JP2007224009A - Agent for prevention or treatment of cancer - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、癌の予防・治療剤および診断薬、癌の予防・治療剤のスクリーニングなどに関する。 The present invention relates to cancer preventive / therapeutic agents and diagnostic agents, screening for cancer preventive / therapeutic agents, and the like.
大腸は虫垂、上行結腸、横行結腸、下行結腸、S状結腸、直腸からなる。虫垂から上行結腸、横行結腸の一部までを右側大腸、横行結腸の一部から下行結腸、S状結腸、直腸までを左側大腸と呼ぶ。右側大腸と左側大腸には差異が存在する。例えば、右側大腸は上腸間膜動脈から血液が供給されるのに対して、左側大腸は下腸間膜動脈から血液の供給を受ける。また、クリプトの長さが左右大腸で異なることが報告されている(Acta pathologica japonica、39巻、725-730頁、1989年)。 The large intestine consists of the appendix, ascending colon, transverse colon, descending colon, sigmoid colon, and rectum. The part from the appendix to the ascending colon and a part of the transverse colon is called the right large intestine, and the part from the transverse colon to the descending colon, the sigmoid colon, and the rectum is called the left large intestine. There is a difference between the right and left colons. For example, the right large intestine receives blood from the superior mesenteric artery, while the left large intestine receives blood from the inferior mesenteric artery. In addition, it has been reported that the length of the crypt differs between the left and right large intestines (Acta pathologica japonica, 39, 725-730, 1989).
右側大腸と左側大腸で発生する大腸がんに差異が存在する。例えば左側大腸癌の約50%にP53変異が認められるのに対し、右側大腸では約30%であること(International Journal of Cancer、74巻、664-669頁、1997年)、K-ras変異も左側に多いこと(Cancer Epidemiology、 Biomarkers and Prevention、12巻、755-762頁、2003年)が報告されている。P53変異やK-ras変異は大腸がん発症過程(アデノーマ-カルシノーマシークエンス)において極めて重要なステップとされる(Cell、61巻、759-767頁、1990年)。逆に、マイクロサテライト不安定性の頻度は右側大腸がんで高頻度に観察される(Cancer Research、53巻、5849-5852、1993年)。 There are differences in colorectal cancer that develops in the right and left colons. For example, P53 mutation is found in about 50% of the left colorectal cancer, whereas it is about 30% in the right colorectal cancer (International Journal of Cancer, 74, 664-669, 1997). Many things on the left (Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention, 12, 755-762, 2003) have been reported. P53 mutation and K-ras mutation are considered to be extremely important steps in the development process of colon cancer (adenoma-carcinoma sequence) (Cell, 61, 759-767, 1990). Conversely, the frequency of microsatellite instability is frequently observed in right colon cancer (Cancer Research, 53, 5849-5852, 1993).
近年、cDNAマイクロアレイやDNAチップが開発され、網羅的に遺伝子発現を解析することが可能となった。特にがんをはじめとする多因子疾患の遺伝子レベルの解析には有効な解析技術であり、臨床的な観点から見た疾患、特にがん研究を進める上でも重要な役割を担う。大腸がん患者の腫瘍組織と正常組織を用いたマイクロアレイ解析から、大腸がんで高発現する遺伝子が報告されている(Cancer Research、61巻、3544-3549頁、2001年)。また、大腸がんDukes'分類の判断基準となり得る遺伝子が報告されている(Cancer Research、62巻、4352-4363、2002年)。さらに、マイクロアレイ解析から得られた、大腸がんで高発現する遺伝子について、siRNAを用いた実験によって大腸がんとの関連を調べた報告がされている(Clinical Cancer Research、9巻、931-946頁、2003年)。 In recent years, cDNA microarrays and DNA chips have been developed, and it has become possible to comprehensively analyze gene expression. In particular, it is an effective analytical technique for analyzing the genetic level of multifactorial diseases such as cancer, and plays an important role in advancing disease research, particularly cancer research, from a clinical viewpoint. From a microarray analysis using tumor tissue and normal tissue of colorectal cancer patients, genes highly expressed in colon cancer have been reported (Cancer Research, 61, 3544-3549, 2001). In addition, genes that can be used as criteria for determining the colorectal cancer Dukes' classification have been reported (Cancer Research, Vol. 62, 4352-4363, 2002). In addition, a report has been made on the high expression of colorectal cancer obtained from microarray analysis, and the relationship with colorectal cancer was examined by experiments using siRNA (Clinical Cancer Research, Vol. 9, pages 931-946). 2003).
また、右側大腸と左側大腸では遺伝子の発現パターンが異なることが報告されている(非特許文献1:Cancer Epidemiology、 Biomarkers and Prevention、12巻、755-762頁、2003年)。また、左右大腸がんで発現が異なる遺伝子についても言及している(非特許文献2:Gut、54巻、374-384、2005年)。しかしながら、発症初期に着目し、アデノーマとカルシノーマを含む腫瘍大腸組織と正常大腸の位置(左右)を基に遺伝子発現および機能解析を行って、大腸がん発症に関わる標的の探索を行った例は無い。 Moreover, it has been reported that the expression pattern of the gene is different between the right colon and the left colon (Non-patent Document 1: Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention, Vol. 12, 755-762, 2003). Reference is also made to genes with different expression in the left and right colon cancers (Non-Patent Document 2: Gut, 54, 374-384, 2005). However, focusing on the early stage of onset, examples of the search for targets involved in the development of colorectal cancer by conducting gene expression and functional analysis based on the position (left and right) of the tumor large intestine tissue including adenoma and carcinoma No.
LEFTBは、発達中のマウス胚において、左側のみに発現する遺伝子としてクローニングされ、その後ヒトホモログがクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#020997; 非特許文献3:American Journal of Human Genetics、64巻、712-721頁、1999年)。
ノックアウトマウスを用いた実験から、LEFTBは左右の決定に重要な役割を果たすことが知られている(非特許文献4:Cell、94巻、287-297頁、1998年)。
LEFTB was cloned as a gene that is expressed only on the left side in a developing mouse embryo, and then a human homolog was cloned (RefSeq Accession No. NM # 020997; Non-Patent Document 3: American Journal of Human Genetics, Vol. 64, 712). -721, 1999).
From experiments using knockout mice, LEFTB is known to play an important role in the determination of left and right (Non-Patent Document 4: Cell, 94, 287-297, 1998).
FOXA2は、forkhead box aスーパーファミリーに属する転写因子である(RefSeq Accession No. NM#021784; 非特許文献5:Developmental Biology、250巻、1-23頁、2002年)。FOXA2の肝臓癌における発現亢進が報告されている(非特許文献6:Journal of Hepatology、40巻、212-218頁、2004年)。また、FOXA2をH358肺癌細胞株に発現させることにより、増殖阻害やアポトーシスが誘導されることが報告されている(非特許文献7:Cancer Research、64巻、4137-4147頁、2004年) FOXA2 is a transcription factor belonging to the forkhead box a superfamily (RefSeq Accession No. NM # 021784; Non-Patent Document 5: Developmental Biology, 250, 1-23, 2002). Increased expression of FOXA2 in liver cancer has been reported (Non-Patent Document 6: Journal of Hepatology, 40, 212-218, 2004). It has also been reported that FOXA2 is expressed in the H358 lung cancer cell line, and growth inhibition and apoptosis are induced (Non-patent Document 7: Cancer Research, 64, 4137-4147, 2004).
S100Pは、S100と相同性のある遺伝子として胎盤よりクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#005980; 非特許文献8:European Journal of Biochemistry、207巻、541-547頁、1992年)。前立腺癌の悪性化に伴うS100Pの発現亢進や(非特許文献9:Cancer Research、62巻、1256-1260頁、2002年)、すい臓癌での高発現(非特許文献10:American Journal of Pathology、160巻、1239-1249頁、2002年)が報告されている。また、S100Pの発現が乳腺上皮細胞に関わる可能性が示唆されている(非特許文献11:International Journal of Oncology、16巻、231-40頁、2000年)。さらに、正常大腸の部位別発現解析から、正常盲腸でS100Pの発現が高く、また大腸がんで発現が亢進するとの報告がなされている(非特許文献12:Gut、54巻、374-384頁、2005年)。 S100P was cloned from the placenta as a gene having homology with S100 (RefSeq Accession No. NM # 005980; Non-Patent Document 8: European Journal of Biochemistry, 207, 541-547, 1992). Increased expression of S100P accompanying malignant transformation of prostate cancer (Non-patent document 9: Cancer Research, 62, 1256-1260, 2002), high expression in pancreatic cancer (Non-patent document 10: American Journal of Pathology, 160, 1239-1249 (2002)). Moreover, it is suggested that the expression of S100P may be related to mammary epithelial cells (Non-patent Document 11: International Journal of Oncology, 16, 231-40, 2000). Furthermore, it has been reported from the site-specific expression analysis of the normal large intestine that the expression of S100P is high in the normal caecum and that the expression is increased in the large intestine (Non-patent Document 12: Gut, 54, 374-384, Year 2005).
CTSEは、胃癌のcDNAライブラリーからクローニングされたアスパラギン酸プロテアーゼである(RefSeq Accession No. NM#001910; 非特許文献13:The Journal of Biological Chemistry、264巻、16748-16753頁、1989年)。ヒト胃癌において、癌の悪性度とCTSEの発現が相関することが報告されている(非特許文献14:Human pathology、27巻、184-190頁、1996年)。また、膵管内乳頭粘液性腫瘍において発現が亢進する遺伝子のひとつとして報告がある(非特許文献15:American Journal of Pathology、160巻、1745-1754頁、2002年)。逆に、CTSEの発現と膀胱癌の進行度は逆相関することが報告されている(非特許文献16:Clinical Cancer Research、11巻、4414-4429頁、2005年)。 CTSE is an aspartic protease cloned from a cDNA library of gastric cancer (RefSeq Accession No. NM # 001910; Non-Patent Document 13: The Journal of Biological Chemistry, 264, 16748-16753, 1989). In human gastric cancer, it has been reported that cancer malignancy and CTSE expression are correlated (Non-patent Document 14: Human pathology, 27, 184-190, 1996). In addition, there is a report as one of genes whose expression is increased in intraductal papillary mucinous tumor (Non-patent Document 15: American Journal of Pathology, 160, 1745-1754, 2002). Conversely, it has been reported that the expression of CTSE and the progression of bladder cancer are inversely correlated (Non-patent Document 16: Clinical Cancer Research, 11, 4414-4429, 2005).
NOX1は、gp91phoxと相同性のある遺伝子としてクローニングされたNADPH酸化酵素であり、NOX1のマウスNIH3T3細胞への過剰発現が細胞増殖を亢進させることが報告された(RefSeq Accession No. NM#007052; 非特許文献17:Nature、401巻、79-82頁、1999年)。
NADPH酸化酵素は活性酸素種を発生させることから、NOX1の癌への関与が考えられており、Ras癌遺伝子による細胞癌化にNOX1が必要であること(非特許文献18:Cancer Reearch、64巻、3580-3485頁、2004年)、前立腺癌における高発現(非特許文献19:The Prostate、62巻、200-207頁、2005年)、大腸良性腫瘍および高分化型腺癌における高発現(非特許文献20:Cancer Letters、221巻、97-104頁、2005年)などが報告されている。
NOX1 is a NADPH oxidase cloned as a homologous gene to gp91phox, and overexpression of NOX1 in mouse NIH3T3 cells has been reported to enhance cell proliferation (RefSeq Accession No. NM # 007052; Patent Document 17: Nature, 401, 79-82, 1999).
Since NADPH oxidase generates reactive oxygen species, it is considered that NOX1 is involved in cancer, and that NOX1 is necessary for cell canceration by Ras oncogene (Non-patent Document 18: Cancer Reearch, Vol. 64) 3580-3485, 2004), high expression in prostate cancer (Non-Patent Document 19: The Prostate, 62, 200-207, 2005), high expression in colon benign tumors and well-differentiated adenocarcinoma (non- Patent Document 20: Cancer Letters, Vol. 221, pp. 97-104, 2005) has been reported.
PITX2は、顔の骨異常が特徴で、常染色体優性遺伝を示すリーガー症候群の原因遺伝子としてクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#000325、Nature Genetics、14巻、392-399頁、1996年)。PITX2は臓器の左右非対称性に関わることが報告されている(Nature、394巻、545-551頁、1998年)。また、Wnt/ベータカテニン経路下流の転写因子であり、c-MycやサイクリンD1、サイクリンD2の発現調節を行うことが示唆されている(非特許文献21:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、100巻、3245-3250頁、2003年)。 PITX2 was cloned as a causative gene of Rieger syndrome, characterized by facial bone abnormalities and showing autosomal dominant inheritance (RefSeq Accession No. NM # 000325, Nature Genetics, 14, 392-399, 1996). PITX2 has been reported to be involved in organ asymmetry (Nature, 394, 545-551, 1998). Moreover, it is a transcription factor downstream of the Wnt / beta-catenin pathway, and it has been suggested to regulate the expression of c-Myc, cyclin D1, and cyclin D2 (Non-patent Document 21: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 100, 3245-3250, 2003).
HOXB13は、多細胞動物の発生分化過程において形態形成の中心的役割を担う転写因子であるHOXファミリーに属する遺伝子として、1996年にクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#006361、Development、122巻、2475-2484頁、1996年)。乳癌において、HOXB13の発現と予後の悪さが相関することが報告されている(Cancer Cell、5巻、607-616頁、2004年)。一方、HOXB13はアンドロゲンシグナルを抑制し、アンドロゲンによる前立腺癌細胞株の増殖を抑制することが報告されている(非特許文献22:Cancer Research、64巻、9185-9192頁、2004年)。 HOXB13 was cloned in 1996 as a gene belonging to the HOX family, which is a transcription factor that plays a central role in morphogenesis in the developmental differentiation process of multicellular animals (RefSeq Accession No. NM # 006361, Development, Vol. 122, 2475-2484, 1996). In breast cancer, HOXB13 expression has been reported to correlate with poor prognosis (Cancer Cell, 5, 607-616, 2004). On the other hand, HOXB13 has been reported to suppress the androgen signal and suppress the growth of prostate cancer cell lines by androgen (Non-patent Document 22: Cancer Research, 64, 9185-9192, 2004).
CDH3は、接着分子である新規カドヘリン分子としてマウス胎盤から見出され、その後ヒト遺伝子が同定された(RefSeq Accession No. NM#001793; Journal of Cell Biology、109巻、1787-1794頁、1989年)。CDH3はaberrant crypt fociに発現し、大腸がん発生の初期に関わることが示唆されている(非特許文献23:Gut、50巻、513-519頁、2002年)。また、CDH3の発現と乳がんの予後の悪さに相関が存在することが報告されている(Cancer、86巻、1263-1272頁、1999年)。 CDH3 was found in the mouse placenta as a novel cadherin molecule that is an adhesion molecule, after which a human gene was identified (RefSeq Accession No. NM # 001793; Journal of Cell Biology, 109, 1787-1794, 1989) . CDH3 is expressed in aberrant crypt foci and is suggested to be involved in the early stage of colorectal cancer development (Non-patent Document 23: Gut, 50, 513-519, 2002). It has also been reported that there is a correlation between CDH3 expression and poor prognosis of breast cancer (Cancer, 86, 1263-1272, 1999).
KLK10は、ヒト乳腺上皮細胞において、放射線照射による形質転換に伴って発現が低下する遺伝子としてクローニングされた分泌型セリンプロテアーゼである(RefSeq Accession No. NM#002776; Cancer Research、56巻、3371-3379頁、1996年)。実際、進行した乳がん患者の大部分で発現が消失していることが報告されている(Clinical Cancer Research、7巻、3393-3398頁、2001年)。一方、卵巣がん患者における血清中KLK10は上昇していることが報告されている(Clinica Chimica Acta、306巻、111-118頁、2001年)。さらに、大腸癌や膵臓癌でもKLK10発現が上昇することが報告されている(非特許文献24:Anticancer Research、24巻、43-51頁、2004年)。 KLK10 is a secreted serine protease cloned as a gene whose expression decreases in human mammary epithelial cells upon transformation by irradiation (RefSeq Accession No. NM # 002776; Cancer Research, Vol. 56, 3371-3379). Page, 1996). Indeed, it has been reported that expression has disappeared in the majority of advanced breast cancer patients (Clinical Cancer Research, 7, 3393-3398, 2001). On the other hand, it has been reported that serum KLK10 in ovarian cancer patients is elevated (Clinica Chimica Acta, 306, 111-118, 2001). Furthermore, it has been reported that KLK10 expression is also increased in colorectal cancer and pancreatic cancer (Non-patent Document 24: Anticancer Research, 24, 43-51, 2004).
DUOX2は、NADPH酸化酵素でとしてヒト甲状腺細胞cDNAライブラリーよりクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#014080; The Journal of Biological Chemistry、275巻、23227-23233頁、2000年)。DUOX2は甲状腺ホルモンの合成に関わることが示唆されており、DUOX2に変異を持つ甲状腺機能低下症患者が報告されている(非特許文献25:New England Journal of Medicine、347巻、95-102頁、2002年)。 DUOX2 was cloned from a human thyroid cell cDNA library as NADPH oxidase (RefSeq Accession No. NM # 014080; The Journal of Biological Chemistry, 275, 23227-23233, 2000). It has been suggested that DUOX2 is involved in the synthesis of thyroid hormone, and patients with hypothyroidism having mutations in DUOX2 have been reported (Non-patent Document 25: New England Journal of Medicine, Vol. 347, pages 95-102, 2002).
S100A2は、S100と相同性のある遺伝子として乳癌細胞からクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#005978; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、89巻、2504-2508頁、1992年)。胃癌や卵巣癌におけるS100A2の発現亢進が報告されている(Cancer Resarch、61巻、3869-3876頁、2001年)。一方、前立腺癌におけるS100A2発現の低下が示唆されている(Journal of Clinical Oncology、21巻、106-112頁、2003年)。また、肺癌での発現低下も報告されている(非特許文献26:Cancer Science、96巻、844-857頁、2005年)。 S100A2 was cloned from breast cancer cells as a gene homologous to S100 (RefSeq Accession No. NM # 005978; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 89, 2504-2508, 1992) ). Increased expression of S100A2 in gastric cancer and ovarian cancer has been reported (Cancer Resarch, 61, 3869-3876, 2001). On the other hand, a decrease in S100A2 expression in prostate cancer has been suggested (Journal of Clinical Oncology, 21, 106-112, 2003). In addition, decreased expression in lung cancer has been reported (Non-patent Document 26: Cancer Science, 96, 844-857, 2005).
GABRPは、GABA受容体サブユニットとしてESTデータベース検索より同定された(RefSeq Accession No. NM#001015618; The Journal of Biological Chemistry、272巻、15346-15350頁、1997年)。GABRPは乳腺組織に高発現し、乳癌組織ではその発現が低下することが報告されている(非特許文献27:International Journal of Cancer、118巻、1453-1459頁、2006年)。 GABRP was identified as a GABA receptor subunit by EST database search (RefSeq Accession No. NM # 001015618; The Journal of Biological Chemistry, 272, 15346-15350, 1997). It has been reported that GABRP is highly expressed in breast tissue and decreased in breast cancer tissue (Non-patent Document 27: International Journal of Cancer, 118, 1453-1459, 2006).
MSLNは、卵巣癌や中皮種を認識する抗体Mab K1の抗原として同定された(RefSeq Accession No. NM#005823; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、93巻、136-140頁、1996年)。MSLNはGPIアンカーにより細胞表面に発現し、細胞接着に関わることが示唆されている(The Journal of Biological Chemistry、279巻、9190-9198頁、2004年)。MSLNは、卵巣癌や中皮種、膵臓癌で高発現することが報告されている(非特許文献28:Clinical Cancer Research、10巻、3937-3942頁、2004年)。 MSLN was identified as the antigen of antibody Mab K1, which recognizes ovarian cancer and mesothelioma (RefSeq Accession No. NM # 005823; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 93, 136-140). Page, 1996). MSLN is expressed on the cell surface by a GPI anchor and is suggested to be involved in cell adhesion (The Journal of Biological Chemistry, 279, 9990-9198, 2004). MSLN has been reported to be highly expressed in ovarian cancer, mesothelioma, and pancreatic cancer (Non-patent Document 28: Clinical Cancer Research, 10, 3937-3942, 2004).
FAIM2は、FASに結合し、FASを介したアポトーシスシグナルを抑制する分子として同定された(RefSeq Accession No. NM#012306; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、96巻、12667-12672頁、1999年)。小脳顆粒ニューロンにおける、FASL誘導アポトーシスに対する抵抗性が、FAIM2によって担われていることが報告されている(非特許文献29:The Journal of Neuroscience、25巻、6765-6774頁、2005年)。 FAIM2 was identified as a molecule that binds to FAS and suppresses FAS-mediated apoptosis signals (RefSeq Accession No. NM # 012306; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 96, 12667- 12672, 1999). It has been reported that resistance to FASL-induced apoptosis in cerebellar granule neurons is borne by FAIM2 (Non-patent Document 29: The Journal of Neuroscience, 25, 6765-6774, 2005).
TACSTD2は、細胞表面に発現する糖タンパク質としてクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#002353; International of Journal of Cancer、62巻、610-618頁、1995年)。TACSTD2は、肺癌発生の初期段階に発現が亢進することが示唆されている(非特許文献30:Cancer Science、96巻、668-675頁、2005年)。 TACSTD2 was cloned as a glycoprotein expressed on the cell surface (RefSeq Accession No. NM # 002353; International of Journal of Cancer, 62, 610-618, 1995). It has been suggested that TACSTD2 is upregulated in the early stages of lung cancer development (Non-patent Document 30: Cancer Science, 96, 668-675, 2005).
CEACAM1は、ヒト正常大腸のcDNAライブラリーよりクローニングされた(RefSeq Accession No. NM#001712; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、85巻、6959-6963頁、1988年)。CEACAM1は大腸癌で発現低下することが報告されている(非特許文献31:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America、90巻、10744-10748頁、1993年)。一方、非小細胞肺癌ではCEACAM1の高発現が報告されている(Clinical Cancer Research、9巻、2260-2266頁、2003年)。
安全で治療効果の優れた大腸癌の予防・治療剤、転移・再発抑制剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤などが切望されている。 There is a strong demand for a preventive / therapeutic agent for colon cancer that is safe and excellent in therapeutic effect, an inhibitor for metastasis / relapse, an apoptosis promoter for colon cancer cells, and a growth inhibitor for colon cancer cells.
本発明者らは、上記の課題を解決するために、大腸サンプルの位置などの情報を基に発現遺伝子を解析し、かつアデノーマおよびカルシノーマを含む腫瘍サンプルの遺伝子発現解析を行った。HOXB13、PITX2などの発現量を基に大腸左右を分類し、(1)S100P、FOXA2、NOX1、LEFTBおよびCTSEが右側腫瘍で発現亢進していること、(2)S100PおよびNOX1が左側腫瘍で発現亢進していること、(3)CDH3、KLK10、DUOX2、S100A2、GABRP、MSLN、FAIM2およびTACSTD2が右側腫瘍および左側腫瘍で発現亢進していること、さらに(4)CEACAM1が右側腫瘍および左側腫瘍で発現低下していることを見出し、本発明を完成するに至った。 In order to solve the above-mentioned problems, the present inventors analyzed an expressed gene based on information such as the position of a large intestine sample, and performed gene expression analysis of a tumor sample including an adenoma and a carcinoma. Based on the expression level of HOXB13, PITX2, etc., the left and right sides of the large intestine are classified. (3) CDH3, KLK10, DUOX2, S100A2, GABRP, MSLN, FAIM2 and TACSTD2 are up-regulated in right and left tumors, and (4) CEACAM1 is expressed in right and left tumors. The present inventors have found that the expression is reduced and have completed the present invention.
すなわち、本発明は、
〔1〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩を含有してなる大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤。
〔1a〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩を含有してなる大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤。
〔2〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩を含有してなる大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤。
〔2a〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩を含有してなる大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤。
〔3〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチド。
〔4〕上記〔3〕記載のアンチセンスポリヌクレオチドを含有してなる医薬。
That is, the present invention
[1] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or a compound containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof or a salt thereof Or a preventive / therapeutic agent or a metastasis / recurrence inhibitor of colorectal cancer comprising the salt thereof.
[1a] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, or a preventive / therapeutic agent for colorectal cancer comprising a compound or salt thereof that inhibits the activity of the protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 or the salt thereof Or a metastasis / recurrence inhibitor.
[2] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 inhibits the expression of a protein comprising the same or substantially the same amino acid sequence as that shown in FIG. A preventive / therapeutic agent or inhibitor of metastasis / recurrence of colorectal cancer, comprising the compound or salt thereof
[2a] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : Prevention of colorectal cancer comprising a compound or a salt thereof that inhibits the expression of the protein or its salt gene comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 21, or SEQ ID NO: 25 Therapeutic agent or metastasis / recurrence inhibitor.
[3] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, or a nucleotide sequence of a polynucleotide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof An antisense polynucleotide containing a complementary or substantially complementary base sequence or a part thereof.
[4] A medicament comprising the antisense polynucleotide according to [3] above.
〔5〕大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤である上記〔4〕記載の医薬。
〔6〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドに対するsiRNAまたはshRNAを含有してなる医薬。
〔6a〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドに対するsiRNAまたはshRNAを含有してなる医薬。
〔7〕大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤である上記〔6〕記載の医薬。
〔8〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなる大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤。
〔8a〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなる大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤。
[5] The medicament described in [4] above, which is a preventive / therapeutic agent for colon cancer or an inhibitor for metastasis / recurrence.
[6] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or siRNA or shRNA against a polynucleotide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof A medicament comprising:
[6a] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : A pharmaceutical comprising siRNA or shRNA against a polynucleotide encoding a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25.
[7] The medicament of the above-mentioned [6], which is a preventive / therapeutic agent for colon cancer or an inhibitor for metastasis / recurrence.
[8] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 containing a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as shown in FIG. A preventive / therapeutic agent or a metastasis / relapse inhibitor for colon cancer.
[8a] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 23 Relapse inhibitor.
〔9〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなる大腸癌の診断薬。
〔9a〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなる大腸癌の診断薬。
〔10〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有してなる大腸癌の診断薬。
〔11〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、または上記タンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いることを特徴とする大腸癌の診断方法。
[9] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A diagnostic agent for colorectal cancer comprising an antibody.
[9a] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27, a diagnostic agent for colorectal cancer comprising an antibody against the protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof .
[10] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 or a partial peptide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 A diagnostic agent for colorectal cancer comprising a nucleotide.
[11] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A method for diagnosing colorectal cancer, comprising using an antibody, or a polynucleotide encoding the protein or a partial peptide thereof.
〔12〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩の大腸癌の診断マーカーとしての使用。
〔13〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とする大腸癌の予防・治療または転移・再発抑制用医薬のスクリーニング方法。
〔14〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を含有することを特徴とする大腸癌の予防・治療または転移・再発抑制用医薬のスクリーニング用キット。
〔15〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いることを特徴とする大腸癌の予防・治療または転移・再発抑制用医薬のスクリーニング方法。
〔16〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有することを特徴とする大腸癌の予防・治療または転移・再発抑制用医薬のスクリーニング用キット。
〔17〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩の活性を測定することを特徴とする大腸癌の予防・治療または転移・再発抑制用医薬のスクリーニング方法。
〔18〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩の量を測定することを特徴とする大腸癌の予防・治療または転移・再発抑制用医薬のスクリーニング方法。
[12] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof Use as a diagnostic marker for colorectal cancer.
[13] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A screening method for a medicament for the prevention / treatment of colorectal cancer or the suppression of metastasis / recurrence, characterized by being used.
[14] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A screening kit for a drug for prevention / treatment of colorectal cancer or suppression of metastasis / recurrence characterized by containing.
[15] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 or a partial peptide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 A method for screening a drug for preventing or treating colorectal cancer or inhibiting metastasis or recurrence, which comprises using a nucleotide.
[16] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 or a partial peptide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 A screening kit for a drug for preventing or treating colorectal cancer or suppressing metastasis or recurrence, which comprises a nucleotide.
[17] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A screening method for a drug for preventing or treating colorectal cancer or inhibiting metastasis or recurrence, which comprises measuring activity.
[18] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A method for screening a drug for preventing or treating colorectal cancer or suppressing metastasis or recurrence, which comprises measuring the amount.
〔19〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する、または上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害することを特徴とする、大腸癌の予防・治療法または転移・再発抑制法。
〔20〕哺乳動物に対して、(i)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物もしくはその塩、(ii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物もしくはその塩、(iii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、または(iv)上記タンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチドの有効量を投与することを特徴とする、大腸癌の予防・治療法または転移・再発抑制法。
[19] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : Inhibits the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof or a salt thereof, Alternatively, a method for preventing or treating colorectal cancer, or a method for suppressing metastasis or recurrence, which comprises inhibiting the expression of a gene of the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof.
[20] For mammals, (i) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof Or a compound or salt thereof that inhibits the activity of the salt, (ii) a compound or salt thereof that inhibits the expression of the gene of the protein or partial peptide or salt thereof, and (iii) the protein or partial peptide or salt thereof. Complementary or substantially complementary to the base sequence of an antibody, or (iv) a polynucleotide encoding the above protein or a partial peptide thereof Complementary base sequence or features that, colorectal cancer prevention and treatment or metastatic or recurrent suppression methods administering an effective amount of an antisense polynucleotide comprising a part thereof.
〔21〕大腸癌の予防・治療剤または転移・再発抑制剤を製造するための、(i)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物もしくはその塩、(ii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物もしくはその塩、(iii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、または(iv)上記タンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチドの使用。
〔22〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物またはその塩を含有してなる大腸癌細胞のアポトーシス促進剤または大腸癌細胞の増殖抑制剤。
〔23〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩を含有してなる大腸癌細胞のアポトーシス促進剤または大腸癌細胞の増殖抑制剤。
〔24〕大腸癌細胞のアポトーシス促進剤または大腸癌細胞の増殖抑制剤である上記〔4〕記載の医薬。
〔25〕大腸癌細胞のアポトーシス促進剤または大腸癌細胞の増殖抑制剤である上記〔6〕記載の医薬。
〔26〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体を含有してなる大腸癌細胞のアポトーシス促進剤または大腸癌細胞の増殖抑制剤。
[21] (i) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, for producing a preventive / therapeutic agent for colon cancer or a metastasis / recurrence inhibitor SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, or the same or substantially the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 A compound or a salt thereof that inhibits the activity of a protein containing the same amino acid sequence or a partial peptide thereof or a salt thereof, (ii) a compound or a salt thereof that inhibits the expression of the gene of the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof, (Iii) an antibody against the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof; or (iv) a polynucleotide encoding the protein or a partial peptide thereof. Use of an antisense polynucleotide comprising a complementary or substantially complementary base sequence or a portion thereof to the base sequence of Reochido.
[22] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or a compound containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof or a salt thereof Or a colon cancer cell apoptosis promoter or colon cancer cell growth inhibitor comprising a salt thereof.
[23] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 inhibits the expression of a protein comprising the same or substantially the same amino acid sequence as that shown in FIG. A colorectal cancer cell apoptosis promoter or colorectal cancer cell growth inhibitor comprising the compound or a salt thereof.
[24] The medicament of the above-mentioned [4], which is a colon cancer cell apoptosis promoter or a colon cancer cell growth inhibitor.
[25] The medicament of the above-mentioned [6], which is a colon cancer cell apoptosis promoter or a colon cancer cell growth inhibitor.
[26] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 containing a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as shown in FIG. A colon cancer cell apoptosis promoter or colon cancer cell growth inhibitor.
〔27〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を用いることを特徴とする大腸癌細胞のアポトーシス促進用または大腸癌細胞の増殖抑制用医薬のスクリーニング方法。
〔28〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩を含有することを特徴とする大腸癌細胞のアポトーシス促進用または大腸癌細胞の増殖抑制用医薬のスクリーニング用キット。
〔29〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いることを特徴とする大腸癌細胞のアポトーシス促進用または大腸癌細胞の増殖抑制用医薬のスクリーニング方法。
〔30〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有することを特徴とする大腸癌細胞のアポトーシス促進用または大腸癌細胞の増殖抑制用医薬のスクリーニング用キット。
[27] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A screening method for a medicament for promoting apoptosis of colorectal cancer cells or suppressing growth of colorectal cancer cells, which is characterized by using.
[28] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 or a partial peptide thereof or a salt thereof A screening kit for a pharmaceutical for promoting apoptosis of colon cancer cells or suppressing proliferation of colon cancer cells, characterized by comprising.
[29] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 or a partial peptide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 A method for screening a drug for promoting apoptosis of colorectal cancer cells or suppressing growth of colorectal cancer cells, comprising using a nucleotide.
[30] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 or a partial peptide encoding a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 A screening kit for a medicament for promoting apoptosis of colorectal cancer cells or suppressing growth of colorectal cancer cells, comprising a nucleotide.
〔31〕配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する、または上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害することを特徴とする、大腸癌細胞のアポトーシス促進法または大腸癌細胞の増殖抑制法。
〔32〕哺乳動物に対して、(i)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物もしくはその塩、(ii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物もしくはその塩、(iii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、または(iv)上記タンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチドの有効量を投与することを特徴とする、大腸癌細胞のアポトーシス促進法または大腸癌細胞の増殖抑制法。
〔33〕大腸癌細胞のアポトーシス促進剤または大腸癌細胞の増殖抑制剤を製造するための、(i)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の活性を阻害する化合物もしくはその塩、(ii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩の遺伝子の発現を阻害する化合物もしくはその塩、(iii)上記タンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩に対する抗体、または(iv)上記タンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチドの使用などを提供する。
[31] SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: : Inhibits the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof or a salt thereof, Alternatively, a method for promoting apoptosis of colon cancer cells or a method for suppressing proliferation of colon cancer cells, characterized by inhibiting expression of the gene of the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof.
[32] For mammals, (i) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 or a partial peptide thereof Or a compound or salt thereof that inhibits the activity of the salt, (ii) a compound or salt thereof that inhibits the expression of the gene of the protein or partial peptide or salt thereof, and (iii) the protein or partial peptide or salt thereof. Complementary or substantially complementary to the base sequence of an antibody, or (iv) a polynucleotide encoding the above protein or a partial peptide thereof Complementary base sequence or features that, proapoptotic method or antiproliferative methods of colon cancer cells in colon cancer cells by administering an effective amount of an antisense polynucleotide comprising a part thereof.
[33] (i) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: for producing a colon cancer cell apoptosis promoter or colon cancer cell growth inhibitor 9, the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 A compound or a salt thereof that inhibits the activity of a protein or a partial peptide thereof or a salt thereof containing substantially the same amino acid sequence; (ii) a compound or a salt thereof that inhibits the expression of the gene of the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof. A salt, (iii) an antibody against the protein or a partial peptide thereof or a salt thereof, or (iv) the protein or a partial peptide thereof Provides, such as the use of antisense polynucleotide comprising a complementary or substantially complementary base sequence or a portion thereof to the base sequence of a polynucleotide that over de.
