又は、（ｂ）（ｉ）あるいは（ｂ）（ｉｉ）である第２の変異対立遺伝子のいずれかから転写される、項目１〜５のいずれか１つに記載の方法。
［項目８］標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、機能が低下した形態で生成される、項目７に記載の方法。
［項目９］標的タンパク質は、同等の野性型タンパク質と比較して、十分に機能的な形態で生成される、項目７に記載の方法。
［項目１０］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６までの領域内の保持されたイントロンにある、項目１〜９のいずれか１つに記載の方法。
［項目１１］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜＋４９７の領域、あるいは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６〜−４９６の領域、
の内部の保持されたイントロンにある、項目１〜９のいずれか１つに記載の方法。
［項目１２］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ〜−４ｅの領域、あるいは
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ〜−４ｅの領域、
の内部にある、項目１〜９のいずれか１つに記載の方法。
［項目１３］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して−４ｅ〜−１，０５４ｅの領域、
（ｂ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜＋４９９の領域、
（ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６〜−４９６の領域、あるいは、
（ｄ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ〜＋１，９１２ｅの領域、
の内部の保持されたイントロンにある、項目１〜９のいずれか１つに記載の方法。
［項目１４］標的タンパク質はＰＣ−２である、項目１〜１３のいずれか１つに記載の方法。
［項目１５］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱＩＤＮＯ：２に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、項目１４に記載の方法。
［項目１６］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱＩＤＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコードされる、項目１４に記載の方法。
［項目１７］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱＩＤＮＯ：２８１の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、項目１４に記載の方法。
［項目１８］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目１４に記載の方法。
［項目１９］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン５の５’スプライス部位に対して−２０４ｅ〜＋４９７までの領域内、あるいは保持されたイントロン５の３’スプライス部位に対して−４９６〜＋２１２ｅの領域内にある、項目１４に記載の方法。
［項目２０］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目１９に記載の方法。
［項目２１］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン５の５’スプライス部位に対して−２０４ｅ〜−４ｅの領域内のエクソン５にある、項目１４に記載の方法。
［項目２２］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜４３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目２１に記載の方法。
［項目２３］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜＋４９７の領域内の保持されたイントロン５にある、項目１４に記載の方法。
［項目２４］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：４４〜１４０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目２３に記載の方法。
［項目２５］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６〜−４９６の領域内の保持されたイントロン５にある、項目１４に記載の方法。
［項目２６］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：１４１〜２３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目２５に記載の方法。
［項目２７］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン５の３’スプライス部位に対して＋２ｅ〜＋２１２ｅの領域内のエクソン６にある、項目１４に記載の方法。
［項目２８］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：２３８〜２８０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目２７に記載の方法。
［項目２９］アンチセンスオリゴマーは、機能的ＲＮＡ又は標的タンパク質をコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡの量を増加させない、項目１〜２８のいずれか１つに記載の方法。
［項目３０］アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の突然変異に起因する異常なスプライシングを調節することにより、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡの量を増加させない、項目１〜２９のいずれか１つに記載の方法。
［項目３１］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、全長のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシング、又は野生型のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシングによって生成された、項目１〜３０のいずれか１つに記載の方法。
［項目３２］標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長の成熟ｍＲＮＡ、あるいは野生型の成熟ｍＲＮＡである、項目１〜３１のいずれか１つに記載の方法。
［項目３３］生成された標的タンパク質は、全長のタンパク質あるいは野生型のタンパク質である、項目１〜３２のいずれか１つに記載の方法。
［項目３４］アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞中で生成された標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量は、対照細胞中で生成された標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡの総量と比較して、約１．１〜約１０倍、約１．５〜約１０倍、約２〜約１０倍、約３〜約１０倍、約４〜約１０倍、約１．１〜約５倍、約１．１〜約６倍、約１．１〜約７倍、約１．１〜約８倍、約１．１〜約９倍、約２〜約５倍、約２〜約６倍、約２〜約７倍、約２〜約８倍、約２〜約９倍、約３〜約６倍、約３〜約７倍、約３〜約８倍、約３〜約９倍、約４〜約７倍、約４〜約８倍、約４〜約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、あるいは少なくとも約１０倍増加する、項目１〜３３のいずれか１つに記載の方法。
［項目３５］アンチセンスオリゴマーと接触させた細胞によって生成された標的タンパク質の総量は、対照細胞によって生成された標的タンパク質の総量として、約１．１〜約１０倍、約１．５〜約１０倍、約２〜約１０倍、約３〜約１０倍、約４〜約１０倍、約１．１〜約５倍、約１．１〜約６倍、約１．１〜約７倍、約１．１〜約８倍、約１．１〜約９倍、約２〜約５倍、約２〜約６倍、約２〜約７倍、約２〜約８倍、約２〜約９倍、約３〜約６倍、約３〜約７倍、約３〜約８倍、約３〜約９倍、約４〜約７倍、約４〜約８倍、約４〜約９倍、少なくとも約１．１倍、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約３．５倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、あるいは少なくとも約１０倍増加する、項目１〜３４のいずれか１つに記載の方法。
［項目３６］アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合又はホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、項目１〜３５のいずれか１つに記載の方法。
［項目３７］アンチセンスオリゴマーはホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、あるいは２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含む、項目１〜３６のいずれか１つに記載の方法。
［項目３８］アンチセンスオリゴマーは少なくとも１つの修飾された糖部を含む、項目１〜３７のいずれか１つに記載の方法。
［項目３９］それぞれの糖部は修飾された糖部である、項目３８に記載の方法。
［項目４０］アンチセンスオリゴマーは、８〜５０の核酸塩基、８〜４０の核酸塩基、８〜３５の核酸塩基、８〜３０の核酸塩基、８〜２５の核酸塩基、８〜２０の核酸塩基、８〜１５の核酸塩基、９〜５０の核酸塩基、９〜４０の核酸塩基、９〜３５の核酸塩基、９〜３０の核酸塩基、９〜２５の核酸塩基、９〜２０の核酸塩基、９〜１５の核酸塩基、１０〜５０の核酸塩基、１０〜４０の核酸塩基、１０〜３５の核酸塩基、１０〜３０の核酸塩基、１０〜２５の核酸塩基、１０〜２０の核酸塩基、１０〜１５の核酸塩基、１１〜５０の核酸塩基、１１〜４０の核酸塩基、１１〜３５の核酸塩基、１１〜３０の核酸塩基、１１〜２５の核酸塩基、１１〜２０の核酸塩基、１１〜１５の核酸塩基、１２〜５０の核酸塩基、１２〜４０の核酸塩基、１２〜３５の核酸塩基、１２〜３０の核酸塩基、１２〜２５の核酸塩基、１２〜２０の核酸塩基、あるいは１２〜１５の核酸塩基からなる、項目１〜３９のいずれか１つに記載の方法。
［項目４１］アンチセンスオリゴマーは、タンパク質をコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分に少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、あるいは１００％相補的である、項目１〜４０のいずれか１つに記載の方法。
［項目４２］細胞は、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団は少なくとも１つの保持されたイントロンを含み、及び、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団で最も豊富な保持されたイントロンに結合する、項目１〜４１のいずれか１つに記載の方法。
［項目４３］最も豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団からの少なくとも１つの保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、請求項４２に記載の方法。
［項目４４］細胞は、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団を含み、ここで、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団は２つ以上の保持されたイントロンを含み、及び、ここで、アンチセンスオリゴマーは、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団で２番目に豊富な保持されたイントロンに結合する、項目１〜４３のいずれか１つに記載の方法。
［項目４５］２番目に豊富な保持されたイントロンに対するアンチセンスオリゴマーの結合は、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡを生成するＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の集団からの２つ以上の保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、請求項４４に記載の方法。
［項目４６］前記方法はＰＣ−２タンパク質発現を評価する工程をさらに含む、項目１〜４５のいずれか１つに記載の方法。
［項目４７］アンチセンスオリゴマーはＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分に結合し、ここで、標的部分はＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０から選択される配列である、項目１〜４６のいずれか１つに記載の方法。
［項目４８］被験体はヒトである、項目１〜４７のいずれか１つに記載の方法。
［項目４９］被験体はヒト以外の動物である、項目１〜４７のいずれか１つに記載の方法。
［項目５０］被験体は胎児、胚、あるいは子供である、項目１〜４８のいずれか１つに記載の方法。
［項目５１］細胞はエクスビボである、項目１〜４７のいずれか１つに記載の方法。
［項目５２］アンチセンスオリゴマーは、被験体の腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射によって投与される、項目１〜５１のいずれか１つに記載の方法。
［項目５３］５’スプライス部位に隣接するエクソンの−３ｅ〜−１ｅと、保持されたイントロンの＋１〜＋６にある９つのヌクレオチドは、対応する野性型配列と同一である、項目１〜５２のいずれか１つに記載の方法。
［項目５４］保持されたイントロンの−１５〜−１と３’スプライス部位に隣接するエクソンの＋１ｅにある１６のヌクレオチドは、対応する野性型配列と同一である、項目１〜５３のいずれか１つに記載の方法。
［項目５５］項目１〜５４のいずれか１つの方法で使用されるアンチセンスオリゴマー。
［項目５６］ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、アンチセンスオリゴマー。
［項目５７］項目５５又は５６のアンチセンスオリゴマーと、薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、又は担体とを含む医薬組成物。
［項目５８］腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射によって、項目５７の医薬組成物を投与することにより被験体を処置する方法。
［項目５９］不足しているタンパク質又は不足している機能的ＲＮＡに関連付けられる被験体の多発性嚢胞腎を処置するために細胞によって標的タンパク質あるいは機能的ＲＮＡの発現を増加させる方法で使用されるアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、
