JP2003159071A - Embryo-specific gene of plant and promoter of the gene, and their utilization - Google Patents
Embryo-specific gene of plant and promoter of the gene, and their utilizationInfo
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Abstract
Description
【0001】[0001]
【発明の属する技術分野】本発明は、植物の胚特異的遺
伝子および該遺伝子のプロモータ、並びにそれらの利用
に関する。TECHNICAL FIELD The present invention relates to a plant embryo-specific gene, a promoter of the gene, and uses thereof.
【0002】[0002]
【従来の技術】植物の種子は穀物や食品原料として利用
されていることは言うまでもないが、それ自身が種苗産
業における主たる商品として生産・販売されており、そ
の品質や特性を制御し改良することの重要性は論を待た
ない。今後、ゲノム研究に代表される分子生物学研究の
成果に基づき、種子形質の分子育種の重要性はますます
大きくなるものと考えられる。遺伝子組換えによる種子
形質の人為的改変によって農業生産技術の高度化をはか
る上で、導入遺伝子を効率的かつ種子組織特異的に発現
させる技術は重要である。2. Description of the Related Art Needless to say, plant seeds are used as grains and food materials, but they are produced and sold as the main products in the seed and seedling industry, and their quality and characteristics are controlled and improved. The importance of is undisputed. Based on the results of molecular biology research represented by genome research, it is considered that the molecular breeding of seed traits will become more important in the future. In order to enhance the agricultural production technology by artificially modifying seed traits by gene recombination, a technology for efficiently and transspecifically expressing a transgene is important.
【0003】これまで胚および胚乳等の種子組織の形成
に伴って特異的に発現する遺伝子が単離されるとともに
その発現制御を司るプロモータについても数多くの報告
があり、その作用機作を詳細に解析した例も多い。しか
しながら、それらは種子貯蔵タンパク質をコードする遺
伝子に代表される種子発育の比較的後期に発現が誘導さ
れる遺伝子に関するものである。胚発生の極初期から種
子胚特異的に任意の遺伝子発現を誘導できるプロモータ
は分子育種の観点から利用価値の高い素材であるが、発
生極初期の胚組織は極めて小さくかつ花器官の内部に埋
没しており母体側の栄養組織と分離することが困難であ
ることから、これまで解析が進んでいなかった。Up to now, many genes have been isolated which are specifically expressed in association with the formation of seed tissues such as embryos and endosperms, and there are many reports on promoters that control their expression. The mechanism of action is analyzed in detail. There are many examples. However, they relate to genes whose expression is induced relatively late in seed development, represented by genes encoding seed storage proteins. A promoter capable of inducing seed-gene-specific gene expression from the very early stage of embryogenesis is a highly useful material from the viewpoint of molecular breeding, but the embryonic tissue at the very early stage of development is extremely small and is buried inside the floral organs. Since it is difficult to separate it from the vegetative tissue on the maternal side, analysis has not progressed so far.
【0004】また、近年、胚発生過程、特に受精卵から
球状胚を経て心臓型胚に至り頂端分裂組織が形成される
までの胚発生の初期段階においては、葉や根等の栄養器
官における遺伝子発現制御機構とは異なるメカニズムが
存在することが明らかになりつつある。例えば、硝酸イ
オンによって一意的に誘導されると考えられていた硝酸
還元酵素の発現が胚発生過程においては硝酸イオンの有
無に関わらず発生ステージ特異的に活性化されることが
明らかになっている(Fukuoka H, Ogawa T, Minami H,
Yano H, Ohkawa Y (1996) L. Plant Physiol. 111:39-4
7)。また、植物の遺伝子操作の多くの場面で広く利用
され、植物の全ての組織で構成的発現を誘導すると考え
られてきたカリフラワーモザイクウイルス由来のCaMV 3
5Sプロモータが、胚発生の極初期では全く活性をもたな
いことが報告されている(Custers JBM Snepvangers SC
HJ. Jansen H J. Zhang L. van Lookeren Campagne M
M.(1999) Protoplasma. 208: 257-264.)。このよう
に、従来の遺伝子発現制御技術では、胚発生初期に胚組
織特異的に任意の導入遺伝子の発現制御を行うことは困
難である。これを可能とする技術は、単細胞不定胚誘導
系を利用した遺伝子操作技術およびアポミクシスの人為
的誘導技術の開発等、高等植物の生殖メカニズムを利用
して品種育成および種苗生産技術の効率化・高度化を図
る上で極めて有用であると考えられる。しかし、そのよ
うな目的に利用可能なプロモータに関する報告は皆無で
あった。Further, in recent years, during the embryonic development process, particularly in the early stage of embryogenesis from the fertilized egg through the spherical embryo to the heart-type embryo until the formation of apical meristems, genes in vegetative organs such as leaves and roots are expressed. It is becoming clear that a mechanism different from the expression control mechanism exists. For example, it has been clarified that the expression of nitrate reductase, which was thought to be uniquely induced by nitrate ions, is activated during embryogenesis in a developmental stage-specific manner regardless of the presence or absence of nitrate ions. (Fukuoka H, Ogawa T, Minami H,
Yano H, Ohkawa Y (1996) L. Plant Physiol. 111: 39-4
7). In addition, CaMV 3 derived from cauliflower mosaic virus has been widely used in many scenes of genetic engineering of plants and has been considered to induce constitutive expression in all tissues of plants.
The 5S promoter has been reported to have no activity in the very early stages of embryonic development (Custers JBM Snepvangers SC
HJ. Jansen H J. Zhang L. van Lookeren Campagne M
M. (1999) Protoplasma. 208: 257-264.). As described above, it is difficult to control the expression of an arbitrary transgene in an embryonic tissue-specific manner in the early stage of embryonic development by the conventional gene expression control technology. Technology that makes this possible is the development of gene manipulation technology that uses a single cell adventitious embryo induction system and the artificial induction technology of apomixis, and the use of the reproductive mechanism of higher plants to improve the efficiency and advanced efficiency of breed breeding and seedling production technology. It is considered to be extremely useful in achieving this. However, there have been no reports on promoters available for such purposes.
【0005】[0005]
【発明が解決しようとする課題】本発明は、このような
状況に鑑みてなされたものであり、その目的は、植物に
おいて、胚特異的かつ胚発生の極初期段階から発現する
遺伝子、並びに、該遺伝子のプロモータであって、胚特
異的かつ胚発生の極初期段階から任意の遺伝子を誘導可
能なプロモータを提供することにある。SUMMARY OF THE INVENTION The present invention has been made in view of the above circumstances, and an object thereof is a gene that is embryo-specific and is expressed from the very early stage of embryogenesis in a plant, and It is intended to provide a promoter for the gene, which is embryo-specific and can induce any gene from the very early stage of embryogenesis.
【0006】[0006]
【課題を解決するための手段】本発明者らは、上記の課
題を解決するために鋭意研究を行った。まず、ナタネの
未熟花粉培養法(Keller WA, Fan Z, Pechan P, Long
N, Grainger J (1987)In Proc. 7th Intl. Rapeseed Co
ngress. Poznan, Poland, pp 152-157.; Fukuoka H, Og
awa T, Minami H, Yano H, Ohkawa Y (1996) L. Plant
Physiol. 111:39-47)を用い、小胞子胚発生を誘導した
細胞と通常の花粉形成を継続する細胞との間で遺伝子発
現を網羅的に解析した。具体的には、ディファレンシャ
ルディスプレー法(Ito, T, Sakaki, Y. (1996) Method
s Mol. Genet. 8, 229-245, 1996.)を用いて、高温処
理による胚発生誘導に伴って強く発現が誘導される遺伝
子を検出し、そのクローニングを行った。クローニング
した遺伝子の発現の時期・器官特異性を、ノーザンブロ
ッティング法およびRT-PCR法によって解析したところ、
該遺伝子は胚発生の極初期から胚組織特異的に発現が強
く誘導され、単離直後の花粉、葉、カルス等においては
検出限界以下であることが明らかとなった。次に、この
遺伝子の発現制御部位と考えられる上流領域を、ナタネ
ゲノムDNAを鋳型として逆PCR法によってクローニングし
た。クローニングしたDNA断片がプロモータ活性を有す
るか否かは、レポーター遺伝子を用いた遺伝子組換え植
物作製実験によって検討した。その結果、該DNA断片は
ナタネ花粉胚発生およびアラビドプシス(シロイヌナズ
ナ)接合子胚発生のどちらの過程においても、胚発生極
初期から胚組織特異的に外来遺伝子の発現を強く誘導す
る性質を持つことが明らかとなった。[Means for Solving the Problems] The inventors of the present invention have conducted extensive studies to solve the above problems. First of all, immature pollen culture method of rapeseed (Keller WA, Fan Z, Pechan P, Long
N, Grainger J (1987) In Proc. 7th Intl. Rapeseed Co
ngress. Poznan, Poland, pp 152-157 .; Fukuoka H, Og
awa T, Minami H, Yano H, Ohkawa Y (1996) L. Plant
Physiol. 111: 39-47) was used to comprehensively analyze gene expression between cells that induced microspore embryogenesis and cells that continued normal pollen formation. Specifically, the differential display method (Ito, T, Sakaki, Y. (1996) Method
S. Mol. Genet. 8, 229-245, 1996.), a gene whose expression is strongly induced by the induction of embryo development by high temperature treatment was detected and cloned. Analysis of the expression timing and organ specificity of the cloned gene by Northern blotting method and RT-PCR method,
It was revealed that the expression of the gene was strongly induced specifically in the embryonic tissue from the very early stage of embryo development, and was below the detection limit in pollen, leaves, callus and the like immediately after isolation. Next, the upstream region, which is considered to be the expression control site of this gene, was cloned by the inverse PCR method using rapeseed genomic DNA as a template. Whether or not the cloned DNA fragment has a promoter activity was examined by a gene recombinant plant production experiment using a reporter gene. As a result, the DNA fragment has a property of strongly inducing the expression of a foreign gene in an embryonic tissue-specific manner from the earliest stage of embryonic development in both processes of rapeseed pollen embryo development and Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) zygote embryogenesis. It became clear.
【0007】また、該DNA断片の塩基配列情報を用い、
公開されている遺伝子データベースに対してBLASTアル
ゴリズムを用いた相同性検索を行ったところ、高い相同
性を持つ既知の塩基配列は検索されなかった。そこで、
上記遺伝子のcDNA配列より推定されるアミノ酸配列と相
同なアミノ酸配列を、シロイヌナズナの全ゲノムシーク
エンス情報より検索し、該アミノ酸配列をコードすると
推定されている領域の上流域をPCR法を用いてクローニ
ングした。クローニングしたDNA断片がプロモータ活性
を有するか否かは、レポーター遺伝子を用いた遺伝子組
換え植物作製実験によって検討した。その結果、ナタネ
からクローニングされたDNA断片と同様に、初期胚特異
的な遺伝子発現誘導パターンを示すことが明らかになっ
た。このことは、上記遺伝子を利用することで、種の違
う植物からも、同様の特性を持つプロモータ活性を有す
るDNAを得ることが可能であることを示している。以上
の結果から、該プロモータ活性を有するDNAは、植物の
胚発生誘導に伴い、極初期から胚組織特異的な遺伝子発
現をもたらす作用があることが示された。Further, using the nucleotide sequence information of the DNA fragment,
When a homology search using the BLAST algorithm was performed on the publicly available gene database, no known nucleotide sequence with high homology was found. Therefore,
An amino acid sequence homologous to the amino acid sequence deduced from the cDNA sequence of the above gene was searched from the entire genome sequence information of Arabidopsis thaliana, and the upstream region of the region presumed to encode the amino acid sequence was cloned using the PCR method. . Whether or not the cloned DNA fragment has a promoter activity was examined by a gene recombinant plant production experiment using a reporter gene. As a result, it was revealed that, similar to the DNA fragment cloned from rapeseed, it exhibits an early embryo-specific gene expression induction pattern. This indicates that it is possible to obtain a DNA having a promoter activity having similar characteristics from plants of different species by using the above gene. From the above results, it was shown that the DNA having the promoter activity has an effect of causing gene expression specific to the embryonic tissue from the very early stage along with the induction of plant embryogenesis.
【0008】遺伝子組換え技術を高等植物を利用した新
品種育成・物質生産等に用いる場合、導入した遺伝子の
発現を植物の目的とする組織特異的、あるいは発育の時
期特異的に制御することは重要な技術である。本発明に
おけるプロモータ活性を有するDNAは、植物の種子が形
成される際、その胚に特異的に、かつ胚発生の極初期段
階から任意の遺伝子の発現を強く誘導する。そのため、
各種代謝系酵素遺伝子の発現誘導による有用物質の胚組
織における産生・蓄積技術、胚致死をもたらすような遺
伝子の強制発現による種子の不活化、ホルモン合成系関
連遺伝子等、形態形成関連遺伝子の胚組織での発現誘導
による種子胚の形態改変等に利用できるものと期待され
る。[0008] When the gene recombination technology is used for the breeding of new varieties and the production of substances using higher plants, it is not possible to control the expression of the introduced gene in a tissue-specific manner or in a development-time-specific manner. This is an important technology. The DNA having the promoter activity in the present invention strongly induces the expression of any gene specifically in the embryo and at the very early stage of embryogenesis when the seed of the plant is formed. for that reason,
Technology for producing and accumulating useful substances in embryo tissues by inducing expression of various metabolic enzyme genes, seed inactivation by forced expression of genes that cause embryonic lethality, embryo tissues of morphogenesis-related genes such as hormone synthesis system-related genes It is expected to be applicable to morphological modification of seed embryos by induction of expression in E. coli.
【0009】さらに、本発明におけるプロモータ活性を
有するDNAを、遺伝子組換え操作時の選抜マーカー遺伝
子の発現制御に用いることにより、単細胞からの不定胚
誘導系を利用した形質転換技術において、抗生物質耐性
等の選抜マーカー遺伝子を不定胚形成の初期段階から発
現させることができるものと期待される。Furthermore, by using the DNA having the promoter activity of the present invention to control the expression of a selectable marker gene during gene recombination, an antibiotic resistance in a transformation technique utilizing an adventitious embryo induction system from a single cell can be obtained. It is expected that selectable marker genes such as E. coli can be expressed from the early stage of somatic embryogenesis.
