JP2013526879A - Microbial detection and quantification - Google Patents

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Abstract

生存微生物を、前記微生物を含むと疑われている試料において検出及び計測するための方法であって、(1)前記試料の前記微生物を修復化合物及び成長媒体と接触させる工程、及び、(2)工程(1)の生成物をインキュベーションする工程、及び(3)前記生存微生物を検出及び計測する工程を含み、その際、前記微生物がレジオネラ・ニューモフィラの種であり、前記修復化合物が、(a)セリン、(b)トレオニン、(c)用量10-6〜10-2mMでカルシウムイオンを含む化合物、(d)用量10-6〜10-2mMでマグネシウムイオンを含む化合物、(e)カリウムイオンを含む化合物、(f)グルタミン酸又はその塩、及び(g)ピルビン酸又はその塩、を含む方法。本発明はまた、レジオネラ・ニューモフィラの種の生存微生物を、前記微生物を含むと疑われている試料において検出及び計測するためのキットも開示する。A method for detecting and measuring viable microorganisms in a sample suspected of containing said microorganisms, comprising: (1) contacting said microorganisms of said sample with a repair compound and a growth medium; and (2) Incubating the product of step (1), and (3) detecting and measuring the viable microorganism, wherein the microorganism is a species of Legionella pneumophila and the repair compound comprises (a ) serine, (b) threonine, (c) dose 10-6 compound containing calcium ions -2 mM, compounds containing magnesium ions (d) dose 10-6 to -2 mM, (e) potassium A method comprising an ion-containing compound, (f) glutamic acid or a salt thereof, and (g) pyruvic acid or a salt thereof. The present invention also discloses a kit for detecting and measuring viable microorganisms of Legionella pneumophila species in a sample suspected of containing said microorganisms.

Description

本発明は、試料においてレジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)の種の生存微生物を検出及び計測するための方法に関する。本発明は、かかる方法における使用に好適なキットも含む。この方法及びキットは、生存微生物をより迅速に定量することを可能にする。   The present invention relates to a method for detecting and measuring viable microorganisms of Legionella pneumophila species in a sample. The invention also includes kits suitable for use in such methods. This method and kit allows for more rapid quantification of viable microorganisms.

レジオネラ細菌は、湿ったか又は湿分のある環境、例えば土壌及び非海洋性水生居住環境において汎存性である。レジオネラ細菌はまた、温水及び冷水設備、エアーコンディショニングシステムの冷却塔及び水加湿器においても見出されることができる。   Legionella bacteria are endemic in moist or moist environments, such as soils and non-marine aquatic environments. Legionella bacteria can also be found in hot and cold water equipment, air conditioning system cooling towers and water humidifiers.

レジオネラ、特にレジオネラ・ニューモフィラは、急性細菌肺炎を生じる可能性のある病原菌であり、一般には、感染した個人にとってしばしば致命的である「レジオネラ病」として知られている。   Legionella, especially Legionella pneumophila, is a pathogen that can cause acute bacterial pneumonia and is generally known as “Legionella disease”, which is often fatal to infected individuals.

従来は、レジオネラ・ニューモフィラの検出及び計測は、細胞培養により達成されている。この方法は、プレートカウントを用いて培養可能細菌の測定又はフィルターメンブラン法を利用してマイクロコロニーの測定により達成されてよい。これら技術は、生存細菌を、コロニー又はマイクロコロニーを形成するためのその能力により評価する。残念ながら、かかる方法は、通常は、コロニー又はマイクロコロニーを形成させるのに、3〜10日間必要とする。水設備がなお作動中である場合には、この間にヒト感染の許容できない危険性が存在する。   Conventionally, detection and measurement of Legionella pneumophila has been achieved by cell culture. This method may be accomplished by measuring culturable bacteria using plate counts or by measuring microcolony using the filter membrane method. These techniques assess viable bacteria by their ability to form colonies or microcolonies. Unfortunately, such methods usually require 3 to 10 days to form colonies or microcolonies. If the water facility is still in operation, there is an unacceptable risk of human infection during this time.

全レジオネラ微生物を検出するための他の方法は、PCR(Polymerase Chain Reaction)技術を含む。PCRは、in vitro酵素複製によるDNA片の増幅のためにDNAポリメラーゼを利用する。この技術の進行の間に、作成したDNAを、DNAテンプレートが対数的に増幅する連鎖反応を生じる増幅のためのテンプレートとして使用する。PCRは、単一又はいくつかのコピーDNA片が、数百万以上のコピーのDNA片の作成により増幅されることを可能にする。典型的には、かかる方法は、Diederen et al., J Med Microbiol. 2007 Jan; 56 (Pt 1 ):94-101により説明されている。   Other methods for detecting all Legionella microorganisms include PCR (Polymerase Chain Reaction) technology. PCR utilizes a DNA polymerase for amplification of a piece of DNA by in vitro enzymatic replication. During the progress of this technique, the generated DNA is used as a template for amplification that results in a chain reaction in which the DNA template is logarithmically amplified. PCR allows single or several copies of DNA pieces to be amplified by making millions of copies of DNA pieces. Typically such methods are described by Diederen et al., J Med Microbiol. 2007 Jan; 56 (Pt 1): 94-101.

しかし、PCRの欠点は、試料が重合反応抑制剤を含む傾向があり、そのため、定量的な結果を一貫して提供しないことである。さらに、この技術は、レジオネラ存在の結果的な過小評価を伴うDNA損失を生じうる、先行するDNA精製工程に依存する。ある程度、これら不利な点は、定量的であるリアルタイムPCRにより克服される。しかし、この技術は、生細胞と非生細胞を区別できない。   However, a drawback of PCR is that the sample tends to contain a polymerization inhibitor and therefore does not consistently provide quantitative results. Furthermore, this technique relies on previous DNA purification steps that can result in DNA loss with consequent underestimation of Legionella presence. To some extent, these disadvantages are overcome by real-time PCR, which is quantitative. However, this technique cannot distinguish between live and non-live cells.

別の技術は、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)であり、この場合には、蛍光物質によりラベル化されたオリゴヌクレオチドプローブが細菌細胞中に侵入する。リボソーム核酸(rRNA)が、標的として知られているプローブに対し正確な配列を有する場合には、プローブはそれ自体がその標的に付着して、後続のいかなる洗浄工程によっても除去されることはない。プローブが固定している細菌は、次に、蛍光シグナルを放出する。この蛍光シグナルは、次いで、フローサイトメトリー、固相サイトメトリー又は落射蛍光顕微鏡といった技術により定量されてよい。典型的なFISH技術は、Dutil S et alによりJ Appl Microbiol. 2006 May;100(5):955-63で説明されている。しかし、FISH技術のみを用いると、生存レジオネラ・ニューモフィラの全数は検出できるが、しかし、残念ながら、この方法は、分裂でき、そして結果としてコロニーを作ることができるレジオネラ・ニューモフィラ細菌のみを排他的に同定することはできない。   Another technique is fluorescence in situ hybridization (FISH), in which an oligonucleotide probe labeled with a fluorescent material enters a bacterial cell. If a ribosomal nucleic acid (rRNA) has the correct sequence for a probe known as a target, the probe will attach itself to the target and will not be removed by any subsequent washing steps. . The bacterium to which the probe is immobilized then emits a fluorescent signal. This fluorescent signal may then be quantified by techniques such as flow cytometry, solid phase cytometry or epifluorescence microscopy. A typical FISH technique is described by Dutil S et al in J Appl Microbiol. 2006 May; 100 (5): 955-63. However, using only FISH technology, the total number of viable Legionella pneumophila can be detected, but unfortunately this method excludes only Legionella pneumophila bacteria that can divide and eventually colonize. Cannot be identified automatically.

