【発明の詳細な説明】
【0001】本発明は、新たに同定されたポリヌクレオ
チド、そのポリヌクレオチドによってコードされるポリ
ペプチド、そのポリヌクレオチド及びポリペプチドの使
用、並びにそのポリヌクレオチド及びポリペプチドの生
産に関する。より具体的に述べると、本発明のポリペプ
チドは、繊維芽細胞増殖因子/ヘパリン結合性増殖因子
(以下、これを「FGF-15」という)であると推定されて
いる。本発明は、上記ポリペプチドの作用を阻害するこ
とにも関する。
【0002】繊維芽細胞増殖因子は、ヘパリンに結合す
るという特性を示すタンパク質のファミリーであり、そ
れゆえにヘパリン結合性増殖因子(HBGF)とも呼ばれ
る。このタンパク質ファミリーの種々の構成要素は様々
な組識で発現し、その発現は独特の時間的空間的制御を
受けている。これらのタンパク質は、繊維芽細胞、角膜
及び血管内皮細胞、顆粒球、副腎皮質細胞、軟骨細胞、
筋芽細胞、血管平滑筋、水晶体上皮細胞、メラニン形成
細胞、ケラチン生成細胞、寡突起膠細胞、星状細胞、骨
芽細胞及び造血細胞を含む、中胚葉、外胚葉及び内胚葉
由来の様々な細胞にとって、強力な有糸分裂促進因子で
ある。
【0003】各構成要素は、互いに重複する機能を持つ
と共に、それぞれ独特の機能スペクトルをも持つ。FGF-
1とFGF-2は、血管内皮細胞の増殖を刺激する能力に加え
て、内皮細胞にとって走化性であり、FGF-2は内皮細胞
が基底膜を貫入するのを可能にすることが示されてい
る。これらの特性と合致して、FGF-1とFGF-2は、血管形
成を刺激する能力を持つ。これら増殖因子のもう1つの
重要な特徴は、それらが創傷治癒を促進できるというこ
とである。FGFファミリーの他の多くの構成要素も、血
管形成及び創傷治癒の促進など、FGF-1及び2と同様の活
性を持つ。FGFファミリーの構成要素のいくつかは、中
胚葉形成を誘発し、ニューロン細胞、含脂肪細胞及び骨
格筋細胞の分化を調節することが示されている。
【0004】正常組識におけるこれら生物活性の他に、
FGFタンパク質は、その発現の制御が解除されると、腫
瘍血管新生を促進することにより、またトランスフォー
ミングタンパク質として、癌腫及び肉腫の腫瘍形成の促
進にも関係する。
【0005】現在、FGFファミリーは、構造的に関係す
る8種類のポリペプチド:塩基性FGF、酸性FGF、int 2、
hst 1/k-FGF、FGF-5、FGF-6、ケラチン生成細胞増殖因
子、AIGF(FGF-8)から構成されており、最近になっ
て、ヒトグリオーム細胞系の培養上清から精製されたグ
リア活性化因子が、新規ヘパリン結合性増殖因子である
ことが示されている(Miyamoto, M.ら, Mol. and Cell.
Biol., 13(7):4251-4259(1993))。それぞれの遺伝
子はクローン化され、配列決定されている。それら構成
要素のうちの2つ、FGF-1とFGF-2は、多くの名前で特徴
づけられているが、それぞれ酸性及び塩基性繊維芽細胞
増殖因子と呼ばれることが最も多い。正常な遺伝子産物
は、大半の内胚葉及び神経外胚葉系細胞の一般的な増殖
能力に影響を及ぼす。それらは、生体内で血管形成を誘
導することができ、初期発生に重要な役割を果たしうる
(Burgess, W.H.及びMaciag, T., Annu. Rev. Bioche
m., 58:575-606, (1989))。
【0006】また、FGFファミリーの上記構成要素の多
くは同じレセプターに結合し、それらのレセプターに対
する結合によって第2メッセージを誘導する。
【0007】分泌型FGF-1をコードする真核発現ベクタ
ーは、遺伝子転移によってブタ動脈内に導入されてい
る。このモデルは生体内の動脈壁における遺伝子機能を
明確にする。FGF-1発現は、遺伝子転移の21日後に、ブ
タ動脈における血管内膜の肥厚化を誘導した(Nabel,
E. G.ら, Nature, 362:844-6(1993))。さらに、塩基
性繊維芽細胞増殖因子が、グリオームの増殖と進行を、
腫瘍血管形成におけるその役割とは無関係に調節しうる
ことと、塩基性繊維芽細胞増殖因子の放出又は分泌がこ
れらの作用には必要であるらしいことも立証されている
(Morrison, R.S.ら, J. Neurosci. Res., 34:502-9(1
993))。
【0008】塩基性FGFのような繊維芽細胞増殖因子
は、カポジ肉腫細胞の試験管内増殖にも関係づけられて
いる(Huang, Y.Q.ら, J. Clin. Invest. 91:1191-7(1
993))。また、ヒト塩基性繊維芽細胞増殖因子をコー
ドするcDNA配列は、バクテリオファージT7 RNAポリメラ
ーゼによって認識される転写プロモーターの下流にクロ
ーニングされている。そのようにして得た塩基性繊維芽
細胞増殖因子は、有糸分裂促進性、プラスミノーゲン活
性化因子の合成及び血管形成アッセイにおいて、ヒト胎
盤繊維芽細胞増殖因子と識別できない生物活性を持つこ
とが示されている(Squires, C. H.ら, J. Biol. Che
m., 263:16297-302(1988))。
【0009】米国特許第5,155,214は、実質上純粋な哺
乳類塩基性繊維芽細胞増殖因子とそれらの生産を開示し
ている。ウシ及びヒト塩基性繊維芽細胞増殖因子のアミ
ノ酸配列と、ウシ種のポリペプチドをコードするDNA配
列が開示されている。
【0010】新たに発見されたFGF-9は、FGFファミリー
の他の構成要素と30%程度の配列類似性を持つ。ファミ
リー構成要素内の2つのシステイン残基とその他の共通
配列も、FGF-9配列にはよく保存されていた。FGF-9は、
そのN末端に、酸性及び塩基性FGFのような典型的シグナ
ル配列を持たないことがわかった。しかし、FGF-9は、
典型的なシグナル配列FGFを欠くにも関わらず、合成後
に細胞から分泌されることがわかった(Miyamoto, M.
ら, Mol. and Cell. Biol., 13(7):4251-4259(199
3))。さらに、FGF-9は、寡突起膠細胞タイプ2星状細
胞前駆細胞BALB/c3T3とPC-12細胞の細胞増殖を刺激する
が、ヒト臍静脈内皮細胞の細胞増殖は刺激しないことが
わかった(Naruo, K.ら, J. Biol. Chem., 268:2857-28
64(1993))。
【0011】塩基性FGFと酸性FGFは細胞増殖、細胞移
動、分化及び生存の強力な調節因子であり、外胚葉、中
胚葉及び内胚葉に由来する細胞タイプに作用する。これ
ら2つのFGFは、KGF及びAIGFと共に、タンパク質精製に
よって同定されている。しかし、他の4つの構成要素は
腫瘍遺伝子として単離され、その発現は、胚形成と一定
のタイプの癌に制限された。FGF-9は、膠細胞に対する
有糸分裂促進因子であることが立証された。FGFファミ
リーの構成要素は腫瘍形成力を持つと報告されている。
FGF-9は、BLB/c3T3細胞に形質転換されると、トランス
フォーミング能力を示す(Miyamoto, M.ら, Mol. Cell.
Biol., 13(7):4251-4259(1993))。
【0012】FGF-8としても知られるアンドロゲン誘導
性増殖因子(AIGF)は、テストステロンで刺激されたマ
ウス乳癌細胞(SC-3)の調整培地から精製された。AIGF
は独特なFGF様増殖因子であり、推定シグナルペプチド
を持ち、既知のFGFファミリー構成要素と30〜40%相同で
ある。AIGFで形質転換された哺乳類細胞は、アンドロゲ
ンの不在下にSC-3細胞の増殖に対して著しい刺激効果を
示す。したがってAIGFは、SC-3細胞と、そしておそらく
は他の細胞のアンドロゲン誘導性増殖を媒介する。なぜ
なら、これは腫瘍細胞自体によって分泌されるからであ
る。
【0013】本発明のポリペプチドは、FGFファミリー
の他の構成要素とのアミノ酸配列相同性から、FGFファ
ミリーの構成要素であると推定された。
【0014】本発明の一側面によれば、新規成熟ポリペ
プチド、並びに生物学的に活性かつ診断又は治療に有用
なその断片、類縁体及び誘導体が提供される。本発明の
ポリペプチドはヒト由来である。
【0015】本発明のもう1つの側面によれば、本発明
のポリペプチドをコードする単離された核酸分子(mRN
A、DNA、cDNA、ゲノムDNAを含む)並びに生物学的に活
性かつ診断又は治療に有用なその断片が提供される。
【0016】本発明のさらなる側面によれば、組換えベ
クター(本発明ポリペプチドの組換え生産に使用する試
薬として有用なクローニング及び発現ベクターなど)と
本発明ポリペプチドをコードする核酸配列を含む組換え
原核及び/又は真核宿主細胞とを使用することにより、
組換え技術で上記ポリペプチドを生産する方法が提供さ
れる。
【0017】本発明のさらなる側面によれば、上記ポリ
ペプチド又は上記ポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチドを、それらに対する作用薬及び拮抗薬をスクリー
ニングするために使用する方法、及び例えば火傷や潰瘍
による創傷の治癒を促進したり、ニューロン障害による
ニューロン損傷を予防し、ニューロン成長を促進した
り、皮膚老化と脱毛を予防したり、初期胚と四肢再生に
おける血管形成、中胚葉誘導を刺激するなどの治療目的
で使用する方法が提供される。
【0018】本発明のさらなる側面によれば、上記ポリ
ペプチドに対する抗体が提供される。
【0019】本発明のさらなる側面によれば、上記ポリ
ペプチドに対する拮抗薬(アンタゴニスト)と、例えば
細胞トランスフォーメーション(例えば腫瘍)の治療で
上記ポリペプチドの作用を阻害するため、傷あとを減ら
すため、あるいは血管過多性疾患を治療するために、そ
れらを使用する方法とが提供される。
【0020】本発明のもう1つの側面によれば、本発明
のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに特異的
にハイブリッド形成するに足る長さの核酸分子からなる
核酸プローブが提供される。
【0021】本発明のさらなる側面によれば、本発明の
核酸配列中の突然変異に関係する疾患又はその疾患に対
する罹病性を検出するため、及びその配列によってコー
ドされるポリペプチドの過剰発現を検出するための診断
的アッセイが提供される。
【0022】本発明のもう1つの側面によれば、上記ポ
リペプチド又は上記ポリペプチドをコードするポリヌク
レオチドを、科学的研究、DNAの合成及びDNAベクターの
製造に関係する試験管内目的に使用する方法が提供され
る。
【0023】本発明のこれらの側面とその他の側面は、
本明細書の教示から当業者には明らかなはずである。
【0024】次の図面は、単に本発明の特定の態様の例
示にすぎず、決して限定を意味するものではない。図1
〜2は、FGF-15のcDNA配列と対応する推定(deduced)
アミノ酸配列を示す図である。図3〜6は、FGF-15と他
のFGFファミリー構成要素の間のアミノ酸配列相同性を
示す図である。保存されたアミノ酸が容易に確認でき
る。
【0025】本発明の一側面によれば、図1〜2の推定
アミノ酸配列(配列番号2)を持つ成熟ポリペプチド、
若しくはATCC寄託番号97146として1995年5月12日に寄託
されたクローンのcDNAによってコードされる成熟ポリペ
プチドをコードする単離された核酸分子(ポリヌクレオ
チド)が提供される。
【0026】本発明のFGF-15をコードするポリヌクレオ
チドは、最初は、ヒト副腎腫瘍組識に由来するcDNAライ
ブラリー中に発見された。これは繊維芽細胞増殖因子フ
ァミリーの全ての構成要素と構造的に関連し、252アミ
ノ酸のポリペプチドをコードする読み取り枠を含有す
る。主な組み合わせのうち、1)ヒトFGF-9に対しては、
129アミノ酸の区間にわたって、41%の同一性と66%の配
列類似性を持ち、2)ヒトKGFに対しては、88アミノ酸の
領域にわたって、37%の同一性と59%の類似性を持つ。
【0027】FGF/HBGFファミリーの特徴、GXLX(S,T,A,
G)X6(D,E)CXFXEは、本発明のポリペプチドにも保存され
ている(Xは任意のアミノ酸残基を表す;(D, E)はD残
基又はE残基を表す;X6は任意の6アミノ酸残基を表
す)。
【0028】本発明のポリヌクレオチドはRNA型であっ
てもよいし、cDNA、ゲノムDNA及び合成DNAを含むDNA型
であってもよい。DNAは二本鎖であってよいし、一本鎖
であってもよい。成熟ポリペプチドをコードするコーデ
ィング配列は、図1〜2に示すコーディング配列(配列
番号1)又は上記寄託クローンのコーディング配列と同
一であってもよいし、図1〜2のDNA(配列番号1)又は
上記寄託cDNAと同じ成熟ポリペプチドをコードするが、
遺伝コードの冗長性又は縮重性ゆえに異なるコーディン
グ配列であってもよい。
【0029】図1〜2の成熟ポリペプチド(配列番号
2)若しくは上記寄託cDNAによってコードされる成熟ポ
リペプチドをコードするポリヌクレオチドは、その成熟
ポリペプチドのコーディング配列のみを含んでもよい
し、その成熟ポリペプチドのコーディング配列とリーダ
ー又は分泌配列などの付加的コーディング配列若しくは
プロタンパク質配列をコードしてもよく、また、成熟ポ
リペプチド(付加的コーディング配列を伴ってもよい)
と非コーディング配列(イントロンや、成熟ポリペプチ
ドに関するコーディング配列の5'及び/又は3'側にある
非コーディング配列など)とを含んでもよい。
【0030】したがって、「ポリペプチドをコードする
ポリヌクレオチド」という用語は、そのポリペプチドの
コーディング配列のみを含むポリヌクレオチドと、さら
に付加的なコーディング配列及び/又は非コーディング
配列をも含むポリヌクレオチドとを包含する。
【0031】さらに本発明は、図1〜2の推定アミノ酸
配列(配列番号2)を持つポリペプチド若しくは上記寄
託クローンのcDNAによってコードされるポリペプチドの
断片、類縁体及び誘導体をコードする、上記ポリヌクレ
オチドの変種にも関係する。このポリヌクレオチド変種
は、上記ポリヌクレオチドの天然に存在する対立遺伝子
変種であってもよいし、上記ポリヌクレオチドの天然に
は存在しない変種であってもよい。
【0032】したがって本発明は、図1〜2に示す成熟
ポリペプチド(配列番号2)又は上記寄託クローンのcDNA
によってコードされる成熟ポリペプチドと同じ成熟ポリ
ペプチドをコードするポリヌクレオチド、並びに図1〜
2のポリペプチド(配列番号2)若しくは上記寄託クロ
ーンのcDNAによってコードされるポリペプチドの断片、
誘導体又は類縁体をコードする上記ポリヌクレオチドの
変種を包含する。そのようなヌクレオチド変種として
は、欠失変種、置換変種及び付加又は挿入変種が挙げら
れる。
【0033】上述のように、本発明のポリヌクレオチド
は、図1〜2に示すコーディング配列(配列番号1)若
しくは上記寄託クローンのコーディング配列の天然に存
在する対立遺伝子変種であるコーディング配列を持って
もよい。当技術分野では知られているように、対立遺伝
子変種は、コードされるポリペプチドの機能を実質的に
変えない1又はそれ以上のヌクレオチドの置換、欠失又
は付加を持ちうる代替型のポリヌクレオチド配列であ
る。
【0034】本発明は、上記成熟ポリペプチドのコーデ
ィング配列が宿主細胞によるポリペプチドの発現と分泌
を促進するポリヌクレオチド配列(例えばポリペプチド
の細胞からの輸送を制御する分泌配列として機能するリ
ーダー配列)に同じ読み枠で融合しているポリヌクレオ
チドをも包含する。リーダー配列を持つポリペプチドは
プレタンパク質であり、そのリーダー配列は宿主細胞に
よって切断されて、そのポリペプチドの成熟型を形成し
うる。本発明ポリヌクレオチドは、成熟タンパク質に5'
アミノ酸残基が追加されたプロタンパク質をコードして
もよい。プロ配列を持つ成熟タンパク質はプロタンパク
質であり、そのタンパク質の不活性型である。そのプロ
配列が切断されると、活性な成熟タンパク質が残る。
【0035】したがって、本発明のポリヌクレオチド
は、成熟タンパク質、プロ配列を持つタンパク質、又は
プロ配列とプレ配列(リーダー配列)の両方を持つタン
パク質をコードできる。
【0036】本発明のポリヌクレオチドは、本発明ポリ
ペプチドの精製に利用されるマーカー配列にインフレー
ム(in frame)融合したコーディング配列を持ってもよ
い。細菌宿主の場合は、pQE-9ベクターによって供給さ
れるヘキサヒスチジン標識をマーカー配列にして、その
マーカーに融合した成熟ポリペプチドの精製に備えるこ
とができ、また、COS-7細胞のような哺乳類宿主を使用
する場合は、例えば血球凝集素(HA)標識をマーカー配
列にすることができる。HA標識は、インフルエンザ血球
凝集素タンパク質由来のエピトープに対応する(Wilso
n, I.ら, Cell,37:767(1984))。
【0037】「遺伝子」という用語は、ポリペプチド鎖
の生産に関与するDNAの区分を意味し、コーディング領
域の前後にある領域(リーダー及びトレーラー)と、個
々のコーディング区間(エクソン)の間にある介在配列
(イントロン)とを含む。
【0038】完全長FGF-15遺伝子の断片をcDNAライブラ
リー用のハイブリッド形成プローブとして用いることに
より、その完全長遺伝子そのものや、その遺伝子に対し
て高い配列類似性又は類似の生物学的活性を持つ他の遺
伝子を単離することができる。このタイプのプローブ
は、少なくとも30塩基からなることが好ましく、50塩基
以上を含んでもよい。また、このプローブは、完全長転
写物に相当するcDNAクローン、ゲノムクローン、若しく
は調節及びプロモーター領域、エクソン並びにイントロ
ンを含む完全なFGF-15遺伝子を含有するクローンを同定
するためにも使用できる。スクリーニングの一例では、
オリゴヌクレオチドプローブの合成に既知のDNA配列を
用いることによって、FGF-15遺伝子のコーディング領域
を単離する。本発明遺伝子の配列に相補的な配列を持つ
標識オリゴヌクレオチドを用いて、ヒトのcDNA、ゲノム
DNA又はmRNAのライブラリーをスクリーニングし、その
プローブがハイブリッド形成するライブラリーの構成要
素を決定する。
【0039】さらに、本発明は、配列間に少なくとも70
%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくと
も95%の同一性がある場合に上述の配列にハイブリッド
形成するポリヌクレオチドに関する。特に本発明は、厳
密な条件下で上述のポリヌクレオチドにハイブリッド形
成するポリヌクレオチドに関する。本明細書で使用する
「厳密な条件」という用語は、配列間に少なくとも95
%、好ましくは少なくとも97%の同一性がある場合にの
み、ハイブリッド形成が起こることを意味する。好まし
い態様として、上述のポリヌクレオチドにハイブリッド
形成するポリヌクレオチドは、図1〜2のcDNA(配列番
号1)又は上記寄託cDNAによってコードされる成熟ポリ
ペプチドと実質上同じ生物学的機能又は活性を保持する
ポリペプチドをコードする。
【0040】また、上記ポリヌクレオチドは、上述のよ
うに、本発明のポリヌクレオチドにハイブリッド形成
し、かつ、該ポリヌクレオチドに対して同一性を持つ
(活性は保持しても、保持しなくてもよい)、少なくと
も20塩基、好ましくは30塩基、より好ましくは少なくと
も50塩基を含んでもよい。このようなポリヌクレオチド
は、例えば、配列番号1のポリヌクレオチドに関する
(例えばポリヌクレオチド回収用の)プローブとして、
診断用プローブとして、あるいはPCRプライマーとして
使用できる。
【0041】したがって、本発明は、配列番号2のポリ
ペプチドをコードするポリヌクレオチドに対して少なく
とも70%の同一性、好ましくは少なくとも90%の同一性、
より好ましくは少なくとも95%の同一性を持つポリヌク
レオチド、及び少なくとも30塩基、好ましくは少なくと
も50塩基からなるその断片、並びにそのようなポリヌク
レオチドによってコードされるポリペプチドに関する。
【0042】本明細書で言及する寄託物は、特許手続上
の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に
基づいて維持されるだろう。これらの寄託物は便宜上、
用意されているに過ぎず、これが35U.S.C§112で求めら
れる寄託であると認めるわけではない。寄託物に含まれ
るポリヌクレオチドの配列と、それによってコードされ
るポリペプチドのアミノ酸配列は、参考として本明細書
