JP2017201932A - Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid - Google Patents

Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid Download PDF

Info

Publication number
JP2017201932A
JP2017201932A JP2016095406A JP2016095406A JP2017201932A JP 2017201932 A JP2017201932 A JP 2017201932A JP 2016095406 A JP2016095406 A JP 2016095406A JP 2016095406 A JP2016095406 A JP 2016095406A JP 2017201932 A JP2017201932 A JP 2017201932A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
reagent
common
target nucleic
analysis
nucleic acid
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2016095406A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
秀章 田副
Hideaki Tazoe
秀章 田副
智史 間嶋
Satoshi Majima
智史 間嶋
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Arkray Inc
Original Assignee
Arkray Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Arkray Inc filed Critical Arkray Inc
Priority to JP2016095406A priority Critical patent/JP2017201932A/en
Publication of JP2017201932A publication Critical patent/JP2017201932A/en
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a reagent cartridge capable of analyzing at a component concentration suitable for oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid, in analysis of a plurality of target nucleic acids, to provide an apparatus for analyzing a target nucleic acid, and to provide a method for analyzing a target nucleic acid.SOLUTION: A reagent cartridge for analyzing a target nucleic acid is disclosed, a cartridge 1 for analyzing a first target nucleic acid having at least one common reagent bath 11, a plurality of concentration adjustment reagent baths 12, and a plurality of non-common reagent baths 13, the common reagent bath(s) 11 being filled with a common reagent respectively containing a plurality of components usable in common with analysis of a plurality of target nucleic acids, the plurality of concentration adjustment reagent baths 12 being filled with a concentration adjustment reagent respectively containing at a different concentration at least one component usable in common with analysis of a plurality of target nucleic acids, and the plurality of non-common reagent baths 13 being capable of being filled with a non-common reagent containing oligonucleotide for analysis for analyzing a particular target nucleic acid.SELECTED DRAWING: Figure 1

Description

本発明は、標的核酸の分析用試薬カートリッジ、標的核酸の分析装置、および標的核酸の分析方法に関する。   The present invention relates to a target nucleic acid analysis reagent cartridge, a target nucleic acid analysis apparatus, and a target nucleic acid analysis method.

特許文献1には、PCR等の遺伝子解析において、共通して使用可能な共通試薬が充填された共通試薬槽と、標的核酸に応じて使用者が用意するプライマー等の分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬を充填可能な非共通試薬槽とを有する試薬カートリッジが記載されている。   Patent Document 1 includes a common reagent tank filled with a common reagent that can be commonly used in gene analysis such as PCR, and a non-analysis oligonucleotide such as a primer prepared by a user according to a target nucleic acid. A reagent cartridge having a non-common reagent tank capable of being filled with a common reagent is described.

特許第5498944号Patent No. 5498944

特許文献1において、前記共通試薬槽は、1つの試薬につき1つの槽が設けられ、各槽に所定濃度の試薬が充填されている。このため、ある成分について、プライマーやプローブ等の特性に合わせ、同じ試薬でも異なる濃度とすることが必要とされる場合、例えば、前記所定濃度よりも低濃度の成分が必要とされる場合、特許文献1のカートリッジは、前記成分の濃度が所定濃度であるため、前記成分のみを異なる濃度とすることが困難であった。   In Patent Document 1, one common reagent tank is provided for each reagent, and each tank is filled with a reagent of a predetermined concentration. For this reason, if it is necessary for a certain component to have different concentrations even with the same reagent in accordance with the characteristics of the primer, probe, etc., for example, if a component having a concentration lower than the predetermined concentration is required, In the cartridge of Document 1, since the concentration of the component is a predetermined concentration, it is difficult to make only the component have a different concentration.

さらに、1つのサンプルに対して、複数の標的遺伝子等の複数の標的核酸を測定する場合、1つのカートリッジにおいて、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに対応した異なる成分の濃度の分析系を調製し、分析することが要求されるが、特許文献1のカートリッジでは対応が困難であった。   Furthermore, when measuring a plurality of target nucleic acids such as a plurality of target genes for one sample, an analysis system having different component concentrations corresponding to each target nucleic acid analysis oligonucleotide is prepared in one cartridge. However, it is difficult to cope with the cartridge of Patent Document 1.

そこで、本発明は、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で分析を行うことが可能な試薬カートリッジ、標的核酸の分析装置、および標的核酸の分析方法の提供を目的とする。   Therefore, the present invention provides a reagent cartridge, a target nucleic acid analyzer, and a target nucleic acid analysis method capable of performing analysis at a component concentration suitable for an oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid in analysis of a plurality of target nucleic acids. The purpose is to provide.

前記本発明の課題を解決するために、本発明の第1の標的核酸の分析用試薬カートリッジ(以下、「カートリッジ」ともいう)は、少なくとも1つの共通試薬槽と、複数の濃度調整試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。
In order to solve the problems of the present invention, a reagent cartridge for analyzing a first target nucleic acid (hereinafter also referred to as “cartridge”) of the present invention comprises at least one common reagent tank, a plurality of concentration adjusting reagent tanks, A plurality of non-common reagent vessels,
Each of the common reagent tanks is filled with a common reagent containing a plurality of components that can be used in common for analysis of a plurality of target nucleic acids,
Each of the plurality of concentration adjustment reagent tanks is filled with a concentration adjustment reagent containing at least one component that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids at different concentrations,
Each of the plurality of non-common reagent tanks can be filled with a non-common reagent containing an analytical oligonucleotide for analyzing a specific target nucleic acid.

本発明の第2のカートリッジは、複数の共通試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分を異なる濃度で含み、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。
The second cartridge of the present invention has a plurality of common reagent reservoirs and a plurality of non-common reagent reservoirs,
Each of the common reagent tanks is filled with a common reagent containing a plurality of components that can be used in common for analysis of a plurality of target nucleic acids,
Each of the common reagents includes at least one component of the plurality of components at different concentrations,
Each of the plurality of non-common reagent tanks can be filled with a non-common reagent containing an analytical oligonucleotide for analyzing a specific target nucleic acid.

本発明の第1の標的核酸の分析装置(以下、「分析装置」ともいう)は、前記本発明の第1のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも1つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする。
A first target nucleic acid analyzer of the present invention (hereinafter, also referred to as “analyzer”) includes a cartridge housing portion in which the first cartridge of the present invention is housed,
Mixing a sample, a common reagent filled in the common reagent tank, at least one concentration adjusting reagent filled in the concentration adjusting reagent tank, and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank A preparation unit for preparing an analysis system for the target nucleic acid,
And an analysis unit for analyzing the target nucleic acid by analyzing the analysis system.

本発明の第1の標的核酸の分析方法(以下、「分析方法」ともいう)は、前記本発明の第1のカートリッジを用い、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも1つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする。
The first target nucleic acid analysis method of the present invention (hereinafter also referred to as “analysis method”) uses the first cartridge of the present invention,
Mixing a sample, a common reagent filled in the common reagent tank, at least one concentration adjusting reagent filled in the concentration adjusting reagent tank, and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank A preparation step of preparing an analysis system for the target nucleic acid,
An analysis step of analyzing the target nucleic acid by analyzing the analysis system.

本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。このため、本発明によれば、例えば、より優れた分析精度で標的核酸を分析できる。   According to the present invention, in analysis of a plurality of target nucleic acids, a reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid. Therefore, according to the present invention, for example, the target nucleic acid can be analyzed with better analysis accuracy.

図1(A)は、実施形態1のカートリッジの構成を示す斜視図であり、(B)は、前記(A)のI−I方向から見た断面図である。FIG. 1A is a perspective view illustrating a configuration of a cartridge according to the first embodiment, and FIG. 1B is a cross-sectional view as viewed from the II direction of FIG. 図2(A)は、実施形態2のカートリッジの構成を示す斜視図であり、(B)は、前記(A)のII−II方向から見た断面図である。FIG. 2A is a perspective view showing the configuration of the cartridge of Embodiment 2, and FIG. 2B is a cross-sectional view as seen from the II-II direction of FIG. 図3(A)は、実施形態3のカートリッジの構成を示す斜視図であり、(B)は、前記(A)のIII−III方向から見た断面図である。FIG. 3A is a perspective view showing the configuration of the cartridge according to the third embodiment, and FIG. 3B is a cross-sectional view taken from the III-III direction of FIG. 図4は、実施形態4の分析装置の構成を示すブロック図である。FIG. 4 is a block diagram illustrating a configuration of the analyzer according to the fourth embodiment.

本発明の第1のカートリッジは、例えば、前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬および前記濃度調整試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である。
In the first cartridge of the present invention, for example, the components contained at different concentrations in the concentration adjusting reagent are:
In the analysis of the target nucleic acid, it is a component whose concentration is adjusted according to the type of analysis oligonucleotide of the non-common reagent used in combination with the common reagent and the concentration adjusting reagent.

本発明の第1のカートリッジは、例えば、前記共通試薬が、前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる成分を含まない。   In the first cartridge of the present invention, for example, the common reagent does not include a component that is contained at a different concentration in the concentration adjusting reagent.

本発明の第2のカートリッジは、例えば、前記共通試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である。
In the second cartridge of the present invention, for example, the components contained in the common reagent at different concentrations are
In the analysis of the target nucleic acid, it is a component whose concentration is adjusted according to the kind of the oligonucleotide for analysis of the non-common reagent used in combination with the common reagent.

本発明の第1および第2のカートリッジは、例えば、前記異なる濃度で含まれる成分が、マグネシウムイオン、カリウムイオン、マンガンイオン、ナトリウムイオン、およびアンモニウムイオンからなる群から選択された少なくとも1つであり、好ましくは、マグネシウムイオンである。   In the first and second cartridges of the present invention, for example, the components contained in the different concentrations are at least one selected from the group consisting of magnesium ions, potassium ions, manganese ions, sodium ions, and ammonium ions. Preferably, it is a magnesium ion.

本発明の第1および第2のカートリッジは、例えば、前記分析用オリゴヌクレオチドが、前記標的核酸を増幅可能なプライマーであり、好ましくは、さらに、前記標的核酸を検出可能なプローブを含む。   In the first and second cartridges of the present invention, for example, the oligonucleotide for analysis is a primer capable of amplifying the target nucleic acid, and preferably further includes a probe capable of detecting the target nucleic acid.

本発明の第1および第2のカートリッジは、例えば、前記非共通試薬槽に、前記非共通試薬が予め充填されている。   In the first and second cartridges of the present invention, for example, the non-common reagent tank is pre-filled with the non-common reagent.

本発明の第1および第2のカートリッジは、例えば、各非共通試薬槽に充填された非共通試薬が、それぞれ、異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを含む。   In the first and second cartridges of the present invention, for example, each non-common reagent filled in each non-common reagent tank contains oligonucleotides for analyzing different target nucleic acids.

本発明の第1の分析装置は、例えば、前記調製部において、前記サンプル、少なくとも2つの前記濃度調整試薬、および少なくとも1つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。   The first analyzer of the present invention prepares the analysis system by, for example, mixing the sample, at least two concentration adjusting reagents, and at least one non-common reagent in the preparation unit.

本発明の分析方法は、例えば、前記調製工程において、前記サンプル、少なくとも2つの前記濃度調整試薬、および少なくとも1つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。   In the analysis method of the present invention, for example, in the preparation step, the analysis system is prepared by mixing the sample, at least two concentration adjusting reagents, and at least one non-common reagent.

<第1の標的核酸の分析用試薬カートリッジ>
本発明の第1のカートリッジは、前述のように、少なくとも1つの共通試薬槽と、複数の濃度調整試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。本発明の第1のカートリッジは、複数の濃度調整試薬槽を有し、前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されていることが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。
<First reagent kit for analyzing target nucleic acid>
As described above, the first cartridge of the present invention has at least one common reagent tank, a plurality of concentration-adjusting reagent tanks, and a plurality of non-common reagent tanks. Are filled with a common reagent containing a plurality of components that can be commonly used for analysis of target nucleic acids, and each of the plurality of concentration adjusting reagent tanks is at least commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids. Concentration adjustment reagents containing different concentrations of one component are filled, and each of the plurality of non-common reagent tanks can be filled with a non-common reagent containing an analysis oligonucleotide for analyzing a specific target nucleic acid. It is characterized by. The first cartridge of the present invention has a plurality of concentration adjustment reagent tanks, and each of the plurality of concentration adjustment reagent tanks has at least one component that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids at different concentrations. It is characterized by being filled with a concentration adjusting reagent contained in the above, and other configurations and conditions are not particularly limited.