生存レジオネラ・ニューモフィラの計測のための更なる方法は、Chem-Chrome V6を伴い、かつ、Delgado-Viscogliosi et al Appl Environ Microbiol. 2005 Jul;71 (7):4086-96により説明されている。この方法は、レジオネラ・ニューモフィラの定量化と、生存細菌及び非生存細菌の間の差別化を可能にする。これは、抗体及び細菌生存性マーカー(Chem-Chrome V6)を用いるレジオネラ細胞の特異的検出と計測のための落射蛍光顕微鏡の使用を組み合わせる。しかし、この技術は、生存細胞と非生存細胞を区別するものの、コロニー形成細菌を別個に同定することは可能でない。   A further method for measurement of viable Legionella pneumophila involves Chem-Chrome V6 and is described by Delgado-Viscogliosi et al Appl Environ Microbiol. 2005 Jul; 71 (7): 4086-96. This method allows quantification of Legionella pneumophila and differentiation between live and non-viable bacteria. This combines the use of epifluorescence microscopy for specific detection and counting of Legionella cells using antibodies and bacterial viability markers (Chem-Chrome V6). However, although this technique distinguishes between viable and non-viable cells, it is not possible to identify colony-forming bacteria separately.

US 20070218522は、生存レジオネラ及び他の従属栄養性の好気性細菌の検出及び定量のための方法及び組成物を説明し、そして、この方法はレジオネラのマイクロコロニーの迅速検出及び定量のために、吸収媒体、成長促進物質及び成長選択物質を含むdipslideの使用を含む。この技術は、損傷した細菌を計測しない。   US 20070218522 describes a method and composition for the detection and quantification of viable Legionella and other heterotrophic aerobic bacteria, and this method absorbs for rapid detection and quantification of Legionella microcolonies. Including the use of dipslides containing media, growth promoting substances and growth selective substances. This technique does not count damaged bacteria.

EP 1329515は、ピルビン酸の塩を含み、微生物のコロニーの発達を可能にする寒天成長媒体を、ガス環境に接触させることによって、過酸化水素を含むガス環境における微生物の存在についての試験方法に関する。   EP 1329515 relates to a test method for the presence of microorganisms in a gas environment comprising hydrogen peroxide by contacting the gas environment with an agar growth medium comprising a salt of pyruvate and allowing the growth of microbial colonies.

成長媒体上のコロニー成長を伴う技術、例えば栄養寒天プレートは、一般により正確であると考えられる。したがって、このプレートカウント法は、全生存カウントを獲得するための方法の好ましい選択肢のままである。このことは一般に、微生物を含むと疑われている試料を、固形栄養源又は成長媒体を含むプレート上に適用することを意味する。かかる技術は、一般にプレーティングと称される。全生存カウントとは、観察者により認識可能な集団を生じることができる細菌の全数を我々は意味する。典型的には、このことは、成長媒体、例えば栄養寒天プレートの表面上の可視コロニーを意味する。   Techniques involving colony growth on the growth medium, such as nutrient agar plates, are generally considered more accurate. Therefore, this plate count method remains the preferred choice of method for obtaining a total survival count. This generally means applying a sample suspected of containing microorganisms onto a plate containing a solid nutrient source or growth medium. Such a technique is generally referred to as plating. By total survival count we mean the total number of bacteria that can produce a population recognizable by the observer. Typically this means a visible colony on the surface of a growth medium such as a nutrient agar plate.

しかし、環境中の微生物、例えばレジオネラ・ニューモフィラは、その環境状況においてこの微生物が成長し増殖することを妨げる1以上のストレスに曝露されてよい。かかるストレスを受けた微生物は、正常な培養条件下で全く分裂しないか又は可視コロニーを形成しない。この環境において、一部の微生物細胞は、環境状況、例えば飢餓、殺生物剤の存在、ヒートショック及び脱水のために一般にストレスを受けている。さらに、これら細胞は攻撃されやすい生理学的状態にあってよく、その状態では、微生物のプレーティング技術は、雰囲気酸素の存在のために、既にストレスを受けた微生物細胞のストレス化を悪化させてよい。さらに、このことは、このストレスを受けた細菌の人工的な死を導き、全生存カウントの過小評価を導く可能性がある。   However, microorganisms in the environment, such as Legionella pneumophila, may be exposed to one or more stresses that prevent the microorganism from growing and proliferating in the environment. Such stressed microorganisms do not divide at all or form visible colonies under normal culture conditions. In this environment, some microbial cells are generally stressed due to environmental conditions such as starvation, the presence of biocides, heat shock and dehydration. In addition, these cells may be in a physiological state that is susceptible to attack, in which microbial plating techniques may exacerbate the stressing of already stressed microbial cells due to the presence of atmospheric oxygen. . Furthermore, this can lead to the artificial death of this stressed bacterium, leading to an underestimation of the overall survival count.

加えて、プレーティング法での生存レジオネラ・ニューモフィラの過小評価は、その病原性に関して有害になる可能性がある。   In addition, underestimation of surviving Legionella pneumophila with the plating method can be detrimental with regard to its pathogenicity.

1970年代から、活性酸素種(ROS)のスカベンジャーが、プレーティングプロセスの間の酸化的ストレスの作用を制限するために使用されるべきであると報告されている。このことは、Speck et al, repair and enumeration of injured coliforms by a plating procedure, Appl Microbiol 29, 549-50 (1975); Martin et al Catalase: its effect on microbial enumeration. Appl Environ Microbiol 32, 731 -4 (1976); Brewer et al Beneficial effects of catalase or pyruvate in a most-probable-number technique for the detection of Staphylococcus aureus. Appl Environ Microbiol 34, 797-800 (1977); McDonald et al, Enhanced recovery of injured Escherichia coli by compounds that degrade hydrogen peroxide or block its formation. Appl Environ Microbiol 45, 360-5 (1983); Marthi et al) Resuscitation effects of catalase on airborne bacteria. AppI Environ Microbiol 57, 2775-6 (1991 ); Busch and Donnelly Development of a repair-enrichment broth for resuscitation of heat-injured Listeria monocytogenes and Listeria innocua. Appl Environ Micro-biol 58, 14-20 (1992);及びDukan et al, Oxidative stress defense and deterioration of growth-arrested Escherichia coli cells. J Biol Chem 274, 26027-32 (1999)により報告されている。   Since the 1970s it has been reported that reactive oxygen species (ROS) scavengers should be used to limit the effects of oxidative stress during the plating process. This is speck et al, repair and enumeration of injured coliforms by a plating procedure, Appl Microbiol 29, 549-50 (1975); Martin et al Catalase: its effect on microbial enumeration.Appl Environ Microbiol 32, 731 -4 ( 1976); Brewer et al Beneficial effects of catalase or pyruvate in a most-probable-number technique for the detection of Staphylococcus aureus.Appl Environ Microbiol 34, 797-800 (1977); McDonald et al, Enhanced recovery of injured Escherichia coli by compounds that degrade hydrogen peroxide or block its formation.Appl Environ Microbiol 45, 360-5 (1983); Marthi et al) Resuscitation effects of catalase on airborne bacteria.AppI Environ Microbiol 57, 2775-6 (1991); Busch and Donnelly Development of a repair-enrichment broth for resuscitation of heat-injured Listeria monocytogenes and Listeria innocua.Appl Environ Micro-biol 58, 14-20 (1992); and Dukan et al, Oxidative stress defense and deterioration of growth-arrested Escherichia coli cells. J Biol Chem 274, 26027-32 (1999).

しかし、前述の全ての場合に、本発明の発明者は、ROSは、化合物が化学的にROSと反応する直接的経路により減少されると信じている。   However, in all of the above cases, the inventors of the present invention believe that ROS is reduced by a direct route by which the compound chemically reacts with ROS.

