JP2012511766A - ターゲットデータベースに対してデータソースのデータをリンクするための方法及びモジュール - Google Patents
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Abstract
Description
US2005/0097628A1は、人間以外の動物を記述した用語の表現型を含むデータベースと、広い範囲をカバーする(人間中心の)臨床用語との間のマッピングの形式による、用語のマッピングを開示している。
更に、従来技術におけるデータソースのオントロジー表現の例としては、US2002/02391A1;「ontology assisted query reformulation using the semantic and assertion capabilities of OWL−DL ontologies」K. Munir他、IDEAS08,10−12,September 2008,PP.81−90,Coimbra,Portugal;「Data model for integrating heterogeneous medical data in the Health−e−Child Project」A.Branson他、HEALTHGRID’08、2−4June 2008,pp.1−10,Chicago,USA;EP1708099A1;及びUS2003/120665A1がある。
本方法は、幾つかの異なる応用によってインプリメントされる。例えば、臨床試験の医療データの統合のための応用が挙げられる。更に、本方法は、エネルギー供給の応用に利用されるオントロジーのいかなる集合に対してもインプリメントされ得る。例えば、エネルギー供給、金融アプリケーション、商業アプリケーション、データが異なるソース及び/又はデバイスから取得される異なる複数の研究プロジェクト等が挙げられる。
ある実施態様によれば、モジュールが提供される。本モジュールは、参照オントロジーの第1のコンセプト又はプロパティに関連する少なくとも1つのテーブルを含むターゲットデータベースにアクセスする第1のユニットと、データセットを含むデータソースのためのデータソースオントロジーを定義する第2のユニットであって、前記データソースオントロジーは、第2のコンセプト又はプロパティを含み、前記第2のコンセプト又はプロパティは、前記第1のコンセプト又はプロパティと異なる、第2のユニットと、前記第2のコンセプト又はプロパティと前記第1のコンセプト又はプロパティとの間のリンクを生成する第3のユニットであって、前記リンクは、前記第2のコンセプト又はプロパティに関連する前記データセットのデータが、前記ターゲットデータベースのどのテーブルと関連するかを定義しており、リンクを生成する前記第3のユニットは、前記データソースの前記第2のコンセプト又はプロパティを、前記参照オントロジーの前記第1のコンセプト又はプロパティに、マニュアルでリンクするためのユーザインターフェースに接続されている、第3のユニットと、を含む。
Claims (14)
- 参照オントロジーの第1のコンセプト又はプロパティに関連する少なくとも1つのテーブルを含むターゲットデータベースにアクセスするステップと;
データセットを含むデータソースのためのデータソースオントロジーを定義するステップであって、前記データソースオントロジーは、第2のコンセプト又はプロパティを含み、前記第2のコンセプト又はプロパティは、前記第1のコンセプト又はプロパティと異なる、ステップと;
前記第2のコンセプト又はプロパティと前記第1のコンセプト又はプロパティとの間のリンクを生成するステップであって、前記リンクは、前記第2のコンセプト又はプロパティに関連する前記データセットのデータが、前記ターゲットデータベースのどのテーブルと関連するかを定義している、ステップと;
を有する方法。 - 前記リンクを利用して、前記データを、前記ターゲットデータベースの対応するテーブルに格納するステップ、を更に有する請求項1記載の方法。
- データ統合モジュールに前記リンクを格納するステップ、を更に有する請求項1記載の方法。
- 前記リンクを生成するステップは、前記第1のコンセプト又はプロパティと前記第2のコンセプト又はプロパティへの前記リンクとをアドレッシングするクエリを統合するステップを更に含む、請求項1記載の方法。
- 前記ターゲットデータベースは、リレーショナルデータベースである、請求項1記載の方法。
- 前記データソースオントロジーを定義するステップは、データソースのリレーショナルスキーマ表現をオントロジーに変換するためのユーザインターフェースを提供するステップを更に含む、請求項1記載の方法。
- 前記ターゲットデータベースのオントロジー表現を、前記ターゲットデータベースのリレーショナル表現にリンクするステップと、前記データソースのオントロジー表現を、前記データソースのリレーショナル表現にリンクするステップと、
を更に有する請求項1記載の方法。 - 前記オントロジー表現をリレーショナル表現にリンクするステップは、メタ表現によって、関係を格納するステップ、を更に含む請求項7記載の方法。
- 前記データソースは、臨床試験の医療データを含む、請求項1記載の方法。
- 請求項1記載の方法をコンピュータに実行させるプログラム。
- 参照オントロジーの第1のコンセプト又はプロパティに関連する少なくとも1つのテーブルを含むターゲットデータベースにアクセスする第1のユニットと;
データセットを含むデータソースのためのデータソースオントロジーを定義する第2のユニットであって、前記データソースオントロジーは、第2のコンセプト又はプロパティを含み、前記第2のコンセプト又はプロパティは、前記第1のコンセプト又はプロパティと異なる、第2のユニットと;