本発明の第1のカートリッジは、前述のように、複数の濃度調整試薬槽を有し、前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されている。このため、例えば、2つの標的核酸を分析する場合、前記異なる濃度で含まれる成分(以下、「調整成分」ともいう)を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度に設定しておくことで、サンプル、前記共通試薬、最適な濃度に設定された前記濃度調整試薬、および対応する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬を、それぞれ予め定めた量で混合することにより、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。また、3以上の標的核酸を分析する場合、前記調整成分のうち1つを、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も高い成分濃度以上に設定し、別の1つを、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も低い成分濃度以下に設定しておくことで、例えば、これら2つの調整成分を含む濃度調整試薬と、サンプル、前記共通試薬、および前記非共通試薬とを、それぞれ予め定めた量で混合することで、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。したがって、本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。さらに、本発明の第1のカートリッジによれば、前記調整成分が前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系とすることができるため、例えば、より優れた分析精度で前記標的核酸を分析できる。   As described above, the first cartridge of the present invention has a plurality of concentration adjustment reagent tanks, and each of the plurality of concentration adjustment reagent tanks can be used in common for analysis of a plurality of target nucleic acids. A concentration-adjusting reagent containing two components at different concentrations is packed. For this reason, for example, when analyzing two target nucleic acids, the components contained in the different concentrations (hereinafter also referred to as “adjusting components”) are optimal according to the type of the oligonucleotide used for analyzing each target nucleic acid. By setting the appropriate concentration, the sample, the common reagent, the concentration adjusting reagent set to the optimum concentration, and the non-common reagent containing the corresponding analytical oligonucleotide are mixed in a predetermined amount. Thus, an analysis system suitable for the analysis oligonucleotide can be easily prepared. Also, when analyzing three or more target nucleic acids, one of the adjustment components is set to the highest component concentration or higher among the optimum concentrations according to the type of oligonucleotide for analysis for analyzing each target nucleic acid. However, by setting another one below the lowest component concentration among the optimal concentrations according to the type of oligonucleotide for analysis for analyzing each target nucleic acid, for example, these two adjustment components An analysis system suitable for the oligonucleotide for analysis can be easily prepared by mixing a concentration adjusting reagent containing a sample, the common reagent, and the non-common reagent in a predetermined amount. Therefore, according to the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid. Furthermore, according to the first cartridge of the present invention, since the adjustment component can be an analysis system suitable for the analysis oligonucleotide, the target nucleic acid can be analyzed with better analysis accuracy, for example.

本発明において、分析とは、例えば、前記標的核酸の有無を判断する定性分析でもよいし、前記標的核酸の量を判断する定量分析でもよい。   In the present invention, the analysis may be, for example, a qualitative analysis for determining the presence or absence of the target nucleic acid, or a quantitative analysis for determining the amount of the target nucleic acid.

本発明において、カートリッジの材質は、特に制限されず、例えば、プラスチック等があげられる。   In the present invention, the material of the cartridge is not particularly limited, and examples thereof include plastic.

本発明において、前記共通試薬は、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む。前記共通試薬が含む複数の成分は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の分析方法に応じて、適宜決定できる。前記分析方法がPCR等の核酸増幅方法を含む場合、前記共通試薬が含む複数の成分は、例えば、核酸増幅方法に使用される試薬があげられ、具体例として、耐熱DNAポリメラーゼ等のDNAポリメラーゼ、デオキシヌクレオチド三リン酸(dNTP)、牛血清アルブミン等のアルブミン、アジ化ナトリウム等の防腐剤等があげられる。前記共通試薬が含む複数の成分の濃度は、特に制限されず、例えば、前記各分析方法に応じて適宜設定できる。前記共通試薬は、後述する濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる成分を含まないことが好ましい。これにより、サンプル、前記共通試薬、前記濃度調整試薬、および前記非共通試薬を混合した分析系において、前記調整成分の濃度をより簡便に調整できる。前記共通試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬(乾燥試薬)でもよい。前者の場合、前記共通試薬は、例えば、溶媒に、前記共通試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記溶媒は、特に制限されず、例えば、水、Tris−HCl、Tricine、MES、MOPS、HEPES、CAPS等の緩衝液等があげられ、具体例として、市販のPCR用緩衝液、市販のPCRキットの緩衝液等があげられる。   In the present invention, the common reagent includes a plurality of components that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids. The plurality of components contained in the common reagent are not particularly limited, and can be appropriately determined according to, for example, the target nucleic acid analysis method. When the analysis method includes a nucleic acid amplification method such as PCR, the plurality of components included in the common reagent include, for example, reagents used in the nucleic acid amplification method. Specific examples include a DNA polymerase such as a heat-resistant DNA polymerase, Examples include deoxynucleotide triphosphate (dNTP), albumin such as bovine serum albumin, and preservatives such as sodium azide. The concentration of the plurality of components contained in the common reagent is not particularly limited, and can be appropriately set according to, for example, each analysis method. It is preferable that the common reagent does not contain components that are contained at different concentrations in the concentration adjusting reagent described later. This makes it possible to more easily adjust the concentration of the adjustment component in the analysis system in which the sample, the common reagent, the concentration adjusting reagent, and the non-common reagent are mixed. The common reagent may be, for example, a liquid reagent or a solid reagent (dry reagent). In the former case, the common reagent is, for example, a reagent in which the common reagent is dissolved, suspended, or mixed in a solvent. The solvent is not particularly limited, and examples thereof include buffers such as water, Tris-HCl, Tricine, MES, MOPS, HEPES, and CAPS. Specific examples include commercially available PCR buffers and commercially available PCR kits. And the like.

本発明において、前記標的核酸は、例えば、DNAでもよいし、RNAでもよい。前記標的核酸の分析は、例えば、前記標的核酸における分析対象の分析ということもできる。前記標的核酸における分析対象は、特に制限されず、例えば、一塩基多型(SNP)、遺伝子、遺伝子変異、ノンコーディングRNA、染色体、染色体異常等があげられる。前記遺伝子変異は、例えば、遺伝子における1以上の塩基の欠失、置換、挿入、および/または付加等があげられる。前記染色体異常は、例えば、染色体の断片化、欠失、重複、逆位、転位、転座、付着、および/または欠失等があげられる。本発明において、前記標的核酸は、例えば、1つでもよいし、複数でもよい。前者の場合、前記標的核酸は、例えば、複数の分析対象を含む。   In the present invention, the target nucleic acid may be, for example, DNA or RNA. The analysis of the target nucleic acid can also be referred to as analysis of an analysis target in the target nucleic acid, for example. The analysis target in the target nucleic acid is not particularly limited, and examples thereof include single nucleotide polymorphism (SNP), gene, gene mutation, non-coding RNA, chromosome, chromosome abnormality and the like. Examples of the gene mutation include deletion, substitution, insertion, and / or addition of one or more bases in the gene. Examples of the chromosomal abnormality include chromosome fragmentation, deletion, duplication, inversion, translocation, translocation, attachment, and / or deletion. In the present invention, the target nucleic acid may be, for example, one or plural. In the former case, the target nucleic acid includes, for example, a plurality of analysis objects.

本発明において、前記濃度調整試薬は、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む。前記調整成分は、例えば、前記標的核酸の分析において、前記共通試薬および前記濃度調整試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分ともいえる。前記濃度調整試薬における前記調整成分の濃度は、例えば、前記分析用オリゴヌクレオチドの塩基配列に応じて、当業者であれば、適宜設定できる。また、各濃度調整試薬間における前記調整成分の濃度比は、特に制限されず、例えば、前記分析用オリゴヌクレオチドに応じて適宜設定できる。前記調整成分の具体例としては、例えば、マグネシウムイオン、カリウムイオン、マンガンイオン、ナトリウムイオン、アンモニウムイオン等があげられ、好ましくは、マグネシウムイオンである。前記濃度調整試薬において、前記調整成分は、例えば、前記濃度調整試薬が含む塩に由来するイオンである。前記調整成分は、1つでもよいし、複数でもよい。前記濃度調整試薬の数は、複数であればよく、例えば、2〜4である。前記複数の濃度調整試薬は、それぞれ、少なくとも1つの成分を異なる濃度で含めばよく、その他の成分の濃度は、同じでもよいし、異なってもよい。前記調整成分がマグネシウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるマグネシウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が1〜10mmol/Lとなる濃度である。前記調整成分がカリウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるカリウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が0〜75mmol/L、0mmol/Lを超え、75mmol/L以下となる濃度である。前記調整成分がナトリウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるナトリウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が0〜75mmol/L、0mmol/Lを超え、75mmol/L以下となる濃度である。前記調整成分がマンガンイオンの場合、各濃度調整試薬におけるマンガンイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が0〜1mmol/L、0mmol/Lを超え、1mmol/L以下となる濃度である。前記調整成分がアンモニウムイオンの場合、各濃度調整試薬におけるアンモニウムイオンの濃度は、例えば、前記分析系における濃度が5〜30mmol/Lとなる濃度である。前記濃度調整試薬の数が3以上の場合、いずれか2つの濃度調整試薬において、前記調整成分の濃度は、同じでもよい。前記濃度調整試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬(乾燥試薬)でもよい。前者の場合、前記濃度調整試薬は、例えば、溶媒に、前記濃度調整試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記溶媒は、例えば、前述の説明を援用できる。前記溶媒は、例えば、前記共通試薬と同じでもよいし、異なってもよい。前記濃度調整試薬が固体試薬の場合、前記調整成分の濃度は、例えば、前記カートリッジにおいて、予め定められた量の溶媒に溶解、懸濁または混合等した際の濃度である。   In the present invention, the concentration adjusting reagent contains at least one component that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids at different concentrations. The adjustment component can be said to be a component whose concentration is adjusted according to the type of oligonucleotide for analysis of the non-common reagent used in combination with the common reagent and the concentration adjustment reagent in the analysis of the target nucleic acid, for example. . The concentration of the adjustment component in the concentration adjustment reagent can be appropriately set by those skilled in the art, for example, according to the base sequence of the oligonucleotide for analysis. In addition, the concentration ratio of the adjustment component between the concentration adjustment reagents is not particularly limited, and can be appropriately set according to, for example, the analysis oligonucleotide. Specific examples of the adjustment component include magnesium ion, potassium ion, manganese ion, sodium ion, ammonium ion, and the like, and preferably magnesium ion. In the concentration adjusting reagent, the adjusting component is, for example, an ion derived from a salt contained in the concentration adjusting reagent. The adjustment component may be one or plural. The number of the concentration adjusting reagents may be plural, for example, 2 to 4. Each of the plurality of concentration adjusting reagents may include at least one component at a different concentration, and the concentrations of the other components may be the same or different. When the adjustment component is magnesium ion, the concentration of magnesium ion in each concentration adjustment reagent is, for example, a concentration at which the concentration in the analysis system is 1 to 10 mmol / L. When the adjustment component is potassium ion, the concentration of potassium ion in each concentration adjustment reagent is, for example, such that the concentration in the analysis system is 0 to 75 mmol / L, exceeds 0 mmol / L, and is 75 mmol / L or less. When the adjustment component is sodium ion, the concentration of sodium ion in each concentration adjustment reagent is, for example, such that the concentration in the analysis system is 0 to 75 mmol / L, more than 0 mmol / L, and 75 mmol / L or less. When the adjustment component is manganese ions, the concentration of manganese ions in each concentration adjustment reagent is, for example, such that the concentration in the analysis system is 0 to 1 mmol / L, more than 0 mmol / L, and 1 mmol / L or less. When the adjustment component is ammonium ions, the concentration of ammonium ions in each concentration adjustment reagent is, for example, a concentration at which the concentration in the analysis system is 5 to 30 mmol / L. When the number of the concentration adjusting reagents is 3 or more, the concentration of the adjusting component in any two concentration adjusting reagents may be the same. The concentration adjusting reagent may be, for example, a liquid reagent or a solid reagent (dry reagent). In the former case, the concentration adjusting reagent is, for example, a reagent obtained by dissolving, suspending, or mixing the concentration adjusting reagent in a solvent. As the solvent, for example, the above description can be used. For example, the solvent may be the same as or different from the common reagent. When the concentration adjusting reagent is a solid reagent, the concentration of the adjusting component is, for example, the concentration when dissolved, suspended, or mixed in a predetermined amount of solvent in the cartridge.