Berube et al, "Rapid detection and identification of Legionella pneumophila by membrane immunoassay", Applied and Environmental Microbiology, 1989, 55, 1640-1641は、モノクローナル抗体を用いたイムノブロットアッセイによるレジオネラ・ニューモフィラの検出及び同定を説明している。損傷した細菌の問題に対処するための手段は与えられていない。   Berube et al, "Rapid detection and identification of Legionella pneumophila by membrane immunoassay", Applied and Environmental Microbiology, 1989, 55, 1640-1641 describes detection and identification of Legionella pneumophila by immunoblot assay using monoclonal antibodies doing. No means are given to deal with the problem of damaged bacteria.

Pine et alによる文献(Role of keto acids and reduced-oxygen-scavenging enzymes in the growth of Legionella species. J Clin Microbiol 23, 33-42 (1986))は、ケト酸及び還元した酸素捕捉酵素の添加が、レジオネラ・ニューモフィラの成長を最適化するために必要であると説明し、そして、この微生物の標準的計測のために使用される媒体においてこれら材料を用いることを提案した。   A reference by Pine et al (Role of keto acids and reduced-oxygen-scavenging enzymes in the growth of Legionella species. J Clin Microbiol 23, 33-42 (1986)) shows that the addition of keto acids and reduced oxygen scavenging enzymes He explained that it is necessary to optimize the growth of Legionella pneumophila and proposed to use these materials in the media used for standard measurements of this microorganism.

しかし、ケト酸及び還元した酸素捕捉酵素の使用は、単独では、このストレスを受けたレジオネラ・ニューモフィラ細胞を修復しかつ正確な計測を可能にするように修復するには不十分である。このことは、レジオネラ・ニューモフィラのために特定の成長媒体、例えば緩衝化した炭酵母抽出物(BCYE)寒天媒体を使用する場合に、特に当てはまる。事実、レジオネラ・ニューモフィラの正確な計測のために有用な標準的な媒体の最適化に関するデータは入手可能でない。   However, the use of keto acids and reduced oxygen scavenging enzymes alone is not sufficient to repair this stressed Legionella pneumophila cell so that it can be accurately measured. This is especially true when using a specific growth medium for Legionella pneumophila, such as a buffered charcoal yeast extract (BCYE) agar medium. In fact, data on standard media optimization useful for accurate measurement of Legionella pneumophila is not available.

WO 2009 121726は、試料中の生存レジオネラ・ニューモフィラ微生物を、この微生物を少なくとも1の修復化合物及び成長媒体と接触させ、その後、インキュベーション及び生存微生物の検出及び定量化の工程が続くことにより、検出及び計測する方法を説明する。この修復化合物は直接的に又は間接的に、この微生物の酸化的ストレスを減少させるべく代謝に影響を生じる。ピルビン酸及びグリコール酸を含む修復化合物が提案されている。この方法は、従来法よりもより短期間で生存レジオネラ・ニューモフィラをより正確に計測するための優れた手段を提供する。   WO 2009 121726 detects a living Legionella pneumophila microorganism in a sample by contacting the microorganism with at least one repair compound and a growth medium, followed by steps of incubation and detection and quantification of the living microorganism. And the method of measuring will be described. The repair compound directly or indirectly affects metabolism to reduce the oxidative stress of the microorganism. Repair compounds containing pyruvic acid and glycolic acid have been proposed. This method provides an excellent means for more accurately measuring the survival Legionella pneumophila in a shorter period of time than conventional methods.

しかし、生存レジオネラ・ニューモフィラをよりいっそう正確にかつよりいっそう迅速に計測するための改善された方法を提供することが望ましい。さらに、このことをレジオネラ・ニューモフィラ株のより広いスペクトルにわたり達成することも望ましいものである。   However, it would be desirable to provide an improved method for measuring survival Legionella pneumophila more accurately and more quickly. It would also be desirable to achieve this over a wider spectrum of Legionella pneumophila strains.

こうして、本発明に応じて、我々は、生存微生物を、この微生物を含むと疑われている試料において検出及び計測するための方法であって、
(1)前記試料の前記微生物を修復化合物及び成長培地と接触させる工程、及び
(2)工程(1)の生成物をインキュベーションする工程、及び
(3)前記生存微生物を検出及び定量化する工程
を含み、その際、前記微生物がレジオネラ・ニューモフィラの種であり、前記修復化合物が、
(a)セリン、
(b)トレオニン、
(c)用量10-6〜10-2mMでカルシウムイオンを含む化合物、
(d)用量10-6〜10-2mMでマグネシウムイオンを含む化合物、
(e)カリウムイオンを含む化合物、
(f)グルタミン酸又はその塩、
及び、
(g)ピルビン酸又はその塩
を含む方法を提供する。
Thus, according to the present invention, we provide a method for detecting and measuring viable microorganisms in a sample suspected of containing the microorganisms, comprising:
(1) contacting the microorganism of the sample with a repair compound and a growth medium; (2) incubating the product of step (1); and (3) detecting and quantifying the viable microorganism. Wherein the microorganism is a species of Legionella pneumophila and the repair compound comprises:
(A) serine,
(B) threonine,
(C) a compound containing calcium ions at a dose of 10 −6 to 10 −2 mM,
(D) a compound containing magnesium ions at a dose of 10 −6 to 10 −2 mM,
(E) a compound containing potassium ions,
(F) glutamic acid or a salt thereof,
as well as,
(G) A method comprising pyruvic acid or a salt thereof is provided.

我々は、本方法において修復化合物として一緒に用いられるこれら化合物の使用が著しく、レジオネラ・ニューモフィラ微生物の潜在期間を著しく減少させたことを見出した。事実、我々は、このことがレジオネラ・ニューモフィラ株のより広いスペクトルにわたり達成されることを見出した。   We have found that the use of these compounds used together as repair compounds in this method has significantly reduced the latency of Legionella pneumophila microorganisms. In fact, we have found that this is achieved over a wider spectrum of Legionella pneumophila strains.

理論に捕らわれることなく、ピルバート、グルタマート及び特定の濃度のカルシウム及びマグネシウムイオンの組み合わせが、直接的に又は間接的に酸化的ストレスの除去又は減少に有用な作用をもたらすと信じられており、そして、セリン及びトレオニンがこの代謝を促進する一方で、カリウムイオンが浸透ショックを減少させると考えられている。修復化合物のこの特殊な組み合わせが、酸化的ストレスの除去又は減少、浸透ショックの低下及び代謝の促進において相乗的な改善を提供し、これによって、本発明の課題を達成すると信じられている。   Without being bound by theory, it is believed that the combination of pyruvate, glutamate and certain concentrations of calcium and magnesium ions has a useful effect in removing or reducing oxidative stress, either directly or indirectly, and While serine and threonine promote this metabolism, potassium ions are believed to reduce osmotic shock. It is believed that this particular combination of repair compounds provides a synergistic improvement in removing or reducing oxidative stress, reducing osmotic shock and promoting metabolism, thereby achieving the objects of the present invention.

本発明では、セリン又はトレオニンの所望の用量は、試料の体積に対する修復化合物の質量に対し0.01〜5%であってよい。望ましくは、これは通常は0.05〜2.5%、例えば0.1〜2%、しばしば0.5〜1%の範囲である。グルタミン酸(又はその塩)及び/又はピルビン酸(又はその塩)は、試料の体積に対する修復化合物の質量に対し0.01〜5%の所望の用量で使用される。望ましくは、これはしばしば0.05〜2.5%、例えば0.1〜2%、しばしば0.5〜1%の範囲にある。   In the present invention, the desired dose of serine or threonine may be 0.01-5% based on the mass of repair compound relative to the volume of the sample. Desirably this is usually in the range of 0.05-2.5%, for example 0.1-2%, often 0.5-1%. Glutamic acid (or a salt thereof) and / or pyruvic acid (or a salt thereof) is used at a desired dose of 0.01-5% based on the mass of the repair compound relative to the volume of the sample. Desirably this is often in the range of 0.05-2.5%, such as 0.1-2%, often 0.5-1%.

