JP2006010391A - Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device - Google Patents

Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device Download PDF

Info

Publication number
JP2006010391A
JP2006010391A JP2004184934A JP2004184934A JP2006010391A JP 2006010391 A JP2006010391 A JP 2006010391A JP 2004184934 A JP2004184934 A JP 2004184934A JP 2004184934 A JP2004184934 A JP 2004184934A JP 2006010391 A JP2006010391 A JP 2006010391A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
probe
immobilization
carrier
amount
rate
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
JP2004184934A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
Yoshinobu Akimoto
佳伸 秋本
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Olympus Corp
Original Assignee
Olympus Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Olympus Corp filed Critical Olympus Corp
Priority to JP2004184934A priority Critical patent/JP2006010391A/en
Priority to PCT/JP2005/011680 priority patent/WO2006001399A1/en
Publication of JP2006010391A publication Critical patent/JP2006010391A/en
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J19/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J19/0046Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277Apparatus
    • B01J2219/00351Means for dispensing and evacuation of reagents
    • B01J2219/00387Applications using probes
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277Apparatus
    • B01J2219/00497Features relating to the solid phase supports
    • B01J2219/00527Sheets
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00605Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00605Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
    • B01J2219/00612Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports the surface being inorganic
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00605Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
    • B01J2219/00632Introduction of reactive groups to the surface
    • B01J2219/00637Introduction of reactive groups to the surface by coating it with another layer
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00659Two-dimensional arrays
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00677Ex-situ synthesis followed by deposition on the substrate
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/0068Means for controlling the apparatus of the process
    • B01J2219/00693Means for quality control
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/0068Means for controlling the apparatus of the process
    • B01J2219/00702Processes involving means for analysing and characterising the products
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00718Type of compounds synthesised
    • B01J2219/0072Organic compounds
    • B01J2219/00722Nucleotides
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00718Type of compounds synthesised
    • B01J2219/0072Organic compounds
    • B01J2219/00725Peptides

Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a manufacturing method of a specimen for an organism-related substance capable of detecting and quantitating accurately a sample material to be reacted specifically with a probe, even when using a plurality of specimens having different probe solidification rates relative to each specimen. <P>SOLUTION: Information on the solidification rate of a probe for solidification rate inspection solidified together with a probe for the reaction is preserved in an information preservation part of the specimen. <P>COPYRIGHT: (C)2006,JPO&NCIPI

Description

本発明は、DNA等の生体関連物質の解析に用いられる試験片の製造方法、及び試験装置に関するものである。   The present invention relates to a test piece manufacturing method and a test apparatus used for analysis of biologically relevant substances such as DNA.

約30億bpという巨大なヒトゲノムの全塩基配列を決定し、それらを解析しようというヒトゲノム計画は、システマティックな塩基配列からシステマティックな機能解析へと焦点が移ってきている。   The human genome project to determine the entire base sequence of a huge human genome of about 3 billion bp and analyze them has shifted the focus from systematic base sequence to systematic functional analysis.

ところで、遺伝情報の具体的内容は、(1)いかなるタンパク質が合成されるのか、そして(2)タンパク質がいかなる条件下で合成されるのか、という点につきるものである。(1)については、ウエスタン・ブロット法、ノーザン・ブロット法やサザン・ブロット法などの解析方法が広く用いられている。しかしながらこれらの方法は、細胞より特異的に抽出された特定蛋白質や、DNA、RNAのみについての解析を行うものであり、その他のタンパク質や、DNA、RNAを同時且つ一度に解析するには必ずしも適していない。   By the way, the specific contents of the genetic information relate to (1) what kind of protein is synthesized and (2) under what conditions the protein is synthesized. Regarding (1), analysis methods such as Western blotting, Northern blotting, Southern blotting, etc. are widely used. However, these methods analyze only specific proteins extracted from cells, DNA, and RNA, and are not always suitable for simultaneous analysis of other proteins, DNA, and RNA at the same time. Not.

一方、上記(2)の、タンパク質がいかなる条件下で合成されるかという点に関しては、転写レベルの制御が深く関与していることから、従来の解析手法では充分な解析を行うことが困難であった。その最大の原因は、DNAにおける制御配列、及びこれに対応した制御内容の双方のデータの不足にある。   On the other hand, regarding the condition under which (2) the protein is synthesized, since the control of the transcription level is deeply involved, it is difficult to perform a sufficient analysis with the conventional analysis method. there were. The biggest cause is the lack of data on both the control sequence in DNA and the control content corresponding to it.

しかし最近になって、DNAチップやDNAマイクロアレイと呼ばれる技術が登場したことにより、遺伝子の発現情報の解析が飛躍的に進歩することが期待され、上記のタンパク質が合成される条件の解析がより容易になっていくことが期待されている。これらのチップやマイクロアレイは、1cm程度の担体表面上に高密度に任意のオリゴヌクレオチドが固相化されたものである。DNAチップは、シリコンチップをフォトリソグラフィー技術によって多くの区画に分割し、それぞれの区画上に特定の塩基配列を持った一本鎖DNAを直接合成したものである。DNAマイクロアレイは、従来メンブレンであった担体をスライドグラスにし、メンブレン担体上の各スポットのスポットサイズが約300μm以上であったものを、約200μm以下にまでしたものである。そのため、DNAマイクロアレイを利用すると、一度に数多くの試料を解析することが容易になった。 However, recently, with the advent of technologies called DNA chips and DNA microarrays, the analysis of gene expression information is expected to make dramatic progress, making it easier to analyze the conditions under which the above proteins are synthesized. It is expected to become. These chips and microarrays are obtained by immobilizing arbitrary oligonucleotides on a carrier surface of about 1 cm 2 at high density. A DNA chip is obtained by dividing a silicon chip into a number of sections by photolithography, and directly synthesizing single-stranded DNA having a specific base sequence on each section. In the DNA microarray, a carrier that has been a conventional membrane is used as a slide glass, and the spot size of each spot on the membrane carrier is about 300 μm or more, and is reduced to about 200 μm or less. Therefore, using a DNA microarray makes it easy to analyze many samples at once.

DNAチップやDNAマイクロアレイは、信号読取装置と、これを制御等するためのコンピュータシステムにつながれ、チップ上、マイクロアレイ上に配置されたプローブと試料核酸がハイブリダイズした際に、試料核酸とプローブとからなる複合体より発せられる信号(蛍光シグナル等)を検出・解析するように構成されている。DNAチップやDNAマイクロアレイ上に配置されるDNAの種類とその配置しだいで、遺伝子DNAの変異解析、多型解析、塩基配列解析、発現解析などさまざまな用途に用いることが可能である。
特開平11-187900号公報 特許第3442327号公報 特許第3350421号公報
A DNA chip or DNA microarray is connected to a signal reader and a computer system for controlling the signal reader. When a probe arranged on the chip or on the microarray and the sample nucleic acid are hybridized, the sample nucleic acid and the probe are separated from each other. A signal (fluorescence signal or the like) emitted from the complex is detected and analyzed. It can be used for various applications such as gene DNA mutation analysis, polymorphism analysis, nucleotide sequence analysis, and expression analysis, depending on the type of DNA and its arrangement on the DNA chip or DNA microarray.
JP-A-11-187900 Japanese Patent No. 3442327 Japanese Patent No. 3350421

しかしながら、DNAマイクロアレイを用いた解析は、マイクロアレイの作製やその検出装置の議論がなされ始めたばかりであり、まだ多くの問題点を抱えているのが実情である。   However, analysis using DNA microarrays has just begun to discuss the fabrication of microarrays and their detection devices, and there are still many problems.

DNAマイクロアレイの作成方法としては、例えばスポッターといわれる装置で、オリゴDNAやcDNAを基板上にスポットするものが挙げられる。スポット方法としては、スライドグラス上にピンを直接接触させてオリゴDNAやcDNAを配置する「接触プリンティング法」や、スライドグラス上にインクジェット技術を用いて、オリゴDNAやcDNAをブロットする「非接触プリンティング法」がある。   As a method for producing a DNA microarray, for example, an apparatus called a spotter is used to spot oligo DNA or cDNA on a substrate. Spotting methods include “contact printing method” in which pins are placed in direct contact with a slide glass to place oligo DNA or cDNA, or “contactless printing” in which oligo DNA or cDNA is blotted on a slide glass using inkjet technology. Law ".

上記したスポット方法等においては、そもそもオリゴDNA、またはcDNAを基板のスライドガラス等に100%固相化することは化学反応的には困難である。場合によっては基板上にオリゴDNAやcDNAが供給されるだけで、全く固相化されないという事態もありえる。従って、DNAマイクロアレイの作製時期が異なる、異ロットのマイクロアレイ間においては、プローブ固相化量のバラつきが存在しているのが実情である。   In the above spot method or the like, it is difficult to chemically immobilize oligo DNA or cDNA on a glass slide on a substrate in the first place. In some cases, the oligo DNA or cDNA is simply supplied onto the substrate and may not be solidified at all. Accordingly, the fact is that there is a variation in the amount of immobilized probe between microarrays of different lots, which are produced at different times.

このようにDNAマイクロアレイ(基板)ごとに、プローブ固相化量のバラつきが生じてしまうと、複数のDNAマイクロアレイを使用して行う解析、特に定量性が要求される解析の結果に悪影響を及ぼしてしまうという問題が生じるとともに、品質管理上の問題が生じる。   As described above, if the amount of the solid phase of the probe varies among DNA microarrays (substrates), it may adversely affect the results of analysis using a plurality of DNA microarrays, particularly analysis requiring quantitativeness. In addition to the problem of quality control.

オリゴDNA、またはcDNAの担体への固相化量を確認する方法としては、例えば特許文献1に記載されるような、実際にハイブリダイゼーションで判断するものがある。また、特許文献2及び特許文献3においては、担体に固相化する全プローブを蛍光標識することによりプローブの固相化量を求めて、これを補正に利用することで、より正確なハイブリダイズ量の定量を可能にしている。しかしながらこれらの方法においては、(1)全プローブに標識を付与するために高コストとなること、(2)プローブ固相化量の定量のための蛍光色素により、ハイブリダイズ反応において立体的障害が生じる可能性があること、(3)ハイブリッド検出のための蛍光色素と、固相化量定量のための蛍光色素との2色蛍光により検出を行うことから、検出装置が複雑になり、更に(4)蛍光色素の発光効率の補正が必要になること、等の問題点が存在する。   As a method for confirming the amount of oligo-DNA or cDNA immobilized on a carrier, there is a method of actually judging by hybridization as described in Patent Document 1, for example. Further, in Patent Document 2 and Patent Document 3, more accurate hybridization is performed by obtaining the amount of immobilized probe by fluorescently labeling all probes immobilized on a carrier and using this for correction. The quantity can be quantified. However, in these methods, (1) the cost is increased because all the probes are labeled, and (2) the steric hindrance is caused in the hybridization reaction due to the fluorescent dye for quantifying the amount of immobilized probe. (3) Since detection is performed by two-color fluorescence of a fluorescent dye for hybrid detection and a fluorescent dye for determination of the amount of solid phase, the detection apparatus becomes complicated, and ( 4) There are problems such as the need to correct the luminous efficiency of the fluorescent dye.

本発明は斯かる問題に鑑みてなされたものであり、以下の構成をとることを特徴とする。即ち本発明の生体関連物質用試験片の製造方法は、
試料物質との結合に供せられる反応用プローブ、及び固相化率検査用プローブをそれぞれ、担体の所定のスポットに供給する工程(A);
担体へ供給された固相化率検査用プローブの量(プローブ供給量)を定量する工程(B);
反応用プローブ及び固相化率検査用プローブが固相化された担体の各スポットを洗浄し、担体に固相化されなかったプローブを担体より除去する工程(C);
スポット洗浄後に担体に存在する固相化率検査用プローブの量(プローブ固相化量)を定量する工程(D);
前記工程(B)及び(D)の定量結果に基づき、固相化率検査用プローブの、当該担体への固相化率(プローブ固相化率)を算出する工程(E);
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及びプローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F);
を含むものである。
The present invention has been made in view of such problems, and is characterized by the following configuration. That is, the method for producing a test piece for a biological substance according to the present invention includes:
Supplying a reaction probe to be bound to the sample substance and a probe for immobilization rate to a predetermined spot on the carrier (A);
A step (B) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate supplied to the carrier (probe supply amount);
A step (C) of washing each spot of the carrier on which the reaction probe and the immobilization rate test probe are immobilized, and removing the probe not immobilized on the carrier from the carrier;
A step (D) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate test present on the carrier after spot washing (probe immobilization amount);
A step (E) of calculating a solid phase immobilization rate (probe solid phase immobilization rate) of the probe for immobilization rate on the carrier based on the quantitative results of the steps (B) and (D);
The probe immobilization rate, and the probe supply amount and the probe immobilization amount, as appropriate, are stored in an information storage unit provided in the carrier, or in an information storage unit provided separately from the carrier. Storing together with the identification number of the carrier (F);
Is included.