不足しているタンパク質又は不足している機能的ＲＮＡは、被験体において量あるいは活性が不足しており、ここで、アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードする、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体（ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体）の構成的なスプライシングを増強し、
ここで、
標的タンパク質は、
（ａ）不足しているタンパク質、あるいは
（ｂ）被験体において不足しているタンパク質を機能的に増大させるか、これに取って代わる、補償タンパク質であり、
ここで、
機能的ＲＮＡは、
（ｃ）不足しているＲＮＡ、あるいは、
（ｄ）被験体の不足している機能的ＲＮＡを機能的に増大させるか、これに取って代わる、補償機能的ＲＮＡであり、
ここで、
ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、保持されたイントロン、５’スプライス部位に隣接するエクソン、及び３’スプライス部位に隣接するエクソンを含み、ここで、保持されたイントロンは、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体からスプライシングされ、それによって、被験体の標的タンパク質あるいは機能的ＲＮＡの生成あるいは活性を増加させる、組成物。
［項目６０］被験体においてＰＣ−２タンパク質に関連する疾病を処置する方法で使用されるアンチセンスオリゴマーを含む組成物であって、
当該方法は、被験体の細胞によってＰＣ−２タンパク質の発現を増加させる工程であって、細胞が、保持されたイントロン、保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン、保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソンを含む、保持されたイントロン含有ｍＲＮＡ前駆体を有し、及び、ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体がＰＣ−２タンパク質をコードする、工程と、アンチセンスオリゴマーに細胞を接触させる工程であって、これによって、保持されたイントロンは、ＰＣ−２タンパク質をコードするＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物から構成的にスプライシングされ、それにより、被験体の細胞においてＰＣ−２タンパク質をコードするｍＲＮＡのレベルを増加させ、ＰＣ−２タンパク質の発現を増加させる、工程を含む、組成物。
［項目６１］疾病は疾患又は障害である、項目６０に記載の組成物。
［項目６２］疾患又は障害は多発性嚢胞腎である、項目６１に記載の組成物。
［項目６３］標的タンパク質とＲＩＣｍＲＮＡ前駆体はＰＫＤ２遺伝子によってコードされる、請求項６２に記載の組成物。
［項目６４］アンチセンスオリゴマーは、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６から、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６までの領域内の保持されたイントロンにあるＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、項目５９〜６３のいずれか１つに記載の組成物。
［項目６５］アンチセンスオリゴマーはＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とし、これは、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜＋４９７の領域、あるいは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６〜−４９６の領域、
の内部の保持されたイントロンにある、項目５９〜６４のいずれか１つに記載の組成物。
［項目６６］アンチセンスオリゴマーは、少なくとも１つの保持されたイントロンの５’スプライス部位の約１００ヌクレオチド下流から、少なくとも１つの保持されたイントロンの３’スプライス部位の約１００ヌクレオチド上流までの領域内にあるＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の一部を標的とする、項目５９〜６３のいずれか１つに記載の組成物。
［項目６７］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ〜−４ｅの領域、あるいは、
（ｂ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に隣接するエクソン中の＋２ｅ〜−４ｅの領域、
の内部にある、項目５９〜６３のいずれか１つに記載の組成物。
［項目６８］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、
（ａ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して−４ｅ〜−１，０５４ｅの領域、
（ｂ）保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜＋４９９の領域、
（ｃ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６〜−４９６の領域、あるいは、
（ｄ）保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して＋２ｅ〜＋１，９１２ｅの領域、
の内部にある、項目５９〜６３のいずれか１つに記載の組成物。
［項目６９］標的タンパク質はＰＣ−２である、項目５９〜６８のいずれか１つに記載の組成物。
［項目７０］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱＩＤＮＯ：２に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、項目６９に記載の組成物。
［項目７１］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、ＳＥＱＩＤＮＯ：１に少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコードされる、項目６９に記載の組成物。
［項目７２］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、ＳＥＱＩＤＮＯ：２８１の少なくとも８つの隣接する核酸を含む領域に少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、項目６９に記載の組成物。
［項目７３］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目６９に記載の組成物。
［項目７４］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン５の５’スプライス部位に対して−２０４ｅ〜＋４９７までの領域内、あるいは保持されたイントロン５の３’スプライス部位に対して−４９６〜＋２１２ｅの領域内にある、項目６９に記載の組成物。
［項目７５］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目７４に記載の組成物。
［項目７６］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン５の５’スプライス部位に対して−２０４ｅ〜−４ｅの領域内のエクソン５にある、項目６９に記載の組成物。
［項目７７］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜４３のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目７６に記載の組成物。
［項目７８］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して＋６〜＋４９７の領域内の保持されたイントロン５にある、項目６９に記載の組成物。
［項目７９］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：４４〜１４０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目７８に記載の組成物。
［項目８０］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して−１６〜−４９６の領域内の保持されたイントロン５にある、項目６９に記載の組成物。
［項目８１］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：１４１〜２３７のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目８０に記載の組成物。
［項目８２］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体の標的部分は、保持されたイントロン５の３’スプライス部位に対して＋２ｅ〜＋２１２ｅの領域内のエクソン６にある、項目６９に記載の組成物。
［項目８３］ＡＳＯは、ＳＥＱＩＤＮＯ：２３８〜２８０のいずれか１つに少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、あるいは１００％相補的な配列を含む、項目８２に記載の組成物。
［項目８４］アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードする遺伝子から転写されたｍＲＮＡ前駆体の選択的スプライシングを調節することにより、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡの量を増加させない、項目５９〜８３のいずれか１つに記載の組成物。
［項目８５］アンチセンスオリゴマーは、標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードする遺伝子の突然変異に起因する異常なスプライシングを調節することにより、機能的ＲＮＡ又は機能的タンパク質の量を増加させない、項目５９〜８４のいずれか１つに記載の組成物。
［項目８６］ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体は、全長のｍＲＮＡ前駆体、あるいは野生型のｍＲＮＡ前駆体の部分的なスプライシングによって生成された、項目５９〜８５のいずれか１つに記載の組成物。
［項目８７］標的タンパク質又は機能的ＲＮＡをコードするｍＲＮＡは、全長の成熟ｍＲＮＡ、あるいは野生型の成熟ｍＲＮＡである、項目５９〜８６のいずれか１つに記載の組成物。
［項目８８］生成された標的タンパク質は、全長のタンパク質あるいは野生型のタンパク質である、項目５９〜８７のいずれか１つに記載の組成物。
［項目８９］保持されたイントロンは律速イントロンである、項目５９〜８８のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９０］前記保持されたイントロンは前記ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体で最も豊富な保持されたイントロンである、項目５９〜８９のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９１］保持されたイントロンは前記ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体で２番目に豊富な保持されたイントロンである、項目５９〜８９のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９２］アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合又はホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、項目５９〜９１のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９３］前記アンチセンスオリゴマーはアンチセンスオリゴヌクレオチドである、項目５９〜９２のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９４］アンチセンスオリゴマーはホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、あるいは２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含む、項目５９〜９３のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９５］アンチセンスオリゴマーは少なくとも１つの修飾された糖部を含む、項目５９〜９４のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９６］それぞれの糖部は修飾された糖部である、項目９５に記載の組成物。
［項目９７］アンチセンスオリゴマーは、８〜５０の核酸塩基、８〜４０の核酸塩基、８〜３５の核酸塩基、８〜３０の核酸塩基、８〜２５の核酸塩基、８〜２０の核酸塩基、８〜１５の核酸塩基、９〜５０の核酸塩基、９〜４０の核酸塩基、９〜３５の核酸塩基、９〜３０の核酸塩基、９〜２５の核酸塩基、９〜２０の核酸塩基、９〜１５の核酸塩基、１０〜５０の核酸塩基、１０〜４０の核酸塩基、１０〜３５の核酸塩基、１０〜３０の核酸塩基、１０〜２５の核酸塩基、１０〜２０の核酸塩基、１０〜１５の核酸塩基、１１〜５０の核酸塩基、１１〜４０の核酸塩基、１１〜３５の核酸塩基、１１〜３０の核酸塩基、１１〜２５の核酸塩基、１１〜２０の核酸塩基、１１〜１５の核酸塩基、１２〜５０の核酸塩基、１２〜４０の核酸塩基、１２〜３５の核酸塩基、１２〜３０の核酸塩基、１２〜２５の核酸塩基、１２〜２０の核酸塩基、あるいは１２〜１５の核酸塩基からなる、項目５９〜９６のいずれか１つに記載の組成物。
［項目９８］項目５９〜９７の組成物のいずれか１つのアンチセンスオリゴマーと、薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、又は担体とを含む医薬組成物。
［項目９９］腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射によって項目９８の医薬組成物を投与することにより被験体を処置する方法。
［項目１００］不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物の標的配列にハイブリダイズされるアンチセンスオリゴマーであって、不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物が保持されたイントロンを含み、アンチセンスオリゴマーが不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物からの保持されたイントロンのスプライシングアウトを誘発する、アンチセンスオリゴマーと、
薬学的に許容可能な賦形剤、希釈剤、又は担体とを含む、
医薬組成物。
［項目１０１］不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物はＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物である、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１０２］ＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物の標的部分は、保持されたイントロンの５’スプライス部位に対して約＋５００〜保持されたイントロンの３’スプライス部位に対して約−５００までの領域内の保持されたイントロンにある、項目１００又は１０１に記載の医薬組成物。