カルシウムイオン、マグネシウムイオン又はカリウムイオンを含む各化合物は、任意の好適な塩であってよい。望ましくは、これらは、所望の用量を可能にするため少なくとも十分に、水溶性でなければならない。塩は、任意の好適な対イオンを有してよい。当業者はいかなる場合にも、この対イオンが微生物、例えばレジオネラ・ニューモフィラにとって既知の毒素であってはならないことを理解するものである。典型的には、この対イオンは、塩化物イオン、硫酸イオン、硝酸イオンその他を含むものであるが、これらに限定されない。   Each compound containing calcium ions, magnesium ions or potassium ions may be any suitable salt. Desirably they must be at least sufficiently water soluble to allow the desired dose. The salt may have any suitable counter ion. The person skilled in the art understands that in any case this counterion must not be a known toxin for microorganisms such as Legionella pneumophila. Typically, the counter ion includes, but is not limited to, chloride ion, sulfate ion, nitrate ion and the like.

上で示したとおり、この化合物がカルシウムイオンを含む場合には、これは10-6〜10-2mMの用量で使用されるべきであり、好ましくは10-5〜10-3mM、より好ましくは5×10-45×10-3mMの範囲内、特に約10-4mMである。上で示したとおりマグネシウムイオンを含む化合物に関して、この用量は、10-6〜10-2mMであることが望ましく、好ましくは10-5〜10-3mM、より好ましくは5×10-4〜5×10-3mMの範囲内、特に約10-4mMである。 As indicated above, if this compound contains calcium ions, it should be used at a dose of 10 −6 to 10 −2 mM, preferably 10 −5 to 10 −3 mM, more preferably Is in the range of 5 × 10 −4 5 × 10 −3 mM, especially about 10 −4 mM. For compounds containing magnesium ions as indicated above, this dose is desirably 10 −6 to 10 −2 mM, preferably 10 −5 to 10 −3 mM, more preferably 5 × 10 −4 to Within the range of 5 × 10 −3 mM, especially about 10 −4 mM.

カリウムイオンを含む修復化合物は、望ましくは、1〜10-4mM、例えば10-1〜10-3mM、より好ましくは5×10-1〜5×10-2mM、特に約10-2mMであってよい用量で使用されるべきである。 The repair compound comprising potassium ions is desirably 1 to 10 −4 mM, such as 10 −1 to 10 −3 mM, more preferably 5 × 10 −1 to 5 × 10 −2 mM, especially about 10 −2 mM. Should be used at doses that may be.

修復化合物は一緒に使用され、このことは、これらが同時に又は逐次に使用されてよいことを意味する。逐次にとは、実質的に次々に各化合物を添加することを我々は意味する。同時にとは、2以上の修復化合物を前記試料に同じ時に添加することを我々は意味する。2以上の修復化合物を1の調合物へと組み合わせ、これによって、修復化合物の別個の添加をなくすことが所望されてもよい。   Repair compounds are used together, meaning that they may be used simultaneously or sequentially. By sequential we mean adding each compound substantially one after another. Simultaneously means that two or more repair compounds are added to the sample at the same time. It may be desirable to combine two or more repair compounds into one formulation, thereby eliminating the separate addition of repair compounds.

我々は、修復化合物ピルバート、グルタマート、カルシウム及びマグネシウム含有物が、微生物の酸化的ストレスを減少させるように、直接的又は間接的に微生物の代謝に作用すると信じている。このようにして、我々は、ピルバート、グルタマート、カルシウム及びマグネシウム含有修復化合物が、内因的に微生物に作用すると信じている。   We believe that the repair compounds pyruvate, glutamate, calcium and magnesium content directly or indirectly affect microbial metabolism so as to reduce microbial oxidative stress. In this way we believe that pyrbert, glutamate, calcium and magnesium containing repair compounds act on microorganisms endogenously.

酸化的ストレスとは、ROS濃度(内因的生産又は外来的付加)と、反応性中間体を容易に解毒するか又は生じるダメージを効率的に修復する微生物の能力の間の不均衡を我々は意味する。   By oxidative stress we mean an imbalance between the ROS concentration (endogenous production or exogenous addition) and the ability of the microorganism to easily detoxify reactive intermediates or to efficiently repair the resulting damage To do.

微生物の正常な代謝プロセスのかかる崩壊は、フリーラジカル及び酸化剤、例えば過酸化物の形成のために、毒性作用を生じる可能性があり、これは、微生物細胞の成分、例えばDNA、タンパク質又は脂質にダメージを導く可能性がある。   Such disruption of the normal metabolic processes of microorganisms can cause toxic effects due to the formation of free radicals and oxidants such as peroxides, which can be components of microbial cells such as DNA, proteins or lipids. May lead to damage.

微生物の代謝に作用を引き起こすとは、微生物細胞内に天然の内部化学プロセスに変化をもたらすことを意味する。   To cause an effect on the metabolism of microorganisms means to bring about changes in the natural internal chemical processes within the microbial cells.

内因的を参照すると、酸化的ストレスを減少させるために微生物細胞内に変化がもたらされることを意味する。このことは、例えば、微生物内の代謝プロセスに対する変化であってよい。これは、微生物細胞内のROSの除去も含んでよい。   With reference to endogenous, it is meant that changes are made in the microbial cells to reduce oxidative stress. This may be, for example, a change to a metabolic process within the microorganism. This may also include removal of ROS in the microbial cells.

さらに、ピルバート、グルタマート、カルシウムイオン及びマグネシウムイオンは、直接的又は間接的に、ROSの形成の抑制及び/又はROSの分解をしてよいと信じられている。ROSに対して間接的な作用を発揮するかかる化合物は、微生物の代謝に干渉することによりこれをしてよい。修復化合物のかかる組み合わせは、例えば好気呼吸の間に、内在性ROSを間接的に減少させると考えられてよい。   Furthermore, it is believed that pyruvate, glutamate, calcium ions and magnesium ions may directly or indirectly inhibit the formation of ROS and / or degrade ROS. Such compounds that exert an indirect action on ROS may do this by interfering with microbial metabolism. Such a combination of repair compounds may be considered to indirectly reduce endogenous ROS, for example during aerobic respiration.

カリウム化合物は、浸透ショックを減少させるのに役立つ。浸透ショックとは、細胞を取り囲む環境と細胞内の間の溶質濃度の不均衡を我々は意味する。この不均衡は、細胞膜を介した水移動における迅速な変化を引き起こし、かつ、細胞ダメージを導く可能性がある。損傷した細胞又は老化した細胞は、浸透ストレスに対しより敏感であり、そして、この種のストレスのために生存性を失う可能性がある。   Potassium compounds help to reduce osmotic shock. By osmotic shock we mean an imbalance of solute concentration between the environment surrounding the cell and the cell. This imbalance can cause rapid changes in water movement through the cell membrane and can lead to cell damage. Damaged or aged cells are more sensitive to osmotic stress and can lose viability due to this type of stress.

セリン及びトレオニンは、微生物の代謝を改変すると信じられている。これにより、セリン及びトレオニンが、制限されたか又は減少した代謝を有する細胞内で促進した代謝速度を直接的又は間接的に誘発すると信じられている代謝経路に関与することを我々は意味する。これら2つの分子を使用すると、細胞は改善した成長を示すことができた。   Serine and threonine are believed to modify microbial metabolism. By this we mean that serine and threonine are involved in metabolic pathways that are believed to directly or indirectly induce metabolic rates that are promoted in cells with limited or reduced metabolism. Using these two molecules, the cells could show improved growth.

望ましくは、本発明に応じた修復化合物の前述の組み合わせは、ROSの減少又は除去、浸透ショックの減少及び代謝の改善の組み合わせを相乗的に改善する。このことは、以前可能であったよりも、より広いスペクトルのレジオネラ・ニューモフィラ株の場合に特に当てはまる。   Desirably, the aforementioned combination of repair compounds according to the present invention synergistically improves the combination of reducing or eliminating ROS, reducing osmotic shock and improving metabolism. This is especially true for the broader spectrum Legionella pneumophila strain than was previously possible.