本発明において、前記非共通試薬は、前記特定の標的核酸を分析する前記分析用オリゴヌクレオチドを含む。本発明において、前記分析用オリゴヌクレオチドは、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の種類に応じて、適宜決定できる。具体例として、前記分析用オリゴヌクレオチドは、例えば、プライマーがあげられる。前記プライマーは、例えば、前記標的核酸を増幅可能なプライマーでもよいし、前記標的核酸を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマーでもよく、具体例として、前記標的核酸を増幅可能なフォワードプライマーとリバースプライマーとを含むプライマーセット、前記標的核酸を含むポリヌクレオチドを増幅可能なフォワードプライマーとリバースプライマーとを含むプライマーセットがあげられる。前記分析用オリゴヌクレオチドが前記プライマーを含む場合、前記分析用オリゴヌクレオチドは、さらに、前記プライマーに加えて、または代えてプローブを含んでもよい。前記プローブは、例えば、前記標的核酸を検出可能なプローブであり、より具体的には、前記プライマーにより増幅された増幅断片において、前記標的核酸を検出可能なプローブである。前記分析用オリゴヌクレオチドが前記プライマーおよびプローブを含む場合、前記プライマーおよびプローブは、別個の非共通試薬槽に配置してもよい。前記プライマーおよび前記プローブは、例えば、それぞれ、標識物質により標識されていてもよい。本発明において、前記プライマーおよび前記プローブの塩基配列は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の種類およびその塩基配列等に応じて、当業者であれば、適宜設計できる。   In the present invention, the non-common reagent includes the analysis oligonucleotide for analyzing the specific target nucleic acid. In the present invention, the analytical oligonucleotide is not particularly limited, and can be appropriately determined according to, for example, the type of the target nucleic acid. As a specific example, the oligonucleotide for analysis includes, for example, a primer. The primer may be, for example, a primer capable of amplifying the target nucleic acid or a primer capable of amplifying a polynucleotide containing the target nucleic acid. As a specific example, a forward primer and a reverse primer capable of amplifying the target nucleic acid And a primer set including a forward primer and a reverse primer capable of amplifying a polynucleotide including the target nucleic acid. When the analysis oligonucleotide includes the primer, the analysis oligonucleotide may further include a probe in addition to or instead of the primer. The probe is, for example, a probe that can detect the target nucleic acid, and more specifically, a probe that can detect the target nucleic acid in an amplified fragment amplified by the primer. When the analytical oligonucleotide includes the primer and probe, the primer and probe may be placed in separate non-common reagent vessels. The primer and the probe may be labeled with a labeling substance, for example. In the present invention, the base sequences of the primer and the probe are not particularly limited, and can be appropriately designed by those skilled in the art according to, for example, the type of the target nucleic acid and the base sequence thereof.

前記非共通試薬は、例えば、前記共通試薬が含む、前記複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分の一部を含んでもよく、具体例として、前記分析方法が核酸増幅方法を含む場合、前記非共通試薬が、dNTPを含んでもよい。この場合、前記共通試薬が、dNTPを含まないことが好ましい。前記非共通試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬(乾燥試薬)でもよい。前者の場合、前記非共通試薬は、例えば、溶媒に、前記非共通試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記溶媒は、例えば、前述の説明を援用できる。前記溶媒は、例えば、前記共通試薬および/または前記濃度調整試薬と同じでもよいし、異なってもよい。   The non-common reagent may include, for example, a part of a plurality of components that can be commonly used for analysis of the plurality of target nucleic acids included in the common reagent. As a specific example, the analysis method is a nucleic acid amplification method. The non-common reagent may contain dNTPs. In this case, it is preferable that the common reagent does not contain dNTP. The non-common reagent may be, for example, a liquid reagent or a solid reagent (dry reagent). In the former case, the non-common reagent is, for example, a reagent obtained by dissolving, suspending, or mixing the non-common reagent in a solvent. As the solvent, for example, the above description can be used. For example, the solvent may be the same as or different from the common reagent and / or the concentration adjusting reagent.

以下、本発明の第1のカートリッジおよびそれを用いた分析方法について、図面を参照して、例をあげて詳細に説明する。ただし、本発明は、以下の例に限定および制限されない。また、図面においては、説明の便宜上、各部の構造は適宜簡略化して示す場合があり、各部の寸法比等は、実際とは異なり、模式的に示す場合がある。各実施形態は、特に言及しない限り、互いに組合せ可能である。   Hereinafter, a first cartridge of the present invention and an analysis method using the same will be described in detail with reference to the drawings. However, the present invention is not limited or limited to the following examples. In the drawings, for convenience of explanation, the structure of each part may be simplified as appropriate, and the dimensional ratio of each part may be schematically shown, unlike the actual case. Each embodiment can be combined with each other unless otherwise specified.

(実施形態1)
図1は、実施形態1のカートリッジの概略を示す図面であり、(A)は、実施形態1のカートリッジの斜視図を示し、(B)は、前記(A)のI−I方向に見た断面図である。図1(A)に示すように、本実施形態のカートリッジ1は、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12、および非共通試薬槽13を含む。また、図1(B)に示すように、共通試薬槽11には、前記複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬111が充填されている。そして、濃度調整試薬槽12は、濃度調整試薬槽12a、12bに分かれており、濃度調整試薬槽12a、12bには、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬112a、112bが、それぞれ、充填されている。さらに、非共通試薬槽13は、非共通試薬槽13a、13bに分かれている。本実施形態のカートリッジ1における各槽は、一端から他端に向かって、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12a、12b、非共通試薬槽13a、13bがこの順序で配置されているが、本発明はこれに限定されず、各槽は、任意の順序で配置できる。
(Embodiment 1)
1A and 1B are schematic views of a cartridge according to a first embodiment. FIG. 1A is a perspective view of the cartridge according to the first embodiment, and FIG. 1B is a view in the II direction of FIG. It is sectional drawing. As shown in FIG. 1A, the cartridge 1 of the present embodiment includes a common reagent tank 11, a concentration adjusting reagent tank 12, and a non-common reagent tank 13. Further, as shown in FIG. 1B, the common reagent tank 11 is filled with a common reagent 111 containing a plurality of components that can be used in common for the analysis of the plurality of target nucleic acids. The concentration adjustment reagent tank 12 is divided into concentration adjustment reagent tanks 12a and 12b, and at least one component that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids differs in the concentration adjustment reagent tanks 12a and 12b. Concentration adjusting reagents 112a and 112b including the concentration are filled, respectively. Further, the non-common reagent tank 13 is divided into non-common reagent tanks 13a and 13b. Each tank in the cartridge 1 of this embodiment has a common reagent tank 11, concentration adjusting reagent tanks 12a and 12b, and non-common reagent tanks 13a and 13b arranged in this order from one end to the other end. The invention is not limited to this, and each tank can be arranged in any order.

本実施形態のカートリッジ1において、共通試薬槽11は、1つであるが、本発明はこれに限定されず、複数としてもよく、具体例として、共通試薬槽11の数は、1〜2である。共通試薬槽11を複数含む場合、各共通試薬槽は、同じ成分を有する共通試薬が充填されていてもよいし、異なる成分を含む共通試薬が充填されていてもよい。前記共通試薬が同じ成分を含む場合、各共通試薬において、前記同じ成分は、同じ濃度でもよいし、異なる濃度でもよい。共通試薬槽11の容積は、特に制限されず、例えば、共通試薬槽11に充填される共通試薬111の体積に応じて、適宜設定できる。   In the cartridge 1 of the present embodiment, the number of the common reagent tank 11 is one, but the present invention is not limited to this, and may be plural. As a specific example, the number of the common reagent tanks 11 is 1-2. is there. When a plurality of common reagent tanks 11 are included, each common reagent tank may be filled with a common reagent having the same component, or may be filled with a common reagent containing different components. When the common reagent includes the same component, the same component may have the same concentration or a different concentration in each common reagent. The volume of the common reagent tank 11 is not particularly limited, and can be appropriately set according to the volume of the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11, for example.

本実施形態のカートリッジ1において、共通試薬槽11に充填された共通試薬111は、液体試薬であるが、本発明はこれに限定されず、乾燥試薬としてもよい。共通試薬111が液体試薬の場合、共通試薬槽11に充填された共通試薬111の体積は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の数に応じて、適宜設定できる。   In the cartridge 1 of the present embodiment, the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11 is a liquid reagent, but the present invention is not limited to this and may be a dry reagent. When the common reagent 111 is a liquid reagent, the volume of the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11 is not particularly limited, and can be appropriately set according to, for example, the number of target nucleic acids.

本実施形態のカートリッジ1において、濃度調整試薬槽12は、2つであるが、本発明はこれに限定されず、複数であればよく、具体例として、濃度調整試薬槽12の数は、2〜4である。濃度調整試薬槽12a、12bの容積は、特に制限されず、例えば、濃度調整試薬槽12に充填される濃度調整試薬112a、112bの体積に応じて、適宜設定できる。   In the cartridge 1 of the present embodiment, there are two concentration adjustment reagent tanks 12, but the present invention is not limited to this, and there may be a plurality, and as a specific example, the number of concentration adjustment reagent tanks 12 is two. ~ 4. The volume of the concentration adjustment reagent tanks 12a and 12b is not particularly limited, and can be appropriately set according to the volume of the concentration adjustment reagents 112a and 112b filled in the concentration adjustment reagent tank 12, for example.

本実施形態のカートリッジ1において、濃度調整試薬槽12a、12bに充填された濃度調整試薬112a、112bは、液体試薬であるが、本発明はこれに限定されず、乾燥試薬としてもよい。濃度調整試薬112a、112bが液体試薬の場合、濃度調整試薬槽12a、12bに充填された濃度調整試薬112a、112bの体積は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の数に応じて、適宜設定できる。   In the cartridge 1 of the present embodiment, the concentration adjusting reagents 112a and 112b filled in the concentration adjusting reagent tanks 12a and 12b are liquid reagents, but the present invention is not limited to this and may be a dry reagent. When the concentration adjusting reagents 112a and 112b are liquid reagents, the volume of the concentration adjusting reagents 112a and 112b filled in the concentration adjusting reagent tanks 12a and 12b is not particularly limited. For example, depending on the number of the target nucleic acids, Can be set.

本実施形態のカートリッジ1において、非共通試薬槽13は、2つであるが、本発明はこれに限定されず、複数であればよく、具体例として、非共通試薬槽13の数は、2〜4である。非共通試薬槽13a、13bの容積は、特に制限されず、例えば、非共通試薬槽13に充填される非共通試薬113a、113bの体積に応じて、適宜設定できる。   In the cartridge 1 of the present embodiment, the number of non-common reagent tanks 13 is two. However, the present invention is not limited to this, and a plurality of non-common reagent tanks 13 may be used. As a specific example, the number of non-common reagent tanks 13 is two. ~ 4. The volumes of the non-common reagent tanks 13a and 13b are not particularly limited, and can be appropriately set according to the volumes of the non-common reagents 113a and 113b filled in the non-common reagent tank 13, for example.

本実施形態のカートリッジ1において、非共通試薬槽13a、13bには、前記非共通試薬が充填されていないが、本発明はこれに限定されず、前記非共通試薬が充填されていてもよい。前記非共通試薬が充填されている場合、非共通試薬槽13a、13bに充填された共通試薬は、それぞれ、異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを含むことが好ましい。このように、前記標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む前記非共通試薬を予め調製し、非共通試薬槽13a、13bに充填しておくことで、より簡便に前記標的核酸の分析が実施できる。   In the cartridge 1 of the present embodiment, the non-common reagent tanks 13a and 13b are not filled with the non-common reagent, but the present invention is not limited to this, and the non-common reagent may be filled. When the non-common reagent is filled, the common reagent filled in the non-common reagent tanks 13a and 13b preferably includes different target nucleic acid analysis oligonucleotides. As described above, the non-common reagent containing the analytical oligonucleotide for analyzing the target nucleic acid is prepared in advance and filled in the non-common reagent tanks 13a and 13b, so that the target nucleic acid can be analyzed more easily. it can.

つぎに、本実施形態のカートリッジ1を用いた分析方法について、説明する。まず、カートリッジ1の非共通試薬槽13a、13bに、それぞれ、非共通試薬を充填する。つぎに、サンプルと、共通試薬槽11に充填された共通試薬111と、濃度調整試薬12a、12bに充填された濃度調整試薬112a、112bの少なくとも一方と、非共通試薬槽13a、13bに充填された一方の非共通試薬とを混合し、第1の分析系を調製する。また、前記サンプルと、共通試薬槽11に充填された共通試薬111と、濃度調整試薬12a、12bに充填された濃度調整試薬112a、112bの少なくとも一方と、他方の非共通試薬とを混合し、第2の分析系を調製する。   Next, an analysis method using the cartridge 1 of the present embodiment will be described. First, the non-common reagent tanks 13a and 13b of the cartridge 1 are filled with non-common reagents, respectively. Next, the sample, the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11, at least one of the concentration adjusting reagents 112a and 112b filled in the concentration adjusting reagents 12a and 12b, and the non-common reagent tanks 13a and 13b are filled. One non-common reagent is mixed to prepare the first analytical system. Also, the sample, the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11, at least one of the concentration adjustment reagents 112a and 112b filled in the concentration adjustment reagents 12a and 12b, and the other non-common reagent are mixed, A second analytical system is prepared.