また、本発明の生体関連物質用試験片の製造方法は、
試料物質との結合に供せられる反応用プローブ、及び固相化率検査用プローブをそれぞれ、担体の所定のスポットに供給する工程(A);
担体へ供給された固相化率検査用プローブの量(プローブ供給量)を定量する工程(B);
反応用プローブ及び固相化率検査用プローブが固相化された担体の各スポットを洗浄して、担体に固相化されなかったプローブを担体より除去する工程(C);
スポット洗浄後に担体に存在する固相化率検査用プローブの量(プローブ固相化量)を定量する工程(D);
前記工程(B)及び(D)の定量結果に基づき、固相化率検査用プローブの、当該担体への固相化率(プローブ固相化率)を算出する工程(E);更に、
予め定めておいた最低固相化率と、当該プローブ固相化率を比較する工程(E’);及び、
当該プローブ固相化率が、当該最低固相化率以上である場合には、
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F)を行い、又は
当該プローブ固相化率が、当該最低固相化率未満である場合には、
当該担体を製造工程より排除するか、又は当該担体が不良であることを示す情報を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、若しくは当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F’);
を含むものである。
In addition, the method for producing a test piece for a biological substance according to the present invention includes:
Supplying a reaction probe to be bound to the sample substance and a probe for immobilization rate to a predetermined spot on the carrier (A);
A step (B) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate supplied to the carrier (probe supply amount);
A step of washing each spot of the carrier on which the reaction probe and the immobilization rate test probe are immobilized, and removing the probe not immobilized on the carrier from the carrier (C);
A step (D) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate test present on the carrier after spot washing (probe immobilization amount);
A step (E) of calculating an immobilization rate (probe immobilization rate) of the probe for immobilization rate on the carrier based on the quantitative results of the steps (B) and (D);
A step (E ′) of comparing the predetermined minimum immobilization rate with the probe immobilization rate; and
When the probe immobilization rate is equal to or higher than the minimum immobilization rate,
The probe immobilization ratio, as appropriate, the probe supply amount and the probe solid phase immobilization amount are stored in an information storage unit provided in the carrier, or an information storage unit provided separately from the carrier Or the step (F) of storing together with the identification number of the carrier, or if the probe immobilization rate is less than the minimum immobilization rate,
An information storage unit that is excluded from the manufacturing process, or that stores information indicating that the carrier is defective is stored in an information storage unit provided in the carrier, or is provided separately from the carrier And storing together with the identification number of the carrier (F ′);
Is included.

更に本発明の生体関連物質用試験片の製造方法は、
試料物質との結合に供せられる反応用プローブ、及び固相化率検査用プローブをそれぞれ、担体の所定のスポットに供給する工程(A);
担体へ供給された固相化率検査用プローブの量(プローブ供給量)を定量する工程(B);
反応用プローブ及び固相化率検査用プローブが固相化された担体の各スポットを洗浄して、担体に固相化されなかったプローブを担体より除去する工程(C);
スポット洗浄後に担体に存在する固相化率検査用プローブの量(プローブ固相化量)を定量する工程(D);
前記工程(B)及び(D)の定量結果に基づき、固相化率検査用プローブの、当該担体への固相化率(プローブ固相化率)を算出する工程(E);
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F);
前記情報保存部に保存されたプローブ固相化率を、予め定めておいた最低固相化率と比較し、
当該プローブ固相化率が当該最低固相化率以上である場合には、当該プローブ固相化率を有する試験片を、「合格」と判定し、又は
当該プローブ固相化率が当該最低固相化率未満である場合には、当該プローブ固相化率を有する試験片を、「不合格」と判定し、
合格品と不合格品とを分離する
工程(G);
を含むものである。
Furthermore, the method for producing a test piece for a biological substance according to the present invention includes:
Supplying a reaction probe to be bound to the sample substance and a probe for immobilization rate to a predetermined spot on the carrier (A);
A step (B) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate supplied to the carrier (probe supply amount);
A step of washing each spot of the carrier on which the reaction probe and the immobilization rate test probe are immobilized, and removing the probe not immobilized on the carrier from the carrier (C);
A step (D) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate test present on the carrier after spot washing (probe immobilization amount);
A step (E) of calculating a solid phase immobilization rate (probe solid phase immobilization rate) of the probe for immobilization rate on the carrier based on the quantitative results of the steps (B) and (D);
The probe immobilization ratio, as appropriate, the probe supply amount and the probe solid phase immobilization amount are stored in an information storage unit provided in the carrier, or an information storage unit provided separately from the carrier And storing together with the identification number of the carrier (F);
Compare the probe solid-phase rate stored in the information storage unit with a predetermined minimum solid-phase rate,
When the probe immobilization rate is not less than the minimum immobilization rate, the test piece having the probe immobilization rate is determined as “pass”, or the probe immobilization rate is the minimum immobilization rate. When it is less than the phase rate, the test piece having the probe solid phase rate is determined as “fail”,
A step (G) of separating a pass product and a reject product;
Is included.

上記した本発明の生体関連物質用試験片の製造方法においては、前記工程(B)及び(D)における定量を、前記固相化率検査用プローブに固有のスペクトルを測定することにより行うことができ、また、前記固相化率検査用プローブに固有のスペクトルの測定を、前記固相化率検査用プローブに予め導入された蛍光色素に由来するシグナル測定とすることができる。   In the above-described method for producing a test piece for a biological substance according to the present invention, the quantification in the steps (B) and (D) may be performed by measuring a spectrum specific to the probe for immobilization rate test. In addition, the measurement of the spectrum unique to the probe for immobilization rate test can be a signal measurement derived from a fluorescent dye introduced in advance to the probe for immobilization rate test.

本発明の生体関連物質の測定方法は、
担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
当該測定された固有のスペクトル強度を、当該情報保存部に記録されたプローブ固相化率又はプローブ固相化量で補正し、予め定めた標準固相化率又は標準固相化量あたりの値に変換する工程(IV);
を含むものである。
The method for measuring a biological substance of the present invention includes:
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate on the carrier, and the probe supply amount and the probe immobilization amount are appropriately recorded, or the probe immobilization rate, and the probe supply amount and A probe in which the amount of immobilized probe is recorded in an information storage unit provided separately from the carrier together with the identification number of the carrier, and a probe that specifically reacts to the sample substance Supplying the sample substance to the carrier immobilized on the spot (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex that may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time has not dissociated;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
The measured intrinsic spectral intensity is corrected by the probe immobilization rate or probe immobilization amount recorded in the information storage unit, and a predetermined standard immobilization rate or value per standard immobilization amount. Converting to (IV);
Is included.

また本発明の生体関連物質の測定方法は、
担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及びプローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
を含む、生体関連物質の測定方法において、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)に対する、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量の比率(算出比率)により、当該標準固相化率又は当該標準固相化量と同一の固相化率又は固相化量を有する試験片の場合の予め定めた標準反応時間を除することにより求めた時間を、前記工程(I)の開始から前記工程(II)の開始までの反応時間として、前記工程(I)及び(II)を行うことを特徴とする。
The method for measuring a biological substance of the present invention includes:
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate on the carrier and, if appropriate, the probe supply amount and the probe immobilization amount are recorded, or the probe immobilization rate, and the probe supply amount as appropriate In addition, the amount of immobilized probe and the identification number of the carrier are recorded in the information storage unit provided separately from the carrier, and a probe that specifically reacts to the sample substance is predetermined. Supplying the sample substance to the carrier immobilized on the spot of (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex that may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time has not dissociated;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
In a method for measuring a biological substance,
Ratio of probe immobilization rate or probe immobilization amount of test piece to standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) of test sample probe immobilization rate or probe immobilization amount (standard immobilization rate or standard immobilization amount) Calculated by dividing the predetermined standard reaction time in the case of a test piece having the same solid phase immobilization rate or solid phase immobilization rate by the calculated ratio). The steps (I) and (II) are performed by using the time as the reaction time from the start of the step (I) to the start of the step (II).

更に本発明の生体関連物質の測定方法は、
担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
を含む、生体関連物質の測定方法において、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)に対する、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量の比率(算出比率)により、当該標準固相化率又は当該標準固相化量と同一の固相化率又は固相化量を有する試験片の場合の予め定めた標準測定時間を除することにより求めた時間を、前記工程(III)の測定時間として前記工程(III)を行うことを特徴とする。
Furthermore, the method for measuring a biological substance of the present invention includes:
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate on the carrier and, if appropriate, the probe supply amount and the probe immobilization amount are recorded, or the probe immobilization rate, and the probe supply amount as appropriate And a probe that is recorded in an information storage unit provided separately from the carrier, in which the amount of immobilized probe is combined with the identification number of the carrier, and a probe that specifically reacts to a sample substance. Supplying a sample substance to a carrier immobilized on a predetermined spot (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex that may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time has not dissociated;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
In a method for measuring a biological substance,
Ratio of probe immobilization rate or probe immobilization amount of test piece to standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) of test sample probe immobilization rate or probe immobilization amount (standard immobilization rate or standard immobilization amount) Calculated by dividing the predetermined standard measurement time in the case of a test piece having the same solid phase immobilization rate or solid phase immobilization rate or solid phase immobilization amount by the calculation ratio). The step (III) is performed using the time as the measurement time of the step (III).

上記した本発明の生体関連物質の測定方法においては、前記固有のスペクトルの測定を、試料物質に予め導入された蛍光色素に由来するシグナルの測定とすることができる。   In the above-described method for measuring a biological substance according to the present invention, the measurement of the intrinsic spectrum can be a measurement of a signal derived from a fluorescent dye introduced in advance into a sample substance.

また、本発明の生体関連物質の検出装置は、
生体関連物質検出用試験片へ流体を供給、及び当該試験片より流体を排除するための流体輸送部;
当該試験片における反応温度を制御する温度調節部;
当該試験片への光源;
当該試験片からのスペクトルを検出するためのスペクトル検出部;
当該試験片に備えられた情報保存部、又は当該試験片とは別個に備えられた情報保存部中に保存された情報を読み取るための試験片情報読取り部;及び
当該スペクトル検出部で検出したシグナル強度を、当該試験片情報読取り部に保存された情報に基づき補正するための、シグナル補正アプリケーションが保存された記憶部;
を含み、コンピュータにより制御される生体関連物質の検出装置である。
Moreover, the detection apparatus for biologically related substances of the present invention is
A fluid transport unit for supplying a fluid to a test piece for detecting a biological substance and for removing the fluid from the test piece;
A temperature control unit for controlling the reaction temperature in the test piece;
Light source to the specimen;
A spectrum detector for detecting a spectrum from the test piece;
An information storage unit provided in the test piece, or a test piece information reading unit for reading information stored in an information storage unit provided separately from the test piece; and a signal detected by the spectrum detection unit A storage unit storing a signal correction application for correcting the intensity based on the information stored in the test piece information reading unit;
And a biologically relevant substance detection device controlled by a computer.

更に本発明の測定シグナル補正プログラムは、
コンピュータに、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)を入力する手順;
当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み取り、当該プローブ固相化率又は当該プローブ固相化量の、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を求める手順;
当該試験片からの測定シグナル値を読み取り、これを当該算出比率で除することにより、標準固相化率又は標準固相化量あたりの値(変換値)を求める手順;及び、
当該変換値を出力する手順;
を実行させるためのプログラムである。
Furthermore, the measurement signal correction program of the present invention includes:
On the computer,
A procedure for inputting a standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece;
The probe immobilization ratio or the amount of probe immobilization specific to the test piece stored in the information storage unit provided in the test piece or in the information storage unit provided separately from the test piece. A procedure for reading and obtaining a ratio (calculation ratio) of the probe immobilization rate or the probe immobilization amount to the standard immobilization rate or the standard immobilization amount;
A procedure for obtaining a standard solid phase immobilization rate or a value per standard solid phase immobilization amount (conversion value) by reading a measured signal value from the test piece and dividing this by the calculated ratio; and
Procedure for outputting the converted value;
Is a program for executing

また本発明の補正プログラムは、
コンピュータに、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)と、当該試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量が標準固相化率又は標準固相化量と同一の場合における当該試験片での反応時間又は当該試験片からのシグナルの測定時間とを入力する手順;
当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み取り、当該プローブ固相化率又はプローブ固相化量の、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を求める手順;
当該反応時間又は当該測定時間を、当該算出比率で除することにより、当該試験片における実際の反応時間又は測定時間を決定し、これを試験片の反応時間制御部又はシグナル測定部に指示する手順;
を実行させるためのプログラムである。
The correction program of the present invention is
On the computer,
The standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece and the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece are standard. A procedure for inputting a reaction time of the test piece or a measurement time of a signal from the test piece in the case where the solidification rate or the standard solidification amount is the same;
The probe immobilization ratio or the amount of probe immobilization specific to the test piece stored in the information storage unit provided in the test piece or in the information storage unit provided separately from the test piece. A procedure for reading and determining the ratio (calculation ratio) of the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization to the standard immobilization rate or the standard immobilization amount;
Procedure for determining the actual reaction time or measurement time in the test piece by dividing the reaction time or measurement time by the calculated ratio, and instructing this to the reaction time control unit or signal measurement unit of the test piece ;
Is a program for executing

本発明は更に、上記のプログラムが記録された、コンピュータ読み足り可能な記録媒体をも提供する。   The present invention further provides a computer-readable recording medium in which the above program is recorded.