の一部を構成し、万一、本明細書に記載する配列の説明
と矛盾する場合は、これが支配的となる。上記寄託物を
製造、使用又は販売するには承諾が必要な場合があり、
本明細書はそのような承諾を与えるものではない。
【0043】さらに本発明は、図1〜2の推定アミノ酸
配列(配列番号2)を持つポリペプチド又は上記寄託cDN
Aによってコードされるアミノ酸配列を持つポリペプチ
ド、及びそのようなポリペプチドの断片、類縁体及び誘
導体に関する。
【0044】図1〜2のポリペプチド(配列番号2)又
は上記寄託cDNAによってコードされるポリペプチドに関
して「断片」、「誘導体」及び「類縁体」という場合、
これらの用語は、そのポリペプチドと実質上同じ生物学
的機能又は活性を保持するポリペプチドを意味する。し
たがって類縁体には、プロタンパク質部分の切断によっ
て活性化されて活性な成熟ポリペプチドを生成しうるプ
ロタンパク質が含まれる。
【0045】本発明のポリペプチドは、組換えポリペプ
チド、天然のポリペプチド及び合成ポリペプチドのいず
れであってもよく、組換えポリペプチドが好ましい。
【0046】図1〜2のポリペプチド(配列番号2)又
は上記寄託cDNAによってコードされるポリペプチドの断
片、誘導体又は類縁体は、(i)1又はそれ以上のアミノ
酸残基が保存的又は非保存的アミノ酸残基(好ましくは
保存的アミノ酸残基)で置換されているもの(その置換
アミノ酸残基は遺伝コードによってコードされるもので
あってもよいし、そうでなくてもよい)であってもよい
し、(ii)1又はそれ以上のアミノ酸残基が置換基を含
有するものであってもよく、或いは(iii)成熟ポリペ
プチドがもう1つの化合物(例えばそのポリペプチドの
半減期を増大させるための化合物(ポリエチレングリコ
ールなど))に融合しているものや、(iv)リーダー又
は分泌配列や、成熟ポリペプチド又はプロタンパク質配
列の精製に使用される配列などといった付加的アミノ酸
が成熟ポリペプチドに融合しているものであってもよ
い。そのような断片、誘導体及び類縁体は、本明細書の
教示から、当業者の技術範囲に含まれると考えられる。
【0047】本発明のポリペプチド及びポリヌクレオチ
ドは、単離型で提供されることが好ましく、また、均一
に精製されることが好ましい。
【0048】「単離された」という用語は、その物質が
その当初の環境(例えばそれが天然物ならばその自然環
境)から取り出されていることを意味する。例えば、生
きた動物中に存在する天然のポリヌクレオチド又はポリ
ペプチドは「単離され」ていないが、その天然系中に共
在する物質の一部又は全部から分離されたそのポリヌク
レオチド又はポリペプチドは「単離され」ている。その
ようなポリヌクレオチドがベクターの一部であったり、
かつ/または、そのようなポリヌクレオチド又はポリペ
プチドが組成物の一部であっても、そのようなベクター
又は組成物がその自然環境の一部でないという点で、そ
れらは「単離され」ている。
【0049】本発明のポリペプチドは、配列番号2のポ
リペプチド(特にその成熟ポリペプチド)及び配列番号
2のポリペプチドに対して少なくとも70%の類似性(好ま
しくは70%の同一性)、より好ましくは配列番号2のポリ
ペプチドに対して少なくとも90%の類似性(より好まし
くは90%の同一性)、さらに好ましくは配列番号2のポリ
ペプチドに対して少なくとも95%の類似性(さらに好ま
しくは95%の同一性)を持つポリペプチドを包含し、ま
た、一般的には少なくとも30アミノ酸、より好ましくは
少なくとも50アミノ酸を含有する上記ポリぺプチドの一
部をも包含する。
【0050】当技術分野では知られているように、2つ
のポリペプチド間の「類似性」は、一方のポリペプチド
のアミノ酸配列とその保存的アミノ酸置換を、他方のポ
リペプチドの配列と比較することによって決定される。
【0051】本発明ポリペプチドの断片又は一部は、対
応する完全長ポリペプチドのペプチド合成による生産に
使用できる。つまり、これらの断片は、完全長ポリペプ
チドを生産するための中間体として使用できる。本発明
ポリヌクレオチドの断片又は一部は、本発明の完全長ポ
リヌクレオチドの合成に使用できる。
【0052】本発明は、本発明のポリヌクレオチドを含
むベクター、本発明のベクターで遺伝子操作された宿主
細胞、及び組換え技術による本発明ポリペプチドの生産
にも関係する。
【0053】宿主細胞は、本発明のベクター(それは例
えばクローニングベクターであってもよいし、発現ベク
ターであってもよい)によって遺伝子操作(形質導入又
は形質転換若しくはトランスフェクション)されうる。
ベクターは、例えばプラスミド、ウイルス粒子、ファー
ジなどの形態をとりうる。操作された宿主細胞は、プロ
モーターの活性化、形質転換体の選択若しくは本発明遺
伝子の増幅に適した変更が施された従来の栄養培地で培
養できる。温度やpHなどといった培養条件は、発現用に
選択したその宿主細胞に対して過去に用いられた条件で
あり、当業者には明らかだろう。
【0054】本発明のポリヌクレオチドは、組換え技術
によってポリペプチドを生産するために使用できる。し
たがって、例えば、そのポリヌクレオチド配列は、種々
の発現ベヒクル(具体的にはそのポリペプチドを発現さ
せるためのベクター又はプラスミド)のいずれにも組込
むことができる。そのようなベクターとしては、染色体
DNA配列、非染色体DNA配列及び合成DNA配列、例えばSV4
0の誘導体、細菌性プラスミド、ファージDNA、酵母プラ
スミド、プラスミドとファージDNAの組み合わせに由来
するベクター、ウイルスDNA(例えばワクシニア、アデ
ノウイルス、鶏痘ウイルス、偽性狂犬病ウイルス)など
が挙げられる。ただし、その他のベクター又はプラスミ
ドであっても、それがその宿主内で複製可能かつ生存可
能であるかぎり、使用できる。
【0055】適当なDNA配列は、種々の手法によってベ
クターに挿入できる。一般的には、当技術分野で知られ
る手法によって、適当な制限エンドヌクレアーゼ部位に
DNA配列を挿入する。そのような手法その他は、当業者
の技術範囲に含まれると考えられる。
【0056】発現ベクター中のDNA配列は、mRNA合成を
指令する適当な発現制御配列(プロモーター)に作動可
能に連結される。そのようなプロモーターの代表例とし
ては、LTR又はSV40プロモーター、大腸菌lac又はtrp、
ファージラムダPLプロモーター、及び原核細胞、真核
細胞若しくはそれらのウイルス中の遺伝子の発現を制御
することが知られているその他のプロモーターを挙げる
ことができる。発現ベクターは、翻訳開始用のリボソー
ム結合部位と転写終結区(ターミネーター)をも含有す
る。またベクターは、発現の増幅に適した配列を含んで
もよい。さらに発現ベクターは、形質転換された宿主細
胞の選択に利用できる表現型的特徴を与えるための遺伝
子(例えば真核細胞培養用のネオマイシン耐性やジヒド
ロ葉酸レダクターゼ、大腸菌におけるテトラサイクリン
耐性やアンピシリン耐性など)を含有することが好まし
い。
【0057】上述の適当なDNA配列と適当なプロモータ
ー又は制御配列とを含有するベクターを、適当な宿主の
形質転換に使用することによって、その宿主にそのタン
パク質を発現させることができる。適当な宿主の代表例
としては、大腸菌、ストレプトミセス、ネズミチフス菌
などの細菌細胞、酵母などの真菌細胞、キイロショウジ
ョウバエS2及びSpodoptera Sf9などの昆虫細胞、CHO、C
OS又はボーズ黒色腫などの動物細胞、アデノウイルス、
植物細胞などを挙げることができる。適当な宿主の選択
は、本明細書の教示から、当業者の技術範囲に含まれる
と考えられる。
【0058】より具体的に述べると、本発明は、上に広
く記述した配列の1又はそれ以上を含む組換え構築物を
も包含する。これらの構築物は、本発明の配列が正方向
又は逆方向に挿入されているベクター(プラスミドやウ
イルスベクターなど)を含む。この態様の好ましい側面
では、上記構築物がさらに、上記配列に作動可能に連結
した調節配列(プロモーターなどを含む)をも含有す
る。好適なベクターとプロモーターは当業者に多数知ら
れており、市販されている。次に挙げるベクターはその
例である。細菌用:pQE70、pQE60、pQE-9(Qiagen)、p
BS、phagescript、psiX174、pBluescript SK、pBsKS、p
NH8a、pNH16a、pNH18a、pNH46a(Stratagene)、pTRC99
A、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmaci
a)。真核細胞用:pWLneo、pSV2cat、pOG44、pXT1、pSG
(Stratagene)、pSVK3、pBPV、pMSG、pSVL(Pharmaci
a)。ただし、その他のプラスミド又はベクターであっ
ても、それがその宿主内で複製可能かつ生存可能である
限り、使用できる。
【0059】プロモーター領域は、CAT(クロラムフェ
ニコールトランスフェラーゼ)ベクターや、選択可能マ
ーカーを持つ他のベクターを用いて、所望の遺伝子から
選択することができる。適当なベクターはPKK232-8とpC
M7である。特に有名な細菌プロモーターとしては、lac
I、lacZ、T3、T7、gpt、ラムダPR、PL及びtrpが挙げ
られる。真核プロモーターとしては、CMV即時型初期、H
SVチミジンキナーゼ、初期及び後期SV40、レトロウイル
スのLTR、マウスメタロチオネイン-Iが挙げられる。適
当なベクターとプロモーターの選択は、当該技術分野の
通常の技術水準に十分含まれる。
【0060】さらなる態様として、本発明は、上述の構
築物を含有する宿主細胞に関する。本発明の宿主細胞
は、哺乳類細胞のような高等真核細胞であってもよい
し、酵母細胞のような下等真核細胞であってもよく、ま
た、細菌細胞のような原核細胞であってもよい。宿主細
胞への上記構築物の導入は、リン酸カルシウムトランス
フェクション、DEAE-デキストラン媒介トランスフェク
ション、又はエレクトロポレーションによって達成でき
る(Davis, L., Dibner, M. Battey, I., Basic Method
s in Molecular Biology(1986))。
【0061】宿主細胞中の構築物を従来のように使用す
ることによって、その組換え配列によってコードされる
遺伝子産物を生産することができる。別法として、本発
明のポリペプチドを従来のペプチド合成装置で合成生産
することもできる。
【0062】成熟タンパク質は、適当なプロモーターの
制御下に、哺乳類細胞、酵母、細菌その他の細胞中で発
現させることができる。本発明のDNA構築物から得られ
るRNAを用いて上記タンパク質を生産するには、無細胞
翻訳系も使用できる。原核宿主及び真核宿主での使用に
適したクローニングベクターと発現ベクターは、Sambro
okら, Molecular Cloning: A Laboratory Manual(第2
版,ニューヨーク州コールドスプリングハーバー(198
9))に記述されており、その開示は参考文献として本
明細書の一部を構成する。
【0063】本発明のポリペプチドをコードするDNAの
高等真核生物による転写は、そのベクターにエンハンサ
ー配列を挿入することによって増大する。エンハンサー
はDNAのシス作用性要素であり、通常10〜300bpであっ
て、プロモーターに作用してその転写を増大させる。複
製起点の後期側(100〜270bp)にあるSV40エンハンサ
ー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサ
ー、複製起点の後期側にあるポリオーマエンハンサー及
びアデノウイルスエンハンサーなどがその例である。
【0064】一般的に、組換え発現ベクターは、複製起
点、その宿主細胞の形質転換を可能にする選択可能マー
カー(例えば大腸菌のアンピシリン耐性遺伝子やサッカ
ロミセス・セレビシェTRP1遺伝子)及び下流構造配列の
転写を指令する高発現遺伝子由来のプロモーターを含む
だろう。そのようなプロモーターは、なかんずく、3-ホ
スホグリセリン酸キナーゼ(PGK)のような解糖系酵
素、α-因子、酸性ホスファターゼ又は熱ショックタン
パク質をコードするオペロンから得ることができる。異
種構造配列は、翻訳開始配列と終止配列及び好ましくは
翻訳されたタンパク質の周辺腔又は細胞外培地への分泌
を指令することのできるリーダー配列に対して適当な位
相で組み立てられる。任意に、その異種配列が、発現し
た組換え産物の安定化や簡便な精製などといった所望の
特徴を付与するN-末端同定ペプチド(identification p
eptide)を含む融合タンパク質をコードしてもよい。
【0065】細菌の使用に有用な発現ベクターは、所望
のタンパク質をコードする構造DNA配列を、適当な翻
訳開始シグナル及び翻訳終止シグナルと共に、機能的プ
ロモーターに対して作動可能な解読位相(reading phas
e)に挿入することによって、構築される。ベクター
は、そのベクターの維持を保証し、かつ、所望であれ
ば、その宿主内での増幅を提供するために、1又はそれ
以上の表現型選択可能マーカーと複製起点を含むだろ
う。形質転換に好適な原核宿主としては、大腸菌、枯草
菌、ネズミチフス菌、並びにシュードモナス属、ストレ
プトミセス属及びスタフィロコッカス属に属する様々な
種が挙げられる。ただし、その他の宿主も選択肢として
使用できる。
【0066】細菌の使用に有用な発現ベクターの典型例
としては、周知のクローニングベクターpBR322(ATCC 3
7017)の遺伝要素を含む市販のプラスミドに由来する選
択可能マーカー及び細菌性複製起点を含むものを挙げる
ことができる(ただしこれに限られるわけではない)。
そのような市販ベクターとしては、例えばpKK223-3(Ph
armacia Fine Chemicals,スウェーデン・ウプサラ)及び
GEM1(Promega Biotec.,米国ウィスコンシン州マディソ
ン)が挙げられる。これらのpBR322「骨格」部分を、適
当なプロモーター及び発現させようとする構造配列と組
み合わせる。
【0067】適当な宿主株を形質転換し、その宿主株を
適当な細胞密度まで成長させた後、選択したプロモータ
ーを適当な手段(例えば温度変化や化学誘導)によって
抑制解除し、細胞をさらに培養する。
【0068】典型的には、細胞を遠心分離によって収集
し、物理的又は化学的手段によって破壊し、得られた粗
抽出物をさらなる精製のために確保する。
【0069】タンパク質の発現に使用する微生物細胞
は、凍結−融解サイクル、超音波処理、機械的破壊又は
細胞溶解剤の使用など、都合のよい方法のいずれでも破
壊できる。
【0070】組換えタンパク質の発現には、種々の哺乳
類細胞培養系も使用できる。哺乳類発現系の例として
は、Gluzman, Cell, 23:175(1981)に記載のサル腎繊
維芽細胞のCOS-7系や、適合するベクターを発現させる
ことのできる他の細胞系(例えばC127、3T3、CHO、HeLa
及びBHK細胞系)が挙げられる。哺乳類発現ベクター
は、複製起点、適当なプロモーター及びエンハンサーを
含み、さらに必須のリボソーム結合部位、ポリアデニル
化部位、スプライス供与部位とスプライス受容部位、転
写終止配列及び5'隣接非転写配列をも含むだろう。必要
な非転写遺伝子要素を提供するには、SV40ウイルスゲノ
ムに由来するDNA配列(例えばSV40起点、初期プロモー
ター、エンハンサー、スプライス部位及びポリアデニル
化部位)を使用することができる。
【0071】本発明のポリペプチドは、硫酸アンモニウ
ム又はエタノール沈殿、酸抽出、陰イオン又は陽イオン
交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグ
ラフィー、疎水相互作用クロマトグラフィー、アフィニ
ティークロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロ
マトグラフィー及びレクチンクロマトグラフィーを含む
従来の方法によって、組換え細胞培養から回収、精製で
きる。必要なら、成熟タンパク質の立体配置の完成に、
タンパク質再生段階を使用してもよい。最後に、最終的
な精製段階として、高性能液体クロマトグラフィー(HP
LC)を使用することができる。
【0072】本発明のポリペプチドは、天然の精製産物
であってもよいし、化学合成法の生成物であってもよ
く、また組換え技術によって原核宿主又は真核宿主(例
えば培養された細菌細胞、酵母細胞、高等植物細胞、昆
虫細胞及び哺乳類細胞など)から生産されるものであっ
てもよい。組換え生産法に使用する宿主によって、本発
明のポリペプチドは、哺乳類その他の真核炭水化物でグ
リコシル化されることもあるし、グリコシル化されない
こともある。本発明のポリペプチドは、開始メチオニン
アミノ酸残基を含んでもよい。
【0073】本発明のポリペプチドは、血管内皮細胞成
長を刺激することができるので、種々の疾患状態(例え
ば血栓症、動脈硬化、その他の心血管病)による虚血組
識の再血管化を刺激するための処置に使用できる。これ
らのポリペプチドは、血管形成と四肢再生の刺激にも使
用できる。
【0074】本発明ポリペプチドは、けが、火傷、手術
後の組識修復及び潰瘍による創傷の処置にも使用でき
る。というのは、本発明ポリペプチドは、起源の異なる
種々の細胞(例えば繊維芽細胞と骨格筋細胞)に対して
有糸分裂促進性を持ち、それゆえに、傷ついた組識又は
病的な組識の修復又は交換を促進するからである。
【0075】本発明のポリペプチドは、ニューロン成長
の刺激や、ある種のニューロン障害又は神経変性病(ア
ルツハイマー病、パーキンソン病及びAIDS関連合併症な
ど)で起こるニューロン損傷の治療及び予防にも使用で
きる。FGF-15は軟骨細胞成長刺激能力を持つので、それ
らを用いて、骨及び歯周再生を向上させ、組識移植や骨
移植片の補助とすることができる。
【0076】本発明のポリペプチドを使用すれば、ケラ
チン生成細胞の成長を刺激することによって、日焼けに
よる皮膚の老化を予防することもできる。
【0077】FGF-15ポリペプチドは、脱毛の予防にも使
用できる。というのは、FGFファミリー構成要素は、毛
髪形成細胞を活性化し、メラニン形成細胞の成長を刺激
するからである。同様に、本発明のポリペプチドを他の
サイトカインと併用すれば、造血細胞と骨髄細胞の増殖
と分化を刺激することもできる。
【0078】FGF-15ポリペプチドは、移植前の器官を維
持するためや、一次組識の細胞培養を支持するために使
用することもできる。
【0079】本発明のポリペプチドは、初期胚における
内胚葉由来組識の分化を誘導するためにも使用できる。
【0080】本発明のさらなる側面によれば、科学的研
究、DNAの合成、DNAベクターの生産に関係する試験管内
用途や、ヒト疾患治療用の治療薬と診断薬を提供する目
的で、上記ペプチド又は上記ポリペプチドをコードする
ポリヌクレオチドを使用する方法が提供される。
【0081】本発明は、本発明ポリペプチドに対するレ
セプターの同定法を提供する。レセプターをコードする
遺伝子は、例えばリガンドパンニング(ligand pannin
g)やFACSソーティング(Coliganら, Current Protocol
s in Immun., 1(2),第5章(1991))など、当業者の知
る数多くの方法によって同定できる。好ましくは、本発
明ポリペプチドに応答する細胞(例えばFGFファミリー
タンパク質に対するレセプターを複数含有することが知
られているNIH3T3細胞や、SC-3細胞)からポリアデニル
化RNAを調製し、そのRNAから作成したcDNAライブラリー
をいくつかのプールに分割し、それらを用いて本発明ポ
リペプチドに応答しないCOS細胞その他の細胞をトラン
スフェクションするという発現クローニング法を使用す
る。トランスフェクションされた細胞をガラススライド
上で生育し、それを標識しておいた本発明のポリペプチ
ドにさらす。ポリペプチドは、ヨウ素化や、部位特異的
プロテインキナーゼに関する認識部位の組み込みなどと
いった種々の手段で標識できる。
【0082】固定と培養の後、そのスライドをオートラ
ジオグラフィー分析にかける。陽性プールを同定し、サ
ブプールを調製して再トランスフェクションし、サブプ
ール化と再スクリーニング作業を繰り返すことによっ
て、最終的に、その推定レセプターをコードする単一の
クローンを得る。
【0083】レセプターを同定するためのもう1つの方
法として、標識したポリペプチドを、そのレセプター分