そして、前記第1の分析系および前記第2の分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する。前記標的核酸の分析方法は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸に応じて、公知の核酸分析方法により実施できる。前記標的核酸がDNAであり、前記標的核酸の分析対象がSNPである場合、前記第1の分析系および前記第2の分析系について、例えば、前記非共通試薬に含まれる分析用オリゴヌクレオチドである標的核酸を増幅可能なプライマーを用いて、前記標的核酸を核酸増幅方法により増幅し、前記分析用オリゴヌクレオチドである標的核酸を検出可能なプローブを用いて、前記標的核酸およびその増幅断片について、融解曲線解析を実施することにより、分析する。   Then, the target nucleic acid is analyzed by analyzing the first analysis system and the second analysis system. The method for analyzing the target nucleic acid is not particularly limited, and can be performed by, for example, a known nucleic acid analysis method according to the target nucleic acid. When the target nucleic acid is DNA and the analysis target of the target nucleic acid is SNP, for example, the first analysis system and the second analysis system are analysis oligonucleotides included in the non-common reagent. Using a primer capable of amplifying the target nucleic acid, the target nucleic acid is amplified by a nucleic acid amplification method, and the target nucleic acid and its amplified fragment are melted using a probe capable of detecting the target nucleic acid that is the oligonucleotide for analysis. Analyze by performing a curve analysis.

本実施形態のカートリッジ1は、さらに、サンプルを充填可能なサンプル槽を有してもよい。前記サンプルおよびサンプル槽の数は、特に制限されず、例えば、それぞれ、1〜4である。前記サンプル槽の容積は、特に制限されず、前記サンプルの容積に応じて、適宜決定できる。前記サンプルは、特に制限されず、例えば、生体試料等があげられる。前記生体試料は、例えば、血液(例えば、全血、白血球等の血球、血漿、血清等)、組織(例えば、大腸、肺等)、口腔内細胞(例えば、口腔粘膜等)、体細胞(例えば、爪および毛髪等)、生殖細胞、喀痰、羊水、腹膜液、尿、胃液等があげられる。また、前記生体試料としては、その他に、胃洗液、パラフィン包埋組織、培養細胞等の生体由来の試料もあげられる。   The cartridge 1 of this embodiment may further include a sample tank that can be filled with a sample. The numbers of the sample and the sample tank are not particularly limited and are, for example, 1 to 4, respectively. The volume of the sample tank is not particularly limited and can be appropriately determined according to the volume of the sample. The sample is not particularly limited, and examples thereof include biological samples. Examples of the biological sample include blood (for example, blood cells such as whole blood and leukocytes, plasma, serum, etc.), tissue (for example, large intestine, lung, etc.), oral cells (for example, oral mucosa, etc.), somatic cells (for example, , Nails and hair, etc.), germ cells, sputum, amniotic fluid, peritoneal fluid, urine, gastric juice and the like. In addition, examples of the biological sample include biological samples such as gastric lavage fluid, paraffin-embedded tissue, and cultured cells.

本実施形態のカートリッジ1は、さらに、サンプルの前処理試薬および前記前処理試薬が充填された前処理試薬槽を含んでもよい。前記前処理試薬および前処理試薬槽の数は、特に制限されず、例えば、それぞれ、1〜4である。前記前処理試薬は、例えば、前記サンプルに含まれる細胞等の細胞膜を破壊する試薬、DNA、RNA等の核酸を単離する試薬、RNAからDNAを合成する試薬等があげられる。具体例として、前記前処理試薬は、例えば、界面活性剤、還元剤、プロテアーゼ阻害剤、DNase阻害剤、RNase阻害剤、RNA依存性DNAポリメラーゼ等の逆転写酵素等があげられる。   The cartridge 1 of the present embodiment may further include a sample pretreatment reagent and a pretreatment reagent tank filled with the pretreatment reagent. The numbers of the pretreatment reagent and the pretreatment reagent tank are not particularly limited and are, for example, 1 to 4, respectively. Examples of the pretreatment reagent include a reagent that breaks cell membranes such as cells contained in the sample, a reagent that isolates nucleic acids such as DNA and RNA, a reagent that synthesizes DNA from RNA, and the like. Specific examples of the pretreatment reagent include a surfactant, a reducing agent, a protease inhibitor, a DNase inhibitor, an RNase inhibitor, and a reverse transcriptase such as an RNA-dependent DNA polymerase.

本実施形態のカートリッジ1は、さらに、前記標的核酸の分析に関連するその他の試薬および前記その他の試薬が充填されたその他の試薬槽を含んでもよい。前記その他の試薬およびその他の試薬槽の数は、特に制限されず、例えば、それぞれ、1〜4である。前記その他の試薬は、特に制限されず、例えば、ミネラルオイル、各試薬を希釈するための希釈液等があげられる。   The cartridge 1 of this embodiment may further include other reagents related to the analysis of the target nucleic acid and other reagent tanks filled with the other reagents. The number of the other reagents and other reagent tanks is not particularly limited, and is, for example, 1 to 4, respectively. The other reagents are not particularly limited, and examples thereof include mineral oil and a diluent for diluting each reagent.

(実施形態2)
図2は、実施形態2のカートリッジの概略を示す図面であり、(A)は、実施形態2のカートリッジの斜視図を示し、(B)は、前記(A)のII−II方向に見た断面図である。図2において、図1と同一箇所には同一符号を付している。図2(A)に示すように、カートリッジ2は、さらに、サンプル槽14、前処理試薬槽15、およびその他の試薬槽16を含み、シール17により、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12、非共通試薬槽13、前処理試薬槽15、およびその他の試薬槽16の上部開口が封止され、サンプル槽14は、上部が開口している。また、非共通試薬槽13a、13bには、それぞれ、非共通試薬113a、113bが、充填されている。前処理試薬槽15は、前処理試薬槽15a、15bに分かれており、前処理試薬槽15a、15bには、前処理試薬115a、115bが、それぞれ充填されている。そして、その他の試薬槽16には、その他の試薬116が、充填されている。この点を除き、本実施形態のカートリッジ2は、実施形態1のカートリッジ1と同様の構成を有し、その説明を援用できる。本実施形態のカートリッジ2によれば、例えば、前処理が必要なサンプルについても、標的核酸を分析できる。本実施形態のカートリッジ2における各槽は、一端から他端に向かって、他の試薬槽16、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12a、12b、前処理試薬槽15a、15b、非共通試薬槽13a、13b、サンプル槽14がこの順序で配置されているが、本発明はこれに限定されず、各槽は、任意の順序で配置できる。
(Embodiment 2)
2A and 2B are schematic views of the cartridge of the second embodiment. FIG. 2A is a perspective view of the cartridge of the second embodiment, and FIG. 2B is a view taken in the II-II direction of FIG. It is sectional drawing. In FIG. 2, the same parts as those in FIG. As shown in FIG. 2A, the cartridge 2 further includes a sample tank 14, a pretreatment reagent tank 15, and another reagent tank 16, and a common reagent tank 11, a concentration adjusting reagent tank 12, The upper openings of the non-common reagent tank 13, the pretreatment reagent tank 15, and the other reagent tanks 16 are sealed, and the sample tank 14 is opened at the top. The non-common reagent tanks 13a and 13b are filled with non-common reagents 113a and 113b, respectively. The pretreatment reagent tank 15 is divided into pretreatment reagent tanks 15a and 15b, and the pretreatment reagent tanks 15a and 15b are filled with pretreatment reagents 115a and 115b, respectively. The other reagent tanks 16 are filled with other reagents 116. Except for this point, the cartridge 2 of the present embodiment has the same configuration as the cartridge 1 of the first embodiment, and the description thereof can be used. According to the cartridge 2 of the present embodiment, for example, a target nucleic acid can be analyzed even for a sample that requires pretreatment. Each tank in the cartridge 2 of the present embodiment has another reagent tank 16, a common reagent tank 11, concentration adjusting reagent tanks 12a and 12b, pretreatment reagent tanks 15a and 15b, non-common reagent tanks from one end to the other end. Although 13a, 13b and the sample tank 14 are arrange | positioned in this order, this invention is not limited to this, Each tank can be arrange | positioned in arbitrary orders.

本実施形態のカートリッジ2において、非共通試薬槽13a、13bには、非共通試薬113a、113bが充填されているが、本発明はこれに限定されず、非共通試薬113a、113bが充填されていなくてもよい。また、非共通試薬槽13a、13bに充填された非共通試薬113a、113bは、液体試薬であるが、本発明はこれに限定されず、乾燥試薬としてもよい。非共通試薬113a、113bが液体試薬の場合、非共通試薬槽13a、13bに充填された非共通試薬113a、113bの体積は、特に制限されず、例えば、前記標的核酸の数に応じて、適宜設定できる。   In the cartridge 2 of this embodiment, the non-common reagent tanks 13a and 13b are filled with non-common reagents 113a and 113b. However, the present invention is not limited to this, and the non-common reagents 113a and 113b are filled. It does not have to be. Further, the non-common reagents 113a and 113b filled in the non-common reagent tanks 13a and 13b are liquid reagents, but the present invention is not limited to this and may be dry reagents. When the non-common reagent 113a, 113b is a liquid reagent, the volume of the non-common reagent 113a, 113b filled in the non-common reagent tank 13a, 13b is not particularly limited. For example, depending on the number of the target nucleic acids, Can be set.

本実施形態のカートリッジ2は、シール17を含むが、本発明はこれに限定されず、シール17は、任意の構成であり、あってもよいし、なくてもよい。また、シール17は、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12、非共通試薬槽13、前処理試薬槽15、およびその他の試薬槽16の上部開口を封止しているが、本発明はこれに限定されず、シール17は、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12、非共通試薬槽13、サンプル槽14、前処理試薬槽15、およびその他の試薬槽16のいずれか1つの上部開口を封止してもよいし、複数の上部開口を封止してもよいし、全ての上部開口を封止してもよい。シール17が複数の上部開口を封止する場合、シール17は、例えば、共通試薬槽11および濃度調整試薬槽12を封止してもよいし、共通試薬槽11、濃度調整試薬槽12、前処理試薬槽15、およびその他の試薬槽16を封止してもよい。シール17は、特に制限されず、公知のシール部材を使用できる。   The cartridge 2 of the present embodiment includes the seal 17, but the present invention is not limited to this, and the seal 17 may have any configuration and may or may not be present. The seal 17 seals the upper openings of the common reagent tank 11, the concentration adjusting reagent tank 12, the non-common reagent tank 13, the pretreatment reagent tank 15, and the other reagent tanks 16. The seal 17 is not limited to the upper opening of any one of the common reagent tank 11, the concentration adjusting reagent tank 12, the non-common reagent tank 13, the sample tank 14, the pretreatment reagent tank 15, and the other reagent tanks 16. It may be sealed, a plurality of upper openings may be sealed, or all the upper openings may be sealed. When the seal 17 seals a plurality of upper openings, the seal 17 may seal, for example, the common reagent tank 11 and the concentration adjustment reagent tank 12, or the common reagent tank 11, the concentration adjustment reagent tank 12, and the front. The processing reagent tank 15 and other reagent tanks 16 may be sealed. The seal 17 is not particularly limited, and a known seal member can be used.

つぎに、本実施形態のカートリッジ2を用いた分析方法について、説明する。まず、カートリッジ2のサンプル槽14に、サンプルを充填する。つぎに、前記サンプルを2つに分け、それぞれのサンプルについて、前記サンプルと、前処理試薬槽15a、15bに充填された前処理試薬115a、115bの少なくとも一方とを混合し、前記サンプルに対して前処理を行なう。そして、一方の前処理後のサンプルと、共通試薬槽11に充填された共通試薬111と、濃度調整試薬12a、12bに充填された濃度調整試薬112a、112bの少なくとも一方と、非共通試薬槽13a、13bに充填された非共通試薬113a、113bの一方とを混合し、第1の分析系を調製する。また、他方の前処理後のサンプルと、共通試薬槽11に充填された共通試薬111と、濃度調整試薬12a、12bに充填された濃度調整試薬112a、112bの少なくとも一方と、非共通試薬113a、113bの他方とを混合し、第2の分析系を調製する。そして、前記第1の分析系および前記第2の分析系に、その他の試薬槽16に充填されたその他の試薬116(例えば、ミネラルオイル)を添加する。そして、前記第1の分析系および前記第2の分析系について、前記実施形態1と同様に分析する。   Next, an analysis method using the cartridge 2 of the present embodiment will be described. First, the sample is filled in the sample tank 14 of the cartridge 2. Next, the sample is divided into two, and for each sample, the sample and at least one of the pretreatment reagents 115a and 115b filled in the pretreatment reagent tanks 15a and 15b are mixed, and the sample is mixed. Perform pre-processing. Then, at least one of the pretreated sample, the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11, the concentration adjusting reagents 112a and 112b filled in the concentration adjusting reagents 12a and 12b, and the non-common reagent tank 13a. , 13b are mixed with one of the non-common reagents 113a and 113b, to prepare a first analysis system. The other pretreated sample, the common reagent 111 filled in the common reagent tank 11, at least one of the concentration adjustment reagents 112a and 112b filled in the concentration adjustment reagents 12a and 12b, and the non-common reagent 113a, A second analytical system is prepared by mixing with the other of 113b. Then, another reagent 116 (for example, mineral oil) filled in the other reagent tank 16 is added to the first analysis system and the second analysis system. Then, the first analysis system and the second analysis system are analyzed in the same manner as in the first embodiment.