我々は、本方法が、より広いスペクトルのレジオネラ・ニューモフィラ株にわたりストレスを受けたレジオネラ・ニューモフィラ細胞の修復を誘発し、こうして、より正確に全生存カウントを提供することを見出した。予想外なことに、我々は、本方法がさらに、必要とされるインキュベーション時間の長さを減少させることも見出した。一般に、我々は、本方法は、数時間、ある場合には少なくとも1又は2日間、インキュベーション時間を減少できることを見出す。   We have found that this method induces the repair of stressed Legionella pneumophila cells over a broader spectrum of Legionella pneumophila strains, thus providing a more accurate overall survival count. Unexpectedly we have also found that the method further reduces the length of incubation time required. In general, we find that the method can reduce the incubation time for several hours, in some cases at least one or two days.

予想外なことに、我々は、本発明の方法は、干渉する微生物、即ち、レジオネラ・ニューモフィラ以外の微生物の減少をもたらすことができることも見出した。   Unexpectedly, we have also found that the method of the present invention can result in a reduction of interfering microorganisms, ie microorganisms other than Legionella pneumophila.

ストレスを受けたレジオネラ・ニューモフィラ微生物細胞を本発明の修復化合物の組み合わせと接触させることを好適に伴う本発明の方法は、所望のように、ROS形成の抑制及び/又はROSの減少及び/又はROSの除去をし、浸透ストレスを低下させ、そして代謝を改善し、そして、このことはストレスを受けた細胞の修復を誘発する傾向にある。   The method of the present invention suitably involving contacting a stressed Legionella pneumophila microbial cell with a combination of repair compounds of the present invention comprises, as desired, inhibiting ROS formation and / or reducing ROS and / or It removes ROS, reduces osmotic stress and improves metabolism, and this tends to induce repair of stressed cells.

レジオネラ・ニューモフィラ微生物は、試料の回収のさいに修復化合物と直接的に接触されてよい。こうして、その中に水の試料(微生物を含むと考えられている)が回収されるこの容器は、既に修復化合物を含んでよい。代わりに、レジオネラ・ニューモフィラを含む水の試料が回収されると、これは、分析目的で、修復化合物を含む希釈水で希釈されてよい。別の代替策では、この試料は、任意に希釈されているが、修復化合物を含む成長媒体と接触されてよく、又は、修復化合物は、微生物と成長媒体の接触後に適用されてよい。試料を回収すると、この試料を、本発明の方法を実施するのに便利になるまで、貯蔵することが望ましい可能性がある。貯蔵の間に全ての修復化合物を組み込むことが望ましい可能性がある。   Legionella pneumophila microorganisms may be contacted directly with the repair compound during sample collection. Thus, the container in which the sample of water (which is believed to contain microorganisms) is recovered may already contain the repair compound. Alternatively, when a sample of water containing Legionella pneumophila is collected, it may be diluted with dilution water containing the repair compound for analytical purposes. In another alternative, the sample is optionally diluted, but may be contacted with a growth medium that includes a repair compound, or the repair compound may be applied after contacting the microorganism with the growth medium. Once the sample is collected, it may be desirable to store the sample until it is convenient to perform the method of the present invention. It may be desirable to incorporate all repair compounds during storage.

好ましくは、本発明に応じて一緒に使用される全ての修復化合物は、希釈工程の間に又は試料の貯蔵の間に、微生物と接触されることが望ましい。   Preferably, all repair compounds used together according to the present invention are contacted with the microorganism during the dilution process or during sample storage.

本発明の一形態は、望ましくは、前記試料を修復媒体、好ましくは非選択的修復媒体であって前記修復化合物を含むものと接触させ、次いでこれを成長媒体、好ましくは選択的成長媒体と接触させることを伴う。好ましくは、前記修復媒体は液体であり、より好ましくはブイヨンである。修復媒体が液体である場合には、これは、好適には、液体修復法と称される。典型的には、液体修復法においては、試料は本発明の組み合わせを含む液体媒体中に最初に導入される。理想的には、液体修復法は、非選択的液体媒体においてストレスを受けた細菌が修復することを可能にする。好ましくは、液体修復法は、液体媒体としてブイヨンを採用するものである。一般に、レジオネラ・ニューモフィラ微生物を含む液体媒体は、次いで、成長媒体に移される。ストレスを受けた微生物は、成長媒体への移動前に修復されているか、又は、成長媒体との接触の際に修復するものである。より好ましくは、成長媒体は、選択的成長媒体である。典型的には、微生物を含む液体媒体は、選択的成長媒体プレート、例えば選択的寒天成長媒体プレート上に播かれるものである。   One form of the present invention desirably contacts the sample with a repair medium, preferably a non-selective repair medium comprising the repair compound, which is then contacted with a growth medium, preferably a selective growth medium. Accompanied by. Preferably, the repair medium is a liquid, more preferably a bouillon. If the repair medium is a liquid, this is preferably referred to as a liquid repair method. Typically, in a liquid repair method, the sample is first introduced into a liquid medium containing the combination of the present invention. Ideally, liquid repair methods allow stressed bacteria to repair in a non-selective liquid medium. Preferably, the liquid restoration method employs bouillon as the liquid medium. In general, the liquid medium containing Legionella pneumophila microorganisms is then transferred to the growth medium. The stressed microorganisms are either repaired before transfer to the growth medium or are repaired upon contact with the growth medium. More preferably, the growth medium is a selective growth medium. Typically, the liquid medium containing the microorganisms is seeded on a selective growth medium plate, such as a selective agar growth medium plate.

代替的な好ましい一形態では、工程(1)は、前記試料を成長媒体、好ましくは非選択的成長媒体(前記の修復化合物の組み合わせを含む)と接触させ、次いで、これを修復媒体(やはり前記修復化合物を含む)と接触させることを含む。好ましくは、修復媒体は、非選択的修復媒体、より好ましくは固形物、特により好ましくは選択的寒天成長媒体である。修復媒体が固形物である場合には、これは固形物修復法と呼ばれるものである。典型的には、固形物修復法は、前記試料を非選択的成長媒体(本発明に応じた前記の修復化合物の組み合わせを含む)と接触させることを伴うものである。引き続き、これを、修復化合物又は修復化合物の組み合わせを含む選択的成長媒体と接触させることができる。この形態では、選択的成分、及び、ROSの形成を防止し、減少させ又は除去する1又は複数の化合物は、非選択的媒体中へと拡散する。望ましくは、非選択的成長媒体は、非選択的寒天成長媒体であってよい。好適には、この形態では、前記試料は任意の非選択的寒天上に播かれることができ、次いで選択的寒天成長媒体(ROSの形成を防止し、減少させ又は除去する1又は複数の化合物を含む)が、非選択的寒天成長媒体上にオーバーレイされる。   In an alternative preferred form, step (1) comprises contacting said sample with a growth medium, preferably a non-selective growth medium (comprising a combination of said repair compounds), which is then contacted with a repair medium (also said said Contact with a restorative compound). Preferably, the repair medium is a non-selective repair medium, more preferably a solid, particularly preferably a selective agar growth medium. If the repair medium is a solid, this is called a solid repair method. Typically, solids repair methods involve contacting the sample with a non-selective growth medium (including a combination of the repair compounds described above according to the present invention). This can subsequently be contacted with a selective growth medium comprising a repair compound or a combination of repair compounds. In this form, the selective component and the compound or compounds that prevent, reduce or eliminate the formation of ROS diffuse into the non-selective medium. Desirably, the non-selective growth medium may be a non-selective agar growth medium. Preferably, in this form, the sample can be seeded on any non-selective agar and then a selective agar growth medium (one or more compounds that prevent, reduce or eliminate the formation of ROS). Are overlaid on a non-selective agar growth medium.