［項目１０３］ＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物は、ＳＥＱＩＤＮＯ：１に対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、あるいは１００％の配列同一性を備えた遺伝子配列によってコードされる、項目１００又は１０１に記載の医薬組成物。
［項目１０４］ＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物は、ＳＥＱＩＤＮＯ：２に対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、あるいは１００％の配列同一性を備えた配列を含む、項目１００又は１０１に記載の医薬組成物。
［項目１０５］アンチセンスオリゴマーは、ホスホロチオエート結合又はホスホロジアミデート結合を含む骨格修飾を含む、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１０６］アンチセンスオリゴマーはアンチセンスオリゴヌクレオチドである、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１０７］アンチセンスオリゴマーは、ホスホロジアミデートモルホリノ、ロックド核酸、ペプチド核酸、２’−Ｏ−メチル、２’−フルオロ、あるいは２’−Ｏ−メトキシエチル部分を含む、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１０８］アンチセンスオリゴマーは少なくとも１つの修飾された糖部を含む、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１０９］アンチセンスオリゴマーは、８〜５０の核酸塩基、８〜４０の核酸塩基、８〜３５の核酸塩基、８〜３０の核酸塩基、８〜２５の核酸塩基、８〜２０の核酸塩基、８〜１５の核酸塩基、９〜５０の核酸塩基、９〜４０の核酸塩基、９〜３５の核酸塩基、９〜３０の核酸塩基、９〜２５の核酸塩基、９〜２０の核酸塩基、９〜１５の核酸塩基、１０〜５０の核酸塩基、１０〜４０の核酸塩基、１０〜３５の核酸塩基、１０〜３０の核酸塩基、１０〜２５の核酸塩基、１０〜２０の核酸塩基、１０〜１５の核酸塩基、１１〜５０の核酸塩基、１１〜４０の核酸塩基、１１〜３５の核酸塩基、１１〜３０の核酸塩基、１１〜２５の核酸塩基、１１〜２０の核酸塩基、１１〜１５の核酸塩基、１２〜５０の核酸塩基、１２〜４０の核酸塩基、１２〜３５の核酸塩基、１２〜３０の核酸塩基、１２〜２５の核酸塩基、１２〜２０の核酸塩基、あるいは１２〜１５の核酸塩基を含む、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１１０］アンチセンスオリゴマーは、ＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物の標的部分に少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、あるいは１００％相補的である、項目１００又は１０１に記載の医薬組成物。
［項目１１１］ＰＫＤ２ＲＩＣｍＲＮＡ前駆体転写産物の標的部分は、ＳＥＱＩＤＮＯ：２８１内にある、項目１００又は１０１に記載の医薬組成物。
［項目１１２］アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、あるいは９９％の配列同一性であるヌクレオチド配列を含む、請求項１００に記載の医薬組成物。
［項目１１３］アンチセンスオリゴマーは、ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０から選択されたヌクレオチド配列を含む、項目１００に記載の医薬組成物。
［項目１１４］医薬組成物は、髄腔内注射、脳室内注射、腹腔内注射、筋肉内注射、皮下注射、あるいは静脈内注射のために製剤される、項目１００〜１１３のいずれか１つに記載の医薬組成物。
［項目１１５］ＰＣ−２タンパク質の機能的な形態をコードする十分に処理されたＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物を生成するべく、保持されたイントロンの除去を促すために不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物の処理を誘発する方法であって、
前記方法は、
（ａ）被験体の標的細胞へアンチセンスオリゴマーを接触させる工程と、
（ｂ）不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物へアンチセンスオリゴマーをハイブリダイズする工程であって、不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物が、ＰＣ−２タンパク質の機能的な形態をコードすることができ、少なくとも１つの保持されたイントロンを含む、工程と、
（ｃ）ＰＣ−２タンパク質の機能的な形態をコードする十分に処理されたＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物を生成するために不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物から少なくとも１つの保持されたイントロンを除去する工程と、
（ｄ）十分に処理されたＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物からＰＣ−２タンパク質の機能的な形態を翻訳する工程、
を含む、方法。
［項目１１６］保持されたイントロンは保持されたイントロン全体である、項目１１５に記載の方法。
［項目１１７］不足しているＰＫＤ２ｍＲＮＡ転写産物はＰＫＤ２ｍＲＮＡ前駆体転写産物である、項目１１５に記載の方法。
［項目１１８］ＰＣ２タンパク質の量と活性の不足によって引き起こされた疾病を抱える被験体を処置する方法であって、
ＳＥＱＩＤＮＯ：３〜２８０のいずれか１つに対して少なくとも約８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、あるいは９９％の配列同一性を備えたヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴマーを被験体に投与する工程を含む、方法。 <Incorporation by reference>
  All publications, patents, and patent applications mentioned herein are the same as if each individual publication, patent, or patent application was specifically and individually indicated to be incorporated by reference. The extent is incorporated herein by reference.
  This application includes the following inventions.
[Item 1] A method for treating polycystic kidney disease in a subject by increasing expression of a target protein or functional RNA by cells of the subject,
  The cell has a retained intron-containing pre-mRNA (RIC pre-mRNA), which contains a retained intron, an exon adjacent to the 5 'splice site, and an exon adjacent to the 3' splice site. And the RIC pre-mRNA encodes a target protein or functional RNA,
  The method comprises:
  Contacting the subject's cells with an antisense oligomer (ASO) complementary to a target portion of a RIC pre-mRNA encoding a target protein or functional RNA, whereby the retained introns are Alternatively, it is constitutively spliced from a RIC pre-mRNA encoding a functional RNA, thereby increasing the level of the mRNA encoding the target protein or functional RNA, and increasing the level of the target protein or functional RNA in the cells of the subject. A method of increasing expression.
[Item 2] A method for increasing the expression of a target protein which is PC-2 by a cell having a retained intron-containing pre-mRNA (RIC pre-mRNA),
  The RIC pre-mRNA comprises a retained intron, an exon adjacent to the 5 'splice site of the retained intron, an exon adjacent to the 3' splice site of the retained intron, and the RIC pre-mRNA comprises PC- Encodes two proteins,
  The method comprises:
  Contacting a subject's cells with an antisense oligomer (ASO) that is complementary to a target portion of a RIC pre-mRNA encoding a PC-2 protein, whereby the retained intron is a PC-2 protein A method that is constitutively spliced from a RIC pre-mRNA that encodes, thereby increasing the level of mRNA that encodes the PC-2 protein and increasing expression of the PC-2 protein in cells.
[Item 3] The method according to item 1, wherein the target protein is PC-2.
[Item 4] The target protein or functional RNA is a compensating protein or functional RNA that functionally increases or replaces a target protein or functional RNA deficient in quantity or activity in a subject. 3. The method according to item 1, wherein
[Item 5] The method according to Item 2, wherein the cell is in or from a subject having a disease caused by a deficient amount or activity of PC-2 protein. .
[Item 6] The deficient amount of the target protein is caused by haploinsufficiency of the target protein, wherein the subject has a first allele encoding a functional target protein and a second allele that does not produce the target protein. Two alleles, or a second allele encoding a non-functional target protein, wherein the antisense oligomer binds to the target portion of the RIC pre-mRNA transcribed from the first allele. 6. The method according to any one of items 1 to 5,
[Item 7] The subject has a disease caused by a disorder caused by a deficiency in the amount or function of the target protein, wherein the subject has
(A)
  (I) the target protein is produced at a reduced level compared to production from the wild-type allele;
  (Ii) the target protein is produced in a form with reduced function compared to the equivalent wild-type protein, or
  (Iii) no target protein is produced,
A first mutant allele;
(B)
  (I) the target protein is produced at a reduced level compared to production from the wild-type allele;
  (Ii) the target protein is produced in a form with reduced function compared to the equivalent wild-type protein, or
  (Iii) no target protein is produced,
A second mutant allele,
  Here, when the subject has the first mutant allele (a) (iii), the second mutant allele is (b) (i) or (b) (ii), wherein the subject Has the second mutant allele (b) (iii), the first mutant allele is (a) (i) or (a) (ii), wherein the RIC pre-mRNA is a) a first mutant allele which is (i) or (a) (ii) and / or a second mutant allele which is (b) (i) or (b) (ii) 6. The method according to any one of items 1 to 5, which is transcribed.
