JP2013520981A - 試験化合物の感作ポテンシャルを評価する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
第1の相は、感作相と呼ばれ、その相の間に抗原/アレルゲンが免疫系、特に、分子シグナルを記録し、産生されたサイトカインを介して他の関連細胞集団(B細胞、T CD8、内皮細胞、マクロファージ、肥満細胞 ケラチノサイトなど)を制御するT細胞に提示される;
第2の相は、エフェクター相と呼ばれ、その相の間に様々な皮膚細胞集団が病理学的障害に関与するケミカルメディエーターを介して作用する。即時型過敏症の場合、IgEなどのアナフィラキシー抗体が生成され、肥満細胞および好塩基球と結合し、アレルギー徴候の主要な媒介物であるヒスタミンの放出がもたらされる。遅延型過敏症の場合、それは、ケラチノサイトの破壊により皮膚病変に関与する細胞傷害性T細胞(TCD8)である。
a)試験化合物を生体サンプルと接触させる工程;
b)BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(インターロイキン−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(ゼラチナーゼ関連リポカリン)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、SERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)、AKR1B10(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーB10)、AKR1C1(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC1)、AKR1C2(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC2)、CYP1B1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーB,ポリペプチド1)、FTH1P(フェリチン,重ポリペプチド1)、FTL(フェリチン,軽ポリペプチド1)、G6PD(グルコース−6−リン酸脱水素酵素)、GCLM(グルタミン酸−システインリガーゼモディファイヤーサブユニット)、NQO2(NAD(P)H脱水素酵素,キノン2)、SLC7A11(溶質輸送体ファミリー7,メンバー11)、TXNRD1(チオレドキシンレダクターゼ1)、UGT1A1(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA1)、UGT1A9(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA9)、YWHAZ(チロシン3−モノオキシゲナーゼ/トリプトファン5−モノオキシゲナーゼ活性化タンパク質,ゼータポリペプチド)、CD36(CD36分子)、CYP1A1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーA,ポリペプチド1)、GCLC(グルタミン酸−システインリガーゼ,触媒サブユニット)、HMOX1(ヘムオキシゲナーゼ1)、NQ01(NAD(P)H脱水素酵素,キノン1)およびS100A8(S100カルシウム結合タンパク質A8)からなる群から選択される少なくとも6種の遺伝子の発現レベルを決定する工程
を含んでなる方法に関する。
より優先的には、BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(ゼラチナーゼ関連リポカリン)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、およびSERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)からなる群からなお選択され、
さらに優先的には、BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、からなる群から、またはCXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(リポカリン2)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、およびSERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)からなる群からなお選択される。
さらに優先的には、遺伝子群:BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、およびTPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、または、遺伝子群:CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(リポカリン2)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、およびSERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)のうちの少なくとも1種の発現を決定することを含んでなる。
所望により、少なくとも10種、好ましくは11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種の発現レベル、より優先的には、次の遺伝子群:BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(インターロイキン−18)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(リポカリン2)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、およびSERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)の少なくとも10種、好ましくは11種、12種、13種、14種、15種、16種、17種、18種、19種の発現レベルの発現レベルを測定する工程β)、並びに、
試験化合物の感作ポテンシャルを決定する工程c)
{ここで、工程α)において測定された少なくとも7種の遺伝子の発現レベルが閾値よりも大きく;および/または
工程β)において測定された少なくとも7種の遺伝子の発現レベルが限界値よりも大きい:ならば、その化合物は感作性であると決定される。}
を含んでなる。
1)少なくとも1種の試験化合物希釈物を得る工程、および
2)前記請求項のいずれか一項に記載に記載された方法によって、該試験化合物の感作ポテンシャルを該少なくとも1種の希釈物で決定する工程
を含んでなる。
製品が1/1000希釈で感作ポテンシャルを有し、および/または
製品が1/100希釈で感作ポテンシャルを有するが、1/1000希釈では感作ポテンシャルを有さず、刺激ポテンシャルを有する
ならば、その製品は極強度感作性である(極強度 E)と推断することができる。
製品が1/100希釈で感作ポテンシャルを有するが、1/1000希釈では感作ポテンシャルを有さず、または
製品が1/10希釈で感作ポテンシャルを有するが、1/100希釈では感作ポテンシャルを有さず、刺激ポテンシャルを有する