更なる代替的一形態において、この試料を、修復化合物の組み合わせを既に含む選択的成長媒体に適用してよい。かかる選択的成長媒体は、選択的寒天成長媒体であってよい。この試料のプレーティングは、以前に説明しているように実施されてよい。   In a further alternative form, the sample may be applied to a selective growth medium that already contains a combination of repair compounds. Such a selective growth medium may be a selective agar growth medium. The sample plating may be performed as previously described.

更なる代替的一形態において、この試料は、エアロゾルの形の水から回収されてよい。典型的には、このエアロゾルは、冷却塔又はエアーコンディショナー中にあってよい。望ましくは、本発明の方法に応じた試験前にエアロゾルから水が凝縮されている。代替的な好ましい一形態において、工程(1)は、エアロゾルからの試料を、修復媒体を含む希釈水、好ましくは修復化合物の組み合わせを含む非選択的修復媒体と接触させ、次いで、これをやはり修復化合物の組み合わせを含む成長媒体と接触させることを含む。   In a further alternative form, the sample may be recovered from water in the form of an aerosol. Typically, the aerosol may be in a cooling tower or air conditioner. Desirably, water is condensed from the aerosol prior to testing according to the method of the present invention. In an alternative preferred form, step (1) comprises contacting the sample from the aerosol with a non-selective repair medium comprising a combination of dilution water containing the repair medium, preferably a repair compound, which is then also repaired. Contacting with a growth medium comprising a combination of compounds.

本発明の前述の形態の全てにおいて、成長媒体は、レジオネラ・ニューモフィラの成長にとって好適であることが望ましい。好適な成長媒体タイプは、文献において記録されており、かつ、当業者に良く知られている。通常、成長媒体は、活性化炭素及びシステインを含むことが望ましい。   In all of the foregoing aspects of the invention, the growth medium is preferably suitable for the growth of Legionella pneumophila. Suitable growth media types are recorded in the literature and are well known to those skilled in the art. It is usually desirable for the growth medium to include activated carbon and cysteine.

選択的成長媒体が選択的寒天成長媒体であり、より好ましくは緩衝化した炭酵母抽出物(BCYE)寒天成長媒体であることが好ましい。BCYE成長媒体は、抗生物質サプリメントの添加により選択的になるものである。抗生物質を有する極めて望ましいBCYE成長媒体は、GVPC(グリシン、バンコマイシン、ポリミクシンB、シクロヘキシミド)として知られている。   It is preferred that the selective growth medium is a selective agar growth medium, more preferably a buffered charcoal yeast extract (BCYE) agar growth medium. The BCYE growth medium is made selective by the addition of antibiotic supplements. A highly desirable BCYE growth medium with antibiotics is known as GVPC (Glycine, Vancomycin, Polymixin B, Cycloheximide).

プレーティング法は、文献において記録されており、かつ、当業者に良く知られている。典型的には、この方法は、ペトリ皿に配置されている寒天ゲル上に多量のこれら水試料を適用することを伴うものである。このことは、ペトリ皿法又は寒天プレーティング法と呼ばれてよい。寒天プレーティングの目的は、ペトリ皿中の固形媒体上にアリコート、典型的には100μlの、微生物を含むと疑われている水(細菌懸濁物と呼ばれる)を伸ばすことである。ガラスビーズ又はセルスクレーパーは、寒天プレート上の細菌懸濁物を伸ばすために使用できる。伸ばした後に、大抵の液体が寒天により吸収され、そして、細菌を有する薄層が寒天表面上に残存する。インキュベーションにより、コロニーの形の細菌成長が寒天表面で発達した。インキュベーションは微生物に最も好適な温度で行われ、このことは文献において十分記録されており、かつ、当業者に良く知られている。典型的には、この温度は30℃〜50℃、例えば約37℃である。   Plating methods are recorded in the literature and are well known to those skilled in the art. Typically, this method involves applying large quantities of these water samples onto an agar gel that is placed in a petri dish. This may be referred to as the Petri dish method or the agar plating method. The purpose of agar plating is to spread an aliquot, typically 100 μl of water suspected of containing microorganisms (called a bacterial suspension) onto a solid medium in a petri dish. Glass beads or cell scrapers can be used to stretch bacterial suspensions on agar plates. After stretching, most of the liquid is absorbed by the agar and a thin layer with bacteria remains on the agar surface. By incubation, bacterial growth in the form of colonies developed on the agar surface. Incubations are performed at temperatures most suitable for the microorganism, which are well documented in the literature and well known to those skilled in the art. Typically, this temperature is 30 ° C to 50 ° C, for example about 37 ° C.

修復化合物の組み合わせは、この微生物の酸化的ストレスを減少させるのに効果的な量で添加されることが望ましい。好ましくは、これは、微生物細胞中のROSを減少させるか又は実質的に除去するために効果的な量である。   It is desirable that the repair compound combination be added in an amount effective to reduce the oxidative stress of the microorganism. Preferably this is an amount effective to reduce or substantially eliminate ROS in the microbial cell.

事実、我々は、修復化合物の組み合わせの使用が、レジオネラ・ニューモフィラの発達の間の誘導期の著しい減少を、特に液体媒体においてもたらすことを見出した。液体媒体における誘導期のかかる減少は、寒天プレート上の可視可能なコロニーを獲得するために必要とされる時間の減少を生じる。   In fact, we have found that the use of a combination of repair compounds results in a significant reduction in the induction period during Legionella pneumophila development, especially in liquid media. Such a decrease in induction period in liquid media results in a decrease in the time required to obtain visible colonies on the agar plate.

修復媒体及び/又は成長媒体にケト酸及び/又は還元した酸素捕捉酵素を含めることも望ましくあってよい。ケト酸及び/又は還元した酸素捕捉酸素は、本発明の修復化合物とはみなされない。にもかかわらず、これら化合物の1又は両方を、修復化合物の前述の組み合わせのいずれかに含めることが有用であってよい。   It may also be desirable to include keto acids and / or reduced oxygen scavenging enzymes in the repair medium and / or growth medium. Keto acids and / or reduced oxygen scavenging oxygen are not considered repair compounds of the present invention. Nevertheless, it may be useful to include one or both of these compounds in any of the aforementioned combinations of repair compounds.

生存微生物の検出及び定量化は、文献において記録されている既知の技術のいずれかにより実施できる。典型的には、このことは、成長媒体、例えば栄養寒天プレートの表面の可視可能なコロニーのカウントを意味する。   Detection and quantification of viable microorganisms can be performed by any of the known techniques recorded in the literature. Typically this means a count of visible colonies on the surface of the growth medium, eg nutrient agar plates.

本発明の方法は、レジオネラ・ニューモフィラの生存について正確な定量的決定を容易にする。さらに、インキュベーション時間は著しく減少されてよい。本方法は、工業的冷却水、飲料水及び天然水から選択される群の任意のものに由来する試料中のレジオネラ・ニューモフィラの検出に好適である。   The method of the present invention facilitates an accurate quantitative determination of Legionella pneumophila survival. Furthermore, the incubation time may be significantly reduced. The method is suitable for detection of Legionella pneumophila in a sample derived from any of the group selected from industrial cooling water, drinking water and natural water.