<第2の標的核酸の分析用試薬カートリッジ>
本発明の第2のカートリッジは、前述のように、複数の共通試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分を異なる濃度で含み、前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする。本発明の第2のカートリッジは、前記複数の共通試薬槽を有し、前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分を異なる濃度で含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の第2のカートリッジは、前記本発明の第1のカートリッジの濃度調整試薬における調整成分を、前記共通試薬が含む。このため、本発明の第2のカートリッジは、例えば、前記本発明の第1のカートリッジの前記共通試薬が、複数であり、前記複数の共通試薬が、それぞれ、前記濃度調整試薬を含むカートリッジということもできる。本発明の第2のカートリッジは、例えば、前記本発明の第1のカートリッジの説明を援用できる。
<Second target nucleic acid analysis reagent cartridge>
As described above, the second cartridge of the present invention has a plurality of common reagent vessels and a plurality of non-common reagent vessels, and each of the common reagent vessels is commonly used for analyzing a plurality of target nucleic acids. The common reagent containing a plurality of components that can be used is filled, and each of the common reagents includes at least one of the plurality of components at different concentrations, and each of the plurality of non-common reagent vessels includes: A non-common reagent containing an analytical oligonucleotide for analyzing a specific target nucleic acid can be filled. The second cartridge of the present invention includes the plurality of common reagent tanks, and each of the common reagents includes at least one component of the plurality of components at different concentrations, and the other configuration The conditions are not particularly limited. In the second cartridge of the present invention, the common reagent contains the adjustment component in the concentration adjusting reagent of the first cartridge of the present invention. For this reason, the second cartridge of the present invention is, for example, a cartridge that includes a plurality of the common reagents of the first cartridge of the present invention, and each of the plurality of common reagents includes the concentration adjusting reagent. You can also. For example, the description of the first cartridge of the present invention can be used for the second cartridge of the present invention.

本発明の第2のカートリッジは、前述のように、複数の共通試薬槽を有し、前記複数の共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む共通試薬が充填されている。このため、例えば、2つの標的核酸を分析する場合、前記調整成分を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度に設定しておくことで、サンプル、最適な濃度に設定された前記共通試薬、および対応する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬を混合することにより、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。また、3以上の標的核酸を分析する場合、前記調整成分のうち一方を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も高い成分濃度以上に設定し、他方を、それぞれの標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じた最適な濃度のうち、最も低い成分濃度以下に設定しておくことで、例えば、これら2つの調整成分を含む共通試薬と、サンプル、および前記非共通試薬とを混合することで、前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系を簡便に調製できる。したがって、本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。さらに、本発明の第2のカートリッジによれば、前記調整成分が前記分析用オリゴヌクレオチドに適した分析系とすることができるため、例えば、より優れた分析精度で前記標的核酸を分析できる。   As described above, the second cartridge of the present invention has a plurality of common reagent tanks, and each of the plurality of common reagent tanks is at least one component that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids. Are filled with common reagents containing different concentrations. For this reason, for example, when analyzing two target nucleic acids, the adjustment component is set to an optimum concentration according to the type of analysis oligonucleotide for analyzing each target nucleic acid. By mixing the common reagent set to the concentration and a non-common reagent containing the corresponding analytical oligonucleotide, an analysis system suitable for the analytical oligonucleotide can be easily prepared. When analyzing three or more target nucleic acids, one of the adjustment components is set to the highest component concentration or higher among the optimum concentrations according to the type of analysis oligonucleotide for analyzing each target nucleic acid. The other is set to a concentration lower than the lowest component among the optimum concentrations according to the type of the oligonucleotide for analysis for analyzing each target nucleic acid, for example, a common reagent containing these two adjustment components By mixing the sample and the non-common reagent, an analysis system suitable for the analysis oligonucleotide can be easily prepared. Therefore, according to the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid. Furthermore, according to the second cartridge of the present invention, since the adjustment component can be an analysis system suitable for the analysis oligonucleotide, the target nucleic acid can be analyzed with better analysis accuracy, for example.

本発明の第2のカートリッジにおいて、前記共通試薬は、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含み、且つ前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む。前記調整成分は、例えば、前記標的核酸の分析において、前記共通試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分ということもできる。前記調整成分は、例えば、前述の説明を援用できる。前記共通試薬の数は、複数であればよく、例えば、2〜5である。前記複数の共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分を異なる濃度で含めばよく、その他の成分の濃度は、同じでもよいし、異なってもよい。前記共通試薬の数が3以上の場合、いずれか2つの共通試薬において、前記調整成分の濃度は、同じでもよい。前記共通試薬は、例えば、液体試薬でもよいし、固体試薬(乾燥試薬)でもよい。前者の場合、前記共通試薬は、例えば、溶媒に、前記共通試薬を溶解、懸濁または混合等した試薬である。前記共通試薬が固体試薬の場合、前記調整成分の濃度は、例えば、前記カートリッジにおいて、予め定められた量の溶媒に溶解、懸濁または混合等した際の濃度である。   In the second cartridge of the present invention, the common reagent includes a plurality of components that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids, and includes at least one of the plurality of components at different concentrations. The adjustment component can also be referred to as a component whose concentration is adjusted depending on the type of the non-common reagent analysis oligonucleotide used in combination with the common reagent in the analysis of the target nucleic acid, for example. For the adjustment component, for example, the above description can be used. The number of the common reagents may be plural, for example, 2 to 5. Each of the plurality of common reagents may include at least one of the plurality of components at different concentrations, and the concentrations of the other components may be the same or different. When the number of the common reagents is 3 or more, the concentration of the adjustment component in any two common reagents may be the same. The common reagent may be, for example, a liquid reagent or a solid reagent (dry reagent). In the former case, the common reagent is, for example, a reagent in which the common reagent is dissolved, suspended, or mixed in a solvent. When the common reagent is a solid reagent, the concentration of the adjustment component is, for example, the concentration when the cartridge is dissolved, suspended, or mixed in a predetermined amount of solvent.

以下、本発明の第2のカートリッジおよびそれを用いた分析方法について、図面を参照して、例をあげて詳細に説明する。ただし、本発明は、以下の例に限定および制限されない。また、図面においては、説明の便宜上、各部の構造は適宜簡略化して示す場合があり、各部の寸法比等は、実際とは異なり、模式的に示す場合がある。   Hereinafter, the second cartridge of the present invention and the analysis method using the same will be described in detail with reference to the drawings. However, the present invention is not limited or limited to the following examples. In the drawings, for convenience of explanation, the structure of each part may be simplified as appropriate, and the dimensional ratio of each part may be schematically shown, unlike the actual case.

(実施形態3)
図3は、実施形態3のカートリッジの概略を示す図面であり、(A)は、実施形態3のカートリッジの斜視図を示し、(B)は、前記(A)のIII−III方向に見た断面図である。図3において、図1と同一箇所には同一符号を付している。図3(A)に示すように、本実施形態のカートリッジ3は、共通試薬槽11’および非共通試薬槽13を含む。また、図3(B)に示すように、共通試薬槽11’は、共通試薬槽11’a、11’bに分かれており、共通試薬槽11’a、11’bには、前記複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含み、且つ前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分が異なる濃度である共通試薬111’a、111’bが、それぞれ、充填されている。さらに、非共通試薬槽13は、非共通試薬槽13a、13bに分かれている。本実施形態のカートリッジ3における各槽は、一端から他端に向かって、共通試薬槽11’a、11’b、非共通試薬槽13a、13bがこの順序で配置されているが、本発明はこれに限定されず、各槽は、任意の順序で配置できる。
(Embodiment 3)
FIG. 3 is a schematic view of the cartridge of the third embodiment, (A) is a perspective view of the cartridge of the third embodiment, and (B) is viewed in the III-III direction of (A). It is sectional drawing. In FIG. 3, the same parts as those in FIG. As shown in FIG. 3A, the cartridge 3 of this embodiment includes a common reagent tank 11 ′ and a non-common reagent tank 13. Further, as shown in FIG. 3B, the common reagent tank 11 ′ is divided into common reagent tanks 11′a and 11′b, and the common reagent tanks 11′a and 11′b include a plurality of the plurality of common reagent tanks 11′a and 11′b. Common reagents 111′a and 111′b each containing a plurality of components that can be commonly used for analysis of the target nucleic acid and at least one of the plurality of components having different concentrations are packed. . Further, the non-common reagent tank 13 is divided into non-common reagent tanks 13a and 13b. Each tank in the cartridge 3 of the present embodiment has common reagent tanks 11′a, 11′b and non-common reagent tanks 13a, 13b arranged in this order from one end to the other end. Without being limited to this, each tank can be arranged in any order.

本実施形態のカートリッジ3において、共通試薬槽11’は、2つであるが、本発明はこれに限定されず、複数であればよく、具体例として、共通試薬槽11’の数は、2〜5である。共通試薬槽11’a、11’bの容積は、特に制限されず、例えば、共通試薬槽11’に充填される共通試薬111’a、111’bの体積に応じて、適宜設定できる。本実施形態のカートリッジ3は、さらに、前述のサンプル槽、前処理試薬および前処理試薬槽、ならびにその他の試薬およびその他の試薬槽のいずれか1つ以上を含んでもよく、各槽および試薬は、前述の説明を援用できる。   In the cartridge 3 of the present embodiment, the number of common reagent tanks 11 ′ is two. However, the present invention is not limited to this, and a plurality of common reagent tanks 11 ′ may be used. As a specific example, the number of common reagent tanks 11 ′ is two. ~ 5. The volumes of the common reagent tanks 11'a and 11'b are not particularly limited, and can be appropriately set according to the volumes of the common reagents 111'a and 111'b filled in the common reagent tank 11 ', for example. The cartridge 3 of the present embodiment may further include any one or more of the above-described sample tank, pretreatment reagent and pretreatment reagent tank, and other reagents and other reagent tanks. The above description can be incorporated.

つぎに、本実施形態のカートリッジ3を用いた分析方法について、説明する。まず、カートリッジ3の非共通試薬槽13a、13bに、それぞれ、非共通試薬を充填する。つぎに、サンプルと、共通試薬槽11’a、11’bに充填された共通試薬111’a、111’bの少なくとも一方と、非共通試薬槽13に充填された一方の非共通試薬とを混合し、第1の分析系を調製する。また、前記サンプルと、共通試薬槽11’a、11’bに充填された共通試薬111’a、111’bの少なくとも一方と、他方の非共通試薬とを混合し、第2の分析系を調製する。そして、前記第1の分析系および前記第2の分析系について、前記実施形態1と同様に分析する。   Next, an analysis method using the cartridge 3 of the present embodiment will be described. First, the non-common reagent tanks 13a and 13b of the cartridge 3 are filled with the non-common reagent, respectively. Next, a sample, at least one of the common reagents 111′a and 111′b filled in the common reagent tanks 11′a and 11′b, and one non-common reagent filled in the non-common reagent tank 13 Mix to prepare the first analytical system. Further, the sample is mixed with at least one of the common reagents 111′a and 111′b filled in the common reagent tanks 11′a and 11′b and the other non-common reagent, and a second analysis system is prepared. Prepare. Then, the first analysis system and the second analysis system are analyzed in the same manner as in the first embodiment.

<第1の標的核酸の分析装置>
本発明の第1の分析装置は、前述のように、前記本発明の第1のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも1つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする。本発明の第1の分析装置は、前記本発明の第1のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部を含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の第1の分析装置は、例えば、前記本発明の第1のカートリッジの説明を援用できる。本発明の第1の分析装置によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
<First target nucleic acid analyzer>
As described above, the first analyzer according to the present invention includes a cartridge housing portion in which the first cartridge according to the present invention is housed, a sample, a common reagent filled in the common reagent tank, and the concentration adjustment. A preparation unit for preparing the target nucleic acid analysis system by mixing at least one concentration adjusting reagent filled in a reagent tank and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank; And an analysis unit for analyzing the target nucleic acid by analyzing the analysis system. The first analyzer of the present invention is characterized in that it includes a cartridge housing portion in which the first cartridge of the present invention is housed, and other configurations and conditions are not particularly limited. For example, the description of the first cartridge of the present invention can be used for the first analyzer of the present invention. According to the first analyzer of the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid.

以下、本発明の第1の分析装置およびそれを用いた分析方法について、図面を参照して、例をあげて詳細に説明する。ただし、本発明は、以下の例に限定および制限されない。また、図面においては、説明の便宜上、各部の構造は適宜簡略化して示す場合があり、各部の寸法比等は、実際とは異なり、模式的に示す場合がある。   Hereinafter, the first analyzer of the present invention and the analysis method using the same will be described in detail with reference to the drawings. However, the present invention is not limited or limited to the following examples. In the drawings, for convenience of explanation, the structure of each part may be simplified as appropriate, and the dimensional ratio of each part may be schematically shown, unlike the actual case.