本発明によれば、担体へのプローブの固相化率が分かっている試験片を製造することが可能になるとともに、品質管理が容易になり、更に蛍光標識等をプローブに付与する場合には、固相化率検査用プローブのみに標識し、反応用プローブには標識を付与しないことが本質的に可能であるため、従来の製造方法と比較して製造コストを抑えることが可能になる。またそのように製造された試験片を、本発明の装置、プログラムとともに利用すれば、固相化率の異なる担体を複数利用して測定を行う場合であっても、測定結果の、より正確な定量的解析を行うことが可能になり、信頼性のより高い解析を提供することが可能になる。   According to the present invention, it is possible to produce a test piece in which the solid-phase rate of the probe on the carrier is known, the quality control becomes easy, and further, when a fluorescent label or the like is added to the probe. Since it is essentially possible to label only the solid-phase-immobilization rate test probe and not label the reaction probe, it is possible to reduce the manufacturing cost as compared with the conventional manufacturing method. In addition, if the test piece manufactured in this way is used together with the apparatus and program of the present invention, even when a measurement is performed using a plurality of carriers having different solid phase immobilization rates, the measurement result is more accurate. Quantitative analysis can be performed, and analysis with higher reliability can be provided.

(定義)
本願において「試料物質」とは、解析対象の生体関連物質であって、解析用に調製されているものを意味する。これには、DNA、cDNA、RNA等の核酸;種々のホルモン類、腫瘍マーカー、酵素、抗体、抗原等のタンパク質;及びPNA等の複合体が含まれるが、これらは天然由来の物質であっても、人工的に調製されたものであってもよい。
(Definition)
In the present application, the “sample substance” means a biological substance to be analyzed and prepared for analysis. This includes nucleic acids such as DNA, cDNA, and RNA; various hormones, tumor markers, proteins such as enzymes, antibodies, and antigens; and complexes such as PNA, which are naturally derived substances. May also be prepared artificially.

また、「プローブ」とは、上記の試料物質に対して特異的に結合する性質を有することが知られている物質であり、例えば試料物質が核酸である場合には、プローブは当該核酸の塩基配列と相補的な塩基配列を有する核酸である。プローブと試料物質との組合せのその他の例としては、抗体に対する抗原やその逆の組合せ、リガンドに対するレセプタやその逆の組合せ、更には転写因子等の遺伝子発現制御タンパク質に対する、制御配列含有核酸分子やその逆の組合せなどである。   The “probe” is a substance known to have a property of specifically binding to the above sample substance. For example, when the sample substance is a nucleic acid, the probe is a base of the nucleic acid. A nucleic acid having a base sequence complementary to the sequence. Other examples of combinations of probes and sample substances include antigens for antibodies and vice versa, receptors for ligands and vice versa, and regulatory sequence-containing nucleic acid molecules for gene expression control proteins such as transcription factors The reverse is the case.

本発明の生体関連物質用プローブ固相化方法においては前段階として、プローブを固相化する担体の固相化部に前処理を行うことができる。前処理としては、ポリ-L-リジン等の物質で担体の固相化部を処理することが挙げられる。前処理を行って予め担体表面にプローブ中の基(プローブにもともと備わっている基、又は人為的に導入された基、例えばアミノ基)と反応する性質を付与しておく。或いは、このような前処理の代わりに、プローブとの反応性を有する金属酸化膜等を表面に備えた担体を使用することも可能である。   In the probe immobilization method for biologically relevant substances of the present invention, as a pre-stage, pretreatment can be performed on the solid phase immobilization part of the carrier on which the probe is solid phased. Pretreatment includes treating the solid phase part of the carrier with a substance such as poly-L-lysine. Pretreatment is performed in advance to impart a property of reacting with a group in the probe (a group originally provided in the probe, or an artificially introduced group such as an amino group) on the surface of the carrier. Alternatively, instead of such pretreatment, it is also possible to use a carrier having a metal oxide film or the like having reactivity with the probe on the surface.

そして本発明の生体関連物質用プローブの固相化方法においては、まず上記の工程(A)を行う。工程(A)においては、「反応用プローブ」と「固相化率検査用プローブ」の二種類のプローブを担体へ固相化する。反応用プローブとは、試料物質に対して特異的に結合するプローブである。一方、固相化率検査用プローブは、反応用プローブと同一クラスのプローブであって、以下の条件を満たすものである。即ち、
(1)担体への固相化反応に関して、反応用プローブと実質的に同一の性質を有するものであること;更に
(2)プローブが使用される系において、十分な定量性を有すること、好ましくは系内のその他の物質と区別することが可能な、固有のスペクトルを発するものであること。
And in the solid-phase immobilization method of the probe for biological substances of the present invention, first, the above step (A) is carried out. In step (A), two types of probes, “reaction probe” and “immobilization rate test probe”, are immobilized on a carrier. The reaction probe is a probe that specifically binds to a sample substance. On the other hand, the immobilization rate test probe is the same class as the reaction probe and satisfies the following conditions. That is,
(1) The solid phase reaction on the carrier has substantially the same properties as the reaction probe; and (2) has sufficient quantitativeness in the system in which the probe is used, preferably Must emit a unique spectrum that can be distinguished from other substances in the system.

これらの条件を満たす固相化率検査用プローブの具体例としては、反応用プローブが核酸分子である場合には、固相化率検査用プローブも核酸分子、反応用プローブがタンパク質である場合には、固相化率検査用プローブもタンパク質であって、更に蛍光標識等を付したものを挙げることができる。より好ましくは固相化率検査用プローブが担体へ固相化されるとともに、同じく担体に固相化される複数種類の反応用プローブのうちの一つと同一種類のプローブであって、更に蛍光標識等を付したものを挙げることができる。付加する標識としては、蛍光色素以外にも、特徴的な分光学スペクトルを発する基や、放射性標識が可能である。ここで、固相化率検査用プローブに付する標識や基は、試料物質との反応及び担体との反応に実質的に影響しない形態でプローブに取り付けることが必要である。本発明においては、固相化率検査用プローブのみに標識を付与し、反応用プローブには標識を一切付与しないこととすることが本質的に可能である。   As a specific example of the probe for immobilization rate satisfying these conditions, when the reaction probe is a nucleic acid molecule, the immobilization rate test probe is also a nucleic acid molecule, and the reaction probe is a protein. The solid phase-immobilization rate test probe is also a protein and can be further labeled with a fluorescent label or the like. More preferably, the immobilization rate test probe is immobilized on a carrier, and is the same type of probe as one of a plurality of types of reaction probes that are also immobilized on the carrier, and further a fluorescent label The thing which attached | subjected etc. can be mentioned. As a label to be added, in addition to a fluorescent dye, a group that emits a characteristic spectroscopic spectrum or a radioactive label can be used. Here, the label or group to be attached to the probe for immobilization rate inspection needs to be attached to the probe in a form that does not substantially affect the reaction with the sample substance and the reaction with the carrier. In the present invention, it is essentially possible to give a label only to the probe for immobilization rate test and not to give any label to the probe for reaction.

担体へのプローブの固相化は、当該技術分野で知られる方法において、スポッター等を使用して行うことができる。より具体的には、プローブが核酸分子である場合には、例えば3’末端にアミノ基を予め導入しておいたプローブの必要量を担体上の所定のスポットへ供給して、当該アミノ基と、担体上に予め導入しておいたポリ-L-リジンとの間で結合を生じさせることにより、プローブを固相化することができる。   The probe can be immobilized on the support using a spotter or the like in a method known in the art. More specifically, when the probe is a nucleic acid molecule, for example, a necessary amount of a probe having an amino group introduced in advance at the 3 ′ end is supplied to a predetermined spot on the carrier, The probe can be solid-phased by forming a bond with poly-L-lysine previously introduced onto the carrier.

担体へのプローブの供給後は、上記の工程(B)を行う。定量は、プローブが使用される系において、系内のその他の物質と区別することが可能なプローブ固有のスペクトルを測定することにより行われ、より具体的にはプローブの標識、例えば蛍光標識に由来するシグナルを測定することにより行われる。定量は、測定値(シグナル強度)を、プローブ供給量を間接的に表すものとしてそのまま使用することや、又は、予め準備しておいた検量線に当てはめて、工程(A)で供給されたプローブの絶対量に換算することも可能である。検量線を利用する場合には、プローブ供給量と、測定シグナルとの間に線形性が確保される量において行うことが望ましい。これらの方法とは異なり、供給するプローブ溶液の均一性と、スポッターによるプローブ供給量の正確性が保証されている場合には、プローブ溶液の濃度とスポッターの供給量とを確認する工程とすることもできる。この場合、この工程においては固相化率検査用プローブに固有のスペクトルを測定するのではなく、上記のプローブ溶液濃度とプローブ供給量を、適宜、下記の情報保存部や、別途試験片製造システムに接続されたコンピュータの記録部等に記録して、後の固相化率の算出工程に供する工程とすることができる。   After supplying the probe to the carrier, the above step (B) is performed. The quantification is performed by measuring a probe-specific spectrum that can be distinguished from other substances in the system in which the probe is used, and more specifically, derived from a probe label, such as a fluorescent label. This is done by measuring the signal to be transmitted. For quantification, the measured value (signal intensity) is used as it is indirectly representing the probe supply amount, or the probe supplied in step (A) is applied to a calibration curve prepared in advance. It is also possible to convert to the absolute amount. When using a calibration curve, it is desirable that the linearity be ensured between the probe supply amount and the measurement signal. Unlike these methods, when the uniformity of the probe solution to be supplied and the accuracy of the probe supply amount by the spotter are guaranteed, the step of checking the concentration of the probe solution and the supply amount of the spotter You can also In this case, in this step, the spectrum specific to the probe for immobilization rate inspection is not measured, but the probe solution concentration and the probe supply amount are appropriately set according to the following information storage unit or a separate test piece manufacturing system. This can be recorded in a recording unit or the like of a computer connected to, and used as a process for calculating the solid phase rate later.

次に、上記の工程(C)を行う。洗浄は、上記工程(A)で供給されたプローブと担体との間の固相化反応が平衡に達すると考えられる時間の経過後に行うことが望ましい。通常は、工程(A)及び(B)を行う時間の経過後に当該反応が平衡に達している条件で、上記工程(A)及び(B)を行うことが好ましいが、反応が平衡に達する時間が、上記工程(A)及び(B)の合計時間よりも長いと考えられる場合には、本工程(C)においては、適切な時間の経過後、即ち平衡状態になったと考えられる時以降に洗浄を開始ことが望ましい。特に、スポット毎の洗浄に時間差が存在するような場合には、反応が平衡に達する前に洗浄を開始してしまうと、スポットごとの固相化量にバラつきが生じ、固相化率検査用プローブの固相化率とは異なる固相化率で、各反応用プローブが担体に固相化されてしまう可能性があるため、望ましくない。   Next, said process (C) is performed. The washing is desirably performed after a lapse of time considered that the solid phase reaction between the probe and the carrier supplied in the step (A) reaches equilibrium. Usually, it is preferable to perform the above steps (A) and (B) under the condition that the reaction has reached equilibrium after the elapse of time for performing steps (A) and (B). Is considered to be longer than the total time of the above steps (A) and (B), in this step (C), after an appropriate time has elapsed, that is, after the time when it is considered that an equilibrium state has been reached. It is desirable to start cleaning. In particular, when there is a time difference in the cleaning of each spot, if the cleaning is started before the reaction reaches equilibrium, the amount of the solid phase for each spot will vary, and the solidification rate test will be performed. Since each reaction probe may be immobilized on the carrier at a solid phase rate different from the solid phase rate of the probe, it is not desirable.

次に、上記の工程(D)を行う。この工程(D)においては、洗浄後に担体に残っているプローブ、即ち洗浄前に担体に供給されたプローブの内、担体に固相化されたと考えられるプローブのみの量を定量する。ここでの定量は、上記工程(B)と同様に、測定値(シグナル強度)を、供給量(相対量)を表すものとしてそのまま使用することや、又は、予め準備しておいた検量線に当てはめて、担体上に固相化されたプローブの絶対量へ換算することも可能である。前者の場合、担体へ供給するプローブの量が常に一定である場合に有効である。一方後者の場合は、担体へのプローブ供給量が担体により異なったり、又は供給量が担体ごとに変動してしまうと考えられる場合にも有効である。この工程で算出されたプローブ固相化量は、適宜、上記のプローブ供給量とともに下記の情報保存部や、別途試験片製造システムに接続されたコンピュータの記録部等に記録して、後の固相化率の算出工程に供することができる。   Next, said process (D) is performed. In this step (D), the amount of the probe remaining on the carrier after washing, that is, only the probe considered to be immobilized on the carrier among the probes supplied to the carrier before washing is quantified. As in the above step (B), the quantification here can be carried out using the measured value (signal intensity) as it is to represent the supply amount (relative amount) or using a calibration curve prepared in advance. It is also possible to convert to the absolute amount of the probe immobilized on the carrier. The former case is effective when the amount of probe supplied to the carrier is always constant. On the other hand, the latter case is also effective when the amount of probe supplied to the carrier varies depending on the carrier, or the amount supplied varies from carrier to carrier. The amount of immobilized probe calculated in this step is appropriately recorded together with the above-mentioned probe supply amount in the following information storage unit, a recording unit of a computer separately connected to the test piece manufacturing system, etc. It can use for the calculation process of a phase conversion rate.