前記第2のコンセプト又はプロパティと前記第1のコンセプト又はプロパティとの間のリンクを生成する第3のユニットであって、前記リンクは、前記第2のコンセプト又はプロパティに関連する前記データセットのデータが、前記ターゲットデータベースのどのテーブルと関連するかを定義している、第3のユニットと;
を有するモジュール。 - 前記リンクを利用して、前記データを、前記ターゲットデータベースの対応するテーブルに格納する第4のユニット、を更に有する請求項11記載のモジュール。
- データ統合モジュールに前記リンクを格納する第5のユニット、を更に有する請求項11記載のモジュール
- リンクを生成する前記第3のユニットは、前記データソースの前記第2のコンセプト又はプロパティを、前記参照オントロジーの前記第1のコンセプト又はプロパティに、マニュアルでリンクするためのユーザインターフェースに接続されている、請求項11記載のモジュール。
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Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2022260292A1 (ko) * | 2021-06-11 | 2022-12-15 | 주식회사 라인웍스 | 암 병리 보고서의 데이터 추출 방법, 이를 구현한 시스템 및 프로그램 |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20140129493A1 (en) * | 2012-10-11 | 2014-05-08 | Orboros, Inc. | Method and System for Visualizing Complex Data via a Multi-Agent Query Engine |
US9720972B2 (en) | 2013-06-17 | 2017-08-01 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Cross-model filtering |
US11321337B2 (en) * | 2018-06-04 | 2022-05-03 | Cisco Technology, Inc. | Crowdsourcing data into a data lake |
US11593401B1 (en) | 2022-03-03 | 2023-02-28 | iDesignEDU, LLC | Systems and methods for a multi-hierarchy physical storage architecture for managing program and outcome data |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2003233528A (ja) * | 2002-01-15 | 2003-08-22 | Unicorn Solutions Inc | あるデータスキーマから別のデータスキーマへデータを変換するための変換を導出する方法及びシステム、データスキーマが埋め込まれ得るオントロジーモデルを構築する方法及びシステム、あるデータスキーマから別のデータスキーマへデータを変換するための命令プログラムを収録しておりコンピュータが読込み可能な一つ以上の媒体を含む製品並びにデータスキーマが埋め込まれ得る共通のオントロジーモデルを構築するための命令プログラムを収録しておりコンピュータが読込み可能な一つ以上の媒体を含む製品 |
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2001270069A1 (en) | 2000-06-23 | 2002-01-08 | The Johns-Hopkins University | Architecture for distributed database information access |
WO2002103466A2 (en) * | 2001-01-19 | 2002-12-27 | Engeneos, Inc. | Methods and systems for designing machines including biologically-derived parts |
US7146399B2 (en) * | 2001-05-25 | 2006-12-05 | 2006 Trident Company | Run-time architecture for enterprise integration with transformation generation |
AU2003218345A1 (en) | 2002-11-06 | 2004-06-03 | Mount Sinai School Of Medicine | Treatment of amyotrophic lateral sclerosis with nimesulide |
US20050203920A1 (en) * | 2004-03-10 | 2005-09-15 | Yu Deng | Metadata-related mappings in a system |
US7328209B2 (en) | 2004-08-11 | 2008-02-05 | Oracle International Corporation | System for ontology-based semantic matching in a relational database system |