ならば、その製品は強度感作性である(強度 S)と推断することができる。
製品が1/10希釈で感作ポテンシャルを有するが、1/100希釈では感作ポテンシャルを有さず、または
製品が1/2希釈で感作ポテンシャルを有するが、1/2より低い希釈率では感作ポテンシャルを有さず、刺激ポテンシャルを有する
ならば、その製品は中等度感作性である(中等度 M)と推断することができる。
1.07cm2の皮膚片をEP1SKINから購入した。様々な物質を液体形態(異なる濃度で30μL)または固体形態(異なる粉末濃度を評価するために30μL PBSまたはオリーブ油+30μg以下)のいずれかで皮膚片に塗布した。室温で15分のインキュベーション後、皮膚片をPBS(25mL)で洗浄し、CO2インキュベーター中37℃で3時間、6時間または18時間インキュベートした。インキュベーション後、穿孔器を用いて皮膚片のサンプルを採取し、コラーゲン支持体から分離した。次いで、それらを「Tri Reagent」溶液(Ambion)(1ml)に直接入れ、直ちに機械的に解離した。
組織を「Tri Reagent」溶液(Ambion)に入れ、機械的に破砕した。供給業者によって記載されたプロトコールに従って、イソプロパノール沈殿を用いてRNAを調製した。cDNAを調製するために、全RNAをDNアーゼで前処理して、ゲノムDNA混入物を除去した。RNアーゼ不含DNアーゼ、RNAsin(1μL)およびランダムプライマー(3μg)を使用し、処理に1〜5μgの全RNAを使用した。次いで、superscript III RT(200U/μLで1.5mL)を加えた。その後、cDNAをRT−PCRによって試験した。
リアルタイム定量的PCRは、Roche社製LC480サイクラーでSYBR Green技術を用いて行った。プライマーは、ゲノムDNA増幅の影響がないようにイントロン−エキソン結合部を含むように設計した。増幅によって100〜150bpの間のアンプリコンが得られる。総てのプライマー対を制限酵素による消化によって認定し、電気泳動によって解析した。PCRは、10μLで、Roche社製PCRプレートにおいてRoche社製Sybr green 2X PCR mixを使用することによって行った。4種のハウスキーピング遺伝子を用いたRNAの正規化後に標的遺伝子発現を測定し、その値を、CT法を用いることによって表し、理論値ゼロに対する増加発現量で表した(User Bulletin no. 2, Applied Biosystems, December 1997)。
この解析のために、15分の塗布に続いて洗浄を行い6時間のインキュベーションを行った後に、生検および遺伝子転写の解析を行った。結果を表1に示す。
Claims (11)
- 試験化合物の感作ポテンシャルを評価する方法であって、以下の工程:
a)試験化合物を生体サンプルと接触させる工程;
b)BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(リポカリン2)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、SERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)、AKR1B10(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーB10)、AKR1C1(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC1)、AKR1C2(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC2)、CYP1B1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーB,ポリペプチド1)、FTH1P(フェリチン,重ポリペプチド1)、FTL(フェリチン,軽ポリペプチド1)、G6PD(グルコース−6−リン酸脱水素酵素)、GCLM(グルタミン酸−システインリガーゼモディファイヤーサブユニット)、NQO2(NAD(P)H脱水素酵素,キノン2)、SLC7A11(溶質輸送体ファミリー7,メンバー11)、TXNRD1(チオレドキシンレダクターゼ1)、UGT1A1(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA1)、UGT1A9(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA9)、YWHAZ(チロシン3−モノオキシゲナーゼ/トリプトファン5−モノオキシゲナーゼ活性化タンパク質,ゼータポリペプチド)、CD36(CD36分子)、CYP1A1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーA,ポリペプチド1)、GCLC(グルタミン酸−システインリガーゼ,触媒サブユニット)、HMOX1(ヘムオキシゲナーゼ1)、NQ01(NAD(P)H脱水素酵素,キノン1)およびS100A8(S100カルシウム結合タンパク質A8)からなる群から選択される少なくとも6種の遺伝子の発現レベルを決定する工程;
を含んでなる、方法。 - 前記少なくとも6種の遺伝子の各々の発現レベルを基準値と比較する工程をさらに含む、請求項1に記載の評価方法。
- 前記少なくとも6種の遺伝子の各々の発現レベルが、前記遺伝子またはそのフラグメントによってコードされるポリペプチドの発現レベルを測定することによって、または前記少なくとも1種の遺伝子またはそのフラグメントのmRNAの発現レベルを決定することによって決定される、請求項1または2に記載の評価方法。
- 前記6種の遺伝子の各々のmRNAまたはcDNA、その相補配列またはそのフラグメントを増幅する追加の工程を含んでなる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の評価方法。
- 生体サンプルが皮膚サンプル、好ましくは、イン・ビトロで再構築された皮膚サンプルである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 工程b)が、BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(リポカリン2)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、SERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)、AKR1B10(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーB10)、AKR1C1(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC1)、AKR1C2(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC2)、CYP1B1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーB,ポリペプチド1)、FTH1P(フェリチン,重ポリペプチド1)、FTL(フェリチン,軽ポリペプチド1)、G6PD(グルコース−6−リン酸脱水素酵素)、GCLM(グルタミン酸−システインリガーゼモディファイヤーサブユニット)