子を発現させる細胞膜又は抽出調製物と光親和性(phot
o-affinity)結合させてもよい。架橋した物質をPAGE分
析によって分離し、X線フィルムにさらす。そのポリペ
プチドのレセプターを含有する標識された複合体を切り
出し、ペプチド断片に分割し、タンパク質微量配列決定
にかけることができる。微量配列決定によって得たアミ
ノ酸配列を用いて、cDNAライブラリーをスクリーニング
するための一組の縮重オリゴヌクレオチドプローブを設
計することにより、その推定レセプターをコードする遺
伝子を同定する。
【0084】本発明は、本発明ポリペプチドの作用を調
節する化合物を同定するための化合物スクリーニング法
を提供する。そのようなアッセイの一例では、繊維芽細
胞が正常に増殖する細胞培養条件下に、哺乳類繊維芽細
胞、本発明のポリペプチド、スクリーニングしようとす
る化合物、及び3[H]チミジンを混合する。スクリーニ
ングする化合物の不在下に対照アッセイを行なって、そ
の化合物の存在下における繊維芽細胞増殖の量と比較す
れば、それぞれの場合の3[H]チミジンの取り込みを測
定することにより、その化合物が増殖を刺激するかどう
かを決定できる。繊維芽細胞増殖の量は、液体シンチレ
ーションクロマトグラフィーで3[H]チミジンの取り込
みを測定することによって測定される。この方法によっ
て、アゴニスト(作用薬)化合物とアンタゴニスト(拮
抗薬)化合物の両方を同定することができる。
【0085】もう1つの方法として、本発明のポリペプ
チドに対するレセプターを発現させる哺乳類細胞又は膜
調製物を、被験化合物の存在下に、標識した本発明ポリ
ペプチドと共に培養する。そうすれば、その化合物がこ
の相互作用を増大させる能力又は遮断する能力を測定す
ることができるだろう。別法として、スクリーニングす
る化合物とFGF-15レセプターの相互作用後に、既知の第
2メッセンジャー系の応答を測定し、その化合物の上記
レセプターへの結合能と、第2メッセンジャー応答誘導
能を測定することにより、その化合物が潜在的アゴニス
ト又はアンタゴニストであるかどうかを決定する。この
ような第2メッセンジャー系としては、cAMPグアニル酸
シクラーゼ、イオンチャンネル又はホスホイノシチド加
水分解などが挙げられるが、これらに限るわけではな
い。
【0086】アンタゴニスト化合物の例には、本発明ポ
リペプチドのレセプターに結合するが第2メッセンジャ
ー応答を誘導しない、又はFGF-15ポリペプチド自体に結
合する、抗体又は(場合によって)オリゴペプチドがあ
る。また、そのレセプターに結合するが、第2メッセン
ジャー応答を誘導しないので、本発明ポリペプチドの作
用を効果的に遮断する、突然変異型ポリペプチドも、潜
在的アンタゴニストでありうる。
【0087】FGF-15遺伝子及び遺伝子産物に対するもう
1つのアンタゴニスト化合物は、アンチセンス技術を用
いて作成されるアンチセンス構築物である。アンチセン
ス技術は、アンチセンスDNA又はRNA若しくは三重らせん
形成による遺伝子発現の制御に使用でき、これらの方法
は共に、DNA又はRNAに対するポリヌクレオチドの結合に
基づいている。例えば、本発明の成熟ポリペプチドをコ
ードするポリヌクレオチド配列の5'コーディング部分を
用いて、約10〜40塩基対長のアンチセンスRNAオリゴヌ
クレオチドを設計する。DNAオリゴヌクレオチドは、転
写に関与する遺伝子の領域に相補的になるように設計さ
れるので(三重らせん−Leeら, Nucl. Acids. Res., 6:
3073(1979);Cooneyら, Science, 241:456(1988);
Dervanら, Science, 251:1360(1991)を参照)、本発
明ポリペプチドの転写と生産を妨害する。アンチセンス
RNAオリゴヌクレオチドは生体内でmRNAにハイブリッド
形成し、そのmRNA分子の本発明ポリペプチドへの翻訳を
遮断する(アンチセンス−Okano, J. Neurochem., 56:5
60(1991);Oligodeoxynucleotides as AntisenseInhi
bitors of Gene Expression, CRC Press,フロリダ州ボ
カラトン(1988)を参照)。アンチセンスRNA又はDNAが
生体内で発現して、ポリペプチドの生産を阻害しうるよ
うに、上述のオリゴヌクレオチドを細胞に送達すること
もできる。
【0088】潜在的アンタゴニスト化合物には、レセプ
ターの結合部位に結合し、その部位を占拠して、レセプ
ターをそのポリペプチドに近づけなくすることによっ
て、正常な生物活性を妨害する小分子も含まれる。その
ような小分子の例としては、小ペプチド又は小さいペプ
チド様分子が挙げられるが、これらに限られるわけでは
ない。
【0089】アンタゴニスト化合物は、新生物細胞及び
組識に対する本発明ポリペプチドの細胞成長及び増殖効
果(すなわち、腫瘍血管形成の刺激)を阻害することに
より、例えば腫瘍の形成又は増殖において、異常な細胞
成長及び増殖を遅延又は防止するために使用できる。
【0090】上記アンタゴニストは、血管過多性疾患を
予防するため、及び被膜外白内障手術後の上皮水晶体細
胞の増殖を予防するためにも使用できる。本発明ポリペ
プチドの有糸分裂促進活性の予防は、気球血管形成術後
の再狭窄のような場合にも望ましいだろう。
【0091】上記アンタゴニストは、創傷治癒中の瘢痕
組識の成長を予防するためにも使用できる。
【0092】上記アンタゴニストは、後述するような医
薬的に許容しうる担体を含む組成物として使用できる。
【0093】本発明のポリペプチド、アゴニスト及びア
ンタゴニストを、適当な医薬担体と組み合わせて、非経
口投与用医薬組成物にすることができる。そのような組
成物は、治療有効量の上記ペプチド、アゴニスト又はア
ンタゴニストと、医薬的に許容できる担体又は賦形剤と
を含有する。そのような担体としては、塩水、緩衝塩
水、デキストロース、水、グリセロール、エタノール及
びそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限られ
るわけではない。その製剤は、投与法に適合すべきであ
る。
【0094】本発明は、本発明医薬組成物の1又はそれ
以上の成分で満たされた1又はそれ以上の容器からなる
医薬パック又はキットをも提供する。そのような容器に
は、医薬品又は生物学的製品の製造、使用又は販売を規
制する政府機関によって規定された形式で、ヒト投与に
関する製造、使用又は販売の該機関による認可を反映す
る情報を付すことができる。さらに、本発明のポリペプ
チド、アゴニスト及びアンタゴニストを他の治療用化合
物と併用してもよい。
【0095】上記医薬組成物は、経口経路、局所経路、
静脈内経路、腹腔内経路、筋肉内経路、皮下経路、鼻孔
内経路又は皮内経路など、都合の良い方法で投与でき
る。上記医薬組成物は、特定の適応症の処置及び/又は
予防に有効な量で投与される。一般的には、少なくとも
約10mg/kg体重の量で投与され、ほとんど場合は、約8mg
/kg体重/日を超えない量で投与されるだろう。ほとんど
の場合、日用量は、投与経路、症状などを考慮して、約
10mg/kg〜約1mg/kg体重であり、1cm2あたり約0.1μg〜
9mgまでの投与量を投与することが好ましい。
【0096】本発明のポリペプチドと、ポリペプチドで
あるアゴニスト及びアンタゴニスト化合物を、本発明に
従って使用する場合は、それを生体内における上記ポリ
ペプチドの発現によってすることもできる。これはしば
しば「遺伝子療法」と呼ばれる。
【0097】したがって、例えば、細胞を、生体外で、
ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド(DNA又はR
NA)で操作し、そのポリペプチドで処置しようとする患
者に、操作したその細胞を与えることができる。このよ
うな方法は当技術分野では良く知られている。例えば、
本発明のポリペプチドをコードするRNAを含有するレト
ロウイルス粒子を使用して、当技術分野で知られる手法
で、細胞を操作することができる。
【0098】さらに、生体内でポリペプチドを発現させ
るために、例えば当技術分野で知られる手法によって、
生体内で細胞を操作することもできる。生体内で細胞を
操作し、生体内でポリペプチドを発現させるには、当技
術分野では知られているように、本発明のポリペプチド
をコードするRNAを含有するレトロウイルス粒子を生産
するための生産細胞を患者に投与すればよい。そのよう
な方法による本発明ポリペプチドの上記その他の投与法
は、本発明の教示から、当業者には明らかなはずであ
る。例えば、細胞を操作するための発現ベヒクルは、適
当な送達ベヒクルと組み合わせれば生体内で細胞を操作
するために使用できるアデノウイルスなど、レトロウイ
ルス粒子以外であってもよい。
【0099】上述のレトロウイルスプラスミドベクター
の供給源となりうるレトロウイルスとしては、モロニー
ネズミ白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、レトロウイ
ルス、例えばラウス肉腫ウイルス、ハーヴェー肉腫ウイ
ルス、鳥類白血病ウイルス、テナガザル白血病ウイル
ス、ヒト免疫不全症ウイルス、アデノウイルス、脊髄増
殖性肉腫ウイルス及び乳癌ウイルスが挙げられるが、こ
れらに限られるわけではない。一態様として、レトロウ
イルスプラスミドベクターをモロニーネズミ白血病ウイ
ルスから誘導する。
【0100】ベクターは1又はそれ以上のプロモーター
を含む。使用できる好適なプロモーターとしては、レト
ロウイルスLTR、SV40プロモーター、Millerら, Biotech
niques,第7巻,第9号, 980-990(1989)に記載のヒトサ
イトメガロウイルス(CMV)プロモーター、その他任意
のプロモーター(例えばヒストンプロモーター、pol II
Iプロモーター、β-アクチンプロモーター(ただしこれ
らに限らない)のような真核細胞プロモーターなどの細
胞性プロモーター)が挙げられるが、これらに限られる
わけではない。使用できるその他のウイルスプロモータ
ーとしては、アデノウイルスプロモーター、チミジンキ
ナーゼ(TK)プロモーター及びB19パルボウイルスプロ
モーターが挙げられるが、これらに限られるわけではな
い。適当なプロモーターの選択は、本明細書の教示か
ら、当業者には明らかだろう。
【0101】本発明のポリペプチドをコードする核酸配
列は、好適なプロモーターの制御下にある。使用できる
好適なプロモーターとしては、アデノウイルスプロモー
ター(アデノウイルス主要後期プロモーターなど)、異
種プロモーター(サイトメガロウイルス(CMV)プロモ
ーターなど)、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)プロモー
ター、誘導性プロモーター(MMTプロモーターやメタロ
チオネインプロモーターなど)、熱ショックプロモータ
ー、アルブミンプロモーター、ApoAIプロモーター、ヒ
トグロビンプロモーター、ウイルスチミジンキナーゼプ
ロモーター(単純ヘルペスチミジンキナーゼプロモータ
ーなど)、レトロウイルスLTR(上述の修飾レトロウイ
ルスLTRを含む)、β-アクチンプロモーター、ヒト成長
ホルモンプロモーターが挙げられるが、これらに限るわ
けではない。プロモーターは、本発明ポリペプチドをコ
ードする遺伝子を制御する天然のプロモーターであって
もよい。
【0102】上記レトロウイルスプラスミドベクターを
用いてパッケージング細胞を形質導入することによっ
て、生産細胞系を作成する。トランスフェクションでき
るパッケージング細胞の例としては、Miller, Human Ge
ne Therapy,第1巻, 5-14頁(1990)(この刊行物の全内
容は参考文献として本明細書の一部を構成する)に記載
のDAN、PE501、PA317、ψ-2、ψ-AM、PA12、T19-14X、V
T-19-17-H2、ψCRE、ψCRIP、GP+E-86及びGP+envAm12細
胞系が挙げられるが、これらに限るわけではない。ベク
ターは、当技術分野で知られる任意の手段で、パッケー
ジング細胞に形質導入できる。そのような手段として
は、エレクトロポレーション、リポソームの使用及びリ
ン酸カルシウム沈降法が挙げられるが、これらに限るわ
けではない。もう1つの方法として、レトロウイルスプ
ラスミドベクターをリポソームに封入するか、脂質にカ
ップリングしてから、宿主に投与してもよい。
【0103】上記生産細胞系は、本発明ポリペプチドを
コードする核酸配列を含む感染性レトロウイルスベクタ
ー粒子を生成する。そのようなレトロウイルスベクター
粒子は、試験管内又は生体内で、真核細胞の形質導入に
使用できる。形質導入された真核細胞は、本発明ポリペ
プチドをコードする核酸配列を発現させるだろう。形質
導入できる真核細胞としては、胚幹細胞、胚癌細胞、造
血幹細胞、肝細胞、繊維芽細胞、筋芽細胞、ケラチン生
成細胞、内皮細胞及び気管支上皮細胞が挙げられるが、
これらに限られるわけではない。
【0104】本発明は、本発明のポリペプチドをコード
する核酸配列中の突然変異の存在に関係する疾患、又は
その疾患に対する罹病性を検出するための診断的アッセ
イの一部として、本発明遺伝子を使用することにも関係
する。
【0105】本発明の遺伝子に突然変異を持つ個体は、
種々の技術によってDNAレベルで検出できる。診断用の
核酸は、血液、尿、唾液、組織生検及び剖検などといっ
た患者の細胞から得ることができる。ゲノムDNAは、検
出に直接使用してもよいし、分析に先立って、PCRを用
いて酵素的に増幅してもよい(Saikiら, Nautre, 324:1
63-166(1986))。RNAやcDNAも同じ目的に使用でき
る。例えば、本発明のポリペプチドをコードする核酸に
相補的なPCRプライマーを使用して、突然変異を同定及
び分析することができる。例えば、欠失や挿入は、増幅
産物のサイズが正常な遺伝子型とは異なることによって
検出できる。点変異は、放射線標識したRNA配列若しく
は放射線標識したアンチセンスDNA配列に、増幅したDNA
をハイブリッド形成させることによって同定できる。完
全に一致する配列は、RNaseA消化若しくは融解温度の相
違によって、ミスマッチを持つ二本鎖分子と識別するこ
とができる。
【0106】DNA配列の相違に基づく遺伝子試験は、変
性剤を含む(若しくは含まない)ゲルにおけるDNA断片
の電気泳動移動度の変化を検出することによって、達成
できる。小さい配列の欠失と挿入は、高分解能ゲル電気
泳動によって可視化できる。配列が異なるDNA断片は、
変性ホルムアミド勾配ゲルで識別できる。この場合、異
なるDNA断片の移動度は、それぞれの融解温度又は部分
的融解温度に従って、ゲル中の異なる位置で減速される
(例えばMyersら, Science, 230:1242(1985)を参照の
こと)。
【0107】特定の位置における配列の変化は、化学的
切断法や、RNase及びS1保護などのヌクレアーゼ保護ア
ッセイでも明らかにできる(例えばCottonら, PNAS, US
A, 85:4397-4401(1985)を参照)。
【0108】したがって、特定のDNA配列の検出は、ハ
イブリッド形成、RNase保護、化学的切断、直接DNA配列
決定などの方法、若しくは制限酵素の使用(例えば制限
断片長多形(Restriction Fragment Length Polymorphi
sms;RFLP))及びゲノムDNAのサザンブロッティングに
よって達成できる。
【0109】より従来的なゲル電気泳動とDNA配列決定
に加えて、インシチュー分析でも突然変異を検出するこ
とができる。
【0110】また、本発明は、種々の組織におけるFGF-
15ポリペプチドのレベルの変化を検出する診断的アッセ
イにも関係する。正常な対照組織試料に比べて本発明タ
ンパク質の発現が過剰であることは、異常な細胞増殖
(例えば腫瘍)の存在を示しうるからである。宿主から
得た試料中のタンパク質レベルを検出するためのアッセ
イは、当業者にはよく知られており、ラジオイムノアッ
セイ、競争結合アッセイ、ウェスタンブロット分析、EL
ISAアッセイ及び「サンドイッチ」アッセイなどがあ
る。ELISAアッセイ(Coliganら, Current Protocols in
Immunology, 1(2),第6章(1991))では、先ず、本発
明ポリペプチドの抗原に特異的な抗体(好ましくはモノ
クローナル抗体)を調製する。さらに、そのモノクロー
ナル抗体に対するリポーター抗体を調製する。リポータ
ー抗体には、放射活性や蛍光などの検出可能な試薬(こ
の例では西洋ワサビペルオキシダーゼ酵素)を結合す
る。次に、宿主から試料を採取し、その試料中のタンパ
ク質を結合する固体支持体(例えばポリスチレン皿)上
でインキュベートする。次に、非特異的タンパク質(ウ
シ血清アルブミンなど)と共にインキュベートすること
によって、皿上の遊離のタンパク質結合部位をすべて覆
う。次に、上記モノクローナル抗体をその皿中でインキ
ュベートする。この間に、モノクローナル抗体は、ポリ
スチレン皿に結合した本発明ポリペプチドのすべてに結
合する。未結合のモノクローナル抗体を緩衝液で洗い流
す。次に、西洋ワサビペルオキシダーゼに結合したリポ
ーター抗体をその皿に入れ、目的のタンパク質に結合し
たモノクローナル抗体にレポーター抗体を結合させる。
【0111】次に、未結合のリポーター抗体を洗い流
す。次に、ペルオキシダーゼ基質をその皿に加え、所定
の期間中に発色する色の量を標準曲線と比較すれば、所
定の体積の患者試料中に存在するポリペプチドの量の測
定値が得られる。
【0112】競争アッセイを使用する場合は、本発明の
ポリペプチドに特異的な抗体を固形支持体に結合する。
次に、標識したFGF-13と宿主から得た試料をその固形支
持体上に通し、例えば液体シンチレーションクロマトグ
ラフィーなどによって検出した標識の量を、その試料中
の本発明ポリペプチドの量に相関させることができる。
【0113】「サンドウィッチ」アッセイはELISAアッ
セイに似ている。「サンドウィッチ」アッセイでは、本
発明のポリペプチドを固形支持体上に通し、固形支持体
に取り付けた抗体に結合させる。次に、二次抗体を目的
のポリペプチドに結合させる。次に、二次抗体に特異的
であってかつ標識されている三次抗体をその固形支持体
上に通して、二次抗体に結合させると、量を定量するこ
とができる。
【0114】本発明の配列は、染色体同定にも有効であ
る。本発明の配列は、個々のヒト染色体上の特定の位置
に特異的に誘導され、それにハイブリッド形成すること
ができる。また、染色体上の特定の部位を同定すること
は、現在必要とされていることでもある。現在のとこ
ろ、染色体位置の標識に利用できる、実際の配列データ
(反復多形(repeat polymorphism's))に基づく染色
体標識試薬はほとんどない。本発明による染色体に対す
るDNAのマッピングは、それらの配列を疾患に関係する
遺伝子と相関させる際の重要な第1段階である。
【0115】簡単に述べると、配列は、そのcDNAからPC
Rプライマー(15〜25bpが好ましい)を調製することに
よって、染色体に対してマッピングできる。ゲノムDNA
中の2エクソン以上にまたがることによって増幅工程を
複雑にすることのないプライマーをすばやく選択するに
は、3'非翻訳領域のコンピューター分析を用いる。次
に、個々のヒト染色体を含有する体細胞ハイブリッドの
PCRスクリーニングに、これらのプライマーを用いる。
そのプライマーに対応するヒト遺伝子を含有するハイブ
リッドのみが、増幅断片を生成するだろう。
【0116】体細胞ハイブリッドのPCRマッピングは、
特定のDNAを特定の染色体に割り当てる迅速な方法であ
る。同じオリゴヌクレオチドプライマーで本発明を用い
ると、同様の方法で、特定の染色体に由来する断片のパ
ネル若しくは大きいゲノムクローンのプールで、サブマ
ッピング(sublocalization)を達成できる。染色体に
対するマッピングに同様に使用できる他のマッピング法
としては、インシチューハイブリッド形成、染色体特異
的cDNAライブラリーを構築するためのハイブリッド形成
による予備選択及び標識フロー選別(labeled flow-sor
ted)染色体による予備スクリーニングが挙げられる。
【0117】中期染色体に対するcDNAクローンの蛍光イ
ンシチューハイブリッド形成(FISH)を用いると、1段
階で正確な染色体位置を得ることができる。この技術は
50又は60塩基程度のcDNAでも使用できる。この技術の概