(実施形態4)
図4は、本実施形態の分析装置の構成を示すブロック図である。図4に示すように、本実施形態の分析装置4は、中央演算処理装置(CPU)41、調製部であるサンプリングポンプユニット42、およびノズル駆動ユニット43、分析部である測定部ユニット44、記憶装置45、入力装置46、ならびに出力装置47を主要構成要素として備える。CPU41は、サンプリングポンプユニット42、ノズル駆動ユニット43、および測定部ユニット44の動きを制御する。サンプリングポンプユニット42は、サンプルおよび各試薬等をサンプリングするためのポンプを駆動する。ノズル駆動ユニット43は、カートリッジの各槽にノズルを移動し、かつノズルを上下させる。測定部ユニット44は、サンプルと各試薬とを混合した分析系の反応を分析する。反応の分析方法は、例えば、光学的方法および電気化学的方法があげられる。光学的方法の場合は、前記測定ユニット44は、例えば、光源および受光部を含む。電気化学的方法の場合は、例えば、電極を含む。前記記憶装置45は、分析条件情報、その他の情報および各種プログラム等が記憶されており、フラッシュメモリ、RAMおよびROM等を適宜組み合わせて構成される。入力装置46は、分析装置に情報を入力するためのものであり、キーボード、キーシート、USB等の端子、CDやCD−R等のドライブ等があげられる。出力装置47は、分析結果およびその他の情報を出力するためのものであり、例えば、プリンターおよびディスプレイがあげられる。本実施例において、前記の各構成要素は一体化されていてもよいし、複数の装置に分かれて構成されていてもよい。例えば、サンプリングポンプユニット42、ノズル駆動ユニット43および測定部ユニット44を備えた分析装置と、CPU41、記憶装置45、入力装置46および出力装置47を含むパーソナルコンピュター(PC)とを組み合わせてもよい。
(Embodiment 4)
FIG. 4 is a block diagram showing the configuration of the analyzer according to this embodiment. As shown in FIG. 4, the analysis device 4 of this embodiment includes a central processing unit (CPU) 41, a sampling pump unit 42 that is a preparation unit, a nozzle drive unit 43, a measurement unit unit 44 that is an analysis unit, and a storage. A device 45, an input device 46, and an output device 47 are provided as main components. The CPU 41 controls the movement of the sampling pump unit 42, the nozzle drive unit 43, and the measurement unit unit 44. The sampling pump unit 42 drives a pump for sampling the sample and each reagent. The nozzle drive unit 43 moves the nozzle to each tank of the cartridge and moves the nozzle up and down. The measurement unit 44 analyzes the reaction of the analysis system in which the sample and each reagent are mixed. Examples of the reaction analysis method include an optical method and an electrochemical method. In the case of an optical method, the measurement unit 44 includes, for example, a light source and a light receiving unit. In the case of an electrochemical method, for example, an electrode is included. The storage device 45 stores analysis condition information, other information, various programs, and the like, and is configured by appropriately combining flash memory, RAM, ROM, and the like. The input device 46 is for inputting information to the analysis device, and includes a keyboard, a key sheet, a terminal such as a USB, a drive such as a CD and a CD-R, and the like. The output device 47 is for outputting analysis results and other information, and examples thereof include a printer and a display. In the present embodiment, each of the above-described constituent elements may be integrated or may be divided into a plurality of devices. For example, you may combine the analyzer provided with the sampling pump unit 42, the nozzle drive unit 43, and the measurement part unit 44, and the personal computer (PC) containing CPU41, the memory | storage device 45, the input device 46, and the output device 47. FIG.

つぎに、本実施形態の分析装置を用いた分析方法について、実施形態2のカートリッジを用いた場合を例にあげて説明する。まず、サンプルが、カートリッジ2のサンプル槽14に充填される。カートリッジ2が分析装置にセットされると、ノズル駆動ユニット43により自動的にノズルが移動して、サンプリングポンプユニット42によりサンプル槽14の試料をサンプリングして、分析装置4にセットされた複数の分析槽(図示せず)に、サンプルが、それぞれ導入される。そして、自動的にノズルが移動して、シールを破って、前処理試薬115a、115bの少なくとも一方をサンプリングして、前記分析槽に導入し、前処理を行なう。つづいて、自動的にノズルが移動して、シールを破って、共通試薬111をサンプリングし、前記分析槽に導入し、さらに、ノズルが移動して、シールを破って、濃度調整試薬112a、112bの少なくとも一方をサンプリングし、前記分析槽に導入する。そして、自動的にノズルが移動して、シールを破って、非共通試薬113a、113bの一方をサンプリングし、前記分析槽に導入し、混合することで第1の分析系を調製後、前記サンプルを反応させる。また、非共通試薬113a、113bの他方をサンプリングする以外は同様にして、第2の分析系を調製後、前記サンプルを反応させる。前記第1の分析系および第2の分析系の反応がPCRの場合は、測定部ユニット44により温度サイクルが制御される。一定のサイクル数の反応の後、例えば、光学的手法により反応物中のプローブを検出する。なお、実施形態2のカートリッジ2を用いた場合を例にあげて説明したが、実施形態1のカートリッジ1を用いて実施してもよい。   Next, an analysis method using the analyzer according to the present embodiment will be described by taking the case of using the cartridge according to the second embodiment as an example. First, the sample is filled in the sample tank 14 of the cartridge 2. When the cartridge 2 is set in the analyzer, the nozzle is automatically moved by the nozzle drive unit 43, the sample in the sample tank 14 is sampled by the sampling pump unit 42, and a plurality of analyzes set in the analyzer 4 is performed. Each sample is introduced into a bath (not shown). Then, the nozzle automatically moves, breaks the seal, samples at least one of the pretreatment reagents 115a and 115b, introduces it into the analysis tank, and performs pretreatment. Subsequently, the nozzle automatically moves, breaks the seal, samples the common reagent 111, introduces it into the analysis tank, and further moves the nozzle, breaks the seal, and the concentration adjusting reagents 112a, 112b. Are sampled and introduced into the analysis tank. Then, the nozzle automatically moves, breaks the seal, samples one of the non-common reagents 113a and 113b, introduces it into the analysis tank, and mixes the first analysis system to prepare the sample. React. Further, the sample is reacted after preparing the second analysis system in the same manner except that the other of the non-common reagents 113a and 113b is sampled. When the reaction of the first analysis system and the second analysis system is PCR, the temperature cycle is controlled by the measurement unit 44. After a certain number of cycles of reaction, the probe in the reaction is detected, for example, by optical techniques. Although the case where the cartridge 2 of the second embodiment is used has been described as an example, the cartridge 1 of the first embodiment may be used.

<第2の標的核酸の分析装置>
本発明の第2の分析装置は、前記本発明の第2のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの共通試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする。本発明の第2の分析装置は、前記本発明の第2のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部を含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の第2の分析装置は、例えば、前記本発明の第1および第2のカートリッジならびに前記本発明の第1の標的核酸の分析装置の説明を援用できる。本発明の第2の分析装置によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
<Second target nucleic acid analyzer>
The second analyzer of the present invention includes a cartridge housing portion in which the second cartridge of the present invention is housed, a sample, at least one common reagent filled in the common reagent tank, and the non-common reagent. A preparation unit that prepares an analysis system for the target nucleic acid by mixing at least one non-common reagent filled in the tank, and an analysis unit that analyzes the target nucleic acid by analyzing the analysis system It is characterized by including. The second analyzer of the present invention is characterized in that it includes a cartridge housing portion in which the second cartridge of the present invention is housed, and other configurations and conditions are not particularly limited. For example, the description of the first and second cartridges of the present invention and the first target nucleic acid analyzer of the present invention can be used for the second analyzer of the present invention. According to the second analyzer of the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid.

本発明の第2の分析装置は、前記本発明の第1のカートリッジに代えて、前記本発明の第2のカートリッジを用い、前記調製部が、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの共通試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する点を除き、前記第1の標的核酸の分析装置と同様であり、その説明を援用できる。   The second analyzer of the present invention uses the second cartridge of the present invention instead of the first cartridge of the present invention, and the preparation section is filled with a sample and the common reagent tank at least. The first target nucleic acid analyzer except that the target nucleic acid analysis system is prepared by mixing one common reagent and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank. And the description can be used.

本発明の第2の分析装置は、例えば、前記調製部において、前記サンプル、少なくとも2つの前記共通試薬、および少なくとも1つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。   The second analyzer of the present invention prepares the analysis system by, for example, mixing the sample, at least two common reagents, and at least one non-common reagent in the preparation unit.

<第1の標的核酸の分析方法>
本発明の第1の分析方法は、前述のように、前記本発明の第1のカートリッジを用い、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも1つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする。本発明の第1の分析方法は、前記本発明の第1のカートリッジを用いることが特徴であり、その他の工程および条件は、特に制限されない。本発明の第1の分析方法は、例えば、前記本発明の第1のカートリッジおよび前記本発明の第1の分析装置の説明を援用できる。本発明の第1の分析方法によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
<Analyzing method of first target nucleic acid>
As described above, the first analysis method of the present invention uses the first cartridge of the present invention and fills the sample, the common reagent filled in the common reagent tank, and the concentration adjusting reagent tank. A preparation step of preparing an analysis system of the target nucleic acid by mixing at least one concentration adjusting reagent and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank; and analyzing the analysis system And an analysis step of analyzing the target nucleic acid. The first analysis method of the present invention is characterized by using the first cartridge of the present invention, and other processes and conditions are not particularly limited. For example, the description of the first cartridge of the present invention and the first analysis apparatus of the present invention can be used for the first analysis method of the present invention. According to the first analysis method of the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid.

<第2の標的核酸の分析方法>
本発明の第2の分析方法は、前記本発明の第2のカートリッジを用い、サンプル、前記共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの共通試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする。本発明の第2の分析方法は、前記本発明の第2のカートリッジを用いることが特徴であり、その他の工程および条件は、特に制限されない。本発明の第2の分析方法は、例えば、前記本発明の第1および第2のカートリッジ、前記本発明の第1および第2の分析装置、ならびに前記本発明の第1の分析方法の説明を援用できる。本発明の第2の分析方法によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。
<Second target nucleic acid analysis method>
The second analysis method of the present invention uses the second cartridge of the present invention and uses a sample, at least one common reagent filled in the common reagent tank, and at least filled in the non-common reagent tank. The method includes a preparation step of preparing an analysis system for the target nucleic acid by mixing one non-common reagent, and an analysis step for analyzing the target nucleic acid by analyzing the analysis system. The second analysis method of the present invention is characterized by using the second cartridge of the present invention, and other processes and conditions are not particularly limited. The second analysis method of the present invention includes, for example, the description of the first and second cartridges of the present invention, the first and second analysis devices of the present invention, and the first analysis method of the present invention. Can be used. According to the second analysis method of the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid.

本発明の第2の分析方法は、例えば、前記調製工程において、前記サンプル、少なくとも2つの前記共通試薬、および少なくとも1つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する。   In the second analysis method of the present invention, for example, in the preparation step, the analysis system is prepared by mixing the sample, at least two common reagents, and at least one non-common reagent.

つぎに、本発明の実施例について説明する。なお、本発明は、下記の実施例により何ら制限されない。   Next, examples of the present invention will be described. In addition, this invention is not restrict | limited at all by the following Example.

[実施例1]
異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを用いた分析において、各分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオンおよびカリウムイオン濃度が異なることを確認した。
[Example 1]
In the analysis using different oligonucleotides for analysis of different target nucleic acids, it was confirmed that the magnesium ion and potassium ion concentrations suitable for each analysis oligonucleotide were different.

NRAS遺伝子(以下、「NRAS」という。)のコドン117の変異の分析系およびNRASのコドン146の変異の分析系として、それぞれ、下記表1および2の組成の分析系を調製した。下記表1に示すように、NRAS コドン117の分析系は、前記分析用オリゴヌクレオチドとして、NRASのコドン117の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なフォワードプライマー1およびリバースプライマー1、ならびにNRASのコドン117の変異を検出可能なプローブ1およびNRASのコドン117の特定の変異を検出可能なプローブ2を含む分析系である。また、下記表2に示すように、NRAS コドン146の分析系は、前記分析用オリゴヌクレオチドとして、NRASのコドン146の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なフォワードプライマー2およびリバースプライマー2、ならびにNRASのコドン146の変異を検出可能なプローブ3を含む分析系である。各分析系において、前記調整成分のマグネシウムイオンおよびカリウムイオンの濃度は、各分析用オリゴヌクレオチドに最適な濃度に調整されている。   As analysis systems for the mutation of codon 117 of the NRAS gene (hereinafter referred to as “NRAS”) and analysis of the mutation of codon 146 of NRAS, the analysis systems having the compositions shown in Tables 1 and 2 below were prepared, respectively. As shown in Table 1 below, the analysis system for NRAS codon 117 includes, as the analysis oligonucleotide, forward primer 1 and reverse primer 1 capable of amplifying a polynucleotide containing a mutation of codon 117 of NRAS, and codon 117 of NRAS. This is an analysis system comprising a probe 1 capable of detecting the mutation 1 and a probe 2 capable of detecting a specific mutation of codon 117 of NRAS. In addition, as shown in Table 2 below, the NRAS codon 146 analysis system uses, as the analysis oligonucleotide, a forward primer 2 and a reverse primer 2 that can amplify a polynucleotide containing a mutation in the codon 146 of NRAS, and an NRAS codon. The analysis system includes a probe 3 capable of detecting a mutation of codon 146. In each analytical system, the concentration of magnesium ions and potassium ions of the adjustment component is adjusted to an optimum concentration for each analytical oligonucleotide.

