JP2005521930A5 - - Google Patents

Download PDF

Info

Publication number
JP2005521930A5
JP2005521930A5 JP2003580832A JP2003580832A JP2005521930A5 JP 2005521930 A5 JP2005521930 A5 JP 2005521930A5 JP 2003580832 A JP2003580832 A JP 2003580832A JP 2003580832 A JP2003580832 A JP 2003580832A JP 2005521930 A5 JP2005521930 A5 JP 2005521930A5
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
scanning
technology
association
genetic
single nucleotide
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2003580832A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2005521930A (ja
Filing date
Publication date
Priority claimed from US10/107,508 external-priority patent/US7135286B2/en
Application filed filed Critical
Publication of JP2005521930A publication Critical patent/JP2005521930A/ja
Publication of JP2005521930A5 publication Critical patent/JP2005521930A5/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Claims (45)

  1. 以下の段階を含むビジネス方法:
    a.1ヌクレオチド多型を求めて、遺伝子領域および非遺伝子領域の両方を含む、10,000,000を上回る塩基を対象にヒトゲノムをスキャンする段階;
    b.1ヌクレオチド多型をハプロタイプブロックにグループ分けする段階;
    c.ハプロタイプブロックを表現型状態との関連研究に用いる段階;
    d.段階cに由来する関連を発見プロセスに用いる段階;ならびに
    e.共同で、または独立に、発見プロセスに由来する製品の商品化を行う段階。
  2. 以下の段階を含むビジネス方法:
    a.共通の1ヌクレオチド多型を求めて、10,000,000を上回る塩基を対象にヒトゲノムをスキャンする段階;
    b.共通の1ヌクレオチド多型をハプロタイプブロックにグループ分けする段階;ならびに
    c.パートナーと共同で、ハプロタイプブロックを表現型状態との関連研究に用いる段階。
  3. スキャンする段階で、反復遺伝子領域をスキャンしない、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  4. スキャンする段階で、データベース中の配列の遺伝子領域および非遺伝子領域をスキャンする、請求項2に記載の方法。
  5. スキャンする段階で、50,000,000を上回る塩基をスキャンする、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  6. 研究対象の試料集団の2%を超えて存在する1ヌクレオチド多型のみを、グループ分けする段階で用いる、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  7. 表現型状態が疾患状態である、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  8. ハプロタイプブロックを関連研究に用いる段階が、核酸アレイ上のハプロタイプブロック中の少なくとも複数の1ヌクレオチド多型をスキャンする段階を含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  9. ハプロタイプブロックを関連研究に用いる段階が、1ヌクレオチド多型を同定するアッセイ法で、ハプロタイプブロック中の少なくとも複数の1ヌクレオチド多型をスキャンする段階を含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  10. 表現型状態が薬剤応答状態である、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  11. 薬剤応答状態が応答者状態である、請求項10記載の方法。
  12. 薬剤応答状態が毒性状態である、請求項10記載の方法。
  13. 薬剤使用患者を層別化する診断試験と併せて薬剤を市販する段階をさらに含む、請求項10記載の方法。
  14. スキャンする段階で、1ヌクレオチド多型を求めて、10を上回る供給源からゲノムDNAまたはこの誘導体をスキャンする、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  15. 第2の生物で遺伝子領域および非遺伝子領域をスキャンし、また第2の生物とヒト間における比較研究に使用する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  16. 共通多型のみを、グループ分けする段階に用いる、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  17. 関連研究をパートナーとともに実施する、請求項1に記載の方法。
  18. スキャンする段階で、2本を越える染色体を解析する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  19. パートナーが、スキャンする段階、グループ分け段階、および関連研究のいずれか1つのための資金を提供する、請求項2または17のいずれか一項記載の方法。
  20. 関連研究で、500を超える疾患試料および対照試料を評価する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  21. パートナーが、関連研究で使用される試料を提供する、請求項2または17のいずれか一項記載の方法。
  22. 表現型状態を明らかにするための薬学的化合物を同定する段階をさらに含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  23. 薬学的化合物の販売に基づいてロイヤリティを回収する段階をさらに含む、請求項22記載の方法。