上記「癌の予防・治療用医薬」は、癌の予防・治療作用を有する物質(例、合成化合物、ペプチド、タンパク質、抗体、非ペプチド性化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿など)自体であってもよく、該物質を含有してなる医薬であってもよい。
本明細書中、「大腸癌の予防・治療」という用語は、「大腸ポリープの悪性化(癌化)抑制」という意味を含む用語として用いられている。
上記「癌細胞のアポトーシス促進用医薬」は、癌細胞のアポトーシス促進作用を有する物質自体であってもよく、該物質(例、合成化合物、ペプチド、タンパク質、抗体、非ペプチド性化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿など)を含有してなる医薬であってもよい。
上記「癌細胞の増殖抑制用医薬」は、癌細胞の増殖抑制作用を有する物質(例、合成化合物、ペプチド、タンパク質、抗体、非ペプチド性化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿など)自体であってもよく、該物質を含有してなる医薬であってもよい。
The above-mentioned “medicine for preventing / treating cancer” is a substance having an action for preventing / treating cancer (eg, synthetic compound, peptide, protein, antibody, non-peptidic compound, fermentation product, cell extract, plant extract, Animal tissue extract, plasma, etc.) itself or a medicine containing the substance may be used.
In the present specification, the term “prevention / treatment of colorectal cancer” is used as a term including the meaning of “suppression of malignant (cancerous) colon polyps”.
The above-mentioned “medicine for promoting apoptosis of cancer cells” may be a substance itself having an effect of promoting apoptosis of cancer cells, and the substance (eg, synthetic compound, peptide, protein, antibody, non-peptidic compound, fermentation product) , A cell extract, a plant extract, an animal tissue extract, plasma and the like.
The above-mentioned “medicine for inhibiting the growth of cancer cells” is a substance having an action of inhibiting the growth of cancer cells (eg, synthetic compounds, peptides, proteins, antibodies, non-peptide compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, Animal tissue extract, plasma, etc.) itself or a medicine containing the substance may be used.
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質は、例えば抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性などを有するため、該タンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩、該タンパク質の遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩、該タンパク質に対する抗体、該タンパク質をコードするポリヌクレオチドのアンチセンスポリヌクレオチド、siRNA、shRNAなどは、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌の転移・再発抑制剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞細胞の増殖抑制剤などとして安全な医薬として使用することができる。
配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩、該タンパク質の遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩などは、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌の転移・再発抑制剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞細胞の増殖抑制剤などとして安全な医薬として期待できるので、該タンパク質は、そのような医薬の有効成分のスクリーニングに用いることができる。
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, A protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 has, for example, anti-apoptotic activity, cancer cell proliferation promoting activity and the like A compound that inhibits the activity of the protein or a salt thereof, a compound that inhibits the expression of the gene of the protein or a salt thereof, an antibody against the protein, an antisense polynucleotide of a polynucleotide encoding the protein, siRNA, shRNA, etc. For example, preventive / therapeutic agents for colon cancer, colon cancer metastasis / relapse inhibitors, colon cancer cell apoptosis promoter, colon cancer cell It can be used as a safe medicine as a cell growth inhibitor.
A compound or a salt thereof that promotes the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27, a compound that promotes the expression of the gene of the protein, or a salt thereof, etc. Since it can be expected as a safe pharmaceutical as a preventive / therapeutic agent for colorectal cancer, a metastasis / relapse inhibitor of colorectal cancer, an apoptosis promoter of colorectal cancer cells, a growth inhibitor of colorectal cancer cell cells, the protein is It can be used for screening active pharmaceutical ingredients.
本明細書中、配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質を「本発明で用いられるタンパク質A」または「本発明のタンパク質A」と略し;配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質を「本発明で用いられるタンパク質B」または「本発明のタンパク質B」と略し;これらのタンパク質をまとめて「本発明で用いられるタンパク質」または「本発明のタンパク質」と略すこともある。
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列としては、例えば、配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、さらに好ましくは約70%以上、より好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアミノ酸配列などが挙げられる。
アミノ酸配列の相同性は、相同性計算アルゴリズムNCBI BLAST(National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool)を用い、以下の条件(期待値=10;ギャップを許す;マトリクス=BLOSUM62;フィルタリング=OFF)にて計算することができる。
In the present specification, SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, A protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25 is referred to as “protein A used in the present invention” or Abbreviated as “protein A of the present invention”; a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 is referred to as “protein B used in the present invention” or “protein of the present invention” These proteins may be collectively abbreviated as “proteins used in the present invention” or “proteins of the present invention”.
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, As an amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27, for example, SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: : 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 23 Or about 50% or more, preferably about 60% or more, more preferably about 70% or more, more preferably about 80% or more, and particularly preferably about 90% or more. Most preferably about 9 Such an amino acid sequence having a% homology thereof.
The homology of the amino acid sequence was determined using the homology calculation algorithm NCBI BLAST (National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool) under the following conditions (expected value = 10; allow gap; matrix = BLOSUM62; filtering = OFF) Can be calculated.
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質としては、例えば、前記の配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有し、配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質などが好ましい。
実質的に同質の活性としては、本発明のタンパク質Aの場合、例えば抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性などが、本発明のタンパク質Bの場合、例えばアポトーシス活性、癌細胞増殖抑制活性など挙げられる。実質的に同質とは、それらの性質が性質的に(例、生理学的に、または薬理学的に)同質であることを示す。したがって、これらの活性が同等(例、約0.01〜100倍、好ましくは約0.1〜10倍、より好ましくは0.5〜2倍)であることが好ましいが、これらの活性の程度、タンパク質の分子量などの量的要素は異なっていてもよい。
抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性、アポトーシス活性、癌細胞増殖抑制活性などの測定は、自体公知の方法、例えば「分子生物学研究のための培養細胞実験法(羊土社)」に記載の方法またはそれに準じる方法に従って測定することができる。
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, Examples of the protein containing the amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 include, for example, the above-mentioned SEQ ID NO: 1, sequence SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 21 The amino acid sequence substantially the same as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27 is contained, SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7 , SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 1. It contains the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or SEQ ID NO: 27. A protein having substantially the same quality of activity as a protein is preferred.
In the case of the protein A of the present invention, the substantially homogeneous activity includes, for example, an anti-apoptotic activity and a cancer cell proliferation promoting activity, and in the case of the protein B of the present invention, for example, an apoptotic activity and a cancer cell proliferation inhibiting activity. . Substantially homogeneous indicates that their properties are qualitatively (eg, physiologically or pharmacologically) homogeneous. Therefore, it is preferable that these activities are equivalent (eg, about 0.01 to 100 times, preferably about 0.1 to 10 times, more preferably 0.5 to 2 times). Quantitative factors such as protein molecular weight may be different.
Measurement of anti-apoptotic activity, cancer cell proliferation promoting activity, apoptotic activity, cancer cell growth inhibitory activity, etc. is a method known per se, for example, “Cultured Cell Experimental Method for Molecular Biology Research (Yodosha)” It can be measured according to a method or a method analogous thereto.
また、本発明のタンパク質としては、例えば、(i)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失したアミノ酸配列、(ii)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加したアミノ酸配列、(iii)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7または配列番号:9で表されるアミノ酸配列に1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入されたアミノ酸配列、(iv)配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列中の1または2個以上(例えば1〜100個程度、好ましくは1〜30個程度、好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されたアミノ酸配列、または(v)それらを組み合わせたアミノ酸配列を含有するタンパク質などのいわゆるムテインも含まれる。
上記のようにアミノ酸配列が挿入、欠失または置換されている場合、その挿入、欠失または置換の位置としては、とくに限定されない。
Examples of the protein of the present invention include (i) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, and sequence. SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or 1 or 2 or more in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 (for example, 1 to 2) About 100, preferably about 1-30, preferably about 1-10, more preferably several (1-5) amino acids, (ii) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: : 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 21 : 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 1 or 2 (for example, about 1 to 100, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably number (1 to 5)) amino acids in the amino acid sequence represented by 7 (Iii) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7 or 1 or more in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 (for example, 1 to 100) About, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5) amino acids, (iv) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO : 1 or 2 or more in the amino acid sequence represented by 27 (for example, about 1 to 100, preferably about 1 to 30, preferably about 1 to 10, more preferably number (1 to 5)) Also included are so-called muteins such as proteins containing amino acid sequences in which are replaced with other amino acids, or (v) amino acid sequences combining them.
When the amino acid sequence is inserted, deleted or substituted as described above, the position of the insertion, deletion or substitution is not particularly limited.
本明細書におけるタンパク質は、ペプチド標記の慣例に従って左端がN末端(アミノ末端)、右端がC末端(カルボキシル末端)である。配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表わされるアミノ酸配列を含有するタンパク質をはじめとする、本発明で用いられるタンパク質は、C末端がカルボキシル基(-COOH)、カルボキシレート(-COO-)、アミド(-CONH2)またはエステル(-COOR)の何れであってもよい。
ここでエステルにおけるRとしては、例えば、メチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n−ブチルなどのC1-6アルキル基、例えば、シクロペンチル、シクロヘキシルなどのC3-8シクロアルキル基、例えば、フェニル、α−ナフチルなどのC6-12アリール基、例えば、ベンジル、フェネチルなどのフェニル−C1-2アルキル基もしくはα−ナフチルメチルなどのα−ナフチル−C1-2アルキル基などのC7-14アラルキル基、ピバロイルオキシメチル基などが用いられる。
本発明で用いられるタンパク質がC末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有している場合、カルボキシル基がアミド化またはエステル化されているものも本発明で用いられるタンパク質に含まれる。この場合のエステルとしては、例えば上記したC末端のエステルなどが用いられる。
さらに、本発明で用いられるタンパク質には、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1-6アルカノイルなどのC1-6アシル基など)で保護されているもの、生体内で切断されて生成するN末端のグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基(例えば−OH、−SH、アミノ基、イミダゾール基、インドール基、グアニジノ基など)が適当な保護基(例えば、ホルミル基、アセチル基などのC1-6アルカノイル基などのC1-6アシル基など)で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖タンパク質などの複合タンパク質なども含まれる。
本発明で用いられるタンパク質の具体例としては、例えば、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:3で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:5で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:7で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質、配列番号:9で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質などがあげられる。
The protein in the present specification has an N-terminus (amino terminus) at the left end and a C-terminus (carboxyl terminus) at the right end according to the convention of peptide designation. SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, The protein used in the present invention including the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, or SEQ ID NO: 27 has a carboxyl group (—COOH) at the C-terminus. , Carboxylate (—COO − ), amide (—CONH 2 ) or ester (—COOR).
Here, as R in the ester, for example, a C 1-6 alkyl group such as methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, for example, a C 3-8 cycloalkyl group such as cyclopentyl, cyclohexyl, etc., for example, phenyl C 6-12 aryl groups such as α-naphthyl, C 7- such as phenyl-C 1-2 alkyl groups such as benzyl and phenethyl or α-naphthyl-C 1-2 alkyl groups such as α-naphthylmethyl 14 aralkyl group, pivaloyloxymethyl group is used.
When the protein used in the present invention has a carboxyl group (or carboxylate) other than the C-terminus, a protein in which the carboxyl group is amidated or esterified is also included in the protein used in the present invention. As the ester in this case, for example, the above C-terminal ester or the like is used.
Furthermore, the protein used in the present invention, the amino acid residue (eg, methionine residue) of the N-terminal amino group protecting group (e.g., formyl group, such as C 1-6 alkanoyl such as acetyl group C 1- 6 protected with an acyl group, N-terminal glutamine residue generated by cleavage in vivo is pyroglutamine oxidized, and a substituent on the side chain of an amino acid in the molecule (eg, —OH, — SH, amino group, imidazole group, indole group, guanidino group, etc.) are protected with an appropriate protecting group (for example, C 1-6 acyl group such as C 1-6 alkanoyl group such as formyl group, acetyl group, etc.) Or a complex protein such as a so-called glycoprotein having a sugar chain bound thereto.
Specific examples of the protein used in the present invention include, for example, a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3, and a protein represented by SEQ ID NO: 5. A protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 7, a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9, and the like.
本発明で用いられるタンパク質の部分ペプチドとしては、前記した本発明で用いられるタンパク質の部分ペプチドであって、好ましくは、前記した本発明で用いられるタンパク
質と同様の性質を有するものであればいずれのものでもよい。
具体的には、後述する本発明の抗体を調製する目的には、例えば、本発明で用いられるタンパク質の構成アミノ酸配列のうち少なくとも20個以上、好ましくは50個以上、さらに好ましくは70個以上、より好ましくは100個以上、最も好ましくは200個以上のアミノ酸配列を含有するペプチドなどが用いられる。
また、本発明で用いられる部分ペプチドは、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が欠失し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が付加し、または、そのアミノ酸配列に1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が挿入され、または、そのアミノ酸配列中の1または2個以上(好ましくは1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらに好ましくは数(1〜5)個)のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されていてもよい。
The partial peptide of the protein used in the present invention is a partial peptide of the protein used in the present invention as described above, and preferably any one having the same properties as the protein used in the present invention described above. It may be a thing.
Specifically, for the purpose of preparing the antibody of the present invention described later, for example, at least 20 or more, preferably 50 or more, more preferably 70 or more of the constituent amino acid sequences of the protein used in the present invention, More preferably, a peptide containing 100 or more, most preferably 200 or more amino acid sequences is used.
Moreover, the partial peptide used by this invention is 1 or 2 or more in the amino acid sequence (preferably about 1-20 pieces, More preferably, about 1-10 pieces, More preferably, it is a number (1-5) pieces). Amino acids are deleted, or 1 or 2 (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, more preferably a number (1 to 5)) of amino acids are present in the amino acid sequence. Or 1 or 2 (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5)) amino acids are inserted into the amino acid sequence, or In the amino acid sequence, one or more (preferably about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, more preferably several (1 to 5)) amino acids are substituted with other amino acids. The Good.
また、本発明で用いられる部分ペプチドはC末端がカルボキシル基(-COOH)、カルボキシレート(-COO-)、アミド(-CONH2)またはエステル(-COOR)の何れであってもよい。
さらに、本発明で用いられる部分ペプチドには、前記した本発明で用いられるタンパク質と同様に、C末端以外にカルボキシル基(またはカルボキシレート)を有しているもの、N末端のアミノ酸残基(例、メチオニン残基)のアミノ基が保護基で保護されているもの、N端側が生体内で切断され生成したグルタミン残基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基が適当な保護基で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖ペプチドなどの複合ペプチドなども含まれる。
本発明で用いられる部分ペプチドは抗体作成のための抗原としても用いることができる。
In the partial peptide used in the present invention, the C-terminus may be any of a carboxyl group (—COOH), a carboxylate (—COO − ), an amide (—CONH 2 ), or an ester (—COOR).
Furthermore, the partial peptides used in the present invention include those having a carboxyl group (or carboxylate) in addition to the C terminus, as well as the N-terminal amino acid residues (examples) as in the protein used in the present invention described above. , The amino group of the methionine residue) is protected with a protecting group, the N-terminal side is cleaved in vivo, the resulting glutamine residue is pyroglutamine oxidized, the substituent on the side chain of the amino acid in the molecule Also included are those protected with an appropriate protecting group, or complex peptides such as so-called glycopeptides to which sugar chains are bound.
The partial peptide used in the present invention can also be used as an antigen for antibody production.
本発明で用いられるタンパク質または部分ペプチドの塩としては、生理学的に許容される金属塩、アンモニウム塩、有機塩基との塩、無機酸との塩、有機酸との塩、塩基性または酸性アミノ酸との塩などが挙げられる。金属塩の好適な例としては、例えばナトリウム塩、カリウム塩などのアルカリ金属塩;カルシウム塩、マグネシウム塩、バリウム塩などのアルカリ土類金属塩;アルミニウム塩などが挙げられる。有機塩基との塩の好適な例としては、例えばトリメチルアミン、トリエチルアミン、ピリジン、ピコリン、2,6−ルチジン、エタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミン、シクロヘキシルアミン、ジシクロヘキシルアミン、N,N'−ジベンジルエチレンジアミンなどとの塩が挙げられる。無機酸との塩の好適な例としては、例えば塩酸、臭化水素酸、硝酸、硫酸、リン酸などとの塩が挙げられる。有機酸との塩の好適な例としては、例えばギ酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、プロピオン酸、フタル酸、フマル酸、シュウ酸、酒石酸、マレイン酸、クエン酸、コハク酸、リンゴ酸、メタンスルホン酸、安息香酸、ベンゼンスルホン酸、p−トルエンスルホン酸などとの塩が挙げられる。塩基性アミノ酸との塩の好適な例としては、例えばアルギニン、リジン、オルニチンなどとの塩が挙げられ、酸性アミノ酸との塩の好適な例としては、例えばアスパラギン酸、グルタミン酸などとの塩などが挙げられる。
本発明で用いられるタンパク質もしくはその部分ペプチドまたはその塩は、前述したヒトや温血動物の細胞または組織から自体公知のタンパク質の精製方法によって製造することもできるし、タンパク質をコードするDNAを含有する形質転換体を培養することによっても製造することができる。また、後述のペプチド合成法に準じて製造することもできる。
ヒトや哺乳動物の組織または細胞から製造する場合、ヒトや哺乳動物の組織または細胞をホモジナイズした後、酸などで抽出を行ない、該抽出液を逆相クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーなどのクロマトグラフィーを組み合わせることにより精製単離することができる。
Examples of salts of proteins or partial peptides used in the present invention include physiologically acceptable metal salts, ammonium salts, salts with organic bases, salts with inorganic acids, salts with organic acids, basic or acidic amino acids, and the like. And the like. Preferable examples of the metal salt include alkali metal salts such as sodium salt and potassium salt; alkaline earth metal salts such as calcium salt, magnesium salt and barium salt; aluminum salt and the like. Preferable examples of the salt with an organic base include, for example, trimethylamine, triethylamine, pyridine, picoline, 2,6-lutidine, ethanolamine, diethanolamine, triethanolamine, cyclohexylamine, dicyclohexylamine, N, N′-dibenzylethylenediamine. And the like. Preferable examples of the salt with inorganic acid include salts with hydrochloric acid, hydrobromic acid, nitric acid, sulfuric acid, phosphoric acid and the like. Preferable examples of salts with organic acids include formic acid, acetic acid, trifluoroacetic acid, propionic acid, phthalic acid, fumaric acid, oxalic acid, tartaric acid, maleic acid, citric acid, succinic acid, malic acid, methanesulfonic acid And salts with benzoic acid, benzenesulfonic acid, p-toluenesulfonic acid and the like. Preferable examples of salts with basic amino acids include salts with arginine, lysine, ornithine and the like, and preferable examples of salts with acidic amino acids include salts with aspartic acid, glutamic acid and the like. Can be mentioned.
The protein used in the present invention or a partial peptide thereof or a salt thereof can be produced from the above-described human or warm-blooded animal cells or tissues by a known protein purification method, and contains a DNA encoding the protein. It can also be produced by culturing a transformant. Moreover, it can also manufacture according to the below-mentioned peptide synthesis method.
When producing from human or mammalian tissue or cells, the human or mammalian tissue or cells are homogenized and then extracted with acid, etc., and the extract is subjected to chromatography such as reverse phase chromatography or ion exchange chromatography. Can be purified and isolated.
本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、またはそのアミド体の合成には、通常市販のタンパク質合成用樹脂を用いることができる。そのような樹脂としては、例えば、クロロメチル樹脂、ヒドロキシメチル樹脂、ベンズヒドリルアミン樹脂、アミノメチル樹脂、4−ベンジルオキシベンジルアルコール樹脂、4−メチルベンズヒドリルアミン樹脂、PAM樹脂、4−ヒドロキシメチルメチルフェニルアセトアミドメチル樹脂、ポリアクリルアミド樹脂、4−(2',4'−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル)フェノキシ樹脂、4−(2',4'−ジメトキシフェニル−Fmocアミノエチル)フェノキシ樹脂などを挙げることができる。このような樹脂を用い、α−アミノ基と側鎖官能基を適当に保護したアミノ酸を、目的とするタンパク質の配列通りに、自体公知の各種縮合方法に従い、樹脂上で縮合させる。反応の最後に樹脂からタンパク質または部分ペプチドを切り出すと同時に各種保護基を除去し、さらに高希釈溶液中で分子内ジスルフィド結合形成反応を実施し、目的のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはそれらのアミド体を取得する。
上記した保護アミノ酸の縮合に関しては、タンパク質合成に使用できる各種活性化試薬を用いることができるが、特に、カルボジイミド類がよい。カルボジイミド類としては、DCC、N,N'−ジイソプロピルカルボジイミド、N−エチル−N'−(3−ジメチルアミノプロリル)カルボジイミドなどが用いられる。これらによる活性化にはラセミ化抑制添加剤(例えば、HOBt,HOOBt)とともに保護アミノ酸を直接樹脂に添加するかまたは、対称酸無水物またはHOBtエステルあるいはHOOBtエステルとしてあらかじめ保護アミノ酸の活性化を行なった後に樹脂に添加することができる。
For the synthesis of the protein or partial peptide used in the present invention or a salt thereof, or an amide thereof, a commercially available resin for protein synthesis can be used. Examples of such resins include chloromethyl resin, hydroxymethyl resin, benzhydrylamine resin, aminomethyl resin, 4-benzyloxybenzyl alcohol resin, 4-methylbenzhydrylamine resin, PAM resin, 4-hydroxymethylmethyl. Examples include phenylacetamidomethyl resin, polyacrylamide resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-hydroxymethyl) phenoxy resin, 4- (2 ′, 4′-dimethoxyphenyl-Fmocaminoethyl) phenoxy resin, and the like. it can. Using such a resin, an amino acid having an α-amino group and a side chain functional group appropriately protected is condensed on the resin according to various condensation methods known per se according to the sequence of the target protein. At the end of the reaction, the protein or partial peptide is excised from the resin, and at the same time, various protecting groups are removed, and further, intramolecular disulfide bond forming reaction is performed in a highly diluted solution to obtain the target protein or partial peptide or their amides. To do.
For the above-mentioned condensation of protected amino acids, various activating reagents that can be used for protein synthesis can be used, and carbodiimides are particularly preferable. As the carbodiimide, DCC, N, N′-diisopropylcarbodiimide, N-ethyl-N ′-(3-dimethylaminoprolyl) carbodiimide and the like are used. For activation by these, a protected amino acid is added directly to the resin together with a racemization inhibitor (for example, HOBt, HOBt), or the protected amino acid is activated in advance as a symmetric acid anhydride, HOBt ester or HOBt ester. It can later be added to the resin.
保護アミノ酸の活性化や樹脂との縮合に用いられる溶媒としては、タンパク質縮合反応に使用しうることが知られている溶媒から適宜選択されうる。例えば、N,N−ジメチルホルムアミド,N,N−ジメチルアセトアミド,N−メチルピロリドンなどの酸アミド類、塩化メチレン,クロロホルムなどのハロゲン化炭化水素類、トリフルオロエタノールなどのアルコール類、ジメチルスルホキシドなどのスルホキシド類、ピリジン,ジオキサン,テトラヒドロフランなどのエーテル類、アセトニトリル,プロピオニトリルなどのニトリル類、酢酸メチル,酢酸エチルなどのエステル類あるいはこれらの適宜の混合物などが用いられる。反応温度はタンパク質結合形成反応に使用され得ることが知られている範囲から適宜選択され、通常約−20℃〜50℃の範囲から適宜選択される。活性化されたアミノ酸誘導体は通常1.5〜4倍過剰で用いられる。ニンヒドリン反応を用いたテストの結果、縮合が不十分な場合には保護基の脱離を行なうことなく縮合反応を繰り返すことにより十分な縮合を行なうことができる。反応を繰り返しても十分な縮合が得られないときには、無水酢酸またはアセチルイミダゾールを用いて未反応アミノ酸をアセチル化することによって、後の反応に影響を与えないようにすることができる。 The solvent used for the activation of the protected amino acid and the condensation with the resin can be appropriately selected from solvents known to be usable for protein condensation reactions. For example, acid amides such as N, N-dimethylformamide, N, N-dimethylacetamide, N-methylpyrrolidone, halogenated hydrocarbons such as methylene chloride and chloroform, alcohols such as trifluoroethanol, dimethyl sulfoxide, etc. Examples include sulfoxides, ethers such as pyridine, dioxane, and tetrahydrofuran, nitriles such as acetonitrile and propionitrile, esters such as methyl acetate and ethyl acetate, and appropriate mixtures thereof. The reaction temperature is appropriately selected from a range that is known to be usable for protein bond forming reactions, and is usually selected from the range of about -20 ° C to 50 ° C. The activated amino acid derivative is usually used in an excess of 1.5 to 4 times. As a result of a test using the ninhydrin reaction, if the condensation is insufficient, sufficient condensation can be performed by repeating the condensation reaction without removing the protecting group. When sufficient condensation is not obtained even if the reaction is repeated, acetylation of the unreacted amino acid with acetic anhydride or acetylimidazole can prevent the subsequent reaction from being affected.
原料のアミノ基の保護基としては、例えば、Z、Boc、t−ペンチルオキシカルボニル、イソボルニルオキシカルボニル、4−メトキシベンジルオキシカルボニル、Cl−Z、Br−Z、アダマンチルオキシカルボニル、トリフルオロアセチル、フタロイル、ホルミル、2−ニトロフェニルスルフェニル、ジフェニルホスフィノチオイル、Fmocなどが用いられる。
カルボキシル基は、例えば、アルキルエステル化(例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、t−ブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、2−アダマンチルなどの直鎖状、分枝状もしくは環状アルキルエステル化)、アラルキルエステル化(例えば、ベンジルエステル、4−ニトロベンジルエステル、4−メトキシベンジルエステル、4−クロロベンジルエステル、ベンズヒドリルエステル化)、フェナシルエステル化、ベンジルオキシカルボニルヒドラジド化、t−ブトキシカルボニルヒドラジド化、トリチルヒドラジド化などによって保護することができる。
セリンの水酸基は、例えば、エステル化またはエーテル化によって保護することができる。このエステル化に適する基としては、例えば、アセチル基などの低級(C1-6)アルカノイル基、ベンゾイル基などのアロイル基、ベンジルオキシカルボニル基、エトキシカルボニル基などの炭酸から誘導される基などが用いられる。また、エーテル化に適する基としては、例えば、ベンジル基、テトラヒドロピラニル基、t−ブチル基などである。
チロシンのフェノール性水酸基の保護基としては、例えば、Bzl、Cl2−Bzl、2−ニトロベンジル、Br−Z、t−ブチルなどが用いられる。
ヒスチジンのイミダゾールの保護基としては、例えば、Tos、4−メトキシ−2,3,6−トリメチルベンゼンスルホニル、DNP、ベンジルオキシメチル、Bum、Boc、Trt、Fmocなどが用いられる。
Examples of the protective group for the amino group of the raw material include Z, Boc, t-pentyloxycarbonyl, isobornyloxycarbonyl, 4-methoxybenzyloxycarbonyl, Cl-Z, Br-Z, adamantyloxycarbonyl, and trifluoroacetyl. , Phthaloyl, formyl, 2-nitrophenylsulfenyl, diphenylphosphinothioyl, Fmoc and the like.
The carboxyl group is, for example, alkyl esterified (eg, linear, branched or cyclic alkyl ester such as methyl, ethyl, propyl, butyl, t-butyl, cyclopentyl, cyclohexyl, cycloheptyl, cyclooctyl, 2-adamantyl, etc. ), Aralkyl esterification (eg, benzyl ester, 4-nitrobenzyl ester, 4-methoxybenzyl ester, 4-chlorobenzyl ester, benzhydryl esterification), phenacyl esterification, benzyloxycarbonylhydrazide, t-butoxy It can be protected by carbonyl hydrazation, trityl hydrazation or the like.
The hydroxyl group of serine can be protected, for example, by esterification or etherification. Examples of groups suitable for esterification include groups derived from carbonic acid such as lower (C 1-6 ) alkanoyl groups such as acetyl groups, aroyl groups such as benzoyl groups, benzyloxycarbonyl groups, and ethoxycarbonyl groups. Used. Examples of the group suitable for etherification include a benzyl group, a tetrahydropyranyl group, and a t-butyl group.
Examples of the protecting group for the phenolic hydroxyl group of tyrosine include Bzl, Cl 2 -Bzl, 2-nitrobenzyl, Br-Z, t-butyl and the like.
Examples of the protecting group for imidazole of histidine include Tos, 4-methoxy-2,3,6-trimethylbenzenesulfonyl, DNP, benzyloxymethyl, Bum, Boc, Trt, Fmoc, and the like.
原料のカルボキシル基の活性化されたものとしては、例えば、対応する酸無水物、アジド、活性エステル〔アルコール(例えば、ペンタクロロフェノール、2,4,5−トリクロロフェノール、2,4−ジニトロフェノール、シアノメチルアルコール、パラニトロフェノール、HONB、N−ヒドロキシスクシミド、N−ヒドロキシフタルイミド、HOBt)とのエステル〕などが用いられる。原料のアミノ基の活性化されたものとしては、例えば、対応するリン酸アミドが用いられる。
保護基の除去(脱離)方法としては、例えば、Pd−黒あるいはPd−炭素などの触媒の存在下での水素気流中での接触還元や、また、無水フッ化水素、メタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロ酢酸あるいはこれらの混合液などによる酸処理や、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン、ピペリジン、ピペラジンなどによる塩基処理、また液体アンモニア中ナトリウムによる還元なども用いられる。上記酸処理による脱離反応は、一般に約−20℃〜40℃の温度で行なわれるが、酸処理においては、例えば、アニソール、フェノール、チオアニソール、メタクレゾール、パラクレゾール、ジメチルスルフィド、1,4−ブタンジチオール、1,2−エタンジチオールなどのようなカチオン捕捉剤の添加が有効である。また、ヒスチジンのイミダゾール保護基として用いられる2,4−ジニトロフェニル基はチオフェノール処理により除去され、トリプトファンのインドール保護基として用いられるホルミル基は上記の1,2−エタンジチオール、1,4−ブタンジチオールなどの存在下の酸処理による脱保護以外に、希水酸化ナ
トリウム溶液、希アンモニアなどによるアルカリ処理によっても除去される。
Examples of the activated carboxyl group of the raw material include a corresponding acid anhydride, azide, active ester [alcohol (eg, pentachlorophenol, 2,4,5-trichlorophenol, 2,4-dinitrophenol, And esters thereof with cyanomethyl alcohol, paranitrophenol, HONB, N-hydroxysuccinimide, N-hydroxyphthalimide, HOBt) and the like. As the activated amino group of the raw material, for example, a corresponding phosphoric acid amide is used.
Examples of the method for removing (eliminating) the protecting group include catalytic reduction in a hydrogen stream in the presence of a catalyst such as Pd-black or Pd-carbon, anhydrous hydrogen fluoride, methanesulfonic acid, trifluoro. Acid treatment with romethanesulfonic acid, trifluoroacetic acid or a mixture thereof, base treatment with diisopropylethylamine, triethylamine, piperidine, piperazine, etc., reduction with sodium in liquid ammonia, and the like are also used. The elimination reaction by the acid treatment is generally performed at a temperature of about −20 ° C. to 40 ° C. In the acid treatment, for example, anisole, phenol, thioanisole, metacresol, paracresol, dimethyl sulfide, 1,4 -Addition of a cation scavenger such as butanedithiol, 1,2-ethanedithiol, etc. is effective. The 2,4-dinitrophenyl group used as an imidazole protecting group of histidine is removed by thiophenol treatment, and the formyl group used as an indole protecting group of tryptophan is the above 1,2-ethanedithiol and 1,4-butane. In addition to deprotection by acid treatment in the presence of dithiol or the like, it can also be removed by alkali treatment with dilute sodium hydroxide solution, dilute ammonia or the like.
原料の反応に関与すべきでない官能基の保護ならびに保護基、およびその保護基の脱離、反応に関与する官能基の活性化などは公知の基または公知の手段から適宜選択しうる。
タンパク質または部分ペプチドのアミド体を得る別の方法としては、例えば、まず、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基をアミド化して保護した後、アミノ基側にペプチド(タンパク質)鎖を所望の鎖長まで延ばした後、該ペプチド鎖のN末端のα−アミノ基の保護基のみを除いたタンパク質または部分ペプチドとC末端のカルボキシル基の保護基のみを除去したタンパク質または部分ペプチドとを製造し、これらのタンパク質またはペプチドを上記したような混合溶媒中で縮合させる。縮合反応の詳細については上記と同様である。縮合により得られた保護タンパク質またはペプチドを精製した後、上記方法によりすべての保護基を除去し、所望の粗タンパク質またはペプチドを得ることができる。この粗タンパク質またはペプチドは既知の各種精製手段を駆使して精製し、主要画分を凍結乾燥することで所望のタンパク質またはペプチドのアミド体を得ることができる。
タンパク質またはペプチドのエステル体を得るには、例えば、カルボキシ末端アミノ酸のα−カルボキシル基を所望のアルコール類と縮合しアミノ酸エステルとした後、タンパク質またはペプチドのアミド体と同様にして、所望のタンパク質またはペプチドのエステル体を得ることができる。
The protection of the functional group that should not be involved in the reaction of the raw material, the protection group, the removal of the protective group, the activation of the functional group involved in the reaction, etc. can be appropriately selected from known groups or known means.
As another method for obtaining an amide form of a protein or partial peptide, for example, first, the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid is amidated and protected, and then the peptide (protein) chain is moved to the desired chain length on the amino group side. After extending, a protein or partial peptide from which only the N-terminal α-amino group protecting group of the peptide chain has been removed and a protein or partial peptide from which only the C-terminal carboxyl group protecting group has been prepared, The protein or peptide is condensed in a mixed solvent as described above. The details of the condensation reaction are the same as described above. After purifying the protected protein or peptide obtained by condensation, all the protecting groups can be removed by the above method to obtain the desired crude protein or peptide. This crude protein or peptide can be purified using various known purification means, and the main fraction can be lyophilized to obtain an amide of the desired protein or peptide.
In order to obtain a protein or peptide ester, for example, the α-carboxyl group of the carboxy terminal amino acid is condensed with a desired alcohol to form an amino acid ester, and then the desired protein or peptide amide is obtained in the same manner as the protein or peptide amide. An ester of a peptide can be obtained.
本発明で用いられる部分ペプチドまたはそれらの塩は、自体公知のペプチドの合成法に従って、あるいは本発明で用いられるタンパク質を適当なペプチダーゼで切断することによって製造することができる。ペプチドの合成法としては、例えば、固相合成法、液相合成法のいずれによっても良い。すなわち、本発明で用いられる部分ペプチドを構成し得る部分ペプチドもしくはアミノ酸と残余部分とを縮合させ、生成物が保護基を有する場合は保護基を脱離することにより目的のペプチドを製造することができる。公知の縮合方法や保護基の脱離としては、例えば、以下の(i)〜(v)に記載された方法が挙げられる。
(i)M. Bodanszky および M.A. Ondetti、ペプチド・シンセシス (Peptide Synthesis), Interscience Publishers, New York (1966年)
(ii)SchroederおよびLuebke、ザ・ペプチド(The Peptide), Academic Press, New York (1965年)
(iii)泉屋信夫他、ペプチド合成の基礎と実験、 丸善(株) (1975年)
(iv)矢島治明 および榊原俊平、生化学実験講座 1、 タンパク質の化学IV、 205、(1977年)
(v)矢島治明監修、続医薬品の開発、第14巻、ペプチド合成、広川書店
また、反応後は通常の精製法、例えば、溶媒抽出・蒸留・カラムクロマトグラフィー・液体クロマトグラフィー・再結晶などを組み合わせて本発明で用いられる部分ペプチドを精製単離することができる。上記方法で得られる部分ペプチドが遊離体である場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって適当な塩に変換することができるし、逆に塩で得られた場合は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって遊離体または他の塩に変換することができる。
The partial peptide used in the present invention or a salt thereof can be produced according to a peptide synthesis method known per se, or by cleaving the protein used in the present invention with an appropriate peptidase. As a peptide synthesis method, for example, either a solid phase synthesis method or a liquid phase synthesis method may be used. That is, the partial peptide or amino acid that can constitute the partial peptide used in the present invention is condensed with the remaining portion, and when the product has a protective group, the target peptide can be produced by removing the protective group. it can. Examples of known condensation methods and protecting group elimination include the methods described in the following (i) to (v).