、NQO2(NAD(P)H脱水素酵素,キノン2)、SLC7A11(溶質輸送体ファミリー7,メンバー11)、TXNRD1(チオレドキシンレダクターゼ1)、UGT1A1(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA1)、UGT1A9(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA9)、YWHAZ(チロシン3−モノオキシゲナーゼ/トリプトファン5−モノオキシゲナーゼ活性化タンパク質,ゼータポリペプチド)、CD36(CD36分子)、CYP1A1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーA,ポリペプチド1)、GCLC(グルタミン酸−システインリガーゼ,触媒サブユニット)、HMOX1(ヘムオキシゲナーゼ1)、NQ01(NAD(P)H脱水素酵素,キノン1)およびS100A8(S100カルシウム結合タンパク質A8)からなる群から選択される少なくとも7種、少なくとも8種、少なくとも9種、少なくとも10種、少なくとも11種、少なくとも12種、少なくとも13種、少なくとも14種、少なくとも15種、少なくとも16種、少なくとも17種、少なくとも18種、少なくとも19種、少なくとも20種、少なくとも21種、少なくとも22種、少なくとも23種、少なくとも24種、より優先的には少なくとも25種の遺伝子の発現を測定することを含んでなる、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- 工程b)が、工程a)後2〜24時間の間に、さらに好ましくは、工程a)後4〜18時間の間に、特に優先的には、工程a)後5〜7時間の間に、最も好ましくは、工程a)の6時間後に行われる、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
- 試験化合物の感作力を評価する方法であって、下記の工程:
1)少なくとも1種の試験化合物希釈物を得る工程、および
2)請求項1〜7のいずれか一項に記載された方法によって、該試験化合物の感作ポテンシャルを該少なくとも1種の希釈物で決定する工程
を含んでなる、方法。 - 試験化合物の感作ポテンシャルのイン・ビトロ評価のための、BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(リポカリン2)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、SERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)、AKR1B10(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーB10)、AKR1C1(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC1)、AKR1C2(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC2)、CYP1B1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーB,ポリペプチド1)、FTH1P(フェリチン,重ポリペプチド1)、FTL(フェリチン,軽ポリペプチド1)、G6PD(グルコース−6−リン酸脱水素酵素)、GCLM(グルタミン酸−システインリガーゼモディファイヤーサブユニット)、NQO2(NAD(P)H脱水素酵素,キノン2)、SLC7A11(溶質輸送体ファミリー7,メンバー11)、TXNRD1(チオレドキシンレダクターゼ1)、UGT1A1(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA1)、UGT1A9(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA9)、および、YWHAZ(チロシン3−モノオキシゲナーゼ/トリプトファン5−モノオキシゲナーゼ活性化タンパク質,ゼータポリペプチド)からなる群から選択される少なくとも1種の遺伝子の使用。
- 請求項1〜7のいずれか一項に記載の試験化合物の感作ポテンシャルまたは請求項8に記載の感作力のイン・ビトロ評価方法の実施のためのキットであって、BRAK(CXCケモカインリガンド14)、CTSS(カテプシンS)、DAPK2(細胞死関連プロテインキナーゼ2)、FABP4(脂肪酸結合タンパク質4)、HSP27(熱ショック27kDaタンパク質)、IL18(IL−18)、HSP90(熱ショック90kDaタンパク質)、IL1R2(インターロイキン−1受容体II型)、TPSAB1(トリプターゼ アルファ/ベータ1)、CXCR1(インターロイキン8受容体,アルファ)、DEFB1(ディフェンシン,ベータ1)、DHFR(ジヒドロ葉酸リダクターゼ)、EHF(etsホモロガスファクター)、IVL(インボルクリン)、KRT4(ケラチン4)、MELANA(メラン−A)、NGAL(ゼラチナーゼ関連リポカリン)、PDZK1IP1(PDZK1相互作用タンパク質1)、PI3(ペプチダーゼインヒビター3)、PSME2(プロテアソームアクティベータサブユニット2)、SERPINB3(セルピンペプチダーゼインヒビターメンバー3)、AKR1B10(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーB10)、AKR1C1(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC1)、AKR1C2(アルド−ケトレダクターゼファミリー1,メンバーC2)、CYP1B1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーB,ポリペプチド1)、FTH1P(フェリチン,重ポリペプチド1)、FTL(フェリチン,軽ポリペプチド1)、G6PD(グルコース−6−リン酸脱水素酵素)、GCLM(グルタミン酸−システインリガーゼモディファイヤーサブユニット)、NQO2(NAD(P)H脱水素酵素,キノン2)、SLC7A11(溶質輸送体ファミリー7,メンバー11)、TXNRD1(チオレドキシンレダクターゼ1)、UGT1A1(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA1)、UGT1A9(UDPグルクロノシルトランスフェラーゼ1ファミリー,ポリペプチドA9)、YWHAZ(チロシン3−モノオキシゲナーゼ/トリプトファン5−モノオキシゲナーゼ活性化タンパク質,ゼータポリペプチド)、CD36(CD36分子)、CYP1A1(チトクロムP450,ファミリー1,サブファミリーA,ポリペプチド1)、GCLC(グルタミン酸−システインリガーゼ,触媒サブユニット)、HMOX1(ヘムオキシゲナーゼ1)、NQ01(NAD(P)H脱水素酵素,キノン1)およびS100A8(S100カルシウム結合タンパク質A8)からなる群から選択される少なくとも6種の遺伝子の発現レベルを決定するための手段を含んでなる、キット。
- 少なくとも6種のプライマー対を含んでなり、各々が、請求項9に記載の群から選択される少なくとも1種の遺伝子を増幅する、請求項10に記載のキット。
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