  24. 薬剤患者集団を関連研究で得られた結果で分ける段階をさらに含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  25. スキャンする段階もしくは関連研究の少なくとも1つのために、技術提供者が、値引きされた技術を提供し、値引きされた技術の見返りに株式を受領する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  26. 技術提供者が、技術を使用するために、スキャンする段階もしくは関連研究の1つから内容を受け取る、請求項25記載の方法。
  27. 薬学的化合物が低分子量有機分子、タンパク質化合物、抗体、およびアンチセンス分子からなる群より選択される、請求項22記載の方法。
  28. 関連研究を、表現型状態の遺伝的関連に関する事前の仮説を立てることなく実施する、請求項1または21のいずれか一項記載の方法。
  29. 関連研究を、ハプロタイプ中の代表的な1ヌクレオチド多型のみを対象に実施する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  30. 関連研究が300,000未満のヌクレオチド多型を用いるが、生物の全染色体に及ぶ潜在的な関連を提供する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  31. 標的ゲノム領域をハプロタイプブロックを用いて評価する、商取引に進む段階をさらに含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  32. 関連研究が、表現型状態との複数の潜在的な遺伝的関連を提供する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  33. 潜在的な遺伝的関連の少なくとも一部に関する薬剤開発プロセスを実施する段階、およびさらに進んだ発見プロセスから遺伝的関連の一部を除去する段階をさらに含む、請求項32記載の方法。
  34. ハプロタイプデータベースのライセンスを供与する段階をさらに含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  35. ハプロタイプを関連付けに関与する契約に用いる段階を含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  36. 内部の薬学的開発の取り組みにおける関連付けに関与する契約に由来する収入を用いる段階を含む、請求項35記載の方法。
  37. 関連研究に基づいて開発された薬剤に関する目標達成報奨金を得る段階をさらに含む、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  38. スキャンする段階で、技術提供者から提供された技術プラットフォームを用い、技術提供者が、株式と引換に技術プラットフォームを値引き後の価格で提供する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  39. スキャンする段階で、技術提供者から提供された技術プラットフォームを用い、技術提供者が、スキャンする段階またはグループ分けする段階の少なくとも1つに由来するデータと引換に技術プラットフォームを値引き後の価格で提供する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  40. スキャンする段階で、技術提供者から提供された技術プラットフォームを用い、技術提供者が、技術プラットフォームを改善する権利と引換に技術プラットフォームを値引き後の価格で提供する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  41. パートナーが、化合物に関するロイヤリティを支払う、請求項22記載の方法。
  42. スキャンする段階で、民族的に多様な個人のゲノムをスキャンする、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  43. スキャンする段階で、ハプロイドゲノムをスキャンする、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  44. スキャンする段階を、関連研究の結果を用いて繰返して、関心対象の領域中に1ヌクレオチド多型をさらに同定する、請求項1または2のいずれか一項記載の方法。
  45. 以下の段階を含むビジネス方法:
    a.多数の個体の遺伝的変異を同定する段階;
    b.少なくとも複数の他の遺伝的変異とともに存在する少なくとも複数の遺伝的変異を同定する段階;ならびに
    c.表現型状態と相関する少なくとも他の何らかの遺伝的変異とともに存在する変異の全てではなく一部を共同合意で使用する段階。
JP2003580832A 2002-03-26 2003-03-26 ライフサイエンスビジネスのシステムおよび方法 Pending JP2005521930A (ja)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US10/107,508 US7135286B2 (en) 2002-03-26 2002-03-26 Pharmaceutical and diagnostic business systems and methods
PCT/US2003/009832 WO2003083442A2 (en) 2002-03-26 2003-03-26 Life sciences business systems and methods

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2005521930A JP2005521930A (ja) 2005-07-21
JP2005521930A5 true JP2005521930A5 (ja) 2006-05-25

Family

ID=28452655

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2003580832A Pending JP2005521930A (ja) 2002-03-26 2003-03-26 ライフサイエンスビジネスのシステムおよび方法

Country Status (5)

Country Link
US (2) US7135286B2 (ja)
EP (1) EP1490519A4 (ja)
JP (1) JP2005521930A (ja)
AU (1) AU2003226153A1 (ja)
WO (1) WO2003083442A2 (ja)