(I) M. Bodanszky and MA Ondetti, Peptide Synthesis, Interscience Publishers, New York (1966)
(Ii) Schroeder and Luebke, The Peptide, Academic Press, New York (1965)
(Iii) Nobuo Izumiya et al., Basics and Experiments of Peptide Synthesis, Maruzen Co., Ltd. (1975)
(Iv) Haruaki Yajima and Shunpei Sugawara, Biochemistry Experiment Course 1, Protein Chemistry IV, 205, (1977)
(V) Supervised by Haruaki Yajima, Development of follow-up drugs, Volume 14, Peptide synthesis, Hirokawa Shoten Also, after the reaction, usual purification methods such as solvent extraction, distillation, column chromatography, liquid chromatography, recrystallization, etc. Can be combined to purify and isolate the partial peptide used in the present invention. When the partial peptide obtained by the above method is a free form, it can be converted to an appropriate salt by a known method or a method equivalent thereto, and conversely, when obtained as a salt, the known method or a method equivalent thereto. It can be converted to the free form or other salts by methods.
本発明で用いられるタンパク質をコードするポリヌクレオチドとしては、前述した本発明で用いられるタンパク質をコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。好ましくはDNAである。DNAとしては、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
ライブラリーに使用するベクターは、バクテリオファージ、プラスミド、コスミド、ファージミドなどいずれであってもよい。また、前記した細胞・組織よりtotalRNAまたはmRNA画分を調製したものを用いて直接 Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction(以下、RT−PCR法と略称する)によって増幅することもできる。
本発明で用いられるタンパク質をコードするDNAとしては、例えば、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表される塩基配列を含有するDNA、または配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、前記した配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25または配列番号:27で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質と実質的に同質の性質を有するタンパク質をコードするDNAであれば何れのものでもよい。
The polynucleotide encoding the protein used in the present invention may be any as long as it contains the base sequence encoding the protein used in the present invention described above. Preferably it is DNA. The DNA may be any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the cells / tissues described above, cDNA library derived from the cells / tissues described above, and synthetic DNA.
The vector used for the library may be any of bacteriophage, plasmid, cosmid, phagemid and the like. Further, it can also be directly amplified by reverse transcription polymerase chain reaction (hereinafter abbreviated as RT-PCR method) using a total RNA or mRNA fraction prepared from the cells / tissues described above.
Examples of the DNA encoding the protein used in the present invention include SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28, or SEQ ID NO: 2 SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 A nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, or SEQ ID NO: 28 under highly stringent conditions, and includes the aforementioned SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, Arrangement SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 23 Any DNA may be used as long as it encodes a protein having substantially the same properties as the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 or SEQ ID NO: 27.
配列番号:2で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズできるDNAとしては、例えば、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表される塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、さらに好ましくは約70%以上、より好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
塩基配列の相同性は、相同性計算アルゴリズムNCBI BLAST(National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool)を用い、以下の条件(期待値=10;ギャップを許す;フィルタリング=ON;マッチスコア=1;ミスマッチスコア=-3)にて計算することができる。
ハイブリダイゼーションは、自体公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えば、Molecular Cloning 2nd(J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。より好ましくは、ハイストリンジェントな条件に従って行なうことができる。
ハイストリンジェントな条件とは、例えば、ナトリウム濃度が約19〜40mM、好ましくは約19〜20mMで、温度が約50〜70℃、好ましくは約60〜65℃の条件を示す。特に、ナトリウム濃度が約19mMで温度が約65℃の場合が最も好ましい。
より具体的には、配列番号:1で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:2で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:3で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:4で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:5で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:6で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:7で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:8で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:9で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:10で表される塩基配列を含有するDNA、配列番号:11で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:12で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:13で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:14で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:15で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:16で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:17で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:18で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:19で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:20で表される塩基配列を含有するDNA,配列番号:21で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:22で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:23で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:24で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:25で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:26で表される塩基配列を含有するDNAなどが、配列番号:27で表されるアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするDNAとしては、配列番号:28で表される塩基配列を含有するDNAなどが用いられる。
Examples of DNA that can hybridize with the base sequence represented by SEQ ID NO: 2 under highly stringent conditions include, for example, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, and SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28 A homology of about 50% or more, preferably about 60% or more, more preferably about 70% or more, more preferably about 80% or more, particularly preferably about 90% or more, most preferably about 95% or more with the base sequence. For example, DNA containing the nucleotide sequence is used.
The homology of the base sequence was determined using the homology calculation algorithm NCBI BLAST (National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool) under the following conditions (expected value = 10; allow gap; filtering = ON; match score = 1; It can be calculated by mismatch score = -3).
Hybridization can be performed according to a method known per se or a method analogous thereto, for example, the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). Moreover, when using a commercially available library, it can carry out according to the method as described in an attached instruction manual. More preferably, it can be carried out according to highly stringent conditions.
The highly stringent conditions are, for example, conditions in which the sodium concentration is about 19 to 40 mM, preferably about 19 to 20 mM, and the temperature is about 50 to 70 ° C., preferably about 60 to 65 ° C. In particular, the case where the sodium concentration is about 19 mM and the temperature is about 65 ° C. is most preferable.
More specifically, as a DNA encoding a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, a DNA containing a base sequence represented by SEQ ID NO: 2 is represented by SEQ ID NO: 3. As a DNA encoding a protein containing the amino acid sequence, a DNA containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 5 such as a DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 4 As the DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 7 such as the DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 6, the base represented by SEQ ID NO: 8 The DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 such as DNA containing the sequence is represented by SEQ ID NO: 10. Examples of the DNA containing the base sequence and the DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11 include the DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 12, As the DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented, the DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 14 encodes the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 15. Examples of the DNA include a DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 16 and the like, and a DNA encoding a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 17 is represented by SEQ ID NO: 18. As DNA encoding a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 19, such as DNA containing a base sequence The DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 20 and the DNA encoding the protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21 include the base sequence represented by SEQ ID NO: 22. As a DNA encoding a protein containing the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23, a DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 24 is represented by SEQ ID NO: 25. Examples of DNA encoding a protein containing an amino acid sequence include a DNA containing a base sequence represented by SEQ ID NO: 26, and a DNA encoding a protein containing an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27. DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 28 is used.
本発明で用いられる部分ペプチドをコードするDNAとしては、前述した本発明で用いられる部分ペプチドをコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよい。また、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、前記した細胞・組織由来のcDNA、前記した細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAのいずれでもよい。
本発明で用いられる部分ペプチドをコードするDNAとしては、例えば、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表される塩基配列を含有するDNAの一部分を有するDNA、または配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表される塩基配列とハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズする塩基配列を含有し、本発明のタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質をコードするDNAの一部分を含有するDNAなどが用いられる。
配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表される塩基配列とハイブリダイズできるDNAは、前記と同意義を示す。
ハイブリダイゼーションの方法およびハイストリンジェントな条件は前記と同様のものが用いられる。
The DNA encoding the partial peptide used in the present invention may be any DNA as long as it contains a base sequence encoding the partial peptide used in the present invention described above. Further, any of genomic DNA, genomic DNA library, cDNA derived from the cells / tissues described above, cDNA library derived from the cells / tissues described above, and synthetic DNA may be used.
Examples of the DNA encoding the partial peptide used in the present invention include SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, and SEQ ID NO: 14. SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or DNA having a part of the DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 28 Or SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, comprising a nucleotide sequence that hybridizes with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28 under highly stringent conditions, A DNA containing a portion of the DNA encoding a protein having a quality substantially the same quality of activity are used.
SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, The DNA that can hybridize with the base sequence represented by SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28 has the same significance as described above.
Hybridization methods and highly stringent conditions are the same as those described above.
本発明で用いられるタンパク質、部分ペプチド(以下、これらをコードするDNAのクローニングおよび発現の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)を完全にコードするDNAのクローニングの手段としては、本発明のタンパク質をコードする塩基配列の一部分を有する合成DNAプライマーを用いてPCR法によって増幅するか、または適当なベクターに組み込んだDNAを本発明のタンパク質の一部あるいは全領域をコードするDNA断片もしくは合成DNAを用いて標識したものとのハイブリダイゼーションによって選別することができる。ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、Molecular Cloning 2nd(J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989)に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。
DNAの塩基配列の変換は、PCR、公知のキット、例えば、MutanTM-super Express Km(宝酒造(株))、MutanTM-K(宝酒造(株))等を用いて、ODA-LA PCR法、Gapped duplex法、Kunkel法等の自体公知の方法あるいはそれらに準じる方法に従って行なうことができる。
クローン化されたタンパク質をコードするDNAは目的によりそのまま、または所望により制限酵素で消化したり、リンカーを付加したりして使用することができる。該DNAはその5'末端側に翻訳開始コドンとしてのATGを有し、また3'末端側には翻訳終止コドンとしてのTAA、TGAまたはTAGを有していてもよい。これらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合成DNAアダプターを用いて付加することもできる。
本発明のタンパク質の発現ベクターは、例えば、(i)本発明のタンパク質をコードするDNAから目的とするDNA断片を切り出し、(ii)該DNA断片を適当な発現ベクタ
ー中のプロモーターの下流に連結することにより製造することができる。
Means for cloning DNA that completely encodes the protein and partial peptide used in the present invention (hereinafter, in the description of cloning and expression of DNA encoding them, these may be simply abbreviated as the protein of the present invention) As described above, a synthetic DNA primer having a part of the base sequence encoding the protein of the present invention is used to amplify by PCR method, or DNA incorporated into an appropriate vector encodes a part or all region of the protein of the present invention. Can be selected by hybridization with a DNA fragment or synthetic DNA labeled. The hybridization method can be performed, for example, according to the method described in Molecular Cloning 2nd (J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989). Moreover, when using a commercially available library, it can carry out according to the method as described in an attached instruction manual.
The DNA base sequence is converted by PCR, a known kit such as Mutan ™ -super Express Km (Takara Shuzo), Mutan ™ -K (Takara Shuzo), etc., using the ODA-LA PCR method, It can be carried out according to a method known per se such as the Gapped duplex method and the Kunkel method or a method analogous thereto.
The DNA encoding the cloned protein can be used as it is or after digestion with a restriction enzyme or addition of a linker if desired. The DNA may have ATG as a translation initiation codon on the 5 ′ end side, and may have TAA, TGA, or TAG as a translation termination codon on the 3 ′ end side. These translation initiation codon and translation termination codon can be added using an appropriate synthetic DNA adapter.
The protein expression vector of the present invention can be obtained by, for example, (i) cutting out a target DNA fragment from the DNA encoding the protein of the present invention, and (ii) linking the DNA fragment downstream of a promoter in an appropriate expression vector. Can be manufactured.
ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド(例、pBR322,pBR325,pUC12,pUC13)、枯草菌由来のプラスミド(例、pUB110,pTP5,pC194)、酵母由来プラスミド(例、pSH19,pSH15)、λファージなどのバクテリオファージ、レトロウイルス,ワクシニアウイルス,バキュロウイルスなどの動物ウイルスなどの他、pA1−11、pXT1、pRc/CMV、pRc/RSV、pcDNAI/Neoなどが用いられる。
本発明で用いられるプロモーターとしては、遺伝子の発現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであればいかなるものでもよい。例えば、動物細胞を宿主として用いる場合は、SRαプロモーター、SV40プロモーター、LTRプロモーター、CMVプロモーター、HSV-TKプロモーターなどが挙げられる。
これらのうち、CMV(サイトメガロウイルス)プロモーター、SRαプロモーターなどを用いるのが好ましい。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、trpプロモーター、lacプロモーター、recAプロモーター、λPLプロモーター、lppプロモーター、T7プロモーターなどが、宿主がバチルス属菌である場合は、SPO1プロモーター、SPO2プロモーター、penPプロモーターなど、宿主が酵母である場合は、PHO5プロモーター、PGKプロモーター、GAPプロモーター、ADHプロモーターなどが好ましい。宿主が昆虫細胞である場合は、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターなどが好ましい。
発現ベクターには、以上の他に、所望によりエンハンサー、スプライシングシグナル、ポリA付加シグナル、選択マーカー、SV40複製オリジン(以下、SV40oriと略称する場合がある)などを含有しているものを用いることができる。選択マーカーとしては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素(以下、dhfrと略称する場合がある)遺伝子〔メソトレキセート(MTX)耐性〕、アンピシリン耐性遺伝子(以下、Amprと略称する場合がある)、ネオマイシン耐性遺伝子(以下、Neorと略称する場合がある、G418耐性)等が挙げられる。特に、dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞を用いてdhfr遺伝子を選択マーカーとして使用する場合、目的遺伝子をチミジンを含まない培地によっても選択できる。
また、必要に応じて、宿主に合ったシグナル配列を、本発明のタンパク質のN端末側に付加する。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、PhoA・シグナル配列、OmpA・シグナル配列などが、宿主がバチルス属菌である場合は、α−アミラーゼ・シグナル配列、サブチリシン・シグナル配列などが、宿主が酵母である場合は、MFα・シグナル配列、SUC2・シグナル配列など、宿主が動物細胞である場合には、インシュリン・シグナル配列、α−インターフェロン・シグナル配列、抗体分子・シグナル配列などがそれぞれ利用できる。
このようにして構築された本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターを用いて、形質転換体を製造することができる。
Examples of vectors include E. coli-derived plasmids (eg, pBR322, pBR325, pUC12, pUC13), Bacillus subtilis-derived plasmids (eg, pUB110, pTP5, pC194), yeast-derived plasmids (eg, pSH19, pSH15), λ phage, and the like. In addition to animal viruses such as bacteriophage, retrovirus, vaccinia virus and baculovirus, pA1-11, pXT1, pRc / CMV, pRc / RSV, pcDNAI / Neo and the like are used.
The promoter used in the present invention may be any promoter as long as it is suitable for the host used for gene expression. For example, when animal cells are used as the host, SRα promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, HSV-TK promoter and the like can be mentioned.
Of these, it is preferable to use a CMV (cytomegalovirus) promoter, SRα promoter, or the like. When the host is Escherichia, trp promoter, lac promoter, recA promoter, .lambda.P L promoter, lpp promoter, T7 promoter, etc. When the host is Bacillus, SPO1 promoter, SPO2 promoter, penP promoter, etc. When the host is yeast, the PHO5 promoter, PGK promoter, GAP promoter, ADH promoter and the like are preferable. When the host is an insect cell, a polyhedrin promoter, a P10 promoter and the like are preferable.
In addition to the above, an expression vector containing an enhancer, a splicing signal, a poly A addition signal, a selection marker, an SV40 replication origin (hereinafter sometimes abbreviated as SV40ori) and the like is used as desired. it can. Selectable markers include, for example, dihydrofolate reductase (hereinafter sometimes abbreviated as dhfr) gene [methotrexate (MTX) resistance], ampicillin resistance gene (hereinafter sometimes abbreviated as Amp r ), neomycin resistance gene (hereinafter sometimes abbreviated as Neo r, G418 resistance). In particular, when a dhfr gene-deficient Chinese hamster cell is used and the dhfr gene is used as a selection marker, the target gene can also be selected by a medium not containing thymidine.
If necessary, a signal sequence suitable for the host is added to the N-terminal side of the protein of the present invention. When the host is Escherichia, the PhoA signal sequence, OmpA, signal sequence, etc., and when the host is Bacillus, the α-amylase signal sequence, subtilisin signal sequence, etc. In some cases, MFα • signal sequence, SUC2 • signal sequence, etc., and when the host is an animal cell, insulin signal sequence, α-interferon signal sequence, antibody molecule / signal sequence, etc. can be used.
A transformant can be produced using a vector containing the DNA encoding the protein of the present invention thus constructed.
宿主としては、例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、酵母、昆虫細胞、昆虫、動物細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌の具体例としては、例えば、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)K12・DH1〔Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 60巻, 160(1968)〕,JM103〔Nucleic Acids Research,9巻,309(1981)〕,JA221〔Journal of Molecular Biology,120巻,517(1978)〕,HB101〔Journal of Molecular Biology,41巻,459(1969)〕,C600〔Genetics,39巻,440(1954)〕などが用いられる。
バチルス属菌としては、例えば、バチルス・サブチルス(Bacillus subtilis)MI114〔Gene,24巻,255(1983)〕,207−21〔Journal of Biochemistry,95巻,87(1984)〕などが用いられる。
酵母としては、例えば、サッカロマイセス セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)AH22,AH22R-,NA87−11A,DKD−5D,20B−12、シゾサッカロマイセス ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)NCYC1913,NCYC2036、ピキア パストリス(Pichia pastoris)KM71などが用いられる。
昆虫細胞としては、例えば、ウイルスがAcNPVの場合は、夜盗蛾の幼虫由来株化細胞(Spodoptera frugiperda cell;Sf細胞)、Trichoplusia niの中腸由来のMG1細胞、Trichoplusia niの卵由来のHigh FiveTM細胞、Mamestra brassicae由来の細胞またはEstigmena acrea由来の細胞などが用いられる。ウイルスがBmNPVの場合は、蚕由来株化細胞(Bombyx mori N 細胞;BmN細胞)などが用いられる。該Sf細胞としては、例えば、Sf9細胞(ATCC CRL1711)、Sf21細胞(以上、Vaughn, J.L.ら、In Vivo,13, 213-217,(1977))などが用いられる。
昆虫としては、例えば、カイコの幼虫などが用いられる〔前田ら、Nature,315巻,592(1985)〕。
動物細胞としては、例えば、サル細胞COS−7,Vero,チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO細胞と略記),dhfr遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞CHO(以下、CHO(dhfr-)細胞と略記),マウスL細胞,マウスAtT−20,マウスミエローマ細胞,マウスATDC5細胞,ラットGH3,ヒトFL細胞などが用いられる。
エシェリヒア属菌を形質転換するには、例えば、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,69巻, 2110(1972)やGene,17巻,107(1982)などに記載の方法に従って行なうことができる。
As the host, for example, Escherichia, Bacillus, yeast, insect cells, insects, animal cells and the like are used.
Specific examples of the genus Escherichia include, for example, Escherichia coli K12 · DH1 [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 60, 160 (1968)], JM103 [Nucleic Acids Research, 9, 309 (1981)], JA221 [Journal of Molecular Biology, 120, 517 (1978)], HB101 [Journal of Molecular Biology, 41, 459 (1969)], C600 [Genetics, 39, 440 (1954)] Etc. are used.
Examples of the Bacillus bacterium include Bacillus subtilis MI114 [Gene, 24, 255 (1983)], 207-21 [Journal of Biochemistry, 95, 87 (1984)].
Examples of yeast include Saccharomyces cerevisiae AH22, AH22R − , NA87-11A, DKD-5D, 20B-12, Schizosaccharomyces pombe NCYC1913, NCYC2036, Used.
As insect cells, for example, when the virus is AcNPV, larvae-derived cell lines (Spodoptera frugiperda cells; Sf cells), MG1 cells derived from the midgut of Trichoplusia ni, High Five ™ derived from eggs of Trichoplusia ni Cells, cells derived from Mamestra brassicae or cells derived from Estigmena acrea are used. When the virus is BmNPV, sputum-derived cell lines (Bombyx mori N cells; BmN cells) and the like are used. Examples of the Sf cells include Sf9 cells (ATCC CRL 1711), Sf21 cells (Vaughn, JL et al., In Vivo, 13, 213-217, (1977)) and the like.
Examples of insects include silkworm larvae [Maeda et al., Nature, 315, 592 (1985)].
Examples of animal cells include monkey cells COS-7, Vero, Chinese hamster cells CHO (hereinafter abbreviated as CHO cells), dhfr gene-deficient Chinese hamster cells CHO (hereinafter abbreviated as CHO (dhfr − ) cells), mouse L Cells, mouse AtT-20, mouse myeloma cells, mouse ATDC5 cells, rat GH3, human FL cells and the like are used.
Transformation of Escherichia can be performed, for example, according to the method described in Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 69, 2110 (1972), Gene, 17, 107 (1982).
バチルス属菌を形質転換するには、例えば、Molecular & General Genetics,168巻,111(1979)などに記載の方法に従って行なうことができる。
酵母を形質転換するには、例えば、Methods in Enzymology,194巻,182-187(1991)、Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75巻, 1929(1978)などに記載の方法に従って行なうことができる。
昆虫細胞または昆虫を形質転換するには、例えば、Bio/Technology,6, 47-55(1988)などに記載の方法に従って行なうことができる。
動物細胞を形質転換するには、例えば、細胞工学別冊8 新細胞工学実験プロトコール.263-267(1995)(秀潤社発行)、Virology,52巻,456(1973)に記載の方法に従って行なうことができる。
このようにして、タンパク質をコードするDNAを含有する発現ベクターで形質転換された形質転換体を得ることができる。
宿主がエシェリヒア属菌、バチルス属菌である形質転換体を培養する際、培養に使用される培地としては液体培地が適当であり、その中には該形質転換体の生育に必要な炭素源、窒素源、無機物その他が含有せしめられる。炭素源としては、例えば、グルコース、デキストリン、可溶性澱粉、ショ糖など、窒素源としては、例えば、アンモニウム塩類、硝酸塩類、コーンスチープ・リカー、ペプトン、カゼイン、肉エキス、大豆粕、バレイショ抽出液などの無機または有機物質、無機物としては、例えば、塩化カルシウム、リン酸二水素ナトリウム、塩化マグネシウムなどが挙げられる。また、酵母エキス、ビタミン類、生長促進因子などを添加してもよい。培地のpHは約5〜8が望ましい。
エシェリヒア属菌を培養する際の培地としては、例えば、グルコース、カザミノ酸を含むM9培地〔ミラー(Miller),Journal of Experiments in Molecular Genetics,431-433,Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972〕が好ましい。ここに必要によりプロモーターを効率よく働かせるために、例えば、3β−インドリルアクリル酸のような薬剤を加えることができる。
宿主がエシェリヒア属菌の場合、培養は通常約15〜43℃で約3〜24時間行ない、必要により、通気や撹拌を加えることもできる。
宿主がバチルス属菌の場合、培養は通常約30〜40℃で約6〜24時間行ない、必要により通気や撹拌を加えることもできる。
宿主が酵母である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、バークホールダー(Burkholder)最小培地〔Bostian, K. L. ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,77巻,4505(1980)〕や0.5%カザミノ酸を含有するSD培地〔Bitter, G. A. らProc. Natl. Acad. Sci. USA,81巻,5330(1984)〕が挙げられる。培地のpHは約5〜8に調整するのが好ましい。培養は通常約20℃〜35℃で約24〜72時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が昆虫細胞または昆虫である形質転換体を培養する際、培地としては、Grace's Insect Medium(Grace, T.C.C., Nature,195,788(1962))に非動化した10%ウシ血清等の添加物を適宜加えたものなどが用いられる。培地のpHは約6.2〜6.4に調整するのが好ましい。培養は通常約27℃で約3〜5日間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
宿主が動物細胞である形質転換体を培養する際、培地としては、例えば、約5〜20%の胎児牛血清を含むMEM培地〔Science,122巻,501(1952)〕,DMEM培地〔Virology,8巻,396(1959)〕,RPMI 1640培地〔The Journal of the American Medical Association 199巻,519(1967)〕,199培地〔Proceeding of the Society for the Biological Medicine,73巻,1(1950)〕などが用いられる。pHは約6〜8であるのが好ましい。
培養は通常約30℃〜40℃で約15〜60時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加える。
以上のようにして、形質転換体の細胞内、細胞膜または細胞外に本発明のタンパク質を生成せしめることができる。
Transformation of Bacillus can be performed, for example, according to the method described in Molecular & General Genetics, 168, 111 (1979).
In order to transform yeast, for example, the method described in Methods in Enzymology, 194, 182-287 (1991), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929 (1978) and the like can be performed. it can.
Insect cells or insects can be transformed, for example, according to the method described in Bio / Technology, 6, 47-55 (1988).
In order to transform animal cells, for example, cell engineering separate volume 8 New Cell Engineering Experiment Protocol. 263-267 (1995) (published by Shujunsha), Virology, 52, 456 (1973) Can do.
In this way, a transformant transformed with an expression vector containing DNA encoding the protein can be obtained.
When culturing a transformant whose host is an Escherichia bacterium or Bacillus genus, a liquid medium is suitable as a medium used for the culture, and a carbon source necessary for the growth of the transformant, Nitrogen sources, inorganic substances, etc. are contained. Examples of the carbon source include glucose, dextrin, soluble starch, and sucrose. Examples of the nitrogen source include ammonium salts, nitrates, corn steep liquor, peptone, casein, meat extract, soybean cake, and potato extract. Examples of inorganic or organic substances and inorganic substances include calcium chloride, sodium dihydrogen phosphate, and magnesium chloride. In addition, yeast extract, vitamins, growth promoting factors and the like may be added. The pH of the medium is preferably about 5-8.
As a medium for culturing Escherichia, for example, M9 medium containing glucose and casamino acid (Miller, Journal of Experiments in Molecular Genetics, 431-433, Cold Spring Harbor Laboratory, New York 1972) is preferable. . In order to make the promoter work efficiently here, a drug such as 3β-indolylacrylic acid can be added.
When the host is Escherichia, the culture is usually performed at about 15 to 43 ° C. for about 3 to 24 hours, and if necessary, aeration or agitation can be added.
When the host is a genus Bacillus, the culture is usually performed at about 30 to 40 ° C. for about 6 to 24 hours, and if necessary, aeration or agitation can be added.
When cultivating a transformant whose host is yeast, examples of the medium include a Burkholder minimum medium [Bostian, KL et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 77, 4505 (1980)]. And SD medium containing 0.5% casamino acid [Bitter, GA et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5330 (1984)]. The pH of the medium is preferably adjusted to about 5-8. The culture is usually performed at about 20 ° C. to 35 ° C. for about 24 to 72 hours, and aeration and agitation are added as necessary.
When cultivating a transformant whose host is an insect cell or an insect, an appropriate medium such as 10% bovine serum that has been immobilized on Grace's Insect Medium (Grace, TCC, Nature, 195,788 (1962)) is used as the medium. Additions etc. are used. The pH of the medium is preferably adjusted to about 6.2 to 6.4. The culture is usually performed at about 27 ° C. for about 3 to 5 days, and aeration and agitation are added as necessary.
When culturing a transformant whose host is an animal cell, examples of the medium include MEM medium (Science, Vol. 122, 501 (1952)) containing about 5 to 20% fetal calf serum, DMEM medium [Virology, 8, 396 (1959)], RPMI 1640 medium [The Journal of the American Medical Association 199, 519 (1967)], 199 medium [Proceeding of the Society for the Biological Medicine, 73, 1 (1950)], etc. Is used. The pH is preferably about 6-8.
Culture is usually performed at about 30 ° C. to 40 ° C. for about 15 to 60 hours, and aeration and agitation are added as necessary.
As described above, the protein of the present invention can be produced inside the cell, the cell membrane, or outside the cell of the transformant.
上記培養物から本発明のタンパク質を分離精製するには、例えば、下記の方法により行なうことができる。
本発明のタンパク質を培養菌体あるいは細胞から抽出するに際しては、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、これを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、リゾチームおよび/または凍結融解などによって菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過によりタンパク質の粗抽出液を得る方法などが適宜用いられる。緩衝液の中に尿素や塩酸グアニジンなどのタンパク質変性剤や、トリトンX−100TMなどの界面活性剤が含まれていてもよい。培養液中にタンパク質が分泌される場合には、培養終了後、それ自体公知の方法で菌体あるいは細胞と上清とを分離し、上清を集める。
このようにして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれるタンパク質の精製は、自体公知の分離・精製法を適切に組み合わせて行なうことができる。これらの公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法などの溶解度を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ過法、およびSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動法などの主として分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィーなどの荷電の差を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーなどの疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動法などの等電点の差を利用する方法などが用いられる。
Separation and purification of the protein of the present invention from the culture can be performed, for example, by the following method.
When extracting the protein of the present invention from cultured cells or cells, after culturing, the cells or cells are collected by a known method, suspended in an appropriate buffer, and subjected to ultrasound, lysozyme and / or freeze-thaw, etc. A method of obtaining a crude protein extract by centrifugation or filtration after destroying cells or cells by the method is appropriately used. The buffer solution may contain a protein denaturant such as urea or guanidine hydrochloride, or a surfactant such as Triton X-100 ™ . When the protein is secreted into the culture solution, after completion of the culture, the cells or cells and the supernatant are separated by a method known per se, and the supernatant is collected.
Purification of the protein contained in the thus obtained culture supernatant or extract can be performed by appropriately combining per se known separation and purification methods. These known separation and purification methods include mainly molecular weights such as methods utilizing solubility such as salting out and solvent precipitation, dialysis, ultrafiltration, gel filtration, and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Using difference in charge, method using difference in charge such as ion exchange chromatography, method using specific affinity such as affinity chromatography, and difference in hydrophobicity such as reverse phase high performance liquid chromatography A method using a difference in isoelectric point, such as a method or isoelectric focusing method, is used.
かくして得られるタンパク質が遊離体で得られた場合には、自体公知の方法あるいはそれに準じる方法によって塩に変換することができ、逆に塩で得られた場合には自体公知の方法あるいはそれに準じる方法により、遊離体または他の塩に変換することができる。
なお、組換え体が産生するタンパク質を、精製前または精製後に適当な蛋白修飾酵素を作用させることにより、任意に修飾を加えたり、ポリペプチドを部分的に除去することもできる。蛋白修飾酵素としては、例えば、トリプシン、キモトリプシン、アルギニルエンドペプチダーゼ、プロテインキナーゼ、グリコシダーゼなどが用いられる。
かくして生成する本発明のタンパク質の存在は、特異抗体を用いたエンザイムイムノアッセイやウエスタンブロッティングなどにより測定することができる。
When the protein thus obtained is obtained in a free form, it can be converted into a salt by a method known per se or a method analogous thereto, and conversely, when obtained as a salt, a method known per se or a method analogous thereto Can be converted to the free form or other salts.
The protein produced by the recombinant can be arbitrarily modified or the polypeptide can be partially removed by allowing an appropriate protein modifying enzyme to act before or after purification. Examples of the protein modifying enzyme include trypsin, chymotrypsin, arginyl endopeptidase, protein kinase, glycosidase and the like.
The presence of the protein of the present invention thus produced can be measured by enzyme immunoassay or Western blotting using a specific antibody.
本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体は、本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩を認識し得る抗体であれば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体の何れであってもよい。
本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、抗体の説明においては、これらを単に本発明のタンパク質と略記する場合がある)に対する抗体は、本発明のタンパク質を抗原として用い、自体公知の抗体または抗血清の製造法に従って製造することができる。
〔モノクローナル抗体の作製〕
(a)モノクローナル抗体産生細胞の作製
本発明のタンパク質は、温血動物に対して投与により抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は通常2〜6週毎に1回ずつ、計2〜10回程度行われる。用いられる温血動物としては、例えば、サル、ウサギ、イヌ、モルモット、マウス、ラット、ヒツジ、ヤギ、ニワトリが挙げられるが、マウスおよびラットが好ましく用いられる。
モノクローナル抗体産生細胞の作製に際しては、抗原で免疫された温血動物、例えばマウスから抗体価の認められた個体を選択し最終免疫の2〜5日後に脾臓またはリンパ節を
採取し、それらに含まれる抗体産生細胞を同種または異種動物の骨髄腫細胞と融合させることにより、モノクローナル抗体産生ハイブリドーマを調製することができる。抗血清中の抗体価の測定は、例えば、後記の標識化タンパク質と抗血清とを反応させたのち、抗体に結合した標識剤の活性を測定することにより行なうことができる。融合操作は既知の方法、例えば、ケーラーとミルスタインの方法〔Nature、256、495 (1975)〕に従い実施することができる。融合促進剤としては、例えば、ポリエチレングリコール(PEG)やセンダイウィルスなどが挙げられるが、好ましくはPEGが用いられる。
The antibody to the protein or partial peptide or salt thereof used in the present invention may be either a polyclonal antibody or a monoclonal antibody as long as it can recognize the protein or partial peptide or salt thereof used in the present invention.
An antibody against the protein or partial peptide used in the present invention or a salt thereof (hereinafter, in the description of the antibody, these may be simply abbreviated as the protein of the present invention) is known per se using the protein of the present invention as an antigen The antibody or antiserum can be produced according to the production method.
[Production of monoclonal antibodies]
(A) Production of Monoclonal Antibody-Producing Cells The protein of the present invention is administered to a warm-blooded animal by itself, together with a carrier and a diluent, at a site where antibody production can be achieved. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance antibody production ability upon administration. The administration is usually performed once every 2 to 6 weeks, about 2 to 10 times in total. Examples of the warm-blooded animal used include monkeys, rabbits, dogs, guinea pigs, mice, rats, sheep, goats and chickens, and mice and rats are preferably used.
When producing monoclonal antibody-producing cells, select a warm-blooded animal immunized with an antigen, for example, an individual with a confirmed antibody titer from a mouse, and collect spleen or lymph nodes 2 to 5 days after the final immunization. Monoclonal antibody-producing hybridomas can be prepared by fusing the antibody-producing cells to be fused with allogeneic or xenogeneic myeloma cells. The antibody titer in the antiserum can be measured, for example, by reacting the labeled protein described below with the antiserum and then measuring the activity of the labeling agent bound to the antibody. The fusion operation can be carried out according to a known method, for example, the method of Kohler and Milstein [Nature, 256, 495 (1975)]. Examples of the fusion promoter include polyethylene glycol (PEG) and Sendai virus. Preferably, PEG is used.
骨髄腫細胞としては、例えば、NS−1、P3U1、SP2/0、AP−1などの温血動物の骨髄腫細胞が挙げられるが、P3U1が好ましく用いられる。用いられる抗体産生細胞(脾臓細胞)数と骨髄腫細胞数との好ましい比率は1:1〜20:1程度であり、PEG(好ましくはPEG1000〜PEG6000)が10〜80%程度の濃度で添加され、20〜40℃、好ましくは30〜37℃で1〜10分間インキュベートすることにより効率よく細胞融合を実施できる。
モノクローナル抗体産生ハイブリドーマのスクリーニングには種々の方法が使用できるが、例えば、タンパク質抗原を直接あるいは担体とともに吸着させた固相(例、マイクロプレート)にハイブリドーマ培養上清を添加し、次に放射性物質や酵素などで標識した抗免疫グロブリン抗体(細胞融合に用いられる細胞がマウスの場合、抗マウス免疫グロブリン抗体が用いられる)またはプロテインAを加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法、抗免疫グロブリン抗体またはプロテインAを吸着させた固相にハイブリドーマ培養上清を添加し、放射性物質や酵素などで標識したタンパク質を加え、固相に結合したモノクローナル抗体を検出する方法などが挙げられる。
モノクローナル抗体の選別は、自体公知あるいはそれに準じる方法に従って行なうことができる。通常HAT(ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン)を添加した動物細胞用培地で行なうことができる。選別および育種用培地としては、ハイブリドーマが生育できるものならばどのような培地を用いても良い。例えば、1〜20%、好ましくは10〜20%の牛胎児血清を含むRPMI 1640培地、1〜10%の牛胎児血清を含むGIT培地(和光純薬工業(株))あるいはハイブリドーマ培養用無血清培地(SFM−101、日水製薬(株))などを用いることができる。培養温度は、通常20〜40℃、好ましくは約37℃である。培養時間は、通常5日〜3週間、好ましくは1週間〜2週間である。培養は、通常5%炭酸ガス下で行なうことができる。ハイブリドーマ培養上清の抗体価は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。
Examples of myeloma cells include warm-blooded animal myeloma cells such as NS-1, P3U1, SP2 / 0, AP-1, and P3U1 is preferably used. The preferred ratio between the number of antibody-producing cells (spleen cells) and the number of myeloma cells used is about 1: 1 to 20: 1, and PEG (preferably PEG 1000 to PEG 6000) is added at a concentration of about 10 to 80%. Cell fusion can be efficiently carried out by incubating at 20 to 40 ° C., preferably 30 to 37 ° C. for 1 to 10 minutes.