【0010】また、胚組織に特異的に任意の遺伝子発現
が誘導されるため、胚以外の組織に対する導入遺伝子の
影響を軽減することができるものと期待される。例えば
種子胚以外の葉、根、果肉等を可食部とする農作物にお
いては、収穫物において蓄積していないことが望ましい
選抜マーカー遺伝子産物の産生を防止することができ
る。その他、高等植物における遺伝子工学系の産業分野
において、胚組織に特異的に導入遺伝子を発現させるこ
とが必要とされる際に広汎に利用可能である。Furthermore, since the expression of an arbitrary gene is specifically induced in the embryonic tissue, it is expected that the effect of the introduced gene on tissues other than the embryo can be reduced. For example, it is possible to prevent the production of a selectable marker gene product, which is desirable not to be accumulated in the harvested product, in agricultural products other than the seed embryo, which have edible parts such as leaves, roots and pulp. In addition, in the industrial field of genetic engineering in higher plants, it can be widely used when it is necessary to express a transgene specifically in embryonic tissues.
【0011】即ち、本発明は、植物において、胚特異的
かつ胚発生の極初期段階から発現する遺伝子、並びに、
該遺伝子のプロモータであって、胚特異的かつ胚発生の
極初期段階から任意の遺伝子を誘導可能なプロモータに
関し、より具体的には、〔1〕 植物の胚発生特異的に
発現する、以下の(a)〜(c)のいずれかに記載の天
然由来のDNA、(a)配列番号:6に記載のアミノ酸
配列からなるタンパク質をコードするDNA、(b)配
列番号:6に記載のアミノ酸配列において1または複数
のアミノ酸が置換、欠失、付加、および/または挿入さ
れたアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするDN
A、(c)配列番号:5に記載の塩基配列からなるDN
Aとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするD
NA、〔2〕 〔1〕に記載のDNAの人工的な改変
体、〔3〕 〔1〕または〔2〕に記載のDNAにより
コードされるタンパク質、〔4〕 以下の(a)〜
(c)のいずれかに記載のプロモータ活性を有するDN
A、(a)〔3〕に記載のタンパク質をコードする遺伝
子の発現制御に関与するDNA、(b)配列番号:7、
8または9のいずれかに記載の塩基配列を含むDNA、
(c)配列番号:7、8または9のいずれかに記載の塩
基配列において1または複数の塩基が置換、欠失、付
加、および/または挿入された塩基配列を含むDNA、
〔5〕 〔1〕、〔2〕または〔4〕のいずれかに記載
のDNAを含むベクター、〔6〕 〔1〕、〔2〕もし
くは〔4〕のいずれかに記載のDNA、または〔5〕に
記載のベクターを保持する形質転換植物細胞、〔7〕
〔6〕に記載の形質転換植物細胞を有する形質転換植物
体、〔8〕 〔7〕に記載の形質転換植物体の子孫また
はクローンである、形質転換植物体、That is, the present invention relates to a gene which is expressed in a plant in an embryo-specific manner from the very early stage of embryo development, and
A promoter of the gene, which is embryo-specific and is capable of inducing an arbitrary gene from an extremely early stage of embryogenesis, more specifically, [1] which is expressed specifically in embryogenesis of a plant, (A) to (c) the naturally-occurring DNA, (a) a DNA encoding a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, (b) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 Which encodes a protein consisting of an amino acid sequence in which one or more amino acids are substituted, deleted, added, and / or inserted in
A, (c) DN comprising the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 5
D that hybridizes with A under stringent conditions
NA, [2] an artificial modified form of the DNA described in [1], [3] a protein encoded by the DNA described in [1] or [2], [4] the following (a) to
DN having the promoter activity according to any one of (c)
A, (a) DNA involved in the expression control of the gene encoding the protein described in [3], (b) SEQ ID NO: 7,
A DNA containing the nucleotide sequence according to any one of 8 and 9;
(C) a DNA containing a base sequence in which one or more bases have been substituted, deleted, added, and / or inserted in the base sequence of any of SEQ ID NOs: 7, 8 or 9;
[5] A vector containing the DNA according to any one of [1], [2] or [4], [6] the DNA according to any one of [1], [2] or [4], or [5] [7] A transformed plant cell carrying the vector according to [7].
A transformed plant comprising the transformed plant cell according to [6], [8] A transformed plant which is a progeny or a clone of the transformed plant according to [7],
〔9〕 〔7〕ま
たは〔8〕に記載の形質転換植物体の繁殖材料、〔1
0〕 〔7〕または〔8〕に記載の形質転換植物体の製
造方法であって、〔1〕、〔2〕もしくは〔4〕のいず
れかに記載のDNA、または〔5〕に記載のベクターを
植物細胞に導入し、該植物細胞から植物体を再生させる
工程を含む方法、〔11〕 被験化合物について、
〔4〕に記載のDNAのプロモータ活性を調節するか否
かを評価する方法であって、(a)〔4〕に記載のDN
Aとレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有す
るDNAを含む細胞または細胞抽出液と、被験化合物を
接触させる工程、(b)該レポーター遺伝子の発現レベ
ルを測定する工程、を含み、被験化合物が該レポーター
遺伝子の発現レベルを変化させた場合に、被験化合物が
〔4〕に記載のDNAのプロモータ活性を調節すると判
定される方法、〔12〕 以下の工程(a)および
(b)を含む、〔4〕に記載のDNAのプロモータ活性
を調節する化合物のスクリーニング方法、(a)〔1
1〕に記載の評価方法により、被験化合物について、
〔4〕に記載のDNAのプロモータ活性を調節するか否
かを評価する工程、(b)被験化合物から、〔4〕に記
載のDNAのプロモータ活性を調節すると評価された化
合物を選択する工程、を提供するものである。[9] Reproduction material for the transformed plant according to [7] or [8], [1
0] The method for producing the transformed plant according to [7] or [8], which comprises the DNA according to any one of [1], [2] or [4], or the vector according to [5]. Is introduced into a plant cell, and a method comprising the step of regenerating a plant from the plant cell, [11] a test compound,
A method for evaluating whether or not to regulate the promoter activity of the DNA according to [4], which comprises (a) DN according to [4]
A test compound, which comprises a step of contacting a test compound with a cell or cell extract containing a DNA having a structure in which A and a reporter gene are functionally linked, and (b) measuring the expression level of the reporter gene. [12] a method of determining that the test compound regulates the promoter activity of DNA according to [4] when the expression level of the reporter gene is changed, [12] comprising the following steps (a) and (b) , [4] a method for screening a compound that regulates the promoter activity of DNA, (a) [1.
According to the evaluation method described in 1],
Evaluating whether or not to regulate the promoter activity of the DNA according to [4], (b) selecting from the test compound a compound evaluated to regulate the promoter activity of the DNA according to [4], Is provided.
【0012】[0012]
【発明の実施の形態】本発明者らは、植物の胚発生極初
期から活性を持ち、かつ、胚組織に特異的に発現するタ
ンパク質をコードする遺伝子をクローニングした。該遺
伝子DNAの塩基配列を配列番号:5に、該DNAによってコ
ードされるタンパク質のアミノ酸配列を配列番号:6に
記載する。さらに本発明者らは、該遺伝子を利用して、
該遺伝子の発現制御に関与する、プロモータ活性を有す
るDNAを単離することに成功した。BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION The present inventors have cloned a gene encoding a protein which is active from the very early stage of embryonic development of a plant and which is specifically expressed in embryonic tissues. The nucleotide sequence of the gene DNA is shown in SEQ ID NO: 5, and the amino acid sequence of the protein encoded by the DNA is shown in SEQ ID NO: 6. Furthermore, the present inventors utilize the gene,
We have succeeded in isolating a DNA having a promoter activity that is involved in the regulation of expression of the gene.
【0013】本発明は、植物の胚発生特異的に発現する
タンパク質をコードするDNA(BES1(Brassica Embryogen
esis Specific gene 1)遺伝子)を提供する。本発明の
上記DNAは、プロモータ活性を有する胚特異的遺伝子の
発現制御に関与するDNAの取得(単離)に利用すること
ができる。本発明の好ましい態様においてはまず、本発
明のDNAもしくはその一部をプローブとして、または、
本発明のDNAに特異的にハイブリダイズするオリゴヌク
レオチドをプライマーとして、所望の植物から上記DNA
と高い相同性を有するDNAの単離を行う。当業者におい
ては、この単離の工程を周知の方法に従って行うことが
できる。このように本発明の上記DNAを利用して取得さ
れるDNAは、胚組織特異的に発現するものと考えられる
ことから、取得される上記DNAには、胚特異的遺伝子の
発現制御に関与する領域(プロモータ)が含まれること
が期待される。該DNAに発現制御領域が含まれない場合
であっても、該DNAが位置するゲノムDNAの近傍には、発
現制御DNA領域が存在するものと考えられる。該発現制
御DNA領域は、当業者においては本発明の上記DNAを利用
することにより、一般的に周知の方法により取得するこ
とが可能である。さらに本発明のDNAは、植物の胚発生
特異的に発現することから、植物の胚発生初期段階のマ
ーカーとして使用することも可能である。The present invention provides a DNA (BES1 (Brassica Embryogen) encoding a protein that is specifically expressed in plant embryogenesis.
esis Specific gene 1) gene) is provided. The above-mentioned DNA of the present invention can be used for obtaining (isolating) DNA involved in the expression control of an embryo-specific gene having a promoter activity. In a preferred embodiment of the present invention, first, the DNA of the present invention or a part thereof as a probe, or
The above-mentioned DNA from a desired plant is prepared using an oligonucleotide that hybridizes specifically with the DNA of the present invention as a primer
Isolate DNA with high homology to. Those skilled in the art can perform this isolation step according to well-known methods. Thus, the DNA obtained by using the above-mentioned DNA of the present invention is considered to express specifically in embryonic tissue, and thus the obtained DNA is involved in the regulation of the expression of embryo-specific genes. Regions (promoters) are expected to be included. Even when the expression control region is not included in the DNA, it is considered that the expression control DNA region exists near the genomic DNA in which the DNA is located. The expression control DNA region can be obtained by those skilled in the art by generally known methods using the above-mentioned DNA of the present invention. Furthermore, since the DNA of the present invention is expressed specifically in the embryonic development of plants, it can be used as a marker in the early stage of embryonic development of plants.
【0014】本発明の上記DNAとしては、好ましくは配
列番号:6に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質を
コードするDNAを挙げることができる。また、一般的な
ハイブリダイゼーション技術(Southern EM: J Mol Bio
l 98: 503, 1975)またはPCR技術(Saiki RK, et al: S
cience 230: 1350, 1985、Saiki RK, et al: Science23
9: 487, 1988)によって単離可能な、配列番号:5に記
載の塩基配列からなるDNAとハイブリダイズするDNAもま
た、本発明のDNAに含まれる。すなわち、配列番号:5
に記載の塩基配列からなるDNAもしくはその一部をプロ
ーブとして、また配列番号:5に記載の塩基配列からな
るDNAに特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチ
ドをプライマーとして、他の植物から配列番号:5に記
載の塩基配列からなるDNAと高い相同性を有するDNAを単
離することは、当業者にとって通常行い得ることであ
る。The above-mentioned DNA of the present invention is preferably a DNA encoding a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6. In addition, general hybridization techniques (Southern EM: J Mol Bio
l 98: 503, 1975) or PCR technology (Saiki RK, et al: S
cience 230: 1350, 1985, Saiki RK, et al: Science23
9: 487, 1988), which can be isolated, and which hybridize with the DNA consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 is also included in the DNA of the present invention. That is, SEQ ID NO: 5
SEQ ID NO: 5 from another plant, using as a probe the DNA having the nucleotide sequence described in SEQ ID NO: 5 or a part thereof, and using an oligonucleotide that specifically hybridizes to the DNA having the nucleotide sequence described in SEQ ID NO: 5 as a primer. Isolation of a DNA having a high homology with the DNA having the nucleotide sequence described in 1 above can be usually performed by those skilled in the art.
【0015】このようなDNAを単離するためには、好ま
しくはストリンジェントな条件下でハイブリダイゼーシ
ョン反応を行う。本発明においてストリンジェントなハ
イブリダイゼーション条件とは、6M 尿素、0.4% SDS、
0.5×SSCの条件またはこれと同等のストリンジェンシー
のハイブリダイゼーション条件を指す。よりストリンジ
ェンシーの高い条件、例えば、6M 尿素、0.4% SDS、0.
1×SSCの条件下では、より相同性の高いDNAを単離でき
ることが期待される。こうして単離されたDNAは、アミ
ノ酸レベルにおいて、配列番号:6に記載のアミノ酸配
列と高い相同性を有すると考えられる。高い相同性と
は、アミノ酸配列全体で少なくとも50%以上、好ましく
は70%以上、さらに好ましくは90%以上、最も好ましく
は95%以上の配列の同一性を指す。In order to isolate such DNA, the hybridization reaction is preferably carried out under stringent conditions. In the present invention, stringent hybridization conditions include 6M urea, 0.4% SDS,
It refers to the condition of 0.5 × SSC or the hybridization condition of stringency equivalent thereto. More stringent conditions, such as 6M urea, 0.4% SDS, 0.
Under the condition of 1 × SSC, it is expected that more homologous DNA can be isolated. The DNA thus isolated is considered to have a high homology with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 at the amino acid level. High homology means at least 50% or more, preferably 70% or more, more preferably 90% or more, and most preferably 95% or more sequence identity over the entire amino acid sequence.
【0016】アミノ酸配列や塩基配列の同一性は、カー
リンおよびアルチュールによるアルゴリズムBLAST(Pro
c. Natl. Acad. Sei. USA 87:2264-2268, 1990、Karlin
S &Altschul SF: Proc Natl Acad Sci USA 90: 5873,
1993)を用いて決定できる。BLASTのアルゴリズムに基
づいたBLASTNやBLASTXと呼ばれるプログラムが開発され
ている(Altschul SF, et al: J Mol Biol 215: 403, 1
990)。BLASTNを用いて塩基配列を解析する場合は、パ
ラメーターは、例えばscore=100、wordlength=12とす
る。また、BLASTXを用いてアミノ酸配列を解析する場合
は、パラメーターは、例えばscore=50、wordlength=3
とする。BLASTとGapped BLASTプログラムを用いる場合
は、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。
これらの解析方法の具体的な手法は公知である(http:/
/www.ncbi.nlm.nih.gov/)。The identity of amino acid sequences and nucleotide sequences is determined by the algorithm BLAST (Prol
c. Natl. Acad. Sei. USA 87: 2264-2268, 1990, Karlin.