Families Citing this family (71)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1138692A1 (en) 2000-03-29 2001-10-04 Erasmus Universiteit Rotterdam Fragments of human chorionic gonadotropin (hcg) as immunoregulator
US20050227925A1 (en) * 2004-04-08 2005-10-13 Robbert Benner Compositions capable of reducing elevated blood urea concentration
US6921751B1 (en) 1998-05-20 2005-07-26 Erasmus Universiteit Rotterdam Immunoregulator
US20040202645A1 (en) * 2003-04-08 2004-10-14 Khan Nisar Ahmed Administration of gene-regulatory peptides
US8680059B2 (en) 1998-05-20 2014-03-25 Biotempt B.V. Oligopeptide acetate and formulations thereof
US6844315B2 (en) * 1998-05-20 2005-01-18 Erasmus Universiteit Rotterdam Immunoregulator
US7175679B2 (en) * 2001-03-29 2007-02-13 Biotempt B.V. Oligopeptide treatment of NF-κB mediated inflammation
US20030220258A1 (en) * 2001-12-21 2003-11-27 Robbert Benner Treatment of ischemic events
USRE43279E1 (en) 2000-03-29 2012-03-27 Biotemp B.V. Compositions capable of reducing elevated blood urea concentration
EP1300418A1 (en) * 2001-10-04 2003-04-09 Erasmus Universiteit Rotterdam Gene regulation by oligopeptides
US20050037430A1 (en) * 2000-03-29 2005-02-17 Biotempt B.V. Methods and uses for protein breakdown products
US7576174B2 (en) * 2000-03-29 2009-08-18 Biotempt B.V. Compositions capable of reducing elevated blood urea concentration
US7358330B2 (en) 2001-03-29 2008-04-15 Biotempt B.V. Immunoregulatory compositions
US20080026367A9 (en) * 2001-08-17 2008-01-31 Perlegen Sciences, Inc. Methods for genomic analysis
US20030220259A1 (en) * 2001-12-21 2003-11-27 Robbert Benner Treatment of neurological disorders
US20030220261A1 (en) * 2001-12-21 2003-11-27 Khan Nisar Ahmed Treatment of iatrogenic disease
US20080242837A1 (en) * 2001-12-21 2008-10-02 Khan Nisar A Peptide compositions
US20080318871A1 (en) * 2001-12-21 2008-12-25 Khan Nisar A Treatment of neurological disorders
US7501391B2 (en) 2001-12-21 2009-03-10 Biotempt B.V. Treatment of transplant survival
US20030224995A1 (en) * 2001-12-21 2003-12-04 Khan Nisar Ahmed Treatment of burns
US7560433B2 (en) 2001-12-21 2009-07-14 Biotempt B.V. Treatment of multiple sclerosis (MS)
US7786084B2 (en) 2001-12-21 2010-08-31 Biotempt B.V. Treatment of burns
US20030220260A1 (en) * 2001-12-21 2003-11-27 Khan Nisar Ahmed Peptide compositions
US20030220257A1 (en) * 2001-12-21 2003-11-27 Robbert Benner Treatment of trauma
JP4041842B2 (ja) * 2002-01-15 2008-02-06 デジタル・インフォメーション・テクノロジー株式会社 Snp特定方法
GB0211750D0 (en) * 2002-05-22 2002-07-03 Ouwehand Willem Abnormal blood conditions
US7563600B2 (en) 2002-09-12 2009-07-21 Combimatrix Corporation Microarray synthesis and assembly of gene-length polynucleotides
WO2009027843A2 (en) * 2007-05-18 2009-03-05 Optimata Ltd. Techniques for purposing a new compound and for repurposing a drug
US9232077B2 (en) * 2003-03-12 2016-01-05 Qualcomm Incorporated Automatic subscription system for applications and services provided to wireless devices
US7517529B2 (en) * 2003-04-08 2009-04-14 Biotempt B.V. Treatment of type I diabetes
US7425700B2 (en) 2003-05-22 2008-09-16 Stults John T Systems and methods for discovery and analysis of markers
WO2005030952A1 (ja) * 2003-09-30 2005-04-07 Riken ハプロタイプの解析方法
AU2005206954A1 (en) 2004-01-21 2005-08-04 Qualcomm Incorporated Application-based value billing in a wireless subscriber network
US20070122817A1 (en) * 2005-02-28 2007-05-31 George Church Methods for assembly of high fidelity synthetic polynucleotides
AU2005295351A1 (en) * 2004-10-18 2006-04-27 Codon Devices, Inc. Methods for assembly of high fidelity synthetic polynucleotides
JPWO2006077631A1 (ja) * 2005-01-19 2008-06-12 デジタル・インフォメーション・テクノロジー株式会社 関連ゲノム領域(含む関連遺伝子/関連ハプロタイプ)のシステマチック関連遺伝子解析方法
US9185538B2 (en) 2005-05-31 2015-11-10 Qualcomm Incorporated Wireless subscriber application and content distribution and differentiated pricing
CA2614084A1 (en) 2005-07-05 2007-01-11 Biotempt B.V. Treatment of tumors
US20070039624A1 (en) * 2005-08-18 2007-02-22 Roberts Richard H Patient compliance system and method to promote patient compliance
US9143622B2 (en) 2006-02-17 2015-09-22 Qualcomm Incorporated Prepay accounts for applications, services and content for communication devices
US9185234B2 (en) 2006-02-22 2015-11-10 Qualcomm Incorporated Automated account mapping in a wireless subscriber billing system
EP1864692A1 (en) 2006-06-07 2007-12-12 Biotempt B.V. Use of peptides for the control of radiation injury