Various methods can be used to screen for monoclonal antibody-producing hybridomas. For example, the hybridoma culture supernatant is added to a solid phase (eg, microplate) on which a protein antigen is adsorbed directly or together with a carrier, and then a radioactive substance or An anti-immunoglobulin antibody labeled with an enzyme or the like (when the cell used for cell fusion is a mouse, an anti-mouse immunoglobulin antibody is used) or protein A, and a method for detecting a monoclonal antibody bound to a solid phase; Examples include a method in which a hybridoma culture supernatant is added to a solid phase on which a globulin antibody or protein A is adsorbed, a protein labeled with a radioactive substance or an enzyme is added, and a monoclonal antibody bound to the solid phase is detected.
The selection of the monoclonal antibody can be performed according to a method known per se or a method analogous thereto. Usually, it can be performed in a medium for animal cells supplemented with HAT (hypoxanthine, aminopterin, thymidine). As the selection and breeding medium, any medium may be used as long as it can grow a hybridoma. For example, RPMI 1640 medium containing 1-20%, preferably 10-20% fetal bovine serum, GIT medium (Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) containing 1-10% fetal bovine serum, or serum-free for hybridoma culture A culture medium (SFM-101, Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.) etc. can be used. The culture temperature is usually 20 to 40 ° C, preferably about 37 ° C. The culture time is usually 5 days to 3 weeks, preferably 1 to 2 weeks. Culturing can usually be performed under 5% carbon dioxide gas. The antibody titer of the hybridoma culture supernatant can be measured in the same manner as the antibody titer in the above antiserum.
(b)モノクローナル抗体の精製
モノクローナル抗体の分離精製は、自体公知の方法、例えば、免疫グロブリンの分離精製法〔例、塩析法、アルコール沈殿法、等電点沈殿法、電気泳動法、イオン交換体(例、DEAE)による吸脱着法、超遠心法、ゲルろ過法、抗原結合固相あるいはプロテインAあるいはプロテインGなどの活性吸着剤により抗体のみを採取し、結合を解離させて抗体を得る特異的精製法〕に従って行なうことができる。
〔ポリクローナル抗体の作製〕
本発明のポリクローナル抗体は、それ自体公知あるいはそれに準じる方法に従って製造することができる。例えば、免疫抗原(タンパク質抗原)自体、あるいはそれとキャリアータンパク質との複合体をつくり、上記のモノクローナル抗体の製造法と同様に温血動物に免疫を行ない、該免疫動物から本発明のタンパク質に対する抗体含有物を採取して、抗体の分離精製を行なうことにより製造することができる。
温血動物を免疫するために用いられる免疫抗原とキャリアータンパク質との複合体に関し、キャリアータンパク質の種類およびキャリアーとハプテンとの混合比は、キャリアー
に架橋させて免疫したハプテンに対して抗体が効率良くできれば、どの様なものをどの様な比率で架橋させてもよいが、例えば、ウシ血清アルブミンやウシサイログロブリン、ヘモシアニン等を重量比でハプテン1に対し、約0.1〜20、好ましくは約1〜5の割合でカプルさせる方法が用いられる。
また、ハプテンとキャリアーのカプリングには、種々の縮合剤を用いることができるが、グルタルアルデヒドやカルボジイミド、マレイミド活性エステル、チオール基、ジチオビリジル基を含有する活性エステル試薬等が用いられる。
縮合生成物は、温血動物に対して、抗体産生が可能な部位にそれ自体あるいは担体、希釈剤とともに投与される。投与に際して抗体産生能を高めるため、完全フロイントアジュバントや不完全フロイントアジュバントを投与してもよい。投与は、通常約2〜6週毎に1回ずつ、計約3〜10回程度行なわれる。
ポリクローナル抗体は、上記の方法で免疫された温血動物の血液、腹水など、好ましくは血液から採取することができる。
抗血清中のポリクローナル抗体価の測定は、上記の抗血清中の抗体価の測定と同様にして測定できる。ポリクローナル抗体の分離精製は、上記のモノクローナル抗体の分離精製と同様の免疫グロブリンの分離精製法に従って行なうことができる。
(B) Purification of monoclonal antibody Separation and purification of the monoclonal antibody can be performed by a method known per se, for example, an immunoglobulin separation and purification method [eg, salting out method, alcohol precipitation method, isoelectric point precipitation method, electrophoresis method, ion exchange method. Absorption / desorption method by body (eg, DEAE), ultracentrifugation method, gel filtration method, antigen-binding solid phase, or an antibody-active adsorbent such as protein A or protein G. Purification method].
[Preparation of polyclonal antibody]
The polyclonal antibody of the present invention can be produced according to a method known per se or a method analogous thereto. For example, an immune antigen (protein antigen) itself or a complex of it and a carrier protein is prepared, and a warm-blooded animal is immunized in the same manner as the monoclonal antibody production method described above, and the antibody against the protein of the present invention is contained from the immunized animal. It can be produced by collecting the product and performing separation and purification of the antibody.
Regarding the complex of immunizing antigen and carrier protein used to immunize warm-blooded animals, the type of carrier protein and the mixing ratio of carrier and hapten are effective for antibodies against hapten immunized by cross-linking to carrier. As long as it is possible, any substance may be cross-linked at any ratio. For example, bovine serum albumin, bovine thyroglobulin, hemocyanin and the like are about 0.1 to 20, preferably about 1 with respect to hapten 1 by weight ratio. A method of coupling at a rate of ˜5 is used.
Various coupling agents can be used for coupling of the hapten and the carrier, but active ester reagents containing glutaraldehyde, carbodiimide, maleimide active ester, thiol group, and dithiobilidyl group are used.
The condensation product is administered to warm-blooded animals at the site where antibody production is possible, or with a carrier and a diluent. Complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance antibody production ability upon administration. The administration is usually performed once every about 2 to 6 weeks and about 3 to 10 times in total.
Polyclonal antibodies can be collected from blood, ascites, etc., preferably from blood of warm-blooded animals immunized by the above method.
The polyclonal antibody titer in the antiserum can be measured in the same manner as the antibody titer in the antiserum described above. Separation and purification of the polyclonal antibody can be performed according to the same immunoglobulin separation and purification method as the above-described monoclonal antibody separation and purification.
本発明で用いられるタンパク質または部分ペプチドをコードするポリヌクレオチド(好ましくはDNA)(以下、アンチセンスポリヌクレオチドの説明においては、これらのDNAを本発明のDNAと略記する場合がある)の塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を有するアンチセンスポリヌクレオチドとしては、本発明のDNAの塩基配列に相補的な、または実質的に相補的な塩基配列またはその一部を有し、該DNAの発現を抑制し得る作用を有するものであれば、いずれのアンチセンスポリヌクレオチドであってもよいが、アンチセンスDNAが好ましい。
本発明のDNAに実質的に相補的な塩基配列とは、例えば、本発明のDNAに相補的な塩基配列(すなわち、本発明のDNAの相補鎖)の全塩基配列あるいは部分塩基配列と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有する塩基配列などが挙げられる。特に、本発明のDNAの相補鎖の全塩基配列うち、(i)翻訳阻害を指向したアンチセンスポリヌクレオチドの場合は、本発明のタンパク質のN末端部位をコードする部分の塩基配列(例えば、開始コドン付近の塩基配列など)の相補鎖と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアンチセンスポリヌクレオチドが、(ii)RNaseHによるRNA分解を指向するアンチセンスポリヌクレオチドの場合は、イントロンを含む本発明のDNAの全塩基配列の相補鎖と約70%以上、好ましくは約80%以上、より好ましくは約90%以上、最も好ましくは約95%以上の相同性を有するアンチセンスポリヌクレオチドがそれぞれ好適である。
具体的には、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表わされる塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補的な、もしくは実質的に相補的な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド、好ましくは例えば、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表わされる塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド(より好ましくは、配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28で表わされる塩基配列を含有するDNAの塩基配列に相補な塩基配列、またはその一部分を有するアンチセンスポリヌクレオチド)が挙げられる。
アンチセンスポリヌクレオチドは通常、10〜40個程度、好ましくは15〜30個程度の塩基から構成される。
ヌクレアーゼなどの加水分解酵素による分解を防ぐために、アンチセンスDNAを構成する各ヌクレオチドのりん酸残基(ホスフェート)は、例えば、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオネートなどの化学修飾りん酸残基に置換されていてもよい。また、各ヌクレオチドの糖(デオキシリボース)は、2'−O−メチル化などの化学修飾糖構造に置換されていてもよいし、塩基部分(ピリミジン、プリン)も化学修飾を受けたものであってもよく、配列番号:2、配列番号:6、配列番号:8または配列番号:10で表わされる塩基配列を含有するDNAにハイブリダイズするものであればいずれのものでもよい。これらのアンチセンスポリヌクレオチドは、公知のDNA合成装置などを用いて製造することができる。
In the base sequence of a polynucleotide (preferably DNA) encoding a protein or partial peptide used in the present invention (hereinafter, in the description of an antisense polynucleotide, these DNAs may be abbreviated as the DNA of the present invention). The antisense polynucleotide having a complementary or substantially complementary nucleotide sequence or a part thereof is a nucleotide sequence complementary to or substantially complementary to the nucleotide sequence of the DNA of the present invention. Any antisense polynucleotide may be used as long as it has a portion and has an action capable of suppressing the expression of the DNA, but antisense DNA is preferred.
The base sequence substantially complementary to the DNA of the present invention is, for example, about 70 of the total base sequence or partial base sequence of the base sequence complementary to the DNA of the present invention (that is, the complementary strand of the DNA of the present invention). % Or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more of a base sequence having homology. In particular, among the entire base sequences of the complementary strand of the DNA of the present invention, (i) in the case of an antisense polynucleotide directed to translation inhibition, the base sequence of the portion encoding the N-terminal site of the protein of the present invention (for example, the start An antisense polynucleotide having a homology of about 70% or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% or more, and most preferably about 95% or more with a complementary strand (such as a base sequence near a codon) ii) In the case of an antisense polynucleotide directed to RNA degradation by RNase H, it is about 70% or more, preferably about 80% or more, more preferably about 90% with the complementary strand of the entire base sequence of the DNA of the present invention including introns. As mentioned above, antisense polynucleotides having a homology of about 95% or more are most preferable.
Specifically, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, A nucleotide sequence complementary to or substantially complementary to the nucleotide sequence of DNA containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28 Or an antisense polynucleotide having a portion thereof, preferably, for example, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or complementary to the base sequence of DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 28 An antisense polynucleotide having a base sequence or a part thereof (more preferably, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, complementary to the base sequence of DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28 An antisense polynucleotide having a simple nucleotide sequence or a part thereof.
The antisense polynucleotide is usually composed of about 10 to 40 bases, preferably about 15 to 30 bases.
In order to prevent degradation by a hydrolase such as nuclease, the phosphate residues (phosphates) of each nucleotide constituting the antisense DNA are changed to chemically modified phosphate residues such as phosphorothioate, methylphosphonate and phosphorodithionate. May be substituted. In addition, the sugar (deoxyribose) of each nucleotide may be substituted with a chemically modified sugar structure such as 2′-O-methylation, and the base portion (pyrimidine, purine) is also chemically modified. Any one may be used as long as it hybridizes to DNA containing the base sequence represented by SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8 or SEQ ID NO: 10. These antisense polynucleotides can be produced using a known DNA synthesizer.
本発明に従えば、本発明のタンパク質遺伝子の複製または発現を阻害することのできる該遺伝子に対応するアンチセンスポリヌクレオチド(核酸)を、クローン化した、あるいは決定されたタンパク質をコードするDNAの塩基配列情報に基づき設計し、合成しうる。かかるアンチセンスポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質遺伝子のRNAとハイブリダイズすることができ、該RNAの合成または機能を阻害することができるか、あるいは本発明のタンパク質関連RNAとの相互作用を介して本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御することができる。本発明のタンパク質関連RNAの選択された配列に相補的なポリヌクレオチド、および本発明のタンパク質関連RNAと特異的にハイブリダイズすることができるポリヌクレオチドは、生体内および生体外で本発明のタンパク質遺伝子の発現を調節・制御するのに有用であり、また病気などの治療または診断に有用である。
用語「対応する」とは、遺伝子を含めたヌクレオチド、塩基配列または核酸の特定の配列に相同性を有するあるいは相補的であることを意味する。ヌクレオチド、塩基配列または核酸とタンパク質との間で「対応する」とは、ヌクレオチド(核酸)の配列またはその相補体から誘導される(指令にある)タンパク質のアミノ酸を通常指している。タンパク質遺伝子の5'端ヘアピンループ、5'端6−ベースペア・リピート、5'端非翻訳領域、ポリペプチド翻訳開始コドン、タンパク質コード領域、ORF翻訳終止コドン、3'端非翻訳領域、3'端パリンドローム領域または3'端ヘアピンループなどは、好ましい対象領域として選択しうるが、タンパク質遺伝子内の如何なる領域も対象として選択しうる。
目的核酸と、対象領域の少なくとも一部に相補的なポリヌクレオチドとの関係については、目的核酸が対象領域とハイブリダイズすることができる場合は、その目的核酸は、当該対象領域のポリヌクレオチドに対して「アンチセンス」であるということができる。アンチセンスポリヌクレオチドは、2−デオキシ−D−リボースを含有しているポリヌクレオチド、D−リボースを含有しているポリヌクレオチド、プリンまたはピリミジン塩基のN−グリコシドであるその他のタイプのポリヌクレオチド、非ヌクレオチド骨格を有するその他のポリマー(例えば、市販のタンパク質核酸および合成配列特異的な核酸ポリマー)または特殊な結合を含有するその他のポリマー(但し、該ポリマーはDNAやRNA中に見出されるような塩基のペアリングや塩基の付着を許容する配置をもつヌクレオチドを含有する)などが挙げられる。それらは、2本鎖DNA、1本鎖DNA、2本鎖RNA、1本鎖RNA、DNA:RNAハイブリッドであってもよく、さらに非修飾ポリヌクレオチド(または非修飾オリゴヌクレオチド)、公知の修飾の付加されたもの、例えば当該分
野で知られた標識のあるもの、キャップの付いたもの、メチル化されたもの、1個以上の天然のヌクレオチドを類縁物で置換したもの、分子内ヌクレオチド修飾のされたもの、例えば非荷電結合(例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホルアミデート、カルバメートなど)を持つもの、電荷を有する結合または硫黄含有結合(例、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど)を持つもの、例えばタンパク質(例、ヌクレアーゼ、ヌクレアーゼ・インヒビター、トキシン、抗体、シグナルペプチド、ポリ−L−リジンなど)や糖(例、モノサッカライドなど)などの側鎖基を有しているもの、インターカレント化合物(例、アクリジン、ソラレンなど)を持つもの、キレート化合物(例えば、金属、放射活性をもつ金属、ホウ素、酸化性の金属など)を含有するもの、アルキル化剤を含有するもの、修飾された結合を持つもの(例えば、αアノマー型の核酸など)であってもよい。ここで「ヌクレオシド」、「ヌクレオチド」および「核酸」とは、プリンおよびピリミジン塩基を含有するのみでなく、修飾されたその他の複素環型塩基をもつようなものを含んでいて良い。このような修飾物は、メチル化されたプリンおよびピリミジ
ン、アシル化されたプリンおよびピリミジン、あるいはその他の複素環を含むものであってよい。修飾されたヌクレオチドおよび修飾されたヌクレオチドはまた糖部分が修飾されていてよく、例えば、1個以上の水酸基がハロゲンとか、脂肪族基などで置換されていたり、またはエーテル、アミンなどの官能基に変換されていてよい。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、RNA、DNAまたは修飾された核酸(RNA、DNA)である。修飾された核酸の具体例としては、核酸の硫黄誘導体、チオホスフェート誘導体、ポリヌクレオシドアミドやオリゴヌクレオシドアミドの分解に抵抗性のものなどが挙げられる。本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、例えば、以下のように設計されうる。すなわち、細胞内でのアンチセンスポリヌクレオチドをより安定なものにする、アンチセンスポリヌクレオチドの細胞透過性をより高める、目標とするセンス鎖に対する親和性をより大きなものにする、また、もし毒性があるような場合はアンチセンスポリヌクレオチドの毒性をより小さなものにする。このような修飾は、例えばPharm Tech Japan, 8巻, 247頁または395頁, 1992年、Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993年などで数多く報告されている。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、変化せしめられたり、修飾された糖、塩基、結合を含有していて良く、リポゾーム、ミクロスフェアのような特殊な形態で供与されたり、遺伝子治療により適用されたり、付加された形態で与えられることができうる。こうして付加形態で用いられるものとしては、リン酸基骨格の電荷を中和するように働くポリリジンのようなポリカチオン体、細胞膜との相互作用を高めたり、核酸の取込みを増大せしめるような脂質(例、ホスホリピド、コレステロールなど)などの疎水性のものが挙げられる。付加するに好ましい脂質としては、コレステロールやその誘導体(例、コレステリルクロロホルメート、コール酸など)が挙げられる。こうしたものは、核酸の3'端または5'端に付着させることができ、塩基、糖、分子内ヌクレオシド結合を介して付着させることができうる。その他の基としては、核酸の3'端または5'端に特異的に配置されたキャップ用の基で、エキソヌクレアーゼ、RNaseなどのヌクレアーゼによる分解を阻止するためのものが挙げられる。こうしたキャップ用の基としては、ポリエチレングリコール、テトラエチレングリコールなどのグリコールをはじめとした当該分野で知ら
れた水酸基の保護基が挙げられるが、それに限定されるものではない。
アンチセンスポリヌクレオチドの阻害活性は、本発明の形質転換体、本発明の生体内や生体外の遺伝子発現系、または本発明のタンパク質の生体内や生体外の翻訳系を用いて調べることができる。
According to the present invention, an antisense polynucleotide (nucleic acid) corresponding to the gene capable of inhibiting the replication or expression of the protein gene of the present invention is cloned, or the base of DNA encoding the determined protein is determined. Design and synthesis based on sequence information. Such antisense polynucleotides can hybridize with the RNA of the protein gene of the present invention, inhibit the synthesis or function of the RNA, or through interaction with the protein-related RNA of the present invention. The expression of the protein gene of the present invention can be regulated and controlled. The polynucleotide complementary to the selected sequence of the protein-related RNA of the present invention and the polynucleotide capable of specifically hybridizing with the protein-related RNA of the present invention are the protein gene of the present invention in vivo and in vitro. It is useful for regulating / controlling the expression of and for the treatment or diagnosis of diseases.
The term “corresponding” means homologous to or complementary to a specific sequence of nucleotides, base sequences or nucleic acids including genes. “Corresponding” between a nucleotide, base sequence or nucleic acid and protein usually refers to the amino acid of the protein (instructed) derived from the nucleotide (nucleic acid) sequence or its complement. 5 'end hairpin loop of protein gene, 5' end 6-base pair repeat, 5 'end untranslated region, polypeptide translation start codon, protein coding region, ORF translation stop codon, 3' end untranslated region, 3 ' An end palindromic region or a 3 ′ end hairpin loop or the like can be selected as a preferred region of interest, but any region within a protein gene can be selected as a target.
Regarding the relationship between the target nucleic acid and a polynucleotide complementary to at least a part of the target region, if the target nucleic acid can hybridize to the target region, the target nucleic acid It can be said that it is “antisense”. Antisense polynucleotides include polynucleotides containing 2-deoxy-D-ribose, polynucleotides containing D-ribose, other types of polynucleotides that are N-glycosides of purine or pyrimidine bases, non-polynucleotides, Other polymers with a nucleotide backbone (eg, commercially available protein nucleic acids and synthetic sequence-specific nucleic acid polymers) or other polymers containing special linkages (provided that the polymer is a base such as found in DNA or RNA) And a nucleotide having a configuration allowing the attachment of a pairing or base). They may be double-stranded DNA, single-stranded DNA, double-stranded RNA, single-stranded RNA, DNA: RNA hybrids, unmodified polynucleotides (or unmodified oligonucleotides), known modifications Additions, such as those with labels known in the art, capped, methylated, one or more natural nucleotides replaced with analogs, intramolecular nucleotide modifications Such as those having uncharged bonds (eg methylphosphonates, phosphotriesters, phosphoramidates, carbamates, etc.), charged or sulfur-containing bonds (eg phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.) Things such as proteins (eg, nucleases, nuclease inhibitors, toxins, antibodies, Nalpeptides, poly-L-lysine, etc.) and sugars (eg, monosaccharides), etc., side chain groups, intercurrent compounds (eg, acridine, psoralen, etc.), chelate compounds (eg, , Metals, radioactive metals, boron, oxidizing metals, etc.), alkylating agents, and modified bonds (eg, alpha anomeric nucleic acids) Also good. Here, the “nucleoside”, “nucleotide” and “nucleic acid” may include not only purine and pyrimidine bases but also those having other modified heterocyclic bases. Such modifications may include methylated purines and pyrimidines, acylated purines and pyrimidines, or other heterocycles. Modified nucleotides and modified nucleotides may also be modified at the sugar moiety, eg, one or more hydroxyl groups are replaced by halogens, aliphatic groups, etc., or functional groups such as ethers, amines, etc. It may have been converted.
The antisense polynucleotide of the present invention is RNA, DNA or a modified nucleic acid (RNA, DNA). Specific examples of the modified nucleic acids include nucleic acid sulfur derivatives, thiophosphate derivatives, polynucleoside amides and oligonucleoside amides that are resistant to degradation. The antisense polynucleotide of the present invention can be designed, for example, as follows. That is, to make the antisense polynucleotide in the cell more stable, to increase the cell permeability of the antisense polynucleotide, to increase the affinity for the target sense strand, and to reduce the toxicity In some cases, the antisense polynucleotide is less toxic. Many such modifications have been reported in, for example, Pharm Tech Japan, 8, 247 or 395, 1992, Antisense Research and Applications, CRC Press, 1993, and the like.
The antisense polynucleotides of the present invention may be altered, contain modified sugars, bases, linkages, be provided in special forms such as liposomes, microspheres, or applied by gene therapy. Can be provided in an added form. In this way, the additional form can be used as a polycationic substance such as polylysine that works to neutralize the charge of the phosphate group skeleton, or a lipid that enhances the interaction with the cell membrane or increases the uptake of nucleic acids ( Examples include hydrophobic ones such as phospholipid and cholesterol. Preferred lipids for addition include cholesterol and derivatives thereof (eg, cholesteryl chloroformate, cholic acid, etc.). Such can be attached to the 3 'or 5' end of the nucleic acid and can be attached via a base, sugar, intramolecular nucleoside bond. Examples of the other group include a cap group specifically arranged at the 3 ′ end or 5 ′ end of a nucleic acid, which prevents degradation by a nuclease such as exonuclease or RNase. Such capping groups include, but are not limited to, hydroxyl protecting groups known in the art, including glycols such as polyethylene glycol and tetraethylene glycol.
The inhibitory activity of the antisense polynucleotide can be examined using the transformant of the present invention, the in vivo or in vitro gene expression system of the present invention, or the in vivo or in vitro translation system of the protein of the present invention. .
以下に、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩(以下、本発明のタンパク質と略記する場合がある)、本発明のタンパク質または部分ペプチドをコードするポリヌクレオチド(例、DNA)(以下、本発明のDNAと略記する場合がある)、本発明のタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)、および本発明のポリヌクレオチド(例、DNA)のアンチセンスポリヌクレオチド(以下、本発明のアンチセンスポリヌクレオチドと略記する場合がある)などの用途を説明する。 The protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter sometimes abbreviated as the protein of the present invention), a polynucleotide (eg, DNA) encoding the protein or partial peptide of the present invention (hereinafter referred to as the present invention). An antibody against the protein or partial peptide of the present invention or a salt thereof (hereinafter sometimes abbreviated as the antibody of the present invention), and the polynucleotide (eg, DNA) of the present invention. The use of a sense polynucleotide (hereinafter sometimes abbreviated as the antisense polynucleotide of the present invention) and the like will be described.
本発明のタンパク質Aは、大腸癌の発症に伴い、部位特異的に高発現しているので、大腸癌の早期診断、症状の重症度の判定、疾患進行の予測のためのマーカーとして有用である。本発明のタンパク質Aの活性を阻害する化合物またはその塩、本発明のタンパク質Aに対する抗体、本発明のタンパク質Aをコードする遺伝子のアンチセンスポリヌクレオチド、本発明のタンパク質Aをコードする遺伝子のsiRNA、shRNAなどは、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。
本発明のタンパク質Bは、大腸癌の発症に伴い、部位特異的に発現が低下するので、大腸癌の早期診断、症状の重症度の判定、疾患進行の予測のためのマーカーとして有用である。本発明のタンパク質Bの活性を促進する化合物またはその塩などは、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。
Since protein A of the present invention is highly expressed in a site-specific manner with the onset of colorectal cancer, it is useful as a marker for early diagnosis of colorectal cancer, determination of the severity of symptoms, and prediction of disease progression. . A compound which inhibits the activity of the protein A of the present invention or a salt thereof, an antibody against the protein A of the present invention, an antisense polynucleotide of the gene encoding the protein A of the present invention, an siRNA of the gene encoding the protein A of the present invention, shRNA can be used, for example, as a preventive / therapeutic agent for colon cancer, an apoptosis promoter for colon cancer cells, a growth inhibitor for colon cancer cells, a metastasis / recurrence inhibitor for colon cancer, and the like.
Protein B of the present invention is useful as a marker for early diagnosis of colorectal cancer, determination of symptom severity, and prediction of disease progression because expression decreases in a site-specific manner as colon cancer develops. The compound or its salt that promotes the activity of protein B of the present invention includes, for example, a preventive / therapeutic agent for colon cancer, an apoptosis promoter for colon cancer cells, a growth inhibitor for colon cancer cells, and a metastasis / recurrence inhibitor for colon cancer. It can be used as an agent.
(1)疾病に対する医薬候補化合物のスクリーニング
本発明のタンパク質Aは、抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性などを有する。よって、本発明のタンパク質Aの活性を阻害する化合物またはその塩は、例えば、大腸癌の低毒性な予防・治療剤、癌細胞のアポトーシス促進剤、癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。したがって、本発明のタンパク質Aは、本発明のタンパク質Aの活性を阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
一方、本発明のタンパク質Bは、アポトーシス活性、癌細胞増殖抑制活性などを有する。よって、本発明のタンパク質Bの活性を促進する化合物またはその塩は、例えば、大腸癌の低毒性な予防・治療剤、癌細胞のアポトーシス促進剤、癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。したがって、本発明のタンパク質Bは、本発明のタンパク質Bの活性を促進する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
すなわち、本発明は、本発明のタンパク質Aを用いることを特徴とする本発明のタンパク質の活性(例、抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性、CTSEのプロテアーゼ活性、NOX1の酸化酵素活性など)を阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。また、本発明は、本発明のタンパク質Bを用いることを特徴とする本発明のタンパク質の活性(例、アポトーシス活性、癌細胞増殖抑制活性など)を促進する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
(1) Screening of drug candidate compounds for diseases Protein A of the present invention has anti-apoptotic activity, cancer cell proliferation promoting activity and the like. Therefore, the compound or salt thereof that inhibits the activity of protein A of the present invention includes, for example, a low-toxic preventive / therapeutic agent for colorectal cancer, a cancer cell apoptosis promoter, a cancer cell growth inhibitor, a colorectal cancer metastasis / It can be used as a recurrence inhibitor. Therefore, the protein A of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that inhibits the activity of the protein A of the present invention.
On the other hand, protein B of the present invention has apoptotic activity, cancer cell growth inhibitory activity and the like. Therefore, the compound or its salt that promotes the activity of protein B of the present invention is, for example, a low-toxic preventive / therapeutic agent for colon cancer, an apoptosis promoter for cancer cells, a growth inhibitor for cancer cells, a metastasis / It can be used as a recurrence inhibitor. Therefore, the protein B of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein B of the present invention.
That is, the present invention has the activity of the protein of the present invention characterized by using the protein A of the present invention (eg, anti-apoptotic activity, cancer cell proliferation promoting activity, protease activity of CTSE, oxidase activity of NOX1). Provided are screening methods for inhibiting compounds or salts thereof. The present invention also provides a method for screening a compound or a salt thereof that promotes the activity (eg, apoptosis activity, cancer cell growth inhibitory activity, etc.) of the protein of the present invention, characterized by using the protein B of the present invention. .
具体例として、以下の方法などが挙げられる。
A)(i)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養させた場合と、(ii)試験化合物の存在下、本発明のタンパク質(本発明のタンパク質AまたはB)を産生する能力を有する細胞を培養させた場合の、抗アポトーシス活性またはアポトーシス活性をそれぞれ測定し、本発明のタンパク質Aの活性を阻害する化合物もしくはその塩、または本発明のタンパク質Bの活性を促進する化合物をスクリーニングする。
抗アポトーシス活性またはアポトーシス活性の測定は、Cell death detection ELISA (Roche社)、Apo-ONE Homogeneous Caspase-3/7 Assay (Promega社)などを用いる公知の方法に従って行う。
B)(i)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養させた場合と、(ii)試験化合物の存在下、本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養させた場合の、癌細胞増殖促進活性または癌細胞増殖抑制活性をそれぞれ測定し、本発明のタンパク質Aの活性を阻害する化合物もしくはその塩、または本発明のタンパク質Bの活性を促進する化合物をスクリーニングする。
癌細胞増殖促進活性または癌細胞増殖抑制活性の測定は、CellTiter-Glo (Promega社)、_BrdU ELISA (Roche社)などを用いる公知の方法に従って行う。
C)(i)本発明のタンパク質のプロテアーゼ活性と、(ii)本発明のタンパク質と試験化合物の混合物のプロテアーゼ活性を比較し、本発明のタンパク質の活性を阻害又は促進する作用を有する化合物またはその塩をスクリーニングする。
本反応は、適当な緩衝液中で行う。プロテアーゼ活性の測定は、公知の方法、例えばBiological Chemistry、386巻、299-305頁、2005年記載の方法またはそれに準じる方法に従って行う。
D)(i)本発明のタンパク質の酸化酵素活性と、(ii)本発明のタンパク質と試験化合物の混合物の酸化酵素活性を比較し、本発明のタンパク質の活性を阻害又は促進する作用を有する化合物またはその塩をスクリーニングする。
本反応は、適当な緩衝液中で行う。酸化酵素活性の測定は、公知の方法、例えばBiological & Pharmaceutical Bulletin、27巻、147-155頁、2004年)記載の方法またはそれに準じる方法に従って行う。
上記の本発明のタンパク質は、好ましくは、本発明のタンパク質をコードするDNAを含有する形質転換体を培養することによって製造されたものである。さらには、本発明のタンパク質を発現し得る細胞を用いて同様に反応させてもよい。
本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、例えば、前述した本発明のタンパク質をコードするDNAを含有するベクターで形質転換された宿主(形質転換体)が用いられる。宿主としては、例えば、COS7細胞、CHO細胞、HEK293細胞などの動物細胞が好ましく用いられる。該スクリーニングには、例えば、前述の方法で培養することによって、本発明のタンパク質を発現させた形質転換体が好ましく用いられる。本発明のタンパク質を発現し得る細胞の培養方法は、前記した本発明の形質変換体の培養法と同様である。
試験化合物としては、例えばペプチド、タンパク質、抗体、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などがあげられる。
例えば、上記(ii)の場合における活性が上記(i)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上減少(または増加)させる試験化合物を、本発明のタンパク質の活性を阻害(または促進)する化合物として選択することができる。
Specific examples include the following methods.
A) (i) when cells having the ability to produce the protein of the present invention are cultured, and (ii) ability to produce the protein of the present invention (protein A or B of the present invention) in the presence of the test compound. Anti-apoptotic activity or apoptotic activity in the case of culturing cells having the same, respectively, and screening for a compound that inhibits the activity of protein A of the present invention or a salt thereof, or a compound that promotes the activity of protein B of the present invention .
Anti-apoptotic activity or apoptotic activity is measured according to a known method using Cell death detection ELISA (Roche), Apo-ONE Homogeneous Caspase-3 / 7 Assay (Promega) or the like.
B) (i) when cells having the ability to produce the protein of the present invention are cultured, and (ii) when cells having the ability to produce the protein of the present invention are cultured in the presence of the test compound, The cancer cell growth promoting activity or the cancer cell growth inhibiting activity is measured, respectively, and a compound that inhibits the activity of protein A of the present invention or a salt thereof, or a compound that promotes the activity of protein B of the present invention is screened.
Measurement of cancer cell growth promoting activity or cancer cell growth inhibitory activity is performed according to a known method using CellTiter-Glo (Promega), _BrdU ELISA (Roche) or the like.
C) a compound having the action of inhibiting or promoting the activity of the protein of the present invention by comparing (i) the protease activity of the protein of the present invention and (ii) the protease activity of the mixture of the protein of the present invention and the test compound, or a compound thereof Screen for salt.
This reaction is performed in an appropriate buffer. The protease activity is measured according to a known method, for example, the method described in Biological Chemistry, 386, 299-305, 2005 or a method analogous thereto.
D) A compound having an action of inhibiting or promoting the activity of the protein of the present invention by comparing (i) the oxidase activity of the protein of the present invention and (ii) the oxidase activity of the mixture of the protein of the present invention and the test compound Or screen its salts.
This reaction is performed in an appropriate buffer. The oxidase activity is measured according to a known method, for example, the method described in Biological & Pharmaceutical Bulletin, 27, pp. 147-155, 2004) or a method analogous thereto.
The above protein of the present invention is preferably produced by culturing a transformant containing DNA encoding the protein of the present invention. Furthermore, you may make it react similarly using the cell which can express the protein of this invention.
As the cell having the ability to produce the protein of the present invention, for example, a host (transformant) transformed with a vector containing the above-described DNA encoding the protein of the present invention is used. As the host, animal cells such as COS7 cells, CHO cells, HEK293 cells are preferably used. For the screening, for example, a transformant in which the protein of the present invention is expressed by culturing by the aforementioned method is preferably used. The method for culturing cells capable of expressing the protein of the present invention is the same as the method for culturing the transformant of the present invention described above.
Examples of the test compound include peptides, proteins, antibodies, non-peptide compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, plasma and the like.
For example, a test compound that reduces (or increases) the activity in the above-mentioned case (ii) by about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably about 50% or more compared to the above-mentioned case (i). It can be selected as a compound that inhibits (or promotes) the activity of the protein of the invention.