S & Altschul SF: Proc Natl Acad Sci USA 90: 5873,
1993). Programs called BLASTN and BLASTX based on the BLAST algorithm have been developed (Altschul SF, et al: J Mol Biol 215: 403, 1
990). When BLASTN is used to analyze the nucleotide sequence, the parameters are, for example, score = 100 and wordlength = 12. When BLASTX is used to analyze the amino acid sequence, the parameters are, for example, score = 50, wordlength = 3.
And When using BLAST and Gapped BLAST programs, the default parameters for each program are used.
Specific methods of these analysis methods are known (http: /
/www.ncbi.nlm.nih.gov/).
【0017】また、本発明は、上記の植物の胚発生特異
的に発現するタンパク質(例えば、配列番号:6)と構
造的に類似しているタンパク質をコードするDNAも提供
する。このようなDNAとしては、該タンパク質において1
または複数のアミノ酸が置換、欠失、付加、および/ま
たは挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質をコー
ドするDNAが挙げられる。このようなDNAもまた、本発明
のプロモータ活性を有するDNAの単離に利用される。The present invention also provides a DNA encoding a protein structurally similar to the above-mentioned protein expressed specifically in embryogenesis of plants (for example, SEQ ID NO: 6). As such DNA, 1 in the protein
Alternatively, a DNA encoding a protein having an amino acid sequence in which a plurality of amino acids are substituted, deleted, added, and / or inserted is included. Such DNA is also used for isolation of DNA having the promoter activity of the present invention.
【0018】上記の植物の胚発生特異的に発現するタン
パク質と構造的に類似しているタンパク質をコードする
DNAを調製するために、当業者によく知られた方法とし
ては、上記ハイブリダイゼーション技術またはポリメラ
ーゼ連鎖反応(PCR)技術が挙げられる。また、自然界
においても、塩基配列の変異によりコードするタンパク
質のアミノ酸配列が変異することは起こり得る。変異が
タンパク質中のアミノ酸の変異を伴わないこと(縮重変
異)があるが、このような縮重変異DNAも本発明に含ま
れる。Encodes a protein structurally similar to the above-mentioned protein expressed specifically in embryogenesis of plants
Methods well known to those skilled in the art for preparing DNA include the hybridization techniques or polymerase chain reaction (PCR) techniques described above. Also in the natural world, it is possible that the amino acid sequence of the encoded protein is mutated due to the mutation of the nucleotide sequence. Although the mutation may not be accompanied by the mutation of amino acid in the protein (degenerate mutation), such degenerate mutant DNA is also included in the present invention.
【0019】また、本発明は、上記の植物の胚発生特異
的に発現するタンパク質をコードするDNAの人工的な改
変体を提供する。該改変体とは、上記DNAにおいて、1ま
たは複数の塩基が、人工的に、置換、欠失、付加、およ
び/または挿入された塩基配列からなるDNAを意味す
る。このような改変体としては、例えば、活性が改変さ
れたタンパク質を調製するために塩基が置換等されたDN
Aやタンパク質の精製と容易にするためにHisタグやGST
タグが付加されたDNA等が例示できる。該改変体の調製
方法としては、特に制限はなく、例えば、通常の遺伝子
組み換え技術を用いて組み換え体を作製する方法、さら
に、本発明の植物の胚発生特異的に発現するタンパク質
をコードするDNAに対し、site-directed mutagenesis法
(Kramer W& Fritz H-J: Methods Enzymol 154: 350, 1
987)により変異を導入する方法等が挙げられる。この
ような改変体は、後述する形質転換植物体の作製の他、
本発明の植物の胚発生特異的に発現するタンパク質をコ
ードするDNA、または、本発明のプロモータ活性を有す
るDNAの単離に利用できる。The present invention also provides an artificially modified DNA of the above-mentioned plant-encoding DNA encoding a protein specifically expressed in embryogenesis. The modified form means a DNA having a base sequence in which one or more bases are artificially substituted, deleted, added, and / or inserted in the above DNA. Examples of such a variant include a DN in which a base has been substituted in order to prepare a protein with modified activity.
His-tag and GST to facilitate purification of A and proteins
An example is a tag-added DNA or the like. The method for preparing the variant is not particularly limited, and for example, a method for producing a recombinant using a normal gene recombination technique, and further, a DNA encoding a protein specifically expressed in the embryogenesis of the plant of the present invention In contrast, the site-directed mutagenesis method (Kramer W & Fritz HJ: Methods Enzymol 154: 350, 1
987) and a method for introducing a mutation. Such a modified product is used in addition to the production of a transformed plant described below,
It can be used for the isolation of the DNA encoding the protein of the present invention that is specifically expressed in the embryonic development of the plant, or the DNA having the promoter activity of the present invention.
【0020】本発明のDNAには、ゲノムDNA、cDNA、およ
び化学合成DNAが含まれる。ゲノムDNAおよびcDNAの調製
は、当業者にとって常套手段を利用して行うことが可能
である。ゲノムDNAは、例えば、上記の植物の胚発生特
異的に発現する遺伝子を有する植物からゲノムDNAを抽
出し、ゲノミックライブラリー(ベクターとしては、プ
ラスミド、ファージ、コスミド、BAC、PAC等が利用でき
る)を作製し、これを展開して、該タンパク質をコード
するDNAを基に調製したプローブを用いてコロニーハイ
ブリダイゼーション、あるいはプラークハイブリダイゼ
ーションを行うことにより調製することが可能である。
また、上記の植物の胚発生特異的に発現するタンパク質
をコードするDNAに特異的なプライマーを作成し、これ
を利用したPCRを行うことによって調製することも可能
である。また、cDNAは、例えば、該タンパク質をコード
する遺伝子を有する植物から抽出したmRNAを基にcDNAを
合成し、これをλZAP等のベクターに挿入してcDNAライ
ブラリーを作製し、上記と同様にコロニーハイブリダイ
ゼーション、あるいはプラークハイブリダイゼーショ
ン、またはPCRを行うことにより調製することが可能で
ある。The DNA of the present invention includes genomic DNA, cDNA, and chemically synthesized DNA. The genomic DNA and cDNA can be prepared by a person skilled in the art using conventional means. The genomic DNA is, for example, genomic DNA extracted from a plant having a gene that is specifically expressed in the embryogenesis of the above-mentioned plant, and a genomic library (as a vector, plasmid, phage, cosmid, BAC, PAC, etc. can be used). It is possible to prepare by preparing colonies, developing this, and performing colony hybridization or plaque hybridization using a probe prepared based on the DNA encoding the protein.
It is also possible to prepare by preparing a primer specific to the DNA encoding the protein which is specifically expressed in the embryonic development of the above plant, and performing PCR using this primer. In addition, cDNA is, for example, cDNA is synthesized based on mRNA extracted from a plant having a gene encoding the protein, and this is inserted into a vector such as λZAP to prepare a cDNA library. It can be prepared by performing hybridization, plaque hybridization, or PCR.
【0021】さらに、本発明は、上記DNAによりコード
されるタンパク質を提供する。Further, the present invention provides a protein encoded by the above DNA.
【0022】また本発明は、上記タンパク質をコードす
る遺伝子の発現制御に関与する、プロモータ活性を有す
るDNAを提供する。本発明においては、該プロモータ活
性を有するDNAを植物に導入することにより、任意の遺
伝子について、胚発生の極初期から後期まで胚組織特異
的に転写活性化を行うことが可能である。The present invention also provides a DNA having a promoter activity, which is involved in the expression control of the gene encoding the above protein. In the present invention, by introducing a DNA having the promoter activity into a plant, transcriptional activation can be carried out in an embryonic tissue-specific manner for any gene from the very early stage to the late stage of embryogenesis.
【0023】上記プロモータ活性を有するDNAは、例え
ば、本発明の植物の胚発生特異的に発現するタンパク質
をコードするDNAを利用して単離することができる。こ
の単離方法としては、例えば上記のハイブリダイゼーシ
ョン技術やPCR技術によって、本発明の植物の胚発生特
異的に発現するタンパク質をコードするDNAをクローニ
ングした後に、PCR法等で該DNAの上流領域を単離する方
法等を挙げることができる。単離された上流領域がプロ
モータ活性を有するか否かは、当業者においてはレポー
ター遺伝子を用いた周知のレポーターアッセイ等により
検討することが可能である。該レポーター遺伝子として
は、その発現が検出可能なものであれば特に制限され
ず、例えば、当業者において一般的に使用されるCAT遺
伝子、lacZ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、β−グルク
ロニダーゼ遺伝子(GUS)およびGFP遺伝子等を挙げるこ
とができる。また、本発明の上記遺伝子をレポーターと
して、該遺伝子の発現を検討することにより、該遺伝子
の上流領域がプロモータ活性を有するか否かを検討する
ことも可能である。The above-mentioned DNA having a promoter activity can be isolated using, for example, a DNA encoding a protein expressed specifically in the embryonic development of the plant of the present invention. As this isolation method, for example, by the above-mentioned hybridization technique or PCR technique, after cloning the DNA encoding the protein that is specifically expressed in the embryonic development of the plant of the present invention, the upstream region of the DNA is determined by the PCR method or the like. The method of isolation etc. can be mentioned. Whether or not the isolated upstream region has a promoter activity can be examined by those skilled in the art by a well-known reporter assay or the like using a reporter gene. The reporter gene is not particularly limited as long as its expression can be detected, and examples thereof include CAT gene, lacZ gene, luciferase gene, β-glucuronidase gene (GUS) and GFP commonly used by those skilled in the art. A gene etc. can be mentioned. It is also possible to examine whether or not the upstream region of the gene has a promoter activity by examining the expression of the gene of the present invention as a reporter.
【0024】レポーター遺伝子の発現レベルは、該レポ
ーター遺伝子の種類に応じて、当業者に公知の方法によ
り測定することができる。例えば、レポーター遺伝子が
CAT遺伝子である場合には、該遺伝子産物によるクロラ
ムフェニコールのアセチル化を検出することによって、
レポーター遺伝子の発現レベルを測定することができ
る。レポーター遺伝子がlacZ遺伝子である場合には、該
遺伝子発現産物の触媒作用による色素化合物の発色を検
出することにより、また、ルシフェラーゼ遺伝子である
場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用による蛍光化合
物の蛍光を検出することにより、また、β−グルクロニ
ダーゼ遺伝子(GUS)である場合には、該遺伝子発現産
物の触媒作用によるGlucuron(ICN社)の発光や5−ブロ
モ−4−クロロ−3−インドリル−β−グルクロニド(X
−Gluc)の発色を検出することにより、さらに、GFP遺
伝子である場合には、GFPタンパク質による蛍光を検出
することにより、レポーター遺伝子の発現レベルを測定
することができる。The expression level of the reporter gene can be measured by a method known to those skilled in the art depending on the kind of the reporter gene. For example, if the reporter gene
In the case of the CAT gene, by detecting the acetylation of chloramphenicol by the gene product,
The expression level of the reporter gene can be measured. When the reporter gene is the lacZ gene, by detecting the color development of the dye compound due to the catalytic action of the gene expression product, and when it is the luciferase gene, the fluorescent compound due to the catalytic action of the gene expression product By detecting fluorescence, and in the case of β-glucuronidase gene (GUS), Glucuron (ICN) emits light or 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-catalyst of the gene expression product. β-glucuronide (X
The expression level of the reporter gene can be measured by detecting the color development of -Gluc) and, in the case of the GFP gene, by detecting the fluorescence from the GFP protein.
【0025】また、本発明の上記遺伝子をレポーターと
する場合、該遺伝子の発現レベルの測定は、当業者に公
知の方法によって行うことができる。例えば、本発明の
DNA断片から発現する遺伝子のmRNAを定法に従って抽出
し、このmRNAを鋳型としたノーザンハイブリダイゼーシ
ョン法、またはRT-PCR法を実施することによって該遺伝
子の転写レベルの測定を行うことができる。さらに、DN
Aアレイ技術を用いて、該遺伝子の転写レベルを測定す
ることも可能である。また、該遺伝子からコードされる
タンパク質を含む画分を定法に従って回収し、本発明の
タンパク質の発現をSDS-PAGE等の電気泳動法で検出する
ことにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うこともで
きる。さらに、該遺伝子からコードされるタンパク質に
対する抗体を用いて、ウェスタンブロッティング法を実
施し、該タンパク質の発現を検出することにより、遺伝
子の翻訳レベルの測定を行うことも可能である。該遺伝
子からコードされるタンパク質の検出に用いる抗体とし
ては、検出可能な抗体であれば、特に制限はないが、例
えばモノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体の
両方を利用することができる。該抗体は、当業者に公知
の方法により調製することが可能である。ポリクローナ
ル抗体であれば、例えば、次のようにして取得すること
ができる。本発明のタンパク質、あるいはGSTとの融合
タンパク質として大腸菌等の微生物において発現させた
リコンビナントタンパク質、またはその部分ペプチドを
ウサギ等の小動物に免疫し血清を得る。これを、例え
ば、硫安沈殿、プロテインA、プロテインGカラム、DEAE
イオン交換クロマトグラフィー、本発明のタンパク質や
合成ペプチドをカップリングしたアフィニティーカラム
等により精製することにより調製する。また、モノクロ
ーナル抗体であれば、例えば、本発明のタンパク質また
はその部分ペプチドをマウス等の小動物に免疫を行い、
同マウスより脾臓を摘出し、これをすりつぶして細胞を
分離し、該細胞とマウスミエローマ細胞とをポリエチレ
ングリコール等の試薬を用いて融合させ、これによりで
きた融合細胞(ハイブリドーマ)の中から、本発明のタ
ンパク質に結合する抗体を産生するクローンを選択す
る。次いで、得られたハイブリドーマをマウス腹腔内に
移植し、同マウスより腹水を回収し、得られたモノクロ
ーナル抗体を、例えば、硫安沈殿、プロテインA、プロ
テインGカラム、DEAEイオン交換クロマトグラフィー、
本発明のタンパク質や合成ペプチドをカップリングした
アフィニティーカラム等により精製することで、調製す
ることが可能である。When the gene of the present invention is used as a reporter, the expression level of the gene can be measured by a method known to those skilled in the art. For example,
The transcription level of the gene can be measured by extracting the mRNA of the gene expressed from the DNA fragment according to a standard method and carrying out the Northern hybridization method or RT-PCR method using this mRNA as a template. In addition, DN
It is also possible to measure the transcription level of the gene using A array technology. It is also possible to measure the translation level of a gene by collecting a fraction containing the protein encoded by the gene according to a standard method and detecting the expression of the protein of the present invention by an electrophoresis method such as SDS-PAGE. it can. Furthermore, it is also possible to measure the translation level of a gene by performing Western blotting using an antibody against the protein encoded by the gene and detecting the expression of the protein. The antibody used for detecting the protein encoded by the gene is not particularly limited as long as it is a detectable antibody, and for example, both a monoclonal antibody and a polyclonal antibody can be used. The antibody can be prepared by a method known to those skilled in the art. The polyclonal antibody can be obtained, for example, as follows. A small animal such as a rabbit is immunized with the protein of the present invention or a recombinant protein expressed as a fusion protein with GST in a microorganism such as Escherichia coli or a partial peptide thereof to obtain serum. For example, ammonium sulfate precipitation, protein A, protein G column, DEAE
It is prepared by purification by ion exchange chromatography, an affinity column coupled with the protein of the present invention or a synthetic peptide, and the like. If it is a monoclonal antibody, for example, a small animal such as a mouse is immunized with the protein of the present invention or a partial peptide thereof,
The spleen was excised from the same mouse, the cells were crushed to separate the cells, and the cells were fused with mouse myeloma cells using a reagent such as polyethylene glycol. From the resulting fused cells (hybridomas), A clone is selected that produces an antibody that binds to the protein of the invention. Then, the obtained hybridoma was intraperitoneally transplanted to a mouse, ascites was collected from the mouse, and the obtained monoclonal antibody was, for example, ammonium sulfate precipitation, protein A, protein G column, DEAE ion exchange chromatography,
It can be prepared by purification with an affinity column or the like to which the protein or synthetic peptide of the present invention is coupled.