次に、上記の工程(E)を行う。ここで算出される固相化率とは、工程(D)における測定値の、工程(B)における測定値に対する割合のことであり、即ち担体に固相化されたと考えられるプローブに由来するシグナル値(プローブ量)の、担体に供給された全プローブに由来するシグナル値(プローブ量)に対する割合を意味する。担体へのプローブ供給量が、担体によらずに一定である場合には、シグナル値の比率を求めればよく、一方、担体へのプローブ供給量を変化させる場合や、変動量が無視できない場合には、上記工程(B)及び(D)においては、測定シグナルとプローブの実在量との間に線形性が確保される条件下でシグナル測定を行い、検量線で適宜プローブ量を定量し、この量比を求めることが望ましい。   Next, said process (E) is performed. The immobilization rate calculated here is the ratio of the measured value in the step (D) to the measured value in the step (B), that is, a signal derived from the probe that is considered to be immobilized on the carrier. It means the ratio of the value (probe amount) to the signal value (probe amount) derived from all probes supplied to the carrier. When the probe supply amount to the carrier is constant regardless of the carrier, the ratio of the signal values may be obtained. On the other hand, when the probe supply amount to the carrier is changed or when the fluctuation amount cannot be ignored. In the steps (B) and (D), signal measurement is performed under the condition that linearity is ensured between the measurement signal and the actual amount of the probe, and the amount of the probe is appropriately quantified with a calibration curve. It is desirable to determine the quantitative ratio.

次に、上記の工程(F)を行う。上記工程(E)において算出された固相化率は、生体関連物質用試験片の品質管理の点で有益な情報である。従って、これを当該固相化率が算出された担体に備えられた情報保存部に保存しておき、適宜この情報を後の実験や品質管理時に使用することによって、解析結果の補正や、試験片の品質管理を行うことが容易になる。プローブ固相化率とあわせて、プローブ供給量及びプローブ固相化量も当該情報保存部に保存することができる。ここで、「担体に備えられた情報保存部」とは、ICチップやICタグ、バーコード等を含むものである。一方の、「担体とは別個に設けられた情報保存部」とは、生体関連物質用試験片を用いた解析システムで利用するコンピュータシステムにおいて読み取り可能な記憶媒体とすることも可能である。この場合、固相化率を算出した担体に予め割り振られていた識別番号と組にして固相化率を当該読み取り部に記録することが必要である。   Next, said process (F) is performed. The solid-phase ratio calculated in the above step (E) is useful information in terms of quality control of the biological related substance test piece. Therefore, by storing this in the information storage unit provided in the carrier for which the solidification rate has been calculated, and using this information appropriately in subsequent experiments and quality control, correction of analysis results and testing It becomes easy to perform quality control of the pieces. Together with the probe immobilization rate, the probe supply amount and the probe immobilization amount can also be stored in the information storage unit. Here, the “information storage unit provided on the carrier” includes an IC chip, an IC tag, a barcode, and the like. On the other hand, the “information storage unit provided separately from the carrier” may be a storage medium that can be read by a computer system used in an analysis system using a test piece for a biological substance. In this case, it is necessary to record the solid phase rate in the reading unit in combination with an identification number assigned in advance to the carrier for which the solid phase rate has been calculated.

以上の工程(A)〜(F)により、プローブの固相化率等が明確になった、生体関連物質用試験片を製造することが可能になる。   Through the above steps (A) to (F), it is possible to produce a test piece for a biological substance with a solid phase ratio of the probe clarified.

本発明はまた、上記工程(A)〜(E)、並びに、
予め定めておいた最低固相化率と、前記工程(E)において算出されたプローブ固相化率を比較する工程(E’);及び、
当該プローブ固相化率が、当該最低固相化率以上である場合には、
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F)、又は
当該プローブ固相化率が、当該最低固相化率未満である場合には、
当該担体を製造工程より排除するか、又は当該担体が不良であることを示す情報を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、若しくは当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F’);
を含む、生体関連物質用試験片の製造方法をも提供する。
The present invention also provides the above steps (A) to (E), and
A step (E ′) for comparing the predetermined minimum immobilization rate with the probe immobilization rate calculated in the step (E); and
When the probe immobilization rate is equal to or higher than the minimum immobilization rate,
The probe immobilization ratio, as appropriate, the probe supply amount and the probe solid phase immobilization amount are stored in an information storage unit provided in the carrier, or an information storage unit provided separately from the carrier (F) storing together with the identification number of the carrier, or when the probe immobilization rate is less than the minimum immobilization rate,
An information storage unit that is excluded from the manufacturing process, or that stores information indicating that the carrier is defective is stored in an information storage unit provided in the carrier, or is provided separately from the carrier And storing together with the identification number of the carrier (F ′);
There is also provided a method for producing a test piece for a biological substance, comprising:

この製造方法においては、工程(A)〜(E)の後で、予め定めておいた最低固相化率と、上記のプローブ固相化率とを比較して、当該プローブ固相化率が当該最低固相化率以上である場合には、必要十分量のプローブが固相化されたと判断し、前記固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F)を行う。一方、当該プローブ固相化率が当該最低固相化率未満である場合には、品質管理上問題であるため、当該担体についての処理を中止して、その担体を廃棄・再処理等の工程にかけるか、又は当該担体が不良であることを示す情報を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、若しくは当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F’)行う。不良であることを示す情報が情報保存部に保存される場合には、製造工程後の品質管理工程で不良品として、これを他の正常な製品と区別することが可能である。   In this manufacturing method, after the steps (A) to (E), the predetermined solid phase immobilization rate is compared with the probe solid phase immobilization rate. If it is equal to or higher than the minimum immobilization rate, it is determined that a necessary and sufficient amount of the probe has been immobilized, and the immobilization rate, as appropriate, the probe supply amount and the probe immobilization amount, The step (F) of storing in the information storage unit provided in the carrier or storing the information in the information storage unit provided separately from the carrier together with the identification number of the carrier is performed. On the other hand, if the probe immobilization rate is less than the minimum solid phase immobilization rate, it is a quality control problem, so the processing for the carrier is stopped, and the carrier is discarded and reprocessed. Or the information indicating that the carrier is defective is stored in the information storage unit provided in the carrier, or the carrier identification number is provided in the information storage unit provided separately from the carrier. And the step (F ′) of storing together. When information indicating a defect is stored in the information storage unit, it can be distinguished from other normal products as a defective product in a quality control process after the manufacturing process.

本発明はまた、上記工程(A)〜(E)、及び(F)、並びに
前記情報保存部に保存されたプローブ固相化率を、予め定めておいた最低固相化率と比較し、
当該プローブ固相化率が当該最低固相化率以上である場合には、当該プローブ固相化率を有する試験片を、「合格」と判定し、又は
当該プローブ固相化率が当該最低固相化率未満である場合には、当該プローブ固相化率を有する試験片を、「不合格」と判定し、
合格品と不合格品とを分離する
工程(G);
を含む、生体関連物質用試験片の製造方法をも提供する。
The present invention also compares the above-described steps (A) to (E) and (F), and the probe immobilization rate stored in the information storage unit with a predetermined minimum immobilization rate,
When the probe immobilization rate is not less than the minimum immobilization rate, the test piece having the probe immobilization rate is determined as “pass”, or the probe immobilization rate is the minimum immobilization rate. When it is less than the phase rate, the test piece having the probe solid phase rate is determined as “fail”,
A step (G) of separating a pass product and a reject product;
There is also provided a method for producing a test piece for a biological substance, comprising:

上記製造方法においては、工程(A)〜(F)を行った段階で、プローブ固相化率が最低固相化率未満であっても、当該プローブ固相化率を情報保存部に保存する。従って、一定品質以下の試験片を製造ラインから除外するためには、この製造後に、プローブ固相化率を最低固相化率と比較して品質管理を行う工程を行う必要があるが、合格品であるか、不合格品であるかを問わず、一旦、試験片を完成させ、その後に品質管理的な工程を実施している。これにより、当該品質管理的な工程により、純粋な製造工程が影響されないため、製造ラインを簡略化することが可能である。更には、最低固相化率を柔軟に設定することが、この製造方法の場合には可能である。   In the manufacturing method described above, even when the steps (A) to (F) are performed, even if the probe immobilization rate is less than the minimum immobilization rate, the probe immobilization rate is stored in the information storage unit. . Therefore, in order to exclude test pieces of a certain quality or lower from the production line, it is necessary to perform a quality control process after the production by comparing the probe solidification rate with the minimum solidification rate. Regardless of whether it is a product or a rejected product, a test piece is once completed, and then a quality control process is performed. Thus, the production line can be simplified because the pure production process is not affected by the quality control process. Furthermore, in the case of this production method, it is possible to flexibly set the minimum solid phase immobilization rate.

本発明はまた、
担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
当該測定された固有のスペクトル強度を、当該情報保存部に記録されたプローブ固相化率又はプローブ固相化量で補正し、予め定めた標準固相化率又は標準固相化量あたりの値に変換する工程(IV);
を含む、生体関連物質の測定方法を提供する(ここで、情報保存部に記録されたプローブ固相化率で補正する場合には標準固相化率あたりの値に変換し、情報保存部に記録されたプローブ固相化量で補正する場合には、標準固相化量あたりの値にそれぞれ変換する)。
The present invention also provides
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate on the carrier, and the probe supply amount and the probe immobilization amount are appropriately recorded, or the probe immobilization rate, and the probe supply amount and A probe in which the amount of immobilized probe is recorded in an information storage unit provided separately from the carrier together with the identification number of the carrier, and a probe that specifically reacts to the sample substance Supplying the sample substance to the carrier immobilized on the spot (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex that may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time has not dissociated;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
The measured intrinsic spectral intensity is corrected by the probe immobilization rate or probe immobilization amount recorded in the information storage unit, and a predetermined standard immobilization rate or value per standard immobilization amount. Converting to (IV);
(In this case, when correcting with the probe immobilization rate recorded in the information storage unit, it is converted to a value per standard solid phase immobilization rate, and the information storage unit When correcting with the recorded probe immobilization amount, it is converted into a value per standard immobilization amount).

本発明の生体関連物質測定方法においては、まず上記の工程(I)を行う。この工程においては、反応用プローブの中に試料物質と特異的に反応するものが含まれている場合に、これらの間において複合体が形成され、安定に存在する条件を設定することが必要である。ここで反応用プローブは、従来の方法(例えば特許文献2及び特許文献3に記載のもの)とは異なり、標識されている必要はない。反応用プローブの担体に対する固相化率(又は固相化量)は、情報保存部に記録された(固相化率検査用)プローブの固相化率(又は固相化量)から間接的に規定される。   In the biological material measuring method of the present invention, first, the step (I) is performed. In this step, if the reaction probe contains a substance that specifically reacts with the sample substance, it is necessary to set conditions under which a complex is formed and exists stably. is there. Here, unlike conventional methods (for example, those described in Patent Document 2 and Patent Document 3), the reaction probe does not need to be labeled. The immobilization rate (or amount of immobilization) of the reaction probe to the carrier is indirectly determined from the immobilization rate (or immobilization amount) of the probe (for immobilization rate test) recorded in the information storage unit. Stipulated in

しかし、工程(I)においては、反応用プローブとは反応しないもの、反応用プローブや担体表面と非特異的に反応したものも混在しているので、次に、上記の洗浄工程(II)を行う。洗浄は、形成された複合体を解離することがないと考えられる組成・条件において行う。より具体的には、試料物質を含まない点以外は試料溶液と同一の組成の溶液を洗浄溶液とし、上記工程(I)と同様の条件(温度等)とすることができるが、使用する積算容量は、試料溶液の少なくとも数倍であることが好ましい。   However, in the step (I), those that do not react with the reaction probe and those that react non-specifically with the reaction probe or the carrier surface are mixed, so the above washing step (II) is then performed. Do. Washing is performed under a composition and conditions that are considered not to dissociate the formed complex. More specifically, a solution having the same composition as the sample solution except that it does not contain the sample substance can be used as the cleaning solution, and the conditions (temperature, etc.) can be the same as in the above step (I). The volume is preferably at least several times that of the sample solution.

この工程(II)の後、上記複合体を定量すべく、上記の工程(III)を行い、複合体の形成を確認するためのスペクトルを測定する。プローブと試料物質との組合せによっては、それらの間の複合体に固有のスペクトルを測定することが可能な場合があり、この場合には試料物質には特に標識を予め導入する必要はないが、通常は、試料物質に予め導入しておいた蛍光色素等に由来するシグナルを測定する。   After this step (II), the above step (III) is performed to quantify the complex, and a spectrum for confirming the formation of the complex is measured. Depending on the combination of the probe and the sample material, it may be possible to measure the spectrum specific to the complex between them, in which case it is not necessary to introduce a label in advance in the sample material, Usually, a signal derived from a fluorescent dye or the like previously introduced into the sample substance is measured.

次に、上記工程(IV)を行い、測定したスペクトル強度を、測定に供した担体におけるプローブ固相化率又はプローブ固相化量を考慮して補正する。この方法において使用される担体は、その情報保存部にプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が保存されているので、適宜、読み取り手段によりプローブ固相化率等を読み取る。読み取ったプローブ固相化率又はプローブ固相化量を、予め定めた標準固相化率又は標準固相化量でそれぞれ除することにより、それぞれ標準固相化率又は標準固相化量当たりの値に変換する。担体へのプローブ供給量が常に一定であるような場合には、プローブ固相化率及び標準固相化率を利用することが可能であるが、一方、担体へのプローブ供給量が担体ごとに変動しているような場合には、プローブ供給量及び標準固相化量を利用して、変換を行う。   Next, the above step (IV) is performed, and the measured spectral intensity is corrected in consideration of the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization in the carrier subjected to the measurement. Since the carrier used in this method stores the probe immobilization rate and the probe supply amount and the probe immobilization amount as appropriate in the information storage unit, the probe immobilization rate etc. Read. By dividing the read probe immobilization rate or probe immobilization amount by the predetermined standard immobilization rate or standard immobilization amount, respectively, the standard immobilization rate or standard immobilization amount Convert to value. When the amount of probe supplied to the carrier is always constant, the probe immobilization rate and the standard immobilization rate can be used. On the other hand, the probe supply amount to the carrier is different for each carrier. If it fluctuates, conversion is performed using the probe supply amount and the standard solid phase amount.