要については、Vermaら, Human Chromosomes: a Manual
of Basic Techniques, Pergamon Press,ニューヨーク
(1988)を参照のこと。
【0118】配列を正確な染色体位置にマッピングした
ら、その配列の染色体上の物理的位置を遺伝子マップデ
ータと相関させることができる。そのようなデータは、
例えばV. McKusick, Mendelian Inheritance in Man
(ジョーンズホプキンス大学ウェルチ・メディカル・ライ
ブラリーからオンラインで入手できる)に認められる。
次に、同じ染色体領域にマッピングされた疾患と遺伝子
の関係を連鎖分析(linkage analysis)(物理的に隣接
する遺伝子の同時遺伝)によって同定する。
【0119】次に、患者と非患者の間で、そのcDNA又は
ゲノム配列の相違を決定する必要がある。ある突然変異
がその患者の一部又は全部に観測され、正常な個体には
観測されない場合、その突然変異はその疾患の原因因子
であるかもしれない。
【0120】物理的マッピング技術と遺伝子マッピング
技術の現在の解像度では、その疾患に関係する染色体領
域に正確にその位置が特定されるcDNAは、50〜500個の
潜在的原因因子のうちの一つであろう(1メガ塩基マッ
ピング解像度と20kbにつき1遺伝子と仮定)。
【0121】本発明ポリペプチド、その断片その他の誘
導体、その類縁体、若しくはそれらを発現させる細胞
は、それらに対する抗体を生産するための免疫原として
使用できる。これらの抗体は、例えばポリクローナル抗
体やモノクローナル抗体でありうる。本発明は、キメラ
抗体、一本鎖抗体、擬人化抗体及びFab断片又はFab発現
ライブラリーの産物をも包含する。このような抗体及び
断片の生産には、当技術分野で知られる種々の方法を使
用することができる。
【0122】本発明の配列に対応するポリペプチドに対
して生じる抗体は、動物(好ましくはヒト以外の動物)
にそのポリペプチドを直接注射するか、投与することに
よって得ることができる。そのようにして得た抗体は、
そのポリペプチド自体に結合するだろう。この方法で
は、そのペプチドの断片のみをコードする配列を使用し
て、その全天然ポリペプチドを結合する抗体を生成させ
ることもできる。そのような抗体は、そのポリペプチド
を発現させる組織からそのポリペプチドを単離するため
に使用できる。
【0123】モノクローナル抗体の製造には、連続的継
代細胞系培養によって生産される抗体を与える任意の技
術を使用できる。その例としては、ハイブリドーマ技術
(Kohler及びMilstein, 1975, Nature, 256:495-49
7)、トリオーマ(trioma)技術、ヒトB細胞ハイブリド
ーマ技術(Kozborら, 1983, Immunology Today 4:72)
及びヒトモノクローナル抗体を生産するためのEBVハイ
ブリドーマ技術(Coleら, 1985, Monoclonal Antibodie
s and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc., 77-96
頁)が挙げられる。
【0124】一本鎖抗体の生産について記述した技術
(米国特許4,946,778)は、本発明の免疫原性ポリペプ
チド産物に対する一本鎖抗体の生産に適合させることが
できる。また、形質転換マウスを用いて、本発明の免疫
原性ポリペプチド産物に対する擬人化抗体を発現させる
こともできる。
【0125】以下の実施例を参照して、本発明をさらに
説明する。ただし、本発明はこれらの実施例に限定され
ないと理解すべきである。特に指定しない限り、割合や
量はすべて重量に基づく。
【0126】下記実施例の理解を容易にするため、頻繁
に使用する方法及び/又は用語をいくつか説明してお
く。
【0127】「プラスミド」は、小文字pとその前後の
大文字及び/又は数字で指定される。本明細書における
出発プラスミドは市販されているか、公に無制限に入手
できるか、若しくは入手できるプラスミドから公表され
た方法に従って構築できる。さらに、当該技術分野で
は、本明細書に記述するプラスミドと等価なプラスミド
が知られており、それらは当業者には明らかだろう。
【0128】DNAの「消化」とは、そのDNA中の特定の配
列でのみ作用する制限酵素によるDNAの触媒的切断を意
味する。本明細書で使用する種々の制限酵素は市販され
ており、それらの反応条件、補因子その他の必要条件
は、当業者に知られているであろうものを使用した。分
析には、通常、1μgのプラスミド又はDNA断片を約2単位
の酵素と共に約20μlの緩衝溶液中で使用する。プラス
ミド構築用のDNA断片を単離する場合は、通常、より大
きい体積中で、5〜50μgのDNAを20〜250単位の酵素で消
化する。特定の制限酵素に適した緩衝液と基質の量は、
製造者によって指定される。通常は37℃で約1時間のイ
ンキュベーション時間を使用するが、これは供給者の指
示に従って変えることができる。消化後、その反応液を
ポリアクリルアミドゲルで直接電気泳動して、所望の断
片を単離する。切断した断片のサイズ分離は、Goeddel,
D.ら, Nucleic Acids Res., 8:4057(1980)に記載の8
%ポリアクリルアミドゲルを用いて行なう。
【0129】「オリゴヌクレオチド」とは、化学的に合
成できる一本鎖ポリデオキシヌクレオチド又は2本の相
補的ポリデオキシヌクレオチド鎖を意味する。そのよう
な合成オリゴヌクレオチドは5'リン酸基を持たないの
で、キナーゼの存在下にATPでリン酸基を付加しない
と、もう1つのオリゴヌクレオチドには連結しないだろ
う。合成オリゴヌクレオチドは、脱リン酸化されていな
い断片に連結するだろう。
【0130】「連結」とは、2本の二本鎖核酸断片間に
リン酸ジエステル結合を形成させる工程をいう(Maniat
is, T.ら,同上, 146頁)。特に断わらない限り、連結
は、既知の緩衝液と条件を用いて、連結しようとするほ
ぼ等モル量のDNA断片0.5μgにつき10単位のT4 DNAリガ
ーゼ(「リガーゼ」)で達成することができる。
【0131】特に明言しない限り、形質転換はGraham,
F.及びVan der Eb, A., Virology,52:456-457(1973)
の方法で行なった。
【従来の技術】
【0132】
【実施例】実施例1
FGF-15タンパク質の細菌発現と精製
FGF-15をコードするDNA配列(ATCC No. 97146)を、ま
ず、プロセシングされたタンパク質(シグナルペプチド
配列を欠く)の5'配列とその遺伝子の3'側にあるベクタ
ー配列に対応するPCRオリゴヌクレオチドプライマーを
用いて増幅する。その遺伝子に対応する追加のヌクレオ
チドを、その5'配列と3'配列に付加する。5'オリゴヌク
レオチドプライマーは、5' GCCAGA CCATGG TAAAACCG GT
GCCCCTC3'(配列番号3)という配列を持ち、NcoI制限酵
素部位(太字部分)を含有する。3'配列(5' GGCAGG AG
ATCT TGTTGTCTTACTCTTGTTGAC 3';配列番号4)は、BglI
I部位に相補的な配列(太字部分)を含有し、その後
に、FGF-15コーディング配列の21ヌクレオチドが続いて
いる。
【0133】これらの制限酵素部位は、細菌発現ベクタ
ーpQE60(Quiagen, Inc., 91311カリフォルニア州チャ
ッツワース)上の制限酵素部位に対応する。pQE-60は抗
生物質耐性(Ampr)、細菌性複製起点(ori)、IPTGで
制御できるプロモーターオペレーター(P/O)、リボソ
ーム結合部位(RBS)、6-His標識及び制限酵素部位をコ
ードする。次に、pQE-60をNcoIとBglIIで消化した。増
幅した配列をpQE-60中に連結し、ヒスチジン標識及びリ
ボソーム結合部位(RBS)と枠を合わせて挿入する。次
に、その連結混合物を用いて、Sambrook, J.ら, Molecu
lar Cloning: ALaboratory Manual, Cold Harbor Labor
atory Press(1989)に記載の手法で、大腸菌M15/rep4
株(Qiagen, Inc.)を形質転換する。M15/rep4は、lacI
抑制因子を発現し、かつ、カナマイシン耐性(Kanr)
を付与するプラスミドpREP4の複数コピーを含有する。L
Bプレート上で成長するそれらの能力によって形質転換
体を同定し、アンピシリン/カナマイシン耐性コロニー
を選択する。プラスミドDNAを単離し、制限分析によっ
てそれを確認する。所望の構築物を含有するクローン
を、Amp(100μg/ml)とKan(25μg/ml)の両方を補足
したLB液体培地で、終夜(O/N)培養する。そのO/N培養
物を、1:100〜1:250の比率で、大きい培養に接種する。
光学密度600(O.D.600)が0.4〜0.6になるまで細胞
を生育する。次に、IPTG(「イソプロピル-β-D-チオガ
ラクトピラノシド」)を最終濃度1mMになるよう加え
る。IPTGは、lacI抑制因子を不活化することによって、
P/Oをきれいにし、遺伝子発現の増大を誘導する。細胞
をさらに3〜4時間生育する。次に、遠心分離によって細
胞を収集する。細胞ペレットをカオトロピック試薬6M塩
酸グアニジン中で可溶化する。清浄化の後、この溶液か
ら、6-His標識を含有するタンパク質による強固な結合
が可能な条件下に、ニッケル-キレートカラムでのクロ
マトグラフィーによって、可溶化したFGF-15を精製する
(Hochuli, E.ら, J. Chromatography 411:177-184(19
84))。タンパク質を6M塩酸グアニジンpH5.0でカラムか
ら溶出させ、再生のために、3M塩酸グアニジン、100mM
リン酸ナトリウム、10mMグルタチオン(還元型)及び2m
Mグルタチオン(酸化型)に調節する。この溶液を12時
間インキュベートした後、タンパク質を10mMリン酸ナト
リウムに対して透析する。
【0134】実施例2
バクロウイルス発現系を用いるFGF-15のクローニングと
発現
完全長FGF-15タンパク質をコードするDNA配列(ATCC N
o. 97146)を、その遺伝子の5'及び3'配列に対応するPC
Rオリゴヌクレオチドプライマーを用いて増幅する。
【0135】そのFGF-15 5'プライマーは、5' CTAGT GG
ATCC GCCATCATGGTAAAACC GGTGCCC 3'(配列番号5)とい
う配列を持ち、Bam HI制限酵素部位(太字部分)を含有
し、その部分に、真核細胞における翻訳開始用の効率の
よいシグナルに似た4ヌクレオチド(Kozak, M., J. Mo
l. Biol., 196:947-950(1987))が続き、それは上記
遺伝子の最初の18ヌクレオチドのすぐ後方にある(翻訳
開始コドン「ATG」に下線を引いてある)。
【0136】3'プライマーは5' CGACT GGTACC AGCCACGG
AGCAGGAATGTCT 3'(配列番号6)という配列を持ち、制
限エンドヌクレアーゼAsp718の切断部位(太字部分)
と、上記遺伝子の3'非翻訳配列に相補的な21ヌクレオチ
ドを含有する。
【0137】増幅した配列を、市販のキット(「Genecl
ean」, BIO 101 Inc.,カリフォルニア州ラジョラ)を用
いて、1%アガロースゲルから単離する。次に、その断片
を各エンドヌクレアーゼで消化した後、1%アガロースゲ
ルで再び精製する。この断片をF2と命名する。
【0138】バクロウイルス発現系(概要についてはSu
mmers, M.D.及びSmith, G.E., 1987, A manual of meth
ods for baculovirus vectors and insect cell cultur
e procedures, Texas Agricultural Experimental Stat
ion Bulletin No. 1555を参照のこと)によるタンパク
質の発現には、ベクターpA2(pVL941ベクターを改良し
たもの、後述)を使用する。この発現ベクターは、Auto
grapha californica核多角体病ウイルス(AcMNPV)の強
力なポリヘドリン(polyhedrin)プロモーターと、それ
に続く制限エンドヌクレアーゼBamHI及びXbaIの認識部
位とを含有する。効率のよいポリアデニル化のために、
シミアンウイルス(SV)40のポリアデニル化部位を使用
する。組換えウイルスを簡単に選択するため、大腸菌由
来のβ-ガラクトシダーゼ遺伝子を、ポリヘドリン遺伝
子のポリアデニル化シグナルに先行するポリヘドリンプ
ロモーターと同じ方向に挿入する。ポリヘドリン配列の
両端には、同時にトランスフェクションされる野生型ウ
イルスDNAの細胞媒介性相同組換え用に、ウイルス配列
を隣接させる。pA2の代わりに、pRG1、pAc373、pVL941
及びpAcIM1(Luckow, V.A.及びSummers, M.D., Virolog
y, 170:31-39)などといった他の多くのバクロウイルス
ベクターも使用できる。
【0139】そのプラスミドを上記制限酵素で消化した
後、ウシ腸ホスファターゼを用いて、当技術分野で知ら
れる手法で脱リン酸化する。次に、市販のキット(「Ge
neclean」, BIO 101 Inc.,カリフォルニア州ラジョラ)
を用いて、そのDNAを1%アガロースゲルから単離する。
このベクターをV2と命名する。
【0140】断片F2と脱リン酸化プラスミドV2をT4 DNA
リガーゼで連結する。次に、大腸菌DH5α細胞を形質転
換し、そのプラスミド(pBacFGF-15)を含有する細菌
を、各制限酵素を用いて同定する。クローン化した断片
の配列をDNA配列決定によって確認する。
【0141】リポフェクション法(Felgnerら, Proc. N
atl. Acad. Sci. USA, 84:7413-7417(1987))を用い
て、5μgのプラスミドpBacFGF-15を、市販の直鎖化した
バクロウイルス(「BaculoGoldTM baculovirus DN
A」, Pharmingen,カリフォルニア州サンディエゴ)1.0
μgと同時にトランスフェクションする。
【0142】1μgのBaculoGoldTMウイルスDNAと5μg
の上記プラスミドを、血清非含有グレース培地(Life T
echnologies Inc.,メリーランド州ガイサースブルク)5
0μlの入ったマイクロタイタープレートの滅菌ウェル中
で混合する。その後、リポフェクチン10μlとグレース
培地90μlを加え、混合し、室温で15分間インキュベー
トする。次に、血清を含まないグレース培地1mlが入っ
ている35mm組織培養プレートに接種したSf9昆虫細胞(A
TCC CRL 1711)に、上記トランスフェクション混合物を
滴下する。プレートを前後にゆすって、新たに加えた溶
液を混合する。次に、そのプレートを27℃で5時間培養
する。5時間後、トランスフェクション溶液をプレート
から取り除き、10%ウシ胎児血清を補足したグレース昆
虫培地1mlを加える。そのプレートを培養器に戻し、培
養を27℃で4日間続ける。
【0143】4日後に上清を集め、Summers及びSmith
(上記)の記述と同様にして、プラークアッセイを行な
う。改良点として、「Blue Gal」(Life Technologies
Inc.,ガイサースブルク)を含むアガロースゲルを使用
する。これは、青く染色したプラークの単離を容易にす
る。「プラークアッセイ」に関する詳細な説明は、Life
Technologies Inc.(ガイサースブルク)が発行してい
る昆虫細胞培養とバクロウイルス学に関するユーザーズ
ガイドの9-10頁にも認められる。
【0144】連続希釈の4日後に、ウイルスを細胞に加
え、青く染色したプラークをエッペンドルフピペットの
チップで拾う。次に、組換えウイルスを含有するその寒
天を、グレース培地200μlの入ったエッペンドルフチュ
ーブ中に再懸濁する。短い遠心分離によって寒天を除去
し、組換えバクロウイルスを含有する上清を用いて、35
mm皿に接種したSf9細胞を感染させる。4日後に、これら
の培養皿の上清を収集し、4℃で保存する。
【0145】Sf9細胞を、10%熱不活化FBSを補足したグ
レース培地で生育する。その細胞を組換えバクロウイル
スV-FGF-15に感染多重度(MOI)2で感染させる。6時間
後、培地を除去し、メチオニンとシステインを欠くSF90
0 II培地(Life Technologies Inc.,ガイサースブル
ク)に置換する。42時間後、5μCiの35S-メチオニン
と5μCiの35S-システイン(Amersham)を加える。細
胞をさらに16時間培養した後、遠心分離によって収集
し、標識されたタンパク質をSDS-PAGEとオートラジオグ
ラフィーで可視化する。
【0146】実施例4
COS細胞における組換えFGF-15の発現
1)SV40複製起点、2)アンピシリン耐性遺伝子、3)大
腸菌複製起点、4)CMVプロモーターとそれに続くポリリ
ンカー領域、SV40イントロン及びポリアデニル化部位を
含有するベクターpcDNA3/Amp(Invitrogen)から誘導さ
れるプラスミドFGF-15-HAの発現。全FGF-15前駆体と、
その3'末端にインフレーム(in frame)融合したHA標識
とをコードするDNA断片を、上記ベクターのポリリンカ
ー領域にクローニングする。したがって、その組換えタ
ンパク質の発現はCMVプロモーターに制御される。HA標
識は、既に記述したように、インフルエンザ血球凝集素
タンパク質に由来するエピトープに対応する(I. Wilso
n, H. Niman, R. Heighten, A. Cherenson, M. Connoll
y及びR. Lerner, Cell, 37:767(1984))。標的タンパ
ク質にHA標識を融合すると、HAエピトープを認識する抗
体でその組換えタンパク質を容易に検出できるようにな
る。
【0147】プラスミド構築法は次の通りである。FGF-
15をコードするDNA配列(ATCC No. 97146)を、次の2つ
のプライマーを用いるPCRによって構築する。5'プライ
マー(5' CTAGT GGATCC GCCATC ATGGTAAAACCGGTGCCC
3';配列番号7)は、BamHI部位と、それに続く、開始コ
ドンから始まるコーディング配列の18ヌクレオチドとを
含有する。3'配列(5' GTCGAC CTCGAGTGTGTGCTTACTCTTG
TT 3';配列番号8)は、XhoI部位、翻訳終止コドン、HA
標識及びFGF-15コーディング配列の最後の18ヌクレオチ
ド(終止コドンを含まない)に相補的な配列を含有す
る。したがって、そのPCR産物は、BamHI部位、コーディ
ング配列とそれに続いてインフレーム融合したHA標識、
HA標識に続く翻訳終結終止コドン、及びXhoI部位を含有
する。
【0148】そのPCR増幅DNA断片とベクターpcDNA3/Amp
を、各制限酵素で消化し、連結する。その連結混合物で
大腸菌SURE株(Stratagene Cloning Systems, 92037カ
リフォルニア州ラジョラから入手可能)を形質転換し、
その形質転換培養をアンピシリン培地プレートで培養し
て、耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを形質転
換体から単離し、制限分析によって正しい断片の存在を
調べる。この組換えFGF-15を発現させるために、DEAE-
デキストラン法(J. Sambrook, E. Fritsch, T.Maniati
s, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Sp
ring Laboratory Press(1989))によって、COS細胞を
上記発現ベクターでトランスフェクションする。FGF-15
-HAタンパク質の発現は、放射線標識と免疫沈降法(E.
Harlow,D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, C
old Spring Harbor LaboratoryPress(1988))によっ
て検出される。トランスフェクションの2日後に、細胞
を 35S-システインで8時間標識する。次に、培養培地
を集め、細胞を界面活性剤(RIPA緩衝液(150mM NaCl,
1%NP-40, 0.1%SDS, 1%NP-40, 0.5%DOC, 50mM Tris,pH7.