【0026】本発明のプロモータ活性を有するDNAとし
て具体的には、配列番号:7、8または9のいずれかに
記載の塩基配列を含むDNAを例示することができる。ま
た、配列番号:7、8または9のいずれかに記載の塩基
配列を含むDNAと構造的に類似しており、かつ、配列番
号:7、8または9のいずれかに記載の塩基配列を含む
DNAと同等あるいは改善されたプロモータ活性能を持つD
NAも、本発明の「プロモータ活性を有するDNA」に含ま
れる。このようなDNAとしては、例えば、配列番号:
7、8または9のいずれかに記載の塩基配列において1
または複数の塩基が置換、欠失、付加、および/または
挿入された塩基配列を含むDNAが例示できる。該DNAは、
上記ハイブリダイゼーション技術やポリメラーゼ連鎖反
応(PCR)技術、site-directed mutagenesis法等の方法
により調製することが可能である。Specific examples of the DNA having a promoter activity of the present invention include DNAs containing the nucleotide sequence of any of SEQ ID NO: 7, 8 or 9. Further, the DNA is structurally similar to the DNA containing the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 7, 8 or 9 and includes the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 7, 8 or 9.
D with promoter activity equivalent to or improved with DNA
NA is also included in the “DNA having promoter activity” of the present invention. As such DNA, for example, SEQ ID NO ::
1 in the nucleotide sequence of any of 7, 8 or 9
Alternatively, a DNA containing a nucleotide sequence in which a plurality of bases are substituted, deleted, added, and / or inserted can be exemplified. The DNA is
It can be prepared by the above-mentioned hybridization technique, polymerase chain reaction (PCR) technique, site-directed mutagenesis method and the like.
【0027】また本発明は、本発明のDNA、および本発
明のタンパク質をコードする遺伝子の発現制御に関与す
るプロモータ活性を有するDNAを含むベクター、並び
に、本発明のDNAまたは上記ベクターを保持する形質転
換植物細胞、該形質転換植物細胞を有する形質転換植物
体、該形質転換植物体の子孫またはクローンである形質
転換植物体、および該形質転換植物体の繁殖材料を提供
する。The present invention also provides a vector containing the DNA of the present invention, a DNA having a promoter activity involved in the expression control of a gene encoding the protein of the present invention, and a trait carrying the DNA of the present invention or the above vector. Provided are a transformed plant cell, a transformed plant having the transformed plant cell, a transformed plant which is a progeny or a clone of the transformed plant, and a propagation material for the transformed plant.
【0028】さらに、本発明は、上記の形質転換植物体
の製造方法であって、本発明のタンパク質をコードする
DNA、もしくは本発明のタンパク質をコードする遺伝子
の発現制御に関与するプロモータ活性を有するDNA、ま
たは、該DNAを含むベクターを植物の細胞に導入し、該
植物細胞から植物体を再生させる工程を含む方法を提供
する。Further, the present invention is a method for producing the above transformed plant, which encodes the protein of the present invention.
A step of introducing a DNA or a DNA having a promoter activity involved in the expression control of a gene encoding the protein of the present invention, or a vector containing the DNA into a plant cell to regenerate a plant from the plant cell Provide a way.
【0029】本発明のDNAまたは該DNAを含むベクターの
植物細胞への導入は、当業者においては、公知の方法、
例えばアグロバクテリウム法、電気穿孔法(エレクトロ
ポーレーション法)、パーティクルガン法等により実施
することができる。The introduction of the DNA of the present invention or the vector containing the DNA into plant cells is known to those skilled in the art,
For example, it can be carried out by the Agrobacterium method, electroporation method (electroporation method), particle gun method or the like.
【0030】上記アグロバクテリウム法を用いる場合、
例えばNagelらの方法(Microbiol.Lett. 67: 325, 199
0)が用いられる。この方法によれば、組み換えベクタ
ーをアグロバクテリウム細菌中に形質転換して、次いで
形質転換されたアグロバクテリウムを、リーフディスク
法等の公知の方法により植物細胞に導入する。また、上
記ベクターは、例えば植物体に導入した後、該DNAが植
物体中で発現するように、発現プロモータを含む。一般
に、該プロモータの下流には本発明のDNAが位置し、さ
らに該DNAの下流にはターミネーターが位置する。この
目的に用いられる組み換えベクターは、植物への導入方
法、または植物の種類に応じて、当業者によって適宜選
択される。上記プロモータとして、例えばカリフラワー
モザイクウイルス由来のCaMV35S、トウモロコシのユビ
キチンプロモータ(特開平2-79983号公報)等を挙げる
ことができる。When the above Agrobacterium method is used,
For example, the method of Nagel et al. (Microbiol. Lett. 67: 325, 199).
0) is used. According to this method, the recombinant vector is transformed into an Agrobacterium bacterium, and then the transformed Agrobacterium is introduced into plant cells by a known method such as the leaf disk method. In addition, the vector includes an expression promoter so that the DNA is expressed in the plant after being introduced into the plant, for example. Generally, the DNA of the present invention is located downstream of the promoter, and the terminator is located downstream of the DNA. The recombinant vector used for this purpose is appropriately selected by those skilled in the art depending on the method of introduction into the plant or the type of plant. Examples of the promoter include CaMV35S derived from cauliflower mosaic virus, corn ubiquitin promoter (Japanese Patent Laid-Open No. 2-79983), and the like.
【0031】また、上記ターミネーターは、カリフラワ
ーモザイクウイルス由来のターミネーター、あるいはノ
パリン合成酵素遺伝子由来のターミネーター等を例示す
ることができるが、植物体中で機能するプロモータやタ
ーミネーターであれば、これらに限定されない。The terminator may be, for example, a terminator derived from cauliflower mosaic virus, a terminator derived from the nopaline synthase gene, or the like, but is not limited thereto as long as it is a promoter or terminator that functions in a plant. .
【0032】また、本発明のDNAまたは該DNAを含むベク
ターを導入する植物は、外植片であってもよく、これら
の植物から培養細胞を調製し、得られた培養細胞に導入
してもよい。本発明の「植物細胞」は、例えば葉、根、
茎、花および種子中の胚盤等の植物細胞、カルス、懸濁
培養細胞等が挙げられる。The plant into which the DNA of the present invention or a vector containing the DNA is introduced may be an explant, and cultured cells may be prepared from these plants and introduced into the obtained cultured cells. Good. The “plant cell” of the present invention includes, for example, leaves, roots,
Examples include plant cells such as scutellum in stems, flowers and seeds, callus, suspension cultured cells and the like.
【0033】また、本発明のDNAまたは該DNAを含むベク
ターの導入により形質転換した植物細胞を効率的に選択
するために、上記組み換えベクターは、適当な選抜マー
カー遺伝子を含む、もしくは選抜マーカー遺伝子を含む
プラスミドベクターと共に植物細胞へ導入するのが好ま
しい。この目的に使用する選抜マーカー遺伝子は、例え
ば抗生物質ハイグロマイシンに耐性であるハイグロマイ
シンホスホトランスフェラーゼ遺伝子、カナマイシンま
たはゲンタマイシンに耐性であるネオマイシンホスホト
ランスフェラーゼ、および除草剤ホスフィノスリシンに
耐性であるアセチルトランスフェラーゼ遺伝子等が挙げ
られる。In order to efficiently select plant cells transformed by introducing the DNA of the present invention or a vector containing the DNA, the recombinant vector contains an appropriate selectable marker gene or contains a selectable marker gene. It is preferable to introduce it into a plant cell together with the plasmid vector containing it. Selectable marker genes used for this purpose include, for example, the hygromycin phosphotransferase gene resistant to the antibiotic hygromycin, the neomycin phosphotransferase resistant to kanamycin or gentamicin, and the acetyltransferase gene resistant to the herbicide phosphinothricin. Etc.
【0034】組み換えベクターを導入した植物細胞は、
導入された選抜マーカー遺伝子の種類に従って適当な選
抜用薬剤を含む公知の選抜用培地に置床し培養する。こ
れにより形質転換された植物培養細胞を得ることができ
る。The plant cells into which the recombinant vector has been introduced are
According to the kind of the introduced selectable marker gene, it is placed in a known selective medium containing an appropriate selective drug and cultured. As a result, transformed plant cultured cells can be obtained.
【0035】次いで、本発明のDNAまたは該DNAを含むベ
クターを導入した形質転換細胞から植物体を再生する。
植物体の再生は植物細胞の種類に応じて当業者に公知の
方法で行うことが可能である。本発明において使用可能
なベクターは、特に制限されず、例えば実施例で使用し
たpBI121等を適宜改変して使用することができる。ま
た、本発明のベクターを、例えばアグロバクテリウムに
導入して、カルスまたは幼植物に感染させることによ
り、形質転換植物を作製する事が可能であり、さらに、
そのような形質転換植物に由来する種子を得る事が可能
である。本発明のDNAまたは該DNAを含むベクターを植物
に導入する形質転換法はアグロバクテリウムによるバイ
ナリーベクター法に限定されるものではなく、パーティ
クルガン法、電気穿孔法等の方法を用いることも可能で
ある。Then, a plant is regenerated from a transformed cell into which the DNA of the present invention or a vector containing the DNA has been introduced.
Regeneration of a plant can be performed by a method known to those skilled in the art depending on the type of plant cell. The vector that can be used in the present invention is not particularly limited, and for example, pBI121 and the like used in Examples can be appropriately modified and used. Further, the vector of the present invention, for example, by introducing into Agrobacterium, by infecting callus or young plants, it is possible to produce a transformed plant, further,
It is possible to obtain seeds derived from such transformed plants. The transformation method of introducing the DNA of the present invention or a vector containing the DNA into a plant is not limited to the binary vector method using Agrobacterium, and a particle gun method, an electroporation method or the like can also be used. is there.
【0036】形質転換細胞から再生させた植物体は、次
いで順化用培地で培養する。その後、順化した再生植物
体を、通常の栽培条件で栽培する。The plant body regenerated from the transformed cells is then cultured in an acclimation medium. Then, the acclimatized regenerated plant is cultivated under normal cultivation conditions.
【0037】なお、このように再生され、かつ栽培した
形質転換植物体中の導入された外来DNAの存在は、公知
のPCR法やサザンハイブリダイゼーション法によって、
または植物体中の核酸の塩基配列を解析することによっ
て確認することができる。この場合、形質転換植物体か
らの核酸の抽出は、公知のJ.Sambrookらの方法(Molecu
lar Cloning, 第2版, Cold SpringHarbor laboratory P
ress, 1989)に準じて実施することができる。The presence of the introduced exogenous DNA in the transformed and cultivated transformed plants was determined by the known PCR method or Southern hybridization method.
Alternatively, it can be confirmed by analyzing the base sequence of the nucleic acid in the plant. In this case, the nucleic acid extraction from the transformed plant can be performed by the method known by J. Sambrook et al. (Molecu
lar Cloning, 2nd Edition, Cold Spring Harbor laboratory P
ress, 1989).
【0038】再生させた植物体中に存在する外来遺伝子
を、PCR法を用いて解析する場合には、上記のように再
生植物体から抽出した核酸を鋳型として増幅反応を行
う。また、該核酸がDNAである場合には、該DNAの塩基配
列に従って適当に選択された塩基配列をもつ合成したオ
リゴヌクレオチドをプライマーとして用い、これらを混
合させた反応液中おいて増幅反応を行うこともできる。
増幅反応においては、DNAの変性、アニーリング、伸張
反応を数十回繰り返すと、本発明のDNAを含むDNA断片の
増幅生成物を得ることができる。増幅生成物を含む反応
液を例えばアガロース電気泳動にかけると、増幅された
各種のDNA断片が分画されて、そのDNA断片が本発明のDN
Aに対応することを確認することが可能である。When the foreign gene existing in the regenerated plant is analyzed by the PCR method, the amplification reaction is carried out using the nucleic acid extracted from the regenerated plant as a template as described above. Further, when the nucleic acid is DNA, a synthesized oligonucleotide having a base sequence appropriately selected according to the base sequence of the DNA is used as a primer, and an amplification reaction is performed in a reaction solution in which these are mixed. You can also
In the amplification reaction, the denaturation of DNA, the annealing, and the extension reaction are repeated tens of times to obtain an amplification product of a DNA fragment containing the DNA of the present invention. When the reaction solution containing the amplification product is subjected to, for example, agarose gel electrophoresis, various amplified DNA fragments are fractionated, and the DNA fragments are isolated by the DN of the present invention.
It is possible to confirm that it corresponds to A.