本発明は、次のものを含む、レジオネラ・ニューモフィラの種の生存微生物を、この微生物を含むと疑われている試料においてより正確に検出及び計測するためのキットも組み込む:
(1)修復化合物、
(2)成長媒体、
(3)インキュベーション手段、
(4)微生物の検出及び定量化のための手段、
その際、前記微生物がレジオネラ・ニューモフィラの種であり、前記修復化合物が、次のものを含む
(a)セリン、
(b)トレオニン、
(c)カルシウムイオンを含む化合物、
(d)マグネシウムイオンを含む化合物、
(e)カリウムイオンを含む化合物、
(f)グルタミン酸又はその塩、
及び
(g)ピルビン酸又はその塩。
The present invention also incorporates a kit for more accurately detecting and measuring viable microorganisms of Legionella pneumophila species in samples suspected of containing the microorganisms, including:
(1) a repair compound,
(2) Growth medium
(3) incubation means,
(4) Means for detection and quantification of microorganisms,
In this case, the microorganism is a species of Legionella pneumophila, and the repair compound includes (a) serine,
(B) threonine,
(C) a compound containing calcium ions,
(D) a compound containing magnesium ions,
(E) a compound containing potassium ions,
(F) glutamic acid or a salt thereof,
And (g) pyruvic acid or a salt thereof.

このキットは、本発明の第1の観点に関して説明した実施態様のいずれかを含んでもよい。   The kit may include any of the embodiments described with respect to the first aspect of the invention.

このキットは、本発明の方法を用いた使用のために好適であり、かつ、レジオネラ・ニューモフィラのより正確な計測を、特により広いスペクトルのレジオネラ・ニューモフィラ株に関して可能にする。   This kit is suitable for use with the method of the present invention and allows for a more accurate measurement of Legionella pneumophila, especially for the broader spectrum Legionella pneumophila strain.

以下の実施例は、本発明を説明する。   The following examples illustrate the invention.

実施例
化合物の選択及びその最適濃度の決定
様々な化合物の作用を測定するために、2つの尺度を比較する:潜時及び成長速度を培養媒体及び補給した媒体補給していない培地で観察する。簡素化のために、潜時を、600nmで0.1の光学密度を得るために必要な時間により見積もる。全ての試験した化合物について、潜時増大(GTにより表す)が、参照媒体(YEC)で獲得した潜時と補給した媒体で獲得した潜時の差により獲得される。同じ条件において、成長速度の比(RVCにより表す)が、参照媒体で獲得した成長速度と補給した媒体(YEC+X)で獲得した成長速度の間の比として定義される。参照媒体(YEC)においては、L.ニューモフィラの株は、5h〜15hの時間差があり、0.1〜0.3の光学密度(ODとして表される)に達するために約10時間を必要とする。
Examples Compound Selection and Determination of Optimal Concentrations To measure the effect of various compounds, two scales are compared: latency and growth rate are observed in culture medium and supplemented medium without supplementation. For simplicity, the latency is estimated by the time required to obtain an optical density of 0.1 at 600 nm. For all tested compounds, the latency increase (represented by GT) is obtained by the difference between the latency obtained with the reference medium (YEC) and the latency obtained with the supplemented medium. Under the same conditions, the growth rate ratio (represented by RVC) is defined as the ratio between the growth rate obtained with the reference medium and the growth rate obtained with the replenished medium (YEC + X). In the reference medium (YEC), L.I. Pneumophila strains have a time difference of 5-15 hours and require about 10 hours to reach an optical density of 0.1-0.3 (expressed as OD).

セリン又はトレオニンを修復化合物として使用する場合に、各ケースで種々のレジオネラ・ニューモフィラ株について潜時及び/又は成長速度に改善が観察される。用量の範囲にわたり、例えば、試料の体積に対する化合物の質量に対して0.01〜5%で、約1g/リットルの最適用量でもって改善が見受けられる。   When using serine or threonine as a repair compound, an improvement in latency and / or growth rate is observed for various Legionella pneumophila strains in each case. Over a range of doses, for example, improvements can be seen with an optimal dose of about 1 g / liter, 0.01% to 5% of the mass of the compound relative to the volume of the sample.

潜時及び/又は成長速度における改善は、多数のレジオネラ・ニューモフィラ株について、塩化カルシウム又は塩化マグネシウムを10-6〜10-2mM、特に10-4mMの用量で使用する場合に観察される。 An improvement in latency and / or growth rate is observed for a number of Legionella pneumophila strains when calcium chloride or magnesium chloride is used at a dose of 10 −6 to 10 −2 mM, especially 10 −4 mM. .

潜時及び/又は成長速度における改善は、数々のレジオネラ・ニューモフィラ株について、塩化カリウムを1〜10-4mM、特に約10-2mMの用量で使用する場合に観察される。 Improvements in latency and / or growth rate are observed for a number of Legionella pneumophila strains when potassium chloride is used at a dose of 1-10 −4 mM, especially about 10 −2 mM.

特に効率的な修復化合物組み合わせは次のものを含む:
組み合わせA
1g/リットル ピルバート、1g/リットル セリン、1g/リットル トレオニン、1g/リットル グルタミン酸、10-4mM 塩化カルシウム、10-4mM 塩化マグネシウム。
Particularly efficient repair compound combinations include the following:
Combination A
1 g / liter pyrbert, 1 g / liter serine, 1 g / liter threonine, 1 g / liter glutamic acid, 10 −4 mM calcium chloride, 10 −4 mM magnesium chloride.

組み合わせB
1.5g/リットル ピルバート、1.5g/リットル セリン、1.5g/リットル トレオニン、1g/リットル グルタミン酸、10-4mM 塩化カルシウム及び10-4mM 塩化マグネシウム。
Combination B
1.5 g / l Pyrbert, 1.5 g / l serine, 1.5 g / l threonine, 1 g / l glutamic acid, 10 −4 mM calcium chloride and 10 −4 mM magnesium chloride.

組み合わせC
2g/リットル ピルバート、2.5g/リットル セリン、1g/リットル トレオニン、1g/リットル グルタミン酸、10-4mM 塩化カルシウム、10-4mM 塩化マグネシウム及び1.16×10-2mM 塩化カリウム。
Combination C
2 g / l Pyrbert, 2.5 g / l serine, 1 g / l threonine, 1 g / l glutamic acid, 10 −4 mM calcium chloride, 10 −4 mM magnesium chloride and 1.16 × 10 −2 mM potassium chloride.

この結果は、いくつかの組み合わせが、特に、異なる株を含む液体媒体において、成長にとって有益であることを示す。   This result shows that some combinations are beneficial for growth, especially in liquid media containing different strains.

Claims (9)