5)で溶解する(Wilson, I.ら,同上, 37:767(198
4))。細胞溶解液と培養培地の両方を、HA特異的モノ
クローナル抗体で沈殿させる。沈殿したタンパク質を15
%SDS-PAGEゲルで分析する。
【0149】上の教示を考慮すれば、本発明には数多く
の改良や変更を加えることができるので、具体的に説明
した態様の他にも、添付の請求の範囲内で本発明を実施
することができる。
【配列表】(1) 一般的情報:
(i) 出願人:グリーンら
(ii) 発明の名称: 繊維芽細胞増殖因子−15
(iii) 配列の数: 8
(iv) 連絡先:
(A) 宛名:カレラ、バイアーン、ベイン、ジルフィラ
ン、セッチ、ステュワート・アンド・オルスタイン
(B) 通り:ベッカー・ファーム・ロード 6番
(C) 市:ローズランド
(D) 州:ニュージャージー
(E) 国:アメリカ合衆国
(F) ZIP:07068
(v) コンピューター解読書式:
(A) 媒体型:3.5インチディスケット
(B) コンピューター:IBM PS/2適合
(C) オペレーティング・システム:MS−DOS
(D) ソフトウエア:ワード・パーフェクト 5.1
(vi) 本出願のデータ:
(A) 出願番号:
(B) 出願日:同時に提出
(C) 分類:
(vii) 優先権主張出願のデータ:
(A) 出願番号:08/207,412
(B) 出願日:1994年3月8日
(viii) 弁理士/代理人 情報:
(A) 氏名:フェラーロ、グレゴリー・ディー
(B) 登録番号:36,134
(C) 参照/整理番号:325800−268
(ix) 電話連絡先情報:
(A) 電話番号:201−994−1700
(B) ファックス番号:201−994−1744
(2) 配列番号1の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:680塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:cDNA
(xi) 配列:配列番号1:
ATGGTAAAAC CGGTGCCCCT CTTCAGGAGA ACTGATTTCA AATTATTATT ATGCAACCAC 60
AAGGATCTCT TCTTTCTCAG GGTGTCTAAG CTGCTGGATT GCTTTTCGCC CAAATCAATG 120
TGGTTTCTTT GGAACATTTT CAGCAAAGGA ACGCATATGC TGCAGTGTCT TTGTGGCAAG 180
AGTCTTAAGA AAAACAAGAA CCCAACTGAT CCCCAGCTCA AGGGTATAGT GACCAGGTTA 240
TATTGCAGGC AAGGCTACTA CTTGCAAATG CACCCCGATG GAGCTCTCGA TGGAACCAAG 300
GGTGACAGCA CTAATTCTAC ACTCTTCAAC CTCATACCAG TGGGACTACG TGTTGTTGCC 360
ATCCAGGGAG TGAAAACAGG GTTGTATATA ACCATGAATG GAGAAGGTTA CCTCTACCCA 420
TCAGAACTTT TTACCCCTGA ATGCAAGTTT AAAGAATCTG TTTTTGAAAA TTATTATGTA 480
ATCTACTCAT CCATGTTGTA CAGACAACAG GAATCTGGTA GAGCCTGGTT TTTGGGATTA 540
AATAAGGAAG GGCAAGCTAT GAAAGGGAAC AGAGTAAAGA AAACCAAACC AGCAGCTCAT 600
TTTCTACCCA AGCCATTGGA AGTTGCCATG TACCGAGAAC CATCTTTGCA TGATGTTGGG 660
GAAACGGTCC CGAAGCCTGG GGTGACGCCA AGTAAAAGCA CAAGTGCGTC TGCAATAATG 720
AATGGAGGCA AACCAGTCAA CAAGAGTAAG ACAACATAG 759
(2) 配列番号2の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:225アミノ酸
(B) 型:アミノ酸
(C) 鎖の数:
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:蛋白質
(xi) 配列:配列番号2:
Met Val Lys Pro Val Pro Leu Phe Arg Arg Thr Asp Phe Lys Leu
5 10 15
Leu Leu Cys Asn His Lys Asp Leu Phe Phe Leu Arg Val Ser Lys
20 25 30
Leu Leu Asp Cys Phe Ser Pro Lys Ser Met Trp Phe Leu Trp Asn
35 40 45
Ile Phe Ser Lys Gly Thr His Met Leu Gln Cys Leu Cys Gly Lys
50 55 60
Ser Leu Lys Lys Asn Lys Asn Pro Thr Asp Pro Gln Leu Lys Gly
65 70 75
Ile Val Thr Arg Leu Tyr Cys Arg Gln Gly Tyr Tyr Leu Gln Met
80 85 90
His Pro Asp Gly Ala Leu Asp Gly Thr Lys Gly Asp Ser Thr Asn
95 100 105
Ser Thr Leu Phe Asn Leu Ile Pro Val Gly Leu Arg Val Val Ala
110 115 120
Ile Gln Gly Val Lys Thr Gly Leu Tyr Ile Thr Met Asn Gly Glu
125 130 135
Gly Tyr Leu Tyr Pro Ser Glu Leu Phe Thr Pro Glu Cys Lys Phe
140 145 150
Lys Glu Ser Val Phe Glu Asn Tyr Tyr Val Ile Tyr Ser Ser Met
155 160 165
Leu Tyr Arg Gln Gln Glu Ser Gly Arg Ala Trp Phe Leu Gly Leu
170 175 180
Asn Lys Glu Gly Gln Ala Met Lys Gly Asn Arg Val Lys Lys Thr
185 190 195
Lys Pro Ala Ala His Phe Leu Pro Lys Pro Leu Glu Val Ala Met
200 205 210
Tyr Arg Glu Pro Ser Leu His Asp Val Gly Glu Thr Val Pro Lys
215 220 225
Pro Gly Val Thr Pro Ser Lys Ser Thr Ser Ala Ser Ala Ile Met
230 235 240
Asn Gly Gly Lys Pro Val Asn Lys Ser Lys Thr Thr
245 250
(2) 配列番号3の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:32塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:配列番号3:
GCCAGACCAT GGTAAAACCG GTGCCCCTC 29
(2) 配列番号4の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:33塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:配列番号4:
GGCAGGAGAT CTTGTTGTCT TACTCTTGTT GAC 33
(2) 配列番号5の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:33塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:配列番号5:
CTAGTGGATC CGCCATCATG GTAAAACCGG TGCCC 35
(2) 配列番号6の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:30塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:配列番号6:
CGACTGGTAC CAGCCACGGA GCAGGAATGT CT 32
(2) 配列番号7の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:33塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:配列番号7:
CTAGTGGATC CGCCATCATG GTAAAACCGG TGCCC 35
(2) 配列番号8の情報:
(i) 配列の特徴:
(A) 長さ:33塩基対
(B) 型:核酸
(C) 鎖の数:一本鎖
(D) トポロジー:直鎖状
(ii) 配列の種類:オリゴヌクレオチド
(xi) 配列:配列番号8:
GTCGACCTCG AGTGTGTGCT TACTCTTGTT 30Description: The present invention relates to a newly identified polynucleotide.
Tide, the polynucleotide encoded by the polynucleotide
Use of peptides, their polynucleotides and polypeptides
For the production of polynucleotides and polypeptides
About birth. More specifically, the polypeptide of the present invention
Tide is a fibroblast growth factor / heparin binding growth factor
(Hereinafter referred to as "FGF-15")
I have. The present invention relates to inhibiting the action of the polypeptide.
Also related to. [0002] Fibroblast growth factor binds to heparin
Is a family of proteins that
Therefore it is also called heparin binding growth factor (HBGF)
You. The various components of this protein family vary
Expression with unique organization, and its expression
is recieving. These proteins are found in fibroblasts, cornea
And vascular endothelial cells, granulocytes, adrenocortical cells, chondrocytes,
Myoblasts, vascular smooth muscle, lens epithelial cells, melanogenesis
Cells, keratinocytes, oligodendrocytes, astrocytes, bone
Mesodermal, ectodermal and endodermal, including blasts and hematopoietic cells
A powerful mitogen for various cells of origin
is there. [0003] Each component has a function that overlaps with each other.
In addition, each has a unique functional spectrum. FGF-
1 and FGF-2, in addition to their ability to stimulate vascular endothelial cell proliferation,
Is chemotactic for endothelial cells, and FGF-2 is
Have been shown to allow penetration of the basement membrane
You. Consistent with these properties, FGF-1 and FGF-2
Has the ability to stimulate growth. Another of these growth factors
An important feature is that they can promote wound healing.
And Many other members of the FGF family are also blood
Activities similar to FGF-1 and FGF-2, such as promoting tube formation and wound healing
Have sex. Some of the members of the FGF family are medium
Induces germ layer formation, neurons, adipocytes and bone
It has been shown to regulate skeletal muscle cell differentiation. In addition to these biological activities in normal tissues,
When expression of the FGF protein is deregulated, tumors
By promoting tumor angiogenesis,
Promotes carcinoma and sarcoma tumor formation as a mining protein
It also relates to progress. At present, the FGF family is structurally related.
8 types of polypeptides: basic FGF, acidic FGF, int 2,
hst 1 / k-FGF, FGF-5, FGF-6, keratinocyte growth factor
Child, AIGF (FGF-8)
Purified from human glioma cell line culture supernatant
Laria activator is a novel heparin-binding growth factor
(Miyamoto, M. et al., Mol. And Cell.
Biol., 13 (7): 4251-4259 (1993)). Each heredity
The offspring have been cloned and sequenced. Their composition
Two of the elements, FGF-1 and FGF-2, are characterized by many names
Attached, respectively, acidic and basic fibroblasts
Most often called growth factors. Normal gene product
Is the general growth of most endodermal and neuroectodermal cells
Affects ability. They induce angiogenesis in vivo
Can play an important role in early development
(Burgess, WH and Maciag, T., Annu. Rev. Bioche
m., 58: 575-606, (1989)). In addition, many of the above-mentioned components of the FGF family
Or bind to the same receptor and
The second message is guided by the binding that is performed. Eukaryotic expression vector encoding secreted FGF-1
Was introduced into the pig artery by gene transfer.
You. This model demonstrates gene function in the arterial wall in vivo.
To clarify. FGF-1 expression was detected 21 days after gene transfer.
Induced intimal hyperplasia in the human artery (Nabel,
EG et al., Nature, 362: 844-6 (1993)). Furthermore, the base
Fibroblast growth factor regulates glioma growth and progression,
Can regulate independently of its role in tumor angiogenesis
And the release or secretion of basic fibroblast growth factor
Proven to be necessary for their action
(Morrison, RS et al., J. Neurosci. Res., 34: 502-9 (1
993)). [0008] Fibroblast growth factors such as basic FGF
Is also associated with in vitro proliferation of Kaposi's sarcoma cells
(Huang, YQ et al., J. Clin. Invest. 91: 1191-7 (1
993)). In addition, human basic fibroblast growth factor was
The cDNA sequence to be coded is a bacteriophage T7 RNA polymerase.
Downstream of the transcription promoter recognized by
Have been trained. Basic fiber sprouts thus obtained
Cell growth factors are mitogenic, plasminogen active
Human embryos were assayed for virulence factor synthesis and angiogenesis assays.
Have a biological activity indistinguishable from disc fibroblast growth factor
(Squires, CH et al., J. Biol. Che
m., 263: 16297-302 (1988)). US Pat. No. 5,155,214 discloses a substantially pure baby.
Disclose milk basic fibroblast growth factors and their production
ing. Bovine and human basic fibroblast growth factor
Acid sequence and the DNA sequence encoding the bovine polypeptide
Columns are disclosed. [0010] The newly discovered FGF-9 is a member of the FGF family.
Has about 30% sequence similarity to other components. Fami
Two cysteine residues in Lie components and other commonalities
The sequence was also well conserved in the FGF-9 sequence. FGF-9 is
At its N-terminus, typical signals such as acidic and basic FGFs
It has been found that it does not have a file array. However, FGF-9
Post-synthesis despite lacking the typical signal sequence FGF
Is secreted from cells (Miyamoto, M.
Et al., Mol. And Cell. Biol., 13 (7): 4251-4259 (199
3)). In addition, FGF-9 is oligodendrocyte type 2
Stimulates cell proliferation of vesicle precursor cells BALB / c3T3 and PC-12 cells
May not stimulate human umbilical vein endothelial cell proliferation
(Naruo, K. et al., J. Biol. Chem., 268: 2857-28
64 (1993)). Basic FGF and acidic FGF are used for cell growth and cell migration.
Is a potent regulator of motility, differentiation and survival;
Acts on cell types derived from germ and endoderm. this
These two FGFs, together with KGF and AIGF, are used for protein purification.
Therefore, it has been identified. But the other four components are
Isolated as an oncogene, whose expression is consistent with embryogenesis
Type of cancer was restricted. FGF-9 acts on glial cells
It has been proven to be a mitogen. FGF Family
Lee's components have been reported to have tumorigenic potential.
FGF-9 transforms when transformed into BLB / c3T3 cells.
Demonstrates forming ability (Miyamoto, M. et al., Mol. Cell.
Biol., 13 (7): 4251-4259 (1993)). Androgen induction, also known as FGF-8
Sexual growth factor (AIGF) is a testosterone-stimulated marker.
Mouse breast cancer cells (SC-3) were purified from conditioned media. AIGF
Is a unique FGF-like growth factor and putative signal peptide
With 30-40% homology to known FGF family members
is there. Mammalian cells transformed with AIGF are
Significant stimulatory effect on SC-3 cell proliferation in the absence of
Show. Thus, AIGF is associated with SC-3 cells and probably
Mediates androgen-induced proliferation of other cells. why
This is because it is secreted by the tumor cells themselves.
You. [0013] The polypeptide of the present invention is an FGF family.
Amino acid sequence homology with other components
Presumed to be a component of Millie. According to one aspect of the present invention, a novel mature polypeptide
Peptides, and biologically active and useful for diagnosis or therapy
Fragments, analogs and derivatives thereof are provided. Of the present invention
The polypeptide is of human origin. According to another aspect of the present invention,
An isolated nucleic acid molecule (mRN) encoding a polypeptide of
A, DNA, cDNA, genomic DNA) and biologically active
Fragments thereof are provided that are sexual and useful for diagnosis or therapy. According to a further aspect of the present invention, the recombinant vector
(A test for recombinant production of the polypeptide of the present invention)
Cloning and expression vectors useful as drugs)
Recombination comprising a nucleic acid sequence encoding a polypeptide of the invention
By using prokaryotic and / or eukaryotic host cells,
Methods for producing the polypeptides by recombinant techniques are provided.
It is. According to a further aspect of the present invention,
Peptide or polynucleotide encoding the above polypeptide
Otides, agonists and antagonists against them
Method used to burn and e.g. burns and ulcers
Promotes wound healing by
Prevented neuronal damage and promoted neuronal growth
To prevent skin aging and hair loss and to regenerate early embryos and limbs
Purposes such as stimulating angiogenesis and mesoderm induction in
There is provided a method for use with: According to a further aspect of the present invention, the poly
Antibodies to the peptides are provided. According to a further aspect of the present invention, the poly
Antagonists to the peptide, for example
In the treatment of cell transformation (eg tumors)
Reduces scars by inhibiting the action of the above polypeptides
To treat or treat hypervascular disease
Methods of using them are provided. According to another aspect of the present invention,
Specific for polynucleotides encoding different polypeptides
Consists of nucleic acid molecules long enough to hybridize to
A nucleic acid probe is provided. According to a further aspect of the present invention,
A disease associated with a mutation in the nucleic acid sequence or
To detect susceptibility to disease and its sequence
Diagnostics to detect overexpression of polypeptides that are loaded
A specific assay is provided. According to another aspect of the present invention, the above-mentioned
Polypeptide encoding the polypeptide or the above polypeptide
Reotide is used for scientific research, DNA synthesis and DNA vector
Provides methods for use in manufacturing related in vitro purposes
You. These and other aspects of the invention are as follows:
It should be apparent to those skilled in the art from the teachings herein. The following drawings are merely examples of certain embodiments of the invention.
It is only an indication and is not meant to be limiting. FIG.
~ 2 correspond to the deduced cDNA sequence of FGF-15
It is a figure which shows an amino acid sequence. Figures 3-6 show FGF-15 and others
Amino acid sequence homology between FGF family members
FIG. You can easily check the stored amino acids
You. According to one aspect of the present invention, the estimation of FIGS.
A mature polypeptide having an amino acid sequence (SEQ ID NO: 2),
Or deposited as ATCC Deposit No. 97146 on May 12, 1995
Mature polypeptide encoded by the cDNA of the clone
Isolated nucleic acid molecule encoding the peptide (polynucleotide
Is provided. Polynucleotide encoding FGF-15 of the present invention
Pide was initially a cDNA line derived from a human adrenal tumor tissue.
Found during the Bully. This is the fibroblast growth factor factor.
Structurally related to all components of the family, 252
Contains an open reading frame encoding a polypeptide
You. Among the main combinations, 1) for human FGF-9,
Over the 129 amino acid interval, 41% identity and 66% alignment
2) has 88 amino acids for human KGF
It has 37% identity and 59% similarity across regions. The characteristics of the FGF / HBGF family, GXLX (S, T, A,
G) X6 (D, E) CXFXE is also conserved in the polypeptides of the present invention.
(X represents any amino acid residue; (D, E) is D residue
Represents a group or an E residue; X6 represents any six amino acid residues
). The polynucleotide of the present invention is of the RNA type.
DNA type including cDNA, genomic DNA and synthetic DNA
It may be. DNA can be double-stranded or single-stranded
It may be. A code encoding a mature polypeptide
The coding sequence (coding sequence) shown in FIGS.
No. 1) or the same as the coding sequence of the deposited clone
One or the DNA (SEQ ID NO: 1) of FIGS.
Encodes the same mature polypeptide as the deposited cDNA,
Different codings due to redundancy or degeneracy of the genetic code
It may be an array. The mature polypeptide of FIG.
2) Alternatively, the mature polynucleotide encoded by the deposited cDNA
The polynucleotide encoding the repeptide is matured
May contain only the polypeptide coding sequence
And the coding sequence and leader of the mature polypeptide
Or additional coding sequences such as secretory sequences or
It may encode a proprotein sequence and
Repeptide (may have additional coding sequence)
And non-coding sequences (introns, mature polypeptides)
On the 5 'and / or 3' side of the coding sequence for the
Non-coding sequences). Thus, "encoding a polypeptide
The term "polynucleotide" refers to the polypeptide
A polynucleotide containing only the coding sequence,
Additional coding sequences and / or non-coding
A polynucleotide that also includes a sequence. Further, the present invention relates to the deduced amino acids shown in FIGS.
A polypeptide having the sequence (SEQ ID NO: 2) or
Of the polypeptide encoded by the cDNA of the deposited clone
The above-described polynucleotide encoding fragments, analogs and derivatives
It is also related to variants of Otide. This polynucleotide variant
Is the naturally occurring allele of the polynucleotide
It may be a variant or a naturally occurring version of the polynucleotide
May be a variant that does not exist. Accordingly, the present invention provides
Polypeptide (SEQ ID NO: 2) or cDNA of the deposited clone
The same mature polypeptide as the mature polypeptide encoded by
Polynucleotides encoding peptides, and FIGS.
2 (SEQ ID NO: 2) or the deposited
Fragments of a polypeptide encoded by the cDNA of the
Derivatives or analogs of the above polynucleotides
Includes variants. As such nucleotide variants
Include deletion variants, substitution variants and addition or insertion variants.
It is. As described above, the polynucleotide of the present invention
Is the coding sequence (SEQ ID NO: 1) shown in FIGS.
Or the coding sequence of the deposited clone
With coding sequences that are allelic variants
Is also good. As is known in the art, allelic
Offspring variants substantially alter the function of the encoded polypeptide.
One or more nucleotide substitutions, deletions or
Is an alternative polynucleotide sequence that may have additional
You. [0034] The present invention relates to the coding of the above-mentioned mature polypeptide.
Expression and secretion of polypeptides by host cells
A polynucleotide sequence (eg, a polypeptide)
That function as secretory sequences that regulate the transport of
Sequence) fused to the same reading frame
Also encompasses tides. A polypeptide having a leader sequence
Preprotein, whose leader sequence is
Is cleaved to form the mature form of the polypeptide.
sell. The polynucleotide of the present invention has a 5 ′
Encoding a proprotein with additional amino acid residues
Is also good. Mature protein with prosequence is proprotein
Quality and the inactive form of the protein. That professional
When the sequence is cleaved, the active mature protein remains. Therefore, the polynucleotide of the present invention
Is a mature protein, a protein with a prosequence, or
Tan with both a pro-sequence and a pre-sequence (leader sequence)
Can code for Parkin. The polynucleotide of the present invention comprises the polynucleotide of the present invention.
Inflation occurs in the marker sequence used for peptide purification.
May have coding sequences fused in frame
No. For bacterial hosts, supplied by the pQE-9 vector
Hexahistidine label to be used as a marker sequence
Prepare for purification of the mature polypeptide fused to the marker
Use a mammalian host such as COS-7 cells
For example, if a hemagglutinin (HA) label is
Can be a column. HA label for influenza blood cells
Corresponding to an epitope from the agglutinin protein (Wilso
n, I. et al., Cell, 37: 767 (1984)). The term “gene” refers to a polypeptide chain
Means the division of DNA involved in the production of
Area (leader and trailer) before and after the area
Intervening sequences between the various coding segments (exons)
(Intron). The full-length FGF-15 gene fragment was
To be used as hybridization probes for
From the full-length gene itself,
Other residues with high sequence similarity or similar biological activity
The gene can be isolated. This type of probe
Preferably consists of at least 30 bases, 50 bases
The above may be included. In addition, this probe
CDNA clones, genomic clones,
Are regulatory and promoter regions, exons and intros
Clone containing the complete FGF-15 gene
Can also be used to In one example of screening,
Known DNA sequence for oligonucleotide probe synthesis
By using the coding region of the FGF-15 gene
Is isolated. Has a sequence complementary to the sequence of the gene of the present invention
Using labeled oligonucleotides, human cDNA and genome
Screen DNA or mRNA libraries and
Construction of library for probe hybridization
Determine the prime. Further, the present invention provides that at least 70
%, Preferably at least 90%, more preferably at least
Hybrid to the above sequence if there is also 95% identity
Related to the polynucleotide to be formed. In particular, the present invention
Hybrid form to the above polynucleotides under dense conditions
The resulting polynucleotide. As used herein
The term "stringent conditions" means that at least 95
%, Preferably at least 97% when there is identity
Means that hybridization occurs. Preferred
In another embodiment, a hybrid to the above-described polynucleotide
The polynucleotide to be formed is the cDNA shown in FIGS.
No. 1) or the mature polyencoded by the deposited cDNA
Retains substantially the same biological function or activity as the peptide
Encodes a polypeptide. [0040] The above-mentioned polynucleotide is as described above.
As described above, hybridization to the polynucleotide of the present invention
And has identity to the polynucleotide
(Activity may or may not be retained), at least
Also 20 bases, preferably 30 bases, more preferably at least
May also contain 50 bases. Such polynucleotides
Refers to, for example, the polynucleotide of SEQ ID NO: 1.