本発明のタンパク質Aの活性を阻害する活性を有する化合物は、本発明のタンパク質の生理活性を抑制するための安全で低毒性な医薬、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして有用である。
本発明のタンパク質Bの活性を促進する活性を有する化合物は、本発明のタンパク質Bの生理活性を促進するための安全で低毒性な医薬、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして有用である。 本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、例えば、ペプチド、タンパク質、抗体、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などから選ばれた化合物である。該化合物の塩としては、前記した本発明のペプチドの塩と同様のものが用いられる。
The compound having the activity of inhibiting the activity of protein A of the present invention is a safe and low-toxic drug for suppressing the physiological activity of the protein of the present invention, such as a preventive / therapeutic agent for colon cancer, apoptosis of colon cancer cells. It is useful as a promoter, a colon cancer cell growth inhibitor, a colon cancer metastasis / recurrence inhibitor, and the like.
The compound having the activity of promoting the activity of the protein B of the present invention is a safe and low-toxic drug for promoting the physiological activity of the protein B of the present invention, such as a preventive / therapeutic agent for colorectal cancer, colon cancer cells. It is useful as an apoptosis promoter, a colon cancer cell growth inhibitor, a colon cancer metastasis / relapse inhibitor, and the like. The compound or salt thereof obtained using the screening method or screening kit of the present invention is, for example, a peptide, protein, antibody, non-peptide compound, synthetic compound, fermentation product, cell extract, plant extract, animal tissue. It is a compound selected from extracts, plasma and the like. As the salt of the compound, the same salts as those of the peptide of the present invention described above can be used.
さらに、本発明のタンパク質Aをコードする遺伝子は、抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進、CTSEのプロテアーゼ活性、NOX1の酸化酵素活性などを有するタンパク質を産生するため、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩も、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。したがって、本発明のタンパク質AをコードするDNAは、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
さらに、本発明のタンパク質Bをコードする遺伝子は、アポトーシス活性、癌細胞増殖抑制活性などを有するタンパク質を産生するため、本発明のタンパク質Bをコードする遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩も、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。したがって、本発明のタンパク質BをコードするDNAは、本発明のタンパク質をコードする遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。
スクリーニング方法としては、(iii)本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合と、(iv)試験化合物の存在下、本発明で用いられるタンパク質を産生する能力を有する細胞を培養した場合との比較を行うことを特徴とするスクリーニング方法が挙げられる。
上記方法において、(iii)と(iv)の場合における、前記遺伝子の発現量(具体的には、本発明のタンパク質量または前記タンパク質をコードするmRNA量)を測定して、比較する。
試験化合物および本発明のタンパク質を産生する能力を有する細胞としては、上記と同様のものが挙げられる。
タンパク質量の測定は、公知の方法、例えば、本発明のタンパク質を認識する抗体を用いて、細胞抽出液中などに存在する前記タンパク質を、ウェスタン解析、ELISA法などの方法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
mRNA量の測定は、公知の方法、例えば、プローブとして配列番号:2、配列番号:4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28またはそれらの一部を含有する核酸を用いるノーザンハイブリダイゼーション、あるいはプライマーとして配列番号:2、配列番号:4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26または配列番号:28またはそれらの一部を含有する核酸を用いるPCR法またはそれに準じる方法に従い測定することができる。
例えば、本発明のタンパク質Aをコードする遺伝子の場合、上記(iv)の場合における遺伝子発現量を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上阻害する試験化合物を、本発明のタンパク質Aをコードする遺伝子の発現を抑制(阻害)する化合物として選択することができる。また、本発明のタンパク質Bをコードする遺伝子の場合、上記(iv)の場合における遺伝子発現量を、上記(iii)の場合に比べて、約20%以上、好ましくは30%以上、より好ましくは約50%以上促進する試験化合物を、本発明のタンパク質Bをコードする遺伝子の発現を促進する化合物として選択することができる。
Furthermore, the gene encoding the protein A of the present invention produces a protein having anti-apoptotic activity, promotion of cancer cell growth, protease activity of CTSE, oxidase activity of NOX1, and the like. The compound that inhibits expression or a salt thereof can also be used as, for example, a preventive / therapeutic agent for colon cancer, an apoptosis promoter for colon cancer cells, a growth inhibitor for colon cancer cells, a metastasis / recurrence inhibitor for colon cancer, and the like. it can. Therefore, the DNA encoding the protein A of the present invention is useful as a reagent for screening for compounds or salts thereof that inhibit the expression of the gene encoding the protein of the present invention.
Furthermore, since the gene encoding protein B of the present invention produces a protein having apoptosis activity, cancer cell growth inhibitory activity, etc., a compound or a salt thereof that promotes the expression of the gene encoding protein B of the present invention, For example, it can be used as a prophylactic / therapeutic agent for colorectal cancer, a colorectal cancer cell apoptosis promoter, a colorectal cancer cell growth inhibitor, a colorectal cancer metastasis / recurrence inhibitor, and the like. Therefore, the DNA encoding the protein B of the present invention is useful as a reagent for screening a compound or a salt thereof that promotes the expression of the gene encoding the protein of the present invention.
As a screening method, (iii) when cells having the ability to produce the protein of the present invention were cultured, and (iv) cells having the ability to produce the protein used in the present invention were cultured in the presence of the test compound. There is a screening method characterized by comparison with the case.
In the above method, the expression level of the gene (specifically, the amount of the protein of the present invention or the amount of mRNA encoding the protein) in the cases of (iii) and (iv) is measured and compared.
Examples of the cell having the ability to produce the test compound and the protein of the present invention include those described above.
The amount of protein is measured by a known method, for example, by using an antibody that recognizes the protein of the present invention, the protein present in a cell extract or the like according to a method such as Western analysis, ELISA method or the like or a method equivalent thereto. can do.
Measurement of the amount of mRNA is a known method, for example, as a probe, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16 , SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28, or Northern hybridization using a nucleic acid containing a part thereof, or SEQ ID NO: as a primer : 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, It can be measured according to a PCR method using a nucleic acid containing SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26 or SEQ ID NO: 28 or a part thereof, or a method analogous thereto. That.
For example, in the case of the gene encoding the protein A of the present invention, the gene expression level in the case (iv) is about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably compared to the case (iii). A test compound that inhibits about 50% or more can be selected as a compound that suppresses (inhibits) the expression of the gene encoding protein A of the present invention. In the case of the gene encoding the protein B of the present invention, the gene expression level in the case (iv) is about 20% or more, preferably 30% or more, more preferably compared to the case (iii). A test compound that promotes about 50% or more can be selected as a compound that promotes the expression of the gene encoding protein B of the present invention.
本発明のスクリーニング用キットは、本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドまたはその塩、または本発明で用いられるタンパク質もしくは部分ペプチドを産生する能力を有する細胞を含有するものである。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などから選ばれた化合物またはその塩であり、(a)本発明のタンパク質Aの活性(例、抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性、CTSEのプロテアーゼ活性、NOX1の酸化酵素活性など)を阻害、タンパク質Aの遺伝子の発現を阻害、またはタンパク質Aの発現を阻害する化合物またはその塩、(b)本発明のタンパク質Bの活性(例、アポトーシス活性、癌細胞増殖抑制活性など)を促進、タンパク質Bの遺伝子の発現を促進、またはタンパク質Bの発現を促進する化合物またはその塩などである。
該化合物の塩としては、前記した本発明のタンパク質の塩と同様のものが用いられる。
本発明のタンパク質Aの活性を阻害する化合物またはその塩、本発明のタンパク質Aをコードする遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩、本発明のタンパク質Aの発現を阻害する化合物またはその塩は、低毒性であり、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などの医薬として有用である。
本発明のタンパク質Bの活性を促進する化合物またはその塩、本発明のタンパク質Bをコードする遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩、本発明のタンパク質Bの発現を促進する化合物またはその塩は、低毒性であり、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などの医薬として有用である。
本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩を上述の予防・治療剤として使用する場合、常套手段に従って製剤化することができる。
The screening kit of the present invention contains cells having the ability to produce the protein or partial peptide used in the present invention or a salt thereof, or the protein or partial peptide used in the present invention.
The compound obtained by using the screening method or the screening kit of the present invention or a salt thereof is the above-described test compound, for example, peptide, protein, non-peptide compound, synthetic compound, fermentation product, cell extract, plant extract. (A) the activity of protein A of the present invention (eg, anti-apoptotic activity, cancer cell proliferation promoting activity, protease activity of CTSE, oxidation of NOX1) A compound or a salt thereof that inhibits the enzyme activity, etc., inhibits the expression of the protein A gene, or inhibits the expression of the protein A, (b) the activity of the protein B of the present invention (eg, apoptotic activity, cancer cell growth inhibitory activity) Etc.), the expression of the protein B gene, or the expression of the protein B or a salt thereof It is.
As the salt of the compound, the same salt as the protein salt of the present invention described above can be used.
A compound or salt thereof that inhibits the activity of protein A of the present invention, a compound or salt thereof that inhibits the expression of the gene encoding protein A of the present invention, a compound or salt thereof that inhibits the expression of protein A of the present invention, It has low toxicity and is useful, for example, as a medicament for preventing or treating colorectal cancer, colorectal cancer cell apoptosis promoter, colorectal cancer cell growth inhibitor, colorectal cancer metastasis / recurrence inhibitor, and the like.
A compound or a salt thereof that promotes the activity of the protein B of the present invention, a compound or a salt thereof that promotes the expression of the gene encoding the protein B of the present invention, a compound or a salt thereof that promotes the expression of the protein B of the present invention, It has low toxicity and is useful, for example, as a medicament for preventing or treating colorectal cancer, colorectal cancer cell apoptosis promoter, colorectal cancer cell growth inhibitor, colorectal cancer metastasis / recurrence inhibitor, and the like.
When the compound or salt thereof obtained using the screening method or screening kit of the present invention is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated according to conventional means.
例えば、経口投与のための組成物としては、固体または液体の剤形、具体的には錠剤(糖衣錠、フィルムコーティング錠を含む)、丸剤、顆粒剤、散剤、カプセル剤(ソフトカプセル剤を含む)、シロップ剤、乳剤、懸濁剤などがあげられる。かかる組成物は自体公知の方法によって製造され、製剤分野において通常用いられる担体、希釈剤もしくは賦形剤を含有するものである。例えば、錠剤用の担体、賦形剤としては、乳糖、でんぷん、蔗糖、ステアリン酸マグネシウムなどが用いられる。
非経口投与のための組成物としては、例えば、注射剤、坐剤などが用いられ、注射剤は静脈注射剤、皮下注射剤、皮内注射剤、筋肉注射剤、点滴注射剤、関節内注射剤などの剤形を包含する。かかる注射剤は、自体公知の方法に従って、例えば、上記抗体またはその塩を通常注射剤に用いられる無菌の水性もしくは油性液に溶解、懸濁または乳化することによって調製する。注射用の水性液としては、例えば、生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液などが用いられ、適当な溶解補助剤、例えば、アルコール(例、エタノール)、ポリアルコール(例、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール)、非イオン界面活性剤〔例、ポリソルベート80、HCO−50(polyoxyethylene(50mol)adduct of hydrogenated castor oil)〕などと併用してもよい。油性液としては、例えば、ゴマ油、大豆油などが用いられ、溶解補助剤として安息香酸ベンジル、ベンジルアルコールなどを併用してもよい。調製された注射液は、通常、適当なアンプルに充填される。
直腸投与に用いられる坐剤は、上記抗体またはその塩を通常の坐薬用基剤に混合することによって調製される。
For example, compositions for oral administration include solid or liquid dosage forms, specifically tablets (including sugar-coated tablets and film-coated tablets), pills, granules, powders, capsules (including soft capsules). Syrup, emulsion, suspension and the like. Such a composition is produced by a method known per se, and contains a carrier, diluent or excipient usually used in the pharmaceutical field. For example, lactose, starch, sucrose, magnesium stearate and the like are used as carriers and excipients for tablets.
As a composition for parenteral administration, for example, injections, suppositories and the like are used, and injections are intravenous injections, subcutaneous injections, intradermal injections, intramuscular injections, intravenous injections, intraarticular injections. Includes dosage forms such as agents. Such an injection is prepared according to a method known per se, for example, by dissolving, suspending or emulsifying the above antibody or a salt thereof in a sterile aqueous or oily liquid usually used for injection. As an aqueous solution for injection, for example, isotonic solutions containing physiological saline, glucose and other adjuvants are used, and appropriate solubilizers such as alcohol (eg, ethanol), polyalcohol (eg, Propylene glycol, polyethylene glycol), nonionic surfactants (eg, polysorbate 80, HCO-50 (polyoxyethylene (50 mol) adduct of hydrogenated castor oil)) and the like may be used in combination. As the oily liquid, for example, sesame oil, soybean oil and the like are used, and benzyl benzoate, benzyl alcohol and the like may be used in combination as a solubilizing agent. The prepared injection solution is usually filled in a suitable ampoule.
A suppository used for rectal administration is prepared by mixing the above-described antibody or a salt thereof with a normal suppository base.
上記の経口用または非経口用医薬組成物は、活性成分の投与量に適合するような投薬単位の剤形に調製されることが好都合である。かかる投薬単位の剤形としては、錠剤、丸剤、カプセル剤、注射剤(アンプル)、坐剤などが例示され、それぞれの投薬単位剤形当たり通常5〜500mg、とりわけ注射剤では5〜100mg、その他の剤形では10〜250mgの上記抗体が含有されていることが好ましい。
なお前記した各組成物は、上記抗体との配合により好ましくない相互作用を生じない限り他の活性成分を含有してもよい。
このようにして得られる製剤は安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは温血動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、トリ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)に対して経口的にまたは非経口的に投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、その作用、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、大腸癌の治療の目的で本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)においては、一日につき該化合物またはその塩を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物またはその塩の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、大腸癌の治療の目的で本発明のタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)に投与する場合、一日につき該化合物またはその塩を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を癌病変部に注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
また、上記化合物は、既存の抗癌剤〔例、アルキル化剤(例、シクロフォスファミド、ブスルファン、メルファランなど)、代謝拮抗剤(例、シタラビン、6−メルカプトプリン、メソトレキサート、5−フルオロウラシルなど)、抗癌性抗生物質(例、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ピラルビシン、ミトキサントロン、イダルビシン、マイトマイシン、アドリアマイシンなど)、植物由来抗癌剤(例、ビンクリスチン、ビンデシン、タキソール、エトポシドなど)、酵素製剤(例、L-アスパラギナーゼなど)、副腎皮質ホルモン薬(例、プレドニゾロン、プレドニゾン、デキサメタゾン、酢酸コルチゾンなど)、エストロゲン薬(例、エストラジオール、エチニルエストラジオール、ホスフェストロール、クロロトリアニセンなど)、抗エストロゲン薬(例、エピチオスタノール、メピチオスタン、タモキシフェン、クロミフェンなど)、黄体ホルモン薬(例、カプロン酸ヒドロキシプロゲステロン、ジドロゲステロン、メドロキシプロゲステロン、ノルエチステロン、ノルエチンドロンなど)、LHRH誘導体(例、酢酸リュープロレリンなど)、シスプラチン、カルボプラチン、トランスレチノイン酸、インターフェロンα、イマチニブなど〕と組
み合わせて用いることができる。この際、投与時期は限定されず、これらを投与対象に対し、同時に投与してもよいし、時間差をおいて投与してもよい。投与量は、臨床上用いられている用量を基準として適宜選択することができる。また、上記化合物と抗癌剤の配合比は、投与対象、投与ルート、対象疾患、症状、組み合わせ等に応じて適宜選択することができる。
The above oral or parenteral pharmaceutical compositions are conveniently prepared in dosage unit form to suit the dosage of the active ingredient. Examples of the dosage form of such a dosage unit include tablets, pills, capsules, injections (ampoules), suppositories, etc., and usually 5 to 500 mg, especially 5 to 100 mg for injections, Other dosage forms preferably contain 10 to 250 mg of the above antibody.
Each of the above-described compositions may contain other active ingredients as long as they do not cause an unfavorable interaction by blending with the antibody.
Since the preparation thus obtained is safe and has low toxicity, for example, humans or warm-blooded animals (eg, mice, rats, rabbits, sheep, pigs, cows, horses, birds, cats, dogs, monkeys, chimpanzees, etc. ) Orally or parenterally.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on its action, target disease, administration subject, administration route, etc. For example, a compound or salt thereof that inhibits the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating colorectal cancer, for example. In general, in an adult (with a body weight of 60 kg), about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 Administer ~ 20 mg. When administered parenterally, the single dose of the compound or a salt thereof varies depending on the administration subject, target disease, etc., for example, a compound that inhibits the activity of the protein of the present invention for the purpose of treating colon cancer Or when the salt is administered to an adult (usually 60 kg body weight) in the form of an injection, the compound or salt thereof is about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably per day. It is convenient to administer about 0.1 to 10 mg to a cancer lesion site by injection. In the case of other animals, an amount converted per 60 kg body weight can be administered.
In addition, the above compound is an existing anticancer agent [eg, alkylating agent (eg, cyclophosphamide, busulfan, melphalan, etc.), antimetabolite (eg, cytarabine, 6-mercaptopurine, methotrexate, 5-fluorouracil, etc.) , Anticancer antibiotics (eg, daunorubicin, doxorubicin, pirarubicin, mitoxantrone, idarubicin, mitomycin, adriamycin, etc.), plant-derived anticancer agents (eg, vincristine, vindesine, taxol, etoposide, etc.), enzyme preparations (eg, L- Asparaginase), corticosteroids (eg, prednisolone, prednisone, dexamethasone, cortisone acetate), estrogen (eg, estradiol, ethinylestradiol, phosfestol, chlorotrianicene), Estrogen drugs (eg, epithiostanol, mepithiostane, tamoxifen, clomiphene, etc.), luteinizing hormone drugs (eg, hydroxyprogesterone caproate, didogesterone, medroxyprogesterone, norethisterone, norethindrone, etc.), LHRH derivatives (eg, leuprorelin acetate, etc.) ), Cisplatin, carboplatin, transretinoic acid, interferon α, imatinib, etc.]. In this case, the administration time is not limited, and these may be administered simultaneously to the administration subject or may be administered with a time difference. The dose can be appropriately selected based on the clinically used dose. Moreover, the compounding ratio of the said compound and anticancer agent can be suitably selected according to an administration subject, administration route, an object disease, a symptom, a combination, etc.
(2)本発明のタンパク質、その部分ペプチドまたはその塩の定量
本発明のタンパク質に対する抗体(以下、本発明の抗体と略記する場合がある)は、本発明のタンパク質を特異的に認識することができるので、被検液中の本発明のタンパク質の定量、特にサンドイッチ免疫測定法による定量などに使用することができる。
すなわち、本発明は、
(i)本発明の抗体と、被検液および標識化された本発明のタンパク質とを競合的に反応させ、該抗体に結合した標識化された本発明のタンパク質の割合を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法、および
(ii)被検液と担体上に不溶化した本発明の抗体および標識化された本発明の別の抗体とを同時あるいは連続的に反応させたのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することを特徴とする被検液中の本発明のタンパク質の定量法を提供する。
上記(ii)の定量法においては、一方の抗体が本発明のタンパク質のN端部を認識する抗体で、他方の抗体が本発明のタンパク質のC端部に反応する抗体であることが望ましい。
また、本発明のタンパク質に対するモノクローナル抗体(以下、本発明のモノクローナル抗体と称する場合がある)を用いて本発明のタンパク質の定量を行なえるほか、組織染色等による検出を行なうこともできる。これらの目的には、抗体分子そのものを用いてもよく、また、抗体分子のF(ab')2 、Fab'またはFab画分を用いてもよい。
本発明の抗体を用いる本発明のタンパク質の定量法は、特に制限されるべきものではなく、被測定液中の抗原量(例えば、タンパク質量)に対応した抗体、抗原もしくは抗体−抗原複合体の量を化学的または物理的手段により検出し、これを既知量の抗原を含む標準液を用いて作製した標準曲線より算出する測定法であれば、いずれの測定法を用いてもよい。例えば、ネフロメトリー、競合法、イムノメトリック法およびサンドイッチ法が好適に用いられるが、感度、特異性の点で、後述するサンドイッチ法を用いるのが特に好ましい。
標識物質を用いる測定法に用いられる標識剤としては、例えば、放射性同位元素(例、
〔125I〕、〔131I〕、〔3H〕、〔14C〕、〔32P〕、〔33P〕、〔35S〕など)、蛍光物質〔
例、シアニン蛍光色素(例、Cy2、Cy3、Cy5、Cy5.5、Cy7(アマシャムバイオサイエンス社製)など)、フルオレスカミン、フルオレッセンイソチオシアネート、NBD (7-nitrobenz-2-oxa-1,3-diazol)など〕、酵素(例、β−ガラクトシダーゼ、β−グルコシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、パーオキシダーゼ、リンゴ酸脱水素酵素など)、発光物質(例、ルミノール、ルミノール誘導体、ルシフェリン、ルシゲニンなど)、ビオチン、ランタニド元素などが用いられる。さらに、抗体または抗原と標識剤との結合にビオチン−アビジン系を用いることもできる。
(2) Quantification of the protein of the present invention, a partial peptide thereof or a salt thereof The antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes abbreviated as the antibody of the present invention) can specifically recognize the protein of the present invention. Therefore, it can be used for quantification of the protein of the present invention in a test solution, particularly quantification by sandwich immunoassay.
That is, the present invention
(I) The antibody of the present invention is competitively reacted with a test solution and the labeled protein of the present invention, and the ratio of the labeled protein of the present invention bound to the antibody is measured. And (ii) the test solution and the antibody of the present invention insolubilized on the carrier and the labeled another antibody of the present invention simultaneously or successively. Provided is a method for quantifying the protein of the present invention in a test solution, characterized by measuring the activity of a labeling agent on an insolubilized carrier after the reaction.
In the above quantification method (ii), it is desirable that one antibody is an antibody that recognizes the N-terminal part of the protein of the present invention and the other antibody is an antibody that reacts with the C-terminal part of the protein of the present invention.
In addition to quantification of the protein of the present invention using a monoclonal antibody against the protein of the present invention (hereinafter sometimes referred to as the monoclonal antibody of the present invention), detection by tissue staining or the like can also be performed. For these purposes, the antibody molecule itself may be used, or F (ab ′) 2 , Fab ′ or Fab fraction of the antibody molecule may be used.
The method for quantifying the protein of the present invention using the antibody of the present invention is not particularly limited, and an antibody, antigen or antibody-antigen complex corresponding to the amount of antigen (for example, the amount of protein) in the solution to be measured is not limited. Any measurement method may be used as long as it is a measurement method in which the amount is detected by chemical or physical means and calculated from a standard curve prepared using a standard solution containing a known amount of antigen. For example, nephrometry, competition method, immunometric method and sandwich method are preferably used, but the sandwich method described later is particularly preferable in view of sensitivity and specificity.
Examples of the labeling agent used in the measurement method using the labeling substance include radioisotopes (eg,
[125 I], [131 I], [3 H], [14 C], [32 P], [33 P] and [35 S]), a fluorescent substance [
Examples, cyanine fluorescent dyes (eg, Cy2, Cy3, Cy5, Cy5.5, Cy7 (manufactured by Amersham Biosciences)), fluorescamine, fluorescein isothiocyanate, NBD (7-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazol), enzymes (eg, β-galactosidase, β-glucosidase, alkaline phosphatase, peroxidase, malate dehydrogenase, etc.), luminescent substances (eg, luminol, luminol derivatives, luciferin, lucigenin, etc.), biotin Lanthanide elements are used. Furthermore, a biotin-avidin system can also be used for binding of an antibody or antigen to a labeling agent.
抗原あるいは抗体の不溶化に当っては、物理吸着を用いてもよく、また通常タンパク質あるいは酵素等を不溶化、固定化するのに用いられる化学結合を用いる方法でもよい。担体としては、アガロース、デキストラン、セルロースなどの不溶性多糖類、ポリスチレン、ポリアクリルアミド、シリコン等の合成樹脂、あるいはガラス等が挙げられる。
サンドイッチ法においては不溶化した本発明のモノクローナル抗体に被検液を反応させ(1次反応)、さらに標識化した別の本発明のモノクローナル抗体を反応させ(2次反応)たのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することにより被検液中の本発明のタンパク質量を定量することができる。1次反応と2次反応は逆の順序に行っても、また、同時に行なってもよいし時間をずらして行なってもよい。標識化剤および不溶化の方法は前記のそれらに準じることができる。また、サンドイッチ法による免疫測定法において、固相用抗体あるいは標識用抗体に用いられる抗体は必ずしも1種類である必要はなく、測定感度を向上させる等の目的で2種類以上の抗体の混合物を用いてもよい。
本発明のサンドイッチ法による本発明のタンパク質の測定法においては、1次反応と2次反応に用いられる本発明のモノクローナル抗体は、本発明のタンパク質の結合する部位が相異なる抗体が好ましく用いられる。すなわち、1次反応および2次反応に用いられる抗体は、例えば、2次反応で用いられる抗体が、本発明のタンパク質のC端部を認識する場合、1次反応で用いられる抗体は、好ましくはC端部以外、例えばN端部を認識する抗体が用いられる。
For insolubilization of an antigen or antibody, physical adsorption may be used, or a method using a chemical bond usually used to insolubilize or immobilize a protein or an enzyme may be used. Examples of the carrier include insoluble polysaccharides such as agarose, dextran, and cellulose, synthetic resins such as polystyrene, polyacrylamide, and silicon, or glass.
In the sandwich method, the test solution is reacted with the insolubilized monoclonal antibody of the present invention (primary reaction), and further labeled with another monoclonal antibody of the present invention (secondary reaction), and then on the insolubilized carrier. By measuring the activity of the labeling agent, the amount of the protein of the present invention in the test solution can be quantified. The primary reaction and the secondary reaction may be performed in the reverse order, or may be performed simultaneously or at different times. The labeling agent and the insolubilization method can be the same as those described above. In the immunoassay by the sandwich method, the antibody used for the solid phase antibody or the labeling antibody is not necessarily one type, and a mixture of two or more types of antibodies is used for the purpose of improving measurement sensitivity. May be.
In the method for measuring the protein of the present invention by the sandwich method of the present invention, the monoclonal antibody of the present invention used for the primary reaction and the secondary reaction is preferably an antibody having a different site to which the protein of the present invention binds. That is, the antibody used in the primary reaction and the secondary reaction, for example, when the antibody used in the secondary reaction recognizes the C-terminus of the protein of the present invention, the antibody used in the primary reaction is preferably For example, an antibody that recognizes the N end other than the C end is used.
本発明のモノクローナル抗体をサンドイッチ法以外の測定システム、例えば、競合法、イムノメトリック法あるいはネフロメトリーなどに用いることができる。
競合法では、被検液中の抗原と標識抗原とを抗体に対して競合的に反応させたのち、未反応の標識抗原(F)と、抗体と結合した標識抗原(B)とを分離し(B/F分離)、B,Fいずれかの標識量を測定し、被検液中の抗原量を定量する。本反応法には、抗体として可溶性抗体を用い、B/F分離をポリエチレングリコール、前記抗体に対する第2抗体などを用いる液相法、および、第1抗体として固相化抗体を用いるか、あるいは、第1抗体は可溶性のものを用い第2抗体として固相化抗体を用いる固相化法とが用いられる。
イムノメトリック法では、被検液中の抗原と固相化抗原とを一定量の標識化抗体に対して競合反応させた後固相と液相を分離するか、あるいは、被検液中の抗原と過剰量の標識化抗体とを反応させ、次に固相化抗原を加え未反応の標識化抗体を固相に結合させたのち、固相と液相を分離する。次に、いずれかの相の標識量を測定し被検液中の抗原量を定量する。
また、ネフロメトリーでは、ゲル内あるいは溶液中で抗原抗体反応の結果生じた不溶性の沈降物の量を測定する。被検液中の抗原量が僅かであり、少量の沈降物しか得られない場合にもレーザーの散乱を利用するレーザーネフロメトリーなどが好適に用いられる。
The monoclonal antibody of the present invention can be used in measurement systems other than the sandwich method, for example, competitive method, immunometric method, nephrometry, and the like.
In the competition method, the antigen in the test solution and the labeled antigen are reacted competitively with the antibody, and then the unreacted labeled antigen (F) and the labeled antigen (B) bound to the antibody are separated. (B / F separation), the amount of labeling of either B or F is measured, and the amount of antigen in the test solution is quantified. In this reaction method, a soluble antibody is used as an antibody, B / F separation is performed using polyethylene glycol, a liquid phase method using a second antibody against the antibody, and a solid-phased antibody is used as the first antibody, or As the first antibody, a soluble method is used, and a solid phase method using a solid phase antibody as the second antibody is used.
In the immunometric method, the antigen in the test solution and the immobilized antigen are subjected to a competitive reaction with a certain amount of labeled antibody, and then the solid phase and the liquid phase are separated, or the antigen in the test solution is separated. And an excess amount of the labeled antibody are reacted, and then the solid phase antigen is added to bind the unreacted labeled antibody to the solid phase, and then the solid phase and the liquid phase are separated. Next, the labeled amount of any phase is measured to quantify the amount of antigen in the test solution.
In nephrometry, the amount of insoluble precipitate produced as a result of the antigen-antibody reaction in a gel or solution is measured. Laser nephrometry using laser scattering is preferably used even when the amount of antigen in the test solution is small and only a small amount of precipitate is obtained.
これら個々の免疫学的測定法を本発明の定量方法に適用するにあたっては、特別の条件、操作等の設定は必要とされない。それぞれの方法における通常の条件、操作法に当業者の通常の技術的配慮を加えて本発明のタンパク質の測定系を構築すればよい。これらの一般的な技術手段の詳細については、総説、成書などを参照することができる。
例えば、入江 寛編「ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和49年発行)、入江 寛編「続ラジオイムノアッセイ」(講談社、昭和54年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(医学書院、昭和53年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第2版)(医学書院、昭和57年発行)、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」(第3版)(医学書院、昭和62年発行)、「Methods in ENZYMOLOGY」 Vol. 70(Immunochemical Techniques(Part A))、 同書 Vol. 73(Immunochemical Techniques(Part B))、 同書 Vol. 74(Immunochemical Techniques(Part C))、 同書 Vol. 84(Immunochemical Techniques(Part D:Selected Immunoassays))、 同書 Vol. 92(Immunochemical Techniques(Part E:Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods))、 同書 Vol. 121(Immunochemical Techniques(Part I:Hybridoma Technology and Monoclonal Antibodies))(以上、アカデミックプレス社発行)などを参照することができる。
以上のようにして、本発明の抗体を用いることによって、本発明のタンパク質を感度良く定量することができる。
また、本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在する本発明のタンパク質を検出するために使用することができる。また、本発明のタンパク質を精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中の本発明のタンパク質の検出、被検細胞内における本発明のタンパク質の挙動の分析などのために使用することができる。
In applying these individual immunological measurement methods to the quantification method of the present invention, special conditions, operations and the like are not required to be set. What is necessary is just to construct | assemble the measurement system of the protein of this invention, adding the usual technical consideration of those skilled in the art to the usual conditions and operation methods in each method. For details of these general technical means, it is possible to refer to reviews, books and the like.
For example, Hiroshi Irie “Radioimmunoassay” (Kodansha, published in 1974), Hiroshi Irie “Sequel Radioimmunoassay” (published in Kodansha, 1979), “Enzyme Immunoassay” edited by Eiji Ishikawa et al. 53), "Enzyme Immunoassay" edited by Eiji Ishikawa et al. (2nd edition) (Medical Shoin, published in 1982), "Enzyme Immunoassay" edited by Eiji Ishikawa et al. (3rd edition) (Medical Shoin, Showa) 62), “Methods in ENZYMOLOGY” Vol. 70 (Immunochemical Techniques (Part A)), Id. Vol. 73 (Immunochemical Techniques (Part B)), Id. Vol. 74 (Immunochemical Techniques (Part C)), Id. 84 (Immunochemical Techniques (Part D: Selected Immunoassays)), ibid.Vol. 92 (Immunochemical Techniques (Part E: Monoclonal Antibodies and General Immunoassay Methods)), ibid. )) (From Academic Press ) And the like can be referred to.
As described above, the protein of the present invention can be quantified with high sensitivity by using the antibody of the present invention.
The antibody of the present invention can be used for detecting the protein of the present invention present in a subject such as a body fluid or tissue. In addition, for the production of an antibody column used for purifying the protein of the present invention, detection of the protein of the present invention in each fraction during purification, analysis of the behavior of the protein of the present invention in a test cell, etc. Can be used.
(3)大腸癌の診断薬及び診断方法
本発明のタンパク質をコードするDNA(本発明のDNA)は、例えば、プローブとして使用することにより、ヒトまたは温血動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)における本発明のタンパク質またはその部分ペプチドをコードするDNAまたはmRNAの異常(遺伝子異常)を検出することができるので、例えば、該DNAまたはmRNAの損傷、突然変異あるいは発現低下や、該DNAまたはmRNAの増加あるいは発現過多などの遺伝子診断薬として有用である。
本発明のDNAを用いる上記の遺伝子診断は、例えば、自体公知のノーザンハイブリダイゼーションやPCR-SSCP法(Genomics,第5巻,874〜879頁, 1989年、Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,第86巻,2766〜2770頁,1989年)などにより実施することができる。
例えば、ノーザンハイブリダイゼーションにより発現過多が検出された場合やPCR-SSCP法によりDNAの突然変異が検出された場合は、大腸癌である可能性が高いと診断することができる。
(3) Colorectal cancer diagnostic agent and diagnostic method DNA encoding the protein of the present invention (DNA of the present invention) can be used, for example, as a probe to allow humans or warm-blooded animals (eg, rats, mice, guinea pigs, (Abnormality of a DNA or mRNA encoding a protein of the present invention or a partial peptide thereof (gene abnormality) in a rabbit, bird, sheep, pig, cow, horse, cat, dog, monkey, chimpanzee, etc.) For example, it is useful as a genetic diagnostic agent for damaging, mutating or reducing expression of the DNA or mRNA, and increasing or overexpressing the DNA or mRNA.
The above gene diagnosis using the DNA of the present invention includes, for example, known Northern hybridization and PCR-SSCP method (Genomics, Vol. 5, pp. 874-879, 1989, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States). States of America, 86, 2766-2770, 1989).
For example, when an overexpression is detected by Northern hybridization or a DNA mutation is detected by the PCR-SSCP method, it can be diagnosed that there is a high possibility of colorectal cancer.
具体的には、LEFTB、FOXA2、S100P、CTSE、NOX1、CDH3、KLK10、DUOX2、S100A2、GABRP、MSLN、FAIM2およびTACSTD2は大腸癌の腫瘍組織で発現が上昇しているので、例えば、ノーザンハイブリダイゼーションによりこれらのタンパク質の翻訳鋳型となるmRNAが検出されたり、その発現量が高いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が高い、大腸癌に罹患している、大腸癌の再発の可能性が高い、予後が良好ではない、転移の可能性が高い、悪性度が高いなどと診断、判定、予測または分類することができる。また、これらのタンパク質の翻訳鋳型となるmRNAが検出されなかったり、その発現量が低いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が低い、大腸癌に罹患していない、大腸癌の再発の可能性が低い、予後が良好である、転移の可能性が低い、悪性度が低いなどと診断、判定、予測または分類することができる。
他方、CEACAM1は、大腸癌の腫瘍組織で発現が低下しているので、例えば、ノーザンハイブリダイゼーションによりこれらのタンパク質の翻訳鋳型となるmRNAが検出されたり、その発現量が高いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が低い、大腸癌に罹患していない、大腸癌の再発の可能性が低い、予後が良好である、転移の可能性が低い、悪性度が低いなどと診断、判定、予測または分類することができる。また、これらのタンパク質の翻訳鋳型となるmRNAが検出されなかったり、その発現量が低いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が高い、大腸癌に罹患している、大腸癌の再発の可能性が高い、予後が良好ではない、転移の可能性が高い、悪性度が高いなどと診断、判定、予測または分類することができる。
Specifically, LEFTB, FOXA2, S100P, CTSE, NOX1, CDH3, KLK10, DUOX2, S100A2, GABRP, MSLN, FAIM2, and TACSTD2 are upregulated in colon cancer tumor tissue, for example, Northern hybridization When mRNA that is a translation template for these proteins is detected or the expression level is recognized to be high, for example, there is a high possibility of having colorectal cancer, colorectal cancer, recurrence of colorectal cancer Can be diagnosed, determined, predicted or classified as having a high probability of metastasis, poor prognosis, high possibility of metastasis, high malignancy, and the like. In addition, when mRNA serving as a translation template for these proteins is not detected or its expression level is recognized to be low, for example, it is less likely to suffer from colorectal cancer, colorectal cancer, colon cancer Can be diagnosed, determined, predicted or classified as having a low probability of recurrence, good prognosis, low probability of metastasis, low grade of malignancy, etc.