【0039】一旦、染色体内に本発明のDNAが導入され
た形質転換植物体が得られれば、該植物体から有性生殖
または無性生殖により子孫を得ることが可能である。ま
た、該植物体やその子孫あるいはクローンから繁殖材料
(例えば種子、果実、切穂、塊茎、塊根、株、カルス、
プロトプラスト等)を得て、それらを基に該植物体を量
産することも可能である。Once a transformed plant in which the DNA of the present invention has been introduced into the chromosome is obtained, it is possible to obtain progeny from the plant by sexual reproduction or asexual reproduction. In addition, propagation material (eg seeds, fruits, cuttings, tubers, tuberous roots, strains, callus, from the plant or its progeny or clones,
It is also possible to obtain protoplasts and the like) and mass-produce the plant based on them.
【0040】さらに本発明は、被験化合物について、本
発明のプロモータ活性を有するDNAのプロモータ活性を
調節するか否かを評価する方法を提供する。本発明の評
価方法に用いられる被検化合物としては、特に制限はな
く、例えば、天然化合物、有機化合物、無機化合物、タ
ンパク質、ペプチド等の単一化合物、並びに、化合物ラ
イブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出
物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出
物、植物抽出物、原核細胞抽出物、真核単細胞抽出物も
しくは動物細胞抽出物等を挙げることができる。The present invention further provides a method for evaluating whether or not a test compound regulates the promoter activity of a DNA having the promoter activity of the present invention. The test compound used in the evaluation method of the present invention is not particularly limited, and examples thereof include single compounds such as natural compounds, organic compounds, inorganic compounds, proteins, peptides, and expression of compound libraries and gene libraries. Examples include products, cell extracts, cell culture supernatants, fermented microorganism products, marine organism extracts, plant extracts, prokaryotic cell extracts, eukaryotic single cell extracts or animal cell extracts.
【0041】この方法においては、まず、本発明のプロ
モータ活性を有するDNAとレポーター遺伝子とが機能的
に結合した構造を有するDNAを含む細胞または細胞抽出
液と、被験化合物を接触させる。In this method, first, a test compound is brought into contact with a cell or cell extract containing a DNA having a structure in which a DNA having a promoter activity of the present invention and a reporter gene are functionally linked.
【0042】本発明において、「機能的に結合した」と
は、本発明のプロモータ活性を有するDNAに転写因子が
結合することにより、レポーター遺伝子の発現が誘導さ
れるように、本発明のプロモータ活性を有するDNAとレ
ポーター遺伝子とが結合していることをいう。従って、
レポーター遺伝子が他の遺伝子と結合しており、他の遺
伝子産物との融合タンパク質を形成する場合であって
も、本発明のプロモータ活性を有するDNAに転写因子が
結合することによって、該融合タンパク質の発現が誘導
されるものであれば、上記「機能的に結合した」の意に
含まれる。本方法に用いるレポーター遺伝子としては、
前出の遺伝子を使用することが可能である。In the present invention, "operably linked" means that the expression of the reporter gene is induced by binding of a transcription factor to the DNA having the promoter activity of the present invention. Means that the reporter gene is bound to a DNA having Therefore,
Even when the reporter gene is bound to another gene to form a fusion protein with another gene product, the transcription factor binds to the DNA having the promoter activity of the present invention to bind the fusion protein of the fusion protein. If expression is induced, it is included in the meaning of "functionally linked". The reporter gene used in this method is
It is possible to use the genes mentioned above.
【0043】本方法における「本発明のプロモータ活性
を有するDNAとレポーター遺伝子とが機能的に結合した
構造を有するDNAを含む細胞」として、例えば、上記DNA
を含むベクターを導入した細胞を挙げることができる。
該ベクターは、当業者に周知の方法により作製すること
ができる。ベクターの細胞への導入は、一般的な方法、
例えば、リン酸カルシウム沈殿法、電気パルス穿孔法、
リポフェタミン法、マイクロインジェクション法等によ
って実施することができる。As the "cells containing a DNA having a structure in which the DNA having the promoter activity of the present invention and a reporter gene are functionally linked" in the present method, for example, the above-mentioned DNA
A cell into which a vector containing is introduced.
The vector can be produced by a method well known to those skilled in the art. Introduction of a vector into a cell is a general method,
For example, calcium phosphate precipitation method, electric pulse perforation method,
It can be carried out by a lipofetamine method, a microinjection method or the like.
【0044】また、「本発明のプロモータ活性を有する
DNAとレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有
するDNAを含む細胞」には、染色体に該構造が挿入され
た細胞も含まれる。染色体へのDNA構造の挿入は、当業
者に一般的に用いられる方法、例えば、相同組み換えを
利用した遺伝子導入法により行うことができる。用いら
れる「細胞」は、例えば、ナタネ、シロイヌナズナ等に
由来する細胞が挙げられるが、その由来は特に制限され
ない。In addition, "having the promoter activity of the present invention
The "cell containing DNA having a structure in which DNA and a reporter gene are operably linked" also includes cells in which the structure is inserted into the chromosome. The insertion of the DNA structure into the chromosome can be performed by a method generally used by those skilled in the art, for example, a gene introduction method utilizing homologous recombination. Examples of the “cell” used include cells derived from rapeseed, Arabidopsis thaliana, etc., but the origin is not particularly limited.
【0045】本方法における「本発明のプロモータ活性
を有するDNAとレポーター遺伝子とが機能的に結合した
構造を有するDNAを含む細胞抽出液」とは、例えば、市
販の試験管内転写翻訳キットに含まれる細胞抽出液に、
本発明のプロモータ活性を有するDNAとレポーター遺伝
子とが機能的に結合した構造を有するDNAを添加したも
のを挙げることができる。The "cell extract containing a DNA having a structure in which the DNA having the promoter activity of the present invention and a reporter gene are functionally linked" in the present method is contained in, for example, a commercially available in vitro transcription / translation kit. In the cell extract,
Examples thereof include those to which a DNA having a structure in which a DNA having a promoter activity of the present invention and a reporter gene are functionally linked is added.
【0046】本方法における「接触」は、本発明のプロ
モータ活性を有するDNAとレポーター遺伝子とが機能的
に結合した構造を有するDNAを含む細胞の培養液に被験
化合物を添加する、または該DNAを含む上記の市販され
た細胞抽出液に被験化合物を添加することにより行うこ
とができる。被験化合物がタンパク質の場合には、例え
ば、該タンパク質をコードするDNAを含むベクターを、
該細胞へ導入する、または該ベクターを該細胞抽出液に
添加することで行うことも可能である。The "contact" in the present method is to add a test compound to the culture solution of cells containing DNA having a structure in which a DNA having a promoter activity of the present invention and a reporter gene are functionally linked, or It can be carried out by adding a test compound to the above-mentioned commercially available cell extract. When the test compound is a protein, for example, a vector containing DNA encoding the protein,
It can also be carried out by introducing into the cells or adding the vector to the cell extract.
【0047】本方法においては、次いで、該レポーター
遺伝子の発現レベルを測定する。レポーター遺伝子の発
現レベルは、該レポーター遺伝子の種類に応じて、前記
の方法により測定することができる。In this method, the expression level of the reporter gene is then measured. The expression level of the reporter gene can be measured by the method described above depending on the type of the reporter gene.
【0048】本方法においては、被験化合物の非存在下
において測定した場合と比較して、被験化合物がレポー
ター遺伝子の発現レベルを変化させた場合に、被験化合
物が本発明のDNAのプロモータ活性を調節したと判定さ
れる。In the present method, the test compound regulates the promoter activity of the DNA of the present invention when the test compound changes the expression level of the reporter gene, as compared with the case of the measurement in the absence of the test compound. It is judged that it did.
【0049】さらに、本発明においては、上記評価方法
を利用して、複数の被験化合物について、本発明のDNA
のプロモータ活性を調節するか否かを評価し、プロモー
タ活性を調節する化合物を選択することにより、効率的
にプロモータ活性を調節する化合物をスクリーニングす
ることができる。本発明は、このようなプロモータ活性
を調節する化合物のスクリーニング方法も提供する。Furthermore, in the present invention, the above-mentioned evaluation method is utilized to analyze the DNA of the present invention for a plurality of test compounds.
It is possible to efficiently screen a compound that regulates the promoter activity by evaluating whether or not the promoter activity is regulated and selecting a compound that regulates the promoter activity. The present invention also provides a method for screening a compound that regulates such promoter activity.
【0050】[0050]
【実施例】以下、本発明を実施例により、さらに具体的
に説明するが本発明はこれら実施例に制限されるもので
はない。EXAMPLES The present invention will be described in more detail below with reference to examples, but the present invention is not limited to these examples.
【0051】[実施例1] 胚発生特異的遺伝子のクロー
ニング
植物の胚発生は外界から隔てられた花組織の深部で進行
し、受精卵および極初期の受精胚を人為的に単離するこ
とは一般的に困難である。そこで、単細胞から同調的か
つ高頻度に胚発生を誘導できる実験系として、ナタネ
(Brassica napus)の未熟花粉培養法を用いる。この培
養法は、開花前の蕾より単核期後期の未熟花粉を取り出
し、これを人工培養する(Keller WA, Fan Z, Pechan
P, Long N,Grainger J (1987) In Proc. 7th Intl. Rap
eseed Congress. Poznan, Poland,pp 152-157.; Fukuok
a H, Ogawa T, Minami H, Yano H, Ohkawa Y (1996) L.
Plant Physiol. 111:39-47)。この操作によって単核
の未熟花粉は、成熟花粉形成の経路から逸脱し、胚発生
を開始する。この手法を用い、小胞子胚発生を誘導した
細胞と通常の花粉形成を継続する細胞との間で遺伝子発
現を網羅的に解析し、胚発生誘導に伴って強く発現が誘
導される遺伝子を検出し、そのクローニングと構造解明
を行った。[Example 1] Cloning of embryogenesis-specific gene Embryonic development of a plant proceeds deep in the flower tissue separated from the outside world, and it is not possible to artificially isolate a fertilized egg and a very early embryo. Generally difficult. Therefore, the immature pollen culture method of rape (Brassica napus) is used as an experimental system capable of synchronously and frequently inducing embryonic development from single cells. In this culture method, immature pollen in the late mononuclear stage is extracted from the bud before flowering and artificially cultured (Keller WA, Fan Z, Pechan
P, Long N, Grainger J (1987) In Proc. 7th Intl. Rap
eseed Congress. Poznan, Poland, pp 152-157 .; Fukuok
a H, Ogawa T, Minami H, Yano H, Ohkawa Y (1996) L.
Plant Physiol. 111: 39-47). By this operation, the mononuclear immature pollen deviates from the pathway of mature pollen formation and initiates embryonic development. Using this method, gene expression is comprehensively analyzed between cells that have induced microspore embryogenesis and cells that continue normal pollen formation, and genes that are strongly induced by embryogenesis induction are detected. Then, its cloning and structure elucidation were performed.
【0052】ここで用いたナタネ未熟花粉培養法におい
ては、培養開始後24ないし96時間の間、32℃の高温処理
を与えることが胚形成の誘導のために必須である。一
方、20℃の培養温度条件下では未熟花粉は自然条件下と
同様に成熟花粉を形成し、胚発生は観察されない。すな
わち、この32℃の温度条件が未熟花粉の発生運命を成熟
花粉形成から胚発生へと変更する引き金の役割を果たし
ており、遺伝子発現の総合的パターンも胚発生を開始し
進行させるためのものへと大きく変化していくものと考
えられる。そこで、この高温処理に呼応して発現が誘導
される遺伝子を以下のようにして単離した。In the rapeseed immature pollen culture method used here, it is essential for the induction of embryogenesis that a high temperature treatment of 32 ° C. is performed for 24 to 96 hours after the start of culture. On the other hand, under the culture temperature condition of 20 ° C, immature pollen forms mature pollen as in natural conditions, and embryonic development is not observed. In other words, this temperature condition of 32 ° C plays a role of triggering the change in the developmental fate of immature pollen from mature pollen formation to embryogenesis, and the overall pattern of gene expression is also to initiate and progress embryogenesis. It is thought that it will change greatly. Therefore, a gene whose expression is induced in response to this high temperature treatment was isolated as follows.
【0053】単離した未熟花粉は32℃、2日間(以下サ
ンプル232)、または20℃、2日間(サンプル220)暗黒
下で培養し、それぞれから全RNAを定法に基づいて抽出
した。その2種類のRNAサンプルについて、それぞれ3種
類の1本鎖DNAプライマー(5'- GTTTTTTTTTTTTTTTA -3'
(配列番号:1)、5'- GTTTTTTTTTTTTTTTC -3'(配列
番号:2)、5'- GTTTTTTTTTTTTTTTG -3'(配列番号:
3)、以下それぞれGT15A、GT15C、GT15G、また、これ
ら3つを総称してGTプライマーと呼ぶ)を用いて第1鎖cD
NAを合成した。この操作により、サンプル220+GT15A、
サンプル220+GT15C、サンプル220+GT15G、サンプル23
2+GT15A、サンプル232+GT15C、サンプル232+GT15G、
の合計6種類のcDNA混合物を得た。これらのcDNA混合物
を鋳型とし、12merの任意プライマー(和光純薬製)と
個々のGTプライマー(cDNA合成に用いたものと同じ配列
のもの)とを用い、それぞれ別々にPCR反応によってcDN
Aを増幅した。その際、GT15A、GT15C、GT15Gは蛍光色素
FITCで5'末端を標識したものを用いた。この操作によっ
て、1種類の任意プライマーおよび1種類のGTプライマー
の組み合わせについて、サンプル220およびサンプル232
より2種類の増幅産物が得られた。The isolated immature pollen was cultured in the dark at 32 ° C. for 2 days (hereinafter referred to as sample 232), or at 20 ° C. for 2 days (sample 220), and total RNA was extracted from each in accordance with a standard method. Three single-stranded DNA primers (5'- GTTTTTTTTTTTTTTTA -3 'for each of the two RNA samples)
(SEQ ID NO: 1), 5'- GTTTTTTTTTTTTTTTC-3 '(SEQ ID NO: 2), 5'- GTTTTTTTTTTTTTTTG -3' (SEQ ID NO:
3), hereinafter GT15A, GT15C, GT15G, respectively, and these three are collectively referred to as GT primers)
NA was synthesized. By this operation, sample 220 + GT15A,
Sample 220 + GT15C, Sample 220 + GT15G, Sample 23
2 + GT15A, sample 232 + GT15C, sample 232 + GT15G,
A total of 6 types of cDNA mixture were obtained. Using these cDNA mixtures as templates, 12-mer arbitrary primers (manufactured by Wako Pure Chemical Industries) and individual GT primers (having the same sequences as those used for cDNA synthesis) were used, and cDNs were separately prepared by PCR reaction.