上記測定方法においては、測定したシグナルを、測定後に補正しているが、これとは異なり、固相化率又は固相化量を考慮して、試験片での試料物質とプローブとの反応時間を調節するか、又は試験片からのシグナルの測定時間を調節することも可能である。   In the above measurement method, the measured signal is corrected after measurement, but unlike this, the reaction time between the sample substance and the probe on the test piece in consideration of the solidification rate or solidification amount. It is also possible to adjust the measurement time of the signal from the test piece.

即ち上記工程(I)乃至(IV)を含む測定方法において、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量のそれぞれに関しての標準値(それぞれ標準固相化率、標準固相化量)に対する、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量の比率(算出比率)により、当該標準固相化率又は当該標準固相化量と同一の固相化率又は固相化量を有する試験片の場合の予め定めた標準反応時間を除することにより求めた時間を、前記工程(I)の開始から前記工程(II)の開始までの反応時間として、前記工程(I)及び(II)を行う
ことにより、プローブ固相化率又はプローブ固相化量の違いを考慮した反応時間を決定し、測定を行うことが可能である。
That is, in the measurement method including the steps (I) to (IV),
The probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece relative to the standard values (standard immobilization rate and standard immobilization amount, respectively) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece, respectively. The predetermined standard reaction time in the case of a test piece having the same solid phase immobilization rate or solid phase immobilization amount as the standard solid immobilization rate or the standard solid immobilization amount is divided by the ratio (calculation ratio) of By performing the steps (I) and (II) as the reaction time from the start of the step (I) to the start of the step (II) It is possible to determine and measure the reaction time in consideration of the difference in the amount of acidification.

また、上記工程(I)乃至(IV)を含む測定方法において、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量のそれぞれに関しての標準値(それぞれ標準固相化率、標準固相化量)に対する、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量の比率(算出比率)により、当該標準固相化率又は当該標準固相化量と同一の固相化率又は固相化量を有する試験片の場合の予め定めた標準測定時間を除することにより求めた時間を、前記工程(III)の測定時間として前記工程(III)を行う
ことにより、プローブ固相化率又はプローブ固相化量の違いを考慮した測定時間を決定し、測定を行うことが可能である。
In the measurement method including the steps (I) to (IV),
The probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece relative to the standard values (standard immobilization rate and standard immobilization amount, respectively) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece, respectively. The standard measurement time in the case of a test piece having the same solid phase immobilization rate or solid phase immobilization amount as the standard solid immobilization rate or the standard solid immobilization amount is divided by the ratio (calculation ratio) of By performing the step (III) with the time obtained by the above as the measurement time of the step (III), the measurement time considering the difference in the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization is determined and measured. It is possible.

本発明は更に、図6に一態様が示されているような、生体関連物質の検出装置であって、
生体関連物質検出用試験片へ流体を供給、及び当該試験片より流体を排除するための流体輸送部;
当該試験片における反応温度を制御する温度調節部;
当該試験片への光源;
当該試験片からのスペクトルを検出するためのスペクトル検出部;
当該試験片に備えられた情報保存部、又は当該試験片とは別個に備えられた情報保存部中に保存された情報を読み取るための試験片情報読取り部;及び
当該スペクトル検出部で検出したシグナル強度を、当該試験片情報読取り部に保存された情報に基づき補正するための、シグナル補正アプリケーションが保存された記憶部;
を含み、コンピュータにより制御されるものも提供する。
The present invention further relates to an apparatus for detecting a biological substance as shown in FIG.
A fluid transport unit for supplying a fluid to a test piece for detecting a biological substance and for removing the fluid from the test piece;
A temperature control unit for controlling the reaction temperature in the test piece;
Light source to the specimen;
A spectrum detector for detecting a spectrum from the test piece;
An information storage unit provided in the test piece, or a test piece information reading unit for reading information stored in an information storage unit provided separately from the test piece; and a signal detected by the spectrum detection unit A storage unit storing a signal correction application for correcting the intensity based on the information stored in the test piece information reading unit;
And those controlled by a computer are also provided.

本発明の、生体関連物質の検出装置に備えられている流体輸送部は、試料物質溶液貯蔵部(図示せず)に貯蔵されている試料物質溶液を漏れなく試験片へ供給し、且つ試験片よりこれを排除するためのものである。これは、好ましくはμl単位の溶液の輸送に適したポンプを使用した流量制御システムにより、その供給量や供給速度(流速)等が調節されるものである。また、試料溶液貯蔵部及び流体輸送部は、温度調節機能を備えていることが好ましい。   The fluid transport unit provided in the biological material detecting device of the present invention supplies the sample material solution stored in the sample material solution storage unit (not shown) to the test piece without leakage, and the test piece. This is to eliminate this more. This is preferably such that the supply amount, supply speed (flow velocity), etc. are adjusted by a flow rate control system using a pump suitable for transporting a solution of μl. Moreover, it is preferable that the sample solution storage part and the fluid transport part have a temperature control function.

本発明の、生体関連物質の検出装置に備えられている温度調節部は、試験片において行われる反応温度を制御するものであり、好ましくは、0.1℃程度の単位で温度設定できるものである。また、上記の試料溶液貯蔵部及び流体輸送部の温度調節機能と連動していることが望ましい。   The temperature control unit provided in the biological substance detection device of the present invention controls the reaction temperature performed on the test piece, and preferably can set the temperature in units of about 0.1 ° C. is there. In addition, it is desirable to link with the temperature control function of the sample solution storage unit and the fluid transport unit.

本発明の、生体関連物質の検出装置に備えられている光源は、検出すべきスペクトルを発生させるのに適した波長の光線を発するものであり、検出すべき標識等の分光学的性質に応じて選択されるものである。   The light source provided in the biological material detection apparatus of the present invention emits a light beam having a wavelength suitable for generating a spectrum to be detected, and depends on spectroscopic properties such as a label to be detected. Is selected.

本発明の、生体関連物質の検出装置に備えられているスペクトル検出部は、プローブ-試料物質複合体から発せられるシグナルを検出するためのものであり、例えば試料物質に導入された蛍光標識からのシグナルを検出する場合には、CCDカメラ等とすることができる。また、このスペクトル検出部で検出されたシグナルは、適切な電気信号に変換されて、コンピュータ等の制御装置に送信される。   The spectrum detection unit provided in the biologically relevant substance detection device of the present invention is for detecting a signal emitted from a probe-sample substance complex, for example, from a fluorescent label introduced into the sample substance. In the case of detecting a signal, a CCD camera or the like can be used. The signal detected by the spectrum detection unit is converted into an appropriate electrical signal and transmitted to a control device such as a computer.

本発明の、生体関連物質の検出装置に備えられている試験片情報読取り部は、情報保存部がICチップやICタグである場合には、専用の読取器であり、情報保存部がバーコードである場合には、バーコードリーダである。   The test piece information reading unit provided in the biologically relevant substance detection device of the present invention is a dedicated reader when the information storage unit is an IC chip or an IC tag, and the information storage unit is a barcode. Is a bar code reader.

本発明の、生体関連物質の検出装置に備えられている、シグナル補正アプリケーションが保存された記憶部は、本検出装置を制御するコンピュータにおいて読み取り可能な記憶媒体である。   The storage unit in which the signal correction application stored in the biological material-detecting device of the present invention is stored is a computer-readable storage medium that controls the detection device.

本発明はまた、測定シグナル補正プログラムであって、
コンピュータに、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)を入力する手順;
当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み取り、当該プローブ固相化率又は当該プローブ固相化量の、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を求めて、適宜、当該算出比率を当該情報保存部に記憶し、更にこれを読み取る手順;
当該試験片からの測定シグナル値を読み取り、これを当該算出比率で除することにより、標準固相化率又は標準固相化量あたりの値(変換値)を求める手順;及び、
当該変換値を出力する手順;
を実行させるための、測定シグナル補正プログラムをも提供する。
The present invention also provides a measurement signal correction program,
On the computer,
A procedure for inputting a standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece;
The probe immobilization ratio or the amount of probe immobilization specific to the test piece stored in the information storage unit provided in the test piece or in the information storage unit provided separately from the test piece. Reading, obtaining the ratio (calculation ratio) of the probe immobilization rate or the probe immobilization amount with respect to the standard immobilization rate or the standard immobilization amount, and appropriately calculating the calculated ratio as the information storage unit Procedure for storing and reading this;
A procedure for obtaining a standard solid phase immobilization rate or a value per standard solid phase immobilization amount (conversion value) by reading a measured signal value from the test piece and dividing this by the calculated ratio; and
Procedure for outputting the converted value;
A measurement signal correction program is also provided.

本発明の測定シグナル補正プログラムがインストールされたコンピュータのCPUは、メインメモリ中の本プログラムからの指令を受けて、まずユーザに、キーボードなどの入力装置から、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)を入力することを促し、入力された値を出力装置上に表示する。   The CPU of the computer in which the measurement signal correction program of the present invention is installed receives a command from the program in the main memory, and first asks the user from the input device such as a keyboard, the probe solid phase ratio or the probe. The user is prompted to input a standard value (standard solidification rate or standard solidification amount) regarding the amount of solid phase, and the input value is displayed on the output device.

上記値が入力されたかどうかを判断し、入力された場合には、CPUは本プログラムからの指令を受けて、読取手段を介し、当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存された、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み出す。当該プローブ固相化率又は当該プローブ固相化量が読み出されると、CPUは、これらの何れかの、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を算出して、適宜、この算出比率を当該情報保存部へと記録する。   The CPU determines whether or not the above value has been input. If the value is input, the CPU receives an instruction from the program, and reads the information storage unit provided in the test piece or the test piece via the reading unit. Read out the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization unique to the test piece, which is stored in an information storage unit provided separately. When the probe immobilization rate or the probe immobilization amount is read, the CPU calculates a ratio (calculation ratio) of any of these to the standard immobilization rate or the standard immobilization amount. The calculation ratio is recorded in the information storage unit as appropriate.

次にCPUは、試験片からのシグナルを測定するシグナル測定手段からシグナル測定値が送信されたかを判断し、送信された場合にはその信号を受け、メモリに保持又は情報保存部に保存されている上記算出比率を読み出す。そしてCPUは、当該シグナル測定値を、当該算出比率で除する計算を行うことにより、標準固相化率又は標準固相化量あたりの値(変換値)を算出し、これをユーザ及び出力装置に出力する。   Next, the CPU determines whether the signal measurement value is transmitted from the signal measuring means for measuring the signal from the test piece, and when it is transmitted, receives the signal and holds it in the memory or stored in the information storage unit. Read the calculated ratio. And CPU calculates the value (conversion value) per standard solidification rate or standard solidification amount by performing the calculation which divides the said signal measurement value by the said calculation ratio, This is a user and an output device. Output to.

以上の手順を実行することにより、試験片ごとにバラつきのあるプローブ固相化率を考慮した、シグナル測定値の補正値を求めることが可能になり、これを利用したシステムにおいては、プローブ固相化率の異なる複数の試験片を利用した場合であっても、試料物質の検出を定量的に行うことが可能になる。   By executing the above procedure, it becomes possible to obtain a correction value of the signal measurement value in consideration of the probe immobilization rate that varies from specimen to specimen. Even when a plurality of test pieces having different conversion rates are used, the sample substance can be detected quantitatively.

本発明は更に、プログラムであって、
コンピュータに、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)と、当該試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量が標準固相化率又は標準固相化量と同一の場合における当該試験片での反応時間又は当該試験片からのシグナルの測定時間とを、入力する手順;
当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み取り、当該プローブ固相化率又はプローブ固相化量の、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を求め、適宜、当該算出比率を当該情報保存部に記憶し、更にこれを読み取る手順;
当該反応時間又は当該測定時間を、当該算出比率で除することにより、当該試験片における実際の反応時間又は測定時間を決定し、これを試験片の反応時間制御部又はシグナル測定部に指示する手順;
を実行させるためのプログラムを提供する。
The present invention further comprises a program comprising:
On the computer,
The standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece and the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece are standard. A procedure for inputting a reaction time in the test piece or a measurement time of a signal from the test piece in the case where the solidification rate or the standard solidification amount is the same;
The probe immobilization ratio or the amount of probe immobilization specific to the test piece stored in the information storage unit provided in the test piece or in the information storage unit provided separately from the test piece. Reading, obtaining the ratio (calculation ratio) of the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization to the standard immobilization ratio or the standard immobilization amount, and appropriately storing the calculated ratio in the information storage unit And further reading this procedure;
Procedure for determining the actual reaction time or measurement time in the test piece by dividing the reaction time or measurement time by the calculated ratio, and instructing this to the reaction time control unit or signal measurement unit of the test piece ;
Provide a program to execute.

本発明のプログラムがインストールされたコンピュータのCPUは、メインメモリ中の本プログラムからの指令を受けて、まずユーザに、キーボードなどの入力装置から、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)と、当該試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量が標準固相化率又は標準固相化量と同一の場合における当該試験片での反応時間又は当該試験片からのシグナルの測定時間とを入力することを促し、入力された値を出力装置上に表示する。   The CPU of the computer in which the program of the present invention is installed receives a command from the program in the main memory, and first asks the user from the input device such as a keyboard, the probe immobilization rate of the test piece or the probe immobilization. The standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the amount and the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece are the same as the standard immobilization rate or standard immobilization amount. In this case, the user is prompted to input the reaction time of the test piece or the measurement time of the signal from the test piece, and the input value is displayed on the output device.