[Item 8] The method according to item 7, wherein the target protein is produced in a form with reduced function as compared to an equivalent wild-type protein.
[Item 9] The method according to Item 7, wherein the target protein is produced in a sufficiently functional form as compared to an equivalent wild-type protein.
[Item 10] The target portion of the RIC pre-mRNA is a retained intron in the region from +6 for the 5 'splice site of the retained intron to -16 for the 3' splice site of the retained intron. The method according to any one of items 1 to 9 above.
[Item 11] The target portion of the RIC pre-mRNA is:
(A) a region of +6 to +497 relative to the 5 'splice site of the retained intron, or
(B) a region of -16 to -496 relative to the 3 'splice site of the retained intron;
10. The method according to any one of items 1 to 9, wherein the intron is in a retained intron.
[Item 12] The target portion of the RIC pre-mRNA is:
(A) the region from + 2e to -4e in the exon adjacent to the 5 'splice site of the retained intron, or
(B) the + 2e to -4e region in the exon adjacent to the 3 'splice site of the retained intron;
10. The method according to any one of items 1 to 9, wherein
[Item 13] The target portion of the RIC pre-mRNA is:
(A) a region of -4e to -1,054e relative to the 5 'splice site of the retained intron;
(B) the region +6 to +499 relative to the 5 'splice site of the retained intron;
(C) a region of -16 to -496 relative to the 3 'splice site of the retained intron, or
(D) a region from + 2e to + 1,912e with respect to the 3 ′ splice site of the retained intron;
10. The method according to any one of items 1 to 9, wherein the intron is in a retained intron.
[Item 14] The method according to any one of Items 1 to 13, wherein the target protein is PC-2.
[Item 15] The RIC pre-mRNA may comprise a sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to SEQ ID NO: 2. The described method.
[Item 16] The RIC pre-mRNA is encoded by a gene sequence that has at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to SEQ ID NO: 1. Item 15. The method according to Item 14.
[Item 17] The target portion of the RIC pre-mRNA is at least 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% of the sequence containing at least eight adjacent nucleic acids of SEQ ID NO: 281. 15. The method according to item 14, comprising a sequence with identity.
[Item 18] The ASO according to Item 14, wherein the ASO comprises a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 3-280. The described method.
[Item 19] The target portion of the RIC pre-mRNA is in the region from -204e to +497 with respect to the 5 'splice site of retained intron 5, or-with respect to the 3' splice site of retained intron 5. Item 15. The method according to Item 14, which is in the range of 496 to + 212e.
[Item 20] The ASO according to Item 19, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 3-280. The described method.
[Item 21] The method according to Item 14, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in exon 5 within the region of -204e to -4e with respect to the 5 'splice site of retained intron 5.
[Item 22] The ASO according to item 21, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 3-43. The described method.
[Item 23] The method according to Item 14, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in the retained intron 5 within a region of +6 to +497 with respect to the 5 'splice site of the retained intron.
[Item 24] The ASO according to Item 23, wherein the ASO comprises a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 44-140. The described method.
[Item 25] The method according to item 14, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in the retained intron 5 within a region of -16 to -496 with respect to the 3 'splice site of the retained intron.
[Item 26] The ASO according to Item 25, which comprises a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 141-237. The described method.
[Item 27] The method according to Item 14, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in exon 6 within a region from + 2e to + 212e with respect to the 3 'splice site of retained intron 5.
[Item 28] The ASO according to Item 27, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 238-280. The described method.
[Item 29] The antisense oligomer according to Item 1, wherein the antisense oligomer does not increase the amount of the target protein or functional RNA by modulating the alternative splicing of a pre-mRNA transcribed from the gene encoding the functional RNA or target protein. 29. The method according to any one of -28.
[Item 30] The antisense oligomer does not increase the amount of the target protein or the functional RNA by modulating aberrant splicing due to mutation of the gene encoding the target protein or the functional RNA. The method according to any one of the preceding claims.
[Item 31] The RIC pre-mRNA according to any one of items 1 to 30, wherein the RIC pre-mRNA is generated by partial splicing of a full-length pre-mRNA or partial splicing of a wild-type pre-mRNA. Method.
[Item 32] The method according to any one of Items 1 to 31, wherein the mRNA encoding the target protein or the functional RNA is a full-length mature mRNA or a wild-type mature mRNA.
[Item 33] The method according to any one of Items 1 to 32, wherein the generated target protein is a full-length protein or a wild-type protein.
[Item 34] The total amount of mRNA encoding the target protein or functional RNA produced in the cells contacted with the antisense oligomer is the total amount of mRNA encoding the target protein or functional RNA produced in the control cells About 1.1 to about 10 times, about 1.5 to about 10 times, about 2 to about 10 times, about 3 to about 10 times, about 4 to about 10 times, about 1.1 to about 5 times, about 1.1 to about 6 times, about 1.1 to about 7 times, about 1.1 to about 8 times, about 1.1 to about 9 times, about 2 to about 5 times, about 2 to about 6 times, about 2 to about 7 times, about 2 to about 8 times, about 2 to about 9 times, about 3 to about 6 times, about 3 to about 7 times, about 3 to about 8 times, about 3 to about 9 times Fold, about 4 to about 7 fold, about 4 to about 8 fold, about 4 to about 9 fold, at least about 1.1 fold, at least about 1.5 fold, at least about 2 fold, at least about 2.5 fold, at least About 3 times less 34. The method of any one of the preceding items, wherein the increase is at least about 3.5-fold, at least about 4-fold, at least about 5-fold, or at least about 10-fold.
[Item 35] The total amount of the target protein produced by the cells contacted with the antisense oligomer is about 1.1 to about 10 times, about 1.5 to about 10 times as the total amount of the target protein produced by the control cells. About 2 times to about 10 times, about 3 to about 10 times, about 4 to about 10 times, about 1.1 to about 5 times, about 1.1 to about 6 times, about 1.1 to about 7 times, About 1.1 to about 8 times, about 1.1 to about 9 times, about 2 to about 5 times, about 2 to about 6 times, about 2 to about 7 times, about 2 to about 8 times, about 2 to about 9 times, about 3 to about 6 times, about 3 to about 7 times, about 3 to about 8 times, about 3 to about 9 times, about 4 to about 7 times, about 4 to about 8 times, about 4 to about 9 times Fold, at least about 1.1 fold, at least about 1.5 fold, at least about 2 fold, at least about 2.5 fold, at least about 3 fold, at least about 3.5 fold, at least about 4 fold, at least about 5 fold, Or less 35. The method according to any one of the items 1 to 34, wherein both increase by about 10 times.