A was amplified. At that time, GT15A, GT15C, and GT15G are fluorescent dyes.
FITC was used with its 5'end labeled. This operation allows sample 220 and sample 232 for one arbitrary primer and one GT primer combination.
Two kinds of amplification products were obtained.
【0054】この2種類の増幅産物を電気泳動法によっ
て分子量の違いに基づいて分離し、その分離像を蛍光画
像解析装置によって検出し、サンプル220とサンプル232
との間で比較した。双方のサンプルに共通して発現して
いる遺伝子に対応するcDNAは、2サンプル間で共通に観
察されるが、胚発生特異的に発現する遺伝子に由来する
cDNAはサンプル232においてのみ認められた。このよう
にして特異的に発現する遺伝子を検出する手法は一般に
ディファレンシャルディスプレー法と呼ばれるものであ
り、本実施例では(Ito, T, Sakaki, Y. (1996) Method
s Mol. Genet.8, 229-245, 1996.)の方法に従った。These two kinds of amplification products were separated by electrophoresis based on the difference in molecular weight, and the separated images were detected by a fluorescence image analyzer, and sample 220 and sample 232.
Compared between. The cDNA corresponding to the gene commonly expressed in both samples is commonly observed between the two samples, but is derived from the gene specifically expressed in embryogenesis.
cDNA was found only in sample 232. A method of detecting a gene specifically expressed in this way is generally called a differential display method, and in this example, (Ito, T, Sakaki, Y. (1996) Method
s Mol. Genet. 8, 229-245, 1996.).
【0055】この手法を用い、高温処理を行った細胞の
みに存在するmRNA分子によるバンドを電気泳動ゲル上で
複数種類検出した。そのうちの1つであるBES1はGT15Aと
任意プライマー(5'- GCCTGCCTCACG -3'(配列番号:
4))を用いた反応産物から見いだされた。その増幅DN
A産物を泳動ゲルから抽出・精製し、クローニングベク
ター(pGEM-T、プロメガ社)に挿入してクローン化し、
その塩基配列を決定した。さらに、その塩基配列を元に
ライフテック・オリエンタル社の5'RACEシステムを用い
て全長のcDNAを単離し、前述のpGEM-Tベクターに挿入し
てクローニングし、その全塩基配列を決定した。そのcD
NAの塩基配列を配列番号:5に、その塩基配列を元に推
定されるアミノ酸配列を配列番号:6にそれぞれ示す。
ノーザンブロッティング法およびRT-PCR法によって該遺
伝子の発現の時期・器官特異性を解析したところ、図1
および図2に示されたとおり、BES1遺伝子の転写産物は
胚発生の極初期から胚組織特異的に発現が強く誘導さ
れ、単離直後の花粉、葉、カルス等においては検出限界
以下であることが明らかとなった。Using this method, plural kinds of bands due to mRNA molecules existing only in cells subjected to high temperature treatment were detected on an electrophoretic gel. One of them, BES1, is GT15A and an arbitrary primer (5'-GCCTGCCTCACG -3 '(SEQ ID NO:
4)) was used in the reaction product. Its amplified DN
A product is extracted and purified from electrophoresis gel, inserted into cloning vector (pGEM-T, Promega), cloned,
The base sequence was determined. Further, based on the nucleotide sequence, a full-length cDNA was isolated using Lifetech Oriental's 5'RACE system, inserted into the above-mentioned pGEM-T vector and cloned, and the entire nucleotide sequence was determined. Its cD
The nucleotide sequence of NA is shown in SEQ ID NO: 5, and the amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence is shown in SEQ ID NO: 6, respectively.
When the timing and organ specificity of the expression of the gene were analyzed by the Northern blotting method and the RT-PCR method, FIG.
As shown in Fig. 2 and Fig. 2, expression of BES1 gene transcript was strongly induced in embryonic tissue from the very early stage of embryogenesis, and was below the detection limit in pollen, leaves, callus, etc. immediately after isolation. Became clear.
【0056】[実施例2] 胚発生時特異的遺伝子の発現
制御部位のクローニング
このBES1の発現制御部位と考えられるBES1の翻訳領域の
上流領域をナタネゲノムDNAを鋳型として逆PCR法によっ
てクローニングした。ナタネゲノムDNAを制限酵素BamHI
およびEcoRIで2重消化し、両端をT4 DNAポリメラーゼに
よって平滑化したのち、T4 DNAリガーゼによって自己環
状化した。これを鋳型として、BES1 cDNAの配列より設
計した2種類の逆PCRプライマーを用いてPCRを行い、さ
らにその増幅産物の塩基配列データよりBES1遺伝子の翻
訳開始点上流2179bpをPCR法によってクローン化した。
その全塩基配列を決定し、既知のDNA配列データベース
に対してBLASTアルゴリズムを用いて相同性検索を行っ
たところ、得られた2179bpのうち5’側約1.1kbpの部分
は、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)の既知遺
伝子のタンパク質コード領域と非常に高い相同性を示し
たため、この領域はBES1の転写制御領域ではないものと
判断し、この5’側の領域を除く3’側1035bpをBES1の転
写制御領域としてクローン化した。その塩基配列を配列
番号:7に示し、このDNA断片を以下PBES1と記載する。
なお、本発明におけるDNAおよびアミノ酸配列データお
よびこれを利用した相同性検索は、インターネットを介
して公開されている米国NCBI(National Center for Bi
othchnology Information)の運営するコンピュータシ
ステム上のプログラムおよび当該システム上で公開され
ている遺伝子データベースによった。Example 2 Cloning of Expression Control Site of Gene Specific to Embryonic Development The upstream region of the BES1 translation region, which is considered to be the BES1 expression control site, was cloned by the inverse PCR method using rapeseed genomic DNA as a template. Rapeseed genomic DNA restriction enzyme BamHI
After double digestion with EcoRI and blunting both ends with T4 DNA polymerase, self-circularization with T4 DNA ligase was performed. Using this as a template, PCR was carried out using two types of reverse PCR primers designed from the sequence of BES1 cDNA, and 2179 bp upstream of the translation initiation site of the BES1 gene was cloned by the PCR method from the nucleotide sequence data of the amplified product.
The entire base sequence was determined, and a homology search was performed using the BLAST algorithm on a known DNA sequence database. As a result, the portion of the obtained 2179 bp at the 5'side of about 1.1 kbp was Arabidopsis thaliana. It was judged that this region is not the transcriptional control region of BES1 because it showed extremely high homology with the protein coding region of the known gene of BES1. Cloned as. Its nucleotide sequence is shown in SEQ ID NO: 7, and this DNA fragment is hereinafter referred to as PBES1.
The DNA and amino acid sequence data of the present invention and the homology search using the data are used for the NCBI (National Center for Biological Information) published on the Internet.
(Othchnology Information) operated by a program on a computer system and a gene database published on the system.
【0057】[実施例3] 遺伝子発現制御パターンの特
異性の検討
PBES1のプロモータとしての活性はレポーター遺伝子を
用いた遺伝子組換え植物作製実験によって検討した。用
いたベクターは、植物形質転換遺伝子ベクターとして一
般的に用いられるpBI121である。このベクターは、レポ
ーター遺伝子としてカリフラワーモザイクウイルス由来
のCaMV-35Sプロモータに制御されるβ−グルクロニダー
ゼ遺伝子(GUS)をもつ。本実験においては、このCaMV-35
Sプロモータを取り除き、そこにPBES1を挿入して作製し
た改変ベクターを用いた。このベクターをアグロバクテ
リウムを介したバイナリーベクター法によってナタネお
よびシロイヌナズナに形質転換した。その形質転換植物
におけるGUSの発現誘導パターンを指標としてPBES1の持
つプロモータとしての遺伝子発現誘導能およびその時期
・組織特異性を5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル
−β−グルクロニド(X−Gluc)を基質として組織化学
的に活性染色して検出した。その結果、該DNA断片PBES1
はナタネ花粉胚発生およびシロイヌナズナ接合子胚発生
のどちらの過程においても、胚発生極初期から胚組織特
異的に外来遺伝子の発現を強く誘導する性質を持つこと
を明らかにした(図3−1、2、3および5を参照)。
また、図3−4に示すように、葉、根、等の栄養組織に
おける活性は検出されなかった。以上の結果から、該プ
ロモータ配列は植物の胚発生誘導に伴い、極初期から胚
組織特異的な遺伝子発現をもたらす作用があることが示
された。その時間的、空間的な制御は極めて厳密なもの
であり、その特異性は極めて高いものであることは明瞭
である。[Example 3] Examination of specificity of gene expression control pattern The activity of PBES1 as a promoter was examined by a gene recombinant plant production experiment using a reporter gene. The vector used is pBI121 which is commonly used as a plant transformation gene vector. This vector has a β-glucuronidase gene (GUS) controlled by the CaMV-35S promoter derived from cauliflower mosaic virus as a reporter gene. In this experiment, this CaMV-35
A modified vector prepared by removing the S promoter and inserting PBES1 therein was used. This vector was transformed into rapeseed and Arabidopsis thaliana by the binary vector method via Agrobacterium. Using the expression induction pattern of GUS in the transformed plant as an index, the gene expression inducing ability as a promoter of PBES1 and its timing / tissue specificity were determined by 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-glucuronide (X-Gluc ) Was used as a substrate for histochemical activity staining for detection. As a result, the DNA fragment PBES1
Revealed that in both the development of rapeseed pollen embryo and the development of Arabidopsis zygote embryo, it has a property of strongly inducing the expression of a foreign gene specifically in the embryonic tissue from the earliest stage of embryogenesis (Fig. 3-1, (See 2, 3 and 5).
Moreover, as shown in FIG. 3-4, no activity was detected in vegetative tissues such as leaves and roots. From the above results, it was shown that the promoter sequence has an action of inducing gene expression specific to embryonic tissue from the very early stages along with the induction of plant embryogenesis. It is clear that its temporal and spatial control is extremely strict and its specificity is extremely high.
【0058】このような胚特異的発現制御を司る領域を
特定する目的で、PBES1を5’側から削った欠失断片を用
いて形質転換植物による同様の解析を行った。形質転換
体の未熟種子(開花後4日目)から粗タンパクを抽出
し、Glucuron(ICN社)を基質とした発光強度を指標と
して、GUS活性をフォトンカウンティングによって定量
的に測定した。その結果、図4に示すように、PBES1の
3’側から297塩基と400塩基の間の長さ104bpの領域に当
該プロモータの胚特異的な発現制御に重要な働きを持つ
配列が存在することが明らかになった。この領域の塩基
配列を配列番号:8に示す。For the purpose of identifying the region controlling such embryo-specific expression control, a similar analysis was carried out by a transformed plant using a deletion fragment obtained by deleting PBES1 from the 5 ′ side. Crude protein was extracted from immature seeds (4 days after flowering) of the transformant, and GUS activity was quantitatively measured by photon counting using luminescence intensity with Glucuron (ICN) as a substrate. As a result, as shown in Fig. 4, PBES1
It was revealed that there is a sequence that plays an important role in embryo-specific expression control of the promoter in the region of 104 bp in length between 297 and 400 bases from the 3'side. The nucleotide sequence of this region is shown in SEQ ID NO: 8.
【0059】[実施例4] 他の植物種からの類似プロモ
ータのクローニング
PBES1の塩基配列情報を用い、公開されている遺伝子デ
ータベースに対してBLASTアルゴリズムを用いた相同性
検索を行ったが、高い相同性を持つ既知の塩基配列は検
索されなかった。しかし、先に単離したBES1遺伝子のcD
NA配列より推定されるアミノ酸配列(配列番号:6)
は、シロイヌナズナの全ゲノムシークエンス情報より推
定される推定タンパク質F20O9.30(GenBankアクセッシ
ョン番号: T04605)と高い相同性を示すことがBLASTア
ルゴリズムを用いたデータベース検索によって明らかと
なった。そこで、F20O9.30遺伝子の座乗しているシロイ
ヌナズナのゲノム配列をデータベースより取得し(GenB
ankアクセッション番号: AL021749)、F20O9.30をコー
ドすると推定されている領域の上流域421bpをPCR法を用
いてクローニングした。その塩基配列を配列番号:9に
示し、以下PAtBES1とする。PAtBES1をGUSの上流につな
ぎ、バイナリーベクター法を用いてシロイヌナズナに導
入し、同様の形質転換実験を行った。その結果、図3−
6に示すように、PAtBES1もPBES1と同様に初期胚特異的
な遺伝子発現誘導パターンを示すことが明らかになっ
た。このことは、BES1タンパクのアミノ酸配列情報を利
用して、種の違う植物からも同様の特性を持つプロモー
タ配列を得ることが可能であることを示している。Example 4 Cloning of Similar Promoters from Other Plant Species Using the nucleotide sequence information of PBES1, a homology search was performed using the BLAST algorithm against a public gene database, and high homology was found. No known base sequence with sex was searched. However, the cD of the previously isolated BES1 gene
Amino acid sequence deduced from NA sequence (SEQ ID NO: 6)
Was highly homologous to the putative protein F20O9.30 (GenBank accession number: T04605) deduced from the whole genome sequence information of Arabidopsis thaliana, which was revealed by database search using the BLAST algorithm. Therefore, the genome sequence of Arabidopsis thaliana with the F20O9.30 gene was acquired from the database (GenB
ank accession number: AL021749), upstream region 421 bp of the region presumed to encode F20O9.30 was cloned using the PCR method. Its base sequence is shown in SEQ ID NO: 9 and is hereinafter referred to as PAtBES1. PAtBES1 was ligated upstream of GUS and introduced into Arabidopsis using the binary vector method, and the same transformation experiment was performed. As a result, Fig. 3-
As shown in 6, it was revealed that PAtBES1 also exhibits an early embryo-specific gene expression induction pattern like PBES1. This indicates that it is possible to obtain a promoter sequence having similar characteristics from plants of different species by using the amino acid sequence information of BES1 protein.