生存微生物を、前記微生物を含むと疑われている試料において検出及び計測するための方法であって、
(1)前記試料の前記微生物を修復化合物及び成長媒体と接触させる工程、及び
(2)工程(1)の生成物をインキュベーションする工程、及び
(3)前記生存微生物を検出及び定量化する工程、
を含み、その際、前記微生物がレジオネラ・ニューモフィラの種であり、前記修復化合物が、
(a)セリン、
(b)トレオニン、
(c)用量10-6〜10-2mMでカルシウムイオンを含む化合物、
(d)用量10-6〜10-2mMでマグネシウムイオンを含む化合物、
(e)カリウムイオンを含む化合物、
(f)グルタミン酸又はその塩、
及び、
(g)ピルビン酸又はその塩
を含む方法。
A method for detecting and measuring viable microorganisms in a sample suspected of containing said microorganisms, comprising:
(1) contacting the microorganism of the sample with a repair compound and a growth medium; (2) incubating the product of step (1); and (3) detecting and quantifying the viable microorganism.
Wherein the microorganism is a species of Legionella pneumophila and the repair compound is
(A) serine,
(B) threonine,
(C) a compound containing calcium ions at a dose of 10 −6 to 10 −2 mM,
(D) a compound containing magnesium ions at a dose of 10 −6 to 10 −2 mM,
(E) a compound containing potassium ions,
(F) glutamic acid or a salt thereof,
as well as,
(G) A method comprising pyruvic acid or a salt thereof.
工程(1)が、前記試料を修復媒体、好ましくは非選択的修復媒体であって前記修復化合物を含むものと接触させ、次いでこれを成長媒体、好ましくは選択的成長媒体と接触させることを含む請求項1記載の方法。   Step (1) comprises contacting the sample with a repair medium, preferably a non-selective repair medium comprising the repair compound, and then contacting it with a growth medium, preferably a selective growth medium. The method of claim 1. 前記修復媒体が液体、好ましくはブイヨンである請求項2記載の方法。   3. A method according to claim 2, wherein the repair medium is a liquid, preferably a bouillon. 工程(1)が、前記試料を成長媒体、好ましくは非選択的成長媒体と接触させ、次いでこれを前記修復化合物を含む修復媒体と接触させることを含む請求項1から3のいずれか1項記載の方法。   4. A method according to claim 1, wherein step (1) comprises contacting the sample with a growth medium, preferably a non-selective growth medium, and then contacting it with a repair medium comprising the repair compound. the method of. 前記修復媒体が選択的修復媒体、好ましくは固形物、より好ましくは選択的寒天成長媒体である請求項1から4のいずれか1項記載の方法。   5. A method according to any one of claims 1 to 4, wherein the repair medium is a selective repair medium, preferably a solid, more preferably a selective agar growth medium. 工程(1)が、前記試料を、前記修復化合物を含む成長媒体と接触させることを含む請求項1から5のいずれか1項記載の方法。   The method according to any one of claims 1 to 5, wherein step (1) comprises contacting the sample with a growth medium comprising the repair compound. 前記成長媒体が、緩衝化した炭酵母抽出物(BCYE)又はGVPC寒天成長媒体である請求項1から6のいずれか1項記載の方法。   The method according to any one of claims 1 to 6, wherein the growth medium is a buffered charcoal yeast extract (BCYE) or a GVPC agar growth medium. 前記修復媒体及び/又は成長媒体が、ケト酸及び/又は還元した酸素捕捉酵素を含む請求項1から7のいずれか1項記載の方法。   The method according to any one of claims 1 to 7, wherein the repair medium and / or growth medium comprises keto acid and / or reduced oxygen scavenging enzyme. レジオネラ・ニューモフィラの種の生存微生物を、前記微生物を含むと疑われている試料においてより正確に検出及び計測するためのキットであって、
(1)修復化合物、
(2)成長媒体、
(3)インキュベーション手段、
(4)微生物を検出及び定量化するための手段、
を含み、
前記微生物がレジオネラ・ニューモフィラの種であり、かつ、前記修復化合物が
(a)セリン、
(b)トレオニン、
(c)カルシウムイオンを含む化合物、
(d)マグネシウムイオンを含む化合物、
(e)カリウムイオンを含む化合物、
(f)グルタミン酸又はその塩、
及び、
(g)ピルビン酸又はその塩
を含むキット。
A kit for more accurately detecting and measuring viable microorganisms of Legionella pneumophila species in a sample suspected of containing the microorganisms,
(1) a repair compound,
(2) Growth medium
(3) incubation means,
(4) Means for detecting and quantifying microorganisms,
Including
The microorganism is Legionella pneumophila species, and the repair compound is (a) serine,
(B) threonine,
(C) a compound containing calcium ions,
(D) a compound containing magnesium ions,
(E) a compound containing potassium ions,
(F) glutamic acid or a salt thereof,
as well as,
(G) A kit containing pyruvic acid or a salt thereof.
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Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
HUE034397T2 (en) 2011-07-13 2018-02-28 Foodchek Systems Inc Culture medium, method for culturing listeria, and method for detecting listeria
EP2617833A1 (en) * 2012-01-18 2013-07-24 Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) A method for specifically detecting living bacteria
CN104662425B (en) 2012-05-02 2017-10-10 查尔斯河实验室公司 Vital staining method
EP2769204B1 (en) 2012-05-02 2016-02-17 Charles River Laboratories, Inc. Cell capture system and use thereof
US9709500B2 (en) 2012-05-02 2017-07-18 Charles River Laboratories, Inc. Optical method for detecting viable microorganisms in a cell sample
CN103160587B (en) * 2013-04-02 2015-04-22 南开大学 Genetic typing chip of 10 common pathogenic legionella and detection kit
EP2868750A1 (en) * 2013-10-30 2015-05-06 Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) A method for labeling specifically living bacteria comprising the use of modified monosaccharide compounds
EP3183332A1 (en) 2014-08-20 2017-06-28 3M Innovative Properties Company Self-contained anaerobic culture device for sulfate-reducing microorganisms
US20170240949A1 (en) 2014-08-20 2017-08-24 3M Innovative Properties Company Devices and methods for sample partitioning and analysis
EP3091082A1 (en) * 2015-05-04 2016-11-09 Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) A method for labeling specifically living bacteria comprising the use of modified non endogenous monosaccharide compounds
EP3091081A1 (en) * 2015-05-04 2016-11-09 Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) A method for labeling specifically living microorganisms comprising the use of modified monosaccharide compounds
DE102018115381B3 (en) * 2018-06-26 2019-08-14 Inwatec Gmbh & Co. Kg Method for the accelerated determination of the concentration of living thermophilic bacteria in aquifers

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006500940A (en) * 2002-10-01 2006-01-12 メティス バイオテクノロジーズ Method for detecting and counting microorganisms in a sample
JP2006280219A (en) * 2005-03-31 2006-10-19 Aquas Corp Selective culture medium for determining legionella, and method for culturing legionella bacterium
CN101100650A (en) * 2007-06-15 2008-01-09 上海科玛嘉微生物技术有限公司 Legionella culture medium, preparation method thereof and using method for legionella kit
WO2009121726A1 (en) * 2008-04-04 2009-10-08 Basf Se Detection and enumeration of microorganisms
CN101643713A (en) * 2009-06-16 2010-02-10 广州金域医学检验中心有限公司 Legionnella selective separation medium

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5601998A (en) * 1994-08-18 1997-02-11 Minnesota Mining & Mfg Culture medium and device for detection and enumeration of enterobacteriaceae
CU22808A1 (en) * 2000-04-18 2005-06-24 Ct Nac Biopreparados COMPOSITION AND METHOD FOR THE DETECTION AND DIFFERENTIATED AND EARLY COUNT OF GRAM-NEGATIVE MICROSCOPIC ORGANISMS
FR2834998B1 (en) 2002-01-18 2004-04-02 Millipore Sas METHOD FOR MONITORING THE PRESENCE OF MICROORGANISMS IN A GASEOUS MEDIUM COMPRISING HYDROGEN PEROXIDE
US7901932B2 (en) 2005-03-17 2011-03-08 Phigenics, Llc Methods and compositions for rapidly detecting and quantifying viable Legionella
EP2262910B1 (en) * 2008-04-04 2012-06-06 Basf Se Detection and enumeration of microorganisms
CN101597647B (en) * 2009-07-09 2011-08-17 广州金域医学检验中心有限公司 Rapid detection kit of legionella bacteria and detection method thereof

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006500940A (en) * 2002-10-01 2006-01-12 メティス バイオテクノロジーズ Method for detecting and counting microorganisms in a sample
JP2006280219A (en) * 2005-03-31 2006-10-19 Aquas Corp Selective culture medium for determining legionella, and method for culturing legionella bacterium
CN101100650A (en) * 2007-06-15 2008-01-09 上海科玛嘉微生物技术有限公司 Legionella culture medium, preparation method thereof and using method for legionella kit
WO2009121726A1 (en) * 2008-04-04 2009-10-08 Basf Se Detection and enumeration of microorganisms
CN101643713A (en) * 2009-06-16 2010-02-10 广州金域医学检验中心有限公司 Legionnella selective separation medium

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JPN6014021177; TESH et al: CAN. J. MICROBIOL. Vol. 28, 1982, p. 1055-1058 *
JPN6014021179; REEVES et al: Journal of Clinical Microbiology Vol. 13, No. 4, 198104, p. 688-695 *
JPN6014021180; TESH et al: Journal of Clinical Microbiology Vol. 13, No. 5, 198105, p. 865-869 *

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