上記値が入力されたかどうかを判断し、入力された場合には、CPUは本プログラムからの指令を受けて、読取手段を介し、当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み出す。当該プローブ固相化率又はプローブ固相化量が読み出されると、CPUは、これらの何れかの、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を算出して、適宜、この算出比率を当該情報保存部へと記録する。   The CPU determines whether or not the above value has been input. If the value is input, the CPU receives an instruction from the program, and reads the information storage unit provided in the test piece or the test piece via the reading unit. Reads out the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization specific to the test piece, which is stored in an information storage unit provided separately. When the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization is read, the CPU calculates the ratio (calculation ratio) of any of these to the standard immobilization rate or the standard immobilization amount, The calculation ratio is recorded in the information storage unit as appropriate.

CPUは次に、当該反応時間又は当該測定時間を、当該算出比率で除する計算を行うことにより、当該試験片における実際の反応時間又は測定時間を算出し、これを試験片の反応時間制御部又はシグナル測定部に指示する。   Next, the CPU calculates the actual reaction time or measurement time in the test piece by dividing the reaction time or the measurement time by the calculation ratio, and calculates the reaction time control unit of the test piece. Alternatively, the signal measurement unit is instructed.

上記の手順を実行することにより、本プログラムは、試験片ごとにバラつきがあるプローブ固相化率を考慮して、試料の反応時間又はシグナルの測定時間を補正することが可能になる。従って、本プログラムを実行しつつ測定されたシグナル値は、互いにプローブ固相化率を考慮して変換した値となっていることから、プローブ固相化率の異なる複数の試験片を利用した場合であっても、試料物質の検出を定量的に行うことが可能になる。   By executing the above procedure, the present program can correct the sample reaction time or the signal measurement time in consideration of the probe immobilization rate that varies from specimen to specimen. Therefore, the signal value measured while executing this program is a value converted in consideration of the probe immobilization rate, so when using multiple test pieces with different probe immobilization rates Even so, it is possible to quantitatively detect the sample substance.

上記プログラムを実行するコンピュータ、及び上記検出装置に備えられているコンピュータは、それぞれ本プログラムやその他の必要なプログラムであって、コンピュータ読取り可能な記録媒体に記録されたものを読み出して実行することにより、それぞれ適切な処理が行われ、適切な機能が発揮されるものである。ここで、コンピュータ読取り可能な記録媒体とは、磁気ディスク、光磁気ディスク、CD−ROM、DVD−ROM、半導体メモリ等をいう。また、上記プログラムは、通信回線によりコンピュータへ送信し、この配信を受けたコンピュータが当該プログラムを実行するような態様とすることも可能である。   The computer that executes the program and the computer that is included in the detection apparatus read and execute the program and other necessary programs recorded on a computer-readable recording medium. Each of them is subjected to appropriate processing and an appropriate function is exhibited. Here, the computer-readable recording medium means a magnetic disk, a magneto-optical disk, a CD-ROM, a DVD-ROM, a semiconductor memory, or the like. Further, the program may be transmitted to a computer via a communication line, and the computer that receives the distribution may execute the program.

スライドガラス担体にポリ-L-リジンをコーティングし、100種類の既知の特異的結合物質である無標識のオリゴDNA(反応用プローブ)と、1種類の既知の、5’にFITC標識したオリゴDNA(固相化率検査用プローブ)を、インクジェット方式のスポッターを用いてそれぞれ担体上の所定の位置に供給した。反応用プローブ及び固相化率検査用プローブはともに、3’にアミノ基を付加した。反応用プローブは60mer、50μM水溶液とし、固相化率検査用プローブは30mer、5μM水溶液とした。   A slide glass carrier is coated with poly-L-lysine, 100 kinds of known specific binding substances, unlabeled oligo DNA (probe for reaction), and one kind of known 5 ′ FITC-labeled oligo DNA The (immobilization rate inspection probe) was supplied to a predetermined position on the carrier using an inkjet spotter. In both the reaction probe and the probe for inspecting the solid phase, an amino group was added to 3 '. The reaction probe was a 60 mer, 50 μM aqueous solution, and the solid phase immobilization rate test probe was a 30 mer, 5 μM aqueous solution.

蛍光顕微鏡(OLYMPUS社製BX51WI、キューブWIBA)で固相化率検査用プローブのFITC標識を励起させ、CCDカメラ(撮影時間500ms)で撮影し蛍光強度を測定した。この値を以後、「プローブ供給量」と呼ぶ。   The FITC label of the probe for solid phase immobilization rate was excited with a fluorescence microscope (BX51WI, cube WIBA manufactured by OLYMPUS), photographed with a CCD camera (photographing time 500 ms), and the fluorescence intensity was measured. This value is hereinafter referred to as “probe supply amount”.

該スライドガラスをPBS緩衝液及び滅菌水に順次浸漬して、該スライドガラスに固相化されなかった反応用プローブ及び固相化率検査用プローブとを、該スライドガラスより除去し、更に該スライドガラスを乾燥機にて乾燥させDNAチップを作製した。   The slide glass is sequentially immersed in PBS buffer solution and sterilized water, and the reaction probe and the solid phase immobilization rate test probe that have not been immobilized on the slide glass are removed from the slide glass, and further the slide The glass was dried with a dryer to produce a DNA chip.

乾燥後、蛍光顕微鏡(OLYMPUS製BX51WI、キューブWIBA)で固相化率検査用プローブのFITC標識を励起させ、CCDカメラで撮影し蛍光強度を測定した。この値を以後、「プローブ固相化量」と呼ぶ。   After drying, the FITC label of the probe for immobilization test was excited with a fluorescence microscope (BX51WI, cube WIBA manufactured by OLYMPUS), photographed with a CCD camera, and the fluorescence intensity was measured. This value is hereinafter referred to as “probe immobilized amount”.

次に、以下の式を用いて、プローブ固相化率を求めた。
プローブ固相化率(%)=(プローブ固相化量/プローブ供給量)×100
Next, the probe immobilization rate was determined using the following equation.
Probe immobilization rate (%) = (probe immobilization amount / probe supply amount) × 100

上記の一連の操作を、1日当たりスライドガラス10枚に対して行い、これを5日間連続して行うことにより、合計で50枚のDNAチップを作製した。これらのDNAチップのそれぞれについてのプローブ固相化率の結果を図1に示した。   The above-described series of operations was performed on 10 slide glasses per day, and this was continuously performed for 5 days, thereby producing a total of 50 DNA chips. The results of the probe immobilization rate for each of these DNA chips are shown in FIG.

図1においては、No.1〜10のチップは一日目に、No11〜20のチップは二日目に、No.21〜30のチップは三日目に、No.31〜40のチップは四日目に、そしてNo.41〜50のチップは五日目にそれぞれ作製されたものを示している。   In FIG. 1, the chips No. 1 to 10 are on the first day, the chips No. 11 to 20 are the second day, the chips No. 21 to 30 are the third day, and the chips No. 31 to 40 are On the fourth day, and the chips No. 41 to 50 indicate those produced on the fifth day.

図1から分かるとおり、作製した日にちによって、プローブ固相化率にバラつきがあることが判る。これは、チップを作製した日によってスポット時の温度・湿度等の条件が異なり、固相化反応速度等に無視できない差異が存在したためと推測される。また、作製した日の環境等や条件により、スライドガラスにコーティングしたポリ-L-リジンの量にバラつきが生じたことも要因と考えられる。
また、同一作製日におけるスライドガラスにコーティングしたポリ-L-リジンの量のバラつきは、異なる作製日でのバラつきほど大きくはないものの、同一作製日におけるプローブ固相化率のバラつきの要因の1つとなっていると考えられる。
As can be seen from FIG. 1, it can be seen that there is a variation in the probe immobilization rate depending on the date of preparation. This is presumed to be because the conditions such as temperature and humidity at the time of spotting differ depending on the day when the chip was manufactured, and there were non-negligible differences in the solid phase reaction rate and the like. Another possible cause is that the amount of poly-L-lysine coated on the slide glass varies depending on the environment and conditions of the day of manufacture.
In addition, the variation in the amount of poly-L-lysine coated on the slide glass on the same production date is not as large as the variation on the different production dates, but it is It is thought that it has become.

次に、作製した全てのDNAチップを、FITC標識したランダムオリゴDNA(試料物質;30mer、100nmol)の1M NaCl/50mMリン酸緩衝液に25℃で3時間浸漬させて、担体に固相化された反応用プローブとのハイブリダイゼーション反応を行った。その後、スライドガラスを1M NaCl/50mMリン酸緩衝液で洗浄して、蛍光顕微鏡(OLYMPUS製BX51WI、キューブWIBA)とCCDカメラで撮影し、プローブとハイブリダイズした試料物質の蛍光強度を測定した。   Next, all the prepared DNA chips were immersed in FITC-labeled random oligo DNA (sample material; 30 mer, 100 nmol) in 1 M NaCl / 50 mM phosphate buffer at 25 ° C. for 3 hours to be immobilized on a carrier. Hybridization reaction with the reaction probe was performed. Thereafter, the slide glass was washed with 1 M NaCl / 50 mM phosphate buffer, photographed with a fluorescence microscope (BX51WI, cube WIBA manufactured by OLYMPUS) and a CCD camera, and the fluorescence intensity of the sample substance hybridized with the probe was measured.

図2は、プローブ固相化率に差異のある複数の担体(図1に固相化率が示されているもの)を用いて、これらの担体上の反応用プローブとのハイブリダイゼーション反応に供した100種類の試料物質のうちから選択した4種類の試料物質についての蛍光強度と、各担体のプローブ固相化率との関係を示すものである。この図からは、蛍光強度、即ち担体にハイブリダイズした試料物質の量は、反応用プローブの種類に関わらず、固相化率検査用プローブの固相化率に比例していることが判る。このことは、それぞれのDNAチップ内における、反応用プローブと、固相化率検査用プローブとの、担体への固相化率は等しいことを示しており、固相化率検査用プローブの固相化率をもってして、反応用プローブの固相化率を規定し、これをDNAチップ(試験片)の品質情報として有効に利用することが可能なことを意味している。   FIG. 2 shows the use of a plurality of carriers having different probe immobilization rates (showing the immobilization rate in FIG. 1) for the hybridization reaction with reaction probes on these carriers. The relationship between the fluorescence intensity about 4 types of sample materials selected from the 100 types of sample materials and the probe solid-phase rate of each support | carrier is shown. From this figure, it can be seen that the fluorescence intensity, that is, the amount of the sample substance hybridized to the carrier, is proportional to the solidification rate of the probe for immobilization rate test regardless of the type of the probe for reaction. This indicates that the reaction probe and the immobilization rate test probe in each DNA chip have the same immobilization rate on the carrier, and the immobilization rate test probe is immobilized. This means that the solidification rate of the reaction probe is defined by the phase rate and can be effectively used as quality information of the DNA chip (test piece).

ここで、同一条件でハイブリダイズをした場合の試験結果は、どのDNAチップでも等しいことが望まれる。しかしながら現実には、必ずしも制御できない条件が存在することから、全てのDNAチップにおいてプローブの固相化率を同一にすることは困難である。従ってこの対策として、固相化率検査用プローブの固相化率をある一定の範囲で合格基準を設けることにより、製造される試験片のハイブリダイズ能のバラつきを低減することが可能である。例えば、固相化率検査用プローブの固相化率の合格範囲を基準値+/-5%とすると、反応用プローブの固相化量のバラつき、即ち反応用プローブへの試料物質のハイブリダイズ量も同様に、約+/-5%程度に抑えられると考えられ、定量性の要求される実験において精度の高い結果を与えることが可能となる。   Here, it is desirable that the test results when hybridizing under the same conditions are the same for all DNA chips. However, in reality, since there are conditions that cannot always be controlled, it is difficult to make the solid phase immobilization ratios of the probes uniform in all DNA chips. Therefore, as a countermeasure against this, it is possible to reduce the variation in the hybridization ability of the test specimens to be manufactured by providing acceptance criteria within a certain range for the solid phase ratio of the probe for solid phase ratio test. For example, if the acceptable range of the immobilization rate of the probe for immobilization rate is the reference value +/− 5%, the amount of immobilization of the reaction probe varies, that is, the sample substance hybridizes to the reaction probe. Similarly, the amount is considered to be suppressed to about +/− 5%, and it is possible to give a highly accurate result in an experiment that requires quantitativeness.

上記実施例1で作製したDNAチップ50枚について、固相化率の標準値を45%とし、この標準値に対する各DNAチップの固相化率の比(補正値と呼ぶ)を算出した。各反応用プローブへハイブリダイズした試料物質に由来する蛍光強度(生データと呼ぶ)について、以下の式を用いて補正データを算出した。
補正データ:生データ/補正値
For the 50 DNA chips prepared in Example 1, the standard value of the solid phase immobilization rate was set to 45%, and the ratio of the solid phase immobilization rate of each DNA chip to this standard value (called correction value) was calculated. Correction data was calculated using the following formula for the fluorescence intensity (referred to as raw data) derived from the sample substance hybridized to each reaction probe.
Correction data: Raw data / correction value

図3は、それぞれのDNAチップ上における、ある反応用プローブとハイブリダイズした試料物質からの蛍光強度を生データのまま示したものである。図4は、補正データを利用して図3の結果を示したものである。   FIG. 3 shows the fluorescence intensity from the sample substance hybridized with a certain reaction probe on each DNA chip as raw data. FIG. 4 shows the result of FIG. 3 using correction data.