[Item 36] The method according to any one of Items 1 to 35, wherein the antisense oligomer comprises a backbone modification containing a phosphorothioate bond or a phosphorodiamidate bond.
[Item 37] Any of Items 1-36, wherein the antisense oligomer comprises a phosphorodiamidate morpholino, a locked nucleic acid, a peptide nucleic acid, a 2'-O-methyl, 2'-fluoro, or 2'-O-methoxyethyl moiety. A method according to any one of the preceding claims.
[Item 38] The method according to any one of Items 1 to 37, wherein the antisense oligomer comprises at least one modified sugar moiety.
[Item 39] The method according to Item 38, wherein each sugar moiety is a modified sugar moiety.
[Item 40] The antisense oligomer includes 8 to 50 nucleobases, 8 to 40 nucleobases, 8 to 35 nucleobases, 8 to 30 nucleobases, 8 to 25 nucleobases, and 8 to 20 nucleobases , 8-15 nucleobases, 9-50 nucleobases, 9-40 nucleobases, 9-35 nucleobases, 9-30 nucleobases, 9-25 nucleobases, 9-20 nucleobases, 9-15 nucleobases, 10-50 nucleobases, 10-40 nucleobases, 10-35 nucleobases, 10-30 nucleobases, 10-25 nucleobases, 10-20 nucleobases, 10-20 nucleobases, To 15 nucleobases, 11 to 50 nucleobases, 11 to 40 nucleobases, 11 to 35 nucleobases, 11 to 30 nucleobases, 11 to 25 nucleobases, 11 to 20 nucleobases, 11 to 11 15 nucleobases, 12 to 50 nucleobases, 12 to 40 nucleic acid salts Any one of the items 1 to 39, comprising a group, a nucleobase of 12 to 35, a nucleobase of 12 to 30, a nucleobase of 12 to 25, a nucleobase of 12 to 20, or a nucleobase of 12 to 15 The described method.
[Item 41] The antisense oligomer is at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, at least 99%, or 100% complementary to the target portion of the RIC pre-mRNA encoding the protein. The method according to any one of items 1 to 40, wherein
[Item 42] The cell comprises a population of RIC pre-mRNA transcribed from a gene encoding a target protein or functional RNA, wherein the population of RIC pre-mRNA comprises at least one retained intron; And wherein the antisense oligomer binds to the most abundant retained intron in the population of RIC pre-mRNAs.
[Item 43] Binding of the antisense oligomer to the most abundant retained intron is splicing out of at least one retained intron from a population of RIC pre-mRNAs that produces mRNA encoding a target protein or functional RNA 43. The method of claim 42, wherein the method induces
[Item 44] The cell comprises a population of RIC pre-mRNA transcribed from a gene encoding a target protein or functional RNA, wherein the population of RIC pre-mRNA comprises two or more retained introns. And wherein the antisense oligomer binds to the second most abundant retained intron in the population of RIC pre-mRNAs.
[Item 45] The binding of the antisense oligomer to the second most abundant retained intron is the binding of two or more retained introns from a population of RIC pre-mRNAs that produces mRNA encoding the target protein or functional RNA 45. The method of claim 44, wherein the method induces splicing out of
[Item 46] The method according to any one of items 1 to 45, wherein the method further comprises a step of evaluating PC-2 protein expression.
47. The antisense oligomer binds to a target portion of a PKD2 RIC pre-mRNA, wherein the target portion is a sequence selected from SEQ ID NOs: 3-280. The method described in.
[Item 48] The method according to any one of items 1 to 47, wherein the subject is a human.
[Item 49] The method according to any one of items 1 to 47, wherein the subject is a non-human animal.
[Item 50] The method according to any one of Items 1 to 48, wherein the subject is a fetus, an embryo, or a child.
[Item 51] The method according to any one of items 1 to 47, wherein the cell is ex vivo.
[Item 52] The method according to any one of Items 1 to 51, wherein the antisense oligomer is administered by intraperitoneal injection, intramuscular injection, subcutaneous injection or intravenous injection of the subject.
[Item 53] The nine nucleotides at -3e to -1e of the exon adjacent to the 5 'splice site and at +1 to +6 of the retained intron are identical to the corresponding wild-type sequence. A method according to any one of the preceding claims.
[Item 54] Any one of Items 1-53, wherein the 16 nucleotides at -15e of the retained intron and + 1e of the exon adjacent to the 3 'splice site are identical to the corresponding wild-type sequence. The method described in one.
[Item 55] An antisense oligomer used in the method of any one of Items 1 to 54.
[Item 56] SEQ ID NO: including a sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to any one of any of 3-280. Antisense oligomer.
[Item 57] A pharmaceutical composition comprising the antisense oligomer of Item 55 or 56, and a pharmaceutically acceptable excipient, diluent, or carrier.
[Item 58] A method of treating a subject by administering the pharmaceutical composition of Item 57 by intraperitoneal injection, intramuscular injection, subcutaneous injection, or intravenous injection.
[Item 59] Used in a method to increase expression of a target protein or functional RNA by a cell to treat polycystic kidney disease in a subject associated with a missing protein or a missing functional RNA. A composition comprising an antisense oligomer,
  The deficient protein or deficient functional RNA is deficient in quantity or activity in the subject, wherein the antisense oligomer comprises a retained intron containing the target protein or functional RNA. enhance constitutive splicing of pre-mRNA (RIC pre-mRNA),
  here,
  The target protein is
(A) missing protein, or
(B) a compensating protein that functionally increases or replaces the missing protein in the subject;
  here,
  Functional RNA is
(C) missing RNA, or
(D) a compensating functional RNA that functionally increases or replaces the subject's missing functional RNA;
  here,
  The RIC pre-mRNA comprises a retained intron, an exon adjacent to the 5 'splice site, and an exon adjacent to the 3' splice site, wherein the retained intron encodes a target protein or functional RNA A composition that is spliced from a RIC pre-mRNA, thereby increasing the production or activity of a target protein or functional RNA in a subject.
[Item 60] A composition comprising an antisense oligomer used in a method for treating a disease associated with a PC-2 protein in a subject, comprising:
  The method comprises increasing expression of the PC-2 protein by cells of the subject, the cells comprising a retained intron, an exon adjacent to the 5 ′ splice site of the retained intron, a retained intron. Having a retained intron-containing pre-mRNA comprising an exon adjacent to the 3 'splice site, and the RIC pre-mRNA encodes a PC-2 protein; and contacting the cell with an antisense oligomer Whereby the retained intron is constitutively spliced from the RIC pre-mRNA transcript encoding the PC-2 protein, whereby the mRNA encoding the PC-2 protein in the cells of the subject is Increasing the level and increasing the expression of the PC-2 protein. A composition comprising:
[Item 61] The composition according to item 60, wherein the disease is a disease or disorder.
[Item 62] The composition according to Item 61, wherein the disease or disorder is polycystic kidney disease.
[Item 63] The composition according to claim 62, wherein the target protein and the RIC pre-mRNA are encoded by a PKD2 gene.
[Item 64] The antisense oligomer has a RIC at the retained intron in the region from +6 for the 5 'splice site of the retained intron to -16 for the 3' splice site of the retained intron. 64. The composition according to any one of items 59-63, wherein the composition targets a portion of the pre-mRNA.
[Item 65] The antisense oligomer targets a portion of the RIC pre-mRNA,
(A) a region of +6 to +497 relative to the 5 'splice site of the retained intron, or
(B) a region of -16 to -496 relative to the 3 'splice site of the retained intron;
65. The composition according to any one of items 59-64, wherein the composition is in a retained intron inside.
[Item 66] The antisense oligomer is within a region from about 100 nucleotides downstream of the 5 'splice site of the at least one retained intron to about 100 nucleotides upstream of the 3' splice site of the at least one retained intron. 64. The composition of any one of items 59-63, wherein the composition targets a portion of an RIC pre-mRNA.
[Item 67] The target portion of the RIC pre-mRNA is
(A) the region from + 2e to -4e in the exon adjacent to the 5 'splice site of the retained intron, or
(B) the + 2e to -4e region in the exon adjacent to the 3 'splice site of the retained intron;
64. The composition according to any one of items 59-63, wherein
[Item 68] The target portion of the RIC pre-mRNA is
(A) a region of -4e to -1,054e relative to the 5 'splice site of the retained intron;
(B) the region +6 to +499 relative to the 5 'splice site of the retained intron;
(C) a region of -16 to -496 relative to the 3 'splice site of the retained intron, or
(D) a region from + 2e to + 1,912e with respect to the 3 ′ splice site of the retained intron;
64. The composition according to any one of items 59-63, wherein
[Item 69] The composition according to any one of items 59 to 68, wherein the target protein is PC-2.
[Item 70] The RIC pre-mRNA comprises a sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to SEQ ID NO: 2 according to item 69. A composition as described.
[Item 71] The RIC pre-mRNA is encoded by a gene sequence that has at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to SEQ ID NO: 1. 70. The composition according to item 69.
[Item 72] The target portion of the RIC pre-mRNA is at least 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% of the sequence comprising at least eight adjacent nucleic acids of SEQ ID NO: 281. 70. The composition of item 69, comprising a sequence with identity.
[Item 73] The ASO according to Item 69, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 3-280. A composition as described.
[Item 74] The target portion of the RIC pre-mRNA is in the region from -204e to +497 with respect to the 5 'splice site of retained intron 5, or-with respect to the 3' splice site of retained intron 5. 70. The composition according to item 69, wherein the composition is in the range from 496 to + 212e.
[Item 75] The ASO according to Item 74, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 3-280. A composition as described.
76. The composition of claim 69, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in exon 5 within the region -204e to -4e relative to the 5 'splice site of retained intron 5.
[Item 77] The ASO according to Item 76, wherein the ASO comprises a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 3-43. A composition as described.
[Item 78] The composition of Item 69, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in the retained intron 5 in the region +6 to +497 relative to the 5 'splice site of the retained intron.
[Item 79] The ASO according to Item 78, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 44-140. A composition as described.
[Item 80] The composition of Item 69, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in the retained intron 5 in the region -16 to -496 relative to the 3 'splice site of the retained intron.
[Item 81] The ASO according to Item 80, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 141-237. A composition as described.
82. The composition of claim 69, wherein the target portion of the RIC pre-mRNA is in exon 6 within the region + 2e to + 212e relative to the 3 'splice site of retained intron 5.
[Item 83] The ASO according to Item 82, comprising a sequence that is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% complementary to any one of SEQ ID NOs: 238-280. A composition as described.
[Item 84] The antisense oligomer does not increase the amount of the target protein or functional RNA by modulating the alternative splicing of the pre-mRNA transcribed from the gene encoding the target protein or functional RNA. 84. The composition according to any one of -83.
[Item 85] The antisense oligomer does not increase the amount of the functional RNA or functional protein by modulating aberrant splicing due to a mutation in the gene encoding the target protein or functional RNA. 84. The composition according to any one of the items 84.
[Item 86] The composition according to any one of Items 59 to 85, wherein the RIC pre-mRNA is produced by partial splicing of a full-length pre-mRNA or a wild-type pre-mRNA.
[Item 87] The composition according to any one of Items 59 to 86, wherein the mRNA encoding the target protein or the functional RNA is a full-length mature mRNA or a wild-type mature mRNA.
[Item 88] The composition according to any one of items 59 to 87, wherein the generated target protein is a full-length protein or a wild-type protein.
[Item 89] The composition according to any one of items 59 to 88, wherein the retained intron is a rate-limiting intron.
[Item 90] The composition according to any one of Items 59 to 89, wherein the retained intron is the most abundant retained intron in the RIC pre-mRNA.
[Item 91] The composition according to any one of items 59 to 89, wherein the retained intron is the second abundant retained intron in the RIC pre-mRNA.
[Item 92] The composition according to any one of Items 59 to 91, wherein the antisense oligomer comprises a backbone modification including a phosphorothioate bond or a phosphorodiamidate bond.
[Item 93] The composition according to any one of items 59 to 92, wherein the antisense oligomer is an antisense oligonucleotide.
[Item 94] Any of Items 59 to 93, wherein the antisense oligomer comprises a phosphorodiamidate morpholino, locked nucleic acid, peptide nucleic acid, 2'-O-methyl, 2'-fluoro, or 2'-O-methoxyethyl moiety. A composition according to any one of the preceding claims.
