JP2016021880A - 抗菌効果判定システム、抗菌効果判定方法及び抗菌効果判定プログラム - Google Patents
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Abstract
Description
以下、本発明の第1の実施形態について図面を参照して説明する。図1は、本発明の第1の実施形態に係る抗菌効果判定システム1の構成を示すブロック図である。抗菌効果判定システム1は、領域判定部2と、効果判定部3とから構成されている。領域判定部2は、観測画像から抗菌剤の抗菌効果を判定するために有効な領域と無効な領域を判定し、領域判定結果を効果判定部3に供給する。効果判定部3は、領域判定部2から供給される領域判定結果に基づいて、抗菌剤の抗菌効果を判定し、効果判定結果を出力する。
本発明の実施の形態1によれば、第3の従来例のような高価な酸化還元系発色試薬や装置を用いることなく、抗菌剤の抗菌効果を簡易かつ安価な構成で判定をすることができる。
次に、本発明の第2の実施形態について図面を参照して説明する。なお、第1の実施形態と同一又は同等の構成については、同等の符号を用いるとともに、その説明を省略又は簡略化する。本実施形態に係る抗菌効果判定システム51は、一般的なコンピュータ、又はマイクロコンピュータなどの装置と同様の構成によって実現されている点で、第1の実施形態に係る抗菌効果判定システム1と相違している。
試験菌が培養されたシャーレをデジタルカメラで撮影する際にシャーレを載置する台を無地黒色と仮定する。有効領域が判定された後、有効領域の平均輝度値μeを算出する。有効領域の輝度値が0〜1の値に正規化されていると仮定し、式(16)で表される透明度Tを算出する。無効領域では試験菌の繁殖により白濁が進むため、上記透明度Tの値は0に近づいていく。
T=1−μe …(16)
有効領域の連結ブロブ解析により得られた有効領域の面積A及び離心率exを用いて、式(17)で表される輪郭のにじみ具合Bを定義する。
B=定数×ex/A …(17)
本実施の形態では、有効領域の形状は円形を基本としているので、にじみが生じると形状が円形から歪むため、にじみ具合Bは大きな値となる。また、にじみにより有効領域の面積Aが小さくなってもにじみ具合Bは大きな値となる。
Claims (9)
- 細菌が塗抹された培地表面に抗菌剤を静置し、前記細菌を培養した後の前記培地表面を撮影した画像に基づいて前記抗菌剤の抗菌効果を判定する抗菌効果判定システムであって、
前記画像の局所領域の明るさの特徴量である局所平均画像と、前記画像の局所的平坦度の特徴量である局所分散画像とを前記画像から抽出する特徴抽出部と、第1の事前確率と、前記局所平均画像及び前記局所分散画像とに基づいて、前記画像の画素ごとに、前記抗菌剤の抗菌効果を判定するために有効な有効領域と無効な無効領域とをベイズ推定によって判定し、前記有効領域と前記無効領域とからなる二値画像を出力する第1のベイズ判定部とを有する領域判定部と、
前記二値画像をブロブ解析して前記有効領域を連結した最大面積を有するブロブを形成し、前記ブロブの前記画像における占有率と、前記ブロブの離心率とを求めるブロブ解析部と、第2の事前確率と、前記占有率及び前記離心率とに基づいて、前記画像の有効領域の形状をベイズ推定によって判定する第2のベイズ判定部とを有する効果判定部と
を具備することを特徴とする抗菌効果判定システム。 - 前記特徴抽出部は、
前記画像を離散ハール・ウェーブレット変換する離散ハール・ウェーブレット変換部と、
前記離散ハール・ウェーブレット変換部の出力低周波画像を離散ハール・ウェーブレット逆変換して前記局所平均画像を出力する離散ハール・ウェーブレット逆変換部と、
前記画像から前記離散ハール・ウェーブレット逆変換部の出力画像を減算する減算部と、
前記減算部の出力画像を2乗する2乗部と、
前記2乗部の出力画像の局所的な平均値を算出して前記局所分散画像を出力する平均フィルタと
を含むことを特徴とする請求項1に記載の抗菌効果判定システム。 - 前記第1の事前確率は、前記画像内の中心座標点でピーク値を有する二次元ガウス関数でモデル化していることを特徴とする請求項1又は2に記載の抗菌効果判定システム。
- 細菌が塗抹された培地表面に抗菌剤を静置し、前記細菌を培養した後の前記培地表面を撮影した画像に基づいて前記抗菌剤の抗菌効果を判定する抗菌効果判定方法であって、
前記画像の局所領域の明るさの特徴量である局所平均画像と、前記画像の局所的平坦度の特徴量である局所分散画像とを前記画像から抽出する第1のステップと、
第1の事前確率と、前記局所平均画像及び前記局所分散画像とに基づいて、前記画像の画素ごとに、前記抗菌剤の抗菌効果を判定するために有効な有効領域と無効な無効領域とをベイズ推定によって判定し、前記有効領域と前記無効領域とからなる二値画像を出力する第2のステップと、