【0060】[0060]
【発明の効果】遺伝子組換え技術を高等植物を利用した
新品種育成・物質生産等に用いる場合、導入した遺伝子
の発現を植物の目的とする組織特異的、あるいは発育の
時期特異的に制御することは重要な技術である。本発明
におけるプロモータ活性を有するDNAは、植物の種子が
形成される際、その胚に特異的に、かつ胚発生の極初期
段階から任意の遺伝子の発現を強く誘導する。そのた
め、各種代謝系酵素遺伝子の発現誘導による有用物質の
胚組織における産生・蓄積技術、胚致死をもたらすよう
な遺伝子の強制発現による種子の不活化、ホルモン合成
系関連遺伝子等、形態形成関連遺伝子の胚組織での発現
誘導による種子胚の形態改変等に利用可能である。[Effects of the Invention] When the gene recombination technology is used for the breeding of new varieties and the production of substances using higher plants, the expression of the introduced gene is controlled in a tissue-specific or development-specific manner of the plant. That is an important technology. The DNA having the promoter activity in the present invention strongly induces the expression of any gene specifically in the embryo and at the very early stage of embryogenesis when the seed of the plant is formed. Therefore, technologies for producing and accumulating useful substances in embryonic tissues by inducing expression of various metabolic enzyme genes, seed inactivation by forced expression of genes that cause embryonic lethality, morphogenesis-related genes such as hormone synthesis-related genes, etc. It can be used to modify the morphology of seed embryos by inducing expression in embryo tissues.
【0061】さらに、本発明におけるプロモータ活性を
有するDNAを、遺伝子組換え操作時の選抜マーカー遺伝
子の発現制御に用いることにより、単細胞からの不定胚
誘導系を利用した形質転換技術において、抗生物質耐性
等の選抜マーカー遺伝子を不定胚形成の初期段階から発
現させることが可能となる。Furthermore, by using the DNA having the promoter activity of the present invention to control the expression of a selectable marker gene during gene recombination, an antibiotic resistance can be obtained in a transformation technique utilizing a somatic embryo induction system from a single cell. It becomes possible to express a selectable marker gene such as from the early stage of somatic embryogenesis.
【0062】また、胚組織に特異的に任意の遺伝子発現
が誘導されるため、胚以外の組織に対する導入遺伝子の
影響を軽減することが可能となる。例えば種子胚以外の
葉、根、果肉等を可食部とする農作物においては、収穫
物において蓄積していないことが望ましい選抜マーカー
遺伝子産物の産生を防止することができる。その他、高
等植物における遺伝子工学系の産業分野において、胚組
織に特異的に導入遺伝子を発現させることが必要とされ
る際に広汎に利用可能である。Further, since the expression of an arbitrary gene is specifically induced in the embryonic tissue, it is possible to reduce the influence of the introduced gene on tissues other than the embryo. For example, it is possible to prevent the production of a selectable marker gene product, which is desirable not to be accumulated in the harvested product, in agricultural products other than the seed embryo, which have edible parts such as leaves, roots and pulp. In addition, in the industrial field of genetic engineering in higher plants, it can be widely used when it is necessary to express a transgene specifically in embryonic tissues.
【0063】[0063]
【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> National Agricultural Research Organization <120> Embryo specific genes of plants, promoters of the genes, and use t hereof <130> ARO-A0102 <140> <141> <160> 9 <170> PatentIn Ver. 2.1 <210> 1 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 1 gttttttttt tttttta 17 <210> 2 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 2 gttttttttt ttttttc 17 <210> 3 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 3 gttttttttt ttttttg 17 <210> 4 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 4 gcctgcctca cg 12 <210> 5 <211> 873 <212> DNA <213> Brassica napus <220> <221> CDS <222> (51)..(680) <400> 5 acacatttca agagactgat ttatttgagg tctagttaaa gtttggaggg atg ggt 56 Met Gly 1 ttg atc aaa agg ttt gat gct tat ttg atg act gtg atg tta gtg agt 104 Leu Ile Lys Arg Phe Asp Ala Tyr Leu Met Thr Val Met Leu Val Ser 5 10 15 ttg ggg ttt gca att ggg ttt tca aat ggg tac aag ttc tat gtt ggt 152 Leu Gly Phe Ala Ile Gly Phe Ser Asn Gly Tyr Lys Phe Tyr Val Gly 20 25 30 ggg aga gat ggt tgg gtc ctt act cca tcc gag gac tat tct cat tgg 200 Gly Arg Asp Gly Trp Val Leu Thr Pro Ser Glu Asp Tyr Ser His Trp 35 40 45 50 tct tat cga agc cgg ttt cag gtc aat gac act ctt tat ttt aag tac 248 Ser Tyr Arg Ser Arg Phe Gln Val Asn Asp Thr Leu Tyr Phe Lys Tyr 55 60 65 cct aag ggg aaa gat tca gtg ttg gag gtg agt gaa gaa gaa ttc aac 296 Pro Lys Gly Lys Asp Ser Val Leu Glu Val Ser Glu Glu Glu Phe Asn 70 75 80 aca tgc aac act act cac cca ata acc tcc ctc acg ggc gga gac tct 344 Thr Cys Asn Thr Thr His Pro Ile Thr Ser Leu Thr Gly Gly Asp Ser 85 90 95 ctc tat gtt ctt agc cgc tca ggt ccg ttc ttt ttt gtc agc ggc aac 392 Leu Tyr Val Leu Ser Arg Ser Gly Pro Phe Phe Phe Val Ser Gly Asn 100 105 110 tca gaa aat tgt ctc aaa ggt cag aag cta ccc gtg aag gtc atg tcc 440 Ser Glu Asn Cys Leu Lys Gly Gln Lys Leu Pro Val Lys Val Met Ser 115 120 125 130 gcc gcc cac cac agc cac agt cct cgt cag cca tct cca tcg ccc tca 488 Ala Ala His His Ser His Ser Pro Arg Gln Pro Ser Pro Ser Pro Ser 135 140 145 ccg tca ccg act ctg tct cca agc cat cag gct ttg tca tct cca gcg 536 Pro Ser Pro Thr Leu Ser Pro Ser His Gln Ala Leu Ser Ser Pro Ala 150 155 160 cct tct ccg aga gtg gtt ctt tct gaa tct gaa gct ctt gct ccg gct 584 Pro Ser Pro Arg Val Val Leu Ser Glu Ser Glu Ala Leu Ala Pro Ala 165 170 175 cca gga cca gcg aaa gct cac aat tcg gcc ggt ttg gtg agt cct agg 632 Pro Gly Pro Ala Lys Ala His Asn Ser Ala Gly Leu Val Ser Pro Arg 180 185 190 gcg gtc tct cta gga ttg gtt ctc gtg gtt att ata agt ttc gtg ctt 680 Ala Val Ser Leu Gly Leu Val Leu Val Val Ile Ile Ser Phe Val Leu 195 200 205 210 tagagttata atggcgaggg taataaatcc tccataattg agtttaatat taatgttcct 740 tgaaccatct tattaattgt gtttgaactt tgttatgttt gtcctttttg ttatgttttt 800 catgtctcgt gtttttcttt actaaacaaa gtttgtattt atactaaaaa gagcatgtat 860 ttgttttgtg tct 873 <210> 6 <211> 210 <212> PRT <213> Brassica napus <400> 6 Met Gly Leu Ile Lys Arg Phe Asp Ala Tyr Leu Met Thr Val Met Leu 1 5 10 15 Val Ser Leu Gly Phe Ala Ile Gly Phe Ser Asn Gly Tyr Lys Phe Tyr 20 25 30 Val Gly Gly Arg Asp Gly Trp Val Leu Thr Pro Ser Glu Asp Tyr Ser 35 40 45 His Trp Ser Tyr Arg Ser Arg Phe Gln Val Asn Asp Thr Leu Tyr Phe 50 55 60 Lys Tyr Pro Lys Gly Lys Asp Ser Val Leu Glu Val Ser Glu Glu Glu 65 70 75 80 Phe Asn Thr Cys Asn Thr Thr His Pro Ile Thr Ser Leu Thr Gly Gly 85 90 95 Asp Ser Leu Tyr Val Leu Ser Arg Ser Gly Pro Phe Phe Phe Val Ser 100 105 110 Gly Asn Ser Glu Asn Cys Leu Lys Gly Gln Lys Leu Pro Val Lys Val 115 120 125 Met Ser Ala Ala His His Ser His Ser Pro Arg Gln Pro Ser Pro Ser 130 135 140 Pro Ser Pro Ser Pro Thr Leu Ser Pro Ser His Gln Ala Leu Ser Ser 145 150 155 160 Pro Ala Pro Ser Pro Arg Val Val Leu Ser Glu Ser Glu Ala Leu Ala 165 170 175 Pro Ala Pro Gly Pro Ala Lys Ala His Asn Ser Ala Gly Leu Val Ser 180 185 190 Pro Arg Ala Val Ser Leu Gly Leu Val Leu Val Val Ile Ile Ser Phe 195 200 205 Val Leu 210 <210> 7 <211> 1035 <212> DNA <213> Brassica napus <400> 7 tattgtttga catacagcta aaacatacca caattatttg acaaaagatt caattagaaa 60 gcatggttcc acaaaggcca agcaattatc acagagcttc aatatagtca atggtgggca 120 tttcactaaa gtgtgatcag ctcaatagtg ataagaagat aaatctaaaa cacaaacctg 180 gtcgctccat tatcgagttt cgaactctga tcccaaaacc cctagaggtt ccagcttttc 240 catctcacaa cttctagtga aactagggtt tgggttttct gcagactgta gaggaagcag 300 tagaagattg ctggctgtat cagaagctaa atagacgtgg ctgaagaata ttttgaagct 360 tcacaattag ctcctctcta agctaggcat actgaagaaa gcatccatcc acttatagaa 420 atagatgggc tttaaacgta gaggatgaaa tatgttctgt tacaagaaaa tagtaaatag 480 tttattctaa tattgtccaa ctagttgggc tgcaaatata gaggataaaa tccttaaagc 540 ctttctttta acatacttga tcatttaaaa gcacattagt tttttaatta ttttgaactc 600 cttctagttg gtttttttag gcttttagct catttgtata cttttttttt cttatataaa 660 atgaagacaa tacgttacgc aagttatttt tttaagaaaa ttgaatttca gctttatatt 720 aaatgactga caaattagaa gatctagttt taaatggttg tttgtgattt gaggagggag 780 taaatgaaat gtgtgaaaag aagagagatg gccgttaagt ccattgcatg ttgaaacgtg 840 tgaagaaaac aaaagaggag caaaacttga aacgcttctt attaattttg catattctct 900 agagagtcga agttgatgca gccaaaagct aacggctatg acttctctac tttcactata 960 aatacgcata caagcactga agagcaacac acatttcaag agactgattt atttgaggtc 1020 tagttaaagt ttgga 1035 <210> 8 <211> 104 <212> DNA <213> Brassica napus <400> 8 gtatactttt tttttcttat ataaaatgaa gacaatacgt tacgcaagtt atttttttaa 60 gaaaattgaa tttcagcttt atattaaatg actgacaaat taga 104 <210> 9 <211> 421 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <400> 9 gatatttatc gatttgtaaa ttgaaatata aaataaaaca atatgtaacg taagttttaa 60 ataataataa atactaaagg attacaattt tatatttgat ggctaaataa ttacaagatc 120 tgagtgagaa atgtttgttt gtgagaaaga aagtgaaaaa ttaaaggtag atagccgtta 180 agtccactgc atgtcgagac gtgttcaaaa gaagacagga gcaaaaccaa aacgcttcta 240 cttaattcgc atttctttag gtaatcgatg cacagcccaa aaagcttgac ctaacggcta 300 tgttttcttt actttcacca taaataagca cctcttgagg ttgcaaacac acacacacac 360 acacactcac ttcaaaagag ttagtaagaa gttggggttt gattaacgtt ttgcatcgga 420 g 421[Sequence list] SEQUENCE LISTING <110> National Agricultural Research Organization <120> Embryo specific genes of plants, promoters of the genes, and use t hereof <130> ARO-A0102 <140> <141> <160> 9 <170> PatentIn Ver. 2.1 <210> 1 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 1 gttttttttt tttttta 17 <210> 2 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 2 gttttttttt ttttttc 17 <210> 3 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 3 gttttttttt ttttttg 17 <210> 4 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: An Artificially Synthesized Primer Sequence <400> 4 gcctgcctca cg 12 <210> 5 <211> 873 <212> DNA <213> Brassica napus <220> <221> CDS <222> (51) .. (680) <400> 5 acacatttca agagactgat ttatttgagg tctagttaaa gtttggaggg atg ggt 56 Met Gly 1 ttg atc aaa agg ttt gat gct tat ttg atg act gtg atg tta gtg agt 104 Leu Ile Lys Arg Phe Asp Ala Tyr Leu Met Thr Val Met Leu Val Ser 5 10 15 ttg ggg ttt gca att ggg ttt tca aat ggg tac aag ttc tat gtt ggt 152 Leu Gly Phe Ala Ile Gly Phe Ser Asn Gly Tyr Lys Phe Tyr Val Gly 20 25 30 ggg aga gat ggt tgg gtc ctt act cca tcc gag gac tat tct cat tgg 200 Gly Arg Asp Gly Trp Val Leu Thr Pro Ser Glu Asp Tyr Ser His Trp 35 40 45 50 tct tat cga agc cgg ttt cag gtc aat gac act ctt tat ttt aag tac 248 Ser Tyr Arg Ser Arg Phe Gln Val Asn Asp Thr Leu Tyr Phe Lys Tyr 55 60 65 cct aag ggg aaa gat tca gtg ttg gag gtg agt gaa gaa gaa ttc aac 296 Pro Lys Gly Lys Asp Ser Val Leu Glu Val Ser Glu Glu Glu Phe Asn 70 75 80 aca tgc aac act act cac cca ata acc tcc ctc acg ggc gga gac tct 344 Thr Cys Asn Thr Thr His Pro Ile Thr Ser Leu Thr Gly Gly Asp Ser 85 90 95 ctc tat gtt ctt agc cgc tca ggt ccg ttc ttt ttt gtc agc ggc aac 392 Leu Tyr Val Leu Ser Arg Ser Gly Pro Phe Phe Phe Val Ser Gly Asn 100 105 110 tca gaa aat tgt ctc aaa ggt cag aag cta ccc gtg aag gtc atg tcc 440 Ser Glu Asn Cys Leu Lys Gly Gln Lys Leu Pro Val Lys Val Met Ser 115 120 125 130 gcc gcc cac cac agc cac agt cct cgt cag cca tct cca tcg ccc tca 488 Ala Ala His His Ser His Ser Pro Arg Gln Pro Ser Pro Ser Pro Ser 135 140 145 ccg tca ccg act ctg