On the other hand, since CEACAM1 has decreased expression in tumor tissue of colorectal cancer, for example, when mRNA serving as a translation template of these proteins is detected by Northern hybridization, or its expression level is recognized as high, For example, diagnosed as having a low likelihood of developing colorectal cancer, not having colorectal cancer, low likelihood of recurrence of colorectal cancer, good prognosis, low probability of metastasis, low malignancy, etc. Can be determined, predicted or classified. In addition, when mRNA serving as a translation template for these proteins is not detected or the expression level is recognized to be low, for example, it is highly probable to have colorectal cancer, colorectal cancer, colorectal cancer Can be diagnosed, determined, predicted, or classified as having a high probability of recurrence, poor prognosis, high possibility of metastasis, high malignancy, and the like.
また、(i) LEFTBの翻訳鋳型となるmRNA、FOXA2の翻訳鋳型となるmRNA、S100Pの翻訳鋳型となるmRNA、CTSEの翻訳鋳型となるmRNA、NOX1の翻訳鋳型となるmRNA、CDH3の翻訳鋳型となるmRNA、KLK10の翻訳鋳型となるmRNA、DUOX2の翻訳鋳型となるmRNA、S100A2の翻訳鋳型となるmRNA、GABRPの翻訳鋳型となるmRNA、MSLNの翻訳鋳型となるmRNA、FAIM2の翻訳鋳型となるmRNAおよびTACSTD2の翻訳鋳型となるmRNAから選ばれるいずれか二種以上の発現の有無もしくは発現量の高低、および/または(ii) CEACAM1の翻訳鋳型となるmRNAの発現の有無もしくは発現量の高低を公知の統計解析方法によって解析することにより、例えば、大腸癌の罹患の可能性、罹患の有無、再発の可能性の高低、予後の良悪、転移の可能性の高低、悪性度の高低などを診断、判定、予測または分類することもできる。公知の統計解析方法としては、例えば、(i)Gene Spring (Silicon Genetics社)のPredict Parameter Valueを用いる方法、(ii)leave-one-out cross-validation を用いたweighted voting cross-validation algorithm(Science, 286巻,531-537頁, 1999年)を用いる方法などがあげられる。このような統計解析方法を用いた診断、判定、予測または分類方法に用いられる本発明のDNAの種類・数には特に制限はないが、通常2種〜14種、好ましくは3種〜10種、より好ましくは4種〜8種、特に好ましくは5種〜7種のポリヌクレオチドを適宜選択して用いることができる。 In addition, (i) mRNA serving as a translation template for LEFTB, mRNA serving as a translation template for FOXA2, mRNA serving as a translation template for S100P, mRNA serving as a translation template for CTSE, mRNA serving as a translation template for NOX1, and a translation template for CDH3 MRNA, KLK10 translation template mRNA, DUOX2 translation template mRNA, S100A2 translation template mRNA, GABRP translation template mRNA, MSLN translation template mRNA, FAIM2 translation template mRNA And / or (2) the presence / absence or level of expression of any two or more selected from mRNA serving as a translation template for TACSTD2 and / or (ii) the presence / absence or level of expression of mRNA serving as a translation template for CEACAM1 Analysis, for example, the possibility of developing colorectal cancer, the presence or absence of disease, the possibility of recurrence, the prognosis, the possibility of metastasis Height, diagnosis and level of malignancy, the determination may be predicted or classified. Known statistical analysis methods include, for example, (i) a method using Gene Spring (Silicon Genetics) Predict Parameter Value, and (ii) a weighted voting cross-validation algorithm (Science using leave-one-out cross-validation). 286, 531-537, 1999). The type and number of the DNA of the present invention used in the diagnosis, determination, prediction or classification method using such a statistical analysis method is not particularly limited, but usually 2 to 14 types, preferably 3 to 10 types. More preferably, 4 to 8 and particularly preferably 5 to 7 polynucleotides can be appropriately selected and used.
上述の本発明のDNAと同様に、本発明の相補DNA、すなわち本発明で用いられるタンパク質の翻訳鋳型となるmRNAの塩基配列の相補配列全長またはその一部の塩基配列を含有するDNAも、例えば、プローブとして使用することにより、ヒトまたは温血動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、トリ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サル、チンパンジーなど)における本発明で用いられるタンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチド(好ましくは、DNAまたはmRNA)の発現の有無、発現量もしくは異常(遺伝子異常)を検出することができるので、例えば、該DNAまたはmRNAの発現の有無あるいは発現量に関連する疾患または状態や、該DNAまたはmRNAの損傷あるいは突然変異などの遺伝子診断薬として有用である。
本発明の相補DNAなどを大腸癌の罹患の可能性、罹患の有無、再発の可能性の高低、予後の良悪、転移の可能性の高低、悪性度の高低などの診断、判定、予測または分類に用いる場合、上述の本発明のポリヌクレオチドと同様にして使用することができる。
Similar to the above-described DNA of the present invention, the complementary DNA of the present invention, that is, the DNA containing the full-length complementary sequence of the base sequence of the mRNA used as the translation template of the protein used in the present invention or a partial base sequence thereof, for example, The protein used in the present invention in humans or warm-blooded animals (eg, rats, mice, guinea pigs, rabbits, birds, sheep, pigs, cows, horses, cats, dogs, monkeys, chimpanzees, etc.) Alternatively, since the presence / absence, expression level or abnormality (gene abnormality) of the polynucleotide (preferably DNA or mRNA) encoding the partial peptide can be detected, for example, the presence / absence or expression of the DNA or mRNA. Disease or condition related to the amount, or damage to the DNA or mRNA It is useful as a gene diagnostic agent, such as a mutation.
The complementary DNA of the present invention can be used to diagnose, determine, predict or predict the possibility of colorectal cancer, whether or not it is affected, the likelihood of recurrence, the prognosis, the possibility of metastasis, the degree of metastasis, and the like. When used for classification, it can be used in the same manner as the polynucleotide of the present invention described above.
また、本発明のDNA、本発明の相補DNAなどは、マイクロアレイに使用することができる。マイクロアレイ(好ましくはDNAマイクロアレイ)は、公知の方法またはそれに準じた方法によって調製し、使用し、そして分析することができる。マイクロアレイの調製、使用、分析方法などは、例えば、(i)DNA Microarrays: A Practical Approach(M. Schena編集、Oxford University Press, London、1999年)、(ii)Schena, M.ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、93巻、10614-10619頁、1996年、(iii)Heller, R. A.ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、94巻、2150-2155頁、1997年などに記載されている。
さらに、このような本発明のDNAマイクロアレイなどは、本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドの発現の有無もしくは発現量に関連する疾患または状態を診断するための診断用キットに使用することもできる。
Moreover, the DNA of the present invention, the complementary DNA of the present invention, and the like can be used for a microarray. A microarray (preferably a DNA microarray) can be prepared, used and analyzed by a known method or a method analogous thereto. Preparation, use, and analysis methods of microarrays are described in, for example, (i) DNA Microarrays: A Practical Approach (edited by M. Schena, Oxford University Press, London, 1999), (ii) Schena, M. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93, 10614-10619, 1996, (iii) Heller, RA et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 2150-2155, 1997, etc. ing.
Furthermore, such a DNA microarray of the present invention can also be used in a diagnostic kit for diagnosing a disease or condition related to the presence or absence or expression level of a polynucleotide encoding the protein of the present invention.
また、本発明で用いられる抗体は、上述のように本発明で用いられるタンパク質を検出または定量できるので、本発明のタンパク質の発現の有無もしくは発現量に関連する疾患または状態の診断などに使用することができる。
すなわち、本発明は、(i)本発明で用いられる抗体と、被検液および標識化された本発明で用いられるタンパク質とを競合的に反応させ、前記抗体に結合した標識化された本発明で用いられるタンパク質の割合を測定することを特徴とする被検液中の本発明で用いられるタンパク質の定量法、(ii)被検液と担体上に不溶化した本発明で用いられる抗体および標識化された本発明で用いられる別の抗体とを同時あるいは連続的に反応させたのち、不溶化担体上の標識剤の活性を測定することを特徴とする被検液中の本発明で用いられるタンパク質の定量法、および(iii)上記(i)または(ii)の定量法などを用いた本発明のタンパク質の発現の有無もしくは発現量に関連する疾患または状態の診断方法および診断薬を提供する。上記(ii)の定量法においては、一方の抗体が本発明で用いられるタンパク質のN端部を認識する抗体で、他方の抗体が本発明で用いられるタンパク質のC端部に反応する抗体であることが望ましい。
In addition, since the antibody used in the present invention can detect or quantify the protein used in the present invention as described above, it is used for diagnosis of diseases or conditions related to the presence or absence of the expression of the protein of the present invention or the expression level. be able to.
That is, the present invention provides (i) a labeled present invention that binds to the antibody by competitively reacting an antibody used in the present invention with a test solution and a labeled protein used in the present invention. (Ii) the antibody used in the present invention insolubilized on the test solution and the carrier and the labeling method, characterized by measuring the ratio of the protein used in Wherein the activity of the labeling agent on the insolubilized carrier is measured after reacting with another antibody used in the present invention simultaneously or continuously, Provided are a quantification method, and (iii) a diagnostic method and a diagnostic agent for a disease or condition related to the presence or absence or expression level of the protein of the present invention using the quantification method of (i) or (ii) above. In the quantification method (ii) above, one antibody is an antibody that recognizes the N-terminal part of the protein used in the present invention, and the other antibody is an antibody that reacts with the C-terminal part of the protein used in the present invention. It is desirable.
また、本発明で用いられる抗体は、抗体マイクロアレイ、すなわち基板上に固定された複数のまたは1つの抗体のアレイで形成された「抗体チップ」に使用することができる。このような抗体マイクロアレイは、公知の方法またはそれに準じた方法によって調製し、使用し、そして分析することができる。このような抗体マイクロアレイの調製、使用方法などは、例えば、(i)MacBeathおよびSchriber、Science、289、1760-1763頁、2000年、(ii)Haab, B. B.ら、Genome Biology、2(2)、2001年などに記載されている。
さらに、このような本発明の抗体マイクロアレイは、本発明のタンパク質の発現の有無もしくは発現量に関連する疾患または状態を診断するための診断用キットに使用することもできる。
The antibody used in the present invention can also be used in an antibody microarray, that is, an “antibody chip” formed of an array of a plurality of or one antibody immobilized on a substrate. Such an antibody microarray can be prepared, used and analyzed by a known method or a method analogous thereto. Preparation and use of such antibody microarrays are described in, for example, (i) MacBeath and Schriber, Science, 289, 1760-1763, 2000, (ii) Haab, BB et al., Genome Biology, 2 (2), It is described in 2001.
Furthermore, such an antibody microarray of the present invention can also be used in a diagnostic kit for diagnosing a disease or condition related to the presence or absence or expression level of the protein of the present invention.
LEFTB、FOXA2、S100P、CTSE、NOX1、CDH3、KLK10、DUOX2、S100A2、GABRP、MSLN、FAIM2およびTACSTD2は大腸癌の腫瘍組織で発現が上昇しているので、本発明で用いられる抗体を用いてこれらのタンパク質の濃度を定量することにより、これらのタンパク質が検出されたり、その発現量が高いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が高い、大腸癌に罹患している、大腸癌の再発の可能性が高い、予後が良好ではない、転移の可能性が高い、悪性度が高いなどと診断、判定、予測または分類することができる。また、これらのタンパク質が検出されなかったり、その発現量が低いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が低い、大腸癌に罹患していない、大腸癌の再発の可能性が低い、予後が良好である、転移の可能性が低い、悪性度が低いなどと診断、判定、予測または分類することができる。
他方、CEACAM1は、大腸癌の腫瘍組織で発現が低下しているので、本発明で用いられる抗体を用いてこれらのタンパク質の濃度を定量することにより、これらのタンパク質が検出されたり、その発現量が高いと認められた場合、例えば、大腸癌に罹患する可能性が低い、大腸癌に罹患していない、大腸癌の再発の可能性が低い、予後が良好である、転移の可能性が低い、悪性度が低いなどと診断、判定、予測または分類することができる。
また、(i) LEFTB、FOXA2、S100P、CTSE、NOX1、CDH3、KLK10、DUOX2、S100A2、GABRP、MSLN、FAIM2およびTACSTD2から選ばれるいずれか二種以上の発現の有無もしくは発現量の高低、(ii) CEACAM1の発現の有無もしくは発現量の高低などを、公知の統計解析方法によって解析することにより、例えば、大腸癌の罹患の可能性、罹患の有無、再発の可能性の高低、予後の良悪、転移の可能性の高低、悪性度の高低などを診断、判定、予測または分類することもできる。公知の統計解析方法としては、例えば、(i)Gene Spring (Silicon Genetics社)のPredict Parameter Valueを用いる方法、(ii)leave-one-out cross-validation を用いたweighted voting cross-validation algorithm(Science, 286巻,531-537頁, 1999年)を用いる方法などがあげられる。このような統計解析方法を用いた診断、判定、予測または分類方法に用いられる本発明のタンパク質の種類・数には特に制限はないが、通常2種〜14種、好ましくは3種〜10種、より好ましくは4種〜8種、特に好ましくは5種〜7種のタンパク質を適宜選択して用いることができる。
なお、本明細書において、「発現量が高い」または「発現量が低い」とは、絶対的な発現量の高低を意味するだけではなく、相対的な発現量の高低をも意味する。
Since the expression of LEFTB, FOXA2, S100P, CTSE, NOX1, CDH3, KLK10, DUOX2, S100A2, GABRP, MSLN, FAIM2 and TACSTD2 is increased in tumor tissues of colorectal cancer, these are used with the antibodies used in the present invention. By quantifying the protein concentration of these proteins, if these proteins are detected or the expression level is recognized to be high, for example, there is a high possibility of suffering from colon cancer, colon cancer, colon It can be diagnosed, determined, predicted or classified as having a high possibility of cancer recurrence, poor prognosis, high possibility of metastasis, high malignancy, and the like. In addition, when these proteins are not detected or are found to be low in expression level, for example, there is a low possibility of developing colorectal cancer, no colorectal cancer, or the possibility of recurrence of colorectal cancer. Diagnose, determine, predict or classify as low, good prognosis, low chance of metastasis, low malignancy, etc.
On the other hand, CEACAM1 has decreased expression in the tumor tissue of colorectal cancer, so by quantifying the concentration of these proteins using the antibody used in the present invention, these proteins can be detected and their expression levels Is found to be high, for example, low likelihood of developing colorectal cancer, no colorectal cancer, low likelihood of recurrence of colorectal cancer, good prognosis, low probability of metastasis It can be diagnosed, judged, predicted or classified as having a low malignancy.
In addition, (i) presence or absence of expression or expression level of any two or more selected from LEFTB, FOXA2, S100P, CTSE, NOX1, CDH3, KLK10, DUOX2, S100A2, GABRP, MSLN, FAIM2, and TACSTD, (ii ) Analyzing the presence or absence of CEACAM1 expression or the level of expression by known statistical analysis methods, for example, the possibility of developing colorectal cancer, the presence or absence of disease, the likelihood of recurrence, and the prognosis It is also possible to diagnose, determine, predict or classify the possibility of metastasis and the degree of malignancy. Known statistical analysis methods include, for example, (i) a method using Gene Spring (Silicon Genetics) Predict Parameter Value, and (ii) a weighted voting cross-validation algorithm (Science using leave-one-out cross-validation). 286, 531-537, 1999). The type and number of the protein of the present invention used in the diagnosis, determination, prediction or classification method using such a statistical analysis method is not particularly limited, but usually 2 to 14 types, preferably 3 to 10 types. More preferably, 4 to 8 proteins, particularly preferably 5 to 7 proteins can be appropriately selected and used.
In the present specification, “high expression level” or “low expression level” not only means absolute expression level, but also means relative expression level.
(4)アンチセンスポリヌクレオチドを含有する医薬
本発明のタンパク質AをコードするDNAに相補的に結合し、該DNAの発現を抑制することができる本発明のアンチセンスポリヌクレオチドは、癌細胞の増殖抑制作用、癌細胞のアポトーシス促進・亢進作用などを有し、低毒性であり、生体内における本発明のタンパク質または本発明のタンパク質AをコードするDNAの機能(例、抗アポトーシス活性、癌細胞増殖促進活性)を抑制することができるので、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。
上記アンチセンスポリヌクレオチドを上記の予防・治療剤として使用する場合、自体公知の方法に従って製剤化し、投与することができる。
また、例えば、前記のアンチセンスポリヌクレオチドを単独あるいはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターに挿入した後、常套手段に従って、ヒトまたは哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的に投与することができる。該アンチセンスポリヌクレオチドは、そのままで、あるいは摂取促進のために補助剤などの生理学的に認められる担体とともに製剤化し、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与できる。あるいは、エアロゾル化して吸入剤として気管内に局所投与することもできる。
さらに、体内動態の改良、半減期の長期化、細胞内取り込み効率の改善を目的に、前記のアンチセンスポリヌクレオチドを単独またはリポゾームなどの担体とともに製剤(注射剤)化し、静脈、皮下、関節腔内、癌病変部等に投与してもよい。
該アンチセンスポリヌクレオチドの投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、大腸癌の治療の目的で本発明のアンチセンスポリヌクレオチドを投与する場合、一般的に成人(体重60kg)においては、一日につき該アンチセンスポリヌクレオチドを約0.1〜100mg投与する。
さらに、該アンチセンスポリヌクレオチドは、組織や細胞における本発明のDNAの存在やその発現状況を調べるための診断用オリゴヌクレオチドプローブとして使用することもできる。
(4) Pharmaceutical containing antisense polynucleotide The antisense polynucleotide of the present invention capable of binding to DNA encoding the protein A of the present invention in a complementary manner and suppressing the expression of the DNA It has inhibitory action, cancer cell apoptosis promoting / promoting action, etc., has low toxicity, and functions of DNA encoding the protein of the present invention or protein A of the present invention in vivo (eg, anti-apoptotic activity, cancer cell proliferation) (Promoting activity) can be suppressed. For example, it can be used as a prophylactic / therapeutic agent for colon cancer, an apoptosis promoting agent for colon cancer cells, a growth inhibitor for colon cancer cells, a metastasis / recurrence inhibitor for colon cancer, etc. Can do.
When the antisense polynucleotide is used as the above-mentioned prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered according to a method known per se.
In addition, for example, after inserting the above-described antisense polynucleotide alone or into an appropriate vector such as a retrovirus vector, an adenovirus vector, an adenovirus associated virus vector, etc., a human or mammal (eg, rat, Rabbits, sheep, pigs, cows, cats, dogs, monkeys, etc.) orally or parenterally. The antisense polynucleotide can be formulated as it is or together with a physiologically recognized carrier such as an adjuvant for promoting ingestion, and can be administered by a gene gun or a catheter such as a hydrogel catheter. Alternatively, it can be aerosolized and locally administered into the trachea as an inhalant.
Furthermore, for the purpose of improving pharmacokinetics, prolonging the half-life, and improving the efficiency of cellular uptake, the above-mentioned antisense polynucleotides can be formulated (injection) alone or with a carrier such as liposome to produce veins, subcutaneouss, joint cavities Of these, it may be administered to cancerous lesions.
The dosage of the antisense polynucleotide varies depending on the target disease, administration subject, administration route, etc. For example, when the antisense polynucleotide of the present invention is administered for the purpose of treating colorectal cancer, In a body weight of 60 kg, about 0.1 to 100 mg of the antisense polynucleotide is administered per day.
Furthermore, the antisense polynucleotide can also be used as a diagnostic oligonucleotide probe for examining the presence and expression status of the DNA of the present invention in tissues and cells.
(4a)siRNA、shRNAなどを含有する医薬
上記アンチセンスポリヌクレオチドと同様に、本発明のタンパク質AをコードするRNAの一部を含有する二重鎖RNA(本発明のポリヌクレオチドに対するsiRNA(small (short) interfering RNA)、shRNA(small (short) hairpin RNA)など)、本発明のタンパク質をコードするRNAの一部を含有するリボザイムなども、本発明の遺伝子の発現を抑制することができ、生体内における本発明で用いられるタンパク質または本発明で用いられるDNAの機能を抑制することができるので、例えば、大腸癌の予防・治療剤、癌細胞のアポトーシス促進剤、癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。
二重鎖RNAは、公知の方法(例、Nature, 411巻, 494頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。
リボザイムは、公知の方法(例、TRENDS in Molecular Medicine, 7巻, 221頁, 2001年)に準じて、本発明のポリヌクレオチドの配列を基に設計して製造することができる。例えば、本発明のタンパク質をコードするRNAの一部に公知のリボザイムを連結することによって製造することができる。本発明のタンパク質をコードするRNAの一部としては、公知のリボザイムによって切断され得る本発明のRNA上の切断部位に近接した部分(RNA断片)が挙げられる。
上記の二重鎖RNAまたはリボザイムを上記予防・治療剤として使用する場合、アンチセンスポリヌクレオチドと同様にして製剤化し、投与することができる。
(4a) Pharmaceutical containing siRNA, shRNA, etc. Similar to the above-mentioned antisense polynucleotide, double-stranded RNA containing a part of RNA encoding protein A of the present invention (siRNA against the polynucleotide of the present invention (small ( short (interfering RNA), shRNA (small (short) hairpin RNA)), ribozymes containing a part of the RNA encoding the protein of the present invention can also suppress the expression of the gene of the present invention, Since the function of the protein used in the present invention or the DNA used in the present invention in the body can be suppressed, for example, a preventive / therapeutic agent for colon cancer, an apoptosis promoter for cancer cells, a growth inhibitor for cancer cells, a colon It can be used as a cancer metastasis / recurrence inhibitor.
Double-stranded RNA can be produced by designing based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, Nature, 411, 494, 2001).
The ribozyme can be designed and produced based on the sequence of the polynucleotide of the present invention according to a known method (eg, TRENDS in Molecular Medicine, 7, 221 pages, 2001). For example, it can be produced by linking a known ribozyme to a part of the RNA encoding the protein of the present invention. Examples of the RNA encoding the protein of the present invention include a portion (RNA fragment) adjacent to the cleavage site on the RNA of the present invention that can be cleaved by a known ribozyme.
When the above double-stranded RNA or ribozyme is used as the prophylactic / therapeutic agent, it can be formulated and administered in the same manner as the antisense polynucleotide.
(5)本発明の抗体を含有する医薬
本発明の抗体、例えば本発明のタンパク質Aの活性を中和する作用を有する抗体は、例えば、大腸癌の予防・治療剤、癌細胞のアポトーシス促進剤、癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤として使用することができる。
該抗体を含有する上記疾患の予防・治療剤は低毒性であり、そのまま液剤として、または適当な剤型の医薬組成物として、ヒトまたは哺乳動物(例、ラット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して経口的または非経口的(例、静脈注射)に投与することができる。投与量は、投与対象、対象疾患、症状、投与ルートなどによっても異なるが、例えば、成人の大腸癌の治療・予防のために使用する場合には、本発明の抗体を1回量として、通常0.01〜20mg/kg体重程度、好ましくは0.1〜10mg/kg体重程度、さらに好ましくは0.1〜5mg/kg体重程度を、1日1〜5回程度、好ましくは1日1〜3回程度、投与するのが好都合である。他の非経口投与および経口投与の場合もこれに準ずる量を投与することができる。症状が特に重い場合には、その症状に応じて増量してもよい。
該抗体は、それ自体または適当な医薬組成物として投与することができる。上記投与に用いられる医薬組成物は、上記抗体またはその塩と薬理学的に許容され得る担体、希釈剤もしくは賦形剤とを含むものである。かかる組成物は、経口または非経口投与(例、静脈注射)に適する剤形として提供される。好ましくは吸入剤として提供される。
なお前記した各組成物は、上記抗体との配合により好ましくない相互作用を生じない限り他の活性成分を含有してもよい。
(5) Pharmaceutical containing the antibody of the present invention The antibody of the present invention, for example, an antibody having an action of neutralizing the activity of protein A of the present invention is, for example, a preventive / therapeutic agent for colorectal cancer, an apoptosis promoting agent for cancer cells. It can be used as a cancer cell growth inhibitor and a colon cancer metastasis / recurrence inhibitor.
The prophylactic / therapeutic agent for the above-mentioned diseases containing the antibody has low toxicity and can be used as a liquid or as a pharmaceutical composition of an appropriate dosage form as a human or mammal (eg, rat, rabbit, sheep, pig, bovine, Cats, dogs, monkeys, etc.) or can be administered parenterally (eg, intravenous injection). The dose varies depending on the administration subject, target disease, symptom, administration route, etc. For example, when used for treatment / prevention of colorectal cancer in adults, the antibody of the present invention is usually used as a single dose. About 0.01-20 mg / kg body weight, preferably about 0.1-10 mg / kg body weight, more preferably about 0.1-5 mg / kg body weight, about 1-5 times a day, preferably 1 It is convenient to administer about 3 times. In the case of other parenteral administration and oral administration, an equivalent amount can be administered. When symptoms are particularly severe, the dose may be increased according to the symptoms.
The antibody can be administered per se or as a suitable pharmaceutical composition. The pharmaceutical composition used for the administration comprises the antibody or a salt thereof and a pharmacologically acceptable carrier, diluent or excipient. Such compositions are provided as dosage forms suitable for oral or parenteral administration (eg, intravenous injection). Preferably it is provided as an inhalant.
Each of the above-described compositions may contain other active ingredients as long as they do not cause an unfavorable interaction by blending with the antibody.
(6)DNA転移動物
本発明は、外来性の本発明のタンパク質をコードするDNA(以下、本発明の外来性DNAと略記する)またはその変異DNA(本発明の外来性変異DNAと略記する場合がある)を有する非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物、
(2)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である第(1)記載の動物、
(3)ゲッ歯動物がマウスまたはラットである第(2)記載の動物、および
(4)本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを含有し、哺乳動物において発現しうる組換えベクターを提供するものである。
本発明の外来性DNAまたはその変異DNAを有する非ヒト哺乳動物(以下、本発明のDNA転移動物と略記する)は、未受精卵、受精卵、精子およびその始原細胞を含む胚芽細胞などに対して、好ましくは、非ヒト哺乳動物の発生における胚発生の段階(さらに好ましくは、単細胞または受精卵細胞の段階でかつ一般に8細胞期以前)に、リン酸カルシウム法、電気パルス法、リポフェクション法、凝集法、マイクロインジェクション法、パーティクルガン法、DEAE−デキストラン法などにより目的とするDNAを転移することによって作出することができる。また、該DNA転移方法により、体細胞、生体の臓器、組織細胞などに目的とする本発明の外来性DNAを転移し、細胞培養、組織培養などに利用することもでき、さらに、これら細胞を上述の胚芽細胞と自体公知の細胞融合法により融合させることにより本発明のDNA転移動物を作出することもできる。
非ヒト哺乳動物としては、例えば、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、マウス、ラットなどが用いられる。なかでも、病体動物モデル系の作成の面から個体発生および生物サイクルが比較的短く、また、繁殖が容易なゲッ歯動物、とりわけマウス(例えば、純系として、C57BL/6系統,DBA2系統など、交雑系として、B6C3F1系統,BDF1系統,B6D2F1系統,BALB/c系統,ICR系統など)またはラット(例えば、Wistar,SDなど)などが好ましい。
哺乳動物において発現しうる組換えベクターにおける「哺乳動物」としては、上記の非ヒト哺乳動物の他にヒトなどがあげられる。
本発明の外来性DNAとは、非ヒト哺乳動物が本来有している本発明のDNAではなく、いったん哺乳動物から単離・抽出された本発明のDNAをいう。
本発明の変異DNAとしては、元の本発明のDNAの塩基配列に変異(例えば、突然変異など)が生じたもの、具体的には、塩基の付加、欠損、他の塩基への置換などが生じたDNAなどが用いられ、また、異常DNAも含まれる。
該異常DNAとしては、異常な本発明のタンパク質を発現させるDNAを意味し、例えば、正常な本発明のタンパク質の機能を抑制するタンパク質を発現させるDNAなどが用いられる。
本発明の外来性DNAは、対象とする動物と同種あるいは異種のどちらの哺乳動物由来のものであってもよい。本発明のDNAを対象動物に転移させるにあたっては、該DNAを動物細胞で発現させうるプロモーターの下流に結合したDNAコンストラクトとして用いるのが一般に有利である。例えば、本発明のヒトDNAを転移させる場合、これと相同性が高い本発明のDNAを有する各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のDNAを発現させうる各種プロモーターの下流に、本発明のヒトDNAを結合したDNAコンストラクト(例、ベクターなど)を対象哺乳動物の受精卵、例えば、マウス受精卵へマイクロインジェクションすることによって本発明のDNAを高発現するDNA転移哺乳動物を作出することができる。
(6) DNA-transferred animal In the present invention, a DNA encoding a foreign protein of the present invention (hereinafter abbreviated as a foreign DNA of the present invention) or a mutant DNA thereof (abbreviated as a foreign mutant DNA of the present invention) There is provided a non-human mammal having
That is, the present invention
(1) a non-human mammal having the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof,
(2) the animal according to (1), wherein the non-human mammal is a rodent;
(3) An animal according to (2), wherein the rodent is a mouse or a rat, and (4) a recombinant vector containing the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof and capable of being expressed in a mammal. Is.
A non-human mammal having the exogenous DNA of the present invention or a mutant DNA thereof (hereinafter abbreviated as the DNA-transferred animal of the present invention) is used for embryos including unfertilized eggs, fertilized eggs, spermatozoa and progenitor cells thereof. Preferably, at the stage of embryonic development in non-human mammal development (more preferably at the single cell or fertilized egg cell stage and generally prior to the 8-cell stage), the calcium phosphate method, electric pulse method, lipofection method, aggregation method, It can be produced by transferring the target DNA by the microinjection method, particle gun method, DEAE-dextran method or the like. Further, by the DNA transfer method, the target exogenous DNA of the present invention can be transferred to somatic cells, living organs, tissue cells, etc., and can be used for cell culture, tissue culture, etc. The DNA-transferred animal of the present invention can also be produced by fusing the above-mentioned embryo cells with a cell fusion method known per se.
Examples of non-human mammals include cows, pigs, sheep, goats, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, mice, rats and the like. Among them, rodents, especially mice (for example, C57BL / 6 strain, DBA2 strain, etc. as pure strains, etc.) that are relatively short in ontogenesis and biological cycle from the viewpoint of creating a disease animal model system and that are easy to reproduce. As the system, B6C3F 1 system, BDF 1 system, B6D2F 1 system, BALB / c system, ICR system, etc.) or rats (for example, Wistar, SD, etc.) are preferable.
Examples of the “mammal” in the recombinant vector that can be expressed in the mammal include humans and the like in addition to the above non-human mammals.
The exogenous DNA of the present invention is not the DNA of the present invention inherently possessed by a non-human mammal but the DNA of the present invention once isolated and extracted from the mammal.
Examples of the mutant DNA of the present invention include those in which a mutation (for example, mutation or the like) has occurred in the base sequence of the original DNA of the present invention, specifically, addition of a base, deletion, substitution to another base, etc. The resulting DNA is used, and abnormal DNA is also included.
The abnormal DNA means DNA that expresses the abnormal protein of the present invention, and for example, DNA that expresses a protein that suppresses the function of the normal protein of the present invention is used.
The exogenous DNA of the present invention may be derived from mammals of the same or different species as the target animal. In transferring the DNA of the present invention to a target animal, it is generally advantageous to use the DNA as a DNA construct bound downstream of a promoter that can be expressed in animal cells. For example, when transferring the human DNA of the present invention, expression of DNA derived from various mammals (for example, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) having the DNA of the present invention having high homology with the human DNA of the present invention. The DNA of the present invention is highly expressed by microinjecting a DNA construct (eg, a vector, etc.) in which the human DNA of the present invention is bound downstream of various promoters into a fertilized egg of a target mammal, such as a mouse fertilized egg. DNA transfer mammals can be created.
本発明のタンパク質の発現ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミド、酵母由来のプラスミド、λファージなどのバクテリオファージ、モロニー白血病ウィルスなどのレトロウィルス、ワクシニアウィルスまたはバキュロウィルスなどの動物ウイルスなどが用いられる。なかでも、大腸菌由来のプラスミド、枯草菌由来のプラスミドまたは酵母由来のプラスミドなどが好ましく用いられる。
上記のDNA発現調節を行なうプロモーターとしては、例えば、(i)ウイルス(例、シミアンウイルス、サイトメガロウイルス、モロニー白血病ウイルス、JCウイルス、乳癌ウイルス、ポリオウイルスなど)に由来するDNAのプロモーター、(ii)各種哺乳動物(ヒト、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来のプロモーター、例えば、アルブミン、インスリンII、ウロプラキンII、エラスターゼ、エリスロポエチン、エンドセリン、筋クレアチンキナーゼ、グリア線維性酸性タンパク質、グルタチオンS−トランスフェラーゼ、血小板由来成長因子β、ケラチンK1,K10およびK14、コラーゲンI型およびII型、サイクリックAMP依存タンパク質キナーゼβIサブユニット、ジストロフィン、酒石酸抵抗性アルカリフォスファターゼ、心房ナトリウム利尿性因子、内皮レセプターチロシンキナーゼ(一般にTie2と略される)、ナトリウムカリウムアデノシン3リン酸化酵素(Na,K−ATPase)、ニューロフィラメント軽鎖、メタロチオネインIおよびIIA、メタロプロティナーゼ1組織インヒビター、MHCクラスI抗原(H−2L)、H−ras、レニン、ドーパミンβ−水酸化酵素、甲状腺ペルオキシダーゼ(TPO)、ペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)、βアクチン、αおよびβミオシン重鎖、ミオシン軽鎖1および2、ミエリン基礎タンパク質、チログロブリン、Thy−1、免疫グロブリン、H鎖可変部(VNP)、血清アミロイドPコンポーネント、ミオグロビン、トロポニンC、平滑筋αアクチン、プレプロエンケファリンA、バソプレシンなどのプロモーターなどが用いられる。なかでも、全身で高発現することが可能なサイトメガロウイルスプロモーター、ヒトペプチド鎖延長因子1α(EF−1α)のプロモーター、ヒトおよびニワトリβアクチンプロモーターなどが好適である。
上記ベクターは、DNA転移哺乳動物において目的とするメッセンジャーRNAの転写を終結する配列(一般にターミネターと呼ばれる)を有していることが好ましく、例えば、ウイルス由来および各種哺乳動物由来の各DNAの配列を用いることができ、好ましくは、シミアンウイルスのSV40ターミネターなどが用いられる。
Examples of the expression vector for the protein of the present invention include plasmids derived from Escherichia coli, plasmids derived from Bacillus subtilis, plasmids derived from yeast, bacteriophages such as λ phage, retroviruses such as Moloney leukemia virus, animal viruses such as vaccinia virus and baculovirus. Etc. are used. Of these, plasmids derived from Escherichia coli, plasmids derived from Bacillus subtilis or plasmids derived from yeast are preferably used.