前記二値画像をブロブ解析して前記有効領域を連結した最大面積を有するブロブを形成し、前記ブロブの前記画像における占有率と、前記ブロブの離心率とを求める第3のステップと、
第2の事前確率と、前記占有率及び前記離心率とに基づいて、前記画像の有効領域の形状をベイズ推定によって判定する第4のステップと
を有することを特徴とする抗菌効果判定方法。 - 前記第1のステップは、
前記画像を離散ハール・ウェーブレット変換する第1のサブステップと、
前記離散ハール・ウェーブレット変換された低周波画像を離散ハール・ウェーブレット逆変換して前記局所平均画像を出力する第2のサブステップと、
前記画像から前記離散ハール・ウェーブレット逆変換された画像を減算する第3のサブステップと、
前記減算結果の画像を2乗する第4のサブステップと、
前記2乗された画像の局所的な平均値を算出して前記局所分散画像を出力する第5のサブステップと
を含むことを特徴とする請求項4に記載の抗菌効果判定方法。 - 前記第1の事前確率は、前記画像内の中心座標点でピーク値を有する二次元ガウス関数でモデル化していることを特徴とする請求項4又は5に記載の抗菌効果判定方法。
- 細菌が塗抹された培地表面に抗菌剤を静置し、前記細菌を培養した後の前記培地表面を撮影した画像に基づいて前記抗菌剤の抗菌効果を判定する抗菌効果判定プログラムであって、
前記画像の局所領域の明るさの特徴量である局所平均画像と、前記画像の局所的平坦度の特徴量である局所分散画像とを前記画像から抽出する第1のステップと、
第1の事前確率と、前記局所平均画像及び前記局所分散画像とに基づいて、前記画像の画素ごとに、前記抗菌剤の抗菌効果を判定するために有効な有効領域と無効な無効領域とをベイズ推定によって判定し、前記有効領域と前記無効領域とからなる二値画像を出力する第2のステップと、
前記二値画像をブロブ解析して前記有効領域を連結した最大面積を有するブロブを形成し、前記ブロブの前記画像における占有率と、前記ブロブの離心率とを求める第3のステップと、
第2の事前確率と、前記占有率及び前記離心率とに基づいて、前記画像の有効領域の形状をベイズ推定によって判定する第4のステップと
をコンピュータに実行させることを特徴とする抗菌効果判定プログラム。 - 前記第1のステップは、
前記画像を離散ハール・ウェーブレット変換する第1のサブステップと、
前記離散ハール・ウェーブレット変換された低周波画像を離散ハール・ウェーブレット逆変換して前記局所平均画像を出力する第2のサブステップと、
前記画像から前記離散ハール・ウェーブレット逆変換された画像を減算する第3のサブステップと、
前記減算結果の画像を2乗する第4のサブステップと、
前記2乗された画像の局所的な平均値を算出して前記局所分散画像を出力する第5のサブステップと
を含むことを特徴とする請求項7に記載の抗菌効果判定プログラム。 - 前記第1の事前確率は、前記画像内の中心座標点でピーク値を有する二次元ガウス関数でモデル化していることを特徴とする請求項7又は8に記載の抗菌効果判定プログラム。
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE112016006146T5 (de) | 2016-02-08 | 2018-09-20 | Mitsubishi Hitachi Power Systems, Ltd. | U-rohr wärmetauscher |
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---|---|---|---|---|
JP2006141298A (ja) * | 2004-11-19 | 2006-06-08 | Eisai Co Ltd | 細胞に対する被検物質の評価 |
WO2009093525A1 (ja) * | 2008-01-23 | 2009-07-30 | Niigata University | 識別装置、識別方法及び識別処理プログラム |
WO2013038925A1 (ja) * | 2011-09-13 | 2013-03-21 | 国立大学法人大阪大学 | 細菌または真菌の抗菌薬感受性の検査方法およびそれに用いるシステム |
JP2013517459A (ja) * | 2010-01-12 | 2013-05-16 | ライジェル ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド | 作用機序スクリーニング法 |
JP2014514580A (ja) * | 2011-05-06 | 2014-06-19 | ビオメリュー | バイオ画像化方法及びシステム |
-
2014
- 2014-07-17 JP JP2014146465A patent/JP6365830B2/ja active Active
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