[Item 95] The composition according to any one of items 59 to 94, wherein the antisense oligomer comprises at least one modified sugar moiety.
[Item 96] The composition according to item 95, wherein each sugar moiety is a modified sugar moiety.
[Item 97] The antisense oligomer includes 8 to 50 nucleobases, 8 to 40 nucleobases, 8 to 35 nucleobases, 8 to 30 nucleobases, 8 to 25 nucleobases, and 8 to 20 nucleobases , 8-15 nucleobases, 9-50 nucleobases, 9-40 nucleobases, 9-35 nucleobases, 9-30 nucleobases, 9-25 nucleobases, 9-20 nucleobases, 9-15 nucleobases, 10-50 nucleobases, 10-40 nucleobases, 10-35 nucleobases, 10-30 nucleobases, 10-25 nucleobases, 10-20 nucleobases, 10-20 nucleobases, To 15 nucleobases, 11 to 50 nucleobases, 11 to 40 nucleobases, 11 to 35 nucleobases, 11 to 30 nucleobases, 11 to 25 nucleobases, 11 to 20 nucleobases, 11 to 11 15 nucleobases, 12 to 50 nucleobases, 12 to 40 nucleic acid salts The base, 12 to 35 nucleobases, 12 to 30 nucleobases, 12 to 25 nucleobases, 12 to 20 nucleobases, or 12 to 15 nucleobases, in any one of the items 59 to 96, A composition as described.
[Item 98] A pharmaceutical composition comprising the antisense oligomer of any one of items 59 to 97, and a pharmaceutically acceptable excipient, diluent, or carrier.
[Item 99] A method of treating a subject by administering the pharmaceutical composition of Item 98 by intraperitoneal injection, intramuscular injection, subcutaneous injection, or intravenous injection.
[Item 100] An antisense oligomer hybridized to a target sequence of a deficient PKD2 mRNA transcript, wherein the antisense oligomer contains an intron in which a deficient PKD2 mRNA transcript is retained, and the antisense oligomer is deficient. An antisense oligomer that triggers splicing out of retained introns from the PKD2 mRNA transcript that is present;
  A pharmaceutically acceptable excipient, diluent, or carrier.
Pharmaceutical composition.
[Item 101] The pharmaceutical composition according to item 100, wherein the deficient PKD2 mRNA transcript is a PKD2 RIC pre-mRNA transcript.
[Item 102] The target portion of the PKD2 RIC pre-mRNA transcript is in the region from about +500 to the 5 'splice site of the retained intron to about -500 to the 3' splice site of the retained intron. 102. The pharmaceutical composition according to item 100 or 101, wherein the pharmaceutical composition is in the retained intron.
[Item 103] The PKD2 RIC pre-mRNA transcript is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% of SEQ ID NO: 1. 102. The pharmaceutical composition according to item 100 or 101, which is encoded by a gene sequence having the sequence identity of:
[Item 104] The PKD2 RIC pre-mRNA transcript is at least about 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% relative to SEQ ID NO: 2. 110. The pharmaceutical composition according to item 100 or 101, comprising a sequence having the sequence identity of
[Item 105] The pharmaceutical composition according to item 100, wherein the antisense oligomer comprises a backbone modification containing a phosphorothioate bond or a phosphorodiamidate bond.
[Item 106] The pharmaceutical composition according to item 100, wherein the antisense oligomer is an antisense oligonucleotide.
[Item 107] The item of Item 100, wherein the antisense oligomer comprises a phosphorodiamidate morpholino, a locked nucleic acid, a peptide nucleic acid, a 2′-O-methyl, 2′-fluoro, or 2′-O-methoxyethyl moiety. Pharmaceutical composition.
[Item 108] The pharmaceutical composition according to item 100, wherein the antisense oligomer comprises at least one modified sugar moiety.
[Item 109] The antisense oligomer includes 8 to 50 nucleobases, 8 to 40 nucleobases, 8 to 35 nucleobases, 8 to 30 nucleobases, 8 to 25 nucleobases, and 8 to 20 nucleobases , 8-15 nucleobases, 9-50 nucleobases, 9-40 nucleobases, 9-35 nucleobases, 9-30 nucleobases, 9-25 nucleobases, 9-20 nucleobases, 9-15 nucleobases, 10-50 nucleobases, 10-40 nucleobases, 10-35 nucleobases, 10-30 nucleobases, 10-25 nucleobases, 10-20 nucleobases, 10-20 nucleobases, To 15 nucleobases, 11 to 50 nucleobases, 11 to 40 nucleobases, 11 to 35 nucleobases, 11 to 30 nucleobases, 11 to 25 nucleobases, 11 to 20 nucleobases, 11 to 11 15 nucleobases, 12 to 50 nucleobases, 12 to 40 nucleic acids 100. The pharmaceutical composition of item 100, comprising a base, 12-35 nucleobases, 12-30 nucleobases, 12-25 nucleobases, 12-20 nucleobases, or 12-15 nucleobases.
[Item 110] The antisense oligomer is at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, at least 98%, at least 99%, or 100% complementary to the target portion of the PKD2 RIC pre-mRNA transcript. A pharmaceutical composition according to item 100 or 101.
[Item 111] The pharmaceutical composition according to item 100 or 101, wherein the target portion of the PKD2 RIC pre-mRNA transcript is in SEQ ID NO: 281.
[Item 112] The antisense oligomer has at least about 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, or 90% of any one of SEQ ID NOs: 3 to 280. 110. The pharmaceutical composition of claim 100, comprising a nucleotide sequence that is 96%, 97%, 98%, or 99% sequence identity.
[Item 113] The pharmaceutical composition according to item 100, wherein the antisense oligomer comprises a nucleotide sequence selected from SEQ ID NOs: 3-280.
[Item 114] The pharmaceutical composition according to any one of Items 100 to 113, wherein the pharmaceutical composition is formulated for intrathecal injection, intraventricular injection, intraperitoneal injection, intramuscular injection, subcutaneous injection, or intravenous injection. The pharmaceutical composition according to any one of the preceding claims.
[Item 115] Treatment of a missing PKD2 mRNA transcript to facilitate removal of retained introns to generate a fully processed PKD2 mRNA transcript encoding a functional form of the PC-2 protein A method of inducing
  The method comprises:
(A) contacting an antisense oligomer with target cells of a subject;
(B) hybridizing the antisense oligomer to the missing PKD2 mRNA transcript, wherein the missing PKD2 mRNA transcript can encode a functional form of the PC-2 protein; Including at least one retained intron,
(C) removing at least one retained intron from the missing PKD2 mRNA transcript to produce a fully processed PKD2 mRNA transcript encoding a functional form of the PC-2 protein; ,
(D) translating a functional form of the PC-2 protein from the fully processed PKD2 mRNA transcript;
Including, methods.
[Item 116] The method of Item 115, wherein the retained intron is the entire retained intron.
[Item 117] The method according to item 115, wherein the deficient PKD2 mRNA transcript is a PKD2 pre-mRNA transcript.
[Item 118] A method of treating a subject having a disease caused by a deficiency in the amount and activity of PC2 protein,
  SEQ ID NO: at least about 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, for any one of 3-280 Alternatively, a method comprising administering to the subject an antisense oligomer comprising a nucleotide sequence with 99% sequence identity.