tct cca agc cat cag gct ttg tca tct cca gcg 536 Pro Ser Pro Thr Leu Ser Pro Ser His Gln Ala Leu Ser Ser Pro Ala 150 155 160 cct tct ccg aga gtg gtt ctt tct gaa tct gaa gct ctt gct ccg gct 584 Pro Ser Pro Arg Val Val Leu Ser Glu Ser Glu Ala Leu Ala Pro Ala 165 170 175 cca gga cca gcg aaa gct cac aat tcg gcc ggt ttg gtg agt cct agg 632 Pro Gly Pro Ala Lys Ala His Asn Ser Ala Gly Leu Val Ser Pro Arg 180 185 190 gcg gtc tct cta gga ttg gtt ctc gtg gtt att ata agt ttc gtg ctt 680 Ala Val Ser Leu Gly Leu Val Leu Val Val Ile Ile Ser Phe Val Leu 195 200 205 210 tagagttata atggcgaggg taataaatcc tccataattg agtttaatat taatgttcct 740 tgaaccatct tattaattgt gtttgaactt tgttatgttt gtcctttttg ttatgttttt 800 catgtctcgt gtttttcttt actaaacaaa gtttgtattt atactaaaaa gagcatgtat 860 ttgttttgtg tct 873 <210> 6 <211> 210 <212> PRT <213> Brassica napus <400> 6 Met Gly Leu Ile Lys Arg Phe Asp Ala Tyr Leu Met Thr Val Met Leu 1 5 10 15 Val Ser Leu Gly Phe Ala Ile Gly Phe Ser Asn Gly Tyr Lys Phe Tyr 20 25 30 Val Gly Gly Arg Asp Gly Trp Val Leu Thr Pro Ser Glu Asp Tyr Ser 35 40 45 His Trp Ser Tyr Arg Ser Arg Phe Gln Val Asn Asp Thr Leu Tyr Phe 50 55 60 Lys Tyr Pro Lys Gly Lys Asp Ser Val Leu Glu Val Ser Glu Glu Glu 65 70 75 80 Phe Asn Thr Cys Asn Thr Thr His Pro Ile Thr Ser Leu Thr Gly Gly 85 90 95 Asp Ser Leu Tyr Val Leu Ser Arg Ser Gly Pro Phe Phe Phe Val Ser 100 105 110 Gly Asn Ser Glu Asn Cys Leu Lys Gly Gln Lys Leu Pro Val Lys Val 115 120 125 Met Ser Ala Ala His His Ser His Ser Pro Arg Gln Pro Ser Pro Ser 130 135 140 Pro Ser Pro Ser Pro Thr Leu Ser Pro Ser His Gln Ala Leu Ser Ser 145 150 155 160 Pro Ala Pro Ser Pro Arg Val Val Leu Ser Glu Ser Glu Ala Leu Ala 165 170 175 Pro Ala Pro Gly Pro Ala Lys Ala His Asn Ser Ala Gly Leu Val Ser 180 185 190 Pro Arg Ala Val Ser Leu Gly Leu Val Leu Val Val Ile Ile Ser Phe 195 200 205 Val Leu 210 <210> 7 <211> 1035 <212> DNA <213> Brassica napus <400> 7 tattgtttga catacagcta aaacatacca caattatttg acaaaagatt caattagaaa 60 gcatggttcc acaaaggcca agcaattatc acagagcttc aatatagtca atggtgggca 120 tttcactaaa gtgtgatcag ctcaatagtg ataagaagat aaatctaaaa cacaaacctg 180 gtcgctccat tatcgagttt cgaactctga tcccaaaacc cctagaggtt ccagcttttc 240 catctcacaa cttctagtga aactagggtt tgggttttct gcagactgta gaggaagcag 300 tagaagattg ctggctgtat cagaagctaa atagacgtgg ctgaagaata ttttgaagct 360 tcacaattag ctcctctcta agctaggcat actgaagaaa gcatccatcc acttatagaa 420 atagatgggc tttaaacgta gaggatgaaa tatgttctgt tacaagaaaa tagtaaatag 480 tttattctaa tattgtccaa ctagttgggc tgcaaatata gaggataaaa tccttaaagc 540 ctttctttta acatacttga tcatttaaaa gcacattagt tttttaatta ttttgaactc 600 cttctagttg gtttttttag gcttttagct catttgtata cttttttttt cttatataaa 660 atgaagacaa tacgttacgc aagttatttt tttaagaaaa ttgaatttca gctttatatt 720 aaatgactga caaattagaa gatctagttt taaatggttg tttgtgattt gaggagggag 780 taaatgaaat gtgtgaaaag aagagagatg gccgttaagt ccattgcatg ttgaaacgtg 840 tgaagaaaac aaaagaggag caaaacttga aacgcttctt attaattttg catattctct 900 agagagtcga agttgatgca gccaaaagct aacggctatg acttctctac tttcactata 960 aatacgcata caagcactga agagcaacac acatttcaag agactgattt atttgaggtc 1020 tagttaaagt ttgga 1035 <210> 8 <211> 104 <212> DNA <213> Brassica napus <400> 8 gtatactttt tttttcttat ataaaatgaa gacaatacgt tacgcaagtt atttttttaa 60 gaaaattgaa tttcagcttt atattaaatg actgacaaat taga 104 <210> 9 <211> 421 <212> DNA <213> Arabidopsis thaliana <400> 9 gatatttatc gatttgtaaa ttgaaatata aaataaaaca atatgtaacg taagttttaa 60 ataataataa atactaaagg attacaattt tatatttgat ggctaaataa ttacaagatc 120 tgagtgagaa atgtttgttt gtgagaaaga aagtgaaaaa ttaaaggtag atagccgtta 180 agtccactgc atgtcgagac gtgttcaaaa gaagacagga gcaaaaccaa aacgcttcta 240 cttaattcgc atttctttag gtaatcgatg cacagcccaa aaagcttgac ctaacggcta 300 tgttttcttt actttcacca taaataagca cctcttgagg ttgcaaacac acacacacac 360 acacactcac ttcaaaagag ttagtaagaa gttggggttt gattaacgtt ttgcatcgga 420 g 421
【図1】 RT-PCR法により検出されたナタネBES1転写産
物を示す写真である。1〜12は、それぞれ、単離直後の
未熟花粉、20℃2日間培養後の未熟花粉、32℃4日間培養
後の未熟花粉、32℃4日間培養後の未熟花粉、数細胞期
胚、球状胚、心臓型/魚雷型胚、子葉胚、完熟種子、
葉、カルス(培養温度20℃)、カルス(培養温度32℃)
から調製したサンプルを示す。FIG. 1 is a photograph showing a rapeseed BES1 transcript detected by RT-PCR. 1 to 12 are immature pollen immediately after isolation, immature pollen after culturing at 20 ° C. for 2 days, immature pollen after culturing at 32 ° C. for 4 days, immature pollen after culturing at 32 ° C. for 4 days, embryo at several cell stages, spherical Embryo, heart / torpedo, cotyledon, ripe seed,
Leaf, callus (culture temperature 20 ℃), callus (culture temperature 32 ℃)
The sample prepared from is shown.
【図2】 ノーザンハイブリダイゼーション法により検
出されたナタネBES1転写産物を示す写真である。1〜7
は、それぞれ、単離直後の未熟花粉、20℃2日間培養後
の未熟花粉、32℃2日間培養後の未熟花粉、32℃4日間培
養後の未熟花粉、球状胚、心臓型/魚雷型胚、葉から調
製したサンプルを示す。FIG. 2 is a photograph showing a rapeseed BES1 transcript detected by the Northern hybridization method. 1 ~ 7
Are immature pollen immediately after isolation, immature pollen after culturing at 20 ° C for 2 days, immature pollen after culturing at 32 ° C for 2 days, immature pollen after culturing at 32 ° C for 4 days, spherical embryos, heart-shaped / torpedo embryos, respectively. , Shows samples prepared from leaves.
【図3】 遺伝子組換え実験により検出されたプロモー
タの遺伝子発現制御パターンを示す写真である。全ての
サンプルはX-Glucを基質として組織化学的に活性染色し
た。黒色の部位がGUSの活性を示している。1〜6は、そ
れぞれ、PBES1::GUSを導入した形質転換ナタネより単離
した花粉胚の培養4日目、同8日目、同14日目、PBES1::G
USを導入したシロイヌナズナ形質転換体の実生(播種後
7日目)、同形質転換体の未熟胚(開花4日後)、PAtBES
1::GUSを導入したシロイヌナズナ形質転換体の未熟胚
(開花4日後)の写真である。FIG. 3 is a photograph showing a gene expression control pattern of a promoter detected by a gene recombination experiment. All samples were histochemically active stained with X-Gluc as a substrate. The black part shows the activity of GUS. 1 to 6 are PBES1 :: GUS-introduced pollen embryos isolated from the rapeseed, respectively, 4th day, 8th day, 14th day, and PBES1 :: G
Seedlings of Arabidopsis transformants introduced with US (after sowing)
7th day), immature embryo of the same transformant (4 days after flowering), PAtBES
1 is a photograph of immature embryos (4 days after flowering) of Arabidopsis transformants introduced with 1 :: GUS.
【図4】 PBES1を5'側から削った7種類の断片および該
断片のプロモータ活性(GUSの活性)を示す図である。FIG. 4 is a diagram showing 7 types of fragments in which PBES1 is deleted from the 5 ′ side and promoter activity (activity of GUS) of the fragments.
フロントページの続き Fターム(参考) 2B030 AA02 AB03 AD20 CA08 CD14 HA01 4B024 AA08 BA80 CA04 DA01 EA04 FA02 FA10 GA11 GA17 4B063 QA08 QA18 QQ32 QR58 QR59 QR80 QS24 QS28 QX01 4B065 AA88X AA88Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA53 4H045 AA10 AA30 BA10 CA30 EA05 FA74 Continued front page F term (reference) 2B030 AA02 AB03 AD20 CA08 CD14 HA01 4B024 AA08 BA80 CA04 DA01 EA04 FA02 FA10 GA11 GA17 4B063 QA08 QA18 QQ32 QR58 QR59 QR80 QS24 QS28 QX01 4B065 AA88X AA88Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA53 4H045 AA10 AA30 BA10 CA30 EA05 FA74
Claims (12)
(a)〜(c)のいずれかに記載の天然由来のDNA。 (a)配列番号:6に記載のアミノ酸配列からなるタン
パク質をコードするDNA。 (b)配列番号:6に記載のアミノ酸配列において1ま
たは複数のアミノ酸が置換、欠失、付加、および/また
は挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質をコード
するDNA。 (c)配列番号:5に記載の塩基配列からなるDNAと
ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDN
A。1. The naturally-derived DNA according to any one of the following (a) to (c), which is specifically expressed in plant embryogenesis. (A) A DNA encoding a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6. (B) A DNA encoding a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 in which one or more amino acids are substituted, deleted, added and / or inserted. (C) DN which hybridizes with the DNA consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 under stringent conditions
A.
体。2. An artificial modified form of the DNA according to claim 1.
コードされるタンパク質。3. A protein encoded by the DNA according to claim 1 or 2.
のプロモータ活性を有するDNA。 (a)請求項3に記載のタンパク質をコードする遺伝子
の発現制御に関与するDNA。 (b)配列番号:7、8または9のいずれかに記載の塩
基配列を含むDNA。 (c)配列番号:7、8または9のいずれかに記載の塩
基配列において1または複数の塩基が置換、欠失、付
加、および/または挿入された塩基配列を含むDNA。4. A DNA having a promoter activity according to any of the following (a) to (c). (A) A DNA involved in the expression control of the gene encoding the protein according to claim 3. (B) A DNA containing the nucleotide sequence of any of SEQ ID NOs: 7, 8 or 9. (C) A DNA containing a base sequence in which one or more bases have been substituted, deleted, added, and / or inserted in the base sequence of SEQ ID NO: 7, 8 or 9.
のDNAを含むベクター。5. A vector containing the DNA according to claim 1, 2 or 4.
載のDNA、または請求項5に記載のベクターを保持す
る形質転換植物細胞。6. A transformed plant cell carrying the DNA according to claim 1, 2 or 4, or the vector according to claim 5.
する形質転換植物体。7. A transformed plant comprising the transformed plant cell according to claim 6.
またはクローンである、形質転換植物体。8. A transformed plant which is a progeny or a clone of the transformed plant according to claim 7.
体の繁殖材料。9. A propagation material for the transformed plant according to claim 7 or 8.
物体の製造方法であって、請求項1、2もしくは4のい
ずれかに記載のDNA、または請求項5に記載のベクタ
ーを植物細胞に導入し、該植物細胞から植物体を再生さ
せる工程を含む方法。10. A method for producing the transformed plant according to claim 7 or 8, wherein the DNA according to any one of claims 1, 2 or 4 or the vector according to claim 5 is added to a plant cell. And a step of regenerating a plant from the plant cell.
のDNAのプロモータ活性を調節するか否かを評価する
方法であって、(a)請求項4に記載のDNAとレポー
ター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを
含む細胞または細胞抽出液と、被験化合物を接触させる
工程、(b)該レポーター遺伝子の発現レベルを測定す
る工程、を含み、被験化合物が該レポーター遺伝子の発
現レベルを変化させた場合に、被験化合物が請求項4に
記載のDNAのプロモータ活性を調節すると判定される
方法。11. A method for evaluating whether or not a test compound regulates the promoter activity of the DNA according to claim 4, wherein (a) the DNA according to claim 4 and the reporter gene are functional. Comprising a step of contacting a test compound with a cell or cell extract containing DNA having a structure bound to, and (b) measuring the expression level of the reporter gene, the test compound expressing the expression level of the reporter gene. The method of determining that a test compound regulates the promoter activity of DNA according to claim 4, when it is changed.
む、請求項4に記載のDNAのプロモータ活性を調節す
る化合物のスクリーニング方法。 (a)請求項11に記載の評価方法により、被験化合物
について、請求項4に記載のDNAのプロモータ活性を
調節するか否かを評価する工程。(b)被験化合物か
ら、請求項4に記載のDNAのプロモータ活性を調節す
ると評価された化合物を選択する工程。12. A method for screening a compound that regulates the promoter activity of DNA according to claim 4, which comprises the following steps (a) and (b). (A) A step of evaluating whether or not the test compound regulates the promoter activity of the DNA according to claim 4 with respect to the test compound by the evaluation method according to claim 11. (B) A step of selecting, from the test compounds, a compound evaluated to regulate the promoter activity of the DNA according to claim 4.
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