US20070231805A1 (en) * 2006-03-31 2007-10-04 Baynes Brian M Nucleic acid assembly optimization using clamped mismatch binding proteins
US20070288388A1 (en) * 2006-06-07 2007-12-13 Beth Eckenrode Method of selling plastic material
US20080131887A1 (en) * 2006-11-30 2008-06-05 Stephan Dietrich A Genetic Analysis Systems and Methods
US20080217002A1 (en) * 2007-03-07 2008-09-11 Floyd Randolph Simonds Sand control screen having a micro-perforated filtration layer
JP5491400B2 (ja) * 2007-09-26 2014-05-14 ナビジェニクス インコーポレイティド 祖先データを用いるゲノム解析の方法及びシステム
US20090187420A1 (en) * 2007-11-15 2009-07-23 Hancock William S Methods and Systems for Providing Individualized Wellness Profiles
KR20110074527A (ko) * 2008-09-12 2011-06-30 네이비제닉스 인크. 복수의 환경 및 유전 위험 인자를 통합하기 위한 방법 및 시스템
US20100088112A1 (en) * 2008-10-03 2010-04-08 Katen & Associates, Llc Life insurance funded heroic medical efforts trust feature
US20100167403A1 (en) * 2008-12-30 2010-07-01 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Identification and selection of commercial-quality transgenic plant events
WO2012059839A2 (en) * 2010-11-01 2012-05-10 Koninklijke Philips Electronics N.V. In vitro diagnostic testing including automated brokering of royalty payments for proprietary tests
US8718950B2 (en) 2011-07-08 2014-05-06 The Medical College Of Wisconsin, Inc. Methods and apparatus for identification of disease associated mutations
CN104094266A (zh) * 2011-11-07 2014-10-08 独创系统公司 用于识别原因性基因组变体的方法和系统
US9235686B2 (en) 2012-01-06 2016-01-12 Molecular Health Gmbh Systems and methods for using adverse event data to predict potential side effects
US8751166B2 (en) 2012-03-23 2014-06-10 International Business Machines Corporation Parallelization of surprisal data reduction and genome construction from genetic data for transmission, storage, and analysis
US8812243B2 (en) 2012-05-09 2014-08-19 International Business Machines Corporation Transmission and compression of genetic data
US10353869B2 (en) 2012-05-18 2019-07-16 International Business Machines Corporation Minimization of surprisal data through application of hierarchy filter pattern
US8855938B2 (en) 2012-05-18 2014-10-07 International Business Machines Corporation Minimization of surprisal data through application of hierarchy of reference genomes
USD731510S1 (en) 2012-06-06 2015-06-09 Omicia, Inc. Display screen or portion thereof with a graphical user interface
US9002888B2 (en) 2012-06-29 2015-04-07 International Business Machines Corporation Minimization of epigenetic surprisal data of epigenetic data within a time series
US8972406B2 (en) 2012-06-29 2015-03-03 International Business Machines Corporation Generating epigenetic cohorts through clustering of epigenetic surprisal data based on parameters
US9213947B1 (en) 2012-11-08 2015-12-15 23Andme, Inc. Scalable pipeline for local ancestry inference
US9836576B1 (en) 2012-11-08 2017-12-05 23Andme, Inc. Phasing of unphased genotype data
US10920279B2 (en) 2014-09-30 2021-02-16 Genetic Technologies Limited Method for modifying a treatment regimen of a human female subject
US10395759B2 (en) 2015-05-18 2019-08-27 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Methods and systems for copy number variant detection
BR112020007449A2 (pt) 2017-10-17 2020-10-20 Jungla Llc plataforma de evidência molecular para otimização auditável e contínua de interpretação de variantes em testes e análises genéticas e genômicas
CN109360112A (zh) * 2018-10-27 2019-02-19 平安医疗健康管理股份有限公司 一种基于数据处理的精神性疾病认证方法及相关设备
JP7441303B2 (ja) 2019-08-05 2024-02-29 シアー, インコーポレイテッド サンプル調製、データ生成、タンパク質コロナ分析のためのシステムおよび方法
US11817176B2 (en) 2020-08-13 2023-11-14 23Andme, Inc. Ancestry composition determination
WO2023077487A1 (zh) * 2021-11-06 2023-05-11 江汉大学 一种腺病毒的mnp标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5525464A (en) * 1987-04-01 1996-06-11 Hyseq, Inc. Method of sequencing by hybridization of oligonucleotide probes
US5972614A (en) 1995-12-06 1999-10-26 Genaissance Pharmaceuticals Genome anthologies for harvesting gene variants
DE1233366T1 (de) 1999-06-25 2003-03-20 Genaissance Pharmaceuticals Verfahren zur herstellung und verwendung von Haplotype Daten
WO2001004270A1 (en) 1999-07-13 2001-01-18 Genaissance Pharmaceuticals, Inc. Drug target isogenes: polymorphisms in the interleukin 4 receptor alpha gene
EP1290613A1 (en) 2000-04-18 2003-03-12 Genaissance Pharmaceuticals, Inc. Method and system for determining haplotypes from a collection of polymorphisms