図3及び図4の比較から分かるように、プローブの固相化率を考慮して求めた補正値を利用することで、結果の定量性がより向上した。図3のグラフでは、生データのバラつきは、CV値約20%であったが、図4の補正データを用いた場合には、バラつきは、CV値約1%にまで減少した。   As can be seen from the comparison between FIG. 3 and FIG. 4, the quantification of the results was further improved by using the correction value obtained in consideration of the solid phase ratio of the probe. In the graph of FIG. 3, the variation of the raw data was about 20% of the CV value. However, when the correction data of FIG. 4 was used, the variation was reduced to about 1% of the CV value.

上記実施例1で作製したDNAチップ50枚について、上記実施例2と同様に補正値を得たが、この実施例においては、測定した生データの補正に補正データを使用するのではなく、固相化率の比率を考慮して、各スポットにおける最適の撮影時間を決定した。即ち、以下の式を用いて、各DNAチップの最適撮影時間を算出した。
最適撮影時間:500ms/補正値
Correction values were obtained for 50 DNA chips prepared in Example 1 in the same manner as in Example 2. However, in this example, correction data is not used for correction of measured raw data, but is fixed. Considering the ratio of the phase ratio, the optimum shooting time at each spot was determined. That is, the optimum photographing time for each DNA chip was calculated using the following formula.
Optimal shooting time: 500 ms / correction value

このように算出された、各スポット毎の最適撮影時間を用いて、全てのDNAチップを再度撮影し、プローブ毎ごとのハイブリダイズ量(以後、適正撮影時間データと呼ぶ)を出力した結果を図5に示した。この図においても図4の場合と同様に、ハイブリダイズした量のバラつきが少ない結果が得られた。図5においては、データ間のバラつきは、CV値約1%であった。   Using the optimal imaging time for each spot calculated in this way, all DNA chips were imaged again, and the results of outputting the amount of hybridization for each probe (hereinafter referred to as appropriate imaging time data) are shown in FIG. This is shown in FIG. Also in this figure, as in the case of FIG. 4, the results were obtained in which the amount of hybridization was small. In FIG. 5, the variation between the data was about 1% of the CV value.

このように、プローブの固相化率を考慮することで算出された適正撮影時間で撮影することで、プローブ固相化率に起因したデータのバラつきを少なくすることが可能となった。   As described above, it is possible to reduce the variation in data caused by the probe immobilization rate by taking an image with an appropriate imaging time calculated by considering the probe immobilization rate.

実施例1と同様の方法により、DNAチップを50枚作製した。全てのDNAチップにはそれぞれのプローブ固相化率の値が入力されたバーコードが付されている。
全てのDNAチップについて、図6に概略が示されている測定システムを利用して、実施例1と同様の条件でハイブリダイゼーションを行った。図中の制御装置には、記録部が備えられており、ここにDNAチップ全50枚の生データを記録した。各生データは、実施例2と同様の方法により、バーコードリーダが読み取った各DNAチップ固有のプローブ固相化率で補正され、出力装置に補正値を出力し、且つ記録部に記録した。
50 DNA chips were produced in the same manner as in Example 1. All DNA chips are attached with barcodes in which the values of the respective probe immobilization rates are input.
All DNA chips were hybridized under the same conditions as in Example 1 using the measurement system schematically shown in FIG. The control device in the figure is provided with a recording unit, in which raw data of all 50 DNA chips were recorded. Each raw data was corrected by the same method as in Example 2 with the probe solidification rate specific to each DNA chip read by the barcode reader, and the correction value was output to the output device and recorded in the recording unit.

図7は、全DNAチップにおける補正値を示したものである。DNAチップ間におけるバラつきは、CV値約1%であった。   FIG. 7 shows correction values for all DNA chips. The variation between the DNA chips was about 1% of the CV value.

実施例4と同様の方法により、50枚のDNAチップを利用して測定を行った。各DNAチップにおける測定時間は、DNAチップに備えられたバーコードから読取った各DNAチップのプローブ固相化率を基にして、制御装置が算出した最適撮影時間とした。結果を図8に示す。この図から分かるように、各DNAチップごとの補正データのバラつきは小さく、CV値約1%であった。   In the same manner as in Example 4, measurement was performed using 50 DNA chips. The measurement time for each DNA chip was set to the optimum imaging time calculated by the control device based on the probe solid-phase rate of each DNA chip read from the barcode provided on the DNA chip. The results are shown in FIG. As can be seen from this figure, the variation in the correction data for each DNA chip was small and the CV value was about 1%.

この図は、実施例1において作製したDNAチップ50枚のそれぞれにおいて、固相化率検査用プローブの固相化率を示したものである。This figure shows the solidification rate of the probe for immobilization rate test in each of 50 DNA chips produced in Example 1. この図は、実施例1で作製したDNAチップ上に固相化した100種類の反応用プローブのうちの4種類のプローブについて、固相化率と、試料物質の定量結果との間の関係を示すものである。This figure shows the relationship between the immobilization rate and the quantification result of the sample substance for four types of probes out of the 100 types of probes immobilized on the DNA chip prepared in Example 1. It is shown. この図は、実施例2における測定結果(補正前)を示すものである。This figure shows the measurement results (before correction) in Example 2. この図は、実施例2における測定結果(補正後)を示すものである。This figure shows the measurement results (after correction) in Example 2. この図は、実施例3における測定結果を示すものである。This figure shows the measurement results in Example 3. この図は、本発明の生体関連物質用検出装置の一態様を示す図である。This figure is a diagram showing one embodiment of the detection apparatus for biologically related substances of the present invention. この図は、実施例4における測定結果を示すものである。This figure shows the measurement results in Example 4. この図は、実施例5における測定結果を示すものである。This figure shows the measurement results in Example 5.

符号の説明Explanation of symbols

1・・・生体関連物質用検出装置、
10・・・出力装置、
11・・・制御装置(コンピュータ)、
12・・・スペクトル検出部、
13・・・光源、
14・・・DNAチップ(試験片)、
15・・・バーコード(情報保存部)、
16・・・CCD、
17・・・蛍光観察用ミラーユニット、
18・・・対物レンズ
19・・・バーコード・リーダ

1 ... Detection device for biological materials,
10: Output device,
11 ... Control device (computer),
12 ... Spectrum detection unit,
13 ... light source,
14: DNA chip (test piece),
15 ... Barcode (information storage unit),
16 ... CCD,
17 ... Mirror unit for fluorescence observation,
18 ... Objective lens 19 ... Barcode reader

Claims (13)