Examples of promoters that regulate DNA expression include (i) promoters of DNA derived from viruses (eg, simian virus, cytomegalovirus, Moloney leukemia virus, JC virus, breast cancer virus, poliovirus, etc.) ) Promoters derived from various mammals (human, rabbit, dog, cat, guinea pig, hamster, rat, mouse, etc.), such as albumin, insulin II, uroplakin II, elastase, erythropoietin, endothelin, muscle creatine kinase, glial fibrillary acidity Protein, glutathione S-transferase, platelet-derived growth factor β, keratin K1, K10 and K14, collagen type I and type II, cyclic AMP-dependent protein kinase βI subunit, dystroph , Tartrate-resistant alkaline phosphatase, atrial natriuretic factor, endothelial receptor tyrosine kinase (generally abbreviated as Tie2), sodium potassium adenosine 3 kinase (Na, K-ATPase), neurofilament light chain, metallothionein I And IIA, metalloproteinase 1 tissue inhibitor, MHC class I antigen (H-2L), H-ras, renin, dopamine β-hydroxylase, thyroid peroxidase (TPO), peptide chain elongation factor 1α (EF-1α), β Actin, α and β myosin heavy chain, myosin light chain 1 and 2, myelin basic protein, thyroglobulin, Thy-1, immunoglobulin, heavy chain variable region (VNP), serum amyloid P component, myoglobin, troponin C, smooth muscle α act , Pre-pro-enkephalin A, such as a promoter, such as vasopressin is used. Among these, the cytomegalovirus promoter capable of being highly expressed throughout the body, the human peptide chain elongation factor 1α (EF-1α) promoter, the human and chicken β-actin promoters, and the like are suitable.
The vector preferably has a sequence (generally called a terminator) that terminates transcription of a target messenger RNA in a DNA-transferred mammal. For example, the sequence of each DNA derived from viruses and various mammals The SV40 terminator of simian virus or the like is preferably used.
その他、目的とする外来性DNAをさらに高発現させる目的で各DNAのスプライシングシグナル、エンハンサー領域、真核DNAのイントロンの一部などをプロモーター領域の5'上流、プロモーター領域と翻訳領域間あるいは翻訳領域の3'下流 に連結することも目的により可能である。
正常な本発明のタンパク質の翻訳領域は、ヒトまたは各種哺乳動物(例えば、ウサギ、イヌ、ネコ、モルモット、ハムスター、ラット、マウスなど)由来の肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来DNAおよび市販の各種ゲノムDNAライブラリーよりゲノムDNAの全てあるいは一部として、または肝臓、腎臓、甲状腺細胞、線維芽細胞由来RNAより公知の方法により調製された相補DNAを原料として取得することが出来る。また、外来性の異常DNAは、上記の細胞または組織より得られた正常なタンパク質の翻訳領域を点突然変異誘発法により変異した翻訳領域を作製することができる。
該翻訳領域は転移動物において発現しうるDNAコンストラクトとして、前記のプロモーターの下流および所望により転写終結部位の上流に連結させる通常のDNA工学的手法により作製することができる。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの転移は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞のすべてに存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において、本発明の外来性DNAが存在することは、作出動物の後代がすべて、その胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを保持することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞のすべてに本発明の外来性DNAを有する。
本発明の外来性正常DNAを転移させた非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して、該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育することが出来る。
受精卵細胞段階における本発明の外来性DNAの転移は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに過剰に存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において本発明の外来性DNAが過剰に存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫はその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の外来性DNAを過剰に有する。
導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを過剰に有するように繁殖継代することができる。
In addition, the splicing signal of each DNA, enhancer region, a part of intron of eukaryotic DNA, etc. 5 ′ upstream of the promoter region, between the promoter region and the translation region or between the translation regions for the purpose of further expressing the target foreign DNA It is also possible to connect it 3 'downstream of the target.
The normal translation region of the protein of the present invention includes liver, kidney, thyroid cell, fibroblast-derived DNA derived from humans or various mammals (eg, rabbits, dogs, cats, guinea pigs, hamsters, rats, mice, etc.) and commercially available DNA. As a raw material, complementary DNA prepared by a known method as a whole or a part of genomic DNA or from RNA derived from liver, kidney, thyroid cells, or fibroblasts can be obtained. In addition, exogenous abnormal DNA can produce a translation region obtained by mutating a normal protein translation region obtained from the above cells or tissues by a point mutagenesis method.
The translation region can be prepared as a DNA construct that can be expressed in a metastasized animal by an ordinary DNA engineering technique in which it is linked downstream of the promoter and optionally upstream of the transcription termination site.
The transfer of the foreign DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the subject mammal. The presence of the exogenous DNA of the present invention in the embryo cells of the produced animal after the DNA transfer indicates that all the progeny of the produced animal retain the exogenous DNA of the present invention in all the germ cells and somatic cells. means. The offspring of this type of animal that has inherited the foreign DNA of the present invention has the foreign DNA of the present invention in all of its germ cells and somatic cells.
The non-human mammal to which the exogenous normal DNA of the present invention has been transferred can be subcultured in a normal breeding environment as the DNA-bearing animal after confirming that the exogenous DNA is stably retained by mating. .
The transfer of the exogenous DNA of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be excessively present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. Excessive exogenous DNA of the present invention is present in the germ cells of the produced animal after DNA transfer. This means that all the offspring of the produced animal have the exogenous DNA of the present invention in all the germ cells and somatic cells. Means. The offspring of this type of animal that has inherited the foreign DNA of the present invention has an excess of the foreign DNA of the present invention in all germ cells and somatic cells.
By obtaining a homozygous animal having the introduced DNA in both homologous chromosomes and mating the male and female animals, all the offspring can be bred and passaged so as to have the DNA in excess.
本発明の正常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の正常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を促進することにより最終的に本発明のタンパク質の機能亢進症を発症することがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の正常DNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能亢進症や、本発明のタンパク質が関連する疾患の病態機序の解明およびこれらの疾患の治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、本発明の外来性正常DNAを転移させた哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質に関連する疾患に対する予防・治療剤、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤のスクリーニング試験にも利用可能である。
一方、本発明の外来性異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、交配により外来性DNAを安定に保持することを確認して該DNA保有動物として通常の飼育環境で継代飼育する
ことが出来る。さらに、目的とする外来DNAを前述のプラスミドに組み込んで原科として用いることができる。プロモーターとのDNAコンストラク卜は、通常のDNA工学的手法によって作製することができる。受精卵細胞段階における本発明の異常DNAの転移は、対象哺乳動物の胚芽細胞および体細胞の全てに存在するように確保される。DNA転移後の作出動物の胚芽細胞において本発明の異常DNAが存在することは、作出動物の子孫が全てその胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有することを意味する。本発明の外来性DNAを受け継いだこの種の動物の子孫は、その胚芽細胞および体細胞の全てに本発明の異常DNAを有する。導入DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得し、この雌雄の動物を交配することによりすべての子孫が該DNAを有するように繁殖継代することができる。
In the non-human mammal having the normal DNA of the present invention, the normal DNA of the present invention is highly expressed, and finally the function of the endogenous normal DNA is promoted, thereby finally causing the hyperfunction of the protein of the present invention. It can develop and can be used as a disease model animal. For example, the normal DNA-transferred animal of the present invention can be used to elucidate the hyperfunction of the protein of the present invention, the pathological mechanism of the disease associated with the protein of the present invention, and the method of treatment for these diseases Is possible.
Further, since the mammal to which the foreign normal DNA of the present invention has been transferred has increased symptoms of the released protein of the present invention, a preventive / therapeutic agent for diseases related to the protein of the present invention, for example, colon cancer It can also be used in screening tests for prophylactic / therapeutic agents, colon cancer cell apoptosis promoters, colon cancer cell growth inhibitors, and colon cancer metastasis / relapse inhibitors.
On the other hand, the non-human mammal having the exogenous abnormal DNA of the present invention can be subcultured in a normal breeding environment as the DNA-bearing animal after confirming that the exogenous DNA is stably retained by mating. Furthermore, the target foreign DNA can be incorporated into the aforementioned plasmid and used as a raw material. A DNA construct with a promoter can be prepared by a normal DNA engineering technique. The abnormal DNA transfer of the present invention at the fertilized egg cell stage is ensured to be present in all germ cells and somatic cells of the target mammal. The presence of the abnormal DNA of the present invention in the embryo cell of the produced animal after DNA transfer means that all the offspring of the produced animal have the abnormal DNA of the present invention in all the germ cells and somatic cells. The offspring of this type of animal that has inherited the foreign DNA of the present invention has the abnormal DNA of the present invention in all of its germ cells and somatic cells. By obtaining a homozygous animal having the introduced DNA in both homologous chromosomes and mating the male and female animals, all the offspring can be bred and passaged so as to have the DNA.
本発明の異常DNAを有する非ヒト哺乳動物は、本発明の異常DNAが高発現させられており、内在性の正常DNAの機能を阻害することにより最終的に本発明のタンパク質の機能不活性型不応症となることがあり、その病態モデル動物として利用することができる。例えば、本発明の異常DNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症の病態機序の解明およびこの疾患を治療方法の検討を行なうことが可能である。
また、具体的な利用可能性としては、本発明の異常DNA高発現動物は、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症における本発明の異常タンパク質による正常タンパク質の機能阻害(dominant negative作用)を解明するモデルとなる。
また、本発明の外来異常DNAを転移させた哺乳動物は、遊離した本発明のタンパク質の増加症状を有することから、本発明のタンパク質または機能不活性型不応症に対する予防・治療剤、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤のスクリーニング試験にも利用可能である。
また、上記2種類の本発明のDNA転移動物のその他の利用可能性として、例えば、
(i)組織培養のための細胞源としての使用、
(ii)本発明のDNA転移動物の組織中のDNAもしくはRNAを直接分析するか、またはDNAにより発現されたペプチド組織を分析することによる、本発明のタンパク質により特異的に発現あるいは活性化するペプチドとの関連性についての解析、
(iii)DNAを有する組織の細胞を標準組織培養技術により培養し、これらを使用して、一般に培養困難な組織からの細胞の機能の研究、
(iv)上記(iii)記載の細胞を用いることによる細胞の機能を高めるような薬剤のスクリーニング、および
(v)本発明の変異タンパク質を単離精製およびその抗体作製などが考えられる。
In the non-human mammal having the abnormal DNA of the present invention, the abnormal DNA of the present invention is highly expressed, and finally the functional inactive form of the protein of the present invention is inhibited by inhibiting the function of the endogenous normal DNA. It may become refractory and can be used as a model animal for the disease state. For example, by using the abnormal DNA-transferred animal of the present invention, it is possible to elucidate the pathological mechanism of the functional inactive refractory of the protein of the present invention and to examine a method for treating this disease.
Further, as a specific applicability, the abnormal DNA high-expressing animal of the present invention exhibits the function inhibition (dominant negative action) of the normal protein by the abnormal protein of the present invention in the functional inactive refractory disease of the protein of the present invention. It becomes a model to elucidate.
Further, since the mammal to which the foreign abnormal DNA of the present invention has been transferred has an increased symptom of the released protein of the present invention, a preventive / therapeutic agent for the protein of the present invention or a functional inactive refractory disease, for example, the large intestine It can also be used in screening tests for cancer prevention / treatment agents, colon cancer cell apoptosis promoters, colon cancer cell growth inhibitors, and colon cancer metastasis / recurrence inhibitors.
Further, as other applicability of the above-mentioned two kinds of DNA transfer animals of the present invention, for example,
(I) use as a cell source for tissue culture;
(Ii) Peptides that are specifically expressed or activated by the protein of the present invention by directly analyzing DNA or RNA in the tissue of the DNA-transferred animal of the present invention or by analyzing peptide tissue expressed by the DNA Analysis of the relationship with
(Iii) culturing cells of a tissue having DNA by a standard tissue culture technique, and using them, studying the function of cells from tissues generally difficult to cultivate,
(Iv) Screening of drugs that enhance the function of cells by using the cells described in (iii) above, and (v) isolation and purification of the mutant protein of the present invention and production of antibodies thereof are conceivable.
さらに、本発明のDNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症などを含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の臨床症状を調べることができ、また、本発明のタンパク質に関連する疾患モデルの各臓器におけるより詳細な病理学的所見が得られ、新しい治療方法の開発、さらには、該疾患による二次的疾患の研究および治療に貢献することができる。
また、本発明のDNA転移動物から各臓器を取り出し、細切後、トリプシンなどのタンパク質分解酵素により、遊離したDNA転移細胞の取得、その培養またはその培養細胞の系統化を行なうことが可能である。さらに、本発明のタンパク質産生細胞の特定化、アポトーシス、分化あるいは増殖との関連性、またはそれらにおけるシグナル伝達機構を調べ、それらの異常を調べることなどができ、本発明のタンパク質およびその作用解明のための有効な研究材料となる。
さらに、本発明のDNA転移動物を用いて、本発明のタンパク質の機能不活性型不応症を含む、本発明のタンパク質に関連する疾患の治療薬の開発を行なうために、上述の検査法および定量法などを用いて、有効で迅速な該疾患治療薬のスクリーニング法を提供することが可能となる。また、本発明のDNA転移動物または本発明の外来性DNA発現ベクターを用いて、本発明のタンパク質が関連する疾患のDNA治療法を検討、開発することが可能である。
Furthermore, using the DNA-transferred animal of the present invention, clinical symptoms of diseases related to the protein of the present invention, including functional inactive refractories of the protein of the present invention, can be examined, and the protein of the present invention More detailed pathological findings in each organ of the disease model related to the disease can be obtained, and it is possible to contribute to the development of a new treatment method and further to the study and treatment of secondary diseases caused by the disease.
Moreover, each organ can be taken out from the DNA-transferred animal of the present invention, and after minced, it is possible to obtain free DNA-transferred cells, culture them, or systematize the cultured cells with a proteolytic enzyme such as trypsin. . Furthermore, the protein of the present invention and its action can be investigated by identifying the protein-producing cells of the present invention, examining the relationship with apoptosis, differentiation or proliferation, or the signal transduction mechanism in them, and examining their abnormalities. It becomes an effective research material for.
Furthermore, in order to develop a therapeutic agent for a disease related to the protein of the present invention, including the functional inactive refractory of the protein of the present invention, using the DNA-transferred animal of the present invention, the above-described test method and quantification are performed. It is possible to provide an effective and rapid screening method for a therapeutic agent for the disease using a method or the like. Moreover, it is possible to examine and develop a DNA treatment method for diseases associated with the protein of the present invention using the DNA-transferred animal of the present invention or the exogenous DNA expression vector of the present invention.
(7)ノックアウト動物
本発明は、本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞および本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を提供する。
すなわち、本発明は、
(1)本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞、
(2)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化された第(1)項記載の胚幹細胞、
(3)ネオマイシン耐性である第(1)項記載の胚幹細胞、
(4)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である第(1)項記載の胚幹細胞、
(5)ゲッ歯動物がマウスである第(4)項記載の胚幹細胞、
(6)本発明のDNAが不活性化された該DNA発現不全非ヒト哺乳動物、
(7)該DNAがレポーター遺伝子(例、大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子)を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうる第(6)項記載の非ヒト哺乳動物、
(8)非ヒト哺乳動物がゲッ歯動物である第(6)項記載の非ヒト哺乳動物、
(9)ゲッ歯動物がマウスである第(8)項記載の非ヒト哺乳動物、および
(10)第(7)項記載の動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞とは、該非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAに人為的に変異を加えることにより、DNAの発現能を抑制するか、もしくは該DNAがコードしている本発明のタンパク質の活性を実質的に喪失させることにより、DNAが実質的に本発明のタンパク質の発現能を有さない(以下、本発明のノックアウトDNAと称することがある)非ヒト哺乳動物の胚幹細胞(以下、ES細胞と略記する)をいう。
非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
本発明のDNAに人為的に変異を加える方法としては、例えば、遺伝子工学的手法により該DNA配列の一部又は全部の削除、他DNAを挿入または置換させることによって行なうことができる。これらの変異により、例えば、コドンの読み取り枠をずらしたり、プロモーターあるいはエキソンの機能を破壊することにより本発明のノックアウトDNAを作製すればよい。
(7) Knockout Animal The present invention provides a non-human mammal embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated and the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention.
That is, the present invention
(1) a non-human mammalian embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated,
(2) The embryonic stem cell according to (1), wherein the DNA is inactivated by introducing a reporter gene (eg, β-galactosidase gene derived from E. coli),
(3) The embryonic stem cell according to (1), which is neomycin-resistant,
(4) The embryonic stem cell according to item (1), wherein the non-human mammal is a rodent.
(5) The embryonic stem cell according to (4), wherein the rodent is a mouse,
(6) the DNA expression-deficient non-human mammal in which the DNA of the present invention is inactivated,
(7) The DNA can be inactivated by introducing a reporter gene (eg, β-galactosidase gene derived from E. coli), and the reporter gene can be expressed under the control of a promoter for the DNA of the present invention (6) The non-human mammal according to Item,
(8) The non-human mammal according to (6), wherein the non-human mammal is a rodent.
(9) administering a test compound to the non-human mammal according to (8) and (10) the animal according to (7), wherein the rodent is a mouse, and detecting the expression of the reporter gene The screening method of the compound or its salt which promotes or inhibits the promoter activity with respect to DNA of this invention characterized by these is provided.
The non-human mammal embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated refers to suppressing the DNA expression ability by artificially adding mutation to the DNA of the present invention possessed by the non-human mammal, or By substantially losing the activity of the protein of the present invention encoded by the DNA, the DNA has substantially no ability to express the protein of the present invention (hereinafter sometimes referred to as the knockout DNA of the present invention). ) Non-human mammal embryonic stem cells (hereinafter abbreviated as ES cells).
As the non-human mammal, the same ones as described above are used.
As a method for artificially adding a mutation to the DNA of the present invention, for example, a part or all of the DNA sequence can be deleted or another DNA can be inserted or replaced by a genetic engineering technique. With these mutations, for example, the knockout DNA of the present invention may be prepared by shifting the reading frame of codons or destroying the function of the promoter or exon.
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞(以下、本発明のDNA不活性化ES細胞または本発明のノックアウトES細胞と略記する)の具体例としては、例えば、目的とする非ヒト哺乳動物が有する本発明のDNAを単離し、そのエキソン部分にネオマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子を代表とする薬剤耐性遺伝子、あるいはlacZ(β−ガラクトシダーゼ遺伝子)、cat(クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子)を代表とするレポーター遺伝子等を挿入することによりエキソンの機能を破壊するか、あるいはエキソン間のイントロン部分に遺伝子の転写を終結させるDNA配列(例えば、polyA付加シグナルなど)を挿入し、完全なメッセンジャーRNAを合成できなくすることによって、結果的に遺伝子を破壊するように構築したDNA配列を含有するDNA鎖(以下、ターゲッティングベクターと略記する)を、例えば相同組換え法により該動物の染色体に導入し、得られたES細胞について本発明のDNA上あるいはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析あるいはターゲッティングベクター上のDNA配列とターゲッティングベクター作製に使用した本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列をプライマーとしたPCR法により解析し、本発明のノックアウトES細胞を選別することにより得ることができる。
また、相同組換え法等により本発明のDNAを不活化させる元のES細胞としては、例えば、前述のような既に樹立されたものを用いてもよく、また公知 EvansとKaufmaの方法に準じて新しく樹立したものでもよい。例えば、マウスのES細胞の場合、現在、一般的には129系のES細胞が使用されているが、免疫学的背景がはっきりしていないので、これに代わる純系で免疫学的に遺伝的背景が明らかなES細胞を取得するなどの目的で例えば、C57BL/6マウスやC57BL/6の採卵数の少なさをDBA/2との交雑により改善したBDF1マウス(C57BL/6とDBA/2とのF1)を用いて樹立したものなども良好に用いうる。BDF1マウスは、採卵数が多く、かつ、卵が丈夫であるという利点に加えて、C57BL/6マウスを背景に持つので、これを用いて得られたES細胞は病態モデルマウスを作出したとき、C57BL/6マウスとバッククロスすることでその遺伝的背景をC57BL/6マウスに代えることが可能である点で有利に用い得る。
また、ES細胞を樹立する場合、一般には受精後3.5日目の胚盤胞を使用するが、これ以外に8細胞期胚を採卵し胚盤胞まで培養して用いることにより効率よく多数の初期胚を取得することができる。
また、雌雄いずれのES細胞を用いてもよいが、通常雄のES細胞の方が生殖系列キメラを作出するのに都合が良い。また、煩雑な培養の手間を削減するためにもできるだけ早く雌雄の判別を行なうことが望ましい。
Specific examples of non-human mammalian embryonic stem cells in which the DNA of the present invention is inactivated (hereinafter abbreviated as the DNA inactivated ES cell of the present invention or the knockout ES cell of the present invention) A DNA of the present invention possessed by a non-human mammal is isolated and a neomycin resistance gene, a drug resistance gene typified by a hygromycin resistance gene, or lacZ (β-galactosidase gene), cat (chloramphenicol acetyl) Inserting a reporter gene or the like typified by a transferase gene), or inserting a DNA sequence (for example, a polyA addition signal) that terminates the transcription of the gene into an intron between exons, Preventing the synthesis of complete messenger RNA As a result, a DNA strand containing a DNA sequence constructed so as to disrupt the gene (hereinafter abbreviated as a targeting vector) is introduced into the chromosome of the animal by, for example, homologous recombination, and the resulting ES cell PCR using Southern hybridization analysis using the DNA sequence of or near the DNA of the present invention as a probe or the DNA sequence of the targeting vector and the DNA sequence of the neighboring region other than the DNA of the present invention used for the preparation of the targeting vector It can be obtained by analyzing by the method and selecting the knockout ES cell of the present invention.
In addition, as the original ES cell for inactivating the DNA of the present invention by homologous recombination method, for example, those already established as described above may be used, or according to the known Evans and Kaufma method. Newly established may be used. For example, in the case of mouse ES cells, currently 129 ES cells are generally used, but since the immunological background is unclear, an alternative purely immunologically genetic background For example, C57BL / 6 mice and BDF 1 mice (C57BL / 6 and DBA / 2, which have improved the number of eggs collected from C57BL / 6 mice by crossing with DBA / 2) are obtained. Those established using F 1 ) can be used well. BDF 1 mice have the advantage of having a large number of eggs collected and strong eggs, and since C57BL / 6 mice are used as background, ES cells obtained using these mice can be used to produce pathological model mice. The genetic background can be advantageously replaced by C57BL / 6 mice by backcrossing with C57BL / 6 mice.
When establishing ES cells, blastocysts on the third day after fertilization are generally used, but in addition to this, many blastocysts can be efficiently obtained by collecting eggs and culturing them to blastocysts. Early embryos can be obtained.
Although both male and female ES cells may be used, male ES cells are usually more convenient for producing germline chimeras. In addition, it is desirable to discriminate between males and females as soon as possible in order to reduce troublesome culture work.
ES細胞の雌雄の判定方法としては、例えば、PCR法によりY染色体上の性決定領域の遺伝子を増幅、検出する方法が、その1例としてあげることができる。この方法を使用すれば、従来、核型分析をするのに約106個の細胞数を要していたのに対して、1コロニー程度のES細胞数(約50個)で済むので、培養初期におけるES細胞の第一次セレクションを雌雄の判別で行なうことが可能であり、早期に雄細胞の選定を可能にしたことにより培養初期の手間は大幅に削減できる。
また、第二次セレクションとしては、例えば、G−バンディング法による染色体数の確認等により行うことができる。得られるES細胞の染色体数は正常数の100%が望ましいが、樹立の際の物理的操作等の関係上困難な場合は、ES細胞の遺伝子をノックアウトした後、正常細胞(例えば、マウスでは染色体数が2n=40である細胞)に再びクローニングすることが望ましい。
このようにして得られた胚幹細胞株は、通常その増殖性は大変良いが、個体発生できる能力を失いやすいので、注意深く継代培養することが必要である。例えば、STO繊維芽細胞のような適当なフィーダー細胞上でLIF(1〜10000U/ml)存在下に炭酸ガス培養器内(好ましくは、5%炭酸ガス、95%空気または5%酸素、5%炭酸ガス、90%空気)で約37℃で培養するなどの方法で培養し、継代時には、例えば、トリプシン/EDTA溶液(通常0.001〜0.5%トリプシン/0.1〜5mM EDTA、好ましくは約0.1%トリプシン/1mM EDTA)処理により単細胞化し、新たに用意したフィーダー細胞上に播種する方法などがとられる。このような継代は、通常1〜3日毎に行なうが、この際に細胞の観察を行い、形態的に異常な細胞が見受けられた場合はその培養細胞は放棄することが望まれる。
ES細胞は、適当な条件により、高密度に至るまで単層培養するか、または細胞集塊を形成するまで浮遊培養することにより、頭頂筋、内臓筋、心筋などの種々のタイプの細胞に分化させることが可能であり〔M. J. Evans及びM. H. Kaufman, ネイチャー(Nature)第292巻、154頁、1981年;G. R. Martin プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス・ユーエスエー(Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.)第78巻、7634頁、1981年;T. C. Doetschman ら、ジャーナル・オブ・エンブリオロジー・アンド・エクスペリメンタル・モルフォロジー、第87巻、27頁、1985年〕、本発明のES細胞を分化させて得られる本発明のDNA発現不全細胞は、インビトロにおける本発明のタンパク質の細胞生物学的検討において有用である。
One example of a method for determining the sex of an ES cell is a method of amplifying and detecting a gene in the sex-determining region on the Y chromosome by PCR. If this method is used, the number of ES cells of about 1 colony (about 50) is required, whereas about 10 6 cells were conventionally required for karyotype analysis. It is possible to perform primary selection of ES cells in the early stage by discriminating between males and females, and by allowing male cells to be selected at an early stage, labor in the initial stage of culture can be greatly reduced.
The secondary selection can be performed, for example, by confirming the number of chromosomes by the G-banding method. The number of chromosomes of the obtained ES cell is preferably 100% of the normal number. However, if it is difficult due to physical operations during establishment, the gene of the ES cell is knocked out, and then normal cells (for example, chromosomes in mice) It is desirable to clone again into cells where the number is 2n = 40.
The embryonic stem cell line obtained in this way is usually very proliferative, but it tends to lose its ontogenic ability, so it needs to be subcultured carefully. For example, in a carbon dioxide incubator (preferably 5% carbon dioxide, 95% air or 5% oxygen, 5%) in the presence of LIF (1-10000 U / ml) on a suitable feeder cell such as STO fibroblast. Culturing is carried out by a method such as culturing at about 37 ° C. with carbon dioxide gas and 90% air. Preferably, the cells are converted into single cells by treatment with about 0.1% trypsin / 1 mM EDTA and seeded on newly prepared feeder cells. Such passage is usually carried out every 1 to 3 days. At this time, the cells are observed, and if morphologically abnormal cells are observed, the cultured cells are preferably discarded.
ES cells can be differentiated into various types of cells such as parietal muscle, visceral muscle, and myocardium by monolayer culture to high density or suspension culture until a cell conglomerate is formed under appropriate conditions. [MJ Evans and MH Kaufman, Nature 292, 154, 1981; GR Martin Proceedings of National Academy of Sciences USA (Proc. Natl. Acad. Sci. USA) 78, 7634, 1981; TC Doetschman et al., Journal of Embrology and Experimental Morphology, 87, 27, 1985], ES cells of the present invention. The DNA expression-deficient cells of the present invention obtained by differentiation are useful for in vitro cell biology of the protein of the present invention.
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、該動物のmRNA量を公知方法を用いて測定して間接的にその発現量を比較することにより、正常動物と区別することが可能である。
該非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものが用いられる。
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、例えば、前述のようにして作製したターゲッティングベクターをマウス胚幹細胞またはマウス卵細胞に導入し、導入によりターゲッティングベクターの本発明のDNAが不活性化されたDNA配列が遺伝子相同組換えにより、マウス胚幹細胞またはマウス卵細胞の染色体上の本発明のDNAと入れ換わる相同組換えをさせることにより、本発明のDNAをノックアウトさせることができる。
本発明のDNAがノックアウトされた細胞は、本発明のDNA上またはその近傍のDNA配列をプローブとしたサザンハイブリダイゼーション解析またはターゲッティングベクター上のDNA配列と、ターゲッティングベクターに使用したマウス由来の本発明のDNA以外の近傍領域のDNA配列とをプライマーとしたPCR法による解析で判定することができる。非ヒト哺乳動物胚幹細胞を用いた場合は、遺伝子相同組換えにより、本発明のDNAが不活性化された細胞株をクローニングし、その細胞を適当な時期、例えば、8細胞期の非ヒト哺乳動物胚または胚盤胞に注入し、作製したキメラ胚を偽妊娠させた該非ヒト哺乳動物の子宮に移植する。作出された動物は正常な本発明のDNA座をもつ細胞と人為的に変異した本発明のDNA座をもつ細胞との両者から構成されるキメラ動物である。
該キメラ動物の生殖細胞の一部が変異した本発明のDNA座をもつ場合、このようなキメラ個体と正常個体を交配することにより得られた個体群より、全ての組織が人為的に変異を加えた本発明のDNA座をもつ細胞で構成された個体を、例えば、コートカラーの判定等により選別することにより得られる。このようにして得られた個体は、通常、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体であり、本発明のタンパク質のヘテロ発現不全個体同志を交配し、それらの産仔から本発明のタンパク質のホモ発現不全個体を得ることができる。
The DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention can be distinguished from normal animals by measuring the mRNA level of the animal using a known method and comparing the expression level indirectly.
As the non-human mammal, those similar to the above can be used.
The DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention is a DNA in which, for example, a targeting vector prepared as described above is introduced into mouse embryonic stem cells or mouse egg cells, and the DNA of the present invention of the targeting vector is inactivated by the introduction. The DNA of the present invention can be knocked out by homologous recombination in which the sequence replaces the DNA of the present invention on the chromosome of mouse embryonic stem cells or mouse egg cells by gene homologous recombination.
A cell in which the DNA of the present invention is knocked out is obtained by analyzing a DNA sequence on a Southern hybridization analysis or targeting vector using the DNA sequence of or near the DNA of the present invention as a probe and the mouse derived from the mouse used for the targeting vector. It can be determined by analysis by a PCR method using a DNA sequence in a neighboring region other than DNA as a primer. When non-human mammalian embryonic stem cells are used, a cell line in which the DNA of the present invention has been inactivated by gene homologous recombination is cloned, and the cells are cultured at an appropriate time, for example, the 8-cell stage non-human mammal. It is injected into animal embryos or blastocysts, and the produced chimeric embryos are transplanted into the uterus of the non-human mammal that is pseudopregnant. The produced animal is a chimeric animal composed of both cells having the normal DNA locus of the present invention and cells having the artificially mutated DNA locus of the present invention.
When some of the germ cells of the chimeric animal have the mutated DNA locus of the present invention, all the tissues are artificially mutated from the population obtained by mating such a chimeric individual with a normal individual. It can be obtained by selecting an individual composed of cells having the added DNA locus of the present invention, for example, by determining the coat color. Individuals thus obtained are usually individuals with deficient hetero-expression of the protein of the present invention, and individuals with deficient hetero-expression of the protein of the present invention are crossed and homozygous expression of the protein of the present invention from their offspring. Failure individuals can be obtained.
卵細胞を使用する場合は、例えば、卵細胞核内にマイクロインジェクション法でDNA溶液を注入することによりターゲッティングベクターを染色体内に導入したトランスジェニック非ヒト哺乳動物を得ることができ、これらのトランスジェニック非ヒト哺乳動物に比べて、遺伝子相同組換えにより本発明のDNA座に変異のあるものを選択することにより得られる。
このようにして本発明のDNAがノックアウトされている個体は、交配により得られた動物個体も該DNAがノックアウトされていることを確認して通常の飼育環境で飼育継代を行なうことができる。
さらに、生殖系列の取得および保持についても常法に従えばよい。すなわち、該不活化DNAの保有する雌雄の動物を交配することにより、該不活化DNAを相同染色体の両方に持つホモザイゴート動物を取得しうる。得られたホモザイゴート動物は、母親動物に対して、正常個体1,ホモザイゴート複数になるような状態で飼育することにより効率的に得ることができる。ヘテロザイゴート動物の雌雄を交配することにより、該不活化DNAを有するホモザイゴートおよびヘテロザイゴート動物を繁殖継代する。
本発明のDNAが不活性化された非ヒト哺乳動物胚幹細胞は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を作出する上で、非常に有用である。
また、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のタンパク質により誘導され得る種々の生物活性を欠失するため、本発明のタンパク質の生物活性の不活性化を原因とする疾病のモデルとなり得るので、これらの疾病の原因究明及び治療法の検討に有用である。
In the case of using an egg cell, for example, a transgenic non-human mammal having a targeting vector introduced into a chromosome can be obtained by injecting a DNA solution into the nucleus of the egg cell by a microinjection method. Compared to mammals, it can be obtained by selecting those having mutations in the DNA locus of the present invention by gene homologous recombination.
Thus, an individual in which the DNA of the present invention is knocked out can be reared in a normal breeding environment after confirming that the animal individual obtained by mating has also been knocked out.
In addition, germline acquisition and retention may be followed in accordance with conventional methods. That is, a homozygous animal having the inactivated DNA in both homologous chromosomes can be obtained by mating male and female animals possessed by the inactivated DNA. The obtained homozygous animal can be efficiently obtained by rearing the mother animal in a state where there are 1 normal individual and multiple homozygous animals. By breeding male and female heterozygotes, homozygotes and heterozygotes having the inactivated DNA are bred and passaged.
The non-human mammal embryonic stem cell in which the DNA of the present invention is inactivated is very useful for producing the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention.
In addition, since the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention lacks various biological activities that can be induced by the protein of the present invention, it is a model for diseases caused by inactivation of the biological activity of the protein of the present invention. Therefore, it is useful for investigating the causes of these diseases and for examining therapeutic methods.
(7a)本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物のスクリーニング方法
本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病に対して治療・予防効果を有する化合物(具体的には、大腸癌の予防・治療効果、大腸癌細胞のアポトーシス促進効果、大腸癌細胞の増殖抑制効果、大腸癌の転移・再発抑制剤効果を有する化合物)のスクリーニングに用いることができる。
すなわち、本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、該動物の変化を観察・測定することを特徴とする、本発明のDNAの欠損や損傷などに起因する疾病、例えば癌などに対して治療・予防効果を有する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
該スクリーニング方法において用いられる本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記と同様のものがあげられる。
試験化合物としては、例えば、ペプチド、タンパク質、非ペプチド性化合物、合成化合物、発酵生産物、細胞抽出液、植物抽出液、動物組織抽出液、血漿などがあげられ、これら化合物は新規な化合物であってもよいし、公知の化合物であってもよい。
具体的には、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物を、試験化合物で処理し、無処理の対照動物と比較し、該動物の各器官、組織、疾病の症状などの変化を指標として試験化合物の治療・予防効果を試験することができる。
試験動物を試験化合物で処理する方法としては、例えば、経口投与、静脈注射などが用いられ、試験動物の症状、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。
また、試験化合物の投与量は、投与方法、試験化合物の性質などにあわせて適宜選択することができる。
(7a) Method for screening compound having therapeutic / preventive effect on diseases caused by deficiency or damage of DNA of the present invention The non-human mammal deficient in the expression of DNA of the present invention may have deficiency or damage of the DNA of the present invention. Compounds that have therapeutic / preventive effects on diseases caused by cancer (specifically, colon cancer preventive / therapeutic effects, colon cancer cell apoptosis promoting effects, colon cancer cell growth inhibitory effects, colorectal cancer metastasis / relapse) It can be used for screening of compounds having an inhibitor effect.