Figure 2017201932
Figure 2017201932

Figure 2017201932
Figure 2017201932

各分析系を、遺伝子解析装置(i-densy(商標))を用いて、PCRおよび融解曲線解析を行なった。この結果、いずれの分析系においても、対象とする変異を優れた分析精度で分析できた。以上のことから、各分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオンおよびカリウムイオン濃度が異なることがわかった。   Each analysis system was subjected to PCR and melting curve analysis using a gene analyzer (i-densy ™). As a result, in any analysis system, the target mutation could be analyzed with excellent analysis accuracy. From the above, it was found that the magnesium ion and potassium ion concentrations suitable for each oligonucleotide for analysis were different.

[実施例2]
異なる濃度のマグネシウムイオンをそれぞれ含む2種類の濃度調整試薬を用い、標的核酸であるNRAS遺伝子の変異について、前記標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオン濃度で反応を行なうことができ、またより優れた分析精度で標的核酸を分析できることを確認した。
[Example 2]
Using two kinds of concentration adjusting reagents each containing different concentrations of magnesium ions, the NRAS gene mutation that is a target nucleic acid can be reacted at a magnesium ion concentration suitable for the oligonucleotide for analyzing the target nucleic acid, and It was confirmed that the target nucleic acid can be analyzed with better analytical accuracy.

(1)試薬
DNAポリメラーゼ、BSA等を含む共通試薬および異なる濃度のマグネシウムイオンを含む2種類の濃度調整試薬1、2を調製した。また、非共通試薬として、dNTPを含む非共通試薬1〜4を調製した。非共通試薬1は、NRASのコドン12および13の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにNRASのコドン12および13の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬2は、NRASのコドン59および61の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにNRASのコドン59および61の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬3は、NRASのコドン117の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにNRASのコドン117の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬4は、NRASのコドン146の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにNRASのコドン146の変異を検出可能なプローブを含む試薬である。なお、濃度調整試薬1は、非共通試薬1および2の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。また、濃度調整試薬2は、非共通試薬3および4の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。
(1) Reagents Two types of concentration adjusting reagents 1 and 2 containing a common reagent including DNA polymerase, BSA and the like and different concentrations of magnesium ions were prepared. In addition, non-common reagents 1 to 4 containing dNTP were prepared as non-common reagents. Non-common reagent 1 is a reagent including a primer capable of amplifying a polynucleotide containing mutations of codons 12 and 13 of NRAS, and a probe capable of detecting the mutation of codons 12 and 13 of NRAS. A reagent comprising a primer capable of amplifying a polynucleotide comprising mutations of codons 59 and 61 of NRAS, and a probe capable of detecting the mutations of codons 59 and 61 of NRAS, and non-common reagent 3 comprises a mutation of codon 117 of NRAS A reagent capable of amplifying a polynucleotide containing NRAS and a probe capable of detecting a mutation in codon 117 of NRAS, and non-common reagent 4 is a primer capable of amplifying a polynucleotide containing a mutation in codon 146 of NRAS, As well as pros capable of detecting mutations in codon 146 of NRAS It is a reagent that contains the drive. The concentration adjusting reagent 1 is a reagent in which the concentration of the magnesium ion that is the adjusting component is adjusted according to the primer that is the analytical oligonucleotide of the non-common reagents 1 and 2. The concentration adjusting reagent 2 is a reagent in which the concentration of magnesium ions as the adjusting component is adjusted in accordance with the primer that is the oligonucleotide for analysis of the non-common reagents 3 and 4.

(2)サンプル
サンプルは、各変異を含むオリゴヌクレオチドを使用した。
(2) Sample Oligonucleotides containing each mutation were used as samples.

(3)PCRおよび融解曲線解析
そして、各試薬を、それぞれ予め定めた量で組合せて分析系を調製し、前記遺伝子解析装置を用いて、PCRおよび融解曲線解析を行なった。この結果、いずれの試薬の組合せにおいても、対象とする変異は分析できた。また、非共通試薬1および2は、濃度調整試薬2と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬1と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。さらに、非共通試薬3および4は、濃度調整試薬1と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬2と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。これらの結果から、本発明のカートリッジによれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができることが分かった。また、本発明のカートリッジによれば、より優れた分析精度で標的核酸を分析できることがわかった。
(3) PCR and melting curve analysis Then, each reagent was combined in a predetermined amount to prepare an analytical system, and PCR and melting curve analysis were performed using the gene analyzer. As a result, the target mutation could be analyzed in any combination of reagents. In addition, the non-common reagents 1 and 2 were able to analyze the target mutation with higher accuracy when combined with the concentration adjusting reagent 1 than when combined with the concentration adjusting reagent 2. Furthermore, the non-common reagents 3 and 4 were able to analyze the target mutation with higher accuracy when combined with the concentration adjusting reagent 2 than when combined with the concentration adjusting reagent 1. From these results, it was found that according to the cartridge of the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid. Moreover, according to the cartridge of this invention, it turned out that a target nucleic acid can be analyzed with the outstanding analysis precision.

[実施例3]
異なる濃度のマグネシウムイオンをそれぞれ含む、2種類の濃度調整試薬を用い、標的核酸であるKRAS遺伝子(以下、「KRAS」という)の変異について、前記標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適したマグネシウムイオン濃度で反応を行なうことができ、またより優れた分析精度で標的核酸を分析できることを確認した。
[Example 3]
Using two types of concentration adjusting reagents each containing different concentrations of magnesium ions, the magnesium ion concentration suitable for the target nucleic acid analysis oligonucleotide for mutation of the target nucleic acid KRAS gene (hereinafter referred to as “KRAS”) It was confirmed that the target nucleic acid can be analyzed with better analytical accuracy.

(1)試薬
DNAポリメラーゼ、BSA等を含む共通試薬および異なる濃度のマグネシウムイオンを含む2種類の濃度調整試薬1、2を調製した。また、非共通試薬として、dNTPを含む非共通試薬5〜8を調製した。非共通試薬5は、KRASのコドン12および13の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにKRASのコドン12および13の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬6は、KRASのコドン59および61の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにKRASのコドン59および61の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬7は、KRASのコドン117の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにKRASのコドン117の変異を検出可能なプローブを含む試薬であり、非共通試薬8は、KRASのコドン146の変異を含むポリヌクレオチドを増幅可能なプライマー、ならびにKRASのコドン146の変異を検出可能なプローブを含む試薬である。なお、濃度調整試薬1は、非共通試薬5および6の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。また、濃度調整試薬2は、非共通試薬7および8の分析用オリゴヌクレオチドであるプライマーに応じて、前記調整成分であるマグネシウムイオンの濃度が調整された試薬である。
(1) Reagents Two types of concentration adjusting reagents 1 and 2 containing a common reagent including DNA polymerase, BSA and the like and different concentrations of magnesium ions were prepared. Further, non-common reagents 5 to 8 containing dNTP were prepared as non-common reagents. Non-common reagent 5 is a reagent including a primer capable of amplifying a polynucleotide containing mutations of codons 12 and 13 of KRAS, and a probe capable of detecting mutations of codons 12 and 13 of KRAS. A reagent comprising a primer capable of amplifying a polynucleotide containing mutations of codons 59 and 61 of KRAS, and a probe capable of detecting mutations of codons 59 and 61 of KRAS, and non-common reagent 7 is a mutation of codon 117 of KRAS A reagent capable of amplifying a polynucleotide containing KRAS and a probe capable of detecting a mutation in codon 117 of KRAS, and non-common reagent 8 is a primer capable of amplifying a polynucleotide containing a mutation in codon 146 of KRAS, As well as pros capable of detecting mutations in codon 146 of KRAS It is a reagent that contains the drive. The concentration adjusting reagent 1 is a reagent in which the concentration of magnesium ions as the adjusting component is adjusted according to the primer that is the analytical oligonucleotide of the non-common reagents 5 and 6. The concentration adjusting reagent 2 is a reagent in which the concentration of magnesium ions as the adjusting component is adjusted according to the primer that is the analytical oligonucleotide of the non-common reagents 7 and 8.

(2)サンプル
サンプルは、各変異を含むオリゴヌクレオチドを使用した。
(2) Sample Oligonucleotides containing each mutation were used as samples.

(3)PCRおよび融解曲線解析
そして、各試薬を、それぞれ予め定めた量で組合せて分析系を調製し、前記遺伝子解析装置を用いて、PCRおよび融解曲線解析を行なった。この結果、いずれの試薬の組合せにおいても、対象とする変異は分析できた。また、非共通試薬5および6は、濃度調整試薬2と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬1と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。さらに、非共通試薬7および8は、濃度調整試薬1と組合せた場合と比較して、濃度調整試薬2と組合せた場合の方がより優れた精度で対象とする変異を分析できた。これらの結果から、本発明のカートリッジによれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができることが分かった。また、本発明のカートリッジによれば、より優れた分析精度で標的核酸を分析できることがわかった。
(3) PCR and melting curve analysis Then, each reagent was combined in a predetermined amount to prepare an analytical system, and PCR and melting curve analysis were performed using the gene analyzer. As a result, the target mutation could be analyzed in any combination of reagents. In addition, the non-common reagents 5 and 6 were able to analyze the target mutation with higher accuracy when combined with the concentration adjusting reagent 1 than when combined with the concentration adjusting reagent 2. Further, the non-common reagents 7 and 8 were able to analyze the target mutation with higher accuracy when combined with the concentration adjusting reagent 2 than when combined with the concentration adjusting reagent 1. From these results, it was found that according to the cartridge of the present invention, in the analysis of a plurality of target nucleic acids, the reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid. Moreover, according to the cartridge of this invention, it turned out that a target nucleic acid can be analyzed with the outstanding analysis precision.

以上、実施形態および実施例を参照して本発明を説明したが、本発明は上記実施形態および実施例に限定されるものではない。本発明の構成や詳細には、本発明のスコープ内で当業者が理解し得る様々な変更をすることができる。   As mentioned above, although this invention was demonstrated with reference to embodiment and an Example, this invention is not limited to the said embodiment and Example. Various changes that can be understood by those skilled in the art can be made to the configuration and details of the present invention within the scope of the present invention.

本発明によれば、複数の標的核酸の分析において、各標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドに適した成分濃度で反応を行うことができる。このため、本発明によれば、例えば、よりすぐれた分析精度で標的核酸を分析できる。したがって、本発明は、例えば、生命科学分野、臨床分野等において、極めて有用であるといえる。   According to the present invention, in analysis of a plurality of target nucleic acids, a reaction can be performed at a component concentration suitable for the oligonucleotide for analysis of each target nucleic acid. Therefore, according to the present invention, for example, the target nucleic acid can be analyzed with better analysis accuracy. Therefore, it can be said that the present invention is extremely useful in, for example, the life science field, the clinical field, and the like.