試料物質との結合に供せられる反応用プローブ、及び固相化率検査用プローブをそれぞれ、担体の所定のスポットに供給する工程(A);
担体へ供給された固相化率検査用プローブの量(プローブ供給量)を定量する工程(B);
反応用プローブ及び固相化率検査用プローブが固相化された担体の各スポットを洗浄し、担体に固相化されなかったプローブを担体より除去する工程(C);
スポット洗浄後に担体に存在する固相化率検査用プローブの量(プローブ固相化量)を定量する工程(D);
前記工程(B)及び(D)の定量結果に基づき、固相化率検査用プローブの、当該担体への固相化率(プローブ固相化率)を算出する工程(E);
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及びプローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F);
を含む、生体関連物質用試験片の製造方法。
Supplying a reaction probe to be bound to the sample substance and a probe for immobilization rate to a predetermined spot on the carrier (A);
A step (B) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate supplied to the carrier (probe supply amount);
A step (C) of washing each spot of the carrier on which the reaction probe and the immobilization rate test probe are immobilized, and removing the probe not immobilized on the carrier from the carrier;
A step (D) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate test present on the carrier after spot washing (probe immobilization amount);
A step (E) of calculating a solid phase immobilization rate (probe solid phase immobilization rate) of the probe for immobilization rate on the carrier based on the quantitative results of the steps (B) and (D);
The probe immobilization rate, and the probe supply amount and the probe immobilization amount, as appropriate, are stored in an information storage unit provided in the carrier, or in an information storage unit provided separately from the carrier. Storing together with the identification number of the carrier (F);
The manufacturing method of the test piece for biologically relevant substances containing this.
試料物質との結合に供せられる反応用プローブ、及び固相化率検査用プローブをそれぞれ、担体の所定のスポットに供給する工程(A);
担体へ供給された固相化率検査用プローブの量(プローブ供給量)を定量する工程(B);
反応用プローブ及び固相化率検査用プローブが固相化された担体の各スポットを洗浄して、担体に固相化されなかったプローブを担体より除去する工程(C);
スポット洗浄後に担体に存在する固相化率検査用プローブの量(プローブ固相化量)を定量する工程(D);
前記工程(B)及び(D)の定量結果に基づき、固相化率検査用プローブの、当該担体への固相化率(プローブ固相化率)を算出する工程(E);更に、
予め定めておいた最低固相化率と、当該プローブ固相化率を比較する工程(E’);及び、
当該プローブ固相化率が、当該最低固相化率以上である場合には、
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F)、又は
当該プローブ固相化率が、当該最低固相化率未満である場合には、
当該担体を製造工程より排除するか、又は当該担体が不良であることを示す情報を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、若しくは当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F’);
を含む、生体関連物質用試験片の製造方法。
Supplying a reaction probe to be bound to the sample substance and a probe for immobilization rate to a predetermined spot on the carrier (A);
A step (B) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate supplied to the carrier (probe supply amount);
A step of washing each spot of the carrier on which the reaction probe and the immobilization rate test probe are immobilized, and removing the probe not immobilized on the carrier from the carrier (C);
A step (D) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate test present on the carrier after spot washing (probe immobilization amount);
A step (E) of calculating an immobilization rate (probe immobilization rate) of the probe for immobilization rate on the carrier based on the quantitative results of the steps (B) and (D);
A step (E ′) of comparing the predetermined minimum immobilization rate with the probe immobilization rate; and
When the probe immobilization rate is equal to or higher than the minimum immobilization rate,
The probe immobilization ratio, as appropriate, the probe supply amount and the probe solid phase immobilization amount are stored in an information storage unit provided in the carrier, or an information storage unit provided separately from the carrier (F) storing together with the identification number of the carrier, or when the probe immobilization rate is less than the minimum immobilization rate,
An information storage unit that is excluded from the manufacturing process, or that stores information indicating that the carrier is defective is stored in an information storage unit provided in the carrier, or is provided separately from the carrier And storing together with the identification number of the carrier (F ′);
The manufacturing method of the test piece for biologically relevant substances containing this.
試料物質との結合に供せられる反応用プローブ、及び固相化率検査用プローブをそれぞれ、担体の所定のスポットに供給する工程(A);
担体へ供給された固相化率検査用プローブの量(プローブ供給量)を定量する工程(B);
反応用プローブ及び固相化率検査用プローブが固相化された担体の各スポットを洗浄して、担体に固相化されなかったプローブを担体より除去する工程(C);
スポット洗浄後に担体に存在する固相化率検査用プローブの量(プローブ固相化量)を定量する工程(D);
前記工程(B)及び(D)の定量結果に基づき、固相化率検査用プローブの、当該担体への固相化率(プローブ固相化率)を算出する工程(E);
当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量を、当該担体に備えられた情報保存部に保存するか、又は当該担体とは別個に設けられた情報保存部に当該担体の識別番号とあわせて保存する工程(F);
前記情報保存部に保存されたプローブ固相化率を、予め定めておいた最低固相化率と比較し、
当該プローブ固相化率が当該最低固相化率以上である場合には、当該プローブ固相化率を有する試験片を、「合格」と判定し、又は
当該プローブ固相化率が当該最低固相化率未満である場合には、当該プローブ固相化率を有する試験片を、「不合格」と判定し、
合格品と不合格品とを分離する
工程(G);
を含む、生体関連物質用試験片の製造方法。
Supplying a reaction probe to be bound to the sample substance and a probe for immobilization rate to a predetermined spot on the carrier (A);
A step (B) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate supplied to the carrier (probe supply amount);
A step of washing each spot of the carrier on which the reaction probe and the immobilization rate test probe are immobilized, and removing the probe not immobilized on the carrier from the carrier (C);
A step (D) of quantifying the amount of the probe for immobilization rate test present on the carrier after spot washing (probe immobilization amount);
A step (E) of calculating a solid phase immobilization rate (probe solid phase immobilization rate) of the probe for immobilization rate on the carrier based on the quantitative results of the steps (B) and (D);
The probe immobilization ratio, as appropriate, the probe supply amount and the probe solid phase immobilization amount are stored in an information storage unit provided in the carrier, or an information storage unit provided separately from the carrier And storing together with the identification number of the carrier (F);
Compare the probe solid-phase rate stored in the information storage unit with a predetermined minimum solid-phase rate,
When the probe immobilization rate is not less than the minimum immobilization rate, the test piece having the probe immobilization rate is determined as “pass”, or the probe immobilization rate is the minimum immobilization rate. When it is less than the phase rate, the test piece having the probe solid phase rate is determined as “fail”,
A step (G) of separating a pass product and a reject product;
The manufacturing method of the test piece for biologically relevant substances containing this.
前記工程(B)及び(D)における定量が、前記固相化率検査用プローブに固有のスペクトルを測定することにより行われる、請求項1乃至3の何れか一項に記載の方法。   The method according to any one of claims 1 to 3, wherein the quantification in the steps (B) and (D) is performed by measuring a spectrum specific to the probe for immobilization test. 前記固相化率検査用プローブに固有のスペクトルの測定が、前記固相化率検査用プローブに予め導入された蛍光色素に由来するシグナル測定である、請求項4に記載の方法。   5. The method according to claim 4, wherein the measurement of the spectrum unique to the probe for immobilization rate test is a signal measurement derived from a fluorescent dye previously introduced into the probe for immobilization rate test. 担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
当該測定された固有のスペクトル強度を、当該情報保存部に記録されたプローブ固相化率又はプローブ固相化量で補正し、予め定めた標準固相化率又は標準固相化量あたりの値に変換する工程(IV);
を含む、生体関連物質の測定方法。
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate on the carrier, and the probe supply amount and the probe immobilization amount are appropriately recorded, or the probe immobilization rate, and the probe supply amount and A probe in which the amount of immobilized probe is recorded in an information storage unit provided separately from the carrier together with the identification number of the carrier, and a probe that specifically reacts to the sample substance Supplying the sample substance to the carrier immobilized on the spot (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex that may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time has not dissociated;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
The measured intrinsic spectral intensity is corrected by the probe immobilization rate or probe immobilization amount recorded in the information storage unit, and a predetermined standard immobilization rate or value per standard immobilization amount. Converting to (IV);
A method for measuring a biological substance, comprising:
担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及びプローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
を含む、生体関連物質の測定方法において、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)に対する、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量の比率(算出比率)により、当該標準固相化率又は当該標準固相化量と同一の固相化率又は固相化量を有する試験片の場合の予め定めた標準反応時間を除することにより求めた時間を、前記工程(I)の開始から前記工程(II)の開始までの反応時間として、前記工程(I)及び(II)を行うことを特徴とする、生体関連物質の測定方法。
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate on the carrier and, if appropriate, the probe supply amount and the probe immobilization amount are recorded, or the probe immobilization rate, and the probe supply amount as appropriate In addition, the amount of immobilized probe and the identification number of the carrier are recorded in the information storage unit provided separately from the carrier, and a probe that specifically reacts to the sample substance is predetermined. Supplying the sample substance to the carrier immobilized on the spot of (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex that may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time has not dissociated;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
In a method for measuring a biological substance,
Ratio of probe immobilization rate or probe immobilization amount of test piece to standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) of test sample probe immobilization rate or probe immobilization amount (standard immobilization rate or standard immobilization amount) Calculated by dividing the predetermined standard reaction time in the case of a test piece having the same solid phase immobilization rate or solid phase immobilization rate by the calculated ratio). The method for measuring a biological substance, characterized in that the steps (I) and (II) are performed with time as a reaction time from the start of the step (I) to the start of the step (II).
担体へのプローブ固相化率、並びに適宜、プローブ供給量及びプローブ固相化量が記録された情報保存部を有する担体であるか、又は当該プローブ固相化率、並びに適宜、当該プローブ供給量及び当該プローブ固相化量が当該担体の識別番号とあわせて、当該担体とは別個に備えられた情報保存部に記録さている担体であって、試料物質に対して特異的に反応するプローブが所定のスポットに固相化された担体に対し、試料物質を供給する工程(I);
一定時間の経過後に当該担体のスポットに形成されている可能性のある、プローブ-試料物質複合体が解離しない条件下で、当該担体の各スポットを洗浄する工程(II);
当該プローブ-試料物質複合体に固有のスペクトル、又は洗浄後に担体に残っている試料物質に固有のスペクトルを測定する工程(III);
を含む、生体関連物質の測定方法において、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)に対する、試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量の比率(算出比率)により、当該標準固相化率又は当該標準固相化量と同一の固相化率又は固相化量を有する試験片の場合の予め定めた標準測定時間を除することにより求めた時間を、前記工程(III)の測定時間として前記工程(III)を行うことを特徴とする、生体関連物質の測定方法。
It is a carrier having an information storage unit in which the probe immobilization rate to the carrier and, if appropriate, the probe supply amount and the probe immobilization amount are recorded, or the probe immobilization rate and the probe supply amount as appropriate And a probe that is recorded in an information storage unit provided separately from the carrier, together with the identification number of the carrier, and a probe that specifically reacts to a sample substance. Supplying a sample substance to a carrier immobilized on a predetermined spot (I);
A step (II) of washing each spot of the carrier under a condition in which the probe-sample substance complex which may be formed in the spot of the carrier after a certain period of time does not dissociate;
Measuring the spectrum specific to the probe-sample substance complex or the spectrum specific to the sample substance remaining on the carrier after washing (III);
In a method for measuring a biological substance,
Ratio of the ratio of probe immobilization of the test piece or the amount of immobilization of the probe to the standard value (standard immobilization ratio or amount of standard immobilization of the test piece) Calculated by dividing the predetermined standard measurement time in the case of a test piece having the same solid phase immobilization rate or solid phase immobilization rate or solid phase immobilization amount. The method for measuring a biological substance, wherein the step (III) is performed with the time as the measurement time of the step (III).
前記固有のスペクトルの測定が、試料物質に予め導入された蛍光色素に由来するシグナルの測定である、請求項6乃至8の何れか一項に記載の方法。   The method according to any one of claims 6 to 8, wherein the measurement of the intrinsic spectrum is a measurement of a signal derived from a fluorescent dye previously introduced into a sample substance. 生体関連物質検出用試験片へ流体を供給、及び当該試験片より流体を排除するための流体輸送部;
当該試験片における反応温度を制御する温度調節部;
当該試験片への光源;
当該試験片からのスペクトルを検出するためのスペクトル検出部;
当該試験片に備えられた情報保存部、又は当該試験片とは別個に備えられた情報保存部中に保存された情報を読み取るための試験片情報読取り部;及び
当該スペクトル検出部で検出したシグナル強度を、当該試験片情報読取り部に保存された情報に基づき補正するための、シグナル補正アプリケーションが保存された記憶部;
を含み、コンピュータにより制御される生体関連物質の検出装置。
A fluid transport unit for supplying a fluid to a test piece for detecting a biological substance and for removing the fluid from the test piece;
A temperature control unit for controlling the reaction temperature in the test piece;
Light source to the specimen;
A spectrum detector for detecting a spectrum from the test piece;
An information storage unit provided in the test piece, or a test piece information reading unit for reading information stored in an information storage unit provided separately from the test piece; and a signal detected by the spectrum detection unit A storage unit storing a signal correction application for correcting the intensity based on the information stored in the test piece information reading unit;
And a biologically relevant substance detection device controlled by a computer.
コンピュータに、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)を入力する手順;
当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み取り、当該プローブ固相化率又は当該プローブ固相化量の、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を求める手順;
当該試験片からの測定シグナル値を読み取り、これを当該算出比率で除することにより、標準固相化率又は標準固相化量あたりの値(変換値)を求める手順;及び、
当該変換値を出力する手順;
を実行させるための、測定シグナル補正プログラム。
On the computer,
A procedure for inputting a standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece;
The probe immobilization ratio or the amount of probe immobilization specific to the test piece stored in the information storage unit provided in the test piece or in the information storage unit provided separately from the test piece. A procedure for reading and obtaining a ratio (calculation ratio) of the probe immobilization rate or the probe immobilization amount to the standard immobilization rate or the standard immobilization amount;
A procedure for obtaining a standard solid phase immobilization rate or a value per standard solid phase immobilization amount (conversion value) by reading a measured signal value from the test piece and dividing this by the calculated ratio; and
Procedure for outputting the converted value;
Measurement signal correction program to execute
コンピュータに、
試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量に関しての標準値(標準固相化率又は標準固相化量)と、当該試験片のプローブ固相化率又はプローブ固相化量が標準固相化率又は標準固相化量と同一の場合における当該試験片での反応時間又は当該試験片からのシグナルの測定時間とを、入力する手順;
当該試験片に備えられている情報保存部又は当該試験片とは別個に備えられている情報保存部に保存されている、当該試験片に固有のプローブ固相化率又はプローブ固相化量を読み取り、当該プローブ固相化率又はプローブ固相化量の、前記標準固相化率又は前記標準固相化量に対する比率(算出比率)を求め、適宜、当該算出比率を当該情報保存部に記憶し、更にこれを読み取る手順;
当該反応時間又は当該測定時間を、当該算出比率で除することにより、当該試験片における実際の反応時間又は測定時間を決定し、これを試験片の反応時間制御部又はシグナル測定部に指示する手順;
を実行させるためのプログラム。
On the computer,
The standard value (standard immobilization rate or standard immobilization amount) for the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece and the probe immobilization rate or probe immobilization amount of the test piece are standard. A procedure for inputting a reaction time in the test piece or a measurement time of a signal from the test piece in the case where the solidification rate or the standard solidification amount is the same;
The probe immobilization ratio or the amount of probe immobilization specific to the test piece stored in the information storage unit provided in the test piece or in the information storage unit provided separately from the test piece. Reading, obtaining the ratio (calculation ratio) of the probe immobilization rate or the amount of probe immobilization to the standard immobilization ratio or the standard immobilization amount, and appropriately storing the calculated ratio in the information storage unit And further reading this procedure;
Procedure for determining the actual reaction time or measurement time in the test piece by dividing the reaction time or measurement time by the calculated ratio, and instructing this to the reaction time control unit or signal measurement unit of the test piece ;
A program for running
請求項11又は12に記載のプログラムを記録した、コンピュータ読み取り可能な記録媒体。

A computer-readable recording medium on which the program according to claim 11 or 12 is recorded.

JP2004184934A 2004-06-23 2004-06-23 Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device Withdrawn JP2006010391A (en)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2004184934A JP2006010391A (en) 2004-06-23 2004-06-23 Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device
PCT/JP2005/011680 WO2006001399A1 (en) 2004-06-23 2005-06-20 Manufacturing method for test piece for organism-related substance and text equipment therefor

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2004184934A JP2006010391A (en) 2004-06-23 2004-06-23 Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2006010391A true JP2006010391A (en) 2006-01-12

Family

ID=35044775

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2004184934A Withdrawn JP2006010391A (en) 2004-06-23 2004-06-23 Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device

Country Status (2)

Country Link
JP (1) JP2006010391A (en)
WO (1) WO2006001399A1 (en)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1975247A1 (en) * 2007-03-30 2008-10-01 Micronas GmbH Bio chip and method for its production
DE102015005238A1 (en) 2015-04-24 2016-10-27 Wolfgang Hölderich Production of lactams by Beckmann rearrangement of oximes

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE19842164B4 (en) * 1998-09-15 2004-06-03 Deutsches Krebsforschungszentrum Stiftung des öffentlichen Rechts Quality control procedures for the construction of oligomer grids
AU2002224831A1 (en) * 2000-11-17 2002-05-27 Zeptosens Ag Kit and method for determining multiple analytes
WO2002072889A2 (en) * 2001-01-12 2002-09-19 Applera Corporation Methods and compositions for microarray control
US20050239104A1 (en) * 2003-11-04 2005-10-27 Ferea Tracy L Microarray controls

Also Published As

Publication number Publication date
WO2006001399A1 (en) 2006-01-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6215894B1 (en) Automatic imaging and analysis of microarray biochips
JP3502803B2 (en) Microarray, method for producing microarray, and method for correcting spot amount error between pins in microarray
JP2003130875A (en) Quality inspection method of biochemical substance microarray chip
US7331511B2 (en) Biopolymeric array scanners capable of automatic scale factor selection for a plurality of different dyes, and methods for making and using the same
JP3955952B2 (en) Analytical method of specimen by molecular array using micro infrared spectroscopy
JP2004520052A5 (en)
JP2006010391A (en) Manufacturing method of specimen for organism-related substance, and testing device
JP4024442B2 (en) Quantitative method and apparatus for test piece and biological material
US6775621B1 (en) Degree of hybridization detection method
Napoli New Advances in Microarrays Finding the Genes Causally Involved in Disease
JP2006105803A (en) Analysis method, analysis apparatus, microarray and immunoassay for biological sample material
JP2007010488A (en) Probe immobilization carrier with manufacturing condition and its manufacturing method, detection method of target material using it, and device, kit and system therefor
JP4257217B2 (en) Method for producing test piece for analysis of biological material and test method for test piece for biological material
TWI271517B (en) Method for manufacturing a microarray and verifying the same
JP3910000B2 (en) Single base substitution detection method
JP2007033173A (en) Quality testing method, manufacturing method and manufacturing apparatus for testpiece used for analyzing biological matter, and method using above testpiece for analyzing biological matter
Dufva Fabrication of DNA microarray
JP2004016132A (en) Method for measuring nucleic acid, and method for analyzing data obtained by the method
JP2002181709A (en) Image analyzing method and apparatus thereof
JP4009311B2 (en) Method for confirming probe mounting position in nucleic acid array
US20050244984A1 (en) Methods and compositions for calibrating chemical array readers
US20010018185A1 (en) Test piece and quantitative method and apparatus for an organism-oriented substance
JPWO2004090129A1 (en) DNA microarray, method for producing the same, and method for using the same
JP2007010557A (en) Detection method and manufacturing method for biosensor
JP2006029953A (en) Solidification carrier for living body-related substance detection, probe solidification method, and living body-related substance analysis method

Legal Events

Date Code Title Description
A300 Application deemed to be withdrawn because no request for examination was validly filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A300

Effective date: 20070904