That is, the present invention is caused by the deficiency or damage of the DNA of the present invention, which comprises administering a test compound to the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention and observing and measuring changes in the animal. Provided is a screening method for a compound having a therapeutic / prophylactic effect on a disease such as cancer, or a salt thereof.
Examples of the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention used in the screening method include those described above.
Examples of test compounds include peptides, proteins, non-peptidic compounds, synthetic compounds, fermentation products, cell extracts, plant extracts, animal tissue extracts, plasma, and the like, and these compounds are novel compounds. It may be a known compound.
Specifically, the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention is treated with a test compound, compared with an untreated control animal, and tested using changes in each organ, tissue, disease symptom, etc. of the animal as an index. The therapeutic / prophylactic effect of the compound can be tested.
As a method for treating a test animal with a test compound, for example, oral administration, intravenous injection and the like are used, and can be appropriately selected according to the symptoms of the test animal, the properties of the test compound, and the like.
The dosage of the test compound can be appropriately selected according to the administration method, the properties of the test compound, and the like.
例えば、大腸癌に対して治療・予防効果を有する化合物、大腸癌細胞のアポトーシス促進効果、大腸癌細胞の増殖抑制効果、大腸癌の転移・再発抑制剤効果を有する化合物などをスクリーニングする場合、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に試験化合物を投与し、試験化合物非投与群と癌の発症度合いの違いや癌の治癒度合いの違いを上記組織で経時的に観察する。
該スクリーニング方法において、試験動物に試験化合物を投与した場合、該試験動物の上記疾患症状が約10%以上、好ましくは約30%以上、より好ましくは約50%以上改善した場合、該試験化合物を上記の疾患に対して治療・予防効果を有する化合物として選択することができる。
該スクリーニング方法を用いて得られる化合物は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のタンパク質の欠損や損傷などによって引き起こされる疾患に対して治療・予防効果を有するので、該疾患に対する安全で低毒性な予防・治療剤などの医薬として使用することができる。さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、生理学的に許容される金属塩、アンモニウム塩、有機塩基との塩、無機酸との塩、有機酸との塩、塩基性または酸性アミノ酸との塩などが挙げられる。金属塩の好適な例としては、例えばナトリウム塩、カリウム塩などのアルカリ金属塩;カルシウム塩、マグネシウム塩、バリウム塩などのアルカリ土類金属塩;アルミニウム塩などが挙げられる。有機塩基との塩の好適な例としては、例えばトリメチルアミン、トリエチルアミン、ピリジン、ピコリン、2,6−ルチジン、エタノールアミン、ジエタノールアミン、トリエタノールアミン、シクロヘキシルアミン、ジシクロヘキシルアミン、N,N'−ジベンジルエチレンジアミンなどとの塩が挙げられる。無機酸との塩の好適な例としては、例えば塩酸、臭化水素酸、硝酸、硫酸、リン酸などとの塩が挙げられる。有機酸との塩の好適な例としては、例えばギ酸、酢酸、トリフルオロ酢酸、プロピオン酸、フタル酸、フマル酸、シュウ酸、酒石酸、マレイン酸、クエン酸、コハク酸、リンゴ酸、メタンスルホン酸、安息香酸、ベンゼンスルホン酸、p−トルエンスルホン酸などとの塩が挙げられる。塩基性ア
ミノ酸との塩の好適な例としては、例えばアルギニン、リジン、オルニチンなどとの塩が挙げられ、酸性アミノ酸との塩の好適な例としては、例えばアスパラギン酸、グルタミン酸などとの塩などが挙げられる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、該化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の大腸癌患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、該化合物を注射剤の形で通常成人(60kgとして)の大腸癌患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、60kg当たりに換算した量を投与することができる。
For example, when screening a compound having a therapeutic / preventive effect on colorectal cancer, a colorectal cancer cell apoptosis promoting effect, a colorectal cancer cell growth inhibitory effect, a colorectal cancer metastasis / relapse inhibitory effect, etc. A test compound is administered to a non-human mammal deficient in DNA expression of the invention, and the difference in the degree of onset of cancer and the degree of cure of cancer from the test compound non-administered group is observed over time in the tissue.
In the screening method, when a test compound is administered to a test animal, the test compound is improved when the disease symptoms of the test animal are improved by about 10% or more, preferably about 30% or more, more preferably about 50% or more. It can be selected as a compound having a therapeutic / prophylactic effect on the above-mentioned diseases.
The compound obtained by using the screening method is a compound selected from the test compounds described above, and has a therapeutic / prophylactic effect on diseases caused by deficiency or damage of the protein of the present invention. It can be used as a medicine such as a safe and low-toxic preventive / therapeutic agent. Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used as well.
The compound obtained by the screening method may form a salt. Examples of the salt of the compound include physiologically acceptable metal salts, ammonium salts, salts with organic bases, salts with inorganic acids, organic Examples include salts with acids, salts with basic or acidic amino acids, and the like. Preferable examples of the metal salt include alkali metal salts such as sodium salt and potassium salt; alkaline earth metal salts such as calcium salt, magnesium salt and barium salt; aluminum salt and the like. Preferable examples of the salt with an organic base include, for example, trimethylamine, triethylamine, pyridine, picoline, 2,6-lutidine, ethanolamine, diethanolamine, triethanolamine, cyclohexylamine, dicyclohexylamine, N, N′-dibenzylethylenediamine. And the like. Preferable examples of the salt with inorganic acid include salts with hydrochloric acid, hydrobromic acid, nitric acid, sulfuric acid, phosphoric acid and the like. Preferable examples of salts with organic acids include formic acid, acetic acid, trifluoroacetic acid, propionic acid, phthalic acid, fumaric acid, oxalic acid, tartaric acid, maleic acid, citric acid, succinic acid, malic acid, methanesulfonic acid And salts with benzoic acid, benzenesulfonic acid, p-toluenesulfonic acid and the like. Preferable examples of salts with basic amino acids include salts with arginine, lysine, ornithine and the like, and preferable examples of salts with acidic amino acids include salts with aspartic acid, glutamic acid and the like. Can be mentioned.
The medicament containing the compound obtained by the screening method or a salt thereof can be produced in the same manner as the aforementioned medicament containing the protein of the present invention.
Since the preparation thus obtained is safe and low toxic, it can be used, for example, in humans or mammals (eg, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, pigs, cows, horses, cats, dogs, monkeys, etc.). Can be administered.
Although the dose of the compound or a salt thereof varies depending on the target disease, administration subject, administration route, etc., for example, when the compound is administered orally, generally in an adult (with a body weight of 60 kg) colon cancer patients The compound is administered at about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 20 mg per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, target disease, etc., but for example, the compound is usually administered to an adult (60 kg) colon cancer patient in the form of an injection. In this case, it is convenient to administer about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound per day by intravenous injection. In the case of other animals, an amount converted per 60 kg can be administered.
(7b)本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物のスクリーニング方法
本発明は、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物に、試験化合物を投与し、レポーター遺伝子の発現を検出することを特徴とする本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩のスクリーニング方法を提供する。
上記スクリーニング方法において、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物としては、前記した本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物の中でも、本発明のDNAがレポーター遺伝子を導入することにより不活性化され、該レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの制御下で発現しうるものが用いられる。
試験化合物としては、前記と同様のものがあげられる。
レポーター遺伝子としては、前記と同様のものが用いられ、β−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)、可溶性アルカリフォスファターゼ遺伝子またはルシフェラーゼ遺伝子などが好適である。
本発明のDNAをレポーター遺伝子で置換された本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物では、レポーター遺伝子が本発明のDNAに対するプロモーターの支配下に存在するので、レポーター遺伝子がコードする物質の発現をトレースすることにより、プロモーターの活性を検出することができる。
例えば、本発明のタンパク質をコードするDNA領域の一部を大腸菌由来のβ−ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)で置換している場合、本来、本発明のタンパク質の発現する組織で、本発明のタンパク質の代わりにβ−ガラクトシダーゼが発現する。従って、例えば、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−gal)のようなβ−ガラクトシダーゼの基質となる試薬を用いて染色することにより、簡便に本発明のタンパク質の動物生体内における発現状態を観察することができる。具体的には、本発明のタンパク質欠損マウスまたはその組織切片をグルタルアルデヒドなどで固定し、リン酸緩衝生理食塩液(PBS)で洗浄後、X−galを含む染色液で、室温または37℃付近で、約30分ないし1時間反応させた後、組織標本を1mM EDTA/PBS溶液で洗浄することによって、β−ガラクトシダーゼ反応を停止させ、呈色を観察すればよい。また、常法に従い、lacZをコードするmRNAを検出してもよい。
上記スクリーニング方法を用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物である。
該スクリーニング方法で得られた化合物は塩を形成していてもよく、該化合物の塩としては、上記したような塩が挙げられる。
(7b) Method for screening a compound that promotes or inhibits the activity of a promoter for the DNA of the present invention In the present invention, a test compound is administered to a non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention to detect the expression of a reporter gene. The screening method of the compound or its salt which promotes or inhibits the activity of the promoter with respect to DNA of this invention characterized by these is provided.
In the screening method described above, the DNA expression-deficient non-human mammal of the present invention is inactivated by introducing a reporter gene among the DNA expression-deficient non-human mammals of the present invention described above, A gene capable of expressing the reporter gene under the control of a promoter for the DNA of the present invention is used.
Examples of the test compound are the same as described above.
As the reporter gene, the same one as described above is used, and a β-galactosidase gene (lacZ), a soluble alkaline phosphatase gene, a luciferase gene or the like is preferable.
In the non-human mammal of the present invention in which the DNA of the present invention is replaced with a reporter gene, the expression of the substance encoded by the reporter gene is traced because the reporter gene exists under the control of the promoter for the DNA of the present invention. By doing so, the activity of the promoter can be detected.
For example, when a part of the DNA region encoding the protein of the present invention is replaced with the β-galactosidase gene (lacZ) derived from Escherichia coli, the protein of the present invention is originally replaced with the tissue expressing the protein of the present invention. Β-galactosidase is expressed. Therefore, for example, by staining with a reagent that is a substrate of β-galactosidase such as 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-galactopyranoside (X-gal), the present invention can be easily performed. The expression state of the protein in the animal can be observed. Specifically, the protein-deficient mouse of the present invention or a tissue section thereof is fixed with glutaraldehyde or the like, washed with phosphate buffered saline (PBS), and then stained with X-gal at room temperature or around 37 ° C. Then, after reacting for about 30 minutes to 1 hour, the tissue specimen is washed with a 1 mM EDTA / PBS solution to stop the β-galactosidase reaction and observe the coloration. Moreover, you may detect mRNA which codes lacZ according to a conventional method.
The compound obtained by using the screening method or a salt thereof is a compound selected from the test compounds described above, and is a compound that promotes or inhibits the promoter activity for the DNA of the present invention.
The compound obtained by the screening method may form a salt, and examples of the salt of the compound include salts as described above.
本発明のDNAに対するプロモーター活性を促進または阻害する化合物またはその塩は、本発明のタンパク質の発現の調節、該タンパク質の機能を調節することができるので、例えば、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして有用である。
さらに、上記スクリーニングで得られた化合物から誘導される化合物も同様に用いることができる。
該スクリーニング方法で得られた化合物またはその塩を含有する医薬は、前記した本発明のタンパク質またはその塩を含有する医薬と同様にして製造することができる。
このようにして得られる製剤は、安全で低毒性であるので、例えば、ヒトまたは哺乳動物(例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ブタ、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、サルなど)に対して投与することができる。
該化合物またはその塩の投与量は、対象疾患、投与対象、投与ルートなどにより差異はあるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を経口投与する場合、一般的に成人(体重60kgとして)の大腸癌患者においては、一日につき該化合物を約0.1〜100mg、好ましくは約1.0〜50mg、より好ましくは約1.0〜20mg投与する。非経口的に投与する場合は、該化合物の1回投与量は投与対象、対象疾患などによっても異なるが、例えば、本発明のDNAに対するプロモーター活性を阻害する化合物を注射剤の形で通常成人(体重60kgとして)の大腸癌患者に投与する場合、一日につき該化合物を約0.01〜30mg程度、好ましくは約0.1〜20mg程度、より好ましくは約0.1〜10mg程度を静脈注射により投与するのが好都合である。他の動物の場合も、体重60kg当たりに換算した量を投与することができる。
このように、本発明のDNA発現不全非ヒト哺乳動物は、本発明のDNAに対するプロモーターの活性を促進または阻害する化合物またはその塩をスクリーニングする上で極めて有用であり、本発明のDNA発現不全に起因する各種疾患の原因究明または予防・治療剤の開発に大きく貢献することができる。
また、本発明のタンパク質のプロモーター領域を含有するDNAを使って、その下流に種々のタンパクをコードする遺伝子を連結し、これを動物の卵細胞に注入していわゆるトランスジェニック動物(遺伝子移入動物)を作成すれば、特異的にそのタンパク質を合成させ、その生体での作用を検討することも可能となる。さらに上記プロモーター部分に適当なレポーター遺伝子を結合させ、これが発現するような細胞株を樹立すれば、本発明のタンパク質そのものの体内での産生能力を特異的に促進もしくは抑制する作用を持つ低分子化合物の探索系として使用できる。
Since the compound or its salt that promotes or inhibits the promoter activity for the DNA of the present invention can regulate the expression of the protein of the present invention and the function of the protein, for example, a preventive / therapeutic agent for colorectal cancer, colon It is useful as a cancer cell apoptosis promoter, a colon cancer cell growth inhibitor, a colon cancer metastasis / relapse inhibitor, and the like.
Furthermore, compounds derived from the compounds obtained by the above screening can be used as well.
The pharmaceutical containing the compound obtained by the screening method or a salt thereof can be produced in the same manner as the pharmaceutical containing the protein of the present invention or a salt thereof.
Since the preparation thus obtained is safe and low toxic, it can be used, for example, in humans or mammals (eg, rats, mice, guinea pigs, rabbits, sheep, pigs, cows, horses, cats, dogs, monkeys, etc.). Can be administered.
The dose of the compound or a salt thereof varies depending on the target disease, administration subject, administration route, and the like. For example, when a compound that inhibits the promoter activity against the DNA of the present invention is orally administered, generally an adult (body weight) In a colon cancer patient (as 60 kg), the compound is administered at about 0.1 to 100 mg, preferably about 1.0 to 50 mg, more preferably about 1.0 to 20 mg per day. When administered parenterally, the single dose of the compound varies depending on the administration subject, the target disease, etc. For example, a compound that inhibits the promoter activity against the DNA of the present invention is usually administered in the form of an injection (in adults) When administered to a colon cancer patient (with a body weight of 60 kg), about 0.01 to 30 mg, preferably about 0.1 to 20 mg, more preferably about 0.1 to 10 mg of the compound per day is intravenously injected. Are conveniently administered. In the case of other animals, an amount converted per 60 kg body weight can be administered.
Thus, the non-human mammal deficient in DNA expression of the present invention is extremely useful in screening for compounds or salts thereof that promote or inhibit the activity of the promoter for the DNA of the present invention. It can greatly contribute to the investigation of the causes of various diseases caused or the development of preventive / therapeutic agents.
In addition, using DNA containing the promoter region of the protein of the present invention, genes encoding various proteins are ligated downstream thereof, and this is injected into an egg cell of an animal to produce a so-called transgenic animal (gene transgenic animal). Once created, the protein can be specifically synthesized and its action in the living body can be studied. Furthermore, if a suitable reporter gene is bound to the above promoter portion and a cell line that expresses it is established, a low molecular weight compound that specifically promotes or suppresses the production ability of the protein itself of the present invention in the body. Can be used as a search system.
本明細書および配列表において、塩基やアミノ酸などを略号で表示する場合、IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature による略号あるいは当該分野における慣用略号に基づくものであり、その例を下記する。またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特に明示しなければL体を示すものとする。
DNA :デオキシリボ核酸
cDNA :相補的デオキシリボ核酸
A :アデニン
T :チミン
G :グアニン
C :シトシン
RNA :リボ核酸
mRNA :メッセンジャーリボ核酸
dATP :デオキシアデノシン三リン酸
dTTP :デオキシチミジン三リン酸
dGTP :デオキシグアノシン三リン酸
dCTP :デオキシシチジン三リン酸
ATP :アデノシン三リン酸
EDTA :エチレンジアミン四酢酸
SDS :ドデシル硫酸ナトリウム
Gly :グリシン
Ala :アラニン
Val :バリン
Leu :ロイシン
Ile :イソロイシン
Ser :セリン
Thr :スレオニン
Cys :システイン
Met :メチオニン
Glu :グルタミン酸
Asp :アスパラギン酸
Lys :リジン
Arg :アルギニン
His :ヒスチジン
Phe :フェニルアラニン
Tyr :チロシン
Trp :トリプトファン
Pro :プロリン
Asn :アスパラギン
Gln :グルタミン
pGlu :ピログルタミン酸
Sec :セレノシステイン(selenocysteine)
In the present specification and sequence listing, bases, amino acids and the like are indicated by abbreviations based on abbreviations by IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature or conventional abbreviations in the field, examples of which are described below. In addition, when there is an optical isomer with respect to an amino acid, the L form is shown unless otherwise specified.
DNA: deoxyribonucleic acid cDNA: complementary deoxyribonucleic acid A: adenine T: thymine G: guanine C: cytosine RNA: ribonucleic acid mRNA: messenger ribonucleic acid dATP: deoxyadenosine triphosphate dTTP: deoxythymidine triphosphate dGTP: deoxyguanosine tri Phosphoric acid dCTP: Deoxycytidine triphosphate ATP: Adenosine triphosphate EDTA: Ethylenediaminetetraacetic acid SDS: Sodium dodecyl sulfate Gly: Glycine Ala: Alanine Val: Valine Leu: Leucine Ile: Isoleucine Ser: Threon Cys: Threon Cyny : Methionine Glu: Glutamic acid Asp: Aspartic acid Lys: Lysine Arg: Arginine His: Histidine Phe Phenylalanine Tyr: tyrosine Trp: tryptophan Pro: proline Asn: asparagine Gln: glutamine pGlu: pyroglutamic acid Sec: selenocysteine (selenocysteine)
また、本明細書中で繁用される置換基、保護基および試薬を下記の記号で表記する。
Me :メチル基
Et :エチル基
Bu :ブチル基
Ph :フェニル基
TC :チアゾリジン−4(R)−カルボキサミド基
Tos :p−トルエンスルフォニル
CHO :ホルミル
Bzl :ベンジル
Cl2-Bzl :2,6−ジクロロベンジル
Bom :ベンジルオキシメチル
Z :ベンジルオキシカルボニル
Cl−Z :2−クロロベンジルオキシカルボニル
Br−Z :2−ブロモベンジルオキシカルボニル
Boc :t−ブトキシカルボニル
DNP :ジニトロフェニル
Trt :トリチル
Bum :t−ブトキシメチル
Fmoc :N−9−フルオレニルメトキシカルボニル
HOBt :1−ヒドロキシベンズトリアゾール
HOOBt :3,4−ジヒドロ−3−ヒドロキシ−4−オキソ−
1,2,3−ベンゾトリアジン
HONB :1-ヒドロキシ-5-ノルボルネン-2,3-ジカルボキシイミド
DCC :N,N'−ジシクロヘキシルカルボジイミド
In addition, substituents, protecting groups and reagents frequently used in the present specification are represented by the following symbols.
Me: methyl group Et: ethyl group Bu: butyl group Ph: phenyl group TC: thiazolidine-4 (R) -carboxamide group Tos: p-toluenesulfonyl CHO: formyl Bzl: benzyl
Cl 2 -Bzl: 2,6-dichlorobenzyl Bom: benzyloxymethyl Z: benzyloxycarbonyl Cl-Z: 2-chlorobenzyloxycarbonyl Br-Z: 2-bromobenzyloxycarbonyl Boc: t-butoxycarbonyl DNP: dinitro Phenyl Trt: Trityl Bum: t-Butoxymethyl Fmoc: N-9-fluorenylmethoxycarbonyl HOBt: 1-hydroxybenztriazole HOOBt: 3,4-dihydro-3-hydroxy-4-oxo-
1,2,3-benzotriazine HONB: 1-hydroxy-5-norbornene-2,3-dicarboximide DCC: N, N'-dicyclohexylcarbodiimide
本願明細書の配列表の配列番号は、以下の配列を示す。
〔配列番号:1〕
LEFTBのアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:2〕
配列番号:1で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(LEFTB)をコードするcDNA
の塩基配列を示す。
〔配列番号:3〕
FOXA2のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:4〕
配列番号:3で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(FOXA2)をコードするcDNA
の塩基配列を示す。
〔配列番号:5〕
S100Pのアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:6〕
配列番号:5で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(S100P)をコードするcDNA
の塩基配列を示す。
〔配列番号:7〕
CTSEのアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:8〕
配列番号:7で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(CTSE)をコードするcDNAの
塩基配列を示す。
〔配列番号:9〕
NOX1のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:10〕
配列番号:9で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(NOX1)をコードするcDNAの
塩基配列を示す。
〔配列番号:11〕
CDH3のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:12〕
配列番号:11で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(CDH3)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:13〕
KLK10のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:14〕
配列番号:13で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(KLK10)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:15〕
DUOX2のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:16〕
配列番号:15で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(DUOX2)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:17〕
S100A2のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:18〕
配列番号:17で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(S100A2)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:19〕
GABRPのアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:20〕
配列番号:19で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(GABRP)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:21〕
MSLNのアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:22〕
配列番号:21で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(MSLN)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:23〕
FAIM2のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:24〕
配列番号:23で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(FAIM2)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:25〕
TACSTD2のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:26〕
配列番号:25で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(TACSTD2)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:27〕
CEACAM1のアミノ酸配列を示す。
〔配列番号:28〕
配列番号:27で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(CEACAM1)をコードするcDNAの塩基配列を示す。
〔配列番号:29〕
HOXB13の塩基配列を示す。
〔配列番号:30〕
HOXB13のアミノ酸列を示す。
〔配列番号:31〕
PITX2の塩基配列を示す。
〔配列番号:32〕
PITX2のアミノ酸配列を示す。
The sequence numbers in the sequence listing in the present specification indicate the following sequences.
[SEQ ID NO: 1]
The amino acid sequence of LEFTB is shown.
[SEQ ID NO: 2]
CDNA encoding a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (LEFTB)
The base sequence is shown.
[SEQ ID NO: 3]
The amino acid sequence of FOXA2 is shown.
[SEQ ID NO: 4]
CDNA encoding a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 (FOXA2)
The base sequence is shown.
[SEQ ID NO: 5]
The amino acid sequence of S100P is shown.
[SEQ ID NO: 6]
CDNA encoding a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 5 (S100P)
The base sequence is shown.
[SEQ ID NO: 7]
Shows the amino acid sequence of CTSE.
[SEQ ID NO: 8]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 7 (CTSE).
[SEQ ID NO: 9]
The amino acid sequence of NOX1 is shown.
[SEQ ID NO: 10]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein (NOX1) having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 9.
[SEQ ID NO: 11]
The amino acid sequence of CDH3 is shown.
[SEQ ID NO: 12]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 11 (CDH3).
[SEQ ID NO: 13]
The amino acid sequence of KLK10 is shown.
[SEQ ID NO: 14]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 13 (KLK10).
[SEQ ID NO: 15]
The amino acid sequence of DUOX2 is shown.
[SEQ ID NO: 16]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 15 (DUOX2).
[SEQ ID NO: 17]
The amino acid sequence of S100A2 is shown.
[SEQ ID NO: 18]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 17 (S100A2).
[SEQ ID NO: 19]
The amino acid sequence of GABRP is shown.
[SEQ ID NO: 20]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 19 (GABRP).
[SEQ ID NO: 21]
The amino acid sequence of MSLN is shown.
[SEQ ID NO: 22]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21 (MSLN).
[SEQ ID NO: 23]
The amino acid sequence of FAIM2 is shown.
[SEQ ID NO: 24]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 23 (FAIM2).
[SEQ ID NO: 25]
The amino acid sequence of TACSTD2 is shown.
[SEQ ID NO: 26]
This shows the base sequence of cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 25 (TACSTD2).
[SEQ ID NO: 27]
The amino acid sequence of CEACAM1 is shown.
[SEQ ID NO: 28]
This shows the base sequence of the cDNA encoding the protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27 (CEACAM1).
[SEQ ID NO: 29]
Shows the base sequence of HOXB13.
[SEQ ID NO: 30]
The amino acid sequence of HOXB13 is shown.
[SEQ ID NO: 31]
Shows the base sequence of PITX2.
[SEQ ID NO: 32]
The amino acid sequence of PITX2 is shown.
以下において、実施例により本発明をより具体的にするが、この発明はこれらに限定さ
れるものではない。
In the following, the present invention will be more specifically described with reference to examples, but the present invention is not limited thereto.
実施例1
大腸腫瘍発症部位特異的に発現変動する遺伝子を見出す目的で、以下の実験を行った。
大腸腫瘍組織およびその周辺正常組織から抽出されたtotal RNAを自治医科大学から供与いただき(表1)、オリゴヌクレオチド・マイクロアレイ(Human Genome U133A;Affymetrix社) を用いて遺伝子発現解析を行った。実験方法は、Affymetrix社の実験手引き書 (Expression analysis technical manual) に従った。得られた実験結果について、GeneSpring
(SiliconGenetics社)用いて解析した。尚、今回の検討では、直腸、S状結腸、下行結腸を左側大腸、横行結腸、上行結腸、虫垂を右側大腸と分類し、右側大腸の腫瘍群(患者番号1−5)をCR群、右側大腸の周辺正常組織群をNR群、左側大腸の腫瘍群(患者番号6−12)をCL群、左側大腸の周辺正常組織群をNL群として解析を行った。
まず、NR群とNL群を比較するために、両群で有意(p<0.05)、かつ2.5倍以上の発現差を示す遺伝子を抽出した。その結果、225遺伝子が抽出された。
Example 1
The following experiment was conducted for the purpose of finding a gene whose expression changes specifically in the colorectal tumor onset site.
Total RNA extracted from colorectal tumor tissue and surrounding normal tissues was provided by Jichi Medical University (Table 1), and gene expression analysis was performed using an oligonucleotide microarray (Human Genome U133A; Affymetrix). The experiment method was in accordance with the Affymetrix experiment manual (Expression analysis technical manual). About the obtained experimental results, GeneSpring
(SiliconGenetics) was used for analysis. In this study, the rectum, sigmoid colon, and descending colon were classified as the left colon, transverse colon, ascending colon, and appendix as the right colon, and the right colon tumor group (patient number 1-5) was the CR group, the right colon Analysis was performed with the normal tissue group around the large intestine as the NR group, the tumor group in the left large intestine (patient number 6-12) as the CL group, and the normal tissue around the left large intestine as the NL group.
First, in order to compare the NR group with the NL group, genes that were significant (p <0.05) and showed an expression difference of 2.5 times or more in both groups were extracted. As a result, 225 genes were extracted.
実施例2
実施例1で得られた遺伝子のうち、HOXB13(配列番号: 29〔塩基配列〕、配列番号:30〔アミノ酸配列〕)およびPITX2(配列番号:31〔塩基配列〕、配列番号:32〔アミノ酸配列〕)について、GeneChipの結果を確認するため、定量的PCRを行った。定量的PCRに使用したcDNAは、実施例1で使用したtotal RNAを鋳型とし、TaqMan Reverse Transcription Reagents(Applied Biosystems社製)を用いて調製した。それぞれの遺伝子および検体間の発現量補正のために利用する18s rRNA遺伝子に対するプライマーとプローブは、Applied Biosystemsより購入した。
その結果、GeneChipの結果とTaqManによる結果がよく相関することが分かった。表2にサンプル1Nの発現を1とした相対値を示す。
Example 2
Among the genes obtained in Example 1, HOXB13 (SEQ ID NO: 29 [base sequence], SEQ ID NO: 30 [amino acid sequence]) and PITX2 (SEQ ID NO: 31 [base sequence]), SEQ ID NO: 32 [amino acid sequence] ]), Quantitative PCR was performed to confirm the GeneChip results. The cDNA used for quantitative PCR was prepared using TaqMan Reverse Transcription Reagents (Applied Biosystems) using the total RNA used in Example 1 as a template. Primers and probes for the 18s rRNA gene used to correct the expression level between each gene and specimen were purchased from Applied Biosystems.
As a result, it was found that the results of GeneChip and TaqMan correlated well. Table 2 shows the relative values when the expression of sample 1N is 1.
さらにこれらの遺伝子が大腸左右判別に有効であることを確認するために、新たに追加されたサンプル(表3)のtotal RNAを用いて上記と同様の手法で定量的PCRを行った。結果を表4に示す。その結果、これらの遺伝子発現量を指標として大腸左右を容易に判別できる事が分かった。 Furthermore, in order to confirm that these genes are effective in distinguishing the left and right of the large intestine, quantitative PCR was performed by the same method as described above using the total RNA of the newly added sample (Table 3). The results are shown in Table 4. As a result, it was found that the left and right of the large intestine can be easily distinguished using these gene expression levels as an index.
実施例3
実施例1から得られたGeneChipデータを用いた解析を行った。実施例1の遺伝子群のうち、NR群に比べて2倍以上CR群で発現が亢進している遺伝子としてS100P(配列番号:6)、FOXA2(配列番号:4)、NOX1(配列番号:10)、LEFTB(配列番号:2)およびCTSE(配列番号:8)を見出した。また、実施例1の遺伝子群のうち、NL群に比べて2倍以上CL群で発現が亢進している遺伝子としてS100PおよびNOX1を見出した。これらの遺伝子について、定量的PCRを行った。方法は実施例2に準じた。
その結果、表5に示すように、GeneChipの結果とTaqManによる結果がよく相関することが分かった。
Example 3
Analysis using GeneChip data obtained from Example 1 was performed. Among the gene groups of Example 1, S100P (SEQ ID NO: 6), FOXA2 (SEQ ID NO: 4), NOX1 (SEQ ID NO: 10) are genes whose expression is increased more than twice in the CR group compared to the NR group. ), LEFTB (SEQ ID NO: 2) and CTSE (SEQ ID NO: 8). In addition, among the gene group of Example 1, S100P and NOX1 were found as genes whose expression was enhanced twice or more in the CL group compared to the NL group. Quantitative PCR was performed on these genes. The method was in accordance with Example 2.
As a result, as shown in Table 5, it was found that the GeneChip result and the TaqMan result correlated well.
実施例4
実施例1において、オリゴヌクレオチド・マイクロアレイ(Human Genome U133A; Affymetrix社)を用いて得られた結果について、GeneSpring (SiliconGenetics社)を用いてさらに解析を行った。今回、右側大腸および左側大腸の周辺正常組織群をNR+NL、右側大腸および左側大腸の腫瘍組織群をCR+CLとして解析を行った。NR+NL群とCR+CL群を比較するために、両群で有意(p<0.05)かつ4倍以上の発現差を示す遺伝子を抽出した。
この結果、180遺伝子が抽出された。CR+CL群で発現が上昇する遺伝子として、CDH3(配列番号:12)、KLK10(配列番号:14)、DUOX2(配列番号:16)、S100A2(配列番号:18)、GABRP(配列番号:20)、MSLN(配列番号:22)、FAIM2(配列番号:24)、TACSTD2(配列番号:26)などを見出した。CR+CL群で発現が低下する遺伝子として、CEACAM1(配列番号:28)などを見出した。
Example 4
In Example 1, the results obtained using the oligonucleotide microarray (Human Genome U133A; Affymetrix) were further analyzed using GeneSpring (SiliconGenetics). In this study, the normal tissue group around the right and left large intestine was analyzed as NR + NL, and the tumor tissue group in the right and left large intestine was analyzed as CR + CL. In order to compare the NR + NL group and the CR + CL group, genes that were significant (p <0.05) and showed an expression difference of 4 times or more were extracted in both groups.
As a result, 180 genes were extracted. As genes whose expression increases in the CR + CL group, CDH3 (SEQ ID NO: 12), KLK10 (SEQ ID NO: 14), DUOX2 (SEQ ID NO: 16), S100A2 (SEQ ID NO: 18), GABRP (SEQ ID NO: 20) ), MSLN (SEQ ID NO: 22), FAIM2 (SEQ ID NO: 24), TACSTD2 (SEQ ID NO: 26), and the like. As a gene whose expression decreases in the CR + CL group, CEACAM1 (SEQ ID NO: 28) and the like were found.
配列番号:1、配列番号:3、配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23または配列番号:25で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質の活性を阻害する化合物またはその塩、該タンパク質遺伝子の発現を阻害する化合物またはその塩、該タンパク質またはその部分ペプチドをコードするポリヌクレオチドの塩基配列に相補的もしくは実質的に相補的な塩基配列またはその一部を含有するアンチセンスポリヌクレオチド、該タンパク質に対する抗体などは、大腸癌などの予防・治療剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞の増殖抑制剤、大腸癌の転移・再発抑制剤などとして使用することができる。
なお、配列番号:27で表されるアミノ酸配列と同一もしくは実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質の活性を促進する化合物またはその塩、該タンパク質の遺伝子の発現を促進する化合物またはその塩などは、大腸癌の予防・治療剤、大腸癌の転移・再発抑制剤、大腸癌細胞のアポトーシス促進剤、大腸癌細胞細胞の増殖抑制剤などとして安全な医薬として期待できるので、該タンパク質はそのような医薬の有効成分のスクリーニングに用いることができる。
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, A compound that inhibits the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23 or SEQ ID NO: 25, or a salt thereof, and expression of the protein gene An inhibitory compound or salt thereof, an antisense polynucleotide containing a base sequence complementary to or substantially complementary to the base sequence of a polynucleotide encoding the protein or its partial peptide, or a part thereof, an antibody against the protein, etc. Preventive / therapeutic agents for colorectal cancer, colon cancer cell apoptosis promoter, colon cancer cell growth inhibitor, colon cancer metastasis / It can be used as such originating inhibitor.
In addition, a compound or a salt thereof that promotes the activity of a protein containing the same or substantially the same amino acid sequence as the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 27, a compound that promotes the expression of the gene of the protein, or a salt thereof, and the like Can be expected as a safe drug as a preventive / therapeutic agent for colorectal cancer, a metastasis / recurrence inhibitor for colorectal cancer, an apoptosis promoter for colorectal cancer cells, a proliferation inhibitor for colorectal cancer cell cells, and so on. It can be used for screening active ingredients of various pharmaceuticals.
Claims (33)
(I) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, sequence for producing a colon cancer cell apoptosis promoter or colon cancer cell growth inhibitor SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, or SEQ ID NO: 23. (Ii) a compound or salt thereof that inhibits the activity of a protein containing the same amino acid sequence, or a partial peptide thereof, or a salt thereof, (ii) a gene that inhibits the expression of the gene of the protein or the partial peptide or salt thereof, iii) an antibody against the protein or its partial peptide or salt thereof, or (iv) it encodes the protein or its partial peptide Use of an antisense polynucleotide comprising a complementary or substantially complementary base sequence or a portion thereof to the base sequence of the polynucleotide.
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