Claims

A pharmaceutical composition comprising an antisense oligomer (ASO) complementary to a target portion of a retained intron-containing pre-mRNA (RIC pre-mRNA) encoding a PC-2 protein , wherein the RIC pre-mRNA comprises a retained RIC pre-mRNA. ASO comprising a retained intron, an exon adjacent to the 5 'splice site of the retained intron, and an exon adjacent to the 3' splice site of the retained intron, wherein the ASO is a RIC pre-mRNA in a cell that expresses a RIC pre-mRNA by binding to and held intron it is constitutively spliced from RIC mRNA precursor, thereby the level of mRNA encoding a PC-2 protein increases in a cell, the pharmaceutical composition.

The pharmaceutical composition according to claim 1, for use as a medicament.

The pharmaceutical composition according to claim 1 or 2 for use in treating polycystic kidney disease in a subject.

Target portion of the RIC mRNA precursors, 'to +6 relative to the splice site, 3 of the retained intron 5' of the retained intron in -16 region with respect to the splice site, any claim 1-3 The pharmaceutical composition according to claim 1.

RIC mRNA precursor, SEQ ID NO: at least 80% 2, 85%, 90%, 95%, 97%, or a sequence having 100% sequence identity, of claims 1 to 4 The pharmaceutical composition according to any one of the preceding claims .

The target portion of the RIC pre-mRNA has at least 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to the region comprising at least eight adjacent nucleic acids of SEQ ID NO: 281. The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 5, comprising a sequence comprising:

The ASO comprises a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, or 100% sequence identity to a sequence selected from SEQ ID NOs: 3-280. The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 6 .

PC-2 protein compared to the equivalent wild-type protein:
i) a form with reduced function ; or
ii) a fully functional form,
The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 7, which is produced by:

ASOs include backbone modifications that include phosphorothioate or phosphorodiamidate linkages ; or modified sugar moieties or analogs , phosphorodiamidate morpholinos, locked nucleic acids, peptide nucleic acids, 2′-O-methyl moieties, 2 ′ The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 8 , which may comprise a -fluoro moiety or a 2'-O-methoxyethyl moiety .

ASO is composed of nucleobases 8-50, pharmaceutical composition according to any one of claims 1-9.

The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 10, wherein the PC-2 protein is deficient in amount or activity in the subject to be treated.

The PC-2 protein is deficient in amount or activity in the subject to be treated, and the deficient amount of PC-2 protein is caused by the haploinsufficiency of the PC-2 protein and the subject has a functional PC first allelic gene encoding 2 protein, and a second allele that encodes a second allele or nonfunctional PC-2 protein PC-2 protein is not generated, ASO is first The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 11 , which binds to a target portion of a RIC pre-mRNA transcribed from an allele of

The PC-2 protein is deficient in quantity or activity in the subject to be treated, the subject has a first mutated allele and a second mutated allele, and the PC-2 protein is:
(A) From the first mutant allele:
(I) produced at a reduced level as compared to production from the wild-type allele;
(Ii) produced in a reduced form compared to the equivalent wild-type PC-2 protein; or (iii) not produced, and (b) from the second mutant allele:
(I) produced at a reduced level as compared to production from the wild-type allele;
(Ii) produced in a reduced form compared to the equivalent wild-type PC-2 protein; or (iii) not produced,
Here, when the subject has the first mutant allele (a) (iii), the second mutant allele is (b) (i) or (b) (ii), and the subject has the first mutant allele. If there are two mutant alleles (b) (iii), the first mutant allele is (a) (i) or (a) (ii) and the RIC pre-mRNA is (a) (i) or (a) is transcribed from the second mutant allele is a first mutant allele or (b) (i) or (b) (ii) is (ii), of claim 1 to 11 The pharmaceutical composition according to any one of the preceding claims .

14. The pharmaceutical composition according to any one of claims 1 to 13 , wherein the ASO is administered by intrathecal injection, intraventricular injection, intraperitoneal injection, intramuscular injection, subcutaneous injection, or intravenous injection.

ASO is, does not increase the amount of mRNA encoding the PC-2 protein or PC-2 protein in the cell by regulating the alternative splicing of the mRNA precursor transcribed from a gene encoding PC-2 protein, wherein Item 15. The pharmaceutical composition according to any one of Items 1 to 14 .