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2005521930A5 (ja)
Kidd et al. Mapping and sequencing of structural variation from eight human genomes
US7427480B2 (en) Life sciences business systems and methods
CN103392182B (zh) 用于发现遗传疾病中致病突变的系统和方法
Fareed et al. Single nucleotide polymorphism in genome-wide association of human population: a tool for broad spectrum service
Lockhart et al. Expressing what's on your mind: DNA arrays and the brain
Duan et al. Recent advances in detecting mitochondrial DNA heteroplasmic variations
US10210306B2 (en) Evaluating genetic disorders
JP6121642B2 (ja) 予測を行うための、遺伝子データを清浄化し、そして、そのデータを使用するためのシステムおよび方法
US6955883B2 (en) Life sciences business systems and methods
US10522240B2 (en) Evaluating genetic disorders
US20090118129A1 (en) Virtual reads for readlength enhancement
Hakonarson et al. deCODE genetics, Inc.
EP1975255A2 (en) Method and apparatus for the determination of genetic associations
Kerr et al. An actionable KCNH2 Long QT Syndrome variant detected by sequence and haplotype analysis in a population research cohort
Negi et al. Applications and challenges of microarray and RNA-sequencing
Kuo et al. Microarrays and clinical dentistry
Primrose et al. Genomics: applications in human biology
Austin et al. Genetic epidemiology: methods and applications
CN112195247B (zh) 一种folfox药物方案有效性检测方法及试剂盒
Prescott et al. From linkage maps to quantitative trait loci: the history and science of the Utah genetic reference project
US20080269063A1 (en) Method and system for preparing a microarray for a disease association gene transcript test
Cowley Jr The emergence of physiological genomics
US20090006128A1 (en) Life sciences business systems and methods
Moreira et al. Development and validation of a Xanthomonas axonopodis pv. citri DNA microarray platform (XACarray) generated from the shotgun libraries previously used in the sequencing of this bacterial genome