As a probe (eg, for polynucleotide recovery)
As a diagnostic probe or as a PCR primer
Can be used. Accordingly, the present invention provides
Less for polynucleotides encoding peptides
Both 70% identity, preferably at least 90% identity,
More preferably a polynucle with at least 95% identity
Reotide, and at least 30 bases, preferably at least
A fragment consisting of 50 bases, as well as
The present invention relates to polypeptides encoded by leotide. The deposit referred to in this specification may be
Budapest Treaty on International Recognition of Deposits of Microorganisms
Will be maintained based on. These deposits are, for convenience,
It is only provided and is required by 35 U.SC §112.
I do not admit that it is a deposit. Included in the deposit
The sequence of the polynucleotide and the
The amino acid sequence of the polypeptide
Of the sequence described in the present specification.
If it contradicts, this becomes dominant. The above deposit
Consent may be required to manufacture, use or sell,
This specification does not give such a consent. Further, the present invention relates to the deduced amino acids shown in FIGS.
A polypeptide having the sequence (SEQ ID NO: 2) or the deposited cDN
Polypeptide having the amino acid sequence encoded by A
And fragments, analogs and derivatives of such polypeptides.
For conductors. The polypeptide (SEQ ID NO: 2) of FIGS.
Is related to the polypeptide encoded by the deposited cDNA.
When referring to "fragments", "derivatives" and "analogs"
These terms are essentially the same as the polypeptide
Polypeptide that retains a functional function or activity. And
Therefore, analogs may be affected by cleavage of the proprotein part.
That can be activated to produce an active mature polypeptide
Roprotein. The polypeptide of the present invention is a recombinant polypeptide.
Pride, natural and synthetic polypeptides
And a recombinant polypeptide is preferred. The polypeptide of FIGS. 1-2 (SEQ ID NO: 2)
Is a fragment of the polypeptide encoded by the deposited cDNA
The fragment, derivative or analog may comprise (i) one or more amino acids
The acid residue is a conservative or non-conservative amino acid residue (preferably
Conservative amino acid residue) (substitution
Amino acid residues are those encoded by the genetic code
May or may not be)
And (ii) one or more amino acid residues contain a substituent.
Or (iii) mature polypeptide
The peptide is bound to another compound (eg, the polypeptide
Compounds to increase half-life (polyethylene glyco
Or (iv) leader or
Is the secretory sequence, mature polypeptide or proprotein sequence
Additional amino acids, such as sequences used for column purification
May be fused to the mature polypeptide
No. Such fragments, derivatives and analogs are described herein.
From the teachings, it is considered within the skill of the artisan. Polypeptides and Polynucleotides of the Invention
Is preferably provided in an isolated form, and
It is preferably purified to The term "isolated" means that the substance is
Its original environment (for example, if it is a natural product, its natural environment
Means that it is taken out of the border. For example, raw
Naturally occurring polynucleotides or poly
The peptide is not "isolated", but shared in its natural system.
The polynucleus separated from part or all of the existing substance
Reotide or polypeptide is "isolated." That
Such a polynucleotide may be part of a vector,
And / or such a polynucleotide or polypeptide
Such vectors can be used even if the peptide is part of the composition.
Or that the composition is not part of its natural environment.
They are "isolated." The polypeptide of the present invention comprises the polypeptide of SEQ ID NO: 2.
Ripeptide (especially its mature polypeptide) and SEQ ID NO:
At least 70% similarity to the two polypeptides (preferably
Or 70% identity), more preferably the sequence of SEQ ID NO: 2.
At least 90% similarity to the peptide (more preferred
Or 90% identity), more preferably the polypeptide of SEQ ID NO: 2.
At least 95% similarity to the peptide (more
Or 95% identity).
Generally at least 30 amino acids, more preferably
One of the above polypeptides containing at least 50 amino acids
Parts. As is known in the art, two
"Similarity" between two polypeptides
Amino acid sequence and its conservative amino acid substitutions
It is determined by comparing to the sequence of the polypeptide. Fragments or portions of the polypeptides of the present invention
For the production of corresponding full-length polypeptides by peptide synthesis
Can be used. That is, these fragments are
Can be used as an intermediate to produce tide. The present invention
A fragment or portion of a polynucleotide may be a full-length polynucleotide of the present invention.
It can be used for the synthesis of oligonucleotides. The present invention includes the polynucleotide of the present invention.
Vector, host genetically engineered with the vector of the present invention
Production of polypeptides of the invention by cells and recombinant techniques
Related to The host cell is a vector of the present invention, which is
For example, it may be a cloning vector or an expression vector.
Gene manipulation (transduction or
Can be transformed or transfected).
Vectors include, for example, plasmids, viral particles,
It can take the form of a dice. The engineered host cells are
Activation of motor, selection of transformants or the present invention
Culture in a conventional nutrient medium modified for gene amplification
Can be nourished. Culture conditions such as temperature and pH
Under conditions previously used for the selected host cell
Yes, and will be apparent to those skilled in the art. The polynucleotide of the present invention can be obtained by a recombinant technique.
Can be used to produce polypeptides. And
Thus, for example, the polynucleotide sequence may vary.
Expression vehicle (specifically, expressing the polypeptide)
Vector or plasmid)
Can be taken. Such vectors include chromosomes
DNA sequences, non-chromosomal DNA sequences and synthetic DNA sequences, such as SV4
0 derivative, bacterial plasmid, phage DNA, yeast plasmid
Derived from a combination of smid, plasmid and phage DNA
Vector, viral DNA (eg, vaccinia,
Virus, fowlpox virus, pseudorabies virus)
Is mentioned. However, other vectors or plasmids
Is replicable and viable in its host
Can be used as long as it is capable. An appropriate DNA sequence can be identified by various techniques.
Can be inserted into the Generally, as known in the art,
Technique to provide appropriate restriction endonuclease sites.
Insert the DNA sequence. Such techniques and others are known to those skilled in the art.
It is considered to be included in the technical range. The DNA sequence in the expression vector
Operable with appropriate expression control sequence (promoter)
Noh is linked. Representative examples of such promoters
LTR or SV40 promoter, E. coli lac or trp,
Phage lambda P L Promoter, prokaryotic, eukaryotic
Controls gene expression in cells or their viruses
List other promoters known to
be able to. The expression vector is a ribosomal for translation initiation.
Also contains a binding site and a terminator
You. Vectors also contain sequences suitable for amplifying expression.
Is also good. In addition, the expression vector may contain the transformed host cells.
Genetics to confer phenotypic features that can be used for vesicle selection
Offspring (eg neomycin resistance or dihydrogen for eukaryotic cell culture)
Lofolate reductase, tetracycline in Escherichia coli
Resistance, ampicillin resistance, etc.)
No. A suitable DNA sequence as described above and a suitable promoter
Or a vector containing a control sequence and an appropriate host.
By using it for transformation,
The protein can be expressed. Representative examples of suitable hosts
Escherichia coli, Streptomyces, Salmonella typhimurium
Bacterial cells such as yeast, fungal cells such as yeast, yellow ginger
Insect cells such as Drosophila S2 and Spodoptera Sf9, CHO, C
Animal cells such as OS or Bose melanoma, adenovirus,
Plant cells and the like can be mentioned. Choosing the right host
Is within the skill of the artisan from the teachings herein.
it is conceivable that. More specifically, the present invention is broadly described.
Recombinant constructs containing one or more of the well-described sequences.
Also included. In these constructs, the sequence of the invention is
Or, a vector inserted in the reverse direction (such as a plasmid or
Ills vector etc.). Preferred aspects of this embodiment
Now, the construct is further operably linked to the sequence
Contains regulatory sequences (including promoters)
You. Many suitable vectors and promoters are known to those of skill in the art.
And are commercially available. The following vectors are
It is an example. For bacteria: pQE70, pQE60, pQE-9 (Qiagen), p
BS, phagescript, psiX174, pBluescript SK, pBsKS, p
NH8a, pNH16a, pNH18a, pNH46a (Stratagene), pTRC99
A, pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5 (Pharmaci
a). For eukaryotic cells: pWLneo, pSV2cat, pOG44, pXT1, pSG
(Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG, pSVL (Pharmaci
a). However, other plasmids or vectors
It is replicable and viable in its host
As long as it can be used. The promoter region is CAT (chloramphene).
Nicol transferase) vector and selectable
From the desired gene using another vector
You can choose. Suitable vectors are PKK232-8 and pC
M7. One of the most famous bacterial promoters is lac
I, lacZ, T3, T7, gpt, lambda P R , P L And trp
Can be As eukaryotic promoters, CMV immediate early, H
SV thymidine kinase, early and late SV40, retrovirus
LTR and mouse metallothionein-I. Suitable
Selection of the appropriate vector and promoter is well-known in the art.
It is well contained in the ordinary technical level. As a further aspect, the present invention relates to the above-described structure.
The present invention relates to host cells containing structures. The host cell of the present invention
May be a higher eukaryotic cell, such as a mammalian cell.
Alternatively, it may be a lower eukaryotic cell such as a yeast cell.
Prokaryotic cells such as bacterial cells may also be used. Host details
The introduction of the above-described construct into the vesicle is carried out by calcium phosphate trans.
Transfection, DEAE-dextran mediated transfection
Or electroporation
(Davis, L., Dibner, M. Battey, I., Basic Method
s in Molecular Biology (1986)). The construct in the host cell is used conventionally.
Encoded by its recombination sequence
Gene products can be produced. Alternatively,
Synthesize and produce light polypeptides using a conventional peptide synthesizer
You can also. [0062] The mature protein is
Controlled release in mammalian cells, yeast, bacteria and other cells
Can be manifested. Obtained from the DNA construct of the present invention.
Cell-free production of the above proteins using RNA
A translation system can also be used. For use in prokaryotic and eukaryotic hosts
Suitable cloning and expression vectors are available from Sambro
ok et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Part 2
Edition, Cold Spring Harbor, NY (198
9)), the disclosure of which is
Form a part of the specification. The DNA encoding the polypeptide of the present invention
Transcription by higher eukaryotes is enhanced by the vector
-Increased by inserting sequences. Enhancer
Is a cis-acting element of DNA, usually 10-300 bp.
Act on the promoter to increase its transcription. Duplicate
SV40 enhancer on the late side (100-270bp) of origin
ー, cytomegalovirus early promoter enhancer
ー 、 Polyoma enhancer and the late side of the replication origin
And adenovirus enhancers are examples. In general, a recombinant expression vector has a replication origin.
Point, a selectable marker that allows transformation of the host cell.
Carr (for example, E. coli ampicillin resistance gene or sucker)
Romyces cerevisiae TRP1 gene) and downstream structural sequences
Including promoters derived from highly expressed genes that direct transcription
right. Such promoters are, above all,
Glycolytic enzymes such as sphoglycerate kinase (PGK)
Element, α-factor, acid phosphatase or heat shock tan
It can be obtained from operons that encode protein. Different
The species structural sequence includes a translation initiation sequence and a termination sequence, and preferably a translation sequence.
Secretion of translated protein into the periplasmic space or extracellular medium
Position appropriate for the leader sequence that can direct
Assembled in phases. Optionally, the heterologous sequence is expressed and
Desired recombinant products, such as stabilization and convenient purification
N-terminal identification peptide (identification p
eptide). Useful expression vectors for bacterial use are
The structural DNA sequence encoding the protein of interest
Together with the translation initiation and translation termination signals,
Reading phas operable for the motor
e) is constructed by inserting vector
Guarantees the maintenance of the vector and, if desired,
One or more to provide amplification in the host.
Would include the above phenotype selectable marker and origin of replication
U. Suitable prokaryotic hosts for transformation include Escherichia coli and Bacillus subtilis.
Fungi, Salmonella typhimurium, Pseudomonas, strain
Various species belonging to the genus Puttomyces and Staphylococcus
Seeds. However, other hosts are also options.
Can be used. Typical Examples of Expression Vectors Useful for Bacterial Use
As a well-known cloning vector pBR322 (ATCC 3
7017) Selection from commercial plasmids containing genetic elements
List those containing selectable markers and bacterial origin of replication
(But not limited to).
Such commercially available vectors include, for example, pKK223-3 (Ph
armacia Fine Chemicals, Uppsala, Sweden) and
GEM1 (Promega Biotec., Madiso, Wisconsin, USA
N). These pBR322 “skeleton” parts are
The appropriate promoter and the structural sequence and set to be expressed
Combine. A suitable host strain is transformed and the host strain is
After growing to the appropriate cell density,
-By appropriate means (eg temperature change or chemical induction)
Release suppression and culture the cells further. Typically, cells are collected by centrifugation
Crushed by physical or chemical means.
The extract is reserved for further purification. Microbial cells used for protein expression
Is a freeze-thaw cycle, sonication, mechanical disruption or
Break down in any convenient way, such as using a cell lysing agent.
Can be broken. For expression of the recombinant protein, various mammalian
Cell-like culture systems can also be used. Examples of mammalian expression systems
Is the monkey kidney fiber described in Gluzman, Cell, 23: 175 (1981).
Expression of COS-7 system of fibroblasts and compatible vector
Other cell lines (eg C127, 3T3, CHO, HeLa
And BHK cell lines). Mammalian expression vectors
Should include an origin of replication, an appropriate promoter and enhancer.
Polyadenyl, an additional, essential ribosome binding site
Site, splice donor and splice acceptor,
It will also include the transcription termination sequence and the 5 'flanking non-transcribed sequence. necessary
SV40 viral genomics
DNA sequence (eg, SV40 origin, early promoter)
Ter, enhancer, splice site and polyadenyl
Site). The polypeptide of the present invention comprises ammonium sulfate
Or ethanol precipitation, acid extraction, anions or cations
Exchange chromatography, phosphocellulose chromatography
Raffy, hydrophobic interaction chromatography, affinity
Tea chromatography, hydroxyapatite chromatography
Including mattography and lectin chromatography
Recovered and purified from recombinant cell culture by conventional methods
Wear. If necessary, to complete the configuration of the mature protein,
A protein regeneration step may be used. Finally, finally
High performance liquid chromatography (HP)
LC) can be used. The polypeptide of the present invention is a natural purified product
Or a product of a chemical synthesis method.
And prokaryotic or eukaryotic hosts (eg,
For example, cultured bacterial cells, yeast cells, higher plant cells,
Insect cells and mammalian cells).
You may. Depending on the host used for the recombinant production method,
Light polypeptides are found in mammals and other eukaryotic carbohydrates.
May be lysosylated or not glycosylated
Sometimes. The polypeptide of the invention may comprise an initiator methionine.
It may include amino acid residues. The polypeptide of the present invention can be used for vascular endothelial cell formation.
Because it can stimulate the length, various disease states (eg,
Ischemia due to thrombosis, arteriosclerosis, and other cardiovascular diseases)
It can be used in procedures to stimulate revascularization of knowledge. this
These polypeptides are also used to stimulate angiogenesis and limb regeneration.
Can be used. The polypeptide of the present invention is useful for injuries, burns,
Can also be used for later tissue repair and ulcer wound treatment
You. This is because the polypeptide of the present invention has a different origin.
For various cells (eg fibroblasts and skeletal muscle cells)
Mitogenic and therefore injured tissue or
It promotes the repair or replacement of pathological tissues. The polypeptide of the present invention can be used for neuronal growth.
Stimulation or certain neuronal disorders or neurodegenerative diseases (A
No Ruzheimer's disease, Parkinson's disease and AIDS-related complications
Also used to treat and prevent neuronal damage
Wear. Since FGF-15 has the ability to stimulate chondrocyte growth,
Using them to improve bone and periodontal regeneration,
It can be an aid for grafts. If the polypeptide of the present invention is used,
Sunburn by stimulating the growth of tin-producing cells
It can also prevent skin aging. [0077] FGF-15 polypeptides are also used to prevent hair loss.
Can be used. Because the FGF family members are hair
Activates hair-forming cells and stimulates the growth of melanocytes
Because you do. Similarly, a polypeptide of the present invention can be used in other
Proliferation of hematopoietic cells and bone marrow cells when used in combination with cytokines
And can stimulate differentiation. [0078] The FGF-15 polypeptide maintains the organ before transplantation.
Used to support primary tissue cultures.
Can also be used. The polypeptide of the present invention
It can also be used to induce differentiation of endoderm-derived tissue. According to a further aspect of the present invention, a scientific research
In vitro for research, DNA synthesis, and DNA vector production
The purpose of providing therapeutics and diagnostics for human diseases
And encodes the peptide or the polypeptide
Methods for using the polynucleotides are provided. The present invention relates to a polypeptide for the present invention.
Provided is a method for identifying a scepter. Encodes a receptor
Genes include, for example, ligand pannin
g) and FACS sorting (Coligan et al., Current Protocol
s in Immun., 1 (2), Chapter 5 (1991)).
Can be identified by a number of methods. Preferably,
Cells that respond to the light polypeptide (eg, the FGF family
It is known that it contains multiple receptors for proteins.
NIH3T3 cells and SC-3 cells)
CDNA library prepared from prepared RNA
Into several pools and use them to
Transform COS cells and other cells that do not respond to
Use the expression cloning method of
You. Transfected cells on glass slide
The polypeptide of the present invention which has been grown on and labeled with
Exposed. Polypeptides can be iodinated or site-specific
Incorporation of recognition sites for protein kinases, etc.
Labeling can be performed by various means. After fixing and culturing, slide the slides
Subject to geographic analysis. Identify the positive pool and
Prepared, retransfected, and
Re-screening and re-screening
And, ultimately, a single
Obtain a clone. Another Way to Identify Receptors
As a method, the labeled polypeptide is
Photoaffinity (phot)
o-affinity). PAGE of crosslinked material
Separated by precipitation and exposed to X-ray film. That polype
Cut the labeled complex containing the peptide receptor
Out, split into peptide fragments, and protein microsequencing
Can be used. Amides obtained by microsequencing
Screening of cDNA library using no acid sequence
A set of degenerate oligonucleotide probes to
By measuring, the residual encoding the putative receptor
Identify the gene. [0098] The present invention provides an effect of the polypeptide of the present invention.
Compound screening method to identify compounds that knot
I will provide a. In one example of such an assay, fibroblasts
Mammalian fibroblasts under cell culture conditions in which the cells
Cells, polypeptides of the invention, to be screened
Compounds, and 3 [H] Thymidine is mixed. Screenini
Perform a control assay in the absence of the
Of fibroblast proliferation in the presence of different compounds
If so, in each case 3 Measures [H] thymidine incorporation
Determines whether the compound stimulates growth.
Can be determined. The amount of fibroblast proliferation was determined by liquid scintillation.
By chromatography 3 [H] Thymidine uptake
It is measured by measuring only This method
Agonist (agonist) compound and antagonist (antagonist)
Both anti-drug compounds can be identified. As another method, the polypep of the present invention
Mammalian cells or membranes that express receptors for tide
The preparation is prepared in the presence of the test compound in the presence of the labeled
Incubate with peptide. That way, the compound
The ability to increase or block the interaction of
Will be able to Alternatively, screening
After the interaction of the compound with the FGF-15 receptor,
2 Measure the response of the messenger system and
Receptor binding ability and second messenger response induction
The ability of the compound to measure potential agonists
Or an antagonist. this
Such a second messenger system includes cAMP guanylate
Cyclase, ion channel or phosphoinositide
Such as, but not limited to, water splitting.
No. Examples of antagonist compounds include the compounds of the present invention.
Binds to the receptor of the polypeptide but is a second messenger
-Does not induce a response or binds to FGF-15 polypeptide itself
Antibodies or (optionally) oligopeptides
You. It also binds to its receptor,
Does not induce a jar response.
Mutant polypeptides that effectively block
May be a local antagonist. [0087] The FGF-15 gene and gene product
One antagonist compound uses antisense technology
This is an antisense construct created. Antisen
Technology uses antisense DNA or RNA or triple helix
These methods can be used to control gene expression by formation.
Are both involved in binding polynucleotides to DNA or RNA.
Based on. For example, a mature polypeptide of the invention
Encoding the 5 'coding portion of the polynucleotide sequence
Using antisense RNA oligonucleotides of about 10-40 base pairs in length.
Design cleides. DNA oligonucleotides are
Designed to be complementary to the region of the gene involved in transcription
(Triple helix-Lee et al., Nucl. Acids. Res., 6:
3073 (1979); Cooney et al., Science, 241: 456 (1988);
Dervan et al., Science, 251: 1360 (1991)).
Interfering with transcription and production of the polypeptide. Antisense
RNA oligonucleotides hybridize to mRNA in vivo
The translation of the mRNA molecule into a polypeptide of the invention.
Block (antisense-Okano, J. Neurochem., 56: 5
60 (1991); Oligodeoxynucleotides as AntisenseInhi
bitors of Gene Expression, CRC Press, Bo, Florida
Karaton (1988)). Antisense RNA or DNA
Can be expressed in vivo to inhibit polypeptide production
Delivering the above-described oligonucleotide to cells
You can also. [0088] Potential antagonist compounds include receptor
Binds to the binding site of the receptor, occupies that site, and
By bringing the protein closer to the polypeptide.