EP1708099A1 (en) | 2005-03-29 | 2006-10-04 | BRITISH TELECOMMUNICATIONS public limited company | Schema matching |
US20070130206A1 (en) | 2005-08-05 | 2007-06-07 | Siemens Corporate Research Inc | System and Method For Integrating Heterogeneous Biomedical Information |
JP4859456B2 (ja) * | 2005-12-27 | 2012-01-25 | 株式会社日立製作所 | データスキーマのマッピングプログラム及び計算機システム |
US8495004B2 (en) * | 2006-03-27 | 2013-07-23 | International Business Machines Corporation | Determining and storing at least one results set in a global ontology database for future use by an entity that subscribes to the global ontology database |
US8510321B2 (en) | 2006-08-03 | 2013-08-13 | International Business Machines Corporation | Information retrieval from relational databases using semantic queries |
CN100485612C (zh) * | 2006-09-08 | 2009-05-06 | 中国科学院软件研究所 | 软件需求获取系统 |
JP4171757B2 (ja) * | 2006-09-28 | 2008-10-29 | 株式会社東芝 | オントロジー統合支援装置、オントロジー統合支援方法及びオントロジー統合支援プログラム |
WO2008146807A1 (ja) * | 2007-05-31 | 2008-12-04 | Nec Corporation | オントロジ処理装置、オントロジ処理方法、及びオントロジ処理プログラム |
US8522195B2 (en) * | 2007-09-14 | 2013-08-27 | Exigen Properties, Inc. | Systems and methods to generate a software framework based on semantic modeling and business rules |
US8214401B2 (en) * | 2009-02-26 | 2012-07-03 | Oracle International Corporation | Techniques for automated generation of ontologies for enterprise applications |
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Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2003233528A (ja) * | 2002-01-15 | 2003-08-22 | Unicorn Solutions Inc | あるデータスキーマから別のデータスキーマへデータを変換するための変換を導出する方法及びシステム、データスキーマが埋め込まれ得るオントロジーモデルを構築する方法及びシステム、あるデータスキーマから別のデータスキーマへデータを変換するための命令プログラムを収録しておりコンピュータが読込み可能な一つ以上の媒体を含む製品並びにデータスキーマが埋め込まれ得る共通のオントロジーモデルを構築するための命令プログラムを収録しておりコンピュータが読込み可能な一つ以上の媒体を含む製品 |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
CSND200800234001; 田中 博: 'SERIES 第10回 ライフサイエンス分野の統合データベース' 蛋白質 核酸 酵素 第53巻,第6号, 20080501, page774-782, 共立出版株式会社 * |
CSNG200900334041; 中辻 真: '意味情報に基づくインタフェースマッピングによるシステム連携手法の提案と評価' DEWS2005論文集 [online] , 20050502, (社)電子情報通信学会データ工学研究専門委員会 * |
JPN6013044832; 田中 博: 'SERIES 第10回 ライフサイエンス分野の統合データベース' 蛋白質 核酸 酵素 第53巻,第6号, 20080501, page774-782, 共立出版株式会社 * |
JPN6014014397; 中辻 真: '意味情報に基づくインタフェースマッピングによるシステム連携手法の提案と評価' DEWS2005論文集 [online] , 20050502, (社)電子情報通信学会データ工学研究専門委員会 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2022260292A1 (ko) * | 2021-06-11 | 2022-12-15 | 주식회사 라인웍스 | 암 병리 보고서의 데이터 추출 방법, 이를 구현한 시스템 및 프로그램 |
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