1、2、3 カートリッジ
11、11’、11’a、11’b 共通試薬槽
111、111’a、111’b 共通試薬
12、12a、12b 濃度調整試薬槽
112、112a、112b 濃度調整試薬
13、13a、13b 非共通試薬槽
113、113a、113b 非共通試薬
14 サンプル槽
15、15a、15b 前処理試薬槽
115、115a、115b 前処理試薬
16 その他の試薬槽
116 その他の試薬
17 シール
4 分析装置
41 CPU
42 サンプリングポンプユニット
43 ノズル駆動ユニット
44 測定部ユニット
45 記憶装置
46 入力装置
47 出力装置
1, 2, 3 Cartridge 11, 11 ', 11'a, 11'b Common reagent tank 111, 111'a, 111'b Common reagent 12, 12a, 12b Concentration adjusting reagent tank 112, 112a, 112b Concentration adjusting reagent 13 , 13a, 13b Non-common reagent tank 113, 113a, 113b Non-common reagent 14 Sample tank 15, 15a, 15b Pretreatment reagent tank 115, 115a, 115b Pretreatment reagent 16 Other reagent tank 116 Other reagent 17 Seal 4 Analyzer 41 CPU
42 Sampling pump unit 43 Nozzle drive unit 44 Measuring unit 45 Storage device 46 Input device 47 Output device

Claims (15)

少なくとも1つの共通試薬槽と、複数の濃度調整試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記複数の濃度調整試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な少なくとも1つの成分を異なる濃度で含む濃度調整試薬が充填されており、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする、標的核酸の分析用試薬カートリッジ。
Having at least one common reagent tank, a plurality of concentration adjusting reagent tanks, and a plurality of non-common reagent tanks;
Each of the common reagent tanks is filled with a common reagent containing a plurality of components that can be used in common for analysis of a plurality of target nucleic acids,
Each of the plurality of concentration adjustment reagent tanks is filled with a concentration adjustment reagent containing at least one component that can be commonly used for analysis of a plurality of target nucleic acids at different concentrations,
Each of the plurality of non-common reagent tanks can be filled with a non-common reagent containing an analysis oligonucleotide for analyzing a specific target nucleic acid.
前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬および前記濃度調整試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である、請求項1記載のカートリッジ。
The components contained at different concentrations in the concentration adjusting reagent,
2. The cartridge according to claim 1, wherein in the analysis of the target nucleic acid, the cartridge is a component whose concentration is adjusted according to the type of oligonucleotide for analysis of the non-common reagent used in combination with the common reagent and the concentration adjusting reagent. .
前記共通試薬が、前記濃度調整試薬において異なる濃度で含まれる成分を含まない、請求項1または2記載のカートリッジ。 The cartridge according to claim 1, wherein the common reagent does not include a component contained in the concentration adjusting reagent at a different concentration. 複数の共通試薬槽と、複数の非共通試薬槽とを有し、
前記共通試薬槽は、それぞれ、複数の標的核酸の分析に共通して使用可能な複数の成分を含む共通試薬が充填されており、
前記共通試薬は、それぞれ、前記複数の成分のうち少なくとも1つの成分を異なる濃度で含み、
前記複数の非共通試薬槽は、それぞれ、特定の標的核酸を分析する分析用オリゴヌクレオチドを含む非共通試薬が充填可能であることを特徴とする、標的核酸の分析用試薬カートリッジ。
It has a plurality of common reagent tanks and a plurality of non-common reagent tanks,
Each of the common reagent tanks is filled with a common reagent containing a plurality of components that can be used in common for analysis of a plurality of target nucleic acids,
Each of the common reagents includes at least one component of the plurality of components at different concentrations,
Each of the plurality of non-common reagent tanks can be filled with a non-common reagent containing an analysis oligonucleotide for analyzing a specific target nucleic acid.
前記共通試薬において異なる濃度で含まれる前記成分が、
前記標的核酸の分析において、前記共通試薬と組み合わせて使用する前記非共通試薬の分析用オリゴヌクレオチドの種類に応じて、濃度が調整される成分である、請求項4記載のカートリッジ。
The components contained at different concentrations in the common reagent,
The cartridge according to claim 4, wherein the concentration of the target nucleic acid is adjusted according to the type of oligonucleotide for analysis of the non-common reagent used in combination with the common reagent in the analysis of the target nucleic acid.
前記異なる濃度で含まれる成分が、マグネシウムイオン、カリウムイオン、マンガンイオン、ナトリウムイオン、およびアンモニウムイオンからなる群から選択された少なくとも1つである、請求項1から5のいずれか一項に記載のカートリッジ。 The component contained in the different concentration is at least one selected from the group consisting of magnesium ion, potassium ion, manganese ion, sodium ion, and ammonium ion, according to any one of claims 1 to 5. cartridge. 前記異なる濃度で含まれる成分が、マグネシウムイオンである、請求項1から6のいずれか一項に記載のカートリッジ。 The cartridge according to any one of claims 1 to 6, wherein the components contained in the different concentrations are magnesium ions. 前記分析用オリゴヌクレオチドが、前記標的核酸を増幅可能なプライマーである、請求項1から7のいずれか一項に記載のカートリッジ。 The cartridge according to claim 1, wherein the analytical oligonucleotide is a primer capable of amplifying the target nucleic acid. 前記分析用オリゴヌクレオチドが、さらに、前記標的核酸を検出可能なプローブを含む、請求項8記載のカートリッジ。 The cartridge according to claim 8, wherein the analytical oligonucleotide further comprises a probe capable of detecting the target nucleic acid. 前記非共通試薬槽に、前記非共通試薬が予め充填されている、請求項1から9のいずれかに記載のカートリッジ。 The cartridge according to claim 1, wherein the non-common reagent tank is filled with the non-common reagent in advance. 各非共通試薬槽に充填された非共通試薬が、それぞれ、異なる標的核酸の分析用オリゴヌクレオチドを含む、請求項1から10のいずれか一項に記載のカートリッジ。 The cartridge according to any one of claims 1 to 10, wherein each non-common reagent filled in each non-common reagent tank contains a different target nucleic acid analysis oligonucleotide. 請求項1から3および6から11のいずれか一項に記載のカートリッジが収容されているカートリッジ収容部と、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも1つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製部と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析部とを含むことを特徴とする、標的核酸の分析装置。
A cartridge housing portion in which the cartridge according to any one of claims 1 to 3 and 6 to 11 is housed;
Mixing a sample, a common reagent filled in the common reagent tank, at least one concentration adjusting reagent filled in the concentration adjusting reagent tank, and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank A preparation unit for preparing an analysis system for the target nucleic acid,
An analysis device for a target nucleic acid, comprising: an analysis unit that analyzes the target nucleic acid by analyzing the analysis system.
前記調製部において、前記サンプル、少なくとも2つの前記濃度調整試薬、および少なくとも1つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する、請求項12記載の分析装置。 13. The analyzer according to claim 12, wherein the preparation unit prepares the analysis system by mixing the sample, at least two concentration adjusting reagents, and at least one non-common reagent. 請求項1から3および6から11のいずれか一項に記載のカートリッジを用い、
サンプル、前記共通試薬槽に充填されている共通試薬、前記濃度調整試薬槽に充填されている少なくとも1つの濃度調整試薬、および前記非共通試薬槽に充填されている少なくとも1つの非共通試薬を混合することにより、前記標的核酸の分析系を調製する調製工程と、
前記分析系を分析することにより、前記標的核酸を分析する分析工程とを含むことを特徴とする、標的核酸の分析方法。
Using the cartridge according to any one of claims 1 to 3 and 6 to 11,
Mixing a sample, a common reagent filled in the common reagent tank, at least one concentration adjusting reagent filled in the concentration adjusting reagent tank, and at least one non-common reagent filled in the non-common reagent tank A preparation step of preparing an analysis system for the target nucleic acid,
An analysis step of analyzing the target nucleic acid by analyzing the analysis system.
前記調製工程において、前記サンプル、少なくとも2つの前記濃度調整試薬、および少なくとも1つの前記非共通試薬を混合することにより、前記分析系を調製する、請求項14記載の分析方法。

The analysis method according to claim 14, wherein in the preparation step, the analysis system is prepared by mixing the sample, at least two of the concentration adjusting reagents, and at least one of the non-common reagents.

JP2016095406A 2016-05-11 2016-05-11 Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid Pending JP2017201932A (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2016095406A JP2017201932A (en) 2016-05-11 2016-05-11 Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2016095406A JP2017201932A (en) 2016-05-11 2016-05-11 Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2017201932A true JP2017201932A (en) 2017-11-16

Family

ID=60321349

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2016095406A Pending JP2017201932A (en) 2016-05-11 2016-05-11 Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JP2017201932A (en)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109289955A (en) * 2018-11-28 2019-02-01 北京市中医研究所 A kind of vertical adjustable more concentration loading slots of spacing of organ
CN109913362A (en) * 2019-04-02 2019-06-21 乐山力朴能源环保科技有限公司 A kind of biogas slurry transportation system
CN117360960A (en) * 2023-12-07 2024-01-09 苏州天隆生物科技有限公司 Tube-connecting type consumable, preparation method and use method thereof

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001508644A (en) * 1996-09-16 2001-07-03 アルファヘリックス・アクチボラゲット Cartridges and systems for storing and dispensing reagents
JP2007538230A (en) * 2004-05-05 2007-12-27 メトリカ・インコーポレーテッド Analysis system, apparatus, and cartridge therefor
JP2008504046A (en) * 2004-07-02 2008-02-14 イギリス国 Method for stabilizing reagents useful for nucleic acid amplification
WO2012002477A1 (en) * 2010-06-30 2012-01-05 三菱化学メディエンス株式会社 Highly sensitive mutated gene detection method
WO2014051076A1 (en) * 2012-09-28 2014-04-03 株式会社Bna Bna clamp method
JP5498944B2 (en) * 2009-01-23 2014-05-21 アークレイ株式会社 Analysis system, analysis apparatus, container, analysis method, program, and recording medium
JP2014522656A (en) * 2011-07-28 2014-09-08 エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー DNA polymerase with improved activity

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001508644A (en) * 1996-09-16 2001-07-03 アルファヘリックス・アクチボラゲット Cartridges and systems for storing and dispensing reagents
JP2007538230A (en) * 2004-05-05 2007-12-27 メトリカ・インコーポレーテッド Analysis system, apparatus, and cartridge therefor
JP2008504046A (en) * 2004-07-02 2008-02-14 イギリス国 Method for stabilizing reagents useful for nucleic acid amplification
JP5498944B2 (en) * 2009-01-23 2014-05-21 アークレイ株式会社 Analysis system, analysis apparatus, container, analysis method, program, and recording medium
WO2012002477A1 (en) * 2010-06-30 2012-01-05 三菱化学メディエンス株式会社 Highly sensitive mutated gene detection method
JP2014522656A (en) * 2011-07-28 2014-09-08 エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー DNA polymerase with improved activity
WO2014051076A1 (en) * 2012-09-28 2014-04-03 株式会社Bna Bna clamp method

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109289955A (en) * 2018-11-28 2019-02-01 北京市中医研究所 A kind of vertical adjustable more concentration loading slots of spacing of organ
CN109289955B (en) * 2018-11-28 2023-08-22 北京市中医研究所 Organ vertical type interval-adjustable multi-concentration sample adding groove
CN109913362A (en) * 2019-04-02 2019-06-21 乐山力朴能源环保科技有限公司 A kind of biogas slurry transportation system
CN117360960A (en) * 2023-12-07 2024-01-09 苏州天隆生物科技有限公司 Tube-connecting type consumable, preparation method and use method thereof
CN117360960B (en) * 2023-12-07 2024-02-27 苏州天隆生物科技有限公司 Tube-connecting type consumable, preparation method and use method thereof

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10894980B2 (en) Methods of amplifying nucleic acid sequences mediated by transposase/transposon DNA complexes
US20190224675A1 (en) Fluidic system and related methods
Tan et al. Current commercial dPCR platforms: Technology and market review
Geng et al. “Sample-to-answer” detection of rare ctDNA mutation from 2 mL plasma with a fully integrated DNA extraction and digital droplet PCR microdevice for liquid biopsy
Yoo et al. International comparison of enumeration-based quantification of DNA copy-concentration using flow cytometric counting and digital polymerase chain reaction
Huang et al. Rapid screening of complex DNA samples by single-molecule amplification and sequencing
CN105849276A (en) Systems and methods for detecting structural variants
JP2017201932A (en) Reagent cartridge for analysis of target nucleic acid, apparatus for analyzing target nucleic acid, and method for analyzing target nucleic acid
O'Flaherty et al. Steady‐State Kinetic Analysis of DNA Polymerase Single‐Nucleotide Incorporation Products
JP2022517906A (en) Microfluidic array for sample digitization
Blackburn et al. Use of synthetic DNA spike-in controls (sequins) for human genome sequencing
JP2018520706A (en) Automation from sampling to NGS library preparation
McGinn et al. New technologies for DNA analysis–a review of the READNA Project
CN108026591B (en) Diagnostic methods and compositions
EP3325697B1 (en) Optimized clinical sample sequencing
LaFranzo et al. Predictive immune modeling of solid tumors
EP3491116B1 (en) High speed nucleic acid melting analysis
EP3212767A1 (en) Sample preparation vessels, microfluidic circuits, and systems and methods for sample preparation, extraction, and analysis
CN112513291A (en) Reaction mixtures, methods and kits for performing quantitative real-time PCR
Rajasekaran et al. Employing digital droplet pcr to detect braf v600e mutations in formalin-fixed paraffin-embedded reference standard cell lines
WO2023064960A2 (en) Methods and systems for genotyping by sanger-based dna sequencing
Cain Targeted STR and SNP in-field sequencing by Oxford Nanopore MinION™ for the identification of an individual in a military scenario
Vinayagamoorthy et al. Detection of EGFR deletion using unique RepSeq technology
Dalton Continuous Flow Digital PCR for Absolute Quantification of Nucleic Acids
CN115216550A (en) Coli residual DNA detection kit and use method thereof

Legal Events

Date Code Title Description
RD03 Notification of appointment of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7423

Effective date: 20170113

RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20170124

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20180126

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20190108

A02 Decision of refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02

Effective date: 20190716