And small molecules that interfere with normal biological activity. That
Examples of such small molecules include small peptides or small peptides.
Include, but are not limited to, tide-like molecules
Absent. Antagonist compounds include neoplastic cells and
Cell growth and proliferation effects of the polypeptide of the present invention on tissues
To inhibit the outcome (ie, stimulation of tumor angiogenesis)
More abnormal cells, eg, in tumor formation or growth
Can be used to slow or prevent growth and proliferation. The above-mentioned antagonists are useful for treating hypervascular diseases.
Epithelial lens for prevention and after extracapsular cataract surgery
It can also be used to prevent vesicle growth. The present invention
Prevention of the mitogenic activity of the peptide after balloon angioplasty
It may be desirable in cases such as restenosis of the stomach. The above antagonists may be used for scars during wound healing.
It can also be used to prevent organizational growth. [0092] The above-mentioned antagonists can be used
It can be used as a composition comprising a pharmaceutically acceptable carrier. The polypeptides, agonists and agonists of the present invention
In combination with an appropriate pharmaceutical carrier, the
It can be a pharmaceutical composition for oral administration. Such pairs
The composition is a therapeutically effective amount of the peptide, agonist or agonist.
Antagonist and a pharmaceutically acceptable carrier or excipient
It contains. Such carriers include saline, buffered salt
Water, dextrose, water, glycerol, ethanol and
And combinations thereof, but are not limited to
Not necessarily. The formulation should be compatible with the mode of administration.
You. The present invention relates to one or more of the pharmaceutical compositions of the present invention.
Consists of one or more containers filled with the above ingredients
A pharmaceutical pack or kit is also provided. In such a container
Regulates the manufacture, use or sale of pharmaceuticals or biological products.
For human administration in a format prescribed by regulatory agencies
Reflect the agency's authorization to manufacture, use, or sell
Information can be attached. Furthermore, the polypep of the present invention
Peptides, agonists and antagonists can be used in other therapeutic compounds.
It may be used in combination with a product. The above pharmaceutical composition can be administered orally, topically,
Intravenous, intraperitoneal, intramuscular, subcutaneous, nostrils
Can be administered by any convenient method, such as intra- or intradermal routes
You. The pharmaceutical composition may be used to treat certain indications and / or
It is administered in a prophylactically effective amount. Generally, at least
Administered in an amount of about 10 mg / kg body weight, most often about 8 mg
/ kg body weight / day will not be administered. Almost
In this case, the daily dose should be about
10 mg / kg to about 1 mg / kg body weight, 1 cm 2 About 0.1 μg per
Preferably, a dose of up to 9 mg is administered. The polypeptide of the present invention and a polypeptide
Certain agonist and antagonist compounds are useful in the present invention.
Therefore, when used, it should be
It can also be done by expressing the peptide. This is often
Often called "gene therapy". Thus, for example, cells can be transferred in vitro
A polynucleotide encoding a polypeptide (DNA or R
NA) and the patient to be treated with the polypeptide
Can be given the manipulated cells. This
Such methods are well known in the art. For example,
Leto containing RNA encoding the polypeptide of the present invention
Techniques known in the art using virus particles
Can manipulate the cells. Further, the polypeptide is expressed in vivo.
For example, by techniques known in the art,
Cells can also be manipulated in vivo. Cells in vivo
Manipulation and expression of polypeptides in vivo
As is known in the art, the polypeptides of the invention
Produces Retroviral Particles Containing RNA Encoding
The production cells may be administered to the patient. Like that
And other administration methods of the polypeptide of the present invention by simple methods
Should be apparent to those skilled in the art from the teachings of the present invention.
You. For example, expression vehicles for manipulating cells are suitable.
Manipulate cells in vivo when combined with the right delivery vehicle
Retroviruses, such as adenoviruses that can be used to
Other than the loose particles may be used. The above retroviral plasmid vector
Moloney is a retrovirus that can be a source of
Murine leukemia virus, spleen necrosis virus, retrovirus
Lus, for example, Rous sarcoma virus, Harvey sarcoma ui
Ruth, avian leukemia virus, gibbon leukemia virus
Virus, human immunodeficiency virus, adenovirus, spinal cord increase
Reproductive sarcoma virus and breast cancer virus.
It is not limited to these. In one embodiment, retro
Ills plasmid vector for Moloney murine leukemia
Derived from Luz. The vector may contain one or more promoters.
including. Suitable promoters that can be used include
Rovirus LTR, SV40 promoter, Miller et al., Biotech
niques, Vol. 7, No. 9, 980-990 (1989)
Itomegalovirus (CMV) promoter and other options
Promoters (eg histone promoter, pol II
I promoter, β-actin promoter (however
Such as eukaryotic cell promoters
Vesicular promoter), but are not limited to
Do not mean. Other virus promoters you can use
-Adenovirus promoter, thymidine
Nase (TK) promoter and B19 parvovirus pro
Motors, but not limited to
No. The selection of an appropriate promoter depends on the teachings herein.
Will be apparent to those skilled in the art. Nucleic acid sequence encoding the polypeptide of the present invention
The rows are under the control of a suitable promoter. Can be used
Suitable promoters include adenovirus promoters.
(Such as adenovirus major late promoter)
Seed promoter (cytomegalovirus (CMV) promoter
Respiratory syncytial virus (RSV) promoter
Promoter, inducible promoter (MMT promoter or metallo
Thionein promoter), heat shock promoter
ー, albumin promoter, ApoAI promoter, human
Toglobin promoter, viral thymidine kinase
Promoter (herpes simplex thymidine kinase promoter)
), Retrovirus LTR (modified retrovirus described above)
Lus LTR), β-actin promoter, human growth
Hormone promoters, but only
Not only. The promoter cooperates with the polypeptide of the present invention.
A natural promoter that controls the gene
Is also good. The above retroviral plasmid vector was
To transduce packaging cells
To create a production cell line. Transfectable
Examples of packaging cells include Miller, Human Ge
ne Therapy, Volume 1, pages 5-14 (1990) (of this publication
The contents are incorporated by reference into this specification)
DAN, PE501, PA317, ψ-2, ψ-AM, PA12, T19-14X, V
T-19-17-H2, ψCRE, ψCRIP, GP + E-86 and GP + envAm12
Cell system, but is not limited to these. Baek
The packager can be packaged by any means known in the art.
Zing cells can be transduced. As such means
Include electroporation, the use of liposomes and
Calcium carbonate precipitation method, but not limited to these.
Not only. Alternatively, retrovirus programs
Enclose the rasmid vector in liposomes, or
After coupling, it may be administered to a host. The above-mentioned production cell line contains the polypeptide of the present invention.
Infectious retroviral vector containing the encoding nucleic acid sequence
-Generate particles. Such retroviral vectors
Particles can be used to transduce eukaryotic cells in vitro or in vivo.
Can be used. The transduced eukaryotic cell is a polypeptide of the present invention.
The nucleic acid sequence encoding the peptide will be expressed. Trait
Eukaryotic cells that can be introduced include embryonic stem cells, embryonic cancer cells,
Blood stem cells, hepatocytes, fibroblasts, myoblasts, keratinocytes
Adult cells, endothelial cells and bronchial epithelial cells,
However, it is not limited to these. The present invention encodes the polypeptide of the present invention.
A disease associated with the presence of a mutation in the nucleic acid sequence
A diagnostic assay to detect susceptibility to the disease
Related to the use of the gene of the present invention as part of
I do. An individual having a mutation in the gene of the present invention
It can be detected at the DNA level by various techniques. Diagnostic
Nucleic acids include blood, urine, saliva, tissue biopsy and autopsy.
Can be obtained from the cells of a patient. Genomic DNA is analyzed
Can be used directly for PCR, or use PCR prior to analysis.
And enzymatic amplification (Saiki et al., Nautre, 324: 1
63-166 (1986)). RNA and cDNA can be used for the same purpose
You. For example, a nucleic acid encoding the polypeptide of the present invention
Identify mutations using complementary PCR primers
And analyze. For example, deletions and insertions
The size of the product differs from the normal genotype
Can be detected. Point mutations can be caused by radiolabeled RNA sequences
Is the radiolabeled antisense DNA sequence and the amplified DNA
Can be identified by hybridization. Complete
Completely matched sequences are those for RNase A digestion or melting temperature.
Differences can be used to identify mismatched double-stranded molecules.
Can be. Genetic testing based on DNA sequence differences
DNA fragments in gels with (or without) sexual agents
Achieved by detecting changes in electrophoretic mobility
it can. Small sequence deletions and insertions can be achieved by high resolution gel electrolysis.
It can be visualized by electrophoresis. DNA fragments with different sequences
It can be identified on a denaturing formamide gradient gel. In this case,
The mobility of DNA fragments is determined by their melting temperatures or fractions.
Is slowed down at different locations in the gel according to the specific melting temperature
(See, eg, Myers et al., Science, 230: 1242 (1985).
thing). Sequence changes at specific positions may be
Cleavage methods and nuclease protection such as RNase and S1 protection
(See, for example, Cotton et al., PNAS, US
A, 85: 4397-4401 (1985)). Therefore, detection of a specific DNA sequence is
Hybridization, RNase protection, chemical cleavage, direct DNA sequencing
Determination, or the use of restriction enzymes (eg, restriction
Restriction Fragment Length Polymorphi
sms; RFLP)) and for Southern blotting of genomic DNA
Thus it can be achieved. More conventional gel electrophoresis and DNA sequencing
In addition, in situ analysis can detect mutations.
Can be. The present invention also relates to FGF-
Diagnostic assays to detect changes in levels of 15 polypeptides
Related to Lee. Compared to a normal control tissue sample,
Excessive protein expression can indicate abnormal cell growth
(Eg, a tumor). From the host
Assay for detecting protein levels in the obtained sample
Lee is well known to those skilled in the art and
Say, competitive binding assay, western blot analysis, EL
ISA assays and “sandwich” assays
You. ELISA assays (Coligan et al., Current Protocols in
Immunology, 1 (2), Chapter 6 (1991))
Antibodies specific to the antigen of the light polypeptide (preferably
Clonal antibody). Furthermore, its monochrome
Prepare a reporter antibody against the null antibody. Reporter
-Antibodies include detectable reagents (such as radioactivity or fluorescence)
Example of binding horseradish peroxidase enzyme)
You. Next, a sample is taken from the host, and the
On a solid support (eg, a polystyrene dish) that binds the substrate
Incubate with Next, non-specific proteins (C
With serum albumin)
Cover all free protein binding sites on the dish.
U. Next, the monoclonal antibody was ink-injected in the dish.
Lab. During this time, monoclonal antibodies are
Binding to all of the polypeptides of the invention bound to the styrene dish
Combine. Wash off unbound monoclonal antibody with buffer
You. Next, liposome bound to horseradish peroxidase
Protein antibody in the dish and bind to the protein of interest.
The reporter antibody is bound to the monoclonal antibody. Next, the unbound reporter antibody is washed away.
You. Next, a peroxidase substrate is added to the dish and
By comparing the amount of color developed during the period of
Determination of the amount of polypeptide present in a fixed volume of patient sample
A constant value is obtained. When using a competition assay, the invention
An antibody specific for the polypeptide is bound to a solid support.
Next, labeled FGF-13 and a sample obtained from the host were
Through the support, for example liquid scintillation chromatography
The amount of label detected by laffy etc.
Of the polypeptide of the present invention. The "sandwich" assay is an ELISA
Similar to Say. In the “sandwich” assay,
Passing the polypeptide of the invention over a solid support;
Bind to the antibody attached to Next, aim for the secondary antibody
To the polypeptide. Next, specific for the secondary antibody
A tertiary antibody which is labeled
Once bound to the secondary antibody, the amount can be quantified.
Can be. The sequence of the present invention is also effective for chromosome identification.
You. The sequences of the present invention may be located at specific locations on individual human chromosomes.
Specifically induced by and hybridize to
Can be. Also, to identify specific sites on the chromosome
Is also what is needed now. Current location
Actual sequence data that can be used to label chromosomal locations
(Repeat polymorphism's) based staining
There are few body labeling reagents. For chromosomes according to the present invention
DNA mapping maps their sequences to disease
This is an important first step in correlating with genes. [0115] Briefly, the sequence was converted from its cDNA to PC
To prepare an R primer (preferably 15 to 25 bp)
Therefore, mapping can be performed for chromosomes. Genomic DNA
Amplification process by straddling more than two exons
Quick selection of primers without complexity
Uses computer analysis of the 3 'untranslated region. Next
Of somatic cell hybrids containing individual human chromosomes
These primers are used for PCR screening.
A hive containing the human gene corresponding to the primer
Only the lid will generate an amplified fragment. The PCR mapping of somatic cell hybrids
A quick way to assign specific DNA to specific chromosomes
You. Using the present invention with the same oligonucleotide primer
Then, in a similar way, the fragment
Pool of cells or large genomic clones
Sub-localization can be achieved. On the chromosome
Other mapping methods that can be used for mapping to
Include in situ hybridization, chromosome specific
Hybridization for Construction of Dynamic cDNA Library
Pre-selection and label flow sorting (labeled flow-sor)
ted) Preliminary screening by chromosome. Fluorescence of cDNA clones against metaphase chromosomes
Using one-stage hybridization (FISH)
The exact chromosome location can be obtained at the floor. This technology
A cDNA of about 50 or 60 bases can also be used. Overview of this technology
In summary, see Verma et al., Human Chromosomes: a Manual
of Basic Techniques, Pergamon Press, New York
(1988). Sequences mapped to exact chromosomal locations
The genetic location of the sequence on the chromosome
Data can be correlated. Such data is
For example, V. McKusick, Mendelian Inheritance in Man
(Johns Hopkins University Welch Medical Rye
(Available online from Bally).
Next, diseases and genes mapped to the same chromosomal region
Relationship analysis (linkage analysis)
(Simultaneous inheritance of the genes to be performed) Next, between the patient and the non-patient, the cDNA or
It is necessary to determine genomic sequence differences. A mutation
Is observed in some or all of the patients and in normal individuals
If not observed, the mutation is the causative agent of the disease.
Might be. Physical mapping technology and gene mapping
At the current resolution of the technology, the chromosomal regions involved in the disease
The exact location of the cDNA in the region is 50-500
One of the potential causative factors (1 megabase
Ping resolution and one gene per 20 kb). The polypeptides of the present invention, fragments thereof and other derivatives
Conductors, their analogs, or cells that express them
As an immunogen to produce antibodies against them
Can be used. These antibodies are, for example, polyclonal antibodies.
It can be a body or a monoclonal antibody. The invention relates to chimeras
Antibodies, single-chain antibodies, humanized antibodies and Fab fragments or Fab expression
Also includes the products of the library. Such antibodies and
Fragments are produced using various methods known in the art.
Can be used. For polypeptides corresponding to the sequences of the present invention,
Antibodies (preferably non-human animals)
Direct injection or administration of the polypeptide to
Therefore, it can be obtained. The antibodies so obtained are
Will bind to the polypeptide itself. using this method
Uses sequences that encode only fragments of that peptide.
To generate an antibody that binds the all-natural polypeptide
You can also. Such an antibody may comprise the polypeptide
To isolate the polypeptide from tissues that express
Can be used for For the production of monoclonal antibodies, continuous serial
Any technique that provides antibodies produced by cell culture
You can use art. Examples include hybridoma technology
(Kohler and Milstein, 1975, Nature, 256: 495-49
7), trioma technology, human B cell hybrid
Technology (Kozbor et al., 1983, Immunology Today 4:72)
And EBV high to produce human monoclonal antibodies
Bridoma technology (Cole et al., 1985, Monoclonal Antibodie
s and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc., 77-96
Page). Techniques Described for the Production of Single Chain Antibodies
(U.S. Pat. No. 4,946,778) describes an immunogenic polypeptide of the invention.
Adapted for the production of single-chain antibodies to tide products
it can. In addition, using the transgenic mouse,
Expressing anthropomorphic antibodies to a protogenic polypeptide product
You can also. The present invention will be further described with reference to the following examples.
explain. However, the present invention is limited to these Examples.
It should be understood that there is no. Unless specified otherwise,
All amounts are based on weight. To facilitate understanding of the following examples,
Describe some methods and / or terms used for
Good. “Plasmids” are indicated by a lower case “p” and before and after the lower case “p”.
Specified in uppercase letters and / or numbers. In this specification
Starting plasmids are commercially available or publicly available without restriction
Published from available or available plasmids
It can be built according to the method. Furthermore, in the technical field
Is a plasmid equivalent to the plasmid described herein.
Are known and will be apparent to those skilled in the art. “Digestion” of DNA refers to specific arrangements in the DNA.
Refers to catalytic cleavage of DNA by a restriction enzyme that acts only on the
To taste. The various restriction enzymes used herein are commercially available.
The reaction conditions, cofactors and other requirements
Was used as would be known to those skilled in the art. Minute
For analysis, 1 μg of plasmid or DNA fragment is usually
Used in about 20 μl of buffer solution. plus
When isolating DNA fragments for construction of the mid
5 to 50 μg of DNA in a critical volume with 20 to 250 units of enzyme
Become Suitable amounts of buffer and substrate for a particular restriction enzyme
Specified by the manufacturer. Usually at 37 ° C for about 1 hour
Use the incubation time, which is
Can be changed as indicated. After digestion, the reaction
Direct electrophoresis on polyacrylamide gel
Isolate the pieces. Goeddel,
8 described in D. et al., Nucleic Acids Res., 8: 4057 (1980).
Perform using a% polyacrylamide gel. “Oligonucleotide” is a chemical compound.
A single-stranded polydeoxynucleotide or two phases
Means a complementary polydeoxynucleotide chain. Like that
No synthetic oligonucleotides have a 5 'phosphate group
Does not add a phosphate group with ATP in the presence of kinase
Will not ligate to another oligonucleotide
U. Synthetic oligonucleotides are not dephosphorylated
Will be linked to the new fragment. "Ligation" is defined as the connection between two double-stranded nucleic acid fragments.
Refers to the step of forming a phosphodiester bond (Maniat
is, T. et al., ibid., p. 146). Consolidated unless otherwise noted
Is likely to be ligated using known buffers and conditions.
10 units of T4 DNA ligase per 0.5 μg of equimolar DNA fragment
(“Ligase”). Unless otherwise stated, transformation was performed according to Graham,
F. and Van der Eb, A., Virology, 52: 456-457 (1973)
Was performed in the following manner. EXAMPLES Example 1 Bacterial Expression of FGF-15 Protein and Purification The DNA sequence encoding FGF-15 (ATCC No. 97146) was
No processed protein (signal peptide
5 'sequence (lacking the sequence) and the vector on the 3' side of the gene
-PCR oligonucleotide primers corresponding to the sequence
To amplify. Additional nucleons corresponding to the gene
A tide is added to the 5 'and 3' sequences. 5 'oligonucus
Reotide primer is 5 'GCCAGA CCATGG TAAAACCG GT
It has the sequence GCCCCTC3 '(SEQ ID NO: 3) and is an NcoI restriction enzyme.
Contains elementary sites (bold). 3 'sequence (5' GGCAGG AG
ATCT TGTTGTCTTACTCTTGTTGAC 3 ′; SEQ ID NO: 4) is BglI
Contains a sequence complementary to the I site (bold), followed by
Followed by 21 nucleotides of the FGF-15 coding sequence
I have. These restriction enzyme sites are compatible with bacterial expression vectors.
-PQE60 (Quiagen, Inc., Cha, California, 91311)
(Wattsworth). pQE-60 is anti-
Biomaterial resistance (Amp r ), Bacterial origin of replication (ori), IPTG
Controllable promoter operator (P / O), Riboso
Site binding site (RBS), 6-His label and restriction enzyme site
To load. Next, pQE-60 was digested with NcoI and BglII. Increase
The width sequence was ligated into pQE-60, histidine-labeled and
Insert it in frame with the ribosome binding site (RBS). Next
Using the ligation mixture, Sambrook, J. et al., Molecu
lar Cloning: ALaboratory Manual, Cold Harbor Labor
E. coli M15 / rep4 by the method described in atory Press (1989).
Transform the strain (Qiagen, Inc.). M15 / rep4 is lacI
Expresses a suppressor and has kanamycin resistance (Kan r )
Contains multiple copies of plasmid pREP4. L
Transform by their ability to grow on B plates
Identify body, ampicillin / kanamycin resistant colonies
Select Isolate plasmid DNA and perform restriction analysis.
Check it. Clones containing the desired construct
Supplemented with both Amp (100 μg / ml) and Kan (25 μg / ml)
Culture overnight (O / N) in the LB liquid medium. O / N culture
The inoculation is inoculated into a large culture at a ratio of 1: 100 to 1: 250.
Optical density 600 (OD 600 Until the cell is 0.4-0.6
To grow. Next, IPTG (“Isopropyl-β-D-thioga
Lactopyranoside ") to a final concentration of 1 mM
You. IPTG, by inactivating the lacI repressor,
Cleans P / O and induces increased gene expression. cell
Grow for an additional 3-4 hours. Next, centrifuge to
Collect the vesicles. Cell pellet with chaotropic reagent 6M salt
Solubilize in guanidine acid. After cleaning, this solution
Tight binding by proteins containing 6-His label
Chromatography on a nickel-chelate column
Purify solubilized FGF-15 by chromatography
(Hochuli, E. et al., J. Chromatography 411: 177-184 (19
84)). Is the protein on a column with 6M guanidine hydrochloride pH 5.0?
3M guanidine hydrochloride, 100 mM for regeneration
Sodium phosphate, 10mM glutathione (reduced) and 2m
Adjust to M-glutathione (oxidized form). 12:00 this solution
After incubation for 10 minutes, the protein is
Dialyze against lium. Example 2 Cloning of FGF-15 Using Baculovirus Expression System and
DNA sequence encoding the expressed full-length FGF-15 protein (ATCC N
o. 97146) is replaced by the PC corresponding to the 5 'and 3' sequences of the gene.
Amplify using R oligonucleotide primers. [0135] The FGF-15 5 'primer was a 5' CTAGT GG.
ATCC GCCATCATGGTAAAACC GGTGCCC 3 '(SEQ ID NO: 5)
Sequence and contains a Bam HI restriction enzyme site (bold)
And, in part, the efficiency of translation initiation in eukaryotic cells.
4 nucleotides similar to a good signal (Kozak, M., J. Mo
l. Biol., 196: 947-950 (1987))
Just after the first 18 nucleotides of the gene
The start codon "ATG" is underlined). The 3 'primer was 5' CGACT GGTACC AGCCACGG
AGCAGGAATGTCT 3 '(SEQ ID NO: 6)
Cleavage site of restriction endonuclease Asp718 (bold part)
And 21 nucleotides complementary to the 3 'untranslated sequence of the above gene
Contains The amplified sequence was prepared using a commercially available kit (“Genecl
ean ", BIO 101 Inc., La Jolla, CA)
And isolated from a 1% agarose gel. Then, the fragment
After digestion with each endonuclease, 1% agarose
Again. This fragment is named F2. Baculovirus expression system (Su
mmers, MD and Smith, GE, 1987, A manual of meth
ods for baculovirus vectors and insect cell cultur
e procedures, Texas Agricultural Experimental Stat
protein by ion Bulletin No. 1555)
For quality expression, the vector pA2 (modified from the pVL941 vector)
Used later). This expression vector is
grapha californica nuclear polyhedrosis virus (AcMNPV)
Powerful polyhedrin promoter and it
Recognition sites for restriction endonucleases BamHI and XbaI following
Containing For efficient polyadenylation,
Uses the simian virus (SV) 40 polyadenylation site
I do. For easy selection of recombinant virus,
The original β-galactosidase gene, polyhedrin
Polyhedrinp preceding the offspring polyadenylation signal
Insert in the same direction as the motor. Of the polyhedrin sequence
At both ends, wild-type transfected
Viral sequences for cell-mediated homologous recombination of ils DNA
Are adjacent. Instead of pA2, pRG1, pAc373, pVL941
And pAcIM1 (Luckow, VA and Summers, MD, Virolog
y, 170: 31-39) and many other baculoviruses
Vectors can also be used. The plasmid was digested with the above restriction enzymes.
Later known in the art using bovine intestinal phosphatase.
Dephosphorylation by the method described below. Next, a commercially available kit ("Ge
neclean ", BIO 101 Inc., La Jolla, CA)
Is used to isolate the DNA from a 1% agarose gel.
This vector is named V2. The fragment F2 and the dephosphorylated plasmid V2 were replaced with T4 DNA
Connect with ligase. Next, transform E. coli DH5α cells.
Bacteria containing the plasmid (pBacFGF-15)
Is identified using each restriction enzyme. Cloned fragment
Is confirmed by DNA sequencing. Lipofection method (Felgner et al., Proc. N
atl. Acad. Sci. USA, 84: 7413-7417 (1987)).
5 μg of plasmid pBacFGF-15 was commercially linearized.
Baculovirus ("BaculoGold TM baculovirus DN
A ", Pharmingen, San Diego, CA 1.0
Transfect simultaneously with μg. 1 μg of BaculoGold TM 5 μg with viral DNA
Of the above plasmid in a serum-free Grace's medium (Life T
echnologies Inc., Gaithersburg, MD 5
In a sterile well of a microtiter plate containing 0 μl
Mix with. Then, add 10 μl of Lipofectin and Grace
Add 90 μl of medium, mix and incubate at room temperature for 15 minutes.
To Next, 1 ml of Grace's medium without serum
Sf9 insect cells (A
Add the above transfection mixture to TCC CRL 1711).
Drip. Shake the plate back and forth to add the newly added solution
Mix the liquids. Next, incubate the plate at 27 ° C for 5 hours
I do. After 5 hours, plate the transfection solution
Grace Kon, supplemented with 10% fetal bovine serum
Add 1 ml of insect medium. Return the plate to the incubator and culture
Feeding is continued at 27 ° C. for 4 days. After 4 days, the supernatant was collected, and Summers and Smith were collected.
Perform a plaque assay as described (above).
U. Improvements include “Blue Gal” (Life Technologies
Inc., Inc., Gaisersburg)
I do. This facilitates the isolation of blue-stained plaques.
You. For a detailed description of the “plaque assay”, see Life
Technologies Inc. (Gaithersburg)
Users on insect cell culture and baculovirology
It is also found on pages 9-10 of the guide. Four days after serial dilution, the virus was added to the cells.
The blue stained plaque is transferred to an Eppendorf pipette.
Pick up with chips. Next, the cold containing the recombinant virus
Fill the eppendorf tube with 200 μl of Grace's medium.
Resuspend in the tube. Remove agar by short centrifugation
Using the supernatant containing the recombinant baculovirus, 35
Infect Sf9 cells inoculated in mm dishes. 4 days later, these
Collect the culture dish supernatant and store at 4 ° C. Sf9 cells were cultured in cells supplemented with 10% heat-inactivated FBS.
Grow on race medium. Transform the cells into recombinant baculoils
V-FGF-15 at a multiplicity of infection (MOI) of 2. 6 hours
Later, the medium was removed and SF90 lacking methionine and cysteine
0 II medium (Life Technologies Inc., Gaithersburg
H). 42 hours later, 5 μCi 35 S-methionine
And 5μCi 35 Add S-cysteine (Amersham). Fine
Incubate cells for an additional 16 hours and collect by centrifugation
And label the protein with SDS-PAGE and autoradiography.
Visualize with Raffy. Example 4 Expression of recombinant FGF-15 in COS cells 1) SV40 origin of replication, 2) ampicillin resistance gene, 3) large
Intestinal replication origin, 4) CMV promoter followed by polylysine
Anchor region, SV40 intron and polyadenylation site.
Derived from the containing vector pcDNA3 / Amp (Invitrogen)
Expression of plasmid FGF-15-HA. All FGF-15 precursors,
HA label fused to its 3 'end in frame
And the DNA fragment encoding
Cloned into the region. Therefore, the recombinant
Protein expression is controlled by the CMV promoter. HA mark
Knowledge, as already described, influenza hemagglutinin
Corresponding to an epitope derived from the protein (I. Wilso
n, H. Niman, R. Heighten, A. Cherenson, M. Connoll
y and R. Lerner, Cell, 37: 767 (1984)). Target tamper
When HA tag is fused to protein,
The recombinant protein in the body.
You. The plasmid construction method is as follows. FGF-
The following two DNA sequences (ATCC No. 97146)
Constructed by PCR using the primers. 5 'ply
Marker (5 'CTAGT GGATCC GCCATC ATGGTAAAACCGGTGCCC
3 ′; SEQ ID NO: 7) is a BamHI site followed by a start site.
18 nucleotides of the coding sequence starting from the don
contains. 3 'sequence (5' GTCGAC CTCGAGTGTGTGCTTACTCTTG
TT 3 ′; SEQ ID NO: 8) is an XhoI site, a translation stop codon, HA
Last 18 nucleotides of label and FGF-15 coding sequence
Contains a sequence complementary to the sequence (excluding the stop codon)
You. Therefore, the PCR product contains a BamHI site,
Labeling sequence followed by an in-frame fused HA label,
Contains a translation termination stop codon following the HA label, and an XhoI site
I do. The PCR-amplified DNA fragment and the vector pcDNA3 / Amp
Is digested with each restriction enzyme and ligated. In that linked mixture
E. coli SURE strain (Stratagene Cloning Systems, 92037
(Available from La Jolla, California)
The transformed culture is cultured on an ampicillin medium plate.
To select resistant colonies. Transform plasmid DNA
Isolated from the recombinant and the presence of the correct fragment
Find out. To express this recombinant FGF-15, DEAE-
Dextran method (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniati
s, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Sp
ring Laboratory Press (1989))
Transfect with the above expression vector. FGF-15
-HA protein expression was determined by radiolabeling and immunoprecipitation (E.
Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, C
old Spring Harbor Laboratory Press (1988))
Detected. Two days after transfection, cells
To 35 Label with S-cysteine for 8 hours. Next, the culture medium
And collect the cells with detergent (RIPA buffer (150 mM NaCl,
1% NP-40, 0.1% SDS, 1% NP-40, 0.5% DOC, 50 mM Tris, pH 7.
5) (Wilson, I. et al., Supra, 37: 767 (198
Four)). Replace both cell lysate and culture medium with HA-specific
Precipitate with clonal antibody. Remove 15 precipitated proteins
Analyze on a% SDS-PAGE gel. In view of the above teachings, the present invention has numerous features.
Can be improved or changed.
In addition to the embodiments described above, the present invention may be practiced within the scope of the appended claims.
can do. [Sequence listing] (1) General information: (i) Applicant: Green et al. (Ii) Title of the invention: Fibroblast growth factor-15 (iii) Number of sequences: 8 (iv) Contact: (A) Address: Carrera, Bahiaan, Bain, Zylphyra
St., Stewart and Olstein (B) Street: Becker Farm Road No. 6 (C) City: Roseland (D) State: New Jersey (E) Country: United States (F) ZIP: 07068 (v) Computer reading / reading ceremony: (A) Medium type: 3.5 inch diskette (B) Computer: IBM PS / 2 compatible (C) Operating system: MS-DOS (D) Software: Word Perfect 5.1 (vi) Data of this application: (A) Application number: (B) Filing date: Submitted at the same time (C) Classification: (vii) Priority claim application data: (A) Application number: 08 / 207,412 (B) Filing date : March 8, 1994 (viii) Patent attorney / agent Information: (A) Name: Ferraro, Gregory D (B) Registration number: 36,134 (C) Reference / Reference number: 325800-268 (ix) Telephone chain Contact information: (A) Phone number: 201-994-1700 (B) Fax number: 201-994-1744 (2) Information of SEQ ID NO: 1 (i) Sequence characteristics: (A) Length: 680 base pairs (B) Type: nucleic acid (C) Number of chains: single-stranded (D) Topology: linear (ii) Sequence type: cDNA (xi) Sequence: SEQ ID NO: 1 ATGGTAAAAC CGGTGCCCCT CTTCAGGAGA ACTGATTTCA AATTATTATT ATGCAACCAC 60 AAGGATCTCT TCTTTCTCAG GGTGTCTAAG CTGCTGGATT GCTTTTCGCC CAAATCAATG 120 TGGTTTCTTT GGAACATTTT CAGCAAAGGA ACGCATATGC TGCAGTGTCT TTGTGGCAAG 180 AGTCTTAAGA AAAACAAGAA CCCAACTGAT CCCCAGCTCA AGGGTATAGT GACCAGGTTA 240 TATTGCAGGC AAGGCTACTA CTTGCAAATG CACCCCGATG GAGCTCTCGA TGGAACCAAG 300 GGTGACAGCA CTAATTCTAC ACTCTTCAAC CTCATACCAG TGGGACTACG TGTTGTTGCC 360 ATCCAGGGAG TGAAAACAGG GTTGTATATA ACCATGAATG GAGAAGGTTA CCTCTACCCA 420 TCAGAACTTT TTACCCCTGA ATGCAAGTTT AAAGAATCTG TTTTTGAAAA TTATTATGTA 480 ATCTACTCAT CCATGTTGTA CAGACAACAG GAATCTGGTA GAGCCTGGTT TTTGGGAT TA 540 AATAAGGAAG GGCAAGCTAT GAAAGGGAAC AGAGTAAAGA AAACCAAACC AGCAGCTCAT 600 TTTCTACCCA AGCCATTGGA AGTTGCCATG TACCGAGAAC CATCTTTGCA TGATGTTGGG 660 GAAACGGTCC CGAAGCCTGG GGTGACCA CAAGTGCGTCAGAGCAAGAGCATCAGAGCAAGAGCAGA 225 amino acids (B) Type: amino acid (C) Number of chains: (D) Topology: linear (ii) Sequence type: protein (xi) Sequence: SEQ ID NO: 2: Met Val Lys Pro Val Pro Leu Phe Arg Arg Thr Asp Phe Lys Leu 5 10 15 Leu Leu Cys Asn His Lys Asp Leu Phe Phe Leu Arg Val Ser Lys 20 25 30 Leu Leu Asp Cys Phe Ser Pro Lys Ser Met Trp Phe Leu Trp Asn 35 40 45 Ile Phe Ser Lys Gly Thr His Met Leu Gln Cys Leu Cys Gly Lys 50 55 60 Ser Leu Lys Lys Asn Lys Asn Pro Thr Asp Pro Gln Leu Lys Gly 65 70 75 Ile Val Thr Arg Leu Tyr Cys Arg Gln Gly Tyr Tyr Leu Gln Met 80 85 90 His Pro Asp Gly Ala Leu Asp Gly Thr Lys Gly Asp Ser Thr Asn 95 100 105 Ser Thr Leu Phe Asn Leu Ile Pro Val Gly Leu Arg Val Val Ala 110 115 120 Ile Gln Gly Val Lys Thr Gly Leu Tyr Ile Thr Met Asn Gly Glu 125 130 135 Gly Tyr Leu Tyr Pro Ser Glu Leu Phe Thr Pro Glu Cys Lys Phe 140 145 150 Lys Glu Ser Val Phe Glu Asn Tyr Tyr Val Ile Tyr Ser Ser Met 155 160 165 Leu Tyr Arg Gln Gln Glu Ser Gly Arg Ala Trp Phe Leu Gly Leu 170 175 180 Asn Lys Glu Gly Gln Ala Met Lys Gly Asn Arg Val Lys Lys Thr 185 190 195 Lys Pro Ala Ala His Phe Leu Pro Lys Pro Leu Glu Val Ala Met 200 205 210 Tyr Arg Glu Pro Ser Leu His Asp Val Gly Glu Thr Val Pro Lys 215 220 225 Pro Gly Val Thr Pro Ser Lys Ser Thr Ser Ala Ser Ala Ile Met 230 235 240 Asn Gly Gly Lys Pro Val Asn Lys Ser Lys Thr Thr 245 250 (2) Information of SEQ ID NO: 3 (i) Sequence characteristics: (A) Length: 32 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Number of strands: Single strand (D) Topology: Linear (ii) Type of sequence: Oligonucleotide (xi) Sequence: SEQ ID NO: 3: GCCAGACCAT GGTAAAACCG GTGCCCCTC 29 (2) SEQ ID NO: 4 Emotion Information: (i) Sequence characteristics: (A) Length: 33 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Number of chains: single-stranded (D) Topology: linear (ii) Sequence type: oligo Nucleotide (xi) sequence: SEQ ID NO: 4: GGCAGGAGAT CTTGTTGTCT TACTCTTGTT GAC 33 (2) information of SEQ ID NO: 5: (i) sequence characteristics: (A) length: 33 base pairs (B) type: nucleic acid (C) chain Number: single-stranded (D) Topology: linear (ii) Sequence type: oligonucleotide (xi) Sequence: SEQ ID NO: 5: CTAGTGGATC CGCCATCATG GTAAAACCGG TGCCC 35 (2) Information of SEQ ID NO: 6: (i) Sequence Features: (A) Length: 30 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Number of strands: Single strand (D) Topology: Linear (ii) Sequence type: Oligonucleotide (xi) Sequence: SEQ ID NO: 6: CGACTGGTAC CAGCCACGGA GCAGGAATGT CT 32 (2) Information of SEQ ID NO: 7: (i) Sequence characteristics: (A) Length: 33 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Number of chains: single strand (D) Topologyー: Linear (ii) Sequence type: Oligonucleotide (xi) Sequence: SEQ ID NO: 7: CTAGTGGATC CGCCATCATG GTAAAACCGG TGCCC 35 (2) Information of SEQ ID NO: 8: (i) Sequence characteristics: (A) Length: 33 base pairs (B) Type: Nucleic acid (C) Number of strands: Single strand (D) Topology: Linear (ii) Sequence type: Oligonucleotide (xi) Sequence: SEQ ID NO: 8: GTCGACCTCG AGTGTGTGCT TACTCTTGTT 30
【図面の簡単な説明】
【図1】 FGF-15のcDNA配列と対応する推定(deduce
d)アミノ酸配列を示す図である。
【図2】 FGF-15のcDNA配列と対応する推定(deduce
d)アミノ酸配列を示す図である。
【図3】 FGF-15と他のFGFファミリー構成要素の間の
アミノ酸配列相同性を示す図である。保存されたアミノ
酸が容易に確認できる。
【図4】 FGF-15と他のFGFファミリー構成要素の間の
アミノ酸配列相同性を示す図である。保存されたアミノ
酸が容易に確認できる。
【図5】 FGF-15と他のFGFファミリー構成要素の間の
アミノ酸配列相同性を示す図である。保存されたアミノ
酸が容易に確認できる。
【図6】 FGF-15と他のFGFファミリー構成要素の間の
アミノ酸配列相同性を示す図である。保存されたアミノ
酸が容易に確認できる。BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS FIG. 1 FGF-15 cDNA sequence and corresponding deduced (deduce)
d) It is a figure which shows an amino acid sequence. FIG. 2. cDNA sequence of FGF-15 and corresponding deduced (deduce)
d) It is a figure which shows an amino acid sequence. FIG. 3 shows amino acid sequence homology between FGF-15 and other FGF family members. The conserved amino acids can be easily confirmed. FIG. 4 shows amino acid sequence homology between FGF-15 and other FGF family members. The conserved amino acids can be easily confirmed. FIG. 5 shows amino acid sequence homology between FGF-15 and other FGF family members. The conserved amino acids can be easily confirmed. FIG. 6 shows amino acid sequence homology between FGF-15 and other FGF family members. The conserved amino acids can be easily confirmed.
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
A61P 17/14 A61P 25/00
17/16 C07K 14/50
25/00 16/22
C07K 14/50 C12P 21/02 C
16/22 C12Q 1/68 A
C12P 21/02 C12N 15/00 ZNAA
C12Q 1/68 A61K 37/24
(72)発明者 ジョン・エム・グリーン
アメリカ合衆国20878メリーランド州ゲイ
ザーズバーグ、ダイアモンド・ドライブ
872番
(72)発明者 クレイグ・エイ・ローゼン
アメリカ合衆国20882メリーランド州レイ
トンズビル、ローリング・ヒル・ロード
22400番
Fターム(参考) 4B024 AA01 AA11 BA61 CA04 DA02
DA06 EA02 EA04 GA13 HA01
4B063 QA01 QA05 QA18 QQ42 QR32
QS25 QS33 QS34 QX02 QX07
4B064 AG13 AG26 CA02 CA10 CA12
CA19 CC24 CE12 DA01 DA13
4C084 AA02 AA07 AA17 BA01 BA02
BA08 BA22 CA04 CA59 DB54
NA14 ZA012 ZA892 ZA922
4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10
CA40 EA20 EA50 FA74 GA26──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) A61P 17/14 A61P 25/00 17/16 C07K 14/50 25/00 16/22 C07K 14/50 C12P 21 / 02 C 16/22 C12Q 1/68 A C12P 21/02 C12N 15/00 ZNAA C12Q 1/68 A61K 37/24 (72) Inventor John M. Green United States 20878 Diamond Drive, Gay Saarsburg, MD 782 872 Number (72) Inventor Craig A. Rosen United States 20882 Rolling Hill Road, Raytonsville, MD 22400 F Term (Reference) 4B024 AA01 AA11 BA61 CA04 DA02 DA06 EA02 EA04 GA13 HA01 4B063 QA01 QA05 QA18 QQ42 QR32 QS25 QS33 QS34 QX02 QX07 4B064 AG13 AG26 CA02 CA10 CA12 CA19 CC24 CE12 DA01 DA13 4C084 AA02 AA07 AA17 BA01 BA02 BA08 BA22 CA04 CA59 DB54 NA14 ZA012 ZA892 ZA922 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10 CA40 EA20 EA50 FA74 GA26